View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6774_low_35 (Length: 233)

Name: NF6774_low_35
Description: NF6774
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6774_low_35
NF6774_low_35
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (1-214)||(18710877-18711090)
chr8 (6-214)||(44563395-44563603)
chr8 (1-209)||(19658756-19658964)
chr8 (1-209)||(33244956-33245164)
chr8 (39-214)||(22080589-22080764)
chr8 (1-221)||(16283740-16283960)
chr8 (28-221)||(2136963-2137156)
chr8 (9-193)||(16277853-16278037)
chr8 (1-193)||(27608637-27608829)
chr8 (26-193)||(14557940-14558107)
chr8 (27-220)||(33259040-33259233)
chr8 (1-193)||(3329239-3329431)
chr8 (1-220)||(19674732-19674951)
chr8 (26-193)||(19688414-19688581)
chr8 (27-220)||(19208065-19208258)
chr8 (27-220)||(28361660-28361853)
chr8 (27-220)||(31489455-31489648)
chr8 (9-129)||(189393-189513)
chr8 (1-193)||(19286753-19286945)
chr8 (1-220)||(29829613-29829832)
chr8 (1-193)||(12092456-12092648)
chr8 (37-124)||(9354950-9355037)
chr8 (1-124)||(31354815-31354938)
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (1-214)||(2775651-2775864)
chr7 (1-214)||(26484986-26485199)
chr7 (1-214)||(26682638-26682851)
chr7 (1-214)||(39210661-39210874)
chr7 (1-221)||(16449629-16449849)
chr7 (1-209)||(4200839-4201047)
chr7 (1-221)||(16041615-16041835)
chr7 (1-200)||(2108657-2108856)
chr7 (1-209)||(31088107-31088315)
chr7 (1-209)||(45733752-45733960)
chr7 (9-193)||(2154873-2155057)
chr7 (1-193)||(5128284-5128476)
chr7 (9-193)||(10916527-10916711)
chr7 (1-193)||(11424435-11424627)
chr7 (1-193)||(26435549-26435741)
chr7 (1-193)||(31125212-31125404)
chr7 (26-220)||(5146972-5147166)
chr7 (27-220)||(26319501-26319694)
chr7 (1-220)||(3445598-3445817)
chr7 (1-124)||(11441864-11441987)
chr7 (1-124)||(26274822-26274945)
chr7 (1-220)||(31564022-31564241)
chr7 (26-220)||(16736092-16736286)
chr7 (26-220)||(16751146-16751340)
chr7 (26-220)||(17523849-17524043)
chr7 (26-220)||(17529172-17529366)
chr7 (27-193)||(26669573-26669739)
chr7 (27-220)||(9618969-9619162)
chr7 (42-191)||(18541132-18541281)
chr7 (9-193)||(16503039-16503223)
chr7 (9-193)||(16518075-16518259)
chr7 (1-193)||(26537529-26537721)
chr7 (1-124)||(24592269-24592392)
chr7 (42-191)||(5159852-5160001)
chr7 (27-157)||(4144818-4144948)
chr7 (39-124)||(45387673-45387758)
[»] chr3 (57 HSPs)
chr3 (1-214)||(31033910-31034123)
chr3 (1-214)||(32293004-32293217)
chr3 (1-221)||(16626292-16626512)
chr3 (1-221)||(18530640-18530860)
chr3 (1-209)||(5652639-5652847)
chr3 (1-209)||(5713479-5713687)
chr3 (1-209)||(5724389-5724597)
chr3 (1-209)||(5767771-5767979)
chr3 (1-209)||(4626196-4626404)
chr3 (1-193)||(18051514-18051706)
chr3 (1-136)||(5756954-5757088)
chr3 (9-221)||(6192576-6192788)
chr3 (2-221)||(4721884-4722103)
chr3 (1-193)||(7073464-7073656)
chr3 (9-193)||(8296232-8296416)
chr3 (1-209)||(17993582-17993790)
chr3 (1-193)||(18292167-18292359)
chr3 (1-193)||(18330921-18331113)
chr3 (9-221)||(29148541-29148753)
chr3 (1-193)||(35881018-35881210)
chr3 (26-193)||(8301081-8301248)
chr3 (1-220)||(48466179-48466398)
chr3 (9-191)||(15740910-15741092)
chr3 (1-193)||(4796467-4796659)
chr3 (9-193)||(15892520-15892704)
chr3 (1-193)||(18276866-18277058)
chr3 (1-193)||(18307468-18307660)
chr3 (1-220)||(20576634-20576853)
chr3 (1-220)||(21674945-21675164)
chr3 (1-220)||(28021527-28021746)
chr3 (1-220)||(51782275-51782494)
chr3 (42-220)||(20066336-20066514)
chr3 (27-220)||(5013990-5014183)
chr3 (27-220)||(24328437-24328630)
chr3 (1-193)||(10396385-10396577)
chr3 (1-193)||(18242991-18243183)
chr3 (1-124)||(4417171-4417294)
chr3 (1-220)||(5596144-5596363)
chr3 (26-193)||(6542276-6542443)
chr3 (1-220)||(36996864-36997083)
chr3 (27-220)||(47023731-47023924)
chr3 (1-193)||(8211990-8212182)
chr3 (1-193)||(11110163-11110355)
chr3 (26-193)||(28115768-28115935)
chr3 (1-220)||(29664757-29664976)
chr3 (42-191)||(32439447-32439596)
chr3 (1-220)||(5609109-5609328)
chr3 (27-220)||(28339580-28339773)
chr3 (1-124)||(4346570-4346693)
chr3 (1-124)||(5467237-5467360)
chr3 (39-124)||(18225481-18225566)
chr3 (1-193)||(22387392-22387584)
chr3 (37-124)||(22870739-22870826)
chr3 (37-124)||(22885798-22885885)
chr3 (1-191)||(31964289-31964479)
chr3 (39-124)||(7996852-7996937)
chr3 (39-124)||(10643360-10643445)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (1-214)||(22925769-22925982)
chr2 (1-221)||(21702898-21703118)
chr2 (2-221)||(19456155-19456374)
chr2 (1-214)||(16163886-16164102)
chr2 (6-209)||(27118980-27119183)
chr2 (6-209)||(34303049-34303252)
chr2 (1-209)||(3784941-3785149)
chr2 (1-209)||(31891074-31891282)
chr2 (1-209)||(34157297-34157505)
chr2 (1-220)||(9349717-9349936)
chr2 (26-221)||(20838230-20838425)
chr2 (1-220)||(32050085-32050304)
chr2 (9-221)||(27434178-27434390)
chr2 (9-221)||(28882509-28882721)
chr2 (9-193)||(12655837-12656021)
chr2 (1-220)||(27777509-27777728)
chr2 (1-220)||(27817267-27817486)
chr2 (42-220)||(34286682-34286860)
chr2 (42-220)||(34291742-34291920)
chr2 (27-220)||(19416234-19416427)
chr2 (1-220)||(12587097-12587316)
chr2 (1-220)||(12716337-12716556)
chr2 (1-220)||(13936279-13936498)
chr2 (1-220)||(16829073-16829292)
chr2 (1-220)||(16892189-16892408)
chr2 (1-220)||(27803994-27804213)
chr2 (1-220)||(39051557-39051776)
chr2 (27-220)||(37685644-37685837)
chr2 (27-220)||(37700909-37701102)
chr2 (27-220)||(37925806-37925999)
chr2 (1-193)||(37375448-37375640)
chr2 (26-193)||(11634948-11635115)
chr2 (26-193)||(11641137-11641304)
chr2 (1-220)||(39890361-39890580)
chr2 (27-221)||(31876594-31876788)
chr2 (27-220)||(34861993-34862186)
chr2 (9-221)||(23128300-23128512)
chr2 (37-220)||(260488-260671)
chr2 (1-193)||(40233798-40233990)
chr2 (37-193)||(21676944-21677100)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (1-214)||(28152152-28152365)
chr1 (1-221)||(20340080-20340300)
chr1 (2-221)||(20461372-20461591)
chr1 (1-221)||(16207776-16207996)
chr1 (27-220)||(28585297-28585490)
chr1 (1-193)||(51638508-51638700)
chr1 (1-191)||(41793083-41793273)
chr1 (27-124)||(10962986-10963083)
[»] chr6 (43 HSPs)
chr6 (1-214)||(14142980-14143193)
chr6 (1-214)||(26788232-26788445)
chr6 (1-214)||(27196605-27196818)
chr6 (1-214)||(27252422-27252635)
chr6 (1-214)||(13521768-13521981)
chr6 (1-214)||(22456638-22456842)
chr6 (1-209)||(33373956-33374164)
chr6 (1-209)||(8892011-8892219)
chr6 (1-209)||(8903246-8903454)
chr6 (1-209)||(28162945-28163153)
chr6 (1-220)||(17092129-17092348)
chr6 (9-221)||(13298639-13298851)
chr6 (1-193)||(27272296-27272488)
chr6 (9-193)||(27290086-27290270)
chr6 (1-191)||(29549763-29549953)
chr6 (9-221)||(24304306-24304518)
chr6 (9-193)||(26989297-26989481)
chr6 (1-193)||(26918668-26918860)
chr6 (1-220)||(4545464-4545683)
chr6 (26-193)||(15424033-15424200)
chr6 (1-220)||(34463035-34463254)
chr6 (27-220)||(16943716-16943909)
chr6 (1-193)||(16750142-16750334)
chr6 (9-221)||(22934568-22934780)
chr6 (9-221)||(23857013-23857225)
chr6 (1-220)||(4773294-4773513)
chr6 (1-220)||(30557705-30557924)
chr6 (27-220)||(29573327-29573520)
chr6 (9-193)||(24864013-24864197)
chr6 (1-221)||(27359680-27359900)
chr6 (1-221)||(27450023-27450243)
chr6 (1-193)||(27485417-27485609)
chr6 (1-220)||(4723823-4724042)
chr6 (1-220)||(16674427-16674646)
chr6 (1-220)||(26116099-26116318)
chr6 (1-220)||(29501703-29501922)
chr6 (26-220)||(27008040-27008234)
chr6 (1-193)||(4758052-4758244)
chr6 (1-124)||(27044676-27044799)
chr6 (1-220)||(28207742-28207961)
chr6 (1-124)||(4525574-4525697)
chr6 (38-129)||(27019461-27019552)
chr6 (27-193)||(3696395-3696561)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (1-221)||(2403-2623)
[»] chr5 (49 HSPs)
chr5 (1-214)||(33877547-33877760)
chr5 (1-209)||(29888736-29888944)
chr5 (1-221)||(22888770-22888990)
chr5 (1-209)||(13184303-13184510)
chr5 (1-221)||(25199329-25199549)
chr5 (1-220)||(23892506-23892725)
chr5 (1-209)||(11326094-11326302)
chr5 (1-209)||(13440148-13440356)
chr5 (1-209)||(9548197-9548405)
chr5 (9-193)||(30934941-30935125)
chr5 (1-193)||(23752120-23752312)
chr5 (9-221)||(22998756-22998968)
chr5 (9-221)||(23717630-23717842)
chr5 (9-221)||(24687799-24688011)
chr5 (1-193)||(33777787-33777979)
chr5 (26-193)||(24970343-24970510)
chr5 (27-220)||(30029741-30029934)
chr5 (1-220)||(6874605-6874824)
chr5 (1-220)||(43078552-43078771)
chr5 (27-220)||(12132481-12132674)
chr5 (26-193)||(11549679-11549846)
chr5 (26-221)||(15658402-15658597)
chr5 (1-220)||(24681740-24681959)
chr5 (1-220)||(24724267-24724486)
chr5 (37-220)||(30168805-30168988)
chr5 (1-220)||(31431740-31431959)
chr5 (1-220)||(33516656-33516875)
chr5 (1-220)||(40473192-40473411)
chr5 (42-193)||(41675050-41675201)
chr5 (27-220)||(9317777-9317970)
chr5 (1-220)||(2511351-2511570)
chr5 (1-220)||(3789841-3790060)
chr5 (1-220)||(13324472-13324691)
chr5 (1-220)||(37358286-37358505)
chr5 (1-191)||(31826079-31826269)
chr5 (27-124)||(5638236-5638333)
chr5 (27-124)||(29966805-29966902)
chr5 (1-193)||(18500400-18500592)
chr5 (1-193)||(28649535-28649727)
chr5 (1-124)||(18375151-18375274)
chr5 (37-220)||(28959429-28959612)
chr5 (1-124)||(30152318-30152441)
chr5 (37-220)||(32599115-32599298)
chr5 (1-220)||(37671126-37671345)
chr5 (42-191)||(33292866-33293015)
chr5 (37-220)||(34616854-34617037)
chr5 (1-124)||(37755280-37755403)
chr5 (27-124)||(26480718-26480814)
chr5 (37-193)||(37770657-37770813)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (1-221)||(15284673-15284893)
chr4 (1-221)||(15228176-15228396)
chr4 (1-220)||(1900563-1900782)
chr4 (1-209)||(24460362-24460570)
chr4 (46-214)||(15391090-15391258)
chr4 (1-199)||(14235292-14235490)
chr4 (9-221)||(24592059-24592271)
chr4 (9-221)||(14665332-14665544)
chr4 (9-193)||(17014314-17014498)
chr4 (37-220)||(21970043-21970226)
chr4 (1-193)||(14763077-14763269)
chr4 (1-193)||(36344288-36344480)
chr4 (1-220)||(6570159-6570378)
chr4 (1-220)||(18800359-18800578)
chr4 (27-220)||(40105384-40105577)
chr4 (1-124)||(27163159-27163282)
chr4 (1-220)||(30754060-30754279)
chr4 (1-220)||(31126264-31126483)
chr4 (42-191)||(24113009-24113158)
chr4 (1-193)||(54833693-54833885)
chr4 (1-124)||(5006179-5006302)
chr4 (37-220)||(33673544-33673727)
chr4 (1-220)||(39850944-39851163)
chr4 (27-193)||(14098873-14099039)
chr4 (42-191)||(34188735-34188884)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (32-200)||(21883-22051)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (1-193)||(391-583)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (9-221)||(46730-46942)
scaffold0089 (9-189)||(39846-40026)
scaffold0089 (37-193)||(30090-30246)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (9-193)||(27591-27775)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (9-193)||(30751-30935)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (1-193)||(9857-10049)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (27-220)||(6985-7178)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (27-193)||(25974-26140)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (1-193)||(6305-6497)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (26-193)||(14703-14870)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-220)||(8240-8459)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (37-106)||(46659-46728)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (1-220)||(8812-9031)
scaffold0159 (1-191)||(20306-20496)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (9-86)||(9-86)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 174; Significance: 9e-94; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 18710877 - 18711090
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18710877 ctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctc 18710976  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18710977 tctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaat 18711076  T
Q  201 catttgactatcag 214  Q
    ||||||||| ||||    
T  18711077 catttgactgtcag 18711090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 214
Target Start/End: Original strand, 44563395 - 44563603
Alignment:
Q  6 aacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgt 105  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||   || ||  ||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44563395 aacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgt 44563494  T
Q  106 ttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcattt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44563495 ttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaatcattt 44563594  T
Q  206 gactatcag 214  Q
    |||| ||||    
T  44563595 gactgtcag 44563603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19658964 - 19658756
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||  || || |||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19658964 ctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagaccggacgttcgtaacgttgcaactcctctggtgccactacccatcaagttatgccaagcctc 19658865  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  19658864 tctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcctgatgaacgacaat 19658765  T
Q  201 catttgact 209  Q
     || |||||    
T  19658764 tatctgact 19658756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 33244956 - 33245164
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||  || ||  ||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33244956 ctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctctcagaccggacgtttgtaacgttgcaactcctatggtgccactacacatcaaattatgccaagcctc 33245055  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || |||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||    
T  33245056 tctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagagcctgatgaacgacaat 33245155  T
Q  201 catttgact 209  Q
     || |||||    
T  33245156 tatctgact 33245164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22080764 - 22080589
Alignment:
Q  39 cttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtt 138  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  22080764 cttgacgttcgtaatgttgcaactcctctggtaccgctacacatcaagctatgccaagcctccttgtttgaccatgatcatgccaattgtccagaatgcc 22080665  T
Q  139 tctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactatcag 214  Q
     |  ||||| || |||||||| ||||||||| || || ||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||    
T  22080664 gccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgatatccagagcctgatgaacgacaattatctgactatcag 22080589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 16283740 - 16283960
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||||||||  |||||| |||||||||| |  ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||| ||    
T  16283740 ctgtgaacatgattgaagtatgtgaggaagctcctagacttgttgtccgtaatgtcacaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcttc 16283839  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    |||||||  |||||||||| ||| ||||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||  | |||    
T  16283840 tctgtttagccatgatcataccatttgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataat 16283939  T
Q  201 catttgactatcagtgatgtc 221  Q
      ||||||| |||||||||||    
T  16283940 tttttgactgtcagtgatgtc 16283960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 2137156 - 2136963
Alignment:
Q  28 aagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattg 127  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||||||||||||||| ||    
T  2137156 aagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtg 2137057  T
Q  128 cccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactatcagtgatgtc 221  Q
    || || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||| ||||||| | |||||||||    
T  2137056 cctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttttgactgttagtgatgtc 2136963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 193
Target Start/End: Original strand, 16277853 - 16278037
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| |||||||||     
T  16277853 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttta 16277952  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||| ||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  16277953 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgagttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaa 16278037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 27608829 - 27608637
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  27608829 ctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 27608730  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
     || ||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  27608729 cctattcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 27608637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Original strand, 14557940 - 14558107
Alignment:
Q  26 ggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaat 125  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||    ||||||||||||||     
T  14557940 ggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagtcatgatcatgccaag 14558039  T
Q  126 tgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  14558040 tgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 14558107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 220
Target Start/End: Original strand, 33259040 - 33259233
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaatt 126  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | |||||||||||||| |    
T  33259040 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 33259139  T
Q  127 gcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactatcagtgatgt 220  Q
    | |  | |||| || || ||| ||||||||||   | ||||||| ||||||| || |||||||||||  | |||| | ||||| ||||||||||    
T  33259140 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacattcaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 33259233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 3329431 - 3329239
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  3329431 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 3329332  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||     ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  3329331 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 3329239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 19674732 - 19674951
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  19674732 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 19674831  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| ||||||||| |  | |||    
T  19674832 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataat 19674931  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  19674932 cttctgactgtcagtgatgt 19674951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Original strand, 19688414 - 19688581
Alignment:
Q  26 ggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaat 125  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||||||||||||     
T  19688414 ggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaag 19688513  T
Q  126 tgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||| ||| | |||||||| |||||||||||    
T  19688514 tgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgtccaagatgacatccaaagcttgatgaa 19688581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19208258 - 19208065
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaatt 126  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | |||||||||||||| |    
T  19208258 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 19208159  T
Q  127 gcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactatcagtgatgt 220  Q
    | |  | |||| || || ||| ||||||||| |    ||||||| | |||||||| |||||||||||  | |||| | ||||| ||||||||||    
T  19208158 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 19208065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 28361853 - 28361660
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaatt 126  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | |||||||||||||| |    
T  28361853 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 28361754  T
Q  127 gcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactatcagtgatgt 220  Q
    | |  | |||| || || ||| ||||||||| |    ||||||| | |||||||| |||||||||||  | |||| | ||||| ||||||||||    
T  28361753 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 28361660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 31489648 - 31489455
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaatt 126  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | |||||||||||||| |    
T  31489648 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 31489549  T
Q  127 gcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | || |||  ||||  ||| |||||| ||||    ||||||| |||||||||| ||||||||| |  | |||| | ||||| ||||||||||    
T  31489548 gtctaggatgcctctgggatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 31489455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 189393 - 189513
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||      
T  189393 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttca 189492  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcc 129  Q
     ||||||||||||||| ||||    
T  189493 gccatgatcatgccaagtgcc 189513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 19286753 - 19286945
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  19286753 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 19286852  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  |  ||||||  |||||||||     ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  19286853 tctgttcagccatgatcatgccaaatgtctaggatgccttcgtaatcccttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 19286945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 29829613 - 29829832
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  29829613 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 29829712  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| |||||| ||||    ||||||| |||||||||| ||||||||| |  | |||    
T  29829713 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataat 29829812  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  29829813 cttctgactgtcagtgatgt 29829832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 12092648 - 12092456
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| |||||||  ||||||||||| || || || |||||| ||||| |||| ||    
T  12092648 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatattgtcactcctctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcttc 12092549  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    ||||||   ||||||||||| ||| || | || |||  || || ||  ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  12092548 tctgttcagccatgatcatgacaagtgtctaggatgcctccgtgattctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 12092456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 124
Target Start/End: Original strand, 9354950 - 9355037
Alignment:
Q  37 gacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||||||||||||    
T  9354950 gacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 9355037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 31354815 - 31354938
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||| ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  31354815 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcccagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 31354914  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
     |||||   |||||| ||||||||    
T  31354915 cctgttcagccatgagcatgccaa 31354938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 174; Significance: 9e-94; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 2775651 - 2775864
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2775651 ctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctc 2775750  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2775751 tctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctataatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaat 2775850  T
Q  201 catttgactatcag 214  Q
    ||||||||||||||    
T  2775851 catttgactatcag 2775864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 26484986 - 26485199
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26484986 ctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctc 26485085  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26485086 tctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaat 26485185  T
Q  201 catttgactatcag 214  Q
    ||||||||| ||||    
T  26485186 catttgactgtcag 26485199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26682851 - 26682638
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26682851 ctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctc 26682752  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26682751 tctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaat 26682652  T
Q  201 catttgactatcag 214  Q
    ||||||||| ||||    
T  26682651 catttgactgtcag 26682638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 39210874 - 39210661
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39210874 ctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctc 39210775  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39210774 tctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgtgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaat 39210675  T
Q  201 catttgactatcag 214  Q
    ||||||||| ||||    
T  39210674 catttgactgtcag 39210661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16449849 - 16449629
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  16449849 ctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactggacgtccgtaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctc 16449750  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  16449749 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcagaatgacatccagagcttgatgaacgacaat 16449650  T
Q  201 catttgactatcagtgatgtc 221  Q
     |||||||| |||| ||||||    
T  16449649 tatttgactgtcagcgatgtc 16449629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 4200839 - 4201047
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4200839 ctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctc 4200938  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||  |||||||| |||||    
T  4200939 tctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctacgttgttcagaatgacatccagagactgatgaacgacaat 4201038  T
Q  201 catttgact 209  Q
     || |||||    
T  4201039 tatctgact 4201047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 16041615 - 16041835
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||    
T  16041615 ctgtgaacatgattgaggtatacgaggaagctcccagactcgatgttcgtaacattgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgtcaagcctc 16041714  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||| | || |||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  16041715 tctgtttaatcacgatcataccaattgcccagaatgcttccgtaatcttttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaat 16041814  T
Q  201 catttgactatcagtgatgtc 221  Q
     |||||||| |||| ||||||    
T  16041815 tatttgactgtcagcgatgtc 16041835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 2108856 - 2108657
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2108856 ctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggactggacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaaattatgccaagcctc 2108757  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || |||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||    
T  2108756 tctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagagcctgatgaacgacaat 2108657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 31088315 - 31088107
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||   || ||  ||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31088315 ctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctc 31088216  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| |  |||||||| ||||||||| || |||||||||||  |||||||| |||||    
T  31088215 tctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatcctcggggttgctacgttgttcagaatgacatccagagactgatgaacgacaat 31088116  T
Q  201 catttgact 209  Q
     || |||||    
T  31088115 tatctgact 31088107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 45733752 - 45733960
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||   || ||  ||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45733752 ctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctc 45733851  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || |||||||| ||||||||| || ||||||||||   |||||||| |||||    
T  45733852 tctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagaaactgatgaacgacaat 45733951  T
Q  201 catttgact 209  Q
     || |||||    
T  45733952 tatctgact 45733960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 193
Target Start/End: Original strand, 2154873 - 2155057
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||      
T  2154873 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttca 2154972  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  2154973 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 2155057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 5128284 - 5128476
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || |||| || |||||||||  |||||||||||| |||  | | |||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||    
T  5128284 ctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccataacgtcgtaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttc 5128383  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    ||||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| ||||||||||| |  ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  5128384 tctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaa 5128476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 10916711 - 10916527
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||  |||| |||||||||     
T  10916711 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgtaaagcttctctgttta 10916612  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  10916611 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaa 10916527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 11424627 - 11424435
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || |||| || |||| ||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  11424627 ctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 11424528  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    ||||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  11424527 tctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaa 11424435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 26435549 - 26435741
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  26435549 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 26435648  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    ||||||   ||||||||||||| | || | || |||  || |||||| ||||||||||     ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  26435649 tctgttcagccatgatcatgccgagtgtctaggatgcctccgtaatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 26435741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 31125212 - 31125404
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  31125212 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatattgccactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 31125311  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  |  || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  31125312 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagtttgatgaa 31125404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 5147166 - 5146972
Alignment:
Q  26 ggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaat 125  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||  | | ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||||||||||||     
T  5147166 ggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgtaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaag 5147067  T
Q  126 tgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactatcagtgatgt 220  Q
    || | || |||  || || ||| ||||||||||     ||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||| | ||||| ||||||||||    
T  5147066 tgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 5146972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 26319694 - 26319501
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaatt 126  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | |||||||||||||| |    
T  26319694 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 26319595  T
Q  127 gcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactatcagtgatgt 220  Q
    | |  | |||| || || ||| ||||||||| |    ||||||| | |||||||| |||||||||||  | |||| | ||||| ||||||||||    
T  26319594 gactgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 26319501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 3445598 - 3445817
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || |||| || |||| ||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  3445598 ctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 3445697  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||   |||||| |||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| ||||||||| |  | |||    
T  3445698 tctgttcagccatgagcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataat 3445797  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  3445798 cttctgactgtcagtgatgt 3445817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 11441864 - 11441987
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  11441864 ctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 11441963  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||   |||||||||||||||    
T  11441964 tctgttcagccatgatcatgccaa 11441987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 26274945 - 26274822
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| ||||| | ||  ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  26274945 ctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 26274846  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||  | ||||||||||||||    
T  26274845 tctgttcaatcatgatcatgccaa 26274822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 31564241 - 31564022
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  31564241 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 31564142  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| || |||||||   | ||||||| |||||||||| || ||||||||  | |||    
T  31564141 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatccttcgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagtttgatgaatgataat 31564042  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  31564041 cttctgactgtcagtgatgt 31564022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16736286 - 16736092
Alignment:
Q  26 ggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaat 125  Q
    |||||||||  | ||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||||||||||||     
T  16736286 ggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaag 16736187  T
Q  126 tgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactatcagtgatgt 220  Q
    || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| ||||||||| |  | |||| | ||||| ||||||||||    
T  16736186 tgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 16736092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16751340 - 16751146
Alignment:
Q  26 ggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaat 125  Q
    |||||||||  | ||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||||||||||||     
T  16751340 ggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaag 16751241  T
Q  126 tgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactatcagtgatgt 220  Q
    || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| ||||||||| |  | |||| | ||||| ||||||||||    
T  16751240 tgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 16751146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 220
Target Start/End: Original strand, 17523849 - 17524043
Alignment:
Q  26 ggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaat 125  Q
    |||||||||  | ||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||||||||||||     
T  17523849 ggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaag 17523948  T
Q  126 tgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactatcagtgatgt 220  Q
    || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| ||||||||| |  | |||| | ||||| ||||||||||    
T  17523949 tgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 17524043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 17529366 - 17529172
Alignment:
Q  26 ggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaat 125  Q
    |||||||||  | ||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||||||||||||     
T  17529366 ggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaag 17529267  T
Q  126 tgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactatcagtgatgt 220  Q
    || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| ||||||||| |  | |||| | ||||| ||||||||||    
T  17529266 tgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 17529172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 26669739 - 26669573
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaatt 126  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | |||||||||||||| |    
T  26669739 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 26669640  T
Q  127 gcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    | |  | |||| || || ||| ||||||||| |    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  26669639 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaa 26669573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 220
Target Start/End: Original strand, 9618969 - 9619162
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaatt 126  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||| |||||||| |    
T  9618969 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacccctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgagcatgccaagt 9619068  T
Q  127 gcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactatcagtgatgt 220  Q
    | |  | |||| || || ||| ||||||||| |    ||||||| | |||||||| |||||||||||  | |||| | ||||| ||||||||||    
T  9619069 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 9619162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 191
Target Start/End: Original strand, 18541132 - 18541281
Alignment:
Q  42 gatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttct 141  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |   ||||||| |||||||||||  | |||| |||||||| |     
T  18541132 gatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgccactccatatcaagttgtgccaagctttattgtttgaacatgatcatgctgaatgccaagaatgttccc 18541231  T
Q  142 gtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    | |||| |||||| |||   || || ||||||||  ||||||||||||||    
T  18541232 gcaatcctttgggctgccatgtcgtccaaaacgatgtccagagcttgatg 18541281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 16503223 - 16503039
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||| ||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||| ||||      
T  16503223 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtctgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctttgttca 16503124  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||     |||||| | |||||||| |||||||||||    
T  16503123 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttaccgttcaagatgacatccaaagcttgatgaa 16503039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 16518259 - 16518075
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||| ||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||| ||||      
T  16518259 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtctgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctttgttca 16518160  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||     |||||| | |||||||| |||||||||||    
T  16518159 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttaccgttcaagatgacatccaaagcttgatgaa 16518075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 26537721 - 26537529
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  26537721 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 26537622  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  |  || ||| || |||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  26537621 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtgatccttcgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 26537529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 24592392 - 24592269
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  24592392 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 24592293  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||   |||||||||||||||    
T  24592292 tctgttcagccatgatcatgccaa 24592269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 191
Target Start/End: Original strand, 5159852 - 5160001
Alignment:
Q  42 gatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttct 141  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| || || || |||||||| |||||||| |   ||||||| |||||||||||  | |||| |||||||| |     
T  5159852 gatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgccgctccatatcaagttgtgccaagctttattgtttgaacatgatcatgctgagtgccaagaatgttccc 5159951  T
Q  142 gtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    | |||| |||||| |||   || || ||||||||  ||||||||||||||    
T  5159952 gcaatcctttgggctgccatgtcgtccaaaacgatgtccagagcttgatg 5160001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 4144948 - 4144818
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaatt 126  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||||||||||||||| |    
T  4144948 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagt 4144849  T
Q  127 gcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttg 157  Q
    | | || |||  ||||| ||| |||||||||    
T  4144848 gtctaggatgcctctgtgatcctttgggttg 4144818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 124
Target Start/End: Original strand, 45387673 - 45387758
Alignment:
Q  39 cttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||||||||    ||||||||||||||    
T  45387673 cttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagtcatgatcatgccaa 45387758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 174; Significance: 9e-94; HSPs: 57)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 31034123 - 31033910
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31034123 ctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctc 31034024  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31034023 tctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaat 31033924  T
Q  201 catttgactatcag 214  Q
    ||||||||| ||||    
T  31033923 catttgactgtcag 31033910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 32293004 - 32293217
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32293004 ctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctc 32293103  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32293104 tctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaat 32293203  T
Q  201 catttgactatcag 214  Q
    ||||||||| ||||    
T  32293204 catttgactgtcag 32293217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16626512 - 16626292
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16626512 ctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctc 16626413  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16626412 tttgtttgaccatgatcatgccagttgcccggaatgcttccataatcctttgggttgctacgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 16626313  T
Q  201 catttgactatcagtgatgtc 221  Q
     |||||||| |||| ||||||    
T  16626312 tatttgactgtcagcgatgtc 16626292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 18530640 - 18530860
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||     
T  18530640 ctgtgaacatgattgaggtatatgagggagctcccagacttaatgttcgtaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctt 18530739  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  18530740 tttgtttgaccatgatcatgccaattgtccagaatgcttccgtaatcctttgggttgctatgttgttcaaaatgacatccagggcttgatgaacgacaat 18530839  T
Q  201 catttgactatcagtgatgtc 221  Q
     |||||||| |||| ||||||    
T  18530840 tatttgactgtcagcgatgtc 18530860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 5652639 - 5652847
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||  || || |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5652639 ctgtgaacatgattgaggtatgtgaggaagctcccagaccggacgttcgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctc 5652738  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || |||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||    
T  5652739 tctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagagcctgatgaacgacaat 5652838  T
Q  201 catttgact 209  Q
     || |||||    
T  5652839 tatctgact 5652847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 5713479 - 5713687
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||   || ||  ||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5713479 ctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctc 5713578  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || |||||||| ||||||||| || ||||||||||   |||||||| |||||    
T  5713579 tctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagaaactgatgaacgacaat 5713678  T
Q  201 catttgact 209  Q
     || |||||    
T  5713679 tatctgact 5713687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 5724389 - 5724597
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||   || ||  ||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5724389 ctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctc 5724488  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || |||||||| ||||||||| || ||||||||||   |||||||| |||||    
T  5724489 tctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagaaactgatgaacgacaat 5724588  T
Q  201 catttgact 209  Q
     || |||||    
T  5724589 tatctgact 5724597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 5767979 - 5767771
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||   || ||  ||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5767979 ctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctc 5767880  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || |||||||| ||||||||| || ||||||||||   |||||||| |||||    
T  5767879 tctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagaaactgatgaacgacaat 5767780  T
Q  201 catttgact 209  Q
     || |||||    
T  5767779 tatctgact 5767771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 4626196 - 4626404
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||   || ||  ||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  4626196 ctgtaaacatgattgaggtatatgagaaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccgagcctc 4626295  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || |||||||| ||||||||| || ||||||||||   |||||||| |||||    
T  4626296 tctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagaaactgatgaacgacaat 4626395  T
Q  201 catttgact 209  Q
     || |||||    
T  4626396 tatctgact 4626404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 18051514 - 18051706
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||| |||| || | |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||| ||    
T  18051514 ctgtgaacatgattgaagtatgtgagaaagctcctagacttgatgtccgtaatatcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcttc 18051613  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||| || |||  |  |||||| ||||||||||| |   |||||| | |||||||| |||||||||||    
T  18051614 tctgtttagccatgatcatgtcaattgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacaccgttcaagatgacatccaaagcttgatgaa 18051706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 5757088 - 5756954
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||   || ||  ||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5757088 ctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctc 5756989  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatg 136  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||    
T  5756988 tctgtttga-catgatcatgccagtttgccagaatg 5756954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 221
Target Start/End: Original strand, 6192576 - 6192788
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||      
T  6192576 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttca 6192675  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgac 208  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| ||||||||||| |  ||||||| | |||||||| |||||||||||  | |||  ||||||    
T  6192676 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgac 6192775  T
Q  209 tatcagtgatgtc 221  Q
    | |||||||||||    
T  6192776 tgtcagtgatgtc 6192788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 4721884 - 4722103
Alignment:
Q  2 tgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctct 101  Q
    |||||| ||||| || |||| || |||||||||  |||| |||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| |||    
T  4721884 tgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagactcgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 4721983  T
Q  102 ctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatc 201  Q
    |||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| ||||||||||| |  ||||||| | |||||||| |||||||||||  | |||     
T  4721984 ctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataatt 4722083  T
Q  202 atttgactatcagtgatgtc 221  Q
     ||||||| |||||||||||    
T  4722084 ttttgactgtcagtgatgtc 4722103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 7073464 - 7073656
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||||||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  7073464 ctgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 7073563  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    ||||||   ||||||||||||||| |||| ||||||  |  |||| | |||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  7073564 tctgttcagccatgatcatgccaagtgcctagaatgccttcgtaaccctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 7073656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 193
Target Start/End: Original strand, 8296232 - 8296416
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||      
T  8296232 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttca 8296331  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  8296332 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 8296416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17993790 - 17993582
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||   || ||  ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  17993790 ctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 17993691  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  |  |||||| || |||||||| ||||||||| || ||||||||||   |||||||| |||||    
T  17993690 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagaaactgatgaacgacaat 17993591  T
Q  201 catttgact 209  Q
     || |||||    
T  17993590 tatctgact 17993582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18292359 - 18292167
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||    
T  18292359 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagttgtgcaaagcttc 18292260  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  |  |||||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  18292259 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcttttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 18292167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 18330921 - 18331113
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||    
T  18330921 ctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttc 18331020  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    ||||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| ||| |||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  18331021 tctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttaggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaa 18331113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29148753 - 29148541
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  |  ||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||      
T  29148753 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcacaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttca 29148654  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgac 208  Q
     ||||||||||||||| || | || |||  |  |||||| ||||||||||| |  ||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||  ||||||    
T  29148653 gccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgacaattctttgac 29148554  T
Q  209 tatcagtgatgtc 221  Q
    | |||||||||||    
T  29148553 tgtcagtgatgtc 29148541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 35881018 - 35881210
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || |||| || |||| ||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  35881018 ctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 35881117  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    ||||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  35881118 tctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 35881210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 8301248 - 8301081
Alignment:
Q  26 ggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaat 125  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||||||||||||     
T  8301248 ggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaag 8301149  T
Q  126 tgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  8301148 tgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttactgttcaaaatgacatccaaagcttgatgaa 8301081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 48466179 - 48466398
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  48466179 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 48466278  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || |||||| ||||||||||     ||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||    
T  48466279 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtaatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataat 48466378  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  48466379 cttctgactgtcagtgatgt 48466398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 15741092 - 15740910
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| |||||||||     
T  15741092 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcccctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttta 15740993  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  15740992 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 15740910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 4796659 - 4796467
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  4796659 ctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 4796560  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    ||||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| ||||||||| |    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  4796559 tctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgttatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaa 4796467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15892704 - 15892520
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  |  ||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||      
T  15892704 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcacaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttca 15892605  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  | ||||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  15892604 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgcctttgtaatcctttgggttgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaa 15892520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18277058 - 18276866
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  18277058 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 18276959  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  |  |||||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  18276958 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcttttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 18276866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18307660 - 18307468
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  18307660 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 18307561  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  |  |||||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  18307560 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcttttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 18307468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20576853 - 20576634
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  20576853 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 20576754  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||    
T  20576753 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataat 20576654  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  20576653 cttctgactgtcagtgatgt 20576634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 21674945 - 21675164
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  21674945 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 21675044  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||     ||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||    
T  21675045 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataat 21675144  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  21675145 cttctgactgtcagtgatgt 21675164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 28021527 - 28021746
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  28021527 ctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 28021626  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  |  |||||| | |||||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||    
T  28021627 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctctgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataat 28021726  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  28021727 cttctgactgtcagtgatgt 28021746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 51782275 - 51782494
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  51782275 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 51782374  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||  |||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||    
T  51782375 tctgttcaaccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataat 51782474  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  51782475 cttctgactgtcagtgatgt 51782494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 220
Target Start/End: Original strand, 20066336 - 20066514
Alignment:
Q  42 gatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttct 141  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |   ||||||| ||||||||||   | |||| |||||||| |     
T  20066336 gatgtccgcaatgttgcaactcctctggtaccactccatatcaagttgtgccaagctttattgtttgaacatgatcatgttgaatgccaagaatgttccc 20066435  T
Q  142 gtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactatcagtgatgt 220  Q
    | |||| ||||||||||   || || ||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||  | ||| ||||||||||    
T  20066436 gcaatcctttgggttgccatgtcgtccaaaacgatgtccagagcttgatggacagcaatcaccttactgtcagtgatgt 20066514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 220
Target Start/End: Original strand, 5013990 - 5014183
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaatt 126  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | |||||||||||||| |    
T  5013990 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 5014089  T
Q  127 gcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactatcagtgatgt 220  Q
    | |  | |||| || || ||| ||||||||||   | ||||||| ||||||| || |||||||||||  | |||| | ||||| ||||||||||    
T  5014090 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacattcaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 5014183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 220
Target Start/End: Original strand, 24328437 - 24328630
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaatt 126  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| |    
T  24328437 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttaatcatgatcatgccaagt 24328536  T
Q  127 gcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||| | |||||||||| ||||||||| |  | |||| | ||||| ||||||||||    
T  24328537 gtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 24328630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 10396385 - 10396577
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| || || ||||||||||||||  | |||||||||||| | ||| |||||||    
T  10396385 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacatcgcaactcctctggtgtctctacacatcaagctgtgcaaagcctc 10396484  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  10396485 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaggacgacatccaaagcttgatgaa 10396577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 18242991 - 18243183
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  18242991 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 18243090  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  18243091 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagtttgatgaa 18243183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 4417171 - 4417294
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||    
T  4417171 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcctc 4417270  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||   |||||||||||||||    
T  4417271 tctgttcagccatgatcatgccaa 4417294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 5596363 - 5596144
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || || ||| ||||| | ||| |||| ||    
T  5596363 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctgcacgtcaagctgtgcaaagcttc 5596264  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  ||||| ||| ||||||||| |    ||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||    
T  5596263 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataat 5596164  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  5596163 cttctgactgtcagtgatgt 5596144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 6542443 - 6542276
Alignment:
Q  26 ggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaat 125  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||||||||||||     
T  6542443 ggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgctactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaag 6542344  T
Q  126 tgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  6542343 tgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagtttgatgaa 6542276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 36997083 - 36996864
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || |||| || |||| ||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  36997083 ctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 36996984  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| ||||||||| |  | |||    
T  36996983 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataat 36996884  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  36996883 cttctgactgtcagtgatgt 36996864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 220
Target Start/End: Original strand, 47023731 - 47023924
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaatt 126  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| |  || |||| ||||||||| | |||||||||||||| |    
T  47023731 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgcgcaaagcttctctgtttaatcatgatcatgccaagt 47023830  T
Q  127 gcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactatcagtgatgt 220  Q
    | |  | |||| || || ||| ||||||||| |    ||||||| | |||||||| |||||||||||  | |||| | ||||| ||||||||||    
T  47023831 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 47023924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 8211990 - 8212182
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||  | ||| |||| ||    
T  8211990 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaaactgtgcaaagcttc 8212089  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  8212090 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgatgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 8212182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 11110355 - 11110163
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| |||||||| || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  11110355 ctgtgaatatgattgaagtgtgtgaggaagctccaagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 11110256  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  11110255 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaaacttgatgaa 11110163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 28115935 - 28115768
Alignment:
Q  26 ggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaat 125  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||||||||||||     
T  28115935 ggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaag 28115836  T
Q  126 tgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    || |  | |||  || || ||| ||||||||| |    ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  28115835 tgtctgggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 28115768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29664976 - 29664757
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  29664976 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 29664877  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||| | |||||||||| ||||| |||||  | |||    
T  29664876 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttaatgaatgataat 29664777  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  29664776 cttctgactgtcagtgatgt 29664757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 191
Target Start/End: Original strand, 32439447 - 32439596
Alignment:
Q  42 gatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttct 141  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |   ||||||| |||||||||||  | |||| |||||||| |     
T  32439447 gatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgccactccatatcaagttgtgccaggctttattgtttgaacatgatcatgctgagtgccaagaatgttccc 32439546  T
Q  142 gtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    | |||| ||||||||||   || || ||||||||  ||||||||||||||    
T  32439547 gcaatcctttgggttgccatgtcgtccaaaacgatgtccagagcttgatg 32439596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 5609328 - 5609109
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  | ||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  5609328 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 5609229  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||  |||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||     ||||||| |||||||||| ||||||||| |  | |||    
T  5609228 tctgttcaaccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataat 5609129  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  5609128 cttctgactgtcagtgatgt 5609109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 220
Target Start/End: Original strand, 28339580 - 28339773
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaatt 126  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||||||||||||||| |    
T  28339580 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagt 28339679  T
Q  127 gcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||| | |||||||||| ||||||||| |  | |||| | ||||| ||||||||||    
T  28339680 gtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 28339773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 4346693 - 4346570
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  4346693 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 4346594  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||   |||||||||||||||    
T  4346593 tctgttcagccatgatcatgccaa 4346570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 5467237 - 5467360
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  5467237 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 5467336  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||   |||||||||||||||    
T  5467337 tctgttcagccatgatcatgccaa 5467360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 124
Target Start/End: Original strand, 18225481 - 18225566
Alignment:
Q  39 cttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||||||||||||    
T  18225481 cttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 18225566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22387584 - 22387392
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||| | ||| |||| ||    
T  22387584 ctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcttatacacaacaagctgtgcaaagcttc 22387485  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  |  |||||  |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  22387484 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaattctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaa 22387392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 22870826 - 22870739
Alignment:
Q  37 gacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||||||||||||    
T  22870826 gacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 22870739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 22885885 - 22885798
Alignment:
Q  37 gacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||||||||||||    
T  22885885 gacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 22885798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 31964479 - 31964289
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  31964479 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 31964380  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
     |||||   |||||| |||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||| | |||||||||| |||||||||    
T  31964379 cctgttcagccatgagcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatg 31964289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 124
Target Start/End: Original strand, 7996852 - 7996937
Alignment:
Q  39 cttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||||||||    ||||||||||||||    
T  7996852 cttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagtcatgatcatgccaa 7996937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 124
Target Start/End: Original strand, 10643360 - 10643445
Alignment:
Q  39 cttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||||||||    ||||||||||||||    
T  10643360 cttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagtcatgatcatgccaa 10643445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22925982 - 22925769
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22925982 ctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctc 22925883  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22925882 tctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaattctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaat 22925783  T
Q  201 catttgactatcag 214  Q
    ||||||||| ||||    
T  22925782 catttgactgtcag 22925769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21703118 - 21702898
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  21703118 ctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactcgatgttcgtaacattgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctc 21703019  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||    
T  21703018 tctgtttaaccacgatcataccaattgcccagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacggcaat 21702919  T
Q  201 catttgactatcagtgatgtc 221  Q
     |||||||| |||| ||||||    
T  21702918 tatttgactgtcagcgatgtc 21702898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19456374 - 19456155
Alignment:
Q  2 tgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctct 101  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19456374 tgtgaacatgattgaggtatgtgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctagtgccactacacatcaagctatgccaagcctct 19456275  T
Q  102 ctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatc 201  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||     
T  19456274 ttgtttgaccatgatcatgccagttgcccggaatgcttctgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgatatccagagtttgatgaacgacaatt 19456175  T
Q  202 atttgactatcagtgatgtc 221  Q
    |||||||| |||| ||||||    
T  19456174 atttgactgtcagcgatgtc 19456155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 16163886 - 16164102
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||   || ||  ||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16163886 ctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctc 16163985  T
Q  101 ---tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaac 197  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16163986 ctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattatgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacaac 16164085  T
Q  198 aatcatttgactatcag 214  Q
    |||||||||||| ||||    
T  16164086 aatcatttgactgtcag 16164102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 6 - 209
Target Start/End: Original strand, 27118980 - 27119183
Alignment:
Q  6 aacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgt 105  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||  || ||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27118980 aacatgattgaggtatatgaggaagctcccagaccggacgtttgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgt 27119079  T
Q  106 ttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcattt 205  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || |||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||| || |    
T  27119080 ttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagagcctgatgaacgacaattatct 27119179  T
Q  206 gact 209  Q
    ||||    
T  27119180 gact 27119183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 6 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 34303252 - 34303049
Alignment:
Q  6 aacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgt 105  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  34303252 aacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctccttgt 34303153  T
Q  106 ttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcattt 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||   |  ||||| || |||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||| ||| ||||| || |    
T  34303152 ttgacaatgatcatgccaattgcccaaaatgccgccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagagcctgatcaacgacaattatct 34303053  T
Q  206 gact 209  Q
    ||||    
T  34303052 gact 34303049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 3784941 - 3785149
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||   || ||  ||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3784941 ctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctc 3785040  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || |||||||| ||||||||| || ||||||||||   |||||||| |||||    
T  3785041 tctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagaaactgatgaacgacaat 3785140  T
Q  201 catttgact 209  Q
     || |||||    
T  3785141 tatctgact 3785149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 31891282 - 31891074
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||   || ||  ||||  |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  31891282 ctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccaccacacatcgagttatgccaagcctc 31891183  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || |||||||| ||||||||| || |||||||||||  |||||||| |||||    
T  31891182 tctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagagactgatgaacgacaat 31891083  T
Q  201 catttgact 209  Q
     || |||||    
T  31891082 tatctgact 31891074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 34157297 - 34157505
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||   || ||  ||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34157297 ctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctc 34157396  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || |||||||| ||||||||| || ||||||||||   |||||||| |||||    
T  34157397 tctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagaaactgatgaacgacaat 34157496  T
Q  201 catttgact 209  Q
     || |||||    
T  34157497 tatctgact 34157505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 9349936 - 9349717
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| || |||| |||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  9349936 ctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggtcttgacgtccgtaatgttacaacccctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 9349837  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||  ||||||||||   | ||||| | |||||||||| |||||||||||  | |||    
T  9349836 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgattctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatgaatgataat 9349737  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  9349736 cttctgactgtcagtgatgt 9349717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Original strand, 20838230 - 20838425
Alignment:
Q  26 ggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaat 125  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||||||||||||     
T  20838230 ggaagctcctagacttgatgtccgtaacatcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaag 20838329  T
Q  126 tgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactatcagtgatgtc 221  Q
    |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||  | |||  ||||||| |||||||||||    
T  20838330 tgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 20838425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 32050085 - 32050304
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| |||||||| || | || ||||| |||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  32050085 ctgtgaatatgattgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 32050184  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||| | |||||||||||||| || |  | |||| || || ||| |||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||    
T  32050185 tctgtttaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataat 32050284  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  32050285 cttctgactgtcagtgatgt 32050304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 27434390 - 27434178
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||      
T  27434390 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttca 27434291  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgac 208  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||  | |||  ||||||    
T  27434290 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgac 27434191  T
Q  209 tatcagtgatgtc 221  Q
    | |||||||||||    
T  27434190 tgtcagtgatgtc 27434178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 221
Target Start/End: Original strand, 28882509 - 28882721
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||      
T  28882509 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttca 28882608  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgac 208  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||  | |||  ||||||    
T  28882609 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgac 28882708  T
Q  209 tatcagtgatgtc 221  Q
    | |||||||||||    
T  28882709 tgtcagtgatgtc 28882721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 193
Target Start/End: Original strand, 12655837 - 12656021
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| |||||||||     
T  12655837 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttta 12655936  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
     ||||||||||||||| |||| || ||   |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  12655937 gccatgatcatgccaagtgcctaggataccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaa 12656021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 27777509 - 27777728
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  27777509 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 27777608  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||    
T  27777609 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataat 27777708  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  27777709 cttctgactgtcagtgatgt 27777728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 27817267 - 27817486
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  27817267 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 27817366  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||    
T  27817367 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataat 27817466  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  27817467 cttctgactgtcagtgatgt 27817486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 220
Target Start/End: Original strand, 34286682 - 34286860
Alignment:
Q  42 gatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttct 141  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  ||     
T  34286682 gatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctcc 34286781  T
Q  142 gtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactatcagtgatgt 220  Q
    |||||| ||||||||||     ||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||  | ||||| ||||||||||    
T  34286782 gtaatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaacgataattttctgactgtcagtgatgt 34286860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 220
Target Start/End: Original strand, 34291742 - 34291920
Alignment:
Q  42 gatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttct 141  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  ||     
T  34291742 gatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctcc 34291841  T
Q  142 gtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactatcagtgatgt 220  Q
    |||||| ||||||||||     ||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||  | ||||| ||||||||||    
T  34291842 gtaatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaacgataattttctgactgtcagtgatgt 34291920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19416427 - 19416234
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaatt 126  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| |    
T  19416427 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttaatcatgatcatgccaagt 19416328  T
Q  127 gcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactatcagtgatgt 220  Q
    | |  | |||| || || ||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| ||| |||||||  | |||| | ||||| ||||||||||    
T  19416327 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgctatactgttcaagaagacatccaaagcctgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 19416234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 12587097 - 12587316
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  12587097 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 12587196  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||| | |||||||||| |||||||||||  | |||    
T  12587197 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatgaatgataat 12587296  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  12587297 cttctgactgtcagtgatgt 12587316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12716556 - 12716337
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  12716556 ctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 12716457  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||   |||||| |||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| ||||||||| |  | |||    
T  12716456 tctgttcagccatgagcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataat 12716357  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  12716356 cttctgactgtcagtgatgt 12716337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13936498 - 13936279
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  13936498 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 13936399  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || |  ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||    
T  13936398 tctgttcagccatgatcatgccaaatgtctaggatgcctccgcgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataat 13936299  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  13936298 cttctgactgtcagtgatgt 13936279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16829292 - 16829073
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| ||||| | ||  ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  16829292 ctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 16829193  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||  | |||||||||||||| || |  | |||| || || ||| ||||||||| |    ||||||| | |||||||| |||||||||||  | |||    
T  16829192 tctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataat 16829093  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  16829092 cttctgactgtcagtgatgt 16829073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 16892189 - 16892408
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| ||||| | ||  ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  16892189 ctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 16892288  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||  | |||||||||||||| || |  | |||| || || ||| ||||||||| |    ||||||| | |||||||| |||||||||||  | |||    
T  16892289 tctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataat 16892388  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  16892389 cttctgactgtcagtgatgt 16892408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 27803994 - 27804213
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  27803994 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgaccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 27804093  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||    
T  27804094 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataat 27804193  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  27804194 cttctgactgtcagtgatgt 27804213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 39051776 - 39051557
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  39051776 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 39051677  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    |||| |   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| || ||||||| |||||||||||  | |||    
T  39051676 tctgatcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacaacatccaaagcttgatgaatgataat 39051577  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  39051576 cttctgactgtcagtgatgt 39051557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 37685837 - 37685644
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaatt 126  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | |||||||||||||| |    
T  37685837 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 37685738  T
Q  127 gcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactatcagtgatgt 220  Q
    | |  | |||| || || ||| ||||||||| |    ||||||| | |||||||| |||||||||||  | |||| | ||||| ||||||||||    
T  37685737 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 37685644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 37701102 - 37700909
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaatt 126  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | |||||||||||||| |    
T  37701102 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 37701003  T
Q  127 gcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactatcagtgatgt 220  Q
    | |  | |||| || || ||| ||||||||| |    ||||||| | |||||||| |||||||||||  | |||| | ||||| ||||||||||    
T  37701002 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 37700909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 220
Target Start/End: Original strand, 37925806 - 37925999
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaatt 126  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | |||||||||||||| |    
T  37925806 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 37925905  T
Q  127 gcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactatcagtgatgt 220  Q
    | |  | |||| || || ||| ||||||||| |    ||||||| | |||||||| |||||||||||  | |||| | ||||| ||||||||||    
T  37925906 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 37925999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 37375448 - 37375640
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||  | ||| |||| ||    
T  37375448 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtggggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaaactgtgcaaagcttc 37375547  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    ||||||   |||||| |||||||| || | || |||  |  |||||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  37375548 tctgttcagccatgaacatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 37375640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 11635115 - 11634948
Alignment:
Q  26 ggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaat 125  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||||||||||||     
T  11635115 ggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaag 11635016  T
Q  126 tgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    || |  | |||  || || ||| ||||||||| |    ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  11635015 tgtctgggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 11634948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 11641304 - 11641137
Alignment:
Q  26 ggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaat 125  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||||||||||||     
T  11641304 ggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaag 11641205  T
Q  126 tgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    || |  | |||  || || ||| ||||||||| |    ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  11641204 tgtctgggatgcctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 11641137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 39890361 - 39890580
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  39890361 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 39890460  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||||  |||||||| |  | |||    
T  39890461 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgttgttcaagacgacatccaaggcttgatggatgataat 39890560  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  39890561 cttctgactgtcagtgatgt 39890580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 221
Target Start/End: Original strand, 31876594 - 31876788
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaatt 126  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||  ||||||||  | |||||||||||||| |    
T  31876594 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagtttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 31876693  T
Q  127 gcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactatcagtgatgtc 221  Q
    | |  | |||| || || | | ||||||||||   | ||||||| ||||||| || |||||||||||  | |||| | ||||| |||||||||||    
T  31876694 gtctgggatgtctccgtgaccctttgggttgccatgctgttcaagacgacattcaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgtc 31876788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 220
Target Start/End: Original strand, 34861993 - 34862186
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaatt 126  Q
    ||||||||  |||| |||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | |||||||||||||| |    
T  34861993 gaagctccgagactagatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 34862092  T
Q  127 gcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactatcagtgatgt 220  Q
    | |  | |||| || || ||| ||||||||| |    ||||||| | |||||||| |||||||||||  | |||| | ||||| ||||||||||    
T  34862093 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 34862186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23128512 - 23128300
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||||| |||| |  |||||||||||| | ||| |||| ||||||||      
T  23128512 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctttggtgcttctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttca 23128413  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgac 208  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    | ||||| | || ||||| |||||||||||  | |||  ||||||    
T  23128412 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactattcaagatgatatccaaagcttgatgaatgataattttttgac 23128313  T
Q  209 tatcagtgatgtc 221  Q
    | |||||||||||    
T  23128312 tgtcagtgatgtc 23128300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 260671 - 260488
Alignment:
Q  37 gacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatg 136  Q
    ||||||||||||| ||  | | ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||| ||||||||||| || | || |||    
T  260671 gacttgatgtccgcaacgtcgtaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccacgatcatgccaagtgtctaggatg 260572  T
Q  137 tttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactatcagtgatgt 220  Q
      || || ||| ||||||||||     ||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||| | ||||| ||||||||||    
T  260571 cctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 260488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 40233798 - 40233990
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | | ||||||||||||||| |||||||||||  | ||| |||| ||    
T  40233798 ctgtgaaaatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgtaactcctctggtacctctacacatcaaactgtgcaaagcttc 40233897  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || |  | |||  || |||||| ||||||||||     ||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  40233898 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctgggatgcctccgtaatcctttgggttgccatactgttcaggacgacatccaaagcttgatgaa 40233990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 21677100 - 21676944
Alignment:
Q  37 gacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatg 136  Q
    ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||    
T  21677100 gacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatg 21677001  T
Q  137 tttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
      || || ||| ||||||||||   | |||||||  ||| ||||| |||||||||||    
T  21677000 cctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaaggcgatatccaaagcttgatgaa 21676944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 28152152 - 28152365
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28152152 ctgtgaacatgattgagatatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctc 28152251  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28152252 tctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaat 28152351  T
Q  201 catttgactatcag 214  Q
    ||||||||| ||||    
T  28152352 catttgactgtcag 28152365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20340300 - 20340080
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20340300 ctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctc 20340201  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20340200 tctgtttgaccatgatcatgccagttgtccagaatgtttctgtaatcctttgggttactgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacgacaat 20340101  T
Q  201 catttgactatcagtgatgtc 221  Q
     |||||||| |||| ||||||    
T  20340100 tatttgactgtcagcgatgtc 20340080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 20461372 - 20461591
Alignment:
Q  2 tgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctct 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  20461372 tgtgaacatgattgaggtatatgagcaagctcgcagacttgatgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgtcaagcctct 20461471  T
Q  102 ctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatc 201  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  20461472 ttgtttgaccatgatcatgccagttgtccagaatgctttcgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacgacaatt 20461571  T
Q  202 atttgactatcagtgatgtc 221  Q
    |||||||| |||| ||||||    
T  20461572 atttgactgtcagcgatgtc 20461591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16207996 - 16207776
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  16207996 ctgtaaacatgattgaggtatatgagaaagctcccagacttgatgttcgtaatgttgcaactcctttggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctc 16207897  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||  || |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  16207896 tttgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccgtaatcctttggggtgctatgtcgttcaaaatgacatccaaagcttgatgaacgacaat 16207797  T
Q  201 catttgactatcagtgatgtc 221  Q
     |||||||| |||| ||||||    
T  16207796 tatttgactgtcagcgatgtc 16207776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 220
Target Start/End: Original strand, 28585297 - 28585490
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaatt 126  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | |||||||||||||| |    
T  28585297 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 28585396  T
Q  127 gcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactatcagtgatgt 220  Q
    | |  | |||| || || ||| ||||||||||   | ||||||| ||||||| || |||||||||||  | |||| | ||||| ||||||||||    
T  28585397 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacattcaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 28585490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 51638508 - 51638700
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| |||| ||    
T  51638508 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctacatatcaagttgtgcaaagcttc 51638607  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  ||||| ||| ||||||||| |    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  51638608 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaggacatccaaagcttgatgaa 51638700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 41793273 - 41793083
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  41793273 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 41793174  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||  |||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  41793173 tctgttcaaccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 41793083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 124
Target Start/End: Original strand, 10962986 - 10963083
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  10962986 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaa 10963083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 166; Significance: 5e-89; HSPs: 43)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 14143193 - 14142980
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14143193 ctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctc 14143094  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14143093 tctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgtttaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaat 14142994  T
Q  201 catttgactatcag 214  Q
     |||||||| ||||    
T  14142993 tatttgactgtcag 14142980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 26788232 - 26788445
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26788232 ctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctc 26788331  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26788332 tctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgtttaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaat 26788431  T
Q  201 catttgactatcag 214  Q
     |||||||| ||||    
T  26788432 tatttgactgtcag 26788445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 27196605 - 27196818
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27196605 ctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctc 27196704  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27196705 tctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgtttaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaat 27196804  T
Q  201 catttgactatcag 214  Q
     |||||||| ||||    
T  27196805 tatttgactgtcag 27196818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27252635 - 27252422
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27252635 ctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctc 27252536  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27252535 tctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgtttaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaat 27252436  T
Q  201 catttgactatcag 214  Q
     |||||||| ||||    
T  27252435 tatttgactgtcag 27252422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13521981 - 13521768
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13521981 ctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacatccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctc 13521882  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13521881 tctgtttgaccatgaccatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgttgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaat 13521782  T
Q  201 catttgactatcag 214  Q
    ||||||||| ||||    
T  13521781 catttgactgtcag 13521768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22456842 - 22456638
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||         ||||||||| ||||| |||| ||    
T  22456842 ctgtgaacgtgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaactcctctg---------cacatcaagctatgcaaagcttc 22456752  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22456751 tttgtttgaccatgatcatgccaattgtccagaatgcttctgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaacgacatccagagattgatgaacgacaat 22456652  T
Q  201 catttgactatcag 214  Q
     |||||||| ||||    
T  22456651 tatttgactgtcag 22456638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 33374164 - 33373956
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||   || ||  ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  33374164 ctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgggttatgccaagcctc 33374065  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || |||||||| ||||||||| || |||||||||||  |||||||| |||||    
T  33374064 tctgtttgaccacgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagagactgatgaacgacaat 33373965  T
Q  201 catttgact 209  Q
     || |||||    
T  33373964 tatctgact 33373956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8892219 - 8892011
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||   || ||  ||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8892219 ctgtaaacatgattgaagtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctc 8892120  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || |||||||| ||||||||| || ||||||||||   |||||||| |||||    
T  8892119 tctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagaaactgatgaacgacaat 8892020  T
Q  201 catttgact 209  Q
     || |||||    
T  8892019 tatctgact 8892011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8903454 - 8903246
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||   || ||  ||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8903454 ctgtaaacatgattgaagtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctc 8903355  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || |||||||| ||||||||| || ||||||||||   |||||||| |||||    
T  8903354 tctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagaaactgatgaacgacaat 8903255  T
Q  201 catttgact 209  Q
     || |||||    
T  8903254 tatctgact 8903246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 28162945 - 28163153
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||   || ||  ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  28162945 ctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgggttatgccaagcctc 28163044  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || |||||||| || |||||| || |||||||||||  |||||||| |||||    
T  28163045 tctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacggtgttcagaatgacatccagagactgatgaacgacaat 28163144  T
Q  201 catttgact 209  Q
     || |||||    
T  28163145 tatctgact 28163153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 17092348 - 17092129
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||| ||  |||||||||||| | | |||||||||||||||| || ||| |||||||| |||| ||||||||    
T  17092348 ctgtgaacatgactgaggtatgtgaggaagctaccaaacttgatgtccgcagtgttgcaactcctctggtgcctctaaacatcaagctatgtcaagcctc 17092249  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    | |||||||||||||||||  || ||||||| |||  ||| || ||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||     
T  17092248 tttgtttgaccatgatcatagcagttgcccataatacttccgtgatcctttgggttgctacattgttcaaaatgacatccagggcttgatgaacgacaac 17092149  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
     || ||||| | ||||||||    
T  17092148 tatctgactgttagtgatgt 17092129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13298851 - 13298639
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| |||||||||     
T  13298851 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttta 13298752  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgac 208  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |   ||||| ||||||||| |    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  13298751 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcataatcctttgggttggtatactgttcaaaatgacatccagagcttgatgaatgacaattatttgac 13298652  T
Q  209 tatcagtgatgtc 221  Q
    | |||||||||||    
T  13298651 tgtcagtgatgtc 13298639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 27272488 - 27272296
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || |||| || || ||||||  ||||||||||||||||  ||| |||||||||||| || ||||| |||||||| ||| |||| ||    
T  27272488 ctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggtagctcctagacttgatgtccgtaacgttgtaactcctctggtgcctctacatatcaagttgtgcaaagcttc 27272389  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    ||||||   ||||||||||||||| |||| || |||  || |||||| |||||||||||   |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  27272388 tctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgcctccgtaatcctttgggttgctttattgttcaagatgacatccagagcttgatgaa 27272296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 27290270 - 27290086
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||||||||      
T  27290270 atgattgaggtatatgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttca 27290171  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  27290170 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 27290086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 29549763 - 29549953
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||||||||| || || | || ||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  29549763 ctgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctggacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 29549862  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  29549863 tctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 29549953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24304518 - 24304306
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||      
T  24304518 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacatcacaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttca 24304419  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgac 208  Q
     |||||| |||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||| ||||||    
T  24304418 gccatgaccatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttttgac 24304319  T
Q  209 tatcagtgatgtc 221  Q
    | | |||||||||    
T  24304318 tgttagtgatgtc 24304306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 193
Target Start/End: Original strand, 26989297 - 26989481
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||||||||||  | |||||||||||| | ||| |||| |||||||||     
T  26989297 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgtctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttta 26989396  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  26989397 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 26989481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 26918668 - 26918860
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  26918668 ctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 26918767  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    ||||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| |  ||||||| |||||||||||    
T  26918768 tctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagataacatccaaagcttgatgaa 26918860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 4545683 - 4545464
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  4545683 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgctactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 4545584  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  ||||| ||| |||||| ||||    ||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||    
T  4545583 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataat 4545484  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  4545483 cttctgactgtcagtgatgt 4545464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15424200 - 15424033
Alignment:
Q  26 ggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaat 125  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||||||||||||| |     
T  15424200 ggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccgag 15424101  T
Q  126 tgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  15424100 tgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 15424033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 34463254 - 34463035
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  34463254 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 34463155  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||    
T  34463154 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataat 34463055  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  34463054 cttctgactgtcagtgatgt 34463035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16943909 - 16943716
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaatt 126  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | |||||||||||||| |    
T  16943909 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 16943810  T
Q  127 gcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactatcagtgatgt 220  Q
    | |  | |||| || || ||| ||||||||||   | ||||||| ||||||| || |||||||||||  | |||| | ||||| ||||||||||    
T  16943809 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacattcaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 16943716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 16750142 - 16750334
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || ||||||||||||   ||| |||| ||    
T  16750142 ctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgcccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagcggtgcaaagcttc 16750241  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  |  |||||| ||||||||||| |  ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  16750242 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 16750334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22934780 - 22934568
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||||| |||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||      
T  22934780 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctttggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttca 22934681  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgac 208  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||     |||||| | |||||||| |||||||||||  | |||  ||||||    
T  22934680 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttaccgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgac 22934581  T
Q  209 tatcagtgatgtc 221  Q
    | |||||||||||    
T  22934580 tgtcagtgatgtc 22934568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23857225 - 23857013
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||||| |||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||      
T  23857225 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctttggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttca 23857126  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgac 208  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||     |||||| | |||||||| |||||||||||  | |||  ||||||    
T  23857125 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttaccgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgac 23857026  T
Q  209 tatcagtgatgtc 221  Q
    | |||||||||||    
T  23857025 tgtcagtgatgtc 23857013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 4773294 - 4773513
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| |||  ||||||||||| || || ||| ||||| | ||| |||||||    
T  4773294 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgtcactcctctggtgcctctgcacgtcaagctgtgcaaagcctc 4773393  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  ||||| ||| |||||| ||||    ||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||    
T  4773394 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataat 4773493  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  4773494 cttctgactgtcagtgatgt 4773513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 30557924 - 30557705
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| ||||| | ||  ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  30557924 ctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 30557825  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||  | |||||||||||||| || |  | |||| || || ||| ||||||||| |    ||||||| | |||||||| |||||||||||  | |||    
T  30557824 tctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataat 30557725  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  30557724 cttctgactgtcagtgatgt 30557705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 220
Target Start/End: Original strand, 29573327 - 29573520
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaatt 126  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | |||||||||||||| |    
T  29573327 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 29573426  T
Q  127 gcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactatcagtgatgt 220  Q
    | |  | |||| || || ||| ||||||||| |    ||||||| | |||||||| |||||||||||  | |||| | ||||| ||||||||||    
T  29573427 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 29573520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 193
Target Start/End: Original strand, 24864013 - 24864197
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| || ||||||||||      
T  24864013 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaatcctctctgttca 24864112  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | ||| |||| |||||||||||    
T  24864113 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttactgttcaagatgacgtccaaagcttgatgaa 24864197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 27359900 - 27359680
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||| || || || |||||| ||||| |||||||    
T  27359900 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccacaatgttgccactcctctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcctc 27359801  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  ||||| ||| |||||| ||||    ||||||| |||||||||| ||| ||||| |  | |||    
T  27359800 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcctgatggatgataat 27359701  T
Q  201 catttgactatcagtgatgtc 221  Q
    | | ||||| |||||||||||    
T  27359700 cttctgactgtcagtgatgtc 27359680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 27450243 - 27450023
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||| || || || |||||| ||||| |||||||    
T  27450243 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccacaatgttgccactcctctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcctc 27450144  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  ||||| ||| |||||| ||||    ||||||| |||||||||| ||| ||||| |  | |||    
T  27450143 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcctgatggatgataat 27450044  T
Q  201 catttgactatcagtgatgtc 221  Q
    | | ||||| |||||||||||    
T  27450043 cttctgactgtcagtgatgtc 27450023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 27485417 - 27485609
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  | ||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  27485417 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 27485516  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  27485517 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 27485609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 4724042 - 4723823
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  4724042 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgctactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 4723943  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || |  ||| |||||| |||   | ||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||    
T  4723942 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgagatcctttgggctgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataat 4723843  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  4723842 cttctgactgtcagtgatgt 4723823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 16674427 - 16674646
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | | ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  16674427 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgtaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 16674526  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||| ||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||     ||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||    
T  16674527 tctattcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataat 16674626  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  16674627 cttctgactgtcagtgatgt 16674646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 26116318 - 26116099
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| |||  ||||||||||| || ||||| |||||| | ||| |||| ||    
T  26116318 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgtcactcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttc 26116219  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| || | ||||||| | |||    
T  26116218 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagttcgatgaacgataat 26116119  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  26116118 cttctgactgtcagtgatgt 26116099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 29501703 - 29501922
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  29501703 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 29501802  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  ||||| ||| |||||| ||||    ||||||| |||||||||| ||| ||||| |  | |||    
T  29501803 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcctgatggatgataat 29501902  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  29501903 cttctgactgtcagtgatgt 29501922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 220
Target Start/End: Original strand, 27008040 - 27008234
Alignment:
Q  26 ggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaat 125  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||||||||||||     
T  27008040 ggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaag 27008139  T
Q  126 tgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactatcagtgatgt 220  Q
    || | || |||  ||||| ||| |||||| ||||    ||||||| |||||||||| ||| ||||| |  | |||| | ||||| ||||||||||    
T  27008140 tgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcctgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 27008234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 4758052 - 4758244
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| |||  || |||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  4758052 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgtcacccctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 4758151  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  4758152 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 4758244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 27044676 - 27044799
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || ||||| |||||| | ||| |||| ||    
T  27044676 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttc 27044775  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||   |||||||||||||||    
T  27044776 tctgttcagccatgatcatgccaa 27044799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 28207742 - 28207961
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| || || || |||||| ||||| |||| ||    
T  28207742 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcccctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcttc 28207841  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||   ||||||||||| ||| || | || |||  || || ||  ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||    
T  28207842 tctgttcagccatgatcatgacaagtgtctaggatgcctccgtgattctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataat 28207941  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  28207942 cttctgactgtcagtgatgt 28207961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 4525574 - 4525697
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| || || || |||||| ||||| |||| ||    
T  4525574 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcccctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcttc 4525673  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||   |||||||||||||||    
T  4525674 tctgttcagccatgatcatgccaa 4525697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 129
Target Start/End: Original strand, 27019461 - 27019552
Alignment:
Q  38 acttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcc 129  Q
    |||||||||||||||  | |||||||| ||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||||||||||||||| ||||    
T  27019461 acttgatgtccgtaacgtcgcaactcccctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcc 27019552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Original strand, 3696395 - 3696561
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaatt 126  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||| ||||||||||| |    
T  3696395 gaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccacgatcatgccaagt 3696494  T
Q  127 gcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    | | || |||  |  || ||| ||||||||||     ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  3696495 gtctaggatgccttcgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 3696561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 2623 - 2403
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2623 ctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctc 2524  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2523 tctgtttgaccatgatcatgccagttgtccagaatgtttctgtaatcctttgggttactgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacgacaat 2424  T
Q  201 catttgactatcagtgatgtc 221  Q
     |||||||| |||| ||||||    
T  2423 tatttgactgtcagcgatgtc 2403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 49)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 33877547 - 33877760
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33877547 ctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacatccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctc 33877646  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33877647 tctgtttgaccatgaccatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgttgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacaacaat 33877746  T
Q  201 catttgactatcag 214  Q
    ||||||||| ||||    
T  33877747 catttgactgtcag 33877760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 29888944 - 29888736
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  29888944 ctgtgaacatgattgaggtgtatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaactcctctggtaccactacacatcaagctatgcaaagcttc 29888845  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  29888844 tctgtttaaccgtgatcatgccaattgcccagattgctttcgtaatcctttgggttgctatgctgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaat 29888745  T
Q  201 catttgact 209  Q
     ||||||||    
T  29888744 tatttgact 29888736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 22888770 - 22888990
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||    
T  22888770 ctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcctagactcgatgttcgtaacattgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaaacctc 22888869  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    | ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  22888870 tttgtttgaccatgatcatgctagttgcccagaatgcttccgtaatcctttgggttgttacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatgaacgacaat 22888969  T
Q  201 catttgactatcagtgatgtc 221  Q
     |||||||| |||| ||||||    
T  22888970 tatttgactgtcagcgatgtc 22888990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13184510 - 13184303
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||   || ||  ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13184510 ctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctc 13184411  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||| |||||    
T  13184410 tctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcagaatgacatccagag-atgatgaacgacaat 13184312  T
Q  201 catttgact 209  Q
     || |||||    
T  13184311 tatctgact 13184303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 25199329 - 25199549
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||     
T  25199329 ctgtaaacatgattgaggtatatgagaaagcccccagacttgatgttcgtaatgttgcaactcctctggtgcctttacacatcaagctatgccaagcctt 25199428  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||| |||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  25199429 tttgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttctgtaatccttcggggtgctacgtcgttcaagatgacatccagagcttgatgaacgacaat 25199528  T
Q  201 catttgactatcagtgatgtc 221  Q
     |||||||| |||| ||||||    
T  25199529 tatttgactgtcagcgatgtc 25199549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 23892506 - 23892725
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||| ||    
T  23892506 ctgtgaacgtgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcttc 23892605  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||| |||||| |||| | | |||||||| |||||||| |||||||||||  |||||    
T  23892606 tctgtttaaccatgatcatgccaactgcccaggatgccttcgtaatcctttggggtgctacttcgttcaaaatgacatccaaagcttgatgaatgacaat 23892705  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
     |||| ||| | ||||||||    
T  23892706 tatttaactgttagtgatgt 23892725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 11326094 - 11326302
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||   || ||  ||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11326094 ctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctc 11326193  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || |||||||| ||||||||| || ||||||||||   |||||||| |||||    
T  11326194 tctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagaaactgatgaacgacaat 11326293  T
Q  201 catttgact 209  Q
     || |||||    
T  11326294 tatctgact 11326302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13440356 - 13440148
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||   || ||  ||||  |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||     
T  13440356 ctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgcctctacacatcgagttatgccaagcctt 13440257  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || |||||||| ||||||||| || |||||||||||  |||||||| |||||    
T  13440256 tctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagagactgatgaacgacaat 13440157  T
Q  201 catttgact 209  Q
     || |||||    
T  13440156 tatctgact 13440148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 9548405 - 9548197
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  9548405 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcgagttatgccaagcctc 9548306  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||  ||||| || |||||||| ||||||||| || |||||||||||  |||||||| |||||    
T  9548305 tctgtttgaccatgattatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagagactgatgaacgacaat 9548206  T
Q  201 catttgact 209  Q
     || |||||    
T  9548205 tatctgact 9548197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 193
Target Start/End: Original strand, 30934941 - 30935125
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||||||      
T  30934941 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaatatcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctgttca 30935040  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| ||||||||||| |   |||||| | |||||||| |||||||||||    
T  30935041 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacaccgttcaagatgacatccaaagcttgatgaa 30935125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 23752312 - 23752120
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  23752312 ctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 23752213  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||| || |||  |   ||||| |||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  23752212 tctgtttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcataatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 23752120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22998968 - 22998756
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||      
T  22998968 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttca 22998869  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgac 208  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||  | |||  ||||||    
T  22998868 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgac 22998769  T
Q  209 tatcagtgatgtc 221  Q
    | |||||||||||    
T  22998768 tgtcagtgatgtc 22998756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23717842 - 23717630
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||      
T  23717842 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttca 23717743  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgac 208  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||  | |||  ||||||    
T  23717742 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgac 23717643  T
Q  209 tatcagtgatgtc 221  Q
    | |||||||||||    
T  23717642 tgtcagtgatgtc 23717630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24688011 - 24687799
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||      
T  24688011 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttca 24687912  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgac 208  Q
     ||||||||||||||  |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||  | |||  ||||||    
T  24687911 gccatgatcatgccatgtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgac 24687812  T
Q  209 tatcagtgatgtc 221  Q
    | |||||||||||    
T  24687811 tgtcagtgatgtc 24687799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 33777787 - 33777979
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  33777787 ctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 33777886  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    ||| ||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| ||||||||||| |  ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  33777887 tctattcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaa 33777979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Original strand, 24970343 - 24970510
Alignment:
Q  26 ggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaat 125  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||||||   |||||||||||||||     
T  24970343 ggaagctcctagacttgatgtccgtaacatcacaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaag 24970442  T
Q  126 tgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  24970443 tgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaa 24970510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 220
Target Start/End: Original strand, 30029741 - 30029934
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaatt 126  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | |||||||||||||| |    
T  30029741 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 30029840  T
Q  127 gcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactatcagtgatgt 220  Q
    | |  | |||| || || ||| ||||||||||  || ||||||| ||||||| || |||||||||||  | |||| | ||||| ||||||||||    
T  30029841 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgccacgctgttcaagacgacattcaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 30029934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 6874605 - 6874824
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  6874605 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 6874704  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||  |||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||    
T  6874705 tctgttcaaccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataat 6874804  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  6874805 cttctgactgtcagtgatgt 6874824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 43078552 - 43078771
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  43078552 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 43078651  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||    
T  43078652 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataat 43078751  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  43078752 cttctgactgtcagtgatgt 43078771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 220
Target Start/End: Original strand, 12132481 - 12132674
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaatt 126  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | |||||||||||||| |    
T  12132481 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 12132580  T
Q  127 gcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | || |||| || || ||| ||||||||| |    ||||||| | |||||||| |||||||||||  | |||| | ||||| ||||||||||    
T  12132581 gtctaggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 12132674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Original strand, 11549679 - 11549846
Alignment:
Q  26 ggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaat 125  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||||||||||||     
T  11549679 ggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaag 11549778  T
Q  126 tgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    || | || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  11549779 tgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaa 11549846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15658597 - 15658402
Alignment:
Q  26 ggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaat 125  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||||||||||||     
T  15658597 ggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcgaagcttctctgttcagccatgatcatgccaag 15658498  T
Q  126 tgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactatcagtgatgtc 221  Q
    || | || |||  |  |||||| ||||||||||     ||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||  ||||||| |||||||||||    
T  15658497 tgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgactgtcagtgatgtc 15658402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 24681740 - 24681959
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  24681740 ctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 24681839  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||   |||||| |||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| ||||||||| |  | |||    
T  24681840 tctgttcagccatgagcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataat 24681939  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  24681940 cttctgactgtcagtgatgt 24681959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 24724267 - 24724486
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  24724267 ctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 24724366  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||   |||||| |||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| ||||||||| |  | |||    
T  24724367 tctgttcagccatgagcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataat 24724466  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  24724467 cttctgactgtcagtgatgt 24724486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 37 - 220
Target Start/End: Original strand, 30168805 - 30168988
Alignment:
Q  37 gacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatg 136  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | ||||||||||| || || |  | |||    
T  30168805 gacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgctaagtgtctgggatg 30168904  T
Q  137 tttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactatcagtgatgt 220  Q
    | || || ||| ||||||||| |  | ||||||| |||||||||| ||||| |||||  | |||| | ||||| ||||||||||    
T  30168905 tctccgtgatcctttgggttgttatgctgttcaagacgacatccaaagcttaatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 30168988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 31431740 - 31431959
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || || || |||||| ||||| |||| ||    
T  31431740 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcttc 31431839  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  ||||| ||| |||||| ||||    ||||||| |||||||||| ||||||||| |  | |||    
T  31431840 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataat 31431939  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  31431940 cttctgactgtcagtgatgt 31431959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 33516656 - 33516875
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| ||||| | ||  ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  33516656 ctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 33516755  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||  | |||||||||||||| || |  | |||| || || ||| ||||||||| |    ||||||| | |||||||| |||||||||||  | |||    
T  33516756 tctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataat 33516855  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  33516856 cttctgactgtcagtgatgt 33516875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 40473411 - 40473192
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  40473411 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 40473312  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||   |||||| |||||||| || | || |||| || || ||| ||||||||||   | ||||| | |||||||||| ||||||| |||  | |||    
T  40473311 tctgttcagccatgaccatgccaagtgtctaggatgtctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgacgaatgataat 40473212  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  40473211 cttctgactgtcagtgatgt 40473192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 193
Target Start/End: Original strand, 41675050 - 41675201
Alignment:
Q  42 gatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttct 141  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||  | ||| |||| ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  ||     
T  41675050 gatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaaactgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctcc 41675149  T
Q  142 gtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    |||||| |||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  41675150 gtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 41675201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 220
Target Start/End: Original strand, 9317777 - 9317970
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaatt 126  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | |||||||||||||| |    
T  9317777 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 9317876  T
Q  127 gcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactatcagtgatgt 220  Q
    | |  | |||| || || ||| ||||||||| |    ||||||| | |||||||| |||||||||||  | |||| | ||||| ||||||||||    
T  9317877 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 9317970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 2511351 - 2511570
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  | ||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  2511351 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 2511450  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| ||||||||| |  | |||    
T  2511451 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataat 2511550  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  2511551 cttctgactgtcagtgatgt 2511570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 3789841 - 3790060
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||| || || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  3789841 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctagtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 3789940  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||    
T  3789941 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataat 3790040  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  3790041 cttctgactgtcagtgatgt 3790060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13324691 - 13324472
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||| |||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  13324691 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaacccctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 13324592  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||    
T  13324591 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataat 13324492  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  13324491 cttctgactgtcagtgatgt 13324472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 37358505 - 37358286
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  37358505 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcccctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 37358406  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| || ||||||||  | |||    
T  37358405 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagattgatgaatgataat 37358306  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  37358305 cttctgactgtcagtgatgt 37358286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 31826269 - 31826079
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || |||| || |||| ||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||| |||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  31826269 ctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctttggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 31826170  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  31826169 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccaagctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 31826079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 124
Target Start/End: Original strand, 5638236 - 5638333
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  5638236 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaa 5638333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 29966902 - 29966805
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  29966902 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaa 29966805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18500592 - 18500400
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||  ||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  18500592 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagactgaatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 18500493  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  18500492 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaa 18500400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 28649535 - 28649727
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  28649535 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 28649634  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| |||||||||||     |||||  |||||||||| |||||||||||    
T  28649635 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgctataccgttcaggacgacatccaaagcttgatgaa 28649727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 18375274 - 18375151
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| |||||||| || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  18375274 ctgtgaatatgattgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 18375175  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||  | ||||||||||||||    
T  18375174 tctgttcaatcatgatcatgccaa 18375151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 28959612 - 28959429
Alignment:
Q  37 gacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatg 136  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||| || || ||| ||||| | ||| |||||||||||||   ||||||||||||||| || | || |||    
T  28959612 gacttgatgtccacaatgttgccactcctctggtgcctctgcacgtcaagctgtgcaaagcctctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatg 28959513  T
Q  137 tttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactatcagtgatgt 220  Q
      ||||| ||| |||||| |||     ||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||| | ||||| ||||||||||    
T  28959512 cctctgtgatcctttgggctgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 28959429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 30152318 - 30152441
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || ||||| |||||| | ||| |||| ||    
T  30152318 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttc 30152417  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||  | ||||||||||||||    
T  30152418 tctgttcaatcatgatcatgccaa 30152441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 32599298 - 32599115
Alignment:
Q  37 gacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatg 136  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||| || || ||| ||||| | ||| |||||||||||||   ||||||||||||||| || | || |||    
T  32599298 gacttgatgtccacaatgttgccactcctctggtgcctctgcacgtcaagctgtgcaaagcctctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatg 32599199  T
Q  137 tttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactatcagtgatgt 220  Q
      ||||| ||| |||||| ||||    ||||||| |||||||||| ||||||||| |  | |||| | ||||| ||||||||||    
T  32599198 cctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataatcttctgactgtcagtgatgt 32599115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 37671345 - 37671126
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| |||   | |||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  37671345 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgtcgcccctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 37671246  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  ||||| ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| || ||||||||  | |||    
T  37671245 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagtttgatgaatgataat 37671146  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  37671145 cttctgactgtcagtgatgt 37671126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 191
Target Start/End: Original strand, 33292866 - 33293015
Alignment:
Q  42 gatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttct 141  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |   ||||||| |||||||||||  | |||| |||||||| |     
T  33292866 gatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgccactccatatcaagttgtgccaagctttattgtttgaacatgatcatgctgagtgccaagaatgttccc 33292965  T
Q  142 gtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    | || | |||||| |||   || || ||||||||  ||||||||||||||    
T  33292966 gcaaccctttgggctgccatgtcgtccaaaacgatgtccagagcttgatg 33293015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 220
Target Start/End: Original strand, 34616854 - 34617037
Alignment:
Q  37 gacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatg 136  Q
    ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||    
T  34616854 gacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatg 34616953  T
Q  137 tttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactatcagtgatgt 220  Q
      | |||||||  |||||||||     ||||||  |||||||||| |||||||||||  | |||| | ||||| ||||||||||    
T  34616954 cctttgtaatcccttgggttgccatactgttcaggacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 34617037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 37755280 - 37755403
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || ||||| |||||| | ||| |||| ||    
T  37755280 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttc 37755379  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||   |||||||||||||||    
T  37755380 tctgttcagccatgatcatgccaa 37755403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 124
Target Start/End: Original strand, 26480718 - 26480814
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  26480718 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactc-tctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaa 26480814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 37770813 - 37770657
Alignment:
Q  37 gacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatg 136  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || ||||| |||||| | ||| |||| ||| ||||   ||||||||||||||| || | || |||    
T  37770813 gacttgatgtccgcaatgttgctactcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttctttgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatg 37770714  T
Q  137 tttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
      || || ||| ||||||||| |    ||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  37770713 cctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgacatccaaaacttgatgaa 37770657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15284893 - 15284673
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15284893 ctgtgaacatgattgaggtatgtgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctc 15284794  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||    
T  15284793 tttgtttgaccatgatcatgccagttgcccgaaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatctagagtttgatgaacgacaat 15284694  T
Q  201 catttgactatcagtgatgtc 221  Q
     |||||||| |||| ||||||    
T  15284693 tatttgactgtcagcgatgtc 15284673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 15228176 - 15228396
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |  ||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15228176 ctgtgaacatgattggggtatatgagatagctcccagacttgatgttcgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctc 15228275  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||| ||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  15228276 tttgtttgaccatgatcatgccaattgtccagaatgcttccgtaatcctttaggttgccacgttgttcgaaatgacatccagagcttgatgaacgacagt 15228375  T
Q  201 catttgactatcagtgatgtc 221  Q
     |||||||| |||| ||||||    
T  15228376 tatttgactgtcagcgatgtc 15228396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 1900563 - 1900782
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  1900563 ctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactcgatgttcataacattgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctc 1900662  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||  ||||  ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  1900663 tttgtttgaccatgaccatgccagttgcccagaatgattccataatactttgggttgctacgttgttcaaaatgaaatccagagcttgatgaacgacaat 1900762  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
     |||||||| |||| |||||    
T  1900763 tatttgactgtcagcgatgt 1900782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24460570 - 24460362
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||   || ||  ||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24460570 ctgtaaacatgattgaagtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctc 24460471  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || |||||||| ||||||||| || ||||||||||   |||||||| |||||    
T  24460470 tctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagaaactgatgaacgacaat 24460371  T
Q  201 catttgact 209  Q
     || |||||    
T  24460370 tatctgact 24460362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 46 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15391258 - 15391090
Alignment:
Q  46 tccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaa 145  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |  |||    
T  15391258 tccgtaatgttgcaactcctctggtaccgctacacatcaagctatgccaagcctccttgtttgaccataatcatgccaattgcccagaatgccgccataa 15391159  T
Q  146 tcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactatcag 214  Q
    || || |||||||| ||||||||| || || ||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||    
T  15391158 tccttggggttgctacgttgttcagaatgatatccagagcctgatgaacgacaattatctgactgtcag 15391090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 14235490 - 14235292
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||||   ||||  ||||||||| | ||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  14235490 ctgtgaacatgattgagacctatgaagaagctcccagtcttgacgttcgtaacgttgcgactcctctggtaccactacacatcaagctatgccaagcttc 14235391  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaa 199  Q
      ||||||||||||| ||||||  ||| || |||||  ||  ||||| ||| || |||| ||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||    
T  14235390 cttgtttgaccatgaccatgccgtttgtccggaatgcctccataatcctttaggctgctacgttgttcagaatgacatccagagcctgatggacaacaa 14235292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24592271 - 24592059
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| |||||||||     
T  24592271 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttta 24592172  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgac 208  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |   ||||| ||||||||||| |  ||||||| | |||||||| |||||||||||  | |||  ||||||    
T  24592171 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcataatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgac 24592072  T
Q  209 tatcagtgatgtc 221  Q
    | |||||||||||    
T  24592071 tgtcagtgatgtc 24592059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 221
Target Start/End: Original strand, 14665332 - 14665544
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||      
T  14665332 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttca 14665431  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgac 208  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||  | |||  ||||||    
T  14665432 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaatgataattttttgac 14665531  T
Q  209 tatcagtgatgtc 221  Q
    | |||||||||||    
T  14665532 tgtcagtgatgtc 14665544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 193
Target Start/End: Original strand, 17014314 - 17014498
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||      
T  17014314 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttca 17014413  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| ||||||||||| |  ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  17014414 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaa 17014498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 220
Target Start/End: Original strand, 21970043 - 21970226
Alignment:
Q  37 gacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatg 136  Q
    ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| || |  | |||    
T  21970043 gacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttaatcatgatcatgccaagtgtctgggatg 21970142  T
Q  137 tttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactatcagtgatgt 220  Q
    | || || ||| |||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||| | ||||| ||||||||||    
T  21970143 tctccgtgatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 21970226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 14763269 - 14763077
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  14763269 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 14763170  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  |  |||||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  14763169 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcttttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 14763077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 36344480 - 36344288
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||    
T  36344480 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttc 36344381  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  |  |||||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  36344380 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 36344288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 6570159 - 6570378
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  6570159 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 6570258  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||   ||||||| ||||||| || | || |||  || |||||| ||||||||||     ||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||    
T  6570259 tctgttcagccatgattatgccaagtgtctaggatgcctccgtaatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataat 6570358  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  6570359 cttctgactgtcagtgatgt 6570378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18800578 - 18800359
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  18800578 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 18800479  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||    
T  18800478 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataat 18800379  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  18800378 cttctgactgtcagtgatgt 18800359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 40105577 - 40105384
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaatt 126  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| |    
T  40105577 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttaatcatgatcatgccaagt 40105478  T
Q  127 gcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactatcagtgatgt 220  Q
    | |  | |||| || || ||| ||||||||| |    ||||||| | |||||||| |||||||||||  | |||| | ||||| ||||||||||    
T  40105477 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 40105384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 27163282 - 27163159
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||    
T  27163282 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtacctctacatatcaagttgtgcaaagcttc 27163183  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||  | ||||||||||||||    
T  27163182 tctgttcaatcatgatcatgccaa 27163159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 30754060 - 30754279
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  30754060 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 30754159  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| ||||||||| |  | |||    
T  30754160 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatggatgataat 30754259  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  30754260 cttctgactgtcagtgatgt 30754279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 31126483 - 31126264
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| ||||| | ||  ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  31126483 ctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 31126384  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||  | |||||||||||||| || |  | |||| || || ||| ||||||||| |    ||||||| | |||||||| |||||||||||  | |||    
T  31126383 tctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataat 31126284  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  31126283 cttctgactgtcagtgatgt 31126264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 191
Target Start/End: Original strand, 24113009 - 24113158
Alignment:
Q  42 gatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttct 141  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |   ||||||| ||||||||||| || |||| |||||||| |     
T  24113009 gatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgccactccatatcaagttgtgccaagctttattgtttgaacatgatcatgctaagtgccaagaatgttccc 24113108  T
Q  142 gtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    | |||| |||||| |||   || || ||||||||  ||||||||||||||    
T  24113109 gcaatcctttgggctgccatgtcgtccaaaacgatgtccagagcttgatg 24113158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 54833693 - 54833885
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  54833693 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 54833792  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  |  ||||||  |||||||||     ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  54833793 tctgttcagccatgatcatgccaaatgtctaggatgccttcgtaatcccttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 54833885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 5006179 - 5006302
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| |||||||    
T  5006179 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacattaagctgtgcaaagcctc 5006278  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||   |||||||||||||||    
T  5006279 tctgttcagccatgatcatgccaa 5006302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 33673727 - 33673544
Alignment:
Q  37 gacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatg 136  Q
    ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||    
T  33673727 gacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatg 33673628  T
Q  137 tttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactatcagtgatgt 220  Q
      || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||| | ||||| ||||||||||    
T  33673627 cctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 33673544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 39850944 - 39851163
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  39850944 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 39851043  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||     ||||| | |||||||||| |||||||||||  | |||    
T  39851044 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcgagacgacatccaaagcttgatgaatgataat 39851143  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  39851144 cttctgactgtcagtgatgt 39851163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Original strand, 14098873 - 14099039
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaatt 126  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | |||||||||||||| |    
T  14098873 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 14098972  T
Q  127 gcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    | |  | |||| || || ||| ||||||||| |    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  14098973 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaa 14099039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 34188884 - 34188735
Alignment:
Q  42 gatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttct 141  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |   ||||||| |||||||||||  | |||| |||||||| |     
T  34188884 gatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgccactccatatcaagttgtgccaagctttgttgtttgaacatgatcatgctgagtgccaagaatgttccc 34188785  T
Q  142 gtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    | || | |||||| |||   || || ||||||||  ||||||||||||||    
T  34188784 gcaaccctttgggctgccatgtcgtccaaaacgatgtccagagcttgatg 34188735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 32 - 200
Target Start/End: Original strand, 21883 - 22051
Alignment:
Q  32 tcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccca 131  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21883 tcccggtcttgatgtccgtaatgttgcaactcctctggtaccgctacacatcaagctatgccaagcctccttgtttgaccatgatcatgccaattgccca 21982  T
Q  132 gaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    |||||   |  ||||| || |||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||    
T  21983 gaatgccgccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagagcctgatgaacgacaat 22051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 583 - 391
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||||||||| |||   ||||  |||| |||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||    
T  583 ctgtgaacatgatcgagacttatgaagaagttcccagtcttgacgtccgtaatgttgcaactcctctggtaccgctacacatcaagctatgccaagtctc 484  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |  ||||| || |||||| | ||||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  483 cttgtttgaccatgatcatgccaattgcccataatgccgccataatccttggggttgttacgttgttcagaatgacatccagagcctgatgaa 391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 46942 - 46730
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| |||||||||     
T  46942 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaatgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttta 46843  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgac 208  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| ||||||||||| |  ||||||| | ||||||||  ||||||||||  | |||  ||||||    
T  46842 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaggcttgatgaatgataattttttgac 46743  T
Q  209 tatcagtgatgtc 221  Q
    | |||||||||||    
T  46742 tgtcagtgatgtc 46730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 40026 - 39846
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||      
T  40026 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttca 39927  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttga 189  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||    
T  39926 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttga 39846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 193
Target Start/End: Original strand, 30090 - 30246
Alignment:
Q  37 gacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatg 136  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||||||||| ||||| |||| || |||    
T  30090 gacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcccctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcacgccaagtgcctaggatg 30189  T
Q  137 tttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
      |  | |||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  30190 ccttcggaatcctttgggttgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaa 30246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 193
Target Start/End: Original strand, 27591 - 27775
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||| ||||  | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||| |||     
T  27591 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtctgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctattta 27690  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  27691 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagaggacatccaaagcttgatgaa 27775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 193
Target Start/End: Original strand, 30751 - 30935
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | | |||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| |||||||||     
T  30751 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgtaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttta 30850  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  30851 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaa 30935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 9857 - 10049
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||||||||| | ||| ||||||     
T  9857 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcctt 9956  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||| ||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  9957 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttaggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaa 10049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 7178 - 6985
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaatt 126  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | |||||||||||||| |    
T  7178 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 7079  T
Q  127 gcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaatcatttgactatcagtgatgt 220  Q
    | |  | |||| || || ||| ||||||||| |    ||||||| | |||||||| |||||||||||  | |||| | ||||| ||||||||||    
T  7078 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatgaatgataatcttctgactgtcagtgatgt 6985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 26140 - 25974
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaatt 126  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| |||| ||||||||   ||||||||||||||| |    
T  26140 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacatatcaagttgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagt 26041  T
Q  127 gcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    | | || |||  ||||| ||| ||||||||| |    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  26040 gtctaggatgcctctgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaggacatccaaagcttgatgaa 25974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 6305 - 6497
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||  ||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  6305 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagactgaatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 6404  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  6405 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatgaa 6497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 14870 - 14703
Alignment:
Q  26 ggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaat 125  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | ||||||||||||||     
T  14870 ggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaag 14771  T
Q  126 tgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaa 193  Q
    || |  | |||| || || ||| ||||||||| |    ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  14770 tgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaggacatccaaagcttgatgaa 14703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 8240 - 8459
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| || || || |||||| ||||| |||| ||    
T  8240 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcccctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcttc 8339  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||   ||||||||||| ||| || | || |||  || || ||  ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||||  | |||    
T  8340 tctgttcagccatgatcatgacaagtgtctaggatgcctccgtgattctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatgaatgataat 8439  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  8440 cttctgactgtcagtgatgt 8459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 46728 - 46659
Alignment:
Q  37 gacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtt 106  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  46728 gacttgatgtccgtaacatcacaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctgtt 46659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 9031 - 8812
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  | ||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  9031 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 8932  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatgaacaacaat 200  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||| | |||||||||| ||||||||| |  | |||    
T  8931 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatggatgataat 8832  T
Q  201 catttgactatcagtgatgt 220  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  8831 cttctgactgtcagtgatgt 8812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 20306 - 20496
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  | ||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  20306 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 20405  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||| | |||||||||| |||||||||    
T  20406 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatg 20496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 86 - 9
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaag 86  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  86 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaag 9  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University