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Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6729_high_1 (Length: 983)

Name: NF6729_high_1
Description: NF6729
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6729_high_1
NF6729_high_1
[»] chr6 (1 HSPs)
chr6 (69-963)||(34353323-34354222)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 800; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 800; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 69 - 963
Target Start/End: Original strand, 34353323 - 34354222
Alignment:
Q  69 agttgatttttgtcattccatataggtgggtcaccaaatgacccattgtattgccaaacatgcaacccaaaatgaggaaataaatgtagg---gataaga 165  Q
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T  34353323 agttgatttttgtcattccatataggtgggtcaccaaatgacccattgtattgccaaacatgcaacccaaaatgaggaaataaatgtaggatcgataaga 34353422  T
Q  166 aattaccaatgatttggattttggaagtcccgtatttttgtgtgctctcctttgtaagtgacctgactcatttgggtctttaattcttcaaaaatatctt 265  Q
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T  34353423 aattaccaatgatttggattttggaagtcccgtatttttgtgtgctctcctttgtaagtgacctgactcatttgggtctttaattcttcaaaaatatctt 34353522  T
Q  266 attttattaacacaaaaaa--tactattttaaggaacgtttcaattaannnnnnnn-gttaactctctggtttttatggaaatggtgccccaataattca 362  Q
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T  34353523 attttattaacacaaaaaaaatactattttaaggaacgtttcagttattttttttttgttaactctctggtttttatggaaatggtgccccaataattca 34353622  T
Q  363 aatttgtgatactcattaaacacttaagctaaattcacttgattgttgatttattaattttaaagaccaacttactcacgcatacaattacattacaatt 462  Q
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T  34353623 aatttgtggaactcattaaacacttaagctaaattcacttgattgttgatttattaattttaaagaccaacttactcacgcatacaattacattacaatt 34353722  T
Q  463 gtagaatgaaatcgagaatttacttattgtttttgttaacaagttttaggatttactagtttattaggataccatagttttattttgtacttaagttacc 562  Q
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T  34353723 gtagaatgaaatcgagaatttacttattgtttttgttaacaagttttaggatttactagtttattaggataccatagttttattttgtacttaagttacc 34353822  T
Q  563 aattacttttcacttgctttttcttcttctcttacatatgcctggctctacattatagagggatatgttttgggtgcattttatttcgagcataacgaca 662  Q
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T  34353823 aattacttttcacttgctttttcttcttctcttacatatgcctggctctacattatagagggatatgttttgtgtgcattttatttcgagcataacgaca 34353922  T
Q  663 aatatcaactcattatcctttacatgtattttttcatatgatgtatatggacacaaagtgtttacgtgattggagtttgtcacgataatggagcttctca 762  Q
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T  34353923 aatatcaactcattaccctttacatgtattttttcatatgatgtatatgga-acaaagtgtttacgtgattggagtttgtcacgataatggagcttctca 34354021  T
Q  763 ttttctacaatttgggtatgaaattagtggtgaaagatacataagagttagatttttcatttggccattgtgatcttggatatagaacgattcttaaggg 862  Q
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T  34354022 ttttctacaatttgggtatgaaattagtggtgaaagatacacaagagttagatttttcatttggccattgtgatcttggatatagaacgattcttaaggg 34354121  T
Q  863 gtaagtggtggattatcaagaggtggaagcaaaagataaaatcagtgtttttggttcattttaagaaaggctaaagcctcattttgaagtattttttatt 962  Q
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T  34354122 gtatgtggtggattatcaagacgtggaagcaaaagataaaatcagtgtttttggttcattttaagaaaggctaaagcctcattttgaagtattttttatt 34354221  T

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