View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6692_low_42 (Length: 235)

Name: NF6692_low_42
Description: NF6692
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6692_low_42
NF6692_low_42
[»] chr7 (32 HSPs)
chr7 (1-226)||(16445551-16445776)
chr7 (1-229)||(16045683-16045911)
chr7 (1-229)||(26270628-26270856)
chr7 (4-229)||(26533415-26533640)
chr7 (1-229)||(16513972-16514200)
chr7 (1-229)||(24588076-24588304)
chr7 (1-229)||(45735675-45735903)
chr7 (4-229)||(2105705-2105930)
chr7 (4-229)||(2158945-2159170)
chr7 (4-229)||(39208681-39208906)
chr7 (1-229)||(4140788-4141016)
chr7 (1-229)||(10845988-10846216)
chr7 (1-229)||(26315390-26315618)
chr7 (4-229)||(10912411-10912636)
chr7 (4-229)||(11420321-11420546)
chr7 (4-229)||(26511238-26511463)
chr7 (4-229)||(26517163-26517388)
chr7 (1-229)||(4203757-4203985)
chr7 (4-229)||(5132367-5132592)
chr7 (4-229)||(5162754-5162979)
chr7 (4-229)||(31128278-31128503)
chr7 (1-229)||(26665456-26665684)
chr7 (1-229)||(26680648-26680876)
chr7 (7-229)||(2777628-2777850)
chr7 (4-229)||(3449677-3449902)
chr7 (1-229)||(31559932-31560160)
chr7 (1-229)||(5142882-5143110)
chr7 (1-229)||(31086164-31086392)
chr7 (4-229)||(26439628-26439853)
chr7 (4-229)||(11445258-11445483)
chr7 (4-229)||(45391591-45391816)
chr7 (4-229)||(16747059-16747284)
[»] chr5 (50 HSPs)
chr5 (1-229)||(22892841-22893069)
chr5 (4-229)||(23896256-23896481)
chr5 (1-229)||(13182347-13182575)
chr5 (1-229)||(26484772-26485000)
chr5 (4-229)||(3793922-3794147)
chr5 (4-229)||(22994671-22994896)
chr5 (4-229)||(23630351-23630576)
chr5 (4-229)||(24974287-24974512)
chr5 (4-229)||(30172850-30173075)
chr5 (4-229)||(37766545-37766770)
chr5 (1-229)||(12136553-12136781)
chr5 (1-229)||(33781863-33782091)
chr5 (4-229)||(11553736-11553961)
chr5 (4-229)||(24587755-24587980)
chr5 (1-229)||(41679083-41679311)
chr5 (4-229)||(2515443-2515668)
chr5 (4-229)||(6878686-6878911)
chr5 (4-229)||(9321857-9322082)
chr5 (4-229)||(28955339-28955564)
chr5 (4-229)||(30156412-30156637)
chr5 (4-229)||(30939016-30939241)
chr5 (4-229)||(40469104-40469329)
chr5 (1-229)||(11328015-11328243)
chr5 (1-229)||(13438237-13438465)
chr5 (1-229)||(24728347-24728575)
chr5 (1-229)||(29886751-29886979)
chr5 (4-229)||(5642169-5642394)
chr5 (4-229)||(18123970-18124195)
chr5 (4-229)||(18371088-18371313)
chr5 (4-229)||(33296909-33297134)
chr5 (4-229)||(33879509-33879734)
chr5 (1-229)||(8661029-8661257)
chr5 (1-229)||(9546263-9546491)
chr5 (1-229)||(30033806-30034034)
chr5 (1-229)||(37667040-37667268)
chr5 (42-229)||(25204697-25204884)
chr5 (42-229)||(25268852-25269039)
chr5 (4-229)||(15654312-15654537)
chr5 (1-229)||(34620896-34621124)
chr5 (4-229)||(18496279-18496504)
chr5 (4-229)||(28653624-28653849)
chr5 (4-229)||(31821961-31822186)
chr5 (4-229)||(43082636-43082861)
chr5 (1-229)||(15754406-15754634)
chr5 (1-229)||(33520758-33520986)
chr5 (1-229)||(37759361-37759589)
chr5 (4-229)||(13320384-13320609)
chr5 (4-229)||(32591828-32592053)
chr5 (4-229)||(31435845-31436070)
chr5 (4-229)||(37354197-37354422)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (1-229)||(16203691-16203919)
chr1 (1-229)||(20336073-20336301)
chr1 (1-229)||(20465349-20465577)
chr1 (1-229)||(28154109-28154337)
chr1 (1-229)||(51642591-51642819)
chr1 (1-229)||(3645514-3645743)
chr1 (4-229)||(21893405-21893630)
chr1 (1-229)||(10949450-10949678)
chr1 (4-227)||(41788969-41789192)
chr1 (1-229)||(10967038-10967266)
chr1 (1-229)||(28589453-28589681)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (1-229)||(22076543-22076771)
chr8 (4-229)||(16287326-16287550)
chr8 (1-229)||(19656959-19657187)
chr8 (1-229)||(22137280-22137508)
chr8 (4-229)||(18795077-18795302)
chr8 (4-229)||(27604523-27604748)
chr8 (1-229)||(9358995-9359223)
chr8 (1-229)||(28357570-28357798)
chr8 (4-229)||(2132878-2133103)
chr8 (4-229)||(19692471-19692696)
chr8 (4-229)||(19912780-19913005)
chr8 (4-229)||(33263107-33263332)
chr8 (4-229)||(15771947-15772172)
chr8 (4-229)||(21343789-21344014)
chr8 (4-229)||(44565357-44565582)
chr8 (1-229)||(29833695-29833923)
chr8 (4-229)||(14561997-14562222)
chr8 (4-229)||(18713857-18714082)
chr8 (4-229)||(33246743-33246968)
chr8 (1-229)||(19678817-19679045)
chr8 (1-229)||(31358898-31359126)
chr8 (4-229)||(12088341-12088566)
chr8 (4-229)||(31485489-31485714)
chr8 (1-229)||(19203980-19204208)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (4-229)||(31667-31892)
scaffold0143 (4-229)||(8334-8559)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (1-229)||(23487-23715)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (4-226)||(20842286-20842508)
chr2 (1-229)||(19452069-19452297)
chr2 (1-229)||(21698817-21699045)
chr2 (1-229)||(27780604-27780832)
chr2 (1-229)||(27820361-27820589)
chr2 (4-229)||(27430087-27430312)
chr2 (4-229)||(19412147-19412372)
chr2 (1-229)||(12591178-12591406)
chr2 (4-229)||(256299-256524)
chr2 (4-229)||(37681541-37681766)
chr2 (4-229)||(37696806-37697031)
chr2 (1-229)||(27808073-27808301)
chr2 (2-229)||(11630830-11631057)
chr2 (4-229)||(3786866-3787091)
chr2 (4-229)||(9345632-9345857)
chr2 (4-229)||(12659909-12660134)
chr2 (4-229)||(28886652-28886877)
chr2 (4-229)||(32054176-32054401)
chr2 (4-229)||(34866057-34866282)
chr2 (4-229)||(37929742-37929967)
chr2 (1-229)||(27120894-27121122)
chr2 (1-229)||(34159214-34159442)
chr2 (1-229)||(34295524-34295752)
chr2 (4-229)||(23124215-23124440)
chr2 (4-225)||(31889141-31889362)
chr2 (4-229)||(37382050-37382275)
chr2 (1-229)||(12712247-12712475)
chr2 (1-229)||(22923794-22924022)
chr2 (4-229)||(13932193-13932418)
chr2 (4-229)||(16165853-16166078)
chr2 (4-229)||(37947508-37947733)
chr2 (4-229)||(40237881-40238106)
chr2 (4-229)||(31880659-31880884)
chr2 (4-229)||(34270566-34270791)
chr2 (4-229)||(39894442-39894667)
chr2 (1-229)||(16824984-16825212)
chr2 (1-229)||(16896268-16896496)
chr2 (1-229)||(21672821-21673049)
chr2 (4-229)||(39047465-39047690)
chr2 (1-71)||(27395932-27396002)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (1-229)||(10416-10644)
scaffold0322 (1-229)||(29-257)
[»] chr4 (26 HSPs)
chr4 (1-229)||(15278284-15278512)
chr4 (4-229)||(18796271-18796496)
chr4 (1-229)||(15381890-15382118)
chr4 (43-229)||(15232242-15232428)
chr4 (4-229)||(14669400-14669625)
chr4 (4-229)||(40101294-40101519)
chr4 (4-229)||(17017433-17017658)
chr4 (4-229)||(34184617-34184842)
chr4 (4-229)||(54837778-54838003)
chr4 (4-229)||(20334078-20334303)
chr4 (4-229)||(24588018-24588243)
chr4 (4-229)||(30758147-30758372)
chr4 (4-229)||(33669457-33669682)
chr4 (1-229)||(18312835-18313063)
chr4 (4-229)||(6574245-6574470)
chr4 (4-229)||(36340174-36340399)
chr4 (1-229)||(14102927-14103155)
chr4 (4-229)||(14755149-14755374)
chr4 (4-229)||(39855024-39855249)
chr4 (4-229)||(5010262-5010487)
chr4 (1-229)||(21974085-21974313)
chr4 (1-229)||(31122169-31122397)
chr4 (4-229)||(5698922-5699147)
chr4 (4-229)||(24117049-24117274)
chr4 (4-229)||(27158974-27159199)
chr4 (42-229)||(1904679-1904866)
[»] chr3 (57 HSPs)
chr3 (1-229)||(31031936-31032164)
chr3 (4-229)||(15888405-15888630)
chr3 (1-229)||(19698822-19699050)
chr3 (1-229)||(21679035-21679263)
chr3 (1-229)||(35885098-35885326)
chr3 (4-229)||(4421250-4421475)
chr3 (4-229)||(4792335-4792560)
chr3 (4-229)||(6206239-6206464)
chr3 (4-229)||(32443486-32443711)
chr3 (1-229)||(28111654-28111882)
chr3 (4-229)||(4725965-4726190)
chr3 (4-229)||(8285170-8285395)
chr3 (4-229)||(18334965-18335190)
chr3 (1-229)||(8000892-8001120)
chr3 (1-229)||(10647405-10647633)
chr3 (1-229)||(17972561-17972789)
chr3 (1-229)||(29660670-29660898)
chr3 (1-229)||(32294960-32295188)
chr3 (1-229)||(48470259-48470487)
chr3 (4-229)||(4687990-4688215)
chr3 (4-229)||(5715408-5715633)
chr3 (4-229)||(5726318-5726543)
chr3 (4-229)||(5765825-5766050)
chr3 (4-229)||(22383278-22383503)
chr3 (4-229)||(28343512-28343737)
chr3 (1-229)||(6538442-6538670)
chr3 (1-229)||(7077538-7077766)
chr3 (5-229)||(15736794-15737018)
chr3 (1-229)||(47027785-47028013)
chr3 (4-229)||(18055597-18055822)
chr3 (4-229)||(29144456-29144681)
chr3 (1-229)||(5471320-5471548)
chr3 (1-229)||(5605014-5605242)
chr3 (1-229)||(20070372-20070600)
chr3 (1-229)||(24332495-24332723)
chr3 (1-229)||(31960155-31960383)
chr3 (4-229)||(11106059-11106284)
chr3 (4-229)||(20572543-20572768)
chr3 (4-229)||(28025616-28025841)
chr3 (4-229)||(51786358-51786583)
chr3 (1-229)||(5018046-5018274)
chr3 (1-229)||(5592057-5592285)
chr3 (1-229)||(18247073-18247301)
chr3 (4-229)||(4342376-4342601)
chr3 (4-229)||(4628120-4628345)
chr3 (4-229)||(18288053-18288278)
chr3 (4-229)||(18303354-18303579)
chr3 (4-229)||(10400479-10400704)
chr3 (1-229)||(18229528-18229756)
chr3 (1-229)||(17980649-17980877)
chr3 (1-229)||(22866548-22866776)
chr3 (1-229)||(22881607-22881835)
chr3 (46-229)||(16620190-16620373)
chr3 (1-165)||(5654417-5654581)
chr3 (4-157)||(8216070-8216223)
chr3 (4-83)||(8300306-8300385)
chr3 (160-229)||(5656625-5656694)
[»] chr6 (45 HSPs)
chr6 (4-229)||(27625311-27625536)
chr6 (1-229)||(14140994-14141222)
chr6 (1-229)||(27285964-27286192)
chr6 (1-229)||(27357710-27357938)
chr6 (4-229)||(24868087-24868312)
chr6 (4-229)||(27023508-27023733)
chr6 (1-229)||(26774227-26774455)
chr6 (1-229)||(26922745-26922973)
chr6 (1-229)||(28164859-28165087)
chr6 (1-229)||(29553925-29554153)
chr6 (1-229)||(29577382-29577610)
chr6 (4-229)||(27183300-27183525)
chr6 (4-229)||(27265714-27265939)
chr6 (1-229)||(16754189-16754417)
chr6 (4-229)||(4541374-4541599)
chr6 (4-229)||(8901303-8901528)
chr6 (4-229)||(13294551-13294776)
chr6 (4-229)||(22930484-22930709)
chr6 (4-229)||(23852929-23853154)
chr6 (4-229)||(33372031-33372256)
chr6 (1-229)||(16678508-16678736)
chr6 (1-229)||(16939627-16939855)
chr6 (4-229)||(4719735-4719960)
chr6 (4-229)||(13519794-13520019)
chr6 (4-229)||(15408133-15408358)
chr6 (4-229)||(15419920-15420145)
chr6 (4-229)||(27061877-27062102)
chr6 (1-229)||(3700451-3700679)
chr6 (1-229)||(4777248-4777476)
chr6 (3-229)||(27198555-27198781)
chr6 (1-229)||(4529653-4529881)
chr6 (4-229)||(4762134-4762359)
chr6 (4-229)||(24301357-24301582)
chr6 (4-229)||(34460106-34460331)
chr6 (1-229)||(27489501-27489729)
chr6 (1-229)||(30553616-30553844)
chr6 (3-229)||(27250453-27250680)
chr6 (4-229)||(26112012-26112237)
chr6 (4-229)||(28211825-28212050)
chr6 (4-229)||(27012102-27012327)
chr6 (4-229)||(29505787-29506012)
chr6 (1-229)||(26790184-26790412)
chr6 (46-229)||(17088043-17088226)
chr6 (4-229)||(20172918-20173143)
chr6 (4-229)||(22162848-22163073)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (4-229)||(16956-17181)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (4-229)||(4441-4666)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (4-229)||(10410-10635)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (7-229)||(13948-14170)
[»] scaffold0159 (4 HSPs)
scaffold0159 (1-229)||(11830-12058)
scaffold0159 (1-229)||(4836-5064)
scaffold0159 (1-191)||(9712-9902)
scaffold0159 (133-229)||(24076-24172)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (1-229)||(21848-22076)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (4-229)||(10585-10810)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (4-229)||(12323-12548)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (1-229)||(10393-10622)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (4-229)||(42337-42566)
[»] scaffold0815 (1 HSPs)
scaffold0815 (4-57)||(2105-2158)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16445776 - 16445551
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16445776 tcgcatgtgttcgctattggggacgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccttggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 16445677  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16445676 gtgagtatccactgggtgcttccaacagagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattatgtacaaaagaaacta 16445577  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  16445576 cgacatggtattgttaagatgtgttg 16445551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 16045683 - 16045911
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16045683 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggttaaaatgtggttggcaataaaccctggtattacgacatcgagcagttcttgctaagcc 16045782  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    || |||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16045783 gtaagtatccaccgggtgcttccaacaaagacaagaaaaccctgagaagattggccagtaaattcctgctagagggagatattctgtacaaaagaaacta 16045882  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16045883 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 16045911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26270856 - 26270628
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26270856 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtattatgacatcaagcagttcttgctaagcc 26270757  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  26270756 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagcagatttctgttagatggagatattctgtacaagagaaacta 26270657  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26270656 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 26270628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26533640 - 26533415
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  26533640 catgtgttcgctattggagatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactatgacatcaaacagttcttgctaagccgtg 26533541  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  26533540 agtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 26533441  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  26533440 catggtattgttaagatgtgttgatg 26533415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16514200 - 16513972
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16514200 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgagaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagcc 16514101  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    || ||||||| || | ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  16514100 gtaagtatccgccaggtgcttccaaccaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaacta 16514001  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16514000 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 16513972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24588304 - 24588076
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24588304 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctaagcc 24588205  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  24588204 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaacta 24588105  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24588104 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 24588076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 45735675 - 45735903
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45735675 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggcgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctaagcc 45735774  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  45735775 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaacta 45735874  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45735875 tgacatagtattgttaagatgtgttgatg 45735903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2105930 - 2105705
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  2105930 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 2105831  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  2105830 agtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 2105731  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  2105730 catggtattgttaagatgtgttgatg 2105705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 2158945 - 2159170
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  2158945 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaatagttcttgctgagccgtg 2159044  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    |||||||||||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  2159045 agtatccaccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 2159144  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  2159145 catggtattgttaagatgtgttgatg 2159170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 39208906 - 39208681
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  39208906 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 39208807  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  39208806 agtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 39208707  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  39208706 catggtattgttaagatgtgttgatg 39208681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4141016 - 4140788
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4141016 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttggctatagaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctaagcc 4140917  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  4140916 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaacta 4140817  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4140816 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 4140788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 10845988 - 10846216
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  10845988 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacaccaaacagttcttgctaagcc 10846087  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||| | ||| ||| | ||||||||  | ||| ||||||| ||||||||    
T  10846088 gtgagtatccacagggtgcttccaacaaagacaagaagactctaagaagattggctagtaggttcttattagatggggacattttgtacaagagaaacta 10846187  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10846188 cgacatggtattgttaagatgtattgatg 10846216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26315618 - 26315390
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  26315618 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtattacgacattaaacagttcttgctgagcc 26315519  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  26315518 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagcagatttctgttagatggagatattatgtacaagagaaacta 26315419  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||    
T  26315418 tgacatggtgttgttaagatgtgttgatg 26315390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10912636 - 10912411
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  10912636 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctgatactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 10912537  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  10912536 agtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 10912437  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  10912436 catggtattgttaagatgtgttgatg 10912411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11420546 - 11420321
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  11420546 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggcgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 11420447  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  11420446 agtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 11420347  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  11420346 catggtattgttaagatgtgttgatg 11420321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26511463 - 26511238
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  26511463 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctagtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 26511364  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  26511363 agtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 26511264  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  26511263 catggtattgttaagatgtgttgatg 26511238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 26517163 - 26517388
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  26517163 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 26517262  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||| ||    
T  26517263 agtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagaaattctgtacaagagaaactatga 26517362  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  26517363 catggtattgttaagatgtgttgatg 26517388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 4203757 - 4203985
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  4203757 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatatggttgactatagaccctggtattatgacatcaaacagttcttgctgagcc 4203856  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  4203857 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaacta 4203956  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4203957 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 4203985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 5132367 - 5132592
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5132367 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggcgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 5132466  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||    
T  5132467 agtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcttgttagatggagatattatgtacaagaggaactatga 5132566  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  5132567 catggtattgttaagatgtgttgatg 5132592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 5162754 - 5162979
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5162754 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggcgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 5162853  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  5162854 agtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattgaccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 5162953  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  5162954 catggtattgttaagatgtgttgatg 5162979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 31128278 - 31128503
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  31128278 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatggggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 31128377  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||    
T  31128378 agtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaactatga 31128477  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  31128478 catggtattgttaagatgtgttgatg 31128503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26665684 - 26665456
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  26665684 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttggctataaaccctggtactatgacatcaagcagttcttgctgagcc 26665585  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  26665584 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaacta 26665485  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26665484 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 26665456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26680876 - 26680648
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  26680876 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttggctataaaccctggtactatgacatcaagcagttcttgctgagcc 26680777  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  26680776 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaacta 26680677  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680676 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 26680648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Original strand, 2777628 - 2777850
Alignment:
Q  7 gtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtgagt 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2777628 gtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtgagt 2777727  T
Q  107 atccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacgacat 206  Q
    ||||  ||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||| |||||    
T  2777728 atccgtcgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctctacaagagaaactatgacat 2777827  T
Q  207 ggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  2777828 ggtattgttaagatgtgttgatg 2777850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 3449677 - 3449902
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  3449677 catgtgtttgctattggggacgtgatcgatcaggctggtgaaattgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 3449776  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||    
T  3449777 agtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaactatga 3449876  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  3449877 catggtactgttaagatgtgttgatg 3449902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 31560160 - 31559932
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  31560160 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccttggtactacgacatcaaacagttcttgctgagcc 31560061  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  31560060 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattttgtacaagaggaacta 31559961  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31559960 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 31559932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5143110 - 5142882
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |    
T  5143110 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggcgaaaatgtggttgactatagaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagtc 5143011  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| || |||||    
T  5143010 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaggataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatatcctgtacaagaggaacta 5142911  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5142910 tgacatggtactgttaagatgtgttgatg 5142882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 31086392 - 31086164
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  31086392 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtattatggcatcaaacagttcttgctgagcc 31086293  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||  ||||| ||||||| ||||||||    
T  31086292 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtaggttccggttagatggggatattctgtacaagagaaacta 31086193  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31086192 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 31086164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 26439628 - 26439853
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  26439628 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactatgacatcaagcagttcttgctaagccgcg 26439727  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    | ||||| |||| |||||||||    || |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||    
T  26439728 aatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgaggagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaactatga 26439827  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  26439828 catggtattgttaagatgtgttgatg 26439853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 11445258 - 11445483
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  11445258 catgtgtttgctattggggacgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactatgacatcaagcagttcttgctgagccgtg 11445357  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| || | |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||    
T  11445358 agtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaactatga 11445457  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  11445458 catggtattgttaaggtgtgttgatg 11445483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 45391591 - 45391816
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  45391591 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtgattgactatagaccctggtactatgacatcaagcagttcttgctgagccgtg 45391690  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| || | |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||    
T  45391691 agtatccgccaggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaactatga 45391790  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  45391791 catggtattgttaaggtgtgttgatg 45391816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16747284 - 16747059
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  16747284 catgtatttgctattggggaggtgatcgatcaggctggcgaaaatatggttgactataaaccctggtactatgacatcaagcagttcttgctaagccgcg 16747185  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    | ||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||| |||| || || ||||| ||    
T  16747184 aatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagacggagatattctgtataagaggaactatga 16747085  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16747084 catggtattattaagatgtgttgatg 16747059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 50)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 22892841 - 22893069
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22892841 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccttggtactacgacatcaagcagttcttgctaagcc 22892940  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||    
T  22892941 gtgagtatccaccaggtgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagctggagatgttctgtacaaaagaaacta 22893040  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22893041 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 22893069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 23896256 - 23896481
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23896256 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgacaatgaaccctggtaccacgacatcaaacagttcttgctaagtcgtg 23896355  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  23896356 agtatccgccggatgcttccaacaaagacaagaagaccctgagaagattggccagtaaattcttgctagatggaaacattttgtacaagagaaactacga 23896455  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  23896456 catggtattgttaagatgtgttgatg 23896481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13182575 - 13182347
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13182575 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggcgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctaagcc 13182476  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  13182475 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaacta 13182376  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13182375 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 13182347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 26484772 - 26485000
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  26484772 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtattacgacattaaacagttcttgctgagcc 26484871  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  26484872 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagcagatttctgttagatggagatattatgtacaagagaaacta 26484971  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26484972 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 26485000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 3793922 - 3794147
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  3793922 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 3794021  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  3794022 agtatccgccgggtgcttccaagcaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactacga 3794121  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  3794122 catggtattgttaagatgtgttgatg 3794147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22994896 - 22994671
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22994896 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 22994797  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  22994796 agtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaaaagaaactatga 22994697  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22994696 catggtattattaagatgtgttgatg 22994671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 23630351 - 23630576
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  23630351 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggcgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 23630450  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  23630451 agtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaaaagaaactatga 23630550  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  23630551 catggtattgttaagatgtgttgatg 23630576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 24974287 - 24974512
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24974287 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 24974386  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| || | ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  24974387 agtatccgccaggtgcttccaaccaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcatgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 24974486  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  24974487 catggtattgttaagatgtgttgatg 24974512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 30172850 - 30173075
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  30172850 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactatgacatcaagcagttcttgctgagccgtg 30172949  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  30172950 agtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 30173049  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  30173050 catggtattgttaagatgtgttgatg 30173075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 37766770 - 37766545
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  37766770 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 37766671  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||    
T  37766670 agtatccgccggatgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaaatattctgtacaagaggaactatga 37766571  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  37766570 catggtattgttaagatgtgttgatg 37766545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 12136553 - 12136781
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  12136553 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtattacgacattaaacagttcttgctgagcc 12136652  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  12136653 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagcagatttctgttagatggagatattatgtacaagagaaacta 12136752  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||    
T  12136753 tgacatggtgttgttaagatgtgttgatg 12136781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 33781863 - 33782091
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  33781863 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggcgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagcc 33781962  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||    
T  33781963 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggggatattctgtacaagagaaacta 33782062  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33782063 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 33782091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 11553736 - 11553961
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  11553736 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaagcagttcttgcggagccgtg 11553835  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| | || |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  11553836 agtatccgctgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 11553935  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  11553936 catggtattgttaagatgtgttgatg 11553961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 24587755 - 24587980
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24587755 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 24587854  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| ||   ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  24587855 agtatccgccaagtgcttccaaccaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattccttttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 24587954  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  24587955 catggtattgttaagatgtgttgatg 24587980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 41679083 - 41679311
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||    
T  41679083 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttggctataaaccctggtactacgacattaaacagttcttgctgagcc 41679182  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  41679183 gtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaacta 41679282  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41679283 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 41679311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 2515443 - 2515668
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  2515443 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttaactatagaccctggtattatgacatcaaacagttcttgctaagccgtg 2515542  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  2515543 agtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagatttctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 2515642  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  2515643 catggtgttgttaagatgtgttgatg 2515668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 6878686 - 6878911
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6878686 catgtgtttgctattggggatgtggtcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 6878785  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||| ||    
T  6878786 agtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagagattttgtacaagagaaactatga 6878885  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  6878886 catggtattgttaagatgtgttgatg 6878911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 9321857 - 9322082
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  9321857 catgtgtttgctattggggatgtggtcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 9321956  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  9321957 agtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 9322056  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  9322057 catggtattgttaagatgtgttgatg 9322082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 28955564 - 28955339
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  28955564 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttggctataaaccctagtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 28955465  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  28955464 agtatccgccgggtgcttccaagcaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 28955365  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  28955364 catggtattgttaagatgtgttgatg 28955339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 30156412 - 30156637
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  30156412 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactatgacatcaagcagttcttgctgagccgtg 30156511  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||    
T  30156512 agtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggaaatattctgtacaagaggaactatga 30156611  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  30156612 catggtattgttaaggtgtgttgatg 30156637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 30939016 - 30939241
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  30939016 catgtgttttctattggggatgtgatcgatcaggctggcgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 30939115  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  30939116 agtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 30939215  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  30939216 catggtattgttaagatgtgttgatg 30939241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 40469329 - 40469104
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40469329 catgtgtttgctattggagatatgatcgatcaggctggtgaaaatatggttgactataaaccctggtactatgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 40469230  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||    
T  40469229 agtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaaaaggaactatga 40469130  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  40469129 catggtactgttaagatgtgttgatg 40469104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 11328015 - 11328243
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  11328015 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggcgaaaatgtggttgactatagaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagcc 11328114  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||    
T  11328115 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagagattctgtacaagagaaacta 11328214  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11328215 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 11328243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13438465 - 13438237
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  13438465 tcgcatttgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagcc 13438366  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||    
T  13438365 gtgagtatccgccgggtgcttccaagcaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatgttctgtacaagagaaacta 13438266  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13438265 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 13438237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 24728347 - 24728575
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24728347 tcgcatgtgtttactattggagatgtgatcgatcaggctggtgaaaatatggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagcc 24728446  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| || | |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  24728447 gtgagtatccgcctggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaaaagaaacta 24728546  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24728547 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 24728575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 29886979 - 29886751
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  29886979 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggccggtgaaaatatggttgactataaaccctggtattacgatatcaagcagttcttgctgagcc 29886880  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    ||||||||||  | | ||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29886879 gtgagtatccgtcaggtgcttccaaccaagacaagaagaccctaagaagattggccagtagattccttttggatggagatattctgtacaaaagaaacta 29886780  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29886779 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 29886751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 5642169 - 5642394
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  5642169 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactatgacatcaagcagttcttgctgagccgtg 5642268  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| ||| |||||    || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||| ||    
T  5642269 agtatccgccgggtgcctccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctatacaagagaaactatga 5642368  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  5642369 catggtattgttaagatgtgttgatg 5642394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18124195 - 18123970
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18124195 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 18124096  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    |||||||  | | |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  18124095 agtatccgacaggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatgaagatattctgtacaagagaaactatga 18123996  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  18123995 catggtattgttaagatgtgttgatg 18123970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18371313 - 18371088
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18371313 catgtgtttgctattggggatgtaatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 18371214  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    |||||||  ||| |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||    
T  18371213 agtatccgtcgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaactatga 18371114  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  18371113 catggtattgttaagatgtgttgatg 18371088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 33296909 - 33297134
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  33296909 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggcgaaaatgtgattgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 33297008  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||    
T  33297009 agtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaactatga 33297108  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  33297109 catggtattgttaagatgtgttgatg 33297134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 33879509 - 33879734
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  33879509 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactatgacatcaagcagttcttgctgagccgtg 33879608  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||| ||    
T  33879609 agtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggtcagtagattcctgttagatggagagattctgtacaagagaaactatga 33879708  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  33879709 catggtattgttaagatgtgttgatg 33879734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8661257 - 8661029
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |    
T  8661257 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatggggttgactatagaccttggtactacgacatcaaacagttcttgctgagtc 8661158  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  8661157 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaacta 8661058  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8661057 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 8661029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9546491 - 9546263
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  9546491 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggcgaaaatggggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagcc 9546392  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    | |||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  9546391 gggagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattttgtacaagagaaacta 9546292  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9546291 tgacatggtattattaagatgtgttgatg 9546263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 30033806 - 30034034
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  30033806 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgagaatgtggttgactatagaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagcc 30033905  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  30033906 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggaaatattctgtacaagaggaacta 30034005  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30034006 tgacatggtattgttaaggtgtgttgatg 30034034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 37667268 - 37667040
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  37667268 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccttggtattacgacatcaaacagttcttgctgagcc 37667169  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| || |||||    
T  37667168 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatatcctgtacaagaggaacta 37667069  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37667068 tgacatggtactgttaagatgtgttgatg 37667040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 229
Target Start/End: Original strand, 25204697 - 25204884
Alignment:
Q  42 tgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagacc 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  25204697 tgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagtcgtaagtatccaccgggtgcttccaacaaagacaagaagacc 25204796  T
Q  142 ctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    |||||||||||||| | || ||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25204797 ctgagaagattggctagtaaattcctgctagatggagatattctgtacaagagaaactacgacatggtattgttaagatgtgttgatg 25204884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 42 - 229
Target Start/End: Original strand, 25268852 - 25269039
Alignment:
Q  42 tgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagacc 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  25268852 tgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagtcgtaagtatccaccgggtgcttccaacaaagacaagaagacc 25268951  T
Q  142 ctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    |||||||||||||| | || ||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25268952 ctgagaagattggctagtaaattcctgctagatggagatattctgtacaagagaaactacgacatggtattgttaagatgtgttgatg 25269039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15654537 - 15654312
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  15654537 catgtgtttgctattgaggatgtgatcgatcaggctggcgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacgtcaagcaattcttgctgagccgtg 15654438  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  15654437 agtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 15654338  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  15654337 catggtattattaagatgtgttgatg 15654312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 34620896 - 34621124
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  34620896 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactatgacatcaagcagttcttgctgagcc 34620995  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| || | |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  34620996 gtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaacta 34621095  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34621096 tgacatggtattgttaaggtgtgttgatg 34621124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18496504 - 18496279
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  18496504 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggcgaaaatgcggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccggg 18496405  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||    
T  18496404 agtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaactatga 18496305  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  18496304 catggtattattaagatgtgttgatg 18496279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 28653624 - 28653849
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  28653624 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggttggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactatgacatcaagcagttcttgctaagccgcg 28653723  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    | ||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||    
T  28653724 aatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaactatga 28653823  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  28653824 catggtattgttaagatgtgttgatg 28653849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 31822186 - 31821961
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  31822186 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactatgacatcaagcagttcttgctgagccgtg 31822087  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| || | | |||||||    || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||    
T  31822086 agtatccgccaggtacttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaactatga 31821987  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  31821986 catggtattgttaagatgtgttgatg 31821961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 43082636 - 43082861
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  43082636 catgtgtttgctattggagatgtgatcgatcaggctggtgaaaatatggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 43082735  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| || | |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||  ||    
T  43082736 agtatccgcctggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactgtga 43082835  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  43082836 catggtactgttaagatgtgttgatg 43082861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15754634 - 15754406
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15754634 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgagaatgtggttgactatagaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagcc 15754535  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| || |||||    
T  15754534 gtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagacggagatattctgtacaagaggaacta 15754435  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15754434 tgacatggtattattaagatgtgttgatg 15754406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 33520758 - 33520986
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  33520758 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatggggttgactatagaccttggtactatgacatcaagcagttcttgctgagcc 33520857  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  33520858 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaacta 33520957  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||    
T  33520958 tgacatggtattgctaagatgtgttgatg 33520986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 37759361 - 37759589
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||    
T  37759361 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggcgggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactatgacatcaaacagttcttcctgagcc 37759460  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  37759461 gtgagtatccgccgggtgcttacaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaacta 37759560  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37759561 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 37759589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13320609 - 13320384
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||    
T  13320609 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgttgttgactatagaccctggtactatgacatcaagcagttcttgttgagccgtg 13320510  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| || | |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||    
T  13320509 agtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaactatga 13320410  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  13320409 catggtattgttaagatgtgttgatg 13320384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 32592053 - 32591828
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  32592053 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 32591954  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    |||||||  ||| |||||||||    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| || ||||| ||    
T  32591953 agtatccgtcgggtgcttccaaacaagacaagaaaaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatatcctgtacaagaggaactatga 32591854  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  32591853 catggtactgttaagatgtgttgatg 32591828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 31435845 - 31436070
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  31435845 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactatgacatcaagcagttcttgctgagccgtg 31435944  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| || | |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||    
T  31435945 agtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaactatga 31436044  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||    
T  31436045 catggtactgttgaggtgtgttgatg 31436070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 37354422 - 37354197
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  37354422 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaagctggtgaaaatgtggttgactatagaccttggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 37354323  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||  |||||||||    |||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||    
T  37354322 agtatccgccgagtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaaaattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaactatga 37354223  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  37354222 catggtattgttaagatgtgttgatg 37354197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16203919 - 16203691
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16203919 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaaacagttcttgctaagcc 16203820  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  16203819 gtgagtatccaccgggtgcttccaacaaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaacta 16203720  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16203719 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 16203691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20336301 - 20336073
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20336301 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgatatcaagcagttcttgctaagcc 20336202  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20336201 gtaagtatccaccgggtgcttccaacagagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaaaagaaacta 20336102  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20336101 cgacatggtattgctaagatgtgttgatg 20336073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 20465349 - 20465577
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20465349 tcgcatgtgttcgctattggggatgtaatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagtc 20465448  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  20465449 gtgagtatccaccgggtgcttccaacagggacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagacattttgtacaaaagaaacta 20465548  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20465549 cgacatggtattgctaagatgtgttgatg 20465577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 28154109 - 28154337
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  28154109 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactatgacatcaaacagttcttgctaagcc 28154208  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  28154209 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaacta 28154308  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28154309 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 28154337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 51642591 - 51642819
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51642591 tcgcatgtgtttgctattggggatgtaatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctaagcc 51642690  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  51642691 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaacta 51642790  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51642791 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 51642819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 3645514 - 3645743
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaat-gtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagc 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  3645514 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatagtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctaagc 3645613  T
Q  100 cgtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaact 199  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  3645614 cgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaact 3645713  T
Q  200 acgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3645714 atgacatggtattgttaagatgtgttgatg 3645743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21893630 - 21893405
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  21893630 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 21893531  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  21893530 agtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaaaagaaactatga 21893431  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  21893430 catggtattgttaagatgtgttgatg 21893405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 10949450 - 10949678
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10949450 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttggctatagaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctaagcc 10949549  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  10949550 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaacta 10949649  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10949650 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 10949678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 41789192 - 41788969
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  41789192 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 41789093  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  41789092 agtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 41788993  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  41788992 catggtattgttaagatgtgttga 41788969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 10967038 - 10967266
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  10967038 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactatgacatcaagcagttcttgctaagcc 10967137  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    | || ||||| |||| |||||||||    || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  10967138 gcgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaacta 10967237  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10967238 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 10967266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 28589453 - 28589681
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  28589453 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggcgaaaatgtggttgactatagaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagcc 28589552  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| || | |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  28589553 gtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaacta 28589652  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28589653 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 28589681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22076771 - 22076543
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22076771 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 22076672  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||||    
T  22076671 gtgagtatccaccgggtgcttccaacaaagacaagaagactctgagaagattggctagtaggttcttgttagatggggacattttgtacaaaagaaacta 22076572  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22076571 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 22076543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 16287326 - 16287550
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  16287326 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatatggttgacaataaaccctggtactacgacataaaacagttcttgctaagccgtg 16287425  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  16287426 agtatccaccgggtgcttccaaca-agacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 16287524  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  16287525 catggtattgttaagatgtgttgatg 16287550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19657187 - 19656959
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||    
T  19657187 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatatggttgacaataaaccctggtactacgacatcaaacaattcttgctgagcc 19657088  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19657087 gtgagtatctgccgggtgcttccaacaaagacaagaagaccctaagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaaaagaaacta 19656988  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19656987 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 19656959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 22137280 - 22137508
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22137280 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatgaaccgtggtaccacgacatcaaacagttcttgctaagcc 22137379  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    | |||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  22137380 gagagtatccgccgggtgcttccaacaaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaacta 22137479  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22137480 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 22137508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 18795077 - 18795302
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18795077 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaagcagttcttgcggagccgtg 18795176  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  18795177 agtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 18795276  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  18795277 catggtattgttaagatgtgttgatg 18795302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27604748 - 27604523
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  27604748 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacatttcttgctgagccgtg 27604649  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  27604648 agtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaaaagaaactatga 27604549  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  27604548 catggtattgttaagatgtgttgatg 27604523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 9358995 - 9359223
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  9358995 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagcc 9359094  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| || ||||||    || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  9359095 gtgagtatccgccgggtgtttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtaaattcctgttagatggagatattctgtacaaaagaaacta 9359194  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9359195 tgacatggtactgttaagatgtgttgatg 9359223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 28357798 - 28357570
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28357798 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtattacgacatcaaacagttcttgctaagcc 28357699  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  28357698 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggcagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaacta 28357599  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||    
T  28357598 tgacatggtattgctaagatgtgttgatg 28357570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2133103 - 2132878
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  2133103 catgtgtttgctattggggatgtgattgatcaggctggcgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 2133004  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  2133003 agtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 2132904  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  2132903 catggtattgttaagatgtgttgatg 2132878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 19692471 - 19692696
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19692471 catgtgtttgctattggggatgtgatcgaccaggctggtgaaaatgcggttgactatagaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctaagccgtg 19692570  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    |||||||  ||| ||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  19692571 agtatccgtcgggtgcttccaaccaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 19692670  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  19692671 catggtattgttaagatgtgttgatg 19692696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19913005 - 19912780
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  19913005 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactatgatatcaaacagttcttgctgagccgtg 19912906  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| || | ||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  19912905 agtatccgccaggtgcttccaaccaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 19912806  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  19912805 catggtattgttaagatgtgttgatg 19912780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 33263107 - 33263332
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  33263107 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactgtaaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 33263206  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||| ||    
T  33263207 agtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatgttctgtacaagagaaactatga 33263306  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  33263307 catggtattgttaagatgtgttgatg 33263332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 15771947 - 15772172
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15771947 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccttggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 15772046  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  15772047 agtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccaatagattcctgctagatggagatattctgtacaagagaaactatga 15772146  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15772147 catggtactgttaagatgtgttgatg 15772172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21344014 - 21343789
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||| | ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  21344014 catgtgcttgctattgagaatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtattacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 21343915  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  21343914 agtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 21343815  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  21343814 catggtatttttaagatgtgttgatg 21343789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 44565357 - 44565582
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44565357 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggcgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctaagccgtg 44565456  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    |||||||  ||| |||||||||    |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  44565457 agtatccgtcgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaatattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 44565556  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  44565557 catggtattattaagatgtgttgatg 44565582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 29833695 - 29833923
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  29833695 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccttggtactacgacatcaaacagttcttgctgagcc 29833794  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  29833795 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattttgtacaagaggaacta 29833894  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29833895 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 29833923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 14561997 - 14562222
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  14561997 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaagtgtggttggctataaaccttggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 14562096  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| || | ||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  14562097 agtatccgccaggtgcctccaaccaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcatgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 14562196  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  14562197 catggtattgttaagatgtgttgatg 14562222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 18713857 - 18714082
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  18713857 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaatagttcttgctgagccgtg 18713956  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    |||||||  ||| |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  18713957 agtatccgtcgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcatgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 18714056  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  18714057 catggtattgctaagatgtgttgatg 18714082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 33246743 - 33246968
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  33246743 catgtgtttgctattggggatgtgatcgaccaggctggtgaaaatgtggtcgactataaaccctagtactacgacatcaaacagttcttactgagccgtg 33246842  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  33246843 agtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 33246942  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  33246943 catggtattgttaagatgtgttgatg 33246968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 19678817 - 19679045
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  19678817 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactatgacatcaagcagttcttgctgagcc 19678916  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| || | |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  19678917 gtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaacta 19679016  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19679017 tgacatggtattgttaaggtgtgttgatg 19679045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 31358898 - 31359126
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  31358898 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccttggtattatgacatcaagcagttcttgctgagcc 31358997  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    || ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  31358998 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaaaaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaacta 31359097  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31359098 tgacatggtattgttaaggtgtgttgatg 31359126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12088566 - 12088341
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12088566 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaagctggtgaaaatgtggttgactatagaccttggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 12088467  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||  |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  12088466 agtatccgccgagtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 12088367  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  12088366 catggtattgttaagatgtgttgatg 12088341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 31485714 - 31485489
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  31485714 catgtgtttgctattggggatgtaatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 31485615  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| || | |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||    
T  31485614 agtatccgccaggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaactatga 31485515  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  31485514 catggtattgttaaggtgtgttgatg 31485489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19204208 - 19203980
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  19204208 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactatgacatcaagcagttcttgctaagcc 19204109  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    | || ||||| || | |||||||||    || |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  19204108 gcgaatatccgccaggtgcttccaaacaagataagaagaccctgaggagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaacta 19204009  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19204008 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 19203980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 174; Significance: 9e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 31667 - 31892
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  31667 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatatggttgacaataaaccctggtactacgacataaaacagttcttgctaagccgtg 31766  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  31767 agtatccaccgggtgcttccaacaaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 31866  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  31867 catggtattgttaagatgtgttgatg 31892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 8334 - 8559
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  8334 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggcgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 8433  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  8434 agtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcatgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 8533  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  8534 catggtattgttaagatgtgttgatg 8559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 169; Significance: 9e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 23487 - 23715
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23487 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaagatggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 23586  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||||    
T  23587 gtgagtatccaccgggtgcttccaacaaagacaagaagactctgagaagattggctagtaggttcttgttagatggggacattttgtacaaaagaaacta 23686  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||    
T  23687 caacatggtattgttaagatgtgttgatg 23715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 226
Target Start/End: Original strand, 20842286 - 20842508
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20842286 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctaagccgtg 20842385  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    |||||||  ||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  20842386 agtatccgtcgggtgctttcaacaaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaaaagaaactatga 20842485  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20842486 catggtattgttaagatgtgttg 20842508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19452297 - 19452069
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19452297 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 19452198  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    ||| ||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | ||||||||  | ||| ||||||| ||||||||    
T  19452197 gtgggtatccgtcgggtgcttccaacaaagacaagaagaccctgagaagattggctagtaggttcttattagatggggacattttgtacaagagaaacta 19452098  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19452097 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 19452069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21699045 - 21698817
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||  || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21699045 tcgcatgtgttcgctattgaagatatgatcagtcgggctgatgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 21698946  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  21698945 gtgagtatccaccggatgcttccaacaaagacaagaagaccctgaggagattggccagtagatttctgttagatggagacattttgtacaaaagaaacta 21698846  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21698845 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 21698817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 27780604 - 27780832
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27780604 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggcgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctaagcc 27780703  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  27780704 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaacta 27780803  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27780804 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 27780832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 27820361 - 27820589
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27820361 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggcgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctaagcc 27820460  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  27820461 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaacta 27820560  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27820561 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 27820589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27430312 - 27430087
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27430312 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggcgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctaagccgtg 27430213  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    |||||||  ||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  27430212 agtatccgtcgggtgcttccaacaaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 27430113  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  27430112 catggtattgttaagatgtgttgatg 27430087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19412372 - 19412147
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19412372 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggcgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 19412273  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  19412272 agtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 19412173  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  19412172 catggtattgttaagatgtgttgatg 19412147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 12591178 - 12591406
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12591178 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagcc 12591277  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| || | |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  12591278 gtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaacta 12591377  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12591378 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 12591406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 256524 - 256299
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  256524 catgtgtttgctattggggatgtggtcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactatgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 256425  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  256424 agtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattttgtacaagagaaactatga 256325  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  256324 catggtattgttaagatgtgttgatg 256299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 37681766 - 37681541
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  37681766 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagtcgtg 37681667  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  37681666 agtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 37681567  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  37681566 catggtattgttaagatgtgttgatg 37681541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 37697031 - 37696806
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  37697031 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagtcgtg 37696932  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  37696931 agtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 37696832  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  37696831 catggtattgttaagatgtgttgatg 37696806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 27808073 - 27808301
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  27808073 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgaacc 27808172  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| || | |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  27808173 gtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaacta 27808272  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27808273 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 27808301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11631057 - 11630830
Alignment:
Q  2 cgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccg 101  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  11631057 cgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtattatgacatcaaacagttcttgctgagccg 11630958  T
Q  102 tgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactac 201  Q
    ||||||||| || | |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||     
T  11630957 tgagtatccgccaggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactat 11630858  T
Q  202 gacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11630857 gacatggtattgttaagatgtgttgatg 11630830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 3786866 - 3787091
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  3786866 catgtgtttgctattggggatgtgaccgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttactaagncgtg 3786965  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  3786966 agtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactacga 3787065  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  3787066 catggtattgttaaggtgtgttgatg 3787091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9345857 - 9345632
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9345857 catgtgtttgctattggagatatgatcgatcaggctggtgaaaatatggttgactataaaccctggtactatgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 9345758  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||    
T  9345757 agtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaaaaggaactatga 9345658  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  9345657 catggtactgttaagatgtgttgatg 9345632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 12659909 - 12660134
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12659909 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggtcgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 12660008  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| || | ||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  12660009 agtatccgccaggtgcttccaaccaagacaagaagaccctgaggagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 12660108  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  12660109 catggtattgttaaggtgtgttgatg 12660134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 28886652 - 28886877
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  28886652 catgtgtttgctattggggatgtgattgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 28886751  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  28886752 agtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 28886851  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  28886852 catggtatggttaagatgtgttgatg 28886877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 32054176 - 32054401
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  32054176 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactatgacatcaagcagttcttgctgagccgtg 32054275  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||    
T  32054276 agtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggaaatattctgtacaagaggaactatga 32054375  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  32054376 catggtattgttaaggtgtgttgatg 32054401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 34866057 - 34866282
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34866057 catgtgtttgctattggagatgtgatcgatcgggctggtgaaaatatggttgactataaaccctggtactatgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 34866156  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||    
T  34866157 agtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctatacaaaaggaactacga 34866256  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  34866257 catggtattgttaagatgtgttgatg 34866282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 37929742 - 37929967
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  37929742 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactatgacatcaagcagttcttgctgagccgtg 37929841  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||    
T  37929842 agtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggaaatattctgtacaagaggaactatga 37929941  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  37929942 catggtattgttaaggtgtgttgatg 37929967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 27120894 - 27121122
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27120894 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgattgatcaagctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagcc 27120993  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  27120994 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaacta 27121093  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27121094 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 27121122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 34159214 - 34159442
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  34159214 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggcgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagcc 34159313  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
     ||||||||| |||| |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  34159314 atgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaacta 34159413  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159414 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 34159442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 34295524 - 34295752
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  34295524 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggcgaaaatgtggttgactataaactctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagcc 34295623  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  34295624 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagagtcctgttagatggagatattctgtacaagagaaacta 34295723  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34295724 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 34295752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23124440 - 23124215
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  23124440 catgtgtttgctattggggatgtgaccgatcaggctggcgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 23124341  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  23124340 agtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaaaaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 23124241  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  23124240 catggtattgttaagatgtgttgatg 23124215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 31889362 - 31889141
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  31889362 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 31889263  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| || | |||||||||    |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  31889262 agtatccgcctggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattagccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 31889163  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgtt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  31889162 catggtattgttaagatgtgtt 31889141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 37382050 - 37382275
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  37382050 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggcgaaaatgtggttgactataaaccctggtactatgacatcaaacagttcttgctaagccgtg 37382149  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| | |||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  37382150 agtatccgccgggtacttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 37382249  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  37382250 catggtattattaagatgtgttgatg 37382275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12712475 - 12712247
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  12712475 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactatgacatcaagcagttcttgctgagcc 12712376  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| || | |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  12712375 gtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaacta 12712276  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12712275 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 12712247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22924022 - 22923794
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  22924022 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccttggtattatgacatcaagcagttcttgctgagcc 22923923  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  22923922 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaacta 22923823  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22923822 tgacatggtattgttaaggtgtgttgatg 22923794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13932418 - 13932193
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  13932418 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggcgggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagtcgtg 13932319  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  13932318 agtatccgccgggtgcttccaagcaagacaagaagaccttgagaagattggccagcagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 13932219  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  13932218 catggtattgttaagatgtgttgatg 13932193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 16165853 - 16166078
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | | |||    
T  16165853 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgaactgtg 16165952  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| ||   |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  16165953 agtatccgccaagtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 16166052  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  16166053 catggtattgttaagatgtgttgatg 16166078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 37947733 - 37947508
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  37947733 catgtgtttgctattggggatgtggtcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactacgacatcaaacagtttttgctgagccgtg 37947634  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  37947633 agtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 37947534  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  37947533 catggtattgttaagatgtgttgatg 37947508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 40237881 - 40238106
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  40237881 catgtgtttgctattggagatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactatgacatcaagcagttcttgctaagccgcg 40237980  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    | ||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  40237981 aatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 40238080  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  40238081 catggtattgttaagatgtgttgatg 40238106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 31880659 - 31880884
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  31880659 catgtgtttgctattggggatgtaatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactatgacatcaaacagttcttgctaaaccgtg 31880758  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    |||||||  | | |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||    
T  31880759 agtatccgacaggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaaatattctgtacaagaggaactatga 31880858  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  31880859 catggtattgttaagatgtgttgatg 31880884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 34270791 - 34270566
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  34270791 catgtgtttgatattggggatgtgatcgatcaggctggtgagaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttactgagccgtg 34270692  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    |||||||  ||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||| ||    
T  34270691 agtatccgtcgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagacactatga 34270592  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  34270591 catggtattgttaagatgtgttgatg 34270566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 39894442 - 39894667
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  39894442 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactatgacatcaagtagttcttgctgagccgtg 39894541  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    | ||||| || | |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  39894542 aatatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 39894641  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  39894642 catggtattattaagatgtgttgatg 39894667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16825212 - 16824984
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  16825212 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatggggttgactatagaccttggtactatgacatcaagcagttcttgctgagcc 16825113  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  16825112 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaacta 16825013  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||    
T  16825012 tgacatggtattgctaagatgtgttgatg 16824984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 16896268 - 16896496
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  16896268 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatggggttgactatagaccttggtactatgacatcaagcagttcttgctgagcc 16896367  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  16896368 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaacta 16896467  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||    
T  16896468 tgacatggtattgctaagatgtgttgatg 16896496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21673049 - 21672821
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  21673049 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactatgacatcaagcagttcttgctgagcc 21672950  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||| ||||| || | |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||| ||||||| || |||||    
T  21672949 gtgaatatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggaggtattctgtacaagaggaacta 21672850  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21672849 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 21672821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 39047690 - 39047465
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  39047690 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 39047591  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    |||||||  ||| |||||||||    |||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| || ||||| ||    
T  39047590 agtatccgtcgggtgcttccaaacaagacaagaaaaccttgagaaggttggccagtagattcctgttagatggagatatcctgtacaagaggaactatga 39047491  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  39047490 catggtactgttaagatgtgttgatg 39047465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 27395932 - 27396002
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggta 71  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27395932 tcgcatgtgttcgctattgcggatgtgatcaatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggta 27396002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 10416 - 10644
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10416 tcgcttgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataagccctggtattacgtcatcaagcagttcttgctaagcc 10515  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  10516 gtgagtatccgccgggtgcttccaactaagacaagaagactctgagaagattggctagtaggttcttgttagatggagatattctgtataaaagaaacta 10615  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10616 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 10644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 29 - 257
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  29 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactatgacatcaagcagttcttgctgagcc 128  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| || | |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  129 gtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaacta 228  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  229 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 26)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15278512 - 15278284
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15278512 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaaacagttcttgctaagcc 15278413  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||| | ||||||||  | ||| ||||||| ||||||||    
T  15278412 gtgagtatccaccgggtgcttccaacaaagacaagaagactctgagaagattggctagtaggttcttattagatggggacattttgtacaagagaaacta 15278313  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||    
T  15278312 caacatggtattgttaagatgtgttgatg 15278284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18796496 - 18796271
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796496 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactatgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 18796397  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  18796396 agtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaaaaggaactacga 18796297  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  18796296 catggtactgttaagatgtgttgatg 18796271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15382118 - 15381890
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  15382118 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtgtttcgacatcaagcagttcttgataagcc 15382019  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||| | ||||||||  | ||| ||||||||||||||||    
T  15382018 gtgagtatccaccaggtgcttccaacaaagacaagaagactctgagaagattggctagtaggttctttttagatggggacattttgtacaaaagaaacta 15381919  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15381918 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 15381890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 43 - 229
Target Start/End: Original strand, 15232242 - 15232428
Alignment:
Q  43 gaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccc 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  15232242 gaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaacaaagacaagaagaccc 15232341  T
Q  143 tgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15232342 tgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattttgtacaagagaaactacgacatggtattgttaagatgtgttgatg 15232428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 14669400 - 14669625
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  14669400 catgtgtttactattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 14669499  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| ||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  14669500 agtatccgccgggtgcttccaaccaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 14669599  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  14669600 catggtattgttaagatgtgttgatg 14669625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 40101519 - 40101294
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40101519 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctaagccgtg 40101420  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  40101419 agtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 40101320  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  40101319 catggtattgttaagatgtgttgatg 40101294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 17017433 - 17017658
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  17017433 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggcgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 17017532  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  17017533 agtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 17017632  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  17017633 catggtattgttaagatgtgttgatg 17017658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 34184842 - 34184617
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||    
T  34184842 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgaaccgtg 34184743  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| || | |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  34184742 agtatccgccaggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaaaagaaactatga 34184643  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  34184642 catggtattgttaagatgtgttgatg 34184617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 54837778 - 54838003
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  54837778 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 54837877  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  54837878 agtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattttgtacaagagaaactatga 54837977  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  54837978 catggtattgttaagatgtgttgatg 54838003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20334303 - 20334078
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  20334303 catgtgtttgctattggggatgtggtcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 20334204  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  20334203 agtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 20334104  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  20334103 catggtattgttaagatgtgttgatg 20334078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24588243 - 24588018
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24588243 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggcgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 24588144  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  24588143 agtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaaggccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 24588044  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  24588043 catggtattgttaagatgtgttgatg 24588018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 30758147 - 30758372
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  30758147 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttactaagccgtg 30758246  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  30758247 agtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattccggttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 30758346  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  30758347 catggtattgttaaggtgtgttgatg 30758372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 33669682 - 33669457
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33669682 catgtgtttgctattggggatgtgatcgaccaggctggtgaaaatgcggttgactatagaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctaagccgtg 33669583  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    |||||||  ||| ||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  33669582 agtatccgtcgggtgcttccaaccaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 33669483  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  33669482 catggtattgttaagatgtgttgatg 33669457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18313063 - 18312835
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18313063 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagcc 18312964  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  18312963 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaacta 18312864  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18312863 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 18312835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 6574245 - 6574470
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6574245 catgtgtttgctattggggacgtgatcgatcaggctggtgaaaatggggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 6574344  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||    
T  6574345 agtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaactatga 6574444  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  6574445 catggtattgttaagatgtgttgatg 6574470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 36340399 - 36340174
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  36340399 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggcgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 36340300  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| || ||||| ||    
T  36340299 agtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatatcctgtacaagaggaactatga 36340200  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  36340199 catggtattgttaagatgtgttgatg 36340174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 14102927 - 14103155
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14102927 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggcgaaaatgtggttgactatagaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagcc 14103026  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  14103027 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaacta 14103126  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14103127 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 14103155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14755374 - 14755149
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  14755374 catgtgtttgctattggggatgtggtcgatcaggctggcgaaaatgtggctgactataaaccctggtactacgacatcaagcagttcttgctgagccatg 14755275  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  14755274 agtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 14755175  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  14755174 catggtattgttaagatgtgttgatg 14755149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 39855024 - 39855249
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  39855024 catgtgtttgctattggagatgtgatcgatcaggctggtgaaaacgtggttgactatagaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 39855123  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| || | |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  39855124 agtatccgcctggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 39855223  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  39855224 catggtgttgttaagatgtgttgatg 39855249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 5010262 - 5010487
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5010262 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagactctggtattatgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 5010361  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    | ||||| |||| |||||||||    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  5010362 aatatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagactctgagaagattggccagcagattcctgatagatggagatattctgtacaagagaaactatga 5010461  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  5010462 catggtattgttaagatgtgttgatg 5010487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 21974085 - 21974313
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  21974085 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatggggttgactatagaccttggtactatgacatcaagcagttcttgctgagcc 21974184  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  21974185 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaacta 21974284  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||    
T  21974285 tgacatggtattgctaagatgtgttgatg 21974313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 31122397 - 31122169
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  31122397 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatggggttgactatagaccttggtactatgacatcaagcagttcttgctgagcc 31122298  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  31122297 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaacta 31122198  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||    
T  31122197 tgacatggtattgctaagatgtgttgatg 31122169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 5698922 - 5699147
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  5698922 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtgattgactatagaccctggtactatgacatcaagcagttcttgctgagccgtg 5699021  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| || | |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||    
T  5699022 agtatccgccaggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaactatga 5699121  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  5699122 catggtattgttaaggtgtgttgatg 5699147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 24117049 - 24117274
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24117049 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggcgaaaatgtggttaactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 24117148  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    |||||||  ||| |||||||||    ||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  24117149 agtatccgtcgggtgcttccaaacaagacaagaggactttgagaagattggccagtagattcctgttagatggggatattctgtacaagagaaactatga 24117248  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  24117249 catggtattgttaagatgtgttgatg 24117274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27159199 - 27158974
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  27159199 catgtgtttgctattggagatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactatgacatcaagcagttcttgctaagccgcg 27159100  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    | ||||| |||| |||||||||    || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| || ||||| ||    
T  27159099 aatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatatcctgtacaagaggaactatga 27159000  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  27158999 catggtactgttaagatgtgttgatg 27158974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 42 - 229
Target Start/End: Original strand, 1904679 - 1904866
Alignment:
Q  42 tgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagacc 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||     
T  1904679 tgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcctgctaagccatgagtatccaccgggtgcttccaacaaagacaagaagact 1904778  T
Q  142 ctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    |||||||||||||| | ||| ||| | ||||||||  | ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1904779 ctgagaagattggctagtaggttcttattagatggggacattttgtacaagagaaactacaacatggtattgttaagatgtgttgatg 1904866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 57)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 31032164 - 31031936
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  31032164 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcagaccggtgaaaatatggttgacagtaaaccctggtattatgacatcaagcagttcttgctaagct 31032065  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    || ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  31032064 gtaagtatccaccgggagcttccaacaaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaacta 31031965  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31031964 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 31031936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15888630 - 15888405
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15888630 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctaagccgtg 15888531  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| ||||||||||   || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  15888530 agtatccgccgggtgcttccaaccaagataagaagaccctgagcagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 15888431  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  15888430 catagtattgttaagatgtgttgatg 15888405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 19698822 - 19699050
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  19698822 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgataataaaccctggtattacgataacaagcagttcttgctaagcc 19698921  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
      ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||| | ||| ||||||| ||||||||    
T  19698922 acgagtatccaccgggtgcttccaacaaagacaagaagaccctgagaagattggccagtaaattcttgctagatggagacattttgtacaagagaaacta 19699021  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||    
T  19699022 caacatggtattgttaagatgtgttgatg 19699050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 21679035 - 21679263
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  21679035 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagcc 21679134  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  21679135 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaacta 21679234  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21679235 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 21679263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 35885098 - 35885326
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35885098 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctagtactacgacatcaaacagttcttgctaagcc 35885197  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  35885198 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaacta 35885297  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35885298 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 35885326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 4421250 - 4421475
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4421250 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 4421349  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  4421350 agtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 4421449  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  4421450 catggtattgttaagatgtgttgatg 4421475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4792560 - 4792335
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  4792560 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaagcagttcttgcggagccgtg 4792461  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  4792460 agtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 4792361  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  4792360 catggtattgttaagatgtgttgatg 4792335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 6206239 - 6206464
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6206239 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 6206338  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  6206339 agtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattttgtacaagagaaactatga 6206438  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  6206439 catggtattgttaagatgtgttgatg 6206464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 32443486 - 32443711
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  32443486 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 32443585  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  32443586 agtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 32443685  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  32443686 catggtattgttaagatgtgttgatg 32443711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 28111882 - 28111654
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  28111882 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtattatgacatcaaacagttcttgctgagcc 28111783  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  28111782 gtgagtatccgccggttgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagcagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaacta 28111683  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||    
T  28111682 tgacatggtgttgttaagatgtgttgatg 28111654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 4725965 - 4726190
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4725965 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 4726064  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| | || |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  4726065 agtatccgctgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 4726164  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  4726165 catggtattgttaagatgtgttgatg 4726190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8285395 - 8285170
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  8285395 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 8285296  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| || | ||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| || ||    
T  8285295 agtatccgccaggtgcttccaaccaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaattatga 8285196  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  8285195 catggtattgttaagatgtgttgatg 8285170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 18334965 - 18335190
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18334965 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggcgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctaagccgtg 18335064  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| || | |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  18335065 agtatccgcctggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggggatattctgtacaagagaaactatga 18335164  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  18335165 catggtattgttaagatgtgttgatg 18335190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 8000892 - 8001120
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  8000892 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgagaatgtggttgactatagaccctggtactatgacatcaagcagttcttgctgagcc 8000991  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| || | |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  8000992 gtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaacta 8001091  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8001092 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 8001120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 10647405 - 10647633
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  10647405 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgagaatgtggttgactatagaccctggtactatgacatcaagcagttcttgctgagcc 10647504  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| || | |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  10647505 gtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaacta 10647604  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10647605 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 10647633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17972789 - 17972561
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  17972789 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtattacgacattaaacagttcttgctgagcc 17972690  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  17972689 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccccgagaagattggccagcagatttctgttagatggagatattatgtacaagagaaacta 17972590  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||    
T  17972589 tgacatggtgttgttaagatgtgttgatg 17972561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 29660898 - 29660670
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  29660898 tcgcatgtatttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagcc 29660799  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  29660798 gtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaacta 29660699  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29660698 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 29660670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 32294960 - 32295188
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  32294960 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagcc 32295059  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| || | |||||||||    || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  32295060 gtgagtatccgcctggtgcttccaaacaagataagaagaccctaagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaacta 32295159  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32295160 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 32295188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 48470259 - 48470487
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  48470259 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactatgacatcaaacagttcttgctaagcc 48470358  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| | |||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  48470359 gtgagtatccgccgggtacttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaacta 48470458  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||    
T  48470459 tgacatggtattgctaagatgtgttgatg 48470487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 4687990 - 4688215
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4687990 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcgggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctaagccgtg 4688089  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    |||||||  ||| ||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  4688090 agtatccgtcgggtgcttccaaccaagataagaagaccctgagaagattgaccagtagattcctgttagacggagatattctgtacaagagaaactatga 4688189  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  4688190 catggtattgttaagatgtgttgatg 4688215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 5715408 - 5715633
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5715408 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 5715507  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    |||||||  ||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  5715508 agtatccgtcgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 5715607  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  5715608 catggtattgttaagatgtgttgatg 5715633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 5726318 - 5726543
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5726318 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 5726417  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    |||||||  ||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  5726418 agtatccgtcgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 5726517  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  5726518 catggtattgttaagatgtgttgatg 5726543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5766050 - 5765825
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5766050 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 5765951  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    |||||||  ||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  5765950 agtatccgtcgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 5765851  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  5765850 catggtattgttaagatgtgttgatg 5765825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22383503 - 22383278
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22383503 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggcgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 22383404  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| || | |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  22383403 agtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 22383304  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  22383303 catggtattgttaagatgtgttgatg 22383278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 28343512 - 28343737
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  28343512 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccttggtattatgacatcaagcagttcttgctgagccgtg 28343611  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  28343612 agtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 28343711  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  28343712 catggtattgttaagatgtgttgatg 28343737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6538670 - 6538442
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  6538670 tcgcatgtgtttgctattgggggtgtgattgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagcc 6538571  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  6538570 gtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaacta 6538471  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6538470 tgacatggtattattaagatgtgttgatg 6538442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 7077538 - 7077766
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7077538 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggcgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaagcagttcttgctgagcc 7077637  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||    
T  7077638 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggctagtagatttctgttagatggggatattctgtacaagagaaacta 7077737  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7077738 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 7077766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15737018 - 15736794
Alignment:
Q  5 atgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtga 104  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15737018 atgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggcgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtga 15736919  T
Q  105 gtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacgac 204  Q
    |||||| | || |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||    
T  15736918 gtatccgctgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatgac 15736819  T
Q  205 atggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  15736818 atggtattgttaagatgtgttgatg 15736794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 47027785 - 47028013
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47027785 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttggctatagaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctaagcc 47027884  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  47027885 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaacta 47027984  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47027985 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 47028013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 18055597 - 18055822
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  18055597 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggcgaaaatgtggttgactataaaccttggtactacgacatcaaacagttcttgctgagtcgtg 18055696  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  18055697 agtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 18055796  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  18055797 catggtattgttaagatgtgttgatg 18055822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 29144681 - 29144456
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  29144681 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggcgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 29144582  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| || | |||||||||    || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  29144581 agtatccgccaggtgcttccaaacaagataagaagaccctgaggagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 29144482  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  29144481 catggtattgttaagatgtgttgatg 29144456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 5471320 - 5471548
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  5471320 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactatgacatcaagcagttcttgctaagcc 5471419  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    | || ||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  5471420 gcgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaacta 5471519  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5471520 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 5471548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5605242 - 5605014
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  5605242 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccttggtattatgacatcaagcagttcttgctgagcc 5605143  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  5605142 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaacta 5605043  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5605042 tgacatggtattgttaaggtgtgttgatg 5605014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 20070372 - 20070600
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20070372 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgcggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagcc 20070471  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  20070472 gtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaacta 20070571  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  20070572 tgacatggtgttgttaagatgtgtcgatg 20070600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 24332495 - 24332723
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  24332495 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactatgacatcaagcagttcttgctaagcc 24332594  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    | || ||||| |||| |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  24332595 gcgaatatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaacta 24332694  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24332695 tgacatggtattgttaaggtgtgttgatg 24332723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 31960383 - 31960155
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  31960383 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccttggtattatgacatcaagcagttcttgctgagcc 31960284  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  31960283 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaacta 31960184  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31960183 tgacatggtattgttaaggtgtgttgatg 31960155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11106284 - 11106059
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  11106284 catgtgtttgctattggggatgtggtcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactacagaccctggtactatgacatcaagcagttcttgctgagccgtg 11106185  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| | || |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  11106184 agtatccgctgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 11106085  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  11106084 catggtattgttaagatgtgttgatg 11106059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20572768 - 20572543
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  20572768 catgtatttgctattggggatgtggtcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 20572669  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  20572668 agtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 20572569  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  20572568 catggtattgttaagatgtgttgatg 20572543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 28025616 - 28025841
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  28025616 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 28025715  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||| ||    
T  28025716 agtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggggatattctgtacaagaggaactatga 28025815  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  28025816 catggtactgttaagatgtgttgatg 28025841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 51786358 - 51786583
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  51786358 catgtgtttgctattggggacgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactatgacatcaagcagttcttgctgagccgtg 51786457  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| || | |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||| ||    
T  51786458 agtatccgccaggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagagattctgtacaagagaaactatga 51786557  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  51786558 catggtattgttaagatgtgttgatg 51786583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 5018046 - 5018274
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||    
T  5018046 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactgtaaaccctggtactatgacatcaaacagttcttgctgagcc 5018145  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
     ||||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  5018146 atgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaacta 5018245  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5018246 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 5018274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5592285 - 5592057
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  5592285 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactatgacatcaagcagttcttgctaagcc 5592186  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    | || ||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  5592185 gcgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaacta 5592086  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||    
T  5592085 tgacatggtgttgttaagatgtgttgatg 5592057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 18247073 - 18247301
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18247073 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccttggtactacgacatcaaacagttcttgctgagcc 18247172  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||  |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  18247173 gtgagtatccgccgagtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattttgtacaagaggaacta 18247272  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18247273 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 18247301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4342601 - 4342376
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4342601 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 4342502  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    |||||||  ||| |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||    
T  4342501 agtatccgtcgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaactatga 4342402  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  4342401 catggtattgttaaggtgtgttgatg 4342376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 4628120 - 4628345
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||    
T  4628120 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactatgacatcaaacagttcttgctgagtcgtg 4628219  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||   ||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||    
T  4628220 agtatccgccgggtgcttccaaacaggataggaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaactatga 4628319  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  4628320 catggtattgttaagatgtgttgatg 4628345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18288278 - 18288053
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||    
T  18288278 catgtgtttgctattggggatgtggtcgatcaggctggcgaaaatgtggctgactataaaccctggtactatgacatcaagcagttcttgctgagccatg 18288179  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  18288178 agtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 18288079  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  18288078 catggtattgttaagatgtgttgatg 18288053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18303579 - 18303354
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||    
T  18303579 catgtgtttgctattggggatgtggtcgatcaggctggcgaaaatgtggctgactataaaccctggtactatgacatcaagcagttcttgctgagccatg 18303480  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  18303479 agtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 18303380  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  18303379 catggtattgttaagatgtgttgatg 18303354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 10400479 - 10400704
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  10400479 catgtgtttgctattgaggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 10400578  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    |||||||  ||| |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| || ||||| ||    
T  10400579 agtatccgtcgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatatcctgtacaagaggaactatga 10400678  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  10400679 catggtactgttaagatgtgttgatg 10400704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 18229528 - 18229756
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  18229528 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatggggttgactatagaccttggtactatgacatcaagcagttcttgctgagcc 18229627  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  18229628 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaacta 18229727  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  18229728 tgacatggtattgataaggtgtgttgatg 18229756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17980877 - 17980649
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  17980877 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgggtttgactatagaccttggtactatgacatcaagcagttcttgctgagcc 17980778  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  17980777 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaacta 17980678  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  17980677 tgacatggtattgataaggtgtgttgatg 17980649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22866776 - 22866548
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  22866776 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatggggttgactatagaccttggtactatgacatcaagcagttcttgctgagcc 22866677  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| || | |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||| ||||||| || |||||    
T  22866676 gtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatagagatattctgtacaagaggaacta 22866577  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22866576 tgacatggtattgttaaggtgtgttgatg 22866548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22881835 - 22881607
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  22881835 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatggggttgactatagaccttggtactatgacatcaagcagttcttgctgagcc 22881736  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| || | |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||| ||||||| || |||||    
T  22881735 gtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatagagatattctgtacaagaggaacta 22881636  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22881635 tgacatggtattgttaaggtgtgttgatg 22881607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 46 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16620373 - 16620190
Alignment:
Q  46 aatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctga 145  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16620373 aatgtggttgacgatagaccatggtattacgacaccaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaacaaagacaagaagaccctga 16620274  T
Q  146 gaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||   ||| ||| ||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16620273 gaagattggctggtaggttcttgttagatggggacattttgtacaaaagaaactacgacatggtattgttaagatgtgttgatg 16620190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 5654417 - 5654581
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  5654417 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgacaatgaaccgtggtaccacgacatcaaacagttcttgctaagcc 5654516  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattc 165  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  5654517 gtgagtatccgccgggtgcttccaacaaagacaagaagaccctgagaagattggccggtagattc 5654581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 157
Target Start/End: Original strand, 8216070 - 8216223
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  8216070 catgtgtttgctattggggatgtgattgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 8216169  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggcca 157  Q
    |||||||  ||| |||||||||    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  8216170 agtatccgtcgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggcca 8216223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Original strand, 8300306 - 8300385
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaa 83  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  8300306 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggcgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaa 8300385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 160 - 229
Target Start/End: Original strand, 5656625 - 5656694
Alignment:
Q  160 agattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    |||||| || |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5656625 agattcttgctagatggaaacattttgtacaagagaaactacgacatgatattgttaagatgtgttgatg 5656694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 45)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27625536 - 27625311
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27625536 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtattacgacatcaaacagttcttgctaagccgtg 27625437  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| || | |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  27625436 agtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttggatggagatattctgtacaaaagaaactatga 27625337  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  27625336 catggtattgttaagatgtgttgatg 27625311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14141222 - 14140994
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14141222 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggcgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctaagcc 14141123  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  14141122 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaacta 14141023  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14141022 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 14140994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27286192 - 27285964
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  27286192 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcaggccggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattatgatatcaagcagttcttgctaagcc 27286093  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    || |||| ||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  27286092 gtaagtacccaccaggtgcttccaacaaagacaagaagaccctgagaagattggccagtaaattccttttagatggggatattctgtacaaaagaaacta 27285993  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27285992 cgacatggtattgttgagatgtgttgatg 27285964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27357938 - 27357710
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27357938 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggcgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctaagcc 27357839  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  27357838 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaacta 27357739  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27357738 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 27357710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 24868087 - 24868312
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24868087 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatggggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctaagccgtg 24868186  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    |||||||  ||| ||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  24868187 agtatccgtcgggtgcttccaaccaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaaaagaaactatga 24868286  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  24868287 catggtattgttaagatgtgttgatg 24868312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 27023508 - 27023733
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27023508 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaagcagttcttgctgagccgtg 27023607  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||  |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  27023608 agtatcagccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattatgtacaagagaaactatga 27023707  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  27023708 catggtattgttaagatgtgttgatg 27023733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26774455 - 26774227
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  26774455 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagcc 26774356  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  26774355 gtgagtatccgccgggtgcttccaagcaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaacta 26774256  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26774255 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 26774227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 26922745 - 26922973
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  26922745 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttggctataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagcc 26922844  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  26922845 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaacta 26922944  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26922945 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 26922973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 28164859 - 28165087
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||    
T  28164859 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggcgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgttgagcc 28164958  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  28164959 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaacta 28165058  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28165059 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 28165087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 29553925 - 29554153
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29553925 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggcgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaagcagttcttgctgagcc 29554024  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    | |||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  29554025 gcgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaacta 29554124  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29554125 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 29554153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 29577382 - 29577610
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  29577382 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtattacgacattaaacagttcttgctgagcc 29577481  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  29577482 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagcagatttctgttagatggagatattatgtacaagagaaacta 29577581  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||    
T  29577582 tgacatggtgttgttaagatgtgttgatg 29577610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 27183300 - 27183525
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  27183300 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtattacgacatcaaacagttcttgttgagccgtg 27183399  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    |||||||  ||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  27183400 agtatccgtcgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 27183499  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  27183500 catggtattgttaagatgtgttgatg 27183525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27265939 - 27265714
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  27265939 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtattacgacatcaaacagttcttgttgagccgtg 27265840  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    |||||||  ||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  27265839 agtatccgtcgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 27265740  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  27265739 catggtattgttaagatgtgttgatg 27265714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 16754189 - 16754417
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16754189 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggcaaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagcc 16754288  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  16754289 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaacta 16754388  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16754389 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 16754417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4541599 - 4541374
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  4541599 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggcgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacggttcttgctgagccgtg 4541500  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  4541499 agtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 4541400  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  4541399 catggtattgttaagatgtgttgatg 4541374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8901528 - 8901303
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  8901528 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 8901429  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    | |||||  ||| |||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  8901428 aatatccgtcgggtgcttccaagcaggataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 8901329  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  8901328 catggtattgttaagatgtgttgatg 8901303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13294776 - 13294551
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  13294776 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggcgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 13294677  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||| | ||   ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  13294676 agtattcgccaagtgcttccaaccaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaaaagaaactatga 13294577  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13294576 catggtattattaagatgtgttgatg 13294551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22930709 - 22930484
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  22930709 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcgaacagttcttgctgagccgtg 22930610  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  22930609 agtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 22930510  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22930509 catggtattgttaaggtgtgttgatg 22930484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23853154 - 23852929
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  23853154 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcgaacagttcttgctgagccgtg 23853055  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  23853054 agtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 23852955  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  23852954 catggtattgttaaggtgtgttgatg 23852929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 33372256 - 33372031
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  33372256 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 33372157  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||| ||    
T  33372156 agtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctatacaagagaaactatga 33372057  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  33372056 catggtattgttaagatgtgttgatg 33372031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 16678508 - 16678736
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  16678508 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactatgacatcaaacagttcttgctaagcc 16678607  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  | ||||| || |||||    
T  16678608 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatatcctatacaagaggaacta 16678707  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16678708 tgacatggtactgttaagatgtgttgatg 16678736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16939855 - 16939627
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16939855 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagcc 16939756  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| || | |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  16939755 gtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaacta 16939656  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||    
T  16939655 tgacatggtattgctaagatgtgttgatg 16939627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4719960 - 4719735
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  4719960 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggcgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacggttcttgctgagccgtg 4719861  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  4719860 agtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 4719761  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  4719760 catggtattgttaaggtgtgttgatg 4719735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13520019 - 13519794
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  13520019 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactatgacatcaagcagttcttgctgagccgtg 13519920  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||| ||    
T  13519919 agtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggtcagtagattcctgttagatggagagattctgtacaagagaaactatga 13519820  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  13519819 catggtattgttaagatgtgttgatg 13519794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15408358 - 15408133
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15408358 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatatggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 15408259  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| || | |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  15408258 agtatccgccaggtgcttccaatcaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcatgttagatggagatattctgtacaaaagaaactatga 15408159  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15408158 catggtattattaaggtgtgttgatg 15408133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15420145 - 15419920
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15420145 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatatggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 15420046  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| || | |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  15420045 agtatccgccaggtgcttccaatcaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcatgttagatggagatattctgtacaaaagaaactatga 15419946  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15419945 catggtattattaaggtgtgttgatg 15419920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 27061877 - 27062102
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27061877 catgtgtttgctattggggatgtaatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 27061976  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    |||||||  ||| |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  27061977 agtatccgtcgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttaaatggagatattctgtacaagagaaactatga 27062076  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  27062077 catggtattgttaagatgtgttgatg 27062102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 3700451 - 3700679
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  3700451 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactatgacatcaagcagttcttgctgagcc 3700550  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    || |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  3700551 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagactctgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaacta 3700650  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3700651 tgacatggtattgttaagatgtgtcgatg 3700679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 4777248 - 4777476
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4777248 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccttggtactacgacatcaaacagttcttgctgagcc 4777347  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  4777348 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattttgtacaagaggaacta 4777447  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4777448 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 4777476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 27198555 - 27198781
Alignment:
Q  3 gcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgt 102  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  27198555 gcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactatgacatcaagcagttcttgctgagccgt 27198654  T
Q  103 gagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacg 202  Q
    |||||||| || | |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| |    
T  27198655 gagtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattttgtacaagaggaactatg 27198754  T
Q  203 acatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  27198755 acatggtattgttaagatgtgttgatg 27198781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 4529653 - 4529881
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4529653 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatatggttgactatagaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagcc 4529752  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  4529753 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcttgttagatggagatattctgtacaagaggaacta 4529852  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4529853 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 4529881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 4762134 - 4762359
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4762134 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgcaaatgtggttgactatagaccctggtactatgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 4762233  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||    
T  4762234 agtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaactatga 4762333  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  4762334 catggtatggttaagatgtgttgatg 4762359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24301582 - 24301357
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||| | ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24301582 catgtgtttgctattggggatgtgattgatcaggctggcgaaaatgtgattggctataaaccctggtactatgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 24301483  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| || | ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  24301482 agtatccgccaggtgcttccaaccaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcatgttagatggagatattttgtacaagagaaactatga 24301383  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  24301382 catggtattgttaagatgtgttgatg 24301357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 34460331 - 34460106
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  34460331 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 34460232  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    |||||||  | | |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| || ||||| ||    
T  34460231 agtatccgtcaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttaaatggagatattctgtacaagaggaactatga 34460132  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  34460131 catggtattgttaagatgtgttgatg 34460106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 27489501 - 27489729
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27489501 tcgcatgtgtttgctattggggatgcgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccttggtactacgacatcaaacagttcttgctgagcc 27489600  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    |||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  27489601 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagactttgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattttgtacaagaggaacta 27489700  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27489701 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 27489729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 30553844 - 30553616
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  30553844 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatggggttgactatagaccttggtactatgacatcaagcagttcttgctgagcc 30553745  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  30553744 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaacta 30553645  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||    
T  30553644 tgacatggtattgctaagatgtgttgatg 30553616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27250680 - 27250453
Alignment:
Q  3 gcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgt 102  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  27250680 gcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactatgacatcaagcagttcttgctgagccgt 27250581  T
Q  103 gagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaa-aagaaactac 201  Q
    |||||||| || | |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | |||||     
T  27250580 gagtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattttgtacaagagggaactat 27250481  T
Q  202 gacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27250480 gacatggtattgttaagatgtgttgatg 27250453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26112237 - 26112012
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  26112237 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaagctggtgaaaatgtggttgactatagaccttggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 26112138  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||  |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||    
T  26112137 agtatccgccgagtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattttgtacaagaggaactatga 26112038  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  26112037 catggtattgttaagatgtgttgatg 26112012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 28211825 - 28212050
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  28211825 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaagctggtgaaaatgtggttgactatagaccttggtactacgacatcaaacagttcttgccgagccgtg 28211924  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||  |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  28211925 agtatccgccgagtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 28212024  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  28212025 catggtattgttaagatgtgttgatg 28212050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 27012102 - 27012327
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  27012102 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactatgacatcaagcagttcttgctgagccgtg 27012201  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| || | |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||    
T  27012202 agtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaactatga 27012301  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||    
T  27012302 catggtactgttgaggtgtgttgatg 27012327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 29505787 - 29506012
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29505787 catgtgtttgctattggagatgtgatcgatcgggctggtgaaaatatggttgactataaaccctggtactatgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 29505886  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| || ||||| ||    
T  29505887 agtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctaagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctttacaagaggaactatga 29505986  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||    
T  29505987 catggtgttgataagatgtgttgatg 29506012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 26790184 - 26790412
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  26790184 tcgcatgtgtttgctattgaggatgtaattgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagcc 26790283  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  26790284 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaacta 26790383  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||| |||| || ||||||||||    
T  26790384 tgacatggtactgttgaggtgtgttgatg 26790412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 46 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17088226 - 17088043
Alignment:
Q  46 aatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctga 145  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17088226 aatgtggttgacagtagaccatggtattatgacatcaagcagttcttgcaaaatcatgagtatccatcgggtgcttccaacaaagacaagaagaccctga 17088127  T
Q  146 gaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17088126 gaagattggccagtaggttcttgttagatggggatattctgtacaaaagaaactacgacatggtattgttaaaatgtgttgatg 17088043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 20172918 - 20173143
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||   || | ||| |||||| |||||||||| ||  || |||||||| |||||||||||||||||||  |  | ||    
T  20172918 catgtgtttgctattgaagatgtgattagtcgggctgatgaaaacgtggttgacagtaggccatggtattatgacatcaagcagttcttgcagaatcatg 20173017  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| || ||||||||    
T  20173018 agtatccacggggtgcttccaacagagacaagaagaccttgagaagattagccggtagattcctgttagatggagatattctatacaagaggaactacga 20173117  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  20173118 catggtattgttaagatgtgttgatg 20173143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22163073 - 22162848
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||   || | ||| |||||| |||||||||| ||  || |||||||| |||||||||||||||||||  |  | ||    
T  22163073 catgtgtttgctattgaagatgtgattagtcgggctgatgaaaacgtggttgacagtaggccatggtattatgacatcaagcagttcttgcagaatcatg 22162974  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| || ||||||||    
T  22162973 agtatccacggggtgcttccaacagagacaagaagaccttgagaagattagccggtagattcctgttagatggagatattctatacaagaggaactacga 22162874  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  22162873 catggtattgttaagatgtgttgatg 22162848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 16956 - 17181
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16956 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 17055  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  17056 agtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 17155  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  17156 catggtattgttaagatgtgttgatg 17181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 4441 - 4666
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4441 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 4540  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| || | ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  4541 agtatccgccaggtgcttccaaccaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcatgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 4640  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  4641 catggtattgttaagatgtgttgatg 4666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 10410 - 10635
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  10410 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactacgacatcaaacagttcttgctgagccgtg 10509  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    |||||||  ||| |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  10510 agtatccgtcgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 10609  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  10610 catggtattgttaagatgtgttgatg 10635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 229
Target Start/End: Original strand, 13948 - 14170
Alignment:
Q  7 gtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtgagt 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13948 gtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactataaaccctggtactatgacatcaaacagttcttgctgagccgtgagt 14047  T
Q  107 atccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacgacat 206  Q
    |||| || | |||||||||    || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  14048 atccgcctggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagcagattcctgttagatggagatattctgtacaaaagaaactatgacat 14147  T
Q  207 ggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  14148 ggtattgttaagatgtgttgatg 14170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 4)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12058 - 11830
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  12058 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccttggtattatgacatcaagcagttcttgctgagcc 11959  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  11958 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaacta 11859  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11858 tgacatggtattgttaaggtgtgttgatg 11830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5064 - 4836
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  5064 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctgatgaaaatgtggttgactatagaccctggtactatgacatcaagcagttcttgctgagcc 4965  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| || | | |||||||    || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  4964 gtgagtatccgccaggtacttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaacta 4865  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4864 tgacatggtattgttaaggtgtgttgatg 4836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 9902 - 9712
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  9902 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtggttgactatagaccttggtattatgacatcaagcagttcttgctgagcc 9803  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaa 191  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  9802 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaa 9712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 133 - 229
Target Start/End: Original strand, 24076 - 24172
Alignment:
Q  133 aagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24076 aagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatg 24172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22076 - 21848
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  22076 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatatggttgactataaaccctggtactatgacatcaagcagttcttgctgagcc 21977  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  21976 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattgaccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaacta 21877  T
Q  201 cgacatggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21876 tgacatggtattgttaagatgtgttgatg 21848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10810 - 10585
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  10810 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatgtgattgactatagaccctggtactatgacatcaagcagttcttgctgagccgtg 10711  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| || | |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||    
T  10710 agtatccgccaggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaactatga 10611  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  10610 catggtattgttaaggtgtgttgatg 10585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Original strand, 12323 - 12548
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagccgtg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  12323 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaagctggtgaaaatgtggttgactatagaccttggtactacgacatcaaacagttcttgccgagccgtg 12422  T
Q  104 agtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaactacga 203  Q
    ||||||| |||  |||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||    
T  12423 agtatccgccgagtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagagaaactatga 12522  T
Q  204 catggtattgttaagatgtgttgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  12523 catggtattgttaagatgtgttgatg 12548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 10393 - 10622
Alignment:
Q  1 tcgcatgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgacaataaaccctggtattacgacatcaagcagttcttgctaagcc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  10393 tcgcatgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatggggttgactatagaccttggtactatgacatcaagcagttcttgctgagcc 10492  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  10493 gtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaacta 10592  T
Q  201 cgacatggtatt-gttaagatgtgttgatg 229  Q
     |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  10593 tgacatggtattatttaagatgtgttgatg 10622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 42566 - 42337
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaa-tgtggttgacaat-aaaccctggtattacgacatcaagcagtt-cttgctaagcc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  42566 catgtgtttgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaaatgtggttgactattaaaccctggtactacgacatcaaacagtttcttgctgagcc 42467  T
Q  101 gtgagtatccaccggatgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccactagattcctgttagatggaaatattatgtacaaaagaaacta 200  Q
    |||||||||| || | ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  42466 gtgagtatccgccaggtgcttccaaccaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcatgttagatggagatattctgtacaagagaaacta 42367  T
Q  201 cgacatggtattg-ttaagatgtgttgatg 229  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42366 tgacatggtattgtttaagatgtgttgatg 42337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0815 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0815
Description:

Target: scaffold0815; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 57
Target Start/End: Original strand, 2105 - 2158
Alignment:
Q  4 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcagactggtgaaaatgtggttgac 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  2105 catgtgttcgctattggggatgtgatcgatcaggctggtgaaaatatggttgac 2158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University