View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6715_low_1 (Length: 1029)

Name: NF6715_low_1
Description: NF6715
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6715_low_1
NF6715_low_1
[»] chr2 (6 HSPs)
chr2 (1-1018)||(41571010-41572025)
chr2 (1-1018)||(41583427-41584438)
chr2 (196-1018)||(41589958-41590780)
chr2 (188-1018)||(41557298-41558128)
chr2 (4-184)||(41590859-41591039)
chr2 (438-490)||(41598570-41598622)
[»] chr4 (3 HSPs)
chr4 (426-529)||(23916089-23916192)
chr4 (777-871)||(23916437-23916531)
chr4 (436-490)||(23911557-23911611)
[»] chr7 (1 HSPs)
chr7 (426-489)||(22546323-22546386)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 929; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 929; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 1018
Target Start/End: Complemental strand, 41572025 - 41571010
Alignment:
Q  1 tgtggtgaaaagaattggaaccaaacagtctcgacaacttaatctctcaaattaaaaaatatcgatgaaaatagtcnnnnnnngaactagcaccgtaatt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||| |||||    
T  41572025 tgtggtgaaaagaagtggaaccaaacagtctcgacagcttaatctctcaaattaaaaaatatcgatgaaaatagtctttttttgaactagcaccataatt 41571926  T
Q  101 ttaaaagttttagtttgtcctaatgcatcctgagattattcaaagcaatatataagtctttcattaattttaatagctagtttcataacaattttcaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41571925 ttaaaagttttagtttgtcctaatgcatc--gagattattcaaagcaatatataagtctttcattaattttaatagctattttcataacaattttcaaga 41571828  T
Q  201 acaaaaatgttagtttactcccaacatgttgtgaagctctatgctggaatccaacaagaagaaccaaatagaattctacccttccaaccttgtagcatcc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41571827 acaaaaatgttagtttactcccaacatgttgtgaagctctatgctggaatccaacaagaagaaccaaatagaattctacccttccaaccttgtagcatcc 41571728  T
Q  301 aattttcattcacctcaaacagaaaatcactattatatgcatcatctctcaacttacacttcaatttatctataacatgcttatccaatttcaaagactt 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  41571727 aattttcattcacctcaaacagaaaatcactattatatgcatcatctctcaacttacacttcaatttatctataatctgcttatccaatttcaaagactt 41571628  T
Q  401 aaacccatttcccatgtgcctaaaatgccattgcctatatgtctctggcctctcaaccctatcacaaccttcacaagctataacattcattatatccttc 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41571627 aaacccatttcccatgtgcctaaaatgccattgcctatatgtctctggcctctcaaccctatcacaaccttcacaagctataacattcattatatccttc 41571528  T
Q  501 ccccaaaactcttcctcaaacatcaacctattagggtcctcacgttcaacattgttgttatcaagcatatcaaacaatgatgagtaatgaaaaacagctt 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41571527 ccccaaaactcttcctcaaacatcaacctattaggatcctcacgttcaacattgttgttatcaagcatatcaaacaatgatgagtaatgaaaaacagctt 41571428  T
Q  601 ctttaaaccttgtcacnnnnnnnggtgcatcataacaaccattaacaatgctttgaacaaatatattcggatttgccttcttaatcaaatccaaaacagc 700  Q
    ||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41571427 ctttaaaccttgtcacaaaaaaaggtgcatcataacaaccattaacaatgctttgaacaaatatattcggatttgccttcttaatcaaatccaaaacagc 41571328  T
Q  701 accccttggattctccggagcaaccgtctcatcaagtagattctcaaatttaaaataacaattcacagcaacaaactcatttttccttatcttaaaatcc 800  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41571327 accccttggattctccggagcaaccgtctcatcaagtagattctcaaatttaaaataacaattcacagcaacaaactcatttttccttatcttaaaatcc 41571228  T
Q  801 tcaactttgatactttcccaattttttgcaataccattgaactcaaaaggaacaccgaaacgttcgcaataagctgcaagcctaagacctgttccattca 900  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41571227 tcaactttgatactttcccaatttttcgcaataccattgaactcaaaaggaacaccgaaacgttcgcaataagctgcaagcctaagacctgttccattca 41571128  T
Q  901 ctctctccgacaaatttggaagatctatccctgtgatcttcaacttgggtggcccaccagatcttttcgataaacgaagcattaaaccaggccacttgaa 1000  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41571127 ctctctccaacaaatttggaagatctatccctgtgatcttcaacttgggtggcccaccagatcttttcgataaacgaagcattaaaccaggccacttgaa 41571028  T
Q  1001 accgtaaccaacaccaaa 1018  Q
    ||||||||||||||||||    
T  41571027 accgtaaccaacaccaaa 41571010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 633; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 1018
Target Start/End: Complemental strand, 41584438 - 41583427
Alignment:
Q  1 tgtggtgaaaagaattggaaccaaacagtctcgacaacttaatctctcaaattaaaaaatatcgatgaaaatagtcnnnnnnn-gaactagcaccgtaat 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||| ||||    
T  41584438 tgtggtgaaaagaagtggaaccaaacagtctagacaacttaa--------attaaaaaatatcgatgaaaatagtctttttcttgaactagcaccataat 41584347  T
Q  100 tttaaaagttttagtttgtcctaatgcatcctgagattattcaaagcaatatataagtctttcattaattttaatagctagtttcataacaattttcaag 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41584346 tttaaaggttttagtttgtcctaatgcatcctgggattattcaaagcaatatataagtctttcattaattttaatagctagtttcataacaattttcaag 41584247  T
Q  200 aacaaaaatgttagtttactcccaacatgttgtgaagctctatgctggaatccaacaagaagaaccaaatagaattctacccttccaaccttgtagcatc 299  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41584246 aacgaaaatgttaatttactcccaacatgttgtgaaggtctatgctggaacccaacatgaagaaccaaatagaattctacccttccaaccttgtagcatc 41584147  T
Q  300 caattttcattcacctcaaacagaaaatcactattatatgcatcatctctcaacttacacttcaatttatctataacatgcttatccaatttc-aaagac 398  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||    
T  41584146 caattttcattcacctcaaataaaaaatcactattatatgcatcatttctcaacctacccttcaatttatctataatctgcttattcaatttcaaaagac 41584047  T
Q  399 ttaaacccatttcccatgtgcctaaaatgccattgcctatatgtctctggcctctcaaccctatcacaaccttcacaagctataacattcattatatcct 498  Q
     ||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41584046 ctaaacccatttactatgtgcctagaatgccaatgcctgtatgtctctggcctctcaaccctatcacaaccttcacaagctataacattcattatatcct 41583947  T
Q  499 tcccccaaaactcttcctcaaacatcaacctattagggtcctcacgttcaacattgttgttatcaagcatatcaaacaatgatgagtaatgaaaaacagc 598  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  41583946 tcccccaaaacacttcctcaaacatcaacctaataggatcctcacgttcaacattgttgtgatcaagcgtatcaaacaatgctgaataatgaaaaacagc 41583847  T
Q  599 ttctttaaaccttgtcacnnnnnnnggtgcatcataacaaccattaacaatgctttgaacaaatatattcggatttgccttcttaatcaaatccaaaaca 698  Q
    ||| ||||||||||||||       ||| |||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  41583846 ttccttaaaccttgtcacaaaaaaaggttcatcgtaaccaccattaacaatgctatgaataaatatattcggatttgtctttctaatcaaatccaaaaca 41583747  T
Q  699 gcaccccttggattctccggagcaaccgtctcatcaagtagattctcaaatttaaaataacaattcacagcaacaaactcatttttccttatcttaaaat 798  Q
     ||||| | |||||||||| | | || |||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41583746 tcacccttcggattctccgaaactactgtctcatccagtagattctcaaacttaaacaaacaattcacagcaacaaactcgtttttccttatcttaaaat 41583647  T
Q  799 cctcaactttgatactttcccaattttttgcaataccattgaactcaaaaggaacaccgaaacgttcgcaataagctgcaagcctaagacctgttccatt 898  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||| | ||    
T  41583646 cttcaactttgatactttcccaattttttgcaataccattgtactcaaaaggaacattgaaacgtttgcaataacttgcaagcctaagaccagtttcttt 41583547  T
Q  899 cactctctccgacaaatttggaagatctatccctgtgatcttcaacttgggtggcccaccagatcttttcgataaacgaagcattaaaccaggccacttg 998  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||  | || ||| |||||||||||    
T  41583546 cactctctccaatgaatttggaagatctatccctgtgatcctcaatttgggtggcccaccggatcttttcgatagacggtgtataaaagcaggccacttg 41583447  T
Q  999 aaaccgtaaccaacaccaaa 1018  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  41583446 aaaccataaccaacaccaaa 41583427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 196 - 1018
Target Start/End: Complemental strand, 41590780 - 41589958
Alignment:
Q  196 caagaacaaaaatgttagtttactcccaacatgttgtgaagctctatgctggaatccaacaagaagaaccaaatagaattctacccttccaaccttgtag 295  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41590780 caagcacagaaatgttaatttactcccacctagttgtgaaggtctatgttggaatccaacaagaagaaccaaatagaattctacccttccaaccttgtag 41590681  T
Q  296 catccaattttcattcacctcaaacagaaaatcactattatatgcatcatctctcaacttacacttcaatttatctataacatgcttatccaatttcaaa 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  41590680 catccaattttcattcacctcaaacagaaaatcactattatatgcatcatctctcaacttacacttcaatttatttataatctgcttatccaatttcaaa 41590581  T
Q  396 gacttaaacccatttcccatgtgcctaaaatgccattgcctatatgtctctggcctctcaaccctatcacaaccttcacaagctataacattcattatat 495  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41590580 gacctaaacccatttcccatgtgcctagaatgccaatgcatatatgtctctggcctctcaaccctatcacaaccttcacaagctataacattcattatat 41590481  T
Q  496 ccttcccccaaaactcttcctcaaacatcaacctattagggtcctcacgttcaacattgttgttatcaagcatatcaaacaatgatgagtaatgaaaaac 595  Q
    | |||||||||||  || |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  41590480 cattcccccaaaaaactacctcaaacatcaacctaaaaggatcctcacgttcaacattgttgtaatcaagcatatcaaacaatgctgaataataaaaaac 41590381  T
Q  596 agcttctttaaaccttgtcacnnnnnnnggtgcatcataacaaccattaacaatgctttgaacaaatatattcggatttgccttcttaatcaaatccaaa 695  Q
    |||||| ||||||||||||||       ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41590380 agcttccttaaaccttgtcacaaaaaaaggtgcatcataaccaccattaacaatgctatgaataaatatattcggatttgccttcttaatcaaatccaaa 41590281  T
Q  696 acagcaccccttggattctccggagcaaccgtctcatcaagtagattctcaaatttaaaataacaattcacagcaacaaactcatttttccttatcttaa 795  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||   |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41590280 acagcacccctcggattctccgaaacaactgtctcatcaggtagattctcaaacttaaacacacaagtcactgcaacaaactcatttttccttatcttaa 41590181  T
Q  796 aatcctcaactttgatactttcccaattttttgcaataccattgaactcaaaaggaacaccgaaacgttcgcaataagctgcaagcctaagacctgttcc 895  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||  || |||||||||||||||| |    
T  41590180 aatcctgaactttgatactttcccaattttttgcaataccattgtactcaaaaggaacattgaaacgtttgcaataacttgaaagcctaagacctgtttc 41590081  T
Q  896 attcactctctccgacaaatttggaagatctatccctgtgatcttcaacttgggtggcccaccagatcttttcgataaacgaagcattaaaccaggccac 995  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||    
T  41590080 attcactctctccaatgaatttggaagatctatccctgtgatcctcaatttgggtggcccaccagatcttttcgataaacgatatataaaaccaagccac 41589981  T
Q  996 ttgaaaccgtaaccaacaccaaa 1018  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  41589980 ttgaaaccataaccaacaccaaa 41589958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 522; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 188 - 1018
Target Start/End: Complemental strand, 41558128 - 41557298
Alignment:
Q  188 acaattttcaagaacaaaaatgttagtttactcccaacatgttgtgaagctctatgctggaatccaacaagaagaaccaaatagaattctacccttccaa 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41558128 acaattttcaagaacaaaaatgttgatttactcccaacatattgtgaaggtctatgctggaacccaacatgaagaaccaaatagaattctacccttccaa 41558029  T
Q  288 ccttgtagcatccaattttcattcacctcaaacagaaaatcactattatatgcatcatctctcaacttacacttcaatttatctataacatgcttatcca 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  41558028 ccttgtagcatccaattttcattcacctcaaataaaaaatcactattatatgcatcatttctcaacctacccttcaatttatctataatctgcttattca 41557929  T
Q  388 atttcaaagacttaaacccatttcccatgtgcctaaaatgccattgcctatatgtctctggcctctcaaccctatcacaaccttcacaagctataacatt 487  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41557928 atttcaaagacctaaacccatttcctatgtgcctagaatgccaatgcctgtatgtctctggcctctcaaccctatcacaaccttcacaagctataacatt 41557829  T
Q  488 cattatatccttcccccaaaactcttcctcaaacatcaacctattagggtcctcacgttcaacattgttgttatcaagcatatcaaacaatgatgagtaa 587  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  41557828 cattatatctttcccccaaacgtctccctcaaacatcaacctaacaggatcctcacgttcaacattgttgttatcaagcatatcaaacaatgctgaataa 41557729  T
Q  588 tgaaaaacagcttctttaaaccttgtcacnnnnnnnggtgcatcataacaaccattaacaatgctttgaacaaatatattcggatttgccttcttaatca 687  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||       ||| |||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  41557728 tgaaaaacagcttccttaaaccttgtcacaaaaaaaggttcatcgtaaccaccattaacaatgctatgaataaatatattcggatttgtctttctaatca 41557629  T
Q  688 aatccaaaacagcaccccttggattctccggagcaaccgtctcatcaagtagattctcaaatttaaaataacaattcacagcaacaaactcatttttcct 787  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| | | || |||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41557628 aatccaaaacagcacccttcggattctccgaaactactgtctcatccagtagattctcaaacttaaacaaacaattcacagcaacaaactcgtttttcct 41557529  T
Q  788 tatcttaaaatcctcaactttgatactttcccaattttttgcaataccattgaactcaaaaggaacaccgaaacgttcgcaataagctgcaagcctaaga 887  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  41557528 tatgttaaaatcttcaactttgatactttcccaattttttgcaataccattgtactcaaaaggaacattgaaacgtttgcaataacttgcaagcctaaga 41557429  T
Q  888 cctgttccattcactctctccgacaaatttggaagatctatccctgtgatcttcaacttgggtggcccaccagatcttttcgataaacgaagcattaaac 987  Q
    || ||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||  | || |||     
T  41557428 ccagtttctttcactctctccaatgaatttggaagatctatccctgtgatcctcaatttgggtggcccaccggatcttttcgatagacggtgtataaaag 41557329  T
Q  988 caggccacttgaaaccgtaaccaacaccaaa 1018  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41557328 caggccacttgaaaccataaccaacaccaaa 41557298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 41591039 - 41590859
Alignment:
Q  4 ggtgaaaagaattggaaccaaacagtctcgacaacttaatctctcaaattaaaaaatatcgatgaaaatagtcnnnnnnn-gaactagcaccgtaatttt 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||  |||| ||| ||||| || ||||||||||||| ||||| |||||        ||||||||||| |||||||    
T  41591039 ggtgaaaagaagtggaaccaaacactctaaacaa-ttagtctcttaatttaaaaaatatcgttgaaattagtctttttcttgaactagcaccataatttt 41590941  T
Q  103 aaaagttttagtttgtcctaatgcatcctgagattattcaaagcaatatataagtctttcattaattttaatagctagtttc 184  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41590940 aaaggttttagtttgtcttaatgcatcctgagattgttcaaagcaatatataagtctttcattaattttaatagctagtttc 41590859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 438 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 41598622 - 41598570
Alignment:
Q  438 tatgtctctggcctctcaaccctatcacaaccttcacaagctataacattcat 490  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  41598622 tatgtctcgggcctctcaaccctctcaaaaccttcacatgctacaacattcat 41598570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 56; Significance: 1e-22; HSPs: 3)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 426 - 529
Target Start/End: Original strand, 23916089 - 23916192
Alignment:
Q  426 tgccattgcctatatgtctctggcctctcaaccctatcacaaccttcacaagctataacattcattatatccttcccccaaaactcttcctcaaacatca 525  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  23916089 tgccatttcctgtatgtctctggcctctcaaccctctgagaaccttcacaggctataatattcattacttccctcccccagaactctttctcaaacatca 23916188  T
Q  526 acct 529  Q
    ||||    
T  23916189 acct 23916192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 777 - 871
Target Start/End: Original strand, 23916437 - 23916531
Alignment:
Q  777 tcatttttccttatcttaaaatcctcaactttgatactttcccaattttttgcaataccattgaactcaaaaggaacaccgaaacgttcgcaata 871  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||  ||||||| || | ||||||| ||||||||||||| ||||||   |||||||| |||||    
T  23916437 tcatttttctttatcttcaagtcctcaactttgatggtttcccatttctgtgcaatagcattgaactcaaacggaacattaaaacgttcacaata 23916531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 436 - 490
Target Start/End: Original strand, 23911557 - 23911611
Alignment:
Q  436 tatatgtctctggcctctcaaccctatcacaaccttcacaagctataacattcat 490  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||| ||| |||||    
T  23911557 tatatgtctctggcctctcaactctctctaaaccttcacaagctacaacgttcat 23911611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 426 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 22546386 - 22546323
Alignment:
Q  426 tgccattgcctatatgtctctggcctctcaaccctatcacaaccttcacaagctataacattca 489  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  22546386 tgccactgccgatatgtctctggcctctctactctctcacaaccttcacaggctataacattca 22546323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University