View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6708_low_7 (Length: 511)

Name: NF6708_low_7
Description: NF6708
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6708_low_7
NF6708_low_7
[»] chr3 (68 HSPs)
chr3 (16-511)||(16741975-16742470)
chr3 (20-511)||(30138183-30138674)
chr3 (20-511)||(30147734-30148225)
chr3 (16-511)||(13966616-13967107)
chr3 (16-511)||(8273671-8274166)
chr3 (25-511)||(16257526-16258012)
chr3 (93-511)||(15610554-15610971)
chr3 (19-511)||(6152125-6152615)
chr3 (40-511)||(17193491-17193962)
chr3 (202-511)||(12792700-12793009)
chr3 (38-511)||(6711683-6712154)
chr3 (16-432)||(18749038-18749454)
chr3 (72-511)||(15095434-15095873)
chr3 (30-171)||(266907-267048)
chr3 (50-282)||(10419535-10419767)
chr3 (120-269)||(17490317-17490466)
chr3 (50-255)||(14087080-14087285)
chr3 (50-278)||(44777654-44777882)
chr3 (50-261)||(18133857-18134068)
chr3 (20-98)||(15577127-15577205)
chr3 (50-278)||(4678845-4679073)
chr3 (50-278)||(8758576-8758804)
chr3 (50-278)||(41177929-41178157)
chr3 (122-269)||(15248616-15248763)
chr3 (50-283)||(16835999-16836232)
chr3 (50-278)||(13942431-13942659)
chr3 (50-282)||(17493037-17493269)
chr3 (50-269)||(9523116-9523335)
chr3 (191-269)||(15209429-15209507)
chr3 (120-255)||(13971637-13971772)
chr3 (50-261)||(14574330-14574541)
chr3 (196-269)||(14580456-14580529)
chr3 (69-170)||(16491794-16491895)
chr3 (434-511)||(18750735-18750812)
chr3 (120-261)||(47124421-47124562)
chr3 (50-282)||(12360032-12360264)
chr3 (50-170)||(16371810-16371930)
chr3 (50-269)||(12498645-12498864)
chr3 (196-283)||(16380417-16380504)
chr3 (215-269)||(5424444-5424498)
chr3 (215-269)||(10006162-10006216)
chr3 (215-269)||(10906772-10906826)
chr3 (120-170)||(15062211-15062261)
chr3 (120-282)||(15228126-15228288)
chr3 (215-269)||(15724448-15724502)
chr3 (215-269)||(16411796-16411850)
chr3 (215-269)||(16806440-16806494)
chr3 (215-269)||(26791913-26791967)
chr3 (120-261)||(28754795-28754936)
chr3 (50-261)||(11303284-11303495)
chr3 (196-264)||(15015275-15015343)
chr3 (221-269)||(15588906-15588954)
chr3 (221-269)||(16636341-16636389)
chr3 (221-269)||(20061568-20061616)
chr3 (221-269)||(43163665-43163713)
chr3 (221-269)||(48426015-48426063)
chr3 (215-269)||(13253252-13253306)
chr3 (215-269)||(14126108-14126162)
chr3 (215-269)||(15339831-15339885)
chr3 (215-269)||(15347759-15347813)
chr3 (215-269)||(15402031-15402085)
chr3 (196-282)||(31694676-31694762)
chr3 (120-269)||(6601203-6601352)
chr3 (120-269)||(16692631-16692780)
chr3 (71-260)||(31939331-31939520)
chr3 (217-269)||(16371976-16372028)
chr3 (221-269)||(16756099-16756147)
chr3 (221-269)||(53384532-53384580)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (20-511)||(2911-3402)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (20-511)||(24173-24664)
[»] scaffold0076 (3 HSPs)
scaffold0076 (20-511)||(41037-41528)
scaffold0076 (50-255)||(32969-33174)
scaffold0076 (56-282)||(56165-56391)
[»] chr7 (49 HSPs)
chr7 (20-511)||(27106816-27107307)
chr7 (20-511)||(7824637-7825128)
chr7 (16-511)||(15364673-15365168)
chr7 (16-511)||(45147285-45147780)
chr7 (16-511)||(17924384-17924879)
chr7 (16-511)||(14937080-14937575)
chr7 (16-507)||(4440661-4441152)
chr7 (16-511)||(13455480-13455975)
chr7 (45-511)||(21673575-21674041)
chr7 (16-511)||(13353883-13354377)
chr7 (35-511)||(17144303-17144778)
chr7 (38-511)||(23642203-23642673)
chr7 (404-511)||(27171402-27171509)
chr7 (191-269)||(14040603-14040681)
chr7 (191-269)||(14350633-14350711)
chr7 (50-283)||(13666305-13666538)
chr7 (50-282)||(40417-40649)
chr7 (50-282)||(19147979-19148211)
chr7 (50-282)||(20747378-20747610)
chr7 (50-269)||(11771525-11771744)
chr7 (50-279)||(18053205-18053434)
chr7 (50-278)||(23505123-23505351)
chr7 (50-255)||(19613443-19613648)
chr7 (190-266)||(321324-321400)
chr7 (191-269)||(15625460-15625538)
chr7 (120-269)||(15153941-15154090)
chr7 (56-261)||(15341205-15341410)
chr7 (120-261)||(49153139-49153280)
chr7 (62-282)||(14263493-14263713)
chr7 (120-269)||(11236497-11236646)
chr7 (50-283)||(14130641-14130874)
chr7 (50-283)||(14434459-14434692)
chr7 (215-269)||(8708537-8708591)
chr7 (215-269)||(9596989-9597043)
chr7 (215-269)||(10871927-10871981)
chr7 (215-269)||(13686996-13687050)
chr7 (215-269)||(14333328-14333382)
chr7 (196-262)||(15204532-15204598)
chr7 (215-269)||(44790635-44790689)
chr7 (221-269)||(8199566-8199614)
chr7 (221-269)||(18551042-18551090)
chr7 (196-271)||(21662874-21662949)
chr7 (196-282)||(656-742)
chr7 (50-100)||(6414279-6414329)
chr7 (215-269)||(18178674-18178728)
chr7 (215-269)||(23202897-23202951)
chr7 (215-269)||(23509024-23509078)
chr7 (120-176)||(12457478-12457534)
chr7 (193-261)||(12688411-12688479)
[»] chr6 (52 HSPs)
chr6 (20-511)||(16381551-16382042)
chr6 (16-511)||(23996856-23997351)
chr6 (20-511)||(1647992-1648483)
chr6 (16-511)||(16233636-16234131)
chr6 (28-511)||(14624535-14625018)
chr6 (16-511)||(18837086-18837581)
chr6 (16-511)||(18572259-18572754)
chr6 (16-511)||(16098658-16099153)
chr6 (16-511)||(23026894-23027389)
chr6 (16-511)||(21927813-21928308)
chr6 (16-408)||(15077647-15078039)
chr6 (153-511)||(35275264-35275622)
chr6 (347-511)||(16649147-16649311)
chr6 (50-282)||(15459978-15460210)
chr6 (398-511)||(14129459-14129572)
chr6 (50-283)||(14380873-14381106)
chr6 (120-269)||(5838639-5838788)
chr6 (120-269)||(20636721-20636870)
chr6 (50-278)||(28282224-28282452)
chr6 (120-269)||(22078110-22078259)
chr6 (120-269)||(22761875-22762024)
chr6 (120-269)||(25609281-25609430)
chr6 (59-261)||(19435653-19435855)
chr6 (196-269)||(18197145-18197218)
chr6 (56-261)||(19879946-19880151)
chr6 (56-261)||(34645014-34645219)
chr6 (50-269)||(19865329-19865548)
chr6 (128-282)||(19488679-19488833)
chr6 (191-269)||(23079252-23079330)
chr6 (120-269)||(2874223-2874372)
chr6 (120-269)||(16962865-16963014)
chr6 (120-269)||(18407362-18407511)
chr6 (200-269)||(18966712-18966781)
chr6 (191-255)||(15896877-15896941)
chr6 (50-261)||(18795332-18795543)
chr6 (50-269)||(27566400-27566619)
chr6 (215-269)||(24312588-24312642)
chr6 (215-269)||(29591340-29591394)
chr6 (120-269)||(27188148-27188297)
chr6 (120-269)||(27260943-27261092)
chr6 (120-168)||(27330954-27331002)
chr6 (120-168)||(27391694-27391742)
chr6 (215-269)||(16626137-16626191)
chr6 (50-100)||(17416128-17416178)
chr6 (191-269)||(18436392-18436470)
chr6 (215-269)||(25113359-25113413)
chr6 (212-269)||(1542504-1542561)
chr6 (120-261)||(10468277-10468418)
chr6 (212-269)||(22434673-22434730)
chr6 (212-269)||(22443071-22443128)
chr6 (120-269)||(28262617-28262766)
chr6 (120-269)||(28341366-28341515)
[»] chr1 (28 HSPs)
chr1 (20-511)||(20830497-20830988)
chr1 (16-511)||(22134662-22135157)
chr1 (16-230)||(21201677-21201889)
chr1 (311-473)||(21201484-21201645)
chr1 (50-252)||(19855098-19855300)
chr1 (50-261)||(20835243-20835454)
chr1 (128-269)||(20139701-20139842)
chr1 (120-269)||(22361591-22361740)
chr1 (120-269)||(50619591-50619740)
chr1 (185-269)||(16373457-16373541)
chr1 (50-255)||(20856121-20856327)
chr1 (50-283)||(20939396-20939629)
chr1 (120-269)||(21749804-21749953)
chr1 (50-261)||(31539352-31539563)
chr1 (50-261)||(37677873-37678084)
chr1 (215-269)||(16078003-16078057)
chr1 (215-269)||(21837908-21837962)
chr1 (120-269)||(20250665-20250813)
chr1 (212-269)||(41353009-41353066)
chr1 (221-269)||(16349946-16349994)
chr1 (50-282)||(24098937-24099169)
chr1 (191-262)||(19760227-19760298)
chr1 (191-269)||(22109956-22110034)
chr1 (191-269)||(22113805-22113883)
chr1 (50-100)||(22432632-22432682)
chr1 (215-269)||(33390376-33390430)
chr1 (215-269)||(51332840-51332894)
chr1 (221-269)||(21025137-21025185)
[»] chr5 (47 HSPs)
chr5 (20-511)||(21936403-21936894)
chr5 (20-511)||(24581872-24582363)
chr5 (16-511)||(27011742-27012237)
chr5 (16-456)||(23504100-23504540)
chr5 (38-511)||(25243566-25244038)
chr5 (38-511)||(25307718-25308190)
chr5 (38-278)||(19566137-19566377)
chr5 (56-282)||(20822151-20822377)
chr5 (50-282)||(20774451-20774683)
chr5 (50-282)||(28894386-28894618)
chr5 (50-282)||(28915857-28916089)
chr5 (50-282)||(28923212-28923444)
chr5 (50-255)||(22462644-22462849)
chr5 (120-269)||(25423969-25424117)
chr5 (50-261)||(17268799-17269010)
chr5 (120-255)||(21680249-21680384)
chr5 (120-282)||(21831205-21831367)
chr5 (50-283)||(22235363-22235596)
chr5 (120-261)||(37542846-37542987)
chr5 (120-282)||(21563417-21563579)
chr5 (120-269)||(26738184-26738333)
chr5 (122-282)||(21496837-21496997)
chr5 (50-269)||(23440920-23441139)
chr5 (212-269)||(37290953-37291010)
chr5 (196-264)||(20467559-20467627)
chr5 (50-262)||(21890223-21890435)
chr5 (215-269)||(14999196-14999250)
chr5 (215-269)||(18776645-18776699)
chr5 (215-269)||(19770835-19770889)
chr5 (191-269)||(21338754-21338832)
chr5 (215-269)||(22135543-22135597)
chr5 (215-269)||(27611229-27611283)
chr5 (215-269)||(27684857-27684911)
chr5 (215-269)||(29475530-29475584)
chr5 (215-269)||(41771717-41771771)
chr5 (431-507)||(16064995-16065071)
chr5 (221-269)||(16357383-16357431)
chr5 (120-176)||(20343044-20343100)
chr5 (50-170)||(23574447-23574567)
chr5 (221-269)||(27519288-27519336)
chr5 (221-269)||(34567375-34567423)
chr5 (191-266)||(23472080-23472155)
chr5 (120-170)||(18776550-18776600)
chr5 (215-269)||(22332344-22332398)
chr5 (215-269)||(40709655-40709709)
chr5 (212-269)||(21408010-21408067)
chr5 (217-269)||(23574614-23574666)
[»] chr4 (37 HSPs)
chr4 (16-511)||(15292191-15292686)
chr4 (16-511)||(9291579-9292074)
chr4 (16-511)||(14998060-14998555)
chr4 (16-511)||(13248389-13248884)
chr4 (56-511)||(12341898-12342352)
chr4 (68-261)||(16028907-16029100)
chr4 (50-282)||(27901164-27901396)
chr4 (68-168)||(38811703-38811803)
chr4 (50-269)||(1639440-1639659)
chr4 (50-261)||(1648560-1648771)
chr4 (50-269)||(15078413-15078632)
chr4 (50-282)||(15414288-15414520)
chr4 (120-267)||(7091280-7091427)
chr4 (50-261)||(15246702-15246913)
chr4 (120-261)||(14160318-14160459)
chr4 (120-268)||(14850382-14850530)
chr4 (212-269)||(14302993-14303050)
chr4 (120-269)||(15146900-15147049)
chr4 (215-269)||(8387355-8387409)
chr4 (120-282)||(8706766-8706928)
chr4 (215-269)||(27712279-27712333)
chr4 (215-268)||(8052639-8052692)
chr4 (212-269)||(16354460-16354517)
chr4 (221-269)||(12477549-12477597)
chr4 (50-170)||(14691680-14691800)
chr4 (221-269)||(18226461-18226509)
chr4 (56-176)||(20891766-20891886)
chr4 (221-269)||(29038419-29038467)
chr4 (155-282)||(18549321-18549448)
chr4 (191-269)||(14681486-14681564)
chr4 (196-282)||(15320074-15320160)
chr4 (215-269)||(18298148-18298202)
chr4 (215-269)||(19777808-19777862)
chr4 (215-269)||(23956690-23956744)
chr4 (120-169)||(12524524-12524573)
chr4 (120-261)||(29452820-29452961)
chr4 (120-176)||(33223771-33223827)
[»] chr2 (49 HSPs)
chr2 (20-511)||(24830761-24831251)
chr2 (48-511)||(12639806-12640269)
chr2 (16-511)||(22761142-22761637)
chr2 (16-511)||(24569241-24569736)
chr2 (16-446)||(23816681-23817111)
chr2 (16-333)||(22276653-22276970)
chr2 (32-388)||(21905865-21906221)
chr2 (330-511)||(22278794-22278975)
chr2 (16-239)||(25129022-25129244)
chr2 (278-511)||(25129246-25129479)
chr2 (120-269)||(23066870-23067019)
chr2 (50-255)||(27210001-27210206)
chr2 (50-261)||(23294344-23294555)
chr2 (124-269)||(21890533-21890678)
chr2 (50-278)||(27788150-27788378)
chr2 (50-278)||(12574762-12574990)
chr2 (120-255)||(27364908-27365043)
chr2 (56-282)||(19651854-19652080)
chr2 (50-176)||(24642151-24642277)
chr2 (120-278)||(45529990-45530148)
chr2 (120-261)||(1064230-1064371)
chr2 (50-283)||(23277185-23277418)
chr2 (50-261)||(11357697-11357908)
chr2 (215-269)||(22324671-22324725)
chr2 (120-261)||(31831137-31831278)
chr2 (50-170)||(23107644-23107764)
chr2 (215-270)||(24262944-24262999)
chr2 (215-269)||(16925934-16925988)
chr2 (215-269)||(16999574-16999628)
chr2 (215-269)||(21144856-21144910)
chr2 (215-269)||(24710608-24710662)
chr2 (215-269)||(41608200-41608254)
chr2 (215-269)||(44385384-44385438)
chr2 (196-269)||(24819501-24819574)
chr2 (221-269)||(9610716-9610764)
chr2 (221-269)||(16923469-16923517)
chr2 (221-269)||(16982732-16982780)
chr2 (221-269)||(17064297-17064345)
chr2 (221-269)||(17067955-17068003)
chr2 (221-269)||(27218596-27218644)
chr2 (215-269)||(21325081-21325135)
chr2 (120-170)||(22756379-22756429)
chr2 (215-269)||(27371843-27371897)
chr2 (120-262)||(30210739-30210880)
chr2 (212-269)||(24676060-24676117)
chr2 (221-269)||(10869430-10869478)
chr2 (221-269)||(22756280-22756328)
chr2 (124-168)||(24707398-24707442)
chr2 (120-168)||(41608301-41608349)
[»] chr8 (57 HSPs)
chr8 (16-511)||(21849813-21850308)
chr8 (20-511)||(16876571-16877062)
chr8 (16-511)||(21195978-21196473)
chr8 (16-511)||(20651809-20652304)
chr8 (16-511)||(23156488-23156983)
chr8 (16-511)||(22316001-22316496)
chr8 (240-508)||(23901221-23901489)
chr8 (51-355)||(25283201-25283505)
chr8 (17-192)||(22983244-22983419)
chr8 (47-282)||(25282971-25283206)
chr8 (38-231)||(22283836-22284029)
chr8 (47-259)||(22366393-22366605)
chr8 (311-511)||(22284086-22284286)
chr8 (16-149)||(23901085-23901218)
chr8 (382-480)||(22435465-22435563)
chr8 (120-267)||(21043359-21043506)
chr8 (120-269)||(23650955-23651104)
chr8 (50-278)||(31570551-31570779)
chr8 (120-269)||(21921454-21921603)
chr8 (120-269)||(22377172-22377321)
chr8 (120-269)||(22383347-22383496)
chr8 (120-269)||(22988110-22988259)
chr8 (50-282)||(19868537-19868769)
chr8 (50-282)||(31416179-31416411)
chr8 (120-267)||(21393585-21393732)
chr8 (120-267)||(21788079-21788226)
chr8 (56-282)||(1267088-1267314)
chr8 (50-282)||(21841261-21841493)
chr8 (51-282)||(19852256-19852487)
chr8 (51-282)||(19858292-19858523)
chr8 (50-269)||(19978811-19979030)
chr8 (50-269)||(22248135-22248354)
chr8 (191-262)||(23949904-23949975)
chr8 (191-269)||(20395850-20395928)
chr8 (120-261)||(803399-803540)
chr8 (120-269)||(22040773-22040922)
chr8 (120-261)||(23655841-23655982)
chr8 (47-107)||(22365694-22365754)
chr8 (196-283)||(22051853-22051940)
chr8 (120-262)||(14566056-14566198)
chr8 (215-269)||(15534392-15534446)
chr8 (215-269)||(18857586-18857640)
chr8 (212-282)||(20009625-20009695)
chr8 (120-282)||(20389013-20389175)
chr8 (215-269)||(22128676-22128730)
chr8 (215-269)||(30312862-30312916)
chr8 (212-269)||(19483782-19483839)
chr8 (221-269)||(16407763-16407811)
chr8 (221-269)||(19113705-19113753)
chr8 (50-278)||(22371784-22372012)
chr8 (215-269)||(17673741-17673795)
chr8 (50-100)||(20975538-20975588)
chr8 (120-170)||(21166355-21166405)
chr8 (120-170)||(21251855-21251905)
chr8 (215-269)||(22132759-22132813)
chr8 (221-269)||(21166256-21166304)
chr8 (221-269)||(32601159-32601207)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (16-511)||(5950-6444)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (16-511)||(13683-14178)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (20-511)||(6844-7336)
scaffold0124 (50-168)||(13007-13125)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (16-511)||(8897-9392)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (16-511)||(18822-19317)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (16-508)||(3317-3811)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (18-511)||(239-732)
[»] scaffold0077 (4 HSPs)
scaffold0077 (16-511)||(27302-27797)
scaffold0077 (302-509)||(25920-26127)
scaffold0077 (309-511)||(16600-16802)
scaffold0077 (50-261)||(20727-20938)
[»] scaffold0235 (3 HSPs)
scaffold0235 (16-486)||(26581-27051)
scaffold0235 (50-283)||(10721-10954)
scaffold0235 (50-283)||(20935-21168)
[»] scaffold0011 (4 HSPs)
scaffold0011 (16-511)||(180699-181194)
scaffold0011 (50-283)||(194968-195201)
scaffold0011 (191-269)||(25811-25889)
scaffold0011 (50-261)||(149379-149590)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (16-511)||(105609-106104)
scaffold0028 (50-255)||(49806-50011)
scaffold0028 (197-262)||(901-966)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (16-511)||(10069-10564)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (16-511)||(15431-15917)
scaffold0132 (16-111)||(44313-44408)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (16-511)||(24738-25232)
scaffold0021 (16-511)||(71964-72459)
scaffold0021 (16-511)||(32449-32944)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (16-511)||(2988-3475)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (16-511)||(7926-8421)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (16-511)||(460-955)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (16-511)||(8040-8535)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (16-511)||(265-752)
scaffold0243 (191-269)||(26222-26300)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (16-511)||(7944-8442)
[»] scaffold0310 (2 HSPs)
scaffold0310 (16-378)||(13906-14268)
scaffold0310 (452-511)||(13850-13909)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (147-511)||(23082-23446)
scaffold0120 (128-269)||(6910-7048)
scaffold0120 (120-269)||(12937-13086)
scaffold0120 (50-168)||(903-1021)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (16-353)||(3933-4270)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (16-272)||(46929-47185)
[»] scaffold0589 (2 HSPs)
scaffold0589 (18-299)||(9763-10044)
scaffold0589 (333-511)||(10041-10219)
[»] scaffold0023 (6 HSPs)
scaffold0023 (270-511)||(54977-55218)
scaffold0023 (16-231)||(55216-55431)
scaffold0023 (185-269)||(3735-3819)
scaffold0023 (50-170)||(28749-28869)
scaffold0023 (196-269)||(59710-59783)
scaffold0023 (221-269)||(28650-28698)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (20-511)||(9103-9594)
[»] scaffold0387 (2 HSPs)
scaffold0387 (193-511)||(15028-15338)
scaffold0387 (16-131)||(14913-15028)
[»] scaffold0008 (4 HSPs)
scaffold0008 (310-511)||(133525-133726)
scaffold0008 (286-511)||(24871-25096)
scaffold0008 (16-230)||(24655-24869)
scaffold0008 (38-208)||(232352-232522)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (16-230)||(424-638)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (16-219)||(382-585)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (89-484)||(75406-75801)
scaffold0058 (50-261)||(19929-20140)
[»] scaffold0091 (3 HSPs)
scaffold0091 (16-162)||(45272-45418)
scaffold0091 (263-411)||(45421-45569)
scaffold0091 (473-511)||(45577-45615)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (363-511)||(25813-25961)
[»] scaffold0081 (4 HSPs)
scaffold0081 (392-511)||(157-276)
scaffold0081 (120-170)||(19481-19531)
scaffold0081 (120-170)||(34905-34955)
scaffold0081 (224-269)||(50415-50460)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (50-269)||(9779-9998)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (56-283)||(95266-95493)
scaffold0029 (215-269)||(109089-109143)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (50-255)||(692-897)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (120-269)||(575-724)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (50-282)||(51128-51360)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (120-269)||(29824-29973)
scaffold0026 (128-264)||(28944-29080)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (120-269)||(229922-230071)
scaffold0012 (191-269)||(218695-218773)
scaffold0012 (16-72)||(32472-32528)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (50-283)||(261117-261350)
scaffold0005 (120-269)||(278108-278257)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (50-282)||(68179-68411)
scaffold0034 (50-283)||(4217-4450)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (56-282)||(1237-1463)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (56-282)||(41732-41958)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (120-269)||(1555-1704)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (50-255)||(526-731)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (50-267)||(6858-7075)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (120-269)||(16534-16683)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (50-283)||(19658-19891)
scaffold0090 (50-283)||(23820-24053)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (50-283)||(46663-46896)
scaffold0010 (191-269)||(2864-2942)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (50-282)||(27333-27565)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (50-269)||(6823-7042)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (120-267)||(7611-7758)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (50-261)||(11343-11554)
scaffold0298 (50-261)||(15113-15324)
scaffold0298 (56-282)||(20798-21024)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (120-255)||(390492-390627)
scaffold0001 (191-252)||(89740-89801)
scaffold0001 (191-252)||(90418-90479)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (191-269)||(15827-15905)
scaffold0040 (191-269)||(112766-112844)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (191-269)||(116183-116261)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (120-269)||(3253-3402)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (50-255)||(6993-7198)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (58-282)||(2620-2844)
scaffold0222 (50-261)||(7869-8080)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (50-282)||(414-646)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (50-250)||(100849-101049)
scaffold0020 (50-269)||(181008-181227)
[»] scaffold1710 (1 HSPs)
scaffold1710 (50-261)||(673-884)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (50-269)||(4840-5059)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (198-269)||(4828-4899)
scaffold0270 (198-269)||(11958-12029)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (50-261)||(13585-13796)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (50-261)||(28034-28245)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (120-255)||(19633-19768)
[»] scaffold2094 (1 HSPs)
scaffold2094 (120-282)||(327-489)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (120-282)||(24337-24499)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (50-283)||(25129-25362)
[»] scaffold1646 (1 HSPs)
scaffold1646 (50-282)||(133-365)
[»] scaffold1602 (1 HSPs)
scaffold1602 (120-269)||(1345-1494)
[»] scaffold1061 (1 HSPs)
scaffold1061 (50-250)||(2397-2597)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (50-267)||(7181-7398)
scaffold0403 (120-261)||(3670-3811)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (50-283)||(6502-6735)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (50-283)||(57111-57344)
scaffold0053 (196-267)||(48314-48385)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (50-282)||(3560-3792)
scaffold0035 (50-282)||(12461-12693)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (197-269)||(1849-1921)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (50-170)||(14848-14968)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (122-269)||(4870-5017)
[»] scaffold0324 (2 HSPs)
scaffold0324 (120-267)||(19282-19429)
scaffold0324 (196-267)||(14491-14562)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (191-269)||(14357-14435)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (191-269)||(32031-32109)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (50-264)||(40042-40256)
scaffold0064 (50-170)||(28145-28265)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (191-269)||(102183-102261)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (50-283)||(6022-6255)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (196-269)||(17636-17709)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (196-269)||(18493-18566)
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (120-169)||(39389-39438)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (191-255)||(17269-17333)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (120-264)||(5309-5453)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (50-282)||(4717-4949)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (196-283)||(12050-12137)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (120-267)||(196758-196905)
scaffold0017 (221-269)||(19345-19393)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (50-261)||(323513-323724)
scaffold0004 (196-282)||(202733-202819)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (215-269)||(1388-1442)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (215-269)||(13442-13496)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (120-170)||(71-121)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (215-269)||(32851-32905)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (191-269)||(4090-4168)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (196-282)||(48471-48557)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (50-168)||(39199-39317)
scaffold0042 (212-268)||(39099-39155)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (196-269)||(1863-1936)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (198-279)||(11690-11771)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (196-261)||(2616-2681)
scaffold0476 (128-168)||(10204-10244)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (38-111)||(11423-11496)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (120-253)||(980-1113)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (191-268)||(8366-8443)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (45-102)||(3364-3421)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (212-269)||(25945-26002)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (196-269)||(11475-11548)
scaffold0018 (196-269)||(17667-17740)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (196-264)||(824-892)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (50-170)||(3003-3123)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (50-170)||(12303-12423)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (50-170)||(24307-24427)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (56-176)||(32690-32810)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (202-269)||(10294-10361)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (120-255)||(34067-34202)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (120-170)||(2346-2396)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (215-269)||(22841-22895)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (215-269)||(8371-8425)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (191-260)||(25006-25075)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (221-270)||(4630-4679)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (124-269)||(63309-63454)
[»] scaffold0719 (1 HSPs)
scaffold0719 (221-269)||(212-260)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (196-264)||(6319-6387)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (120-168)||(27140-27188)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (221-269)||(79772-79820)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 448; Significance: 0; HSPs: 68)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 448; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 16742470 - 16741975
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16742470 atcaaaacccttactagtcttaggcaacgctccaacaaaatccatagaaatgctattccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacctgac 16742371  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16742370 ggtctctgatgttcaatcttcgatttctgacaaaccaaacaagcataaacaaactcagcgatctccttcttcattccaagccaccaaaacaaccttttca 16742271  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16742270 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatttgcctcttaagctcaaacacatctggcacaca 16742171  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16742170 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaaatct 16742071  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16742070 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccattaggtgtcaactcactaaccaaactc 16741975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 511
Target Start/End: Original strand, 30138183 - 30138674
Alignment:
Q  20 aaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtc 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30138183 aaacccttactagtcttaggcaacgctccaacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtc 30138282  T
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30138283 tctgatgttcaatcttcgatttctgacaaaccaaacaagcataaacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 30138382  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacacaaact 319  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  30138383 ctgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatttgcctcttaagctcaaacacatccggcacacaaact 30138482  T
Q  320 cgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtcttcct 419  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  30138483 cgatcacgaaacatcaaaacaccagtctcacccaatctaaagtctccaccttttccttgattaaccaacgtcactcgattcacgagttccaaatcttcct 30138582  T
Q  420 tctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30138583 tctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 30138674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 511
Target Start/End: Original strand, 30147734 - 30148225
Alignment:
Q  20 aaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtc 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30147734 aaacccttactagtcttaggcaacgctccaacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtc 30147833  T
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30147834 tctgatgttcaatcttcgatttctgacaaaccaaacaagcataaacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 30147933  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacacaaact 319  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  30147934 ctgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatttgcctcttaagctcaaacacatccggcacacaaact 30148033  T
Q  320 cgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtcttcct 419  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  30148034 cgatcacgaaacatcaaaacaccagtctcacccaatctaaagtctccaccttttccttgattaaccaacgtcactcgattcacgagttccaaatcttcct 30148133  T
Q  420 tctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30148134 tctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 30148225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 423; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 13967107 - 13966616
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13967107 atcaaaacccttactagtcttaggcaacgctccaacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgat 13967008  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13967007 ggtctttgatgttcaatcttcgatttctgacaaaccaaacaagcataaacaaactcagcgatttccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 13966908  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13966907 aatcctgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatttgcctcttaagctcaaacacatctggcacaca 13966808  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||| |||    
T  13966807 aactcgatcccgaaacattaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcac----tccacgagttccaaatct 13966712  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13966711 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 13966616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 8274166 - 8273671
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  8274166 atcaaaacccttactagtcttaggcaatgctccaacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaagaatggttgcatcaaacccgac 8274067  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8274066 ggtctctgatgttcaatctttgatttctgacaaaccaagcaagaataaacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 8273967  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  8273966 aatcctgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatttgcctcttaagctcaaacacatctggcacata 8273867  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||    
T  8273866 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacatttaccttgattaaccaatgtcattcggtccacgagttccaaatct 8273767  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8273766 tccttctgacccttcttaatctcttctaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactgaccaaactc 8273671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 511
Target Start/End: Original strand, 16257526 - 16258012
Alignment:
Q  25 cttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctga 124  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16257526 cttactagtcttaggcaacgctccaacaaaatccatagaaatgttatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctga 16257625  T
Q  125 tgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgat 224  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16257626 tgatcaatcttcgatttctgacaaaccaaacaagcataaacaaactcagcggtctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgat 16257725  T
Q  225 acatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacacaaactcgatc 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  16257726 acatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttatatgaccttcgtccaaaatctgcctcttaagctcaagaacatctggtacacaaactcgatc 16257825  T
Q  325 acgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtcttccttctga 424  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16257826 acgaaacatcaagacactaatctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaaatcttccttctga 16257925  T
Q  425 ccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16257926 ccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcatcatacccaacctcacaccatccggtgtcaactcactaaccaaactc 16258012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 93 - 511
Target Start/End: Original strand, 15610554 - 15610971
Alignment:
Q  93 acaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattcc 192  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  15610554 acaacggttgcatcaaacccgatggtctctgatgttcaatcttcgatttctgacaaaccaaacaagcataaacagactcagcgatctccttcttcattcc 15610653  T
Q  193 aggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttc 292  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  15610654 aggccaccaaa-caaccttttcaaatcctgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatttgcctctta 15610752  T
Q  293 agctcaaacacatctggcacacaaactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtca 392  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15610753 agctcaaacacatccggcacacaaacttgatcacgaaacatcaaaacaccattctcacccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtca 15610852  T
Q  393 ctcggtccacgagttccaagtcttccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgt 492  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15610853 ctcggtccacgagttccaaatcttccttctgacccttcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatccggtgt 15610952  T
Q  493 caactcactaaccaaactc 511  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15610953 caactcactaaccaaactc 15610971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 6152615 - 6152125
Alignment:
Q  19 aaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggt 118  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6152615 aaaactcttactagtcttaggcaacgccccaacaaaatccatagagatactatcccacttccactcaagcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggt 6152516  T
Q  119 ctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaat 218  Q
    || |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6152515 ctttgatgttcaatcttcgacttctgacaaactaaacaaacataaacaaactcagcaatttccttcttcattccaggccaccaaaacaacctcttcaaat 6152416  T
Q  219 cttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacacaaac 318  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||    ||||||||||||||||    
T  6152415 cctgatacatcttagtttctcctggatgaatac-caaactactcctatgaccttcgtccaaaatctgtctcttaagctcagtagcatctggcacacaaac 6152317  T
Q  319 tcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtcttcc 418  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  6152316 tcga-cacgaaacatcaaaacatcattctcatccaatctaaagtctccacctttgccttgattaaccaacaccactcgatccacaagttccaagtcttcc 6152218  T
Q  419 ttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6152217 ttctgaccattcttgatctcttccaaaatattacttgtcagcttcaacattcctaacctcacaccatccggtgtcaactcactaaccaaactc 6152125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 40 - 511
Target Start/End: Original strand, 17193491 - 17193962
Alignment:
Q  40 caacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgat 139  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||     
T  17193491 caacgctccaacaaaatccatagagatactatcccacttccactctggcacaaacaacatttgcatcaaacccgatggtttctgatgttcaatcttcgac 17193590  T
Q  140 ttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctc 239  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  17193591 ttctgacaaatcaaacaagcataaacaaactctgcaatttccttgttcattccaagccaccaaaacaacctcttcaaattctgatacatcttagtcgctc 17193690  T
Q  240 ctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacacaaactcgatcacgaaacatcaaaac 339  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||  ||| |||||| |||||||||||||| ||| |||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17193691 ctggatgaatactcagattactcctgcgactttcgtccaaaatttgcctcttaagcccaagtacatccgacacacaaactcgatcacgaaacatcaaaac 17193790  T
Q  340 accattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtcttccttctgaccattcttgatctct 439  Q
    ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  17193791 accgttctcatccaatctgaaatctccacctttaccttgattaaccaacaccactcgatccacaagttccaaatcttccttctgatcattcttaatctct 17193890  T
Q  440 tccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17193891 tccaaaatattacttgtcagcttcaacatccctaacctcacaccatccggtgtcaactcactaaccaaactc 17193962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 202 - 511
Target Start/End: Original strand, 12792700 - 12793009
Alignment:
Q  202 aaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaac 301  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  12792700 aaacaatcttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatttgcctcttaagatcaaac 12792799  T
Q  302 acatctggcacacaaactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtcca 401  Q
    ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12792800 acataaggcacacaaactcgataacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtcca 12792899  T
Q  402 cgagttccaagtcttccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcact 501  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12792900 cgagttccaaatcttccttctgaccattcttgatctcttccaatatattgtttgtcaacatcaacatacccaacctcacaccagcaggtgtcaactcact 12792999  T
Q  502 aaccaaactc 511  Q
    ||||||||||    
T  12793000 aaccaaactc 12793009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 38 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 6712154 - 6711683
Alignment:
Q  38 ggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcg 137  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |    
T  6712154 ggcaacgctccaacaaagtccattgagatattatcccacttccactctggcacaaacaacaattgcatcaaacccgacgatttctgatgttcaatcttag 6712055  T
Q  138 atttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgc 237  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||     
T  6712054 acttctgacaaaccaaacaagcataaacaaattccgcgatctccttcttcattccaggccaccaaaacaacctcttcaaatcctgatacatcttagttgt 6711955  T
Q  238 tcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacacaaactcgatcacgaaacatcaaa 337  Q
    || |||||||||||||| |||||| || |||||||| || |||||  | ||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6711954 tcttggatgaatactcagactactcctgtgaccttcttccaaaatccgtctcttaagctcaagaacatctggtacacaaactcgatcacgaaacatcaaa 6711855  T
Q  338 acaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtcttccttctgaccattcttgatct 437  Q
    |||||  ||||||| ||| | || ||  |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  6711854 acacc--tctcatctaatatgaaatccacacctttaccttgattaaccaacaccactcgatccacaagttccaaatcttccttctgaccattcttaatct 6711757  T
Q  438 cttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  6711756 cttccaaaatattactcgtcagcttcaacattcctaacctcacaccctccggtgtcaactcactaaccgaactc 6711683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 432
Target Start/End: Original strand, 18749038 - 18749454
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||||||||  ||| || |||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  18749038 atcaaaacccttaacagtcttcggcaacgctccaaccaagtccatagagatactatctcatttccactctggcaaaaacaacggttgcatcaaaaccgac 18749137  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    ||| | || ||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  18749138 ggtttatgttgttcaatcttcgacttctaacaaaccaaacaagaataaacaaattccgcgatctccttcatcattccaggccactaaaacaacctcttca 18749237  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  18749238 aatcctgatacatcttagtcactcctagatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatctgtctcttaagctcaagcacatccggcacaca 18749337  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| ||| | || |||    
T  18749338 aactcgatcacgaaacattaaaacaccgttctcacccaatctgaagtctccacctttaccttggttaaccaacaccactcgatccacaagtcctaaatct 18749437  T
Q  416 tccttctgaccattctt 432  Q
    ||||||| | |||||||    
T  18749438 tccttctaaacattctt 18749454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 72 - 511
Target Start/End: Original strand, 15095434 - 15095873
Alignment:
Q  72 cccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactc 171  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15095434 cccacttccacgcaggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacgacttttgatgttcaatcttcgacttttgaaaaaccaaacaagcatacacaaactc 15095533  T
Q  172 agcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgacct 271  Q
     || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| || || |||  |||||| | ||||| ||||||  | ||||||    
T  15095534 tgctatatccttcttcattccaggccaccaaaacaacctctttaaatcctggtacattttcgtcgcttttggatggaaactcagactactcatgtgacct 15095633  T
Q  272 tcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacacaaactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctt 371  Q
    || || |||||  || |||| |||| ||  ||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||   |||  ||| ||    
T  15095634 tcttccaaaatccgcttcttaagcttaagtacattcggtacacaaactcgatcatgaaacatcaaaacatcattttcatccaatcttttgtcctcacgtt 15095733  T
Q  372 taccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtcttccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacc 471  Q
    | | ||||| ||| |||  ||  || || || |||| ||| || || |||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||    
T  15095734 ttctttgatcaacaaacaccaaacgatctacaagttacaaatcctctttctcaccattcttaatctcttccaaaatattactcgtcaactagaacattcc 15095833  T
Q  472 caacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    |||| ||||||||||    ||||||||||| |||||||||    
T  15095834 caacttcacaccatccaacgtcaactcacttaccaaactc 15095873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 267048 - 266907
Alignment:
Q  30 tagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttc 129  Q
    |||||||||| || ||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| | |   | || |||||    
T  267048 tagttttaggtaatgctccaacaaaattcatagaaatattatcccacttccactccggtacaaacaatggttgcatcaaacccaatgacttttggtgttc 266949  T
Q  130 aaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactc 171  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  266948 aatcttcgacttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactc 266907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 50 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 10419767 - 10419535
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || | |  |||||||  || ||| ||||  ||  |||||||||||||||| || || ||||||     
T  10419767 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtatatccaacggtgtcaacaatcccgcaggcttctgatgttcaaccttagacttttgacaag 10419668  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||||||||||   || |  |||||||||| || || ||||||||||||| | ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||    
T  10419667 tcaaacacgcatacacaaaccgcgcgacatccttcttcaatctagaccaccaaaacaacttcttcaagtcatgatacattttcgtagctcctggatgaat 10419568  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
    ||||||| ||||  |||||| ||| ||||||||    
T  10419567 actcaaattactcttatgactttcttctaaaat 10419535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 120 - 269
Target Start/End: Original strand, 17490317 - 17490466
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||  ||    |||| ||| | ||||||||||||| | || | |||    
T  17490317 tctgatgctcaaccttcgatttctgacaaatcaaacaagaatacacaaactaagcaacgtcgcgtttcaatccggaccaccaaaacaacttctttagatc 17490416  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
     ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17490417 atgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatgac 17490466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 255
Target Start/End: Original strand, 14087080 - 14087285
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||  ||| |||  || ||| || |  ||| |||||||||||||||| || ||||| |||     
T  14087080 acaaaatccatagaaatactatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaaccctgcaggtttctgatgttcaaccttagacttctggcaag 14087179  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||||||||| | |||||  ||   |||||  |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  14087180 tcaaacatgcatacacaaattgagcaacatcacgcttcaaaccaggccaccaaaacagctttttcaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatggat 14087279  T
Q  250 actcaa 255  Q
    ||||||    
T  14087280 actcaa 14087285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 50 - 278
Target Start/End: Original strand, 44777654 - 44777882
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||| |||  || ||| || |  ||  |||||||||||||||| || |||||||||     
T  44777654 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactctggtacatccaatggtgtcaacaatcctgcgggcttctgatgttcaaccttagacttctgacaag 44777753  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
      ||||| ||||||||||| | |||||  ||   |||||  |||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  44777754 ttaaacatgcatacacaaaatgagcaacatctcgcttcaacccagaccaccaaaacagctttttcaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaat 44777853  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtcta 278  Q
     || || |||||  |||||| ||| ||||    
T  44777854 gcttaagctactcttatgactttcctcta 44777882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 50 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 18134068 - 18133857
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||  || ||| || |  ||  ||| |||||||||||| || |||||||||     
T  18134068 acaaaatccattgaaatgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctaatgttcaaccttagacttctgacaag 18133969  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||||||||| | ||| |  ||   |||||  || | ||||||||||| | | |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18133968 tcaaacatgcatacacaaaatgagcgacgtcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgatacatctttgtagctcctggatgaat 18133869  T
Q  250 actcaaactact 261  Q
    ||| || |||||    
T  18133868 acttaagctact 18133857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 98
Target Start/End: Original strand, 15577127 - 15577205
Alignment:
Q  20 aaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacg 98  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15577127 aaacccttattagtcttaggcaacactccaacaaaatccatagaaatgttatcccatttccaatctggcacaaacaacg 15577205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 50 - 278
Target Start/End: Original strand, 4678845 - 4679073
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||  ||| |||  || ||| || |  ||| |||| ||||||||||| || |||||||||     
T  4678845 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaatcctgcaggtttctggtgttcaaccttagacttctgacaag 4678944  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
      ||||| ||||||||||| | |||||  ||   |||||  |||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  4678945 ttaaacatgcatacacaaaatgagcaacatctcgcttcaacccagaccaccaaaacagctttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaat 4679044  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtcta 278  Q
     || || |||||  |||||| ||| ||||    
T  4679045 gcttaagctactcttatgactttcctcta 4679073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 50 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 8758804 - 8758576
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||  ||| |||  || ||| || |  ||| |||| |||||||| || || |||||||||     
T  8758804 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaatcctgcaggtttctggtgttcaactttagacttctgacaag 8758705  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
      ||||| ||||||||||| | |||||  ||   |||||  |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  8758704 ttaaacatgcatacacaaaatgagcaacatctcgcttcaacccagaccaccaaaacaactttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaat 8758605  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtcta 278  Q
     || || |||||  |||||| ||| ||||    
T  8758604 gcttaagctactcttatgactttcctcta 8758576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 50 - 278
Target Start/End: Original strand, 41177929 - 41178157
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||  ||| |||  || ||| || |  ||| |||| ||||||||||| || |||||||||     
T  41177929 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaatcctgcaggtttctggtgttcaaccttagacttctgacaag 41178028  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
      ||||| ||||||||||| | |||||  ||   |||||  |||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  41178029 ttaaacatgcatacacaaaatgagcaacatctcgcttcaacccagaccaccaaaacagctttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaat 41178128  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtcta 278  Q
     || || |||||  |||||| ||| ||||    
T  41178129 gcttaagctactcttatgactttcctcta 41178157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 269
Target Start/End: Original strand, 15248616 - 15248763
Alignment:
Q  122 tgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatctt 221  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||  || |  ||    ||||  |||| ||||||||||||| | |||||||| |    
T  15248616 tgatgctcaactttcgacttctgacaaatcaaacaggaatacacaaactgtgccacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcat 15248715  T
Q  222 gatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  15248716 gatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 15248763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16836232 - 16835999
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||   ||||||  || ||| || |  ||  ||||||| |||||||| || |||||||||     
T  16836232 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaag 16836133  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
      || || ||||||||||| | ||| |  ||   |||||  || | ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  16836132 tgaagcacgcatacacaaaatgagcgacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacaactttttcaactcatgatacatcttcgtagctccgggatgaat 16836033  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatt 283  Q
    |||||| |||||  | |||| ||| |||||||||    
T  16836032 actcaagctactcttgtgactttcctctaaaatt 16835999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 278
Target Start/End: Original strand, 13942431 - 13942659
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||  ||| | |  || ||| || |  ||| |||||||||||||||| || |||||||||     
T  13942431 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaatgatgtcaacaatcctgcaggtttctgatgttcaaccttagacttctgacaag 13942530  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
      ||||| |||||||| || | |||||  ||   |||||  |||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  13942531 ttaaacatgcatacacgaaatgagcaacatctcgcttcaacccagaccaccaaaacagctttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaat 13942630  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtcta 278  Q
     || || |||||  |||||| ||| ||||    
T  13942631 gcttaagctactcttatgactttcctcta 13942659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 282
Target Start/End: Original strand, 17493037 - 17493269
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||  || ||| || |  ||  |||||||||||||||| ||||||||||||     
T  17493037 acaaaatccatagaaatgctatcccacttcaactctggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgttcaaccttagatttctgacaag 17493136  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||||| ||| | ||| |  ||   |||||  || | ||||||||||| | | |||||||| |||||||| || || ||||| | ||||||    
T  17493137 tcaaacatgcatacaaaaattgagcgacgtcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgatacattttcgtagctccagaatgaat 17493236  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
    ||| || |||||  | |||| ||| ||||||||    
T  17493237 acttaagctactcttgtgactttcctctaaaat 17493269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 269
Target Start/End: Original strand, 9523116 - 9523335
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||   || |||  ||||| ||| |  ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  9523116 acaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatctaatggtatcatcataccagcaggtttctgatgctcaactttcgacttctgacaaa 9523215  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||||| |||||||||||  ||||  ||    || | || || ||||||||||||| | || | ||| ||||||||||| || ||||| | ||||||    
T  9523216 tcaaacaagaatacacaaactgtgcaacatcacgtttgagtctagaccaccaaaacaacttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccgaatgaat 9523315  T
Q  250 actcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||||  ||||||||||||    
T  9523316 actcaagttacttctatgac 9523335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 269
Target Start/End: Original strand, 15209429 - 15209507
Alignment:
Q  191 ccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  15209429 ccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcttcgtagcacccggatgaatactcaagctacttctatgac 15209507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 13971772 - 13971637
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||  |||||| ||||||||||| | |||||  ||   |||||  |||| ||||||||||| | ||||||| ||    
T  13971772 tctgatgttcaaccttagacttctggcaagtcaaacatgcatacacaaattgagcaacatcacgcttcaaaccagaccaccaaaacagctttttcaagtc 13971673  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaa 255  Q
     ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  13971672 gtgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaa 13971637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 261
Target Start/End: Original strand, 14574330 - 14574541
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |  || ||| || |  ||  ||||||| |||||||| || |||||||||     
T  14574330 acaaaatccatggaaatgctatcccacttccactctggcacatctaacgatgtcaacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaag 14574429  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||| ||||||  |||||  ||    ||||  |||| ||||||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  14574430 tcaaacatgcataaacaaaccgagcaacatctcgtttcaacccagaccaccaaaacaatttcttcaagtcgtgatacatctttgtagctcccggatgaat 14574529  T
Q  250 actcaaactact 261  Q
    ||| || |||||    
T  14574530 acttaagctact 14574541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 14580529 - 14580456
Alignment:
Q  196 ccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  14580529 ccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacattttcgtagctcctgggtgaatactcaagctacttctgtgac 14580456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 16491895 - 16491794
Alignment:
Q  69 tatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaa 168  Q
    ||||||| |||||||||||||||   |||| |  ||||| ||| |  ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  16491895 tatcccatttccactctggcacatctaacgataccatcataccagcaggtttctgatgctcaaccttcgacttctgacaaatcaaacaagaatacacaaa 16491796  T
Q  169 ct 170  Q
    ||    
T  16491795 ct 16491794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 511
Target Start/End: Original strand, 18750735 - 18750812
Alignment:
Q  434 atctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    |||||||||||||||||  |||| | ||||||||| || |||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  18750735 atctcttccaaaatattagttgttagcttcaacattcctaacctcacaccatctggcgtcagctcactaatcaaactc 18750812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 261
Target Start/End: Original strand, 47124421 - 47124562
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||  ||| | ||||  || | ||||||||||| | | ||||||||    
T  47124421 tctgatgctcaaccttggacttctgacaaatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatcccttttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatc 47124520  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactact 261  Q
     || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  47124521 atggtacatttttgtagcccctgggtgaatactcaacctact 47124562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 12360264 - 12360032
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||| ||  || ||| || |  ||  ||| || ||||||||  || |||||||||     
T  12360264 acaaaatccatagaaatgttatcccacttccactccggcacatccaactgtgtcaacaaccctgcaggcttctaatattcaacctgagacttctgacaag 12360165  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||||||||| | ||| |  ||   |||||  || | ||||||||||| | | |||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||    
T  12360164 tcaaacatgcatacacaaaatgagcgacgtcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaat 12360065  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
    |||||| |||||  | |||| ||| ||||||||    
T  12360064 actcaagctactcttgtgactttcctctaaaat 12360032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 170
Target Start/End: Original strand, 16371810 - 16371930
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||   || | |  ||||| ||| |  ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  16371810 acaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctgatgttcaatcttcgacttctgacaaa 16371909  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaact 170  Q
    | ||||||| |||||||||||    
T  16371910 ctaaacaagaatacacaaact 16371930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 269
Target Start/End: Original strand, 12498645 - 12498864
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||   |||| |  ||||| ||| |  ||| ||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  12498645 acaaaatccatagatatactatcccatttccattctggcacatctaacgataccatcataccagcaggtttctgatgtttaatcttcgacttctgacaaa 12498744  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
    | ||||||| ||||||||| |  || |  ||    |||| ||||| |||||| || | | | || | ||| ||||||||||| || ||||| || |||||    
T  12498745 ctaaacaagaatacacaaattgtgccacatcgcatttcaatccagaccaccagaaaatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaat 12498844  T
Q  250 actcaaactacttctatgac 269  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  12498845 actcaagctacttctatgac 12498864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 196 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16380504 - 16380417
Alignment:
Q  196 ccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatt 283  Q
    ||||||||||| | |||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  | |||| ||| |||||||||    
T  16380504 ccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaatt 16380417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 5424498 - 5424444
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5424498 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 5424444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Original strand, 10006162 - 10006216
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  10006162 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 10006216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Original strand, 10906772 - 10906826
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  10906772 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 10906826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 170
Target Start/End: Original strand, 15062211 - 15062261
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaact 170  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  15062211 tctgatgttcaatcttcgacttctgacaaactaaacaagaatacacaaact 15062261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 282
Target Start/End: Original strand, 15228126 - 15228288
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||  ||||  ||    ||||  || | ||||||||||||  | ||||| ||    
T  15228126 tctgatgttcaactttagatttctgacaagtcaaacatgcatatacaaactgtgcaacatcacgtttcaaaccggaccaccaaaacaatttcttcaagtc 15228225  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
     |||||||||||  | ||||| ||||||||||| || |||||||| |||| ||| ||||||||    
T  15228226 atgatacatctttatagctcccggatgaatacttaagctacttctgtgactttcttctaaaat 15228288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 15724502 - 15724448
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  15724502 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 15724448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 16411850 - 16411796
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16411850 aaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 16411796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 16806494 - 16806440
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  16806494 aaatcgtgatacatcttcgtagctcctagatgaatactcaagctacttctatgac 16806440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 26791967 - 26791913
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  26791967 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 26791913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 120 - 261
Target Start/End: Original strand, 28754795 - 28754936
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||  ||| | ||||  || | |||||||||||   | ||||||||    
T  28754795 tctgatgctcaaccttggacttctgacaaatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatcccttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatc 28754894  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactact 261  Q
     || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  28754895 atggtacatttttgtagcccctgggtgaatactcaacctact 28754936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 11303495 - 11303284
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtct-ctgatgttcaaccttcgatttctgacaa 148  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||  |||||||  || ||| ||| ||   || |||||| |||||||| || |||||||||    
T  11303495 acaaaatccatagaaatgttgtcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaa-ccctacaagcttctgatgctcaaccttagacttctgacaa 11303397  T
Q  149 accaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaa 248  Q
      |||||| ||||||||||||| |||||  ||    ||||  || | ||||||||| | | | |||||||| |||||||| || || |||||  ||||||    
T  11303396 gtcaaacacgcatacacaaactgagcaacatcacatttcaacccggaccaccaaaatagcttcttcaaatcatgatacattttcgtagctcccagatgaa 11303297  T
Q  249 tactcaaactact 261  Q
    ||||||| |||||    
T  11303296 tactcaagctact 11303284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 15015343 - 15015275
Alignment:
Q  196 ccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttct 264  Q
    ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  15015343 ccaccaaaataacttcttcaaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatactcaaattacttct 15015275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 15588954 - 15588906
Alignment:
Q  221 tgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  15588954 tgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 15588906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 269
Target Start/End: Original strand, 16636341 - 16636389
Alignment:
Q  221 tgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16636341 tgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 16636389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 20061616 - 20061568
Alignment:
Q  221 tgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  20061616 tgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 20061568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 269
Target Start/End: Original strand, 43163665 - 43163713
Alignment:
Q  221 tgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  43163665 tgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 43163713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 269
Target Start/End: Original strand, 48426015 - 48426063
Alignment:
Q  221 tgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  48426015 tgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 48426063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Original strand, 13253252 - 13253306
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  13253252 aaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgac 13253306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 14126162 - 14126108
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  14126162 aaatcttgatacatcttcgtagctcccggttgaatgctcaagctacttctatgac 14126108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Original strand, 15339831 - 15339885
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  15339831 aaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgac 15339885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 15347813 - 15347759
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  15347813 aaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 15347759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 15402085 - 15402031
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  15402085 aaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgac 15402031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 196 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 31694762 - 31694676
Alignment:
Q  196 ccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
    ||||||||||||| | |||| ||| | ||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  | |||| ||| ||||||||    
T  31694762 ccaccaaaacaacttcttcagatcataatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcctctaaaat 31694676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 269
Target Start/End: Original strand, 6601203 - 6601352
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||  || |  || |  ||||  | || ||||||||| | | | || | |||    
T  6601203 tctgatgctcgaccttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatcttgtttcaaactagaccaccaaaaaatcttctttagatc 6601302  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
     ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  6601303 atgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgac 6601352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 269
Target Start/End: Original strand, 16692631 - 16692780
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||  || |  ||   |||||  |||| |||||| || | | | || || ||    
T  16692631 tctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgcgccacatctcgcttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaagtc 16692730  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
     ||||||||||| || ||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16692731 ctgatacatcttcgtagctctcggatgaatactcaagctacttctatgac 16692780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 260
Target Start/End: Original strand, 31939331 - 31939520
Alignment:
Q  71 tcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaact 170  Q
    |||||||||||||| ||||||   ||||||  || ||| || || ||  |||||||||||||||| || || ||||||  |||||| ||||||||||| |    
T  31939331 tcccacttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgaaggcttctgatgttcaaccttagacttttgacaagtcaaacatgcatacacaaaat 31939430  T
Q  171 cagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactac 260  Q
     ||| |  ||    ||||  || | ||||||||||| | |||||| ||| | ||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  31939431 gagcgacgtcacgtttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcagatcataatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctac 31939520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 269
Target Start/End: Original strand, 16371976 - 16372028
Alignment:
Q  217 atcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  16371976 atcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgac 16372028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 221 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 16756147 - 16756099
Alignment:
Q  221 tgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  16756147 tgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgac 16756099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 221 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 53384580 - 53384532
Alignment:
Q  221 tgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  53384580 tgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgac 53384532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 436; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 3402 - 2911
Alignment:
Q  20 aaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtc 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3402 aaacccttactagtcttaggcaacgctccaacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtc 3303  T
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3302 tctgatgttcaatcttcgatttctgacaaaccaaacaagcataaacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 3203  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacacaaact 319  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  3202 ctgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatttgcctcttaagctcaaacacatccggcacacaaact 3103  T
Q  320 cgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtcttcct 419  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  3102 cgatcacgaaacatcaaaacaccagtctcacccaatctaaagtctccaccttttccttgattaaccaacgtcactcgattcacgagttccaaatcttcct 3003  T
Q  420 tctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3002 tctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 2911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 436; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 511
Target Start/End: Original strand, 24173 - 24664
Alignment:
Q  20 aaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtc 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24173 aaacccttactagtcttaggcaacgctccaacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtc 24272  T
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24273 tctgatgttcaatcttcgatttctgacaaaccaaacaagcataaacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 24372  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacacaaact 319  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  24373 ctgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatttgcctcttaagctcaaacacatccggcacacaaact 24472  T
Q  320 cgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtcttcct 419  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  24473 cgatcacgaaacatcaaaacaccagtctcacccaatctaaagtctccaccttttccttgattaaccaacgtcactcgattcacgagttccaaatcttcct 24572  T
Q  420 tctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24573 tctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 24664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 436; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 511
Target Start/End: Original strand, 41037 - 41528
Alignment:
Q  20 aaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtc 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41037 aaacccttactagtcttaggcaacgctccaacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtc 41136  T
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41137 tctgatgttcaatcttcgatttctgacaaaccaaacaagcataaacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 41236  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacacaaact 319  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  41237 ctgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatttgcctcttaagctcaaacacatccggcacacaaact 41336  T
Q  320 cgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtcttcct 419  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  41337 cgatcacgaaacatcaaaacaccagtctcacccaatctaaagtctccaccttttccttgattaaccaacgtcactcgattcacgagttccaaatcttcct 41436  T
Q  420 tctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41437 tctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 41528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 33174 - 32969
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||  ||| |||  || ||| || |  ||| |||||||||||||||| || ||||| |||     
T  33174 acaaaatccatagaaatactatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaaccctgcaggtttctgatgttcaaccttagacttctggcaag 33075  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||||||||| | |||||  ||   |||||  |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  33074 tcaaacatgcatacacaaattgagcaacatcacgcttcaaaccaggccaccaaaacagctttttcaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatggat 32975  T
Q  250 actcaa 255  Q
    ||||||    
T  32974 actcaa 32969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 56 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 56391 - 56165
Alignment:
Q  56 tccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaac 155  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||  || ||| || |  ||  ||||||||||||| || || |||||||||  |||||    
T  56391 tccatagaaatgctatctcacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgttcaactttagacttctgacaagtcaaac 56292  T
Q  156 aagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaa 255  Q
    | ||||||||||||| |||||  ||   |||||  || | ||||||||||| | | |||||||| || |||||||| || ||||  ||||||||||||||    
T  56291 atgcatacacaaactgagcaacttcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatggtacatctttgtagctctcggatgaatactcaa 56192  T
Q  256 actacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
     |||||  | |||| ||| ||||||||    
T  56191 gctactcttgtgactttcttctaaaat 56165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 436; Significance: 0; HSPs: 49)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 27107307 - 27106816
Alignment:
Q  20 aaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtc 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27107307 aaacccttactagtcttaggcaacgctccaacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtc 27107208  T
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27107207 tctgatgttcaatcttcgatttctgacaaaccaaacaagcataaacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 27107108  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacacaaact 319  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  27107107 ctgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatttgcctcttaagctcaaacacatccggcacacaaact 27107008  T
Q  320 cgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtcttcct 419  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  27107007 cgatcacgaaacatcaaaacaccagtctcacccaatctaaagtctccaccttttccttgattaaccaacgtcactcgattcacgagttccaaatcttcct 27106908  T
Q  420 tctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27106907 tctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 27106816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 511
Target Start/End: Original strand, 7824637 - 7825128
Alignment:
Q  20 aaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtc 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7824637 aaacccttactagtcttaggcaacgctccaacaaaatccatagaaatgttatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtc 7824736  T
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7824737 tctgatgttcaatcttcgatttctgacaaaccaaacaagcataaacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 7824836  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacacaaact 319  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  7824837 ctaatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatttgcctcttaagctcaaacacatccggcacacaaact 7824936  T
Q  320 cgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtcttcct 419  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  7824937 cgatcacgaaacatcaaaacaccagtctcacccaatctaaagtctccaccttttccttgattaaccaacgtcactcgattcacgagttccaaatcttcct 7825036  T
Q  420 tctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7825037 tctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 7825128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 16 - 511
Target Start/End: Original strand, 15364673 - 15365168
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||| ||||  ||| || ||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15364673 atcaaaactcttaacagtcttcggcaatgctccaacaaagtccatagagttgctatcccacttccactttggcacaaacaacggttgcatcaaacctgac 15364772  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    ||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15364773 ggtttctgatgttcaatcttcgacttatgacaaaccaaactagcataaacaaactctgcaatttcgttcttcattctaggccaccaaaacaacctcttca 15364872  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    |||| | ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15364873 aatcctaatacatcttcgtcgctcctagatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatttgcctcttaagctcaaacacatccggcacaca 15364972  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| ||||| |||||||| |||    
T  15364973 aactcgatcacgaaacattaaaataccgttctcacccaatctaaagtctccacctttaccttggttaacgaacaccactcgatccacaagttccaaatct 15365072  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |  |||||||| || |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  15365073 tccttctgaccattcttaatctcttccaaaatattacttgttagtttcaacattcctaacctcacaccatccggcgtcagctcactaaccaaactc 15365168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 16 - 511
Target Start/End: Original strand, 45147285 - 45147780
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45147285 atcaaaacccttaacagtcttcggcaatgctccaacaaagtccatagagatgttatcccatttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 45147384  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45147385 ggtttctgatgttcaatcttcgacttctgacaaaccaaacaagcataaacaaattccgcgatctccttcttcattccaggccaccaaaacaacctcttca 45147484  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||  | |||||||| ||||| || |||| ||||||   ||||||    
T  45147485 aatcctgatacatcttattcgctcctggatgaatactcagactactcctgtgaccttcaaccaaaatttgtctcttaagttcaagcacatcctacacaca 45147584  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||    
T  45147585 aactcgatcacgaaacattaaaacaccgttctcatctaatctgaagttcccacctttaccttgattaaccaacaccactcgatcaacaagttccaaatct 45147684  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| || |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  45147685 tccttctgaccattcttaatctcttccaaaatattacttgttagcttcaacattcctaacctcacaccatccggcgtcagctcactaaccaaactc 45147780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 16 - 511
Target Start/End: Original strand, 17924384 - 17924879
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17924384 atcaaaacccttaacagtcttcggcaatgctccaacaaagtccatagagatactatctcactttcactctggctcaaacaacggttgcatcaaacccgac 17924483  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17924484 ggtctctgatgttcaatcttcgacttctgacaaacaaagcaagcataaacaaattccgcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaacctcttca 17924583  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    |||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| |||||  ||||||||    
T  17924584 aatcctaatacatcttcgtcgctcctggatgaatactcagactactcctgtgaccttcgtccaaaatctgtctcttaagctcaagcacatacggcacaca 17924683  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||| | |    
T  17924684 aactcgatcatgaaacattaaaacaccattctcatccaatctgaagtccccacctttaccttgattaactaacaccactcgatccacgagttccaaatat 17924783  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||| ||| | |||||||||    
T  17924784 tccttttgaccattcttaatctcttccaaaatattacttatcagcttcaacattcctaacctcacaccatccggcatcaagtcatttaccaaactc 17924879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 16 - 511
Target Start/End: Original strand, 14937080 - 14937575
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||| ||||  ||| || ||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14937080 atcaaaactcttaacagtcttcggcaatgctccaacaaagtccatagagttgctatcccacttccactgtggcacaaacaacggttgcatcaaacctgac 14937179  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    ||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  14937180 ggtttctgatgttcaatcttcgacttatgacaaaccaaactagcataaacaaactctgcaatttcgttcttcattctaggccaccaaaacaacctcttca 14937279  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    |||| | ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||| |||||||  ||||| | ||||||    
T  14937280 aatcctaatacatcttcgtcgctcctagatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatctctctcttaagctcaagtacatccgacacaca 14937379  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| ||||| |||||||| |||    
T  14937380 aactcgatcacgaaacattaaaataccgttctcacccaatctaaagtctccacctttaccttggttaacgaacaccactcgatccacaagttccaaatct 14937479  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |  |||||||| || |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  14937480 tccttctgaccattcttaatctcttccaaaatattacttgttagtttcaacattcctaacctcacaccatccggcgtcagctcactaaccaaactc 14937575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 16 - 507
Target Start/End: Original strand, 4440661 - 4441152
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  4440661 atcaaaacccttaacagtcttcggcaacgctccaacaaaatccatagagatattatcccacttccactctggcacaaataacggttgcatcaaaccgtac 4440760  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    ||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |    
T  4440761 ggtttctgatgttcaatcgtcgacttctgacaaaccatacaagcatatacaaattctgcgatctccttcttcattccagaccaccaaaacaacctcttta 4440860  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||| ||||||| |||||  ||||||||    
T  4440861 aatcctgatacatcttcgtcgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatctaactcttaagctcaagcacattcggcacaca 4440960  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||| |||    
T  4440961 aactcgataatgaaacatcaaaacaccgttctcacccaatatgaagtcttcacctttaccttgattaaccaacaccactcgacccacgagttccaaatct 4441060  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaa 507  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| || ||| |||||||||| || || | ||||||||||||    
T  4441061 tccttctgaccattcttaatctcttccaaaatattacttgttagcttcaacattcctaacatcacaccatccggcgttagctcactaaccaa 4441152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 511
Target Start/End: Original strand, 13455480 - 13455975
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    ||||||||| ||  |||| || ||| ||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||    
T  13455480 atcaaaacctttcatagtattcggcgacgctccaacaaaatccatagagatactatctcatttccattctggaacaaacaacggttgcatcaaacctaac 13455579  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  13455580 ggtttctgatgttcaaccttcgacttctgacaaaccaagcaagcataaacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccataacaacctcttca 13455679  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    |||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  |||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  13455680 aatcctaatacatcttcgtcgctcctggatgaatactcaaactacttctatgatcttcgtccaaaatctgtttcttaagctcaagcacatctggtacaca 13455779  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    ||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||| | || || |||||||  |||    
T  13455780 aacccgatcatgaaacatcaatacaccgttctcatcaaatctaaagtccccacctttaccttgattgaccaacaccacttgatctacaagttccagatct 13455879  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    | ||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  13455880 ttcttctaaccattcttaatcttttccaaaatattacttgtcagcttcaacattcctaacctcacacgatccggcatcaactcactaaccaaactc 13455975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 45 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 21674041 - 21673575
Alignment:
Q  45 ctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctg 144  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21674041 ctccaacaaagtccatagagatactatctcacttccactctagcacaatcaacggttgcatcaaacctgacggtctttgatgttcaatcttcgatttctg 21673942  T
Q  145 acaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctgga 244  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| || | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  21673941 acaaaccaagcaagcataaacaaattctgaaatctctttcttcagtccaggccaccaaaacaacatcttcaaatcctgatacatcttagtcgcttctgga 21673842  T
Q  245 tgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacacaaactcgatcacgaaacatcaaaacaccat 344  Q
    |||||||||| |||||  || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| |||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  21673841 tgaatactcagactacccctgtgaccttcgtccaaaatctgtctcttaagctcaaccacattcggaacacaaactcaatcacgaaacatcaaaacacggt 21673742  T
Q  345 tctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtcttccttctgaccattcttgatctcttccaa 444  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21673741 tctcacccaatctaaaatccccacctttaccttgattaaccaacaccactcgagccacaagttccaaatcttccttctgaccattcttaatctcttccaa 21673642  T
Q  445 aatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    |||||| ||||| | ||||||||| || | |||||||||||  || ||||||||||| |||||||||    
T  21673641 aatattacttgttagcttcaacattcctagcctcacaccattcggcgtcaactcacttaccaaactc 21673575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 16 - 511
Target Start/End: Original strand, 13353883 - 13354377
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    ||||||||||||   ||| || |||||| |||||||||| || ||||| || || | ||| ||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| ||     
T  13353883 atcaaaacccttcacagtcttcggcaacactccaacaaattcgatagagatactgttccatttccattatgaaacaaacaacggttgcatcaaacctgat 13353982  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    | | |||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  13353983 gatttctgatgttcaatcttagacttctaacaaaccaaacaagcataaacaaactctgcgatctccttcttcattccagtccaccaaaacaatctcttca 13354082  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |  ||||| ||||||| |||||| ||  ||||    
T  13354083 aatcctgatacatcttcgttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaattctatctcttaagctcaatcacatccgg-tcaca 13354181  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
     || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||| ||||||||||||||||||||   ||| | ||||| |||||||| ||     
T  13354182 gacccgatcacgaaacatcaaaacaccgttctcatctaatctgaaatccccatctttaccttgattaaccaacactacttgatccacaagttccaaatcg 13354281  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||| |||||| || |||||| ||||||| || ||||||| |||||| || || |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  13354282 tccttcttaccatttttaatctctcccaaaatgttacttgtcagcttcaatatccctaacctcacaccatccggcgtcagctcactaaccaaactc 13354377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 35 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 17144778 - 17144303
Alignment:
Q  35 ttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaacct 134  Q
    |||||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||| || ||    
T  17144778 ttaggcaa-gctccgacaaaattcatagatatgttattccacttccactccggtacaaacaacgattgcatcaaacccgatggcttctgatgttaaatct 17144680  T
Q  135 tcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagt 234  Q
    | || || ||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||| | ||||||| || ||||| || ||| || |||||||||||||||||||| ||    
T  17144679 tagacttttgacaaatcaaacaagcatacacaaactccgctatttcccttttcattctagaccacctaagcaatctcttcaaatcttgatacatcttcgt 17144580  T
Q  235 tgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacacaaactcgatcacgaaacatc 334  Q
     |||| |||||||||||||| |||||| |||| ||| || || ||||| ||| |||| ||||||   ||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  17144579 cgctcatggatgaatactcagactactcctataaccctcttccaaaatctgcttcttaagctcaggtacatccgatacacaaactcgatcacgaaacatc 17144480  T
Q  335 aaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtcttccttctgaccattcttga 434  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||    |||||||||| ||||||||||  |||  | |||||  ||||||| ||   ||||||||| |||||||    
T  17144479 aaaacaccattctcatcaaatttaaagtccattcctttacctttattaaccaacaccacatgatccacaggttccaaatccatcttctgacctttcttga 17144380  T
Q  435 tctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    | ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||   |||||||||||||| |||||||||    
T  17144379 tatcttctaaaatgttacttgttaacttcaacattcccaacttcacaccacttggtgtcaactcacttaccaaactc 17144303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 38 - 511
Target Start/End: Original strand, 23642203 - 23642673
Alignment:
Q  38 ggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcg 137  Q
    |||||| | |||||||| | |||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||   ||||||||||||  || |    
T  23642203 ggcaacacgccaacaaaatacatagaaatattatcccacttccactcagggacaaacaacggttgaatcaaacctgacgacttctgatgttcaatgttag 23642302  T
Q  138 atttctgacaaac-caaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttg 236  Q
    | || |||||||  ||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |    
T  23642303 actt-tgacaaaatcaaacaagcatacacaaactcat--atgtccttcttcattccaggccaccaaaacaacctcttcaaatcctgatacatctttgtcg 23642399  T
Q  237 ctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacacaaactcgatcacgaaacatcaa 336  Q
    |||||||||||||||||| | ||||  | | |||||| |  ||||| ||| |||| || | |   |||||||| |||||||||||||| | |||| ||||    
T  23642400 ctcctggatgaatactcatattactcatgtaaccttcttgcaaaatctgcttcttaagttgatgtacatctggtacacaaactcgatcccaaaacctcaa 23642499  T
Q  337 aacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtcttccttctgaccattcttgatc 436  Q
     ||||||||||||| |||| | || ||  ||| |||||||||||||||||||  ||| || ||||| | |||||| || || |||||||| | ||| ||     
T  23642500 gacaccattctcatacaatttgaaatccacacatttaccttgattaaccaacaccacacgatccacaaattccaaatcctctttctgaccttccttaatt 23642599  T
Q  437 tcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    || || ||||| || ||||||| | ||||| | |||||| ||||| ||   || |||| |||||| |||||||||    
T  23642600 tcctcaaaaatgttacttgtcagcatcaac-ttcccaacttcacatcactcggcgtcagctcactcaccaaactc 23642673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 404 - 511
Target Start/End: Original strand, 27171402 - 27171509
Alignment:
Q  404 agttccaagtcttccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaa 503  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27171402 agttccaaatcttccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaa 27171501  T
Q  504 ccaaactc 511  Q
    ||||||||    
T  27171502 ccaaactc 27171509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 191 - 269
Target Start/End: Original strand, 14040603 - 14040681
Alignment:
Q  191 ccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14040603 ccagaccaccaaaacaactttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaaactacttctatgac 14040681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 191 - 269
Target Start/End: Original strand, 14350633 - 14350711
Alignment:
Q  191 ccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14350633 ccagaccaccaaaacaactttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaaactacttctatgac 14350711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 283
Target Start/End: Original strand, 13666305 - 13666538
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||  || ||| || |  ||  ||||||||||||||||||| |||||||||     
T  13666305 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactccggcacatccatcggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgttcaaccttcgacttctgacaag 13666404  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||||||||| | ||| |  ||   |||||  || | ||||||||||| | | |||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||    
T  13666405 tcaaacatgcatacacaaaatgagcgacgtcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaat 13666504  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatt 283  Q
    ||| || |||||  | |||| ||| |||||||||    
T  13666505 acttaagctactcttgtgactttcctctaaaatt 13666538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 50 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 40649 - 40417
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||| || |||||| | |||||||| || || ||||| |||||||    
T  40649 acaaaatccatcgaaatgctgtcccacttccactctggaatactcaagggttgcatcaacccagacggtttttgatgttctacttttgatttttgacaaa 40550  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
      |  |||||||||||||| || || || |||||| |||| || | ||||||||| | | | || |  ||||||||||||||||| |||||  | || ||    
T  40549 ttaggcaagcatacacaaattcggctatatccttcgtcatacctgcccaccaaaatatcttcttaaggtcttgatacatcttagtggctcccaggtgtat 40450  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
    ||| || ||||| || |||||||| ||||||||    
T  40449 acttaagctactcctgtgaccttcctctaaaat 40417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 50 - 282
Target Start/End: Original strand, 19147979 - 19148211
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||  || ||| || |  ||  ||||||| |||||||| || |||||||||     
T  19147979 acaaaatccatggaaatgctatcccacttccattctggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaag 19148078  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||| ||||||| |||||  ||    ||||  |||| ||||||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19148079 tcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaatttcttcaagtcatgatacatctttgtagctcctggatgaat 19148178  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
    ||| || ||| || | |||| ||| ||||||||    
T  19148179 acttaagctatttatgtgactttcttctaaaat 19148211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 50 - 282
Target Start/End: Original strand, 20747378 - 20747610
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||  || ||| || |  ||  ||||||| |||||||| || |||||||||     
T  20747378 acaaaatccatggaaatgctatcccacttccattctggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaag 20747477  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||| ||||||| |||||  ||    ||||  |||| ||||||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  20747478 tcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaatttcttcaagtcatgatacatctttgtagctcctggatgaat 20747577  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
    ||| || ||| || | |||| ||| ||||||||    
T  20747578 acttaagctatttatgtgactttcttctaaaat 20747610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 50 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 11771744 - 11771525
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||   || |||  |||||| || |  ||| ||| ||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  11771744 acaaaatccatggatatgctatcccatttccactctggtacatctaaaggtgtcatcaaccctgcaggtttctaatgctcaactttcgacttctgacaaa 11771645  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| | |||||||||||  || |  ||    |||| ||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||    
T  11771644 tcaaacaggaatacacaaactgtgccacatcacgtttcaatccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaat 11771545  T
Q  250 actcaaactacttctatgac 269  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  11771544 actcaagctacttctatgac 11771525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 50 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 18053434 - 18053205
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||  ||| |||  || ||| || |  ||| |||| ||||||||||| || |||||||||     
T  18053434 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaatcctgcaggtttctggtgttcaaccttagacttctgacaag 18053335  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
      ||||| ||||||||||| | |||||  ||   |||||  |||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  18053334 ttaaacatgcatacacaaaatgagcaacatctcgcttcaacccagaccaccaaaacagctttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaat 18053235  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtctaa 279  Q
     || || |||||  |||||| ||| |||||    
T  18053234 gcttaagctactcttatgactttcctctaa 18053205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 50 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 23505351 - 23505123
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||  ||| ||   || ||| || |  ||| |||||||||||||||| || |||||||||     
T  23505351 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaatggcgtcaacaatcctgcaggtttctgatgttcaaccttagacttctgacaag 23505252  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
      ||||| ||||||||||| | |||||  ||   |||||  |||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  23505251 ttaaacatgcatacacaaaatgagcaacatctcgcttcaacccagaccaccaaaacagctttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaat 23505152  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtcta 278  Q
     || || |||||  |||||| ||| ||||    
T  23505151 gcttaagctactcttatgactttcctcta 23505123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 255
Target Start/End: Original strand, 19613443 - 19613648
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||  ||| |||  || ||| || |  ||  |||||||||||||||| || ||||| |||     
T  19613443 acaaaatccatagaaatactatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgttcaaccttagacttctggcaag 19613542  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||||||||| | |||||  ||   |||||  |||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  19613543 tcaaacatgcatacacaaattgagcaacatcacgcttcaaaccagaccaccaaaacagctttttcaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatggat 19613642  T
Q  250 actcaa 255  Q
    ||||||    
T  19613643 actcaa 19613648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 321400 - 321324
Alignment:
Q  190 tccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctat 266  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  321400 tccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcttcgtagctcctggatggatactcaagctacttctat 321324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 269
Target Start/End: Original strand, 15625460 - 15625538
Alignment:
Q  191 ccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15625460 ccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacttctgtgac 15625538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 15154090 - 15153941
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||  ||    |||| ||||| ||||||||||||  | |||| |||    
T  15154090 tctgatgctcaactttcgacttctgacaaatcaaacaagaatacacaaactgtgcaacatcacgtttcaatccagaccaccaaaacaaattcttcagatc 15153991  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
     |||||||||||  | ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  15153990 atgatacatcttcatagctcccggatggatactcaagctactcctatgac 15153941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 261
Target Start/End: Original strand, 15341205 - 15341410
Alignment:
Q  56 tccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaac 155  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || |||  |||||||  || ||| || |  ||  ||||||||||||| || || |||||||||  |||||    
T  15341205 tccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgttcaactttagacttctgacaagtcaaac 15341304  T
Q  156 aagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaa 255  Q
    | ||||||||||||| ||| |  ||    ||||  || | ||||||||||| | | |||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  15341305 atgcatacacaaactgagctacgtcacgtttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaa 15341404  T
Q  256 actact 261  Q
     |||||    
T  15341405 gctact 15341410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 261
Target Start/End: Original strand, 49153139 - 49153280
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||  || || ||||  || | |||||||||||   | ||||||||    
T  49153139 tctgatgctcaaccttggatttctgacaaatcaaacaggcataaacaaactgagcaacatcttttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatc 49153238  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactact 261  Q
     |||||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  49153239 atgatacatttttgtagcccctgggtgaatactcaacctact 49153280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 14263713 - 14263493
Alignment:
Q  62 gaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcat 161  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||   ||||||  || ||| | ||  ||  ||||||| |||||||| || |||||||||  |||||| ||||    
T  14263713 gaaatgttgtcccacttccactctggcacatctaacggtgtcaacaaccacgcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacacgcat 14263614  T
Q  162 acacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactact 261  Q
    | ||||||| |||||  ||    ||||  |||| ||||||||||||| | ||||| || ||||||||||| || | ||||||||||||||| |  ||| |    
T  14263613 aaacaaactgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaagtcatgatacatctttgtagttcctggatgaatacttaggctatt 14263514  T
Q  262 tctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
    ||| |||| ||| ||||||||    
T  14263513 tctgtgactttcctctaaaat 14263493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 11236646 - 11236497
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  || |  ||    ||||  |||| |||||| || | | | || |||||    
T  11236646 tctgatgctcaactttcgatttctgacaaactaaacaagaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaaatc 11236547  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
     ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  11236546 atgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgac 11236497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 283
Target Start/End: Original strand, 14130641 - 14130874
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||   ||||||  || ||| || |  ||  |||||||||||||||| || ||||| |||     
T  14130641 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgttcaaccttagacttctggcaag 14130740  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     ||| || ||||| ||||| | ||| |  ||   |||||   | | ||||||||||| | |||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||    
T  14130741 tcaagcatgcatatacaaaatgagcgacatcacgcttcaaaacggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaat 14130840  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatt 283  Q
    |||||| |||||  | |||| ||| |||||||||    
T  14130841 actcaagctactcttgtgactttcctctaaaatt 14130874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 283
Target Start/End: Original strand, 14434459 - 14434692
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||   ||||||  || ||| || |  ||  |||||||||||||||| || ||||| |||     
T  14434459 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgttcaaccttagacttctggcaag 14434558  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     ||| || ||||| ||||| | ||| |  ||   |||||   | | ||||||||||| | |||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||    
T  14434559 tcaagcatgcatatacaaaatgagcgacatcacgcttcaaaacggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaat 14434658  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatt 283  Q
    |||||| |||||  | |||| ||| |||||||||    
T  14434659 actcaagctactcttgtgactttcctctaaaatt 14434692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Original strand, 8708537 - 8708591
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  8708537 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 8708591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Original strand, 9596989 - 9597043
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  9596989 aaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 9597043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Original strand, 10871927 - 10871981
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  10871927 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 10871981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Original strand, 13686996 - 13687050
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  13686996 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 13687050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Original strand, 14333328 - 14333382
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  14333328 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 14333382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 262
Target Start/End: Original strand, 15204532 - 15204598
Alignment:
Q  196 ccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactactt 262  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| || ||| | |||||||||||||| ||||||    
T  15204532 ccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcttcgtagcttccggatgaatactcaagctactt 15204598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 44790689 - 44790635
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  44790689 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 44790635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 269
Target Start/End: Original strand, 8199566 - 8199614
Alignment:
Q  221 tgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  8199566 tgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 8199614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 18551090 - 18551042
Alignment:
Q  221 tgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  18551090 tgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 18551042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 271
Target Start/End: Original strand, 21662874 - 21662949
Alignment:
Q  196 ccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgacct 271  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  21662874 ccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatatatttttgtagctcccggatgaatactcaaattatttctgtgacct 21662949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 196 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 742 - 656
Alignment:
Q  196 ccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
    |||||||||||   | |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||  | |||| ||| ||||||||    
T  742 ccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatctttgttgctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcttctaaaat 656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 100
Target Start/End: Original strand, 6414279 - 6414329
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggt 100  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  6414279 acaaaatccatagaaatactatcccacttccactccggcacatccaacggt 6414329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Original strand, 18178674 - 18178728
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  18178674 aaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgac 18178728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 23202951 - 23202897
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  23202951 aaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgac 23202897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 23509078 - 23509024
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  23509078 aaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgac 23509024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 120 - 176
Target Start/End: Original strand, 12457478 - 12457534
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaa 176  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||    
T  12457478 tctgatgttcaactttagacttctgacaagtcaaacaagcataaacaaactgagcaa 12457534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 261
Target Start/End: Original strand, 12688411 - 12688479
Alignment:
Q  193 aggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactact 261  Q
    |||||||||||| | | | || ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  12688411 aggccaccaaaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctact 12688479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 436; Significance: 0; HSPs: 52)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 16382042 - 16381551
Alignment:
Q  20 aaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtc 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16382042 aaacccttactagtcttaggcaacgctccaacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtc 16381943  T
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16381942 tctgatgttcaatcttcgatttctgacaaaccaaacaagcataaacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 16381843  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacacaaact 319  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  16381842 ctgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatttgcctcttaagctcaaacacatccggcacacaaact 16381743  T
Q  320 cgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtcttcct 419  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  16381742 cgatcacgaaacatcaaaacaccagtctcacccaatctaaagtctccaccttttccttgattaaccaacgtcactcgattcacgagttccaaatcttcct 16381643  T
Q  420 tctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16381642 tctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 16381551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 511
Target Start/End: Original strand, 23996856 - 23997351
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23996856 atcaaaacccttactagtcttaggcaacgctccaacgaaatccatagaaatgctatcccatttccactctggcacaaacaatggttgcatcaaacccgac 23996955  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23996956 ggtctctgatgttcaatcttcgatttctgacaaaccaaacaagcataaacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttaa 23997055  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  23997056 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatttgcctcttgagctcaaacacattcggcacaca 23997155  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23997156 aactcgattacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaaatct 23997255  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23997256 tccttctgacccttcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 23997351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 1648483 - 1647992
Alignment:
Q  20 aaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtc 119  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1648483 aaacccttattagtcttaggcaacgctccaacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccaacggtc 1648384  T
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1648383 tctgatgttcaatcttcgatttctgacaaaccaaacaagcataaacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 1648284  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacacaaact 319  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  1648283 ctgatacatcttagttgctcttggatgaatactcaaactacttctatgaccttcatccaaaatttgcctcttaagctcaaacacatccggcacacaaact 1648184  T
Q  320 cgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtcttcct 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1648183 cgatcacgaaacatcaaaacaccattcttacccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaaatcttcct 1648084  T
Q  420 tctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1648083 tctgacccttcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaacccgctaaccaaactc 1647992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 511
Target Start/End: Original strand, 16233636 - 16234131
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16233636 atcaaaacccttcctagtcttaggcaacgctccaacaaaatccatggaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaatggttgcatcaaacccgac 16233735  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16233736 ggtctctgatgttcaatcttcgatttctgacaaaccaaacaagcataaacaaactcagcgatctccatcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 16233835  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||    
T  16233836 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatacacaaaatacttctatgaccttcgtccaaaatttgcctcttaagctcaagaacatctggtacaca 16233935  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16233936 aactcgatcacgaaacatcaaaacatcattctcgtccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaaatct 16234035  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16234036 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatccggtgtcaactcactaaccaaactc 16234131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 14625018 - 14624535
Alignment:
Q  28 actagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgt 127  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14625018 actagtcttaggcaacgctccaacaaaatcaatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgt 14624919  T
Q  128 tcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgataca 227  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14624918 tcaatcttcgatttttgacaaaccaaacaagcataaacaaactcagcaatctccttcttcattccagaacaccaaaacaaccttttcaaatcctgataca 14624819  T
Q  228 tcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacacaaactcgatcacg 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14624818 tcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatttgcctcttgagctcaaacacatctggcacacaaactcgatcacg 14624719  T
Q  328 aaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtcttccttctgacca 427  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14624718 aaacatcaaaacaccactctcgtccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaatgtcactcgatccacgagttccaaatcttccttctgacca 14624619  T
Q  428 ttcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14624618 ttcttgatctcttccaaaatattgcttgtcagcttcaacattctcaatctcacaccatccggtgtcaactcactaaccaaactc 14624535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 18837581 - 18837086
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18837581 atcaaaactcttactagtcttaggtaacgccccaacaaagtccatagaaatgctatcccacgtccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 18837482  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  18837481 ggtctctgatgttcaatcattgatttctgacaaaccaaacaagcataaacaaactcagcaatttccttcttcattccaggccaccaaaacaatctcttta 18837382  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| || ||||  ||||| ||||||||    
T  18837381 aatcctgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatctgccgcttaaggtcaagaacatccggcacaca 18837282  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18837281 aactcgatcacgaaacatcaaaacatcattctcgtccaatctaaagtctccacctttaccttggttaaccaacgtcactcggtccacgagttccaaatct 18837182  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18837181 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatccggtgtcaactcactaaccaaactc 18837086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 511
Target Start/End: Original strand, 18572259 - 18572754
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18572259 atcaaaactcttactagtctttggcaacaccccaacaaagtccatagaaatgctatctcacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacctgac 18572358  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  18572359 ggtctctgatgttcaatcttcgatttctgacaaaccaaacaagcataaacaaactcagtaatctccttcttaattccaggccacaaaaacaacctcttca 18572458  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||  ||||| ||||||||    
T  18572459 aatcctgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatctgccttttaagctcaagaacatccggcacaca 18572558  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  18572559 aactcgatcacgaaacatcaaaacatcattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcgatccacgagtgccaaatct 18572658  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18572659 tccttctgaccattcttgatctcttctaaaatattgtttgtcagcttcaacatttccaacctcgcaccatccggtgtcaactcactaaccaaactc 18572754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 16 - 511
Target Start/End: Original strand, 16098658 - 16099153
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||| ||||| ||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  16098658 atcaaaacacttaccagtcttcggtaacgctccaacaaagtccatagaaatgctatcccacttccactctagcacgaacaacagttgcatcaaactcgac 16098757  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    ||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  16098758 ggtttctgatgttcaatcttcgacttatgacaaaccaaacaagcatagacaaactccgcaatttccttcttcattccgggccaccaaaacaacttcttca 16098857  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |  ||||||  ||||||    
T  16098858 aatcctgatacatcttagtcgctcctggatgaatactcaaactactcctatgaccttcgtccaaaatctgcctcttaagctccaggacatctaacacaca 16098957  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||| |||    
T  16098958 aacttgaacacgaaacatcaaaacaccattcttatccaatctaaagtctccacccttaccttggttaaccaacaccactcggtccacaagttccaaatct 16099057  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16099058 tccttctgaccattcttaatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacattcctaacctcacaccatccggtgtcaactcactaaccaaactc 16099153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 16 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 23027389 - 23026894
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23027389 atcaaaacccttacgagtcttcggcaacgctccaacaaaatccataaagatactatcccacttccactccggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 23027290  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    | | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23027289 gatttctgatgttcaatcttcgacttctgacaaaccaaacaagcataaacaaactctgcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaacctcttca 23027190  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  23027189 aatcctgatatatcttagtcgctcctggatgaatacttaaactacttgtgtgaccttcgtccaaaatctgtctcttaagctcaagcacatccgacacaca 23027090  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||| ||||||||   |    
T  23027089 aactcgatcacgaaacattaaaacaccgttctcacccaaactgaagtctccacctttaccttgattaaccatcaccactcgatccacaagttccaaacat 23026990  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||| || |||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||    
T  23026989 tccttctgaccattcttaatctcttccaaaatattacttgtcagtttcaacattcctaacctcacaccatccggcgtcagctcaataaccaaactc 23026894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 16 - 511
Target Start/End: Original strand, 21927813 - 21928308
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    ||||||||||||  ||||  | || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  21927813 atcaaaacccttcgtagtcctcggtaacgctccaacaaagtccatagagatactatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaactcaac 21927912  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  21927913 ggtctctgatgttcaatcttcgacttttgacaaaccaaacaagcataaacaaattccgcgatctccttcttcattccaggccaccaaaacgacctcttca 21928012  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |  || ||||| || ||||| ||||||| |||||  || |||||    
T  21928013 aatcctcatacatcttagtcgctcctggatgaatactcagactactcctgtgacccttatccaaaatctgtctcttaagctcaagcacattcggtacaca 21928112  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||| |||    
T  21928113 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccgttctcatccattctaaagtccccacctttaccttgattaaccaacaccactcgatccacaagttccaaatct 21928212  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||| ||| ||||| | ||||||||| || ||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  21928213 tccttctggccattcttaatttcttccaaaacattacttgttagcttcaacattcctaacctcataccatccggcgtcagctcactaaccaaactc 21928308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 16 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 15078039 - 15077647
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    ||||||||| |||| ||| || || |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15078039 atcaaaaccgttaccagtcttcggtaacgctccgacaaaatccatagagatactatcccacttccactctggcacaaacaacagttgcatcaaacccgac 15077940  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
     || |||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15077939 agtttctggtgttcaatcttcgacttttgacaaaccaaacaagcatatacaaactcagcaatttccttcttcattctaggccaccaaaacaacctcttca 15077840  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||| |||||||  ||||| ||||||||    
T  15077839 aatcctgatacatcttagtcgctcctggatgaatactcaaactacttctaataccttcgtccaaaatctacctcttaagctcaagaacatccggcacaca 15077740  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttc 408  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| |||||    
T  15077739 aactcggtcacgaaacatcaaaacatcattcccatccaatctaaagtctccacctttaccttggttaaccaacaccactcgatccacaagttc 15077647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 153 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 35275622 - 35275264
Alignment:
Q  153 aacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatact 252  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  35275622 aacaagcatagacaaattcagcaatttccttcttcatttcaggccaccaaaacaacctcttcaaatcctgatacatcttacttgctcctgaatgaatact 35275523  T
Q  253 caaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacacaaactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatcc 352  Q
    || ||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| |||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  35275522 cagactacttctttgaccttcgtccaaagtctgcctcttaagctcaagaacatcaagcacacaaactcgatcacgaaacatcaaagcatcattctcatcc 35275423  T
Q  353 aatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtcttccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgc 452  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||| | ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35275422 aatctgaagtctccacctttaccttgattaaccaatactacttgatccacaagctctaaatcttccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattac 35275323  T
Q  453 ttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||| |||| || || ||||||||||||||||||    
T  35275322 ttgtcagcttcaacatccctaacctcacagcatccggcgttaactcactaaccaaactc 35275264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 347 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 16649311 - 16649147
Alignment:
Q  347 tcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtcttccttctgaccattcttgatctcttccaaaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16649311 tcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaaatcctccttctgaccattcttgatctcttccaaaa 16649212  T
Q  447 tattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16649211 tattgcttgtcaacttcaacatacccaacgtcacaccatcaggtgtcaactcactatccaaactc 16649147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 50 - 282
Target Start/End: Original strand, 15459978 - 15460210
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || | |  |||||||  || ||| || |  ||  |||||||||||| ||| || |||||||||     
T  15459978 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtatatccaacggtgtcaacaatcctgcaggcttctgatgttcaatcttagacttctgacaag 15460077  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||||||||||   || |  |||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||    
T  15460078 tcaaacacgcatacacaaaccgcgcgacatccttcttcaatccagaccaccaaaacaacttcttcaagtcatgatacattttcgtagctcctggatgaat 15460177  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
    ||||||| | ||  |||||| ||| ||||||||    
T  15460178 actcaaattgctcttatgactttcttctaaaat 15460210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 398 - 511
Target Start/End: Original strand, 14129459 - 14129572
Alignment:
Q  398 tccacgagttccaagtcttccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaact 497  Q
    ||||| ||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| || || ||||||||||  || |||||||    
T  14129459 tccacaagttctaaatattccttctgaccattcttaatctcttccaagatattgcttgttagcttcaacatccctaatctcacaccatttggcgtcaact 14129558  T
Q  498 cactaaccaaactc 511  Q
    | ||||||||||||    
T  14129559 cgctaaccaaactc 14129572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 14381106 - 14380873
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||  || ||| || |  || ||||||||||||||||| || |||||||||     
T  14381106 acaaaatccatagaaatgctatctcacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaatcctgcaggcctctgatgttcaaccttagacttctgacaag 14381007  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||||||||| | |||||  ||   |||||  || | |||||||||||   | |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||     
T  14381006 tcaaacatgcatacacaaaatgagcaacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatctttgtagctcccggatgaac 14380907  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatt 283  Q
    |||||| |||||  | |||| ||| |||||||||    
T  14380906 actcaagctactcttgtgactttcctctaaaatt 14380873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 120 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 5838788 - 5838639
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||  ||    |||| ||||  ||||||||| ||| | ||||||||    
T  5838788 tctgatgctcgaccttcgacttctgacaaatcaaacaagaatacacaaactgtgcaacatcacgtttcaatccaaaccaccaaaataacttcttcaaatc 5838689  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
     ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  5838688 atgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgac 5838639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 120 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 20636870 - 20636721
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||  ||    |||| ||| | ||||||||| ||| | || | |||    
T  20636870 tctgatgctcaaccttcgatttctgacaaatcaaacaagaatacacaaactgtgcaacgtcgcgtttcaatccggaccaccaaaataacttctttagatc 20636771  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
     ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20636770 atgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatgac 20636721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 50 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 28282452 - 28282224
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||  ||| |||  || ||| || |  ||| |||| ||||||||||| || |||||||||     
T  28282452 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaatcctgcaggtttctggtgttcaaccttagacttctgacaag 28282353  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
      ||||| ||||||||||| | |||||  ||   |||||  |||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  28282352 ttaaacatgcatacacaaaatgagcaacatctcgcttcaacccagaccaccaaaacagctttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaat 28282253  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtcta 278  Q
     || || |||||  |||||| ||| ||||    
T  28282252 gcttaagctactcttatgactttcctcta 28282224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 120 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 22078259 - 22078110
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||  || |  ||    |||| ||||| ||||||||| ||  |||| | |||    
T  22078259 tctgatgctcaaccttcgacttctgacaaatcaaacaagaatacacaaactgtgccacatcacgtttcaatccagaccaccaaaataatttttttagatc 22078160  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
     ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  22078159 atgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgac 22078110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 120 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 22762024 - 22761875
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||  ||||  ||    |||| ||||| ||||||||||||| | || | |||    
T  22762024 tctgatgctcaaccttcgacttctgaaaaatcaaacaagaatacataaactgtgcaacatcgcgtttcaatccagaccaccaaaacaacttctttagatc 22761925  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
     ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22761924 atgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatgac 22761875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 120 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 25609430 - 25609281
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| ||||| ||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||   ||||  ||    |||| ||||| ||||||||||||| | || | |||    
T  25609430 tctgatgctcaactttcgacttttgacaaatcaaacaagaatacacaaacggtgcaacatcacatttcaatccagaccaccaaaacaacttctttagatc 25609331  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
     ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  25609330 atgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 25609281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 261
Target Start/End: Original strand, 19435653 - 19435855
Alignment:
Q  59 atagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaag 158  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || |||  |||||||  || ||| || |  ||  |||||||||||||||| || |||||||||  |||||| |    
T  19435653 atagaaatactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgttcaaccttagacttctgacaagtcaaacacg 19435752  T
Q  159 catacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaact 258  Q
    |||||| ||||| |||||  ||   |||||  || | |||||||||||   | |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||    
T  19435753 catacataaactgagcaacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagct 19435852  T
Q  259 act 261  Q
    |||    
T  19435853 act 19435855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 18197218 - 18197145
Alignment:
Q  196 ccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  18197218 ccaccaaaacaaatttttcaaatcatgatacatcttggtagctcccggatgaatactcaagctacttctgtgac 18197145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 261
Target Start/End: Original strand, 19879946 - 19880151
Alignment:
Q  56 tccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaac 155  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||| |||  || ||| || |  ||  ||||||||||||| || || ||||| |||  |||||    
T  19879946 tccatagaaatgctatcccatttccactctggtacatccaatggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgttcaactttagacttctggcaagtcaaac 19880045  T
Q  156 aagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaa 255  Q
    | ||||||||||| | |||||  ||   |||||  |||| |||| |||||| | ||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  19880046 aggcatacacaaattgagcaacatcacgcttcaaaccagaccactaaaacagctttttcaagtcgtgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaa 19880145  T
Q  256 actact 261  Q
     |||||    
T  19880146 gctact 19880151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 34645219 - 34645014
Alignment:
Q  56 tccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaac 155  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||  ||| |||  || ||| || |  || ||||||||||||||||| || |||||||||  |||||    
T  34645219 tccatagaaatactatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaaccctgcaggcctctgatgttcaacctttgacttctgacaagtcaaac 34645120  T
Q  156 aagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaa 255  Q
    | ||||| ||||||| |||||  ||   |||||  |||  ||||||||||| | ||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  34645119 acgcatatacaaactgagcaacatcacgcttcaaaccaacccaccaaaacagctttttcaagtcgtggtacatcttcgtagctcccggatggatactcaa 34645020  T
Q  256 actact 261  Q
     |||||    
T  34645019 gctact 34645014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 269
Target Start/End: Original strand, 19865329 - 19865548
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||   || | |  ||||| ||| |  ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  19865329 acaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctgatgttcaatcttcgacttctgacaaa 19865428  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
    ||||||| | |||||||||||  || |  ||    |||| ||||| |||||| || | | | |||| ||  ||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  19865429 ccaaacaggaatacacaaactgtgccacatcgcgtttcaatccagaccaccagaatatcttcttcagataatgatacatcttcgtagctcccggatgaat 19865528  T
Q  250 actcaaactacttctatgac 269  Q
    |||||| ||||| |||||||    
T  19865529 actcaagctactcctatgac 19865548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 128 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19488833 - 19488679
Alignment:
Q  128 tcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgataca 227  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  ||||  ||    |||| ||| | ||||||||||||  | ||||| || |||||||    
T  19488833 tcaactttagatttctgacaaatcaaacatgcatatacaaactgtgcaacatcacgtttcaatccggaccaccaaaacaatttcttcaagtcatgataca 19488734  T
Q  228 tcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
    |||| || ||||| ||||||||||| || |||||||| |||| ||| ||||||||    
T  19488733 tctttgtagctcccggatgaatacttaagctacttctgtgactttcttctaaaat 19488679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 191 - 269
Target Start/End: Original strand, 23079252 - 23079330
Alignment:
Q  191 ccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23079252 ccagaccaccaaaacaactttttcagatcatgatacattttcgtagctcccggatggatactcaagctacttctatgac 23079330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 2874372 - 2874223
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||  || |  ||    ||||  |||| ||||||||| | | | || |||||    
T  2874372 tctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcgtttcaaaccagaccaccaaaaaatcttctttaaatc 2874273  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
     ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  2874272 atgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 2874223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 16963014 - 16962865
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||  || |  ||   ||||| ||||| ||||||||| |   | || | |||    
T  16963014 tctgatgctcaatcttcgacttctgacaaatcaaacaagagtacacaaactgtgccacatcgcgcttcaatccagaccaccaaaatatattctttagatc 16962915  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
     ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16962914 gtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 16962865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 18407511 - 18407362
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||  ||||  ||    |||| ||||| | | ||||||||| | || | |||    
T  18407511 tctgatgctcaaccttcgacttctgacaaatcaaacaagaatacaaaaactgtgcaacatcgcgtttcaatccagactagcaaaacaacttctttagatc 18407412  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
     ||||||||||| || |||||  |||||||||||||  ||||||||||||    
T  18407411 atgatacatcttcgtagctcccagatgaatactcaagttacttctatgac 18407362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 18966781 - 18966712
Alignment:
Q  200 caaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  18966781 caaaacaaatttttcaaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacttctgtgac 18966712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 255
Target Start/End: Original strand, 15896877 - 15896941
Alignment:
Q  191 ccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaa 255  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  15896877 ccagaccaccaaaataacctcttcaaatcatgatacatctttgtagctcctggatggatactcaa 15896941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 261
Target Start/End: Original strand, 18795332 - 18795543
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||   || |||  || ||| || |  ||  ||||||| || ||||| || ||||| |||     
T  18795332 acaaaatccatagaaatgttgtcccacttccactctggaacatctaatggtatcaacaaccctgcaggcttctgatgctcgaccttagacttctggcaag 18795431  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||||||||| | |||||  ||   |||||  || | ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  18795432 tcaaacacgcatacacaaattgagcaacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatggat 18795531  T
Q  250 actcaaactact 261  Q
    |||||| |||||    
T  18795532 actcaagctact 18795543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 27566619 - 27566400
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||||   || | |  ||||| ||| |  ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  27566619 acaaaatccatggatatactatcccacttccattctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctgatgttcaatcttcgacttctgacaaa 27566520  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
    | ||||| | ||||||||| |  || |  ||    |||| ||||| |||||| || | | | || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  27566519 ctaaacaggaatacacaaattgtgccacatcacgtttcaatccagaccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaat 27566420  T
Q  250 actcaaactacttctatgac 269  Q
    |||||| |||||| ||||||    
T  27566419 actcaagctacttttatgac 27566400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 24312642 - 24312588
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  24312642 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 24312588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 29591394 - 29591340
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  29591394 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 29591340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 120 - 269
Target Start/End: Original strand, 27188148 - 27188297
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||| |  ||    ||||  |||| |||||| || | | | ||||||||    
T  27188148 tctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgagccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttcttcaaatc 27188247  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
     |||||||| || || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  27188248 atgatacattttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgac 27188297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 120 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 27261092 - 27260943
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||| |  ||    ||||  |||| |||||| || | | | ||||||||    
T  27261092 tctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgagccacatctcgtttcaaaccagaccaccagaaaatcttcttcaaatc 27260993  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
     |||||||| || || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  27260992 atgatacattttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgac 27260943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 27331002 - 27330954
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaa 168  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  27331002 tctgatgctcaaccttcgacttctgacaaatcaaacaagaatacacaaa 27330954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 27391742 - 27391694
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaa 168  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  27391742 tctgatgctcaaccttcgacttctgacaaatcaaacaagaatacacaaa 27391694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 16626191 - 16626137
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16626191 aaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 16626137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 100
Target Start/End: Original strand, 17416128 - 17416178
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggt 100  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  17416128 acaaaatccatagaaatgttatcccacttccactccggcacatccaacggt 17416178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 269
Target Start/End: Original strand, 18436392 - 18436470
Alignment:
Q  191 ccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    |||| ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| || || | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  18436392 ccagaccaccaaaataacttcttcaaatcatgatacatttttgtaggtcccggatgaatactcaaattacttctgtgac 18436470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Original strand, 25113359 - 25113413
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  25113359 aaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgac 25113413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 1542561 - 1542504
Alignment:
Q  212 ttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||    
T  1542561 ttcaaatcgtgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctgtgac 1542504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 10468418 - 10468277
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||  || | |||||  || | |||||||||||   | ||||||||    
T  10468418 tctgatgttcaactttagacttctgacaagtcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcatgcttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatc 10468319  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactact 261  Q
     || |||||||| || || || || ||||||||||| |||||    
T  10468318 atggtacatctttgtagcccccgggtgaatactcaacctact 10468277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 269
Target Start/End: Original strand, 22434673 - 22434730
Alignment:
Q  212 ttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    |||| ||| ||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  22434673 ttcagatcatgaaacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 22434730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 269
Target Start/End: Original strand, 22443071 - 22443128
Alignment:
Q  212 ttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    |||| ||| ||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  22443071 ttcagatcatgaaacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 22443128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 28262766 - 28262617
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaa--tctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaa 217  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||  || |  |||||||  |||  |||| |||||| || | | | || | |    
T  28262766 tctgatgctcgaccttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcctt--tcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaga 28262669  T
Q  218 tcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  28262668 tcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgac 28262617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 28341515 - 28341366
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaa--tctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaa 217  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||  || |  |||||||  |||  |||| |||||| || | | | || | |    
T  28341515 tctgatgctcgaccttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatctcctt--tcaaaccagaccaccagaaaatcttctttaga 28341418  T
Q  218 tcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  28341417 tcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgac 28341366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 436; Significance: 0; HSPs: 28)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 20830988 - 20830497
Alignment:
Q  20 aaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtc 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20830988 aaacccttactagtcttaggcaacgctccaacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtc 20830889  T
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20830888 tctgatgttcaatcttcgatttctgacaaaccaaacaagcataaacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 20830789  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacacaaact 319  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  20830788 ctgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatttgcctcttaagctcaaacacatccggcacacaaact 20830689  T
Q  320 cgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtcttcct 419  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  20830688 cgatcacgaaacatcaaaacaccagtctcacccaatctaaagtctccaccttttccttgattaaccaacgtcactcgattcacgagttccaaatcttcct 20830589  T
Q  420 tctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20830588 tctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 20830497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 16 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 22135157 - 22134662
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||||||||| ||| || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22135157 atcaaaacccttaccagtcttcggtaacgccccaacaaagtccatagagatactatcccacttctactgtggcacaaacaacagttgcatcaaacccgac 22135058  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    ||| | | |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  22135057 ggttttttatgttcaatcttcaacttctgacaaaccaaacaagcataaacaaattccgcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaagctcttca 22134958  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||  | ||| ||||||||    
T  22134957 aatcctgatacatcttagtcactcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatctgcctctcaagctcaagtatatccggcacaca 22134858  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||| ||||||||||| || |||    
T  22134857 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatatgaagtctccacctttaccttggttaaccatcaccactcgatccacgagttctaaatct 22134758  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  22134757 tccttttgaccattcttaatctcttccaaaatattacttgttagcttcaacattcccaatctcacaccatctggcgtcaactcactaaccaaactc 22134662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21201889 - 21201677
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    ||||||||||||   ||| || ||||||| ||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||     
T  21201889 atcaaaacccttcacagtcttcggcaacgttccaaaaaagtccatagagatactatcccacttccactctggcacaaacaatggttgcatcaaactcgat 21201790  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaacca---aacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttt 212  Q
    ||  ||||||||||||  ||||| |||| ||||| ||   || ||| ||| | | |||     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21201789 ggcttctgatgttcaattttcgacttctaacaaatcaaataagaaggatagagatact-----atatccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttt 21201695  T
Q  213 tcaaatcttgatacatct 230  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  21201694 tcaaatcctgatacatct 21201677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 311 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 21201645 - 21201484
Alignment:
Q  311 acacaaactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttcca 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||| ||||||  |||  | ||| | |||||||    
T  21201645 acacaaactcgatcacgaaacatcaaaacatcattctcatccaatctgaaatccacacctttaccttgattcaccaacaccacaagatccgctagttcca 21201546  T
Q  411 agtcttccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacataccca 473  Q
    | || || |||| || ||| || ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  21201545 aatcctcattctaactattttttatctcttccaatatattacttgtc-acttcaacattccca 21201484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 50 - 252
Target Start/End: Original strand, 19855098 - 19855300
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  || ||| ||||  ||  ||||||| |||||||| || |||||||||     
T  19855098 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactctggcacatccaacggtgtcaacaaccccgcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaag 19855197  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||||||||  | |||||| |||   ||||  |||| ||||||||||| | | |||||||| |||||||| || || |||||  |||||||    
T  19855198 tcaaacatgcatacacaatttgagcaatatcccgtttcaacccagaccaccaaaacagcgtcttcaaatcatgatacattttcgtagctcccagatgaat 19855297  T
Q  250 act 252  Q
    |||    
T  19855298 act 19855300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 50 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 20835454 - 20835243
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||  || ||| || |  ||  |||||||||||||||| ||  ||||||||     
T  20835454 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgttcaaccttagacatctgacaag 20835355  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||  ||    ||||  |||| ||||||||||| | | ||||| || |||||||| || || ||||| ||||||||    
T  20835354 tcaaacatgcatacacaaactgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacagcttcttcaagtcatgatacattttcgtagctcccggatgaat 20835255  T
Q  250 actcaaactact 261  Q
    |||||| |||||    
T  20835254 actcaagctact 20835243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 128 - 269
Target Start/End: Original strand, 20139701 - 20139842
Alignment:
Q  128 tcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgataca 227  Q
    ||||| ||||| || ||||||| |||||||| ||| |||||||  ||||  ||    |||| ||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  20139701 tcaactttcgacttttgacaaatcaaacaagaatagacaaactgtgcaacatcacgtttcaatccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgataca 20139800  T
Q  228 tcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  20139801 tcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 20139842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 120 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 22361740 - 22361591
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||  ||    |||| ||||| ||||||||||||| | || | |||    
T  22361740 tctgatgctcaaccttcgatttctgacaaatcaaacaagaatacacaaactatgcaacgtcgcgtttcaatccagaccaccaaaacaacttctttagatc 22361641  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
     ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  22361640 atgatagatcttcgtagctcccggatgaatactcaagtttcttctatgac 22361591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 120 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 50619740 - 50619591
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| ||||| ||||| || ||||||| |||||| | |||||||||||  || |  ||    |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  50619740 tctgatgctcaactttcgacttttgacaaatcaaacaggaatacacaaactgtgccacatcacgtttcaatccagaccaccaaaacaactttttcaaatc 50619641  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
     ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  50619640 atgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttttatgac 50619591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 185 - 269
Target Start/End: Original strand, 16373457 - 16373541
Alignment:
Q  185 ttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16373457 ttcaatccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcttcgcagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 16373541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 20856327 - 20856121
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||   |||||||  || |||||| |  || ||||||||||||||||| || |||| ||||     
T  20856327 acaaaatccatagaaatgatatcccatttccactctggtacctccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgttcaaccttagacttctaacaag 20856228  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttc-ttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaa 248  Q
      ||||| ||||||||||||  ||| |  |||||| || |  |||| ||||||||||||  | ||||| || |||||||| || || ||||| |||||||    
T  20856227 tgaaacacgcatacacaaaccgagcgacatccttctttaaaaccagaccaccaaaacaatttcttcaagtcatgatacatttttgtagctcccggatgaa 20856128  T
Q  249 tactcaa 255  Q
    |||||||    
T  20856127 tactcaa 20856121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 20939629 - 20939396
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||||||||   ||||||||||||||| ||||||  |||||||  || ||| || |  ||  |||||||||||||||| || |||||||||     
T  20939629 acaaaatccatagaaataaaatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgttcaaccttagacttctgacaag 20939530  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||||||||| | ||| |  ||   |||||  || | ||||||||| | | | |||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||    
T  20939529 tcaaacatgcatacacaaaatgagcgacgtcacgcttcaaaccggaccaccaaaatagcttcttcaaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaat 20939430  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatt 283  Q
    |||||| |||||  | |||| ||| |||||||||    
T  20939429 actcaagctactcttgtgactttcttctaaaatt 20939396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 269
Target Start/End: Original strand, 21749804 - 21749953
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |  || |  ||    |||| ||||| ||||||||||| | | || | |||    
T  21749804 tctgatgctcaaccttcgacttctgacaaatcaaacaagaatacacaaattgtgccacatcacgtttcaatccagaccaccaaaacatcttctttagatc 21749903  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
     ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  21749904 atgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatgac 21749953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 31539563 - 31539352
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||||| || || |||||||||||||| || |||  |||||||  || ||| || |  ||  ||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  31539563 acaaaatccatagagatactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaaa 31539464  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||| ||||||| |||||  ||| | ||||  || | |||||||||||   | |||||||| |||||||| || || || ||||| |||||    
T  31539463 tcaaacaggcataaacaaactgagcaacatcccttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgatacattttcgtagcccctgggtgaat 31539364  T
Q  250 actcaaactact 261  Q
    |||||| |||||    
T  31539363 actcaacctact 31539352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 261
Target Start/End: Original strand, 37677873 - 37678084
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||   ||||||  || ||| || |  ||  ||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  37677873 acaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaga 37677972  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||| ||||||| |||||  ||| | ||||  || | |||||||||||   | |||||||| |||||||| || || || ||||| |||||    
T  37677973 tcaaacaggcataaacaaactaagcaacatcccttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatgatacatttttgtagcccctgggtgaat 37678072  T
Q  250 actcaaactact 261  Q
    ||||||||||||    
T  37678073 actcaaactact 37678084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 16078057 - 16078003
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16078057 aaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 16078003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Original strand, 21837908 - 21837962
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  21837908 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 21837962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 120 - 269
Target Start/End: Original strand, 20250665 - 20250813
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||  ||||  ||    |||| ||||  ||||||||||||| | || | |||    
T  20250665 tctgatgctcaactttcgacttctgacaaatcaaataagaatacacaaactgtgcaacatcacgtttcagtccaa-ccaccaaaacaacttctttagatc 20250763  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
     ||||||||||| || ||||| | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  20250764 atgatacatcttcgtagctcccgaatgaatactcaagttacttctatgac 20250813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 41353066 - 41353009
Alignment:
Q  212 ttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  41353066 ttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgac 41353009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 16349994 - 16349946
Alignment:
Q  221 tgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16349994 tgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 16349946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24099169 - 24098937
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||   ||||||  || ||| || |  ||  ||||||| |||||||| || |||||||||     
T  24099169 acaaaatccatagaaatactgtcccatttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaag 24099070  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     ||| |||||||| ||||| | |||||  || | |||||  || | |||||||||||   | |||||||| || |||||||| || ||||| || |||||    
T  24099069 tcaagcaagcataaacaaaatgagcaacatcatgcttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatctttgtagctcccgggtgaat 24098970  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
    |||||| |||||  | |||| ||| ||||||||    
T  24098969 actcaagctactcttgtgactttcttctaaaat 24098937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 19760298 - 19760227
Alignment:
Q  191 ccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactactt 262  Q
    |||| ||||||||||||| | || ||||| |||||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  19760298 ccagaccaccaaaacaacttctttaaatcatgatacatctttatagctcctggatggatactcaagctactt 19760227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 269
Target Start/End: Original strand, 22109956 - 22110034
Alignment:
Q  191 ccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    |||| ||||||||||||| | || ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||  ||||||||||||    
T  22109956 ccagaccaccaaaacaacttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagttacttctatgac 22110034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 269
Target Start/End: Original strand, 22113805 - 22113883
Alignment:
Q  191 ccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    |||| ||||||||||||| | || ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||  ||||||||||||    
T  22113805 ccagaccaccaaaacaacttctttaaatcgtggtacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagttacttctatgac 22113883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 22432682 - 22432632
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  22432682 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactctggtacatccaacggt 22432632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 33390430 - 33390376
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  33390430 aaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 33390376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 51332894 - 51332840
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  51332894 aaatcgtgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgac 51332840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 221 - 269
Target Start/End: Original strand, 21025137 - 21025185
Alignment:
Q  221 tgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  21025137 tgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgac 21025185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 432; Significance: 0; HSPs: 47)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 21936894 - 21936403
Alignment:
Q  20 aaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtc 119  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21936894 aaacccttattagtcttaggcaacgctccaacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtc 21936795  T
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21936794 tctgatgttcaatcttcgatttctgacaaaccaaacaagcataaacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 21936695  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacacaaact 319  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21936694 ctgatacatcttagttgctcctgggtgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatttgcctcttaagctcaaacacatctggcacacaaact 21936595  T
Q  320 cgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtcttcct 419  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  21936594 cgatcacgaaacatcaaaacaccagtctcacccaatctaaagtctccaccttttccttgattaaccaacgtcactcgattcacgagttccaaatcttcct 21936495  T
Q  420 tctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21936494 tctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 21936403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 511
Target Start/End: Original strand, 24581872 - 24582363
Alignment:
Q  20 aaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtc 119  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24581872 aaacccttattagtcttaggcaacgctccaacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtc 24581971  T
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24581972 tctgatgttcaatctttgatttctgacaaaccaaacaagcataaacaaactcagcaatctccttcttcattacaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 24582071  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacacaaact 319  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24582072 ctgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatttgcctcttaagctcaaacatatctggcacacaaact 24582171  T
Q  320 cgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtcttcct 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24582172 cgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtccccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaaatcttcct 24582271  T
Q  420 tctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24582272 tctgacccttcttaatctcttcctaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactgaccaaactc 24582363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 511
Target Start/End: Original strand, 27011742 - 27012237
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27011742 atcaaaactcttactagtcttaggcaacgccccaacaaagtccatagaaatgctatctcacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 27011841  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27011842 gttctctgatgttcaatcttcgatttctgacaaaccaaacaagcataaacaaactcagtaatctccttcttcattccagaccaccaaaacaaccttttca 27011941  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27011942 aatcctgatacatcttagttgctcctggatgaatactaaaactacttctatgaccttcgtccaaaatttgcctcttaagctcaaacacatctggcacaca 27012041  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  27012042 aactcgatcacgaaacattaaaacaccactctcgtccaatctaaagtttccacctttaccttgattaaccaacgtcactcgatccacgagttccaaatct 27012141  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  27012142 tccttctgacaattcttgatctcttccaaaatattacttgtcagcttcaacattcccaatctcaccccttcaagtgtcaactcgctaaccaaactc 27012237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 16 - 456
Target Start/End: Original strand, 23504100 - 23504540
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||| ||||||||| || || |||||||||||||| |||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23504100 atcaaaactcttactagtcttcggtaacgctccaacaaaatccataaagatactatcccaattccactctggcacaaacaacagttgcatcaaacccgac 23504199  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23504200 ggtctctgatgttcaatcttcgatttttgacaaaccaaacaagcataaacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaacctcttca 23504299  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||  ||||||| | ||||    
T  23504300 aatcttgatacatcttagtcgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatttgtctcttaagctcaagaacatctgccgcaca 23504399  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  23504400 aactcgatcacgaaacatcaaaacattattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttggttaaccaacgtcactcgatccacgagttccaaatct 23504499  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgt 456  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||    
T  23504500 tccttctgaccattcatgatctctttcaatatattacttgt 23504540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 38 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 25244038 - 25243566
Alignment:
Q  38 ggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcg 137  Q
    ||||||||| | ||||| || ||||||||   ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| ||| |    
T  25244038 ggcaacgctgcgacaaaatctatagaaataagatcccgcttccactctagcacaaacaacggttgcatcaaacccgatgacttctgatgttcaatcttag 25243939  T
Q  138 atttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgc 237  Q
    | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||   || |||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||| || ||    
T  25243938 acttctgacaaatcaaacaagcatgcacaaactcatttatatccttcttcactccaggccgccaaaacaacatctttaaatcttgatacatcttcgtcgc 25243839  T
Q  238 tcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacacaaactcgatcacgaaacatcaaa 337  Q
    |||| |||||||||||| ||||||  | ||||| || ||||||||  || |||| || | |   ||||  || | |||||||| |||||||||| || ||    
T  25243838 tcctagatgaatactcagactactcatgtgaccctcttctaaaatccgcttcttaagtttaggtacattcggtatacaaactcaatcacgaaacttc-aa 25243740  T
Q  338 acaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtcttccttctgaccattcttgatct 437  Q
    || ||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||  ||| |  ||||| |||||||| || || ||| |||| | ||| || |    
T  25243739 accccattctcatccaatataaagtccatacctttaccttgattaaccaacaccacacaatccacaagttccaaatcctctttcagaccttccttaattt 25243640  T
Q  438 cttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    | ||| |||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||   || |||| |||||| |||||||||    
T  25243639 cctccgaaatgttacttgtcaacttcaacattcccaacttcacaccactcggagtcagctcactcaccaaactc 25243566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 38 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 25308190 - 25307718
Alignment:
Q  38 ggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcg 137  Q
    ||||||||| | ||||| || ||||||||   ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| ||| |    
T  25308190 ggcaacgctgcgacaaaatctatagaaataagatcccgcttccactctagcacaaacaacggttgcatcaaacccgatgacttctgatgttcaatcttag 25308091  T
Q  138 atttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgc 237  Q
    | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||   || |||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||| || ||    
T  25308090 acttctgacaaatcaaacaagcatgcacaaactcatttatatccttcttcactccaggccgccaaaacaacatctttaaatcttgatacatcttcgtcgc 25307991  T
Q  238 tcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacacaaactcgatcacgaaacatcaaa 337  Q
    |||| |||||||||||| ||||||  | ||||| || ||||||||  || |||| || | |   ||||  || | |||||||| |||||||||| || ||    
T  25307990 tcctagatgaatactcagactactcatgtgaccctcttctaaaatccgcttcttaagtttaggtacattcggtatacaaactcaatcacgaaacttc-aa 25307892  T
Q  338 acaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtcttccttctgaccattcttgatct 437  Q
    || ||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||  ||| |  ||||| |||||||| || || ||| |||| | ||| || |    
T  25307891 accccattctcatccaatataaagtccatacctttaccttgattaaccaacaccacacaatccacaagttccaaatcctctttcagaccttccttaattt 25307792  T
Q  438 cttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    | ||| |||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||   || |||| |||||| |||||||||    
T  25307791 cctccgaaatgttacttgtcaacttcaacattcccaacttcacaccactcggagtcagctcactcaccaaactc 25307718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 38 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 19566377 - 19566137
Alignment:
Q  38 ggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcg 137  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||  ||||||| |||| ||| |    
T  19566377 ggcaaagctccaacaaagtccatcgaaatactatcccaattccactctggcacaaacaacggttgcatcatttcagacggcttctgatgctcaatcttag 19566278  T
Q  138 atttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgc 237  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |  ||| |||||||||| ||||||||||||||| | || | ||||||||||||||| |||||    
T  19566277 atttctgacaaacgaaacaatcatacaaaaactcagctacatccctcttcattcctggccaccaaaacaacttcttaagatcttgatacatcttcgttgc 19566178  T
Q  238 tcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtcta 278  Q
    ||  |||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  19566177 tctaggataaatactcaaactactcctgtgacattcgtcta 19566137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 56 - 282
Target Start/End: Original strand, 20822151 - 20822377
Alignment:
Q  56 tccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaac 155  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||  |||||||  || ||| ||||  || ||||||||||||||||| || || ||||||  |||||    
T  20822151 tccatagaaatactatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaatcccgcaggcctctgatgttcaaccttagacttttgacaagtcaaac 20822250  T
Q  156 aagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaa 255  Q
    | ||||||||||||   || |  |||||||||| ||| | ||||||||||||| | ||||| || |||||||| || || ||||| ||||||||||||||    
T  20822251 acgcatacacaaaccgtgcgacatccttcttcaatccggaccaccaaaacaacttcttcaagtcatgatacattttcgtagctcccggatgaatactcaa 20822350  T
Q  256 actacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
    | ||||  |||||| ||| ||||||||    
T  20822351 attactcttatgactttcttctaaaat 20822377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 50 - 282
Target Start/End: Original strand, 20774451 - 20774683
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||  |||||||  || |||||| |  || |||||||||||||| || || ||||| |||     
T  20774451 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcgggcctctgatgttcaactttagacttctggcaag 20774550  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||||||||||  ||| |  ||||||||||  |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||| || || |||||  | |||||    
T  20774551 tcaaacatgcatacacaaaccgagcgacatccttcttcaaaccagaccaccaaaacaacttcttcaagtcttgatacatttttgtagctcccaggtgaat 20774650  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
    ||||||  | ||  |||||||||| ||||||||    
T  20774651 actcaagttgctcttatgaccttcttctaaaat 20774683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 50 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 28894618 - 28894386
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||  |||||||  || |||||| |  || |||||||||||||| || || ||||| |||     
T  28894618 acaaaatccatagaaatactatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcgggcctctgatgttcaactttagacttctggcaag 28894519  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||||||||||  ||| |  ||||||||||  |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||| || || ||||| || |||||    
T  28894518 tcaaacatgcatacacaaaccgagcgacatccttcttcaaaccagaccaccaaaacaacttcttcaagtcttgatacatttttgtagctcccgggtgaat 28894419  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
    ||||||  | ||  |||||||||| ||||||||    
T  28894418 actcaagttgctcttatgaccttcttctaaaat 28894386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 50 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 28916089 - 28915857
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||  |||||||  || |||||| |  || |||||||||||||| || || ||||| |||     
T  28916089 acaaaatccatagaaatactatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcgggcctctgatgttcaactttagacttctggcaag 28915990  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||||||||||  ||| |  ||||||||||  |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||| || || ||||| || |||||    
T  28915989 tcaaacatgcatacacaaaccgagcgacatccttcttcaaaccagaccaccaaaacaacttcttcaagtcttgatacatttttgtagctcccgggtgaat 28915890  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
    ||||||  | ||  |||||||||| ||||||||    
T  28915889 actcaagttgctcttatgaccttcttctaaaat 28915857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 50 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 28923444 - 28923212
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||  |||||||  || |||||| |  || |||||||||||||| || || ||||| |||     
T  28923444 acaaaatccatagaaatactatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcgggcctctgatgttcaactttagacttctggcaag 28923345  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||||||||||  ||| |  ||||||||||  |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||| || || ||||| || |||||    
T  28923344 tcaaacatgcatacacaaaccgagcgacatccttcttcaaaccagaccaccaaaacaacttcttcaagtcttgatacatttttgtagctcccgggtgaat 28923245  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
    ||||||  | ||  |||||||||| ||||||||    
T  28923244 actcaagttgctcttatgaccttcttctaaaat 28923212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 50 - 255
Target Start/End: Original strand, 22462644 - 22462849
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||   |||||||  || |||||| |  || ||||||||||||||||| || |||||||||     
T  22462644 acaaaatccatagaaatgatatcccatttccactctggtacctccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgttcaaccttagacttctgacaag 22462743  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||||||||||  ||| |   |||||||||  |||| ||||||||||| | | ||||| || |||||||| || || ||||| ||||||||    
T  22462744 tcaaacacgcatacacaaaccgagcgacagccttcttcaaaccagaccaccaaaacagcttcttcaagtcatgatacatttttgtagctcccggatgaat 22462843  T
Q  250 actcaa 255  Q
    ||||||    
T  22462844 actcaa 22462849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 120 - 269
Target Start/End: Original strand, 25423969 - 25424117
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||  ||    |||| ||||| ||||||||||||| | || | |||    
T  25423969 tctgatgctcaaccttcgatttctgacaaatcaaacaagaatacacaaactgtgcaacatcgcgtttcaatccagaccaccaaaacaacttctttagatc 25424068  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
     ||||||||||| || ||||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  25424069 atgatacatcttcgtagctcccggatgaatactc-aattacttctatgac 25424117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 50 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 17269010 - 17268799
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||  || ||| || |  ||| ||||||| |||||||| || ||||| |||     
T  17269010 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactctggtacatccaacggtgtcaacaatcctgcaggtttctgatggtcaaccttagacttctggcaag 17268911  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
      ||||| ||||||||||| | ||| |  ||   |||||  |||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  17268910 ttaaacatgcatacacaaaatgagcgacatctcgcttcaacccagaccaccaaaacagctttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaat 17268811  T
Q  250 actcaaactact 261  Q
     ||||| |||||    
T  17268810 gctcaagctact 17268799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 21680384 - 21680249
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||  |||||| ||||||||||| | |||||  ||   |||||  |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  21680384 tctgatgttcaaccttagacttctggcaagtcaaacatgcatacacaaattgagcaacatcacgcttcaaaccaggccaccaaaacagctttttcaaatc 21680285  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaa 255  Q
     ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  21680284 gtgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaa 21680249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 120 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 21831367 - 21831205
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||  ||||  ||   ||||| ||| | ||||||||||||  | ||||| ||    
T  21831367 tctgatgttcaactttagatttttgacaaatcaaacatgcatatacaaactgtgcaacatcacgcttcaatccggaccaccaaaacaatttcttcaagtc 21831268  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
     ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||| ||| ||||||||    
T  21831267 atgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaaactacttttgtgactttcttctaaaat 21831205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22235596 - 22235363
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac-ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaa 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||  || | ||||| || ||  |||||||||||||||| || |||||||||    
T  22235596 acaaaatccatagaaatgctatctcacttccactccggcacatccaacggtgtcaac-aaccctacaggcttctgatgttcaaccttagacttctgacaa 22235498  T
Q  149 accaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaa 248  Q
      |||||| ||||||||||| | ||| |  ||   |||||  |||| |||| |||||| | |||||||||| || |||||||| || |||||  ||||||    
T  22235497 gtcaaacatgcatacacaaaatgagcgacgtcacgcttcaaaccagaccactaaaacagctttttcaaatcatggtacatctttgtagctcccagatgaa 22235398  T
Q  249 tactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatt 283  Q
    |||| || |||||  | |||| ||| |||||||||    
T  22235397 tacttaagctactcttgtgactttcctctaaaatt 22235363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 120 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 37542987 - 37542846
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  ||| | ||||| || | |||||||||||   | ||||||||    
T  37542987 tctgatgctcaaccttggacttctgacaaaccaaacaggcataaacaaactgagcaacatcccttttcataccggaccaccaaaacagtttcttcaaatc 37542888  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactact 261  Q
     || ||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  37542887 atggtacattttcgtagctcctgggtgaatactcaacctact 37542846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 21563579 - 21563417
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| ||||| |||||||  ||||  ||    |||| ||| | ||||||||||||  | ||||| ||    
T  21563579 tctgatgttcaactttagatttatggcaaatcaaacatgcatatacaaactgtgcaacatcacgtttcaatccggaccaccaaaacaatttcttcaagtc 21563480  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
     ||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||| ||||||||    
T  21563479 atgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaagctacttctgtgactttcttctaaaat 21563417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 26738333 - 26738184
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| ||||| || || |||||||||| |||||| | |||||||||||  ||||  ||    |||| ||||| ||||||||||||| | |||| |||    
T  26738333 tctgatgctcaacttttgacttctgacaaatcaaacaggaatacacaaactgtgcaacatcacgtttcaatccagaccaccaaaacaacttcttcagatc 26738234  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
     |||||||| || || |||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  26738233 atgatacattttcgtagctccctgatgaatactcaagctacttctatgac 26738184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 282
Target Start/End: Original strand, 21496837 - 21496997
Alignment:
Q  122 tgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatctt 221  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||  ||    ||||  |||| ||||||||||||  | ||||  || |    
T  21496837 tgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaatttcttcaggtcat 21496936  T
Q  222 gatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||| ||||||||    
T  21496937 gatacatctttgtagctcctggatgaatacttaagctacttctgtgactttcttctaaaat 21496997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 269
Target Start/End: Original strand, 23440920 - 23441139
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||   || | |  ||||| ||| |  ||| |||||||||||| |||||| || |||||||    
T  23440920 acaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctgatgttcaatcttcgacttatgacaaa 23441019  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
    | ||||||| ||||||||| |  || |  ||    |||| ||||| |||||| || | | | || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  23441020 ctaaacaagaatacacaaattgtgctacatcgcgtttcaatccagaccaccagaatatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaat 23441119  T
Q  250 actcaaactacttctatgac 269  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  23441120 actcaagctacttctatgac 23441139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 37291010 - 37290953
Alignment:
Q  212 ttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  37291010 ttcaaatcatgatacatcttcgtggctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 37290953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 20467627 - 20467559
Alignment:
Q  196 ccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttct 264  Q
    |||||||| |||| | |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20467627 ccaccaaaccaacttcttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttct 20467559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 21890435 - 21890223
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||   ||||||  || ||| ||    ||  ||||||| |||||||| || || ||||||     
T  21890435 acaaaatccatggaaatgttgtcccacttccactctggcacatctaacggtgtcaacaacccttcaggcttctgatgctcaaccttagacttttgacaag 21890336  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     | |||| ||||| ||||||| |||||  || |  ||||  |||| ||||||||||||  | |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  21890335 tcgaacatgcataaacaaactgagcaacatcatgtttcaacccagaccaccaaaacaatttcttcaaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaat 21890236  T
Q  250 actcaaactactt 262  Q
    ||| || ||||||    
T  21890235 actaaagctactt 21890223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 14999250 - 14999196
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  14999250 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 14999196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Original strand, 18776645 - 18776699
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  18776645 aaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 18776699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Original strand, 19770835 - 19770889
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  19770835 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 19770889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 21338832 - 21338754
Alignment:
Q  191 ccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    |||| |||| |||||||| | |||||||| |||||||| || || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  21338832 ccagaccacgaaaacaacttcttcaaatcatgatacattttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgac 21338754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Original strand, 22135543 - 22135597
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  22135543 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 22135597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Original strand, 27611229 - 27611283
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  27611229 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 27611283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 27684911 - 27684857
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  27684911 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 27684857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 29475584 - 29475530
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  29475584 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 29475530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Original strand, 41771717 - 41771771
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  41771717 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 41771771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 431 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 16065071 - 16064995
Alignment:
Q  431 ttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaa 507  Q
    ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||| |||  ||| ||||||||||| |||||    
T  16065071 ttgatttcctccaaaatattactcgtcaacttcaacattcccaacttcaccccactaggcgtcaactcactcaccaa 16064995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 269
Target Start/End: Original strand, 16357383 - 16357431
Alignment:
Q  221 tgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16357383 tgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 16357431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 176
Target Start/End: Original strand, 20343044 - 20343100
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaa 176  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||    
T  20343044 tctgatgttcaaccttggacttctgacaaatcaaacaggcataaacaaactgagcaa 20343100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 170
Target Start/End: Original strand, 23574447 - 23574567
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||   || | |  ||||| ||| |  ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  23574447 acaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctgatgttcaatcttcgacttctgacaaa 23574546  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaact 170  Q
    | ||||| | |||||||||||    
T  23574547 ctaaacaggaatacacaaact 23574567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 269
Target Start/End: Original strand, 27519288 - 27519336
Alignment:
Q  221 tgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  27519288 tgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 27519336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 269
Target Start/End: Original strand, 34567375 - 34567423
Alignment:
Q  221 tgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  34567375 tgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 34567423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 266
Target Start/End: Original strand, 23472080 - 23472155
Alignment:
Q  191 ccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctat 266  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |  | ||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  23472080 ccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcgttctagctcccggatgaatacttaagctacttctat 23472155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 170
Target Start/End: Original strand, 18776550 - 18776600
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaact 170  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  18776550 tctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaagaatacacaaact 18776600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 22332398 - 22332344
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  22332398 aaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgac 22332344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Original strand, 40709655 - 40709709
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  40709655 aaatcgtgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgac 40709709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 269
Target Start/End: Original strand, 21408010 - 21408067
Alignment:
Q  212 ttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  21408010 ttcaaatcatgatacatttttgtagctcctgcatgaatactcaaattacttctgtgac 21408067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 269
Target Start/End: Original strand, 23574614 - 23574666
Alignment:
Q  217 atcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  23574614 atcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgac 23574666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 432; Significance: 0; HSPs: 37)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 15292686 - 15292191
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15292686 atcaaaaccattactagtcttaggcaacgctccaacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgat 15292587  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15292586 ggtctctgatgttcaatcttcgatttctgacaaaccaaacaagcataaacatactcagcgatctccttcttcattccagaccaccaaaacaaccttttca 15292487  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15292486 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatttgcctcttaagctcaaacacatctggcacaca 15292387  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15292386 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaaatct 15292287  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15292286 tctttctgacccttcttaatctcttctaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 15292191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 511
Target Start/End: Original strand, 9291579 - 9292074
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9291579 atcaaaactcttactagtcttaggcaacgccccaacaaagtccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 9291678  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9291679 ggtctctgatgttcaatctttgatttcttacaaaccaaacaagcataaacaaactcagcaatttccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 9291778  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  9291779 aatcttgatacatcttaatcgctcctagatgaatactcaaactacttctatgaccctcgtccaaaatttgcctcttaagctcaataacatctggcacaca 9291878  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||    
T  9291879 aactcgatcatgaaacattaaaacaccgttctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgatcaaccaacatcactcggtccacaagttccaaatct 9291978  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  9291979 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatccggtgtcaactcactaacaaaactc 9292074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 511
Target Start/End: Original strand, 14998060 - 14998555
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    ||||||||| |||  ||| || |||||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14998060 atcaaaacctttaacagtcttcggcaacgccccaacaaagtccataaaaatactatctcacttccactttggcacaaacaacggttgcatccaacccgac 14998159  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14998160 ggtctctgatgttcaatcttcgatttctgacaaaccaaacaagcataaacaaactcagcgatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 14998259  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  14998260 aatcttgatacattttagtcgctcctgaatgaatactcaaactacttctataagcttcgtccaaaattttcctcttaagctcaaacacattcggcacaca 14998359  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14998360 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtccccacctttaccttgactaaccaacgtcactcggtccacgagttccaaatct 14998459  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14998460 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatccggtgtcaactcactaaccaaactc 14998555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 511
Target Start/End: Original strand, 13248389 - 13248884
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248389 atcaaaactcttattagtcttaggcaacgtcccaacaaagtccatagaaatacaatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 13248488  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||  | || ||||||||||||| ||||    
T  13248489 ggtctctgatattcaatcttcgatttctgacaaaccaaacaagcataaacaaactcaaaaatatccttcttcattaaaagcaaccaaaacaacctcttca 13248588  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  13248589 aatcttgatacatcttagttgctcctgaatgcatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatctgcctcttaagctcaagaacatctggcacaca 13248688  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   | ||| ||||| |||||||| |||    
T  13248689 aactcgatcacgaaatatcaaaacgtcattctcatccaatctaaagtctccacccttaccttgattaaccaacactattcgatccacaagttccaaatct 13248788  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13248789 tccttctgacccttcttgatcccttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactaactaaccaaactc 13248884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 56 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 12342352 - 12341898
Alignment:
Q  56 tccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaac 155  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||   | |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  12342352 tccatagagatgctatcccacttccactccggcacaaaaaacgattgcatcaaactcgagact-tctgatgttcaatcttcgacttctgacaaatcaaac 12342254  T
Q  156 aagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaa 255  Q
    ||||||| | ||| |  || || ||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |     
T  12342253 aagcataaaaaaattatgcgatatccttcttcattccaggccagtaaaataacctcttcaaatcctgatacatctttgtcactcctggatgaatacttag 12342154  T
Q  256 actacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacacaaactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaat 355  Q
    ||||||  | |||||||| || ||||| ||| |||| ||||||| |||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  12342153 actactcatgtgaccttcttccaaaatctgcttcttaagctcaagcacatccggtacacaaactcagtcacgaaacatcaaaacattgttctcatccaat 12342054  T
Q  356 ctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtcttccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttg 455  Q
    ||||  ||  |||||||||||||||||||||||  ||| || ||||  |||||||| || ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  12342053 ctaacatccacacctttaccttgattaaccaacaccacacgatccaaaagttccaaatcctccttatgaacattcttaatctcttccaaaatattactcg 12341954  T
Q  456 tcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
      | ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12341953 ctagcttcaacattcccaacttcacaccatccggtgtcaactcactaaccaaactc 12341898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 68 - 261
Target Start/End: Original strand, 16028907 - 16029100
Alignment:
Q  68 ctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaa 167  Q
    |||||| ||||||| || |||||||| || ||||||| ||||||||||    ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16028907 ctatcctacttccagtcaggcacaaa-aatggttgcaacaaacccgacaacttctgatgttaaattttcgacttctgacaaaccaaacaagcatacataa 16029005  T
Q  168 actcagcaatctccttcttcattccagg-ccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactact 261  Q
    |||| |  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||    
T  16029006 actctgttatatccttcttcattccagggccaccaaaacaaccttttcaaatcctgatacatcttcgtcgctcctggatgaatactaagactact 16029100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 50 - 282
Target Start/End: Original strand, 27901164 - 27901396
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||  |||||||  || ||| || |  || |||||||| |||||||| || |||||||||     
T  27901164 acaaaatccatagaaatgctgtcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcctctgatgctcaaccttagacttctgacaag 27901263  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||||||||||| ||| |  ||| ||||||  |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||    
T  27901264 tcaaacacgcatacacaaactgagcgacatccctcttcaaaccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatttttgtagcttccggatgaat 27901363  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
    ||||||  ||||  |||||| ||| ||||||||    
T  27901364 actcaagttactcttatgactttcttctaaaat 27901396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 68 - 168
Target Start/End: Original strand, 38811703 - 38811803
Alignment:
Q  68 ctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaa 167  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||  |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38811703 ctatcccactttcactcaggcacaaacagcggtcgcatcaaacccagcggcttctgatgttcaatcttcgatttctgacaaaccaaacaagtatacacaa 38811802  T
Q  168 a 168  Q
    |    
T  38811803 a 38811803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 50 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 1639659 - 1639440
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| | |   || |||  |||||  || |  ||| ||||||| || || ||||| || |||||||    
T  1639659 acaaaatccatggatatgctatcccacttccactctggtatatctaaaggtaccatcattccagcaggtttctgatgctcgactttcgacttttgacaaa 1639560  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
    ||||||||| ||||||||| |  ||||  ||    |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||  || |||||    
T  1639559 ccaaacaagaatacacaaaatatgcaacatcacgtttcaatccagaccaccaaaacaactttttcaaatcatgatacatcttcgtagctctcgggtgaat 1639460  T
Q  250 actcaaactacttctatgac 269  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  1639459 actcaagctacttctatgac 1639440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 50 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 1648771 - 1648560
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  | | |  |||||||  || ||| || |  || |||||||| |||||||| || |||||||||     
T  1648771 acaaaatccatagaaatgctgtcccatttccactccagtatatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcctctgatgctcaaccttagacttctgacaag 1648672  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| |||||||||||||  || |  ||| ||||||  |||| ||||||||||||| | |||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||    
T  1648671 tcaaacatgcatacacaaactgtgcgacatccctcttcaaaccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatggtacatctttgtagctcccggatgaat 1648572  T
Q  250 actcaaactact 261  Q
    ||| || |||||    
T  1648571 acttaagctact 1648560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 50 - 269
Target Start/End: Original strand, 15078413 - 15078632
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||   || |||  ||| || || |  ||  |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  15078413 acaaaatccatggaaatgttgtcccacttccactctggcacatctaatggtgtcattaaccctgcaggcttctgatgttcaaccttagacttctgacaaa 15078512  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||| ||||||| |||||  ||    |||| |||   ||||||||| ||  | ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  15078513 tcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcacgtttcaatccgaaccaccaaaataatttcttcaagtcatgatacatctttgtagctcctggatgaat 15078612  T
Q  250 actcaaactacttctatgac 269  Q
    ||| || |||||||||||||    
T  15078613 acttaagctacttctatgac 15078632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 15414520 - 15414288
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||   || |||| || ||| || |  ||  ||||||||||||| || ||||||||||||     
T  15414520 acaaagtccatggatatgctatcccatttccactctggcacatctaatggtttcagcaacccagcaggcttctgatgttcaactttagatttctgacaag 15414421  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||| |||||||  ||||  ||    || |  || | ||||||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  15414420 tcaaacatgcatatacaaactgtgcaacatcacgtttaaaaccggaccaccaaaacaatttcttcaagtcatgatacatctttgtagctcctggatgaat 15414321  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||| || |||||    
T  15414320 acttaaactacttctgtgactttcttccaaaat 15414288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 267
Target Start/End: Original strand, 7091280 - 7091427
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |  ||||  ||    |||| ||||| ||||||||||||||| || | |||    
T  7091280 tctgatgctcaaccttcgatttctgataaatcaaacaagaatacacaaattgtgcaacatcacgtttcaatccagaccaccaaaacaacctctttagatc 7091379  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatg 267  Q
     ||||||||||| || ||||| |||| |||||| ||  ||||||||||    
T  7091380 atgatacatcttcgtagctcccggataaatacttaagttacttctatg 7091427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 261
Target Start/End: Original strand, 15246702 - 15246913
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||  || ||| || |  ||  ||||||| |||||||| || |||||||||     
T  15246702 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaag 15246801  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||| ||||||| |||||  ||    ||||   ||| ||||||||||||| | ||||| || |||||||| || || ||||| ||||||||    
T  15246802 tcaaacatgcatagacaaactgagcaacatcacgtttcagctcagaccaccaaaacaacttcttcaagtcatgatacatttttgtagctcccggatgaat 15246901  T
Q  250 actcaaactact 261  Q
    ||| || |||||    
T  15246902 acttaagctact 15246913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 261
Target Start/End: Original strand, 14160318 - 14160459
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||  || |  ||    |||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  14160318 tctgatgctcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatcacgtttcaatccagaccaccaaaacaacttcttcaaatc 14160417  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactact 261  Q
     ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  14160418 atgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctact 14160459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 14850530 - 14850382
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||  || |  ||    ||||  |||| ||||||||||||| | || |||||    
T  14850530 tctgatgctcaactttcgacttctgacaaatcaaacaggaatacacaaactgtgccacatcgcgtttcaacccagaccaccaaaacaacttctttaaatc 14850431  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatga 268  Q
     |||||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  14850430 atgatacatcttcatagctcccggatgaatactcaagctacttctatga 14850382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 14303050 - 14302993
Alignment:
Q  212 ttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  14303050 ttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 14302993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 15147049 - 15146900
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | | |||||||||||  || |  ||    |||| ||||| | |||| || | | | |||| |||    
T  15147049 tctgatgttcaatcttcgacttctgacaaaccaaataggaatacacaaactgtgccacatcgcatttcaatccagacgaccagaatatcttcttcagatc 15146950  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
     ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  15146949 atgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 15146900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Original strand, 8387355 - 8387409
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  8387355 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 8387409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 282
Target Start/End: Original strand, 8706766 - 8706928
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  ||||  ||    |||| ||||| ||||||||||||  | || || ||    
T  8706766 tctgatgttcaactttagatttctgacaaatcaaacatgcatatacaaactgtgcaacatcacgtttcaatccagaccaccaaaacaatttctttaagtc 8706865  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
     ||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  ||||| | |||| ||| ||||||||    
T  8706866 atgatacatctttgtagctctcggatgaatacttaagttacttttgtgactttcttctaaaat 8706928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Original strand, 27712279 - 27712333
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  27712279 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 27712333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 215 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 8052692 - 8052639
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatga 268  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  8052692 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatga 8052639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 16354517 - 16354460
Alignment:
Q  212 ttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16354517 ttcagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 16354460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 269
Target Start/End: Original strand, 12477549 - 12477597
Alignment:
Q  221 tgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  12477549 tgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 12477597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 170
Target Start/End: Original strand, 14691680 - 14691800
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||   ||||||  |||||| || |  ||| |||||||||||||||| || || |||||||    
T  14691680 acaaaatccatggatatgctatcccatttccactctggtacatctaacggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatgttcaacctttgacttttgacaaa 14691779  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaact 170  Q
     |||||| | |||||| ||||    
T  14691780 tcaaacaggaatacaccaact 14691800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 18226509 - 18226461
Alignment:
Q  221 tgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  18226509 tgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 18226461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 176
Target Start/End: Original strand, 20891766 - 20891886
Alignment:
Q  56 tccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaac 155  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| || |||  |||||||  |||||| || |  ||  ||||||| |||||||| || |||||||||| ||| |    
T  20891766 tccatagagatactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcatcaaccctgtaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaaatcaagc 20891865  T
Q  156 aagcatacacaaactcagcaa 176  Q
    ||||||| ||||||| |||||    
T  20891866 aagcataaacaaactgagcaa 20891886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 29038467 - 29038419
Alignment:
Q  221 tgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  29038467 tgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 29038419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 18549448 - 18549321
Alignment:
Q  155 caagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactca 254  Q
    |||||||||| ||| || || || ||||||||||| || | ||||||||| | | | || | |||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |    
T  18549448 caagcatacataaattcggctatatccttcttcatacctgcccaccaaaatatcttcttaagatcttgatacatcttagtggctcccgggtgtatactta 18549349  T
Q  255 aactacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
    | |||||  | |||||||| ||||||||    
T  18549348 agctactcttgtgaccttcctctaaaat 18549321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 269
Target Start/End: Original strand, 14681486 - 14681564
Alignment:
Q  191 ccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||||||||| || | | | || ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  14681486 ccaggccaccagaaaatcttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcctatgac 14681564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 196 - 282
Target Start/End: Original strand, 15320074 - 15320160
Alignment:
Q  196 ccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
    ||||||||||||  | ||||| || ||||||||||| || | ||||||||||||||| || |||||||| |||| ||| | ||||||    
T  15320074 ccaccaaaacaatttcttcaagtcgtgatacatctttgtaggtcctggatgaatacttaagctacttctgtgactttcttttaaaat 15320160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Original strand, 18298148 - 18298202
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  18298148 aaatcgtgatacatctttgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgac 18298202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 19777862 - 19777808
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  19777862 aaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 19777808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Original strand, 23956690 - 23956744
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  23956690 aaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 23956744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 169
Target Start/End: Original strand, 12524524 - 12524573
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaac 169  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  12524524 tctgatgctcaactttcgacttctgacaaaccaaacaggaatacacaaac 12524573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 29452961 - 29452820
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||  ||  | ||||  |||| |||||||||||   | ||||||||    
T  29452961 tctgatgctccaccttggacttctgacaaaccaaacaggcataaacgaacttagcaacatctcttttcaaaccagaccaccaaaacagtttcttcaaatc 29452862  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactact 261  Q
     |||||||| || || || || || ||||||||||| |||||    
T  29452861 atgatacatttttgtagcccccgggtgaatactcaacctact 29452820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 120 - 176
Target Start/End: Original strand, 33223771 - 33223827
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaa 176  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||    
T  33223771 tctgatgttcaactttagacttctgacaagtcaaacatgcatacacaaactgagcaa 33223827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 424; Significance: 0; HSPs: 49)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 24831251 - 24830761
Alignment:
Q  20 aaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtc 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24831251 aaacccttactagtcttaggcaacgctccaacgaaatccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtc 24831152  T
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24831151 tctgatgttcaatcttcgatttctgacaaaccaaacaagcataaacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 24831052  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacacaaact 319  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||     
T  24831051 t-gatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatttgcctcttgagctcaaacacattcggcacacaaacc 24830953  T
Q  320 cgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtcttcct 419  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24830952 cgatcactaaacatcaaaacgccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaaatcttcct 24830853  T
Q  420 tctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24830852 tctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcatcatacccaacctcacaccatccggtgtcaactcactaaccaaactc 24830761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 12640269 - 12639806
Alignment:
Q  48 caacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgaca 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  12640269 caacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactttggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaatctttgatttctgaca 12640170  T
Q  148 aaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatga 247  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  12640169 aaccaagcaagaataaacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaacctcttcaaatcctgatacatcttcgttgctcctggatga 12640070  T
Q  248 atactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacacaaactcgatcacgaaacatcaaaacaccattct 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  12640069 atactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatttgcctcttaagttcaaacacatccggcacacaaacccgatcacgaaacatcaaaacgccattct 12639970  T
Q  348 catccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtcttccttctgaccattcttgatctcttccaaaat 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12639969 catccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaaatcctccttctgaccattcttgatctcttccaaaat 12639870  T
Q  448 attgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12639869 attgcttgtcaacttcaacatacccaacctcagaccatcaggtgtcaactcactagccaaactc 12639806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 16 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 22761637 - 22761142
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||||||| | ||| || || ||||||||  |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22761637 atcaaaacccttgccagtctttggtaacgctccggcaaaatccatagagatgatatcccacttccactctggcacaaacaacggttacatcaaacccgac 22761538  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22761537 ggtttctgatgttcaatcttcgatttctaacaaaccaaagaagcataaacaaactctgcaatttccttcttcattccaggccaccaaaacaacctcttca 22761438  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| ||  ||||| | ||||||    
T  22761437 aatcttgatacatcttagtcgctcctggatgaatacttagactacttctatggccttcgtccaaaatctgcctcttaagcttaagaacatccgacacaca 22761338  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||| |||    
T  22761337 aactcggtcatgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctgaagtctccacctttaccttaattaaccaacaccactcgatccacaagttccaaatct 22761238  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22761237 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattacttgtcagcttcaacattcttaacctcacaccatccggtgtcaactcactaaccaaactc 22761142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 16 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 24569736 - 24569241
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||  |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24569736 atcaaaactcttaccagtcttaggcaatactccaacaatgtccatagaaatgttatcccacttccactctggcacaaacaacagttgcatcaaacccgac 24569637  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24569636 ggtttctgatgttcaatcttcgatttctaacaaaccaaacaagcatatacaaactcagcaatttccttcttcattccaggccaccaaaacaacctcttca 24569537  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||  ||||  | ||||||    
T  24569536 aatcctgatacatcttagtcgctcctagatgaatacttaaactacttctatgaccctcgtccaaaatccgcctcttaagctcaagaacattcgacacaca 24569437  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||| |||||||| |||    
T  24569436 aacttgatcacggaatatcaaaacaccattctcatccaatctaaactccccacctttaccttgattaactaacaccactcgatccacaagttccaaatct 24569337  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24569336 tccttctgaccattcttaatctcttccaaaatattacttgtcagcttcagcatccctaacctcacaccatccggtgtcaactcactaaccaaactc 24569241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 16 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 23817111 - 23816681
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  23817111 atcaaaacccttactagtcttaggcaacactccaacaaaatccatagcgatactatcccacttccactctggcacaaacaacggttgtatcaaacctgac 23817012  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  23817011 ggtttctgatgttcaatcttcgacttctgacaaaccaaacaagcataaacaaactctggaatttccttcttcattccaggccactaaaacaacctcttca 23816912  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  23816911 aatactgatacatcttagtcgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgcccaaaatctacctcttaagctcaaaaacatccggtacaca 23816812  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||| |||    
T  23816811 aactcggtcacgaaacatcaaaacaccgttctcatcgaatctgaagtctccacctttaccttgattaaccaacaccactcgatcctcgagttccaaatct 23816712  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaa 446  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  23816711 tccttctgaccattcttaatctattccaaaa 23816681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 16 - 333
Target Start/End: Original strand, 22276653 - 22276970
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22276653 atcaaaactcttactagtcttaggcaacgctccaacaaaatccatagaaatgctatcccatttccattttggtacaaacaacggttgcatcaaacccgac 22276752  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  22276753 ggtctctgatgttcaatcttctatttctgacaaaccaaacaagcataaacaaactcagcaatctccttcttcattttaggccaccaaaacaacctcttca 22276852  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||| |||||||  ||||| ||||||||    
T  22276853 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctacgaccttcgtccaaaatctgcatcttaagctcaagaacatccggcacaca 22276952  T
Q  316 aactcgatcacgaaacat 333  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22276953 aactcgatcacgaaacat 22276970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 32 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 21906221 - 21905865
Alignment:
Q  32 gttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaa 131  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||| |||    
T  21906221 gtttttggcaacgctccaacaaaattcatagatatactatcacacttccactccggtacaaacaacggttgcatcaagcttgacggtttctgatgtccaa 21906122  T
Q  132 ccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatctt 231  Q
     ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  21906121 tcttagacttctgacaaaccacacaagcatacacaaattgagctatatccttcttcgttccaggcgaccaaaacaacctctttaaatcctgatacatctt 21906022  T
Q  232 agttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacacaaactcgatcacgaaac 331  Q
     || ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| || |||||   | |||| |||||||  ||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  21906021 cgtcgctcctggatgaatactaagactactcctgtgaccttcttccaaaatccacttcttaagctcaagtacatccggtacacaaattcgatcacgaaac 21905922  T
Q  332 atcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaac 388  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||    
T  21905921 atcaaaacacaattttcatccaatctaaaatccacacctttactttgattaaccaac 21905865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 330 - 511
Target Start/End: Original strand, 22278794 - 22278975
Alignment:
Q  330 acatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtcttccttctgaccatt 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  22278794 acatcaaaacaccaatctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacaccactcgatccacgagttccaaatcttccttctgatcatt 22278893  T
Q  430 cttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22278894 cttgatctcttccaaaatattgctcgtcaacttcaacatacccaaccttacaccatctggtgtcaactcactaaccaaactc 22278975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 16 - 239
Target Start/End: Original strand, 25129022 - 25129244
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25129022 atcaaaacccttaacagtctttggcaatgctccaacaaagtccatagagatattatcccatttccactctggcataaacaacggttgcatcaaacccgac 25129121  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    ||| | |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  25129122 ggtttatgatattcaatcttcgacttctgacaaaccaaacaagcataaacaaactctgcaatctccttcttccttctaggccaccaaaacaacctcttca 25129221  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctc 239  Q
    |||| | |||||||||||||||||    
T  25129222 aatcct-atacatcttagttgctc 25129244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 278 - 511
Target Start/End: Original strand, 25129246 - 25129479
Alignment:
Q  278 aaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacacaaactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttacctt 377  Q
    |||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  25129246 aaaatttgtctcttaagctcaagcacatccggcacacaaactcgatcacgaaacttcagaacaccgttctcatcctatctgaagtctccacctttacctt 25129345  T
Q  378 gattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtcttccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacct 477  Q
    | |||||||||  ||||  ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| | |||||||||  | |||||    
T  25129346 ggttaaccaacaccacttagtccacgagttccaaatcttctttatgaccattcttaatatcttctaaaatattacttgttagcttcaacatttctaacct 25129445  T
Q  478 cacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  25129446 cacaccatctggcgtcagctcactaaccaaactc 25129479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 120 - 269
Target Start/End: Original strand, 23066870 - 23067019
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||  ||||| ||    |||| ||||| ||||||||||||| | || | |||    
T  23066870 tctgatgctcaaccttcgacttctgacaaatcaaacaataatacacaaactgtgcaatatcgcgtttcaatccagaccaccaaaacaacttctttagatc 23066969  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
     ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23066970 gtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatgac 23067019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 27210206 - 27210001
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || |||  |||||||  || ||| || |  || |||||||| |||||||| || |||||||||     
T  27210206 acaaaatccatataaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaatcctgcaggcctctgatgctcaaccttagacttctgacaag 27210107  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| |||||||||||   ||| |  ||||||||||  |||| ||||||||||||| | ||||| || |||||||| || || ||||| ||||||||    
T  27210106 tcaaacacgcatacacaaaacgagcgacatccttcttcaaaccagaccaccaaaacaacttcttcaagtcatgatacattttcgtagctcccggatgaat 27210007  T
Q  250 actcaa 255  Q
    ||||||    
T  27210006 actcaa 27210001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 50 - 261
Target Start/End: Original strand, 23294344 - 23294555
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||  || ||| || |  ||  |||||||||||||||| || |||||||||     
T  23294344 acaaaatccatagaaatgctatcccactttcactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgttcaaccttagacttctgacaag 23294443  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||||||||| | ||| |  ||   |||||  || | ||||||||||| | | |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||    
T  23294444 tcaaacatgcatacacaaaatgagcgacgtcacacttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgatacattttcgttgctcccggatgaat 23294543  T
Q  250 actcaaactact 261  Q
    | |||| |||||    
T  23294544 attcaagctact 23294555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 124 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 21890678 - 21890533
Alignment:
Q  124 atgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttga 223  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |  ||||  ||   ||||| ||| | ||||||||||||| | || | ||| ||     
T  21890678 atgttcaaccttcgacttctgacaaatcaaacaagaatacacaaattgtgcaacatcgcgcttcaatccggaccaccaaaacaacttctttagatcgtgg 21890579  T
Q  224 tacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  21890578 tacatcttcgtagctcctagatgaatactcaagctacttctatgac 21890533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 50 - 278
Target Start/End: Original strand, 27788150 - 27788378
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||  ||| |||  || ||| || |  ||| |||| ||||||||||| || |||||||||     
T  27788150 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaatcctgcaggtttctggtgttcaaccttagacttctgacaag 27788249  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
      ||||| ||||||||||| | |||||  ||   |||||  |||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  27788250 ttaaacatgcatacacaaaatgagcaacatctcgcttcaacccagaccaccaaaacagctttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaat 27788349  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtcta 278  Q
     || || |||||  |||||| ||| ||||    
T  27788350 gcttaagctactcttatgactttcctcta 27788378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 278
Target Start/End: Original strand, 12574762 - 12574990
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||  ||| |||  || ||| || |  ||| |||| ||||||||||| || |||||||||     
T  12574762 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaatcctgcaggtttctggtgttcaaccttagacttctgacaag 12574861  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
      ||||| ||||||||||| | |||||  ||   |||||  |||| ||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  12574862 ttaaacatgcatacacaaaatgagcaacatctcgcttcaacccagaccaccaaaacagctctttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaat 12574961  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtcta 278  Q
     || || |||||  |||||| ||| ||||    
T  12574962 gcttaagctactcttatgactttcctcta 12574990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 27365043 - 27364908
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||  |||||| ||||||||||| | |||||  ||   |||||  |||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  27365043 tctgatgttcaaccttagacttctggcaagtcaaacatgcatacacaaattgagcaacatcacgcttcaaaccagaccaccaaaacagctttttcaaatc 27364944  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaa 255  Q
     ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  27364943 gtgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaa 27364908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19652080 - 19651854
Alignment:
Q  56 tccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaac 155  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||  |||||||  || ||| || |  || |||||||||||||| || || |||||||||  |||||    
T  19652080 tccatagaaatactgtcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcctctgatgttcaacgttagacttctgacaagtcaaac 19651981  T
Q  156 aagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaa 255  Q
    | ||||||||||| | |||||  ||   |||||  || | |||||||| || | | |||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||| ||||    
T  19651980 atgcatacacaaaatgagcaacatcacgcttcaaaccggaccaccaaatcagcttcttcaaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaatattcaa 19651881  T
Q  256 actacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
     |||||  | |||| ||| ||||||||    
T  19651880 gctactcttgtgactttcttctaaaat 19651854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 176
Target Start/End: Original strand, 24642151 - 24642277
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||  || ||| || |  ||  ||||||| |||||||| || |||||||||     
T  24642151 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgccaacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaag 24642250  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaa 176  Q
     |||||| ||||| ||||||| |||||    
T  24642251 tcaaacatgcatagacaaactgagcaa 24642277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 278
Target Start/End: Original strand, 45529990 - 45530148
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| |  || |  ||   |||||  || | ||||||||||||| | ||||||||    
T  45529990 tctgatgttcaactttcgacttctgacaaattaaacacgcatacacaaattgtgccacatctcgcttcaacccggaccaccaaaacaacttcttcaaatc 45530089  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtcta 278  Q
     |||||||| || || ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||    
T  45530090 atgatacatttttgtagctcccggatgaatactcaaattacttctgtgactttcttcta 45530148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 261
Target Start/End: Original strand, 1064230 - 1064371
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  ||| | ||||  || | |||||||||||   | ||||||||    
T  1064230 tctgatgctcaaccttggacttctgacaaaccaaacaggcataaacaaactgagcaacatcccttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatc 1064329  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactact 261  Q
     || |||||||| || || || || |||||||||||||||||    
T  1064330 atggtacatctttgtagcccccgggtgaatactcaaactact 1064371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 283
Target Start/End: Original strand, 23277185 - 23277418
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||   ||| ||  || ||| || |  ||  |||||||||||||||| || |||||||||     
T  23277185 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccattccggcacatctaacagtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgttcaaccttagacttctgacaac 23277284  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     ||| || ||||| ||||| | ||| |  || | |||||  || | ||||||||| | | | |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  23277285 tcaagcacgcatatacaaattgagcgacgtcatgcttcaaaccggaccaccaaaatagcttcttcaaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaat 23277384  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatt 283  Q
    |||||| |||||  | |||| ||| |||||||||    
T  23277385 actcaagctactcttgtgactttcctctaaaatt 23277418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 11357908 - 11357697
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||   ||||||  || ||| || |  ||  ||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  11357908 acaaaatccatagagatactatcccacttccactccggtacatctaacggtgccaacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttggacttctgacaaa 11357809  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||| ||||||| |||||  ||| | ||||  || | |||||||||||   | ||||| || |||||||| || || || ||||| |||||    
T  11357808 tcaaacaggcataaacaaactgagcaacatcccttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaagtcatgatacatttttgtagcccctgggtgaat 11357709  T
Q  250 actcaaactact 261  Q
    ||||||||||||    
T  11357708 actcaaactact 11357697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 22324725 - 22324671
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22324725 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaaactacttctatgac 22324671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 261
Target Start/End: Original strand, 31831137 - 31831278
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||  ||  | ||||| || | ||||||||||| | | ||||||||    
T  31831137 tctgatgctcaaccttagacttctgacaaatcaaacatgcataaacaaactgagcaacatctcttttcataccggaccaccaaaacagcttcttcaaatc 31831236  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactact 261  Q
     || ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  31831237 atggtacatttttgtagcccctgggtgaatactcaacctact 31831278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 23107764 - 23107644
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||   || | |  ||||| ||| |  ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  23107764 acaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctgatgttcaatcttcgacttctgacaaa 23107665  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaact 170  Q
    ||||||| | |||||||||||    
T  23107664 ccaaacaggaatacacaaact 23107644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 270
Target Start/End: Original strand, 24262944 - 24262999
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgacc 270  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24262944 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgacc 24262999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Original strand, 16925934 - 16925988
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16925934 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 16925988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Original strand, 16999574 - 16999628
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16999574 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 16999628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 21144910 - 21144856
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  21144910 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 21144856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Original strand, 24710608 - 24710662
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  24710608 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 24710662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 41608254 - 41608200
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  41608254 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 41608200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 44385438 - 44385384
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  44385438 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 44385384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 196 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 24819574 - 24819501
Alignment:
Q  196 ccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  | ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  24819574 ccaccaaaacaacctcttcaaataatgatacatctttctagctcccggatggatactcaagctacttctgtgac 24819501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 269
Target Start/End: Original strand, 9610716 - 9610764
Alignment:
Q  221 tgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  9610716 tgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 9610764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 269
Target Start/End: Original strand, 16923469 - 16923517
Alignment:
Q  221 tgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16923469 tgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 16923517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 269
Target Start/End: Original strand, 16982732 - 16982780
Alignment:
Q  221 tgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16982732 tgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 16982780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 269
Target Start/End: Original strand, 17064297 - 17064345
Alignment:
Q  221 tgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  17064297 tgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 17064345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 269
Target Start/End: Original strand, 17067955 - 17068003
Alignment:
Q  221 tgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  17067955 tgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 17068003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 269
Target Start/End: Original strand, 27218596 - 27218644
Alignment:
Q  221 tgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  27218596 tgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 27218644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 21325135 - 21325081
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  21325135 aaatcgtgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgac 21325081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 22756429 - 22756379
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaact 170  Q
    |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  22756429 tctgatgttcaatcttcgacttcttacaaaccaaacaggaatacacaaact 22756379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Original strand, 27371843 - 27371897
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  27371843 aaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 27371897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 30210880 - 30210739
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| |  || |  ||   |||||  || | |||||||| |||| | ||||||||    
T  30210880 tctgatgttcaactttcgacttctgacaaattaaacacgcatacacaaattgtgccacatctcgcttcaacccggaccaccaaa-caacttcttcaaatc 30210782  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactactt 262  Q
     |||||||| || || ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  30210781 atgatacatttttgtagctcccggatgaatactcaaattactt 30210739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 269
Target Start/End: Original strand, 24676060 - 24676117
Alignment:
Q  212 ttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  24676060 ttcagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaggctacttctatgac 24676117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 221 - 269
Target Start/End: Original strand, 10869430 - 10869478
Alignment:
Q  221 tgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  10869430 tgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcctatgac 10869478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 221 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 22756328 - 22756280
Alignment:
Q  221 tgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  22756328 tgatacatcttcgtagctcccggttgaatactcaagctacttctatgac 22756280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 124 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 24707442 - 24707398
Alignment:
Q  124 atgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaa 168  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24707442 atgttcaatcttcgacttctgacaaactaaacaagaatacacaaa 24707398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 120 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 41608349 - 41608301
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaa 168  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  41608349 tctgatgttcaactttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaa 41608301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 416; Significance: 0; HSPs: 57)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 21850308 - 21849813
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21850308 atcaaaacccttactagtcttaggcaatgctccaacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactatggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 21850209  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21850208 ggtctctgatgttcaatcttcgatttctgacaaaccaaacaagcataaacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccgaaacaaccttttca 21850109  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  21850108 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatttgcctcttaagctcaaacacatcagacacaca 21850009  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21850008 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctctacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaaatct 21849909  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  21849908 tccttctgacccttcttgatctcttccaaattgttgcttgtcaacttcaacatacccaaccgcacaccctccggtgtcaactcactaaccaaactc 21849813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 16877062 - 16876571
Alignment:
Q  20 aaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtc 119  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16877062 aaacccttattagtcttaggcaacgctccaacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtc 16876963  T
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16876962 tctgatgttcaatctttgatttctgacaaaccaagtaagaataaacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 16876863  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacacaaact 319  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||     
T  16876862 ctgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatttgcctcttgagctcaaacacattcggcacacaaacc 16876763  T
Q  320 cgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtcttcct 419  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  16876762 cgatcacgaaacatcaaaacgccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaaatcctcct 16876663  T
Q  420 tctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16876662 tctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcgacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactagccaaactc 16876571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 16 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 21196473 - 21195978
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21196473 atcaaaacccttcctagtcttaggcaacgctccaacaaaatccatagagatactatcccacctccactatggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 21196374  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    ||| ||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  21196373 ggtttctgatgttcaatttttgacttctgacaaaccaaacaagcataaacaaactatgcaatttcctttttcattccaggccaccaaaacaacatcttca 21196274  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  21196273 aatcctgatacatcttagtcgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatctgcctcttaagctcaagaacatctggcacaca 21196174  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||    
T  21196173 aacttgatcacaaaacatcaaaacctcattctcatccaatctgaagtctccacctttacctagattaaccaacatcactcgatccacgagttccaaatct 21196074  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||| ||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  21196073 tccttctggccatttttaatctcttccaaaatattactcgtcatcttcaacattcctaacctcacaccagccggtgtcaactcactaaccaaactc 21195978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 16 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 20652304 - 20651809
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||  ||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20652304 atcaaaattcttactagtcttcggcaacgctacaacaaagtccatagagatactatcccacttccactctagcacaaacaatggttgcatcaaacccgac 20652205  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20652204 ggtttctgatgttcaatcttcgacttctgacaaaccaagcaagcatacacaaactcagcaatttccttcttcattccaggccaccaaaacaacctcttca 20652105  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||||    
T  20652104 aatcctgattcatcttagtcgctcctggatgaatactcaaactacttctatgacctttttccaaaatctgcctcttaagctcaagaacatccggcacaca 20652005  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||    
T  20652004 aactcggtcacgaaacatcaaaacactgttctcatccaatccgaagtttcctcctttaccttgattaaccaacaccgctcgatccacgagttccaaatct 20651905  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20651904 tccttctaaccattcttaatctcatccaaaatattacttgtcagcttcaacatccccaacctcacaccatctggtgtcaactcactaaccaaactc 20651809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 16 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 23156983 - 23156488
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23156983 atcaaaacccttaacagtcttcggcaacgctccaacaaaatccatagagatactatcccacttccaatctggtacaaacaacggttgcatcaaacccgac 23156884  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  23156883 ggtctctgatgttcaatcttcgacttctgacaaaccaaacaagcaaacacaaatttcgcaatctccttcttcattccaggccacaaaaacaacctcttca 23156784  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  23156783 aatcctgatacatcttagtcgctcctggatgaatactcaaactactcttatgaccttcgtccaaaatctgtctcttaagctcaagcacatctggcacgca 23156684  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||| |||    
T  23156683 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccgttctcatccaatctgaagtctccacctttaccttgattaaccaacaccactcgaaccaccagttccaaatct 23156584  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||| | |||  |||||||||| |  ||||| |||||||||||||||    
T  23156583 tccttctgaccattcttaatctcttccaaaatatttcttgccagcttcaacattctcaatatcacaccatctgacgtcaattcactaaccaaactc 23156488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 16 - 511
Target Start/End: Original strand, 22316001 - 22316496
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    ||||||||||||   ||| || |||||| |||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  22316001 atcaaaacccttcacagtcttcggcaacactccaacaaagtccatagagatattgtcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaactcgat 22316100  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    | | ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  22316101 gatttctaatgttcaatcttcgacttctgacaaaccaaacaagcataaacaaactctgtgatctccttcttcattccaggccaccaaaacaatctcttca 22316200  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  22316201 aatcctgatacatcttcgttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatctgtctcttaagctcaagcacatccggcacaca 22316300  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| ||||| |||||||| |||    
T  22316301 aactcgatcatgaaacatcaaaacaccgttctcacccaatctgaagtctcctcctttaccttgattaactaacaccactcgatccacaagttccaaatct 22316400  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  22316401 tctttttgaccattcttaatctcttccaaaatattacttgtcagcttcaacattcctaacctcacaccatccggcgccaactcactaaccaaactc 22316496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 240 - 508
Target Start/End: Original strand, 23901221 - 23901489
Alignment:
Q  240 ctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacacaaactcgatcacgaaacatcaaaac 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  23901221 ctggatgaatactcaaactacttctatgatcttcgtccaaaatctgtctcttaagcttaagcacatctggcacacaaacttgatcacaaaacattaaaac 23901320  T
Q  340 accattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtcttccttctgaccattcttgatctct 439  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||| ||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||     
T  23901321 accgttctcatccaatctaaagtctccacctttaccttggttaaccaacacccctcgatccacaagtttcaaatctaccttctgaccattcttaatctcc 23901420  T
Q  440 tccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaa 508  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  23901421 tccaaaatattactcgtcaacttcaacatccctaacctcacgccattcggtgtcaactcactaaccaaa 23901489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 51 - 355
Target Start/End: Original strand, 25283201 - 25283505
Alignment:
Q  51 caaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaac 150  Q
    |||| |||||| | || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  25283201 caaaatccatatagatactatcctacttccactcaggcacaaacaacggttgcatcaaaccctacatcttctgatgttcaatcttagacttctgacaaac 25283300  T
Q  151 caaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaata 250  Q
    |||||||||||||||||||||    || |||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||    
T  25283301 caaacaagcatacacaaactcctatatatccttcttcattcctggccaccaaaacaatttcttcaaatcctgatacatcttcgtcactcctagatgaata 25283400  T
Q  251 ctcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacacaaactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcat 350  Q
    || ||||||||  | |||||||| || ||||| ||| |||| |||||||  ||||  || ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  25283401 cttaaactactcttgtgaccttcttccaaaatctgcttcttaagctcaagtacatgcggtacacagactcgatcatgaaacatcaaaacatcattctcat 25283500  T
Q  351 ccaat 355  Q
    |||||    
T  25283501 ccaat 25283505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 192
Target Start/End: Original strand, 22983244 - 22983419
Alignment:
Q  17 tcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacg 116  Q
    ||||||||||||| ||| || || |||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  22983244 tcaaaacccttaccagtcttcggtaacgctccaacaaaatccatagagatactatcccaattccactctggcacaaacaacggttgcatcaaaccctgcg 22983343  T
Q  117 gtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattcc 192  Q
    || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22983344 gtttctgatgttcaatcttcgacttctgacaaaccaaacaagcatatacaaactcagcaatttccttcttcattcc 22983419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 47 - 282
Target Start/End: Original strand, 25282971 - 25283206
Alignment:
Q  47 ccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgac 146  Q
    |||||||| |||||| | || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||| ||| || |||||||    
T  25282971 ccaacaaaatccatatagatactatcctacttccactcaggcacaaacaacggttgcatcaaaccctacatcttctgatgttcaatcttagacttctgac 25283070  T
Q  147 aaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatg 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||||| ||||    
T  25283071 aaaccaaacaagcatacacaaactctgatatatccttcttcattcctggccaccaaaacaacttcttcaaatcctgatacatcttcgtcgctcctagatg 25283170  T
Q  247 aatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
    |||||| |||||||| || |||||||| || |||||    
T  25283171 aatacttaaactactcctgtgaccttcttccaaaat 25283206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 231
Target Start/End: Original strand, 22283836 - 22284029
Alignment:
Q  38 ggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcg 137  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||  |||| ||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||| |   |||||||||||| ||| |    
T  22283836 ggcaacgctccaacaaaatccatataaatattatctcacttccactcaggaataaacaacggttgcgtcaaacccgaagacttctgatgttcaatcttag 22283935  T
Q  138 atttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatctt 231  Q
    | |||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||    
T  22283936 acttctgacagatcaaacaagcatacacaaactcagctatatccttcttcattccatgccaccaaaacaacttcttcagatcctgatacatctt 22284029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22366605 - 22366393
Alignment:
Q  47 ccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgac 146  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||  || |||||  ||||||| || | ||| ||||||||||    
T  22366605 ccaacaaaatccatcgaaatactatcccacttccactccggcacaaaaaatggttgcatcactcctgacggcatctgatgctcgatcttagatttctgac 22366506  T
Q  147 aaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatg 246  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | | |  ||| ||||||||||  |||||| | ||||| | || | |||||||||||||||  | |||||  ||||    
T  22366505 aaaccaaacaagcaaacacaaacttatctacgtccctcttcattcctagccaccgatacaacttcttaagatcttgatacatcttcatcgctccgagatg 22366406  T
Q  247 aatactcaaacta 259  Q
    |||||||||||||    
T  22366405 aatactcaaacta 22366393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 311 - 511
Target Start/End: Original strand, 22284086 - 22284286
Alignment:
Q  311 acacaaactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttcca 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||  ||| |||||||||||||||||||  | | || ||||| |||||||    
T  22284086 acacaaactcgatcacgaaacatcaagacaccattctcatccaatctgaaatccacacttttaccttgattaaccaacaccgcacgatccacaagttcca 22284185  T
Q  411 agtcttccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaact 510  Q
    | || || ||||||   ||||| || || ||||||||||| |||| || ||||||||| | |||  ||||||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  22284186 aatcctctttctgagtgttcttaatttcctccaaaatattacttgccagcttcaacattctcaaattcacaccactcggcgtcaactcacttaccaaact 22284285  T
Q  511 c 511  Q
    |    
T  22284286 c 22284286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 149
Target Start/End: Original strand, 23901085 - 23901218
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    ||||||||||||  ||||  | ||||||||||||||||| ||||||   ||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23901085 atcaaaacccttcgtagtcctcggcaacgctccaacaaagtccatatgtatattatcccacttccaatctagcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 23901184  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    | | | |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  23901185 gatttatgatgttcaatcttcgacttctgacaaa 23901218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 382 - 480
Target Start/End: Original strand, 22435465 - 22435563
Alignment:
Q  382 aaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtcttccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcac 480  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  22435465 aaccaacaccactcgatccacgagttccaaatcttctctctgaccattcttaatctcttccaaaatattacttgttaacttcaacattcctaacctcac 22435563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 120 - 267
Target Start/End: Original strand, 21043359 - 21043506
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||  ||    |||| ||| | ||||||||||||| | || |||||    
T  21043359 tctgatgctcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagaatacacaaattgtgcaacgtcgcatttcaatccggaccaccaaaacaacttctttaaatc 21043458  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatg 267  Q
     ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  ||||||||||    
T  21043459 atgatacatcttcgtagctctcggatgaatactcaagttacttctatg 21043506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 120 - 269
Target Start/End: Original strand, 23650955 - 23651104
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||  ||||  ||    |||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  23650955 tctgatgctcaactttcgacttctgacaaatccaacaagaatacacaaactgtgcaacatcacgtttcaatccagaccaccaaaacaactttttcagatc 23651054  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
     ||||||||||| || |||||  |||||||||||||  ||||||||||||    
T  23651055 atgatacatcttcgtagctcccagatgaatactcaagatacttctatgac 23651104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 50 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 31570779 - 31570551
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||  ||| |||  || ||| || |  ||| |||| ||||||||||| || |||||||||     
T  31570779 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaatcctgcaggtttctggtgttcaaccttagacttctgacaag 31570680  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
      ||||| ||||||||||| | |||||  ||   |||||  |||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  31570679 ttaaacatgcatacacaaaatgagcaacatctcgcttcaacccagaccaccaaaacagctttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaat 31570580  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtcta 278  Q
     || || |||||  |||||| ||| ||||    
T  31570579 gcttaagctactcttatgactttcctcta 31570551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 120 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 21921603 - 21921454
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||  ||    |||| ||||| ||||||||||||| | || | |||    
T  21921603 tctgatgctcaacctttgatttctgacaaatcaaacaagaatacacaaactgtgcaacatcacgtttcaatccagaccaccaaaacaacttctttagatc 21921504  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
     || |||||||| || ||||| ||||||||||||||  |||| |||||||    
T  21921503 gtggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttactcctatgac 21921454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 120 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 22377321 - 22377172
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| |||||  | ||||| ||||||| |||||| | |||||||||||  || |  || |  |||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  22377321 tctgatgctcaactattgatttatgacaaatcaaacaggaatacacaaactgtgccacatcgtgtttcaatccagaccaccaaaacaacttcttcaaatc 22377222  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
     ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22377221 atgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctatttctatgac 22377172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 120 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 22383496 - 22383347
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| |||||  | ||||| ||||||| |||||| | |||||||||||  || |  || |  |||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  22383496 tctgatgctcaactattgatttatgacaaatcaaacaggaatacacaaactgtgccacatcgtgtttcaatccagaccaccaaaacaacttcttcaaatc 22383397  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
     ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22383396 atgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctatttctatgac 22383347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 120 - 269
Target Start/End: Original strand, 22988110 - 22988259
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||  || || ||    ||||  |||| ||||||||||||| | |||| |||    
T  22988110 tctgatgctcaactttcgacttctgacaaatcaaacaggaatacacaaactgtgccatatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcagatc 22988209  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
     |||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  22988210 atgatacattttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 22988259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 282
Target Start/End: Original strand, 19868537 - 19868769
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||  | | |  ||| ||||||||||| || |||||| | |||||||| || || || || |||||||    
T  19868537 acaaaatccatcgaaatgttgtcccacttccactccagaatactcaagggttgcatcaatccagacggtttttgatgttctacttttgacttttgacaaa 19868636  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
      |  |||||||||||||| || || || ||||||||||| || | ||||||||| | | | || | |||||||||||||||||| ||||| || || ||    
T  19868637 ttaggcaagcatacacaaattcggctatatccttcttcatacctgcccaccaaaatatcttcttaagatcttgatacatcttagtggctcccgggtgtat 19868736  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
    | | || ||||| || |||||||| ||||||||    
T  19868737 agttaagctactcctgtgaccttcctctaaaat 19868769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 31416411 - 31416179
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||  || ||| || |  ||  ||||||| |||||||| || |||||||||     
T  31416411 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaag 31416312  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     ||| || ||||| ||||| | |||||  ||   |||||  || | ||||||||||| | | |||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||    
T  31416311 tcaagcatgcataaacaaaatgagcaacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatggtacatctttgtagctcccggatgaat 31416212  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
    |||||| |||||  | |||| ||| ||||||||    
T  31416211 actcaagctactcttgtgactttcttctaaaat 31416179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 21393732 - 21393585
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||  ||    |||| ||| | ||||||||| ||| | || | |||    
T  21393732 tctgatgctcaaccttcgacttctggcaaatcaaacaagcatacacaaactgtgcaacgtcgcgtttcaatccggaccaccaaaataacttctttagatc 21393633  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatg 267  Q
     ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21393632 atgacacatcttcgtagctcctggatgaatactcaagttacttctatg 21393585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 21788226 - 21788079
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||  ||    |||| ||| | ||||||||| ||| | || | |||    
T  21788226 tctgatgctcaaccttcgacttctggcaaatcaaacaagcatacacaaactgtgcaacgtcgcgtttcaatccggaccaccaaaataacttctttagatc 21788127  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatg 267  Q
     ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21788126 atgacacatcttcgtagctcctggatgaatactcaagttacttctatg 21788079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 282
Target Start/End: Original strand, 1267088 - 1267314
Alignment:
Q  56 tccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaac 155  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||  || ||| || |  ||  ||||||| |||||||| || |||||  ||  |||||    
T  1267088 tccatagaaatgctatcccatttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttagacttctggaaagtcaaac 1267187  T
Q  156 aagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaa 255  Q
    | ||||||||||| |  ||||  ||    ||||  || | ||||||||||| | |||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  1267188 atgcatacacaaaatgggcaacgtcacgtttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatctttgtagctcctggatgaatactcaa 1267287  T
Q  256 actacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
     |||||  | |||| ||| ||||||||    
T  1267288 gctactcttgtgactttcttctaaaat 1267314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 282
Target Start/End: Original strand, 21841261 - 21841493
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||   ||||||  || ||| || |  ||  ||| ||| |||||||| || |||| ||||     
T  21841261 acaaaatccatggaaatgttgtcccacttccactctggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctaatgctcaaccttagacttctaacaag 21841360  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||| ||||||  |||||  ||    ||||  |||| ||||||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21841361 tcaaacatgcataaacaaacatagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaatttcttcaagtcatgatacatctttgtagctcctggatgaat 21841460  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
    ||| || |||||||| |||| ||| ||||||||    
T  21841461 acttaagctacttctgtgactttcttctaaaat 21841493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 282
Target Start/End: Original strand, 19852256 - 19852487
Alignment:
Q  51 caaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaac 150  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||  || ||| || |   |  ||||||| |||||||| || |||||||||      
T  19852256 caaaatccatggaaatgctgtcccacttccactctggcacatcgaacggtgtcaacaaccctgcatgcttctgatgctcaaccttagacttctgacaagt 19852355  T
Q  151 caaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaata 250  Q
     ||||| ||||| | ||||| |||||  ||    ||||  || | ||||||||||||  | ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  19852356 taaacatgcataaaaaaactgagcaacatcacgtttcaaaccggaccaccaaaacaatttcttcaagtcatgatacatctttgtagctcctggatgaata 19852455  T
Q  251 ctcaaactacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
    || || |||||||| |||| ||| ||||||||    
T  19852456 cttaagctacttctgtgactttcttctaaaat 19852487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 282
Target Start/End: Original strand, 19858292 - 19858523
Alignment:
Q  51 caaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaac 150  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||  || ||| || |   |  ||||||| |||||||| || |||||||||      
T  19858292 caaaatccatggaaatgctgtcccacttccactctggcacatcgaacggtgtcaacaaccctgcatgcttctgatgctcaaccttagacttctgacaagt 19858391  T
Q  151 caaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaata 250  Q
     ||||| ||||| | ||||| |||||  ||    ||||  || | ||||||||||||  | ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  19858392 taaacatgcataaaaaaactgagcaacatcacgtttcaaaccggaccaccaaaacaatttcttcaagtcatgatacatctttgtagctcctggatgaata 19858491  T
Q  251 ctcaaactacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
    || || |||||||| |||| ||| ||||||||    
T  19858492 cttaagctacttctgtgactttcttctaaaat 19858523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 269
Target Start/End: Original strand, 19978811 - 19979030
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||   || | |  ||||| ||| |  ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  19978811 acaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctgatgttcaatcttcgacttctgacaaa 19978910  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
    ||||||| | |||||||||||  || |  ||    || | ||||| |||||| || | | | || | ||| ||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  19978911 ccaaacaggaatacacaaactgtgccacatcacgttttaatccagaccaccagaatatcttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaat 19979010  T
Q  250 actcaaactacttctatgac 269  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  19979011 actcaagctacttctatgac 19979030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 22248354 - 22248135
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||   || |||   ||||| || |  ||| ||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  22248354 acaaaatccatggatatgctatcccatttccactctggtacatctaaaggtgttatcaaccctgcaggtttctgatgctcaactttcgacttttgacaaa 22248255  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| | |||||||||||  || |  ||    ||||  |||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||| | || ||||| ||||||||    
T  22248254 tcaaacaggaatacacaaactgtgccacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcctcgtagctcccggatgaat 22248155  T
Q  250 actcaaactacttctatgac 269  Q
    || ||| |||||||||||||    
T  22248154 acacaagctacttctatgac 22248135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 262
Target Start/End: Original strand, 23949904 - 23949975
Alignment:
Q  191 ccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactactt 262  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23949904 ccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactt 23949975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 191 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 20395928 - 20395850
Alignment:
Q  191 ccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  20395928 ccagaccaccaaaacaatttcttcaaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacttctgtgac 20395850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 803540 - 803399
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||  ||  | ||||  |||| |||||||||||   | ||||||||    
T  803540 tctgatgctcaaccttggacttctgacaaaccaaacaggcataaacgaacttagcaacatctcttttcaaaccagaccaccaaaacagtttcttcaaatc 803441  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactact 261  Q
     || |||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  803440 atggtacatctttgtagcccctgggtgaatactcaacctact 803399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 269
Target Start/End: Original strand, 22040773 - 22040922
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||  || |  ||    |||| ||||| |||||| || | | | || |||||    
T  22040773 tctgatgctcaatcttcgacttctgacaaactaaacaggaatacacaaactgtgccacatcacgtttcaatccagaccaccagaaaatcttctttaaatc 22040872  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
     ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  22040873 gtgatacatcttcgtagctcctagatgaatactcaagctacttctatgac 22040922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 261
Target Start/End: Original strand, 23655841 - 23655982
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||  ||    ||||  |||| ||||||||||| | | ||||||||    
T  23655841 tctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcataaacaaactgagcaacgtcacgtttcaacccagaccaccaaaacagcttcttcaaatc 23655940  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactact 261  Q
     ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||    
T  23655941 atgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctact 23655982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 22365754 - 22365694
Alignment:
Q  47 ccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatca 107  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22365754 ccaacaaaatccatcgaaatattatcccacttccactccggcacaaacaatggttgcatca 22365694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 196 - 283
Target Start/End: Original strand, 22051853 - 22051940
Alignment:
Q  196 ccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatt 283  Q
    ||||||||||| | |||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  | |||| ||| |||||||||    
T  22051853 ccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaacctactcttgtgactttcctctaaaatt 22051940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 262
Target Start/End: Original strand, 14566056 - 14566198
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||  ||||| ||||| ||||||| |||||  ||| | ||||  || | |||||||||||   | ||||||||    
T  14566056 tctgatgctcaaccttggacttctgacaaattaaacaggcataaacaaactgagcaacatcccttttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatc 14566155  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactactt 262  Q
     |||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||||    
T  14566156 atgatacatttttgtagcccctgggtgaatactcaacctactt 14566198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Original strand, 15534392 - 15534446
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  15534392 aaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 15534446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Original strand, 18857586 - 18857640
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  18857586 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 18857640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 20009695 - 20009625
Alignment:
Q  212 ttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||| ||||||||    
T  20009695 ttcaaatcatgatacatatttgtagctcctggatgaatacttaagctacttctgtgactttcttctaaaat 20009625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 282
Target Start/End: Original strand, 20389013 - 20389175
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||   |||  ||   ||||| ||| | |||| |||||||  | ||||| ||    
T  20389013 tctgatgttcaactttagatttctgacaaatcaaacatgcatatacaaactgtacaacatcacgcttcaatccggaccactaaaacaatttcttcaagtc 20389112  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
     ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||| | | |||| ||| ||||||||    
T  20389113 atgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctacgtatgtgactttcttctaaaat 20389175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 22128730 - 22128676
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  22128730 aaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaaactacttctatgac 22128676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 30312916 - 30312862
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  30312916 aaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 30312862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 19483839 - 19483782
Alignment:
Q  212 ttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  19483839 ttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgac 19483782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 16407811 - 16407763
Alignment:
Q  221 tgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16407811 tgatacatcttcgtagctcctgggtgaatactcaagctacttctatgac 16407763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 269
Target Start/End: Original strand, 19113705 - 19113753
Alignment:
Q  221 tgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  19113705 tgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 19113753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 278
Target Start/End: Original strand, 22371784 - 22372012
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||   ||||||  || ||| || |  ||  |||||||||||||||| || |||||||||     
T  22371784 acaaaatccatggaaatgttgtcccacttccactcaggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgttcaaccttagacttctgacaag 22371883  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||| ||||||| |||||  || |  |||| ||  | ||||||||| ||  | ||||| || ||||||||||| || |||||  | |||||    
T  22371884 tcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcatgtttcaatctggaccaccaaaataatttcttcaagtcatgatacatctttgtagctcccaggtgaat 22371983  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtcta 278  Q
    ||| || |||||||| |||| ||| ||||    
T  22371984 acttaagctacttctgtgactttcttcta 22372012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 17673795 - 17673741
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  17673795 aaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 17673741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 20975588 - 20975538
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  20975588 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggcacatccaacggt 20975538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 21166405 - 21166355
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaact 170  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  21166405 tctgatgttcaatcttcgacttctgataaaccaaacaggaatacacaaact 21166355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 170
Target Start/End: Original strand, 21251855 - 21251905
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaact 170  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  21251855 tctgatgctcaaccttcgacttctgacaaatcaaacaagaatatacaaact 21251905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 22132813 - 22132759
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  22132813 aaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttcaatgac 22132759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 221 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 21166304 - 21166256
Alignment:
Q  221 tgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  21166304 tgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgac 21166256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 221 - 269
Target Start/End: Original strand, 32601159 - 32601207
Alignment:
Q  221 tgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  32601159 tgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagctacttctatgac 32601207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 400; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 511
Target Start/End: Original strand, 5950 - 6444
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5950 atcaaaactcttactagtcttaggcaacgctccaacaaagtccatagaaatgctatcccacttccactctggaacaaacaacggttgcatcaaacccgac 6049  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6050 ggtctctaatgttcaatcttcgatttctgacaaaccaaacaagcataaacaaactcagcaatttccttcttcattccaggccaccaaaacaacctcttca 6149  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  6150 aatcttgatacatcttagttgctcctggatga-tactcaaactacttctatgaccttcatctaaaatcttcctcttaagctcaaacacatccgacacaca 6248  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  6249 aactcgatcacgaaacatcaaaacattattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccacatct 6348  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6349 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattacttgtcagcctcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 6444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 396; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 511
Target Start/End: Original strand, 13683 - 14178
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    ||||||| |||||  ||| || |||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13683 atcaaaaaccttaacagtcttcggcaaccccccaacaaagtccatagaaatactatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 13782  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13783 ggtctctgttattcaatcttcgatttctgacaaaccaaacaagcataaacaaactcagcaatttccttcttcattccaggccaccaaaacaacctcttca 13882  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  13883 aatcttgatacatcttagtcgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatttgcctcttaagctcaaacacatccggcacaca 13982  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  13983 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccagtctcacccaatctaaagtctccaccttttccttgattaaccaacgtcactcgattcacgagttccaaatct 14082  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14083 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 14178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 393; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 7336 - 6844
Alignment:
Q  20 aaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctat-cccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggt 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7336 aaacccttactagtcttaggcaacgctccaacaaaatccatggaaatgctatacccatttccactttggcacaaacaacggttgcatcaaacccgatggt 7237  T
Q  119 ctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaat 218  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7236 ctttgatgttcaatcttcgatttctgacaaaccaagcaaacataaacaaactcagcgatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaat 7137  T
Q  219 cttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacacaaac 318  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  7136 cctgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatttgcctcttaagctcaaacacatccggcacacaaac 7037  T
Q  319 tcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtcttcc 418  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  7036 tcgatcacgaaacatcaagacaccattctcacccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcacttggtccacgagtttcaaatcttcc 6937  T
Q  419 ttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6936 ttctgacccttcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcgctaaccaaactc 6844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 168
Target Start/End: Original strand, 13007 - 13125
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||  || ||| || |  ||  |||||||||||||||| || ||| |||||     
T  13007 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgttcaaccttagacttcagacaag 13106  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaa 168  Q
     |||||| |||||||||||    
T  13107 tcaaacatgcatacacaaa 13125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 376; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 9392 - 8897
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||| |||| |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9392 atcaaaactcttattagtcttaggaaacgccccaacaaagtccatagaaatgctatcccacttccattctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 9293  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9292 ggtctctgatgttcaatcttcgatttctaacaaaccaaacaagcataaacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaacctcttca 9193  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||  ||||| ||||||||    
T  9192 aatcctaatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttcgatgaccttcgtctaaaatctgccttttaagctcaagaacatccggcacaca 9093  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||| |||    
T  9092 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattcaccaacatcactccatccacgagttccaaatct 8993  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8992 tccttctgaccattcttaatctcttccaaaatattgcttgttagcctcaacatacccaacctcacaccatccggtgtcaactcactaaccaaactc 8897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 376; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 511
Target Start/End: Original strand, 18822 - 19317
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |     
T  18822 atcaaaacccttaacagtcttcggcaatgctccaacaaagtccatagaaatactatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacacaaa 18921  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18922 ggtctctgatgttcaatcttcgatttctgacaaaccaaacaagcataaacaaactcagcaatttccttcttcattccaggccaccaaaacaacctcttca 19021  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||  ||||| ||||||||    
T  19022 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatcttcctcttaagctcaagaacatccggcacaca 19121  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||    
T  19122 aactcgatcacgaaacattaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacaccactcgatccacgagttccaaatct 19221  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  19222 tccttctgaccattcttaatctcttccaaaatattacttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatccggtatcaactcactaaccaaactc 19317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 368; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 508
Target Start/End: Original strand, 3317 - 3811
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3317 atcaaaactcttactagtcttaggcaacgttcgaacaaagtccatagaaatattatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 3416  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3417 ggtctctgatgttcaatctttgatttttgacaaagcaaacaagcataaacaaactcaccaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaacctcttca 3516  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  ||||||  ||||| ||||||||    
T  3517 aatcttgatacatcttagtcgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatccgcctcttacgctcaataacatccggcacaca 3616  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3617 aaatcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaaatct 3716  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttcc--aaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaa 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3717 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaaaatattacttgtcaacttcaacatccctaacctcacaccatccggtgtcaactcactaaccaaa 3811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 366; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 511
Target Start/End: Original strand, 239 - 732
Alignment:
Q  18 caaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacgg 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  239 caaaacccttactagtcttaggcaacgctccaacaaaatccatagaaatgctatcccaaatccactctggaacaaacaacggttgcatcaaacccgatgg 338  T
Q  118 tctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaa 217  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  339 tctctgatgttcaatcttcgatttctgacaaaccaaacaagcataaacaaactcagcaatatcattcttcattccaggccaccaaaacaacctcttcaaa 438  T
Q  218 tcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacacaaa 317  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||| ||| |||    
T  439 tcttgatacatcttagtcgctcctagatgaatactcaaactacttatatgaccttcgtccaaaatttgcctcttaagctcaagaacatctggtacataaa 538  T
Q  318 ctcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtcttc 417  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  539 ctcgatcacaaaacatcaaaacattattctcatccaatctaaagtatccacccgtaccttgattaactaacgtcactcggtccacgagttccaaatcttc 638  T
Q  418 cttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  639 cttttgaccattcttgatctcttccaaaatactgcttgtcagcttcaacatacccaacctcacaccatccggtgtcaactcactaaccaaactc 732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 364; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 27797 - 27302
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||| ||||||| | ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27797 atcaaaactcttactaatcttaggtaatgctccaacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 27698  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  27697 ggtctctgatgttcaatctttgatttctgacaaaccaaacaagcataaacaaactcagcaatctccttcttcatcccaggccaccaaaacaacctcttca 27598  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||||  ||||| ||||||||    
T  27597 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttatatgaccttcgtccaaaatttgtcttttaagctcaataacatccggcacaca 27498  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||   | ||| ||||| |||||||| |||    
T  27497 aactcgatcacgaaacatcaaaacatcattctcatccaatctaaaatctccagctttaccttgattaaccaacactattcgatccacaagttccaaatct 27398  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27397 tccttctgaccattcttaatctcttccaaaatattgcttttcaacttcaacatacccaacctcacaccatcctgtgtcaactcactaaccaaactc 27302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 302 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 26127 - 25920
Alignment:
Q  302 acatctggcacacaaactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtcca 401  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26127 acatccggcacacaaactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtcca 26028  T
Q  402 cgagttccaagtcttccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcact 501  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26027 cgagttccaaatcttccttctgaccattctcgatctcttccaaaatattacttttcaacttcaacatccctaacctcacaccatccggtgtcaactcact 25928  T
Q  502 aaccaaac 509  Q
    ||||||||    
T  25927 aaccaaac 25920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 309 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 16802 - 16600
Alignment:
Q  309 gcacacaaactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttc 408  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16802 gcacacaaaatcgatcatgaaccatcaaaacatcattctcatccaatctaaagtcttcacctttaccttgattaaccaacgtcactcgatccacgagttc 16703  T
Q  409 caagtcttccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaa 508  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16702 caaatcttccttctgaccattcttaatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatccagtgtcaactcactaaccaaa 16603  T
Q  509 ctc 511  Q
    |||    
T  16602 ctc 16600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 20938 - 20727
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  |||||||  || ||| || |  ||  ||||||| |||||||| || |||||||||     
T  20938 acaaaatccatagaaatgctgtcccatttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaag 20839  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||| ||||||| |||||  ||   |||||  |||| ||||||||| | | | ||||||||  |||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  20838 tcaaacacgcatagacaaactgagcaacatcacgcttcaacccagaccaccaaaaaagcttcttcaaatcaagatagatctttgtagctcccggatgaat 20739  T
Q  250 actcaaactact 261  Q
    ||| || |||||    
T  20738 acttaagctact 20727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 363; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 26581 - 27051
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26581 atcaaaaaccttactagtcttaggcaacgccccaacaaagtccatagaaatgttatcccacttccattctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgat 26680  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26681 agtctctgatgttcaatcttcgatttcttacaaaccaaataagcataaacaaaatcagcgatctccttcttcattccaggccaccaaaacaacctcttca 26780  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  26781 aatcatgatacatcttcgttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcatccaaaatttgcctcttaagctcaagaacatctggcacaca 26880  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  26881 aactcgatcacgaaacatcaaaacattattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccatgagttccaaatct 26980  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatc 486  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26981 tccttctgaccattcttgatttcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatc 27051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 50 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 10954 - 10721
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||  || ||| || |  || ||||||||||||||||| || || ||||||     
T  10954 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcctctgatgttcaaccttagacttttgacaag 10855  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| |||||||| || | ||| |  ||   |||||  |  | ||||||||||||| | |||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||    
T  10854 tcaaacatgcatacacgaaatgagcgacgtcacgcttcaaactggaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaat 10755  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatt 283  Q
    ||| || |||||  | |||| ||| |||||||||    
T  10754 acttaagctactcttgtgactttcctctaaaatt 10721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 50 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 21168 - 20935
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||  || ||| || |  || ||||||||||||||||| || || ||||||     
T  21168 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcctctgatgttcaaccttagacttttgacaag 21069  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| |||||||| || | ||| |  ||   |||||  |  | ||||||||||||| | |||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||    
T  21068 tcaaacatgcatacacgaaatgagcgacgtcacgcttcaaactggaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaat 20969  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatt 283  Q
    ||| || |||||  | |||| ||| |||||||||    
T  20968 acttaagctactcttgtgactttcctctaaaatt 20935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 360; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 511
Target Start/End: Original strand, 180699 - 181194
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  180699 atcaaaactcttactagtcttaggcaacgctctaagaaagtccatagaaatgttatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 180798  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |    
T  180799 ggtctctgatgttcaatcttcgatttctgacaaaccaaacaagcataaacaaactcagcaatctccttcttcattcaaggccaccaaaacaacatattaa 180898  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||  ||||  | ||||||    
T  180899 aatcatgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatcttcctcttaagctcaagaacatacgacacaca 180998  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||| |||||||| |||    
T  180999 aactcgatcacgaaacatcaaaacatcattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacattattcgatccacaagttccaaatct 181098  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  181099 tccttctaaccattcataatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaatctcacaccatccggtgtcaactcactaaccaaactc 181194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 195201 - 194968
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||  || ||| || |  ||  |||||||||||||||| || |||||||||     
T  195201 acaaaatccatagaaatgctatccaacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgtaggcttctgatgttcaaccttagacttctgacaag 195102  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||||||||| | ||| |  ||   |||||  || | ||||||||||| | | |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  195101 tcaaacatgcatacacaaaatgagcgacgtcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcgtgatacatctttgtagctcccggatgaat 195002  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatt 283  Q
    ||| || |||||  | |||| ||| |||||||||    
T  195001 acttaagctactcttgtgactttcctctaaaatt 194968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 25889 - 25811
Alignment:
Q  191 ccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  25889 ccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcgtgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgac 25811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 261
Target Start/End: Original strand, 149379 - 149590
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||  |||||  |||||||  || ||| || |  ||  ||||||| ||||| || || |||||||||     
T  149379 acaaaatccatagaaatgctgtcccaattacactccagcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgctcaacattagacttctgacaag 149478  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||| ||||||| |||||  ||    ||||  |||| ||||||||||| | | |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  149479 tcaaacatgcatagacaaactgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaat 149578  T
Q  250 actcaaactact 261  Q
    ||| || |||||    
T  149579 acttaagctact 149590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 356; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 106104 - 105609
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  106104 atcaaaactcttactagtcttaggcaacattccaacaaagtccatagaaatgctttcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 106005  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  106004 agtctctgatgttcaatcttcgatttctgacaaaccaaacaagcatatacaaactcagcaatttccttcttcattccaggccaccaaaagaacctcttca 105905  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||  ||||| ||||||||    
T  105904 aatcctgatacatcttcgttgctcctggatgaatacttaaactacttctatgaccttcgtccaaaatttgtctcttaagctcaataacatccggcacaca 105805  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| ||||| |||||||| |||    
T  105804 aactcgatcacgaaacatcaaaacatcattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacactattcgatccacaagttccaaatct 105705  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  105704 tccttctgacccttcttgatctcgtccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaatctcacaccatccggtttcaacccactaaccaaactc 105609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 50 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 50011 - 49806
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||  ||| |||  || ||| || |  ||  |||||||||||||||| || ||||| |||     
T  50011 acaaaatccatagaaatactatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgttcaaccttagacttctggcaag 49912  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||||||||| | |||||  ||   |||||  |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  49911 tcaaacatgcatacacaaattgagcaacatcacgcttcaaaccaggccaccaaaacagctttttcaaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatggat 49812  T
Q  250 actcaa 255  Q
    ||||||    
T  49811 actcaa 49806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 197 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 966 - 901
Alignment:
Q  197 caccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactactt 262  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  966 caccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatactcaagctactt 901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 348; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 511
Target Start/End: Original strand, 10069 - 10564
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10069 atcaaaacccttactagtcttcgacaacgctccaacaaaatccatagagatactatcccacttccacactggcacaaacaacggttgcatcaaaccctac 10168  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10169 ggtttctgatgttcaatcttcgatttctgacaaaccaaacaagcataaacaaattctgcgatctccttcttcattccaggccaccaaaacaacctcttca 10268  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  10269 aatcctgatacatcttagtcgctcctggatgaatactcaaactactcctatgaccttcgtccaaaatctgcctcttaagctgaagaacatctggcacaca 10368  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  10369 aactctatcacgaaacatcataacatcattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaaatcc 10468  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  10469 tccttctgaccattcttaatctcttccaacatattacttgtcaacttcaacatcccccatctcacaccatccggtgtcaactcgctaaccaaactc 10564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 340; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 511
Target Start/End: Original strand, 15431 - 15917
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15431 atcaaaacccttactagtcttaggcatcgccccaacaaattccatagaaatgttatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 15530  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15531 ggtctctgatgataaatcttcgatttctgacaaaccaaacaagcataaacaaactaaacaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaacctcttca 15630  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  15631 aatcctgatacatcttagttgctcctggatgaatacttaaactacttctgtgaccctcatccaaaatctgcctcttaagctcaagaacatctggcacaca 15730  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||         ||||| |||    
T  15731 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtcttcaccttttcctcgattaaccaacatcacttgg---------tccaaatct 15821  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15822 tccttctgaccattcttgatctcttccaaagtattacttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatccggtgtcaactcactaaccaaactc 15917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 111
Target Start/End: Original strand, 44313 - 44408
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacc 111  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44313 atcaaaactcttactagtcttaggcaacgctccaacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacc 44408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 328; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 511
Target Start/End: Original strand, 24738 - 25232
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24738 atcaaaacccttaccagtcttcggcaacgctccgacaaaatcgatagagatactatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 24837  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    ||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  24838 ggtttctgatgttcaatcttcgacttttgacaaaccaatcaagcatatacaaactcatcaatttccttcttcattccaggtcaccaaa-caacctcttca 24936  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  24937 aatcctgatacatcttagtagctcctgggtgaatactcaaactagttctatgaccttcgtccaaaatctgcctcttaagctcaagaacatctggcacaca 25036  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| | |||    
T  25037 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccgttctcatccaatctgaagtctccacctttaccttgattaaccaacaccactcgatccacgagttcctaatct 25136  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25137 tccttttgaccattcttaatctcttccaaaatattgcttgtcaatttcaacatcccgaacctcacaccatctggtgtcaactcactaaccaaactc 25232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 511
Target Start/End: Original strand, 71964 - 72459
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  71964 atcaaaactcttactagtcttacgcaacgctccaacaaagtccatataaatgctatcccacttccactctagcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 72063  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    ||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  72064 ggtttctgatgttcaatcttcgacttctaacaaaccaaacaagcatatacaaattctgcgatctccttcttcattccaggccaccaaaacaacctcttca 72163  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||  ||||| ||||| ||    
T  72164 aatcttgatacatcttatttgctcctggatgaatactcagactactcctgtgaccttcgtccaaaatctgtctcttaagctcaagaacatccggcactca 72263  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||| |||||||| |||    
T  72264 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccgttctcatccaatctgaagtctccacctctaccttgattaaccaacactactcgatccacaagttccaaatct 72363  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  72364 tccttatgaccattcttaatctcttccaaaatattgcttgtcaatttcaacattcctaacctcacaccatccgatgtcaactcactaaccaaactc 72459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 16 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 32944 - 32449
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||    
T  32944 atcaaaacccttaccagtcttcggcaacgctccaacaaagtccatagaaaggctatcccacttccactctggaacaaacaatggttacatcaaacctgac 32845  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || || || || || |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  32844 ggtttctgatgttcaatcttcgacttctgacaaaccaaacaaccataaacgaattctgcgatttccttcatcattcctggccaccaaaacaacctcttca 32745  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||  | ||||||    
T  32744 aatcctgatacatcttagtcgctcctggatgaatactcaaactacttttatgaccttcgtctaaaatctgtctcttaagctcaagcacattcgacacaca 32645  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||| || |||    
T  32644 aactcgatcacgaaacattaaaacaccgttctcatccaatctgaagtctccacctttaccttgattaaccaacaccacttgatccacgagttctaaatct 32545  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| || || ||||||||||| || || ||||  ||||||||||||    
T  32544 tccttctgaccattcttaatctcttccaaaatattacttgttagcttcaacattcctaagctcacaccatccggcgttaacttgctaaccaaactc 32449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 3475 - 2988
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |    
T  3475 atcaaaactcttattagttttaggcaacgccccaacaaagtccatagaaatgctatcccacttccactccggcacaaacaacggttgcatcaaactcgtc 3376  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3375 ggtctctgattttcaatcttcgatttctgacaaaccaaacaagcataaacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaacctcttca 3276  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | |||||  ||||| |||| |||    
T  3275 aatcctgatacatcttcgttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatcagcctcttaaactcaaggacatccggcataca 3176  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    || ||||||        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| ||||| |||||||| |||    
T  3175 aattcgatc--------tcaaaacatcattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacactattcgatccacaagttccaaatct 3084  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3083 tccttctgacctttctttatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaatctcacaccatccggtgtcaactcactaaccaaactc 2988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 316; Significance: 1e-178; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 16 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 8421 - 7926
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |    
T  8421 atcaaaacccttactagtcttaggcaatgctccaacaaagtccatagaaatgctgtccaacttccactctagcacaaacaacggttgtatcaaacccggc 8322  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    ||| ||| |||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  8321 ggtttctaatgttcaatctttgacttctgacgaaccaaacaagcataaacaaactcagcaaattccttcttcattctaggccaccaaaacaacctcttca 8222  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||  ||||| | ||||||    
T  8221 aatcctgatacatcttagtcgctcctaggtgaatactcaaaatacttctatgaccctcgtccaaaatctgcctcttatgctcaagaacatccgacacaca 8122  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||| |||    
T  8121 aactcgatcgcgaaacatcaaaataccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacaccactcgatccactagttccaaatct 8022  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8021 tccttctgaccattcttaatctcttccaaaatattacttgtcaacttcaacatccctaacctcacaccatccggtgtcaactcactaaccaaactc 7926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 316; Significance: 1e-178; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 16 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 955 - 460
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  955 atcaaaactcttactagtcttaggcaacgccccaacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactctggtacaaacaacaattgcatcaaacccgac 856  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    ||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  855 ggtttctgatgttcattcttcgacttctgacaaaccaaacaagcataaacaaagtcatcaatttccttcttcattctaggccaccaaaacaacctcttca 756  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||  ||||| ||||||||    
T  755 aatcctgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactatttctatgaccttcgtccaaaatccgcctcttaagctcaagaacatccggcacaca 656  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    |||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  655 aacctgatcacgaaacatcaaaacatcattctcattcaatctgaagtctccacctttaccttgattaactaacgtcactcgatccacgagctccaaatct 556  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  555 tccttctgacccttcctaatctcttccgaaatattgcttgtaagcttcaacatccctaacctcacaccattcggtgtcaactcactaaccaaactc 460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 312; Significance: 1e-176; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 16 - 511
Target Start/End: Original strand, 8040 - 8535
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  8040 atcaaaacccttactagttttcggcatcgctccaacaaaatctatagagatactatcccacttccactttggcacaaacaacggttgcatcaaacctaac 8139  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    ||| |||||| || || ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  8140 ggtttctgatatttaatcttcgatttttgacaaacaaaacaagcataaacaaattctgcgatctccttcttcattccaggccaccaaaacagcctcttca 8239  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  8240 aatcctgatacatcttagtcgctcctggatgaatactcaaactactcctttgaccttcgtccaaaatctgcctcttaagctcaagaacatctggcacaca 8339  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||| || |||    
T  8340 aactctatcacgaaacatcaaaacatcattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacaccactcgatccacaagttctaaatct 8439  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  8440 tccttctgaccattcttaatttcttccaaaatataacttgtcaacttcaacatccccaatctcacaccatccggtgtcaactcgctaaccaaactc 8535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 16 - 511
Target Start/End: Original strand, 265 - 752
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||||||||  ||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  265 atcaaaacccttaacagtcttcggcaacgccccaacaaaatccatagatatgttatcccacttccgttctagcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 364  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    ||| |||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||   ||||||||||||||||||||||| || |    
T  365 ggtttctgatgttcaatcttcgacttccaacaaaccaaacaagcataaacaaactctgcaacctccttc---attccaggccaccaaaacaacctcttta 461  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    |||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  462 aatcctgatacatcatagtcactcttggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatctgtctcttcagctcaagcacatctggcacaca 561  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtct 415  Q
    ||||||||||||||||||||     || |||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||| ||||| |||||||| |||    
T  562 aactcgatcacgaaacatca-----ccgttctcatccaatttgaagtctccaccttgaccttggttaaccaacaccactcgatccacaagttccaaatct 656  T
Q  416 tccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  657 tccttctgaccattcttaatctcttccaaaatattacttgtcagcttcaacattcctaacctcacaccatccggtgtcaactcactaaccaaactc 752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 26300 - 26222
Alignment:
Q  191 ccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26300 ccagaccaccaaaataactttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctatttctatgac 26222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 16 - 511
Target Start/End: Original strand, 7944 - 8442
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  7944 atcaaaacccttaccagtcttaggcaacgctctaacaaaattcatagagatattatcccacttccactctggcacaaacaacgattgcatcaaacctgac 8043  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    ||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8044 ggtctatgatgttcaatcttcgacttatgacaaaccaaacaagcataaacaaattccgcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaacctcttca 8143  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcag---ctcaaacacatctggcac 312  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    ||||| |||||| |||||    
T  8144 aatcctgatacatcttagtcgctcctggatgaatagtcaaactgcttctatgaccttcgtccaaaatctgcctcttaataatctcaagcacatccggcac 8243  T
Q  313 acaaactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaag 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| || || |||||||||    
T  8244 acaaactcgatcacgaaacatcaaaacactattctcatctaatctgaagtctccacccttaccttgattaaccaacaccactcgatctacaagttccaag 8343  T
Q  413 tcttccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||| || ||||| |||||||||||    ||||| |||||||| ||||||    
T  8344 ttctccttctgaccattcttaatctcttccaaaatattacctgtcagcttcaagattcccaatctcacaccatccaacgtcaattcactaacaaaactc 8442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 275; Significance: 1e-153; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 16 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 14268 - 13906
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14268 atcaaaactcttactagtcttaggcaacgctccaacaaagtccatagaaatactatcccacttccactctggcacaaacaacgtttgcatcaaacccgac 14169  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14168 ggtctctgatgttcaatctttgatttctaacaaaccaaacaagcataaacaaactcttcaatttccttcttcattccaggccaccaaaacaacctcttca 14069  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||  ||||| ||||||||    
T  14068 aatcttgatacatcttagtcgctcctggatgaatactcagactacttctatgaccttcgtccaaaatctacctcttaagctcaacaacatccggcacaca 13969  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttg 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13968 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttg 13906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 452 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 13909 - 13850
Alignment:
Q  452 cttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13909 cttgtcaactttaacatccctaacctcacaccatccggtgtcaactcactaaccaaactc 13850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 147 - 511
Target Start/End: Original strand, 23082 - 23446
Alignment:
Q  147 aaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatg 246  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  23082 aaaccaaacaagcataaataaactctgcaatttccttcttcattccaggccactaaaacaacttcatcaaatcctgatacatcttagtcgctcctggatg 23181  T
Q  247 aatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacacaaactcgatcacgaaacatcaaaacaccattc 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23182 aatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatctgcctcttaagctcaataacatttggcacacaaactcgatcacgaaacatcaaaacaccgttc 23281  T
Q  347 tcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtcttccttctgaccattcttgatctcttccaaaa 446  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||    
T  23282 tcatgcaatctgaagtctccacctttaccttgattaaccaacaccactcgatccacgagttccaaatcttccttctgaccattcttaatctcttttaaaa 23381  T
Q  447 tattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  23382 tattacttgtcaacttcaacatccctaaccttacaccatccggtgtcaacacattaaccaaactc 23446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 128 - 269
Target Start/End: Original strand, 6910 - 7048
Alignment:
Q  128 tcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgataca 227  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||  ||    |||| ||||| |||||||||||||   || | ||| || ||||    
T  6910 tcaaccttcgatttctgacaaatcaaacaagtatacacaaactgtgcaacatcgcgtttcaatccagaccaccaaaacaac---tttagatcgtggtaca 7006  T
Q  228 tcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7007 tcttcgtagctcctggatgaatactcaagctacttctatgac 7048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 269
Target Start/End: Original strand, 12937 - 13086
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||||  ||||  ||    |||| ||||| | ||||||||||| | || | |||    
T  12937 tctgatgctcaaccttcgacttctgacaaattaaacaagaatacacgaactgtgcaacatctcgtttcagtccagacaaccaaaacaacttctttagatc 13036  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
     ||||||||||| || ||||| || |||||||||||  ||||||||||||    
T  13037 atgatacatcttcgtagctccagggtgaatactcaagttacttctatgac 13086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 1021 - 903
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||||||||    |||||||||||||| ||||||  |||||||  || ||| || |  ||  |||||||||||||||| || |||||||||     
T  1021 acaaaatccatagaaattaggtcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgttcaaccttagacttctgacaag 922  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaa 168  Q
     |||||| |||||||||||    
T  921 tcaaacatgcatacacaaa 903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 16 - 353
Target Start/End: Original strand, 3933 - 4270
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||| ||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  3933 atcaaaactcttactagtcttcggtaacgctcgaacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactctggcacgaacaacggttgcatcaaacctgac 4032  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    ||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  4033 ggtttctgatgttcaatcttcgacttcggacaaaccagacaagcatatacaaactcagcaatttccttcttcattccaggccatcaaaacaatctcttca 4132  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacaca 315  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  4133 aatcatgatacatcttagtcgctcttgggtgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatccgcctcttaagctcaagaacatctggcacaca 4232  T
Q  316 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatcca 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4233 aactcgatcacgaaacatcaaaacaccattcccatcca 4270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 16 - 272
Target Start/End: Original strand, 46929 - 47185
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46929 atcaaaacccttaatagtcttaggcaacgccccaacaaagtccatagaaatgctatcccacttccactcaggcacaaacaacggttgcatgaaacccgac 47028  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47029 ggtctctgatgttcaatcttcgacttctgacaaaccaaacaagcataaacaaactcagcaatttcctccttcattccaggccaccaaaacaacctcttca 47128  T
Q  216 aatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgacctt 272  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47129 aatcttgatacatcttagccgctccaggatgaatactcaaactacttctatgacctt 47185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 18 - 299
Target Start/End: Original strand, 9763 - 10044
Alignment:
Q  18 caaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacgg 117  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9763 caaaaccctcaccagtcttaggcaacgctccaacaaaatccatagagatattatctcacttccactctggcacaaacaatggttgcatcaaacccgacgg 9862  T
Q  118 tctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaa 217  Q
    | | | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9863 ttttttatgttcaatcttcgatttctaacaaaccaaacaagcataaacaaactcagcaatttccttcttcattccaggccaccaaaacaacctcttcaaa 9962  T
Q  218 tcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaa 299  Q
    || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||    
T  9963 tcctgatacatcgtagtcgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgttcaaaatctgcctcttaagctcaa 10044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 333 - 511
Target Start/End: Original strand, 10041 - 10219
Alignment:
Q  333 tcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtcttccttctgaccattctt 432  Q
    |||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10041 tcaagacaccattcttatccaatcagaagtctccacctttaccttgattaaccaacaccactcgatccatgagttccaaatcttccttctgaccattctt 10140  T
Q  433 gatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||    
T  10141 aatctcttccaaaatattgcttgtcaatttcaacattcctaacctcacaccatccggcgtcaactcgctatccaaactc 10219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 182; Significance: 4e-98; HSPs: 6)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 270 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 55218 - 54977
Alignment:
Q  270 cttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacacaaactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacc 369  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  55218 cttcgtccaaaatttgcctcttaagctcaagaacatctggcacacaaactcgatcacaaaacatcaaaacattattctcatccaatctaaagtctccacc 55119  T
Q  370 tttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtcttccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacata 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  55118 tttaccttgattaaccaacgtcactcggtccaagagttccaaatcttccttctgaccattcttgatctcttccaatacattgcttgtcaacttcaccata 55019  T
Q  470 cccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  55018 cccaacctcacaccgtccggtgtcaattcactaaccaaactc 54977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 55431 - 55216
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||| |  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55431 atcaaaacccttaacagtcttaggcaatgtcccagcaaagtccatagaaatgctatcccacttccattctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 55332  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  55331 ggtctctgatgttcaatcttcaatttctgacaaaccaaacaagcataaaaaaactcagcaatatccatcttcattccaggccaccaaaacaacctcttca 55232  T
Q  216 aatcttgatacatctt 231  Q
    ||||||||||||||||    
T  55231 aatcttgatacatctt 55216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 3819 - 3735
Alignment:
Q  185 ttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| | |||| ||| |||||||| || || |||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  3819 ttcaatccagaccaccaaaacaacttcttcagatcatgatacattttcgtagctcccagatgaatactcaagctacttctatgac 3735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 28869 - 28749
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||   || | |  ||||| ||| |  ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  28869 acaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatctaaagataccatcataccagcgggtttctgatgttcaatcttcgacttctgacaaa 28770  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaact 170  Q
    ||||||| | |||||||||||    
T  28769 ccaaacaggaatacacaaact 28749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 196 - 269
Target Start/End: Original strand, 59710 - 59783
Alignment:
Q  196 ccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||||||| ||| | || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  59710 ccaccaaaataacttcttaaaatcttgatacatttttgtagctcccggatgaatactcaaattacttctgtgac 59783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 221 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 28698 - 28650
Alignment:
Q  221 tgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  28698 tgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgac 28650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 20 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 9594 - 9103
Alignment:
Q  20 aaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtc 119  Q
    ||||||||  |||| || |||||| |||| ||||| ||||||||  |  |||| |||||| |||| || ||||||||| ||| |||||||   |||||      
T  9594 aaacccttcatagtcttcggcaacactccgacaaaatccatagagttattatctcacttctactcaggtacaaacaacagttacatcaaatatgacggct 9495  T
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    |||| || |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||   | || ||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||    
T  9494 tctgctgctcaatcttcgacttttgacaaaccaaacaagcatacacaaacttttctatatccttcttcattccatgccattaaaacaacctcttcaaatc 9395  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacacaaact 319  Q
     ||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||| || |||||  || |||| |||||||  | ||| || |||||||||    
T  9394 ctgatacatctttgtggctcctagatgaatactcagactactcctatgatcttcttccaaaatccgcttcttaagctcaagtatatccggtacacaaact 9295  T
Q  320 cgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtcttcct 419  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||  |||  |||| || ||| |||| || || |    
T  9294 tgatcacgaaacatcaaaacaccgttctcatccaatctgaaatccacacctttaccttgattaaccaacaccacatggtctaccagtcccaaatcatctt 9195  T
Q  420 tctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||  ||||||||  ||||| |||||||||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  9194 tctgaccgttcttaatttcctccaaaatattgctcgtcagtttcaacatttccaacttcacaccatcgggcgtcaactcgctaacgaaactc 9103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 193 - 511
Target Start/End: Original strand, 15028 - 15338
Alignment:
Q  193 aggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttc 292  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||     
T  15028 aggccacccaaacaacctcttcaaatcctggtacatcttagtcgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtccaaaatctgtctctta 15127  T
Q  293 agctcaaacacatctggcacacaaactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtca 392  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||        ||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||   |    
T  15128 agctcaagaacatccggcacacaaactcgatca--------caaaacatcgttctcgtccaatctgaagtctccacctttacattggttaaccaacacta 15219  T
Q  393 ctcggtccacgagttccaagtcttccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgt 492  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||    
T  15220 ctcgatccacaagttccaaatcttccttctgaccatccttaatctcttccaaaatattacttgtcaacttcaacattcctaacctcaccccatctggcgt 15319  T
Q  493 caactcactaaccaaactc 511  Q
    |  ||||||||||||||||    
T  15320 cggctcactaaccaaactc 15338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 131
Target Start/End: Original strand, 14913 - 15028
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    ||||||| |||||| ||| || |||||| |||||||||| |||||||| ||   |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  14913 atcaaaatccttaccagtcttcggcaactctccaacaaaatccatagagatatgatcccacttccactttggcacaaacaatggttgcatcaaacctgac 15012  T
Q  116 ggtctctgatgttcaa 131  Q
    ||| ||||||||||||    
T  15013 ggtttctgatgttcaa 15028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 4)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 310 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 133726 - 133525
Alignment:
Q  310 cacacaaactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttcc 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  133726 cacacaaactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatttaaagtctccacctttaccttgattaaccagcgtcactcgatccacgagttcc 133627  T
Q  410 aagtcttccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaac 509  Q
    || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  133626 aaatcttcctgctgaccattcttaatctcttccaaaatattacttgtcagccttaacatacccaacctcacaccatccggtgtcagctcactaaccaaac 133527  T
Q  510 tc 511  Q
    ||    
T  133526 tc 133525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 286 - 511
Target Start/End: Original strand, 24871 - 25096
Alignment:
Q  286 cctcttcagctcaaacacatctggcacacaaactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaacc 385  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24871 cctcttaagctcaagaacatctggcacacaaactcgatcatgaaacattaaaacatcattctcatccaatctaaagtctccaccttttccttgattaacc 24970  T
Q  386 aacgtcactcggtccacgagttccaagtcttccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccat 485  Q
    |||  |||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  24971 aacaccactcgatccagaagttctaaatcttccttctgacccttcttaatctcttccaaaatattacttgtcaacttcaacatccccaatctcacaccat 25070  T
Q  486 caggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  25071 caggtgtcaactcactaaccaaactc 25096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 230
Target Start/End: Original strand, 24655 - 24869
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||| | |||||||||  | || |||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24655 atcaaagctcttactagtcctcggtaacgctacaacaaagtccatagagatattatcccacttccactctggtacaaacaacgattgcatcaaacccgac 24754  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24755 ggtttctgatgttcaatcttcgacttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatttacttcttcattccaggccaccaaaacaacctcttca 24854  T
Q  216 aatcttgatacatct 230  Q
    |||| ||||||||||    
T  24855 aatcctgatacatct 24869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 208
Target Start/End: Original strand, 232352 - 232522
Alignment:
Q  38 ggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcg 137  Q
    |||||| |||| | ||| |||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||   | |||||||||| ||| |    
T  232352 ggcaacactccgaaaaagtccatagagatactatcccacttccactccgacacaaacaatggttgcatcaaactcgacgacttttgatgttcaatctttg 232451  T
Q  138 atttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaac 208  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  232452 acttctaacaaaccaaacaagcatacacaaactctgctctatccttattcattctaggccaccaaaacaac 232522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 230
Target Start/End: Original strand, 424 - 638
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||||||||  ||| || |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  424 atcaaaacccttaacagtcttcggcaacactccaacaaaatccatagaaatactatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaactcgac 523  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  524 ggtctctgatgttcaatcttcgacttttgacaaaccaaacaagcatagacatattcagcgatctccttcttcattccaggccaccaaaacaacctcttca 623  T
Q  216 aatcttgatacatct 230  Q
    |||| ||||||||||    
T  624 aatcctgatacatct 638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 585 - 382
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| |||  ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  585 atcaaaacccttaccagtattaggcaacactctgacaaaatccatagagatactatcccactttcactctggcacaaacaagggttgcatcaaacccgac 486  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttca 215  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  485 ggtttctgatgttcaatcttcgattttttacaaaccaaacaagcatatacaaactcagcaatttccttcttcattccaggccaccaaaacaacctcttca 386  T
Q  216 aatc 219  Q
    ||||    
T  385 aatc 382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 89 - 484
Target Start/End: Original strand, 75406 - 75801
Alignment:
Q  89 acaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttca 188  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||| ||| || || ||||||| |||||||||||| |||||||  |  || ||||||||||    
T  75406 acaaacaacggttgcatccaacccgatggcttctgatgttcaatcttagacttttgacaaagcaaacaagcatatacaaacttcgttatatccttcttca 75505  T
Q  189 ttccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatttgcct 288  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||| | ||||||| | ||||||| |||||||| || |||||  || |    
T  75506 ttccaggccaccaaaacaatctcttcaaatcatgatacatctttgtcgctcctggagggatactcataatacttctgtgaccttcatccaaaatccgctt 75605  T
Q  289 cttcagctcaaacacatctggcacacaaactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagtctccacctttaccttgattaaccaac 388  Q
    ||| |||| ||  ||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||| || |||||||||||||||    
T  75606 cttaagctaaagtacatccggtacacaaactcgatcatgtaacatcaaaacaccattctcatccaatttgaagtccacaccatttccttgattaaccaac 75705  T
Q  389 gtcactcggtccacgagttccaagtcttccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacacca 484  Q
      ||| || ||||| |||||||| || || |||| || |||||| || || |  ||||| || || |||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  75706 accacacgatccacaagttccaaatcctctttctaactattcttaatttcctaaaaaatgttactagtcagcttcaacattcccaacttcacacca 75801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 50 - 261
Target Start/End: Original strand, 19929 - 20140
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||  || ||| || |  ||  |||||||||||||||| || |||||||||     
T  19929 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgttcaacctttgacttctgacaag 20028  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||||||||||| ||| |  ||   |||||  || | ||||||||||| | | |||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  20029 tcaaacatgcatacacaaactgagcgacgtcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgatacaaattagtagctccaggatgaat 20128  T
Q  250 actcaaactact 261  Q
    |||||| |||||    
T  20129 actcaagctact 20140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 162
Target Start/End: Original strand, 45272 - 45418
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 115  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45272 atcaaaactcttactagtcttaggcaatgctccaacgaagtccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgac 45371  T
Q  116 ggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcata 162  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45372 ggtctctgatgttaaatcttcgatttctgacaaaccaaacaagcata 45418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 263 - 411
Target Start/End: Original strand, 45421 - 45569
Alignment:
Q  263 ctatgaccttcgtctaaaatttgcctcttcagctcaaacacatctggcacacaaactcgatcacgaaacatcaaaacaccattctcatccaatctaaagt 362  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  45421 ctatgaccttcgtccaaaatctgcctcttaagctcaaaaacatccggcacacaaactcgatcacgaaacatcaaaacatcattctcatccaatcttaagt 45520  T
Q  363 ctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaa 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||    
T  45521 ctccacctttaccttgattaaccaacactactcgatccacaagttccaa 45569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 473 - 511
Target Start/End: Original strand, 45577 - 45615
Alignment:
Q  473 aacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45577 aacctcacaccatccggtgtcaactcactaaccaaactc 45615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 363 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 25961 - 25813
Alignment:
Q  363 ctccacctttaccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaagtcttccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaactt 462  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  25961 ctccaccttttccttgattaaccaacgtcactcggtccacgagttccaaatcttccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgttagctt 25862  T
Q  463 caacatacccaacctcacaccatcaggtgtcaactcactaaccaaactc 511  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  25861 caacattcccagcctcacaccatccggtgtcaacttactaaccaaactc 25813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 4)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 392 - 511
Target Start/End: Original strand, 157 - 276
Alignment:
Q  392 actcggtccacgagttccaagtcttccttctgaccattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaacttcaacatacccaacctcacaccatcaggtg 491  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  157 actcggtccacgagttccaaatcttccttctgacaattcttgatctcttccaaaatattgcttgtcaactttaacatacccaacctcacaccatcaggtg 256  T
Q  492 tcaactcactaaccaaactc 511  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  257 tcaactcactaaccaaactc 276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 170
Target Start/End: Original strand, 19481 - 19531
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaact 170  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  19481 tctgatgttcaatcttcgacttctgacaaaccaaacaggaatacacaaact 19531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 170
Target Start/End: Original strand, 34905 - 34955
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaact 170  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  34905 tctgatgttcaatcttcgacttctgacaaaccaaacaggaatacacaaact 34955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 269
Target Start/End: Original strand, 50415 - 50460
Alignment:
Q  224 tacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  50415 tacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 50460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 50 - 269
Target Start/End: Original strand, 9779 - 9998
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||| || || |||||| | |||||||||||||||   ||||||  |||||| || |  ||| | ||||| |||||||| || ||||||||||    
T  9779 acaaaatccatggatatactatcctatttccactctggcacatctaacggtgtcatcaaccctgcaggtttttgatgctcaacctttgacttctgacaaa 9878  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||||| |||||||||||  || |  ||    |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  9879 tcaaacaagaatacacaaactatgccacatcacgtttcagtccagaccaccaaaacaactttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcctggatgaat 9978  T
Q  250 actcaaactacttctatgac 269  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  9979 gctcaagctacttctatgac 9998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 56 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 95493 - 95266
Alignment:
Q  56 tccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaac 155  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||  |||||||  || |||||| |  || |||||||||||||| || || ||||| |||  |||||    
T  95493 tccatagaaatactatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcgggcctctgatgttcaactttagacttctggcaagtcaaac 95394  T
Q  156 aagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaa 255  Q
    | ||||||||||||  ||| |  ||||||||||  |||| ||||||||||||| | ||||| || |||||||| || || ||||| ||||||||||||||    
T  95393 atgcatacacaaaccgagcgacatccttcttcaaaccagaccaccaaaacaacttcttcaagtcatgatacattttcgtagctcccggatgaatactcaa 95294  T
Q  256 actacttctatgaccttcgtctaaaatt 283  Q
    | | ||  |||||| ||| |||||||||    
T  95293 attgctcttatgactttcttctaaaatt 95266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 109143 - 109089
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  109143 aaatcatgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgac 109089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 50 - 255
Target Start/End: Original strand, 692 - 897
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||| || |||  ||||||   || ||| || |  || |||||||| ||||||||  | |||||||||     
T  692 acaaaatccatagaaatgttgtcccatttccactccggtacatccaacggcgtcaacaatcctgcaggcctctgatgctcaaccttatacttctgacaag 791  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||  |||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  792 tcaaacacgcatacacaaactgagcgacatccttcttcaaaccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaat 891  T
Q  250 actcaa 255  Q
    ||||||    
T  892 actcaa 897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 120 - 269
Target Start/End: Original strand, 575 - 724
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |  ||||  || |  |||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  575 tctgatgctcaaccttcgacttctgacaaatcaaacaagaatacacaaattgtgcaacatcgtgtttcaatccagaccaccaaaacaacttcttcaaatc 674  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
     ||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  675 atgatacatcttcgtagctcccggatgaataatcaagttacttctatgac 724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 50 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 51360 - 51128
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||  || ||| || |  ||  ||||||| |||||||| || |||||||||     
T  51360 acaaaatccatggaaatgctgtcccacttccactctggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaag 51261  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||| ||||||| |||||  ||    ||||  |||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||    
T  51260 tcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaatctcttcaaatcatgatacatctttgtagctcctagatgaat 51161  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
    ||| ||  ||||||| |||| ||| ||||||||    
T  51160 acttaagttacttctgtgactttcttctaaaat 51128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 120 - 269
Target Start/End: Original strand, 29824 - 29973
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||  ||    |||| ||||| | || |||||||||| || | |||    
T  29824 tctgatggtcaaccttcgatttctgacaaatcaaacaagaatacacaaactctgcaacatcgcgtttcaatccagacgacaaaaacaacctctttagatc 29923  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
     || |||||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  29924 gtggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatgac 29973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 264
Target Start/End: Original strand, 28944 - 29080
Alignment:
Q  128 tcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgataca 227  Q
    |||||||| || |||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||  ||    ||||  |||| ||||||||||||  | ||||| || |||||||    
T  28944 tcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcataaacaaactaagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaatttcttcaagtcatgataca 29043  T
Q  228 tcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttct 264  Q
    |||| || ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  29044 tctttgtagctcctggatgaatacttaagctacttct 29080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 120 - 269
Target Start/End: Original strand, 229922 - 230071
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |  || |  ||    |||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  229922 tctgatgctcaattttcgacttctgacaaaccaaacaagaatacacaaattgtgccacatcacgtttcaatccagaccaccaaaccaactttttcaaatc 230021  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
     ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  230022 atgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 230071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 191 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 218773 - 218695
Alignment:
Q  191 ccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  218773 ccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 218695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 32528 - 32472
Alignment:
Q  16 atcaaaacccttactagttttaggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatc 72  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  32528 atcaaaacccttactagtcttaggcaacgctcaaacaaagtccatagaaatgctatc 32472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 283
Target Start/End: Original strand, 261117 - 261350
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||  ||||||   || ||| || |  ||  ||||||||||||| || || |||||||||     
T  261117 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggcgtcaacaaccctgcaggcttctgatgttcaactttagacttctgacaag 261216  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||  ||    ||||  || | ||||||||||| | |||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||    
T  261217 tcaaacatgcatacacaaactgagcaacgtcacgtttcaaaccggaccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaat 261316  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatt 283  Q
    |||||| |||||  | |||||||| |||||||||    
T  261317 actcaagctactcttgtgaccttcttctaaaatt 261350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 120 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 278257 - 278108
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |  || |  ||    |||| ||||| |||||| || | | | || | |||    
T  278257 tctgatgttcaatcttcgacttctgacaaaccaaacatgaatacacaaattgtgccacatcgcgtttcaatccagaccaccagaatatcttctttagatc 278158  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
     ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  278157 atgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaacctacttctatgac 278108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 50 - 282
Target Start/End: Original strand, 68179 - 68411
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||  | |||  |||||||  || ||| || |  || |||||||| |||||||| || |||||||||     
T  68179 acaaagtccatagaaatgttgtcccatttccactccagtacatccaacggtgtcaacaaccctgtaggcctctgatgctcaaccttagacttctgacaag 68278  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||||||||||| ||| |  ||| ||||||  |||| |||| |||||||| | |||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||    
T  68279 tcaaacacgcatacacaaactgagcgacatccctcttcaaaccagaccacaaaaacaacttcttcaaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaat 68378  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
    ||||||  ||||  |||||| ||| ||||||||    
T  68379 actcaagttactcttatgactttcttctaaaat 68411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 4450 - 4217
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||  || ||| || |  ||  | |||||||||||||| || |||||||||     
T  4450 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttttgatgttcaaccttagacttctgacaag 4351  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||||||||| | ||| |  ||   |||||  || | ||||||||||| | | || ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||    
T  4350 tcaaacacgcatacacaaattgagcgacgtcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttctttaaatcatgatacatctttgtagctcccgaatgaat 4251  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatt 283  Q
    ||| || |||||  | |||| ||| |||||||||    
T  4250 acttaagctactcttgtgactttcctctaaaatt 4217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 56 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 1463 - 1237
Alignment:
Q  56 tccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaac 155  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   || |||  || ||| || |  ||  ||||||| |||||||| || |||||||||  |||||    
T  1463 tccatggaaatgctatcccacttccactctggcacatctaatggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaac 1364  T
Q  156 aagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaa 255  Q
    | ||||| ||||||| |||||  ||    ||||  |||| ||||||||||||  | ||||| || ||||||||||| || |||||| |||||||||| ||    
T  1363 atgcataaacaaactgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaatttcttcaagtcatgatacatctttgtagctcctagatgaatacttaa 1264  T
Q  256 actacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
     |||||||| |||| ||| ||||||||    
T  1263 gctacttctgtgactttcttctaaaat 1237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 56 - 282
Target Start/End: Original strand, 41732 - 41958
Alignment:
Q  56 tccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaac 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||  || ||| || |  ||  |||||||||||||||| || |||||||||  |||||    
T  41732 tccatagaaatgctatcccacttccactccggcatatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgttcaaccttagacttctgacaagtcaaac 41831  T
Q  156 aagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaa 255  Q
    | ||||||||||| | ||| |  ||   |||||  || | ||||||||||| | | |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||    
T  41832 atgcatacacaaaatgagcgacgtcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaa 41931  T
Q  256 actacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
     |||||  | |||| ||| ||||||||    
T  41932 gctactcttgtgactttcctctaaaat 41958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 120 - 269
Target Start/End: Original strand, 1555 - 1704
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||   ||||  ||   ||||| ||||| ||| ||||||||| | ||||||||    
T  1555 tctgatgctcaactttcgacttctgacaaatcaaacaagaatacacaaaccgtgcaacatcacgcttcaatccagaccatcaaaacaacatcttcaaatc 1654  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
     || | |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  1655 atggtgcatcttcgtagctcccggatgaatactcaaactacttcaatgac 1704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 50 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 731 - 526
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||   |||||||  || |||||| |  || ||||||||||||||||| || ||| || ||     
T  731 acaaaatccatagaaatgttatcccatttccactctggtacttccaacggtgtcaacaaacctgcaggcctctgatgttcaaccttagacttccgataag 632  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||||||||||  ||| |  ||||||||||  |||| |||| |||||| | | ||||| || |||||||| || || ||||| ||||||||    
T  631 tcaaacacgcatacacaaaccgagcgacatccttcttcaaaccagaccactaaaacagcttcttcaagtcatgatacatttttgtagctcccggatgaat 532  T
Q  250 actcaa 255  Q
    ||||||    
T  531 actcaa 526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 50 - 267
Target Start/End: Original strand, 6858 - 7075
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| ||||||   |||| |  ||||| ||| |  ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  6858 acaaaatccatggatatactatcccatttccactcaggcacatctaacgataccatcataccagcaggtttctgatgctcaaccttcgacttctgacaaa 6957  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     ||| |||| |||||||||||  ||||  ||    |||| ||| | ||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  6958 tcaagcaagaatacacaaactgtgcaacgtcgcatttcaatccggaccaccaaaacaacttttttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaat 7057  T
Q  250 actcaaactacttctatg 267  Q
    ||||||  ||||||||||    
T  7058 actcaagttacttctatg 7075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 120 - 269
Target Start/End: Original strand, 16534 - 16683
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||  || |  ||    |||| ||||| ||||||||| ||| |||| | |||    
T  16534 tctgatgctcaactttcgacttctgacaaatcaaacaagaatacacaaactgtgccacatcacgtttcaatccagaccaccaaaataacttttttagatc 16633  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
     ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16634 atgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 16683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 50 - 283
Target Start/End: Original strand, 19658 - 19891
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||   || |||  || ||| || |  ||  |||||||||| ||||| || ||||| |||     
T  19658 acaaaatccatagaaatgttgtcccacttccattctggcacatctaaaggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgttcgaccttagacttctggcaag 19757  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||||||||| | |||||  |||  |||||  || | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||    
T  19758 tcaaacatgcatacacaaattaagcaacatcccccttcaaaccggaccaccaaaacaactttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccgaatgaat 19857  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatt 283  Q
    |||||| |||||  | |||| ||| |||||||||    
T  19858 actcaagctactcttgtgactttcctctaaaatt 19891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 50 - 283
Target Start/End: Original strand, 23820 - 24053
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||   || |||  || ||| || |  ||  |||||||||| ||||| || ||||| |||     
T  23820 acaaaatccatagaaatgttgtcccacttccattctggcacatctaaaggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgttcgaccttagacttctggcaag 23919  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||||||||| | |||||  |||  |||||  || | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||    
T  23920 tcaaacatgcatacacaaattaagcaacatcccccttcaaaccggaccaccaaaacaactttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccgaatgaat 24019  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatt 283  Q
    |||||| |||||  | |||| ||| |||||||||    
T  24020 actcaagctactcttgtgactttcctctaaaatt 24053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 50 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 46896 - 46663
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||  || ||| ||    ||  |||||||||||||||| || |||||||||     
T  46896 acaaaatccatagaaatgttatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaacccttcaggcttctgatgttcaaccttagacttctgacaag 46797  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||||||||| | ||| |  ||   |||||  || | ||||||||||| | | |||||||| |||| ||| || || ||||||||||||||    
T  46796 tcaaacatgcatacacaaaatgagcgacgtcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgattcatttttgtagctcctggatgaat 46697  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatt 283  Q
    |||||| |||||  | |||| ||| |||||||||    
T  46696 actcaagctactcttgtgactttcttctaaaatt 46663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 269
Target Start/End: Original strand, 2864 - 2942
Alignment:
Q  191 ccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  2864 ccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatctttgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgac 2942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 50 - 282
Target Start/End: Original strand, 27333 - 27565
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||  || ||| || |  ||  ||||||| |||||||| || |||||||||     
T  27333 acaaaatccatggaaatgctatcccacttccactctggcacatctaacagtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaag 27432  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||| ||||||| |||||  ||    |||| ||| | ||||||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  27433 tcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcacgtttcaatccggaccaccaaaacaatttcttcaagtcatgatacatctttgtagctcccggatgaat 27532  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
    ||| || |||||||| |||| ||| || |||||    
T  27533 acttaagctacttctgtgactttcttccaaaat 27565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 50 - 269
Target Start/End: Original strand, 6823 - 7042
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||   || | |  ||||| ||| |  ||| ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  6823 acaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctgatgttcaaccttcgacttatgacaaa 6922  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||||| |||||||||||  ||||  ||    |||| ||||| ||||||||| | | | || | ||| |||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  6923 tcaaacaagaatacacaaactgtgcaacgtcgcgtttcaatccagaccaccaaaatatcttctttagatcatgatacatcttcatagctcccggatgaat 7022  T
Q  250 actcaaactacttctatgac 269  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  7023 actcaagctacttctatgac 7042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 7758 - 7611
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||  ||||  ||    |||| ||| | ||||||||||||| | || | |||    
T  7758 tctgatgttcaaccttcgacttctaacaaatcaaacaagaatacacaaactgtgcaacgtcgcgtttcaatccggaccaccaaaacaacttctttagatc 7659  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatg 267  Q
     ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  7658 atgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatg 7611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 50 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 11554 - 11343
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||  || ||| || |  ||  |||||||||||||||| || || ||||||     
T  11554 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgttcaaccttagacttttgacaag 11455  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||||||||| | ||| |  ||   |||||  || | ||||||||||| | | |||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||    
T  11454 tcaaacatgcatacacaaaatgagcgacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaat 11355  T
Q  250 actcaaactact 261  Q
    ||| || |||||    
T  11354 acttaagctact 11343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 50 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 15324 - 15113
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||  || ||| || |  ||  |||||||||||||||| || || ||||||     
T  15324 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgttcaaccttagacttttgacaag 15225  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||||||||| | ||| |  ||   |||||  || | ||||||||||| | | |||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||    
T  15224 tcaaacatgcatacacaaaatgagcgacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaat 15125  T
Q  250 actcaaactact 261  Q
    ||| || |||||    
T  15124 acttaagctact 15113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 282
Target Start/End: Original strand, 20798 - 21024
Alignment:
Q  56 tccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaac 155  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||  |||||||  |||||| || |  ||  ||||||| |||||||| || |||||||||  | |||    
T  20798 tccatagaaatgttgtcccacttccactccggcacatccaacggtgtcatcaaccctgtaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaagtctaac 20897  T
Q  156 aagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaa 255  Q
    | |||||||| |||| |||||  ||    ||||  |||| | ||||||| | | | |||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||    
T  20898 acgcatacaccaactgagcaacatcacgtttcaacccagacaaccaaaatagcttcttcaaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaatacttaa 20997  T
Q  256 actacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
     |||||  | |||| ||| ||||||||    
T  20998 gctactcttgtgactttcctctaaaat 21024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 390627 - 390492
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||  || |  ||    |||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  390627 tctgatgctcaactttcgacttctgacaaatcaaacaagaatacacaaactgtgctacatcacgtttcaatccagaccaccaaaataactttttcaaatc 390528  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaa 255  Q
     ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  390527 atgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaa 390492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 89801 - 89740
Alignment:
Q  191 ccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatact 252  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  89801 ccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatact 89740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 90479 - 90418
Alignment:
Q  191 ccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatact 252  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  90479 ccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatttttgtagctcccggatgaatact 90418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 191 - 269
Target Start/End: Original strand, 15827 - 15905
Alignment:
Q  191 ccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15827 ccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcttagtagctcccggatgaatactcaagctacttctgtgac 15905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 112844 - 112766
Alignment:
Q  191 ccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    |||| ||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  112844 ccagaccaccaaaacaacttcttcagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 112766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 191 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 116261 - 116183
Alignment:
Q  191 ccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  116261 ccagaccaccaaaacaactttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctgtgac 116183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 120 - 269
Target Start/End: Original strand, 3253 - 3402
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||  ||    |||| ||||| |||||| |||||| | || | |||    
T  3253 tctgatgctcaaccttcaatttctgacaaatcaaacaagaatacacaaactgtgcaacatcacgtttcaatccagaccaccagaacaacttctttagatc 3352  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
     || |||||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  3353 gtggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatgac 3402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 255
Target Start/End: Original strand, 6993 - 7198
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||  ||| |||  || |   || |  || |||||||| |||||||| || |||||||||     
T  6993 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaatggtgtcaactttcctgcaggcctctgatgctcaaccttagacttctgacaag 7092  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||| ||||||  ||| |  ||||||||||  |||| ||||||||||||| | ||||| || |||||||| || || ||||| ||||||||    
T  7093 tcaaacatgcatatacaaaccgagcgacatccttcttcaaaccagaccaccaaaacaacttcttcaagtcatgatacattttcgtagctcccggatgaat 7192  T
Q  250 actcaa 255  Q
    ||||||    
T  7193 actcaa 7198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 2844 - 2620
Alignment:
Q  58 catagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaa 157  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||   ||||||  || ||| || |  ||  ||| |||||||||||| || |||||||||  ||||||     
T  2844 catagaaatactatcccacttccactccggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttcttatgttcaaccttagacttctgacaagtcaaacat 2745  T
Q  158 gcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaac 257  Q
    |||||||| || | ||| |  ||   |||||  || | ||||||||||||| | |||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| |    
T  2744 gcatacacgaaatgagcgacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacattttcgtagctcctggatgaatactcaagc 2645  T
Q  258 tacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
    ||||  | |||| ||| ||||||||    
T  2644 tactcttgtgactttcttctaaaat 2620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 261
Target Start/End: Original strand, 7869 - 8080
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||  || ||| || |  ||  |||||||||||||||| || |||||| ||     
T  7869 acaaaatccagagaaatgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgttcaaccttagacttctgataag 7968  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||||||||| | ||| |  ||   |||||  |  | ||||||||||||| | |||||||| |||||||| || || |||||  |||||||    
T  7969 tcaaacatgcatacacaaaatgagcgacgtcacgcttcaaactggaccaccaaaacaacttattcaaatcatgatacattttcgtagctcccagatgaat 8068  T
Q  250 actcaaactact 261  Q
    |||||| |||||    
T  8069 actcaagctact 8080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 646 - 414
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||  || ||| || |  ||  ||||||| |||||||| || |||||||||     
T  646 acaaaatccatggaaatgctatcccactttcactctggcacatctaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaag 547  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||| ||||||| |||||  || |  ||||  |||| |||||||||||| || ||||  || | ||||||||| || ||||||  ||||||    
T  546 tcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcatgtttcaacccagaccaccaaaacaatctcttcaggtcataatacatctttgtagctcctaaatgaat 447  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
    ||| || |||||||| |||| ||| || |||||    
T  446 acttaagctacttctgtgactttcttcgaaaat 414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 101049 - 100849
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || |||  |||||||  || ||| || |  ||  |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  101049 acaaaatccatagaaatattgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgttcaaccttagacttctgacaaa 100950  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||  ||   |||||   ||| ||||||||||| | | |||||||| ||||||||||| || |||||  |||||||    
T  100949 tcaaacacgcatacacaaactgagcaacatcacgcttcaaatcagaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgatacatctttgtagctcccagatgaat 100850  T
Q  250 a 250  Q
    |    
T  100849 a 100849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 269
Target Start/End: Original strand, 181008 - 181227
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||   || | |  ||||| ||| |  ||| |||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  181008 acaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctgatgttcgatcttcgacttctgacaaa 181107  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
    ||||||| | |||||||||||  || |  ||    |||| ||||| |||||| || | | | |||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  181108 ccaaacaggaatacacaaactgtgccacatcgcgtttcaatccagaccaccagaatatcttcttcagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaat 181207  T
Q  250 actcaaactacttctatgac 269  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  181208 actcaagctacttctatgac 181227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 261
Target Start/End: Original strand, 673 - 884
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||  |||||||  || ||| || |  ||  |||||||||||||||| || |||||||||     
T  673 acaaaatccatagaaatgttatcccacttccacttcggcacatccaacggtgacaacaaccctgcaggcttctgatgttcaaccttagacttctgacaag 772  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||||||||| | ||| |  ||   |||||  || | ||||||||| | | | |||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||    
T  773 tcaaacatgcatacacaaaatgagcgacgtcacgcttcaaaccggaccaccaaaatagcttcttcaaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaat 872  T
Q  250 actcaaactact 261  Q
    |||||| |||||    
T  873 actcaagctact 884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 269
Target Start/End: Original strand, 4840 - 5059
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||| | ||| | || |||  ||||||||| |  ||| ||||||| ||||| || || ||||||||||    
T  4840 acaaaatccatggatatgctatcccatttccactctagaacatataaaggtgtcatcaaacctgcaggtttctgatgctcaacttttgacttctgacaaa 4939  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| | |||||||||||  || |  ||    ||||  |||| ||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| || ||||| |||||| |    
T  4940 tcaaacaggaatacacaaactgtgccacatcacatttcaacccagaccaccaaaacaacttctttaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgatt 5039  T
Q  250 actcaaactacttctatgac 269  Q
    |||||| |||||| ||||||    
T  5040 actcaagctacttttatgac 5059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 198 - 269
Target Start/End: Original strand, 4828 - 4899
Alignment:
Q  198 accaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  4828 accaaaacaacttcttcaaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 4899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 198 - 269
Target Start/End: Original strand, 11958 - 12029
Alignment:
Q  198 accaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  11958 accaaaacaacttcttcaaatcatgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 12029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 13796 - 13585
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||  || ||| |  |  ||  |||||||||||||||| || ||||| |||     
T  13796 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactctggtacatccaacggtgtcaacaaccttgcaggcttctgatgttcaaccttagacttctggcaag 13697  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||||||||| | ||| |  ||   |||||  || | ||||||||||| | | |||||||| |||||||| || || |||||| |||||||    
T  13696 tcaaacatgcatacacaaaatgagcgacgtcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgatacatttttgtagctcctagatgaat 13597  T
Q  250 actcaaactact 261  Q
    ||| || |||||    
T  13596 acttaagctact 13585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 261
Target Start/End: Original strand, 28034 - 28245
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||  || ||| |  |  ||  ||||||| |||||||| || |||||||||     
T  28034 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccgtgcaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaag 28133  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||||||||| | |||||  ||    ||||  |||| ||||||||||| | | ||||| || |||||||| || || ||||| ||||||||    
T  28134 tcaaacatgcatacacaaattgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacagcttcttcaagtcgtgatacatttttgtagctcccggatgaat 28233  T
Q  250 actcaaactact 261  Q
    ||| || |||||    
T  28234 acttaagctact 28245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 19768 - 19633
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||  ||||  ||    |||| ||| | ||||||||||||| | || | |||    
T  19768 tctgatgctcaaccttcgatttctgacaaatcaaacaagaatacacgaactgtgcaacgtcgcgtttcaatccggaccaccaaaacaacttctttagatc 19669  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaa 255  Q
     ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  19668 atgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaa 19633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2094 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold2094
Description:

Target: scaffold2094; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 489 - 327
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||||  ||||  ||    ||||  || | ||||||||| ||  | ||||| ||    
T  489 tctgatgttcaaccttagacttctgacaaatcaaacatgcatatacaaactgtgcaacgtcacgtttcaaaccggaccaccaaaataatttcttcaagtc 390  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
     ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  389 atgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctacttctatgactttcttctaaaat 327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24499 - 24337
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||  ||    |||| ||| | ||||||||||||  | ||||| ||    
T  24499 tctgatgttcaactttagatttctgacaaatcaaacaagcatatacaaactgtgcaacatcacgtttcaatccggaccaccaaaacaatttcttcaagtc 24400  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
     | ||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||| | |||| ||| ||||||||    
T  24399 attatacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctacttttgtgactttcttctaaaat 24337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 25362 - 25129
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtct-ctgatgttcaaccttcgatttctgacaa 148  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||  |||||||  ||  ||||||  | | || ||||||||||||||| || |||||||||    
T  25362 acaaaatccatagaaatgttttcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaa-aaaccctgcagacttctgatgttcaaccttagacttctgacaa 25264  T
Q  149 accaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaa 248  Q
      |||||| ||||||||||||| |||||  ||    ||||  |||| ||||||||||| | | ||||||||  ||||||| || || ||||| |||||||    
T  25263 gtcaaacacgcatacacaaactgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacagcttcttcaaatcaggatacattttcgtagctcccggatgaa 25164  T
Q  249 tactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatt 283  Q
    |||| || |||||  | |||| ||| |||||||||    
T  25163 tacttaagctactcttgtgactttcctctaaaatt 25129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1646 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1646
Description:

Target: scaffold1646; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 282
Target Start/End: Original strand, 133 - 365
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtct-ctgatgttcaaccttcgatttctgacaa 148  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||  |||||||  || ||| ||| || | || |||||||||||| || || |||||||||    
T  133 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaa-ccctacaggcttctgatgttcaactttagacttctgacaa 231  T
Q  149 accaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaa 248  Q
      |||||| ||||||||||||| |||||  || |  ||||  || | |||||||||||   | |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||    
T  232 gtcaaacatgcatacacaaactgagcaacgtcatgtttcaaaccggaccaccaaaacagtttcttcaaatcatggtacatttttgtagctcccggatgaa 331  T
Q  249 tactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
    ||||||| |||||  | |||| ||| ||||||||    
T  332 tactcaagctactcttgtgactttcttctaaaat 365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1602 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1602
Description:

Target: scaffold1602; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 1494 - 1345
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||  || |  ||    ||||  ||||  |||||||||||| |||||| |||    
T  1494 tctgatgctcaactttcgacttctgacaaatcaaacaagaatacacaaactgtgccacatcacgtttcaacccagatcaccaaaacaactttttcagatc 1395  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
     ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  1394 atgatatatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcctatgac 1345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1061
Description:

Target: scaffold1061; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 250
Target Start/End: Original strand, 2397 - 2597
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtct-ctgatgttcaaccttcgatttctgacaa 148  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||   ||||||  ||  |||||| || | || |||||| |||||||| || |||||||||    
T  2397 acaaaatccatagaaatactgtcccacttccactccggcacatcaaacggtgtcaa-aaacccaacaggcttctgatgctcaaccttagacttctgacaa 2495  T
Q  149 accaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaa 248  Q
      |||||| ||||||||||||| |||||  ||  | ||||  |||| ||||||||||| | | |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||    
T  2496 gtcaaacacgcatacacaaactgagcaacatcacttttcaaaccagaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaa 2595  T
Q  249 ta 250  Q
    ||    
T  2596 ta 2597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 267
Target Start/End: Original strand, 7181 - 7398
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||   |||| |  ||||| ||| |  ||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7181 acaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatctaacgataccatcataccagcaggtttttgatgctcaaccttcgacttctgacaaa 7280  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||||| ||||||||| |  ||||  ||    |||| | | | ||||||||||||||| || | ||| ||||||||||| || |||||  |||||||    
T  7281 tcaaacaagaatacacaaattgtgcaacgtcacgtttcaattcggaccaccaaaacaacctctttagatcatgatacatcttcgtagctcccagatgaat 7380  T
Q  250 actcaaactacttctatg 267  Q
    ||||||  ||||||||||    
T  7381 actcaagttacttctatg 7398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 120 - 261
Target Start/End: Original strand, 3670 - 3811
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| |||||||| |  |||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||  ||    ||||  |||| ||||||||||||| | ||||| ||    
T  3670 tctgatgctcaaccttagtcttctgacaagtcaaacatgcatagacaaactgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaagtc 3769  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactact 261  Q
     ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||    
T  3770 atgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctact 3811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 6735 - 6502
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || ||||  || ||| || |  ||  |||||||||||||||| || |||||||||     
T  6735 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactccggtacatccagcggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgttcaaccttagacttctgacaag 6636  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||||||||| | ||| |  ||   |||||  || | ||||||||||| | | |||||||| |||| ||  || || ||||| ||||||||    
T  6635 tcaaacatgcatacacaaaatgagcgacgtcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgatgcactttcgtagctcccggatgaat 6536  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatt 283  Q
    |||||| |||||  | |||| ||| |||||||||    
T  6535 actcaagctactcttgtgactttcctctaaaatt 6502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 57344 - 57111
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||  |||||||  || ||| || |  ||  ||||||| |||||||| || ||||| |||     
T  57344 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgctcaaccttagacttctggcaag 57245  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     ||| || ||||||||||| | ||| |  ||   |||||  || | ||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||    
T  57244 tcaagcatgcatacacaaaatgagcgacatcacgcttcaaaccggaccaccaaaacaacttttttaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaat 57145  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatt 283  Q
    |||||| |||||  | |||| ||| |||||||||    
T  57144 actcaagctactcttgtgactttcctctaaaatt 57111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 48385 - 48314
Alignment:
Q  196 ccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatg 267  Q
    ||||||||||||| | ||||| || ||||||||||| || |||||| |||||||||| || ||||| |||||    
T  48385 ccaccaaaacaacttcttcaagtcatgatacatctttgtagctcctagatgaatacttaagctactcctatg 48314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 282
Target Start/End: Original strand, 3560 - 3792
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtct-ctgatgttcaaccttcgatttctgacaa 148  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||  |||||||  || ||| || | | |||| |||||| |||||||| || |||||||||    
T  3560 acaaaatccatagaaatgctgtcccacttccattccgccacatccaacggtgtcaacaaccctg-cagtcttctgatgctcaaccttagacttctgacaa 3658  T
Q  149 accaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaa 248  Q
      |||||| ||||||||||||| |||||  ||    ||||  |||| |||| |||||| | | |||||||| |||||||| || || |||||||||||||    
T  3659 gtcaaacacgcatacacaaactgagcaacatcacgtttcaacccagaccactaaaacagcttcttcaaatcatgatacattttcgtagctcctggatgaa 3758  T
Q  249 tactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
    |||| || |||||  | |||| ||| ||||||||    
T  3759 tacttaagctactcttgtgactttcctctaaaat 3792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 12693 - 12461
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||| |||||  | |||||||||||||| || | |  ||| ||||||||||| |  |||||| | |||||||| || || || || |||||||    
T  12693 acaaaatccatcgaaatattgtcccacttccactccggaatactcaagggttgcatcaatctagacggtttttgatgttctacttttgagttttgacaaa 12594  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
      |  |||||||||||||| || || || ||||||||||| |  | ||||||||| | | | || | || ||||||||||||||| ||||  || || ||    
T  12593 ttaggcaagcatacacaaattcggctatatccttcttcatgcatgcccaccaaaatatcttcttaagattttgatacatcttagtggctctagggtgtat 12494  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
    ||| || ||||| || |||||||| ||||||||    
T  12493 acttaagctactcctgtgaccttcctctaaaat 12461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 197 - 269
Target Start/End: Original strand, 1849 - 1921
Alignment:
Q  197 caccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  1849 caccaaaataactttttcaaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 1921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 170
Target Start/End: Original strand, 14848 - 14968
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||   |||| |  ||||| ||| |  ||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  14848 acaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatctaacgataccatcataccagcaggtttctgatgctcaaccttcgacttctaacaaa 14947  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaact 170  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  14948 tcaaacaagcatacacaaact 14968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 5017 - 4870
Alignment:
Q  122 tgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatctt 221  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| |  ||||  ||   ||| |  || | ||||||||| ||| | |||||||| |    
T  5017 tgatgttcaaccttcgacttctgacaaattaaacatgcatacacaaattgtgcaacatctcgctttaacccggaccaccaaaataacttcttcaaatcgt 4918  T
Q  222 gatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||||| || || ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  4917 gatacatttttgtagctcccggatgaatactcaaattacttctgtgac 4870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 19429 - 19282
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||   ||||  ||    |||| ||| | ||||||||||||| | || | |||    
T  19429 tctgatgctcaatcttcgacttctggcaaatcaaacaagcatacacaaaccgtgcaacgtcgcgtttcaatccggaccaccaaaacaacttctttagatc 19330  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatg 267  Q
     ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  19329 atgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatg 19282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 14562 - 14491
Alignment:
Q  196 ccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatg 267  Q
    ||||||||||||| | || | ||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  14562 ccaccaaaacaacttctttagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatg 14491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 191 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 14435 - 14357
Alignment:
Q  191 ccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  14435 ccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcttcgtagctccctgatgaatactcaagctacttctgtgac 14357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 191 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 32109 - 32031
Alignment:
Q  191 ccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  32109 ccagaccaccaaaacaactttttcacatcatgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaagttacttctatgac 32031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 50 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 40256 - 40042
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||   || |||  || ||| || |   || ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  40256 acaaaatccatggatatgctatcccatttccactctggcacatctaatggtgtcaacaacccagcaagtttctgatgttcaactttagatttctgacaaa 40157  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||| |||||||  ||||  ||    |||| ||| | ||||||||||||  | ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  40156 tcaaacatgcatatacaaactgtgcaacatcacgtttcaatccggaccaccaaaacaatttcttcaagtcatgataaatctttgtagctcccggatgaat 40057  T
Q  250 actcaaactacttct 264  Q
    ||| || ||||||||    
T  40056 acttaagctacttct 40042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 28265 - 28145
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||   || |||  || ||| || |   || ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  28265 acaaaatccatggatatgctatcccatttccactctggcacatctaatggtgtcaacaacccagcaagtttctgatgttcaactttagatttctgacaaa 28166  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaact 170  Q
     |||||| ||||| |||||||    
T  28165 tcaaacatgcatatacaaact 28145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 191 - 269
Target Start/End: Original strand, 102183 - 102261
Alignment:
Q  191 ccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  102183 ccagaccaccaaaacaactttttcagatcatgatacattttcgtagctcccggatggatactcaagctacttctatgac 102261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 283
Target Start/End: Original strand, 6022 - 6255
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||  |||||||  || |||||| |  ||  ||||||| |||||||| || ||||| |||     
T  6022 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaacctgcaggcttctgatgctcaaccttagacttctggcaag 6121  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     ||| || ||||||||||| | ||| |  ||   |||||  |  | ||||||||| | | |||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||    
T  6122 tcaagcatgcatacacaaaatgagcgacatctcgcttcaaactggaccaccaaaatagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaat 6221  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatt 283  Q
    |||||| |||||  | |||| ||| |||||||||    
T  6222 actcaagctactcttgtgactttcctctaaaatt 6255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 269
Target Start/End: Original strand, 17636 - 17709
Alignment:
Q  196 ccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  17636 ccaccaaaacaacttcttcagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatacttaagctacttctatgac 17709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 18566 - 18493
Alignment:
Q  196 ccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||||  | ||||||||||| |||||||||||||    
T  18566 ccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccaggtgaatactcaagctacttctatgac 18493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 39438 - 39389
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaac 169  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  39438 tctgatgctcaaccttcgatttctgacaaatcaaacaagaatacacaaac 39389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 17333 - 17269
Alignment:
Q  191 ccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaa 255  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  17333 ccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaa 17269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 264
Target Start/End: Original strand, 5309 - 5453
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||  ||    ||||  |||| |||||||||||   | ||||| ||    
T  5309 tctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacatgcataaacaaactgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacagtttcttcaagtc 5408  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttct 264  Q
     ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  5409 atgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaagctacttct 5453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 4949 - 4717
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |  |||  |||||||  || ||| || |  ||  ||||||||||||| || || |||||||||     
T  4949 acaaaatccatagaaatgttatcccatttccactccgatacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgttcaactttagacttctgacaag 4850  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||  ||    ||||  || | ||||||||||| | | |||||||| || ||||| || || ||| | ||||||||    
T  4849 tcaaacatgcatacacaaactgagcaacgtcacgtttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatggtacattttcgtagcttccggatgaat 4750  T
Q  250 actcaaactacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
    |||||| |||||  |||||| ||| ||||||||    
T  4749 actcaagctactcttatgactttcttctaaaat 4717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 196 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12137 - 12050
Alignment:
Q  196 ccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaatt 283  Q
    ||||||||||| | |||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  | |||| ||| |||||||||    
T  12137 ccaccaaaacagctttttcaaatcatggtacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctactcttgtgactttcatctaaaatt 12050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 196905 - 196758
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || |  ||    |||| ||||| |||||| || | | | || | |||    
T  196905 tctgatgctcaatcttcgacttctgacaaaccaaacaagaatacacaaactatgccacatctcgtttcaatccagaccaccataaaatcttctttagatc 196806  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatg 267  Q
     ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  196805 atgatacatcttcgtagctcccggttgaatactcaagctacttctatg 196758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 221 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 19393 - 19345
Alignment:
Q  221 tgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  19393 tgatacatctttgtagctcccggatgaatactcaagctacttatatgac 19345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 261
Target Start/End: Original strand, 323513 - 323724
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||  || ||| || |   |  | |||||||||||||| || |||||||||     
T  323513 acaaaatccatagaaatgttatcccacttccactccggcacatccaacggtgtcaacaaccctgcaagcttttgatgttcaaccttagacttctgacaag 323612  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaat 249  Q
     |||||| || |||||||| | ||  |  ||   |||||  || | ||||||||||| | | |||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||    
T  323613 tcaaacatgcgtacacaaaatgagtgacgtcacgcttcaaaccggaccaccaaaacagcttcttcaaatcatgatacattttcgtagctcccggatgaat 323712  T
Q  250 actcaaactact 261  Q
    |||||| |||||    
T  323713 actcaagctact 323724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 196 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 202819 - 202733
Alignment:
Q  196 ccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
    ||||||||||||  | ||||| || ||||||||||| || |||||  |||||||||| || |||||||| |||| ||| ||||||||    
T  202819 ccaccaaaacaatttcttcaagtcatgatacatctttgtagctccctgatgaatacttaagctacttctgtgactttcttctaaaat 202733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Original strand, 1388 - 1442
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  1388 aaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 1442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Original strand, 13442 - 13496
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  13442 aaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 13496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 121 - 71
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaact 170  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  121 tctgatgctcaaccttcgatttctgacaaatcaaataagaatacacaaact 71  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 32905 - 32851
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  32905 aaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 32851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 269
Target Start/End: Original strand, 4090 - 4168
Alignment:
Q  191 ccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| || | |||   |||||||||||| |||||||||||||    
T  4090 ccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcgtgatacatcttggtagatcccaaatgaatactcaagctacttctatgac 4168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 48557 - 48471
Alignment:
Q  196 ccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaaaat 282  Q
    ||||||||||| | |||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||  |||||| ||| ||||||||    
T  48557 ccaccaaaacagctttttcaaatcgtggtacatttttgtagctcccggatgaatactcaagctactcttatgactttcctctaaaat 48471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 39317 - 39199
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||   || | |  ||||||||| |  ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  39317 acaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatctaaggataccatcaaaccagcgggtttctgatgttcaatcttcgacttctgacaaa 39218  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaa 168  Q
    | ||||| | |||||||||    
T  39217 ctaaacaggaatacacaaa 39199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 39155 - 39099
Alignment:
Q  212 ttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatga 268  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  39155 ttcagatcatgatacatctttgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatga 39099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 196 - 269
Target Start/End: Original strand, 1863 - 1936
Alignment:
Q  196 ccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||||||||| | | |||||||| |||||||||||  | ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  1863 ccaccaaaacagcttcttcaaatcatgatacatctttatagctcccggatgaatactcaagctacttctgtgac 1936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 198 - 279
Target Start/End: Original strand, 11690 - 11771
Alignment:
Q  198 accaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgaccttcgtctaa 279  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||  |||||| ||| |||||    
T  11690 accaaaacaacttcttcaaatcatgatacatttttgtagctcctggatgaatacttaagctactcttatgactttcttctaa 11771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 196 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 2681 - 2616
Alignment:
Q  196 ccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactact 261  Q
    |||| |||||| | |||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  2681 ccacgaaaacagctttttcaaatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctact 2616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 168
Target Start/End: Original strand, 10204 - 10244
Alignment:
Q  128 tcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaa 168  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  10204 tcaaccttcgatttctgacaaatcaaacaagaatacacaaa 10244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 111
Target Start/End: Original strand, 11423 - 11496
Alignment:
Q  38 ggcaacgctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacc 111  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||| | | |||||||||| ||| |||||||||    
T  11423 ggcaacgctccgacaaaatccatagagatactatctcacttccaccccgacacaaacaacagttacatcaaacc 11496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 120 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 1113 - 980
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||  ||    ||||  |||| ||||||||||||| | ||||| ||    
T  1113 tctgatgctcaaccttagacttctgacaagtcaaacacgcatacacaaactgagcaacatcacgtttcaacccagaccaccaaaacaacttcttcaagtc 1014  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactc 253  Q
     |||||||| || || ||||| || |||||||||    
T  1013 atgatacatttttgtagctcccgggtgaatactc 980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 191 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 8443 - 8366
Alignment:
Q  191 ccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatga 268  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||| ||||| || | ||||||||||    
T  8443 ccagaccaccaaaacaactttttcaaatcatgatacatctgcgtagctcccggatggatacttaagccacttctatga 8366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 45 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 3421 - 3364
Alignment:
Q  45 ctccaacaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttg 102  Q
    |||||||||| |||||| | || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  3421 ctccaacaaaatccatatatatactatcctacttccactccggcacaaacaacggttg 3364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 269
Target Start/End: Original strand, 25945 - 26002
Alignment:
Q  212 ttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  25945 ttcagatcatgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttctatgac 26002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 196 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 11548 - 11475
Alignment:
Q  196 ccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  | ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  11548 ccaccaaaacaacctcttcaaataatgatacatctttctagctcccggatggatactcaagctacttctgtgac 11475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 196 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 17740 - 17667
Alignment:
Q  196 ccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  | ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  17740 ccaccaaaacaacctcttcaaataatgatacatctttctagctcccggatggatactcaagctacttctgtgac 17667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 264
Target Start/End: Original strand, 824 - 892
Alignment:
Q  196 ccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttct 264  Q
    ||||||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  824 ccaccaaaacaatttcttcaagtcatgatacatctttgtagctcctggatgaatacttaagctacttct 892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 170
Target Start/End: Original strand, 3003 - 3123
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||   || | |  ||||| ||| |  ||| |||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  3003 acaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctgatgttcaatcgtcgacttctgacaaa 3102  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaact 170  Q
    ||||||| | |||||||||||    
T  3103 ccaaacaggaatacacaaact 3123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 170
Target Start/End: Original strand, 12303 - 12423
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||   ||||||  |||||| || |  ||| |||||||||||||||| || || |||||||    
T  12303 acaaaatccatggatatgctatcccatttccactctggtacatctaacggtgtcatcaaccctgcaggtttctgatgttcaacctttgacttttgacaaa 12402  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaact 170  Q
     |||||| | |||||| ||||    
T  12403 tcaaacaggaatacaccaact 12423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 170
Target Start/End: Original strand, 24307 - 24427
Alignment:
Q  50 acaaactccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaa 149  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||   || | |  ||||| ||| |  ||| |||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  24307 acaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatctaaagataccatcataccagcaggtttctgatgttcaatcatcgacttctgacaaa 24406  T
Q  150 ccaaacaagcatacacaaact 170  Q
    ||||||| | |||||||||||    
T  24407 ccaaacaggaatacacaaact 24427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 32810 - 32690
Alignment:
Q  56 tccatagaaatgctatcccacttccactctggcacaaacaacggttgcatcaaacccgacggtctctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaac 155  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || |||  |||||||  || ||| || |  ||  ||||||||||||| || || |||||||||  |||||    
T  32810 tccatagaaatactgtcccacttccactccggtacatccaacggtgtcaacaaccctgcaggcttctgatgttcaactttagacttctgacaagtcaaac 32711  T
Q  156 aagcatacacaaactcagcaa 176  Q
    | ||||||||||||| |||||    
T  32710 atgcatacacaaactgagcaa 32690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 10361 - 10294
Alignment:
Q  202 aaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  10361 aaacaacttcttcaaatcatgatacatctttgtagctcccggatgtatactcaagctacttctgtgac 10294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 255
Target Start/End: Original strand, 34067 - 34202
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatc 219  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||  |||||| ||||| | ||| | |||||  ||   |||||  |||| ||||||||| | | ||||||||||    
T  34067 tctgatgttcaaccttagacttctggcaagtcaaacatgcataaaaaaattgagcaacatcacgcttcaaaccagaccaccaaaaaagctttttcaaatc 34166  T
Q  220 ttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaa 255  Q
     ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  34167 gtgatacatcttcgtagctcccggatggatactcaa 34202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 170
Target Start/End: Original strand, 2346 - 2396
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaact 170  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2346 tctgatgctcaaccttcgacttttgacaaatcaaacaagaatacacaaact 2396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Original strand, 22841 - 22895
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  22841 aaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagctacttatatgac 22895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Original strand, 8371 - 8425
Alignment:
Q  215 aaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  8371 aaatcgtgatacatcttcgtagctcccggatgaatactcaagttacttctatgac 8425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 25075 - 25006
Alignment:
Q  191 ccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactac 260  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||||   |||||||||||| ||||    
T  25075 ccagaccaccaaaacaacttcttcaaatcatgatacatctttgtagctccctaatgaatactcaagctac 25006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 4679 - 4630
Alignment:
Q  221 tgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgacc 270  Q
    ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  4679 tgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgacc 4630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 63454 - 63309
Alignment:
Q  124 atgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaactcagcaatctccttcttcattccaggccaccaaaacaaccttttcaaatcttga 223  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||  || |  ||    |||| ||||| |||||| || | | | || | ||| |||    
T  63454 atgttcaatcttcgacttctgacaaacctaacaggaatacacaaactgcgccacatcgcgtttcaatccagaccaccagaatatcttctttagatcgtga 63355  T
Q  224 tacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  63354 tacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgac 63309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0719 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0719
Description:

Target: scaffold0719; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 221 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 260 - 212
Alignment:
Q  221 tgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  260 tgatacatcttcgtagctcccgggtgaatactcaagctacttctatgac 212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 196 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 6387 - 6319
Alignment:
Q  196 ccaccaaaacaaccttttcaaatcttgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttct 264  Q
    ||||||||||||  | ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  6387 ccaccaaaacaatttcttcaagtcatgatacatctttgtagctcccggatgaatacttaagctacttct 6319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 120 - 168
Target Start/End: Original strand, 27140 - 27188
Alignment:
Q  120 tctgatgttcaaccttcgatttctgacaaaccaaacaagcatacacaaa 168  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  27140 tctgatgctcaaccttggacttctgacaaatcaaacaagcataaacaaa 27188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 221 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 79820 - 79772
Alignment:
Q  221 tgatacatcttagttgctcctggatgaatactcaaactacttctatgac 269  Q
    ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  79820 tgatacatcttcgtagctcccggttgaatactcaagctacttctatgac 79772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University