View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6698_low_18 (Length: 507)

Name: NF6698_low_18
Description: NF6698
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6698_low_18
NF6698_low_18
[»] chr5 (64 HSPs)
chr5 (1-480)||(6223940-6224419)
chr5 (247-420)||(40296310-40296483)
chr5 (259-427)||(6500453-6500620)
chr5 (246-468)||(299478-299702)
chr5 (247-425)||(42405588-42405764)
chr5 (247-425)||(15370089-15370267)
chr5 (250-427)||(1028505-1028682)
chr5 (247-427)||(25327925-25328105)
chr5 (246-425)||(34753015-34753194)
chr5 (247-414)||(36492218-36492385)
chr5 (259-429)||(18603106-18603276)
chr5 (247-480)||(26075093-26075330)
chr5 (263-480)||(9498590-9498806)
chr5 (263-416)||(41170640-41170793)
chr5 (259-427)||(6500825-6500992)
chr5 (247-371)||(26074602-26074726)
chr5 (259-427)||(27502024-27502192)
chr5 (250-399)||(13415776-13415925)
chr5 (244-416)||(3295344-3295514)
chr5 (250-418)||(41632775-41632943)
chr5 (259-425)||(624198-624364)
chr5 (253-427)||(3295003-3295176)
chr5 (250-427)||(36568557-36568732)
chr5 (247-416)||(12662651-12662820)
chr5 (259-417)||(32487396-32487553)
chr5 (252-415)||(35150002-35150164)
chr5 (259-480)||(623820-624040)
chr5 (250-371)||(26074190-26074311)
chr5 (247-416)||(11416976-11417143)
chr5 (282-427)||(15370427-15370572)
chr5 (250-430)||(24489191-24489369)
chr5 (247-371)||(26074825-26074950)
chr5 (247-371)||(35167882-35168006)
chr5 (246-418)||(35914838-35915010)
chr5 (269-411)||(33747783-33747925)
chr5 (249-355)||(42508604-42508710)
chr5 (259-371)||(29549299-29549411)
chr5 (247-371)||(300949-301065)
chr5 (250-338)||(39309677-39309764)
chr5 (259-337)||(26074320-26074398)
chr5 (262-407)||(38427553-38427697)
chr5 (247-364)||(41635242-41635359)
chr5 (259-395)||(5723811-5723947)
chr5 (249-371)||(31509615-31509738)
chr5 (250-365)||(36521946-36522061)
chr5 (259-332)||(7768852-7768925)
chr5 (260-426)||(2411010-2411176)
chr5 (343-425)||(26900007-26900089)
chr5 (294-371)||(26590954-26591031)
chr5 (247-299)||(35150737-35150789)
chr5 (247-299)||(35151028-35151080)
chr5 (260-371)||(36522281-36522392)
chr5 (250-371)||(13786045-13786166)
chr5 (344-468)||(38427306-38427432)
chr5 (260-317)||(6225047-6225104)
chr5 (247-303)||(26900082-26900138)
chr5 (324-371)||(13042606-13042653)
chr5 (257-355)||(42524717-42524814)
chr5 (271-371)||(31509745-31509846)
chr5 (341-389)||(795258-795306)
chr5 (324-372)||(13112604-13112652)
chr5 (315-371)||(32445943-32445999)
chr5 (249-281)||(36527217-36527249)
chr5 (325-369)||(41341523-41341567)
[»] chr6 (48 HSPs)
chr6 (245-478)||(16454563-16454797)
chr6 (247-480)||(2579807-2580040)
chr6 (259-477)||(29518505-29518724)
chr6 (247-468)||(2377744-2377966)
chr6 (247-416)||(2578442-2578610)
chr6 (259-476)||(35210206-35210423)
chr6 (259-416)||(29518922-29519079)
chr6 (259-416)||(32741181-32741338)
chr6 (247-427)||(16454897-16455077)
chr6 (247-480)||(16107668-16107904)
chr6 (259-416)||(2378128-2378285)
chr6 (261-426)||(3415462-3415629)
chr6 (250-480)||(2578769-2578999)
chr6 (259-405)||(3409261-3409407)
chr6 (250-479)||(10074298-10074528)
chr6 (259-405)||(26544051-26544197)
chr6 (259-416)||(1846750-1846907)
chr6 (247-480)||(2579044-2579273)
chr6 (259-425)||(14748332-14748494)
chr6 (247-427)||(5832016-5832194)
chr6 (259-416)||(3409662-3409819)
chr6 (259-417)||(3058228-3058386)
chr6 (262-480)||(2579426-2579645)
chr6 (247-416)||(2843544-2843714)
chr6 (250-415)||(10073991-10074156)
chr6 (247-365)||(32460630-32460748)
chr6 (250-430)||(10073601-10073779)
chr6 (247-348)||(16108053-16108154)
chr6 (247-399)||(1950201-1950353)
chr6 (259-427)||(593695-593865)
chr6 (263-428)||(1127366-1127531)
chr6 (245-412)||(6999799-6999966)
chr6 (247-367)||(9062398-9062517)
chr6 (249-371)||(6071124-6071246)
chr6 (249-371)||(8481919-8482040)
chr6 (250-371)||(10911558-10911680)
chr6 (250-468)||(12092428-12092647)
chr6 (247-371)||(5958647-5958771)
chr6 (324-427)||(31714736-31714838)
chr6 (259-449)||(12071657-12071847)
chr6 (272-371)||(2975567-2975666)
chr6 (250-449)||(12085001-12085198)
chr6 (294-335)||(14789284-14789325)
chr6 (277-330)||(35210498-35210551)
chr6 (325-369)||(22605301-22605345)
chr6 (303-449)||(30618584-30618727)
chr6 (249-281)||(7588358-7588390)
chr6 (325-369)||(21130103-21130147)
[»] chr2 (68 HSPs)
chr2 (247-471)||(6421375-6421599)
chr2 (250-471)||(42514642-42514863)
chr2 (259-468)||(36178552-36178761)
chr2 (247-430)||(15880253-15880436)
chr2 (259-468)||(37105926-37106136)
chr2 (259-468)||(14745612-14745823)
chr2 (259-425)||(5542615-5542781)
chr2 (259-413)||(37106190-37106344)
chr2 (259-427)||(41283463-41283631)
chr2 (250-468)||(962591-962808)
chr2 (259-449)||(5542964-5543154)
chr2 (247-416)||(6712966-6713136)
chr2 (247-408)||(36005887-36006047)
chr2 (252-479)||(35580659-35580886)
chr2 (250-478)||(23346228-23346457)
chr2 (247-415)||(15511495-15511661)
chr2 (273-416)||(6422126-6422269)
chr2 (247-414)||(38796619-38796788)
chr2 (250-412)||(40679632-40679794)
chr2 (250-399)||(5367448-5367597)
chr2 (246-371)||(28254281-28254406)
chr2 (247-413)||(33731636-33731804)
chr2 (275-430)||(36178156-36178311)
chr2 (247-416)||(40733507-40733676)
chr2 (250-368)||(28531361-28531479)
chr2 (247-367)||(31259664-31259787)
chr2 (247-416)||(40733873-40734041)
chr2 (254-471)||(7598225-7598443)
chr2 (259-364)||(36178320-36178425)
chr2 (254-405)||(1769889-1770040)
chr2 (250-369)||(37632643-37632762)
chr2 (247-364)||(16542439-16542556)
chr2 (247-371)||(29676893-29677022)
chr2 (247-365)||(31468800-31468914)
chr2 (254-371)||(7598606-7598715)
chr2 (263-371)||(14745338-14745446)
chr2 (247-335)||(38796298-38796386)
chr2 (246-345)||(31899496-31899595)
chr2 (268-404)||(40163383-40163520)
chr2 (319-480)||(6421793-6421955)
chr2 (248-405)||(12529038-12529195)
chr2 (249-369)||(37895107-37895227)
chr2 (247-314)||(36785664-36785731)
chr2 (253-371)||(29874067-29874185)
chr2 (249-449)||(30313170-30313369)
chr2 (250-427)||(16590881-16591053)
chr2 (250-365)||(33561501-33561616)
chr2 (247-305)||(6421294-6421352)
chr2 (265-415)||(29676543-29676687)
chr2 (249-371)||(30323456-30323578)
chr2 (252-369)||(37894738-37894855)
chr2 (311-425)||(3673122-3673236)
chr2 (329-468)||(3672773-3672913)
chr2 (250-365)||(33953821-33953936)
chr2 (250-364)||(9231242-9231356)
chr2 (250-364)||(12910221-12910335)
chr2 (273-362)||(28254165-28254254)
chr2 (249-365)||(29873587-29873703)
chr2 (299-371)||(31385779-31385851)
chr2 (299-449)||(30312831-30312982)
chr2 (310-388)||(36784287-36784365)
chr2 (247-292)||(3673075-3673120)
chr2 (250-319)||(42515005-42515078)
chr2 (319-417)||(6421688-6421786)
chr2 (247-292)||(3672709-3672754)
chr2 (250-371)||(33954306-33954426)
chr2 (250-364)||(41678419-41678534)
chr2 (247-279)||(40734268-40734300)
[»] chr7 (60 HSPs)
chr7 (247-480)||(1085550-1085784)
chr7 (260-479)||(37533299-37533519)
chr7 (245-427)||(7517568-7517750)
chr7 (245-480)||(45433229-45433462)
chr7 (259-479)||(37532946-37533166)
chr7 (247-426)||(30244260-30244439)
chr7 (247-430)||(30245067-30245246)
chr7 (247-416)||(40094773-40094942)
chr7 (244-427)||(22567027-22567209)
chr7 (246-416)||(23376-23546)
chr7 (247-417)||(24177425-24177595)
chr7 (247-480)||(45754706-45754937)
chr7 (247-460)||(47129085-47129297)
chr7 (247-371)||(7554015-7554139)
chr7 (247-425)||(11845183-11845359)
chr7 (247-366)||(22566711-22566830)
chr7 (247-416)||(45434626-45434795)
chr7 (259-427)||(29157567-29157735)
chr7 (245-425)||(30032555-30032735)
chr7 (247-413)||(34218036-34218202)
chr7 (252-416)||(6054555-6054719)
chr7 (247-371)||(16569186-16569310)
chr7 (247-371)||(16596352-16596476)
chr7 (248-424)||(36939724-36939900)
chr7 (246-425)||(41854624-41854802)
chr7 (265-405)||(19122740-19122879)
chr7 (247-425)||(118290-118469)
chr7 (250-370)||(8128486-8128606)
chr7 (259-371)||(14681512-14681624)
chr7 (247-371)||(36534828-36534952)
chr7 (244-355)||(41910654-41910765)
chr7 (247-413)||(9901635-9901799)
chr7 (247-365)||(24838751-24838870)
chr7 (252-371)||(40230335-40230454)
chr7 (247-369)||(1085294-1085417)
chr7 (247-322)||(30245484-30245559)
chr7 (247-322)||(30255329-30255404)
chr7 (246-368)||(36622949-36623071)
chr7 (247-327)||(30244691-30244771)
chr7 (247-371)||(43241485-43241609)
chr7 (250-345)||(28301613-28301708)
chr7 (248-322)||(36109010-36109084)
chr7 (262-362)||(44361517-44361616)
chr7 (299-430)||(30253534-30253661)
chr7 (247-371)||(20599304-20599430)
chr7 (340-415)||(47129452-47129527)
chr7 (316-413)||(37167840-37167937)
chr7 (245-309)||(36967335-36967399)
chr7 (345-430)||(37532736-37532821)
chr7 (250-307)||(40094502-40094559)
chr7 (303-426)||(28300242-28300366)
chr7 (324-371)||(21416185-21416232)
chr7 (378-449)||(30245276-30245347)
chr7 (378-461)||(30253691-30253774)
chr7 (326-371)||(23569046-23569091)
chr7 (436-480)||(40094702-40094746)
chr7 (340-414)||(28300569-28300644)
chr7 (324-369)||(21619091-21619136)
chr7 (378-427)||(30244473-30244522)
chr7 (325-369)||(27391815-27391859)
[»] chr4 (80 HSPs)
chr4 (246-471)||(10245909-10246135)
chr4 (247-461)||(25483326-25483540)
chr4 (252-478)||(3340802-3341029)
chr4 (251-478)||(44620654-44620880)
chr4 (250-427)||(36629230-36629407)
chr4 (252-480)||(39404013-39404242)
chr4 (247-414)||(39404388-39404555)
chr4 (247-415)||(36572009-36572177)
chr4 (250-405)||(52884688-52884844)
chr4 (247-414)||(1731646-1731813)
chr4 (247-430)||(36608644-36608827)
chr4 (254-425)||(54017583-54017754)
chr4 (246-416)||(50002415-50002585)
chr4 (259-424)||(55933113-55933278)
chr4 (250-480)||(20825829-20826061)
chr4 (259-427)||(50630741-50630909)
chr4 (246-424)||(22183253-22183431)
chr4 (251-480)||(49076765-49076992)
chr4 (247-469)||(22028311-22028537)
chr4 (250-413)||(39792860-39793023)
chr4 (266-477)||(44621011-44621220)
chr4 (250-480)||(2740693-2740914)
chr4 (259-416)||(41370359-41370516)
chr4 (247-371)||(34646691-34646815)
chr4 (247-398)||(4955332-4955483)
chr4 (247-371)||(52884877-52885002)
chr4 (247-427)||(22027947-22028127)
chr4 (250-405)||(54108908-54109060)
chr4 (247-414)||(50459711-50459878)
chr4 (249-371)||(41707507-41707628)
chr4 (245-371)||(54936188-54936310)
chr4 (266-480)||(44620362-44620569)
chr4 (247-429)||(4390085-4390267)
chr4 (259-371)||(49880162-49880274)
chr4 (247-471)||(54108527-54108751)
chr4 (247-480)||(16889469-16889703)
chr4 (250-410)||(20826210-20826370)
chr4 (267-416)||(54343005-54343147)
chr4 (250-408)||(32941128-32941286)
chr4 (260-415)||(49302907-49303064)
chr4 (283-416)||(18932746-18932879)
chr4 (250-366)||(2741064-2741180)
chr4 (247-425)||(16888804-16888983)
chr4 (311-480)||(23817612-23817783)
chr4 (247-414)||(45489331-45489497)
chr4 (247-372)||(3341118-3341243)
chr4 (247-371)||(43174496-43174621)
chr4 (247-365)||(54017750-54017870)
chr4 (247-351)||(49076510-49076614)
chr4 (250-365)||(3244499-3244614)
chr4 (272-371)||(45496820-45496919)
chr4 (250-364)||(54741227-54741341)
chr4 (250-346)||(10246340-10246436)
chr4 (252-412)||(34004586-34004744)
chr4 (246-322)||(44620285-44620361)
chr4 (249-320)||(3700357-3700428)
chr4 (247-399)||(19504695-19504838)
chr4 (303-413)||(18879852-18879962)
chr4 (248-358)||(51768115-51768225)
chr4 (250-371)||(28034222-28034343)
chr4 (278-371)||(48111740-48111833)
chr4 (263-371)||(6975498-6975606)
chr4 (247-322)||(44620934-44621010)
chr4 (297-416)||(43827480-43827598)
chr4 (251-322)||(44621420-44621491)
chr4 (308-479)||(31691203-31691375)
chr4 (262-371)||(760194-760302)
chr4 (255-371)||(40067041-40067158)
chr4 (259-309)||(50788087-50788137)
chr4 (249-305)||(45050593-45050649)
chr4 (257-477)||(45489650-45489870)
chr4 (311-416)||(3271841-3271948)
chr4 (324-371)||(11197293-11197340)
chr4 (299-367)||(34544148-34544217)
chr4 (247-331)||(11348410-11348494)
chr4 (299-371)||(15841410-15841482)
chr4 (324-371)||(10396198-10396245)
chr4 (247-298)||(11706636-11706687)
chr4 (251-364)||(15841034-15841146)
chr4 (375-427)||(11702285-11702337)
[»] scaffold0702 (2 HSPs)
scaffold0702 (247-468)||(460-682)
scaffold0702 (259-416)||(146-298)
[»] chr8 (73 HSPs)
chr8 (247-480)||(34834866-34835098)
chr8 (259-449)||(3669689-3669879)
chr8 (247-469)||(3038234-3038458)
chr8 (247-407)||(30359261-30359421)
chr8 (259-430)||(3670062-3670232)
chr8 (247-425)||(34835199-34835377)
chr8 (250-415)||(9608738-9608903)
chr8 (243-423)||(33113359-33113539)
chr8 (249-480)||(40518061-40518295)
chr8 (267-480)||(18371928-18372142)
chr8 (259-430)||(30441083-30441258)
chr8 (245-415)||(37544490-37544660)
chr8 (247-425)||(6876852-6877031)
chr8 (247-425)||(34835464-34835643)
chr8 (247-425)||(34835730-34835909)
chr8 (252-418)||(1513912-1514078)
chr8 (247-412)||(70277-70441)
chr8 (247-411)||(9482608-9482770)
chr8 (247-415)||(25561815-25561984)
chr8 (246-411)||(30359598-30359763)
chr8 (283-411)||(9483191-9483319)
chr8 (247-480)||(147441-147675)
chr8 (259-480)||(1014178-1014401)
chr8 (252-413)||(40518577-40518738)
chr8 (247-371)||(9309345-9309469)
chr8 (259-429)||(45121896-45122066)
chr8 (252-405)||(45122067-45122220)
chr8 (247-415)||(8918764-8918932)
chr8 (248-415)||(5915863-5916025)
chr8 (259-425)||(40579496-40579662)
chr8 (247-408)||(45121663-45121823)
chr8 (259-407)||(1013879-1014027)
chr8 (259-427)||(20870561-20870731)
chr8 (250-412)||(41972151-41972316)
chr8 (250-479)||(9308970-9309204)
chr8 (283-480)||(45122650-45122852)
chr8 (247-416)||(45122996-45123165)
chr8 (249-365)||(5420643-5420759)
chr8 (282-429)||(32305502-32305649)
chr8 (247-370)||(43274824-43274947)
chr8 (247-371)||(8794101-8794225)
chr8 (247-405)||(147819-147968)
chr8 (294-371)||(9609122-9609199)
chr8 (264-416)||(18371660-18371807)
chr8 (261-414)||(18380020-18380171)
chr8 (264-345)||(41416241-41416322)
chr8 (247-361)||(18372988-18373098)
chr8 (262-362)||(20130454-20130553)
chr8 (260-427)||(32640519-32640682)
chr8 (249-371)||(9507769-9507896)
chr8 (250-371)||(4154710-4154831)
chr8 (260-329)||(18372342-18372411)
chr8 (260-329)||(18372785-18372854)
chr8 (259-407)||(6731906-6732045)
chr8 (255-365)||(18372656-18372762)
chr8 (251-406)||(12283867-12284021)
chr8 (267-322)||(25561737-25561792)
chr8 (264-416)||(6651510-6651653)
chr8 (340-478)||(8919082-8919219)
chr8 (332-426)||(40579258-40579352)
chr8 (250-430)||(9620663-9620841)
chr8 (260-347)||(3037776-3037865)
chr8 (249-371)||(4154325-4154446)
chr8 (342-427)||(41129073-41129158)
chr8 (357-480)||(18372218-18372342)
chr8 (250-334)||(33831971-33832055)
chr8 (261-366)||(43398117-43398225)
chr8 (260-301)||(18372485-18372526)
chr8 (250-314)||(20995502-20995566)
chr8 (252-371)||(5274770-5274889)
chr8 (294-349)||(18373236-18373291)
chr8 (378-461)||(3037921-3038006)
chr8 (440-480)||(9482960-9483000)
[»] chr3 (74 HSPs)
chr3 (247-449)||(43346756-43346959)
chr3 (247-480)||(37990911-37991145)
chr3 (246-426)||(42342377-42342557)
chr3 (247-430)||(29644887-29645070)
chr3 (247-471)||(32462843-32463069)
chr3 (250-417)||(35946515-35946682)
chr3 (247-471)||(52634666-52634889)
chr3 (249-449)||(54017782-54017982)
chr3 (247-430)||(12114547-12114730)
chr3 (247-416)||(37990638-37990807)
chr3 (245-480)||(3135389-3135631)
chr3 (247-471)||(15772844-15773069)
chr3 (246-430)||(29644566-29644750)
chr3 (246-416)||(54018197-54018367)
chr3 (259-416)||(22304571-22304728)
chr3 (250-480)||(33803186-33803417)
chr3 (247-416)||(32589694-32589862)
chr3 (247-426)||(25739413-25739593)
chr3 (246-468)||(22303900-22304117)
chr3 (247-413)||(42342092-42342258)
chr3 (247-416)||(25755384-25755553)
chr3 (247-371)||(45901703-45901828)
chr3 (247-469)||(41359710-41359929)
chr3 (266-407)||(39934963-39935104)
chr3 (247-407)||(49336694-49336855)
chr3 (246-415)||(31190006-31190167)
chr3 (247-479)||(53577354-53577588)
chr3 (247-409)||(15773182-15773346)
chr3 (247-371)||(32462602-32462727)
chr3 (259-371)||(39389072-39389184)
chr3 (249-417)||(45395651-45395819)
chr3 (250-416)||(21832344-21832508)
chr3 (249-390)||(3135098-3135237)
chr3 (250-371)||(8327897-8328018)
chr3 (259-398)||(4823657-4823796)
chr3 (245-430)||(53117961-53118144)
chr3 (247-404)||(39914242-39914399)
chr3 (250-365)||(33175711-33175829)
chr3 (247-363)||(1634366-1634483)
chr3 (331-428)||(41359478-41359575)
chr3 (267-410)||(42584829-42584970)
chr3 (247-371)||(11661941-11662066)
chr3 (259-333)||(50612534-50612608)
chr3 (250-371)||(9240142-9240263)
chr3 (251-359)||(33362349-33362460)
chr3 (249-417)||(44160545-44160710)
chr3 (247-322)||(11661525-11661600)
chr3 (247-313)||(43346640-43346706)
chr3 (315-412)||(22303662-22303759)
chr3 (250-371)||(47964562-47964683)
chr3 (259-334)||(51886563-51886638)
chr3 (260-349)||(7767380-7767469)
chr3 (259-312)||(22304248-22304301)
chr3 (375-480)||(22304311-22304419)
chr3 (259-322)||(37726506-37726569)
chr3 (254-364)||(3384317-3384427)
chr3 (391-480)||(9239947-9240037)
chr3 (252-352)||(39336292-39336392)
chr3 (250-365)||(46546375-46546490)
chr3 (307-367)||(52634990-52635050)
chr3 (327-371)||(54017592-54017636)
chr3 (299-366)||(12749211-12749278)
chr3 (391-471)||(41360079-41360161)
chr3 (250-371)||(47964959-47965080)
chr3 (249-289)||(12747878-12747918)
chr3 (325-369)||(17731950-17731994)
chr3 (325-369)||(19033181-19033225)
chr3 (299-371)||(39336014-39336086)
chr3 (324-371)||(53596027-53596074)
chr3 (324-371)||(53596342-53596389)
chr3 (324-371)||(53596542-53596589)
chr3 (249-289)||(2299968-2300008)
chr3 (325-369)||(16871005-16871049)
chr3 (324-372)||(48127858-48127906)
[»] chr1 (66 HSPs)
chr1 (247-480)||(31767096-31767329)
chr1 (259-480)||(44290757-44290981)
chr1 (249-430)||(17294569-17294751)
chr1 (259-425)||(44290448-44290614)
chr1 (247-480)||(41156981-41157217)
chr1 (246-416)||(41142361-41142532)
chr1 (246-479)||(26661833-26662067)
chr1 (247-480)||(34649428-34649662)
chr1 (247-416)||(26661521-26661690)
chr1 (247-471)||(34364497-34364722)
chr1 (250-480)||(22077429-22077660)
chr1 (261-476)||(9955911-9956129)
chr1 (249-426)||(41157367-41157545)
chr1 (249-480)||(66406-66638)
chr1 (265-416)||(14318875-14319026)
chr1 (247-476)||(37850539-37850768)
chr1 (262-415)||(3537599-3537752)
chr1 (247-371)||(34364915-34365039)
chr1 (247-406)||(37556101-37556260)
chr1 (243-399)||(38804371-38804527)
chr1 (259-415)||(41759485-41759641)
chr1 (247-416)||(11977270-11977439)
chr1 (253-427)||(45084378-45084546)
chr1 (249-415)||(5319965-5320131)
chr1 (259-417)||(48588486-48588644)
chr1 (260-480)||(50051958-50052178)
chr1 (259-411)||(3550722-3550871)
chr1 (248-407)||(40082398-40082556)
chr1 (249-427)||(3875319-3875497)
chr1 (247-417)||(29798189-29798359)
chr1 (259-371)||(32594760-32594872)
chr1 (247-351)||(41184489-41184593)
chr1 (247-417)||(39066199-39066368)
chr1 (259-418)||(45493971-45494135)
chr1 (252-469)||(22077774-22077991)
chr1 (248-406)||(37555721-37555878)
chr1 (263-371)||(5575110-5575218)
chr1 (259-336)||(3537226-3537303)
chr1 (259-415)||(32168698-32168843)
chr1 (250-366)||(66136-66254)
chr1 (250-408)||(24600321-24600479)
chr1 (283-424)||(22077101-22077242)
chr1 (294-371)||(44043816-44043893)
chr1 (247-338)||(21378118-21378209)
chr1 (247-405)||(45839617-45839779)
chr1 (250-415)||(19283455-19283620)
chr1 (250-351)||(44685449-44685551)
chr1 (249-409)||(22793270-22793431)
chr1 (250-351)||(24132049-24132150)
chr1 (250-363)||(30630690-30630803)
chr1 (267-371)||(5528798-5528902)
chr1 (244-304)||(35154150-35154210)
chr1 (322-416)||(11977009-11977103)
chr1 (250-371)||(1188632-1188753)
chr1 (250-316)||(50469180-50469246)
chr1 (257-325)||(4266872-4266940)
chr1 (356-415)||(21378059-21378118)
chr1 (284-365)||(4956218-4956299)
chr1 (378-480)||(41184340-41184445)
chr1 (250-318)||(4878796-4878864)
chr1 (340-371)||(12466366-12466397)
chr1 (312-371)||(35154047-35154106)
chr1 (252-365)||(1187414-1187527)
chr1 (320-365)||(31877262-31877307)
chr1 (306-351)||(41184152-41184197)
chr1 (299-371)||(10351202-10351274)
[»] scaffold0391 (4 HSPs)
scaffold0391 (246-425)||(1096-1275)
scaffold0391 (304-371)||(1735-1802)
scaffold0391 (247-308)||(3092-3153)
scaffold0391 (385-480)||(1618-1713)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (249-371)||(5349-5471)
scaffold0078 (247-408)||(4972-5133)
[»] scaffold0734 (2 HSPs)
scaffold0734 (238-406)||(5377-5546)
scaffold0734 (247-347)||(5767-5867)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (247-371)||(17498-17624)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (247-416)||(47350-47519)
[»] scaffold0504 (1 HSPs)
scaffold0504 (246-334)||(10192-10280)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (249-289)||(39830-39870)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 416; Significance: 0; HSPs: 64)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 480
Target Start/End: Original strand, 6223940 - 6224419
Alignment:
Q  1 aggtgtatttgtaattttgtatcaataatctagcttattttaatgttttgaatttggcagctataggtataactgaacatcctgttgaagtatatcatat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6223940 aggtgtatttgtaattttgtatcaataatgtagcttattttaatgttttgaatttggcagctataggtataactgaacatcctattgaagtatatcatat 6224039  T
Q  101 gtgagaggtggtcagaaatttgttgatatcccagctaaaaaagtatgctgtaatgtgtgtacattttagtacactgtactttgcttaacagtattgcggg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6224040 gtgagaggtggtcagaaatttgttgatatctcagctaaaaaagtatgctgtaatgcgtgtacattttagtacactgtactttgcttaacagtattgcggg 6224139  T
Q  201 ctggctttagcagaaagattttgatgcacatttagtgggtgctttatgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaag 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6224140 ttggctttagcagaaagattttgatgcacatttagtgggtgctttatgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacttcggataaaagagtaaag 6224239  T
Q  301 gttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctca 400  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6224240 gttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgcctcagttgcttgtgcggttggtctagcctca 6224339  T
Q  401 atgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatcagaacccggttcgacgaagggtacgtccgaggca 480  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  6224340 atatggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagcagtatcagagcccggttcgacgaagggtacgactgaggca 6224419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 247 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 40296483 - 40296310
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |    
T  40296483 tgttggtgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagaaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttga 40296384  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggc 420  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40296383 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccaggc 40296310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 259 - 427
Target Start/End: Original strand, 6500453 - 6500620
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  6500453 caagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctttaaacccattgccttaaggttttgggtaa 6500551  T
Q  359 gagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctc 427  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6500552 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccaggctcccctc 6500620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 246 - 468
Target Start/End: Original strand, 299478 - 299702
Alignment:
Q  246 atgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcctta 345  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  299478 atgttgttgtgcgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaactcatagcctta 299577  T
Q  346 aggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccag-gctcccctcgtg-ttcctacagtggt 443  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||   |||||||| |||||| |||||| || |||||||| ||||||| | ||||||||| ||   || ||||||||    
T  299578 aggttttgtgtaagagtgtggcgtctctattgcttgtacggttgttctagcatcgatgtggacagtcccccggagctcccctcatgaccccaacagtggt 299677  T
Q  444 atcagaacccggttcgacgaagggt 468  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||    
T  299678 atcagagcctcgttcgacgaagggt 299702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 247 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 42405764 - 42405588
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||| |  |||||||    
T  42405764 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtccaacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttacaagtaaaaggactcataaacctaatgccttaa 42405665  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccc 425  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  42405664 ggttttgggtaagagtgtggtgtct--cttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccc 42405588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 247 - 425
Target Start/End: Original strand, 15370089 - 15370267
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||    
T  15370089 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaatccacagccttaa 15370188  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccc 425  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  15370189 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgggattgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccc 15370267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 250 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 1028682 - 1028505
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||    
T  1028682 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggatgaacactttataagtaagaggacccataaacctataaccttaaggt 1028583  T
Q  350 ttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctc 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||   |  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  1028582 ttttggtaagagtgtggcgtctctctcacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctagctcccctc 1028505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 247 - 427
Target Start/End: Original strand, 25327925 - 25328105
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||    
T  25327925 tgttgttgtgtctaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaacagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaatgccttaa 25328024  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctc 427  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   ||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  25328025 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcccccgagctcccctc 25328105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 246 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 34753194 - 34753015
Alignment:
Q  246 atgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcctta 345  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  34753194 atgttgttgtgtacaaatgtaagttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtaagaagacccataaaccgattgcctta 34753095  T
Q  346 aggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccc 425  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||| |||||||    
T  34753094 aggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtttcccaagctcccc 34753015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 247 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 36492385 - 36492218
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||  |||| |    
T  36492385 tgttgttgtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccaataaacacattaccttta 36492286  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccc 414  Q
    |||||| | ||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  36492285 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 36492218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 259 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 18603276 - 18603106
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  18603276 caagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 18603177  T
Q  359 gagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgt 429  Q
    ||||||||  |||   ||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||    
T  18603176 gagtgtggcatctctcttgcttgtgtggtagttctagcctcgatgtggacggttctcctggctcccctcgt 18603106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 247 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 26075330 - 26075093
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  26075330 tgttgttgtgtacaagtgtgatttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 26075231  T
Q  347 ggtttttggt-aagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccc-aggctcccct--cgtgttcctacagtgg 442  Q
    |||||| ||| |||||||||  ||||   ||||  ||| ||||| | ||||||| ||||||||  |||||| | ||||||||   | | ||| |||||||    
T  26075230 ggttttgggtaaagagtgtgtcgtctctcttgcaagtgtggttgttttagcctcgatgtggactatccccctaagctcccctaaagcgatccaacagtgg 26075131  T
Q  443 tatcagaacccggttcgacgaagggtacgtccgaggca 480  Q
    ||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  26075130 tatcagagcctcgttcgacgaagggtacgaccgaggca 26075093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 263 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 9498806 - 9498590
Alignment:
Q  263 tgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagt 362  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  9498806 tgtgagttatatgtctcacatcagatagaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattttgggtaagagt 9498707  T
Q  363 gtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatcagaacccggttcgacg 462  Q
    |||||||||   ||| || ||  | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  || |  | ||||||||| ||| |||||||     
T  9498706 gtggtgtctctcttgtttatg-tgctggtctagcctcaatgtggacggtccccctagctcccctcgtgacccaagtgcggtatcagagccccgttcgaca 9498608  T
Q  463 aagggtacgtccgaggca 480  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  9498607 aagggtacgaccgaggca 9498590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 263 - 416
Target Start/End: Original strand, 41170640 - 41170793
Alignment:
Q  263 tgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagt 362  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  41170640 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 41170739  T
Q  363 gtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccc 416  Q
    ||||||| ||  ||||||||| ||||| |||||||||  ||| |||||||||||    
T  41170740 gtggtgtttttcttgcttgtgtggttgttctagcctcggtgtagacggtccccc 41170793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 259 - 427
Target Start/End: Original strand, 6500825 - 6500992
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||    
T  6500825 caagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataaaaggacccataaactcattgccttaaggttttggataa 6500923  T
Q  359 gagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctc 427  Q
    |||||||||||||   || |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6500924 gagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttattctagcctcgatgtggacggtcccccaggctcccctc 6500992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 247 - 371
Target Start/End: Original strand, 26074602 - 26074726
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  26074602 tgtttttgtgtacaagtgtgagttatatgttccatatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 26074701  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  26074702 ggttttgggtaagagtgtggtgtct 26074726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 259 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 27502192 - 27502024
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  27502192 caagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaagatttttggtaa 27502093  T
Q  359 gagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctc 427  Q
     ||||||||||||   ||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  27502092 aagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctatcctcgatgtggacggtccccctagctcccctc 27502024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 250 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 13415925 - 13415776
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||    
T  13415925 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaattagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattaccttaaggt 13415826  T
Q  350 ttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctc 399  Q
    ||| ||||||||||||| ||||   ||||||||||||||| |||||||||    
T  13415825 tttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctc 13415776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 244 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 3295514 - 3295344
Alignment:
Q  244 ttatgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcct 343  Q
    |||| |||||||||  |||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  3295514 ttatcttgttgtgtggaagtgtgagt-atatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccaattgcct 3295416  T
Q  344 taaggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccc 416  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||   ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  3295415 taagg-ttttggtaagagtgtgttgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 3295344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 250 - 418
Target Start/End: Original strand, 41632775 - 41632943
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||| |    
T  41632775 tgttgtgtgcaagtgtaagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccaatgctttaagat 41632874  T
Q  350 ttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccag 418  Q
    ||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  41632875 tttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttttagtctcgatgtggacggtcccccag 41632943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 259 - 425
Target Start/End: Original strand, 624198 - 624364
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  624198 caagtgtgagttatatgtcccacattgtataaaatagtaaaggttgaacacgttataagtaagatgacccataaacccatagccttgaggttttgggtaa 624297  T
Q  359 gagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccc 425  Q
    |||||||||||||   |  |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||    
T  624298 gagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggttccccgagctcccc 624364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 253 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 3295176 - 3295003
Alignment:
Q  253 tgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttt 352  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  3295176 tgtgtgcaagtgtgagt-atatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccataaacccattgccttgaggtttt 3295078  T
Q  353 tggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctc 427  Q
     |||| |||||||||||||   ||| ||||| ||||| | ||||||| |||||||| |||||||  |||||||||    
T  3295077 gggtatgagtgtggtgtctctcttggttgtgtggttgttgtagcctcgatgtggacagtccccctcgctcccctc 3295003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 250 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 36568732 - 36568557
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  36568732 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtgagatgacccgtaaacccattgccttaaggt 36568633  T
Q  350 ttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctc 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||   |  |||||| ||||| |||| |||| ||||||| ||||||||  |||||||||    
T  36568632 ttttggtaagagtgtggcgtct--ctctcttgtgtggttgttctatcctcgatgtggaaggtcccccgagctcccctc 36568557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 247 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 12662820 - 12662651
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| |||| | |||||    
T  12662820 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacattttataagtaagaaaacccataaatccattgtcttaa 12662721  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccc 416  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||  ||||||||| |||||| |||||||||    
T  12662720 gtttttgggtaagagtgtggtgcctttcttgcttgtggggttcttctagcctcgatgtggtcggtccccc 12662651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 259 - 417
Target Start/End: Original strand, 32487396 - 32487553
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  32487396 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacc-tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 32487494  T
Q  359 gagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccca 417  Q
    |||||||  || |   |||||| || ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  32487495 gagtgtgacgtatctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggatggtccccca 32487553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 252 - 415
Target Start/End: Original strand, 35150002 - 35150164
Alignment:
Q  252 ttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggttt 351  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||    
T  35150002 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtcaaggttgaacaccttataagtaaga-gacccataaatccattgtcttaaggttt 35150100  T
Q  352 ttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccc 415  Q
    | ||||| ||||||||||||   |  || ||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  35150101 tgggtaaaagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctaacctcaatgtggaccgtcccc 35150164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 259 - 480
Target Start/End: Original strand, 623820 - 624040
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||  || |||||||||||||  ||||    
T  623820 caagtgtgagttatatgtctcacatcggatataatagtaaaggttgaacactttacaagtaagttgagccataaacttatagccttaaggttttgagtaa 623919  T
Q  359 gagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatcagaacccggttc 458  Q
    |||||||||||||   |  |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||| |  |||  || |||||||||||||| ||| ||||    
T  623920 gagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgttctagcctcaatgtagacggtcccccgagctcctc-agtgacccaacagtggtatcagagccctgttc 624018  T
Q  459 gacgaagggtacgtccgaggca 480  Q
    || |||||||||| ||| ||||    
T  624019 gaagaagggtacgaccgtggca 624040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 250 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 26074311 - 26074190
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  26074311 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaaaagtaaaggttgaacacctcatatgtaagaggacccatgaacccattgccttaaggt 26074212  T
Q  350 ttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  26074211 tttgggtaagagtgtggtgtct 26074190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 247 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 11417143 - 11416976
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  11417143 tgttgttgtgtgcaagtg--agttatatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccattgccttaa 11417046  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccc 416  Q
    ||||||  ||||||||||| | |||   ||||||||| | ||| |||||| || ||||||| ||||||||    
T  11417045 ggttttgtgtaagagtgtgatctctctcttgcttgtgggattgttctagcttcgatgtggatggtccccc 11416976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 282 - 427
Target Start/End: Original strand, 15370427 - 15370572
Alignment:
Q  282 gtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttg 381  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||   ||| |||    
T  15370427 gtcggatgaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgcgtaagagtgtggcgtctctcttgtttg 15370526  T
Q  382 tgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctc 427  Q
    || ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  15370527 tggggttgttctagcctcgatgtggacggtcctccatgctcccctc 15370572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 250 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 24489369 - 24489191
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| || || ||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |    
T  24489369 tgttgtgttcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagaaaaggttaaacaccttattagtaaga--acccataaacccattgccttaagat 24489272  T
Q  350 ttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtg 430  Q
    |||  |||||||||||| ||||   || |||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  24489271 tttgcgtaagagtgtggcgtctcttttacttgtgcggttgttctagtctcgatgtgggcggtccctcagactcccctcgtg 24489191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 247 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 26074950 - 26074825
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||| || | |||||    
T  26074950 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacaatataagtaggaggacccataaacctattgtcttaa 26074851  T
Q  347 ggtttttggt-aagagtgtggtgtct 371  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||    
T  26074850 ggttttgggtaaagagtgtggcgtct 26074825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 247 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 35168006 - 35167882
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||| |    
T  35168006 tgttgttgtgtacaagtatgagttatgtatctcacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaggatgacccataaatctattgccttga 35167907  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
     |||||||||||||||||| |||||    
T  35167906 tgtttttggtaagagtgtgatgtct 35167882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 246 - 418
Target Start/End: Original strand, 35914838 - 35915010
Alignment:
Q  246 atgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcctta 345  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||| |||| ||| ||    
T  35914838 atgttgttgtgtataagtatgagttatatgtcacacatcggataaaagagtaaaggttgaacattttataagtaagaagacccgtaaatccattgcccta 35914937  T
Q  346 aggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccag 418  Q
    |  | || | ||||| |||||| |||   |||||| |  | |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  35914938 aattattggataagaatgtggtatctctcttgcttatatgattggtcaaacctcaatgtggacggtcccccag 35915010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 269 - 411
Target Start/End: Original strand, 33747783 - 33747925
Alignment:
Q  269 ttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtg 368  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || || |||||||||||| || |||||||| ||| |||||||| |||| | |||||||||||||    
T  33747783 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaatactttataagtaagaggatccataaactcattgccttaagattttggataagagtgtggtg 33747882  T
Q  369 tcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggt 411  Q
    |||   || ||| |||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  33747883 tctctcttccttatgcggttgttctagccttgatgtggacggt 33747925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 249 - 355
Target Start/End: Original strand, 42508604 - 42508710
Alignment:
Q  249 ttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaagg 348  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| || |||||||||| |||| || |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  42508604 ttgttgtgtacaagtgtgaattatatatcccacatcggatagaaaagtaaaggttaaacatctaataagtaagaggactcataaacccattgccttaagg 42508703  T
Q  349 tttttgg 355  Q
    |||||||    
T  42508704 tttttgg 42508710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 259 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 29549411 - 29549299
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    |||||||||||||||||| |||  || ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||| | |||    
T  29549411 caagtgtgagttatatgttccatatcagataaaatagtaaaggatgaacaccatataagtaagaagacccataaacacattaccttaaggttttggataa 29549312  T
Q  359 gagtgtggtgtct 371  Q
    |||||||| ||||    
T  29549311 gagtgtggcgtct 29549299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 247 - 371
Target Start/End: Original strand, 300949 - 301065
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||         || |||| |||||||    
T  300949 tgtttttgtgtacaagtgtgggttatatgtcccacatcagataaaacagtaaaggttgaataccttataagtaaga--------gaatccattgccttaa 301040  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  301041 gatttttggtaagagtgtggtgtct 301065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 250 - 338
Target Start/End: Original strand, 39309677 - 39309764
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccat 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||    
T  39309677 tgttgtgtacaagtatgagttatatgtcccacatcggataaaagggtaaatgttgaacacattataaataagagga-ccataaacccat 39309764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 259 - 337
Target Start/End: Original strand, 26074320 - 26074398
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaaccca 337  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| || | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26074320 caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaactaaagattgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca 26074398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 262 - 407
Target Start/End: Original strand, 38427553 - 38427697
Alignment:
Q  262 gtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagag 361  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| || |||| | |||||||||||  |||||||    
T  38427553 gtgtgagttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagt-agaggacccattaatccattgtcttaaggttttgtgtaagag 38427651  T
Q  362 tgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtgga 407  Q
    ||||  ||||   |  |||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  38427652 tgtgacgtctctctcacttgtgcggttgttctaacctcgatgtgga 38427697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 247 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 41635359 - 41635242
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||  | | || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||| | |||||    
T  41635359 tgttgttgtgtataagtatgagttatatgtttcccatcagataaaagagtaaatgttgaacaccttataaataagaggatccataaatccattgtcttaa 41635260  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgt 364  Q
      |||| |||||||||||    
T  41635259 aattttaggtaagagtgt 41635242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 259 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 5723947 - 5723811
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||| ||||| ||||||  |||||| ||   || | ||||||||||| || ||    
T  5723947 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaataataaaagttgaacacattatatgtaagagaacccattaatttattgtcttaaggttttgggaaa 5723848  T
Q  359 gagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctag 395  Q
    |||| | ||||||   ||||||||||||||| |||||    
T  5723847 gagtatagtgtctctcttgcttgtgcggttgttctag 5723811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 249 - 371
Target Start/End: Original strand, 31509615 - 31509738
Alignment:
Q  249 ttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaagg 348  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||  ||||||| ||| |||||||| ||| ||| ||||||| ||| ||||| |||    
T  31509615 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagaggactcataaactcattgccttgagg 31509714  T
Q  349 -tttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
     |||||||||||| ||| ||||||    
T  31509715 ttttttggtaagaatgtagtgtct 31509738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 250 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 36522061 - 36521946
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||| || |||  |||||||||||  | ||| | ||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  36522061 tgttgtgcgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagttgaggttgaacactctttaaatgagaggacccataaaccaattgccttaaggt 36521962  T
Q  350 ttttggtaagagtgtg 365  Q
    ||| ||||||||||||    
T  36521961 tttgggtaagagtgtg 36521946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 259 - 332
Target Start/End: Original strand, 7768852 - 7768925
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataa 332  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  7768852 caagtgtgagttatatatcctacatcggataaaataataaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataa 7768925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 426
Target Start/End: Original strand, 2411010 - 2411176
Alignment:
Q  260 aagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaag 359  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||| |  |||||| |||||||| ||| |||||||||  ||||||||||  || |||||||||||||  |||||    
T  2411010 aagtgtgagttatatgtcctacattggatagagaagtaaaagttgaacatcttgtaagtaagagaacccataaacttattgccttaaggttttgagtaag 2411109  T
Q  360 agtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccct 426  Q
    ||||| || |||   || ||||   | ||| |||| |||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  2411110 agtgtagtttctctattacttgaatgattgttctaacctcgatatggacggtcccccaagctcccct 2411176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 26900089 - 26900007
Alignment:
Q  343 ttaaggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccc 425  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| | ||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  26900089 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgggtttgttctagccttgatgtggacggtcccccaagctcccc 26900007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 26591031 - 26590954
Alignment:
Q  294 agtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||  |||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  26591031 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaattcaatgccttaaggttttgagtaagagtgtggcgtct 26590954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 247 - 299
Target Start/End: Original strand, 35150737 - 35150789
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaa 299  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  35150737 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaa 35150789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 247 - 299
Target Start/End: Original strand, 35151028 - 35151080
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaa 299  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  35151028 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaa 35151080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 36522392 - 36522281
Alignment:
Q  260 aagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaag 359  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||| || | |  | ||||||||  |||||||| ||| |||| ||||||||||   ||||||||||| ||||||    
T  36522392 aagtgtgagttatatgtctcacattggatagaaaaatggaagttgaacattttataagtgagaggaccaataaacccattatcttaaggttttgggtaag 36522293  T
Q  360 agtgtggtgtct 371  Q
    ||||||||||||    
T  36522292 agtgtggtgtct 36522281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 250 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 13786166 - 13786045
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttat-atgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaagg 348  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||  ||| |||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |||| | || | ||||||     
T  13786166 tgttgtgcacaagtgtgagtaattatgtttcacatcggataaaa-agtgatggttgaacactttataagtaagatgacccgtaaatctattgtcttaaga 13786068  T
Q  349 tttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    |||| | |||||||||| |||||    
T  13786067 ttttggataagagtgtgatgtct 13786045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 344 - 468
Target Start/End: Original strand, 38427306 - 38427432
Alignment:
Q  344 taaggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcg-tgttcctacagtgg 442  Q
    |||| |||| ||||||||||||| ||||   ||||||||||||||| |||| |||| |||| | |||||||||  |||||| ||| || ||| |||||||    
T  38427306 taagattttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctaacctcgatgttggcggtcccccgagctcccttcgatgatccaacagtgg 38427405  T
Q  443 tatcaga-acccggttcgacgaagggt 468  Q
    ||| |||  ||||||||||||||||||    
T  38427406 tattagagccccggttcgacgaagggt 38427432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 317
Target Start/End: Original strand, 6225047 - 6225104
Alignment:
Q  260 aagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataag 317  Q
    |||| |||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6225047 aagtctgagttatatatcccacatcagataaaagaataaaggttgaacaccttataag 6225104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 26900138 - 26900082
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggtt 303  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  26900138 tgttgttgtgtacaaatttgagttatatgtcccacatcagataaaagagttaaggtt 26900082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 324 - 371
Target Start/End: Original strand, 13042606 - 13042653
Alignment:
Q  324 gacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  13042606 gacccataaacccattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtct 13042653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 355
Target Start/End: Original strand, 42524717 - 42524814
Alignment:
Q  257 tacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttgg 355  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| || |||||| |||||||| ||||| | ||||| ||| |||||| |||| | || |||||||||||    
T  42524717 tacaagtgtgaattatatgtctcacatcggatagaaaagtaaa-gttgaacatcttatgaataagaggactcataaatccattgtctgaaggtttttgg 42524814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 271 - 371
Target Start/End: Original strand, 31509745 - 31509846
Alignment:
Q  271 atatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttt-tggtaagagtgtggtgt 369  Q
    ||||||| ||| ||||||| || |||  ||||||| ||| |||||||| ||| ||| ||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  31509745 atatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagaggactcataaactcattgccttgaggttttttggtaagaatgtggtgt 31509844  T
Q  370 ct 371  Q
    ||    
T  31509845 ct 31509846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 341 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 795306 - 795258
Alignment:
Q  341 ccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttg 389  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  795306 ccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttg 795258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 324 - 372
Target Start/End: Original strand, 13112604 - 13112652
Alignment:
Q  324 gacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtctt 372  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  13112604 gacccataaacccattgtcttaaggttttggataagagtgtggtgtctt 13112652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 315 - 371
Target Start/End: Original strand, 32445943 - 32445999
Alignment:
Q  315 aagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  32445943 aagtgagaggacccataaacccaacgccttaaggttttgggttaaagtgtggtgtct 32445999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 249 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 36527249 - 36527217
Alignment:
Q  249 ttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccac 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36527249 ttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccac 36527217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 325 - 369
Target Start/End: Original strand, 41341523 - 41341567
Alignment:
Q  325 acccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgt 369  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41341523 acccatacactcattgccttaaggtttttggtaagaatgtggtgt 41341567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 48)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 245 - 478
Target Start/End: Original strand, 16454563 - 16454797
Alignment:
Q  245 tatgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcctt 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16454563 tatgttgttgtgtacaagtgtgagttatgtgtcccacatcagataaaagaataaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctt 16454662  T
Q  345 aaggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggta 444  Q
    ||| |||| | ||||||||||| ||||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||  || |||||||||    
T  16454663 aagattttggataagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccctcgtgacccaacagtggta 16454762  T
Q  445 tcagaaccc-ggttcgacgaagggtacgtccgagg 478  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  16454763 tcagagcccaggttcgacgaagggtacgaccgagg 16454797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 247 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 2580040 - 2579807
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  2580040 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccataaacccacagccttaa 2579941  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatc 446  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||| |   || |||||||||||    
T  2579940 ggttttgggtaagaatgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggaaggt-ccccaagctcccctcattacccaacagtggtatc 2579842  T
Q  447 aga-acccggttcgacgaagggtacgtccgaggca 480  Q
    |||  |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  2579841 agagccccggttccacgaagggtacgaccgaggca 2579807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 259 - 477
Target Start/End: Original strand, 29518505 - 29518724
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  29518505 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaa 29518604  T
Q  359 gagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatcaga-acccggtt 457  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| |   || ||||||||||||||  |||||||    
T  29518605 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcctctcataacccaacagtggtatcagagccccggtt 29518704  T
Q  458 cgacgaagggtacgtccgag 477  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  29518705 cgacgaagggtgcgaccgag 29518724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 247 - 468
Target Start/End: Original strand, 2377744 - 2377966
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  2377744 tgttgttgtgcacaagtgtgagttatatgtcccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 2377843  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatc 446  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||| | ||||  ||||||||| ||||||| ||||||||  ||| |||  |||  || |||||||||||    
T  2377844 ggttttgggtaagagtgtggtgtctttcttgcttgagtggtttttctagcctcgatgtggaaggtcccccgagcttccccagtgacccaacagtggtatc 2377943  T
Q  447 aga-acccggttcgacgaagggt 468  Q
    |||  ||||||||||||||||||    
T  2377944 agagccccggttcgacgaagggt 2377966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 247 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 2578610 - 2578442
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  2578610 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccaca-cggataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccatagccttaa 2578512  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccc 416  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  2578511 ggttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 2578442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 259 - 476
Target Start/End: Original strand, 35210206 - 35210423
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  35210206 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaaccattgccttaaggttttgggtaa 35210305  T
Q  359 gagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatcagaacc-cggtt 457  Q
    ||||||||||| |   ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  |||  || |||||||||||| | || |||||    
T  35210306 gagtgtggtgtttcttttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtggacggt-cccctggctcccccagtgacccaacagtggtatcaaagcctcggtt 35210404  T
Q  458 cgacgaagggtacgtccga 476  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  35210405 cgacgaagggtacgaccga 35210423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 259 - 416
Target Start/End: Original strand, 29518922 - 29519079
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  29518922 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaa 29519021  T
Q  359 gagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccc 416  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  29519022 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 29519079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 259 - 416
Target Start/End: Original strand, 32741181 - 32741338
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  32741181 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaa 32741280  T
Q  359 gagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccc 416  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  32741281 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 32741338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 247 - 427
Target Start/End: Original strand, 16454897 - 16455077
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||    
T  16454897 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatgtgtcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaataggacccataaacctattgccttaa 16454996  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctc 427  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  16454997 ggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccctc 16455077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 247 - 480
Target Start/End: Original strand, 16107668 - 16107904
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  16107668 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtgtcacatcggataaaaaagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaa 16107767  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccct--cgtgttcctacagtggta 444  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||   |||||||   |||  || |||||||||    
T  16107768 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtgggtggtacccctaactccccttcagtgacccaacagtggta 16107867  T
Q  445 tcaga-acccggttcgacgaagggtacgtccgaggca 480  Q
    |||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16107868 tcagagccccggttcgacgaagggtatgaccgaggca 16107904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 259 - 416
Target Start/End: Original strand, 2378128 - 2378285
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  2378128 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttaggtaa 2378227  T
Q  359 gagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccc 416  Q
    || ||||||||||   ||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  2378228 gaatgtggtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 2378285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 261 - 426
Target Start/End: Original strand, 3415462 - 3415629
Alignment:
Q  261 agtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaaga 360  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3415462 agtgtgagttatatgtcccacatcacataaaatagtaaaggttgaacaccatataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggtaaga 3415561  T
Q  361 gtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttg--gtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccct 426  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||   ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  3415562 gtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctctagcctcgatgtggaaggtcccccaagctcccct 3415629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 250 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 2578999 - 2578769
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||| || |||||||| |||  |||||||||    
T  2578999 tgttgtgagcaagtgtgatttatatgtccctcatcggataaaa-agtaaatgttgaataccttataaataagaggatccataaactcattaccttaaggt 2578901  T
Q  350 ttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatcaga 449  Q
    ||| ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||   | ||||||||||||||    
T  2578900 tttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcttgtgtggttgttctgacctcgatgtggacggtcccccaggctcccctcatgaatcaacagtggtatcaga 2578801  T
Q  450 -acccggttcgacgaagggtacgtccgaggca 480  Q
      ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2578800 gccccggttcgacgaagggtacgaccgaggca 2578769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 259 - 405
Target Start/End: Original strand, 3409261 - 3409407
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  3409261 caagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa 3409360  T
Q  359 gagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtg 405  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  3409361 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 3409407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 250 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 10074528 - 10074298
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  10074528 tgttgtgtgcaagtgtgagttagaggtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 10074429  T
Q  350 ttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatcaga 449  Q
    ||| ||||||||||||||||||   |  || ||| ||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||  || ||  | ||||||||    
T  10074428 tttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggatagtcccccaggctccccttgtgacccaactcttgtatcaga 10074329  T
Q  450 -acccggttcgacgaagggtacgtccgaggc 479  Q
      |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  10074328 gccccggttcgaagaagggtacgaccgaggc 10074298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 259 - 405
Target Start/End: Original strand, 26544051 - 26544197
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  26544051 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacgttataagtaagaggacccataaacccaccgccttaaggttttgagtaa 26544150  T
Q  359 gagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtg 405  Q
    ||||||| |||||   ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  26544151 gagtgtgatgtctctcttgcttgtgcgattgttctagcctcaatgtg 26544197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 259 - 416
Target Start/End: Original strand, 1846750 - 1846907
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    ||||||||| || |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||| | |||    
T  1846750 caagtgtgaattctatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagcacccataaatccattgccttaaggttttggataa 1846849  T
Q  359 gagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccc 416  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  1846850 gagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 1846907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 247 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 2579273 - 2579044
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    | || ||||||||||||  | ||||    
T  2579273 tgttgttgtgtacaagtgttagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaagttgaacaccttataag----aggaaccataaacccataactttaa 2579178  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatc 446  Q
    || ||| | ||||||||||||||||   ||||| ||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||  || |||||| ||||    
T  2579177 ggctttggctaagagtgtggtgtctctcttgctcgtgtggttgttctagcctcgatgtgcacggtccccga-gctcccctcatgacccaacagtgatatc 2579079  T
Q  447 aga-acccggttcgacgaagggtacgtccgaggca 480  Q
    |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2579078 agagtcccggttcgacgaagggtacgaccgaggca 2579044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 259 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 14748494 - 14748332
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| || |||||||||| |||||    
T  14748494 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaactcattgcgttaaggttttgggtaa 14748395  T
Q  359 gagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccc 425  Q
    ||||||||| ||    ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  14748394 gagtgtggtctc----ttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 14748332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 247 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 5832194 - 5832016
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||    
T  5832194 tgttgttgtgcacaagtgtaagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaagcca-ccccttaa 5832096  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctc 427  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||   || |||||| ||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  5832095 gattttgggtaaaagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttctagcctcgatgtagacggt-ccccaggctcccctc 5832016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 259 - 416
Target Start/End: Original strand, 3409662 - 3409819
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |  |||| |||||    
T  3409662 caagtgtgagttatatgtaccacatcagataaaatagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgcctttattttttgggtaa 3409761  T
Q  359 gagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccc 416  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  3409762 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 3409819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 259 - 417
Target Start/End: Original strand, 3058228 - 3058386
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  3058228 caagtgttagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtatgaggatccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 3058327  T
Q  359 gagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccca 417  Q
    |||||||||||||   ||||||||  ||| | |||| |||| |||||||| ||||||||    
T  3058328 gagtgtggtgtctctcttgcttgtagggtggttctaacctcgatgtggaccgtccccca 3058386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 262 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 2579645 - 2579426
Alignment:
Q  262 gtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagag 361  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| | | ||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  2579645 gtgtgagttatatgtcccacatcggacaaaaaagtaaaggtcggataccttataagtaagagggcccataaactcattgccttaaggttttgggtaaaag 2579546  T
Q  362 tgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatcaga-acccggttcga 460  Q
    | ||||||||   ||||||||| ||||| |||| |||| ||||||| ||| || ||||||||||||  |   | ||||||||||||||  ||||||||||    
T  2579545 tatggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtggatggttccacaggctcccctcacgaatcaacagtggtatcagagccccggttcga 2579446  T
Q  461 cgaagggtacgtccgaggca 480  Q
    |||| |||||| ||||||||    
T  2579445 cgaacggtacgaccgaggca 2579426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 247 - 416
Target Start/End: Original strand, 2843544 - 2843714
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgaccc-ataaacccatcgcctta 345  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||  ||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||    
T  2843544 tgttgttgtgcacaattgtgagttatatgtttcacatcggataaaataataaaagttgaacaccttataagtaagaggaccccataaactcattgcctta 2843643  T
Q  346 aggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccc 416  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||   ||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  2843644 aggttttgggtaagagtgtggtatctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 2843714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 250 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 10074156 - 10073991
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  10074156 tgttgtgtgcaagggtgagttatatatcccacatcggatagaaaagtaaacgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 10074057  T
Q  350 ttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccc 415  Q
    ||| ||||| ||||||||||||   | |||| |  ||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  10074056 tttgggtaaaagtgtggtgtctctctcgcttatttggttgttctagcctcgacgtggacggtcccc 10073991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 247 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 32460748 - 32460630
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    |||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  32460748 tgttgttgtgcaaaggtgtgagttatatgtcccacatcgtataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaa 32460649  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtg 365  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  32460648 ggttttgggtaagagtgtg 32460630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 250 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 10073779 - 10073601
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| | |||||| |    
T  10073779 tgttgtgtgcaagtgttagttatatgtcccacatcggagaaaag--taaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaactcattggcttaagat 10073682  T
Q  350 ttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtg 430  Q
    ||| ||||||||||||||||||   |  || ||| ||||| |||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  10073681 tttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcatcgatgtggacggtccttcaggctcccctcgtg 10073601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 247 - 348
Target Start/End: Original strand, 16108053 - 16108154
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  16108053 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcagataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 16108152  T
Q  347 gg 348  Q
    ||    
T  16108153 gg 16108154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 247 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 1950353 - 1950201
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| | |  |||||||    
T  1950353 tgttgttgcgtataagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttacaagtaagaggagccataaatctaatgccttaa 1950254  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctc 399  Q
    ||||||  |||||||||||  ||||   || |||||||||||| |||||||||    
T  1950253 ggttttgagtaagagtgtgacgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctc 1950201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 259 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 593865 - 593695
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||||||||||||| |||||    
T  593865 caagtgtgagttgtatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaaccgactgccttaaggttttgggtaa 593766  T
Q  359 gagtgtgg--tgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctc 427  Q
     |||||||  | |||   || ||||| |||||| ||||| ||| |||| |||||||||||  |||||||||    
T  593765 tagtgtggtatctctctcttacttgtacggttgttctaggctcgatgttgacggtcccccgagctcccctc 593695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 263 - 428
Target Start/End: Original strand, 1127366 - 1127531
Alignment:
Q  263 tgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagt 362  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  1127366 tgtgagttatatatcccacatcgggtaaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattaccttaaggttttgggtaagagt 1127465  T
Q  363 gtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcg 428  Q
    |||| ||||   || ||| || ||||| |||| |||| ||||||  ||||||| | ||||||||||    
T  1127466 gtggcgtctctcttacttatgtggttgctctaacctcgatgtgggtggtccccaaagctcccctcg 1127531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 245 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 6999966 - 6999799
Alignment:
Q  245 tatgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcctt 344  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||  |||||    
T  6999966 tatgttattgtgtataagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaaaagtaaaagttgaacaccttatatgtaagaggatccataaactcactgcctt 6999867  T
Q  345 aaggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtc 412  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||   |||||  || ||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  6999866 aaggttttggataagagtgtggcgtctctcttgctaatgtggttgttctagtctcgatgtggacggtc 6999799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 247 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 9062517 - 9062398
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||| | |||||    
T  9062517 tgttattgtgtataaatgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaactcattgtcttaa 9062418  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggt 367  Q
     ||||| ||||| ||||||||    
T  9062417 -gttttgggtaaaagtgtggt 9062398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 249 - 371
Target Start/End: Original strand, 6071124 - 6071246
Alignment:
Q  249 ttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaagg 348  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| || |||  ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||     
T  6071124 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattgaatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgagatgatccataaactcattgccttaaga 6071223  T
Q  349 tttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    |||| | ||||||||||| ||||    
T  6071224 ttttggataagagtgtggcgtct 6071246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 249 - 371
Target Start/End: Original strand, 8481919 - 8482040
Alignment:
Q  249 ttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaagg 348  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| || |||  ||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||| ||| ||||||||     
T  8481919 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcc-acatcagatataaaagtggaggttgaacactttataaatgagatgactcataaactcattgccttaaga 8482017  T
Q  349 tttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  8482018 ttttgggtaagagtgtggtgtct 8482040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 250 - 371
Target Start/End: Original strand, 10911558 - 10911680
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaaga-gtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaagg 348  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| || || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||| |    
T  10911558 tgttgtatgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataaaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaag 10911657  T
Q  349 tttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    ||||   |||||||||| |||||    
T  10911658 ttttgaataagagtgtgatgtct 10911680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 250 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 12092647 - 12092428
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||||||| |||| ||| |||| ||||||||| ||||||| || |||  ||||||| ||| |||||||| ||| || |||||||| ||| ||||||||||    
T  12092647 tgttgtgtgcaagggtgtgttagatgtcccacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagaggatccataaactcattgccttaaggt 12092548  T
Q  350 ttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatcaga 449  Q
    |||  |||||| ||||||||||   |  |||||| ||||| ||| ||||  ||||||  |||||||  ||| |||||||||| || ||  |||||| |||    
T  12092547 tttgagtaagactgtggtgtctctctcacttgtgaggttgctctggcctggatgtgggtggtccccttggcccccctcgtgtcccaactctggtattaga 12092448  T
Q  450 acc-cggttcgacgaagggt 468  Q
     || ||||| ||||||||||    
T  12092447 gccgcggtttgacgaagggt 12092428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 247 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 5958771 - 5958647
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||| ||| | |||||    
T  5958771 tgttgtggtgtgcaattgtgagttatatgtgttacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagaactcataaactcattgtcttaa 5958672  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
     ||||| ||  |||||||| |||||    
T  5958671 agttttgggatagagtgtgatgtct 5958647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 427
Target Start/End: Original strand, 31714736 - 31714838
Alignment:
Q  324 gacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcc 423  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||  |||||||||||| || ||  | ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  31714736 gacccattaactcattgccttaaggttttgagtaagagtgtggcgttttt-tcgcttgtgtggttgctctagcctcgatgtggacggtctcccagactcc 31714834  T
Q  424 cctc 427  Q
    ||||    
T  31714835 cctc 31714838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 259 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 12071847 - 12071657
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    ||||||||||||||||||| | | || |||| || | |  || |||||||| ||||||   | | ||| |||||||| ||  |||||||||||| |||||    
T  12071847 caagtgtgagttatatgtctcgcatcagatagaaaaatggagtttgaacactttataatagaaaggactcataaacctatgaccttaaggttttgggtaa 12071748  T
Q  359 gagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatcaga 449  Q
    |||||||| ||||   |  |||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||  |  ||||||||||||||    
T  12071747 gagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtgaacggtcccctaagctcccctcatgacctaacagtggtatcaga 12071657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 371
Target Start/End: Original strand, 2975567 - 2975666
Alignment:
Q  272 tatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    |||||||||| ||  ||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | | ||||| |||||   |||||||||| |||||    
T  2975567 tatgtcccacatcaaatagaaaagtaaatgttgaacaccttataagcaagatgacccataaatcctttgtcttaaagttttgaataagagtgtgatgtct 2975666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 12085198 - 12085001
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||  | || |||| || |||  || |||||||| ||||||   | | ||| |||||| |||| ||||||||||    
T  12085198 tgttttgtgcaagtgtgagttatatgtcctgcatcagatagaa-agtggagtttgaacactttataatagaaaggactcataaaaccatggccttaaggt 12085100  T
Q  350 ttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatcaga 449  Q
    ||| ||||||||||||| ||||   |  |||||| ||||| ||||||||| ||| | |||||| || | ||||||||| ||  || ||||||||||||||    
T  12085099 tttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgcgaacggtctcctaagctcccctcatg-acccacagtggtatcaga 12085001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 294 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14789325 - 14789284
Alignment:
Q  294 agtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacc 335  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  14789325 agtaaaggttgaacaccttacaagtaagaggacccataaacc 14789284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 277 - 330
Target Start/End: Original strand, 35210498 - 35210551
Alignment:
Q  277 cccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccat 330  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  35210498 cccacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttgtaagtaagaggacccat 35210551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 325 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22605345 - 22605301
Alignment:
Q  325 acccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgt 369  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22605345 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgt 22605301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 303 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 30618727 - 30618584
Alignment:
Q  303 tgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaat 402  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  | | ||||||||| | ||||| | ||||||||||   || ||| || ||||| ||| |||| |||    
T  30618727 tgaacactttataagtaagatgacc-ataaaccgtt-gtcttaaggttatgggtaaaaatgtggtgtctctcttacttatgtggttgctcttgcct-aat 30618631  T
Q  403 gtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatcaga 449  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||||  || |||||||| |||||    
T  30618630 gtgggtggtccccaaggctcccctcgtgacccaacagtggtctcaga 30618584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 249 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 7588390 - 7588358
Alignment:
Q  249 ttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccac 281  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7588390 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccac 7588358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 325 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21130147 - 21130103
Alignment:
Q  325 acccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgt 369  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  21130147 acccataaatccattgccttaaggttttggataagagtgtggtgt 21130103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 133; Significance: 6e-69; HSPs: 68)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 247 - 471
Target Start/End: Original strand, 6421375 - 6421599
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| |    
T  6421375 tgttgttgtgcacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttga 6421474  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatc 446  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||  || |||||||||||    
T  6421475 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagtctcgatgtggacggtcccccgagctcccctcgtgacccaacagtggtatc 6421574  T
Q  447 agaacccggttcgacgaagggtacg 471  Q
    ||| | | ||||||| |||||||||    
T  6421575 agagcaccgttcgacaaagggtacg 6421599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 250 - 471
Target Start/End: Original strand, 42514642 - 42514863
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| || || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  42514642 tgttgtatgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatcgccttaagat 42514741  T
Q  350 ttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatcaga 449  Q
    ||| ||||||||||||| ||||   || |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  42514742 tttgggtaagagtgtggcgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccctcgtgacccaacagtggtatcaga 42514841  T
Q  450 acccggttcgacgaagggtacg 471  Q
     ||| |||||||||||||||||    
T  42514842 gccctgttcgacgaagggtacg 42514863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 259 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 36178761 - 36178552
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  36178761 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 36178662  T
Q  359 gagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatcaga-acccggtt 457  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||||||  || | ||||||||||||  |||||||    
T  36178661 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctctatgtggacgatcccccgcgct-ccctcgtgacccaatagtggtatcagagccccggtt 36178563  T
Q  458 cgacgaagggt 468  Q
    |||||||||||    
T  36178562 cgacgaagggt 36178552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 247 - 430
Target Start/End: Original strand, 15880253 - 15880436
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  15880253 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 15880352  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtg 430  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||| ||  ||||| ||||||    
T  15880353 ggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttttagcctcgatgtggacgttcctccgagctccactcgtg 15880436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 259 - 468
Target Start/End: Original strand, 37105926 - 37106136
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||    
T  37105926 caagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaggggacccataaactcattgccttaagattttgggtaa 37106025  T
Q  359 gagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatcaga-acccggtt 457  Q
    |||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||  || ||||||||||||||  |||||||    
T  37106026 gagtgtggtgtctctcttgcttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctccccttgtgacccaacagtggtatcagagccccggtt 37106125  T
Q  458 cgacgaagggt 468  Q
    |||||||||||    
T  37106126 cgacgaagggt 37106136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 259 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 14745823 - 14745612
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  14745823 caagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 14745724  T
Q  359 gagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggct-cccctcgtgttcctacagtggtatcaga-acccggt 456  Q
    |||||||| ||||   ||||  ||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||  ||| |||||||||  || ||||||||||||||  ||||||    
T  14745723 gagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcgatgtggacagtcccccgagctccccctcgtgacccaacagtggtatcagagccccggt 14745624  T
Q  457 tcgacgaagggt 468  Q
    |||| |||||||    
T  14745623 tcgatgaagggt 14745612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 259 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 5542781 - 5542615
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  5542781 caagtgtgagttatatgtcccatatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaaggtttttggtaa 5542682  T
Q  359 gagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccc 425  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  5542681 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttcaagtctcgatgtggacggtcccccgagctcccc 5542615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 259 - 413
Target Start/End: Original strand, 37106190 - 37106344
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  37106190 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatttccttaaggttttgggtaa 37106289  T
Q  359 gagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcc 413  Q
    ||||||||||| |   ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  37106290 gagtgtggtgtttctcttgcttgtgcgattgttctagcctcgatgtggacggtcc 37106344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 259 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 41283631 - 41283463
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  41283631 caagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttaggtaa 41283532  T
Q  359 gagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctc 427  Q
    |||||||| ||||   ||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  41283531 gagtgtggcgtctctcttgtttgtgtggttgttctagccttgatgtggacggtcccccatgctcccctc 41283463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 250 - 468
Target Start/End: Original strand, 962591 - 962808
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  962591 tgttgtatgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggacccataaacccattgtcttaaggt 962690  T
Q  350 ttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatcaga 449  Q
    ||| |||||||||||| ||||    ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||   |||||| | || ||| ||||| |||| |||    
T  962691 tttgggtaagagtgtgttgtcactcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtctcccgaactcccc-catgatccaacagtagtattaga 962789  T
Q  450 acccggttcgacgaagggt 468  Q
     |||||||||| |||||||    
T  962790 gcccggttcgatgaagggt 962808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 259 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 5543154 - 5542964
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||| |||| |||||    
T  5543154 caagtgtgagttatatgtcccacatccgataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacctattgccttaagattttgggtaa 5543055  T
Q  359 gagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatcaga 449  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||    ||||||| | || ||| ||||||||||||||    
T  5543054 gagtgtggtgtctctattgcttgtgcggttgttcaagcctcgatgtggacggtaccttgagctccccccatgatccaacagtggtatcaga 5542964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 247 - 416
Target Start/End: Original strand, 6712966 - 6713136
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||    
T  6712966 tgttgttgtatacaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgctttaa 6713065  T
Q  347 ggttttt-ggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccc 416  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||   |||||| || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  6713066 ggtttttgggtaagagtgtgatgtctctcttgcttatgggattgttctagcctcgatgtggacggtccccc 6713136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 247 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 36006047 - 36005887
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  36006047 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaa-agtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 36005949  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggac 408  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||   ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  36005948 ggttttgggtaaaagtgtggcgtctctcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggac 36005887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 252 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 35580886 - 35580659
Alignment:
Q  252 ttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggttt 351  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  35580886 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacaataaatgttgaacaccttataagtgagagga-ccataaacccattgccttaaggttt 35580788  T
Q  352 ttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatcaga-a 450  Q
    | |||||||||| || ||||   ||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||   ||  || | | ||||||||||      
T  35580787 tgggtaagagtgcggcgtctctcttgtttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctgactcccccaatgacccaataatggtatcagagc 35580688  T
Q  451 cccggttcgacgaagggtacgtccgaggc 479  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  35580687 cccggttcgacgaagggtatgaccgaggc 35580659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 250 - 478
Target Start/End: Original strand, 23346228 - 23346457
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatat--gtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaag 347  Q
    |||||||| | ||||||||||||||  ||| ||| ||| ||| || |||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  23346228 tgttgtgtgcgagtgtgagttatatatgtctcacatcgtatagaaaagtaaaggttaaacaccttataa-taagagggcccataaacccatagccttaag 23346326  T
Q  348 gtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatca 447  Q
    ||||| |||||||||||| |||||   ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||  ||||||||| ||  || ||| ||||||||    
T  23346327 gttttcggtaagagtgtgatgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctagatgtggacggtcgcccgagctcccctcatgacccaacaatggtatca 23346426  T
Q  448 gaacccggttcgacgaagggtacgtccgagg 478  Q
    || ||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  23346427 gagcccggtttgacgtagggtacgaccgagg 23346457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 247 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 15511661 - 15511495
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  15511661 tgttgttgtgtgcaagtg--agttatatgtcacacaacggataaaagagtaaaggttgaacacgttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaa 15511564  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccc 415  Q
    | |||| ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||| |||||    
T  15511563 gattttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagtctcgatgtggacgatcccc 15511495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 273 - 416
Target Start/End: Original strand, 6422126 - 6422269
Alignment:
Q  273 atgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtctt 372  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  6422126 atgtcccacatcagataaaaaagtaaaggttgaacacattataattaagaggacccataaacccatagccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctc 6422225  T
Q  373 agttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccc 416  Q
      ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  6422226 tcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggactgtccccc 6422269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 247 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 38796788 - 38796619
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||    
T  38796788 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgataaaacaataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaatgccttaa 38796689  T
Q  347 ggtttttggtaagag--tgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccc 414  Q
    |||||| ||||||||  ||||| ||||   ||||||||| ||||| || |||||| |||| |||||||||    
T  38796688 ggttttgggtaagagtatgtggcgtctctattgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtcgacggtccc 38796619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 250 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 40679794 - 40679632
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |    
T  40679794 tgttgtgtgcaaatgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaagggttgaacaccttataagtaagagaacccataaacccatcgccttaagat 40679695  T
Q  350 ttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtc 412  Q
    ||| ||||||||||||| ||||   || |||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  40679694 tttgggtaagagtgtggcgtctctcttacttgtggggttgttctagtctcgatgtggacggtc 40679632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 250 - 399
Target Start/End: Original strand, 5367448 - 5367597
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||  |||||||||    
T  5367448 tgttgtgtacaagtgtgatatatatgtcccagatcggataaaagagcaaaggttgaacaccttataagtaagatgatccatgaacacataaccttaaggt 5367547  T
Q  350 ttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctc 399  Q
    ||| ||||||||||||| ||||   |||||||||| |||| |||||||||    
T  5367548 tttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctc 5367597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 246 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 28254406 - 28254281
Alignment:
Q  246 atgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcctta 345  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  28254406 atgttgttgtgtgccagtgtgacttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 28254307  T
Q  346 aggtttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  28254306 aggttttgggtaagagtgtggtgtct 28254281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 247 - 413
Target Start/End: Original strand, 33731636 - 33731804
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgt--gagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcctt 344  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| || |||||    
T  33731636 tgttgttgtgttcaagtgtgtgagttatatatctcacatcggataaaagagtaaaggttgagcaccttataagtaagaggatccataaacctattgcctt 33731735  T
Q  345 aaggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcc 413  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||   |||||| |||||||| ||||||||| ||||  |||||||    
T  33731736 aaggttttgggtaagagtatggtgtctctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgtaaacggtcc 33731804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 275 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 36178311 - 36178156
Alignment:
Q  275 gtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtcttag 374  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||       
T  36178311 gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagggaacccataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgcctctc 36178212  T
Q  375 ttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtg 430  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  36178211 ttgcttgtgtggttgttatagcctcgatgtagacggtcccccgcgctcccctcgtg 36178156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 247 - 416
Target Start/End: Original strand, 40733507 - 40733676
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |   ||||||    
T  40733507 tgttattgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctacaaccttaa 40733606  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccc 416  Q
     ||||| ||||||||||||||||||   | ||||||| ||| | || || ||| ||||||| ||||||||    
T  40733607 agttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttgtgtggtagttcaagtctcgatgtggatggtccccc 40733676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 250 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 28531479 - 28531361
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||| |    
T  28531479 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagcaaaggttgaacaccttataagtaagaggtcccataaactcattgccttaagat 28531380  T
Q  350 ttttggtaagagtgtggtg 368  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  28531379 tttgggtaagagtgtggtg 28531361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 247 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 31259787 - 31259664
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtc---ggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcct 343  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  31259787 tgttgttgtgtgtaagtgcgagttatatgtctcacatcatcggataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagatgacccataaacctatcacct 31259688  T
Q  344 taaggtttttggtaagagtgtggt 367  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  31259687 taaggttttgggtaagagtgtggt 31259664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 247 - 416
Target Start/End: Original strand, 40733873 - 40734041
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| | | ||| |||| |  |||||||    
T  40733873 tgttattgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaagatttaacaccttataagtaagagggctcat-aacctacagccttaa 40733971  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccc 416  Q
     ||||| ||||||||||||||||||   | ||||||| ||||| || || ||| ||||||||||||||||    
T  40733972 agttttgggtaagagtgtggtgtctgtctcgcttgtgtggttgttcaagtctcgatgtggacggtccccc 40734041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 254 - 471
Target Start/End: Original strand, 7598225 - 7598443
Alignment:
Q  254 gtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggttttt 353  Q
    |||| ||||||||| |||||||| | || ||| ||| || |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||     
T  7598225 gtgtgcaagtgtgaattatatgttctacatcgaatagaaaagtaaaggttcaacaccttataaataagaggacccataaactcatagccttaaggttttg 7598324  T
Q  354 ggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatcagaaccc 453  Q
    ||||||| | ||||||||   |  |||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||    |||||||||||  || ||| |||||||| | |||    
T  7598325 ggtaagaatatggtgtctctctcacttgtgcggttgttcaagcctcgatgtgaacggtcccctgatctcccctcgtgacccaacactggtatcaaagccc 7598424  T
Q  454 -ggttcgacgaagggtacg 471  Q
     ||||||||||||||||||    
T  7598425 aggttcgacgaagggtacg 7598443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 259 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 36178425 - 36178320
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  36178425 caagtgtgagttatatgtcccacttcggataaaatagtaaaggtggaacaccttataagtaaggggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaa 36178326  T
Q  359 gagtgt 364  Q
    ||||||    
T  36178325 gagtgt 36178320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 254 - 405
Target Start/End: Original strand, 1769889 - 1770040
Alignment:
Q  254 gtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggttttt 353  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| || || | | |||     
T  1769889 gtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcatagctttgaagctttg 1769988  T
Q  354 ggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtg 405  Q
      ||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  1769989 aataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcgatgtg 1770040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 250 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 37632762 - 37632643
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||  |||  |||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||    
T  37632762 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggtttgacattttataagtaagaggacccataaacccataactttaaggt 37632663  T
Q  350 ttttggtaagagtgtggtgt 369  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  37632662 tttgggtaagagtgtggtgt 37632643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 247 - 364
Target Start/End: Original strand, 16542439 - 16542556
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| ||| |||||||    
T  16542439 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttataagtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacttataaactcattgccttaa 16542538  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgt 364  Q
    | ||||  ||||||||||    
T  16542539 gattttgagtaagagtgt 16542556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 247 - 371
Target Start/End: Original strand, 29676893 - 29677022
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagt-----aagatgacccataaacccatcgc 341  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||      ||| ||||||||||||||| ||    
T  29676893 tgttgttgtgtgcaggtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggtttaacaccttataggtgagaggagaagacccataaacccattgc 29676992  T
Q  342 cttaaggtttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  29676993 cttaaggctttaagtaagagtgtggtgtct 29677022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 247 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 31468914 - 31468800
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||    ||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  31468914 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaatatctta----taagaggacccataaactcattgccttaa 31468819  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtg 365  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  31468818 ggttttgggtaagagtgtg 31468800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 254 - 371
Target Start/End: Original strand, 7598606 - 7598715
Alignment:
Q  254 gtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggttttt 353  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||| ||||||    
T  7598606 gtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa--------ccttaacgttttt 7598697  T
Q  354 ggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    ||||||||||||||||||    
T  7598698 ggtaagagtgtggtgtct 7598715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 263 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 14745446 - 14745338
Alignment:
Q  263 tgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagt 362  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  14745446 tgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaatggttgaacatcttgtaagtatgaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 14745347  T
Q  363 gtggtgtct 371  Q
    |||| ||||    
T  14745346 gtggcgtct 14745338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 247 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 38796386 - 38796298
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacc 335  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  38796386 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacctataaacc 38796298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 246 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 31899595 - 31899496
Alignment:
Q  246 atgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcctta 345  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  31899595 atgttgttgtgtgaaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 31899496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 268 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 40163520 - 40163383
Alignment:
Q  268 gttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaaccca-tcgccttaaggtttttggtaagagtgtgg 366  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |  | |||||||||| ||||| |||||||    
T  40163520 gttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccattaacctagtgtctttaaggttttgggtaaaagtgtgg 40163421  T
Q  367 tgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgt 404  Q
    |||||   ||||||||| ||||| |||| |||| ||||    
T  40163420 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgt 40163383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 319 - 480
Target Start/End: Original strand, 6421793 - 6421955
Alignment:
Q  319 aagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccag 418  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||   |  |||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||      
T  6421793 aagaggacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctaacttgtgtggttgttctggcctcgatgtggacggtcccccga 6421892  T
Q  419 gctcccctcgtgttcctacagtggtatcagaacc-cggttcgacgaagggtacgtccgaggca 480  Q
    ||||||||| ||  || || ||||||| ||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  6421893 gctcccctcatgacccaacggtggtattagagcctcggttcgacaaagggtacgaccgaggca 6421955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 248 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 12529195 - 12529038
Alignment:
Q  248 gttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaag 347  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| || ||  |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||     
T  12529195 gttgttgtatgcaagtgtgagttatatgtcctacatcaaataaaacagtaaagattgaacaccgtataagtaagaggactcataaactcattgccttaaa 12529096  T
Q  348 gtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtg 405  Q
    ||||| | |||||  || ||||||   ||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  12529095 gttttagataagaacgtagtgtctctcttgtttgtgcggttgttctaacctcaatgtg 12529038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 249 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 37895227 - 37895107
Alignment:
Q  249 ttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaagg 348  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||| || | |||| |||||| |||||| |||||| |  || ||||||||||| |||||||||    
T  37895227 ttgttgtgtgcgagtttgagttatatgtcccacatcggatagaaaaataaaagttgaaaaccttaaaagtaaaagaacacataaacccattgccttaagg 37895128  T
Q  349 tttttggtaagagtgtggtgt 369  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  37895127 ttttgggtaagagtgtggtgt 37895107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 247 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 36785731 - 36785664
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttat 314  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36785731 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttat 36785664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 253 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 29874185 - 29874067
Alignment:
Q  253 tgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttt 352  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| || |||  ||||||||||| |||||| |  || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29874185 tgtgtacaagtgtgtgttatatgtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacactttataattgggaggacccataaacccattgccttaaggtttt 29874086  T
Q  353 tggtaagagtgtggtgtct 371  Q
     | ||||||||||| ||||    
T  29874085 ggataagagtgtggcgtct 29874067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 249 - 449
Target Start/End: Original strand, 30313170 - 30313369
Alignment:
Q  249 ttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaagg 348  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||| ||| ||||||| || |||  ||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||| ||||||||     
T  30313170 ttgttgtgtgcaagcgtgtgttatatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgaacac-ttataagtgagaggacccaaaaactcattgccttaaga 30313268  T
Q  349 tttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatcag 448  Q
    |||| ||||||||||||| ||||   |  |||||| ||||| ||| ||||  || | |||| |||||| ||||| |||||||  || |||||||||||||    
T  30313269 ttttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgctctggcctggattttgacgatcccccgggctctcctcgtgacccaacagtggtatcag 30313368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 427
Target Start/End: Original strand, 16590881 - 16591053
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaaga-gtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaagg 348  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||| | ||||||||||||||      |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  16590881 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcaaataaaaaaagtaaaggttgaaca------aagtaagaggacccataaacacattgccttaagg 16590974  T
Q  349 tttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctc 427  Q
    ||||  |||||| | |  |||||   || |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||    
T  16590975 ttttaagtaagaatctaatgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcaatgtggacagtctcccgagctcccctc 16591053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 33561616 - 33561501
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||| || |||  ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  33561616 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgttccacatcagatagaaaagtggaggttaaacactttataagtgagaggacccataaactcattgtcttaaggt 33561517  T
Q  350 ttttggtaagagtgtg 365  Q
    ||| ||||||||||||    
T  33561516 tttgggtaagagtgtg 33561501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 247 - 305
Target Start/End: Original strand, 6421294 - 6421352
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttga 305  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6421294 tgttgttgtgtacaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttga 6421352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 265 - 415
Target Start/End: Original strand, 29676543 - 29676687
Alignment:
Q  265 tgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgt 364  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||  |||||||||| ||| |||      |||| |||||||||||    
T  29676543 tgagttatatgtctcacattggataaaagagtaaagattgaacacattataagtgagagaacccataaactcattgcc------ttttgggtaagagtgt 29676636  T
Q  365 ggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccc 415  Q
    |||||||   ||||||||| ||||  || | |||| |||||||||||||||    
T  29676637 ggtgtctctcttgcttgtggggttattcaaacctcgatgtggacggtcccc 29676687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 249 - 371
Target Start/End: Original strand, 30323456 - 30323578
Alignment:
Q  249 ttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaagg 348  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||  || |||| || | |  ||||||||||| ||| |||| ||| |||| |||||| ||| |||||||||    
T  30323456 ttgttgtgtgcaagtgtgtgttatatgtcccaaatcagatagaaaattggaggttgaacactttagaagtgagaggacctataaactcattgccttaagg 30323555  T
Q  349 tttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    |||| ||||||||||||| ||||    
T  30323556 ttttgggtaagagtgtggcgtct 30323578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 252 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 37894855 - 37894738
Alignment:
Q  252 ttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggttt 351  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||| | | ||| || |||||||| | || ||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||| |||    
T  37894855 ttgtgtgcaaatgtgagttatatgtcccacattgaatagaaaagtaaaggctaaaaaccttataagtaagaagactcataaatccattgccttaagattt 37894756  T
Q  352 ttggtaagagtgtggtgt 369  Q
    | | ||| ||||||||||    
T  37894755 tggttaaaagtgtggtgt 37894738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 425
Target Start/End: Original strand, 3673122 - 3673236
Alignment:
Q  311 ttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacgg 410  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||| || ||||| |||| | |||||||||| |||||   || || ||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  3673122 ttataagtaagaggatccataaactcattgctttaagattttggctaagagtgtgatgtctctcttactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 3673221  T
Q  411 tcccccaggctcccc 425  Q
    |||||| ||||||||    
T  3673222 tccccctggctcccc 3673236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 468
Target Start/End: Original strand, 3672773 - 3672913
Alignment:
Q  329 ataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccc-tc 427  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||  ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||| |     
T  3672773 ataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttaattgtgtggttgttctagtctcgatgtggacggttcccctggctcccccta 3672872  T
Q  428 gtgttcctacagtggtatcagaacccggttcgacgaagggt 468  Q
    |||  || ||  || ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  3672873 gtgacccaacgctgttatcagagccccgttcgacgaagggt 3672913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 33953936 - 33953821
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||||| || |||| || |||  |||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||  | |||||||  |    
T  33953936 tgttgtgtgcaaatgtgagttataagtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacactatataagtgagaggacccataaacctgttgccttaaaat 33953837  T
Q  350 ttttggtaagagtgtg 365  Q
    ||| ||||||||||||    
T  33953836 tttgggtaagagtgtg 33953821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 250 - 364
Target Start/End: Original strand, 9231242 - 9231356
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||| ||  || |||| || |||||||||||||||  |||||| ||||| || |||| |||||| |||||||| ||    
T  9231242 tgttgtgtgtaagtatgagttatatgtctcatatcagatagaaaagtaaaggttgaacatattataaataagaggatccatcaacccaccgccttaaagt 9231341  T
Q  350 ttttggtaagagtgt 364  Q
    ||| | |||||||||    
T  9231342 tttggttaagagtgt 9231356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 250 - 364
Target Start/End: Original strand, 12910221 - 12910335
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||| |||| ||||||  || |||| ||||||||| |||||||||| | |||||  |||||  ||| | ||||||||    
T  12910221 tgttgtgtgtaagtttgagttatatgttccacatcggatggaaaagtacaggttgaaccccttataagtgaaatgacttataaattcattgtcttaaggt 12910320  T
Q  350 ttttggtaagagtgt 364  Q
    ||| |||||||||||    
T  12910321 tttgggtaagagtgt 12910335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 273 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 28254254 - 28254165
Alignment:
Q  273 atgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagt 362  Q
    ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| | | ||||||| ||||  |||||||||    
T  28254254 atgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaacactttgccttaaagtttagggtaagagt 28254165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 29873703 - 29873587
Alignment:
Q  249 ttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaagg 348  Q
    ||||||||| |||| ||| |||| ||||||||| || |||| || |||  ||||||||||  ||||||||  || ||| ||||||| ||| |||||||||    
T  29873703 ttgttgtgtgcaagggtgtgttacatgtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacattttataagtgggaggactcataaactcattgccttaagg 29873604  T
Q  349 tttttggtaagagtgtg 365  Q
    ||||  |||||||||||    
T  29873603 ttttgagtaagagtgtg 29873587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 299 - 371
Target Start/End: Original strand, 31385779 - 31385851
Alignment:
Q  299 aggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    ||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||| || |  ||||||||||||    
T  31385779 aggttgagcaccttataagtgaaaggacccataaacccattgccttaaggttttgggaataagtgtggtgtct 31385851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 449
Target Start/End: Original strand, 30312831 - 30312982
Alignment:
Q  299 aggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtct-tagttgcttgtgcggttggtctagcc 397  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||  ||  |||||||||||| ||||| ||||||  |||| |      ||||||||||| ||| |||    
T  30312831 aggttgaacactttataacttagatgacccataaacttatttccttaaggttttgggtaaaagtgtgtagtctctctcaatttgtgcggttgctctggcc 30312930  T
Q  398 tcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatcaga 449  Q
    | |||||||  ||||||||  ||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  30312931 tgaatgtgggtggtcccccgagctcccctcgtgacccaacagtggtatcaga 30312982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 36784365 - 36784287
Alignment:
Q  310 cttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggtt 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| | ||| ||||| ||||||   ||||||||| ||||    
T  36784365 cttataagtaagatgacccataaaccctttgtcttaaggttttggataaaagtgttgtgtctctcttgcttgtgtggtt 36784287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 247 - 292
Target Start/End: Original strand, 3673075 - 3673120
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaa 292  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  3673075 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaa 3673120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 250 - 319
Target Start/End: Original strand, 42515005 - 42515078
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgt----cccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagta 319  Q
    |||||||| || |||||||||||||||    ||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  42515005 tgttgtgtgcaggtgtgagttatatgtatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttaaacaccttataagta 42515078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 319 - 417
Target Start/End: Original strand, 6421688 - 6421786
Alignment:
Q  319 aagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccca 417  Q
    |||| |||||||||||| || | || |||||||| ||||||||||||||||||   |  |||||| ||||| ||  ||||| ||||||||||| |||||    
T  6421688 aagaggacccataaacctattgactaaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctaacttgtgtggttgttccggcctcgatgtggacggtacccca 6421786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 292
Target Start/End: Original strand, 3672709 - 3672754
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaa 292  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  3672709 tgttgttgtgtgcaagtatgagttatatgtcccacatcgaataaaa 3672754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 33954426 - 33954306
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| || |||  ||||| ||||   ||||| | | ||||| |||||| | || |||||| | |    
T  33954426 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagttgaggttaaacattatataacttaaatgactcataaatctat-gccttacgat 33954328  T
Q  350 ttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    ||| ||||||||||||| ||||    
T  33954327 tttgggtaagagtgtggcgtct 33954306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 41678534 - 41678419
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatat--gtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaag 347  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||| ||| || |||| || ||   ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| || | ||||||||    
T  41678534 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatatgtctcacatcagatagaaaaggggaggttaaacactttataagtgagaggacccataaa-cctttgccttaag 41678436  T
Q  348 gtttttggtaagagtgt 364  Q
    |||||  ||||||||||    
T  41678435 gttttgagtaagagtgt 41678419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 247 - 279
Target Start/End: Original strand, 40734268 - 40734300
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtccc 279  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40734268 tgttattgtgtacaagtgtgagttatatgtccc 40734300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 60)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 247 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 1085784 - 1085550
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  1085784 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 1085685  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatc 446  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||   || |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||  || |||||||||||    
T  1085684 ggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttacttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctggctcccctcatgacccaacagtggtatc 1085585  T
Q  447 aga-acccggttcgacgaagggtacgtccgaggca 480  Q
    | |  |||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  1085584 atagccccggttcgatgaagggtatgaccgaggca 1085550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 260 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 37533519 - 37533299
Alignment:
Q  260 aagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaag 359  Q
    ||||||||||||||||| | || | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  37533519 aagtgtgagttatatgttctacattgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaaggttttgggtaag 37533420  T
Q  360 agtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatcaga-acccggttc 458  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||  || ||||||||||||||  ||||||||    
T  37533419 agtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcgtgacccaacagtggtatcagagccccggttc 37533320  T
Q  459 gacgaagggtacgtccgaggc 479  Q
    |||||||||| || |||||||    
T  37533319 gacgaagggtgcgaccgaggc 37533299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 245 - 427
Target Start/End: Original strand, 7517568 - 7517750
Alignment:
Q  245 tatgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcctt 344  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  7517568 tatgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctt 7517667  T
Q  345 aaggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctc 427  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||   |  |||||| ||||| ||||||||| ||||||  |||||||  ||||||||||    
T  7517668 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctgtctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggtggtccccttggctcccctc 7517750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 245 - 480
Target Start/End: Original strand, 45433229 - 45433462
Alignment:
Q  245 tatgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcctt 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| || |||||    
T  45433229 tatgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgatccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaactcataaacctattgcctt 45433328  T
Q  345 aaggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctc-gtgttcctacagtggt 443  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||  ||  ||| ||   ||    
T  45433329 aagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggtcggtccccctggctcccctctatgaccctgca---gt 45433425  T
Q  444 atcagaacccggttcgacgaagggtacgtccgaggca 480  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  45433426 atcagagcccggttcgacaaagggtacgaccgaggca 45433462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 259 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 37533166 - 37532946
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  37533166 caagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa 37533067  T
Q  359 gagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatcaga-acccggtt 457  Q
     ||||||||||||   ||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||  |||||| |||||  || ||||||||||||||  |||||||    
T  37533066 -agtgtggtgtctctcttgcttgtgcgcttgttctaacctcgatgtggacggtcccccgcgctcccatcgtgacccaacagtggtatcagagccccggtt 37532968  T
Q  458 cgacgaagggtacgtccgaggc 479  Q
    ||||||||||| || |||||||    
T  37532967 cgacgaagggtgcgaccgaggc 37532946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 247 - 426
Target Start/End: Original strand, 30244260 - 30244439
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  30244260 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaagaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaa 30244359  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccct 426  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   |  |||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||||||  ||||||||    
T  30244360 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggatggtcccccgagctcccct 30244439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 247 - 430
Target Start/End: Original strand, 30245067 - 30245246
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  30245067 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagacgacccataaactcattgccttaa 30245166  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtg 430  Q
    |||||| |||||||||||||||||    |  |||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  30245167 ggttttgggtaagagtgtggtgtc----tctcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggatggtcccccgagctcccctcgtg 30245246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 247 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 40094942 - 40094773
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  40094942 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcgaataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagaggacccataaacccatcgtcttaa 40094843  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccc 416  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  40094842 ggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcgatgtggtcggtccccc 40094773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 244 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 22567209 - 22567027
Alignment:
Q  244 ttatgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcct 343  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  22567209 ttatgttgttgtatgcaagtgtgagtaatatgtcc-acatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcct 22567111  T
Q  344 taaggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctc 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||  ||||| ||||||| ||||||||  |||||||||    
T  22567110 taaggtttttggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttcgggcctcgatgtggatggtcccccgagctcccctc 22567027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 246 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 23546 - 23376
Alignment:
Q  246 atgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcctta 345  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  23546 atgttgttgtgtgcaattgtgagttatatgttccacatcggatacaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgcctta 23447  T
Q  346 aggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccc 416  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||   |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  23446 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcatgtgcggttgttctagcctcgatttggacggtccccc 23376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 247 - 417
Target Start/End: Original strand, 24177425 - 24177595
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  24177425 tgttgttgtgtgcaagtatgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggctgaacaccttataagtaagcggacccataaacccattgccttaa 24177524  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccca 417  Q
     ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||||    
T  24177525 agtttttggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgtcttagcctcgacgtggacggtccccca 24177595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 247 - 480
Target Start/End: Original strand, 45754706 - 45754937
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  45754706 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagatgactcataaacccatagccttaa 45754804  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatc 446  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| || |||||| |||| | ||||| | |  |||||||   ||  || |||||||||||    
T  45754805 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtag-cggtcactcgagctcccccaatgacccaacagtggtatc 45754903  T
Q  447 agaacccggttcgacgaagggtacgtccgaggca 480  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||| | ||||||||    
T  45754904 agagccccgttcggcgaagggtatgaccgaggca 45754937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 247 - 460
Target Start/End: Original strand, 47129085 - 47129297
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  47129085 tgttgttgtgcacaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacctcttataagtaagaggacccataaacccatcgctttaa 47129184  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatc 446  Q
    |||||| |||| |||||||||||||   |  |  ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| || ||| |||||||||||    
T  47129185 ggttttgggtaggagtgtggtgtctctctcacaagtgtggttgttctagcctcaatgtagacggtccccga-gctcccctcatgatccaacagtggtatc 47129283  T
Q  447 agaacccggttcga 460  Q
    ||| ||| ||||||    
T  47129284 agagccccgttcga 47129297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 247 - 371
Target Start/End: Original strand, 7554015 - 7554139
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  7554015 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccatagccttaa 7554114  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  7554115 ggttttgggtaagagtgtggtgtct 7554139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 247 - 425
Target Start/End: Original strand, 11845183 - 11845359
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  11845183 tgttgttgtgcacaagtg--agttatatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaa 11845280  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccc 425  Q
    |||||| | ||||||||||||||||   |||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||    
T  11845281 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcgatgtagacggtcccccgtgctcccc 11845359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 247 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 22566830 - 22566711
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  22566830 tgttgttgtatgcaagtgtgagtaatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 22566731  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtgg 366  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  22566730 ggttttgggtaagagtgtgg 22566711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 247 - 416
Target Start/End: Original strand, 45434626 - 45434795
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |  |||||||    
T  45434626 tgttgttgtgtacaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacttactgccttaa 45434725  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccc 416  Q
    |||||| |||||||||||| |||||   || ||||||  |||| ||||||||| |||||  |||||||||    
T  45434726 ggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtggagttgttctagcctcgatgtgatcggtccccc 45434795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 259 - 427
Target Start/End: Original strand, 29157567 - 29157735
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  29157567 caagtgtgagttatatgtcccacaccggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagacgacccataaatccattgccttaaggttttgggtaa 29157666  T
Q  359 gagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctc 427  Q
    |||||||||||||   ||||| |||  |||| ||||| ||  |||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  29157667 gagtgtggtgtctctcttgctcgtgtagttgctctagtcttgatgtggacggtctcccagactctcctc 29157735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 245 - 425
Target Start/End: Original strand, 30032555 - 30032735
Alignment:
Q  245 tatgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcctt 344  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  | ||||||||| || |||||    
T  30032555 tatgttgttgcgtacatgtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaagtgttgaacaccttataagtaagagtatccataaacctatagcctt 30032654  T
Q  345 aaggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccc 425  Q
    |||||||| ||||||||||||   |||   ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  30032655 aaggttttgggtaagagtgtgacatctctcttgcttgtgcggttgttctatcctcgatgtggacggtcccccgagctcccc 30032735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 247 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 34218202 - 34218036
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||||    
T  34218202 tgttgttgtgtacaaatgtgagttatatgtctcacatcggataaaaaagtaaatgttgaacaccttataagtgagaggactcataaacccattgtcttaa 34218103  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcc 413  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   | ||||||  ||||| || |||||| |||||||||||||    
T  34218102 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 34218036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 252 - 416
Target Start/End: Original strand, 6054555 - 6054719
Alignment:
Q  252 ttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggttt 351  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  6054555 ttgtggacaagtgttagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttt 6054654  T
Q  352 ttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccc 416  Q
    | ||||||||||||||||||    | |||||  ||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  6054655 tgggtaagagtgtggtgtctctcctacttgtatggttgttctagccttgatgtggacggtccccc 6054719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 247 - 371
Target Start/End: Original strand, 16569186 - 16569310
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  16569186 tgttgttgtatgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 16569285  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  16569286 ggtttttggtaagagtgcggtgtct 16569310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 247 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 16596476 - 16596352
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  16596476 tgttgttgtatgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 16596377  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  16596376 ggtttttggtaagagtgcggtgtct 16596352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 248 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 36939900 - 36939724
Alignment:
Q  248 gttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaag 347  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  36939900 gttgttctgtgcaagtgtgagttatatgtcccaaatcgtataaaatagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaag 36939801  T
Q  348 gtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctccc 424  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |   |||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||  ||||| ||||||    
T  36939800 gttttgggtaaaagtgtggtgtttctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgtggatgggtccccatgctccc 36939724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 246 - 425
Target Start/End: Original strand, 41854624 - 41854802
Alignment:
Q  246 atgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcctta 345  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||   |  ||||||    
T  41854624 atgtttttgtgtgcaagtatgagttatatgtcccacatcag-taaaagagtaaaggttgaacaccttataagcaagatgacctataaatataatgcctta 41854722  T
Q  346 aggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccc 425  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||  || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  41854723 aggttttgggtaagagtgtgacgtctttcttacttgtgcggttgttctagcctcaatgtagacggtccccctgactcccc 41854802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 265 - 405
Target Start/End: Original strand, 19122740 - 19122879
Alignment:
Q  265 tgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgt 364  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  19122740 tgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaatccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 19122838  T
Q  365 ggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtg 405  Q
    |||||||   ||||||||| ||||| ||||| ||| |||||    
T  19122839 ggtgtctatcttgcttgtgtggttgttctagtctcgatgtg 19122879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 247 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 118469 - 118290
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||  || |||    
T  118469 tgttgttgtgtgcaagtgtaagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaaggttgaacacctaataagtaagaggatccataaacccattaccgtaa 118370  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtc--ttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccc 425  Q
    |||||| ||||||||||||| |||  |   ||||||||| ||||| |||||| |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  118369 ggttttgggtaagagtgtggcgtctatctcttgcttgtgtggttgttctagctttgatgtggacggt-ccccaggctcccc 118290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 250 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 8128606 - 8128486
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  8128606 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaaataaaggttgaacaccttatatgtaagaggacccataaacccataaccttaaggt 8128507  T
Q  350 ttttggtaagagtgtggtgtc 370  Q
    ||| | |||||||||||||||    
T  8128506 tttggttaagagtgtggtgtc 8128486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 259 - 371
Target Start/End: Original strand, 14681512 - 14681624
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  14681512 caagtgtaagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagagggcccataaacccattgtcttaaggttttgggtaa 14681611  T
Q  359 gagtgtggtgtct 371  Q
    |||||||||||||    
T  14681612 gagtgtggtgtct 14681624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 247 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 36534952 - 36534828
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  | |||||    
T  36534952 tgttgttgtgtgcaagtgtaacttatatgtcccacctcggataaaacagtagaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaaagtcttaa 36534853  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||    
T  36534852 ggttttgggtaagagtgtggcgtct 36534828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 244 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 41910765 - 41910654
Alignment:
Q  244 ttatgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcct 343  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||| | ||    
T  41910765 ttatgttgttgtgtgtaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaataccttataactgagaggacccataaacccattggct 41910666  T
Q  344 taaggtttttgg 355  Q
    |||| |||||||    
T  41910665 taagatttttgg 41910654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 247 - 413
Target Start/End: Original strand, 9901635 - 9901799
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| || || |||||||| ||| | |||||    
T  9901635 tgttattgtgtataagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaacagtaaaggttgaacatcttatacgta-gaggatccataaactcattgtcttaa 9901732  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcc 413  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   ||||| ||||||||| |||||||||  ||||||| ||||    
T  9901733 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctagtgcggttgttctagcctcggtgtggactgtcc 9901799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 247 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 24838870 - 24838751
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaag-atgacccataaacccatcgcctta 345  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| | | ||||    
T  24838870 tgttgttgtgtataagtgtaagttatatgtctcacatcgaataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaaggatccataaacccgttgtctta 24838771  T
Q  346 aggtttttggtaagagtgtg 365  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  24838770 aggttttgggtaagagtgtg 24838751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 252 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 40230454 - 40230335
Alignment:
Q  252 ttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggttt 351  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  40230454 ttgtgtgcaagtgtaagttatatgtcccacatcgaataaaaaagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccatagtcttaaggttt 40230355  T
Q  352 ttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    | ||||| ||| ||||||||    
T  40230354 tgggtaaaagtctggtgtct 40230335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 247 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 1085417 - 1085294
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttat-atgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcctta 345  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||  |||||||||| ||| ||||||    
T  1085417 tgttgttgtgtgcaagtgtgagtttttatgtcccatatcggataaaatagtaaaagttgaacaactcataagtaagagaacccataaactcattgcctta 1085318  T
Q  346 aggtttttggtaagagtgtggtgt 369  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  1085317 aggttttgggtaagagtgtggtgt 1085294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 247 - 322
Target Start/End: Original strand, 30245484 - 30245559
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 322  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30245484 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 30245559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 247 - 322
Target Start/End: Original strand, 30255329 - 30255404
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 322  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30255329 tgttgttgtgtgcaagtgtgcgttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 30255404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 246 - 368
Target Start/End: Original strand, 36622949 - 36623071
Alignment:
Q  246 atgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcctta 345  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||| || || ||||||| |||| ||||||    
T  36622949 atgttattgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaacattttataagtaggaggatccataaatccattgcctta 36623048  T
Q  346 aggtttttggtaagagtgtggtg 368  Q
    ||||||| |||| |||| |||||    
T  36623049 aggttttgggtaggagtatggtg 36623071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 247 - 327
Target Start/End: Original strand, 30244691 - 30244771
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacc 327  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  30244691 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacc 30244771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 247 - 371
Target Start/End: Original strand, 43241485 - 43241609
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||  || | |||||    
T  43241485 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaaaaataaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacttattgacttaa 43241584  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    |||||| ||||| ||| || |||||    
T  43241585 ggttttaggtaaaagtatgatgtct 43241609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 250 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 28301708 - 28301613
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcctta 345  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  28301708 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaagctgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 28301613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 248 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 36109084 - 36109010
Alignment:
Q  248 gttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 322  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36109084 gttgttgtgtgcaagtgtgagttatatttctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 36109010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 262 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 44361616 - 44361517
Alignment:
Q  262 gtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagag 361  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||    
T  44361616 gtgtgagatatatgtctcacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctt-taagtaagatgatccataaacccataaccttacggttttaggtaagag 44361518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 299 - 430
Target Start/End: Original strand, 30253534 - 30253661
Alignment:
Q  299 aggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcct 398  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    |  |||||| ||||| || |||||    
T  30253534 aggttgaagaccttataagtaagagaacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtc----tctcttgtgtggttgttcaagcct 30253629  T
Q  399 caatgtggacggtcccccaggctcccctcgtg 430  Q
    | ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  30253630 cgatgtggatggtcccccgagctcccctcgtg 30253661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 247 - 371
Target Start/End: Original strand, 20599304 - 20599430
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | ||||| |||||| ||||| |||  |||||| ||| |||||||    
T  20599304 tgttgttgtctataagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaaaagtaaaggataaacactttataaataagaggacatataaactcattgccttaa 20599403  T
Q  347 ggtttttggta--agagtgtggtgtct 371  Q
     ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  20599404 cgttttgggtaagagagtgtggtgtct 20599430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 340 - 415
Target Start/End: Original strand, 47129452 - 47129527
Alignment:
Q  340 gccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccc 415  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  47129452 gccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgatctagcctcgatgtggacggtcccc 47129527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 316 - 413
Target Start/End: Original strand, 37167840 - 37167937
Alignment:
Q  316 agtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcc 413  Q
    ||||||| || ||||||| |||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  37167840 agtaagaggatccataaatccattgacttaaagttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 37167937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 36967399 - 36967335
Alignment:
Q  245 tatgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacac 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| || |||||    
T  36967399 tatgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaaaagtaaagattaaacac 36967335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 37532821 - 37532736
Alignment:
Q  345 aaggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtg 430  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||   | |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  37532821 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctagcttgtgctgttgttctagcctcgatgtggacggtcctccgcgctcccctcgtg 37532736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 40094559 - 40094502
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaac 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  40094559 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtccaacatcagataaaagagtaaaggttgaac 40094502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 303 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 28300366 - 28300242
Alignment:
Q  303 tgaacaccttataagtaagatgaccc-ataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaa 401  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||||   ||||  ||| ||||| ||  ||||| |    
T  28300366 tgaacaccttataagtaagagaaccccataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttcgggcctcga 28300267  T
Q  402 tgtggacggtcccccaggctcccct 426  Q
    |||||||||||| || | |||||||    
T  28300266 tgtggacggtcctcctgactcccct 28300242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 324 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 21416232 - 21416185
Alignment:
Q  324 gacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  21416232 gacccataaacccattgccttagggttttgggtaagagtgtggtgtct 21416185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 378 - 449
Target Start/End: Original strand, 30245276 - 30245347
Alignment:
Q  378 cttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatcaga 449  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||  || ||||||||||||||    
T  30245276 cttgtgtggttgttcaagcctcaatgtggacggtcccccatgctccccttatgacccaacagtggtatcaga 30245347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 378 - 461
Target Start/End: Original strand, 30253691 - 30253774
Alignment:
Q  378 cttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatcagaacccggttcgac 461  Q
    |||||| ||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  || ||| |||||||||| ||| |||||||    
T  30253691 cttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggactgtcccccaggctcccctcatgacccaacaatggtatcagagccccgttcgac 30253774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 326 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 23569091 - 23569046
Alignment:
Q  326 cccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  23569091 cccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtct 23569046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 436 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 40094746 - 40094702
Alignment:
Q  436 acagtggtatcagaacccggttcgacgaagggtacgtccgaggca 480  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  40094746 acagtggtatcagagccctgttcgacgaagggtacgaccgaggca 40094702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 28300644 - 28300569
Alignment:
Q  340 gccttaaggtttttgg-taagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccc 414  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||   ||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||| ||||    
T  28300644 gccttaaggttttggggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtggacgatccc 28300569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21619136 - 21619091
Alignment:
Q  324 gacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgt 369  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  21619136 gacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaaaagtgtggtgt 21619091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 378 - 427
Target Start/End: Original strand, 30244473 - 30244522
Alignment:
Q  378 cttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctc 427  Q
    |||||| ||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  30244473 cttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggacggtccctcaggctcccctc 30244522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 325 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 27391859 - 27391815
Alignment:
Q  325 acccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgt 369  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27391859 acccataaatccactgccttaaggttttaggtaagagtgtggtgt 27391815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 80)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 246 - 471
Target Start/End: Original strand, 10245909 - 10246135
Alignment:
Q  246 atgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcctta 345  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||    
T  10245909 atgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgccccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-ccataaacccaaagcctta 10246007  T
Q  346 aggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcg-tgttcctacagtggta 444  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||  || |||||||||    
T  10246008 aggttttgggtaagagtgtggtgtctcccttgcttgtctggttgttctagcctcgatgtggacgctcccccaagctcccctcgctgacccaacagtggta 10246107  T
Q  445 tcagaa-cccggttcgacgaagggtacg 471  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  10246108 tcagaaccccggttcgatgaagggtacg 10246135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 247 - 461
Target Start/End: Original strand, 25483326 - 25483540
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  25483326 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggatccataaacccattgccttaa 25483425  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatc 446  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  |||  || |||||||||||    
T  25483426 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtctccctggctcccccagtgacccaacagtggtatc 25483525  T
Q  447 agaacccggttcgac 461  Q
    | | ||| |||||||    
T  25483526 atagccccgttcgac 25483540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 252 - 478
Target Start/End: Original strand, 3340802 - 3341029
Alignment:
Q  252 ttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggttt 351  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  3340802 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccgcatcagatgaaagagtaaaggttgagcaccttataagtaagaggacccataaacccactgccttaaggttt 3340901  T
Q  352 ttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatcaga-a 450  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||   |||||||  |||  || ||||||||||||||      
T  3340902 tgggtaagagtgtggtgtctttcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtctcctgagctcccccagtgacccaacagtggtatcagagc 3341001  T
Q  451 cccggttcgacgaagggtacgtccgagg 478  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  3341002 cccggttcgacgaacggtacgaccgagg 3341029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 251 - 478
Target Start/End: Original strand, 44620654 - 44620880
Alignment:
Q  251 gttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtt 350  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||    
T  44620654 gttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatgaaatagtagaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacc-ataaccttaaggtt 44620752  T
Q  351 tttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatcagaa 450  Q
    || |||||||||||||| |||   ||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||| | ||||||||||||     
T  44620753 ttgggtaagagtgtggtttctctcttgcttgtgcggttgttatatcctcgatgtggacggtcccccaagctcccctcatgatccaatagtggtatcagag 44620852  T
Q  451 cccggttcgacgaagggtacgtccgagg 478  Q
    ||| ||||| | ||||||||| ||||||    
T  44620853 ccccgttcgtcaaagggtacgaccgagg 44620880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 250 - 427
Target Start/End: Original strand, 36629230 - 36629407
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  36629230 tgttgtgttcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaagttaaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggt 36629329  T
Q  350 ttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctc 427  Q
    ||| ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  36629330 tttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccacatgctcccctc 36629407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 252 - 480
Target Start/End: Original strand, 39404013 - 39404242
Alignment:
Q  252 ttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggttt 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||| || |||||||||    
T  39404013 ttgtgtacaagtgtgagttatatgtcctacattgaataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaactcatagcattaaggttt 39404112  T
Q  352 ttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctc-gtgttcctacagtggtatcagaa 450  Q
    | ||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||  |  ||| ||||||||||||| |    
T  39404113 tgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccctcactaatccaacagtggtatcagga 39404212  T
Q  451 cccggttcgacgaagggtacgtccgaggca 480  Q
    | | ||||||||||||||| | ||||||||    
T  39404213 cactgttcgacgaagggtatgaccgaggca 39404242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 247 - 414
Target Start/End: Original strand, 39404388 - 39404555
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  39404388 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggtggaacaccttataagtaagaggacccataaacctatagccttaa 39404487  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccc 414  Q
    |||||| || |||| ||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  39404488 ggttttgggcaagaatgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgaacggtccc 39404555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 247 - 415
Target Start/End: Original strand, 36572009 - 36572177
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  36572009 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaagacccataaatccattgccttaa 36572108  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccc 415  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||   | ||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||    
T  36572109 ggttttgggttagagtatggtgtctctctcgcttgtgcggttgttcaagcctcgatgtgaacggtcccc 36572177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 250 - 405
Target Start/End: Original strand, 52884688 - 52884844
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  52884688 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgatcgataaacccattgccttaaggt 52884787  T
Q  350 ttt-tggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtg 405  Q
    |||  ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  52884788 tttggggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgatctagcctcgatgtg 52884844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 247 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 1731813 - 1731646
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||    
T  1731813 tgttgttgtgtgcaaatgtgagttatatgtcccacatcagataaaacagtaaaggttgaacatcttataaataagaggacccataaaccaattgccttaa 1731714  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccc 414  Q
    |||||| |||||||||||||||| |   ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1731713 ggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtccc 1731646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 247 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 36608827 - 36608644
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||| | |||||    
T  36608827 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtccaacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctcataagtaagaggatccataaatccattgtcttaa 36608728  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtg 430  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   |  || ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36608727 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccaagctcccctcgtg 36608644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 254 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 54017754 - 54017583
Alignment:
Q  254 gtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggttttt 353  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||     
T  54017754 gtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacgtcagataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttta 54017655  T
Q  354 ggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccc 425  Q
    |||||||||||| |||||   |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||| |||  |||||||    
T  54017654 ggtaagagtgtgatgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtctccctagctcccc 54017583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 246 - 416
Target Start/End: Original strand, 50002415 - 50002585
Alignment:
Q  246 atgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcctta 345  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||| | ||||    
T  50002415 atgttgttgtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacactttttaagtaagaggacccataaatccattgtctta 50002514  T
Q  346 aggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccc 416  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||   || |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  50002515 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtgggcggtccccc 50002585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 259 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 55933278 - 55933113
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  55933278 caagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaagggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaagttttgggtaa 55933179  T
Q  359 gagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctccc 424  Q
    |||||||||||||   || ||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  55933178 gagtgtggtgtctctcttacttgtacagttgttctagcctcgatgtggacggtcccccaagctccc 55933113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 250 - 480
Target Start/End: Original strand, 20825829 - 20826061
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||    
T  20825829 tgttgtgtacaaatgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagagcacccataaacctttagccttaaggt 20825928  T
Q  350 ttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctc-gtgttcctacagtggtatcag 448  Q
    ||| |||||||||||||||| |   || ||| |||||||| ||||||||  |||||||| |||||||| |||||| ||  || ||| ||||||| |||||    
T  20825929 tttgggtaagagtgtggtgtttctcttccttatgcggttgttctagccttgatgtggacagtcccccatgctcccttcaatgatccaacagtggcatcag 20826028  T
Q  449 a-acccggttcgacgaagggtacgtccgaggca 480  Q
    |  |||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  20826029 agccccaattcgacgaagggtacgaccgaggca 20826061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 259 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 50630909 - 50630741
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  50630909 caagcgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 50630810  T
Q  359 gagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctc 427  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||| ||  |||||||||    
T  50630809 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttttagcctcgatgtgggcggtccgcctagctcccctc 50630741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 246 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 22183431 - 22183253
Alignment:
Q  246 atgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcctta 345  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  22183431 atgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatatcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacaatttataagtaaaaggacccataaacccattgcctta 22183332  T
Q  346 aggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctccc 424  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||   |  ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  22183331 aggttttggataagagtgtggcgtctctctcacttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccagactccc 22183253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 251 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 49076992 - 49076765
Alignment:
Q  251 gttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtt 350  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||  | || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||  ||||||||||    
T  49076992 gttgtgtgcaagtgtgagttatatgttccatattggctaaaatagtaaaggttgaacaccttata-gtaagagaacccataaacccataaccttaaggtt 49076894  T
Q  351 tttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatcagaa 450  Q
    || ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||   ||| ||||| ||  || ||||||||||||||     
T  49076893 ttgggttagagtgtggtgtctttcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggactgtcccctgagct-ccctcatgacccaacagtggtatcagag 49076795  T
Q  451 cccggttcgacgaagggtacgtccgaggca 480  Q
    ||| ||||||| ||||||||  ||||||||    
T  49076794 ccccgttcgacaaagggtactaccgaggca 49076765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 247 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 22028537 - 22028311
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagag--taaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcctt 344  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||||| || |||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| | |||    
T  22028537 tgttgttgtgtgcaagtgttacttatatgtcctacatcggataaaaaaaaataaaggttgaacaccttattagtaagaggacccataaactcattgtctt 22028438  T
Q  345 aaggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccag-gctcccctcg-tgttcctacagtgg 442  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||  || |||||||    
T  22028437 aatgttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcaatgtggacggtcccccaaagctcccctcactgacccaacagtgg 22028338  T
Q  443 tatcagaacccggttcgacgaagggta 469  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||    
T  22028337 tatcggagccccgttcgacgaagggta 22028311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 250 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 39793023 - 39792860
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||| ||||||||||||||||| |||| || || ||||| ||| ||||||||||    
T  39793023 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaatgttgaacaccttataagaaagaggaaccgtaaactcattgccttaaggt 39792924  T
Q  350 ttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcc 413  Q
    ||| ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  39792923 tttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 39792860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 266 - 477
Target Start/End: Original strand, 44621011 - 44621220
Alignment:
Q  266 gagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtg 365  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  44621011 gagttgtatgacccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcacataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 44621110  T
Q  366 gtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatcagaaccc-ggttcgacgaa 464  Q
    |||| |   ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||   ||||| ||| || ||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  44621111 gtgtttctcttgcttgtgcggttattctagcctcgatgtggacggtcccc---gctcctctcatgatccaacagtggtatcagagccctggtttgacgaa 44621207  T
Q  465 gggtacgtccgag 477  Q
    ||||||| |||||    
T  44621208 gggtacgaccgag 44621220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 250 - 480
Target Start/End: Original strand, 2740693 - 2740914
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||    
T  2740693 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaacccagagccttaaggt 2740792  T
Q  350 ttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatcaga 449  Q
    |||  |||||||||||| ||||   |  |||||  ||||| ||||||||| || |||| ||||||||  ||||||||       | ||||||||||||||    
T  2740793 tttacgtaagagtgtggcgtctctctcacttgt--ggttgttctagcctcgatatggatggtcccccgagctcccct-------caacagtggtatcaga 2740883  T
Q  450 acccggttcgacgaagggtacgtccgaggca 480  Q
     ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  2740884 gccccgttcgacgaagggtacgaccgaggca 2740914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 259 - 416
Target Start/End: Original strand, 41370359 - 41370516
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  41370359 caagtgtgagttatatgtcccaaatcggataaaatagtaaatgttgaaaaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaagttttgggtaa 41370458  T
Q  359 gagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccc 416  Q
    |||||| ||||||   ||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  41370459 gagtgtagtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 41370516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 247 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 34646815 - 34646691
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||| |||||||    
T  34646815 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataactaagaggactcataaactcattgccttaa 34646716  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  34646715 ggttttgggtaagagtgtggtgtct 34646691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 247 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 4955483 - 4955332
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  4955483 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcatatcggataaaatagttaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaa 4955384  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcct 398  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||   || |||||||||||| ||||||||    
T  4955383 ggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttacttgtgcggttgctctagcct 4955332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 247 - 371
Target Start/End: Original strand, 52884877 - 52885002
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  52884877 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccattgccttaa 52884976  T
Q  347 ggtttt-tggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    ||||||  ||||||| ||||||||||    
T  52884977 ggttttggggtaagaatgtggtgtct 52885002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 247 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 22028127 - 22027947
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||    
T  22028127 tgttgttgtgtgcaagtgtgacttatatgtcccacatcggataaaatacgaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacatattgccttaa 22028028  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctc 427  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||   | |||| || ||||| | ||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22028027 ggttttgggtaagaatgtggtgtctctctcgcttatgtggttgttttagtctcgatgtggacagtccctcaggctcccctc 22027947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 250 - 405
Target Start/End: Original strand, 54108908 - 54109060
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||||||| ||||||| ||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  54108908 tgttgtgtgcaagtgtcagttat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa-gt 54109004  T
Q  350 ttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtg 405  Q
    ||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  54109005 tttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcttcgatgtg 54109060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 247 - 414
Target Start/End: Original strand, 50459711 - 50459878
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||   |||||    
T  50459711 tgttgtagtgcataagtgtgagttatatgttccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaacccattatcttaa 50459810  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccc 414  Q
    |||||| |||||||| |||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  50459811 ggttttaggtaagagcgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgcacggtccc 50459878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 249 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 41707628 - 41707507
Alignment:
Q  249 ttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaagg 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||| ||| | |||||||    
T  41707628 ttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccatataagtaaaagaacccataaactcattgtcttaagg 41707529  T
Q  349 tttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  41707528 -ttttggtaagagtgtggtgtct 41707507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 245 - 371
Target Start/End: Original strand, 54936188 - 54936310
Alignment:
Q  245 tatgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcctt 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  54936188 tatgttgttgtgtacaagtgtgagttat----cccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagaggacccataaacccattgcctt 54936283  T
Q  345 aaggtttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    
T  54936284 aaggttttgggtaagagtgtggtgtct 54936310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 266 - 480
Target Start/End: Original strand, 44620362 - 44620569
Alignment:
Q  266 gagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtg 365  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  44620362 gagttatatgttccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagagcccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 44620461  T
Q  366 gtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatcagaacccggttcgacgaag 465  Q
     ||| |   ||||||||| ||||| |||| |||  |||||||||||||||   ||||| ||| || ||| |||||||||||    || ||||||||||||    
T  44620462 atgtttctcttgcttgtgtggttgttctaaccttgatgtggacggtcccc---gctcctctcatgatccaacagtggtatc----cctggttcgacgaag 44620554  T
Q  466 ggtacgtccgaggca 480  Q
    |||||  ||||||||    
T  44620555 ggtacaaccgaggca 44620569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 247 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 4390267 - 4390085
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | | | ||| || ||||    
T  4390267 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttacatatcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatcctttagcacattgcgttaa 4390168  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgt 429  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||   |||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||| |||| |||||| ||||    
T  4390167 ggttttgggtaagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcgatgcggacggtctcccaagctcccgtcgt 4390085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 259 - 371
Target Start/End: Original strand, 49880162 - 49880274
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  49880162 caagtgtgagttatatgtcccacattgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccactgccttaaggttttgggtaa 49880261  T
Q  359 gagtgtggtgtct 371  Q
    ||| |||||||||    
T  49880262 gagcgtggtgtct 49880274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 247 - 471
Target Start/End: Original strand, 54108527 - 54108751
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgta-caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacc-catcgcctt 344  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||  ||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||   ||| |||||    
T  54108527 tgttgttgtgttgcaagtgtgagttat--gtcccatataggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataaaattcattgcctt 54108624  T
Q  345 aaggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccca-ggctcccctcgtgttcctacagtggt 443  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||  || |||| |||    
T  54108625 aaggttttggctaagagtgtggtgtctatcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtgg-cggtcccccatagctcccccagtgacccaacagcggt 54108723  T
Q  444 atcagaacccggttcgacgaagggtacg 471  Q
    |||||| ||  |||||||||||||||||    
T  54108724 atcagagccacgttcgacgaagggtacg 54108751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 247 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 16889703 - 16889469
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgta-caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcctta 345  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||| |  ||||||    
T  16889703 tgttgttgtgtggcaagtgtgagttatatgtctcaaatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagaggattcataaacctactgcctta 16889604  T
Q  346 aggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtat 445  Q
    | ||||| ||||||||| ||||||||   || |||||| | ||| |||| |||| |||||||||||||| |  ||||||| ||||  || ||| |||||     
T  16889603 aagttttgggtaagagtatggtgtctctcttccttgtgtgattgttctaacctcgatgtggacggtccctcgagctccccacgtgacccaacaatggtac 16889504  T
Q  446 cagaacccggttcgacgaagggtacgtccgaggca 480  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  16889503 cagagccctgttcgacgaagggtacgactgaggca 16889469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 250 - 410
Target Start/End: Original strand, 20826210 - 20826370
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||  |    
T  20826210 tgttatgtagaaatgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaagttgaacacgttataagtaagagaacccataaacccatagccttaacat 20826309  T
Q  350 ttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacgg 410  Q
    ||| |||||||||||| |||||   || ||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  20826310 tttaggtaagagtgtgatgtctctcttccttatgcgattgttctagcctcgatgtggacgg 20826370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 267 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 54343147 - 54343005
Alignment:
Q  267 agttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtgg 366  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||       ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  54343147 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggac-------cccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 54343055  T
Q  367 tgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccc 416  Q
    |||||   ||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  54343054 tgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggatggtccccc 54343005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 250 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 32941286 - 32941128
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||  || ||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||| ||| ||||||||||    
T  32941286 tgttgtctgcaagtgtgagttatatgtcttacatcggaaagaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagggctcataaactcattgccttaaggt 32941187  T
Q  350 ttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggac 408  Q
    ||| ||||||||||||  ||||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  32941186 tttgggtaagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggac 32941128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 260 - 415
Target Start/End: Original strand, 49302907 - 49303064
Alignment:
Q  260 aagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataa--gtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggta 357  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  49302907 aagtgtgagttatatgtcccacatcaaataaaaaagtaaaggttgaacatcttataaaagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 49303006  T
Q  358 agagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccc 415  Q
    |||||||||||| |   || ||| |||| ||| |||| |||| ||||||||| |||||    
T  49303007 agagtgtggtgtatctcttacttatgcgattgttctatcctcgatgtggacgatcccc 49303064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 283 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 18932879 - 18932746
Alignment:
Q  283 tcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgt 382  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||   || ||||     
T  18932879 tcggataaaatagtaaaggttgaataccttataaataagaggacccataaacccattgccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctctcttacttga 18932780  T
Q  383 gcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccc 416  Q
    | ||||| | ||||||| ||||| ||||||||||    
T  18932779 gtggttgttatagcctcgatgtgtacggtccccc 18932746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 250 - 366
Target Start/End: Original strand, 2741064 - 2741180
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||    
T  2741064 tgttatgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataactccattgccttaaggt 2741163  T
Q  350 ttttggtaagagtgtgg 366  Q
    ||| |||||||||||||    
T  2741164 tttgggtaagagtgtgg 2741180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 247 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 16888983 - 16888804
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgta-caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcctta 345  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||| ||| | ||||    
T  16888983 tgttgttgtgtggcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagagaacctataaactcattgtctta 16888884  T
Q  346 aggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccc 425  Q
     |||||| |||||||||||| |||||   ||| ||||||| ||| |||||  || |||| |||||||||| | |||||||    
T  16888883 cggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttgtttgtgcgattgttctagtttcgatgtagacggtcccctaagctcccc 16888804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 311 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 23817783 - 23817612
Alignment:
Q  311 ttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacgg 410  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  23817783 ttataagtaagaggattcataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 23817684  T
Q  411 tccccca-ggctcccctcg-tgttcctacagtggtatcagaacccggttcgacgaagggtacgtccgaggca 480  Q
    |||||||  |||||||||| || ||| |||||||||||| | |||  ||||||||||||||||  |||||||    
T  23817683 tcccccatagctcccctcgatgatccaacagtggtatcatagccccattcgacgaagggtacgatcgaggca 23817612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 247 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 45489497 - 45489331
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || | |||||| | |   ||||    
T  45489497 tgttgttgtgtacaagtgtgaattatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccatataagtaagagaactcttaaaccta-ctgtttaa 45489399  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccc 414  Q
    | ||||||||||||||||| |||||   ||||| ||| | ||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  45489398 gatttttggtaagagtgtgatgtctcttttgctagtgtgattgttctagcctcgatgtggatggtccc 45489331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 247 - 372
Target Start/End: Original strand, 3341118 - 3341243
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||   ||| |  ||||    
T  3341118 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttaaacactttataagtaagaggacccataacatcattgttttaa 3341217  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtctt 372  Q
    | |||| |||||||||||| ||||||    
T  3341218 gattttgggtaagagtgtgatgtctt 3341243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 247 - 371
Target Start/End: Original strand, 43174496 - 43174621
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaa-gagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcctta 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||  |||||    
T  43174496 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgccacacatcagataaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacacataaacctatgacctta 43174595  T
Q  346 aggtttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    | || || ||||||||||||| ||||    
T  43174596 aagtgttgggtaagagtgtggcgtct 43174621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 247 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 54017870 - 54017750
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgt--cccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcctt 344  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||    
T  54017870 tgttgttgtgtgcaaatgtgagttatatatatcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccatattcccattgtctt 54017771  T
Q  345 aaggtttttggtaagagtgtg 365  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  54017770 aaggttttaggtaagagtgtg 54017750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 247 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 49076614 - 49076510
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||    
T  49076614 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtaccatatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaacccattgtcttaa 49076515  T
Q  347 ggttt 351  Q
     ||||    
T  49076514 agttt 49076510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 250 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 3244614 - 3244499
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||    
T  3244614 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaagt 3244515  T
Q  350 ttttggtaagagtgtg 365  Q
    ||| ||||||| ||||    
T  3244514 tttgggtaagaatgtg 3244499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 272 - 371
Target Start/End: Original strand, 45496820 - 45496919
Alignment:
Q  272 tatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45496820 tatgtcccacatcggataaaatcgtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 45496919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 250 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 54741341 - 54741227
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  || | ||||||||    
T  54741341 tgttgtgtgcaagtgtgaattatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccatacacagattgtcttaaggt 54741242  T
Q  350 ttttggtaagagtgt 364  Q
    ||| | |||||||||    
T  54741241 tttggataagagtgt 54741227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 250 - 346
Target Start/End: Original strand, 10246340 - 10246436
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  10246340 tgttgtgtgcaagtgtctgttatatgtctcaaatcggataaaagagtaaaggttgaacatcttataagttagaggacccataaacccatagccttaa 10246436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 252 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 34004744 - 34004586
Alignment:
Q  252 ttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggttt 351  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| |  ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||    
T  34004744 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatatgataaaa-actaaaggttgaacaacttataagtaagaggacccataaactcat-tccttaaggttt 34004647  T
Q  352 ttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtc 412  Q
    | | ||||||||||  ||||   |  |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  34004646 tcgataagagtgtgccgtctctctcccttgtgcggttgttctagcctcgatgtgaacggtc 34004586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 246 - 322
Target Start/End: Original strand, 44620285 - 44620361
Alignment:
Q  246 atgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 322  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620285 atgttgttgtgtacaaatatgagttatatgtcccacatgggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 44620361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 249 - 320
Target Start/End: Original strand, 3700357 - 3700428
Alignment:
Q  249 ttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaa 320  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3700357 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaa 3700428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 247 - 399
Target Start/End: Original strand, 19504695 - 19504838
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||         |||| |||||||||| | || |||||||    
T  19504695 tgttgttgtgtacaagtatgagttatatgtcccatatcggataaaatagtaaaagttgaacac---------aagaggacccataaatctattgccttaa 19504785  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctc 399  Q
     ||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||| |||||||||    
T  19504786 agttttgggtaagagtgtggcgtctatcttgcttgtgtggttgttctagcctc 19504838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 303 - 413
Target Start/End: Original strand, 18879852 - 18879962
Alignment:
Q  303 tgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaat 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||   ||| ||||| ||||| |||||| || ||    
T  18879852 tgaacaccttataagtaagatgacctataaacctatttccttaaggttttgggtaagagtgtgacgtctcttttggttgtgtggttgttctagcttcgat 18879951  T
Q  403 gtggacggtcc 413  Q
    |||||||||||    
T  18879952 gtggacggtcc 18879962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 248 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 51768225 - 51768115
Alignment:
Q  248 gttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaag 347  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| |  ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||| | ||||||    
T  51768225 gttgttgtgtgcaaatgtgagttatatgtcctatatcgaatataagagtaaatgttgaacaccttataaataagaggactcataaactcattgtcttaag 51768126  T
Q  348 gtttttggtaa 358  Q
    ||||| |||||    
T  51768125 gttttgggtaa 51768115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 250 - 371
Target Start/End: Original strand, 28034222 - 28034343
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||| || |||  ||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||  || || |||||||    
T  28034222 tgttgtgtgcaagtgtgaattatatgtcccgcatcggatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgagagaacccataaacttattgctttaaggt 28034321  T
Q  350 ttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    ||| ||||||||||||| ||||    
T  28034322 tttaggtaagagtgtggcgtct 28034343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 278 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 48111833 - 48111740
Alignment:
Q  278 ccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||  ||||| ||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  48111833 ccacctcggataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaaaaggacttataaatccattaccttaaggttttaggtatgagtgtggtgtct 48111740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 263 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 6975606 - 6975498
Alignment:
Q  263 tgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagt 362  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||| ||||   |||||| |||| |||||||||    
T  6975606 tgtgagttatatgtctcacatccgataaaatagtaaaggttgaatatcttataagtaagaggactcataaatccattatcttaagattttgggtaagagt 6975507  T
Q  363 gtggtgtct 371  Q
    |||| ||||    
T  6975506 gtggcgtct 6975498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 247 - 322
Target Start/End: Original strand, 44620934 - 44621010
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtccca-cgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 322  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620934 tgttgttgtggacaagtgtgagttagatgtcccaacatcggataaaactgtaaaggttgaacaccttataagtaaga 44621010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 297 - 416
Target Start/End: Original strand, 43827480 - 43827598
Alignment:
Q  297 aaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagc 396  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||   || |||||||||||| |||| |    
T  43827480 aaagattgaactccttataaataagaggacccataaattcattgccttaaggtttg-gataagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctaac 43827578  T
Q  397 ctcaatgtggacggtccccc 416  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  43827579 ctcgatgtggacggtccccc 43827598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 251 - 322
Target Start/End: Original strand, 44621420 - 44621491
Alignment:
Q  251 gttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 322  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44621420 gttgtgtgcaagtgtgagttatatgtccaacatgggataaaacagtaaaggttaaacaccttataagtaaga 44621491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 308 - 479
Target Start/End: Original strand, 31691203 - 31691375
Alignment:
Q  308 accttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtc--ttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtg 405  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||  |   |||||||| || ||| ||||||||| |||||    
T  31691203 accttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctatctcttgcttgtacgattgttctagcctcgatgtg 31691302  T
Q  406 gacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatcagaacccggttcgacgaagggtacgtccgaggc 479  Q
    |||| |||  |  |||||||   ||  || |||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  31691303 gacgatccttcgagctcccccaatgacccaacagtggtattagagccc-gtttgacgaagggtacgaccgaggc 31691375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 371
Target Start/End: Original strand, 760194 - 760302
Alignment:
Q  262 gtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagag 361  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| || | | ||||||||  || |||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||| ||    
T  760194 gtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaaatgaaggttgagaactttataagtgagaggacccataaactcattgccttaa-gattttggtaaaag 760292  T
Q  362 tgtggtgtct 371  Q
    ||||||||||    
T  760293 tgtggtgtct 760302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 371
Target Start/End: Original strand, 40067041 - 40067158
Alignment:
Q  255 tgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagt-aaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggttttt 353  Q
    |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||   ||||||| ||||     
T  40067041 tgtacaagtgtgagttatatgttctacatcggataaaagtgtaaaaagttgaacacattataagtaagaggacacatagatccactaccttaagattttg 40067140  T
Q  354 ggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    ||||| |||||| |||||    
T  40067141 ggtaaaagtgtgatgtct 40067158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 259 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 50788137 - 50788087
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacac 309  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  50788137 caagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 50788087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 305
Target Start/End: Original strand, 45050593 - 45050649
Alignment:
Q  249 ttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttga 305  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||    
T  45050593 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcaaataaaagagtaaaggttga 45050649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 45489870 - 45489650
Alignment:
Q  257 tacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggt 356  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||| || ||||||       |||||||||| |||    
T  45489870 tacaattgtgagttatatgtatcacattggataaaagagtaaagattgaatatcatataagtaagatgatccttaaaccttaaagtttaaggttttgggt 45489771  T
Q  357 aagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatcagaacccggt 456  Q
    || ||||||||||||   | |||||   ||||| ||||| ||| |||||| || |||||||  |||| |  |||  || ||| ||||||||||  || ||    
T  45489770 aatagtgtggtgtctctctcgcttgcatggttgttctagtctcgatgtggccgatcccccaaactcctccagtgacccaacaatggtatcagagtcccgt 45489671  T
Q  457 tcgacgaagggtacgtccgag 477  Q
    | ||||||||||||| |||||    
T  45489670 ttgacgaagggtacgaccgag 45489650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 311 - 416
Target Start/End: Original strand, 3271841 - 3271948
Alignment:
Q  311 ttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtg-gtgtct-tagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggac 408  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| || ||| | |||  || || ||||| ||||||||| ||||||||    
T  3271841 ttataagtaagagaacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtgtgtctctctcgtttattatgtggttgttctagcctcgatgtggac 3271940  T
Q  409 ggtccccc 416  Q
     |||||||    
T  3271941 agtccccc 3271948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 324 - 371
Target Start/End: Original strand, 11197293 - 11197340
Alignment:
Q  324 gacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  11197293 gacccataaacccattgccttagggttttgggtaagagtgtggtgtct 11197340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 299 - 367
Target Start/End: Original strand, 34544148 - 34544217
Alignment:
Q  299 aggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggttttt-ggtaagagtgtggt 367  Q
    ||||||| ||| |||||| | ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34544148 aggttgatcactttataaatgagaggacccataaactcattgccttaaggtttttgggtaagagtgtggt 34544217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 11348494 - 11348410
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccata 331  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| | || || ||||||| |||  ||||||||||| |||||||| ||| || |||||    
T  11348494 tgttgttgtgtgcaattgtgagttatatgttctacatcagataaaatagtggaggttgaacactttataagtgagaggatccata 11348410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 299 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 15841482 - 15841410
Alignment:
Q  299 aggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    ||||||||||| || ||||| ||| ||  ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  15841482 aggttgaacactttgtaagtgagaggattcataaacacattgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtct 15841410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 371
Target Start/End: Original strand, 10396198 - 10396245
Alignment:
Q  324 gacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  10396198 gacccataaacccattgccttagggttttaggtaagagggtggtgtct 10396245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 11706687 - 11706636
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaa 298  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  11706687 tgttgttgtgtgcaagggtgagttgtatgtcccacatcggataaaaaagtaa 11706636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 15841146 - 15841034
Alignment:
Q  251 gttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtt 350  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||  || |||| || |||  ||| ||||||  |||||||| ||| || | |||||||||| || |||| |||    
T  15841146 gttgtgtacaaatgtgaattatatgtcccatatcagatagaaaagtggaggctgaacattttataagtgagaggatctataaacccattgctttaa-gtt 15841048  T
Q  351 tttggtaagagtgt 364  Q
    || |||||||||||    
T  15841047 ttgggtaagagtgt 15841034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 375 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 11702337 - 11702285
Alignment:
Q  375 ttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctc 427  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||  |||||||||    
T  11702337 ttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgaacagtccccctcgctcccctc 11702285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702 (Bit Score: 123; Significance: 6e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 247 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 682 - 460
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  682 tgttgttgtgcacaagtgtgagttatatgtcccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 583  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatc 446  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||| | ||||  ||||||||| ||||||| ||||||||  ||| |||  |||  || |||||||||||    
T  582 ggttttgggtaagagtgtggtgtctttcttgcttgagtggtttttctagcctcgatgtggaaggtcccccgagcttccccagtgacccaacagtggtatc 483  T
Q  447 aga-acccggttcgacgaagggt 468  Q
    |||  ||||||||||||||||||    
T  482 agagccccggttcgacgaagggt 460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 259 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 298 - 146
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||   ||| ||| ||| |||||    
T  298 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-ccataaa-ccat--actttagg-tttaggtaa 204  T
Q  359 gagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccc 416  Q
    || ||||||||||   ||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  203 gaatgtggtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 73)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 247 - 480
Target Start/End: Original strand, 34834866 - 34835098
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  34834866 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttaaacaccttataagtaagatgactcataaactcattgccttaa 34834965  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatc 446  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| | ||||    ||| |||| |||  || |||||||||||    
T  34834966 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggatgatcccttgcgct-ccctagtgacccaacagtggtatc 34835064  T
Q  447 agaacccggttcgacgaagggtacgtccgaggca 480  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34835065 agagcccggttcgacgaagggtacgaccgaggca 34835098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 259 - 449
Target Start/End: Original strand, 3669689 - 3669879
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  3669689 caagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaggttttgggtaa 3669788  T
Q  359 gagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatcaga 449  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||  || || |||||||||||    
T  3669789 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtccccctagctcccctcgtgacccaacggtggtatcaga 3669879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 247 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 3038458 - 3038234
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  3038458 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaa 3038359  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctccc-ctc-gtgttcctacagtggta 444  Q
    |||||| |||||||||||||  |||   ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||  |||||| ||| |||  || |||||||||    
T  3038358 ggttttgggtaagagtgtggcatctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcctccgagctccctctcagtgacccaacagtggta 3038259  T
Q  445 tcagaacccggttcgacgaagggta 469  Q
    ||||| ||  ||||||| |||||||    
T  3038258 tcagagcctcgttcgacaaagggta 3038234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 247 - 407
Target Start/End: Original strand, 30359261 - 30359421
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  30359261 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagcaagaggacccataaacccatagccttaa 30359360  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtgga 407  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   || ||||||  |||| | |||||||||||||||    
T  30359361 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctctttcttgtgatgttgttttagcctcaatgtgga 30359421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 259 - 430
Target Start/End: Original strand, 3670062 - 3670232
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||  |||||||||||| |||||    
T  3670062 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggtttaacaccttataagtatgaggacccataaacctatttccttaaggttttgggtaa 3670161  T
Q  359 gagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtg 430  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  3670162 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggttcccta-gctcccctcgtg 3670232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 247 - 425
Target Start/End: Original strand, 34835199 - 34835377
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  34835199 tgttgctgtgtacaagggtgagttatatgtcccacatccgataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaa 34835298  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccc 425  Q
     ||||| |||||||||||||||||    ||||||||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  34835299 agttttgggtaagagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtagacggtccccctggctcccc 34835377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 250 - 415
Target Start/End: Original strand, 9608738 - 9608903
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9608738 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcaccttaaggt 9608837  T
Q  350 ttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccc 415  Q
    ||| |||| |||||||| ||||   ||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  9608838 tttgggtatgagtgtggcgtctctcttgctagtgaggttgttctagcctcgatgtggacggccccc 9608903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 243 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 33113539 - 33113359
Alignment:
Q  243 tttatgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcc 342  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||    
T  33113539 tttatgttgttgtgtacaagtttgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacgtcttataagtaagaggacccataaactcattgcc 33113440  T
Q  343 ttaaggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcc 423  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||| ||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||| | ||||||    
T  33113439 ttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctagtgtggttgttctaggctcaatgcggacggtccctctggctcc 33113359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 249 - 480
Target Start/End: Original strand, 40518061 - 40518295
Alignment:
Q  249 ttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaaga--gtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||  |||||||    
T  40518061 ttgttgtgttcaagtgtgagttatatgttccacattggataaaaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaaatggacccataaacccaatgccttaa 40518160  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctc-gtgttcctacagtggtat 445  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||  ||||||| | |||  |  ||| ||||||    
T  40518161 ggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagccttgatgtggacggtcccccgagctccccccggtgaccaaacaatggtat 40518260  T
Q  446 cagaacccggttcgacgaagggtacgtccgaggca 480  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  40518261 cagagccccgttcgacgaagggtacgaccgaggca 40518295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 267 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 18372142 - 18371928
Alignment:
Q  267 agttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtgg 366  Q
    |||||||||| |||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  18372142 agttatatgtaccacatccaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaactcattgctttaaggttttgggtaagagtgtgg 18372043  T
Q  367 tgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacgg-tcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatcagaacccggttcgacgaag 465  Q
    ||| |   | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||| ||  || |||||||||||||| || |||||||| |||    
T  18372042 tgtttctctcgcttgtgcggttgctctagcctcaatgtgaacggttcccccgagctcccctcatgacccaacagtggtatcagagcctggttcgacaaag 18371943  T
Q  466 ggtacgtccgaggca 480  Q
    |||||| ||||||||    
T  18371942 ggtacgaccgaggca 18371928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 259 - 430
Target Start/End: Original strand, 30441083 - 30441258
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacacctta----taagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttg 354  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  30441083 caagtgtgagttatatgtcccacatcggctaaaatagtaaaggttgaacaccttaattataagtaagagggcccataaacccattgccttaaggttttgg 30441182  T
Q  355 gtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtg 430  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||  |||||||||||||    
T  30441183 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacagtcaccttggctcccctcgtg 30441258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 245 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 37544660 - 37544490
Alignment:
Q  245 tatgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcctt 344  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||  | ||    
T  37544660 tatgttgttgtgcacaagtgtgagttataagtcgcacatcggataaaatagtaaaggttgaacacattataagaaagaggacccataaatccattacttt 37544561  T
Q  345 aaggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccc 415  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  37544560 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctttcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacgatcccc 37544490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 247 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 6877031 - 6876852
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatat-gtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcctta 345  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||    
T  6877031 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatagtcccacatcggataaaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagatgacccatacactcattgtctta 6876932  T
Q  346 aggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccc 425  Q
     |||||| |||||||||||||||| |   ||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  6876931 gggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttgtttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccc 6876852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 247 - 425
Target Start/End: Original strand, 34835464 - 34835643
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcg-gataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcctta 345  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  34835464 tgttgctgtgtacaagggtgagttatatgtcccacgtcccgataaaatagtaaaggtttaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 34835563  T
Q  346 aggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccc 425  Q
    | ||||| |||||||||||||||||    ||||||||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  34835564 aagttttgggtaagagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtagacggtccccctggctcccc 34835643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 247 - 425
Target Start/End: Original strand, 34835730 - 34835909
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcg-gataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcctta 345  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  34835730 tgttgctgtgtacaagggtgagttatatgtcccacgtcccgataaaatagtaaaggtttaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 34835829  T
Q  346 aggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccc 425  Q
    | ||||| |||||||||||||||||    ||||||||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  34835830 aagttttgggtaagagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtagacggtccccctggctcccc 34835909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 252 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 1514078 - 1513912
Alignment:
Q  252 ttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggttt 351  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||    
T  1514078 ttgtgtacaagtatgagttatatatcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccttaaacccataaccttaaggttt 1513979  T
Q  352 ttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccag 418  Q
    | ||||| |||||||| |||   || | |||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1513978 tgggtaaaagtgtggtatctctcttacatgtggggttattctagcctcgatgtggacggtcccccag 1513912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 247 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 70441 - 70277
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  70441 tgttgttgtgtacaaa-gtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccactgccttaa 70343  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtc 412  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||   ||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  70342 ggttttaggtaagagtgtgacgtctatcttgcttgtgtggttgttctaacctcaatgcggacggtc 70277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 247 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 9482770 - 9482608
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||    
T  9482770 tgttgttgtgtacaagtg--agttatatgttccacatgggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctaaa 9482673  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggt 411  Q
    | ||||   |||||||||||| |||   ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  9482672 gattttgtataagagtgtggtatctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 9482608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 247 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 25561984 - 25561815
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||    
T  25561984 tgttgttgtctacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaacgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaa 25561885  T
Q  347 ggtttt-tggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccc 415  Q
    ||||||  ||||||||||||   |||   ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  25561884 ggttttggggtaagagtgtgacatctctcttgcttgtgtggttgctctagcctcgatgtggaaggtcccc 25561815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 246 - 411
Target Start/End: Original strand, 30359598 - 30359763
Alignment:
Q  246 atgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcctta 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||    
T  30359598 atgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccataacctta 30359697  T
Q  346 aggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggt 411  Q
    || |||| ||||||||||||||||||   || ||| |||||||| |||| | || |||||||||||    
T  30359698 agattttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttatgcggttgttctaacttcgatgtggacggt 30359763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 283 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 9483319 - 9483191
Alignment:
Q  283 tcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgt 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||| ||    
T  9483319 tcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgctcgt 9483220  T
Q  383 gcggttggtctagcctcaatgtggacggt 411  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  9483219 gcggttgttctagcctcgatgtggacggt 9483191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 247 - 480
Target Start/End: Original strand, 147441 - 147675
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||    
T  147441 tgttgttgcgtgtaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacctattgccttaa 147540  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccca-ggctcccctcgtgttcctacagtggtat 445  Q
     ||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||||||| | |||||| |  ||||||  |||||||||  ||||||| | ||  || |||||| |||    
T  147541 agttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggtagttctagcattgatgtgggtggtcccccatagctcccc-catgacccaacagtgatat 147639  T
Q  446 caga-acccggttcgacgaagggtacgtccgaggca 480  Q
    ||||  ||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  147640 cagagccccggttcgacaaagggtacgatcgaggca 147675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 259 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 1014401 - 1014178
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    |||||||||||||||||||  || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |  |||||| ||||| |||||    
T  1014401 caagtgtgagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccgtaaactcgttaccttaaagttttgggtaa 1014302  T
Q  359 gagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacgg-tcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatcaga-acccggt 456  Q
    |||||||||||||    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||  |||||||  ||| | | ||||||||||||||  ||||||    
T  1014301 gagtgtggtgtctctcctgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggttcccccgagctcccccagtgatacaacagtggtatcagagccccggt 1014202  T
Q  457 tcgacgaagggtacgtccgaggca 480  Q
    ||||||||||||||| | ||||||    
T  1014201 tcgacgaagggtacgactgaggca 1014178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 252 - 413
Target Start/End: Original strand, 40518577 - 40518738
Alignment:
Q  252 ttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggttt 351  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  40518577 ttgtgttcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacccaatgacttaaggttt 40518676  T
Q  352 ttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcc 413  Q
    | ||||||||||||  |||    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40518677 tgggtaagagtgtgacgtcactcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcc 40518738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 247 - 371
Target Start/End: Original strand, 9309345 - 9309469
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||    
T  9309345 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccttaaactcattgccttaa 9309444  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||    
T  9309445 ggtgtcgggtaagagtgtggtgtct 9309469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 259 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 45122066 - 45121896
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||| |||| |||||    
T  45122066 caagtgtgagttatatgtcccacatcgcataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaactcattgccttaagattttgggtaa 45121967  T
Q  359 gagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgt 429  Q
     ||||||| ||||   ||||| ||| ||||  || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45121966 cagtgtggcgtctcttttgctcgtgtggttattcaagcctcgatgtggaaggtcccccaggctcccctcgt 45121896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 252 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 45122220 - 45122067
Alignment:
Q  252 ttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggttt 351  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||   ||||||||||    
T  45122220 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaactcattttcttaaggttt 45122121  T
Q  352 ttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtg 405  Q
    | ||||||||||||||||||   || |||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  45122120 tgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcgatgtg 45122067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 247 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 8918932 - 8918764
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || | |||||    
T  8918932 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttacatgtcccacatcagatagcagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacctattgacttaa 8918833  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccc 415  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||  |||| |||| ||||| | || |||| |||||||||||||||    
T  8918832 ggttttgggtaagagtgtgacgtctttcttgcgtgtgtggttgttttaacctcgatgtggacggtcccc 8918764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 248 - 415
Target Start/End: Original strand, 5915863 - 5916025
Alignment:
Q  248 gttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaag 347  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||  ||||| ||| ||||| |||    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  5915863 gttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacattggataaaaatgtaaa-gtttaacacttta----taagaggacccataaactcattgccttaag 5915957  T
Q  348 gtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccc 415  Q
    ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  5915958 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 5916025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 259 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 40579662 - 40579496
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    ||||||||| ||||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || || |||||||||| |||||    
T  40579662 caagtgtgaattatatgtttcatattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacttattgctttaaggttttaggtaa 40579563  T
Q  359 gagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccc 425  Q
    |||||||||||||   |||||||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||| ||| |||||||    
T  40579562 gagtgtggtgtctctattgcttgtacggttgttctatcctcgatgtggacgatcctccatgctcccc 40579496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 247 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 45121823 - 45121663
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| |  |||||||    
T  45121823 tgttgttgtgtacaagtgtgagttgt-tgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgatcaccttataagtaagaggatccataaacctacagccttaa 45121725  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggac 408  Q
    ||||||  ||||||||||| | |||   || ||| || ||||| ||||||||| ||||||||    
T  45121724 ggttttgagtaagagtgtgatatctctcttacttatggggttgttctagcctcgatgtggac 45121663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 259 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 1014027 - 1013879
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||  |||||  ||||    
T  1014027 caagtgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaagttgaacaccctataagtaagaggaccaataaacccattgccttagagttttgagtaa 1013928  T
Q  359 gagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtgga 407  Q
    ||||||| |||||   || |||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  1013927 gagtgtgttgtctcttttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 1013879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 259 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 20870731 - 20870561
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatat--gtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggt 356  Q
    ||||||||||||||||  || |||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||| | |    
T  20870731 caagtgtgagttatatatgttccacatcagataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccactgccttaagattttggat 20870632  T
Q  357 aagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctc 427  Q
    |||||||||||||||   ||||||||| ||||| |||| |||  || |||||||||| || ||||||||||    
T  20870631 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaaccttgatatggacggtcctcctggctcccctc 20870561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 250 - 412
Target Start/End: Original strand, 41972151 - 41972316
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||| ||| ||    
T  41972151 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtgataggacccataaacccattgccataaagt 41972250  T
Q  350 t---tttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtc 412  Q
    |   || ||||||||||||| |||    ||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||    
T  41972251 tttgttgggtaagagtgtggcgtcactcttgcttgtgtggttgttccagcctcaatatggacggtc 41972316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 250 - 479
Target Start/End: Original strand, 9308970 - 9309204
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcc--cacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaag 347  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  9308970 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacacatcagataaaagagtaaaagttgaacatgttataagtaagaggacccataaacccattgcctaaag 9309069  T
Q  348 gtttttggtaag---agtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggta 444  Q
    ||||| || |||   ||||||||||||   |  | | || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||  |||  || | |||||||    
T  9309070 gttttgggcaagagtagtgtggtgtctctctcac-tatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccccagtgacccaaaagtggta 9309168  T
Q  445 tcagaa-cccggttcgacgaagggtacgtccgaggc 479  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  9309169 tcagaaccccagttcgacggagggtacgaccgaggc 9309204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 283 - 480
Target Start/End: Original strand, 45122650 - 45122852
Alignment:
Q  283 tcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgt 382  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||| |||||||| ||||   ||||||||    
T  45122650 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggttttgggtatgagtgtggcgtctctcttgcttgt 45122749  T
Q  383 gcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccagg-----ctcccctcgtgttcctacagtggtatcagaacccggttcgacgaagggtacgtccgag 477  Q
    | ||||| || |||||| ||||||| |||||||| ||     |||||| | ||  |  ||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||| |||||    
T  45122750 gtggttgttcaagcctcgatgtggaaggtccccctggcccgactccccccatgaccaaacagtggcatcagagcctagttcgacgaagggtacgaccgag 45122849  T
Q  478 gca 480  Q
    |||    
T  45122850 gca 45122852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 247 - 416
Target Start/End: Original strand, 45122996 - 45123165
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||   |||||    
T  45122996 tgttgctgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaacacct--taagtaagatgacccataaacctattttcttaa 45123093  T
Q  347 ggtttttggta--agagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccc 416  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||   ||  ||||| ||||| ||||  ||| ||||||||||||||||    
T  45123094 ggttttgggtaagagagtgtggtgtctctcttatttgtggggttgttctaatctcgatgtggacggtccccc 45123165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 249 - 365
Target Start/End: Original strand, 5420643 - 5420759
Alignment:
Q  249 ttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaagg 348  Q
    ||||||| | ||||||||  ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  5420643 ttgttgtatgcaagtgtgtattatatgtcccacatcggatagaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaacccattgccttaagg 5420742  T
Q  349 tttttggtaagagtgtg 365  Q
    ||||| |||||||||||    
T  5420743 ttttttgtaagagtgtg 5420759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 282 - 429
Target Start/End: Original strand, 32305502 - 32305649
Alignment:
Q  282 gtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttg 381  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||| | ||||||||||| |||||  || |||     
T  32305502 gtcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacctataaacccattaccttaagattttggataagagtgtggcgtctttattactta 32305601  T
Q  382 tgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgt 429  Q
    ||| |||| |||| |||  |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  32305602 tgcagttgttctaaccttgatgtggacggtccccctgactcccctcgt 32305649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 247 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 43274947 - 43274824
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||| || | |||||    
T  43274947 tgttgttgtgtataagtgtgagttatatgtttcacatcagataaaagagtaaaggttgaatatattataagtaagaggacccataaacctattgtcttaa 43274848  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtc 370  Q
    ||||||  ||||||||||||||||    
T  43274847 ggttttgagtaagagtgtggtgtc 43274824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 247 - 371
Target Start/End: Original strand, 8794101 - 8794225
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |    |||||    
T  8794101 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagaataaatgttgaacatcttataagtaagaggactcataaacctaatatcttaa 8794200  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||    
T  8794201 ggttttgggtgagagtgcggtgtct 8794225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 247 - 405
Target Start/End: Original strand, 147819 - 147968
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||| | |||||         |||||||||| || |||||||    
T  147819 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgataaaaaagtaaatgttgaacaacatataa---------cccataaacctattgccttaa 147909  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtg 405  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   || ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  147910 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgcagttgttctagcctcaatgtg 147968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 294 - 371
Target Start/End: Original strand, 9609122 - 9609199
Alignment:
Q  294 agtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  9609122 agtaaaggttgaacatcttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaatgttttcggtaagagtgtggcgtct 9609199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 264 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 18371807 - 18371660
Alignment:
Q  264 gtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtg 363  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||     ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  18371807 gtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaggttgaaca----ttaagtaagaagacccataaacccat-gccttaaggttttgggtaagagtg 18371713  T
Q  364 tggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccc 416  Q
    |||||| |   |   ||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||    
T  18371712 tggtgtgtctctcatttgtgcggttgctctagcttcgatgtggacggttcccc 18371660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 261 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 18380171 - 18380020
Alignment:
Q  261 agtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaaga 360  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||   ||||||||||||  ||||||    
T  18380171 agtgtgagttatatatcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagggggcctataaacccactaccttaaggttttgagtaaga 18380072  T
Q  361 gtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccc 414  Q
    |||||||| ||   ||||||||||| ||  |||||| || |||||||| |||||    
T  18380071 gtgtggtgcct--cttgcttgtgcgattcttctagcttcgatgtggacagtccc 18380020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 264 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 41416322 - 41416241
Alignment:
Q  264 gtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcctta 345  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||    
T  41416322 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacctatcacctta 41416241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 247 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 18373098 - 18372988
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||| |||   |    
T  18373098 tgttgttgtgtaca-gtgtgatttatatgtcccacttcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggactcataaactcattgcc---a 18373003  T
Q  347 ggtttttggtaagag 361  Q
    |||||| ||||||||    
T  18373002 ggttttgggtaagag 18372988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 262 - 362
Target Start/End: Original strand, 20130454 - 20130553
Alignment:
Q  262 gtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagag 361  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||    
T  20130454 gtgtgagatatatgtctcacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctt-taagtaagatgatccataaacccataaccttacggttttaggtaagag 20130552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 260 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 32640682 - 32640519
Alignment:
Q  260 aagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaag 359  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||     || |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  32640682 aagtgtgagttatctgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaaca-----taggtaagaggaccgataaacccattgccttaaggttttgggtaag 32640588  T
Q  360 agtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccag-gctcccctc 427  Q
    ||||| | ||||   |||||| || | ||| ||||||||| |||||  |||||| |||| |||||||||    
T  32640587 agtgttgcgtctctcttgcttttgtgattgttctagcctcgatgtgagcggtccgccagagctcccctc 32640519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 249 - 371
Target Start/End: Original strand, 9507769 - 9507896
Alignment:
Q  249 ttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcc--cacgtcggataaaag---agtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcct 343  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||  ||  | |||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||    
T  9507769 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatctcctccatattggataaaagtacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggactcataaacccattacct 9507868  T
Q  344 taaggtttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  9507869 taaggttttgggtaagagtgtggcgtct 9507896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 250 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 4154831 - 4154710
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| || |||  ||||||||||| |||||||| | | ||||||||||| ||| |||  |||||    
T  4154831 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgaaaggacccataaactcattgccccaaggt 4154732  T
Q  350 ttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    ||| ||||||||||||| ||||    
T  4154731 tttgggtaagagtgtggcgtct 4154710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 260 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 18372411 - 18372342
Alignment:
Q  260 aagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgaccca 329  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18372411 aagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagaccca 18372342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 260 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 18372854 - 18372785
Alignment:
Q  260 aagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgaccca 329  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18372854 aagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 18372785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 259 - 407
Target Start/End: Original strand, 6731906 - 6732045
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||         ||||||||  |||||||||  ||| |||||||||||||  ||||    
T  6731906 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga---------aagtaagagaacccataaattcattgccttaaggttttgagtaa 6731996  T
Q  359 gagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtgga 407  Q
    |||||||||||||   |||||| |||||||| |||| |||| |||||||    
T  6731997 gagtgtggtgtctctcttgcttatgcggttgttctaacctcgatgtgga 6732045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 255 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 18372762 - 18372656
Alignment:
Q  255 tgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttg 354  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||   ||||||| |    
T  18372762 tgtacaagtgtgatttatatgttccatttcggataaaatagtaaaggttgaaca-cttataagtaagaggactcataaacccattgcc---aggttttgg 18372667  T
Q  355 gtaagagtgtg 365  Q
    |||||||||||    
T  18372666 gtaagagtgtg 18372656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 251 - 406
Target Start/End: Original strand, 12283867 - 12284021
Alignment:
Q  251 gttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtt 350  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| | |||| |||||| ||||| ||||||| ||  | |||||||||    
T  12283867 gttgtgtgcaagtgtaagttatatgtcccacgtcagataaaaaagtaaatgttgaatatcttaaaagtaaaatgacacataaactca-agtcttaaggtt 12283965  T
Q  351 tttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtgg 406  Q
    || | ||||||||| ||||||   |  |||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  12283966 ttggataagagtgtagtgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctctatgtgg 12284021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 267 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 25561792 - 25561737
Alignment:
Q  267 agttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 322  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25561792 agttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 25561737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 264 - 416
Target Start/End: Original strand, 6651510 - 6651653
Alignment:
Q  264 gtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtg 363  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |         |||||  |||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  6651510 gtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaaaa---------taagagaacccataaattcattgccttaaggttttgggtaagagtg 6651600  T
Q  364 tggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccc 416  Q
    ||||||||   ||||||||||| ||| |||| |||| ||||||| ||||||||    
T  6651601 tggtgtctctcttgcttgtgcgattgttctaacctcgatgtggatggtccccc 6651653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 340 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 8919219 - 8919082
Alignment:
Q  340 gccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacag 439  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||   | |||     
T  8919219 gccttaaggttttggataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgtggttgttctagcttcgatgtggacggtccccca-gcttccctcgtgactcaacaa 8919121  T
Q  440 tggtatcagaacccggttcgacgaagggtacgtccgagg 478  Q
    ||||||||||  || |||| |||||||||| | ||||||    
T  8919120 tggtatcagagtcccgttcaacgaagggtatgaccgagg 8919082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 332 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 40579352 - 40579258
Alignment:
Q  332 aacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccct 426  Q
    ||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||    
T  40579352 aacccattgccttaggattttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggactgtcccccgagctcccct 40579258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 250 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 9620841 - 9620663
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||  | |||| || |||| | ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| |    
T  9620841 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacaacagatagaaaagtagaagttgatcactttataagtgagaggacccataaactcattgccttaagat 9620742  T
Q  350 ttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtg 430  Q
    |||   ||||||| || |||||   |  |||||| ||||| ||  ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9620741 ttt--ataagagtttgatgtctctctcacttgtgtggttgctcaggcctggatgtggacggtcccccgggctcccctcgtg 9620663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 3037865 - 3037776
Alignment:
Q  260 aagtgtgagttatat--gtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaag 347  Q
    |||||||||||||||  || |||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||    
T  3037865 aagtgtgagttatatatgttccacatcggatgaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgtcttaag 3037776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 249 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 4154446 - 4154325
Alignment:
Q  249 ttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaagg 348  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| || || |||| || |||  ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||      
T  4154446 ttgttgtgtgcaaatgtgagttatatgtcctacatcagatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgaga-gacccataaactcattgccttaata 4154348  T
Q  349 tttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    |||| |||||| ||||| |||||    
T  4154347 ttttgggtaagtgtgtgatgtct 4154325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 427
Target Start/End: Original strand, 41129073 - 41129158
Alignment:
Q  342 cttaaggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctc 427  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||   || |||||| ||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41129073 cttaaggttttgggtatgagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttcaaacctcgatgtggacggtcccccaggctcccctc 41129158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 357 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 18372342 - 18372218
Alignment:
Q  357 aagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccag-gctcccctcgtgttcctacagtggtatcagaacccgg 455  Q
    |||||||||||||||   | ||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||| |||| | ||||||||| ||  || | |||||||||||| || ||    
T  18372342 aagagtgtggtgtctctctcgcttgtgcggttgctttagtctcgatgtggacggttcccccgagctcccctcatgacccaatagtggtatcagagcctgg 18372243  T
Q  456 ttcgacgaagggtacgtccgaggca 480  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||    
T  18372242 ttcgacaaagggtacgaccgaggca 18372218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 334
Target Start/End: Original strand, 33831971 - 33832055
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaac 334  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | | | || |||| | ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  33831971 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacgttgaagagaaaagtagaagttgaacactttataagtaagaggacctataaac 33832055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 43398225 - 43398117
Alignment:
Q  261 agtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaa---gatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggta 357  Q
    |||||||||||||| || ||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||   || ||||||||||  ||| ||||||| ||||| | ||    
T  43398225 agtgtgagttatatatctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagaggaggacccataaattcattgccttaaagttttggata 43398126  T
Q  358 agagtgtgg 366  Q
    ||| |||||    
T  43398125 agaatgtgg 43398117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 260 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 18372526 - 18372485
Alignment:
Q  260 aagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaagg 301  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  18372526 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagg 18372485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 250 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 20995566 - 20995502
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttat 314  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||  ||||||||||| ||||    
T  20995566 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaaaagtggaggttgaacactttat 20995502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 371
Target Start/End: Original strand, 5274770 - 5274889
Alignment:
Q  252 ttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggttt 351  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| | || | | |||||| || | ||||||||||| |||||| |  || ||||||||||  ||| |||||||| |||    
T  5274770 ttgtgtgcaagtatgagttatatgttctacattgaataaaaaaggagaggttgaacactttataaatgggaagacccataaaatcattgccttaagattt 5274869  T
Q  352 ttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    |  ||||||||||| |||||    
T  5274870 tgagtaagagtgtgatgtct 5274889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 18373291 - 18373236
Alignment:
Q  294 agtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||| | ||||||||    
T  18373291 agtaaaggttgaacaccttataaataagaggatccattaacccattgtcttaaggt 18373236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 378 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 3038006 - 3037921
Alignment:
Q  378 cttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccc-tc-gtgttcctacagtggtatcagaacccggttcgac 461  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| || |||  || |||||||||||||| ||| |||||||    
T  3038006 cttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctccccctcagtgacccaacagtggtatcagagccccgttcgac 3037921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 440 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 9483000 - 9482960
Alignment:
Q  440 tggtatcagaacccggttcgacgaagggtacgtccgaggca 480  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  9483000 tggtatcagagccccgttcgacgaagggtacgaccgaggca 9482960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 74)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 247 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 43346959 - 43346756
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||    
T  43346959 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaactcattgccttaa 43346860  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcc-cccaggctcccctcgtgttcctacagtggtat 445  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||| ||| |  ||||||||||    
T  43346859 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctctatgtggacggtcctccgaagctcccctcatgtcctaacagtggtat 43346760  T
Q  446 caga 449  Q
    ||||    
T  43346759 caga 43346756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 247 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 37991145 - 37990911
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  37991145 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaactcatcgccttaa 37991046  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggct-cccctcgtgttcctacagtggtat 445  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||  || ||||||||||    
T  37991045 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccctcaggctccccctcatgacccaacagtggtat 37990946  T
Q  446 cagaacccggttcgacgaagggtacgtccgaggca 480  Q
    |||  |||  |||||| |||||||||  |||||||    
T  37990945 cagggccccattcgacaaagggtacgatcgaggca 37990911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 246 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 42342557 - 42342377
Alignment:
Q  246 atgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcctta 345  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||    
T  42342557 atgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatccgataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgtctta 42342458  T
Q  346 aggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccct 426  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42342457 aggttttgggtaagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtccccctggctcccct 42342377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 247 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 29645070 - 29644887
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  29645070 tgttgttgtgtgcaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaa 29644971  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtg 430  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||   |||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29644970 ggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttatgcggttgttttagcctcgatgtggacggtcccccaagctcccctcgtg 29644887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 247 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 32463069 - 32462843
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcctta 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  32463069 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaagagtaaaaggttgaataccttataagtaagaagactcataaacccattgcctta 32462970  T
Q  346 aggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccc-tcgtgttcctacagtggta 444  Q
    |||||||  |||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||  ||| ||||||| | ||||||  ||||||| |    
T  32462969 aggttttgagtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgtacggtcttccaagctccccttagtgttctaacagtggca 32462870  T
Q  445 tcagaacccggttcgacgaagggtacg 471  Q
    ||||| ||  |||||||||||||||||    
T  32462869 tcagagcctagttcgacgaagggtacg 32462843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 250 - 417
Target Start/End: Original strand, 35946515 - 35946682
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  35946515 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccgttgccttaaggt 35946614  T
Q  350 ttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccca 417  Q
    ||| ||||| ||||||||||||   ||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  35946615 tttgggtaaaagtgtggtgtctctcttgcttgtgcaattgttctagcctcgatgtggacggtccccca 35946682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 247 - 471
Target Start/End: Original strand, 52634666 - 52634889
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  52634666 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacgccttataagtaaga-gacccataaacccattgccttaa 52634764  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatc 446  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||   |||||||||| |||| ||||||||  |||| ||| |||||||  |||||||  |||  || |||||| ||||    
T  52634765 ggttttgggtaagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcagttgttctagccttgatgtagactgtcccccgagctcccccagtgacccaacagtgatatc 52634864  T
Q  447 agaacccggttcgacgaagggtacg 471  Q
    ||| |||  ||||||||||||||||    
T  52634865 agagcccccttcgacgaagggtacg 52634889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 249 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 54017982 - 54017782
Alignment:
Q  249 ttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaagg 348  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||    
T  54017982 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacctaacgccttaagg 54017883  T
Q  349 tttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatcag 448  Q
    |||| ||||||||||||||||||   || |||||| ||||| |||||| || |||||| ||||||||| ||||||||  |||  || |||||||||||||    
T  54017882 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttctagcttcgatgtgggcggtccccctggctcccccagtgacccaacagtggtatcag 54017783  T
Q  449 a 449  Q
    |    
T  54017782 a 54017782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 247 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 12114730 - 12114547
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  12114730 tgttgttgtgtgcaagtgtaagttatatatcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaa 12114631  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtg 430  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   || |||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  12114630 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagccacgatgtggtcggtcccccagactcccctcgtg 12114547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 247 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 37990807 - 37990638
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||    
T  37990807 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaa 37990708  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccc 416  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  37990707 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtgattgttctagcctcgatgtggacggtccccc 37990638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 245 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 3135631 - 3135389
Alignment:
Q  245 tatgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataa-----gtaagatgaccc--ataaaccca 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |     |||||| |||||  |||||||||    
T  3135631 tatgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacctcagataaaagagtaaaagttgaacaccttattatattagtaagaggacccccataaaccca 3135532  T
Q  338 tcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctac 437  Q
    | ||||||||||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||| ||  || ||    
T  3135531 ttgccttaaggttttagataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctgactctcctcatgacccaac 3135432  T
Q  438 agtggtatcagaacccggttcgacgaagggtacgtccgaggca 480  Q
     ||||||||||| |||  |||||| |||||||||  |||||||    
T  3135431 tgtggtatcagagccccattcgacaaagggtacgaacgaggca 3135389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 247 - 471
Target Start/End: Original strand, 15772844 - 15773069
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||    
T  15772844 tgttgtcgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgctttaa 15772943  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatc 446  Q
    |||||| | ||||||||||||||||   ||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||    | |||||||| ||  || |||||||||||    
T  15772944 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtggacggtccttttgactcccctcatgacccaacagtggtatc 15773043  T
Q  447 agaaccc-ggttcgacgaagggtacg 471  Q
    ||| ||| | ||||||||||||||||    
T  15773044 agagccctgattcgacgaagggtacg 15773069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 246 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 29644750 - 29644566
Alignment:
Q  246 atgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcctta 345  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||    
T  29644750 atgtttttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggattaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaacccattgtctta 29644651  T
Q  346 aggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtg 430  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||   |||||| |||||||| | |||| || ||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  29644650 aggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttatgcggttgttttagcttcgatgtggatggtcccccaaactcccctcgtg 29644566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 246 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 54018367 - 54018197
Alignment:
Q  246 atgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcctta 345  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  54018367 atgttgttatgtgcaagtgtgagttatatgtcctgcatcggataaaagagtaaagattgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaacgcctta 54018268  T
Q  346 aggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccc 416  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    |||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  54018267 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcatgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtccccc 54018197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 259 - 416
Target Start/End: Original strand, 22304571 - 22304728
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  22304571 caagtgtgagctatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttttgggtaa 22304670  T
Q  359 gagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccc 416  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||    
T  22304671 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagtctcgatgtggacagtccccc 22304728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 250 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 33803417 - 33803186
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  33803417 tgttgtgtgcaattgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccatataagtaagaggacccataaacccattgcattaaggt 33803318  T
Q  350 ttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatcaga 449  Q
     || ||||||||||||| ||||   |  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||     || ||||||||||||||    
T  33803317 attgggtaagagtgtggcgtctccctctcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccaaactcccatcaatgaccaacagtggtatcaga 33803218  T
Q  450 acc-cggttcgacgaagggtacgtccgaggca 480  Q
     || || |||||||||||||||| | ||||||    
T  33803217 gcctcgattcgacgaagggtacgactgaggca 33803186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 247 - 416
Target Start/End: Original strand, 32589694 - 32589862
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  32589694 tgttgttgtgtgcaagtgtgagt-atatgtcccacataagataaaataataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 32589792  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccc 416  Q
    |||||| |||||||||| | |||||   ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  32589793 ggttttgggtaagagtgcgatgtctctcttgcttgtgtggttgttctaggctcgatgtggacggtccccc 32589862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 247 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 25739593 - 25739413
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||| || || |    
T  25739593 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaagttgaacatcatataagtaagaggacccataaactcattgctttta 25739494  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccc-aggctcccct 426  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||   | ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  25739493 ggttttgggtaagagtgtgacgtctctctagcttgtgcggtagttctagcctcgatgtggacggtcccccaaggctcccct 25739413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 246 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 22304117 - 22303900
Alignment:
Q  246 atgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcctta 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||       ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  22304117 atgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggt-------cttataagtaagcggacccataaacccattgcctta 22304025  T
Q  346 aggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccc-aggctcccctcgtgttcctacagtggta 444  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||   ||||||| | ||||| ||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||  |||  |  |||||||||    
T  22304024 aggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggattgtcccccaaggctcccccagtgacctaacagtggta 22303925  T
Q  445 tcaga-acccggttcgacgaagggt 468  Q
    |||||  ||||||||||||||||||    
T  22303924 tcagagccccggttcgacgaagggt 22303900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 247 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 42342258 - 42342092
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||    
T  42342258 tgttgttgtgtgcaagtgtgattcatatgttccacatcggataaaagagtaaatgttcaatgccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaa 42342159  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcc 413  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  42342158 ggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 42342092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 247 - 416
Target Start/End: Original strand, 25755384 - 25755553
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||| | | |||    
T  25755384 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaagagtaaaggttgaataccttataagtaagaggactcataaatccattgtcctaa 25755483  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccc 416  Q
     ||| | ||||| ||||||| ||||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  25755484 agttgtgggtaaaagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtccccc 25755553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 247 - 371
Target Start/End: Original strand, 45901703 - 45901828
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcctta 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||    
T  45901703 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagaaaaaaaggttgaacaccttataagtaagaggacgcataaactcatggcctta 45901802  T
Q  346 aggtttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  45901803 aagtttttggtaagagtgtggtgtct 45901828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 247 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 41359929 - 41359710
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    ||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  41359929 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttat----cccacatcggatacaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 41359834  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccag-gctcccctcgtgttcctacagtggtat 445  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||   | ||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||  |||  || | ||||||||    
T  41359833 ggttttgggtaagaatgtggcgtctctctcgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtccccccgagctcccccagtgacccaatagtggtat 41359734  T
Q  446 cagaacccggttcgacgaagggta 469  Q
    || | |||  ||||||||||||||    
T  41359733 catagccccattcgacgaagggta 41359710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 266 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 39935104 - 39934963
Alignment:
Q  266 gagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtg 365  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||    
T  39935104 gagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaagttttgagtaagagtgtg 39935005  T
Q  366 gtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtgga 407  Q
     |||||   ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  39935004 atgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 39934963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 247 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 49336855 - 49336694
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  49336855 tgttgttgtgtacaagtgtgagttacatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaccaccttataagtaagaggacccataaacccatagtcttaa 49336756  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtct-tagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtgga 407  Q
     ||| | |||||||||||||||||| |  ||  ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  49336755 agttctgggtaagagtgtggtgtctctctttttttgtgcggttgttctatcctcaatgtgga 49336694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 246 - 415
Target Start/End: Original strand, 31190006 - 31190167
Alignment:
Q  246 atgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcctta 345  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||        ||||||    
T  31190006 atgttgttgtgtgcaagtgtgagtgatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagttagaggacccata--------gcctta 31190097  T
Q  346 aggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccc 415  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||  ||||| ||||||||| || |||||| |||||    
T  31190098 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtcgggttgttctagcctcgatttggacgctcccc 31190167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 247 - 479
Target Start/End: Original strand, 53577354 - 53577588
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||  || ||||||||  || |||||||    
T  53577354 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaacagtaaaggttgaacatcttaaaaataagtggatccataaacatattgccttaa 53577453  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcc-cctcgtgttcctacagtggtat 445  Q
    ||| || ||||||||||||||||||   ||||  ||| ||||| |||||||||  |||||| ||||||||   |||| | | |||  || ||||||||||    
T  53577454 ggtcttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcggtgtggatggtcccccgaactcctctttgtgacccaacagtggtat 53577553  T
Q  446 caga-acccggttcgacgaagggtacgtccgaggc 479  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53577554 cagagtcccggttcgacgaagggtacgaccgaggc 53577588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 247 - 409
Target Start/End: Original strand, 15773182 - 15773346
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||    
T  15773182 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggactcataagctcattgccttaa 15773281  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtg--gtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacg 409  Q
     ||||| ||||||||||||  || ||||  ||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||    
T  15773282 agttttgggtaagagtgtgatgtctcttgcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtggacg 15773346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 247 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 32462727 - 32462602
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcctta 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||    
T  32462727 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgaatgaaagagtaaaaggttgaacaccttataagtaagatgatccataaacctattgcttta 32462628  T
Q  346 aggtttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||    
T  32462627 aggttttggataagagtgtggggtct 32462602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 259 - 371
Target Start/End: Original strand, 39389072 - 39389184
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  39389072 caagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttaaaactaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaa 39389171  T
Q  359 gagtgtggtgtct 371  Q
    |||||||||||||    
T  39389172 gagtgtggtgtct 39389184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 249 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 45395819 - 45395651
Alignment:
Q  249 ttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaagg 348  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||| | ||||| |    
T  45395819 ttgttgtgtgcaagtgtaagttatatatcccacatcgaataaaagagtaaaggttaaacacgttataagtaagaggatccataaacccattgtcttaatg 45395720  T
Q  349 tttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccca 417  Q
    |||| ||||||||||||||||||   |  |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  45395719 ttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgctctagcctcgatgtggagggtctccca 45395651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 250 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 21832508 - 21832344
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  21832508 tgttatgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcatagccttaaggt 21832409  T
Q  350 ttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccc 416  Q
    ||| |||||||  |||| ||||   ||||||||  ||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  21832408 tttgggtaaga--gtggcgtctctcttgcttgtctggttgttctagcctcgatgtggacagtccccc 21832344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 249 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 3135237 - 3135098
Alignment:
Q  249 ttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaagg 348  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||  ||| |||||    
T  3135237 ttgttgtgtacaagtg--agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaaaagaacccataaacccactgccataagg 3135140  T
Q  349 tttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttgg 390  Q
    ||||  |||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  3135139 ttttgagtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgg 3135098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 250 - 371
Target Start/End: Original strand, 8327897 - 8328018
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||  |  ||||||||||    
T  8327897 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggatgaatatcttataagtaagagaacccataaacgtaatgccttaaggt 8327996  T
Q  350 ttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  8327997 tttgggtaagagtgtggtgtct 8328018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 259 - 398
Target Start/End: Original strand, 4823657 - 4823796
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||    
T  4823657 caagtgtgagttataagtctcacatcggataaaatagtaaaagttaaacaccttataagtaggaggacccataaactcattgccttaagattttgggtaa 4823756  T
Q  359 gagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcct 398  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||| || ||||||||    
T  4823757 gagtgtggtgtcttttttgcttatgcggatgttctagcct 4823796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 245 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 53118144 - 53117961
Alignment:
Q  245 tatgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcctt 344  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  || |||||||| |||||    
T  53118144 tatgttgttgtgggcaagtgtgagttatatgttccatatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggattca-aaacccattgcctt 53118046  T
Q  345 aaggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtg 430  Q
    ||| |||| ||||||||||| ||||||   |  |  ||| ||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  53118045 aagattttgggtaagagtgtagtgtctctctcacaagtgtggttgttctagcatcgatgtgaacggtccccca-gctcccctcgtg 53117961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 247 - 404
Target Start/End: Original strand, 39914242 - 39914399
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |  |||||||    
T  39914242 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaacagtagaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacctaatgccttaa 39914341  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgt 404  Q
      |||| | ||||||||||||||||   |  ||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  39914342 tattttggataagagtgtggtgtctctctcacttatgcggttgttctagcctcgatgt 39914399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 250 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 33175829 - 33175711
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgaccc---ataaacccatcgccttaa 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||   |||||| ||| |||||||    
T  33175829 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataataaactcatagccttaa 33175730  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtg 365  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  33175729 ggttttgggtaagagtgtg 33175711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 247 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 1634483 - 1634366
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcctta 345  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  1634483 tgttgctgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaaataaaaggttaaacacattataagtaagaggacccataaacccattggctta 1634384  T
Q  346 aggtttttggtaagagtg 363  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  1634383 aggttttgggtaagagtg 1634366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 331 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 41359575 - 41359478
Alignment:
Q  331 aaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcg 428  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41359575 aaacccataaccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtcccccagactcccctcg 41359478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 267 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 42584970 - 42584829
Alignment:
Q  267 agttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtgg 366  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| || | |||||| ||||  | ||||||||||    
T  42584970 agttatatgtcccacatcggatagaagagtaaagattgaacaccttataagtaagaggatccataaaccaattgtcttaagattttgagaaagagtgtgg 42584871  T
Q  367 tgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacgg 410  Q
    |||||   || ||| |||||||| |||||  |||||||||||||    
T  42584870 tgtct--cttacttatgcggttgttctagtttcaatgtggacgg 42584829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 247 - 371
Target Start/End: Original strand, 11661941 - 11662066
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | | |||||||| || |||||||    
T  11661941 tgttgttgtatgtaagtgtgagttaaatgccccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttaaaagtgagaggcctcataaaccaattgccttaa 11662040  T
Q  347 ggttttt-ggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||    
T  11662041 ggtttttgggtaagagtgaggtgtct 11662066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 259 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 50612608 - 50612534
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaa 333  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  50612608 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagattgaacaccttataagtaagaggactcataaa 50612534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 250 - 371
Target Start/End: Original strand, 9240142 - 9240263
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||| |    
T  9240142 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgttccacatcggatagagaagtaaaagctgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattaccttaagat 9240241  T
Q  350 ttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    ||  | ||||| ||||||||||    
T  9240242 ttcggataagaatgtggtgtct 9240263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 251 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 33362460 - 33362349
Alignment:
Q  251 gttgtgtacaagtgtgagttatatg---tcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaag 347  Q
    |||||||| ||||||||||||||||   || || ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  33362460 gttgtgtataagtgtgagttatatgatatctcatgtcggataaaataataaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccatttccttaag 33362361  T
Q  348 gtttttggtaag 359  Q
     |||| ||||||    
T  33362360 attttgggtaag 33362349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 249 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 44160710 - 44160545
Alignment:
Q  249 ttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaagg 348  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||||  ||  | |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| | |||||||    
T  44160710 ttgttgtatgcaagtgtcagttatatgtttcatattggataaaacaataaaggttgaacaccttataaataagaggatccataaacccattgtcttaagg 44160611  T
Q  349 tttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccca 417  Q
     ||||||||||| ||||| ||||   || ||  |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  44160610 -ttttggtaagaatgtggcgtctctcttact--tgcgattgttctagcctcgatgtggacggtccccca 44160545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 247 - 322
Target Start/End: Original strand, 11661525 - 11661600
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 322  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  11661525 tgttggtgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaacggttaaacatcttataagtaaga 11661600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 247 - 313
Target Start/End: Original strand, 43346640 - 43346706
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacacctta 313  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43346640 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttgtatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctta 43346706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 315 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 22303759 - 22303662
Alignment:
Q  315 aagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtc 412  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |   || |||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||    
T  22303759 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttacttgtgcgattgttctagcctcgatgtagacggtc 22303662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 250 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 47964683 - 47964562
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||| ||  ||  ||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  47964683 tgttgtgtgcaagtgtgagttgtatgtcccgcatcggatagaaatgtggaggttgaacgctatataagtgagaggacccataaacctattgccttaaggt 47964584  T
Q  350 ttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    ||| ||||||||||||| ||||    
T  47964583 tttgggtaagagtgtggcgtct 47964562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 259 - 334
Target Start/End: Original strand, 51886563 - 51886638
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaac 334  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  51886563 caagtgtgagttatatgtctcacatcgaataaaatagtaaaggttgaacatcatataagtaagaggacccataaac 51886638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 260 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 7767469 - 7767380
Alignment:
Q  260 aagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  7767469 aagtctgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttggacactttataactaagaggactcataaacccattgtcttaaggt 7767380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 259 - 312
Target Start/End: Original strand, 22304248 - 22304301
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacacctt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22304248 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctt 22304301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 375 - 480
Target Start/End: Original strand, 22304311 - 22304419
Alignment:
Q  375 ttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccc-aggctcccctc-gtgttcctacagtggtatcaga-acccggttcgacgaagggtacg 471  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||  ||  || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  22304311 ttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctagcttcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggtacg 22304410  T
Q  472 tccgaggca 480  Q
     ||||||||    
T  22304411 accgaggca 22304419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 259 - 322
Target Start/End: Original strand, 37726506 - 37726569
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 322  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  37726506 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaatgttgaataccttataagtaaga 37726569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 254 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 3384427 - 3384317
Alignment:
Q  254 gtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggttttt 353  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| |  ||||||| |||| ||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||  |  ||||||| |||||     
T  3384427 gtgtgcaagcgtgagttatatgtcccacatatgataaaacagtataggttaaacactttataaggaagaggacccataaacttaatgccttaaagttttg 3384328  T
Q  354 ggtaagagtgt 364  Q
    |||||||||||    
T  3384327 ggtaagagtgt 3384317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 391 - 480
Target Start/End: Original strand, 9239947 - 9240037
Alignment:
Q  391 tctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatcagaacc-cggttcgacgaagggtacgtccgaggca 480  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||  |||||||    
T  9239947 tctagcctcgatgtggacggtcccccaagctcccctcatgatccaacagtagtatcagaacctcggttcaacaaagggtacgatcgaggca 9240037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 39336392 - 39336292
Alignment:
Q  252 ttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggttt 351  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |  ||||||||||| |||||||| ||| || |||||||| ||| || |||||||||    
T  39336392 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaagttggaggttgaacactttataagtgagaggatccataaactcattgctttaaggttt 39336293  T
Q  352 t 352  Q
    |    
T  39336292 t 39336292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 46546490 - 46546375
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| || | ||||  ||  ||  ||||||||||| |||||||| |||  | |||||||||||| ||||||||||    
T  46546490 tgttgtgtgtaagtgtgagttatatgtcctacattggattgaaatgtggaggttgaacactttataagttagagaatccataaacccattgccttaaggt 46546391  T
Q  350 ttttggtaagagtgtg 365  Q
    |||  |||||||||||    
T  46546390 tttgtgtaagagtgtg 46546375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 367
Target Start/End: Original strand, 52634990 - 52635050
Alignment:
Q  307 caccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggt 367  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  52634990 caccttataaataagaggacccataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggt 52635050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 327 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 54017636 - 54017592
Alignment:
Q  327 ccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54017636 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 54017592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 366
Target Start/End: Original strand, 12749211 - 12749278
Alignment:
Q  299 aggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtgg 366  Q
    ||||||||||| ||||||||  || |||||||||||| || || |||||||||||| |||||||||||    
T  12749211 aggttgaacactttataagtgtgaggacccataaaccaattgcattaaggtttttgataagagtgtgg 12749278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 391 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 41360161 - 41360079
Alignment:
Q  391 tctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcg-tgttcctacagtggtatcagaac-ccggttcgacgaagggtacg 471  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |  |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  41360161 tctagcctcgatgtggacggttccccgggctcccctcgctgtcctaacagtggtatcagagcgccggttcgacgaagagtacg 41360079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 250 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 47965080 - 47964959
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||   || ||||||| || |||  ||||| ||||   ||||||| ||| | | ||||| ||||| |||||||| |    
T  47965080 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgttttacatcggatagaaaagtggaggttaaacattatataagtgagagggctcataagcccattgccttaagat 47964981  T
Q  350 ttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    ||| ||||||||||||| ||||    
T  47964980 tttgggtaagagtgtggcgtct 47964959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 249 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 12747918 - 12747878
Alignment:
Q  249 ttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggata 289  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12747918 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 12747878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 325 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 17731994 - 17731950
Alignment:
Q  325 acccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgt 369  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17731994 acccataaacccattgccttaaggttttgagtaagagtgtggtgt 17731950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 325 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 19033225 - 19033181
Alignment:
Q  325 acccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgt 369  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  19033225 acccataaacccattgccttaaggttttgagtaagagtgtggtgt 19033181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 299 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 39336086 - 39336014
Alignment:
Q  299 aggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    ||||||||||| |||||| | | | ||| ||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39336086 aggttgaacactttataaatgataagactcataaaatcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 39336014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 371
Target Start/End: Original strand, 53596027 - 53596074
Alignment:
Q  324 gacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53596027 gacccataaacccgttaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 53596074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 371
Target Start/End: Original strand, 53596342 - 53596389
Alignment:
Q  324 gacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53596342 gacccataaacccgttaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 53596389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 371
Target Start/End: Original strand, 53596542 - 53596589
Alignment:
Q  324 gacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  53596542 gacccataaacccattgacttaagattttaggtaagagtgtggtgtct 53596589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 249 - 289
Target Start/End: Original strand, 2299968 - 2300008
Alignment:
Q  249 ttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggata 289  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  2299968 ttgttgtgtgcaagtgtgggttatatgtcccacgtcagata 2300008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 325 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16871049 - 16871005
Alignment:
Q  325 acccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgt 369  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16871049 acccataaactcattgccttaaggttttaggtaagagtgtcgtgt 16871005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 324 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 48127906 - 48127858
Alignment:
Q  324 gacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtctt 372  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  48127906 gacccataaacccattgctttaatgttttggataagagtgtggtgtctt 48127858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 66)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 247 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 31767329 - 31767096
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |  |||||||    
T  31767329 tgttgttgtgtgcaagtgtgggttatatgttccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccattaacctaatgccttaa 31767230  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatc 446  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||   ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||  || |||||||||||    
T  31767229 ggttttgggtaagagtgtgacgtctatcttgcttgtgtggttgttctagactcgatgtggacggtcccccaagcttccctcatgacccaacagtggtatc 31767130  T
Q  447 agaacccggttcgacgaagggtacgtccgaggca 480  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  31767129 agagccccgttcgacgaagggtacgaccgaggca 31767096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 259 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 44290981 - 44290757
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggt-a 357  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  44290981 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 44290882  T
Q  358 agagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctc-gtgttcctacagtggtatcaga-acccgg 455  Q
    |||||||||||| |   ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |  ||  || ||||||||||||||  |||||    
T  44290881 agagtgtggtgtatctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctccccccactgacccaacagtggtatcagagccccgg 44290782  T
Q  456 ttcgacgaagggtacgtccgaggca 480  Q
    ||||||||||||| || ||||||||    
T  44290781 ttcgacgaagggtgcgaccgaggca 44290757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 249 - 430
Target Start/End: Original strand, 17294569 - 17294751
Alignment:
Q  249 ttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaagg 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  17294569 ttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 17294668  T
Q  349 tttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgc-ggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtg 430  Q
    |||| ||||||||||||||||||   | |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  17294669 ttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttatgcaggttgctctagcctcgatgtggacggtcgcccgagctcccctcgtg 17294751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 259 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 44290614 - 44290448
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  44290614 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 44290515  T
Q  359 gagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccc 425  Q
    |||| |||||||||  |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  44290514 gagtatggtgtctttcttgcttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccc 44290448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 247 - 480
Target Start/End: Original strand, 41156981 - 41157217
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||    
T  41156981 tgttgttgtgtgcaagtgtgaattatatgtcccataacggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgctttaa 41157080  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccc-aggctcccct--cgtgttcctacagtggt 443  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||   |||  || ||| ||||    
T  41157081 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctattgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtcccccaaggctccccttcagtgacccaacaatggt 41157180  T
Q  444 atcagaacccggttcgacgaagggtacgtccgaggca 480  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||| || |||||    
T  41157181 atcagagccccgttcgacaaagggtacgaccaaggca 41157217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 246 - 416
Target Start/End: Original strand, 41142361 - 41142532
Alignment:
Q  246 atgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcctta 345  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  41142361 atgttgttctgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataaacccattgcctta 41142460  T
Q  346 aggtttttggt-aagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccc 416  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||   ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  41142461 aggtttttggtaaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 41142532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 246 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 26662067 - 26661833
Alignment:
Q  246 atgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcctta 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||    
T  26662067 atgttgttgtgtacaagtgtgagttatatatcccatatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaagacccataaaccgattgcctta 26661968  T
Q  346 aggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtat 445  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| || | |||  ||| ||| |||| |||  ||||||||||||  || | ||||||||    
T  26661967 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaatccttgatgcggatggtctccctagctcccctcgtgacccaaaagtggtat 26661868  T
Q  446 cagaacc-cggttcgacgaagggtacgtccgaggc 479  Q
     |||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  26661867 tagaacctcgattcgacgaagggtacgaccgaggc 26661833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 247 - 480
Target Start/End: Original strand, 34649428 - 34649662
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  ||||||||||| |  |||||||    
T  34649428 tgttgttgtatacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgcaagaacccataaacctaatgccttaa 34649527  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccag-gctcccctcgtgttcctacagtggtat 445  Q
    |||||| |||||||||| || ||||   ||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||| |||  || ||||||||||    
T  34649528 ggttttgggtaagagtgaggcgtctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccggagcttccctagtgacccaacagtggtat 34649627  T
Q  446 cagaacccggttcgacgaagggtacgtccgaggca 480  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  34649628 cagagccccgttcgatgaagggtacgaccgaggca 34649662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 247 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 26661690 - 26661521
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  26661690 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgggtaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggacccataaactcattgccttaa 26661591  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccc 416  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   | ||||||| ||||| || |||||| || |||||||||||||    
T  26661590 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttgtgtggttgttcaagcctcgatatggacggtccccc 26661521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 247 - 471
Target Start/End: Original strand, 34364497 - 34364722
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||    
T  34364497 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccgtaaacccatagccttaa 34364596  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatc 446  Q
    |||||| |||||||||||| |||||   | |||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||   |||||||  |||  || |||||||||||    
T  34364597 ggttttgggtaagagtgtgatgtctctctcgcttatgcggttgctctagcctcgatgtggatggttccctgagctcccccagtgacccaacagtggtatc 34364696  T
Q  447 aga-acccggttcgacgaagggtacg 471  Q
    |||  |||||||||||||||||||||    
T  34364697 agagccccggttcgacgaagggtacg 34364722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 250 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 22077660 - 22077429
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||    
T  22077660 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcgtagccttaaggt 22077561  T
Q  350 ttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatcaga 449  Q
    ||| ||||||||||||| ||||   |  ||| |||||||| || ||| || || ||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||| ||||||    
T  22077560 tttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttatgcggttgttcaagcatcgatatggacggtcccccaggctccccttgtgacccaacagtggcatcaga 22077461  T
Q  450 accc-ggttcgacgaagggtacgtccgaggca 480  Q
     ||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  22077460 gcccaggttcgacgaagggtacgaccaaggca 22077429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 476
Target Start/End: Original strand, 9955911 - 9956129
Alignment:
Q  261 agtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaaga-gtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccat-aaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||    
T  9955911 agtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaaagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccattaaaccaattgccttaaggttttgggtaa 9956010  T
Q  359 gagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatcagaacc-cggtt 457  Q
    ||||||| |||||   ||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||| |||||| |||||||  || |||||||||||||| || |||||    
T  9956011 gagtgtgatgtctctcttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtgagcggtcccctaggctctcctcgtgacccaacagtggtatcagagcctcggtt 9956110  T
Q  458 cgacgaagggtacgtccga 476  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  9956111 cgacgaagggtacgaccga 9956129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 249 - 426
Target Start/End: Original strand, 41157367 - 41157545
Alignment:
Q  249 ttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaagg 348  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  41157367 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctttagg 41157466  T
Q  349 tttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccc-ccaggctcccct 426  Q
    ||||  |||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||    
T  41157467 ttttgagtaagagtgtggtgtctgtcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtccctcaaggctcccct 41157545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 249 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 66638 - 66406
Alignment:
Q  249 ttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaagg 348  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  || |||||||||    
T  66638 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgttccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacatatggccttaagg 66539  T
Q  349 tttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatcag 448  Q
    |||| ||||||||| | | ||||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||| ||||||||| ||  || |||||| ||||||    
T  66538 ttttgggtaagagtatagcgtctctctcgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggttatccaagctcccctcatgacccaacagtgatatcag 66439  T
Q  449 a-acccggttcgacgaagggtacgtccgaggca 480  Q
    |  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  66438 agtcccggttcgacgaagggtacgaccgaggca 66406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 265 - 416
Target Start/End: Original strand, 14318875 - 14319026
Alignment:
Q  265 tgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgt 364  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||    
T  14318875 tgagttatatgttccacgtcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccataaatctattgccttaaggttttgggtaagagtgt 14318974  T
Q  365 ggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccc 416  Q
    |||||||   ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14318975 ggtgtctctcttatttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtccccc 14319026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 247 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 37850768 - 37850539
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  |  ||||    
T  37850768 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgcataaaacagtagaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaacctaatgttttaa 37850669  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatc 446  Q
    |||||  | ||||||||||||||||   |  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| || ||| ||  |||||||    
T  37850668 ggtttcggataagagtgtggtgtctctctcacttgtgcggttgctctagcctcgatgtggacggtccccta-gctcccctcatgatccaactctggtatc 37850570  T
Q  447 aga-acccggttcgacgaagggtacgtccga 476  Q
    |||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  37850569 agagccccggttcgacaaagggtacgtccga 37850539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 262 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 3537752 - 3537599
Alignment:
Q  262 gtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagag 361  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  3537752 gtgttagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttatgagtaagaggacctataaacccattggcttaaggttttgggtaagag 3537653  T
Q  362 tgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccc 415  Q
    ||||| ||||   ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  3537652 tgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 3537599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 247 - 371
Target Start/End: Original strand, 34364915 - 34365039
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  34364915 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaataataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatagccttaa 34365014  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  34365015 ggttttgggtaagagtgtggtgtct 34365039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 247 - 406
Target Start/End: Original strand, 37556101 - 37556260
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaag-agtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcctta 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  37556101 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacc-ataaacccatagcctta 37556199  T
Q  346 aggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtgg 406  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  37556200 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtgg 37556260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 243 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 38804527 - 38804371
Alignment:
Q  243 tttatgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcc 342  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||  ||    
T  38804527 tttatattgttgtttacaagtgtgagttatacgtcccacatcgaataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaagaggatccataaacccataacc 38804428  T
Q  343 ttaaggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctc 399  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||   ||||||||||||||| |||||||||    
T  38804427 ttaaggttttgggtaagagtgtagtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctc 38804371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 259 - 415
Target Start/End: Original strand, 41759485 - 41759641
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  41759485 caagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaagttgaacaccttataagtaagatgatccataaatccattgccttaaggttttgggtaa 41759584  T
Q  359 gagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccc 415  Q
    |||||||||||||   |||||| || ||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  41759585 gagtgtggtgtctctcttgcttatgtggttgttctagccttgatgtggacggtcccc 41759641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 247 - 416
Target Start/End: Original strand, 11977270 - 11977439
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||| |  |||||||    
T  11977270 tgttgctgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgggtaaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagagcactcataaacctaatgccttaa 11977369  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccc 416  Q
    |||||| |||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  11977370 ggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttgcaagtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 11977439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 253 - 427
Target Start/End: Original strand, 45084378 - 45084546
Alignment:
Q  253 tgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttt 352  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      || |||||||||||    
T  45084378 tgtgtgcaagtgtgagttatatctcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa------cgtcttaaggtttt 45084471  T
Q  353 tggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctc 427  Q
     |||||||| |||||||||   ||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  45084472 gggtaagagagtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctaacctcgatgcggacggtcccccaggcttccctc 45084546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 249 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 5320131 - 5319965
Alignment:
Q  249 ttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaagg 348  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  5320131 ttgttgtatgcaagtgtgagttatatgttccacatcggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtgagaggacccataaactcatagccttaagg 5320032  T
Q  349 tttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccc 415  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   |||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  5320031 ttttgggtaagagtgtagtgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcaatgtagacggtcccc 5319965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 259 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 48588644 - 48588486
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||||||| |||||    
T  48588644 caagtgtgagttctatgtccgacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccgtaaattcattgccttaaggttttgggtaa 48588545  T
Q  359 gagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccca 417  Q
    ||||| |||||||   || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  48588544 gagtgcggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcgccca 48588486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 260 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 50052178 - 50051958
Alignment:
Q  260 aagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaag 359  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||   ||||| ||||| ||||||    
T  50052178 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacctattttcttaaagttttgggtaag 50052079  T
Q  360 agtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatcaga-acccggttc 458  Q
    ||||||||||||   ||| || ||  |||| |||| |||| |||||||| |||||||  ||||||||||||  || ||||||||||||||  ||||||||    
T  50052078 agtgtggtgtctctcttgtttatg-tgttgttctaacctcgatgtggacagtcccccgagctcccctcgtgacccaacagtggtatcagagccccggttc 50051980  T
Q  459 gacgaagggtacgtccgaggca 480  Q
    ||| |||||  || ||||||||    
T  50051979 gacaaagggcgcgaccgaggca 50051958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 259 - 411
Target Start/End: Original strand, 3550722 - 3550871
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  3550722 caagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaagttttgggtaa 3550821  T
Q  359 gagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggt 411  Q
    |||||||||||||   ||||   | |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  3550822 gagtgtggtgtctctcttgc---tacggttgttctagcctcgatgtggacggt 3550871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 248 - 407
Target Start/End: Original strand, 40082398 - 40082556
Alignment:
Q  248 gttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaag 347  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||  ||| ||||||||    
T  40082398 gttgttgtgcgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-tcataaattcattgccttaag 40082496  T
Q  348 gtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtgga 407  Q
    ||||| |||||||||||||| |||   ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  40082497 gttttgggtaagagtgtggtatctctcttgcttgtgcgtttgttctagcctcgatgtgga 40082556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 249 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 3875497 - 3875319
Alignment:
Q  249 ttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaagg 348  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  3875497 ttgttgtgtgcaagagtcagttatatgtcacacatcggataaaaaagtaaaggttgtacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaagg 3875398  T
Q  349 tttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctc 427  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||   |  || ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||    
T  3875397 ttttaggtaagaatgtggagtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccctc 3875319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 247 - 417
Target Start/End: Original strand, 29798189 - 29798359
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  29798189 tgttgttgtatgcaagtgtgagttatatgtcctacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaa 29798288  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccca 417  Q
    ||| || | ||||||||||||||||   ||||  ||| ||||| |||| |||| || | ||||||||||||    
T  29798289 ggtcttggataagagtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctaacctcgatatagacggtccccca 29798359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 259 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 32594872 - 32594760
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||    
T  32594872 caagtgtgagttatatgtcctacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggttttgggtaa 32594773  T
Q  359 gagtgtggtgtct 371  Q
    |||||||||||||    
T  32594772 gagtgtggtgtct 32594760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 247 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 41184593 - 41184489
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  41184593 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 41184494  T
Q  347 ggttt 351  Q
    |||||    
T  41184493 ggttt 41184489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 247 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 39066368 - 39066199
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||    
T  39066368 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatattccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagatgacccataaaatcattgtcttaa 39066269  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccca 417  Q
    |||||| | ||||||||||||||||   || ||| || ||||| ||||||||  |||| ||||||||||||    
T  39066268 ggttttggataagagtgtggtgtctctcttacttatgtggttgttctagccttgatgt-gacggtccccca 39066199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 259 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 45494135 - 45493971
Alignment:
Q  259 caagtgtgagtt-atatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacacc----ttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggttttt 353  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||     |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||     
T  45494135 caagtgtgagtttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccatatatataagtaagatgatccataaacccattgccttaaagttttg 45494036  T
Q  354 ggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccag 418  Q
    | ||||||||||||||||   || ||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  45494035 gataagagtgtggtgtctctcttccttatgtggttgttcaagcctcgatgtggacggtcccccag 45493971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 252 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 22077991 - 22077774
Alignment:
Q  252 ttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggttt 351  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   |  ||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  22077991 ttgtgtgcaagtgtgagttatatgttttaaatcggatagaaaaataaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactcatagcc-taaggttt 22077893  T
Q  352 ttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatcagaac 451  Q
      ||||||||||||| ||||   |  ||| |||||||| || ||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||  || ||||||| |||||| |    
T  22077892 ggggtaagagtgtggcgtctctttcacttatgcggttgttcaagcatcgatgtggacggtcctccaggctccccttgtgacccaacagtggcatcagagc 22077793  T
Q  452 cc-ggttcgacgaagggta 469  Q
    || ||||||||||||||||    
T  22077792 ccaggttcgacgaagggta 22077774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 248 - 406
Target Start/End: Original strand, 37555721 - 37555878
Alignment:
Q  248 gttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaag 347  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||| || || |||| || | ||||||||    
T  37555721 gttgttgtgtaaaagtgtgagttataagtcccacatcggataaaatagtgaaggttgaatacattataagtaagagga-ccttaaatccttagccttaag 37555819  T
Q  348 gtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtgg 406  Q
    ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  37555820 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtgg 37555878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 263 - 371
Target Start/End: Original strand, 5575110 - 5575218
Alignment:
Q  263 tgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagt 362  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| || |||||||||| | |||||||    
T  5575110 tgtgaattatatgtcccacgtcggatagaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaatccatagctttaaggttttggataagagt 5575209  T
Q  363 gtggtgtct 371  Q
    |||| ||||    
T  5575210 gtggcgtct 5575218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 259 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 3537303 - 3537226
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaaccc 336  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3537303 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccc 3537226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 259 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 32168843 - 32168698
Alignment:
Q  259 caagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaa 358  Q
    |||||||||||||||||||||     |||||||| ||||||||||||||||||||      ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  32168843 caagtgtgagttatatgtccc-----ggataaaatagtaaaggttgaacacctta------agaggacccataaacccattgccttgaggttttgggtaa 32168755  T
Q  359 gagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccc 415  Q
    |||||||| ||||   ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  32168754 gagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacagtcccc 32168698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 250 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 66254 - 66136
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttat-atgtcccacgtcggataaaagagtaaaggtt-gaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaag 347  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||| ||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  66254 tgttgtgtgcaagtgtgagtaatcatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggtttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctatggccttaag 66155  T
Q  348 gtttttggtaagagtgtgg 366  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  66154 gttttgggtaagagtgtgg 66136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 250 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 24600479 - 24600321
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||  || ||||||| ||| | ||||||||    
T  24600479 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacatattataagtaagagaactcataaactcattgtcttaaggt 24600380  T
Q  350 ttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggac 408  Q
    |||  |||||||||||||||||   | ||| ||  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  24600379 tttgtgtaagagtgtggtgtctctctcgctagtatggttgttctagcctcgatgtggac 24600321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 283 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 22077242 - 22077101
Alignment:
Q  283 tcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgt 382  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||||||||  ||||   |  ||| |    
T  22077242 tcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaactcattgccctaaggttttggataagagtgtgacgtctccctcacttat 22077143  T
Q  383 gcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctccc 424  Q
    ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22077142 gcggttgttcaagcctcgatgtggacggtcccccaggctccc 22077101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 294 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 44043893 - 44043816
Alignment:
Q  294 agtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  44043893 agtaaatgttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccattgtcttaagattttgggtaagagtgtggtgtct 44043816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 247 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 21378209 - 21378118
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccat 338  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21378209 tgttgttgtgtgcaagtgtcagttatatgtcccagatcggatagaacagtaaaggttgaatatcttataagtaagaggacccataaacccat 21378118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 247 - 405
Target Start/End: Original strand, 45839617 - 45839779
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggtt-----gaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgc 341  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||     ||||||||||||||||||| ||||||||||   |  ||    
T  45839617 tgttgttgtgtacaagtatgagttatatgtcccacatcggatagaa-aataaaggttgaatcgaacaccttataagtaagaagacccataaatgtaatgc 45839715  T
Q  342 cttaaggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtg 405  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||   ||||||||| | ||| ||| ||||| |||||    
T  45839716 cttaaggttttgggtaagattgtggtgtctctcttgcttgtgggattgttctggcctcgatgtg 45839779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 250 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 19283620 - 19283455
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| || |||  ||||||| ||| || ||| | ||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  19283620 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacaccggatagaaaagtggaggttgagcactttgtaaatgagaggacacataaactcatcgccttaaggt 19283521  T
Q  350 ttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccc 415  Q
    ||| | ||||||||||| ||||   |  |||||||||||| ||||||||  ||||||  |||||||    
T  19283520 tttggataagagtgtggcgtctctctcacttgtgcggttgctctagcctggatgtgggaggtcccc 19283455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 351
Target Start/End: Original strand, 44685449 - 44685551
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaagg-ttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaagg 348  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| |    
T  44685449 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggtttgaaaaccttataagtaagaggaccaataaactcattgccttaatg 44685548  T
Q  349 ttt 351  Q
    |||    
T  44685549 ttt 44685551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 249 - 409
Target Start/End: Original strand, 22793270 - 22793431
Alignment:
Q  249 ttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaaccca-tcgccttaag 347  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||| |||||||| || |||||||| ||| || ||||||||||| | |||||| |    
T  22793270 ttgttgtgagcaagtgtgagttatatgtcccacatcgtatagaaaagtagaggttgaaaactttataagtgagaggatccataaacccatttgccttacg 22793369  T
Q  348 gtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacg 409  Q
    |||||  |||||||||||  ||||   || |||||| ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  22793370 gttttgagtaagagtgtgacgtctctcttacttgtgtggttgttctggcctcaatatggacg 22793431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 250 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 24132150 - 24132049
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||| ||||||||||    
T  24132150 tgttgtatgcaactgtgagttatatgtccctcatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataaggggatccataaactcattgccttaaggt 24132051  T
Q  350 tt 351  Q
    ||    
T  24132050 tt 24132049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 250 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 30630803 - 30630690
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||| ||    
T  30630803 tgttatgtgcaagtgtgatttatatgtctcacatcggataaaaaattaaaggtttgacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagt 30630704  T
Q  350 ttttggtaagagtg 363  Q
    ||| ||||||||||    
T  30630703 tttgggtaagagtg 30630690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 267 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 5528902 - 5528798
Alignment:
Q  267 agttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtgg 366  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||| |||   ||||||||||| |||||  ||||||    
T  5528902 agttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacatcttataaataagaggactcataaactcattttcttaaggttttgggtaaatgtgtgg 5528803  T
Q  367 tgtct 371  Q
     ||||    
T  5528802 cgtct 5528798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 244 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 35154210 - 35154150
Alignment:
Q  244 ttatgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttg 304  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  35154210 ttatgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggttg 35154150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 416
Target Start/End: Original strand, 11977009 - 11977103
Alignment:
Q  322 atgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccc 416  Q
    ||||| |||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||  ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  11977009 atgactcataaacctaatgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcaagtgcggtagttctagcctcgatgtggacggtccccc 11977103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 1188753 - 1188632
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggt 349  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||| || |||  |||||||| |  |||||||| ||| ||| ||||||| ||| || |||||||    
T  1188753 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgttccatatcggatagaaaagtggaggttgaatattttataagtgagaagactcataaactcattgctttaaggt 1188654  T
Q  350 ttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||    
T  1188653 tttgggtaaaagtgtggcgtct 1188632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 250 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 50469246 - 50469180
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataa 316  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  50469246 tgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataataaagtaaaggttgaacactttataa 50469180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 4266940 - 4266872
Alignment:
Q  257 tacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatga 325  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |  |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  4266940 tacaaatgtgagttatatgtcctacattagataaaagagtaaatgttgaacacattagaagtaagatga 4266872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 356 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 21378118 - 21378059
Alignment:
Q  356 taagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccc 415  Q
    ||||||||||| ||||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21378118 taagagtgtggcgtctatattgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcccc 21378059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 284 - 365
Target Start/End: Original strand, 4956218 - 4956299
Alignment:
Q  284 cggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtg 365  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||| ||||||    
T  4956218 cggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggatccataaactcattgctctaaagttttaggtaaaagtgtg 4956299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 378 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 41184445 - 41184340
Alignment:
Q  378 cttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccag-gctcccctc-gtgttcctacagtggtatcagaacccg-gttcgacgaagggtacgtcc 474  Q
    |||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||| | |||||||||  || ||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | ||    
T  41184445 cttgtgcggttgttccagcctcgatgtcgacggtccccccgagctcccctcactgatccaacagtggtatcagagcccgagctcgacgaagggtaagacc 41184346  T
Q  475 gaggca 480  Q
    ||||||    
T  41184345 gaggca 41184340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 250 - 318
Target Start/End: Original strand, 4878796 - 4878864
Alignment:
Q  250 tgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagt 318  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||| |||||||  ||||||||    
T  4878796 tgttgtgtgcaattgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtgaagcttgaacattttataagt 4878864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 371
Target Start/End: Original strand, 12466366 - 12466397
Alignment:
Q  340 gccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12466366 gccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtct 12466397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 35154106 - 35154047
Alignment:
Q  312 tataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    ||||||||||| | |||||||||  || | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35154106 tataagtaagagggcccataaactgattgtcttaaggtttttggcaagagtgtggtgtct 35154047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 1187527 - 1187414
Alignment:
Q  252 ttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggttt 351  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||| ||| || |||  ||||| ||||  |||||||| ||| ||||||||||| |||  ||||||| |||    
T  1187527 ttgtgtgcaagtgtgaattatatgtctcacatcgaatataaaagtggaggttaaacattttataagtgagaagacccataaactcattaccttaagattt 1187428  T
Q  352 ttggtaagagtgtg 365  Q
    |  |||| ||||||    
T  1187427 tgagtaaaagtgtg 1187414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 365
Target Start/End: Original strand, 31877262 - 31877307
Alignment:
Q  320 agatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtg 365  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  31877262 agatgacccataaactcatcatcttaaggttttaggtaagagtgtg 31877307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 41184197 - 41184152
Alignment:
Q  306 acaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggttt 351  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  41184197 acactttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttt 41184152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 299 - 371
Target Start/End: Original strand, 10351202 - 10351274
Alignment:
Q  299 aggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    ||||||||||| |||||||| |||  |||||||||| |||  | ||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  10351202 aggttgaacactttataagtgagagaacccataaacacattactttaagattttgggtaagagtgtggcgtct 10351274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 4)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 246 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 1275 - 1096
Alignment:
Q  246 atgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgcctta 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||| ||||||    
T  1275 atgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagaaaaaggactcataaacccattgcctta 1176  T
Q  346 aggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccc 425  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||   ||| || || ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  1175 aggttttgggtaagagtatggtgtctctcttgtttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggttccccaagctcccc 1096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 304 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 1802 - 1735
Alignment:
Q  304 gaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1802 gaacaccttataagtgagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtct 1735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 247 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 3153 - 3092
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaaca 308  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3153 tgttgttgtgtgcaggtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaaca 3092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 385 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 1713 - 1618
Alignment:
Q  385 ggttggtctagcctcaatgtggacggtcccccaggctcccctcgtgttcctacagtggtatcagaacccggttcgacgaagggtacgtccgaggca 480  Q
    ||||| ||||||||| |||||| | |||||||  ||||||||||||  || |||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||  ||||||||    
T  1713 ggttgttctagcctcgatgtgggcagtccccctagctcccctcgtgacccaacagtggtatcagagcctcgttcgacaaagggtacaaccgaggca 1618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 249 - 371
Target Start/End: Original strand, 5349 - 5471
Alignment:
Q  249 ttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaagg 348  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  5349 ttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgttccacatcggatagaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaga 5448  T
Q  349 tttttggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    |||| | ||||||||||||||||    
T  5449 ttttggataagagtgtggtgtct 5471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 247 - 408
Target Start/End: Original strand, 4972 - 5133
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||| | || |||||||||| || | ||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||     
T  4972 tgttgttgtgtgcaagtgtgaattatatgtctcacatcggagagaacagtaaaggtttaatatcttataagtaaaaagacccataaactcattgccttat 5071  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggac 408  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   | |||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  5072 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttatgcggttgctctagcctcgatgtggac 5133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 238 - 406
Target Start/End: Original strand, 5377 - 5546
Alignment:
Q  238 ggtgctttatgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaaccca 337  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |    
T  5377 ggtgcttattgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcccataaacata 5476  T
Q  338 tcgccttaaggttttt-ggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtgg 406  Q
    | | ||||| |||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  5477 ttgtcttaaagtttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttcaagcctcgatgtgg 5546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 247 - 347
Target Start/End: Original strand, 5767 - 5867
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  5767 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcgcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 5866  T
Q  347 g 347  Q
    |    
T  5867 g 5867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 247 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 17624 - 17498
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  17624 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagaggacccataaacccatagccttaa 17525  T
Q  347 ggttttt--ggtaagagtgtggtgtct 371  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||    
T  17524 ggttttttgggtaagagtatggtgtct 17498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 247 - 416
Target Start/End: Original strand, 47350 - 47519
Alignment:
Q  247 tgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaa 346  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||| ||||| ||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||    
T  47350 tgttgatgtgtgcaagtgtgaattaaatgtctcacatccgataaaatagtaaagtttgaacaccttataagtaagagaatccataaacccattgccttaa 47449  T
Q  347 ggtttttggtaagagtgtggtgtcttagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatgtggacggtccccc 416  Q
     ||||| ||||| | ||||||||||   ||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  47450 agttttgggtaaaaatgtggtgtctctcttgcttgcgcggttgttctaacctcgatgtggacggtccccc 47519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0504 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0504
Description:

Target: scaffold0504; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 246 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 10280 - 10192
Alignment:
Q  246 atgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaac 334  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10280 atgttgttgtgcacaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatggtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 10192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 249 - 289
Target Start/End: Original strand, 39830 - 39870
Alignment:
Q  249 ttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacgtcggata 289  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39830 ttgttgtgttcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 39870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University