View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6704_low_14 (Length: 279)

Name: NF6704_low_14
Description: NF6704
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6704_low_14
NF6704_low_14
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (7-267)||(30727-30987)
scaffold0044 (7-267)||(72544-72804)
scaffold0044 (11-264)||(8262-8515)
[»] chr8 (30 HSPs)
chr8 (7-267)||(17669216-17669476)
chr8 (7-267)||(17675868-17676128)
chr8 (6-266)||(22084032-22084292)
chr8 (7-267)||(21915216-21915476)
chr8 (7-267)||(5534085-5534345)
chr8 (7-266)||(20019586-20019845)
chr8 (7-266)||(20013510-20013768)
chr8 (7-258)||(28454968-28455219)
chr8 (7-265)||(19111428-19111686)
chr8 (7-265)||(19117719-19117977)
chr8 (7-265)||(8354409-8354667)
chr8 (11-265)||(22123035-22123289)
chr8 (11-265)||(18865533-18865787)
chr8 (11-265)||(16882822-16883076)
chr8 (11-265)||(18855138-18855392)
chr8 (11-265)||(29123287-29123541)
chr8 (11-265)||(22115370-22115624)
chr8 (7-265)||(22048148-22048406)
chr8 (7-265)||(19496592-19496850)
chr8 (21-265)||(20527651-20527895)
chr8 (11-134)||(22122072-22122195)
chr8 (21-258)||(18065540-18065777)
chr8 (11-170)||(20023578-20023737)
chr8 (62-259)||(19905705-19905901)
chr8 (21-240)||(26934836-26935055)
chr8 (21-240)||(3216488-3216707)
chr8 (21-90)||(23845443-23845512)
chr8 (201-265)||(22124368-22124432)
chr8 (129-170)||(22124296-22124337)
chr8 (195-240)||(23845595-23845640)
[»] chr7 (65 HSPs)
chr7 (7-267)||(40523007-40523267)
chr7 (7-267)||(9510658-9510918)
chr7 (7-267)||(18164319-18164579)
chr7 (6-266)||(60321-60581)
chr7 (7-266)||(14330987-14331246)
chr7 (7-266)||(14337571-14337830)
chr7 (7-258)||(21891-22142)
chr7 (7-258)||(8201720-8201971)
chr7 (10-265)||(11366402-11366657)
chr7 (7-258)||(15022338-15022590)
chr7 (11-265)||(14655066-14655320)
chr7 (7-265)||(44786120-44786378)
chr7 (7-265)||(44792761-44793019)
chr7 (11-265)||(18176306-18176560)
chr7 (11-265)||(18182978-18183232)
chr7 (7-267)||(12703033-12703315)
chr7 (11-265)||(15155819-15156073)
chr7 (11-265)||(15162470-15162724)
chr7 (11-259)||(16406944-16407192)
chr7 (11-265)||(13684664-13684918)
chr7 (11-265)||(13691279-13691533)
chr7 (11-265)||(20702641-20702895)
chr7 (11-265)||(32767876-32768130)
chr7 (11-170)||(11238621-11238780)
chr7 (105-267)||(49051570-49051732)
chr7 (11-170)||(11231934-11232093)
chr7 (11-170)||(33404-33563)
chr7 (11-170)||(70415-70574)
chr7 (46-265)||(1347710-1347928)
chr7 (11-170)||(74523-74683)
chr7 (21-265)||(4318205-4318449)
chr7 (21-265)||(14953399-14953643)
chr7 (21-265)||(14959365-14959609)
chr7 (52-170)||(12704349-12704467)
chr7 (44-265)||(18531446-18531667)
chr7 (21-265)||(11262530-11262774)
chr7 (21-259)||(14148777-14149015)
chr7 (46-265)||(12692697-12692916)
chr7 (44-265)||(25038893-25039114)
chr7 (21-258)||(18553192-18553429)
chr7 (21-258)||(18584960-18585197)
chr7 (21-253)||(10869662-10869893)
chr7 (21-264)||(23519614-23519857)
chr7 (21-259)||(10875736-10875973)
chr7 (47-265)||(11547953-11548170)
chr7 (47-265)||(11554549-11554766)
chr7 (21-240)||(6016831-6017050)
chr7 (21-250)||(8706212-8706441)
chr7 (21-250)||(8719628-8719857)
chr7 (47-170)||(9410241-9410364)
chr7 (195-265)||(26420201-26420271)
chr7 (21-91)||(44408019-44408089)
chr7 (21-91)||(26420353-26420423)
chr7 (195-265)||(44408171-44408241)
chr7 (21-92)||(39267294-39267365)
chr7 (7-57)||(1245667-1245717)
chr7 (21-151)||(7536501-7536631)
chr7 (199-265)||(13570096-13570162)
chr7 (201-265)||(11232123-11232187)
chr7 (201-265)||(11238810-11238874)
chr7 (21-92)||(2831954-2832025)
chr7 (21-92)||(9751198-9751269)
chr7 (21-92)||(18302580-18302651)
chr7 (195-265)||(9410146-9410216)
chr7 (133-170)||(13570190-13570227)
[»] chr5 (68 HSPs)
chr5 (7-267)||(22265145-22265405)
chr5 (7-267)||(27663435-27663695)
chr5 (7-267)||(27670075-27670335)
chr5 (7-265)||(22062527-22062785)
chr5 (7-267)||(41097868-41098128)
chr5 (7-266)||(23584341-23584600)
chr5 (7-267)||(17706576-17706836)
chr5 (7-267)||(41769442-41769702)
chr5 (7-267)||(41776016-41776276)
chr5 (7-266)||(27615546-27615805)
chr5 (11-267)||(34294202-34294458)
chr5 (19-266)||(27608940-27609187)
chr5 (6-265)||(40707324-40707582)
chr5 (6-265)||(40713966-40714224)
chr5 (7-267)||(23610102-23610362)
chr5 (7-267)||(23841498-23841758)
chr5 (11-267)||(24471897-24472153)
chr5 (7-258)||(25106993-25107244)
chr5 (7-258)||(25166086-25166337)
chr5 (7-258)||(16355054-16355305)
chr5 (7-258)||(16361713-16361964)
chr5 (7-258)||(34565047-34565298)
chr5 (7-258)||(34571702-34571953)
chr5 (11-265)||(19992085-19992339)
chr5 (11-265)||(15001328-15001582)
chr5 (11-265)||(14994685-14994939)
chr5 (7-265)||(27516954-27517211)
chr5 (7-265)||(27523591-27523848)
chr5 (11-265)||(1692086-1692340)
chr5 (11-265)||(18038317-18038571)
chr5 (11-265)||(27686978-27687232)
chr5 (6-265)||(37293128-37293387)
chr5 (11-265)||(22327813-22328067)
chr5 (11-239)||(22334467-22334695)
chr5 (6-265)||(37286425-37286684)
chr5 (21-265)||(22133200-22133444)
chr5 (21-265)||(22139892-22140136)
chr5 (21-265)||(22588296-22588540)
chr5 (21-253)||(25406639-25406871)
chr5 (11-265)||(17284268-17284522)
chr5 (11-265)||(29477604-29477858)
chr5 (11-265)||(41294084-41294338)
chr5 (7-265)||(37544243-37544502)
chr5 (11-265)||(29471009-29471263)
chr5 (11-170)||(15236430-15236589)
chr5 (21-265)||(21294923-21295167)
chr5 (44-265)||(23336971-23337192)
chr5 (44-265)||(25535190-25535411)
chr5 (99-262)||(33726064-33726227)
chr5 (21-259)||(14359479-14359717)
chr5 (21-265)||(15441614-15441858)
chr5 (21-265)||(24554736-24554979)
chr5 (7-170)||(19775241-19775404)
chr5 (8-170)||(19768645-19768807)
chr5 (126-252)||(20776103-20776229)
chr5 (11-170)||(23250237-23250396)
chr5 (23-240)||(22325588-22325805)
chr5 (21-258)||(22410258-22410495)
chr5 (21-258)||(29316627-29316864)
chr5 (21-264)||(22258133-22258375)
chr5 (49-258)||(21667494-21667703)
chr5 (21-170)||(25808146-25808295)
chr5 (11-90)||(24020637-24020716)
chr5 (21-240)||(22343724-22343943)
chr5 (44-149)||(22353194-22353299)
chr5 (21-92)||(22119841-22119912)
chr5 (195-240)||(25808320-25808365)
chr5 (197-265)||(24020484-24020552)
[»] chr4 (62 HSPs)
chr4 (7-267)||(19779936-19780196)
chr4 (6-266)||(36884380-36884640)
chr4 (7-265)||(12475221-12475479)
chr4 (7-265)||(18024074-18024332)
chr4 (6-266)||(15362333-15362593)
chr4 (6-266)||(15383139-15383399)
chr4 (6-266)||(22194820-22195080)
chr4 (7-267)||(23954347-23954607)
chr4 (7-267)||(23961009-23961269)
chr4 (11-266)||(4772297-4772552)
chr4 (7-266)||(8048142-8048401)
chr4 (7-266)||(8054755-8055014)
chr4 (7-258)||(17961971-17962222)
chr4 (6-265)||(15148657-15148916)
chr4 (6-266)||(16231487-16231747)
chr4 (6-265)||(18295827-18296086)
chr4 (7-265)||(12481851-12482109)
chr4 (7-258)||(8385043-8385294)
chr4 (7-258)||(8391698-8391949)
chr4 (7-258)||(14074039-14074290)
chr4 (7-258)||(15256817-15257068)
chr4 (7-258)||(17808622-17808873)
chr4 (7-258)||(17089624-17089875)
chr4 (7-258)||(29040545-29040796)
chr4 (7-265)||(14298474-14298732)
chr4 (11-265)||(20115344-20115598)
chr4 (21-265)||(14268118-14268362)
chr4 (6-265)||(14305097-14305356)
chr4 (11-265)||(40478349-40478603)
chr4 (21-265)||(7900831-7901075)
chr4 (11-265)||(26284558-26284812)
chr4 (11-265)||(40471676-40471930)
chr4 (21-265)||(51493478-51493722)
chr4 (11-265)||(6873026-6873280)
chr4 (21-265)||(15321754-15321998)
chr4 (11-262)||(18071373-18071624)
chr4 (11-170)||(17810569-17810728)
chr4 (11-170)||(14757072-14757231)
chr4 (21-265)||(9271764-9272008)
chr4 (7-122)||(17991315-17991430)
chr4 (21-265)||(23838635-23838879)
chr4 (21-265)||(14679164-14679408)
chr4 (21-265)||(14685372-14685617)
chr4 (50-259)||(35170836-35171045)
chr4 (44-265)||(12522286-12522507)
chr4 (21-141)||(386014-386134)
chr4 (44-265)||(41385428-41385649)
chr4 (21-265)||(35614141-35614384)
chr4 (11-170)||(27710042-27710201)
chr4 (21-258)||(12349234-12349471)
chr4 (21-170)||(16956310-16956459)
chr4 (11-170)||(19941804-19941963)
chr4 (11-170)||(23081885-23082044)
chr4 (21-240)||(53433604-53433823)
chr4 (21-253)||(55795672-55795903)
chr4 (127-258)||(12299664-12299795)
chr4 (21-170)||(30234838-30234987)
chr4 (195-265)||(386166-386236)
chr4 (21-170)||(9556827-9556976)
chr4 (21-92)||(22633861-22633932)
chr4 (195-240)||(16956484-16956529)
chr4 (195-259)||(30235012-30235076)
[»] chr3 (96 HSPs)
chr3 (6-266)||(26889657-26889917)
chr3 (7-267)||(37615592-37615852)
chr3 (7-265)||(418203-418461)
chr3 (7-265)||(14672845-14673103)
chr3 (7-267)||(26788450-26788710)
chr3 (7-267)||(26794040-26794300)
chr3 (7-267)||(6598919-6599179)
chr3 (7-267)||(6605599-6605859)
chr3 (7-267)||(5106529-5106789)
chr3 (7-267)||(10845929-10846188)
chr3 (11-267)||(31422202-31422458)
chr3 (21-267)||(10153394-10153640)
chr3 (7-258)||(48423578-48423829)
chr3 (7-258)||(48430356-48430607)
chr3 (11-262)||(16623704-16623955)
chr3 (7-258)||(16634061-16634312)
chr3 (7-258)||(16640671-16640922)
chr3 (7-258)||(43161336-43161587)
chr3 (7-258)||(43167573-43167824)
chr3 (7-258)||(1332706-1332956)
chr3 (7-265)||(16747484-16747742)
chr3 (7-265)||(16758216-16758474)
chr3 (11-259)||(53380001-53380247)
chr3 (11-259)||(53386653-53386899)
chr3 (7-265)||(13250922-13251180)
chr3 (7-265)||(13257568-13257826)
chr3 (21-267)||(5221605-5221851)
chr3 (11-265)||(16489319-16489573)
chr3 (11-265)||(41201447-41201701)
chr3 (7-265)||(20057048-20057306)
chr3 (7-265)||(20063686-20063944)
chr3 (11-265)||(23704418-23704672)
chr3 (11-265)||(23722874-23723128)
chr3 (11-265)||(23741330-23741584)
chr3 (11-259)||(15726581-15726829)
chr3 (21-253)||(5149627-5149859)
chr3 (11-265)||(15691927-15692181)
chr3 (7-265)||(3690822-3691080)
chr3 (7-170)||(30066246-30066409)
chr3 (11-265)||(41091996-41092250)
chr3 (11-170)||(14499625-14499784)
chr3 (11-170)||(11070368-11070527)
chr3 (11-170)||(11165179-11165338)
chr3 (21-262)||(10911105-10911346)
chr3 (21-265)||(24187979-24188223)
chr3 (21-258)||(839455-839692)
chr3 (21-262)||(10003843-10004084)
chr3 (21-265)||(55149180-55149424)
chr3 (99-262)||(10010490-10010653)
chr3 (99-262)||(10904433-10904596)
chr3 (11-265)||(19809231-19809485)
chr3 (11-141)||(22642988-22643118)
chr3 (21-265)||(7985909-7986152)
chr3 (11-170)||(15825961-15826120)
chr3 (11-170)||(17710241-17710400)
chr3 (11-141)||(55023174-55023304)
chr3 (11-170)||(15991753-15991912)
chr3 (21-265)||(20723203-20723447)
chr3 (11-96)||(22670536-22670621)
chr3 (11-265)||(15404143-15404396)
chr3 (11-170)||(410400-410559)
chr3 (11-170)||(1145201-1145360)
chr3 (21-259)||(6608688-6608926)
chr3 (21-240)||(17252716-17252935)
chr3 (21-170)||(4710596-4710744)
chr3 (21-170)||(10236054-10236202)
chr3 (21-258)||(12482638-12482875)
chr3 (21-258)||(15584379-15584616)
chr3 (21-258)||(15591037-15591274)
chr3 (44-265)||(28350844-28351065)
chr3 (21-265)||(13321174-13321418)
chr3 (11-265)||(15397552-15397805)
chr3 (21-240)||(12891633-12891852)
chr3 (11-170)||(15343255-15343414)
chr3 (11-170)||(15349898-15350057)
chr3 (21-170)||(4291069-4291218)
chr3 (21-258)||(5201433-5201670)
chr3 (21-264)||(5426362-5426605)
chr3 (11-265)||(15360895-15361148)
chr3 (11-170)||(8720805-8720964)
chr3 (11-170)||(9072692-9072851)
chr3 (11-90)||(15337810-15337889)
chr3 (21-253)||(5419964-5420196)
chr3 (21-265)||(16333375-16333618)
chr3 (21-166)||(10326154-10326299)
chr3 (117-170)||(13315943-13315996)
chr3 (199-265)||(15337636-15337702)
chr3 (21-92)||(4588463-4588534)
chr3 (21-92)||(12340154-12340225)
chr3 (195-265)||(10236227-10236297)
chr3 (195-265)||(13316021-13316091)
chr3 (195-265)||(15825866-15825936)
chr3 (195-240)||(4290999-4291044)
chr3 (43-92)||(12852034-12852083)
chr3 (196-265)||(15991938-15992007)
chr3 (195-240)||(30777057-30777102)
[»] chr2 (54 HSPs)
chr2 (7-267)||(26877214-26877474)
chr2 (7-267)||(22320632-22320892)
chr2 (7-267)||(22326785-22327045)
chr2 (7-258)||(27216275-27216526)
chr2 (7-258)||(16986153-16986404)
chr2 (7-258)||(28431558-28431809)
chr2 (7-258)||(13306235-13306486)
chr2 (11-267)||(24913614-24913870)
chr2 (7-267)||(27617496-27617756)
chr2 (7-258)||(9340492-9340743)
chr2 (7-258)||(9489126-9489377)
chr2 (7-258)||(9608387-9608638)
chr2 (7-265)||(16997252-16997510)
chr2 (11-258)||(19489574-19489821)
chr2 (7-265)||(17003885-17004143)
chr2 (21-265)||(29233731-29233975)
chr2 (21-265)||(29347030-29347274)
chr2 (7-264)||(1843286-1843543)
chr2 (11-265)||(23171240-23171494)
chr2 (11-265)||(23582497-23582751)
chr2 (53-265)||(27599466-27599678)
chr2 (21-265)||(12829272-12829516)
chr2 (92-258)||(16922741-16922907)
chr2 (93-265)||(16928558-16928730)
chr2 (11-170)||(10101295-10101454)
chr2 (21-265)||(10866574-10866818)
chr2 (21-265)||(10873741-10873985)
chr2 (21-259)||(27197093-27197331)
chr2 (7-88)||(29282430-29282511)
chr2 (7-107)||(16980563-16980663)
chr2 (21-265)||(21138931-21139175)
chr2 (21-265)||(24503312-24503556)
chr2 (11-170)||(41604381-41604540)
chr2 (11-170)||(41610278-41610437)
chr2 (7-91)||(16928832-16928916)
chr2 (21-265)||(21146949-21147193)
chr2 (47-170)||(37318572-37318695)
chr2 (11-170)||(13970019-13970178)
chr2 (11-170)||(45057075-45057234)
chr2 (21-265)||(24640621-24640864)
chr2 (21-240)||(30970639-30970858)
chr2 (44-170)||(24872090-24872216)
chr2 (44-170)||(24879975-24880101)
chr2 (127-264)||(44380959-44381095)
chr2 (19-170)||(24715009-24715160)
chr2 (127-264)||(44387629-44387765)
chr2 (46-240)||(19645662-19645856)
chr2 (21-258)||(27369511-27369748)
chr2 (21-258)||(27376021-27376258)
chr2 (21-170)||(15477901-15478050)
chr2 (195-240)||(24880126-24880171)
chr2 (21-78)||(27602186-27602243)
chr2 (195-240)||(41604565-41604610)
chr2 (195-240)||(41610462-41610507)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (7-267)||(9462-9722)
[»] chr6 (68 HSPs)
chr6 (7-267)||(20649439-20649699)
chr6 (7-266)||(6980860-6981119)
chr6 (6-266)||(20060851-20061111)
chr6 (7-267)||(2869782-2870041)
chr6 (7-267)||(2876397-2876656)
chr6 (7-266)||(4233144-4233403)
chr6 (11-267)||(12762902-12763158)
chr6 (7-266)||(14059262-14059521)
chr6 (7-258)||(8229097-8229348)
chr6 (7-258)||(18931286-18931537)
chr6 (7-258)||(29593466-29593717)
chr6 (7-267)||(30597418-30597678)
chr6 (7-258)||(29587325-29587576)
chr6 (11-265)||(27327706-27327960)
chr6 (11-265)||(27388446-27388700)
chr6 (11-258)||(30637780-30638026)
chr6 (44-265)||(18194207-18194428)
chr6 (44-265)||(30694565-30694786)
chr6 (21-265)||(1538604-1538848)
chr6 (21-265)||(1544703-1544947)
chr6 (7-259)||(28258100-28258351)
chr6 (7-259)||(28264724-28264975)
chr6 (7-259)||(28336849-28337100)
chr6 (7-259)||(28343473-28343724)
chr6 (21-260)||(8797398-8797637)
chr6 (11-262)||(27429933-27430184)
chr6 (59-265)||(17031073-17031279)
chr6 (11-265)||(26130670-26130925)
chr6 (21-265)||(17036995-17037239)
chr6 (21-262)||(20801962-20802202)
chr6 (21-259)||(22331648-22331886)
chr6 (44-265)||(16372061-16372282)
chr6 (21-265)||(34369633-34369877)
chr6 (21-259)||(19808735-19808973)
chr6 (11-265)||(25117646-25117900)
chr6 (21-170)||(34832952-34833101)
chr6 (21-240)||(25595012-25595231)
chr6 (116-259)||(28287565-28287707)
chr6 (21-253)||(28314786-28315018)
chr6 (11-265)||(25111043-25111297)
chr6 (21-170)||(14098924-14099073)
chr6 (21-259)||(27185918-27186156)
chr6 (21-259)||(27207754-27207992)
chr6 (21-259)||(27241236-27241474)
chr6 (21-259)||(27263084-27263322)
chr6 (21-258)||(32564902-32565139)
chr6 (21-253)||(16551680-16551912)
chr6 (21-253)||(16577041-16577273)
chr6 (21-253)||(16618107-16618339)
chr6 (21-253)||(16628236-16628468)
chr6 (11-170)||(14472567-14472726)
chr6 (47-166)||(3708168-3708287)
chr6 (127-258)||(17016688-17016819)
chr6 (11-170)||(24314729-24314888)
chr6 (11-170)||(31316742-31316901)
chr6 (44-170)||(4168222-4168348)
chr6 (195-265)||(34298457-34298527)
chr6 (45-170)||(4208902-4209027)
chr6 (21-265)||(22759055-22759297)
chr6 (21-170)||(23276938-23277087)
chr6 (44-92)||(31164529-31164577)
chr6 (11-90)||(24290723-24290802)
chr6 (199-265)||(25928499-25928565)
chr6 (22-91)||(34295728-34295797)
chr6 (195-265)||(3708316-3708386)
chr6 (21-92)||(21939785-21939856)
chr6 (199-265)||(4168128-4168194)
chr6 (199-265)||(4208808-4208874)
[»] chr1 (34 HSPs)
chr1 (7-267)||(20215574-20215834)
chr1 (7-266)||(44844528-44844788)
chr1 (6-265)||(51334957-51335216)
chr1 (7-258)||(46156966-46157217)
chr1 (6-265)||(51328322-51328582)
chr1 (7-258)||(43078649-43078900)
chr1 (11-265)||(41478226-41478481)
chr1 (11-265)||(18599755-18600009)
chr1 (7-265)||(16345420-16345678)
chr1 (7-265)||(16352068-16352326)
chr1 (21-265)||(21828916-21829160)
chr1 (21-265)||(21844429-21844673)
chr1 (11-170)||(1011020-1011179)
chr1 (7-265)||(41355933-41356191)
chr1 (7-265)||(41348496-41348754)
chr1 (21-265)||(47659419-47659663)
chr1 (24-259)||(19063728-19063963)
chr1 (24-259)||(19111618-19111853)
chr1 (21-265)||(23763413-23763657)
chr1 (21-265)||(20524875-20525119)
chr1 (21-265)||(21437996-21438240)
chr1 (21-259)||(19104961-19105199)
chr1 (11-170)||(33385873-33386032)
chr1 (11-170)||(33392517-33392676)
chr1 (21-258)||(44756314-44756552)
chr1 (21-258)||(27898319-27898556)
chr1 (21-258)||(43062936-43063173)
chr1 (21-258)||(49334781-49335018)
chr1 (21-264)||(18625935-18626177)
chr1 (11-170)||(21806850-21807009)
chr1 (21-240)||(50887412-50887631)
chr1 (11-170)||(21835663-21835822)
chr1 (129-258)||(33394056-33394185)
chr1 (60-170)||(8305433-8305543)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (6-262)||(59105-59361)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (6-262)||(139272-139528)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (7-261)||(108970-109224)
[»] scaffold0052 (3 HSPs)
scaffold0052 (7-258)||(10568-10819)
scaffold0052 (7-258)||(56990-57241)
scaffold0052 (7-267)||(698-958)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (11-267)||(67708-67964)
scaffold0028 (21-265)||(41739-41983)
scaffold0028 (21-265)||(57246-57490)
scaffold0028 (11-170)||(7301-7460)
scaffold0028 (11-139)||(23363-23491)
scaffold0028 (195-265)||(13731-13801)
scaffold0028 (195-265)||(23259-23329)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (7-258)||(38913-39164)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (11-265)||(26844-27098)
scaffold0109 (21-91)||(43667-43737)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (11-265)||(125763-126017)
scaffold0029 (44-265)||(105561-105782)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (11-253)||(307310-307553)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (7-265)||(38244-38502)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (7-265)||(76310-76568)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (11-262)||(57179-57430)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (11-170)||(12719-12878)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (21-265)||(14200-14444)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (21-170)||(3536-3685)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (47-171)||(3005-3129)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (21-265)||(29867-30111)
scaffold0138 (21-91)||(41863-41933)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (21-265)||(242259-242503)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (46-265)||(58103-58322)
scaffold0004 (11-170)||(78511-78671)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (21-170)||(3069-3218)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (21-265)||(9542-9786)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (11-170)||(12741-12900)
[»] scaffold0560 (1 HSPs)
scaffold0560 (22-265)||(5459-5702)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (21-259)||(36916-37153)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (21-265)||(10379-10623)
[»] scaffold0256 (2 HSPs)
scaffold0256 (21-265)||(24635-24879)
scaffold0256 (21-91)||(19792-19862)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (7-93)||(61180-61266)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (21-170)||(8537-8686)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (11-170)||(74293-74452)
[»] scaffold0553 (1 HSPs)
scaffold0553 (21-258)||(8998-9235)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (99-259)||(32050-32209)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (21-258)||(3738-3975)
[»] scaffold0780 (1 HSPs)
scaffold0780 (21-170)||(411-560)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (127-258)||(22413-22544)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (195-265)||(19411-19481)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (21-141)||(17392-17512)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (21-92)||(7942-8013)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (199-265)||(14831-14897)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (133-170)||(4052-4089)
scaffold0149 (133-170)||(8483-8520)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (44-92)||(430-478)


Alignment Details
Target: scaffold0044 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 7 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 30987 - 30727
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30987 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 30888  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30887 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 30788  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30787 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 30727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 7 - 267
Target Start/End: Original strand, 72544 - 72804
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  72544 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 72643  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  72644 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 72743  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  72744 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 72804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 8515 - 8262
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| || || | |||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  8515 gtgtttcgacttttttagttggaccttggatgccttagagtccctgaacatacctgatattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 8416  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||| ||  |  || ||  |||||||||| |||||    
T  8415 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcacgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcaatctg 8316  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgat 264  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  8315 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgat 8262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 30)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 7 - 267
Target Start/End: Original strand, 17669216 - 17669476
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17669216 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 17669315  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17669316 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 17669415  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17669416 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 17669476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 7 - 267
Target Start/End: Original strand, 17675868 - 17676128
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17675868 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 17675967  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17675968 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 17676067  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17676068 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 17676128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22084292 - 22084032
Alignment:
Q  6 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactca 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22084292 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 22084193  T
Q  106 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22084192 gaacaaccttagtttgggagttgaggggtactcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcg 22084093  T
Q  206 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgt 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22084092 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgt 22084032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 267
Target Start/End: Original strand, 21915216 - 21915476
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21915216 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 21915315  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21915316 aacaaccttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 21915415  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21915416 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccccaactgataatgagacctagtgatgtc 21915476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 7 - 267
Target Start/End: Original strand, 5534085 - 5534345
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5534085 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttttatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 5534184  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5534185 aacaaccttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 5534284  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 267  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5534285 tctgtgtcgcactcgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctaatgatgtc 5534345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 7 - 266
Target Start/End: Original strand, 20019586 - 20019845
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20019586 tttcgtgtttcgacctttttagttgaattttgtatgcctttgagtaccagaacatagctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 20019685  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20019686 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgccttgcgagtacaaccaggatgaacttgtttgtgtgtttgtgcga 20019785  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgt 266  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20019786 tcagtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctagtgatgt 20019845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 7 - 266
Target Start/End: Original strand, 20013510 - 20013768
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20013510 tttcgtgtttcgacctttttagttgaattttgtatgcctttgagtaccagaacatagctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 20013609  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  20013610 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgccttgcgagtacaaccaggatgaacttgtttgtgtg-ttgtgcga 20013708  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgt 266  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20013709 tcagtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctagtgatgt 20013768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 28455219 - 28454968
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28455219 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttttatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 28455120  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28455119 aacaagctcagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgggagtacaaccaggatgaacttgcttatgtgtttgtgcga 28455020  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  28455019 tctgtgtcgcactttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 28454968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 7 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19111686 - 19111428
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19111686 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 19111587  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  || | ||   |  |||| |||||||    
T  19111586 aacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgcga 19111487  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19111486 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctagctggtaatgagacctagtgatg 19111428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 7 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19117977 - 19117719
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19117977 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 19117878  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  || | ||   |  |||| |||||||    
T  19117877 aacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgcga 19117778  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19117777 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctagctggtaatgagacctagtgatg 19117719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 265
Target Start/End: Original strand, 8354409 - 8354667
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||  | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8354409 tttcgtgattcgaccttttcagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 8354508  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||| | ||| || || ||||||||||    
T  8354509 aacaagcttagtttgggagttgagtggtattcgccacggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacagccaggatgtagttgcttgtgagtttgtgcga 8354608  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  8354609 tctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctaatgatg 8354667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 22123035 - 22123289
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| || || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  22123035 gtgtttcgacatttttagttggaccttggatgccatagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaagatcagagggaacccagaaca 22123134  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  22123135 acattagtttgggagatgagtggtactctccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtacttgtttgagtgtttgtgcgatctg 22123234  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||| | ||||||| |||||    
T  22123235 tgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccctagttggtattaagacctaatgatg 22123289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 18865787 - 18865533
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  18865787 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 18865688  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||| ||  ||||||||||| ||||    
T  18865687 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgttctg 18865588  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||| | || ||||| |||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  18865587 tgtcgcccgtgctgatcgagagggaacccctaattggtaatgaaacctagtgatg 18865533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 16882822 - 16883076
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| || || | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||    
T  16882822 gtgtttagacctttttagttggaccttggatgccttagagtgtctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtagaatcagattgaacccagaaca 16882921  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |   ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  16882922 acactagtttgggagatgagcggtactcgccatggcgagtaagaactttcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 16883021  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  16883022 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatg 16883076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 18855392 - 18855138
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  18855392 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacgtagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 18855293  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  18855292 acactagtgtgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 18855193  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||| | || ||||| |||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  18855192 tgtcgcccgtgctgatcgagagggaacccctaattggtaatgaaacctagtgatg 18855138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 29123541 - 29123287
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || |  | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  29123541 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgctttagagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 29123442  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  29123441 acactagtttggaagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 29123342  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  29123341 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatg 29123287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 22115370 - 22115624
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||  | || || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22115370 gtgttccgacctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctgaacatacctagtattgattgggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 22115469  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatg-aacttgtttatgtgtttgtgcgatct 209  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||      ||| ||| |  ||||||  ||| | |||||||||    
T  22115470 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagctagcccagaatgtagtttgtttgagtg-tagtgcgatct 22115568  T
Q  210 gtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  22115569 gtgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatg 22115624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22048406 - 22048148
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||   ||  |||| |||    
T  22048406 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattagggatgattttaggacaggattgaacccag 22048307  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||  | |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | | | ||| ||  ||||||||||||    
T  22048306 aacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtataaccagaaggtagttgcttgagtgtttgtgcga 22048207  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||| | |||| ||||||||||    
T  22048206 tctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaattggcattgaggcctagtgatg 22048148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19496850 - 19496592
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||  | || || | ||||| | |||||||||    |||||||||||| | |||||   ||  |||| |||    
T  19496850 tttcgtgtttcgacctttttagttggatcttgagtgcctttaaatgcctaaacatacctagagacgattaggaatgattttaggacaggattgaacccag 19496751  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  ||||||||||||    
T  19496750 aacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcga 19496651  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  19496650 tctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtgatg 19496592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20527895 - 20527651
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||  ||||||     
T  20527895 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 20527796  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||  || | |  |||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  20527795 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 20527696  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  20527695 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatg 20527651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 134
Target Start/End: Original strand, 22122072 - 22122195
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22122072 gtgttccgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgaattggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 22122171  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggt 134  Q
    |  |||||||||||| ||||||||    
T  22122172 acattagtttgggagatgagtggt 22122195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18065777 - 18065540
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  18065777 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 18065678  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |   |||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  18065677 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagttcagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 18065578  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18065577 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaacct 18065540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 20023578 - 20023737
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||    || |||||||    
T  20023578 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggtaagattagacccagaaca 20023677  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |  ||||||||||| |||  | |||||||||||||| || ||| || |||||||||||||    
T  20023678 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcaagcaagaaccctcgcctcgcgag 20023737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19905901 - 19905705
Alignment:
Q  62 acctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcg 161  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  ||||||   ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  19905901 acctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaccattagtttggaaattgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcg 19905802  T
Q  162 cctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    ||||||||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  19905801 cctcgcgagcacttccagattggagtgtcttgagtgtttgtgcaatctgtgtcgcacat-ttgatcaagagtgaatccctaattggtaatgagaccta 19905705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 26934836 - 26935055
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||   ||| |||||||   |||||||    
T  26934836 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacagcattagttt 26934935  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | |||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||   |||| || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  26934936 ggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 26935035  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccc 240  Q
     | ||||||||  |||||||    
T  26935036 ttggatcaagagagaacccc 26935055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 3216707 - 3216488
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||  |||   ||  |||||||   |||||||    
T  3216707 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgaatagggatgaatgtaggacaagattaaatccagaacagcattagttt 3216608  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | |||  | ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||   |||| || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  3216607 ggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgtctcgcgagcacttccaggttggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 3216508  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccc 240  Q
     | ||||||||  |||||||    
T  3216507 ttggatcaagagagaacccc 3216488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 90
Target Start/End: Original strand, 23845443 - 23845512
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtagg 90  Q
    ||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23845443 ctttttagttggaccttgaatgccttagagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagg 23845512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 201 - 265
Target Start/End: Original strand, 22124368 - 22124432
Alignment:
Q  201 gtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  22124368 gtgcgatctgtgtcgcacgtgttgattaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatg 22124432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 129 - 170
Target Start/End: Original strand, 22124296 - 22124337
Alignment:
Q  129 agtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  22124296 agtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgag 22124337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 240
Target Start/End: Original strand, 23845595 - 23845640
Alignment:
Q  195 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccc 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||    
T  23845595 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccc 23845640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 65)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 7 - 267
Target Start/End: Original strand, 40523007 - 40523267
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40523007 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 40523106  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40523107 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 40523206  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40523207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 40523267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 7 - 267
Target Start/End: Original strand, 9510658 - 9510918
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9510658 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 9510757  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  9510758 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgagcttgtttatgtgtttatgcga 9510857  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9510858 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 9510918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 7 - 267
Target Start/End: Original strand, 18164319 - 18164579
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18164319 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 18164418  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18164419 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 18164518  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18164519 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 18164579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Original strand, 60321 - 60581
Alignment:
Q  6 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  60321 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatatccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 60420  T
Q  106 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 205  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  60421 gaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttgtgtgtttgtgcg 60520  T
Q  206 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgt 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  60521 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagcgatgt 60581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 7 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 14331246 - 14330987
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14331246 tttcgtgtttcgacctttttagttgaattttgtatgcctttgagtaccagaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 14331147  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14331146 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaactaggatgaacttgtttgtgtgtttgtgcga 14331047  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgt 266  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14331046 tcagtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctagtgatgt 14330987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 7 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 14337830 - 14337571
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || ||| || |||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14337830 tttcgtgtttcgacctttttagttgaattttttatgcctttgagtaccataacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 14337731  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14337730 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttgtgtgtttgtgcga 14337631  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgt 266  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14337630 tcagtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctagtgatgt 14337571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22142 - 21891
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22142 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 22043  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22042 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 21943  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  21942 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 21891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Original strand, 8201720 - 8201971
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8201720 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 8201819  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8201820 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 8201919  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  8201920 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 8201971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 11366657 - 11366402
Alignment:
Q  10 cgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaac 109  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  11366657 cgtgattcgacctttttagttggaccttgtgtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaagatcagagggaacccagaac 11366558  T
Q  110 aagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatct 209  Q
    ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11366557 aagtttatgttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacagccaggatgaagttgtttatgtgtttgtgcgatct 11366458  T
Q  210 gtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  11366457 gtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccccaactggtaataagacctaatgatg 11366402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 15022590 - 15022338
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15022590 tttcttgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 15022491  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtg-tttgtgcg 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  15022490 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgttttgtgcg 15022391  T
Q  206 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  15022390 atctgtgtcgcactttttgatccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 15022338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 14655066 - 14655320
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14655066 gtgttttgacctgtttagttgaaccttgcatgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 14655165  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |  ||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  14655166 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaaggactctcgcctcgcgagcatagccaggatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 14655265  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  14655266 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctaatgatg 14655320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 265
Target Start/End: Original strand, 44786120 - 44786378
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  44786120 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggaccagagggaacccag 44786219  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  || | ||   |  |||| |||||||    
T  44786220 aacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgcga 44786319  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44786320 tctgtgtcgcacctgttgatcaagagtgaacccctagctggtaatgagacctagtgatg 44786378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 265
Target Start/End: Original strand, 44792761 - 44793019
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  44792761 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggaccagagggaacccag 44792860  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  || | ||   |  |||| |||||||    
T  44792861 aacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgcga 44792960  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44792961 tctgtgtcgcacctgttgatcaagagtgaacccctagctggtaatgagacctagtgatg 44793019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 18176560 - 18176306
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18176560 gtgtttctacctgtttagttggaccttgtgtacctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 18176461  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||| | ||| || || ||||||||||||||    
T  18176460 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccacggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacagccaggatgtagttgcttgtgagtttgtgcgatctg 18176361  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  18176360 tgtcgcacgtgttgattaagagtgaacccctaattggtattgagacctaatgatg 18176306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 18183232 - 18182978
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18183232 gtgtttctacctgtttagttggaccttgtgtacctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 18183133  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||| | ||| || || ||||||||||||||    
T  18183132 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccacggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacagccaggatgtagttgcttgtgagtttgtgcgatctg 18183033  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  18183032 tgtcgcacgtgttgattaagagtgaacccctaattggtattgagacctaatgatg 18182978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 7 - 267
Target Start/End: Original strand, 12703033 - 12703315
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12703033 tttcatgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 12703132  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggta----------------------ctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatga 184  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||                      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  12703133 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggaaga 12703232  T
Q  185 acttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 267  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12703233 gcttgtttatgtgtttatgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 12703315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 15155819 - 15156073
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  | || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15155819 gtgtttcgacatttttagttggaccttggctgccatagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 15155918  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  15155919 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtacttgcttgagtgtttgtgcgatctg 15156018  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||| ||  ||||| | ||||||| |||||    
T  15156019 tgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccgtagttggtattaagacctaatgatg 15156073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 15162470 - 15162724
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  | || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  15162470 gtgtttcgacatttttagttggaccttggctgccatagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccaggaca 15162569  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  15162570 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtacttgcttgagtgtttgtgcgatctg 15162669  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||| | ||||||| |||||    
T  15162670 tgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccctagttggtattaagacctaatgatg 15162724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 16406944 - 16407192
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||  | | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16406944 gtgtttcgacatttttagttggaccttggatgtcatagggtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 16407043  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  16407044 acgttagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtacttgcttgagtgtttgtgcgatctg 16407143  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||| | |||||||    
T  16407144 tgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccctagttggtattaagaccta 16407192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13684918 - 13684664
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  | || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  13684918 gtgtttcgacatttttagttggaccttggctgccatagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccataaca 13684819  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  13684818 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtacttgcttgagtgtttgtgcgatctg 13684719  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||| || |||||||||  |||||||||  ||||| | ||||||| |||||    
T  13684718 tgtcgcacgtgctgatcaagagcgaacccctagttggtattaagacctaatgatg 13684664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13691533 - 13691279
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  | || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  13691533 gtgtttcgacatttttagttggaccttggctgccatagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccataaca 13691434  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  13691433 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtacttgcttgagtgtttgtgcgatctg 13691334  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||| || |||||||||  |||||||||  ||||| | ||||||| |||||    
T  13691333 tgtcgcacgtgctgatcaagagcgaacccctagttggtattaagacctaatgatg 13691279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 20702641 - 20702895
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  20702641 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 20702740  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  20702741 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 20702840  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  20702841 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatg 20702895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 32768130 - 32767876
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  32768130 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 32768031  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  32768030 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 32767931  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  32767930 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatg 32767876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 11238621 - 11238780
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11238621 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 11238720  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11238721 agtttattttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgag 11238780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 105 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 49051732 - 49051570
Alignment:
Q  105 agaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgc 204  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| | ||   |  ||||||||||    
T  49051732 agaaaaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccacggcgagtaagaactctcgcctcacgagtacaaccagaatgtagtttcctgagtgtttgtgc 49051633  T
Q  205 gatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49051632 gatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 49051570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 11231934 - 11232093
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |  | || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  11231934 gtgtttcgacctttttagttggacctcgagtgcctttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaataaatgtaggatcagagggaacccagaaca 11232033  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11232034 agtttattttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgag 11232093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 33563 - 33404
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  33563 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattaattaggattgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 33464  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33463 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 33404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 70415 - 70574
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  70415 gtgtttcgacctctttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 70514  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  70515 atactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 70574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 46 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 1347928 - 1347710
Alignment:
Q  46 ttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatgg 145  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1347928 ttgagtgcctgaacatgcctagtatttattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaacaagtttattttgggagttgagtggtactcgccatgg 1347829  T
Q  146 cgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaact 245  Q
    ||||| || |||||||||||||||||     ||| ||| | ||  ||  ||| | |||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||| |    
T  1347828 cgagtgagaactctcgcctcgcgagttagcccagaatgtagtttgttgagtg-tagtgcgatctgtgtcgcacgttttgaccaagagtgaacccctaatt 1347730  T
Q  246 ggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    ||||| || ||||| |||||    
T  1347729 ggtaacgaaacctaatgatg 1347710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 74523 - 74683
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaa-ctcagaac 109  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| | ||||||    
T  74523 gtgtttcgacctctttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaaccccagaac 74622  T
Q  110 aagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  74623 aatactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 74683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 4318205 - 4318449
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||  |||| ||||||||   ||||||    
T  4318205 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatggatgtaggacaagattgaacccagaacaacactagttt 4318304  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||   ||| ||| | |   ||  ||||||| |||||||||||||||| |    
T  4318305 gggaattgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccagaatggagtgtcttgagtgtttgcgcgatctgtgtcgcacgt 4318404  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
     |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  4318405 tttgatcaagagtgaatccctaattggtaatgagacctattgatg 4318449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 14953643 - 14953399
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||  ||||||     
T  14953643 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 14953544  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||  || | | ||||  ||||||||||||||||||||| || |    
T  14953543 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtggtttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgtacgt 14953444  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  14953443 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatg 14953399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 14959609 - 14959365
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||  ||||||     
T  14959609 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 14959510  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  ||||  || | |  |||  |||||| ||||||||||||||||| |    
T  14959509 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcactttcagattggagtgttttgagtgtttatgcgatctgtgtcgcacgt 14959410  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  14959409 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatg 14959365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 52 - 170
Target Start/End: Original strand, 12704349 - 12704467
Alignment:
Q  52 gcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagta 151  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12704349 gcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacccagaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagta 12704448  T
Q  152 agtactctcgcctcgcgag 170  Q
    || ||||||||||||||||    
T  12704449 agaactctcgcctcgcgag 12704467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 44 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 18531667 - 18531446
Alignment:
Q  44 ccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccat 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||  |||| ||||||||  ||||||||  | |||| | |||||||||||    
T  18531667 ccttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattgaacccagaacaacattagtttgaaacttgacttgtactcgccat 18531568  T
Q  144 ggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaa 243  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||    
T  18531567 ggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcatgagtgaacccctaa 18531468  T
Q  244 ctggtaatgagacctagtgatg 265  Q
     ||||||||| ||||| |||||    
T  18531467 ttggtaatgaaacctaatgatg 18531446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 11262774 - 11262530
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||  ||||||     
T  11262774 ctttttagttggaccttgagtgccattgaatgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 11262675  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  11262674 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 11262575  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  11262574 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatg 11262530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 14149015 - 14148777
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||  |||||||    
T  14149015 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttt 14148916  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | |||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  14148915 ggaaattgactggtactcgccatggcgagtaggaactcccgcctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 14148816  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||||| || | |||||| |||||||||||||||    
T  14148815 tttgatcaagagtggatccctaattggtaatgagaccta 14148777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 46 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 12692916 - 12692697
Alignment:
Q  46 ttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatgg 145  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||  ||||  |||||||  |||||| || |||||  | |||||||||||||    
T  12692916 ttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtcggacaagattgaacctagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatgg 12692817  T
Q  146 cgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaact 245  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| ||   |||  || | |  |||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||| |    
T  12692816 cgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgttttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaatccctaatt 12692717  T
Q  246 ggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||| ||||| |||||    
T  12692716 ggtaatgaaacctaatgatg 12692697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 265
Target Start/End: Original strand, 25038893 - 25039114
Alignment:
Q  44 ccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccat 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||  |||||| || |||||  | |||||||||||    
T  25038893 ccttgagtgcctgaacatacctagaaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccat 25038992  T
Q  144 ggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaa 243  Q
    || |||||  ||||||||||||||||| ||   |||  || | |  |||  ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  25038993 ggtgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgctttgagtgtttgtgtgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaa 25039092  T
Q  244 ctggtaatgagacctagtgatg 265  Q
     ||||||||| ||||| |||||    
T  25039093 ttggtaatgaaacctaatgatg 25039114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Original strand, 18553192 - 18553429
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  ||||||| |||||  ||||||     
T  18553192 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaactcaaaacaacattagttg 18553291  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  18553292 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 18553391  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18553392 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaacct 18553429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Original strand, 18584960 - 18585197
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  18584960 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 18585059  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| | ||||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  18585060 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagttgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 18585159  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18585160 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaacct 18585197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 10869893 - 10869662
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  10869893 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaccatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggaatgaacccaaaacaacattagttg 10869794  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||| | ||| |||||||||||||||||||| |    
T  10869793 ggaatctgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtacagaatgtagatgttga-gtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 10869695  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatga 253  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10869694 tttgatcaagaatgaacccctaactggtaatga 10869662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 264
Target Start/End: Original strand, 23519614 - 23519857
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  23519614 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgccttaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 23519713  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  23519714 ggaatctgagtggtactcgccatggcgagtgaggactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 23519813  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgat 264  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  23519814 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgat 23519857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 10875973 - 10875736
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  10875973 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaccatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggaatgaacccaaaacaacattagttg 10875874  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||| | ||| |||||||||||||||||||| |    
T  10875873 ggaatctgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgttga-gtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 10875775  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  10875774 tttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgaaaccta 10875736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 265
Target Start/End: Original strand, 11547953 - 11548170
Alignment:
Q  47 tgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggc 146  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||  |||||| || |||||  | ||||||||||||||    
T  11547953 tgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggaaaagattgaacctagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggc 11548052  T
Q  147 gagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactg 246  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||| ||| || ||    
T  11548053 gagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgattaagagtgaa-cccaaattg 11548151  T
Q  247 gtaatgagacctagtgatg 265  Q
    ||||||| ||||| |||||    
T  11548152 gtaatgaaacctaatgatg 11548170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 265
Target Start/End: Original strand, 11554549 - 11554766
Alignment:
Q  47 tgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggc 146  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||  |||||| || |||||  | ||||||||||||||    
T  11554549 tgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggaaaagattgaacctagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatggc 11554648  T
Q  147 gagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactg 246  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||| ||| || ||    
T  11554649 gagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgattaagagtgaa-cccaaattg 11554747  T
Q  247 gtaatgagacctagtgatg 265  Q
    ||||||| ||||| |||||    
T  11554748 gtaatgaaacctaatgatg 11554766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 6016831 - 6017050
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||   ||| |||||||   |||||||    
T  6016831 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacagcattagttt 6016930  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | |||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||   |||| || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  6016931 ggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 6017030  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccc 240  Q
     | ||||||||  |||||||    
T  6017031 ttggatcaagagagaacccc 6017050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 8706441 - 8706212
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  8706441 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 8706342  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  8706341 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 8706242  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaa 250  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  8706241 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaa 8706212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 8719857 - 8719628
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  8719857 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 8719758  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  8719757 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 8719658  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaa 250  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  8719657 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaa 8719628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 9410364 - 9410241
Alignment:
Q  47 tgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggc 146  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||   |||    || || |||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  9410364 tgagtgcctgaacatacctagtaatgattaagaatgaatgtagggcaagattagacccaaaacaactttagtttgggaattgtttggtactcgccatggc 9410265  T
Q  147 gagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    ||||||| | ||||||||||||||    
T  9410264 gagtaaggattctcgcctcgcgag 9410241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 195 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 26420271 - 26420201
Alignment:
Q  195 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  26420271 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatg 26420201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 91
Target Start/End: Original strand, 44408019 - 44408089
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtagga 91  Q
    ||||||||||||||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44408019 ctttttagttgaaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagga 44408089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 26420423 - 26420353
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtagga 91  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26420423 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagga 26420353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 265
Target Start/End: Original strand, 44408171 - 44408241
Alignment:
Q  195 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  44408171 gtgtttgtgtgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatg 44408241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Original strand, 39267294 - 39267365
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    ||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||| |||  ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  39267294 cttttgagttgaaccttatatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggat 39267365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 57
Target Start/End: Original strand, 1245667 - 1245717
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctga 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||    
T  1245667 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctga 1245717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 7536631 - 7536501
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || | |||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||  |||   ||| |||||||   |||||||    
T  7536631 ctttttagttggaccttgagtgccttagagtgcctgaacatacctagtaatgaatagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacagctttagttt 7536532  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagta 151  Q
    ||   |||  |||||||||||||||||||||    
T  7536531 ggtttttgtctggtactcgccatggcgagta 7536501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13570162 - 13570096
Alignment:
Q  199 ttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||| || |||| ||||||| |||||    
T  13570162 ttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaatccctaattgataataagacctaatgatg 13570096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 265
Target Start/End: Original strand, 11232123 - 11232187
Alignment:
Q  201 gtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||| |||||| || ||||| |||||    
T  11232123 gtgcgatctgtgtcgcacgttttgaccaagagtgaacccctaattggtaacgaaacctaatgatg 11232187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 265
Target Start/End: Original strand, 11238810 - 11238874
Alignment:
Q  201 gtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||| |||||| || ||||| |||||    
T  11238810 gtgcgatctgtgtcgcacgttttgaccaagagtgaacccctaattggtaacgaaacctaatgatg 11238874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Original strand, 2831954 - 2832025
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    ||||| |||||||||||  || || |||||||||||| |||  ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  2831954 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggat 2832025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Original strand, 9751198 - 9751269
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    ||||| |||||||||||  || || |||||||||||| |||  ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  9751198 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggat 9751269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 18302651 - 18302580
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    ||||| |||||||||||  || ||||||||||||||| |||  ||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  18302651 cttttgagttgaaccttagatgcccttgagtgcctgaacatgtctaatatttattaggaaagaatgtaggat 18302580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 9410216 - 9410146
Alignment:
Q  195 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | || ||||| ||||||||    ||||||||||||||| |||||    
T  9410216 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggaccaagagtgaacccccttatggtaatgagacctaatgatg 9410146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 13570227 - 13570190
Alignment:
Q  133 gtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  13570227 gtactcgccatggcgagcaagaactctcgcctcgcgag 13570190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 68)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 7 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22265405 - 22265145
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22265405 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgagcattcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 22265306  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22265305 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 22265206  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22265205 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 22265145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 7 - 267
Target Start/End: Original strand, 27663435 - 27663695
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27663435 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 27663534  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27663535 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 27663634  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27663635 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 27663695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 7 - 267
Target Start/End: Original strand, 27670075 - 27670335
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27670075 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 27670174  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27670175 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 27670274  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27670275 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 27670335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 265
Target Start/End: Original strand, 22062527 - 22062785
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22062527 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 22062626  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22062627 aacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 22062726  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22062727 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 22062785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 7 - 267
Target Start/End: Original strand, 41097868 - 41098128
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  41097868 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaaagtaggatcagagggaacccag 41097967  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41097968 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 41098067  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41098068 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 41098128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 23584600 - 23584341
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23584600 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 23584501  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||| |||||||||||||    
T  23584500 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccacggcgagtaaggactctcgcctcgcgagtacaaccagaacgaaattgtttttgtgtttgtgcga 23584401  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgt 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23584400 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgatcccctaactggtaatgagacctagtgatgt 23584341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 267
Target Start/End: Original strand, 17706576 - 17706836
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17706576 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagcacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 17706675  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17706676 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagcacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 17706775  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17706776 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 17706836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 41769702 - 41769442
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  41769702 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaaagtaggatcagagggaacccag 41769603  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41769602 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 41769503  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41769502 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacatagtgatgtc 41769442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 41776276 - 41776016
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  41776276 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaaagtaggatcagagggaacctag 41776177  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41776176 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 41776077  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41776076 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacatagtgatgtc 41776016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 27615805 - 27615546
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27615805 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 27615706  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27615705 aacaaccttaatttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtaaaaccaggatgaacttgtttgtgtgtttgtgcga 27615606  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgt 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27615605 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctagtgatgt 27615546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 11 - 267
Target Start/End: Original strand, 34294202 - 34294458
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  34294202 gtgtttcgaccttttgagttggaccttggatgcctatgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatttaggatcacagggaacccagaaca 34294301  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34294302 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccgtggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 34294401  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 267  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34294402 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 34294458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 27609187 - 27608940
Alignment:
Q  19 acctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagt 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  27609187 acctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaacaaccttaat 27609088  T
Q  119 ttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcac 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27609087 ttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttgtgtgtttgtgcgatctgtgtcgcac 27608988  T
Q  219 ttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgt 266  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27608987 ttgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctagtgatgt 27608940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 6 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 40707582 - 40707324
Alignment:
Q  6 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactca 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40707582 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 40707483  T
Q  106 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  || | ||  | | |||| ||||||    
T  40707482 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagttcctga-gtgtctgtgcg 40707384  T
Q  206 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40707383 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 40707324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 6 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 40714224 - 40713966
Alignment:
Q  6 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactca 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40714224 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 40714125  T
Q  106 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  || | ||  | | |||| ||||||    
T  40714124 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagttcctga-gtgtctgtgcg 40714026  T
Q  206 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40714025 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 40713966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 7 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 23610362 - 23610102
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||| ||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  23610362 tttcgtgtttcgacctttttagttgaattttgtatgcctttgagtacctaaacacatctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagaggaaacccag 23610263  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  23610262 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagcacaaccagaatggaattgtttatgtgtttgtgcga 23610163  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 267  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23610162 tctgtgtcgcacttgatgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 23610102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 7 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 23841758 - 23841498
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||| ||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  23841758 tttcgtgtttcgacctttttagttgaattttgtatgcctttgagtacctaaacacatctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagaggaaacccag 23841659  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  23841658 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagcacaaccagaatggaattgtttatgtgtttgtgcga 23841559  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 267  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23841558 tctgtgtcgcacttgatgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 23841498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 267
Target Start/End: Original strand, 24471897 - 24472153
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  | || | || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  24471897 gtgtttcgacatttttagttggaccttggctgccatagaatgcttgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 24471996  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24471997 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 24472096  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 267  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24472097 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 24472153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 25107244 - 25106993
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25107244 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 25107145  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25107144 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 25107045  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  25107044 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 25106993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 25166337 - 25166086
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25166337 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 25166238  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25166237 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 25166138  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  25166137 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 25166086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16355305 - 16355054
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  16355305 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 16355206  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16355205 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 16355106  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16355105 tctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 16355054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16361964 - 16361713
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  16361964 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 16361865  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16361864 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 16361765  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16361764 tctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 16361713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 34565298 - 34565047
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  34565298 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 34565199  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34565198 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 34565099  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  34565098 tctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 34565047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 34571953 - 34571702
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  34571953 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 34571854  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34571853 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 34571754  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  34571753 tctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 34571702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19992339 - 19992085
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19992339 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 19992240  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||| | ||| || |||||| ||||||||||    
T  19992239 agtttattttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacagccaggatgcagttgcttgtgtgttggtgcgatctg 19992140  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  19992139 tgtcgcacgtgttgatctagagtgaacccctaactagtaataagacctaatgatg 19992085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 15001328 - 15001582
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||| || || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15001328 gtgtttcgacattttcagttggaccttggatgccatagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 15001427  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||  || |||||||||||||    
T  15001428 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgaacttgcttgagtatttgtgcgatctg 15001527  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| | ||||||| |||||    
T  15001528 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctagttggtattaagacctaatgatg 15001582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 14994685 - 14994939
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||| || || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14994685 gtgtttcgacattttcagttggaccttggatgccatagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 14994784  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  14994785 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgaacttgcttgagtgtttgtgcgatctg 14994884  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||| ||| |||||||||| | ||||||||||  ||||| | ||||||| |||||    
T  14994885 tgtcccacgtgttgatcaaaagtgaacccctagttggtattaagacctaatgatg 14994939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 27517211 - 27516954
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| || || |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  27517211 tttcgtgtttcgacctttctagttggaccttggatgcctttgagtacctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagaggaaacccag 27517112  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  || | ||   |  |||| |||||||    
T  27517111 aacaagcttag-ttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaaggactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgcga 27517013  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27517012 tctgtgtcgcacttgttgatctagagtgaacccctaactggtaatgagatctagtgatg 27516954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 27523848 - 27523591
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| || || |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  27523848 tttcgtgtttcgacctttctagttggaccttggatgcctttgagtacctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagaggaaacccag 27523749  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  || | ||   |  |||| |||||||    
T  27523748 aacaagcttag-ttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaaggactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgcga 27523650  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27523649 tctgtgtcgcacttgttgatctagagtgaacccctaactggtaatgagatctagtgatg 27523591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 1692086 - 1692340
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  | || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  1692086 gtgtttcgacatttttagttggaccttggctgccatagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagagaacccagaaca 1692185  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  1692186 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtacttgcttgagtgtttgtgcgatctg 1692285  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||| | ||||||| |||||    
T  1692286 tgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccctagttggtattaagacctaatgatg 1692340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 18038317 - 18038571
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||| || | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  18038317 gtgtttcgacatttttagttggactttggatgctctagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccaaaaca 18038416  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  18038417 actttagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtacttgcttgagtgtttgtgcgatctg 18038516  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||| | ||||||| |||||    
T  18038517 tgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccctagttggtattaagacctaatgatg 18038571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 27686978 - 27687232
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  27686978 gtgtttcgacatttttagttggaccttggatgccatagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagagaacccagaaca 27687077  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  27687078 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagcaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtacttgcttgagtgtttgtgcgatctg 27687177  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||| | ||||||| |||||    
T  27687178 tgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccctagttggtattaagacctaatgatg 27687232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 6 - 265
Target Start/End: Original strand, 37293128 - 37293387
Alignment:
Q  6 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactca 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||  |    
T  37293128 gttttgtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaaccta 37293227  T
Q  106 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 205  Q
    ||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  |||||||||||    
T  37293228 gaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcg 37293327  T
Q  206 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| |||| |||| |||||    
T  37293328 atctgtgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccctaattggtattgaggcctaatgatg 37293387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 22327813 - 22328067
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  22327813 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagttcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 22327912  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||  ||||||| | ||| |  |||||||||||||||||    
T  22327913 agtttattttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactttcgcctcgcgagcacagccaggatgcagttgctggtgtgtttgtgcgatctg 22328012  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
     ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||  |||| ||||||| |||||    
T  22328013 agtcgcacgtgttgatctagagtgaacccctaactactaataagacctaatgatg 22328067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 239
Target Start/End: Original strand, 22334467 - 22334695
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22334467 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 22334566  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||  ||||||| | ||| |  |||||||||||||||||    
T  22334567 agtttattttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactatcgcctcgcgagcacagccaggatgcagttgctggtgtgtttgtgcgatctg 22334666  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaaccc 239  Q
     ||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  22334667 agtcgcacgtgttgatctagagtgaaccc 22334695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 6 - 265
Target Start/End: Original strand, 37286425 - 37286684
Alignment:
Q  6 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactca 105  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||  |    
T  37286425 gttttgtgttttgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaaccta 37286524  T
Q  106 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 205  Q
    ||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  |||||||||||    
T  37286525 gaacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcg 37286624  T
Q  206 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| |||| |||| |||||    
T  37286625 atctgtgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccctaattggtattgaggcctaatgatg 37286684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22133444 - 22133200
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  |  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||   ||||||    
T  22133444 ctttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtatgatcagattgaacccagaacaacactagttt 22133345  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  22133344 gggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 22133245  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  22133244 gttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatg 22133200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22140136 - 22139892
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  |  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||   ||||||    
T  22140136 ctttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtatgatcagattgaacccagaacaacactagttt 22140037  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  22140036 gggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 22139937  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  22139936 gttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatg 22139892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22588540 - 22588296
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  |  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||   ||||||    
T  22588540 ctttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaactcagaacaacactagttt 22588441  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  22588440 gggagatgagtggtactcgccaaggcgagtaagaactctcgcctcgcaagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 22588341  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  22588340 gttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatg 22588296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 25406871 - 25406639
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  |  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||   ||||||    
T  25406871 ctttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaacaacactagttt 25406772  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  25406771 gggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 25406672  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatga 253  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25406671 gttgatcaagagtgaacccctaattggtaatga 25406639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 17284522 - 17284268
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  17284522 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 17284423  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||  ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  17284422 acactagtttggaagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccataatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 17284323  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  17284322 tgtcccacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatg 17284268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 29477604 - 29477858
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||    
T  29477604 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagttttgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccataaca 29477703  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  || ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  29477704 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaactagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 29477803  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  29477804 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatg 29477858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 41294084 - 41294338
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||| || || | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  41294084 gtgtttcgacccttttagttggactttggatgccttagagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 41294183  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||   | ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  41294184 acactagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaacttgaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 41294283  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  41294284 tgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatg 41294338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 37544502 - 37544243
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||| | |||||   ||  |||| |||    
T  37544502 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatgcctttgagtaccataacatacctagtattgattaggaatgattttaggacaggattgaacccag 37544403  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagt-tgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 205  Q
    |||||  | ||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  |||||||||||    
T  37544402 aacaacatcagtttgggagaatcagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcg 37544303  T
Q  206 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  37544302 atctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtgatg 37544243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 29471009 - 29471263
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||    
T  29471009 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagttttgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccataaca 29471108  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  || ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  29471109 acactagtttggaagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaactagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 29471208  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  29471209 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatg 29471263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 15236430 - 15236589
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  15236430 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 15236529  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15236530 acactagtttggaagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 15236589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 21294923 - 21295167
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||  ||||||     
T  21294923 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 21295022  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||  || | |  |||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  21295023 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 21295122  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  21295123 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatg 21295167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 265
Target Start/End: Original strand, 23336971 - 23337192
Alignment:
Q  44 ccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccat 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  |||| || |||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  23336971 ccttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacccataacaactttagtttggaaattgaatggtactcgccat 23337070  T
Q  144 ggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaa 243  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||  || | |   |   |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||     
T  23337071 ggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggattgcctggagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctag 23337170  T
Q  244 ctggtaatgagacctagtgatg 265  Q
     ||||||||||||||| |||||    
T  23337171 ttggtaatgagacctaatgatg 23337192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 25535411 - 25535190
Alignment:
Q  44 ccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccat 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||  |||||| || |||||  | |||||||||||    
T  25535411 ccttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccat 25535312  T
Q  144 ggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaa 243  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||  || | |  |||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  25535311 ggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaa 25535212  T
Q  244 ctggtaatgagacctagtgatg 265  Q
     ||||||||| ||||| |||||    
T  25535211 ttggtaatgaaacctaatgatg 25535190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 99 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 33726227 - 33726064
Alignment:
Q  99 gaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgt 198  Q
    |||| ||||||||  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  |||     
T  33726227 gaacccagaacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgg 33726128  T
Q  199 ttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtg 262  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||  |||  ||||||||||||    
T  33726127 ttgtgcgatctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaagcggtgttgagacctagtg 33726064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 14359479 - 14359717
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||| ||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||  ||||  |||||||  || ||||    
T  14359479 cttttgagttggaccttgagtgccattgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacatgattgaacctagaacaacattggttt 14359578  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  14359579 ggaatttgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 14359678  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||    
T  14359679 tttgatcaagagtgaatccctatttggtaatgagaccta 14359717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 15441614 - 15441858
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  |||| || |||||  ||||||     
T  15441614 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacccataacaacattagttg 15441713  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||||||  | | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||  |  | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  15441714 gggagttggcttgaactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattagagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 15441813  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
     |||||||||| |||| ||||   ||||||||||||||| |||||    
T  15441814 tttgatcaagagtgaatccctttatggtaatgagacctaatgatg 15441858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24554979 - 24554736
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||  ||||||     
T  24554979 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaatatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 24554880  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |||||  | |||||||| ||||||||||  |||||||||||  |||| ||   |||  || | |  |||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  24554879 ggaagttggctagtactcgcaatggcgagtagatactctcgccttacgagcacttccagattggagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 24554780  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  24554779 -ttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatg 24554736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 19775404 - 19775241
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || | | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || |||    
T  19775404 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccag 19775305  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |||||  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  19775304 aacaactttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 19775241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 19768807 - 19768645
Alignment:
Q  8 ttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcaga 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || || | | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || ||||    
T  19768807 ttcgtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccaga 19768708  T
Q  108 acaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    ||||  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  19768707 acaactttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 19768645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 126 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 20776229 - 20776103
Alignment:
Q  126 ttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttga 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    ||| ||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  20776229 ttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctttttgtgtgtttgtgcgatctgtgtcgcaccttttga 20776130  T
Q  226 tcaagaatgaacccctaactggtaatg 252  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20776129 tcaagagtgaacccctaattggtaatg 20776103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 23250396 - 23250237
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || |||||||    
T  23250396 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 23250297  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  23250296 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 23250237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 240
Target Start/End: Original strand, 22325588 - 22325805
Alignment:
Q  23 ttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgg 122  Q
    ||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||  |||  |||| |||||||   |||||||||    
T  22325588 ttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgaatagggatgaatgtaggaaaagattgaacccagaacagcattagtttgg 22325687  T
Q  123 gagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgt 222  Q
     | |||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||   |||| || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| | |    
T  22325688 aacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttt 22325787  T
Q  223 tgatcaagaatgaacccc 240  Q
     |||||||| ||||||||    
T  22325788 ggatcaagagtgaacccc 22325805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Original strand, 22410258 - 22410495
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  22410258 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 22410357  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    ||| ||| |  | |||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  22410358 ggaatctgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctttttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 22410457  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
     |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  22410458 tttgatcaagagtgaacccgtaattggtaatgagacct 22410495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 29316864 - 29316627
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  29316864 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 29316765  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  29316764 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 29316665  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  29316664 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaacct 29316627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 264
Target Start/End: Original strand, 22258133 - 22258375
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  22258133 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 22258232  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||| | ||| |||||||||||||||||||| |    
T  22258233 ggaatctgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgttga-gtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 22258331  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgat 264  Q
     |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22258332 tttgatcaagagtgaatccctaactggtaatgaaacctaatgat 22258375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 49 - 258
Target Start/End: Original strand, 21667494 - 21667703
Alignment:
Q  49 agtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcga 148  Q
    ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  |||||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  21667494 agtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttgggaatttgagtggtactcgccatggcga 21667593  T
Q  149 gtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggt 248  Q
    || || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  21667594 gtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtgattgtgcgatctgtgtcgcaccttttgatcaggagtgaacccctaattggt 21667693  T
Q  249 aatgagacct 258  Q
    ||||| ||||    
T  21667694 aatgaaacct 21667703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 170
Target Start/End: Original strand, 25808146 - 25808295
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| |||||| || || | || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || ||||||||  || ||||    
T  25808146 ctttttagttggaccttgaatgccttagaatgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaacaacttttgttt 25808245  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |||| |||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  25808246 gggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaactctcgcctcgcgag 25808295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 24020716 - 24020637
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtagg 90  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  24020716 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggattgaatgtagg 24020637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22343943 - 22343724
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||| |||||  |||   ||| || |||||  |||||||    
T  22343943 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgaatagggatgaatataggacaagattaaacccaaaacaacattagttt 22343844  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | |||  | | ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||   |||| || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  22343843 ggaacttgtcttgaactcgccatggcgagtaagaattctcgcatcgcgagcacttccaggttggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 22343744  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccc 240  Q
     | ||||||||  |||||||    
T  22343743 ttggatcaagagagaacccc 22343724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 22353299 - 22353194
Alignment:
Q  44 ccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccat 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||  |||   ||| |||||||   ||||||||| | |||  | |||||||||||    
T  22353299 ccttgagtgcctgaacatacctagtaatgaatagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacagcattagtttggaacttgtcttgtactcgccat 22353200  T
Q  144 ggcgag 149  Q
    ||||||    
T  22353199 ggcgag 22353194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Original strand, 22119841 - 22119912
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    ||||| |||||||||||  || || |||||||||||| |||  ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  22119841 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggat 22119912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 240
Target Start/End: Original strand, 25808320 - 25808365
Alignment:
Q  195 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccc 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||    
T  25808320 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccc 25808365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24020552 - 24020484
Alignment:
Q  197 gtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||    || |||||||||||| |||||    
T  24020552 gtttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaacccccttatgttaatgagacctaatgatg 24020484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 62)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 7 - 267
Target Start/End: Original strand, 19779936 - 19780196
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19779936 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 19780035  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19780036 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 19780135  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19780136 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 19780196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Original strand, 36884380 - 36884640
Alignment:
Q  6 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactca 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36884380 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 36884479  T
Q  106 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 205  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36884480 gaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcg 36884579  T
Q  206 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgt 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36884580 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgt 36884640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 12475479 - 12475221
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12475479 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 12475380  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12475379 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 12475280  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12475279 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 12475221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 265
Target Start/End: Original strand, 18024074 - 18024332
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  18024074 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatttaggatcagagggaacccag 18024173  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18024174 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgcgatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 18024273  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18024274 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagagatg 18024332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 15362593 - 15362333
Alignment:
Q  6 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactca 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  15362593 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccga 15362494  T
Q  106 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 205  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  15362493 gaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgcttgtgcg 15362394  T
Q  206 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgt 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15362393 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgt 15362333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Original strand, 15383139 - 15383399
Alignment:
Q  6 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactca 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15383139 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatacccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 15383238  T
Q  106 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 205  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15383239 gaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacagccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcg 15383338  T
Q  206 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgt 266  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15383339 atctgtgtcgcactagttgatcaagagtgaacccctatctggtaatgagacctagtgatgt 15383399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22195080 - 22194820
Alignment:
Q  6 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22195080 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatatccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 22194981  T
Q  106 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 205  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  22194980 gaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattttgtgtttgtgcg 22194881  T
Q  206 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgt 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22194880 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctagctggtaatgagacctagggatgt 22194820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 7 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 23954607 - 23954347
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23954607 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 23954508  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23954507 aacaaccttagtttgggagttgagtggtacttgccatggcgagtaagttatctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 23954408  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23954407 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 23954347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 7 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 23961269 - 23961009
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23961269 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 23961170  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23961169 aacaaccttagtttgggagttgagtggtacttgccatggcgagtaagttatctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 23961070  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23961069 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 23961009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 4772552 - 4772297
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4772552 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgcctttgagtacctaaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 4772453  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4772452 accttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttggctatgtgtttgtgcgatctg 4772353  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgt 266  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4772352 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgt 4772297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 266
Target Start/End: Original strand, 8048142 - 8048401
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8048142 tttcgtgtttcgacctttttagttgaattttgtatgcctttgagtaccagaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 8048241  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8048242 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttgtgtgtttgtgcga 8048341  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgt 266  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8048342 tcagtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctagtgatgt 8048401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 266
Target Start/End: Original strand, 8054755 - 8055014
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8054755 tttcgtgtttcgacctttttagttgaattttgtatgcctttgagtaccagaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 8054854  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8054855 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttgtgtgtttgtgcga 8054954  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgt 266  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8054955 tcagtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctagtgatgt 8055014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Original strand, 17961971 - 17962222
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17961971 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 17962070  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  17962071 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaactcgtttatgtgtttatgcga 17962170  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17962171 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgaaacct 17962222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 6 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15148916 - 15148657
Alignment:
Q  6 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15148916 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatatccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 15148817  T
Q  106 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 205  Q
     ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15148816 aaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcg 15148717  T
Q  206 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  15148716 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctattgatg 15148657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Original strand, 16231487 - 16231747
Alignment:
Q  6 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactca 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16231487 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatacccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 16231586  T
Q  106 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 205  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16231587 gaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtatagccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcg 16231686  T
Q  206 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgt 266  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16231687 atctgtgtcgcactagttgatcaagagtaaacccctatctggtaatgagacctagtgatgt 16231747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 6 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 18296086 - 18295827
Alignment:
Q  6 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactca 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18296086 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 18295987  T
Q  106 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  || | ||   |  |||| ||||||    
T  18295986 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgcg 18295887  T
Q  206 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18295886 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 18295827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 7 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 12482109 - 12481851
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12482109 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 12482010  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12482009 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 12481910  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgat--caagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||||||||   ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12481909 tctgtgtcgcact--gtgatnncaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 12481851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 8385294 - 8385043
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8385294 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 8385195  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8385194 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 8385095  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  8385094 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 8385043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 8391949 - 8391698
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8391949 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 8391850  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8391849 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 8391750  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  8391749 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 8391698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 14074290 - 14074039
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14074290 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 14074191  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14074190 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 14074091  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  14074090 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 14074039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 15257068 - 15256817
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15257068 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 15256969  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15256968 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 15256869  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  15256868 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 15256817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 17808873 - 17808622
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17808873 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 17808774  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17808773 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 17808674  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17808673 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 17808622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Original strand, 17089624 - 17089875
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17089624 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 17089723  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17089724 aacaagcttagtttgtgagtggagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 17089823  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17089824 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 17089875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Original strand, 29040545 - 29040796
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  29040545 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 29040644  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29040645 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 29040744  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  29040745 tctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 29040796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 265
Target Start/End: Original strand, 14298474 - 14298732
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||  | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  14298474 tttcgtgattcgacctttttagttggactttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaagatcagagggaacccag 14298573  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||| | ||| || |||||| ||||||    
T  14298574 aacaagtttattttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacagccaggatgcagttgcttgtgtgttggtgcga 14298673  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  14298674 tctgtgtcgcacgtgttgatctagagtgaacccctaactagtaataagacctaatgatg 14298732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20115598 - 20115344
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20115598 gtgtttcgacatttttagttggaccttggatgccctagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 20115499  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  20115498 actttagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtacttgcttgagtgtttgtgcgatctg 20115399  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    ||||| || ||||||||||||  |||||||||  ||||| | ||||||| |||||    
T  20115398 tgtcggacgtgttgatcaagagcgaacccctagttggtattaagacctaatgatg 20115344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 14268118 - 14268362
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14268118 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaacaagcttagttt 14268217  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||  ||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||| | |    
T  14268218 gggagttgagtggtactcgccacggcgagtaagaactttcgcctcgcgagcacagccaggatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcgcat 14268317  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  14268318 gttgattaagagtgaacccctaattggtattgagacctaatgatg 14268362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 6 - 265
Target Start/End: Original strand, 14305097 - 14305356
Alignment:
Q  6 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactca 105  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||  | || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  14305097 gtttcgtgattcgacctttttagttggactttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaagatcagagggaaccca 14305196  T
Q  106 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 205  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||  ||||||| | ||| || |||||| |||||    
T  14305197 gaacaagtttattttgggagttgagtggtactcgccatggcaagtaagaactctcgcctcgcgagcacagccaggatgcagttgcttgtgtgttggtgcg 14305296  T
Q  206 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    || |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  14305297 atatgtgtcgcacgtgttgatctagagtgaacccctaactagtaataagacctaatgatg 14305356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 40478603 - 40478349
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  40478603 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 40478504  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  40478503 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 40478404  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  40478403 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatg 40478349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 7900831 - 7901075
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  |  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||   ||||||    
T  7900831 ctttttagttggaccttgggtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaacaacactagttt 7900930  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  7900931 gggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 7901030  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  7901031 gttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatg 7901075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 26284558 - 26284812
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||  | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  26284558 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgtcttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 26284657  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  26284658 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 26284757  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  26284758 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatg 26284812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 40471930 - 40471676
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||    
T  40471930 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacctagaaca 40471831  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  40471830 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 40471731  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  40471730 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatg 40471676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 51493478 - 51493722
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  |  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||   ||||||    
T  51493478 ctttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaacaacactagttt 51493577  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  51493578 gggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 51493677  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  51493678 gttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatg 51493722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 6873026 - 6873280
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  6873026 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattatgaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 6873125  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||| ||  ||||||||||| ||||    
T  6873126 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgttctg 6873225  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||| | || |||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  6873226 tgtcgcccgtgctgatcaagagggaacccctaattggtaatgaaacctagtgatg 6873280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 15321754 - 15321998
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  |  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||   ||||||    
T  15321754 ctttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaacaacactagttt 15321853  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||| ||  |||||| ||||||||||||||||| |    
T  15321854 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtaattgcttgagtgtttatgcgatctgtgtcgcacgt 15321953  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  15321954 gttgatcaatagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatg 15321998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18071624 - 18071373
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || ||  ||||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| |||||||    
T  18071624 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctatgagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaaca 18071525  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  18071524 acattagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 18071425  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtg 262  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18071424 tgtcgcacgagttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtg 18071373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 17810728 - 17810569
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  17810728 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagcgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 17810629  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17810628 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 17810569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 14757072 - 14757231
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  14757072 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattaattaggattgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 14757171  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  14757172 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgccttgcgag 14757231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 9271764 - 9272008
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||  ||   |||| ||||||||  |||||||    
T  9271764 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgaatagggatgaatgtaggacaagcctgaacccagaacaactttagttt 9271863  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatg-aacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcact 219  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | ||| ||| |  ||||||  ||| | ||||||||||||||||||     
T  9271864 gggatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagtatgaccagaatgtaggttgtttgagtg-tagtgcgatctgtgtcgcacg 9271962  T
Q  220 tgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    | |||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  9271963 tattgatcaagagtgaacctctaattggtaatgaaacctagtgatg 9272008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Original strand, 17991315 - 17991430
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17991315 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 17991414  T
Q  107 aacaagcttagtttgg 122  Q
    ||||| ||||||||||    
T  17991415 aacaaccttagtttgg 17991430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 23838879 - 23838635
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||  ||||||     
T  23838879 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 23838780  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||  || | |  |||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  23838779 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 23838680  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  23838679 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatg 23838635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 14679408 - 14679164
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| |||||| || || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||  |||||      
T  14679408 ctttttagttggaccttgaatgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagtag 14679309  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||  |  | |  |||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  14679308 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattagagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 14679209  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  14679208 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatg 14679164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 14685617 - 14685372
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||  |||||||  ||| ||     
T  14685617 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggataagattgaacctagaacaacattatttg 14685518  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcag-gatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcact 219  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||   || | |  |||  ||||||||||||||||||||||||     
T  14685517 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagatttggagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacg 14685418  T
Q  220 tgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    | |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  14685417 ttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatg 14685372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 50 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 35171045 - 35170836
Alignment:
Q  50 gtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgag 149  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  35171045 gtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagtttggaaattgactggtactcgccatggcgag 35170946  T
Q  150 taagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggta 249  Q
    || | ||||||| |||||||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||| |||||    
T  35170945 taggaactctcgtctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaatccctaattggta 35170846  T
Q  250 atgagaccta 259  Q
    ||||||||||    
T  35170845 atgagaccta 35170836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 12522507 - 12522286
Alignment:
Q  44 ccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccat 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||  |||||||  |||||| ||||||||  | |||||||||||    
T  12522507 ccttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagatggaacctagaacaacattagttggggagttggcttgtactcgccat 12522408  T
Q  144 ggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaa 243  Q
    ||  ||||  ||||||| ||||||||| ||    ||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||     
T  12522407 ggaaagtagatactctcacctcgcgagcacttctagtttggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctag 12522308  T
Q  244 ctggtaatgagacctagtgatg 265  Q
     ||||||||||||||| |||||    
T  12522307 ttggtaatgagacctaatgatg 12522286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 141
Target Start/End: Original strand, 386014 - 386134
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  |  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||   ||||||    
T  386014 ctttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaacaacactagttt 386113  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgcc 141  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  386114 gggagatgagtggtactcgcc 386134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 265
Target Start/End: Original strand, 41385428 - 41385649
Alignment:
Q  44 ccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccat 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||  ||||  |||||||  |||||| || ||||   | |||||||||||    
T  41385428 ccttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggagtgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttgggaagttcgcttgtactcgccat 41385527  T
Q  144 ggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaa 243  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||  || | |   ||  ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |    
T  41385528 ggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgcttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctga 41385627  T
Q  244 ctggtaatgagacctagtgatg 265  Q
     ||||||||| ||||| |||||    
T  41385628 ttggtaatgaaacctaatgatg 41385649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 35614384 - 35614141
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| |||| |||||| |||| ||| ||||||||||||  |||   |||  |||||||  |||||||    
T  35614384 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatatctagtaatgataagggatgaatgtaggactagattaaacctagaacaactttagttt 35614285  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||   |||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  35614284 ggtt-ttgtctggtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 35614186  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
     |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  35614185 tttgatcaagagtgaacccctagttggtaatgagacctaatgatg 35614141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 27710201 - 27710042
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || || ||||    
T  27710201 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgagcatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccataaca 27710102  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  27710101 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 27710042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Original strand, 12349234 - 12349471
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  12349234 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 12349333  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  12349334 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 12349433  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  12349434 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaacct 12349471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 170
Target Start/End: Original strand, 16956310 - 16956459
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || ||||||||  |||||||    
T  16956310 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggctagattagacccagaacaactttagttt 16956409  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |||| |||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16956410 gggaattgtttcgtactcgccatggcgagcaagaactctcgcctcgcgag 16956459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 19941804 - 19941963
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || |||||||    
T  19941804 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 19941903  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |  ||||||||| | |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  19941904 actttagtttggaaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 19941963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 23082044 - 23081885
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || || ||||    
T  23082044 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccaaaaca 23081945  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  23081944 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 23081885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 53433823 - 53433604
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||   ||| |||||||   |||||||    
T  53433823 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacagcattagttt 53433724  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | |||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||   |||| || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  53433723 ggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 53433624  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccc 240  Q
     | ||||||||  |||||||    
T  53433623 ttggatcaagagagaacccc 53433604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 55795903 - 55795672
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  55795903 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 55795804  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |   ||| | ||| |||||||||||||||||||| |    
T  55795803 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagcagttga-gtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 55795705  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatga 253  Q
     |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  55795704 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatga 55795672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 127 - 258
Target Start/End: Original strand, 12299664 - 12299795
Alignment:
Q  127 tgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  12299664 tgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcaccttttgat 12299763  T
Q  227 caagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||| ||||    
T  12299764 caagagtgaacccctatttggtaatgaaacct 12299795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 170
Target Start/End: Original strand, 30234838 - 30234987
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | ||  ||||||||||| ||||||||||| |||||| | || |||||||||  |||  | || ||||||||  |||||||    
T  30234838 ctttttagttggaccttgagtgcctatgagtgcctgaacatacctagtaatgattatggattaatgtaggacaagattggacccagaacaactttagttt 30234937  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |||| |||  ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  30234938 gggaattgtttggtactcgccatggcgagtaagaatcctcgcctcgcgag 30234987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 195 - 265
Target Start/End: Original strand, 386166 - 386236
Alignment:
Q  195 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  386166 gtgtttgtgcgatatgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatg 386236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 9556976 - 9556827
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||   |||  ||||  ||||||| |||||||     
T  9556976 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtagggcaagattgaacctagaacaaccttagttg 9556877  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    || |  ||  | ||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||    
T  9556876 ggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 9556827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Original strand, 22633861 - 22633932
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    ||||| |||||||| ||  || ||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  22633861 cttttgagttgaactttagatgcccttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggat 22633932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 240
Target Start/End: Original strand, 16956484 - 16956529
Alignment:
Q  195 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccc 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||    
T  16956484 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccc 16956529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 259
Target Start/End: Original strand, 30235012 - 30235076
Alignment:
Q  195 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||||||||||||||||||| |   |||||||| ||||||||    |||||||||||||||    
T  30235012 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttcagatcaagagtgaacccccttatggtaatgagaccta 30235076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 96)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 26889917 - 26889657
Alignment:
Q  6 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactca 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26889917 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 26889818  T
Q  106 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 205  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26889817 gaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcg 26889718  T
Q  206 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgt 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26889717 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgt 26889657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 7 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 37615852 - 37615592
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37615852 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 37615753  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37615752 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 37615653  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37615652 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 37615592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 418461 - 418203
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  418461 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 418362  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  418361 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 418262  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  418261 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 418203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 265
Target Start/End: Original strand, 14672845 - 14673103
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  14672845 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatttaggatcagagggaacccag 14672944  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14672945 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgcgatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 14673044  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14673045 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagagatg 14673103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 267
Target Start/End: Original strand, 26788450 - 26788710
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26788450 tttcgtgttccgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtaccttaacatacctagtattggttaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 26788549  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26788550 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 26788649  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26788650 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 26788710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 267
Target Start/End: Original strand, 26794040 - 26794300
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26794040 tttcgtgttccgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtaccttaacatacctagtattggttaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 26794139  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26794140 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 26794239  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26794240 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 26794300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 7 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 6599179 - 6598919
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6599179 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttttatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 6599080  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6599079 aacaaccttagtttgggagatgagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcaa 6598980  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 267  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6598979 tctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 6598919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 7 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 6605859 - 6605599
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6605859 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttttatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 6605760  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6605759 aacaaccttagtttgggagatgagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcaa 6605660  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 267  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6605659 tctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 6605599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 7 - 267
Target Start/End: Original strand, 5106529 - 5106789
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  5106529 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggagcccag 5106628  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5106629 aacaaccttagtttgggagatgagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaactaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 5106728  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5106729 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtagtgagacctagtgatgtc 5106789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 7 - 267
Target Start/End: Original strand, 10845929 - 10846188
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10845929 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttgagtacctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 10846028  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  10846029 aacaaccttaatttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgaacttgtttgtgtg-ttgtgcga 10846127  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10846128 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactagtaatgagacctagtgatgtc 10846188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 267
Target Start/End: Original strand, 31422202 - 31422458
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  | || | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  31422202 gtgtttcgacatttttagttggaccttggctgccatagaatgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 31422301  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31422302 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 31422401  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 267  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31422402 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 31422458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 21 - 267
Target Start/End: Original strand, 10153394 - 10153640
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10153394 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgtttgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaacaagcttagttt 10153493  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10153494 gggagttgagtggtactcgccacggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccaggatgaacttgtttgtgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 10153593  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 267  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10153594 gttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 10153640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 48423829 - 48423578
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  48423829 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttttatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 48423730  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48423729 aacaagctcagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgcttatgtgtttgtgcga 48423630  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  48423629 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 48423578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 48430607 - 48430356
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  48430607 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttttatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 48430508  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48430507 aacaagctcagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgcttatgtgtttgtgcga 48430408  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  48430407 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 48430356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 262
Target Start/End: Original strand, 16623704 - 16623955
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16623704 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctatgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 16623803  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  16623804 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 16623903  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtg 262  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16623904 tgtcgcacgtgttgaccaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtg 16623955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16634312 - 16634061
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  16634312 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 16634213  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16634212 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 16634113  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16634112 tctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 16634061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16640922 - 16640671
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  16640922 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 16640823  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16640822 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 16640723  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16640722 tctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 16640671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 43161587 - 43161336
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  43161587 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 43161488  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43161487 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 43161388  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  43161387 tctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 43161336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 43167824 - 43167573
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  43167824 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 43167725  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43167724 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 43167625  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  43167624 tctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 43167573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Original strand, 1332706 - 1332956
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1332706 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 1332805  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1332806 aacaagcttagtt-gtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 1332904  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||| ||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  1332905 tctgtgtcgcgctttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 1332956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 265
Target Start/End: Original strand, 16747484 - 16747742
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||    
T  16747484 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttttatgcctttgagtacctgaacctacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagaaagcccag 16747583  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16747584 aacaaccttagtttgggagaagagtgtcactcgccatggcgagtgagtgctctcgcctcgcgagtacaaccaggacgaacttgtttatgtgtttgtgcga 16747683  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16747684 tctgtgtcgcacttgtagattaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 16747742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 265
Target Start/End: Original strand, 16758216 - 16758474
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | | |||    
T  16758216 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttttatgcctttgagtacctgaacctacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagataaagcccag 16758315  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16758316 aacaaccttagtttgggagaagagtgtcactcgccatggcgagtgagtgctctcgcctcgcgagtacaaccaggacgaacttgtttatgtgtttgtgcga 16758415  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16758416 tctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 16758474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 53380001 - 53380247
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  53380001 gtgtttcgacccttttagttgaatcttgtatgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagaggggacccataaca 53380100  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  53380101 accttagtttggaagttgagtggtactcgccatggcgagtaaggactctcgcctcgcgggtacaatcagaatgaacttgtttgtgt-tttgtgcgatctg 53380199  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||    
T  53380200 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-ccctaacttataatgagaccta 53380247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 53386653 - 53386899
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  53386653 gtgtttcgacccttttagttgaatcttgtatgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagaggggacccataaca 53386752  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  53386753 accttagtttggaagttgagtggtactcgccatggcgagtaaggactctcgcctcgcgggtacaatcagaatgaacttgtttgtgt-tttgtgcgatctg 53386851  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||    
T  53386852 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaa-ccctaacttataatgagaccta 53386899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 7 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13251180 - 13250922
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13251180 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtacctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 13251081  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  || | ||   |  |||| |||||||    
T  13251080 aacaagcttagtttggaagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgcga 13250981  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13250980 tctgtgtcgcactcgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 13250922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 7 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13257826 - 13257568
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13257826 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctttgagtacctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 13257727  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  || | ||   |  |||| |||||||    
T  13257726 aacaagcttagtttggaagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgcga 13257627  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13257626 tctgtgtcgcactcgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 13257568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 5221851 - 5221605
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||  ||||||  | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5221851 ctttttagttagaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaacaagcttagttt 5221752  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||  | ||| ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  5221751 gggagttgagtggtactcgacacggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacagccaggatatagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 5221652  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 267  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5221651 gttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 5221605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 16489319 - 16489573
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16489319 gtgtttcgacatttttagttggaccttggatgccctagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 16489418  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  16489419 actttagtttgggagatgagtggtactcgccacggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtacttgcttgagtgtttgtgcgatctg 16489518  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||||||  ||||| | ||||||| |||||    
T  16489519 tgtcgcacgtgctgatcaagagtgaacccctagttggtattaagacctaatgatg 16489573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 41201447 - 41201701
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  41201447 gtgtttcaacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 41201546  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  41201547 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 41201646  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  41201647 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatg 41201701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 265
Target Start/End: Original strand, 20057048 - 20057306
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||   ||  |||| |||    
T  20057048 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgattttaggacaggattgaacccag 20057147  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  ||||||||||||    
T  20057148 aacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaaggactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcga 20057247  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||||||  ||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  20057248 tctgtgtcgcatgtgttgatcaggagtgaacccctaattggtattgagacctagtgatg 20057306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 265
Target Start/End: Original strand, 20063686 - 20063944
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||   ||  |||| |||    
T  20063686 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgattttaggacaggattgaacccag 20063785  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  ||||||||||||    
T  20063786 aacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaaggactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcga 20063885  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||||||  ||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  20063886 tctgtgtcgcatgtgttgatcaggagtgaacccctaattggtattgagacctagtgatg 20063944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 23704418 - 23704672
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  23704418 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 23704517  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  23704518 acactagtttggaagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 23704617  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| |||||    
T  23704618 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattagtaatgaaacctaatgatg 23704672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 23722874 - 23723128
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  23722874 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 23722973  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  23722974 acactagtttggaagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 23723073  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| |||||    
T  23723074 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattagtaatgaaacctaatgatg 23723128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 23741330 - 23741584
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  23741330 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 23741429  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  23741430 acactagtttggaagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 23741529  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| |||||    
T  23741530 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattagtaatgaaacctaatgatg 23741584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 15726581 - 15726829
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||    
T  15726581 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgaaggatcagattgaacccagaaca 15726680  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |   ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  15726681 acactagtttgggagataagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 15726780  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15726781 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaaccta 15726829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 253
Target Start/End: Original strand, 5149627 - 5149859
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  |  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||   ||||||    
T  5149627 ctttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatttgggatcagattgaacccagaacaacactagttt 5149726  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  5149727 gggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 5149826  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatga 253  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  5149827 gttgatcaagagtgaacccctaattggtaatga 5149859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 15691927 - 15692181
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  15691927 gtgtttcgacctttttagtttgaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 15692026  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |   ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || | || | | ||  |  || ||  ||||||||||||||||    
T  15692027 acactagtttgggagatgagtggtactctccatggcgagtaagaactctcgcctcgcaagcataacctgaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatctg 15692126  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  15692127 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatg 15692181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 3691080 - 3690822
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| | |||||||||    |||||||||||| | |||||   ||  |||| |||    
T  3691080 tttcgtgtttcgacctttttagttaaaccttgtatgcctttgagtgcctaaacatacctagagacgattaggaatgattttaggacaggattgaacccag 3690981  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  ||||||||||||    
T  3690980 aacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcga 3690881  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  3690880 tctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaattgggattgagacctagtgatg 3690822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 30066409 - 30066246
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||    
T  30066409 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacccag 30066310  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30066309 aacaacactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 30066246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 41091996 - 41092250
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  41091996 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggagcagagggaacccagaaca 41092095  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaactt-gtttatgtgtttgtgcgatct 209  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||      ||| ||| | || ||||  ||||  |||||||||    
T  41092096 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagctagcccagaatgtagtttgtttgagtgta-gtgcgatct 41092194  T
Q  210 gtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||| |||| | |||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  41092195 gtgttgcacgttttgaccaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatg 41092250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 14499784 - 14499625
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  14499784 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 14499685  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14499684 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 14499625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 11070527 - 11070368
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  11070527 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 11070428  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11070427 acactagtttggaagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 11070368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 11165179 - 11165338
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| || ||||    
T  11165179 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacccaaaaca 11165278  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11165279 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 11165338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 10911346 - 10911105
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || |||||||   |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| ||||||||  | |||||    
T  10911346 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctagacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacatcagttt 10911247  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||  |    
T  10911246 gggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcatgt 10911147  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtg 262  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  10911146 gttgatcaagagtgaacccctaattggtgttgagacctagtg 10911105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24188223 - 24187979
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||  ||||||     
T  24188223 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 24188124  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||  || | |  |||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  24188123 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 24188024  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  24188023 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatg 24187979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 839692 - 839455
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||| ||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||  ||||||     
T  839692 cttttaagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 839593  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  839592 gggagttgacttgaactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgtattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 839493  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  839492 tttgatcaagagtgaacccctaagtggtaatgagacct 839455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 10004084 - 10003843
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || |||||||   |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| ||||||||  | |||||    
T  10004084 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctagacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacttcagttt 10003985  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  ||| |||||||||||||||||||  |    
T  10003984 gggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcatgt 10003885  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtg 262  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  10003884 gttgatcaagagtgaacccctaagtggtgttgagacctagtg 10003843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 55149424 - 55149180
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||  ||||||     
T  55149424 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 55149325  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||  |  | |  |||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  55149324 ggaagttggattgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagatttgagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 55149225  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  55149224 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatg 55149180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 99 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 10010653 - 10010490
Alignment:
Q  99 gaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgt 198  Q
    |||| ||||||||  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  |||     
T  10010653 gaacccagaacaacttcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgg 10010554  T
Q  199 ttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtg 262  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  10010553 ttgtgcgatctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaagtggtgttgagacctagtg 10010490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 99 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 10904596 - 10904433
Alignment:
Q  99 gaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgt 198  Q
    |||| ||||||||  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  ||||    
T  10904596 gaacccagaacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgt 10904497  T
Q  199 ttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtg 262  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  10904496 ttgtgcgatctgtgtcgcatgtgttgatcatgagtgaacccctaattggtgttgagacctagtg 10904433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19809485 - 19809231
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||   ||   | || |||||||    
T  19809485 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggattgaatgtagggcaaggttggacccagaaca 19809386  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||   |||  |  | |   ||  ||||||||||||||||    
T  19809385 actttagtttgggaattgtttggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacttccagctttgagtgtcttgagtgtttgtgcgatctg 19809286  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||| | | |||||||| |||||||||   || |||||||||||| |||||    
T  19809285 tgtcgcacatttggatcaagagtgaacccctttatgataatgagacctaatgatg 19809231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 141
Target Start/End: Original strand, 22642988 - 22643118
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||    
T  22642988 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagacttaacccagaaca 22643087  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgcc 141  Q
    |   ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22643088 acactagtttgggagttgagttgtactcgcc 22643118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 7986152 - 7985909
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||  |||  ||||  |||||||  |||||||    
T  7986152 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacttagtaatgattaggaaggaatgtaagacaagattgaacctagaacaacattagttt 7986053  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||||||  | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |   ||||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  7986052 gggagttggcttgaactcgccatggcgagtaggtactctcgcctcgcgagcattttcagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 7985953  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
     |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  7985952 tttgatcaagagtgaacccctta-tggtaatgagacctaatgatg 7985909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 15826120 - 15825961
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||  | || ||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||  | || |||||||    
T  15826120 gtgtttcgacctttttagttagaccttgagtgcctttgagtgtctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattggacccagaaca 15826021  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |  ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15826020 actttagtttgggaattgtttggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 15825961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 17710241 - 17710400
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || |||||||    
T  17710241 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 17710340  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |  ||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17710341 actttagtttgggaattgaatggtactcgccaaggcaagtaagaactctcgcctcgcgag 17710400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 55023304 - 55023174
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  55023304 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 55023205  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgcc 141  Q
    |   |||||||| || |||||||||||||||    
T  55023204 acactagtttggaagatgagtggtactcgcc 55023174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 15991753 - 15991912
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | |  |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||  | || || ||||    
T  15991753 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcgtttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattggacccaaaaca 15991852  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |  ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  15991853 actttagtttgggaattgtttggtactcgccatggcgagtaaggattctcgcctcgcgag 15991912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20723447 - 20723203
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||  ||||||     
T  20723447 ctttttagttggaccttgagtgccattgagtgcttgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 20723348  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || || ||  | |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||  |    
T  20723347 ggaagctggcttgtactcgccatggcgagtagatgctctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcatgt 20723248  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  20723247 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatg 20723203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Original strand, 22670536 - 22670621
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcaga 96  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22670536 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcaga 22670621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 15404143 - 15404396
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || |||||      
T  15404143 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaatg 15404242  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgt-ttgtgcgatct 209  Q
    |  ||||||| ||| |||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||   |||  |  | |   ||||| || |||||||||||    
T  15404243 actttagttttggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaactctcgcctcgcgagcacctccagctttgagt--gttatgagtgttgtgcgatct 15404340  T
Q  210 gtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||| |||||    
T  15404341 gtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaattgataataagacctaatgatg 15404396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 410400 - 410559
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || |||||||    
T  410400 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacgcagaaca 410499  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  410500 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 410559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 1145201 - 1145360
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || |||||||    
T  1145201 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 1145300  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  1145301 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 1145360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 6608926 - 6608688
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| ||||||||  ||||||     
T  6608926 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacattagtt- 6608828  T
Q  121 gggagtt-gagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcact 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    ||| ||| | |  ||| ||||||||||||||| |||||||||     
T  6608827 gggagtttgagtggtactcgccatggcgagtaaggactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagtgttttgtgtgtttgtgcgatccgtgtcgcacc 6608728  T
Q  220 tgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    | | |||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||    
T  6608727 tttcgatcaagagtgaacccctagttggtaatgaaaccta 6608688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 17252716 - 17252935
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||   ||| |||||||   |||||||    
T  17252716 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacagcattagttt 17252815  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | |||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||   |||| || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  17252816 ggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 17252915  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccc 240  Q
     | |||||||| ||||||||    
T  17252916 ttggatcaagagtgaacccc 17252935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 4710744 - 4710596
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||   |||    || ||||||||  |||||||    
T  4710744 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaacaaatgtagggcaagattagac-cagaacaactttagttt 4710646  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4710645 gggatttgagtggtactcgccatggcgagtgaggactctcgcctcgcgag 4710596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 170
Target Start/End: Original strand, 10236054 - 10236202
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | ||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||  | || ||||||||  |||||||    
T  10236054 ctttttagttggaccttgagtgcctatgagtgcctgaacatacctagtaatgattagga-tgaatgtaggacaagattggacccagaacaactttagttt 10236152  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    ||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10236153 gggaaatgtttggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 10236202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 12482875 - 12482638
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  12482875 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 12482776  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  12482775 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 12482676  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  12482675 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaacct 12482638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Original strand, 15584379 - 15584616
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  15584379 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 15584478  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |    ||| ||| |  |||||  ||| | |||||||||||||||||| |    
T  15584479 ggaatctgagtggtactcgccatggcgagtaagaaccctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggtggtgcgatctgtgtcgcacct 15584578  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15584579 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacct 15584616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Original strand, 15591037 - 15591274
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  15591037 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 15591136  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |    ||| ||| |  |||||  ||| | |||||||||||||||||| |    
T  15591137 ggaatctgagtggtactcgccatggcgagtaagaaccctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggtggtgcgatctgtgtcgcacct 15591236  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15591237 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacct 15591274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 265
Target Start/End: Original strand, 28350844 - 28351065
Alignment:
Q  44 ccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccat 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||  |||| ||||||||  |||||| ||||||||  |   |||||||||    
T  28350844 ccttgagtgcctgaacatacctagtgatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacccagaacaacattagttggggagttggcttcaactcgccat 28350943  T
Q  144 ggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaa 243  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||| ||||      
T  28350944 ggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttaatcaagagtgaatcccttt 28351043  T
Q  244 ctggtaatgagacctagtgatg 265  Q
     ||||||||||| ||| |||||    
T  28351044 atggtaatgagatctaatgatg 28351065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13321418 - 13321174
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||   || |||||||||  |||||||    
T  13321418 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattaaattcagaacaacattagttt 13321319  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | | |  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| | |||| |    |  ||| ||||||||| |||||||||| |    
T  13321318 ggaactagtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcactttcaagttgaagtgtaatgagtgcttgtgcgatatgtgtcgcacgt 13321219  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
     | |||||||| ||||||||    ||||||||||||||| |||||    
T  13321218 ttggatcaagagtgaacccccttatggtaatgagacctaatgatg 13321174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 15397552 - 15397805
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || |||||      
T  15397552 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaatg 15397651  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgt-ttgtgcgatct 209  Q
    |  ||||||| ||| |||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||   |||  |  | |   ||||| || ||||| |||||    
T  15397652 actttagttttggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaactctcgcctcgcgagcacctccagctttgagt--gttatgagtgttgtgggatct 15397749  T
Q  210 gtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||| |||||    
T  15397750 gtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaattgataataagacctaatgatg 15397805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12891852 - 12891633
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||   ||| |||||||   |||||||    
T  12891852 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacagcattagttt 12891753  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | |||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||   |||| || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  12891752 ggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 12891653  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccc 240  Q
     | ||||||||  |||||||    
T  12891652 ttggatcaagagagaacccc 12891633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 15343255 - 15343414
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || || ||||    
T  15343255 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccataaca 15343354  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  15343355 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 15343414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 15349898 - 15350057
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || |||||||    
T  15349898 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 15349997  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||    
T  15349998 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcacctcgcgag 15350057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 4291218 - 4291069
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    ||  |||||||  || ||||    
T  4291218 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacctagaacaacttttgttt 4291119  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |||| |||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  4291118 gggaattgtttggtactcgccatggcgagcaagaactctcgcctcgcgag 4291069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 5201670 - 5201433
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  5201670 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 5201571  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |    ||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  5201570 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcacctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 5201471  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  5201470 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaacct 5201433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 264
Target Start/End: Original strand, 5426362 - 5426605
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  5426362 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 5426461  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatc-aggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcact 219  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | | || || | | |  |||||  ||| ||||||||||||||||||||     
T  5426462 ggaatctgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagca-agtctagaacgtagctgtttgggtggttgtgcgatctgtgtcgcacc 5426560  T
Q  220 tgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgat 264  Q
    | |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  5426561 ttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgat 5426605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15361148 - 15360895
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||    || |||||      
T  15361148 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaattaatgtagggcaagattagacccagaatg 15361049  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgt-ttgtgcgatct 209  Q
    |  ||||||| ||| |||  | ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||   |||  |  | |   ||||| || |||||||||||    
T  15361048 actttagttttggaattgtttagtactcgccatggtgagcaagaactctcgcctcgcgagcacctccagctttgagt--gttatgagtgttgtgcgatct 15360951  T
Q  210 gtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||| |||||    
T  15360950 gtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaattgataataagacctaatgatg 15360895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 8720805 - 8720964
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || |||||||    
T  8720805 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 8720904  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |  ||||||||||| |||  | |||||||||||||| || | | || |||||||||||||    
T  8720905 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcaagcaggaaccctcgcctcgcgag 8720964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 9072692 - 9072851
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || |||||||    
T  9072692 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 9072791  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |  ||||||||||| |||  | |||||||||||||| || | | || |||||||||||||    
T  9072792 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcaagcaggaaccctcgcctcgcgag 9072851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 15337889 - 15337810
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtagg 90  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15337889 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagg 15337810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 253
Target Start/End: Original strand, 5419964 - 5420196
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  5419964 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 5420063  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatc-aggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcact 219  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | | || || | | |  |||||  ||| ||||||||||||||||||||     
T  5420064 ggaatctgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagca-agtctagaacgtagctgtttgggtggttgtgcgatctgtgtcgcacc 5420162  T
Q  220 tgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatga 253  Q
    | |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  5420163 ttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatga 5420196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16333618 - 16333375
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| |||||   | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||   ||| || |||||  |||||||    
T  16333618 ctttttagttggaccttaagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattaaacccataacaactttagttt 16333519  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
     |   | |  ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  16333518 tgttct-gtctggtactcgccatggcgagtaggaaccctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 16333420  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
     |||||||||| |||| ||||   ||||||||||||||| |||||    
T  16333419 tttgatcaagagtgaatccctttatggtaatgagacctaatgatg 16333375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 10326299 - 10326154
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||   ||| |||||||   |||||||    
T  10326299 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcttgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacagctttagttt 10326200  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcg 166  Q
    ||   |||  ||||||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  10326199 ggtttttgtctggtactcgccatggcgagtaggaaccctcgcctcg 10326154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 117 - 170
Target Start/End: Original strand, 13315943 - 13315996
Alignment:
Q  117 gtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  13315943 gtttgggatttgagtggtactcgccatggcgagtaataactctcgcctcgcgag 13315996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15337702 - 15337636
Alignment:
Q  199 ttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||| || |||| ||||||| |||||    
T  15337702 ttgtgcgatctgtgtcgcacgttttcatcaagagtgaacccctaattgataataagacctaatgatg 15337636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Original strand, 4588463 - 4588534
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    ||||| |||||||||||  || || |||||||||||| |||  ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  4588463 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggat 4588534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 12340225 - 12340154
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    ||||| |||||||||||  || || |||||||||||| |||  ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  12340225 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggat 12340154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 265
Target Start/End: Original strand, 10236227 - 10236297
Alignment:
Q  195 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||    || |||||||||||| |||||    
T  10236227 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaacccccttatgataatgagacctaatgatg 10236297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 265
Target Start/End: Original strand, 13316021 - 13316091
Alignment:
Q  195 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||    ||||||||| ||||| |||||    
T  13316021 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaacccccttatggtaatgaaacctaatgatg 13316091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15825936 - 15825866
Alignment:
Q  195 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||    || |||||||||||| |||||    
T  15825936 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaacccccttatgataatgagacctaatgatg 15825866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 4291044 - 4290999
Alignment:
Q  195 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccc 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||    
T  4291044 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccc 4290999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 92
Target Start/End: Original strand, 12852034 - 12852083
Alignment:
Q  43 cccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    ||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  12852034 cccttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggat 12852083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 265
Target Start/End: Original strand, 15991938 - 15992007
Alignment:
Q  196 tgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||    || |||||||||||| |||||    
T  15991938 tgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaacccccttatgataatgagacctaatgatg 15992007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 240
Target Start/End: Original strand, 30777057 - 30777102
Alignment:
Q  195 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccc 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||    
T  30777057 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccc 30777102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 54)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 7 - 267
Target Start/End: Original strand, 26877214 - 26877474
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26877214 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttgtatgcctatgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 26877313  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26877314 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 26877413  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26877414 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 26877474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 7 - 267
Target Start/End: Original strand, 22320632 - 22320892
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22320632 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 22320731  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22320732 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 22320831  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22320832 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 22320892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 7 - 267
Target Start/End: Original strand, 22326785 - 22327045
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22326785 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 22326884  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22326885 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 22326984  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22326985 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 22327045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 27216526 - 27216275
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27216526 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 27216427  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27216426 aacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 27216327  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  27216326 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 27216275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16986404 - 16986153
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16986404 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 16986305  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16986304 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 16986205  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16986204 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 16986153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Original strand, 28431558 - 28431809
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28431558 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 28431657  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28431658 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 28431757  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  28431758 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 28431809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Original strand, 13306235 - 13306486
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13306235 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgccttcgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 13306334  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13306335 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 13306434  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  13306435 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 13306486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 267
Target Start/End: Original strand, 24913614 - 24913870
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24913614 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 24913713  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  24913714 acactagtttgggagttgagtggtactcgccgtggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgaagttgcttgtgtgtttgtgcgatctg 24913813  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 267  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24913814 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 24913870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 27617756 - 27617496
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| || |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27617756 tttcgtgtttcaacctttttagtcgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagcattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 27617657  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||   |  ||||||||||||    
T  27617656 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccacggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagtttcctgagtgtttgtgcga 27617557  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27617556 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 27617496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 9340743 - 9340492
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  9340743 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 9340644  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9340643 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 9340544  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  9340543 tctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 9340492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 9489377 - 9489126
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  9489377 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 9489278  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9489277 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 9489178  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  9489177 tctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 9489126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 9608638 - 9608387
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  9608638 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 9608539  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9608538 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 9608439  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  9608438 tctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 9608387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16997510 - 16997252
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  16997510 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggaccagagggaacccag 16997411  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  || | ||   |  |||| |||||||    
T  16997410 aacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgcga 16997311  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16997310 tctgtgtcgcacctgttgatcaagagtgaacccctagctggtaatgagacctagtgatg 16997252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Original strand, 19489574 - 19489821
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| || ||  ||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||    
T  19489574 gtgtttcgaccttttgagttggaccttggatgcctatgagtgcctgaacctacctagtattgtttaggaacgaatttaggatcagagggaacccataaca 19489673  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  19489674 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttttgcgatccg 19489773  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19489774 tgtcgcaccttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 19489821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 7 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 17004143 - 17003885
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  17004143 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctaatattgattaggaatgaatgtaggaccagagggaacccag 17004044  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  || | ||   |  |||| |||||||    
T  17004043 aacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgcga 17003944  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17003943 tctgtgtcgcacctgttgatcaagagtgaacccctagctggtaatgagacctagtgatg 17003885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 29233975 - 29233731
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29233975 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaacaagcttagttt 29233876  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | ||| || || |||||||||||||||||||||| |    
T  29233875 gggagttgagtggtactcgccacgacgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccaggatgtagttgcttgtgagtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 29233776  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  29233775 gttgatcaagggtgaacccctaattggtattgagacctaatgatg 29233731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 29347274 - 29347030
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29347274 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaacaagcttagttt 29347175  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | ||| || || |||||||||||||||||||||| |    
T  29347174 gggagttgagtggtactcgccacgacgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccaggatgtagttgcttgtgagtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 29347075  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  29347074 gttgatcaagggtgaacccctaattggtattgagacctaatgatg 29347030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 1843543 - 1843286
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  1843543 tttcgtgattcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaagatcagagggaacctag 1843444  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||| || |||||| ||||||    
T  1843443 aacaagtttattttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcttcgcgagcacaaccaggatgcagttgcttgtgtgttggtgcga 1843344  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgat 264  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  1843343 tctgtgtcgcacgtgttgatctagagtgaacccctaactagtaataagacctaatgat 1843286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 23171494 - 23171240
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23171494 gtgtttcgacttttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 23171395  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  23171394 acactaatttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 23171295  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  23171294 tgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatg 23171240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 23582751 - 23582497
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23582751 gtgtttcgacttttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 23582652  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  23582651 acactaatttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 23582552  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  23582551 tgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccctaattggtattgagacctaatgatg 23582497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 53 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 27599678 - 27599466
Alignment:
Q  53 cctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 152  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27599678 cctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaagatcagagggaacccagaacaagtttattttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaa 27599579  T
Q  153 gtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatg 252  Q
    | |||||||||||||||| |||  ||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||     
T  27599578 gaactctcgcctcgcgagcacagccaggatgcagttgcttgtgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatctagagtgaacccctaactagtaata 27599479  T
Q  253 agacctagtgatg 265  Q
    ||||||| |||||    
T  27599478 agacctaatgatg 27599466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 12829516 - 12829272
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  |  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||   ||||||    
T  12829516 ctttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaacaacactagttt 12829417  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  12829416 gggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacat 12829317  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||| |||||    
T  12829316 gttgatcaagagtgaacccctaattggtaattaaacctaatgatg 12829272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 92 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16922907 - 16922741
Alignment:
Q  92 tcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtt 191  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  16922907 tcagagggaacccagaacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgat 16922808  T
Q  192 tatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16922807 tatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 16922741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 93 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16928730 - 16928558
Alignment:
Q  93 cagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgttt 192  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  || | ||   |    
T  16928730 cagagggaacccagaacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcct 16928631  T
Q  193 atgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
      |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16928630 gagtgtctgtgcgatctgtgtcgcacctgttgatcaagagtgaacccctagctggtaatgagacctagtgatg 16928558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 10101295 - 10101454
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  10101295 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagcgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 10101394  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10101395 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 10101454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 10866818 - 10866574
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| ||||||||  | |||||    
T  10866818 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacatcagttt 10866719  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | | ||| ||  ||||||| |||||||||||||||  |    
T  10866718 gggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaaggtagttgcttgagtgtttgcgcgatctgtgtcgcatgt 10866619  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  10866618 gttgatcaagagtgaacccctaattggcattgagacctagtgatg 10866574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 10873985 - 10873741
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| ||||||||  | |||||    
T  10873985 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacatcagttt 10873886  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | | ||| ||  ||||||| |||||||||||||||  |    
T  10873885 gggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaaggtagttgcttgagtgtttgcgcgatctgtgtcgcatgt 10873786  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  10873785 gttgatcaagagtgaacccctaattggcattgagacctagtgatg 10873741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 27197331 - 27197093
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  ||||||   |||||||    
T  27197331 ctttttagttggaccttgagtgccattgtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaccattagttt 27197232  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  27197231 ggaaattgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 27197132  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  27197131 tttgatcaagagtgaatccctaattggtaatgagaccta 27197093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 88
Target Start/End: Original strand, 29282430 - 29282511
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgta 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29282430 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgta 29282511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 16980663 - 16980563
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16980663 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 16980564  T
Q  107 a 107  Q
    |    
T  16980563 a 16980563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 21138931 - 21139175
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||  |||| |||||||   |||||||    
T  21138931 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtatgacaagattgaacccagaacagctttagttt 21139030  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |  ||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  21139031 ggaacctgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 21139130  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  21139131 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatg 21139175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24503556 - 24503312
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||  ||||||     
T  24503556 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 24503457  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    |  |||||  | |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||  |||   || | |  |||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  24503456 gaaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcccgagcactttcatattggagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 24503357  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
     ||||||| ||  |||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  24503356 tttgatcaggagcgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatg 24503312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 41604381 - 41604540
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || |||||||    
T  41604381 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 41604480  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  41604481 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaactctcgcctcgcgag 41604540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 41610278 - 41610437
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || |||||||    
T  41610278 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 41610377  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  41610378 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaactctcgcctcgcgag 41610437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 16928916 - 16928832
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtagga 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16928916 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtagga 16928832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 21146949 - 21147193
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||  |||| ||||| |   |||||||    
T  21146949 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctggacatacctagtaatgattatgaatgaatgtaggacaagattgaacccagaatagctttagttt 21147048  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |  ||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  21147049 ggaacctgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacat 21147148  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  21147149 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatg 21147193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 47 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 37318695 - 37318572
Alignment:
Q  47 tgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggc 146  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||    || ||||||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  37318695 tgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggtaagattagacccagaacaactttagtttgggaattgtttggtactcgccatggc 37318596  T
Q  147 gagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  37318595 gagtaagaactctcgcctcgcgag 37318572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 13970019 - 13970178
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || |||||||    
T  13970019 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 13970118  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  13970119 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 13970178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 45057075 - 45057234
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || |||||||    
T  45057075 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 45057174  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  45057175 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 45057234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 24640621 - 24640864
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || ||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||||  |||   ||| |||||||   |||||||    
T  24640621 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgccagaacaaacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacagctttagttt 24640720  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||   |||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  24640721 ggtt-ttgtctggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacctccagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 24640819  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
     |||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||| |||||    
T  24640820 tttgatcaagagtgaacccctagttggtaatgaaacctaatgatg 24640864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 30970639 - 30970858
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||   ||| |||||||   |||||||    
T  30970639 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacagcattagttt 30970738  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | |||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||   |||| || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  30970739 ggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 30970838  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccc 240  Q
     | ||||||||  |||||||    
T  30970839 ttggatcaagagagaacccc 30970858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 170
Target Start/End: Original strand, 24872090 - 24872216
Alignment:
Q  44 ccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccat 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||  |||   ||| ||||||||  ||||||||| | |||  | |||||||||||    
T  24872090 ccttgagtgcctgaacatacctagtaatgaatagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacaacattagtttggaacttgtcttgtactcgccat 24872189  T
Q  144 ggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24872190 ggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 24872216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 170
Target Start/End: Original strand, 24879975 - 24880101
Alignment:
Q  44 ccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccat 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||  |||   ||| ||||||||  ||||||||| | |||  | |||||||||||    
T  24879975 ccttgagtgcctgaacatacctagtaatgaatagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacaacattagtttggaacttgtcttgtactcgccat 24880074  T
Q  144 ggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24880075 ggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 24880101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 127 - 264
Target Start/End: Original strand, 44380959 - 44381095
Alignment:
Q  127 tgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||| | ||| ||||| |||||||||||||| | |||||    
T  44380959 tgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgttga-gtggttgtgtgatctgtgtcgcaccttttgat 44381057  T
Q  227 caagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgat 264  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  44381058 caagagtgaacccctaactggtaatgaaacctaatgat 44381095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 24715160 - 24715009
Alignment:
Q  19 acctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagt 118  Q
    ||||||||||||| |||||| || || | | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || ||||||||  |||||    
T  24715160 acctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaacaactttagt 24715061  T
Q  119 ttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  24715060 ttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 24715009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 127 - 264
Target Start/End: Original strand, 44387629 - 44387765
Alignment:
Q  127 tgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||| | ||| ||||| |||||||||||||| | |||||    
T  44387629 tgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgttga-gtggttgtgtgatctgtgtcgcaccttttgat 44387727  T
Q  227 caagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgat 264  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  44387728 caagagtgaacccctaactagtaatgaaacctaatgat 44387765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 46 - 240
Target Start/End: Original strand, 19645662 - 19645856
Alignment:
Q  46 ttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatgg 145  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||  |||   ||| |||||||   ||||||||| | |||  | |||||||||||||    
T  19645662 ttgagtgcctgaacatacctagtaatgaatagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacagtattagtttggaacttgtcttgtactcgccatgg 19645761  T
Q  146 cgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccc 240  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||   |||| || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  |||||||    
T  19645762 cgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagagaacccc 19645856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 27369748 - 27369511
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  27369748 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 27369649  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatc-aggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcact 219  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | | || || | | |  |||||  ||| ||||||||||||||||||||     
T  27369648 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagca-agtctagaacgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacc 27369550  T
Q  220 tgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    | ||||||| || ||||||||||  ||||||||| ||||    
T  27369549 ttttgatcaggagtgaacccctagttggtaatgaaacct 27369511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 27376258 - 27376021
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  27376258 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 27376159  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatc-aggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcact 219  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | | || || | | |  |||||  ||| ||||| ||||||||||||||     
T  27376158 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagca-agtctagaacgtagctgtttgagtggttgtgagatctgtgtcgcacc 27376060  T
Q  220 tgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    | ||||||| || ||||||||||  ||||||||| ||||    
T  27376059 ttttgatcaggagtgaacccctagttggtaatgaaacct 27376021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 15478050 - 15477901
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || ||||||| |||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||   |||  ||||  ||||||| |||||||     
T  15478050 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgtctgaacatacctagttatgattagggatgaatgtagggcaagattgaacctagaacaatcttagttg 15477951  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    || |  ||  | ||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||    
T  15477950 ggaatctggcttgtactcgccatggcgagcagatgctctcgcctcgcgag 15477901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 240
Target Start/End: Original strand, 24880126 - 24880171
Alignment:
Q  195 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccc 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||    
T  24880126 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaacccc 24880171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 27602243 - 27602186
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattagg 78  Q
    ||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  27602243 ctttttagttggaccttgagtacctttgagtgcctgaacatacctactaatgattagg 27602186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 240
Target Start/End: Original strand, 41604565 - 41604610
Alignment:
Q  195 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccc 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||    
T  41604565 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccc 41604610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 240
Target Start/End: Original strand, 41610462 - 41610507
Alignment:
Q  195 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccc 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||    
T  41610462 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagcgaacccc 41610507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 7 - 267
Target Start/End: Original strand, 9462 - 9722
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9462 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 9561  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9562 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcacctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 9661  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9662 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 9722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 68)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 7 - 267
Target Start/End: Original strand, 20649439 - 20649699
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20649439 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 20649538  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  20649539 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaatttgtttatgtgtttatgcga 20649638  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20649639 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 20649699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 6981119 - 6980860
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6981119 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 6981020  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6981019 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 6980920  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgt 266  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6980919 tctgtgtcgcacttgttgatcgagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgt 6980860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 6 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 20061111 - 20060851
Alignment:
Q  6 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20061111 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatatccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 20061012  T
Q  106 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 205  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20061011 gaacgaccttagtttgggagttgagtggtgctcgccaaggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcg 20060912  T
Q  206 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgt 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20060911 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgt 20060851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 7 - 267
Target Start/End: Original strand, 2869782 - 2870041
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2869782 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcc-ttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 2869880  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2869881 aacaaccttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 2869980  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2869981 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactagtaatgagacctagtgatgtc 2870041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 7 - 267
Target Start/End: Original strand, 2876397 - 2876656
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2876397 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcc-ttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 2876495  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2876496 aacaaccttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 2876595  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2876596 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactagtaatgagacctagtgatgtc 2876656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 7 - 266
Target Start/End: Original strand, 4233144 - 4233403
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4233144 tttcatgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgtctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 4233243  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  4233244 aacaaccttattttgggagttgagtggtactcgtcatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgaacttgtttgtgtgtttgtgcga 4233343  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgt 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4233344 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgt 4233403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 12763158 - 12762902
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  12763158 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctatgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatttaggatcagagggaacccagaaca 12763059  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12763058 agcttagtttgggagttgagaggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcacgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 12762959  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 267  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  12762958 tgtcgcacttgttgattaagagtgaacccctagctggtaatgagacctggtgatgtc 12762902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 7 - 266
Target Start/End: Original strand, 14059262 - 14059521
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14059262 tttcgtgtttcgaccctttttgttgaaccttgtatacctttgagtgcccgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 14059361  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  14059362 aacaagcttagtttggaagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgagattgtttatgtgtttgtgcga 14059461  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgt 266  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  14059462 tctgtgtcgcacttgttaatcaagagtgaaccgctaactggtattgagacctagtgatgt 14059521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 8229348 - 8229097
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8229348 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 8229249  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8229248 aacaagcttagtttgtgagttgagtggttctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 8229149  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  8229148 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 8229097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18931537 - 18931286
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18931537 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 18931438  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18931437 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 18931338  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18931337 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 18931286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Original strand, 29593466 - 29593717
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29593466 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 29593565  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29593566 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 29593665  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  29593666 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 29593717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 7 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 30597678 - 30597418
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  30597678 tttcgtgtttcgacctttttagttgaattttgtatgcctttgagtacctgaacacatctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagaaggaacccag 30597579  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||| | ||||||||||||||||||||    
T  30597578 aacaaccttggtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagcacaaccaatatggaattgtttatgtgtttgtgcga 30597479  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 267  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30597478 tctgtgtcgcacttgatgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 30597418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Original strand, 29587325 - 29587576
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29587325 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 29587424  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29587425 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 29587524  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| | ||||||| ||||    
T  29587525 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattcgtaatgaaacct 29587576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 27327706 - 27327960
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27327706 gtgtttcgacctgtttagttggaccttgtatgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 27327805  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  27327806 agattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaatcagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 27327905  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  27327906 tgtcgcacgtgttgaccaagagtgaacccctaattggtattgagacctaatgatg 27327960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 27388446 - 27388700
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27388446 gtgtttcgacctgtttagttggaccttgtatgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 27388545  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  27388546 agattagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaatcagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 27388645  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  27388646 tgtcgcacgtgttgaccaagagtgaacccctaattggtattgagacctaatgatg 27388700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Original strand, 30637780 - 30638026
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30637780 gtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 30637879  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  30637880 agcttagtt-gtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgagtatgtgtttgtgcgatctg 30637978  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||| |||  | ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  30637979 tgtcgcactttttggcccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 30638026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 44 - 265
Target Start/End: Original strand, 18194207 - 18194428
Alignment:
Q  44 ccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccat 143  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18194207 cctttagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccac 18194306  T
Q  144 ggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaa 243  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||| | ||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  18194307 ggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacagccaggatgtagttgcttgtgagtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgattaagagtgaacccctaa 18194406  T
Q  244 ctggtaatgagacctagtgatg 265  Q
     ||||| ||||||||| |||||    
T  18194407 ttggtattgagacctaatgatg 18194428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 44 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 30694786 - 30694565
Alignment:
Q  44 ccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccat 143  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30694786 ccttgagtgcctgaacatgcctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccaaaacaagtttattttgggagttgagtggtactcgccat 30694687  T
Q  144 ggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaa 243  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||    
T  30694686 ggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacagccaggatgcagttgcttgtgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatctagggtgaacccctaa 30694587  T
Q  244 ctggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    || ||||| ||| ||| |||||    
T  30694586 ctagtaataagatctaatgatg 30694565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 1538604 - 1538848
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  |  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||   ||||||    
T  1538604 ctttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaacaacactagttt 1538703  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||  ||  |||||||||||||| ||||||||| |    
T  1538704 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagtttcttgagtgtttgtgcgatcggtgtcgcacgt 1538803  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  1538804 gttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatg 1538848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 1544703 - 1544947
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  |  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||   ||||||    
T  1544703 ctttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaacaacactagttt 1544802  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||  ||  |||||||||||||| ||||||||| |    
T  1544803 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagtttcttgagtgtttgtgcgatcggtgtcgcacgt 1544902  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  1544903 gttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatg 1544947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 259
Target Start/End: Original strand, 28258100 - 28258351
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || || ||||||||||||||||||||||||| | |||||   ||  |||| |||    
T  28258100 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatgcctttgagtaccagaacatacctagtattgattaggaatgattttaggacaggattgaacccag 28258199  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  ||| ||||||||    
T  28258200 aacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtg-ttgtgcga 28258298  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||    
T  28258299 tctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctagttggtaatgaaaccta 28258351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 259
Target Start/End: Original strand, 28264724 - 28264975
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || || ||||||||||||||||||||||||| | |||||   ||  |||| |||    
T  28264724 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatgcctttgagtaccagaacatacctagtattgattaggaatgattttaggacaggattgaacccag 28264823  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  ||| ||||||||    
T  28264824 aacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtg-ttgtgcga 28264922  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||    
T  28264923 tctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctagttggtaatgaaaccta 28264975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 259
Target Start/End: Original strand, 28336849 - 28337100
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || || ||||||||||||||||||||||||| | |||||   ||  |||| |||    
T  28336849 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatgcctttgagtaccagaacatacctagtattgattaggaatgattttaggacaggattgaacccag 28336948  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  ||| ||||||||    
T  28336949 aacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtg-ttgtgcga 28337047  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||    
T  28337048 tctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctagttggtaatgaaaccta 28337100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 259
Target Start/End: Original strand, 28343473 - 28343724
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || || ||||||||||||||||||||||||| | |||||   ||  |||| |||    
T  28343473 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatgcctttgagtaccagaacatacctagtattgattaggaatgattttaggacaggattgaacccag 28343572  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  ||| ||||||||    
T  28343573 aacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtg-ttgtgcga 28343671  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||    
T  28343672 tctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctagttggtaatgaaaccta 28343724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 8797637 - 8797398
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| ||||||||  | |||||    
T  8797637 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacatcagttt 8797538  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  8797537 gggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttgtgcgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 8797438  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctag 260  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  8797437 gttgatcaagagtgaacctctaattggtaatgagacctag 8797398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 262
Target Start/End: Original strand, 27429933 - 27430184
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || ||  ||||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| |||||||    
T  27429933 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctatgagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaaca 27430032  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  27430033 acattagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 27430132  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtg 262  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27430133 tgtcgcacgagttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtg 27430184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 59 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 17031279 - 17031073
Alignment:
Q  59 catacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactc 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  |||| || |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17031279 catacctagtattgattaggaatgaatgtaggacaggatagaacccaaaacaacattagtttgggaattgagtggtactcgccatggcgagtaagaactc 17031180  T
Q  159 tcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17031179 tcgcctcgcgagcacaaacagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtattgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 17031080  T
Q  259 agtgatg 265  Q
    | |||||    
T  17031079 aatgatg 17031073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 26130925 - 26130670
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26130925 gtgttccgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattgggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 26130826  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatg-aacttgtttatgtgtttgtgcgatct 209  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||      ||||||| |  ||||||  |||||||| ||||||    
T  26130825 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtgagaactttcgtctcgcgagctagcccaggatgtagtttgtttgagtgtttgtacgatct 26130726  T
Q  210 gtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||| ||| | | ||||||| |||||    
T  26130725 gtgtcgcacgtgtggatcaagagcgaacccctaattggcattaagacctaatgatg 26130670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 17036995 - 17037239
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  |  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  |||| ||||||||  |||||||    
T  17036995 ctttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggacaggattgaacccagaacaacattagttt 17037094  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatg-aacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcact 219  Q
    |||| || ||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||| |||  ||| ||| |  ||||||  ||| ||||||||||||||||||||     
T  17037095 gggaattaagtggtacttgccatgacgagtgagaactctcgcctcgcgagcacatccagaatgtaggttgtttgagtg-ttgtgcgatctgtgtcgcacg 17037193  T
Q  220 tgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  17037194 ttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctaatgatg 17037239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 20802202 - 20801962
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| ||||||||  |||||||    
T  20802202 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacattagttt 20802103  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  ||| ||||||||||||||||||||      
T  20802102 gggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtg-ttgtgcgatctgtgtcgcacga 20802004  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtg 262  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  20802003 gttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtg 20801962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22331886 - 22331648
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||  |||||||    
T  22331886 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacgttagttt 22331787  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  22331786 ggaaattgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 22331687  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  22331686 tttgatcaagagtgaatccctaattggtaatgagaccta 22331648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 44 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16372282 - 16372061
Alignment:
Q  44 ccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccat 143  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||  |||  |||| ||||||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  16372282 ccttgagtgcctgaacatatctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattgaacccagaacaacattagtttggaaattgactggtactcgccat 16372183  T
Q  144 ggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaa 243  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  16372182 ggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaa 16372083  T
Q  244 ctggtaatgagacctagtgatg 265  Q
     ||||||||||||||| |||||    
T  16372082 ttggtaatgagacctaatgatg 16372061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 34369633 - 34369877
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  |  | |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||  |||| ||||||||  |||||||    
T  34369633 ctttttagttggaccttgagtgtcattgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattgaacccagaacaacattagttt 34369732  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    |  | |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||| ||| |    
T  34369733 gtaatttgacttgtactcgccatggcgagtatgtactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcacacgt 34369832  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
     |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  34369833 tttgatcaagagtgaatccctaattggtaatgagacctaatgatg 34369877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19808973 - 19808735
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || ||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||   ||||  |||||||  || ||||    
T  19808973 ctttttagttggaccttgagtgccattgtgtgcctggacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagtttgaacctagaacaacattggttt 19808874  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||   |||  || | |   ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  19808873 ggaatttgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcacgagcacttccagattggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 19808774  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  19808773 tttgatcaagagtgaatccctaattggtaatgagaccta 19808735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 25117900 - 25117646
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||  | || |||||||    
T  25117900 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtagtgattaggaatgaatgtagggcaagattggacccagaaca 25117801  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  ||| |||||||  ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||   |||  |  | |   ||  ||||||||||||||||    
T  25117800 actttaatttgggaaatgtttggtactcgccatggctagtaagaactctcgcctcgcgagcacttccagctttgagtgtcttgagtgtttgtgcgatctg 25117701  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||| | | |||||||| ||||||||    ||||||||||||||| |||||    
T  25117700 tgtcgcacgtttggatcaagagtgaaccccattatggtaatgagacctaatgatg 25117646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 34833101 - 34832952
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||  | || ||||||||  |||||||    
T  34833101 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattggacccagaacaactttagttt 34833002  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34833001 gggaattgtgtggtactcgctatggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 34832952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 25595012 - 25595231
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||  |||  | || ||||||||  |||||||    
T  25595012 ctttttagttgaaccttgagtgcccttgagtgcctaaacatacctagtaatgattagggatggatgtaggacgagattggacccagaacaactttagttt 25595111  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    |||| |||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||   |||| || | |    |  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  25595112 gggaattgttgggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgtaatgagtgcttgtgcgatctgtgtcgcacgt 25595211  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccc 240  Q
     |||||||||| ||||||||    
T  25595212 tttgatcaagagtgaacccc 25595231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 116 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 28287707 - 28287565
Alignment:
Q  116 agtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcg 215  Q
    |||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  ||| |||||||||||||||||    
T  28287707 agttggggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtg-ttgtgcgatctgtgtcg 28287609  T
Q  216 cacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    ||  |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||    
T  28287608 catgtgttgatcaagagtgaacccctagttggtaatgaaaccta 28287565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 28315018 - 28314786
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| ||||||||  ||||||     
T  28315018 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacattagtt- 28314920  T
Q  121 gggagtt-gagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcact 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    ||| ||| | |  ||| |||||||||||||||||||||||||     
T  28314919 gggagtttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagtgttttgtgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacc 28314820  T
Q  220 tgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatga 253  Q
    | |||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  28314819 ttttgatcaagagtgaacccctagttggtaatga 28314786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 25111297 - 25111043
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||   |||  | || |||||||    
T  25111297 gtgtttggacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtagcgattaggaatgaatgtagggcaagattggacccagaaca 25111198  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  ||| |||||||  ||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||   |||  |  | |   ||  ||||||||||||||||    
T  25111197 actttaatttgggaaatgtttggtactcgccatggctagtaagaactctcgcctcgcgagcacttccagctttgagtgtcttgagtgtttgtgcgatctg 25111098  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||| | | |||||||| ||||||||    ||||||||||||||| |||||    
T  25111097 tgtcgcacgtttggatcaagagtgaaccccattatggtaatgagacctaatgatg 25111043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 14099073 - 14098924
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || ||||||||  |||||||    
T  14099073 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaacaactttagttt 14098974  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |||| |||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  14098973 gggaattgtttggtactcgccatggcgagtaaggattctcgcctcgcgag 14098924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 27186156 - 27185918
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| |||||| || || || |||||||   |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| ||||||||  ||||||     
T  27186156 ctttttagttggaccttgaatgcctttaagtgcctagacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacattagtt- 27186058  T
Q  121 gggagtt-gagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcact 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    ||| ||| | |  ||| |||||||| ||||||||||||||||     
T  27186057 gggagtttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagtgttttgtgtgtttgcgcgatctgtgtcgcacc 27185958  T
Q  220 tgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    | |||||||||| |||||||||   ||||||||| |||||    
T  27185957 ttttgatcaagagtgaacccctggttggtaatgaaaccta 27185918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 27207992 - 27207754
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| |||||| || || || |||||||   |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| ||||||||  ||||||     
T  27207992 ctttttagttggaccttgaatgcctttaagtgcctagacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacattagtt- 27207894  T
Q  121 gggagtt-gagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcact 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    ||| ||| | |  ||| |||||||| ||||||||||||||||     
T  27207893 gggagtttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagtgttttgtgtgtttgcgcgatctgtgtcgcacc 27207794  T
Q  220 tgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    | |||||||||| |||||||||   ||||||||| |||||    
T  27207793 ttttgatcaagagtgaacccctggttggtaatgaaaccta 27207754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 27241236 - 27241474
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| |||||| || || || |||||||   |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| ||||||||  ||||||     
T  27241236 ctttttagttggaccttgaatgcctttaagtgcctagacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacattagtt- 27241334  T
Q  121 gggagtt-gagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcact 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    ||| ||| | |  ||| |||||||| ||||||||||||||||     
T  27241335 gggagtttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagtgttttgtgtgtttgcgcgatctgtgtcgcacc 27241434  T
Q  220 tgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    | |||||||||| |||||||||   ||||||||| |||||    
T  27241435 ttttgatcaagagtgaacccctggttggtaatgaaaccta 27241474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 27263084 - 27263322
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| |||||| || || || |||||||   |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| ||||||||  ||||||     
T  27263084 ctttttagttggaccttgaatgcctttaagtgcctagacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaacaacattagtt- 27263182  T
Q  121 gggagtt-gagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcact 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    ||| ||| | |  ||| |||||||| ||||||||||||||||     
T  27263183 gggagtttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagtgttttgtgtgtttgcgcgatctgtgtcgcacc 27263282  T
Q  220 tgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    | |||||||||| |||||||||   ||||||||| |||||    
T  27263283 ttttgatcaagagtgaacccctggttggtaatgaaaccta 27263322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Original strand, 32564902 - 32565139
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  32564902 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 32565001  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  32565002 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 32565101  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  32565102 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaacct 32565139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 253
Target Start/End: Original strand, 16551680 - 16551912
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  16551680 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 16551779  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  16551780 ggaatttgagtggcactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttaagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 16551879  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatga 253  Q
     ||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  16551880 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatga 16551912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16577273 - 16577041
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  16577273 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 16577174  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  16577173 ggaatttgagtggcactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttaagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 16577074  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatga 253  Q
     ||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  16577073 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatga 16577041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 253
Target Start/End: Original strand, 16618107 - 16618339
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  16618107 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 16618206  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  16618207 ggaatttgagtggcactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttaagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 16618306  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatga 253  Q
     ||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  16618307 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatga 16618339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 253
Target Start/End: Original strand, 16628236 - 16628468
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  16628236 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 16628335  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  16628336 ggaatttgagtggcactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttaagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 16628435  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatga 253  Q
     ||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  16628436 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatga 16628468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 14472726 - 14472567
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || |||||||    
T  14472726 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 14472627  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    | ||||||| || | |||  | ||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||    
T  14472626 accttagttgggaatttggcttgtactcgccatggcgagcatatgctctcgcctcgcgag 14472567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 166
Target Start/End: Original strand, 3708168 - 3708287
Alignment:
Q  47 tgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggc 146  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || ||||||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  3708168 tgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaacaactttagtttgggaattgtttggtactcgccatggc 3708267  T
Q  147 gagtaagtactctcgcctcg 166  Q
    ||||||| | ||||||||||    
T  3708268 gagtaaggattctcgcctcg 3708287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 127 - 258
Target Start/End: Original strand, 17016688 - 17016819
Alignment:
Q  127 tgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  17016688 tgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcaccttttgat 17016787  T
Q  227 caagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||| ||||    
T  17016788 caagagtgaacccctatttggtaatgaaacct 17016819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 24314729 - 24314888
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || |  | | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||     || |||||||    
T  24314729 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgctttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagtttagacccagaaca 24314828  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |  ||||||||||| |||  | |||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  24314829 actttagtttgggaattgtttagtactcaccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 24314888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 31316742 - 31316901
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |  ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||   ||     || |||||||    
T  31316742 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtatgcctgaacatgcctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagtttagacccagaaca 31316841  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  31316842 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 31316901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 4168348 - 4168222
Alignment:
Q  44 ccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccat 143  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || || |||||  ||||||||||| |||  ||||| |||||||    
T  4168348 ccttgagtgcctgcacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccataacaactttagtttgggaattgtttggtaatcgccat 4168249  T
Q  144 ggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||    
T  4168248 ggcgattaaggattctcgcctcgcgag 4168222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 265
Target Start/End: Original strand, 34298457 - 34298527
Alignment:
Q  195 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  34298457 gtgtttgtgcgatttgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatg 34298527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 45 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 4209027 - 4208902
Alignment:
Q  45 cttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatg 144  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || || |||||  ||||||||||| |||  ||||| ||||||||    
T  4209027 cttgagtgcctgcacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccataacaactttagtttgggaattgtttggtaatcgccatg 4208928  T
Q  145 gcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |||| |||| | ||||||||||||||    
T  4208927 gcgattaaggattctcgcctcgcgag 4208902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22759297 - 22759055
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||  ||||||  | || |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||   ||| |||||||   |||||||    
T  22759297 ctttttagtttgaccttgagtgcctttgagtgcttgaacatacctagtattgattagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacagctttagttt 22759198  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgt-ttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcact 219  Q
    ||   |||  ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||   ||| || |   ||  ||  ||||||||||||||||| ||||||     
T  22759197 ggtt-ttgtctggtacttgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccag-ataagagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtatcgcacg 22759100  T
Q  220 tgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    | |||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  22759099 t-ttgatcaagagtgaaaccctaattggtaatgaaacctaatgatg 22759055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 170
Target Start/End: Original strand, 23276938 - 23277087
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||    || |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||   ||| |||||||   |||||||    
T  23276938 ctttttagttggaccttgagctcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacatcattagttt 23277037  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    || | | |    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  23277038 ggaactagtcccgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgag 23277087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 92
Target Start/End: Original strand, 31164529 - 31164577
Alignment:
Q  44 ccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31164529 ccttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggat 31164577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 90
Target Start/End: Original strand, 24290723 - 24290802
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtagg 90  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || |    | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24290723 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgcttcagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagg 24290802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 25928565 - 25928499
Alignment:
Q  199 ttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  25928565 ttgtgcgatatgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaaaccctaaatggtaatgagacctaatgatg 25928499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 91
Target Start/End: Original strand, 34295728 - 34295797
Alignment:
Q  22 tttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtagga 91  Q
    |||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  34295728 tttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtgatgattaggaatgaatgtagga 34295797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 265
Target Start/End: Original strand, 3708316 - 3708386
Alignment:
Q  195 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||    ||||||||||||||| |||||    
T  3708316 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaacccccttatggtaatgagacctaatgatg 3708386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 21939856 - 21939785
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    ||||| |||||||||||  || ||||||||||||||| |||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  21939856 cttttgagttgaaccttagatgcccttgagtgcctgaacatgtgtaatattgattaggaaagaatgtaggat 21939785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 4168194 - 4168128
Alignment:
Q  199 ttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||    ||||||||||||||| |||||    
T  4168194 ttgtgcgatctgtgtcgcacgtttcgatcaagagtgaacccccttatggtaatgagacctaatgatg 4168128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 4208874 - 4208808
Alignment:
Q  199 ttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||    ||||||||||||||| |||||    
T  4208874 ttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaacccccttatggtaatgagacctaatgatg 4208808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 34)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 267
Target Start/End: Original strand, 20215574 - 20215834
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20215574 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 20215673  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20215674 aacaaccttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcga 20215773  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20215774 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccccaactggtaatgagacctagtgatgtc 20215834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 7 - 266
Target Start/End: Original strand, 44844528 - 44844788
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  44844528 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatataggatcagagggaacccag 44844627  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaa-tcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 205  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44844628 aacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagagctctcgcctcgcgagtacaacccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcg 44844727  T
Q  206 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgt 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44844728 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgt 44844788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 265
Target Start/End: Original strand, 51334957 - 51335216
Alignment:
Q  6 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactca 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  51334957 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccca 51335056  T
Q  106 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||  || | ||   |  |||| ||||||    
T  51335057 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcaagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgcg 51335156  T
Q  206 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51335157 atctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 51335216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Original strand, 46156966 - 46157217
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  46156966 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 46157065  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46157066 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 46157165  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  46157166 tctgtgtcgcactttttggtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 46157217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 6 - 265
Target Start/End: Original strand, 51328322 - 51328582
Alignment:
Q  6 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcc-tgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51328322 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtaccctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaaccc 51328421  T
Q  105 agaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||  || | ||   |  |||| |||||    
T  51328422 agaacaagcttagtttgggagttgagtggtgctcgccatggcaagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagattgtagtttcctgagtgtctgtgc 51328521  T
Q  205 gatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51328522 gatctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 51328582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 43078900 - 43078649
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  43078900 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 43078801  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43078800 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 43078701  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  43078700 tctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 43078649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 41478226 - 41478481
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41478226 gtgtttcgacatttttagttggactttggatgccctagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccagaaca 41478325  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatc-aggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatct 209  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||| | ||| ||  |||||||||||||||    
T  41478326 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccaagaatgtaattgcttgagtgtttgtgcgatct 41478425  T
Q  210 gtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| | ||||||| |||||    
T  41478426 gtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctagttggtattaagacctaatgatg 41478481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 18599755 - 18600009
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    |||||| ||| |||||||||| | |||| || |||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  18599755 gtgttttgacatttttagttggatcttggatgccctagagtgccataacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccataaca 18599854  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||   |||||||||||||||    
T  18599855 actttagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtacttgcttgaatgtttgtgcgatctg 18599954  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||| |  ||||| | ||||||| |||||    
T  18599955 tgtcgcacgtgttgatcaagagcgaacccccagttggtattaagacctaatgatg 18600009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 265
Target Start/End: Original strand, 16345420 - 16345678
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||    |||||||||||| | |||||   ||  |||| |||    
T  16345420 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatgcctttgagtgcctaaacatacctagagacgattaggaatgattttaggacaggattgaacccag 16345519  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  ||||||||||||    
T  16345520 aacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcga 16345619  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  16345620 tctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtgatg 16345678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 265
Target Start/End: Original strand, 16352068 - 16352326
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||    |||||||||||| | |||||   ||  |||| |||    
T  16352068 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatgcctttgagtgcctaaacatacctagagacgattaggaatgattttaggacaggattgaacccag 16352167  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  ||||||||||||    
T  16352168 aacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcga 16352267  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  16352268 tctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtgatg 16352326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 21829160 - 21828916
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  |  | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||   ||||||    
T  21829160 ctttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtatggattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaacaacactagttt 21829061  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||  || ||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||      
T  21829060 gggagttgagtggtactcgccttggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaactagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacga 21828961  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  21828960 gttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatg 21828916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 21844673 - 21844429
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  |  | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||   ||||||    
T  21844673 ctttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtatggattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaacaacactagttt 21844574  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||      
T  21844573 gggagatgagtggtactcgccttggtgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacga 21844474  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  21844473 gttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatg 21844429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 1011179 - 1011020
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  1011179 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 1011080  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1011079 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 1011020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 265
Target Start/End: Original strand, 41355933 - 41356191
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||  | || || | ||||| | |||||||||    |||||||||||| | |||||   ||  |||| |||    
T  41355933 tttcgtgtttcgacctttttagttggatcttgagtgcctttaaatgcctaaacatacctagagacgattaggaatgattttaggacaggattgaacccag 41356032  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  ||||||||||||    
T  41356033 aacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcga 41356132  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  41356133 tctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtgatg 41356191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 265
Target Start/End: Original strand, 41348496 - 41348754
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||  | || || | ||||| | |||||||||    |||||||||||| | |||||   ||  |||| |||    
T  41348496 tttcgtgtttcgacctttttagttggatcttgagtgcctttaaatgcctaaacatacctagagacgattaggaatgattttaggacaggattgaacccag 41348595  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | ||| ||  ||||||||||||    
T  41348596 aacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcacgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcga 41348695  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  41348696 tctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtgatg 41348754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 47659663 - 47659419
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || |||||||   |||||||||||||||||||| |||| | |||||   ||  |||| ||||||||  | |||||    
T  47659663 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctagacatacctagtattgattagggatgattttaggacaggattgaacccagaacaacatcagttt 47659564  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | | ||| ||  |||||||||||||||||||||||  |    
T  47659563 gggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaaggtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcatgt 47659464  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | | | |||||||||||||||    
T  47659463 gttgatcaagagtgaacccctaattagcattgagacctagtgatg 47659419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19063963 - 19063728
Alignment:
Q  24 tttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttggg 123  Q
    |||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  |||| ||||||||  |||||||||     
T  19063963 tttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacccagaacaacattagtttgga 19063864  T
Q  124 agttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgtt 223  Q
      |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| | ||    
T  19063863 tattgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtttt 19063764  T
Q  224 gatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  19063763 gatcaagagtgaacccctaattggtaatgagaccta 19063728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19111853 - 19111618
Alignment:
Q  24 tttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttggg 123  Q
    |||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  |||| ||||||||  |||||||||     
T  19111853 tttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacccagaacaacattagtttgga 19111754  T
Q  124 agttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgtt 223  Q
      |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| | ||    
T  19111753 tattgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtttt 19111654  T
Q  224 gatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  19111653 gatcaagagtgaacccctaattggtaatgagaccta 19111618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 23763657 - 23763413
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||  ||||||     
T  23763657 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 23763558  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||  || | |  |||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  23763557 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 23763458  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  23763457 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatg 23763413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 20524875 - 20525119
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  | |||||  |||||||    
T  20524875 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctataacaacattagttt 20524974  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||   ||   || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  20524975 ggaagttgattggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccaaattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 20525074  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
     |||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  20525075 tttgatcaaaagtgaatccctaattggtaatgagacctaatgatg 20525119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 21438240 - 21437996
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||  ||||||     
T  21438240 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttg 21438141  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||  || | |  |||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  21438140 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgttttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacat 21438041  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
     |||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||| |||||    
T  21438040 tttgatcaagagtgaacccctatttggtaatgaaacctaatgatg 21437996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19105199 - 19104961
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  |  | |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  |||| || |||||  |||||||    
T  19105199 ctttttagttggaccttgagtgactttgagtgcctaaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacccataacaacattagttt 19105100  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  19105099 ggaaattgactggtactcgccatggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 19105000  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  19104999 tttgatcaaaagtgaacccctaattggtaatgagaccta 19104961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 33385873 - 33386032
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || |||||||    
T  33385873 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 33385972  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  33385973 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 33386032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 33392517 - 33392676
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || |||||||    
T  33392517 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 33392616  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  33392617 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 33392676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 44756552 - 44756314
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagt-attgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtt 119  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||  ||||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||    
T  44756552 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagattgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagtt 44756453  T
Q  120 tgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcact 219  Q
     || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||||  ||| ||||||||||||||||||||     
T  44756452 gggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacc 44756353  T
Q  220 tgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    | ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  44756352 ttttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaacct 44756314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Original strand, 27898319 - 27898556
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  27898319 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 27898418  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  27898419 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 27898518  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  27898519 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaacct 27898556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Original strand, 43062936 - 43063173
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  43062936 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 43063035  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  43063036 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 43063135  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  43063136 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaacct 43063173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 49335018 - 49334781
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  49335018 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 49334919  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  49334918 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 49334819  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  49334818 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaacct 49334781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 264
Target Start/End: Original strand, 18625935 - 18626177
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  18625935 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 18626034  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||| | ||| |||||||||||||||||||| |    
T  18626035 ggaatctgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgttga-gtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 18626133  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgat 264  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  18626134 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgat 18626177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Original strand, 21806850 - 21807009
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| || || | | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || |||||||    
T  21806850 gtgtttcgacctttttagttggacattgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagatttgacccagaaca 21806949  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  21806950 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 21807009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Original strand, 50887412 - 50887631
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||   ||| |||||||   |||||||    
T  50887412 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacagcattagttt 50887511  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | |||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||   |||| || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  50887512 ggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcgcgagcacttccaggttggagtgtcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 50887611  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccc 240  Q
     | ||||||||  |||||||    
T  50887612 ttggatcaagagagaacccc 50887631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 21835822 - 21835663
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    ||  ||||||    
T  21835822 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagatttgacctagaaca 21835723  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |  ||||| ||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  21835722 actttagtatgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 21835663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 129 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 33394185 - 33394056
Alignment:
Q  129 agtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatca 228  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| | ||||||  ||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  33394185 agtggcactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagttgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcaccttttgatca 33394086  T
Q  229 agaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
     || ||||||||||  ||||||||| ||||    
T  33394085 ggagtgaacccctagttggtaatgaaacct 33394056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 8305543 - 8305433
Alignment:
Q  60 atacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactct 159  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||   ||| ||||||||  ||||||||| | |||  | ||||||||||||||||||||| | |||    
T  8305543 atacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattaaacccagaacaacattagtttggaacttgtctcgtactcgccatggcgagtaagaattct 8305444  T
Q  160 cgcctcgcgag 170  Q
     ||||||||||    
T  8305443 tgcctcgcgag 8305433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Original strand, 59105 - 59361
Alignment:
Q  6 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactca 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  59105 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgaaggatcagagggaaccca 59204  T
Q  106 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 205  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  59205 gaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtgctctcgcctcacgagtacaaccaggatgagcttgtttatgtgtttgtgcg 59304  T
Q  206 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtg 262  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  59305 atctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtg 59361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 6 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 139528 - 139272
Alignment:
Q  6 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactca 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  139528 gtttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtacctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgaaggatcagagggaaccca 139429  T
Q  106 gaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcg 205  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  139428 gaacgaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtgctctcgcctcacgagtacaaccaggatgagcttgtttatgtgtttgtgcg 139329  T
Q  206 atctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtg 262  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139328 atctgtgtcgcacttgttgattaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtg 139272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 261
Target Start/End: Original strand, 108970 - 109224
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  108970 tttcgtgtttcgaccttttaagttgaaccttgtatacctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 109069  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  109070 aacaaccttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcacctcgcgagtacaaccagaatgagattgtttatgtgtttgtgcga 109169  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagt 261  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  109170 tctgtgtcgcacttgttaatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagt 109224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 3)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 10819 - 10568
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10819 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 10720  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10719 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttgtgtgtttgtgcga 10620  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  10619 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 10568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 57241 - 56990
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  57241 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 57142  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  57141 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttgtgtgtttgtgcga 57042  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  57041 tctgtgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 56990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 267
Target Start/End: Original strand, 698 - 958
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  698 tttcgtgattcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacccag 797  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||  ||||||||||||    
T  798 aacaacactagtttgggagttgagtggtactcgccgtggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccaggatgaagttgcttgagtgtttgtgcga 897  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 267  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  898 tctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctggtgatgtc 958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 67964 - 67708
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  | || | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  67964 gtgtttcgacatttttagttggaccttggctgccatagaatgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctagaaca 67865  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  67864 acattagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgtttatgtgtttatgcgatctg 67765  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 267  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67764 tgtcgcacttgttgatcaagagtgaacccctaactggtaatgagacctagtgatgtc 67708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 41983 - 41739
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  |  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||   ||||||    
T  41983 ctttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcatattgaacccagaacaacactagttt 41884  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  41883 gggatttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 41784  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  41783 gttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatg 41739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 57490 - 57246
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  |  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||   ||||||    
T  57490 ctttttagttggaccttgagtgtctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtagaatcagattgaacccagaacaacactagttt 57391  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  57390 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 57291  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    | ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  57290 ggtgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatg 57246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 7460 - 7301
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||   | || |||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||  | || |||||||    
T  7460 gtgtttcgacctttttagttagaccttaagtgccattgagtgcctgaacgtacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattggacccagaaca 7361  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |  ||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  7360 actttagtttgggaattgtttggtactcgccacggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 7301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 23491 - 23363
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||  | || |||||||    
T  23491 gtgtttcgacctttttagttataccttgagtgccattgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattggacccagaaca 23392  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcg 139  Q
    |  ||||||||||| |||  |||||||||    
T  23391 actttagtttgggaattgtttggtactcg 23363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13801 - 13731
Alignment:
Q  195 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||    || |||||||||||| |||||    
T  13801 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaacccccttatgataatgagacctaatgatg 13731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 23329 - 23259
Alignment:
Q  195 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||    || |||||||||||| |||||    
T  23329 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaacccccttatgataatgagacctaatgatg 23259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 39164 - 38913
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  39164 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaacctag 39065  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39064 aacaagcttagtttgtgagttgagtggtgctcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccaggatgaacttgattatgtgtttgtgcga 38965  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  38964 tctgtgtcgcactttttagtccagagtgaacccctaattggtaatgaaacct 38913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 27098 - 26844
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||    
T  27098 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccaaaaca 26999  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | | ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  26998 acactagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaacctgaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 26899  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||| || |||||    
T  26898 tgtcgcacgtgttgatccagagtgaacccctatttggtaatgagacttaatgatg 26844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 43737 - 43667
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtagga 91  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43737 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagttcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagga 43667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 125763 - 126017
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  125763 gtgtttcaacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaaca 125862  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||| ||| | |   ||  ||||||||||||||||    
T  125863 gcactggtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagaactttcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagtgacttgagtgtttgtgcgatctg 125962  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  125963 tgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacttaatgatg 126017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 44 - 265
Target Start/End: Original strand, 105561 - 105782
Alignment:
Q  44 ccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccat 143  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||    | |||||||||||||||||||||||||||    
T  105561 ccttgagtgcctaaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccataacagcactggtttgggagttgagtggtactcgccat 105660  T
Q  144 ggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaa 243  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  105661 ggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatgtagtgacttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaa 105760  T
Q  244 ctggtaatgagacctagtgatg 265  Q
     |||||||||||| || |||||    
T  105761 ttggtaatgagacttaatgatg 105782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 124; Significance: 8e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 307553 - 307310
Alignment:
Q  11 gtgtttcgaccttttt-agttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaac 109  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  307553 gtgtttcgaccttttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagattgaacccagaac 307454  T
Q  110 aagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatct 209  Q
    ||   || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||  |  || ||  |||||||||||||||    
T  307453 aacactaatttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcacaaccagaatttagatgcttgagtgtttgtgcgatct 307354  T
Q  210 gtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatga 253  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  307353 gtgtcgcacgtgttgatcaagagtgaacccctaattggtaatga 307310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 38502 - 38244
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||   ||  |||| |||    
T  38502 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattagggatgattttaggacaggattgaacccag 38403  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | | ||| ||  ||||||||||||    
T  38402 aacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaaggtagttgcttgagtgtttgtgcga 38303  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  38302 tctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaattggcattgagacctagtgatg 38244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 265
Target Start/End: Original strand, 76310 - 76568
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcag 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||   ||  |||| |||    
T  76310 tttcgtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtacctgaacatacctagtattgattagggatgattttaggacaggattgaacccag 76409  T
Q  107 aacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcga 206  Q
    |||||  | |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | | ||| ||  ||||||||||||    
T  76410 aacaacatcagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaaggtagttgcttgagtgtttgtgcga 76509  T
Q  207 tctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  76510 tctgtgtcgcatgtgttgatcaagagtgaacccctaattggcattgagacctagtgatg 76568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 57430 - 57179
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || ||  ||||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| |||||||    
T  57430 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgcctatgagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccagaaca 57331  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctg 210  Q
    |  |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  57330 acattagtttgggagattagtgttactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaaccagaatgtagttgcttgagtgtttgtgcgatctg 57231  T
Q  211 tgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtg 262  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  57230 tgtcgcacgagttgatcaagagtgaacccctaattggtattgagacctagtg 57179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 12878 - 12719
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||  ||||||    
T  12878 gtgtttcgacctttttagttggaccttggatgccttagagtgcctgaacatacctagtattgattaggattgaatgtaggatcagattgaacctagaaca 12779  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12778 acactagtttgggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 12719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 14200 - 14444
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  |||| ||||||||  ||||||     
T  14200 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacccagaacaacattagttg 14299  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||||||  | | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  14300 gggagttggcttgaactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 14399  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  14400 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgagacctaatgatg 14444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 170
Target Start/End: Original strand, 3536 - 3685
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||   |||||     
T  3536 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggatcagattgaacccagaacaacactagtta 3635  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3636 gggagatgagtggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 3685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 3129 - 3005
Alignment:
Q  47 tgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggc 146  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  |||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3129 tgagtgcctgatcatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacccagaacaacgttagtttgggaattgagtggtactcgccatggc 3030  T
Q  147 gagtaagtactctcgcctcgcgagt 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  3029 gagtaagaactctcgcctcgcgagt 3005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 29867 - 30111
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||  ||| ||     
T  29867 ctttttagttggaccttgagtgccattgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattatttg 29966  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  29967 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 30066  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  30067 tttgatcaagagtgaacccctaaatggtaatgagacctaatgatg 30111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 91
Target Start/End: Original strand, 41863 - 41933
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtagga 91  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41863 ctttttagttggaccttgagtgccattgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagga 41933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 242503 - 242259
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||  ||||  |||||||  ||||||     
T  242503 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattgaacctagaacaacattagttg 242404  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||  || | |  |||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  242403 ggaagttggcttgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 242304  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  242303 tttgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatg 242259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 46 - 265
Target Start/End: Original strand, 58103 - 58322
Alignment:
Q  46 ttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatgg 145  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||  |||||| || |||||  | |||||||||||||    
T  58103 ttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaacattagttgggaagttggcttgtactcgccatgg 58202  T
Q  146 cgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaact 245  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| ||   |||  || | |  |||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |    
T  58203 cgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgctttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgttttgatcaagagtgaacccctaatt 58302  T
Q  246 ggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||| ||||| |||||    
T  58303 ggtaatgaaacctaatgatg 58322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 78671 - 78511
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgta-ggatcagagggaactcagaac 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||   |||  | || ||||||    
T  78671 gtgtttcgacctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggattgaatgtagggcaaagattggacccagaac 78572  T
Q  110 aagcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    ||  |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  78571 aactttagtttgggaaatgtttggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 78511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 3218 - 3069
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||    || |||||||| ||||||||    
T  3218 ctttttagttggaccttgagtgcccttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattagacccagaacaaccttagttt 3119  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |||| |||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3118 gggaattgtttggtacttgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 3069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 9786 - 9542
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||  ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  |||| ||||||||  ||||||     
T  9786 ctttttagttttaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacccagaacaacattagttg 9687  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||||||    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  9686 gggagttggcctgtactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 9587  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
     |||||||||| |||| ||||   ||||||||||||||| |||||    
T  9586 tttgatcaagagtgaatccctttatggtaatgagacctaatgatg 9542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 12900 - 12741
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||  | || ||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||  | || |||||||    
T  12900 gtgtttcgacctttttagttagaccttgagtgcctttgagtgtctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggacaagattggacccagaaca 12801  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |  ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12800 actttagtttgggaattgtttggtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 12741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 265
Target Start/End: Original strand, 5459 - 5702
Alignment:
Q  22 tttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagtttg 121  Q
    |||||||||| ||||||  | || |||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||  ||||  | |||||  |||| |||    
T  5459 tttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctaaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggataagattgaacctaaaacaacattaggttg 5558  T
Q  122 ggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttg 221  Q
    | | |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || | |||  || | |   ||  |||||||||||||||| ||||||| |     
T  5559 gaacttgacttgtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcacgagcactaccagattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgcgtcgcacgtt 5658  T
Q  222 ttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  5659 ttgatcatgagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatg 5702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 37153 - 36916
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||   |||  |||| |||||||   |||| ||    
T  37153 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtagggcaagattgaacccagaacagcattagctt 37054  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | |||| | ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  37053 ggaacttgacttgtactcgccttggcgagtaggaactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgccttgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcacgt 36954  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
     |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  36953 tttgatcaagagtgaacccctaa-tggtaatgagaccta 36916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 10623 - 10379
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    |||||||| || ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  |||| ||||||||  ||||||     
T  10623 ctttttagatggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacccagaacaacattagttg 10524  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||||||  | | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||  || | |   ||  |||||||||||||||||||| ||| |    
T  10523 gggagttggcttgaactcgccatggcgagtagatactctcgcctcgcgagcacttccagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcacacgt 10424  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
     |||||||||| |||  ||||   ||||||||||||||| |||||    
T  10423 tttgatcaagagtgagtccctttatggtaatgagacctaatgatg 10379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 24635 - 24879
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||  ||||  |||| ||  ||||||     
T  24635 ctttttagttggaccttgagtaccattgagtgcctgaacatacctagtaatgattgggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaataacattagttg 24734  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    ||||||||  | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||    ||  || | |   ||  |||||||||||||||||||||||  |    
T  24735 gggagttggcttgtactcgccatggtgagtaggtactctcgcctcgcgggcacttctagattggagtgcattgagtgtttgtgcgatctgtgtcgcatgt 24834  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| || || ||||| |||||    
T  24835 gttgatcaagagtgaacccctaattggcaacgaaacctaatgatg 24879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 91
Target Start/End: Original strand, 19792 - 19862
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtagga 91  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  19792 ctttttagttggaccttgagtgccattgagtgcctgaacatacctagtaatgattgggaatgaatgtagga 19862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 61266 - 61180
Alignment:
Q  7 tttcgtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatc 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  61266 tttcgtgtttcgacctttttagttgaatcttgtatgcctttgagtacctgaacttacctagtattgattaggaatgaatgtaggatc 61180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 170
Target Start/End: Original strand, 8537 - 8686
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| |||||   | || |||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| ||||||||  |||| ||    
T  8537 ctttttagttggaccttaagtgcctttgagtgcgtgaacatacctagtaatgattagggatgaatgtaggataagattgaacccagaacaacattaggtt 8636  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    || | |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8637 ggaacttgacttgtactcgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgag 8686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 74452 - 74293
Alignment:
Q  11 gtgtttcgacctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaaca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || || | | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||    || |||||||    
T  74452 gtgtttcgacctttttagttggaccttgaatgccttagtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtagggcaagattagacccagaaca 74353  T
Q  111 agcttagtttgggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |  ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  74352 actttagtttgggaattgtttagtactcgccatggcgagcaagaaccctcgcctcgcgag 74293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0553 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0553
Description:

Target: scaffold0553; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 9235 - 8998
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  9235 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 9136  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  9135 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 9036  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  9035 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaacct 8998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 99 - 259
Target Start/End: Original strand, 32050 - 32209
Alignment:
Q  99 gaactcagaacaagcttagtttgggag-ttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtg 197  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |    ||| ||| | || ||| ||||    
T  32050 gaacccagaacaaccttagtt-gggagattgagtggtacttgccatggcgagtaagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagtt-tttgtgtg 32147  T
Q  198 tttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagaccta 259  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||    
T  32148 tttgtgcgatctgtgtcgcaccatttgatcaagagtggacccctaattggtaatgaaaccta 32209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Original strand, 3738 - 3975
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || || ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| | |||||   ||  |||| || |||||  ||||||     
T  3738 ctttttagttggaccttgagtgcctttaagtgcctaaacatacctagagatgattaggaatgattttaggacaggattgaacccaaaacaacattagttg 3837  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcactt 220  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  3838 ggaatttgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcacct 3937  T
Q  221 gttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  3938 tttgatcaggagtgaacccctaattggtaatgaaacct 3975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 560 - 411
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||   ||| |||||||   |||||||    
T  560 ctttttagttggaccttgagtgcctttgagtgcctgaacatacctagtaatgattaggtatgaatgtaggattagattaaacccagaacatcattagttt 461  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    || | |||  | ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  460 ggaacttgtcttgtactcgccatggcgagtaagaattctcgcctcacgag 411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 127 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22544 - 22413
Alignment:
Q  127 tgagtggtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgagtacaatcaggatgaacttgtttatgtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    ||| ||| |  |||||  ||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  22544 tgagtggtactcgccatggcgagtgagaactctcgcctcgcgagcaagtccagaatgtagctgtttgagtggttgtgcgatctgtgtcgcaccttttgat 22445  T
Q  227 caagaatgaacccctaactggtaatgagacct 258  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||| ||||    
T  22444 caagagtgaacccctatttggtaatgaaacct 22413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 265
Target Start/End: Original strand, 19411 - 19481
Alignment:
Q  195 gtgtttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  19411 gtgtttgtgcgatctgcgtcgcacgtattgatcaagagtgaacccctaattggtaatgaaacctaatgatg 19481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 141
Target Start/End: Original strand, 17392 - 17512
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggatcagagggaactcagaacaagcttagttt 120  Q
    ||||||||||| ||||||  | || ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||  ||||||   |||||||    
T  17392 ctttttagttggaccttgagtgccattgtgtgcctgaacatacctagtaatgattaggaatgaatgtaggacaagattgaacctagaacaccattagttt 17491  T
Q  121 gggagttgagtggtactcgcc 141  Q
    || | |||| |||||||||||    
T  17492 ggaaattgactggtactcgcc 17512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Original strand, 7942 - 8013
Alignment:
Q  21 ctttttagttgaaccttgtatacccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    ||||| |||||||||||  || || |||||||||||| |||  ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  7942 cttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggat 8013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 265
Target Start/End: Original strand, 14831 - 14897
Alignment:
Q  199 ttgtgcgatctgtgtcgcacttgttgatcaagaatgaacccctaactggtaatgagacctagtgatg 265  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||    ||||||||||||||| |||||    
T  14831 ttgtgcgatctgtgtcgcacgtttggatcaagagtgaacccccttatggtaatgagacctaatgatg 14897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 4089 - 4052
Alignment:
Q  133 gtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  4089 gtactcgccatggcgagtaaatgctctcgcctcgcgag 4052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 8520 - 8483
Alignment:
Q  133 gtactcgccatggcgagtaagtactctcgcctcgcgag 170  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  8520 gtactcgccatggcgagtaaatgctctcgcctcgcgag 8483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 478 - 430
Alignment:
Q  44 ccttgagtgcctgagcatacctagtattgattaggaatgaatgtaggat 92  Q
    |||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  478 ccttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggat 430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University