View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6709_low_3 (Length: 545)

Name: NF6709_low_3
Description: NF6709
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6709_low_3
NF6709_low_3
[»] chr7 (40 HSPs)
chr7 (2-474)||(15978801-15979273)
chr7 (1-496)||(39292481-39292973)
chr7 (1-492)||(21538932-21539425)
chr7 (3-496)||(21675655-21676148)
chr7 (1-496)||(8564330-8564816)
chr7 (98-496)||(28719431-28719828)
chr7 (121-450)||(3193002-3193332)
chr7 (1-364)||(46473030-46473394)
chr7 (103-481)||(44306020-44306399)
chr7 (98-496)||(16382524-16382921)
chr7 (178-443)||(18080595-18080859)
chr7 (101-400)||(17985770-17986071)
chr7 (254-481)||(16369389-16369616)
chr7 (150-444)||(19066518-19066812)
chr7 (383-496)||(4483704-4483817)
chr7 (348-495)||(13617710-13617857)
chr7 (156-458)||(12182955-12183254)
chr7 (1-133)||(18080461-18080592)
chr7 (324-496)||(45148519-45148691)
chr7 (325-476)||(14939684-14939836)
chr7 (325-476)||(15367277-15367429)
chr7 (324-396)||(36301409-36301481)
chr7 (4-94)||(19382541-19382631)
chr7 (324-396)||(38294814-38294886)
chr7 (5-94)||(4597515-4597604)
chr7 (324-393)||(33556819-33556888)
chr7 (442-495)||(46472941-46472994)
chr7 (324-414)||(13350982-13351072)
chr7 (180-249)||(370167-370236)
chr7 (1-50)||(370200-370249)
chr7 (345-485)||(9322193-9322332)
chr7 (180-249)||(15926647-15926716)
chr7 (1-50)||(15926680-15926729)
chr7 (182-249)||(14252007-14252074)
chr7 (1-52)||(14275654-14275705)
chr7 (180-275)||(25123435-25123529)
chr7 (410-485)||(31500110-31500185)
chr7 (1-50)||(14251992-14252041)
chr7 (1-50)||(25123493-25123542)
chr7 (348-416)||(14276103-14276171)
[»] chr6 (31 HSPs)
chr6 (1-496)||(23220677-23221173)
chr6 (104-450)||(17857331-17857678)
chr6 (103-443)||(26505777-26506116)
chr6 (121-457)||(16375278-16375615)
chr6 (142-458)||(4172544-4172858)
chr6 (144-458)||(4228156-4228467)
chr6 (347-496)||(17084398-17084548)
chr6 (324-496)||(11373880-11374052)
chr6 (101-236)||(16135325-16135460)
chr6 (325-496)||(29161467-29161637)
chr6 (1-103)||(25650218-25650320)
chr6 (152-448)||(26523169-26523463)
chr6 (422-496)||(16135259-16135333)
chr6 (275-357)||(18104632-18104714)
chr6 (324-485)||(22463243-22463405)
chr6 (1-112)||(5485377-5485488)
chr6 (1-113)||(19990965-19991077)
chr6 (383-457)||(31162090-31162164)
chr6 (324-396)||(10445428-10445500)
chr6 (324-443)||(22594452-22594571)
chr6 (324-485)||(34965810-34965970)
chr6 (180-249)||(16230971-16231040)
chr6 (1-50)||(16231004-16231053)
chr6 (1-50)||(18003663-18003712)
chr6 (1-40)||(23976893-23976932)
chr6 (1-86)||(10974045-10974129)
chr6 (1-50)||(13621804-13621853)
chr6 (180-249)||(13621817-13621886)
chr6 (1-50)||(15735870-15735919)
chr6 (180-249)||(15735883-15735952)
chr6 (180-249)||(18003676-18003745)
[»] chr5 (18 HSPs)
chr5 (1-496)||(14342461-14342957)
chr5 (1-496)||(21108485-21108979)
chr5 (1-482)||(24226280-24226762)
chr5 (262-496)||(20455061-20455287)
chr5 (1-263)||(20313661-20313923)
chr5 (278-485)||(33627478-33627684)
chr5 (135-272)||(33150237-33150374)
chr5 (324-496)||(11964926-11965098)
chr5 (348-495)||(23414110-23414257)
chr5 (387-496)||(20833191-20833299)
chr5 (1-48)||(22111181-22111228)
chr5 (4-90)||(19267621-19267707)
chr5 (346-448)||(19872798-19872900)
chr5 (1-50)||(9731478-9731527)
chr5 (180-249)||(9731491-9731560)
chr5 (383-438)||(23985523-23985578)
chr5 (212-290)||(20833017-20833094)
chr5 (397-485)||(6455576-6455664)
[»] chr2 (30 HSPs)
chr2 (1-482)||(43641706-43642188)
chr2 (1-482)||(19434272-19434754)
chr2 (12-441)||(29113238-29113658)
chr2 (26-481)||(24840791-24841246)
chr2 (135-495)||(22331695-22332056)
chr2 (104-481)||(20272350-20272718)
chr2 (282-467)||(45618405-45618590)
chr2 (102-291)||(7320526-7320711)
chr2 (286-496)||(24561851-24562061)
chr2 (324-496)||(18534803-18534975)
chr2 (325-496)||(6093809-6093980)
chr2 (1-94)||(19667882-19667975)
chr2 (153-458)||(23166837-23167142)
chr2 (153-458)||(23578094-23578399)
chr2 (1-93)||(22577307-22577399)
chr2 (324-396)||(23799536-23799608)
chr2 (8-93)||(20510504-20510589)
chr2 (383-438)||(32464911-32464966)
chr2 (1-50)||(3799697-3799746)
chr2 (180-249)||(8942926-8942995)
chr2 (1-50)||(8942959-8943008)
chr2 (1-50)||(12636962-12637011)
chr2 (180-249)||(12636975-12637044)
chr2 (1-50)||(12642716-12642765)
chr2 (180-249)||(12642729-12642798)
chr2 (1-50)||(42179055-42179104)
chr2 (180-249)||(42179068-42179137)
chr2 (180-290)||(19659015-19659124)
chr2 (180-249)||(3799710-3799779)
chr2 (1-50)||(21275218-21275267)
[»] chr8 (35 HSPs)
chr8 (1-516)||(19332319-19332827)
chr8 (1-496)||(25756965-25757460)
chr8 (1-496)||(25294945-25295440)
chr8 (1-496)||(45559913-45560408)
chr8 (1-496)||(22312645-22313138)
chr8 (141-496)||(11543490-11543844)
chr8 (103-481)||(20176781-20177160)
chr8 (103-481)||(20221508-20221887)
chr8 (274-496)||(3845114-3845336)
chr8 (103-443)||(17500957-17501297)
chr8 (150-458)||(18118892-18119194)
chr8 (135-272)||(34012895-34013032)
chr8 (95-224)||(24907017-24907147)
chr8 (324-495)||(22498407-22498577)
chr8 (325-485)||(7469150-7469311)
chr8 (251-444)||(24906824-24907017)
chr8 (410-496)||(25609022-25609108)
chr8 (324-485)||(24238581-24238742)
chr8 (1-93)||(17623577-17623669)
chr8 (325-475)||(38636798-38636949)
chr8 (1-94)||(24383790-24383883)
chr8 (324-441)||(22886797-22886914)
chr8 (324-482)||(18042650-18042807)
chr8 (253-293)||(18122570-18122610)
chr8 (500-538)||(3845356-3845394)
chr8 (383-484)||(25609123-25609225)
chr8 (355-485)||(33171158-33171287)
chr8 (383-482)||(37654834-37654931)
chr8 (1-38)||(3432376-3432413)
chr8 (180-249)||(3432389-3432458)
chr8 (383-436)||(16001039-16001092)
chr8 (1-50)||(16040051-16040100)
chr8 (180-249)||(16040064-16040133)
chr8 (1-94)||(22889363-22889456)
chr8 (1-49)||(17623734-17623782)
[»] chr1 (17 HSPs)
chr1 (1-431)||(76756-77187)
chr1 (260-479)||(20821981-20822200)
chr1 (97-280)||(9785017-9785199)
chr1 (345-496)||(33396276-33396428)
chr1 (325-485)||(40437406-40437566)
chr1 (322-458)||(21224198-21224333)
chr1 (324-396)||(34392210-34392282)
chr1 (384-485)||(46144672-46144774)
chr1 (1-99)||(52400416-52400514)
chr1 (383-475)||(49998509-49998602)
chr1 (325-456)||(52400233-52400365)
chr1 (1-94)||(18622787-18622880)
chr1 (28-93)||(21422444-21422509)
chr1 (324-436)||(20193043-20193155)
chr1 (447-496)||(77184-77233)
chr1 (1-50)||(20825921-20825970)
chr1 (180-249)||(20825934-20826003)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (1-496)||(9787-10285)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (1-481)||(13661-14142)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (1-496)||(11557-12050)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (1-441)||(76006-76444)
[»] chr3 (33 HSPs)
chr3 (1-493)||(8603600-8604094)
chr3 (102-478)||(17759238-17759615)
chr3 (102-478)||(19060558-19060935)
chr3 (102-477)||(40040022-40040398)
chr3 (101-477)||(37917272-37917649)
chr3 (135-485)||(25104915-25105254)
chr3 (1-298)||(18738909-18739205)
chr3 (9-282)||(17937556-17937828)
chr3 (102-301)||(15549574-15549774)
chr3 (322-496)||(11401551-11401725)
chr3 (383-496)||(5229191-5229304)
chr3 (325-481)||(38376831-38376987)
chr3 (150-458)||(14969841-14970147)
chr3 (274-372)||(17392442-17392540)
chr3 (1-94)||(11823417-11823510)
chr3 (345-448)||(11516638-11516741)
chr3 (325-485)||(43428670-43428830)
chr3 (324-396)||(12918084-12918156)
chr3 (324-423)||(14181133-14181232)
chr3 (383-485)||(18968992-18969095)
chr3 (180-298)||(11883251-11883367)
chr3 (180-289)||(13327548-13327656)
chr3 (324-396)||(45804098-45804170)
chr3 (1-112)||(12774176-12774287)
chr3 (1-50)||(8631004-8631053)
chr3 (348-484)||(17319733-17319870)
chr3 (180-249)||(18910072-18910141)
chr3 (1-50)||(18910105-18910154)
chr3 (180-249)||(53770043-53770112)
chr3 (1-50)||(53770076-53770125)
chr3 (180-249)||(16260464-16260533)
chr3 (1-50)||(16260497-16260546)
chr3 (1-50)||(51962131-51962180)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (101-496)||(4920-5314)
[»] chr4 (27 HSPs)
chr4 (92-496)||(12134537-12134942)
chr4 (101-496)||(17376353-17376750)
chr4 (102-481)||(54364368-54364747)
chr4 (1-299)||(10238241-10238539)
chr4 (121-457)||(17212786-17213122)
chr4 (262-496)||(5371655-5371888)
chr4 (121-458)||(9651247-9651585)
chr4 (253-459)||(14570269-14570475)
chr4 (324-485)||(19558319-19558480)
chr4 (345-485)||(49070724-49070864)
chr4 (314-481)||(19082191-19082358)
chr4 (324-485)||(24237786-24237947)
chr4 (325-484)||(12733050-12733209)
chr4 (327-485)||(16226295-16226452)
chr4 (149-246)||(19082067-19082164)
chr4 (329-448)||(19623245-19623364)
chr4 (338-485)||(38763678-38763826)
chr4 (3-112)||(9565726-9565835)
chr4 (9-86)||(28800137-28800214)
chr4 (1-50)||(7133140-7133189)
chr4 (180-249)||(7133153-7133222)
chr4 (1-50)||(15273450-15273499)
chr4 (180-249)||(15273463-15273532)
chr4 (180-249)||(19999803-19999872)
chr4 (1-50)||(19999836-19999885)
chr4 (345-485)||(47469475-47469614)
chr4 (324-374)||(9621742-9621792)
[»] scaffold0090 (6 HSPs)
scaffold0090 (1-364)||(4071-4435)
scaffold0090 (282-477)||(35786-35980)
scaffold0090 (383-496)||(1341-1454)
scaffold0090 (383-496)||(5721-5834)
scaffold0090 (1-112)||(35682-35793)
scaffold0090 (313-364)||(1-52)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (147-496)||(14705-15041)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (135-496)||(8060-8420)
[»] scaffold1204 (1 HSPs)
scaffold1204 (98-496)||(1034-1413)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (101-496)||(11905-12283)
[»] scaffold0452 (1 HSPs)
scaffold0452 (98-399)||(8333-8634)
[»] scaffold0174 (2 HSPs)
scaffold0174 (1-262)||(20819-21081)
scaffold0174 (305-496)||(21087-21277)
[»] scaffold1278 (1 HSPs)
scaffold1278 (180-456)||(473-749)
[»] scaffold1957 (1 HSPs)
scaffold1957 (135-445)||(746-1052)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (1-219)||(117149-117362)
scaffold0032 (216-342)||(118544-118670)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (282-448)||(255373-255539)
[»] scaffold0601 (2 HSPs)
scaffold0601 (319-481)||(2119-2280)
scaffold0601 (1-93)||(2035-2127)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (253-459)||(246901-247107)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (328-485)||(4842-4999)
[»] scaffold0205 (2 HSPs)
scaffold0205 (121-276)||(7149-7304)
scaffold0205 (228-264)||(7118-7154)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (282-458)||(39114-39291)
[»] scaffold0153 (1 HSPs)
scaffold0153 (345-493)||(755-903)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (347-495)||(44739-44889)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (1-94)||(14715-14808)
[»] scaffold0258 (1 HSPs)
scaffold0258 (161-375)||(9140-9352)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (324-474)||(34570-34720)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (1-106)||(33924-34028)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (1-112)||(2356-2467)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (4-94)||(1736-1826)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (1-112)||(9335-9445)
[»] scaffold0303 (2 HSPs)
scaffold0303 (1-50)||(1168-1217)
scaffold0303 (180-249)||(1181-1250)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (1-50)||(14557-14606)
scaffold0251 (180-249)||(14570-14639)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (1-50)||(188013-188062)
scaffold0004 (201-249)||(188047-188095)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (1-51)||(94010-94060)
scaffold0037 (180-249)||(93978-94047)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (325-418)||(6694-6787)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (390-438)||(167383-167431)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (1-49)||(190933-190981)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 401; Significance: 0; HSPs: 40)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 474
Target Start/End: Original strand, 15978801 - 15979273
Alignment:
Q  2 tatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatggtaaagt 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15978801 tatacactactgcactcataagtgatttgtgtatatacttagttgaggtttctcaacttgtttgttttgttttgtcggataacttggaaaatggtaaagt 15978900  T
Q  102 gatacgaacttgtcgtatcttgtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtgt 201  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15978901 gatacgaacttgtcgtaacttgtgattttgataatcttgtcgtagccggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtgt 15979000  T
Q  202 atacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataa 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  15979001 atacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttgtctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacaaactttgtcaaaaataa 15979100  T
Q  302 acgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcc 401  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  15979101 tcgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttttaggtgttgaatattatgtttatcc 15979200  T
Q  402 taatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagtt 474  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15979201 taatgtgatgtattttctactttacttggattgtgagaaattgtatgaagttgttgaactatatgatatagtt 15979273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 496
Target Start/End: Original strand, 39292481 - 39292973
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatggtaaag 100  Q
    |||||| |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||  |||||  |||||||||| |||||||||| ||| |||||||     
T  39292481 gtatactctactgcactcatg--tgattggtgtatatacttagttgaggtttccaaatgtgtttactttgttttgtcggataacttgaaaattggtaaaa 39292578  T
Q  101 tgatacgaacttgtcgtatcttgtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtg 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  39292579 tgatacgaacttgtcgtaacttgtgattttgatgattttgtcgtggtcggccggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtggtctaagtg 39292678  T
Q  201 tatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaata 300  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39292679 tatacatagtcgaggccccataatttatttacttggttttggttcatttgtctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaata 39292778  T
Q  301 aacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatc 400  Q
    | | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39292779 atctttaagaccaaatacttggcaaattgtttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatgtgaatgatttctaggtgttgaatatgatgtttatc 39292878  T
Q  401 ctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgattagtgcatatatg 496  Q
     ||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  39292879 ataatgtgttgtattctctcctttacgtgtattgtgagaaattgtatggagttgttgaaccatatgatctagtt-atgttgattaatgcatgtatg 39292973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 492
Target Start/End: Original strand, 21538932 - 21539425
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatggtaaag 100  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  21538932 gtatacactactgcgctcatatacgatttgtgtatatacttagtggaggtttcccaacttgtttgttttgttttgtcggataacttggaaaatggtaaaa 21539031  T
Q  101 tgatacgaacttgtcgtatc-ttgtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagt 199  Q
    ||||| |||| |||| |||| ||||||  ||||| ||||| |||| ||| ||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  21539032 tgatatgaacatgtcatatcgttgtgaggttgatgattttgtcgtggtcagccagtgaaatgcacatgtatattcaactacactcttatgtgatctaagt 21539131  T
Q  200 gtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaat 299  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21539132 ctatacatagtcgaggtcctagagtttatttacttggttttggttcatttgtctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgttgaaaat 21539231  T
Q  300 aaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgat-gttta 398  Q
    || | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||  ||||    
T  21539232 aatctttaagacctaatacttggcaaatctttggtggatagttggttatgtttatatgaagatatgtgaatgattgctagatattgaatatgatatttta 21539331  T
Q  399 tcctaatgtgatgtattttctcctttacttgga-ttgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgattagtgcata 492  Q
    || | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21539332 tcatgatgtgatgtattttctcc-ttacttggatttgtgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcata 21539425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 3 - 496
Target Start/End: Original strand, 21675655 - 21676148
Alignment:
Q  3 atacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatggtaaagtg 102  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||  |||||  |||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||    
T  21675655 atacactactgcactcatatgtgattggtgtatatacttagttgaggtttccaaatgtgtttactttgttttgtcggataacttgaaaattggtaaaatg 21675754  T
Q  103 atacgaacttgtcgtatcttgtgattttgataatttta-tcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtgt 201  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||  |||| || ||||||||||||| ||||||  ||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  21675755 atacaaacttgttgtaacttgtgattttgatgatttttgtcgtggttggccggtgaaacgaacatgtgtattcaactacatgcatatgtgatctaagtgt 21675854  T
Q  202 atacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataa 301  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21675855 atacatagtagagaccctagagtttatttatttggttttgattcatttgtctcaattgttttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcggaaataa 21675954  T
Q  302 acgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcc 401  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||     
T  21675955 tc-ttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagttttctatgactatatgaatatatgtgaatgctttataggtgttgaatatgatgtttatca 21676053  T
Q  402 taatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgattagtgcatatatg 496  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  21676054 taatgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatg 21676148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 496
Target Start/End: Original strand, 8564330 - 8564816
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatggtaaag 100  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||           |||||| |||||||||||||||     
T  8564330 gtatacactactgtactcatatgtgatttgtgtatatacttagttgaggtttcccaacttgtttgtc----------ggataatttggaaaatggtaaaa 8564419  T
Q  101 tgatacgaacttgtcgtatctt-gtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagt 199  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8564420 tgatacgaacttgtcgcaactttgtgattttgatgattttgtcgtagtcggccggtgaaatgcacatgtacattcaactacactcatatgtgatctaagt 8564519  T
Q  200 gtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaat 299  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  8564520 ttatacatagtcgaggccctagagtttattttcttagttttggttcaattgtctcaattattttaaagttgtaatatgagagacgaattttgtcaaaaat 8564619  T
Q  300 aaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttat 399  Q
    || | ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||||||||||    
T  8564620 aatctttaagtccaaatacttggaaaatcttatgtggatagtttgctatgattatatgaagatatgtgaatgctttctaagtgctgaatatgatgtttat 8564719  T
Q  400 cctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgattagtgcatatatg 496  Q
    | |  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8564720 cattgtgtgttgtatgttctcctttacttgaattgtgagaaatcgtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatg 8564816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 98 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 28719828 - 28719431
Alignment:
Q  98 aagtgatacgaacttgtcgtatcttg-tgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatcta 196  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  28719828 aagtgatacgaacttgtcgtagctttatgattttgatgattttgtcgtggtcggccggtgaaacgcacatgtatactcaactacactcatatgtgatcta 28719729  T
Q  197 agtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaa 296  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  28719728 agtgtatacatagtcgaggcc-tagagtttatttacttggttttggttcatttgtctcaattattttaaagttgtaatatgagagatgaactttgtcgaa 28719630  T
Q  297 aataaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtt 396  Q
    ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||  | || ||||||||||||||    
T  28719629 aataatc-ttaagaccaaatacttggaaaatcttttgtggataatttgatatgattatatgaagatatgtgaatgctttacatgtgttgaatatgatgtt 28719531  T
Q  397 tatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgattagtgcatatatg 496  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  28719530 tatcataatgtgttgtattttctcttttacttgaattttgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatagagttgatgttgattaatgcatatatg 28719431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 121 - 450
Target Start/End: Original strand, 3193002 - 3193332
Alignment:
Q  121 ttgtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggcccta 220  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3193002 ttgtgattttgataattttgtcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatcttagtgtatacatagtcgaggcccta 3193101  T
Q  221 gagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattatttt-aaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataaacgttaagaccaaatact 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  3193102 gagtttatttacttggttttggttcatttgtctcaattatttttaaagttgtaaaatgtgagacgaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatact 3193201  T
Q  320 tggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttct 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||    
T  3193202 tggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatgtgaatgattgctaggtattgaatatgatgtttatcataatttgtcgtattttct 3193301  T
Q  420 cctttacttggattgtgagaaattgtatgga 450  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  3193302 cctttacttgaattgtgagaacttgtatgga 3193332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 46473394 - 46473030
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatggtaaag 100  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  46473394 gtatacactactgaactcatatgtgatttatgtatatacttagttgatgtttcccaacttgtttgttttgttttgtcggataacttggaaaatgataaaa 46473295  T
Q  101 tgatacgaacttgtcgtatctt-gtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagt 199  Q
    ||| ||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46473294 tgacacgaacttgtcataactttgtgattttgatgattttgtcgtagtcggctggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagt 46473195  T
Q  200 gtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaat 299  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46473194 ttatacatagtcgaggccttagagtttatttacttgatttttgttcaattgtctcaattattttaaagttgtaatatgagagacgaactttgtcgaaaat 46473095  T
Q  300 aaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatat 364  Q
    || | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46473094 aatctttaagatcaaatacttagcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatat 46473030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 103 - 481
Target Start/End: Original strand, 44306020 - 44306399
Alignment:
Q  103 atacgaacttgtcgta-tcttgtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtgt 201  Q
    |||||||||||| ||| | || |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  44306020 atacgaacttgttgtagttttatgattttgatgattttgtcgtggtcggccggtgaaacgcatatgtatattcaactacactcatatgtgatataagtgt 44306119  T
Q  202 atacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataa 301  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44306120 atatatagtcaaggccctagagtttatttacttggttttggttaatttgtctcaattattttaaagttgtaatatgagagacgaactttgtcgaaaataa 44306219  T
Q  302 acgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcc 401  Q
     | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||| ||||||||||      
T  44306220 tc-taaagaccaaatacttggaaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatgtgaatgattactatgtgttgaatgtgatgtttatta 44306318  T
Q  402 taatgtgatgtattttctcctttacttg-gattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttg 481  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||  |||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  44306319 taaggtgttgtattttctcctttacttgaaattgtgagaaataatatgatgttgttgaattatatgatgaagtcgatgttg 44306399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 98 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 16382921 - 16382524
Alignment:
Q  98 aagtgatacgaacttgtcgtatcttg-tgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatcta 196  Q
    |||||||||||| |||||||| |||  |||||||||| ||||| || | ||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  16382921 aagtgatacgaatttgtcgtagctttatgattttgatgattttgtcatggtcggccagtgaaacgcacatgtatactcaactacactcatatgtgatcta 16382822  T
Q  197 agtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggtttt-ggttcatttatctcaattattttaaagttg----taaaatgagagacgaactttg 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    |||||||||||| ||||||||    
T  16382821 agtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttgtttttaagttcatttgtctcaattattttaaagttgtaattaaaatgagagatgaactttg 16382722  T
Q  292 tcgaaaataaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatg 391  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||       ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||    
T  16382721 tcgaaaataatctttaagaccaattact-------tcttttgcggatagttcgttatgattatatgaagatatgtgaatgattgttaggtgttgaatatg 16382629  T
Q  392 atgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgattagtgcat 491  Q
    ||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||    
T  16382628 atgtttattataaggtgttgtattttctcctttacttggattatgagaaagtatatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaatattacat 16382529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 178 - 443
Target Start/End: Original strand, 18080595 - 18080859
Alignment:
Q  178 tacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatg 277  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  18080595 tacacttatatgtggtctatgtgtatacatagtcgagacccctgaatttatttacttggttttgcttcatttgtctcaattattttaaagttgtaaattg 18080694  T
Q  278 agagacgaactttgtcgaaaataaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttct 377  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||  |    
T  18080695 agagacgaactttgtcgaaaataatctttaagaccaattacttggaaaatcttttgtggatagctttatatgattatgtgaagatatgtgaatgattgtt 18080794  T
Q  378 aggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaatt 443  Q
    |||  ||| |||||||||| ||| ||| ||  |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  18080795 aggcattggatatgatgttcatcataacgtattgtattttct-ctttacttggaatgtgggaaatt 18080859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 101 - 400
Target Start/End: Original strand, 17985770 - 17986071
Alignment:
Q  101 tgatacgaacttgtcgtatctt-gtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagt 199  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||||   | ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| | ||  || |||||||||||  |||| ||    
T  17985770 tgatacgaacttgtcataactttgtgatttcattgattttgtcgtagttagccggtgaaacgcacatgtatactctactgcactcatatgtagtctaggt 17985869  T
Q  200 gtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaat 299  Q
    ||||||||||| |||||  | ||  || ||| |||||| ||| || |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17985870 gtatacatagttgaggcattggatcttgttttcttggtcttgatttatttgttccaattattttaaagttgtaaaatgagagatgaactttgtcgaaaat 17985969  T
Q  300 aaacgttaa-gaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgttta 398  Q
    || | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  17985970 aatctttaaagaccaaatacatggcaaatcttttgtggatagtttgatataattatatgaagatatgtgaatgattgctaagtgttgaatatgatgttta 17986069  T
Q  399 tc 400  Q
    ||    
T  17986070 tc 17986071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 254 - 481
Target Start/End: Original strand, 16369389 - 16369616
Alignment:
Q  254 caattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgatta 353  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16369389 caattactttaaagttttaaaatgatagacgaaccttgtcgaaagtaatctttaagaccaaatacttgacaaatcttttgtggatagtttgatatgacta 16369488  T
Q  354 tatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagtt 453  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||| | || ||  ||||||||||  |||||| |||| |||||||| ||| | ||||    
T  16369489 tatgtagatgtatgaatgatttataggagttgaatatgatgtgtatcatgatatggcgtattttctctcttactttgattatgagaaatggtaggaagtt 16369588  T
Q  454 gttgaacaatatgatatagttgatgttg 481  Q
    ||||||  ||||||  ||||||||||||    
T  16369589 gttgaattatatgacttagttgatgttg 16369616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 150 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 19066812 - 19066518
Alignment:
Q  150 gccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcattt 249  Q
    |||||||||||||||||||| | ||  || |||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||  | ||   ||||| |||||| ||| || | ||    
T  19066812 gccggtgaaacgcacatgtatactctactgcacttatatgtggtctaggtgtatacatagttgaggcattggatcgtatttgcttggtcttgatttactt 19066713  T
Q  250 atctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataa-acgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatat 348  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  | | |||||||||||| ||||| | |||| | ||||||||  ||    
T  19066712 gtttcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaaccttgtcgaaaataatatttgaggaccaaatactt-gcaaaacctttgagaatagtttgtgat 19066614  T
Q  349 gattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattg 444  Q
    |||||| || |||||| |||||||||  |||||  |||| |||| ||||||| ||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  19066613 gattatgtggagatatgtgaatgattgttaggtgctgaacatgaggtttatcataatgtgttgtattttttcttttacttgaattgtgagaaattg 19066518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 383 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 4483817 - 4483704
Alignment:
Q  383 ttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttga 482  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4483817 ttgaatatgatgtttatcataatatgttgtattttcccctttatttgaattgtgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttga 4483718  T
Q  483 ttagtgcatatatg 496  Q
    ||| ||||||||||    
T  4483717 ttaatgcatatatg 4483704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 348 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 13617857 - 13617710
Alignment:
Q  348 tgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtat 447  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||  |||||  ||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  13617857 tgattaaattaagatatttgaatgattgttaggtgctgaatatgatgtttattataaggtgttgtattttctcctttacttggaatgtgagaaagtgtat 13617758  T
Q  448 ggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgattagtgcatatat 495  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  13617757 ggagttgttgagctatattatatagttgatgttgattaatgtatatat 13617710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 156 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 12183254 - 12182955
Alignment:
Q  156 gaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctca 255  Q
    |||||||||||||| | ||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||  || ||||| ||  ||  |||||| |||| ||  | ||    
T  12183254 gaaacgcacatgtatactcaactgcacttatatgtgatctaagagtatacatagttgaggcattatagtttttt--ctcagttttgattcaattgccaca 12183157  T
Q  256 attattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattata 355  Q
    ||| ||| ||||||| |||| || ||||||||| |||| ||||| | | ||||   | ||||  | | |||||||||| |   |||||||||||||||||    
T  12183156 attgttt-aaagttgaaaaacgatagacgaactctgtcaaaaatgacctttaatgtcgaatatcttgtaaatcttttgagatcagtttgatatgattata 12183058  T
Q  356 tgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgt 455  Q
    ||||| | | |||||||||| ||| | |||||||||||||||||| || | ||||| ||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  12183057 tgaagttgtgtgaatgatttatagatgttgaatatgatgtttatcatagtatgatggattttcttcgttacttgaattgtgagatattgtatagagttgt 12182958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 18080461 - 18080592
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatggtaaag 100  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||| | ||||| | ||  |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||     
T  18080461 gtatacactaatgcactcatatgtgatttgtgtatattcttagtcgtggtttccaaatgtgtttactttgttttgtcggataacttggaaattggtaaa- 18080559  T
Q  101 tgatacgaacttgtcgtatcttgtgattttgat 133  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18080560 tgatacgaacttgtcgtaacttgtgattttgat 18080592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 324 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 45148691 - 45148519
Alignment:
Q  324 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctt 423  Q
    |||||| | ||| |||| || ||||||||  |||||||||| ||||||| | ||| |||||| ||  || |||||||||||||   ||||||||||| ||    
T  45148691 aaatctgtcgtgaatagctttatatgattgaatgaagatatgtgaatgagtgctaagttttgtatgcgaggtttatcctaatgcattgtattttctcatt 45148592  T
Q  424 tacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgattagtgcatatatg 496  Q
    ||||||| |||||||| | | |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  45148591 tacttggtttgtgagatagtatatggagttgttgaactataagatataattgatgttgaatattgcatatatg 45148519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 325 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 14939836 - 14939684
Alignment:
Q  325 aatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttc-tcctt 423  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||  |||||||||| ||| | |||   |||| ||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||| |||||    
T  14939836 aatcttttgtgattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgaggtcttgaatatgatatttatcataaggtgttgtattttcctcctt 14939737  T
Q  424 tacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttga 476  Q
    |||||| ||| |||||| || |||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  14939736 tacttgtattatgagaagttatatgaagttgttgaactaaatgatatagttga 14939684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 325 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 15367429 - 15367277
Alignment:
Q  325 aatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttc-tcctt 423  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||  |||||||||| ||| | |||   |||| ||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||| |||||    
T  15367429 aatcttttgtgattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgaggtcttgaatatgatatttatcataaggtgttgtattttcctcctt 15367330  T
Q  424 tacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttga 476  Q
    |||||| ||| |||||| || |||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  15367329 tacttgtattatgagaagttatatgaagttgttgaactaaatgatatagttga 15367277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 324 - 396
Target Start/End: Original strand, 36301409 - 36301481
Alignment:
Q  324 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtt 396  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  36301409 aaatcttttgtggataatttgatatgattatatggagatatttgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtt 36301481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 19382631 - 19382541
Alignment:
Q  4 tacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatg 94  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||   ||||||||| |||||||||||||||||    
T  19382631 tacactactgcagtcatatgtgatttgtgtatatacttagttgaggtttccaaacatgtttaaattgttttgtcggataacttggaaaatg 19382541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 324 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 38294886 - 38294814
Alignment:
Q  324 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtt 396  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  38294886 aaatcttttgtggataaattgatatgattatatggagatatttgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtt 38294814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 94
Target Start/End: Original strand, 4597515 - 4597604
Alignment:
Q  5 acactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatg 94  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4597515 acactacttcactcatatgtgatttgtgtatatacttggttgaggcttctcaacgtgtttgatttgttttgtcggataacttgaaaaatg 4597604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 393
Target Start/End: Original strand, 33556819 - 33556888
Alignment:
Q  324 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgat 393  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||| ||| |||||||    
T  33556819 aaatcttttgtggataatttgatatgattatatggagatatttgaataattgctaggtgttgtatatgat 33556888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 46472994 - 46472941
Alignment:
Q  442 ttgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgattagtgcatatat 495  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  46472994 ttgtatggagttgttgaactatatgatatagtttatgttgattaatgcatatat 46472941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 13351072 - 13350982
Alignment:
Q  324 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtat 414  Q
    ||||| |||||| |||| || ||||||||| | ||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  13351072 aaatcatttgtgaatagctttatatgattaaaagaatatatgtgaatgattcttaggtattgaatatgatgtttaccataaggtgatgtat 13350982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 180 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 370236 - 370167
Alignment:
Q  180 cactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcattt 249  Q
    |||||||||||||| |  || ||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  370236 cactcatatgtgatttgtgtatatacatggttgaggtcctagagtttatttatttggttttagttcattt 370167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 370249 - 370200
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggt 50  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||    
T  370249 gtatacactactgcactcatatgtgatttgtgtatatacatggttgaggt 370200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 485
Target Start/End: Original strand, 9322193 - 9322332
Alignment:
Q  345 atatgattatatgaagatatatgaatgatttct-aggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaatt 443  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||| || | |||| ||||||||||| |||||| ||| ||| || ||||||| ||||||||||| | |||| || |    
T  9322193 atatgactaaatgaagatatgtgaatgaattgttaggtgttgaatatgatatttatcataaggtgttgcattttct-ctttacttggaatatgag-aagt 9322290  T
Q  444 gtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgatta 485  Q
     | |||||| || |||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  9322291 atttggagtggtggaactatattatatggttgatgttgatta 9322332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 180 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15926716 - 15926647
Alignment:
Q  180 cactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcattt 249  Q
    |||||||||||||| |  || ||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15926716 cactcatatgtgatttgtgtatatacatggttgaggtcctagagtttatttatttggttttagttcattt 15926647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 15926729 - 15926680
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggt 50  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||    
T  15926729 gtatacactactgcactcatatgtgatttgtgtatatacatggttgaggt 15926680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 249
Target Start/End: Original strand, 14252007 - 14252074
Alignment:
Q  182 ctcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcattt 249  Q
    |||||||||||| |  || ||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  14252007 ctcatatgtgatttgtgtatatacatggttgaggtcctagagtttatttatttggttttagttcattt 14252074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Original strand, 14275654 - 14275705
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttt 52  Q
    ||||||||||||| |||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14275654 gtatacactactgaactcgtatgtgatttgtgtctatacttagttgaggttt 14275705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 25123529 - 25123435
Alignment:
Q  180 cactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaa 275  Q
    |||||||||||||  |  || ||||||| || |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||    
T  25123529 cactcatatgtgacttgtgtatatacatggttgaggtcctagagtttatatactcagttttggttcaattgtctc-attgttttaaagttgtaaaa 25123435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 410 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 31500185 - 31500110
Alignment:
Q  410 tgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgatta 485  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||   ||||| ||||| |||  |||||||||| ||||||||    
T  31500185 tgtattttctcttttacttggatggtgataaattgtacaaagttgatgaactatagaatatagttgaagttgatta 31500110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 14251992 - 14252041
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggt 50  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| | ||||||||    
T  14251992 gtatacactactgctctcatatgtgatttgtgtatatacatggttgaggt 14252041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 25123542 - 25123493
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggt 50  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| | ||||||||    
T  25123542 gtatacactactgcactcatatgtgacttgtgtatatacatggttgaggt 25123493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 348 - 416
Target Start/End: Original strand, 14276103 - 14276171
Alignment:
Q  348 tgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattt 416  Q
    |||||| |||||| ||| | |||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  14276103 tgattaaatgaagttatgttaatgattgataggtgttgaatatgatgtttatcataaggtgttgtattt 14276171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 31)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 23221173 - 23220677
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatggtaaag 100  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  23221173 gtatacactactacactcatatgtgatttgtgtatatacttagttgaggtttcccaacttgtttgttttgttttgtcggataacttggaaaatggtaaaa 23221074  T
Q  101 tgatacgaacttgtcgtatctt-gtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagt 199  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  23221073 tgatacgaacttgtcataactttgtgattttgatgattttgtcgtagttggccggtgaaacacacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaatt 23220974  T
Q  200 gtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaat 299  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23220973 ttatacatagtcgagaccctagagtttatttacttggttttggttcaattgtctcaattattttaaagttgtaatatgagagacgaactttgtcgaaaat 23220874  T
Q  300 aaacgttaagaccaaatacttggcaaatc-ttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgttta 398  Q
    || | ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  23220873 aatctttaagaccaaatacttgccaaatctttttctggataatttgatattattatatgaagatatgtgaatgatttctaggtgtttaatatgatgttta 23220774  T
Q  399 tcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgattagtgcatatatg 496  Q
    || ||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23220773 tcataatgtgtttcattttctcctttacttgaattgtgagaaattatat-gagttgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatg 23220677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 104 - 450
Target Start/End: Original strand, 17857331 - 17857678
Alignment:
Q  104 tacgaacttgtcgtatctt-gtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtgta 202  Q
    |||||||||||| || ||| ||| |||| || ||||| |||||||||||| |||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  17857331 tacgaacttgtcataactttgtggtttttatgattttgtcgtagtcggccagtgaaactgacatgtatattcaaccacactcatatgtgatctaagtgta 17857430  T
Q  203 tacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataaa 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17857431 tacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttgtctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataat 17857530  T
Q  303 cgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcct 402  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||| ||||| ||||| |||||| |    
T  17857531 ctttaagaccaaatacttggcaaatcttttttggatagtttgatatgattatatgaagatatgttaatgatagctaggtgttgaacatgatatttatcat 17857630  T
Q  403 aatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatgga 450  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17857631 aatgtgttgtattttcttctttacttgaattgtgagaacttgtatgga 17857678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 103 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 26506116 - 26505777
Alignment:
Q  103 atacgaacttgtcgtatctt-gtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtgt 201  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  26506116 atacgaacttgtcgtaactttgtgattttgattattttgtcgtagttggccggtgaaacgcacatgtacattcaactacactcatatgtgatctaagtat 26506017  T
Q  202 atacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataa 301  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26506016 atacattgtcgaggccctagagtttatttacttggttttggctcattg-tctcaattatattaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataa 26505918  T
Q  302 acgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcc 401  Q
     | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |    
T  26505917 tctttaagaccaattacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattaaatgaagatatgtgaatgattgttaggtgttgaatatgatgtttat-c 26505819  T
Q  402 taatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaatt 443  Q
     |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26505818 aaatgtgttgtattttctcatttacttggatcgtgagaaatt 26505777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 121 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 16375615 - 16375278
Alignment:
Q  121 ttgtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggcccta 220  Q
    |||||||||| || ||||| || || |  |||||||||||| | ||| | | ||| || |||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||  ||    
T  16375615 ttgtgattttcatgattttgtcatatttagccggtgaaacgtagatgcatactcaactccacttatatgtgatctaagtgtatgcaaagttgaggcatta 16375516  T
Q  221 gagtttatttacttggtttt-ggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataaacgttaagaccaaatact 319  Q
    || ||| ||| ||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  16375515 gaatttctttgcttggtttttggttcaattgcttcaattattttaaagttgttaaatgatagacgaactttgtcgaaaataatctttaagacctaatact 16375416  T
Q  320 tggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttct 419  Q
    ||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  16375415 tgaaaaatattttggggatagtttgatatgattatatgaagatgtgtgaatgatttctaggtgtggaatatgatgtttatcatagtgtgttgtattttct 16375316  T
Q  420 cctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttg 457  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  16375315 cctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgttg 16375278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 142 - 458
Target Start/End: Original strand, 4172544 - 4172858
Alignment:
Q  142 cgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttg 241  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||| | | | ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||| || || ||  |||| || ||||||    
T  4172544 cgtagttggctggtgatacgcacatgtatacttaactacactcataagtgatctaagagtatacaaagttgaggcacttgacttggtttatttagttttg 4172643  T
Q  242 gttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagt 341  Q
    ||||| || |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||   ||||  | |||||||||||||| |||||    
T  4172644 gttcaattgtctcaattgtgttaaagttgtaaaatgatagacgaactttgtcgaaaatgatctttaagattgaatatcttgcaaatcttttgtgaatagt 4172743  T
Q  342 ttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaa 441  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| || | | ||  | ||| || ||||||||||||||||| ||    
T  4172744 ttgacatgattatatgaagatgtatgaatgattgataggtgttgaatatgatgtttatcatagtataat-aaatttatcatttacttggattgtgag-aa 4172841  T
Q  442 ttgtatggagttgttga 458  Q
    ||||||| | |||||||    
T  4172842 ttgtatgaaattgttga 4172858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 144 - 458
Target Start/End: Original strand, 4228156 - 4228467
Alignment:
Q  144 tagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggt 243  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| | | | ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| ||||| ||  | ||  |||| || ||||||||    
T  4228156 tagttggccggtgatacgcacatgtatacttaactacactcataagtgatctaaga-tatacaaagttgaggcacttaacttggtttatttagttttggt 4228254  T
Q  244 tcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagttt 343  Q
    ||| || |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||  | |||||||||||||| |||||||    
T  4228255 tcaattgtctcaattgtgttaaagttgtaaaatgatagacgaactttgtcgaaaatgatctttaagaccgaatatcttgcaaatcttttgtgaatagttt 4228354  T
Q  344 gatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaatt 443  Q
    || ||||||||||||| || |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| || | | ||  | ||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  4228355 gacatgattatatgaatatgtatgaatgattgataggtgttgaatatgatgtttatcatagtataat-aaatttatcatttacttggattgtgag-aatt 4228452  T
Q  444 gtatggagttgttga 458  Q
    ||||| | |||||||    
T  4228453 gtatgaaattgttga 4228467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 347 - 496
Target Start/End: Original strand, 17084398 - 17084548
Alignment:
Q  347 atgattatatgaagatatatgaatgatttctaggtt-ttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgt 445  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  17084398 atgattatatgaagatatgtgaatgctttttaggtgattgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttctcatttacttgtattgtgagaaattgt 17084497  T
Q  446 atggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgattagtgcatatatg 496  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  17084498 atggagttgttgaactatatgatatagtttatgttgattaatgcatatatg 17084548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 324 - 496
Target Start/End: Original strand, 11373880 - 11374052
Alignment:
Q  324 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctt 423  Q
    |||||||| ||| |||| || ||||||||  |||||||||| ||||||||| ||| |||||  ||  || |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  11373880 aaatctttcgtgaatagctttatatgattgaatgaagatatgtgaatgattgctaagttttttatgcgaggtttatcctaatgctttgtattttctcctt 11373979  T
Q  424 tacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgattagtgcatatatg 496  Q
    |||||||||||||||| | | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  11373980 tacttggattgtgagatagtatatagagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaatattgcatatatg 11374052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 101 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16135460 - 16135325
Alignment:
Q  101 tgatacgaacttgtcgtatcttg-tgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagt 199  Q
    |||||||||||| ||||| |||  |||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||||    
T  16135460 tgatacgaacttttcgtaactttatgattttgatgatgttgtcgtagttggccggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatggatgatctaagt 16135361  T
Q  200 gtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttgg 236  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16135360 gtatacatagtcgagg-cctagagtttatttacttgg 16135325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 325 - 496
Target Start/End: Original strand, 29161467 - 29161637
Alignment:
Q  325 aatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctccttt 424  Q
    ||||||||||  |||| || || ||| || |||||||||| ||| | |||  || || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  29161467 aatcttttgtaaatagctttatgtgactaaatgaagatatgtgagtaattgttaagtgttgaatatgatgtttatcataatgtgaagtattttctccttt 29161566  T
Q  425 acttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgattagtgcatatatg 496  Q
    ||||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  29161567 acttgga-tgtgaaaaagtatatggagttgtcgaactatatgatatagttgatgttgaatattgcatatatg 29161637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 25650320 - 25650218
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatggtaaag 100  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25650320 gtatacactactgcacccatatgtgatttgtgtatacacttagttgaggttttcaaatgtgtttgctttgttttgtcggataacttggaaaatggtaaag 25650221  T
Q  101 tga 103  Q
    |||    
T  25650220 tga 25650218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 152 - 448
Target Start/End: Original strand, 26523169 - 26523463
Alignment:
Q  152 cggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttat 251  Q
    |||||||| ||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||  || |||| | |||| || |    
T  26523169 cggtgaaaagcacatgtatactcaactgcactcatatgtgatctaagtgtatacatagttgaggcagtagaatttatttggttagtttggattcaattgt 26523268  T
Q  252 ctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgat 351  Q
    |||||||  || |||||||| ||| || | |||||| |||||  |||| | | |||||||| | |||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  26523269 ctcaatt-cttcaaagttgtgaaacgacatacgaac-ttgtcagaaatgatctttaagaccgagtacttttcaaatcttttgtgtatagcttgatatgat 26523366  T
Q  352 tatatgaagatatatgaatgatt-tctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatg 448  Q
    |||| |||||| | |||||||||   ||||| ||||||||||||  |||  || | ||||||||||  | | ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  26523367 tatacgaagatgtgtgaatgattagttaggtgttgaatatgatg-atataatagtatgatgtatttctttcgttacttgaattgtgagaaattatatg 26523463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 422 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 16135333 - 16135259
Alignment:
Q  422 tttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgattagtgcatatatg 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16135333 tttacttggattgtgagaaattgtatggagttattgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatg 16135259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 275 - 357
Target Start/End: Original strand, 18104632 - 18104714
Alignment:
Q  275 atgagagacgaactttgtcgaaaataaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatg 357  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18104632 atgagaggcgaactttgtcgaaaataatctttaagatcaaatacttggcaaatctttcgtggatagtttgatatgattatatg 18104714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 324 - 485
Target Start/End: Original strand, 22463243 - 22463405
Alignment:
Q  324 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttc-tcct 422  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||||  |||||||||| ||| | |||   |||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||    
T  22463243 aaatcttttgtgaatagctttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgaggtcttgaatatgatgtttatcataaggtgttgtattttcctcct 22463342  T
Q  423 ttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgatta 485  Q
    |||||||||||||||||||||||  | || | |||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  22463343 ttacttggattgtgagaaattgtgcgaaggttttgaactataggatatagttgaagttgatta 22463405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 5485377 - 5485488
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatggtaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||     
T  5485377 gtatatactactgcactcatatgtgatttgtgtataggcttagttgaggtattcgaacttgtttgatttgttttgtcgaataacttggaaaatgataaaa 5485476  T
Q  101 tgatacgaactt 112  Q
     |||||||||||    
T  5485477 cgatacgaactt 5485488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 19990965 - 19991077
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatggtaaag 100  Q
    |||||| ||| ||||||||||  ||| || |||||||||||| |||| | |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  19990965 gtatacgctaatgcactcatatgtgacttctgtatatacttatttgaagctttcgaacttgtttgatttgttttgttgaataacttggaaaatgataaaa 19991064  T
Q  101 tgatacgaacttg 113  Q
    |||||||||||||    
T  19991065 tgatacgaacttg 19991077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 383 - 457
Target Start/End: Original strand, 31162090 - 31162164
Alignment:
Q  383 ttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttg 457  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  31162090 ttgaatatgatgtttatcataaggtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaactgtatgaagttgttg 31162164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 324 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 10445500 - 10445428
Alignment:
Q  324 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtt 396  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  10445500 aaatcttttgtggataatttgatatgattatatggagatatttgaatgattgctatgtgttgaatatgatgtt 10445428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 443
Target Start/End: Original strand, 22594452 - 22594571
Alignment:
Q  324 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatga-tttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcct 422  Q
    ||||||||| || |||| || |||||||||||||||||||| ||| ||| ||  ||||| ||| |||||||||| ||| ||| ||| ||||||| || ||    
T  22594452 aaatcttttatgaatagatttatatgattatatgaagatatttgagtgacttgttaggtgttggatatgatgttcatcataaggtgttgtatttcct-ct 22594550  T
Q  423 ttacttggattgtgagaaatt 443  Q
    ||||||||| |||| ||||||    
T  22594551 ttacttggaatgtgggaaatt 22594571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 34965970 - 34965810
Alignment:
Q  324 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttct-aggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcct 422  Q
    |||||||| |||  ||| || ||||||||| |||||||||| | ||||| || | || | ||||||||||| |||||| ||| ||| | ||||||||| |    
T  34965970 aaatctttcgtgactagctttatatgattaaatgaagatatgtaaatgaattgttagatgttgaatatgatatttatcataaggtgttttattttctc-t 34965872  T
Q  423 ttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgatta 485  Q
    ||||||||| | |||||| | || |||||| || | || |||| |||||||||||||||||||    
T  34965871 ttacttggaatatgagaagt-gtttggagtggtgggactatattatatagttgatgttgatta 34965810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 180 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16231040 - 16230971
Alignment:
Q  180 cactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcattt 249  Q
    |||||||||||||| |  || ||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  16231040 cactcatatgtgatttgtgtatatacatggttgaggtcctagagtttatttatttggttttagttcattt 16230971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 16231053 - 16231004
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggt 50  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||    
T  16231053 gtatacactactgcactcatatgtgatttgtgtatatacatggttgaggt 16231004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 18003663 - 18003712
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggt 50  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||    
T  18003663 gtatacactactgcactcatatgtgatttgtgtatatacatggttgaggt 18003712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 23976932 - 23976893
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatact 40  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  23976932 gtatacactactgcactcatatgtgatttgtgtatatact 23976893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 10974129 - 10974045
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataactt 86  Q
    |||||||||||||||||||||  | | |||||| ||| |||||||||||  ||| |||||||||  |||| ||||||| |||||||    
T  10974129 gtatacactactgcactcatatgtaacttgtgtgtatgcttagttgaggcattcaaacttgtttcatttg-tttgttgaataactt 10974045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 13621804 - 13621853
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggt 50  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| | ||||||||    
T  13621804 gtatacactactgcactcatatgtgacttgtgtatatacatggttgaggt 13621853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 249
Target Start/End: Original strand, 13621817 - 13621886
Alignment:
Q  180 cactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcattt 249  Q
    |||||||||||||  |  || ||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  13621817 cactcatatgtgacttgtgtatatacatggttgaggtcctagagtttatttatttggttttagttcattt 13621886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 15735870 - 15735919
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggt 50  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||    
T  15735870 gtatacattactgcactcatatgtgatttgtgtatatacatggttgaggt 15735919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 249
Target Start/End: Original strand, 15735883 - 15735952
Alignment:
Q  180 cactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcattt 249  Q
    |||||||||||||| |  || ||||||| || |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  15735883 cactcatatgtgatttgtgtatatacatggttgaggtcctagagtttatttatttgtttttagttcattt 15735952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 249
Target Start/End: Original strand, 18003676 - 18003745
Alignment:
Q  180 cactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcattt 249  Q
    |||||||||||||| |  || ||||||| || |||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  18003676 cactcatatgtgatttgtgtatatacatggttgaggtcctagggtttatttatttggttttagttcattt 18003745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 313; Significance: 1e-176; HSPs: 18)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 496
Target Start/End: Original strand, 14342461 - 14342957
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatggtaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14342461 gtatacactactgcactcatatgtgatttgtgtatacacttagttgaggtttccaaatgtgtttgccttgttttgttggataacttggaaaatggtaaag 14342560  T
Q  101 tgatacgaacttgtcgtatctt-gtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagt 199  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||    
T  14342561 tgatacgaacttgtcataactttgtgattttgatgattttgtcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtatattcaattacactcatatgtgatataagt 14342660  T
Q  200 gtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaat 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  14342661 gtatccatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcaattgtctcaattattttaaagttgtaatatgagatacgaactttgtcgaaaat 14342760  T
Q  300 aaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttat 399  Q
    || | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||  | |||  || || |||||||||||||||||    
T  14342761 aatctttaagaccaaatatttggcaaatcttgtgtggatagtttgatgtgattaaatgaagatatgtgggtaattgttaagtgttgaatatgatgtttat 14342860  T
Q  400 cctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgattagtgcatatatg 496  Q
    | ||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  14342861 cataatgtgttgtattttctccattaattgaattgtgagaaatggtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgaataatgcatatatg 14342957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 21108979 - 21108485
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatggtaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||  |||||   ||||||||| |||||||||||||| |||||||     
T  21108979 gtatacactactgcactcaaatgtgattggtgtatatacttagttgaggtttccaaatgtgttt-acttgttttgtgggataacttggaaattggtaaaa 21108881  T
Q  101 tgatacgaacttgtcgtatcttgtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtg 200  Q
    ||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21108880 tgagatgaacttgtcgtaacttgtgattttgatgattttgtcgtggtcggccggtgaaacacacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagtg 21108781  T
Q  201 tatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaata 300  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21108780 tatacatagtcgaagccctagagtttatttacttggtattggttcatttgtctcaattgttttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaata 21108681  T
Q  301 aacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatc 400  Q
    | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||| |    
T  21108680 atctttaagaccaaatacttgtcaaatcttttgcggatagttcgttatgattatatgaagatatgtgaatgattgttaggtgttgaatatgatgtttacc 21108581  T
Q  401 ctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgattagtgcatatatg 496  Q
     ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  21108580 ataaggtgttgtattttctcctttacttggattgtgagaaagtatatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaatattacatatatg 21108485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 482
Target Start/End: Original strand, 24226280 - 24226762
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatggtaaag 100  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||  ||||  | | ||||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  24226280 gtatacactactgcactgatatgtgatttttgtatatacttagttgaggtttccaaatgtgttaatct-gttttgtcggataacttgggaaatggtaaaa 24226378  T
Q  101 tgatacgaacttgtcgtatctt-gtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagt 199  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||   ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24226379 tgatacgaacttgtcgtaactttgtgattttggcgattttgtcgtggtcggccggtgaaacgcacgtgtatattcaactacactcatatgtgatctaagt 24226478  T
Q  200 gtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24226479 gtatacatagtcgaggccctagagtttatatacttggttttggttcatttgtctcaattattttagagttgtagaatgagagacgaactttgtcgaaaat 24226578  T
Q  300 aaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtgga-tagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgttta 398  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  | || ||||||||||||||||    
T  24226579 aatctttaagaccaaatacttggcaaatctattatagattagtttgatatgattatatgaagatatgtgaatgctttacatgtgttgaatatgatgttta 24226678  T
Q  399 tcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttga 482  Q
    || ||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  24226679 tcataatgtgttttactttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatgtagttgatgttga 24226762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 262 - 496
Target Start/End: Original strand, 20455061 - 20455287
Alignment:
Q  262 ttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaaga 361  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||    
T  20455061 ttaaagttgtaaaataagagacaaattttgtcgaaaataatctttaagagcaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatat--------gaaga 20455152  T
Q  362 tatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaaca 461  Q
    ||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||     
T  20455153 tatgtgaatgttttctaagtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaactgaatggagttgttgaact 20455252  T
Q  462 atatgatatagttgatgttgattagtgcatatatg 496  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20455253 atatgatatagttgatgttgattaatgcatatatg 20455287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 20313923 - 20313661
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatggtaaag 100  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||  | |||||| | |||||||||| |||||||||||     
T  20313923 gtatacattactgcactcatatgtgatttgtgtatatacttagttgaggtttccaaatgtgtttactctgttttatcggataacttgaaaaatggtaaaa 20313824  T
Q  101 tgatacgaacttgtcgtatcttg-tgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagt 199  Q
    |||||| ||||||||||| |||  |||||||||| ||||| | || ||| | ||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20313823 tgatacaaacttgtcgtaactttctgattttgatgattttgt-gtggtctgtcggtgaagcgcacatgtatgttcaactacactcatatctgatctaagt 20313725  T
Q  200 gtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattatttt 263  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20313724 gtttacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttgtctcaattatttt 20313661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 278 - 485
Target Start/End: Original strand, 33627478 - 33627684
Alignment:
Q  278 agagacgaactttgtcgaaaataaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttct 377  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||   |||    
T  33627478 agagatgaactttgtcgaaaataatctttaagatcaaatacttagcaaattttttgtggataatttgttatgattatatggagatatgtgaatgccctct 33627577  T
Q  378 aggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgat 477  Q
    | || ||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  33627578 aagtgttgaatatg-tgtttatcatagtgtgttgtattttctcctttacttgtattatgaaaaattgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaa 33627676  T
Q  478 gttgatta 485  Q
    ||||||||    
T  33627677 gttgatta 33627684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 135 - 272
Target Start/End: Original strand, 33150237 - 33150374
Alignment:
Q  135 attttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttactt 234  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  33150237 attttgtcgtagtcgtccggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatttaagtgtatacatagtcgaggccctaaagtttatatactt 33150336  T
Q  235 ggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgta 272  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  33150337 ggttttggttcatttgtctcaattattttagagttgta 33150374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 324 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 11965098 - 11964926
Alignment:
Q  324 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctt 423  Q
    |||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||  | || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  11965098 aaatctttcgtgaatagctttatatgattatatgaagatatgtgaatgctttacatgtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttctcctt 11964999  T
Q  424 tacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgattagtgcatatatg 496  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11964998 tacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgttgaactaaataatatagttgatgttgattaatgcatatatg 11964926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 348 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 23414257 - 23414110
Alignment:
Q  348 tgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtat 447  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||  |||||  ||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  23414257 tgattaaattaagatatttgaatgattgttaggtgctgaatatgatgtttattataaggtgttgtattttctcctttacttggaatgtgagaaagtgtat 23414158  T
Q  448 ggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgattagtgcatatat 495  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  23414157 ggagttgttgagctatattatatagttgatgttgattaatgtatatat 23414110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 387 - 496
Target Start/End: Original strand, 20833191 - 20833299
Alignment:
Q  387 atatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgattag 486  Q
    ||||||| |||||| |||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  20833191 atatgatatttatcataagatgatgtattttctc-tttacttgtattgtgagaaataatatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataa 20833289  T
Q  487 tgcatatatg 496  Q
    ||||||||||    
T  20833290 tgcatatatg 20833299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 22111228 - 22111181
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgag 48  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  22111228 gtatacactactgcactcatatgtgatttgtgtatatacttagttgag 22111181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 19267707 - 19267621
Alignment:
Q  4 tacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaa 90  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | |||| ||  |||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  19267707 tacactactgcactcatatgtgactcgtgtgtaagcttagttgaggcattcgaacttgtttgatttgttttgtcggataacttggaa 19267621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 346 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 19872900 - 19872798
Alignment:
Q  346 tatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgt 445  Q
    |||||||| ||||||||| |  |||||||  || || | |||||||||||||||| ||| |||   |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  19872900 tatgattaaatgaagataaagaaatgattgttaagtgtggaatatgatgtttatcataaggtgtgatattttctcctttacttggaatgtgggaaatcgt 19872801  T
Q  446 atg 448  Q
    |||    
T  19872800 atg 19872798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 9731478 - 9731527
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggt 50  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||    
T  9731478 gtatacactactgcactcatatgtgatttgtgtatatacatggttgaggt 9731527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 180 - 249
Target Start/End: Original strand, 9731491 - 9731560
Alignment:
Q  180 cactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcattt 249  Q
    |||||||||||||| |  || ||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  9731491 cactcatatgtgatttgtgtatatacatggttgaggtcctagagtttatttatttggttttagttcattt 9731560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 383 - 438
Target Start/End: Original strand, 23985523 - 23985578
Alignment:
Q  383 ttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgag 438  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  23985523 ttgaatgtgatgtttatcttaaggtgatgtattttcctctttacttggaatgtgag 23985578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 290
Target Start/End: Original strand, 20833017 - 20833094
Alignment:
Q  212 gaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaacttt 290  Q
    |||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  20833017 gaggtcctagggtttatatacttagttttggttcaattgtctc-attgttttaaagttgtaaaaggaaagacggacttt 20833094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 397 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 6455664 - 6455576
Alignment:
Q  397 tatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgatta 485  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||   ||||| ||||| |||  ||||| |||| ||||||||    
T  6455664 tatcccaaggtgttgtattttctcctttactttgatggtgataaattgtacaaagttgatgaactataaaatataattgaagttgatta 6455576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 307; Significance: 1e-172; HSPs: 30)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 43642188 - 43641706
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatggtaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||  | |||||||| | ||||||||| ||||||||||     
T  43642188 gtatacactactgcactcatatgtgatttgtgtatatacttagttgaggtttccaaatgtgtttactctgttttgtcgaataacttgggaaatggtaaaa 43642089  T
Q  101 tgatacgaacttgtcgtatctt-gtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagt 199  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  43642088 tgatacgaacttgtcgtaactttgtgattttggtgattttgtcgtggtcggccggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaatt 43641989  T
Q  200 gtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaat 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43641988 ggatacatagtcgaggccctagagtttatatacttggtttttgttcatttgtctcaattattttagagttgtagaatgagagacgaactttgtcgaaaat 43641889  T
Q  300 aaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttat 399  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  | || |||||||||||||||||    
T  43641888 aatctttaagaccaaatacttggcaaatctattgtagatagtttgatatgattatatgaagatatgtgaatgctttacatgtgttgaatatgatgtttat 43641789  T
Q  400 cctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttga 482  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  43641788 cataatgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatgtagttgatgttga 43641706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 482
Target Start/End: Original strand, 19434272 - 19434754
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatggtaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  |||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  19434272 gtatacactactgcactcatatgtgatttgtgtatatacttatttgaggtttccaaatgtgtttactctgttttgtcggataacttggaaaatggtaaaa 19434371  T
Q  101 tgatacgaacttgtcgtatctt-gtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagt 199  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||| | ||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19434372 tgatacgaacttgtcgtaagtttgtgattttggtgattttgtcgtggtcggccagtgaaatgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagt 19434471  T
Q  200 gtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaat 299  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19434472 gtatgcatagtcgaggccctagagtttatatacttggttttggttcatttgtctcaattattttagagttgtagaatgagagacgaactttgtcgaaaat 19434571  T
Q  300 aaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttat 399  Q
    || | ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |  | |||||||||||||||||    
T  19434572 aatctttaagaccaaataattggcaaatctattgtagatagtttgatatgattatatgaagatatgtgaatgctttacatatgttgaatatgatgtttat 19434671  T
Q  400 cctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttga 482  Q
    | ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  19434672 cataatgtattgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtaaggagtttttgaactatatgatgtagttgatgttga 19434754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 12 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 29113658 - 29113238
Alignment:
Q  12 tgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatggtaaagtgatacgaact 111  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29113658 tgcactcatatgtgatttgtgtatatacttagttgaggtttcccaacttgtttgttttgttttgtcggataacttggaaaatggtaaggtgatacgaact 29113559  T
Q  112 tgtcgtatcttgtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtc 211  Q
    ||||||| ||||||||||||         ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  29113558 tgtcgtaacttgtgattttg---------tcgtagtcggccgttgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagtttatacatagtt 29113468  T
Q  212 gaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataaacgttaagac 311  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||    
T  29113467 gagccccaagagtttatttacttggttttggttcatttgtctcaactattttaaagttgtaaaatgagagacaaaccttgtcgaaaataatctttaagac 29113368  T
Q  312 caaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatg 411  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  29113367 caattacttggcaaatcttttgtgaatagtttgttatgattatatgaagatatgtggatgattgctaggtgatgaatatgatgtttatcataatgtgaag 29113268  T
Q  412 tattttctcctttacttggattgtgagaaa 441  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29113267 tattttctcctttatttggattgtgagaaa 29113238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 26 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 24841246 - 24840791
Alignment:
Q  26 atttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatggtaaagtgatacgaacttgtcgtatctt-gt 124  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||    
T  24841246 atttgtgtatatacttagttaaggtttcccaacttgtttattttgttttgtcggataacttagaaaatggtaaaatgatacgaacttgtcgtaactttgt 24841147  T
Q  125 gattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagt 224  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24841146 gattttgatgattttgtcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatacgtgatctaagtgtataaatagtcgaggccctagagt 24841047  T
Q  225 ttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataaacgttaagaccaaatacttggca 324  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  24841046 ttatttaattggttttggttcaattgtctcaattattttaaagttctaaaatgagaaacgaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatacttggca 24840947  T
Q  325 aatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctccttt 424  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||| || ||  |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |     
T  24840946 aatcttttgtggatagttttctattattatatgaatatatgtgcatcctttctaggtttttaatatgatttttatcataatgtgttgtattttctcc-tc 24840848  T
Q  425 acttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttg 481  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||  |||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  24840847 acttgaattgtgagaaataatatgatgttgttgaattatatgataaagtcgatgttg 24840791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 135 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 22332056 - 22331695
Alignment:
Q  135 attttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttactt 234  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22332056 attttgtcgtagtcggccgatgaaacacacatgtatattccactacactcatatgtgatctaagtttatacatagtcgaggccctagagtttatttactt 22331957  T
Q  235 ggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgt 334  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22331956 ggttttggttcaattgtctcaattatgttaaagttgtaatatgagagacgaactttgtcaaaaataatctttaagaccaaatacttggcaaatcttttgt 22331857  T
Q  335 ggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggt-tttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggatt 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  22331856 ggatagtttgatatgattatatgaagatatgtgaatgctttctaggtgattgaatatgatgtttatcataatgtgttgtatcttctcctttacttgtatt 22331757  T
Q  434 gtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgattagtgcatatat 495  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  22331756 gtgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatatagtttatgttgattaatgcatatat 22331695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 104 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 20272718 - 20272350
Alignment:
Q  104 tacgaacttgtcgtatctt-gtgattttgataattttatcgtagtcggcc-ggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtgt 201  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||  | ||||| |||||||  ||| ||||||||| ||||||| | ||| || |||||||||| | |||| ||||    
T  20272718 tacgaacttgtcgtaactttgtgattttattgattttgtcgtagttagcccggtgaaacgtacatgtatactcaacttcactcatatgaggtctaggtgt 20272619  T
Q  202 atacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataa 301  Q
    ||||||||| |||||  | ||  || |||| ||||||||| || | || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20272618 atacatagttgaggcattggaacttttttatttggttttgatttaattgtttcaattattttaaagttgtaaaataagagacgaactttgtcgaaaataa 20272519  T
Q  302 acgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatg-atttctaggttttgaatatgatgtttatc 400  Q
     | ||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||               
T  20272518 tctttaagactaaataattgacaaatctcttgtggatagtttgttatgattatatgaagatatgtgaatgaatttttaggtgttgaata----------- 20272430  T
Q  401 ctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttg 481  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||  |||||||| ||| |||||||    
T  20272429 -taatgtgttgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatgatgttattgaattatatgataaagtcgatgttg 20272350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 282 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 45618590 - 45618405
Alignment:
Q  282 acgaactttgtcgaaaataaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggt 381  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  45618590 acgaactttgtcgaaaataatctttaagaccaattacttggtaaatcttttgtggataatttgatatgattatatgaagatatgtgaatgctttctacgt 45618491  T
Q  382 tttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatga 467  Q
     ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  45618490 gttgaatatgatttttatcataatgtgttgtattttctcttttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgttgaactatatga 45618405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 102 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 7320711 - 7320526
Alignment:
Q  102 gatacgaacttgtcgtatcttgt-gattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7320711 gatacgaacttgtcgtaacttggcgattttgatgatgttgtcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagtg 7320612  T
Q  201 tatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttg 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |     ||| ||||||||||||||||||    
T  7320611 tatacatagtcgaggccctagagtttatatacttggttttggttcatttgtctcaattatttaa-----gtagaatgagagacgaactttg 7320526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 286 - 496
Target Start/End: Original strand, 24561851 - 24562061
Alignment:
Q  286 actttgtcgaaaataaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttg 385  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | |||    
T  24561851 actttgtcgaaaataatctttaggaccaaatacttagaaaatcttttgtagattgtttgatatgattatatgaagatatgtgaatgattgttagatgttg 24561950  T
Q  386 aatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgatta 485  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  |||||||| ||| |||||||||||    
T  24561951 aatatgatgtttatcataaggtgttgtattttctcctttacttggattgtgagaaatagtatgatgttgttgaattatatgataaagtcgatgttgatta 24562050  T
Q  486 gtgcatatatg 496  Q
     ||||||||||    
T  24562051 atgcatatatg 24562061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 324 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 18534975 - 18534803
Alignment:
Q  324 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctt 423  Q
    |||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||  | || |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  18534975 aaatctttcgtgaatagctttatatgattatatgaagatatgtgaatgttttacatgtgttgaatatgatgattatcataatgtgttgtattttctcctt 18534876  T
Q  424 tacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgattagtgcatatatg 496  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18534875 tacttgaattgtgagaaattatatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatg 18534803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 325 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 6093980 - 6093809
Alignment:
Q  325 aatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctccttt 424  Q
    ||||||| ||| |||| || ||||||||| |||||||||| ||| | |||  ||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  6093980 aatctttcgtgaatagctttatatgattaaatgaagatatgtgagtaattgttaggtgttgaatatgatgtttatcataatgcgaagtattttctccttt 6093881  T
Q  425 acttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgattagtgcatatatg 496  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||||||||    
T  6093880 acttggattgtgagaaagtatatggagttgttgaactatatgatatagttattgttgaatattgcatatatg 6093809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 19667882 - 19667975
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatg 94  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  19667882 gtatacactactgcactcatatgtgatttatgtatatacttagttgaggcattcaaacatgtttgatttgttttgtcggataacttggaaaatg 19667975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 153 - 458
Target Start/End: Original strand, 23166837 - 23167142
Alignment:
Q  153 ggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatc 252  Q
    ||||||||||||||||| | ||| || | || |||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||| ||| ||| ||| |||||| |||| ||       
T  23166837 ggtgaaacgcacatgtatactcaacttcgctgatatgtgatctaagagtatgcatagttgaggcattagaatttgtttgcttagttttgattcaattgcg 23166936  T
Q  253 tcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgatt 352  Q
     |  || ||||||||| || ||| || |||||||||||||  ||||| | | ||||| || ||||| | || || |||||||| | ||||||||||||||    
T  23166937 accgttgttttaaagtcgtgaaacgatagacgaactttgttaaaaatgatctttaaggccgaataccttgcgaaccttttgtgaacagtttgatatgatt 23167036  T
Q  353 atatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagt 452  Q
    ||||||| |  | ||||| | |  || |  ||||||||| |||||||| || | ||||| |  |||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||    
T  23167037 atatgaaaacgtgtgaataagtaataagggttgaatatggtgtttatcatagtatgatgcacattctcctttacttgaattatgagaaatggtatgaagt 23167136  T
Q  453 tgttga 458  Q
    ||||||    
T  23167137 tgttga 23167142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 153 - 458
Target Start/End: Original strand, 23578094 - 23578399
Alignment:
Q  153 ggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatc 252  Q
    ||||||||||||||||| | ||| || | || |||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||| ||| ||| ||| |||||| |||| ||       
T  23578094 ggtgaaacgcacatgtatactcaacttcgctgatatgtgatctaagagtatgcatagttgaggcattagaatttgtttgcttagttttgattcaattgcg 23578193  T
Q  253 tcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgatt 352  Q
     |  || ||||||||| || ||| || |||||||||||||  ||||| | | ||||| || ||||| | || || |||||||| | ||||||||||||||    
T  23578194 accgttgttttaaagtcgtgaaacgatagacgaactttgttaaaaatgatctttaaggccgaataccttgcgaaccttttgtgaacagtttgatatgatt 23578293  T
Q  353 atatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagt 452  Q
    ||||||| |  | ||||| | |  || |  ||||||||| |||||||| || | ||||| |  |||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||    
T  23578294 atatgaaaacgtgtgaataagtaataagggttgaatatggtgtttatcatagtatgatgcacattctcctttacttgaattatgagaaatggtatgaagt 23578393  T
Q  453 tgttga 458  Q
    ||||||    
T  23578394 tgttga 23578399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 22577399 - 22577307
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaat 93  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||| | |||||| ||||||    
T  22577399 gtatacactactgcactcatatgtgatttgtgtatgtacttagttgaggtattcgagcttgtttgatttggtttgtttgttaacttagaaaat 22577307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 324 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 23799608 - 23799536
Alignment:
Q  324 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtt 396  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  23799608 aaatattttgtggataatttgatatgattatatggggatatttgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtt 23799536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 20510589 - 20510504
Alignment:
Q  8 ctactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaat 93  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  20510589 ctactgcactcatatgtgacttgtgtgtatacttagttgaggcattcgaacttgtttggtttattttgttgaataactttgaaaat 20510504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 383 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 32464966 - 32464911
Alignment:
Q  383 ttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgag 438  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  32464966 ttgaatatgatgtttatcttaaggtgatgtattttcctctttacttggaatgtgag 32464911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 3799697 - 3799746
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggt 50  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||    
T  3799697 gtatacactactgcactcatatgtgatttgtgtatatacatggttgaggt 3799746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 180 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8942995 - 8942926
Alignment:
Q  180 cactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcattt 249  Q
    |||||||||||||| |  || ||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  8942995 cactcatatgtgatttgtgtatatacatggttgaggtcctagagtttatttatttggttttagttcattt 8942926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 8943008 - 8942959
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggt 50  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||    
T  8943008 gtatacactactgcactcatatgtgatttgtgtatatacatggttgaggt 8942959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 12636962 - 12637011
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggt 50  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||    
T  12636962 gtatacactactgcactcatatgtgatttgtgtatatacatggttgaggt 12637011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 180 - 249
Target Start/End: Original strand, 12636975 - 12637044
Alignment:
Q  180 cactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcattt 249  Q
    |||||||||||||| |  || ||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  12636975 cactcatatgtgatttgtgtatatacatggttgaggtcctagagtttatttatttggttttagttcattt 12637044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 12642716 - 12642765
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggt 50  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||    
T  12642716 gtatacactactgcactcatatgtgatttgtgtatatacatggttgaggt 12642765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 180 - 249
Target Start/End: Original strand, 12642729 - 12642798
Alignment:
Q  180 cactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcattt 249  Q
    |||||||||||||| |  || ||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  12642729 cactcatatgtgatttgtgtatatacatggttgaggtcctagagtttatttatttggttttagttcattt 12642798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 42179055 - 42179104
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggt 50  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||    
T  42179055 gtatacactactgcactcatatgtgatttgtgtatatacatggttgaggt 42179104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 180 - 249
Target Start/End: Original strand, 42179068 - 42179137
Alignment:
Q  180 cactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcattt 249  Q
    |||||||||||||| |  || ||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  42179068 cactcatatgtgatttgtgtatatacatggttgaggtcctagagtttatttatttggttttagttcattt 42179137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 19659124 - 19659015
Alignment:
Q  180 cactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgag 279  Q
    |||||||||||||  |  || ||||||| || |||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||| || |||| ||| |||||||||| ||||| |||    
T  19659124 cactcatatgtgacttgtgtatatacatggttgaggtcctaaggtttatatacttagttttggttcaattgtctc-attgttttaaagttataaaaggag 19659026  T
Q  280 agacgaacttt 290  Q
    ||||| |||||    
T  19659025 agacggacttt 19659015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 249
Target Start/End: Original strand, 3799710 - 3799779
Alignment:
Q  180 cactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcattt 249  Q
    |||||||||||||| |  || ||||||| || |||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  3799710 cactcatatgtgatttgtgtatatacatggttgaggtcctagagtgtatttatttggttttagttcattt 3799779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 21275218 - 21275267
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggt 50  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| | ||||||||    
T  21275218 gtatacactactgcactcatatgtgacttgtgtatatacatggttgaggt 21275267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 35)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 516
Target Start/End: Original strand, 19332319 - 19332827
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatggtaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  19332319 gtatacactactgcactcatatatgatttgagtatatacttagttgaggtttcccaacttgtttgttttgttttgctggacaacttgaaaaatggtaaag 19332418  T
Q  101 tgatacgaacttgtcgtatctt-gtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagt 199  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||         ||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||  |||||| ||||||| |||||||    
T  19332419 tgatacgaacttgtcgtaactttgtgattttg---------tcgtagtcgaccgatgaaacgcacatgtataatcaattacacttatatgtggtctaagt 19332509  T
Q  200 gtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19332510 gtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttgtctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaaccttgtcgaaaat 19332609  T
Q  300 aaacgttaagaccaaatacttggcaaatc-ttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgttta 398  Q
    ||   |||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  19332610 aatttttaagaccaattgcttagcaaatctttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatgtggatgatttctaggtgatgaatatgatgttta 19332709  T
Q  399 tcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgattagtgcatatatggt 498  Q
    || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||| ||    
T  19332710 tcataatgtgaagtattttcttctttacttggattgtgaggaagtatatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgattggttgtgatattgt 19332809  T
Q  499 tggtgaatgcatatatgt 516  Q
    |||||||| |||||||||    
T  19332810 tggtgaatacatatatgt 19332827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 25757460 - 25756965
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatggtaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25757460 gtatacactactgcactcatatgtgatttgtgtatatacttagttgaagtttcccaatgtgtttgctttgttttgttggataacttggaaaatggtaaag 25757361  T
Q  101 tgatacgaacttgtcgtatcttgtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtg 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  ||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  25757360 tgatacgaacttgtcgtaacttgtgattttgatgattttgtcgcggtcggtcggtgaaacgcacgtgtacattcaactacactcctatgtgatctaagtg 25757261  T
Q  201 tatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaat- 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||     
T  25757260 tatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttgtctcaattattct-aagttgtgtaatgagagacgtactttgtcgaaaatg 25757162  T
Q  300 aaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttat 399  Q
       | ||||  |||| ||| |   |||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25757161 gttctttaaagccaattaccttataaatattttgtggatatctttatatgattatatgaagatatgtgaatgatttttaggtgttgaatatgatgtttat 25757062  T
Q  400 cctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgattagtgcatatatg 496  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25757061 cataatgtgttgtattttctcctttacttgacttgtgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatg 25756965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 25295440 - 25294945
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatggtaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25295440 gtatacactactgcactcatatgtgatttatgtatgtacttagttgaggtttcccaatatgtttgctttgttttgttggataacttggaaaatggtaaag 25295341  T
Q  101 tgatacgaacttgtcgtatcttgtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtg 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  25295340 tgatacgaacttgtcgtaacttgtgattttgatgattttgtcgtggtcagtcggtgaaacgcacatgtataatcaactacactcctatgtgatctaagtg 25295241  T
Q  201 tatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaat- 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||     
T  25295240 tatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttgtctcaattattct-aagttgtgtaatgagagacgaactttgtcgaaaatg 25295142  T
Q  300 aaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttat 399  Q
       | ||||  |||| ||| |   |||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  25295141 gttctttaaagccaattaccttataaatattttgtggatatctttatatgattatatgaagatatgtgaatgatttttaagtgttgaatatgatgtttat 25295042  T
Q  400 cctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgattagtgcatatatg 496  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25295041 cataatgtgttgtattttctcctttacttgacttgtgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatg 25294945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 496
Target Start/End: Original strand, 45559913 - 45560408
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatggtaaag 100  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45559913 gtatacactactgcattcatatgtgatttgtgtatatacttagttgaggtttcccaatgtgtttgctttgttttgttgaataacttggaaaatggtaaag 45560012  T
Q  101 tgatacgaacttgtcgtatcttgtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtg 200  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45560013 tgatacgaacatgtcgtaacttgtgattttgatgattttgtcgtggtcggccggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagtg 45560112  T
Q  201 tatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaat- 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||  ||  ||||||| ||||||||||||||     
T  45560113 tatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttgtctcaattgttct-aagttgtgtaagtagagacggactttgtcgaaaatg 45560211  T
Q  300 aaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttat 399  Q
       | ||||  |||| ||| |   ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  45560212 gttctttaaagccaattaccttataaatcttttgtggatatcattatatgattatatgaagatatgtgaacgattgttaggtgttgaatatgatgtttat 45560311  T
Q  400 cctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgattagtgcatatatg 496  Q
    | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45560312 cataaagtgttgtattttctcctttacttggattgtgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatg 45560408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 22313138 - 22312645
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatggtaaag 100  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||| || ||||| ||||| |||||||| | ||  |||||   ||||||||| |||||||||||||| |||||||     
T  22313138 gtatacgctactgcactcatatgtgattggtatatattcttagctgaggtttccaaatgtgtttaccttgttttgtcggataacttggaaattggtaaaa 22313039  T
Q  101 tgatacgaacttgtcgtatcttgtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtg 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22313038 tgatacgaacttgtcgtaacttgtgattttgatgattttgtcgtggtcggcccgtgaaacgcacatctatattcaactacactcatatgtgatctaagtg 22312939  T
Q  201 tatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaata 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22312938 tatacatagtcgaggccctagagtttatctacttggttttggttc-tttgtatcaattattttaaagttgtagaatgagagacgaactttgtcgaaaata 22312840  T
Q  301 aacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatc 400  Q
    |   ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||| ||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  22312839 atttttaagacgaaatacttggcaaatcttttgtgaatagtttgttatgatgaaatgaaggtatgtgaatggttgctaggtgttgaatatgatgtttatc 22312740  T
Q  401 ctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgattagtgcatatatg 496  Q
     |||  || ||||| |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22312739 ataaattgttgtatcttctcc-tcacttgaattgtgagaaatagtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatg 22312645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 141 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 11543844 - 11543490
Alignment:
Q  141 tcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggtttt 240  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  11543844 tcgtggtctgccggtgaaaagcacatgtatattcaactacattcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagaatttaattacttggtttt 11543745  T
Q  241 ggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatag 340  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  11543744 ggttcatttgtctcaattattttaaagttgtaaattgagagacgaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatacttgtcaaatcttttgaggatag 11543645  T
Q  341 tttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaa 440  Q
    |||| |||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||  || ||||| |||||| | ||||| ||||||||||    
T  11543644 tttgttatgattaaatgaaggtatgtgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataaattgttgtatcttctcc-tcacttgaattgtgagaa 11543546  T
Q  441 attgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgattagtgcatatatg 496  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11543545 atagtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatg 11543490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 103 - 481
Target Start/End: Original strand, 20176781 - 20177160
Alignment:
Q  103 atacgaacttgtcgta-tcttgtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtgt 201  Q
    |||||||||||| ||| | || |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  20176781 atacgaacttgttgtagttttatgattttgatgattttgtcgtggtcggccggtgaaacgcatatgtatattcaactacactcatatgtgatataagtgt 20176880  T
Q  202 atacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataa 301  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20176881 atatatagtcaaggccctagagtttatttacttggttttggttaatttgtctcaattattttaaagttgtaatatgagagacgaactttgtcgaaaataa 20176980  T
Q  302 acgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcc 401  Q
     | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||| ||||||||||      
T  20176981 tc-taaagaccaaatacttggaaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatgtgaatgattactatgtgttgaatgtgatgtttatta 20177079  T
Q  402 taatgtgatgtattttctcctttacttg-gattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttg 481  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||  |||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  20177080 taaggtgttgtattttctcctttacttgaaattgtgagaaataatatgatgttgttgaattatatgatgaagtcgatgttg 20177160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 103 - 481
Target Start/End: Original strand, 20221508 - 20221887
Alignment:
Q  103 atacgaacttgtcgta-tcttgtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtgt 201  Q
    |||||||||||| ||| | || |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  20221508 atacgaacttgttgtagttttatgattttgatgattttgtcgtggtcggccggtgaaacgcatatgtatattcaactacactcatatgtgatataagtgt 20221607  T
Q  202 atacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataa 301  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20221608 atatatagtcaaggccctagagtttatttacttggttttggttaatttgtctcaattattttaaagttgtaatatgagagacgaactttgtcgaaaataa 20221707  T
Q  302 acgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcc 401  Q
     | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||| ||||||||||      
T  20221708 tc-taaagaccaaatacttggaaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatgtgaatgattactatgtgttgaatgtgatgtttatta 20221806  T
Q  402 taatgtgatgtattttctcctttacttg-gattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttg 481  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||  |||||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  20221807 taaggtgttgtattttctcctttacttgaaattgtgagaaataatatgatgttgttgaattatatgatgaagtcgatgttg 20221887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 274 - 496
Target Start/End: Original strand, 3845114 - 3845336
Alignment:
Q  274 aatgagagacgaactttgtcgaaaataaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgat 373  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  3845114 aatgtgagacgaactttgtcgaaaataatctgtaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatataaagatatgtaaatgat 3845213  T
Q  374 ttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagt 473  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3845214 ttcaaggctttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatatagt 3845313  T
Q  474 tgatgttgattagtgcatatatg 496  Q
    ||||  |||||||||||||||||    
T  3845314 tgataatgattagtgcatatatg 3845336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 103 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 17501297 - 17500957
Alignment:
Q  103 atacgaacttgtcgtatctt-gtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtgt 201  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||| ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17501297 atacgaacttgttgtaactttgtgatttcgatgatgttgtcgtagtcagccggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagtgt 17501198  T
Q  202 atacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataa 301  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17501197 atacatagtcgaggcactagagtttatatacttgg-attggttcatctgtctcaattattttagagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataa 17501099  T
Q  302 acgt--taagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttat 399  Q
       |  ||||||||| ||| |    |||||||||||||||| || ||||||||| |||||  ||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  17501098 tttttgtaagaccaattacct-tataatcttttgtggatagctttatatgattaaatgaaattatgtgaatgattgttaggtgttgaatatgatgtttat 17501000  T
Q  400 cctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaatt 443  Q
    | ||| ||| |||| ||||  ||||||||||| |||| ||||||    
T  17500999 cataaggtgttgta-tttcatctttacttggaatgtgggaaatt 17500957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 150 - 458
Target Start/End: Original strand, 18118892 - 18119194
Alignment:
Q  150 gccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcattt 249  Q
    |||||||||||||||||||| | ||  |||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||  | ||  ||  ||||||||| ||  || ||||    
T  18118892 gccggtgaaacgcacatgtatactctactacactcatgtgtggtctaggtgtatacatagttgaggcattggatcttggttacttggtcttaatttattt 18118991  T
Q  250 atctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatg 349  Q
     | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18118992 gtttcaattattttaaaattgtaaagtgagagacgaactttgtcgaaaat------taagatcaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatg 18119085  T
Q  350 attatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatgg 449  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||   || |  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  18119086 attatatgaagatatgtgaatgtttgctaggtgttgaatatgatgtttatcatagcatggtagattttctcctttacttgaattttgagaaattgtatga 18119185  T
Q  450 agttgttga 458  Q
    |||||||||    
T  18119186 agttgttga 18119194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 135 - 272
Target Start/End: Original strand, 34012895 - 34013032
Alignment:
Q  135 attttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttactt 234  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  34012895 attttgtcgtagtcgtccggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatttaagtgtatacatagtcgaggccctaaagtttatatactt 34012994  T
Q  235 ggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgta 272  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  34012995 ggttttggttcatttgtctcaattattttagagttgta 34013032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 95 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24907147 - 24907017
Alignment:
Q  95 gtaaagtgatacgaacttgtcgtatcttg-tgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgat 193  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24907147 gtaaaatgatacgaacttgtcgtaactttatgattttgatgattttctcgtagtcggccagtgaaacacgcatgtatattcaactacactcatatgtgat 24907048  T
Q  194 ctaagtgtatacatagtcgaggccctagagt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24907047 ctaagtgtatacatagtcgaggccctagagt 24907017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 324 - 495
Target Start/End: Original strand, 22498407 - 22498577
Alignment:
Q  324 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctt 423  Q
    |||||||| ||| |||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||     
T  22498407 aaatctttcgtgaatagctttatatgattaaatgaagatatgtgaatgattgataggtgttgaatatgatgtttatcacaaggtgttgtattttctccta 22498506  T
Q  424 tacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgattagtgcatatat 495  Q
    |||||||| | |||| || |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  22498507 tacttggaatatgag-aagtgtatggagtggttgaactatattatatagttgatgttgattaatgtatatat 22498577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 325 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 7469311 - 7469150
Alignment:
Q  325 aatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttc-tcctt 423  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||  |||||||||| ||| | ||| | |||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||    
T  7469311 aatcttttgtgaatagctttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgcgaggtcttgaatatgatgtttatcataaggtgttgtattttcctcctt 7469212  T
Q  424 tacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgatta 485  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  7469211 tacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagctgatta 7469150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 251 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 24907017 - 24906824
Alignment:
Q  251 tctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatga 350  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |  ||||||| | ||| |   |||||||||||| ||||  | ||||||    
T  24907017 tctcaattaatttaaagttgcaaaatgagagacgaatcttgtcgaaaataatctctaagaccgattaccttataaatcttttgtgaatagccttatatga 24906918  T
Q  351 ttatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattg 444  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||  |||| |||||||||||| || || | ||||||  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  24906917 ttatatgaagatatgtgaatgatctctatgtgatgaacatgatgtttatcatagtgcgttgtattccctcctttacttgaattgtgagtaattg 24906824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 410 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 25609108 - 25609022
Alignment:
Q  410 tgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgattagtgcatatatg 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  25609108 tgtattttctcctttacttggattgtgagaaatagtatgatgttgttgaactatatgatatagttgatgtggattaatacatatatg 25609022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 324 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 24238742 - 24238581
Alignment:
Q  324 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctt 423  Q
    |||||||| ||| |||| || ||||||||| |||||||||  |||||||||  | ||| ||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||| || |||    
T  24238742 aaatctttcgtgaatagatttatatgattaaatgaagataagtgaatgattcttcggtgttgaatacgaggtttatcgtaacgtgttgtatttacttctt 24238643  T
Q  424 tacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgatta 485  Q
    |||||||||| ||||||| | |||| |||||||||   |||| |||||||||||||||||||    
T  24238642 tacttggattatgagaaagtatatgaagttgttgagttatattatatagttgatgttgatta 24238581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 17623577 - 17623669
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaat 93  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  17623577 gtatacgctactgcactcttatatgatttgggtatatacttagttgaggtattcaaacttgtttgatttgatttgttgaataacttggaaaat 17623669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 325 - 475
Target Start/End: Original strand, 38636798 - 38636949
Alignment:
Q  325 aatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtatttt-ctcctt 423  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||  |||||||||| ||| | |||   |||| ||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||| ||||||    
T  38636798 aatcttttgtgattagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgaggtattgaatatgatatttatcataaggtgttgtattttcctcctt 38636897  T
Q  424 tacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttg 475  Q
    |||||  ||| |||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  38636898 tacttatattatgagaagttatatgaagttgttgaactatatgatatagttg 38636949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 24383883 - 24383790
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatg 94  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||  ||| |||||| | |||||||||||||||    
T  24383883 gtatacactaatgcactcatatgtgatttgtgtatatgcttagttgaggtattcgaacttgttttatttattttgtcgtataacttggaaaatg 24383790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 324 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 22886914 - 22886797
Alignment:
Q  324 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctt 423  Q
    |||||||||||| |||| || |||||| || |||||| ||| |||||||||  || || |||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||    
T  22886914 aaatcttttgtgaatagctttatatgactaaatgaagctatgtgaatgattgttaagtgttgaatatgatgtttatcataaggtgttgtatcttctcctt 22886815  T
Q  424 tacttggattgtgagaaa 441  Q
    ||| |||| |||| ||||    
T  22886814 tacatggaatgtgggaaa 22886797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 482
Target Start/End: Original strand, 18042650 - 18042807
Alignment:
Q  324 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttct-aggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcct 422  Q
    |||||||| |||  ||| || ||||||||| |||||||||| ||||||| || | |||| ||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||| ||    
T  18042650 aaatctttcgtgactagctttatatgattaaatgaagatatgtgaatgaattgttaggtgttgaatatgatatttatcataaggtgttgtattttct-ct 18042748  T
Q  423 ttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttga 482  Q
      ||||||| |  ||| || ||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18042749 aaacttggaatacgag-aagtgtttggagtggttgaactatattatatagttgatgttga 18042807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 293
Target Start/End: Original strand, 18122570 - 18122610
Alignment:
Q  253 tcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtc 293  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18122570 tcaattattttaaagttgtaaagtgagagacgaactttgtc 18122610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 500 - 538
Target Start/End: Original strand, 3845356 - 3845394
Alignment:
Q  500 ggtgaatgcatatatgtcaattgatgttgatattcttgg 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3845356 ggtgaatgcatatatgtcaattgatgttgatattgttgg 3845394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 383 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 25609225 - 25609123
Alignment:
Q  383 ttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttc-tcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttg 481  Q
    |||||||||||||||||| ||| | | ||||||||| ||||||||||||||  | | || ||||  | ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  25609225 ttgaatatgatgtttatcataaggcgttgtattttcctcctttacttggatgataataagttgtgcgaagttgttgaaccataggatatagttgaagttg 25609126  T
Q  482 att 484  Q
    |||    
T  25609125 att 25609123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 33171287 - 33171158
Alignment:
Q  355 atgaagatatatgaatgatttct-aggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagtt 453  Q
    |||||||||| ||||||| || | |||| ||||||||||| |||||| ||| ||| || ||||||| ||||||||||| | |||| || | | ||||||     
T  33171287 atgaagatatgtgaatgaattgttaggtgttgaatatgatatttatcataaggtgttgcattttct-ctttacttggaatatgag-aagtatttggagta 33171190  T
Q  454 gttgaacaatatgatatagttgatgttgatta 485  Q
    || |||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  33171189 gtggaactatattatatggttgatgttgatta 33171158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 383 - 482
Target Start/End: Original strand, 37654834 - 37654931
Alignment:
Q  383 ttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttga 482  Q
    ||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||| | | |||||| ||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  37654834 ttgaatatgatatttatcataaggtgttgtattttct-ctttacttggaatatgagaaa-tatttggagtggtgaaactatatgatgtagttgatgttga 37654931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 3432376 - 3432413
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatata 38  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  3432376 gtatacactactgcactcatatgtgatttgtgtatata 3432413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 249
Target Start/End: Original strand, 3432389 - 3432458
Alignment:
Q  180 cactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcattt 249  Q
    |||||||||||||| |  || |||| || || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  3432389 cactcatatgtgatttgtgtatatagatggttgaggtcctagagtttatttatttggttttagttcattt 3432458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 383 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 16001092 - 16001039
Alignment:
Q  383 ttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtg 436  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16001092 ttgaatatgatgtttatcatagggtgttgtattttctccttcacttggaatgtg 16001039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 16040051 - 16040100
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggt 50  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| | ||||||||    
T  16040051 gtatacactactgcactcatatgtgacttgtgtatatacatggttgaggt 16040100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 249
Target Start/End: Original strand, 16040064 - 16040133
Alignment:
Q  180 cactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcattt 249  Q
    |||||||||||||  |  || ||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  16040064 cactcatatgtgacttgtgtatatacatggttgaggtcctagagtttatttatttggttttagttcattt 16040133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 22889456 - 22889363
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatg 94  Q
    |||||| |||||||| |||||  ||| |||||| |||| ||||||||||  ||| |||||| |||  ||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  22889456 gtatacgctactgcattcatatgtgacttgtgtgtataattagttgaggcattcaaacttggttggcttgttttgttgaataccttagaaaatg 22889363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 17623734 - 17623782
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgagg 49  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||||||    
T  17623734 gtatacactactgcacttatatgtgatttgtgtgtatactcagttgagg 17623782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 300; Significance: 1e-168; HSPs: 17)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Original strand, 76756 - 77187
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatggtaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||     
T  76756 gtatatactactgcactcatatgtgatttgtgtatatacttagttgaggtttcccaacttgtttgttttgttttatcggataacttggaaaatggtaaaa 76855  T
Q  101 tgatacgaacttgtcgta-tcttgtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagt 199  Q
    |||||||||||| || || | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  76856 tgatacgaacttatcataattttgtgattttgatgattttgtcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagt 76955  T
Q  200 gtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaat 299  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  76956 ttatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggctcaattgtctcaattattttaaagttgtaatatgagagacaaactttgtcgaaaat 77055  T
Q  300 aaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttat 399  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  77056 aatctttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgttatgattatatgaagatatgtgaatgattgttaggtgttgaatatgatgtttat 77155  T
Q  400 cctaatgtgatgtattttctcctttacttgga 431  Q
    | ||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  77156 cataaagtgttgtattttctcttttacttgga 77187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 260 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 20822200 - 20821981
Alignment:
Q  260 ttttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaa 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20822200 ttttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcggaaataatctttaagaccaaatactttgcaaatattttgtggatagtttgttatgattatatgaa 20822101  T
Q  360 gatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaa 459  Q
    ||||| || |||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||  |||||||||    
T  20822100 gatatgtggatgattgctaggtgttgaatataatgtttatcataatgtgaagtattttctcctttatttggattgtgagaaatagtgtgatgttgttgaa 20822001  T
Q  460 caatatgatatagttgatgt 479  Q
      |||||||| |||||||||    
T  20822000 ttatatgataaagttgatgt 20821981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 97 - 280
Target Start/End: Original strand, 9785017 - 9785199
Alignment:
Q  97 aaagtgatacgaacttgtcgtatctt-gtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatct 195  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  9785017 aaagtgttacaaacttgtcgtaactttgtgattttgatgattttgtcgtggtcggtcggtgaaacgcacatgtatactcaaatacactcatatgtgatct 9785116  T
Q  196 aagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgaga 280  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  9785117 aagtgtatacgtagtcgagg-cctagagtttatttacttggttttggttcaattgtctc-attgttttaaagttgtgaaatgaga 9785199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 345 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 33396428 - 33396276
Alignment:
Q  345 atatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttgg-attgtgagaaatt 443  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||     
T  33396428 atatgattatatgaagatatgtgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcgtaaggtgttgtattttctcatttacttggaattgtgagaaata 33396329  T
Q  444 gtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgattagtgcatatatg 496  Q
     ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  33396328 atatgatgttgttgaactatatgatatagttgatgttgaatgttgcatatatg 33396276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 325 - 485
Target Start/End: Original strand, 40437406 - 40437566
Alignment:
Q  325 aatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctccttt 424  Q
    ||||||||||| |||  || ||||||||| |||||| ||| ||| | |||  ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||| |||||||    
T  40437406 aatcttttgtgaataactttatatgattaaatgaagttatgtgagtaattgttaggtgttgaacatgatgtttatcataaggtattgtatttcctccttt 40437505  T
Q  425 acttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgatta 485  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||    
T  40437506 acttggattgtgagaaattgtgcgaagttgttgaactataggatataattgaagttgatta 40437566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 322 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 21224333 - 21224198
Alignment:
Q  322 gcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcc 421  Q
    |||||| ||||||| |||  ||||||| |||| |||||||||| |||||||||  | ||| |||||||||||| | ||| |||| || ||   |||||||    
T  21224333 gcaaatattttgtgtataacttgatataattacatgaagatatgtgaatgattattgggtgttgaatatgatgat-atcataatatggtgcgctttctcc 21224235  T
Q  422 tttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttga 458  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21224234 tttacttgaattgtgagaaattgtatggagttgttga 21224198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 324 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 34392282 - 34392210
Alignment:
Q  324 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtt 396  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  34392282 aaatcttttgtggataatttgatatgattatatggagatatttgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtt 34392210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 384 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 46144774 - 46144672
Alignment:
Q  384 tgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttc-tcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttga 482  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||    
T  46144774 tgaatatgatatttatcataaggtgttgtatgttcctcctttacttgtattatgagaagttgtatggagttgttgaactatatgatatagttgaagtgga 46144675  T
Q  483 tta 485  Q
    |||    
T  46144674 tta 46144672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 52400514 - 52400416
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatggtaaa 99  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||  | ||  |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  52400514 gtatacactactgcactcaaatataatttgtatatatacttagttgaggttcccaaatgtgtttgctttgttttgtcggataacttgaaaaatggtaaa 52400416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 383 - 475
Target Start/End: Original strand, 49998509 - 49998602
Alignment:
Q  383 ttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttc-tcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttg 475  Q
    ||||||||||| |||| | ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  49998509 ttgaatatgatatttaacataaggtgttgtattttcctcctttacttgtattatgagaagttgtatgtagttgttgaactatatgatatagttg 49998602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 325 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 52400365 - 52400233
Alignment:
Q  325 aatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttc-tcctt 423  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||   ||||||||| ||| | |||   |||| ||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||| |||||    
T  52400365 aatcttttgtgattagttttatatgattgagtgaagatatgtgactaattgtgaggtcttgaatatgatatttatcataaggtgttgtattttcctcctt 52400266  T
Q  424 tacttggattgtgagaaattgtatggagttgtt 456  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  52400265 tacttgtattatgagaagttgtatggagttgtt 52400233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 18622787 - 18622880
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatg 94  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||| |||| | |||||||||||||||  ||| |||||||||  |||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  18622787 gtatacactactgcattcatatgtgacttgtatgtatacttagttgaggcattcaaacttgtttagtttgctttgttgaataacttagaaaatg 18622880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 21422509 - 21422444
Alignment:
Q  28 ttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaat 93  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21422509 ttgtgtgtatacttagttgaggcattcaaacttgtttgacttgttttgttgaataacttggaaaat 21422444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 20193155 - 20193043
Alignment:
Q  324 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctt 423  Q
    ||||||||| ||  ||| || ||||||||| |||||||||| |  ||||||  || |  |||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||    
T  20193155 aaatcttttatgattagctttatatgattaaatgaagatatttagatgattgttaagcgttgaatatgatgtttatcataaggtgttgcattttctcctt 20193056  T
Q  424 tacttggattgtg 436  Q
    |||||||| ||||    
T  20193055 tacttggaatgtg 20193043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 447 - 496
Target Start/End: Original strand, 77184 - 77233
Alignment:
Q  447 tggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgattagtgcatatatg 496  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  77184 tggagttgttaaactatatgatatagttgatggtgattaatgcatatatg 77233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 20825921 - 20825970
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggt 50  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||    
T  20825921 gtatacactactgcactcatatgtgatttgtgtatatacatggttgaggt 20825970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 180 - 249
Target Start/End: Original strand, 20825934 - 20826003
Alignment:
Q  180 cactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcattt 249  Q
    |||||||||||||| |  || ||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  20825934 cactcatatgtgatttgtgtatatacatggttgaggtcctagagtttatttatttggttttagttcattt 20826003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 10285 - 9787
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatggtaaag 100  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||| |  | | |||| | |||||||||||||||||| |||     
T  10285 gtatacactacttcactcatatgtgatttgtgtatatacttagttgaggtttccaaatgtgtatactctattttttcggataacttggaaaatggcaaaa 10186  T
Q  101 tgatacgaacttgtcgtatctt-gtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagt 199  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10185 tgatacgaacttgtcgtaactttgtgattttgatgattttgtcgtggtcgtctggtgaaatgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagt 10086  T
Q  200 gtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaat 299  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10085 gtatacgtagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttgtctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgttgaaaat 9986  T
Q  300 aaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaaga-tatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgttta 398  Q
    || | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  9985 aatctttaagaccaaatacttggctaatcttttgttgatagtttgatatgattatatgaagattatgtgaattctttctaggtgttgaatatgatgttta 9886  T
Q  399 tcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgag-aaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgattagtgcatatatg 496  Q
     | |||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9885 ccataatatgttgtattttctcttttacttgaattgtgagaaaattgtatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatg 9787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 481
Target Start/End: Original strand, 13661 - 14142
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatggtaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||  | |||||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  13661 gtatacactactgcactcatatatgatttgtgtatatacttagttgaggtttccaaatgtgtttactctgttttgtcggataacttgggaaatggtaaaa 13760  T
Q  101 tgatacgaacttgtcgtatctt-gtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagt 199  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| ||| | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  13761 tgatacgaacttgtcgtaactttgtgatattggtgattttttcgtggtcggccggtgaaatgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatcaaagt 13860  T
Q  200 gtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13861 gtatacatagtcgaggccctagagtt-atttacttggttttggttcatttgtctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgagctttgtcgaaaat 13959  T
Q  300 aaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttat 399  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  13960 aatctttaagaccaaatacttagcaaatcttttgtggatagtttgttatgattatatgaagatatgtggatgattgctaggtgttgaatatgatgtttat 14059  T
Q  400 cctaatgtgatgta-ttttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttg 481  Q
    | |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||  |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  14060 cataatttgaagtatttttctcctttatttggattgtgagaaatagtgtgatgttgttgaattatatgatatagttgatgttg 14142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 12050 - 11557
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatggtaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||  | |||||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  12050 gtatacactactgcactcatg--tgatttgtgtatatacttagttgaggtttccaaatgtgtttactctgttttgtcggataacttgggaaatggtaaaa 11953  T
Q  101 tgatacgaacttgtcgtatctt-gtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagt 199  Q
    ||||||||| |||| ||| ||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11952 tgatacgaatttgttgtaactttgtgattttggtgattttgtcgtggtcggccggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagt 11853  T
Q  200 gtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaat 299  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11852 atatacatagtcgaggccctagagtttagttacttggttttggttcatttgtctcaattattttaaagttgtaaaacgagagacgaactttgtcgaaaat 11753  T
Q  300 aaacgttaagaccaaatacttggcaaatc-ttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgttta 398  Q
    ||   |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| | ||| ||||||||||||||||    
T  11752 aa---ttaagaccaattacttggcaaatctttttttggatagtttgatatgattatatgaagatatgtcaattatttttgggtgttgaatatgatgttta 11656  T
Q  399 tcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttg-atgttgattagtgcatatatg 496  Q
    || ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||   |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  11655 tcataaggtgttttattttctcctttacttggattgtgagaaagtgtatgaagttgttgagttatattatatagttgaatgttgattaatgcatatatg 11557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 76444 - 76006
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatggtaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  76444 gtatacactactgcactcatatgtgatttgtgtatatacttagttgaggtttcccaacttgtttgttttgttttgtcggataacttggaaaatggtaaag 76345  T
Q  101 tgatacgaacttgtcgtatcttgtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtg 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||| | ||  ||| |||| | |||||||||||||    
T  76344 tgatacgaacttgtcgtaacttgtgattttgataattttgtcgtagttgactggtgaaacgcacatgtatactctactatactcttgtgtgatctaagtg 76245  T
Q  201 tatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaata 300  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  76244 tatgcatagtcgagaccctagagcttatttacttggttttggttcatttgtctcaactattttaaagttgtaaaatgagagacgaaccttgtcgaaaata 76145  T
Q  301 aacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatc 400  Q
    | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||  || |  ||||||  |||||  |||||||||||||||||    
T  76144 atctttaagaccaattacttggcaaatcttttgtggatagtttgttttgattatataaag--atgtcgatgattgttaggtgatgaatatgatgtttatc 76047  T
Q  401 ctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaa 441  Q
     |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  76046 ataatgtgaagtattttatcctttatttggattgtgagaaa 76006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 33)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 8604094 - 8603600
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatggtaaag 100  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| || | ||  |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8604094 gtatacactactgcacttatatgtgatttgtgtatatacttagttgaggattccaaatgtgtt-gccttgttttgttggataacttggaaaatggtaaag 8603996  T
Q  101 tgatacgaacttgtcgtatctt-gtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagt 199  Q
    || |||| |||||||||| ||| ||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||| ||| | || || || || ||||||||||||||||||||    
T  8603995 tgttacgtacttgtcgtaactttgtgattttgttgattttgtcatagttggccggtgaaacacacgtatatatgcaactgcactcatatgtgatctaagt 8603896  T
Q  200 gtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcg-aaaa 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8603895 gtatacatagtcgaggccctagagtttatatacttggttttggttcatttgtctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaaa 8603796  T
Q  299 taaacgttaagaccaaatacttggcaaatc-ttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgttt 397  Q
    |||   ||||| |||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  8603795 taatttttaaggccaattgctttgcaaatctttttgtggatagtttgatatgattatgtgaagatatgtgaatgattgttaggtgttgaatatgatgttt 8603696  T
Q  398 atcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgattagtgcatat 493  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  8603695 atcataaggtgttgtattttctcctttacttggattgtgagaaatagtatgatgttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgcatat 8603600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 102 - 478
Target Start/End: Original strand, 17759238 - 17759615
Alignment:
Q  102 gatacgaacttgtcgtatctt-gtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| |   |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17759238 gatacgaacttgtcgtaactttgtgattttaaagtttttgtcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagtg 17759337  T
Q  201 tatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaata 300  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  17759338 tatacatagtcgagggc-tagagtttattttcttggttttggttcaattgtctcaattattttaaagttgtattatgagagacgaactttgtcgaaaata 17759436  T
Q  301 aacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatga-tgtttat 399  Q
    | | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||| | |||| || |||||||  | | |||||    
T  17759437 atctttaagaccaaatacttggaaaatcttttgtgcatagtttgttatgattatatggagatatctgaatgctctctaagtgttgaatacaattttttat 17759536  T
Q  400 cctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatg 478  Q
    | |  |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  17759537 catggtgtgttgtattttctcttttaattggattgtgagaaagtatatggagttgttaaattatatgatatagttgatg 17759615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 102 - 478
Target Start/End: Original strand, 19060558 - 19060935
Alignment:
Q  102 gatacgaacttgtcgtatctt-gtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| |   |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19060558 gatacgaacttgtcgtaactttgtgattttaaagtttttgtcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagtg 19060657  T
Q  201 tatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaata 300  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  19060658 tatacatagtcgagggc-tagagtttattttcttggttttggttcaattgtctcaattattttaaagttgtattatgagagacgaactttgtcgaaaata 19060756  T
Q  301 aacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatga-tgtttat 399  Q
    | | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||| | |||| || |||||||  | | |||||    
T  19060757 atctttaagaccaaatacttggaaaatcttttgtgcatagtttgttatgattatatggagatatctgaatgctctctaagtgttgaatacaattttttat 19060856  T
Q  400 cctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatg 478  Q
    | |  |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  19060857 catggtgtgttgtattttctcttttaattggattgtgagaaagtatatggagttgttaaattatatgatatagttgatg 19060935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 102 - 477
Target Start/End: Original strand, 40040022 - 40040398
Alignment:
Q  102 gatacgaacttgtcgtatctt-gtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||||   |||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  40040022 gatacgaacttgtcgtaactttgtaattttgaagtttttgtcgtagtcggccgatgaaacgcacgtgtatattcaactacactcatatgtgatctaagta 40040121  T
Q  201 tatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaata 300  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  40040122 tatacatagtcgaggccctagaatttatttacttggttttggttcatttgtctcaattgttttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcggacata 40040221  T
Q  301 aacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatc 400  Q
    |   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||    
T  40040222 atatttaagatcaaatacttggcaaatattttgtggatagttggttatgattatatggagatatttgaatgattgataggtgttgaatatgatgtttctc 40040321  T
Q  401 ctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgat 477  Q
     || ||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||  ||||  |||||||||  |||||||  |||||||    
T  40040322 atagtgtgaagtattttctcctttatttggatggtgataaatcatatgatgttgttgaattatatgatgaagttgat 40040398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 101 - 477
Target Start/End: Original strand, 37917272 - 37917649
Alignment:
Q  101 tgatacgaacttgtcgtatctt-gtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagt 199  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37917272 tgatacgaacttgtcgtaactttgtgattttgaagtttttgtcgtagtcggcgggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagt 37917371  T
Q  200 gtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaat 299  Q
     ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  37917372 atatacatagtcgaagccctataatttatttacttggtttttgttcatttgtctcaattgttttaaagttgtaaaatgagagacgaactttatcggacat 37917471  T
Q  300 aaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttat 399  Q
    || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||| |||||||||  || || |||||||||||||||||    
T  37917472 aatctttcagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagttggttatgattatatggacatatttgaatgattgatatgtgttgaatatgatgtttat 37917571  T
Q  400 cctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgat 477  Q
    | || ||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||  |||||||||  |||||||  |||||||    
T  37917572 catagtgtggagtattttctcctttatttggatggtgagaaatcatatgatgttgttgaattatatgatgaagttgat 37917649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 135 - 485
Target Start/End: Original strand, 25104915 - 25105254
Alignment:
Q  135 attttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttactt 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25104915 attttgtcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtg---------tatacatagtcgaggccctagagtttatttcctt 25105005  T
Q  235 ggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgt 334  Q
    || |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25105006 ggatttggttcatttgtctcaattgctttaaagttgtaaaatgagagatgaactttgtcgaaaagaatccttaagaccaaatacttggcaaatcttttgt 25105105  T
Q  335 ggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattg 434  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| | |||| || | ||||| ||||||||||  |  ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  25105106 ggatagtttgttatgattatatggagatatgtgaatgctctctaagtgtcgaatacgatgtttatc--acggtgttgtattttctcctttacttgaattg 25105203  T
Q  435 tgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgatta 485  Q
    || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  25105204 tgggaaattgtatggagttgttgaactaaatgatatagttgaagttgatta 25105254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 18739205 - 18738909
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatggtaaag 100  Q
    |||| ||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18739205 gtatgcactactacactcttatgtgatttgtgtatatacttagttgaggtttcccaatgtgcttgctttgttttgttggataacttggaaaatggtaaag 18739106  T
Q  101 tgatacgaacttgtcgtatc-ttgtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagt 199  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  18739105 tgatacgaacttgtcgtaactttgtgattttgatgattttgtcgtggtcggccggtgaaatgcacatgtatactcaactacactcatatgtgatctaagt 18739006  T
Q  200 gtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaa 298  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  18739005 gtatacatagtcgagg-cctagagtttatttacttggttttggttcatttgtctc-attgttttaaagttgtaaaaggagagacgaactttatcgaaaa 18738909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 17937828 - 17937556
Alignment:
Q  9 tactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatggtaaagtgatacga 108  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17937828 tactacactcatatgtgatttgtgtatatacttagttgaggtttcccaatgtgtttcctttgttttgttggataacttggaaaatggtaaagtgatacga 17937729  T
Q  109 acttgtcgtatc-ttgtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtgtatacat 207  Q
    |||||||||| | |||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| | |||  |||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  17937728 acttgtcgtaactttgtgattttaatgattttgtcgtggtcggccggtgaaacgcacacgtatactcaaatacactcatatgtgatctaattgtatacgt 17937629  T
Q  208 agtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagaga 282  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |||||||| || || |||| ||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  17937628 agtcgagg-cctagagtttatttatttagttttggtgcaattgtctc-attgttttaaagttgtgaaaggagaga 17937556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 102 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 15549774 - 15549574
Alignment:
Q  102 gatacgaacttgtcgtatcttgt-gattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15549774 gatacgaacttgtcgtaacttggagattttgatgatgttgtcgtagtcggccgatgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagtg 15549675  T
Q  201 tatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaata 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  15549674 tatacatagtcgaggccctagagtttatatacttggtattggttcatttgtctcaattattttagagttgtagaatgagagacgaactttgccggaaata 15549575  T
Q  301 a 301  Q
    |    
T  15549574 a 15549574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 322 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 11401725 - 11401551
Alignment:
Q  322 gcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcc 421  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||| || ||| | ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  11401725 gcaaatcttttgtgaatagctttatatgattacataaagttgtatgaatgattgctagttgttgaatatgatgtttatcataatgtgctgtgttttctcc 11401626  T
Q  422 tttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgattagtgcatatatg 496  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  11401625 tttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgttgaactatatgataaagttgatgttgattaatgcatatatg 11401551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 383 - 496
Target Start/End: Original strand, 5229191 - 5229304
Alignment:
Q  383 ttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttga 482  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5229191 ttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaatcgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgtcga 5229290  T
Q  483 ttagtgcatatatg 496  Q
    ||| ||||||||||    
T  5229291 ttaatgcatatatg 5229304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 325 - 481
Target Start/End: Original strand, 38376831 - 38376987
Alignment:
Q  325 aatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctccttt 424  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||  ||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||    
T  38376831 aatcttttgtgaatagtttgatatcattatatgaagatatgtgaatgattgttaggtgttgtgtatgatgtttatcataaggtgttatattttctccttt 38376930  T
Q  425 acttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttg 481  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||  |||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  38376931 acttggattttgagaaataatatgatgttgttgaatcatatgataaagtcgatgttg 38376987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 150 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 14970147 - 14969841
Alignment:
Q  150 gccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcattt 249  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||  || | | | ||| |||  ||||  ||||  |    
T  14970147 gccggtgaaacgtacatgtatattcaactgcactcatatgtgatctaagagtatacataattgatgcattataatgtgttttcttatttttacttcaaat 14970048  T
Q  250 atctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatg 349  Q
     |  ||||| |||||||||||| ||| || ||| |||| ||||||||| | |   |||||||  ||| ||| ||||||  ||| || |||| ||||||||    
T  14970047 gttacaattgttttaaagttgtgaaacgatagatgaaccttgtcgaaagtgattcttaagactgaattctttgcaaatactttatgaatag-ttgatatg 14969949  T
Q  350 attatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatgg 449  Q
    ||| ||||||||| | |||||||||  ||||| |||||||||||||||||| || | ||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||| |    
T  14969948 attgtatgaagatgtgtgaatgattgataggtgttgaatatgatgtttatcatagtatgatggattttc-cccttacttggattgtgagaaatagtatag 14969850  T
Q  450 agttgttga 458  Q
    |||||||||    
T  14969849 agttgttga 14969841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 274 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 17392540 - 17392442
Alignment:
Q  274 aatgagagacgaactttgtcgaaaataaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatga 372  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||    
T  17392540 aatgtgagacgaactttgtcgaaaataatctttaagatcaaatacttggaaaatcttttgcggatagtttgatataaatatatgaagatgtgtgaatga 17392442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 11823510 - 11823417
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatg 94  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  11823510 gtatacactactgcactcatatgttatttgtgtatatacttagttgaggtttccaaacgtgtttgatttgttttgtcggataactttgaaaatg 11823417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 345 - 448
Target Start/End: Original strand, 11516638 - 11516741
Alignment:
Q  345 atatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattg 444  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||| ||| |||||| ||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  11516638 atatgattacataaagatgtatgaataattgctaggtgttgaaaatgatatttatcttaatatgatgtattttcttctttacttggattgtgagaagttg 11516737  T
Q  445 tatg 448  Q
    ||||    
T  11516738 tatg 11516741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 325 - 485
Target Start/End: Original strand, 43428670 - 43428830
Alignment:
Q  325 aatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcct-t 423  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||  |||||||||| ||| | || |   ||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||  || |    
T  43428670 aatcttttgtgaattgttttatatgatttaatgaagatatgtgagtaatgtgg-ggtcttgaatatgatgtttatcataaggtattgtattttcctctat 43428768  T
Q  424 tacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgatta 485  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  43428769 tacttgtattatgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatatagtggaagttgatta 43428830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 324 - 396
Target Start/End: Original strand, 12918084 - 12918156
Alignment:
Q  324 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtt 396  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  12918084 aaatcttttgtggataatatgatatgattatatggagatatttgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtt 12918156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 324 - 423
Target Start/End: Original strand, 14181133 - 14181232
Alignment:
Q  324 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctt 423  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||||  |||||||||| |||||||||  || || |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  14181133 aaatcttttgtgaatagctttatatgattgaatgaagatatgtgaatgattgttaagtgttgaatatgatgtttatcataaggtgttgtattttctcctt 14181232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 383 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 18969095 - 18968992
Alignment:
Q  383 ttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttc-tcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttg 481  Q
    ||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| || |    
T  18969095 ttgaatatgatatttatcataaggtgttgtattttcctcctttacttgtattatgagaagttgaatggagctgttgaactatatgatatagttgaagtgg 18968996  T
Q  482 atta 485  Q
    ||||    
T  18968995 atta 18968992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 180 - 298
Target Start/End: Original strand, 11883251 - 11883367
Alignment:
Q  180 cactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgag 279  Q
    |||||||||||||| |  || ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  11883251 cactcatatgtgatttgtgtatatgcatagtcgagaccctagagtttatatacttag-tttggttcaattgtctc-attgttttaaagttgtaaaatgag 11883348  T
Q  280 agacgaactttgtcgaaaa 298  Q
    ||||  ||||| |||||||    
T  11883349 agacagactttatcgaaaa 11883367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 180 - 289
Target Start/End: Original strand, 13327548 - 13327656
Alignment:
Q  180 cactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgag 279  Q
    |||||||||||||  |  || ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  13327548 cactcatatgtgacttgtgtatatacatggtcgaggtcctagagtttatgtacttagttttggttcaattgtctc-attgttttaaagttgtaaaaggag 13327646  T
Q  280 agacgaactt 289  Q
    ||||| ||||    
T  13327647 agacggactt 13327656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 324 - 396
Target Start/End: Original strand, 45804098 - 45804170
Alignment:
Q  324 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtt 396  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  45804098 aaatcttttgtggataaattgatatgattatatggagatatttgaatgattgctaggtgatgaatatgatgtt 45804170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 12774176 - 12774287
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatggtaaag 100  Q
    ||||||| || ||||||||||  ||| |||||| ||  |||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||| | |||||||| ||| || ||||     
T  12774176 gtatacaatattgcactcatatgtgacttgtgtgtaagcttagttgaggcattcgaacttgtttgatttgttttgtcgtataacttgaaaagtgataaaa 12774275  T
Q  101 tgatacgaactt 112  Q
     |||||||||||    
T  12774276 cgatacgaactt 12774287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 8631053 - 8631004
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggt 50  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||    
T  8631053 gtatacactactgcactcatatatgacttgtgtatatacgtggttgaggt 8631004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 348 - 484
Target Start/End: Original strand, 17319733 - 17319870
Alignment:
Q  348 tgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttc-tcctttacttggattgtgagaaattgta 446  Q
    |||||| |||||||||| ||| | |||  || || |||||| |||||||||||  || ||| ||||||||| |||||||| ||||| || | |||||||     
T  17319733 tgattaaatgaagatatgtgagtaattgttaagtgttgaatttgatgtttatcagaaggtgttgtattttcctcctttacgtggatggtcataaattgtg 17319832  T
Q  447 tggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgatt 484  Q
     | |||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  17319833 cgaagtttttgaactataggatatagttgaagttgatt 17319870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 180 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18910141 - 18910072
Alignment:
Q  180 cactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcattt 249  Q
    |||||||||||||| |  || ||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  18910141 cactcatatgtgatttgtgtatatacatggttgaggtcctagagtttatttatttggttttagttcattt 18910072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 18910154 - 18910105
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggt 50  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||    
T  18910154 gtatacactactgcactcatatgtgatttgtgtatatacatggttgaggt 18910105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 180 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 53770112 - 53770043
Alignment:
Q  180 cactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcattt 249  Q
    |||||||||||||| |  || ||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  53770112 cactcatatgtgatttgtgtatatacatggttgaggtcctagagtttatttatttggttttagttcattt 53770043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 53770125 - 53770076
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggt 50  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||    
T  53770125 gtatacactactgcactcatatgtgatttgtgtatatacatggttgaggt 53770076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16260533 - 16260464
Alignment:
Q  180 cactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcattt 249  Q
    |||||||||||||  |  || ||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  16260533 cactcatatgtgacttgtgtatatacatggttgaggtcctagagtttatttatttggttttagttcattt 16260464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 16260546 - 16260497
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggt 50  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| | ||||||||    
T  16260546 gtatacactactgcactcatatgtgacttgtgtatatacatggttgaggt 16260497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 51962131 - 51962180
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggt 50  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| | ||||||||    
T  51962131 gtatacactactgcactcatatgtgacttgtgtatatacatggttgaggt 51962180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 101 - 496
Target Start/End: Original strand, 4920 - 5314
Alignment:
Q  101 tgatacgaacttgtcgta-tcttgtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagt 199  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| || | || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4920 tgatacgaacttgtcgtaatgttgtgattttgatgattttgtcatggttggccggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagt 5019  T
Q  200 gtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaat 299  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5020 gtatatatagtcgaggccctagagtttatttacttgattttggttcatttgtctcaattattttaaagttttaaaatgagagacgaactttgtcgaaaat 5119  T
Q  300 aaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttat 399  Q
    || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  5120 aatctttaagaccaaatacttgacaaatcttttgtggatagtttg--ttgattatatgaagatatgtgaatgatttctaggtgttgaataagatgtttat 5217  T
Q  400 cctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgattagtgcatatatg 496  Q
    | ||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  5218 cataatgtgttgtattttctccattaattgaattgtgagaaatggtatgaagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgtatatatg 5314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 250; Significance: 1e-138; HSPs: 27)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 92 - 496
Target Start/End: Original strand, 12134537 - 12134942
Alignment:
Q  92 atggtaaagtgatacgaacttgtcgtatctt-gtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgt 190  Q
    |||||||| |||||| |||||||| || ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  12134537 atggtaaaatgatacaaacttgtcataactttgtgattttgatgattttgtcgtagtcggccggtgatacgcacatgtatattcaactatactcatatgt 12134636  T
Q  191 gatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaacttt 290  Q
    ||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  12134637 gatctaagcttatacatagttgaggtcctagagtttatttacttgattttggttcaattgtctcaattattttaaagttgtaatttgagagacgaacttt 12134736  T
Q  291 gtcgaaaataaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatat 390  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  12134737 gtcgaaaataatctttaacaccaaatacttggcaaatcttttgtgtatagtttgttatgattatatgaagatatgtgaatgattgttaggttttgaatat 12134836  T
Q  391 gatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgattagtgca 490  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||    
T  12134837 gatgtttatcataaagtgttgtattttctcttttacttggattgtgagaaagtatatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaataatgca 12134936  T
Q  491 tatatg 496  Q
    | ||||    
T  12134937 tctatg 12134942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 101 - 496
Target Start/End: Original strand, 17376353 - 17376750
Alignment:
Q  101 tgatacgaacttgtcgtatctt-gtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagt 199  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17376353 tgatacgaacttgtcgtaactttgtgattttgatgattttgtcgtagtcggccggtgaaacgcaaatgtatattcatctacactcataagtgatctaagt 17376452  T
Q  200 gtatacatagtcgaggccctagagtttattt-acttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaa 298  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| || || | || |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||    
T  17376453 gtatacatagtcgagaccctagagtttattttacttggctttggtccaattgtttccattattttaaagttgtgaaataagagatgaactttgttgaaaa 17376552  T
Q  299 taaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgttta 398  Q
     || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  17376553 gaatctttaagaccaaatacttggaaaatcttttgtggatagtttgatatgattgtatgaagatatgtgaatgctttctaagtgttgaatatgatgttta 17376652  T
Q  399 tcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgattagtgcatatatg 496  Q
    || || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||  ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  17376653 tcatagtgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattatatggggttgttaaattatatgatttagttgatgttggttaatgcatatatg 17376750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 102 - 481
Target Start/End: Original strand, 54364368 - 54364747
Alignment:
Q  102 gatacgaacttgtcgtatctt-gtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtg 200  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  54364368 gatacgaacttgtcgtaactttgtgattttga-agttttgtcgaagtcggctggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagta 54364466  T
Q  201 tatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaata 300  Q
    ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54364467 tacgcatagtcgaggccctagaatttatttacttggttttggttcatttgtctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaata 54364566  T
Q  301 aacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatc 400  Q
    | | ||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||    
T  54364567 atctttaggcccaaatacttggaaaatcttttgtagatagtttgatatgattatacgaagatatgtgaatgattgttaggtgttgaatatgatatttatc 54364666  T
Q  401 ctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttg 481  Q
     ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  54364667 ataaggtgttgtattttctcctttacttggattgtgagaaatagtatgatgttgttgaattatatgataaagtcgatgttg 54364747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 10238241 - 10238539
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatggtaaag 100  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||  |||||   ||||||||| |||||||||| ||| |||||||     
T  10238241 gtatacactattgcactcatatgtgattggtgtatatacttagttgaggtttccaaatgtgtttaccttgttttgtcggataacttgaaaattggtaaaa 10238340  T
Q  101 tgatacgaacttgtcgtatcttgtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtg 200  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10238341 tgatacgaacttgtcgtaacctgtgattttgatgattttgtcgtagtaggccggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagtg 10238440  T
Q  201 tatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  10238441 tatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggtgttagttcatttgtctcaattattttaaagttgtaaaatgagagttgaactttgtcaaaaat 10238539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 121 - 457
Target Start/End: Original strand, 17212786 - 17213122
Alignment:
Q  121 ttgtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggcccta 220  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| |  |||||||||||| ||||| | | |||  | |||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||  |     
T  17212786 ttgtgattttcatgattttgtcgtatttagccggtgaaacgtacatgcatactcaagtgcacttatatgcgatctaagtgtatgcatagttgaggcattg 17212885  T
Q  221 gagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataaacgttaagaccaaatactt 320  Q
    || ||| |||| ||||||||| |||| ||   |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| | |||||| |||||| ||    
T  17212886 gaatttgtttaattggttttgtttcaattgcttcaattattttaaagttgtaaaatgatagacaaactttgtcaaaaataatctttaagatcaaatattt 17212985  T
Q  321 ggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctc 420  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  17212986 gacaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaaaatgtgtgaatgattgctaggtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttctc 17213085  T
Q  421 ctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttg 457  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  17213086 ctttacttgaattgtgagaaattgtatgaagttgttg 17213122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 262 - 496
Target Start/End: Original strand, 5371655 - 5371888
Alignment:
Q  262 ttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaaga 361  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5371655 ttaaagttgtaaaataagagacatactttgtcgaaaataatctttaagagtaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaaga 5371754  T
Q  362 tatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaaca 461  Q
    ||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||| ||     
T  5371755 tatgtgaatgttttctatgtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttctcctttgcctgaattgtgagaaactgtatggagttgttg-act 5371853  T
Q  462 atatgatatagttgatgttgattagtgcatatatg 496  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5371854 atatgatatagttgatgttgattaatgcatatatg 5371888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 121 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 9651585 - 9651247
Alignment:
Q  121 ttgtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggcccta 220  Q
    |||||||||| || ||||  ||||| | |||||||||| ||||||| || | ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||  || |  ||    
T  9651585 ttgtgatttttatgatttcgtcgtatttggccggtgaagcgcacatctatactcaactgcacttatatgtgatctaagtgtatacatagttaagacatta 9651486  T
Q  221 gagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataaacgttaagaccaaatactt 320  Q
    || ||| ||| ||| |||||| |||| || ||  ||||  ||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||| | | || | ||  |||| ||    
T  9651485 gaatttgtttgcttagttttgattcaattttcataattgattttaagttgtgaaacgatagacgaactttgtcgaaaatgatctttgaaactgaatattt 9651386  T
Q  321 ggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgta-ttttct 419  Q
     ||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  9651385 tgcaaaccatttgtgaatagtttgatatgattgtatgaagatgtatgaatgattaataggtgttgaacatgatgtttatcatgatgtgatgtacttttct 9651286  T
Q  420 cctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttga 458  Q
    |||||  || |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  9651285 cctttgttttgattgtgagaaattatatgaagttgttga 9651247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 253 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 14570475 - 14570269
Alignment:
Q  253 tcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgatt 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||    
T  14570475 tcaattattttaaagttgtaaaatgatagacgaaccttgtcgaaaataatctttaagacaagatacttgacaaatcttttgtgaatagctttatgtgatt 14570376  T
Q  353 atatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagt 452  Q
    | || ||| | |||||||||||  ||| | ||||| ||||| |||||| || | ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||  ||    
T  14570375 acataaaggtgtatgaatgattgatagatgttgaaaatgatatttatcttagtatgaagtattttctcctttattttgattgtgagaaatagtatgatgt 14570276  T
Q  453 tgttgaa 459  Q
    |||||||    
T  14570275 tgttgaa 14570269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 324 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 19558480 - 19558319
Alignment:
Q  324 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctt 423  Q
    |||||||| ||| ||||  | ||||||||||||||||| || |||||| | |  | || ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  19558480 aaatctttcgtgaatagccttatatgattatatgaagacatgtgaatgctctacatgtgttggatatgatgtttatcataatgtgttgtattttctcctt 19558381  T
Q  424 tacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgatta 485  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19558380 tacttgaattgtgagaaattgtatcgagttgttgaaccatatgatatagttgatgttgatta 19558319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 345 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 49070864 - 49070724
Alignment:
Q  345 atatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattg 444  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| |||||  ||||| ||||||||||| |||||  ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |     
T  49070864 atatgattaaatgaagatatgtgagtgattgttaggtgttgaatatgatatttatgataaggtgttgtattctctcctttacttggattgtgagaaagta 49070765  T
Q  445 tatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgatta 485  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  49070764 tatggagttgttgagctatattatatagttgatgttgatta 49070724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 314 - 481
Target Start/End: Original strand, 19082191 - 19082358
Alignment:
Q  314 aatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgta 413  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||| || |||||||||||| ||||| |||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||| ||  ||||| ||    
T  19082191 aatactttgcaaatattttgtgaatagctttatatgattatattaagatgtatgaaggattgataggtgttgaatatgatgtttatcttagcgtgatata 19082290  T
Q  414 ttttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttg 481  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| |||||  ||||||| |||| |||||||    
T  19082291 ttttctcctttacttgaattgtaagaaattgcatgaagttattgaattatatgatgtagtcgatgttg 19082358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 324 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 24237947 - 24237786
Alignment:
Q  324 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctt 423  Q
    |||||||| ||| |||| || ||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||    
T  24237947 aaatctttcgtgaatagctttatatgattaaatgaagatatgttaatgatttttaggtgttgaatatgatatttatcataaggttttgtattttctcctt 24237848  T
Q  424 tacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgatta 485  Q
    |||||||||| | ||||  ||||||||||||||||   |||  |||||||||||||||||||    
T  24237847 tacttggattataagaacgtgtatggagttgttgagatataatatatagttgatgttgatta 24237786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 325 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 12733209 - 12733050
Alignment:
Q  325 aatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctccttt 424  Q
    ||||||| ||| |||| || ||||||| | |||||||||| ||||| |||  || || ||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  12733209 aatctttcgtgaatagctttatatgatcaaatgaagatatgtgaataattgttacgtgttgaacatgatgtttatcataaggtgttgtattttctccttt 12733110  T
Q  425 acttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgatt 484  Q
    ||||| |||||||||||| ||  | ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  12733109 acttgtattgtgagaaatggtgcgaagttgttgaactataggatatagttgaagttgatt 12733050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 327 - 485
Target Start/End: Original strand, 16226295 - 16226452
Alignment:
Q  327 tcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttac 426  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||| |||| ||| | |||||   |||||||| ||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||| || ||    
T  16226295 tctttcgtgaatagctttatatgattaaatgatgatgtgtgaatttcttctaggtgttgaatatgaaatttatcataatgtgttgtattttctcgtt-ac 16226393  T
Q  427 ttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgatta 485  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||  |||||||||||||    
T  16226394 ttggattgtgaggaattgtatggagttgttggattatatgatatgattgatgttgatta 16226452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 149 - 246
Target Start/End: Original strand, 19082067 - 19082164
Alignment:
Q  149 ggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttca 246  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  19082067 ggccggtgaaacgcacatgtatactcaactgcacttatatgtgaactaagtgtatacatagttgaggcactagaatttgtttacttagttttggttca 19082164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 329 - 448
Target Start/End: Original strand, 19623245 - 19623364
Alignment:
Q  329 ttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttactt 428  Q
    ||||||| |||| ||  |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||| | ||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  19623245 ttttgtgaatagctttgtatgattacataaagatgtatgaatgattgctaggtgtcgaaaatgatatttatcttaatatgatgtattttcttctttactt 19623344  T
Q  429 ggattgtgagaaattgtatg 448  Q
     ||||||||||| |||||||    
T  19623345 tgattgtgagaagttgtatg 19623364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 338 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 38763826 - 38763678
Alignment:
Q  338 tagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttc-tcctttacttggattgtg 436  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||| ||| | |||   |||| || |||||||| |||||| | | ||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||    
T  38763826 tagtttgatacgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgaggtcttaaatatgatatttatcattaggtgttgtattttcctcctttacttgtattatg 38763727  T
Q  437 agaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgatta 485  Q
    | || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  38763726 aaaagttgtatgaagttgttgaactatatgatatagttgaagtggatta 38763678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 9565835 - 9565726
Alignment:
Q  3 atacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatggtaaagtg 102  Q
    |||||||||||||| ||||  ||| |||||| ||  ||| |||||||  ||| |||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| ||||  |    
T  9565835 atacactactgcacgcatatgtgacttgtgtgtaagcttggttgaggcattcgaacttgtttgatttgttttgtcaaataacttggaaaatgataaaacg 9565736  T
Q  103 atacgaactt 112  Q
    ||||||||||    
T  9565735 atacgaactt 9565726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 28800214 - 28800137
Alignment:
Q  9 tactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataactt 86  Q
    |||||||||||||  || || |||| ||||||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28800214 tactgcactcatatgtgcttcgtgtgtatacttagttgagacattcaaacttgtttgatttgttttgttggataactt 28800137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 7133140 - 7133189
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggt 50  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||    
T  7133140 gtatacactactgcactcatatgtgatttgtgtatatacatggttgaggt 7133189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 180 - 249
Target Start/End: Original strand, 7133153 - 7133222
Alignment:
Q  180 cactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcattt 249  Q
    |||||||||||||| |  || ||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  7133153 cactcatatgtgatttgtgtatatacatggttgaggtcctagagtttatttatttggttttagttcattt 7133222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 15273450 - 15273499
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggt 50  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||    
T  15273450 gtatacactactgcactcatatgtgatttgtgtatatacatggttgaggt 15273499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 180 - 249
Target Start/End: Original strand, 15273463 - 15273532
Alignment:
Q  180 cactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcattt 249  Q
    |||||||||||||| |  || ||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15273463 cactcatatgtgatttgtgtatatacatggttgaggtcctagagtttatttatttggttttagttcattt 15273532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 180 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 19999872 - 19999803
Alignment:
Q  180 cactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcattt 249  Q
    |||||||||||||| |  || ||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19999872 cactcatatgtgatttgtgtatatacatggttgaggtcctagagtttatttatttggttttagttcattt 19999803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 19999885 - 19999836
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggt 50  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||    
T  19999885 gtatacactactgcactcatatgtgatttgtgtatatacatggttgaggt 19999836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 485
Target Start/End: Original strand, 47469475 - 47469614
Alignment:
Q  345 atatgattatatgaagatatatgaatga-tttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaatt 443  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||  |  |||||||| |||||| ||| ||| || |||||||| |||||||||| |||||||| |     
T  47469475 atatgattaaatgaagatatgtgaatgaatttttaggcgtgaaatatgatatttatcataaggtgttgcattttctc-tttacttggaatgtgagaagta 47469573  T
Q  444 gtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgatta 485  Q
     | |||||| || |||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  47469574 tt-tggagtggtagaactatattatatggttgatgttgatta 47469614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 324 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 9621792 - 9621742
Alignment:
Q  324 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatt 374  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  9621792 aaatcttttgtgaataatttgatatgattatacggagatatttgaatgatt 9621742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 6)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 4071 - 4435
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatggtaaag 100  Q
    ||||||||||||| |||||||  | |||||| |||||||||||||||||||| | ||  |||||  | |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  4071 gtatacactactgaactcatatgttatttgtttatatacttagttgaggtttccaaatgtgtttactctgttttgtcggataacttgggaaatggtaaag 4170  T
Q  101 tgatacgaacttgtcgtatctt-gtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagt 199  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||     
T  4171 tgatacgaacttgtcgtaactttgtgattttggtgattttgtcgtggtcggccggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaaga 4270  T
Q  200 gtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaat 299  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4271 gtatacatagtcgaggctctagagtttatatacttggtttttgttcatttgtctcaattattttagagttgtagaatgagagacgaactttgtcgaaaat 4370  T
Q  300 aaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatat 364  Q
    || | ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4371 aatctttaagacgaaatacttggcaaatctattgtagatagtttgatatgattatatgaagatat 4435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 282 - 477
Target Start/End: Original strand, 35786 - 35980
Alignment:
Q  282 acgaactttgtcgaaaataaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggt 381  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  35786 acgaactttgtcgaaaataatctttaaaaccaaatacttggaaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatgtgaatgattgctgggt 35885  T
Q  382 tttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgat 477  Q
     |||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||  | |||||||  |||||||  |||||||    
T  35886 gttgaatatgatgtttatcatagtgtggtgtattttct-ctttacttggaatatgagaaatcgtatgatgatgttgaattatatgatgcagttgat 35980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 383 - 496
Target Start/End: Original strand, 1341 - 1454
Alignment:
Q  383 ttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttga 482  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  1341 ttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatatagttgacgttga 1440  T
Q  483 ttagtgcatatatg 496  Q
    ||| ||||||||||    
T  1441 ttaatgcatatatg 1454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 383 - 496
Target Start/End: Original strand, 5721 - 5834
Alignment:
Q  383 ttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttga 482  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  5721 ttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattgtatggagttgttgaactatatgatatagttgacgttga 5820  T
Q  483 ttagtgcatatatg 496  Q
    ||| ||||||||||    
T  5821 ttaatgcatatatg 5834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #5
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 35682 - 35793
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatggtaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||   ||  |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  35682 gtatacactactgcactcatatttgatttgtgtatatacttagttgaggtttcaaaatgtgtttactttgttttgtcggataacttggaaaatggtaaaa 35781  T
Q  101 tgatacgaactt 112  Q
    ||||||||||||    
T  35782 tgatacgaactt 35793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 313 - 364
Target Start/End: Original strand, 1 - 52
Alignment:
Q  313 aaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatat 364  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 aaatacttggcaaatctattgtagatagtttgatatgattatatgaagatat 52  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 147 - 496
Target Start/End: Original strand, 14705 - 15041
Alignment:
Q  147 tcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttca 246  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |             |||||    
T  14705 tcggccggtgaaacgcacatgtatattcaactaccctcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgagaccctagagttttt-------------gttca 14791  T
Q  247 tttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgat 346  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14792 tttgtcccaattattttaaagttgtaaaatgagagatgaactttgtcgaaaataatttttaagaccaaatacttgacaaatcttttgtggatagtttgat 14891  T
Q  347 atgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgta 446  Q
    || || |||||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  14892 ataatcatatgacgatatgtcaatgttttctaggtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttctcctttacttgaattgtgagaaattata 14991  T
Q  447 tggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgattagtgcatatatg 496  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  14992 tggagttgttgaactatatgatatagttgatgtcgattaatgcatatatg 15041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 135 - 496
Target Start/End: Original strand, 8060 - 8420
Alignment:
Q  135 attttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttactt 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  8060 attttgtcgtagtcggccggtgaaagacacatgtatattcaactacgctcatatgtgatataagtgtatacattgtcgaggcc-tatagtttatttactt 8158  T
Q  235 ggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgt 334  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  8159 ggttttggttcaattgtctcaattattttaaagttgtagaatgagagacgaaccttgtcggaaataatctttaagaccaattacttgacaaatcttttgt 8258  T
Q  335 ggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattg 434  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||  ||||| ||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8259 ggatagtttgatatgattacatgaatatatgtgaatgattgttaggtgttgaatatgatatttatcataaggtgttgtattttctcctttacttggattg 8358  T
Q  435 tgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttg-atgttgattagtgcatatatg 496  Q
    ||||||| |||||| ||||||| | | |||| ||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  8359 tgagaaagtgtatgaagttgtt-agctatattatatagttgaatgttgattaatgtatatatg 8420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1204 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold1204
Description:

Target: scaffold1204; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 98 - 496
Target Start/End: Original strand, 1034 - 1413
Alignment:
Q  98 aagtgatacgaacttgtcgtatcttgt-gattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatcta 196  Q
    ||||||||||||||||||  | ||| | ||||||||  ||||| || | |||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||    
T  1034 aagtgatacgaacttgtcacagctttttgattttgacgattttgtcttggtcggccggtgaaacgcacatgtatactcaaccacactcatatgtgatcta 1133  T
Q  197 agtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaa 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1134 agtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttgattttggttcagttgtctcaattattttaaagttgtaatatgagagacgaactttgtcgaa 1233  T
Q  297 aataaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtt 396  Q
    ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||                    ||||||||||||| | |||| || ||||||| ||||||    
T  1234 aataatctttaagatcaaatacttggcaaatcttttgtggat--------------------agatatatgaatgctctctaagtgttgaatacgatgtt 1313  T
Q  397 tatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgattagtgcatatatg 496  Q
    |||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  1314 tatcatggtgtgttgtattttctcctttacttggattgtgagaaagtatatggagttgttgaactatatgatatagttgatgttgaatattgcatatatg 1413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 173; Significance: 9e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 101 - 496
Target Start/End: Original strand, 11905 - 12283
Alignment:
Q  101 tgatacgaacttgtcgtatctt-gtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagt 199  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11905 tgatacgaacttgtcataactttgtgattttgatgattttgtcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtatattcaactacactcatatgtgatctaagt 12004  T
Q  200 gtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||  || |||||||||||||||||     
T  12005 gtatacatagtcgaggccctagattttatttacttggttttggttcatttgtcccaattattttaaaattataaaatatgatacgaactttgtcgaaaac 12104  T
Q  300 aaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttat 399  Q
    || | ||  |||||||| ||| | |||||  ||||| |||| ||||||||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||||              
T  12105 aatcttttggaccaaatgctttgtaaatcccttgtgcatagattgatatgaataaatgaatatatgtgaatgattgctaggtaatgaata---------- 12194  T
Q  400 cctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgattagtgcatatatg 496  Q
           |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12195 -------tgatttattttctcc-ttacttgaattgtgagaaattgtatggaattgttgaactatatgatatagttgatgttgattaatgcatatatg 12283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 163; Significance: 8e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 98 - 399
Target Start/End: Original strand, 8333 - 8634
Alignment:
Q  98 aagtgatacgaacttgtcgtatcttg-tgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatcta 196  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||| || | ||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||    
T  8333 aagtgatacgaacttgtcgtagctttatgattttgatgattttgtcatggtcggccagtgaaacgcacatgtatactcaactacactcaaatgtgatcta 8432  T
Q  197 agtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaa 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||    
T  8433 agtgtatacatagtcgaggccctagagttcatttacttggttt-ggttcatttgtctcaatttttttaaagtcgtaaaataggagacgaactttgttgaa 8531  T
Q  297 aataaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtt 396  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||| | |||| || |||| || ||||||    
T  8532 aataatctttaagaccaaatacttggcaaatattttgtggatagtttgttatgattatatagagatatgtgaatgctctctaagtgttgattacgatgtt 8631  T
Q  397 tat 399  Q
    |||    
T  8632 tat 8634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 152; Significance: 3e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 20819 - 21081
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttcc-aacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatggtaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||| || ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  20819 gtatacactactgcactcatatgtgatttgtgtatatacttagtttagttttccccaacttatttgttttgttttgtcggacaacttgaaaaatggtaaa 20918  T
Q  100 gtgatacgaacttgtcgtatc-ttgtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaag 198  Q
    ||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||    
T  20919 gtgatacaaacttgttgtaaccttgtgattttgatgattttgtcgttgtcggccggtgaaacgcacatgtatattcaaatacacttatatgtgatctaag 21018  T
Q  199 tgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattt 262  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  21019 tttatacatagtcgaggccctagagtttatttacatgg-tttggttcatttgtctcaattattt 21081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 305 - 496
Target Start/End: Original strand, 21087 - 21277
Alignment:
Q  305 ttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaa 404  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||  |||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||     
T  21087 ttaagaccaaatacttggcaaatcatttgtggatagttggttatgattatataaagatatgtggttgatttttaggtgttgaatatgatttttatcatac 21186  T
Q  405 tgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgattagtgcatatatg 496  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||  ||||| |||  |||||||| ||| ||||||||| | | ||||||||    
T  21187 tgtgatgtattttctcc-tcacttgaattgtgagaaatagtatgatgttgtggaattatatgataaagtcgatgttgatgaatacatatatg 21277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1278 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold1278
Description:

Target: scaffold1278; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 180 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 749 - 473
Alignment:
Q  180 cactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgag 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  || ||| ||| |||||| |||| || |||||||| ||| |||||||||||||||     
T  749 cactcatatgtgatctaagtgtatacatagttgaggcattgaaacttgtttgcttagttttgattcaattgtctcaattgtttcaaagttgtaaaatgat 650  T
Q  280 agacgaactttgtcgaaaataaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctag 379  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  649 agacgaactttgtcgaaaatgatctttaagaccaactacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatgtattaatggtttctag 550  T
Q  380 gttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgtt 456  Q
     | | |||||||||| ||||| |||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  549 ttgtggaatatgatgcttatcataatatgttgtgttttctcctttacttgaattgtgagacattgtatgaagttgtt 473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1957 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold1957
Description:

Target: scaffold1957; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 135 - 445
Target Start/End: Original strand, 746 - 1052
Alignment:
Q  135 attttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttactt 234  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||  |||||  ||||||||  |||||||||||||    
T  746 attttgtcgtaatcgggcggtgaaacgcgcatgtatattcaactaaactcatatgtgatccaagtgta--catagatgaggccctgcagtttatttactt 843  T
Q  235 ggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgt 334  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  844 ggttttggttcatttgtctcaattattttaaagttgtaaagtgaaagacgaactttgtcgaaaataatctttaagaccaaatatttggcaaatcttttgt 943  T
Q  335 ggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattg 434  Q
    | |||||||| |||||||| ||||||||||    ||||||  ||||| |||||||| ||||||||| ||| |||  ||||||| || |||||| |||| |    
T  944 gaatagtttgttatgattaaatgaagatatgcagatgattgttaggtgttgaatataatgtttatcataa-gtgtggtatttt-tcttttactgggatgg 1041  T
Q  435 tgagaaattgt 445  Q
    ||| |||||||    
T  1042 tgataaattgt 1052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 91; Significance: 8e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 117149 - 117362
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatggtaaag 100  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||   |||||||||| ||||||| |||     
T  117149 gtatacactactacactcaaatatgatttgtgtatatacttagttgaggtttcccaacttg-ttgttttgtttttccggataacttgaaaaatggaaaaa 117247  T
Q  101 tgatacgaacttgtcgtatctt-gtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagt 199  Q
    | |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| |    | |||| ||| ||||||||| || ||||||||||    
T  117248 ttatacgaacttgtcgtaacttggtgattttgatgattttgtcgtagttggctggtgaaatg----tataaa-tcaactacactcacatctgatctaagt 117342  T
Q  200 gtatacatagtcgaggccct 219  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  117343 gtatgcatagtcgaggccct 117362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 216 - 342
Target Start/End: Original strand, 118544 - 118670
Alignment:
Q  216 ccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataaacgttaagaccaaa 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||    
T  118544 ccctagagtttatttacttggttttggttcatttgtcccaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaatgatctttaaaaccaaa 118643  T
Q  316 tacttggcaaatcttttgtggatagtt 342  Q
    || ||  |||| |||||||| ||||||    
T  118644 tattttacaaaccttttgtgaatagtt 118670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 88; Significance: 5e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 282 - 448
Target Start/End: Original strand, 255373 - 255539
Alignment:
Q  282 acgaactttgtcgaaaataaacgttaa-gaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctagg 380  Q
    |||||| |||| |||||||| | |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  255373 acgaaccttgttgaaaataatctttaaagatcaaatacatggcaaatcttttgtggatagtttgatatgaatatatgaagatatgtgaatgatttctagg 255472  T
Q  381 ttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatg 448  Q
    | |||||||||||||||||| || |||| ||||||||| || | ||||| |||||||||||| |||||    
T  255473 tgttgaatatgatgtttatcatactgtggtgtattttc-ccctcacttgaattgtgagaaatagtatg 255539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 319 - 481
Target Start/End: Original strand, 2119 - 2280
Alignment:
Q  319 ttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttc 418  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||    
T  2119 ttggaaaatcttttgtggatagtttgatatgaatatatgaagatatgtgaatgattgttaggtgttgaatatgatg-ttatcataaggtgttgtattttc 2217  T
Q  419 tcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttg 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  2218 tcctttacttggattgtgagaaataatatgatgttgttgaattatatgataaagtcgatgttg 2280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 2035 - 2127
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaat 93  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||  | ||  |||||  |||||||||| |||||  |||||||||    
T  2035 gtatacactactgcactcatatgtgatttgagtatatacttagttgaggttcccaaatgtgttttctttgttttgtcggatagtttggaaaat 2127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 253 - 459
Target Start/End: Original strand, 246901 - 247107
Alignment:
Q  253 tcaattattttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgatt 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||    
T  246901 tcaattattttaaagttgtaaaatgatagacgaaccttgtcgaaaataatctttaagacaagatacttgacaaatcttttgtgaatagctttatgtgatt 247000  T
Q  353 atatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagt 452  Q
    | || ||| | |||||||||||  ||| | ||||| ||||| |||||| || | ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||  ||    
T  247001 acataaaggtgtatgaatgattgatagatgttgaaaatgatatttatcttagtatgaagtattttctcctttattttgattgtgagaaatagtatgatgt 247100  T
Q  453 tgttgaa 459  Q
    |||||||    
T  247101 tgttgaa 247107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 86; Significance: 7e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 328 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 4999 - 4842
Alignment:
Q  328 cttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttact 427  Q
    |||| ||| |||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  4999 ctttcgtgaatagctttatatgattaaatgaagatatgtgaatgattgttaggtgttgaatatgatgtttatcataaggtgttgtattttctcctttact 4900  T
Q  428 tggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgatta 485  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||    
T  4899 tggattgtgagaaagtgtatgaagttgttgagctatattatatagttgatattgatta 4842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 121 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 7304 - 7149
Alignment:
Q  121 ttgtgattttgataattttatcgtagtcggccggtgaaacgcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggcccta 220  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| | ||||||| | |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  7304 ttgtgattttgatgatttggtcgtagttggccggtgaaatgtacatgtatactcaattgcactcatatgtgatctaagtgtatacatagttgaggcacta 7205  T
Q  221 gagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattattttaaagttgtaaaat 276  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||    
T  7204 gagtttgtttacttggttttggttcaattgtctcaattgtttaaaagttgtaaaat 7149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 228 - 264
Target Start/End: Original strand, 7118 - 7154
Alignment:
Q  228 tttacttggttttggttcatttatctcaattatttta 264  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  7118 tttacttggttttggttcaattgtctcaattatttta 7154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 282 - 458
Target Start/End: Original strand, 39114 - 39291
Alignment:
Q  282 acgaactttgtcgaaaataaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggt 381  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||||| ||||| | | ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||    
T  39114 acgaactttgtcgaaaatgatctttaagaccgaataccttgaaaatcttttatgaatagtttgatatgattgtatgaagatgtatgaatgattaataggt 39213  T
Q  382 tttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgta-ttttctcctttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttga 458  Q
     ||||| ||||||||||||   |||||||||| | |||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39214 gttgaacatgatgtttatcaagatgtgatgtactcttctcctttgttttgattgtgagaaattgtatgaagttgttga 39291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0153
Description:

Target: scaffold0153; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 345 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 903 - 755
Alignment:
Q  345 atatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattg 444  Q
    |||||| || |||| ||||| |||||| |||  | || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  903 atatgactaaatgaggatatgtgaatgctttacatgtgttgaatatgatgtttatcataatgtgttgtattttctcctttacttggattgtgagaaagta 804  T
Q  445 tatggagttgttgaacaatatgatatagttgatgttgattagtgcatat 493  Q
     |||  |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  803 catgatgttgttgaacgataggatatagtttatgttgattaatgcatat 755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 347 - 495
Target Start/End: Original strand, 44739 - 44889
Alignment:
Q  347 atgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgagaaattgta 446  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  44739 atgattaaatgaagatctatgaatgattgataggtgttgaatatgatgtttattataaggtgttgtattttctcctctacttggaatgtgagaaagtgta 44838  T
Q  447 tggagttgttgaacaatat--gatatagttgatgttgattagtgcatatat 495  Q
    | |||||||||| | ||||   ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  44839 tagagttgttgagctatattatatatagttgatgttgattaatgtatatat 44889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 14715 - 14808
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatg 94  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  14715 gtatacactactgcactcatatgtgatttgtgtatatacttagttgaggcattcaaacttgtttgttttgttttttcggataacttggaaaatg 14808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0258 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0258
Description:

Target: scaffold0258; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 161 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 9352 - 9140
Alignment:
Q  161 gcacatgtaaattcatctacactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcatttatctcaattat 260  Q
    ||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||| |||| | |||| || ||||||||      
T  9352 gcacatgtatactcaactgcactcatatgtgatctaagtgtatacatagttgaggcactagaatttatttgcttagtttggattcaattgtctcaatt-g 9254  T
Q  261 tttaaagttgtaaaatgagagacgaactttgtcgaaaataaacgttaagaccaaatacttggcaaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaag 360  Q
    || |||||||| ||| |  | |||||| |||||| |||| | | |||| ||| | ||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  9253 ttaaaagttgtgaaacgttatacgaac-ttgtcggaaatgatctttaaaaccgagtactttgcaaatcttttgtgtatagcttgatacgattatatgaag 9155  T
Q  361 atatatgaatgattt 375  Q
    || | | ||||||||    
T  9154 atgtgtaaatgattt 9140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 324 - 474
Target Start/End: Original strand, 34570 - 34720
Alignment:
Q  324 aaatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttct-aggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcct 422  Q
    |||||||| |||  ||| || ||||||||| ||||||||||| |||||| || | |||| |||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  34570 aaatctttcgtgattagctttatatgattaaatgaagatatacgaatgaattgttaggtgttgaatatgaagtttatcataaggtgttgtattttctcct 34669  T
Q  423 ttacttggattgtgagaaattgtatggagttgttgaacaatatgatatagtt 474  Q
    | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  34670 t-acttggaatgtgagaaagtgtatggagttgttgagctatattatatagtt 34720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Original strand, 33924 - 34028
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatggtaaag 100  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||  ||||||| |||| |||   |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  33924 gtatacactactacactcatatgtgatttgtgtatattctc-gttgaggctttcaaacgcatttgctttgttttgtcggataacttggaaaatggtaaaa 34022  T
Q  101 tgatac 106  Q
    ||||||    
T  34023 tgatac 34028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 2467 - 2356
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatggtaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||  |  |||||||||||  ||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||     
T  2467 gtatacactactgcactcatatgtgacttgtgtgaaatcttagttgaggcattcgaacttgtttgatttattttgtcggataacttagaaaatgataaaa 2368  T
Q  101 tgatacgaactt 112  Q
     |||||||||||    
T  2367 cgatacgaactt 2356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 1826 - 1736
Alignment:
Q  4 tacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatg 94  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||| || | | | | | || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  1826 tacactactgcactcacatgtgatttgtgtatatactttgttgaggcttccaagcgtatatgatttgttttgtcggataacttggaaaatg 1736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 9445 - 9335
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggttttccaacttgtttgttttgttttgttggataacttggaaaatggtaaag 100  Q
    |||||||||||| |||| |||  ||| |||||| |||  |||||||||  |||| |||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||| ||||     
T  9445 gtatacactacttcactaatatgtgacttgtgtgtatgtttagttgagtctttcaaacttgtttgatttggtt-gttgcataacttggaaaatgataaaa 9347  T
Q  101 tgatacgaactt 112  Q
     |||||||||||    
T  9346 cgatacgaactt 9335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 1168 - 1217
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggt 50  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||    
T  1168 gtatacactactgcactcatatgtgatttgtgtatatacatggttgaggt 1217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 249
Target Start/End: Original strand, 1181 - 1250
Alignment:
Q  180 cactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcattt 249  Q
    |||||||||||||| |  || ||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  1181 cactcatatgtgatttgtgtatatacatggttgaggtcctagagtttatttatttggttttagtacattt 1250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 14557 - 14606
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggt 50  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||    
T  14557 gtatacactactgcactcatatgtgatttgtgtatatacatggttgaggt 14606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 180 - 249
Target Start/End: Original strand, 14570 - 14639
Alignment:
Q  180 cactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcattt 249  Q
    |||||||||||||| |  || ||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  14570 cactcatatgtgatttgtgtatatacatggttgaggtcctagagtttatttatttggttttagttcattt 14639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 188013 - 188062
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggt 50  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||    
T  188013 gtatacactactgcactcatatatgacttgtgtatatacatggttgaggt 188062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 201 - 249
Target Start/End: Original strand, 188047 - 188095
Alignment:
Q  201 tatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcattt 249  Q
    ||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  188047 tatacatggttgaggtcctagagtttatttatttggttttagttcattt 188095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 94060 - 94010
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgaggtt 51  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||    
T  94060 gtatacactacttcactcatatgtgatttgtgtatatacatggttgaggtt 94010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 94047 - 93978
Alignment:
Q  180 cactcatatgtgatctaagtgtatacatagtcgaggccctagagtttatttacttggttttggttcattt 249  Q
    |||||||||||||| |  || ||||||| || ||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  94047 cactcatatgtgatttgtgtatatacatggttgaggttctagagtttatttatttggttttagttcattt 93978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 6787 - 6694
Alignment:
Q  325 aatcttttgtggatagtttgatatgattatatgaagatatatgaatgatttctaggttttgaatatgatgtttatcctaatgtgatgtattttc 418  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||  |||||||||| ||| | |||   |||| ||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||    
T  6787 aatcttttgtcaatagttttatatgattgaatgaagatatgtgagtaattgtgaggtcttgaatatgatatttatcataaggtgttgtattttc 6694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 390 - 438
Target Start/End: Original strand, 167383 - 167431
Alignment:
Q  390 tgatgtttatcctaatgtgatgtattttctcctttacttggattgtgag 438  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  167383 tgatgtttatcttaaggtgatgtattttcctctttacttggaatgtgag 167431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 190981 - 190933
Alignment:
Q  1 gtatacactactgcactcataaatgatttgtgtatatacttagttgagg 49  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||    
T  190981 gtatacgctactgcactcatatatgaattgtgtgtatgcttagttgagg 190933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University