View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6778_low_9 (Length: 238)

Name: NF6778_low_9
Description: NF6778
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6778_low_9
NF6778_low_9
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (37-235)||(15284673-15284871)
chr4 (37-238)||(15228195-15228396)
chr4 (38-238)||(1900582-1900782)
chr4 (45-238)||(24460358-24460551)
chr4 (44-236)||(15391090-15391282)
chr4 (37-237)||(14235270-14235470)
chr4 (37-235)||(24592059-24592257)
chr4 (37-235)||(14665346-14665544)
chr4 (37-235)||(17014328-17014526)
chr4 (38-235)||(18800359-18800556)
chr4 (38-235)||(36344261-36344458)
chr4 (38-235)||(14763050-14763247)
chr4 (38-235)||(6570181-6570378)
chr4 (38-235)||(33673544-33673741)
chr4 (38-235)||(39850966-39851163)
chr4 (38-235)||(21970029-21970226)
chr4 (38-235)||(30754082-30754279)
chr4 (38-235)||(5006201-5006398)
chr4 (38-231)||(40105384-40105577)
chr4 (38-235)||(54833715-54833912)
chr4 (38-203)||(24113022-24113187)
chr4 (38-231)||(31126264-31126457)
chr4 (38-231)||(14098873-14099066)
chr4 (38-235)||(27163063-27163260)
chr4 (38-203)||(34188706-34188871)
[»] chr3 (60 HSPs)
chr3 (37-238)||(16626292-16626493)
chr3 (37-238)||(18530659-18530860)
chr3 (45-235)||(5652661-5652851)
chr3 (44-238)||(31033910-31034104)
chr3 (44-238)||(32293023-32293217)
chr3 (45-238)||(5713498-5713691)
chr3 (45-238)||(5724408-5724601)
chr3 (45-238)||(5767767-5767960)
chr3 (45-238)||(4626215-4626408)
chr3 (37-235)||(6192590-6192788)
chr3 (37-235)||(4721905-4722103)
chr3 (37-235)||(18051536-18051734)
chr3 (37-235)||(29148541-29148739)
chr3 (45-238)||(17993578-17993771)
chr3 (40-235)||(15740883-15741078)
chr3 (37-235)||(4796439-4796637)
chr3 (37-235)||(8296246-8296444)
chr3 (37-235)||(8301053-8301251)
chr3 (38-235)||(7073486-7073683)
chr3 (37-235)||(15892492-15892690)
chr3 (41-235)||(18330943-18331137)
chr3 (38-235)||(10396407-10396604)
chr3 (41-235)||(35881040-35881234)
chr3 (38-235)||(8212012-8212209)
chr3 (38-235)||(20576634-20576831)
chr3 (38-235)||(51782297-51782494)
chr3 (75-238)||(5756907-5757069)
chr3 (38-235)||(11110136-11110333)
chr3 (38-235)||(18276839-18277036)
chr3 (38-235)||(18307441-18307638)
chr3 (38-235)||(28021549-28021746)
chr3 (38-235)||(48466201-48466398)
chr3 (38-235)||(18292140-18292337)
chr3 (38-235)||(21674967-21675164)
chr3 (38-235)||(29664757-29664954)
chr3 (38-234)||(28115741-28115937)
chr3 (41-235)||(22387368-22387562)
chr3 (38-235)||(4417193-4417390)
chr3 (38-235)||(5609109-5609306)
chr3 (38-235)||(18243013-18243210)
chr3 (38-231)||(24328437-24328630)
chr3 (38-233)||(6542249-6542444)
chr3 (38-231)||(28339580-28339773)
chr3 (38-235)||(36996864-36997061)
chr3 (38-231)||(5013990-5014183)
chr3 (38-235)||(5467259-5467456)
chr3 (38-235)||(5596144-5596341)
chr3 (38-231)||(47023731-47023924)
chr3 (38-235)||(31964260-31964457)
chr3 (38-203)||(32439460-32439625)
chr3 (38-235)||(4346474-4346671)
chr3 (38-231)||(18225469-18225662)
chr3 (38-235)||(22870643-22870840)
chr3 (38-235)||(22885702-22885899)
chr3 (38-201)||(7996870-7997033)
chr3 (38-201)||(10643378-10643541)
chr3 (38-203)||(20066349-20066514)
chr3 (67-231)||(17984772-17984936)
chr3 (161-235)||(51797387-51797461)
chr3 (170-235)||(50133990-50134055)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (37-235)||(19456155-19456353)
chr2 (37-238)||(21702898-21703099)
chr2 (45-238)||(27118994-27119187)
chr2 (44-238)||(22925769-22925963)
chr2 (45-238)||(3784960-3785153)
chr2 (45-238)||(31891070-31891263)
chr2 (45-238)||(34157316-34157509)
chr2 (45-238)||(34303045-34303238)
chr2 (44-238)||(16163905-16164102)
chr2 (37-235)||(20838227-20838425)
chr2 (37-235)||(28882523-28882721)
chr2 (37-235)||(12655851-12656049)
chr2 (37-235)||(27434178-27434376)
chr2 (37-235)||(23128300-23128498)
chr2 (38-235)||(27777531-27777728)
chr2 (38-235)||(27817289-27817486)
chr2 (38-203)||(34286695-34286860)
chr2 (38-203)||(34291755-34291920)
chr2 (38-235)||(12587119-12587316)
chr2 (38-235)||(13936279-13936476)
chr2 (38-235)||(27804016-27804213)
chr2 (38-232)||(37375473-37375667)
chr2 (38-235)||(39890383-39890580)
chr2 (38-238)||(9349717-9349917)
chr2 (38-235)||(32050107-32050304)
chr2 (38-235)||(39051557-39051754)
chr2 (38-235)||(12716337-12716534)
chr2 (38-231)||(19416234-19416427)
chr2 (38-234)||(11634921-11635117)
chr2 (38-234)||(11641110-11641306)
chr2 (38-231)||(16829073-16829266)
chr2 (38-231)||(16892215-16892408)
chr2 (38-235)||(21676917-21677114)
chr2 (38-231)||(37685644-37685837)
chr2 (38-231)||(37700909-37701102)
chr2 (38-231)||(37925806-37925999)
chr2 (38-234)||(260488-260684)
chr2 (38-231)||(34861993-34862186)
chr2 (38-235)||(40233820-40234017)
chr2 (37-231)||(31876594-31876788)
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (37-238)||(16449629-16449830)
chr7 (37-234)||(16041638-16041835)
chr7 (44-238)||(26485005-26485199)
chr7 (44-238)||(26682638-26682832)
chr7 (44-238)||(39210661-39210855)
chr7 (45-238)||(4200858-4201051)
chr7 (44-238)||(2775670-2775864)
chr7 (45-238)||(2108644-2108837)
chr7 (45-238)||(31088103-31088296)
chr7 (45-238)||(45733771-45733964)
chr7 (37-235)||(10916499-10916697)
chr7 (37-235)||(2154887-2155085)
chr7 (37-235)||(16503011-16503209)
chr7 (37-235)||(16518047-16518245)
chr7 (41-235)||(5128306-5128500)
chr7 (41-235)||(11424412-11424605)
chr7 (38-235)||(26435571-26435768)
chr7 (38-235)||(26537502-26537699)
chr7 (38-235)||(31125234-31125431)
chr7 (38-234)||(5146972-5147168)
chr7 (38-235)||(16736092-16736289)
chr7 (38-235)||(16751146-16751343)
chr7 (38-235)||(17523846-17524043)
chr7 (38-235)||(17529172-17529369)
chr7 (38-235)||(24592173-24592370)
chr7 (38-235)||(31564022-31564219)
chr7 (38-200)||(26513130-26513292)
chr7 (38-235)||(3445620-3445817)
chr7 (38-231)||(26319501-26319694)
chr7 (38-231)||(4144755-4144948)
chr7 (38-231)||(9618969-9619162)
chr7 (38-231)||(26274726-26274919)
chr7 (38-231)||(26669546-26669739)
chr7 (100-235)||(11441886-11442021)
chr7 (40-203)||(18541145-18541308)
chr7 (38-203)||(5159865-5160030)
chr7 (38-201)||(45387691-45387854)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (37-238)||(22888789-22888990)
chr5 (37-238)||(25199348-25199549)
chr5 (45-237)||(29888732-29888924)
chr5 (44-238)||(33877566-33877760)
chr5 (45-238)||(11326113-11326306)
chr5 (45-238)||(13184299-13184491)
chr5 (45-238)||(13440144-13440337)
chr5 (45-235)||(9548193-9548383)
chr5 (38-238)||(23892525-23892725)
chr5 (37-235)||(24687799-24687997)
chr5 (37-235)||(22998756-22998954)
chr5 (37-235)||(23717630-23717828)
chr5 (40-235)||(33777809-33778004)
chr5 (37-235)||(30934955-30935153)
chr5 (40-235)||(23752095-23752290)
chr5 (37-235)||(24970340-24970538)
chr5 (48-234)||(11549677-11549863)
chr5 (37-235)||(15658402-15658600)
chr5 (38-235)||(18500373-18500570)
chr5 (38-235)||(6874627-6874824)
chr5 (38-235)||(43078574-43078771)
chr5 (38-235)||(28649557-28649754)
chr5 (38-235)||(3789863-3790060)
chr5 (38-235)||(13324472-13324669)
chr5 (38-203)||(41675063-41675228)
chr5 (37-235)||(18375054-18375252)
chr5 (38-235)||(2511373-2511570)
chr5 (38-231)||(5638236-5638429)
chr5 (38-231)||(12132481-12132674)
chr5 (38-235)||(24681762-24681959)
chr5 (38-235)||(24724289-24724486)
chr5 (38-231)||(30029741-30029934)
chr5 (38-235)||(31826050-31826247)
chr5 (38-235)||(37358286-37358483)
chr5 (38-231)||(9317777-9317970)
chr5 (38-235)||(30152340-30152537)
chr5 (38-235)||(31431762-31431959)
chr5 (38-231)||(33516682-33516875)
chr5 (38-235)||(37755302-37755499)
chr5 (38-235)||(37770630-37770827)
chr5 (38-235)||(40473192-40473389)
chr5 (38-235)||(15758500-15758697)
chr5 (38-235)||(34616840-34617037)
chr5 (38-235)||(8665118-8665315)
chr5 (38-203)||(28959429-28959594)
chr5 (38-203)||(32599115-32599280)
chr5 (38-203)||(33292879-33293044)
chr5 (38-195)||(37671126-37671283)
chr5 (38-201)||(30168825-30168988)
chr5 (38-231)||(26480718-26480910)
chr5 (135-231)||(29966806-29966902)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (37-238)||(20461390-20461591)
chr1 (37-238)||(16207776-16207977)
chr1 (37-238)||(20340080-20340281)
chr1 (44-238)||(28152171-28152365)
chr1 (38-235)||(41793054-41793251)
chr1 (37-235)||(51638530-51638728)
chr1 (38-231)||(28585297-28585490)
chr1 (38-231)||(10962986-10963179)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (45-238)||(19658752-19658945)
chr8 (44-238)||(18710896-18711090)
chr8 (44-238)||(44563409-44563603)
chr8 (45-238)||(33244975-33245168)
chr8 (44-236)||(22080589-22080781)
chr8 (37-235)||(16277867-16278065)
chr8 (37-235)||(16283762-16283960)
chr8 (37-235)||(14557937-14558135)
chr8 (37-234)||(19688412-19688609)
chr8 (37-235)||(2136963-2137161)
chr8 (37-235)||(27608609-27608807)
chr8 (38-235)||(3329212-3329409)
chr8 (38-235)||(19674754-19674951)
chr8 (38-235)||(12092429-12092626)
chr8 (38-235)||(19286775-19286972)
chr8 (38-235)||(29829635-29829832)
chr8 (37-148)||(18791107-18791218)
chr8 (38-231)||(19208065-19208258)
chr8 (38-231)||(28361660-28361853)
chr8 (38-231)||(33259040-33259233)
chr8 (121-235)||(189407-189521)
chr8 (38-235)||(31354837-31355034)
chr8 (38-231)||(31489455-31489648)
chr8 (38-235)||(9354936-9355133)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (37-238)||(2403-2604)
[»] chr6 (48 HSPs)
chr6 (44-238)||(14142980-14143174)
chr6 (44-238)||(26788251-26788445)
chr6 (44-238)||(27196624-27196818)
chr6 (44-238)||(27252422-27252616)
chr6 (44-238)||(13521768-13521962)
chr6 (45-238)||(8892007-8892200)
chr6 (45-238)||(8903242-8903435)
chr6 (45-238)||(28162964-28163157)
chr6 (45-238)||(33373952-33374145)
chr6 (44-238)||(22456638-22456823)
chr6 (37-235)||(13298639-13298837)
chr6 (38-203)||(17092129-17092294)
chr6 (41-235)||(26918690-26918884)
chr6 (37-238)||(27290058-27290259)
chr6 (37-235)||(15424005-15424203)
chr6 (37-235)||(22934568-22934766)
chr6 (37-235)||(23857013-23857211)
chr6 (37-235)||(27272268-27272466)
chr6 (37-235)||(26989311-26989510)
chr6 (37-235)||(24304306-24304504)
chr6 (37-235)||(24864027-24864225)
chr6 (38-235)||(29549785-29549982)
chr6 (38-235)||(16750164-16750361)
chr6 (38-235)||(34463035-34463232)
chr6 (38-235)||(27485439-27485636)
chr6 (38-220)||(27019461-27019643)
chr6 (38-231)||(3696395-3696588)
chr6 (38-235)||(4545464-4545661)
chr6 (38-235)||(4723823-4724020)
chr6 (38-235)||(16674449-16674646)
chr6 (38-235)||(26116099-26116296)
chr6 (38-235)||(4758074-4758271)
chr6 (38-235)||(4773316-4773513)
chr6 (38-231)||(16943716-16943909)
chr6 (38-235)||(27044698-27044895)
chr6 (38-235)||(28207764-28207961)
chr6 (38-231)||(29573327-29573520)
chr6 (38-231)||(30557705-30557898)
chr6 (37-235)||(27359680-27359878)
chr6 (37-235)||(27450023-27450221)
chr6 (38-235)||(4525596-4525793)
chr6 (38-235)||(29501725-29501922)
chr6 (38-233)||(27008039-27008234)
chr6 (64-235)||(20161011-20161182)
chr6 (64-235)||(22171649-22171820)
chr6 (38-176)||(26777299-26777437)
chr6 (170-235)||(17025587-17025652)
chr6 (38-237)||(27629389-27629588)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (45-203)||(21906-22064)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (38-237)||(364-563)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (37-235)||(46730-46928)
scaffold0089 (37-235)||(39814-40012)
scaffold0089 (37-235)||(30076-30274)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (37-235)||(30765-30964)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (38-235)||(6327-6524)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (37-235)||(27605-27804)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (38-235)||(9879-10076)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (37-235)||(14675-14873)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (38-235)||(8812-9009)
scaffold0159 (38-235)||(20328-20526)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (38-231)||(25947-26140)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (38-231)||(6985-7178)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (38-235)||(8262-8459)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (45-100)||(119651-119706)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (170-235)||(7-72)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (99-222)||(46604-46729)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 171; Significance: 6e-92; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Original strand, 15284673 - 15284871
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||    
T  15284673 gacatcgctgacagtcaaataattgtcgttcatcaaactctagatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcatttcgggcaactg 15284772  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15284773 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 15284871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 37 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15228396 - 15228195
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||    
T  15228396 gacatcgctgacagtcaaataactgtcgttcatcaagctctggatgtcatttcgaacaacgtggcaacctaaaggattacggaagcattctggacaattg 15228297  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||    
T  15228296 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacgaacatcaagtctgggagctatctcat 15228197  T
Q  237 at 238  Q
    ||    
T  15228196 at 15228195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 38 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1900782 - 1900582
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||| |||    
T  1900782 acatcgctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatttcattttgaacaacgtagcaacccaaagtattatggaatcattctgggcaactgg 1900683  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 237  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  1900682 catggtcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaatgttatgaacatcgagtctgggagcttcctcata 1900583  T
Q  238 t 238  Q
    |    
T  1900582 t 1900582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Original strand, 24460358 - 24460551
Alignment:
Q  45 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  24460358 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 24460457  T
Q  145 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatat 238  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||    
T  24460458 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatat 24460551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 44 - 236
Target Start/End: Original strand, 15391090 - 15391282
Alignment:
Q  44 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 143  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||    
T  15391090 ctgacagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatatcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggcggcattctgggcaattggcatgat 15391189  T
Q  144 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 236  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| | |||||| |||||| |||| ||||    
T  15391190 tatggtcaaacaaggaggcttggcatagcttgatgtgtagcggtaccagaggagttgcaacattacggatgtcaagactgggaacttcttcat 15391282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 237
Target Start/End: Original strand, 14235270 - 14235470
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    ||||||||| ||| ||| ||| |||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||  | |||  |    
T  14235270 gacatcactaacaatcagatatttgttgtccatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcagcctaaaggattatggaggcattccggacaaacg 14235369  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 236  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14235370 gcatggtcatggtcaaacaaggaagcttggcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagtcgcaacgttacgaacgtcaagactgggagcttcttcat 14235469  T
Q  237 a 237  Q
    |    
T  14235470 a 14235470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Original strand, 24592059 - 24592257
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| | | |||| |||||||  ||    
T  24592059 gacatcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattatgaaggcatcctaggcacttg 24592158  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  24592159 gcatgatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctca 24592257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14665544 - 14665346
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  14665544 gacatcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 14665445  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  14665444 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctca 14665346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17014526 - 17014328
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  17014526 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 17014427  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  17014426 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctca 17014328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 18800359 - 18800556
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  18800359 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 18800458  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  18800459 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 18800556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 36344261 - 36344458
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||||||| | |||| |||| ||  |||    
T  36344261 acatcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttgg 36344360  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  36344361 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 36344458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 14763050 - 14763247
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||| ||||||| | |||| |||| ||  |||    
T  14763050 acatcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaagattacgaaggcatcctagacacttgg 14763149  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  14763150 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 14763247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6570378 - 6570181
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||  |||    
T  6570378 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttgg 6570279  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||| |||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  6570278 cataatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 6570181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 33673544 - 33673741
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  33673544 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 33673643  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| ||||||||    
T  33673644 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctca 33673741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 39851163 - 39850966
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | | |||||   | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  39851163 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtctcgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 39851064  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  39851063 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 39850966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21970226 - 21970029
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  21970226 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 21970127  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||| | ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| ||||||||    
T  21970126 catgatcatgattaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctca 21970029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30754279 - 30754082
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  30754279 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 30754180  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || |||||||| ||||||||||||    
T  30754179 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctca 30754082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5006398 - 5006201
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||| ||||||||| ||||| |||| | || ||  |||    
T  5006398 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtataacaatccaaaggatcacggaggcatcccagacacttgg 5006299  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| |||||||| ||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  5006298 catgatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttaatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 5006201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 231
Target Start/End: Original strand, 40105384 - 40105577
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  40105384 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 40105483  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttc 231  Q
    |||||||||| | ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||    
T  40105484 catgatcatgattaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttc 40105577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 54833912 - 54833715
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||| ||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | ||||||||| |||||||| | |||| |||| ||  |||    
T  54833912 acatcattgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaagggattacgaaggcatcctagacatttgg 54833813  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| ||||||||||||    
T  54833812 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctca 54833715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 24113187 - 24113022
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||||||  || ||||| || || | ||| ||||||||||| ||| | |||||| ||||  | |    
T  24113187 acatcactgacagtaaggtaattgccgtccatcaagctctggacatcgttttggacgacatggcagcccaaaggattgcgggaacattcttggcacttag 24113088  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaa 203  Q
    |||||||||| ||||||||  | |||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  24113087 catgatcatgttcaaacaataaagcttggcacaacttgatatggagtggcaccagaggagttgcaa 24113022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 231
Target Start/End: Original strand, 31126264 - 31126457
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  31126264 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 31126363  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttc 231  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||    
T  31126364 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttc 31126457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 14099066 - 14098873
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |   || || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  14099066 acatcactgacagtcagaaggttatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 14098967  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttc 231  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||    
T  14098966 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttc 14098873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 27163063 - 27163260
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||  |||    
T  27163063 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttgg 27163162  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| | |||||| ||||| || ||||||||||| ||||  || || || |||||||| ||||||||||||    
T  27163163 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacaacttgatatgtagaggtaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctca 27163260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 203
Target Start/End: Original strand, 34188706 - 34188871
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||||||  || ||||| || || | ||| |||||||| || ||| | |||||| ||||    |    
T  34188706 acatcactgacagtaaggtaattgccgtccatcaagctctggacatcgttttggacgacatggcagcccaaagggttgcgggaacattcttggcactcag 34188805  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaa 203  Q
    |||||||||| ||||||||  | |||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  34188806 catgatcatgttcaaacaacaaagcttggcacaacttgatatggagtggcaccagaggagttgcaa 34188871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 60)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 37 - 238
Target Start/End: Original strand, 16626292 - 16626493
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||    
T  16626292 gacatcgctgacagtcaaataattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgtagcaacccaaaggattatggaagcattccgggcaactg 16626391  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16626392 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 16626491  T
Q  237 at 238  Q
    ||    
T  16626492 at 16626493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 37 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18530860 - 18530659
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||    
T  18530860 gacatcgctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagccctggatgtcattttgaacaacatagcaacccaaaggattacggaagcattctggacaattg 18530761  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 236  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  18530760 gcatgatcatggtcaaacaaaaaggcttggcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattacgaacattaagtctgggagctccctcat 18530661  T
Q  237 at 238  Q
    ||    
T  18530660 at 18530659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 45 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5652851 - 5652661
Alignment:
Q  45 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 144  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5652851 tgacagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 5652752  T
Q  145 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5652751 atggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacgaacgtccggtctgggagcttcctca 5652661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 44 - 238
Target Start/End: Original strand, 31033910 - 31034104
Alignment:
Q  44 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 143  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  31033910 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 31034009  T
Q  144 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatat 238  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  31034010 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatat 31034104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 44 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 32293217 - 32293023
Alignment:
Q  44 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 143  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  32293217 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 32293118  T
Q  144 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatat 238  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  32293117 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatat 32293023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 5713691 - 5713498
Alignment:
Q  45 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5713691 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 5713592  T
Q  145 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatat 238  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||    
T  5713591 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatat 5713498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 5724601 - 5724408
Alignment:
Q  45 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5724601 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 5724502  T
Q  145 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatat 238  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||    
T  5724501 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatat 5724408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Original strand, 5767767 - 5767960
Alignment:
Q  45 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5767767 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 5767866  T
Q  145 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatat 238  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||    
T  5767867 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatat 5767960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 4626408 - 4626215
Alignment:
Q  45 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  4626408 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 4626309  T
Q  145 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatat 238  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||||||||||| |||||||    
T  4626308 atggtcaaacagagaggctcggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagctttctcatat 4626215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6192788 - 6192590
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  6192788 gacatcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 6192689  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  6192688 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctca 6192590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4722103 - 4721905
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  4722103 gacatcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 4722004  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || || ||||| ||||||||||||    
T  4722003 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcgagtctaggagcttcctca 4721905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18051734 - 18051536
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||    
T  18051734 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcaattg 18051635  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
     |||||||||||  ||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||| ||||    
T  18051634 acatgatcatggctaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgatattacggacatcaagtctaggagctttctca 18051536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Original strand, 29148541 - 29148739
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||  ||    
T  29148541 gacatcactgacagtcaaagaattgtcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttg 29148640  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  29148641 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctca 29148739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Original strand, 17993578 - 17993771
Alignment:
Q  45 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||| ||  ||||||||||    
T  17993578 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatc 17993677  T
Q  145 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatat 238  Q
    ||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||    
T  17993678 atggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatat 17993771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 40 - 235
Target Start/End: Original strand, 15740883 - 15741078
Alignment:
Q  40 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggca 139  Q
    |||||| ||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  |||||    
T  15740883 atcactaacagtcaaaaaattatcatccatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 15740982  T
Q  140 tgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  15740983 tgatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaggggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctca 15741078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Original strand, 4796439 - 4796637
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   || ||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  4796439 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtataacaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 4796538  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  4796539 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctca 4796637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8296444 - 8296246
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    ||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  8296444 gacatcactgacagtcaaaaaatcatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 8296345  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  8296344 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctca 8296246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Original strand, 8301053 - 8301251
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    |||||||| |||| ||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  8301053 gacatcaccgacaatcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 8301152  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  8301153 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctca 8301251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 7073683 - 7073486
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||  |||    
T  7073683 acatcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaagggttacgaaggcattctaggcacttgg 7073584  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  7073583 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 7073486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Original strand, 15892492 - 15892690
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||  | |||| |||||||  ||    
T  15892492 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacaaaggcatcctaggcacttg 15892591  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  15892592 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctca 15892690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 41 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18331137 - 18330943
Alignment:
Q  41 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 140  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||| ||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  18331137 tcactaacagtcaaaaaattttcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacctaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 18331038  T
Q  141 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  18331037 gatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctca 18330943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10396604 - 10396407
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| |  |||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  10396604 acatcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcctgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 10396505  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| |||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  10396504 catgatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttgatgtgtagagacaccagaggagttgcgatgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 10396407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 41 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 35881234 - 35881040
Alignment:
Q  41 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 140  Q
    ||||| ||||||||| || | || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  35881234 tcactaacagtcaaaaaaatttcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 35881135  T
Q  141 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||| |||||||    
T  35881134 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagtttcctca 35881040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8212209 - 8212012
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  8212209 acatcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacatcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 8212110  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  8212109 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagtttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 8212012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 20576634 - 20576831
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  20576634 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 20576733  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  20576734 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 20576831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 51782494 - 51782297
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  51782494 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 51782395  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||||  |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  51782394 catgatcatggttgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 51782297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 5756907 - 5757069
Alignment:
Q  75 tctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagctt 174  Q
    ||||||||||||| ||| ||  ||||||     |||||||| ||||||||||| |  || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||     
T  5756907 tctggatgtcattctgancacngtagcacnnncaaggattatggaagcattctggcaaactggcatgatcatg-tcaaacagagaggcttggcataactc 5757005  T
Q  175 gatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatat 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||    
T  5757006 gatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatat 5757069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 11110136 - 11110333
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| | |||| || ||||||||| | |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  11110136 acatcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagttttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 11110235  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  11110236 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtcttggagcttcctca 11110333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 18276839 - 18277036
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||| ||||||| | |||| |||| ||  |||    
T  18276839 acatcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaagattacgaaggcatcctagacacttgg 18276938  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  18276939 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 18277036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 18307441 - 18307638
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||| ||||||| | |||| |||| ||  |||    
T  18307441 acatcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaagattacgaaggcatcctagacacttgg 18307540  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  18307541 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 18307638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28021746 - 28021549
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||| ||||||||| | |||| |||| ||  |||    
T  28021746 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccagaggattacgaaggcatcctagacacttgg 28021647  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  28021646 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 28021549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 48466398 - 48466201
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||  |||    
T  48466398 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttgg 48466299  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  48466298 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 48466201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 18292140 - 18292337
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||| ||||||| | |||| |||| ||  |||    
T  18292140 acatcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaagattacgaaggcatcctagacacttgg 18292239  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  18292240 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 18292337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21675164 - 21674967
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  21675164 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 21675065  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  21675064 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 21674967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 29664757 - 29664954
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||| ||||| |||||||| | | ||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  29664757 acatcactgacagtcagaagattatcattcattaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 29664856  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  29664857 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 29664954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 234
Target Start/End: Original strand, 28115741 - 28115937
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||  |||    
T  28115741 acatcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttgg 28115840  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctc 234  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||    
T  28115841 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctc 28115937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 41 - 235
Target Start/End: Original strand, 22387368 - 22387562
Alignment:
Q  41 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 140  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||| | |||| |||| ||  ||||||    
T  22387368 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaagaattacgaaggcatcctagacacttggcat 22387467  T
Q  141 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||| ||||||   |||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  22387468 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgttgtgtataagcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 22387562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4417390 - 4417193
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||| | |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||  |||    
T  4417390 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagttttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatccgagacacttgg 4417291  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| |||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  4417290 catgatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 4417193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 5609109 - 5609306
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  5609109 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 5609208  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||||  |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || ||||| || ||||||||||||    
T  5609209 catgatcatggttgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcctca 5609306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18243210 - 18243013
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    ||||||||||| |||| |  ||| || |||||||| || |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||| ||  |||    
T  18243210 acatcactgacggtcagaagattatcattcatcaaactttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttgg 18243111  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| ||||||||||||    
T  18243110 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctca 18243013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24328630 - 24328437
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | | ||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  24328630 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 24328531  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttc 231  Q
    |||||||||| | ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||    
T  24328530 catgatcatgattaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttc 24328437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 38 - 233
Target Start/End: Original strand, 6542249 - 6542444
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    ||||||||||| ||||   |||| || |||||||| || |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  6542249 acatcactgacggtcaggaaattatcattcatcaaactttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 6542348  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcct 233  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| ||||||||||    
T  6542349 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtagcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcct 6542444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28339773 - 28339580
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | | ||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  28339773 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 28339674  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttc 231  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||    
T  28339673 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttc 28339580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 36996864 - 36997061
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  36996864 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 36996963  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || |||||||| |||| |||||||    
T  36996964 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagtttcctca 36997061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5014183 - 5013990
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||| | | |||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  5014183 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 5014084  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttc 231  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||    
T  5014083 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttc 5013990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5467456 - 5467259
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    ||||||||||| |||| |  ||| || |||||||| || ||||| ||   ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  5467456 acatcactgacggtcagaagattatcattcatcaaactttggatatcgccttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 5467357  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  5467356 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 5467259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 5596144 - 5596341
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| || || |||| |||| ||  |||    
T  5596144 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttgg 5596243  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||| ||| || |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| ||||||||||||    
T  5596244 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgacgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctca 5596341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 47023924 - 47023731
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  47023924 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 47023825  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttc 231  Q
    |||||||||| | ||||| ||| |||| ||  |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||    
T  47023824 catgatcatgattaaacagagaagctttgcgcagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttc 47023731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 31964260 - 31964457
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    ||||| |||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | | ||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  31964260 acatctctgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 31964359  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||| ||||||   ||||  || |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  31964360 catgctcatggctgaacagggaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 31964457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 32439625 - 32439460
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||||||  || ||||| || || | ||||||||||||||| ||| | |||||| ||||    |    
T  32439625 acatcactgacagtaaggtaattgccgtccatcaagctctggacatcgttttggacgacatggcaacccaaaggattgcgggaacattcttggcactcag 32439526  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaa 203  Q
    |||||||||| ||||||||  | || ||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  32439525 catgatcatgttcaaacaataaagcctggcacaacttgatatggagtggcaccagaggagttgcaa 32439460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 4346474 - 4346671
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    ||||||||||| |||| |  ||| || |||||||| || |||||||| |  ||||||   | ||||||||| |||||||  | |||| |||| ||  |||    
T  4346474 acatcactgacggtcagaagattatcattcatcaaactttggatgtcgtcctgaacagtatggcaacccaagggattacaaaggcatcctagacacttgg 4346573  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  4346574 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 4346671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18225662 - 18225469
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||| |||||||| | ||||||    || ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  18225662 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacggtataacaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 18225563  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttc 231  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || || |||||||||||||| | ||| || || ||||| || ||||||||    
T  18225562 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttc 18225469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 22870643 - 22870840
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    ||||||||||| |||| |  ||| || |||||||| || |||||||| |  ||||||   | ||||||||| |||||||  | |||| |||| ||  |||    
T  22870643 acatcactgacggtcagaagattatcattcatcaaactttggatgtcgtcctgaacagtatggcaacccaagggattacaaaggcatcctagacacttgg 22870742  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| ||||||||    
T  22870743 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctca 22870840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 22885702 - 22885899
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    ||||||||||| |||| |  ||| || |||||||| || |||||||| |  ||||||   | ||||||||| |||||||  | |||| |||| ||  |||    
T  22885702 acatcactgacggtcagaagattatcattcatcaaactttggatgtcgtcctgaacagtatggcaacccaagggattacaaaggcatcctagacacttgg 22885801  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| ||||||||    
T  22885802 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctca 22885899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 7997033 - 7996870
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  7997033 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 7996934  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgc 201  Q
    ||||||||||    |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  7996933 catgatcatgactgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgc 7996870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 10643541 - 10643378
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  10643541 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 10643442  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgc 201  Q
    ||||||||||    |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  10643441 catgatcatgactgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgc 10643378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 20066514 - 20066349
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||| |  | ||||  || ||||||||||||||  || ||||| || || | ||||||||||||||| ||| | |||||| ||||         
T  20066514 acatcactgacagtaaggtgattgctgtccatcaagctctggacatcgttttggacgacatggcaacccaaaggattgcgggaacattcttggcattcaa 20066415  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaa 203  Q
    |||||||||| ||||||||  | |||||||| | |||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  20066414 catgatcatgttcaaacaataaagcttggcacaacttgatatggagtggtaccagaggagttgcaa 20066349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 231
Target Start/End: Original strand, 17984772 - 17984936
Alignment:
Q  67 catcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttgg 166  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||||  | |||||||| ||||||||| | |||| |||| ||  |||||||||||||    |||| ||| ||||      
T  17984772 catcaagctttggatgtcgtcttgaacaatatggcaacccagaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatgactgaacagagaagcttta 17984871  T
Q  167 catagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttc 231  Q
    || |||||||| || || || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||    
T  17984872 cacagcttgatatgcagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttc 17984936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 51797461 - 51797387
Alignment:
Q  161 gcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  51797461 gctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 51797387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 235
Target Start/End: Original strand, 50133990 - 50134055
Alignment:
Q  170 agcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  50133990 agcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 50134055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Original strand, 19456155 - 19456353
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||    
T  19456155 gacatcgctgacagtcaaataattgtcgttcatcaaactctggatatcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacagaagcattccgggcaactg 19456254  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19456255 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcactagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 19456353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 37 - 238
Target Start/End: Original strand, 21702898 - 21703099
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  21702898 gacatcgctgacagtcaaataattgccgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctgggcaattg 21702997  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 236  Q
    | |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  21702998 gtatgatcgtggttaaacagagaggcttggcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaatgttacgaacatcgagtctgggagcttcctcat 21703097  T
Q  237 at 238  Q
    ||    
T  21703098 at 21703099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27119187 - 27118994
Alignment:
Q  45 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 144  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27119187 tgacagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 27119088  T
Q  145 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatat 238  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27119087 atggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacaaacgtccggtctgggagcttcctcatat 27118994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 44 - 238
Target Start/End: Original strand, 22925769 - 22925963
Alignment:
Q  44 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 143  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  22925769 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaagaattacagaatcattcttggcaattggcatgat 22925868  T
Q  144 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatat 238  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22925869 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatat 22925963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 3785153 - 3784960
Alignment:
Q  45 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  3785153 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 3785054  T
Q  145 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatat 238  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||    
T  3785053 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatat 3784960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Original strand, 31891070 - 31891263
Alignment:
Q  45 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31891070 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 31891169  T
Q  145 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatat 238  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||    
T  31891170 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtggtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatat 31891263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 34157509 - 34157316
Alignment:
Q  45 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  34157509 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 34157410  T
Q  145 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatat 238  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||    
T  34157409 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatat 34157316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Original strand, 34303045 - 34303238
Alignment:
Q  45 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 144  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | ||||| ||||||||||    
T  34303045 tgacagtcagataattgtcgttgatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggcggcattttgggcaattggcatgatc 34303144  T
Q  145 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatat 238  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  34303145 attgtcaaacaaggaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatat 34303238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 44 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16164102 - 16163905
Alignment:
Q  44 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 143  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||| ||||| |||||||||    
T  16164102 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacataatcattcttggcaattggcatgat 16164003  T
Q  144 catggtcaaaca---aagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatat 238  Q
    ||||||||||||   | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||    
T  16164002 catggtcaaacagagaggaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatat 16163905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20838425 - 20838227
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  20838425 gacatcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 20838326  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  20838325 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgatgttacggacatcaagtctaggagcttcctca 20838227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28882721 - 28882523
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  28882721 gacatcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 28882622  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  28882621 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctca 28882523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12656049 - 12655851
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | | || |||||||  ||    
T  12656049 gacatcactcacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggtatcctaggcacttg 12655950  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  12655949 gcatgatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctca 12655851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Original strand, 27434178 - 27434376
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  27434178 gacatcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 27434277  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  27434278 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctca 27434376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Original strand, 23128300 - 23128498
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||| |||| ||||| |   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  23128300 gacatcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatatcatcttgaatagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 23128399  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  23128400 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaagcaccaaaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctca 23128498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27777728 - 27777531
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  27777728 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 27777629  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  27777628 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 27777531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27817486 - 27817289
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  27817486 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 27817387  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  27817386 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 27817289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 34286860 - 34286695
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||  |||    
T  34286860 acatcactgacagtcagaaaattatcgttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttgg 34286761  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaa 203  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34286760 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaa 34286695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 34291920 - 34291755
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||  |||    
T  34291920 acatcactgacagtcagaaaattatcgttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttgg 34291821  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaa 203  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34291820 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaa 34291755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12587316 - 12587119
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | | ||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  12587316 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 12587217  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  12587216 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 12587119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 13936279 - 13936476
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | ||||||||||||||  |||| |||| |||| ||  |||    
T  13936279 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcgcggaggcatcctagacatttgg 13936378  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  13936379 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 13936476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27804213 - 27804016
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  27804213 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 27804114  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||  | |||||||| ||||||||||||    
T  27804113 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggtcatcaagtctaggagcttcctca 27804016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 37375667 - 37375473
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||||||| | |||| |||| ||  |||    
T  37375667 acatcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttgg 37375568  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcc 232  Q
    |||| ||||||   |||| ||| |||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||    
T  37375567 catgttcatggctgaacagagaagctttgcacagtttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcc 37375473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 39890580 - 39890383
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||  |||||||| | ||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  39890580 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaagccttggatgtcgtcttgaacaacatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 39890481  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  39890480 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 39890383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 238
Target Start/End: Original strand, 9349717 - 9349917
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | | ||||| | | ||||||||||| || ||||| |||| |||| ||  |||    
T  9349717 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaagaatcacggaggcatcctagacacttgg 9349816  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 237  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||  ||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  9349817 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggggttgtaacattacggacgtcaagaccgggagcttcctcata 9349916  T
Q  238 t 238  Q
    |    
T  9349917 t 9349917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 32050304 - 32050107
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  32050304 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 32050205  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||| | ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| ||||||||    
T  32050204 catgatcatgattaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctca 32050107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 39051557 - 39051754
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||  | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  39051557 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgttgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 39051656  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   | || ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  || || || |||||||| ||||||||||||    
T  39051657 catgatcatggctgatcagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctca 39051754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 12716337 - 12716534
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  12716337 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 12716436  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||| ||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || |||||||| ||||||||||||    
T  12716437 catgctcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctca 12716534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 231
Target Start/End: Original strand, 19416234 - 19416427
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  19416234 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacagtatagcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 19416333  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttc 231  Q
    |||||||||| | ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||    
T  19416334 catgatcatgattaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttc 19416427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 234
Target Start/End: Original strand, 11634921 - 11635117
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    ||||||| |||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||  |||    
T  11634921 acatcaccgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttgg 11635020  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctc 234  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||    
T  11635021 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctc 11635117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 234
Target Start/End: Original strand, 11641110 - 11641306
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    ||||||| |||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||  |||    
T  11641110 acatcaccgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttgg 11641209  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctc 234  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||    
T  11641210 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctc 11641306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 231
Target Start/End: Original strand, 16829073 - 16829266
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  16829073 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 16829172  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttc 231  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||    
T  16829173 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttc 16829266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16892408 - 16892215
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  16892408 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 16892309  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttc 231  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||    
T  16892308 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttc 16892215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 21676917 - 21677114
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    ||||||||||| |||| |  ||| || ||||||||||| ||||| ||   ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  21676917 acatcactgacggtcagaagattatcattcatcaagctttggatatcgccttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 21677016  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| ||||||||    
T  21677017 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctca 21677114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 231
Target Start/End: Original strand, 37685644 - 37685837
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  37685644 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 37685743  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttc 231  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||    
T  37685744 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttc 37685837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 231
Target Start/End: Original strand, 37700909 - 37701102
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  37700909 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 37701008  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttc 231  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||    
T  37701009 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttc 37701102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 37925999 - 37925806
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  37925999 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 37925900  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttc 231  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||    
T  37925899 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttc 37925806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 234
Target Start/End: Original strand, 260488 - 260684
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  260488 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 260587  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctc 234  Q
    ||||||| |||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||| | | ||| || || |||||||| ||| |||||||    
T  260588 catgatcgtggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttacgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctc 260684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 34862186 - 34861993
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  34862186 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 34862087  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttc 231  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || || ||||| ||||||||    
T  34862086 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatctagtctcggagcttc 34861993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 40234017 - 40233820
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||| | |  ||| || ||||||||||| |||||||| |  ||||||   | |||||||||||||||||||| |||| | || ||  |||    
T  40234017 acatcactgacagttagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcctgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcccagacacttgg 40233918  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| || ||||||||||| || |||||||||||| | | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  40233917 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagtttgatgtgtagaggtaccagaggagttacgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 40233820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 37 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 31876788 - 31876594
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    ||||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||| | | |||||||||||| | |||||  ||| | || ||  ||    
T  31876788 gacatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaagggtcacggagacatcccagacacttg 31876689  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttc 231  Q
    ||||||||||| |  |||| |||  ||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||    
T  31876688 gcatgatcatgattgaacagagaaactttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttc 31876594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 37 - 238
Target Start/End: Original strand, 16449629 - 16449830
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  16449629 gacatcgctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattctgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctgggcaattg 16449728  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 236  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16449729 gcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattacggacgtccagtctgggagcttcctcat 16449828  T
Q  237 at 238  Q
    ||    
T  16449829 at 16449830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 37 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16041835 - 16041638
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  16041835 gacatcgctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaagattacggaagcattctgggcaattg 16041736  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctc 234  Q
    | |||||| || | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16041735 gtatgatcgtgattaaacagagaggcttgacatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaatgttacgaacatcgagtctgggagcttcctc 16041638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 44 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26485199 - 26485005
Alignment:
Q  44 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 143  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  26485199 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 26485100  T
Q  144 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatat 238  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  26485099 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatat 26485005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 44 - 238
Target Start/End: Original strand, 26682638 - 26682832
Alignment:
Q  44 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 143  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  26682638 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 26682737  T
Q  144 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatat 238  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  26682738 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatat 26682832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 44 - 238
Target Start/End: Original strand, 39210661 - 39210855
Alignment:
Q  44 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 143  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  39210661 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacacagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 39210760  T
Q  144 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatat 238  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  39210761 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatat 39210855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 4201051 - 4200858
Alignment:
Q  45 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  4201051 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaacgtagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatc 4200952  T
Q  145 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatat 238  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  4200951 atggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatat 4200858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 2775864 - 2775670
Alignment:
Q  44 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 143  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  2775864 ctgatagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattatagaatcattcttggcaattggcatgat 2775765  T
Q  144 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatat 238  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  2775764 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatat 2775670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Original strand, 2108644 - 2108837
Alignment:
Q  45 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 144  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  2108644 tgacagttagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 2108743  T
Q  145 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatat 238  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  2108744 atggtcaaacagagaggcttggcataatttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtccagtccgggagcttcctcatat 2108837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Original strand, 31088103 - 31088296
Alignment:
Q  45 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31088103 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccgaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 31088202  T
Q  145 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatat 238  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||    
T  31088203 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatat 31088296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 45733964 - 45733771
Alignment:
Q  45 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  45733964 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 45733865  T
Q  145 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatat 238  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||    
T  45733864 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatat 45733771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Original strand, 10916499 - 10916697
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  10916499 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 10916598  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||||  ||||| ||| ||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  10916599 gcatgatcatggctaaacagagaagctttacacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctca 10916697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2155085 - 2154887
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  2155085 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 2154986  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  2154985 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctca 2154887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Original strand, 16503011 - 16503209
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  16503011 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 16503110  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  || |||||||| ||||||||||||    
T  16503111 gcatgatcatggctgaacaaagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacagacatcaagtctaggagcttcctca 16503209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Original strand, 16518047 - 16518245
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  16518047 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 16518146  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  || |||||||| ||||||||||||    
T  16518147 gcatgatcatggctgaacaaagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacagacatcaagtctaggagcttcctca 16518245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 41 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5128500 - 5128306
Alignment:
Q  41 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 140  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  5128500 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 5128401  T
Q  141 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||| | | |||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  5128400 gatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttacgacgttatggacatcaagtctaggagcttcctca 5128306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 41 - 235
Target Start/End: Original strand, 11424412 - 11424605
Alignment:
Q  41 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 140  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  11424412 tcactaacagtcaaa-aattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 11424510  T
Q  141 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||| |||||||    
T  11424511 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagtttcctca 11424605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26435768 - 26435571
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||   ||    
T  26435768 acatcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcctagacactcgg 26435669  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  26435668 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 26435571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 26537502 - 26537699
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | ||||||| |||||| ||| | |||| |||| ||  |||    
T  26537502 acatcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccgaaggatcacgaaggcatcctagacacttgg 26537601  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  26537602 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 26537699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31125431 - 31125234
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    ||||||||||| |||| |  ||| || |||||||| || |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||| | |||| |||| ||  |||    
T  31125431 acatcactgacggtcagaagattatcattcatcaaactttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacgaaggcatcctagacacttgg 31125332  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || || |||||||| ||||||||||||    
T  31125331 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaatattgcggacatcaagtctaggagcttcctca 31125234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 38 - 234
Target Start/End: Original strand, 5146972 - 5147168
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  5146972 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 5147071  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctc 234  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||| | | ||| || || |||||||| |||||||||||    
T  5147072 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttacgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctc 5147168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 16736092 - 16736289
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  16736092 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 16736191  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || ||||| || ||||||||||||    
T  16736192 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctca 16736289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 16751146 - 16751343
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  16751146 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 16751245  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || ||||| || ||||||||||||    
T  16751246 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctca 16751343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17524043 - 17523846
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  17524043 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 17523944  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || ||||| || ||||||||||||    
T  17523943 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctca 17523846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 17529172 - 17529369
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  17529172 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 17529271  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || ||||| || ||||||||||||    
T  17529272 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctca 17529369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 24592173 - 24592370
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  24592173 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 24592272  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  24592273 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 24592370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 31564022 - 31564219
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || |||||||| || |||||||| | ||||||| | | ||||||| |||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  31564022 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaaactttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccgaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 31564121  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| ||||||||||||    
T  31564122 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctca 31564219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 26513292 - 26513130
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||| ||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  26513292 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccagaggatcacggaggcatcctagacacttgg 26513193  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttg 200  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26513192 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttg 26513130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3445817 - 3445620
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  3445817 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 3445718  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||| ||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || |||||||| |||| |||||||    
T  3445717 catgctcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagtttcctca 3445620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 231
Target Start/End: Original strand, 26319501 - 26319694
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  26319501 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagtcacttgg 26319600  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttc 231  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||    
T  26319601 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttc 26319694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 231
Target Start/End: Original strand, 4144755 - 4144948
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||| | ||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| || || |||| |||| ||  |||    
T  4144755 acatcactgacagtcagaagattatcattcattaggctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttgg 4144854  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttc 231  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||    
T  4144855 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttc 4144948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9619162 - 9618969
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  9619162 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 9619063  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttc 231  Q
    |||| ||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||    
T  9619062 catgctcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaggggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttc 9618969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 231
Target Start/End: Original strand, 26274726 - 26274919
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||| ||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  26274726 acatcactgacagtcagaagattatcattcattaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 26274825  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttc 231  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||    
T  26274826 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttc 26274919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 231
Target Start/End: Original strand, 26669546 - 26669739
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    ||||||||||||||||    ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  26669546 acatcactgacagtcaggagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 26669645  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttc 231  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||    
T  26669646 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttc 26669739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 100 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11442021 - 11441886
Alignment:
Q  100 gcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagtt 199  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  11442021 gcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtt 11441922  T
Q  200 gcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    || |  || || || |||||||| ||||||||||||    
T  11441921 gcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctca 11441886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 40 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 18541308 - 18541145
Alignment:
Q  40 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggca 139  Q
    |||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||||||  || ||||| || || | ||| ||||||||||| ||| | |||||| ||||    |||    
T  18541308 atcactgacagtaaggtaattgccgtccatcaagctctggacatcgttttggacgacatggcagcccaaaggattgcgggaacattcttggcattcagca 18541209  T
Q  140 tgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaa 203  Q
    |||||||| ||||||||  | |||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  18541208 tgatcatgttcaaacaataaagcttggcacaacttgatatggagtggcaccagaggagttgcaa 18541145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 5160030 - 5159865
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||||||  || ||||| || || | ||| ||||||||||| ||| | |||||| ||||    |    
T  5160030 acatcactgacagtaaggtaattgccgtccatcaagctctggacatcgttttggacgacatggcagcccaaaggattgcgggaacattcttggcactcag 5159931  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaa 203  Q
    |||||||||| ||||||||  | |||||||| | |||||| || || |||||||||||||||||||    
T  5159930 catgatcatgttcaaacaataaagcttggcacaacttgatatggagcggcaccagaggagttgcaa 5159865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 45387854 - 45387691
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  45387854 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 45387755  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgc 201  Q
    ||||||||||    |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  45387754 catgatcatgactgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgc 45387691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 37 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22888990 - 22888789
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |     
T  22888990 gacatcgctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtaacaacccaaaggattacggaagcattctgggcaacta 22888891  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  22888890 gcatgatcatggtcaaacaaagaggtttggcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaatgttacgaacatcgagtctaggagcttcctcat 22888791  T
Q  237 at 238  Q
    ||    
T  22888790 at 22888789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 37 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25199549 - 25199348
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  25199549 gacatcgctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcatcttgaacgacgtagcaccccgaaggattacagaagcattctgggcaactg 25199450  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 236  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  25199449 gcatgatcatggtcaaacaaaaaggcttggcatagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcaacattacgaacatcaagtctgggggctttctcat 25199350  T
Q  237 at 238  Q
    ||    
T  25199349 at 25199348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 45 - 237
Target Start/End: Original strand, 29888732 - 29888924
Alignment:
Q  45 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  29888732 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 29888831  T
Q  145 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 237  Q
    | ||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  29888832 acggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcata 29888924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 44 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 33877760 - 33877566
Alignment:
Q  44 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 143  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||| |    
T  33877760 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcaacaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatggt 33877661  T
Q  144 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatat 238  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  33877660 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggatgtcaagtccgggagcttcctcatat 33877566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 11326306 - 11326113
Alignment:
Q  45 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  11326306 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 11326207  T
Q  145 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatat 238  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||    
T  11326206 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatat 11326113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Original strand, 13184299 - 13184491
Alignment:
Q  45 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  13184299 tgacagtcagataattgtcgttcatcat-ctctggatgtcattctgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatc 13184397  T
Q  145 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatat 238  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||    
T  13184398 atggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatat 13184491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Original strand, 13440144 - 13440337
Alignment:
Q  45 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  13440144 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 13440243  T
Q  145 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatat 238  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||    
T  13440244 atggtcaaacagaaaggcttggcataactcgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatat 13440337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 45 - 235
Target Start/End: Original strand, 9548193 - 9548383
Alignment:
Q  45 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  9548193 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcataatc 9548292  T
Q  145 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  9548293 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 9548383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 38 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23892725 - 23892525
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| | |||| || ||||  |||    
T  23892725 acatcactaacagttaaataattgtcattcatcaagctttggatgtcattttgaacgaagtagcaccccaaaggattacgaaggcatcctgggcagttgg 23892626  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 237  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  23892625 catgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcata 23892526  T
Q  238 t 238  Q
    |    
T  23892525 t 23892525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Original strand, 24687799 - 24687997
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  24687799 gacatcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacatg 24687898  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  24687899 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacgttacggacatcaagtctaggagcttcctca 24687997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Original strand, 22998756 - 22998954
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  22998756 gacatcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 22998855  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  22998856 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctca 22998954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Original strand, 23717630 - 23717828
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  23717630 gacatcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 23717729  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  23717730 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctca 23717828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 40 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33778004 - 33777809
Alignment:
Q  40 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggca 139  Q
    |||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  |||||    
T  33778004 atcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 33777905  T
Q  140 tgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||   || | ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  33777904 tgatcatggctgaatagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctca 33777809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30935153 - 30934955
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  30935153 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 30935054  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  30935053 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgatattacggacatcaagtctaggagcttcctca 30934955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 40 - 235
Target Start/End: Original strand, 23752095 - 23752290
Alignment:
Q  40 atcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggca 139  Q
    |||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||| | | |||| |||||||  |||||    
T  23752095 atcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattatgaaggcatcctaggcacttggca 23752194  T
Q  140 tgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  23752195 tgatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctca 23752290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24970538 - 24970340
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  24970538 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 24970439  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  24970438 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgatgttacggacatcaagtctaggagcttcctca 24970340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 48 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11549863 - 11549677
Alignment:
Q  48 cagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatg 147  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||| ||  |||||||||||||    
T  11549863 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatg 11549764  T
Q  148 gtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctc 234  Q
    |   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||    
T  11549763 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctc 11549677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Original strand, 15658402 - 15658600
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||||||| | |||| |||| ||  ||    
T  15658402 gacatcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttg 15658501  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  15658502 gcatgatcatggctgaacagagaagcttcgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 15658600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 18500373 - 18500570
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||| ||  |||    
T  18500373 acatcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttgg 18500472  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |  ||||| ||||||||||||    
T  18500473 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacattcagtctaggagcttcctca 18500570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6874824 - 6874627
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  6874824 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 6874725  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||||  |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  6874724 catgatcatggttgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 6874627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 43078771 - 43078574
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  43078771 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 43078672  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  43078671 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 43078574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28649754 - 28649557
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| |  |||||    |||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  28649754 acatcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcctgaacggtatagcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 28649655  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  28649654 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 28649557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3790060 - 3789863
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  3790060 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 3789961  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  3789960 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcactagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 3789863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 13324472 - 13324669
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  13324472 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 13324571  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  13324572 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggggttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 13324669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 41675228 - 41675063
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||| ||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||  |||    
T  41675228 acattactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttgg 41675129  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaa 203  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41675128 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagtttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaa 41675063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Original strand, 18375054 - 18375252
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    ||||||||||||||||| | | || || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||  ||    
T  18375054 gacatcactgacagtcagaaagttatcattcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttg 18375153  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||| |  |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  18375154 gcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 18375252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2511570 - 2511373
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  2511570 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 2511471  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || ||||| || ||||||||||||    
T  2511470 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctca 2511373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5638429 - 5638236
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  5638429 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 5638330  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttc 231  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||    
T  5638329 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttc 5638236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12132674 - 12132481
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| |||| ||  |||    
T  12132674 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcctagacacttgg 12132575  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttc 231  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||    
T  12132574 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttc 12132481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24681959 - 24681762
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  24681959 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 24681860  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||| ||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || |||||||| ||||||||||||    
T  24681859 catgctcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctca 24681762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24724486 - 24724289
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  24724486 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 24724387  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||| ||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || |||||||| ||||||||||||    
T  24724386 catgctcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctca 24724289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30029934 - 30029741
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||| ||| |||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  30029934 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcgtggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 30029835  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttc 231  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||    
T  30029834 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttc 30029741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 31826050 - 31826247
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| | |||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  31826050 acatcactgacagtcagaaaattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcttggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 31826149  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||| |  || || || |||||||| |||| |||||||    
T  31826150 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccaaaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagtttcctca 31826247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 37358286 - 37358483
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || |||||||| || |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  37358286 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaatctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 37358385  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||  || || || |||||||| ||||||||||||    
T  37358386 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccaggggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctca 37358483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9317970 - 9317777
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  9317970 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 9317871  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttc 231  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||    
T  9317870 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttc 9317777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30152537 - 30152340
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||  |||    
T  30152537 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttgg 30152438  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| ||||||||||||    
T  30152437 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctca 30152340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31431959 - 31431762
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||||||| || || |||| |||| ||  |||    
T  31431959 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttgg 31431860  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| |||||||||||| || || |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| ||||||||||||    
T  31431859 catgatcatggctgaacagagaagctttgcatagcttgatatgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctca 31431762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33516875 - 33516682
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  33516875 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 33516776  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttc 231  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||    
T  33516775 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttc 33516682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 37755499 - 37755302
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  |||  | ||||||||| | |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||  |||| ||  |||    
T  37755499 acatcactgacagtcagaagattagcattcatcaagttttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcaccctagacacttgg 37755400  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  37755399 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 37755302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 37770630 - 37770827
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  |||  | ||||||||| | |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  37770630 acatcactgacagtcagaagattagcattcatcaagttttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 37770729  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||||||| |||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| | ||||||||||    
T  37770730 catgatcatggctgaacaaagaagctttgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagtagcaacattgcggacatcaagtctagaagcttcctca 37770827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 40473192 - 40473389
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||| ||||||| |||||||| | | ||||| | | |||||||||||||| |||||  ||| |||| ||  |||    
T  40473192 acatcactgacagtcagaagattatcattcgtcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggagacatcctagacacttgg 40473291  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||| ||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  40473292 catggtcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 40473389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 15758500 - 15758697
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | | ||||| | | |||||| ||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  15758500 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacctaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 15758599  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||| ||||||   ||||  || |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  15758600 catgctcatggctgaacagggaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 15758697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34617037 - 34616840
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| |  ||||||   | ||||||||| |||||||  | |||| |||| ||  |||    
T  34617037 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcctgaacagtatggcaacccaagggattacaaaggcatcctagacacttgg 34616938  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| ||||||||    
T  34616937 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctca 34616840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 8665118 - 8665315
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    ||||||||||| |||| |  ||| || ||||||||||| ||||| ||   ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  8665118 acatcactgacggtcagaagattatcattcatcaagctttggatatcgccttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 8665217  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||| ||||||   ||||  || |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| ||||||||    
T  8665218 catgctcatggctgaacagggaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctca 8665315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 203
Target Start/End: Original strand, 28959429 - 28959594
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | ||| |||||||||| || || |||| |||| ||  |||    
T  28959429 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttgg 28959528  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaa 203  Q
    |||||||||||   |||| |||||||| ||| ||||||| ||| || |||||||||||||| ||||    
T  28959529 catgatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttgacgtgcagaggcaccagaggagtggcaa 28959594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 203
Target Start/End: Original strand, 32599115 - 32599280
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||||||| || || |||| |||| ||  |||    
T  32599115 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttgg 32599214  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaa 203  Q
    |||||||||||   |||| |||||||| ||| ||||||| ||| || |||||||||||||| ||||    
T  32599215 catgatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttgacgtgcagaggcaccagaggagtggcaa 32599280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 33293044 - 33292879
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||||||  || ||||| || || | ||| |||||||| || ||| | |||||| ||||    |    
T  33293044 acatcactgacagtaaggtaattgccgtccatcaagctctggacatcgttttggacgacatggcagcccaaagggttgcgggaacattcttggcactcag 33292945  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaa 203  Q
    |||||||||| ||||||||  | |||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  33292944 catgatcatgttcaaacaataaagcttggcacaacttgatatggagtggcaccagaggagttgcaa 33292879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 195
Target Start/End: Original strand, 37671126 - 37671283
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || |||||||| || |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| || || |||| |||| ||  |||    
T  37671126 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaaactttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttgg 37671225  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagagg 195  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  37671226 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagagg 37671283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 30168988 - 30168825
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||| ||||| |||||||| | ||||||| | || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  | |    
T  30168988 acatcactgacagtcagaagattatcattcattaagctttggatgtcgtcttgaacagcataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttag 30168889  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgc 201  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  30168888 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgc 30168825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26480910 - 26480718
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||   || | || ||  |||    
T  26480910 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagatatcccagacacttgg 26480811  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttc 231  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||| ||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||    
T  26480810 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccaga-gagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttc 26480718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Original strand, 29966806 - 29966902
Alignment:
Q  135 tggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttc 231  Q
    ||||||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||    
T  29966806 tggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttc 29966902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 37 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20461591 - 20461390
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||    
T  20461591 gacatcgctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgtagcaacccaaaggattacgaaagcattctggacaactg 20461492  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  20461491 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttgacatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacatcaagtctgcgagcttgctcat 20461392  T
Q  237 at 238  Q
    ||    
T  20461391 at 20461390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 37 - 238
Target Start/End: Original strand, 16207776 - 16207977
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  16207776 gacatcgctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctttggatgtcattttgaacgacatagcaccccaaaggattacggaagcattctgggcaactg 16207875  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  16207876 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagaggcaccaaaggagttgcaacattacgaacatcaagtctgggagctttctcat 16207975  T
Q  237 at 238  Q
    ||    
T  16207976 at 16207977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 37 - 238
Target Start/End: Original strand, 20340080 - 20340281
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||| | ||| ||    
T  20340080 gacatcgctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagtaacccaaaggattacagaaacattctggacaactg 20340179  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 236  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20340180 gcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcat 20340279  T
Q  237 at 238  Q
    ||    
T  20340280 at 20340281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 44 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 28152365 - 28152171
Alignment:
Q  44 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 143  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  28152365 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 28152266  T
Q  144 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatat 238  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  28152265 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatat 28152171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 41793054 - 41793251
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||| ||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  41793054 acattactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 41793153  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||||  |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  41793154 catgatcatggttgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 41793251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 51638728 - 51638530
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    ||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| || || |||| |||| ||  ||    
T  51638728 gacatcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtataacaacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttg 51638629  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| |  || || || |||||||| ||||||||||||    
T  51638628 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatatgtagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctca 51638530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28585490 - 28585297
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||| | | |||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  28585490 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 28585391  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttc 231  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||    
T  28585390 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttc 28585297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10963179 - 10962986
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| |  ||||||   | ||||||||| |||||||  | |||| |||  ||  |||    
T  10963179 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcctgaacagtatggcaacccaagggattacaaaggcatcctaaacacttgg 10963080  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttc 231  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||    
T  10963079 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttc 10962986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Original strand, 19658752 - 19658945
Alignment:
Q  45 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 144  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19658752 tgacagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattttgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 19658851  T
Q  145 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatat 238  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  19658852 atggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgggtagtggcaccagaggagttgcaacgttacgaacgtccggtctgggagcttcctcatat 19658945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 44 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18711090 - 18710896
Alignment:
Q  44 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 143  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  18711090 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 18710991  T
Q  144 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatat 238  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  18710990 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatat 18710896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 44 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 44563603 - 44563409
Alignment:
Q  44 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 143  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  44563603 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 44563504  T
Q  144 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatat 238  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||   |||||||||||||||||||    
T  44563503 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatat 44563409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 33245168 - 33244975
Alignment:
Q  45 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 144  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  33245168 tgacagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 33245069  T
Q  145 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatat 238  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  33245068 atggtcaaacagagaggcttggcataatttgatgtgtagtggcaccataggagttgcaacgttacaaacgtccggtctgagagcttcctcatat 33244975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 44 - 236
Target Start/End: Original strand, 22080589 - 22080781
Alignment:
Q  44 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 143  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| | ||| |||||||||    
T  22080589 ctgatagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatatcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggcggcattctggacaattggcatgat 22080688  T
Q  144 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 236  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  22080689 catggtcaaacaaggaggcttggcatagcttgatgtgtagcggtaccagaggagttgcaacattacgaacgtcaagactgggaacttcttcat 22080781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16278065 - 16277867
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   ||||||| |||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  16278065 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaactcaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 16277966  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  16277965 gcatgatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctca 16277867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16283960 - 16283762
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||    
T  16283960 gacatcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcaaatg 16283861  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    | ||||||||||  ||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||| ||  ||||||| ||||||||||||    
T  16283860 gtatgatcatggctaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgacattacggacaacaagtctaggagcttcctca 16283762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14558135 - 14557937
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  14558135 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 14558036  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||    |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  14558035 gcatgatcatgactgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctca 14557937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 37 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19688609 - 19688412
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| ||| |||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  19688609 gacatcattgacattcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttggacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 19688510  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctc 234  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||    
T  19688509 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctc 19688412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Original strand, 2136963 - 2137161
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  2136963 gacatcactaacagtcaaaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 2137062  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||| ||||    
T  2137063 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctttctca 2137161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Original strand, 27608609 - 27608807
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  27608609 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 27608708  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||||   || |  || |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  27608709 gcatgatcatggctgaatagggaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctca 27608807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 3329212 - 3329409
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    ||||||||||||||||   | || || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  3329212 acatcactgacagtcaggaagttatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 3329311  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| ||||||||||||    
T  3329312 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctca 3329409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19674951 - 19674754
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  19674951 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 19674852  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || |||||||| ||||||||||||    
T  19674851 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctca 19674754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 12092429 - 12092626
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    ||||||||||| |||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | ||||||||||| || ||||| |||| |||| ||  ||     
T  12092429 acatcactgacggtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaagaatcacggaggcatcctagacacttgt 12092528  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| |||||||||||| || || ||||||||||||||  |||| || || || |||||||| ||||||||||||    
T  12092529 catgatcatggctgaacagagaagctttgcatagcttgatatgcagaggcaccagaggagtgacaatattgcggacatcaagtctaggagcttcctca 12092626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19286972 - 19286775
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||| ||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | ||||||||| |||||||| | |||| |||| ||  |||    
T  19286972 acatcattgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaagggattacgaaggcatcctagacatttgg 19286873  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| ||||||||||||    
T  19286872 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctca 19286775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29829832 - 29829635
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  29829832 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 29829733  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| ||||||||||||    
T  29829732 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctca 29829635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 18791218 - 18791107
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  18791218 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgagcagtgtagcaacccaaaggattacgaatgcatcctaggcacttg 18791119  T
Q  137 gcatgatcatgg 148  Q
    ||||||||||||    
T  18791118 gcatgatcatgg 18791107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 231
Target Start/End: Original strand, 19208065 - 19208258
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  19208065 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 19208164  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttc 231  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||    
T  19208165 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttc 19208258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 231
Target Start/End: Original strand, 28361660 - 28361853
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  28361660 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 28361759  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttc 231  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||    
T  28361760 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttc 28361853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33259233 - 33259040
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||| | | |||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  33259233 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 33259134  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttc 231  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||    
T  33259133 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttc 33259040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 121 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 189521 - 189407
Alignment:
Q  121 gcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagt 220  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || ||||||    
T  189521 gcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagt 189422  T
Q  221 ctgggagcttcctca 235  Q
    || ||||||||||||    
T  189421 ctaggagcttcctca 189407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31355034 - 31354837
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    ||||||||||||||||    ||| || | ||||| ||| |||||||| | | ||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  31355034 acatcactgacagtcaggagattatcatccatcaggctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 31354935  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||| ||||||   ||||  || |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||||||||||||||||    
T  31354934 catgctcatggctgaacagggaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctgggagcttcctca 31354837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 231
Target Start/End: Original strand, 31489455 - 31489648
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | |||||||   ||||| ||||||||||  | || |||| |||| ||  |||    
T  31489455 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcccagaggcatcctagacacttgg 31489554  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttc 231  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||    
T  31489555 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttc 31489648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9355133 - 9354936
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||| |||||||| |  ||||||   | ||||||||| |||||||  | |||| |||| ||  |||    
T  9355133 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcgtcctgaacagtatggcaacccaagggattacaaaggcatcctagacacttgg 9355034  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| ||||||||    
T  9355033 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctca 9354936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 37 - 238
Target Start/End: Original strand, 2403 - 2604
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||| | ||| ||    
T  2403 gacatcgctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagtaacccaaaggattacagaaacattctggacaactg 2502  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 236  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2503 gcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcat 2602  T
Q  237 at 238  Q
    ||    
T  2603 at 2604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 48)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 44 - 238
Target Start/End: Original strand, 14142980 - 14143174
Alignment:
Q  44 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 143  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  14142980 ctgacagtcaaataattgttgttcatcaagctctggatgtcattttaaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 14143079  T
Q  144 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatat 238  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  14143080 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatat 14143174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 44 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26788445 - 26788251
Alignment:
Q  44 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 143  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  26788445 ctgacagtcaaataattgttgttcatcaagctctggatgtcattttaaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 26788346  T
Q  144 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatat 238  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  26788345 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatat 26788251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 44 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27196818 - 27196624
Alignment:
Q  44 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 143  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  27196818 ctgacagtcaaataattgttgttcatcaagctctggatgtcattttaaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 27196719  T
Q  144 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatat 238  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  27196718 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatat 27196624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 44 - 238
Target Start/End: Original strand, 27252422 - 27252616
Alignment:
Q  44 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 143  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  27252422 ctgacagtcaaataattgttgttcatcaagctctggatgtcattttaaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 27252521  T
Q  144 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatat 238  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  27252522 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatat 27252616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 44 - 238
Target Start/End: Original strand, 13521768 - 13521962
Alignment:
Q  44 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 143  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||| |    
T  13521768 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcaacaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatggt 13521867  T
Q  144 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatat 238  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  13521868 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggatgtcaagtccgggagcttcctcatat 13521962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Original strand, 8892007 - 8892200
Alignment:
Q  45 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8892007 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 8892106  T
Q  145 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatat 238  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||    
T  8892107 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatat 8892200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Original strand, 8903242 - 8903435
Alignment:
Q  45 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8903242 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 8903341  T
Q  145 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatat 238  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||    
T  8903342 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatat 8903435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 28163157 - 28162964
Alignment:
Q  45 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  28163157 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaccgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 28163058  T
Q  145 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatat 238  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||    
T  28163057 atggtcaaacagagaggcttggcataacccgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatat 28162964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Original strand, 33373952 - 33374145
Alignment:
Q  45 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  33373952 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 33374051  T
Q  145 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatat 238  Q
     |||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||    
T  33374052 gtggtcaaacagagaggcttggcataacccgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatat 33374145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 44 - 238
Target Start/End: Original strand, 22456638 - 22456823
Alignment:
Q  44 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||    
T  22456638 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaatctctggatgtcgttttgaacaacgtagcaacccaaaggattacagaagcattctggacaattggcatgat 22456737  T
Q  144 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatat 238  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||         ||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  22456738 catggtcaaacaaagaagctttgcatagcttgatgtg---------cagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatat 22456823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Original strand, 13298639 - 13298837
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||| | | |||| |||||||  ||    
T  13298639 gacatcactgacagtcaaataattgtcattcatcaagctctggatgtcattttgaacagtataccaacccaaaggattatgaaggcatcctaggcacttg 13298738  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  13298739 gcatgatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctca 13298837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 38 - 203
Target Start/End: Original strand, 17092129 - 17092294
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||| ||     
T  17092129 acatcactaacagtcagatagttgtcgttcatcaagccctggatgtcattttgaacaatgtagcaacccaaaggatcacggaagtattatgggcaactgc 17092228  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaa 203  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  17092229 tatgatcatggtcaaacaaagaggcttgacatagcttgatgtttagaggcaccagaggagttgcaa 17092294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 41 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26918884 - 26918690
Alignment:
Q  41 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 140  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||| || |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  26918884 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgttatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 26918785  T
Q  141 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  26918784 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctca 26918690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 238
Target Start/End: Original strand, 27290058 - 27290259
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  27290058 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 27290157  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcat 236  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  27290158 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcat 27290257  T
Q  237 at 238  Q
    ||    
T  27290258 at 27290259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Original strand, 15424005 - 15424203
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||   |    
T  15424005 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcactcg 15424104  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  15424105 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctca 15424203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Original strand, 22934568 - 22934766
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  22934568 gacatcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 22934667  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  22934668 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccaaaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctca 22934766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Original strand, 23857013 - 23857211
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  23857013 gacatcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 23857112  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  23857113 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccaaaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctca 23857211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Original strand, 27272268 - 27272466
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    ||||||||| ||||||||| | || || |||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||    
T  27272268 gacatcactaacagtcaaaaacttatcattcatcaagctctggatgtcatcttgaacaataaagcaacccaaaggattacggaggcatcctaggcacttg 27272367  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||| |||||| |||||    
T  27272368 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatatgtagaggcaccagaggagttacaacgttacggacatcaagtctaggagctacctca 27272466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26989510 - 26989311
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattg-tcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagt 135  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  |    
T  26989510 gacatcactaacagtcaaaaaattaatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcactt 26989411  T
Q  136 ggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  26989410 ggcatgatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagagacaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctca 26989311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Original strand, 24304306 - 24304504
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  24304306 gacatcactaacagtcaaaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 24304405  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||| ||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  24304406 gcatggtcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgatgttacggacatcaagtctaggagcttcctca 24304504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24864225 - 24864027
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||| ||||| |||||||    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  24864225 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggacgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 24864126  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||||   |||| ||||| || ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  24864125 gcatgatcatggctgaacagagaggatttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctca 24864027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29549982 - 29549785
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| | |||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||||||| | |||| |||||||  |||    
T  29549982 acatcactgacagtcagaaaattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttgg 29549883  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||  ||||||||||||    
T  29549882 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtccaggagcttcctca 29549785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16750361 - 16750164
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||  |||    
T  16750361 acatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttgg 16750262  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||  | |||||||| ||||||||||||    
T  16750261 catgatcatggctgaacagagaagctttgcaccgcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcgggcatcaagtctaggagcttcctca 16750164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 34463035 - 34463232
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  34463035 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 34463134  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  34463135 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 34463232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27485636 - 27485439
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||| ||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  27485636 acatcactaacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 27485537  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || ||||| || ||||||||||||    
T  27485536 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcctca 27485439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 27019643 - 27019461
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   || |||| ||||| |||||| | |||| |||||||  |||    
T  27019643 acatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtataacaactcaaagcattacgaaggcatcctaggcacttgg 27019544  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagt 220  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||| || ||||||    
T  27019543 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccaggggagttgcgacgttacggacatcaagt 27019461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3696588 - 3696395
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    ||||| |||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||| ||| | |||| |||| ||  |||    
T  3696588 acatcgctgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacgaaggcatcctagacacttgg 3696489  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttc 231  Q
    ||||||| |||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||    
T  3696488 catgatcgtggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttc 3696395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 4545464 - 4545661
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||||||| || || |||| |||| ||  |||    
T  4545464 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttgg 4545563  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| ||||||||||||    
T  4545564 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtagcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctca 4545661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 4723823 - 4724020
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | ||| ||||||||||  |||| |||| |||| ||  |||    
T  4723823 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcagcccaaaggatctcggaggcatcctagacacttgg 4723922  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| ||||||||||||    
T  4723923 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtagcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctca 4724020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16674646 - 16674449
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  16674646 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 16674547  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   || | ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||| | | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  16674546 catgatcatggctgaatagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttacgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 16674449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 26116099 - 26116296
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| ||||||||| | || |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  26116099 acatcactgacagtcagaagattatcgttcatcgaactttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 26116198  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||  |||  || || || |||||||| ||||||||||||    
T  26116199 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagtgacaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctca 26116296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4758271 - 4758074
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||  |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  4758271 acatcactgacagtccgaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 4758172  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||  |||  || || || |||||||| ||||||||||||    
T  4758171 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggggtgacaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctca 4758074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4773513 - 4773316
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||||||| || || |||| |||| ||  |||    
T  4773513 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttgg 4773414  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| |||||||| ||| ||||||| ||| || ||||||||||||||  |||  || || || |||||||| ||||||||||||    
T  4773413 catgatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttgacgtgcagaggcaccagaggagtgacaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctca 4773316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 231
Target Start/End: Original strand, 16943716 - 16943909
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||| | | |||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  16943716 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 16943815  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttc 231  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||    
T  16943816 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttc 16943909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27044895 - 27044698
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||| ||||| |||||||| | |||||||   | ||||||||| |||||||| | |||| |||| ||  |||    
T  27044895 acatcactgacagtcagaagattatcattcattaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaagggattacgaaggcatcctagacacttgg 27044796  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| ||||||||||||    
T  27044795 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctca 27044698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28207961 - 28207764
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | ||||||||||| || ||||| |||| |||| ||  ||     
T  28207961 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaagaatcacggaggcatcctagacacttgt 28207862  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| |||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||  || || || |||||||| ||||||||||||    
T  28207861 catgatcatggctgaacagagaagctttgcatagcttgatatgcagaggcaccaggggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctca 28207764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29573520 - 29573327
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  29573520 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 29573421  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttc 231  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||    
T  29573420 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttc 29573327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 231
Target Start/End: Original strand, 30557705 - 30557898
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  30557705 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 30557804  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttc 231  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||    
T  30557805 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttc 30557898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Original strand, 27359680 - 27359878
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    ||||||||||||||||| |  ||| || | ||||| ||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||||||| || || |||| |||| ||  ||    
T  27359680 gacatcactgacagtcagaagattatcatccatcaggctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttg 27359779  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||||   |||| |||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||| ||||  ||  | || |||||||| ||||||||||||    
T  27359780 gcatgatcatggctgaacagagaggctttgcatagcttgatatgcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggagcttcctca 27359878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Original strand, 27450023 - 27450221
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    ||||||||||||||||| |  ||| || | ||||| ||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||||||| || || |||| |||| ||  ||    
T  27450023 gacatcactgacagtcagaagattatcatccatcaggctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttg 27450122  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||||   |||| |||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||| ||||  ||  | || |||||||| ||||||||||||    
T  27450123 gcatgatcatggctgaacagagaggctttgcatagcttgatatgcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggagcttcctca 27450221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4525793 - 4525596
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||| ||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  4525793 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaggctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 4525694  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| |||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||  || || || |||||||| ||||||||||||    
T  4525693 catgatcatggctgaacagagaagctttgcatagcttgatatgcagaggcaccaggggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctca 4525596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29501922 - 29501725
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||| ||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||||||| || || |||| |||| ||  |||    
T  29501922 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaggctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttgg 29501823  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  29501822 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 29501725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27008234 - 27008039
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||| ||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||||||| || || |||| |||| ||  |||    
T  27008234 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaggctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttgg 27008135  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcct 233  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| ||||||||||    
T  27008134 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcct 27008039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20161182 - 20161011
Alignment:
Q  64 gttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggct 163  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| || |||| | | ||||| | ||||||| ||| ||||||  ||||| || |||| ||||||  |||||| ||||||    
T  20161182 gttcatcaggctctggatatcattctgcacaatgcaacaacctagaggattaaggaggcattccgggcaactgacatggtcatggctaaacaacgaggct 20161083  T
Q  164 tggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||| | |||||||  ||||| || |||| | ||||  | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  20161082 tggtagagcttgacatgtagcggtaccaaatgagtcacgatgttgcgaacgtcaagtctaggagcttcctca 20161011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 235
Target Start/End: Original strand, 22171649 - 22171820
Alignment:
Q  64 gttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggct 163  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| || |||| | | ||||| | ||||||| ||| ||||||  ||||| || |||| ||||||  |||||| ||||||    
T  22171649 gttcatcaggctctggatatcattctgcacaatgcaacaacctagaggattaaggaggcattccgggcaactgacatggtcatggctaaacaacgaggct 22171748  T
Q  164 tggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||| | |||||||  ||||| || |||| | ||||  | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22171749 tggtagagcttgacatgtagcggtaccaaatgagtcacgatgttgcgaacgtcaagtctaggagcttcctca 22171820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 176
Target Start/End: Original strand, 26777299 - 26777437
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||||||| || || |||| |||| ||  |||    
T  26777299 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttgg 26777398  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttga 176  Q
    |||||||||||   |||| |||||||| ||| |||||||    
T  26777399 catgatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttga 26777437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17025652 - 17025587
Alignment:
Q  170 agcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  17025652 agcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 17025587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 237
Target Start/End: Original strand, 27629389 - 27629588
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||| ||||||| || ||| || ||||||||||||||||| || | ||| ||||||  ||||||||| |||||| ||  ||| ||   |||| ||     
T  27629389 acatcactaacagtcagatgattatcattcatcaagctctggatatcctcttgcacaacgcggcaacccaagggattaagggcgcactcggagcaactgt 27629488  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 237  Q
    |||||||||| | ||||||||| || ||||| || || |  || || ||||||| |||||| ||||  ||||| || || ||| |||| ||||| |||||    
T  27629489 catgatcatgtttaaacaaagaagcctggcaaagtttaacatgcaggggcaccaaaggagtcgcaacattacggacatctagtttgggcgcttcttcata 27629588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 45 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22064 - 21906
Alignment:
Q  45 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 144  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||||    
T  22064 tgacaatcagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggcggcattctgggcaattggcatgatc 21965  T
Q  145 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaa 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  21964 atggtcaaacaaggaggcttggcatagcttgatgtgtagcggtaccagaggagttgcaa 21906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 237
Target Start/End: Original strand, 364 - 563
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||| | ||||| |||    
T  364 acatcgctgacagtaagataattgtcattcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtaacaaccccaaggattatggcggcattatgggcaattgg 463  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcata 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||| |||| |||||    
T  464 catgatcatggtcaaacaaggagacttggcatagcttgatgtgtagcggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagactgggaacttcttcata 563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Original strand, 46730 - 46928
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||  |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  46730 gacatcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagccttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 46829  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  46830 gcatgatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacattacggacatcaagtctaggagcttcctca 46928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Original strand, 39814 - 40012
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||    
T  39814 gacatcattgacagtcaaaaaattatcattcgtcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttg 39913  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  39914 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacgttacggacatcaagtctaggagcttcctca 40012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30274 - 30076
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||    |||||||||||||||| || | |||| |||||||  ||    
T  30274 gacatcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattccgaaggcatcctaggcacttg 30175  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    || |||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||  |||||||||||    
T  30174 gcgtgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaggggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaagagcttcctca 30076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30964 - 30765
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataa-ttgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagt 135  Q
    ||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  |    
T  30964 gacatcactgacagtcaaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcactt 30865  T
Q  136 ggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  30864 ggcatgatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttacgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctca 30765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6524 - 6327
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||| ||  |||    
T  6524 acatcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttgg 6425  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |  ||||| ||||||||||||    
T  6424 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacattcagtctaggagcttcctca 6327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27804 - 27605
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattg-tcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagt 135  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  |    
T  27804 gacatcactaacagtcaaaaaattaatcattcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcactt 27705  T
Q  136 ggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||||  ||| | ||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  || |||||||| ||||||||||||    
T  27704 ggcatgatcatggctaaatagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacagacatcaagtctaggagcttcctca 27605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10076 - 9879
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||| ||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  10076 acatcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacctaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 9977  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| | |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| ||||||||||||    
T  9976 catgatcatggctgaacagaaaggctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctca 9879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Original strand, 14675 - 14873
Alignment:
Q  37 gacatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    ||||||||||||||||| | | || || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||    
T  14675 gacatcactgacagtcagaaagttatcattcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttg 14774  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  14775 gcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 14873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 8812 - 9009
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | | ||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||    
T  8812 acatcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttgg 8911  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || ||||| || ||||||||||||    
T  8912 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcctca 9009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20526 - 20328
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaata-attgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtg 136  Q
    |||||||||||||||| | | ||| || | ||||||||| |||||||| | | ||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||    
T  20526 acatcactgacagtcagaaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttg 20427  T
Q  137 gcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || ||||| || ||||||||||||    
T  20426 gcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcctca 20328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 231
Target Start/End: Original strand, 25947 - 26140
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| || || |||| |||| ||  |||    
T  25947 acatcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtataacaacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttgg 26046  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttc 231  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||    
T  26047 catgatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatatgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttc 26140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 231
Target Start/End: Original strand, 6985 - 7178
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  |||    
T  6985 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttgg 7084  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttc 231  Q
    |||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||    
T  7085 catgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttc 7178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8459 - 8262
Alignment:
Q  38 acatcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtgg 137  Q
    |||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | ||||||||||| || ||||| |||| |||| ||  ||     
T  8459 acatcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaagaatcacggaggcatcctagacacttgt 8360  T
Q  138 catgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||   |||| ||| |||| |||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||  || || || |||||||| ||||||||||||    
T  8359 catgatcatggctgaacagagaagctttgcatagcttgatatgcagaggcaccaggggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctca 8262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 100
Target Start/End: Original strand, 119651 - 119706
Alignment:
Q  45 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtag 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  119651 tgacagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtag 119706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 170 - 235
Target Start/End: Original strand, 7 - 72
Alignment:
Q  170 agcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 235  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  7 agcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctca 72  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 222
Target Start/End: Original strand, 46604 - 46729
Alignment:
Q  99 agcaacccaaa-ggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat-catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagagga 196  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||| |||||||  ||||||||| |||||   |||| ||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  46604 agcaacccaaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgattcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagagga 46703  T
Q  197 gttgcaatgttacgaacgtcaagtct 222  Q
    ||||  |||||||| || ||||||||    
T  46704 gttgtgatgttacggacatcaagtct 46729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University