View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6776_low_51 (Length: 206)

Name: NF6776_low_51
Description: NF6776
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6776_low_51
NF6776_low_51
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (1-191)||(18710877-18711067)
chr8 (6-191)||(44563395-44563580)
chr8 (1-191)||(19658774-19658964)
chr8 (1-191)||(33244956-33245146)
chr8 (39-191)||(22080612-22080764)
chr8 (1-191)||(16283740-16283930)
chr8 (28-191)||(2136993-2137156)
chr8 (9-191)||(16277853-16278035)
chr8 (1-191)||(27608639-27608829)
chr8 (26-191)||(14557940-14558105)
chr8 (1-191)||(3329241-3329431)
chr8 (1-191)||(19674732-19674922)
chr8 (26-159)||(19688414-19688547)
chr8 (9-129)||(189393-189513)
chr8 (27-191)||(31489484-31489648)
chr8 (27-191)||(33259040-33259204)
chr8 (1-124)||(19286753-19286876)
chr8 (1-191)||(29829613-29829803)
chr8 (27-124)||(19208161-19208258)
chr8 (27-124)||(28361756-28361853)
chr8 (1-191)||(12092458-12092648)
chr8 (37-124)||(9354950-9355037)
chr8 (1-124)||(31354815-31354938)
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (1-191)||(26484986-26485176)
chr7 (1-191)||(26682661-26682851)
chr7 (1-191)||(2775651-2775841)
chr7 (1-191)||(39210684-39210874)
chr7 (1-184)||(4200839-4201022)
chr7 (1-191)||(16449659-16449849)
chr7 (1-191)||(2108666-2108856)
chr7 (1-191)||(16041615-16041805)
chr7 (1-183)||(45733752-45733934)
chr7 (1-184)||(31088132-31088315)
chr7 (9-191)||(2154873-2155055)
chr7 (1-191)||(5128284-5128474)
chr7 (9-191)||(10916529-10916711)
chr7 (1-191)||(11424437-11424627)
chr7 (1-124)||(31125212-31125335)
chr7 (1-191)||(26435549-26435739)
chr7 (1-124)||(11441864-11441987)
chr7 (1-124)||(26274822-26274945)
chr7 (1-191)||(3445598-3445788)
chr7 (26-191)||(5147001-5147166)
chr7 (26-191)||(16736121-16736286)
chr7 (26-191)||(16751175-16751340)
chr7 (26-191)||(17523849-17524014)
chr7 (26-191)||(17529201-17529366)
chr7 (42-191)||(18541132-18541281)
chr7 (27-124)||(26319597-26319694)
chr7 (27-124)||(26669642-26669739)
chr7 (1-124)||(24592269-24592392)
chr7 (1-124)||(26537598-26537721)
chr7 (1-124)||(31564118-31564241)
chr7 (9-159)||(16503073-16503223)
chr7 (9-159)||(16518109-16518259)
chr7 (42-191)||(5159852-5160001)
chr7 (27-124)||(9618969-9619066)
chr7 (27-157)||(4144818-4144948)
chr7 (39-124)||(45387673-45387758)
[»] chr3 (57 HSPs)
chr3 (1-191)||(31033933-31034123)
chr3 (1-191)||(32293004-32293194)
chr3 (1-191)||(16626322-16626512)
chr3 (1-191)||(18530640-18530830)
chr3 (1-191)||(5652639-5652829)
chr3 (1-183)||(5713479-5713661)
chr3 (1-183)||(5724389-5724571)
chr3 (1-183)||(5767797-5767979)
chr3 (1-183)||(4626196-4626378)
chr3 (1-191)||(18051514-18051704)
chr3 (1-136)||(5756954-5757088)
chr3 (9-191)||(6192576-6192758)
chr3 (1-191)||(7073464-7073654)
chr3 (9-191)||(8296232-8296414)
chr3 (9-191)||(15740910-15741092)
chr3 (1-183)||(17993608-17993790)
chr3 (1-191)||(18292169-18292359)
chr3 (1-191)||(18330921-18331111)
chr3 (1-191)||(35881018-35881208)
chr3 (2-191)||(4721884-4722073)
chr3 (26-191)||(8301083-8301248)
chr3 (1-191)||(4796469-4796659)
chr3 (9-191)||(15892522-15892704)
chr3 (1-191)||(18276868-18277058)
chr3 (1-191)||(18307470-18307660)
chr3 (1-191)||(48466179-48466369)
chr3 (27-191)||(24328437-24328601)
chr3 (1-124)||(4417171-4417294)
chr3 (1-191)||(10396385-10396575)
chr3 (1-191)||(18242991-18243181)
chr3 (1-191)||(20576663-20576853)
chr3 (1-191)||(21674945-21675135)
chr3 (1-191)||(28021527-28021717)
chr3 (9-191)||(29148571-29148753)
chr3 (1-191)||(36996893-36997083)
chr3 (1-191)||(51782275-51782465)
chr3 (26-191)||(6542278-6542443)
chr3 (42-191)||(20066336-20066485)
chr3 (27-191)||(5013990-5014154)
chr3 (1-191)||(5596173-5596363)
chr3 (1-191)||(8211990-8212180)
chr3 (1-191)||(11110165-11110355)
chr3 (26-124)||(28115837-28115935)
chr3 (42-191)||(32439447-32439596)
chr3 (27-124)||(47023731-47023828)
chr3 (1-124)||(29664853-29664976)
chr3 (1-191)||(5609138-5609328)
chr3 (27-191)||(28339580-28339744)
chr3 (1-124)||(4346570-4346693)
chr3 (1-124)||(5467237-5467360)
chr3 (39-124)||(18225481-18225566)
chr3 (1-124)||(22387461-22387584)
chr3 (37-124)||(22870739-22870826)
chr3 (37-124)||(22885798-22885885)
chr3 (1-191)||(31964289-31964479)
chr3 (39-124)||(7996852-7996937)
chr3 (39-124)||(10643360-10643445)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (1-191)||(2433-2623)
[»] chr6 (43 HSPs)
chr6 (1-191)||(14143003-14143193)
chr6 (1-191)||(26788232-26788422)
chr6 (1-191)||(27196605-27196795)
chr6 (1-191)||(27252445-27252635)
chr6 (1-191)||(13521791-13521981)
chr6 (1-191)||(22456661-22456842)
chr6 (1-184)||(33373981-33374164)
chr6 (1-183)||(8892037-8892219)
chr6 (1-183)||(8903272-8903454)
chr6 (1-184)||(28162945-28163128)
chr6 (1-191)||(17092158-17092348)
chr6 (1-191)||(27272298-27272488)
chr6 (9-191)||(27290088-27290270)
chr6 (1-191)||(29549763-29549953)
chr6 (9-191)||(13298669-13298851)
chr6 (9-191)||(26989297-26989479)
chr6 (9-191)||(24304336-24304518)
chr6 (1-159)||(26918668-26918826)
chr6 (26-191)||(15424035-15424200)
chr6 (1-191)||(4545493-4545683)
chr6 (1-191)||(16750142-16750332)
chr6 (1-191)||(34463064-34463254)
chr6 (27-191)||(16943745-16943909)
chr6 (1-124)||(30557801-30557924)
chr6 (1-191)||(4773294-4773484)
chr6 (9-159)||(22934630-22934780)
chr6 (9-159)||(23857075-23857225)
chr6 (9-159)||(24864013-24864163)
chr6 (1-191)||(27359710-27359900)
chr6 (1-191)||(27450053-27450243)
chr6 (1-191)||(27485417-27485607)
chr6 (1-191)||(29501703-29501893)
chr6 (26-191)||(27008040-27008205)
chr6 (27-124)||(29573327-29573424)
chr6 (1-124)||(4723919-4724042)
chr6 (1-124)||(27044676-27044799)
chr6 (1-191)||(4758052-4758242)
chr6 (1-191)||(16674427-16674617)
chr6 (1-181)||(26116138-26116318)
chr6 (1-124)||(4525574-4525697)
chr6 (38-129)||(27019461-27019552)
chr6 (1-191)||(28207742-28207932)
chr6 (27-124)||(3696395-3696492)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (1-191)||(22925792-22925982)
chr2 (1-191)||(21702928-21703118)
chr2 (2-191)||(19456185-19456374)
chr2 (6-191)||(27118980-27119165)
chr2 (1-191)||(16163886-16164079)
chr2 (6-190)||(34303068-34303252)
chr2 (1-183)||(3784941-3785123)
chr2 (1-183)||(34157297-34157479)
chr2 (1-184)||(31891099-31891282)
chr2 (1-124)||(9349813-9349936)
chr2 (1-191)||(32050085-32050275)
chr2 (26-191)||(20838230-20838395)
chr2 (9-191)||(12655837-12656019)
chr2 (9-191)||(27434208-27434390)
chr2 (9-191)||(28882509-28882691)
chr2 (1-191)||(12716366-12716556)
chr2 (1-191)||(27777509-27777699)
chr2 (1-191)||(27817267-27817457)
chr2 (27-124)||(19416330-19416427)
chr2 (42-191)||(34286682-34286831)
chr2 (42-191)||(34291742-34291891)
chr2 (1-124)||(16829169-16829292)
chr2 (1-124)||(16892189-16892312)
chr2 (26-124)||(11635017-11635115)
chr2 (26-124)||(11641206-11641304)
chr2 (1-191)||(12587097-12587287)
chr2 (1-191)||(13936308-13936498)
chr2 (1-191)||(27803994-27804184)
chr2 (1-191)||(37375448-37375638)
chr2 (1-191)||(39051586-39051776)
chr2 (1-191)||(39890361-39890551)
chr2 (27-124)||(37685740-37685837)
chr2 (27-124)||(37701005-37701102)
chr2 (27-124)||(37925806-37925903)
chr2 (9-159)||(23128362-23128512)
chr2 (27-124)||(31876594-31876691)
chr2 (27-124)||(34861993-34862090)
chr2 (1-124)||(40233798-40233921)
chr2 (37-191)||(260517-260671)
chr2 (37-124)||(21677013-21677100)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (1-191)||(20340110-20340300)
chr1 (1-191)||(28152152-28152342)
chr1 (2-191)||(20461372-20461561)
chr1 (1-191)||(16207806-16207996)
chr1 (1-191)||(41793083-41793273)
chr1 (1-191)||(51638508-51638698)
chr1 (27-191)||(28585297-28585461)
chr1 (27-124)||(10962986-10963083)
[»] chr5 (49 HSPs)
chr5 (1-191)||(33877547-33877737)
chr5 (1-191)||(29888754-29888944)
chr5 (1-184)||(13184327-13184510)
chr5 (1-191)||(22888770-22888960)
chr5 (1-191)||(25199329-25199519)
chr5 (1-191)||(23892506-23892696)
chr5 (1-183)||(11326094-11326276)
chr5 (1-184)||(13440173-13440356)
chr5 (1-184)||(9548222-9548405)
chr5 (9-191)||(30934941-30935123)
chr5 (1-191)||(23752122-23752312)
chr5 (1-191)||(33777787-33777977)
chr5 (26-191)||(24970343-24970508)
chr5 (9-191)||(22998786-22998968)
chr5 (9-191)||(23717660-23717842)
chr5 (9-191)||(24687829-24688011)
chr5 (27-191)||(30029741-30029905)
chr5 (1-191)||(6874605-6874795)
chr5 (1-191)||(24681740-24681930)
chr5 (1-191)||(24724267-24724457)
chr5 (1-191)||(31431740-31431930)
chr5 (1-191)||(43078552-43078742)
chr5 (26-191)||(11549679-11549844)
chr5 (42-191)||(41675050-41675199)
chr5 (27-191)||(12132481-12132645)
chr5 (1-189)||(40473223-40473411)
chr5 (1-124)||(33516656-33516779)
chr5 (1-191)||(2511351-2511541)
chr5 (37-187)||(30168805-30168955)
chr5 (1-191)||(31826079-31826269)
chr5 (27-124)||(5638236-5638333)
chr5 (27-124)||(9317777-9317874)
chr5 (26-191)||(15658432-15658597)
chr5 (27-124)||(29966805-29966902)
chr5 (1-124)||(18375151-18375274)
chr5 (1-124)||(28649535-28649658)
chr5 (1-124)||(30152318-30152441)
chr5 (1-191)||(3789841-3790031)
chr5 (1-191)||(13324501-13324691)
chr5 (1-191)||(18500402-18500592)
chr5 (37-191)||(32599144-32599298)
chr5 (1-191)||(37358315-37358505)
chr5 (42-191)||(33292866-33293015)
chr5 (1-124)||(37755280-37755403)
chr5 (37-191)||(28959458-28959612)
chr5 (1-191)||(37671155-37671345)
chr5 (27-124)||(26480718-26480814)
chr5 (37-124)||(34616854-34616941)
chr5 (37-124)||(37770726-37770813)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (1-191)||(15284703-15284893)
chr4 (1-191)||(15228176-15228366)
chr4 (1-191)||(1900563-1900753)
chr4 (1-183)||(24460388-24460570)
chr4 (46-191)||(15391113-15391258)
chr4 (1-191)||(14235300-14235490)
chr4 (9-191)||(17014314-17014496)
chr4 (9-191)||(24592089-24592271)
chr4 (9-191)||(14665332-14665514)
chr4 (1-191)||(14763079-14763269)
chr4 (37-191)||(21970043-21970197)
chr4 (1-191)||(36344290-36344480)
chr4 (1-124)||(27163159-27163282)
chr4 (1-191)||(6570159-6570349)
chr4 (1-191)||(18800388-18800578)
chr4 (1-191)||(30754060-30754250)
chr4 (42-191)||(24113009-24113158)
chr4 (27-124)||(40105480-40105577)
chr4 (1-124)||(5006179-5006302)
chr4 (1-124)||(31126360-31126483)
chr4 (1-124)||(54833693-54833816)
chr4 (27-124)||(14098873-14098970)
chr4 (1-124)||(39850944-39851067)
chr4 (37-191)||(33673573-33673727)
chr4 (42-191)||(34188735-34188884)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (32-191)||(21883-22042)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (1-191)||(393-583)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (9-191)||(46760-46942)
scaffold0089 (9-189)||(39846-40026)
scaffold0089 (37-191)||(30090-30244)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (9-191)||(27591-27773)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (9-191)||(30751-30933)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (1-191)||(9857-10047)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (27-124)||(7081-7178)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (27-191)||(25976-26140)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (1-191)||(6305-6495)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (26-124)||(14772-14870)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (37-106)||(46659-46728)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (1-191)||(8841-9031)
scaffold0159 (1-191)||(20306-20496)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-191)||(8240-8430)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (9-86)||(9-86)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 18710877 - 18711067
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18710877 ctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctc 18710976  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18710977 tctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatg 18711067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Original strand, 44563395 - 44563580
Alignment:
Q  6 aacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgt 105  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||   || ||  ||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44563395 aacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgt 44563494  T
Q  106 ttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44563495 ttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatg 44563580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 19658964 - 19658774
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||  || || |||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19658964 ctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagaccggacgttcgtaacgttgcaactcctctggtgccactacccatcaagttatgccaagcctc 19658865  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  19658864 tctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcctgatg 19658774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 33244956 - 33245146
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||  || ||  ||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33244956 ctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctctcagaccggacgtttgtaacgttgcaactcctatggtgccactacacatcaaattatgccaagcctc 33245055  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || |||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  33245056 tctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagagcctgatg 33245146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 22080764 - 22080612
Alignment:
Q  39 cttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtt 138  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  22080764 cttgacgttcgtaatgttgcaactcctctggtaccgctacacatcaagctatgccaagcctccttgtttgaccatgatcatgccaattgtccagaatgcc 22080665  T
Q  139 tctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
     |  ||||| || |||||||| ||||||||| || || ||||||||| |||||    
T  22080664 gccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgatatccagagcctgatg 22080612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 16283740 - 16283930
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||||||||  |||||| |||||||||| |  ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||| ||    
T  16283740 ctgtgaacatgattgaagtatgtgaggaagctcctagacttgttgtccgtaatgtcacaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcttc 16283839  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    |||||||  |||||||||| ||| ||||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  16283840 tctgtttagccatgatcataccatttgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 16283930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 2137156 - 2136993
Alignment:
Q  28 aagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattg 127  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||||||||||||||| ||    
T  2137156 aagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtg 2137057  T
Q  128 cccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    || || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  2137056 cctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 2136993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 191
Target Start/End: Original strand, 16277853 - 16278035
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| |||||||||     
T  16277853 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttta 16277952  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||| ||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  16277953 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgagttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 16278035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 27608829 - 27608639
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  27608829 ctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 27608730  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
     || ||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  27608729 cctattcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 27608639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 26 - 191
Target Start/End: Original strand, 14557940 - 14558105
Alignment:
Q  26 ggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaat 125  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||    ||||||||||||||     
T  14557940 ggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagtcatgatcatgccaag 14558039  T
Q  126 tgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  14558040 tgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 14558105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 3329431 - 3329241
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  3329431 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 3329332  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||     ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  3329331 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 3329241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 19674732 - 19674922
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  19674732 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 19674831  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  19674832 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 19674922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 159
Target Start/End: Original strand, 19688414 - 19688547
Alignment:
Q  26 ggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaat 125  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||||||||||||     
T  19688414 ggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaag 19688513  T
Q  126 tgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 159  Q
    |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    
T  19688514 tgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgct 19688547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Original strand, 189393 - 189513
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||      
T  189393 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttca 189492  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcc 129  Q
     ||||||||||||||| ||||    
T  189493 gccatgatcatgccaagtgcc 189513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 31489648 - 31489484
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaatt 126  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | |||||||||||||| |    
T  31489648 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 31489549  T
Q  127 gcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    | | || |||  ||||  ||| |||||| ||||    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  31489548 gtctaggatgcctctgggatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 31489484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 191
Target Start/End: Original strand, 33259040 - 33259204
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaatt 126  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | |||||||||||||| |    
T  33259040 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 33259139  T
Q  127 gcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    | |  | |||| || || ||| ||||||||||   | ||||||| ||||||| || |||||||||    
T  33259140 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacattcaaagcttgatg 33259204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 19286753 - 19286876
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  19286753 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 19286852  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||   |||||||||||||||    
T  19286853 tctgttcagccatgatcatgccaa 19286876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 29829613 - 29829803
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  29829613 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 29829712  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| |||||| ||||    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  29829713 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 29829803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 19208258 - 19208161
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  19208258 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaa 19208161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 28361853 - 28361756
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  28361853 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaa 28361756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 12092648 - 12092458
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| |||||||  ||||||||||| || || || |||||| ||||| |||| ||    
T  12092648 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatattgtcactcctctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcttc 12092549  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||| ||| || | || |||  || || ||  ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  12092548 tctgttcagccatgatcatgacaagtgtctaggatgcctccgtgattctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 12092458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 124
Target Start/End: Original strand, 9354950 - 9355037
Alignment:
Q  37 gacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||||||||||||    
T  9354950 gacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 9355037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 31354815 - 31354938
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||| ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  31354815 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcccagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 31354914  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
     |||||   |||||| ||||||||    
T  31354915 cctgttcagccatgagcatgccaa 31354938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 26484986 - 26485176
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26484986 ctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctc 26485085  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26485086 tctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatg 26485176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 26682851 - 26682661
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26682851 ctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctc 26682752  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26682751 tctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatg 26682661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 2775651 - 2775841
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2775651 ctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctc 2775750  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2775751 tctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctataatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatg 2775841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 39210874 - 39210684
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39210874 ctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctc 39210775  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39210774 tctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgtgttgttcaaaatgacatccagagcttgatg 39210684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 4200839 - 4201022
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4200839 ctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctc 4200938  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagag 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  4200939 tctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctacgttgttcagaatgacatccagag 4201022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 16449849 - 16449659
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  16449849 ctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactggacgtccgtaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctc 16449750  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  16449749 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcagaatgacatccagagcttgatg 16449659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 2108856 - 2108666
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2108856 ctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggactggacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaaattatgccaagcctc 2108757  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || |||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  2108756 tctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagagcctgatg 2108666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 16041615 - 16041805
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||    
T  16041615 ctgtgaacatgattgaggtatacgaggaagctcccagactcgatgttcgtaacattgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgtcaagcctc 16041714  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||| | || |||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16041715 tctgtttaatcacgatcataccaattgcccagaatgcttccgtaatcttttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatg 16041805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 45733752 - 45733934
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||   || ||  ||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45733752 ctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctc 45733851  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccaga 183  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || |||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  45733852 tctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccaga 45733934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 31088315 - 31088132
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||   || ||  ||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31088315 ctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctc 31088216  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagag 184  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| |  |||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  31088215 tctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatcctcggggttgctacgttgttcagaatgacatccagag 31088132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 191
Target Start/End: Original strand, 2154873 - 2155055
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||      
T  2154873 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttca 2154972  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  2154973 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 2155055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 5128284 - 5128474
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || |||| || |||||||||  |||||||||||| |||  | | |||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||    
T  5128284 ctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccataacgtcgtaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttc 5128383  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| ||||||||||| |  ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  5128384 tctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 5128474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 10916711 - 10916529
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||  |||| |||||||||     
T  10916711 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgtaaagcttctctgttta 10916612  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  10916611 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 10916529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11424627 - 11424437
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || |||| || |||| ||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  11424627 ctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 11424528  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  11424527 tctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 11424437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 31125212 - 31125335
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  31125212 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatattgccactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 31125311  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||   |||||||||||||||    
T  31125312 tctgttcagccatgatcatgccaa 31125335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 26435549 - 26435739
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  26435549 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 26435648  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||| | || | || |||  || |||||| ||||||||||     ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  26435649 tctgttcagccatgatcatgccgagtgtctaggatgcctccgtaatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 26435739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 11441864 - 11441987
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  11441864 ctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 11441963  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||   |||||||||||||||    
T  11441964 tctgttcagccatgatcatgccaa 11441987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 26274945 - 26274822
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| ||||| | ||  ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  26274945 ctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 26274846  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||  | ||||||||||||||    
T  26274845 tctgttcaatcatgatcatgccaa 26274822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 3445598 - 3445788
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || |||| || |||| ||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  3445598 ctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 3445697  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   |||||| |||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  3445698 tctgttcagccatgagcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 3445788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 5147166 - 5147001
Alignment:
Q  26 ggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaat 125  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||  | | ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||||||||||||     
T  5147166 ggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgtaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaag 5147067  T
Q  126 tgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    || | || |||  || || ||| ||||||||||     ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  5147066 tgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 5147001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 16736286 - 16736121
Alignment:
Q  26 ggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaat 125  Q
    |||||||||  | ||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||||||||||||     
T  16736286 ggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaag 16736187  T
Q  126 tgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16736186 tgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 16736121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 16751340 - 16751175
Alignment:
Q  26 ggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaat 125  Q
    |||||||||  | ||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||||||||||||     
T  16751340 ggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaag 16751241  T
Q  126 tgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16751240 tgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 16751175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 191
Target Start/End: Original strand, 17523849 - 17524014
Alignment:
Q  26 ggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaat 125  Q
    |||||||||  | ||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||||||||||||     
T  17523849 ggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaag 17523948  T
Q  126 tgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17523949 tgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 17524014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 17529366 - 17529201
Alignment:
Q  26 ggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaat 125  Q
    |||||||||  | ||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||||||||||||     
T  17529366 ggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaag 17529267  T
Q  126 tgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17529266 tgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 17529201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 191
Target Start/End: Original strand, 18541132 - 18541281
Alignment:
Q  42 gatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttct 141  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |   ||||||| |||||||||||  | |||| |||||||| |     
T  18541132 gatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgccactccatatcaagttgtgccaagctttattgtttgaacatgatcatgctgaatgccaagaatgttccc 18541231  T
Q  142 gtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    | |||| |||||| |||   || || ||||||||  ||||||||||||||    
T  18541232 gcaatcctttgggctgccatgtcgtccaaaacgatgtccagagcttgatg 18541281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 26319694 - 26319597
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  26319694 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaa 26319597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 26669739 - 26669642
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  26669739 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaa 26669642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 24592392 - 24592269
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  24592392 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 24592293  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||   |||||||||||||||    
T  24592292 tctgttcagccatgatcatgccaa 24592269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 26537721 - 26537598
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  26537721 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 26537622  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||   |||||||||||||||    
T  26537621 tctgttcagccatgatcatgccaa 26537598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 31564241 - 31564118
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  31564241 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 31564142  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||   |||||||||||||||    
T  31564141 tctgttcagccatgatcatgccaa 31564118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 16503223 - 16503073
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||| ||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||| ||||      
T  16503223 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtctgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctttgttca 16503124  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 159  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    
T  16503123 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgct 16503073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 16518259 - 16518109
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||| ||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||| ||||      
T  16518259 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtctgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctttgttca 16518160  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 159  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    
T  16518159 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgct 16518109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 191
Target Start/End: Original strand, 5159852 - 5160001
Alignment:
Q  42 gatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttct 141  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| || || || |||||||| |||||||| |   ||||||| |||||||||||  | |||| |||||||| |     
T  5159852 gatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgccgctccatatcaagttgtgccaagctttattgtttgaacatgatcatgctgagtgccaagaatgttccc 5159951  T
Q  142 gtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    | |||| |||||| |||   || || ||||||||  ||||||||||||||    
T  5159952 gcaatcctttgggctgccatgtcgtccaaaacgatgtccagagcttgatg 5160001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 124
Target Start/End: Original strand, 9618969 - 9619066
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||| ||||||||    
T  9618969 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacccctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgagcatgccaa 9619066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 4144948 - 4144818
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaatt 126  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||||||||||||||| |    
T  4144948 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagt 4144849  T
Q  127 gcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttg 157  Q
    | | || |||  ||||| ||| |||||||||    
T  4144848 gtctaggatgcctctgtgatcctttgggttg 4144818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 39 - 124
Target Start/End: Original strand, 45387673 - 45387758
Alignment:
Q  39 cttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||||||||    ||||||||||||||    
T  45387673 cttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagtcatgatcatgccaa 45387758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 57)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 31034123 - 31033933
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31034123 ctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctc 31034024  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31034023 tctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatg 31033933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 32293004 - 32293194
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32293004 ctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctc 32293103  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32293104 tctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatg 32293194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 16626512 - 16626322
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16626512 ctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctc 16626413  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16626412 tttgtttgaccatgatcatgccagttgcccggaatgcttccataatcctttgggttgctacgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 16626322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 18530640 - 18530830
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||     
T  18530640 ctgtgaacatgattgaggtatatgagggagctcccagacttaatgttcgtaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctt 18530739  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  18530740 tttgtttgaccatgatcatgccaattgtccagaatgcttccgtaatcctttgggttgctatgttgttcaaaatgacatccagggcttgatg 18530830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 5652639 - 5652829
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||  || || |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5652639 ctgtgaacatgattgaggtatgtgaggaagctcccagaccggacgttcgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctc 5652738  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || |||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  5652739 tctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagagcctgatg 5652829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 5713479 - 5713661
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||   || ||  ||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5713479 ctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctc 5713578  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccaga 183  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || |||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  5713579 tctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccaga 5713661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 5724389 - 5724571
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||   || ||  ||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5724389 ctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctc 5724488  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccaga 183  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || |||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  5724489 tctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccaga 5724571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 5767979 - 5767797
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||   || ||  ||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5767979 ctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctc 5767880  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccaga 183  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || |||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  5767879 tctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccaga 5767797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 4626196 - 4626378
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||   || ||  ||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  4626196 ctgtaaacatgattgaggtatatgagaaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccgagcctc 4626295  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccaga 183  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || |||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  4626296 tctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccaga 4626378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 18051514 - 18051704
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||| |||| || | |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||| ||    
T  18051514 ctgtgaacatgattgaagtatgtgagaaagctcctagacttgatgtccgtaatatcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcttc 18051613  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||| || |||  |  |||||| ||||||||||| |   |||||| | |||||||| |||||||||    
T  18051614 tctgtttagccatgatcatgtcaattgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacaccgttcaagatgacatccaaagcttgatg 18051704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 5757088 - 5756954
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||   || ||  ||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5757088 ctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctc 5756989  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatg 136  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||    
T  5756988 tctgtttga-catgatcatgccagtttgccagaatg 5756954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 191
Target Start/End: Original strand, 6192576 - 6192758
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||      
T  6192576 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttca 6192675  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| ||||||||||| |  ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  6192676 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 6192758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 7073464 - 7073654
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||||||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  7073464 ctgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 7073563  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| |||| ||||||  |  |||| | |||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  7073564 tctgttcagccatgatcatgccaagtgcctagaatgccttcgtaaccctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 7073654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 191
Target Start/End: Original strand, 8296232 - 8296414
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||      
T  8296232 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttca 8296331  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  8296332 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 8296414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 15741092 - 15740910
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| |||||||||     
T  15741092 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcccctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttta 15740993  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  15740992 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 15740910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 17993790 - 17993608
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||   || ||  ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  17993790 ctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 17993691  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccaga 183  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  |  |||||| || |||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  17993690 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccaga 17993608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18292359 - 18292169
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||    
T  18292359 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagttgtgcaaagcttc 18292260  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  |  |||||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  18292259 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcttttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 18292169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 18330921 - 18331111
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||    
T  18330921 ctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttc 18331020  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| ||| |||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  18331021 tctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttaggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 18331111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 35881018 - 35881208
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || |||| || |||| ||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  35881018 ctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 35881117  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  35881118 tctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 35881208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 191
Target Start/End: Original strand, 4721884 - 4722073
Alignment:
Q  2 tgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctct 101  Q
    |||||| ||||| || |||| || |||||||||  |||| |||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| |||    
T  4721884 tgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagactcgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttct 4721983  T
Q  102 ctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    |||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| ||||||||||| |  ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  4721984 ctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 4722073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 8301248 - 8301083
Alignment:
Q  26 ggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaat 125  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||||||||||||     
T  8301248 ggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaag 8301149  T
Q  126 tgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  8301148 tgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttactgttcaaaatgacatccaaagcttgatg 8301083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 4796659 - 4796469
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  4796659 ctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 4796560  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| ||||||||| |    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  4796559 tctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgttatactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 4796469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 15892704 - 15892522
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  |  ||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||      
T  15892704 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcacaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttca 15892605  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  | ||||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  15892604 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgcctttgtaatcctttgggttgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 15892522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18277058 - 18276868
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  18277058 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 18276959  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  |  |||||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  18276958 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcttttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 18276868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18307660 - 18307470
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  18307660 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 18307561  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  |  |||||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  18307560 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcttttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 18307470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 48466179 - 48466369
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  48466179 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 48466278  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || |||||| ||||||||||     ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  48466279 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtaatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 48466369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 191
Target Start/End: Original strand, 24328437 - 24328601
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaatt 126  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| |    
T  24328437 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttaatcatgatcatgccaagt 24328536  T
Q  127 gcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    | | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||| | |||||||||| |||||||||    
T  24328537 gtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatg 24328601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 4417171 - 4417294
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||    
T  4417171 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcctc 4417270  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||   |||||||||||||||    
T  4417271 tctgttcagccatgatcatgccaa 4417294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 10396385 - 10396575
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| || || ||||||||||||||  | |||||||||||| | ||| |||||||    
T  10396385 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacatcgcaactcctctggtgtctctacacatcaagctgtgcaaagcctc 10396484  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||  |||||||||| |||||||||    
T  10396485 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaggacgacatccaaagcttgatg 10396575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 18242991 - 18243181
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  18242991 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 18243090  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| |||||||||| || ||||||    
T  18243091 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagtttgatg 18243181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 20576853 - 20576663
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  20576853 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 20576754  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  20576753 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 20576663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 21674945 - 21675135
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  21674945 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 21675044  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||     ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  21675045 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 21675135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 28021527 - 28021717
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  28021527 ctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 28021626  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  |  |||||| | |||||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  28021627 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctctgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 28021717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 29148753 - 29148571
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  |  ||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||      
T  29148753 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcacaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttca 29148654  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
     ||||||||||||||| || | || |||  |  |||||| ||||||||||| |  ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  29148653 gccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 29148571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 36997083 - 36996893
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || |||| || |||| ||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  36997083 ctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 36996984  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  36996983 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 36996893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 51782275 - 51782465
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  51782275 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 51782374  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||  |||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  51782375 tctgttcaaccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 51782465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 6542443 - 6542278
Alignment:
Q  26 ggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaat 125  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||||||||||||     
T  6542443 ggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgctactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaag 6542344  T
Q  126 tgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| || ||||||    
T  6542343 tgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagtttgatg 6542278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 191
Target Start/End: Original strand, 20066336 - 20066485
Alignment:
Q  42 gatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttct 141  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |   ||||||| ||||||||||   | |||| |||||||| |     
T  20066336 gatgtccgcaatgttgcaactcctctggtaccactccatatcaagttgtgccaagctttattgtttgaacatgatcatgttgaatgccaagaatgttccc 20066435  T
Q  142 gtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    | |||| ||||||||||   || || ||||||||  ||||||||||||||    
T  20066436 gcaatcctttgggttgccatgtcgtccaaaacgatgtccagagcttgatg 20066485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 191
Target Start/End: Original strand, 5013990 - 5014154
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaatt 126  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | |||||||||||||| |    
T  5013990 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 5014089  T
Q  127 gcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    | |  | |||| || || ||| ||||||||||   | ||||||| ||||||| || |||||||||    
T  5014090 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacattcaaagcttgatg 5014154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 5596363 - 5596173
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || || ||| ||||| | ||| |||| ||    
T  5596363 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctgcacgtcaagctgtgcaaagcttc 5596264  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  ||||| ||| ||||||||| |    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  5596263 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 5596173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 8211990 - 8212180
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||  | ||| |||| ||    
T  8211990 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaaactgtgcaaagcttc 8212089  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  8212090 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgatgttcaagacgacatccaaagcttgatg 8212180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11110355 - 11110165
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| |||||||| || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  11110355 ctgtgaatatgattgaagtgtgtgaggaagctccaagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 11110256  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| | |||||||    
T  11110255 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaaacttgatg 11110165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 28115935 - 28115837
Alignment:
Q  26 ggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||||||||||||    
T  28115935 ggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 28115837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 191
Target Start/End: Original strand, 32439447 - 32439596
Alignment:
Q  42 gatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttct 141  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |   ||||||| |||||||||||  | |||| |||||||| |     
T  32439447 gatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgccactccatatcaagttgtgccaggctttattgtttgaacatgatcatgctgagtgccaagaatgttccc 32439546  T
Q  142 gtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    | |||| ||||||||||   || || ||||||||  ||||||||||||||    
T  32439547 gcaatcctttgggttgccatgtcgtccaaaacgatgtccagagcttgatg 32439596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 124
Target Start/End: Original strand, 47023731 - 47023828
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| |  || |||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  47023731 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgcgcaaagcttctctgtttaatcatgatcatgccaa 47023828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 29664976 - 29664853
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  29664976 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 29664877  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||   |||||||||||||||    
T  29664876 tctgttcagccatgatcatgccaa 29664853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 5609328 - 5609138
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  | ||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  5609328 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 5609229  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||  |||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||     ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  5609228 tctgttcaaccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 5609138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 191
Target Start/End: Original strand, 28339580 - 28339744
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaatt 126  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||||||||||||||| |    
T  28339580 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagt 28339679  T
Q  127 gcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    | | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||| | |||||||||| |||||||||    
T  28339680 gtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatg 28339744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 4346693 - 4346570
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  4346693 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 4346594  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||   |||||||||||||||    
T  4346593 tctgttcagccatgatcatgccaa 4346570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 5467237 - 5467360
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  5467237 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 5467336  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||   |||||||||||||||    
T  5467337 tctgttcagccatgatcatgccaa 5467360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 124
Target Start/End: Original strand, 18225481 - 18225566
Alignment:
Q  39 cttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||||||||||||    
T  18225481 cttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 18225566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 22387584 - 22387461
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||| | ||| |||| ||    
T  22387584 ctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcttatacacaacaagctgtgcaaagcttc 22387485  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||   |||||||||||||||    
T  22387484 tctgttcagccatgatcatgccaa 22387461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 22870826 - 22870739
Alignment:
Q  37 gacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||||||||||||    
T  22870826 gacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 22870739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 22885885 - 22885798
Alignment:
Q  37 gacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||||||||||||    
T  22885885 gacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 22885798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 31964479 - 31964289
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  31964479 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 31964380  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
     |||||   |||||| |||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||| | |||||||||| |||||||||    
T  31964379 cctgttcagccatgagcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatg 31964289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 39 - 124
Target Start/End: Original strand, 7996852 - 7996937
Alignment:
Q  39 cttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||||||||    ||||||||||||||    
T  7996852 cttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagtcatgatcatgccaa 7996937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 39 - 124
Target Start/End: Original strand, 10643360 - 10643445
Alignment:
Q  39 cttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||||||||    ||||||||||||||    
T  10643360 cttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagtcatgatcatgccaa 10643445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 151; Significance: 4e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 2623 - 2433
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2623 ctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctc 2524  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2523 tctgtttgaccatgatcatgccagttgtccagaatgtttctgtaatcctttgggttactgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 2433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 151; Significance: 4e-80; HSPs: 43)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 14143193 - 14143003
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14143193 ctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctc 14143094  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  14143093 tctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgtttaaaatgacatccagagcttgatg 14143003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 26788232 - 26788422
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26788232 ctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctc 26788331  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  26788332 tctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgtttaaaatgacatccagagcttgatg 26788422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 27196605 - 27196795
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27196605 ctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctc 27196704  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  27196705 tctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgtttaaaatgacatccagagcttgatg 27196795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 27252635 - 27252445
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27252635 ctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctc 27252536  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  27252535 tctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgtttaaaatgacatccagagcttgatg 27252445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 13521981 - 13521791
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13521981 ctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacatccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctc 13521882  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13521881 tctgtttgaccatgaccatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgttgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatg 13521791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 22456842 - 22456661
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||         ||||||||| ||||| |||| ||    
T  22456842 ctgtgaacgtgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaactcctctg---------cacatcaagctatgcaaagcttc 22456752  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22456751 tttgtttgaccatgatcatgccaattgtccagaatgcttctgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaacgacatccagagattgatg 22456661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 33374164 - 33373981
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||   || ||  ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  33374164 ctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgggttatgccaagcctc 33374065  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagag 184  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || |||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  33374064 tctgtttgaccacgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagag 33373981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 8892219 - 8892037
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||   || ||  ||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8892219 ctgtaaacatgattgaagtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctc 8892120  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccaga 183  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || |||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  8892119 tctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccaga 8892037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 8903454 - 8903272
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||   || ||  ||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8903454 ctgtaaacatgattgaagtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctc 8903355  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccaga 183  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || |||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  8903354 tctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccaga 8903272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 28162945 - 28163128
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||   || ||  ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  28162945 ctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgggttatgccaagcctc 28163044  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagag 184  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || |||||||| || |||||| || |||||||||||    
T  28163045 tctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacggtgttcagaatgacatccagag 28163128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 17092348 - 17092158
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||| ||  |||||||||||| | | |||||||||||||||| || ||| |||||||| |||| ||||||||    
T  17092348 ctgtgaacatgactgaggtatgtgaggaagctaccaaacttgatgtccgcagtgttgcaactcctctggtgcctctaaacatcaagctatgtcaagcctc 17092249  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    | |||||||||||||||||  || ||||||| |||  ||| || ||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  17092248 tttgtttgaccatgatcatagcagttgcccataatacttccgtgatcctttgggttgctacattgttcaaaatgacatccagggcttgatg 17092158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 27272488 - 27272298
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || |||| || || ||||||  ||||||||||||||||  ||| |||||||||||| || ||||| |||||||| ||| |||| ||    
T  27272488 ctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggtagctcctagacttgatgtccgtaacgttgtaactcctctggtgcctctacatatcaagttgtgcaaagcttc 27272389  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| |||| || |||  || |||||| |||||||||||   |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  27272388 tctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgcctccgtaatcctttgggttgctttattgttcaagatgacatccagagcttgatg 27272298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 27290270 - 27290088
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||||||||      
T  27290270 atgattgaggtatatgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttca 27290171  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  27290170 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 27290088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 29549763 - 29549953
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||||||||| || || | || ||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  29549763 ctgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctggacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 29549862  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  29549863 tctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 29549953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 13298851 - 13298669
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| |||||||||     
T  13298851 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttta 13298752  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |   ||||| ||||||||| |    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13298751 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcataatcctttgggttggtatactgttcaaaatgacatccagagcttgatg 13298669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 191
Target Start/End: Original strand, 26989297 - 26989479
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||||||||||  | |||||||||||| | ||| |||| |||||||||     
T  26989297 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgtctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttta 26989396  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  26989397 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 26989479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24304518 - 24304336
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||      
T  24304518 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacatcacaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttca 24304419  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
     |||||| |||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  24304418 gccatgaccatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 24304336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 26918668 - 26918826
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  26918668 ctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 26918767  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 159  Q
    ||||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    
T  26918768 tctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgct 26918826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 26 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 15424200 - 15424035
Alignment:
Q  26 ggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaat 125  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||||||||||||| |     
T  15424200 ggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccgag 15424101  T
Q  126 tgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  15424100 tgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 15424035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 4545683 - 4545493
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  4545683 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgctactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 4545584  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  ||||| ||| |||||| ||||    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  4545583 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 4545493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 16750142 - 16750332
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || ||||||||||||   ||| |||| ||    
T  16750142 ctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgcccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagcggtgcaaagcttc 16750241  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  |  |||||| ||||||||||| |  ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16750242 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 16750332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 34463254 - 34463064
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  34463254 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 34463155  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  34463154 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 34463064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 16943909 - 16943745
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaatt 126  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | |||||||||||||| |    
T  16943909 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 16943810  T
Q  127 gcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    | |  | |||| || || ||| ||||||||||   | ||||||| ||||||| || |||||||||    
T  16943809 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacattcaaagcttgatg 16943745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 30557924 - 30557801
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| ||||| | ||  ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  30557924 ctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 30557825  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||  | ||||||||||||||    
T  30557824 tctgttcaatcatgatcatgccaa 30557801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 4773294 - 4773484
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| |||  ||||||||||| || || ||| ||||| | ||| |||||||    
T  4773294 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgtcactcctctggtgcctctgcacgtcaagctgtgcaaagcctc 4773393  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  ||||| ||| |||||| ||||    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  4773394 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 4773484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 22934780 - 22934630
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||||| |||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||      
T  22934780 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctttggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttca 22934681  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 159  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    
T  22934680 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgct 22934630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 23857225 - 23857075
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||||| |||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||      
T  23857225 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctttggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttca 23857126  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 159  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    
T  23857125 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgct 23857075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 159
Target Start/End: Original strand, 24864013 - 24864163
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| || ||||||||||      
T  24864013 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaatcctctctgttca 24864112  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 159  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    
T  24864113 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgct 24864163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 27359900 - 27359710
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||| || || || |||||| ||||| |||||||    
T  27359900 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccacaatgttgccactcctctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcctc 27359801  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  ||||| ||| |||||| ||||    ||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  27359800 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcctgatg 27359710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 27450243 - 27450053
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||| || || || |||||| ||||| |||||||    
T  27450243 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccacaatgttgccactcctctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcctc 27450144  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  ||||| ||| |||||| ||||    ||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  27450143 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcctgatg 27450053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 27485417 - 27485607
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  | ||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  27485417 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 27485516  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  27485517 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 27485607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 29501703 - 29501893
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  29501703 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 29501802  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  ||||| ||| |||||| ||||    ||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  29501803 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcctgatg 29501893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 191
Target Start/End: Original strand, 27008040 - 27008205
Alignment:
Q  26 ggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaat 125  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||||||||||||     
T  27008040 ggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaag 27008139  T
Q  126 tgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    || | || |||  ||||| ||| |||||| ||||    ||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  27008140 tgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcctgatg 27008205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 124
Target Start/End: Original strand, 29573327 - 29573424
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  29573327 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaa 29573424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 4724042 - 4723919
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  4724042 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgctactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 4723943  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||   |||||||||||||||    
T  4723942 tctgttcagccatgatcatgccaa 4723919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 27044676 - 27044799
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || ||||| |||||| | ||| |||| ||    
T  27044676 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttc 27044775  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||   |||||||||||||||    
T  27044776 tctgttcagccatgatcatgccaa 27044799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 4758052 - 4758242
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| |||  || |||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  4758052 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgtcacccctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 4758151  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  4758152 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 4758242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 16674427 - 16674617
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | | ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  16674427 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgtaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 16674526  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||| ||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||     ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16674527 tctattcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 16674617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 26116318 - 26116138
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| |||  ||||||||||| || ||||| |||||| | ||| |||| ||    
T  26116318 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgtcactcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttc 26116219  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatcca 181  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| ||||||||||    
T  26116218 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatcca 26116138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 4525574 - 4525697
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| || || || |||||| ||||| |||| ||    
T  4525574 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcccctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcttc 4525673  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||   |||||||||||||||    
T  4525674 tctgttcagccatgatcatgccaa 4525697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 129
Target Start/End: Original strand, 27019461 - 27019552
Alignment:
Q  38 acttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcc 129  Q
    |||||||||||||||  | |||||||| ||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||||||||||||||| ||||    
T  27019461 acttgatgtccgtaacgtcgcaactcccctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcc 27019552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 28207742 - 28207932
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| || || || |||||| ||||| |||| ||    
T  28207742 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcccctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcttc 28207841  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||| ||| || | || |||  || || ||  ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  28207842 tctgttcagccatgatcatgacaagtgtctaggatgcctccgtgattctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 28207932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 124
Target Start/End: Original strand, 3696395 - 3696492
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||| |||||||||||    
T  3696395 gaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccacgatcatgccaa 3696492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 151; Significance: 4e-80; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 22925982 - 22925792
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22925982 ctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctc 22925883  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22925882 tctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaattctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatg 22925792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 21703118 - 21702928
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  21703118 ctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactcgatgttcgtaacattgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctc 21703019  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21703018 tctgtttaaccacgatcataccaattgcccagaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatg 21702928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 19456374 - 19456185
Alignment:
Q  2 tgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctct 101  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19456374 tgtgaacatgattgaggtatgtgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctagtgccactacacatcaagctatgccaagcctct 19456275  T
Q  102 ctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  19456274 ttgtttgaccatgatcatgccagttgcccggaatgcttctgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgatatccagagtttgatg 19456185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 191
Target Start/End: Original strand, 27118980 - 27119165
Alignment:
Q  6 aacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgt 105  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||  || ||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27118980 aacatgattgaggtatatgaggaagctcccagaccggacgtttgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgt 27119079  T
Q  106 ttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || |||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  27119080 ttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagagcctgatg 27119165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 16163886 - 16164079
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||   || ||  ||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16163886 ctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctc 16163985  T
Q  101 ---tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16163986 ctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattatgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatg 16164079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 6 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 34303252 - 34303068
Alignment:
Q  6 aacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgt 105  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  34303252 aacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctccttgt 34303153  T
Q  106 ttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgat 190  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||   |  ||||| || |||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  34303152 ttgacaatgatcatgccaattgcccaaaatgccgccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagagcctgat 34303068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 3784941 - 3785123
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||   || ||  ||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3784941 ctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctc 3785040  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccaga 183  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || |||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  3785041 tctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccaga 3785123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 34157297 - 34157479
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||   || ||  ||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34157297 ctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctc 34157396  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccaga 183  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || |||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  34157397 tctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccaga 34157479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 31891282 - 31891099
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||   || ||  ||||  |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  31891282 ctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccaccacacatcgagttatgccaagcctc 31891183  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagag 184  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || |||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  31891182 tctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagag 31891099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 9349936 - 9349813
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| || |||| |||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  9349936 ctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggtcttgacgtccgtaatgttacaacccctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 9349837  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||   |||||||||||||||    
T  9349836 tctgttcagccatgatcatgccaa 9349813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 32050085 - 32050275
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| |||||||| || | || ||||| |||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  32050085 ctgtgaatatgattgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 32050184  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||| | |||||||||||||| || |  | |||| || || ||| |||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  32050185 tctgtttaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 32050275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 191
Target Start/End: Original strand, 20838230 - 20838395
Alignment:
Q  26 ggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaat 125  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||||||||||||     
T  20838230 ggaagctcctagacttgatgtccgtaacatcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaag 20838329  T
Q  126 tgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  20838330 tgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 20838395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 191
Target Start/End: Original strand, 12655837 - 12656019
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| |||||||||     
T  12655837 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttta 12655936  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
     ||||||||||||||| |||| || ||   |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  12655937 gccatgatcatgccaagtgcctaggataccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 12656019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 27434390 - 27434208
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||      
T  27434390 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttca 27434291  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  27434290 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 27434208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 191
Target Start/End: Original strand, 28882509 - 28882691
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||      
T  28882509 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttca 28882608  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  28882609 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 28882691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 12716556 - 12716366
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  12716556 ctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 12716457  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   |||||| |||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  12716456 tctgttcagccatgagcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 12716366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 27777509 - 27777699
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  27777509 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 27777608  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  27777609 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 27777699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 27817267 - 27817457
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  27817267 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 27817366  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  27817367 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 27817457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 19416427 - 19416330
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  19416427 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttaatcatgatcatgccaa 19416330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 191
Target Start/End: Original strand, 34286682 - 34286831
Alignment:
Q  42 gatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttct 141  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  ||     
T  34286682 gatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctcc 34286781  T
Q  142 gtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    |||||| ||||||||||     ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  34286782 gtaatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 34286831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 191
Target Start/End: Original strand, 34291742 - 34291891
Alignment:
Q  42 gatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttct 141  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  ||     
T  34291742 gatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctcc 34291841  T
Q  142 gtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    |||||| ||||||||||     ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  34291842 gtaatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 34291891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 16829292 - 16829169
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| ||||| | ||  ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  16829292 ctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 16829193  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||  | ||||||||||||||    
T  16829192 tctgttcaatcatgatcatgccaa 16829169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 16892189 - 16892312
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| ||||| | ||  ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  16892189 ctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 16892288  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||  | ||||||||||||||    
T  16892289 tctgttcaatcatgatcatgccaa 16892312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 11635115 - 11635017
Alignment:
Q  26 ggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||||||||||||    
T  11635115 ggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 11635017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 11641304 - 11641206
Alignment:
Q  26 ggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||||||||||||    
T  11641304 ggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 11641206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 12587097 - 12587287
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  12587097 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 12587196  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||| | |||||||||| |||||||||    
T  12587197 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatg 12587287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 13936498 - 13936308
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  13936498 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 13936399  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || |  ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  13936398 tctgttcagccatgatcatgccaaatgtctaggatgcctccgcgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 13936308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 27803994 - 27804184
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  27803994 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgaccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 27804093  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  27804094 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 27804184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 37375448 - 37375638
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||  | ||| |||| ||    
T  37375448 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtggggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaaactgtgcaaagcttc 37375547  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   |||||| |||||||| || | || |||  |  |||||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  37375548 tctgttcagccatgaacatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 37375638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 39051776 - 39051586
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  39051776 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 39051677  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    |||| |   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| || ||||||| |||||||||    
T  39051676 tctgatcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacaacatccaaagcttgatg 39051586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 39890361 - 39890551
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  39890361 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 39890460  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  39890461 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgttgttcaagacgacatccaaggcttgatg 39890551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 37685837 - 37685740
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  37685837 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaa 37685740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 37701102 - 37701005
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  37701102 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaa 37701005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 124
Target Start/End: Original strand, 37925806 - 37925903
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  37925806 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaa 37925903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 23128512 - 23128362
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||||| |||| |  |||||||||||| | ||| |||| ||||||||      
T  23128512 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctttggtgcttctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttca 23128413  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 159  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    
T  23128412 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgct 23128362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 124
Target Start/End: Original strand, 31876594 - 31876691
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||  ||||||||  | ||||||||||||||    
T  31876594 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagtttctctgttcaatcatgatcatgccaa 31876691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 124
Target Start/End: Original strand, 34861993 - 34862090
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||||  |||| |||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  34861993 gaagctccgagactagatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaa 34862090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 40233798 - 40233921
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | | ||||||||||||||| |||||||||||  | ||| |||| ||    
T  40233798 ctgtgaaaatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgtaactcctctggtacctctacacatcaaactgtgcaaagcttc 40233897  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||   |||||||||||||||    
T  40233898 tctgttcagccatgatcatgccaa 40233921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 37 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 260671 - 260517
Alignment:
Q  37 gacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatg 136  Q
    ||||||||||||| ||  | | ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||| ||||||||||| || | || |||    
T  260671 gacttgatgtccgcaacgtcgtaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccacgatcatgccaagtgtctaggatg 260572  T
Q  137 tttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
      || || ||| ||||||||||     ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  260571 cctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 260517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 21677100 - 21677013
Alignment:
Q  37 gacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||||||||||||    
T  21677100 gacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 21677013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 151; Significance: 4e-80; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 20340300 - 20340110
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20340300 ctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctc 20340201  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20340200 tctgtttgaccatgatcatgccagttgtccagaatgtttctgtaatcctttgggttactgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 20340110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 28152152 - 28152342
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28152152 ctgtgaacatgattgagatatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctc 28152251  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28152252 tctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatg 28152342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 191
Target Start/End: Original strand, 20461372 - 20461561
Alignment:
Q  2 tgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctct 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  20461372 tgtgaacatgattgaggtatatgagcaagctcgcagacttgatgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgtcaagcctct 20461471  T
Q  102 ctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20461472 ttgtttgaccatgatcatgccagttgtccagaatgctttcgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 20461561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 16207996 - 16207806
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  16207996 ctgtaaacatgattgaggtatatgagaaagctcccagacttgatgttcgtaatgttgcaactcctttggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctc 16207897  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||  || |||||||| |||||||| |||||||||    
T  16207896 tttgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccgtaatcctttggggtgctatgtcgttcaaaatgacatccaaagcttgatg 16207806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 41793273 - 41793083
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  41793273 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 41793174  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||  |||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  41793173 tctgttcaaccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 41793083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 51638508 - 51638698
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| |||| ||    
T  51638508 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctacatatcaagttgtgcaaagcttc 51638607  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  ||||| ||| ||||||||| |    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  51638608 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaggacatccaaagcttgatg 51638698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 191
Target Start/End: Original strand, 28585297 - 28585461
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaatt 126  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | |||||||||||||| |    
T  28585297 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 28585396  T
Q  127 gcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    | |  | |||| || || ||| ||||||||||   | ||||||| ||||||| || |||||||||    
T  28585397 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacattcaaagcttgatg 28585461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 124
Target Start/End: Original strand, 10962986 - 10963083
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  10962986 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaa 10963083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 49)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 33877547 - 33877737
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33877547 ctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacatccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctc 33877646  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33877647 tctgtttgaccatgaccatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgttgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatg 33877737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 29888944 - 29888754
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  29888944 ctgtgaacatgattgaggtgtatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaactcctctggtaccactacacatcaagctatgcaaagcttc 29888845  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29888844 tctgtttaaccgtgatcatgccaattgcccagattgctttcgtaatcctttgggttgctatgctgttcaaaatgacatccagagcttgatg 29888754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 13184510 - 13184327
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||   || ||  ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13184510 ctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctc 13184411  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagag 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  13184410 tctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcagaatgacatccagag 13184327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 22888770 - 22888960
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||    
T  22888770 ctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcctagactcgatgttcgtaacattgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaaacctc 22888869  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    | ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22888870 tttgtttgaccatgatcatgctagttgcccagaatgcttccgtaatcctttgggttgttacgttgttcaaaatgacatccagagcttgatg 22888960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 25199329 - 25199519
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||     
T  25199329 ctgtaaacatgattgaggtatatgagaaagcccccagacttgatgttcgtaatgttgcaactcctctggtgcctttacacatcaagctatgccaagcctt 25199428  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||| |||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  25199429 tttgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttctgtaatccttcggggtgctacgtcgttcaagatgacatccagagcttgatg 25199519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 23892506 - 23892696
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||| ||    
T  23892506 ctgtgaacgtgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcttc 23892605  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||| |||||| |||| | | |||||||| |||||||| |||||||||    
T  23892606 tctgtttaaccatgatcatgccaactgcccaggatgccttcgtaatcctttggggtgctacttcgttcaaaatgacatccaaagcttgatg 23892696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 11326094 - 11326276
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||   || ||  ||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11326094 ctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctc 11326193  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccaga 183  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || |||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  11326194 tctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccaga 11326276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 13440356 - 13440173
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||   || ||  ||||  |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||     
T  13440356 ctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgcctctacacatcgagttatgccaagcctt 13440257  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagag 184  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || |||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  13440256 tctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagag 13440173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 9548405 - 9548222
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  9548405 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcgagttatgccaagcctc 9548306  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagag 184  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||  ||||| || |||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  9548305 tctgtttgaccatgattatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagag 9548222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 191
Target Start/End: Original strand, 30934941 - 30935123
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||||||      
T  30934941 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaatatcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctgttca 30935040  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| ||||||||||| |   |||||| | |||||||| |||||||||    
T  30935041 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacaccgttcaagatgacatccaaagcttgatg 30935123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 23752312 - 23752122
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  23752312 ctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 23752213  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||| || |||  |   ||||| |||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  23752212 tctgtttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcataatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 23752122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 33777787 - 33777977
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  33777787 ctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 33777886  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||| ||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| ||||||||||| |  ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  33777887 tctattcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 33777977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 191
Target Start/End: Original strand, 24970343 - 24970508
Alignment:
Q  26 ggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaat 125  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||||||   |||||||||||||||     
T  24970343 ggaagctcctagacttgatgtccgtaacatcacaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaag 24970442  T
Q  126 tgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  24970443 tgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 24970508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 22998968 - 22998786
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||      
T  22998968 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttca 22998869  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  22998868 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 22998786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 23717842 - 23717660
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||      
T  23717842 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttca 23717743  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  23717742 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 23717660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24688011 - 24687829
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||      
T  24688011 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttca 24687912  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
     ||||||||||||||  |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  24687911 gccatgatcatgccatgtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 24687829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 191
Target Start/End: Original strand, 30029741 - 30029905
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaatt 126  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | |||||||||||||| |    
T  30029741 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 30029840  T
Q  127 gcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    | |  | |||| || || ||| ||||||||||  || ||||||| ||||||| || |||||||||    
T  30029841 gtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgccacgctgttcaagacgacattcaaagcttgatg 30029905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 6874605 - 6874795
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  6874605 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 6874704  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||  |||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  6874705 tctgttcaaccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 6874795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 24681740 - 24681930
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  24681740 ctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 24681839  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   |||||| |||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  24681840 tctgttcagccatgagcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 24681930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 24724267 - 24724457
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  24724267 ctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 24724366  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   |||||| |||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  24724367 tctgttcagccatgagcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 24724457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 31431740 - 31431930
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || || || |||||| ||||| |||| ||    
T  31431740 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcttc 31431839  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  ||||| ||| |||||| ||||    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  31431840 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 31431930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 43078552 - 43078742
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  43078552 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 43078651  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  43078652 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 43078742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 191
Target Start/End: Original strand, 11549679 - 11549844
Alignment:
Q  26 ggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaat 125  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||||||||||||     
T  11549679 ggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaag 11549778  T
Q  126 tgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    || | || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  11549779 tgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 11549844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 191
Target Start/End: Original strand, 41675050 - 41675199
Alignment:
Q  42 gatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttct 141  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||  | ||| |||| ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  ||     
T  41675050 gatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaaactgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctcc 41675149  T
Q  142 gtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    |||||| |||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  41675150 gtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 41675199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 191
Target Start/End: Original strand, 12132481 - 12132645
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaatt 126  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | |||||||||||||| |    
T  12132481 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaagt 12132580  T
Q  127 gcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    | | || |||| || || ||| ||||||||| |    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  12132581 gtctaggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatg 12132645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 40473411 - 40473223
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  40473411 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 40473312  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttga 189  Q
    ||||||   |||||| |||||||| || | || |||| || || ||| ||||||||||   | ||||| | |||||||||| |||||||    
T  40473311 tctgttcagccatgaccatgccaagtgtctaggatgtctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttga 40473223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 33516656 - 33516779
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| ||||| | ||  ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  33516656 ctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 33516755  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||  | ||||||||||||||    
T  33516756 tctgttcaatcatgatcatgccaa 33516779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 2511351 - 2511541
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  | ||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  2511351 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 2511450  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  2511451 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 2511541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 187
Target Start/End: Original strand, 30168805 - 30168955
Alignment:
Q  37 gacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatg 136  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | ||||||||||| || || |  | |||    
T  30168805 gacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgctaagtgtctgggatg 30168904  T
Q  137 tttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagctt 187  Q
    | || || ||| ||||||||| |  | ||||||| |||||||||| |||||    
T  30168905 tctccgtgatcctttgggttgttatgctgttcaagacgacatccaaagctt 30168955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 31826269 - 31826079
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || |||| || |||| ||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||| |||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  31826269 ctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctttggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 31826170  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  31826169 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccaagctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 31826079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 124
Target Start/End: Original strand, 5638236 - 5638333
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  5638236 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaa 5638333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 124
Target Start/End: Original strand, 9317777 - 9317874
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  9317777 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaa 9317874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 15658597 - 15658432
Alignment:
Q  26 ggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaat 125  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||||||||||||     
T  15658597 ggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcgaagcttctctgttcagccatgatcatgccaag 15658498  T
Q  126 tgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    || | || |||  |  |||||| ||||||||||     ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  15658497 tgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 15658432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 29966902 - 29966805
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  29966902 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaa 29966805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 18375274 - 18375151
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| |||||||| || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  18375274 ctgtgaatatgattgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 18375175  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||  | ||||||||||||||    
T  18375174 tctgttcaatcatgatcatgccaa 18375151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 28649535 - 28649658
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  28649535 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 28649634  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||   |||||||||||||||    
T  28649635 tctgttcagccatgatcatgccaa 28649658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 30152318 - 30152441
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || ||||| |||||| | ||| |||| ||    
T  30152318 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttc 30152417  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||  | ||||||||||||||    
T  30152418 tctgttcaatcatgatcatgccaa 30152441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 3789841 - 3790031
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||| || || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  3789841 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctagtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 3789940  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  3789941 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 3790031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 13324691 - 13324501
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||| |||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  13324691 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaacccctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 13324592  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  13324591 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 13324501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18500592 - 18500402
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||  ||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  18500592 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagactgaatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 18500493  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  18500492 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 18500402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 32599298 - 32599144
Alignment:
Q  37 gacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatg 136  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||| || || ||| ||||| | ||| |||||||||||||   ||||||||||||||| || | || |||    
T  32599298 gacttgatgtccacaatgttgccactcctctggtgcctctgcacgtcaagctgtgcaaagcctctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatg 32599199  T
Q  137 tttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
      ||||| ||| |||||| ||||    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  32599198 cctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 32599144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 37358505 - 37358315
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  37358505 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcccctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 37358406  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| || ||||||    
T  37358405 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagattgatg 37358315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 191
Target Start/End: Original strand, 33292866 - 33293015
Alignment:
Q  42 gatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttct 141  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |   ||||||| |||||||||||  | |||| |||||||| |     
T  33292866 gatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgccactccatatcaagttgtgccaagctttattgtttgaacatgatcatgctgagtgccaagaatgttccc 33292965  T
Q  142 gtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    | || | |||||| |||   || || ||||||||  ||||||||||||||    
T  33292966 gcaaccctttgggctgccatgtcgtccaaaacgatgtccagagcttgatg 33293015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 37755280 - 37755403
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || ||||| |||||| | ||| |||| ||    
T  37755280 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttc 37755379  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||   |||||||||||||||    
T  37755380 tctgttcagccatgatcatgccaa 37755403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 37 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 28959612 - 28959458
Alignment:
Q  37 gacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatg 136  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||| || || ||| ||||| | ||| |||||||||||||   ||||||||||||||| || | || |||    
T  28959612 gacttgatgtccacaatgttgccactcctctggtgcctctgcacgtcaagctgtgcaaagcctctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatg 28959513  T
Q  137 tttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
      ||||| ||| |||||| |||     ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  28959512 cctctgtgatcctttgggctgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 28959458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 37671345 - 37671155
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| |||   | |||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  37671345 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgtcgcccctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 37671246  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  ||||| ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| || ||||||    
T  37671245 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagtttgatg 37671155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 124
Target Start/End: Original strand, 26480718 - 26480814
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  26480718 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactc-tctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaa 26480814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 124
Target Start/End: Original strand, 34616854 - 34616941
Alignment:
Q  37 gacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||||||||||||    
T  34616854 gacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 34616941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 37770813 - 37770726
Alignment:
Q  37 gacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || ||||| |||||| | ||| |||| ||| ||||   |||||||||||||||    
T  37770813 gacttgatgtccgcaatgttgctactcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaagcttctttgttcagccatgatcatgccaa 37770726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 115; Significance: 1e-58; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 15284893 - 15284703
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15284893 ctgtgaacatgattgaggtatgtgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctc 15284794  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  15284793 tttgtttgaccatgatcatgccagttgcccgaaatgcttccgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgacatctagagtttgatg 15284703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 15228176 - 15228366
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |  ||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15228176 ctgtgaacatgattggggtatatgagatagctcccagacttgatgttcgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctc 15228275  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||| ||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  15228276 tttgtttgaccatgatcatgccaattgtccagaatgcttccgtaatcctttaggttgccacgttgttcgaaatgacatccagagcttgatg 15228366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 1900563 - 1900753
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  1900563 ctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactcgatgttcataacattgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctc 1900662  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||  ||||  ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1900663 tttgtttgaccatgaccatgccagttgcccagaatgattccataatactttgggttgctacgttgttcaaaatgaaatccagagcttgatg 1900753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 24460570 - 24460388
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||   || ||  ||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24460570 ctgtaaacatgattgaagtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctc 24460471  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccaga 183  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || |||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  24460470 tctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccaga 24460388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 46 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 15391258 - 15391113
Alignment:
Q  46 tccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaa 145  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |  |||    
T  15391258 tccgtaatgttgcaactcctctggtaccgctacacatcaagctatgccaagcctccttgtttgaccataatcatgccaattgcccagaatgccgccataa 15391159  T
Q  146 tcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    || || |||||||| ||||||||| || || ||||||||| |||||    
T  15391158 tccttggggttgctacgttgttcagaatgatatccagagcctgatg 15391113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 14235490 - 14235300
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    |||||||||||||||||   ||||  ||||||||| | ||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  14235490 ctgtgaacatgattgagacctatgaagaagctcccagtcttgacgttcgtaacgttgcgactcctctggtaccactacacatcaagctatgccaagcttc 14235391  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
      ||||||||||||| ||||||  ||| || |||||  ||  ||||| ||| || |||| ||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  14235390 cttgtttgaccatgaccatgccgtttgtccggaatgcctccataatcctttaggctgctacgttgttcagaatgacatccagagcctgatg 14235300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 191
Target Start/End: Original strand, 17014314 - 17014496
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||      
T  17014314 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttca 17014413  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| ||||||||||| |  ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  17014414 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 17014496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24592271 - 24592089
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| |||||||||     
T  24592271 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttta 24592172  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |   ||||| ||||||||||| |  ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  24592171 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcataatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 24592089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 191
Target Start/End: Original strand, 14665332 - 14665514
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||      
T  14665332 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttca 14665431  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  14665432 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 14665514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 14763269 - 14763079
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  14763269 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 14763170  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  |  |||||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  14763169 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcttttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 14763079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 37 - 191
Target Start/End: Original strand, 21970043 - 21970197
Alignment:
Q  37 gacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatg 136  Q
    ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| || |  | |||    
T  21970043 gacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttaatcatgatcatgccaagtgtctgggatg 21970142  T
Q  137 tttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    | || || ||| |||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  21970143 tctccgtgatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 21970197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 36344480 - 36344290
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||    
T  36344480 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttc 36344381  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  |  |||||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  36344380 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 36344290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 27163282 - 27163159
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||    
T  27163282 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtacctctacatatcaagttgtgcaaagcttc 27163183  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||  | ||||||||||||||    
T  27163182 tctgttcaatcatgatcatgccaa 27163159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 6570159 - 6570349
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  6570159 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 6570258  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||| ||||||| || | || |||  || |||||| ||||||||||     ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  6570259 tctgttcagccatgattatgccaagtgtctaggatgcctccgtaatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 6570349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18800578 - 18800388
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  18800578 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 18800479  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  18800478 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 18800388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 30754060 - 30754250
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  30754060 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 30754159  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  30754160 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 30754250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 191
Target Start/End: Original strand, 24113009 - 24113158
Alignment:
Q  42 gatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttct 141  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |   ||||||| ||||||||||| || |||| |||||||| |     
T  24113009 gatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgccactccatatcaagttgtgccaagctttattgtttgaacatgatcatgctaagtgccaagaatgttccc 24113108  T
Q  142 gtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    | |||| |||||| |||   || || ||||||||  ||||||||||||||    
T  24113109 gcaatcctttgggctgccatgtcgtccaaaacgatgtccagagcttgatg 24113158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 40105577 - 40105480
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  40105577 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttaatcatgatcatgccaa 40105480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 5006179 - 5006302
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| |||||||    
T  5006179 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacattaagctgtgcaaagcctc 5006278  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||   |||||||||||||||    
T  5006279 tctgttcagccatgatcatgccaa 5006302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 31126483 - 31126360
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| ||||| | ||  ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  31126483 ctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 31126384  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||  | ||||||||||||||    
T  31126383 tctgttcaatcatgatcatgccaa 31126360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 54833693 - 54833816
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  54833693 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 54833792  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||   |||||||||||||||    
T  54833793 tctgttcagccatgatcatgccaa 54833816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 124
Target Start/End: Original strand, 14098873 - 14098970
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  14098873 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaa 14098970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 39850944 - 39851067
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  39850944 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 39851043  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||   |||||||||||||||    
T  39851044 tctgttcagccatgatcatgccaa 39851067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 33673727 - 33673573
Alignment:
Q  37 gacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatg 136  Q
    ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||    
T  33673727 gacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatg 33673628  T
Q  137 tttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
      || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  33673627 cctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 33673573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 34188884 - 34188735
Alignment:
Q  42 gatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttct 141  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |   ||||||| |||||||||||  | |||| |||||||| |     
T  34188884 gatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgccactccatatcaagttgtgccaagctttgttgtttgaacatgatcatgctgagtgccaagaatgttccc 34188785  T
Q  142 gtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    | || | |||||| |||   || || ||||||||  ||||||||||||||    
T  34188784 gcaaccctttgggctgccatgtcgtccaaaacgatgtccagagcttgatg 34188735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 92; Significance: 7e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 32 - 191
Target Start/End: Original strand, 21883 - 22042
Alignment:
Q  32 tcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccca 131  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21883 tcccggtcttgatgtccgtaatgttgcaactcctctggtaccgctacacatcaagctatgccaagcctccttgtttgaccatgatcatgccaattgccca 21982  T
Q  132 gaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    |||||   |  ||||| || |||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  21983 gaatgccgccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagagcctgatg 22042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 583 - 393
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||||||||| |||   ||||  |||| |||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||    
T  583 ctgtgaacatgatcgagacttatgaagaagttcccagtcttgacgtccgtaatgttgcaactcctctggtaccgctacacatcaagctatgccaagtctc 484  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |  ||||| || |||||| | ||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  483 cttgtttgaccatgatcatgccaattgcccataatgccgccataatccttggggttgttacgttgttcagaatgacatccagagcctgatg 393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 59; Significance: 3e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 46942 - 46760
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| |||||||||     
T  46942 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaatgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttta 46843  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| ||||||||||| |  ||||||| | ||||||||  ||||||||    
T  46842 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaggcttgatg 46760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 40026 - 39846
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||      
T  40026 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttca 39927  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttga 189  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||    
T  39926 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttga 39846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 191
Target Start/End: Original strand, 30090 - 30244
Alignment:
Q  37 gacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatg 136  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||||||||| ||||| |||| || |||    
T  30090 gacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcccctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcacgccaagtgcctaggatg 30189  T
Q  137 tttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
      |  | |||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  30190 ccttcggaatcctttgggttgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 30244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 191
Target Start/End: Original strand, 27591 - 27773
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||| ||||  | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||| |||     
T  27591 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtctgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctattta 27690  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  27691 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagaggacatccaaagcttgatg 27773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 191
Target Start/End: Original strand, 30751 - 30933
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttg 108  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | | |||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| |||||||||     
T  30751 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgtaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttta 30850  T
Q  109 accatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
     ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  30851 gccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagaagacatccaaagcttgatg 30933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 9857 - 10047
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||||||||| | ||| ||||||     
T  9857 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcctt 9956  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||| ||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  9957 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttaggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 10047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 7178 - 7081
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  7178 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaa 7081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 26140 - 25976
Alignment:
Q  27 gaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaatt 126  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| |||| ||||||||   ||||||||||||||| |    
T  26140 gaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacatatcaagttgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagt 26041  T
Q  127 gcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    | | || |||  ||||| ||| ||||||||| |    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  26040 gtctaggatgcctctgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaggacatccaaagcttgatg 25976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 6305 - 6495
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||  ||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||    
T  6305 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagactgaatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttc 6404  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  6405 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 6495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 14870 - 14772
Alignment:
Q  26 ggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 124  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  14870 ggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaa 14772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 46728 - 46659
Alignment:
Q  37 gacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtt 106  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  46728 gacttgatgtccgtaacatcacaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctgtt 46659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 9031 - 8841
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  | ||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  9031 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 8932  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||| | |||||||||| |||||||||    
T  8931 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatg 8841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 20306 - 20496
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  | ||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||    
T  20306 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttc 20405  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||| | |||||||||| |||||||||    
T  20406 tctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatg 20496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 8240 - 8430
Alignment:
Q  1 ctgtgaacatgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctc 100  Q
    ||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| || || || |||||| ||||| |||| ||    
T  8240 ctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcccctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaagcttc 8339  T
Q  101 tctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 191  Q
    ||||||   ||||||||||| ||| || | || |||  || || ||  ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  8340 tctgttcagccatgatcatgacaagtgtctaggatgcctccgtgattctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 8430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 86 - 9
Alignment:
Q  9 atgattgaggtatatggggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaag 86  Q
    ||||| || |||| || |||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  86 atgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaag 9  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University