View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6778_low_4 (Length: 447)

Name: NF6778_low_4
Description: NF6778
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6778_low_4
NF6778_low_4
[»] chr5 (39 HSPs)
chr5 (1-446)||(19773016-19773461)
chr5 (1-446)||(22329772-22330217)
chr5 (1-446)||(16359558-16360003)
chr5 (1-446)||(34569550-34569995)
chr5 (1-446)||(27521462-27521907)
chr5 (7-446)||(14996624-14997063)
chr5 (1-446)||(41773898-41774343)
chr5 (1-446)||(27682285-27682730)
chr5 (1-446)||(27613412-27613857)
chr5 (1-446)||(40711836-40712281)
chr5 (1-446)||(29472958-29473403)
chr5 (1-446)||(27665388-27665820)
chr5 (1-446)||(37288381-37288826)
chr5 (1-446)||(22350975-22351420)
chr5 (1-446)||(22137724-22138169)
chr5 (110-446)||(18782279-18782618)
chr5 (17-412)||(20803669-20804067)
chr5 (231-446)||(23537097-23537312)
chr5 (139-377)||(23461165-23461406)
chr5 (184-386)||(25429659-25429864)
chr5 (184-383)||(21883014-21883218)
chr5 (1-443)||(23526107-23526552)
chr5 (178-446)||(14883873-14884144)
chr5 (187-446)||(25851296-25851558)
chr5 (184-389)||(23077844-23078052)
chr5 (187-446)||(20345506-20345768)
chr5 (184-398)||(22505900-22506117)
chr5 (269-386)||(21631341-21631458)
chr5 (269-386)||(21331931-21332048)
chr5 (283-390)||(21870216-21870323)
chr5 (283-390)||(21874496-21874603)
chr5 (280-389)||(23474532-23474641)
chr5 (352-446)||(16257918-16258012)
chr5 (352-446)||(22591637-22591731)
chr5 (352-446)||(22595192-22595286)
chr5 (7-107)||(21882836-21882936)
chr5 (7-52)||(25429483-25429528)
chr5 (269-386)||(26735670-26735787)
chr5 (44-108)||(25851153-25851217)
[»] chr3 (49 HSPs)
chr3 (1-446)||(10008343-10008788)
chr3 (1-446)||(12889452-12889897)
chr3 (1-446)||(10908953-10909398)
chr3 (1-446)||(15345187-15345632)
chr3 (1-446)||(43165418-43165863)
chr3 (1-446)||(20058996-20059441)
chr3 (1-446)||(48428190-48428635)
chr3 (1-446)||(5421872-5422317)
chr3 (1-446)||(16753643-16754088)
chr3 (4-446)||(6603481-6603923)
chr3 (1-446)||(16638516-16638961)
chr3 (1-446)||(26790355-26790800)
chr3 (1-446)||(3688686-3689131)
chr3 (1-446)||(15712998-15713443)
chr3 (1-446)||(53381961-53382405)
chr3 (1-446)||(13255433-13255878)
chr3 (1-446)||(15586334-15586779)
chr3 (7-446)||(15399460-15399898)
chr3 (113-446)||(5110351-5110684)
chr3 (1-446)||(24185933-24186378)
chr3 (172-446)||(6596969-6597243)
chr3 (198-446)||(15358992-15359240)
chr3 (94-446)||(16803886-16804241)
chr3 (37-446)||(16694943-16695355)
chr3 (26-412)||(11861121-11861510)
chr3 (74-446)||(23414729-23415104)
chr3 (7-171)||(15358832-15358996)
chr3 (133-412)||(12501808-12502090)
chr3 (1-398)||(15065814-15066214)
chr3 (184-440)||(23078962-23079221)
chr3 (187-446)||(10408907-10409169)
chr3 (187-386)||(17497620-17497822)
chr3 (184-443)||(14873527-14873789)
chr3 (187-446)||(28757258-28757520)
chr3 (187-446)||(47126883-47127145)
chr3 (132-386)||(14578420-14578677)
chr3 (280-446)||(16831456-16831622)
chr3 (385-446)||(5108481-5108542)
chr3 (283-440)||(16326641-16326798)
chr3 (283-446)||(16384300-16384463)
chr3 (289-389)||(16825264-16825364)
chr3 (283-446)||(12357455-12357618)
chr3 (352-446)||(2036840-2036934)
chr3 (352-446)||(2040581-2040675)
chr3 (352-446)||(14039853-14039947)
chr3 (294-386)||(13028345-13028437)
chr3 (271-353)||(11958202-11958284)
chr3 (269-386)||(19727774-19727890)
chr3 (346-390)||(10417029-10417073)
[»] chr1 (34 HSPs)
chr1 (1-446)||(33387804-33388249)
chr1 (1-446)||(21833441-21833886)
chr1 (1-446)||(51330267-51330712)
chr1 (1-446)||(16347369-16347815)
chr1 (1-446)||(41350444-41350888)
chr1 (7-446)||(21842357-21842796)
chr1 (1-446)||(22400459-22400904)
chr1 (1-446)||(19109507-19109953)
chr1 (1-408)||(24784667-24785077)
chr1 (263-446)||(16354018-16354201)
chr1 (74-446)||(21228328-21228703)
chr1 (37-446)||(17041788-17042199)
chr1 (15-440)||(22435521-22435939)
chr1 (184-440)||(21176689-21176948)
chr1 (7-390)||(22401737-22402123)
chr1 (184-371)||(20081223-20081413)
chr1 (187-446)||(48426229-48426491)
chr1 (1-386)||(22496088-22496476)
chr1 (271-386)||(16379506-16379621)
chr1 (187-398)||(37680405-37680619)
chr1 (187-398)||(20297739-20297953)
chr1 (184-377)||(20074550-20074746)
chr1 (184-446)||(52989094-52989358)
chr1 (301-443)||(21738811-21738953)
chr1 (187-446)||(38909598-38909860)
chr1 (271-386)||(21752459-21752574)
chr1 (280-386)||(20921860-20921966)
chr1 (292-390)||(21742380-21742478)
chr1 (283-389)||(22015574-22015680)
chr1 (269-368)||(22117124-22117223)
chr1 (283-446)||(31536769-31536932)
chr1 (184-377)||(21961380-21961576)
chr1 (25-107)||(20081490-20081572)
chr1 (187-328)||(24096505-24096649)
[»] chr7 (39 HSPs)
chr7 (1-446)||(18180856-18181300)
chr7 (1-446)||(15157769-15158214)
chr7 (1-446)||(13689154-13689599)
chr7 (1-446)||(8710718-8711163)
chr7 (1-446)||(14335509-14335954)
chr7 (1-446)||(18586883-18587328)
chr7 (1-446)||(11233925-11234370)
chr7 (1-446)||(44788063-44788508)
chr7 (78-446)||(10873652-10874019)
chr7 (1-446)||(11549814-11550259)
chr7 (1-446)||(12690614-12691059)
chr7 (36-446)||(14957656-14958066)
chr7 (74-446)||(11984178-11984553)
chr7 (74-440)||(9591550-9591919)
chr7 (69-446)||(17703164-17703544)
chr7 (69-446)||(16726150-16726530)
chr7 (187-446)||(26091485-26091747)
chr7 (187-446)||(26115277-26115539)
chr7 (283-390)||(16947215-16947322)
chr7 (187-398)||(40924552-40924766)
chr7 (191-386)||(15145692-15145890)
chr7 (284-390)||(13004865-13004971)
chr7 (187-447)||(13965354-13965617)
chr7 (269-382)||(15627908-15628021)
chr7 (184-443)||(12459925-12460187)
chr7 (187-446)||(49155601-49155863)
chr7 (283-390)||(14260989-14261096)
chr7 (283-389)||(11385173-11385279)
chr7 (283-446)||(14145060-14145223)
chr7 (283-390)||(19150410-19150517)
chr7 (283-390)||(20749809-20749916)
chr7 (292-390)||(12712406-12712504)
chr7 (283-446)||(21755811-21755974)
chr7 (184-389)||(13024641-13024849)
chr7 (280-446)||(14283061-14283227)
chr7 (283-389)||(12798248-12798354)
chr7 (346-446)||(13676907-13677007)
chr7 (44-107)||(12459785-12459848)
chr7 (44-92)||(21755569-21755617)
[»] chr6 (36 HSPs)
chr6 (1-446)||(27205610-27206055)
chr6 (1-446)||(27243173-27243618)
chr6 (1-446)||(24292630-24293075)
chr6 (1-446)||(29589287-29589732)
chr6 (1-446)||(28312618-28313063)
chr6 (1-446)||(28260045-28260490)
chr6 (1-446)||(28285426-28285871)
chr6 (1-446)||(28338794-28339239)
chr6 (1-446)||(16574878-16575323)
chr6 (1-446)||(16620057-16620502)
chr6 (1-446)||(2871650-2872095)
chr6 (1-414)||(25115540-25115954)
chr6 (1-446)||(22829234-22829679)
chr6 (1-446)||(5836076-5836521)
chr6 (1-386)||(22436857-22437245)
chr6 (74-446)||(25756460-25756835)
chr6 (184-440)||(21764983-21765242)
chr6 (133-446)||(27558814-27559130)
chr6 (283-389)||(19438275-19438381)
chr6 (9-287)||(18404948-18405229)
chr6 (184-443)||(10465696-10465958)
chr6 (187-398)||(24367574-24367788)
chr6 (283-389)||(21566893-21566999)
chr6 (269-389)||(19456282-19456402)
chr6 (269-389)||(19466427-19466547)
chr6 (280-386)||(18660189-18660295)
chr6 (284-390)||(19881670-19881776)
chr6 (292-390)||(34642486-34642584)
chr6 (270-386)||(18182293-18182409)
chr6 (1-149)||(19867675-19867823)
chr6 (283-398)||(14376809-14376924)
chr6 (187-386)||(23081597-23081799)
chr6 (10-62)||(16924872-16924924)
chr6 (44-107)||(10466035-10466098)
chr6 (304-386)||(18404841-18404923)
chr6 (187-227)||(21474774-21474814)
[»] chr4 (35 HSPs)
chr4 (1-446)||(19775236-19775681)
chr4 (1-446)||(12479724-12480169)
chr4 (1-446)||(23958871-23959316)
chr4 (1-446)||(17091592-17092037)
chr4 (1-446)||(8050066-8050511)
chr4 (1-446)||(27714460-27714905)
chr4 (1-446)||(14300422-14300867)
chr4 (1-446)||(16233435-16233880)
chr4 (1-446)||(8389536-8389981)
chr4 (1-446)||(19635260-19635705)
chr4 (7-446)||(40476170-40476609)
chr4 (1-446)||(14683691-14684136)
chr4 (74-440)||(13513547-13513916)
chr4 (94-446)||(18604259-18604614)
chr4 (187-440)||(16248122-16248378)
chr4 (126-411)||(18223948-18224236)
chr4 (184-446)||(7357574-7357839)
chr4 (231-440)||(16350188-16350397)
chr4 (187-446)||(3261494-3261756)
chr4 (245-386)||(14162841-14162982)
chr4 (187-446)||(29450237-29450499)
chr4 (187-446)||(44658566-44658828)
chr4 (184-440)||(20893338-20893597)
chr4 (1-154)||(15144627-15144780)
chr4 (74-167)||(16250572-16250665)
chr4 (283-401)||(14993112-14993230)
chr4 (187-386)||(8346-8548)
chr4 (280-372)||(14697507-14697599)
chr4 (283-446)||(11203932-11204095)
chr4 (283-401)||(15073768-15073886)
chr4 (269-389)||(16219583-16219703)
chr4 (269-389)||(16222903-16223023)
chr4 (44-127)||(7357434-7357517)
chr4 (283-390)||(18259850-18259957)
chr4 (187-227)||(15073669-15073709)
[»] chr2 (32 HSPs)
chr2 (1-446)||(9338337-9338782)
chr2 (1-446)||(9486971-9487416)
chr2 (1-446)||(24712789-24713234)
chr2 (1-446)||(22322585-22323030)
chr2 (1-446)||(10871605-10872050)
chr2 (1-446)||(16983995-16984440)
chr2 (1-446)||(24265125-24265570)
chr2 (1-446)||(44382813-44383258)
chr2 (1-446)||(27374024-27374469)
chr2 (1-446)||(17001755-17002200)
chr2 (1-446)||(24873993-24874438)
chr2 (1-278)||(21139392-21139669)
chr2 (30-446)||(23116299-23116718)
chr2 (1-410)||(24704758-24705170)
chr2 (37-446)||(22462721-22463133)
chr2 (7-443)||(24678248-24678687)
chr2 (133-446)||(24656898-24657214)
chr2 (1-377)||(23028771-23029149)
chr2 (1-386)||(22742266-22742654)
chr2 (289-389)||(16931598-16931698)
chr2 (184-397)||(21320292-21320508)
chr2 (187-386)||(23039877-23040079)
chr2 (69-266)||(23205137-23205337)
chr2 (69-266)||(23676741-23676941)
chr2 (7-386)||(23105027-23105410)
chr2 (187-386)||(22733074-22733276)
chr2 (15-232)||(11351168-11351385)
chr2 (283-446)||(20848626-20848789)
chr2 (283-389)||(23274633-23274739)
chr2 (297-443)||(23029815-23029961)
chr2 (186-266)||(23065353-23065436)
chr2 (186-266)||(23074803-23074886)
[»] chr8 (31 HSPs)
chr8 (1-446)||(17671168-17671613)
chr8 (1-446)||(20015409-20015854)
chr8 (1-446)||(19115590-19116035)
chr8 (1-446)||(19481219-19481663)
chr8 (1-446)||(18859767-18860212)
chr8 (1-446)||(22126105-22126550)
chr8 (1-446)||(22117321-22117766)
chr8 (74-446)||(22043090-22043465)
chr8 (115-446)||(32603449-32603783)
chr8 (37-446)||(30310287-30310699)
chr8 (37-446)||(15536609-15537021)
chr8 (7-386)||(18880860-18881242)
chr8 (1-386)||(19981157-19981545)
chr8 (1-440)||(21163679-21164129)
chr8 (7-386)||(21391064-21391446)
chr8 (7-386)||(21780390-21780772)
chr8 (94-260)||(22031386-22031554)
chr8 (187-446)||(16268367-16268629)
chr8 (187-446)||(28984287-28984549)
chr8 (264-389)||(29300626-29300751)
chr8 (187-386)||(21671891-21672093)
chr8 (283-446)||(22027423-22027586)
chr8 (231-386)||(22421096-22421251)
chr8 (283-389)||(21928903-21929009)
chr8 (269-386)||(22523971-22524088)
chr8 (280-386)||(22054335-22054441)
chr8 (355-446)||(17830113-17830204)
chr8 (187-383)||(19985556-19985755)
chr8 (292-389)||(3274589-3274686)
chr8 (7-52)||(21254141-21254186)
chr8 (284-401)||(22374345-22374462)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (1-446)||(22400-22845)
[»] scaffold0052 (1 HSPs)
scaffold0052 (1-446)||(7389-7834)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (1-446)||(3577-4022)
scaffold0044 (74-445)||(17386-17760)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (7-446)||(10527-10965)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (11-446)||(11632-12050)
scaffold0028 (11-446)||(21160-21578)
scaffold0028 (1-446)||(55157-55602)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (1-446)||(41308-41753)
scaffold0109 (37-401)||(12872-13239)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (1-446)||(8411-8856)
[»] scaffold0789 (1 HSPs)
scaffold0789 (1-445)||(91-524)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (9-446)||(424469-424909)
scaffold0003 (283-443)||(203819-203979)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (1-446)||(48818-49263)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (233-446)||(107480-107693)
scaffold0029 (184-386)||(8550-8755)
scaffold0029 (346-390)||(93653-93697)
[»] scaffold1881 (1 HSPs)
scaffold1881 (94-440)||(189-538)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (37-446)||(229555-229967)
scaffold0009 (190-389)||(251961-252163)
[»] scaffold0177 (2 HSPs)
scaffold0177 (74-440)||(14750-15119)
scaffold0177 (74-440)||(11065-11434)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (74-446)||(5224-5599)
[»] scaffold0451 (1 HSPs)
scaffold0451 (74-446)||(13733-14110)
[»] scaffold0289 (1 HSPs)
scaffold0289 (74-440)||(14-383)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (7-440)||(36657-37093)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (1-446)||(3-450)
scaffold0008 (121-446)||(139313-139641)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (37-446)||(14613-15025)
scaffold0010 (269-386)||(5339-5456)
scaffold0010 (346-390)||(180598-180642)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (7-440)||(15288-15724)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (1-443)||(7363-7808)
[»] scaffold2059 (1 HSPs)
scaffold2059 (37-445)||(473-884)
[»] scaffold0080 (5 HSPs)
scaffold0080 (7-386)||(32038-32420)
scaffold0080 (77-401)||(9987-10314)
scaffold0080 (77-401)||(12642-12969)
scaffold0080 (7-386)||(54796-55178)
scaffold0080 (7-218)||(37504-37715)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (37-401)||(68-435)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (37-401)||(171307-171674)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (9-443)||(36526-36963)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (1-386)||(21757-22145)
scaffold0081 (1-386)||(37181-37569)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (186-412)||(121913-122142)
scaffold0034 (283-446)||(11609-11772)
scaffold0034 (283-446)||(1655-1818)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (37-446)||(7482-7894)
[»] scaffold1220 (1 HSPs)
scaffold1220 (115-413)||(3-304)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (187-386)||(141-343)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (7-386)||(17112-17494)
scaffold0114 (283-386)||(40496-40599)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (1-386)||(193-581)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (25-398)||(291-667)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (7-386)||(10643-11025)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (7-386)||(15070-15452)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (7-386)||(8569-8952)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (12-266)||(10041-10298)
[»] scaffold1459 (1 HSPs)
scaffold1459 (132-440)||(801-1112)
[»] scaffold0501 (2 HSPs)
scaffold0501 (184-384)||(260-463)
scaffold0501 (1-149)||(77-225)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (184-384)||(30623-30826)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (187-386)||(11602-11804)
scaffold0120 (187-371)||(14423-14610)
scaffold0120 (1-95)||(14237-14331)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (85-446)||(3101-3465)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (1-374)||(30349-30725)
scaffold0023 (283-443)||(164107-164267)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (7-383)||(9106-9485)
[»] scaffold0490 (2 HSPs)
scaffold0490 (187-386)||(230-432)
scaffold0490 (283-387)||(3303-3407)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (184-386)||(50108-50313)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (7-386)||(8382-8764)
[»] scaffold0017 (4 HSPs)
scaffold0017 (185-440)||(16775-17033)
scaffold0017 (233-386)||(194631-194784)
scaffold0017 (10-107)||(194883-194980)
scaffold0017 (312-440)||(21297-21425)
[»] scaffold0611 (1 HSPs)
scaffold0611 (187-372)||(9220-9408)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (231-386)||(6886-7041)
[»] scaffold0276 (1 HSPs)
scaffold0276 (187-446)||(23626-23888)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (184-386)||(2325-2530)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (133-446)||(28631-28947)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (187-386)||(23708-23910)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (187-398)||(42074-42288)
[»] scaffold0523 (2 HSPs)
scaffold0523 (296-431)||(11461-11596)
scaffold0523 (298-390)||(5890-5982)
[»] scaffold0993 (1 HSPs)
scaffold0993 (1-370)||(1135-1507)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (184-389)||(30086-30294)
[»] scaffold0020 (3 HSPs)
scaffold0020 (292-389)||(98343-98440)
scaffold0020 (292-401)||(176434-176543)
scaffold0020 (187-229)||(176326-176368)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (259-386)||(19812-19939)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (184-398)||(797-1014)
[»] scaffold1517 (1 HSPs)
scaffold1517 (184-389)||(1247-1455)
[»] scaffold1299 (1 HSPs)
scaffold1299 (283-389)||(1608-1714)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (280-386)||(9550-9656)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (187-386)||(356-558)
scaffold0621 (187-386)||(4773-4975)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (271-386)||(40270-40385)
[»] scaffold1433 (1 HSPs)
scaffold1433 (283-389)||(1071-1177)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (283-389)||(305-411)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (283-389)||(8182-8288)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (231-377)||(66302-66448)
scaffold0064 (7-208)||(69366-69566)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (184-377)||(514125-514321)
[»] scaffold0423 (2 HSPs)
scaffold0423 (7-287)||(2125-2408)
scaffold0423 (310-386)||(1395-1471)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (269-446)||(17187-17364)
scaffold0348 (289-329)||(4669-4709)
[»] scaffold1426 (1 HSPs)
scaffold1426 (187-446)||(1310-1572)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (270-386)||(11453-11569)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (187-398)||(480-694)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (187-386)||(4318-4520)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (292-440)||(66817-66965)
[»] scaffold1845 (1 HSPs)
scaffold1845 (184-386)||(1067-1272)
[»] scaffold0088 (2 HSPs)
scaffold0088 (283-446)||(30348-30511)
scaffold0088 (181-226)||(30267-30312)
[»] scaffold0765 (1 HSPs)
scaffold0765 (283-329)||(6077-6123)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (280-370)||(216199-216289)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (269-386)||(14028-14145)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (269-386)||(15834-15951)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (1-317)||(3704-4023)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (1-154)||(34713-34866)
scaffold0022 (271-386)||(42058-42173)
scaffold0022 (271-386)||(75778-75893)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (187-386)||(9958-10160)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (182-389)||(33132-33342)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (292-440)||(17686-17834)
[»] scaffold1530 (1 HSPs)
scaffold1530 (283-446)||(942-1105)
[»] scaffold0457 (1 HSPs)
scaffold0457 (283-446)||(13757-13920)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (283-390)||(62531-62638)
scaffold0053 (280-390)||(65081-65191)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (280-386)||(1185-1291)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (283-389)||(50543-50649)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (293-386)||(5536-5629)
[»] scaffold0310 (2 HSPs)
scaffold0310 (283-431)||(11415-11563)
scaffold0310 (44-107)||(11173-11236)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (271-390)||(5479-5598)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (187-386)||(48069-48271)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (187-386)||(110670-110872)
scaffold0040 (280-386)||(18280-18386)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (283-443)||(263664-263824)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (283-446)||(64305-64468)
scaffold0067 (283-446)||(48883-49046)
scaffold0067 (283-446)||(57917-58080)
scaffold0067 (283-389)||(30062-30168)
[»] scaffold2165 (1 HSPs)
scaffold2165 (184-337)||(615-771)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (283-389)||(5662-5768)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (283-329)||(307-353)
scaffold0222 (187-390)||(21153-21359)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (280-386)||(16372-16478)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (289-386)||(2275-2372)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (292-377)||(17084-17169)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (283-388)||(8223-8328)
scaffold0235 (283-388)||(18437-18542)
[»] scaffold1914 (1 HSPs)
scaffold1914 (280-388)||(991-1099)
[»] scaffold1274 (1 HSPs)
scaffold1274 (280-380)||(53-152)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (346-446)||(3126-3226)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (283-446)||(53126-53289)
[»] scaffold0505 (1 HSPs)
scaffold0505 (292-386)||(2199-2292)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (178-224)||(34667-34713)
[»] scaffold0046 (2 HSPs)
scaffold0046 (280-386)||(364-470)
scaffold0046 (283-389)||(70546-70652)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (269-386)||(23296-23413)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (346-390)||(63298-63342)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (187-227)||(51990-52030)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 374; Significance: 0; HSPs: 39)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 19773016 - 19773461
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19773016 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaca 19773115  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19773116 caatgtccgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggccttt 19773215  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19773216 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtac 19773315  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19773316 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 19773415  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||    
T  19773416 cctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 19773461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 22330217 - 22329772
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22330217 tgagtaccagtcaaagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgcgaccctctccattgcagttaaaacaca 22330118  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22330117 caatgtccgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggccttt 22330018  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  22330017 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtac 22329918  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22329917 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaaat 22329818  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    | ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22329817 ctggaaaaactctcagctgttggtacccaattgccctcttgatgtc 22329772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 16359558 - 16360003
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||| |    
T  16359558 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaaa 16359657  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16359658 caatgtctgtacggttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 16359757  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  16359758 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtac 16359857  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  16359858 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctattaaccaagt 16359957  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  16359958 cctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 16360003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 34569550 - 34569995
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||| |    
T  34569550 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaaa 34569649  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34569650 caatgtctgtacggttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 34569749  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  34569750 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtac 34569849  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  34569850 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctattaaccaagt 34569949  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  34569950 cctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 34569995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 27521462 - 27521907
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |    
T  27521462 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaa 27521561  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27521562 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgatctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggccttt 27521661  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  27521662 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttagaccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcaggggcactgtac 27521761  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27521762 ggcttaggacgactctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtgtcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 27521861  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  27521862 cctgaaaaactctcaactgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 27521907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 14997063 - 14996624
Alignment:
Q  7 ccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14997063 ccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcacacaatgt 14996964  T
Q  107 ctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcacc 206  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14996963 ccgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcctttctcacc 14996864  T
Q  207 acaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggctta 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  14996863 acaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcaaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggctta 14996764  T
Q  307 ggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaa 406  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  14996763 ggacgactctgctgtcccttgccctttctctcattcactacctcgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagtctggaa 14996664  T
Q  407 aaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14996663 aaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 14996624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 41773898 - 41774343
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  41773898 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaca 41773997  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41773998 caatgtccgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggccttt 41774097  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41774098 ctcaccacaattgaaacacacaatctcagcagcattcttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtac 41774197  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  41774198 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagattctgcagctattaaccaaat 41774297  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||    
T  41774298 cctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 41774343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 27682730 - 27682285
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27682730 tgagtaccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggatgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaca 27682631  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27682630 caacgtccgtacgattgcaatcagctacagcatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggccttt 27682531  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  27682530 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggacgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtac 27682431  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  27682430 ggcttaggacgactctgctgtcccttgccctttctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgtagctattaaccaaat 27682331  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  27682330 cctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 27682285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 27613412 - 27613857
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  27613412 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgagcctctccattgcaattaaagcaca 27613511  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  27613512 caatgtccgtacgattgcaatcagctaccacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcttcagggcagacattgctcttgtggccctt 27613611  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  27613612 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccctcttcttaggccgtctcacatcgaccaccttctgtttccctttatcagcaggggcactgtac 27613711  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27613712 ggcttaggacgactctgttgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagattctgcagctattaaccaaat 27613811  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || ||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  27613812 cctgaaaaactctcagttgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 27613857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 40711836 - 40712281
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  40711836 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaca 40711935  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  40711936 caatgtctgtacgattgcaatcagccaccacacgacccttcttaccacaccggacgcacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggccttt 40712035  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||    
T  40712036 ctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgggggcactgtac 40712135  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40712136 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctgttaaccaaat 40712235  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||    
T  40712236 cctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 40712281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 29473403 - 29472958
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  29473403 tgagtaccagtcaaagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacaca 29473304  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  29473303 caatgtccgtacgcttgcattcagctacaatatgacctttcttgccacatcgaacacacttcttgatttcttcagggcagacattgcttttgtggccttt 29473204  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  29473203 cccaccacaattgaaacacacaatctctgtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcggggacactgtac 29473104  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29473103 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcattcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 29473004  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29473003 ccggaaaaactcttagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 29472958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 27665820 - 27665388
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  27665820 tgagtcccagtcaaagcgaaaaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaca 27665721  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27665720 caatgtctgtatgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcaggcgttgctcttgtggccttt 27665621  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    |||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||    
T  27665620 ctcaccacaat-------------ctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgggggcactgtac 27665534  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27665533 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagattctgcagctattaaccaaat 27665434  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27665433 cctgaaaaactctcagctgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 27665388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 37288826 - 37288381
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  37288826 tgagtaccagtcaaagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacaca 37288727  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37288726 caatgtccgtacgcttgcattcagctacaatgtgaactttcttgccacaccggacacacttcttgatttcttcagggcagacgttgcttttgtggccttt 37288627  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  37288626 cccaccacaattgaaacacacaatctctgtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcgggagcactgtac 37288527  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37288526 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagattctgcagctattaaccaaat 37288427  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || ||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  37288426 cctgaaaaactctcagttgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 37288381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 22350975 - 22351420
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  22350975 tgagtaccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggatgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacaca 22351074  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||  ||||| ||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||    
T  22351075 caatgttcgtacgcttgcattaagctacaatatgacctttcttgccacaccggacacacttcttcatttcttcggggcagacattgcttttgtggccttt 22351174  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  22351175 cccaccacagttgaaacacacaatctcagtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtac 22351274  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    |||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22351275 ggcttatgacgactctgctgccccttgcccttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttagtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 22351374  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    | ||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  22351375 ctggaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 22351420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 22137724 - 22138169
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22137724 tgagtaccagtcaaagcaaagactctaccagtattcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaaacaca 22137823  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  22137824 caatgtccgtacgcttgcattcagctacaatatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgcttttgtggccttt 22137923  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    | |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  22137924 cccaccacaattgaaacacacaatctcaatagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttccctttatcagcaggggcactgtac 22138023  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22138024 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttagtatcttcttcatagatcctgcagctattgaccaaat 22138123  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  22138124 cctgaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 22138169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 110 - 446
Target Start/End: Original strand, 18782279 - 18782618
Alignment:
Q  110 tacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccaca 209  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||| |||||    
T  18782279 tacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacattttttgatctcttcaggacaaacattactcttgtggcctttctcgccaca 18782378  T
Q  210 attgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggctta 306  Q
     |||||||| |||||||| ||||   ||||||||||||||| || |||| ||||||||||  | ||||| || |||||||| |||||||| || ||||||    
T  18782379 gttgaaacaaacaatctccgcaggagcatccttcttcttagaccacctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactataaggctta 18782478  T
Q  307 ggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaa 406  Q
    || ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| |||||||| | |||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||  || |    
T  18782479 gggcgactctgttggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaattagccttagtatcttcctcgtagattctgcagctattcactaaattaggga 18782578  T
Q  407 aaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    ||||||  | |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  18782579 aaactcggatctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 18782618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 412
Target Start/End: Original strand, 20803669 - 20804067
Alignment:
Q  17 caaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtctgtacgatt 116  Q
    |||| ||||| ||||||| | || ||||||| |||||  | |||||||| | |||  ||| |||| | ||||  || ||||||||||| ||  || | ||    
T  20803669 caaaaacccttccagtagtcagcaccctcttaggctgcttgcactgagaaccaatatgactctcttccttgccattgaagcacacaatatcactatgctt 20803768  T
Q  117 gcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaa 216  Q
    ||| ||||||| |  |||||| ||||| ||||||| || ||| ||||| |  ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20803769 gcagtcagctaaagtatgacccttcttgccacaccagaaacatttcttcacctcctcagggcaaacatttctcttgtggcctttctcaccataattgaaa 20803868  T
Q  217 cacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgac 313  Q
    || |||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | | ||| || |||||||| |||||||| || ||||||||  |||    
T  20803869 cagacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctatttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggagac 20803968  T
Q  314 tctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactc 412  Q
    | ||||| ||||||  ||||  ||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  20803969 tttgttggcccttagtcttctgctcatccacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctcatagattctgcagctatttaccaactcaggaaaaactc 20804067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 231 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 23537312 - 23537097
Alignment:
Q  231 agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttaccc 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| || |||||||  |||||||| || ||| |||| |||||||| || ||||||  |    
T  23537312 agcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcaggaggggcactatagggcatagggcgactctgctggcccttagtc 23537213  T
Q  331 ttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaa 430  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||| || || |    
T  23537212 ttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctcataaattctgcagctattaaccaaatcaggaaaaactcagatctgttggtatccga 23537113  T
Q  431 tcgccctcttgatgtc 446  Q
    |||||||||| |||||    
T  23537112 tcgccctcttaatgtc 23537097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 139 - 377
Target Start/End: Original strand, 23461165 - 23461406
Alignment:
Q  139 ttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---cat 235  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||| |  ||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||   |||    
T  23461165 ttcttgccacaccggaaacatttcttcacctcctctggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaatagacaatttccgcaggagcat 23461264  T
Q  236 ccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcct 335  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  | | ||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||  |||||     
T  23461265 ccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctattttcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccg 23461364  T
Q  336 ctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcata 377  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  23461365 ctcattcacaaccttgtaatgagctttggtgtcctcttcata 23461406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 184 - 386
Target Start/End: Original strand, 25429659 - 25429864
Alignment:
Q  184 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagca---tccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccat 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||| | || |||||| | | ||| || |    
T  25429659 ttgctcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctgcaggagtatccttcttcttaggccgcctatcttcaaccatcctctatttgccct 25429758  T
Q  281 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagat 380  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||| | |||||||| || ||||||  ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  25429759 tattagcaggggcactgtaaggcttaaggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcataaat 25429858  T
Q  381 cctgca 386  Q
    ||||||    
T  25429859 cctgca 25429864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 184 - 383
Target Start/End: Original strand, 21883014 - 21883218
Alignment:
Q  184 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccat 280  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||   |||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||  | ||||| || |    
T  21883014 ttgctcttgtggcctttctcgccacaattaaaacagacaatctcagcagaaacatctttcttcctcggccgtctatcctcgaccattctctgtttgccct 21883113  T
Q  281 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagc--cttcgtatcctcttcatag 378  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||  ||||| ||||||||| |||||||| |||||  ||| |||||||| ||||||    
T  21883114 tatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagcctcttagtatcctcctcatag 21883213  T
Q  379 atcct 383  Q
    |||||    
T  21883214 atcct 21883218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 443
Target Start/End: Original strand, 23526107 - 23526552
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| ||| ||||||| || || |||||||||| ||||||| |||| |||||  | |||||||| | |||  |||||||| ||||||| || |||||||    
T  23526107 tgagtaccaatcaaagcgaaaactctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactgagaaccaatatgaccctcttcattgcaattgaagcaca 23526206  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    |||| ||  |||| |||||||  ||||   ||||||| ||||||||||| | || |||  | || |  ||   ||| ||  | |||||||||||||||||    
T  23526207 caatatcattacggttgcaattggctaatgcatgacccttcttaccacatctgaaacatctttttacctctctaggacaagcattgctcttgtggccttt 23526306  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactg 297  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||   ||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||| | | ||| || || |||||  | |||||     
T  23526307 ctcaccacaattaaaacagacaatctcagcaggagcatccttcttccttggccgtctatcctcgaccatcctctatttgcccttgtcagcaagagcacta 23526406  T
Q  298 tacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaacca 397  Q
    || |||||||  |||||||| || ||||||  ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || || ||||    
T  23526407 tagggcttagtgcgactctgctggcccttagtcttccactcattcacaatcttgtaatgagcctttgtgtcctcctcataaatcctgcaactgttcacca 23526506  T
Q  398 aatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgat 443  Q
    | || |  |||||||  | |||||| || ||||| || ||||||||    
T  23526507 actcggagaaaactcggatctgttggtatccaattgctctcttgat 23526552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 178 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 14884144 - 14883873
Alignment:
Q  178 cagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtt 274  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||   ||||||  || |||| |||| |||| ||||  ||||| | || |    
T  14884144 cagacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagctggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcctctgct 14884045  T
Q  275 tcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttc 374  Q
    | || || ||||  || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||  | ||| || ||||| || || || |||||    
T  14884044 ttcctttgtcagtaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgagctttggtgtcttcttc 14883945  T
Q  375 atagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| || |  || ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14883944 atagattctgcacctattaaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagcccttttgatgtc 14883873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 187 - 446
Target Start/End: Original strand, 25851296 - 25851558
Alignment:
Q  187 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgca---gcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattat 283  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||  ||   |||||  || |||| |||| |||| ||||  ||||||| || || || || |    
T  25851296 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaagagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgt 25851395  T
Q  284 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 383  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || |||||||| || ||    
T  25851396 cagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcataaattct 25851495  T
Q  384 gcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    ||| ||||||||||| || |  |||||||| | ||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  25851496 gcacctattaaccaactcagagaaaactctgatctgctgatacccaatagctcttttgatgtc 25851558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 184 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 23078052 - 23077844
Alignment:
Q  184 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccat 280  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||   ||||  || |||| |||| |||| ||||   |||||| || ||||| |    
T  23078052 ttgcttttgtggcctttttcaccacacttgaaacatacaatctcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcattcatcttctgcttccctt 23077953  T
Q  281 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagat 380  Q
    | ||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||| || || || || ||||| ||    
T  23077952 tgtcagcaggagcactgtaaggtttaggacgactctgctgtcccttacccctcctctcactcattaccttgtaatgagctttggtgtcttcctcatatat 23077853  T
Q  381 cctgcagct 389  Q
    |||||||||    
T  23077852 cctgcagct 23077844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 187 - 446
Target Start/End: Original strand, 20345506 - 20345768
Alignment:
Q  187 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattat 283  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||   ||||  || |||| |||| |||| ||||  ||||||| || || || || |    
T  20345506 ctcttgtgggctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgt 20345605  T
Q  284 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 383  Q
    |||| || ||||| || |||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || || ||||| || ||    
T  20345606 cagcaggagcactataaggcttaggacgattctactgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcctcataaattct 20345705  T
Q  384 gcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    ||| ||||||||||| || | ||| ||||| | ||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  20345706 gcacctattaaccaactcagaaaagactctgatctgctgatacccaatagctcttttgatgtc 20345768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 184 - 398
Target Start/End: Original strand, 22505900 - 22506117
Alignment:
Q  184 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccat 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | ||   ||||  || ||||||||| |||| ||||   |||||| || || || |    
T  22505900 ttgctcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttaggcctcctatcatcattcatcttctgctttcctt 22505999  T
Q  281 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagat 380  Q
    | ||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||| || ||| || ||||| || || || |||||||| ||    
T  22506000 tgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttataatgagctttggtgtcttcttcataaat 22506099  T
Q  381 cctgcagctattaaccaa 398  Q
     ||||| || ||||||||    
T  22506100 tctgcacctgttaaccaa 22506117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 269 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 21631458 - 21631341
Alignment:
Q  269 tttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatc 368  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || || | | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  21631458 tttgtttacccttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactttgctgactcctacccttcctctcattcacaaccttgtaatgagctttcgtatc 21631359  T
Q  369 ctcttcatagatcctgca 386  Q
     || |||||||| |||||    
T  21631358 ttcctcatagattctgca 21631341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 269 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 21332048 - 21331931
Alignment:
Q  269 tttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatc 368  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || || || || |||||||||||||| | | |||| |||||||| |||||    
T  21332048 tttgttttcccttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactctgctgacctttgcctttcctctcattcacaatcctgtaatgagccttagtatc 21331949  T
Q  369 ctcttcatagatcctgca 386  Q
    ||| ||||| ||||||||    
T  21331948 ctcctcataaatcctgca 21331931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 283 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 21870323 - 21870216
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  21870323 tcagcaggggcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtatcctcttcatatatcc 21870224  T
Q  383 tgcagcta 390  Q
    ||||||||    
T  21870223 tgcagcta 21870216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 283 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 21874603 - 21874496
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  21874603 tcagcaggggcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtatcctcttcatatatcc 21874504  T
Q  383 tgcagcta 390  Q
    ||||||||    
T  21874503 tgcagcta 21874496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 389
Target Start/End: Original strand, 23474532 - 23474641
Alignment:
Q  280 ttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcataga 379  Q
    |||||||| || ||| |||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||  |    
T  23474532 ttatcagcaggagcaatgtaaggctttggacgactttgctgacccttgcctttcctctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcttcctcatgta 23474631  T
Q  380 tcctgcagct 389  Q
    | ||||||||    
T  23474632 ttctgcagct 23474641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 16258012 - 16257918
Alignment:
Q  352 tagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || | ||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||| |||||    
T  16258012 tagtgagctttggtatcctcctcatatatcctgcagctattcaccaactcggaaaagactctgatctgctgatacccaatagctctcttaatgtc 16257918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 22591731 - 22591637
Alignment:
Q  352 tagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || | ||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||| |||||    
T  22591731 tagtgagctttggtatcctcctcatatatcctgcagctattcaccaactcggaaaagactctgatctgctgatacccaatagctctcttaatgtc 22591637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 22595286 - 22595192
Alignment:
Q  352 tagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || | ||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||| |||||    
T  22595286 tagtgagctttggtatcctcctcatatatcctgcagctattcaccaactcggaaaagactctgatctgctgatacccaatagctctcttaatgtc 22595192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 107
Target Start/End: Original strand, 21882836 - 21882936
Alignment:
Q  7 ccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgt 106  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||| |||| || |||| |||||  |||||||||| | |||| |||| ||| |||| || || |||||||||||||    
T  21882836 ccagccaaagccaaaaccctaccagtagtcggcaccttcttaggctgcttacactgagaaccaatgtgaccttcttcattacaattgaagcacacaatgt 21882935  T
Q  107 c 107  Q
    |    
T  21882936 c 21882936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 52
Target Start/End: Original strand, 25429483 - 25429528
Alignment:
Q  7 ccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggct 52  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  25429483 ccagtcaaagcaaaaactctaccagtagccggcgccttcttaggct 25429528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 26735787 - 26735670
Alignment:
Q  269 tttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatc 368  Q
    ||||||| || |||||||  || |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||  | |||| |||||| || | |||||| |||||||| |||||    
T  26735787 tttgttttcctttatcagtaggagcactgtaaggctttggacgactctgctgacctttgactttccgctcatttacaatcttgtaatgagccttagtatc 26735688  T
Q  369 ctcttcatagatcctgca 386  Q
    ||| ||||| || |||||    
T  26735687 ctcctcataaattctgca 26735670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 108
Target Start/End: Original strand, 25851153 - 25851217
Alignment:
Q  44 tcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtct 108  Q
    ||||||||| || |||||| || |||||  |||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  25851153 tcttcggctcaggacactgtgaactaatatgaccctctccattgcagttgtagcagacaatgtct 25851217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 370; Significance: 0; HSPs: 49)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 10008343 - 10008788
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |    
T  10008343 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaa 10008442  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10008443 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggccttt 10008542  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  10008543 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtac 10008642  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  10008643 ggcttaggacgactctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaactaagt 10008742  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10008743 cctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 10008788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 12889452 - 12889897
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||| |    
T  12889452 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaaa 12889551  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12889552 caatgtctgtacggttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 12889651  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  12889652 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtac 12889751  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12889752 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 12889851  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  12889852 cctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 12889897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 10908953 - 10909398
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |    
T  10908953 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgggaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaa 10909052  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10909053 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggccttt 10909152  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  10909153 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcaacatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtac 10909252  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  10909253 ggcttaggacgactctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaactaagt 10909352  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10909353 cctgaaaaactctaagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 10909398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 15345632 - 15345187
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  15345632 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaca 15345533  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15345532 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggccttt 15345433  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||    
T  15345432 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgggggcactgtac 15345333  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15345332 ggcttaggaggactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 15345233  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||    
T  15345232 cctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 15345187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 43165418 - 43165863
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||| |    
T  43165418 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaaa 43165517  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43165518 caatgtctgtacggttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 43165617  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  43165618 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtac 43165717  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  43165718 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctattaaccaagt 43165817  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  43165818 cctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 43165863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 20059441 - 20058996
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |    
T  20059441 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaa 20059342  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20059341 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggccttt 20059242  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20059241 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtac 20059142  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  20059141 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaaccaagt 20059042  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20059041 cctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttaatgtc 20058996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 48428190 - 48428635
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||| |    
T  48428190 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaaa 48428289  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48428290 caatgtctgtacggttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 48428389  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  48428390 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtac 48428489  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48428490 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctgttaaccaaat 48428589  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||    
T  48428590 cctgaaaaactctcagctgctggtatccaatcgccctcttgatgtc 48428635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 5422317 - 5421872
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  5422317 tgagtcccagtcaaagcgaaaaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactatgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaca 5422218  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  5422217 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcaggcgttactcttgtggccttt 5422118  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||    
T  5422117 ctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgggggcactgtac 5422018  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5422017 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcgttcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctgttaaccaaat 5421918  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5421917 ctggaaaaactctcagctgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 5421872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 16754088 - 16753643
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16754088 tgagtcccagtcaaagcgaaaaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacattgagaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaca 16753989  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  16753988 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccagacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggccttt 16753889  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  16753888 ctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttccctttgtcagcgggggcactgtac 16753789  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16753788 ggcttaggacgactatgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctgttaaccaaat 16753689  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16753688 ctagaaaaactctcagctgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 16753643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 446
Target Start/End: Original strand, 6603481 - 6603923
Alignment:
Q  4 gtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaa 103  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6603481 gtcccagtcaaagcgaaaaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgagagctaatgtgaccctctccattgcaattaaagcacacaa 6603580  T
Q  104 tgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  6603581 tgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgatccttcttaccacaccggacacagttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctc 6603680  T
Q  204 accacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggc 303  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  6603681 accacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtacggc 6603780  T
Q  304 ttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccg 403  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  6603781 ttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaaatctg 6603880  T
Q  404 gaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6603881 gaaaaactctcagctgttgatacccgatcgccctcttgatgtc 6603923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 16638516 - 16638961
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  16638516 tgagtcccagtcaaagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccttctccgttgcaattaaagcaca 16638615  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16638616 caatgtccgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccgggcacacttcttgatttcttcagggcagacgttgctcttgtggccttt 16638715  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  16638716 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtac 16638815  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  16638816 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctattaaccaagt 16638915  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  16638916 cctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 16638961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 26790800 - 26790355
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26790800 tgagtaccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccgtcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaca 26790701  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26790700 caacgtccgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggtagacgttgctcttgtggccttt 26790601  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  26790600 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcattgggggcactgtac 26790501  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26790500 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 26790401  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  26790400 cctgaaaaactctcagttgttggtacccaatcgccctcttaatgtc 26790355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 3688686 - 3689131
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  3688686 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcaccctcttaggctgagtacactgagaactaatgtgaccttctccattgcagttaaagcaca 3688785  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  3688786 caatgtctgcacgattacaatcagctacgacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagaacaggcgttgctcttgtggccttt 3688885  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||    
T  3688886 ctcaccacaattgaagcacacaatctcagcagcatccttcttcttaggccgcctaacgtcgaccatcttctgtttacccttgtcagcgggggcactgtac 3688985  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3688986 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaaccaaat 3689085  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||    
T  3689086 cctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 3689131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 15713443 - 15712998
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  15713443 tgagtaccagtcaaagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctaagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacaca 15713344  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15713343 caatgtccgtacgcttgcattcagctacaatatgacctttcttgccacaccgaacacacttcttgatttcttcagggcagacgttgcttttgtggccttt 15713244  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15713243 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgcttccctttatcagcgggggcactgtac 15713144  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15713143 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 15713044  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15713043 ccggaaaaactctcagttgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 15712998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 53382405 - 53381961
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  53382405 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgagaactaatgtgaccctctgcattgcaattaaagcaca 53382306  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    || |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53382305 cagtgtctgtacgattgcaatcagccaccacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacagacgttgctcttgtggccttt 53382206  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||    
T  53382205 ctcgccacagttgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcag-gggggcactgtac 53382107  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53382106 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatccttctcatagatcctgcagctgttaaccaaat 53382007  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53382006 ctggaaaaactctcagctgttgatacccaatcgccctcttaatgtc 53381961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 13255433 - 13255878
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  || |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |    
T  13255433 tgagtcccagtcaaagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactatgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaa 13255532  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||    
T  13255533 caatgtctgtacggttgcaatcagctaccacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagaacaagcgttgctcttgtggccttt 13255632  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  13255633 ctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcctcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtac 13255732  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  13255733 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtgtcctcttcgtagatcctgcagctattaaccaagt 13255832  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13255833 cctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 13255878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 15586779 - 15586334
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |    
T  15586779 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaa 15586680  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  15586679 caatgtctgtacggttgcaatcagccaccacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagaacaggcgttgctcttgtggccttt 15586580  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  15586579 ctcaccacaattgaagcacacaatctccgcagcatccttcctcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtac 15586480  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  15586479 ggcttaggacgactttgttgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctctttgtagatcctgcagctattaaccaaat 15586380  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||    
T  15586379 cctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 15586334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 7 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 15399898 - 15399460
Alignment:
Q  7 ccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15399898 ccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaacta-tgtgaccctctccattgcagttaaaacacacaatgt 15399800  T
Q  107 ctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcacc 206  Q
    | ||||| ||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  15399799 ccgtacgcttgcattcggctacaatatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgcttttgtggcctttcccacc 15399700  T
Q  207 acaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggctta 306  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15399699 acaattgaaacacacaatctcagtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggctta 15399600  T
Q  307 ggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaa 406  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  15399599 ggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcgttcactatcttgtagtgaaccttggtatcctcttcctagatcctgcagctattgaccaaattctgaa 15399500  T
Q  407 aaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    ||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  15399499 aaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 15399460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 113 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 5110684 - 5110351
Alignment:
Q  113 gattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaatt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5110684 gattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttaatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcctttctcaccacaatt 5110585  T
Q  213 gaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacga 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5110584 gaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggctgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcggggacactgtacggcttaggacga 5110485  T
Q  313 ctctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactc 412  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5110484 ctctattgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactc 5110385  T
Q  413 tcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    ||| |||||| || |||||||||||||| |||||    
T  5110384 tcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 5110351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 24185933 - 24186378
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||  | |||||| ||||||||||||| ||||    
T  24185933 tgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatatgtccctcttcattgcagttaaaacaca 24186032  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  24186033 caatgtccttacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatctcttcaggacagacattgcttttgtggccttt 24186132  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  24186133 cacaccacaattgaaacacacaatctcagtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcgtgggcactgtac 24186232  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  24186233 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttccactcgttcacaatcttatagtgagccttagtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaatt 24186332  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    | ||||||||||| | |||||| || |||||||||||||| |||||    
T  24186333 ctggaaaaactctaatctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 24186378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 172 - 446
Target Start/End: Original strand, 6596969 - 6597243
Alignment:
Q  172 tcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatctttt 271  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6596969 tcaggacaggcgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttct 6597068  T
Q  272 gtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctc 371  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6597069 gtttccctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctc 6597168  T
Q  372 ttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6597169 ctcatagatcctgcagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagctgttgatacccgatcgccctcttgatgtc 6597243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 198 - 446
Target Start/End: Original strand, 15358992 - 15359240
Alignment:
Q  198 tttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactg 297  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  15358992 tttcccaccacaattgaaacacacaatctcaatagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcttctgtttcactttatcagcgggggcactg 15359091  T
Q  298 tacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaacca 397  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15359092 tacggcttagggcgactctgctgtcccttgcccttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgcagctattgacca 15359191  T
Q  398 aatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    ||||| |||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  15359192 aatcctgaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 15359240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 94 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 16804241 - 16803886
Alignment:
Q  94 aagcacacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgt 193  Q
    ||||||||||| ||  | || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||    
T  16804241 aagcacacaatatcatttcgcttgcaatcagctacaatatgacctttcttgccacaccggacacatttcttgatctcttcaggacaaacattgctcttgt 16804142  T
Q  194 ggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcggg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| || |||||||| ||    
T  16804141 ggcctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagctggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcagg 16804042  T
Q  291 ggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagcta 390  Q
    |||||| || |||||||| |||||||| || |||||   ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||    
T  16804041 ggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctcataaattctgcagcta 16803942  T
Q  391 ttaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    ||||||||||| ||||||||||  | |||||| ||  | ||||||||||| |||||    
T  16803941 ttaaccaaatcaggaaaaactcggatctgttggtattcgatcgccctcttaatgtc 16803886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 37 - 446
Target Start/End: Original strand, 16694943 - 16695355
Alignment:
Q  37 ggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgac 136  Q
    |||||||||||||||||  | || || || | |||  |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||  | || |||||||||||||||| |||||    
T  16694943 ggcgccctcttcggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattacagttgaagcacacaatgtcatttcgcttgcaatcagctacaatatgac 16695042  T
Q  137 ctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agc 233  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||| ||| | || || || || |||||| |||||||||| ||||||||||||||   |||||| ||   |||    
T  16695043 ccttcttgccacaccggacacatttcttgatctccaccggacaaacattactcttgcggcctttctcgccacaattgaaacaagtaatctcagctggagc 16695142  T
Q  234 atccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttc 333  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| |  |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || |||||   ||||    
T  16695143 atccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcacttatcagcaggggcactataaggcttcgggcgactctgatggcccttggtcttc 16695242  T
Q  334 ctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcg 433  Q
    | |||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||  | |||||| || || ||||    
T  16695243 cactcatttacaaccttgtaatgagccttagtatcctcctcatagatcctgcagctattcactaaatcagggaaaactcggatctgttggtatccgatcg 16695342  T
Q  434 ccctcttgatgtc 446  Q
    |||||||||||||    
T  16695343 ccctcttgatgtc 16695355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 412
Target Start/End: Original strand, 11861121 - 11861510
Alignment:
Q  26 taccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtctgtacgattgcaatcagc 125  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||  | |||||||| | |||  |||||||| | ||| | || ||||||||||| ||  || | |||||||||||    
T  11861121 taccagtagtcggcgccctcttaggctgcttgcactgagaaccaatatgaccctcttccttggaattgaagcacacaatatcactatgcttgcaatcagc 11861220  T
Q  126 tacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatc 225  Q
    || |  |||||| ||||||||||||| || ||| ||||| |  ||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  11861221 taaagtatgacccttcttaccacaccagaaacatttcttcacctcctctggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaatagacaatc 11861320  T
Q  226 tctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtc 322  Q
    || ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||  ||||||| || |    
T  11861321 tccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcctttatcagcaggggcactatagggcttagggtgactctggtggc 11861420  T
Q  323 ccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactc 412  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| || || || |||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||    
T  11861421 ccttactcttccactcattcacaaccttgtaatgagccttggtgtcttcctcatagattctacagctattcaccaactcaggaaaaactc 11861510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 74 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 23415104 - 23414729
Alignment:
Q  74 gaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctc 173  Q
    |||||||| | ||||| || ||||||||||| ||  | || |||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||| |||||||| || |     
T  23415104 gaccctcttcgttgcaattgaagcacacaatatcatttcgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgtcacaccggacacatttcttgatctcttt 23415005  T
Q  174 agggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttt 270  Q
    ||| || || || ||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |     
T  23415004 aggacaaacattactcttgtggcctttctcgccatagttgaaacagacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctc 23414905  T
Q  271 tgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcct 370  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||| ||| |||||   ||||| ||||||||| |||||||  |||||||| |||||||    
T  23414904 tgtttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctattggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtcatgagccttagtatcct 23414805  T
Q  371 cttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    | || ||||| |||||| |||| || ||||| || |||||||  | |||||| || || || ||||||||||||||    
T  23414804 cctcgtagattctgcaggtattcactaaatcagggaaaactcggagctgttggtatccgattgccctcttgatgtc 23414729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 171
Target Start/End: Original strand, 15358832 - 15358996
Alignment:
Q  7 ccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15358832 ccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactatgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacacacaatgt 15358931  T
Q  107 ctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcc 171  Q
    ||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15358932 ctgtacgcttgcattcggctacaatatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcc 15358996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 133 - 412
Target Start/End: Original strand, 12501808 - 12502090
Alignment:
Q  133 tgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag 232  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| |  |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||| ||||    
T  12501808 tgacccttcttgccacaccggaaacatttctttacctcctcaggacaaacattgctcttgtggcctttctcgccacaattgaaacaggtaatctcagcag 12501907  T
Q  233 ---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacc 329  Q
       ||||||||||||||||||| ||  | ||||||||| | ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||  || |||||       
T  12501908 gaacatccttcttcttaggccgtctttcctcgaccatcctctgttttcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctactggcccttggt 12502007  T
Q  330 cttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactc 412  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| | ||||||||    
T  12502008 cttccgctcattcacaaccttgtaatgagccctggtatcctcctcatagattctacagctattcaccaaatctgaaaaaactc 12502090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 398
Target Start/End: Original strand, 15065814 - 15066214
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||| |||||  | |||||||| | |||  |||||||| | ||||| || ||| |||    
T  15065814 tgagtaccagtcaaagcaaaaaccctacctgtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactgagaaccaatatgaccctcttctttgcaattgaagaaca 15065913  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    |||| ||  || | |||||||||| ||   ||||||| |||||||||||||||| |||  | || |  || || || || || |||||||||||||||||    
T  15065914 caatatcattatgcttgcaatcagttaatgcatgacccttcttaccacaccggaaacatctttttacctcttctggacaaacattgctcttgtggccttt 15066013  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactg 297  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| | ||||   ||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||  | ||||| || |||||||| |||| |||     
T  15066014 ctcaccacaattaaaacagacaatcgcagcaggagcatccttcttccttggccgtctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggaacta 15066113  T
Q  298 tacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaacca 397  Q
    || |||||||| |||||||| || ||||||  ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||||| || ||||    
T  15066114 tagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattcaccatcttgtaatgagccttggtatcttcctcataaattctacagctgttcacca 15066213  T
Q  398 a 398  Q
    |    
T  15066214 a 15066214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 184 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 23079221 - 23078962
Alignment:
Q  184 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccat 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||   ||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||| | ||||| || |    
T  23079221 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacaaacaatcacagcaggagcatccttcttccttggccgtctatcctcgaccatcctctgttttccct 23079122  T
Q  281 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagat 380  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||  ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  23079121 tatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcttcataaat 23079022  T
Q  381 cctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctctt 440  Q
    |||||| || || ||||| || |  |||||||  | |||||| |||| ||| ||||||||    
T  23079021 cctgcaactgttcaccaactcggagaaaactcgaatctgttggtacctaattgccctctt 23078962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 187 - 446
Target Start/End: Original strand, 10408907 - 10409169
Alignment:
Q  187 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattat 283  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||   ||||||  || |||| |||| |||| ||||  ||||||| ||||| || || |    
T  10408907 ctcttgtggcctttctcaccacatttgtaacaaacaatctcagctggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgtttacccttgt 10409006  T
Q  284 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 383  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || ||||||||||| ||    
T  10409007 cagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctggtgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcatagattct 10409106  T
Q  384 gcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    ||| ||||||||||| || | ||||||||| | ||| ||||| ||||| || || ||||||||    
T  10409107 gcacctattaaccaactcagaaaaaactctgatctgctgatatccaatagctcttttgatgtc 10409169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 187 - 386
Target Start/End: Original strand, 17497620 - 17497822
Alignment:
Q  187 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattat 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||   ||| | ||||||||||| ||||| || ||||    
T  17497620 ctcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctgcaggagcatccttcttcttaggctatctatcttcgaccatcttctgtttgcccttat 17497719  T
Q  284 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 383  Q
    ||||  ||| |||||| |||||||| |||||||| || ||||||  ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  17497720 cagcaagggtactgtaaggcttagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcctagatcct 17497819  T
Q  384 gca 386  Q
    |||    
T  17497820 gca 17497822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 184 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 14873789 - 14873527
Alignment:
Q  184 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgca---gcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccat 280  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||   |||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||| | ||||| || |    
T  14873789 ttgctcttatggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctcagcatgagcatccttcttcctcggccgtctatcctcgaccatcctctgtttgccct 14873690  T
Q  281 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagat 380  Q
    |||||||  ||||| | || |||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| | ||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  14873689 tatcagcaagggcattatagggcttagggcgactctgttggcccttagtcttccgcacattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcatatat 14873590  T
Q  381 cctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgat 443  Q
    |||||| || || ||||| || |  |||||||  | || ||| || ||||| |||||||||||    
T  14873589 cctgcaactgttcaccaactcagagaaaactcggatctattggtatccaattgccctcttgat 14873527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 187 - 446
Target Start/End: Original strand, 28757258 - 28757520
Alignment:
Q  187 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattat 283  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||  |||   ||||  || |||| |||| |||| ||||  ||||||| || || || || |    
T  28757258 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgt 28757357  T
Q  284 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 383  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || ||||||||||| ||    
T  28757358 cagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcatagattct 28757457  T
Q  384 gcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    ||| ||||||||||| || |  || ||||| | ||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  28757458 gcacctattaaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagctcttttgatgtc 28757520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 187 - 446
Target Start/End: Original strand, 47126883 - 47127145
Alignment:
Q  187 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattat 283  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||  |||   ||||  || |||| |||| |||| ||||  ||||| | || || || || |    
T  47126883 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcctctgctttcctttgt 47126982  T
Q  284 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 383  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||  | ||| || ||||| || || || ||||||||||| ||    
T  47126983 cagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgagctttggtgtcttcttcatagattct 47127082  T
Q  384 gcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    ||| ||||||||||| || |  || ||||| | ||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  47127083 gcacctattaaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagctcttttgatgtc 47127145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 132 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 14578677 - 14578420
Alignment:
Q  132 atgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgca 231  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| |||| |  ||| |||| ||  | || ||||||||||||||||||||||||    | |||||||||||  ||    
T  14578677 atgacctttcttaccacaacggaaacacctcttcacatccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagcatagcacacaatctcaaca 14578578  T
Q  232 g---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttac 328  Q
    |   |||| |||||  |||| |||||| |||| |||||  | ||||| || ||||| || || ||| |||| ||||||||||| ||||| || |||||      
T  14578577 ggagcatctttctttctagggcgcctatcatcaaccattctctgtttacccttatcggcaggagcattgtaaggcttaggacggctctgctgacccttgg 14578478  T
Q  329 ccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 386  Q
    |||||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  14578477 ccttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcatcctcataaatcctgca 14578420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 16831622 - 16831456
Alignment:
Q  280 ttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcataga 379  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||  | | |||| |||  ||||| || ||||| || || ||||| |||||||    
T  16831622 ttatcagcaggggcactatacggcttaggatgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcataga 16831523  T
Q  380 tcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    ||||||| | | | |||||||| |  |||| ||| | |||||| ||||| || || |||||||||||    
T  16831522 tcctgcaacgacttaccaaatcagagaaaattcttatctgttggtaccctatggctctcttgatgtc 16831456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 385 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 5108542 - 5108481
Alignment:
Q  385 cagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||    
T  5108542 cagctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 5108481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 283 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 16326798 - 16326641
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || |||||||| ||||    
T  16326798 tcagcaggagcactgtcaggcttaggacgactctgctgtcccttgcccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcataaatcc 16326699  T
Q  383 tgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctctt 440  Q
    |||| || || ||||| || |  || ||||| | ||| ||||||||||| || |||||    
T  16326698 tgcaactgtttaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagctctctt 16326641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 16384463 - 16384300
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | | |||| |||  ||||| || ||||| ||  | ||||| ||||||||||    
T  16384463 tcagcaggggcactgtatggcttaggacgactctgttgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttgctgtcctcctcatagatcc 16384364  T
Q  383 tgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    | |||| | | |||||||| |  |||| ||| | |||||| || || || || |||||||||||    
T  16384363 tacagcaacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatggctctcttgatgtc 16384300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 16825364 - 16825264
Alignment:
Q  289 ggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagc 388  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||| ||  | | |||| |||  |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  16825364 ggggcactatacggcttcggacgactcagctgtcccttgcctctgcgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatcttcttcatagatcctacagc 16825265  T
Q  389 t 389  Q
    |    
T  16825264 t 16825264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 283 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 12357618 - 12357455
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| || ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || || || |||||||| ||||    
T  12357618 tcagcaggagcactatatggtttaggacgactctgatgtcccttacctctgcgctcactcatcaccttgtaatgagctttagtgtcttcttcatatatcc 12357519  T
Q  383 tgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    |||||||| | |||||||| |  |||| ||| | ||  ||||||| ||| || |||||||||||    
T  12357518 tgcagctactcaccaaatcagagaaaattcttatcttctgatacctaatggctctcttgatgtc 12357455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 2036934 - 2036840
Alignment:
Q  352 tagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || | ||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||| |||||    
T  2036934 tagtgagctttggtatcctcctcatatatcctgcagctattcaccaactcggaaaagactctgatctgctgatacccaatagctctcttaatgtc 2036840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 2040675 - 2040581
Alignment:
Q  352 tagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || | ||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||| |||||    
T  2040675 tagtgagctttggtatcctcctcatatatcctgcagctattcaccaactcggaaaagactctgatctgctgatacccaatagctctcttaatgtc 2040581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 446
Target Start/End: Original strand, 14039853 - 14039947
Alignment:
Q  352 tagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || | ||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||| |||||    
T  14039853 tagtgagctttggtatcctcctcatatatcctgcagctattcaccaactcggaaaagactctgatctgctgatacccaatagctctcttaatgtc 14039947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 294 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 13028437 - 13028345
Alignment:
Q  294 actgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 386  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| || || |||| | || |||||||||||| |||| | ||||| || |||||||| || |||||||||||    
T  13028437 actgtaaggctttggacgactctgctggcctttactcctcttctcattcactatcttgaaatgagctttggtatcctcctcctagatcctgca 13028345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 271 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 11958284 - 11958202
Alignment:
Q  271 tgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgta 353  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||| |||  ||||||||    
T  11958284 tgtttccctttgtcagcaggagcactgtaaggtttaggacgattctgctgtcccttacctctcctctcactcatcaccttgta 11958202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 386
Target Start/End: Original strand, 19727774 - 19727890
Alignment:
Q  269 tttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatc 368  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||| |||| || || || || || || ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  19727774 tttgtttgcccttatcagcaggagcactgtaaggctttggaagactttgctgacc-ttgccttttctctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatc 19727872  T
Q  369 ctcttcatagatcctgca 386  Q
     || ||||| || |||||    
T  19727873 ttcctcatatattctgca 19727890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 346 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 10417073 - 10417029
Alignment:
Q  346 accttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagcta 390  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  10417073 accttgtaatgagccttcgtatcctcctcataaattctgcagcta 10417029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 366; Significance: 0; HSPs: 34)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 33388249 - 33387804
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  33388249 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaca 33388150  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  33388149 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctccgggcaaacgttgcttttgtggccttt 33388050  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||    
T  33388049 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgggggcactgtac 33387950  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33387949 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 33387850  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
     |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33387849 tcggaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 33387804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 21833441 - 21833886
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  21833441 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctacgagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaca 21833540  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21833541 caatgtccgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggccttt 21833640  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21833641 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttatcagcgggggcactgtac 21833740  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21833741 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctctccatagatcctgcagctattaaccaaat 21833840  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||| | |||||| || |||||||||||||| |||||    
T  21833841 cctgaaaaactcttagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 21833886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 51330712 - 51330267
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |    
T  51330712 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaa 51330613  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  51330612 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcctct 51330513  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  51330512 ctctccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctgacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtac 51330413  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51330412 ggcttaggacgactctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagt 51330313  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||    
T  51330312 cctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 51330267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 16347815 - 16347369
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  16347815 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgagaactaatgtgaccttctccattgcagttaaagcaca 16347716  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  16347715 caatgtctgcacgattacaatcagctacgacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagaacaggcgttgctcttgtggccttt 16347616  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||    
T  16347615 ctcaccacaattgaagcacacaatctcagcagcatccttcttcttaggccgcctaacgtcgaccatcttctgtttacccttgtcagcgggggcactgtac 16347516  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaacc-aaa 399  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  16347515 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaaccaaaa 16347416  T
Q  400 tccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    ||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||    
T  16347415 tcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 16347369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 41350888 - 41350444
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| || ||||||||||    
T  41350888 tgagtcccagtcaaagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgagaactaatgtgaccttctccattacaattaaagcaca 41350789  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  41350788 caatgtctgcacgattgcaatcagctacgacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagaacaggcgttgctcttgtggccttt 41350689  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||    
T  41350688 ctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacccttgtcagcgggggcactgtac 41350589  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  41350588 ggcttaggacgactctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtaagccttcgtatcctcttcataga-cctgcagctatgaaccaagt 41350490  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  41350489 cctgaaaaactctcagctgttggtacccaagcgccctcttgatgtc 41350444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 7 - 446
Target Start/End: Original strand, 21842357 - 21842796
Alignment:
Q  7 ccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21842357 ccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactatgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacacacaatgt 21842456  T
Q  107 ctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcacc 206  Q
    | ||||| ||||| || ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  21842457 ccgtacgcttgcattcggctacaatatgacctttcttgccacatcggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgcttttgtggcctttcccacc 21842556  T
Q  207 acaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggctta 306  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21842557 acaattgaaacacacaatctcagtagcatccttcttcttaggccgtctatcatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggctta 21842656  T
Q  307 ggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaa 406  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  21842657 ggacgactctgatgtcccttgcccttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaaatcctgaa 21842756  T
Q  407 aaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    ||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  21842757 aaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 21842796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 22400459 - 22400904
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  22400459 tgagtaccagtcaatgcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacaca 22400558  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    | ||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||    
T  22400559 cgatgtccgtacgcttgcaatccgctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatctcttcagggcagacattacttttatggccttt 22400658  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    | | ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  22400659 ccctccacaattgaaacacacaatctcagtagcatccatcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcaggggcactgtac 22400758  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
     |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22400759 agcttaggacgactctgctctcccttgcccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaaat 22400858  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||| | ||||||  | ||||||||||| ||||||||    
T  22400859 ccagaaaaactctaagctgttggcatccaatcgcccttttgatgtc 22400904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 19109507 - 19109953
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  19109507 tgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaacaca 19109606  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| | ||| |||||    
T  19109607 caatgtccttacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatctcttcaggacagacattgctttagtgaccttt 19109706  T
Q  201 ctcaccacaattgaaa--cacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgt 298  Q
    | ||| ||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  19109707 cacacaacaattgaaaaacacacaatctcggtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcaaccatcctctgtttccctttatcagcaggggcactgt 19109806  T
Q  299 acggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaa 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19109807 acggcttaggacgactctgttgtcccttgcccttcctctcattgacaatcttacagtgagccttagtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaa 19109906  T
Q  399 atccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    |||||| |||||||| | |||||| || |||||||||||||| |||||    
T  19109907 atccgg-aaaactctaatctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 19109953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 24785077 - 24784667
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||  | |||||||| | |||| |||||||| ||||||| || || ||||    
T  24785077 tgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactgagaaccaatgtgaccctcttcattgcaattgaaacaca 24784978  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    |||| ||  |||| ||||| ||||||||   |||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||    
T  24784977 caatatcattacgcttgcagtcagctaccgtatgacccttcttgccacaccgggcacatttctttatctcctctggacaaacattgctcttgtggccttt 24784878  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactg 297  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| || |||||||| | ||||||     
T  24784877 ctcaccataattgaaacagacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcagaggcacta 24784778  T
Q  298 tacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaacca 397  Q
    || ||||||||  |||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||| |||||||| || ||||| || ||||    
T  24784777 tagggcttagggagactctgttggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttgttatcctcctcatagattctacagctgttcacca 24784678  T
Q  398 aatccggaaaa 408  Q
    |||| ||||||    
T  24784677 aatcaggaaaa 24784667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 263 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 16354201 - 16354018
Alignment:
Q  263 ccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctt 362  Q
    ||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16354201 ccatcttctgtttacccttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctt 16354102  T
Q  363 cgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||    
T  16354101 cgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 16354018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 74 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 21228703 - 21228328
Alignment:
Q  74 gaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctc 173  Q
    |||||||| |||| || || ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||| ||  |    
T  21228703 gaccctcttcattacaattgaagcacacaatatcatttcgcttgcaatcagctacaatttgacccttcttgccacacctgacacatttcttgatctctac 21228604  T
Q  174 agggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttt 270  Q
    | | || || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |     
T  21228603 aagacaaacattactcttgtggcctttctcgccacagttgaaacaaacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctc 21228504  T
Q  271 tgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcct 370  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||  ||||  ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  21228503 tgtttacccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttctgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcct 21228404  T
Q  371 cttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||  | |||||| || || ||||||||||| |||||    
T  21228403 cctcatagatcctgcagctattaactaaatcagggaaaactcagatctgttggtatccgatcgccctcttaatgtc 21228328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 17042199 - 17041788
Alignment:
Q  37 ggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgac 136  Q
    |||| ||||||||||||  | ||||| || || ||  |||||||| |||| || || ||||||||||| ||  | |  |||||||||||||||| |||||    
T  17042199 ggcgtcctcttcggctgcttgcactgggaacttatatgaccctcttcattacaattgaagcacacaatatcatttctcttgcaatcagctacaatatgac 17042100  T
Q  137 ctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---c 233  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||  | || || ||||||||||||||| | ||||| |||||||| | |||||| | ||   |    
T  17042099 ccttcttgccacaccggacacatttcttgatctcttcaggataaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaa-aatctccgaaggagc 17042001  T
Q  234 atccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttc 333  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | || || || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||  ||||    
T  17042000 atccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgcttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttagtcttc 17041901  T
Q  334 ctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcg 433  Q
    |||||||| || |||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| || |||||||  |  ||||| || || ||||    
T  17041900 ctctcattaacaaccttgtaatgagctctggtatcctcttcgtagatcctacagctgttcaccaaatcagggaaaactcggagttgttggtatccgatcg 17041801  T
Q  434 ccctcttgatgtc 446  Q
    |||||||||||||    
T  17041800 ccctcttgatgtc 17041788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 22435939 - 22435521
Alignment:
Q  15 agcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtctgtacga 114  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||  | |||||||| | |||| |||||||| | ||||| || ||||||||||| ||  || |     
T  22435939 agcaaaaaccctaccagtagtcggcgccctcttaggttgcttgcactgagaaccaatgtgaccctcttccttgcaattgaagcacacaatatcactatgc 22435840  T
Q  115 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 214  Q
    |||||||||||||    |||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||| |  ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22435839 ttgcaatcagctaatgtatgacccttcttgccacatcggaaacatttctttacctcctctggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattga 22435740  T
Q  215 aacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgact 314  Q
    || | |||||||  |||| | | | |||||       |||| ||| ||||||  | ||||| || |||||||  |||||||| || |||||||| |||||    
T  22435739 aatagacaatcttcgcaggagcatccttct-------cctatcattgaccattctctgttttcccttatcagtaggggcactatagggcttagggcgact 22435647  T
Q  315 ctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctc 414  Q
    ||| || ||||||  ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || ||| | || ||||| || |||||||||       
T  22435646 ctgctggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctcatagattctacagttgttcaccaactcgggaaaaacttgg 22435547  T
Q  415 aactgttgatacccaatcgccctctt 440  Q
    | |||||| || ||||||||||||||    
T  22435546 atctgttggtatccaatcgccctctt 22435521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 184 - 440
Target Start/End: Original strand, 21176689 - 21176948
Alignment:
Q  184 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccat 280  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||  |||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| || |    
T  21176689 ttgctcttgtggactttctcaccacaattaatacagacaatctccacaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgccct 21176788  T
Q  281 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagat 380  Q
    ||||||| |||||||| || | |||||| | |||||| || ||||||  ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  21176789 tatcagcaggggcactatatgtcttagggctactctgctggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctcatagat 21176888  T
Q  381 cctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctctt 440  Q
     || || ||||| |||||||| |||||||| |  |  |||||||||| ||| ||||||||    
T  21176889 tctacaactattcaccaaatcaggaaaaacacggatttgttgatacctaattgccctctt 21176948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Original strand, 22401737 - 22402123
Alignment:
Q  7 ccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgt 106  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||   | ||||| || | |||| |||||||| |||| || || ||||| || || |    
T  22401737 ccagtcaaagcaaaaactctaccagtagccggcgccttcttaggcttcttgcactgcgaaccaatgtgaccctcttcattacaattgaagcatactatat 22401836  T
Q  107 ctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcacc 206  Q
    |   | | ||||| |||||||   ||||| | ||||| ||||| || | |||  ||||| | ||| |||| ||  | || ||||||||||||||||||||    
T  22401837 catcatgtttgcactcagctagtgcatgatccttctttccacagcgaaaacatctcttggtatccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcacc 22401936  T
Q  207 acaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggc 303  Q
    |||| | ||||| | ||| |||||||   |||||||||||||||| || ||| | ||||||||  | ||||| || |||||||| ||||||||||| |||    
T  22401937 acaagtaaaacagaaaatttctgcaggagcatccttcttcttaggtcgtctatcttcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactgtaaggc 22402036  T
Q  304 ttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagcta 390  Q
    ||||| |||||||| || ||||||  ||||| |||||| || | |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22402037 ttagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcatttacaatcttgtaatgagccttagtatcctcctcataaatcctgcagcta 22402123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 184 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 20081413 - 20081223
Alignment:
Q  184 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccat 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| || |    
T  20081413 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattaaagcagacaatctcagcatgaacatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgccct 20081314  T
Q  281 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctc 371  Q
    ||||||| ||||| || || |||||| | |||||||| || || |||  ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||    
T  20081313 tatcagcaggggcgctataaggcttaaggcgactctgctggccgttagtcttccgctcattcacgatcttgtaatgagccttggtatcctc 20081223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 187 - 446
Target Start/End: Original strand, 48426229 - 48426491
Alignment:
Q  187 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattat 283  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||  |||   ||||  || |||| |||| |||| ||||  ||||||| || || || || |    
T  48426229 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgt 48426328  T
Q  284 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 383  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || ||||||||||| ||    
T  48426329 cagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcatagattct 48426428  T
Q  384 gcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    ||| ||||||||||| || |  || ||||| | ||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  48426429 gcacctattaaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagctcttttgatgtc 48426491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 22496476 - 22496088
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||||||| ||||||| |||| |||||  ||||||| || |||||| |||||||| ||||||| || |||||||    
T  22496476 tgagtaccagtcaaagcgaaaactctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttacactgcgaactaatgtgaccctcttcattgcaattgaagcaca 22496377  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    |||| ||  || | ||||| |||||||   | ||||| ||||||||||| || | |||  |||| |  ||  | || ||  | | |||||||||||||||    
T  22496376 caatatcattatgtttgcactcagctagtgcgtgacccttcttaccacatcgaaaacatctctttacctctcccggacaagcatcgctcttgtggccttt 22496277  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactg 297  Q
    ||||||| |||| || || ||||||||  |||   ||||||||||| | ||||| |||   ||||||||  | ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  22496276 ctcaccataattaaagcagacaatctcaacaggaacatccttcttccttggccgtctatactcgaccattctctgttttcccttatcagcaggggcgcta 22496177  T
Q  298 tacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 386  Q
    || ||||||||  ||||||| || |||||   ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  22496176 taaggcttagggagactctggtggcccttcgtcttccgctcattcacgaccttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 22496088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 271 - 386
Target Start/End: Original strand, 16379506 - 16379621
Alignment:
Q  271 tgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcct 370  Q
    ||||| || |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  16379506 tgtttgcccttatcagcagaggcactgtaaggcttaggacgactctgttgacccttgcctttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcct 16379605  T
Q  371 cttcatagatcctgca 386  Q
    | ||||| ||||||||    
T  16379606 cctcataaatcctgca 16379621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 187 - 398
Target Start/End: Original strand, 37680405 - 37680619
Alignment:
Q  187 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagca---tccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattat 283  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||  ||| |   ||  || |||| |||| |||| ||||  ||||||| || || || || |    
T  37680405 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagtatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgt 37680504  T
Q  284 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 383  Q
    |||  || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || ||||||||||| ||    
T  37680505 cagtaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcatagattct 37680604  T
Q  384 gcagctattaaccaa 398  Q
    ||| |||||||||||    
T  37680605 gcacctattaaccaa 37680619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 187 - 398
Target Start/End: Original strand, 20297739 - 20297953
Alignment:
Q  187 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattat 283  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||   ||||  || |||| |||| |||  ||||  ||||||| ||||| || || |    
T  20297739 ctcttgtggcatttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctgtcatcacccatcttctgttttcccttgt 20297838  T
Q  284 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 383  Q
    |||  || |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || |||||||| || ||    
T  20297839 cagtaggagcactgtaaggcttaggacgattctgatgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcataaattct 20297938  T
Q  384 gcagctattaaccaa 398  Q
     || || ||||||||    
T  20297939 acacctgttaaccaa 20297953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 20074746 - 20074550
Alignment:
Q  184 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccat 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |    ||||||  || ||||| ||| |||  ||||   |||||| || || || |    
T  20074746 ttgctcttgtggcctttctcaccacacttgtaacacacaatctcagtgggagcatctctcctcttaagcctcctgtcatcactcatcttctgctttcctt 20074647  T
Q  281 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcata 377  Q
    | ||||| |  |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || ||||||||    
T  20074646 tgtcagcagaagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcata 20074550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 446
Target Start/End: Original strand, 52989094 - 52989358
Alignment:
Q  184 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccat 280  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||| | ||   ||||  || ||||||||| |||| ||||   |||||| || || || |    
T  52989094 ttgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttaggcctcctatcatcattcatcttctgctttcctt 52989193  T
Q  281 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagat 380  Q
    | ||||| || |||||||| |||||||||||| | || |||||||||||| |||||||| ||| ||  ||||| ||||| || || || |||||||| ||    
T  52989194 tgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattttgctgtcccttacccctcctctcactcatta-tttgtaatgagctttggtgtcttcttcataaat 52989292  T
Q  381 cctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
     || || || |||||||| || |  || ||||| | ||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  52989293 tctacacctgttaaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagctcttttgatgtc 52989358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 301 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 21738953 - 21738811
Alignment:
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  | |  ||| |||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |    
T  21738953 ggcttcggacgactctgttgtcccttacctctgcggtcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatcctcttcatatatcctgcagctacttaccaatt 21738854  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgat 443  Q
    | | ||||   || | || |||||| ||||| |||||||||||    
T  21738853 cagaaaaattccttaccttttgatagccaatagccctcttgat 21738811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 38909860 - 38909598
Alignment:
Q  187 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattat 283  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||  |||   ||||  || |||| |||| |||| ||||  ||||| | || || || || |    
T  38909860 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcctctgctttcctttgt 38909761  T
Q  284 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 383  Q
    |||| || |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||| || |||||| ||||| || || || |||||||| || ||    
T  38909760 cagcaggagcactgtaaggtttaggacgattctgttgtcccttacccctcctcccactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcataaattct 38909661  T
Q  384 gcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
     || || || ||||| || |  || ||||| | ||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  38909660 acatctgtttaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagctcttttgatgtc 38909598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 386
Target Start/End: Original strand, 21752459 - 21752574
Alignment:
Q  271 tgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcct 370  Q
    ||||| || |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| | || | ||||||||| | |||||| |||| ||| ||||| |    
T  21752459 tgttttcccttatcagcagtggcactgtaaggcttaggacgactctgctgacccttagcttttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatctt 21752558  T
Q  371 cttcatagatcctgca 386  Q
    | ||||| ||||||||    
T  21752559 cctcataaatcctgca 21752574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 280 - 386
Target Start/End: Original strand, 20921860 - 20921966
Alignment:
Q  280 ttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcataga 379  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||| | ||| | ||  | ||||| || || || ||||||||||||||||    
T  20921860 ttatcagcgggagcactgtaaggcttaggacgactctgttgattcttacccttcttttcacttacagctttgtaatgtgctttggtatcctcttcataga 20921959  T
Q  380 tcctgca 386  Q
    | |||||    
T  20921960 ttctgca 20921966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 292 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 21742478 - 21742380
Alignment:
Q  292 gcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagcta 390  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||  |||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21742478 gcactatacggtttcggacgactctactgtcccttacctctgcgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatcctcttcatatatcctgcagcta 21742380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 283 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 22015680 - 22015574
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||| | | |||| |||  |||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||    
T  22015680 tcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtccctttcccctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtaacttcttcatagatcc 22015581  T
Q  383 tgcagct 389  Q
    | |||||    
T  22015580 tacagct 22015574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 368
Target Start/End: Original strand, 22117124 - 22117223
Alignment:
Q  269 tttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatc 368  Q
    ||||||| || |||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||    
T  22117124 tttgttttcccttatcagcaggaacactgtaaggctttggacgactttgctgacccttgcctttcctctcattcaaaaccttgtaatgagccttagtatc 22117223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 283 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 31536932 - 31536769
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || |||||||| || |    
T  31536932 tcagcaggagcactataaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcataaattc 31536833  T
Q  383 tgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    | || || || ||||| || |  || ||||| | ||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  31536832 tacatctgtttaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagctcttttgatgtc 31536769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 377
Target Start/End: Original strand, 21961380 - 21961576
Alignment:
Q  184 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccat 280  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||| | ||   ||||  || |||| || | |||| ||||   |||||| || || || |    
T  21961380 ttgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttgggtctcctatcatcattcatcttctgctttcctt 21961479  T
Q  281 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcata 377  Q
    | ||||  || |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || ||||||||    
T  21961480 tgtcagaaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacctctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcata 21961576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 20081572 - 20081490
Alignment:
Q  25 ctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtc 107  Q
    |||||||||| ||||||| |||| ||| | |||||||| || | |||| |||| ||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  20081572 ctaccagtagtcggcgccttcttaggccgcgtacactgcgaaccaatgtgaccttcttcattgcaattgaagcacacaatgtc 20081490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 24096649 - 24096505
Alignment:
Q  187 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatct---ctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattat 283  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||   | | ||||||  || |||| |||| |||  ||||   |||| | ||||| || || |    
T  24096649 ctcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattcatcctctgttttcctttgt 24096550  T
Q  284 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttac 328  Q
    |||| || ||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  24096549 cagcaggagcactataaggtttaggacgactctgttgtcccttac 24096505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 362; Significance: 0; HSPs: 39)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 18180856 - 18181300
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18180856 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaca 18180955  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  18180956 caatgtccgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgctttcgtggccttt 18181055  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18181056 ctcgccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacctcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtac 18181155  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18181156 ggcttaggaagactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 18181255  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||    
T  18181256 ccggaaaaactctcagttgttaat-cccaatcgccctcttgatgtc 18181300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 15158214 - 15157769
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15158214 tgagtaccagtcaaagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaca 15158115  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15158114 caatgtccgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggccttt 15158015  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  15158014 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtac 15157915  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15157914 ggcttaggacgactctgctgtcccttgccctttctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 15157815  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  15157814 cctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 15157769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 13689154 - 13689599
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  13689154 tgagtaccagtcaaagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctatccgttgcaattaaagcaca 13689253  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13689254 caatgtccgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggccttt 13689353  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  13689354 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagtaggggcactgtac 13689453  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13689454 ggcttaggacgactctggtgtcccttgccctttctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagt 13689553  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13689554 ctggaaaaactctcagctgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 13689599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 8710718 - 8711163
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| |    
T  8710718 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctttccgttgcaattaaagcaaa 8710817  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  8710818 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgcttttgtggccttt 8710917  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  8710918 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtac 8711017  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8711018 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaaccaaat 8711117  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| |||||| || || ||||||||||| |||||    
T  8711118 cctgaaaaactctcagctgttggtatccgatcgccctcttaatgtc 8711163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 14335509 - 14335954
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |    
T  14335509 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaa 14335608  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  14335609 caatgtctgtacgattgcaatcagccaccacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggccttt 14335708  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||    
T  14335709 ctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcattgtac 14335808  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14335809 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaaccaaat 14335908  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  14335909 cctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttaatgtc 14335954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 18587328 - 18586883
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |    
T  18587328 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctactagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaa 18587229  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  18587228 caatgtccgtacgattgcaatcagccaccacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggccttt 18587129  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||    
T  18587128 ctcaccacaattgaagcacacaatctctgtagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcattgtac 18587029  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18587028 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaaccaaat 18586929  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  18586928 cctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttaatgtc 18586883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 11234370 - 11233925
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  11234370 tgagtaccagtcaaagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacaca 11234271  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11234270 caatgtccgtacgcttgcattcagctacaatatgacctttcttgccacaccgaacacacttcttgatttcttcagggcagacgttgcttttgtggccttt 11234171  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11234170 cccaccacaattgaaacacacaatctctgtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcgggggcactgtac 11234071  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  11234070 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattgaccaaat 11233971  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  11233970 cctgaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 11233925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 44788508 - 44788063
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |    
T  44788508 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctaagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaa 44788409  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  44788408 caatgtctgtacggttgcaatcagccaccacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggccttt 44788309  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||  ||||||||||||    
T  44788308 ctcgccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgttttcctttatcagtaggggcactgtac 44788209  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  44788208 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctattaaccaagt 44788109  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||    
T  44788108 cctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 44788063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 78 - 446
Target Start/End: Original strand, 10873652 - 10874019
Alignment:
Q  78 ctctccattgcagttaaagcacacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggg 177  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10873652 ctctccatt-caattaaagcacacaatgtctgtacgattgcaatcagccaccacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagga 10873750  T
Q  178 cagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcc 277  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10873751 caggcgttgctcttgtggtctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttcc 10873850  T
Q  278 cattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcata 377  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  10873851 ctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccctgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcata 10873950  T
Q  378 gatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10873951 gatcctgcagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagctgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 10874019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 11550259 - 11549814
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  || |||||  | |||||||||||||||||||| ||||    
T  11550259 tgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactatgaactaatatgtccctctccattgcagttaaaacaca 11550160  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    |||||||  |||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  11550159 caatgtccttacgcttgcaatcaactacaatatgacccttcttgccacaccagacacacttcttgatctcttcaggacagacattgcttttgtggccttt 11550060  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  11550059 cacaccacaattgaaacacacaatctcggtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcaggggcactgtac 11549960  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11549959 ggcttaggacgactctgttgtcccttccccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttagtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaaat 11549860  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    | ||||||||||| | |||||| || |||||||||||||| |||||    
T  11549859 ctggaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 11549814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 12690614 - 12691059
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||  | |||||| |||||||||||||  |||    
T  12690614 tgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatatgtccctcttcattgcagttaaaataca 12690713  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||| ||||    
T  12690714 caatgtccttacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatctcttcaggacagacattgcttttgtggacttt 12690813  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  12690814 cacaccacaattgaaacacacaatctcggtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcaggggcactgtac 12690913  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12690914 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttagtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaaat 12691013  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    | ||||||||||| | |||||| || |||||||||||||| |||||    
T  12691014 ctggaaaaactctaatctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 12691059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 36 - 446
Target Start/End: Original strand, 14957656 - 14958066
Alignment:
Q  36 cggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatga 135  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || |||||  | |||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||    
T  14957656 cggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatatgtccctcttcattgcagttaaaacacacaatgtccttacgcttgcaatcagctacaatatga 14957755  T
Q  136 cctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcat 235  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||    
T  14957756 cccttcttgccacaccggacacacttcttgatctcttcaggacagacattgcttttgtggcctttcacaccacaattgaaacacacaatctcggtagtat 14957855  T
Q  236 ccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcct 335  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||    
T  14957856 ccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgaccctactgtcccttgcccttcct 14957955  T
Q  336 ctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgcc 435  Q
    ||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| || |||||| ||    
T  14957956 ctcgttcacaatcttatagtgagccttagtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaaatctggaaaaactctaatctgttggtatccaatcacc 14958055  T
Q  436 ctcttgatgtc 446  Q
    ||||| |||||    
T  14958056 ctcttaatgtc 14958066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 74 - 446
Target Start/End: Original strand, 11984178 - 11984553
Alignment:
Q  74 gaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctc 173  Q
    |||||||| ||||| | || ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  11984178 gaccctcttcattgaaattgaagcacacaatatcattacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacatttcttgatctcttc 11984277  T
Q  174 agggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttt 270  Q
    ||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||   ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |     
T  11984278 agtacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagctggagcatccttcttcttaggccgtctatcatcgaccattctc 11984377  T
Q  271 tgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcct 370  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||   ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |    
T  11984378 tgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatctt 11984477  T
Q  371 cttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    |||| |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||  |  ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  11984478 cttcgtagatcctacaactgttaaccaaatcaggaaaaactcggatttgttggtatccgatcgccctcttaatgtc 11984553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 74 - 440
Target Start/End: Original strand, 9591550 - 9591919
Alignment:
Q  74 gaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctc 173  Q
    |||||||| |||| || || ||||||||||| ||  | || ||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  9591550 gaccctcttcattacaattgaagcacacaatatcatttcgcttgcaatcagctataatatgacccttcttgccacaccggacacatttcttgatctcttc 9591649  T
Q  174 agggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttt 270  Q
    ||| || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |     
T  9591650 aggacaaacattgctcttgtggcctttctcgccacagttgaaacagacaatctctgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcaaccattctc 9591749  T
Q  271 tgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcct 370  Q
    || || || |||||| | |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||   |||||||||||| || |||||||| |||||  | |||||||    
T  9591750 tgcttgcccttatcaacaggggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttggtcttcctctcattaacaaccttgtaatgagctctggtatcct 9591849  T
Q  371 cttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctctt 440  Q
    | |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||  | |||||| || || |||||||||||    
T  9591850 cctcatagattctgcagctattcaccaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctctt 9591919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 69 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 17703544 - 17703164
Alignment:
Q  69 aatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatt 168  Q
    |||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||| |||||| || || ||||| |||||||| ||||||||     
T  17703544 aatgtgaccctcttcattacagttgaagcacacaatatcattacgcttgcaatcagctacaatatgaccctttttgccacatcggacacatttcttgatc 17703445  T
Q  169 tcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgacca 265  Q
    || ||||| || || || ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||| || ||||   ||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  17703444 tcttcaggacaaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaacaatatccgcaggagcatccttcttctttggccgcctatcatcgacca 17703345  T
Q  266 tcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgt 365  Q
    |  | ||||| || |||||||  |||||||| || || ||||| |||||||| || |||||   ||||| ||||||||| |||||||| |||||  | ||    
T  17703344 ttctctgtttgcccttatcagtaggggcactataaggtttagggcgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagctctggt 17703245  T
Q  366 atcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||  |  |||||||  | |||||| || || |||||||||||||||||    
T  17703244 atcctcttcatagatcctacagctgttcaccaaataggcgaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctcttgatgtc 17703164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 69 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 16726530 - 16726150
Alignment:
Q  69 aatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatt 168  Q
    |||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||| |||||| || || ||||| |||||||| ||||||||     
T  16726530 aatgtgaccctcttcattacagttgaagcacacaatatcattacgcttgcaatcagctacaatatgaccctttttgccacatcggacacatttcttgatc 16726431  T
Q  169 tcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgacca 265  Q
    || ||||| || || || ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||| || ||   ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  16726430 tcttcaggacaaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaacaatatccgcaggagcatccttcttctttggccgcctatcatcgacca 16726331  T
Q  266 tcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgt 365  Q
    |  | ||||| || |||||||  |||||||| || || ||||| |||||||| || |||||   ||| | ||||||||| |||||||| |||||  | ||    
T  16726330 ttctctgtttgcccttatcagtaggggcactttaaggtttagggcgactctgctggcccttggtctttcgctcattcacaaccttgtaatgagctctggt 16726231  T
Q  366 atcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||  |  |||||||  | |||||| || || |||||||||||||||||    
T  16726230 atcctcttcatagatcctacagctgttcaccaaataggcgaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctcttgatgtc 16726150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 187 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 26091747 - 26091485
Alignment:
Q  187 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattat 283  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||  |||   ||||  || |||| |||| |||| ||||  ||||||| || || || || |    
T  26091747 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgt 26091648  T
Q  284 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 383  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || ||||||||||| ||    
T  26091647 cagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcatagattct 26091548  T
Q  384 gcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    ||| ||||||||||| || |  || ||||| | ||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  26091547 gcacctattaaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagctcttttgatgtc 26091485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 187 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 26115539 - 26115277
Alignment:
Q  187 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattat 283  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||   ||||||  || |||| |||| |||| ||||   |||||| || || || || |    
T  26115539 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagccggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcactcatcttctgctttcctttgt 26115440  T
Q  284 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 383  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || ||||||||||| ||    
T  26115439 cagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttatcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcatagattct 26115340  T
Q  384 gcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
     || || |||||||| || |  || ||||| | ||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  26115339 acacctgttaaccaactcagagaagactctgatctgctgatatccaatggctctcttgatgtc 26115277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 283 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 16947322 - 16947215
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  16947322 tcagcaggggcactgtatggtttaggacgactctgctgtcccttaccccttctctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatcctcttcatagattc 16947223  T
Q  383 tgcagcta 390  Q
    ||||||||    
T  16947222 tgcagcta 16947215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 187 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 40924766 - 40924552
Alignment:
Q  187 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattat 283  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||  |||   ||||  || |||| |||| |||| ||||  ||||||| || || || || |    
T  40924766 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgt 40924667  T
Q  284 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 383  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||  | ||| || ||||| || || || ||||||||||| ||    
T  40924666 cagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgagctttggtgtcttcttcatagattct 40924567  T
Q  384 gcagctattaaccaa 398  Q
    ||| |||||||||||    
T  40924566 gcacctattaaccaa 40924552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 191 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 15145890 - 15145692
Alignment:
Q  191 tgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagc 287  Q
    |||||||||||||||||||| | ||  | |||||||| ||||   |||||||||||||||| |||||| |||| || |   | ||||| || ||||||||    
T  15145890 tgtggcctttctcaccacaagtaaagaagacaatctcagcaggagcatccttcttcttagggcgcctatcatcaactactctctgtttgcccttatcagc 15145791  T
Q  288 gggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 386  Q
     |||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||  |||| | ||||||||| | |||||| |||| ||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  15145790 agggggactataaggcttaggacgactctgttgacccttggcctttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcttcctcaaagatcctgca 15145692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 284 - 390
Target Start/End: Original strand, 13004865 - 13004971
Alignment:
Q  284 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 383  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| |||  |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| ||    
T  13004865 cagcaggggcgctgtacggcttaggacgactctgttgtcccttgcccctccgttcactcatcaccttgtaatgagcctttgaatcttcttcatagattct 13004964  T
Q  384 gcagcta 390  Q
    |||||||    
T  13004965 gcagcta 13004971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 187 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 13965617 - 13965354
Alignment:
Q  187 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattat 283  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| | ||  ||||||| ||||   ||||  || |||| |||| |||| ||||  ||||||| || || || || |    
T  13965617 ctcttgtggtctttctcaccacacttgtagcaatcaatctcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgt 13965518  T
Q  284 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 383  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||| || || ||| ||||| || || || |||||||| ||||     
T  13965517 cagcaggagcactgtaaggcttaggacgattatgttgtcccttacccctcctctcactcattatctggtaatgagctttggtgtcttcttcataaatcca 13965418  T
Q  384 gcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtcc 447  Q
     || || |||||||| || | ||| ||||| | ||| ||||||||||| || || |||||||||    
T  13965417 acacctgttaaccaactcagaaaagactctgatctgctgatacccaatagctcttttgatgtcc 13965354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 269 - 382
Target Start/End: Original strand, 15627908 - 15628021
Alignment:
Q  269 tttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatc 368  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| | |||||  |||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||    
T  15627908 tttgtttacccttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactttgttgactcttacttttcctctcattcataaccttgtaatgagctttcgtatc 15628007  T
Q  369 ctcttcatagatcc 382  Q
    ||| ||||||||||    
T  15628008 ctcctcatagatcc 15628021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 184 - 443
Target Start/End: Original strand, 12459925 - 12460187
Alignment:
Q  184 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccat 280  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||| ||||   ||||  || |||| |||| |||| ||||   ||| || || || || |    
T  12459925 ttgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacagacaatctcagcaggaacatctctcctcttgggcctcctatcatcattcattttctgctttccct 12460024  T
Q  281 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagat 380  Q
    | |||||  | ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||  |||||||| ||||| || || || || ||||| ||    
T  12460025 tgtcagcaagagcattgtaaggcttaggacgactctgctgtcccttacccctcctctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtgtcttcctcatatat 12460124  T
Q  381 cctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgat 443  Q
    |||||||||  | ||||| || |  |||||||| | ||  |||||||| || |||||||||||    
T  12460125 cctgcagctgctcaccaactcagagaaaactctaatcttctgataccctatagccctcttgat 12460187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 187 - 446
Target Start/End: Original strand, 49155601 - 49155863
Alignment:
Q  187 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattat 283  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||  |||   ||||  || |||| |||| |||| | ||  ||||| | || || || || |    
T  49155601 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcctcacccatcctctgctttcctttgt 49155700  T
Q  284 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 383  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||  | ||| || ||||| || || || ||||||||||| ||    
T  49155701 cagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgagctttggtgtcttcttcatagattct 49155800  T
Q  384 gcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    ||| |||||||| || || |  || ||||| | ||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  49155801 gcatctattaactaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagctcttttgatgtc 49155863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 283 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 14261096 - 14260989
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| || | |||| | |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  14261096 tcagcaggggcactatacggcttcggacgactctactgtcccttacctttgcgctcactgatcaccttgtaatgagctttcgtatcctcttcatatatcc 14260997  T
Q  383 tgcagcta 390  Q
    ||||||||    
T  14260996 tgcagcta 14260989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 283 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 11385279 - 11385173
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||  | |||||| ||||| || | ||| || |||||||| |    
T  11385279 tcagcaggggcactgtacggcttaggatgactctgttgtcccttacccctccgctcactcatcatcttgtaatgagcttttgaatcttcctcatagattc 11385180  T
Q  383 tgcagct 389  Q
    |||||||    
T  11385179 tgcagct 11385173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 283 - 446
Target Start/End: Original strand, 14145060 - 14145223
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | | |||| |||  ||||| || ||||| || ||  |||| ||||||||||    
T  14145060 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgccctcctcatagatcc 14145159  T
Q  383 tgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    |||| | | | |||||||| || |||| ||| | |||||| || || || || |||||||||||    
T  14145160 tgcaacgactcaccaaatcagggaaaattctaatctgttggtatcctatggctctcttgatgtc 14145223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 283 - 390
Target Start/End: Original strand, 19150410 - 19150517
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  19150410 tcagcaggggcactaaacggcttcggacgactctgctgtcccttacctatgcgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtatcctcttcatatatcc 19150509  T
Q  383 tgcagcta 390  Q
    ||||||||    
T  19150510 tgcagcta 19150517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 283 - 390
Target Start/End: Original strand, 20749809 - 20749916
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  20749809 tcagcaggggcactaaacggcttcggacgactctgctgtcccttacctatgcgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtatcctcttcatatatcc 20749908  T
Q  383 tgcagcta 390  Q
    ||||||||    
T  20749909 tgcagcta 20749916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 292 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 12712504 - 12712406
Alignment:
Q  292 gcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagcta 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| |||  |||||| | |||||||| | ||| || |||||||| |||||||||    
T  12712504 gcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttgcccctccgttcactcatcaccttggaatgagcctttgaatcttcctcatagattctgcagcta 12712406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 446
Target Start/End: Original strand, 21755811 - 21755974
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||| ||||| ||  | || |||||||| || |    
T  21755811 tcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattttgttgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttgatgtcttcttcataaattc 21755910  T
Q  383 tgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    | || || |||||||| || |  || ||||| | ||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  21755911 tacacctgttaaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagctcttttgatgtc 21755974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 184 - 389
Target Start/End: Original strand, 13024641 - 13024849
Alignment:
Q  184 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccat 280  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| || ||||   ||||  || |||| |||| |||| ||||   |||| | || ||||| |    
T  13024641 ttgcttttgtggcctttttcaccacacttgtaacaaacaatttcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcattcatcctctgcttccctt 13024740  T
Q  281 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagat 380  Q
    | ||||| || |||||||| || ||||||||| |||  |||||||||||| |||||||| |||  |||||||| ||||| || || || || ||||| ||    
T  13024741 tgtcagcaggagcactgtaaggtttaggacgattctactgtcccttacccctcctctcactcatcaccttgtaatgagctttggtgtcttcctcatatat 13024840  T
Q  381 cctgcagct 389  Q
    |||||||||    
T  13024841 cctgcagct 13024849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 280 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 14283227 - 14283061
Alignment:
Q  280 ttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcataga 379  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||  | | |||||| |||  |||||||| ||||| || || ||||| |||||||    
T  14283227 ttatcagcaggggcactatacggcttcgggcgactctgctgtcccttattccttctctcactcatcaccttgtaatgagctttagtgtcctcctcataga 14283128  T
Q  380 tcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    ||||||| | | | |||||||| |  |||| ||| | |||||| ||||| ||  | |||||||||||    
T  14283127 tcctgcaacgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttgctaccctatgactctcttgatgtc 14283061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 12798354 - 12798248
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||  | | |||| |||  ||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  12798354 tcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttgcctctgcgctcactcatcaccttgtaaagagctttcgtatcctcttcataaatcc 12798255  T
Q  383 tgcagct 389  Q
    | |||||    
T  12798254 tacagct 12798248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 346 - 446
Target Start/End: Original strand, 13676907 - 13677007
Alignment:
Q  346 accttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgt 445  Q
    |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||| |  |||| ||| | ||  ||||||||||| || ||||||||||    
T  13676907 accttgtaatgagctttagtatcttcttcatatatcctgcagctactcaccaaatcagagaaaattcttatcttctgatacccaatggctctcttgatgt 13677006  T
Q  446 c 446  Q
    |    
T  13677007 c 13677007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 107
Target Start/End: Original strand, 12459785 - 12459848
Alignment:
Q  44 tcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtc 107  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||  |||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  12459785 tcttcggctgagtacactgtgaactaatatgaccttcttcattgcagttatagcagacaatgtc 12459848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 92
Target Start/End: Original strand, 21755569 - 21755617
Alignment:
Q  44 tcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagtt 92  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  21755569 tcttcggctcaggacactgtgagctaatatgaccctctccattgcagtt 21755617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 362; Significance: 0; HSPs: 36)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 27205610 - 27206055
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| || |||||||    
T  27205610 tgagtcccagtcaaagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgagaactaatatgaccctctccattgcaattgaagcaca 27205709  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27205710 caatgtccgaacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcaggcgttgctcttgtggccttt 27205809  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  27205810 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttccctttatcggcgggagcactgtac 27205909  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27205910 ggcttaggacgactctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagt 27206009  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    |  |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  27206010 cttgaaaaactctcagctgttggtacccaagcgccctcttgatgtc 27206055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 27243618 - 27243173
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| || |||||||    
T  27243618 tgagtcccagtcaaagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgagaactaatatgaccctctccattgcaattgaagcaca 27243519  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27243518 caatgtccgaacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcaggcgttgctcttgtggccttt 27243419  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  27243418 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttccctttatcggcgggagcactgtac 27243319  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27243318 ggcttaggacgactctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagt 27243219  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    |  |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  27243218 cttgaaaaactctcagctgttggtacccaagcgccctcttgatgtc 27243173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 24293075 - 24292630
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  24293075 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaca 24292976  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24292975 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcaggcgttgctcttgtggccttt 24292876  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24292875 ctcgccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacctcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtac 24292776  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  24292775 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagattctgcagctattaaccaaat 24292676  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||    
T  24292675 cctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 24292630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 29589732 - 29589287
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||| |    
T  29589732 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaaa 29589633  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29589632 caatgtctgtacggttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 29589533  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||    
T  29589532 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagtgggggcactgtac 29589433  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  29589432 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctattaaccaagt 29589333  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  29589332 cctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 29589287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 28312618 - 28313063
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28312618 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttcggctgagtacactgagaactaatgtgaccttctccattgcaattaaagcaca 28312717  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||    
T  28312718 caatgtctgtacgattgcaatcagctactacatgacctttcttgccacaccgggcacacttcttgatttcctcggaacaggcgttgctcttgtggccttt 28312817  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||    
T  28312818 ctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgggggcactgtac 28312917  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28312918 ggcttaggacgactctgctgtcccttacccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagt 28313017  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  28313018 cctgaaaaactctcagctgttggtacccaagcgccctcttgatgtc 28313063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 28260490 - 28260045
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28260490 tgagtctcagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcggcgccctcttcggctgagtacactgagaactaatgtgaccctctccattgcagttaaagcaca 28260391  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||    
T  28260390 caatgtccgtgcgattgcaatcagctacaacatgacctctcttaccacaccggacacacttcttgatttcttcgggacaggcgttgctcttgtggccttt 28260291  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  28260290 cccaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtac 28260191  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28260190 ggcttaggacgactctgctgccccttacccttcctttcgttcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagt 28260091  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28260090 cctgaaaaactctcagctgttgatacccaagcgccctcttgatgtc 28260045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 28285426 - 28285871
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28285426 tgagtctcagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcggcgccctcttcggctgagtacactgagaactaatgtgaccctctccattgcagttaaagcaca 28285525  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||    
T  28285526 caatgtccgtgcgattgcaatcagctacaacatgacctctcttaccacaccggacacacttcttgatttcttcgggacaggcgttgctcttgtggccttt 28285625  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  28285626 cccaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtac 28285725  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28285726 ggcttaggacgactctgctgccccttacccttcctttcgttcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagt 28285825  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28285826 cctgaaaaactctcagctgttgatacccaagcgccctcttgatgtc 28285871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 28339239 - 28338794
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28339239 tgagtctcagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcggcgccctcttcggctgagtacactgagaactaatgtgaccctctccattgcagttaaagcaca 28339140  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||    
T  28339139 caatgtccgtgcgattgcaatcagctacaacatgacctctcttaccacaccggacacacttcttgatttcttcgggacaggcgttgctcttgtggccttt 28339040  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  28339039 cccaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtac 28338940  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28338939 ggcttaggacgactctgctgccccttacccttcctttcgttcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaagt 28338840  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28338839 cctgaaaaactctcagctgttgatacccaagcgccctcttgatgtc 28338794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 16574878 - 16575323
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |    
T  16574878 tgagtccccgtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaa 16574977  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  16574978 caatgtctgtacgattgcaatcagccaccacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggccttt 16575077  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  16575078 ctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtac 16575177  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16575178 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaaccaaat 16575277  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||    
T  16575278 cctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 16575323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 16620502 - 16620057
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |    
T  16620502 tgagtccccgtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaa 16620403  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  16620402 caatgtctgtacgattgcaatcagccaccacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggccttt 16620303  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  16620302 ctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtac 16620203  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16620202 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaaccaaat 16620103  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||    
T  16620102 cctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 16620057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 2872095 - 2871650
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  2872095 tgagtaccagtcaaagcaaagactctaccagtagtcggtgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaca 2871996  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2871995 caatgtccgtacaattgcagtcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggccttt 2871896  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  2871895 cccaccacaattgaaacacacaatctctgtagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtac 2871796  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2871795 agcttaggacgactctgttgtcccttgcccttcctctcattcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaaat 2871696  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  2871695 cctgaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 2871650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 414
Target Start/End: Original strand, 25115540 - 25115954
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  25115540 tgagtaccagtcaaggcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacaca 25115639  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  25115640 caatatccgtacgattgcaatcagctacaatatgacctttcttgccacaccgaacacacttcttgatttcctcagggcagacattgcttttgtggccttt 25115739  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  25115740 cccaccacaattgaaacacacaatctcagtagcatccttcttcttaggctgcctatcatcgaccattctctgtttccctttatcagcaggggcactgtac 25115839  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25115840 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 25115939  T
Q  401 cc-ggaaaaactctc 414  Q
    || ||||||||||||    
T  25115940 ccgggaaaaactctc 25115954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 22829679 - 22829234
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  22829679 tgagtaccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacacggtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacaca 22829580  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  22829579 caatgtccttacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccagacacacttcttgatctcttcaggacagacattgcttttgtggccttt 22829480  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
      ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | | |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  22829479 tccaccacaattgaaacacacaatctcagtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctatttccctttatcagcaggggcactgtac 22829380  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22829379 ggcttaggacgactctgttgtcccttgcccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaaat 22829280  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    | ||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  22829279 ctggaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 22829234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 5836521 - 5836076
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||| | ||||||||||| ||||    
T  5836521 tgagtaccagtcaaagcaaaaactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctcttcgttgcagttaaaacaca 5836422  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    |||||||  |||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || || || || ||||| | |||||||||    
T  5836421 caatgtccttacgcttgcaatcggctacaatatgacccttcttgccacaccggacacatttcttgatctcttctggacaaacattgctttcgtggccttt 5836322  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  5836321 cccaccacagttgaaacacacaatctcagcagcatccttcttcttgggtcgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcaggggcactatac 5836222  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   |||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  5836221 ggcttaggacgactctgttgtcccttgcccttccgctcattcacagtcttgtagtgagctttggtatcctcttcgtaaatcctgcagctattaaccaaat 5836122  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    ||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  5836121 ccggaaaaactctaatctattggtacccaatcgccctcttaatgtc 5836076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 386
Target Start/End: Original strand, 22436857 - 22437245
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||||||| ||||||| |||| |||||  | |||||||| | |||| |||| ||| |||| || || |||||||    
T  22436857 tgagtaccagtcaaagcgaaaactctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactgagaaccaatgtgaccatcttcattacaattgaagcaca 22436956  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    |||||||  |||| ||||| |||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||  |||| |  ||  | || ||  | |||||||||||||||||    
T  22436957 caatgtcattacgtttgcactcagctagtgcatgacccttcttaccacatcggaaacatctctttacctcacccggacaagcattgctcttgtggccttt 22437056  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactg 297  Q
    |||||||||||| || || |||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||  | |||||||| ||||| ||     
T  22437057 ctcaccacaattaaagcagacaatctcagcaggaacatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctatttggccttatcagcaggggcgcta 22437156  T
Q  298 tacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 386  Q
    || |||||||| |||||||| || ||||||  ||| | ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22437157 taaggcttagggcgactctgctggcccttagtctttcgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcttcataaatcctgca 22437245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 74 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 25756835 - 25756460
Alignment:
Q  74 gaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctc 173  Q
    |||||||  ||||||| || ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||| | |||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || ||    
T  25756835 gaccctcctcattgcaattgaagcacacaatatcattacgcttgcaatcagctactatatgacccttcttgccgcaccggacacatttctttatctcttc 25756736  T
Q  174 agggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttt 270  Q
     ||  | || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |     
T  25756735 tggaaaaacattgcacttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctc 25756636  T
Q  271 tgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcct 370  Q
    ||||| || |||||| |  ||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||  |||||  ||||| || |||||||| |||||    || ||||    
T  25756635 tgtttgcccttatcaactagggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccggtcattaaccaccttgtaatgagctcgggtgtcct 25756536  T
Q  371 cttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    | |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||   | |||||| || || ||||||||||| |||||    
T  25756535 cctcatagatcctgcagctattcactaaatcctgaaaaacttggacctgttggtatcctatcgccctcttaatgtc 25756460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 184 - 440
Target Start/End: Original strand, 21764983 - 21765242
Alignment:
Q  184 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccat 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |  || || |    
T  21764983 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctaattgccct 21765082  T
Q  281 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagat 380  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || |||| |   |||| ||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||    
T  21765083 tatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggccctcagtgttccactcattcacaaccttgtaatgagctttggtgtcctcctcatagat 21765182  T
Q  381 cctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctctt 440  Q
      | ||||| || |||||||| | ||||||||  | |||||| || ||||| ||||||||    
T  21765183 tttacagctgttcaccaaatcagcaaaaactcggatctgttggtatccaattgccctctt 21765242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 133 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 27559130 - 27558814
Alignment:
Q  133 tgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag 232  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |  |||||||| || ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  27559130 tgacccttcttgccacaccggaaacacttcttcacctcctcaggacaaacagtactcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagcag 27559031  T
Q  233 ---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacc 329  Q
       ||| ||| ||||||||||| ||  | ||||||||| | ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||      
T  27559030 gaacatgctttttcttaggccgtctttcctcgaccatcctctgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagt 27558931  T
Q  330 cttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgataccca 429  Q
    ||||| |||||| || |||||||| |||||  | || ||||| ||||| || |||||||||||  ||||||| ||||||||||  |  ||||| || ||     
T  27558930 cttccgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcctcctcataaattctgcagctattctccaaatctggaaaaactcggatttgttggtatccg 27558831  T
Q  430 atcgccctcttgatgtc 446  Q
    ||||||||||| |||||    
T  27558830 atcgccctcttaatgtc 27558814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 283 - 389
Target Start/End: Original strand, 19438275 - 19438381
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||  |||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  19438275 tcagcaggagcactatatggcttcggacgactctgctgtcccttacctctcctttcactcactaccttgtaataagccttcgtatcctcttcatagatcc 19438374  T
Q  383 tgcagct 389  Q
    | |||||    
T  19438375 tacagct 19438381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 18405229 - 18404948
Alignment:
Q  9 agtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtct 108  Q
    |||||||||||| || |||||||||| || |||| |||| ||||   | |||||||| | |||| |||| ||| ||||||| || ||||| || || ||     
T  18405229 agtcaaagcaaaaactctaccagtagtcgacgccttcttaggcttcttgcactgagaaccaatgtgaccttcttcattgcaattgaagcatactatatcc 18405130  T
Q  109 gtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccac 208  Q
      | | ||||| |||||||   ||||||| ||||||||||| || | |||| |||| |  ||| |||| ||  | || ||||||||||||||||||||||    
T  18405129 tcatgtttgcactcagctagtgcatgacccttcttaccacagcgaaaacacctcttaacatccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcaccac 18405030  T
Q  209 aattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagc 287  Q
    || ||||||| ||||||| |||   |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  | ||||| || ||||||||    
T  18405029 aagtgaaacagacaatctttgcaggagcatccttcttgttaggccgcctatcttcgaccattctctgtttgcccttatcagc 18404948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 184 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 10465958 - 10465696
Alignment:
Q  184 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccat 280  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||| ||||   ||||  || |||| |||| |||| ||||   ||| || || || || |    
T  10465958 ttgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacagacaatctcagcaggaacatctctcctcttgggcctcctatcatcattcattttctgctttccct 10465859  T
Q  281 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagat 380  Q
    | |||||  | ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||  |||||||| ||||| || || || || ||||| ||    
T  10465858 tgtcagcaagagcattgtaaggcttaggacgactctgctgtcccttacccctcctctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtgtcttcctcatatat 10465759  T
Q  381 cctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgat 443  Q
    |||||||||  | ||||| || |  |||||||| | ||  |||||||| || |||||||||||    
T  10465758 cctgcagctgctcaccaactcagagaaaactctaatcttctgataccctatagccctcttgat 10465696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 187 - 398
Target Start/End: Original strand, 24367574 - 24367788
Alignment:
Q  187 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgca---gcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattat 283  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||  ||   |||||  || |||| |||| |||| ||||  ||||||| || || || || |    
T  24367574 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacatgagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgt 24367673  T
Q  284 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 383  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || |||| |||||| ||    
T  24367674 cagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttgatagattct 24367773  T
Q  384 gcagctattaaccaa 398  Q
     || || ||||||||    
T  24367774 acacctgttaaccaa 24367788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 283 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 21566999 - 21566893
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| |||  |||||||| ||||| || | ||| || |||||||| |    
T  21566999 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttactcctccgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgaatcttcctcatagattc 21566900  T
Q  383 tgcagct 389  Q
    | |||||    
T  21566899 tacagct 21566893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 269 - 389
Target Start/End: Original strand, 19456282 - 19456402
Alignment:
Q  269 tttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatc 368  Q
    ||||||| || || ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||  | |  ||| |||| | |||||| |||||||| |||||    
T  19456282 tttgttttcctttgtcagcaggagcactatatggtttaggacgactctgttgtcccttacctctgcgttcactcaccagcttgtaatgagccttagtatc 19456381  T
Q  369 ctcttcatagatcctgcagct 389  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  19456382 ctcttcatatatcctgcagct 19456402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 269 - 389
Target Start/End: Original strand, 19466427 - 19466547
Alignment:
Q  269 tttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatc 368  Q
    ||||||| || || ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||  | |  ||| |||| | |||||| |||||||| |||||    
T  19466427 tttgttttcctttgtcagcaggagcactatatggtttaggacgactctgttgtcccttacctctgcgttcactcaccagcttgtaatgagccttagtatc 19466526  T
Q  369 ctcttcatagatcctgcagct 389  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  19466527 ctcttcatatatcctgcagct 19466547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 386
Target Start/End: Original strand, 18660189 - 18660295
Alignment:
Q  280 ttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcataga 379  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || || | |||||| ||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  18660189 ttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactttgctgactcttacctttcctctcactcacagccttgtaatgagctttcgtatcctcctcataga 18660288  T
Q  380 tcctgca 386  Q
    | |||||    
T  18660289 ttctgca 18660295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 390
Target Start/End: Original strand, 19881670 - 19881776
Alignment:
Q  284 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 383  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||  ||| |||  |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| ||    
T  19881670 cagcaggggcgctgtacggcttaggacgactttgttgttccttgcccctccgttcactcatcaccttgtaatgagcctttgaatcttcttcatagattct 19881769  T
Q  384 gcagcta 390  Q
    |||||||    
T  19881770 gcagcta 19881776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 292 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 34642584 - 34642486
Alignment:
Q  292 gcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagcta 390  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| |||  |||||||| |||||| | | ||| ||||||||||| |||||||||    
T  34642584 gcactatacggcttaggacgactctgttgtcccttgcccctccgttcactcatcaccttgtaatgagcccttgaatcttcttcatagattctgcagcta 34642486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 270 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 18182409 - 18182293
Alignment:
Q  270 ttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcc 369  Q
    ||||||| | |||||||| || |||| ||| ||||||||| ||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||    
T  18182409 ttgtttctccttatcagcaggagcacggtaaggcttaggatgactctgctgacctttacctttcctctcattcacaaccttctaatgagccttagtatcc 18182310  T
Q  370 tcttcatagatcctgca 386  Q
     | ||||| || |||||    
T  18182309 gcctcataaattctgca 18182293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 19867675 - 19867823
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||| ||||| ||||||| |||| |||||  ||||||| || | |||| |||||||| ||||||| || |||||||    
T  19867675 tgagtaccagtcaaagcgaaaactctactagtagtcggcgccttcttaggctgcttacactgcgaaccaatgtgaccctcttcattgcaattgaagcaca 19867774  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccaca 149  Q
    |||| ||  || | ||||| |||||||   ||||||| |||||||||||    
T  19867775 caatatcattatgtttgcactcagctagtgcatgacccttcttaccaca 19867823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 14376924 - 14376809
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| | | | |  ||| |||  |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  14376924 tcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttgctccttcgatcactcatcaccttgtaatgagctttcgtgtcctcctcatagatcc 14376825  T
Q  383 tgcagctattaaccaa 398  Q
    |||||||| |||||||    
T  14376824 tgcagctactaaccaa 14376809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 187 - 386
Target Start/End: Original strand, 23081597 - 23081799
Alignment:
Q  187 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatct-tttgtttcccatta 282  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||  |||   |||| |||||| ||||||||||  |||| |  | || |||| || || |||    
T  23081597 ctcttgtggcctttctcaccacaagtataacaaacaatctcaacaggagcatctttcttcctaggccgcctctcatc-attaactctttgctttccttta 23081695  T
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| |  |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||  | |||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| || |    
T  23081696 tcagcagcagcactgtaaggctttggacgactctgctgacctttgactttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatcctcctcataaattc 23081795  T
Q  383 tgca 386  Q
    ||||    
T  23081796 tgca 23081799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 16924924 - 16924872
Alignment:
Q  10 gtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactg 62  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  16924924 gtcaaagcaaaaactctaccagtagtcggcgccttcttaggctgagtacactg 16924872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 10466098 - 10466035
Alignment:
Q  44 tcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtc 107  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||  |||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  10466098 tcttcggctgagtacactgtgaactaatatgaccttcttcattgcagttatagcagacaatgtc 10466035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 304 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 18404923 - 18404841
Alignment:
Q  304 ttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 386  Q
    ||||| ||||||||||| || ||| |||| | ||||||||| | |||||| |||| ||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  18404923 ttagggcgactctgttgacctttagcctttcactcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcctcctcataaatcctgca 18404841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 187 - 227
Target Start/End: Original strand, 21474774 - 21474814
Alignment:
Q  187 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctc 227  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  21474774 ctcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatctc 21474814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 362; Significance: 0; HSPs: 35)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 19775681 - 19775236
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19775681 tgagtcccagtcaaagcgaaaaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaca 19775582  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19775581 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcaggcgttgctcttgtggccttt 19775482  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||    
T  19775481 ctcaccacaattgaatcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgggggcactgtac 19775382  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19775381 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagattctgcagctattaaccaaat 19775282  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19775281 cctgaaaaactctcagctgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 19775236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 12479724 - 12480169
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |    
T  12479724 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaa 12479823  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12479824 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttatggccttt 12479923  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  12479924 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcctcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtac 12480023  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12480024 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaaccaaat 12480123  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  12480124 cctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttaatgtc 12480169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 23958871 - 23959316
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  23958871 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaca 23958970  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23958971 caatatctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcaggcgttgctcttgtggccttt 23959070  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||    
T  23959071 ctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgggggcactgtac 23959170  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  23959171 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagattctgcagctattaaccaaat 23959270  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  23959271 cctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttaatgtc 23959316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 17092037 - 17091592
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||| |    
T  17092037 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaaa 17091938  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17091937 caatgtctgtacggttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 17091838  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  17091837 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtac 17091738  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17091737 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctgttaaccaaat 17091638  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||    
T  17091637 cctgaaaaactctcagctgctggtatccaatcgccctcttgatgtc 17091592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 8050511 - 8050066
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  8050511 tgagtaccagtcaaagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaca 8050412  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8050411 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccgaacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccctt 8050312  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  8050311 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccctcttcttaggccgtctcacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtac 8050212  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8050211 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaaat 8050112  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8050111 cctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 8050066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 27714460 - 27714905
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  27714460 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttagactgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaca 27714559  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27714560 caatgtccgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcaggcgttgctcttgtggccttt 27714659  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||    
T  27714660 ctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgggggcactgtac 27714759  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27714760 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagattctgcagctattaaccaaat 27714859  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||    
T  27714860 cctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 27714905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 14300867 - 14300422
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  || |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |    
T  14300867 tgagtaccagtcaaagcaaagactctacctgtagtcggcgccctcttaggctgagtacactatgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaa 14300768  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  14300767 caatgtccgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcaaggcagacgttgcttttgtggccttt 14300668  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  14300667 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtac 14300568  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14300567 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaaat 14300468  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    |  |||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  14300467 cttgaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 14300422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 16233880 - 16233435
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |    
T  16233880 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaa 16233781  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  16233780 caatgtctgtacggttgcaatcagccaccacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggccttt 16233681  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  16233680 ctcaccacaattgaagtacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttccctttgtcagcgggggcactgtac 16233581  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16233580 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcttcttcgtagatcctgcagctattaaccaaat 16233481  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||    
T  16233480 cctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 16233435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 8389536 - 8389981
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||| |    
T  8389536 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgggtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaaa 8389635  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  8389636 caatgtctgtacggttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggccttt 8389735  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||    
T  8389736 ctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttctgtttacccttgtcagcgggggcactgtac 8389835  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8389836 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctgttaaccaaat 8389935  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||    
T  8389936 cctgaaaaactctcagctgctggtatccaatcgccctcttgatgtc 8389981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 19635260 - 19635705
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  19635260 tgagtaccagtcaaagcaaagactctaccagtagtcggcgccttcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacaca 19635359  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||    
T  19635360 caatgtccgtacgcttgcattcagctacaatatgacctttcttgccacaccgaacacacttcttgatttcttcagggcatacattgcttttgtggccttt 19635459  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19635460 cccaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcgggggcactgtac 19635559  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19635560 ggcttaggacaactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcaactattaaccaaat 19635659  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19635660 ccggaaaaactctcagttgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 19635705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 7 - 446
Target Start/End: Original strand, 40476170 - 40476609
Alignment:
Q  7 ccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  40476170 ccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggccgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcagttaaaacacacaatgt 40476269  T
Q  107 ctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcacc 206  Q
    | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  40476270 ccgtacgcttgcattcagctacaatatgacctttcttgccacactgaacacacttcttgatttcttcagggcagacgttgcttttgtggcctttcccacc 40476369  T
Q  207 acaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggctta 306  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  40476370 acaattgaaacacacaatctcagtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggctta 40476469  T
Q  307 ggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaa 406  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  40476470 ggacgactccgctgtcccttgcccttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaaatcctgaa 40476569  T
Q  407 aaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40476570 aaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 40476609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 14683691 - 14684136
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  || |||||  | |||||| ||||||||||||| ||||    
T  14683691 tgagtaccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactatgaactaatatgtccctcttcattgcagttaaaacaca 14683790  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| | ||| |||||||||||    
T  14683791 caatgtccttacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttgatctcttcaggacagacatagcttttgtggccttt 14683890  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||     
T  14683891 cccaccacaattgaaacacacaatctcggtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcaggggcactgtat 14683990  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  14683991 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttagtatcctcttcatagatcctgcaactattgaccaaat 14684090  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    | ||||||||||| | |||||| || |||||||||||||| |||||    
T  14684091 ctggaaaaactctaatctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 14684136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 74 - 440
Target Start/End: Original strand, 13513547 - 13513916
Alignment:
Q  74 gaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctc 173  Q
    |||||||| |||| || || ||||||||||| ||  | || ||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  13513547 gaccctcttcattacaattgaagcacacaatatcatttcgcttgcaatcagctataatatgacccttcttgccacaccggacacatttcttgatctcttc 13513646  T
Q  174 agggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttt 270  Q
    ||| || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |     
T  13513647 aggacaaacattgctcttgtggcctttctcgccacagttgaaacagacaatctctgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcaaccattctc 13513746  T
Q  271 tgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcct 370  Q
    || || || |||||| | |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||   |||||||||||| || |||||||| |||||  | |||||||    
T  13513747 tgcttgcccttatcaacaggggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttggtcttcctctcattaacaaccttgtaatgagctctggtatcct 13513846  T
Q  371 cttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctctt 440  Q
    | |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||  | |||||| || || |||||||||||    
T  13513847 cctcatagattctgcagctattcaccaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctctt 13513916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 94 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 18604614 - 18604259
Alignment:
Q  94 aagcacacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgt 193  Q
    ||||||||||| ||  | || |||||||||||||||| | |||| || || |||||||||||||| |||||||| || ||||| || || || |||||||    
T  18604614 aagcacacaatatcatttcgcttgcaatcagctacaataagaccctttttgccacaccggacacatttcttgatctcttcaggacaaacattactcttgt 18604515  T
Q  194 ggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctc---tgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcggg 290  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| | ||||||    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | || || || |||||||| ||    
T  18604514 ggcctttctcgccacagttaaaacaaataatctccgaaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgcttgcccttatcagcagg 18604415  T
Q  291 ggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagcta 390  Q
    |||| | || |||||||| |||||||| || ||||||  |||||||||||| || |||||||| |||||  | |||||||||||||||||||| |||||     
T  18604414 ggcattataaggcttagggcgactctgctggcccttagtcttcctctcattaacaaccttgtaatgagctatggtatcctcttcatagatcctacagctg 18604315  T
Q  391 ttaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||| || |||||||  |  ||||| || || |||||||||||||||||    
T  18604314 ttcaccaaatcagggaaaactcggagttgttggtatccgatcgccctcttgatgtc 18604259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 187 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 16248378 - 16248122
Alignment:
Q  187 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctc---tgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattat 283  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||   || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||  || ||||    
T  16248378 ctcttgtggcctttctcaccataattgaaacatgtaatctcagttggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgttggcccttat 16248279  T
Q  284 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 383  Q
    |||| |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||  ||||  ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||    
T  16248278 cagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttctgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcctccttatagatcct 16248179  T
Q  384 gcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctctt 440  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||  | |||||| || |  |||||||||||    
T  16248178 gcagctattaaccaaatcagggaaaactcggatctgttggtatctgatcgccctctt 16248122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 18224236 - 18223948
Alignment:
Q  126 tacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatc 225  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| || || || | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  18224236 tacaatatgacccttcttgccacaccggacacatttcttgatctcttcaggacaaacattacacttgtggcctttctcgccacagttgaaacaaacaatc 18224137  T
Q  226 tctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtc 322  Q
    || ||||   ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  | ||||| || |||||| | |||||||| || |||||||| |||||||| || |    
T  18224136 tccgcaggagcatccttcttcttaggccgtctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcaacaggggcactataaggcttagggcgactctgctggc 18224037  T
Q  323 ccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaact 411  Q
    ||||   ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||    
T  18224036 ccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcttcctcgtagattctgcagctattcactaaatcagggaaaact 18223948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 184 - 446
Target Start/End: Original strand, 7357574 - 7357839
Alignment:
Q  184 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccat 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||   ||||  || |||| |||| |||| ||||  ||||||| || || || |    
T  7357574 ttgctcttgtggcctttctcaccactcttgtaacaaacaatctcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctt 7357673  T
Q  281 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagat 380  Q
    | ||||| || ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||| |||||||| || || |||||||| ||    
T  7357674 tgtcagcaggagcaatgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagccttggtgtcttcttcataaat 7357773  T
Q  381 cctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    ||| || || |||||||| || | ||| ||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||    
T  7357774 cctacacctgttaaccaactcagaaaagactctgatctgttgatacccaatagctcttttgatgtc 7357839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 231 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 16350397 - 16350188
Alignment:
Q  231 agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttaccc 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||  |    
T  16350397 agcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtc 16350298  T
Q  331 ttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaa 430  Q
    |||| |||||| || |||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || ||| | || |||||||| ||||||||||  | |||||| || ||||    
T  16350297 ttccgctcatttacaaccttgtaatgagctttggtgtcctcctcatagattctacagttgttcaccaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatccaa 16350198  T
Q  431 tcgccctctt 440  Q
    | ||||||||    
T  16350197 ttgccctctt 16350188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 187 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 3261756 - 3261494
Alignment:
Q  187 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattat 283  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||  |||   ||||  || |||| |||| |||| ||||  ||||||| || || || || |    
T  3261756 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgt 3261657  T
Q  284 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 383  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || ||||||||||| ||    
T  3261656 cagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcatagattct 3261557  T
Q  384 gcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    ||| ||||||||||| || |  || ||||| | ||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  3261556 gcacctattaaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagctcttttgatgtc 3261494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 245 - 386
Target Start/End: Original strand, 14162841 - 14162982
Alignment:
Q  245 taggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcac 344  Q
    |||| |||||| | ||||||||  | ||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||   || |||||    
T  14162841 tagggcgcctatcctcgaccattctctgtttacccttatcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgttgtcccttaactttctgttcgttcac 14162940  T
Q  345 taccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 386  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  14162941 aaccttgtagtgagccttagtatccttttcataaatcctgca 14162982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 187 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 29450499 - 29450237
Alignment:
Q  187 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattat 283  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||  |||   ||||  || ||||||||| |||| ||||  ||||||| || || || || |    
T  29450499 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttaggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgt 29450400  T
Q  284 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 383  Q
    |||| || |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||  | ||| || ||||| || || || |||||||| ||  |    
T  29450399 cagcaggagcactgtaaggtttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgagctttggtgtcttcttcataaatttt 29450300  T
Q  384 gcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    ||| ||||||||||| || | ||| | ||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  29450299 gcacctattaaccaactcagaaaagattctgatctgttgatatccaatagcccttttgatgtc 29450237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 187 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 44658828 - 44658566
Alignment:
Q  187 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattat 283  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||  |||   ||||  || |||| |||| |||| |||   ||||||| || || || || |    
T  44658828 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatgacccatcttctgctttcctttgt 44658729  T
Q  284 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 383  Q
    | || || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || ||||||||||| ||    
T  44658728 ccgcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcatagattct 44658629  T
Q  384 gcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
     || || |||||||| || |  || ||||| | ||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  44658628 acacctgttaaccaactcagagaagactctgatctgctgatatccaatggctctcttgatgtc 44658566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 440
Target Start/End: Original strand, 20893338 - 20893597
Alignment:
Q  184 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccat 280  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||| |||| |||||||| | ||   ||||  || ||||||||| |||| ||||   |||||| || || || |    
T  20893338 ttgctcttgttgcctttttcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttaggcctcctatcatcattcatcttctgctttcctt 20893437  T
Q  281 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagat 380  Q
    | ||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || ||||  || ||    
T  20893438 tgtcagcaggagcactttaaggcttaggacgactctgctgtcccttgcccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttctttgtaaat 20893537  T
Q  381 cctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctctt 440  Q
    |||||| || || ||||| || | ||| ||||| | ||| ||||||||||| || |||||    
T  20893538 cctgcaactgtttaccaactcagaaaagactctgatctgctgatacccaatagctctctt 20893597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 15144780 - 15144627
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||| ||| |  ||||||| || | |||| |||||||| |||| ||||| |||||||    
T  15144780 tgagtaccagtcaaagcgaaaaccctaccagtagtcggcgccttcttaggcagcttacactgcgaaccaatgtgaccctcttcattacagttgaagcaca 15144681  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccgga 154  Q
    |||| ||  || | ||||| |||||||   |||| || ||||||||||| ||||    
T  15144680 caatatcattatgtttgcactcagctagtgcatggcccttcttaccacatcgga 15144627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 16250665 - 16250572
Alignment:
Q  74 gaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgat 167  Q
    |||||||| |||| || || ||||||||||| ||  |||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16250665 gaccctcttcattacaattgaagcacacaatatcattacgcttgcaatcaactacaatatgacccttcttgccacaccggacacatttcttgat 16250572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 283 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 14993230 - 14993112
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||  | | |||| |||  |||||||| ||||| ||| ||||||||||||| || |    
T  14993230 tcagcaggggcactatacggcttcagacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttcatatcctcttcataaattc 14993131  T
Q  383 tgcagctattaaccaaatc 401  Q
    |||| ||| | ||||||||    
T  14993130 tgcaactacttaccaaatc 14993112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 386
Target Start/End: Original strand, 8346 - 8548
Alignment:
Q  187 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattat 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  | || ||||||||  |||   |||| |||||  |||| |||||  |||| |||||  | ||||| || ||||    
T  8346 ctcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatctcaacaggagcatctttctttatagggcgcctctcatcaaccattctctgtttacccttat 8445  T
Q  284 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 383  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||||||||| || || ||  | || | ||||||||| | |||||| |||| ||| |||||||| ||||| || ||    
T  8446 cagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgacctttggcttttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcctcctcataaattct 8545  T
Q  384 gca 386  Q
    |||    
T  8546 gca 8548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 372
Target Start/End: Original strand, 14697507 - 14697599
Alignment:
Q  280 ttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctct 372  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||    
T  14697507 ttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactttgctgacccttgcctttcctctcattcacaactttgtaatgagctttggtatcctct 14697599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 283 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 11204095 - 11203932
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || |||||||| || |    
T  11204095 tcagcaggagcactataaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcataaattc 11203996  T
Q  383 tgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    | || || || ||||| || |  || ||||| | ||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  11203995 tacatctgtttaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagctcttttgatgtc 11203932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 401
Target Start/End: Original strand, 15073768 - 15073886
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| || ||||| ||||| || ||||||||| | |||||||||||  | | |||| |||  ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||    
T  15073768 tcagcaggagcactatacggtttcggacgactcagctgtcccttacctctacgctcactcatcaccttataatgagcttttgtatcctcttcatagatcc 15073867  T
Q  383 tgcagctattaaccaaatc 401  Q
    | |||||| | ||||||||    
T  15073868 tacagctactcaccaaatc 15073886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 389
Target Start/End: Original strand, 16219583 - 16219703
Alignment:
Q  269 tttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatc 368  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | || || || |  |||||||||||||| | ||| || ||| ||||||||||    
T  16219583 tttgttttcccttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactcggctgacctttgcttttcctctcattcacaatcttataatgatccttcgtatc 16219682  T
Q  369 ctcttcatagatcctgcagct 389  Q
     ||  ||||||| ||||||||    
T  16219683 ttccacatagattctgcagct 16219703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 389
Target Start/End: Original strand, 16222903 - 16223023
Alignment:
Q  269 tttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatc 368  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | || || || |  |||||||||||||| | ||| || ||| ||||||||||    
T  16222903 tttgttttcccttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactcggctgacctttgcttttcctctcattcacaatcttataatgatccttcgtatc 16223002  T
Q  369 ctcttcatagatcctgcagct 389  Q
     ||  ||||||| ||||||||    
T  16223003 ttccacatagattctgcagct 16223023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 127
Target Start/End: Original strand, 7357434 - 7357517
Alignment:
Q  44 tcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtctgtacgattgcaatcagcta 127  Q
    ||||||||| || |||||| || |||||  |||||||||||||||||||  |||| |||||||||  ||| ||||| |||||||    
T  7357434 tcttcggctcaggacactgtgaactaatatgaccctctccattgcagttgtagcagacaatgtctccacgcttgcattcagcta 7357517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 283 - 390
Target Start/End: Original strand, 18259850 - 18259957
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||| ||| | | |||| |||  |||||||| ||||  || ||||| |||||||||||||    
T  18259850 tcagcaggagcactatacggcttcggatgactctgctgtcccttgcccctacgctcactcatcaccttgtaatgagattttgtatcttcttcatagatcc 18259949  T
Q  383 tgcagcta 390  Q
    || |||||    
T  18259950 tgtagcta 18259957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 187 - 227
Target Start/End: Original strand, 15073669 - 15073709
Alignment:
Q  187 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctc 227  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  15073669 ctcttgtggcctttttcaccacacttgaaacagacaatctc 15073709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 362; Significance: 0; HSPs: 32)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 9338337 - 9338782
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||| |    
T  9338337 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaaa 9338436  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9338437 caatgtctgtacggttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 9338536  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  9338537 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtac 9338636  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  9338637 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctattaaccaagt 9338736  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  9338737 cctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 9338782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 9486971 - 9487416
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||| |    
T  9486971 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaaa 9487070  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9487071 caatgtctgtacggttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 9487170  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  9487171 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtac 9487270  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  9487271 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctattaaccaagt 9487370  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  9487371 cctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 9487416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 24712789 - 24713234
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  24712789 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaca 24712888  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24712889 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggccttt 24712988  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||    
T  24712989 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgggggcactgtac 24713088  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24713089 ggcttaggacgactctgctgtcccttgccctttctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 24713188  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||    
T  24713189 cctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 24713234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 22323030 - 22322585
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22323030 tgagtcccagtcaaagcaaagatcctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaca 22322931  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22322930 caatgtctgtacgattgcaatcagctataacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggccttt 22322831  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||    
T  22322830 ctcaccacaattgaaacacacaatctccgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgggggcactgtac 22322731  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22322730 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 22322631  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||    
T  22322630 cctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 22322585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 10871605 - 10872050
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||  || |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |    
T  10871605 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgggtacactatgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaa 10871704  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10871705 caatgtctgtgcgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggccttt 10871804  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  10871805 ctcaccacaattgaaacacacaagctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtac 10871904  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10871905 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcttcgtagatcctgcagctattaaccaaat 10872004  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||    
T  10872005 cctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 10872050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 16983995 - 16984440
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||| |    
T  16983995 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaaa 16984094  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16984095 caatgtctgtacggttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 16984194  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  16984195 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcattcttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtac 16984294  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16984295 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctgttaaccaaat 16984394  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||    
T  16984395 cctgaaaaactctcagctgctggtatccaatcgccctcttgatgtc 16984440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 24265125 - 24265570
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  24265125 tgagtaccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaca 24265224  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24265225 caacgtccgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggccttt 24265324  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  24265325 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttatcagcaggggcactgtac 24265424  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  24265425 ggcttaggacgactctgctgtcccttgccctttctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaaccaagt 24265524  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24265525 ctgaaaaaactctcagctgttgatacccaatcgccctcttaatgtc 24265570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 44383258 - 44382813
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  44383258 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctacccgtagtcagcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaca 44383159  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  44383158 caacgtccgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcaggcattgctcttgtggccttt 44383059  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  44383058 ctcaccacaattgaagcacacaatctctgcaacatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccccttgtcagcgggggcactgtac 44382959  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44382958 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctgttaaccaaat 44382859  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44382858 ctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 44382813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 27374024 - 27374469
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |    
T  27374024 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaa 27374123  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  27374124 caatgtctgtacgattgcaatcagctaccacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggccttt 27374223  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  27374224 ctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtac 27374323  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27374324 ggcttaggacgactctgcagtcccttgcccttcctttcattcactaccttatagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaaccaaat 27374423  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||    
T  27374424 cctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 27374469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 17001755 - 17002200
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  || |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |    
T  17001755 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactatgaactaatgtgaccctctccgttgcaattaaagcaaa 17001854  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  17001855 caatgtctgtacggttgcaatcagccaccacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggccttt 17001954  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  17001955 ctcgccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgttttcctttatcagcaggggcactgtac 17002054  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  17002055 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctattaaccaagt 17002154  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||    
T  17002155 cctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 17002200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 24874438 - 24873993
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  24874438 tgagtaccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcagcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatttgaccctctccattgcagttaaaacaca 24874339  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  24874338 caatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacctttcttgccacaccggacacatttcttaatttcttcatggcagacattgcttttgtggccttt 24874239  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  24874238 cccaccacagttgaaacacacaatctcagtaacatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcaggggcactgtac 24874139  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  24874138 ggcttagaacgactctgccgtcccttgcccttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcaactatttaccaaat 24874039  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24874038 ctggaaaaactctaagctgttgatacccaatcgcccttttgatgtc 24873993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 21139669 - 21139392
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21139669 tgagtaccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctattaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacaca 21139570  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||  |||||||| || ||| | ||||| ||||| |||||||||||    
T  21139569 caatgtcttcacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacggttcttgatctcttcacgacagacattgcttttgtggccttt 21139470  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttccc 278  Q
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  21139469 tccaccacaattgaaacacacaatctctgtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccc 21139392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 23116718 - 23116299
Alignment:
Q  30 agtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtctgtacgattgcaatcagctaca 129  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||  || | ||||||||||||||     
T  23116718 agtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctcttcattgcagttaaaacacacaatgtccttatgcttgcaatcagctacg 23116619  T
Q  130 acatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctct- 228  Q
    | ||||||  |||| | |||||||||||| |||||||| || ||||| || || || ||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||     
T  23116618 atatgacccctcttgctacaccggacacatttcttgatctcttcaggacaaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaacaatctctg 23116519  T
Q  229 --gcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtccctt 326  Q
      | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | || || || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |  |||||    
T  23116518 aaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgcttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgcttgccctt 23116419  T
Q  327 acccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatac 426  Q
    |  |||||||||||| || |||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||  |  ||||| ||     
T  23116418 agtcttcctctcattaacaaccttgtaatgagctctggtatcctcttcgtagatcctacagctgttcactaaatcagggaaaactcggagttgttggtat 23116319  T
Q  427 ccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||||||||    
T  23116318 ccgatcgccctcttgatgtc 23116299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 24705170 - 24704758
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||| |||||  | |||||||| |  ||| |||||||| |||| || || |||||||    
T  24705170 tgagtaccagtcaaagcaaaaaccctactagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactgagaacctatgtgaccctcttcattacaattgaagcaca 24705071  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||| |   ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| |  |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  24705070 caatgtcattacgcttgcaatcagctaaagtgtgacccttcttgccacactggaaacatttctttacctcctcaggacaaacattgctcttgtggccttt 24704971  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactg 297  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||   |||||||||||||||| || ||  | ||||||||| | ||||| || |||||||| ||||||||     
T  24704970 ctcaccacaattgaaacagataatctcagcaggaacatccttcttcttaggtcgtctttcctcgaccatcctatgtttgcccttatcagcaggggcacta 24704871  T
Q  298 tacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaacca 397  Q
    || |||||||| |||||||| || ||||||  ||||  ||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  24704870 tagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttctgctcattcacaaccttgtaatgagccctggtatcctcctcatagattctacagctattcacca 24704771  T
Q  398 aatccggaaaaac 410  Q
    |||| ||||||||    
T  24704770 aatctggaaaaac 24704758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 22463133 - 22462721
Alignment:
Q  37 ggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgac 136  Q
    |||||||||||||||||  | || || || | |||  |||||||| | ||||| || ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||| | |||||    
T  22463133 ggcgccctcttcggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcgttgcaattgaagcacacaatatcattacgcttgcaatcagctacgatatgac 22463034  T
Q  137 ctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agc 233  Q
    | ||||| |||||| ||||||| |||||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||   |||    
T  22463033 ccttcttgccacactggacacatttcttgatctcttcaggacaaacattactcttgtggcctttctcaccacagttgaaacaaacaatctccgcaggagc 22462934  T
Q  234 atccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttc 333  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | ||||  || |||| ||  |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||   ||||    
T  22462933 atccttcttcttaggccacctatcatcgaccattctctgttcgcccttattagaaggggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttggtcttc 22462834  T
Q  334 ctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcg 433  Q
    | |||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| |  |||||||  |  ||||| || |  ||||    
T  22462833 cgctcatttacaaccttgtaatgagcctttgtatcttcctcgtagattctgcagctattcactaaatcagcgaaaactcggatttgttggtatctgatcg 22462734  T
Q  434 ccctcttgatgtc 446  Q
    |||||||||||||    
T  22462733 ccctcttgatgtc 22462721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 443
Target Start/End: Original strand, 24678248 - 24678687
Alignment:
Q  7 ccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgt 106  Q
    ||||||||||| || || |||||||||| ||||||| |||| |||||  | |||||||| |  ||| ||| |||| || |||| || |||||||||||||    
T  24678248 ccagtcaaagcgaaaactctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactgagaacctatgtgactctcttcaatgcaattgaagcacacaatgt 24678347  T
Q  107 ctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcacc 206  Q
    |  |||| ||||| |||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||  |||| |  ||  | || ||  | |||||||||||||||||||||||    
T  24678348 cattacgcttgcactcagctagtgcatgacccttcttaccacaacggaaacatctcttaacctctcccggacaagcattgctcttgtggcctttctcacc 24678447  T
Q  207 acaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggc 303  Q
    |||||| || || |||||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||| || |||||||| ||||| || || |||    
T  24678448 acaattaaagcagacaatctcagcaggaacatccttcttcttaggccgtctatcatcgaccatcctctgtttgcccttatcagcaggggcgctatagggc 24678547  T
Q  304 ttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccg 403  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||  ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||      
T  24678548 ttagggcgactctattggcccttagtcttccgctcattcacgatcttgtaatgagccttggtatcctcgtcataaattctgcaactgttcaccaactcgc 24678647  T
Q  404 gaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgat 443  Q
     ||||||||  | || ||| || ||||| |||||||||||    
T  24678648 aaaaaactcggatctattggtatccaattgccctcttgat 24678687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 133 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 24657214 - 24656898
Alignment:
Q  133 tgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag 232  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |  |||||||| || ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  24657214 tgacccttcttgccacaccggaaacacttcttcacctcctcaggacaaacagtactcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagcag 24657115  T
Q  233 ---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacc 329  Q
       ||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||| | ||||| || |||||||  |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||      
T  24657114 gaacatcctttttcttaggccgtctctcctcgaccatcctctgtttgcccttatcagtaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagt 24657015  T
Q  330 cttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgataccca 429  Q
    ||||| |||||| || |||||||| |||||  | || ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||  | |||||| || ||     
T  24657014 cttccgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcctcctcatagattctgcagctattcatcaaatctggaaaaactcggatctgttggtatccg 24656915  T
Q  430 atcgccctcttgatgtc 446  Q
    ||||||||||| |||||    
T  24656914 atcgccctcttaatgtc 24656898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 23029149 - 23028771
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||||||| ||||||| |||| || ||  | |||||||| | |||| |||||||| ||||||| || |||||||    
T  23029149 tgagtaccagtcaaagcgaaaactctaccagtagtcggcgccttcttaggttgcttgcactgagaaccaatgtgaccctcttcattgcaattgaagcaca 23029050  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    |||| ||  || | |||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||  |||| |  ||  |||| ||  | |||||||||||||||||    
T  23029049 caatatcattatgtttgcaatcagctagtgcatgacccttcttaccacatcggaaacatctctttacctctccaggacaagcattgctcttgtggccttt 23028950  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactg 297  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||| ||||   ||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||| | ||||| || |||||||| ||||||||     
T  23028949 ctcaccacaata-aaacagacaatctcagcaggagcatccttcttccttggccgtctatcctcgaccatcctctgtttgcccttatcagcaggggcacta 23028851  T
Q  298 tacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcata 377  Q
    || |||||||| |||||||| || || |||   |||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  23028850 tagggcttagggcgactctgctggcctttagtattccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcata 23028771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 22742654 - 22742266
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| ||||||||||| || ||  ||||||||| ||||||| |||| |||||  ||||||| || | |||| |||||||| ||||||| || |||||||    
T  22742654 tgagtaccagtcaaagcgaaaactttaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttacactgcgaaccaatgtgaccctcttcattgcaattgaagcaca 22742555  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    |||||||  || | ||||| |||||||   ||||||| |||||||| || |||| |||  | || |  ||  | || ||  | ||||||||||||| |||    
T  22742554 caatgtcattatgtttgcactcagctagtgcatgacccttcttaccgcatcggaaacatctatttacctctcccggacaagcattgctcttgtggcattt 22742455  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagca---tccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactg 297  Q
    |||||||||||| || || ||||||||  |||||   ||||||||| | ||||| ||| | || |||||  | ||||| || |||||||| ||||||||     
T  22742454 ctcaccacaattaaagcagacaatctcaccagcaacatccttcttcctcggccgtctatcctcaaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcacta 22742355  T
Q  298 tacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 386  Q
    || |||||||| |||||||| || ||||||  ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  22742354 taaggcttagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacgaccttgtaatgagccttggtatcctcttcgtaaatcctgca 22742266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 289 - 389
Target Start/End: Original strand, 16931598 - 16931698
Alignment:
Q  289 ggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagc 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16931598 ggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagc 16931697  T
Q  389 t 389  Q
    |    
T  16931698 t 16931698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 184 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 21320508 - 21320292
Alignment:
Q  184 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccat 280  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||| || |    
T  21320508 ttgctcttgtggcctttctcgccacaattaaaacagacaatctcagcagggacatccttcttcttaggccgcctatcctcgaccattctttgtttgccct 21320409  T
Q  281 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagat 380  Q
    ||||||| ||||  || || |||||||| | |||||| || ||| ||  ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||||| || ||||| ||    
T  21320408 tatcagcaggggtgctataaggcttagggcaactctgctggcccctagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcatcctcataaat 21320309  T
Q  381 cctgcagctattaacca 397  Q
     ||||||||||| ||||    
T  21320308 tctgcagctattcacca 21320292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 187 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 23040079 - 23039877
Alignment:
Q  187 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattat 283  Q
    ||||||||||| ||||||||||||   ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| | ||||| || ||||    
T  23040079 ctcttgtggcccttctcaccacaagaaaaacagacaatctctgtaggagcatccttcttcttaggccgtctaccttcgaccatcctctgtttgcccttat 23039980  T
Q  284 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 383  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| || ||||||  ||||| ||||||||| | |||||| ||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  23039979 cagcaggggcactgtaaggcttagggagactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttaatatcctcctcgtagatcct 23039880  T
Q  384 gca 386  Q
    |||    
T  23039879 gca 23039877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 69 - 266
Target Start/End: Original strand, 23205137 - 23205337
Alignment:
Q  69 aatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatt 168  Q
    |||| |||||||| |||| || || ||||||||||| ||  | |  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||     
T  23205137 aatgtgaccctcttcattacaattgaagcacacaatatcatttctcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacactggacacatttcttgatc 23205236  T
Q  169 tcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctc---tgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgacca 265  Q
    || ||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23205237 tcttcaggacaaacattactcttgtggcctttctcgccacagttgaaacaaacaatctccgaaggagcattcttcttcttaggccgcctatcatcgacca 23205336  T
Q  266 t 266  Q
    |    
T  23205337 t 23205337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 69 - 266
Target Start/End: Original strand, 23676741 - 23676941
Alignment:
Q  69 aatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatt 168  Q
    |||| |||||||| |||| || || ||||||||||| ||  | |  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||     
T  23676741 aatgtgaccctcttcattacaattgaagcacacaatatcatttctcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacactggacacatttcttgatc 23676840  T
Q  169 tcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctc---tgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgacca 265  Q
    || ||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23676841 tcttcaggacaaacattactcttgtggcctttctcgccacagttgaaacaaacaatctccgaaggagcattcttcttcttaggccgcctatcatcgacca 23676940  T
Q  266 t 266  Q
    |    
T  23676941 t 23676941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 23105410 - 23105027
Alignment:
Q  7 ccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgacc-ctctccattgcagttaaagcacacaatg 105  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||| |||||  ||||||| || | |||| |||| |||| ||||||| || |||||||||||     
T  23105410 ccagtcaaagcaaaaactctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttacactgtgaaccaatgtgacctctcttcattgcaattgaagcacacaata 23105311  T
Q  106 tctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcac 205  Q
    ||   | | ||||| |||||||   ||||||| ||||| ||||| || | |||  ||||||  || | ||| ||  | || ||||||||||| |||||||    
T  23105310 tcatcatgtttgcactcagctagtgcatgacccttctttccacagcgaaaacatctcttgacgtcttaaggacaagcattactcttgtggcccttctcac 23105211  T
Q  206 cacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacgg 302  Q
    |||||  |||||| | |||||| ||||   ||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||  | ||||| || |||||||| || |||||||| ||    
T  23105210 cacaagagaaacaaataatctcagcaggagcatccttcttcctcggccgtctatcttcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggtgcactgtaagg 23105111  T
Q  303 cttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 386  Q
    |||||| || ||||| || ||||||  ||||  ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  23105110 cttagggcggctctgctggcccttagtcttctgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 23105027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 187 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 22733276 - 22733074
Alignment:
Q  187 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattat 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||| ||   ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||  | | ||| || ||||    
T  22733276 ctcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatttctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctctttgcccttat 22733177  T
Q  284 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 383  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||||  ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || || |||||    
T  22733176 cagcaggggcactgtaaagcttagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcct 22733077  T
Q  384 gca 386  Q
    |||    
T  22733076 gca 22733074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11351385 - 11351168
Alignment:
Q  15 agcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtctgtacga 114  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||  |  ||||||| | |||| |||||||| | ||||| || ||||||||||| ||  || |     
T  11351385 agcaaaaaccctaccagtagtcggcaccctcttaggctgcttggactgagaaccaatgtgaccctcttccttgcaattgaagcacacaatatcactatgc 11351286  T
Q  115 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 214  Q
    |||||||||||||    |||||| ||||| ||||||| || ||| ||||  |  ||||  || || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11351285 ttgcaatcagctaatgtatgacccttcttgccacaccagaaacatttctctacctcctttggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattga 11351186  T
Q  215 aacacacaatctctgcag 232  Q
    |||| |||||||| ||||    
T  11351185 aacagacaatctccgcag 11351168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 283 - 446
Target Start/End: Original strand, 20848626 - 20848789
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||  | ||| || ||||| || || || |||||||| || |    
T  20848626 tcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgagctttggtgtcttcttcataaattc 20848725  T
Q  383 tgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    |||| || |||||||| || | ||| | ||| | ||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  20848726 tgcacctgttaaccaactcagaaaagattctgatctgttgatatccaatagctctcttgatgtc 20848789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 283 - 389
Target Start/End: Original strand, 23274633 - 23274739
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| || ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||| | |  ||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23274633 tcagcaggagcactatactgcttcggacgactctgttgtcccttgcccctacgttcactcatcaccttgtaatgagccttcgtatcctcttcatagatcc 23274732  T
Q  383 tgcagct 389  Q
    | |||||    
T  23274733 tacagct 23274739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 297 - 443
Target Start/End: Original strand, 23029815 - 23029961
Alignment:
Q  297 gtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaacc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||| | |||    
T  23029815 gtacggcttaggacgactctgttgtcccctggtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtgtcctcctcataaatcctgcaactactcacc 23029914  T
Q  397 aaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgat 443  Q
    || || |  |||||||  | || ||| || ||||||||||| |||||    
T  23029915 aactcggagaaaactcgaatcttttggtaaccaatcgcccttttgat 23029961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 266
Target Start/End: Original strand, 23065353 - 23065436
Alignment:
Q  186 gctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccat 266  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| | |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  23065353 gctcttgtggcccttctcaccataagtaaaatagacaatctctgcaggaccatccttcttcttaggccgcctatcttcgaccat 23065436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 266
Target Start/End: Original strand, 23074803 - 23074886
Alignment:
Q  186 gctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccat 266  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||| | |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  23074803 gctcttgtggcccttctcaccataagtaaaatagacaatctctgcaggaccatccttcttcttaggccgcctatcttcgaccat 23074886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 350; Significance: 0; HSPs: 31)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 17671613 - 17671168
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  17671613 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagttggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaca 17671514  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  17671513 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccagacacacttcttgatttcctccgggcagacattgcttttgtggccttt 17671414  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||    
T  17671413 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgggggcactgtac 17671314  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17671313 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 17671214  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||    
T  17671213 cctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 17671168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 20015854 - 20015409
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  20015854 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaca 20015755  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  20015754 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttgccacaccgaacacacttcttgatttcctcagggcagacgttactcttgtggccctt 20015655  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20015654 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccctcttcttaggccgtctcacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtac 20015555  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  20015554 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcttcgtagatcctgcagctattgaccaaat 20015455  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  20015454 cctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 20015409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 19115590 - 19116035
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19115590 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctctttggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaca 19115689  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  19115690 caatgtctgtacgattgcaatcagccaccacatgacccttcttaccacaccggacgcacttcttgatttcctcaggacaggcgttgctcttgtggccttt 19115789  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  19115790 ctcgccacaattgaagcacacaacctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtac 19115889  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  19115890 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagctattaaccaagt 19115989  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||    
T  19115990 cctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 19116035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 19481663 - 19481219
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| || ||||||||||    
T  19481663 tgagtcccagtcaaagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgagaactaatgtgaccttctccattacaattaaagcaca 19481564  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  19481563 caatgtctgcacgattgcaatcagctacgacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagaacaggcgttgctcttgtggccttt 19481464  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||    
T  19481463 ctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacccttgtcagcgggggcactgtac 19481364  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  19481363 ggcttaggacgactctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtaagccttcgtatcctcttcataga-cctgcagctatgaaccaagt 19481265  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19481264 cctgaaaaactctcagctgttggtacccaagcgccctcttgatgtc 19481219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 18859767 - 18860212
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18859767 tgagtaccactcaaagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaaacaca 18859866  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||    
T  18859867 caatgtctgtacgcttgcattcagctacaatatgacctttcttgccacaccgaacacacttcttgatttcttcagggcatacattgcttttgtggccttt 18859966  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18859967 cccaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcccctgtttccctttatcagcgggggcactgtac 18860066  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18860067 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctacagctattaaccaaat 18860166  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18860167 ccggaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 18860212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 22126550 - 22126105
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  22126550 tgagtaccagtcaaagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgactttctccattgcagttaaaacaca 22126451  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  22126450 caatgtctgtacgcttgcattcagctacaatatgacctttcttgccacaccgaacacacttcttgatttcttcaaggaagacgttgcttttgtggccttt 22126351  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22126350 cccaccacaattgaaacacacaatctctgtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcgggggcactgtac 22126251  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22126250 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 22126151  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||| | |||||| || |||||||||||||| |||||    
T  22126150 cctgaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 22126105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 22117766 - 22117321
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  22117766 tgagtaccagtcaaagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacaca 22117667  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22117666 caatgtccgtacgcttgcattcagctacaatatgacctttcttgccacaccgaacacacttcttgatttcttcagggcagacgttgcttttgtggccttt 22117567  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  22117566 cccaccacgattgaaacacacaatctctatagcatccttattcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttccctttatcagtgggggcactgtac 22117467  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22117466 ggcttaggacgactttgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 22117367  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||| | |||||| || |||||||||||||| |||||    
T  22117366 cctgaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 22117321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 74 - 446
Target Start/End: Original strand, 22043090 - 22043465
Alignment:
Q  74 gaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctc 173  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||    
T  22043090 gaccctcttcattacagttgaagcacacaatatcattacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccgaacacatttcttgatctcttc 22043189  T
Q  174 agggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctc---tgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttt 270  Q
     || || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||   || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |     
T  22043190 tggacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagttggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctc 22043289  T
Q  271 tgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcct 370  Q
    ||||| || || ||||  |||||||| || ||||||||  ||||||| || |||||   ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  22043290 tgtttgcccttgtcagtaggggcactataaggcttagggtgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcct 22043389  T
Q  371 cttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||  | |||||| || || ||||||||||| |||||    
T  22043390 cctcataaatcctgcatctattaaccaaatcagggaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctcttaatgtc 22043465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 115 - 446
Target Start/End: Original strand, 32603449 - 32603783
Alignment:
Q  115 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 214  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| | || || || ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  32603449 ttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacatttcttgatctcttcaagacaaacattactcttgtggcctttcccaccacagttga 32603548  T
Q  215 aacacacaatctc---tgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacg 311  Q
    |||| ||||| ||    | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | || || || |||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  32603549 aacaaacaatttccgaaggagcatccttcttcttaggtcgcctatcatcgaccattctctgcttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcg 32603648  T
Q  312 actctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaact 411  Q
    |||||| || ||||||  |||||||||||| || |||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| || ||||||    
T  32603649 actctgctggcccttagtcttcctctcattaacaaccttgtaatgagctctggtatcctcttcgtagatcctacagctgttcaccaaatcagggaaaact 32603748  T
Q  412 ctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    |  |  |||||||| || |||||||||||||||||    
T  32603749 cggagttgttgatatccgatcgccctcttgatgtc 32603783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 37 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 30310699 - 30310287
Alignment:
Q  37 ggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgac 136  Q
    |||||| ||||||||||  |||| || || | |||  |||||||| | ||||| || ||||||||||| ||  | || |||||||||||||||| |||||    
T  30310699 ggcgccttcttcggctgcttacattgggaaccaatatgaccctcttcgttgcaattgaagcacacaatatcatttcgcttgcaatcagctacaatatgac 30310600  T
Q  137 ctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---c 233  Q
    | ||||| ||||||| |||||| |||||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||   |    
T  30310599 ccttcttgccacaccagacacatttcttgatctcttcaggacaaacattactcttgtggcctttctcgccacagttgaaacaaacaatatccgcaggagc 30310500  T
Q  234 atccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttc 333  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||  | ||||| || |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||| || |||||   ||||    
T  30310499 atccttcttctttggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactataaggtttagggcgactctgctgacccttggtcttc 30310400  T
Q  334 ctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcg 433  Q
    | ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||||||  |  ||||| || |  ||||    
T  30310399 cgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcctcctcgtagattctgcaactattcactaaatcagggaaaactcggagttgttggtatctgatcg 30310300  T
Q  434 ccctcttgatgtc 446  Q
    |||||||||||||    
T  30310299 ccctcttgatgtc 30310287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 446
Target Start/End: Original strand, 15536609 - 15537021
Alignment:
Q  37 ggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgac 136  Q
    |||||||||||||||||  | || || || | |||  |||||||| |||| || || ||||||||| | ||  | || |||||||||||||||| |||||    
T  15536609 ggcgccctcttcggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattacaattgaagcacacagtatcatttcgcttgcaatcagctacaatatgac 15536708  T
Q  137 ctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctc---tgcagc 233  Q
    | || || |||||||||||||| |||||||| || | ||| || || || |||||||||||||  || |||||||| ||||| | ||||||    | |||    
T  15536709 cctttttgccacaccggacacatttcttgatctctttaggacaaacattactcttgtggccttcttcgccacaattaaaacaaataatctccgaaggagc 15536808  T
Q  234 atccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttc 333  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | || || || ||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||   ||||    
T  15536809 atccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgcttgcccttatcggcaggggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttggtcttc 15536908  T
Q  334 ctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcg 433  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||||||  |||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||  |  ||||| || || ||||    
T  15536909 cgctcattcacaaccttgtaatgagccttactatcttcctcgtagatcctgcagctattcactaaatcagggaaaactcgaagttgttggtatccgatcg 15537008  T
Q  434 ccctcttgatgtc 446  Q
    |||||||||||||    
T  15537009 ccctcttgatgtc 15537021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 18881242 - 18880860
Alignment:
Q  7 ccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgt 106  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||   | ||||| || | |||| |||||||| |||| || || ||||| || || |    
T  18881242 ccagtcaaagcaaaaactctaccagtagccggcgccttcttaggcttcttgcactgtgaaccaatgtgaccctcttcattacaattgaagcatactatat 18881143  T
Q  107 ctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcacc 206  Q
    |   | | ||||| |||||||   ||||||| ||||| |||||  | | |||  ||||| | ||| |||| ||  | || ||||||||||||||||||||    
T  18881142 catcatgtttgcactcagctagtgcatgacccttctttccacagtgaaaacatctcttggtatccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcacc 18881043  T
Q  207 acaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggc 303  Q
    |||| | ||||| ||||| | |||||   ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||  | ||||| || |||||||  ||||||||||| |||    
T  18881042 acaagtaaaacagacaatttttgcaggagcatccttcttcttaggccgtctatcttcgaccattctctgtttgcccttatcagtaggggcactgtaaggc 18880943  T
Q  304 ttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 386  Q
    ||||| |||||||| || ||||||  ||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  18880942 ttagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcactatcttgtaatgagccttagtatcctcctcataaatcctgca 18880860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 386
Target Start/End: Original strand, 19981157 - 19981545
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| ||||||||||  || || |||||||||| ||||||| |||| |||||  | |||||||| | |||| |||||||| |||| || || |||||||    
T  19981157 tgagtaccagtcaaagtgaaaactctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactgagaaccaatgtgaccctcttcattacaattgaagcaca 19981256  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttc-ctcagggcagacgttgctcttgtggcctt 199  Q
    |||||||  || | ||||| |||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||  | || |  || ||| || ||  | ||||||||||||||||    
T  19981257 caatgtcattatgtttgcactcagctagtgcatgacccttcttaccacatcggaaacatcttttcacctctctc-ggacaagcattgctcttgtggcctt 19981355  T
Q  200 tctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcact 296  Q
    ||||||||||||| ||  | |||||||| ||||   ||||||||||| | || |||||| | ||||||||| | | ||| || |||||||| ||||| ||    
T  19981356 tctcaccacaattaaagaagacaatctcagcaggaacatccttcttccttggtcgcctatcttcgaccatcctctatttgcccttatcagcaggggcgct 19981455  T
Q  297 gtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 386  Q
     || |||||||| |||||||| || ||||||  ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  19981456 ataaggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccactcattcacgaccttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 19981545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 21164129 - 21163679
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| ||||||||||| || || ||||||||||  |||||| |||| || ||  | || ||||| | |||| |||||||| ||||||| || |||||||    
T  21164129 tgagtaccagtcaaagcgaaaactctaccagtagttggcgccttcttaggttgcttgcattgagaaccaatgtgaccctcttcattgcaattgaagcaca 21164030  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcct--------cagggcagacgttgctcttg 192  Q
    |||||||  |||  ||||||||||| |   ||||||| ||||||||||| |||| |||  |||| || || |        || | ||  | |||||||||    
T  21164029 caatgtcattacagttgcaatcagccagtgcatgacccttcttaccacatcggaaacatctctttatctctttatctctccatgacaagcattgctcttg 21163930  T
Q  193 tggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgg 289  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||   ||||||||||| | || || ||| | ||||||||| | ||||| || |||||||| |    
T  21163929 tggtctttctcgccacaattaaaacagacaatctcagcaggagcatccttcttccttggtcgtctatcctcgaccatcctctgtttgcccttatcagcag 21163830  T
Q  290 gggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagct 389  Q
    ||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||    
T  21163829 gggcactatagggcttagggcgactttgttggcccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcataaatcctgcaact 21163730  T
Q  390 attaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctctt 440  Q
     || ||||| || |  |||||||  | |||||| || ||||| ||||||||    
T  21163729 gttcaccaactcggagaaaactcggatctgttggtatccaattgccctctt 21163679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 21391446 - 21391064
Alignment:
Q  7 ccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||   | ||||  || | |||| |||||||| |||| || || ||||| || || |    
T  21391446 ccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccttcttaggcttcttgcactatgaaccaatgtgaccctcttcattacaattgaagcatactatat 21391347  T
Q  107 ctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcacc 206  Q
    |   | | ||||| |||||||   ||||||| ||||| ||||| || | |||  ||||||  ||| |||| ||  | || ||||||||||||||||||||    
T  21391346 catcatgtttgcactcagctagtgcatgacccttctttccacagcgaaaacatctcttgacgtccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcacc 21391247  T
Q  207 acaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggc 303  Q
    ||||   ||||| |||||||| ||||   ||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||  | | ||| || |||||| |  ||||||| || |||    
T  21391246 acaagaaaaacaaacaatctcagcaggagcatccttcttcctcggccgtctatcttcgaccattctctatttgcccttatcaacaagggcactataaggc 21391147  T
Q  304 ttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 386  Q
    ||||| |||||||| || ||||||  ||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  21391146 ttagggcgactctgctggcccttagtcttcctctcattcacgatcttgtaatgagccttagtatcctcctcgtaaatcctgca 21391064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 21780772 - 21780390
Alignment:
Q  7 ccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||   | ||||  || | |||| |||||||| |||| || || ||||| || || |    
T  21780772 ccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccttcttaggcttcttgcactatgaaccaatgtgaccctcttcattacaattgaagcatactatat 21780673  T
Q  107 ctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcacc 206  Q
    |   | | ||||| |||||||   ||||||| ||||| ||||| || | |||  ||||||  ||| |||| ||  | || ||||||||||||||||||||    
T  21780672 catcatgtttgcactcagctagtgcatgacccttctttccacagcgaaaacatctcttgacgtccccaggacaagcattactcttgtggcctttctcacc 21780573  T
Q  207 acaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggc 303  Q
    ||||   ||||| |||||||| ||||   ||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||  | | ||| || |||||| |  ||||||| || |||    
T  21780572 acaagaaaaacaaacaatctcagcaggagcatccttcttcctcggccgtctatcttcgaccattctctatttgcccttatcaacaagggcactataaggc 21780473  T
Q  304 ttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 386  Q
    ||||| |||||||| || ||||||  ||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  21780472 ttagggcgactctgctggcccttagtcttcctctcattcacgatcttgtaatgagccttagtatcctcctcgtaaatcctgca 21780390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 94 - 260
Target Start/End: Original strand, 22031386 - 22031554
Alignment:
Q  94 aagcacacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgt 193  Q
    ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || | ||| || || |||||||| |    
T  22031386 aagcacacaatatcattacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacatttctttatctctttaggacaaacattgctcttat 22031485  T
Q  194 ggcctttctcaccacaattgaaacacacaatct---ctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatc 260  Q
    ||||||| |||||||||||||||||   |||||   ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22031486 ggccttt-tcaccacaattgaaacaagtaatctcagctggagcatccttcttcttaggccgcctatcatc 22031554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 187 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 16268629 - 16268367
Alignment:
Q  187 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattat 283  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | ||   ||||  |||||||||||| |||  ||||   |||||| || || || || |    
T  16268629 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcttcttaggcctcctgtcatcactcatcttctgctttcctttgt 16268530  T
Q  284 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 383  Q
    ||||  | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||  ||||| ||||| || || || |||||||| || ||    
T  16268529 cagcaagagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcattatattgtaatgagctttggtgtcttcttcataaattct 16268430  T
Q  384 gcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
     || ||||||||||| || |  || ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16268429 acaactattaaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagcccttttgatgtc 16268367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 187 - 446
Target Start/End: Original strand, 28984287 - 28984549
Alignment:
Q  187 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctc---tgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattat 283  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||   || ||||||  || |||| |||| |||| ||||  ||||| | || || || || |    
T  28984287 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcaactggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcctctgctttcccttgt 28984386  T
Q  284 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 383  Q
    | || || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||  | |||||| ||||| || || || |||||||| |||||    
T  28984387 ccgcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcataaatcct 28984486  T
Q  384 gcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
     || || |||||||| || | ||| ||||| | ||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  28984487 acacctgttaaccaactcagaaaagactctgatctgttgatatccaatggctcttttgatgtc 28984549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 264 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 29300751 - 29300626
Alignment:
Q  264 catcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttc 363  Q
    |||||| || ||||| || ||||| || |||||||| || |||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||| ||     
T  29300751 catcttctgcttccctttgtcagcaggagcactgtaaggtttaggacgactctaatgtcccttacccctcctctcactcattaccttgtaatgagctttt 29300652  T
Q  364 gtatcctcttcatagatcctgcagct 389  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||    
T  29300651 gtgtcctcctcatatatcctgcagct 29300626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 187 - 386
Target Start/End: Original strand, 21671891 - 21672093
Alignment:
Q  187 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattat 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  | || ||||||||  |||   |||| |||||  |||  |||||| |||| |||||  | ||||| || ||||    
T  21671891 ctcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatctcaacaggagcatctttctttctagagcgcctatcatctaccattctctgtttacccttat 21671990  T
Q  284 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 383  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||||||||| || |||||  |||| | ||||||||| | |||||| |||| ||| | |||||| ||||| |||||    
T  21671991 cagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgacccttggcctttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggcatcctcctcataaatcct 21672090  T
Q  384 gca 386  Q
    |||    
T  21672091 gca 21672093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 283 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 22027586 - 22027423
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | | |||| |||  ||||| || ||| | || || ||||| ||||||||||    
T  22027586 tcagcaggggcactgtacggtttaggacgactctgctgtcccttaccacttcgctcactcatcaccttataatgatcttttgtgtcctcctcatagatcc 22027487  T
Q  383 tgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    |||| | | | |||||||| |  |||| ||| | |||||||||||| || || |||||||||||    
T  22027486 tgcaacgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttgataccctatggctctcttgatgtc 22027423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 22421251 - 22421096
Alignment:
Q  231 agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttaccc 330  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  |||| |||||  | ||||| || |||| ||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||  |     
T  22421251 agcatctttcttcctaggccgcctctcatcaaccattctctgtttgcccttattagcaggagcactgtaaggctttggacgactctgctgacctttgact 22421152  T
Q  331 ttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 386  Q
    |||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  22421151 ttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatcctcctcataaatcctgca 22421096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 283 - 389
Target Start/End: Original strand, 21928903 - 21929009
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
T  21928903 tcagcaggagcactatacggtttaggacgactctgttgtcccttacctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtatcctcttcatagattc 21929002  T
Q  383 tgcagct 389  Q
    | |||||    
T  21929003 tacagct 21929009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 386
Target Start/End: Original strand, 22523971 - 22524088
Alignment:
Q  269 tttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatc 368  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || || || | ||||||||| | |||||| |||||||| |||||    
T  22523971 tttgttttcccttatcagcaggggcactgtaaggctttggacgactctgctgacctttgccttttcgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatc 22524070  T
Q  369 ctcttcatagatcctgca 386  Q
    ||| | ||| ||||||||    
T  22524071 ctccttataaatcctgca 22524088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 280 - 386
Target Start/End: Original strand, 22054335 - 22054441
Alignment:
Q  280 ttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcataga 379  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  | | |||| |||  ||||| || ||||| || || ||||| ||| |||    
T  22054335 ttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgccgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcacaga 22054434  T
Q  380 tcctgca 386  Q
    |||||||    
T  22054435 tcctgca 22054441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 355 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 17830204 - 17830113
Alignment:
Q  355 tgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||  | ||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  17830204 tgagcctttgtatcttcctcgtagatcctgcagctattcactaaatcagggaaaactcggagctgttgatatccgatcgcactcttgatgtc 17830113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 187 - 383
Target Start/End: Original strand, 19985556 - 19985755
Alignment:
Q  187 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattat 283  Q
    |||||||||| ||| || ||||| |||||||| |||||||| | ||   ||||  || ||||||||| |||  |||| | |||| | ||||| || || |    
T  19985556 ctcttgtggcttttttcgccacacttgaaacaaacaatctcagtaggagcatctctcctcttaggcctcctctcatcaatcatcctctgtttacccttgt 19985655  T
Q  284 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 383  Q
    | || |||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| ||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  19985656 ccgcaggggcactatacggcttcggacgactctgctatcccttgccactgcgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtatcctcttcatatatcct 19985755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 389
Target Start/End: Original strand, 3274589 - 3274686
Alignment:
Q  292 gcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagct 389  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || || || |||||  || ||||||||||||  ||||| |||||  | |||||||| |||||||| ||||||||    
T  3274589 gcactgtaaggctttggacgactttgctggcctttacctctcttctcattcactattttgtaatgagctcttgtatcctcctcatagattctgcagct 3274686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 52
Target Start/End: Original strand, 21254141 - 21254186
Alignment:
Q  7 ccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggct 52  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  21254141 ccagtcaaagcaaaaacactaccagtagccggcgccttcttaggct 21254186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 401
Target Start/End: Original strand, 22374345 - 22374462
Alignment:
Q  284 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 383  Q
    |||| |||||||| ||||| || ||||||||||  |||||||||||  | | |||| |||  ||||| || ||||| || |||||||| | |||||||||    
T  22374345 cagcaggggcactatacggtttcggacgactctactgtcccttacctctgcgctcactcatcaccttataatgagcttttgtatcctcctgatagatcct 22374444  T
Q  384 gcagctattaaccaaatc 401  Q
     |||||| | ||||||||    
T  22374445 acagctactcaccaaatc 22374462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 346; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 22400 - 22845
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||| |    
T  22400 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaaa 22499  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22500 caatgtctgtacggttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcggggcagacgttgctcttgtggccttt 22599  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  22600 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagtatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtac 22699  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22700 ggcttaggacgactctgctgtctcttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccatcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaaccaaat 22799  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||    
T  22800 cctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 22845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 346; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 7389 - 7834
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||| |    
T  7389 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaagcaaa 7488  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7489 caatgtctgtacggttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcggggcagacgttgctcttgtggccttt 7588  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  7589 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagtatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgggggcactgtac 7688  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7689 ggcttaggacgactctgctgtctcttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccatcgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaaccaaat 7788  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    || |||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||    
T  7789 cctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 7834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 334; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 3577 - 4022
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  3577 tgagtaccagtcaaagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcaattaaaacaca 3676  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3677 caatgtccgtacgcttgcattcagctacaataggacctttcttaccacaccgaacacacttcttgatttcttcagggcagacgttgcttttgtggccttt 3776  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3777 cccaccacaattgaaacacacaatctctgtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcgggggcactgtac 3876  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3877 ggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcataggtcctgcagctattaaccaaat 3976  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3977 ccggaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 4022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 74 - 445
Target Start/End: Original strand, 17386 - 17760
Alignment:
Q  74 gaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctc 173  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||| ||  |||| |   |||||||||| | |||||| || || |||||||||||||| ||||| || || ||    
T  17386 gaccctcttcattgcaattgaagcacacaatatcattacgctaaaaatcagctactatatgacccttattgccacaccggacacatttctttatctcttc 17485  T
Q  174 agggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttt 270  Q
     || || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |     
T  17486 tggacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattcta 17585  T
Q  271 tgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcct 370  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||  ||||| ||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||    
T  17586 tgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattcacaaccgtgtaatgagccttggtatcct 17685  T
Q  371 cttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgt 445  Q
    | ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||| || || || |||||||| ||||    
T  17686 cctcataaattctgcagctattaaccaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatccgattgccctcttaatgt 17760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 7 - 446
Target Start/End: Original strand, 10527 - 10965
Alignment:
Q  7 ccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgt 106  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  10527 ccagtcaaaacaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctttccattgcagttaaaacacataatgt 10626  T
Q  107 ctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcacc 206  Q
    | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  10627 ccgtacgcttgcattcagctacaatatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacattgcttttgtggcctttcccacc 10726  T
Q  207 acaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggctta 306  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  10727 acaattgaaacacacaatctcagtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcttctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggctta 10826  T
Q  307 ggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaa 406  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  10827 ggacgactctgctgtcccttgcccttcccctcgttcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaaatccgg-a 10925  T
Q  407 aaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    ||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  10926 aaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 10965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 446
Target Start/End: Original strand, 11632 - 12050
Alignment:
Q  11 tcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtctgt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  11632 tcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcaccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacacacaatgtccgt 11731  T
Q  111 acgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaa 210  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  11732 acgcttgcattcagctacaatatgacctttcttgcgacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcctttcccaccacaa 11831  T
Q  211 ttgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggac 310  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||                 | ||||||||||||||||||||||    
T  11832 ttgaaacacacaatctcagtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatctt-----------------caggggcactgtacggcttaggac 11914  T
Q  311 gactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaac 410  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11915 gactctgctgtcccttgctcttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaaatccggaaaaac 12014  T
Q  411 tctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    ||| | |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  12015 tctaatctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 12050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 446
Target Start/End: Original strand, 21160 - 21578
Alignment:
Q  11 tcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtctgt 110  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  21160 tcaaagcaaagaccctactagtagtcggcgtcctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacacacaatgtccgt 21259  T
Q  111 acgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaa 210  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  21260 acgcttgcattcagctacaatatgacctttcttgccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgcttttgtggcctttcccaccacaa 21359  T
Q  211 ttgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggac 310  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||                 | ||||||||||||||||||||||    
T  21360 ttgaaacacacaatctcagtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatctt-----------------caggggcactgtacggcttaggac 21442  T
Q  311 gactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaac 410  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21443 gactctgctgtcccttgctcttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaaatccggaaaaac 21542  T
Q  411 tctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    ||| | |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  21543 tctaagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 21578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 55157 - 55602
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||| ||||||||||||| || |    
T  55157 tgagttccagtcaaagcaaagaccctaccagtagttggcgccctcttaggctgagtacactgagaactaatatgtccctcttcattgcagttaaaacata 55256  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    |||||||   ||| |||||||||| ||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  55257 caatgtcctgacgcttgcaatcagatactatatgacccttcttgccacaccggacacacttcttaatttcttcaggacaaccattgctcttgtggccttt 55356  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
      ||||||| ||||| |||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  55357 tccaccacagttgaagcacacaatttcagaaacatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttccctttatcagcaggggcactgtac 55456  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| | |||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||    
T  55457 ggcttaggacgactctgttgtcctttgcccttcttctcattcaccatcttgtaatgagccttagtatcttcctcgtagattctgcagctattaaccaaat 55556  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    |||||||||  || | |||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  55557 ccggaaaaatcctaatctgtcgatgcccaatcgccctcttaatgtc 55602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 41308 - 41753
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  41308 tgagtaccagtcaaagcaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacaca 41407  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| | || ||||| || || ||||| |||||||||||    
T  41408 caatgtccgtacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccagacacacttcttgctctcttcaggacaaacattgcttttgtggccttt 41507  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||| |||| ||| |||||| |||||    
T  41508 cccaccacaattgaaacacacaatctcagtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttccctttattagcaggggcaatgtac 41607  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41608 ggcttaggacaactctgctgtccattgcccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttggtattctcttcatagatcctgcagctattgaccaaat 41707  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
     |||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  41708 tcggaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 41753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 13239 - 12872
Alignment:
Q  37 ggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgac 136  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || | |||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||| |||||    
T  13239 ggcgccctcttaggctgcgtgcattgcgaaccaatgtgaccctcttcattacagttgaagcacacaatatcattacgcttgcaatcagctacaatatgac 13140  T
Q  137 ctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agc 233  Q
    | ||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| || || || ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||| || ||   |||    
T  13139 ccttcttaccacaccagacacatttcttgatctcttcaggacaaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaacaatatccgcaggagc 13040  T
Q  234 atccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttc 333  Q
    |||||||||||| |||  |||| ||||||||||  | || || || ||||| || |||||||| || || ||||| |||||||| || | |||   ||||    
T  13039 atccttcttctttggcttcctatcatcgaccattctctgcttgcccttatctgcaggggcactataaggtttagggcgactctgctggctcttggtcttc 12940  T
Q  334 ctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatc 401  Q
     ||||||| || | |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  12939 ttctcattaacaatcttgtaatgagctttgatatcctcttcatagatcctgcagctattcactaaatc 12872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 8411 - 8856
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||  | |||||  ||||| ||||||| ||||    
T  8411 tgagtaccagtcaaagcaataaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatatgtccctcatcattgtagttaaaacaca 8510  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||| |    
T  8511 caatgtccttacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacactggacacacttcttgatctcttcaggacagacattgcttttgtggcctct 8610  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  8611 cccaccacaattgaaacacacaatctcggtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagttggggcactgtac 8710  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8711 ggcttaggacgactctgatgtcccttgcccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttagtatcttcttcatagatcctgcagctattgaccaaat 8810  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    | ||||||||||| | |||||| || |||||||||||||| |||||    
T  8811 ctggaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 8856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0789 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0789
Description:

Target: scaffold0789; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 445
Target Start/End: Original strand, 91 - 524
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  91 tgagtaccaatcaaagcaaagactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactaatgtgaccctctccattgcagttaaaacaca 190  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||    
T  191 caatgtccgtacgcttgcaatcagctacaaaatgacccttcttgccacaccggacacatttcttaatctcttcaggacaaacattgcttttgtggccttt 290  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    | ||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| | ||||||           ||    
T  291 cccaccataattgaaacacacaatttcagtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttcccttcatcagc-----------ac 379  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  380 ggcttaggacgactctgctgccccttgcccttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttagtatcctcttcatagatcctacagatattgaccaaat 479  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgt 445  Q
    | ||||||||||| | |||||| || |||||||||||||| ||||    
T  480 ctggaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttaatgt 524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 9 - 446
Target Start/End: Original strand, 424469 - 424909
Alignment:
Q  9 agtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtct 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||     
T  424469 agtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgtgaactgatgtgaccctcttcattgcagttaaaacacacaatgtcc 424568  T
Q  109 gtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccac 208  Q
      ||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || ||||| |||||||||||| ||||||    
T  424569 tcacgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacatcggacacatttcttaatctcttcaggacaaacattgcttttgtggcctttcacaccac 424668  T
Q  209 aattgaaacacacaatctc---tgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggctt 305  Q
    | ||||| |||||||||||    | |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  424669 agttgaagcacacaatctcagtaggagcacccttcttcgtaggccgcctatcatcgaccatattttgtttccctttatcagcaggggcattgtacggctt 424768  T
Q  306 aggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccgga 405  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  424769 aggacgactatgctgtcccttgcccttccgctcattcaccatcttgtaatgagccttggtatcctcctcatagattctgcagctattaaccaaatccaga 424868  T
Q  406 aaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  424869 aaaactctaatctgttgatatccaatcgccctcttaatgtc 424909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 283 - 443
Target Start/End: Original strand, 203819 - 203979
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | | |||| |||  ||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  203819 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcatagatcc 203918  T
Q  383 tgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgat 443  Q
    |||| | | | |||||||| |  |||| ||| | |||||| ||||| || || ||||||||    
T  203919 tgcaacgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtaccctatggctctcttgat 203979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 48818 - 49263
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||| ||||||||||||| || |    
T  48818 tgagtcccagtcaaaggaaagaccctaccagtagtcggcgccctcttaggctgagtacactgagaactaatttgtccctcttcattgcagttaaaacata 48917  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  48918 caatgtcttgacgcttgcaatcagctactatatgacccttcttgccacattggacacacttcttaatttcttcaggacaaccattgctcttgtggccttt 49017  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtac 300  Q
    | ||||| | |||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  | |||||||| |||||||  |||||| |||||    
T  49018 cccaccatagttgaaacacaaaatttcagaagcatccttcttcttaggccgcctatcatcggccattctctgtttccctttatcagtaggggcattgtac 49117  T
Q  301 ggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaat 400  Q
    || |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| | |||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||    
T  49118 ggtttaggacgactctgctgtcccttgcccttcttctcattcaccatcttgtaatgagccttagtatcttcctcgtagattctgcagctattaaccaaat 49217  T
Q  401 ccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    ||| |||||  || | |||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  49218 ccgtaaaaatcctaatctgtcgatgcccaatcgccctcttaatgtc 49263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 233 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 107693 - 107480
Alignment:
Q  233 catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttaccctt 332  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  107693 catctttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttgccctt 107594  T
Q  333 cctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatc 432  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  107593 cctctcattcactatctcgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtacccaatc 107494  T
Q  433 gccctcttgatgtc 446  Q
     |||||||||||||    
T  107493 tccctcttgatgtc 107480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 184 - 386
Target Start/End: Original strand, 8550 - 8755
Alignment:
Q  184 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgca---gcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccat 280  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||| |||   || ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| | ||||| || |    
T  8550 ttgctcttgtggcctttctcgccacaattaaaacagataatctcagcaagagcgtccttcttctttggccgtctatcctcgaccatcctctgtttgccct 8649  T
Q  281 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagat 380  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||||| || ||||| ||    
T  8650 tatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgttggcccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcatcctcataaat 8749  T
Q  381 cctgca 386  Q
     |||||    
T  8750 tctgca 8755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 346 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 93697 - 93653
Alignment:
Q  346 accttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagcta 390  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  93697 accttgtaatgagccttcgtatcctcctcataaattctgcagcta 93653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1881 (Bit Score: 148; Significance: 6e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold1881
Description:

Target: scaffold1881; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 94 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 538 - 189
Alignment:
Q  94 aagcacacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgt 193  Q
    ||||||||||| ||  | || ||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||    
T  538 aagcacacaatatcatttcgcttgcaatcatctacaatatgacccttcttgccacaccggacacatttcttgatctcctcaggacaaacattgctcttgt 439  T
Q  194 ggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctc---tgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcggg 290  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| || |||||||| ||    
T  438 ggcctttctcgccacaattgaaacaaacaatctccgtaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctttgtttgcccttatcagcagg 339  T
Q  291 ggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagcta 390  Q
    |||| | || |||||||| |||||||| || |||||   ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || |||    
T  338 ggcaatataaggcttagggcgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcttcatagattctacaacta 239  T
Q  391 ttaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctctt 440  Q
    || |||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||| ||||||||    
T  238 ttcaccaaatcaggaaaaactcggatttgttgatacccaattgccctctt 189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 37 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 229967 - 229555
Alignment:
Q  37 ggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgac 136  Q
    |||||||||||||||||  | || || || | |||  |||||||| | ||||| || ||||||||||| ||  || | |||||||||||||  | |||||    
T  229967 ggcgccctcttcggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcgttgcaattgaagcacacaatatcattaagcttgcaatcagctattatatgac 229868  T
Q  137 ctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---c 233  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||| || || || || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||   |    
T  229867 ccttcttgccacaccggacacatttctttatctcttctggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaaacaatctccgcaggagc 229768  T
Q  234 atccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttc 333  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||  | ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||  |||||  ||||    
T  229767 atccttcttattaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggtccttagtcttc 229668  T
Q  334 ctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcg 433  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||| || |  ||||    
T  229667 ctctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctcataaattctgcagctattaaccaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatctgatcg 229568  T
Q  434 ccctcttgatgtc 446  Q
    ||||||| |||||    
T  229567 ccctcttaatgtc 229555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 389
Target Start/End: Original strand, 251961 - 252163
Alignment:
Q  190 ttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgca---gcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcag 286  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||   |||||  || |||| |||| |||| ||||   |||||| ||||| ||  |  |||    
T  251961 ttgtggcctttttcaccacacttgaaacacacaatctcaacaagagcatctctcctcttgggcctcctatcatcattcatcttatgttttcctgtggcag 252060  T
Q  287 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 386  Q
    | || |||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||| ||||| || || || || ||||| ||||||||    
T  252061 caggagcactgtaaggtttaggacgattatgttgtcccttacccctcctctcactcatcaccttgtaatgagctttggtgtcttcctcatatatcctgca 252160  T
Q  387 gct 389  Q
    |||    
T  252161 gct 252163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 136; Significance: 9e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 74 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 15119 - 14750
Alignment:
Q  74 gaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctc 173  Q
    |||||||| ||||||| || || |||||||| ||  |||| |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||    
T  15119 gaccctcttcattgcaattgaatcacacaatatcattacgcttgcaatcagctactatatgacccttcttgccacaccggacacatttctttatctcttc 15020  T
Q  174 agggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctc---tgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttt 270  Q
     || || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |     
T  15019 tggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctccgtaggagcatccttcttcttaggctgcctatcatcgaccattctc 14920  T
Q  271 tgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcct 370  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||  ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  14919 tgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcct 14820  T
Q  371 cttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctctt 440  Q
    | | |||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||| ||||||||    
T  14819 cctaatagattctacaactattcaccaaatcaggaaaaactcggatttgttgatacccaattgccctctt 14750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 74 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 11434 - 11065
Alignment:
Q  74 gaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctc 173  Q
    |||||||| ||||||| || || |||||||| ||  |||| |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||    
T  11434 gaccctcttcattgcaattgaatcacacaatatcattacgcttgcaatcagctactatatgacccttcttgccacaccggacacatttctttatctcttc 11335  T
Q  174 agggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctc---tgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttt 270  Q
     || || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |     
T  11334 tggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctccgtaggagcatccttcttcttaggctgcctatcatcgaccattctc 11235  T
Q  271 tgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcct 370  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||   ||| ||||| ||||||  ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  11234 tgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggtaactttgttggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcct 11135  T
Q  371 cttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctctt 440  Q
    | | |||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||| ||||||||    
T  11134 cctaatagattctacaactattcaccaaatcaggaaaaactcggatttgttgatacccaattgccctctt 11065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 74 - 446
Target Start/End: Original strand, 5224 - 5599
Alignment:
Q  74 gaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctc 173  Q
    |||||||| ||||||| || || |||||||| ||  | || |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||| || ||    
T  5224 gaccctcttcattgcaattgaaccacacaatatcatttcgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttgccacaccagacacatttcttgatctcttc 5323  T
Q  174 agggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttt 270  Q
    ||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |     
T  5324 aggacaaacattactcttatggcccttctcgccacagttgaaacaaacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctc 5423  T
Q  271 tgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcct 370  Q
    ||||| || ||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||   ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  5424 tgtttgcccttatcagcaagggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcct 5523  T
Q  371 cttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    | |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||  | |||||| || || ||||||||||| |||||    
T  5524 catcatagattctgcagctattcaccaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctcttaatgtc 5599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0451 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0451
Description:

Target: scaffold0451; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 74 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 14110 - 13733
Alignment:
Q  74 gaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctc 173  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||| | | |||| ||||| ||||||| |||||| ||||| || || ||    
T  14110 gaccctcttcattgcaattgaagcacacaatatcattacgcttgcaatcagctactatacgacccttcttgccacacctgacacatttctttatctcttc 14011  T
Q  174 agggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttt 270  Q
     || || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |     
T  14010 tggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctc 13911  T
Q  271 tgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcct 370  Q
    ||||| || |||||| | |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| |||||| || |||||||| |||||  | || ||||    
T  13910 tgtttgcccttatcatcaggggcactatagggcttagggcgactctgttggcccttagtcttccgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcct 13811  T
Q  371 cttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgtt--gatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    | || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||  | |||||  | || |||||||||||||| |||||    
T  13810 cctcgtagatcctgcagctattcactaaatctggaaaaactcgaatctgttgcggtatccaatcgccctcttaatgtc 13733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0289
Description:

Target: scaffold0289; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 74 - 440
Target Start/End: Original strand, 14 - 383
Alignment:
Q  74 gaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctc 173  Q
    |||||||  ||||||| || ||||||||||||||  |||| ||||||||| |||    |||||||||||| |||| ||| | ||  ||||| |  |||||    
T  14 gaccctcctcattgcaattgaagcacacaatgtcattacgcttgcaatcaactaatgtatgacctttcttgccacgccgaaaacttttcttcacctcctc 113  T
Q  174 agggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttt 270  Q
    ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |     
T  114 aggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagacaatctctgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctc 213  T
Q  271 tgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcct 370  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||  | ||||||  ||||| ||||||||| |||||||| ||||| || || ||||    
T  214 tgttttcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgccggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagctttggtgtcct 313  T
Q  371 cttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctctt 440  Q
    | |||||||| || ||||| || |||||||  ||||||||||  | ||||||||| ||||| ||||||||    
T  314 cctcatagattctacagctgttcaccaaattaggaaaaactcggatctgttgatatccaattgccctctt 383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 440
Target Start/End: Original strand, 36657 - 37093
Alignment:
Q  7 ccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgt 106  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||   |||  | || ||||| | |||  |||||||| | ||||| |||||||||||||| |    
T  36657 ccagccaaagcaaaaactctaccagtagtcggcgccctcttaaactgcttgcattgagaaccaatatgaccctcttccttgcaattaaagcacacaatat 36756  T
Q  107 ctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcacc 206  Q
    |  |||| |||||||||||||    |||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| |  ||||| || || || |||||||||||||||||||||||    
T  36757 cactacgcttgcaatcagctaacgtatgacccttcttgccacaccggaaacatttcttcacctcctctggacaaacattgctcttgtggcctttctcacc 36856  T
Q  207 acaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggc 303  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| || |||||||| |||||||| || |||    
T  36857 acaattgaaacagacgatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactatagggc 36956  T
Q  304 ttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccg 403  Q
    |||||  ||||||| || ||||||  ||||| |||||| || |||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || ||| | || |||||||| |    
T  36957 ttagggagactctgctggcccttagtcttccgctcatttacaaccttgtaatgagctttggtgtcctcctcatagattctacagttgttcaccaaatcag 37056  T
Q  404 gaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctctt 440  Q
    |||||||||  | |||||| || ||||| ||||||||    
T  37057 gaaaaactcggatctgttggtatccaattgccctctt 37093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 446
Target Start/End: Original strand, 3 - 450
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| |||| ||||||||| || | ||| ||||  ||||||||||| |||||  | || || || | |||  |||||||| |||| || || |||||||    
T  3 tgagtaccagccaaagcaaaaactcgacccgtagtaggcgccctcttaggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattacaattgaagcaca 102  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    |||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| || || || ||||||||||||||    
T  103 caatatcatttcgcttgcaatcagctacaacatgacccttcttaccacaccggacacatttcttgatctctacaggacaaacattactcttgtggccttt 202  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatct---ctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactg 297  Q
    ||||||||||||||| ||   |||||   ||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||  | ||||| || |||||||| ||||||||     
T  203 ctcaccacaattgaagcaagtaatctcaactggagcatccctcttcttagggcgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcacta 302  T
Q  298 tacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaacca 397  Q
    || |||||| |||||||||| || |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || || || || ||||||||||||||||| || |    
T  303 taaggctta-gacgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagcctttgtttcttcctcgtagatcctgcagctattcacta 401  T
Q  398 aatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    |||| || |||||||  | |||||| || || |||||||||||||||||    
T  402 aatcagggaaaactcggagctgttggtatccgatcgccctcttgatgtc 450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 121 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 139641 - 139313
Alignment:
Q  121 tcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaca 220  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  139641 tcagctacaatatgacccttcttgccacaccggacacatttcttgatctctacaggacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcaag 139542  T
Q  221 caatctctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctg 317  Q
     |||||| ||   || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||    
T  139541 taatctcagctggagtatccctcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctg 139442  T
Q  318 ttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaac 417  Q
     || |||||   ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || |||| ||  | |    
T  139441 ctggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagcctttgtatcttcctcgtagatcctgcagctattcactaaatcagggaaaattcggagc 139342  T
Q  418 tgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||    
T  139341 tgttgatatccgatcgccctcttgatgtc 139313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 37 - 446
Target Start/End: Original strand, 14613 - 15025
Alignment:
Q  37 ggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgac 136  Q
    |||||||||||||||||  | || || || | |||  |||||||| |||| || || ||||| || || ||  |||| |||||||||||||||| |||||    
T  14613 ggcgccctcttcggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcattacaattgaagcatacgatatcattacgcttgcaatcagctacaatatgac 14712  T
Q  137 ctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---c 233  Q
      ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| | || || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||   |    
T  14713 tcttcttgccacaccggacacatttcttgatctcttcaagacaaacattactcttgtggccattctcgccacacttgaaacaaacaatctccgcaggagc 14812  T
Q  234 atccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttc 333  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||  | ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||   ||||    
T  14813 atccttcttcttaggccgcatatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttggtcttc 14912  T
Q  334 ctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcg 433  Q
    | ||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||  | |||||| || || ||||    
T  14913 cgctcattcacaacctagtaatgagccttggtatcttcctcgtagattctgcagctattcactaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatccgatcg 15012  T
Q  434 ccctcttgatgtc 446  Q
    ||||||| |||||    
T  15013 ccctcttaatgtc 15025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 386
Target Start/End: Original strand, 5339 - 5456
Alignment:
Q  269 tttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatc 368  Q
    ||||||| || |||||||| || |||| ||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  5339 tttgtttgcccttatcagcaggagcaccgtaaggctttggacgactttgctgacccttgcctttcctctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatc 5438  T
Q  369 ctcttcatagatcctgca 386  Q
     || ||||| || |||||    
T  5439 ttcctcatatattctgca 5456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 346 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 180642 - 180598
Alignment:
Q  346 accttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagcta 390  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  180642 accttgtaatgagccttcgtatcctcctcataaattctgcagcta 180598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 15724 - 15288
Alignment:
Q  7 ccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgt 106  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| |||||  | |||||||| |  ||  |||||||  ||||||| || |||||||||||||    
T  15724 ccagccaaagcaaaaactctaccagtagttggcgccctcttaggctgcttgcactgagaaccgatatgaccctcatcattgcaattgaagcacacaatgt 15625  T
Q  107 ctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcacc 206  Q
    |  |  | |||||||||||||    |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    ||||| || || |  |||||||||||||||||||||||    
T  15624 cattgtgcttgcaatcagctaatgtatgacccttcttgccacaccggaaacacttctttgcctcctctggacaaaaattgctcttgtggcctttctcacc 15525  T
Q  207 acaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggc 303  Q
    |||||||||||| |  ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| || |||||||| |||||||| || |||    
T  15524 acaattgaaacagatgatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagctggggcactatagggc 15425  T
Q  304 ttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccg 403  Q
    ||||| | |||||| || | ||||  ||||| |||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| || |||||||| |    
T  15424 ttagggcaactctgctggcgcttagtcttccactcatttacaacattgtaatgagctttcgtgtcctcctcatagattctacagctgttcaccaaatcag 15325  T
Q  404 gaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctctt 440  Q
    |||||||||  | |||||| || ||||| ||||||||    
T  15324 gaaaaactcagatctgttggtatccaattgccctctt 15288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 7808 - 7363
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||| |||||  | ||| |||| | |||| |||||||| ||||||| || |||||||    
T  7808 tgagtaccagtcaaagcgaaaaccctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcaccgagaaccaatgtgaccctcttcattgcaattgaagcaca 7709  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    |||| ||  || | ||||| ||| |||   ||||||| ||||||||||| |||| | |  |||| |  || || || || |  |||||||||||||||||    
T  7708 caatatcattaagtttgcactcatctagtgcatgacccttcttaccacatcggaaatatctctttacctcttccggacaaatattgctcttgtggccttt 7609  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactg 297  Q
    |||||||||||| || || |||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||  | ||||| || |||||||| |||||||||    
T  7608 ctcaccacaattaaagcagacaatctcagcaggaacatccttcttcttaggccgcctatcttcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactg 7509  T
Q  298 tacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaacca 397  Q
    || |||||||| |||||||| || || |||  ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| || || ||||    
T  7508 taaggcttagggcgactctgctggcctttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcttcctcataaatcctgcaactgttcacca 7409  T
Q  398 aatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgat 443  Q
    | || |  |||||||  | |||||| || ||||| |||||||||||    
T  7408 actcggagaaaactcggatctgttggtaaccaattgccctcttgat 7363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2059 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold2059
Description:

Target: scaffold2059; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 884 - 473
Alignment:
Q  37 ggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgac 136  Q
    |||||||||||||||||  | || || || | |||  |||||||| | || || || ||||||||||| ||  | || |||||||||||||||| |||||    
T  884 ggcgccctcttcggctgcttgcattgggaaccaatatgaccctcttcgttacaattgaagcacacaatatcatttcgcttgcaatcagctacaatatgac 785  T
Q  137 ctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatct---ctgcagc 233  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||| || || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||   ||| |||    
T  784 ccttcttgccacaccggacacatttcttgatctctacaggacaaacattactcttgtggtctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagctggagc 685  T
Q  234 atccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctg-ttgtcccttaccctt 332  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||| ||||   |||    
T  684 atccctcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgcttgt-ccttggtctt 586  T
Q  333 cctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatc 432  Q
    || ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||| |||| || ||||  || |||||||  |  ||||| || || |||    
T  585 ccgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcttcctcgtagatcctgcagttattcactaaataagggaaaactcggagttgttggtatccgatc 486  T
Q  433 gccctcttgatgt 445  Q
    |||||||||||||    
T  485 gccctcttgatgt 473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 5)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 386
Target Start/End: Original strand, 32038 - 32420
Alignment:
Q  7 ccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgt 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||  | |||||||| | |||| |||||||| | ||||  |  || |||||||| |    
T  32038 ccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactgagaaccaatgtgaccctcttcgttgcgatcgaaacacacaatat 32137  T
Q  107 ctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcacc 206  Q
    |  || | |||||||||||||   ||||||  |||||||||||||||| |||  | || |  ||  |||| ||  | |||||||||||||||||||| ||    
T  32138 cattatgtttgcaatcagctaatgcatgactcttcttaccacaccggaaacatctttttacctctccaggacaagcattgctcttgtggcctttctcgcc 32237  T
Q  207 acaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggc 303  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| || ||||||||  |||| || || |||    
T  32238 acaattaaaacagacaatctcagcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctttgtttgcccttatcagcaagggcgctatagggc 32337  T
Q  304 ttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 386  Q
    ||||| |||||||| || ||||||  ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  32338 ttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctcataaattctgca 32420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 77 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 10314 - 9987
Alignment:
Q  77 cctctccattgcagttaaagcacacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagg 176  Q
    ||||| |||| || || ||||||||||| ||  || | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  10314 cctcttcattacaattgaagcacacaatatcattatgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttaccacaccggacacatttcttgatctcttcagg 10215  T
Q  177 gcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgt 273  Q
     || || || ||||||||||||||| | ||| | |||||||| ||||| || ||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  | ||     
T  10214 acaaacattactcttgtggcctttcccgccatagttgaaacaaacaatatccgcaggagcatccttcttctttggccgcctatcatcgaccattctctgc 10115  T
Q  274 ttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctctt 373  Q
    || || ||||||||  ||||||| || || ||||| |||||||| || |||||   || | ||||||| || | |||||| |||||  | ||||||||||    
T  10114 ttgcccttatcagcaagggcactataaggtttagggcgactctgctgacccttggtctacttctcattaacaatcttgtaatgagctctggtatcctctt 10015  T
Q  374 catagatcctgcagctattaaccaaatc 401  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||    
T  10014 catagatcctgcagctattcactaaatc 9987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 77 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 12969 - 12642
Alignment:
Q  77 cctctccattgcagttaaagcacacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagg 176  Q
    ||||| |||| || || ||||||||||| ||  || | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  12969 cctcttcattacaattgaagcacacaatatcattatgcttgcaatcagctacaatatgacccttcttaccacaccggacacatttcttgatctcttcagg 12870  T
Q  177 gcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgt 273  Q
     || || || ||||||||||||||| | ||| | |||||||| ||||| || ||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  | ||     
T  12869 acaaacattactcttgtggcctttcccgccatagttgaaacaaacaatatccgcaggagcatccttcttctttggccgcctatcatcgaccattctctgc 12770  T
Q  274 ttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctctt 373  Q
    || || ||||||||  ||||||| || || ||||| |||||||| || |||||   || | ||||||| || | |||||| |||||  | ||||||||||    
T  12769 ttgcccttatcagcaagggcactataaggtttagggcgactctgctgacccttggtctacttctcattaacaatcttgtaatgagctctggtatcctctt 12670  T
Q  374 catagatcctgcagctattaaccaaatc 401  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||    
T  12669 catagatcctgcagctattcactaaatc 12642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 386
Target Start/End: Original strand, 54796 - 55178
Alignment:
Q  7 ccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgt 106  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||| ||||   ||||||  || | |||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||| |    
T  54796 ccagtcaaagcaaatactctactagtagccggcgccttcttaggcttcttacactacgaaccaatgtgaccctcttcattgcaattaaaacacacaatat 54895  T
Q  107 ctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcacc 206  Q
    |   | | ||||| ||||||    ||||||||||||| ||||| || | |||  ||||||  |||  ||| ||  | || ||||||||||| |||||||     
T  54896 catcatgtttgcactcagctcgtgcatgacctttctttccacagcgaaaacatctcttgacgtccctaggacaaccattactcttgtggcccttctcaca 54995  T
Q  207 acaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggc 303  Q
    | ||   ||||| |||||||  ||||   ||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| | ||||| |  |||||||| |||||||| || |||    
T  54996 ataagaaaaacaaacaatcttagcaggagcatccttcttcttcggccgtctatcttcgaccatcctctgtttgctcttatcagcaggggcactataaggc 55095  T
Q  304 ttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 386  Q
    ||| | ||||| ||||| | ||||  ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  55096 ttatggcgactttgttggcacttagtcttccgctcattcaccatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcctgca 55178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 218
Target Start/End: Original strand, 37504 - 37715
Alignment:
Q  7 ccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgt 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||  | |||||||| | |||| |||||||| | ||||  |  || |||||||| |    
T  37504 ccagtcaaagcaaaaaccctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactgagaaccaatgtgaccctcttcgttgcgatcgaaacacacaatat 37603  T
Q  107 ctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcacc 206  Q
    |  || | |||||||||||||   ||||||  |||||||||||||||| |||  | || |  ||  |||| ||  | |||||||||||||||||||| ||    
T  37604 cattatgtttgcaatcagctaatgcatgactcttcttaccacaccggaaacatctttttacctctccaggacaagcattgctcttgtggcctttctcgcc 37703  T
Q  207 acaattgaaaca 218  Q
    |||||| |||||    
T  37704 acaattaaaaca 37715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 401
Target Start/End: Original strand, 68 - 435
Alignment:
Q  37 ggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgac 136  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || | |||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||| |||||    
T  68 ggcgccctcttaggctgcgtgcattgcgaaccaatgtgaccctcttcattacagttgaagcacacaatatcattacgcttgcaatcagctacaatatgac 167  T
Q  137 ctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agc 233  Q
    | ||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| || || || ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||| || ||   |||    
T  168 ccttcttaccacaccagacacatttcttgatctcttcaggacaaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaacaatatccgcaggagc 267  T
Q  234 atccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttc 333  Q
    |||||||||||| |||  |||| ||||||||||  | || || || ||||| || |||||||| || || ||||| |||||||| || | |||   ||||    
T  268 atccttcttctttggcttcctatcatcgaccattctctgcttgcccttatctgcaggggcactataaggtttagggcgactctgctggctcttggtcttc 367  T
Q  334 ctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatc 401  Q
     ||||||| || | |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  368 ttctcattaacaatcttgtaatgagctttgatatcctcttcatagatcctgcagctattcactaaatc 435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 401
Target Start/End: Original strand, 171307 - 171674
Alignment:
Q  37 ggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgac 136  Q
    ||||||||||||||||| || || || || |  ||  |||||||| |||| ||||| |||||| |||| ||  |||| |||||||||||||||| |||||    
T  171307 ggcgccctcttcggctgcgtgcattgggaaccgatatgaccctcttcattacagttgaagcacgcaatatcattacgcttgcaatcagctacaatatgac 171406  T
Q  137 ctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatct---ctgcagc 233  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||  |||| || || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||   ||| |||    
T  171407 ctttcttgccacaccgaacacatttcttgatctctacaggacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgtaacaagtaatctcaactggagc 171506  T
Q  234 atccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttc 333  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||||||  | ||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| || |||||   ||||    
T  171507 atccttcttctttggccgcctatcaacgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcgctatagggcttagggcgactctgctggcccttggtcttc 171606  T
Q  334 ctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatc 401  Q
    | ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||  ||||||| || |||||    
T  171607 cgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcttcctcgtagattctatagctattcactaaatc 171674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 36963 - 36526
Alignment:
Q  9 agtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtct 108  Q
    |||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||| || ||  | |||| ||| | |||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||||     
T  36963 agtcaaagcaaaaactctaccagtagtcggcgccttcttaggttgcttgcactaagaaccaatgtgaccctcttcattgcaattgaagcacacaatgtca 36864  T
Q  109 gtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccac 208  Q
     |||| |||||||| || |   ||||||| ||||||||||| |||| |||  |||  || ||   ||| ||  | |||||||| ||||||||||| ||||    
T  36863 ttacggttgcaatcggccagtgcatgacccttcttaccacatcggaaacatctctgtatctctctaggacaagcattgctcttatggcctttctcgccac 36764  T
Q  209 aattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggctt 305  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||   ||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||    
T  36763 aattaaaacagacaatctcagcaggagcatccttcttccttggccgtctatcctcgaccatcctttgtttgcccttatcagcaggggcactatagggctt 36664  T
Q  306 aggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccgga 405  Q
    ||| |||||||| || ||||||| ||||| || |||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||||| || |      
T  36663 agggcgactctgctggcccttactcttccgctaattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcataaattctgcaactgttcaccaactcggag 36564  T
Q  406 aaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgat 443  Q
    |||||||  | |||||| || ||||| |||||||||||    
T  36563 aaaactcagatctgttggtatccaattgccctcttgat 36526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 386
Target Start/End: Original strand, 21757 - 22145
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| |||||||||||||| |  |||||||||| ||||||| |||| |||||  | |||| ||| | |||| |||||||| ||||||| || |||||||    
T  21757 tgagtaccagtcaaagcaaaaagtctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactaagaaccaatgtgaccctcttcattgcaattgaagcaca 21856  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    |||| ||  || | |||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||  |||| || ||   ||| ||  | ||| |||||||||||||    
T  21857 caatatcattatggttgcaatcagctagtgcatgacccttcttaccacatcggaaacatctctttatctctcgaggacaagcattgatcttgtggccttt 21956  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactg 297  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||   ||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||| | ||||| || |||  ||| ||||||||     
T  21957 ctcaccacaattaaaacagacaatctcagcaggagcatccttcttccttggccgtctatcatcgaccatcctctgtttgcccttaaaagcaggggcacta 22056  T
Q  298 tacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 386  Q
    || |||||| |||||||| | || ||||||  ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  22057 tagggcttaagacgactcagctggcccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcataaatcctgca 22145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 386
Target Start/End: Original strand, 37181 - 37569
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| |||||||||||||| |  |||||||||| ||||||| |||| |||||  | |||| ||| | |||| |||||||| ||||||| || |||||||    
T  37181 tgagtaccagtcaaagcaaaaagtctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactaagaaccaatgtgaccctcttcattgcaattgaagcaca 37280  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    |||| ||  || | |||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||  |||| || ||   ||| ||  | ||| |||||||||||||    
T  37281 caatatcattatggttgcaatcagctagtgcatgacccttcttaccacatcggaaacatctctttatctctcgaggacaagcattgatcttgtggccttt 37380  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactg 297  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||   ||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||| | ||||| || |||  ||| ||||||||     
T  37381 ctcaccacaattaaaacagacaatctcagcaggagcatccttcttccttggccgtctatcatcgaccatcctctgtttgcccttaaaagcaggggcacta 37480  T
Q  298 tacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 386  Q
    || |||||| |||||||| | || ||||||  ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  37481 tagggcttaagacgactcagctggcccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcataaatcctgca 37569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 186 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 122142 - 121913
Alignment:
Q  186 gctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccatta 282  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| || |||    
T  122142 gctcttgtggcctttttcaccacaattgaaacaagtaatctcagctggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgccctta 122043  T
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||||||| ||| ||||||  | ||| |||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |    
T  122042 tcagcaggggcactatagggcttagggcgactctattggcccttagtcgtccgctcatttacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctcatagattc 121943  T
Q  383 tgcagctattaaccaaatccggaaaaactc 412  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  121942 tgcagctattcaccaactcaggaaaaactc 121913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 11772 - 11609
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| || ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||  | |||||| |||  ||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||    
T  11772 tcagcaggagcactatatggtttaggacgactctgctgtcccttacctcttctctcactcatcaccttataatgagccttagtgtcctcttcatatatcc 11673  T
Q  383 tgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    |||||||  | |||||||| |  |||| | | | || ||||||||| || || |||||||||||    
T  11672 tgcagctgcttaccaaatcagagaaaattttaatcttttgataccctatggctctcttgatgtc 11609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 283 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 1818 - 1655
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| || ||||| || || |||||| ||||||| |||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||     
T  1818 tcagcaggagcactatatggtttaggatgactctgctgtcccttacctctgcgctcactcatcaccttgtaatgagctttagtatcttcttcatatatca 1719  T
Q  383 tgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    ||| |||| | |||||||| |  |||| ||| | ||  ||||||||||| || |||||||||||    
T  1718 tgctgctactcaccaaatcagagaaaattcttatcttctgatacccaatggctctcttgatgtc 1655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 7894 - 7482
Alignment:
Q  37 ggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgac 136  Q
    |||||||||||||||||  | || || || | |||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||  |||  ||||||||||||| || |||||    
T  7894 ggcgccctcttcggctgcttgcattgggaaccaatgtgaccctcttcattacagttgaagcacacaatatcattacttttgcaatcagctataatatgac 7795  T
Q  137 ctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agc 233  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| || || || ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||| || ||   ||     
T  7794 ccttcttgccacaccggacacatttcttgatctcttcaggacaaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaacaatatccgcaggagt 7695  T
Q  234 atccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttc 333  Q
    | |||| ||||| ||||||||| | ||||||||  | | ||| || |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||| || |||||   ||||    
T  7694 agccttattctttggccgcctatcgtcgaccattctctatttgcctttatcagcaggggcactataaggtttagggcgactctgctggcccttggtcttc 7595  T
Q  334 ctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcg 433  Q
    | ||||||||| |||||||| |||||  | |||||||||||||||||||| ||| | || || ||||| |  | |||||  | |||||| || || ||||    
T  7594 cgctcattcacaaccttgtaatgagctctggtatcctcttcatagatcctacagatgttcactaaatcagcgacaactcggatctgttggtatccgatcg 7495  T
Q  434 ccctcttgatgtc 446  Q
    |||||||||||||    
T  7494 ccctcttgatgtc 7482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold1220
Description:

Target: scaffold1220; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 115 - 413
Target Start/End: Original strand, 3 - 304
Alignment:
Q  115 ttgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattga 214  Q
    ||||||||||||| |  |||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| |  ||||  || || || ||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  3 ttgcaatcagctaaagtatgacccttcttgccacaccggaaacatttcttcacctcctttggacaaacattgcttttgtggcctttctcaccacaaatga 102  T
Q  215 aacacacaatctctgca---gcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacg 311  Q
    |||| |||||||| |||   |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | | ||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  103 aacagacaatctccgcaagagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgacaatactctatttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcg 202  T
Q  312 actctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaact 411  Q
    |||||| || ||||||  ||||| ||||||||| |||||||  ||||| || || || || ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  203 actctgctggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtgatgagctttggtgtcttcctcataaatcctacagctgttcaccaaatcaggaaaaact 302  T
Q  412 ct 413  Q
    ||    
T  303 ct 304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 187 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 343 - 141
Alignment:
Q  187 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattat 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| | ||||| || ||||    
T  343 ctcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctgcaggagcatccttcttcttaggccgtctatcttcgaccatcctctgtttgcccttat 244  T
Q  284 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 383  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||  || ||||||  ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  243 cagcaggggcactgtaaggcttagggcgactcttctgacccttagtcttccgctcattcacgatcttgtaatgagccttagtatcctcatcataaatcct 144  T
Q  384 gca 386  Q
    |||    
T  143 gca 141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 17494 - 17112
Alignment:
Q  7 ccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgt 106  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||| |||||||  ||| ||||   | ||||| || | |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |    
T  17494 ccagttaaagcaaacactctaccagtagtcggcgcctgcttaggcttcttgcactgtgaaccaatgtgaccctcttcattgcagttaaagcatacaatat 17395  T
Q  107 ctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcacc 206  Q
    |   | | ||||| |||||||   ||||||| ||||| ||||| |||| |||  ||||| | ||| |||| ||  | || ||||||||||| ||||||||    
T  17394 catcatgtttgcactcagctagtgcatgacccttcttcccacatcggaaacatctcttggtatccccaggacaagcattactcttgtggcccttctcacc 17295  T
Q  207 acaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggc 303  Q
    ||||   ||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||| || ||| | ||||||||| | ||||| || |||||||| |||||||| || |||    
T  17294 acaagaaaaacaaacaatctctgtaggagcatccttcttcttaggtcgtctatcttcgaccatcctctgtttgcccttatcagcaggggcactataaggc 17195  T
Q  304 ttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 386  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| | |||| ||||||||| | |||||| | || ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  17194 ttagggcgactctgttgacccttagctttccgctcattcacaatcttgtaataagtcttggtatcctcctcatagatcctgca 17112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 283 - 386
Target Start/End: Original strand, 40496 - 40599
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  | | |||| |||  ||||| || ||||| || || ||||||| |||||| |    
T  40496 tcagcaggggcactgtacggtttaggacgactctgttgtcccatacctcttcgctcactcatcaccttataatgagcttttgtgtcctctttatagattc 40595  T
Q  383 tgca 386  Q
    ||||    
T  40596 tgca 40599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 386
Target Start/End: Original strand, 193 - 581
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||||||| ||||||| |||| |||||  | |||||||| | |||| |||||||| |||| || || |||||||    
T  193 tgagtaccagtcaaagcgaaaactctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactgagaaccaatgtgaccctcttcattacaattgaagcaca 292  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcaggg-cagacgttgctcttgtggcctt 199  Q
    |||||||  || | ||||| |||||||    |||||| ||||||||| | |||| |||  | || |  || ||| || ||  | ||||||||||||||||    
T  293 caatgtcattatgtttgcactcagctagtgaatgacccttcttaccaaatcggaaacatcttttaacctc-tcacggacaagcattgctcttgtggcctt 391  T
Q  200 tctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcact 296  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||   ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||| | ||||| || |||||||| ||||| ||    
T  392 tctcaccacaattaaaacaaacaatctcagcaggaacatccttcttccttggccgcctatcttcgaccatcctctgtttgcccttatcagcaggggcgct 491  T
Q  297 gtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 386  Q
     || |||||||| |||||||| || ||||||  ||||| ||||| ||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  492 ataaggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcatacacaaccttgtaatgagccttagtgtcctcctcataaatcctgca 581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 398
Target Start/End: Original strand, 291 - 667
Alignment:
Q  25 ctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtctgtacgattgcaatcag 124  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||||  | |||||||| |||||  |||||||| | ||||| || ||||||||||| ||  || | ||||||||||    
T  291 ctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcttgcactgagaactaatatgaccctcttctttgcaattgaagcacacaatatcattatgcttgcaatcag 390  T
Q  125 ctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaat 224  Q
    |||   ||||||| |||||||||||| ||| |||  | || |  || |  ||  | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  391 ctaatgcatgacccttcttaccacactggaaacatctttttacctctttcggaaaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaat 490  T
Q  225 ctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgt 321  Q
    ||| ||||   ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||  | ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| |||||||| ||     
T  491 ctcagcaggagcattcttcttcttaggtcgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggagcactatagggcttagggcgactctgctgg 590  T
Q  322 cccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaa 398  Q
    ||||||  ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||||| || |||||    
T  591 cccttagtcttccgctcattcaccatcttgtaatgagccttggtatcttcgtcataaattctacagctgttcaccaa 667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 11025 - 10643
Alignment:
Q  7 ccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgt 106  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||   | ||||| || | |||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||| |    
T  11025 ccagtcaaagcaaaaactctaccagtagccggcgccttcttaggcttcttgcactgtgaaccaatgtgaccctcttcattgtagttaaagcatacaatat 10926  T
Q  107 ctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcacc 206  Q
    |   | | ||||| |||||||   ||||||| ||||| ||||| |||| |||  | ||| | |||  ||| ||  | || ||||||||||| ||||||||    
T  10925 catcatgtttgcactcagctagtgcatgacccttcttcccacatcggaaacatctgttggtatccctaggacaagcattactcttgtggcccttctcacc 10826  T
Q  207 acaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggc 303  Q
    ||||   ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||||| ||  | ||||||||| | ||||| || |||||||| ||||||||||| |||    
T  10825 acaagaaaaacaaacaatctctgtaggagcatccttcttcttaggccgtctgtcttcgaccatcctctgtttgcccttatcagcaggggcactgtaaggc 10726  T
Q  304 ttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 386  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| | |||| ||||||||| | |||||| |||  ||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  10725 ttagggcgactcttttgacccttagctttccgctcattcacaatcttgtaatgaatcttggtatcctcctcatagatcttgca 10643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 386
Target Start/End: Original strand, 15070 - 15452
Alignment:
Q  7 ccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgt 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||   | ||||| || | |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |    
T  15070 ccagtcaaagcaaagactctaccagtagccgacgccttcttaggcttcttgcactgtgaaccaatgtgaccctcttcattgcagttaaagcatacaatat 15169  T
Q  107 ctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcacc 206  Q
        | | ||||| |||||||   ||| ||| ||||| ||||| |||| |||  | ||| | |||  ||| ||  | || | ||||||||| ||||||||    
T  15170 tatcatgtttgcactcagctagtgcataacccttcttcccacatcggaaacatctattggtatccctaggacaagcattacccttgtggcccttctcacc 15269  T
Q  207 acaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggc 303  Q
    ||||   ||| | |||||||||| ||   ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| | ||||| || |||||||| |||||||| || |||    
T  15270 acaagaaaaaaaaacaatctctgtaggagcatccttcttcttaggccgtctatcttcgaccatcctctgtttgcccttatcagcaggggcactataaggc 15369  T
Q  304 ttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 386  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| | |||| ||||||||| | |||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  15370 ttagggcgactctgttgacccttagctttccgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcctcctcatagatcctgca 15452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 386
Target Start/End: Original strand, 8569 - 8952
Alignment:
Q  7 ccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagta-cactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatg 105  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||| ||||   |  ||||| || | |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||     
T  8569 ccagtcaaagcaaacactctaccagtagtcggcgccttcttaggctttcttgcactgtgaaccaatgtgaccctcttcattgcagttaaagcatacaata 8668  T
Q  106 tctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcac 205  Q
    ||   | | ||||| ||||||| | ||||||| ||||| ||||| || | |||  ||||| | |||  ||| ||  | || ||||||||||| |||||||    
T  8669 tcatcatgtttgcactcagctagagcatgacccttctttccacagcgaaaacatctcttggtatccctaggacaagcattactcttgtggcccttctcac 8768  T
Q  206 cacaattgaaacacacaatctctgcagca---tccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacgg 302  Q
    |||||   ||||| |||||||| | || |   |||||||||||||| || ||| | ||||||||| | ||||| || |||||||| ||||||||||| ||    
T  8769 cacaagaaaaacaaacaatctcagtaggagtatccttcttcttaggtcgtctatcttcgaccatcctctgttttcccttatcagcaggggcactgtaagg 8868  T
Q  303 cttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 386  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | |||| ||||||||| | |||||| |||| ||| |||||||  ||||||||||||||    
T  8869 cttagggcgactctgttgacccttagctttccgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatccttctcatagatcctgca 8952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 10298 - 10041
Alignment:
Q  12 caaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtctgta 111  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||  | |||||||| | |||| |||||||| | ||||| || ||||||||||| ||  ||    
T  10298 caaagcaaaaactctaccagtagtcggcgccctcttaggctgcttgcactgagaaccaatgtgaccctcttccttgcaattgaagcacacaatatcacta 10199  T
Q  112 cgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaat 211  Q
     | || ||||||||||    |||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| |  |||||  | || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10198 tgcttacaatcagctaatgtatgacccttcttgccacaccggaaacatttctttacctcctctagacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaat 10099  T
Q  212 tgaaacacacaatctc---tgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccat 266  Q
    ||||||| ||||||||    | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  10098 tgaaacagacaatctccgtaggagcatccttcttcttaggccgtctatcatcgaccat 10041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1459 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold1459
Description:

Target: scaffold1459; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 132 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 1112 - 801
Alignment:
Q  132 atgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgca 231  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| |  ||||| || || ||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||   |||||| | |    
T  1112 atgacccttcttgccacaccggaaacatttctttacctcctctggacaaacaatgctcttgcggcctttctcgccacaattgaaacaggtaatctcagta 1013  T
Q  232 g---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttac 328  Q
    |   ||||||||||||||||||| ||  | || |||||| | ||| | |  |||||||| |||||||| || |||||||| | ||||||||| ||||||     
T  1012 ggaacatccttcttcttaggccgtctttcctctaccatcctctgtgtgcgcttatcagcaggggcactatagggcttagggcaactctgttggcccttag 913  T
Q  329 ccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgataccc 428  Q
     ||||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||  ||||||||||  | |||||| || ||    
T  912 tcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccctggtatcctcatcatagattctacagctattcaccaaatatggaaaaactcggatctgttggtatcc 813  T
Q  429 aatcgccctctt 440  Q
    || |||||||||    
T  812 aaacgccctctt 801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 184 - 384
Target Start/End: Original strand, 260 - 463
Alignment:
Q  184 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccat 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||  | ||||| || |    
T  260 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattaaagcagacaatctcagcaggaacatccttcttcttaggccgtctatcctcgaccattctctgtttgccct 359  T
Q  281 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagat 380  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |   ||||| ||||||||| | |||||| ||| |||| || || || ||||| ||    
T  360 tatcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctattgtcccctggtcttccgctcattcacaatcttgtaatgaaccttagtgtcatcctcataaat 459  T
Q  381 cctg 384  Q
    ||||    
T  460 cctg 463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 77 - 225
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||||||| |||| || |||| ||||  |||||||| || |||||  |||| ||  | | ||||||||  ||||    
T  77 tgagtaccagtcaaagcgaaaactctaccagtagtcggcaccttcttaggcttcgtacactgtgaactaatatgaccttcctcttcgcagttaagacaca 176  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccaca 149  Q
    |||||||| || | || || |||||||   ||||||| |||||||||||    
T  177 caatgtctttatgcttacactcagctagtgcatgacccttcttaccaca 225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 184 - 384
Target Start/End: Original strand, 30623 - 30826
Alignment:
Q  184 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccat 280  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||| ||||   ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||  | ||||| || |    
T  30623 ttgctcttgtggtctttctcaccacaattaaagcagacaatctcagcaggaacatccttcttcttagaccgcctatcctcgaccattctctgtttgcctt 30722  T
Q  281 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagat 380  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   ||||| ||||||||| | |||||| ||| |||| || ||||| ||||| ||    
T  30723 tatcagcaggggcactgtacggcttaggatgactctgttgtcccctggtcttccgctcattcacaatcttgtaatgaaccttagtgtcctcctcataaat 30822  T
Q  381 cctg 384  Q
    ||||    
T  30823 cctg 30826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 187 - 386
Target Start/End: Original strand, 11602 - 11804
Alignment:
Q  187 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgca---gcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattat 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| | ||||||||  | ||||| || ||||    
T  11602 ctcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctgcatgagcatccttcttcttaggccgcctatcttcgaccattctctgtttgcccttat 11701  T
Q  284 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 383  Q
    |||  || |||||||| |||||||| |||||||| || |||||| | |||| ||||||||| | |||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  11702 cagtaggagcactgtaaggcttagggcgactctgctgacccttagctttccgctcattcacaatcttgaaatgagccttggtatcctcctcataaattct 11801  T
Q  384 gca 386  Q
    |||    
T  11802 gca 11804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 187 - 371
Target Start/End: Original strand, 14423 - 14610
Alignment:
Q  187 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattat 283  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | ||||| || ||||    
T  14423 ctcttatggcctttctcgccacaagtaaaacagacaatctctgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcattgaccattctctgtttgcccttat 14522  T
Q  284 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctc 371  Q
    |||| | |||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||    
T  14523 cagcagaggcactataaggcttagggcgactctgttgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatcctc 14610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 14237 - 14331
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaa 95  Q
    ||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||   | ||||| || | |||| |||||||| ||||||| |||||    
T  14237 tgagtaccagtcagagcaaaaactctaccagtagccggcgccttcttaggcttcttgcactgtgaaccaatgtgaccctcttcattgcaattaaa 14331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 85 - 446
Target Start/End: Original strand, 3101 - 3465
Alignment:
Q  85 ttgcagttaaagcacacaatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgt 184  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| | | | |||||||||||||     ||||| ||||| |||||||||| ||||||||  |  |||||||| ||  |      
T  3101 ttgcaattaaagcacacgatgtcagcatgtttgcaatcagctaatgtgtgacccttcttgccacaccggaaacacttctccacctcctcaggacaagcag 3200  T
Q  185 tgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccatt 281  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||| ||||   ||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||| | ||||| || ||    
T  3201 tactcttgtggcctttctcaccacaattgaaagaagtaatctcagcaggaacatcctttttcttaggccgtctctcctcgaccatcctctgtttgccctt 3300  T
Q  282 atcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatc 381  Q
    |||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||  ||||| |||||| || |||||||| |||||  | || ||||| | ||| ||     
T  3301 atcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcctccttataaatt 3400  T
Q  382 ctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    ||| || |||| |||||||| ||||||||||  | |||||| || || ||||||||||| |||||    
T  3401 ctgtagttattcaccaaatctggaaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctcttaatgtc 3465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 30725 - 30349
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||| ||||| ||||||| |||| |  ||  | |||||||| | ||||  ||||||| ||||||| || |||||||    
T  30725 tgagtaccagtcaaagcgaaaactctactagtagtcggcgccttcttagattgcttgcactgagaaccaatgtaaccctcttcattgcaattgaagcaca 30626  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    ||| |||  || | |||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||  |||| |  ||  | || ||  | |||||||||||||||||    
T  30625 caaggtcattatgtttgcaatcagctagtgcatgacccttcttaccacatcggaaacatctctttacctctcctggacaagcattgctcttgtggccttt 30526  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactg 297  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||   ||||||||||| | |||||  || | ||||||||| | ||||| || |||||||| |||| |||     
T  30525 ctcaccacaattaaaacagacaatctcagcaggagcatccttcttccttggccgtttatcctcgaccatcctctgttttcccttatcagcaggggtacta 30426  T
Q  298 tacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttc 374  Q
    || ||| |||| |||||||| || || |||  ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||    
T  30425 tagggcctagggcgactctgctggcctttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcttc 30349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 164267 - 164107
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacc-cttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatc 381  Q
    ||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| |||| | ||| |||  |||||||| ||||| ||||| | ||| ||||| |||    
T  164267 tcagcaggggcactgtatgatttaggacgactctgctgtcctttacctcttcgt-tcactcatcaccttgtaatgagctttcgtgttctcctcatatatc 164169  T
Q  382 ctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgat 443  Q
    ||||||||| | ||||| || |  |||| ||| | ||  ||||||||||| || ||||||||    
T  164168 ctgcagctactcaccaactcggagaaaattctgatcttctgatacccaatggctctcttgat 164107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 383
Target Start/End: Original strand, 9106 - 9485
Alignment:
Q  7 ccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgt 106  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| || | |||| |||||||| |||||||||||||||  ||||| |    
T  9106 ccagtcaaagcaaaaactctaccagtagccggcgccttcttaggctgcttacactgtgaaccaatgtgaccctcttcattgcagttaaagcgtacaatat 9205  T
Q  107 ctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcacc 206  Q
    |   | | ||||| ||| |||   ||||||| ||||| ||||| |||| |||  ||||| | ||| |||| ||  | || ||||||||||| ||||||||    
T  9206 catcatgtttgcactcaactagtgcatgacccttcttcccacatcggaaacatctcttggtatccccaggacaagcattactcttgtggcccttctcacc 9305  T
Q  207 acaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggc 303  Q
    ||||   ||||| ||||||| |||   ||||||||||||||||||    ||| | ||||||||| | ||||| || |||||| | |||||||| || ||     
T  9306 acaagaaaaacaaacaatctttgcaggagcatccttcttcttaggttatctatcttcgaccatcctctgtttgcccttatcaccaggggcactataagga 9405  T
Q  304 ttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 383  Q
    ||||  ||||||||||| |||||| | |||| ||| ||||| | || ||| |||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  9406 ttagcgcgactctgttgacccttagctttccgctccttcacaatctagtaatgagtcttggtatcctcctcatagatcct 9485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 187 - 386
Target Start/End: Original strand, 230 - 432
Alignment:
Q  187 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattat 283  Q
    ||||||||||| ||||||||||||   ||||| |||||||||||||   ||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| | ||||| || ||||    
T  230 ctcttgtggcccttctcaccacaagaaaaacaaacaatctctgcaggagcatccttcttctttggccgtctatcttcgaccatcctctgttttcccttat 329  T
Q  284 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 383  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| || |||||| | |||| ||||||||| | |||||| |||| ||| ||||| || |||||||||||    
T  330 cagcaggggcactgtaaggcttagggagactctgctgacccttagctttccgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcttcctcatagatcct 429  T
Q  384 gca 386  Q
    |||    
T  430 gca 432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 283 - 387
Target Start/End: Original strand, 3303 - 3407
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||  | | |||| |||  ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  3303 tcagcaggggcactatacggcttcggacgactctgttgtcccttgcctctgcgctcactcatcaccttataatgagctttcgtatcctcttcatatatcc 3402  T
Q  383 tgcag 387  Q
    |||||    
T  3403 tgcag 3407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 184 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 50313 - 50108
Alignment:
Q  184 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccat 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| || |    
T  50313 ttgcttttgtggcctttctcaccacaattaaagcagacaatctcagcaggaacatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgccct 50214  T
Q  281 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagat 380  Q
    ||||||| ||||| || || ||||||||  ||||||| |  ||| || |||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || || ||    
T  50213 tatcagcaggggcgctataaggcttagggagactctgctagcccatagccttccgctcattcacgatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaat 50114  T
Q  381 cctgca 386  Q
    ||||||    
T  50113 cctgca 50108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 386
Target Start/End: Original strand, 8382 - 8764
Alignment:
Q  7 ccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgt 106  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||   | ||||| || | |||| |||| ||| ||| ||| |||||||| || || |    
T  8382 ccagtcaaagcaaaaactctaccagtagccggcgccttcttaggcttcttccactgtgaaccaatgtgaccttcttcatcgcaattaaagcatactatat 8481  T
Q  107 ctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcacc 206  Q
    |   | | ||||| |||||||   ||||||| ||||| ||||| || | |||| |||| |  |||  ||| ||  | || |||||||||||||||| |||    
T  8482 catcatgtttgcactcagctagtgcatgacccttctttccacagcgaaaacacctcttaacatccctaggacaagcattactcttgtggcctttctgacc 8581  T
Q  207 acaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggc 303  Q
    |||| | || || ||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||  |||||||||  | ||||| || ||||| ||  | |||||||| |||    
T  8582 acaagtaaagcagacaatctttgcaggagcatccttcttcttaggccgcctattatcgaccattctctgtttgcccttatcggcaagagcactgtaaggc 8681  T
Q  304 ttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 386  Q
    ||||| |||||||| || |||||| | |||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  8682 ttagggcgactctgctgacccttagctttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatcctcctcataaattctgca 8764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 4)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 185 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 17033 - 16775
Alignment:
Q  185 tgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccatt 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||   ||||||| |||||||| ||  |  | ||||||||| | ||||| || ||    
T  17033 tgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagcaggaacatcctttttcttaggtcgtttctcctcgaccatcctctgtttgccctt 16934  T
Q  282 atcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatc 381  Q
    |||||| |||||||| || |||||||| | |||||| || ||||||  ||||| |||||| || |||||||| |||||  | || ||||| |||||||||    
T  16933 atcagcaggggcactatatggcttagggctactctgctggcccttagtcttccgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcctcctcatagatc 16834  T
Q  382 ctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctctt 440  Q
    || ||||| || |||||||| |||||||||   | |||||| || || |||||||||||    
T  16833 ctacagctgttcaccaaatctggaaaaactgggatctgttggtatccgatcgccctctt 16775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 233 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 194784 - 194631
Alignment:
Q  233 catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttaccctt 332  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||  |||    
T  194784 catccttattcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttagtctt 194685  T
Q  333 cctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 386  Q
    ||  ||||| || | |||||| | |||||| || ||||| || || ||||||||    
T  194684 ccgttcatttacaatcttgtaataagccttagtgtcctcctcgtaaatcctgca 194631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 10 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 194980 - 194883
Alignment:
Q  10 gtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtc 107  Q
    ||||| ||||| || |||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||  || | |||| |||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  194980 gtcaacgcaaaaactctaccagtagtcggcgccttcttaggctgcgtacactacgaaccaatgtgaccctccttattgcaattaaagcacacaatgtc 194883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 21425 - 21297
Alignment:
Q  312 actctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaact 411  Q
    |||||| || ||||||  ||||| |||||| || |||||||| |||||  | || ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  21425 actctgctggcccttagtcttccgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcctcctcatagatcctacagctgttcaccaaatctggaaaaact 21326  T
Q  412 ctcaactgttgatacccaatcgccctctt 440  Q
       | |||||| || || |||||||||||    
T  21325 gggatctgttggtatccgatcgccctctt 21297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0611 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0611
Description:

Target: scaffold0611; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 187 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 9408 - 9220
Alignment:
Q  187 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattat 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||   |||||||||||| |||||||||| | ||||||||  |  |||| || ||||    
T  9408 ctcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctgcaggagcatccttcttctaaggccgcctatcttcgaccattctcggtttgcccttat 9309  T
Q  284 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctct 372  Q
    |||| |||||||| || |||||| | |||||||| || ||||||  ||||  ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||    
T  9308 cagcaggggcactataaggcttaaggcgactctgctgacccttagtcttcggctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctct 9220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 231 - 386
Target Start/End: Original strand, 6886 - 7041
Alignment:
Q  231 agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttaccc 330  Q
    |||||||||||||||||| || ||| | ||||||||| | ||||| |  |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||  |    
T  6886 agcatccttcttcttaggtcgtctatcttcgaccatcctctgtttgcacttatcagcaggggcactgtaaggcttagggcgactctgctgacccttagtc 6985  T
Q  331 ttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 386  Q
    |||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  6986 ttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatcctcctcgtagatcctgca 7041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0276 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0276
Description:

Target: scaffold0276; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 187 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 23888 - 23626
Alignment:
Q  187 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattat 283  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||  |||   ||||  || |||| |||| |||| ||||  ||||||| || || || || |    
T  23888 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtatcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgt 23789  T
Q  284 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 383  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  | ||| || ||||  || || || ||||||||||| ||    
T  23788 cagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgagttttggtgtcttcttcatagattct 23689  T
Q  384 gcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    ||| ||||||||||| || |  || ||||| | ||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  23688 gcacctattaaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagctcttttgatgtc 23626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 184 - 386
Target Start/End: Original strand, 2325 - 2530
Alignment:
Q  184 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccat 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||| | ||   |||| ||||||||||| || ||| |||| |||||  | | ||| || |    
T  2325 ttgctcttgtggcctttctcaccacaagtatagcacacaatctcagtaggaacatctttcttcttagggcgtctatcatcaaccattctctattttccct 2424  T
Q  281 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagat 380  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||| | ||||||||| | |||||| |||| ||| |||||||| || || ||    
T  2425 tatcagcaagggcactgtaaggcttaggacgactctgttgacccttggcctttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcctcctcgtaaat 2524  T
Q  381 cctgca 386  Q
    ||||||    
T  2525 cctgca 2530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 133 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 28947 - 28631
Alignment:
Q  133 tgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag 232  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| |  |||| ||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||  ||||    
T  28947 tgacccttcttgccacaccggaaacatttctttacctccttaggacaaacattgctcttgtggcctttctcgccacaattgaaacaggtaatcttagcag 28848  T
Q  233 ---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacc 329  Q
       ||||||||||||||||||| ||  | ||||||||  | ||||| || |||||| | |||||||| || |||||||| | || ||| || ||||||      
T  28847 gaacatccttcttcttaggccgtctctcctcgaccattctctgtttgcccttatcaacaggggcactatatggcttagggcaacactgctggcccttagt 28748  T
Q  330 cttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgataccca 429  Q
    ||||  |||||| || |||||||| |||||  | || ||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||||||| ||  | |||||| || ||     
T  28747 cttctgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcctcctcgtagattctgcagctgttcactaaatctggaaaaattcggatctgttggtatccg 28648  T
Q  430 atcgccctcttgatgtc 446  Q
    ||||||||||| |||||    
T  28647 atcgccctcttaatgtc 28631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 187 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 23910 - 23708
Alignment:
Q  187 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgca---gcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattat 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||  ||   | ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||  | ||||| || ||||    
T  23910 ctcttgtggcctttctcaccacaagtataacagacaatctcaacatgagtatctttcttcttaggccacctatcatcaaccattctctgtttgcccttat 23811  T
Q  284 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 383  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||||||||| || || ||| | |||  ||||||||| | ||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  23810 cagcaggagcactgtatggcttaggacgactctgctgacctttagctttctgctcattcacaatcttataatgagccttggtatcctcctcataaatcct 23711  T
Q  384 gca 386  Q
    |||    
T  23710 gca 23708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 187 - 398
Target Start/End: Original strand, 42074 - 42288
Alignment:
Q  187 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattat 283  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||  |||   ||||  || |||| |||| |||| ||||  ||||||| || || || || |    
T  42074 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgt 42173  T
Q  284 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 383  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||  | ||| || ||||| || || || ||||||||||| ||    
T  42174 cagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgagctttggtgtcttcttcatagattct 42273  T
Q  384 gcagctattaaccaa 398  Q
    ||| |||||||||||    
T  42274 gcacctattaaccaa 42288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 296 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 11596 - 11461
Alignment:
Q  296 tgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaac 395  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || |||||||| ||||| || || |||||    
T  11596 tgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcataaatcctacacctgttaac 11497  T
Q  396 caaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaat 431  Q
    ||| |||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  11496 caactccgaaaagactctgatctgttgatacccaat 11461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 298 - 390
Target Start/End: Original strand, 5890 - 5982
Alignment:
Q  298 tacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagcta 390  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||  | | |||| |||  |||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5890 tacggcttcggacgactatgttgtcccttacctctgcgctcactcatcaccttgtaataagctttcgtatcctcttcatatatcctgcagcta 5982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 370
Target Start/End: Original strand, 1135 - 1507
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||| ||||   ||||||| || | |||| |||||||   |||||| ||||||||||    
T  1135 tgagtaccagtcaaagcaaaaactctaccagtagtcggcgccttcttaggcttcttacactgtgaaccaatgtgaccctcctaattgcaattaaagcaca 1234  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    |||||||     | || || |||||||    ||||||||||||||||||  | | |||  |||| |  ||| |||| ||  | || ||||||||||||||    
T  1235 caatgtcatcgtgcttacactcagctagtgtatgacctttcttaccacagggaaaacatctctttacatccccaggacaagcattactcttgtggccttt 1334  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagca---tccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactg 297  Q
    |||||||||| |  |||| ||||||||  ||| |   ||| ||||  | || |||||| |||| |||||  | ||||| || |||||||| || ||||||    
T  1335 ctcaccacaagtataacaaacaatctcaacaggagcttccatctttctcgggcgcctatcatcaaccattctctgtttacccttatcagcaggagcactg 1434  T
Q  298 tacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcct 370  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||||   |||||  |||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  1435 taaggcttagggcgactctgttggcccttggtcttccgttcattcacaatcttgtaatgagccttcgtatcct 1507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 184 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 30294 - 30086
Alignment:
Q  184 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccat 280  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||| ||||   |||| ||| |||| |||| |||  ||||   |||||| |||||||| |    
T  30294 ttgctcttgtggcctttttcaccacacttataacaaacaatctcagcaggagcatctttcctcttgggcctcctgtcatcattcatcttctgtttccctt 30195  T
Q  281 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagat 380  Q
    | ||||| || |||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||| || || ||| ||||| || || ||||| ||||| ||    
T  30194 tgtcagcaggagcactgtaaggtttaggacgattctgttatcccttacccctcctctcactcattatctagtaatgagcttttgtgtcctcctcatatat 30095  T
Q  381 cctgcagct 389  Q
    |||||||||    
T  30094 cctgcagct 30086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 54; Significance: 7e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 292 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 98440 - 98343
Alignment:
Q  292 gcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagct 389  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  98440 gcactatatggcttcggacgactctgttgtcccttacctctcctttcactcattaccttgtaatgagccttcgtatcctcttcattgatcctacagct 98343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 292 - 401
Target Start/End: Original strand, 176434 - 176543
Alignment:
Q  292 gcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctat 391  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||  | | |||| |||  ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||     
T  176434 gcactatacggtttcggacgactctgctgtcccttacctctacgctcactcatcaccttataatgagcttttgtatcctcttcatagatcctacagctac 176533  T
Q  392 taaccaaatc 401  Q
    | ||||||||    
T  176534 tcaccaaatc 176543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 229
Target Start/End: Original strand, 176326 - 176368
Alignment:
Q  187 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctg 229  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  176326 ctcttgtggcctttttcaccacacttgaaacagacaatctctg 176368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 259 - 386
Target Start/End: Original strand, 19812 - 19939
Alignment:
Q  259 tcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgag 358  Q
    ||||||||| | ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||| | |||| ||||||||| | |||||| ||||    
T  19812 tcgaccatcctctgttttcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgctgacccttagctttccgctcattcacaatcttgtaatgag 19911  T
Q  359 ccttcgtatcctcttcatagatcctgca 386  Q
     ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  19912 tcttggtatcctcctcatagatcctgca 19939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 184 - 398
Target Start/End: Original strand, 797 - 1014
Alignment:
Q  184 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccat 280  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||| | ||   ||||  || ||||||||| |||| |||| | || ||| |  || || |    
T  797 ttgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttaggcctcctatcatcaatcaacttctactttcctt 896  T
Q  281 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagat 380  Q
    | ||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || |||||||| ||    
T  897 tgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcataaat 996  T
Q  381 cctgcagctattaaccaa 398  Q
     ||||| || ||||||||    
T  997 tctgcatctgttaaccaa 1014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1517 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1517
Description:

Target: scaffold1517; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 184 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 1455 - 1247
Alignment:
Q  184 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccat 280  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||| ||||   ||||  || |||| |||| |||| ||||   ||| || ||||| || |    
T  1455 ttgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacagacaatctcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcattcattttctgttttccct 1356  T
Q  281 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagat 380  Q
    | ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||  |||||||| ||||| || || || || ||||| ||    
T  1355 tgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgtcccttacctctcctctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtgtcttcctcatatat 1256  T
Q  381 cctgcagct 389  Q
    ||| |||||    
T  1255 cctacagct 1247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1299 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1299
Description:

Target: scaffold1299; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 283 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 1714 - 1608
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||  |||||||| ||||| || | ||| || |||||||| |    
T  1714 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgttttcccttacccctccgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgaatcttcctcatagattc 1615  T
Q  383 tgcagct 389  Q
    |||||||    
T  1614 tgcagct 1608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 280 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 9656 - 9550
Alignment:
Q  280 ttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcataga 379  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||| |||  ||||| || ||||| || || ||||| |||||||    
T  9656 ttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcataga 9557  T
Q  380 tcctgca 386  Q
    |||||||    
T  9556 tcctgca 9550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 187 - 386
Target Start/End: Original strand, 356 - 558
Alignment:
Q  187 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgca---gcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattat 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  | || ||||||||  ||   ||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||  |  |||| || ||||    
T  356 ctcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatctccacaagagcatctttcttcttaggccacctatcatcaaccattctcggtttacccttat 455  T
Q  284 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 383  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||||||||| || || ||  | |||  ||||||||| | ||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  456 cagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgacctttggctttctgctcattcacaatcttataatgagccttggtatcctcctcatatatcct 555  T
Q  384 gca 386  Q
    |||    
T  556 gca 558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 187 - 386
Target Start/End: Original strand, 4773 - 4975
Alignment:
Q  187 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgca---gcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattat 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  | || ||||||||  ||   ||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||  |  |||| || ||||    
T  4773 ctcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatctccacaagagcatctttcttcttaggccacctatcatcaaccattctcggtttacccttat 4872  T
Q  284 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 383  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||||||||| || || ||  | |||  ||||||||| | ||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  4873 cagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgacctttggctttctgctcattcacaatcttataatgagccttggtatcctcctcatatatcct 4972  T
Q  384 gca 386  Q
    |||    
T  4973 gca 4975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 271 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 40385 - 40270
Alignment:
Q  271 tgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcct 370  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||| | ||||||||| | |||||| |||| ||| |||||||    
T  40385 tgttttcccttatcagcaggggcactgtaaggcttaggacgactctgttgacccttggcctttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcct 40286  T
Q  371 cttcatagatcctgca 386  Q
    | || || ||||||||    
T  40285 cctcgtaaatcctgca 40270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1433 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1433
Description:

Target: scaffold1433; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 283 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 1177 - 1071
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  | | |||| |||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1177 tcagcaggagcactgtatggcttcggacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatcctcttcatagatcc 1078  T
Q  383 tgcagct 389  Q
    | |||||    
T  1077 tacagct 1071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 283 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 411 - 305
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||  |||||||| ||||| || | ||| || || ||||| |    
T  411 tcagcagggggactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccctccgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgaatcttcctcgtagattc 312  T
Q  383 tgcagct 389  Q
    |||||||    
T  311 tgcagct 305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 283 - 389
Target Start/End: Original strand, 8182 - 8288
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  | | |||| |||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8182 tcagcaggagcactgtatggcttcggacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatcctcttcatagatcc 8281  T
Q  383 tgcagct 389  Q
    | |||||    
T  8282 tacagct 8288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 231 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 66448 - 66302
Alignment:
Q  231 agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttaccc 330  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||| | || |||||  | ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||  |    
T  66448 agcatccttcttccttggccgtctatcctcaaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtc 66349  T
Q  331 ttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcata 377  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  66348 ttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcttcctcata 66302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 69566 - 69366
Alignment:
Q  7 ccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgt 106  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||| |||| || |||| ||||   | |||||||| | |||| |||||||| | ||||| || ||||||||||| |    
T  69566 ccagccaaagccaaaaccctaccagtagtcggcaccttcttaggctacttgcactgagaaccaatgtgaccctcttctttgcaattgaagcacacaatat 69467  T
Q  107 ctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcacc 206  Q
     | || | |||||||||||||   ||||||| |||||||||||| ||| |||  | || |  || || || ||  | |||||||||||||||||||||||    
T  69466 at-tatgcttgcaatcagctaatgcatgacccttcttaccacactggaaacatctttttacctcttccggacaagcattgctcttgtggcctttctcacc 69368  T
Q  207 ac 208  Q
    ||    
T  69367 ac 69366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 514321 - 514125
Alignment:
Q  184 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccat 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | ||   ||||  || ||||||||| |||| ||||   |||||| |  || || |    
T  514321 ttgctcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttaggcctcctatcatcattcatcttcttctttcctt 514222  T
Q  281 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcata 377  Q
    | ||||| || ||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || ||||||||    
T  514221 tgtcagcaggagcactttaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcata 514125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 2408 - 2125
Alignment:
Q  7 ccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgt 106  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||||||| || |||| ||||   ||||||  || | |||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||| |    
T  2408 ccagtcagagcaaaaactctaccagtagccggcaccttcttaggctacttacactatgaaccaatgtgaccctcttcattgtagttaaagcatacaatat 2309  T
Q  107 ctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggcctttctcacc 206  Q
    |   | | ||||| |||||||   ||||||| ||||| ||||| |||| |||  ||||| | ||| |||| ||  | || ||||||||||| || |||||    
T  2308 catcatgtttgcactcagctagtgcatgacccttcttcccacatcggaaacatctcttggtatccccaggacaagcattactcttgtggcccttgtcacc 2209  T
Q  207 acaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagc 287  Q
    ||||   ||||| ||||||||| |||   ||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  2208 acaagaaaaacaaacaatctctacaggagcatccttcttcttcggccgtctatcttcgaccatcctctgtttgcccttatcagc 2125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 310 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 1471 - 1395
Alignment:
Q  310 cgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 386  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||  |||||||| | |||||| |||| ||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  1471 cgactctgttgacccttagctttccgttcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcctcctcataaatcctgca 1395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 269 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 17364 - 17187
Alignment:
Q  269 tttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatc 368  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | | |||| |||  ||||| || ||||| || || ||    
T  17364 tttgttttcccttgtcagcaggggcactgtacggtttaggacgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagcttttgtgtc 17265  T
Q  369 ctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    ||| |||||||||||||| | ||| |||||||| |  || | ||| | |||||| ||||| || || |||||||||||    
T  17264 ctcctcatagatcctgcaacgatttaccaaatcagagaagattctaatctgttgctaccctatggctctcttgatgtc 17187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 289 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 4709 - 4669
Alignment:
Q  289 ggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacc 329  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  4709 ggggcactgtacggtttaggacgactctgctgtcccttacc 4669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1426 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1426
Description:

Target: scaffold1426; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 187 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 1572 - 1310
Alignment:
Q  187 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattat 283  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||| | ||   ||||  || ||||||||| |||| ||||   |||||| || || || || |    
T  1572 ctcttgtgtcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttaggcctcctatcatcactcatcttctgctttcctttgt 1473  T
Q  284 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 383  Q
    |||| || |||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||| ||  ||||| ||||| || || || |||||||| || ||    
T  1472 cagcaggagcactgtaaggcttatgacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatgttgtaatgagctttggtgtcttcttcataaattct 1373  T
Q  384 gcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
     || || |||||||| || |  || ||||| | ||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  1372 acacctgttaaccaactcagagaagactcttatctgctgatacccaatagctcttttgatgtc 1310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 270 - 386
Target Start/End: Original strand, 11453 - 11569
Alignment:
Q  270 ttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcc 369  Q
    |||||| || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||     
T  11453 ttgtttgcccttatcagcaggggcactataaggcttgggacgactttgctgacccttgcctttcctctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatct 11552  T
Q  370 tcttcatagatcctgca 386  Q
    || ||||| || |||||    
T  11553 tcctcatatattctgca 11569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 187 - 398
Target Start/End: Original strand, 480 - 694
Alignment:
Q  187 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattat 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||  |||   ||||||| ||||| || || ||  | ||||||||| | ||||| || ||||    
T  480 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcaacaggaacatcctttttcttgggtcgtctctcctcgaccatcctctgtttgcccttat 579  T
Q  284 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 383  Q
    || | |||| ||| || |||||||| |||||||| || ||||||  ||||| |||||| || |||||||| |||||  | || ||||| ||||| || ||    
T  580 caacaggggaactataaggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcctcctcataaattct 679  T
Q  384 gcagctattaaccaa 398  Q
    ||| ||||| |||||    
T  680 gcaactattcaccaa 694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 187 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 4520 - 4318
Alignment:
Q  187 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattat 283  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |  | || ||||||||  |||   |||| |||||||||||||||||| |||| |||||  | |||||  | ||||    
T  4520 ctcttgtggcctttttcaccacaagtatagcagacaatctccacaggagcatctttcttcttaggccgcctatcatcaaccattctctgtttatccttat 4421  T
Q  284 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 383  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||||||||| || || ||    |||| ||||||||| | |||||| | || ||| |||||||| ||||| |||||    
T  4420 cagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgacctttggttttccgctcattcacaatcttgtaataagtcttggtatcctcctcatatatcct 4321  T
Q  384 gca 386  Q
    |||    
T  4320 gca 4318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 292 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 66965 - 66817
Alignment:
Q  292 gcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctat 391  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || || ||||| ||||||||||| |    
T  66965 gcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttgcccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcctcataaatcctgcagctgt 66866  T
Q  392 taaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctctt 440  Q
    | |||||||| |  || ||||| | ||| ||||||||||| || |||||    
T  66865 ttaccaaatcagagaacactctgatctgctgatacccaatagctctctt 66817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1845 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1845
Description:

Target: scaffold1845; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 1272 - 1067
Alignment:
Q  184 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgc---agcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccat 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||   ||||||  || |||| || | |||| ||||   |||||| || || || |    
T  1272 ttgctcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagcaggagcatctctcctcttgggtctcctatcatcattcatcttctgctttcctt 1173  T
Q  281 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagat 380  Q
    | ||||| || |||||||| |||||||||||| |||  |||||||| ||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || ||||| || ||    
T  1172 tgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattcttctgtccctttcccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcgtaaat 1073  T
Q  381 cctgca 386  Q
    ||||||    
T  1072 cctgca 1067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 283 - 446
Target Start/End: Original strand, 30348 - 30511
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||| |  |||||| ||||| || || || |||||||| || |    
T  30348 tcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgtcccttgcccctcctctcactcattgtcttgtaatgagctttggtgtcttcttcataaattc 30447  T
Q  383 tgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    |||| || |||||||| || |  || ||||| | ||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  30448 tgcaactgttaaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagctctattgatgtc 30511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 226
Target Start/End: Original strand, 30267 - 30312
Alignment:
Q  181 acgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatct 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  30267 acgttgcttttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatct 30312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0765 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0765
Description:

Target: scaffold0765; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 283 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 6123 - 6077
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacc 329  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6123 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacc 6077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 216289 - 216199
Alignment:
Q  280 ttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcct 370  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  216289 ttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactttgctgacccttgcctttcctctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcct 216199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 14145 - 14028
Alignment:
Q  269 tttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatc 368  Q
    ||||||| || |||||| | || |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  14145 tttgttttcccttatcatcaggagcactgtaaggctttggacgactttgctgacccttgcctttcctctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatc 14046  T
Q  369 ctcttcatagatcctgca 386  Q
     || ||||| || |||||    
T  14045 ttcctcatatattctgca 14028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 386
Target Start/End: Original strand, 15834 - 15951
Alignment:
Q  269 tttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatc 368  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||  |   ||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  15834 tttgtttgcccttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactttgcggaaacttgcctttcctctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatc 15933  T
Q  369 ctcttcatagatcctgca 386  Q
    ||| |||||||| |||||    
T  15934 ctcctcatagattctgca 15951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Original strand, 3704 - 4023
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| |||||||| ||||| || |||||||||| | ||||| |||| ||||   | ||||| || | |||| |||| ||  ||||||| ||||||||||    
T  3704 tgagtaccagtcaatgcaaaaactctaccagtagtctgcgccttcttaggcttcttgcactgtgaaccaatgtgaccttcctcattgcaattaaagcaca 3803  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccggacacacttcttgatttcctcagggcagacgttgctcttgtggccttt 200  Q
    |||| ||   |   ||||| |||||||   ||||||||||||||||||| || | |||| |||| |  ||| |||| ||  | || ||||||||| ||||    
T  3804 caatatcatcatttttgcactcagctagtgcatgacctttcttaccacaacgaaaacacctcttcacatccccaggacaagcattactcttgtggtcttt 3903  T
Q  201 ctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattatcagcgggggcactg 297  Q
    | ||||| || |  | || ||||| || ||||   |||| |||||||||||||||||| |||| |||||  | ||||| || |||||||| || ||||||    
T  3904 cacaccataagtatagcagacaatttcagcaggagcatctttcttcttaggccgcctatcatcaaccattctctgtttacccttatcagcaggagcactg 4003  T
Q  298 tacggcttaggacgactctg 317  Q
    || | |||||||||||||||    
T  4004 taagacttaggacgactctg 4023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 34866 - 34713
Alignment:
Q  1 tgagtcccagtcaaagcaaagaccctaccagtagccggcgccctcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcaca 100  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||| ||| |  ||||||| || | |||| |||||||| |||| ||||| |||||||    
T  34866 tgagtaccagtcaaagcgaaaaccctaccagtagtcggcgccttcttaggcagcttacactgcgaaccaatgtgaccctcttcattacagttgaagcaca 34767  T
Q  101 caatgtctgtacgattgcaatcagctacaacatgacctttcttaccacaccgga 154  Q
    |||| ||  || | ||||| |||||||   |||| || ||||||||||| ||||    
T  34766 caatatcattatgtttgcactcagctagtgcatggcccttcttaccacatcgga 34713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 386
Target Start/End: Original strand, 42058 - 42173
Alignment:
Q  271 tgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcct 370  Q
    ||||| || |||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||| || || ||  | || | ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  42058 tgtttacccttatcagcagaagcactgtaaggcttaggacgactctgctgacctttgacttttcgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatcct 42157  T
Q  371 cttcatagatcctgca 386  Q
    | ||||||||||||||    
T  42158 cctcatagatcctgca 42173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 386
Target Start/End: Original strand, 75778 - 75893
Alignment:
Q  271 tgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcct 370  Q
    ||||| || |||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||| || || ||  | || | ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  75778 tgtttacccttatcagcagaagcactgtaaggcttaggacgactctgctgacctttgacttttcgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatcct 75877  T
Q  371 cttcatagatcctgca 386  Q
    | ||||||||||||||    
T  75878 cctcatagatcctgca 75893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 386
Target Start/End: Original strand, 9958 - 10160
Alignment:
Q  187 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattat 283  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |  |||| ||||||||  |||   |||| |||||| |||| |||||  |||| |||||  ||||||| || ||||    
T  9958 ctcttatggcctttctcaccacaagtacaacatacaatctcgacaggagcatctttcttcctagggcgcctctcatcaaccattctttgtttacccttat 10057  T
Q  284 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 383  Q
     ||| || |||||||| ||||||||||||||||| || ||  |  | |||| ||||||||| | |||||| |||| ||| |||||||| ||||| || ||    
T  10058 tagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgacctgtggctttccgctcattcacgatcttgtaatgagtcttggtatcctcctcataaattct 10157  T
Q  384 gca 386  Q
    |||    
T  10158 gca 10160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 182 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 33342 - 33132
Alignment:
Q  182 cgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttccc 278  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  |||   ||||  || |||| |||| |||  ||||   |||| | ||||| ||    
T  33342 cgttgctcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatttcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattcatcctctgttttcc 33243  T
Q  279 attatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatag 378  Q
     || ||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  |||||||| ||||| || || || || |||||     
T  33242 tttgtcagcaggagcactgtatggtttaggacgactctgctgtcccttaccccttcgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtgtcttcctcatat 33143  T
Q  379 atcctgcagct 389  Q
    |||||||||||    
T  33142 atcctgcagct 33132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 292 - 440
Target Start/End: Original strand, 17686 - 17834
Alignment:
Q  292 gcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctat 391  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| || ||| || ||||| || || || |||||||| || ||||| || |    
T  17686 gcactgtaaggcttaggacgactctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttataatgagctttggtgtcttcttcataaattctgcaactgt 17785  T
Q  392 taaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctctt 440  Q
    | ||||| || |  || ||||| | ||| ||||||||||| || |||||    
T  17786 ttaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagctctctt 17834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1530 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1530
Description:

Target: scaffold1530; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 446
Target Start/End: Original strand, 942 - 1105
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||||||  ||||||| ||||| || |    
T  942 tcagcaggagcactatatggtttaggacgactctgttgtcccttacctctgcgctcactcatcaccttgtaatgagccttattatcctcctcatatattc 1041  T
Q  383 tgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    |||||||| | ||||| || |  |||| ||| | ||  ||||||||||| || |||||||||||    
T  1042 tgcagctactcaccaactcagagaaaattctaatcttctgatacccaatggctctcttgatgtc 1105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0457 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0457
Description:

Target: scaffold0457; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 13920 - 13757
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||| || ||| || ||||| || || || ||||||||||| |    
T  13920 tcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttttaatgagctttggtgtcttcttcatagattc 13821  T
Q  383 tgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    | || || |||||||| || |  || ||||| | ||| ||||| | ||| || |||||||||||    
T  13820 tacacctgttaaccaactcagagaagactctgatctgctgatatctaatagctctcttgatgtc 13757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 62638 - 62531
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||  | | |||| |||  |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  62638 tcagcaggggcactatacggcttcggacgactctgctgccccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtatcctcttcatatatcc 62539  T
Q  383 tgcagcta 390  Q
    ||||||||    
T  62538 tgcagcta 62531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 280 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 65191 - 65081
Alignment:
Q  280 ttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcataga 379  Q
    |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||  | | |||||| |||  |||||||| ||||| || |||||||||||||| |    
T  65191 ttatcagcaggggcactatatggcttcgggcgactctgttgtccattattccttctctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcttcataaa 65092  T
Q  380 tcctgcagcta 390  Q
    | |||||||||    
T  65091 ttctgcagcta 65081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 280 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 1291 - 1185
Alignment:
Q  280 ttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcataga 379  Q
    |||||||| || | |||||| ||||| |||||| ||||||| | |||||| ||||||||| ||||  ||||||  ||||| ||||||||||| |||||||    
T  1291 ttatcagcaggagtactgtaaggctttggacgattctgttgactcttacctttcctctcactcacagccttgtgatgagctttcgtatcctcctcataga 1192  T
Q  380 tcctgca 386  Q
    | |||||    
T  1191 ttctgca 1185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 283 - 389
Target Start/End: Original strand, 50543 - 50649
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||| ||  | | |||| |||  |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  50543 tcagcaggggcactatacggcttcggaccactctgctgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatcttcttcatagatcc 50642  T
Q  383 tgcagct 389  Q
    | |||||    
T  50643 tacagct 50649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 293 - 386
Target Start/End: Original strand, 5536 - 5629
Alignment:
Q  293 cactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 386  Q
    ||||||| |||||  ||||||| || || | | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  5536 cactgtaaggctttagacgactttgctgactcctacccttcctctcattcacaaccttgtaatgagctttcgtatcttcctcatagattctgca 5629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 283 - 431
Target Start/End: Original strand, 11415 - 11563
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||| ||| || |||||| ||||| || || || || ||||| ||||    
T  11415 tcagcaggagcactataaggcttaggacgaatctgctgacccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcctcataaatcc 11514  T
Q  383 tgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaat 431  Q
    ||||||| || ||||| || |  || ||||| | ||| |||||||||||    
T  11515 tgcagctgtttaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaat 11563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 107
Target Start/End: Original strand, 11173 - 11236
Alignment:
Q  44 tcttcggctgagtacactgagagctaatgcgaccctctccattgcagttaaagcacacaatgtc 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||| ||||||||||  |||| ||||||||    
T  11173 tcttcggctgagtacactgtgagctgatatgaccctcttcattgcagttgtagcagacaatgtc 11236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 390
Target Start/End: Original strand, 5479 - 5598
Alignment:
Q  271 tgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacc-cttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcc 369  Q
    ||||| || |||||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||| |||  |||||||| ||||| || |||||     
T  5479 tgttttcccttatcagcaggagcactatatggtttaggacgactctgttgtcctttacctcttcgt-tcactcatcaccttgtaatgagctttagtatct 5577  T
Q  370 tcttcatagatcctgcagcta 390  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  5578 tcttcatatatcctgcagcta 5598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 386
Target Start/End: Original strand, 48069 - 48271
Alignment:
Q  187 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattat 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  | || ||||||||  |||   |||| |||||  |||| |||||  |||| |||||  | ||||| || ||||    
T  48069 ctcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatctcaacaggagcatctttctttctagggcgcctctcatcaaccattctctgtttacccttat 48168  T
Q  284 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 383  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||||||||| || || ||  | || | ||||||||| | |||||| |||| ||| |||||||| ||||| || ||    
T  48169 cagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgacctttggcttttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcctcctcataaattct 48268  T
Q  384 gca 386  Q
    |||    
T  48269 gca 48271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 110872 - 110670
Alignment:
Q  187 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattat 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  | || ||||||||  |||   |||| |||||  |||| |||||  |||| |||||  | || ||||| ||||    
T  110872 ctcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatctcaacaggagcatctttctttctagggcgcctctcatcaaccattctctgcttccccttat 110773  T
Q  284 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 383  Q
    | || || |||||||  ||||||||||| ||||| || || ||  | |||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  110772 cggcaggagcactgtgaggcttaggacggctctgctgacctttgactttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcataaatcct 110673  T
Q  384 gca 386  Q
    |||    
T  110672 gca 110670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 386
Target Start/End: Original strand, 18280 - 18386
Alignment:
Q  280 ttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcataga 379  Q
    |||||||| || ||| |||| ||||| |||||||| |  || || ||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||| |||||||| |    
T  18280 ttatcagcaggagcattgtaaggctttggacgacttttctgacctttacctttcctctcattcacagccttgtaatgagctttggtatcttcttcataaa 18379  T
Q  380 tcctgca 386  Q
    | |||||    
T  18380 ttctgca 18386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 283 - 443
Target Start/End: Original strand, 263664 - 263824
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  | | |||| |||  ||||| || ||| | || || ||||| ||||||||||    
T  263664 tcagcaggggcactgtacggcttaagacgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgaactttggtgtcctcctcatagatcc 263763  T
Q  383 tgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgat 443  Q
    |||| | | | |||||||| |  |||| ||| | |||||| ||||| || || ||||||||    
T  263764 tgcaacgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtaccctatggctctcttgat 263824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 283 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 64468 - 64305
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||  | | |||| |||  ||||| || ||||| || |  ||||| ||||| ||||    
T  64468 tcagccggggcactatacggtttaggacgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagcttttgagtcctcctcatatatcc 64369  T
Q  383 tgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    |||| | | | |||||||| |  |||| ||| | |||||||||||| || || |||||||||||    
T  64368 tgcaacgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttgataccctatggctctcttgatgtc 64305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 283 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 49046 - 48883
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||  | | |||| |||  ||||| || ||||| || |  ||||| ||||| ||||    
T  49046 tcagccggggcactatacggtttaggacgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagcttttgagtcctcctcatatatcc 48947  T
Q  383 tgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    |||| | | | |||||||| |  |||| ||| | ||| |||||||| || || |||||||||||    
T  48946 tgcaacgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgctgataccctatggctctcttgatgtc 48883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 283 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 58080 - 57917
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||  | | |||| |||  ||||| || ||||| || |  ||||| ||||| ||||    
T  58080 tcagccggggcactatacggtttaggacgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagcttttgagtcctcctcatatatcc 57981  T
Q  383 tgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    |||| | | | |||||||| |  |||| ||| | ||| |||||||| || || |||||||||||    
T  57980 tgcaacgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgctgataccctatggctctcttgatgtc 57917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 283 - 389
Target Start/End: Original strand, 30062 - 30168
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||  | | |||| |||  |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  30062 tcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtgtcctcctcataaatcc 30161  T
Q  383 tgcagct 389  Q
    | |||||    
T  30162 tacagct 30168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2165 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold2165
Description:

Target: scaffold2165; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 771 - 615
Alignment:
Q  184 ttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccat 280  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||| | ||   ||||  || ||||||||| |||| ||||   |||||| || || || |    
T  771 ttgctcttgtggcctttctcaccaaacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttaggcctcctatcatcattcatcttctgctttcctt 672  T
Q  281 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctct 337  Q
    | |||   || |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  671 tgtcaataggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctct 615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 5768 - 5662
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||| ||  | | |||| |||  |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  5768 tcagcaggagcactatacggcttcggatgactctgctgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatcttcttcatagatcc 5669  T
Q  383 tgcagct 389  Q
    | |||||    
T  5668 tacagct 5662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 353 - 307
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacc 329  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  353 tcagcaggggcactgtacggcttagggtgactctgttgtcccttacc 307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 390
Target Start/End: Original strand, 21153 - 21359
Alignment:
Q  187 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcag---catccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttcccattat 283  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||   ||||  || |||| |||| |||  ||||   || | | ||||| || || |    
T  21153 ctcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcagcagaagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattcagcctctgttttcctttgt 21252  T
Q  284 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcct 383  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||| || || | |||| |||  |||||||| ||||| ||| |||| || ||||| || ||    
T  21253 cagcaggggcactatacggtttaggacgactctactgtcccttgcctttacgctcactcatcaccttgtaatgagctttcctatcttcctcatatattct 21352  T
Q  384 gcagcta 390  Q
    |||||||    
T  21353 gcagcta 21359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 16478 - 16372
Alignment:
Q  280 ttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcataga 379  Q
    |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| || | ||||||| ||| |||| |||  |||||||| ||||| || ||||| || |||||||    
T  16478 ttatcagcaggagcactataaggctttggacgactctgctgactcttacccctccgctcactcataaccttgtaatgagctttggtatcttcctcataga 16379  T
Q  380 tcctgca 386  Q
    |||||||    
T  16378 tcctgca 16372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 289 - 386
Target Start/End: Original strand, 2275 - 2372
Alignment:
Q  289 ggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 386  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | | |||| |||  ||||| || ||||| || || ||||| ||||||||| ||||    
T  2275 ggggcactgtacggtttaggacgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagcttttgtgtcctcctcatagatcttgca 2372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 292 - 377
Target Start/End: Original strand, 17084 - 17169
Alignment:
Q  292 gcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcata 377  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || | |||| |||  |||||||| ||||| || |||| |||||||||    
T  17084 gcactatacggcttcggacgactctgttgtcccttgcctttgcgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtattctcttcata 17169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 283 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 8328 - 8223
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |  ||| |||  |||||||| ||||| ||| | ||||| |||||||| |    
T  8328 tcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgttgtcccttgcccctgcggtcactcatcaccttgtaatgagctttcatgtcctcctcatagattc 8229  T
Q  383 tgcagc 388  Q
    ||||||    
T  8228 tgcagc 8223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 283 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 18542 - 18437
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |  ||| |||  |||||||| ||||| ||| | ||||| |||||||| |    
T  18542 tcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgttgtcccttgcccctgcggtcactcatcaccttgtaatgagctttcatgtcctcctcatagattc 18443  T
Q  383 tgcagc 388  Q
    ||||||    
T  18442 tgcagc 18437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1914 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1914
Description:

Target: scaffold1914; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 1099 - 991
Alignment:
Q  280 ttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcataga 379  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  | | |||| ||   ||||| || ||||| || || ||||| |||||||    
T  1099 ttatcagccggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcttcaccttataatgagctttggtgtcctcctcataga 1000  T
Q  380 tcctgcagc 388  Q
    |||||||||    
T  999 tcctgcagc 991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1274 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1274
Description:

Target: scaffold1274; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 380
Target Start/End: Original strand, 53 - 152
Alignment:
Q  280 ttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcataga 379  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || || || || || |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |||||||    
T  53 ttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactttgctgacc-ttgcctttcctctcattcacaaccttgtaatgagctttggtatcttcctcataga 151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 346 - 446
Target Start/End: Original strand, 3126 - 3226
Alignment:
Q  346 accttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgt 445  Q
    |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||| |  |||| ||| | ||  ||||||||||| || ||||||||||    
T  3126 accttgtaatgagctttagtatcttcttcatatatcctgcagctactcaccaaatcagagaaaattcttatcttctgatacccaatggctctcttgatgt 3225  T
Q  446 c 446  Q
    |    
T  3226 c 3226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 283 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 53289 - 53126
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||   || ||||||||| |  | | |||| |||  ||||| || |||||||| || || || ||||| ||||    
T  53289 tcagcaggggcactgtatggtttaggacgaacttgatgtcccttatctcttcgctcactcatcaccttataatgagccttggtgtcttcctcatatatcc 53190  T
Q  383 tgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 446  Q
    |||||||| | ||||||||||  || | ||| | || |||||||||||| || |||||||||||    
T  53189 tgcagctactcaccaaatccgagaagattctaatcttttgatacccaatggctctcttgatgtc 53126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0505 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0505
Description:

Target: scaffold0505; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 292 - 386
Target Start/End: Original strand, 2199 - 2292
Alignment:
Q  292 gcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 386  Q
    |||||||| ||||||| |||||| || || |  ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  2199 gcactgtaaggcttag-acgactttgctgactattacctttcctctccttcaaaaccttgtaatgagctttcgtatcctcctcatagattctgca 2292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Original strand, 34667 - 34713
Alignment:
Q  178 cagacgttgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaat 224  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  34667 cagacattactcttgtggcctttctcaccacacttgaaacaaacaat 34713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 386
Target Start/End: Original strand, 364 - 470
Alignment:
Q  280 ttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcataga 379  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||   |||||||||| | ||| | ||  | ||||| || || || |||||| |||||||||    
T  364 ttatcagcgggagcattgtaaggcttaggacgactctgttgattcttacccttcttttcacttacagctttgtaatgtgctttggtatccacttcataga 463  T
Q  380 tcctgca 386  Q
    | |||||    
T  464 ttctgca 470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 283 - 389
Target Start/End: Original strand, 70546 - 70652
Alignment:
Q  283 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 382  Q
    ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||  | | |||| |||  || || || ||||| || ||||||||||||||||| |    
T  70546 tcagcaggagcactatacggtttcggacgactctgttgtcccttacctctgcgctcactcatcactttataatgagctttggtatcctcttcatagattc 70645  T
Q  383 tgcagct 389  Q
    | |||||    
T  70646 tacagct 70652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 23413 - 23296
Alignment:
Q  269 tttgtttcccattatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatc 368  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| |||||| | |  || || || || |||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||    
T  23413 tttgttttcccttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgagtttactgacctttgcctttcctctcattcacaaccttgtaatgacccttagtatc 23314  T
Q  369 ctcttcatagatcctgca 386  Q
     || ||||| || |||||    
T  23313 ttcctcatatattctgca 23296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 346 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 63342 - 63298
Alignment:
Q  346 accttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagcta 390  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  63342 accttgtaatgagctttcgtatcctcttcataaatcctacagcta 63298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 187 - 227
Target Start/End: Original strand, 51990 - 52030
Alignment:
Q  187 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctc 227  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  51990 ctcttgtggcctttctcaccacacttgaaacagataatctc 52030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University