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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
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Alignment Overview
Query: NF6762_low_3 (Length: 505)
Name: NF6762_low_3
Description: NF6762
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF6762_low_3 |
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Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 441; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 441; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 2486755 - 2486285
Alignment:
| Q |
22 |
gttgtaacagaccacccggttaacagaagcgtatatccagtcttatatatactgctgctagcaagtgcaacatcggtgatagaagtgacttttgtttcgt |
121 |
Q |
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| T |
2486755 |
gttgtaacagaccacccggttaacagaagcgtatatccagtcttatatatactgctgctagcaagtgcaacatcggtgatagaagtgacttttgtttcgt |
2486656 |
T |
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| Q |
122 |
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221 |
Q |
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| T |
2486655 |
ggaacgctgctgtcttcgtcttgatcggttggttgagcataattgaagtgattgttaaacaaaacaaggaagtaatccacaatgcagatagattagtttc |
2486556 |
T |
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| Q |
222 |
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321 |
Q |
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| T |
2486555 |
aaacacaaaacgggcaatgttaggaattagtgttatccgtgccctattctacattatttattatggcatagtgcatattgtcattttttaagttcgtttt |
2486456 |
T |
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| Q |
322 |
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421 |
Q |
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| T |
2486455 |
gaactcttatgtatggaacatgctttggattttgttgtatgaaagattaatgtttatgaatgaa--ataggttagtgtttatgatttttgtggctatgtg |
2486358 |
T |
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| Q |
422 |
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498 |
Q |
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| T |
2486357 |
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2486285 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 441; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 441; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 27089341 - 27088871
Alignment:
| Q |
22 |
gttgtaacagaccacccggttaacagaagcgtatatccagtcttatatatactgctgctagcaagtgcaacatcggtgatagaagtgacttttgtttcgt |
121 |
Q |
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| T |
27089341 |
gttgtaacagaccacccggttaacagaagcgtatatccagtcttatatatactgctgctagcaagtgcaacatcggtgatagaagtgacttttgtttcgt |
27089242 |
T |
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| Q |
122 |
ggaacgctgctgtcttcgtcttgatcggttggttgagcataattgaagtgattgttaaacaaaacaaggaagtaatccacaatgcagatagattagtttc |
221 |
Q |
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| T |
27089241 |
ggaacgctgctgtcttcgtcttgatcggttggttgagcataattgaagtgattgttaaacaaaacaaggaagtaatccacaatgcagatagattagtttc |
27089142 |
T |
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| Q |
222 |
aaacacaaaacggacaatgttaggaattagtgttatccgtgccctattctacattatttattatggcatagtgcatattgtaattttttaagttcgtttt |
321 |
Q |
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| T |
27089141 |
aaacacaaaacgggcaatgttaggaattagtgttatccgtgccctattctacattatttattatggcatagtgcatattgtcattttttaagttcgtttt |
27089042 |
T |
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| Q |
322 |
gaactcttatgtatggaacatgctttggattttgttgtatgaaagattaatgtttatgaatgaaatataggttagtgtttatgatttttgtggctatgtg |
421 |
Q |
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| T |
27089041 |
gaactcttatgtatggaacatgctttggattttgttgtatgaaagattaatgtttatgaatgaa--ataggttagtgtttatgatttttgtggctatgtg |
27088944 |
T |
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| Q |
422 |
agcatttctaattcaaaagcaacaaatacgtacataaataatttttgttgtgttgtgtttaatggtatatcaatatt |
498 |
Q |
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| T |
27088943 |
agcatttctaattcaaaagcaacaaa----tacataaataatttttgttgtgttgtgtttaatggtatatcaatatt |
27088871 |
T |
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