View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6730_low_5 (Length: 582)

Name: NF6730_low_5
Description: NF6730
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6730_low_5
NF6730_low_5
[»] chr6 (83 HSPs)
chr6 (12-581)||(16382155-16382724)
chr6 (12-578)||(18837693-18838259)
chr6 (12-581)||(23996178-23996747)
chr6 (13-578)||(16097982-16098546)
chr6 (13-581)||(25742870-25743437)
chr6 (13-581)||(15078148-15078714)
chr6 (13-581)||(18571582-18572150)
chr6 (13-429)||(1648718-1649134)
chr6 (36-479)||(21412822-21413265)
chr6 (12-351)||(16233139-16233478)
chr6 (16-543)||(25655417-25655943)
chr6 (304-578)||(14625023-14625297)
chr6 (23-420)||(17813669-17814064)
chr6 (399-578)||(21927522-21927701)
chr6 (455-581)||(1648596-1648722)
chr6 (37-577)||(10468635-10469175)
chr6 (37-560)||(14381270-14381793)
chr6 (39-542)||(5839040-5839543)
chr6 (40-578)||(24312953-24313491)
chr6 (53-542)||(25609682-25610171)
chr6 (37-578)||(34645371-34645912)
chr6 (37-542)||(19864642-19865147)
chr6 (40-578)||(29591705-29592243)
chr6 (37-362)||(12497981-12498306)
chr6 (37-362)||(12510595-12510920)
chr6 (37-560)||(21471556-21472079)
chr6 (37-539)||(16963191-16963693)
chr6 (37-578)||(16927425-16927966)
chr6 (40-577)||(27187394-27187931)
chr6 (40-577)||(27261309-27261846)
chr6 (37-578)||(27331218-27331759)
chr6 (37-578)||(27391958-27392499)
chr6 (40-578)||(1542869-1543407)
chr6 (40-578)||(28262982-28263520)
chr6 (40-578)||(28341731-28342269)
chr6 (37-353)||(23078424-23078740)
chr6 (40-578)||(16626502-16627040)
chr6 (140-578)||(22433927-22434365)
chr6 (53-578)||(2874588-2875113)
chr6 (91-578)||(11280290-11280777)
chr6 (37-578)||(18407727-18408269)
chr6 (91-560)||(25768200-25768669)
chr6 (37-566)||(28282610-28283139)
chr6 (36-560)||(24364366-24364890)
chr6 (275-372)||(1652266-1652363)
chr6 (37-362)||(12505310-12505635)
chr6 (37-566)||(27560414-27560943)
chr6 (466-578)||(23027501-23027613)
chr6 (36-542)||(22078511-22079015)
chr6 (37-338)||(25765315-25765615)
chr6 (37-575)||(17415441-17415979)
chr6 (53-578)||(25112523-25113048)
chr6 (40-577)||(28292158-28292695)
chr6 (37-578)||(19879253-19879794)
chr6 (274-566)||(5297003-5297294)
chr6 (37-364)||(8766147-8766474)
chr6 (36-560)||(22796435-22796959)
chr6 (40-275)||(26276888-26277124)
chr6 (37-344)||(15459291-15459598)
chr6 (138-304)||(18197606-18197772)
chr6 (433-575)||(19453771-19453913)
chr6 (434-560)||(8762736-8762862)
chr6 (13-71)||(14129391-14129449)
chr6 (40-578)||(22762240-22762778)
chr6 (37-364)||(18794645-18794972)
chr6 (37-167)||(25750764-25750894)
chr6 (264-566)||(27559785-27560087)
chr6 (91-364)||(18800951-18801224)
chr6 (396-575)||(17032697-17032876)
chr6 (433-560)||(21563935-21564062)
chr6 (433-560)||(21569794-21569921)
chr6 (37-160)||(25750901-25751024)
chr6 (91-269)||(11287692-11287870)
chr6 (245-323)||(19453583-19453661)
chr6 (433-577)||(18795041-18795185)
chr6 (487-538)||(17814095-17814146)
chr6 (55-364)||(1640745-1641054)
chr6 (533-578)||(16233479-16233524)
chr6 (247-364)||(21564131-21564248)
chr6 (39-167)||(14131375-14131503)
chr6 (503-542)||(18197549-18197588)
chr6 (16-58)||(23124121-23124163)
chr6 (91-188)||(11291821-11291918)
[»] chr3 (78 HSPs)
chr3 (12-581)||(8274275-8274844)
chr3 (12-581)||(16742579-16743148)
chr3 (13-574)||(15576446-15577007)
chr3 (16-578)||(18748364-18748926)
chr3 (13-581)||(17192790-17193357)
chr3 (13-579)||(6152729-6153283)
chr3 (16-575)||(6712291-6712841)
chr3 (12-363)||(13975140-13975490)
chr3 (16-582)||(267132-267699)
chr3 (16-464)||(21686644-21687091)
chr3 (357-581)||(13967216-13967440)
chr3 (37-581)||(14876375-14876919)
chr3 (37-578)||(12497958-12498499)
chr3 (37-578)||(17489560-17490101)
chr3 (37-578)||(16691870-16692415)
chr3 (37-578)||(9522429-9522970)
chr3 (38-575)||(16806808-16807345)
chr3 (37-344)||(15247857-15248164)
chr3 (37-359)||(15208601-15208923)
chr3 (40-577)||(20061934-20062471)
chr3 (40-578)||(16635486-16636024)
chr3 (40-578)||(43162810-43163348)
chr3 (40-577)||(15589272-15589809)
chr3 (37-577)||(16371123-16371663)
chr3 (40-578)||(10005313-10005851)
chr3 (40-578)||(10905923-10906461)
chr3 (40-578)||(15348124-15348662)
chr3 (37-578)||(16492060-16492601)
chr3 (53-577)||(53384898-53385422)
chr3 (40-578)||(13252403-13252941)
chr3 (40-578)||(48425160-48425698)
chr3 (37-566)||(8758962-8759491)
chr3 (37-578)||(14086393-14086934)
chr3 (138-578)||(5424809-5425249)
chr3 (36-561)||(10383688-10384213)
chr3 (37-578)||(13971988-13972529)
chr3 (40-577)||(16756465-16757002)
chr3 (37-566)||(41177242-41177771)
chr3 (37-566)||(13941744-13942273)
chr3 (36-563)||(47123663-47124190)
chr3 (67-359)||(15015842-15016134)
chr3 (37-575)||(11303644-11304182)
chr3 (88-364)||(11961116-11961392)
chr3 (176-419)||(14182950-14183193)
chr3 (37-560)||(16836396-16836919)
chr3 (37-575)||(18134217-18134755)
chr3 (40-578)||(26792278-26792816)
chr3 (253-563)||(28754254-28754564)
chr3 (40-361)||(6600460-6600781)
chr3 (253-578)||(15724813-15725138)
chr3 (40-578)||(15402389-15402927)
chr3 (37-566)||(16380808-16381336)
chr3 (226-556)||(17492539-17492869)
chr3 (37-577)||(16329530-16330068)
chr3 (240-560)||(12360428-12360748)
chr3 (55-179)||(15227387-15227511)
chr3 (307-578)||(14126473-14126744)
chr3 (37-560)||(15952854-15953377)
chr3 (247-364)||(26009075-26009192)
chr3 (427-575)||(13322523-13322671)
chr3 (247-566)||(4678368-4678687)
chr3 (37-344)||(10420147-10420454)
chr3 (100-563)||(44777030-44777493)
chr3 (40-578)||(16412161-16412699)
chr3 (286-362)||(11564776-11564852)
chr3 (37-361)||(12850364-12850688)
chr3 (433-560)||(16828088-16828215)
chr3 (40-338)||(15338982-15339280)
chr3 (409-577)||(16338381-16338549)
chr3 (426-560)||(14574038-14574172)
chr3 (383-577)||(15061812-15062006)
chr3 (247-366)||(13001839-13001958)
chr3 (427-577)||(6600836-6600986)
chr3 (275-536)||(14573887-14574148)
chr3 (253-362)||(15227585-15227694)
chr3 (37-364)||(13322734-13323061)
chr3 (115-195)||(15725195-15725275)
chr3 (36-186)||(14571567-14571717)
[»] chr4 (62 HSPs)
chr4 (12-578)||(14997382-14997948)
chr4 (12-581)||(15292795-15293363)
chr4 (13-581)||(9290902-9291470)
chr4 (13-579)||(13247712-13248278)
chr4 (40-578)||(12342503-12343041)
chr4 (13-399)||(55375177-55375563)
chr4 (16-563)||(16685324-16685870)
chr4 (12-255)||(16445175-16445418)
chr4 (19-335)||(12132293-12132608)
chr4 (115-578)||(14680736-14681199)
chr4 (37-575)||(16251828-16252366)
chr4 (40-578)||(19778173-19778711)
chr4 (38-575)||(18226829-18227366)
chr4 (40-578)||(27711430-27711968)
chr4 (40-578)||(29038784-29039322)
chr4 (40-353)||(14159586-14159899)
chr4 (39-362)||(14652401-14652724)
chr4 (40-578)||(12476694-12477232)
chr4 (40-578)||(18297299-18297837)
chr4 (37-533)||(16354870-16355366)
chr4 (40-578)||(14303358-14303896)
chr4 (53-575)||(14850749-14851271)
chr4 (138-359)||(1640024-1640245)
chr4 (40-578)||(8386506-8387044)
chr4 (40-578)||(23955841-23956379)
chr4 (36-560)||(3264452-3264976)
chr4 (40-579)||(9849118-9849656)
chr4 (40-578)||(8053003-8053541)
chr4 (40-578)||(12523770-12524308)
chr4 (36-560)||(44661524-44662048)
chr4 (247-578)||(15147264-15147595)
chr4 (36-578)||(20891072-20891614)
chr4 (36-560)||(29453195-29453719)
chr4 (40-578)||(40473134-40473672)
chr4 (39-364)||(15070506-15070831)
chr4 (39-575)||(1648920-1649456)
chr4 (142-560)||(15077831-15078249)
chr4 (253-557)||(8706225-8706529)
chr4 (36-560)||(11206889-11207413)
chr4 (100-364)||(15358944-15359208)
chr4 (37-364)||(51606035-51606362)
chr4 (37-578)||(7090523-7091064)
chr4 (55-362)||(15414882-15415189)
chr4 (38-200)||(15149764-15149926)
chr4 (36-364)||(15003218-15003546)
chr4 (115-362)||(14266495-14266742)
chr4 (260-578)||(18549700-18550018)
chr4 (37-364)||(16146003-16146330)
chr4 (40-323)||(33223012-33223295)
chr4 (434-560)||(33223411-33223537)
chr4 (88-577)||(27900528-27901017)
chr4 (37-560)||(15246015-15246538)
chr4 (433-575)||(15358733-15358875)
chr4 (115-200)||(16676461-16676546)
chr4 (444-575)||(14691400-14691531)
chr4 (427-560)||(15003022-15003155)
chr4 (37-185)||(16752684-16752832)
chr4 (446-533)||(14159970-14160057)
chr4 (444-578)||(15319649-15319783)
chr4 (493-578)||(1639805-1639890)
chr4 (460-577)||(15414667-15414784)
chr4 (312-353)||(15424108-15424149)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (12-581)||(46251-46820)
[»] chr1 (46 HSPs)
chr1 (12-581)||(20831101-20831670)
chr1 (12-581)||(20914291-20914860)
chr1 (92-581)||(22135266-22135756)
chr1 (40-582)||(21201997-21202537)
chr1 (16-582)||(20184266-20184832)
chr1 (12-230)||(46518802-46519020)
chr1 (40-542)||(17044763-17045265)
chr1 (37-579)||(50619955-50620497)
chr1 (40-578)||(16350311-16350849)
chr1 (40-578)||(19106476-19107014)
chr1 (40-578)||(51333205-51333743)
chr1 (138-542)||(16078400-16078804)
chr1 (40-578)||(33390741-33391279)
chr1 (39-575)||(16369405-16369941)
chr1 (40-578)||(21837059-21837597)
chr1 (20-541)||(19760615-19761136)
chr1 (37-359)||(20249956-20250278)
chr1 (40-578)||(21830412-21830950)
chr1 (37-566)||(22432840-22433369)
chr1 (36-563)||(37677184-37677712)
chr1 (36-575)||(20294517-20295056)
chr1 (37-359)||(20136884-20137206)
chr1 (433-575)||(19854815-19854957)
chr1 (37-575)||(20939778-20940316)
chr1 (40-362)||(41354397-41354719)
chr1 (36-323)||(31550148-31550435)
chr1 (383-560)||(24099333-24099510)
chr1 (433-575)||(19662856-19662998)
chr1 (116-330)||(21747720-21747933)
chr1 (37-364)||(20856687-20857014)
chr1 (16-99)||(22142232-22142315)
chr1 (397-578)||(21749407-21749588)
chr1 (36-167)||(11382699-11382830)
chr1 (37-364)||(19854420-19854746)
chr1 (245-364)||(20835814-20835933)
chr1 (36-157)||(20075192-20075313)
chr1 (397-578)||(22361956-22362137)
chr1 (383-563)||(31539724-31539904)
chr1 (445-575)||(20835603-20835733)
chr1 (36-364)||(41307930-41308258)
chr1 (37-167)||(20244306-20244436)
chr1 (444-578)||(20856473-20856607)
chr1 (433-514)||(41308327-41308408)
chr1 (182-281)||(15730882-15730981)
chr1 (281-364)||(19663062-19663145)
chr1 (426-542)||(41354217-41354333)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (12-581)||(40355-40924)
scaffold0076 (37-578)||(33320-33861)
[»] chr8 (73 HSPs)
chr8 (12-581)||(21850417-21850986)
chr8 (12-581)||(16877175-16877744)
chr8 (13-578)||(20652416-20652981)
chr8 (13-578)||(21196585-21197150)
chr8 (13-578)||(22982569-22983131)
chr8 (16-578)||(22315327-22315889)
chr8 (119-581)||(23157092-23157553)
chr8 (40-582)||(25282291-25282832)
chr8 (83-582)||(22283199-22283706)
chr8 (37-575)||(22377540-22378077)
chr8 (37-575)||(22383715-22384252)
chr8 (37-578)||(16408128-16408669)
chr8 (40-575)||(32600304-32600839)
chr8 (37-575)||(15533537-15534075)
chr8 (422-578)||(23900818-23900974)
chr8 (40-578)||(17674106-17674644)
chr8 (37-542)||(21166656-21167161)
chr8 (37-560)||(31416575-31417098)
chr8 (36-560)||(6603814-6604338)
chr8 (37-581)||(22133121-22133665)
chr8 (40-578)||(19112850-19113388)
chr8 (37-542)||(19978124-19978629)
chr8 (36-560)||(6679267-6679791)
chr8 (40-542)||(20017869-20018371)
chr8 (37-575)||(30313230-30313768)
chr8 (37-578)||(21921818-21922359)
chr8 (53-542)||(22046546-22047035)
chr8 (37-578)||(23655084-23655625)
chr8 (36-560)||(803774-804298)
chr8 (53-557)||(20396229-20396733)
chr8 (37-560)||(22061534-22062057)
chr8 (37-566)||(31570937-31571466)
chr8 (115-581)||(22164272-22164737)
chr8 (37-578)||(19851568-19852109)
chr8 (37-578)||(19857604-19858145)
chr8 (37-566)||(22051020-22051549)
chr8 (36-563)||(14565298-14565825)
chr8 (40-229)||(24818048-24818237)
chr8 (40-578)||(22120257-22120795)
chr8 (37-578)||(21251099-21251639)
chr8 (37-578)||(21788442-21788982)
chr8 (37-578)||(23650198-23650739)
chr8 (40-362)||(19485169-19485491)
chr8 (37-577)||(1266396-1266935)
chr8 (138-542)||(23949178-23949581)
chr8 (37-364)||(20010197-20010524)
chr8 (37-578)||(21393948-21394489)
chr8 (36-557)||(12304914-12305435)
chr8 (256-533)||(22040235-22040512)
chr8 (139-578)||(19863316-19863754)
chr8 (139-578)||(19867953-19868391)
chr8 (245-575)||(20975737-20976067)
chr8 (91-281)||(24094353-24094543)
chr8 (37-566)||(29303521-29304050)
chr8 (226-557)||(16271328-16271659)
chr8 (406-560)||(27355074-27355228)
chr8 (253-578)||(18856950-18857275)
chr8 (96-361)||(21840633-21840898)
chr8 (40-364)||(20388259-20388583)
chr8 (138-330)||(22987459-22987651)
chr8 (36-158)||(28982513-28982635)
chr8 (36-158)||(28987733-28987855)
chr8 (36-152)||(16265127-16265243)
chr8 (331-379)||(24094557-24094605)
chr8 (37-212)||(21681919-21682094)
chr8 (37-167)||(21324903-21325033)
chr8 (53-167)||(22032205-22032319)
chr8 (13-86)||(23151081-23151154)
chr8 (503-578)||(22129023-22129098)
chr8 (493-560)||(22371553-22371620)
chr8 (20-153)||(23949029-23949162)
chr8 (426-542)||(19484989-19485105)
chr8 (468-560)||(21841005-21841097)
[»] chr7 (77 HSPs)
chr7 (12-581)||(7823955-7824524)
chr7 (12-581)||(27107420-27107989)
chr7 (16-578)||(15363999-15364561)
chr7 (16-578)||(14936406-14936968)
chr7 (13-578)||(12368225-12368789)
chr7 (16-578)||(4439987-4440549)
chr7 (16-578)||(21674182-21674744)
chr7 (16-557)||(12193615-12194156)
chr7 (16-578)||(45146615-45147173)
chr7 (22-578)||(13353216-13353771)
chr7 (16-578)||(17923739-17924272)
chr7 (16-542)||(17144945-17145469)
chr7 (13-233)||(13378754-13378974)
chr7 (24-497)||(20466849-20467321)
chr7 (115-578)||(12687659-12688122)
chr7 (38-575)||(16968-17505)
chr7 (16-297)||(23641576-23641857)
chr7 (40-577)||(10871078-10871615)
chr7 (111-320)||(5432506-5432712)
chr7 (138-575)||(9596238-9596675)
chr7 (53-578)||(18551407-18551932)
chr7 (36-560)||(11305908-11306432)
chr7 (37-575)||(15102233-15102769)
chr7 (40-578)||(8198711-8199249)
chr7 (40-578)||(8707688-8708226)
chr7 (40-362)||(11552967-11553289)
chr7 (40-578)||(14954703-14955241)
chr7 (53-578)||(44791000-44791525)
chr7 (298-542)||(15171649-15171893)
chr7 (36-563)||(8211770-8212297)
chr7 (36-563)||(49152381-49152908)
chr7 (88-577)||(13021489-13021978)
chr7 (37-560)||(16950116-16950639)
chr7 (37-575)||(6413592-6414130)
chr7 (40-578)||(14332480-14333018)
chr7 (37-559)||(23505516-23506038)
chr7 (40-578)||(11236862-11237400)
chr7 (37-578)||(11388055-11388595)
chr7 (377-582)||(23641868-23642073)
chr7 (37-560)||(1052-1575)
chr7 (76-359)||(35964718-35965001)
chr7 (95-577)||(11771891-11772373)
chr7 (40-578)||(15160706-15161244)
chr7 (36-560)||(26118250-26118774)
chr7 (40-578)||(13686147-13686685)
chr7 (37-575)||(14286006-14286544)
chr7 (37-543)||(23199405-23199911)
chr7 (37-566)||(14129954-14130483)
chr7 (37-566)||(14433772-14434301)
chr7 (37-359)||(15154525-15154842)
chr7 (37-566)||(18053592-18054121)
chr7 (115-542)||(18177900-18178327)
chr7 (37-364)||(19147292-19147619)
chr7 (37-364)||(20746691-20747018)
chr7 (37-578)||(14263871-14264412)
chr7 (55-362)||(12206643-12206950)
chr7 (37-557)||(15624632-15625152)
chr7 (41-560)||(12455787-12456306)
chr7 (40-362)||(23516634-23516956)
chr7 (94-362)||(15204016-15204284)
chr7 (113-353)||(21662117-21662357)
chr7 (37-560)||(16071939-16072462)
chr7 (253-353)||(14039992-14040092)
chr7 (253-353)||(14350022-14350122)
chr7 (433-560)||(13666014-13666141)
chr7 (260-577)||(40796-41113)
chr7 (226-575)||(13968298-13968647)
chr7 (444-566)||(15340919-15341041)
chr7 (40-233)||(14037890-14038083)
chr7 (40-233)||(14347920-14348113)
chr7 (245-364)||(12457068-12457187)
chr7 (245-364)||(13665826-13665945)
chr7 (427-560)||(19147682-19147815)
chr7 (427-560)||(20747081-20747214)
chr7 (100-364)||(15340575-15340839)
chr7 (426-578)||(11552751-11552903)
chr7 (53-136)||(21193851-21193933)
[»] scaffold0124 (4 HSPs)
scaffold0124 (13-581)||(7450-8019)
scaffold0124 (433-575)||(50-192)
scaffold0124 (37-575)||(11010-11548)
scaffold0124 (37-364)||(256-583)
[»] chr5 (69 HSPs)
chr5 (12-581)||(21937007-21937576)
chr5 (12-581)||(24581191-24581759)
chr5 (12-576)||(27011065-27011628)
chr5 (13-578)||(23503424-23503988)
chr5 (13-371)||(11210723-11211081)
chr5 (57-579)||(25244171-25244695)
chr5 (57-579)||(25308323-25308847)
chr5 (50-521)||(16065571-16066040)
chr5 (37-578)||(25423212-25423753)
chr5 (37-542)||(23573765-23574270)
chr5 (37-581)||(23516564-23517108)
chr5 (37-542)||(20798783-20799288)
chr5 (113-578)||(21339108-21339573)
chr5 (40-578)||(16356528-16357066)
chr5 (237-563)||(19566526-19566852)
chr5 (40-578)||(19769986-19770524)
chr5 (40-578)||(27668312-27668850)
chr5 (40-578)||(34566520-34567058)
chr5 (40-578)||(40708806-40709344)
chr5 (40-578)||(41770868-41771406)
chr5 (40-578)||(27610380-27610918)
chr5 (37-335)||(21498101-21498399)
chr5 (40-578)||(27518433-27518971)
chr5 (37-542)||(23440248-23440753)
chr5 (37-359)||(21984346-21984668)
chr5 (36-563)||(14886828-14887355)
chr5 (40-578)||(27685222-27685760)
chr5 (37-566)||(17269168-17269696)
chr5 (37-362)||(26738743-26739068)
chr5 (37-575)||(18775800-18776331)
chr5 (38-542)||(20467954-20468458)
chr5 (40-578)||(29475895-29476433)
chr5 (37-566)||(22381204-22381733)
chr5 (53-578)||(37291318-37291843)
chr5 (37-560)||(24749394-24749917)
chr5 (40-578)||(14999561-15000099)
chr5 (37-575)||(22235745-22236283)
chr5 (36-557)||(22502683-22503204)
chr5 (39-575)||(23471254-23471790)
chr5 (36-575)||(20342286-20342825)
chr5 (36-359)||(25848079-25848402)
chr5 (40-578)||(22332709-22333247)
chr5 (36-479)||(37545417-37545861)
chr5 (115-578)||(22134769-22135232)
chr5 (36-563)||(24798234-24798761)
chr5 (138-359)||(21404944-21405167)
chr5 (37-577)||(23079912-23080452)
chr5 (145-364)||(21831779-21831998)
chr5 (37-364)||(22461957-22462284)
chr5 (433-560)||(24716366-24716493)
chr5 (426-560)||(21890599-21890733)
chr5 (253-542)||(22348662-22348951)
chr5 (254-557)||(21563816-21564119)
chr5 (433-560)||(24620135-24620262)
chr5 (62-158)||(8814243-8814339)
chr5 (37-353)||(24735658-24735974)
chr5 (16-124)||(24516543-24516651)
chr5 (247-364)||(21890795-21890912)
chr5 (37-344)||(20821458-20821765)
chr5 (37-158)||(21564208-21564329)
chr5 (37-186)||(23442507-23442656)
chr5 (280-364)||(1064-1148)
chr5 (504-560)||(21496630-21496686)
chr5 (444-536)||(22462364-22462456)
chr5 (433-578)||(20821854-20821999)
chr5 (433-578)||(28916235-28916380)
chr5 (433-578)||(28923590-28923735)
chr5 (433-536)||(20774160-20774263)
chr5 (37-167)||(24737018-24737148)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (12-581)||(23491-24060)
[»] chr2 (61 HSPs)
chr2 (12-581)||(24831364-24831933)
chr2 (13-581)||(22275977-22276544)
chr2 (13-578)||(24569848-24570413)
chr2 (13-578)||(22761749-22762314)
chr2 (12-414)||(12640263-12640665)
chr2 (92-578)||(23817223-23817719)
chr2 (16-578)||(25128348-25128910)
chr2 (286-484)||(23890753-23890951)
chr2 (36-578)||(24707662-24708204)
chr2 (37-578)||(23063799-23064340)
chr2 (40-578)||(24709758-24710296)
chr2 (40-578)||(9609861-9610399)
chr2 (40-578)||(16998725-16999263)
chr2 (40-577)||(10868575-10869112)
chr2 (37-542)||(21325482-21325987)
chr2 (37-542)||(24675211-24675716)
chr2 (36-563)||(11358069-11358596)
chr2 (40-578)||(16981877-16982415)
chr2 (40-578)||(17063442-17063980)
chr2 (40-578)||(17067100-17067638)
chr2 (40-578)||(44385749-44386287)
chr2 (53-578)||(22325036-22325561)
chr2 (392-579)||(21906348-21906535)
chr2 (37-542)||(24825498-24826003)
chr2 (37-578)||(27365259-27365800)
chr2 (36-563)||(1063472-1063999)
chr2 (40-362)||(16924985-16925307)
chr2 (40-578)||(27370994-27371532)
chr2 (16-133)||(23817718-23817835)
chr2 (37-575)||(23188730-23189267)
chr2 (37-575)||(23293680-23294218)
chr2 (40-578)||(24262095-24262633)
chr2 (40-578)||(27217741-27218279)
chr2 (245-560)||(19652250-19652562)
chr2 (16-266)||(21908785-21909033)
chr2 (37-566)||(12574075-12574604)
chr2 (16-124)||(28144664-28144772)
chr2 (115-362)||(24878391-24878638)
chr2 (36-563)||(31830379-31830906)
chr2 (37-566)||(27787463-27787992)
chr2 (37-578)||(22756645-22757184)
chr2 (91-577)||(23276552-23277038)
chr2 (36-560)||(20832706-20833230)
chr2 (55-362)||(21145426-21145733)
chr2 (253-578)||(41608565-41608890)
chr2 (117-560)||(45529313-45529756)
chr2 (94-560)||(30211115-30211581)
chr2 (426-578)||(21145221-21145373)
chr2 (55-361)||(23087190-23087496)
chr2 (433-577)||(24948707-24948851)
chr2 (444-575)||(20442696-20442827)
chr2 (406-560)||(20828350-20828504)
chr2 (427-560)||(21125355-21125488)
chr2 (447-575)||(24641874-24642002)
chr2 (444-578)||(16923018-16923152)
chr2 (275-361)||(21906549-21906635)
chr2 (433-542)||(24876965-24877074)
chr2 (138-199)||(27368391-27368452)
chr2 (434-578)||(16925479-16925623)
chr2 (37-157)||(24654067-24654187)
chr2 (110-165)||(14708882-14708937)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (13-581)||(3515-4083)
[»] scaffold0761 (2 HSPs)
scaffold0761 (12-581)||(26-595)
scaffold0761 (385-578)||(4742-4935)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (13-578)||(32640-33203)
scaffold0012 (20-359)||(229148-229487)
scaffold0012 (37-542)||(219096-219601)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (13-581)||(14755-15322)
scaffold0132 (13-581)||(43636-44204)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (13-581)||(27906-28474)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (12-520)||(98112-98620)
scaffold0037 (13-142)||(23545-23674)
scaffold0037 (139-542)||(116584-116987)
[»] scaffold0028 (8 HSPs)
scaffold0028 (13-581)||(106213-106781)
scaffold0028 (40-578)||(43279-43817)
scaffold0028 (37-364)||(50371-50698)
scaffold0028 (117-362)||(8687-8932)
scaffold0028 (444-542)||(50193-50291)
scaffold0028 (253-362)||(15285-15394)
scaffold0028 (426-542)||(15447-15563)
scaffold0028 (426-542)||(8985-9101)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (13-581)||(14377-14944)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (13-581)||(3584-4152)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (16-581)||(8530-9096)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (12-578)||(3256-3821)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (12-578)||(13005-13571)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (13-575)||(700-1262)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (100-581)||(25991-26472)
scaffold0235 (53-560)||(21332-21839)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (13-581)||(23978-24546)
scaffold0008 (20-577)||(231663-232219)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (21-575)||(7274-7828)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (12-578)||(9084-9649)
[»] scaffold0011 (6 HSPs)
scaffold0011 (133-581)||(180142-180590)
scaffold0011 (13-375)||(121796-122158)
scaffold0011 (37-577)||(26177-26717)
scaffold0011 (37-577)||(195348-195886)
scaffold0011 (444-575)||(149099-149230)
scaffold0011 (226-364)||(148881-149019)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (12-581)||(14227-14804)
[»] scaffold0117 (2 HSPs)
scaffold0117 (111-581)||(1064-1534)
scaffold0117 (13-105)||(10425-10517)
[»] scaffold0507 (2 HSPs)
scaffold0507 (13-574)||(1-541)
scaffold0507 (37-359)||(9092-9414)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (138-578)||(71442-71882)
scaffold0021 (327-581)||(33053-33307)
scaffold0021 (273-581)||(24332-24629)
scaffold0021 (25-278)||(13361-13614)
scaffold0021 (13-134)||(6408-6529)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (16-566)||(10757-11307)
[»] scaffold0244 (2 HSPs)
scaffold0244 (100-421)||(25957-26278)
scaffold0244 (433-560)||(17877-18004)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (187-581)||(2828-3208)
[»] scaffold0207 (2 HSPs)
scaffold0207 (263-578)||(18399-18714)
scaffold0207 (131-204)||(18325-18398)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (12-306)||(22791-23085)
scaffold0120 (37-578)||(6145-6686)
scaffold0120 (245-575)||(1170-1500)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (16-360)||(14624-14968)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (274-578)||(8-312)
[»] scaffold0551 (1 HSPs)
scaffold0551 (13-279)||(8193-8458)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (327-576)||(9506-9755)
scaffold0266 (37-212)||(14207-14382)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (319-581)||(5579-5841)
[»] scaffold0058 (3 HSPs)
scaffold0058 (16-515)||(74001-74500)
scaffold0058 (37-560)||(19242-19765)
scaffold0058 (91-164)||(58463-58536)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (13-268)||(78582-78837)
scaffold0001 (113-362)||(448257-448506)
scaffold0001 (39-560)||(90593-91114)
scaffold0001 (444-542)||(114709-114807)
scaffold0001 (503-560)||(89915-89972)
[»] scaffold1710 (2 HSPs)
scaffold1710 (13-179)||(952-1118)
scaffold1710 (245-364)||(219-338)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (13-171)||(10453-10611)
scaffold0447 (13-171)||(5839-5997)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (13-171)||(8448-8606)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (83-389)||(21776-22072)
scaffold0017 (16-71)||(14061-14116)
scaffold0017 (426-542)||(197157-197273)
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (13-171)||(16221-16379)
scaffold0234 (55-578)||(24714-25237)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (37-575)||(65527-66065)
scaffold0042 (138-578)||(39463-39902)
[»] scaffold1068 (1 HSPs)
scaffold1068 (109-582)||(447-914)
[»] scaffold0091 (2 HSPs)
scaffold0091 (37-575)||(7912-8450)
scaffold0091 (461-581)||(45043-45163)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (37-542)||(14482-14987)
scaffold0044 (40-578)||(745-1283)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (53-575)||(15015-15537)
scaffold0040 (404-578)||(113130-113304)
[»] scaffold0403 (3 HSPs)
scaffold0403 (37-578)||(6494-7035)
scaffold0403 (433-560)||(3309-3436)
scaffold0403 (275-364)||(3151-3240)
[»] scaffold0020 (3 HSPs)
scaffold0020 (37-362)||(180339-180664)
scaffold0020 (434-560)||(101213-101339)
scaffold0020 (444-578)||(180728-180862)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (454-566)||(1-113)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (36-560)||(47245-47769)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (37-359)||(798-1120)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (40-578)||(539-1077)
[»] scaffold0005 (4 HSPs)
scaffold0005 (37-578)||(278473-279014)
scaffold0005 (39-362)||(164568-164891)
scaffold0005 (37-566)||(260430-260959)
scaffold0005 (53-195)||(308797-308939)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (391-582)||(3558-3749)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (37-344)||(127076-127383)
scaffold0022 (396-522)||(80193-80319)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (37-560)||(41994-42517)
scaffold0010 (37-577)||(47043-47583)
scaffold0010 (397-542)||(2403-2548)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (37-542)||(21989-22494)
[»] scaffold0004 (6 HSPs)
scaffold0004 (37-575)||(117690-118228)
scaffold0004 (16-147)||(370214-370345)
scaffold0004 (37-542)||(112143-112648)
scaffold0004 (37-578)||(322826-323367)
scaffold0004 (37-560)||(385941-386464)
scaffold0004 (138-542)||(203147-203551)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (37-578)||(6136-6677)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (37-566)||(48862-49391)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (39-542)||(63710-64213)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (67-560)||(5252-5744)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (113-581)||(4045-4513)
[»] scaffold0109 (3 HSPs)
scaffold0109 (113-581)||(8794-9262)
scaffold0109 (37-581)||(33213-33757)
scaffold0109 (13-89)||(44578-44654)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (37-578)||(220-761)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (254-575)||(12826-13147)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (37-578)||(337-877)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (36-560)||(26382-26906)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (36-560)||(16374-16898)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (37-362)||(124-449)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (37-362)||(17109-17434)
[»] scaffold0029 (4 HSPs)
scaffold0029 (40-533)||(109499-109992)
scaffold0029 (37-577)||(112681-113221)
scaffold0029 (37-344)||(95879-96186)
scaffold0029 (444-578)||(95645-95779)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (37-364)||(5771-6098)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (39-542)||(12656-13159)
[»] scaffold0298 (4 HSPs)
scaffold0298 (245-560)||(20313-20628)
scaffold0298 (37-575)||(13007-13545)
scaffold0298 (37-575)||(16777-17315)
scaffold0298 (53-185)||(20121-20253)
[»] scaffold0192 (3 HSPs)
scaffold0192 (37-364)||(26264-26591)
scaffold0192 (242-578)||(26851-27187)
scaffold0192 (436-578)||(26663-26805)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (39-542)||(32431-32934)
[»] scaffold0411 (2 HSPs)
scaffold0411 (38-362)||(14938-15262)
scaffold0411 (426-542)||(14758-14874)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (38-310)||(16376-16648)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (40-578)||(7063-7602)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (40-575)||(16062-16597)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (37-364)||(37324-37651)
scaffold0026 (38-212)||(38183-38357)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (37-359)||(1261-1583)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (229-575)||(27539-27885)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (37-359)||(5343-5665)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (53-575)||(13547-14069)
scaffold0034 (37-575)||(4599-5137)
scaffold0034 (444-578)||(67899-68033)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (138-344)||(4331-4537)
scaffold0023 (524-581)||(55545-55602)
scaffold0023 (397-560)||(59236-59399)
scaffold0023 (444-529)||(29071-29156)
scaffold0023 (399-575)||(4100-4276)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (37-566)||(10891-11420)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (253-578)||(34-359)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (37-578)||(466-1006)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (37-578)||(25508-26049)
scaffold0113 (36-167)||(16797-16928)
[»] scaffold0106 (4 HSPs)
scaffold0106 (259-542)||(17785-18068)
scaffold0106 (53-578)||(14177-14702)
scaffold0106 (433-560)||(31928-32055)
scaffold0106 (37-364)||(31532-31859)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (37-560)||(42905-43428)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (37-364)||(51720-52047)
scaffold0049 (447-560)||(51524-51637)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (37-560)||(248735-249258)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (433-575)||(855-997)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (36-578)||(9464-10006)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (37-575)||(4154-4691)
[»] scaffold0114 (5 HSPs)
scaffold0114 (37-299)||(20244-20506)
scaffold0114 (37-323)||(43627-43913)
scaffold0114 (37-323)||(44639-44925)
scaffold0114 (434-566)||(44024-44156)
scaffold0114 (434-566)||(45036-45168)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (37-286)||(195-444)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (37-578)||(3997-4538)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (247-560)||(40071-40383)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (115-535)||(25405-25825)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (37-364)||(14108-14435)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (39-578)||(3264-3803)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (128-560)||(5113-5545)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (37-323)||(6934-7220)
[»] scaffold0431 (2 HSPs)
scaffold0431 (40-362)||(7502-7824)
scaffold0431 (426-533)||(7877-7984)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (40-542)||(7522-8024)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (37-578)||(1127-1662)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (113-542)||(49691-50120)
scaffold0081 (434-578)||(19121-19265)
scaffold0081 (493-578)||(34604-34689)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (37-578)||(2873-3414)
scaffold0035 (139-356)||(13060-13277)
[»] scaffold0222 (1 HSPs)
scaffold0222 (139-575)||(3001-3437)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (37-364)||(5335-5662)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (37-560)||(810-1333)
scaffold0139 (37-573)||(27641-28177)
scaffold0139 (433-573)||(34290-34430)
[»] scaffold0053 (3 HSPs)
scaffold0053 (37-364)||(57674-58000)
scaffold0053 (253-364)||(48890-49001)
scaffold0053 (427-560)||(48695-48828)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (53-578)||(8-532)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (117-362)||(639-884)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (37-566)||(51835-52363)
scaffold0067 (37-566)||(60869-61397)
scaffold0067 (37-566)||(67257-67785)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (91-560)||(12446-12911)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (427-574)||(4945-5092)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (37-560)||(9920-10438)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (36-167)||(28088-28219)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (433-560)||(6898-7025)
scaffold0149 (433-560)||(11329-11456)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (36-286)||(1104-1354)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (247-560)||(2126-2439)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (253-362)||(46566-46675)
scaffold0007 (61-359)||(86366-86664)
[»] scaffold1001 (1 HSPs)
scaffold1001 (256-359)||(12-115)
[»] scaffold0483 (2 HSPs)
scaffold0483 (37-364)||(9940-10267)
scaffold0483 (503-575)||(12082-12154)
[»] scaffold0404 (2 HSPs)
scaffold0404 (427-578)||(5262-5413)
scaffold0404 (37-364)||(4872-5199)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (55-557)||(1048-1550)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (256-578)||(6390-6712)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (256-310)||(262-316)
[»] scaffold0069 (2 HSPs)
scaffold0069 (36-166)||(38942-39072)
scaffold0069 (253-323)||(38785-38855)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (138-531)||(15878-16271)
scaffold0333 (36-223)||(15613-15800)
[»] scaffold0326 (2 HSPs)
scaffold0326 (444-560)||(18198-18314)
scaffold0326 (36-364)||(18394-18722)
[»] scaffold0090 (4 HSPs)
scaffold0090 (37-353)||(18971-19287)
scaffold0090 (37-353)||(23133-23449)
scaffold0090 (444-577)||(19378-19511)
scaffold0090 (444-577)||(23540-23673)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (256-335)||(8214-8293)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (426-533)||(25485-25592)
[»] scaffold0064 (4 HSPs)
scaffold0064 (37-160)||(28830-28953)
scaffold0064 (37-160)||(40821-40944)
scaffold0064 (280-364)||(28625-28709)
scaffold0064 (280-364)||(40616-40700)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (37-575)||(6884-7422)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (253-359)||(1603-1709)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (433-575)||(2521-2663)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (433-578)||(6702-6847)
scaffold0348 (37-344)||(6305-6613)
[»] scaffold0249 (2 HSPs)
scaffold0249 (37-310)||(4913-5186)
scaffold0249 (444-560)||(1633-1749)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (406-577)||(32963-33134)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (433-560)||(1046-1173)
scaffold0104 (247-364)||(860-977)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (460-575)||(81478-81593)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (13-59)||(5189-5235)
[»] scaffold0213 (2 HSPs)
scaffold0213 (404-566)||(5990-6152)
scaffold0213 (253-323)||(6235-6305)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (531-581)||(7881-7931)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (55-361)||(10600-10905)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (274-364)||(136269-136359)
[»] scaffold0924 (1 HSPs)
scaffold0924 (36-212)||(4012-4188)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (433-575)||(41437-41577)
[»] scaffold0375 (2 HSPs)
scaffold0375 (138-200)||(3740-3802)
scaffold0375 (397-522)||(3513-3638)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (385-578)||(19645-19838)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (88-364)||(1091-1367)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (472-575)||(4428-4531)
scaffold0270 (472-575)||(11558-11661)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (487-582)||(9706-9801)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (427-554)||(4942-5069)
scaffold0165 (37-123)||(1299-1385)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (38-167)||(36-165)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 506; Significance: 0; HSPs: 83)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 506; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 16382724 - 16382155
Alignment:
Q  12 gacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcacca 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16382724 gacatcaaacggcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcacca 16382625  T
Q  112 acttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtag 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  16382624 acttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtag 16382525  T
Q  212 tttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16382524 tttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgc 16382425  T
Q  312 cattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaac 411  Q
    ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16382424 cataccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaac 16382325  T
Q  412 aaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaac 511  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16382324 aaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaac 16382225  T
Q  512 tctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16382224 tctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaatct 16382155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 479; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 18838259 - 18837693
Alignment:
Q  12 gacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcacca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18838259 gacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacaccggtcacaggattcacccacaaaaacacatgatcacca 18838160  T
Q  112 acttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtag 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18838159 acttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctatgtactctgagacgccttcatcttttcttgaatcatcttaaccttttccgtag 18838060  T
Q  212 tttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgt 311  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18838059 tctcttgcacaacttccggtgctaacatagcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgc 18837960  T
Q  312 cattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaac 411  Q
    |||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18837959 cattcggatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaatggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaac 18837860  T
Q  412 aaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaac 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18837859 aaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaaactcaacttagttcccaaagcagcttgcaaac 18837760  T
Q  512 tctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18837759 tctcccaaaaattagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaa 18837693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 581
Target Start/End: Original strand, 23996178 - 23996747
Alignment:
Q  12 gacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcacca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  23996178 gacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcataggattcacccttaaaaacacgtgatcacca 23996277  T
Q  112 acttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtag 211  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  23996278 acttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtag 23996377  T
Q  212 tttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||     
T  23996378 tttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaggcctcaaacagtgc 23996477  T
Q  312 cattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaac 411  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23996478 cattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtctcaaccaacaccttgctctaacacacaagctctcaac 23996577  T
Q  412 aaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaac 511  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23996578 aaatcctccaaactctgaatagtcctctccatctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaac 23996677  T
Q  512 tctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
      |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23996678 cttcccaaaacttagaagtaaacctcagatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatgcaatct 23996747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 578
Target Start/End: Original strand, 16097982 - 16098546
Alignment:
Q  13 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16097982 acatcaaacg-tccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggtttcactctcaaaaacacatgatcaccaa 16098080  T
Q  113 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 212  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| || ||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  16098081 cctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctaagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttatgtagt 16098180  T
Q  213 ttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtc 312  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |    
T  16098181 ctcttgcacaacttccggtcctaacaaggcactttctcctgactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcttcaaacggagcc 16098280  T
Q  313 attccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 412  Q
    || || ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  16098281 ataccgatactagaatgaaaattgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcatcccaactaacaccttgctccaacatacaagctctcaaca 16098380  T
Q  413 aatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaact 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16098381 aatcttccaaactctgaatagtcctctttttctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaact 16098480  T
Q  513 ctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16098481 ctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggtataccatgcaa 16098546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 25743437 - 25742870
Alignment:
Q  13 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 112  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  25743437 acatcaaatggtgcaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattctccctcaaaaacacttgatcaccaa 25743338  T
Q  113 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25743337 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctctcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 25743238  T
Q  213 ttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtc 312  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |    
T  25743237 ctcttgcacaacttccggtccta-caaagcactttcacctgactcaaaccaacacaacggtgtcctacagctccgaccatacaaagcctcaaacggagcc 25743139  T
Q  313 attccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 412  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25743138 attccaatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaattaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 25743039  T
Q  413 aatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaact 512  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  25743038 aatcctccaaactctagatagtcctctccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagtagatctcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgtaaact 25742939  T
Q  513 ctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25742938 ctcccaaaacgtagaagtaaacctcagatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatgcaatct 25742870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 15078714 - 15078148
Alignment:
Q  13 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  15078714 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcactggattcagtctcaaaaatacatgatcaccaa 15078615  T
Q  113 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 212  Q
    | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  15078614 cctgaaactcgatatcctttctcttcttatcatgataactcttatgtctactctgagacgctttcatcttttctcggatcatcttaaccttttccgtagt 15078515  T
Q  213 ttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtc 312  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  15078514 ctcttgcacaacttccggtcctaacaaggcactttctcctgactcaaaccaacacaacggtgtcttacacctccgatcatacaaagcctcaaacggtgcc 15078415  T
Q  313 attccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 412  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15078414 attccaatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtagacatttgtcccaactgacaccttgctccaaaa-acaagctctcaaca 15078316  T
Q  413 aatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaact 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15078315 aatcttccaaactctgaatagtcctcccggtctgcccatcggtatg-ggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaact 15078217  T
Q  513 ctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15078216 ctcccaaagcttaggagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatct 15078148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 581
Target Start/End: Original strand, 18571582 - 18572150
Alignment:
Q  13 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18571582 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtctacttcctatacttcaaagcacgaccaacatcggtcacatgattcaccctcaaaaatacatgatcaccaa 18571681  T
Q  113 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| |||||||||||    
T  18571682 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttccttttctcctgaatcatcttaacattttccgtagt 18571781  T
Q  213 ttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtc 312  Q
    |||||||| |||||| |||| ||| |||||| | || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  18571782 ttcttgcataacttctggtcttaataaagcactttcacctgactcaaaccaacacaacagtgtcctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggagtc 18571881  T
Q  313 attccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 412  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18571882 attccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaattaactgtaaatattcgtcccaactaacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 18571981  T
Q  413 aatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaact 512  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  18571982 aatcctccaaactttggatagtcctctccgttttcccatcggtctgaggatggtaagcagaaatcaatctcaacttggttcccaaagcagcttgcaaact 18572081  T
Q  513 ctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  18572082 ctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcctgatctgacacaatactataaggaataccatgcaatct 18572150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 1649134 - 1648718
Alignment:
Q  13 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1649134 acatcaaacggcccaacaaaacgaggagtcaacttcccacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 1649035  T
Q  113 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1649034 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaaccttttccgtagt 1648935  T
Q  213 ttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1648934 ttcttgcacaacttccggtcctaataaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgcc 1648835  T
Q  313 attccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  1648834 attccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacgataaacattcgtcccaactgacaacttgctccaaaactcaagctctcaaca 1648735  T
Q  413 aatcttccaaactctga 429  Q
    |||| ||||||||||||    
T  1648734 aatcctccaaactctga 1648718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 36 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 21413265 - 21412822
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| | ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21413265 aggagtcaacttccgacacttcaaagcacgaccaacaccagttacaggattcactcacaagaacatatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctc 21413166  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 235  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21413165 ctcttatcatgataactcttcggtctactctgagacgctttcatcttttcttggatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaactcccggtccta 21413066  T
Q  236 acaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaact 335  Q
    |||| ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||| ||| |||||||||    
T  21413065 acaatgcgctttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacagtgccataccgatattagaatgaaaact 21412966  T
Q  336 attgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtc 435  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  21412965 gttattgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaaataacaccttgctccaaaacacaagctctgaacaaatcttccaaattctgaatagtc 21412866  T
Q  436 ctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaa 479  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21412865 ctctctgtttgcccatcagtctgaggatggtaagcagaactcaa 21412822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 12 - 351
Target Start/End: Original strand, 16233139 - 16233478
Alignment:
Q  12 gacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcacca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16233139 gacatcaaacggtccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaacgcacgaccaactccggtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcacca 16233238  T
Q  112 acttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16233239 acttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactttgagacgccttcatcttttcttgaataatcttaaccttttccgtag 16233338  T
Q  212 tttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgt 311  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  16233339 tctcttgcacaacttccagtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacaccttcgaccatacaaagcctcaaacggtgc 16233438  T
Q  312 cattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaac 351  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16233439 cattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaac 16233478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 16 - 543
Target Start/End: Original strand, 25655417 - 25655943
Alignment:
Q  16 tcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaactt 115  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| || || |   ||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  25655417 tcaaatggtccaacaaaacggggagttaacttccgacagttcaaagcacgaccaacaccagttatcagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacct 25655516  T
Q  116 gaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttc 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||| |||| | |||| ||    
T  25655517 gaaactcaatgtcctttctcctcttattatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacttttttcttagtctc 25655616  T
Q  216 ttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcatt 315  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| | || | | ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  25655617 ttgcacaacttctgatcctaacaaagcactttcactg-actcaaaccaacacaacgacatcctacacctccgaccatacaaatcctcaaaaggtttcatt 25655715  T
Q  316 ccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaat 415  Q
     | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  25655716 tcgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactccatcaacagtaagcattcgacccaactgacaccttgctccaaaacacaagctcttagcaaat 25655815  T
Q  416 cttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctc 515  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||  ||||| ||  |||||||||| || || |||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  25655816 cctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccattgttctagggatgatacacagaactcaaccttaacttagttcccagagcggcttgcaaactttc 25655915  T
Q  516 ccaaaatttagaagtaaacctcggatcc 543  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  25655916 ccaaaacttagaagtaaaccttggatcc 25655943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 304 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 14625297 - 14625023
Alignment:
Q  304 aacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaag 403  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14625297 aacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaag 14625198  T
Q  404 ctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagc 503  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14625197 ctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcatctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagc 14625098  T
Q  504 ttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14625097 ttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggattccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 14625023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 23 - 420
Target Start/End: Original strand, 17813669 - 17814064
Alignment:
Q  23 gtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactc 122  Q
    |||||||||||||||| || ||||||  ||| |||||||  || ||||| ||||| ||| ||||||| || || | ||||||||||||||| ||||| ||    
T  17813669 gtccaacaaaacgaggtgttaacttctgacatttcaaagtgcgtccaacaccggttacatgattcactcttaagatcacatgatcaccaacctgaaattc 17813768  T
Q  123 aatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcaca 222  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||| |  |||| || |||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||    
T  17813769 aatatccttcctcctcttatcatggtaccttttctgcctactctgagacgc--tcatcttctcttgaatcaacttaacctttttcgtcgtctcttgcaca 17813866  T
Q  223 acttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatac 322  Q
    || |||||||||||||||||| | | ||| |||||| ||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||  | ||||    
T  17813867 acctccggtcctaacaaagcactttatcctgactcataccaacacaacgtcgtcctgcaccttcgaccataaaaagcttcaaactgtgccatctcgatac 17813966  T
Q  323 tagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttcc 420  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17813967 tagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaaccaaaggtaaacattcgacccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaataaatcttcc 17814064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 399 - 578
Target Start/End: Original strand, 21927522 - 21927701
Alignment:
Q  399 acaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaa 498  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||     
T  21927522 acaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatattcctctttgtctgcccattagtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaat 21927621  T
Q  499 gcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21927622 gcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaa 21927701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 455 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 1648722 - 1648596
Alignment:
Q  455 tctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacac 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1648722 tctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacac 1648623  T
Q  555 aatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  1648622 aatactagaaggaataccatgcaatct 1648596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 10469175 - 10468635
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | |||||||||| ||||||||| |    
T  10469175 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttc 10469076  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||  | ||||| ||||||   |||| | | || || || ||||| || || || |  |||||||| ||    
T  10469075 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtcccaa 10468976  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || |||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||| |  ||| | ||     
T  10468975 cacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctg 10468876  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  | |||||||||||||||||    || || ||||    
T  10468875 ttgttataagtgaactcaatcaacggtaggtgactatcccaagcttcaccttgctcgagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattggatcgtcc 10468776  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||| | || ||||||| ||||||  |||| || |||||    
T  10468775 tctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgaacccaaagcatcctgtaaactcttccaaaacctagaggtgaacct 10468676  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgca 577  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |||| ||| ||||    
T  10468675 cggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccgtgca 10468635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 37 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 14381793 - 14381270
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||   |||||||||    
T  14381793 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctcc 14381694  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| || |||||||||||||||| |||||| ||| | ||||| ||||||   |||||||| || || || ||||| |  || || |  |||| ||| ||    
T  14381693 gcttgtcgtgataactcttctgtccactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccgatcccaa 14381594  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    ||   || ||||||  ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  |||||    
T  14381593 cacgacactctctcatgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaacta 14381494  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||       ||||||| |  |||||||||  |  |||||  ||||||||||||| |||||    |  || ||||    
T  14381493 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactgtcccaagttccaccttgcttaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgatttgatcgtcc 14381394  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  14381393 tctccgactgaccatctgtctgaggatgataagctgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacct 14381294  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    |||||| | || ||||||||||||    
T  14381293 cggatctctattcgacacaatact 14381270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 39 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 5839543 - 5839040
Alignment:
Q  39 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctc 138  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||||   || || ||  |||||||||||| ||| || || | |    
T  5839543 agtcaacttcttagacttcaacgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcaaaaacgtgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgc 5839444  T
Q  139 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaaca 238  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||| || |||| ||||||||| || || || ||||| |  || ||||  || |||||||| |    
T  5839443 ttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttctcttaaatcatcttgactttctctgtagtctgctgaacaatctctggtcctaaga 5839344  T
Q  239 aagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactatt 338  Q
       |  | ||||| || ||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  5839343 ccaccctatctcctgattcaaaccaacacaacgaagttctacatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatgctagaatgataactatt 5839244  T
Q  339 gttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctc 438  Q
     || || || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | || ||||| | ||||||| ||||||||||||| || ||   |||||| ||||||    
T  5839243 attatacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccctgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctaacgactgaatcgtcctc 5839144  T
Q  439 tctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcg 538  Q
    || | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||  ||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||| || |    
T  5839143 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 5839044  T
Q  539 gatc 542  Q
    ||||    
T  5839043 gatc 5839040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 24313491 - 24312953
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||| ||||||| ||| || ||   ||    
T  24313491 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctatgct 24313392  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  24313391 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 24313292  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | ||||| || ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  24313291 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 24313192  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |     ||||||| |  | ||||| || | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  24313191 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 24313092  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  24313091 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 24312992  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| |||||||| || ||||| | |||||||||    
T  24312991 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 24312953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 53 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 25610171 - 25609682
Alignment:
Q  53 acttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 152  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||  | || ||||||||||  || || ||  |||||||||||| ||| || || | ||||||||| |||||    
T  25610171 acttcaaagcacgtccaacaccggtcacaggtgtgactctcaaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaact 25610072  T
Q  153 cttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccg 252  Q
    ||| |||| |||||| ||| | ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||  || ||||  || |||||||| |   |  | || ||     
T  25610071 cttttgtcgactctgtgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 25609972  T
Q  253 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaact 352  Q
    ||||||||||||||||| || || || || ||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||| || ||||    
T  25609971 gactcaaaccaacacaatggagttctgcatctccgaccatacaaagcatcataaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtacgtgaact 25609872  T
Q  353 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatc 452  Q
      ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| |||||||||||||||| ||   |||||| ||||| || | |||||||||    
T  25609871 ttatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcctttccgactgaccatc 25609772  T
Q  453 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatc 542  Q
     ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || |||||    
T  25609771 tgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatc 25609682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 34645912 - 34645371
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| || | || || |||||||| || || |||| |||| | |||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||  ||||| || |    
T  34645912 ggagtcaacttcttagattttaatgcacgacccacacctgtcataggagtgaccctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctac 34645813  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| |||||||| |||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||   |||| |||||||||||| ||||||| ||| || |  || ||||| ||    
T  34645812 gcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatatgttctcttatcaacttaaccttttctgtagtttgttgaactatgtctggtcccaa 34645713  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    ||   || | ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||| | |||  |||||    
T  34645712 catcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtcctgcatctgcgaccatacaatgcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaacta 34645613  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||       |||||     |||||||||| |  |||||  | || | |||||| || |||   || || ||||    
T  34645612 ttgttataagtaaattctatcaacggtaagtggctatcccacgctccaccttgctcaagtacacatacccttagcaaatcctctaaagattggattgtcc 34645513  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| | |||||| ||| |||| ||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  34645512 tctccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgatcccaacgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaacct 34645413  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
     ||||||| ||| || |||||||| || || | |||||||||    
T  34645412 tggatccctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaa 34645371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 542
Target Start/End: Original strand, 19864642 - 19865147
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||  ||||| || ||||||||| | || || |||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  19864642 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctgc 19864741  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| |  ||  |||  || ||||||||    
T  19864742 acttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtctgctgaccaatctctggtcctaa 19864841  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | ||||| |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||| |  |||| |||||    
T  19864842 gaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagccgcaaaaggtgccattccaataccaaaatgataacta 19864941  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggta-aacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtc 435  Q
    || || || || |||||||||||||| | |  | | | ||||  |  | |||||||| |  |||||| ||||||||||||| || |    |||||| |||    
T  19864942 ttattatacgtgaactcaatcaacggaagatgactag-cccaggttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtc 19865040  T
Q  436 ctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacc 535  Q
    || || | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||  ||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||| |    
T  19865041 ctatccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatc 19865140  T
Q  536 tcggatc 542  Q
    | |||||    
T  19865141 ttggatc 19865147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 29592243 - 29591705
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||| ||||||| ||| ||||| | ||    
T  29592243 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgct 29592144  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  29592143 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 29592044  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | ||||| || ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  29592043 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 29591944  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || || || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  29591943 ttatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcgagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 29591844  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || ||||||| |||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  29591843 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcactctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 29591744  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| |||||||| || ||||| | |||||||||    
T  29591743 atctctatctgacacaatgctcgaagggacaccatgcaa 29591705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 362
Target Start/End: Original strand, 12497981 - 12498306
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  | ||||| ||||| ||||| ||||||||| || | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| || || |    
T  12497981 ggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgc 12498080  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||  || ||||||||    
T  12498081 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctcgggtcctaa 12498180  T
Q  237 caaagcattctctc--cggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaac 334  Q
     |   |||||| ||  | ||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||    
T  12498181 gac--cattctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataac 12498278  T
Q  335 tattgttgtaagtaaactcaatcaacgg 362  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  12498279 tattattgtatgtgaactcgatcaacgg 12498306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 12510920 - 12510595
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  | ||||| ||||| ||||| ||||||||| || | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| || || |    
T  12510920 ggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgc 12510821  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||  || ||||||||    
T  12510820 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctcgggtcctaa 12510721  T
Q  237 caaagcattctctc--cggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaac 334  Q
     |   |||||| ||  | ||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||    
T  12510720 gac--cattctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataac 12510623  T
Q  335 tattgttgtaagtaaactcaatcaacgg 362  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  12510622 tattattgtatgtgaactcgatcaacgg 12510595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 37 - 560
Target Start/End: Original strand, 21471556 - 21472079
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| || | ||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||| |||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| |    
T  21471556 ggagtcaacttcttagatttcaacgcacgtcctacccccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttctac 21471655  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||| ||||||   || | ||| ||||| |||||||| |  || || |  |||||||| ||    
T  21471656 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttattaacttgaccttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaa 21471755  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    ||  ||| | ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  ||||     
T  21471756 cactgcactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtcctgcacctccgtccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 21471855  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||      ||||||    |||||||||| |  |||||  |||| |  || || || ||   ||||||||| |    
T  21471856 ttgttgtacgtgaactctatcaacggtaaatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactcttagaaagtcctctaatgactgaatagttc 21471955  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    ||||   ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||  | ||||| |||||    
T  21471956 tctcccactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaatctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacct 21472055  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    |||||| | |||||||||||||||    
T  21472056 cggatctctatccgacacaatact 21472079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 37 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 16963693 - 16963191
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  16963693 ggagtcaacttcttttacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacttggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 16963594  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||| || || || ||||| |  || ||||  || ||||||||    
T  16963593 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatctttactttctctgtagtctgctgaacaatctctggtcctaa 16963494  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | ||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||| | |||    
T  16963493 gaccactctttctcctgactcaaatcaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgatagcta 16963394  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||  | || ||||| || ||||| | |     ||||||| |  |||||||||| |  ||||||   || |||||||  || ||   |||||| ||||    
T  16963393 ttgttagacgtgaactctattaacgggagatgactgtcccaagtttcaccttgctctagcacacaaatccttaacaaattctctaacgactgaatcgtcc 16963294  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| || || || |||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||    
T  16963293 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttggtacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 16963194  T
Q  537 cgg 539  Q
    |||    
T  16963193 cgg 16963191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 16927966 - 16927425
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| |  |||||| || | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  16927966 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacactagtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 16927867  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||||||||||||||||| | || |||||| | | | ||||| ||||||||||||||||| || ||  | ||||| |  || ||||  || ||||||||    
T  16927866 gcttatcatgataactcttttttcgactctgcggcgctttcatcttttcttgaatcatctttactttccctgtagtctgctgaacaatctctggtcctaa 16927767  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | ||||| |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| | |||    
T  16927766 gaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagcta 16927667  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    ||||| || || ||||| || ||||| | |     ||||||| |  || ||||||| |  ||||||   ||||||||||| || ||   |||||| ||||    
T  16927666 ttgttatacgtgaactctattaacgggagatgactgtcccaagttccagcttgctctagcacacaaatcctcaacaaatcctctaacgactgaatcgtcc 16927567  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| || || || |||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||    
T  16927566 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttggtacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 16927467  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| || | ||  || ||||| || ||||| |||||||||||    
T  16927466 cgggtctctatttgatacaatgctcgaaggaataccatgcaa 16927425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 40 - 577
Target Start/End: Original strand, 27187394 - 27187931
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | | ||| |||| ||| ||||| | ||    
T  27187394 gtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttcttcgct 27187493  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||| | ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  27187494 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 27187593  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||     
T  27187594 cactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcatctccgaccatacagagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgatagctatta 27187693  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  27187694 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 27187793  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  27187794 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 27187893  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgca 577  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||| | ||||||||    
T  27187894 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgca 27187931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 40 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 27261846 - 27261309
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | | ||| |||| ||| ||||| | ||    
T  27261846 gtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttcttcgct 27261747  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||| | ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  27261746 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 27261647  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||     
T  27261646 cactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcatctccgaccatacagagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgatagctatta 27261547  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  27261546 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 27261447  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  27261446 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 27261347  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgca 577  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||| | ||||||||    
T  27261346 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgca 27261309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 27331759 - 27331218
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||| || ||||| ||  ||||||||||||  || ||||| |    
T  27331759 ggagtcaacttcctttacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatccccttcttgaaactcaaggtcttttctac 27331660  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||||||||| |||||||| |||| |||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||| ||| |||   || ||||||||    
T  27331659 gcttatcatggtaactcttttgtcaactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttaactttctcagtagtttgttgaacattctcgggtcctaa 27331560  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | || || |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  27331559 aaccaccctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 27331460  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || |||||  | ||| | ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| | |||||||| || || |    |||||| ||||    
T  27331459 ttattgtacatgaacactatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagcacacaaaccctcaacaagtcctctagcgactgaatcgtcc 27331360  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||||| | ||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||  | ||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||    
T  27331359 tctctgacagaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaactcaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 27331260  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
     ||||| | ||| || |||||||| ||| | | |||||||||    
T  27331259 tggatctctatctgatacaatactcgaaagaacaccatgcaa 27331218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 27392499 - 27391958
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||| || ||||| ||  ||||||||||||  || ||||| |    
T  27392499 ggagtcaacttcctttacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatccccttcttgaaactcaaggtcttttctac 27392400  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||||||||| |||||||| |||| |||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||| ||| |||   || ||||||||    
T  27392399 gcttatcatggtaactcttttgtcaactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttaactttctcagtagtttgttgaacattctcgggtcctaa 27392300  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | || || |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  27392299 aaccaccctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 27392200  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || |||||  | ||| | ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| | |||||||| || || |    |||||| ||||    
T  27392199 ttattgtacatgaacactatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagcacacaaaccctcaacaagtcctctagcgactgaatcgtcc 27392100  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||||| | ||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||  | ||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||    
T  27392099 tctctgacagaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaactcaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 27392000  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
     ||||| | ||| || |||||||| ||| | | |||||||||    
T  27391999 tggatctctatctgatacaatactcgaaagaacaccatgcaa 27391958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 1543407 - 1542869
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  1543407 gtcaacttctttgacttcaaagcacgccctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctgcgct 1543308  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  1543307 tatcatggtaactcttttgtcgactctgggacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 1543208  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | || || ||||||||||| |||||||| ||  | || ||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||| |||| | |||||     
T  1543207 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttatgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 1543108  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    |||||||| ||||| |||||||| | |      ||||||    | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  1543107 ttgtaagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagctcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagtgactgaattgtcctct 1543008  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  1543007 ccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 1542908  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| ||||| || || ||||| | |||||||||    
T  1542907 atctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaa 1542869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 28263520 - 28262982
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | | ||| |||| ||| ||||| | ||    
T  28263520 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgct 28263421  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||| | ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  28263420 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 28263321  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | ||||| |||||||||||||||||||| || || ||  |||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  28263320 cactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatatccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataactatta 28263221  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |     ||||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||| ||||| || |    |||||| |||||||    
T  28263220 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaataaatcctctagtgactgaattgtcctct 28263121  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  28263120 ccgactgaccatccgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 28263021  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  28263020 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 28262982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 28342269 - 28341731
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | | ||| |||| ||| ||||| | ||    
T  28342269 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgct 28342170  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||| | ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  28342169 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 28342070  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | ||||| |||||||||||||||||||| || || ||  |||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  28342069 cactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatatccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataactatta 28341970  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |     ||||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||| ||||| || |    |||||| |||||||    
T  28341969 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaataaatcctctagtgactgaattgtcctct 28341870  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  28341869 ccgactgaccatccgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 28341770  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  28341769 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 28341731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 353
Target Start/End: Original strand, 23078424 - 23078740
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||| || || ||||| || ||||||||| | || |||||||| || ||||| ||  ||||||||||||  || || || |    
T  23078424 ggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgcccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatctccctcttgaaactcaaggtctttcctac 23078523  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||||||||||||||||| |||| | |||| ||  | ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||| ||| ||||||||    
T  23078524 gcttatcatgataactcttttgtcgagtctgcgatgctttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcctaa 23078623  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   || |||| || |||||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||     
T  23078624 aaccacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttatgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactg 23078723  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactc 353  Q
    || ||||| || |||||    
T  23078724 ttattgtacgtgaactc 23078740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 16627040 - 16626502
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||| ||||||| ||| ||||| | ||    
T  16627040 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgct 16626941  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||| ||| || ||  ||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  16626940 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcaatagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 16626841  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | ||||| || ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||  |||||||     
T  16626840 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactatta 16626741  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  | |||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  16626740 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattttcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 16626641  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||  || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  16626640 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcatctttgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 16626541  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| |||||||| || ||||| | |||||||||    
T  16626540 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 16626502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 140 - 578
Target Start/End: Original strand, 22433927 - 22434365
Alignment:
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  22433927 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagac 22434026  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | ||||| |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||| ||     
T  22434027 cactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactgtta 22434126  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    |||||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | | |||||| |  |||||| | |||||||||||||| ||   || ||| |||||||    
T  22434127 ttgtaagtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctctttgctcaagtacacaaaccctcaacaaatcttctaacgacttaatcgtcctct 22434226  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | || | |||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||  ||||||||  |||||||||||| |||||||  ||||||||| || ||    
T  22434227 ccgactaatcatctgtctgcggatgatacgctgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatccagaagtaaatcttgg 22434326  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  22434327 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 22434365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 53 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 2875113 - 2874588
Alignment:
Q  53 acttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 152  Q
    ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||| | || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  2875113 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaactcgtggtctccttcttgaaactcaaaatcttttctacgcttatcatgataact 2875014  T
Q  153 cttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccg 252  Q
    ||| |||| | |||| ||| ||||||| || ||||| ||||||  ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |   |  | || ||     
T  2875013 cttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatccgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcaccc 2874914  T
Q  253 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaact 352  Q
    ||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||| | |||| ||||||| ||||| || ||||    
T  2874913 gactcaaaccagcacaacggggttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaact 2874814  T
Q  353 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatc 452  Q
    | |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||| | |||||||||    
T  2874813 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 2874714  T
Q  453 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgac 552  Q
     ||||| ||||| || || |||||||| ||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||||| | ||| |||    
T  2874713 tgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgac 2874614  T
Q  553 acaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||||| || ||||| | |||||||||    
T  2874613 acaatgctcgaaggaacaccatgcaa 2874588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 91 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 11280777 - 11280290
Alignment:
Q  91 ctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaa 190  Q
    ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||  ||||| || | ||| |||||||| |||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||   |    
T  11280777 ctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatatgttctctta 11280678  T
Q  191 tcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgacc 290  Q
    | | |||||||||||| ||||||| ||| || |  || ||||| ||||   || | ||||| ||||||||||||||||| || || || || || ||| |    
T  11280677 ttaacttaaccttttctgtagtttgttgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcatcttcgatc 11280578  T
Q  291 atacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgc 390  Q
    |||||| || |||||||||| ||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||| ||  |||||||||        ||||||    ||||||||    
T  11280577 atacaatgcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtaagtaaattctgtcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgc 11280478  T
Q  391 tccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttag 490  Q
    || |  |||||  | ||||| | |||||| ||    || || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |    
T  11280477 tcaagtacacacaccctcaaaagatcttctaaggattgcattgtcctctctgactggccatcggtctgaggatggtaagccgaactcagcctcaatttcg 11280378  T
Q  491 ttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
      ||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| || ||||||||||| | ||| || |||||||| || |  |||||||||||    
T  11280377 agcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagatgtgaacctcggatctctatctgatacaatactcgatgtaataccatgcaa 11280290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 18408269 - 18407727
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || |||||| || | || |||||||| || || ||  |  |||||||||||| ||| || || |    
T  18408269 ggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacacgagttactctcaaaaatacgtggtcttcttcttgaaactcaagatctttcctac 18408170  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||||||||| ||||| || |||| |||||  ||| | ||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||| ||| ||||  || ||||||||    
T  18408169 gcttatcatggtaactattttgtcgactctacgacgctttcatcttctcttgaattatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctctggtcctaa 18408070  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | || || |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  18408069 taccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 18407970  T
Q  337 ttgtt-gtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtc 435  Q
     | || ||| || ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| |||||||||||||||| ||   |||||| |||    
T  18407969 gtatttgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtc 18407870  T
Q  436 ctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacc 535  Q
    ||||| | |||||| || ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||  || |||||  |||||||||| | ||||||| |||| |||||||    
T  18407869 ctctccgactgaccctctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagacgtaaacc 18407770  T
Q  536 tcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    | ||||| | ||| |||||||| || ||||| | |||||||||    
T  18407769 ttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 18407727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 91 - 560
Target Start/End: Original strand, 25768200 - 25768669
Alignment:
Q  91 ctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaa 190  Q
    |||| |||||||||||| ||  |||||||||||| |||||| || | ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||| ||||||   |    
T  25768200 ctcagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctta 25768299  T
Q  191 tcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgacc 290  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||||  || || |  |||||||| || |   || | ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  25768300 tcaacttgaccttctccgtagtttgatgaactaaatccggtccaaagaccacactttctcccgactcaaaccaacacaatggagtcctgcacctccgacc 25768399  T
Q  291 atacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgc 390  Q
    | ||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  |||  |||||||| || ||||| |||||||||| |      ||||||    ||||||||    
T  25768400 acacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaacagttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgc 25768499  T
Q  391 tccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttag 490  Q
    || |  |||||  |||| | |||||| || ||   |||||| ||  |||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |    
T  25768500 tcaagcacacacactcttagcaaatcctcgaatgactgaatcgttttctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaactttg 25768599  T
Q  491 ttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
      ||||| ||| |||| ||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  25768600 aacccaaggcatcttggaaactcttccaaaatcttgaattaaacctcggatctctatcggacacaatact 25768669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 28283139 - 28282610
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||| || || || ||||  ||| |||| || | ||| |||||||||||  ||||||||||||   |||||||||    
T  28283139 ggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 28283040  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||| || |||   |||||||| || ||||| ||||| || || || |  |||||||| |     
T  28283039 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtcccag 28282940  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||| |||||| ||||| | |||| ||||     
T  28282939 cacaacactttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataactg 28282840  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||        ||||||    |||| || || |  |||||  |||||||||| ||||||||    || || || |    
T  28282839 ttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgttc 28282740  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||||| || |  ||||||||  | || ||||||| ||| ||  ||||||| |||||    
T  28282739 tctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacct 28282640  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaagg 566  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  28282639 cggatccctatccgacacaatactcgaagg 28282610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 560
Target Start/End: Original strand, 24364366 - 24364890
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    |||||||||||| ||  ||||||  ||||||||||| || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | |||||||||| ||||||||||    
T  24364366 aggagtcaactttctcgacttcagcgcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctc 24364465  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 235  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||  | ||||| ||||||   |||| | | || || || ||||| || || || |  |||||||| |    
T  24364466 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtccca 24364565  T
Q  236 acaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaact 335  Q
    ||| | || |||| |  ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| || || |||| || ||| |||||||| |  ||| | ||    
T  24364566 acacaacactctcactcgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacgatgccataccaatactcgagtgatagct 24364665  T
Q  336 attgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtc 435  Q
     ||||| ||||||||||||||||| || ||       ||||||    ||||||| || |  |||||  |||||||||||||||||||    ||||| |||    
T  24364666 gttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaatcttccaacgattgaatcgtc 24364765  T
Q  436 ctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacc 535  Q
    ||||| | ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||  | || ||||||| ||| ||  ||||||| ||||    
T  24364766 ctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacc 24364865  T
Q  536 tcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    ||||||| | || ||||||||||||    
T  24364866 tcggatctctattcgacacaatact 24364890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 275 - 372
Target Start/End: Original strand, 1652266 - 1652363
Alignment:
Q  275 tcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcg 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1652266 tcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggagccattccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggcaaacattcg 1652363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 362
Target Start/End: Original strand, 12505310 - 12505635
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  | ||||| ||||| ||||| ||||||||| || | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| || || |    
T  12505310 ggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgc 12505409  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |  || ||||  || ||||||||    
T  12505410 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatattctcttgaatcatcttaacattctcagtagtatgatgaacaatctcgggtcctaa 12505509  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |      | || || ||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  12505510 gaccaatctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataaaaaacctcaaaaggtgacattccaatactagaatgataacta 12505609  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacgg 362  Q
    || ||||| || ||||| ||||||||    
T  12505610 ttattgtatgtgaactcgatcaacgg 12505635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 27560943 - 27560414
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| || || || ||||  ||| | || || | ||| |||||||||||  ||||||||||||   |||||||||    
T  27560943 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 27560844  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||| || ||    |||||||| || ||||| ||||| || || || |  |||||||| ||    
T  27560843 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctccctgatcatcttgactttttctgtagtctcctgaactaaatccggtcccaa 27560744  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || | ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||| |||||| ||||| | |||| ||||     
T  27560743 cacaacactttctcctgattcaaaccaacacaatggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataactg 27560644  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||        ||||||    |||| || || |  |||||  |||||||||| ||||||||    || || || |    
T  27560643 ttgttgtaggtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgttc 27560544  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||||| || |  ||||||||  | || ||||||| ||| ||  ||||||| |||||    
T  27560543 tctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacct 27560444  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaagg 566  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  27560443 cggatccctatccgacacaatactcgaagg 27560414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 466 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 23027613 - 23027501
Alignment:
Q  466 taagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaag 565  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  23027613 taagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagcatcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatccctatctgacacaatactaggag 23027514  T
Q  566 gtataccatgcaa 578  Q
    | |||| ||||||    
T  23027513 gaatactatgcaa 23027501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 22079015 - 22078511
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| || ||||| ||  |||||||| | || |||||||| || || || ||  |||||||||||| ||| || ||     
T  22079015 aggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccaatcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttccta 22078916  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 235  Q
      |||||||||||||||||| |||| |||||  ||| | ||||| |||||| |||||||||||||||| || || |||| ||| ||||  ||  ||||||    
T  22078915 agcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcatcttttctggaatcatcttaaccttctcagtggtttgttgaacaatctctagtccta 22078816  T
Q  236 acaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaact 335  Q
    | |   | || || || |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |  | ||||    
T  22078815 agaccactttttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaa--ataact 22078718  T
Q  336 attgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtc 435  Q
    ||| ||||| || ||||  ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| |   ||||| || |||||||||||||||    |||||| |||    
T  22078717 attattgtacgtgaactttatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcgagttcacaaactttcaacaaatcttccagcgactgaatcgtc 22078618  T
Q  436 ctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacc 535  Q
    ||||| | || |||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||  || |||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| |    
T  22078617 ctctccgactaaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagagcctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 22078518  T
Q  536 tcggatc 542  Q
    | |||||    
T  22078517 ttggatc 22078511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 37 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 25765615 - 25765315
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||||  |  || ||||||| ||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  25765615 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagcgtg-actctcaaaagcacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 25765517  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | ||||| || |||||||||||||| || || || ||||| |  || ||||  || ||||||||    
T  25765516 gcttatcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcattttctcttgaatcatctttactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaa 25765417  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   | || || || ||||||||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  25765416 gaccactttttcacctgactcaaaccaacacaatggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataacta 25765317  T
Q  337 tt 338  Q
    ||    
T  25765316 tt 25765315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 575
Target Start/End: Original strand, 17415441 - 17415979
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||| |||||||||||| ||  ||||||||||||   ||||||| |    
T  17415441 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcataaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctac 17415540  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||  |||| ||||||||||||| |||||  ||| | ||||| |||||    |||||||| || || || ||||| |  || || |  |||||||| ||    
T  17415541 gcttgccatggtaactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaa 17415640  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || | ||| | ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||| | |||  ||||     
T  17415641 cacaacactttcttctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgtcatatcaatactcgaatggtaactg 17415740  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||| ||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  || ||| |||||| |||||    || || ||||    
T  17415741 ttgttgtatgtgaactctatcgacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactatcagcaaatcctccaatgattggatcgtcc 17415840  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||  | ||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || |  ||||| ||| ||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||    
T  17415841 tcttcgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaacttaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacct 17415940  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  17415941 cggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatg 17415979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 578
Target Start/End: Original strand, 25112523 - 25113048
Alignment:
Q  53 acttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 152  Q
    ||||||||||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |    
T  25112523 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataagt 25112622  T
Q  153 cttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccg 252  Q
    ||| |||| |||||| ||| | || || || ||||||||||||| ||| || || |||||||  || || |   | |||||||| |   |  | || ||     
T  25112623 cttttgtcgactctgcgacgctttaattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacgatcgctggtcctaagaccactctttcacct 25112722  T
Q  253 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaact 352  Q
    ||||||||||| || |||||  | || || ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||| || ||||    
T  25112723 gactcaaaccagcataacggaattctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaact 25112822  T
Q  353 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatc 452  Q
    | |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||   ||||||||||| || |    |||||| |||||||| | |||||||||    
T  25112823 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 25112922  T
Q  453 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgac 552  Q
     ||||| ||||| || || ||||| |||||||| || |  ||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||| | ||| ||     
T  25112923 tgtctgtggatgataggccgaacttaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 25113022  T
Q  553 acaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||||| || ||||| | |||||||||    
T  25113023 acaatgctcgaaggaacaccatgcaa 25113048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 40 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 28292695 - 28292158
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | | ||| |||| ||| ||||| | ||    
T  28292695 gtcaacttctttaacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacact 28292596  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||| | ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  28292595 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 28292496  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | || || |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||| |||| | |||||     
T  28292495 cactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 28292396  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || ||||| ||||| ||||| || | |     |||| || |  | |||||||| | |||||||  |||||| ||||| || |    |||||| |||||||    
T  28292395 ttataagtgaactcgatcaatggaagatgactgtccgaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaataaatcctctagtgactgaattgtcctct 28292296  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    |   ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  28292295 ccaactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 28292196  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgca 577  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||| | ||||||||    
T  28292195 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgca 28292158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 578
Target Start/End: Original strand, 19879253 - 19879794
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| || | ||||| ||||| || || || | || |||| | || ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||  ||||| || |    
T  19879253 ggagtcaacttcttagatttcaatgcacggcctacacctgccataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctac 19879352  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| |||||||| |||||||||| |||||| ||| | ||||| | ||||   || | |||||||||||| ||||||| ||| || |  || || || ||    
T  19879353 gcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgaccctttcatctgttctcttattaacttaaccttttctgtagtttgttgaactatgtctggccccaa 19879452  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    ||   || | ||||| || |||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| || |||||||||| ||| |||||||| | |||  |||||    
T  19879453 catcacactttctcccgattcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgtccatacaatgcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaacta 19879552  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  | ||||| | ||| || ||    || || ||||    
T  19879553 ttgttgtaagtaaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaatagatcctctaaggattgtatcgtcc 19879652  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||||| || |  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| || |||||    
T  19879653 tctctgactgtccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagatgtgaacct 19879752  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    |||||| | ||| || |||||||| || || | |||||||||    
T  19879753 cggatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaa 19879794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 274 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 5297294 - 5297003
Alignment:
Q  274 gtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  |||| |||||||| || || || ||||||||||        |    
T  5297294 gtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaattctatcaacggtaggtgactat 5297195  T
Q  374 cccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcaga 473  Q
    |||| ||  |||||||||| |  |||||  ||||||||||||| |||||    || || |||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  5297194 cccagctc-caccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccga 5297096  T
Q  474 actcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaagg 566  Q
    || ||| |||||||| |  ||||||||  | || ||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  5297095 acccaacctcaatttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaagg 5297003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 8766474 - 8766147
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || |  |||| || | | ||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||   |||||||||    
T  8766474 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacccttgtcatagaagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctcc 8766375  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| |||||  ||| ||||||| ||||||   |||||||| || || || ||||| || || || |  ||||||||  |    
T  8766374 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgacgccttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatccggtcccca 8766275  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    ||   || ||||||| ||||||||||| || ||  | ||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  ||||     
T  8766274 cacgacactctctcctgactcaaaccagcataaatgagtcctgcacctccaaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 8766175  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 364  Q
    || ||||| || ||||| ||||||||||    
T  8766174 ttattgtatgtgaactctatcaacggta 8766147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 36 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 22796959 - 22796435
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||| |||||||||||| ||  ||||||||||||   |||| ||     
T  22796959 aggagtcaacttcctagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttccta 22796860  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 235  Q
    | ||| ||||| |||||||| |||  ||| || ||| | ||||| |||||    |||||||||||||| || ||||| |  || || |  |||||||  |    
T  22796859 cgcttgtcatggtaactcttatgtagactttgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttaaccttctctgtagtctgatgaaccaaatccggtcgca 22796760  T
Q  236 acaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaact 335  Q
    |||   || ||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||| |  ||||||| ||| |||||||| | |||  ||||    
T  22796759 acactacactctctcctgactcaaatcaacataaaggagtcctgcacctccgaccgtacaaagctttgaacggtgccataccaatactcgaatggtaact 22796660  T
Q  336 attgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtc 435  Q
     |||||||| || ||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  |||||| |||||| ||  |    ||||| ||     
T  22796659 gttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaatctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctgacgattgaatcgtt 22796560  T
Q  436 ctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacc 535  Q
    ||||| | ||||||||  || || | ||| ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||||| | ||||| ||||    
T  22796559 ctctccgactgaccatatgtttgcgaatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacc 22796460  T
Q  536 tcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    ||||||| | |||||||||||||||    
T  22796459 tcggatctctatccgacacaatact 22796435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 275
Target Start/End: Original strand, 26276888 - 26277124
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||||| | ||| ||  | || || || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||   |    
T  26276888 gtcaacttcttagacttcaaagcacaaccaacactggttacgaggttaactctaaaaaacacaagatctccaacttgaaactcaatattcttcctctgtt 26276987  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacacc-ttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaaca 238  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||  || ||||| || || | |||||||||||||||||| ||| | |  || ||| |||||||||| | ||    
T  26276988 tatcatgataactcttctgcctactcagtgatgcctttcatcttctcctaaatcatcttaaccttttctgtaatctgctgaacagcttccggtccaatca 26277087  T
Q  239 aagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgt 275  Q
     |||| |||||   |||||| ||||||||||||||||    
T  26277088 tagcactctcttttgactcataccaacacaacggtgt 26277124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Original strand, 15459291 - 15459598
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||||| ||| ||||| |||||  | |||||||||| ||| || || |    
T  15459291 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaagatctttcctac 15459390  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||| | ||||| || |||  ||||||| | || || |||||||| || || || |  |||||||| ||    
T  15459391 gcttgtcatggtagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctaatcatcctgactttctccgtagtctcgtgaaccaaatccggtcccaa 15459490  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || | ||||| |||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||||| | |||| ||||     
T  15459491 cacaacactttctcccgactcaaaccaacatagaggagtcctacacctccgaccatataaagcttcaaatggtgccataccaatacttgaatgataactg 15459590  T
Q  337 ttgttgta 344  Q
    || |||||    
T  15459591 ttattgta 15459598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 138 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 18197772 - 18197606
Alignment:
Q  138 cttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaac 237  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| || ||||| | ||  ||||   | ||||||||     
T  18197772 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatcttttcttaaatcatctttaccttctcagtagtctgttaaacaatcgctggtcctaaa 18197673  T
Q  238 aaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaa 304  Q
    |   ||||||| || |||| |||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  18197672 accacattctcacctgacttaaacgaacacaacggagttctgcacctccgaccatacaaagcctcaa 18197606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 433 - 575
Target Start/End: Original strand, 19453771 - 19453913
Alignment:
Q  433 gtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaa 532  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| || |    
T  19453771 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaggtga 19453870  T
Q  533 acctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| || |||| ||||||    
T  19453871 acctcggatccctatccgacataatactcgacggtacaccatg 19453913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 434 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 8762862 - 8762736
Alignment:
Q  434 tcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaa 533  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||| ||||||| |||| ||| ||| ||||||| ||    
T  8762862 tcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccagaatctagaagtgaa 8762763  T
Q  534 cctcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||    
T  8762762 cctcggatctctatccgacacaatact 8762736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 71
Target Start/End: Original strand, 14129391 - 14129449
Alignment:
Q  13 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaac 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  14129391 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaactttcgacacttcaaagcacgaccaac 14129449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 22762778 - 22762240
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  |||||||||| || ||||| || ||||||||| | || |||| ||| || || || ||  |||||||||||| |||  | || | ||    
T  22762778 gtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcacaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctgtcctacgct 22762679  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    ||||||  |||||||  |||| |||||  || || ||||| || |||||||||||||||||||| |  ||| ||| ||| ||||  || |||||||| |     
T  22762678 tatcattgtaactctattgtcgactctccgaaactttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcctaagac 22762579  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | || || |||||||||||||||||||| || || || ||||||||| |||||| |||  | |||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  22762578 tactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagtctcgtaaggtgccattccaatactagaatgataactatta 22762479  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    ||||| || ||||| ||||| || | |      || ||| |  | |||| ||| |  |||||| |||||||||||||||| ||   |||||| |||||||    
T  22762478 ttgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatctcaagttcctccttcctcaagtacacaaactctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcctct 22762379  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | || |||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| |||   || |||||  || ||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  22762378 ccgactaaccatcagtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttataacctaaagcctctggcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 22762279  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| |||||||| || ||||| | |||||||||    
T  22762278 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 22762240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 364
Target Start/End: Original strand, 18794645 - 18794972
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| || | || || ||||| || || || |||| |||| | || ||||| ||||||||||| ||  ||||||||| ||  || || || |    
T  18794645 ggagtcaacttcttagattttaaggcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactgaaggtctttcctac 18794744  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
      || |||||||| |||||||||| |||||| ||| | ||||| | ||||   |||| |||||||||||| ||||| | |||||| |  || || || ||    
T  18794745 gattgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaacttaaccttttctgtagtctgttgcactatgtctggccccaa 18794844  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    ||   || | |||||  |||||||||||||||| || ||  | ||||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||| |||||||| | |||  |||||    
T  18794845 catcacactttctcctaactcaaaccaacacaaaggagttatgcaccttcgaccgtacaaggcttcaaatggtgccataccaatactcgaatggtaacta 18794944  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 364  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  18794945 ttgttgtaggtaaactctatcaacggta 18794972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 167
Target Start/End: Original strand, 25750764 - 25750894
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||| |  || || |||||| || | || |||| |||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| |    
T  25750764 ggagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcttacacccgtcacaagagtgactctcagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttctac 25750863  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 167  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  25750864 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 25750894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 264 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 27560087 - 27559785
Alignment:
Q  264 acacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggt 363  Q
    |||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||| |||||| ||||| | |||| |||| |||||||| || ||||| |||||||||    
T  27560087 acacaatggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaacggt 27559988  T
Q  364 aaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggat 463  Q
    |        ||||||    |||| || || |  |||||  |||||||||| ||||||||    || || || ||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  27559987 aggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggat 27559888  T
Q  464 ggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactaga 563  Q
    | ||||| |||||||  ||||| || |  ||||||||  | || ||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  27559887 gataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcga 27559788  T
Q  564 agg 566  Q
    |||    
T  27559787 agg 27559785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 364
Target Start/End: Original strand, 18800951 - 18801224
Alignment:
Q  91 ctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaa 190  Q
    |||| ||| |||||||| ||  ||||||||||||   |||| || | ||| ||||| |||||||| |||| |||||| ||| | ||||| ||||||  ||    
T  18800951 ctcagaaatacatgatccccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctaa 18801050  T
Q  191 tcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgacc 290  Q
    ||||||| || || |||||||| |  || || |  |||||||| |||| | || | |||||  |||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  18801051 tcatcttgactttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctcctaactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgacc 18801150  T
Q  291 atacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggta 364  Q
    ||||||||| || ||||  | ||| |||||||| | |||  |||| ||||||||| | ||||| || |||||||    
T  18801151 atacaaagcttcgaacgaggccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtaaatgaactctataaacggta 18801224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 396 - 575
Target Start/End: Original strand, 17032697 - 17032876
Alignment:
Q  396 aacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttccc 495  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||||| || | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  |||    
T  17032697 aacacaaattctcaacaaatcttctagcgactgaattgtcctttccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaaccc 17032796  T
Q  496 aaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
    |||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||| | ||||||    
T  17032797 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 17032876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 21564062 - 21563935
Alignment:
Q  433 gtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaa 532  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||| ||||| || |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||| | ||||| |    
T  21564062 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtga 21563963  T
Q  533 acctcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    |||||| ||| | |||| ||||||||||    
T  21563962 acctcgaatctctatcctacacaatact 21563935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 21569921 - 21569794
Alignment:
Q  433 gtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaa 532  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||| ||||| || |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||| | ||||| |    
T  21569921 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtga 21569822  T
Q  533 acctcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    |||||| ||| | |||| ||||||||||    
T  21569821 acctcgaatctctatcctacacaatact 21569794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 160
Target Start/End: Original strand, 25750901 - 25751024
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||| ||||| || | ||||| ||||| || || || ||||||||| | || |||| |||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| |    
T  25750901 ggagtccacttcttagatttcaacgcacgtcctacacccgtcacaggagtgactctcagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttctac 25751000  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtc 160  Q
     ||| ||||| |||||||||||||    
T  25751001 gcttgtcatggtaactcttctgtc 25751024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 91 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 11287870 - 11287692
Alignment:
Q  91 ctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaa 190  Q
    ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||  ||||| || | ||| |||||||| |||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||   |    
T  11287870 ctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatatgttctctta 11287771  T
Q  191 tcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaa 269  Q
    | | |||||||||||| ||||||| ||| || |  || ||||| ||||   || | ||||| |||||||||||||||||    
T  11287770 ttaacttaaccttttctgtagtttgttgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaa 11287692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 245 - 323
Target Start/End: Original strand, 19453583 - 19453661
Alignment:
Q  245 tctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatact 323  Q
    ||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  19453583 tctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatact 19453661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 577
Target Start/End: Original strand, 18795041 - 18795185
Alignment:
Q  433 gtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaa 532  Q
    |||||||| |  |||||||| || |||||||| |||||  ||||||  |||||||| |  ||||||||| ||||||||| || ||| ||| ||||||| |    
T  18795041 gtcctctccgattgaccatccgtatgaggatgataagccaaactcagcctcaatttcgaacccaaagcatcttgcaaacgcttccataatctagaagtga 18795140  T
Q  533 acctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgca 577  Q
    |||||||||| | ||| |||||| |||| || || | ||||||||    
T  18795141 acctcggatctctatctgacacagtactcgacggaacaccatgca 18795185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 487 - 538
Target Start/End: Original strand, 17814095 - 17814146
Alignment:
Q  487 ttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcg 538  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  17814095 ttagttcccaaagcaacttgcaaactctcccaaatcatagaagtaaacctcg 17814146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 364
Target Start/End: Original strand, 1640745 - 1641054
Alignment:
Q  55 ttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactct 154  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||  | || || | |||||||||||| ||  | | ||| ||||  |||||||| | ||| |||||||||||||    
T  1640745 ttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggggtgactcttagaaacacatgatctccttcctaaaattcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactct 1640844  T
Q  155 tctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccgga 254  Q
    |||||| |||||| ||| | ||||| || |||   ||||  || |||||||| ||||| |  || || |  || ||||| ||||   || | || || ||    
T  1640845 tctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctcttatcaatttgaccttttctgtagtctgatgaactatatctggtcccaacattacactttcacccga 1640944  T
Q  255 ctcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactca 354  Q
    || ||||||||| ||||| || || |||||||| |||| |||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  |||| |||||||| || |||||     
T  1640945 cttaaaccaacataacggagttctgcacctccgtccatgcaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactct 1641044  T
Q  355 atcaacggta 364  Q
    ||||| ||||    
T  1641045 atcaatggta 1641054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 533 - 578
Target Start/End: Original strand, 16233479 - 16233524
Alignment:
Q  533 acctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  16233479 acctcggatcccgatcccacacaatactagaaggaataccgtgcaa 16233524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 247 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 21564248 - 21564131
Alignment:
Q  247 tctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaag 346  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||  ||||||||||| |||||||| || |||||   ||| |||||||| | |||  |||||||| |||| |    
T  21564248 tctcctgactcaaaccaacataaaggagtccggcacctccgaccgtacaaagcttcgaacggaaccataccaatactcgaatggtaactattgatgtagg 21564149  T
Q  347 taaactcaatcaacggta 364  Q
    | ||||| ||||||||||    
T  21564148 tgaactctatcaacggta 21564131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 14131503 - 14131375
Alignment:
Q  39 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctc 138  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||||| || || |||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||  | |||||||| |  ||||| || | |    
T  14131503 agtcaacttcttagacttcaatgcacgacctacacctgtcataggagtgaccctcagaaacacatgatctccttcctgaaactccaggtccttcctacgc 14131404  T
Q  139 ttatcatgataactcttctgtctactctg 167  Q
    || |||||||| ||||| |||| ||||||    
T  14131403 ttgtcatgatagctcttttgtcgactctg 14131375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 503 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 18197588 - 18197549
Alignment:
Q  503 cttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatc 542  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  18197588 cttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatc 18197549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 58
Target Start/End: Original strand, 23124121 - 23124163
Alignment:
Q  16 tcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttca 58  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  23124121 tcaaacggtccaacaaaacgtggtgtcaacttcttacacttca 23124163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 188
Target Start/End: Original strand, 11291821 - 11291918
Alignment:
Q  91 ctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttg 188  Q
    ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || |||||    
T  11291821 ctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttg 11291918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 502; Significance: 0; HSPs: 78)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 502; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 8274844 - 8274275
Alignment:
Q  12 gacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcacca 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8274844 gacatcaaacggcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcacca 8274745  T
Q  112 acttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtag 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  8274744 acttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtag 8274645  T
Q  212 tttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8274644 tttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgc 8274545  T
Q  312 cattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaac 411  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8274544 cattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaac 8274445  T
Q  412 aaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaac 511  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8274444 aaatcctccaaactttgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaac 8274345  T
Q  512 tctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8274344 cttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaatct 8274275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 502; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 16743148 - 16742579
Alignment:
Q  12 gacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcacca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16743148 gacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcacca 16743049  T
Q  112 acttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtag 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  16743048 acttgacactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtag 16742949  T
Q  212 tttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgt 311  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16742948 tctcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacaaaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgc 16742849  T
Q  312 cattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaac 411  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16742848 cattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaacacacaagctctcaac 16742749  T
Q  412 aaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaac 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16742748 aaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcctaaagcagcttgcaaac 16742649  T
Q  512 tctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16742648 tctcccaaaacttagaagtaaacctgggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaatct 16742579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 462; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 574
Target Start/End: Original strand, 15576446 - 15577007
Alignment:
Q  13 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 112  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15576446 acatcaaacagcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 15576545  T
Q  113 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 212  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15576546 cctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagt 15576645  T
Q  213 ttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtc 312  Q
     ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15576646 ctctcgcacaacttccggtccaaacaaagcactctctccagactcaaaccaacataacggtgttctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgcc 15576745  T
Q  313 attccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 412  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15576746 attccgatactagcatgcaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacgataaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 15576845  T
Q  413 aatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaact 512  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15576846 aatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaact 15576945  T
Q  513 ctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccat 574  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15576946 ctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccat 15577007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 578
Target Start/End: Original strand, 18748364 - 18748926
Alignment:
Q  16 tcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaactt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  18748364 tcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaactttcgacacttcaaagcacgtccaacaccagttacagggttcactcttaaaaacacatgatcaccaactt 18748463  T
Q  116 gaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttc 215  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  18748464 gaaactcaatgttcttcctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacactttcatcttatcttgaatcatcttaactttttccgtagtctc 18748563  T
Q  216 ttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcatt 315  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | || || || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||     
T  18748564 ttgcacaacctccggtcctaacaaagcactttcacctgattcaaaccaacacaacgacgtcctacacctccgaccatacaaaccctcaaacggtgccata 18748663  T
Q  316 ccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaat 415  Q
    || ||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18748664 ccgatactagaatgaaaattgttgttgtaactaaactcaatcaacggtaaacattcgacccaactgacaccttgctccaaaacacaagctcttaacaaat 18748763  T
Q  416 cttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctc 515  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18748764 cctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactttc 18748863  T
Q  516 ccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  18748864 ccaaaacttagaagtaaacctcggatcctgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaa 18748926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 581
Target Start/End: Original strand, 17192790 - 17193357
Alignment:
Q  13 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 112  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||  |||||   ||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  17192790 acatcaaaaggcccaacaaaacgaggagtcaacttccgacacttcagagaacatccaacattggttacaagattcactctaaaaaacacatgatcaccaa 17192889  T
Q  113 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 212  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17192890 cctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtact 17192989  T
Q  213 ttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtc 312  Q
     ||||||||||||||||||| ||||| | || | |||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17192990 ctcttgcacaacttccggtcgtaacacaacactttctccttattcaaaccaacacaacggcgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgcc 17193089  T
Q  313 attccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 412  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17193090 ataccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagt-aattcaatcaacggtaaacattcaacccaactgacaccatgctccaaaacacaagctctcaaca 17193188  T
Q  413 aatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaact 512  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  17193189 aatcttccaaactctaaatagtcctctctatttgcccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagaagcttgcaaact 17193288  T
Q  513 ctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
     |||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  17193289 ttccctaaacttagaagtaaaccttggatcccgattcgacacaatactagaaggaatatcatgcaatct 17193357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 6153283 - 6152729
Alignment:
Q  13 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  6153283 acatcaaacggtccgacaaaacgaggagtcaactttctgcacttcaaagcacgaccgacaccggtcacatgattcactctcagaaacacatgatcaccaa 6153184  T
Q  113 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 212  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||            |||| | ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  6153183 cttgaaacttaatatcctttctcctcttatcatgataactctt------------agacgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagt 6153096  T
Q  213 ttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtc 312  Q
     ||||||||||||||||  ||||||| | || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  6153095 ctcttgcacaacttccgaccctaacacaacactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaatggagcc 6152996  T
Q  313 attccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 412  Q
    ||  | ||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6152995 atctcgatactagaatgaaaattgttgttgtatgtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactaacaccttgttccaaaacacaagctctcaaca 6152896  T
Q  413 aatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaact 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  6152895 aatcttccaaactctgaatagtcctctctgtttgcccatcagtctgaggatagtaagcagaactcaatctcaacttagttctcaaagcagcttgcaaact 6152796  T
Q  513 ctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaat 579  Q
     |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6152795 ttcccaaaacttataagtaaatctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatgcaat 6152729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 16 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 6712841 - 6712291
Alignment:
Q  16 tcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaactt 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||          || | ||||||||| ||||||||||||||| ||| | | |    
T  6712841 tcaaacggaccaacaaaacgaggagtcaacttccgacacttcaaagcacgt---------gttataggattcactctcaaaaacacatgaacacaaccct 6712751  T
Q  116 gaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttc 215  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| || | ||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  6712750 gaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataactcttctgcctactctgagacgctttcatcttcttttgaatcatcttaaccttttatgtagtctc 6712651  T
Q  216 ttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcatt 315  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||| | || || |||||| ||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6712650 ttgtacaacctccggtcctaacaaagcactttcgcctgactcataccaacacaacggcgttctacaccttctaccatacaaagcctcaaacggtgccatt 6712551  T
Q  316 ccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaat 415  Q
    || ||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6712550 ccgatactagaaggaaaattgttgttgtaagtaaactcaatcaactataaacattcgacccaattgacaccttgctccaaaacacaagctctcgacaaat 6712451  T
Q  416 cttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctc 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6712450 cttccaaactctgaatagtcctctccgtctgcccatcagtctggggatgatacgcagaactcaaccttaacttagttcccaaagcagcttgcacactctc 6712351  T
Q  516 ccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
    | |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  6712350 ctaaaacttagaagtgaacctcagatcccgatccgacacaatactataaggaataccatg 6712291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 12 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 13975490 - 13975140
Alignment:
Q  12 gacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcacca 111  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13975490 gacatcaaacggcccaacgaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaaacacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcacca 13975391  T
Q  112 acttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtag 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  13975390 acttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagatgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtag 13975291  T
Q  212 tttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgt 311  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13975290 tttcttccacaacttccggccctaacaaaggactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgc 13975191  T
Q  312 cattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggt 363  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  13975190 cattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagt-aactcaatcaacggt 13975140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 16 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 267699 - 267132
Alignment:
Q  16 tcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaactt 115  Q
    |||||||||||||||||||  || || ||| |||||||||||||| || |  |||| ||| | || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  267699 tcaaacggtccaacaaaacacggtgttaacctcctacacttcaaatcatgttcaacaccgattactggattaaccctcaaaaacacatgatctccaactt 267600  T
Q  116 gaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttc 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||  ||||| ||    
T  267599 gaaactcaatatccttcctcctcttatcatgataaatctcctgcctaccctgagacactttcatgttttcctaaatcatcttaaccttttttgtagtctc 267500  T
Q  216 ttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcatt 315  Q
    |||||||||||| | |||||| |||| ||| || || |||||| |||||||||||||  ||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| ||     
T  267499 ttgcacaacttctgatcctaaaaaagtattttcccctgactcataccaacacaacggattcctacacctcctcccatataaagcttcaaacggtgttatc 267400  T
Q  316 ccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaac-tgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaa 414  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||   ||||| | | |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  267399 ccaatactcgaatgaaaactgttgttgtaggtaaactcaatcaacactaaacattcaaaccaacttaaaaccttgttccaaaacacaatctctcaacaaa 267300  T
Q  415 tcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactct 514  Q
    || || |||   ||||||||||||||  | |||||||| |  |||||||| ||||||||||||||  |||  ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  267299 tcatcaaaagattgaatagtcctctccatttgaccatcagcttgaggatgataagcagaactcaacttcagcttagttcccaaagctacttgcaaactct 267200  T
Q  515 cccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatctg 582  Q
    |||||||  | ||||||||||||| ||| | |||  ||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  267199 cccaaaacattgaagtaaacctcgaatctctatctaacacaatgctagatggaataccatgcaatctg 267132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 464
Target Start/End: Original strand, 21686644 - 21687091
Alignment:
Q  16 tcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaactt 115  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||  |||| ||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  21686644 tcaaacagtccaacaaaacaaggtgtcaactttcgacacttcaaagcacgtccaacatcggttacatgattcactctaaaaaatacatgatcaccaactt 21686743  T
Q  116 gaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttc 215  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||   |||| |||||| | ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  21686744 gaaactgaatatcttttctcctcttataatgataactcttcttcttactttgagactctttcatcttttcctgaaacatcttaaccttttccgtagtctc 21686843  T
Q  216 ttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcatt 315  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||| |||| || ||| || |||||||||| |||||| || |||| || ||||| |||||||||||| |||||||     
T  21686844 ttgcacaatttctggtcctaacagagcactctcccctgacccataccaacacaatggtgtcatataccttcgtccataaaaagcctcaaac-gtgtcata 21686942  T
Q  316 ccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaat 415  Q
    |  ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |  |||| ||||| |  ||||||||| |||||||||||| ||    
T  21686943 ctgatactagaatgaaaattgttgttgtaagtaaactcaatcaatggtaaacattcagcgtaacttacaccctattccaaaacataagctctcaacagat 21687042  T
Q  416 cttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatg 464  Q
    ||||||||   ||||||||||| |  |||| |||||| |||| ||||||    
T  21687043 cttccaaagattgaatagtcctattcgtctaaccatcagtctcaggatg 21687091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 357 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 13967440 - 13967216
Alignment:
Q  357 caacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtc 456  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||| ||||| |||    
T  13967440 caacggtaagcattcgtcccaactgacaccttgttccaacacacaagctctcaacaaatcctccagactctgaatagtcctcttcgtctgcccatccgtc 13967341  T
Q  457 tgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaa 556  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  13967340 tgaggatggttagcagaactcaatctcaacttagttccaaaagcagcttgcaaaccttcccaaaacttagaagtaaacctcggttcccgatacgacacaa 13967241  T
Q  557 tactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
    | |||||||| ||||||||||||||    
T  13967240 tgctagaaggaataccatgcaatct 13967216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 14876919 - 14876375
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  ||||||||||||  || ||||| |    
T  14876919 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtaactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaaggtcttttctac 14876820  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| |  || ||||  || ||||||||    
T  14876819 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtctgctgaacaatctcgggtcctaa 14876720  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |  ||  | || || ||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  14876719 gaccgctctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataacta 14876620  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || || || || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |    |||||| ||||    
T  14876619 ttattatatgtgaactcgatcaacggaatatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcttctagcgactgaattgtcc 14876520  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    | || | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||    
T  14876519 tttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 14876420  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
     ||||| | ||| || ||||| || ||||| | ||||||||||||    
T  14876419 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaatct 14876375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 578
Target Start/End: Original strand, 12497958 - 12498499
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  12497958 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctac 12498057  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| |  || ||||  || ||||||||    
T  12498058 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaa 12498157  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | || || |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  12498158 gaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataacta 12498257  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| ||||    
T  12498258 ttattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcc 12498357  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||    
T  12498358 tctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 12498457  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
     ||||| | ||  |||||||| || ||||| | |||||||||    
T  12498458 tggatctctatttgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 12498499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 578
Target Start/End: Original strand, 17489560 - 17490101
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  17489560 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctac 17489659  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||  || ||||  || ||||||||    
T  17489660 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcctaa 17489759  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | || || || ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  17489760 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 17489859  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || ||||| || ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| ||||||||| |||||| ||   ||||||  |||    
T  17489860 ttattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacagatcttctaacgactgaatcatcc 17489959  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||  || |||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||    
T  17489960 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 17490059  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
     ||||| | ||| |||||||| || ||||| | |||||||||    
T  17490060 tggatctctatcggacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 17490101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 578
Target Start/End: Original strand, 16691870 - 16692415
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||||||  | |    
T  16691870 ggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcttgc 16691969  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| |  || ||||  || ||||||||    
T  16691970 gcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttttcagtagtctgctgaacaatctcgggtcctaa 16692069  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | || || |||||||||||||||||||| || || ||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  16692070 gaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatatccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataacta 16692169  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |    |||||| ||||    
T  16692170 ttgttgtatgtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcccccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcc 16692269  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagc----agcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaa 532  Q
    |||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |  ||||||||    |||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  16692270 tctccgactgaccatccgtctgtggatgataagctgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctctagcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 16692369  T
Q  533 acctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    | ||  |||| | ||| || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  16692370 atcttagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 16692415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 578
Target Start/End: Original strand, 9522429 - 9522970
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  |||||||||| || ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  ||||||| |||| ||| ||||| |    
T  9522429 ggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaagtcaagatcttttctac 9522528  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||||||||| |||||||| |||| |||||| ||| | ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||  || ||||||||    
T  9522529 gcttatcatggtaactcttttgtcgactctgtgacgctttcatcttttcttgaatcattttaaccttctcagtagtttgttgaacaatctctggtcctaa 9522628  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  |||| || |||||||||||| ||||||| || || || ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||| || ||    
T  9522629 gaccactctctcacctgactcaaaccaagacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataaata 9522728  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || || || || ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| |||||||||||||||| |    |||||  ||||    
T  9522729 ttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtccctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcttctagcgactgaaacgtcc 9522828  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||  || |||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  9522829 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatct 9522928  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
     ||||| | ||| |||||||| || ||||| | |||||||||    
T  9522929 tggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 9522970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 38 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 16807345 - 16806808
Alignment:
Q  38 gagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcct 137  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||  ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||||||||| |     
T  16807345 gagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcctttctgcg 16807246  T
Q  138 cttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaac 237  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| || ||| | ||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||| |  || ||||  || ||||||||     
T  16807245 cttatcatgataattcttctgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcattttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaag 16807146  T
Q  238 aaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactat 337  Q
    |   |  | || || ||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16807145 accactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataactat 16807046  T
Q  338 tgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcct 437  Q
    | ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |    |||||| |||||    
T  16807045 tattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcct 16806946  T
Q  438 ctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctc 537  Q
    ||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |  ||||||||  ||||| |||| | ||||||  |||||||||| ||     
T  16806945 ctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaactttgaacccaaagcctcttgctaacttttccaaaacctagaagtaaatctt 16806846  T
Q  538 ggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
    ||||| | ||| || ||||| || ||||| | ||||||    
T  16806845 ggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 16806808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Original strand, 15247857 - 15248164
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||| || || ||||| || ||||||||| | || |||||||| |||||||| ||  ||||||||||| | |  || || |    
T  15247857 ggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaactcattgtttttcctac 15247956  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||| ||| ||||||||    
T  15247957 gcttatcatgataactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcctaa 15248056  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   || |||| || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||     
T  15248057 aaccacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctacatctccgactatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactg 15248156  T
Q  337 ttgttgta 344  Q
    || |||||    
T  15248157 ttattgta 15248164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 37 - 359
Target Start/End: Original strand, 15208601 - 15208923
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||| || || ||||| || ||||||||| | || |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| |  || || |    
T  15208601 ggagtcaacttcttttacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaatgtttttcctac 15208700  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||| ||| ||||||||    
T  15208701 gcttatcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcctaa 15208800  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   || |||| || |||||||||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||     
T  15208801 aaccacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgtccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactg 15208900  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaa 359  Q
    || ||||| || ||||| |||||    
T  15208901 ttattgtacgtgaactctatcaa 15208923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 40 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 20062471 - 20061934
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | ||||| |||| ||| ||||| | ||    
T  20062471 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgct 20062372  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  20062371 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 20062272  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | ||||| || ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  20062271 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 20062172  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  20062171 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 20062072  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  20062071 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 20061972  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgca 577  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||| | ||||||||    
T  20061971 atctctatctgatacaattctcgaaggaacaccatgca 20061934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Original strand, 16635486 - 16636024
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || ||||||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||| ||||||| ||| ||||| | ||    
T  16635486 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgct 16635585  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  16635586 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 16635685  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | ||||| || ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  16635686 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 16635785  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || || || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  16635786 ttatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 16635885  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  16635886 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 16635985  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  16635986 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 16636024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Original strand, 43162810 - 43163348
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || ||||||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||| ||||||| ||| ||||| | ||    
T  43162810 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgct 43162909  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  43162910 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 43163009  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | ||||| || ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  43163010 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 43163109  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || || || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  43163110 ttatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 43163209  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  43163210 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 43163309  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  43163310 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 43163348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 40 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 15589809 - 15589272
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | ||||| |||| ||| ||||| | ||    
T  15589809 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgct 15589710  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  15589709 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 15589610  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | ||||| || ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  15589609 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 15589510  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||  | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  15589509 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgcttaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 15589410  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  15589409 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 15589310  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgca 577  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||| | ||||||||    
T  15589309 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgca 15589272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 577
Target Start/End: Original strand, 16371123 - 16371663
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||  ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| |  ||  |  ||||||| |||| ||| || || |    
T  16371123 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtagtcttcttcttgaaattcaagatctttcctac 16371222  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| |  || ||||  || ||||||||    
T  16371223 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaa 16371322  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | ||||| |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  16371323 gaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataacta 16371422  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || ||||| || ||||||||||| |  | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |    |||||| ||||    
T  16371423 ttattgtatgtgaactcaatcaatgaaagatgaatatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcc 16371522  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    | || | | ||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||    
T  16371523 tttccgaccgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 16371622  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgca 577  Q
     ||||| | ||| || ||||| || ||||| | ||||||||    
T  16371623 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgca 16371663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Original strand, 10005313 - 10005851
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | ||||| |||| ||| ||||| | ||    
T  10005313 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgct 10005412  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  10005413 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 10005512  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | ||||| || ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  10005513 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 10005612  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | ||||| || | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  10005613 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 10005712  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||||||  |||| ||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  10005713 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgtaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 10005812  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  10005813 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 10005851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Original strand, 10905923 - 10906461
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  ||||||| |||| ||| ||||| | ||    
T  10905923 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaattcaagatcttttctacgct 10906022  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  10906023 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 10906122  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | ||||| || ||||||||||||||||| || || || |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  10906123 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccaaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 10906222  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | ||| | || | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  10906223 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcctcgttcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 10906322  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  10906323 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 10906422  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  10906423 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 10906461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 15348662 - 15348124
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||| ||||||| ||| ||||| | ||    
T  15348662 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgct 15348563  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  |  |||||||| |     
T  15348562 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctttggtcctaagac 15348463  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | ||||| || ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||  |||||||     
T  15348462 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaggcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactatta 15348363  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  15348362 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 15348263  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  15348262 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 15348163  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| |||||||| || ||||| | |||||||||    
T  15348162 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 15348124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 16492601 - 16492060
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  |||| ||||| || ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  16492601 ggagtcaacttctttgactttaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctac 16492502  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||  || ||||  || ||||||||    
T  16492501 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcctaa 16492402  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | || || ||  |||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||     
T  16492401 gaccactctttcacctgatacaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcacaaggtgtcattccaatactagaatgataactg 16492302  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || || || || ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| | || ||||||||||| ||   |||||| ||||    
T  16492301 ttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtacctccttgctcaagaacacaaacccttaacaaatcttctaacgactgaatcgtcc 16492202  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| || || ||||| ||  | |||||||| ||||| ||||  || |||||  |||||||||| | ||| ||| |||||||||| ||    
T  16492201 tctccgactgaccatctgtttgcggatgatacaccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccataatctagaagtaaatct 16492102  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
     ||||| | ||| |||||||| || ||||| | |||||||||    
T  16492101 tggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 16492060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 53 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 53385422 - 53384898
Alignment:
Q  53 acttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 152  Q
    ||||||||||||| || || || ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  | ||||| |||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  53385422 acttcaaagcacgtcctacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataact 53385323  T
Q  153 cttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccg 252  Q
    ||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |   |  | || ||     
T  53385322 cttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 53385223  T
Q  253 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaact 352  Q
    |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | ||||| || ||||| ||||    
T  53385222 gactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacagagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 53385123  T
Q  353 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatc 452  Q
    | |||||||| | |      |||||| |    |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||| | |||||||||    
T  53385122 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcatccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 53385023  T
Q  453 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgac 552  Q
     ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||||| | ||| ||     
T  53385022 cgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 53384923  T
Q  553 acaatactagaaggtataccatgca 577  Q
    ||||| || ||||| | ||||||||    
T  53384922 acaatgctcgaaggaacaccatgca 53384898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Original strand, 13252403 - 13252941
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | ||||| |||| ||| ||||| | ||    
T  13252403 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgct 13252502  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||| ||| ||||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  13252503 tatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 13252602  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||  |||||||     
T  13252603 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagtcctgcatctccgaccatacaaggcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactatta 13252702  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || || || ||||| |||||||| | |     ||||||| |  | ||||| || | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  13252703 ttatatgtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 13252802  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  13252803 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 13252902  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| ||||| || || ||||| | |||||||||    
T  13252903 atctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaa 13252941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Original strand, 48425160 - 48425698
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||| || |||| ||| ||||| | ||    
T  48425160 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgct 48425259  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  ||  ||||||| |     
T  48425260 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctagtcctaagac 48425359  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | ||||| || ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  48425360 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagccttgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 48425459  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| || ||||    
T  48425460 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgttctct 48425559  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  48425560 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 48425659  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  48425660 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 48425698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 8759491 - 8758962
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| || || || ||||  ||| |||| || | ||| |||||||||||  ||||||||||||   |||||||||    
T  8759491 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 8759392  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||| || |||   |||||||| || ||||| ||||| || || || |  |||||||| ||    
T  8759391 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtcccaa 8759292  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||| |||||| ||||| | |||| ||||     
T  8759291 cacaacactttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataactg 8759192  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||        ||||||    |||| || || |  |||||  |||||||||| || |||||    || || ||||    
T  8759191 ttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcctccaatgattggatcgtcc 8759092  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||||| || |  ||||||||  | || ||||||| ||| ||  ||||||| |||||    
T  8759091 tctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacct 8758992  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaagg 566  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  8758991 cggatccctatccgacacaatactcgaagg 8758962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 578
Target Start/End: Original strand, 14086393 - 14086934
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| || | || || ||||| || || || |||| |||| | || ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||  ||||| || |    
T  14086393 ggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctac 14086492  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| |||||||| |||||||||| |||||| ||| | |||||   ||||   || | |||||||||||||||||||| ||| || |  || ||||| ||    
T  14086493 gcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatccgttctcttattaacttaaccttttccgtagtttgttgaactatgtctggtcccaa 14086592  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    ||   || | ||||| ||||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||| | |||  |||||    
T  14086593 catcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaccatacaaggcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaacta 14086692  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  | ||||| | ||| || ||    || || || |    
T  14086693 ttgttgtaagtaaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaatagatcctctaaggattgtatcgttc 14086792  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  14086793 tctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacct 14086892  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    |||||| | ||| || |||||||| || || | |||||||||    
T  14086893 cggatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaa 14086934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 138 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 5425249 - 5424809
Alignment:
Q  138 cttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaac 237  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || ||||||||     
T  5425249 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaag 5425150  T
Q  238 aaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactat 337  Q
    |  ||  | ||||| || ||||||||||||||||| || || || ||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  5425149 accgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctctgaccatacagagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactat 5425050  T
Q  338 tgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcct 437  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| | |     ||||||| |  | ||||| || | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||    
T  5425049 tattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcct 5424950  T
Q  438 ctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctc 537  Q
    ||| | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||     
T  5424949 ctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctt 5424850  T
Q  538 ggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||||| | ||| ||||| || || ||||| | |||||||||    
T  5424849 ggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaa 5424809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 36 - 561
Target Start/End: Original strand, 10383688 - 10384213
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||| || || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | |||||||||| |||||||||     
T  10383688 aggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctt 10383787  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 235  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||  | ||||| ||||||   |||| | | || || || ||||| || || || |  |||||||| |    
T  10383788 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaactaaatccggtccca 10383887  T
Q  236 acaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaact 335  Q
    ||| |  | | || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||| |  ||| | ||    
T  10383888 acacaatactttcacccgactcaaaccagcacaaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagct 10383987  T
Q  336 attgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtc 435  Q
     ||||| ||||| ||||||||||| || ||      |||||||    |||||||||| |  |||||  | |||||||||||||||||    ||||| |||    
T  10383988 gttgttataagtgaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtc 10384087  T
Q  436 ctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacc 535  Q
    ||||| | ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||  | |||||||  | ||| ||  ||||||| ||||    
T  10384088 ctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgcaaacatttccagaacctagaagtgaacc 10384187  T
Q  536 tcggatcccgatccgacacaatacta 561  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||    
T  10384188 tcggatctctatccgacacaatacta 10384213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 37 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 13972529 - 13971988
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| || | || || ||||| || || || |||| |||| | || ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||  ||||| || |    
T  13972529 ggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctac 13972430  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| |||||||| |||||||||| |||||| ||| | |||||   ||||   || | |||||||||||||||||||| ||| || |  || ||||| ||    
T  13972429 gcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatccgttctcttattaacttaaccttttccgtagtttgttgaactatgtctggtcccaa 13972330  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    ||   || | ||||| ||||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||| | |||  |||||    
T  13972329 catcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaccatacaaggcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaacta 13972230  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  | ||||| | ||| || ||    || || ||||    
T  13972229 ttgttgtaagtaaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaatagatcctctaaggattgtatcgtcc 13972130  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||  |||||||| |  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  13972129 tctccgactgaccatctgtctggggatgataagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacct 13972030  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    |||||| | ||| || |||||||| || || | |||||||||    
T  13972029 cggatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaa 13971988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 40 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 16757002 - 16756465
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||  || || ||  | | ||| |||| ||| ||||| | ||    
T  16757002 gtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgct 16756903  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| || ||| | ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  16756902 tatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 16756803  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | ||  | |||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| |||| | |||||     
T  16756802 cactctttcatctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaggcctcgaacgatgccattccaatactagaatgatagctatta 16756703  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |     ||||||| |  | |||||||| |  ||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  16756702 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgctcaagcacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 16756603  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    ||| ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  16756602 ctgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 16756503  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgca 577  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||| | ||||||||    
T  16756502 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgca 16756465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 566
Target Start/End: Original strand, 41177242 - 41177771
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||| || || || ||||  ||| |||| || | ||| |||||||||||  ||||||||||||   |||||||||    
T  41177242 ggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 41177341  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||| || |||   |||||||| || ||||| ||||| || || || |  |||||||| |     
T  41177342 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtcccag 41177441  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||| |||||| ||||| | |||| ||||     
T  41177442 cacaacactttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataactg 41177541  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||        ||||||    |||| || || |  |||||  |||||||||| || |||||    || || ||||    
T  41177542 ttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccatgttcaagcacacacactctcaacaagtcctccaatgattggatcgtcc 41177641  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||||| || |  ||||||||  | || ||||||| ||| ||  ||||||| |||||    
T  41177642 tctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacct 41177741  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaagg 566  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  41177742 cggatccctatccgacacaatactcgaagg 41177771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 566
Target Start/End: Original strand, 13941744 - 13942273
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||| || || || ||||  ||| |||| || | ||| |||||||||||  ||||||||||||   |||||||||    
T  13941744 ggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 13941843  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||| || |||   |||||||| || ||||| ||||| || || || |  |||||||| ||    
T  13941844 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtcccaa 13941943  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || | |||||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||| |||||| ||||| | |||| ||||     
T  13941944 cacaacactttctccttattcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaagggtgccattcctatactcgaatgataactg 13942043  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||        ||||||    |||| || || |  |||||  |||||||||| || ||||     || || ||||    
T  13942044 ttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcctccattgattggatcgtcc 13942143  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||| || |  ||||||||  | || ||||||| ||| ||  ||||||| |||||    
T  13942144 tctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacct 13942243  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaagg 566  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  13942244 cggatccctatccgacacaatactcgaagg 13942273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 563
Target Start/End: Original strand, 47123663 - 47124190
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| || ||||| || |||| |||| | || |||| ||| |||||||||||  | ||||| |||| |||||||||     
T  47123663 aggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctt 47123762  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 235  Q
    | ||| ||||| ||||||||||| | |||||| ||  | ||||| ||||||   |||| | | || || || ||||| || ||||| |  |||||||| |    
T  47123763 cgcttgtcatggtaactcttctgccgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgcaccaaatccggtccca 47123862  T
Q  236 acaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaact 335  Q
    ||| | || | || || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||| |  ||| | ||    
T  47123863 acacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagct 47123962  T
Q  336 attgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtc 435  Q
     ||||| |||||||| |||||||| || ||      |||||||    |||||||||| |  |||||  | |||||||||||||||||    ||||| |||    
T  47123963 gttgttataagtaaattcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtc 47124062  T
Q  436 ctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacc 535  Q
    ||||| | ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||  |||| || |  ||||||||  | || ||||| | ||| ||  ||||||| ||||    
T  47124063 ctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacc 47124162  T
Q  536 tcggatcccgatccgacacaatactaga 563  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||    
T  47124163 tcggatctctatccgacacaatgctaga 47124190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 67 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 15016134 - 15015842
Alignment:
Q  67 ccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactct 166  Q
    ||||| |||||||||||| | || |||||||| || || || ||  |||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15016134 ccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactct 15016035  T
Q  167 gagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaaca 266  Q
    ||||| | ||||| || ||   ||||| ||||||||| || ||||||| ||| |||| ||| |||||||  |   ||||||| ||||| ||| |||||||    
T  15016034 gagacgctttcatcttctccctaatcaacttaaccttctctgtagtttgttgaacaatttctggtcctagtaccacattctcaccggattcataccaaca 15015935  T
Q  267 caacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaa 359  Q
    ||| || || || || |||||| ||||||| || || ||||||| ||||||||| |||| |||  |||| || ||| |||| ||||| |||||    
T  15015934 caatggagttctgcatctccgatcatacaatgcttcgaacggtgccattccaatgctagaatggtaactgttattgcaagtgaactcgatcaa 15015842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 11304182 - 11303644
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| |||    || |||| ||| |||||||||||  |||||||||||| | ||||  | |    
T  11304182 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgtcatagggaaaactctcagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagagccttcatac 11304083  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgca-caacttccggtccta 235  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| ||| || ||| | ||||| ||||||   |||||||| ||||| |||||||  |  || | ||| ||| ||||| |    
T  11304082 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactttgcgacgctttcatcttttctcttatcatctttaccttctccgtagcctgatgaatcaaattc-ggtccca 11303984  T
Q  236 acaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaact 335  Q
    ||| | || ||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| | | |||||||| | |||  ||||    
T  11303983 acacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccttaccaatactcgaatggtaact 11303884  T
Q  336 attgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtc 435  Q
     || ||||| || ||||  ||||||||||        ||||||    || ||||||| |  |||||  |||| |||||||| |||||    || || |||    
T  11303883 gttattgtatgtgaactatatcaacggtaggtgactatcccaagctccaacttgctcaagtacacacactcttaacaaatcctccaatgattggatcgtc 11303784  T
Q  436 ctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacc 535  Q
    ||||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || | |||||| ||  | |||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  11303783 ctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaggcgtcctgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacc 11303684  T
Q  536 tcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  11303683 tcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatg 11303644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 88 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 11961392 - 11961116
Alignment:
Q  88 accctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttctt 187  Q
    ||||||| ||| |||||||||||  | |||||||||| | |||| || | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||  |  ||||||| |||||      
T  11961392 accctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcaaagccttcatcttttccc 11961293  T
Q  188 gaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccg 287  Q
      ||||| || |||||||| || || || || || || |||||||| |||| | || |||| || ||||||||||| || || || ||||| ||||||||    
T  11961292 ttatcattttgaccttttcagtcgtctcatgaaccacatccggtcccaacacaacactctcacctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccg 11961193  T
Q  288 accatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggta 364  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||| | || ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  11961192 accatacaaagcttcgaacggtgccatgccaatactcgaatgatagctgttgttataagtgaactcaatcaacggta 11961116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 176 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 14183193 - 14182950
Alignment:
Q  176 tcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgt 275  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||  |||| |  || |||| ||||| ||| |||| | || | || |  |||||| |||||||||| |||||    
T  14183193 tcatcttttcctgaatcatcttaaccttctcaatagtctgctgaacaatttccgatcccaacacaacactttcactcgactcataccaacacaaaggtgt 14183094  T
Q  276 cctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcc 375  Q
     ||||| ||||   |||||||||| || || || | ||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  14183093 tctacatctcctctcatacaaagcatcgaaaggagccataccaatacttaaatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacaaacatcc 14182994  T
Q  376 caactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttc 419  Q
    ||| | || ||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||    
T  14182993 caaatcactccttgcttcaaaatacacgccctcaacaaatcttc 14182950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 16836919 - 16836396
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| || || || ||||  ||| | || |||||||| |||||||||||  | ||||||||||   |||| ||||    
T  16836919 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctcc 16836820  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||| | ||||| |||||    |||||||| ||||| || || || || || || |  || ||||| ||    
T  16836819 gcttatcatggtaacttttctgtcgactctgtgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcgtctcatgaaccaaatctggtcccaa 16836720  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || ||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||||| | |||  ||||     
T  16836719 cacaacactctctcctgactcaaaccagcataacggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaactg 16836620  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||        ||||||    ||||||| || |  ||||   ||||||||||||| |||||    || || ||||    
T  16836619 ttgttgtaggtgaactctaccaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacgcactctcaacaaatcctccaaggattggatcgtcc 16836520  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||||||  | |||||||||| ||| ||| |||| || |||||    
T  16836519 tctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaatctagatgtgaacct 16836420  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    |||||| | ||||||  |||||||    
T  16836419 cggatctctatccgatgcaatact 16836396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 18134755 - 18134217
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||| ||| ||| |||||||  | ||||||||||   |||| || |    
T  18134755 ggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtaactctcagaaatacaagatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 18134656  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||| || |||   ||||| || || || || ||||| |  || || |  |||||||| ||    
T  18134655 gcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctccgatcattttgactttatctgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaa 18134556  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || ||||||| ||||||||||| || || ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  ||||     
T  18134555 cacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggattcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 18134456  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  ||||||  ||||| |||||    || || ||||    
T  18134455 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtcc 18134356  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
     ||| | ||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||| || |  |||||||   | |||||||||| ||| ||| || |||| |||||    
T  18134355 gctccgactgaccatctgtctgaggatgataagttgaactcaacctcaacttcgaacccaaagtgtcctgcaaactcttccagaatctataagtgaacct 18134256  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  18134255 cggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatg 18134217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 26792816 - 26792278
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || |  |||| |||| | || || |||||||| || || ||  |||| ||||||| ||| || || | ||    
T  26792816 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacactagtcataggagtgactcttaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgct 26792717  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  26792716 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 26792617  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | || || ||||||||||| || || || || || || ||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||| | |||| |||||||     
T  26792616 cactctttcacctgactcaaaccagcataatggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactatta 26792517  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||  | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  26792516 ttgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgcttaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 26792417  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    ||| ||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  26792416 ctgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaactttgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 26792317  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| |||||||| || ||||| | |||||||||    
T  26792316 atctctatctgacacaatgctggaaggaacaccatgcaa 26792278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 253 - 563
Target Start/End: Original strand, 28754254 - 28754564
Alignment:
Q  253 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaact 352  Q
    ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| |  ||| | || ||||| ||||||||||    
T  28754254 gactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaact 28754353  T
Q  353 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatc 452  Q
    ||||||| || ||       ||||||    |||||||||| |  |||||  |||||||||||||||||||    ||||| |||||||| | |||||||||    
T  28754354 caatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatc 28754453  T
Q  453 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgac 552  Q
     || |||||||| ||||| ||||||||  |||| || |  ||||| ||  | || ||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||| | ||| |||    
T  28754454 tgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtaaacctcggatctctatctgac 28754553  T
Q  553 acaatactaga 563  Q
    |||||||||||    
T  28754554 acaatactaga 28754564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 40 - 361
Target Start/End: Original strand, 6600460 - 6600781
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |  || |||| ||| ||||| | ||    
T  6600460 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttgaattcaagatcttttctacgct 6600559  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||| | ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  6600560 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 6600659  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | || || |||||||||||||||||| | || || || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||     
T  6600660 cactctttcacctgactcaaaccaacacaacagagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgatagctatta 6600759  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacg 361  Q
    || ||||| ||||| |||||||    
T  6600760 ttataagtgaactcgatcaacg 6600781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 253 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 15725138 - 15724813
Alignment:
Q  253 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaact 352  Q
    ||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||| | |||| ||||||| ||||| || ||||    
T  15725138 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaact 15725039  T
Q  353 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatc 452  Q
    | |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||||| |||||||||    
T  15725038 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatc 15724939  T
Q  453 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgac 552  Q
     ||||| ||||| || || |||||||| ||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| || ||||||| || ||||| | ||| |||    
T  15724938 tgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctacaagtaaatcttggatctctatctgac 15724839  T
Q  553 acaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||||| |  ||||| | |||||||||    
T  15724838 acaatgcctgaaggaacaccatgcaa 15724813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 15402927 - 15402389
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  15402927 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaaaatcttttctacgct 15402828  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||| |||||| || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  15402827 tatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 15402728  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | || || ||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||  |||||||| || |||| |||||||||||| | |||| |||||||     
T  15402727 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatgtaaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactatta 15402628  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || || || ||||| || ||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||   ||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  15402627 ttatatgtgaactcgattaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcgagaacacaaatcctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 15402528  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||| | ||||  ||||| || || |||||||||||||  || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  15402527 ccgactgaccagctgtctatggatgatacgccgaactcaatctcagcttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 15402428  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| |||||||| || || || | |||||||||    
T  15402427 atctctatctgacacaatgctcgagggaacaccatgcaa 15402389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 16381336 - 16380808
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| || || || ||||  ||| | || || ||||| |||||||||||| |  |||||||||   |||||||||    
T  16381336 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttaaaaatacatgatcaccatcccgaaactcaagggcctttctcc 16381237  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| |||||||   ||| |||||| ||| | ||||| || |||   |||||||| |||||||| ||||| || || || |  ||||||||  |    
T  16381236 gcttgtcatggtaactct---gtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgaccttttctgtagtctcatgaaccaaatccggtcccca 16381140  T
Q  237 --caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaac 334  Q
      || | || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||  || || ||||| | |||  |||    
T  16381139 accataacactctctccggactcaaaccagcacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaacggtgcgatacctatactcgaatggtaac 16381040  T
Q  335 tattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagt 434  Q
    | |||||||| || ||||| ||||| ||||     |  ||||||    ||||||| || |  |||||  ||||||||| ||| |||||    || ||  |    
T  16381039 tgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgattatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacagatcctccaatgattggatcat 16380940  T
Q  435 cctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaac 534  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||| || |  ||||||||  | |||||||||| ||| ||  |||| || |||    
T  16380939 cctctccgactgaccatctgtctgagaatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaac 16380840  T
Q  535 ctcggatcccgatccgacacaatactagaagg 566  Q
     ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16380839 atcggatccctatccgacacaatacttgaagg 16380808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 226 - 556
Target Start/End: Original strand, 17492539 - 17492869
Alignment:
Q  226 tccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactag 325  Q
    |||||||| |||| | || ||||||| ||||||||||| |  || || ||||| |||||||||||||||||||| || | ||||| ||| |||||| | |    
T  17492539 tccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcttaaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgatcggtgccataccaatattcg 17492638  T
Q  326 catgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaact 425  Q
     |||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  |||||| |||||| || ||       
T  17492639 aatgataactattgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagatccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatga 17492738  T
Q  426 ctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaattta 525  Q
     || || |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  17492739 ttggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaagttcgaccccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcta 17492838  T
Q  526 gaagtaaacctcggatcccgatccgacacaa 556  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||| ||||    
T  17492839 gaagtgaacctcggatctctatccgaaacaa 17492869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 16330068 - 16329530
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||| |||  ||||||| ||||| ||||| || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | |||||||||| | |||||||      
T  16330068 ggagtcaactacctcgacttcaatgcacgtccaacacctgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttt 16329969  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| |||||||| |||| |||||| ||  | ||||| |||||    |||| | | || || || ||||| || || || |  |||||||| ||    
T  16329968 gcttgtcatggtaactcttatgtcgactctgtgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtcccaa 16329869  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || |||| || |||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||| |  ||| | ||     
T  16329868 cacaacactctcacctgactcaaaccaacatagaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctg 16329769  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||        ||||||    |||||||||  |  |||||  | |||||||||||||||||    ||||| ||||    
T  16329768 ttgttataagtgaactcaatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctaaagtacaca--ccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcc 16329671  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | || |||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||  |||| ||||||| ||| ||  ||||| | |||||    
T  16329670 tctccgactaaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcttgtaaactcttccagaacctagaaatgaacct 16329571  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgca 577  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |||| ||| ||||    
T  16329570 cggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccgtgca 16329530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 240 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 12360748 - 12360428
Alignment:
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  |||| |||    
T  12360748 agcactctctcctgactcaaaccagcataatggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttg 12360649  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||        ||| ||    |||||||||| |  |||||  || |||| ||||| ||||||   || || |||||||    
T  12360648 ttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatccgaagctccaccttgctcaagtacacacactttcaataaatcctccaaagattgtatggtcctct 12360549  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||| |||| || |||| ||| ||| |||| || ||||||||    
T  12360548 ccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgtaatctcttccataatctagatgtgaacctcgg 12360449  T
Q  540 atcccgatccgacacaatact 560  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  12360448 atccctatccgacacaatact 12360428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 55 - 179
Target Start/End: Original strand, 15227387 - 15227511
Alignment:
Q  55 ttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactct 154  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||| | || |||||||||||||| || ||  |||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  15227387 ttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatgataactct 15227486  T
Q  155 tctgtctactctgagacaccttcat 179  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||    
T  15227487 tctgtcgactctgcgacactttcat 15227511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 307 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 14126744 - 14126473
Alignment:
Q  307 ggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctc 406  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||| || |||||||||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| |||    
T  14126744 ggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactc 14126645  T
Q  407 tcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttg 506  Q
    |||||||||| || |    ||||||  ||||| | | ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||  ||||    
T  14126644 tcaacaaatcctctagcgactgaatcctcctcaccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttg 14126545  T
Q  507 caaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
     ||||| | ||||||| |||||||||| || ||||| | ||| |||||||| || ||||| | |||||||||    
T  14126544 aaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 14126473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 15953377 - 15952854
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||| |  || || |||| |||| | |  |||| ||| |||||||| ||  ||||||||||||   |||| || |    
T  15953377 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcgtacacccgtcataggagtaaatctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctac 15953278  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| |||||||| |||| |||||| ||| | ||||| ||||||   |||||||| || || || ||||| |  || || |  |||||||| ||    
T  15953277 gcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaa 15953178  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || | ||||| ||||||||| |||| || || || || |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  ||||     
T  15953177 cacaacactttctcccgactcaaacaaacataaaggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggcaactg 15953078  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  |||||| ||| || || ||    || || ||||    
T  15953077 ttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaactcctctaatgattggatcgtcc 15952978  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||  || || ||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  15952977 tctccgactgaccatatgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacct 15952878  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    |||||| | |||||||||||||||    
T  15952877 cggatctctatccgacacaatact 15952854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 247 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 26009192 - 26009075
Alignment:
Q  247 tctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaag 346  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||| | |||  |||||||||||||||    
T  26009192 tctcctgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaccatacaaggcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtaag 26009093  T
Q  347 taaactcaatcaacggta 364  Q
    |||||||  |||||||||    
T  26009092 taaactctctcaacggta 26009075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 427 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 13322671 - 13322523
Alignment:
Q  427 tgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttag 526  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||  | |  |||||| || |||||||||||| ||| ||| |||    
T  13322671 tgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaaccttaacctcgaacccaaaacatcttgcaaactcttccagaatctag 13322572  T
Q  527 aagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
    ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| || |||| ||||||    
T  13322571 aagtaaacctcagatccctatctgacacaatactcgacggtacaccatg 13322523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 247 - 566
Target Start/End: Original strand, 4678368 - 4678687
Alignment:
Q  247 tctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaag 346  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||| |||||| ||||| | |||| |||| |||||||| |    
T  4678368 tctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaagggtgccattcctatactcgaatgataactgttgttgtagg 4678467  T
Q  347 taaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctg 446  Q
    | ||||| ||||| ||||        ||||||    |||| || || |  |||||  |||||||||| || |||||    || || |||||||| | |||    
T  4678468 tgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcctccaatgattggatcgtcctctccgactg 4678567  T
Q  447 accatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccga 546  Q
    |||||| || |||||||| ||||| |||||||  ||||| || |  ||||||||  | || ||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||| |    
T  4678568 accatctgtttgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatcccta 4678667  T
Q  547 tccgacacaatactagaagg 566  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  4678668 tccgacacaatactcgaagg 4678687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 10420454 - 10420147
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | ||||| ||||  || || || |    
T  10420454 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccttcctgaaattcaaggtctttcctac 10420355  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||| | ||||| || |||  ||||||| | || || ||||| || || || || |  |||||||| ||    
T  10420354 gcttgtcatggtagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctaatcatcctgactttctccgtggtctcatgaaccaaatccggtcccaa 10420255  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || | ||||| |||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||||| | |||| ||||     
T  10420254 cacaacactttctcccgactcaaaccaacatagaggagtcctacacctccgaccatataaagcttcaaatggtgccataccaatacttgaatgataactg 10420155  T
Q  337 ttgttgta 344  Q
    ||||||||    
T  10420154 ttgttgta 10420147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 100 - 563
Target Start/End: Original strand, 44777030 - 44777493
Alignment:
Q  100 acatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaa 199  Q
    |||||||||||  |||| |||||||   |||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||| || |||   |||||||| |    
T  44777030 acatgatcaccctcttggaactcaagggccttcctcctcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttga 44777129  T
Q  200 ccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagc 299  Q
    | ||||| ||||| || || || |  || ||||| |||| | || | ||||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||    
T  44777130 ctttttctgtagtctcctgaactaaatctggtcccaacacaacactttctcctgtctcgaaccaacacaaaggagtcctgcaccttcgaccatataatgc 44777229  T
Q  300 ctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaaca 399  Q
     || || |||| |||||| ||||| | |||| |||| |||||||| || ||||| ||||| || |        ||||||    |||| || || |  |||    
T  44777230 ttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggcaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcaca 44777329  T
Q  400 caagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaag 499  Q
    ||  |||||||||| ||||||||    || || |||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||||| || |  |||||||    
T  44777330 cacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgagcccaaag 44777429  T
Q  500 cagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactaga 563  Q
    || | || ||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  44777430 catcctgtaaactcttccagaacctagaagtaaacctcggatctctatccgacacaatgctaga 44777493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 16412699 - 16412161
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || || ||  | ||||||||||  || || || | ||    
T  16412699 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcatgaaactcaaggtcattcctacgct 16412600  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| || | |||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||| ||| || |  |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  16412599 tatcatgataactcttttgccaactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttcttagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 16412500  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | || || ||||||||||| |||||||| || || || |||| |||||| |||||||| || |||| |||||||||||| | |||| |||||||     
T  16412499 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccaaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactatta 16412400  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||  | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  16412399 ttgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctgaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 16412300  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    ||| ||||||||| || || || || ||  | |||||||| ||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  16412299 ctgactgaccatctgtttgtggttgatactccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 16412200  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| |||||||| || ||||| | |||||||||    
T  16412199 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 16412161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 286 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 11564852 - 11564776
Alignment:
Q  286 cgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacgg 362  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  11564852 cgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaacgg 11564776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 12850688 - 12850364
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||| |  || ||||||||| | || |||| ||||||||||||  |  ||||||||||||   ||||| | |    
T  12850688 ggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctatacccgtcacaggagtgactctcagaaacacatgatcttcctcttgaaactcaagggcctttattc 12850589  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||   ||||  || || ||||  |||||||  || || |  || ||||| ||    
T  12850588 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacactttcatcttttctcttatcaatttgactttttatgtagtttgatgaactaaatctggtcccaa 12850489  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    ||   || | ||||| ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||| | |  ||||||| ||| |||||||| | |||  || |     
T  12850488 cactacactttctcccgactcaaaccaacacaatggagttctgcacctccgaccatacaaatctttgaacggtgccataccaatacttgaatggtaattg 12850389  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacg 361  Q
    |||||||| || ||||| |||||||    
T  12850388 ttgttgtacgtgaactctatcaacg 12850364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 433 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 16828215 - 16828088
Alignment:
Q  433 gtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaa 532  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |    
T  16828215 gtcctctccgactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaaattcttccaaaatctagaagtga 16828116  T
Q  533 acctcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||    
T  16828115 acctcggatctctatccgacacaatact 16828088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 338
Target Start/End: Original strand, 15338982 - 15339280
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | | |||||||| ||| ||||| | ||    
T  15338982 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgct 15339081  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| |  ||||| ||||||| |||||| || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  15339082 tatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatttgctcttggatcatctgaaccttctcagtagtttgatgaacaatctctggtcctaagac 15339181  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactatt 338  Q
      |  | || || ||||||||||| |||||||| || ||  | ||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||| | |||| |||||||    
T  15339182 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgtatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactatt 15339280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 409 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 16338549 - 16338381
Alignment:
Q  409 aacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgca 508  Q
    ||||||||||||||    ||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||||||  | || |    
T  16338549 aacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgta 16338450  T
Q  509 aactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgca 577  Q
    |||||| ||| ||  ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||| ||||    
T  16338449 aactcttccagaacctagaactgaacctcggatccctatccgacacaatacttgacggtacaccgtgca 16338381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 426 - 560
Target Start/End: Original strand, 14574038 - 14574172
Alignment:
Q  426 ctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaattta 525  Q
    |||||| || ||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  14574038 ctgaatcgtactctctgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcta 14574137  T
Q  526 gaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    ||||| |||||   ||| | ||| |||||||||||    
T  14574138 gaagtgaacctgaaatctctatctgacacaatact 14574172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 383 - 577
Target Start/End: Original strand, 15061812 - 15062006
Alignment:
Q  383 caccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatct 482  Q
    |||||||||| | |||| || ||||||||||||| || |    |||||| ||||| || | ||||||||| ||||| | ||| || || |||||||||||    
T  15061812 caccttgctcaagaacataaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctttccgactgaccatctgtctgcgtatgatacgccgaactcaatct 15061911  T
Q  483 caatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgca 577  Q
    ||| ||||  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||| | ||||||||    
T  15061912 caacttagaacccaaagcctcttgcaaactattccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgca 15062006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 366
Target Start/End: Original strand, 13001839 - 13001958
Alignment:
Q  247 tctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaag 346  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||  | |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  |||| |||||||| |    
T  13001839 tctcccgactcaaaccaacataatggagttttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacg 13001938  T
Q  347 taaactcaatcaacggtaaa 366  Q
    | ||||| || |||||||||    
T  13001939 tgaactctattaacggtaaa 13001958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 427 - 577
Target Start/End: Original strand, 6600836 - 6600986
Alignment:
Q  427 tgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttag 526  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||    
T  6600836 tgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctag 6600935  T
Q  527 aagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgca 577  Q
    ||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||| | ||||||||    
T  6600936 aagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgca 6600986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 536
Target Start/End: Original strand, 14573887 - 14574148
Alignment:
Q  275 tcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtc 374  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| |  ||  |||| |||||||| || ||||| |||||||||| |      ||    
T  14573887 tcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgattggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatc 14573986  T
Q  375 ccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaa 474  Q
    ||||    |||||||||| |  | |||  |  ||| |||||| || ||   |||||| || ||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  14573987 ccaagctccaccttgctcaagtatacacaccatcagcaaatcctctaacgactgaatcgtactctctgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaa 14574086  T
Q  475 ctcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    ||||| ||||| || |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  14574087 ctcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacct 14574148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 362
Target Start/End: Original strand, 15227585 - 15227694
Alignment:
Q  253 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaact 352  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||||||| |||||||||| | || ||||||| ||| |||||||| | |||  |||| |||||||| || ||||    
T  15227585 gactcaaaccaacataacggagttctgcacctccaaccatacaaatcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaact 15227684  T
Q  353 caatcaacgg 362  Q
    | ||||||||    
T  15227685 ctatcaacgg 15227694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 13323061 - 13322734
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||| ||||||||| || ||  | |||||| ||| ||| || || |    
T  13323061 ggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacccccgtcataggagtaactctcagaaacacatggtctccctcctgaaacccaagatctttcctac 13322962  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| |||||||| |||||||||| |||||| ||| | |||||  |||||   |||||||| || || || ||||| |  || || |  |||||||| ||    
T  13322961 gcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatcctttctatgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaa 13322862  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || |||| |||  || ||||||||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| || || |||| ||| |||||||| | |||  || |     
T  13322861 cacagcactctgacctgactcaaaccagcataaaggagttctgcacctccgaccgtacaaagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatggtaattg 13322762  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 364  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  13322761 ttgttgtaggtaaactctatcaaaggta 13322734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 15725275 - 15725195
Alignment:
Q  115 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatc 195  Q
    |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| | |||| ||| ||||||| || ||||| ||||||    
T  15725275 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 15725195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 186
Target Start/End: Original strand, 14571567 - 14571717
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    ||||||||| ||| || ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||   |||| ||     
T  14571567 aggagtcaaattcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttccta 14571666  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttct 186  Q
    | ||| ||| | ||||||||| ||| |||||| ||| | ||||| ||||||    
T  14571667 cgcttgtcacggtaactcttcagtcgactctgcgacgctttcatcttttct 14571717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 495; Significance: 0; HSPs: 62)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 495; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 578
Target Start/End: Original strand, 14997382 - 14997948
Alignment:
Q  12 gacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcacca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14997382 gacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaagattcaccctcaaaaacacatgatcacca 14997481  T
Q  112 acttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14997482 acttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgatgactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcttgaatcatcttaaccttttccgtag 14997581  T
Q  212 tttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgt 311  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14997582 tttcttgcacaactttcggtcctaacaaagcactctctctggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgc 14997681  T
Q  312 cattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaac 411  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14997682 cataccaatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactaacaccttgctccaaaacacaagctctcaac 14997781  T
Q  412 aaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaac 511  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  14997782 aaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaactttgttgccaaagcagcttgcaaac 14997881  T
Q  512 tctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14997882 tctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 14997948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 462; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 15293363 - 15292795
Alignment:
Q  12 gacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcacca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15293363 gacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccattcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcacca 15293264  T
Q  112 acttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtag 211  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  15293263 acttgaaactcaatatccttcctccttttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttctgtag 15293164  T
Q  212 tttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15293163 tttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactttctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgc 15293064  T
Q  312 cattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaac 411  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  15293063 cattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacactttgctccaaaacacaagctcttaac 15292964  T
Q  412 aaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaac 511  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15292963 aaatcctccaaactctgaatagtcctctatgtctgcccatcgatctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaac 15292864  T
Q  512 tctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15292863 tctcccaaaacatagaagtaaacctc-gatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaatct 15292795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 453; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 581
Target Start/End: Original strand, 9290902 - 9291470
Alignment:
Q  13 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  9290902 acatcaaacggtccaacgaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacatcggtcacaggattcaccctcaaaaatacctgatcaccaa 9291001  T
Q  113 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 212  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  9291002 cctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagt 9291101  T
Q  213 ttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9291102 ttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactttctccggactcaaaccaacacaatggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgcc 9291201  T
Q  313 attccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 412  Q
    || || ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9291202 ataccgatactagaatgaaaactgctgttgtaagtaaactcaatcaacgataaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 9291301  T
Q  413 aatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaact 512  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9291302 aatcttccaaactctaaatagtcctctccgtctgtccatcggtctgaggatggtaagcagtactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaact 9291401  T
Q  513 ctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  9291402 ctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactataaggaataccatgcaatct 9291470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 435; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 579
Target Start/End: Original strand, 13247712 - 13248278
Alignment:
Q  13 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13247712 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcaagaccaacaccgatcacatgattcaccctcaaaaatacatgatcaccaa 13247811  T
Q  113 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13247812 cttgaaactcaatatcttttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 13247911  T
Q  213 ttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  13247912 ttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgttctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggagcc 13248011  T
Q  313 attccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 412  Q
    || | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  13248012 atcctaatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattagtcccaactgacaccttgctctaacacacaagctctcaaca 13248111  T
Q  413 aatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaact 512  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13248112 aatcctccaaactctgaatagtcctctccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaact 13248211  T
Q  513 ctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaat 579  Q
    |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  13248212 ctcccagaacttagaagtaaacctcagatcccgatccgacacaatactagaaggaatatcattcaat 13248278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 12343041 - 12342503
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | |||  |||| ||||||| ||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  12343041 gtcaacttccgacacttcaaagcacgtctaacatcggttacaggatacactctaaaaaatacatgatcaccaacctgaaactcaatattcttcctcctct 12342942  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||  ||    
T  12342941 tatcatgataactcttctgcctactctgagacgcccttatattctcttgaatcatcttaaccttttatgtagtctcttgcacaacctccggtcctagtaa 12342842  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
    |||| | || || |||||| ||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| | |||    
T  12342841 agcactttcacctgactcataccaacacaacgacgttctacacctccaaccatacaaagcctcaaacggtgccatcccaatactagaatgaaaattgttg 12342742  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  12342741 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcaacccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttcaaaactctgaatattcctct 12342642  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | ||||| ||||| || || ||||| |||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12342641 ccgtctgcccatcagtatggggatgataagcataactcaaccttaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcag 12342542  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    |||  |||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  12342541 atcttgatctgacacaatactagatggaattccatgcaa 12342503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 13 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 55375563 - 55375177
Alignment:
Q  13 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55375563 acatcaaacggtccaacaaaacgagaagtcaacttcatacacttcaaagctcgaccaacaccagttacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 55375464  T
Q  113 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  55375463 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctactgaatcatcttaaccttttccgtagt 55375364  T
Q  213 ttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtc 312  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| | || || || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  55375363 ttcttgtacaacttctggtcctaacaaagcactttcacctgattcaaaccaacacaacagtgtcctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggtgcc 55375264  T
Q  313 attccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaaca 399  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  55375263 attccgatactagaatgtaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgcttcaaaaca 55375177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 16 - 563
Target Start/End: Original strand, 16685324 - 16685870
Alignment:
Q  16 tcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaactt 115  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  16685324 tcaaacggcccaacaaaacgcggtgtcaacttccaacacttcaaagcacacccaacaccggttacatgattcactctcaaaaacccatgatcaccaactt 16685423  T
Q  116 gaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttc 215  Q
    |||| | |||||||||  ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |  |||| || || |||||||||||||| || | |||||| ||    
T  16685424 gaaattaaatatccttcatcctcttatcatgataaattttctgcctactctgagacgctctcatcttctcctgaatcatcttaactttcttcgtagtctc 16685523  T
Q  216 ttgcaca-acttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcat 314  Q
    ||||||| |  |  ||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||||  || ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  16685524 ttgcacataaat--ggtcctaacaaagcactctatcctgactcataccaacataacgacgttctacacctccttccatacaaagcctcaaacggtgccat 16685621  T
Q  315 tccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaa 414  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  16685622 accaatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcaactcaacttaaaccttgctccaaaacacaagctttcaacaga 16685721  T
Q  415 tcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactct 514  Q
    |||||||||   |||||||  |||||  |||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||  ||||    
T  16685722 tcttccaaagattgaataggtctctccatctgcccatcggtctgaggatgatacgcataactcaacctcaacttagttcccaaagctacttgcaggctct 16685821  T
Q  515 cccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactaga 563  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||    
T  16685822 cccaaaacttcgaagtaaacctcggatctctatccaacacaatgctaga 16685870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 12 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16445418 - 16445175
Alignment:
Q  12 gacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcacca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16445418 gacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccagtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcacca 16445319  T
Q  112 acttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtag 211  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||  ||||    
T  16445318 acttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttatgtag 16445219  T
Q  212 tttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggac 255  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  16445218 tttcttgcacaacttccagtcctaacaaagcactctctccggac 16445175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 12132608 - 12132293
Alignment:
Q  19 aacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12132608 aacggtccaacaaaacgaggagtcaactttcgacacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaa 12132509  T
Q  119 actcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttg 218  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12132508 actcaatgtccttcctcctcttatcatgacaactcttctgcctactttgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttg 12132409  T
Q  219 cacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattcca 318  Q
    ||||||||| || ||||||||| || | || || |||||| ||||||||||||  || ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||     
T  12132408 cacaacttctggacctaacaaaacactttcacctgactcataccaacacaacgacgttctacatc-ccgatcatacaaagcctcaaacggtgtcataccg 12132310  T
Q  319 atactagcatgaaaact 335  Q
    ||||||| |||||||||    
T  12132309 atactagaatgaaaact 12132293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 115 - 578
Target Start/End: Original strand, 14680736 - 14681199
Alignment:
Q  115 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagttt 214  Q
    |||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| |    
T  14680736 tgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 14680835  T
Q  215 cttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcat 314  Q
      || ||||  || |||||||| |   |  | || || |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  14680836 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 14680935  T
Q  315 tccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaa 414  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||  | ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| |||||||||||    
T  14680936 tccaatactagaatgataactattattgtatatgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagcacacaaactctcaacaaa 14681035  T
Q  415 tcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactct 514  Q
    || || |    |||||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| |    
T  14681036 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 14681135  T
Q  515 cccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
     ||||||| |||||||||| || ||||| | |||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  14681136 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgatacaatgctcgaaggaataccatgcaa 14681199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 16252366 - 16251828
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| |||||| || |    
T  16252366 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgc 16252267  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | || || || |||||||||||||||||||| || ||||| |  || | ||  || ||||||||    
T  16252266 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgcttttattttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtctgctgaagaatctctggtcctaa 16252167  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | || || ||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  16252166 gaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaataatagaatgataacta 16252067  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| ||  ||||||||| || |    |||||| ||||    
T  16252066 ttattgtacgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaacttacaacaaatcctctagtgactgaattgtcc 16251967  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||||| ||||||||| ||||| | ||| ||||| |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||    
T  16251966 tctctgactgaccatctgtctgcgaatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 16251867  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
     ||||| | ||| || ||||| || ||||| | ||||||    
T  16251866 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 16251828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 19778711 - 19778173
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||| ||||||| ||| ||||| | ||    
T  19778711 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgct 19778612  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  19778611 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 19778512  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
     ||  | ||||| || ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||  |||||||     
T  19778511 cgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactatta 19778412  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  19778411 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcaactgaattgtcctct 19778312  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  19778311 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 19778212  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| ||||| || || ||||| | |||||||||    
T  19778211 atctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaa 19778173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 18227366 - 18226829
Alignment:
Q  38 gagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcct 137  Q
    ||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| || ||| || |     
T  18227366 gagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtgctctccttcctgaaactcaagattcttcctgcg 18227267  T
Q  138 cttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaac 237  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||| || |  ||||| |  || ||||  || ||||||||     
T  18227266 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttcttagtagtcttctgaacaatctcgggtcctaag 18227167  T
Q  238 aaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactat 337  Q
    |   |  | || || |||| |||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  18227166 accactctttcacctgactaaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactat 18227067  T
Q  338 tgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcct 437  Q
    | ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |    |||||| |||||    
T  18227066 tattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcct 18226967  T
Q  438 ctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctc 537  Q
    ||||| ||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| || |  || |||||  |||||||||||  ||||||| |||||||||| ||     
T  18226966 ctctgactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcctccaaaatctagaagtaaatctt 18226867  T
Q  538 ggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
    ||||| ||||| || ||||| || ||||| | ||||||    
T  18226866 ggatctcgatctgatacaatgctcgaaggcacaccatg 18226829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Original strand, 27711430 - 27711968
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||| ||||||| ||| ||||| | ||    
T  27711430 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgct 27711529  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  27711530 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 27711629  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | ||||| || ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  27711630 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagtctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 27711729  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  27711730 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 27711829  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| |||||  |||| || || |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  27711830 ccgactgaccatctgtctgcagatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 27711929  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| ||||| || || ||||| | |||||||||    
T  27711930 atctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaa 27711968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 29039322 - 29038784
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || ||||||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||| ||||||| ||| ||||| | ||    
T  29039322 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgct 29039223  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  29039222 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 29039123  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | ||||| || ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  29039122 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 29039023  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || || || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  29039022 ttatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 29038923  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  29038922 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 29038823  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  29038822 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 29038784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 40 - 353
Target Start/End: Original strand, 14159586 - 14159899
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || ||||  ||| | || ||||  ||||||||||| ||  ||||||| |||| ||| ||||| | ||    
T  14159586 gtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcatgggagtaactctcaggaacacatgatctcctccttgaaattcaagatcttttctacgct 14159685  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||  |||||||| || |     
T  14159686 tatcatgataactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttcagtagtctgttgaacaatctccggtcccaaaac 14159785  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      ||||||| || |||||||||||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  14159786 cacattctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccgtacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactatta 14159885  T
Q  340 ttgtaagtaaactc 353  Q
    ||||| || |||||    
T  14159886 ttgtacgtgaactc 14159899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 362
Target Start/End: Original strand, 14652401 - 14652724
Alignment:
Q  39 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctc 138  Q
    |||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || |||||| || | || |||||||| || ||||| ||  |||||||||||| ||| || || | |    
T  14652401 agtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaagatctttcctacgc 14652500  T
Q  139 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaaca 238  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || | ||| ||||| || |    
T  14652501 ttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacgatttctggtcccaaaa 14652600  T
Q  239 aagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactatt 338  Q
    |  || |||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||| ||    
T  14652601 atacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagttctgcaccttcgaccatacagagcctcaaaaggtgtcattccaatgctagaatgataactgtt 14652700  T
Q  339 gttgtaagtaaactcaatcaacgg 362  Q
     ||||| || || || ||||||||    
T  14652701 attgtacgtgaattctatcaacgg 14652724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Original strand, 12476694 - 12477232
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || | ||    
T  12476694 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgct 12476793  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||| ||| |  || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  12476794 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaacttcctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 12476893  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | ||||| || ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  12476894 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 12476993  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| ||      |||||| |||||||    
T  12476994 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctcttgcgactgaattgtcctct 12477093  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  12477094 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 12477193  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  12477194 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 12477232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Original strand, 18297299 - 18297837
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||| ||||||| ||| ||||| | ||    
T  18297299 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgct 18297398  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  18297399 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 18297498  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | ||||| || ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  18297499 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 18297598  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| || ||||    
T  18297599 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgttctct 18297698  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | || |||| |||||||||| || ||    
T  18297699 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccgaaatctagaagtaaatcttgg 18297798  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  18297799 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 18297837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 16355366 - 16354870
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || |  ||  ||||||| |||| ||| || || |    
T  16355366 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtttccttcttgaaattcaagatctttcctgc 16355267  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||||||||||||| | || |||| |||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| |  || ||||  || ||||||||    
T  16355266 gcttatcatgataattattttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaa 16355167  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | ||||| ||||||||||||||||||||  | || || ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  16355166 gaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggaattctccatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattcaaatactagaatgataacta 16355067  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || ||||| || |||||||||||||| | |      |||||| |  | |||||||  | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| ||||    
T  16355066 ttattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgcttaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcc 16354967  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaa 533  Q
    |||| | ||||||||| | ||| ||||| || || |||||||||||||| ||||  ||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16354966 tctccgactgaccatctgcctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaa 16354870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 14303896 - 14303358
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || ||||||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||    
T  14303896 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgct 14303797  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||| ||| ||||||| || ||||| ||||||  ||| || || ||||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  14303796 tatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatccgaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagac 14303697  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | || || ||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||     
T  14303696 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagcatgataactatta 14303597  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  14303596 ttgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcttctagcgactgaattgtcctct 14303497  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | || |||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  14303496 ccgactaaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 14303397  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  14303396 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 14303358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 53 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 14851271 - 14850749
Alignment:
Q  53 acttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 152  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||| || | || || ||||| |||||||| ||  ||||||||||||  |  || || | |||||||||||||||    
T  14851271 acttcaatgcacgtccaacaccggtcacatgagtgactctaaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtttttcctacgcttatcatgataact 14851172  T
Q  153 cttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccg 252  Q
    ||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||||| ||  |||||| ||| |||| ||| |||||||| |   || |||| ||     
T  14851171 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgtatcatcttaaccttctcaatagtttgttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacct 14851072  T
Q  253 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaact 352  Q
    ||||| | |||||||||||| || || ||||| |  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| || | || ||||| || ||||    
T  14851071 gactcgagccaacacaacggagttctgcaccttcttccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataattgttattgtatgtgaact 14850972  T
Q  353 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatc 452  Q
    | |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| |||||||||| ||||||||   ||||||  | || || | |||||||||    
T  14850971 ctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcttccaacgactgaatcattctttccgactgaccatc 14850872  T
Q  453 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgac 552  Q
     ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||  || |||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||     
T  14850871 tgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcagatctctatctgat 14850772  T
Q  553 acaatactagaaggtataccatg 575  Q
    ||||| || ||||| | ||||||    
T  14850771 acaatgctcgaaggaacaccatg 14850749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 138 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 1640245 - 1640024
Alignment:
Q  138 cttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaac 237  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||  || ||||||||     
T  1640245 cttatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgccttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctcgggtcctaaa 1640146  T
Q  238 aaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactat 337  Q
    |   |  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| || |||    
T  1640145 accaccctctcacctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcatcttcgaccatacaaagcctcaaaaggtgacattccaatactagaatgataaatat 1640046  T
Q  338 tgttgtaagtaaactcaatcaa 359  Q
    | |||||||| ||||| |||||    
T  1640045 tattgtaagtgaactctatcaa 1640024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Original strand, 8386506 - 8387044
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | ||||| |||| ||| ||||| | ||    
T  8386506 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgct 8386605  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  8386606 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 8386705  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | ||||| || ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||| |||| |||||||     
T  8386706 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggcgccattccaatactagaatgataactatta 8386805  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || || || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  8386806 ttatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 8386905  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  8386906 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 8387005  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  8387006 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 8387044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Original strand, 23955841 - 23956379
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||| ||||||| ||| ||||| | ||    
T  23955841 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgct 23955940  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  23955941 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 23956040  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | ||||| || ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||  |||||||     
T  23956041 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaggcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactatta 23956140  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |     |||| || |  | ||||| || | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  23956141 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgacggtcctaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 23956240  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || ||||| |||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  23956241 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaacttaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 23956340  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| |||||||| || ||||| | |||||||||    
T  23956341 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 23956379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 36 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 3264976 - 3264452
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | |||||||||| |||||||||     
T  3264976 aggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctt 3264877  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 235  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||  | ||||| ||||||   |||| | | || || || ||||| || || || |  |||||||| |    
T  3264876 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtccca 3264777  T
Q  236 acaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaact 335  Q
    ||| | || |||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||| |  ||| | ||    
T  3264776 acacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagct 3264677  T
Q  336 attgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtc 435  Q
     ||||| ||||||||||||||||| || ||       ||||||    |||||||||| |  |||||  | |||||||||||||||||    ||||| |||    
T  3264676 gttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtc 3264577  T
Q  436 ctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacc 535  Q
    ||||| | ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||  |||| || |  ||||| ||  | || ||||| | ||| ||  ||||||| ||||    
T  3264576 ctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacc 3264477  T
Q  536 tcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    ||||||| | |||||||||||||||    
T  3264476 tcggatctctatccgacacaatact 3264452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 40 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 9849656 - 9849118
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||  | |  || ||||||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||   |    
T  9849656 gtcaacttcttggacttcaaagcacgaccaacaccggtcactaggtcaactctcaaaaacatttgatctccgacttgaaattcaatatccttcctctgtt 9849557  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||  ||  | ||||| || || ||||||||||||||||| ||| |||| |  || |||||| | ||||| | ||     
T  9849556 tatcatgacaactcttctacctactctacgatgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttctccatagtctgctgaacaactcctggtccaatcat 9849457  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
    |||| | ||||| |||||| |||||||||||  | | ||| | ||||  || |||||  | ||||| |||| ||| | |||||| | ||||||| | |||    
T  9849456 agcactttctcctgactcataccaacacaacattattctatatctccttccgtacaacacttcaaaaggtgccatactaatactcgaatgaaaattgttg 9849357  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||||   |||||| || || |||||| |||||||  | || ||||||||||| |||  ||| || || ||||    
T  9849356 ttgtaagtgaattcaatcaacggtaagcattcactccaactcactccctgctcctaaacacacacccttaacaaatcttctaaagactggatggttctct 9849257  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | ||||||| |||  | ||||| || |||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||| || ||  |||||||| |    
T  9849256 ccgtctgactatc-atttgaggttgttaagtagaactcaacctcaacttcgttcccaacgcttcttgcaaactctcccaaaactttgatttaaacctcag 9849158  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaat 579  Q
    ||  | ||| | ||||||  |||| || ||||||||||||    
T  9849157 atatctatctggcacaatgatagatggaataccatgcaat 9849118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 8053541 - 8053003
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | ||||| |||| |||  |||| | ||    
T  8053541 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatctcttctacgct 8053442  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || |||| ||| |||||||| |     
T  8053441 tatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatttctggtcctaagac 8053342  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  ||||||| || ||||||||||||||| | || || || |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  8053341 cactctctctcctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctccgaccatacaaggcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 8053242  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||  | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  8053241 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctgaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 8053142  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  8053141 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 8053042  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| ||||| || || ||||| | |||||||||    
T  8053041 atctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaa 8053003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Original strand, 12523770 - 12524308
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || |  |    
T  12523770 gtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacggt 12523869  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  12523870 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaaaac 12523969  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | || || ||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  12523970 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataactatta 12524069  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    ||||| || ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||   ||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  12524070 ttgtatgtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 12524169  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| || || ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||    
T  12524170 ccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctcgg 12524269  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  12524270 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 12524308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 36 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 44662048 - 44661524
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    |||||||||||| ||  ||||||  ||||||||||| || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | |||||||||| ||||||||||    
T  44662048 aggagtcaactttctcgacttcagcgcacgaccaacacccgtcaaaggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctc 44661949  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 235  Q
    | ||| ||| | ||||||||||||| |||||| ||  | ||||| ||||||   |||| | | || || || ||||| || || || |  |||||||| |    
T  44661948 cgcttgtcacggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtccca 44661849  T
Q  236 acaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaact 335  Q
    ||| | || |||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||| |  ||| | ||    
T  44661848 acacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagct 44661749  T
Q  336 attgttgtaagtaaactcaatcaacggtaa-acattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagt 434  Q
     ||||| ||||||||||||||||| |  || | | | |||||||    ||||||| || |  |||||  |||||||||||||||||||    ||||| ||    
T  44661748 gttgttataagtaaactcaatcaaagacaagagact-gtcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaatcttccaacgattgaatcgt 44661650  T
Q  435 cctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaac 534  Q
    |||||  | ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||  | || ||||||| ||| ||  ||||||| |||    
T  44661649 cctcttcgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaac 44661550  T
Q  535 ctcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    |||||||| | |||||||||||||||    
T  44661549 ctcggatctctatccgacacaatact 44661524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 247 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 15147595 - 15147264
Alignment:
Q  247 tctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaag 346  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||| || || |    
T  15147595 tctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattatacg 15147496  T
Q  347 taaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctg 446  Q
    | |||||||||||||| | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| ||||||||||||| || |    |||||| |||||||| | |||    
T  15147495 tgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactg 15147396  T
Q  447 accatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccga 546  Q
    |||||| ||||| ||||| || |  |||||||||||||| ||||  ||||||||  |||||||||||| ||||||| || ||||||| || ||||| | |    
T  15147395 accatctgtctgcggatgatacgtcgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctaaaagtaaatcttggatctcta 15147296  T
Q  547 tccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    || || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  15147295 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 15147264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 36 - 578
Target Start/End: Original strand, 20891072 - 20891614
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | |||||||||| | |||||||     
T  20891072 aggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctt 20891171  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 235  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||  | ||||| |||||    |||| | | || || || ||||| || || || |  | |||||| |    
T  20891172 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaaattcggtccca 20891271  T
Q  236 acaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaact 335  Q
    ||| | || |||| || ||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||| | ||    
T  20891272 acacaacactctcacctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccggccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatacttgaatgatagct 20891371  T
Q  336 attgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtc 435  Q
    |||||| || || ||||||||||| ||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  | |||||||||||||||||    || || |||    
T  20891372 attgttatatgtgaactcaatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaacaaatcttccaatgattggatcgtc 20891471  T
Q  436 ctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacc 535  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||| || |  ||||||||| | || ||||||| ||| ||  ||||||| ||||    
T  20891472 ctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacc 20891571  T
Q  536 tcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    |||||||   ||||||||||||||| || |||| ||| |||||    
T  20891572 tcggatctttatccgacacaatacttgacggtacaccgtgcaa 20891614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 29453719 - 29453195
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |||||||| || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | |||||||||| |||||||||     
T  29453719 aggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctt 29453620  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 235  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||  | ||||| ||||||   |||| | | || || || ||||| || || || |  ||| |||| |    
T  29453619 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaaccttactttctcagtagtctcatgaaccaaatcccgtccca 29453520  T
Q  236 acaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaact 335  Q
    | | | || |||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||| |  ||| | ||    
T  29453519 atacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagct 29453420  T
Q  336 attgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtc 435  Q
     ||||| ||||||||||||||||| || ||       ||||||    |||||||||| |  |||||  | |||||||||||||||||    ||||| |||    
T  29453419 gttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtc 29453320  T
Q  436 ctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacc 535  Q
    ||||| | ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||  | || ||||| | ||| ||  ||||||| ||||    
T  29453319 ctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacc 29453220  T
Q  536 tcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    ||||||| | |||||||||||||||    
T  29453219 tcggatctctatccgacacaatact 29453195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Original strand, 40473134 - 40473672
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  40473134 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 40473233  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||  ||| | ||||| || ||||||||||| | ||| || || |||||||  || ||||  ||||||||||| |     
T  40473234 tatcgtgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattttctcttgaatcatttgaactttctcagtagtttgctgaacaatctccggtcctaagac 40473333  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | || || ||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||| || | |||||||     
T  40473334 cactctttcacctgactcgaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaataataactatta 40473433  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    ||||| || |||||||||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||   ||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  40473434 ttgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 40473533  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| || || ||||| || || |||||||||||||| ||    ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  40473534 ccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcaaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 40473633  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| |||||||| || ||||| | |||||||||    
T  40473634 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 40473672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 364
Target Start/End: Original strand, 15070506 - 15070831
Alignment:
Q  39 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctc 138  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||||| || || |||| |||| | || |||| |||||||||||| ||  ||||||||||||   ||||||| | |    
T  15070506 agtcaacttcataaacttcaacacacgacctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttcttcgc 15070605  T
Q  139 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaaca 238  Q
    || ||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||| ||||||   |||||||| ||||| |||||||| |  || || |  || ||||| ||||    
T  15070606 ttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaactaaatctggtcccaaca 15070705  T
Q  239 aagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactatt 338  Q
       || | ||||| ||||||||||||||||| || || || |||||| ||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  |||| ||    
T  15070706 ctacactttctcccgactcaaaccaacacaatggagttctgcacctctgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgtt 15070805  T
Q  339 gttgtaagtaaactcaatcaacggta 364  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||    
T  15070806 gttgtacgtgaactctatcaacggta 15070831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 39 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 1649456 - 1648920
Alignment:
Q  39 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctc 138  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || || | ||| |||||||| ||  | ||||||||||  ||||| |||| |    
T  1649456 agtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttagaaatacatgatcgccctcctgaaactcaaggtccttcctccgc 1649357  T
Q  139 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaaca 238  Q
    || || || |||||||| |||| |||||| ||| | ||||| ||||||   || ||||| || || | |||||| || || || |  |||||||| ||||    
T  1649356 ttgtcgtggtaactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgattatcttgactttcttcgtagtctcatgaaccaaatccggtcccaaca 1649257  T
Q  239 aagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactatt 338  Q
       || ||||||  ||||||||||| || || || || || |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  |||| ||    
T  1649256 ccacactctctcatgactcaaaccagcataaaggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgacataccaatactcgaatggtaactgtt 1649157  T
Q  339 gttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctc 438  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  | ||||||||||| |||||    || || ||||||    
T  1649156 gttgtaagtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacacactcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctc 1649057  T
Q  439 tctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcg 538  Q
    || | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||||||  | |||||||||| | ||||| | ||||| |||||||    
T  1649056 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttctaaaatctggaagtgaacctcg 1648957  T
Q  539 gatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
    |||| | ||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  1648956 gatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatg 1648920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 142 - 560
Target Start/End: Original strand, 15077831 - 15078249
Alignment:
Q  142 tcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaag 241  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||| ||||||   |||||||| ||||| |||||||| |  || || |  || ||||| ||||       
T  15077831 tcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaactaaatctggtcccaacacta 15077930  T
Q  242 cattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgtt 341  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||| || || || |||||| ||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  |||| |||||    
T  15077931 cactttctcccgactcaaaccaacacaatggagttctgcacctctgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgtt 15078030  T
Q  342 gtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctct 441  Q
    ||| || ||||| |||||||||| |      ||||||    |||||||||| |  |||||  |||||| |||||| || ||   |||||| || ||||      
T  15078031 gtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactgaatcgttctcttc 15078130  T
Q  442 gtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggat 541  Q
    | ||||||||  || || ||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  15078131 gactgaccatttgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtaaacctcggat 15078230  T
Q  542 cccgatccgacacaatact 560  Q
    | | |||||||||||||||    
T  15078231 ctctatccgacacaatact 15078249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 253 - 557
Target Start/End: Original strand, 8706225 - 8706529
Alignment:
Q  253 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaact 352  Q
    |||||||||||||| ||||  || || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||  ||||||| |||  |||| |||||||| || ||||    
T  8706225 gactcaaaccaacataacgaagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaatggtgtcattcatatactagaatggtaactgttgttgtacgtgaact 8706324  T
Q  353 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatc 452  Q
    | |||||||||| |      |||||| |  |||||||||| |  |||||| ||||||||||||| || ||   |||||| |||||||| | |||||||||    
T  8706325 ctatcaacggtagatgactatcccaagtcccaccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatc 8706424  T
Q  453 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgac 552  Q
     || || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||  | ||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||||| | ||| |||    
T  8706425 tgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaactcaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgac 8706524  T
Q  553 acaat 557  Q
    |||||    
T  8706525 acaat 8706529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 11207413 - 11206889
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||| || |||| |||| | || |||| ||| |||||||||||  | |||||||||| |||||||||     
T  11207413 aggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctt 11207314  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 235  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||  | ||||| ||||||   |||| | | || || || ||||| || || || |  |||||||| |    
T  11207313 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtccca 11207214  T
Q  236 acaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaact 335  Q
    ||| | || |||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||| |  ||| | ||    
T  11207213 acacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagct 11207114  T
Q  336 attgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtc 435  Q
     ||||| ||||| ||||||| ||| || ||       ||||||    ||||||| || |  |||||  | |||||||||||||||||    ||||| |||    
T  11207113 gttgttataagtgaactcaaccaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtc 11207014  T
Q  436 ctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacc 535  Q
    ||||| | ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||  | || ||||||| | | ||  ||||||| ||||    
T  11207013 ctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttcaagaacctagaagtgaacc 11206914  T
Q  536 tcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    || |||| | |||||||||||||||    
T  11206913 tcagatctctatccgacacaatact 11206889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 100 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 15359208 - 15358944
Alignment:
Q  100 acatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaa 199  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||   ||||||| | ||| |||||| |||||||||||| |||||| ||| | ||||| ||||||   |||||||| |    
T  15359208 acatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgaaaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttta 15359109  T
Q  200 ccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagc 299  Q
    |||| |||||||| |  || || |  |||||||| |||| | || ||||||| ||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15359108 ccttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagc 15359009  T
Q  300 ctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggta 364  Q
     || ||||||| ||| |||||||  | |||  |||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  15359008 ttcgaacggtgccataccaatacatgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggta 15358944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 51606362 - 51606035
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||| || || || ||||  ||| |||| || | ||| |||||||||||  ||||||||||||   |||||||||    
T  51606362 ggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttataaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 51606263  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
      || ||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||| || |||   |||||||| || ||||| ||||| || || || |  |||||||| |     
T  51606262 gtttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtcccag 51606163  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||| |||||| ||||| |  ||| ||||     
T  51606162 cacaacactttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgagtgataactg 51606063  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 364  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  51606062 ttgttgtaggtgaactctatcaatggta 51606035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 578
Target Start/End: Original strand, 7090523 - 7091064
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  |||||||||| |  ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  7090523 ggagtcaacttctttgacttcaaagctcatccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 7090622  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||||||||| |||||||| |||| |||||  ||| | ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||  || ||||  || ||||||||    
T  7090623 gcttatcatggtaactcttttgtcgactcttcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaa 7090722  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | || || || ||||||||||||||| | || || || ||||||||||| ||||||||| | |||  ||||| |||||||| |||| |||||    
T  7090723 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaactgagttctgcatctccgaccatataaagcctcataaggttccattctaatactagaatgataacta 7090822  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || || || || ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |||||||  | ||| ||| | |||||||||||||| ||   || ||| ||||    
T  7090823 ttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctaaagaacccaaaccctcaacaaatcttctaacgactaaatcgtcc 7090922  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||| ||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||  || |||||  |||||||||| | | ||||| ||||||||||  |    
T  7090923 tctccgactgactatctgtctgcggatgatatgctgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttctaaaatctagaagtaaattt 7091022  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
     ||||| | ||| |||||||| || ||||| | |||||||||    
T  7091023 tggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 7091064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 55 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 15415189 - 15414882
Alignment:
Q  55 ttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactct 154  Q
    ||||| ||||||||||| ||  ||||| || | || |||||||||||||| || ||  ||||||| ||||  || || || | |||||||||||||||||    
T  15415189 ttcaaggcacgaccaacacctatcacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaattcaaggtctttcctacgcttatcatgataactct 15415090  T
Q  155 tctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccgga 254  Q
    | |||| |||||| ||| | ||||| || ||    ||||  || |||||||||||||| | ||| || |  || ||||| ||||   || | || || ||    
T  15415089 tttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcccttatcaatttgaccttttccgtagtctgttgaactatatctggtcccaacattacactttcacccga 15414990  T
Q  255 ctcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactca 354  Q
    |||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||  |||| |||||||| || |||||     
T  15414989 ctcaaaccaacataacggagttctgcacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactct 15414890  T
Q  355 atcaacgg 362  Q
    ||||||||    
T  15414889 atcaacgg 15414882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 15149926 - 15149764
Alignment:
Q  38 gagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcct 137  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || |     
T  15149926 gagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcg 15149827  T
Q  138 cttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaac 200  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || |||||||||||||||||    
T  15149826 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaac 15149764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 36 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 15003546 - 15003218
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||     |||||     
T  15003546 aggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggattttcta 15003447  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 235  Q
    | ||| ||||| |||||||| |||| |||||| ||| | ||||| ||||||   |||||||| || || |||||||| |  || || |  || ||||| |    
T  15003446 cgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtctgatgaactaaatctggtccca 15003347  T
Q  236 acaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaact 335  Q
    |||   || | ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||| |||||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| | |||  ||||    
T  15003346 acaccacactttctcccgactcaaaccaacataaaggagtcctccacttccgaccatacaaagctttgaacggtgccataccaatactcgaatggtaact 15003247  T
Q  336 attgttgtaagtaaactcaatcaacggta 364  Q
     |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  15003246 gttgttgtacgtgaactctatcaacggta 15003218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 14266742 - 14266495
Alignment:
Q  115 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagttt 214  Q
    |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || |||   ||||||| |||||| || |||||||    
T  14266742 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctctcagatcatctgaaccttctcagtagttt 14266643  T
Q  215 cttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcat 314  Q
      || ||||  || |||||||| |   |  | || || ||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || |||| |||    
T  14266642 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 14266543  T
Q  315 tccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacgg 362  Q
    ||||||||| | |||| | ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  14266542 tccaatactggaatgatagctattattgtatgtgaactcgatcaacgg 14266495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 260 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 18550018 - 18549700
Alignment:
Q  260 accaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaa 359  Q
    |||||||||| ||||| | ||| |||| |||||||||  ||||||| |||| ||| |||||||||| ||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||    
T  18550018 accaacacaaaggtgttcgacatctcctaccatacaatacctcaaatggtgccatcccaatactagaatggaaattgttgttataagtaaactcaattaa 18549919  T
Q  360 cggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctga 459  Q
     || ||  |  | ||||||||  | ||||| ||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||    || || || || || ||||||||||| || ||     
T  18549918 tggcaagtaagcatcccaactccctccttgttccagcacacatgctcttaacaagtcttccaatgattggatggttctttcggtctgaccatcagtttgt 18549819  T
Q  460 ggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatac 559  Q
    || || || |||||||||| | | || |||||||||||||||  |||||||||  |||||||  | || || ||||| ||||| | |||||| |||||||    
T  18549818 gggtgatatgcagaactcagttttaacttagttcccaaagcacattgcaaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatac 18549719  T
Q  560 tagaaggtataccatgcaa 578  Q
    | ||||| | |||||||||    
T  18549718 tcgaaggaacaccatgcaa 18549700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 37 - 364
Target Start/End: Original strand, 16146003 - 16146330
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||| ||| ||||||||| |  | ||||||||||   |||| || |    
T  16146003 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcatcctcctgaaactcaagggccttcctac 16146102  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||| |||||    |||| ||| || || |||||||| |  || || |  || ||||| ||    
T  16146103 gcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcaccttgactttctccgtagtctgatgaaccaaatctggtcccaa 16146202  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || ||| ||| ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||| |||||||| | |||  ||||     
T  16146203 cacaacactctgtcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaatcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 16146302  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 364  Q
    || ||||| || || || ||||||||||    
T  16146303 ttattgtatgtgaattctatcaacggta 16146330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 40 - 323
Target Start/End: Original strand, 33223012 - 33223295
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||  |||||||| | ||    
T  33223012 gtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagttcctttcttcgct 33223111  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    | ||||| ||||||||||||| |||||| ||  | ||||| |||||    |||| ||| || || || |||||||| || || |  || ||||| ||||     
T  33223112 tgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacttgactttctcagtagtttcatgaaccaagtctggtcccaacac 33223211  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatact 323  Q
      || ||||||| ||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| || |  || |||||||| ||||||||    
T  33223212 cacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaatgctttgaatggtgtcataccaatact 33223295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 434 - 560
Target Start/End: Original strand, 33223411 - 33223537
Alignment:
Q  434 tcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaa 533  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||||||| | || ||||||| ||| ||  ||||||| ||    
T  33223411 tcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaa 33223510  T
Q  534 cctcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||    
T  33223511 cctcggatctctatccgacacaatact 33223537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 88 - 577
Target Start/End: Original strand, 27900528 - 27901017
Alignment:
Q  88 accctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttctt 187  Q
    ||||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||  || || || | ||| |||||||| ||||||| || |||||| ||| | ||||| || |||     
T  27900528 accctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttctatcgactctgcgacgctttcatcttctctc 27900627  T
Q  188 gaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccg 287  Q
      |||||||| || || || ||||| || || || |  |||||||| |||| | || | ||||| ||||||||||| || || |  ||||| ||||||||    
T  27900628 tgatcatcttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctcccgactcaaaccagcataaagaagtcctgcacctccg 27900727  T
Q  288 accatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacacct 387  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  |||| |||||||| || ||||| || |||||||        ||||||    |||||    
T  27900728 accatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatgaacggtaggtgactatcccaagctccacct 27900827  T
Q  388 tgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatt 487  Q
    ||||| |  |||||  | || | |||||| || |||   || || |||||||| | ||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  27900828 tgctcaagcacacatacccttagcaaatcctctaaagattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctacggatgataagctgaactcaacctcaatt 27900927  T
Q  488 tagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgca 577  Q
    | |  ||||| ||| |||| ||||||| ||||||| | |||||||||| ||| || | ||||||||| ||||| || || | ||||||||    
T  27900928 ttgaacccaatgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaaccccgggtctctatccgacactatactcgacggaacaccatgca 27901017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 560
Target Start/End: Original strand, 15246015 - 15246538
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||| || || || |||| |||  | || |||| ||| |||||||| ||  | ||||||||||   |||| || |    
T  15246015 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggggtaactctcagaaatacatgatctccctcctgaaactcaaaggccttcctac 15246114  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
      || ||||| |||||||| |||| |||||| ||| | ||||| ||||||   |||||||| ||||| | |||||| |  || || |  |||||||| ||    
T  15246115 gtttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatctttaccttcttcgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaa 15246214  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || | ||||| ||||||||| |  | || || || || |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||   |||     
T  15246215 cacaacactttctcctgactcaaactagaataaaggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtgactg 15246314  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||        |||||||   |||||||||| |  |||||  |||||| |||||| || ||    || || || |    
T  15246315 ttgttgtacgtcaactctatcaacggtagttgactatcccaacctccaccttgctcaagtacacacactctcaccaaatcctctaatgattggatcgttc 15246414  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||| ||||| || |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  15246415 tctccgactgaccatctgtctggggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacct 15246514  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    || ||| | |||||| ||||||||    
T  15246515 cgaatctctatccgatacaatact 15246538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 433 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 15358875 - 15358733
Alignment:
Q  433 gtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaa 532  Q
    |||||||| | |||||||||  |||||||||| ||||  |||||||| ||||| || |  ||||| ||| |||||| ||||| || |||| | ||||| |    
T  15358875 gtcctctccgactgaccatctctctgaggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcagactcttcccaaatcttgaagtga 15358776  T
Q  533 acctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  15358775 acctcggatctctatccgacacaatactcgacggtacaccatg 15358733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 16676546 - 16676461
Alignment:
Q  115 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaac 200  Q
    |||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  16676546 tgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcattttctcttaaatcatcttaac 16676461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 575
Target Start/End: Original strand, 14691400 - 14691531
Alignment:
Q  444 ctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcc 543  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||  || |||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||     
T  14691400 ctgaccatctgtctgcggatgatacgccgaacttaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatct 14691499  T
Q  544 cgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
    | ||| || ||||| || ||||| | ||||||    
T  14691500 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 14691531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 427 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 15003155 - 15003022
Alignment:
Q  427 tgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttag 526  Q
    ||||| || ||||| | ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||| | |    
T  15003155 tgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatcttg 15003056  T
Q  527 aagtaaacctcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    |||| |||||||| || |  ||||||||||||||    
T  15003055 aagtgaacctcgggtctctttccgacacaatact 15003022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 185
Target Start/End: Original strand, 16752684 - 16752832
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||| ||||||||  | ||||||||||| || || || ||||  ||| | || |||||||| |||||||||||  | ||||||||||   |||||||||    
T  16752684 ggagttaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctcc 16752783  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttc 185  Q
     ||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||| | ||||| |||||    
T  16752784 gcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttc 16752832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 446 - 533
Target Start/End: Original strand, 14159970 - 14160057
Alignment:
Q  446 gaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaa 533  Q
    ||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||  || |||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  14159970 gaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaa 14160057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 444 - 578
Target Start/End: Original strand, 15319649 - 15319783
Alignment:
Q  444 ctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcc 543  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||  |||| ||||||| ||||||  | ||||| |||||||||||     
T  15319649 ctgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcctcttgtaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcggatct 15319748  T
Q  544 cgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    | ||| |||||||| || || || | |||||||||    
T  15319749 ctatctgacacaatgctcgatgggacaccatgcaa 15319783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 493 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 1639890 - 1639805
Alignment:
Q  493 cccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  1639890 cccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgcttgaaggaacaccatgcaa 1639805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 460 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 15414784 - 15414667
Alignment:
Q  460 ggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatac 559  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||| ||||| || ||||| | ||||||||||||||    
T  15414784 ggatgataagctgaactcaacctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagatgtaaatcttggatctctatccgacacaatac 15414685  T
Q  560 tagaaggtataccatgca 577  Q
    | || || | ||||||||    
T  15414684 ttgacggaacaccatgca 15414667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 15424149 - 15424108
Alignment:
Q  312 cattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactc 353  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15424149 cattccaatacttgcatgaaaactattattgtaggtaaactc 15424108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 490; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 490; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 581
Target Start/End: Original strand, 46251 - 46820
Alignment:
Q  12 gacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcacca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46251 gacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggttacaggatttaccctcaaaaacacatgatcacca 46350  T
Q  112 acttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtag 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  46351 acttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttttgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtag 46450  T
Q  212 tttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  46451 tttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgc 46550  T
Q  312 cattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaac 411  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46551 cattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcatcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaac 46650  T
Q  412 aaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaac 511  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46651 aaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtatgaccatcggtatgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaac 46750  T
Q  512 tctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46751 tctcccaaaaattagaaataaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaatct 46820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 490; Significance: 0; HSPs: 46)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 490; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 20831670 - 20831101
Alignment:
Q  12 gacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcacca 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20831670 gacatcaaacggcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcacca 20831571  T
Q  112 acttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtag 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  20831570 acttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtag 20831471  T
Q  212 tttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgt 311  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20831470 tttcttgcacaacttccggcccaaacaaagcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgc 20831371  T
Q  312 cattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaac 411  Q
    ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20831370 cataccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaac 20831271  T
Q  412 aaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaac 511  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20831270 aaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaac 20831171  T
Q  512 tctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20831170 tctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaatct 20831101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 581
Target Start/End: Original strand, 20914291 - 20914860
Alignment:
Q  12 gacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcacca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20914291 gacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatcacca 20914390  T
Q  112 acttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtag 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  20914391 acttgaaactcaatatcctttctccatttataatgataactcttctctctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtag 20914490  T
Q  212 tttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgt 311  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20914491 tctcttgcacaacttccggttctaacatagcactttctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgc 20914590  T
Q  312 cattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaac 411  Q
    |||||| ||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20914591 cattccgatactagtatgaaaattgtttttgtaagtaaactcaatcaatggtaaactttcgttccaacttacaccttgctccaacacacaagctctcaac 20914690  T
Q  412 aaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaac 511  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20914691 aaatcctccaaactctaaatagtcctctcagtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaagttagttcccaaagcagcttgcaaac 20914790  T
Q  512 tctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20914791 tctcccagaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaatct 20914860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 92 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 22135756 - 22135266
Alignment:
Q  92 tcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaat 191  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||  | |||||    
T  22135756 tcaaaaacacatggtcaccaacctgaaacttaatgtcctttctcctcttatcatgataactcttctgcctactctgagacgctttcatcttcccctgaat 22135657  T
Q  192 catcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgacca 291  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  22135656 catcttaacttttttcgtagtttcttgcacaacttctggtcctaacaaagcactttcacctgactcaaaccaacacaatggcgtcctacaccttcgacca 22135557  T
Q  292 tacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgct 391  Q
    ||||||||||||||||||| |||  | ||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22135556 tacaaagcctcaaacggtgccatatcgatactagaataaaaactgttgttgtaagtaaaatcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgct 22135457  T
Q  392 ccaaaacacaagctctc-aacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttag 490  Q
    |||| || |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  22135456 ccaacacgcaagctctcttacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttag 22135357  T
Q  491 ttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  22135356 ttcctaaagcagcttgcaaactttcccaaaacatagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactataaggaataccatgcaatct 22135266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 40 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 21202537 - 21201997
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  21202537 gtcaacttccgacacttcaaagtacgtccaacaccggttataggattcactctcaaaaacatatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttgtcctct 21202438  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||| || |||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||  |||| |||||||    
T  21202437 tatcatgataactcttctgccttctctgagatgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctctatagtcccttgcacaactctcggttctaacaa 21202338  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
    |||| | || |  |||||| || ||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| | |||||| | ||| || ||||||| ||||||||| |||    
T  21202337 agcactttcacgtgactcatacgaacacaacgatgtcctacaccgcgaaccatacaaagcttaaaacggcgccatcccgatactagaatgaaaactgttg 21202238  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||  |  ||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  21202237 ttgtaggtaaactcaatcaacggtaaacattcgacccaactgataccttgttccagaacacaagctcctagaaaatcctccaaa--ctgaatagtcctct 21202140  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
      ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| ||||  || || ||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  21202139 tcgtctgtccatcagtatggggatgataagcagaactaaatcgtaactttgttcctaaagtagcttgcaaactctcccaaaactttgaagtaaaccttgg 21202040  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatctg 582  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  21202039 atcccgatccgacacattactagaaggaaaaccatgcaatctg 21201997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 582
Target Start/End: Original strand, 20184266 - 20184832
Alignment:
Q  16 tcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccct-caaaaacacatgatcaccaact 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||| | | | ||||| ||  ||||||||||||||||| |||    
T  20184266 tcaaacggtccaacaaaacgtggtgtcaacttccgacacttcaaagcacgaccagcactggttaaaaggttcactctaaaaaaacacatgatcacccact 20184365  T
Q  115 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagttt 214  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||   ||| || ||||| |||||||| || || | | |||| |    
T  20184366 tgaaactcaatatctttcctcctcttatcattataactcttctgcctactctgagacactcacatcttctcttggatcatcttcactttcttcatagtct 20184465  T
Q  215 cttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcat 314  Q
    |||| || |||| ||||||||||||| || | |||||  || || ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||  ||||||||||||    
T  20184466 cttgtaccactttcggtcctaacaaatcactttctccttacacataccaacacaacggcgtcctacacatccgtccatacaaaaccaaaaacggtgtcat 20184565  T
Q  315 tccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaa 414  Q
     || ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  || |||||| |||||| |||||||||| | |||| | ||||    
T  20184566 accgatactagaatgaaaactgttgttgttagtaaactcaatcaacagtaaacattcaacctaactgaaaccttgttccaaaacac-atctcttagcaaa 20184664  T
Q  415 tcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactct 514  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||| |||||||    
T  20184665 tcttccaaactcttaatagtcctctctgtctgcctatcagtctgggaatgataagcagaactcaatctcaacttggttcccaaagctacttgtaaactct 20184764  T
Q  515 cccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatctg 582  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||  |||| |||| |||| | ||||| ||| |||||||||||    
T  20184765 cccaaaacatagaagtaaatctcggatcatgatctgacaaaatattggaaggaatatcatgcaatctg 20184832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 230
Target Start/End: Original strand, 46518802 - 46519020
Alignment:
Q  12 gacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcacca 111  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46518802 gacatcaaacggcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcacca 46518901  T
Q  112 acttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtag 211  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| || || || |||||||||||||||||||||||||    
T  46518902 acttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgtcttaatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtag 46519001  T
Q  212 tttcttgcacaacttccgg 230  Q
    |||||||||||||||||||    
T  46519002 tttcttgcacaacttccgg 46519020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 40 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 17045265 - 17044763
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | || |||||||||||||| || ||  | |||||||||| |||||| || | ||    
T  17045265 gtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcctgaaactcaagatccttcctgcgct 17045166  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  17045165 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagac 17045066  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | || || |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  17045065 cactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactatta 17044966  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |    |||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  17044965 ttgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcatccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 17044866  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  17044865 ccgactgaccatctgtctgcagatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaacctagaagtaaatcttgg 17044766  T
Q  540 atc 542  Q
    |||    
T  17044765 atc 17044763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 50620497 - 50619955
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||| || |||||  |  ||||||||||||  || || || |    
T  50620497 ggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatcttcctcttgaaactcaaggtctttcctac 50620398  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||  || ||||||||    
T  50620397 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatcttttgttgaatcatcttaaccttctcagtagtttattgaacaatctcaggtcctaa 50620298  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   || | || || |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||| |||||    
T  50620297 aaccacactttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgcaattccaatactagaatgataacta 50620198  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || ||||| || ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| | ||||||||||| || ||   |||||| || |    
T  50620197 ttattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaatttcctccttgctcaagtacacaaaccctcaacaaatcctctaacgactgaatcgttc 50620098  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    | || | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||  || |||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  50620097 tttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatct 50619998  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaat 579  Q
     ||||| | ||| || ||||| || ||||| | ||||||||||    
T  50619997 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaat 50619955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 16350849 - 16350311
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||| ||||||| ||| ||||| | ||    
T  16350849 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgct 16350750  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || |||| ||| |||||||| |     
T  16350749 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatttctggtcctaagac 16350650  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | ||||| || ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  16350649 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 16350550  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || || || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  16350549 ttatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 16350450  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  16350449 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 16350350  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| |||||||| || ||||| | |||||||||    
T  16350349 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 16350311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Original strand, 19106476 - 19107014
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||||| ||    
T  19106476 gtcaacttctttgacttcaacgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctccgct 19106575  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  19106576 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 19106675  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | || || ||||| ||||| |||||||| || || || |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  19106676 cactctttcacctgactcgaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagactcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactatta 19106775  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  19106776 ttgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 19106875  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| ||||||||||  | ||    
T  19106876 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatattgg 19106975  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  19106976 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 19107014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 51333743 - 51333205
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||   ||| ||||||| ||| ||||| | ||    
T  51333743 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttattggaactcaagatcttttctacgct 51333644  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  51333643 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 51333544  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | ||||| || ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  51333543 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 51333444  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| || ||||    
T  51333443 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgttctct 51333344  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  51333343 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 51333244  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  51333243 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 51333205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 138 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 16078804 - 16078400
Alignment:
Q  138 cttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaac 237  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| |  || ||||  || ||||||||     
T  16078804 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaag 16078705  T
Q  238 aaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactat 337  Q
    |   |  | || || ||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  16078704 accactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagccttaaaaggtgccattccaatactagaatgataactat 16078605  T
Q  338 tgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcct 437  Q
    | ||||| || ||||| |||||||| | |   |  |||||| |  | |||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||    |||||| |||||    
T  16078604 tattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgattatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctccagcgactgaattgtcct 16078505  T
Q  438 ctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctc 537  Q
    ||| | ||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||| || |   |||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||     
T  16078504 ctccgactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaagccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatctt 16078405  T
Q  538 ggatc 542  Q
    |||||    
T  16078404 ggatc 16078400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 33391279 - 33390741
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||| ||||||| ||| ||||| | ||    
T  33391279 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgct 33391180  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  33391179 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 33391080  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | ||||| || ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||  |||||||     
T  33391079 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaggcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactatta 33390980  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  33390979 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 33390880  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  33390879 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 33390780  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| ||||| || || ||||| | |||||||||    
T  33390779 atctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaa 33390741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 39 - 575
Target Start/End: Original strand, 16369405 - 16369941
Alignment:
Q  39 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctc 138  Q
    |||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| |  ||||||||| | || |||||||| |||||||| ||  |||| || ||||  || || || | |    
T  16369405 agtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacacttgtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttggaattcaaggtctttcctacgc 16369504  T
Q  139 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaaca 238  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||  ||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||| ||||  || |||||||| |    
T  16369505 ttatcatgataacccttttgtcgactctacgacgctttcatcttttcttgaatcatctttaccttttcaatagtttgttgaacaatctctggtcctaaaa 16369604  T
Q  239 aagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactatt 338  Q
       ||||||| ||  ||||||||||||||||||  || || ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||| ||    
T  16369605 ccacattctcacctcactcaaaccaacacaacgaagttctgcacctcctaccatacaaagcctcaaaaagtgtcattccaatactagaatgataactgtt 16369704  T
Q  339 gttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctc 438  Q
     || || || ||||| ||||| || | |      |||||  |  | |||||||| |  |||||| |||||||||| ||||||||   |||||| || |||    
T  16369705 attatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccacgttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcttccaacgactgaatcgttctc 16369804  T
Q  439 tctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcg 538  Q
    || | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||   || |||||  ||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||    
T  16369805 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttatagcctaaagcctcttgcaaacccttccaaaatctagaagtaaatctcg 16369904  T
Q  539 gatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
    |||| | ||| || ||||| || ||||| | ||||||    
T  16369905 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 16369941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Original strand, 21837059 - 21837597
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||| ||||||| ||| ||||| | ||    
T  21837059 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgct 21837158  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
     ||||||||||||||| |||| ||| || ||| ||||||| || ||||| ||||||| |||  | || ||||||| ||| ||||  || |||||||| |     
T  21837159 gatcatgataactcttttgtcgactatgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactgtctcagtagtttgttgaacaatctctggtcctaagac 21837258  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | ||||| || ||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  21837259 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttgtgcatctccgaccatacaaagcgtcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 21837358  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  21837359 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 21837458  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  21837459 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 21837558  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| ||||| || || ||||| | |||||||||    
T  21837559 atctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaa 21837597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 19761136 - 19760615
Alignment:
Q  20 acggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaa 119  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| ||  ||||| || | || |||||||||||||| || ||  |||||||    
T  19761136 acggtccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccaatcacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaa 19761037  T
Q  120 ctcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgc 219  Q
    |||||  || || || | |||||||||||||||||| |||| ||||||  || | ||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||  ||     
T  19761036 ctcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttggatcaacttaaccttctcagtagtttgctga 19760937  T
Q  220 acaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaa 319  Q
    || |  || ||||| || |   || |||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||    
T  19760936 acgatatctggtcccaaaactacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagtcctacacctccgaccatacagagcttcgaaaggtgtcattccaa 19760837  T
Q  320 tactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttc 419  Q
    |||||| |||| |||| || |||||  | ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| |||||| ||| |||||    
T  19760836 tactagaatgataactgttattgtacatgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcagcaagtcttc 19760737  T
Q  420 caaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaa 519  Q
    |||   |||||| || || || | ||||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||  |||| ||||  || |||||  |||||||||||| | ||    
T  19760736 caacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaacttaacttcaacttagaacctaaagcttcttgcaaactcttctaa 19760637  T
Q  520 aatttagaagtaaacctcggat 541  Q
    ||| |||| |||||||||||||    
T  19760636 aatctagaggtaaacctcggat 19760615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 359
Target Start/End: Original strand, 20249956 - 20250278
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||| || || ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  20249956 ggagtcaacttctttgacttcaacgctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 20250055  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||||||||| |||||||| |||| |||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| || |  || ||||||||    
T  20250056 gcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacgatctctggtcctaa 20250155  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | || |  |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  20250156 gaccactctttcgcttgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 20250255  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaa 359  Q
    || || || || ||||| |||||    
T  20250256 ttattatacgtgaactctatcaa 20250278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Original strand, 21830412 - 21830950
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||  | ||    
T  21830412 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttccacgct 21830511  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||  ||||||| |||||| || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  21830512 tatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttagatcatctgaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 21830611  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | || || ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||| | |||| |||||||     
T  21830612 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctacatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactatta 21830711  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || || || ||||| || ||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||   ||||||||||| ||||    |||||| |||||||    
T  21830712 ttatatgtgaactcgattaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcgagaacacaaatcctcaacaaatcctccagcgactgaattgtcctct 21830811  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  21830812 ccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 21830911  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| |||||||| || ||||| | |||||||||    
T  21830912 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 21830950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 22433369 - 22432840
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | |||||||  ||||||||||||||  | ||||||||||    ||||||||    
T  22433369 ggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccctcaggaacacatgatcaccctcctgaaactcaaggggctttctcc 22433270  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||| ||||||   ||||||||||| ||||| ||||| || || || |  | |||||| ||    
T  22433269 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttaactttttctgtagtctcatgaaccaaattcggtcccaa 22433170  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    ||   || || |||| ||||||||||| || || || ||||||||||||| |||||||||||| || || |||| ||| || ||||| | |||  ||||     
T  22433169 caccacactcgctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccaaccatacaaagcttcgaatggtgccatacctatactcgaatggtaactg 22433070  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    ||||| || || ||||| |||| | |||        ||||||    |||||||||| |  |||||  | |||||||||||||||||    || || ||||    
T  22433069 ttgttatatgtgaactctatcagcagtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaaccacacacaccctcaacaaatcttccaatgattggattgtcc 22432970  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||||||  | |||||||||| ||| ||  || |||| |||||    
T  22432969 tctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctataagtgaacct 22432870  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaagg 566  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  22432869 cggatccctatccgacacaatactcgaagg 22432840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 36 - 563
Target Start/End: Original strand, 37677184 - 37677712
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaa-aaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttct 134  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| || |||| |||| | |||||||| ||| |||||||||||  | |||||||| | |||||||||    
T  37677184 aggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcaagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttct 37677283  T
Q  135 cctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcct 234  Q
     | ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||  | ||||| |||||    |||| | | || || || ||||| || || || |  ||||||||     
T  37677284 tcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtccc 37677383  T
Q  235 aacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaac 334  Q
    |||| | || |||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||| |  ||| | |    
T  37677384 aacacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagc 37677483  T
Q  335 tattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagt 434  Q
    | ||||| ||||| || |||||||| || ||       ||||||    |||||||||| |  || ||  |||||||||||||||||||    ||||| ||    
T  37677484 tgttgttataagtgaattcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacgcacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgt 37677583  T
Q  435 cctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaac 534  Q
    |||||| | ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||  | || ||||||| ||| ||  ||||||| |||    
T  37677584 cctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaac 37677683  T
Q  535 ctcggatcccgatccgacacaatactaga 563  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||    
T  37677684 ctcggatctctatccgacacaatgctaga 37677712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 575
Target Start/End: Original strand, 20294517 - 20295056
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||| || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||| |||||| ||     
T  20294517 aggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcttgaaactcaagatccttcctt 20294616  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 235  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||  | ||||| |||||    |||||  | ||||| || ||||| || || || |  |||||||| |    
T  20294617 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcattctgaccttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtccca 20294716  T
Q  236 acaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaact 335  Q
    ||| | || |||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| ||| |||||||| |  ||| | ||    
T  20294717 acacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccaaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagct 20294816  T
Q  336 attgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtc 435  Q
     ||||| ||||| ||||||||||| || |        ||| ||    |||| ||||| |  |||||  | |||||||||||||||||    ||||| |||    
T  20294817 gttgttataagtgaactcaatcaatggaaggtgactatccgaagctccaccctgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtc 20294916  T
Q  436 ctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacc 535  Q
    ||||| | ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||  | || | ||||| ||| ||  ||||||| ||||    
T  20294917 ctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtagactcttccagaacctagaagtgaacc 20295016  T
Q  536 tcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  20295017 tcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatg 20295056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 37 - 359
Target Start/End: Original strand, 20136884 - 20137206
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||||||  | || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  20136884 ggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgaggtctccttcttgaaactcaagatctttcctac 20136983  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||  || ||||  || ||||||||    
T  20136984 gcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacactttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaa 20137083  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | || ||  ||||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||| ||| | || | |||||| ||||||| |||| |||||    
T  20137084 gaccactctttcacctaactcaaaccaacacaacgaagttctgcatctccgaccatacaaagcttcataaggcgccattcctatactagaatgataacta 20137183  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaa 359  Q
    || ||||| || ||||| |||||    
T  20137184 ttattgtacgtgaactctatcaa 20137206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 433 - 575
Target Start/End: Original strand, 19854815 - 19854957
Alignment:
Q  433 gtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaa 532  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  19854815 gtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtga 19854914  T
Q  533 acctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  19854915 acctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatg 19854957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 20940316 - 20939778
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||| ||| |||||||||||  | ||||||||||   |||| || |    
T  20940316 ggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 20940217  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||| ||  | ||||| ||||||   |||||||| || || ||  ||||||  || || |  |||||||| ||    
T  20940216 gcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctatagtttgatgaaccaaatccggtcccaa 20940117  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || ||||||| ||||||||| | || || || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||  ||||||| | |||  ||||     
T  20940116 cacaacactctctcctgactcaaactagcataaaggagtcctatacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataacaatactcgaatggtaactg 20940017  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  ||||||| ||||| ||||||   || || ||||    
T  20940016 ttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaataaatcctccaaagattgtatcgtcc 20939917  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| || || ||||| ||||  ||||||   ||||| ||    |||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  20939916 tctccgactgaccatctgtttgcggatgataagtcgaactcggcctcaacttctaacccaaaacgtcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacct 20939817  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
    |||||| | ||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  20939816 cggatctctatccgacacaatacttgacggtacaccatg 20939778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 40 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 41354719 - 41354397
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | | ||| |||| ||| ||||| | ||    
T  41354719 gtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgct 41354620  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||| | ||||||| ||| || || || ||||  || ||||  || |||||||| |     
T  41354619 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtggtttgctgaacaatctctggtcctaagac 41354520  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | || ||||| ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||     
T  41354519 cactctttcaccggattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgatagctatta 41354420  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacgg 362  Q
    || ||||| ||||| ||||||||    
T  41354419 ttataagtgaactcgatcaacgg 41354397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 31550435 - 31550148
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |||||||| || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | |||||||||| |||||||||     
T  31550435 aggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctt 31550336  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 235  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||| ||| || ||  | ||||| ||||||   |||| | | || || |||||||| || || || |  |||||||| |    
T  31550335 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactttgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctccgtagtctcatgaactaaatccggtccca 31550236  T
Q  236 acaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatact 323  Q
    ||| | || | || || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||||||    
T  31550235 acacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatact 31550148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 383 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 24099510 - 24099333
Alignment:
Q  383 caccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatct 482  Q
    |||||||||| |  |||||  ||||||||||||| |||||    || || |||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  24099510 caccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacct 24099411  T
Q  483 caatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    |||  | | |||||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24099410 caacctcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatact 24099333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 433 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 19662998 - 19662856
Alignment:
Q  433 gtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaa 532  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||| || |    
T  19662998 gtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgtaaactcttccaaaatctagaggtga 19662899  T
Q  533 acctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  19662898 acctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatg 19662856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 116 - 330
Target Start/End: Original strand, 21747720 - 21747933
Alignment:
Q  116 gaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttc 215  Q
    ||||||||| ||| ||||| | ||||| ||| |||||||| |||| |||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||     
T  21747720 gaaactcaagatc-tttctacgcttattatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 21747818  T
Q  216 ttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcatt 315  Q
    ||| ||||  || |||||||| |   |  | || ||  ||||||||||||||||||| || || || |||||| |||||||||||||| | |||| ||||    
T  21747819 ttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcgcctaactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgagcatacaaagcctcataaggtgccatt 21747918  T
Q  316 ccaatactagcatga 330  Q
    |||||||||| ||||    
T  21747919 ccaatactagaatga 21747933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 20857014 - 20856687
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||||| ||| ||||| |||||  | |||||| |||  ||||| || |    
T  20857014 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaacgcaaggtccttcctac 20856915  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| || ||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| || ||   ||||||||| || || ||||||||||| || || | |||| | || ||    
T  20856914 gcttgtcgtgatagctcttttgtcgactctgcgacactttcatcttctccctaatcatcttgactttctccgtagtttcatgaaccaattccagccccaa 20856815  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || | ||||| ||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||| | |||  ||||     
T  20856814 cacaacactttctcccgactcgaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcaaacggtgccataccaacactcgaatggtaactg 20856715  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 364  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||||    
T  20856714 ttgttgtatgtaaattctatcaatggta 20856687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 22142315 - 22142232
Alignment:
Q  16 tcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaac 99  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||    
T  22142315 tcaaatggtccaacaaaatgaggagtcaacttcttacacttcaaagcacgaccaacaccagttacaggattcactctcaaaaac 22142232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 397 - 578
Target Start/End: Original strand, 21749407 - 21749588
Alignment:
Q  397 acacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttccca 496  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||   |||||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||  || |    
T  21749407 acacaaactctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaaccta 21749506  T
Q  497 aagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  21749507 aagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 21749588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 36 - 167
Target Start/End: Original strand, 11382699 - 11382830
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| || |||| |||| | || |||| ||| |||||||||||  | |||||||||| |||||| ||     
T  11382699 aggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatccttcctt 11382798  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttctgtctactctg 167  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  11382799 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 11382830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 364
Target Start/End: Original strand, 19854420 - 19854746
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||| || ||||| || || |||| |||| | || |||| ||| |||||||| ||  ||||||||||||   |||| || |    
T  19854420 ggagtcaacttcttcgacttcaatgcccgacctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctac 19854519  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||||||||||||||||| ||| || ||| | ||||| || |||   |||||||| || || || ||||| |  || || |  |||||||| ||    
T  19854520 gcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaa 19854619  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || ||||||| ||||||||||| |  || || ||||| |||||||||| ||||||||| || ||| ||| ||| |||||||| | |||  ||||     
T  19854620 cacaacactctctcctgactcaaaccagcgtaaaggagtcctgcacctccgactatacaaagcttcgaaccgtgccataccaatactcgaatggtaactg 19854719  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 364  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  19854720 ttgttgtatgtgaactc-atcaacggta 19854746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 20835933 - 20835814
Alignment:
Q  245 tctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgta 344  Q
    ||||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| |||||||| | |||  |||| ||||||||    
T  20835933 tctctcctgactcaaaccagcataaaggagttctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggagccataccaatactcgaatggtaactgttgttgta 20835834  T
Q  345 agtaaactcaatcaacggta 364  Q
     || ||||| ||||||||||    
T  20835833 cgtgaactctatcaacggta 20835814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 20075313 - 20075192
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||| || |||| |||| | ||||| | ||| |||||||||||  | |||||||||| | ||||||||    
T  20075313 aggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgacccttagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctc 20075214  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttct 157  Q
    | ||| ||||| ||||||||||    
T  20075213 cgcttgtcatggtaactcttct 20075192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 397 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 22362137 - 22361956
Alignment:
Q  397 acacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttccca 496  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||   || ||| |||||||| | ||||||||  ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||| ||  |    
T  22362137 acacaaactctgaacaaatcttccaacaactaaatcgtcctctccgactgaccatatgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagatctta 22362038  T
Q  497 aagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || || || | ||| |||||||| || ||||| | |||||||||    
T  22362037 aagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgggtctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 22361956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 383 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 31539904 - 31539724
Alignment:
Q  383 caccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatct 482  Q
    |||||||||| |  |||||  |||||||||||||||||||    ||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  |    
T  31539904 caccttgctcaagtacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaactt 31539805  T
Q  483 caatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactaga 563  Q
    || ||| |  ||||| ||  | || ||||| | ||| ||  ||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  31539804 cattttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctaga 31539724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 445 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 20835733 - 20835603
Alignment:
Q  445 tgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatccc 544  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||| ||||  | |||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  20835733 tgaccgtctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgtcagctcttccagaatctagaagtgaacctcggatccc 20835634  T
Q  545 gatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
     |||||||||||| || || |||| ||||||    
T  20835633 tatccgacacaattctcgacggtacaccatg 20835603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 364
Target Start/End: Original strand, 41307930 - 41308258
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    ||||||||||||  || ||||||| ||||| |  || || |||| |||| | ||||||| ||||||||| || ||  ||||||||||||    ||||||     
T  41307930 aggagtcaactttttagacttcaatgcacgtcatacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatggtctccctcttgaaactcaaggggctttcta 41308029  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 235  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||| ||||||   || || || || || |||||||| |  || || |  ||| |||| |    
T  41308030 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttattattttgactttctccgtagtctgatgaaccaaatccagtccca 41308129  T
Q  236 acaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaact 335  Q
    |||   || | |||||  ||||||||||||| || || ||| | ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  || |    
T  41308130 acaccacactttctcccaactcaaaccaacataaaggagtcatgcaccttcgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatgctaatt 41308229  T
Q  336 attgttgtaagtaaactcaatcaacggta 364  Q
     |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  41308230 gttgttgtacgtgaactctatcaacggta 41308258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 167
Target Start/End: Original strand, 20244306 - 20244436
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| ||| | || || || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||   |||||||||    
T  20244306 ggagtcaactttctcgacttcaatgcatgtcccacacccgtcataggagtaaccctcagaaagacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctcc 20244405  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 167  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  20244406 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 20244436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 20856607 - 20856473
Alignment:
Q  444 ctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcc 543  Q
    ||||||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |  ||||| ||| |||| ||||||| ||||||| | ||||||||||| || ||     
T  20856607 ctgaccatatgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaaccttgggtct 20856508  T
Q  544 cgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    | ||| ||||| ||||| || || | |||||||||    
T  20856507 ctatctgacactatacttgacggaacaccatgcaa 20856473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 514
Target Start/End: Original strand, 41308327 - 41308408
Alignment:
Q  433 gtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactct 514  Q
    |||||||| | ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||  ||||| ||| ||||||||||||    
T  41308327 gtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaatctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactct 41308408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 281
Target Start/End: Original strand, 15730882 - 15730981
Alignment:
Q  182 tttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctaca 281  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| |  || |||||||  ||||| | || || ||| ||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  15730882 tttcctgaatcatcttaaccttttcggtagtctgctgaacaacttttggtccaatcatagaattttctcccgactcataccaacacaatggtgttctaca 15730981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 19663145 - 19663062
Alignment:
Q  281 acctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggta 364  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||||| | |||  |||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  19663145 acctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccgatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggta 19663062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 426 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 41354333 - 41354217
Alignment:
Q  426 ctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaattta 525  Q
    |||||| |||||||| |  |||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||| ||| | ||||||| ||    
T  41354333 ctgaattgtcctctccgattgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcagacttttccaaaatcta 41354234  T
Q  526 gaagtaaacctcggatc 542  Q
    |||||||| || |||||    
T  41354233 gaagtaaatcttggatc 41354217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 486; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 486; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 581
Target Start/End: Original strand, 40355 - 40924
Alignment:
Q  12 gacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcacca 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40355 gacatcaaacggcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcacca 40454  T
Q  112 acttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtag 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  40455 acttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtag 40554  T
Q  212 tttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgt 311  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  40555 tttcttgcacaacttccggcccaaacaaagcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgc 40654  T
Q  312 cattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaac 411  Q
    ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40655 cataccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaac 40754  T
Q  412 aaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaac 511  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40755 aaatcctccaaactctgaatagtcctttctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaac 40854  T
Q  512 tctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40855 tctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaatct 40924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 33861 - 33320
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| || | || || ||||| || || || |||| |||| | || ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||  ||||| || |    
T  33861 ggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctac 33762  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| |||||||| |||||||||| |||||| ||| | |||||   ||||   || | |||||||||||||||||||| ||| || |  || ||||| ||    
T  33761 gcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatccgttctcttattaacttaaccttttccgtagtttgttgaactatgtctggtcccaa 33662  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    ||   || | ||||| ||||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||| | |||  |||||    
T  33661 catcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaccatacaaggcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaacta 33562  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  | ||||| | ||| || ||    || || || |    
T  33561 ttgttgtaagtaaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaatagatcctctaaggattgtatcgttc 33462  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  33461 tctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacct 33362  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    |||||| | ||| || |||||||| || || | |||||||||    
T  33361 cggatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaa 33320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 486; Significance: 0; HSPs: 73)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 486; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 21850986 - 21850417
Alignment:
Q  12 gacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcacca 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21850986 gacatcaaacggcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaatcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcacca 21850887  T
Q  112 acttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtag 211  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21850886 acttgaaactcaatatccttcatcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaaccttttccgtag 21850787  T
Q  212 tttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgt 311  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  21850786 tttcttgcacaacttccggccctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtac 21850687  T
Q  312 cattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaac 411  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21850686 cattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaac 21850587  T
Q  412 aaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaac 511  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21850586 aaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaac 21850487  T
Q  512 tctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21850486 tctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaatct 21850417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 16877744 - 16877175
Alignment:
Q  12 gacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcacca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  16877744 gacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccgacaccggtcaccggattcaccctcaagaacacatgatctcca 16877645  T
Q  112 acttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtag 211  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  16877644 acctgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtag 16877545  T
Q  212 tttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16877544 tttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctgcacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgc 16877445  T
Q  312 cattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaac 411  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16877444 cattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaac 16877345  T
Q  412 aaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaac 511  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  16877344 aaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatcttaacttagttcccaaagcagcttgcaaac 16877245  T
Q  512 tctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16877244 cttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaatct 16877175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 20652981 - 20652416
Alignment:
Q  13 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  20652981 acatcaaacggtccaacgaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcactctcaaaaatacatgatcaccaa 20652882  T
Q  113 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20652881 cttgaaactctatatcctttctcctcttataatgataactcttctgtccactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttctccgtagt 20652782  T
Q  213 ttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtc 312  Q
     |||||||| || |||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  20652781 ctcttgcaccacctccggtcctaacaaggcactttctccggacttaaaccaacacaacggtgtcctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggtgcc 20652682  T
Q  313 attccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 412  Q
    || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20652681 ataccgatactagaatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaaaggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctctaacacacaagctctcaaca 20652582  T
Q  413 aatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaact 512  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  20652581 aatcctccaaactctgaatagtcctctctgtttgcccatcggtctgagaatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaatcagcttgcaaact 20652482  T
Q  513 ctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20652481 ctcccaaaacttagaagttaacctcggatcctgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaa 20652416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 21197150 - 21196585
Alignment:
Q  13 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  21197150 acatcaaacggcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagtacgaccaactccagttacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccta 21197051  T
Q  113 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 212  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||| |||| | ||||    
T  21197050 cctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcctctgccaactctgagacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttttacatagt 21196951  T
Q  213 ttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtc 312  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21196950 ctcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgcc 21196851  T
Q  313 attccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 412  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21196850 attccaatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgataccttgctccaaaacacaagctctcaaca 21196751  T
Q  413 aatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaact 512  Q
    |||| || ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||    
T  21196750 aatcctctaaactctaaatagtcctctatgtctgcccatcggtctggggatgataagcagaactcaatctcaacttagtttccaaagcagtttgcaagct 21196651  T
Q  513 ctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21196650 ctcccaaaacgtagaagtaaacctcggattccgatctgacacaatactagaaggaataccatgcaa 21196585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 578
Target Start/End: Original strand, 22982569 - 22983131
Alignment:
Q  13 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  22982569 acatcaaacggtccgacaaaacgaggagtcaacttctgacacttcaaagcacgaccaacaccaatcacatgattcactctaaaaaacgcatgatcaccaa 22982668  T
Q  113 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 212  Q
    | |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  22982669 cctgaaactcaatatcttttcaccttttatcatgataactcttctgtctactctgagatgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttccatagt 22982768  T
Q  213 ttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtc 312  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22982769 ctcttgcacaacttccggttctaacaaagcactcactt--gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgcc 22982866  T
Q  313 attccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 412  Q
    || || | ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22982867 ataccgacactagaatgaaaattgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtagacatttgtcccaactgacaccttgctccaagacacaagctctcaaca 22982966  T
Q  413 aatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaact 512  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22982967 aatcctccaaactctgaatagtcctctctgtttgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgc-aact 22983065  T
Q  513 ctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22983066 ctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaa 22983131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 578
Target Start/End: Original strand, 22315327 - 22315889
Alignment:
Q  16 tcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaactt 115  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  22315327 tcaaatggtccaacaaaacgaggagtcaacttccgacacttcaaagcacgacctacaccggttacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacct 22315426  T
Q  116 gaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttc 215  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22315427 gaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttctgtagtttc 22315526  T
Q  216 ttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcatt 315  Q
    ||| |||||||||||||||| | ||| | | || || |||||| |||||||||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22315527 ttgaacaacttccggtcctacccaagaactttcacctgactcataccaacacaatggcgttctacaccttctaccatacaaagcctcaaacggtgccatt 22315626  T
Q  316 ccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaat 415  Q
    || ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22315627 ccgatactagaatgaaaactgttgttataagtaaactcaatcaacggtagacattcaacccaactgacaccttgctccaaaacacaagctcttaacaaat 22315726  T
Q  416 cttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctc 515  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  22315727 cttccaaactctaaatagtcctctccgtctgcccatcactctggggatgataagcaggactcaacctcaacttagttcccaaagcagtttgcaaactttc 22315826  T
Q  516 ccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  22315827 ccaaaacctaaaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactggaaggaataccatgcaa 22315889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 119 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 23157553 - 23157092
Alignment:
Q  119 actcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttg 218  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  23157553 actcaatgtccttcctcctcttatcatgataactcctctatctattctgagatgctttcatattctcttgaatcatcttaacctttttcgtagtctcttg 23157454  T
Q  219 cacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattcca 318  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| | || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||     
T  23157453 cacaacttttggtcctaacaaagcactttcacctgattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaatggtgtcataccg 23157354  T
Q  319 atactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatctt 418  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |    
T  23157353 atactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactaacaccttgctcc-aaacacaagttctcaacaaatcct 23157255  T
Q  419 ccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctccca 518  Q
    | |||||||||||| || |||| ||| | ||||| ||||| || || |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23157254 ctaaactctgaataatcttctccgtcggcccatcagtctgggggtgataagtagaactcaatctctacttagttcccaaagcagcttgcaaactttccca 23157155  T
Q  519 aaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23157154 aaacttagaagtaaacctcgaatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaatct 23157092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 40 - 582
Target Start/End: Original strand, 25282291 - 25282832
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    |||||||||  |||| |||||| ||| ||||| | ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  25282291 gtcaacttctaacacatcaaagtacgtccaacactggttacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcgatgtccttcctcctct 25282390  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||  |||| || |||||||| ||||||||||| || || || | |||||||| |||||||||||||||    
T  25282391 tattatgataactcttctgcctactccgagacactctcatcttctcttgaatgatcttaaccttctctgtcgtcttttgcacaatttccggtcctaacaa 25282490  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
     ||| ||||||| ||||||||||||||||||   ||  || ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| | ||| |||| |||||| || |||    
T  25282491 -gcactctctcctgactcaaaccaacacaacaacgttttatacctccgtccatacaaagcctcaaacggcgccatactaatgctagaatgaaatctgttg 25282589  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  25282590 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgacacaattgacaccttgttccaaaacacatgctctcaacaaatcctccaaactctaaatagtcctct 25282689  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    ||||||| ||||| || || ||||| |||| |||||| ||||| || || ||||| |||||  ||| ||||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  25282690 ctgtctgtccatcagtttggggatgataagtagaactaaatcttaacttggttcctaaagccacttacaaactctcccaaaactttgaagtaaacctcag 25282789  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatctg 582  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  25282790 atcctgatccgatacaatactagaaggaatatcatgcaatctg 25282832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 83 - 582
Target Start/End: Original strand, 22283199 - 22283706
Alignment:
Q  83 gattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatatt 182  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||| ||    
T  22283199 gattcactcttaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctccttttatcatgataactcttctacctactctgagacactctcatttt 22283298  T
Q  183 ttcttgaatcatcttaaccttttccgt--------agtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtg 274  Q
     || |||||||||||||||| ||||||        ||| ||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||| || ||| |||||||||||| ||    
T  22283299 ctcctgaatcatcttaacctattccgttattccgtagtctcttgcacaactttcggtcctaacaaaacactctttcctgattcataccaacacaacgatg 22283398  T
Q  275 tcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtc 374  Q
    | |||||||| | |||||||||||  || ||||||| ||| |  ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  22283399 ttctacaccttctaccatacaaagtttccaacggtgccatactgatactagaatgaaaattgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcagc 22283498  T
Q  375 ccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaa 474  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| | ||| ||||||| |||||||||    
T  22283499 ccaacttacaccttgttccaaaacacatgctctcaaaaaatcttccaaactctggatagtcttctctgtctgcccaacagtcggaggatgataagcagaa 22283598  T
Q  475 ctcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccat 574  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||| ||| || | | ||| |||||||||||| || | |||||||    
T  22283599 ctcaatctcaagttagttcctaaagctgcttgcaaactctccaaaaacttcgaagtaaatctcagacctctatctgacacaatactaaaatgaataccat 22283698  T
Q  575 gcaatctg 582  Q
    ||||||||    
T  22283699 gcaatctg 22283706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 22378077 - 22377540
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||  |  | |||||||||||||| || || |    
T  22378077 ggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcactggagtgaccctcaaaaatacatgatctgcttcctgaaactcaatatctttcctac 22377978  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||| ||| ||||||||    
T  22377977 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctccgtagtttgtttaacaatttctggtcctaa 22377878  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   || |||| || ||||| ||||||||||| || || || ||||| |  |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  22377877 aaccacactctcacccgactcgaaccaacacaaaggagttctgcaccttcttccatac-aagcctcaaatggtgccattccaatactagaatgataacta 22377779  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| || || || | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| |||||||||| ||||||||   |||||| || |    
T  22377778 ttgttgtacgtgaactctattaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcttccaacgactgaatcgttc 22377679  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    | || | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||  || |||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  22377678 tttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaaccaaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacct 22377579  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
    |||||| | ||| || ||||| || ||||| | ||||||    
T  22377578 cggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 22377540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 22384252 - 22383715
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||  |  | |||||||||||||| || || |    
T  22384252 ggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcactggagtgaccctcaaaaatacatgatctgcttcctgaaactcaatatctttcctac 22384153  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||| ||| ||||||||    
T  22384152 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctccgtagtttgtttaacaatttctggtcctaa 22384053  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   || |||| || ||||| ||||||||||| || || || ||||| |  |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  22384052 aaccacactctcacccgactcgaaccaacacaaaggagttctgcaccttcttccatac-aagcctcaaatggtgccattccaatactagaatgataacta 22383954  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| || || || | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| |||||||||| ||||||||   |||||| || |    
T  22383953 ttgttgtacgtgaactctattaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcttccaacgactgaatcgttc 22383854  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    | || | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||  || |||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  22383853 tttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaaccaaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacct 22383754  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
    |||||| | ||| || ||||| || ||||| | ||||||    
T  22383753 cggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 22383715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 16408669 - 16408128
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | || ||||| || || || || ||  |||| |||| || ||| || || |    
T  16408669 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaacaatacgtggtctccttcttggaacttaagatctttcctgc 16408570  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| |  || ||||  |||||||||||    
T  16408569 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctccggtcctaa 16408470  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | ||||| |||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  16408469 gaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgtatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataacta 16408370  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || ||||| || |||||||||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |    |||||| ||||    
T  16408369 ttattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcc 16408270  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||  |||||||||| | ||||||| || ||||||| ||    
T  16408269 tctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctataagtaaatct 16408170  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
     || || | ||| || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  16408169 tgggtctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 16408128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 40 - 575
Target Start/End: Original strand, 32600304 - 32600839
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| |||||| || | ||    
T  32600304 gtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcctgcgct 32600403  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  32600404 tatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtctactgaacaatctctggtcctaagac 32600503  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | || || |||  ||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  32600504 cactctttcacctgaccgaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactatta 32600603  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| ||||||||||||| |  ||    ||||| |||||||    
T  32600604 ttgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctataacgattgaattgtcctct 32600703  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  32600704 ccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaacctagaagtaaatcttgg 32600803  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||| | ||||||    
T  32600804 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 32600839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 575
Target Start/End: Original strand, 15533537 - 15534075
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || | ||||||| | || ||||||||||  || |||||  |||||||||||| ||| || || |    
T  15533537 ggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagccacaggagtgactctcaaaaacatgtggtcaccttcttgaaactcaagatctttcctac 15533636  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||| || ||||| ||||| ||||| || || ||||| |  || ||||  || ||||||||    
T  15533637 gcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgtatcattttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaa 15533736  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | || || |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  15533737 gaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataacta 15533836  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |    |||||| ||||    
T  15533837 ttattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcc 15533936  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    ||||   |||||||||  |||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||    
T  15533937 tctccaactgaccatctttctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 15534036  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
     ||||| | ||| || |||||||| ||||| | ||||||    
T  15534037 tggatctctatctgatacaatactcgaaggaacaccatg 15534075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 422 - 578
Target Start/End: Original strand, 23900818 - 23900974
Alignment:
Q  422 aactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaa 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23900818 aactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctggggatgataagtagaactcagcctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaa 23900917  T
Q  522 tttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
      |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  23900918 catagaagtaaacctcagatcccgatctgacacaatattagaaggaataccatgcaa 23900974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 17674644 - 17674106
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||| ||||||| ||| ||||| | ||    
T  17674644 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgct 17674545  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  17674544 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 17674445  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
     ||  | ||||| || ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||  |||||||     
T  17674444 cgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactatta 17674345  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  17674344 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcaactgaattgtcctct 17674245  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  17674244 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 17674145  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| ||||| || || ||||| | |||||||||    
T  17674144 atctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaa 17674106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 21167161 - 21166656
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  21167161 ggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 21167062  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||  || ||||  || ||||||||    
T  21167061 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcctaa 21166962  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  |  | || || ||||||||||||||  | || || || || |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||     
T  21166961 gaccactcttccacctgattcaaaccaacacaattgagttctgcatcttcgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactg 21166862  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || ||||| |||||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| ||||||||||||| || |    |||||| ||||    
T  21166861 ttattgtacgtaaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcc 21166762  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||    
T  21166761 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 21166662  T
Q  537 cggatc 542  Q
     |||||    
T  21166661 tggatc 21166656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 37 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 31417098 - 31416575
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| | || | || |||| ||| |||||||||||  | ||||||||||   ||||| |||    
T  31417098 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataagagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttatcc 31416999  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||  |||||    |||||||| || || || ||||| |  ||||| |  |||||||| ||    
T  31416998 gcttatcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcaccttttcccttatcatcttgactttctcagtagtctgatgcactaaatccggtcccaa 31416899  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || ||||||| ||||||||||| || || || ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| | |||||| | |||  ||||     
T  31416898 cacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcatgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatactaatactcgaatggtaactg 31416799  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  ||||||||||||| |||||    || || ||||    
T  31416798 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcc 31416699  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || | |||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  31416698 tctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacct 31416599  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  31416598 cggatccctatccgacacaatact 31416575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 36 - 560
Target Start/End: Original strand, 6603814 - 6604338
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |||||||| || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | |||||||||| |||||||||     
T  6603814 aggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctt 6603913  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 235  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||  | ||||| ||||||   |||| | | || || || ||||| || || || |  |||||||| |    
T  6603914 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtccca 6604013  T
Q  236 acaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaact 335  Q
    ||| | || |||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||| |  ||| | ||    
T  6604014 acacaacactctcacccgactcaaaccaacacaaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagct 6604113  T
Q  336 attgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtc 435  Q
     ||||| || |||||||||||||| |||||      |||||||    |||||||||| |  |||||  | |||||||||||||||||    ||||| |||    
T  6604114 gttgttatacgtaaactcaatcaaaggtaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtc 6604213  T
Q  436 ctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacc 535  Q
    ||||| | ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||  | || ||||| | ||| ||  ||||||| ||||    
T  6604214 ctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacc 6604313  T
Q  536 tcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    ||||||| | |||||||||||||||    
T  6604314 tcggatctctatccgacacaatact 6604338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 22133665 - 22133121
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || |||||| || |  | ||||||||||||   || ||  | |||||||||| ||| || || |    
T  22133665 ggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacatgagtgtctctcaaaaacacaatgtctccttcctgaaactcaagatctttcctac 22133566  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||  || ||||  || ||||||||    
T  22133565 acttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctcgggtcctaa 22133466  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | || |  ||||||||||  |||||||| || || || | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  22133465 gaccactctttcacttgactcaaacccgcacaacggagttctgcatcaccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataacta 22133366  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |    |||||| ||||    
T  22133365 ttattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcttctagcgactgaattgtcc 22133266  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||    
T  22133265 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 22133166  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
     ||||| | ||  || ||||| || ||||| | ||||||||||||    
T  22133165 tggatctctatttgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaatct 22133121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Original strand, 19112850 - 19113388
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||| ||||||| ||| ||||| | ||    
T  19112850 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgct 19112949  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || | ||  || |||||||| |     
T  19112950 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaataatctctggtcctaagac 19113049  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | ||||| || ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  19113050 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 19113149  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || ||||| ||||| ||||| || | |      |||||| |  | || ||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  19113150 ttataagtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcctccctgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 19113249  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  19113250 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 19113349  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| |||||||| || ||||| | |||||||||    
T  19113350 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 19113388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 542
Target Start/End: Original strand, 19978124 - 19978629
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||||||||| |    
T  19978124 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcctttctac 19978223  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| |  || ||||  || ||||||||    
T  19978224 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaa 19978323  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | ||||| |||||||||||||||||||| || || || || |||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||| |||| || |     
T  19978324 gaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatcttcgaccatataaagcctccaaaggtgccattccaatactagaatgataattg 19978423  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| |  |||| |  |||||||||||| || |    |||||| ||||    
T  19978424 ttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacactaaatctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcc 19978523  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||| ||||| || |  || ||||||||||| ||||  ||||||||  | |||||||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  19978524 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgtcgagctcaatctcaacttagaacccaaagcctcctgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatct 19978623  T
Q  537 cggatc 542  Q
     |||||    
T  19978624 tggatc 19978629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 36 - 560
Target Start/End: Original strand, 6679267 - 6679791
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | |||||||||| |||||||||     
T  6679267 aggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctt 6679366  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 235  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||  | ||||| ||||||   |||| | | || || || ||||| || || || |  |||||||| |    
T  6679367 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtccca 6679466  T
Q  236 acaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaact 335  Q
    ||| | || |||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||| |  ||| | ||    
T  6679467 acacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagct 6679566  T
Q  336 attgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtc 435  Q
     ||||| ||||||||||||||||| || ||      |||||||    |||||||||| |  |||||  |||||||||||||||||||    ||||| |||    
T  6679567 gttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtc 6679666  T
Q  436 ctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacc 535  Q
    ||||| | ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||  |||| || |  ||||| ||  | || ||||| | ||| ||  ||||||| ||||    
T  6679667 ctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacc 6679766  T
Q  536 tcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    ||||||| | |||||||||||||||    
T  6679767 tcggatctctatccgacacaatact 6679791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 40 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 20018371 - 20017869
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | | ||| |||| ||| ||||| | ||    
T  20018371 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctcaaattcaagatcttttctacgct 20018272  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || |||| ||| |||||||| |     
T  20018271 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatttctggtcctaagac 20018172  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | ||||| || ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  20018171 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaggcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 20018072  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || ||   |||||| |||||||    
T  20018071 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctaacgactgaattgtcctct 20017972  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  20017971 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 20017872  T
Q  540 atc 542  Q
    |||    
T  20017871 atc 20017869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 37 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 30313768 - 30313230
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| || || |    
T  30313768 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgc 30313669  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| |  || ||||  ||  | |||||    
T  30313668 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctcgagccctaa 30313569  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | || || ||||||||||| ||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||    
T  30313568 gaccactctttcacctgactcaaaccaccacaatggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccgttccaatactagaatgataacta 30313469  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| |||||||| |||| || |    |||||| ||||    
T  30313468 ttattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaactaatcctctagcgactgaattgtcc 30313369  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    ||||   ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||    
T  30313368 tctccaactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 30313269  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
     ||||| | ||| || ||||| || ||||| | ||||||    
T  30313268 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 30313230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 21922359 - 21921818
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||  | ||||| || |||||| || | || |||||||| || || || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  21922359 ggagtcaacttcttcgacttcaaagcttgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 21922260  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||||||||||||||||| |||  |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||  || ||||||||    
T  21922259 gcttatcatgataactcttttgtggactctgcgacactttcatcttttcttgaatcatcttaaccttttcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaa 21922160  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  |  | || |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||| ||| |||| |||||    
T  21922159 gaccactcttccacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatagaaagcctcataaggtgccattccaatagtagaatgataacta 21922060  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || || || || ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| ||||||||||||| || |     ||||| ||||    
T  21922059 ttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagctattgaatcgtcc 21921960  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||  | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||  || |||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||    
T  21921959 tctacgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 21921860  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
     ||||| | ||| || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  21921859 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 21921818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 53 - 542
Target Start/End: Original strand, 22046546 - 22047035
Alignment:
Q  53 acttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 152  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||| ||| | || ||||||||||| || || ||  | | |||||||| |||||| || |  ||||||||||||||    
T  22046546 acttcaaagcacgtccaacaccagtcactggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctaaaactcaagatccttcctgcgtttatcatgataact 22046645  T
Q  153 cttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccg 252  Q
    ||| |||| ||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| |  || ||||  || |||||||  |   |  | || ||     
T  22046646 cttttgtcgactatgcgacactttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaggaccactctttcacct 22046745  T
Q  253 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaact 352  Q
    || |||||||| |||||||| || || || ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| || ||||    
T  22046746 gattcaaaccagcacaacggagttctgcatctctgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataaccattattgtatgtgaact 22046845  T
Q  353 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatc 452  Q
    | |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |     ||||| |||||||| | |||||||||    
T  22046846 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgattgaattgtcctctccgactgaccatc 22046945  T
Q  453 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatc 542  Q
     ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||    
T  22046946 tgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaatttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatc 22047035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 578
Target Start/End: Original strand, 23655084 - 23655625
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||| ||||| |||||| ||  ||||||||||||   |||||||||    
T  23655084 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacaaatgatctccgtcttgaaactcaagggcctttctcc 23655183  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| |||||||||| || |||||| ||| | ||||| ||||||   |||||||| ||||| |||||||| |  || || |  |||||||| ||    
T  23655184 gcttgtcatggtaactcttctatcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaa 23655283  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || | || || ||||||||||| || || || || || |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| | |||||| | |||| ||||     
T  23655284 cacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatactaatactcgaatgataactg 23655383  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||       ||||||     |||||||||| |  |||||  |||||| |||||| || ||    || || ||||    
T  23655384 ttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactgtcccaggctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcc 23655483  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| ||||| |  |  ||||| ||  |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  23655484 tctctgactgaccatctgtctgcggatgataacccgaactcaacctcaactccgaacccaaggcgtcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacct 23655583  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    |||||| | ||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  23655584 cggatctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgcaa 23655625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 36 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 804298 - 803774
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | |||||||| | |||||||||     
T  804298 aggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttctt 804199  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 235  Q
    | ||| ||||| ||||| ||||||| |||||| ||  | ||||| |||||    |||| | | || || |  ||||| || || || |  |||||||| |    
T  804198 cgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttcttagtagtctcgtgaaccaaatccggtccca 804099  T
Q  236 acaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaact 335  Q
    ||| | || |||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||| |  ||| | ||    
T  804098 acacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagct 803999  T
Q  336 attgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtc 435  Q
     ||||| ||||||||||||||||| |||||       ||||||    ||||||| || |  |||||  |||||||||||||||||||    ||||| |||    
T  803998 gttgttataagtaaactcaatcaaaggtaagtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtc 803899  T
Q  436 ctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacc 535  Q
    ||||| | ||||||||| || |||||||| |||||  ||||||| ||||| || |  ||||| ||  | || ||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  803898 ctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccaaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccaaaatctagaagtgaacc 803799  T
Q  536 tcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    ||||||| | |||||||||||||||    
T  803798 tcggatctctatccgacacaatact 803774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 53 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 20396733 - 20396229
Alignment:
Q  53 acttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 152  Q
    ||||||| ||||| || || |||||||||||| | || || ||||| ||||| || ||  | ||||||||||  || ||||| | ||||||||||||||     
T  20396733 acttcaatgcacgtcctacaccggtcacaggagtgactctaaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataaca 20396634  T
Q  153 cttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccg 252  Q
    ||| |||| |||||| ||| | ||||| |||||| | |||| ||||||||| || ||||||| ||| || |  ||  |||| || |   || |||| ||     
T  20396633 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcgcatcaacttaaccttctcagtagtttgttgaacgatatctagtcccaaaactacactctcgcct 20396534  T
Q  253 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaact 352  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||| |||| || | || ||||| || ||||    
T  20396533 gactcgaaccaacacaacggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaatggtgccattccaatactagaatgataattgttattgtacgtgaact 20396434  T
Q  353 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatc 452  Q
    | |||||||| | |      |||||| |  |||||||||| |  |||||| |||||||||| || |||||   |||||| || || || | |||||||||    
T  20396433 ctatcaacggaagatgactatcccaagtcgcaccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctccaacgactgaatcgttctttccgactgaccatc 20396334  T
Q  453 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgac 552  Q
     |||||  |||| || || |||||||| | ||  ||||  ||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| |||    
T  20396333 tgtctgcagatgatacgccgaactcaaccacagcttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgac 20396234  T
Q  553 acaat 557  Q
    |||||    
T  20396233 acaat 20396229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 37 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 22062057 - 22061534
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||| | || || || |||| |||| | ||||||| |||||||||||||||  | |||||||||| | |||||||||    
T  22062057 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctcc 22061958  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||| |||| |   |||||||| || || || ||||| || || || |  |||||||| ||    
T  22061957 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttttctgatcatcttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatccggtcccaa 22061858  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || ||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| | |||  ||||     
T  22061857 cacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagctttgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 22061758  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||        ||||||    |||||| ||| |  |||||  ||||||||||||  |||||    || || ||||    
T  22061757 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttcctcaagcacacacactctcaacaaatactccaatgattggatcgtcc 22061658  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||  | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||||||  | |||| ||||| ||| ||  ||||||| |||||    
T  22061657 tcttcgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcagactcttccagaacctagaagtgaacct 22061558  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatact 560  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
T  22061557 tggatccctatccgacacaatact 22061534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 37 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 31571466 - 31570937
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||| || || || ||||  ||| |||| |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||   |||||||||    
T  31571466 ggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactctcagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 31571367  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||| || |||   |||||||| || ||||| ||||| || || || |  |||||||| |     
T  31571366 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtcccag 31571267  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||| |||||| ||||| | |||| |||||    
T  31571266 cacaacactttctcctgactcgaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataacta 31571167  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||        ||||||    |||| || || |  |||||  |||||||||| ||||||||    || || || |    
T  31571166 ttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgttc 31571067  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||||| || |  ||||||||  | || ||||||| ||| ||  ||||||| |||||    
T  31571066 tctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacct 31570967  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaagg 566  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  31570966 cggatccctatccgacacaatactcgaagg 31570937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 115 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 22164737 - 22164272
Alignment:
Q  115 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagttt 214  Q
    |||||||||| ||| || || | |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||    
T  22164737 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 22164638  T
Q  215 cttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcat 314  Q
      || ||||  || ||||| || |   |  | || |  ||||||||||  |||||||| || || || | |||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  22164637 gctgaacaatctcgggtccgaagaccactctttcacttgactcaaacctgcacaacggagttctgcatcaccgaccgtacaaagcctcaaaaggtgccat 22164538  T
Q  315 tccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaa 414  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  22164537 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 22164438  T
Q  415 tcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactct 514  Q
    |||| ||    |||||| |||||||||| ||||||||  ||||| |||||  | || |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| |    
T  22164437 tctt-cagcgactgaattgtcctctctgactgaccatatgtctgcggatgacacgctgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 22164339  T
Q  515 cccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
     ||||||| |||||||||| || ||||| | |||  | ||||| || ||||| | ||||||||||||    
T  22164338 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctaatacaatgctcgaaggaacaccatgcaatct 22164272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 578
Target Start/End: Original strand, 19851568 - 19852109
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||| ||  | ||||  ||| | || |||| |||||||||||| ||  ||||||||||||   ||||||| |    
T  19851568 ggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacaaccgtcaacggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctac 19851667  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||  |||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||   |||||||| ||||| |  ||||| |  || || |  || ||||| ||    
T  19851668 gcttgccatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatattttctcttatcatcttgaccttctatgtagtctaatgaactaaatctggtcccaa 19851767  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    ||   || | || || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||  ||| |||||||||| |||  ||||     
T  19851768 caccacactttcacccgactcaaaccaacacaatggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggttccataccaatactagaatggtaactg 19851867  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||| |      | ||||    |||||||||| |  |||||  |||||| |||||| || ||   |||||| || |    
T  19851868 ttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactataccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactgaatcgttc 19851967  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||| ||||| |||||| ||||||  | ||||| |||||    
T  19851968 tctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgcgaactcttccaaaaccttgaagtgaacct 19852067  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    |||||| | ||||||||||||||| || || | |||||||||    
T  19852068 cggatctctatccgacacaatactcgatggaacaccatgcaa 19852109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 578
Target Start/End: Original strand, 19857604 - 19858145
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||| ||  | ||||  ||| | || |||| |||||||||||| ||  ||||||||||||   ||||||| |    
T  19857604 ggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacaaccgtcaacggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctac 19857703  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||  |||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||   |||||||| ||||| |  ||||| |  || || |  || ||||| ||    
T  19857704 gcttgccatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatattttctcttatcatcttgaccttctatgtagtctaatgaactaaatctggtcccaa 19857803  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    ||   || | || || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||  ||| |||||||||| |||  ||||     
T  19857804 caccacactttcacccgactcaaaccaacacaatggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggttccataccaatactagaatggtaactg 19857903  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||| |      | ||||    |||||||||| |  |||||  |||||| |||||| || ||   |||||| || |    
T  19857904 ttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactataccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactgaatcgttc 19858003  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||| ||||| |||||| ||||||  | ||||| |||||    
T  19858004 tctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgcgaactcttccaaaaccttgaagtgaacct 19858103  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    |||||| | ||||||||||||||| || || | |||||||||    
T  19858104 cggatctctatccgacacaatactcgatggaacaccatgcaa 19858145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 566
Target Start/End: Original strand, 22051020 - 22051549
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| || || || ||||  ||| | ||  ||||||| |||||||||||  ||||||||||||   |||| ||||    
T  22051020 ggagtcaacttccttgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactttcaaaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggccttcctcc 22051119  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||| | ||||| |||||    |||||||| ||||| || || || | ||| || |  || ||||| ||    
T  22051120 gcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctctgtcgtctgttgaaccaaatctggtcccaa 22051219  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || ||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||||| | |||  ||||     
T  22051220 cacaacactctctcctgactcaaaccagcataacggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaactg 22051319  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| || || ||||        ||||||    ||||||| || |  |||||  ||||||||| ||| |||||    || || ||||    
T  22051320 ttgttgtaggtgaactctataaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacagatcctccaacgattggatcgtcc 22051419  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |  ||||||||  | |||||||||| ||| ||  |||| || |||||    
T  22051420 tctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaatctcaacttggaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacct 22051519  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaagg 566  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  22051520 cggatccctatccgacacaatactcgaagg 22051549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 563
Target Start/End: Original strand, 14565298 - 14565825
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | |||||||| | |||||||||     
T  14565298 aggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttctt 14565397  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 235  Q
    | ||| ||||| ||||| ||||||| |||||| ||  | ||||| |||||    |||| | | || || || ||||| || || || |  |||||||| |    
T  14565398 cgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtctcgtgaaccaaatccggtccca 14565497  T
Q  236 acaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaact 335  Q
    ||| |  | | || || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||| |  ||| | ||    
T  14565498 acacaatactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagct 14565597  T
Q  336 attgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtc 435  Q
     ||||| ||||||||||||||||| || ||       ||||||    |||||||||| |  |||||  |||||||||||||||||||    ||||| |||    
T  14565598 gttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtc 14565697  T
Q  436 ctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacc 535  Q
    || || | ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||||||  | || ||||||| ||| ||  ||||||| ||||    
T  14565698 ctttccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacc 14565797  T
Q  536 tcggatcccgatccgacacaatactaga 563  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||    
T  14565798 tcggatctctatccgacacaatgctaga 14565825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 40 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24818237 - 24818048
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||  | ||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||| |||| || || ||||    
T  24818237 gtcaacttcctacacttcaaagcacgttcgacaccggtcacgaggttcactcttaaaaacacatgatcttcaacttgaaactcagtatctttccttctct 24818138  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccg 229  Q
     |||||| ||||||||||  ||||||||||||   ||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||| | ||| ||||||||||    
T  24818137 catcatggtaactcttcttcctactctgagacgatttcatcttttcctgaatcatcttaaccttttatgtagtctgttgaacaacttccg 24818048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 22120795 - 22120257
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  22120795 gtcaacttccttgacttcaatgcacgtcccacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 22120696  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||| ||| ||||||| || ||||| ||||||  ||| || || ||||| |  || ||||  || | |||||| |     
T  22120695 tatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatccgaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgatcctaagac 22120596  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | || ||  |||||||||| |||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  22120595 cactctttcacctcactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataactatta 22120496  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  22120495 ttgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 22120396  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    |   ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| || |  ||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||| |||| || ||    
T  22120395 ccaactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaattaaatcttgg 22120296  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||||||    
T  22120295 atctctatctgacacaatgctcgaaggaataccatgcaa 22120257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 37 - 578
Target Start/End: Original strand, 21251099 - 21251639
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  |||||||||| || ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || || ||   ||||||||||| ||| || || |    
T  21251099 ggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttattgaaactcaagatctttcctac 21251198  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | |||||  | |||| ||||||||||||||| || |||||||  || ||||  || ||||||||    
T  21251199 gcttatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgctttcat-ctctctttaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcctaa 21251297  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | || || || ||||||||||||||||| || || || || |||||||||||||| | | | ||||||||  ||||||||| |||| ||||     
T  21251298 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatcttcgaccatacaaagcgtaataaggtgtcatctcaatactagaatgataactg 21251397  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || || || || ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| | |||||||||||||| ||   |||||| ||||    
T  21251398 ttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcc 21251497  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||| ||| ||||| ||||| || ||  ||||||| ||||| ||||  || |||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||    
T  21251498 tctccgactgactatctgtctgtggatgatacgccaaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 21251597  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
     ||||| | ||| |||||||| || ||||| | |||||||||    
T  21251598 tggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 21251639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 37 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 21788982 - 21788442
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||||| ||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||| ||||||| ||| ||  | |    
T  21788982 ggagtcaacttctttgacttcaaagaacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcatgc 21788883  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||  || | ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||  |  ||||  || ||||||||    
T  21788882 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctaaacaatctctggtcctaa 21788783  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | || || || | ||||||||||||||| || || || |||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  21788782 gaccactctttcacctgatttaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatac-aagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 21788684  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || || || || ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| | |||||||||||||| ||    ||||| ||||    
T  21788683 ttattatacgtgaactctatcaatgggagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaacaaatcttctaatgattgaatcgtcc 21788584  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| |||   || |||||  |||||||||| | ||||||| | |||||||| ||    
T  21788583 tctccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttaaaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctggaagtaaatct 21788484  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
     ||||| | ||| |||||||| || ||||| | |||||||||    
T  21788483 tggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 21788442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 37 - 578
Target Start/End: Original strand, 23650198 - 23650739
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| || || || ||||||||| | || ||||||||||  || || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  23650198 ggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 23650297  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||||||||| |||||||| |||| |||||| ||  | || || || |||||||||||||||||||| || |||||||  || ||||  || ||||||||    
T  23650298 gcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgatgcttttatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaa 23650397  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | || || |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||| | || | |||||||||||||| |||| |||||    
T  23650398 gaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcataaggcgccattccaatactagaatgataacta 23650497  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || ||||| || ||||| || || || | |      |||||| |  | |||||||| |  || ||| |||||||||| || || |    |||||| || |    
T  23650498 ttattgtacgtgaactctattaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacgcaaactctcaacaagtcctctagcgactgaatcgttc 23650597  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| |  |||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||  || |||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||    
T  23650598 tctccgattgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 23650697  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
     ||||| | ||| || |||||||| ||||| | |||||||||    
T  23650698 tggatctctatctgaaacaatactcgaaggaacaccatgcaa 23650739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 40 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 19485491 - 19485169
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | | ||| |||| ||| ||||| | ||    
T  19485491 gtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgct 19485392  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||| | ||||||| ||| || || || ||||  || ||||  || |||||||| |     
T  19485391 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtggtttgctgaacaatctctggtcctaagac 19485292  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | || ||||| ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||     
T  19485291 cactctttcaccggattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgatagctatta 19485192  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacgg 362  Q
    || ||||| ||||| ||||||||    
T  19485191 ttataagtgaactcgatcaacgg 19485169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 37 - 577
Target Start/End: Original strand, 1266396 - 1266935
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| || || || ||||  ||| | || |||| ||| |||||||||||  | ||||||||||   |||||||||    
T  1266396 ggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctcc 1266495  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| || ||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| |||||    ||||||||| |||| || || || |  || || |  |||||||| ||    
T  1266496 gcttgtcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatctta-ccttctcagtcgtctgatgaaccaaatccggtcccaa 1266594  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || ||||||| ||||||||| | ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  ||||     
T  1266595 cacaacactctctcctgactcaaactagcacaaaggagtcctgcacctctgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 1266694  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  ||||||  ||||| || |||   || || ||||    
T  1266695 ttgttgtatgtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctctaaagattggatcgtcc 1266794  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | | ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || |  ||||||||| ||||||| |||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  1266795 tctccgaccgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaatctcaactttgaacccaaagcatcttgcaagctcttccataatctagaagtgaacct 1266894  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgca 577  Q
    |||||| | |||||||||||| || || |||| ||||||||    
T  1266895 cggatctctatccgacacaatgctcgacggtacaccatgca 1266935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 138 - 542
Target Start/End: Original strand, 23949178 - 23949581
Alignment:
Q  138 cttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaac 237  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||  |  || | ||| ||||| ||     
T  23949178 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcatcttaactttctcagtagtttgcta-acgatttctggtcccaaa 23949276  T
Q  238 aaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactat 337  Q
    |   || |||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || || |||| |||||||||||||| |||| |||| |    
T  23949277 actacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagtcctacacctccgaccatatagagcttcgaaaggtgccattccaatactagaatgataactgt 23949376  T
Q  338 tgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcct 437  Q
    | ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| |||||||||| ||||||||   |||||| ||  |    
T  23949377 tattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcttccaacgactgaatcgttat 23949476  T
Q  438 ctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctc 537  Q
     || | |||||||||  |||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||  || ||| |   ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  23949477 ttccgactgaccatctatctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaaacctattgcatactcttccaaaatctagaagtaaacctc 23949576  T
Q  538 ggatc 542  Q
    |||||    
T  23949577 ggatc 23949581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 20010524 - 20010197
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||| || || ||||  ||| | || |||| |||||||||||| ||  ||||||||||||   ||||  | |    
T  20010524 ggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacccacacccgtcatcggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagcgccttcttac 20010425  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||| ||||||   |||||||  ||||| ||  |||| |  || || |  || ||||| ||    
T  20010424 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatctggaccttctctatagtctgatgaactaaatctggtcccaa 20010325  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    |||  || | ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||| |||||||| | |||  ||||     
T  20010324 caacacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtcctacacctccgaccatacaaagtttcgaacggtgccataccaatacttgaatggtaactg 20010225  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 364  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  20010224 ttgttgtacgtgaactctatcaacggta 20010197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 21394489 - 21393948
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||||| ||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||| ||||||| ||| ||  | |    
T  21394489 ggagtcaacttctttgacttcaaagaacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcatgc 21394390  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||  || | ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||  |  ||||  || ||||||||    
T  21394389 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctaaacaatctctggtcctaa 21394290  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccga-ccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaact 335  Q
     |   |  | || || || | ||||||||||||||| || || || |||||| |||||| |||||||| | |||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  21394289 gaccactctttcacctgatttaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacccatac-aagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataact 21394191  T
Q  336 attgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtc 435  Q
    ||| || || || ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| | |||||||||||||| ||    ||||| |||    
T  21394190 attattatacgtgaactctatcaatgggagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaacaaatcttctaatgattgaatcgtc 21394091  T
Q  436 ctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacc 535  Q
    ||||| | ||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| |||   || |||||  |||||||||| | ||||||| | |||||||| |    
T  21394090 ctctccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttaaaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctggaagtaaatc 21393991  T
Q  536 tcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    | ||||| | ||| |||||||| || ||||| | |||||||||    
T  21393990 ttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 21393948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 36 - 557
Target Start/End: Original strand, 12304914 - 12305435
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||| || |||| |||| | ||||| | ||| |||||||||||  | |||||||||| | |||||||     
T  12304914 aggagtcaactttctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctaagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctt 12305013  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 235  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||  | ||||| |||||    |||| | | || || || ||||| || || || |  |||||||| |    
T  12305014 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtccca 12305113  T
Q  236 acaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaact 335  Q
    ||| |||| |||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||| || |  ||| | ||    
T  12305114 acacagcactctcacccgactcaaaccagcataaaggggtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatgctcgagtgatagct 12305213  T
Q  336 attgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtc 435  Q
     ||||| ||||| ||||||||||| || |        ||||||    |||||||||| |  |||||  | |||||||||||||||||    ||||| |||    
T  12305214 gttgttataagtgaactcaatcaatggcatgtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtc 12305313  T
Q  436 ctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacc 535  Q
    ||||| | ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || |  ||||| |   | || ||||||| ||| ||  ||||||| ||||    
T  12305314 ctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaatgtgtcctgtaaactcttccagaacatagaagtgaacc 12305413  T
Q  536 tcggatcccgatccgacacaat 557  Q
    ||||||||| ||| ||||||||    
T  12305414 tcggatccctatctgacacaat 12305435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 256 - 533
Target Start/End: Original strand, 22040235 - 22040512
Alignment:
Q  256 tcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaa 355  Q
    |||||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||| ||||| | ||||| || ||||| |    
T  22040235 tcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattcgaatactagaatgataactaatattgtatgtgaactcga 22040334  T
Q  356 tcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggt 455  Q
    ||||||| | |      |||||| |    |||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |     ||||| ||||||||   ||||||||| ||    
T  22040335 tcaacggaagatgactatcccaagttcatccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgattgaattgtcctctccaactgaccatctgt 22040434  T
Q  456 ctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaa 533  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  || |||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  22040435 ctgcggatgataagccgaactcaatctcaatttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaa 22040512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 578
Target Start/End: Original strand, 19863316 - 19863754
Alignment:
Q  139 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaaca 238  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||  | |||||  | ||| ||||||| || |||||||| || || |  || ||||  |||||||| ||||    
T  19863316 ttatcatgatagctcttctgtctactttgtgatgctttcattctctctcgaatcattttgaccttttcggtcgtctgctgaacaatctccggtcccaaca 19863415  T
Q  239 aagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactatt 338  Q
      ||| |||| || |||||  |||||||||| ||||| | ||| |||| ||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||| ||| ||||| ||    
T  19863416 ctgcaatctcgccagactcgtaccaacacaaaggtgttcgacatctcctaccatacaacgcctcaaatggtgccatcccaatactagaatggaaactgtt 19863515  T
Q  339 gttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctc 438  Q
    ||| |||||||||||||| || || ||  |  | ||||||||  | ||||| ||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||    ||||| || ||     
T  19863516 gttataagtaaactcaattaatggcaagtaagcatcccaact-cccccttgttccagcacacatgctcttaacaagtcttccaatgattgaatggttctt 19863614  T
Q  439 tctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcg 538  Q
    || |||||||||||  | || || || || |||||||||| | | || ||||| |||||||||  |||||||||  |||||||  | || || ||||| |    
T  19863615 tcggtctgaccatcaatttgtgggtgatatgcagaactcagttttaacttagtacccaaagcactttgcaaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttg 19863714  T
Q  539 gatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    |||| | |||||| |||||||| ||||| | |||||||||    
T  19863715 gatctctatccgaaacaatactcgaaggaacaccatgcaa 19863754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 578
Target Start/End: Original strand, 19867953 - 19868391
Alignment:
Q  139 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaaca 238  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||  | |||||  | ||| ||||||| || |||||||| || || |  || ||||  |||||||| ||||    
T  19867953 ttatcatgatagctcttctgtctactttgtgatgctttcattctctctcgaatcattttgaccttttcggtcgtctgctgaacaatctccggtcccaaca 19868052  T
Q  239 aagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactatt 338  Q
      ||| |||| || |||||  |||||||||| ||||| | ||| |||| ||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||| ||| ||||| ||    
T  19868053 ctgcaatctcgccagactcgtaccaacacaaaggtgttcgacatctcctaccatacaacgcctcaaatggtgccatcccaatactagaatggaaactgtt 19868152  T
Q  339 gttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctc 438  Q
    ||| |||||||||||||| || || ||  |  | ||||||||  | ||||| ||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||    ||||| || ||     
T  19868153 gttataagtaaactcaattaatggcaagtaagcatcccaact-cccccttgttccagcacacatgctcttaacaagtcttccaatgattgaatggttctt 19868251  T
Q  439 tctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcg 538  Q
    || |||||||||||  | || || || || |||||||||| | | || ||||| |||||||||  |||||||||  |||||||  | || || ||||| |    
T  19868252 tcggtctgaccatcaatttgtgggtgatatgcagaactcagttttaacttagtacccaaagcactttgcaaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttg 19868351  T
Q  539 gatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    |||| | |||||| |||||||| ||||| | |||||||||    
T  19868352 gatctctatccgaaacaatactcgaaggaacaccatgcaa 19868391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 245 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 20976067 - 20975737
Alignment:
Q  245 tctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgta 344  Q
    ||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  |||| ||||||||    
T  20976067 tctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgta 20975968  T
Q  345 agtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtc 444  Q
     || ||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||  |  |||||  ||||||  ||||| |||||    || || |||||||| | |    
T  20975967 cgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctaaagtacacacactctcagtaaatcctccaatgattgtatcgtcctctccgac 20975868  T
Q  445 tgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatccc 544  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||||||| | |||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||| |    
T  20975867 tgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcatgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctc 20975768  T
Q  545 gatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
     ||| ||||||||||| || |||| ||||||    
T  20975767 catctgacacaatactcgacggtacaccatg 20975737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 91 - 281
Target Start/End: Original strand, 24094353 - 24094543
Alignment:
Q  91 ctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaa 190  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||   |||||||||||| ||||||  |||||||||||  | ||||| || ||   ||    
T  24094353 ctcaaaaacacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcatctaattatcatgataaatcttcttcctactctgagatgctttcatcttctccataa 24094452  T
Q  191 tcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctaca 281  Q
    ||||||||||||| |  ||||| |  |||||||||| | ||||||||| | || | ||||| || ||  ||||||||||||||||||||||    
T  24094453 tcatcttaaccttgtatgtagtgtgctgcacaactttcagtcctaacataacactttctcccgattcctaccaacacaacggtgtcctaca 24094543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 29304050 - 29303521
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || ||||  ||| | ||||||| ||| |||||||||||  | |||||||||| | ||||||| |    
T  29304050 ggagtcaacttccttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcattggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttc 29303951  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| |||||||| |||| |||||| ||  | ||||| |||||    |||||  | || || || ||||| || || || |  |||||||| ||    
T  29303950 gcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcattctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtcccaa 29303851  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || |||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| || ||||| | |||| |  |     
T  29303850 cacaacactctcacctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccatacctatactcgaatgatagttg 29303751  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  | || |||||||| |||||    || || ||||    
T  29303750 ttgttataagtgaactctatcaacggtaggtggctatcccaagctccaccttgctcaagtacacacacccttaacaaatcatccaatgattggatcgtcc 29303651  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||  | |  ||||||||  | || ||||||| ||| ||  ||||||| |||||    
T  29303650 tctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacctcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacct 29303551  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaagg 566  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  29303550 cggatccctatccgacacaatactcgaagg 29303521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 226 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 16271659 - 16271328
Alignment:
Q  226 tccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactag 325  Q
    |||||||| |||| | || |||| || ||| ||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||| |    
T  16271659 tccggtcccaacacaacactctcacccgacgcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcg 16271560  T
Q  326 catgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaact 425  Q
      ||| | || ||||| ||||| || |||||||| || ||       ||||||    |||||||||| |  |||||  |||||||||||||||||||       
T  16271559 agtgatagctgttgttataagtgaattcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatga 16271460  T
Q  426 ctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaattta 525  Q
     ||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||  | || ||||||| ||| ||  ||    
T  16271459 ttgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccataaccta 16271360  T
Q  526 gaagtaaacctcggatcccgatccgacacaat 557  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  16271359 gaagtgaacctcggatccctatccgacacaat 16271328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 406 - 560
Target Start/End: Original strand, 27355074 - 27355228
Alignment:
Q  406 ctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagctt 505  Q
    |||||||||||||||||    ||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||||||  | |    
T  27355074 ctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatccgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcct 27355173  T
Q  506 gcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    | ||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  27355174 gtaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatact 27355228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 253 - 578
Target Start/End: Original strand, 18856950 - 18857275
Alignment:
Q  253 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaact 352  Q
    ||||||||||| |||||| | ||  | || ||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||| |||| | ||||| ||||| || ||||    
T  18856950 gactcaaaccagcacaacagagttatgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatacctattattgtatgtgaact 18857049  T
Q  353 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatc 452  Q
    | |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||   ||||||||||| || |    |||||| |||||||| | |||||||||    
T  18857050 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 18857149  T
Q  453 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgac 552  Q
     ||||| || || || || |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||||| | ||| |||    
T  18857150 tgtctgcgggtgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgac 18857249  T
Q  553 acaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||||| || ||||| | |||||||||    
T  18857250 acaatgctcgaaggaacaccatgcaa 18857275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 361
Target Start/End: Original strand, 21840633 - 21840898
Alignment:
Q  96 aaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatc 195  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||   |||| || | ||| ||||| ||||| ||||||| |||||| ||| | || || ||||||   ||||||    
T  21840633 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagtgccttccttcgcttgtcatggtaactattctgtcgactctgcgacgcttttatcttttctcttatcatc 21840732  T
Q  196 ttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccataca 295  Q
    || ||||| |||||||| |  || || |  || ||||| ||||   || | ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  21840733 ttgaccttctccgtagtctgatgaactaaatctggtcccaacaccacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggggtcctgcacctccgaccataca 21840832  T
Q  296 aagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacg 361  Q
    |||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  |||| |||||||| || || || |||||||    
T  21840833 aagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaattctatcaacg 21840898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 40 - 364
Target Start/End: Original strand, 20388259 - 20388583
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||  || | || |||| ||||||||| || ||  ||||||||||||  |||||||| | ||    
T  20388259 gtcaacttcttagacttcaaagcacgaccaacacctgtcactagagtgactctcagaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtcctttctacgct 20388358  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||  ||| | ||||| || |||   ||||  || |||||||  ||||| |  || || |  ||  |||| ||||     
T  20388359 tgtcatgataactcttatgtcgactctacgacgctttcatcttctctcttatcaatttgaccttttttgtagtctgatgaactatatctcgtcccaacac 20388458  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |||| |  || |||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  |||| |||    
T  20388459 tacattttaacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcacctccaaccatacaaagcttcgaacggtgccatgccaatactcgaatggtaactgttg 20388558  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggta 364  Q
    |||||  | ||||| ||||||||||    
T  20388559 ttgtacatgaactctatcaacggta 20388583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 138 - 330
Target Start/End: Original strand, 22987459 - 22987651
Alignment:
Q  138 cttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaac 237  Q
    |||||||||||||||||| |||| | |||| ||| | ||||| || ||||||||||| ||| | || ||  |||||| ||| |||| ||  | ||||||     
T  22987459 cttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatattatctttctcaatagtttgttgaacaatttatgctcctaaa 22987558  T
Q  238 aaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatga 330  Q
    |   || |||| ||  |||| |||||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  22987559 accacactctcacctaactcgaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccgtacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatga 22987651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 158
Target Start/End: Original strand, 28982513 - 28982635
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| || ||||  ||| | ||||||| ||| |||||||||||  | |||||||||| |||||||||     
T  28982513 aggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaacggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctt 28982612  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttctg 158  Q
    | ||| ||||| |||||||||||    
T  28982613 cgcttgtcatggtaactcttctg 28982635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 158
Target Start/End: Original strand, 28987733 - 28987855
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| || ||||  ||| | ||||||| ||| |||||||||||  | |||||||||| |||||||||     
T  28987733 aggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaacggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctt 28987832  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttctg 158  Q
    | ||| ||||| |||||||||||    
T  28987833 cgcttgtcatggtaactcttctg 28987855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 16265243 - 16265127
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||  ||||| || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | |||||||||| |||||||||     
T  16265243 aggagtcaacttcctcgacttcaaagcacatccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaagacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctt 16265144  T
Q  136 ctcttatcatgataact 152  Q
    | ||| ||||| |||||    
T  16265143 cgcttgtcatggtaact 16265127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 331 - 379
Target Start/End: Original strand, 24094557 - 24094605
Alignment:
Q  331 aaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaac 379  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24094557 aaactattgttgtaggtaaactcaatcaacggtaaacattcatcccaac 24094605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21682094 - 21681919
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||| |||||||||||| ||  ||||||||||||   |||| || |    
T  21682094 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctac 21681995  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 212  Q
     ||| ||||||||||||||||||| |||||  ||| | ||||| ||||||   |||||||| || || ||||||||    
T  21681994 gcttgtcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagt 21681919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 21325033 - 21324903
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||   ||||||| |    
T  21325033 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctac 21324934  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 167  Q
     ||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  21324933 gcttgtcatgataactcttttgtcgactctg 21324903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 53 - 167
Target Start/End: Original strand, 22032205 - 22032319
Alignment:
Q  53 acttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 152  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || || ||| | | |||||||| |||||| || |  ||||||||||||||    
T  22032205 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccatcctaaaactcaagatccttcctacgtttatcatgataact 22032304  T
Q  153 cttctgtctactctg 167  Q
    ||| |||| ||||||    
T  22032305 cttttgtcgactctg 22032319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 23151081 - 23151154
Alignment:
Q  13 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggatt 86  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||    
T  23151081 acatcaaaaggaccaacaaaatgaggagtcgacttcctacactttaaagcacgcccaacaccagttacaggatt 23151154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 503 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 22129098 - 22129023
Alignment:
Q  503 cttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| |||| || ||||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||||||    
T  22129098 cttgcaaactcttccaaaatctagaattaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaataccatgcaa 22129023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 493 - 560
Target Start/End: Original strand, 22371553 - 22371620
Alignment:
Q  493 cccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  22371553 cccaacgcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtaaacctcggatctctattcgacacaatact 22371620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 153
Target Start/End: Original strand, 23949029 - 23949162
Alignment:
Q  20 acggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaa 119  Q
    |||| |||||||| |  |||||||||||| |  | ||||||||||| | ||  || ||||||||| | || |||||||||||||| || ||  |||||||    
T  23949029 acggaccaacaaacctcggagtcaacttctttgatttcaaagcacgtctaaaaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaa 23949128  T
Q  120 ctcaatatcctttctcctcttatcatgataactc 153  Q
    |||||  ||||| || | |||||||| |||||||    
T  23949129 ctcaaggtccttcctacgcttatcataataactc 23949162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 426 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 19485105 - 19484989
Alignment:
Q  426 ctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaattta 525  Q
    |||||| |||||||| |  |||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||| ||| | ||||||| ||    
T  19485105 ctgaattgtcctctccgattgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcagacttttccaaaatcta 19485006  T
Q  526 gaagtaaacctcggatc 542  Q
    |||||||| || |||||    
T  19485005 gaagtaaatcttggatc 19484989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 468 - 560
Target Start/End: Original strand, 21841005 - 21841097
Alignment:
Q  468 agcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||| |||  ||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  21841005 agccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttttaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatctctatctgacacaatact 21841097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 486; Significance: 0; HSPs: 77)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 486; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 581
Target Start/End: Original strand, 7823955 - 7824524
Alignment:
Q  12 gacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcacca 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7823955 gacatcaaacggcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcacca 7824054  T
Q  112 acttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtag 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  7824055 acttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtag 7824154  T
Q  212 tttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgt 311  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7824155 tttcttgcacaacttccggcccaaacaaagcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgc 7824254  T
Q  312 cattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaac 411  Q
    ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7824255 cataccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaac 7824354  T
Q  412 aaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaac 511  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  7824355 aaatcctccaaactctgaatagtcctttctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcctaaagcagcttgcaaac 7824454  T
Q  512 tctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7824455 tctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaatct 7824524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 486; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 27107989 - 27107420
Alignment:
Q  12 gacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcacca 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27107989 gacatcaaacggcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcacca 27107890  T
Q  112 acttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtag 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  27107889 acttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtag 27107790  T
Q  212 tttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgt 311  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27107789 tttcttgcacaacttccggcccaaacaaagcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgc 27107690  T
Q  312 cattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaac 411  Q
    ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27107689 cataccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaac 27107590  T
Q  412 aaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaac 511  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27107589 aaatcctccaaactctgaatagtcctttctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaac 27107490  T
Q  512 tctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27107489 tctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaatct 27107420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 578
Target Start/End: Original strand, 15363999 - 15364561
Alignment:
Q  16 tcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaactt 115  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  15363999 tcaaacggtcccacaaaacaaggagtcaacttccgacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacct 15364098  T
Q  116 gaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttc 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||| || |||     
T  15364099 gaaactcaatgtcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccttattttt 15364198  T
Q  216 ttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcatt 315  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | || | |||||  | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  15364199 ttgcacaacttccggtcttaacatatcactttctccttattcaaaccaacacaacgtcgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccata 15364298  T
Q  316 ccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaat 415  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15364299 ccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacacattgctccaacacacaagctctcaacaaat 15364398  T
Q  416 cttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctc 515  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15364399 cctctaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcctaaagcagcttgcaaactctc 15364498  T
Q  516 ccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  15364499 ccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgatacaatactagaaggaataccatgcaa 15364561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 578
Target Start/End: Original strand, 14936406 - 14936968
Alignment:
Q  16 tcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaactt 115  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  14936406 tcaaacggtcccacaaaacaaggagtcaacttccgacacttcaaagcacgaccaacaccagtcacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacct 14936505  T
Q  116 gaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttc 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  14936506 gaaactcaatgtcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccttagttta 14936605  T
Q  216 ttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcatt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   || || || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14936606 ttgcacaacttccggtcctaacaaagcaccttcacctgattcaaaccaacacaacgacgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccatt 14936705  T
Q  316 ccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaat 415  Q
    || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14936706 ccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacacattgctccaacacacaagctctcaacaaat 14936805  T
Q  416 cttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctc 515  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14936806 cctctaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctggggatgataagaagaactcaatctcaacttagttcctaaagcagcttgcaaactctc 14936905  T
Q  516 ccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  14936906 ccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgatacaatactagaaggaataccatgcaa 14936968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 12368789 - 12368225
Alignment:
Q  13 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12368789 acatcaaacggtccaacaaa-cgaggagtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacactggtcacaagattcactctcaaaaacacgtgatcaccaa 12368691  T
Q  113 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 212  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  12368690 cctgaaagtcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcattttctcttggatcatcttaacctttttcgtagt 12368591  T
Q  213 ttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtc 312  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  12368590 ctcttgcacaacttccggtccaaacaaagcactttctccggattcgaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaatggagcc 12368491  T
Q  313 attccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 412  Q
    || |||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12368490 ataccaatactagaatgaaattttttgttgtaagtaaactcaatcaaagttaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 12368391  T
Q  413 aatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaact 512  Q
    |||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||    
T  12368390 aatcatcaaaactctgaatagtccactctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagtagaactcaatctcaacttagtttccaaagcagattgtaaact 12368291  T
Q  513 ctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||    
T  12368290 ctcccagaacttagaagtaaaccttggatcccgatccaatacaatactagacggaataccatgcaa 12368225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 578
Target Start/End: Original strand, 4439987 - 4440549
Alignment:
Q  16 tcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaactt 115  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  4439987 tcaaatggtccaataaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacct 4440086  T
Q  116 gaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttc 215  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4440087 gaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtctc 4440186  T
Q  216 ttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcatt 315  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | || || || || |||||||||||||   | |||||||| |  |||||||||||||||| | ||| |||     
T  4440187 ttgcacaacttccggccctaacaaagcactttcacctgattcgaaccaacacaacgacattctacaccttcttccatacaaagcctcaagcagtgccata 4440286  T
Q  316 ccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaat 415  Q
    ||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4440287 ccggtactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaataaat 4440386  T
Q  416 cttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctc 515  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4440387 cctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttc 4440486  T
Q  516 ccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4440487 ccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatgcaa 4440549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 21674744 - 21674182
Alignment:
Q  16 tcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaactt 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||  ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21674744 tcaaaaggtccaacaaaacgaggagtcaatttcttacacttcaaagcacgtccaataccaatcacaaggttcactctcaaaaacacatgatcaccaactt 21674645  T
Q  116 gaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttc 215  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| || |||||||||||||||   ||||||||||| ||    
T  21674644 gaaattcaatgtccttcctcctcttatcatgataactcttctgtctactttgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttatatttttccgtagtctc 21674545  T
Q  216 ttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcatt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  21674544 ttgcacaacttccggtcctaacaaagcactttctcctgactcaaaccaacacaacgttgtcttacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccata 21674445  T
Q  316 ccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaat 415  Q
    || ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21674444 ccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaattcaatcaacggtaaacattcgatccaactgacatcttgctccaaaacacaagctctcaacaaat 21674345  T
Q  416 cttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctc 515  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21674344 cctctaaactctgaatagtcctctcagtctggccatcggtctgggcatgataagcataactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttc 21674245  T
Q  516 ccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21674244 ccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaa 21674182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 557
Target Start/End: Original strand, 12193615 - 12194156
Alignment:
Q  16 tcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaactt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  12193615 tcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttccggcatttcaaagcacgtccaacaccggttacaggattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacct 12193714  T
Q  116 gaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttc 215  Q
    |||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |  |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12193715 gaaaatcaatgtcattcctcctcttaacatgataactcttctgcctactctgagacgctctcatcttctcttgaatcatcttaaccttctccgtagtttc 12193814  T
Q  216 ttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcatt 315  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  12193815 ttgcacaaccttcggtcctaacaaagcattttcacctgactcataccaacacaaaggagttctacacctccgaccatacaaagcttcaaacggtgtcata 12193914  T
Q  316 ccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaat 415  Q
    |  |||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  12193915 ctgatactttaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgacccaactgacaccttgctccaaaacataagctcttaacaaat 12194014  T
Q  416 cttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctc 515  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  12194015 cttccaaactctgaatagtcatcttcgtcttcccattggtctaaggatgataagcagaactcaatctcaacttagtttccaaagcaacttgccaactctc 12194114  T
Q  516 ccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaat 557  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12194115 ccaaatattagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaat 12194156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 16 - 578
Target Start/End: Original strand, 45146615 - 45147173
Alignment:
Q  16 tcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaactt 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| || ||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  45146615 tcaaacggtccaacaaaatgaggagtcaactttcgacacttcaaagcacgtccaacaccagtc-catgattcattctcaaaaacacatgatcaccaactt 45146713  T
Q  116 gaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttc 215  Q
    ||||| |||| ||||| || ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  45146714 gaaacacaatgtccttcctactcttataatgataactcttctatttactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaacattttccgtagtctc 45146813  T
Q  216 ttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcatt 315  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||| | || || || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||     
T  45146814 ttgcataaccttcggtcctaacaaagcactttcacctgattcaaaccaacacaatggcgtcctacacctccgaccatacagagcctccaacggtgtcata 45146913  T
Q  316 ccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaat 415  Q
    || ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45146914 ccgatactagaatgcaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattctgcccaactgacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaat 45147013  T
Q  416 cttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctc 515  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  45147014 cctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatccgtctgaggatgataagcagaactcaacctcaacttggttccaaaagcagcttgcaaactttc 45147113  T
Q  516 ccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    |||||| |||||||||||||||||     ||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  45147114 ccaaaacttagaagtaaacctcgg---gagatccgacataatactagaaggaataccatgcaa 45147173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 22 - 578
Target Start/End: Original strand, 13353216 - 13353771
Alignment:
Q  22 ggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaact 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  13353216 ggtccaacaaaacgaggagtcaactttcaacacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagtattcactctcagaaacacaagatcaccaatttggaact 13353315  T
Q  122 caatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcac 221  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |  || | || |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  13353316 caatgtccttcctcctcttatcatgataactcttctgcgtactctgagatgctctcgtcttctcttaaatcatcttaacctttttcgtagtctcttgcac 13353415  T
Q  222 aacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaata 321  Q
    ||| |||||||||||||||||| | || || |||||| ||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||  |  ||    
T  13353416 aacctccggtcctaacaaagcactttcacctgactcataccaacacaacgacgtcctacaccttctaccatacaaagcctcaaacggtgccatatcggta 13353515  T
Q  322 ctagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttcca 421  Q
     ||| ||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  13353516 atagaatgaaaactcttattataagtaaactcaatcgacggtaaacattcgacccaactgacaccttgcttcaaaacacaagctcttaacaaatcttcta 13353615  T
Q  422 aactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaa 521  Q
    ||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||  ||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||   ||||||||   ||| ||||    
T  13353616 aactctgaataatcctctccatctaaccatcggtctggagatgacaagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagttccttgcaaatcttcctaaaa 13353715  T
Q  522 tttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  13353716 cttagaagtaaaccttggatcccgatccgacac-atactagaaggaatatcatgcaa 13353771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 16 - 578
Target Start/End: Original strand, 17923739 - 17924272
Alignment:
Q  16 tcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaa-acacatgatcaccaact 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| | ||||| || |||||||| || |||| ||||||||||||||||     
T  17923739 tcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaatttcttacacttcaaagcacgtccaccaccggttaccggattcactcttaaaaaacacatgatcaccaacc 17923838  T
Q  115 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagttt 214  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| | ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  17923839 tgaaactcaatgtccatcctcctcttatcatgacaactcttctgcctattctgagacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttttccgtagtct 17923938  T
Q  215 cttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcat 314  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | || || || |||||                  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  17923939 cttgcacaacctccggtcctaacaaagcactttcacctgattcaaa------------------acacctccgaccatacagagcctcaaacggtgccat 17924020  T
Q  315 tccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaa 414  Q
     || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17924021 accgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaacttaatcaacggtaaacattcgacccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaataaa 17924120  T
Q  415 tcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactct 514  Q
    || |||||||||||||||||||||            |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |    
T  17924121 tcctccaaactctgaatagtcctc------------tcggtctggggatgataagccgaactcaacctcaacttatttcccaaagcagcttgcaaacttt 17924208  T
Q  515 cccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17924209 ttcaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaa 17924272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 17145469 - 17144945
Alignment:
Q  16 tcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaactt 115  Q
    ||||||||||||| |||||  || |||||||||| ||||| |||| |||| ||||| ||||| |||  |||||| || |||||||||||| | |||||||    
T  17145469 tcaaacggtccaataaaacagggtgtcaacttccgacactccaaaacacgtccaacaccggttacattattcactcttaaaaacacatgagctccaactt 17145370  T
Q  116 gaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttc 215  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | || ||    
T  17145369 gaaactcaatatccttcatcctcttatcatgataactcttctgcctactctgagaagctttcatattttcttgaatcatcttcaccttttctatggtctc 17145270  T
Q  216 ttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcatt 315  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||||    |||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||     
T  17145269 ttgaacaactaccggtcctaacaaatcaatttctcctaactcataccaacacaacgacaacctacacctccttccatacaaagcttcaaa-ggtgtcata 17145171  T
Q  316 ccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaat 415  Q
    |||||| ||  ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||  ||||| | |||  ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  17145170 ccaatattaaaatgaaaattgttgttgtaagtaaattcaatcaacgacaaacactcagcccaattcacattttgttctaaaacacaagctctcaacaaat 17145071  T
Q  416 cttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctc 515  Q
    ||||||||   | |||||||||||| || |  | ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||||||  |||||| |||||     
T  17145070 cttccaaagattaaatagtcctctccgttttccgatcagtctgaggatgataagcagaactcaacctc-acatagttcccaaagcctcttgcatactctt 17144972  T
Q  516 ccaaaatttagaagtaaacctcggatc 542  Q
    |||||| || |||||||||||||||||    
T  17144971 ccaaaactttgaagtaaacctcggatc 17144945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 233
Target Start/End: Original strand, 13378754 - 13378974
Alignment:
Q  13 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13378754 acatcaaacggtccaacaaaacaaggagtcaacttccgacaattcaaagcacgaccaactcaagttataggattcactctcaaaaacacatgatcaccaa 13378853  T
Q  113 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 212  Q
    | ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13378854 cctgaaactcaattttctttctcctcttatcataataacgcttctgtctactctgagatgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttccgtagt 13378953  T
Q  213 ttcttgcacaacttccggtcc 233  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  13378954 ctcttgcacaacttccggtcc 13378974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 24 - 497
Target Start/End: Original strand, 20466849 - 20467321
Alignment:
Q  24 tccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactca 123  Q
    ||||||||||| ||| || || ||| |  ||||||||||||||||||| |||||||| || || || || |||||||||| |||  ||||| ||||||||    
T  20466849 tccaacaaaactaggcgttaatttcatcgacttcaaagcacgaccaacaccggtcacggggttaactctaaaaaacacattatcttcaactagaaactca 20466948  T
Q  124 atatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaa 223  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||  | ||||| || || ||||||||| |||||||| | ||||| |  |   |||    
T  20466949 atatccttcctccgcttatcatgataactattctgcctactctgagattctttcatcttctcctgaatcatcataaccttt-ctgtagtctgctaagcaa 20467047  T
Q  224 cttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatact 323  Q
    |||| ||||| | |||| || ||||||| |||||| || ||||||| || |||| | |||| |  |||| ||| || ||||| || | |||| |||||||    
T  20467048 cttctggtccaatcaaaacactctctcctgactcatacaaacacaatggcgtccgataccttcttccatgcaatgcttcaaaaggcgccatttcaatact 20467147  T
Q  324 agcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaa 423  Q
     | ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||| || |||| |||||||||| |||||||||| |||    
T  20467148 cgaatgaaaactgttgttgtaggtgaactcaatcaacggtaaacattcaatccaacttacaccttgttcaaaaatacaagctctcgacaaatcttctaaa 20467247  T
Q  424 ctctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaa 497  Q
       ||||||||||||||||  ||||| || || |||||||  ||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  20467248 tattgaatagtcctctctgattgaccgtccgtatgaggataataagcggaactcaacctcaacttagttcccaa 20467321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 115 - 578
Target Start/End: Original strand, 12687659 - 12688122
Alignment:
Q  115 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagttt 214  Q
    |||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| |    
T  12687659 tgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 12687758  T
Q  215 cttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctc--cggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtc 312  Q
     ||| ||||  || |||||||| |   |||||| ||  | |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  12687759 gttggacaatctctggtcctaagac--cattctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgcc 12687856  T
Q  313 attccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 412  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| |||||||||    
T  12687857 attccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagcacacaaactctcaaca 12687956  T
Q  413 aatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaact 512  Q
    |||| || |    |||||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |  ||||||||  ||||||||||    
T  12687957 aatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaact 12688056  T
Q  513 ctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
     | ||||||| |||||||||| || ||||| | |||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  12688057 tttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgatacaatgctcgaaggaataccatgcaa 12688122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 38 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 17505 - 16968
Alignment:
Q  38 gagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcct 137  Q
    ||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| |||||| || |     
T  17505 gagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcg 17406  T
Q  138 cttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaac 237  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| |  || |||| ||| ||||||||     
T  17405 cttatcatgataacttttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatttcgggtcctaag 17306  T
Q  238 aaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactat 337  Q
    |   |  | || || |||| |||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  17305 accactctttcacctgactgaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactat 17206  T
Q  338 tgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattc-gtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    | ||||| || ||||| |||||||| ||||   |  |||||| |  | |||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |    |||||| ||||    
T  17205 tattgtatgtgaactcgatcaacgg-aaactgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcc 17107  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    ||||   ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |  || |||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  17106 tctccaactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatct 17007  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
     ||||| | ||| || ||||| || ||||| | ||||||    
T  17006 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 16968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 297
Target Start/End: Original strand, 23641576 - 23641857
Alignment:
Q  16 tcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaactt 115  Q
    ||||||||||||| ||||||  | |||||||| | |||||| |||| ||| ||||| ||||| | | ||||||| || ||||||| ||||| | ||||||    
T  23641576 tcaaacggtccaataaaacgcagtgtcaactttcgacacttaaaagaacgtccaacaccggttatatgattcactctgaaaaacatatgattatcaactt 23641675  T
Q  116 gaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttc 215  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||  || |||||||| | ||||| || || |||||||||| ||| || | |||||| ||    
T  23641676 gaaactcaatatccttcctccttttatcatgataagtcttctgcttattctgagacgctttcatcttatcctgaatcatctgaactttcttcgtagtctc 23641775  T
Q  216 ttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaa 297  Q
     |||||||||| ||||||||||||| || |||||||  ||||| | ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  23641776 gtgcacaactttcggtcctaacaaaacactctctcctaactcatatcaagacaacggtgtcctacacctctgtccatacaaa 23641857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 40 - 577
Target Start/End: Original strand, 10871078 - 10871615
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | ||||| ||||  || ||||| | ||    
T  10871078 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgct 10871177  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  10871178 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 10871277  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | ||||| || ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  10871278 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 10871377  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  10871378 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 10871477  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  10871478 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 10871577  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgca 577  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||| ||||||||||    
T  10871578 atctctatctgatacaatgctcgaaggaataccatgca 10871615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 111 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 5432712 - 5432506
Alignment:
Q  111 aacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgta 210  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |  |||| || ||   |||||| || ||||| |  |||    
T  5432712 aacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgataactcttctgcctactttgagacgctctcatcttctc---aatcatattcaccttctatgta 5432616  T
Q  211 gtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtg 310  Q
    || | |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5432615 gtctattgcacaacttctggtcctaacaaagcactttctcctaactcataccaacacaacggtgttctacacctccttccatacaaagcctcaaacggtg 5432516  T
Q  311 tcattccaat 320  Q
    |||| |||||    
T  5432515 tcataccaat 5432506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 138 - 575
Target Start/End: Original strand, 9596238 - 9596675
Alignment:
Q  138 cttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaac 237  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| |  || ||||  || ||||||||     
T  9596238 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctctgtagtctgctgaacaatctctggtcctaag 9596337  T
Q  238 aaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactat 337  Q
    |   |  | || || |||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||  |||||    
T  9596338 accactctttcacctgactcaaaccaacacaacgaagttctacatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaataatagaatgatgactat 9596437  T
Q  338 tgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcct 437  Q
    | ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |    |||||| |||||    
T  9596438 tattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcct 9596537  T
Q  438 ctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctc 537  Q
    ||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||     
T  9596538 ctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaatttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctt 9596637  T
Q  538 ggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
    ||||| | ||| || ||||| || ||||| | ||||||    
T  9596638 ggatctctatctgatacaatgctcgaagggacaccatg 9596675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 53 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 18551932 - 18551407
Alignment:
Q  53 acttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 152  Q
    ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||| ||||||| ||| || || | |||||||||||||||    
T  18551932 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataact 18551833  T
Q  153 cttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccg 252  Q
    ||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |   |  | |||||     
T  18551832 cttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcct 18551733  T
Q  253 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaact 352  Q
    || ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||  ||||||| || ||||| ||||    
T  18551732 gattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactattattataagtgaact 18551633  T
Q  353 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatc 452  Q
    |||||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||| | |||||||||    
T  18551632 caatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 18551533  T
Q  453 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgac 552  Q
     ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||||| | ||| |||    
T  18551532 tgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgac 18551433  T
Q  553 acaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    || || || ||||| | |||||||||    
T  18551432 acgatgctcgaaggaacaccatgcaa 18551407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 36 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 11306432 - 11305908
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | |||||||||| |||||||||     
T  11306432 aggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctt 11306333  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 235  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||  | ||||| |||||    |||| | | || || || ||||| || || || |  |||||||| |    
T  11306332 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaactaaatccggtccca 11306233  T
Q  236 acaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaact 335  Q
    ||| |  | | || || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||| |  ||| | ||    
T  11306232 acacaatactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagct 11306133  T
Q  336 attgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtc 435  Q
     ||||| ||||||||||||||||| |||||       ||||||    |||||||||| |  |||||  |||||||||||||||||||    ||||| |||    
T  11306132 gttgttataagtaaactcaatcaaaggtaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtc 11306033  T
Q  436 ctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacc 535  Q
    || || | ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||  | || ||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  11306032 ctttccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccaaaatctagaagtgaacc 11305933  T
Q  536 tcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    ||||||| | |||||||||||||||    
T  11305932 tcggatctctatccgacacaatact 11305908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 37 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 15102769 - 15102233
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||   |||| || |    
T  15102769 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctac 15102670  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||||   |||||||| || || || ||||| |  || |  |  |||||||| ||    
T  15102669 gcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacactttcattttttctcttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaatcaaatccggtcccaa 15102570  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    |||  || ||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  ||||     
T  15102569 caa--cactctctcctgactcgaaccaacacaaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 15102472  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  |||||| |||||| || ||    || || ||||    
T  15102471 ttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcc 15102372  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  15102371 tctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacct 15102272  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
    |||||| | ||||||||||||| | || |||| ||||||    
T  15102271 cggatctctatccgacacaatattcgatggtaaaccatg 15102233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Original strand, 8198711 - 8199249
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||| || |||| ||| ||||| | ||    
T  8198711 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgct 8198810  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  8198811 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 8198910  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | ||||| || ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  8198911 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 8199010  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || || || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  8199011 ttatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 8199110  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  8199111 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 8199210  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  8199211 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 8199249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Original strand, 8707688 - 8708226
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||| ||||||| ||| || || | ||    
T  8707688 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgct 8707787  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||| ||| || || ||||||| ||| ||||  || |||||||| |     
T  8707788 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgttgaacaatctctggtcctaagac 8707887  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | ||||| || ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||  |||||||     
T  8707888 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactatta 8707987  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  8707988 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 8708087  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || ||  ||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  8708088 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccaaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 8708187  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| ||||| || || ||||| | |||||||||    
T  8708188 atctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaa 8708226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 40 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 11553289 - 11552967
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||||||||| | ||    
T  11553289 gtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcctttctgcgct 11553190  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  11553189 tatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 11553090  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | || || |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  11553089 cactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactatta 11552990  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacgg 362  Q
    ||||| || ||||| ||||||||    
T  11552989 ttgtatgtgaactcgatcaacgg 11552967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Original strand, 14954703 - 14955241
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||||||||| | ||    
T  14954703 gtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcctttctgcgct 14954802  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  14954803 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctggacaatctctggtcctaagac 14954902  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | || || |||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||     
T  14954903 cactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagtctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataactatta 14955002  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| |  ||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  14955003 ttgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagcacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 14955102  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |  ||||||||   ||||||||| |   |||   |||||||||| || ||    
T  14955103 ccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctgttgcaaacttttgaaaatcctagaagtaaatcttgg 14955202  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | |||| | ||||| || ||||| |||||||||||    
T  14955203 atctctatccaatacaatgctcgaaggaataccatgcaa 14955241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 53 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 44791525 - 44791000
Alignment:
Q  53 acttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 152  Q
    ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||| || |||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  44791525 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataact 44791426  T
Q  153 cttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccg 252  Q
    ||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |   |  | |||||     
T  44791425 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcct 44791326  T
Q  253 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaact 352  Q
    || ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| || || || ||||    
T  44791325 gattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattatatgtgaact 44791226  T
Q  353 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatc 452  Q
    | |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||| | |||||||||    
T  44791225 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 44791126  T
Q  453 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgac 552  Q
     ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||||| | ||| ||     
T  44791125 tgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 44791026  T
Q  553 acaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||||| || ||||| | |||||||||    
T  44791025 acaatgctcgaaggaacaccatgcaa 44791000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 298 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 15171893 - 15171649
Alignment:
Q  298 gcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaa 397  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| | ||||| || ||||||||||||| ||| ||||| |   ||||||| ||| |||  |||||||    
T  15171893 gcctcaaacgatgtcataccaatactagaatgaaaattgttgttttaggtaaactcaatcagcggcaaacacttaacccaacttacatcttattccaaaa 15171794  T
Q  398 cacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaa 497  Q
    || ||||| ||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  15171793 cataagctttcaacaaatcttccaaggattgaatagtcctcttcgtctgaccatcgatctgaggctgataagcaaaactcaatctcaacttagtttccaa 15171694  T
Q  498 agcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatc 542  Q
    ||| ||||| ||||| | || |||  |||||||||||||| ||||    
T  15171693 agccgcttgaaaacttttccgaaacatagaagtaaacctcagatc 15171649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 36 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 8212297 - 8211770
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | |||||||||| |||||||||     
T  8212297 aggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctt 8212198  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 235  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||  | ||||| |||||    |||| | | || || || ||||| || || || |  |||||||| |    
T  8212197 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtccca 8212098  T
Q  236 acaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaact 335  Q
    | | | || |||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| || || ||||| | ||| |||||||| |  ||| | ||    
T  8212097 atacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggcgccataccaatactcgagtgatagct 8211998  T
Q  336 attgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtc 435  Q
     ||||| ||||||||||||||||| || ||      |||||||    |||||||||| |  |||||  |||||||||||||||||||    ||||| |||    
T  8211997 gttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtc 8211898  T
Q  436 ctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacc 535  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||  |||| ||||| | ||| ||  ||||||| ||||    
T  8211897 ctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcttgtaaacttttccagaacctagaagtgaacc 8211798  T
Q  536 tcggatcccgatccgacacaatactaga 563  Q
    ||||||| | ||| |||||||| |||||    
T  8211797 tcggatctctatctgacacaatgctaga 8211770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 36 - 563
Target Start/End: Original strand, 49152381 - 49152908
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| || ||||| || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | |||||||||| |||||| ||     
T  49152381 aggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatccttcctt 49152480  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 235  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||  | ||||| ||||||   |||| | | || || || ||||| || ||||| |  |||||||| |    
T  49152481 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgcaccaaatccggtccca 49152580  T
Q  236 acaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaact 335  Q
    ||| | || | || || ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| |  ||| | ||    
T  49152581 acacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagct 49152680  T
Q  336 attgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtc 435  Q
     ||||| ||||||||||||||||| || ||       ||||||    |||||||||| |  |||||  |||||||||||||||||||    ||||| |||    
T  49152681 gttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacatactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtc 49152780  T
Q  436 ctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacc 535  Q
    ||||| | ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||  |||| || |  ||||||||  | || ||||| | ||| ||  ||||||| ||||    
T  49152781 ctctccgactgaccatccgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacc 49152880  T
Q  536 tcggatcccgatccgacacaatactaga 563  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||    
T  49152881 tcggatctctatccgacacaatgctaga 49152908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 88 - 577
Target Start/End: Original strand, 13021489 - 13021978
Alignment:
Q  88 accctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttctt 187  Q
    ||||||| ||| |||||||||||  |||||||||| |   ||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||  | ||||| |||||      
T  13021489 accctcagaaaaacatgatcaccgtcttgaaactctagggcctttttccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttccc 13021588  T
Q  188 gaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccg 287  Q
      |||||||| ||||| || ||||| || || || |  |||||||||||||   || ||| ||| |||||||||||||| |  || ||||| ||||||||    
T  13021589 ttatcatcttgaccttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtcctaacaccacactctttcctgactcaaaccaacatagaggagtcctgcacctccg 13021688  T
Q  288 accatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacacct 387  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||| | || ||||| ||||| ||||| |||||| |||     |  ||||||    |||||    
T  13021689 accatacaaagcctcgaacggtgccataccaatactcgaatgatagctgttgttataagtgaactctatcaacagtaggtgattatcccaagctccacct 13021788  T
Q  388 tgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatt 487  Q
    ||||| |  |||||  ||||||||||||| |||||    || ||||||||||| | || |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |    
T  13021789 tgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatagtcctctccgactaaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaact 13021888  T
Q  488 tagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgca 577  Q
    | | |||||||||| |||||||||| | ||| ||  |||| || ||||||||||||| ||| || |||||||| || |||| ||| ||||    
T  13021889 tcgatcccaaagcatcttgcaaacttttccagaacctagaggtgaacctcggatccctatctgatacaatactcgacggtacaccgtgca 13021978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 16950639 - 16950116
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||| ||| |||||||||||  | |||||||||    |||||||||    
T  16950639 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcatgggcctttctcc 16950540  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||    |||||||| || || || ||||| |  || || |  ||| |||| ||    
T  16950539 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacactttcatcttttcccttatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaagtcctgtcccaa 16950440  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || |||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  ||||     
T  16950439 cacaacactctcacctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 16950340  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaac-attcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtc 435  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||    | |  |||  |||  |||||||||| |  |||||  ||||||||||||| |||||    || || |||    
T  16950339 ttgttgtatgtgaactctatcaatggtaggtgactattccatactc-caccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtc 16950241  T
Q  436 ctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacc 535  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| ||||| || | |||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||    
T  16950240 ctctccgactgaccatctgtctgaggatgataatccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacc 16950141  T
Q  536 tcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||    
T  16950140 tcgaatctctatccgacacaatact 16950116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 37 - 575
Target Start/End: Original strand, 6413592 - 6414130
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||   |||||||||    
T  6413592 ggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaaaggcctttctcc 6413691  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||  | ||||| |||||    |||||||| || || || ||||| |  || || |  ||| | || ||    
T  6413692 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatgttttcccttatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccagacccaa 6413791  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || ||||||| || |||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  ||||     
T  6413792 cacaacactctctcctgattcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 6413891  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || ||||| || ||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  ||||||||||||| |||||    || || ||||    
T  6413892 ttattgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagccccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcc 6413991  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | |||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  || |||||| |||||||||||| ||||||| | ||||| |||||    
T  6413992 tctccgactgaccttctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacctaaagcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacct 6414091  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
    | |||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  6414092 cagatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatg 6414130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Original strand, 14332480 - 14333018
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | ||||| |||| ||| ||||| | ||    
T  14332480 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgct 14332579  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || |||| ||| |||||||| |     
T  14332580 tatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatttctggtcctaagac 14332679  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | |||||  | ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  14332680 cactctttctccttattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaggcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 14332779  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||| ||||| || |    |||||| |||||||    
T  14332780 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaataaatcctctagcgactgaattgtcctct 14332879  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  14332880 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 14332979  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| ||||| || || ||||| | |||||||||    
T  14332980 atctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaa 14333018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 37 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 23506038 - 23505516
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| || || || ||||  ||| |||| || | ||| |||||||||||  ||||||||||||   |||||||||    
T  23506038 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 23505939  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||| || ||    |||| ||| || ||||| ||||| || || || |  |||||||| ||    
T  23505938 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctccctgatcagcttgactttttctgtagtctcctggaccaaatccggtcccaa 23505839  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || | ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || || |||| |||||| ||||| | |||| ||||     
T  23505838 cacaacactttctcccgactcaaaccaacacaacggagttctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataactg 23505739  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||        ||||||    |||| || || | ||||||  |||||||||| ||||||||    || || ||||    
T  23505738 ttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagaacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgtcc 23505639  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||| || |  ||||||||  | || ||||||| ||| ||  ||||||| |||||    
T  23505638 tctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacct 23505539  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatac 559  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  23505538 cggatccctatccgacacaatac 23505516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 11237400 - 11236862
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||    
T  11237400 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgct 11237301  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||| ||| |||||||  | ||||| ||||||  ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  11237300 tatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattctctcttggatcatccgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 11237201  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | || || ||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||| | |||  |||||||     
T  11237200 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggggttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatggtaactatta 11237101  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  11237100 ttgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 11237001  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  11237000 ccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 11236901  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| |||||||| || ||||| | |||||||||    
T  11236900 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 11236862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 11388595 - 11388055
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| || | || || ||||| || || || |||| |||| | || ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||   ||||| || |    
T  11388595 ggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctcct-cttgaaactcatggtccttcctac 11388497  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| |||||||| |||||||||| |||||| ||| | ||||| | ||||   |||| |||||||||||| ||||| |  || || |  || ||||| ||    
T  11388496 gcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaacttaaccttttctgtagtctgctgaactatgtctggtcccaa 11388397  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    ||   || | ||||| ||||||||||||||||| || || || ||||| ||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| | |||  |||||    
T  11388396 catcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaacatacaaagcttcgaacggtgtcataccaatactcgaatggtaacta 11388297  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  ||||||  | ||| || |||   || || ||||    
T  11388296 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtagatcctctaaagattgtatcgtcc 11388197  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| |  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  11388196 tctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacct 11388097  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    |||||| | ||||||||||||||| || || | |||||||||    
T  11388096 cggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgcaa 11388055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 377 - 582
Target Start/End: Original strand, 23641868 - 23642073
Alignment:
Q  377 aactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaact 476  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||   | ||||||| |||||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||    
T  23641868 aacttacaccttgttccaaaacacaagccctcaatagatcttccaaagattaaatagtcttctctgtctgtccatcagattgaggatgataagcagaact 23641967  T
Q  477 caatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgc 576  Q
    ||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||||| | ||||| | ||| |||||||| |||||||| ||| |||||    
T  23641968 caaccttaacttagtccccaacgccgcttgcaaactctcccaaaatgtcggagtaaactttggatctctatctgacacaatgctagaaggaatatcatgc 23642067  T
Q  577 aatctg 582  Q
    ||||||    
T  23642068 aatctg 23642073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 1575 - 1052
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| || | | ||  ||| ||| |||||||||||  | ||||||||||   |||||||||    
T  1575 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagaagtaactttcacaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctcc 1476  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| | |||| ||| | ||||| |||||    |||||||| ||||| || ||||| |  || || |  |||||||| ||    
T  1475 tcttgtcatggtaactcttctgtcgaatctgtgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaa 1376  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || ||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||| ||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| | |||  ||||     
T  1375 cacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtccttcacctctgaccatacaaagctttgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 1276  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  ||||||||||||| |||||    || || |||     
T  1275 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtct 1176  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    | || | || |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||  | | |||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  1175 tttccgactaaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacctcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacct 1076  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatact 560  Q
     | ||||| |||||||||||||||    
T  1075 tgtatccctatccgacacaatact 1052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 76 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 35965001 - 35964718
Alignment:
Q  76 gtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacacct 175  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| || ||  |||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||    
T  35965001 gtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtccccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgcgacgcct 35964902  T
Q  176 tcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgt 275  Q
    |||| ||||||  ||||| ||||||||| || ||||||| ||| ||||  || ||||| |  |   || | || || |||||| ||||||||||||| ||    
T  35964901 tcatcttttctctaatcaacttaaccttctcagtagtttgttgaacaatgtctggtcccagtactacactatcgccagactcataccaacacaacggagt 35964802  T
Q  276 cctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaa 359  Q
     || || |||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||| |||  |||| || || ||||| ||||| |||||    
T  35964801 tctgcatctccgaccatacaacgcttcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactgttattataagtgaactcgatcaa 35964718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 95 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 11772373 - 11771891
Alignment:
Q  95 aaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcat 194  Q
    |||| |||||||| ||  ||||||||||||  || || || | |||||||||||||||||| |||| |||||  |||   |||||  |||||||||||||    
T  11772373 aaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgttttcatcatttcttgaatcat 11772274  T
Q  195 cttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatac 294  Q
    ||||||||| || ||||||| ||| |||| |||||||||||| |   || |||| || |||||||| ||||||||||  || || ||||| |  ||| ||    
T  11772273 cttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttccggtcctaaaaccacactctcacctgactcaaatcaacacaacgaagttctgcaccttcttccacac 11772174  T
Q  295 aaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctcca 394  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||| |||| || ||||| || ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| |    
T  11772173 aaagccttaaatggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtttctccttgctcaa 11772074  T
Q  395 aaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcc 494  Q
      |||||| |||||||||||||||||||   |||||| ||  | || | || |||||| |||||  |||| || || |||||||| ||||| ||||  ||    
T  11772073 gtacacaaactctcaacaaatcttccaatgactgaatcgttttttccgactaaccatctgtctgcagatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacc 11771974  T
Q  495 caaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgca 577  Q
     |||||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| || ||||| || ||||| | ||||||||    
T  11771973 taaagcctcttgcaaactcctccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgca 11771891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 15161244 - 15160706
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||| ||||||| ||| || || | ||    
T  15161244 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgct 15161145  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| | |||||  | ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  15161144 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattctctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 15161045  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | || || ||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||| | |||| |||||||     
T  15161044 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactatta 15160945  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  15160944 ttgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 15160845  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  15160844 ccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 15160745  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| |||||||| || ||||| | |||||||||    
T  15160744 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 15160706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 36 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 26118774 - 26118250
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    |||||||||||| ||  |||||| |||||||||||| || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||  ||||| ||     
T  26118774 aggagtcaactttctcgacttcagagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagctccttcctt 26118675  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 235  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||  | |||||  |||||   |||| | | || || || ||||| || || || |  |||||||| |    
T  26118674 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcctttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtccca 26118575  T
Q  236 acaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaact 335  Q
    ||| | || | || || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||| |  ||| | ||    
T  26118574 acacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagct 26118475  T
Q  336 attgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtc 435  Q
     ||||| ||||||||||||||||| || ||      |||||||    ||||||| || |  |||||  |||||||||||||||||||    ||||| |||    
T  26118474 gttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtc 26118375  T
Q  436 ctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacc 535  Q
    ||||| | ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||  | || |||| || ||| ||  ||||||| ||||    
T  26118374 ctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacgcttccagaacctagaagtgaacc 26118275  T
Q  536 tcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    ||||||| | |||||||||||||||    
T  26118274 tcggatctctatccgacacaatact 26118250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Original strand, 13686147 - 13686685
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||| ||||||| ||| || || | ||    
T  13686147 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgct 13686246  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  13686247 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgctttcattctctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 13686346  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | || || ||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||| | |||| |||||||     
T  13686347 cactctttcacctgactcaaaccatcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactatta 13686446  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  13686447 ttgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 13686546  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  13686547 ccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 13686646  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| |||||||| || ||||| | |||||||||    
T  13686647 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 13686685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 37 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 14286544 - 14286006
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||  || || || ||||  ||| | || |||||||| |||||||||||  | ||||||||||    ||||||||    
T  14286544 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacatcctacacctgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggtctttctcc 14286445  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| |||||  ||| | ||||| |||||    |||||||| ||||| || || || |  || || |  |||||||| ||    
T  14286444 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcgtctgatgaaccaaatccggtcccaa 14286345  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || |||||   ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||| | |||  ||||     
T  14286344 cacaacactctctattgactcaaaccagcacaaaggagtcctgcacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 14286245  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  ||||||| ||||| || |||   || || ||||    
T  14286244 ttgttgtatgtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaataaatcctctaaagattgtatcgtcc 14286145  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||  | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||| ||||||| |||| || |||| |||| || |||||    
T  14286144 tcttcgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaaagcatcttgcaagctcttccgaaatctagatgtgaacct 14286045  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
    |||||| | ||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  14286044 cggatctctatccgacacaatactcgacggtacaccatg 14286006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 37 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 23199911 - 23199405
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| || || || ||||  ||| |||| || | ||| |||||||||||  ||||||||||||   |||||||||    
T  23199911 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 23199812  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||| || ||    |||| ||| || ||||| ||||| || || || |  |||||||| ||    
T  23199811 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctccctgatcagcttgactttttctgtagtctcctggaccaaatccggtcccaa 23199712  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || | ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || || |||| |||||| ||||| | |||| ||||     
T  23199711 cacaacactttctcccgactcaaaccaacacaacggagttctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataactg 23199612  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||        ||||||    |||| || || | ||||||  |||||||||| ||||||||    || || ||||    
T  23199611 ttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagaacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgtcc 23199512  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||| || |  ||||||||  | || ||||||| ||| ||  ||||||| |||||    
T  23199511 tctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacct 23199412  T
Q  537 cggatcc 543  Q
    |||||||    
T  23199411 cggatcc 23199405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 37 - 566
Target Start/End: Original strand, 14129954 - 14130483
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| || || |  ||||  ||| | || || ||||| |||||||||||  | ||||||||||   |||| ||||    
T  14129954 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacactcgtcatcggagtaactctaaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctcc 14130053  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||| | ||||| |||||    |||||||| ||||| || ||  | || || || |  |||||||| ||    
T  14130054 gcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcatctcatgaaccaaatccggtcccaa 14130153  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    ||   || ||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||||| | |||  ||||     
T  14130154 caccacactctctcctgactcaaaccagcataacggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaactg 14130253  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||        ||||||    ||||||| || |  |||||  ||||||||| ||| |||||    || || ||||    
T  14130254 ttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacagatcctccaatgattggatcgtcc 14130353  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |  | ||||||| | |||||||||| ||| ||  |||| || |||||    
T  14130354 tctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaactcaaagcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacct 14130453  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaagg 566  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  14130454 cggatccctatccgacacaatacttgaagg 14130483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 37 - 566
Target Start/End: Original strand, 14433772 - 14434301
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| || || |  ||||  ||| | || || ||||| |||||||||||  | ||||||||||   |||| ||||    
T  14433772 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacactcgtcatcggagtaactctaaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctcc 14433871  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||| | ||||| |||||    |||||||| ||||| || ||  | || || || |  |||||||| ||    
T  14433872 gcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcatctcatgaaccaaatccggtcccaa 14433971  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    ||   || ||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||||| | |||  ||||     
T  14433972 caccacactctctcctgactcaaaccagcataacggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaactg 14434071  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||        ||||||    ||||||| || |  |||||  ||||||||| ||| |||||    || || ||||    
T  14434072 ttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacagatcctccaatgattggatcgtcc 14434171  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || |  | ||||||| | |||||||||| ||| ||  |||| || |||||    
T  14434172 tctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaactcaaagcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacct 14434271  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaagg 566  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14434272 cggatccctatccgacacaatactagaagg 14434301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 37 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 15154842 - 15154525
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || || ||  ||||||| |||| ||| ||||| |    
T  15154842 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaattcaagatcttttctac 15154743  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||  ||   ||||||    
T  15154742 gcttatcatgataactcttttgtcgactcggtgacactttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaa--tc---tcctaa 15154648  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | || || |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||| | |||| ||| |||||||||| |||| |||||    
T  15154647 gaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcataaggtgccatcccaatactagaatgataacta 15154548  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaa 359  Q
    || ||||| || ||||| |||||    
T  15154547 ttattgtacgtgaactctatcaa 15154525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 37 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 18054121 - 18053592
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||| || || || ||||  ||| |||| |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||   |||| ||||    
T  18054121 ggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactctcagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggccttcctcc 18054022  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||| || |||   |||||||| || ||||| ||||| || || || |  |||||||| ||    
T  18054021 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtcccaa 18053922  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | |  | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||| || || |||| |||||| ||||| | |||| ||||     
T  18053921 cacaactctttctcctgactcgaaccaacacaacggagtcctgcaccctcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataactg 18053822  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||        ||||||    |||| || || |  |||||  |||||||||| || |||||    || || ||||    
T  18053821 ttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcctccaatgattggatcgtcc 18053722  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||| || |  ||||||||  | || ||||||| ||| ||  ||||||| |||||    
T  18053721 tctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacct 18053622  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaagg 566  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  18053621 cggatccctatctgacacaatactcgaagg 18053592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 115 - 542
Target Start/End: Original strand, 18177900 - 18178327
Alignment:
Q  115 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagttt 214  Q
    |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||| ||||||||| ||| || || |||||||    
T  18177900 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcgaatcatctaaactttctcagtagttt 18177999  T
Q  215 cttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcat 314  Q
      || ||||  || |||||||| |   |  | || || ||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||| ||||||||||| |||| |||    
T  18178000 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccat 18178099  T
Q  315 tccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaa 414  Q
    ||||||||||| |||| | ||||| ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||   ||||||| |    
T  18178100 tccaatactagaatgatagctattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaga 18178199  T
Q  415 tcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactct 514  Q
    || || |    |||||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| |    
T  18178200 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 18178299  T
Q  515 cccaaaatttagaagtaaacctcggatc 542  Q
     ||||||| || ||||||| || |||||    
T  18178300 tccaaaatctaaaagtaaatcttggatc 18178327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 364
Target Start/End: Original strand, 19147292 - 19147619
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||| |||||||||||| ||  ||||||||||||   | || || |    
T  19147292 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctac 19147391  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||| ||||||   |||||||| ||||| |||||||| |  || || |  || ||||| ||    
T  19147392 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaaccaaatctggtcccaa 19147491  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    ||   || | ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  ||||     
T  19147492 cactacactttctcccgactcaaaccaacataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 19147591  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 364  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  19147592 ttgttgtacgtgaactctatcaacggta 19147619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 364
Target Start/End: Original strand, 20746691 - 20747018
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||| |||||||||||| ||  ||||||||||||   | || || |    
T  20746691 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctac 20746790  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||| ||||||   |||||||| ||||| |||||||| |  || || |  || ||||| ||    
T  20746791 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaactaaatctggtcccaa 20746890  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    ||   || | ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  ||||     
T  20746891 cactacactttctcccgactcaaaccaacataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 20746990  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 364  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  20746991 ttgttgtacgtgaactctatcaacggta 20747018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 14264412 - 14263871
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||| |||||||||||| ||  ||||||||||||   |||| || |    
T  14264412 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagcgccttcctac 14264313  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||| |||||    |||||||| || || | |||||| |  || || |  | |||||| ||    
T  14264312 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcgcttatcatcttgacattcttcgtagtctgatgaaccaaatacggtcccaa 14264213  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    ||   || | ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  ||||     
T  14264212 cactacactttctcctgactcaaaccaacataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 14264113  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| |||||| ||| |      ||||||    |||||||||| |  ||| |  |||||| |||||| || ||    ||||| || |    
T  14264112 ttgttgtacgtgaactctatcaacagtagatgactatcccaagctccaccttgctcgagtacagacactctcatcaaatcctctaacgattgaattgttc 14264013  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| || || || |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  14264012 tctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacct 14263913  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    |||||  | ||||||||||||||| || || | |||||||||    
T  14263912 cggatttctatccgacacaatactcgatggaacaccatgcaa 14263871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 55 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 12206950 - 12206643
Alignment:
Q  55 ttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactct 154  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||| | || |||||||||||||| || ||  ||||||||| || ||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  12206950 ttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaacttaagatcctttctacacttgtcatgataactct 12206851  T
Q  155 tctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccgga 254  Q
    | |||| |||||| ||| | ||||| || ||||  ||||  || |||||||| ||||| |  || || |  |||||||| ||||   || | || || ||    
T  12206850 tttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttttatcaatttgaccttttctgtagtctgctgaactatatccggtcccaacattacactttcacccga 12206751  T
Q  255 ctcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactca 354  Q
    |||||||||||| ||||| ||  | ||||||||| |||||||| | || ||||||| ||| |||||||| | |||  ||||||||||||| || |||||     
T  12206750 ctcaaaccaacataacggagtattgcacctccgatcatacaaaacttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtacgtgaactct 12206651  T
Q  355 atcaacgg 362  Q
    ||||||||    
T  12206650 atcaacgg 12206643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 557
Target Start/End: Original strand, 15624632 - 15625152
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||| |||||  ||||||| ||||| ||||| || |||||| || | || |||||||| ||||| || ||  | ||||||||||  || || ||      
T  15624632 ggagtcaatttccttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtctttcctaa 15624731  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||||||||||||||||||| || |||||| ||| | ||||| || ||||| |||| ||||||||| |  |||||||  || || | ||| ||||| ||    
T  15624732 gcttatcatgataactcttctatcgactctgcgacgctttcatcttctcttggatcaacttaaccttctaagtagtttgatgaacgatttctggtcccaa 15624831  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   || |||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || || || |||||||||| |||||||| |||| ||||     
T  15624832 aattacactctcacctgactcgaaccaacacaatggagtcctacacctccgaccatacagtgcttcgaatggtgtcattctaatactagaatgataactg 15624931  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || ||||| || ||||| |||||| | | |      |||||| |  | || ||||| |  ||| || |||||||||| || |||||   ||| || || |    
T  15624932 ttattgtacgtgaactctatcaacagaagatgactatcccaagttcctccatgctcaagtacataaactctcaacaagtcctccaacgactggattgttc 15625031  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    | || | ||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||  |||||| |  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  15625032 tttccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacccaaaacctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacct 15625131  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaat 557  Q
     ||||| | ||| ||||||||    
T  15625132 tggatctctatctgacacaat 15625152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 41 - 560
Target Start/End: Original strand, 12455787 - 12456306
Alignment:
Q  41 tcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctctt 140  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||  ||||| || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | |||||||| |   ||||||||| |||    
T  12455787 tcaacttcctcgacttcaatgcacatccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactctagggcctttctccgctt 12455886  T
Q  141 atcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaa 240  Q
     ||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||| |||||    |||| ||| || || || ||||| || || || |  |||||||| ||||      
T  12455887 gtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcaccttgactttctcagtagtctcatgtaccaagtccggtcccaacacc 12455986  T
Q  241 gcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgt 340  Q
     || ||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||  ||| || ||||| | |||  |||| || |    
T  12455987 acactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctcctaccatacaaagcttcgaacggtaccatacctatactcgaatggtaactgttat 12456086  T
Q  341 tgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctc 440  Q
    |||| || ||||| |||| |||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  || ||||||| || |||||    || || ||||||||    
T  12456087 tgtatgtgaactctatcagcggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactgtcaacaattcctccaatgattggatcgtcctctc 12456186  T
Q  441 tgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgga 540  Q
     | ||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || | |||||||||| |||| ||| ||| ||| ||  ||||||| |||||||||    
T  12456187 cgactgaccatctgtctggggatgataagccgagctcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgtaaattcttccagaacctagaagtgaacctcgga 12456286  T
Q  541 tcccgatccgacacaatact 560  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  12456287 tccctatccgacacaatact 12456306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23516956 - 23516634
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | ||||| |||| ||| ||||| | ||    
T  23516956 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgct 23516857  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||  ||||||| || ||| | ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  ||  ||||||| |     
T  23516856 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctcttgtcctaagac 23516757  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | || || ||||||||||  |||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | |||||     
T  23516756 cactctttcacctgactcaaaccggcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgatagctatta 23516657  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacgg 362  Q
    || ||||| ||||| ||||||||    
T  23516656 ttataagtgaactcgatcaacgg 23516634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 94 - 362
Target Start/End: Original strand, 15204016 - 15204284
Alignment:
Q  94 aaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatca 193  Q
    ||||||||||| || ||  ||||||||||||  || || || | |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| ||||| || ||||    
T  15204016 aaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcatggatca 15204115  T
Q  194 tcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccata 293  Q
     ||||||||| || |||||||  || ||||  || ||||| || |   || | || ||  |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  15204116 acttaaccttctctgtagtttgctgaacaaaatctggtcccaaaactacactatcaccttactcgaaccaacacaacggagtcctacacctctgaccata 15204215  T
Q  294 caaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacgg 362  Q
    ||  || ||||| |||  |||||||||||||| |||| |||| || ||||| || ||||| ||||||||    
T  15204216 cagcgcttcaaatggttccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacgg 15204284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 113 - 353
Target Start/End: Original strand, 21662117 - 21662357
Alignment:
Q  113 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 212  Q
    |||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||||  ||||| |||||| |||||  ||||    
T  21662117 cttgaaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgtgacgctttcatcttttctctaatcaacttaacattttcattagt 21662216  T
Q  213 ttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtc 312  Q
     | ||| ||||  || ||||| |  |   || |||| |||||||||   ||||||||||| || || || |||||||||||||| || || ||||||| |    
T  21662217 ctgttgaacaatgtctggtcccagtaccacactctcaccggactcatcacaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaacgcttcgaacggtgcc 21662316  T
Q  313 attccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactc 353  Q
    |||||||| |||| |||  ||||||| |||||||| |||||    
T  21662317 attccaatgctagaatggtaactattattgtaagtgaactc 21662357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 16072462 - 16071939
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||| |||||||||||| ||  ||||||||||||   |||| || |    
T  16072462 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttccttc 16072363  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||| ||||||   |||||||| ||||| ||| |||| |   | || |  || ||||| ||    
T  16072362 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccatagtctgacgaaccaaatctggtcccaa 16072263  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    ||   || | ||||| |||||||||||||| || || ||  | | |||||||||||||||||| || || |||| ||| |||||||| | |||  ||||     
T  16072262 cactacactttctcctgactcaaaccaacataaaggagttatgcgcctccgaccatacaaagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatggtaactg 16072163  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||||||  ||        ||||||    |||||||||| |  |||||  |||||| |||||| || ||    ||||| ||||    
T  16072162 ttgttgtacgtgaactctatcaaccataggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgattgaatcgtcc 16072063  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| || || || |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||| | |||||    
T  16072062 tctctgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaactgaacct 16071963  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    |||||| | |||||||||||||||    
T  16071962 cggatctctatccgacacaatact 16071939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 253 - 353
Target Start/End: Original strand, 14039992 - 14040092
Alignment:
Q  253 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaact 352  Q
    |||||||||||||||||||| || || || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||| || ||||    
T  14039992 gactcaaaccaacacaacggagttctgcatctctgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaact 14040091  T
Q  353 c 353  Q
    |    
T  14040092 c 14040092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 253 - 353
Target Start/End: Original strand, 14350022 - 14350122
Alignment:
Q  253 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaact 352  Q
    |||||||||||||||||||| || || || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||| || ||||    
T  14350022 gactcaaaccaacacaacggagttctgcatctctgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaact 14350121  T
Q  353 c 353  Q
    |    
T  14350122 c 14350122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 433 - 560
Target Start/End: Original strand, 13666014 - 13666141
Alignment:
Q  433 gtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaa 532  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||| |||| || |||| ||| ||| ||||||| |    
T  13666014 gtcctctctgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgtaagctcttccagaatctagaagtga 13666113  T
Q  533 acctcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  13666114 acctcggatccctatccgacacaatact 13666141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 260 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 41113 - 40796
Alignment:
Q  260 accaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaa 359  Q
    |||||||||| ||||| | ||| |||| ||||||||| |||||||| |||| ||| ||| |||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  41113 accaacacaaaggtgttcgacatctcctaccatacaacgcctcaaatggtgccatcccagtactagaatggaaactgttgttataagtaaactcaattaa 41014  T
Q  360 cggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctga 459  Q
     || ||  |  | ||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    ||||| || || ||  |||||||||| || ||     
T  41013 tgggaagtaagcatcccaacttcccccttgttccaacacacatgctcttaacaagtcttccaatgattgaatggttctttcgatctgaccatcagtttgt 40914  T
Q  460 ggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatac 559  Q
    || || || |||||||||| | | || ||||| ||||||| |  |||||||||  |||||||  | || || ||||| ||||| | |||||| |||||||    
T  40913 gggtgatatgcagaactcagttttaacttagtacccaaagtactttgcaaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatac 40814  T
Q  560 tagaaggtataccatgca 577  Q
    | ||||| | ||||||||    
T  40813 tcgaaggaagaccatgca 40796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 226 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 13968647 - 13968298
Alignment:
Q  226 tccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactag 325  Q
    |||||||| |||| | || |||| || ||||||||||| || || || ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||| |    
T  13968647 tccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcatacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcg 13968548  T
Q  326 catgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaact 425  Q
      ||| | || ||||| ||||| ||| ||||||| || ||       ||||||    ||||||| || |  |||||  | |||||||||||||||||       
T  13968547 agtgatagctgttgttataagtgaacccaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatga 13968448  T
Q  426 ctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaattta 525  Q
     ||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||  | || ||||||| ||| ||  ||    
T  13968447 ttgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaaccta 13968348  T
Q  526 gaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  13968347 gaagtgaacctcggatccctatccgacacaatacttgacggtacaccatg 13968298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 444 - 566
Target Start/End: Original strand, 15340919 - 15341041
Alignment:
Q  444 ctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcc 543  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||||| || |  ||||||||  | |||||||||| ||| ||  |||| || ||||||||||||    
T  15340919 ctgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcatcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagatgtgaacctcggatcc 15341018  T
Q  544 cgatccgacacaatactagaagg 566  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  15341019 ctatccgacacaatactagaagg 15341041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 233
Target Start/End: Original strand, 14037890 - 14038083
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || |||| |||| | || |||||||| || ||||| ||  |||| |||||||  || || || | ||    
T  14037890 gtcaacttctttgacttcaatgcacgcccaacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctacgct 14037989  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcc 233  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||| ||| |||| ||| |||||    
T  14037990 tatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgctttcatcttttcttgaatcattttaactttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcc 14038083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 233
Target Start/End: Original strand, 14347920 - 14348113
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || |||| |||| | || |||||||| || ||||| ||  |||| |||||||  || || || | ||    
T  14347920 gtcaacttctttgacttcaatgcacgcccaacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctacgct 14348019  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcc 233  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||| ||| |||| ||| |||||    
T  14348020 tatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgctttcatcttttcttgaatcattttaactttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcc 14348113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 364
Target Start/End: Original strand, 12457068 - 12457187
Alignment:
Q  245 tctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgta 344  Q
    ||||||| ||||||||| | || || || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| |  ||| | || ||||| ||    
T  12457068 tctctcctgactcaaactagcataaaggagtcctatacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttata 12457167  T
Q  345 agtaaactcaatcaacggta 364  Q
     || ||||||||||||||||    
T  12457168 tgtgaactcaatcaacggta 12457187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 364
Target Start/End: Original strand, 13665826 - 13665945
Alignment:
Q  245 tctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgta 344  Q
    ||||||| ||||||||||| || || || ||| | | |||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  |||| ||||||||    
T  13665826 tctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcatgcccctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgta 13665925  T
Q  345 agtaaactcaatcaacggta 364  Q
     || ||||| ||||||||||    
T  13665926 tgtgaactctatcaacggta 13665945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 427 - 560
Target Start/End: Original strand, 19147682 - 19147815
Alignment:
Q  427 tgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttag 526  Q
    ||||| || ||||| | ||||||||| || || ||||| ||||  |||||||| ||||  ||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||||| | |    
T  19147682 tgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagttgaactcaacctcatcttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttg 19147781  T
Q  527 aagtaaacctcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    |||| |||||| |||| | |||||||||||||||    
T  19147782 aagtgaacctcagatctctatccgacacaatact 19147815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 427 - 560
Target Start/End: Original strand, 20747081 - 20747214
Alignment:
Q  427 tgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttag 526  Q
    ||||| || ||||| | ||||||||| || || ||||| ||||  |||||||| ||||  ||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||||| | |    
T  20747081 tgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagttgaactcaacctcatcttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttg 20747180  T
Q  527 aagtaaacctcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    |||| |||||| |||| | |||||||||||||||    
T  20747181 aagtgaacctcagatctctatccgacacaatact 20747214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 364
Target Start/End: Original strand, 15340575 - 15340839
Alignment:
Q  100 acatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaa 199  Q
    |||||||||||  | ||||||||||   ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||| | ||||| |||||    |||| ||| |    
T  15340575 acatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgtgacgctttcatcttttcccttatcagcttga 15340674  T
Q  200 ccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagc 299  Q
    |||| || || || |  || || |  |||||||| || | | || ||||||| ||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |    
T  15340675 ccttctcagtcgtctgatgaaccaaatccggtcccaatacaacactctctcctgactcaaactagcataacggagtcctgcacctccgaccatacaaaac 15340774  T
Q  300 ctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggta 364  Q
     || ||||||| ||| || ||||| | |||  || | |||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  15340775 ttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaaatgttgttgtaggtgaactctatcaatggta 15340839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 426 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 11552903 - 11552751
Alignment:
Q  426 ctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaattta 525  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||  |||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| ||    
T  11552903 ctgaattgtcctctccgactgtccatctatctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 11552804  T
Q  526 gaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    |||| ||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  11552803 gaaggaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 11552751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 136
Target Start/End: Original strand, 21193851 - 21193933
Alignment:
Q  53 acttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| ||||||   |||||| || || || |||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    
T  21193851 acttcaaagcacaaccaacattggtcactgg-ttaactctcaaaaacacatgatcttcgacttgaaattcaatatcctttctcc 21193933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 482; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 482; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 8019 - 7450
Alignment:
Q  13 acatcaaacggt-ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcacca 111  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8019 acatcaaacggtaccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcacca 7920  T
Q  112 acttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtag 211  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||    
T  7919 acttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgcag 7820  T
Q  212 tttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgt 311  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7819 tttcttgcacaacttctggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgc 7720  T
Q  312 cattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaac 411  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7719 cattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcatcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaac 7620  T
Q  412 aaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaac 511  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7619 aaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaac 7520  T
Q  512 tctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7519 tctcccaaaacttagaagtaaacctcggatctcgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaatct 7450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 433 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 192 - 50
Alignment:
Q  433 gtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaa 532  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||| || |    
T  192 gtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgtaaactcttccaaaatctagaggtga 93  T
Q  533 acctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  92 acctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatg 50  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 575
Target Start/End: Original strand, 11010 - 11548
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||| | ||| |||||||||||  | ||||||||||   |||| || |    
T  11010 ggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctaagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 11109  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
      || ||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||| || |||   |||||||| || || || ||||| |  || |  | ||||||||| ||    
T  11110 gtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaatcaattccggtcccaa 11209  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || |||||   ||||||||||| || ||  | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | ||   ||||     
T  11210 cacaacactctctattgactcaaaccagcataaatgagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatagtaactg 11309  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||| ||||||        ||| ||    |||||||||| |  |||||  ||||||  ||||| |||||    || || ||||    
T  11310 ttgttgtatgtgaactctatctacggtaggtgactatcctaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtcc 11409  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
     ||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |   |||| ||| |||| || |||| ||||||||||||| | |||||    
T  11410 gctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaatccaatgcatcttgtaagctcttccaaaatttagaaatgaacct 11509  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  11510 cggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatg 11548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 37 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 583 - 256
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||| | ||| |||||||||||  | ||||||||||   |||| || |    
T  583 ggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctaagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 484  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
      || ||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||| || |||   |||||||| || || || ||||| |  || |  | ||||||||| ||    
T  483 gtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaatcaattccggtcccaa 384  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || |||||   ||||||||||| || ||  | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||||| | |||  ||||     
T  383 cacaacactctctattgactcaaaccagcataaatgagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccgatactcgaatggtaactg 284  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 364  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  283 ttgttgtatgtgaactctatcaacggta 256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 482; Significance: 0; HSPs: 69)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 482; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 21937576 - 21937007
Alignment:
Q  12 gacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcacca 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21937576 gacatcaaacagcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcacccttaaaaacacatgatcacca 21937477  T
Q  112 acttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtag 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  21937476 acttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtag 21937377  T
Q  212 tttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgt 311  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21937376 tttcttgcacaacttccggcccaaacaaagcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgc 21937277  T
Q  312 cattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaac 411  Q
    ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21937276 cataccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaac 21937177  T
Q  412 aaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaac 511  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21937176 aaatcctccaaactctgaatagtcctttctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaac 21937077  T
Q  512 tctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21937076 tctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaatct 21937007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 581
Target Start/End: Original strand, 24581191 - 24581759
Alignment:
Q  12 gacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcacca 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  24581191 gacatcaaacggcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcacccttacaaacacgtgatcacca 24581290  T
Q  112 acttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtag 211  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |    
T  24581291 acttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtgg 24581390  T
Q  212 tttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24581391 tttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgc 24581490  T
Q  312 cattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaac 411  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24581491 cattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaaccaacaccttgctccaacacacaagctctcaac 24581590  T
Q  412 aaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaac 511  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24581591 aaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctg-ccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaac 24581689  T
Q  512 tctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
      |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24581690 cttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccaatccgacacaatactagaaggaataccatgcaatct 24581759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 465; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 576
Target Start/End: Original strand, 27011065 - 27011628
Alignment:
Q  12 gacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcacca 111  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27011065 gacatcaaacgg-ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcacca 27011163  T
Q  112 acttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtag 211  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  27011164 acttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgataactcttatgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtag 27011263  T
Q  212 tttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27011264 tttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccgaactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaatggtgt 27011363  T
Q  312 cattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaac 411  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  27011364 cattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctctaacacataagctctcaac 27011463  T
Q  412 aaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaac 511  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  27011464 aaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcaaaactcaatctcaacttagttcccaaagcaacttgcaaac 27011563  T
Q  512 tctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgc 576  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27011564 tctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgc 27011628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 578
Target Start/End: Original strand, 23503424 - 23503988
Alignment:
Q  13 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23503424 acatcaaacggtccaacaaaacgaggattcaacttcctacacttcaaaggacgaccaacaccggtcacatgattcaccctaaaaaacacatgatcaccaa 23503523  T
Q  113 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 212  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  23503524 tttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagt 23503623  T
Q  213 ttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtc 312  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |    
T  23503624 ctcttgcaccacttccggtcctaacaaagcactttcaccagactcaaaccaacacaacggtgtcctagacctccgaccatacaaagccttaaacggagcc 23503723  T
Q  313 attccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 412  Q
    || || | ||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23503724 ataccgacactagaatgaaaattgttgttgttagtaaactcaatcaacggtaaacatttgtcccaactaacaccttgctccaacacacaagctctcaaca 23503823  T
Q  413 aatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaact 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  23503824 aatcttccaaactctgaatagtcctctccgtctgcctatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagtt-ccaaagcagcttgcaaact 23503922  T
Q  513 ctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23503923 ctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactataaggtataccatgcaa 23503988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 13 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 11211081 - 11210723
Alignment:
Q  13 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11211081 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 11210982  T
Q  113 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 212  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||    
T  11210981 cttgaaactcaatatctttcctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagatgctttcatcttctcctgaatcatcttaactttttccgtagt 11210882  T
Q  213 ttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtc 312  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  11210881 ctcttgcacaacttccggtcctaacaaaacactctctccggactcaaaccaacacaacgatgtcctacacctcctaccatacaaggcctcaaacggtgtc 11210782  T
Q  313 attccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattc 371  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11210781 attccaatactagaatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattc 11210723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 57 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 25244695 - 25244171
Alignment:
Q  57 caaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttc 156  Q
    ||||||||| ||||| |||   ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||      
T  25244695 caaagcacgtccaacaccgactacatgattcactctcaaaaacacatgatctccaacttgaaactcaatatctttcatcctcttatgatgataactctct 25244596  T
Q  157 tgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccg--tagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccgga 254  Q
    || ||||| | |  | | ||||| || |  |||||||||||||| || ||||  |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |     
T  25244595 tgcctactgtcacgcgctttcatcttcttctgaatcatcttaacattctccgcgtagtctctttcacaacttctggtcctaacaaagcactttctcctgg 25244496  T
Q  255 ctcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactca 354  Q
      || |||||||||||||||  |||||||||  |||||||| |||||| ||||||| ||| |  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25244495 tacataccaacacaacggtgctctacacctcgtaccatacatagcctctaacggtgacatactgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactca 25244396  T
Q  355 atcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcgg 454  Q
     ||||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||||| ||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  25244395 ttcaacggtaaacactcaacccaacttacaccttgttctaaaacacaaaccctcaacagatcttccaaagattgaatagtcctctcggtctgaccatcag 25244296  T
Q  455 tctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacac 554  Q
    |||||||||| |||| |||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  25244295 tctgaggatgataaggagaattcaacctcaacttagttcccaaagccgattgcaaactctcctaaaacttagaagtaaacctcggatctctatctgacac 25244196  T
Q  555 aatactagaaggtataccatgcaat 579  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||    
T  25244195 aatgctagatggaataccatgcaat 25244171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 57 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 25308847 - 25308323
Alignment:
Q  57 caaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttc 156  Q
    ||||||||| ||||| |||   ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||      
T  25308847 caaagcacgtccaacaccgactacatgattcactctcaaaaacacatgatctccaacttgaaactcaatatctttcatcctcttatgatgataactctct 25308748  T
Q  157 tgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccg--tagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccgga 254  Q
    || ||||| | |  | | ||||| || |  |||||||||||||| || ||||  |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |     
T  25308747 tgcctactgtcacgcgctttcatcttcttctgaatcatcttaacattctccgcgtagtctctttcacaacttctggtcctaacaaagcactttctcctgg 25308648  T
Q  255 ctcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactca 354  Q
      || |||||||||||||||  |||||||||  |||||||| |||||| ||||||| ||| |  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25308647 tacataccaacacaacggtgctctacacctcgtaccatacatagcctctaacggtgacatactgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactca 25308548  T
Q  355 atcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcgg 454  Q
     ||||||||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||||| ||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  25308547 ttcaacggtaaacactcaacccaacttacaccttgttctaaaacacaaaccctcaacagatcttccaaagattgaatagtcctctcggtctgaccatcag 25308448  T
Q  455 tctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacac 554  Q
    |||||||||| |||| |||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  25308447 tctgaggatgataaggagaattcaacctcaacttagttcccaaagccgattgcaaactctcctaaaacttagaagtaaacctcggatctctatctgacac 25308348  T
Q  555 aatactagaaggtataccatgcaat 579  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||    
T  25308347 aatgctagatggaataccatgcaat 25308323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 50 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 16066040 - 16065571
Alignment:
Q  50 tacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgata 149  Q
    ||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16066040 tacacatcaaagcacgcccaacaccagtcacgggattaactctaaaaaatacatgatcaccaacttggaattcaatatccttcctcctcttatcatgata 16065941  T
Q  150 actcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctct 249  Q
    ||||||||  ||| |||||||  |||||  || ||| |||||||||||||| ||  | ||||||| ||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||    
T  16065940 actcttctccctagtctgagatgccttc--atcttcctgaatcatcttaactttccctgtagtttgttgcaaaactttctgtcataacatagcattctct 16065843  T
Q  250 ccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaa 349  Q
    ||  ||||| ||||||||||||   | ||  |  |||  |||| ||| || ||||| |||| ||| |  |||||   ||||||| | |||||||||||||    
T  16065842 cctaactcataccaacacaacgactttctgaatttccttccatgcaacgcttcaaaaggtgccatcctgatactccaatgaaaattgttgttgtaagtaa 16065743  T
Q  350 actcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgacc 449  Q
    | |||||||||  |||||| ||   |||||| |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||   ||||| || ||||| |  |||||    
T  16065742 attcaatcaacaataaacagtcagtccaacttacaccttgttccaacacataagctcttaacaaatcttccaaagattgaattgttctctccgcatgacc 16065643  T
Q  450 atcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaa 521  Q
    ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  16065642 atcagtctgaggataataagcagaactcaatctcaacttatttcccaaagctgcctgcaaactctccaaaaa 16065571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 37 - 578
Target Start/End: Original strand, 25423212 - 25423753
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  25423212 ggagtcaacttctttcacttcaacgcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctac 25423311  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||||||||| |||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||  |  ||||||||    
T  25423312 gcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctttggtcctaa 25423411  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | || || |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  25423412 gaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 25423511  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || ||||| || ||||| ||||| || | |      |||| | |  | |||||||| |  |||||| |||||||||||||||| ||   |||||| |||     
T  25423512 ttattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatccctagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtct 25423611  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||  || |||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  25423612 tctctgtctgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaacct 25423711  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
     ||||| | ||| |||||||| || ||||| | |||||||||    
T  25423712 tggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 25423753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 542
Target Start/End: Original strand, 23573765 - 23574270
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  23573765 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 23573864  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| |  || ||||  || ||||||||    
T  23573865 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaa 23573964  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | ||||| |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||     
T  23573965 gaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactg 23574064  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| ||||||||||||| || |    |||||| ||||    
T  23574065 ttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcc 23574164  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||  ||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  23574165 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatct 23574264  T
Q  537 cggatc 542  Q
     |||||    
T  23574265 tggatc 23574270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 581
Target Start/End: Original strand, 23516564 - 23517108
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || || ||  ||||||||||||  || ||||| |    
T  23516564 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaaggtcttttctac 23516663  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||| |  |||||||  || ||||  || ||||||||    
T  23516664 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatgatcttaaccttcttggtagtttgctgaacaatctctggtcctaa 23516763  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | || || || |||||||| |||||||| || || || |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  23516764 gaccactctttcacctgattcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataccaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataacta 23516863  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || ||||| || ||||| |||||||| | |   |  |||||| |  | |||||||| |  |||||| ||||||||||||| || |    |||||| ||||    
T  23516864 ttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgattatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcc 23516963  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||  |||||| |  ||||||||||||  |||||| |||||||||| ||    
T  23516964 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaaccctcttgcaaactctttcaaaatctagaagtaaatct 23517063  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
     ||||| | ||| || ||||| || ||||| | ||||||||||||    
T  23517064 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaatct 23517108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 542
Target Start/End: Original strand, 20798783 - 20799288
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| |||||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  20798783 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 20798882  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||| || ||| | ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| |  || ||||  |  ||||||||    
T  20798883 gcttatcatgataactcttttgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtctgctgaacaatctttggtcctaa 20798982  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | ||||| |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  20798983 gacctctctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataacta 20799082  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || ||||| || |||||||||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| ||| ||||||||| || |    |||||| ||||    
T  20799083 ttattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactcgcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcc 20799182  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||| | ||||  |||||  ||||||||||||| ||||  |||||| |  |||||||||| | ||||||| || ||||||| ||    
T  20799183 tctccgactgaccatctgtccgcggataataagccaaactcaatctcaacttagaacccaaaacctcttgcaaacttttccaaaatctaaaagtaaatct 20799282  T
Q  537 cggatc 542  Q
     |||||    
T  20799283 tggatc 20799288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 113 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 21339573 - 21339108
Alignment:
Q  113 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 212  Q
    ||||||||||||  || || || | |||||||||||||||||| |||| ||||||  || | ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  21339573 cttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 21339474  T
Q  213 ttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtc 312  Q
    || ||| |||| ||| |||||||| |   || |||| || |||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||| |    
T  21339473 ttgttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaatggtgcc 21339374  T
Q  313 attccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 412  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || ||||| || || || |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| |||||||||    
T  21339373 attccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaattctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaaca 21339274  T
Q  413 aatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaact 512  Q
    | |  || ||   |||||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||  || ||| |  ||||||||||    
T  21339273 agttctctaacgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaaacctcttgcaaact 21339174  T
Q  513 ctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||| | ||| || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  21339173 cttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 21339108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Original strand, 16356528 - 16357066
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || ||||||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||| ||||||| ||| ||||| | ||    
T  16356528 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgct 16356627  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  16356628 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 16356727  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | ||||| || ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  16356728 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 16356827  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || || || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  16356828 ttatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 16356927  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  16356928 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 16357027  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||||| ||| || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  16357028 atccctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 16357066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 19566852 - 19566526
Alignment:
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||  || ||||| ||||  | |||||| || ||| | |  ||||| |||||||| | ||||||| |     
T  19566852 caaagcactctctcctgactcataccaacacaacgacgttctacatctcctcctatacaacgcttcagaagacgtcatcccaatactcgaatgaaaattg 19566753  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || ||||||||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||   |||||||| |    
T  19566752 tttttgtaagtaaattcaatcaatgttaagcattcgacccaacttacatcttgctccaaaacacaagctcttagcaaatcttccaaagattgaatagttc 19566653  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    ||||||  ||||| ||  | |||||||| |||||| || |||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||    
T  19566652 tctctgaatgaccgtccatttgaggatgataagcaaaaatcaaccttaacttagttcccaaagctgcttgcaaactctcgcaaaacttatatgtaaacct 19566553  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactaga 563  Q
    |||||| | ||| |||||||| |||||    
T  19566552 cggatctctatctgacacaatgctaga 19566526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Original strand, 19769986 - 19770524
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||| ||||||| ||| ||||| | ||    
T  19769986 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgct 19770085  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  19770086 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 19770185  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | ||||| || ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  19770186 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 19770285  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  19770286 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 19770385  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  19770386 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 19770485  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| ||||| || || ||||| | |||||||||    
T  19770486 atctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaa 19770524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 27668850 - 27668312
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | ||||| |||| ||| ||||| | ||    
T  27668850 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgct 27668751  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  27668750 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 27668651  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | ||||| || ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  27668650 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 27668551  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |     ||||||| |  | ||||| || | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  27668550 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 27668451  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  27668450 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 27668351  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| |||||||| || ||||| | |||||||||    
T  27668350 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 27668312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Original strand, 34566520 - 34567058
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || ||||||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||| ||||||| ||| ||||| | ||    
T  34566520 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgct 34566619  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  34566620 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 34566719  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | ||||| || ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  34566720 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 34566819  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || || || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  34566820 ttatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 34566919  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  34566920 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 34567019  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  34567020 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 34567058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Original strand, 40708806 - 40709344
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || |||||||||||  | || ||  |||| ||||||| ||| ||||| | ||    
T  40708806 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgcggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgct 40708905  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  40708906 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 40709005  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | ||||| || ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  40709006 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 40709105  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| || ||||    
T  40709106 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgttctct 40709205  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  40709206 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 40709305  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| |||||||| || ||||| | |||||||||    
T  40709306 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 40709344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Original strand, 41770868 - 41771406
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | ||||| |||| ||| ||||| | ||    
T  41770868 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgct 41770967  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  41770968 tatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 41771067  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
     ||  | ||||| || ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  41771068 cgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 41771167  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || ||||| | ||| |||||||| | |     ||||||| |  | ||||| || | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  41771168 ttataagtgagctcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 41771267  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  41771268 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctgaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 41771367  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| ||||| || || ||||| | |||||||||    
T  41771368 atctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaa 41771406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Original strand, 27610380 - 27610918
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | ||||| |||| ||| ||||| | ||    
T  27610380 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgct 27610479  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| | | | ||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  27610480 tatcatgataactcttttgtcgactctgcggcgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 27610579  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | ||||| || ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  27610580 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 27610679  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |     ||||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  27610680 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagtccctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 27610779  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| ||  | |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  27610780 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacaccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 27610879  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| ||||| || || ||||| | |||||||||    
T  27610880 atctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaa 27610918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21498399 - 21498101
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  |||||||  |||| ||||| ||||||||| || | || |||||||  |||||||| ||  |||||||||| || ||  | || |    
T  21498399 ggagtcaacttctttgacttcaattcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaaaactacatgatctccctcttgaaactcgatgtctatcctac 21498300  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||||||||| |||||||| |||| |||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||  || ||||||||    
T  21498299 gcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctcgggtcctaa 21498200  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaact 335  Q
     |   || | || || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  21498199 aaccacactttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctacatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataact 21498101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Original strand, 27518433 - 27518971
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || |||||||||||  | || ||  | ||||| |||| ||| ||||| | ||    
T  27518433 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgaggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgct 27518532  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  27518533 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 27518632  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | ||||| || ||||||||||||||||| || || || |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  27518633 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccaaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 27518732  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  27518733 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcccccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 27518832  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || |  |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  27518833 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgtcgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 27518932  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  27518933 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 27518971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 542
Target Start/End: Original strand, 23440248 - 23440753
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || || ||  ||||||||| || ||| || || |    
T  23440248 ggagtcaacttcattgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaacttaagatctttcctgc 23440347  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||  || ||||  || |||  |||    
T  23440348 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcattttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggttttaa 23440447  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | |||||  |||||||||| |||||||| || || || ||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  23440448 gaccactctttctcctaactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctgaaaaggtgccattccaatactagaatgataacta 23440547  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || ||||| |||||||||||||| || | |      |||||| |  |||||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |    ||||||  | |    
T  23440548 ttattgtatgtaaactcaatcaatggaagatgactatcccaagttccaccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatttttc 23440647  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||| ||||| ||  | |||||||||||||| ||||  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||    
T  23440648 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatacaccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaacctagaagtaaatct 23440747  T
Q  537 cggatc 542  Q
     |||||    
T  23440748 tggatc 23440753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 37 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 21984668 - 21984346
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| ||  |||||||| | || |||||||| || || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  21984668 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccaatcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccctcttgaaactcaagatctttcctac 21984569  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||||||||||||||| || |||| |||||| ||| | ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||  || ||||||||    
T  21984568 gcttatcatgataacttttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctctggtcctaa 21984469  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | || || ||||||||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||  ||||    
T  21984468 gaccactctttcacctgactcaaaccaacacaatggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgattacta 21984369  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaa 359  Q
    || ||||| || ||||| |||||    
T  21984368 ttattgtacgtgaactctatcaa 21984346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 36 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 14887355 - 14886828
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||| || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | |||||||||| |||||||||     
T  14887355 aggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctt 14887256  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 235  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||  | ||||| ||||||   |||| | | || || || ||||| || ||||| |  |||||||| |    
T  14887255 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgcaccaaatccggtccca 14887156  T
Q  236 acaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaact 335  Q
    ||| | || | || || ||||||||||| || || || |||||||||||||| |||||||| || || ||||||| ||| |||||||| |  ||| | ||    
T  14887155 acacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccggccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagct 14887056  T
Q  336 attgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtc 435  Q
     ||||| ||||||||||||||||| || ||       ||||||    |||||||||| |  |||||  |||||||||||||||||||    ||||| |||    
T  14887055 gttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtc 14886956  T
Q  436 ctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacc 535  Q
    ||||| | ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||  |||| || |  ||||||||  | || ||||| | ||| ||  ||||||| ||||    
T  14886955 ctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacc 14886856  T
Q  536 tcggatcccgatccgacacaatactaga 563  Q
    ||||||| | ||| |||||||| |||||    
T  14886855 tcggatctctatctgacacaatgctaga 14886828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 27685760 - 27685222
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || ||||||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||| ||||||| ||| || || | ||    
T  27685760 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgct 27685661  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| | |||||  | ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  27685660 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattctctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 27685561  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | || || ||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| | |||| |||||||     
T  27685560 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaggcctcgaaaggtgtcattccaatacttgaatgataactatta 27685461  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  27685460 ttgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 27685361  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  27685360 ccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 27685261  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| |||||||| || ||||| | |||||||||    
T  27685260 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 27685222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 17269696 - 17269168
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| || || || ||||  ||| | || || | ||| |||||||||||  ||||||||||||   |||||||||    
T  17269696 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 17269597  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||| || |||   |||||||| || ||||| ||||| || || || |  |||||||| ||    
T  17269596 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtcccaa 17269497  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||| |||||| ||||| | |||  ||||     
T  17269496 cacaacactctctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatggtaactg 17269397  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||        ||||||    |||| || || |  |||||  |||||||||| ||||||||    || || ||||    
T  17269396 ttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgtcc 17269297  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | | ||||||||| |  |||| |||  | || ||||||| ||| ||  ||||||| |||||    
T  17269296 tctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaa-ttagtctcaatttcgaacccagagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacct 17269198  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaagg 566  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  17269197 cggatccctatccgacacaatactcgaagg 17269168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 26739068 - 26738743
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||  ||||| || ||||||||| | ||||||||||| | |||||| |   ||||||||||||  || ||||| |    
T  26739068 ggagtcaacttctttgacttcaatgcacatccaacaccagtcacaggagtgaccctcaaaaatatatgatctctttcttgaaactcaaggtcttttctac 26738969  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||| ||| ||||||||    
T  26738968 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgtacaatttctggtcctaa 26738869  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   || |||| || ||||| ||||||||||| || || || || |||| |||||||||||||| |||  ||| ||||||| |||| | || | ||||     
T  26738868 aaccacactctcacctgactcgaaccaacacaatggagttctgcatctccaaccatacaaagccttaaattgtgccattccattactggaataataactg 26738769  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacgg 362  Q
    || ||||| || ||||| ||||||||    
T  26738768 ttattgtacgtgaactctatcaacgg 26738743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 575
Target Start/End: Original strand, 18775800 - 18776331
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||  ||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || || ||  | |||||||||| |||||| || |    
T  18775800 ggagtcaacttctttgacttcagggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaagacgtggtctccctcctgaaactcaagatccttcctgc 18775899  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||  ||| | |||||  | ||||||||||||||||| || || ||||| |  || ||||  || ||||||||    
T  18775900 gcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattctctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctcgggtcctaa 18775999  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | || || ||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  18776000 gaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattcgaatactagaatgataacta 18776099  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || ||||| || ||||| ||||| |   |       |||||| |  | |||||||| | |||||||  | |||||||||| || |    |||||| ||||    
T  18776100 ttattgtatgtgaactcgatcaatgacta-------tcccaagttcctccttgctcaagaacacaaagtttcaacaaatcctctagcgactgaattgtcc 18776192  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |  || || ||  |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  18776193 tctctgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacctaaggcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatct 18776292  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
     ||||| | ||| || ||||| || ||||| | ||||||    
T  18776293 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 18776331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 38 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 20468458 - 20467954
Alignment:
Q  38 gagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcct 137  Q
    ||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||| ||||| || ||  | ||||| ||||  || || || |     
T  20468458 gagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaattcaaggtctttcctacg 20468359  T
Q  138 cttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaac 237  Q
     |||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||| |||||||| |||| |||||| || || |||||||  || || | ||  ||||| ||     
T  20468358 tttatcatgataactcttcagtcaactctgcgacgctttcatcttttcttggatcaacttaacattctcagtagtttgctgaacgatttatggtcccaaa 20468259  T
Q  238 aaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactat 337  Q
    |   || |||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||| |||| |||| |    
T  20468258 actacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagtcctacacctccgaccatgcagagcttcaaatggtgccattccaatactagaatgataactgt 20468159  T
Q  338 tgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcct 437  Q
    | ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| |  ||||||  ||||||||| || |||||   ||||||  ||||    
T  20468158 tattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaaatctcaacaagtcctccaacgactgaatcatcct 20468059  T
Q  438 ctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctc 537  Q
     || | ||| ||||| ||||| ||||  || || |||||||| ||||| ||||  || |||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  20468058 ttcagactggccatctgtctgcggataatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctc 20467959  T
Q  538 ggatc 542  Q
    |||||    
T  20467958 ggatc 20467954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 29476433 - 29475895
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||  | |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  29476433 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacatccgtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 29476334  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||| ||| ||||||| || ||||| ||||||  ||| ||||| ||||| | ||| ||||  || |||||||| |     
T  29476333 tatcatgataactcttttgtcgattctgtgacgccttcattttctcttggatcatccgaactttttcagtagtctgttgaacaatctctggtcctaagac 29476234  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | || || ||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||| | |||| |||||||     
T  29476233 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactatta 29476134  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||| ||||| || |    |||||| |||||||    
T  29476133 ttgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaaaaaatcctctagcgactgaattgtcctct 29476034  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| || |  ||| ||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  29476033 ccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttcgaaccccaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 29475934  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| |||||||| || ||||| | |||||||||    
T  29475933 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 29475895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 566
Target Start/End: Original strand, 22381204 - 22381733
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || ||||  ||| | ||||||| ||| |||||||||||  | |||||||||| | ||||||| |    
T  22381204 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatcggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttc 22381303  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||  | ||||| |||||    ||||| || ||||| || ||||| || || || |  |||||||| ||    
T  22381304 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcattttgaccttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtcccaa 22381403  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || |||| || ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || ||  ||| ||| || ||||| |  ||| | ||     
T  22381404 cacaacactctcacctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaatagtgccatacctatactcgagtgatagctg 22381503  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    ||||| || || ||||||||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  | |||||||||||||||||    || || ||||    
T  22381504 ttgttatatgtgaactcaatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattggatcgtcc 22381603  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| | || |||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||||||| | |||||||||| ||| ||  |||| || |||||    
T  22381604 tctccgactgaccatctgcctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacct 22381703  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaagg 566  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  22381704 cggatccctatccgacacaatactcgaagg 22381733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 53 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 37291843 - 37291318
Alignment:
Q  53 acttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 152  Q
    ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||| ||||||| ||| || || | |||||||||||||||    
T  37291843 acttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacacttatcatgataact 37291744  T
Q  153 cttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccg 252  Q
    ||| |||| | |||| ||| | ||||| || ||||| ||||||| ||| || || ||||| |  || ||||  || |||||||| |   |  | || ||     
T  37291743 cttttgtcgattctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 37291644  T
Q  253 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaact 352  Q
    ||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||| || ||||    
T  37291643 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaact 37291544  T
Q  353 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatc 452  Q
    | |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||| | |||||||||    
T  37291543 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatc 37291444  T
Q  453 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgac 552  Q
     ||||| ||||| || || |||||||| ||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||||| | ||| |||    
T  37291443 tgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgac 37291344  T
Q  553 acaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||||| || ||||| | |||||||||    
T  37291343 acaatgctcgaaggaacaccatgcaa 37291318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 37 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 24749917 - 24749394
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| || | || || ||||| || || || |||| |||| | || ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||  ||||| || |    
T  24749917 ggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctac 24749818  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| |||||||| |||||||||| |||||| ||| | ||||| | ||||   |||| |||||||||||| ||||| |  || || |  || ||||| ||    
T  24749817 gcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaacttaaccttttctgtagtctgctgaactatgtctggtcccaa 24749718  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    ||   || | ||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  ||||     
T  24749717 catcacactttctcccgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 24749618  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  | ||||||||||| || ||    || || ||||    
T  24749617 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcctctaatgattggatcgtcc 24749518  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| |||| |||||| ||||  |||||||| ||||| || | |||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||||| |||||    
T  24749517 tctccgactgaccatctgtctaaggatgctaagtcgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatcttgaagtgaacct 24749418  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    || ||| | |||||||||||||||    
T  24749417 cgaatctctatccgacacaatact 24749394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 15000099 - 14999561
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||| ||||||| ||| ||||| | ||    
T  15000099 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacact 15000000  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  14999999 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 14999900  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | || || ||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||| |||| ||| || |||| |||||||||||| | |||| |||||||     
T  14999899 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagtctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactatta 14999800  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  14999799 ttgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaaattcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 14999700  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||  || || ||||| || || |||||||| ||||| || |  |||||| |  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  14999699 ccgactgaccatatgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaaacctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 14999600  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| |||||||| || ||||| | |||||||||    
T  14999599 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 14999561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 37 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 22236283 - 22235745
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||   |||| || |    
T  22236283 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 22236184  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||| || |||   | |||||| || || || ||||| |  || || |  |||||||| ||    
T  22236183 gcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgaccatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaactccggtcccaa 22236084  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || ||||||| |||||||||||  | || || ||| | |||||||||||||||||||| || |||| || ||| |||||||| | |||  ||||     
T  22236083 cacaacactctctcctgactcaaaccagaataaaggagtcttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacgatgccataccaatactcgaatggtaactg 22235984  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || || || ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  ||||||  ||||| ||||||   || ||  |||    
T  22235983 ttgttgtacgtgaattctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctccaaagattgtatcatcc 22235884  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||||||  |||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  22235883 tctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaagcgtcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacct 22235784  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
     ||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  22235783 tggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatg 22235745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 36 - 557
Target Start/End: Original strand, 22502683 - 22503204
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | |||||||||| | |||||||     
T  22502683 aggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctt 22502782  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 235  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||| |||||  ||  | ||||| |||||    |||| | | || || || ||||| || || || |  || ||||| |    
T  22502783 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtctggtccca 22502882  T
Q  236 acaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaact 335  Q
    ||| | || |||| || ||||||||||| || || || ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||| |  ||| | ||    
T  22502883 acacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcttacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccatgccaatactcgagtgatagct 22502982  T
Q  336 attgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtc 435  Q
     ||||| ||||| ||||||||||| || |        ||||||    |||||||||| |  |||||  | |||||||||||||||||    ||||| |||    
T  22502983 gttgttataagtgaactcaatcaatggcaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtc 22503082  T
Q  436 ctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacc 535  Q
    ||||| | ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || |  ||||| ||  | || ||||||| ||| ||  ||||||| ||||    
T  22503083 ctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaatgcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacc 22503182  T
Q  536 tcggatcccgatccgacacaat 557  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  22503183 tcggatccctatccgacacaat 22503204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 39 - 575
Target Start/End: Original strand, 23471254 - 23471790
Alignment:
Q  39 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctc 138  Q
    |||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || |||||  || | || |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||  || |  || | |    
T  23471254 agtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacttgagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtcttgcctacgc 23471353  T
Q  139 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaaca 238  Q
    |||||||||| |||||| || | |||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||| ||  |||||| ||| |||| ||  || || || |    
T  23471354 ttatcatgattactcttttgccgactctgagacgctttcatcttttgttgaatcatcttaaccttctcaatagtttgttgaacaatttatggccccaaaa 23471453  T
Q  239 aagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactatt 338  Q
       || |||| || |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||| | || ||    
T  23471454 ctacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcatcaaaaggtgccattccaatactagaatgatagctgtt 23471553  T
Q  339 gttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctc 438  Q
     ||||| || ||||| || || || | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| |||||||||| || |||||   ||||||  | |||    
T  23471554 attgtacgtgaactctattaatgggagatgactatcccaagttcccccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctccaacgactgaatcattctc 23471653  T
Q  439 tctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcg 538  Q
    || | ||||||||| ||||  ||||| || ||  |||| || ||||| ||||  || |||||  ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  23471654 tccgactgaccatctgtctacggatgatacgcctaactaaacctcaacttagaacctaaagcctctttcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcg 23471753  T
Q  539 gatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
    |||| | ||| || ||||| || ||||| | ||||||    
T  23471754 gatctctatctgatacaatgcttgaaggaaaaccatg 23471790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 575
Target Start/End: Original strand, 20342286 - 20342825
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||| || |||| |||  | || |||| ||| ||||||||||   | |||||||||| |||||||||     
T  20342286 aggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacctgtcaaaggggtgactctcagaaaaacatgatcacgctcctgaaactcaagatcctttctt 20342385  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 235  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||  | ||||| ||||||   |||| | | || || || ||||| || || || |  |||||||| |    
T  20342386 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtccca 20342485  T
Q  236 acaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaact 335  Q
    ||| | || |||| || ||||||||| | || || || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||| |  ||| | ||    
T  20342486 acacaacactctcacccgactcaaactagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagct 20342585  T
Q  336 attgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtc 435  Q
     ||||| ||||| ||||||||||| || ||       ||||||    ||||||| || |  |||||  | |||||||||||||||||    ||||| |||    
T  20342586 gttgttataagtgaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtc 20342685  T
Q  436 ctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacc 535  Q
    ||||| | ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||  | || ||||||| ||| ||  ||||||| ||||    
T  20342686 ctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacc 20342785  T
Q  536 tcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  20342786 tcggatctctatccgacacaatacttgacggtacaccatg 20342825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 359
Target Start/End: Original strand, 25848079 - 25848402
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    |||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||| || |||| |||| | || |||||||| |||||||||||  | |||||||||| ||||||| ||    
T  25848079 aggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcaaaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttttc 25848178  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 235  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||  | ||||| ||||||   ||||   | || || || ||||| || || || |  |||||||| |    
T  25848179 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaatctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtccca 25848278  T
Q  236 acaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaact 335  Q
    ||| | || |||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||| |  ||| | ||    
T  25848279 acacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagct 25848378  T
Q  336 attgttgtaagtaaactcaatcaa 359  Q
     ||||| |||||||||||||||||    
T  25848379 gttgttataagtaaactcaatcaa 25848402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 22333247 - 22332709
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||    
T  22333247 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgct 22333148  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||| ||| ||||||| || ||||| ||||||   || || || ||||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  22333147 tatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatccggactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagac 22333048  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | || || ||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||| | |||| |||||||     
T  22333047 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactatta 22332948  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    ||||  || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||| |||||||| || |    |||||| |||||||    
T  22332947 ttgtctgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctgaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 22332848  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | |||||||||  |||| ||||| || || |||||||| ||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  22332847 ccgactgaccatctttctgcggatgatatgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 22332748  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| |||||||| || ||||| | |||||||||    
T  22332747 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 22332709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 37545861 - 37545417
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctca-aaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttct 134  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| || |||| |||| | ||||||| |||| |||||||||||  | |||||||||| |||||||||    
T  37545861 aggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttct 37545762  T
Q  135 cctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcct 234  Q
     | ||| ||||| ||||| ||||||| |||||| ||  | ||||| ||||||   |||| | | || || || ||||| || || || |  ||||||||     
T  37545761 tcgcttgtcatggtaactgttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaaccttactttctcagtagtctcatgtaccaaatccggtccc 37545662  T
Q  235 aacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaac 334  Q
    |||| | || | || || ||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| || || ||| ||| ||| |||||||| |  ||| | |    
T  37545661 aacacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaggcttcgaacagtgccataccaatactcgagtgatagc 37545562  T
Q  335 tattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagt 434  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| || ||       ||||||    |||||||||| |  |||||  |||||||||||||||||||    ||||| ||    
T  37545561 tgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgt 37545462  T
Q  435 cctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaa 479  Q
    |||||| | ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  37545461 cctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaa 37545417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 115 - 578
Target Start/End: Original strand, 22134769 - 22135232
Alignment:
Q  115 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagttt 214  Q
    |||||||||| ||| ||||| | ||||||||| |||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||||||||||| ||| || || ||||| |    
T  22134769 tgaaactcaagatcttttctgcgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtct 22134868  T
Q  215 cttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcat 314  Q
      || ||||  || |||||||| |   |  | || || ||||||||| | |||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || |||| |||    
T  22134869 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaactagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 22134968  T
Q  315 tccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaa 414  Q
    ||||||||| | |||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||| ||  ||||||||||    
T  22134969 tccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaaaaattctcaacaaa 22135068  T
Q  415 tcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactct 514  Q
    |  || |    |||||| |||||||| | |||||||||  |||| ||||| || || |||||||| ||||| || |  ||||||||  |||||||||| |    
T  22135069 ttctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctatctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 22135168  T
Q  515 cccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
     ||||||| |||||||||| || ||||| | ||| |||||||| || ||||| | |||||||||    
T  22135169 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 22135232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 36 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 24798761 - 24798234
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| || ||||| || |||| |||| | || |||| ||| |||||||||||  |  ||||||||| |||||| ||     
T  24798761 aggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctccagaaactcaagatccttcctt 24798662  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 235  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||  |  |||| |||||    |||||  | || || || ||||| || || || |  ||| |||| |    
T  24798661 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctctcatcttttcccttatcattctgactttctcagtagtctcgtgaaccaaatccagtccca 24798562  T
Q  236 acaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaact 335  Q
    ||| | || | || || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||| |  ||| | ||    
T  24798561 acacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagct 24798462  T
Q  336 attgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtc 435  Q
     ||||| ||||||||||||||||| || ||      |||||||    | |||||||| |  |||||  |||||||||||||||||||    ||||| |||    
T  24798461 gttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctcctccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtc 24798362  T
Q  436 ctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacc 535  Q
    || || | ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||  ||| ||| |  ||||| ||  | || ||||||| ||| ||  ||||||| ||||    
T  24798361 ctttccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcagtttcgaccccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacc 24798262  T
Q  536 tcggatcccgatccgacacaatactaga 563  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  24798261 tcggatccctatccgacacaatgctaga 24798234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 138 - 359
Target Start/End: Original strand, 21404944 - 21405167
Alignment:
Q  138 cttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaac 237  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| || ||||| | ||| ||||  || ||||| |      
T  21404944 cttatcatgataactcttttgtctactctgtgacaccttcatattttctctaatcaacttaaccttctcagtagtctgttgaacaatgtctggtcccagt 21405043  T
Q  238 aaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccataca--aagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaact 335  Q
    |   || |||| ||||||||| ||||||||||||  || || || |||||||||||||  | || || ||||||| |||||||||||||| |||  ||||    
T  21405044 atcacaatctcaccggactcataccaacacaacgaagttctgcatctccgaccatacaacacgcttcgaacggtgccattccaatactagaatggtaact 21405143  T
Q  336 attgttgtaagtaaactcaatcaa 359  Q
     || || ||||| ||||| |||||    
T  21405144 gttattataagtgaactcgatcaa 21405167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 23080452 - 23079912
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| |  || || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | |||||||  |   |||||||||    
T  23080452 ggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcttacacccgtcataggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactatagggcctttctcc 23080353  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||||||||||||||||| | |||| ||| | ||||| |||||    |||||||| || || || ||||| || ||||| |  || ||||| ||    
T  23080352 gcttgtcatgataactcttctgtcgaatctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctcagtagtctcatgcaccaagtctggtcccaa 23080253  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    ||   || ||||||| ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| |||||||| |  ||| | ||     
T  23080252 caccacactctctcctgactcaaaccagcatagaggagtcctgcacctccgaccatataaagcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctg 23080153  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    ||||| || || ||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  |||||||||||||||||||    || || ||||    
T  23080152 ttgttatatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattggatcgtcc 23080053  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | || |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    ||||||||| | |||||||||| ||| ||  |||| || |||||    
T  23080052 tctccgactaaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcaaacccaaagcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacct 23079953  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgca 577  Q
    || ||||| |||||| |||||||| || |||| ||| ||||    
T  23079952 cgaatccctatccgatacaatactcgacggtacaccgtgca 23079912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 145 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 21831998 - 21831779
Alignment:
Q  145 tgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcat 244  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | ||||| ||||||   || | |||||||||||  ||||| |  || ||||  |||||||| ||||   ||     
T  21831998 tgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttattagcttaaccttttatgtagtctggtgaacaatatccggtcccaacactacac 21831899  T
Q  245 tctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgta 344  Q
     ||| || |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| | |  |||| ||||||||    
T  21831898 cctcacccgactcaaaccaacataacggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcaaatggtgtcattcctatactagaaaggtaactgttgttgta 21831799  T
Q  345 agtaaactcaatcaacggta 364  Q
     || ||||| ||||||||||    
T  21831798 cgtgaactctatcaacggta 21831779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 364
Target Start/End: Original strand, 22461957 - 22462284
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||||| ||| ||||| |||||  | ||||||||||  ||||| || |    
T  22461957 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtccttcctac 22462056  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||   ||||||||| || || || |||||||| || || | |||||| || ||    
T  22462057 gcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctccctaatcatcttgactttctctgtagtttcatgaaccaattccggccccaa 22462156  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || | ||||| ||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||| ||| | |||  ||||     
T  22462157 cacaacactttctcccgactcgaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaacactcgaatggtaactg 22462256  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 364  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||||    
T  22462257 ttgttgtatgtaaattctatcaatggta 22462284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 433 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 24716493 - 24716366
Alignment:
Q  433 gtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaa 532  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || | |||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||||| |    
T  24716493 gtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgctaagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatcttgaagtga 24716394  T
Q  533 acctcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||    
T  24716393 acctcgaatctctatccgacacaatact 24716366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 426 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 21890733 - 21890599
Alignment:
Q  426 ctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaattta 525  Q
    |||||| || ||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||||| |     
T  21890733 ctgaatcgttctctctgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctt 21890634  T
Q  526 gaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21890633 gaagtgaacctcggatctctatccgacacaatact 21890599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 253 - 542
Target Start/End: Original strand, 22348662 - 22348951
Alignment:
Q  253 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaact 352  Q
    ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||| || ||||    
T  22348662 gactcaaaccagcacaacggagttctgcacctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaact 22348761  T
Q  353 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatc 452  Q
    | |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||   | ||||||||| |  |    |||||| |||||||| | |||||||||    
T  22348762 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatccccaacaaatcattgagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 22348861  T
Q  453 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatc 542  Q
     ||||| ||||| ||||| ||||||||||||   || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || |||||    
T  22348862 tgtctgtggatgataagccgaactcaatctctgcttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatc 22348951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 254 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 21564119 - 21563816
Alignment:
Q  254 actcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactc 353  Q
    ||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| | |||  |||| |||||||| || |||||    
T  21564119 actcaaaccaacataacggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgtcataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactc 21564020  T
Q  354 aatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcg 453  Q
     |||||||||| |      ||||||    |||||||||| |  |||||  |||||| |||||| || ||   |||||| |   |||| | ||||||||      
T  21564019 tatcaacggtagatgactatcccaagcttcaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactgaatcgctttctccgactgaccatat 21563920  T
Q  454 gtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgaca 553  Q
    || || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||||| | ||||||||    
T  21563919 gtttgcggatgataagctgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgaca 21563820  T
Q  554 caat 557  Q
    ||||    
T  21563819 caat 21563816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 433 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 24620262 - 24620135
Alignment:
Q  433 gtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaa 532  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||| || | |||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||||| |    
T  24620262 gtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgctaagtcgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatcttgaagtga 24620163  T
Q  533 acctcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||    
T  24620162 acctcgaatctctatccgacacaatact 24620135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 8814339 - 8814243
Alignment:
Q  62 cacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctg 158  Q
    |||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| | ||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  8814339 cacgtccaacaccgattacaggattcactctcaaaaatatatgatcttcaacctgaaactcaatatcctttctcttcttatcatggtaactcttctg 8814243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 24735974 - 24735658
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| || | || || ||||| || || || |||| |||| | || ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||  ||||| || |    
T  24735974 ggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctac 24735875  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| |||||||| |||||||||| |||||| ||| | ||||| | ||||   |||| |||||||||||| ||||| |  || || |  || ||||| ||    
T  24735874 gcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaacttaaccttttctgtagtctgctgaactatgtctggtcccaa 24735775  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    ||   || | ||| | ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  ||||     
T  24735774 catcacactttcttccgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 24735675  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactc 353  Q
    |||||||| || |||||    
T  24735674 ttgttgtatgtgaactc 24735658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 124
Target Start/End: Original strand, 24516543 - 24516651
Alignment:
Q  16 tcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaactt 115  Q
    |||||||||| ||||||| | || |||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| || || || | ||||||||||||||| |    
T  24516543 tcaaacggtcaaacaaaatgtggtgtcaacttccgatacttcaaagcacgtccaacaccggttacatgatttactctaaagagcacatgatcaccaacct 24516642  T
Q  116 gaaactcaa 124  Q
    |||||||||    
T  24516643 gaaactcaa 24516651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 21890912 - 21890795
Alignment:
Q  247 tctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaag 346  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||| |  ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  |||| |||||||| |    
T  21890912 tctcccgactcaaaccaacataatggagtcttgtacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacg 21890813  T
Q  347 taaactcaatcaacggta 364  Q
    | ||||| ||||||||||    
T  21890812 tgaactctatcaacggta 21890795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Original strand, 20821458 - 20821765
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | ||||| ||||  || ||  | |    
T  20821458 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccttcctgaaattcaaggtctttcttac 20821557  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||| | ||||| || |||   |||||| |||| || || ||||| || || || |  ||||| || ||    
T  20821558 gcttgtcatggtagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcctaactttctctgtagtctcatgaaccaaatccggccccaa 20821657  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || | ||||| |||||||||||||| |  || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||||| | |||| ||||     
T  20821658 cacaacactttctcccgactcaaaccaacatagaggagtcctacacttccgaccatataaagcttcaaatggtgccataccaatacttgaatgataactg 20821757  T
Q  337 ttgttgta 344  Q
    ||||||||    
T  20821758 ttgttgta 20821765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 21564329 - 21564208
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||||| ||| |  |||||| || | || |||| ||||||||| || ||  ||||||||||||  |||||||| |    
T  21564329 ggagtcaaattcttagacttcaaagcacgactaacacgtgtcacatgagtgactctcagaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtcctttcttc 21564230  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctg 158  Q
     ||| |||||||||||||||||    
T  21564229 gcttgtcatgataactcttctg 21564208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 23442656 - 23442507
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||| || || |||||||  |||| || || || |||| |||| | || ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| | |||| || |    
T  23442656 ggagtcaacatcttagacttcaacacacgtcctacacccgtcataggagtgactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagagccttcctac 23442557  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttct 186  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||| ||||||    
T  23442556 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttct 23442507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 1148 - 1064
Alignment:
Q  280 cacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggta 364  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  |||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  1148 cacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggta 1064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 504 - 560
Target Start/End: Original strand, 21496630 - 21496686
Alignment:
Q  504 ttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21496630 ttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatact 21496686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 444 - 536
Target Start/End: Original strand, 22462364 - 22462456
Alignment:
Q  444 ctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |  ||||| ||| |||| ||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  22462364 ctgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaacct 22462456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 578
Target Start/End: Original strand, 20821854 - 20821999
Alignment:
Q  433 gtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaa 532  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||  | || ||||||  ||||||| | |||||||    
T  20821854 gtcctctccgactgaccatcagtctgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaacgcgtcctgtaaactcctccaaaatcttgaagtaa 20821953  T
Q  533 acctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||||||| || | ||| ||||| ||||| || || | |||||||||    
T  20821954 acctcgggtctctatctgacactatactcgacggaacaccatgcaa 20821999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 28916380 - 28916235
Alignment:
Q  433 gtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaa 532  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| | |||||| ||| |||| |||||   ||||||  | |||||||    
T  28916380 gtcctctccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgatcccaacgcatcttgtaaacttctccaaaacctcgaagtaa 28916281  T
Q  533 acctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    |||| || || | ||| ||||| ||||| || || || ||||||||    
T  28916280 accttgggtctctatctgacactatactcgacggaatcccatgcaa 28916235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 28923735 - 28923590
Alignment:
Q  433 gtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaa 532  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| | |||||| ||| |||| |||||   ||||||  | |||||||    
T  28923735 gtcctctccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgatcccaacgcatcttgtaaacttctccaaaacctcgaagtaa 28923636  T
Q  533 acctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    |||| || || | ||| ||||| ||||| || || || ||||||||    
T  28923635 accttgggtctctatctgacactatactcgacggaatcccatgcaa 28923590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 536
Target Start/End: Original strand, 20774160 - 20774263
Alignment:
Q  433 gtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaa 532  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |  ||||| ||| |||| |||||   ||||||| | |||||||    
T  20774160 gtcctctccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaacttctccaaaatctcgaagtaa 20774259  T
Q  533 acct 536  Q
    ||||    
T  20774260 acct 20774263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 24737148 - 24737018
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| || | || || ||||| || || || |||| |||| | || ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||  ||||| || |    
T  24737148 ggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctac 24737049  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 167  Q
     ||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  24737048 gcttgtcatgatagctcttctgtcgactctg 24737018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 470; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 581
Target Start/End: Original strand, 23491 - 24060
Alignment:
Q  12 gacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcacca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  23491 gacatcaaacggtccaacaaaacgagcagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacatgattcaccctcaaaaacacgtgatcacta 23590  T
Q  112 acttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtag 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  23591 acttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtag 23690  T
Q  212 tttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgt 311  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23691 tttcttgcacaacctccggtcctaacaaagcactctctccagactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgc 23790  T
Q  312 cattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaac 411  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23791 cattccgatactagcatgaaaaatgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactaacaccttgctccaaaacacaagctctcaac 23890  T
Q  412 aaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaac 511  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23891 aaatactccaaactctgaatagtcctctccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaac 23990  T
Q  512 tctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23991 tctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaatct 24060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 470; Significance: 0; HSPs: 61)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 24831933 - 24831364
Alignment:
Q  12 gacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcacca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24831933 gacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccagtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcacca 24831834  T
Q  112 acttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtag 211  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  24831833 acttgaaactcaatatccttcgttctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtag 24831734  T
Q  212 tttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24831733 tttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgc 24831634  T
Q  312 cattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaac 411  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24831633 cattccgatactaacatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaatggtaaacattcgtcccaactaacaccttgctccaacacacaagctctcaac 24831534  T
Q  412 aaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaac 511  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  24831533 aaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggactgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagtccccaaaggagcttgcaaac 24831434  T
Q  512 tctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24831433 tctcccaaaacttagaagtaaacctcagatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaatct 24831364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 457; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 581
Target Start/End: Original strand, 22275977 - 22276544
Alignment:
Q  13 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22275977 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacccttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaa 22276076  T
Q  113 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 212  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  22276077 cctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagt 22276176  T
Q  213 ttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtc 312  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22276177 ttcttgcacaacttccagtcctaacaaggcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgcc 22276276  T
Q  313 attccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 412  Q
    || || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22276277 ataccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 22276376  T
Q  413 aatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaact 512  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  22276377 aatcctccaaactctgaatagtcctctccgtctacccatcagtctggggatggtaagcagaactcaatctcaacttagtttccaaagcagcttgcaaact 22276476  T
Q  513 ctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22276477 ctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgat-cgacacaatactagaaggaataccatgcaatct 22276544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 24570413 - 24569848
Alignment:
Q  13 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  24570413 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttccaacacttcaaagcacgaccaacaccagttacatgattcactctcaagaatacatgatcaccaa 24570314  T
Q  113 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 212  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||   ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24570313 cctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgatagctcttctatctactctgagacgttttcatcttctcttgattcatcttaaccttttccgtagt 24570214  T
Q  213 ttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtc 312  Q
     |||| |||||||||||||||||||||| || | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |    
T  24570213 ctctttcacaacttccggtcctaacaaaacactttctcctaactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctctgacgatataaagcctcaaacggtgcc 24570114  T
Q  313 attccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 412  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24570113 attccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacactcgtccgaactgaaaccttgctccaaaacacaaactctcaaca 24570014  T
Q  413 aatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaact 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24570013 aatcttccaaactctgaatagtcctttctgtttgcccatcggtgtgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaact 24569914  T
Q  513 ctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24569913 ttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatgcaa 24569848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 22762314 - 22761749
Alignment:
Q  13 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 112  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||| || || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22762314 acatcaaacggtccaccaaaatgaggagtcaactttcgacacttcaaaccacgactaacaccagttacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaa 22762215  T
Q  113 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 212  Q
    | |||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||| || ||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  22762214 cctgaaactcaatatctttcatcctcttgtcatgataactcttcttcctactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttatgtagt 22762115  T
Q  213 ttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtc 312  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  22762114 ctcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactttctcctgattcaaaccaacacaacgacgtcctacacctccgaccatacaaagcttcaaacggtgcc 22762015  T
Q  313 attccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 412  Q
    || || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22762014 ataccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgcttcaaaacacaagctctcaaca 22761915  T
Q  413 aatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaact 512  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22761914 aatcctccaaactttgaagagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagaagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaact 22761815  T
Q  513 ctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  22761814 ctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactaaaaggaataccatgcaa 22761749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 12640665 - 12640263
Alignment:
Q  12 gacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcacca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  12640665 gacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccgacaccggtcaccggattcaccctcaagaacacatgatctcca 12640566  T
Q  112 acttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtag 211  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  12640565 acctgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtag 12640466  T
Q  212 tttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12640465 tttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgc 12640366  T
Q  312 cattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaac 411  Q
    ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12640365 cataccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaac 12640266  T
Q  412 aaa 414  Q
    |||    
T  12640265 aaa 12640263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 92 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 23817719 - 23817223
Alignment:
Q  92 tcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaat 191  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || || ||||| ||    
T  23817719 tcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctccttttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttgatcttctcttggat 23817620  T
Q  192 catcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgacca 291  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23817619 catcttaactttttccgtagtctcttgcacaacctccggtcctaacaaagcactttatcttgactcaaaccaacacaacggtgtcctacatctccgacca 23817520  T
Q  292 tacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgct 391  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  23817519 tacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaatggtaaacatacgtcccaacagacaccttgct 23817420  T
Q  392 ccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagt 491  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23817419 ccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagttctctttgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagt 23817320  T
Q  492 tcccaaagcagcttgca----------aactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    |||||||||||||||||          |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23817319 tcccaaagcagcttgcaaactttcccaaactttcccaaaacttataagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaa 23817223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 578
Target Start/End: Original strand, 25128348 - 25128910
Alignment:
Q  16 tcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaactt 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||| |||||||| || ||||| || |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25128348 tcaaacggtccaacaaaaagaggagtaaactttcgacaattcaaagcgcgtccaacaccagtcacatggttcactctcaaaaacacatgatcaccaactt 25128447  T
Q  116 gaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttc 215  Q
    |||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  25128448 gaaactcaatgtccttcctcctttcatcatgataactcttctgtctactctgagatgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttttccgtagtctc 25128547  T
Q  216 ttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcatt 315  Q
    ||| ||||| |||| |||||||||| || | || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  25128548 ttggacaacctccgatcctaacaaaacactttcacccgactcaaaccaacataacggcgtcctacacctccgaccatacaaagcatcaaacggtgtcata 25128647  T
Q  316 ccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaat 415  Q
    || ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||    
T  25128648 ccgatacttgaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacgacaaacattcgacccaactgacactttgctccaaaatacaagctcttaataaat 25128747  T
Q  416 cttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctc 515  Q
    | || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  25128748 cctctaaactctgaatagtcctctctatctgcccatcggtatggggatgataagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcatcttgcaaactttc 25128847  T
Q  516 ccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25128848 ccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatgcaa 25128910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 286 - 484
Target Start/End: Original strand, 23890753 - 23890951
Alignment:
Q  286 cgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacac 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23890753 cgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacac 23890852  T
Q  386 cttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23890853 cttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcatccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 23890951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 36 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 24708204 - 24707662
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| |||||| ||     
T  24708204 aggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctg 24708105  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 235  Q
    | ||||||||||||  |||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| |  || |||| ||| |||||||    
T  24708104 cgcttatcatgatatttcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatttctggtccta 24708005  T
Q  236 acaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaact 335  Q
    | |   |  | ||||| |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  24708004 agaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataact 24707905  T
Q  336 attgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtc 435  Q
    ||| ||||| || |||||||||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| | ||||| |||||||| |    |||||| |||    
T  24707904 attattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaataaatcttctagcgactgaatcgtc 24707805  T
Q  436 ctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacc 535  Q
    ||||| | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||  ||||||||  |||||||||||| ||||||| || ||||||| |    
T  24707804 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctaaaagtaaatc 24707705  T
Q  536 tcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    | ||||| | ||| || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  24707704 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 24707662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 578
Target Start/End: Original strand, 23063799 - 23064340
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || || ||||| || || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  23063799 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaaaacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctac 23063898  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||  || ||||||||    
T  23063899 gcttatcatggtaactcttttgtctactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttcaacaatctctggtcctaa 23063998  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   || | || || |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||| | |||| |||||    
T  23063999 gaccacactttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcataaggtgccattccaatacttgaatgataacta 23064098  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || ||||| || ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| |||||||||||||||| |||  ||||||  |||    
T  23064099 ttattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtacctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcttcaaaagactgaatcatcc 23064198  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||  || |||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||    
T  23064199 tctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaaact 23064298  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
     ||||| | ||| |||||||| || ||||| | |||||||||    
T  23064299 tggatctctatctgacacaatgcttgaaggaacaccatgcaa 23064340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Original strand, 24709758 - 24710296
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||| ||||||| ||| ||||| | ||    
T  24709758 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgct 24709857  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  24709858 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 24709957  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
     ||  | ||||| || ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||     
T  24709958 cgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaggcctcaaacggtgtcattccaatactagaatgataactatta 24710057  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  24710058 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 24710157  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  24710158 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 24710257  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| |||||||| || ||||| | |||||||||    
T  24710258 atctctatctgacacaatgcttgaaggaacaccatgcaa 24710296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Original strand, 9609861 - 9610399
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || ||||||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||| ||||||| ||| ||||| | ||    
T  9609861 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgct 9609960  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  9609961 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 9610060  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | ||||| || ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  9610061 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 9610160  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || || || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  9610161 ttatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 9610260  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  9610261 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 9610360  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  9610361 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 9610399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Original strand, 16998725 - 16999263
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||| ||||||| ||| ||||| | ||    
T  16998725 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgct 16998824  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  16998825 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 16998924  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | ||||| || ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  16998925 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 16999024  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  16999025 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 16999124  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| || || ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  16999125 ccgactgaccatctgtttgtggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 16999224  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  16999225 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 16999263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 40 - 577
Target Start/End: Original strand, 10868575 - 10869112
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | ||||| |||| ||| || || | ||    
T  10868575 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatctttcctacgct 10868674  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  10868675 tatcatgatagctcttttgtcgactctgcgacaccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 10868774  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | ||||| || ||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  10868775 caccctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccgtacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattg 10868874  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  10868875 ttataagtgaactcgatcaacgggagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 10868974  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  10868975 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 10869074  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgca 577  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||| | ||||||||    
T  10869075 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgca 10869112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 21325987 - 21325482
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  |||||||||| || ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  21325987 ggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 21325888  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| || || || |||| ||| ||||  || ||||||||    
T  21325887 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtggtttgttgaacaatctctggtcctaa 21325788  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | || || || ||||||||||||||||| || || || ||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||| || | |||||    
T  21325787 gaccactctttcacccgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccagataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaataataacta 21325688  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| ||||||||||||| || |    |||||| ||||    
T  21325687 ttattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagcacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcc 21325588  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||  || |||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||    
T  21325587 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccggactcaatctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 21325488  T
Q  537 cggatc 542  Q
     |||||    
T  21325487 tggatc 21325482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 542
Target Start/End: Original strand, 24675211 - 24675716
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||  | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  24675211 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggggtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 24675310  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||  ||| | ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| |  || ||||  || ||||||||    
T  24675311 gcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaa 24675410  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | || || || |||||||||||||| || || || || ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  24675411 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaatggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataacta 24675510  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || ||||| || ||||||||||| || | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||  |||||| |||||| || |    ||||||  |||    
T  24675511 ttattgtatgtgaactcaatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacagactctcagcaaatcctctagcgactgaatcatcc 24675610  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||  ||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  24675611 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatct 24675710  T
Q  537 cggatc 542  Q
     |||||    
T  24675711 tggatc 24675716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 36 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 11358596 - 11358069
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| || |||| |||| | || |||| ||| |||||||||||  | |||||||||| ||||||||||    
T  11358596 aggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctc 11358497  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 235  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||  | ||||| ||||||   |||| | | || || || ||||| || || || |  |||||||| |    
T  11358496 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtccca 11358397  T
Q  236 acaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaact 335  Q
    ||| | || |||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||| |  ||| | ||    
T  11358396 acacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagct 11358297  T
Q  336 attgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtc 435  Q
     ||||| ||||||||||||||||| || ||       ||||||    |||||||||| |  |||||  | |||||||||||||||||    ||||| |||    
T  11358296 gttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctctagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtc 11358197  T
Q  436 ctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacc 535  Q
    ||||| | ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||  | || ||||||| ||| ||  ||||||| ||||    
T  11358196 ctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacc 11358097  T
Q  536 tcggatcccgatccgacacaatactaga 563  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  11358096 tcggatccctatccgacacaatgctaga 11358069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Original strand, 16981877 - 16982415
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||| || |||| ||| ||||| | ||    
T  16981877 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgct 16981976  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  16981977 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 16982076  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | ||||| || ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  16982077 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 16982176  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| || ||||    
T  16982177 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgttctct 16982276  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  16982277 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 16982376  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  16982377 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 16982415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Original strand, 17063442 - 17063980
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||| || |||| ||| ||||| | ||    
T  17063442 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgct 17063541  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  17063542 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 17063641  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | ||||| || ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  17063642 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 17063741  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| || ||||    
T  17063742 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgttctct 17063841  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  17063842 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 17063941  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  17063942 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 17063980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Original strand, 17067100 - 17067638
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||| || |||| ||| ||||| | ||    
T  17067100 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgct 17067199  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  17067200 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 17067299  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | ||||| || ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  17067300 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 17067399  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| || ||||    
T  17067400 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgttctct 17067499  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  17067500 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 17067599  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  17067600 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 17067638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 44386287 - 44385749
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | ||||| ||||  || ||||| | ||    
T  44386287 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgct 44386188  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||| | || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  44386187 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcgttttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 44386088  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
     ||  | ||||| || ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  44386087 cgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 44385988  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  44385987 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagtccctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 44385888  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | |||| |||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  44385887 ccgactgatcatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 44385788  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  44385787 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 44385749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 53 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 22325561 - 22325036
Alignment:
Q  53 acttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 152  Q
    ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | ||||| |||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  22325561 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataact 22325462  T
Q  153 cttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccg 252  Q
    ||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || || ||||| |  ||  | |||||     
T  22325461 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggccctaagaccgctctttctcct 22325362  T
Q  253 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaact 352  Q
    || |||||||||||| |||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| || ||||| ||||    
T  22325361 gattcaaaccaacaccacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactattattataagtgaact 22325262  T
Q  353 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatc 452  Q
    | |||||||| | |     ||||||| |  | ||||| || | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||| | |||||||||    
T  22325261 cgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 22325162  T
Q  453 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgac 552  Q
     ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||||| | ||| |||    
T  22325161 tgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgac 22325062  T
Q  553 acaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    || || || ||||| | |||||||||    
T  22325061 acgatgctcgaaggaacaccatgcaa 22325036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 392 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 21906535 - 21906348
Alignment:
Q  392 ccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagt 491  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  21906535 ccaaaacacatgctctcaacaaatcttccaaagtttgaatagtcctctatgtctgcccatcagtctgaggatgataagcagaactcaaccttaacttagt 21906436  T
Q  492 tcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaat 579  Q
    ||||| |||  |||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||  ||| |||||||| |||| ||| ||||||||    
T  21906435 tcccagagccacttgcaaaatttcccaaaacttagaagtaaaccttggatccctatttgacccaatactataaggaatatcatgcaat 21906348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 24826003 - 24825498
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||| || || ||||| || ||||||||| | || || ||||| |||| ||| ||  | | ||||||||  || || || |    
T  24826003 ggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactcttaaaaatacattatctccttcctaaaactcaaggtctttcctac 24825904  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||||||||||||||| | |||| |||||| ||| | ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||  || |||| ||| ||||| ||    
T  24825903 gcttatcatgataactcctttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcatcttaaccttctcagtagtttgctgaacaatttctggtcccaa 24825804  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   || |||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||| |||||||||| |||  |||||    
T  24825803 aactacactctcacctgactcaacccaacacaacggagtcctacacctccgaccatacagagcttcaaaaggtgccataccaatactagaatgttaacta 24825704  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || || || || ||||| |||||||| | |      |||||| |  |||||||||| |  |||||| |||||||||| |||||||    |||||| || |    
T  24825703 ttattatacgtgaactctatcaacgggagatgactatcccaagttccaccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcttccagcgactgaatcgttc 24825604  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    | || |  |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||  || |||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  24825603 tttccgattgaccatctgtctgcggatgatacgccgaacttaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacct 24825504  T
Q  537 cggatc 542  Q
    ||||||    
T  24825503 cggatc 24825498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 27365800 - 27365259
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| || | || || ||||| || || || |||| |||| | |||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||  ||||| || |    
T  27365800 ggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgaccctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctac 27365701  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| |||||||| |||||||||| |||||| ||| | ||||| | ||||   || | |||||||||||||||||||| ||| || |  || ||||| ||    
T  27365700 gcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttattaacttaaccttttccgtagtttgttgaactatgtctggtcccaa 27365601  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    ||   || | ||||| ||||||||||||||||| || || || ||||| || |||||||| || |||||||||| ||| |||||||| | |||  |||||    
T  27365600 catcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgtccatacaaggcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaacta 27365501  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  | ||||| | ||| || ||    || || ||||    
T  27365500 ttgttgtaagtaaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaatagatcctctaaggattgtatcgtcc 27365401  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| |  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  27365400 tctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacct 27365301  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    |||||| | ||| || |||||||| || || | |||||||||    
T  27365300 cggatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaa 27365259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 36 - 563
Target Start/End: Original strand, 1063472 - 1063999
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |||||||| || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | |||||||||| |||||||||     
T  1063472 aggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctt 1063571  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 235  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||  |  |||| ||||||   |||| | | || || || ||||| || || || |  || ||||| |    
T  1063572 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctctcatcttttctcttatcaaccttactttctcagtagtctcatgtaccaaatctggtccca 1063671  T
Q  236 acaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaact 335  Q
    ||| | || |||| |  ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||| | |||| | ||    
T  1063672 acacaacactctcacacgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatacttgaatgatagct 1063771  T
Q  336 attgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtc 435  Q
     ||||| ||||||||||||||||| || ||      |||||||    |||||||||| |  |||||  ||||||||||||||||| |    ||||| |||    
T  1063772 gttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttcccatgattgaattgtc 1063871  T
Q  436 ctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacc 535  Q
    ||||| | ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||  ||||||| |  ||||| ||  | || ||||||| ||| ||  ||||||| ||||    
T  1063872 ctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaatttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacc 1063971  T
Q  536 tcggatcccgatccgacacaatactaga 563  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  1063972 tcggatctctatccgacacaatactaga 1063999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 362
Target Start/End: Original strand, 16924985 - 16925307
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||| ||||||| ||| ||||| | ||    
T  16924985 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgct 16925084  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  16925085 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 16925184  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | ||||| || ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  16925185 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 16925284  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacgg 362  Q
    || ||||| ||||| ||||||||    
T  16925285 ttataagtgaactcgatcaacgg 16925307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Original strand, 27370994 - 27371532
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||  || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||| ||||||| ||| ||||| | ||    
T  27370994 gtcaacttctttgacttcaaagcacatcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgct 27371093  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  27371094 tatcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 27371193  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | ||||| || |||||||||||||||   || || || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||  |||||||     
T  27371194 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacatagttcttcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactatta 27371293  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  27371294 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 27371393  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    ||| ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  27371394 ctgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 27371493  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| |||||||| || ||||| | |||||||||    
T  27371494 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 27371532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 23817835 - 23817718
Alignment:
Q  16 tcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaactt 115  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  23817835 tcaaatggtcctacaaaactaggagtcaacttccgacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacct 23817736  T
Q  116 gaaactcaatatcctttc 133  Q
    ||||||||||||||||||    
T  23817735 gaaactcaatatcctttc 23817718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 37 - 575
Target Start/End: Original strand, 23188730 - 23189267
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||  || || ||  | ||| |||||| ||| || || |    
T  23188730 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttcctgacactcaagatctttcctgc 23188829  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || |||||||||   |||||||| || ||||| |  || ||||  || ||||||||    
T  23188830 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatctatttaaccttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaa 23188929  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | || || |||||||||||||||| ||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||| |||| |||||    
T  23188930 gaccactctttcacctgactcaaaccaacaca-cggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattcctaaactagaatgataacta 23189028  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| ||||||||| ||||||| ||||| || |    |||||  ||||    
T  23189029 ttgttgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaaaaacacaaactctcaataaatcctctagcgactgaactgtcc 23189128  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | |||||||||  |||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||    
T  23189129 tctccgactgaccatctatctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 23189228  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
     ||||| | ||| || ||||| || ||||| | ||||||    
T  23189229 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 23189267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 575
Target Start/End: Original strand, 23293680 - 23294218
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||| ||| |||||||||||  | ||||||||||   |||| || |    
T  23293680 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 23293779  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||| ||||||   |||||||| || || ||  |||| |  || || |  |||||||| ||    
T  23293780 gcttgtcatgataactcttccgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctatagtctgatgaaccaaatccggtcccaa 23293879  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || ||||||| |||||||||| ||| || || |||||  ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  ||||     
T  23293880 cacaacactctctcctgactcaaaccgacataaaggagtcctcaacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 23293979  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  |||||| |||| | ||||||   || || ||||    
T  23293980 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagcaaaccctccaaagattgtatcgtcc 23294079  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||||||| |||| || |||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  23294080 tctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgtaagctcttccagaatctagaagtgaacct 23294179  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
    |||||| | ||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  23294180 cggatctctatccgacacaatactcgacggtacaccatg 23294218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Original strand, 24262095 - 24262633
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||| ||||||| ||| || || | ||    
T  24262095 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgct 24262194  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  24262195 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 24262294  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | || || ||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||| | |||| |||||||     
T  24262295 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactatta 24262394  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    ||||| ||  |||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  24262395 ttgtatgtggactcgatcaacgggagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 24262494  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    ||| ||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  24262495 ctgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 24262594  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| |||||||| || ||||| | |||||||||    
T  24262595 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 24262633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Original strand, 27217741 - 27218279
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | ||||| |||| ||| ||||| | ||    
T  27217741 gtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgct 27217840  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || | ||  || |||||||| |     
T  27217841 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgtatcatctgaactttctcagtagtttgctgaaaaatctctggtcctaagac 27217940  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | ||||| || ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  27217941 cactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccattccaatactagaatgataactatta 27218040  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || ||||| ||||| || ||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| || || |    
T  27218041 ttataagtgaactcgattaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgttctgt 27218140  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  27218141 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 27218240  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  27218241 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 27218279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 245 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 19652562 - 19652250
Alignment:
Q  245 tctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgta 344  Q
    ||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  ||||   ||||||    
T  19652562 tctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaact---gttgta 19652466  T
Q  345 agtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtc 444  Q
     || ||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  ||||||||||||| ||||||   || || |||||||| | |    
T  19652465 tgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaaagattgtatcgtcctctccgac 19652366  T
Q  445 tgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatccc 544  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||     
T  19652365 tgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatcct 19652266  T
Q  545 gatccgacacaatact 560  Q
     |||||||||||||||    
T  19652265 tatccgacacaatact 19652250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 21909033 - 21908785
Alignment:
Q  16 tcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaactt 115  Q
    ||||| |||||||||||| | || ||||||||||  ||||||||| |||| ||||| || || ||  ||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  21909033 tcaaatggtccaacaaaatgcggtgtcaacttccggcacttcaaatcacgtccaacaccagttacgtgattcactctaaaaaacacatgatcatcaactt 21908934  T
Q  116 gaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttc 215  Q
    |||| |||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||  ||||||||||| |  ||||||| || ||||||||||| ||||| ||  |||| ||    
T  21908933 gaaaatcaatatcctctatcctcttaccatgataa--cttctgcatactctgagacgctatcatattctcgtgaatcatcttcaccttctctatagtctc 21908836  T
Q  216 ttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaaca 266  Q
    |||||||||||||  || || ||||||| | ||||| |||| | |||||||    
T  21908835 ttgcacaacttccattcttatcaaagcactttctcctgacttataccaaca 21908785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 566
Target Start/End: Original strand, 12574075 - 12574604
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| || || || ||||  ||  | ||||| | ||| |||||||||||  ||||||||||||   |||| ||||    
T  12574075 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggggtaacccttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggccttcctcc 12574174  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||| || |||   |||||||| || ||||| ||||| || || || |  |||||||| ||    
T  12574175 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtcccaa 12574274  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || | ||||  ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||| |||||| ||||| | |||| ||||     
T  12574275 cacaacactttctcttgactcgaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataactg 12574374  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||       |||||||    |||| || || |  |||||  |||||||||| ||||||||    || || ||||    
T  12574375 ttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactgtcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgtcc 12574474  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||||| || |  ||||||||  | || ||||||| ||| ||  ||||||| |||||    
T  12574475 tctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacct 12574574  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaagg 566  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  12574575 cggatctctatccgacacaatactcgaagg 12574604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 124
Target Start/End: Original strand, 28144664 - 28144772
Alignment:
Q  16 tcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaactt 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  28144664 tcaaacggtccaacaaaacgatgagttaacttcctacacttcaaagcacgtccaacaccggttacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacct 28144763  T
Q  116 gaaactcaa 124  Q
    ||| |||||    
T  28144764 gaatctcaa 28144772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 115 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24878638 - 24878391
Alignment:
Q  115 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagttt 214  Q
    |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||||||||||  ||| || || |||||||    
T  24878638 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatccgaactttctcagtagttt 24878539  T
Q  215 cttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcat 314  Q
      || ||||  || |||||||| |   |  | || || |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  24878538 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcacctccgaccatataaagcctcgaaaggtgtcat 24878439  T
Q  315 tccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacgg 362  Q
    ||||||||||  |||| ||||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  24878438 tccaatactataatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacgg 24878391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 563
Target Start/End: Original strand, 31830379 - 31830906
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| || ||||| || |||| |||| | || |||| ||| |||||||||||  | ||||| |||| |||||||||     
T  31830379 aggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctt 31830478  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 235  Q
    | ||| ||||| ||||||||||| | |||||| ||  | ||||| ||||||   |||| | | || || || ||||| || ||||| |  |||||||| |    
T  31830479 cgcttgtcatggtaactcttctgccgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtctcatgcaccaaatccggtccca 31830578  T
Q  236 acaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaact 335  Q
    ||| | || | || || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||| |  ||| | ||    
T  31830579 acacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagct 31830678  T
Q  336 attgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtc 435  Q
     ||||| |||||||| |||||||| || ||      |||||||    |||||||||| |  |||||  | |||||||||||||||||    ||||| |||    
T  31830679 gttgttataagtaaattcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtc 31830778  T
Q  436 ctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacc 535  Q
    ||||| | ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||  |||| || |  ||||||||  | || ||||| | ||| ||  ||||||| ||||    
T  31830779 ctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacc 31830878  T
Q  536 tcggatcccgatccgacacaatactaga 563  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||    
T  31830879 tcggatctctatccgacacaatgctaga 31830906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 37 - 566
Target Start/End: Original strand, 27787463 - 27787992
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||| || || || ||||  ||| |||| || | ||| |||||||||||  ||||||||||||   |||||||||    
T  27787463 ggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 27787562  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||| || |||   |||| ||| || ||||| ||||| || || || |  |||||||| |     
T  27787563 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcaccttgactttttctgtagtctcctgaaccaaatccggtcccag 27787662  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||| |||||| ||||| |  ||| ||||     
T  27787663 cacaacactttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgagtgataactg 27787762  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||        ||||||    |||| || || |  |||||  |||||||||| ||||||||    || || || |    
T  27787763 ttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgttc 27787862  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||||| || |  ||||||||  | || ||||||| ||| ||  ||||||| |||||    
T  27787863 tctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacct 27787962  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaagg 566  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  27787963 cggatccctatccgacacaatactcgaagg 27787992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 22757184 - 22756645
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  | ||||||||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || || |   |||||||||||| ||| || || |    
T  22757184 ggagtcaacttctttgatttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctctttcttgaaactcaagatctttcctgc 22757085  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || |||||||||| |||||| || || ||| | | ||| ||||  || ||||||||    
T  22757084 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcaccttaactttctcagtaatctgttgaacaatctctggtcctaa 22756985  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | ||||| |||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| | |  ||||     
T  22756984 gaccactctttctcctgactc--accaacacaacggagttctacatctccgaccatataaagcctcaaagggtgccattccaatactagaacggtaactg 22756887  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || ||||| || || || |||||||| | |      ||| || |  | |||| ||| |  |||||| | ||||||||||| || |    |||||| ||||    
T  22756886 ttattgtacgtgaagtctatcaacggaagatgactatccgaagtccctcctttctcaagtacacaaaccctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcc 22756787  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||| | ||| || || |||||||||||||| ||||  ||||||||  |||| ||||||| ||||||| |||| ||||| ||    
T  22756786 tctccgactgaccatctgtctgtgtatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgaaaactcttccaaaatctagaggtaaatct 22756687  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
     ||||| | ||| || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  22756686 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 22756645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 91 - 577
Target Start/End: Original strand, 23276552 - 23277038
Alignment:
Q  91 ctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaa 190  Q
    |||| ||| |||||||||||  | ||||||||||   |||| || | ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || |||   |    
T  23276552 ctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctga 23276651  T
Q  191 tcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgacc 290  Q
    ||||| | || || |||||||| |  || || |  |||||||| |||| | || ||||||| ||||||||||| || || |  ||||| |||||||||||    
T  23276652 tcatcatgactttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaagaagtcctgcacctccgacc 23276751  T
Q  291 atacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgc 390  Q
    ||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||| |||| |||||||| || ||||| |||||||||| |      ||||||    ||||||||    
T  23276752 atacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatgataactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgc 23276851  T
Q  391 tccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttag 490  Q
    || |  ||| |  || ||| |||||| || ||    || || |||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || || |    
T  23276852 tcaagtacaaacactttcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaaccttaacttcg 23276951  T
Q  491 ttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgca 577  Q
      ||||| ||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  23276952 aacccaatgcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcgaatcactatccgacacaatactcgacggtacaccatgca 23277038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 560
Target Start/End: Original strand, 20832706 - 20833230
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |||||||| || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | |||||||||| |||||||||     
T  20832706 aggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctt 20832805  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 235  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||| |||||  ||  | ||||| ||||||   ||||   | || || || ||||| || || || |  |||||||| |    
T  20832806 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgaagctttcatcttttctcttatcaatctgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtccca 20832905  T
Q  236 acaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaact 335  Q
    | | | || |||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||| |  ||| | ||    
T  20832906 atacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagct 20833005  T
Q  336 attgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtc 435  Q
     ||||| ||||| || |||||||| || ||       ||||||    |||||||||| |  |||||  | |||||||||||||||||    ||||| |||    
T  20833006 gttgttataagtgaattcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtc 20833105  T
Q  436 ctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacc 535  Q
    ||||| | ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||  | || ||||| | ||| ||  ||||||| ||||    
T  20833106 ctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacc 20833205  T
Q  536 tcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    ||||||| | |||||||||||||||    
T  20833206 tcggatctctatccgacacaatact 20833230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 55 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 21145733 - 21145426
Alignment:
Q  55 ttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactct 154  Q
    ||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  21145733 ttcaaagcacgtcctacacccgtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactct 21145634  T
Q  155 tctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccgga 254  Q
    | |||| |||||| ||| | ||||| || ||||||||||||| ||| || || |||||||  || ||||  |  |||||||| |   |  | || ||  |    
T  21145633 tttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtttgctggacaatctttggtcctaagaccactctttcacctaa 21145534  T
Q  255 ctcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactca 354  Q
    ||||||||| |||||||| ||  | || ||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||     
T  21145533 ctcaaaccagcacaacggagttttgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataactattgttgtatgtgaactcg 21145434  T
Q  355 atcaacgg 362  Q
    ||||||||    
T  21145433 atcaacgg 21145426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 253 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 41608890 - 41608565
Alignment:
Q  253 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaact 352  Q
    ||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||| | |||| ||||||| ||||| || ||||    
T  41608890 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaact 41608791  T
Q  353 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatc 452  Q
    | |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||| | |||||||||    
T  41608790 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 41608691  T
Q  453 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgac 552  Q
     ||||  ||||| || || |||||||| ||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||||| |  || |||    
T  41608690 tgtctacggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctgtctgac 41608591  T
Q  553 acaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||||| || ||||| | |||||||||    
T  41608590 acaatgctcgaaggaacaccatgcaa 41608565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 117 - 560
Target Start/End: Original strand, 45529313 - 45529756
Alignment:
Q  117 aaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttct 216  Q
    |||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||  ||||| ||||||||| |  ||||| | |    
T  45529313 aaactcaagatccttcctaggcttatcatgataactcttttgtctactctgcgatgctttcatcttttctctaatcaacttaaccttcttagtagtctgt 45529412  T
Q  217 tgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattc 316  Q
    || ||||  |||||||| || |   || |||| ||||||||| |||||||||| || ||  | || |||||||||||||| || || ||||||| |||||    
T  45529413 tgaacaatgtccggtcccaataccacactctcaccggactcataccaacacaatggagttttgcatctccgaccatacaacgcttcgaacggtgccattc 45529512  T
Q  317 caatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatc 416  Q
    |||| |||  |||  |||| || || ||| | ||||| ||||| || | |   |  |||||| |  | |||||||| |  |||||| |||| ||||| ||    
T  45529513 caatgctaaaatggtaactgttattataaatgaactcgatcaatggaagatgattatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctgaacaagtc 45529612  T
Q  417 ttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcc 516  Q
     |||||   |||||| |||||||  ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||  ||||| ||  | |||||||||| |    
T  45529613 ctccaacgactgaattgtcctctacgtctgtccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactcttc 45529712  T
Q  517 caaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||| ||| || ||||||||    
T  45529713 caaaatctagaagtaaatcttggatccctatctgatacaatact 45529756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 94 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 30211581 - 30211115
Alignment:
Q  94 aaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatca 193  Q
    ||||||||||| || ||  |||||||||||| |||||| || | ||||||| | |||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||||  |||||    
T  30211581 aaaaacacatggtctccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttatcacggtaactcttttgtctactctgcgacgctttcatcttttctctaatca 30211482  T
Q  194 tcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccata 293  Q
     ||||||||| || ||||| | ||| | ||  |  |||| ||  |   || ||||   ||||||| ||||||||||| | || || || |||||||||||    
T  30211481 acttaaccttctcagtagtctgttgaataatgtatggtcttagtactacactctcattggactcataccaacacaacagagttctgcatctccgaccata 30211382  T
Q  294 caaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctcc 393  Q
    ||| |  || ||||||| ||||||||| |||| |||  |||| || |||||||| ||||| | ||| || | |      |||||| |  | ||||||||     
T  30211381 caacgtttcgaacggtgccattccaatgctagaatggtaactgttattgtaagtgaactcgaccaatggaagatgactatcccaagttcccccttgctca 30211282  T
Q  394 aaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttc 493  Q
    |  |||||| |||||||||| || |||||   |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||  | |||||||| ||||| ||||  |    
T  30211281 agtacacaaactctcaacaagtcctccaacgactgaattgtcctctccgtctgtccatctgtctgcggatgatacaccgaactcaaactcaacttagaac 30211182  T
Q  494 ccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    |||| ||  | |||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||| ||| || ||||||||    
T  30211181 ccaacgcctcctgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatccctatctgatacaatact 30211115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 426 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 21145373 - 21145221
Alignment:
Q  426 ctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaattta 525  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| || || ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||||||| |||||||||| | ||||||| ||    
T  21145373 ctgaattgtcctctctgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaacttttccaaaatcta 21145274  T
Q  526 gaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||| || || ||||| | |||||||||    
T  21145273 gaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaa 21145221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 361
Target Start/End: Original strand, 23087190 - 23087496
Alignment:
Q  55 ttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactct 154  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||| || | || |||||||||||||| || ||  ||||||||||||   ||||||| | ||| |||||||||||||    
T  23087190 ttcaaggcacgaccaacacctgtcacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggacctttctacacttgtcatgataactct 23087289  T
Q  155 tctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccgga 254  Q
    |||||| |||||  ||| | ||||| || |||   ||||  |||||||||||  |||| |   | ||||  || ||||| ||||   || | || || ||    
T  23087290 tctgtcgactctacgacgctttcatcttctctcttatcaatttaaccttttcaatagtctgacgaacaatatctggtcccaacattacactttcacccga 23087389  T
Q  255 ctcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactca 354  Q
    |||||||||||| ||||| || |  |||||||||||||||||||| || || |||| ||| |||||| | | |||  |||| |||||||| || |||||     
T  23087390 ctcaaaccaacataacggagttccgcacctccgaccatacaaagcttcgaatggtgccataccaatagtcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactct 23087489  T
Q  355 atcaacg 361  Q
    |||||||    
T  23087490 atcaacg 23087496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 433 - 577
Target Start/End: Original strand, 24948707 - 24948851
Alignment:
Q  433 gtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaa 532  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||  | |   |||| ||| |||||||||||| ||| ||| || |||| |    
T  24948707 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacatcgaaaccaatgcatcttgcaaactcttccagaatctataagtga 24948806  T
Q  533 acctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgca 577  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||| || |||| ||||||||    
T  24948807 acctcggatccctatctgatacaatactcgacggtacaccatgca 24948851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 20442827 - 20442696
Alignment:
Q  444 ctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcc 543  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || |||||     
T  20442827 ctgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 20442728  T
Q  544 cgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
    | ||| || ||||| || ||||| | ||||||    
T  20442727 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 20442696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 406 - 560
Target Start/End: Original strand, 20828350 - 20828504
Alignment:
Q  406 ctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagctt 505  Q
    |||||||||||||||||    ||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||  | |    
T  20828350 ctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcct 20828449  T
Q  506 gcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    | ||||| | ||| ||  ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  20828450 gtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatact 20828504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 427 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 21125488 - 21125355
Alignment:
Q  427 tgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttag 526  Q
    ||||| || ||||| | ||||||||| || || ||||| ||||  |||||||| ||||| || |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||| | |    
T  21125488 tgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagtcgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatcttg 21125389  T
Q  527 aagtaaacctcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    |||| ||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  21125388 aagtgaacctcggatctctatctgacacaatact 21125355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 575
Target Start/End: Original strand, 24641874 - 24642002
Alignment:
Q  447 accatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccga 546  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |  |||||  || |||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||| | | |    
T  24641874 accatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaagtcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggacctcta 24641973  T
Q  547 tccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
    ||||||| |||||| || |||| ||||||    
T  24641974 tccgacataatactcgacggtacaccatg 24642002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 578
Target Start/End: Original strand, 16923018 - 16923152
Alignment:
Q  444 ctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcc 543  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || |||||     
T  16923018 ctgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 16923117  T
Q  544 cgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    | ||| || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  16923118 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 16923152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 21906635 - 21906549
Alignment:
Q  275 tcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacg 361  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| |||||||   || || ||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  21906635 tcctacacctccatcaatacaaagccttaaacggttcaataccgatattagaatgaaaactattgttccaagtaaactcaatcaacg 21906549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 433 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 24877074 - 24876965
Alignment:
Q  433 gtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaa 532  Q
    |||||||| | ||||||||| || || ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  24877074 gtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatgtagaagtaa 24876975  T
Q  533 acctcggatc 542  Q
    | || |||||    
T  24876974 atcttggatc 24876965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 27368452 - 27368391
Alignment:
Q  138 cttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaa 199  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||    
T  27368452 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaa 27368391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 578
Target Start/End: Original strand, 16925479 - 16925623
Alignment:
Q  434 tcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaa 533  Q
    ||||||| | ||||||||| || || ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  16925479 tcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 16925578  T
Q  534 cctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
     || ||||| | ||| || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  16925579 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 16925623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 157
Target Start/End: Original strand, 24654067 - 24654187
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||| | || || || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||   |||| || |    
T  24654067 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcaagtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 24654166  T
Q  137 tcttatcatgataactcttct 157  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  24654167 gcttatcatgataactcttct 24654187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 165
Target Start/End: Original strand, 14708882 - 14708937
Alignment:
Q  110 caacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactc 165  Q
    |||||||||| | |||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14708882 caacttgaaattaaatacctttcctccgcttatcatgataactcttctgtctactc 14708937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 461; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 461; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 4083 - 3515
Alignment:
Q  13 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 112  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||    
T  4083 acatcaaacggtccaactaaacgaggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcactcttaaaaacacatgatcatcaa 3984  T
Q  113 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 212  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  3983 cctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagt 3884  T
Q  213 ttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtc 312  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3883 ttcttgcacaacttccaggcctaacaaagcactctctctggattcaaaccaacacaatggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgcc 3784  T
Q  313 attccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 412  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3783 ataccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 3684  T
Q  413 aatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaact 512  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3683 aatcctccaaactctgaatagtcctttctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaact 3584  T
Q  513 ctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3583 ctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaatct 3515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 446; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 595 - 26
Alignment:
Q  12 gacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcacca 111  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  595 gacatcaaacgttccaacaaaacgaggagtcaacttcctacactccaaagcacggccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgagcacca 496  T
Q  112 acttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtag 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  495 acttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtag 396  T
Q  212 tttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgt 311  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  395 tctctttcacaacttccggtcctaacaaagcactttcaccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaatggtgc 296  T
Q  312 cattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaac 411  Q
    |||||| |||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  295 cattccgatacaagaatgaaaattgttgttgtaagtaaactcaatcaatggtaaacattcgtcccaactaacaccttgctccaaaacacaagttctcaac 196  T
Q  412 aaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaac 511  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  195 aaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaac 96  T
Q  512 tctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  95 tctcccaaaacttagaagtaaacctcggatctcgatctgacacaatactagaaggaataccatgcaatct 26  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 385 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 4935 - 4742
Alignment:
Q  385 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 484  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |    |||||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||| ||    
T  4935 ccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatccca 4836  T
Q  485 atttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    | ||||  ||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  4835 acttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 4742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 435; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 435; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 33203 - 32640
Alignment:
Q  13 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 112  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33203 acatcaaacaatccaacaaaacgaggagtcaacttcttacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggtttcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 33104  T
Q  113 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33103 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaaccttttccgtagt 33004  T
Q  213 ttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtc 312  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |    
T  33003 ttcttgcacaacttctgggcctaacaaagca--ctctccggactcaaaccaacacaacggtgttctacacctcctaccatacaaagccttaaatggtgcc 32906  T
Q  313 attccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 412  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  32905 ataccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaaccaacggtaaacattcgtcccacctaacaccttgctccaacacacaagatctcaaca 32806  T
Q  413 aatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaact 512  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  32805 aatcttccaaactttgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaactttgttcccaaagcagcttgcaaact 32706  T
Q  513 ctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32705 ctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacataatactagaaggtataccatgcaa 32640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Original strand, 229148 - 229487
Alignment:
Q  20 acggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaa 119  Q
    |||| |||||||| |  |||||||||||| |  ||||||| ||||| || || || || | |||| | || |||||||| |||||||| ||  |||||||    
T  229148 acggaccaacaaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtcccacaccagtaataggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaa 229247  T
Q  120 ctcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgc 219  Q
     ||||  || ||||| |  |||||||| |||||||| |||| |||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||     
T  229248 ttcaaggtcttttctacgtttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttga 229347  T
Q  220 acaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaa 319  Q
    ||||  || |||||||| |   || | || || |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||    
T  229348 acaatctctggtcctaaaaccacactttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaaacctcataaggtgccattccaa 229447  T
Q  320 tactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaa 359  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  229448 tactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaa 229487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 219601 - 219096
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||| || |||||  |  ||||||||||||  || || || |    
T  219601 ggagtcaacttctttgacttcaacgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatcttcttcttgaaactcaaggtctttcctac 219502  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || | ||| ||||||||    
T  219501 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacgatttctggtcctaa 219402  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   || |||| || ||||  |||||||||||||| || || ||||| |  |||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||     
T  219401 aaccacactctcacctgacttgaaccaacacaacggagttctgcaccttcttccattcaaaacctcaaatggtgccattccaatactagaatgataactg 219302  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || ||||| || || || || ||||| | |   |  |||||| |  | |||||||| |  |||||| |||||||||| || || ||    ||||| || |    
T  219301 ttattgtacgtgaattctataaacggaagatgattatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctctaacgaatgaatcgttc 219202  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||  | ||||||||| ||||| ||||| ||  | |||||||| ||||| ||||  || |||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  219201 tcttcgactgaccatctgtctgcggatgataccccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacct 219102  T
Q  537 cggatc 542  Q
     |||||    
T  219101 tggatc 219096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 425; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 425; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 581
Target Start/End: Original strand, 14755 - 15322
Alignment:
Q  13 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14755 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaa 14854  T
Q  113 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||    
T  14855 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataacttttctgtctactctgagacaccttcatcttctcctaaatcatcttaaccttttccgtagt 14954  T
Q  213 ttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtc 312  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||      
T  14955 ctcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactctctccggactcaaacc-acacaacggtgtcctacacctcctaccatacaaaacctcaaacggtgct 15053  T
Q  313 attccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 412  Q
    ||  | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  15054 atatcgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcatcccaactgacaccttgctccaacagacacgctctcaaca 15153  T
Q  413 aatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaact 512  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15154 aatcttctaaactctgaatagtcctctccgtctgcccattggtctgaggatggtaagcagaactcaacctcaacttagttcccaaggcagcttgcaaact 15253  T
Q  513 ctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  15254 ctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaagaaataccatgcaatct 15322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 581
Target Start/End: Original strand, 43636 - 44204
Alignment:
Q  13 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43636 acatcaaatggtccaacaaaacgaggagtcaatttcctacactttaaagcacgaccaactacggttacaggattcaccgtcaaaaacacatgatcaccaa 43735  T
Q  113 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 212  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  43736 gttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttatgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagt 43835  T
Q  213 ttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtc 312  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  43836 ctcttgcacaacttccggtcctaataaagcactttctccggactcaaaccaacacagcggtgtcatacacctcctaccatacaaagcctcaaacggtgcc 43935  T
Q  313 attccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 412  Q
    || |  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  43936 atactgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaatggtaaacattcgtcccaactaacacactgctccaaaacacaagctctcaaca 44035  T
Q  413 aatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaact 512  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44036 aatcttctaaactctgaatagtcctctccatctgcccatcggtataaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaact 44135  T
Q  513 ctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44136 ctcccaaaacttagaagtaaacctcggatccagatccgacacaatactagaaggaataccatgcaatct 44204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 425; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 425; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 28474 - 27906
Alignment:
Q  13 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28474 acatcaaacggtccaacaaatcgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccta 28375  T
Q  113 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 212  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28374 cttgtaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactttgagatgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 28275  T
Q  213 ttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtc 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  28274 ttcttgcacaactttcggtcctaacaaagcactttcacctgactcaaaccaacacaatggtgtcctacaccttctaccatacaaagcctcaaacggtgtc 28175  T
Q  313 attccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 412  Q
    || || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28174 ataccgatactagcatgaaaattgttgttgtaagtaaactcaatcaacagtaaacattcgtcccaactaacaccttgcaccaaaacacaagctctcaaca 28075  T
Q  413 aatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaact 512  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  28074 aatcctccaaactctgaatagtcctctccgtctgcccatcggtctggggatggtaagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagcagcttgtaaact 27975  T
Q  513 ctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27974 ctcccagaacttagaagtaaacatcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaatct 27906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 421; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 520
Target Start/End: Original strand, 98112 - 98620
Alignment:
Q  12 gacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcacca 111  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  98112 gacatcaaacggcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcataggattcacccttaaaaacacgtgatcacca 98211  T
Q  112 acttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtag 211  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  98212 acttgaaactcaatatccttactcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtag 98311  T
Q  212 tttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgt 311  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  98312 tttcttgcacaacttctggtcctaacaaaacactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaaacctcaaacggtac 98411  T
Q  312 cattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaac 411  Q
    ||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  98412 cataccgatactagcatgaaaactgttgttgaaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaac 98511  T
Q  412 aaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaac 511  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  98512 aaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaac 98611  T
Q  512 tctcccaaa 520  Q
    |||||||||    
T  98612 tctcccaaa 98620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 23674 - 23545
Alignment:
Q  13 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 112  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23674 acatcaaacggtccaataaaatggggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 23575  T
Q  113 cttgaaactcaatatcctttctcctcttat 142  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23574 catgaaactcaatatcctttctcctcttat 23545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 139 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 116987 - 116584
Alignment:
Q  139 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaaca 238  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||  || | ||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||  || || | ||  ||||| || |    
T  116987 ttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttggatcaacttaaccttctcagtagtttgctgaacgatttatggtcccaaaa 116888  T
Q  239 aagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactatt 338  Q
       || |||| || ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||    
T  116887 ctacactctcacctgactcgaaccaacacaacagagtcctacacctccgaccatacagaacttcaaatggtgtcattccaatactagaatgataactgtt 116788  T
Q  339 gttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctc 438  Q
     ||||| || ||||| |||||||| | |       ||||| |  | |||||||| |  |||||| |||||||||| || |||||   | |||| || ||     
T  116787 attgtacgtcaactctatcaacggaagatgactaacccaagttcctccttgctctagtacacaaactctcaacaagtcctccaacgacggaatcgttctt 116688  T
Q  439 tctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcg 538  Q
    |  | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||  || |||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  116687 ttcgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcg 116588  T
Q  539 gatc 542  Q
    ||||    
T  116587 gatc 116584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 417; Significance: 0; HSPs: 8)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 106781 - 106213
Alignment:
Q  13 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  106781 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacactttaaagcaggaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 106682  T
Q  113 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  106681 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataaatcttatgtctactctgagatgctttcatcttctcctgaatcatcctaaccttttccgtagt 106582  T
Q  213 ttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  106581 ttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactttctctggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccaaccatacaaagcctcaaacggagcc 106482  T
Q  313 attccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 412  Q
    || || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  106481 ataccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgataccttgttccaacacacaagctctcaaca 106382  T
Q  413 aatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaact 512  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  106381 aatcctccaaactctggatagtcctcttcgtctgcccatcggtctggggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcagact 106282  T
Q  513 ctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  106281 ctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaataacatgcaatct 106213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Original strand, 43279 - 43817
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  43279 gtcaacttctttgacttcaaagcacgccctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctgcact 43378  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||| || ||| | ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  43379 tatcatggtaactcttttgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 43478  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | || || ||||||||||| |||||||| || || || |||||| |||| |||||||| || |||| |||||||||||||| |||| | |||||     
T  43479 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaacatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 43578  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    |||||||| ||||| |||||||| | |      ||||||    | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  43579 ttgtaagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagctcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagtgactgaattgtcctct 43678  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  43679 ccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 43778  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| ||||| || || ||||| | |||||||||    
T  43779 atctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaa 43817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 50698 - 50371
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| || | || || ||||| || || || |||| |||| | || ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||  ||||| || |    
T  50698 ggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctac 50599  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| | |||| | |||||||||| |||||| ||| | |||||   ||||   || | |||||||||||||||||||| ||| || |  || ||||| ||    
T  50598 gcttgttatgacagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatccgttctcttattaacttaaccttttccgtagtttgttgaactatgtctggtcccaa 50499  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    ||   || | || || ||||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||| | |||  |||||    
T  50498 catcacactttcccccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaccatacaaggcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaacta 50399  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 364  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50398 ttgttgtaagtaaactctatcaacggta 50371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 117 - 362
Target Start/End: Original strand, 8687 - 8932
Alignment:
Q  117 aaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttct 216  Q
    |||||||| ||| ||||| |  ||||| ||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||||||||||| ||| || || ||||| |      
T  8687 aaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtctgc 8786  T
Q  217 tgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattc 316  Q
    || ||||  ||||||||||| |   |  | || ||  |||| ||||| |||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || |||| |||||    
T  8787 tgaacaatctccggtcctaagaccactctttcacctaactcgaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattc 8886  T
Q  317 caatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacgg 362  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  8887 caatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacgg 8932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 444 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 50291 - 50193
Alignment:
Q  444 ctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatc 542  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||| |||| ||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  50291 ctgaccatccgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgagcccaaagcatcttggaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatc 50193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 253 - 362
Target Start/End: Original strand, 15285 - 15394
Alignment:
Q  253 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaact 352  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||| || ||||    
T  15285 gactcgaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaact 15384  T
Q  353 caatcaacgg 362  Q
    | ||||||||    
T  15385 cgatcaacgg 15394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 426 - 542
Target Start/End: Original strand, 15447 - 15563
Alignment:
Q  426 ctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaattta 525  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||| || || ||||| || || |||||||||||||| || | |||||||||  |||||||||| | ||||||| ||    
T  15447 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgatcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 15546  T
Q  526 gaagtaaacctcggatc 542  Q
    |||||||| || |||||    
T  15547 gaagtaaatcttggatc 15563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #8
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 426 - 542
Target Start/End: Original strand, 8985 - 9101
Alignment:
Q  426 ctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaattta 525  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||| || || ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| ||    
T  8985 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 9084  T
Q  526 gaagtaaacctcggatc 542  Q
    |||||||| || |||||    
T  9085 gaagtaaatcttggatc 9101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 413; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 14944 - 14377
Alignment:
Q  13 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 112  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14944 acatcaaacagtccaacaaa-cgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacactggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 14846  T
Q  113 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 212  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14845 cctgaaattcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 14746  T
Q  213 ttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  14745 ttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcgctttctccggattcaaaccaacacaacggtgttctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggagcc 14646  T
Q  313 attccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 412  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14645 attccgatagtagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcatcggtaaacattcatcccaactgacaccttgctccaacacacaagctctcaaca 14546  T
Q  413 aatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaact 512  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  14545 aatcctccaaactctgaatagtcctctccgtctgcccatcggtctgagaacggtaagcagaactcagtctcaacttagtttccaaagcagcttgcaaact 14446  T
Q  513 ctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14445 ctcccagaacttagaagtaaacctcggatcacgatctgacacaatactagaaggaataccatgcaatct 14377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 413; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 4152 - 3584
Alignment:
Q  13 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4152 acatcaaatggtccaacaaaacgaggagtcaaattcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccaaattcactctcaaaaacacatgatcaccaa 4053  T
Q  113 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 212  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  4052 cctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttatgtctactttgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaacctttttcgtagt 3953  T
Q  213 ttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtc 312  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  3952 ctcttgcacaacttccggtcttaacaaagcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggagcc 3853  T
Q  313 attccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 412  Q
    || || ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3852 atgccgatactagaataaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaatggtaaacattcgtcccaacttacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 3753  T
Q  413 aatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaact 512  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  3752 aatcctccaaactctgattagtcctttttgtctgcccatctgtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttccgaaagtagcttgcaaact 3653  T
Q  513 ctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3652 ctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccaacacaatactagaaggaataccatgcaatct 3584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 407; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 9096 - 8530
Alignment:
Q  16 tcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaactt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  9096 tcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttccgacacttcaaagcacgaccaacaccggtgacatgattcaccctcaaaaacagatgatcaccaacct 8997  T
Q  116 gaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttc 215  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8996 gaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtctc 8897  T
Q  216 ttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcatt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8896 ttgcacaacttccggtcctaacaaagcactttcttcggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaactgtgtcatt 8797  T
Q  316 ccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaat 415  Q
    || ||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8796 ccgatattagtatgaaaactgtttttgtaagtaaactcaatcaacggaaaacattcgtcccatatgacaccctgctccaaaacacaagctctcaacaaat 8697  T
Q  416 cttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggt-aagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactct 514  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  8696 cttctaaactctgaatagtcctctctgtgtgcccatcggtctgaggatggtaaagcagaacccaacctcaacgtagttcccaaagcagcttgcaaactct 8597  T
Q  515 cccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  8596 cccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactataaggaataccatgcaatct 8530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 399; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 578
Target Start/End: Original strand, 3256 - 3821
Alignment:
Q  12 gacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcacca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3256 gacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaataccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcacca 3355  T
Q  112 acttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtag 211  Q
    || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||    
T  3356 acctgaaactcgatgtcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccatag 3455  T
Q  212 tttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgt 311  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  3456 tctcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactttctcctgattcaaactaacacaacggtgtcttacatcttcgaccatacaaagcctcaaacggtgc 3555  T
Q  312 cattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaac 411  Q
    ||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3556 cataccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaaaggtaaacatttgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaac 3655  T
Q  412 aaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaac 511  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3656 aaatcctctaaactcggaatagtcctctctgtttgcccatcggtctg-ggatgataagcagaactcaacgtcaacttagttcccaaagcagcttgcaaac 3754  T
Q  512 tctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  3755 tctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatcttacacaatactagaaggaataccatgcaa 3821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 399; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 578
Target Start/End: Original strand, 13005 - 13571
Alignment:
Q  12 gacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcacca 111  Q
    ||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  13005 gacataaaaaggaccaaaaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacagggttcactctcaacaacacatgatcacca 13104  T
Q  112 acttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtag 211  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13105 acctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttggatcattttaaccttttccgtag 13204  T
Q  212 tttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgt 311  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  13205 tctcttgcacaacttccggtcctaacaaggctctctctccggattcaaaccaacacaatggtgtcctacacctctgaccatacaaagcctcaaacggtgc 13304  T
Q  312 cattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaac 411  Q
    ||| || ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13305 cataccgatactagaatgaaaactgttgttgtaggtaaactcaatcaacggtaaacattcgacccaaataacaccttgctccaacacacaagctctcaac 13404  T
Q  412 aaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaac 511  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  13405 aaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtttgcccatcggtatgaggatggtaagcagaactcaatctgaacttagttcccaaagcagcttgcaaac 13504  T
Q  512 tctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13505 tctcccaaaacttagaagtaaatctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaa 13571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 391; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 1262 - 700
Alignment:
Q  13 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  1262 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttccgacacttcaaagcacgaccaacaccagtcacaggattcactctaaaaaatacatgatcgccaa 1163  T
Q  113 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 212  Q
    |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  1162 ccagaaactcaatatcttttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttggaccatcttaaccttttccgtagt 1063  T
Q  213 ttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtc 312  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1062 ctcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactttcacctaactcaaaccaacacattggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgcc 963  T
Q  313 attccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 412  Q
    ||||  ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||    
T  962 attctgatacttgtatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtagacattcgtcccaactgacactttgctccaaaacgtaagctcttaaca 863  T
Q  413 aatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaact 512  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  862 aatcttccaaactctaaatagtcctctctgtttgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaact 763  T
Q  513 ctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  762 ctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaagaaataccatg 700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 378; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 100 - 581
Target Start/End: Original strand, 25991 - 26472
Alignment:
Q  100 acatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || || |||||||||||||    
T  25991 acatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactatgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaa 26090  T
Q  200 ccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagc 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26091 ccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccaaacaaagcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagc 26190  T
Q  300 ctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaaca 399  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||    
T  26191 ctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaattcgatcaacggtaaacattcgtcccaacagacatcttgttccaacaca 26290  T
Q  400 caagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaag 499  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26291 caagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaagttagttcccaaag 26390  T
Q  500 cagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26391 cagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcagatcctgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaatct 26472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 53 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 21839 - 21332
Alignment:
Q  53 acttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 152  Q
    ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||||| ||| ||||| | |||  ||||||||||||   ||||||||| ||| ||||| |||||    
T  21839 acttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatggttaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaact 21740  T
Q  153 cttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccg 252  Q
    |||||||| |||||| ||| | ||||| |||||    |||||||| || || || ||||| |  || || |  |||||||| |||| | ||  | ||||     
T  21739 cttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaagtccggtcccaacacaacacccactcct 21640  T
Q  253 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaact 352  Q
    ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  |||| |||||||| || ||||    
T  21639 gactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaact 21540  T
Q  353 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatc 452  Q
    | ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  |||||| |||||| ||||||   || || ||| |||| | |||||| ||    
T  21539 ctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctccaaagattgtatcgtcgtctccgactgaccgtc 21440  T
Q  453 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgac 552  Q
     || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||| ||||||| |||| ||| ||| ||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  21439 tgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgac 21340  T
Q  553 acaatact 560  Q
    ||||||||    
T  21339 acaatact 21332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 373; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 581
Target Start/End: Original strand, 23978 - 24546
Alignment:
Q  13 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 112  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||    
T  23978 acatcaaacggtctaacaaaacaaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcaccggattaactctaaaaaacacatgatcaccaa 24077  T
Q  113 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 212  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | || || || || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  24078 cctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactttgagatgctttaatcttctcctgaatcatcttaaccttttccatagt 24177  T
Q  213 ttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtc 312  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24178 ctcttggacaacttctggtcctaacaaagcactctcacttgactcgaactaacacaacggtgtcctacacctctgaccatacaaagcctcaaacggtgtc 24277  T
Q  313 attccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 412  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24278 attccgatactagaatgaaaattattgttgtaagtaaactctaccaaaggtaaacattcatcccaactaacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 24377  T
Q  413 aatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaact 512  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  24378 aatcttccaaactctggatagtcctctccgtctgcccatcagtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaaattaattcccaaagcagcttgcaaact 24477  T
Q  513 ctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
    ||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  24478 ctcccaaaactgagaagtgaaccttggatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatggaatct 24546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 20 - 577
Target Start/End: Original strand, 231663 - 232219
Alignment:
Q  20 acggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaa 119  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |  || ||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  231663 acggtccaacaaaacgaggtgtcaacttccgacacttcaaagcacgtccaacacatgttacatgattcactctaaaaaacacatgatcaccaacctgaaa 231762  T
Q  120 ctcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgc 219  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||   ||| ||  ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  231763 ctcaatgtccttccgcctcttatcatgataactcttctgcttactctaagacactcccatcttcccttgaatcatcttaaccttatccttagtctcttgc 231862  T
Q  220 acaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaa 319  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||| | || || |||||| ||||||| || ||  |  ||||||| | |||||||||| ||| |||||||| ||| || |    
T  231863 acaacctccggtcctagcaatgcactttcacctgactcataccaacaaaa-ggaattttacaccttctaccatacaaaaccttaaacggtgccatcccga 231961  T
Q  320 tactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttc 419  Q
    |||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||     
T  231962 tactagaatgaaaactattattataattaaactcaatccacggtaaaaattcgacccaactgacaccttactccaaaatacaagctctcaaaaaatattt 232061  T
Q  420 caaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaa 519  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  232062 caaactctgaatagtcctctccgtctgcccatcactctggggatgataagcagaactcaaccttaacttagttcccaaagcagcttgcaaactcttgcaa 232161  T
Q  520 aatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgca 577  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  232162 aatatagaagtaaacctcggatctcgatctgacacaatactagatggaataccatgca 232219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 363; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 575
Target Start/End: Original strand, 7274 - 7828
Alignment:
Q  21 cggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaac 120  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  7274 cggtccaacaaaacggggagtcaacttcctacgcttcagagcacgaccaacaccggtcacatgattcgctctcaagaacacatgatcaccaacctgaaat 7373  T
Q  121 tcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgca 220  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||   |||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  7374 tcaatgtccttcctcctcttatcatgataacttttctacgtactctaagacactttcatcttctcttgaatcatcttctctttttccgtagtttcttgca 7473  T
Q  221 caacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaat 320  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  7474 caacttccggtcctaacaaagcactttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagtctcaaacggtgccattccaat 7573  T
Q  321 actagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttcc 420  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7574 actagaatgaaaattgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgataccttgctccaagacacaagctctcaacaaatcttcc 7673  T
Q  421 aaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaa 520  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7674 aaactctgaatagtcctctcggtctgcccatctgtctggggatgataagcagaactcaatctcaaattagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaa 7773  T
Q  521 atttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
    |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7774 acatagaagtaaacctcggatccggatccgacacaatactagaaggaataccatg 7828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 355; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 578
Target Start/End: Original strand, 9084 - 9649
Alignment:
Q  12 gacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcacca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  9084 gacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaaattccaacacttcaaagcacgaccaacaccagttacatgattcactctcaagaatacatgatcacca 9183  T
Q  112 acttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtag 211  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9184 acctgaaactcaatatcctttctcatcttatcatgatagctcttctatctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttctgtag 9283  T
Q  212 tttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgt 311  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  9284 tctcttgcacaacttcctgtcctaacaaagcactttcacctgactcaaaccaacacaacggtaacctacatcttcgaccatacaaagcctcaaacggtgt 9383  T
Q  312 cattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaac 411  Q
    |||  | ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||     
T  9384 catcgcgatactagaatgaaaactgttgttataagtaaactaaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacactttgctctaacacacaagctctcaaa 9483  T
Q  412 aaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaac 511  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||    
T  9484 aagtcttccaaactctgaatagtcctctctgtttgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacatagtt-ccaaagaagcttgcaaac 9582  T
Q  512 tctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    | ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  9583 tttcccaaaacatagaagtaaacctcagatcccgatccgacacaatactggaaggaataccatgcaa 9649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 133 - 581
Target Start/End: Original strand, 180142 - 180590
Alignment:
Q  133 ctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtc 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  180142 ctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgacttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttgcggtc 180241  T
Q  233 ctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaa 332  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  180242 ctaacaaaacactttctccggactcaaaccaacacaatggtgtcctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagaatgaaa 180341  T
Q  333 actattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaata 432  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  180342 actgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactaacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttctaaactctgaata 180441  T
Q  433 gtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaa 532  Q
    |||||||   |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||    
T  180442 gtcctcttcctctgcccatcggtctgaggatggtaagcataactcatcctcaacttagttcccaaagcagcttttaaactctcccagaacttagaagtaa 180541  T
Q  533 acctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  180542 acctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatgcaatct 180590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 122158 - 121796
Alignment:
Q  13 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 112  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  122158 acattaaatggtccaacaaaatgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatcaccaa 122059  T
Q  113 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||| ||||||||||||||| |    
T  122058 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatgttaaccttttccgtaat 121959  T
Q  213 ttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtc 312  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || | || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  121958 ttcttgcacaacttccgttcctaacaaaacactttccccggattcaaaccaacacaacggtgttctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggagcc 121859  T
Q  313 attccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcc 375  Q
    | ||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  121858 aatccgatactagaatgaaaattgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcc 121796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 26717 - 26177
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| | |||||||| || || ||||| || ||||||||| | || |||||||| || ||||| ||  | || |||||||  || || || |    
T  26717 ggagtcaacttctttcacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtaactctcaaaaatacgtgatctccttcctggaactcaaggtctttcctac 26618  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||||||||| |||||||| |||| |||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||| ||   |||||||    
T  26617 gcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttattgtcctaa 26518  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   || |||| ||  |||| |||||||||||||| || || ||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||     
T  26517 aaccacactctcacctaactcgaaccaacacaacggagttctgcaccttcttccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatgctagaatgataactg 26418  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || ||||| || ||||| |||||| | | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| |||||||||| ||||||||   |||||| ||      
T  26417 ttattgtacgtgaactctatcaacagaacatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcttccaataactgaatcgttt 26318  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    | || | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||  || |||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  26317 tttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacct 26218  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgca 577  Q
    |||||| | ||| || ||||| || ||||| | ||||||||    
T  26217 cggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgca 26177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 195886 - 195348
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||   |||| || |    
T  195886 ggagtcaacttcctagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaa-acatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 195788  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| |||||||||||||||||||  ||||  ||| | ||||| || |||   |||||||| || || || ||||| |  || || |  |||||||| ||    
T  195787 gcttgtcatgataactcttctgtcgtctctacgacgctttcatcttctctatgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaagtccggtcccaa 195688  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || ||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  ||||     
T  195687 cacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatataaagcttcgaacggtgccataccaatactcggatggtaactg 195588  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||        ||||||    ||||||||||    |||||  ||||||  ||||| | ||||   || || ||||    
T  195587 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaggtacacacactctcagtaaatccttcaaagattgtatcgtcc 195488  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |  ||||| |||  ||||||||||| ||||||| | ||||| |||||    
T  195487 tctccgac-gaccatctgtctgaggatggtaagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatgttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacct 195389  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgca 577  Q
    |||||| | ||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  195388 cggatctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgca 195348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 444 - 575
Target Start/End: Original strand, 149099 - 149230
Alignment:
Q  444 ctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcc 543  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||   ||| || |  ||||| ||| |||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  149099 ctgaccatctttctgaggatgataagccgaactcaactccaacttcgaacccaatgcatcttgcagactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatcc 149198  T
Q  544 cgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
    | |||||||| |||||| || |||| ||||||    
T  149199 ctatccgacataatactcgacggtacaccatg 149230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 364
Target Start/End: Original strand, 148881 - 149019
Alignment:
Q  226 tccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactag 325  Q
    |||||||| |||| | || ||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||  || ||||| | ||| |||||||| |    
T  148881 tccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaaggttcgaacggagccataccaatactcg 148980  T
Q  326 catgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggta 364  Q
     |||  ||||  ||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  148981 aatggtaactgctgttgtatgtgaactctatcaatggta 149019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 324; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 581
Target Start/End: Original strand, 14227 - 14804
Alignment:
Q  12 gacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcacca 111  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| || | ||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  14227 gacatcaaacggcccaacaaaacgaggagtcaacttccgacacttcaaagcacgactgactccagttataggattcagtctcaaaaatacatgatcacca 14326  T
Q  112 acttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataa-------ctcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttt 204  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||       ||||||||||||||||||||  | ||||| || |||||| |||||||||| |||    
T  14327 acttgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatggtaagtggtaactcttctgtctactctgagatgctttcattttctcttgattcatcttaactttt 14426  T
Q  205 tccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaa 304  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14427 ttcgtagtttcttgcacgacttccggtcctaacaaagaactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaa 14526  T
Q  305 acggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagc 404  Q
    | || | ||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14527 atggcgccataccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacagtaaacaatcgtcccaactgacagcttgctccaaaacacaagc 14626  T
Q  405 tctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttccc-aaagcagc 503  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||| ||||| ||||  ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  14627 tcttaacaaatcctccaaactctgaatagccctctcgatctgcccatctgtcttgggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaaagcagc 14726  T
Q  504 ttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14727 ttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaaccttgaatcccgatctaacacaatactagaaggaataccatgcaatct 14804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 111 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 1534 - 1064
Alignment:
Q  111 aacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgta 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  1534 aacttgaaactcaatatcctttctcttcttatcatgataactcttctatctactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttccgta 1435  T
Q  211 gtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtg 310  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||| | || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  1434 gtctcttgcacaacttccggtcctaacaaggcactttcacctgactcaaactaacacaacggtgtcctacacctcagtccatacaaagcctcaaacggtg 1335  T
Q  311 tcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaa 410  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1334 tcattccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtgaacttaatcaatggttaacattcgtcccaactgacaccttgctccaacacacaagctctcaa 1235  T
Q  411 caaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaa 510  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  1234 caaatcctccaaactctgaatcgtcctctctgtctgctcatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagtccccaaagcagctttcaaa 1135  T
Q  511 ctctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  1134 ctctcccaaaacttagaagtaaacctcggattccgatttgacacaatactagaagaaataccatgcaatct 1064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 10517 - 10425
Alignment:
Q  13 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatga 105  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10517 acatcaaatggcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacaccggtcacaggattcactctcaaaaacccatga 10425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 2)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 13 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 541 - 1
Alignment:
Q  13 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  541 acatcaaacggtccaacaaaacggggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacactagttacaggattcactctcaagaacacatgatcaccaa 442  T
Q  113 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 212  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||| || ||||||||||||||||| |||||          
T  441 cctgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgataactcttctgcctactctgagatgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttttc------ 348  T
Q  213 ttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtc 312  Q
                   |||||||||||||||| | || || || ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |    
T  347 ---------------cggtcctaacaaagcactttcacctgaatcaaaccaacataaccgcgtcctacaccttcgaccacacaaagcctcaaatggtgcc 263  T
Q  313 attccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 412  Q
    || || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  262 ataccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaatggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaagacacaagctttcaaca 163  T
Q  413 aatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaact 512  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  162 aatctttcaaactctaaatagtcctctcggtctgcctatcggtctgaggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaact 63  T
Q  513 ctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccat 574  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  62 ctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccat 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 37 - 359
Target Start/End: Original strand, 9092 - 9414
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | || |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||  || || || |    
T  9092 ggagtcaacttctttgacttcaacgcacgtccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatccccttcttgaaactcaaggtctttcctac 9191  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||||||||| |||||||| |||| |||||| ||| | ||||| |||||||| || ||||||||||| || | ||||| ||| |||| ||| ||| ||||    
T  9192 gcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggattatcttaaccttctcagcagtttgttgaacaatttctggtgctaa 9291  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |    | |||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||     
T  9292 aaccagactctcacctgaatcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttctaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactg 9391  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaa 359  Q
    || ||||| || ||||| |||||    
T  9392 ttattgtatgtgaactctatcaa 9414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 138 - 578
Target Start/End: Original strand, 71442 - 71882
Alignment:
Q  138 cttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaac 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  71442 cttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaac 71541  T
Q  238 aaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactat 337  Q
    | | || | ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |    
T  71542 acaacactttctccagattcaaaccaacacaacagtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagaatgaaaactgt 71641  T
Q  338 tgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcct 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  71642 tgttgtaagtaaactcaatcaacgacaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcgacaaatcttccaaactctgaatagttct 71741  T
Q  438 ctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctc 537  Q
    ||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  71742 ctccgtctgcccatccgtctgaggatggtaagtagaacccaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccagaaattagaagtaaacctt 71841  T
Q  538 ggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
     ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  71842 agatcccgatccgacacaatactagacggaataccatgcaa 71882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 327 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 33307 - 33053
Alignment:
Q  327 atgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactc 426  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  33307 atgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaacagacaccttgctcagaaacacaagctcttaacaaatcctccaaactc 33208  T
Q  427 tgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttag 526  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  33207 tgaatagtcctctttgtctgcccatcgatctagggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttag 33108  T
Q  527 aagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33107 aagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatgcaatct 33053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 273 - 581
Target Start/End: Original strand, 24332 - 24629
Alignment:
Q  273 tgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcg 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  24332 tgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacgaagacaatccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaccatttg 24431  T
Q  373 tcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcag 472  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||          
T  24432 tcccaactgacacattgctccaaaatgcaaactctcaacaaatcttccaaactatgagtagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggt------ 24525  T
Q  473 aactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtatacc 572  Q
         || ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |  ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  24526 -----aacctcaacttagtgcccaaagcaacttgcaaactctcccaaaatatagaagtaaatcttgggtgtcgatctgacacaatactagatggaatacc 24620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 278
Target Start/End: Original strand, 13361 - 13614
Alignment:
Q  25 ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||| || || ||||||||||| ||||||||||    
T  13361 ccaacaaaacgaggagtcaacttccgacactttaacgcacgaccaacaccagttacaggattaactctcaagaatacgtgatcaccaacctgaaactcaa 13460  T
Q  125 tatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaac 224  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  13461 tatcctttctccttttatcatgatagctcttctatctactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttctgtagtctcttgcacaac 13560  T
Q  225 ttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcct 278  Q
     |||||||||||||| ||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  13561 ctccggtcctaacaaggcactttctctggattcaaaccaacacaacggtgtcct 13614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 6408 - 6529
Alignment:
Q  13 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||    
T  6408 acatcaaacggcccaacaaaacgtggagttaacttccgacactttaacgcacgaccaacaccagttacaggattcactctcaagaatacgtgatcaccaa 6507  T
Q  113 cttgaaactcaatatcctttct 134  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  6508 cctgaaactcaatatcctttct 6529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 16 - 566
Target Start/End: Original strand, 10757 - 11307
Alignment:
Q  16 tcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaactt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  10757 tcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttctaacacttgaaagcacgtccaacaccggttacaaaattcactctcaaaaacacatgatcaccaacct 10856  T
Q  116 gaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttc 215  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |  |||| || ||||||||||||||||| ||||  ||||  ||    
T  10857 gaaactcaatgtccttcctcctcttatcatggtaactcttctgcctactatgagacgctctcatcttctcttgaatcatcttaacattttttgtagcctc 10956  T
Q  216 ttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcatt 315  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||| | || || |||||| ||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||     
T  10957 ttgcacaacctacggtcctaacaacgcactttcacctgactcataccaacacaacagcgttctacacctcctaccatacaaagtctcaaacggtgtcatc 11056  T
Q  316 ccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaat 415  Q
    || ||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11057 ccgatactagaatgaaaattgttgttgtaagtaatctcaatcagcggtaaacattcaacccaactgagaccttgctccaaaacacaagctctcaacaagt 11156  T
Q  416 cttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctc 515  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11157 cttccaaactctgaatggtcctctccatctgcccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagcagcttacaaactctc 11256  T
Q  516 ccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaagg 566  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  11257 ccaaaacttagaagtaaatcttggatctcgatctgacataatactagaagg 11307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 2)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 100 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 26278 - 25957
Alignment:
Q  100 acatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  26278 acatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaa 26179  T
Q  200 ccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagc 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | | || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26178 ccttttccgtagtttcttgcacaacttctagtcctaacaaagaactttcaccggattaaaaccaacacaacggtgtcctacacctcggaccatacaaagc 26079  T
Q  300 ctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaaca 399  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  26078 ctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacatctatcccaactgacaccttgctccaacaca 25979  T
Q  400 caagctctcaacaaatcttcca 421  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  25978 caagctctcaacaaatcctcca 25957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 560
Target Start/End: Original strand, 17877 - 18004
Alignment:
Q  433 gtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaa 532  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |  | ||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  17877 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaactcaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtga 17976  T
Q  533 acctcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    | |||||||| | |||| ||||||||||    
T  17977 atctcggatctctatcccacacaatact 18004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 187 - 581
Target Start/End: Original strand, 2828 - 3208
Alignment:
Q  187 tgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctcc 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2828 tgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcgctttctccggattcaaaccaacacaacggtgttctacacctcc 2927  T
Q  287 gaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacacc 386  Q
     ||||||||||||||||||  | | |||||  ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||              |||||  |||||    
T  2928 taccatacaaagcctcaaaaagagccattctgatagtagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaac--------------ccaacaaacacc 3013  T
Q  387 ttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaat 486  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||     
T  3014 ttgctccaacacacaagctctaaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtctgccgatcggtctgagaatggtaagcagaactcagtctcaac 3113  T
Q  487 ttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3114 ttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatgcaatct 3208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 2)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 263 - 578
Target Start/End: Original strand, 18399 - 18714
Alignment:
Q  263 aacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacgg 362  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18399 aacacaatggtgtcctacacctctgtccatacaaagcctcaaacggtgccatactgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacgg 18498  T
Q  363 taaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgagga 462  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18499 taaacatttgtcccagctgacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaatcttctaacctctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgagga 18598  T
Q  463 tggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactag 562  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  18599 tggtaagcagaactcaatctcaacttagttccgaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacgttggatcccgatccgacacaatactag 18698  T
Q  563 aaggtataccatgcaa 578  Q
    |||| |||||||||||    
T  18699 aaggaataccatgcaa 18714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 131 - 204
Target Start/End: Original strand, 18325 - 18398
Alignment:
Q  131 ttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  18325 ttctcctcttatcatgataactcttctgcctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttt 18398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Original strand, 22791 - 23085
Alignment:
Q  12 gacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcacca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22791 gacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacaaccaacaccggtcacatgattcactctcaaaaacacatgatcacca 22890  T
Q  112 acttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtag 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  22891 acttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagactccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtag 22990  T
Q  212 tttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaac 306  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  22991 tctcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactttcacctgactcaaaccaacacaacggtgtccaacacctcctaccatacaaagccttaaac 23085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 578
Target Start/End: Original strand, 6145 - 6686
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  |||||||||| || ||||| || ||||||||  | || |||||||| || || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  6145 ggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggtgtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctac 6244  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||||||||| |||||||| |||| |||||| ||  | ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||  |  ||||||||    
T  6245 gcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctttggtcctaa 6344  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | || || |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  6345 gaccactctttcaccagactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgtaaggtgccattccaatactagaatgataacta 6444  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || || || || ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| |||||||||| || || |    |||||| ||||    
T  6445 ttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctctagtgactgaatcgtcc 6544  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||  || |||||  | |||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  6545 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcatgcaaacttttccaaaatctagaagtaaacct 6644  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
     ||||| | ||| |||||||| || ||||| | |||||||||    
T  6645 tggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 6686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 245 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 1500 - 1170
Alignment:
Q  245 tctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgta 344  Q
    ||||||| ||||||||||| || || || ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| | |||  |||| ||||||||    
T  1500 tctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccattccaatactcgaatggtaactgttgttgta 1401  T
Q  345 agtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtc 444  Q
     || ||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  ||||||  ||||| ||||||   || || || ||||| | |    
T  1400 tgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctccaaagattgtatcgttctctccgac 1301  T
Q  445 tgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatccc 544  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| || |  ||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  1300 tgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaaccacaacttcgaacccaaagcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacctcggatccc 1201  T
Q  545 gatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
      |||||||| ||||| || |||| ||||||    
T  1200 tgtccgacacgatactcgacggtacaccatg 1170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 16 - 360
Target Start/End: Original strand, 14624 - 14968
Alignment:
Q  16 tcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaactt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  14624 tcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttccgacacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgattcactctcaaaaacacatgatccccaacct 14723  T
Q  116 gaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttc 215  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||  ||||||||||| ||    
T  14724 gaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagactctttcatcttctcttcaatcatcttaaatttttccgtagtctc 14823  T
Q  216 ttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcatt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | || || ||||||||| |||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  14824 ttgcacaacttccggtcctaacaaaacactttcacctgactcaaacaaacacaacgacatcctacacctcggaccatacaaagcctcaaacggtgccata 14923  T
Q  316 ccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaac 360  Q
    || |||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  14924 ccgatacaagaatgaaaactgttgttgtaactaaactcaatcaac 14968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 274 - 578
Target Start/End: Original strand, 8 - 312
Alignment:
Q  274 gtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgt 373  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8 gtcctacacctccgaccatacaaggcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgt 107  T
Q  374 cccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcaga 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||  |||| ||||||||    
T  108 cccaactgacaccttgctccaaaacacaagctcttaacaaatcctcgaaactcttaatagtcctctatgtcttcccatcggtctggcgatgataagcaga 207  T
Q  474 actcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtatacca 573  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  208 actcaatctcaacttagttcccaaagtagcttgcaaactttccaaaaacttagaactaaacctcggatcccgatctgacacaagactagaaggaatacca 307  T
Q  574 tgcaa 578  Q
    |||||    
T  308 tgcaa 312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0551 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0551
Description:

Target: scaffold0551; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 13 - 279
Target Start/End: Original strand, 8193 - 8458
Alignment:
Q  13 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8193 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacatcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcaccctcaaaaatacatgatcaccaa 8292  T
Q  113 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8293 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataagtcttctgtctactctgagacgctttcatattctcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 8392  T
Q  213 ttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtccta 279  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  8393 ctcttgcacaacttccggccctaacaaagcact-tctctggattcaaaccaacacaatggtgtccta 8458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 327 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 9755 - 9506
Alignment:
Q  327 atgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactc 426  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9755 atgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactaacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactc 9656  T
Q  427 tgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttag 526  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9655 tgaatagtcctctccgtctgcccatcggtctgtggttggtaagcagaactcaatctcaactttgtttccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttag 9556  T
Q  527 aagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgc 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9555 aagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgc 9506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 212
Target Start/End: Original strand, 14207 - 14382
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||| |||||||| || || |||| |||| | || |||| |||||||||||| ||  ||||||||||||   |||||||      
T  14207 ggagtcaacttcttcgacttcaacgcacgacctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctat 14306  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 212  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||| ||||||   |||||||| || || ||||||||    
T  14307 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgacattctccgtagt 14382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 319 - 581
Target Start/End: Original strand, 5579 - 5841
Alignment:
Q  319 atactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatctt 418  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  5579 atactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacgataaacattcgtcgcaactgacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaatcct 5678  T
Q  419 ccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctccca 518  Q
    |||||||||||| |||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5679 ccaaactctgaaaagtcctatccgtctgcccatcagtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctccca 5778  T
Q  519 aaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  5779 aaacatagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatggaatct 5841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 3)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 16 - 515
Target Start/End: Original strand, 74001 - 74500
Alignment:
Q  16 tcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaactt 115  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |    
T  74001 tcaaacggtccaacaaaacgtggtgtcaacttccaacacttcaaagcacgtccaacaccggttacaggattcactctcagaaacacatgatcatcaacct 74100  T
Q  116 gaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttc 215  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||  |  || | || |   |||||||||||||||| || || || ||    
T  74101 gaaactcaatatctttcctgctcttatcatgatagctcttatgcctactctgagatgctctcgtcttcttgagaatcatcttaaccttctctgtcgtctc 74200  T
Q  216 ttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcatt 315  Q
     |||| ||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |||     
T  74201 gtgcataacttctagccctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacacaacggcatcctacacctccgaccatacaaagccacaaacaattgcata 74300  T
Q  316 ccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaat 415  Q
    || ||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||| |||||||| || || | ||||     
T  74301 ccgatactagaatgaaaaatgtttttgtaagtaaactcaatcaacggtaaatattcaagtcaactgacaccttgctctaaaacacatgcccttagcaaaa 74400  T
Q  416 cttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctc 515  Q
    | |||||||||||||||||| ||||| | || |||||  | ||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||  |||| | ||||||||| ||||    
T  74401 catccaaactctgaatagtcatctctttttgcccatcattttgaagatgataagcataactcaatctcaattttgttatcaaatctgcttgcaaaatctc 74500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 560
Target Start/End: Original strand, 19242 - 19765
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||| | || || || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||    
T  19242 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccatcctgaaactcaaggtcctttctcc 19341  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||  | ||||| |||||    |||||||| || || || ||||| || || || |  |||||||| ||    
T  19342 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttccctgatcatcttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatccggtcccaa 19441  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     | | || ||| ||| |||||||||||  | || || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||| ||||     
T  19442 tacaacactctatcctgactcaaaccagaataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatgataactg 19541  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| |||||| |||        ||||||    |||||||||| |  |||||  ||||||||||||| |||||    || || |||     
T  19542 ttgttgtatgtgaactctatcaacagtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcg 19641  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| || |  ||||||||  | |||||||||| ||| ||  ||||||| |||||    
T  19642 tctccgactgaccatctgtctgaggatcataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaagtgaacct 19741  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    |||||||| ||| |||||||||||    
T  19742 cggatccctatcagacacaatact 19765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 58536 - 58463
Alignment:
Q  91 ctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctact 164  Q
    |||||||||||||| || ||  |||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||| ||||||||    
T  58536 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaagatccttcctatgcttatcatgataactcttttgtctact 58463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 184; Significance: 3e-99; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 78837 - 78582
Alignment:
Q  13 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  78837 acatcaaaccgtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactcctgtcacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaa 78738  T
Q  113 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| || |  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  78737 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctaatctgagatgccttcatcttctactgaatcatcataaccttttccgtagt 78638  T
Q  213 ttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacaca 268  Q
     ||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  78637 ctcttgcacaactttcgatcctaacaaagcactttctccggattcaaaccaacaca 78582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 113 - 362
Target Start/End: Original strand, 448257 - 448506
Alignment:
Q  113 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 212  Q
    ||||||||||||  || || || | |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  448257 cttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgatagctcttctgtcgactctgcgacactttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 448356  T
Q  213 ttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtc 312  Q
    || ||| |||| ||| ||||  || |   || |||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||| |  ||||||||||||||||| |||| |    
T  448357 ttgttgaacaatttctggtcaaaaaaccacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagttctgcaccttcttccatacaaagcctcaaatggtgcc 448456  T
Q  313 attccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacgg 362  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || ||||| || ||||| ||||||||    
T  448457 attccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacgg 448506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 91114 - 90593
Alignment:
Q  39 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctc 138  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||| || || || |||  |||| | || |||| |||||||||||| ||  ||||||||||||   |||| || | |    
T  91114 agtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcgtaggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgc 91015  T
Q  139 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaaca 238  Q
    || ||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||| ||||||   |||||||| || || |||||||| |  || || |  || ||||| |||     
T  91014 ttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtctgatgaactaaatctggtcccaacg 90915  T
Q  239 aagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactatt 338  Q
       || | ||||| |||||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  |||| ||    
T  90914 ctacactttctcctgactcaaaccaacataaaggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgtt 90815  T
Q  339 gttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctc 438  Q
    |||||| || ||||| |||| ||||| |      ||||||    |||||||||| | ||||||  |||||| |||||| || ||    ||||| ||||||    
T  90814 gttgtacgtgaactctatcagcggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagaacacacactctcagcaaatcctctaatgattgaatcgtcctc 90715  T
Q  439 tctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcg 538  Q
    || | ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    |||||  || |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  90714 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcacacccaagccatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 90615  T
Q  539 gatcccgatccgacacaatact 560  Q
    |||| | |||||| ||||||||    
T  90614 gatctctatccgatacaatact 90593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 444 - 542
Target Start/End: Original strand, 114709 - 114807
Alignment:
Q  444 ctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatc 542  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||| ||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  114709 ctgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacctcggatc 114807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 503 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 89972 - 89915
Alignment:
Q  503 cttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  89972 cttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgatacaatact 89915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 155; Significance: 5e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 1118 - 952
Alignment:
Q  13 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1118 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 1019  T
Q  113 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcat 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  1018 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttatgtctactctgagacgccttcat 952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 364
Target Start/End: Original strand, 219 - 338
Alignment:
Q  245 tctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgta 344  Q
    ||||||| ||||||||||| || || ||  |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| | |||||| | |||  |||  ||||||||    
T  219 tctctcctgactcaaaccagcataaaggattcctgcacctccgaccatataaagcttcgaacggtgccatacaaatactcgaatggtaacggttgttgta 318  T
Q  345 agtaaactcaatcaacggta 364  Q
     || ||||| ||||||||||    
T  319 tgtgaactctatcaacggta 338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 143; Significance: 8e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 171
Target Start/End: Original strand, 10453 - 10611
Alignment:
Q  13 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10453 acatcaaacggtccaacaaaacaaggagtcgacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaaaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 10552  T
Q  113 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagac 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10553 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagac 10611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 171
Target Start/End: Original strand, 5839 - 5997
Alignment:
Q  13 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5839 acatcaaacggtccaacaaaacaaggagtcgacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 5938  T
Q  113 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagac 171  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5939 cttgatactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagac 5997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 171
Target Start/End: Original strand, 8448 - 8606
Alignment:
Q  13 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8448 acatcaaacggtccaacaaaacaaggagtcgacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 8547  T
Q  113 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagac 171  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8548 cttgatactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagac 8606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 132; Significance: 3e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 83 - 389
Target Start/End: Original strand, 21776 - 22072
Alignment:
Q  83 gattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatatt 182  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||    
T  21776 gattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctccttctatcatgataactcttctgtctacactgagacgcctacatctt 21875  T
Q  183 ttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacac 282  Q
     ||||          ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| | || || |||||| |||||||||| ||  | ||||||    
T  21876 ctctt----------aaccttttccgtagtctcttgcacaacctctggtcctaacaaagcactttcacctgactcataccaacacaatggcattctacac 21965  T
Q  283 ctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactga 382  Q
    | || |||||||||||||||||| |||| |||  | ||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21966 cccctaccatacaaagcctcaaatggtgccatatcgatactagaatgaaaattgttgttataagtaaactcaatcaacggtaaacattcgacccaactga 22065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 71
Target Start/End: Original strand, 14061 - 14116
Alignment:
Q  16 tcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaac 71  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  14061 tcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaactttcgacacttcaaagcacgtccaac 14116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 426 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 197273 - 197157
Alignment:
Q  426 ctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaattta 525  Q
    |||||| |||||||| | | ||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||  || |||||  |||||||||||| ||||||| ||    
T  197273 ctgaattgtcctctccgaccgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatcta 197174  T
Q  526 gaagtaaacctcggatc 542  Q
    |||||||| || |||||    
T  197173 gaagtaaatcttggatc 197157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 127; Significance: 3e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 16379 - 16221
Alignment:
Q  13 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  16379 acatcaaacggtccaataaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacaaacaccggtcacaggattcacccttaaaaacacatgatccccaa 16280  T
Q  113 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagac 171  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16279 cttgaaagtctatatccttcctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagac 16221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 55 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 25237 - 24714
Alignment:
Q  55 ttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactct 154  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| | || || | ||||||||| || ||  ||||||| |||| ||| || || |  || || |||||| |||    
T  25237 ttcaaagcacgaccaacacctgtcacaggagtgactcttagaaacacatggtctcctgcttgaaattcaagatctttcctacgtttgtcgtgataagtct 25138  T
Q  155 tctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccgga 254  Q
    |||||| |||||| ||| | ||||| || |||   || | |||||||||||| ||||| |  || ||||  |||||||| ||||   || | || || ||    
T  25137 tctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctcttattagcttaaccttttctgtagtctggtgaacaatatccggtcccaacactacactttcacccga 25038  T
Q  255 ctcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactca 354  Q
    |||||||||||| ||||| || || ||||||||||||| |||||| || || |||||||| | |||||||| |||| |||| |||||||| || |||||     
T  25037 ctcaaaccaacagaacggagttctgcacctccgaccatgcaaagcttcgaatggtgtcatccaaatactagaatgataactgttgttgtacgtgaactct 24938  T
Q  355 atcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcgg 454  Q
    |||||||||| |      |||||| |  |||||||||  |  |||||| ||||||||||||| || ||   ||||||  | ||||| | ||||||||| |    
T  24937 atcaacggtagatgactatcccaagtcccaccttgcttaagtacacaaactctcaacaaatcctctaacgactgaatcattctctccgactgaccatctg 24838  T
Q  455 tctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacac 554  Q
    | |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||||| | ||| |||||    
T  24837 tttacggatgataagccgaactcaacctcaacttagatcccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcaatctgacac 24738  T
Q  555 aatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| || || || | |||||||||    
T  24737 aatgctcgacggaacaccatgcaa 24714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 127; Significance: 3e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 37 - 575
Target Start/End: Original strand, 65527 - 66065
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  65527 ggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacgccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctac 65626  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| |  || ||||  || ||||||||    
T  65627 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaa 65726  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | || || |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  65727 gaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataacta 65826  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |    |||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |    |||||| ||||    
T  65827 ttattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcttccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcttctagcgactgaattgtcc 65926  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    | |||  ||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||    
T  65927 tttctaactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaatttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 66026  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
     ||||||| ||| || |||||||| ||||| | ||||||    
T  66027 tggatccctatctgatacaatactcgaaggaacaccatg 66065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 138 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 39902 - 39463
Alignment:
Q  138 cttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaac 237  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||  || ||||  || ||||||||     
T  39902 cttatcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcctaag 39803  T
Q  238 aaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactat 337  Q
    |   | || || || || |||||||||||| |||| || || || ||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| |||| |||| |    
T  39802 accactttttcacctgattcaaaccaacacgacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtaccattccaatactagaatgataactgt 39703  T
Q  338 tgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcct 437  Q
    | ||||| || || || |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| ||||||||||||| || |    |||||| |||||    
T  39702 tattgtatgtgaaatctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcct 39603  T
Q  438 ctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctc 537  Q
    ||| | |||| |||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||  ||||||||  |||||||||| | | ||||| |||||||||| ||     
T  39602 ctccgactga-catctgtctgtggatgatacgccgaactcaatcttaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttcgaaaatctagaagtaaatctt 39504  T
Q  538 ggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||||| | ||| || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  39503 ggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 39463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1068 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold1068
Description:

Target: scaffold1068; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 109 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 914 - 447
Alignment:
Q  109 ccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  | ||||| ||||| | |||||||||||| |||| |     
T  914 ccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgataaatcttctgcctactctgagatgcattcatcttttcctaaatcatcttaacttttttca 815  T
Q  209 tagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacgg 308  Q
    ||||||  || |||| ||  ||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||     |  | ||    
T  814 tagtttgctgaacaaattttggtcctatcaaagcactctctcccgactcataccaacacaacggcgtcatacacctccttccatacaa-----cgtaagg 720  T
Q  309 tgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctc 408  Q
       |||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||||||||||||   |||||| ||| |||| |||||| ||||||||||     
T  719 atccattccaatactcgaatgaaaactgtt-ttgtaagtaagttcaatgaacggtaaacattcactccaacttacaacttgttccaaagcacaagctctt 621  T
Q  409 aacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgca 508  Q
    | ||||||||| |||  || ||||| | ||||    | |||||| || | || ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  620 agcaaatcttctaaagactaaatagccatctccaattaaccatccgttttagcatgataagcagaactcaatcttaacttagttcccaaagctgcttgca 521  T
Q  509 aactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatctg 582  Q
    |||||||| ||||  |||| || |||||| |||| | ||| |||||| | ||||| || | |||||||||||||    
T  520 aactctcctaaaacatagatgtgaacctcagatctctatcagacacattgctagatggaacaccatgcaatctg 447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 575
Target Start/End: Original strand, 7912 - 8450
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| |||||||| | | | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| || || |    
T  7912 ggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccggtcaccgaagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctac 8011  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| |  || ||||  || ||||||||    
T  8012 gcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaa 8111  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | || |  |||||||||||||||||||| || || || | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  8112 gaccactctttcacttgactcaaaccaacacaacggagttctgcatcaccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataacta 8211  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |    |||||| ||||    
T  8212 ttattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcc 8311  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||    
T  8312 tctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacatcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaaactagaagtaaatct 8411  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
     ||||| | ||| || ||||| || ||||| ||||||||    
T  8412 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaataccatg 8450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 461 - 581
Target Start/End: Original strand, 45043 - 45163
Alignment:
Q  461 gatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45043 gatggtaagcagaattcaatctcaacttagtttccaaagcagcttgcaaactctctcaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatact 45142  T
Q  561 agaaggtataccatgcaatct 581  Q
    |||||| ||| ||||||||||    
T  45143 agaaggaatatcatgcaatct 45163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 106; Significance: 9e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 542
Target Start/End: Original strand, 14482 - 14987
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || |  ||  | |||||||||| |||||| || |    
T  14482 ggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtatccttcctgaaactcaagatccttcctgc 14581  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| |  || ||||  || ||||||||    
T  14582 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaa 14681  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | || |  |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||  ||||    
T  14682 gaccactctttcacttgactcaaaccaacacaacggagttctacatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgatgacta 14781  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |    |||||| ||||    
T  14782 ttattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcc 14881  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||    ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||    
T  14882 tctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcaaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 14981  T
Q  537 cggatc 542  Q
     |||||    
T  14982 tggatc 14987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Original strand, 745 - 1283
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||    
T  745 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgct 844  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||  ||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||| ||| || |   |||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  845 tatggtgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttcttactagtctgctgaacaatctctggtcctaagac 944  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | || || ||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||   |||| |||||||     
T  945 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactttaatgataactatta 1044  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    ||||| || ||||| |||||||| | |      ||| || |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  1045 ttgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcctaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 1144  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || ||| |||| ||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  1145 ccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaattcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 1244  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| |||||||| || ||||| | |||||||||    
T  1245 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 1283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 103; Significance: 6e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 53 - 575
Target Start/End: Original strand, 15015 - 15537
Alignment:
Q  53 acttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 152  Q
    ||||||| || || ||||| || ||||||||| | ||  ||||||| |||||||| ||  | ||||||||||  || || ||   |||||||||||||||    
T  15015 acttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactatcaaaaatacatgatctccttcatgaaactcaaggtctttcctaagcttatcatgataact 15114  T
Q  153 cttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccg 252  Q
    | | |||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||| ||| |||||||| |   || |||| ||     
T  15115 catatgtcgactctgagacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacct 15214  T
Q  253 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaact 352  Q
    ||||| ||||||||||| || || || ||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||| |||| || ||||| || ||||    
T  15215 gactcgaaccaacacaatggagttctgcacttcctaccatacaaagcctcaaatggtgccattccaatactggaatgataactgttattgtacgtgaact 15314  T
Q  353 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatc 452  Q
    | ||||| || | |   |  |||||| |  | |||||||| |  |||||| |||||||||| || | |||   |||||| || ||||| | |||||||||    
T  15315 ctatcaatggaagatgattatcccaagttcctccttgctcaagtacacaacctctcaacaagtccttcaacgactgaatcgttctctccgactgaccatc 15414  T
Q  453 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgac 552  Q
     ||||||||||| || |  |||||||| ||||| ||||  || |||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||     
T  15415 tgtctgaggatgatatgtcgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgat 15514  T
Q  553 acaatactagaaggtataccatg 575  Q
    ||||| || ||||| | ||||||    
T  15515 acaatgctcgaaggaacaccatg 15537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 404 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 113304 - 113130
Alignment:
Q  404 ctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagc 503  Q
    |||||||||||||||| | |  | |||| || ||||||| ||||||||| ||||| |||||  | || |||||||| ||||| ||||  || |||||  |    
T  113304 ctctcaacaaatcttctagagaccgaatcgttctctctgactgaccatctgtctgcggatgacacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctc 113205  T
Q  504 ttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  113204 ttgcaaactcttccaaaatctagaattaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 113130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 578
Target Start/End: Original strand, 6494 - 7035
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  6494 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 6593  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
      |||||||| |||||||| |||| |||||| ||| | ||||| |  |||||||||||||||||||| || |||||||  || ||||  || ||||||||    
T  6594 gtttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctactcttgaatcatcttaaccttctctgtagtttgctgaacaatctctggtcctaa 6693  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | || || || ||||||||||||||| | || || || ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  6694 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacta 6793  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || || || || ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| | |||||||||||||| ||   |||||| ||||    
T  6794 ttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcc 6893  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||  || |||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||    
T  6894 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 6993  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
     ||||| | ||| |||||||| || ||||| | |||||||||    
T  6994 tggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 7035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 433 - 560
Target Start/End: Original strand, 3309 - 3436
Alignment:
Q  433 gtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaa 532  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||| || |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  3309 gtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagacgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtga 3408  T
Q  533 acctcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||    
T  3409 acctcggatctctatccgacacaatact 3436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 275 - 364
Target Start/End: Original strand, 3151 - 3240
Alignment:
Q  275 tcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggta 364  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  |||| || ||||| || ||||| ||||||||||    
T  3151 tcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttcttgtacgtgaactctatcaacggta 3240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 362
Target Start/End: Original strand, 180339 - 180664
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| | ||||| || ||||| ||| | || ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |    
T  180339 ggagtcaacttctttgacttcaaagcaggtccaacaccagtcaccggagtaactctcaaaaacacatgatcaccctcttgaaactcaagatcctttctac 180438  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||| || ||  |||| |  || ||||  || ||||||||    
T  180439 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcaatagtctgctgaacaatatctggtcctaa 180538  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||     
T  180539 gaccactctttctcctgactcaaaccaacacaatggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataactg 180638  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacgg 362  Q
    || ||||| || ||||| ||||||||    
T  180639 ttattgtacgtgaactctatcaacgg 180664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 434 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 101339 - 101213
Alignment:
Q  434 tcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaa 533  Q
    ||||||||| |||||||||  |||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||| ||    
T  101339 tcctctctgactgaccatctatctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaa 101240  T
Q  534 cctcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  101239 cctcggatccctatccgacacaatact 101213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 444 - 578
Target Start/End: Original strand, 180728 - 180862
Alignment:
Q  444 ctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcc 543  Q
    ||||||||| |||||  |||| || || |||||||||||||| ||||  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || |||||     
T  180728 ctgaccatctgtctgctgatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactgttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 180827  T
Q  544 cgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    | |||||| ||||| || ||||| | |||||||||    
T  180828 ctatccgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 180862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 101; Significance: 9e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 454 - 566
Target Start/End: Original strand, 1 - 113
Alignment:
Q  454 gtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgaca 553  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 gtctgaggatggtaagaagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgaca 100  T
Q  554 caatactagaagg 566  Q
    |||||||||||||    
T  101 caatactagaagg 113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 101; Significance: 9e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 36 - 560
Target Start/End: Original strand, 47245 - 47769
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||| || || || || | |||| | ||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||   |||| ||     
T  47245 aggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgttataggagtaaccctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttccta 47344  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 235  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||| ||||||   |||||||| || || |||||||| |  || || |  |||||||| |    
T  47345 cgcttttcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtctgatgaactaaatccggtccca 47444  T
Q  236 acaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaact 335  Q
    ||| | || | ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| | |||  ||||    
T  47445 acacaacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgtcataccaatactcgaatggtaact 47544  T
Q  336 attgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtc 435  Q
     |||||||| || ||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  |||||| |||||| || ||    ||||| ||     
T  47545 gttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattgaatcgtt 47644  T
Q  436 ctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacc 535  Q
    ||||||| ||||||||  ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  47645 ctctctgactgaccatttgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacc 47744  T
Q  536 tcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    |||| || | |||||||||||||||    
T  47745 tcgggtctctatccgacacaatact 47769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 359
Target Start/End: Original strand, 798 - 1120
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || || ||  |||||||||||| ||| |||||      
T  798 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctat 897  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||||||||||||||||| |||  |||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||  || ||||||||    
T  898 gcttatcatgataactcttttgttgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctctggtcctaa 997  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   || | || || |||||||||||||||||||| || || || |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  998 aaccacactatcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaacatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataacta 1097  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaa 359  Q
    || ||||| || ||||| |||||    
T  1098 ttattgtacgtgaactctatcaa 1120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Original strand, 539 - 1077
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | ||||| ||||  || ||||| | ||    
T  539 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgct 638  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||| | || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  639 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcgttttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 738  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
     ||  | ||||| || ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||     
T  739 cgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgtcattccaatactagaatgataactatta 838  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  839 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagtccctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 938  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | |||| |||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  939 ccgactgatcatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 1038  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  1039 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 1077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 4)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 279014 - 278473
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||  | || || || ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  279014 ggagtcaacttctttgacttcaaagcttgtcccacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctac 278915  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |  || ||||  ||  ||||||     
T  278914 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctcttgtcctag 278815  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | ||||| || ||||||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  278814 gaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataacta 278715  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || ||||| |  ||||||||||| || | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| ||||||||||||| || |    |||||| ||||    
T  278714 ttattgtatgcgaactcaatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcc 278615  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||  || || ||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| ||    
T  278614 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaatttagaaccgaaggcctcttgcaaactcttccaaaacctagaagtaaatct 278515  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
     ||||| | ||| || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  278514 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 278473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 164891 - 164568
Alignment:
Q  39 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctc 138  Q
    |||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || |||||| || | || |||||||| || ||||| ||  |||||||||||| ||| || || | |    
T  164891 agtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaagatctttcctacgc 164792  T
Q  139 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaaca 238  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || | ||| ||||| || |    
T  164791 ttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacgatttctggtcccaaaa 164692  T
Q  239 aagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactatt 338  Q
    |  || |||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||| ||    
T  164691 atacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagttctgcaccttcgaccatacagagcctcaaaaggtgtcattccaatgctagaatgataactgtt 164592  T
Q  339 gttgtaagtaaactcaatcaacgg 362  Q
     ||||| || || || ||||||||    
T  164591 attgtacgtgaattctatcaacgg 164568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 37 - 566
Target Start/End: Original strand, 260430 - 260959
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||  | || |||||||| || || || ||||  ||| | || |||||||| |||||||||||  | ||||||||||   |||||||||    
T  260430 ggagtcaacttcctcgattttaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctcc 260529  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||| | ||||| |||||    |||||||| ||||| || || || |  || || |  |||||||| ||    
T  260530 gcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcgtctgatgaaccaaatccggtcccaa 260629  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     | | || ||||||| ||||||||||| || ||| | ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||||| | |||  ||||     
T  260630 tacaacactctctcctgactcaaaccagcataacagagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaactg 260729  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||||  ||||       |||||||    ||||||| || |  |||||  ||||||||||||| |||||    |  || ||||    
T  260730 ttgttgtaggtgaactctatcagtggtaggtgactgtcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattagatcgtcc 260829  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    | || | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||||||  | |||||||||| ||| ||  |||| || |||||    
T  260830 tttccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacct 260929  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaagg 566  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  260930 cggatccctatccgacacaatactagaagg 260959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 195
Target Start/End: Original strand, 308797 - 308939
Alignment:
Q  53 acttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 152  Q
    ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  308797 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 308896  T
Q  153 cttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatc 195  Q
    ||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||    
T  308897 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatc 308939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 96; Significance: 8e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 391 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 3749 - 3558
Alignment:
Q  391 tccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttag 490  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| |||||||  || |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||  ||||| ||||    
T  3749 tccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaagatttaattgtcctcttggtttgaccatcagtctgaggatgataagcaaaactcagcctcaacttag 3650  T
Q  491 ttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatctg 582  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  3649 ttcccaaagctgcttgcaaactctcccaaaactttaaagtaaacctcggatctctatctgacacaatgctagatggaataccatgcaatctg 3558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 96; Significance: 8e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 127383 - 127076
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| ||||| ||  |||| |||||||  || || || |    
T  127383 ggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctac 127284  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||  || | ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||| ||| ||||||||    
T  127283 gcttatcatgataactcttctgtcgactctggaacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcctaa 127184  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   || |||| || |||| ||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||     
T  127183 aaccacactctcacctgacttaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactg 127084  T
Q  337 ttgttgta 344  Q
    || |||||    
T  127083 ttattgta 127076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 396 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 80319 - 80193
Alignment:
Q  396 aacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttccc 495  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |    |||||| |||||||| |  |||||||| ||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||  |||    
T  80319 aacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgaatgaccatctgtccgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaaccc 80220  T
Q  496 aaagcagcttgcaaactctcccaaaat 522  Q
    |||||  ||| |||||||| |||||||    
T  80219 aaagcctctttcaaactcttccaaaat 80193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 96; Significance: 8e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 42517 - 41994
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||  || || || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||   |||| || |    
T  42517 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacttcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 42418  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||| | | ||| ||||||   |||||||| || || || ||||| |  || || |  | |||||| ||    
T  42417 gcttgtcatgataactcttcagtcgactctgcgacgcttccatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatacggtcccaa 42318  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || ||||||| ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  ||||     
T  42317 cacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 42218  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  ||||||||||||| |||||    || || ||||    
T  42217 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcc 42118  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  42117 tctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacct 42018  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    |||||| | |||||||||||||||    
T  42017 cggatctctatccgacacaatact 41994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 47583 - 47043
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||   || || || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||   |||| || |    
T  47583 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcatttcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 47484  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||| | | ||| ||||||   |||||||| || || || ||||| |  || || |  | |||||| ||    
T  47483 gcttgtcatgataactcttcagtcgactctgcgacgcttccatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatacggtcccaa 47384  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || ||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  ||||     
T  47383 cacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtccttcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 47284  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||        ||  ||    |||||||||| |  |||||  ||||||  ||||| || |||   || || ||||    
T  47283 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcttaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaatcctctaaagattgtatcgtcc 47184  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||  ||||| || |  ||||||||  |||||||||||| ||| ||  ||||||| |||||    
T  47183 tctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaactcttccagaacctagaagtgaacct 47084  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgca 577  Q
     ||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  47083 tggatccctatccgacacaatacttgacggtacaccatgca 47043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 397 - 542
Target Start/End: Original strand, 2403 - 2548
Alignment:
Q  397 acacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttccca 496  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||   |||||| || ||||| | ||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| |||   || |    
T  2403 acacaaactctcaacaaatcctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttacaaccta 2502  T
Q  497 aagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatc 542  Q
    ||||  |||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  2503 aagcctcttgcacactcttccaaaatctagaggtaaacctcggatc 2548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 542
Target Start/End: Original strand, 21989 - 22494
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||| ||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| |||||| || |    
T  21989 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcgcaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgc 22088  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||  ||| | ||||| || ||||||||||| ||||| || ||  |||| |  || ||||  || ||||||||    
T  22089 acttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcatcttctcttgaatcattttaactttctcaatagtctgctgaacaatctctggtcctaa 22188  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | || || |||||||||||||||||||| |  || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||     
T  22189 gaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagatctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataactg 22288  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || ||||| || ||||| |||||||| | |   |  |||||| |  | |||||||| |  |||||| ||| ||||||||| || |    |||||| ||||    
T  22289 ttattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgattatcccaagttcctccttgctcaaggacacaaactcgcaacaaatcctctagcgactgaattgtcc 22388  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
     ||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| || |  || |||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  22389 actccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatct 22488  T
Q  537 cggatc 542  Q
     |||||    
T  22489 tggatc 22494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 91; Significance: 8e-44; HSPs: 6)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 37 - 575
Target Start/End: Original strand, 117690 - 118228
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || |  |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||   |||| || |    
T  117690 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacactcgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 117789  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||||||||||||||||| ||| || ||| | ||||| || |||   |||||||| || || |||||||| |  || || |  |||||||| ||    
T  117790 gcttgtcatgataactcttctgtcgactttgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctccgtagtatgatgaaccaaatccggtcccaa 117889  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || ||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  |||||    
T  117890 cacaacactctctcctgactcaaaccaacataaaggagtcttacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaacta 117989  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||        | ||||    |||||||||| |  |||||  |||||| |||||| || ||    ||||| || |    
T  117990 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactataccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattgaatcgttc 118089  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||||| | ||||| |||||    
T  118090 tctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacct 118189  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
    |||||| | ||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  118190 cggatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatg 118228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 370345 - 370214
Alignment:
Q  16 tcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaactt 115  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |  ||||| ||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  370345 tcaaatggtccaacaaaacgcggtgtcaacttccaacacttcaaagctcatccaacaccggttacagaattcactctaaaaaacacatgatcaccaacct 370246  T
Q  116 gaaactcaatatcctttctcctcttatcatga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  370245 gaaactcaatatcctttctcctcttatcatga 370214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 542
Target Start/End: Original strand, 112143 - 112648
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||| ||||| || ||  | ||||||||||  |||||  | |    
T  112143 ggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtccttcttac 112242  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||  |  |||| |||||||| |||| ||||||||| ||  |||||| ||| || |  || ||||| ||    
T  112243 gcttatcatgatatctcttttgtcgactctgtgatgctatcatcttttcttggatcaacttaaccttctcaatagtttgttgaacgatatctggtcccaa 112342  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   || ||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||     
T  112343 aactacactctctcctgactcgaaccaacacaacggagttctgcacctccgaccatacagagcttcaaatggtgtcatttcaatactagaatgataactg 112442  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || ||| | || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| |||||||||| || |||||   |||||| ||||    
T  112443 ttattgcatgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctccaacgactgaatcgtcc 112542  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    | |  | ||||||||| ||||  ||||| || || ||||||||  |||| ||||  || |||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  112543 ttttcgactgaccatctgtctacggatgatacgccgaactcaacttcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacct 112642  T
Q  537 cggatc 542  Q
    | ||||    
T  112643 cagatc 112648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 578
Target Start/End: Original strand, 322826 - 323367
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||| ||| |||||||||||  | ||||||||||   |||| || |    
T  322826 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 322925  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||| || |||   |||||||| || || |||||||| |  || || |  ||||| || ||    
T  322926 gcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctccgtagtctgatgaaccaaatccggacccaa 323025  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || ||||||| || |||||||| || || || ||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  ||||     
T  323026 cacaacactctctcctgattcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgatcatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactggaatggtaactg 323125  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  ||||||  ||||| ||||||   || || ||||    
T  323126 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaatcctccaaagattggatcgtcc 323225  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||| ||||| |||||  ||||||  ||||| || |  ||||| ||  |||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  323226 tctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccaaactcagcctcaacttcgaacccaaggcgtcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacct 323325  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    |||||||| |||||||| |||||| || |||| |||||||||    
T  323326 cggatccctatccgacaaaatactcgacggtacaccatgcaa 323367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 37 - 560
Target Start/End: Original strand, 385941 - 386464
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||| ||| || || |||  |||| | || |||| ||| | |||||| ||  ||||||||||||    |||||| |    
T  385941 ggagtcaacttcttatacttcaacgcacaacctacacccgtcgtaggagtgactctcagaaatagatgatctccctcttgaaactcaagggtctttcttc 386040  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||||  |||||| ||| | ||||| ||||||   |||||||||||||| |||||||| |  || || |  || ||||| ||    
T  386041 gcttgtcatggtaactcttctgtggactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttaaccttctccgtagtctaatgaactaaatctggtcccaa 386140  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    ||   || | ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |  ||| ||| ||| |||||||| | |||  ||||     
T  386141 cactacactttctcccgactcaaaccaacacaatggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttagaacagtgccataccaatactcgaatggtaactg 386240  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||| |      ||||||    |||||||||| |  |||||  |||||| |||||| || ||   |||||| ||      
T  386241 ttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactgaatcgtta 386340  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||||  | ||||| |||||    
T  386341 tctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacct 386440  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    |||||| | |||||||||||||||    
T  386441 cggatctctatccgacacaatact 386464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 138 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 203551 - 203147
Alignment:
Q  138 cttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaac 237  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||   || | |||||||||||  ||||| |  || ||||  | |||||| |||    
T  203551 cttatcgtgataaatcttctgtcgactctgcgacgctttcatattttctcttattagcttaaccttttatgtagtctggtgaacaatattcggtcccaac 203452  T
Q  238 aaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactat 337  Q
    |   || |||| || |||||||||||||| ||| | || || |||||||||||||||||||| |  || |||| |||||| ||||||| |||  |||| |    
T  203451 actacactctcacccgactcaaaccaacataacagagttctgcacctccgaccatacaaagctttgaatggtgccattcctatactagaatggtaacttt 203352  T
Q  338 tgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcct 437  Q
    ||||||| || ||||| |||| ||||| |      |||||| |  |||||||||| |  |||||| ||||||||||||| || ||   | |||| |||||    
T  203351 tgttgtacgtgaactctatcagcggtagatgactatcccaagtcccaccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctaatggcagaatcgtcct 203252  T
Q  438 ctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctc 537  Q
    ||| | ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||  |||||||||| | ||||||| || ||||||| ||     
T  203251 ctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctacaagtaaatctt 203152  T
Q  538 ggatc 542  Q
    |||||    
T  203151 ggatc 203147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 578
Target Start/End: Original strand, 6136 - 6677
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| | ||| || ||||||||| | || || |||||||| || || ||  |||||||||||| |||||  || |    
T  6136 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtcaaacaccagtcacaggagtgactcttaaaaacacgtggtctccctcttgaaactcaagatcctgcctgc 6235  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||||| |||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||  |||||||  || ||||||||    
T  6236 gcttattatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgcacaatctctggtcctaa 6335  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | || || || ||||||||||||||| | || || || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| || |     
T  6336 gaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataaatg 6435  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || ||||| || ||||||||||| || | |      |||||| |  | ||||| || | |||| || ||||||||||||| || ||   |||||| ||||    
T  6436 ttattgtatgtgaactcaatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgatcaagaacataaactctcaacaaatcctctaacgactgaatcgtcc 6535  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | || |||||| ||||  ||||| || || |||| ||||||||| ||||  ||||||||  |||||||||||| ||||| | |||||||||| ||    
T  6536 tctccgactaaccatctgtctacggatgatacgccgaacacaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaattctagaagtaaatct 6635  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
     ||||| | ||| || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  6636 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 6677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 49391 - 48862
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||   |||||||||    
T  49391 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggaatgaccctcagaaacacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctcc 49292  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||| ||||||   |||||||| || ||||| ||||| || || || |  || ||||| ||    
T  49291 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttttctgtagtctcatgaaccaaatctggtcccaa 49192  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    ||   || ||||||| ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||||| | |||  ||||     
T  49191 caccacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaactg 49092  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || |        ||||||    |||||||||| |  |||||  ||||||| ||||| || |||   || || ||||    
T  49091 ttgttgtatgtgaactctatcaatggcaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaataaatcctctaaagattgtatcgtcc 48992  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||||||  | || ||||||| ||| ||  ||||||| |||||    
T  48991 tctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacct 48892  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaagg 566  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  48891 cggattcctatccgacacaatactcgaagg 48862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 88; Significance: 5e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 39 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 64213 - 63710
Alignment:
Q  39 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctc 138  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| | ||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||| ||||||| ||| || || | |    
T  64213 agtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaactccagccacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgc 64114  T
Q  139 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaaca 238  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||  || || ||||| |  || ||||  || |||||||| |    
T  64113 ttatcatgataattcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctgctgaacaatatctggtcctaaga 64014  T
Q  239 aagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactatt 338  Q
       |  | |||||  ||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  || | ||    
T  64013 ccactctttctcctaactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgttaattgtt 63914  T
Q  339 gttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctc 438  Q
     ||||| || ||||| |||||||| | |   |  |||||| |  | | |||||| |  |||||| ||||||||||||| || |    |||||| ||||||    
T  63913 attgtacgtgaactctatcaacggaagatgattatcccaagttcctctttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctc 63814  T
Q  439 tctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcg 538  Q
    || | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||  |||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||||| || |    
T  63813 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccagagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 63714  T
Q  539 gatc 542  Q
    ||||    
T  63713 gatc 63710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 86; Significance: 8e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 5744 - 5252
Alignment:
Q  67 ccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactct 166  Q
    ||||| |||||||||||| | || |||||||| ||||| || ||  |||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5744 ccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttcttgaaactcaagatccttt-tgcgcttatcatgataactcttttgtctactct 5646  T
Q  167 gagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaaca 266  Q
    | ||| | ||||| || |||  ||||| ||||||||| || || |||| ||| |||| ||| |||||||  |   ||||||| ||||||||| |||||||    
T  5645 gcgacgctttcatcttctctctaatcaacttaaccttctctgttgtttgttgaacaatttcaggtcctagtaccacattctcaccggactcataccaaca 5546  T
Q  267 caacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaa 366  Q
    |||||| || || || ||||||||| |||| || || ||||||||||||||||| |||| |||  |||| || || || || ||||||||||| || | |    
T  5545 caacggagttctgcatctccgaccaaacaacgcttcgaacggtgtcattccaatgctagaatggtaactgttattatacgtgaactcaatcaatggaaga 5446  T
Q  367 cattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggt 466  Q
          |||||| |  | |||||||| |  |||||| ||||||||||||| || ||    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  5445 ttactatcccaagttcctccttgctcgagtacacaaactctcaacaaatcctcgaacgaatgaattgtcctctctgtctgtccatcggtctgcggatgat 5346  T
Q  467 aagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    | |  |||||||| ||||  ||||  ||||| ||  | ||||||| || ||||||| |||||||||| || ||||| | ||| || ||||||||    
T  5345 acgtcgaactcaaactcagcttagaacccaacgcctcctgcaaacccttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatact 5252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 113 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 4513 - 4045
Alignment:
Q  113 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 212  Q
    |||||||||||| ||| || || | |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||    
T  4513 cttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatcatcttaactttctcggtagt 4414  T
Q  213 ttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtc 312  Q
     | ||| ||||  || |||||||| |   |  | || || ||||||||||| ||||| || || || || ||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  4413 ctgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaatggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcaaaaggtgcc 4314  T
Q  313 attccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 412  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||| || ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||    
T  4313 attccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaaca 4214  T
Q  413 aatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaact 512  Q
    ||||||| |    ||||||  || | || | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||||||  ||||||||||    
T  4213 aatcttctagcgactgaattttcgtttccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaact 4114  T
Q  513 ctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
     | ||||||| |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||| | ||||||||||||    
T  4113 tttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaattctcgaaggaacaccatgcaatct 4045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 113 - 581
Target Start/End: Original strand, 8794 - 9262
Alignment:
Q  113 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 212  Q
    |||||||||||| ||| || || | |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||    
T  8794 cttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatcatcttaactttctcggtagt 8893  T
Q  213 ttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtc 312  Q
     | ||| ||||  || |||||||| |   |  | || || ||||||||||| ||||| || || || || ||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  8894 ctgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaatggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcaaaaggtgcc 8993  T
Q  313 attccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 412  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||| || ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||    
T  8994 attccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaaca 9093  T
Q  413 aatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaact 512  Q
    ||||||| |    ||||||  || | || | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||||||  ||||||||||    
T  9094 aatcttctagcgactgaattttcgtttccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaact 9193  T
Q  513 ctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
     | ||||||| |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||| | ||||||||||||    
T  9194 tttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaattctcgaaggaacaccatgcaatct 9262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 37 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 33757 - 33213
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || |||||| || | ||  |||| ||||| || || ||  | |||||||||| ||| || || |    
T  33757 ggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacatgagtgactttcaataacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctac 33658  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| | ||| ||||  || ||||||||    
T  33657 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtctgttgaacaatctctggtcctaa 33558  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | || || ||||||||||| ||||| || || || || |||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  33557 gaccactctttcacctgactcaaaccagcacaatggagttctgcatctccaaccatacaaagcttcaaaaggtgccattccaatactagaatgataacta 33458  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || ||||| || ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    ||||||  ||     
T  33457 ttattgtatgtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcttctagcgactgaattttcg 33358  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    | || | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||    
T  33357 tttccggctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 33258  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
     ||||| | ||| || ||||| || ||||| | ||||||||||||    
T  33257 tggatctctatctgatacaattctcgaaggaacaccatgcaatct 33213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 44654 - 44578
Alignment:
Q  13 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcac 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44654 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcac 44578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 37 - 578
Target Start/End: Original strand, 220 - 761
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |  || || |||| |||| | || |||| ||| |||||||| ||  ||||||||||||   || |||| |    
T  220 ggagtcaacttcttagacttcaaagcacgtcatacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggcccttctac 319  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| |||||  ||  | ||||| |||||    |||||||| || || || ||||| |  || || |  |||||||| ||    
T  320 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgatgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaa 419  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || ||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| | |||||| | |||  ||||     
T  420 cacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccgtacaaagcttcgaacggtgccatacgaatactcgaatggtaactg 519  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||| |      ||||||    |||||||||| |  |||||  |||| |||||||| ||||||   || ||  |||    
T  520 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactcttaacaaatcctccaaagattggatcatcc 619  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||| ||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||    
T  620 tctccgtctgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacct 719  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    |||||| | ||||  ||||||||| || |||| |||||||||    
T  720 cggatctctatccaccacaatactcgatggtacaccatgcaa 761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 254 - 575
Target Start/End: Original strand, 12826 - 13147
Alignment:
Q  254 actcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactc 353  Q
    ||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||| || |||||    
T  12826 actcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactc 12925  T
Q  354 aatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcg 453  Q
    ||||||||| | |  |   |||||| |  | |||||||| | ||||||  |||||| |||||| || |    || ||| |||||||| | |||||||||     
T  12926 aatcaacggaagatgtctatcccaagttcctccttgctcaagaacacacactctcagcaaatcctctagtgactaaattgtcctctccgactgaccatct 13025  T
Q  454 gtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgaca 553  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||||| | ||| || |    
T  13026 gtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgata 13125  T
Q  554 caatactagaaggtataccatg 575  Q
    |||| || ||||| | ||||||    
T  13126 caatgctcgaaggaacaccatg 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 37 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 877 - 337
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| ||   || ||||||| ||| || || ||  ||||||||| || ||| || || |    
T  877 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacacgagggactctcaaaa-cacgtggtctccttcttgaaacttaagatctttcctac 779  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||  ||| | ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||  || ||||||||    
T  778 gcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtttgttgaacaatctctggtcctaa 679  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | || || |||||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  678 gaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttttgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgtcattccaatactagaatgataacta 579  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || || || || ||||| ||||| || | |   |  || ||| |  |  ||||||| | ||||||| | |||||||||||||| ||   ||||||  |||    
T  578 ttattatacgtgaactctatcaatgggagatgattatctcaagttccttcttgctcaagaacacaaaccctcaacaaatcttctaacgactgaatcatcc 479  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||| ||||| ||  | |||||||| ||||  ||||  || |||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||    
T  478 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatacaccgaactcaacctcagcttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 379  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
     ||||| | |||  ||||||| || ||||| |||||||||||    
T  378 tggatctctatcacacacaatgctcgaaggaataccatgcaa 337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 81; Significance: 8e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 36 - 560
Target Start/End: Original strand, 26382 - 26906
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | |||||||||| | |||||||     
T  26382 aggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctt 26481  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 235  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||  | ||||| |||||    |||| | |||| || || ||||| || || || |  || ||||| |    
T  26482 cacttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctaactttctcagtagtctcatgaaccaaatctggtccca 26581  T
Q  236 acaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaact 335  Q
    ||| | |||| || || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||  ||| |||||||| |  ||| | ||    
T  26582 acacaacattttcacctgactcaaaccaacataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtaccatcccaatactcgagtgatagct 26681  T
Q  336 attgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtc 435  Q
     ||||| ||||| ||||||||||| || |        ||||||    |||||||||| |  |||||  | |||||||||||||||||    ||||| |||    
T  26682 gttgttataagtgaactcaatcaatggcaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtc 26781  T
Q  436 ctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacc 535  Q
    ||||| | ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||||||  | || ||||||| ||| ||  ||||||| ||||    
T  26782 ctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacc 26881  T
Q  536 tcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    || |||||| |||||||||||||||    
T  26882 tcagatccctatccgacacaatact 26906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 81; Significance: 8e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 36 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 16898 - 16374
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||| || || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | |||||||||| |||||||||     
T  16898 aggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctt 16799  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 235  Q
    | ||| ||||| |||||||||||||  ||||| ||  | ||||| ||||||   ||||   | || || || ||||| || || || |  |||||||| |    
T  16798 cgcttgtcatggtaactcttctgtcggctctgcgaagctttcatcttttctcttatcaatctgactttctcagtagtctcatgaaccaagtccggtccca 16699  T
Q  236 acaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaact 335  Q
    ||| | || |||| || |||| |||||| || || || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||| |  ||| | ||    
T  16698 acacaacactctcacccgacttaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagct 16599  T
Q  336 attgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtc 435  Q
     ||||| ||||||||||||||||| || ||       ||||||    ||||||| || |  |||||  |||||||||||||||||||    ||||| |||    
T  16598 gttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtc 16499  T
Q  436 ctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacc 535  Q
    ||||| | ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||||||  | || ||||||| ||| ||  ||||||| ||||    
T  16498 ctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacc 16399  T
Q  536 tcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    ||||||| | |||||||||||||||    
T  16398 tcggatctctatccgacacaatact 16374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 78; Significance: 5e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 362
Target Start/End: Original strand, 124 - 449
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||  |  ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||| |    
T  124 ggagtcaactttttttacttcaaagcacgtccaacaccagtcaccggattgactctcaaaaacacatgataaccctcttgaaactcaagatcctttctac 223  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
      ||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || |||||| |||||||||| || ||  |||| |  || ||||  ||  |||||||    
T  224 ggttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgactcatcttaactttctcaatagtctgctgaacaatatctagtcctaa 323  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | ||||| |||||||||||||||||||| || || || |||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| || | || |     
T  324 gaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccaaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaattataattg 423  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacgg 362  Q
    || ||||| || ||||| ||||||||    
T  424 ttattgtatgtgaactctatcaacgg 449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 78; Significance: 5e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 362
Target Start/End: Original strand, 17109 - 17434
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| |   ||||| || | || |||||||| || ||||| ||  ||||||||||||  || || || |    
T  17109 ggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacacaaatcacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctac 17208  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| |  | ||| ||||| ||    
T  17209 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacactttcatcttttcttgaatcatcttaaccttcacagtagtttgttgaatgatttctggtcccaa 17308  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   || |||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||| |||| ||||     
T  17309 aactacaatctcacctgactcgaaccaacacaacggagttctacacctccgaccatacagagcctcaaaaggtgccattccaatgctagaatgataactg 17408  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacgg 362  Q
    || ||||| || || || ||||||||    
T  17409 ttattgtacgtgaattctatcaacgg 17434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 78; Significance: 5e-36; HSPs: 4)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 40 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 109992 - 109499
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  109992 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 109893  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  109892 tatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 109793  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | || || ||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || |||| | |||||||||||| |||| |||||||     
T  109792 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccgttccaatactagaatgataactatta 109693  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | | |||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  109692 ttgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctctttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 109593  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaa 533  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  109592 ccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 109499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 577
Target Start/End: Original strand, 112681 - 113221
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| || | || || ||||| || || || |||| |||| | || ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||| || |    
T  112681 ggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaagatccttcctac 112780  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| |||||||| |||||||||| |||||| ||| | ||||| | ||||   ||||  || |||||||  ||||||| ||| || |  || ||||| ||    
T  112781 gcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaagtttaccttttatgtagtttgttgaactatgtctggtcccaa 112880  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    ||   || | || || || |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||| | |||  ||||     
T  112881 catcacactttcccccgattcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaccatacaatgcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 112980  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||        ||||||    |||||||| | |  |||||  | ||||||| |||||| ||    || || ||||    
T  112981 ttgttgtaagtaaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgcacaagtacacacaccctcaacagatcttctaaggattgtatcgtcc 113080  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||||  |||||||||  |||||||||| ||||| |||||||  |||||||| |  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| || |||||    
T  113081 tctctaactgaccatctttctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagatgtgaacct 113180  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgca 577  Q
    || ||| | ||| || |||||||| || || | ||||||||    
T  113181 cgaatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgca 113221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 96186 - 95879
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||  | ||||| ||||  || || || |    
T  96186 ggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcaaaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctac 96087  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||    |||| | |||| || |||||||| || || || |  ||||| || ||    
T  96086 gcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctccctgatcaccctaactttctccgtagtctcatgaaccaagtccggccccaa 95987  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || | ||||| |||||||||||||| |  || || ||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| |||||||| | |||  ||||     
T  95986 cacaacactttctcccgactcaaaccaacatagaggagttctacacctccgaccatataaagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatggtaactg 95887  T
Q  337 ttgttgta 344  Q
    ||||||||    
T  95886 ttgttgta 95879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 444 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 95779 - 95645
Alignment:
Q  444 ctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcc 543  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||| |||| |||||   ||||||| | ||||||||||| || ||     
T  95779 ctgaccatcagtctgcggatgataagccgaactcaacctcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaacttctccaaaatctcgaagtaaaccttgggtct 95680  T
Q  544 cgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    | ||| ||||| ||||| || || | |||||||||    
T  95679 ctatctgacactatactcgacggaacaccatgcaa 95645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 76; Significance: 7e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 6098 - 5771
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||| || || |||| |||| | ||||||| |||||||||| | ||  ||||||||||||   ||||||| |    
T  6098 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgacctacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatgagctccctcttgaaactcaagggcctttctac 5999  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||||   |||| ||| |||||||| |||||||   | || |  || ||||| ||    
T  5998 gcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacactttcatcttttctcttatcaacttgaccttttctgtagtttgacgaactaaatctggtcccaa 5899  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    ||   || | ||||| ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  ||||     
T  5898 cactacactttctcccgactcaaaccaacacaatggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 5799  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 364  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  5798 ttgttgtacgtgaactctatcaacggta 5771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 76; Significance: 7e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 13159 - 12656
Alignment:
Q  39 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctc 138  Q
    |||||| ||| || ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || ||||| |||||||| || ||  ||||||| |||| ||| || || | |    
T  13159 agtcaatttcttagacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaataacacatggtctccttcttgaaattcaagatctttcctacgc 13060  T
Q  139 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaaca 238  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| || || |||||||  || | || ||| ||||| || |    
T  13059 ttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcatctaaactttctcagtagtttgctgaagaatttctggtcccaaaa 12960  T
Q  239 aagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactatt 338  Q
      ||| |||  || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| || || |||| |||||||||||||| |||  |||| ||    
T  12959 ctgcactctaacctgactcgaaccaacacaatggagtcctacacctccgaccatacagagcttcgaatggtgccattccaatactagaatggtaactgtt 12860  T
Q  339 gttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctc 438  Q
     || || || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| |||||||||| ||||||||   ||| || || ||     
T  12859 attatatgtgaactctatcaacgggagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcttccaacgactgtatcgttctt 12760  T
Q  439 tctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcg 538  Q
    || | |||||||||  |||| ||||| || || ||||| ||  |||| ||||  || |||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  12759 tccgactgaccatctatctgcggatgatacgctgaactgaacatcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctca 12660  T
Q  539 gatc 542  Q
    ||||    
T  12659 gatc 12656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 76; Significance: 7e-35; HSPs: 4)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 245 - 560
Target Start/End: Original strand, 20313 - 20628
Alignment:
Q  245 tctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgta 344  Q
    ||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| | |||  |||| ||||||||    
T  20313 tctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgtcataccaatactcgaatggtaacttttgttgta 20412  T
Q  345 agtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtc 444  Q
     || ||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||    || || |||||||| | |    
T  20413 tgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgac 20512  T
Q  445 tgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatccc 544  Q
    | | |||| ||||| ||||| ||| | |||||||| ||||| || |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  20513 taaacatctgtctgcggatgataaaccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatcgc 20612  T
Q  545 gatccgacacaatact 560  Q
     |||||||||||||||    
T  20613 tatccgacacaatact 20628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 13545 - 13007
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || || | ||| |||||||||||  | ||||||||||   |||| || |    
T  13545 ggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 13446  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
      || ||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||| || |||   |||||||| || || || ||||| |  || |  | ||||||||| ||    
T  13445 gtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaatcaattccggtcccaa 13346  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || |||||   ||||||||||| || ||  | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | ||   ||||     
T  13345 cacaacactctctattgactcaaaccagcataaatgagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatagtaactg 13246  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||| ||||||        ||| ||    |||||||||| |  |||||  ||||||  ||||| |||||    || || ||||    
T  13245 ttgttgtatgtgaactctatctacggtaggtgactatcctaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtcc 13146  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |   |||| ||| |||| || |||| ||||||||||||| | |||||    
T  13145 tctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaatccaatgcatcttgtaagctcttccaaaatttagaaatgaacct 13046  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  13045 cggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatg 13007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 17315 - 16777
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||| | ||| |||||||||||  | ||||||||||   |||| || |    
T  17315 ggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctaagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctac 17216  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
      || ||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||| || |||   |||||||| || || || ||||| |  || |  | ||||||||| ||    
T  17215 gtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaatcaattccggtcccaa 17116  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || |||||   ||||||||||| || ||  | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | ||   ||||     
T  17115 cacaacactctctattgactcaaaccagcataaatgagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatagtaactg 17016  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||| ||||||        ||| ||    |||||||||| |  |||||  ||||||  ||||| |||||    || || ||||    
T  17015 ttgttgtatgtgaactctatctacggtaggtgactatcctaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtcc 16916  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
     ||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |   |||| ||| |||| || |||| ||||||||||||| | |||||    
T  16915 gctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaatccaatgcatcttgtaagctcttccaaaatttagaaatgaacct 16816  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  16815 cggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatg 16777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 53 - 185
Target Start/End: Original strand, 20121 - 20253
Alignment:
Q  53 acttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 152  Q
    ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||| ||| |||||||| ||  ||||||||||||   ||||||| | ||| |||||||||||    
T  20121 acttcaacgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgataact 20220  T
Q  153 cttctgtctactctgagacaccttcatattttc 185  Q
    ||| |||| |||||| ||| | ||||| |||||    
T  20221 cttttgtcgactctgggacgctttcatcttttc 20253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 76; Significance: 7e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 364
Target Start/End: Original strand, 26264 - 26591
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||   ||||||| |    
T  26264 ggagtcaacttcttagacttcaacgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctac 26363  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| | ||| ||||||||||||| |||||| ||| | || || ||||||   |||||||| ||||| |||||||| |  || || |  |||| ||| ||    
T  26364 gcttgtaatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttgatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaaccaaatccgctcccaa 26463  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    ||   |||| ||||| |||||||||| |||||| || ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||| |||  ||||     
T  26464 cactacattttctcccgactcaaaccgacacaaaggagtcttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactagaatggtaactg 26563  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 364  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  26564 ttgttgtacgtgaactctatcaacggta 26591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 242 - 578
Target Start/End: Original strand, 26851 - 27187
Alignment:
Q  242 cattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgtt 341  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||| || ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  |||| |||||    
T  26851 cattttctcccgactcaaaccgacacaaaggagtcttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatacttgaatggtaactgttgtt 26950  T
Q  342 gtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctct 441  Q
    ||| || ||||| |||||||||| |      ||  ||    |||||||||| |  |||||  |||||| |||||| || ||   || ||| || |||||     
T  26951 gtacgtgaactctatcaacggtagatgactatctgaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactaaatcgttctctcc 27050  T
Q  442 gtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggat 541  Q
    | ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||| |||| || |||| ||||||  | ||||| ||||| ||||    
T  27051 gactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgtaagctcttccaaaaccttgaagtgaaccttggat 27150  T
Q  542 cccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    | | ||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  27151 ctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgcaa 27187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 436 - 578
Target Start/End: Original strand, 26663 - 26805
Alignment:
Q  436 ctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacc 535  Q
    ||||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||| |||| || |||| ||||||  | ||||| ||||    
T  26663 ctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgtaagctcttccaaaaccttgaagtgaacc 26762  T
Q  536 tcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    | ||||| | ||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  26763 ttggatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgcaa 26805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 76; Significance: 7e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 32934 - 32431
Alignment:
Q  39 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctc 138  Q
    |||||||||| |  ||||||| ||| | ||||| || |||||| || | || |||||||| || ||||| ||  ||| |||||||| ||| || || | |    
T  32934 agtcaacttctttaacttcaatgcaagtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttaaaactcaagatctttcctacgc 32835  T
Q  139 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaaca 238  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||  ||  | ||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| |||| ||| || ||||| |    
T  32834 ttatcatgataactcttttgtcgaccctacgatgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttcttagtagtttgttgaacaatttctggccctaaaa 32735  T
Q  239 aagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactatt 338  Q
       || || | || |||||||||||||||||||| || || || |||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||| |||| ||    
T  32734 ccacactcccacctgactcaaaccaacacaacggagttcttcatctccgatcatacaaagcctcaaaagatgccattccaatactagaatgataactgtt 32635  T
Q  339 gttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctc 438  Q
     ||||| || ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| |||||||||| ||||| ||   ||| || || |||    
T  32634 attgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcttctaacgactggatcgttctc 32535  T
Q  439 tctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcg 538  Q
    || | ||||||||| ||||| ||||| || ||  ||||||| ||||| ||||  || |||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||| || |    
T  32534 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccaaactcaacctcaacttagaacctaaagcttcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 32435  T
Q  539 gatc 542  Q
    ||||    
T  32434 gatc 32431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 73; Significance: 5e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 38 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 15262 - 14938
Alignment:
Q  38 gagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcct 137  Q
    ||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || |||||| || | || |||||| | |||||||| ||  | ||||||||||  || || || |     
T  15262 gagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaagatacatgatctccttcctgaaactcaaggtctttcctacg 15163  T
Q  138 cttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaac 237  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| ||  | ||||| |||||||| |||| ||||||||| || ||||||| ||| || |  || ||||| ||     
T  15162 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgctttcatcttttcttggatcaacttaaccttctcagtagtttgttgaacgatatctggtcccaaa 15063  T
Q  238 aaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactat 337  Q
    |   || |||| || ||||| |||||||||||||  || || |||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  15062 actacactctcacctgactcgaaccaacacaacgaagttctgcacctccgaccatacagagcttcaaatggtgccattccaatactagaatgataactat 14963  T
Q  338 tgttgtaagtaaactcaatcaacgg 362  Q
    | ||||| || ||||| ||||||||    
T  14962 tattgtacgtgaactctatcaacgg 14938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 426 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 14874 - 14758
Alignment:
Q  426 ctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaattta 525  Q
    |||||| || ||||| | ||||||||| ||| | || || || || |||||||| ||||| ||||  || ||| |  |||||||||| | ||||||| ||    
T  14874 ctgaatcgttctctccgactgaccatctgtccgcgggtgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaatcctcttgcaaacttttccaaaatcta 14775  T
Q  526 gaagtaaacctcggatc 542  Q
    |||||||||||||||||    
T  14774 gaagtaaacctcggatc 14758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 73; Significance: 5e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 38 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16648 - 16376
Alignment:
Q  38 gagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcct 137  Q
    ||||||||||| |  ||||||| |  || ||||| || ||||||||| | || |||||||| || ||||| ||  ||||||||||||  || || || |     
T  16648 gagtcaacttctttgacttcaatgtgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatctccctcttgaaactcaaggtctttcctacg 16549  T
Q  138 cttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaac 237  Q
    ||||||||| |||||||| |||| |||||| ||| | ||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||| ||  ||||||||     
T  16548 cttatcatggtaactcttttgtcaactctgcgacgctttcatcttttattgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttttggtcctaaa 16449  T
Q  238 aaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtg 310  Q
    |   || |||| || |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16448 accacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtg 16376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 40 - 578
Target Start/End: Original strand, 7063 - 7602
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaa-cacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctc 138  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || |||||||| ||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||  | |    
T  7063 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttccacgc 7162  T
Q  139 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaaca 238  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||  ||||||| |||||| || |||||||  || ||||  || |||||||| |    
T  7163 ttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttagatcatctgaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaaga 7262  T
Q  239 aagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactatt 338  Q
       |  | || || ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||| | |||| |||||||    
T  7263 ccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctacatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatacttgaatgataactatt 7362  T
Q  339 gttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctc 438  Q
     || || || ||||| || ||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||   ||||||||||| ||||    |||||| ||||||    
T  7363 attatatgtgaactcgattaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcgagaacacaaatcctcaacaaatcctccagcgactgaattgtcctc 7462  T
Q  439 tctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcg 538  Q
    || | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || |    
T  7463 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 7562  T
Q  539 gatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    |||| | ||| |||||||| || ||||| | |||||||||    
T  7563 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 7602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 40 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 16597 - 16062
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| ||  |||| ||| | ||||| ||||| |||||||| ||  |||||||   || |||||  || | ||    
T  16597 gtcaacttcttcgacttcaatgcacgtccaacaccaatcactggagtgaccctaaaaaatacatgatctccttcttgaaatataagatcctccctacgct 16498  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||| ||| | || ||| |     
T  16497 tatcatgataactcttttgtcgagtctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctgttcttaaaac 16398  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      || |||| || ||||| |||||||||||||| ||  | ||||||   ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||     
T  16397 cacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagttttgcacctcgttccatacaaagcctcaaatggtgtcattgcaatactagaatgataactatta 16298  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    ||||| || || || || || || | |      |||||| |  | |||||||| |  || ||| |||||||||| || |||||   |||||| || ||||    
T  16297 ttgtacgtgaattctattaatggaagatgactatcccaagtccctccttgctcaagtacgcaaactctcaacaagtcctccaacgactgaatcgttctct 16198  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||  ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||  || |||||   ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  16197 ccgactgaccatttgtctgcggatgatacgccgaacttaacctcaacttagaacctaaagcctattgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcgg 16098  T
Q  540 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||| | ||||||    
T  16097 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 16062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 37 - 364
Target Start/End: Original strand, 37324 - 37651
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||| || || |||| |||  | || || | |||||||||||| |   |||||||||||||  |||| || |    
T  37324 ggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggggtgactctaagaaacacatgatctctcccttgaaactcaatggccttcctac 37423  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||| ||||||   ||||||||||| || |||||||| |  || || |  |||||||| ||    
T  37424 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttaactttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaa 37523  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || | ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||  || |||||||| | |||  || |     
T  37524 cacaacagtttctcctgactcaaaccaacacaaaggggtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgcgataccaatactcgaatggtaattg 37623  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 364  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  37624 ttgttgtacgtgaactccatcaacggta 37651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 38357 - 38183
Alignment:
Q  38 gagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcct 137  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||| ||| |||||||| ||  ||||||||||||   |||| || |     
T  38357 gagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacg 38258  T
Q  138 cttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 212  Q
    ||| || || ||||||||||||| |||||| ||| | | ||| ||||||  ||||||||| || || ||||||||    
T  38257 cttgtcttggtaactcttctgtcgactctgcgacgcttccatcttttctctaatcatcttgactttctccgtagt 38183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 71; Significance: 7e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 37 - 359
Target Start/End: Original strand, 1261 - 1583
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| | ||| || ||||||||| | || || ||||| || || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  1261 ggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtcgaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctac 1360  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||||||||| ||||| || |||| |||||| ||| | ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||  ||  |||||||    
T  1361 acttatcatggtaacttttttgtcgactctgcgacgctttcatcttatcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctctagtcctaa 1460  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | || || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||| |||| |||||    
T  1461 gaccactctttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctacatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccatttcaatactagaatgataacta 1560  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaa 359  Q
    || || || || ||||| |||||    
T  1561 ttattatacgtgaactctatcaa 1583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 71; Significance: 7e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 229 - 575
Target Start/End: Original strand, 27539 - 27885
Alignment:
Q  229 ggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcat 328  Q
    ||||| |||| | |||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | ||    
T  27539 ggtcccaacacaacattttctcctgactcgaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaat 27638  T
Q  329 gaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctg 428  Q
    |  |||| |||||||| || ||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  |||||| |||||| |||||    ||    
T  27639 ggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctccaatgattg 27738  T
Q  429 aatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaa 528  Q
     ||||||||||| | ||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  27739 tatagtcctctccgactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaa 27838  T
Q  529 gtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
    || ||||||||||| | ||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  27839 gtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggtacaccatg 27885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 71; Significance: 7e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 37 - 359
Target Start/End: Original strand, 5343 - 5665
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||| |||||||  |||||||||| || ||||| || ||||||||| | || |||||||| |  || || ||  ||| |||||||| ||| || || |    
T  5343 ggagtcgacttccttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatatgtggtctccttctttaaactcaagatctttcctgc 5442  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
      ||| ||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||  || ||||||||    
T  5443 gtttaccatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttttcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaa 5542  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | || || || ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||| | |||| |||||    
T  5543 gaccactctttcacctgaatcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccgatactggaatgataacta 5642  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaa 359  Q
    || ||||| || ||||| |||||    
T  5643 ttattgtacgtgaactctatcaa 5665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 71; Significance: 7e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 53 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 14069 - 13547
Alignment:
Q  53 acttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 152  Q
    ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || || |||||||||||||| ||  ||||||||||||   ||||||||| ||| ||||| |||||    
T  14069 acttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttaaaaacacatgatccccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaact 13970  T
Q  153 cttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccg 252  Q
    ||| |||| |||||| ||| | ||||| |||||    |||||||| || || || ||||| |  || || |  |||||||| |||| | || |||||||     
T  13969 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcct 13870  T
Q  253 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaact 352  Q
    ||||||||||| || || || ||||| || |||||||||||||| || || ||||||| ||| | |||||| | |||  |||| |||||||| || ||||    
T  13869 gactcaaaccagcataaaggagtcctgcatctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccatactaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaact 13770  T
Q  353 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatc 452  Q
    | ||||||||||        ||||||    ||| |||||| |  |||||  ||||||||||||| |||||    || || || ||||| | |||||||||    
T  13769 ctatcaacggtaggtgactatcccaagctccactttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaacgattggatcgttctctccgactgaccatc 13670  T
Q  453 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgac 552  Q
     ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||| | ||||| |||||| ||| || |||||||    
T  13669 tgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctctgattcctatccgac 13570  T
Q  553 acaatactagaaggtataccatg 575  Q
    |||||||| || |||| ||||||    
T  13569 acaatactcgacggtacaccatg 13547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 5137 - 4599
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||| ||| ||||||||| |  | ||||||||||   |||| || |    
T  5137 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcatcctcctgaaactcaagggccttcctac 5038  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||| || |||   |||||||| || || || ||||| |  || || |  |||||||| ||    
T  5037 gcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctaatgaaccaaatccggtcccaa 4938  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || ||||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||  || ||||||| ||| ||||||||   |||  ||||     
T  4937 cacaacactctctcttgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagattcgaacggtgccataccaatactcaaatggtaactg 4838  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||        ||||||    |||||| ||| |  |||||  ||||||  ||||| |||||    || || ||||    
T  4837 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccacctttctcaagtacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtcc 4738  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||| ||||||| |||| ||| ||| || |||| |||||    
T  4737 tctccgactgaccatctgtctgaggacgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccagaatctaaaagtgaacct 4638  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
    |||||||| |||||||| |||||| || |||| ||||||    
T  4637 cggatccctatccgacataatactcgacggtacaccatg 4599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 444 - 578
Target Start/End: Original strand, 67899 - 68033
Alignment:
Q  444 ctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcc 543  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||| |||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||     
T  67899 ctgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaacctcgggtct 67998  T
Q  544 cgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    | ||||||||| ||||| || || | |||||||||    
T  67999 ctatccgacactatactcgacggaacaccatgcaa 68033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 71; Significance: 7e-32; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 138 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 4537 - 4331
Alignment:
Q  138 cttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaac 237  Q
    ||||||||| |||||||| |||| |||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||| |||| ||| ||||||||     
T  4537 cttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaagcttgtcagtagtttgttgaacaatttctggtcctaaa 4438  T
Q  238 aaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactat 337  Q
    |   || |||| || ||||| ||||||||||| || || |||||  ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||| |    
T  4437 accacactctcacctgactcgaaccaacacaaaggagttctacaaatccaaccatacaaagcctcaaatggtgccattccaatactagaatgataactgt 4338  T
Q  338 tgttgta 344  Q
    | |||||    
T  4337 tattgta 4331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 524 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 55602 - 55545
Alignment:
Q  524 tagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55602 tagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatgcaatct 55545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 397 - 560
Target Start/End: Original strand, 59236 - 59399
Alignment:
Q  397 acacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttccca 496  Q
    |||||| |||||||||| || |||||   |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||  ||||    
T  59236 acacaaactctcaacaagtcctccaacgactgaattgtcctctctgtctgcccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaaactcaacttagaaccca 59335  T
Q  497 aagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    | ||  | |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| | ||| || ||||||||    
T  59336 acgcctcctgcaaactctcccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatact 59399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 444 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 29156 - 29071
Alignment:
Q  444 ctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaag 529  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||  ||||||||  |||||||||| | ||||||| ||||||    
T  29156 ctgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaag 29071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 399 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 4276 - 4100
Alignment:
Q  399 acaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaa 498  Q
    |||| ||||||||||||| || ||   |||||| || |||||   ||||||||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||  || |||    
T  4276 acaaactctcaacaaatcctctaacgactgaatcgttctctccaactgaccatctgtgtgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaa 4177  T
Q  499 gcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
    ||  |||||||||||| ||||||| || ||||||| || ||||| | ||| |||||||| || ||||| | ||||||    
T  4176 gcctcttgcaaactcttccaaaatctataagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatg 4100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 37 - 566
Target Start/End: Original strand, 10891 - 11420
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || |  |||| || | | ||||| | |||||||||||||||  | ||||||||||   |||||||||    
T  10891 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacatgtcatagaagtaaccctaagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctcc 10990  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||| | ||||| ||||||   |||||||| || || || ||||| || || || |  |||||||| ||    
T  10991 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctaagacgcattcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatccggtcccaa 11090  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    ||   || |||||||  |||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||||| | |||  || |     
T  11091 caccacactctctcctaactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaaatg 11190  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| |||| | |||        ||||||    |||||||||| |  |||||  ||||||||||||| |||||    || || ||||    
T  11191 ttgttgtatgtgaactctatcagcagtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcc 11290  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || |  ||||||||  | |||||||||| ||| ||  | ||||| |||||    
T  11291 tctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactgaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctcgaagtgaacct 11390  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaagg 566  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  11391 cggatctccatccgacacaatactcgaagg 11420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 253 - 578
Target Start/End: Original strand, 34 - 359
Alignment:
Q  253 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaact 352  Q
    |||||||||||||| || |  || || || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| || ||||    
T  34 gactcaaaccaacataatgaagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgtcattccaatactagaatgataactattattgtacgtgaact 133  T
Q  353 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatc 452  Q
    | ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| |||||||||||||||| | |  |||||| |||||||| | |||||||||    
T  134 ctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcttcaagagactgaatcgtcctctccgactgaccatc 233  T
Q  453 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgac 552  Q
     ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||  || ||||   |||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||| | ||| ||     
T  234 tgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaaggctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 333  T
Q  553 acaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||||| || ||||| | |||||||||    
T  334 acaatgctcgaaggaacaccatgcaa 359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 37 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 1006 - 466
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  |||||||||| || ||||| || ||||||||| | || |||||||| || || || ||  |||| ||||||| ||| ||||| |    
T  1006 ggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaa-acgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctac 908  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||| | | ||| || ||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||  || ||||||||    
T  907 gcttttcatgataactcttttgtcgactctgtgacgcttccatcttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtttgttgaacaatctctggtcctaa 808  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   |  | || || || ||||||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| | |||| || |     
T  807 gatgactctttcacctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactggaatgataattg 708  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || ||||| || ||||| ||| | || | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| | ||||||||||| || |    |||||| ||||    
T  707 ttattgtacgtgaactctatccatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaacactcaacaaatcctctagcaactgaatcgtcc 608  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| |||||  |||| || || |||||||||||||| ||||  ||||||||  ||| |||||| | ||||||| |||||||||| ||    
T  607 tctccgactgaccatctgtctgctgatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctctttcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 508  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
     ||||| | ||| || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  507 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 37 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 26049 - 25508
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||  || || || |||| |||| | || |||| ||| |||||||| ||  ||||||||||||   ||||||| |    
T  26049 ggagtcaacttcttcgacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatccccctcttgaaactcaagggcctttctac 25950  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||    |||||||| ||||| |||||||| |  || || |  |||||||| |     
T  25949 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgagacgctttcatcttttcccttatcatctttaccttctccgtagtctgatggaccaaatccggtcccag 25850  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || |||||||  |||||||||| || || ||  || | |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  ||||     
T  25849 cacaacactctctcctaactcaaaccagcataaaggattcttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 25750  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||        ||||||    ||||||||||    || ||  ||||||  ||||| |||||    || ||  |||    
T  25749 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcatgtacccacactctcagtaaatcctccaatgattggatcatcc 25650  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || | |||||||||| ||||||| |||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  25649 tctctgaccgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaatctcttccataatctagaagtgaacct 25550  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    |||||| | ||||||||||||||| || || | |||||||||    
T  25549 cggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgcaa 25508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 36 - 167
Target Start/End: Original strand, 16797 - 16928
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | |||||||||| | |||||||     
T  16797 aggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctt 16896  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttctgtctactctg 167  Q
    | ||| ||||| ||||||||||| | ||||||    
T  16897 cgcttgtcatggtaactcttctgccgactctg 16928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 4)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 259 - 542
Target Start/End: Original strand, 17785 - 18068
Alignment:
Q  259 aaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatca 358  Q
    |||||||||||||  || ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||| || || || ||||| ||||    
T  17785 aaccaacacaacgaagttctacatctctgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattttatgtgaactcgatca 17884  T
Q  359 acggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctg 458  Q
      || | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |    |||||| |||||||| | ||||||||| |||||    
T  17885 gtggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctg 17984  T
Q  459 aggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatc 542  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||    
T  17985 cggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatc 18068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 578
Target Start/End: Original strand, 14177 - 14702
Alignment:
Q  53 acttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 152  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||  |||||||||  || || ||  |||||||||||| |||  | || | |||||||||||||||    
T  14177 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactatcaaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatctctcctacgcttatcatgataact 14276  T
Q  153 cttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccg 252  Q
    ||| |||| |||||| ||| | ||||| || |||||||||||||||||||| |  |||||||  || ||||  |  |||||||| |   |  | || ||     
T  14277 cttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttcttggtagtttgctgaacaatctatggtcctaagaccactctttcacct 14376  T
Q  253 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaact 352  Q
    || ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||| ||||||| || || || ||||    
T  14377 gattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactattattatacgtgaact 14476  T
Q  353 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatc 452  Q
      ||||| || | |      |||||| |  | |||| ||| | ||||||| | |||||||||||||| ||   |||||| |||||||| | |||| ||||    
T  14477 atatcaatggaagatgactttcccaagttcctccttactcaagaacacaaaccctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgagcatc 14576  T
Q  453 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgac 552  Q
     || || || || || || |||||||| ||||| ||||   | |||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||||| | ||| |||    
T  14577 tgtttgcggctgatacgccgaactcaacctcaacttagaatctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgac 14676  T
Q  553 acaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||||| || ||| | | |||||||||    
T  14677 acaatgctcgaatgaacaccatgcaa 14702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 433 - 560
Target Start/End: Original strand, 31928 - 32055
Alignment:
Q  433 gtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaa 532  Q
    |||||||| | ||||| ||| || || ||||| ||||| |||||||| | ||| || |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  31928 gtcctctccgactgacaatctgtttgcggatgataagctgaactcaaccccaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtga 32027  T
Q  533 acctcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||    
T  32028 acctcggatctctatccgacacaatact 32055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 364
Target Start/End: Original strand, 31532 - 31859
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||| || || || |||| || | | || |||| |||||||||||  ||  ||||||||||||   |||| || |    
T  31532 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagaagtaactctcagaaacacatgatatccctcttgaaactcaagggccttcctac 31631  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| ||||| ||||||| |||||| ||| | ||||| ||||||   |||||||| || || |  |||||||  || || |  |||| ||| ||    
T  31632 gcttgtcatggtaactattctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctatgtagtttgatgaaccaaatccgatcccaa 31731  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | |  | |||||  |||||||||| || || || ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||| |||  ||||||| | |||  ||||     
T  31732 cacaacgctttctcctaactcaaaccagcataaaggagtcatgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatatcaatactcgaatggtaactg 31831  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 364  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  31832 ttgttgtacgtgaactctatcaacggta 31859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 560
Target Start/End: Original strand, 42905 - 43428
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||| | ||| |||||||||||  | |||||||| |    ||||||||    
T  42905 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgaccctaagaaaaacatgatcaccctcctgaaactctagggactttctcc 43004  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| ||||| ||||||| |||||| ||| | ||||| |||||    |||||||| || || |  ||||| || || || |  |||||||| ||    
T  43005 gcttgtcatggtaactattctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttcttagtagtctcatgaaccaagtccggtcccaa 43104  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    ||   || ||||||| ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||| | |||  ||||     
T  43105 caccacactctctcctgactcaaaccagcatagaggagtcctacacctccgaccatacaacgcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 43204  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  ||||||||||||| |||||    || || ||||    
T  43205 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcc 43304  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||  |||  || | |||||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||| |||||    
T  43305 tctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaaattcagcttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaacctagaagtgaacct 43404  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    |||||||| ||| || ||||||||    
T  43405 cggatccctatctgatacaatact 43428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 52047 - 51720
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||| | || || || |||| |||| | || |||| |||||||||||| ||  ||||||||||||   |||| || |    
T  52047 ggagtcaacttcttagacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctac 51948  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| |||||  ||  | ||||| ||||||   |||||||| ||||| ||||||||||  || || |  |||||||| ||    
T  51947 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgaagctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtttgatgaaccaaatccggtcccaa 51848  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    ||   || | ||||| ||||||||||||||||| || ||| | |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| | |||  ||||     
T  51847 cactacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtcatgcacctccgactatacaaagcttcgaacggtgtcataccaatactcgaatggtaactg 51748  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 364  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  51747 ttgttgtacgtgaactctatcaacggta 51720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 447 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 51637 - 51524
Alignment:
Q  447 accatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccga 546  Q
    |||||| || || ||||| ||||| |||||||| || || || |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||| || |||| |||||| |||| | |    
T  51637 accatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctaaaagtgaacctcagatctcta 51538  T
Q  547 tccgacacaatact 560  Q
    ||||||||||||||    
T  51537 tccgacacaatact 51524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 560
Target Start/End: Original strand, 248735 - 249258
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | |||||||| |    ||||||||    
T  248735 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactctagggactttctcc 248834  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||| |||||    |||||||| || || |  ||||| || || || |  | |||||| ||    
T  248835 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttcttagtagtctcatgaaccaagttcggtcccaa 248934  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    ||   || ||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||| || ||||| | |||  ||||     
T  248935 caccacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctcctaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaactg 249034  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || ||||| || ||||| |||| |||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  ||||||||||||| |||||    || || ||||    
T  249035 ttattgtatgtgaactctatcagcggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaacgattggatcgtcc 249134  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||||||  | |||||||||| ||| ||  |||| ||||||||    
T  249135 tctcagactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaggtaaacct 249234  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    |||||||| ||| |||||||||||    
T  249235 cggatccctatctgacacaatact 249258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 433 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 997 - 855
Alignment:
Q  433 gtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaa 532  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||| |    
T  997 gtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtga 898  T
Q  533 acctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  897 acctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatg 855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 36 - 578
Target Start/End: Original strand, 9464 - 10006
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    |||||||| |||| |  |||||||||| || ||||| || ||||||||| | || ||||| || || || || ||  ||||||||||||  || || ||     
T  9464 aggagtcaccttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaacaatacgtggtctccttcttgaaactcaaggtctttccta 9563  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 235  Q
    | |||||||||||||||||| |||| |||||  ||| ||||||| || |||||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||  || |||||||    
T  9564 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgccttcatcttctcttgaatcatcttaacctactcggtagtttgttaaacaatctctggtccta 9663  T
Q  236 acaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaact 335  Q
    | |   |  | || || |||||||||||||||||| | || || || ||||||||||||||||||||  | |||| | |||||||||||| |||| ||||    
T  9664 aaaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacagagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgtaaggtgcccttccaatactagaatgataact 9763  T
Q  336 attgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtc 435  Q
    ||  ||||| || ||||  ||||| |||| |   |   ||| | |  | |||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |    |||||| |||    
T  9764 atcattgtacgtgaactttatcaatggtagatgattaaccctagttcctccttgctcaagtacacaagctctcaacaagtcttctagcgactgaatcgtc 9863  T
Q  436 ctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacc 535  Q
    ||||| | |||| |||| || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||  |  |||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||| |    
T  9864 ctctccgactgatcatctgtttgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttagaacgtaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatc 9963  T
Q  536 tcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    | ||||| | ||| || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  9964 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 10006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 575
Target Start/End: Original strand, 4154 - 4691
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||| || || ||||| || ||||||||| | || |||||||| |||||||| ||  ||| ||||||||  || || || |    
T  4154 ggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttaaaactcaaggtctttcctac 4253  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||||||||  |||||||| |||| |||||| ||| | ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||| || | ||| ||||||||    
T  4254 gcttatcatagtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcatcttaaccttctcagtagtttattgaacgatttctggtcctaa 4353  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   || |||| || || || |||||||||||||  || || || || |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |     
T  4354 aactacactctcacctgattcgaaccaacacaacgaagttctgca-cttcttccatacaaagcctcaaacggtgccattccaatactagaatgataattg 4452  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || ||||| || ||||| || || || | |      |||||| |  | |||||||| |  | |||| ||||||| || || | |||   |||||| ||||    
T  4453 ttattgtacgtgaactctattaatggaagatgactatcccaagtttctccttgctcaagtaaacaaactctcaagaagtccttcaacgactgaatcgtcc 4552  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | | ||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||   || |||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  4553 tctccgaccgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttataacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacct 4652  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
    |||||| | ||| || ||||| || ||||| | ||||||    
T  4653 cggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 4691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 5)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 299
Target Start/End: Original strand, 20244 - 20506
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| | || | ||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||   |||||||||    
T  20244 ggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataagagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctcc 20343  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||| ||||||  ||||||||| || |||| |||||| || || || |  |||||||| ||    
T  20344 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctaatcatcttgacttttttcgtagtctcatgaaccaaatccggtcccaa 20443  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagc 299  Q
    ||   || ||||||| ||||||||||| || || || |||||||||||||||| |||||||||    
T  20444 caccacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgactatacaaagc 20506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 323
Target Start/End: Original strand, 43627 - 43913
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||  | ||||| ||||| || || ||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||   |||||||||    
T  43627 ggagtcaacttcctcgaattcaatgcacgtcctaccccggtcataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctcc 43726  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| |||||  ||||||||| || |||||  ||| | ||||| ||||||   ||||||||||| ||||| ||||| || || || |  |||| ||| ||    
T  43727 gcttgtcatggcaactcttctatcgactctacgacgctttcatcttttctctgatcatcttaactttttctgtagtctcatgaaccaaatccgttcccaa 43826  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatact 323  Q
    ||   || ||||||| |||||| |||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || |||||    
T  43827 caccacactctctcctgactcataccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatact 43913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 323
Target Start/End: Original strand, 44639 - 44925
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||  | ||||| ||||| || || ||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||   |||||||||    
T  44639 ggagtcaacttcctcgaattcaatgcacgtcctaccccggtcataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctcc 44738  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| |||||  ||||||||| || |||||  ||| | ||||| ||||||   ||||||||||| ||||| ||||| || || || |  |||| ||| ||    
T  44739 gcttgtcatggcaactcttctatcgactctacgacgctttcatcttttctctgatcatcttaactttttctgtagtctcatgaaccaaatccgttcccaa 44838  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatact 323  Q
    ||   || ||||||| |||||| |||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || |||||    
T  44839 caccacactctctcctgactcataccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatact 44925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 434 - 566
Target Start/End: Original strand, 44024 - 44156
Alignment:
Q  434 tcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaa 533  Q
    ||||||| | ||||||||   |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||||||  | || ||||||| ||| ||  ||||||| ||    
T  44024 tcctctccgactgaccatgtatctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaccccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaa 44123  T
Q  534 cctcggatcccgatccgacacaatactagaagg 566  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  44124 cctcggatccctatccgacacaatactcgaagg 44156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 434 - 566
Target Start/End: Original strand, 45036 - 45168
Alignment:
Q  434 tcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaa 533  Q
    ||||||| | ||||||||   |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||||||  | || ||||||| ||| ||  ||||||| ||    
T  45036 tcctctccgactgaccatgtatctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaccccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaa 45135  T
Q  534 cctcggatcccgatccgacacaatactagaagg 566  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  45136 cctcggatccctatccgacacaatactcgaagg 45168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 66; Significance: 7e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 444 - 195
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||  ||||||||||||| || || || |    
T  444 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtccaacaccggttacaggattgactctcaaaaacacatggtccccttcttgaaactcaatgtctttcctac 345  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||||||||| ||  | || |||| |||||| ||| | ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||  || |||| ||| ||||| ||    
T  344 gcttatcatggtagttgttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcatcttaaccttctcagtagtttgctgtacaatttctggtcccaa 245  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctcc 286  Q
     |  ||| |||| || || || |||||||||||| | |||||||||||||    
T  244 aactgcactctcacctgattcgaaccaacacaacagagtcctacacctcc 195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 66; Significance: 7e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 578
Target Start/End: Original strand, 3997 - 4538
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||| || || |||| |||| | ||  ||| |||||||||||| ||  ||||||||||||   | || || |    
T  3997 ggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtgactatcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaaggactttcctac 4096  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| | |||  ||| | ||||| ||||||   |||||||| ||||| |||||||| |  || || |  || ||||| ||    
T  4097 gcttgtcatggtaactcttctgtcgattctccgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaactaaatctggtcccaa 4196  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    ||   || | ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||| ||| ||||||||   |||  ||||     
T  4197 cactacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtcctgcacctccgaccatacgaagcttcgaacggtgccataccaatactcaaatggtaactg 4296  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||| |      ||||||    |||||||||| |  |||||  || |||||||||| || ||    ||||| || |    
T  4297 ttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactatcaacaaatcctctaacgattgaatcgttc 4396  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | |||||||||  |||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||  | ||||| |||||    
T  4397 tctccgactgaccatctctctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacct 4496  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    |||||| |  |||||||||||||| || || | |||||||||    
T  4497 cggatctctttccgacacaatactcgatggaacaccatgcaa 4538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 66; Significance: 7e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 247 - 560
Target Start/End: Original strand, 40071 - 40383
Alignment:
Q  247 tctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaag 346  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||| | |||||||||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||| | |||  |||| |||||||| |    
T  40071 tctcccgactcaaaccaacataaaggagtc-tgcacctccgaccatacagagcttcaaacattgtcataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacg 40169  T
Q  347 taaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctg 446  Q
    | ||||| ||||| |||| |      ||||||    |||||||||| |  |||||  ||||||||||||| |||||   |||||| |||||||| | |||    
T  40170 tgaactctatcaaaggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaacaaatcctccaatgactgaatcgtcctctccgactg 40269  T
Q  447 accatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccga 546  Q
    ||||||  | || ||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| | |    
T  40270 accatctctttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctcta 40369  T
Q  547 tccgacacaatact 560  Q
    ||||||||||||||    
T  40370 tccgacacaatact 40383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 115 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 25825 - 25405
Alignment:
Q  115 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagttt 214  Q
    ||||||||||  ||||| || | ||||||||||||| |||| |||| |||||| ||| | ||||| |||||||| || | ||||||||| || |||||||    
T  25825 tgaaactcaaagtccttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggattaacttaaccttctcagtagttt 25726  T
Q  215 cttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcat 314  Q
      || || |  || ||||| || |   || |||| || ||||| |||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||| || || |||| |||    
T  25725 gctgaacgatatctggtcccaaaactacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagttctacacttctgaccatacaaagcttcgaatggtgccat 25626  T
Q  315 tccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaa 414  Q
    ||||||||||| |||| |||| || ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  |||||||||  |  |||||| ||||||||||     
T  25625 tccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttccaccttgctaaagtacacaaactctcaacaag 25526  T
Q  415 tcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactct 514  Q
    || |||||   |||||| || || || | ||||||||| ||||  ||||| || || |||||||| ||||| ||||  || |||||  ||||||||||||    
T  25525 tcctccaacgactgaattgttctttcagactgaccatctgtctccggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactct 25426  T
Q  515 cccaaaatttagaagtaaacc 535  Q
     ||||||| ||||||||||||    
T  25425 tccaaaatctagaagtaaacc 25405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 14435 - 14108
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | | ||||||||   |||| || |    
T  14435 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctaaaactcaagggccttcctac 14336  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||| |||||||  |||||||| ||  | ||  |||| |  |  || |  |||||||| ||    
T  14335 gcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctttgatcatcttgactatctctatagtctgataaaccaaatccggtcccaa 14236  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || ||||||| |||||||||||  | || || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  ||||     
T  14235 cacaacactctctcctgactcaaaccaggataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 14136  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 364  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  14135 ttgttgtatgtgaactctatcaacggta 14108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 39 - 578
Target Start/End: Original strand, 3264 - 3803
Alignment:
Q  39 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctc 138  Q
    |||||||||| |  ||||||| || || ||||| || ||||||||| | || |||||||| |||||||| ||  ||||||||| ||  || || || | |    
T  3264 agtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaacttaaggtctttcctacgc 3363  T
Q  139 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaaca 238  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||  || | ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||| || || ||      
T  3364 ttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttggatcatcttaaccttctcagtagtttgttgcacgatttctggccccaaat 3463  T
Q  239 aagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactatt 338  Q
       || |||| |  ||||||||| ||||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||  |||| ||    
T  3464 ttacactctcacttgactcaaactaacacaatggagttctgcatctccggccatacaaagcctcgaatggtgccattccaatactagaatggtaactgtt 3563  T
Q  339 gttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctc 438  Q
     |||||  | ||||| || ||||| | |      |||||| |  | |||||||| |  ||| || |||||||||| |||| |||   || ||| || ||     
T  3564 attgtacatgaactctattaacggaagatgactatcccaagtttctccttgctcaagtacagaaactctcaacaagtctttcaacgactaaatcgttctt 3663  T
Q  439 tctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcg 538  Q
    || | ||||||||  |||||  |||| || || |||||||| ||||| ||||  || |||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  3664 tccgactgaccatttgtctgcagatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcg 3763  T
Q  539 gatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    |||| | ||| || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  3764 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 3803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 61; Significance: 7e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 128 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 5545 - 5113
Alignment:
Q  128 cctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttc 227  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||| ||||||   |||||||| || || ||  |||| || || || |  ||    
T  5545 cctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctatagtctcatgaaccaaatc 5446  T
Q  228 cggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagca 327  Q
    |||||| ||||   || ||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||| || ||||| | |    
T  5445 cggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccatcagaaaggagtcctacacctccgaccatccaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaa 5346  T
Q  328 tgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactct 427  Q
    ||  |||| |||||||| || ||||| ||||  ||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  ||||||||||||| |||||    |    
T  5345 tggtaactgttgttgtatgtgaactctatcattggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgatt 5246  T
Q  428 gaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttaga 527  Q
    | || |||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  |||||| || | |||||||||| ||| ||  ||||    
T  5245 ggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaaacatcctgcaaactcttccagaacctaga 5146  T
Q  528 agtaaacctcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    ||| ||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  5145 agtgaacctcaaatccctatccgacacaatact 5113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 7220 - 6934
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||| || || |||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||   | ||||| |    
T  7220 ggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtaaccctcagaaacacatgatctccctcttgacactcaagggcttttctac 7121  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||   |||| ||| |||||||| |||||||  || || |  || ||||| ||    
T  7120 gcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatattttctcttatcaacttgaccttttctgtagtttgatgaactaaatctggtcccaa 7021  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatact 323  Q
    ||   || | |||   |||||||||||||||||  | || || ||||||||||||||||| || || |||||| |||| ||||||||    
T  7020 caccacactttctgtcgactcaaaccaacacaattgagttctgcacctccgaccatacaatgcttcgaacggtatcataccaatact 6934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 362
Target Start/End: Original strand, 7502 - 7824
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || || ||  | |||||||||| ||| ||||| |  |    
T  7502 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgtt 7601  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||||||||||| ||| || || ||||| | ||| |||   ||||||||||| |     
T  7602 tatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtctgttgaacagtctccggtcctaagac 7701  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | || || ||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  7702 cactctttcacctgactcgaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataactatta 7801  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacgg 362  Q
    ||||| || ||||| ||||||||    
T  7802 ttgtatgtgaactcgatcaacgg 7824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 426 - 533
Target Start/End: Original strand, 7877 - 7984
Alignment:
Q  426 ctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaattta 525  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||| || || ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| ||    
T  7877 ctgaattgtcctctccgcctgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 7976  T
Q  526 gaagtaaa 533  Q
    ||||||||    
T  7977 gaagtaaa 7984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 542
Target Start/End: Original strand, 7522 - 8024
Alignment:
Q  40 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || |||||||| || || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  7522 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 7621  T
Q  140 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 239  Q
    |||||||||||||| | |||| ||| || ||| | ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||  || ||||  |  |||||||| |     
T  7622 tatcatgataactcatttgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctttggtcctaagac 7721  T
Q  240 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattg 339  Q
      |  | || ||  |||||||||| |||||||| || || || ||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||     
T  7722 cactctttcacctaactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataaaaaacctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactatta 7821  T
Q  340 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 439  Q
    ||||| || ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||   ||||||||||| || |     ||||| || ||||    
T  7822 ttgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatcctctagcgattgaattgttctct 7921  T
Q  440 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 539  Q
    | | ||||||||| || || ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  7922 ccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 8021  T
Q  540 atc 542  Q
    |||    
T  8022 atc 8024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 578
Target Start/End: Original strand, 1127 - 1662
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||  | || ||||| || |||||||| ||  |||  |||||||  || ||||| |    
T  1127 ggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggggtgactctcaagaatacatgatctccttctttgaactcaaggtcttttctac 1226  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     |||||||||||||||||| || | |||||| |||   ||||  ||||||| |||| |||||||||| || ||||||| |||       || ||||||||    
T  1227 gcttatcatgataactcttttgccgactctgcgacgatttcactttttctt-aatcgtcttaaccttctcagtagtttgttgtc-----tctggtcctaa 1320  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
     |   ||||||| || |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| || |     
T  1321 aaccacattctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataaatg 1420  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    || | ||| || ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |||| ||| |  |||||| |||| ||||||||||| ||   || ||| || |    
T  1421 ttatagtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaaattcctcctttctcaagtacacaaactcttaacaaatcttctaacgactaaatcgttc 1520  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||  || |||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  1521 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactaaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaaact 1620  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
      |||| | ||| || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  1621 aagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 1662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 542
Target Start/End: Original strand, 49691 - 50120
Alignment:
Q  113 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 212  Q
    ||||||||||||  || || || | ||||||||||||| |||| || | |||||| ||| | ||| | |||||||||||||||||||| || || |||||    
T  49691 cttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataaatcttttgccaactctgcgacgctttcctcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagt 49790  T
Q  213 ttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtc 312  Q
    || ||| ||||  ||  ||||||| | | |  | |  || |||||||||||||||||||| || || || ||| ||||||||||||||||| | |||| |    
T  49791 ttgttgaacaatctcgagtcctaaaacaaccctttaacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctctgaccatacaaagcctcataaggtgcc 49890  T
Q  313 attccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 412  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||| || ||| | ||||| ||   | |    ||  || |  | |||||||| |  |||||| |||| ||||    
T  49891 attccaatactagaatgataactattattgtacgtgaacactatcaatggaggataactatcgaaagttcctccttgctcaagtacacaaactcttaaca 49990  T
Q  413 aatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaact 512  Q
    |||||||  |   |||||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||  || |||||  ||||||||||    
T  49991 aatcttcttacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaact 50090  T
Q  513 ctcccaaaatttagaagtaaacctcggatc 542  Q
     | ||||||| |||||||||| || |||||    
T  50091 tttccaaaatctagaagtaaatcttggatc 50120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 434 - 578
Target Start/End: Original strand, 19121 - 19265
Alignment:
Q  434 tcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaa 533  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||  ||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  19121 tcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaa 19220  T
Q  534 cctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
     || ||||| | ||| || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  19221 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 19265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 493 - 578
Target Start/End: Original strand, 34604 - 34689
Alignment:
Q  493 cccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||| | |||||||||    
T  34604 cccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 34689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 578
Target Start/End: Original strand, 2873 - 3414
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||  | ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||| ||| |||||||  ||  ||||||||||||   ||||||| |    
T  2873 ggagtcaacttctcagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcataaatacatgatatccctcttgaaactcaagggcctttctac 2972  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||| ||||| |||||    |||||||| || || || || || |  || || |  |||||||| ||    
T  2973 gcttgtcatggtaacccttctgtcgactctgcgacactttcatcttttcccttatcatcttgactttctctgttgtctgatgaaccaaatccggtcccaa 3072  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || ||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| | |||  ||||     
T  3073 cacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagctttgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 3172  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||        ||||||    ||||||| || |  |||||  ||||||  ||||| |||||    || || ||||    
T  3173 ttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagcaccaccttgttcaagcacacacactctcagtaaatcctccaatgattggattgtcc 3272  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||  | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| |||  ||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  3273 tcttcgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcattttgcagactcttccaaaatctagaagtgaacct 3372  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    | |||| | ||||||||||||||| || || | |||||||||    
T  3373 cagatcactatccgacacaatactcgacggaacaccatgcaa 3414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 139 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 13277 - 13060
Alignment:
Q  139 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaaca 238  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||  | |||||  | ||| ||||||| || |||||||| || ||||  || ||||  ||| |||| ||||    
T  13277 ttatcatgatagctcttctgtctactttgtgatgctttcattctctctcgaatcattttgaccttttcggtcgtttgctgaacaatctccagtcccaaca 13178  T
Q  239 aagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactatt 338  Q
      ||| |||| || |||||  |||||||||| ||||| | ||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||| ||    
T  13177 ctgcaatctcgccagactcgtaccaacacaaaggtgttcgacatctcctaccatacaacgcctcaaatggtgtcatcccaatactagaatggaaactgtt 13078  T
Q  339 gttgtaagtaaactcaat 356  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  13077 gttataagtaaactcaat 13060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 139 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 3437 - 3001
Alignment:
Q  139 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaaca 238  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| ||| | ||||| || |||   ||||||||||| || || ||||| |  || || |  |||| ||| ||||    
T  3437 ttatcacgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttaactttctctgtagtctgatgaaccaaatccgttcccaaca 3338  T
Q  239 aagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactatt 338  Q
     | || ||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  |||| ||    
T  3337 caacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgtt 3238  T
Q  339 gttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctc 438  Q
    ||| || || ||||| ||||| ||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  ||| ||||||||| ||||||   || || || | |    
T  3237 gttctatgtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactcgcaacaaatcctccaaagattggatcgtgccc 3138  T
Q  439 tctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcg 538  Q
    || | ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||  ||||| || |  ||||||||  | |||||||||| ||| ||| || |||| |||||||    
T  3137 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcatgcaaactcttccagaatctataagtgaacctcg 3038  T
Q  539 gatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  3037 gatccctatccgacacaatacttgacggtacaccatg 3001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 364
Target Start/End: Original strand, 5335 - 5662
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| || || || ||||  ||| | || |||||||| |||||||||||  | ||||||||||   |||| ||||    
T  5335 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctcc 5434  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||| | ||||| ||||     |||||||| ||||| || || || |  || || |  |||||||| ||    
T  5435 gcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatctttttccttatcatcttgaccttctcagtcgtctgatgaaccaaatccggtcccaa 5534  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || ||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||| |||| | |||  ||||     
T  5535 cacaacactctctcctgactcaaaccagcataacggagtcctgcacttccgaccatacaaagctttgaacggtgccataccattactcgaatggtaactg 5634  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 364  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  5635 ttgttgtatgtgaactctatcaacggta 5662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 1333 - 810
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||| || || |||| |||| | |  |||| |||||||||||| ||  ||||||||||||   |||| || |    
T  1333 ggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacccgtcataggaatgattctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctac 1234  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| ||||| ||||||| |||||| ||| | ||||| ||||||   |||||||| || || | |||||| |  || || |  || ||||| ||    
T  1233 gcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttcttcgtagtctgatgaactaaatctggtcccaa 1134  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    ||   |||| ||||  |||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||  ||| |||||||| | |||  |||||    
T  1133 caccacattttctcttgactcaaaccaacatagaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggttccataccaatactcgaatggtaacta 1034  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    ||||||||  | ||||| |||||||||| |      ||||||    |||||||||| |  |||||  |||||| || ||| || ||    ||||| || |    
T  1033 ttgttgtacatgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcgagtacacacactctcagcagatcctctaacgattgaatcgttc 934  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| || || ||| | ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||  | ||||| |||||    
T  933 tctccgactgaccatctgtttgcggacgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacct 834  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    |||||| | |||||||||||||||    
T  833 cggatctctatccgacacaatact 810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 573
Target Start/End: Original strand, 27641 - 28177
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||| | ||||| || || || |||| |||| | || |||| |||||||||||| ||  | ||||||||||   |||| || |    
T  27641 ggagtcaacttcttcgacttcgatgcacgtcctacacctgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcctgaaactcaagggccttcctac 27740  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||| |||||||  |||||||| || || || ||||| |  || ||    || ||||| ||    
T  27741 gcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctttgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccgaatctggtcccaa 27840  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || | ||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||| | || ||||||| ||| |||||||| | |||  ||||     
T  27841 cacaacactttctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaaacttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 27940  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || || || ||||||||||        ||||||    ||||||| || |  |||||  ||||||  ||||| |||||    || || ||||    
T  27941 ttgttgtatgtgaattctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtcc 28040  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||  ||||| || | |||||| ||  |||||||||||| ||||||| || |||| |||||    
T  28041 tctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgatcccaaggcgtcttgcaaactcttccaaaatctataagtgaacct 28140  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtatacca 573  Q
    |||||| | ||| ||||||||||| || |||| ||||    
T  28141 cggatctctatctgacacaatacttgacggtacacca 28177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 433 - 573
Target Start/End: Original strand, 34290 - 34430
Alignment:
Q  433 gtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaa 532  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||  ||||| || | |||||| ||  |||||||||||| ||||||| || |||| |    
T  34290 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgatcccaaggcgtcttgcaaactcttccaaaatctataagtga 34389  T
Q  533 acctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtatacca 573  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||| || |||| ||||    
T  34390 acctcggatctctatctgacacaatacttgacggtacacca 34430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 58000 - 57674
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| || || || ||||  ||| | || |||||||| |||||||||||    ||||||||||   |||||||||    
T  58000 ggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcacccttctgaaactcaagggcctttctcc 57901  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||||||||| ||||| || |||| |||||| ||| | ||||| |||||    |||||||| ||| | || || || |  || || |  |||||||| ||    
T  57900 gcttatcatggtaactttt-tgtcaactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccctctcagtcgtctgatgaaccaaatccggtcccaa 57802  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || ||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  ||||     
T  57801 cacaacactctctcctgactcaaaccagcataacggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 57702  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 364  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  57701 ttgttgtaggtgaactctatcaatggta 57674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 253 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 49001 - 48890
Alignment:
Q  253 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaact 352  Q
    ||||| |||||||| || || || || |||||||||||||||||||| ||  |||||| ||| |||||||| | |||  |||| |||||||| || ||||    
T  49001 gactcgaaccaacataaaggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgtacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaact 48902  T
Q  353 caatcaacggta 364  Q
    | ||||||||||    
T  48901 ctatcaacggta 48890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 427 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 48828 - 48695
Alignment:
Q  427 tgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttag 526  Q
    ||||| ||||| || | ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| || || || |  ||||| ||| |||||||||||| |||| || | |    
T  48828 tgaatcgtcctttccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccttaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaacatcttg 48729  T
Q  527 aagtaaacctcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    |||| |||||||||||   |||||||||||||||    
T  48728 aagtgaacctcggatctttatccgacacaatact 48695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 53 - 578
Target Start/End: Original strand, 8 - 532
Alignment:
Q  53 acttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 152  Q
    ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||| |||||||||||| ||  ||||||||||||   |||| || | ||| ||||| |||||    
T  8 acttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaact 107  T
Q  153 cttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccg 252  Q
    |||||| | |||||  ||| | ||||| ||||||   |||||||| ||||| |||||||| |  || || |  |||||||| ||||   || | |||||     
T  108 cttctgccgactctatgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacactacactttctcct 207  T
Q  253 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaact 352  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| || |||| |  |||  ||||||| | |||  |||| |||||||| || ||||    
T  208 gactcaaaccaacataatggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacgttc-cataacaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaact 306  T
Q  353 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatc 452  Q
    | |||| ||||| |      ||||||    ||||||| || |  |||||  |||||| |||||| || |    |||||| || ||||| | |||||||||    
T  307 ctatcatcggtagatgactatcccaagctccaccttggtcaagtacacacactctcagcaaatcctctagcgactgaatcgttctctccgactgaccatc 406  T
Q  453 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgac 552  Q
     || || ||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||| | |||||||    
T  407 tgtttgtggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatctctatccgac 506  T
Q  553 acaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    |||||||| || |||| | |||||||    
T  507 acaatactcgatggtacatcatgcaa 532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 117 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 884 - 639
Alignment:
Q  117 aaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttct 216  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||  ||| | ||||| || ||||||||||||| ||| || || |||||||      
T  884 aaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtttgc 785  T
Q  217 tgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattc 316  Q
    || ||||  || |||||||| |   |  | || || ||||||||||| ||||| || || || || ||||||||||| |||||||| || |||| |||||    
T  784 tgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaatggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattc 685  T
Q  317 caatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacgg 362  Q
    ||||||||| | || ||||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  684 caatactagaacgataactattattgtatgtgaactcgatcaacgg 639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 52363 - 51835
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| || || ||  ||| |||| | ||||||| ||| |||||||| ||  | ||||||||||   |||||||||    
T  52363 ggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctcctgaaactcaagggcctttctcc 52264  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||  | ||||| ||||||   |||||||| || || || ||||| || || || |  || | ||| ||    
T  52263 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatctgatcccaa 52164  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    ||   |  ||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||||| | |||  ||||     
T  52163 caccaccctctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaactg 52064  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  ||||||| || || |||||    || || ||||    
T  52063 ttgttgtatgtgaactctatcaaaggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaataa-tcctccaatgattggatcgtcc 51965  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||||||  | || ||||||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  51964 tctccgactgaccatctgtctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaatctagaagtgaacct 51865  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaagg 566  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  51864 cggatccctatccgacacaatactcgaagg 51835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 61397 - 60869
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| || || ||  ||| |||| | ||||||| ||| |||||||| ||  | ||||||||||   |||||||||    
T  61397 ggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctcctgaaactcaagggcctttctcc 61298  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||  | ||||| ||||||   |||||||| || || || ||||| || || || |  || | ||| ||    
T  61297 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatctgatcccaa 61198  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    ||   |  ||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||||| | |||  ||||     
T  61197 caccaccctctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaactg 61098  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  ||||||| || || |||||    || || ||||    
T  61097 ttgttgtatgtgaactctatcaaaggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaataa-tcctccaatgattggatcgtcc 60999  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||||||  | || ||||||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  60998 tctccgactgaccatctgtctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaatctagaagtgaacct 60899  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaagg 566  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  60898 cggatccctatccgacacaatactcgaagg 60869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 67785 - 67257
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| || || ||  ||| |||| | ||||||| ||| |||||||| ||  | ||||||||||   |||||||||    
T  67785 ggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctcctgaaactcaagggcctttctcc 67686  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||  | ||||| ||||||   |||||||| || || || ||||| || || || |  || | ||| ||    
T  67685 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatctgatcccaa 67586  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    ||   |  ||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||||| | |||  ||||     
T  67585 caccaccctctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaactg 67486  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||        ||||||    |||||||||| |  |||||  ||||||| || || |||||    || || ||||    
T  67485 ttgttgtatgtgaactctatcaaaggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaataa-tcctccaatgattggatcgtcc 67387  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||||||  | || ||||||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  67386 tctccgactgaccatctgtctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaatctagaagtgaacct 67287  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaagg 566  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  67286 cggatccctatccgacacaatactcgaagg 67257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 91 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 12911 - 12446
Alignment:
Q  91 ctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaa 190  Q
    |||||||| |||||||||||  | ||||||||||   ||||||||| ||||||||| ||||| |||| || |||||  ||| | ||||| |||||    |    
T  12911 ctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctatcgactctacgacgctttcatcttttccctta 12812  T
Q  191 tcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgacc 290  Q
    ||||||| ||||| || || || |  || || |  || |||||||| | | || ||||||| ||||||||||| || ||  | ||||| |||||||||||    
T  12811 tcatcttgaccttctcagtcgtctgatgaaccaaatctggtcctaatacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaagagtcctgcacctccgacc 12712  T
Q  291 atacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgc 390  Q
    ||||||||| || ||||||| ||| || ||||| | |||  |||| |||||||| || ||||| ||||| ||||   |     | |||    |||| ||     
T  12711 atacaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatggtaactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggta----gcacaagctccaccatgt 12616  T
Q  391 tccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttag 490  Q
    || |  |||||  ||||||||||||| |||||    || || ||||| || | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |    
T  12615 tcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctttccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcg 12516  T
Q  491 ttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
      ||||||||  | |||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12515 aacccaaagcgtcctgcaaactcttccaaaatctagatgtgaacctcggatccctatccgacacaatact 12446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 427 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 5092 - 4945
Alignment:
Q  427 tgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttag 526  Q
    ||||| ||| |||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || |  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||    
T  5092 tgaatcgtcatctcagactgaccatctgtctgcggatgataagccgaacttaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctag 4993  T
Q  527 aagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccat 574  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||||||| || |||| |||||    
T  4992 aagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggtacaccat 4945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 37 - 560
Target Start/End: Original strand, 9920 - 10438
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||| || || || | || |||| | || |||| |||||||||||| ||  |||||||||||     | | || |    
T  9920 ggagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcctacacccgccataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactca-----cgtcctac 10014  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||| ||||||   |||||||| ||||| |||||||| |  || || |  || ||||| ||    
T  10015 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaactaaatctggtcccaa 10114  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    ||   || | ||||| | |||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  ||||     
T  10115 caccacactttctcccgtctcaaaccaacataaaggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 10214  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||| |      ||||||    ||||||| || |  | |||  |||||| |||||| || ||    ||||| || |    
T  10215 ttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgttcaagtagacacactctcagcaaatcctctaacgattgaatcgttc 10314  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
    |||| | ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||| |||| ||||||| ||||||| | ||||| |||||    
T  10315 tctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgaaaactcttccaaaatcttgaagtgaacct 10414  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatact 560  Q
     ||||| | |||||||||||||||    
T  10415 tggatctctatccgacacaatact 10438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 36 - 167
Target Start/End: Original strand, 28088 - 28219
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    |||| |||||||| |  |||||| |||||| ||||| || ||||| ||| | || ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||     
T  28088 aggattcaacttctttgacttcacagcacgtccaacaccagtcaccggagtaactctcaaaaacacatgatcaccctcttgaaattcaagatcctttcta 28187  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttctgtctactctg 167  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  28188 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 28219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 433 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 7025 - 6898
Alignment:
Q  433 gtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaa 532  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  7025 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtga 6926  T
Q  533 acctcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    ||||| |||| | ||| |||||||||||    
T  6925 acctcagatctctatctgacacaatact 6898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 433 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 11456 - 11329
Alignment:
Q  433 gtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaa 532  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  11456 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtga 11357  T
Q  533 acctcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    ||||| |||| | ||| |||||||||||    
T  11356 acctcagatctctatctgacacaatact 11329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 36 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 1354 - 1104
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||| |||||||||||| ||  ||||||||||||   |||| ||     
T  1354 aggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttccta 1255  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 235  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||   || ||||| ||||| |||||||| |  || || |  |||||||| |    
T  1254 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgagacgctttcatcttttctcttattatcttgaccttctccgtagtctaatgaaccaaatccggtccca 1155  T
Q  236 acaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctcc 286  Q
    ||| | || | ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  1154 acataacactttctcctgactcgaaccaacacaaaggagtcctgcacctcc 1104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 247 - 560
Target Start/End: Original strand, 2126 - 2439
Alignment:
Q  247 tctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaag 346  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  |||| | |||||| |    
T  2126 tctcctgactcgaaccaacataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgtagttgtacg 2225  T
Q  347 taaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctg 446  Q
    | ||||| ||||||||||        ||||||   ||||||||||| |  |||||  |||||| |||||| || ||    | ||| |||||||| | |||    
T  2226 tgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctacaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattaaatcgtcctctccgactg 2325  T
Q  447 accatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccga 546  Q
    |||||| ||||  ||||| || || |||||||| ||||| ||||  ||||| ||| |||||||||||| |||||||   ||||| ||||||||||  | |    
T  2326 accatctgtctacggatgatatgccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcgtgaagtgaacctcggatgtcta 2425  T
Q  547 tccgacacaatact 560  Q
    ||||||||||||||    
T  2426 tccgacacaatact 2439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 253 - 362
Target Start/End: Original strand, 46566 - 46675
Alignment:
Q  253 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaact 352  Q
    ||||||||||| |||||||| || || || |||| |||||| |||||||| || |||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||    
T  46566 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctcctaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtaagtgaact 46665  T
Q  353 caatcaacgg 362  Q
    | ||||||||    
T  46666 cgatcaacgg 46675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 61 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 86664 - 86366
Alignment:
Q  61 gcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtc 160  Q
    ||||| ||||| ||||||||| || | || || ||||||||||| |  ||  |||||||||||| |||||| || |  ||||||||||||||||| ||||    
T  86664 gcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctaaaaaacacatggtatccttcttgaaactcaagatccttcctacgattatcatgataactcttttgtc 86565  T
Q  161 tactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaa 260  Q
    ||||||| ||| | | ||| ||||||   |||| ||||||||| || ||||| | ||| | ||  || ||||| |  |   || |||| ||||||||| |    
T  86564 tactctgtgacgcttccatcttttctcttatcaacttaaccttctcagtagtctgttgaaaaatgtctggtcccagtaccacagtctcaccggactcata 86465  T
Q  261 ccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaa 359  Q
    |||||||||| | || || || |||||||||||||| || || ||||||  |||| |||| |||| |||  |||| || || ||||| ||||| |||||    
T  86464 ccaacacaacagagttctgcatctccgaccatacaacgcttcgaacggtaccattgcaatgctagaatggtaactgttattataagtgaactcgatcaa 86366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1001 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1001
Description:

Target: scaffold1001; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 256 - 359
Target Start/End: Original strand, 12 - 115
Alignment:
Q  256 tcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaa 355  Q
    ||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||| || || || ||||| |    
T  12 tcaaaccaacacaacggagttttgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgtcattccaatactagaatgataactattattatacgtgaactcta 111  T
Q  356 tcaa 359  Q
    ||||    
T  112 tcaa 115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 37 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 10267 - 9940
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||  || || || |    
T  10267 ggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaaggtctttcctac 10168  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||  | ||||| || |||   |||||||| || || || ||||| || || || |  |||||||| ||    
T  10167 gcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgatgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctcatgaaccaaatccggtcccaa 10068  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | || | ||||| ||| ||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||| |||||||| | |||  ||||     
T  10067 cacaacactttctcccgacccaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatggtaactg 9968  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 364  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  9967 ttgttgtatgtgaactctatcaacggta 9940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 503 - 575
Target Start/End: Original strand, 12082 - 12154
Alignment:
Q  503 cttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||| || ||||| || ||||| | ||||||    
T  12082 cttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 12154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 427 - 578
Target Start/End: Original strand, 5262 - 5413
Alignment:
Q  427 tgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttag 526  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||| |||||  |||| ||||  |||||||| ||||| || |  ||||| ||| ||||||| |||| ||||||| |||    
T  5262 tgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcagatgataagttgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccaaaatctag 5361  T
Q  527 aagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    |||| ||||||| ||| | ||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  5362 aagtgaacctcgaatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgcaa 5413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 364
Target Start/End: Original strand, 4872 - 5199
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||| ||| || ||||||| ||||  || || || |||| |||| | || |||| ||| |||||||| ||  ||||||||||||   ||||||| |    
T  4872 ggagtcaatttcttagacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctac 4971  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||| ||||||   |||||||| || || || ||||| |  || || |  || ||||| ||    
T  4972 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaaatctggtcccaa 5071  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    ||   || | ||||| |||||||||||  | || || || || |||||| ||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  ||||     
T  5072 caccacactttctcctgactcaaaccattataaaggagttctgcacctctgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactg 5171  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggta 364  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  5172 ttgttgtacgtgaactctatcaacggta 5199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 55 - 557
Target Start/End: Original strand, 1048 - 1550
Alignment:
Q  55 ttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactct 154  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || || ||||| ||||| || ||  | ||||||||||  || || || | |||||||||||||||||    
T  1048 ttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactct 1147  T
Q  155 tctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccgga 254  Q
    | |||| | |||| ||| | || || |||||||| |||  ||||| ||| || |||||||  || || |  || ||||| || |   || |||| || ||    
T  1148 tttgtcaaatctgcgacgctttaatcttttcttggatccacttaatcttctcagtagtttgctgaacgatatctggtcccaaaactacactctcacctga 1247  T
Q  255 ctcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactca 354  Q
    |||||||||||||||| | || || ||||||| |||||||||||| || || |||| |||||||||||||  |||| |||| || ||||| || |||||     
T  1248 ctcaaaccaacacaacagagttctgcacctccaaccatacaaagcttcgaatggtgccattccaatactaaaatgataactgttattgtacgtgaactct 1347  T
Q  355 atcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcgg 454  Q
    |||||||| | |      || ||| |  ||||||  || |  |||||| ||||||||||||| |||||   |||||| || || |  | || |||||| |    
T  1348 atcaacggaagatgactatctcaagttccaccttattcaagtacacaaactctcaacaaatcctccaacgactgaattgttcttttcgactaaccatctg 1447  T
Q  455 tctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacac 554  Q
    |||| ||||| ||  | ||||||||  |||| ||||  ||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| |||||    
T  1448 tctgcggatgatacaccgaactcaacttcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgacac 1547  T
Q  555 aat 557  Q
    |||    
T  1548 aat 1550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 256 - 578
Target Start/End: Original strand, 6390 - 6712
Alignment:
Q  256 tcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaa 355  Q
    |||||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||| |||| || || || || ||||| |    
T  6390 tcaaaccaacacaatggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcatagggtgccattccaatactagaatgataactgttattatacgtgaactcta 6489  T
Q  356 tcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggt 455  Q
    |||| || | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| | |||||||||||||| ||   |||||| |||||||| | ||||| |||  |    
T  6490 tcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgactatctat 6589  T
Q  456 ctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacaca 555  Q
     || ||||| || || |||||||| ||||| ||||   | |||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||||| | ||| ||||||    
T  6590 ttgcggatgatatgccgaactcaacctcaacttagaatctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacaca 6689  T
Q  556 atactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    ||  | ||||| | |||||||||    
T  6690 atggtcgaaggaacaccatgcaa 6712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 256 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 316 - 262
Alignment:
Q  256 tcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtg 310  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  316 tcaaaccaacacaatggcgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtg 262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 39072 - 38942
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||| || || |||| |||| | || |||| ||| |||||||||||  | ||||| |||| |||||||||     
T  39072 aggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgaccgacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttctt 38973  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttctgtctactct 166  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  38972 cgcttgtcatgataactcttctgtcgactct 38942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 253 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 38855 - 38785
Alignment:
Q  253 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatact 323  Q
    ||||||||||| || || || ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||||||    
T  38855 gactcaaaccagcataaaggagtcttacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatact 38785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 138 - 531
Target Start/End: Original strand, 15878 - 16271
Alignment:
Q  138 cttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaac 237  Q
    ||||||||| |||||||| |||| |||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||| ||| ||||  ||  |||||||     
T  15878 cttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttaactttctcagtagtttgttgaacaatctcgtgtcctaaa 15977  T
Q  238 aaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactat 337  Q
    |   |  | || ||  ||||||||||||||||||| || || || ||||||||| | ||||||||| | | || |||||||||||||| |||| || |||    
T  15978 accaccctttcacctaactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccaaaaaaagcctcataagatgccattccaatactagaatgataaatat 16077  T
Q  338 tgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcct 437  Q
    | ||||| || ||| | ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| |  |||||| |||||||||| || || |    |||||| || ||    
T  16078 tattgtacgtgaacactatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctctagcgactgaattgttct 16177  T
Q  438 ctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagta 531  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||  || |||||  |||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  16178 ctccgactgaccatctgtctgaggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagta 16271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 223
Target Start/End: Original strand, 15613 - 15800
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | ||  ||||||| || || || ||  |||||||||| |  |  || ||     
T  15613 aggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagaatgactgtcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcgaggtatttccta 15712  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaa 223  Q
    | ||||||||| |||||||| |||| |||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||| ||| ||||    
T  15713 cgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttaactttctcagtagtttgttgaacaa 15800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 444 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 18314 - 18198
Alignment:
Q  444 ctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcc 543  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||     
T  18314 ctgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaaccttggatct 18215  T
Q  544 cgatccgacacaatact 560  Q
    | || ||||||||||||    
T  18214 ctatacgacacaatact 18198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 36 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 18722 - 18394
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||  || || || |||| |||| | || |||| |||||||||||| ||  ||||||||||||   |||| ||     
T  18722 aggagtcaacttcttagacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttccta 18623  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 235  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||  | ||||| ||||||   |||||||| || || |||||||| |  || || |  || ||||| |    
T  18622 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtctgatgaactaaatctggtccca 18523  T
Q  236 acaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaact 335  Q
    ||    || | ||||| |||||||| ||||| || || ||  | |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  ||||    
T  18522 actctacactttctcctgactcaaatcaacataaaggagttttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaact 18423  T
Q  336 attgttgtaagtaaactcaatcaacggta 364  Q
     |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  18422 gttgttgtacgtgaactctatcaacggta 18394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 4)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 353
Target Start/End: Original strand, 18971 - 19287
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| || | || || |||||||| || || |||| |||| | || ||||| |||||||| || ||  ||||||||||||  |||||  | |    
T  18971 ggagtcaacttcttagattttaatgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatggtctccctcttgaaactcaaggtccttcatac 19070  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| |||||||| |||||||||  |||||| ||| | ||||| | |||||  |||| ||||| |||||| ||||| | ||| || |  |  || || ||    
T  19071 gcttgtcatgatagctcttctgttgactctgcgacgctttcatctgttcttttatcaacttaatcttttctgtagtctgttgaactatgtatggccccaa 19170  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    ||   || | ||||| ||||| ||||||||||| || || || || || ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||| | |||  |||||    
T  19171 catcacactttctcccgactcgaaccaacacaaaggagttctgcatcttcgaccatacaatgcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaacta 19270  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactc 353  Q
    |||||||||||||||||    
T  19271 ttgttgtaagtaaactc 19287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 353
Target Start/End: Original strand, 23133 - 23449
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| || | || || |||||||| || || |||| |||| | || ||||| |||||||| || ||  ||||||||||||  |||||  | |    
T  23133 ggagtcaacttcttagattttaatgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatggtctccctcttgaaactcaaggtccttcatac 23232  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| |||||||| |||||||||  |||||| ||| | ||||| | |||||  |||| ||||| |||||| ||||| | ||| || |  |  || || ||    
T  23233 gcttgtcatgatagctcttctgttgactctgcgacgctttcatctgttcttttatcaacttaatcttttctgtagtctgttgaactatgtatggccccaa 23332  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    ||   || | ||||| ||||| ||||||||||| || || || || || ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||| | |||  |||||    
T  23333 catcacactttctcccgactcgaaccaacacaaaggagttctgcatcttcgaccatacaatgcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaacta 23432  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactc 353  Q
    |||||||||||||||||    
T  23433 ttgttgtaagtaaactc 23449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 444 - 577
Target Start/End: Original strand, 19378 - 19511
Alignment:
Q  444 ctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcc 543  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| |  |||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||| |||  ||||||     
T  19378 ctgatcatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgaacccagagcatcttgcaaactcttctagaatctagaagtgaactgcggatct 19477  T
Q  544 cgatccgacacaatactagaaggtataccatgca 577  Q
    | ||||||||||||||| || || | ||||||||    
T  19478 ctatccgacacaatactcgacggaacaccatgca 19511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 444 - 577
Target Start/End: Original strand, 23540 - 23673
Alignment:
Q  444 ctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcc 543  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| |  |||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||| |||  ||||||     
T  23540 ctgatcatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgaacccagagcatcttgcaaactcttctagaatctagaagtgaactgcggatct 23639  T
Q  544 cgatccgacacaatactagaaggtataccatgca 577  Q
    | ||||||||||||||| || || | ||||||||    
T  23640 ctatccgacacaatactcgacggaacaccatgca 23673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 256 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 8293 - 8214
Alignment:
Q  256 tcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaact 335  Q
    ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  8293 tcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataact 8214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 426 - 533
Target Start/End: Original strand, 25485 - 25592
Alignment:
Q  426 ctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaattta 525  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||| | ||| ||||| || || |||||||||||||| ||||  ||||||||  |||||||||||| ||||||| ||    
T  25485 ctgaatcgtcctctccgactgaccatctgcctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatcta 25584  T
Q  526 gaagtaaa 533  Q
    ||||||||    
T  25585 gaagtaaa 25592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 4)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 28953 - 28830
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||  || || |||||| || | || |||||||||||||| || ||  ||||||||||||  |||||||| |    
T  28953 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgacagacacctgtcacatgagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtcctttctac 28854  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtc 160  Q
     ||| |||||||||||||||||||    
T  28853 gcttgtcatgataactcttctgtc 28830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 40944 - 40821
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||  || || |||||| || | || |||||||||||||| || ||  ||||||||||||  |||||||| |    
T  40944 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgacagacacctgtcacatgagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtcctttctac 40845  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtc 160  Q
     ||| |||||||||||||||||||    
T  40844 gcttgtcatgataactcttctgtc 40821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 28709 - 28625
Alignment:
Q  280 cacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggta 364  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  |||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  28709 cacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggta 28625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 40700 - 40616
Alignment:
Q  280 cacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggta 364  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  |||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  40700 cacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggta 40616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 7422 - 6884
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || ||  ||| || | | ||||||| ||| |||||||||||  | ||||||| ||   |||| || |    
T  7422 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccatcatagaagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaacttaagggccttcctac 7323  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||  | ||||| ||||||   |||||||| || || || ||||  |  || || |  |||||||| ||    
T  7322 gcttgtcatgataactcttatgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagactgatgaaccaaatccggtcccaa 7223  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaacta 336  Q
    || | ||  |||||| ||| ||||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| | ||| |||||||| | |||  ||||     
T  7222 cacaacaccctctcctgacacaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatataaagcttcgaacggcgccataccaatacttgaatggtaactg 7123  T
Q  337 ttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcc 436  Q
    |||||||| || ||||| ||||||| || |      ||||||    |||||||||| |  |||||  ||||||  ||||| ||||||   || || ||||    
T  7122 ttgttgtacgtgaactctatcaacgttagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctccaaagattgtatcgtcc 7023  T
Q  437 tctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacct 536  Q
     ||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||  ||||| || |  ||||||||  ||||||||||||  || ||| ||||||| |||||    
T  7022 actccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaacgcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaactctttcagaatctagaagtgaacct 6923  T
Q  537 cggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
    |||||| | ||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  6922 cggatctctatccgacacaatacttgacggtacaccatg 6884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 253 - 359
Target Start/End: Original strand, 1603 - 1709
Alignment:
Q  253 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaact 352  Q
    |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||| ||| | |||| ||||||| ||||| || ||||    
T  1603 gactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcataaggtgccattccaacactggaatgataactattattgtacgtgaact 1702  T
Q  353 caatcaa 359  Q
    | |||||    
T  1703 ctatcaa 1709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 433 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 2663 - 2521
Alignment:
Q  433 gtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaa 532  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| | | |||||||||||| ||||||| | ||||| |    
T  2663 gtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggaatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtga 2564  T
Q  533 acctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
    |||| ||||| | |||||| |||||||| || |||| ||||||    
T  2563 accttggatctctatccgatacaatactcgacggtacaccatg 2521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 578
Target Start/End: Original strand, 6702 - 6847
Alignment:
Q  433 gtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaa 532  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||| ||||  |||||| ||||||| ||||||| |    
T  6702 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaatttcgaacccaacgcatcttgtgaactcttccaaaatctagaagtga 6801  T
Q  533 acctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    |||| || || | ||| ||||| ||||| || || |||||||||||    
T  6802 accttgggtctctatcggacactatactcgaggggataccatgcaa 6847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 344
Target Start/End: Original strand, 6305 - 6613
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaa-aaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | |||||||  ||| ||||| |||||  | ||||||||||  || || ||     
T  6305 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcaggaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtctttccta 6404  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtccta 235  Q
    | ||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||| | ||||| || |||   |||||||| || || || ||||| || || || |  |||||||| |    
T  6405 cgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctatgatcatcttgactttctcagtagtctcatgaaccaaatccggtccca 6504  T
Q  236 acaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaact 335  Q
    ||| | || | |||||  |||||||| | || || || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  ||||    
T  6505 acacaacactttctcccaactcaaacaagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatacttgaatggtaact 6604  T
Q  336 attgttgta 344  Q
    |||||||||    
T  6605 attgttgta 6613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 5186 - 4913
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 136  Q
    |||||||||||| || |||||||  ||| ||| || || |||| |||| | |  |||| |||||||||||| ||  ||||||||||||   ||||||| |    
T  5186 ggagtcaacttcttagacttcaacacacaacctacacccgtcataggagtgattctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctac 5087  T
Q  137 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaa 236  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||| ||||||   |||||||| ||||| ||||| || |  || || |  |  ||| | ||    
T  5086 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtggtctgatgaactaaatatggttccaa 4987  T
Q  237 caaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtg 310  Q
    ||   || | |||||  |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  4986 caccacactttctccccactcaaaccaacacaaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtg 4913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 444 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 1749 - 1633
Alignment:
Q  444 ctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcc 543  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||  |||| || |  | ||| ||| |||||||||||| ||||||  | ||||| |||||||||||     
T  1749 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaacttcaactttgaactcaatgcatcttgcaaactcttccaaaacctcgaagtgaacctcggatct 1650  T
Q  544 cgatccgacacaatact 560  Q
    | ||| |||||||||||    
T  1649 ctatctgacacaatact 1633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 406 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 33134 - 32963
Alignment:
Q  406 ctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagctt 505  Q
    |||||||||||||||||    || || |||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||| || |  |||||| || | |    
T  33134 ctcaacaaatcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaatcatcct 33035  T
Q  506 gcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgca 577  Q
    ||||||||| ||| ||  |||| || ||||||||||||| |||||||  |||||| || |||| ||| ||||    
T  33034 gcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcggatccctatccgacgaaatactcgacggtacaccgtgca 32963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 560
Target Start/End: Original strand, 1046 - 1173
Alignment:
Q  433 gtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaa 532  Q
    |||||||| | ||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| ||| ||||||| |||| ||  ||| ||||||| |    
T  1046 gtcctctccgactgaccatctgtctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttcctgaatctagaagtga 1145  T
Q  533 acctcggatcccgatccgacacaatact 560  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  1146 acctcagatctctatccgacacaatact 1173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 247 - 364
Target Start/End: Original strand, 860 - 977
Alignment:
Q  247 tctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaag 346  Q
    ||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||| || || || | ||| |||||||| | |||  |||| || ||||| |    
T  860 tctcccgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaaaggagccataccaatactcgaatggtaactgttattgtatg 959  T
Q  347 taaactcaatcaacggta 364  Q
    | ||||| ||||||||||    
T  960 tgaactctatcaacggta 977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 460 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 81593 - 81478
Alignment:
Q  460 ggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatac 559  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||||||  | ||||| |||| ||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  81593 ggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaagctcttccaaaatctagatgtgaacctcggatccctatccgacacaatac 81494  T
Q  560 tagaaggtataccatg 575  Q
    | || |||| ||||||    
T  81493 tcgacggtacaccatg 81478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 5235 - 5189
Alignment:
Q  13 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaa 59  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5235 acatcaaatggcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaa 5189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 404 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 6152 - 5990
Alignment:
Q  404 ctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagc 503  Q
    ||||||||||||| |||||    || || |||||||| | |||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||||||  |    
T  6152 ctctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctatctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtc 6053  T
Q  504 ttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaagg 566  Q
     || ||||||  ||| ||  ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  6052 ctgtaaactcatccagaacctagaagtgaacctcagatccctatccgacacaatactcgaagg 5990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 253 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 6305 - 6235
Alignment:
Q  253 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatact 323  Q
    ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||| || |||||    
T  6305 gactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacgatgccatacctatact 6235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 531 - 581
Target Start/End: Original strand, 7881 - 7931
Alignment:
Q  531 aaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatct 581  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  7881 aaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaatatcatgcaatct 7931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 55 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 10905 - 10600
Alignment:
Q  55 ttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactct 154  Q
    ||||| |||||||| |  || ||||||||| | || |||||||||||||| || ||  |||| ||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  10905 ttcaaggcacgacctatacctgtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgtaactcaagatcctttctacacttgtcatgataactct 10806  T
Q  155 tctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccgga 254  Q
    | |||| |||||| ||| | ||||| || |||   ||||  ||  |||| || ||||| | ||| || |  || ||||| ||||   || | || || ||    
T  10805 tttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctcttatcaa-ttggccttctctgtagtctgttgaactatatctggtcccaacattacactttcacccga 10707  T
Q  255 ctcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactca 354  Q
    |||||||||||  ||||| || || |||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  |||| |||||||| |||||| |     
T  10706 ctcaaaccaacgtaacggagttctgcacctccgaccacacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtaaacact 10607  T
Q  355 atcaacg 361  Q
    |||||||    
T  10606 atcaacg 10600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 274 - 364
Target Start/End: Original strand, 136269 - 136359
Alignment:
Q  274 gtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggta 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | ||   |||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  136269 gtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaattgtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggta 136359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0924 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0924
Description:

Target: scaffold0924; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 212
Target Start/End: Original strand, 4012 - 4188
Alignment:
Q  36 aggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctc 135  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||| || || || |||| |||| | || |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||   |||| ||     
T  4012 aggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccatcttgaaactcaagggccttccta 4111  T
Q  136 ctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 212  Q
    | ||| ||||| |||||||| |||| |||||  ||| | ||||| ||||||   |||||||| || || ||||||||    
T  4112 cgcttgtcatggtaactcttatgtcgactctacgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagt 4188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 433 - 575
Target Start/End: Original strand, 41437 - 41577
Alignment:
Q  433 gtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaa 532  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||  || ||||| || |  ||||||||  |||||||||||| ||| ||| ||||||| |    
T  41437 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaac--aacctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaactcttccagaatctagaagtga 41534  T
Q  533 acctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 575  Q
    ||| |||||| | || |||||||||||| || |||| ||||||    
T  41535 accccggatctctattcgacacaatactcgacggtacaccatg 41577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 3802 - 3740
Alignment:
Q  138 cttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttcttgaatcatcttaac 200  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| || |||||||||||||||||    
T  3802 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaac 3740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 397 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 3638 - 3513
Alignment:
Q  397 acacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttccca 496  Q
    |||||| ||||||||||||| || |    |||||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||  ||||    
T  3638 acacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaaccca 3539  T
Q  497 aagcagcttgcaaactctcccaaaat 522  Q
    ||||  |||| ||||| | |||||||    
T  3538 aagcctcttgtaaacttttccaaaat 3513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 385 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 19838 - 19645
Alignment:
Q  385 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 484  Q
    |||||||| | ||||||| | ||||||||||| || ||   |||||| ||| || | | ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||    
T  19838 ccttgctcaagaacacaaaccctcaacaaatcctctaacgactgaattgtcttcaccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctca 19739  T
Q  485 atttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaa 578  Q
    | ||||  || |||||  ||| |||||| | ||| ||| |||||||||| || ||||| | ||| |||||||| || ||||| | |||||||||    
T  19738 acttagaacctaaagcctctttcaaacttttccataatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 19645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 1367 - 1091
Alignment:
Q  88 accctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatattttctt 187  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||  | ||||||||||  || || || | ||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||      
T  1367 accctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcaactctgcgacgctttcatcttctccc 1268  T
Q  188 gaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaaagcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccg 287  Q
     ||||||||| || || |||||||| || || || |  ||||| || |||| | || | ||||| | ||| ||||| || || || ||||| ||||||||    
T  1267 taatcatcttgactttctccgtagtctcatgaaccaaatccggccccaacacaacactttctcccgtctcgaaccagcataaaggagtcctgcacctccg 1168  T
Q  288 accatacaaagcctcaaacggtgtcattccaatactagcatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacggta 364  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||  |||| || ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  1167 accatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttattgtatgtaaattctatcaatggta 1091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 472 - 575
Target Start/End: Original strand, 4428 - 4531
Alignment:
Q  472 gaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtatac 571  Q
    |||||||| ||||| ||||  || |||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | ||| || ||||| || ||||| | ||    
T  4428 gaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatatagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 4527  T
Q  572 catg 575  Q
    ||||    
T  4528 catg 4531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 472 - 575
Target Start/End: Original strand, 11558 - 11661
Alignment:
Q  472 gaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtatac 571  Q
    |||||||| ||||| ||||  || |||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | ||| || ||||| || ||||| | ||    
T  11558 gaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatatagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 11657  T
Q  572 catg 575  Q
    ||||    
T  11658 catg 11661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 487 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 9801 - 9706
Alignment:
Q  487 ttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatgcaatctg 582  Q
    ||||||| |||||  ||| ||||||||||| |||| ||  |||||||||||  |||||||||| ||||||| || ||  | |||||||||||||||    
T  9801 ttagttctcaaagtcgctagcaaactctcctaaaacttcaaagtaaacctcaaatcccgatccaacacaatgctcgacagaataccatgcaatctg 9706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 427 - 554
Target Start/End: Original strand, 4942 - 5069
Alignment:
Q  427 tgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttag 526  Q
    ||||| || ||||| | ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||  ||| | | | |||||||||||| ||||||  | |    
T  4942 tgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccgaggaatcttgcaaactcttccaaaaccttg 5041  T
Q  527 aagtaaacctcggatcccgatccgacac 554  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||    
T  5042 aagtaaacctcgaatctctatccgacac 5069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 123
Target Start/End: Original strand, 1299 - 1385
Alignment:
Q  37 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactca 123  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||| || || |||| |||| | || |||| |||||||||||| ||  |||||||||||    
T  1299 ggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactca 1385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 165 - 36
Alignment:
Q  38 gagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcct 137  Q
    ||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || |||||| || | || || ||||| |||||||| ||  ||||||||||||  || || || |     
T  165 gagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctaaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacg 66  T
Q  138 cttatcatgataactcttctgtctactctg 167  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  65 cttatcatgataattcttttgtcgactctg 36  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University