View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6692_low_16 (Length: 376)

Name: NF6692_low_16
Description: NF6692
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6692_low_16
NF6692_low_16
[»] chr3 (59 HSPs)
chr3 (1-368)||(16626792-16627158)
chr3 (24-368)||(18529999-18530343)
chr3 (66-356)||(15893060-15893350)
chr3 (1-367)||(8301553-8301919)
chr3 (18-367)||(18050865-18051214)
chr3 (1-367)||(8295578-8295944)
chr3 (1-181)||(17994070-17994250)
chr3 (66-367)||(4797007-4797308)
chr3 (66-367)||(15741436-15741737)
chr3 (1-181)||(4625736-4625916)
chr3 (1-181)||(5652179-5652359)
chr3 (18-367)||(35880369-35880718)
chr3 (69-367)||(4721234-4721532)
chr3 (18-367)||(18330277-18330621)
chr3 (66-367)||(29149109-29149410)
chr3 (69-367)||(6191919-6192217)
chr3 (58-367)||(8211344-8211653)
chr3 (69-367)||(28116314-28116612)
chr3 (58-367)||(18277398-18277707)
chr3 (58-367)||(18292699-18293008)
chr3 (58-367)||(18308000-18308309)
chr3 (69-367)||(7072815-7073113)
chr3 (69-181)||(5713016-5713128)
chr3 (69-181)||(5723926-5724038)
chr3 (69-181)||(5757439-5757551)
chr3 (69-181)||(5768330-5768442)
chr3 (58-277)||(20065739-20065958)
chr3 (58-356)||(10395750-10396048)
chr3 (102-316)||(22871264-22871478)
chr3 (102-316)||(22886323-22886537)
chr3 (69-367)||(47023056-47023354)
chr3 (102-283)||(5466672-5466853)
chr3 (102-307)||(5596756-5596961)
chr3 (102-284)||(18224877-18225059)
chr3 (78-367)||(21674296-21674585)
chr3 (1-284)||(28020964-28021247)
chr3 (69-319)||(7996213-7996463)
chr3 (69-319)||(10642721-10642971)
chr3 (102-284)||(17985346-17985528)
chr3 (102-367)||(5013315-5013580)
chr3 (102-355)||(6542864-6543117)
chr3 (1-284)||(4346973-4347256)
chr3 (102-316)||(18242381-18242595)
chr3 (69-307)||(36997446-36997684)
chr3 (69-316)||(11110718-11110965)
chr3 (177-316)||(20577327-20577466)
chr3 (177-307)||(51781674-51781804)
chr3 (102-307)||(24327822-24328027)
chr3 (102-283)||(28338989-28339170)
chr3 (102-283)||(31964863-31965044)
chr3 (102-283)||(50134461-50134642)
chr3 (69-253)||(29665342-29665526)
chr3 (1-356)||(32438771-32439126)
chr3 (177-283)||(4416603-4416709)
chr3 (1-206)||(4892977-4893182)
chr3 (1-206)||(22387864-22388069)
chr3 (177-280)||(5609787-5609890)
chr3 (69-316)||(48465569-48465816)
chr3 (177-307)||(51796762-51796893)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (1-368)||(19456655-19457022)
chr2 (1-368)||(21703398-21703765)
chr2 (66-356)||(27434746-27435036)
chr2 (37-368)||(27392630-27392961)
chr2 (18-367)||(23128820-23129169)
chr2 (1-181)||(27118515-27118695)
chr2 (18-367)||(28881852-28882201)
chr2 (1-181)||(31891562-31891742)
chr2 (1-181)||(34156838-34157018)
chr2 (1-181)||(34303537-34303717)
chr2 (18-367)||(20837556-20837905)
chr2 (1-181)||(3784481-3784661)
chr2 (1-181)||(16163426-16163606)
chr2 (18-367)||(12655180-12655529)
chr2 (69-367)||(34279087-34279385)
chr2 (75-367)||(37374799-37375091)
chr2 (69-316)||(13936849-13937096)
chr2 (69-283)||(21677487-21677701)
chr2 (69-316)||(261070-261317)
chr2 (69-367)||(11635494-11635792)
chr2 (69-367)||(11641683-11641981)
chr2 (69-316)||(34286043-34286290)
chr2 (69-316)||(34291103-34291350)
chr2 (69-316)||(37925182-37925429)
chr2 (102-284)||(12716943-12717125)
chr2 (69-316)||(40233188-40233435)
chr2 (102-284)||(31876002-31876184)
chr2 (102-284)||(34861401-34861583)
chr2 (102-284)||(37686247-37686429)
chr2 (102-284)||(37701512-37701694)
chr2 (102-284)||(39889783-39889965)
chr2 (177-316)||(12586490-12586629)
chr2 (102-284)||(16829676-16829858)
chr2 (102-284)||(16891623-16891805)
chr2 (102-307)||(19416837-19417042)
chr2 (102-283)||(22926366-22926547)
chr2 (69-277)||(32049526-32049734)
chr2 (177-316)||(9350407-9350546)
chr2 (177-316)||(27776896-27777035)
chr2 (177-316)||(27803381-27803520)
chr2 (177-316)||(27816663-27816802)
chr2 (63-316)||(39052127-39052380)
[»] chr4 (26 HSPs)
chr4 (1-368)||(15227529-15227896)
chr4 (1-366)||(15285173-15285538)
chr4 (1-368)||(1899916-1900283)
chr4 (8-368)||(14235780-14236140)
chr4 (18-367)||(14664675-14665024)
chr4 (15-368)||(15391594-15391948)
chr4 (66-367)||(17013657-17013958)
chr4 (1-181)||(24460850-24461030)
chr4 (1-367)||(24592559-24592925)
chr4 (11-367)||(36344770-36345126)
chr4 (66-367)||(6569510-6569811)
chr4 (58-367)||(14763609-14763918)
chr4 (85-367)||(19372918-19373200)
chr4 (75-316)||(54833098-54833339)
chr4 (69-367)||(27163633-27163931)
chr4 (102-367)||(14098198-14098463)
chr4 (69-367)||(5005527-5005825)
chr4 (102-284)||(31126867-31127049)
chr4 (69-284)||(30753482-30753697)
chr4 (69-307)||(33674126-33674364)
chr4 (102-307)||(18800971-18801176)
chr4 (102-355)||(40105987-40106240)
chr4 (69-284)||(21969441-21969656)
chr4 (177-316)||(39850331-39850470)
chr4 (1-206)||(24112483-24112688)
chr4 (1-206)||(34189205-34189410)
[»] chr7 (30 HSPs)
chr7 (1-356)||(16040980-16041335)
chr7 (1-368)||(16450129-16450496)
chr7 (66-367)||(16518615-16518916)
chr7 (66-367)||(16503579-16503880)
chr7 (1-181)||(31088595-31088775)
chr7 (1-181)||(45733292-45733472)
chr7 (1-367)||(10916999-10917365)
chr7 (66-367)||(2154216-2154517)
chr7 (66-367)||(5127635-5127936)
chr7 (18-367)||(11424927-11425276)
chr7 (69-367)||(5147542-5147840)
chr7 (69-319)||(45387034-45387284)
chr7 (69-367)||(16736662-16736960)
chr7 (69-367)||(16751716-16752014)
chr7 (69-367)||(17523175-17523473)
chr7 (69-367)||(17529742-17530040)
chr7 (102-367)||(31124554-31124819)
chr7 (58-283)||(4145314-4145539)
chr7 (102-367)||(24592776-24593041)
chr7 (102-316)||(9618345-9618559)
chr7 (69-307)||(11441263-11441501)
chr7 (102-284)||(26275329-26275511)
chr7 (69-367)||(26434900-26435198)
chr7 (102-282)||(26320104-26320284)
chr7 (177-284)||(3445020-3445127)
chr7 (69-284)||(26485946-26486161)
chr7 (1-206)||(5159326-5159531)
chr7 (69-316)||(26538075-26538322)
chr7 (102-316)||(26670149-26670363)
chr7 (177-284)||(31564709-31564816)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (37-368)||(20053-20384)
scaffold0124 (18-367)||(30095-30444)
[»] chr1 (7 HSPs)
chr1 (37-368)||(20460748-20461079)
chr1 (18-368)||(16208290-16208640)
chr1 (1-181)||(20340580-20340760)
chr1 (69-367)||(41793624-41793922)
chr1 (102-316)||(10962362-10962576)
chr1 (102-316)||(51637910-51638124)
chr1 (102-307)||(28584682-28584887)
[»] chr5 (52 HSPs)
chr5 (1-368)||(25198682-25199049)
chr5 (18-369)||(23891855-23892206)
chr5 (1-204)||(22888287-22888490)
chr5 (66-367)||(24688367-24688668)
chr5 (1-367)||(30934287-30934653)
chr5 (18-367)||(23752612-23752961)
chr5 (1-181)||(13184790-13184970)
chr5 (1-181)||(13440636-13440816)
chr5 (1-181)||(33877087-33877267)
chr5 (1-181)||(11325634-11325814)
chr5 (18-367)||(23718150-23718500)
chr5 (173-367)||(24951761-24951955)
chr5 (18-367)||(11549005-11549354)
chr5 (18-366)||(22999276-22999624)
chr5 (66-367)||(33777138-33777439)
chr5 (69-316)||(9548756-9549003)
chr5 (69-367)||(15658973-15659271)
chr5 (69-307)||(41674420-41674658)
chr5 (69-316)||(31431130-31431377)
chr5 (102-316)||(2510753-2510967)
chr5 (69-316)||(30168171-30168418)
chr5 (69-283)||(8665688-8665902)
chr5 (102-316)||(9317153-9317367)
chr5 (177-355)||(40473873-40474051)
chr5 (102-367)||(18375658-18375923)
chr5 (69-367)||(3789177-3789475)
chr5 (102-284)||(12131889-12132071)
chr5 (102-284)||(24681171-24681353)
chr5 (102-284)||(24723698-24723880)
chr5 (102-284)||(37771245-37771427)
chr5 (69-367)||(43077900-43078198)
chr5 (102-367)||(5637561-5637826)
chr5 (102-319)||(15759103-15759320)
chr5 (102-367)||(30151669-30151934)
chr5 (102-355)||(37358901-37359154)
chr5 (177-316)||(6874004-6874143)
chr5 (69-316)||(18500961-18501208)
chr5 (1-284)||(32599614-32599897)
chr5 (66-164)||(24969878-24969976)
chr5 (102-316)||(26480094-26480308)
chr5 (102-284)||(31826665-31826847)
chr5 (102-284)||(33516090-33516272)
chr5 (102-316)||(34616223-34616437)
chr5 (102-284)||(37671738-37671920)
chr5 (177-316)||(37754670-37754809)
chr5 (102-284)||(28960044-28960226)
chr5 (102-307)||(29967312-29967517)
chr5 (102-307)||(30029126-30029331)
chr5 (177-316)||(13325165-13325304)
chr5 (189-307)||(28648937-28649055)
chr5 (1-206)||(33292340-33292545)
chr5 (1-40)||(29889224-29889263)
[»] chr8 (22 HSPs)
chr8 (66-367)||(16283091-16283392)
chr8 (18-367)||(16277196-16277545)
chr8 (36-368)||(22081114-22081446)
chr8 (66-367)||(19687740-19688041)
chr8 (1-367)||(14557269-14557635)
chr8 (1-181)||(9354453-9354633)
chr8 (1-181)||(19659243-19659423)
chr8 (1-181)||(44562932-44563112)
chr8 (18-367)||(2137483-2137832)
chr8 (18-367)||(27609129-27609478)
chr8 (69-367)||(18710228-18710526)
chr8 (69-367)||(19674080-19674378)
chr8 (75-316)||(19286158-19286399)
chr8 (69-307)||(31490025-31490263)
chr8 (58-283)||(31354250-31354475)
chr8 (102-284)||(19208668-19208850)
chr8 (102-316)||(28362263-28362477)
chr8 (102-355)||(3329827-3330080)
chr8 (102-355)||(29828967-29829220)
chr8 (102-307)||(33258425-33258630)
chr8 (177-316)||(19518526-19518665)
chr8 (102-367)||(12093041-12093306)
[»] chr6 (42 HSPs)
chr6 (1-368)||(20160345-20160709)
chr6 (1-368)||(22172122-22172486)
chr6 (18-367)||(13299159-13299508)
chr6 (69-367)||(22935136-22935434)
chr6 (69-367)||(23857581-23857879)
chr6 (66-367)||(24863356-24863657)
chr6 (1-210)||(22477461-22477673)
chr6 (66-367)||(15424573-15424874)
chr6 (1-181)||(13522261-13522441)
chr6 (1-181)||(28162485-28162665)
chr6 (1-181)||(33374444-33374624)
chr6 (18-316)||(24304826-24305124)
chr6 (21-367)||(26988640-26988986)
chr6 (66-367)||(26999712-27000013)
chr6 (1-181)||(8892498-8892678)
chr6 (1-181)||(8903733-8903913)
chr6 (66-367)||(16749493-16749794)
chr6 (69-316)||(26918070-26918317)
chr6 (1-367)||(29549117-29549483)
chr6 (58-367)||(27044029-27044338)
chr6 (69-367)||(3695702-3696000)
chr6 (98-284)||(4525011-4525197)
chr6 (102-367)||(17024901-17025166)
chr6 (102-316)||(27484807-27485021)
chr6 (102-316)||(29501096-29501310)
chr6 (102-284)||(29572735-29572917)
chr6 (102-284)||(30558308-30558490)
chr6 (177-284)||(4757483-4757590)
chr6 (177-316)||(4772687-4772826)
chr6 (177-316)||(27007402-27007541)
chr6 (102-367)||(4546076-4546341)
chr6 (102-307)||(16944319-16944524)
chr6 (102-367)||(28207081-28207346)
chr6 (177-316)||(34463728-34463867)
chr6 (102-283)||(26777919-26778100)
chr6 (69-316)||(16673817-16674064)
chr6 (177-284)||(27360377-27360484)
chr6 (177-284)||(27450720-27450827)
chr6 (8-355)||(27629907-27630254)
chr6 (102-355)||(4724435-4724688)
chr6 (183-284)||(26116792-26116893)
chr6 (174-355)||(27272947-27273128)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (66-367)||(29405-29706)
scaffold0089 (69-367)||(40385-40683)
scaffold0089 (18-367)||(47250-47599)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (37-368)||(21208-21539)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (18-367)||(26934-27283)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (1-181)||(2903-3083)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (66-367)||(443-744)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (98-367)||(7874-8143)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (173-367)||(48568-48769)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (102-367)||(15279-15544)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (102-367)||(26551-26816)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (102-284)||(7588-7770)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (102-367)||(7579-7844)
[»] scaffold0159 (1 HSPs)
scaffold0159 (102-280)||(9415-9593)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (177-316)||(5682-5821)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (1-40)||(273-312)
[»] scaffold0496 (1 HSPs)
scaffold0496 (177-217)||(157-197)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 316; Significance: 1e-178; HSPs: 59)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Original strand, 16626792 - 16627158
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16626792 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtaccggaggttgacccgatggtagagg 16626891  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16626892 atactgatgatagaacggtggaaagaagggatgctgagagtattgtgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagcc 16626991  T
Q  201 atggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16626992 atggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttc-ttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaa 16627090  T
Q  301 ctttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctca 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  16627091 ctttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctaggcgagtccccatggtgaccatctca 16627158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 24 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 18530343 - 18529999
Alignment:
Q  24 tgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaa 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18530343 tgttgagctggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggcacttgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaa 18530244  T
Q  124 agaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcaga 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  18530243 agaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgatggaggtaactgggcagcattaataggggtaacagtagccatggattgactagttccggcaga 18530144  T
Q  224 taccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgcct 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18530143 taccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtatctctttgatgcatttacagaggattcaactttctcgaatacaataatgcct 18530044  T
Q  324 tctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctca 368  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  18530043 tctctgacagcttcttctagacgagtccccatggtgaccatctca 18529999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 66 - 356
Target Start/End: Original strand, 15893060 - 15893350
Alignment:
Q  66 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 165  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||     
T  15893060 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaagggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggag 15893159  T
Q  166 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 265  Q
      |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  15893160 gcatttgggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgtt 15893259  T
Q  266 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatg 356  Q
    ||  |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  15893260 actatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttctctgacagcttcttccagacgagttcccatg 15893350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 367
Target Start/End: Original strand, 8301553 - 8301919
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||| ||||   |||||||| ||| || | | | || || ||||||||||| |||||| |||||| ||| | |||    
T  8301553 gtctagcttgctgattttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagg 8301652  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcc 200  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| | ||||||||||   |  ||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  8301653 gtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgagtacgacggaggcatttgggcagcattgataggagcaacaatagcc 8301752  T
Q  201 atggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||  | |||||||||     
T  8301753 atggattgaccggctccggcagacaccatccatacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgacgcattcacagaggattcag 8301852  T
Q  301 ctttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  8301853 ctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 8301919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 18051214 - 18050865
Alignment:
Q  18 tgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatg 117  Q
    |||||||||||| ||||   |||||||| ||| || | | |||| || ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18051214 tgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatg 18051115  T
Q  118 gtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctcc 217  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||  ||||||| ||||| ||||||   |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18051114 gcggaaagaaaggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctcc 18051015  T
Q  218 ggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaata 317  Q
     || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| |||||     
T  18051014 agctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatg 18050915  T
Q  318 atgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
    || ||||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  18050914 attccttccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatctc 18050865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 8295944 - 8295578
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    |||||||||| || |  ||||||||||||  |||   |||||||| ||| || | | |||| || ||||| ||||| |||||| |||||| ||  |||||    
T  8295944 gtctagcttgctgattttgttgttgttgaattggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacaggtacttgaggttgacccggtgacagagg 8295845  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcc 200  Q
     ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||   |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  8295844 gtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagcc 8295745  T
Q  201 atggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||  | |||||||||     
T  8295744 atggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgatgcattcacagaggattcag 8295645  T
Q  301 ctttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
    |||||||||| ||||| || || ||  |||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  8295644 ctttctcgaacacaatgattccatccttgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 8295578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 17994070 - 17994250
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  17994070 gtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagg 17994169  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||    
T  17994170 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 17994250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 66 - 367
Target Start/End: Original strand, 4797007 - 4797308
Alignment:
Q  66 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 165  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  4797007 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 4797106  T
Q  166 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 265  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  4797107 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 4797206  T
Q  266 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 365  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  4797207 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 4797306  T
Q  366 tc 367  Q
    ||    
T  4797307 tc 4797308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 66 - 367
Target Start/End: Original strand, 15741436 - 15741737
Alignment:
Q  66 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 165  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  15741436 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 15741535  T
Q  166 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 265  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  15741536 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 15741635  T
Q  266 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 365  Q
     || |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  15741636 gccatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 15741735  T
Q  366 tc 367  Q
    ||    
T  15741736 tc 15741737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 4625916 - 4625736
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||| | | |||||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  4625916 gtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacgacattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagg 4625817  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 181  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||    
T  4625816 atactgatgatataatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 4625736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 5652359 - 5652179
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| | | | |    
T  5652359 gtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgattgcaaacg 5652260  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||    
T  5652259 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 5652179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 35880718 - 35880369
Alignment:
Q  18 tgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatg 117  Q
    |||||||||||| ||||   |||||||| ||| || | | |||| || ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  35880718 tgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatg 35880619  T
Q  118 gtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctcc 217  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35880618 gcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctcc 35880519  T
Q  218 ggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaata 317  Q
     || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| |||||     
T  35880518 agctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatg 35880419  T
Q  318 atgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
    || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  35880418 attccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatctc 35880369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 69 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 4721532 - 4721234
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||   |    
T  4721532 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaagatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggca 4721433  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  4721432 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 4721333  T
Q  269 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
     |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  4721332 atacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatctc 4721234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 18330621 - 18330277
Alignment:
Q  18 tgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatg 117  Q
    |||||||||||| ||||   |||||||| ||| || | | |||| || ||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||     ||||||| ||||    
T  18330621 tgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagg-----gatgataaaatg 18330527  T
Q  118 gtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctcc 217  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18330526 gtggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctcc 18330427  T
Q  218 ggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaata 317  Q
     || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||  |||||     
T  18330426 agctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgagcacaatg 18330327  T
Q  318 atgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
    || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  18330326 attccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatctc 18330277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 66 - 367
Target Start/End: Original strand, 29149109 - 29149410
Alignment:
Q  66 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 165  Q
    |||||||| || |||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  29149109 ttaacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 29149208  T
Q  166 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 265  Q
      |  ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  29149209 gcatttgggctgcattgataggagcaatagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 29149308  T
Q  266 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 365  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  29149309 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 29149408  T
Q  366 tc 367  Q
    ||    
T  29149409 tc 29149410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 69 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 6192217 - 6191919
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| |||| |||||| ||||| | |||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||   |    
T  6192217 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactaatgataaaatggcgaaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggca 6192118  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||| |||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  6192117 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccaactgacaccatccatacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 6192018  T
Q  269 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
     |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  6192017 atacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatctc 6191919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 58 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 8211653 - 8211344
Alignment:
Q  58 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggta 157  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  8211653 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcgcatatgggta 8211554  T
Q  158 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 257  Q
     ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  8211553 tgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 8211454  T
Q  258 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 357  Q
    || || ||||| |||||||| |||||| | || ||||| ||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  8211453 tgtccattaccatacctcttcgatgcactcgcagaggactcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 8211354  T
Q  358 tgtccatctc 367  Q
    || |||||||    
T  8211353 tgaccatctc 8211344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 69 - 367
Target Start/End: Original strand, 28116314 - 28116612
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  28116314 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 28116413  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  28116414 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 28116513  T
Q  269 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
     |||||||| |||||| | |  || |||||| ||||||| || |||||||| || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  28116514 atacctcttcgatgcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaataattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 28116612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 58 - 367
Target Start/End: Original strand, 18277398 - 18277707
Alignment:
Q  58 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggta 157  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| |||||    
T  18277398 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggta 18277497  T
Q  158 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 257  Q
     ||||||   |  || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  18277498 tgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 18277597  T
Q  258 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 357  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  18277598 tgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 18277697  T
Q  358 tgtccatctc 367  Q
    || |||||||    
T  18277698 tgaccatctc 18277707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 58 - 367
Target Start/End: Original strand, 18292699 - 18293008
Alignment:
Q  58 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggta 157  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| |||||    
T  18292699 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggta 18292798  T
Q  158 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 257  Q
     ||||||   |  || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  18292799 tgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 18292898  T
Q  258 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 357  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  18292899 tgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 18292998  T
Q  358 tgtccatctc 367  Q
    || |||||||    
T  18292999 tgaccatctc 18293008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 58 - 367
Target Start/End: Original strand, 18308000 - 18308309
Alignment:
Q  58 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggta 157  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| |||||    
T  18308000 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggta 18308099  T
Q  158 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 257  Q
     ||||||   |  || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  18308100 tgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 18308199  T
Q  258 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 357  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  18308200 tgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 18308299  T
Q  358 tgtccatctc 367  Q
    || |||||||    
T  18308300 tgaccatctc 18308309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 69 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 7073113 - 7072815
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  7073113 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 7073014  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  7073013 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgactggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 7072914  T
Q  269 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
     |||||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  7072913 atacctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 7072815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 69 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 5713128 - 5713016
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  5713128 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggta 5713029  T
Q  169 actgggcagcatt 181  Q
     ||| ||||||||    
T  5713028 gctgagcagcatt 5713016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 69 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 5724038 - 5723926
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  5724038 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggta 5723939  T
Q  169 actgggcagcatt 181  Q
     ||| ||||||||    
T  5723938 gctgagcagcatt 5723926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 69 - 181
Target Start/End: Original strand, 5757439 - 5757551
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  5757439 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggta 5757538  T
Q  169 actgggcagcatt 181  Q
     ||| ||||||||    
T  5757539 gctgagcagcatt 5757551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 69 - 181
Target Start/End: Original strand, 5768330 - 5768442
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  5768330 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggta 5768429  T
Q  169 actgggcagcatt 181  Q
     ||| ||||||||    
T  5768430 gctgagcagcatt 5768442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 58 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20065958 - 20065739
Alignment:
Q  58 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggta 157  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| |||||    
T  20065958 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggta 20065859  T
Q  158 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 257  Q
     ||||||   |  ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||| |||    
T  20065858 tgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtatctttcttcttgtga 20065759  T
Q  258 tgaccgttaccgtacctctt 277  Q
    || || ||||| ||||||||    
T  20065758 tgtccattaccatacctctt 20065739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 58 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 10396048 - 10395750
Alignment:
Q  58 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggta 157  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||  ||  ||| |||||    
T  10396048 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcatatatgggta 10395949  T
Q  158 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 257  Q
     ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  10395948 tgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 10395849  T
Q  258 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatg 356  Q
    || || ||||| || ||||| ||||||||  | ||||||||| ||||||| || |||||||| || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||    
T  10395848 tgtccattaccatatctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaataattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatg 10395750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 102 - 316
Target Start/End: Original strand, 22871264 - 22871478
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   | ||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  22871264 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatctgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 22871363  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 301  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| | || ||||||||| |    
T  22871364 tagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcactcgcagaggattcagc 22871463  T
Q  302 tttctcgaatacaat 316  Q
    |||||| || |||||    
T  22871464 tttctcaaacacaat 22871478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 102 - 316
Target Start/End: Original strand, 22886323 - 22886537
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   | ||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  22886323 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatctgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 22886422  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 301  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| | || ||||||||| |    
T  22886423 tagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcactcgcagaggattcagc 22886522  T
Q  302 tttctcgaatacaat 316  Q
    |||||| || |||||    
T  22886523 tttctcaaacacaat 22886537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 69 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 47023354 - 47023056
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  47023354 acgggcacctgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 47023255  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      || |  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  47023254 tttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 47023155  T
Q  269 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
     |||||||| ||||||||  | ||||||||  ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  47023154 atacctcttcgatgcattcacagaggattcggctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 47023056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 102 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 5466853 - 5466672
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  5466853 tactgatgataaaatggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 5466754  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgc 283  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  5466753 tagattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgatgc 5466672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 102 - 307
Target Start/End: Original strand, 5596756 - 5596961
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||||||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  5596756 tactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatatatgggtacgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 5596855  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 301  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| | || |||||||||||    
T  5596856 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcactcgcagaggattcaac 5596955  T
Q  302 tttctc 307  Q
    ||||||    
T  5596956 tttctc 5596961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 102 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 18225059 - 18224877
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  18225059 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 18224960  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 284  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||||    
T  18224959 ttgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgca 18224877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 78 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 21674585 - 21674296
Alignment:
Q  78 tgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcag 177  Q
    |||||| |||||| ||| || || |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||   |  || || |    
T  21674585 tgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaatggcggaaagaacggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctg 21674486  T
Q  178 cattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctt 277  Q
    |||| ||||| || || |||||||||| |||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || |||||    
T  21674485 cattgataggagccacggtagccatgggttgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctctt 21674386  T
Q  278 tgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
     ||||||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  21674385 cgatgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 21674296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 28021247 - 28020964
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    ||||||| | ||||||||| || |||||| |||| || || ||||| |  || | | ||||||| || || || ||||||||| | || | ||| | |||    
T  28021247 gtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagg 28021148  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcc 200  Q
     ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  ||||| | ||| ||||| ||||||||||||    
T  28021147 gtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgtattgataggagcaacagtagcc 28021048  T
Q  201 atggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 284  Q
    |||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||    
T  28021047 atggattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttccttcttcttgtggtgtccgttaccatacctctttgatgca 28020964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 69 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 7996463 - 7996213
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| | ||||   |    
T  7996463 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggca 7996364  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      || || ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  7996363 tttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 7996264  T
Q  269 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataat 319  Q
     |||||||| || ||| | || || |||||| ||||||| || ||||||||    
T  7996263 atacctcttcgaggcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaataat 7996213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 69 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 10642971 - 10642721
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| | ||||   |    
T  10642971 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggca 10642872  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      || || ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  10642871 tttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 10642772  T
Q  269 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataat 319  Q
     |||||||| || ||| | || || |||||| ||||||| || ||||||||    
T  10642771 atacctcttcgaggcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaataat 10642721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 284
Target Start/End: Original strand, 17985346 - 17985528
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| || || ||||| |||||||    
T  17985346 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagcca 17985445  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 284  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||||    
T  17985446 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtacctttttgatgca 17985528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 5013580 - 5013315
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| || || |||||||||||||    
T  5013580 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagcca 5013481  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 301  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||| | |  || |||||| |    
T  5013480 ttgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgcactcgtagaagattcagc 5013381  T
Q  302 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  5013380 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 5013315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 355
Target Start/End: Original strand, 6542864 - 6543117
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  6542864 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 6542963  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 301  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| | |  || |||||| |    
T  6542964 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcactcgtagaagattcagc 6543063  T
Q  302 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 355  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||    
T  6543064 tttctcaaacacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccat 6543117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 4346973 - 4347256
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    ||||||| | ||||||||| || |||||| |||| || || ||||| |  || | | ||||||| || || || ||||||||| | || | ||| | |||    
T  4346973 gtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagg 4347072  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcc 200  Q
     ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  | | ||||| ||||||   |  ||||| || || ||||| ||||||||||||    
T  4347073 gtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatacatgggtatgacggaggcatttgggctgcgttgataggagcaacagtagcc 4347172  T
Q  201 atggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 284  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  4347173 atggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 4347256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 18242595 - 18242381
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  18242595 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 18242496  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 301  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  18242495 ttgattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 18242396  T
Q  302 tttctcgaatacaat 316  Q
    |||||| || |||||    
T  18242395 tttctcaaacacaat 18242381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 69 - 307
Target Start/End: Original strand, 36997446 - 36997684
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    ||||| ||||||||| | || | ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  36997446 acgggcacctgaggttggccgggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 36997545  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  36997546 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 36997645  T
Q  269 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 307  Q
     || ||||| || |||||| | ||||||||| |||||||    
T  36997646 atatctcttcgacgcatttacagaggattcagctttctc 36997684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 69 - 316
Target Start/End: Original strand, 11110718 - 11110965
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  11110718 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 11110817  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      || |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||||    
T  11110818 tttgagttgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttccttcttcttgtggtgtccattacc 11110917  T
Q  269 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 316  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  11110918 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 11110965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 177 - 316
Target Start/End: Original strand, 20577327 - 20577466
Alignment:
Q  177 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 276  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  20577327 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 20577426  T
Q  277 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 316  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  20577427 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 20577466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 177 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 51781804 - 51781674
Alignment:
Q  177 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 276  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  51781804 gcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 51781705  T
Q  277 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 307  Q
    | || |||||| | ||||||||| |||||||    
T  51781704 tcgacgcatttacagaggattcagctttctc 51781674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 24328027 - 24327822
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  24328027 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 24327928  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 301  Q
    | ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  24327927 ttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 24327828  T
Q  302 tttctc 307  Q
    ||||||    
T  24327827 tttctc 24327822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28339170 - 28338989
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| || || |||||||    
T  28339170 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagcca 28339071  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgc 283  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||    
T  28339070 tggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgc 28338989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 283
Target Start/End: Original strand, 31964863 - 31965044
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| || || |||||||    
T  31964863 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagcca 31964962  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgc 283  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||    
T  31964963 tggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgc 31965044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 283
Target Start/End: Original strand, 50134461 - 50134642
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| || || |||||||    
T  50134461 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagcca 50134560  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgc 283  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||    
T  50134561 tggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgc 50134642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 69 - 253
Target Start/End: Original strand, 29665342 - 29665526
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  29665342 acgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatgtatgggtatgacggaggca 29665441  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttctt 253  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29665442 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttctt 29665526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 32439126 - 32438771
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    ||||||| | ||||||||| || |||||| |||| || || |||||||  || | | ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | |||    
T  32439126 gtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagg 32439027  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcc 200  Q
     ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||    ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||    
T  32439026 gtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgggggaaactgagcagcattgacaggagcaacagtagcc 32438927  T
Q  201 atggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaa 300  Q
     ||||| ||   | ||| || | || ||| || || || || ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |  |||||||| || || ||||    
T  32438926 ttggatggattagttccagcggctatcattcccacctccgtatctttcttcttgtgatgtccattaccgtatctcttcgcagcatttgcagatgactcaa 32438827  T
Q  301 ctttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatg 356  Q
      ||||| || ||||| |||||||| |  | ||||||||| ||||| || ||||||    
T  32438826 tcttctcaaacacaatgatgccttcccgaacagcttcttccagacgtgttcccatg 32438771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 177 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 4416709 - 4416603
Alignment:
Q  177 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 276  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  4416709 gcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 4416610  T
Q  277 ttgatgc 283  Q
    | |||||    
T  4416609 tcgatgc 4416603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 4893182 - 4892977
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    ||||||| | ||||||||| || |||||| |||| || || |||||||  || | | ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | |||    
T  4893182 gtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagg 4893083  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcc 200  Q
     ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  4893082 gtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagcc 4892983  T
Q  201 atggat 206  Q
     |||||    
T  4892982 ttggat 4892977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 22387864 - 22388069
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    ||||||| | ||| ||||| || |||||| |||| || || |||||||  || | | ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | |||    
T  22387864 gtctagcatattgttgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagg 22387963  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcc 200  Q
     ||||||||||| || | ||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22387964 gtactgatgataaaacgatgggaagaacggatgctgagagtatggtgcataagggtaggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagcc 22388063  T
Q  201 atggat 206  Q
    ||||||    
T  22388064 atggat 22388069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 177 - 280
Target Start/End: Original strand, 5609787 - 5609890
Alignment:
Q  177 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 276  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  5609787 gcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 5609886  T
Q  277 ttga 280  Q
    ||||    
T  5609887 ttga 5609890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 69 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 48465816 - 48465569
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    ||||| || |||||| |||||| |||  | || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  48465816 acgggcacttgaggttgacccggtggcggggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggca 48465717  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  48465716 tttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 48465617  T
Q  269 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 316  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  48465616 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 48465569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 177 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 51796893 - 51796762
Alignment:
Q  177 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatg-accgttaccgtacctc 275  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||  || ||||| || |||    
T  51796893 gcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtgccattaccatatctc 51796794  T
Q  276 tttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 307  Q
    || || |||||| | ||||||||| |||||||    
T  51796793 ttcgacgcatttacagaggattcagctttctc 51796762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 316; Significance: 1e-178; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Original strand, 19456655 - 19457022
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  19456655 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcattaacgggcacctgaggttgacccgatggtagagg 19456754  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19456755 atactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgaaagtattgcgcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagcc 19456854  T
Q  201 atggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaa 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19456855 atggattgaccagctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaa 19456954  T
Q  301 ctttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctca 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  19456955 ctttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctaggcgagtccccatggtgaccatctca 19457022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Original strand, 21703398 - 21703765
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  21703398 gtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgttgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagg 21703497  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703498 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacggaggtaactaggcagcattaataggggcaacagtagcc 21703597  T
Q  201 atggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  21703598 atggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtatctctttgatgcatttacagaggattcaa 21703697  T
Q  301 ctttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctca 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21703698 ctttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctagacgagtccccatggtgaccatctca 21703765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 66 - 356
Target Start/End: Original strand, 27434746 - 27435036
Alignment:
Q  66 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 165  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||     
T  27434746 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggag 27434845  T
Q  166 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 265  Q
      |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  27434846 gcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgtt 27434945  T
Q  266 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatg 356  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||    
T  27434946 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttttcgaacacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatg 27435036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 37 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 27392961 - 27392630
Alignment:
Q  37 gctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctg 136  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||| || ||||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27392961 gctgttgttgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcggtggcggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctg 27392862  T
Q  137 agagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctact 236  Q
    ||||||||||   ||| ||||||  |||  || ||| |||||||  || ||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  27392861 agagtattgcatgtactggtacggtggaggtagctgagcagcatcgatgggggcaacagtagccacagattgactggttccggcagataccatccctact 27392762  T
Q  237 tctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagctt 336  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| |    
T  27392761 tctgtctctttcttcttatgatgaccattaccatacttccttgatgcatttgcagaggattcacctttctcaaacacaataatgccgtctctgacagcct 27392662  T
Q  337 cttctagacgagtccccatgatgtccatctca 368  Q
    ||||||  || || |||||| || ||||||||    
T  27392661 cttctaagcgggttcccatggtgaccatctca 27392630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 367
Target Start/End: Original strand, 23128820 - 23129169
Alignment:
Q  18 tgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatg 117  Q
    |||||||||||| ||||   |||||||| ||| || | | |||| || ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  23128820 tgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatg 23128919  T
Q  118 gtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctcc 217  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||   |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23128920 gcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctcc 23129019  T
Q  218 ggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaata 317  Q
     || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| |||||     
T  23129020 agctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgttaccatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatg 23129119  T
Q  318 atgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
    || ||||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  23129120 attccttccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatctc 23129169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 27118695 - 27118515
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  27118695 gtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagg 27118596  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||| ||||||||    
T  27118595 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatgcgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 27118515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 28882201 - 28881852
Alignment:
Q  18 tgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatg 117  Q
    |||||||||||| ||||   |||||||| ||| || | | |||| || ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  28882201 tgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatg 28882102  T
Q  118 gtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctcc 217  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||   |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28882101 gcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctcc 28882002  T
Q  218 ggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaata 317  Q
     || || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| |||||     
T  28882001 agctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatg 28881902  T
Q  318 atgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
    || || || |||| ||||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  28881901 attccatccctgacagcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 28881852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 31891562 - 31891742
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||| | |||    
T  31891562 gtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaagg 31891661  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||    
T  31891662 atactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 31891742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 34157018 - 34156838
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  34157018 gtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagg 34156919  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||    
T  34156918 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 34156838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 34303537 - 34303717
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||| | | |||||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  34303537 gtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacgacattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagg 34303636  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||    
T  34303637 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 34303717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 20837905 - 20837556
Alignment:
Q  18 tgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatg 117  Q
    |||||||||||| ||||   |||||||| ||| || | | |||| || ||||||||||| |||||| |||||| ||| || || ||||||||||| ||||    
T  20837905 tgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatg 20837806  T
Q  118 gtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctcc 217  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||   |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20837805 gcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtaggacggatgcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctcc 20837706  T
Q  218 ggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaata 317  Q
    | | || ||||| |||||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||  | | ||||||| |||||||||| |||||     
T  20837705 gactgacaccattcctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgatgcattcacagtggattcagctttctcgaacacaatg 20837606  T
Q  318 atgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
    || ||||| ||||  ||||| || |||||||| |||||| || |||||||    
T  20837605 attccttccctgacggcttcctccagacgagttcccatggtgaccatctc 20837556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 3784661 - 3784481
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  3784661 gtctagcctgttgctactgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagg 3784562  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||    
T  3784561 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 3784481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 16163606 - 16163426
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | ||     
T  16163606 gtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaga 16163507  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||    
T  16163506 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 16163426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 12655529 - 12655180
Alignment:
Q  18 tgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatg 117  Q
    |||||||||||| ||||   |||||||| ||| || | | |||| || ||||||||||| |||||| |||||| ||| || || ||||||||||| ||||    
T  12655529 tgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatg 12655430  T
Q  118 gtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctcc 217  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||   |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12655429 gcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtaggacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctcc 12655330  T
Q  218 ggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaata 317  Q
    | | || ||||| |||||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||  | |||| |||| |||||||||| |||||     
T  12655329 gactgacaccattcctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgatgcattcacagagggttcagctttctcgaacacaatg 12655230  T
Q  318 atgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
    || ||||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  12655229 attccttccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatctc 12655180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 69 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 34279385 - 34279087
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  34279385 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 34279286  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  34279285 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 34279186  T
Q  269 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
     |||||||| || | |||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  34279185 atacctcttcgacgtattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 34279087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 37375091 - 37374799
Alignment:
Q  75 acctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactggg 174  Q
    ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| ||||||   |  || |    
T  37375091 acctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggcgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgag 37374992  T
Q  175 cagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacct 274  Q
      || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||    
T  37374991 ttgcgttgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacct 37374892  T
Q  275 ctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
    ||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  37374891 cttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 37374799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 69 - 316
Target Start/End: Original strand, 13936849 - 13937096
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  13936849 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 13936948  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  13936949 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 13937048  T
Q  269 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 316  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  13937049 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 13937096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 69 - 283
Target Start/End: Original strand, 21677487 - 21677701
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| | ||||   |    
T  21677487 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggca 21677586  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  21677587 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 21677686  T
Q  269 gtacctctttgatgc 283  Q
     |||||||| |||||    
T  21677687 atacctcttcgatgc 21677701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 69 - 316
Target Start/End: Original strand, 261070 - 261317
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  261070 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 261169  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      || |  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  261170 tttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 261269  T
Q  269 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 316  Q
     |||||||| ||||||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  261270 atacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 261317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 69 - 367
Target Start/End: Original strand, 11635494 - 11635792
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  11635494 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 11635593  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||||||||| || || || |||||    
T  11635594 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctcctgctgacaccatccccacttccgcttctttcttcttgtggtgtccattacc 11635693  T
Q  269 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
     ||||||||  | ||| | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  11635694 atacctcttcaacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 11635792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 69 - 367
Target Start/End: Original strand, 11641683 - 11641981
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  11641683 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 11641782  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||||||||| || || || |||||    
T  11641783 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctcctgctgacaccatccccacttccgcttctttcttcttgtggtgtccattacc 11641882  T
Q  269 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
     ||||||||  | ||| | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  11641883 atacctcttcaacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 11641981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 69 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 34286290 - 34286043
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    ||||||||  ||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  34286290 acgggtactggaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcatatatgggtatgacggaggca 34286191  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  34286190 tttgagccgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccacctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 34286091  T
Q  269 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 316  Q
     || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  34286090 atatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 34286043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 69 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 34291350 - 34291103
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    ||||||||  ||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  34291350 acgggtactggaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcatatatgggtatgacggaggca 34291251  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  34291250 tttgagccgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccacctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 34291151  T
Q  269 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 316  Q
     || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  34291150 atatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 34291103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 69 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 37925429 - 37925182
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  37925429 acgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 37925330  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  37925329 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 37925230  T
Q  269 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 316  Q
     || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  37925229 atatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 37925182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 284
Target Start/End: Original strand, 12716943 - 12717125
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  12716943 tactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 12717042  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 284  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  12717043 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 12717125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 69 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 40233435 - 40233188
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| || || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  40233435 acgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggca 40233336  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  40233335 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 40233236  T
Q  269 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 316  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  40233235 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 40233188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 31876184 - 31876002
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  31876184 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 31876085  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 284  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||||    
T  31876084 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgca 31876002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 34861583 - 34861401
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  34861583 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 34861484  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 284  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||||    
T  34861483 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgca 34861401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 284
Target Start/End: Original strand, 37686247 - 37686429
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  37686247 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 37686346  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 284  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||||    
T  37686347 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgca 37686429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 284
Target Start/End: Original strand, 37701512 - 37701694
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  37701512 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 37701611  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 284  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||||    
T  37701612 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgca 37701694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 39889965 - 39889783
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  39889965 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggcca 39889866  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 284  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  39889865 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 39889783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 177 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 12586629 - 12586490
Alignment:
Q  177 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 276  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  12586629 gcattgataggagcaacagtagtcatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 12586530  T
Q  277 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 316  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  12586529 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 12586490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 284
Target Start/End: Original strand, 16829676 - 16829858
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || |  ||||| || || ||||| |||||||    
T  16829676 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgatgggagcaacggtagcca 16829775  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 284  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  16829776 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 16829858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16891805 - 16891623
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || |  ||||| || || ||||| |||||||    
T  16891805 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgatgggagcaacggtagcca 16891706  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 284  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  16891705 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 16891623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 307
Target Start/End: Original strand, 19416837 - 19417042
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  19416837 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagccgcattgataggagcaacagtagcca 19416936  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 301  Q
    | ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  19416937 ttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 19417036  T
Q  302 tttctc 307  Q
    ||||||    
T  19417037 tttctc 19417042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 283
Target Start/End: Original strand, 22926366 - 22926547
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| || || |||||||    
T  22926366 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagcca 22926465  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgc 283  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||    
T  22926466 tggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgc 22926547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 69 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 32049734 - 32049526
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| | ||||   |    
T  32049734 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggca 32049635  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      || || ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || || || |||||    
T  32049634 tttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttcttttttcttgtggtgtccattacc 32049535  T
Q  269 gtacctctt 277  Q
     ||||||||    
T  32049534 atacctctt 32049526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 177 - 316
Target Start/End: Original strand, 9350407 - 9350546
Alignment:
Q  177 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 276  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  9350407 gcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 9350506  T
Q  277 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 316  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  9350507 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 9350546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 177 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27777035 - 27776896
Alignment:
Q  177 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 276  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  27777035 gcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 27776936  T
Q  277 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 316  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  27776935 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 27776896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 177 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27803520 - 27803381
Alignment:
Q  177 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 276  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  27803520 gcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 27803421  T
Q  277 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 316  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  27803420 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 27803381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 177 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27816802 - 27816663
Alignment:
Q  177 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 276  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  27816802 gcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 27816703  T
Q  277 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 316  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  27816702 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 27816663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 63 - 316
Target Start/End: Original strand, 39052127 - 39052380
Alignment:
Q  63 gcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 162  Q
    ||||| ||||| || |||||| |||||| ||| || || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| ||||| ||||    
T  39052127 gcgttgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacg 39052226  T
Q  163 gaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgacc 262  Q
    ||   |  || || |||||  |||| ||||| || || || |||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  39052227 gaggcatttgagctgcattggtaggagcaacggttgctattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 39052326  T
Q  263 gttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 316  Q
     ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  39052327 attaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 39052380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 300; Significance: 1e-168; HSPs: 26)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 15227896 - 15227529
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  15227896 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctgaacgacagcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagg 15227797  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcc 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15227796 atattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagcc 15227697  T
Q  201 atggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaa 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||     
T  15227696 atggattgaccagctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccatgcctctttgatgcatttgcggaggattcat 15227597  T
Q  301 ctttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctca 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  15227596 ctttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctagacgagtccccatggtgaccatctca 15227529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 15285173 - 15285538
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  15285173 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagttggtggctgttgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggcacctgaggttgacccgatggtagagg 15285272  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15285273 atactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatatgggtacaatggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagcc 15285372  T
Q  201 atggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaa 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15285373 atggattgaccagctccggcagataccatccatacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgttcctctttgatgcatttgcggaggattcaa 15285472  T
Q  301 ctttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatct 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  15285473 ctttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctaggcgagtccccatggtgaccatct 15285538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 1900283 - 1899916
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  1900283 gtctagcttgttgatgttgttgctgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagg 1900184  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1900183 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagcc 1900084  T
Q  201 atggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  1900083 atggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgatcgttaccgtacctctttgatgcatttacagaggattcaa 1899984  T
Q  301 ctttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctca 368  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||    
T  1899983 ctttctcaaatacaataatgccttctctgacagcttcttccaaacgagtccccatggtgaccatctca 1899916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 8 - 368
Target Start/End: Original strand, 14235780 - 14236140
Alignment:
Q  8 ttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactga 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||  ||  |||||||||||||||| ||||||    
T  14235780 ttgttgctgctgttgttgctgagccggcggctgttgttgcatttgctgagcaatggcattaacgggtacctatgggtgacccgatggtagagggtactga 14235879  T
Q  108 tgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggatt 207  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||| | ||  |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  14235880 tgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatatactggtacggcagaggtaactgagcagcattaataggggtaacagtggccatggatt 14235979  T
Q  208 gaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 307  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||   |||| ||||||||  |||||||    
T  14235980 gactggttccggcagataccatccctacttctgtctctttcttcttatgatgaccattaccgtacttctttgatgtgcttgcagaggattcccctttctc 14236079  T
Q  308 gaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctca 368  Q
    ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||  || || |||||| || ||||||||    
T  14236080 gaacacaataatgtcttctctgacagcctcttctaagcgggttcccatggtgaccatctca 14236140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 14665024 - 14664675
Alignment:
Q  18 tgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatg 117  Q
    |||||||||||| ||||   |||||||| ||| || | | |||| || ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  14665024 tgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatg 14664925  T
Q  118 gtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctcc 217  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||| ||||||   |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14664924 gcggaaagaaaggatgctgagaatacggtgcatatgggtatgacggaggcatttgggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctcc 14664825  T
Q  218 ggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaata 317  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| |||||     
T  14664824 ggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatg 14664725  T
Q  318 atgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
    || ||||| || |  ||||| || |||||||| |||||| || |||||||    
T  14664724 attccttccctaacggcttcctccagacgagttcccatggtgaccatctc 14664675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 368
Target Start/End: Original strand, 15391594 - 15391948
Alignment:
Q  15 tgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgataga 114  Q
    ||||| |||||||||||  | |||||||| |||||||||| | | ||||| || | ||||||||||||| ||||||  | | | |||||||| ||||| |    
T  15391594 tgctgctgttgttgagccagcggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgatgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaa 15391693  T
Q  115 atggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaa-cagtagccatggattgaccgg 213  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||| | |||| ||||  || ||| ||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  15391694 atggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtagctgagcaacattgatgggggcaaacagtagccatggattgactgg 15391793  T
Q  214 ctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatac 313  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| | || ||    
T  15391794 ttccagcagataccatccctacttctgtctctttcttcttatgatgaccattgccatacttccttgatgcatttgcagaggattcacctttcccaaacac 15391893  T
Q  314 aataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctca 368  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||  || || |||||| || ||||||||    
T  15391894 aataatgccatctctgacagcctcttctaagcgggttcccatggtgaccatctca 15391948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 66 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 17013958 - 17013657
Alignment:
Q  66 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 165  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||| || |||     
T  17013958 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgaaggag 17013859  T
Q  166 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 265  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  17013858 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccggctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 17013759  T
Q  266 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 365  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  17013758 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 17013659  T
Q  366 tc 367  Q
    ||    
T  17013658 tc 17013657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 24460850 - 24461030
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | ||     
T  24460850 gtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaga 24460949  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||    
T  24460950 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 24461030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 367
Target Start/End: Original strand, 24592559 - 24592925
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||| | ||   |||||||| ||| || | | |||| || ||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||    
T  24592559 gtctagcttgctgattttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagg 24592658  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcc 200  Q
     ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  24592659 gtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcc 24592758  T
Q  201 atggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaa 300  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||  | |||||||||     
T  24592759 atggattgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcag 24592858  T
Q  301 ctttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
    |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| ||||| || |||||| || |||||||    
T  24592859 ctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgggttcccatggtgaccatctc 24592925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 367
Target Start/End: Original strand, 36344770 - 36345126
Alignment:
Q  11 ttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatga 110  Q
    ||||||||| || |||||| |||| || || |||||||  || | | ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | |||||||||||||    
T  36344770 ttgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaaggatactgatga 36344869  T
Q  111 tagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgac 210  Q
    || || ||| | ||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| ||||||   |  || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  36344870 taaaacggtaggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgac 36344969  T
Q  211 cggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaa 310  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| ||||||||||    
T  36344970 cggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaa 36345069  T
Q  311 tacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
     ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  36345070 cacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 36345126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 66 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 6569811 - 6569510
Alignment:
Q  66 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 165  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||     
T  6569811 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggag 6569712  T
Q  166 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 265  Q
      |  || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  6569711 gcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 6569612  T
Q  266 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 365  Q
    ||| || ||||| |||||||| || ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  6569611 accatatctcttcgatgcattcgcagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatc 6569512  T
Q  366 tc 367  Q
    ||    
T  6569511 tc 6569510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 58 - 367
Target Start/End: Original strand, 14763609 - 14763918
Alignment:
Q  58 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggta 157  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| |||||    
T  14763609 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggta 14763708  T
Q  158 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 257  Q
     ||||||   |  || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  14763709 tgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 14763808  T
Q  258 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 357  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  14763809 tgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 14763908  T
Q  358 tgtccatctc 367  Q
    || |||||||    
T  14763909 tgaccatctc 14763918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 19373200 - 19372918
Alignment:
Q  85 gacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaat 184  Q
    |||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||    
T  19373200 gacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 19373101  T
Q  185 aggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 284  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  19373100 aggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 19373001  T
Q  285 tttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
    ||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  19373000 ttcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 19372918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 54833339 - 54833098
Alignment:
Q  75 acctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactggg 174  Q
    ||||||||| | |||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| ||||||   |  || |    
T  54833339 acctgaggttggcccggtggtaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgag 54833240  T
Q  175 cagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacct 274  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||    
T  54833239 ctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacct 54833140  T
Q  275 ctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 316  Q
    ||| || ||| | || || |||||| ||||||| || |||||    
T  54833139 cttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaat 54833098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 69 - 367
Target Start/End: Original strand, 27163633 - 27163931
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  27163633 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 27163732  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      || || ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  27163733 tttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 27163832  T
Q  269 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
    |||||| || |||||| | |  || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  27163833 gtaccttttcgatgcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 27163931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 102 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 14098463 - 14098198
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  14098463 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 14098364  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 301  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||| | ||||||||| |    
T  14098363 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcatttacagaggattcagc 14098264  T
Q  302 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  14098263 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 14098198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 69 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 5005825 - 5005527
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  5005825 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 5005726  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      || || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  5005725 tttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 5005626  T
Q  269 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
     |||||||| || | | | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  5005625 atacctcttcgacgtactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 5005527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 102 - 284
Target Start/End: Original strand, 31126867 - 31127049
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  31126867 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 31126966  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 284  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  31126967 ttgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 31127049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 69 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 30753697 - 30753482
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    ||||| || |||||| ||||||  || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  30753697 acgggcacttgaggttgacccggcggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 30753598  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  30753597 tttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacatcatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 30753498  T
Q  269 gtacctctttgatgca 284  Q
     |||||||| ||||||    
T  30753497 atacctcttcgatgca 30753482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 69 - 307
Target Start/End: Original strand, 33674126 - 33674364
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    ||||| || |||||| ||||||  || || || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  33674126 acgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaatggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatgtatgggtatgacggaggca 33674225  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  33674226 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 33674325  T
Q  269 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 307  Q
     || ||||| || |||||| | ||||||||| |||||||    
T  33674326 atatctcttcgacgcatttacagaggattcagctttctc 33674364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 307
Target Start/End: Original strand, 18800971 - 18801176
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  18800971 tactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 18801070  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 301  Q
    | | |||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  18801071 tagcttgaccggctccagctgacaccatccccacttctgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 18801170  T
Q  302 tttctc 307  Q
    ||||||    
T  18801171 tttctc 18801176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 355
Target Start/End: Original strand, 40105987 - 40106240
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  40105987 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 40106086  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 301  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |  ||||||||||| || |||||| | |  || |||||| |    
T  40106087 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtctattaccgtaccttttcgatgcactcgtagaagattcagc 40106186  T
Q  302 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 355  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| ||||||||    
T  40106187 tttctcaaacacaatgattccatccctgactgcttcctcaagacgggtccccat 40106240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 69 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 21969656 - 21969441
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| | ||||   |    
T  21969656 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggca 21969557  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      || || ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || || || |||||    
T  21969556 tttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttcttttttcttgtggtgtccattacc 21969457  T
Q  269 gtacctctttgatgca 284  Q
     |||||||| ||||||    
T  21969456 atacctcttcgatgca 21969441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 177 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 39850470 - 39850331
Alignment:
Q  177 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 276  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  39850470 gcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 39850371  T
Q  277 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 316  Q
    | || | |||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  39850370 tcgacgtattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 39850331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24112688 - 24112483
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    ||||||| | ||||||||| || |||||| |||| || || |||||||  || | | ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | |||    
T  24112688 gtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagg 24112589  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcc 200  Q
     ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||    ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||    
T  24112588 gtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgggggaaactgagcagcattgacaggagcaacagtagcc 24112489  T
Q  201 atggat 206  Q
     |||||    
T  24112488 ttggat 24112483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 34189205 - 34189410
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    ||||||| | ||||||||| || |||||| |||| || || |||||||  || | | ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | |||    
T  34189205 gtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagg 34189304  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcc 200  Q
     ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||    ||||| |||||||| ||||| || |||||||||    
T  34189305 gtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgggggaaactgagcagcattgataggagcgacagtagcc 34189404  T
Q  201 atggat 206  Q
     |||||    
T  34189405 ttggat 34189410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 30)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 16041335 - 16040980
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||  | |||    
T  16041335 gtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggaattaacgggtacctgaggttgacccgatgacaaagg 16041236  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16041235 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagcc 16041136  T
Q  201 atggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16041135 atggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccatacctctttgatgcatttacggaggattcaa 16041036  T
Q  301 ctttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatg 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  16041035 ctttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctagacgagttcccatg 16040980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Original strand, 16450129 - 16450496
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  16450129 gtctagcttgttgctgctgttgctgttgagctggtggctgttgttgcacttgctgaacgacggcattaatgggtacctgaggttgacccgatggcaaagg 16450228  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16450229 atactgatgataaaatggtggaaagaagggatgctgagagtactgcgcgtacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagct 16450328  T
Q  201 atggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||    
T  16450329 atggattgaccggctccggcagataccatccctacttttgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtatctttttgatgcatttacagaggattcaa 16450428  T
Q  301 ctttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctca 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16450429 ctttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctagacgagtccccatggtgaccatctca 16450496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 66 - 367
Target Start/End: Original strand, 16518615 - 16518916
Alignment:
Q  66 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 165  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||     
T  16518615 ttaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtatgacggag 16518714  T
Q  166 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 265  Q
      |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  16518715 gcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgtt 16518814  T
Q  266 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 365  Q
    ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  16518815 accatacctctttgatgcatttacagaggattcagctttttcgaacacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 16518914  T
Q  366 tc 367  Q
    ||    
T  16518915 tc 16518916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 66 - 367
Target Start/End: Original strand, 16503579 - 16503880
Alignment:
Q  66 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 165  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||     
T  16503579 ttaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtatgacggag 16503678  T
Q  166 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 265  Q
      |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  16503679 gcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgtt 16503778  T
Q  266 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 365  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  16503779 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttttcgaacacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 16503878  T
Q  366 tc 367  Q
    ||    
T  16503879 tc 16503880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 31088595 - 31088775
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  31088595 gtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagg 31088694  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||    
T  31088695 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 31088775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 45733472 - 45733292
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  45733472 gtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagg 45733373  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||    
T  45733372 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 45733292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 367
Target Start/End: Original strand, 10916999 - 10917365
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||| ||||   |||||||| ||| || | | |||| || ||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||    
T  10916999 gtctagcttgctgattttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacaggtacttgaggttgacccggtggcagagg 10917098  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcc 200  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| |||| |   |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  10917099 atactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacgaaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagcc 10917198  T
Q  201 atggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaa 300  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||  | |||||||||     
T  10917199 atggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgatgcattcacagaggattcag 10917298  T
Q  301 ctttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
    ||||||| || ||||| ||  | || || |  |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  10917299 ctttctcaaacacaatgatttcatccctaacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 10917365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 66 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 2154517 - 2154216
Alignment:
Q  66 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 165  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  2154517 ttaacggatacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 2154418  T
Q  166 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 265  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  2154417 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 2154318  T
Q  266 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 365  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| ||  | || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  2154317 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgatttcatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 2154218  T
Q  366 tc 367  Q
    ||    
T  2154217 tc 2154216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 66 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 5127936 - 5127635
Alignment:
Q  66 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 165  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  5127936 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggatactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 5127837  T
Q  166 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 265  Q
      |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  5127836 gcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 5127737  T
Q  266 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 365  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||| ||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  5127736 accatacctcttcgatgcattcacagaggactcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 5127637  T
Q  366 tc 367  Q
    ||    
T  5127636 tc 5127635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 367
Target Start/End: Original strand, 11424927 - 11425276
Alignment:
Q  18 tgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatg 117  Q
    |||||||||||| ||||   |||||||| ||| || | | |||| || ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||    
T  11424927 tgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatg 11425026  T
Q  118 gtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctcc 217  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  |||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11425027 gcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctacattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctcc 11425126  T
Q  218 ggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaata 317  Q
     || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| |||||     
T  11425127 agctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatg 11425226  T
Q  318 atgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
    || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  11425227 attccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatctc 11425276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 69 - 367
Target Start/End: Original strand, 5147542 - 5147840
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| || || ||||||   |    
T  5147542 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatggatatgacggaggca 5147641  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      || || ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  5147642 tttgagctgcattgataggagcaatggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 5147741  T
Q  269 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
     |||||||| |||||||| || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  5147742 atacctcttcgatgcattcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgatcccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 5147840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 69 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 45387284 - 45387034
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  45387284 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 45387185  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  45387184 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 45387085  T
Q  269 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataat 319  Q
     |||||||| || ||| |||| || |||||| ||||||| || ||||||||    
T  45387084 atacctcttcgacgcacttgcagaagattcagctttctcaaacacaataat 45387034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 69 - 367
Target Start/End: Original strand, 16736662 - 16736960
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||| | |    
T  16736662 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggagaca 16736761  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  16736762 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 16736861  T
Q  269 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
     || ||||| || ||| | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  16736862 atatctcttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 16736960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 69 - 367
Target Start/End: Original strand, 16751716 - 16752014
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||| | |    
T  16751716 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggagaca 16751815  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  16751816 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 16751915  T
Q  269 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
     || ||||| || ||| | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  16751916 atatctcttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 16752014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 69 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 17523473 - 17523175
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||| | |    
T  17523473 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggagaca 17523374  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  17523373 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 17523274  T
Q  269 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
     || ||||| || ||| | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  17523273 atatctcttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 17523175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 69 - 367
Target Start/End: Original strand, 17529742 - 17530040
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||| | |    
T  17529742 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggagaca 17529841  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  17529842 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 17529941  T
Q  269 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
     || ||||| || ||| | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  17529942 atatctcttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 17530040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 102 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 31124819 - 31124554
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  31124819 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 31124720  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 301  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||| |    
T  31124719 ttgattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgatgcattcgcagaggattcagc 31124620  T
Q  302 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  31124619 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 31124554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 58 - 283
Target Start/End: Original strand, 4145314 - 4145539
Alignment:
Q  58 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggta 157  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||    
T  4145314 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggta 4145413  T
Q  158 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 257  Q
     ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  4145414 tgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtgg 4145513  T
Q  258 tgaccgttaccgtacctctttgatgc 283  Q
    || || ||||| |||||||| |||||    
T  4145514 tgtccattaccatacctcttcgatgc 4145539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 367
Target Start/End: Original strand, 24592776 - 24593041
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  24592776 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 24592875  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 301  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||| | ||||||||| |    
T  24592876 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcatttacagaggattcagc 24592975  T
Q  302 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  24592976 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 24593041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 9618559 - 9618345
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  9618559 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 9618460  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 301  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||||| |  | ||||||||| |    
T  9618459 ttgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgatgcactcacagaggattcagc 9618360  T
Q  302 tttctcgaatacaat 316  Q
    |||||| || |||||    
T  9618359 tttctcaaacacaat 9618345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 69 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 11441501 - 11441263
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  11441501 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 11441402  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  11441401 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 11441302  T
Q  269 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 307  Q
     || ||||| || |||||| | ||||||||| |||||||    
T  11441301 atatctcttcgacgcatttacagaggattcagctttctc 11441263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 284
Target Start/End: Original strand, 26275329 - 26275511
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  26275329 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 26275428  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 284  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||||    
T  26275429 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtacctcttcgatgca 26275511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 69 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 26435198 - 26434900
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  26435198 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggca 26435099  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      || || ||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  26435098 tttgagctgcactgataggagcaacagtggccatggactgaccggctcctgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 26434999  T
Q  269 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
     || ||||| | |||| | |  || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  26434998 atatctcttcggtgcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 26434900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 282
Target Start/End: Original strand, 26320104 - 26320284
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  26320104 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 26320203  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatg 282  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||    
T  26320204 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtacctcttcgatg 26320284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 177 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 3445127 - 3445020
Alignment:
Q  177 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 276  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  3445127 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 3445028  T
Q  277 ttgatgca 284  Q
    | ||||||    
T  3445027 tcgatgca 3445020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 69 - 284
Target Start/End: Original strand, 26485946 - 26486161
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| || || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  26485946 acgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggca 26486045  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  26486046 tttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 26486145  T
Q  269 gtacctctttgatgca 284  Q
     |||||||| ||||||    
T  26486146 atacctcttcgatgca 26486161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 5159531 - 5159326
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    ||||||| | ||||||||| || |||||| |||| || || |||||||  || | | ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | |||    
T  5159531 gtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagg 5159432  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcc 200  Q
     ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  5159431 gtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagcc 5159332  T
Q  201 atggat 206  Q
    ||||||    
T  5159331 atggat 5159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 69 - 316
Target Start/End: Original strand, 26538075 - 26538322
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| || || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  26538075 acgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggca 26538174  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  26538175 tttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 26538274  T
Q  269 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 316  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  26538275 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 26538322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 316
Target Start/End: Original strand, 26670149 - 26670363
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  26670149 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcta 26670248  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 301  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||||| |  | ||||||||| |    
T  26670249 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgatgcactcacagaggattcagc 26670348  T
Q  302 tttctcgaatacaat 316  Q
    |||||| || |||||    
T  26670349 tttctcaaacacaat 26670363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 177 - 284
Target Start/End: Original strand, 31564709 - 31564816
Alignment:
Q  177 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 276  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  31564709 gcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 31564808  T
Q  277 ttgatgca 284  Q
    | ||||||    
T  31564809 tcgatgca 31564816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 37 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 20384 - 20053
Alignment:
Q  37 gctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctg 136  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20384 gctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgatggaaagaagggatgctg 20285  T
Q  137 agagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctact 236  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20284 agagtatggcgcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctact 20185  T
Q  237 tctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagctt 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  20184 tctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaacacaataatgccttctctgacagctt 20085  T
Q  337 cttctagacgagtccccatgatgtccatctca 368  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  20084 cttctaggcgagtccccatggtgaccatctca 20053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 30444 - 30095
Alignment:
Q  18 tgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatg 117  Q
    |||||||||||| ||||   |||||||| ||| || | | |||| || ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  30444 tgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatg 30345  T
Q  118 gtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctcc 217  Q
    | |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||   |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30344 gcggaaagaagggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctcc 30245  T
Q  218 ggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaata 317  Q
     || || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||| | ||||||||  | ||||||||  |||||||||| |||||     
T  30244 agctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcctcgatgcattcacagaggattcggctttctcgaacacaatg 30145  T
Q  318 atgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
    || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  30144 attccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 30095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 7)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 37 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 20461079 - 20460748
Alignment:
Q  37 gctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctg 136  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20461079 gctgttgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatattgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctg 20460980  T
Q  137 agagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctact 236  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20460979 agagtattgcgcatacgggtacggcggaggtaactgggcagcattaataggggcaatagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctact 20460880  T
Q  237 tctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagctt 336  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20460879 tctatttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcattggcggaggattcaactttctcgaatataataatgccttctctgacagctt 20460780  T
Q  337 cttctagacgagtccccatgatgtccatctca 368  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  20460779 cttctaggcgagtccccatggtgaccatctca 20460748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 18 - 368
Target Start/End: Original strand, 16208290 - 16208640
Alignment:
Q  18 tgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatg 117  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  16208290 tgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgatggcattaatgggtacctgaggctgacccgatggtggtggatactggtgatagaatg 16208389  T
Q  118 gtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctcc 217  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||   ||| | |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16208390 gtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctcc 16208489  T
Q  218 ggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaata 317  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16208490 ggcagataccatctctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtaactctttgatgcatttacagaggattcaactttctcaaatacaata 16208589  T
Q  318 atgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctca 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16208590 atgccttctctgacagcttcttctagacgagtccccatggtgaccatctca 16208640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 20340580 - 20340760
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  20340580 gtctagcttgctgatgctgttgttgttgagctggaggctgttgttgcatttgttgaacgacggcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagg 20340679  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||| ||||||||    
T  20340680 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcgtacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 20340760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 69 - 367
Target Start/End: Original strand, 41793624 - 41793922
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  41793624 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 41793723  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  41793724 tttgggctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 41793823  T
Q  269 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
     ||||||||||||||| |  | |||| |||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  41793824 atacctctttgatgcactcacagaggtttcagctttctcaaacacaatgatcccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 41793922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 102 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 10962576 - 10962362
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  10962576 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 10962477  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 301  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |    
T  10962476 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagc 10962377  T
Q  302 tttctcgaatacaat 316  Q
    |||||| || |||||    
T  10962376 tttctcaaacacaat 10962362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 51638124 - 51637910
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  51638124 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 51638025  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 301  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| || ||| |||| || |||||| |    
T  51638024 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgacgcacttgcagaagattcagc 51637925  T
Q  302 tttctcgaatacaat 316  Q
    |||||| || |||||    
T  51637924 tttctcaaacacaat 51637910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 28584887 - 28584682
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||||||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  28584887 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatacgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 28584788  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 301  Q
    | ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  28584787 ttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 28584688  T
Q  302 tttctc 307  Q
    ||||||    
T  28584687 tttctc 28584682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 52)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 25199049 - 25198682
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||    
T  25199049 gtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcgttaacgagtacctgaggttgacccgatggcaaagg 25198950  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||   || |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  25198949 atactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggaggcaattgggaagcattaataggagcaacagtagcc 25198850  T
Q  201 atggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaa 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25198849 atggattgaccggctccggcggataccatccctacttctgtttccttcttcttatgatgtccgttaccgtacctctttgatgcattcacggaggattcaa 25198750  T
Q  301 ctttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctca 368  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||    
T  25198749 ctttctcgaatacaataattccttctctgacagcttcttccagatgagtccccatggtgaccatctca 25198682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 18 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 23892206 - 23891855
Alignment:
Q  18 tgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatg 117  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  23892206 tgttgttgttgaaccggtggctgttgttgcatttgctgaacgatggcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatg 23892107  T
Q  118 gtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctcc 217  Q
     ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||   |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23892106 ttggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgatcggctcc 23892007  T
Q  218 ggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaata 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23892006 ggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgtccgttaccatacctctttgatgcattcacggaggattcaactttctcgaatacaata 23891907  T
Q  318 atgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctcat 369  Q
    || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  23891906 attccttctctgacagcttcttccagacgagtccccatggtgaccatctcat 23891855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22888490 - 22888287
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||| | |||    
T  22888490 gtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacggttacctgaggttgacccgatggcaaagg 22888391  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22888390 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagcc 22888291  T
Q  201 atgg 204  Q
    ||||    
T  22888290 atgg 22888287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 66 - 367
Target Start/End: Original strand, 24688367 - 24688668
Alignment:
Q  66 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 165  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  24688367 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 24688466  T
Q  166 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 265  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  24688467 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 24688566  T
Q  266 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 365  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  24688567 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 24688666  T
Q  366 tc 367  Q
    ||    
T  24688667 tc 24688668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 30934653 - 30934287
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||| ||||   |||||||| ||| || | | |||| || ||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||    
T  30934653 gtctagcttgctgattttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagg 30934554  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcc 200  Q
     ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||   |  ||||| ||||| ||||| |||||||||| |    
T  30934553 gtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagtc 30934454  T
Q  201 atggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaa 300  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||  | |||||||||     
T  30934453 atggattggccggctccggtagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgatgcattcacagaggattcag 30934354  T
Q  301 ctttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  30934353 ctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 30934287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 367
Target Start/End: Original strand, 23752612 - 23752961
Alignment:
Q  18 tgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatg 117  Q
    |||||||||||| ||||   |||||||| ||| || | | |||| || ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  23752612 tgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatg 23752711  T
Q  118 gtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctcc 217  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||   |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23752712 gcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctcc 23752811  T
Q  218 ggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaata 317  Q
     || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| |||||     
T  23752812 agctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatg 23752911  T
Q  318 atgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
    || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  23752912 attccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 23752961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 13184790 - 13184970
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  13184790 gtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagg 13184889  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||    
T  13184890 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 13184970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 13440636 - 13440816
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  13440636 gtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagg 13440735  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||    
T  13440736 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 13440816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 33877267 - 33877087
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  33877267 gtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagg 33877168  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||    
T  33877167 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 33877087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 11325814 - 11325634
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| | ||| |||| | |||    
T  11325814 gtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgtcccaatggcaaagg 11325715  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||    
T  11325714 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 11325634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 367
Target Start/End: Original strand, 23718150 - 23718500
Alignment:
Q  18 tgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatg 117  Q
    |||||||||||| ||||   |||||||| ||| || | | |||| || ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  23718150 tgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatg 23718249  T
Q  118 gtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctcc 217  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||   |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23718250 gcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctcc 23718349  T
Q  218 ggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaata 317  Q
     || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| |||||     
T  23718350 agctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatg 23718449  T
Q  318 atgccttctctgatagctt-cttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
    || || || ||||  |||| |||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  23718450 attccatccctgacggcttccttccagacgagttcccatggtgaccatctc 23718500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 173 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 24951955 - 24951761
Alignment:
Q  173 ggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtac 272  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||    
T  24951955 ggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgttaccatac 24951856  T
Q  273 ctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  24951855 ctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 24951761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 11549354 - 11549005
Alignment:
Q  18 tgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatg 117  Q
    |||||||||||| ||||   |||||||| ||| || | | |||| || ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  11549354 tgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatg 11549255  T
Q  118 gtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctcc 217  Q
    |||||||||| |||||||| || ||  || |||| ||||| ||||||   |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11549254 gtggaaagaaaggatgctgtgaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctcc 11549155  T
Q  218 ggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaata 317  Q
     || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| |||||     
T  11549154 agctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatg 11549055  T
Q  318 atgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
    || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  11549054 attccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatctc 11549005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 366
Target Start/End: Original strand, 22999276 - 22999624
Alignment:
Q  18 tgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatg 117  Q
    |||||||||||| ||||   |||||||| ||| || | | |||| || ||||||||||| |||||| ||||||  || ||||| ||||||||||| ||||    
T  22999276 tgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggcggcagagggtactgatgataaaatg 22999375  T
Q  118 gtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctcc 217  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||   |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22999376 gcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctcc 22999475  T
Q  218 ggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaata 317  Q
     || || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| |||||     
T  22999476 agctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatg 22999575  T
Q  318 atgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatct 366  Q
    || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || ||||||    
T  22999576 attccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatct 22999624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 66 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 33777439 - 33777138
Alignment:
Q  66 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 165  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  33777439 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 33777340  T
Q  166 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 265  Q
      |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  33777339 gcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 33777240  T
Q  266 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 365  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  33777239 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 33777140  T
Q  366 tc 367  Q
    ||    
T  33777139 tc 33777138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 69 - 316
Target Start/End: Original strand, 9548756 - 9549003
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  9548756 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 9548855  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      ||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  9548856 tttgggctgtattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 9548955  T
Q  269 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 316  Q
     |||||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  9548956 atacctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 9549003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 69 - 367
Target Start/End: Original strand, 15658973 - 15659271
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || || || |||||||| ||||||||||| ||  || |||| || || ||||||   |    
T  15658973 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaacggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatggatatgacggaggca 15659072  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      || |  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  15659073 tttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 15659172  T
Q  269 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
     |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  15659173 atacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 15659271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 69 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 41674658 - 41674420
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||  ||  || |||| ||||| ||||||   |    
T  41674658 acgggtacttgaggtggacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagcatacggcacatatgggtatgacggaggca 41674559  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      ||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  41674558 tttgggctgtattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 41674459  T
Q  269 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 307  Q
     |||||||| || |||||  | ||||||||  |||||||    
T  41674458 atacctcttcgacgcattcacagaggattcggctttctc 41674420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 69 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 31431377 - 31431130
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  31431377 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 31431278  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  31431277 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccacagattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 31431178  T
Q  269 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 316  Q
     || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  31431177 atatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 31431130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 102 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 2510967 - 2510753
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  2510967 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtagcca 2510868  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 301  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||| |  | ||||||||| |    
T  2510867 tggattgaccggctccagctgataccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgatgcactcacagaggattcagc 2510768  T
Q  302 tttctcgaatacaat 316  Q
    |||||| || |||||    
T  2510767 tttctcaaacacaat 2510753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 69 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 30168418 - 30168171
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  30168418 acgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggca 30168319  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      || || ||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  30168318 tttgagctgcattgatgggagcaatagtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 30168219  T
Q  269 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 316  Q
     || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  30168218 atatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 30168171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 69 - 283
Target Start/End: Original strand, 8665688 - 8665902
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| | ||||   |    
T  8665688 acgggcacttgaggttgacccggtgacagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggca 8665787  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  8665788 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 8665887  T
Q  269 gtacctctttgatgc 283  Q
     |||||||| |||||    
T  8665888 atacctcttcgatgc 8665902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 102 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 9317367 - 9317153
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  9317367 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 9317268  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 301  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||| |  | ||||||||| |    
T  9317267 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgatgcactcacagaggattcagc 9317168  T
Q  302 tttctcgaatacaat 316  Q
    |||||| || |||||    
T  9317167 tttctcaaacacaat 9317153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 177 - 355
Target Start/End: Original strand, 40473873 - 40474051
Alignment:
Q  177 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 276  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||| ||||    
T  40473873 gcattgataggggcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtatctct 40473972  T
Q  277 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 355  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  |||||||| ||||| || |||||    
T  40473973 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcttcaagacgggttcccat 40474051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 367
Target Start/End: Original strand, 18375658 - 18375923
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| || || |||||||||||||    
T  18375658 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagcca 18375757  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 301  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||| | |  || |||||| |    
T  18375758 ttgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgcactcgtagaagattcagc 18375857  T
Q  302 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  18375858 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 18375923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 69 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 3789475 - 3789177
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    ||||| ||||||||  | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  3789475 acgggcacctgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggca 3789376  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  3789375 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 3789276  T
Q  269 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
     || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  3789275 atatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 3789177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 12132071 - 12131889
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  12132071 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 12131972  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 284  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||||    
T  12131971 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtacctcttcgatgca 12131889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 24681353 - 24681171
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  24681353 tactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 24681254  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 284  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  24681253 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 24681171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 24723880 - 24723698
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  24723880 tactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 24723781  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 284  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  24723780 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 24723698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 284
Target Start/End: Original strand, 37771245 - 37771427
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| || |||||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  37771245 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatggatacgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 37771344  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 284  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  37771345 ttgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 37771427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 69 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 43078198 - 43077900
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||   || ||||||||||||   |    
T  43078198 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtacgacggaggca 43078099  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |  || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  43078098 tttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagcttgaccggctccagttgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 43077999  T
Q  269 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  43077998 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcgagacgggttcccatggtgaccatctc 43077900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 5637826 - 5637561
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  5637826 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 5637727  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 301  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||||| |  | ||||||||| |    
T  5637726 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgatgcactcacagaggattcagc 5637627  T
Q  302 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  5637626 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 5637561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 319
Target Start/End: Original strand, 15759103 - 15759320
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  15759103 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 15759202  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 301  Q
    | |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| || ||| |||| || |||||| |    
T  15759203 ttgattgacctgctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgacgcacttgcagaagattcagc 15759302  T
Q  302 tttctcgaatacaataat 319  Q
    |||||| || ||||||||    
T  15759303 tttctcaaacacaataat 15759320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 30151934 - 30151669
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| || || |||||||||||||    
T  30151934 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagcca 30151835  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 301  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||| | |  || |||||| |    
T  30151834 ttgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgcactcgtagaagattcagc 30151735  T
Q  302 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  30151734 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 30151669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 355
Target Start/End: Original strand, 37358901 - 37359154
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  37358901 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 37359000  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 301  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| | |  || |||||| |    
T  37359001 tagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcactcgtagaagattcagc 37359100  T
Q  302 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 355  Q
    |||||| |||||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||    
T  37359101 tttctcaaatacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccat 37359154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 6874143 - 6874004
Alignment:
Q  177 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 276  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  6874143 gcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 6874044  T
Q  277 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 316  Q
    |||||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  6874043 ttgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 6874004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 69 - 316
Target Start/End: Original strand, 18500961 - 18501208
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  18500961 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 18501060  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      || |  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  18501061 tttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 18501160  T
Q  269 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 316  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  18501161 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 18501208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 32599614 - 32599897
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    ||||||| | ||||||||| || |||||| |||| || || ||||| |  |||| | ||||||| || || || ||||||||| | || | ||| | |||    
T  32599614 gtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgctgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagg 32599713  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcc 200  Q
     ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  ||||| ||||| ||||| |||||||||| |    
T  32599714 gtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagtc 32599813  T
Q  201 atggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 284  Q
    || |||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  32599814 attgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttccttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 32599897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 66 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 24969976 - 24969878
Alignment:
Q  66 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacgga 164  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||    
T  24969976 ttaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtacgacgga 24969878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 26480308 - 26480094
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  26480308 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 26480209  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 301  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||||| |  | ||||||||| |    
T  26480208 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgatgcactcacagaggattcagc 26480109  T
Q  302 tttctcgaatacaat 316  Q
    |||||| || |||||    
T  26480108 tttctcaaacacaat 26480094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 284
Target Start/End: Original strand, 31826665 - 31826847
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  31826665 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 31826764  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 284  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  31826765 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 31826847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 33516272 - 33516090
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| || || ||||| |||||||    
T  33516272 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagccgcattgatgggagcaacggtagcca 33516173  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 284  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  33516172 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 33516090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 34616437 - 34616223
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  34616437 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggtgcaacagtagcca 34616338  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 301  Q
    | | |||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||||| |  | ||||||||| |    
T  34616337 tagcttgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgatgcactcacagaggattcagc 34616238  T
Q  302 tttctcgaatacaat 316  Q
    |||||| || |||||    
T  34616237 tttctcaaacacaat 34616223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 284
Target Start/End: Original strand, 37671738 - 37671920
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  37671738 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 37671837  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 284  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  37671838 tagattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 37671920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 177 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 37754809 - 37754670
Alignment:
Q  177 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 276  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  37754809 gcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 37754710  T
Q  277 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 316  Q
    | || ||| |||| || |||||| ||||||| || |||||    
T  37754709 tcgacgcacttgcagaagattcagctttctcaaacacaat 37754670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 284
Target Start/End: Original strand, 28960044 - 28960226
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  |||||  |||| ||||| ||||||||||||     
T  28960044 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctacattgataggtgcaacagtagccg 28960143  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 284  Q
    | ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  28960144 ttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 28960226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 307
Target Start/End: Original strand, 29967312 - 29967517
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  29967312 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 29967411  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 301  Q
    | ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  29967412 ttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttctttttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 29967511  T
Q  302 tttctc 307  Q
    ||||||    
T  29967512 tttctc 29967517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 30029331 - 30029126
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  30029331 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 30029232  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 301  Q
    | ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  30029231 ttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttctttttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 30029132  T
Q  302 tttctc 307  Q
    ||||||    
T  30029131 tttctc 30029126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 177 - 316
Target Start/End: Original strand, 13325165 - 13325304
Alignment:
Q  177 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 276  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  13325165 gcattgataggagcaacggtagccattgattgaccagctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 13325264  T
Q  277 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 316  Q
    | |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  13325265 tcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 13325304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 28649055 - 28648937
Alignment:
Q  189 gcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttg 288  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||      
T  28649055 gcaacagtagccatagcttgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattca 28648956  T
Q  289 cggaggattcaactttctc 307  Q
    | ||||||||| |||||||    
T  28648955 cagaggattcagctttctc 28648937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 33292545 - 33292340
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    ||||||| | ||| ||||| || |||||| |||| || || |||||||  || | | ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | |||    
T  33292545 gtctagcatattgttgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagg 33292446  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcc 200  Q
     ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  33292445 gtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagcc 33292346  T
Q  201 atggat 206  Q
     |||||    
T  33292345 ttggat 33292340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 29889224 - 29889263
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctg 40  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  29889224 gtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctg 29889263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 22)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 66 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 16283392 - 16283091
Alignment:
Q  66 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 165  Q
    |||| ||||||||||||| |||| | ||| | |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||     
T  16283392 ttaatgggtacctgaggttgacctggtggcaaaggatactaatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggag 16283293  T
Q  166 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 265  Q
      |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  16283292 gcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgtt 16283193  T
Q  266 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 365  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  16283192 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaatacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 16283093  T
Q  366 tc 367  Q
    ||    
T  16283092 tc 16283091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 16277545 - 16277196
Alignment:
Q  18 tgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatg 117  Q
    |||||||||||| ||||   |||||||| ||| || | | |||| || ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  16277545 tgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatg 16277446  T
Q  118 gtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctcc 217  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||   |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16277445 gcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctcc 16277346  T
Q  218 ggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaata 317  Q
     || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| |||||     
T  16277345 agctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatg 16277246  T
Q  318 atgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
    || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  16277245 attccttccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 16277196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 36 - 368
Target Start/End: Original strand, 22081114 - 22081446
Alignment:
Q  36 ggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgct 135  Q
    |||||||| |||||||||| | | ||||| || ||||||||||||||| ||||||  | | | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  22081114 ggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgct 22081213  T
Q  136 gagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctac 235  Q
    |||||||||||   ||| | |||| ||||  || ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  22081214 gagagtattgcatgtactgatacggcggaggtagctgagcagcattgatgggggcaacagtagccatggattgactggttccggcagataccatccctac 22081313  T
Q  236 ttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagct 335  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || || ||| || ||||||||||||| |||||||||  ||| || || ||||||||||| ||||||| |||     
T  22081314 ttctgtctctttcttcttatgatgaccattgccatacttccttgatgcatttgcagaggattcacatttttcaaacacaataatgccatctctgacagcc 22081413  T
Q  336 tcttctagacgagtccccatgatgtccatctca 368  Q
    |||||||  || || |||||| || ||||||||    
T  22081414 tcttctaagcgggttcccatggtgaccatctca 22081446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 66 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 19688041 - 19687740
Alignment:
Q  66 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 165  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  19688041 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactggtgatagaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcgcatatgggtatgacggag 19687942  T
Q  166 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 265  Q
      |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  19687941 gcatttgggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 19687842  T
Q  266 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 365  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| ||||| || |||||| || |||||    
T  19687841 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgggttcccatggtgaccatc 19687742  T
Q  366 tc 367  Q
    ||    
T  19687741 tc 19687740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 14557635 - 14557269
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||| ||||   |||||||| ||| || | | |||| || ||||| ||||| |||||| |||||| ||| |||||    
T  14557635 gtctagcttgctgattttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacaggtacttgaggttgacccggtggcagagg 14557536  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcc 200  Q
     ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||   |  ||||| ||||| ||||| || |||||||||    
T  14557535 gtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcgacagtagcc 14557436  T
Q  201 atggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaa 300  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||  | |||||||||     
T  14557435 atggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgatgcattcacagaggattcag 14557336  T
Q  301 ctttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
    |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  14557335 ctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 14557269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 9354633 - 9354453
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  9354633 gtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagg 9354534  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||    
T  9354533 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 9354453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 19659243 - 19659423
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||  |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  19659243 gtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggttgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagg 19659342  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||    
T  19659343 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 19659423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 44563112 - 44562932
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||||||||||| | |||||||| | |||    
T  44563112 gtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgaacggcggcattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaagg 44563013  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||    
T  44563012 atactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 44562932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 367
Target Start/End: Original strand, 2137483 - 2137832
Alignment:
Q  18 tgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatg 117  Q
    |||||||||||| ||||   |||||||| ||| || | | |||| || ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  2137483 tgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatg 2137582  T
Q  118 gtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctcc 217  Q
      |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||   |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2137583 acggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctcc 2137682  T
Q  218 ggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaata 317  Q
     || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| |||||     
T  2137683 agctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatg 2137782  T
Q  318 atgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
    || | ||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  2137783 attcattccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatctc 2137832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 367
Target Start/End: Original strand, 27609129 - 27609478
Alignment:
Q  18 tgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatg 117  Q
    |||||||||||| ||||   |||||||| ||| || | | |||| || ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  27609129 tgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatg 27609228  T
Q  118 gtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctcc 217  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||   | |||| ||||| ||||||   |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27609229 gcggaaagaaaggatgctgagaatacgacacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctcc 27609328  T
Q  218 ggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaata 317  Q
     || || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||  |||||||||| |||||     
T  27609329 agctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgatgcattcacagaggattcggctttctcgaacacaatg 27609428  T
Q  318 atgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
    || || || ||||  ||||| || |||||||| |||||| || |||||||    
T  27609429 attccatccctgacggcttcctccagacgagttcccatggtgaccatctc 27609478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 69 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 18710526 - 18710228
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    ||||| ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| ||||||   |    
T  18710526 acgggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggca 18710427  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  18710426 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 18710327  T
Q  269 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
     |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  18710326 atacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 18710228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 69 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 19674378 - 19674080
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  19674378 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 19674279  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  19674278 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgactggctccagctgacaccatccccacgtccgtttctttcttcttgtgatgtccattacc 19674179  T
Q  269 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
     |||||||| || ||| | || || |||||| |||||||||| |||||||| || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  19674178 atacctcttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcgaacacaataattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 19674080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 19286399 - 19286158
Alignment:
Q  75 acctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactggg 174  Q
    ||||||||| | |||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| ||||||   |  || |    
T  19286399 acctgaggttggcccggtggtaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgag 19286300  T
Q  175 cagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacct 274  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||    
T  19286299 ctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacct 19286200  T
Q  275 ctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 316  Q
    ||| || ||| | || || |||||| ||||||| || |||||    
T  19286199 cttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaat 19286158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 69 - 307
Target Start/End: Original strand, 31490025 - 31490263
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  31490025 acgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggca 31490124  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  31490125 tttgagctgcattgataggggcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 31490224  T
Q  269 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 307  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| |||||||    
T  31490225 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctc 31490263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 58 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 31354475 - 31354250
Alignment:
Q  58 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggta 157  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||    
T  31354475 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggta 31354376  T
Q  158 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 257  Q
     ||||||   |  ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  31354375 tgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtggccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 31354276  T
Q  258 tgaccgttaccgtacctctttgatgc 283  Q
    || || ||||| |||||||| |||||    
T  31354275 tgtccattaccatacctcttcgatgc 31354250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 284
Target Start/End: Original strand, 19208668 - 19208850
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  19208668 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 19208767  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 284  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||| |||| ||||||    
T  19208768 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtacttcttcgatgca 19208850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 316
Target Start/End: Original strand, 28362263 - 28362477
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| || || ||||| |||||||    
T  28362263 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagcca 28362362  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 301  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||||| |  | ||||||||| |    
T  28362363 tggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgatgcactcacagaggattcagc 28362462  T
Q  302 tttctcgaatacaat 316  Q
    |||||| || |||||    
T  28362463 tttctcaaacacaat 28362477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 355
Target Start/End: Original strand, 3329827 - 3330080
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||  ||||||    
T  3329827 tactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacgatagcca 3329926  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 301  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  3329927 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 3330026  T
Q  302 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 355  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || |||||||| |||||    
T  3330027 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgagttcccat 3330080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 29829220 - 29828967
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  29829220 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 29829121  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 301  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  29829120 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 29829021  T
Q  302 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 355  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||    
T  29829020 tttctcaaacacaatgattccatctctgacggcttcctcaagacgggttcccat 29828967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 33258630 - 33258425
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  33258630 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 33258531  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 301  Q
    | ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  33258530 ttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgcccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 33258431  T
Q  302 tttctc 307  Q
    ||||||    
T  33258430 tttctc 33258425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 177 - 316
Target Start/End: Original strand, 19518526 - 19518665
Alignment:
Q  177 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 276  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  19518526 gcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 19518625  T
Q  277 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 316  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  19518626 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 19518665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 367
Target Start/End: Original strand, 12093041 - 12093306
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||| ||||||||    
T  12093041 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcacttgagctgcattgataggagcaatagtagcca 12093140  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 301  Q
    | ||||| |||||| | || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||||| | |  || |||||| |    
T  12093141 tagattggccggctgcagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgatgcactcgtagaagattcagc 12093240  T
Q  302 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  12093241 tttctcaaacacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 12093306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 42)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 20160709 - 20160345
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| | | ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  20160709 gtctagtttgttgctgttgttgttgttgagctggtggctgttgctgtttttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccggtggtagagg 20160610  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcc 200  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||| ||||| |||||||| || ||| || |||| |  |||  ||| || | |||||||| ||||||||||||||||    
T  20160609 atactgatggtaaaatggtggatagaaaggatgttgagagtaatgtgcaaacaggtatggtggaggtaattgagtagcattaacaggggcaacagtagcc 20160510  T
Q  201 atggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaa 300  Q
    |||||||||||||   | ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |  |||||||||||     
T  20160509 atggattgaccgg---cagcaaattccatccctacttctgtttccttcttcttatgatgaccgttaccgtacctttttggtgcgctcacggaggattcac 20160413  T
Q  301 ctttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctca 368  Q
    |||| || || ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| || |||||| || ||||||||    
T  20160412 ctttatcaaacacaatgattccttccctgacagcttcttctagacgggttcccatggtgaccatctca 20160345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Original strand, 22172122 - 22172486
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| | | ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  22172122 gtctagtttgttgctgttgttgttgttgagctggtggctgttgctgtttttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccggtggtagagg 22172221  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcc 200  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||| ||||| |||||||| || ||| || |||| |  |||  ||| || | |||||||| ||||||||||||||||    
T  22172222 atactgatggtaaaatggtggatagaaaggatgttgagagtaatgtgcaaacaggtatggtggaggtaattgagtagcattaacaggggcaacagtagcc 22172321  T
Q  201 atggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaa 300  Q
    |||||||||||||   | ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |  |||||||||||     
T  22172322 atggattgaccgg---cagcaaattccatccctacttctgtttccttcttcttatgatgaccgttaccgtacctttttggtgcgctcacggaggattcac 22172418  T
Q  301 ctttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctca 368  Q
    |||| || || ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| || |||||| || ||||||||    
T  22172419 ctttatcaaacacaatgattccttccctgacagcttcttctagacgggttcccatggtgaccatctca 22172486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 367
Target Start/End: Original strand, 13299159 - 13299508
Alignment:
Q  18 tgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatg 117  Q
    |||||||||||| ||||   |||||||| ||| || | | |||| || ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  13299159 tgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatg 13299258  T
Q  118 gtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctcc 217  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||   |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13299259 gcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctcc 13299358  T
Q  218 ggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaata 317  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| |||||     
T  13299359 ggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatg 13299458  T
Q  318 atgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
    || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  13299459 attccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 13299508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 69 - 367
Target Start/End: Original strand, 22935136 - 22935434
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||| ||||||   |    
T  22935136 acgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaagggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggca 22935235  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  22935236 tttgggctgcattgataggagcaacagtagtcatggattgaccggccccggctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccgttacc 22935335  T
Q  269 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
     |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  22935336 atacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 22935434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 69 - 367
Target Start/End: Original strand, 23857581 - 23857879
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||| ||||||   |    
T  23857581 acgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaagggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggca 23857680  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  23857681 tttgggctgcattgataggagcaacagtagtcatggattgaccggccccggctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccgttacc 23857780  T
Q  269 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
     |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  23857781 atacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 23857879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 66 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 24863657 - 24863356
Alignment:
Q  66 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 165  Q
    ||||||||||| || ||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  24863657 ttaacgggtacttggggttgactcggtggtagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtaggacggag 24863558  T
Q  166 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 265  Q
      |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  24863557 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 24863458  T
Q  266 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 365  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || |||||||| | |||| || |||||    
T  24863457 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgagttctcatggtgaccatc 24863358  T
Q  366 tc 367  Q
    ||    
T  24863357 tc 24863356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 22477461 - 22477673
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgt---tgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtag 97  Q
    |||||||||||||||| |||   ||||||||| | |||| ||||||||||||||| | | | || || |||||||||||||||||| |||||||||| |     
T  22477461 gtctagcttgttgctgttgtcgttgttgttgaaccggtgactgttgttgcatttgttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaa 22477560  T
Q  98 aggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagta 197  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22477561 aggatactaatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtactgcgcatacgggtacgacagaggtaattgggcagcattaattggggcaacagta 22477660  T
Q  198 gccatggattgac 210  Q
    |||||||||||||    
T  22477661 gccatggattgac 22477673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 66 - 367
Target Start/End: Original strand, 15424573 - 15424874
Alignment:
Q  66 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 165  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  15424573 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 15424672  T
Q  166 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 265  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  15424673 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 15424772  T
Q  266 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 365  Q
    ||| |||||||||||||||||  | || |||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || |||||||| |||||| || |||||    
T  15424773 accatacctctttgatgcattcacagaagattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgagttcccatggtgaccatc 15424872  T
Q  366 tc 367  Q
    ||    
T  15424873 tc 15424874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 13522261 - 13522441
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  13522261 gtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagg 13522360  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||    
T  13522361 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 13522441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 28162665 - 28162485
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||| | |||    
T  28162665 gtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaagg 28162566  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||| ||||||||    
T  28162565 atactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgatggaggtagctgagcagcatt 28162485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 33374444 - 33374624
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  33374444 gtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagg 33374543  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||    
T  33374544 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 33374624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 316
Target Start/End: Original strand, 24304826 - 24305124
Alignment:
Q  18 tgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatg 117  Q
    |||||||||||| ||||   |||||||| ||| || | | |||| || ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  24304826 tgttgttgttgaactggaaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatg 24304925  T
Q  118 gtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctcc 217  Q
    | |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||   |  ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  24304926 gcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggcagcattgataggagcgacagtagccatggattgaccggctcc 24305025  T
Q  218 ggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 316  Q
     || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| |||||    
T  24305026 agctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaat 24305124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 26988986 - 26988640
Alignment:
Q  21 tgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtg 120  Q
    ||||||||| ||||   |||||||| ||| || | | |||| || ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |    
T  26988986 tgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcg 26988887  T
Q  121 gaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggc 220  Q
    ||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||   |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26988886 gaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagc 26988787  T
Q  221 agataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatg 320  Q
     || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| ||     
T  26988786 tgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgatt 26988687  T
Q  321 ccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
    || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  26988686 ccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 26988640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 66 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 27000013 - 26999712
Alignment:
Q  66 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 165  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  27000013 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 26999914  T
Q  166 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 265  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  26999913 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 26999814  T
Q  266 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 365  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  26999813 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 26999714  T
Q  366 tc 367  Q
    ||    
T  26999713 tc 26999712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 8892498 - 8892678
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | ||     
T  8892498 gtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaga 8892597  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 181  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||    
T  8892598 atactgatgatataatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 8892678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 8903733 - 8903913
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | ||     
T  8903733 gtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaga 8903832  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||    
T  8903833 atactgatgatagaatggtggaaagaagagatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 8903913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 66 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 16749794 - 16749493
Alignment:
Q  66 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 165  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  16749794 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 16749695  T
Q  166 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 265  Q
    | |  || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  16749694 acatttgagctgcgttgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 16749595  T
Q  266 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 365  Q
    ||| |||||||| |||||| |  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  16749594 accatacctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcgaacacaatgatcccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 16749495  T
Q  366 tc 367  Q
    ||    
T  16749494 tc 16749493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 69 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 26918317 - 26918070
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||   |    
T  26918317 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggca 26918218  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  26918217 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 26918118  T
Q  269 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 316  Q
     |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| |||||    
T  26918117 atacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaat 26918070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 29549483 - 29549117
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| || || |||||||  || | | ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | |||    
T  29549483 gtctagcgtattgctgctgctgttgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagg 29549384  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcc 200  Q
     ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  29549383 gtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcc 29549284  T
Q  201 atggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaa 300  Q
    || |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||| |  | |||||||||     
T  29549283 atagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgatgtccattaccatacctcttcgatgcactcacagaggattcag 29549184  T
Q  301 ctttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
    ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  29549183 ctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 29549117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 58 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 27044338 - 27044029
Alignment:
Q  58 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggta 157  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||    
T  27044338 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggta 27044239  T
Q  158 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 257  Q
     ||||||   |  ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  27044238 tgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 27044139  T
Q  258 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 357  Q
    || || ||||| || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  27044138 tgtccattaccatatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 27044039  T
Q  358 tgtccatctc 367  Q
    || |||||||    
T  27044038 tgaccatctc 27044029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 69 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 3696000 - 3695702
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  3696000 acgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 3695901  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  3695900 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 3695801  T
Q  269 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
     || ||||| ||||||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  3695800 atatctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 3695702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 98 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 4525197 - 4525011
Alignment:
Q  98 aggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagta 197  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||    
T  4525197 aggatactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagta 4525098  T
Q  198 gccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 284  Q
    ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  4525097 gccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 4525011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 17025166 - 17024901
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  17025166 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagcca 17025067  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 301  Q
    | | |||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||  |    
T  17025066 tagcttgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcggc 17024967  T
Q  302 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  17024966 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 17024901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27485021 - 27484807
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  27485021 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 27484922  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 301  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||| |  | ||||||||| |    
T  27484921 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtatctcttcgatgcactcacagaggattcagc 27484822  T
Q  302 tttctcgaatacaat 316  Q
    |||||| || |||||    
T  27484821 tttctcaaacacaat 27484807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 29501310 - 29501096
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||||||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  29501310 tactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatatatgggtacgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 29501211  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 301  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  |  |||||||| |    
T  29501210 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacaaaggattcagc 29501111  T
Q  302 tttctcgaatacaat 316  Q
    |||||| || |||||    
T  29501110 tttctcaaacacaat 29501096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 29572917 - 29572735
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  29572917 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 29572818  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 284  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||||    
T  29572817 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgca 29572735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 284
Target Start/End: Original strand, 30558308 - 30558490
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| || || ||||| |||||||    
T  30558308 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagcca 30558407  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 284  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  30558408 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 30558490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 177 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 4757590 - 4757483
Alignment:
Q  177 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 276  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  4757590 gcattgataggagcgacagtagccattgattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 4757491  T
Q  277 ttgatgca 284  Q
    | ||||||    
T  4757490 tcgatgca 4757483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 177 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 4772826 - 4772687
Alignment:
Q  177 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 276  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  4772826 gcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 4772727  T
Q  277 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 316  Q
    | |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  4772726 tcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 4772687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 177 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 27007541 - 27007402
Alignment:
Q  177 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 276  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  27007541 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 27007442  T
Q  277 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 316  Q
    | |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  27007441 tcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 27007402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 367
Target Start/End: Original strand, 4546076 - 4546341
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  4546076 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 4546175  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 301  Q
    | |||||||||||| | || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| | |  || |||||| |    
T  4546176 tagattgaccggctgcagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcactcgtagaagattcagc 4546275  T
Q  302 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  4546276 tttctcaaacacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 4546341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 307
Target Start/End: Original strand, 16944319 - 16944524
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  16944319 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 16944418  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 301  Q
    | ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  16944419 ttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 16944518  T
Q  302 tttctc 307  Q
    ||||||    
T  16944519 tttctc 16944524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 28207346 - 28207081
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  28207346 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 28207247  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 301  Q
    | |||||||||||| | || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| | |  || |||||| |    
T  28207246 tagattgaccggctgcagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcactcgtagaagattcagc 28207147  T
Q  302 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  28207146 tttctcaaacacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 28207081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 177 - 316
Target Start/End: Original strand, 34463728 - 34463867
Alignment:
Q  177 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 276  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  34463728 gcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 34463827  T
Q  277 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 316  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  34463828 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 34463867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 283
Target Start/End: Original strand, 26777919 - 26778100
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||||   |  ||||| | ||| ||||| |||||||||||||    
T  26777919 tactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgggctgtattgataggtgcaacagtagcca 26778018  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgc 283  Q
    | ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||    
T  26778019 ttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgc 26778100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 69 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16674064 - 16673817
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| || || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| || || ||||||   |    
T  16674064 acgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatggatatgacggaggca 16673965  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  16673964 tttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 16673865  T
Q  269 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 316  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  16673864 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 16673817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 177 - 284
Target Start/End: Original strand, 27360377 - 27360484
Alignment:
Q  177 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 276  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  27360377 gcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 27360476  T
Q  277 ttgatgca 284  Q
    | ||||||    
T  27360477 tcgatgca 27360484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 177 - 284
Target Start/End: Original strand, 27450720 - 27450827
Alignment:
Q  177 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 276  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  27450720 gcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 27450819  T
Q  277 ttgatgca 284  Q
    | ||||||    
T  27450820 tcgatgca 27450827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 355
Target Start/End: Original strand, 27629907 - 27630254
Alignment:
Q  8 ttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactga 107  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||| || | || |  || || || || ||||||||||||||| | || ||||| | |||||| |||    
T  27629907 ttgttgctgttgttgttgctgaactggtggttgttgtggcttctgttgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattga 27630006  T
Q  108 tgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggatt 207  Q
    || || || ||||| ||||| ||||||||||| ||| | | | | ||||| |  |||  || ||| ||| |||||| |||||| ||||||||| | || |    
T  27630007 tggtaaaacggtgggaagaatggatgctgagaatatggtgtacaggggtatggtggaggtagctgagcaacattaacaggggcgacagtagccgtagact 27630106  T
Q  208 gaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 307  Q
    |||| ||||| |  |||||||| || || |||||||| |||||||| || || || || || |||||||| ||  || |||  || || ||| | |||||    
T  27630107 gacctgctcccgaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtggtggccattgccatacctcttcgacccacttgtagaagactcacccttctc 27630206  T
Q  308 gaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 355  Q
     |||||||| || || |||||||  || || |||||||||||||||||    
T  27630207 aaatacaatgataccctctctgacggcctcctctagacgagtccccat 27630254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 355
Target Start/End: Original strand, 4724435 - 4724688
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  4724435 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 4724534  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 301  Q
    | |||||||||||| | || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || |||||| | |  || |||||| |    
T  4724535 tagattgaccggctgcagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccataccttttcgatgcactcgtagaagattcagc 4724634  T
Q  302 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 355  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||    
T  4724635 tttctcaaacacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccat 4724688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 284
Target Start/End: Original strand, 26116792 - 26116893
Alignment:
Q  183 ataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatg 282  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| ||||    
T  26116792 ataggagcaacggtagctatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgatg 26116891  T
Q  283 ca 284  Q
    ||    
T  26116892 ca 26116893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 355
Target Start/End: Original strand, 27272947 - 27273128
Alignment:
Q  174 gcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacc 273  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||  | |  ||||| ||||| |  |||||||| || || |||||||| |||||||| || || || || || ||||    
T  27272947 gcagcattaacaggggcgacagtagctgtagtctgacctgctccagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtggtggccattgccatacc 27273046  T
Q  274 tctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 355  Q
    ||||  |  ||||||  || || ||| | ||||| |||||||| || ||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  27273047 tcttcaacccatttgtagaagactcacccttctcaaatacaatgataccttccctgacggcttcctctagacgagtccccat 27273128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 146; Significance: 8e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 66 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 29706 - 29405
Alignment:
Q  66 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 165  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||     
T  29706 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatacgggtacgatggag 29607  T
Q  166 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 265  Q
      |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  29606 gcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgtt 29507  T
Q  266 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 365  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  29506 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttttcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 29407  T
Q  366 tc 367  Q
    ||    
T  29406 tc 29405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 69 - 367
Target Start/End: Original strand, 40385 - 40683
Alignment:
Q  69 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 168  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| | ||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||||| ||||   |    
T  40385 acgggtacctgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtacggcggaggca 40484  T
Q  169 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 268  Q
      ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  40485 tttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgttacc 40584  T
Q  269 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
     |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || |||||||| |||||| || |||||||    
T  40585 atacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgagttcccatggtgaccatctc 40683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 367
Target Start/End: Original strand, 47250 - 47599
Alignment:
Q  18 tgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatg 117  Q
    |||||||||||| ||||   |||||||| ||| || | | |||| || ||||||||||| |||||| |||||| ||| || || ||||||||||| ||||    
T  47250 tgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatg 47349  T
Q  118 gtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctcc 217  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| || |||   |  ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47350 gcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgatggaggcatttgggctgcattgataagagcaacagtagccatgggttgaccggctcc 47449  T
Q  218 ggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaata 317  Q
     || || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||     
T  47450 agctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgatgcattcacggaggattcagctttctcgaacacaatg 47549  T
Q  318 atgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
    || || || ||||  |||||||| ||||| || |||||| || |||||||    
T  47550 attccatccctgacggcttcttccagacgggttcccatggtgaccatctc 47599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 37 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 21539 - 21208
Alignment:
Q  37 gctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctg 136  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||| || ||||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21539 gctgttgttgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcggtggtggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctg 21440  T
Q  137 agagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctact 236  Q
    ||||||||||   ||| |||||| ||||  || ||| | |||||| || |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  21439 agagtattgcatgtactggtacggcggaggtagctgagaagcattgatgggggcaacagtagccacggattgactggttccggcagataccatccctact 21340  T
Q  237 tctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagctt 336  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||| || ||||||| ||| |    
T  21339 tctgtctctttcttcttatgatgaccattaccatacttccttgatgcatttgcagaggattcacctttctcaaacacaataattccgtctctgacagcct 21240  T
Q  337 cttctagacgagtccccatgatgtccatctca 368  Q
    ||||||  || || |||||| || ||||||||    
T  21239 cttctaagcgggttcccatggtgaccatctca 21208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 27283 - 26934
Alignment:
Q  18 tgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatg 117  Q
    |||||||||||| ||||   |||||||| ||| || | | |||| || ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27283 tgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggtagagggtactgatgataaaatg 27184  T
Q  118 gtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctcc 217  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||   |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27183 gcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctcc 27084  T
Q  218 ggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaata 317  Q
     || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| |||||     
T  27083 agctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatg 26984  T
Q  318 atgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
    || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  26983 attccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 26934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 2903 - 3083
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagagg 100  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  2903 gtctagcttgctgatgctgttgttgttgagctggaggctgttgttgcatttgttgaacgacggcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagg 3002  T
Q  101 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||| ||||||||    
T  3003 atactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcgtacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 3083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 66 - 367
Target Start/End: Original strand, 443 - 744
Alignment:
Q  66 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 165  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  443 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 542  T
Q  166 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 265  Q
      |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  543 gcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagttgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 642  T
Q  266 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 365  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| ||||| || |||||| || |||||    
T  643 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgggttcccatggtgaccatc 742  T
Q  366 tc 367  Q
    ||    
T  743 tc 744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 98 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 8143 - 7874
Alignment:
Q  98 aggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagta 197  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||    
T  8143 aggatactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagta 8044  T
Q  198 gccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggatt 297  Q
    ||||  |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||  | |||||||    
T  8043 gccacagattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggatt 7944  T
Q  298 caactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
    || ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  7943 cagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 7874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 173 - 367
Target Start/End: Original strand, 48568 - 48769
Alignment:
Q  173 ggcagcattaataggggcaacag-tagccatggattga--ccggctccggca-gataccatccc-tacttctgtttctttcttcttatgatgacc-gtta 266  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||    
T  48568 ggcagcattgataggagcaacaggtagccatggattggacccggctccggcaagacaccatcccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcccgtta 48667  T
Q  267 ccgtacctcttt-gatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 365  Q
    || ||||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  48668 ccatacctcttttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 48767  T
Q  366 tc 367  Q
    ||    
T  48768 tc 48769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 367
Target Start/End: Original strand, 15279 - 15544
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| || || |||||||||||||    
T  15279 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagcca 15378  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 301  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||| | |  || |||||| |    
T  15379 ttgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgcactcgtagaagattcagc 15478  T
Q  302 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  15479 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 15544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 367
Target Start/End: Original strand, 26551 - 26816
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  26551 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 26650  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 301  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||| | ||||||||| |    
T  26651 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcatttacagaggattcagc 26750  T
Q  302 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  26751 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 26816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 102 - 284
Target Start/End: Original strand, 7588 - 7770
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  7588 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 7687  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 284  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||||    
T  7688 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtacctcttcgatgca 7770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 7844 - 7579
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  7844 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 7745  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 301  Q
    | |||||||||||| | || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| | |  || |||||| |    
T  7744 tagattgaccggctgcagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcactcgtagaagattcagc 7645  T
Q  302 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 367  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  7644 tttctcaaacacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 7579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 280
Target Start/End: Original strand, 9415 - 9593
Alignment:
Q  102 tactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 201  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| || || |||||||    
T  9415 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagcca 9514  T
Q  202 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttga 280  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||||||    
T  9515 tggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctctttga 9593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 177 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 5821 - 5682
Alignment:
Q  177 gcattaataggggcaacagtagccatg-gattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctc 275  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || |||    
T  5821 gcattgataggagcaacagtagccatttgattgaccggctccagctgacaccatccc-acttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctc 5723  T
Q  276 tttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 316  Q
    || || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  5722 ttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 5682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 273 - 312
Alignment:
Q  1 gtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctg 40  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  273 gtctagcttgttgctgctgttgctgttgagctggtggctg 312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0496 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0496
Description:

Target: scaffold0496; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 217
Target Start/End: Original strand, 157 - 197
Alignment:
Q  177 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctcc 217  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  157 gcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctcc 197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University