View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6790_low_20 (Length: 254)

Name: NF6790_low_20
Description: NF6790
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6790_low_20
NF6790_low_20
[»] chr1 (33 HSPs)
chr1 (1-254)||(16347990-16348243)
chr1 (1-254)||(51330887-51331140)
chr1 (1-254)||(33388424-33388677)
chr1 (1-254)||(41351063-41351316)
chr1 (1-254)||(21833013-21833266)
chr1 (1-254)||(19109079-19109332)
chr1 (1-254)||(24785252-24785505)
chr1 (1-254)||(17042410-17042663)
chr1 (107-254)||(21839661-21839808)
chr1 (1-127)||(20081771-20081897)
chr1 (1-246)||(16378813-16379058)
chr1 (56-254)||(21233181-21233379)
chr1 (68-254)||(22502751-22502937)
chr1 (1-111)||(21842066-21842176)
chr1 (25-252)||(21751650-21751877)
chr1 (24-155)||(429575-429706)
chr1 (35-207)||(19857063-19857235)
chr1 (1-55)||(22496651-22496705)
chr1 (11-180)||(20833305-20833474)
chr1 (113-254)||(21861880-21862021)
chr1 (113-254)||(22359751-22359892)
chr1 (1-180)||(22016140-22016319)
chr1 (1-246)||(20854155-20854400)
chr1 (1-246)||(21739431-21739676)
chr1 (1-180)||(21742947-21743126)
chr1 (35-132)||(38910255-38910352)
chr1 (13-180)||(24097022-24097189)
chr1 (35-180)||(31537426-31537571)
chr1 (35-180)||(48425689-48425834)
chr1 (35-180)||(52988557-52988702)
chr1 (44-132)||(12200382-12200470)
chr1 (185-254)||(20140794-20140863)
chr1 (35-131)||(37679914-37680010)
[»] chr8 (34 HSPs)
chr8 (1-254)||(17671788-17672041)
chr8 (1-254)||(18859339-18859592)
chr8 (1-254)||(19115162-19115415)
chr8 (1-254)||(20016029-20016282)
chr8 (1-254)||(19481838-19482091)
chr8 (1-254)||(22126725-22126978)
chr8 (1-254)||(22117941-22118194)
chr8 (1-254)||(19980729-19980982)
chr8 (1-254)||(30310910-30311163)
chr8 (1-254)||(21164304-21164557)
chr8 (1-254)||(22129383-22129636)
chr8 (1-254)||(32602907-32603160)
chr8 (1-254)||(15536145-15536398)
chr8 (1-254)||(22042589-22042842)
chr8 (1-254)||(22030865-22031118)
chr8 (1-254)||(21391627-21391880)
chr8 (1-254)||(21780953-21781206)
chr8 (1-254)||(21786121-21786374)
chr8 (1-246)||(21253715-21253960)
chr8 (1-254)||(22989807-22990060)
chr8 (1-246)||(22421658-22421903)
chr8 (1-228)||(22375220-22375446)
chr8 (1-246)||(22246199-22246444)
chr8 (1-232)||(22523330-22523561)
chr8 (1-252)||(20390850-20391101)
chr8 (118-231)||(21919987-21920100)
chr8 (1-88)||(22245781-22245868)
chr8 (1-180)||(22373705-22373884)
chr8 (113-180)||(21323157-21323224)
chr8 (11-246)||(22028056-22028291)
chr8 (1-175)||(21928269-21928443)
chr8 (1-180)||(22053699-22053878)
chr8 (113-228)||(23887816-23887931)
chr8 (113-175)||(31568722-31568784)
[»] chr7 (41 HSPs)
chr7 (1-254)||(10873375-10873628)
chr7 (1-254)||(14335081-14335334)
chr7 (1-254)||(44788683-44788936)
chr7 (1-254)||(8200733-8200986)
chr7 (1-254)||(8710290-8710543)
chr7 (1-254)||(18587503-18587756)
chr7 (1-254)||(11234545-11234798)
chr7 (1-254)||(13688726-13688979)
chr7 (1-254)||(15158389-15158642)
chr7 (1-254)||(18180430-18180681)
chr7 (1-254)||(11550434-11550687)
chr7 (1-254)||(12690187-12690440)
chr7 (1-254)||(14957239-14957492)
chr7 (1-254)||(17703787-17704040)
chr7 (1-254)||(9591053-9591302)
chr7 (95-254)||(14149862-14150021)
chr7 (1-156)||(15146255-15146410)
chr7 (8-232)||(14042402-14042626)
chr7 (8-232)||(14352432-14352656)
chr7 (1-230)||(15627233-15627462)
chr7 (131-254)||(16726845-16726968)
chr7 (1-180)||(19149771-19149950)
chr7 (1-180)||(20749170-20749349)
chr7 (201-249)||(15146416-15146464)
chr7 (1-207)||(13676184-13676390)
chr7 (1-180)||(18051263-18051442)
chr7 (41-231)||(15099953-15100143)
chr7 (11-180)||(14261566-14261734)
chr7 (1-180)||(14140439-14140618)
chr7 (1-180)||(16947782-16947961)
chr7 (1-180)||(12459388-12459567)
chr7 (41-180)||(12798851-12798990)
chr7 (1-180)||(13024105-13024284)
chr7 (11-180)||(11385749-11385918)
chr7 (35-180)||(26092142-26092287)
chr7 (1-180)||(14283684-14283863)
chr7 (113-180)||(19615435-19615502)
chr7 (11-180)||(12204120-12204289)
chr7 (11-180)||(15343191-15343360)
chr7 (35-131)||(26115934-26116030)
chr7 (44-180)||(49155061-49155197)
[»] chr6 (39 HSPs)
chr6 (1-254)||(27189996-27190249)
chr6 (1-254)||(27258991-27259244)
chr6 (1-254)||(28312190-28312443)
chr6 (1-254)||(29589907-29590160)
chr6 (1-254)||(28260665-28260918)
chr6 (1-254)||(28284998-28285251)
chr6 (1-254)||(28339414-28339667)
chr6 (1-254)||(25115112-25115365)
chr6 (1-254)||(2872270-2872524)
chr6 (1-254)||(16574450-16574703)
chr6 (1-254)||(16620677-16620930)
chr6 (1-254)||(24293250-24293503)
chr6 (19-254)||(22827841-22828076)
chr6 (1-254)||(27559437-27559690)
chr6 (1-254)||(19867247-19867500)
chr6 (5-254)||(16925112-16925361)
chr6 (1-254)||(22436429-22436682)
chr6 (1-254)||(5836696-5836949)
chr6 (1-249)||(18405412-18405660)
chr6 (1-246)||(23080991-23081236)
chr6 (1-232)||(18182835-18183066)
chr6 (41-232)||(20135556-20135747)
chr6 (41-232)||(22197122-22197313)
chr6 (119-254)||(16961067-16961203)
chr6 (1-231)||(30678492-30678721)
chr6 (1-116)||(23085293-23085408)
chr6 (1-189)||(19437627-19437815)
chr6 (41-180)||(19455657-19455796)
chr6 (1-180)||(18797324-18797503)
chr6 (1-180)||(21474234-21474413)
chr6 (1-180)||(21567459-21567638)
chr6 (1-180)||(34643054-34643233)
chr6 (11-180)||(19486772-19486939)
chr6 (11-180)||(25770478-25770647)
chr6 (1-246)||(15461904-15462149)
chr6 (35-180)||(24515916-24516061)
chr6 (101-189)||(18451072-18451160)
chr6 (113-231)||(8761334-8761452)
chr6 (1-246)||(10466316-10466561)
[»] chr5 (41 HSPs)
chr5 (1-254)||(27665995-27666248)
chr5 (1-254)||(40711408-40711661)
chr5 (1-254)||(16359130-16359383)
chr5 (1-254)||(27612984-27613237)
chr5 (1-254)||(34569122-34569375)
chr5 (1-254)||(22330392-22330645)
chr5 (1-254)||(27521034-27521287)
chr5 (1-254)||(41773470-41773723)
chr5 (1-254)||(19772588-19772841)
chr5 (1-254)||(29473578-29473831)
chr5 (1-254)||(37289001-37289254)
chr5 (1-254)||(14997244-14997497)
chr5 (1-254)||(22137296-22137549)
chr5 (1-254)||(22350547-22350800)
chr5 (1-254)||(27682905-27683158)
chr5 (1-254)||(20803225-20803478)
chr5 (1-254)||(18781742-18781995)
chr5 (1-254)||(21882402-21882655)
chr5 (1-249)||(21342919-21343167)
chr5 (1-254)||(25429049-25429302)
chr5 (1-232)||(26736232-26736463)
chr5 (1-246)||(23473831-23474076)
chr5 (1-245)||(21336799-21337043)
chr5 (18-102)||(23525867-23525951)
chr5 (1-171)||(20311561-20311731)
chr5 (1-180)||(21983682-21983861)
chr5 (1-180)||(21561530-21561709)
chr5 (41-231)||(23563713-23563903)
chr5 (4-189)||(21409827-21410012)
chr5 (1-231)||(20824086-20824316)
chr5 (1-246)||(17266839-17267084)
chr5 (1-246)||(20778531-20778776)
chr5 (1-246)||(28892447-28892692)
chr5 (1-245)||(22464569-22464813)
chr5 (113-180)||(22233537-22233604)
chr5 (113-246)||(439-572)
chr5 (69-189)||(22505354-22505474)
chr5 (113-180)||(21676451-21676518)
chr5 (35-189)||(14884530-14884684)
chr5 (113-250)||(24796014-24796151)
chr5 (1-29)||(23460824-23460852)
[»] chr4 (35 HSPs)
chr4 (1-254)||(12479296-12479549)
chr4 (1-254)||(16234055-16234308)
chr4 (1-254)||(17092212-17092465)
chr4 (1-254)||(23958443-23958696)
chr4 (1-254)||(8389108-8389361)
chr4 (1-254)||(19634832-19635085)
chr4 (1-254)||(19775856-19776109)
chr4 (1-254)||(27714032-27714285)
chr4 (1-254)||(40475736-40475989)
chr4 (1-254)||(8050686-8050939)
chr4 (1-254)||(14301042-14301295)
chr4 (1-254)||(14683263-14683516)
chr4 (1-254)||(18224509-18224762)
chr4 (1-254)||(15144955-15145209)
chr4 (1-254)||(16250913-16251166)
chr4 (1-246)||(14696805-14697050)
chr4 (2-246)||(14188210-14188454)
chr4 (1-246)||(14162174-14162419)
chr4 (11-246)||(16218934-16219169)
chr4 (11-246)||(16222254-16222489)
chr4 (1-254)||(16098-16351)
chr4 (105-254)||(16352697-16352846)
chr4 (1-109)||(16350617-16350725)
chr4 (1-180)||(15073129-15073308)
chr4 (122-254)||(22632396-22632528)
chr4 (35-180)||(29450894-29451039)
chr4 (116-246)||(14848543-14848673)
chr4 (35-180)||(14993724-14993869)
chr4 (1-246)||(51604115-51604360)
chr4 (1-180)||(27903155-27903334)
chr4 (35-180)||(3262151-3262296)
chr4 (41-180)||(8708677-8708816)
chr4 (11-180)||(15258697-15258866)
chr4 (1-137)||(15354363-15354499)
chr4 (35-131)||(44659223-44659319)
[»] chr3 (61 HSPs)
chr3 (1-254)||(3688258-3688511)
chr3 (1-254)||(12889024-12889277)
chr3 (1-254)||(13255005-13255258)
chr3 (1-254)||(16754263-16754516)
chr3 (1-254)||(53382580-53382833)
chr3 (1-254)||(5422492-5422745)
chr3 (1-254)||(6603051-6603303)
chr3 (1-254)||(16638088-16638341)
chr3 (1-254)||(20059616-20059869)
chr3 (1-254)||(43164990-43165243)
chr3 (1-254)||(48427762-48428015)
chr3 (1-254)||(15586954-15587207)
chr3 (1-254)||(26790975-26791228)
chr3 (1-254)||(15345807-15346060)
chr3 (1-254)||(15713618-15713871)
chr3 (1-254)||(10908525-10908778)
chr3 (1-254)||(15400079-15400332)
chr3 (1-254)||(10007915-10008168)
chr3 (1-254)||(15358398-15358651)
chr3 (1-254)||(24185505-24185758)
chr3 (1-240)||(15065400-15065639)
chr3 (1-254)||(14874130-14874383)
chr3 (1-254)||(16804509-16804762)
chr3 (60-243)||(26190937-26191120)
chr3 (1-254)||(16694479-16694732)
chr3 (2-246)||(15261953-15262197)
chr3 (1-231)||(14578970-14579200)
chr3 (3-254)||(17492166-17492417)
chr3 (2-231)||(12843666-12843895)
chr3 (113-252)||(18437457-18437596)
chr3 (1-180)||(15013320-15013497)
chr3 (1-245)||(12858046-12858290)
chr3 (1-180)||(12272737-12272916)
chr3 (1-178)||(14291083-14291260)
chr3 (1-246)||(31692736-31692981)
chr3 (41-246)||(31941236-31941441)
chr3 (1-180)||(13944423-13944602)
chr3 (41-207)||(11949499-11949665)
chr3 (1-246)||(10417596-10417841)
chr3 (113-198)||(13969783-13969868)
chr3 (35-180)||(47126343-47126488)
chr3 (1-180)||(12358078-12358257)
chr3 (1-180)||(17494045-17494224)
chr3 (35-180)||(10408367-10408512)
chr3 (113-228)||(11888027-11888143)
chr3 (35-246)||(13318087-13318298)
chr3 (1-180)||(16832079-16832258)
chr3 (11-180)||(15230002-15230171)
chr3 (11-180)||(15235870-15236039)
chr3 (1-82)||(17188871-17188952)
chr3 (44-180)||(12510077-12510213)
chr3 (1-180)||(14575385-14575564)
chr3 (1-180)||(16378485-16378664)
chr3 (1-180)||(16825832-16826011)
chr3 (1-180)||(24189703-24189882)
chr3 (41-207)||(18131937-18132103)
chr3 (35-180)||(28756718-28756863)
chr3 (1-180)||(8744941-8745120)
chr3 (113-180)||(14089072-14089139)
chr3 (113-180)||(44779646-44779713)
chr3 (1-207)||(12180716-12180922)
[»] chr2 (36 HSPs)
chr2 (1-254)||(16983567-16983820)
chr2 (1-254)||(17001327-17001580)
chr2 (1-254)||(9337909-9338162)
chr2 (1-254)||(9486543-9486796)
chr2 (1-254)||(22323205-22323458)
chr2 (1-254)||(27220343-27220596)
chr2 (1-254)||(44383433-44383686)
chr2 (1-254)||(21142904-21143157)
chr2 (1-254)||(24712361-24712614)
chr2 (1-254)||(10871177-10871430)
chr2 (1-254)||(27373596-27373849)
chr2 (4-254)||(24874616-24874866)
chr2 (1-254)||(24264697-24264950)
chr2 (1-254)||(41606249-41606501)
chr2 (1-231)||(11351574-11351804)
chr2 (1-254)||(24677814-24678067)
chr2 (1-254)||(24657521-24657774)
chr2 (1-254)||(21323129-21323382)
chr2 (1-254)||(24705345-24705598)
chr2 (1-254)||(23204641-23204894)
chr2 (1-246)||(23105591-23105836)
chr2 (1-168)||(23029324-23029491)
chr2 (1-254)||(23074190-23074443)
chr2 (1-138)||(45673875-45674012)
chr2 (1-231)||(22733637-22733867)
chr2 (1-228)||(24817703-24817930)
chr2 (1-164)||(19817264-19817427)
chr2 (1-180)||(23097881-23098060)
chr2 (1-180)||(23113124-23113303)
chr2 (35-207)||(23279150-23279322)
chr2 (1-189)||(30208783-30208971)
chr2 (1-179)||(23273995-23274173)
chr2 (1-177)||(19716880-19717056)
chr2 (9-180)||(12576754-12576925)
chr2 (218-254)||(11351800-11351836)
chr2 (113-180)||(27790141-27790208)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (1-254)||(10093-10346)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (1-254)||(53452-53705)
scaffold0028 (1-254)||(11194-11447)
scaffold0028 (1-254)||(17662-17915)
scaffold0028 (113-231)||(47952-48070)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (1-254)||(21972-22225)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (1-254)||(40880-41133)
scaffold0109 (1-254)||(13450-13703)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (1-254)||(3149-3402)
scaffold0044 (1-254)||(16885-17138)
[»] scaffold0079 (3 HSPs)
scaffold0079 (1-248)||(36229-36476)
scaffold0079 (113-254)||(28803-28944)
scaffold0079 (75-180)||(3517-3622)
[»] scaffold1459 (1 HSPs)
scaffold1459 (1-254)||(1358-1611)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (1-254)||(7983-8236)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (1-254)||(37146-37399)
scaffold0042 (1-231)||(26100-26330)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (1-254)||(35041-35293)
scaffold0022 (1-254)||(41357-41610)
scaffold0022 (1-254)||(75077-75330)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (1-254)||(17392-17645)
scaffold0017 (1-249)||(195164-195412)
scaffold0017 (1-189)||(24096-24284)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (1-254)||(10484-10737)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (1-254)||(29254-29507)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (1-254)||(21329-21582)
scaffold0081 (1-254)||(36753-37006)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (1-249)||(50671-50919)
scaffold0102 (11-180)||(42497-42666)
[»] scaffold0080 (5 HSPs)
scaffold0080 (1-254)||(31609-31861)
scaffold0080 (1-254)||(10564-10817)
scaffold0080 (1-254)||(37075-37327)
scaffold0080 (1-254)||(13219-13472)
scaffold0080 (1-253)||(54363-54615)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (1-254)||(11682-11935)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (1-254)||(12388-12641)
[»] scaffold0010 (4 HSPs)
scaffold0010 (1-200)||(14203-14402)
scaffold0010 (11-246)||(4648-4883)
scaffold0010 (1-180)||(44753-44932)
scaffold0010 (35-180)||(39693-39838)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (1-231)||(10534-10764)
scaffold0476 (1-180)||(871-1050)
[»] scaffold0560 (1 HSPs)
scaffold0560 (80-254)||(8146-8320)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (1-231)||(25038-25268)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (1-229)||(18400-18628)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (1-245)||(23859-24103)
scaffold0011 (1-252)||(151294-151545)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (1-246)||(5846-6091)
scaffold0074 (11-180)||(14922-15091)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (1-246)||(151814-152059)
scaffold0023 (2-252)||(47309-47541)
scaffold0023 (77-254)||(1907-2084)
scaffold0023 (1-39)||(30900-30938)
scaffold0023 (41-179)||(164767-164905)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (107-254)||(9665-9812)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (1-231)||(24271-24501)
scaffold0243 (1-179)||(10098-10276)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (4-231)||(3349-3576)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (60-254)||(15379-15573)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (1-223)||(8706-8928)
scaffold0358 (60-223)||(17902-18065)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (82-254)||(554-726)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (3-230)||(13807-14034)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (9-252)||(111241-111484)
scaffold0040 (1-246)||(17611-17856)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (1-231)||(4182-4412)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (1-254)||(7948-8201)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-246)||(216746-216991)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (1-246)||(103960-104205)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (1-246)||(14592-14837)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (1-246)||(6606-6851)
scaffold0270 (1-246)||(13736-13981)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (1-246)||(495753-495998)
scaffold0001 (1-132)||(441500-441631)
scaffold0001 (113-165)||(452651-452703)
scaffold0001 (173-228)||(441441-441496)
scaffold0001 (1-180)||(514679-514858)
[»] scaffold1881 (1 HSPs)
scaffold1881 (1-168)||(806-973)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (5-254)||(1177-1426)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (9-246)||(17683-17914)
scaffold0114 (11-246)||(39791-40026)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (1-254)||(55796-56049)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (1-155)||(11206-11360)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (1-198)||(13865-14062)
scaffold0120 (146-231)||(8770-8855)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (1-228)||(15305-15532)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (1-119)||(1-119)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (1-245)||(4317-4561)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (1-138)||(2589-2726)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (1-228)||(23624-23851)
scaffold0018 (1-228)||(9677-9904)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (1-231)||(704-934)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (1-229)||(4838-5066)
[»] scaffold0993 (2 HSPs)
scaffold0993 (1-168)||(793-960)
scaffold0993 (83-231)||(630-778)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (1-219)||(40833-41049)
[»] scaffold1985 (1 HSPs)
scaffold1985 (104-254)||(1-151)
[»] scaffold0324 (2 HSPs)
scaffold0324 (34-254)||(12573-12792)
scaffold0324 (1-103)||(1865-1967)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (3-111)||(8107-8217)
scaffold0130 (1-180)||(4215-4394)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (1-143)||(15258-15400)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (132-254)||(27952-28074)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (1-123)||(57940-58062)
scaffold0077 (114-231)||(19073-19190)
[»] scaffold0312 (1 HSPs)
scaffold0312 (24-155)||(844-975)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (77-231)||(6489-6643)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (1-231)||(21511-21743)
[»] scaffold0052 (1 HSPs)
scaffold0052 (1-74)||(7141-7214)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (4-189)||(83850-84035)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (1-180)||(200794-200973)
scaffold0004 (1-246)||(325440-325685)
[»] scaffold0046 (2 HSPs)
scaffold0046 (1-231)||(60487-60717)
scaffold0046 (108-180)||(79264-79336)
[»] scaffold1530 (1 HSPs)
scaffold1530 (1-207)||(355-561)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (1-231)||(181-411)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (1-207)||(20586-20792)
scaffold0222 (1-180)||(813-992)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (180-254)||(52430-52504)
scaffold0031 (1-231)||(110358-110588)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (11-179)||(11630-11798)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (1-165)||(1813-1977)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (113-231)||(114476-114594)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (1-182)||(2668-2849)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (1-246)||(53749-53994)
scaffold0076 (113-180)||(31115-31182)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (1-246)||(94220-94465)
scaffold0029 (1-198)||(115343-115540)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (88-180)||(8459-8551)
scaffold0083 (88-180)||(7125-7217)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (41-180)||(919-1058)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (1-180)||(11759-11938)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (1-180)||(25015-25194)
scaffold0104 (11-180)||(43755-43924)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (41-180)||(98949-99088)
scaffold0020 (11-180)||(175787-175956)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (43-180)||(5550-5687)
scaffold0035 (1-165)||(41434-41597)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (129-254)||(231-358)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (122-254)||(7106-7238)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (1-137)||(1209-1345)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (1-60)||(8329-8388)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (1-180)||(3496-3675)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (1-180)||(63845-64024)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (1-180)||(49203-49382)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (41-207)||(991-1157)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (1-179)||(6838-7016)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (114-228)||(5328-5442)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (35-180)||(11608-11753)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (1-246)||(25845-26090)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (1-254)||(29252-29505)
[»] scaffold1615 (1 HSPs)
scaffold1615 (186-254)||(1244-1312)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (1-229)||(4415-4643)
[»] scaffold1433 (1 HSPs)
scaffold1433 (1-180)||(1637-1816)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (13-252)||(1610-1849)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (1-180)||(7543-7722)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (13-252)||(28623-28862)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (1-180)||(49904-50083)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (1-180)||(49506-49685)
scaffold0067 (1-180)||(58540-58719)
scaffold0067 (1-180)||(64928-65107)
scaffold0067 (1-231)||(29372-29602)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (1-180)||(263025-263204)
[»] scaffold0298 (1 HSPs)
scaffold0298 (1-207)||(9553-9758)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (118-228)||(20992-21102)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (118-228)||(175788-175898)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (1-246)||(5175-5420)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (95-180)||(4670-4755)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (11-180)||(21921-22090)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (11-231)||(5350-5570)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (113-228)||(16524-16640)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (35-246)||(34070-34281)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (11-246)||(53780-54015)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (1-180)||(65624-65803)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (1-179)||(2278-2457)
scaffold0034 (1-207)||(70144-70350)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (1-175)||(8788-8962)
scaffold0235 (1-175)||(19002-19176)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (113-231)||(14956-15074)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (11-180)||(170-339)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (113-246)||(923-1056)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (11-180)||(10122-10291)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (95-180)||(51611-51696)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (1-180)||(8413-8592)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (1-180)||(260-439)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (1-180)||(21650-21829)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (1-180)||(251421-251600)
[»] scaffold2059 (1 HSPs)
scaffold2059 (1-31)||(1095-1125)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (35-180)||(4980-5125)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (11-180)||(36738-36907)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (1-53)||(8065-8117)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 33)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 16347990 - 16348243
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16347990 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 16348089  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16348090 gatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 16348189  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16348190 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 16348243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 51330887 - 51331140
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51330887 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 51330986  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  51330987 gatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttcttttccgtcgaagaggaaagtggtg 51331086  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51331087 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 51331140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 33388424 - 33388677
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33388424 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 33388523  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33388524 gatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 33388623  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  33388624 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactgaaacgcgacggtatcttga 33388677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 41351063 - 41351316
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41351063 gggttcggtgcttacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttagtcgtgattttgaaatggatttagtttgcctacctttgagtggtatg 41351162  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41351163 gatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 41351262  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41351263 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 41351316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 21833266 - 21833013
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21833266 gggttcggtgactacttctctcgtctgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgatttcaaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 21833167  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21833166 gatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 21833067  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21833066 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 21833013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 19109332 - 19109079
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19109332 gggttcggtgactacttctctagtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcatgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 19109233  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19109232 gatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 19109133  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  19109132 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttga 19109079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 24785252 - 24785505
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  24785252 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatctggtttgtctacctttgagcggtatg 24785351  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24785352 gatgtaattatgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaaatcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 24785451  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24785452 cagagttcttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttga 24785505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 17042410 - 17042663
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17042410 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 17042509  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||  |||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  17042510 gatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtg 17042609  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||    
T  17042610 cagagttcttatctgctaagcagctgaagcaaatggaacacgatagtattttga 17042663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 107 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 21839808 - 21839661
Alignment:
Q  107 attctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagt 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21839808 attctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagt 21839709  T
Q  207 ttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21839708 ttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 21839661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 20081771 - 20081897
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20081771 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 20081870  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  20081871 gatgtgattctgggtatgaactggttg 20081897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16379058 - 16378813
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| || |||    
T  16379058 gggttcggtgactacttctcttgtttgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagattgatttggtttgtttacctttgagcggaatg 16378959  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||| |  || || || ||||| |    
T  16378958 gatgtaatcctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttctgctgaggaagagagtggag 16378859  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 246  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  16378858 caaagtttttgtctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 16378813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 56 - 254
Target Start/End: Original strand, 21233181 - 21233379
Alignment:
Q  56 cgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgtt 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  21233181 cgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgtt 21233280  T
Q  156 ttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||| ||||  |||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||  | ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  21233281 ttagcaagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcaaagttcgtatctactatgcagctgaagcaaatgaaacgcgatggtattttga 21233379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 68 - 254
Target Start/End: Original strand, 22502751 - 22502937
Alignment:
Q  68 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacag 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||     
T  22502751 atggatttagtttgtctacctttgagcggaatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaagtcaa 22502850  T
Q  168 tacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |  |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  22502851 tgtatttctcctccgttgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaactagaacgcgatggtattttga 22502937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 21842176 - 21842066
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  21842176 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcatttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctgcctttgagcggtatg 21842077  T
Q  101 gatgtgattct 111  Q
    |||||||||||    
T  21842076 gatgtgattct 21842066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 21751877 - 21751650
Alignment:
Q  25 atgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactgg 124  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || |||| |    
T  21751877 atgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtaattttgagattgatatggtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggcatcaactcg 21751778  T
Q  125 ttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagc 224  Q
    || ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||  | ||  |||| |||||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  21751777 ttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaaatcggtgtatttctcttctactgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaaacagc 21751678  T
Q  225 tgaagcaactggaacgcgatggtatctt 252  Q
    |||||||  | ||||| ||||| |||||    
T  21751677 tgaagcagttagaacgtgatggaatctt 21751650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 155
Target Start/End: Original strand, 429575 - 429706
Alignment:
Q  24 tatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactg 123  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  429575 tatgtttaagatgtcatttgtctatgtttgatagtgattttgagatggatttggtttgtctacatttgagtggtatggatgtgattcttggtatgaattg 429674  T
Q  124 gttggagtacaaccacgttcttattaattgtt 155  Q
    |||||| |||||||| || |  ||||||||||    
T  429675 gttggaatacaaccatgtgcacattaattgtt 429706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 19857235 - 19857063
Alignment:
Q  35 tgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtaca 134  Q
    ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| |||| |||||||||||  ||| | || ||||||| ||| ||||| |    
T  19857235 tgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgactggtatggatgatatttttgggatgaacttgttagagtata 19857136  T
Q  135 accacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 207  Q
    |||  |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| || ||||| ||||||||    
T  19857135 accgagttcatatcaattgttttagcaagacagtgcatttttcttctgctgaagaagagagtggagcagagtt 19857063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 22496651 - 22496705
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 55  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22496651 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 22496705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 180
Target Start/End: Original strand, 20833305 - 20833474
Alignment:
Q  11 actacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattc 110  Q
    ||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  || |||||||| |||     
T  20833305 actacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggaatggatgttattt 20833404  T
Q  111 tgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    | || ||||||||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  20833405 ttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaagacggtgcatttttcttc 20833474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 254
Target Start/End: Original strand, 21861880 - 21862021
Alignment:
Q  113 ggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||  ||| | ||  |||| ||||| |  ||||| ||| |||| |||||||| || |    
T  21861880 ggtatgaactggttggagtacaaccatgttaatattaattgttttattaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaagaatgtggcgcagagttcttat 21861979  T
Q  213 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||    
T  21861980 ctacgaagcagctgaagcaattagaacgtgatggaatcttga 21862021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 254
Target Start/End: Original strand, 22359751 - 22359892
Alignment:
Q  113 ggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgt 212  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| ||| ||||| ||  ||||  || | ||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22359751 ggtatgaactggttagagtataaccatgttcatattatttgctttagtaaatcagtgtatatctcttctgctgaagagaaaagtggtgcagagtttttgt 22359850  T
Q  213 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||||||||||||| |  | ||||| |||||||| ||||    
T  22359851 ctactaagcagctgaagtagttagaacgtgatggtattttga 22359892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 22016140 - 22016319
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||  |||||||| |||| ||||  ||||||    
T  22016140 gggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacctagtttgtttaccgttgacgggtatg 22016239  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||| ||| | || ||||||||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  22016240 gatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagcaagacggtgcatttttcttc 22016319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 20854155 - 20854400
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||| ||||||||||||||| | ||||||||  | || ||||| |||||||| |||   || |||    
T  20854155 gggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgttgggaatg 20854254  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| ||| | || ||||| ||||| ||||| ||||  ||   ||| |||||||||| |||||| || || |||||||| |  |||||||| ||||| |    
T  20854255 gatgttattttcgggatgaattggttagagtataaccgagtctgtataaattgttttaacaagacggtgcacttttcttctgcggaagaggagagtggag 20854354  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 246  Q
    |||||||| |  ||||||| ||| |||||||  ||||||| |||||    
T  20854355 cagagtttctaactactaaacagttgaagcagttggaacgagatgg 20854400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 21739431 - 21739676
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||| ||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||| |||| ||| | || ||||  ||||||    
T  21739431 gggttcagtaactacttttcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgacgggtatg 21739530  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| ||| | || ||||||||||| ||||| ||||  |||| ||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| |  ||||| || ||||  |    
T  21739531 gatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgctttagtaagacggcgcatttttcttctgctgaagaagagagtgaag 21739630  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 246  Q
    | ||||| ||  ||||||| ||| |||||||| |||| || |||||    
T  21739631 ctgagttcttaactactaaacagttgaagcaattggagcgtgatgg 21739676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 21742947 - 21743126
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || |||||||  ||||  ||||||||||||||| | || |||||| | ||| |||| ||| | || |||   ||| ||    
T  21742947 gggttcggtaactacgtctcttgtttgtttgagttgtctgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgtcgggtgtg 21743046  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||||||| | || ||||||||||| ||||| |||||  ||| |||||| || ||||| ||||| || |||||||||||    
T  21743047 gatgtgatttttgggatgaactggttagagtataaccattttcatattaactgctttagtaagacggtgcatttttcttc 21743126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 132
Target Start/End: Original strand, 38910255 - 38910352
Alignment:
Q  35 tgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagta 132  Q
    |||||| | |||||||||||| | |||||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||    
T  38910255 tgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagta 38910352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 180
Target Start/End: Original strand, 24097022 - 24097189
Alignment:
Q  13 tacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctg 112  Q
    ||||||||| || || |||| |||||| ||||||||||||||| | || |||| | | || ||||||||| | || ||||  ||||||||||| ||| |     
T  24097022 tacttctcttgtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagagactttgtagtcgacttagtttgtttgccgttgacgggtatggatgttattttt 24097121  T
Q  113 ggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
     | ||||| ||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  24097122 agaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagtaagacggtgcatttttcttc 24097189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 180
Target Start/End: Original strand, 31537426 - 31537571
Alignment:
Q  35 tgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtaca 134  Q
    |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||  | |||||||| ||||| || || |    
T  31537426 tgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctaccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagaatata 31537525  T
Q  135 accacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    | |  |||| ||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  31537526 atcgagttcatatcaactgctttagtaagacggtacatttctcttc 31537571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 48425834 - 48425689
Alignment:
Q  35 tgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtaca 134  Q
    |||||| | |||||||||||| | |||||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||| |    
T  48425834 tgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtata 48425735  T
Q  135 accacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    | |  |||| ||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  48425734 atcgagttcatatcaactgctttagtaagacggtacatttctcttc 48425689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 52988702 - 52988557
Alignment:
Q  35 tgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtaca 134  Q
    |||||| | |||||||||||| | |||||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||| |    
T  52988702 tgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtata 52988603  T
Q  135 accacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    | |  |||| ||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  52988602 atcgagttcatatcaactgctttagtaagacggtacatttctcttc 52988557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 12200470 - 12200382
Alignment:
Q  44 tctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagta 132  Q
    |||||||||||| | |||||||  || |||||||| ||||| || ||||  ||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||    
T  12200470 tctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtgtgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagta 12200382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 185 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 20140863 - 20140794
Alignment:
Q  185 gaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||||||| ||| | ||  ||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||    
T  20140863 gaagaggaaagtggcgcataattcatgtctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggtattttga 20140794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 37680010 - 37679914
Alignment:
Q  35 tgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagt 131  Q
    |||||| | |||||||||||| | |||||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||    
T  37680010 tgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagt 37679914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 34)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 17671788 - 17672041
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17671788 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 17671887  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17671888 gatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 17671987  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17671988 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 17672041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 18859592 - 18859339
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18859592 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 18859493  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18859492 gaagtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 18859393  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18859392 cagagtttttgtcaactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 18859339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 19115415 - 19115162
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19115415 gggttcagtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 19115316  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19115315 gatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 19115216  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19115215 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 19115162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 20016029 - 20016282
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20016029 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgggtttagtttgtctacctttgagtggtatg 20016128  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20016129 gatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 20016228  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20016229 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 20016282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 19481838 - 19482091
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19481838 gggttcggtgcttacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttagtcgtgattttgaaatggatttagtttgcctacctttgagtggtatg 19481937  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19481938 gatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 19482037  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19482038 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 19482091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 22126725 - 22126978
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  22126725 gggttcggtgattacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctctgagcggtatg 22126824  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22126825 gatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 22126924  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22126925 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 22126978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 22117941 - 22118194
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  22117941 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctctgagcggtatg 22118040  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22118041 gatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacatttttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 22118140  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22118141 cggagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 22118194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 19980982 - 19980729
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  19980982 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacccttgagcggtatg 19980883  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||  |||  |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  19980882 gatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaagttagtgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtggtg 19980783  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  19980782 cagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaactggaacgggatggtattttga 19980729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 30310910 - 30311163
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30310910 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 30311009  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||  |||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  30311010 gatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtg 30311109  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  30311110 cagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttga 30311163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 21164304 - 21164557
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21164304 gggttcagtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgagatggacttagtttgtctacctttgagtggtatg 21164403  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||  |||| || || |||||||||||||||||||    
T  21164404 gatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcctcagtcgaagaggaaagtggtg 21164503  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  21164504 cagagttcttgtctactaagcagctgaagcaattggaacgcgatgatattttga 21164557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 22129383 - 22129636
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22129383 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 22129482  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||  |||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  22129483 gatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtg 22129582  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22129583 cagaattcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttga 22129636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 32603160 - 32602907
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32603160 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggttgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 32603061  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||  |||| |||||||  ||||||||| ||||||    
T  32603060 gatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaggtggtg 32602961  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  32602960 cagagttcttatctactaaacagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttga 32602907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 15536398 - 15536145
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15536398 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttacgttgtcctttgtctatatttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 15536299  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
     |||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  15536298 aatgtgattttgggtacgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtg 15536199  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  15536198 cagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttga 15536145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22042842 - 22042589
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  22042842 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgaacggtatg 22042743  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| |||| ||| |||||||||||||||  |||  |||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  22042742 gatgtgattctaggtatgaattggttagaatacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagttagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtg 22042643  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22042642 cagagttcttaactactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttga 22042589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22031118 - 22030865
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  22031118 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcatgatttcgaaatggatttagtttgtctacatttaagcggtatg 22031019  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||   ||| |||||||  || |||||||||||||    
T  22031018 gatgtaattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgtgtttctcttccgctgaggaggaaagtggtg 22030919  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22030918 catagtttttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttga 22030865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 21391627 - 21391880
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21391627 gggttcggtgaccacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatggatttagtttttctacctttgagtggtatg 21391726  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| || ||| ||| | ||  |||  ||||| |  || |||||||||||||    
T  21391727 gatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattattatagtaagtcggtgtattactcttctgctgaggaggaaagtggtg 21391826  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||    
T  21391827 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggtatcttga 21391880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 21780953 - 21781206
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21780953 gggttcggtgaccacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatggatttagtttttctacctttgagtggtatg 21781052  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| || ||| ||| | ||  |||  ||||| |  || |||||||||||||    
T  21781053 gatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattattatagtaagtcggtgtattactcttctgctgaggaggaaagtggtg 21781152  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||    
T  21781153 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggtatcttga 21781206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 21786121 - 21786374
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21786121 gggttcggtgaccacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatggatttagtttttctacctttgagtggtatg 21786220  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| || ||| ||| | ||  |||  ||||| |  || |||||||||||||    
T  21786221 gatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattattatagtaagtcggtgtattactcttctgctgaggaggaaagtggtg 21786320  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||    
T  21786321 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggtattttga 21786374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21253960 - 21253715
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21253960 gggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatggatttggtttgtctacctttgagtggtatg 21253861  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
     |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||  |||||||||| ||| ||| |  |  |||| ||||| |  |||||||||||||| |    
T  21253860 catgtgattcttggtatgagctggttggaatacaaccatgttcacattaattgttatagtaagtcgctgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcg 21253761  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  21253760 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcagttggaacgtgatgg 21253715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22990060 - 22989807
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||    
T  22990060 gggttcggtgactacttctcttgtatgtttaagatgtcccttgtctatgtttggtcgtgattttgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggtatg 22989961  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| | ||  |||| ||||| |  |||||||||||||  |    
T  22989960 gatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtgacg 22989861  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||    
T  22989860 catagttcttgtctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatggaatcttga 22989807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 22421658 - 22421903
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||    
T  22421658 gggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttatctatgtttgatcgtgattttgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggtatg 22421757  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| ||||| || ||||||| ||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| | ||  |||| ||||| |  ||||||| |||||| |    
T  22421758 gatgtaattcttggcatgaactagttagtgtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggtaagtggcg 22421857  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 246  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  22421858 cagagttcttgtctactaagcagctgaagcaattggaacgtgatgg 22421903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 22375220 - 22375446
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  22375220 gggttcggtgactacttctc-cgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtagagattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatg 22375318  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| | ||  |||||||||| | ||| ||||||||||| |    
T  22375319 gatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttttcttctgccgacgaggaaagtggcg 22375418  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaa 228  Q
    |||| || |||||||||||| |||||||    
T  22375419 cagaattcttgtctactaagtagctgaa 22375446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 22246199 - 22246444
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||  |||    
T  22246199 gggttcggtgactacttctcttgtgtgcttaatatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattaatttggtttgtttacctttgagtgaaatg 22246298  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||| |  |  |||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  22246299 gatgtaatccttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattagttgttttagtaagtcgatgtatttttcttctgctgaagaggaaagtggtg 22246398  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 246  Q
    || | || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  22246399 cataattcttgtctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 22246444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22523561 - 22523330
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  22523561 gggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgttctttttctatgtttggtcttgattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggtatg 22523462  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||   ||  |||| ||||| |  ||||| |||||| | |    
T  22523461 gatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagttggtgtatttctcttctgctgaagaagaaagtagcg 22523362  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaa 232  Q
    || |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  22523361 caaagttcttgtctaccaagcagctgaagcaa 22523330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 20391101 - 20390850
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||  ||||  ||||||||||||||| | ||||||||| | ||| | || ||| | || ||||  ||||||    
T  20391101 gggttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtctgttgtctatgtttggtagagattttgaagttgatcttgtatgtttgccgttgatgggtatg 20391002  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||| |||||| |||||  | ||||||||||| |  || || || |||   |    
T  20391001 gatgtaatctttgggatgaactggttggagtataaccatgttcatatcaattattttagtaagacgatgcatttttcttctgctgaggaagagagtaaag 20390902  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatctt 252  Q
    | ||||| ||| ||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| |||||    
T  20390901 ctgagttcttgactactaaacagctgaagcaattagaacgtgatgggatctt 20390850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 118 - 231
Target Start/End: Original strand, 21919987 - 21920100
Alignment:
Q  118 gaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctact 217  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||  |||||||||||||| ||| | ||  |||| | ||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21919987 gaactggttggaatagaaccatgttcacattaattgttttagtaagtcggtgtatttcttttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctact 21920086  T
Q  218 aagcagctgaagca 231  Q
    ||||||||||||||    
T  21920087 aagcagctgaagca 21920100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 22245781 - 22245868
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacct 88  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||| |||||    
T  22245781 gggttcggtgactacttctcttgtgtgcttaatatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattaatttggtttgtttacct 22245868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 22373884 - 22373705
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| | | || |||||| | ||| | || ||| | || | ||  ||||||    
T  22373884 gggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttgatagagactttgaagttgatcttgtatgtttgccatcgacaggtatg 22373785  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||| ||  | || ||||||||||| ||||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22373784 gatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgttttagtaagacggtacatttttcttc 22373705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 113 - 180
Target Start/End: Original strand, 21323157 - 21323224
Alignment:
Q  113 ggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || | ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21323157 ggtatgaactggttggagtataaccatgtccatatcaattgttttagcaagacggtgcatttttcttc 21323224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 22028056 - 22028291
Alignment:
Q  11 actacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattc 110  Q
    ||||||||||| || ||||| |  ||||| ||||||||||||||| | ||||||||  | || ||||| ||| | || ||||  |||||| |||| |||     
T  22028056 actacttctcttgtttgtttaaggtgtccattgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtatgtttgccgttgacgggtatgaatgttattt 22028155  T
Q  111 tgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 210  Q
    | || ||||| ||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| ||  |||  |  ||||| ||    
T  22028156 ttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatataaattgttttagtaagacggtgcatttttcttctgttgaagaagagggtgaagtggagttctt 22028255  T
Q  211 gtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 246  Q
    |||||| || ||| |||| ||||| ||||| |||||    
T  22028256 gtctacgaaacagatgaaacaactagaacgtgatgg 22028291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 21928443 - 21928269
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || |||||||  ||| | ||||||||||||||| | || |||||| | ||| |||| ||| | || ||||  ||||||    
T  21928443 gggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagctgtgcgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgacgggtatg 21928344  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttt 175  Q
    ||| | ||| | || ||||||||| | ||||| ||||  |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  21928343 gatataatttttgggatgaactggatagagtataaccgtgttcatattaattgctttagtaagacggtacatttt 21928269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 22053878 - 22053699
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||| |||  ||||||   |||||||||||| | || ||||   | |||||||||||| |||| ||||  ||||||    
T  22053878 gggttcagtaactacttctcttgtttgtctgaggtgtcctacatctatgtttggtagagactttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatg 22053779  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||| ||| | || ||||| ||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||| |||||  | |||||||||||    
T  22053778 gatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgggttcatatcaattgctttagtaagacgatgcatttttcttc 22053699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23887931 - 23887816
Alignment:
Q  113 ggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgt 212  Q
    |||||||||| |||  |||| ||||| |||| ||||||||||||||  ||| |  || ||||||||||    ||||| |||||||| |||||||| ||      
T  23887931 ggtatgaactagttaaagtataaccatgttcatattaattgttttaataagccgatatatttttcttctactgaagaagaaagtggagcagagttcttaa 23887832  T
Q  213 ctactaagcagctgaa 228  Q
    ||||||||||||||||    
T  23887831 ctactaagcagctgaa 23887816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 175
Target Start/End: Original strand, 31568722 - 31568784
Alignment:
Q  113 ggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttt 175  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||| |||| |||||| || ||||||    
T  31568722 ggtatgaactggttggagtataaccatgttcatatcaattgctttaacaagacggtgcatttt 31568784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 41)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 10873628 - 10873375
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10873628 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 10873529  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10873528 gatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 10873429  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10873428 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 10873375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 14335334 - 14335081
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14335334 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 14335235  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14335234 gatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 14335135  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14335134 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 14335081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 44788683 - 44788936
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44788683 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 44788782  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44788783 gatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 44788882  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44788883 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 44788936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 8200986 - 8200733
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8200986 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 8200887  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8200886 gatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 8200787  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8200786 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 8200733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 8710543 - 8710290
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8710543 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 8710444  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8710443 gatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 8710344  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8710343 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 8710290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 18587503 - 18587756
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18587503 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 18587602  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18587603 gatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 18587702  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18587703 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 18587756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 11234545 - 11234798
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11234545 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 11234644  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11234645 gatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 11234744  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11234745 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 11234798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 13688979 - 13688726
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13688979 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 13688880  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13688879 gatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 13688780  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13688779 cggagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 13688726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 15158389 - 15158642
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15158389 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcaaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 15158488  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15158489 gatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 15158588  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15158589 cggagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 15158642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 18180681 - 18180430
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18180681 gggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatg 18180582  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18180581 gatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttctcatcaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 18180482  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18180481 cagag--tttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 18180430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 11550434 - 11550687
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11550434 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 11550533  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||  |||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  11550534 gatgtgattctgggtatgaattggttggagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtattcctcttccgccgaagaggaaagtggtg 11550633  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  11550634 cagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgtgatggtattttga 11550687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 12690440 - 12690187
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12690440 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 12690341  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| |||||| ||| ||||||    
T  12690340 gatgtgattctgggtatgaattggttggagtacaagcatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgccgaagaagaatgtggtg 12690241  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  12690240 cagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgtgatggtattttga 12690187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 14957492 - 14957239
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14957492 gggttcagtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 14957393  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  14957392 gatgtgattttgggtatgaattggttggagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgccgaagaggaaagtggtg 14957293  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  14957292 cagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgtgatggtattttga 14957239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 17703787 - 17704040
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17703787 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 17703886  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||  |||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  17703887 gatgtgattctgggtatgaattggttagaatacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtg 17703986  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  17703987 cagagttcttatctactaagaagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttga 17704040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 9591302 - 9591053
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| ||||||    
T  9591302 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagttt----acctttgagcggtatg 9591207  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || | ||| ||||||||||||||| || |  |||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  9591206 gatgtgattctaggtatgaattggttagagtacaaccatgtacatatcaattgttttagcaagtcaatgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtg 9591107  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  9591106 cagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttga 9591053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 95 - 254
Target Start/End: Original strand, 14149862 - 14150021
Alignment:
Q  95 ggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||  |||  |||| |||||||  ||||||||||    
T  14149862 ggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccattttcatatcaattgttttagcaagtgagtgtatttctcttccgctgaagaggaaa 14149961  T
Q  195 gtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14149962 gtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggagcgcgatggtattttga 14150021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 15146255 - 15146410
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||| || ||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  15146255 gggttcggtgactacttctctcgtatgttcgaaatgtcctttatctatgtttgatcttgattttgagattgatatggtttgtttacctttgagtggtatg 15146354  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttt 156  Q
    ||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  15146355 gatgtaatagttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttt 15146410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14042626 - 14042402
Alignment:
Q  8 gtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtga 107  Q
    |||||||||||||| || ||||  | |||||||||||||||||||| || |||||||||||| || || |||||| ||||||| |||||||||||||| |    
T  14042626 gtgactacttctcttgtgtgttcaagatgtcctttgtctatgtttgatcatgattttgaaattgacttggtttgtttaccttttagtggtatggatgtaa 14042527  T
Q  108 ttctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 207  Q
    | |   | ||||||||||| || |||||||| ||||  ||||||| |||||| ||| | ||  |||| ||||| |  ||||| |||||||| ||||||||    
T  14042526 tccctagcatgaactggttagaatacaaccatgttcacattaatttttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaagaaagtggcgcagagtt 14042427  T
Q  208 tttgtctactaagcagctgaagcaa 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  14042426 cttgtctactaagcagctgaagcaa 14042402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14352656 - 14352432
Alignment:
Q  8 gtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtga 107  Q
    |||||||||||||| || ||||  | |||||||||||||||||||| || |||||||||||| || || |||||| ||||||| |||||||||||||| |    
T  14352656 gtgactacttctcttgtgtgttcaagatgtcctttgtctatgtttgatcatgattttgaaattgacttggtttgtttaccttttagtggtatggatgtaa 14352557  T
Q  108 ttctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 207  Q
    | |   | ||||||||||| || |||||||| ||||  ||||||| |||||| ||| | ||  |||| ||||| |  ||||| |||||||| ||||||||    
T  14352556 tccctagcatgaactggttagaatacaaccatgttcacattaatttttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaagaaagtggcgcagagtt 14352457  T
Q  208 tttgtctactaagcagctgaagcaa 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  14352456 cttgtctactaagcagctgaagcaa 14352432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15627462 - 15627233
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||| | |  ||| ||||| | ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| | | ||||||||| |||    
T  15627462 gggttcggtgactacttctttagtgtgtctaaggtgttctttgccgatgtttggtcgagactttgaaattgatttagtttgtttgcatttgagtggaatg 15627363  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||  ||| | ||  |||||||||| |  ||||| || ||||| |    
T  15627362 gatgtaatccttggtatgaactggttggagtataaccatgttcatattaattgttttaataagtcggtgtatttttcttctgcggaagaagagagtggag 15627263  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagc 230  Q
    | ||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  15627262 cggagttcttaactactaagcagctgaagc 15627233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 131 - 254
Target Start/End: Original strand, 16726845 - 16726968
Alignment:
Q  131 tacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagc 230  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||  |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  16726845 tacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctactaagaagctgaagc 16726944  T
Q  231 aactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    || |||||||||||||||| ||||    
T  16726945 aaatggaacgcgatggtattttga 16726968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 19149950 - 19149771
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| | || |||||| |  || |||| ||| | |||||||  ||||||    
T  19149950 gggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagtcaatctagtatgtttgcctttgacgggtatg 19149851  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||| ||| | || ||||||||||| ||||| ||||  |||| ||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||    
T  19149850 gatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgctttagtaagacgatacatttttcttc 19149771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 20749349 - 20749170
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| | || |||||| |  || |||| ||| | |||||||  ||||||    
T  20749349 gggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagtcaatctagtatgtttgcctttgacgggtatg 20749250  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||| ||| | || ||||||||||| ||||| ||||  |||| ||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||    
T  20749249 gatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgctttagtaagacgatacatttttcttc 20749170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 201 - 249
Target Start/End: Original strand, 15146416 - 15146464
Alignment:
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtat 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15146416 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtat 15146464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13676390 - 13676184
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||| ||| |||| ||||  || |||    
T  13676390 gggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatg 13676291  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| ||| | || ||||||||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |  ||||| || ||||| |    
T  13676290 gatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagcaagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggag 13676191  T
Q  201 cagagtt 207  Q
    |||||||    
T  13676190 cagagtt 13676184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 18051263 - 18051442
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || ||||  |||||  | |||||||||||| | ||||||||| | |||||||| ||| |||| ||||  || |||    
T  18051263 gggttcagtgactacttctctggtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagagattttgaagtagatttagtgtgtttaccgttgacggggatg 18051362  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||| ||| | || ||||| ||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  18051363 gatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttaacaagactgtgcatttttcttc 18051442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 231
Target Start/End: Original strand, 15099953 - 15100143
Alignment:
Q  41 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacg 140  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| | ||  |||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| | || ||||||| ||| ||||| ||||  |    
T  15099953 ttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacctagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttgggatgaactagttagagtataaccgag 15100052  T
Q  141 ttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 231  Q
    ||| ||| ||||| |||| |||||| || ||||||||||| |  ||||| || ||||| || |||||  | |||||||| ||| |||||||    
T  15100053 ttcatatcaattgctttaacaagacggtgcatttttcttctgctgaagaagagagtggagctgagttcctatctactaaacagttgaagca 15100143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 180
Target Start/End: Original strand, 14261566 - 14261734
Alignment:
Q  11 actacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattc 110  Q
    ||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| | || || ||| | ||| |||| ||||| || |||   |||||||||||||||     
T  14261566 actacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagaatt-gaagtcgatctagtatgtctgccgttgtcgggtatggatgtgattt 14261664  T
Q  111 tgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    | || ||||||||||| ||||| ||||   ||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  14261665 ttgggatgaactggttagagtataaccgtattcatattaattgctttagtaagacggtgcatttttcttc 14261734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 14140618 - 14140439
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||||||||  | || ||||| ||| | || ||||  || |||    
T  14140618 gggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgaggtagacttagtctgtttgccgttgacgggaatg 14140519  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||| ||| | || ||||| ||||| ||||| ||||  |||| ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14140518 gatgttatttttgggatgaaatggttagagtataaccgagttcatatcaactgttttagtaagacggtacatttttcttc 14140439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 16947782 - 16947961
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || || |||| |||||| ||||||||||||||| | || |||| | | || ||||||||  | || ||||  ||||||    
T  16947782 gggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagagactttgtagtcgacttagtttgcttgccgttgacgggtatg 16947881  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||| ||| | || ||||| ||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  16947882 gatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagtaagacggtgcatttttcttc 16947961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 12459567 - 12459388
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||| || |||||||||||| | || ||||   | |||||||||||| |||| ||||  ||||||    
T  12459567 gggttcagtaactacttctcttgtctgtttaaggtgtccgttatctatgtttggtagagactttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatg 12459468  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||| ||| | || ||||| ||||| ||||| ||||  |||| ||| || || ||||| ||||| || |||||||||||    
T  12459467 gatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgggttcatatcaactgctttagtaagacggtgcatttttcttc 12459388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 180
Target Start/End: Original strand, 12798851 - 12798990
Alignment:
Q  41 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacg 140  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| | ||| |||| ||| | || ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||| ||||| ||||  |    
T  12798851 ttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtg 12798950  T
Q  141 ttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||| ||||||||| ||| | ||||| || |||||||||||    
T  12798951 ttcatattaattgctttggtaagacggtgcatttttcttc 12798990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 13024284 - 13024105
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || || ||||  ||||| ||||||||||||||| | ||||||    | || ||||| |||||||| ||||  ||||||    
T  13024284 gggttcagtaactacttctctagtttgcttgaggtgtccgttgtctatgtttggtagggattttttggtcgacttagtgtgtctaccgttgacgggtatg 13024185  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||||| ||||| || |  |||| ||| || || ||||| ||||| || |||||||||||    
T  13024184 gatgttatttttggtatgaattggttagagtataatcgagttcatatcaactgctttagtaagacggtgcatttttcttc 13024105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 180
Target Start/End: Original strand, 11385749 - 11385918
Alignment:
Q  11 actacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattc 110  Q
    ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||||||||  | || ||||||||| | || ||||  || |||||||| |||     
T  11385749 actacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggatgttattt 11385848  T
Q  111 tgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    | || ||||| ||||| ||||| ||||  |||  ||| || || ||||||||||| || |||||||||||    
T  11385849 ttgggatgaattggttagagtataaccgagttaatatcaactgctttagcaagacggtgcatttttcttc 11385918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 180
Target Start/End: Original strand, 26092142 - 26092287
Alignment:
Q  35 tgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtaca 134  Q
    |||||| | |||||||||||| | |||||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||| |    
T  26092142 tgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtata 26092241  T
Q  135 accacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    | |  |||| ||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  26092242 atcgagttcatatcaactgctttagtaagacggtacatttctcttc 26092287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 14283684 - 14283863
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||||||||  | || ||||||||| | || ||||  || |||    
T  14283684 gggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatg 14283783  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||| ||| | || ||||| ||||| ||||| ||||  |||| ||| |  || ||||| ||||| || |||||||||||    
T  14283784 gatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcagctgctttagtaagacggtgcatttttcttc 14283863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 19615502 - 19615435
Alignment:
Q  113 ggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  19615502 ggtatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagtaagacggtgcatttttcttc 19615435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 180
Target Start/End: Original strand, 12204120 - 12204289
Alignment:
Q  11 actacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattc 110  Q
    ||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| | |||||||||   ||| | || ||| | |  || |  ||||||||||| ||      
T  12204120 actacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagattttgaagatgatcttgtgtgtttgctgttaacgggtatggatgtaatct 12204219  T
Q  111 tgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    | || ||||||||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||||||||| |||||  ||| |||||||||    
T  12204220 ttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatatcaattgttttagtaagacgatacttttttcttc 12204289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 15343360 - 15343191
Alignment:
Q  11 actacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattc 110  Q
    ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||||||||  | || ||||||||| | || ||||  || |||||  | |||     
T  15343360 actacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggacattattt 15343261  T
Q  111 tgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    | || ||||| ||||| ||||| |||   |||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15343260 ttggaatgaattggttagagtataacagagttcatatcaattgctttagtaagacggtacatttttcttc 15343191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 131
Target Start/End: Original strand, 26115934 - 26116030
Alignment:
Q  35 tgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagt 131  Q
    |||||| | |||||||||||| | |||||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||    
T  26115934 tgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagt 26116030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 49155197 - 49155061
Alignment:
Q  44 tctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttc 143  Q
    |||||||||||| | |||||||  || ||||| ||||| || || ||||  ||||||||||| ||| | |||||||| ||||| ||||| || |  ||||    
T  49155197 tctatgtttggtagagattttgtgattgatttggtttgcctgccgttgacgggtatggatgttatttttggtatgaattggttagagtataatcgagttc 49155098  T
Q  144 ttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
     ||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  49155097 atatcaactgctttagtaagacggtacatttctcttc 49155061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 39)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 27190249 - 27189996
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27190249 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatatttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 27190150  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27190149 gatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttctgtcgaagaggaaagtggtg 27190050  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27190049 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 27189996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 27258991 - 27259244
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27258991 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatatttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 27259090  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27259091 gatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttctgtcgaagaggaaagtggtg 27259190  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27259191 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 27259244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 28312443 - 28312190
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28312443 gggttcggtgactacttctctcgtatttttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 28312344  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28312343 gatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 28312244  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28312243 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 28312190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 29589907 - 29590160
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29589907 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 29590006  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29590007 gatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 29590106  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29590107 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 29590160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 28260665 - 28260918
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28260665 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 28260764  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28260765 gatgtgattttgggtatgaactggttaaagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 28260864  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28260865 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgatatcttga 28260918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 28285251 - 28284998
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28285251 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 28285152  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28285151 gatgtgattttgggtatgaactggttaaagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 28285052  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28285051 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgatatcttga 28284998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 28339414 - 28339667
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28339414 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 28339513  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28339514 gatgtgattttgggtatgaactggttaaagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 28339613  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28339614 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgatatcttga 28339667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 25115365 - 25115112
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25115365 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatg 25115266  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  25115265 gatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaggaggaaagtggtg 25115166  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25115165 caaagtttttatccactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 25115112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 2872270 - 2872524
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2872270 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 2872369  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2872370 gatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 2872469  T
Q  201 cagag-tttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  2872470 cagagttttttatctactaagcagctgaagcaactagaacgcgacggtatcttga 2872524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16574703 - 16574450
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16574703 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgcctacctttgagcggtatg 16574604  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16574603 gatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgtccttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 16574504  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16574503 cggagtttttatctactaagcagctgaagcaactgaaacgcgacggtatcttga 16574450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 16620677 - 16620930
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16620677 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgcctacctttgagcggtatg 16620776  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16620777 gatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgtccttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 16620876  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16620877 cggagtttttatctactaagcagctgaagcaactgaaacgcgacggtatcttga 16620930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 24293250 - 24293503
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24293250 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcaaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 24293349  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24293350 gatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattagttgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 24293449  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  24293450 cggagtttttatctactaagcagctgatgcaactggaacgtgacggtatcttga 24293503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 254
Target Start/End: Original strand, 22827841 - 22828076
Alignment:
Q  19 tctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22827841 tctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatg 22827940  T
Q  119 aactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctacta 218  Q
    || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  22827941 aattgcttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgaagagtttttatctacta 22828040  T
Q  219 agcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22828041 agcaggtgaagcaactggaacgcgatgatatcttga 22828076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 27559437 - 27559690
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  27559437 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacttttgagcggtatg 27559536  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27559537 gatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 27559636  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    || |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27559637 caaagttcttatctactaagcaggtgaagcaactggaacgcgatggtattttga 27559690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 19867500 - 19867247
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19867500 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 19867401  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||  |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  19867400 gatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtggtg 19867301  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
     |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  19867300 tagagttcttgtctaccaagcagctgaaacaactagaacgcgatggtattttga 19867247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Original strand, 16925112 - 16925361
Alignment:
Q  5 tcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  16925112 tcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttttctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtttgcctttgagtggtatggacg 16925211  T
Q  105 tgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcaga 204  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16925212 tcatccttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccatcgaagaggaaagtggtgcaga 16925311  T
Q  205 gtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||    
T  16925312 gttcttatctactaagcagctgaagcaaatgtagcgcgatggtattttga 16925361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22436682 - 22436429
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||  | |||||||||||||||    
T  22436682 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgttctttgtctatgtttggtcgtgattttgagattgatatggtttgcttgcctttgagtggtatg 22436583  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |  || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  22436582 ggcgtcattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttctctttcgtcgaagaggaaagtggtg 22436483  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  22436482 cagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaactggaacgtgatggtattttga 22436429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 5836696 - 5836949
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  5836696 gggttcggtaactaccactctagtatgtttgaaatgtcctttttctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctccctttgagcggtatg 5836795  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| ||||| |||| ||| ||||| |||||||| || |||| ||||||||||  ||||||| ||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  5836796 gatgttattcttggtaggaattggttagagtacaatcatgttcatattaattgtgctagcaagtcagtgtatttctcttcagtcgaagaggaaagtggtg 5836895  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5836896 cagaattcttatctactaaacagctgaagcaactggaacgcgatggtattttga 5836949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 18405412 - 18405660
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  18405412 gggttcggtgactacttctcttgtgtgtttgagatgtcccttgtctatgtttgattgtgattttgaaattaatttggtttgtctgcctttgagtggtatg 18405511  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||| ||||||||| ||  ||||  |||| ||||| |  |||||||||||||| |    
T  18405512 gatgtaattcttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattacttgttttagtaaatcagtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcg 18405611  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtat 249  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  18405612 caaagtttttgtctaccaagcagctgaagcagttagaacgtgatggtat 18405660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23081236 - 23080991
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || || |||||| ||||||||| |||||||    
T  23081236 gggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattatgaaattgacttggtttgtttacctttgattggtatg 23081137  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| || || |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||| ||| | ||  |||| |||||    |||||||||||||| |    
T  23081136 gatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaatcatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttcttctgaagaggaaagtggcg 23081037  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 246  Q
    || | |||| |||||| |||||| |||||||| | ||||| |||||    
T  23081036 caaaattttggtctaccaagcagttgaagcaattagaacgtgatgg 23080991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 18182835 - 18183066
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||    ||||| |||||||| |||| |||    
T  18182835 gggttcggtgactacttctcttgtttgtttaagatgtcatttgtctatgcttggtcgagattttgaaattgatacgttttgtttacctttgtgtggaatg 18182934  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||| ||||  | |||||||| |  ||||| |||||||| |    
T  18182935 gatgtaatccttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattattttagtaagtcagtgtacttttcttctgctgaagaagaaagtggag 18183034  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaa 232  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18183035 cagagttcttgtctactaagtagctgaagcaa 18183066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 41 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 20135747 - 20135556
Alignment:
Q  41 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacg 140  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||| ||| ||| ||||||||||| |    
T  20135747 ttgtctatgtttggccgagattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatggactagttagagtacaaccatg 20135648  T
Q  141 ttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaa 232  Q
    ||| ||||||||||||||| ||| ||||  | |||||||  |  ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20135647 ttcatattaattgttttagtaagtcagtgtacttttcttttgctgaagaagaaagtggagcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaa 20135556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 41 - 232
Target Start/End: Original strand, 22197122 - 22197313
Alignment:
Q  41 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacg 140  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||| ||| ||| ||||||||||| |    
T  22197122 ttgtctatgtttggccgagattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatggactagttagagtacaaccatg 22197221  T
Q  141 ttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaa 232  Q
    ||| ||||||||||||||| ||| ||||  | |||||||  |  ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22197222 ttcatattaattgttttagtaagtcagtgtacttttcttttgctgaagaagaaagtggagcagagttcttgtctactaagcagctgaagcaa 22197313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 119 - 254
Target Start/End: Original strand, 16961067 - 16961203
Alignment:
Q  119 aactggttggagtacaaccacgttcttat-taattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctact 217  Q
    ||||||||| || | ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||  |||| || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  16961067 aactggttgaaggataaccatgttcttatctaatagttttagcaagtcagtgtatttctcctcagtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctact 16961166  T
Q  218 aagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  16961167 aagcagctgaagcaactggaacgtgatggtatattga 16961203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 30678492 - 30678721
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||| ||| ||||||||||| || ||| |||| ||| | ||||| ||||||||||| || |||||| | |||||||| ||| | ||||||||||| |||    
T  30678492 gggtttggttactacttctctagtgtgtctgaagtgttcgttgtcgatgtttggtcgagactttgaagttgatttagtctgttttcctttgagtggaatg 30678591  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||| |||| | | ||||||||||| |  ||||| || ||||  |    
T  30678592 gatgtaatacttggtatgaattggttggagtataaccatgttcacattaattgttttagtaaga-aatgcatttttcttctgctgaagaagagagtgaag 30678690  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagca 231  Q
    | ||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  30678691 ctgagttcttgactactacgcagctgaagca 30678721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 23085293 - 23085408
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| |||    
T  23085293 gggttcggtgactacttctctagtgtgtttaagatgtcctttatctatgtttggtagagattttgaaattgatttggtttgtttgcctttgagtggaatg 23085392  T
Q  101 gatgtgattctgggta 116  Q
    ||||| ||||| ||||    
T  23085393 gatgtaattcttggta 23085408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 19437815 - 19437627
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||| |||| |||||||| | | || |||||| | || ||||||||| | ||||||| |||||||    
T  19437815 gggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtttatgtttgttagagactttgaagtcgacttagtttgttttcctttgactggtatg 19437716  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaaga 189  Q
    ||||| ||| | || ||||||| ||| ||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  19437715 gatgttatttttgggatgaacttgttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaagacggtgcatttttcttctgtggaaga 19437627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 41 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 19455796 - 19455657
Alignment:
Q  41 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacg 140  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||| ||||| ||||  |    
T  19455796 ttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgag 19455697  T
Q  141 ttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  19455696 ttcatatcaattgctttagcaagacggtgcatttttcttc 19455657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 18797503 - 18797324
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||  | |||| | |||||||||||| | ||||||||  | || ||||| ||| ||||  |||  ||||||    
T  18797503 gggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtttcctatatctatgtttggtagggattttgaggtagacttagtgtgtttaccgctgacgggtatg 18797404  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||| ||| | || ||||| ||||| ||||| ||||  |||| ||| || || |||||||||||||| |||||||||||    
T  18797403 gatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatataaactgctttagcaagacagtgcatttttcttc 18797324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 21474413 - 21474234
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||  || |||||||  ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||| | || ||| |  | ||||  ||||||    
T  21474413 gggttcagtaactacttctcatgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagttgatcttgtatgtttgtcgttgacgggtatg 21474314  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||| ||  | || ||||||||||| ||||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21474313 gatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatattaattgttttagtaagacggtacatttttcttc 21474234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 21567459 - 21567638
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | |||||||   | || ||||| |||||||| ||||  ||||||    
T  21567459 gggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggtcgacttagtgtgtctaccgttgacgggtatg 21567558  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||| ||| | || ||||||| ||| ||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  21567559 gatgtcatttttggaatgaactagttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagtaagacggtgcatttttcttc 21567638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 34643054 - 34643233
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||| | |||||||||||| | ||||||||| | ||  |||||||  |||||||||  || |||    
T  34643054 gggttcagtgactacttctcttgtttgtttgagatgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtagacctagtttgcttacctttgacggggatg 34643153  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||| ||  | || ||||| ||||| ||||| ||||  |||| ||| || || ||||  ||||| ||||||||||||||    
T  34643154 gatgttatatttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaactgctttaataagactgtacatttttcttc 34643233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 180
Target Start/End: Original strand, 19486772 - 19486939
Alignment:
Q  11 actacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattc 110  Q
    ||||||||||| || |||||||  ||||  ||||||||||||||| | ||||||||| | ||| |||| ||| | |||  ||  ||||||||||| ||      
T  19486772 actacttctcttgtttgtttgagttgtctgttgtctatgtttggtagagattttgaagttgatctagtatgtttgcct--gacgggtatggatgtaatct 19486869  T
Q  111 tgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| |||||  | |||||||||||    
T  19486870 ttgggatgaactggttggagtataaccatgttcatatgaattgttttagtaagacgatgcatttttcttc 19486939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 25770647 - 25770478
Alignment:
Q  11 actacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattc 110  Q
    ||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||  | || ||| | || ||||  ||||||||||| ||      
T  25770647 actacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagttgaccttgtatgtttgccattgacgggtatggatgtaatct 25770548  T
Q  111 tgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    | || ||||||||||| ||||| ||||  |||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  25770547 ttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattattttagtaagacaatacatttttcttc 25770478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 15462149 - 15461904
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||| || |||||||||||| | ||||||||  | || ||||| |||||||| |||   || |||    
T  15462149 gggttcagtaactacttctctggtgtgtctaaggtgtccgttatctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgttggggatg 15462050  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| ||  | || ||||| ||||| || || ||||  |||  |||||||||||||| |||||| || |||||||||||  | ||||| || ||||| |    
T  15462049 gatgttatcttcgggatgaattggttagaatataaccgagtttgtattaattgttttaacaagacggtgcatttttcttctatggaagaagagagtggag 15461950  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 246  Q
    |||||||| |  ||||||| ||| |||||||  ||||||| |||||    
T  15461949 cagagtttctaactactaaacagttgaagcagttggaacgagatgg 15461904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 180
Target Start/End: Original strand, 24515916 - 24516061
Alignment:
Q  35 tgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtaca 134  Q
    ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||| |||| ||| |||| ||||  || |||||  | ||| | || ||||||||||| ||||| |    
T  24515916 tgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatctagtgtgtttaccgttgacgggaatggacattatttttgggatgaactggttagagtata 24516015  T
Q  135 accacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    |||  |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  24516016 accgagttcatatcaattgttttagcaagacggtgcatttttcttc 24516061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 101 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18451160 - 18451072
Alignment:
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaaga 189  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||  ||| | |||| ||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||| | ||||||    
T  18451160 gatgtgatactaggtatgaactggttggagtttaactatgttcatattaattgttttagaatgacggtacgtttttcttctgccgaaga 18451072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 113 - 231
Target Start/End: Original strand, 8761334 - 8761452
Alignment:
Q  113 ggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgt 212  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || | ||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| |   |||| || ||||| |||||||| ||      
T  8761334 ggtatgaactggttggagtataaccatgtccatatcaattgctttagcaagacggtgcaattttcttctgcgaaagaagagagtggagcagagttcttaa 8761433  T
Q  213 ctactaagcagctgaagca 231  Q
    ||||||| ||| |||||||    
T  8761434 ctactaaacagttgaagca 8761452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 10466316 - 10466561
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||  || |||||||||||| | || ||||   | |||||||||||| |||| ||||  ||||||    
T  10466316 gggttcagtaactacttctcttgtctgtttaaggtgtctgttatctatgtttggtagggactttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatg 10466415  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| ||| | || || || ||||| ||||| ||||  |||| ||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| |  ||||| ||| |||  |    
T  10466416 gatgttatttttgggataaattggttagagtataaccgagttcatatcaactgctttagtaagacggtgcatttttcttctgctgaagaagaaggtgaag 10466515  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 246  Q
      ||||| |||||||| || ||| |||| || |||||||| |||||    
T  10466516 ttgagttcttgtctacaaaacagatgaaacagctggaacgtgatgg 10466561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 41)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 27665995 - 27666248
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27665995 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 27666094  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27666095 gatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 27666194  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27666195 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 27666248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 40711661 - 40711408
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40711661 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 40711562  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40711561 gatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 40711462  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40711461 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 40711408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16359383 - 16359130
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16359383 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 16359284  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16359283 gatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 16359184  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16359183 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 16359130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 27613237 - 27612984
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27613237 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatg 27613138  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27613137 gatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 27613038  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27613037 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 27612984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 34569375 - 34569122
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34569375 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 34569276  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34569275 gatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 34569176  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34569175 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 34569122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 22330392 - 22330645
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22330392 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 22330491  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22330492 gatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 22330591  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22330592 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 22330645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 27521287 - 27521034
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27521287 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 27521188  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  27521187 gatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggcg 27521088  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27521087 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 27521034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 41773723 - 41773470
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41773723 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtactttgtctatgtttggtcgcgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 41773624  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41773623 gatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 41773524  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41773523 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 41773470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 19772841 - 19772588
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19772841 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 19772742  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19772741 gatgtgatcctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 19772642  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19772641 cagagtttttatctactaagcagttgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 19772588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 29473578 - 29473831
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29473578 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 29473677  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29473678 gatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 29473777  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  29473778 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacgatatcttga 29473831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 37289001 - 37289254
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37289001 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctttgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 37289100  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37289101 gatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 37289200  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37289201 tagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 37289254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 14997244 - 14997497
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14997244 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 14997343  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14997344 gatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 14997443  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  14997444 cggagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacagtatcttga 14997497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22137549 - 22137296
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22137549 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtttatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 22137450  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22137449 gatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 22137350  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22137349 cagagtttttatctaccaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 22137296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22350800 - 22350547
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22350800 gggttcggtgactacttatctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgcgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 22350701  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  22350700 gatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaatttttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggagagtggtg 22350601  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22350600 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 22350547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 27682905 - 27683158
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  27682905 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtgtgtctacctttgagcggtatg 27683004  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27683005 gatgtgattctgggtatgaactgtttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 27683104  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  27683105 cggagtttttatctactaagcagctgaaggaactggaacgcaacggtatcttga 27683158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 20803478 - 20803225
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20803478 gggtttggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 20803379  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20803378 gatgtgattcttggtatgaagtggttagagtacaaccatgttcatatcaattgctttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 20803279  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20803278 cagagttcttatctaccaagcagctgaagcaactggaacgcgaaggtatcttga 20803225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 18781995 - 18781742
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  18781995 gggttccgtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggattaagtttgtctacctttgagcggtatg 18781896  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||  |||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  18781895 gatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtg 18781796  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  18781795 cagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttga 18781742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 21882655 - 21882402
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  21882655 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctttaagcggtatg 21882556  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||  |||| || |||||| | |||||||||||||    
T  21882555 gatgtgattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcggtgtatttctcctccgtctaggaggaaagtggtg 21882456  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  21882455 cagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaactggaacgtgatggtattttga 21882402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 21342919 - 21343167
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||    
T  21342919 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgaaatggatttagtttgtataccattgaacggtatg 21343018  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||  |||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  21343019 gatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtttatttctattccgttgaagaggaaagtggtg 21343118  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtat 249  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21343119 cagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtat 21343167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 25429302 - 25429049
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25429302 gggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcccttgtctatgtttgatcgtgattttgagattgatttggtttgtctacctttgagtggtatg 25429203  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||  ||||  |||| ||||| |  |||||||||||||| |    
T  25429202 gatgtaattcttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaaatcagtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcg 25429103  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||    
T  25429102 cagagtttttgtctaccaagcagctgaagcagttagaacgtgatggtattttga 25429049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 26736232 - 26736463
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  26736232 gggtttggtgactacttctcttgtatgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggtatg 26736331  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| | ||  |||| ||||| |  |||||||||||||| |    
T  26736332 gatgtgatccttggaatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcg 26736431  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaa 232  Q
    || | ||||||||||  |||||||||||||||    
T  26736432 caaaatttttgtctatgaagcagctgaagcaa 26736463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23474076 - 23473831
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| |||    
T  23474076 gggttcggtgactacttctcttgtgtattaaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggaatg 23473977  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    || || || || |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| | ||  |||||||||| |  ||||| ||||||||||    
T  23473976 gacgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttttcttctgctgaagaagaaagtggtg 23473877  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 246  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  23473876 cagaattcttgtctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 23473831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 21336799 - 21337043
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||  || ||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || || | |||| ||||||||||||| |||    
T  21336799 gggtttggtgactacttctcgtgtgtgtttaagatgtcttttgtctatgtttggtcgcgattttgaaattgacttggattgtttacctttgagtggaatg 21336898  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| | ||  |||||||||| |  ||||| |||||||| |    
T  21336899 gatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttttcttctgctgaagaagaaagtggcg 21336998  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatg 245  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  21336999 cagagttcttgtctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatg 21337043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 23525951 - 23525867
Alignment:
Q  18 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgga 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23525951 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatgga 23525867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 20311731 - 20311561
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||| | |||| ||||| ||| |  | ||||||||||||    
T  20311731 gggttcggtgactacttctctagtatgcttgaagtgtcctttgtcgatgtttggtagagattttgcagtggacttagtctgtttgtcgttgagtggtatg 20311632  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtaca 171  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||  ||| | |||| ||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  20311631 gatgtgatactaggtatgaactggttggagtttaactatgttcatatcaattgttttagtaagacggtaca 20311561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 21983682 - 21983861
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||| | ||||||||| | ||| |||| ||| | || ||||  ||||||    
T  21983682 gggttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtccattgtttatgtttggtagagattttgaagttgatctagtatgtttgccgttgacgggtatg 21983781  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  21983782 gatgtaatctttgggatgaactggttggagtataaccatgttcatatcaattgttttagtaagacggtgcatttttcttc 21983861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 21561530 - 21561709
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||| |||| ||| | || ||||  ||| ||    
T  21561530 gggttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagattttgaagttgatctagtatgtttgccattgacgggtgtg 21561629  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| || || || |||||||||||    
T  21561630 gatgtaatctttgggatgaactggttggagtataaccatgttcatatcaattgttttagtaaaacggtgcatttttcttc 21561709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 41 - 231
Target Start/End: Original strand, 23563713 - 23563903
Alignment:
Q  41 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacg 140  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||| ||||| ||||  |    
T  23563713 ttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccattgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgag 23563812  T
Q  141 ttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 231  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||    ||||| || ||||| ||||||||  | |||||||| ||| |||||||    
T  23563813 ttcatatcaattgctttagcaagacggtgcatttttcttctacagaagaagagagtggagcagagttgctatctactaaacagttgaagca 23563903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 21410012 - 21409827
Alignment:
Q  4 ttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggat 103  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||| | ||||||| | |||| ||||| ||| | || |||| ||| ||||||    
T  21410012 ttcggtgactagttctctagtatgcttgaagtgtcctttgttgatgtttggtagagattttgcagtggacttagtctgtttgccgttgactgggatggat 21409913  T
Q  104 gtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaaga 189  Q
    || || || ||||||||||||||||| |  ||||  |||| |||||| |||||| | ||||| || | ||||||||| | ||||||    
T  21409912 gtaatactaggtatgaactggttggaatttaaccttgttcatattaaatgttttcgaaagacggtgcgtttttcttctgccgaaga 21409827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20824316 - 20824086
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||  | |||||||| |||||||| |||   || |||    
T  20824316 gggttcagtaactacttctctggtgtgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagatttcgaggtcgatttagtgtgtctaccgttgttggggatg 20824217  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| ||| | || ||||| ||||| ||||| ||||  ||   |||||||||||||| |||||| || || |||||||| || ||||| || ||||| |    
T  20824216 gatgttattttcgggatgaattggttagagtataaccgagtctgtattaattgttttaacaagacggtgcacttttcttctgtggaagaagagagtggag 20824117  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagca 231  Q
    |||||||| |  ||||||| ||| |||||||    
T  20824116 cagagtttctaactactaaacagttgaagca 20824086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 17266839 - 17267084
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || ||||  |||||  | |||||||||||| | ||||||||| | || ||||||||| | || ||||  || |||    
T  17266839 gggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagagattttgaagtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatg 17266938  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| ||| | || ||||| ||||| ||||| |||   |||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||  |    
T  17266939 gatgttatttttgggatgaattggttagagtataactgagttcatatcaactgttttagtaagacggtacatttttcttccgccgaagaagagagtgaag 17267038  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 246  Q
      |||||||||  ||| |||||  |||||||  ||||||| |||||    
T  17267039 ttgagtttttgaatacgaagcaaatgaagcagttggaacgtgatgg 17267084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 20778776 - 20778531
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||| |  ||||| ||||||||||||||| | ||||||||  | || ||||| |||||||| |||   || |||    
T  20778776 gggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgttggggatg 20778677  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| ||| | || ||||| ||||| ||||| ||||  ||   |||||||||||||| |||||| || || |||||||| |  ||||| || ||||| |    
T  20778676 gatgttattttcgggatgaattggttagagtataaccgagtctgtattaattgttttaacaagacggtgcacttttcttctgcggaagaagagagtggag 20778577  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 246  Q
    || ||||| |  ||||||| ||| |||||||  ||||||| |||||    
T  20778576 cacagtttctaactactaaacagttgaagcagttggaacgagatgg 20778531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 28892447 - 28892692
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | || ||||| |||||||| |||   || |||    
T  28892447 gggttcagtaactacttctctggtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaagtcgacttagtgtgtctaccgttgttggggatg 28892546  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| ||  | || ||||| ||||| ||||| ||||  ||   |||||||||||||| |||||| || || |||||||| || ||||| || ||||| |    
T  28892547 gatgtcatcttcgggatgaattggttagagtataaccgagtctgtattaattgttttaacaagacggtgcacttttcttctgtggaagaagagagtggag 28892646  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 246  Q
    |||||||| |  ||||||| ||| |||||||  ||||||| |||||    
T  28892647 cagagtttctaactactaaacagttgaagcagttggaacgagatgg 28892692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22464813 - 22464569
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||| ||||||||||||||| | ||||||||  | || ||||| |||||||| |||   || |||    
T  22464813 gggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtatgtctaccgttgttgggaatg 22464714  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| ||| | || ||||| ||||| ||||||||||  ||   ||| |||||||||| |||||| || || |||||||| |  |||||||| ||||| |    
T  22464713 gatgttattttcgggatgaattggttagagtacaaccgagtctgtataaattgttttaacaagacggtgcacttttcttctgcggaagaggagagtggag 22464614  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatg 245  Q
    |||||||| |  ||||||| ||  |||||||  ||||||| ||||    
T  22464613 cagagtttctaactactaaacaattgaagcagttggaacgggatg 22464569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 180
Target Start/End: Original strand, 22233537 - 22233604
Alignment:
Q  113 ggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  22233537 ggtatgaactggttggaatataaccatgttcatattaattgctttagtaagacggtgcatttttcttc 22233604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Original strand, 439 - 572
Alignment:
Q  113 ggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgt 212  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| || | ||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |  ||||| || ||||| | ||||||  | |    
T  439 ggtatgaaccggttggagtataaccatgtccatatcaattgctttagcaagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggagtagagttcctat 538  T
Q  213 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 246  Q
    |||| || ||| |||||||  |||| ||||||||    
T  539 ctacaaaacagttgaagcagttggagcgcgatgg 572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 22505474 - 22505354
Alignment:
Q  69 tggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagt 168  Q
    |||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| | || ||||| ||||| ||||| ||||  |||| ||| || || | ||| |||||| |    
T  22505474 tggatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaactgctatagtaagacaat 22505375  T
Q  169 acatttttcttccgtcgaaga 189  Q
     ||||||||||| || |||||    
T  22505374 gcatttttcttctgttgaaga 22505354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 180
Target Start/End: Original strand, 21676451 - 21676518
Alignment:
Q  113 ggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  21676451 ggtatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagtaagacggtgcatttttcttc 21676518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 189
Target Start/End: Original strand, 14884530 - 14884684
Alignment:
Q  35 tgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtaca 134  Q
    |||||| | |||||||||||| | |||||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||| ||||| || || |    
T  14884530 tgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtcttccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagaatata 14884629  T
Q  135 accacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaaga 189  Q
    | |  |||| ||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  14884630 atcgggttcatatcaactgctttagtaagacggtacatttctcttctgttgaaga 14884684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 113 - 250
Target Start/End: Original strand, 24796014 - 24796151
Alignment:
Q  113 ggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgt 212  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||| ||| ||||| || | |||||| || ||||||||||| |  || || || ||||| |||||||| ||      
T  24796014 ggtatgaactggttggagtatacccatgttcatatcaattgcttaaacaagacggtgcatttttcttctgcggaggaagagagtggagcagagttcttaa 24796113  T
Q  213 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatc 250  Q
    |||| || ||| |||||||  | ||||| |||||||||    
T  24796114 ctacaaaacagttgaagcagtttgaacgtgatggtatc 24796151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Complemental strand, 23460852 - 23460824
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtt 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23460852 gggttcggtgactacttctctcgtatgtt 23460824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 35)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 12479549 - 12479296
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12479549 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 12479450  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12479449 gatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 12479350  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12479349 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 12479296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 16234055 - 16234308
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16234055 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 16234154  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16234155 gatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 16234254  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16234255 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 16234308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 17092212 - 17092465
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17092212 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 17092311  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17092312 gatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 17092411  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17092412 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 17092465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 23958696 - 23958443
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23958696 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 23958597  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23958596 gatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 23958497  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23958496 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 23958443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 8389361 - 8389108
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8389361 gggttcggtgactacttcactcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 8389262  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8389261 gatgtgattttgggaatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 8389162  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8389161 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 8389108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 19635085 - 19634832
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19635085 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgttcggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 19634986  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19634985 gatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 19634886  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19634885 caaagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 19634832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 19775856 - 19776109
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19775856 gggttcggtgactacttctctcatatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 19775955  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19775956 gatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 19776055  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  19776056 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacagtatcttga 19776109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 27714285 - 27714032
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27714285 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcttttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 27714186  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27714185 gatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtatatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 27714086  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27714085 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 27714032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 40475989 - 40475736
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40475989 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 40475890  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40475889 gatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttatagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 40475790  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40475789 cagagtttgtatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 40475736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 8050686 - 8050939
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8050686 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatttcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 8050785  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8050786 gatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 8050885  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  8050886 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacacgacggtatcttga 8050939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 14301042 - 14301295
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14301042 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatatttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 14301141  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14301142 gatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 14301241  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14301242 cggagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 14301295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 14683516 - 14683263
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  14683516 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcagtatg 14683417  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  14683416 gatgtgattctgggaatgaattggttggagtacaaccatgttcatattaattgttttagcatgtcagtgtatttctcttccgccgaagaggaaagtggtg 14683317  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  14683316 cagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgtgatggtattttga 14683263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 18224509 - 18224762
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18224509 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 18224608  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||| ||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  18224609 gatgttattttgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcataacaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgttgaagaggaaagtggtg 18224708  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  18224709 cagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttga 18224762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 15144955 - 15145209
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15144955 gggttcggtgactacgtctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttaagcggtatg 15145054  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttag-caagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagt-gg 198  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| |||| ||||  |||| || |||||||||||||||||| ||    
T  15145055 gatgtga-tctgggtataaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagtcaagtcagtgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtagg 15145153  T
Q  199 tgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15145154 tgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttga 15145209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 16250913 - 16251166
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16250913 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 16251012  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||  |||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  16251013 gatgtgattctgggtataaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtg 16251112  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||| ||  |||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  16251113 cagagttcttaactactaaatagctgaagcaaatggaacgtgatggtattttga 16251166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14697050 - 14696805
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  14697050 gggttcggtgactacttctcttgtgtgcttaagatgtcccttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgatttagtttgtttacctttgagtggaatg 14696951  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||| |  |||||||||||||| |    
T  14696950 gatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcagtgtatttttcttctgctgaagaggaaagtggcg 14696851  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 246  Q
    || | || || ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  14696850 caaaattcttttctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 14696805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14188454 - 14188210
Alignment:
Q  2 ggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgg 101  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||     
T  14188454 ggttcggttactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctttgtttgatcgtgattttgaaatggatttagtttgtttacctttgagtggaatga 14188355  T
Q  102 atgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgc 201  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||  | ||    |  || || |  ||||| |||||||| |     
T  14188354 atgtgattcttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcttatcaactgttttagcaattcggtgtcctcctcctctgctgaagaagaaagtggagt 14188255  T
Q  202 agagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 246  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14188254 ggagttcttgtctactaagcagctgaagcaactagaacgagatgg 14188210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14162419 - 14162174
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||| |  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  14162419 gggttcggtaactacttctcttgtgtgtttaaggtgtcctttgtctatgtatgatcgtgattttgaaatggatttagtttgtttacctttgagtggaatg 14162320  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||    || || || || ||||| ||||| || |    
T  14162319 gatgtgattcttggcatgaactggttagagtacaaccatgttcttattaattgttttagcaagtcggtgtccttctcctctgttgaagaagaaagcggag 14162220  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 246  Q
     |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  14162219 tagagttcttgtctaccaagcaactgaagcaactagaacgtgatgg 14162174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16219169 - 16218934
Alignment:
Q  11 actacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattc 110  Q
    ||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || |    
T  16219169 actacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatcc 16219070  T
Q  111 tgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 210  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||| | ||  |||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||| ||    
T  16219069 ttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattggtttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagttctt 16218970  T
Q  211 gtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 246  Q
    |||||  ||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  16218969 gtctatcaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 16218934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16222489 - 16222254
Alignment:
Q  11 actacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattc 110  Q
    ||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || |    
T  16222489 actacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatcc 16222390  T
Q  111 tgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 210  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||| | ||  |||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||| ||    
T  16222389 ttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattggtttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagttctt 16222290  T
Q  211 gtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 246  Q
    |||||  ||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  16222289 gtctatcaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 16222254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 16098 - 16351
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  16098 gggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgatttctaaattgatttggtttgtttacctttgagtggtatg 16197  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| || || ||||||||||||||  |||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| | ||  ||||  |||| |  |||||||||||||| |    
T  16198 gatgtaatccttggtatgaactggttaaagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaagtcggtgtatttcccttctgctgaagaggaaagtggcg 16297  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||  | ||||| |||||||| ||||    
T  16298 caaagtttttgtctactaaacagctgaagcagttagaacgtgatggtattttga 16351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 105 - 254
Target Start/End: Original strand, 16352697 - 16352846
Alignment:
Q  105 tgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcaga 204  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16352697 tgattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcaga 16352796  T
Q  205 gtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16352797 gttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttga 16352846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 16350617 - 16350725
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  16350617 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtctggtcgtgatttcgaaatggatctagtttgtctacctttgagcggtatg 16350716  T
Q  101 gatgtgatt 109  Q
    |||||||||    
T  16350717 gatgtgatt 16350725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 15073308 - 15073129
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| ||  ||||||  ||||||||||||||||||||| | || |||||| | ||| | || ||||| || ||||  ||||||    
T  15073308 gggttcagtaactacttctcttgtcagtttgagttgtcctttgtctatgtttggtagagactttgaagttgatcttgtatgtctgccgttgacgggtatg 15073209  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||| ||  | || ||||||||||| ||||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15073208 gatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgttttagtaagacggtacatttttcttc 15073129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22632528 - 22632396
Alignment:
Q  122 tggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagc 221  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||  | ||  |||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22632528 tggttggagtataaccatgttcatattaattgttttagtaaatcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagc 22632429  T
Q  222 agctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    || |||||||  | ||||| |||||||| ||||    
T  22632428 agttgaagcagttagaacgtgatggtattttga 22632396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 180
Target Start/End: Original strand, 29450894 - 29451039
Alignment:
Q  35 tgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtaca 134  Q
    |||||| | |||||||||||| | |||||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||| |    
T  29450894 tgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagtata 29450993  T
Q  135 accacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    | |  |||| ||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29450994 atcgggttcatatcaactgctttagtaagacggtacatttttcttc 29451039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 246
Target Start/End: Original strand, 14848543 - 14848673
Alignment:
Q  116 atgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtcta 215  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||  ||  | ||  |||||||||| |  |||||||||||||| ||| |  | |||||||    
T  14848543 atgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattattttattaaatcggtgtatttttcttctgctgaagaggaaagtggcgcaaaactcttgtcta 14848642  T
Q  216 ctaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 246  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  14848643 ctaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 14848673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 180
Target Start/End: Original strand, 14993724 - 14993869
Alignment:
Q  35 tgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtaca 134  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |  |||||| | ||  | |||||| |||| ||||  |||||| |||||||| | || ||||||||||| ||||| |    
T  14993724 tgtccgttgtctatgtttggtggaggctttgaagtcgaccttgtttgtttaccgttgacgggtatgcatgtgatttttgggatgaactggttagagtata 14993823  T
Q  135 accacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    |||  |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  14993824 accgagttcatattaattgctttagtaagacggtgcatttttcttc 14993869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 51604115 - 51604360
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || ||||  |||||  | |||||||||||| | ||||||||| | || ||||||||| | ||  |||  || |||    
T  51604115 gggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagagattttgaagtagacttagtttgtttgccgctgacgggaatg 51604214  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| ||| | || ||||| ||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||| |||| |||||| || ||||||||||| |  ||||| || ||||| |    
T  51604215 gatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttaacaagactgtgcatttttcttctgctgaagaagagagtggag 51604314  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 246  Q
      ||  |||| ||||| |||||| |||||||| | ||||| |||||    
T  51604315 ttgaaattttatctacaaagcagatgaagcaattagaacgtgatgg 51604360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 27903334 - 27903155
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||| ||||||||||||||| | ||||||||  | || ||||| |||||||| ||||  || |||    
T  27903334 gggttcagtaactacttctctagtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgatgggaatg 27903235  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
     |||| ||| | || ||||| ||||| ||||| ||||  |||  ||| |||||||| | |||||| || |||||||||||    
T  27903234 aatgttattttagggatgaattggttagagtataaccgagtttatataaattgtttcaacaagacggtgcatttttcttc 27903155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 180
Target Start/End: Original strand, 3262151 - 3262296
Alignment:
Q  35 tgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtaca 134  Q
    |||||| | |||||||||||| | |||||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||| |    
T  3262151 tgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtata 3262250  T
Q  135 accacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    | |  |||| ||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  3262251 atcgagttcatatcaactgctttagtaagacggtacatttctcttc 3262296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 41 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 8708816 - 8708677
Alignment:
Q  41 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacg 140  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||| | ||| |||| ||| |  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||||||||||| ||| ||||| |    
T  8708816 ttgtttatgtttggtagagattttgaagttgatctagtatgtttgtcgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttggcgtataaccatg 8708717  T
Q  141 ttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||  | |||||||||||    
T  8708716 ttcatatcaattgttttagtaagacgatgcatttttcttc 8708677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 15258866 - 15258697
Alignment:
Q  11 actacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattc 110  Q
    ||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | || |||| | | ||  | |||||| |||| ||||  ||||||||||| |||     
T  15258866 actacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgtagtcgaccttgtttgtttaccgttgacgggtatggatgtcattt 15258767  T
Q  111 tgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    |  | ||||| ||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  15258766 tttggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagcaagacggtgcatttttcttc 15258697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 15354363 - 15354499
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||| | | |||||  ||||||||||||||| | || ||| || | || ||||||||| |||| ||||  ||||||    
T  15354363 gggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtctgttgtctatgtttggtagagactttaaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatg 15354462  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaacc 137  Q
    ||||| ||| | || |||||||| || ||||| ||||    
T  15354463 gatgttatttttgggatgaactgattagagtataacc 15354499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 131
Target Start/End: Original strand, 44659223 - 44659319
Alignment:
Q  35 tgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagt 131  Q
    |||||| | |||||||||||| | |||||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||    
T  44659223 tgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagt 44659319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 61)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 3688511 - 3688258
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3688511 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 3688412  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3688411 gatgtgattttgggtatgaactggttacagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 3688312  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3688311 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 3688258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 12889277 - 12889024
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12889277 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 12889178  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12889177 gatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 12889078  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12889077 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 12889024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 13255258 - 13255005
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13255258 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 13255159  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13255158 gatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 13255059  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13255058 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 13255005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 16754263 - 16754516
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16754263 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctctgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 16754362  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16754363 gatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaggaggaaagtggtg 16754462  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16754463 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 16754516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 53382580 - 53382833
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53382580 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 53382679  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53382680 gatgtgattttgggtatgaactggttggagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 53382779  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53382780 cagagtttttgtctaccaaacagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 53382833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 5422492 - 5422745
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5422492 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcttttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 5422591  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5422592 gatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 5422691  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5422692 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 5422745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 6603303 - 6603051
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6603303 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 6603204  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6603203 gatgtgattctgggtatgaactggtt-gagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcaatacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 6603105  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6603104 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttga 6603051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16638341 - 16638088
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16638341 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 16638242  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16638241 gatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 16638142  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16638141 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 16638088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 20059616 - 20059869
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20059616 gggttcggtgactacttctctagtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 20059715  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20059716 gatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 20059815  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20059816 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 20059869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 43165243 - 43164990
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43165243 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 43165144  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43165143 gatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 43165044  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43165043 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 43164990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 48428015 - 48427762
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48428015 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 48427916  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48427915 gatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattattttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 48427816  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48427815 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 48427762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 15586954 - 15587207
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15586954 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgaatggtatg 15587053  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15587054 gatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaatcacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 15587153  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15587154 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 15587207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 26790975 - 26791228
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26790975 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 26791074  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26791075 gatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 26791174  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26791175 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 26791228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 15345807 - 15346060
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  15345807 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtaag 15345906  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15345907 gatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 15346006  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  15346007 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactgaaacgcgacggtatcttga 15346060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 15713618 - 15713871
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15713618 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 15713717  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15713718 gatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 15713817  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  15713818 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacgatatcttga 15713871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 10908778 - 10908525
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10908778 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtcatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 10908679  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10908678 gatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 10908579  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10908578 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 10908525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 15400079 - 15400332
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15400079 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctgcctttgagcggtatg 15400178  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  15400179 gatgtaattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagtaagtcagtgcatttttcttccgtcgaagagaagagtggtg 15400278  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15400279 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 15400332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 10008168 - 10007915
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10008168 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgcgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 10008069  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10008068 gatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 10007969  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10007968 cagagtttttatctactaagcaactgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 10007915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 15358651 - 15358398
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15358651 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctgcctttgagcggtatg 15358552  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15358551 gatgtaattctgggtatgaactagttagagtgcaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttttcttccgtcgaagaggagagtggtg 15358452  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15358451 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacacgatggtatcttga 15358398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24185758 - 24185505
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24185758 gggtttggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 24185659  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  24185658 gatgtgattctgggtatgaattggttggagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgccgaagaggaaagtggtg 24185559  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  24185558 cagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgtgatggtattttga 24185505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15065639 - 15065400
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15065639 gggttcggtgactacttctctcgtttgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 15065540  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15065539 gatgtgattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagaaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 15065440  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacg 240  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15065439 cagagttcttatctaccaagcagctgaagcaactggaacg 15065400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 14874130 - 14874383
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14874130 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaaagttctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 14874229  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||  |||| || || ||||||||||||| |||||    
T  14874230 tatgtgattctgggtatgaactggttcgagtagaaccatgttcatattaattattttagcaagtcagtgtatttctcctcagtcgaagaggaaattggtg 14874329  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  14874330 cagagttcttgtttactaagcagctgaagcaactggaacgtgatggtatattga 14874383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 16804509 - 16804762
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16804509 gggtttggtgactacttctctcgtatgcttgcgatgtcttctgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 16804608  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| |||| ||||| |||| ||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16804609 gatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattattttaccaagtcagtgtatttctcttccgttgaagaggaaagtggtg 16804708  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16804709 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttga 16804762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 60 - 243
Target Start/End: Original strand, 26190937 - 26191120
Alignment:
Q  60 attttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttag 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26190937 attttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctaggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttag 26191036  T
Q  160 caagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcga 243  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26191037 caagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcga 26191120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16694732 - 16694479
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  16694732 gggttctgtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtttg 16694633  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||| | ||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| || |  |||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  16694632 gatttaattatgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcaatgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtg 16694533  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16694532 cagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttga 16694479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 15262197 - 15261953
Alignment:
Q  2 ggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgg 101  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  15262197 ggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatgg 15262098  T
Q  102 atgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgc 201  Q
    |||| || || ||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||    ||||| |||||||| ||    
T  15262097 atgtaatccttggtgtgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcagtgtatttttcttctactgaagaagaaagtggcgc 15261998  T
Q  202 agagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  15261997 agagtttttgtctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 15261953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 14578970 - 14579200
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  14578970 gggttcagtaactacttctatagtatgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgaaattgatttggtttgtttgcctttgagtggtatg 14579069  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| | ||  |||| ||||| |  |||||||||||||| |    
T  14579070 gatgtgattctaggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcg 14579169  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagca 231  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  14579170 cagaatttttatctactaagcagctgaagca 14579200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 17492417 - 17492166
Alignment:
Q  3 gttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgga 102  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| | |||||| |||| |||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17492417 gttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcccttgtttatgtttgatcgtgattttgagattgatttggtttgtctacctttgagtggtatgga 17492318  T
Q  103 tgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgca 202  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||  | ||  |||| ||||| |  |||||||||||||| ||     
T  17492317 tgtaattcttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaaatctgtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcg 17492218  T
Q  203 gagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||    
T  17492217 gagtttttgtctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggtattttga 17492166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Original strand, 12843666 - 12843895
Alignment:
Q  2 ggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgg 101  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||    
T  12843666 ggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtttatgtttgatcgtgattttgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggtatgg 12843765  T
Q  102 atgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgc 201  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| | ||  |||| ||||  |  |||||||||||||| ||    
T  12843766 atgtaatcctgggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttatgctgaagaggaaagtggcgc 12843865  T
Q  202 agagtttttgtctactaagcagctgaagca 231  Q
    | | || |||||||||||||||| ||||||    
T  12843866 ataattcttgtctactaagcagcagaagca 12843895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 18437596 - 18437457
Alignment:
Q  113 ggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgt 212  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||| ||| | ||  |||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |    
T  18437596 ggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatagtaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggtgcagagtttttat 18437497  T
Q  213 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatctt 252  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||    
T  18437496 ctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggaatctt 18437457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 15013320 - 15013497
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | | ||||| | |||| ||||| | ||| || |||||||| |||    
T  15013320 gggttcggtgactacttctctagtatgcttgaagtgtcctttgtcgatgtttggtagag-ttttgcagtggacttagtat-tctgccgttgagtggaatg 15013417  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    |||||||| || ||||||||||  |||||||  ||| | |||| ||| ||||||||||| ||||| || | |||||||||    
T  15013418 gatgtgatactaggtatgaactacttggagtttaactatgttcatataaattgttttagtaagacggtgcgtttttcttc 15013497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 12858046 - 12858290
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||| |||||| | ||| | || ||| | || ||||  ||||||    
T  12858046 gggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagtgactttgaagttgatcttgtatgtttgccgttgatgggtatg 12858145  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| ||  | || ||||||||||| ||||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||  |||||        
T  12858146 gatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgttttagtaagacggtacatttctcttctgttgaggaaaaaagtaaaa 12858245  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatg 245  Q
    | ||||| ||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||    
T  12858246 ctgagttcttgactactaagcagctgaaacaattagaacgtgatg 12858290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 12272916 - 12272737
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||| |||||||| |||| ||||  ||||||    
T  12272916 gggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatctagtttgtttaccgttgacgggtatg 12272817  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||| ||| | || ||||||||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  12272816 gatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagcaagacggtgcatttttcttc 12272737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 14291083 - 14291260
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||| | || ||| | || |||   ||||||    
T  14291083 gggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatcttgtatgtttgccgttgtcgggtatg 14291182  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttct 178  Q
    ||||||||| | || ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||||||    
T  14291183 gatgtgatttttgggatgaactggttagagtataaccatgttcatattaattgctttagtaagacggtgcatttttct 14291260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 31692736 - 31692981
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||| ||| |||| ||||  || |||    
T  31692736 gggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatg 31692835  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| ||| | || |||||||| || ||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||| || |||| ||    
T  31692836 gatgttatttttgggatgaactgattagagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtgttg 31692935  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 246  Q
    |||| ||  |  ||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||    
T  31692936 cagaattcctaactactaaacagttgaagcaattggagcgcgatgg 31692981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 41 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 31941441 - 31941236
Alignment:
Q  41 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacg 140  Q
    ||||||||||||||  | || |||||| | || ||||| ||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||||||||| ||||| ||||  |    
T  31941441 ttgtctatgtttggcagagactttgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgag 31941342  T
Q  141 ttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacg 240  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||  |  ||||||| ||| |||||||| |||| ||    
T  31941341 ttcatataaattgttttagcaagacagtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggagcagaattcctaactactaaacagttgaagcaattggagcg 31941242  T
Q  241 cgatgg 246  Q
    ||||||    
T  31941241 cgatgg 31941236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 13944602 - 13944423
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || ||||  |||||  | |||||||||||| | ||||||||| | || |||||||||||||| ||||  || |||    
T  13944602 gggttcagtgactacttctctagtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagagattttgaagtagacttagtttgtctaccgttgacgggaatg 13944503  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||| ||| | || ||||| ||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  13944502 gatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttaacaagactgtgcatttttcttc 13944423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Original strand, 11949499 - 11949665
Alignment:
Q  41 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacg 140  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  || |||||||| ||| | |  ||||||||||| ||||| ||||  |    
T  11949499 ttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgatgggaatggatgttatttttgcgatgaactggttcgagtataaccgag 11949598  T
Q  141 ttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 207  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||| || ||||| ||||||||    
T  11949599 ttcatatcaattgttttagcaagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggagcagagtt 11949665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 10417596 - 10417841
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||  | || ||||| |||||||| |||   || |||    
T  10417596 gggttcagtgactacttctctggtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagatttcgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgttggggatg 10417695  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| ||| | || ||||| ||||| ||||| |||   |||  |||||||||||||| |||||| || || |||||||| || ||||| || ||||| |    
T  10417696 gatgttattttcgggatgaattggttagagtataactgagtttgtattaattgttttaacaagacggtgcacttttcttctgtggaagaagagagtggag 10417795  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 246  Q
    |||||||| |  ||||||| ||| |||||||  ||||||| |||||    
T  10417796 cagagtttctaactactaaacagttgaagcagttggaacgagatgg 10417841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 198
Target Start/End: Original strand, 13969783 - 13969868
Alignment:
Q  113 ggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtgg 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||    
T  13969783 ggtatgaactggttggagtataaccatgttcatatcaattgctttaacaagacagtgcatttttcttccgccgaagaagagagtgg 13969868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 47126488 - 47126343
Alignment:
Q  35 tgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtaca 134  Q
    |||||| | |||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||| |    
T  47126488 tgtcctatatctatgtttggtagagattttgtaattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagtata 47126389  T
Q  135 accacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    | |  |||| ||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  47126388 atcgagttcatatcaactgctttagtaagacggtacatttctcttc 47126343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 12358078 - 12358257
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| || | ||||  ||||||    
T  12358078 gggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttagcgttgacgggtatg 12358177  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||| ||| | |  ||||||||||| ||||| ||||  |||| ||| |||||||||||||| || || |||||||||||    
T  12358178 gatgttatttttgcgatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaaaacggtgcatttttcttc 12358257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 17494224 - 17494045
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || |||| |||||| || ||| | | |||||| ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||    
T  17494224 gggttcagtaactaattctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatg 17494125  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
     |||| ||| | || ||||||||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||    
T  17494124 tatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagcaagacggtggatttttcttc 17494045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 10408512 - 10408367
Alignment:
Q  35 tgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtaca 134  Q
    |||||| | |||||||||||| | |||||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||| |    
T  10408512 tgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagtata 10408413  T
Q  135 accacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    | |  |||| ||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  10408412 atcgggttcatatcaactgctttagtaagacggtacatttctcttc 10408367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 228
Target Start/End: Original strand, 11888027 - 11888143
Alignment:
Q  113 ggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtaca-tttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 211  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||  ||  | ||| | ||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||    
T  11888027 ggtaagaactagttggagtataaccatgttcatattaattgttttaataaatcggtatattttttcttctgttgaagaagagagtggagcagagtttttg 11888126  T
Q  212 tctactaagcagctgaa 228  Q
     ||||||||||||||||    
T  11888127 actactaagcagctgaa 11888143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 246
Target Start/End: Original strand, 13318087 - 13318298
Alignment:
Q  35 tgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtaca 134  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||||  | ||| | || |||||||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||| ||||| |    
T  13318087 tgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggttgatcttgtatgtctaccgttgatgggtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtata 13318186  T
Q  135 accacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaact 234  Q
    |||  |||| ||| |||||||||| |||||| ||  |||||||||| |  ||||| || ||||| | ||||||  |  ||||||| ||| |||||||  |    
T  13318187 accgagttcatataaattgttttaacaagacggtgtatttttcttctgcggaagaagagagtggaggagagttcctaactactaaacagttgaagcagtt 13318286  T
Q  235 ggaacgcgatgg 246  Q
    |||||| |||||    
T  13318287 ggaacgagatgg 13318298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 16832079 - 16832258
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||||||||  | || ||||||||| | || ||||  || |||    
T  16832079 gggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatg 16832178  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    || || ||| | || ||||| ||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16832179 gacgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagtaagacggtacatttttcttc 16832258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 15230171 - 15230002
Alignment:
Q  11 actacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattc 110  Q
    ||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||| || | ||||||||| | ||| | || ||| | || || |  ||||||||||| ||      
T  15230171 actacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgttttgtagagattttgaagttgatcttgtatgtttgccgttaacgggtatggatgtaatct 15230072  T
Q  111 tgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    | || ||||||| ||| ||||| ||||  |||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15230071 ttgggatgaactagttagagtataaccgtgttcatatcaattgttttagtaagacggtacatttttcttc 15230002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 15236039 - 15235870
Alignment:
Q  11 actacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattc 110  Q
    ||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||| || | ||||||||| | ||| | || ||| | || || |  ||||||||||| ||      
T  15236039 actacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgttttgtagagattttgaagttgatcttgtatgtttgccgttaacgggtatggatgtaatct 15235940  T
Q  111 tgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    | || ||||||| ||| ||||| ||||  |||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15235939 ttgggatgaactagttagagtataaccgtgttcatatcaattgttttagtaagacggtacatttttcttc 15235870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 17188952 - 17188871
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgt 82  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||||||||| | || |||||||||    
T  17188952 gggttcagtgactacttctctcgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgaagtagacttagtttgt 17188871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 180
Target Start/End: Original strand, 12510077 - 12510213
Alignment:
Q  44 tctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttc 143  Q
    |||||||||||| | |||||||   | |||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| | || ||||| ||||| ||||| ||||  ||||    
T  12510077 tctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttc 12510176  T
Q  144 ttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
     ||| || || | ||| |||||||| |||||||||||    
T  12510177 atatcaactgctatagtaagacagtgcatttttcttc 12510213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 14575564 - 14575385
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||  |||||||| |||| ||||  ||||||    
T  14575564 gggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacctagtttgtttaccgttgacgggtatg 14575465  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||| ||| | || ||||||||||| || || ||||  | || ||||||||| ||||| |||||  | |||||||||||    
T  14575464 gatgtaatttttggaatgaactggttagattataaccgagctcgtattaattgctttagtaagacgatgcatttttcttc 14575385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 16378485 - 16378664
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || || ||||  |||||  | |||||||||||| | ||||||||  | || ||||||||| | || ||||  || |||    
T  16378485 gggttcagtaactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatatctatgtttggtagagattttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatg 16378584  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||| ||| | || ||||| ||||| ||||| ||||  |||| ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16378585 gatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaactgttttagtaagacggtacatttttcttc 16378664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 16825832 - 16826011
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||  ||||| | || |||||| | ||| | |||||| |||| ||||  ||||||    
T  16825832 gggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtctataattggtagagactttgaagtcgatcttgtttgtttaccgttgacgggtatg 16825931  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||||||| | || ||||||||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||| |||||  | |||||||||||    
T  16825932 gatgtgatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagtaagacgatgcatttttcttc 16826011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 24189882 - 24189703
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||||||||  | || ||||||| | ||||  |||  || |||    
T  24189882 gggttcagtgactacttttctcgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgaggtagacttagtttttttaccgctgacgggaatg 24189783  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||| ||| | || ||||| ||||| || || ||||  |||| ||| || || ||||||||||| || |||||||||||    
T  24189782 gatgttatttttggaatgaattggttagaatataaccgagttcatatcaactgctttagcaagacggtgcatttttcttc 24189703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Original strand, 18131937 - 18132103
Alignment:
Q  41 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacg 140  Q
    ||||||||||||||| | || | |||| | || ||||| ||| |||| ||||  ||||||||||| ||| |  | ||||| ||||| ||||| ||||  |    
T  18131937 ttgtctatgtttggtagagactatgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggtatggatgttattttttggatgaattggttagagtataaccgag 18132036  T
Q  141 ttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 207  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |  ||||| || ||||| ||||||||    
T  18132037 ttcatatcaattgctttagcaagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggagcagagtt 18132103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 28756863 - 28756718
Alignment:
Q  35 tgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtaca 134  Q
    |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||  | |||||||| ||||| || || |    
T  28756863 tgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctaccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagaatata 28756764  T
Q  135 accacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    | |  |||| ||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  28756763 atcgagttcatatcaactgctttagtaagacggtacatttctcttc 28756718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 8744941 - 8745120
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || ||||  |||||  | |||||||||||| | ||||||||| | || ||||||||| | ||  |||  || |||    
T  8744941 gggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagagattttgaagtagacttagtttgtttgccgctgacgggaatg 8745040  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||| ||| | || ||||| ||||| ||||| || |  |||| ||| ||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  8745041 gatgttatttttgggatgaattggttagagtataatcgagttcatatcaattgctttaacaagactgtgcatttttcttc 8745120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 14089139 - 14089072
Alignment:
Q  113 ggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  14089139 ggtatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagtaagacggtgcatttttcttc 14089072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 44779713 - 44779646
Alignment:
Q  113 ggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  44779713 ggtatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagtaagacggtgcatttttcttc 44779646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12180922 - 12180716
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || |||   | |||||| ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||| | |||| ||||  ||||||    
T  12180922 gggttcagtaactacttctcttgtttgtccaagatgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttctttaccgttgacgggtatg 12180823  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    | ||| ||  | || ||||||||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||| |||||||  || || | ||||||||| |  ||||| || ||||| |    
T  12180822 gttgttatctttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagcagaacggtgcttttttcttctgctgaagatgagagtggag 12180723  T
Q  201 cagagtt 207  Q
    |||||||    
T  12180722 cagagtt 12180716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 36)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16983820 - 16983567
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16983820 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 16983721  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16983720 gatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 16983621  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16983620 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 16983567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 17001580 - 17001327
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17001580 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 17001481  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17001480 gatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 17001381  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17001380 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 17001327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 9338162 - 9337909
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9338162 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 9338063  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9338062 gatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 9337963  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9337962 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 9337909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 9486796 - 9486543
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9486796 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 9486697  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9486696 gatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 9486597  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9486596 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 9486543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 22323205 - 22323458
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22323205 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 22323304  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22323305 gatgtgattttaggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 22323404  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22323405 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 22323458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 27220596 - 27220343
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27220596 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 27220497  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27220496 gatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacgtttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 27220397  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27220396 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 27220343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 44383433 - 44383686
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44383433 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 44383532  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44383533 gatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 44383632  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44383633 tagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 44383686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 21142904 - 21143157
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21142904 gggttcgatgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 21143003  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21143004 gatgtgattctaggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 21143103  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21143104 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 21143157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24712614 - 24712361
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24712614 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 24712515  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  24712514 gatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaaatcagtacatttctcttccgtcgaagaggagagtggtg 24712415  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24712414 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 24712361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 10871430 - 10871177
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10871430 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcgtttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 10871331  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10871330 gatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 10871231  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10871230 cggagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 10871177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 27373849 - 27373596
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  27373849 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgcctacctttgagcggtatg 27373750  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27373749 gatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtacatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 27373650  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  27373649 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactgaaacgcgacggtatcttga 27373596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Original strand, 24874616 - 24874866
Alignment:
Q  4 ttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24874616 ttcggtgactacttctctcgtatgtttcaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggat 24874715  T
Q  104 gtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcag 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24874716 gtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacattcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggagagtggtgcag 24874815  T
Q  204 agtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24874816 agtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 24874866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24264950 - 24264697
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24264950 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtttatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 24264851  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24264850 gatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 24264751  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24264750 cggagtttctatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 24264697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 41606249 - 41606501
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  41606249 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctt-gtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctatctttgagcggtatg 41606347  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41606348 gatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtctgtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 41606447  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41606448 cggagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 41606501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 11351574 - 11351804
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  11351574 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcgatatg 11351673  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11351674 gatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 11351773  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagca 231  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  11351774 cagagttcttatctaccaagcagctgaagca 11351804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24678067 - 24677814
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24678067 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 24677968  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||| ||||  |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  24677967 gatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttatagcaagtcagtgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtggtg 24677868  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    || |||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  24677867 caaagttcttatctaccaagcagctgaagcaactggaacacgatggtattttga 24677814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 24657521 - 24657774
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24657521 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 24657620  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||||| | |||||| ||| | ||||||||||| |||| ||| |||||||||||  || ||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  24657621 gatgtgattcttgatatgaattgggtagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagtcagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggag 24657720  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24657721 cagagttcttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttga 24657774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 21323129 - 21323382
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  21323129 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtgtg 21323228  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||| ||| || |||||||||||| ||||  |||| || || ||||||||||||||||| |    
T  21323229 gatgtgattctgggtatgaattggttgcaatacaaccatgttcatatgaactgttttagcaagtcagtgtatttctcctcagtcgaagaggaaagtggcg 21323328  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21323329 cagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttga 21323382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 24705345 - 24705598
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24705345 gggtttggtaactacttctctcgtatgtttgagatgccctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatt 24705444  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
     || ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24705445 aatatgattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 24705544  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24705545 cagagttcttatctaccaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttga 24705598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 23204894 - 23204641
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23204894 gggttcggtgactacttctctcgtatgctcgcgatgtcctttgtctatggatggtcgtgattttgtaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 23204795  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||  |||| |||||||  |||||||| |||| ||    
T  23204794 gatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggagagtgatg 23204695  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23204694 cagagttcttatctactaagcagttgaagcaaatggaacgcgatggtatcttga 23204641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 23105591 - 23105836
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  23105591 gggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctttgatcggtatg 23105690  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||| ||| ||| | ||  |||| ||||| |  |||||||||||||| |    
T  23105691 gatgtgtttctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttatagtaagtcggtgtatttctcttctgatgaagaggaaagtggcg 23105790  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||    
T  23105791 cagagtttttgtctactaagcagctgaagtagttggaacgtgatgg 23105836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 23029324 - 23029491
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23029324 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 23029423  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  23029424 gatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaagtcagt 23029491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 23074443 - 23074190
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23074443 gggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcttgattttgagattgatttggtttgtctacctttgagtggtatg 23074344  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||| ||| ||| | ||  |||| ||||| |  |||||||||||||| |    
T  23074343 gatgtaattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcacattaattgttatagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcg 23074244  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    || ||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||    
T  23074243 caaagtttttatctaccaagcagctgaagcagttagaacgtgatggtattttga 23074190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 45673875 - 45674012
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45673875 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcttttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgaatttagtttgtctacctttgagcggtatg 45673974  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaacca 138  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  45673975 gatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaacca 45674012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 22733637 - 22733867
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| | | |||||| ||||||||||||| |||||||||| | || ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  22733637 gggttcggtgactacttctcttgtgtgtataagatgtcccttgtctatgtttgatcgtgattttcagattgatttggtttgtctagctttgagtggtatg 22733736  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||  |||||||||| ||| ||| | ||   ||| ||||| |  |||||||||||||| |    
T  22733737 gatgtaattcttggtatgacctggttagagtacaaccatgttcacattaattgttatagtaagtcggtgtttttctcttctgctgaagaggaaagtggcg 22733836  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagca 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22733837 cagagtttttgtctactaagcagctgaagca 22733867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 24817703 - 24817930
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| | | ||||||||| |||||||||||| | |||||||| || ||||| |||||| | ||||||||| | |||    
T  24817703 gggttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtagagattttgagattgatttggtttgtttgcctttgagtagaatg 24817802  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||  |||||||||| ||  ||| | ||  |||||||||  |||||||| || ||||  |    
T  24817803 gatgtaattcttggtatgaactggttggagtgtaaccatgttcacattaattgttataataagtcggtgtatttttcttttgtcgaagaagagagtgcag 24817902  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaa 228  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||    
T  24817903 cagagttcttgtctactaatcaactgaa 24817930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 19817427 - 19817264
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||| || |||||| | ||||||| | |||| ||||| ||| | || |||||||| |||    
T  19817427 gggttcggtgactacttctctagtatgcttgaagtttcctttgtcgatatttggtagagattttgcagtggacttagtctgtttgccgttgagtgggatg 19817328  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaaga 164  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |  ||| | |||| ||||||||||||||| ||||    
T  19817327 gatgtgatactaggtatgaactggttggaatttaactatgttcatattaattgttttagaaaga 19817264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 23097881 - 23098060
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | |||||||   | || ||||| |||||||| ||||  ||||||    
T  23097881 gggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggtcgacttagtgtgtctaccgttgatgggtatg 23097980  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||| ||| | || ||||||||| | ||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23097981 gatgtcatttttggaatgaactgggtagagtataaccgtgttcatatcaattgttttagcaagacggtgcatttttcttc 23098060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 23113303 - 23113124
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||| |||| ||| | || ||||  ||||||    
T  23113303 gggttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagattttgaagttgatctagtatgtttgccgttgacgggtatg 23113204  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||| ||  | || ||||||||||| ||||| ||||  |||  ||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  23113203 gatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgtgtttatataaattgttttagtaagacgatacatttttcttc 23113124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23279322 - 23279150
Alignment:
Q  35 tgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtaca 134  Q
    ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||| ||||||| ||||| |    
T  23279322 tgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatggactggttagagtata 23279223  T
Q  135 accacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 207  Q
    |||  |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    ||||| |||||||| ||||||||    
T  23279222 accgagttcatatcaattgttttagcaagacggtgcatttttcttctacggaagaagaaagtggagcagagtt 23279150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 30208783 - 30208971
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||| || ||| || || || || ||||||||||| ||||||| | | ||||||| | |||| ||||| ||| | || |||||||| |||    
T  30208783 gggttcggtgactaattttctagtgtgcttaaagtgtcctttgtcgatgtttgatagagattttgcagtggacttagtctgtttgccattgagtgggatg 30208882  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaaga 189  Q
    |||||||| || ||||||||||  ||||| |  ||| | |||| ||||||||||||||| ||||| || | ||||||||| | ||||||    
T  30208883 gatgtgatactaggtatgaactaattggaatttaactatgttcatattaattgttttagaaagacggtgcgtttttcttctgccgaaga 30208971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 23274173 - 23273995
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  || |||    
T  23274173 gggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggaatg 23274074  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttctt 179  Q
    ||||| ||| | || ||| ||||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  23274073 gatgttatttttgggatggactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaagacggtgcatttttctt 23273995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 19716880 - 19717056
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || || |||| |||||| ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| | || ||||  ||||||    
T  19716880 gggttcagtaactacttctcttgtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttgccgttgacgggtatg 19716979  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttc 177  Q
    ||||| ||| | || ||||| ||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  19716980 gatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagtaagacggtgcatttttc 19717056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 12576925 - 12576754
Alignment:
Q  9 tgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgat 108  Q
    ||||||||||||| || || ||||  |||||  | |||||||||||| | ||||||||| | || ||||| ||| |||| ||||  || |||||||| ||    
T  12576925 tgactacttctctggtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagagattttgaagtagacttagtgtgtttaccgttgacggggatggatgttat 12576826  T
Q  109 tctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    | | || ||||| ||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  12576825 ttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttaacaagactgtgcatttttcttc 12576754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 254
Target Start/End: Original strand, 11351800 - 11351836
Alignment:
Q  218 aagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11351800 aagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttga 11351836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 27790208 - 27790141
Alignment:
Q  113 ggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  27790208 ggtatgaactggttggagtataaccgagttcatatcaattgctttaacaagactgtgcatttttcttc 27790141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 10346 - 10093
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10346 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 10247  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  10246 gatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgtttttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccctcgaagaggaaagtggtg 10147  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10146 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactgggacgcgatggtatcttga 10093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 53705 - 53452
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  53705 gggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttggtttgtctacctttgagcggtatg 53606  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53605 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 53506  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53505 caaagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 53452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 11447 - 11194
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  11447 gggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttggtttgtctacctttgagcggtatg 11348  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  11347 gatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggagagtggtg 11248  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11247 cagagtttttatctactaagcagctgaagcgactggaacgcgatggtatcttga 11194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 17915 - 17662
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  17915 gggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttggtttgtctacctttgagcggtatg 17816  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  17815 gatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggagagtggtg 17716  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  17715 cagagtttttatctactaagcagctgaagcgactggaatgcgatggtatcttga 17662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 113 - 231
Target Start/End: Original strand, 47952 - 48070
Alignment:
Q  113 ggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgt 212  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||    ||||| || ||||| |||||||| ||      
T  47952 ggtatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagtaagacggtgcatttttcttctacggaagaagagagtggagcagagttcttaa 48051  T
Q  213 ctactaagcagctgaagca 231  Q
    ||||||| ||| |||||||    
T  48052 ctactaaacagttgaagca 48070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22225 - 21972
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22225 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 22126  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  22125 gatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaaaaggaaagtggtg 22026  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  22025 cagagtttttatctactaagcagctgaagcaactgaaacgcgacggtatcttga 21972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 41133 - 40880
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41133 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 41034  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41033 gatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaaccacattcttataaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 40934  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40933 cagagtttttatctactaggcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 40880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 13450 - 13703
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  13450 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttatcaatggttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcgttatg 13549  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||  |||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  13550 gatgtgattttgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatataaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtg 13649  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  13650 cagaattcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgcgatggtattttga 13703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 3402 - 3149
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3402 gggttcgatgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 3303  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3302 gatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 3203  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3202 cgaagtttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 3149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 17138 - 16885
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17138 gggttcgatgactacttctctcgtatgtttaagatgccctttatctatgtttagtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 17039  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||| ||||  | || |||||||||||||||||||||||||    
T  17038 gatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccgtgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgtacttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 16939  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  16938 cagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaatgcgatggtattttga 16885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 3)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 36476 - 36229
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  36476 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatctagtttgtctacctttgagcggtatg 36377  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36376 gatgtgattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 36277  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 248  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36276 cagagttcttgtttaccaagcagctgaagcaactggaacgcgatggta 36229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 113 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 28944 - 28803
Alignment:
Q  113 ggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgt 212  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28944 ggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgt 28845  T
Q  213 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28844 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttga 28803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 3622 - 3517
Alignment:
Q  75 tagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacattt 174  Q
    |||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||  ||||||||||| || |||||    
T  3622 tagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattactttagcaagacggtgcattt 3523  T
Q  175 ttcttc 180  Q
    ||||||    
T  3522 ttcttc 3517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1459 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold1459
Description:

Target: scaffold1459; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 1358 - 1611
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1358 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 1457  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  1458 gatgtgattctgggtatgaattggttacagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccatcgaagaggaaagtggtg 1557  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
     ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  1558 tagagtttctatctactaagcagctgaagcaactgcaacgcgatggtattttga 1611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 8236 - 7983
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8236 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcattgtccgttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 8137  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  8136 gatgtgattctgggtatgaattggttggagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgccgaagaggatagtggtg 8037  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  8036 cagagttcttatctactaagcagctgaagcaaatggaacgtgatggtattttga 7983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 37146 - 37399
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  37146 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgatatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcaagatggacttagtttgtctacctttgagcggtatg 37245  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||  |||| || || |||||||||||||||||||    
T  37246 gatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcctcagtcgaagaggaaagtggtg 37345  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37346 cagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttga 37399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26330 - 26100
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| | | ||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| |||    
T  26330 gggttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtcgagactttgaaattgatttggtttgtttgcctttgagtggaatg 26231  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||  ||| | ||| |||||||||| ||  |||| || ||||| |    
T  26230 gatgtaatccttggtatgaactggttggagtataaccatgttcatattaattgttttaataagtcggtatatttttcttctgttaaagaagagagtgggg 26131  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagca 231  Q
    | ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  26130 cggagtttttgactactaagcagctaaagca 26100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 35041 - 35293
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  35041 gggttcggtgactacgtctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttaagcggtatg 35140  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||  |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  35141 gatgtga-tctgggtataaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtggtg 35239  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35240 cagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttga 35293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 41610 - 41357
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  41610 gggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgaaattgacttagtttgtttacctttgagtggtatg 41511  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| || || | |||||| | ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| | ||  |||| ||||| |  |||||||||||||| |    
T  41510 gatgtaatccttgatatgaatttgttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcg 41411  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||| |||||||    
T  41410 cagagttcttgtctactaagcagctgaagcaattagaatgtgatggaatcttga 41357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 75330 - 75077
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  75330 gggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgaaattgacttagtttgtttacctttgagtggtatg 75231  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| || || | |||||| | ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| | ||  |||| ||||| |  |||||||||||||| |    
T  75230 gatgtaatccttgatatgaatttgttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcg 75131  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||| |||||||    
T  75130 cagagttcttgtctactaagcagctgaagcaattagaatgtgatggaatcttga 75077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 17392 - 17645
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  17392 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcgatatg 17491  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17492 gatgtgattcttggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtatatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 17591  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  17592 cagagttcttatctactaagaagctgaagcaattggaacgcgatggtattttga 17645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 195164 - 195412
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||    
T  195164 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggacgtgatttcgagatggatttagtttctctacctttgagcggtgtg 195263  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||  ||||||||||| |||||| ||||  |||| || || |||||||||||||||||||    
T  195264 gatgtgattctgggtatgaactgattgcaatacaaccatgttcacattaattgtttcagcaagtcagtgtatttctcctcagtcgaagaggaaagtggtg 195363  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtat 249  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  195364 cagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaattagaacgcgatggtat 195412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 24284 - 24096
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||| | ||||  |||| ||| |  | |||||||| |||    
T  24284 gggttcagtgactacttctctagtatgcctgaagtgtcctttgtcgatgtttggtagagattttgtagtggacctagtctgtttgtcgttgagtgggatg 24185  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaaga 189  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || | ||||||||| | ||||||    
T  24184 gatgtgatactaggtatgaactggttggagtttaaccatgttcatattaattgctttagaaagacggtgcgtttttcttctgccgaaga 24096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 10484 - 10737
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10484 gggttcggtaactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 10583  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||| ||||| ||||||||||||| ||||  |||| || || |||||||||||||||||||    
T  10584 gatgtaattctgggtatgaattggttagagtacaatcatgttcatattagttgttttagcaagtcagtgtatttctcctctgtcgaagaggaaagtggtg 10683  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10684 cagagttcttgtctactaagaagctgaagcaactggaacgcgatggtatattga 10737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 29254 - 29507
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  29254 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacatttgagcggtatg 29353  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29354 gatgtgattctggatatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtg 29453  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  29454 cagagttcttatctactaagcagctgaagaaactggagcgcgatggtattttga 29507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 21582 - 21329
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21582 gggttcggtgactacttatctcgtatgtttgaaatttcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 21483  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||  |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  21482 gatgtgattctgcgtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtggtg 21383  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  21382 cagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaacaggaacgcgatggtatattga 21329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 37006 - 36753
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37006 gggttcggtgactacttatctcgtatgtttgaaatttcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 36907  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||  |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  36906 gatgtgattctgcgtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcctccgtcgaagaggaaagtggtg 36807  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  36806 cagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaacaggaacgcgatggtatattga 36753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 50671 - 50919
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50671 gggttcagtgactacttctctcatatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 50770  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||  |||| || || |||||||||||||||||||    
T  50771 gatgtgattatgggtatgaactggttaaaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcctcagtcgaagaggaaagtggtg 50870  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtat 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50871 cagagttcttgtctactaagcagctgaagcaactagaacgcgatggtat 50919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 42666 - 42497
Alignment:
Q  11 actacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattc 110  Q
    ||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| |||     
T  42666 actacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccattgacaggtatggatgtaattt 42567  T
Q  111 tgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    | || ||||||||||| ||||| ||||  |||| ||||||||| ||||| ||| | || |||| ||||||    
T  42566 ttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatattaattgctttagtaagccggtgcattattcttc 42497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 5)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 31861 - 31609
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  31861 gggttcggtaactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgatatggatttagtttgtctacctttgagcggtttg 31762  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||   ||| || || |||||||||||||||||||    
T  31761 gatgtgattctaggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtaagt-gttttctcctctgtcgaagaggaaagtggtg 31663  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  31662 cagagttcttgtctactaagcagctgatgcgactggaacgcgatggtattttga 31609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 10564 - 10817
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10564 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttaactatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 10663  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||  |||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  10664 gatgtgattatgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatataaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtg 10763  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    || | || || ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  10764 caaaattcttatctactaagtagatgaagcaaatggaacgcgatggtattttga 10817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 37327 - 37075
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  37327 gggttctgttactacttctctcttatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgatatggatttagtttgtctacctttgagcggtttg 37228  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||   ||| || || |||||||||||||||||||    
T  37227 gatgtgattctaggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtaagt-gttttctcctctgtcgaagaggaaagtggtg 37129  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  37128 cagagttcttgtctactaagcagctgatgcgactggaacgcgatggtattttga 37075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 13219 - 13472
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13219 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttaactatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 13318  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||  |||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  13319 gatgtgattatgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatataaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgctgaagaggaaagtggtg 13418  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    || | || || ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  13419 caaaattcttatctactaagtagatgaagcaaatggaacgcgatggtattttga 13472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 54615 - 54363
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54615 gggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttttctatgtttgatcgtgattttgagatggatttagtttgtttacctttgagtggtatg 54516  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| | ||  |||| ||||| |  |||||||||||||| |    
T  54515 gatgtgattcttggcatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcg 54416  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||| ||||| ||||||    
T  54415 cagagtttttgtctactaagcagttgaagcagttagaacgtgatggaatcttg 54363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 11682 - 11935
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  11682 gggttcggtgactacttgtctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttagtcgtgattttgaaatgaatttagtttgtctacccttgagcggtatg 11781  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  11782 gatgtgattatgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttctgtcgaagaggaaagtggtg 11881  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
     |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  11882 tagagttcttatctactaagcagctgaagtaactggaacgcgatggtattttga 11935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 154; Significance: 9e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 12641 - 12388
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||  | |||||||||||||||    
T  12641 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagattgatatggtttgcttgcctttgagtggtatg 12542  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    || || ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||  |||| || |||||| |||||||||||||||    
T  12541 gacgtcattcttggtctgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcctccgtcaaagaggaaagtggtg 12442  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12441 cagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaactagaacgcgatggtattttga 12388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 4)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 14402 - 14203
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14402 gggttcggtgactacttctctcgtatttttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 14303  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  14302 gatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatatcaattgttttagcaagtcagtgtatttttcttccgctgaagaggaaagtggtg 14203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 4883 - 4648
Alignment:
Q  11 actacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattc 110  Q
    ||||||||||| || ||||| | ||||||||||||| |||||||||  || |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |    
T  4883 actacttctcttgtgtgtttaacatgtcctttgtctttgtttggtcaagagtttgaaattgacttagtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatcc 4784  T
Q  111 tgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 210  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||   |||||| || ||||| ||||| || ||    
T  4783 tgggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcagtatatttttcttctaccgaagaagagagtggagcagaattctt 4684  T
Q  211 gtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 246  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  4683 gtctactaagcagctgaagcaattagaacgcgatgg 4648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 44753 - 44932
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||    
T  44753 gggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacaggtatg 44852  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||| ||| | || ||||||| ||| ||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  44853 gatgttatttttgggatgaactagttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaagacggtgcatttttcttc 44932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 180
Target Start/End: Original strand, 39693 - 39838
Alignment:
Q  35 tgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtaca 134  Q
    |||||| | |||||||||||| | |||||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||| |    
T  39693 tgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtata 39792  T
Q  135 accacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    | |  |||| ||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  39793 atcgagttcatatcaactgctttagtaagacggtacatttctcttc 39838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10764 - 10534
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  10764 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtccattgtctatgtttggtcgtgattttgaaattgatttagtttgtttacctttgagtggaatg 10665  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| ||||  |||| ||||| |  |||||||||||| | |    
T  10664 gatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaagtcagtgtatttctcttctgcggaagaggaaagtagcg 10565  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagca 231  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10564 tagagtttttgtctactaagcagctgaagca 10534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 871 - 1050
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| ||||||||||| || || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||||||||  | || |||||||||||||| ||||  || |||    
T  871 gggttcagtgactacttcccttgtttgtttgaggtgtcctctatctatgtttggtagggattttgaggtagacttagtttgtctaccgttgacgggaatg 970  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||| ||| | || ||||| ||||| ||||| ||||  |||| ||| || |  |||||||||||||| |||||||||||    
T  971 gatgtcatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatataaactactttagcaagacagtgcatttttcttc 1050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 80 - 254
Target Start/End: Original strand, 8146 - 8320
Alignment:
Q  80 tgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttctt 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  8146 tgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaaccacgttcttattcattgttttagcaagtcagtgcatttctctt 8245  T
Q  180 ccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8246 tcgttgaagaggaaagtggtgcagagtttttatctactaagcagctgaagaaactggaacgcgatggtatcttga 8320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 25038 - 25268
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25038 gggttcggtgactacatctcttgtgtgtttaagatgtcctttatctatgtttgatcgtgattttgagatggatttagtttgtttacctttgagtggtatg 25137  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||||||| ||| ||| | ||  |||| ||||| |  |||||||||||||| |    
T  25138 gatgtgattctgggtatgaactagttagagtacaaccatgttcacattaattgttatagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcg 25237  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagca 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25238 cagagtttttgtctactaagcagctgaagca 25268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18628 - 18400
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  18628 gggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgattgtgattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggtatg 18529  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| | ||  |||| ||||| |  |||||||||||||| |    
T  18528 gatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcg 18429  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaag 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18428 cagagtttttgtctactaagcagctgaag 18400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 23859 - 24103
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  23859 gggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgttctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatg 23958  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||| |  |||||||||||||| |    
T  23959 gatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtatatttttcttctgctgaagaggaaagtggcg 24058  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatg 245  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  24059 cagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaattagaacgtgatg 24103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 151545 - 151294
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||| | | |||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | || ||||||||| |||  ||||  ||||||    
T  151545 gggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttggtagagacattgaagtcgacttagtttgtttacagttgacgggtatg 151446  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| ||| | || ||||||||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||| || ||||| |    
T  151445 gatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggag 151346  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatctt 252  Q
    |||||||  | ||||| || ||| |||||||  |||| || ||||| |||||    
T  151345 cagagttcctatctacgaaacagttgaagcagttggagcgtgatggaatctt 151294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 6091 - 5846
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  6091 gggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtcaatgtttggtcgagatgttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatg 5992  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||| | ||  |||||||||| || ||||| |||||||| |    
T  5991 gatgtaatcctgggtatgaactggttagagtgcaacaacgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttttcttcggttgaagaagaaagtggag 5892  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 246  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  5891 cagagttcttatctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 5846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 15091 - 14922
Alignment:
Q  11 actacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattc 110  Q
    ||||||||||| || ||| | |  ||||| |||||||||||| || | ||||||||| | || ||||||||| | || ||||  ||||||||||| |||     
T  15091 actacttctctagtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttcgtagagattttgaagtcgacttagtttgtttgccgttgatgggtatggatgttattt 14992  T
Q  111 tgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    | || ||||| ||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  14991 ttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagtaagacggtgcatttttcttc 14922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 152059 - 151814
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  152059 gggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagattgatttggtttgtttaccttttagtggtatg 151960  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||| ||| ||| | ||  ||||  |||| |  |||||||||||||| |    
T  151959 gatgtgattcttggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttatagtaagtcggtgtatttcgcttctgctgaagaggaaagtggcg 151860  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  151859 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcagttggaacgtgatgg 151814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 252
Target Start/End: Original strand, 47309 - 47541
Alignment:
Q  2 ggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgg 101  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| |  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |           
T  47309 ggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaaggtgtcttttgtctatgtttgatcgtgattttgaaattgatttggtttgtctacctttgaat------- 47401  T
Q  102 atgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgc 201  Q
               |||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||||||||| ||| || |  |||| ||||| |  |||||||||||||| ||    
T  47402 -----------ggtatgaactggttagagtacaatcatgttcacattaattgttttagtaagtcaatgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgc 47490  T
Q  202 agagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatctt 252  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||    
T  47491 agagttttagtctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggaatctt 47541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 77 - 254
Target Start/End: Original strand, 1907 - 2084
Alignment:
Q  77 gtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacattttt 176  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| | ||  ||||||    
T  1907 gtttgtttccctttgagtggtatggatgtaatccagggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtattttt 2006  T
Q  177 cttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||| |  ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||| ||||    
T  2007 cttctgctgaagaagacagtgacgcagagttcttatctactaaacagctgaagcaattagaacgtgatggtattttga 2084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 30900 - 30938
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcc 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30900 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcc 30938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 41 - 179
Target Start/End: Original strand, 164767 - 164905
Alignment:
Q  41 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacg 140  Q
    ||||||||||||||| | || ||| |  | |||||||| ||| |||| ||||  || || ||||| ||| | || ||||||||||| ||||| ||||  |    
T  164767 ttgtctatgtttggtagggactttcaggtcgatttagtgtgtttaccgttgacgggaatagatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgag 164866  T
Q  141 ttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttctt 179  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  164867 ttcatatcaattgttttagcaagacggtgcatttttctt 164905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 107 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 9812 - 9665
Alignment:
Q  107 attctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagt 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9812 attctgggtatgaactggttagagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagtcagtgcatttctcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagt 9713  T
Q  207 ttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9712 ttttatctactaagcagctgaagcaactggaacgcgacggtatcttga 9665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 24271 - 24501
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||   || ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  24271 gggttcggtgactacttctcttgtgcgtttgagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttaggattgatttggtttgtttacctttgagtggtatg 24370  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||  | ||  |||| ||||| |  |||||| |||||||||    
T  24371 gatgtgattcttggcatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaaatcggtgtatttctcttctgctgaagagaaaagtggtg 24470  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagca 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24471 cagagtttttgtctactaagcagctgaagca 24501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 10098 - 10276
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||| | | |||||| |||||||||||| || | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||    
T  10098 gggttcagtaactacttctctagtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttagtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatg 10197  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttctt 179  Q
    ||||| ||| | || ||||||||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  10198 gatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaagacggtgcatttttctt 10276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3576 - 3349
Alignment:
Q  4 ttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggat 103  Q
    |||||| |||| |||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3576 ttcggtaactatttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgaaattgatttggtttgtctacctttgagtggtatggat 3477  T
Q  104 gtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcag 203  Q
    || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| | ||  |||| ||||| |  |||||||||||||| ||||    
T  3476 gtaattcttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgcggaagaggaaagtggcgcag 3377  T
Q  204 agtttttgtctactaagcagctgaagca 231  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  3376 agtttttatctactaaacagctgaagca 3349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 60 - 254
Target Start/End: Original strand, 15379 - 15573
Alignment:
Q  60 attttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttag 159  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  15379 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctaggtatgaattggttagagtacaaccatgttcatattaactgttttag 15478  T
Q  160 caagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||| | ||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15479 caagtcggtgtatttctctttcgtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttatctaccaagcagctgaagcaactggaacgtgatggtattttga 15573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8928 - 8706
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8928 gggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgattgtgattttgagatggatttagtttgtttacctttgagtggtatg 8829  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||| ||| ||| | ||  |||| ||||| |  |||||||||||||| |    
T  8828 gatgtgattcttggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttatagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcg 8729  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcag 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  8728 cagattttttgtctactaagcag 8706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18065 - 17902
Alignment:
Q  60 attttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttag 159  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||| |||    
T  18065 attttgagatggatttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttatag 17966  T
Q  160 caagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcag 223  Q
     ||| | ||  |||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  17965 taagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagattttttgtctactaagcag 17902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 82 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 726 - 554
Alignment:
Q  82 tctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttcc 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||  |||| || ||     
T  726 tctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgttttagcaagtcagtgaatttctcctca 627  T
Q  182 gtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  626 gtcgaagaggaaagtggtgcagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtattttga 554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 230
Target Start/End: Original strand, 13807 - 14034
Alignment:
Q  3 gttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatgga 102  Q
    ||||||||||||||||||| || || || | |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  13807 gttcggtgactacttctcttgtgtgattaagatgtccattgtctatgtttggtcgagattttaaaattgatttagtttgtttacctttgagtggaatgga 13906  T
Q  103 tgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgca 202  Q
    ||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||| |  |||||||||||||| |||    
T  13907 tgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcagtgtatttttcttctgctgaagaggaaagtggcgca 14006  T
Q  203 gagtttttgtctactaagcagctgaagc 230  Q
     | || ||||||||||||||||||||||    
T  14007 taattcttgtctactaagcagctgaagc 14034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 252
Target Start/End: Original strand, 111241 - 111484
Alignment:
Q  9 tgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgat 108  Q
    ||||||||||||| || ||||| | ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  111241 tgactacttctcttgtgtgtttaagatgccctttgtttatgtttgatcgtgattttgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtgat 111340  T
Q  109 tctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttt 208  Q
    ||| || ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| | ||  |||| ||||| |  ||| |||||||||| |||||||||    
T  111341 tcttggcatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaaaaggaaagtggcgcagagttt 111440  T
Q  209 ttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatctt 252  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||    
T  111441 ttgtctactaagcagctgaagcagttagaacgtgatggaatctt 111484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 17856 - 17611
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  17856 gggtttggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagactttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatg 17757  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| || || |||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||   ||| | ||  ||||||||||    | ||| |||||||| |    
T  17756 gatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaatcatgttcatattaattgttttgttaagtcggtgtatttttcttctactgtagaagaaagtggag 17657  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 246  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  17656 cagagtttttgtctactaagtagctgaagcaattagaacgcgatgg 17611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4412 - 4182
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  4412 gggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatcgatttggtttgtttacctttgagtggtatg 4313  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
     |||||||||| || |  || ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| | ||  |||| ||||| |  ||||||||||||||      
T  4312 aatgtgattcttggcaaaaattggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggca 4213  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagca 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4212 cagagtttttgtctactaagcagctgaagca 4182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 8201 - 7948
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  8201 gggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagattcatttggtttgtctaccgttgagtgctatg 8102  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||  | ||  |||| ||||| |  |||||||||||||| |    
T  8101 gatgtaattcttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaattctgtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcg 8002  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||    
T  8001 cagagtttttgtcaattaagcagctgaagcagttagaacgtgatggtattttga 7948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 216746 - 216991
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  216746 gggttcggtgactacttctcttgtgtgtttcagatgtcctttgtctatgattggtcgagattttaaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatg 216845  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| | ||  |||||||||| |  |||| ||||||||| |    
T  216846 gatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttttcttctgctgaagcggaaagtggcg 216945  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 246  Q
    || | || |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  216946 caaaattcttgtctactaagcagctgaaacaattagaacgcgatgg 216991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 104205 - 103960
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||| ||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| |||    
T  104205 gggttaggtaactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggcatg 104106  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||| | ||  |||| ||||| |  |||||||||||||| |    
T  104105 gatgtaatcatgggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattacttgttttagcaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcg 104006  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  104005 cagagtttttgtctaccaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 103960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 14592 - 14837
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  14592 gggttcggtgactacttctcttgtgtatttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatg 14691  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    || || || || || ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||   ||  |||||||||| |  |||||||||||||| |    
T  14692 gaagtaatccttggaatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagttggtgtatttttcttctgctgaagaggaaagtggcg 14791  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 246  Q
    || | || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  14792 cataattcttgtctactaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 14837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 6851 - 6606
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| |||    
T  6851 gggtttggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggaatg 6752  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| | ||  |||| ||||| |  ||||||||||||||      
T  6751 gatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggca 6652  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 246  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  6651 cagagttcttatctaccaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 6606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 13981 - 13736
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| |||    
T  13981 gggtttggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggaatg 13882  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| | ||  |||| ||||| |  ||||||||||||||      
T  13881 gatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggca 13782  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 246  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  13781 cagagttcttatctaccaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 13736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 495998 - 495753
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  495998 gggttcggtgactacttctcttgtgtttttaagatgttctttgtctatgtttggtcgagatttttaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatg 495899  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| | ||  ||||||||||    ||||| |||||||| |    
T  495898 gatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcatattaattgttttagtaagtcggtttatttttcttcttctgaagatgaaagtggcg 495799  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 246  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  495798 cagagttcttgtctaccaagcagctgaagcaattagaacgtgatgg 495753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 441631 - 441500
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| | | ||||||||| |||||||||||| | |||||| | || ||||| |||||| | |||| |||||| |||    
T  441631 gggttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtagagatttttagattgatttggtttgtttgccttagagtggaatg 441532  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagta 132  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  441531 gatgtaattcttggtatgaattggtaggagta 441500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 165
Target Start/End: Original strand, 452651 - 452703
Alignment:
Q  113 ggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagac 165  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  452651 ggtatgaactggttggagtataaccatgttcatattaattgttttagtaagac 452703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 441496 - 441441
Alignment:
Q  173 ttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaa 228  Q
    |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  441496 ttttcttctgtcgaagaagagagtggagcagagttcttgtctactaagcagctgaa 441441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 514679 - 514858
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | |||||||   | |||||||||||| |||| ||||  ||||||    
T  514679 gggttcagtaactacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatg 514778  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||||||| | || ||||| ||||| ||| | ||||  |||| ||| || || | ||| ||||| || |||||||||||    
T  514779 gatgtgatttttggaatgaattggttagagaataaccgagttcatatcaactgctatagtaagacggtgcatttttcttc 514858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1881 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold1881
Description:

Target: scaffold1881; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 806 - 973
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  806 gggttaggtaactacttctctcgtatgatagaaatgtcctttatatatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 905  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagt 168  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||| ||| |||||||| |||||| ||||    
T  906 gatgtgattctgggtatgaattggttagagtgcaaccatgttcatatcaattgtttcagcaagtcagt 973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 1426 - 1177
Alignment:
Q  5 tcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatg 104  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  1426 tcggtgactacttctcttgcgtgtttaagatgtcctttgtctatgcttgatcgtgattttgagattgatttggtttgtttacctttgagtggtacggatg 1327  T
Q  105 tgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcaga 204  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||| |||   ||  |||| ||||| |  |||||||||||||| | |||    
T  1326 tgattcttggcatgaactggttagagtacaaccatgtccatattaattgttttagtaagttggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgtaga 1227  T
Q  205 gtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  | ||||| ||||| |||||||    
T  1226 gtttttgtctactaagcagttgaagcagttagaacgtgatggaatcttga 1177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 246
Target Start/End: Original strand, 17683 - 17914
Alignment:
Q  9 tgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgat 108  Q
    ||||||||||||| || ||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  17683 tgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctt-gtctatgtttgatcgtgattttgagatggatttagtttgcttacctttgagtggtatggatgtgat 17781  T
Q  109 tctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttt 208  Q
    | | ||||||||||||||||||     ||| ||||  |||||||||| ||| ||| ||||  |||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||    
T  17782 tattggtatgaactggttggag-----ccatgttcacattaattgttatagtaagtcagtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagttt 17876  T
Q  209 ttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 246  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  17877 ttgtctactaagcagctgaagcagttggaacgtgatgg 17914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 40026 - 39791
Alignment:
Q  11 actacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattc 110  Q
    ||||||||||| || ||||| |  ||||| ||||||||||||||| | |||||||   | || ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| | |     
T  40026 actacttctcttgtctgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgtggtcgacttagtgtgtctaccgttgacaggtatggatgttagtt 39927  T
Q  111 tgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 210  Q
    | || ||||| ||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||  ||||| ||  ||| ||  ||||| ||    
T  39926 ttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatataaattgctttagtaagacggtgcatttttcttccgatgaagaagagggtgatgtggagttctt 39827  T
Q  211 gtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 246  Q
    |||||| || ||| |||| ||||| ||||| |||||    
T  39826 gtctacgaaacagatgaaacaactagaacgtgatgg 39791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 55796 - 56049
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || | |||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  55796 gggttcggtgactacttctcttgtgtgattaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgatttctaaattgatttggtttgtttacctttgagtggtatg 55895  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| || || ||||||||||||||  |||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| | ||  ||||  |||| |  |||||||||||||| |    
T  55896 gatgtaatccttggtatgaactggttaaagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaagtcggtgtatttcccttctgctgaagaggaaagtggcg 55995  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||  | ||||| |||||||| ||||    
T  55996 caaagtttttgtctactaaacagctgaagcagttagaacgtgatggtattttga 56049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 11206 - 11360
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  11206 gggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatggatttggtttgtctacctttcagtggtatg 11305  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgtt 155  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||    
T  11306 gatgtgattcttggtatgaactggttggaatacaaccatgttcacattaattgtt 11360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 14062 - 13865
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||| |||| |||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14062 gggttcggtgactacttctcttgtatgtttaagatgttctttgtctatttttgatcgtgactttgagattgatttggtttgtctacctttgagtggtatg 13963  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtgg 198  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| | ||  |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  13962 gatgtaattcttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgttgaagaggaaagtgg 13865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 146 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8855 - 8770
Alignment:
Q  146 attaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 231  Q
    |||||||||||||| ||  ||||  |||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8855 attaattgttttagtaaatcagtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttgtctaccaagcagctgaagca 8770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 15305 - 15532
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||| | || |||||| |||||||||||| |  ||||||| || ||||| |||||| | ||||||||||| |||    
T  15305 gggttcggtgactacttctttagtgtgtttaagatatcctttatctatgtttggtagatattttgagattgatttggtttgtttgcctttgagtggaatg 15404  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| || |||| ||||  |||||||||| |||||||| || ||||| |    
T  15405 gatgtaattcttggtatgaactggttggagtataaccatgttcacattaattgttataacaagtcagtgtatttttcttctgtcgaagaagagagtggag 15504  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaa 228  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15505 cagagttcttgtctactaagcagctgaa 15532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 119 - 1
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  119 gggtttggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttggtcatgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 20  T
Q  101 gatgtgattctgggtatga 119  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19 gatgtgattctgggtatga 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4561 - 4317
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||| | | |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  4561 gggttcggtgactacttcccttgtgtgtttaagaagtcctttgtctatgtttgatcatgattttgaaattgatttggtttgtttacctttgtgtggtatg 4462  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| ||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| | ||  |||| ||||| |  |||||||||||| | |    
T  4461 gatgtaattcttgtcatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagttgcg 4362  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatg 245  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||| | ||||| ||||    
T  4361 cagagttcttatctactaaacagctgaagcaattagaacgtgatg 4317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 2589 - 2726
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  2589 gggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatagatttggtttgtttacctttgagtggtatg 2688  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaacca 138  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  2689 gatgtgattcttggtatgaactggttggaatacaacca 2726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 23624 - 23851
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||||| | ||||| ||| |||||||||||| | |||||||| || ||||| |||||| | ||||||||||| |||    
T  23624 gggttcggcgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcatttatctatgtttggtagagattttgagattgatttggtttgtttgcctttgagtggaatg 23723  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| || |||| | ||  |||||||||| |||||| | || ||||| |    
T  23724 gatgtaattcttggtatgaactggttggagtataaccatgttcacattaattgttataacaagtcggtgtatttttcttctgtcgaataagagagtggag 23823  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaa 228  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23824 cagagttcttgtcaactaagcagctgaa 23851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 9677 - 9904
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| | | ||||||||| |||||||||||| | |||||||| || ||||| |||||| | ||||||||| | |||    
T  9677 gggttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtagagattttgagattgatttggtttgtttgcctttgagtagaatg 9776  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||  |||||||||| ||  ||| | ||  |||||||||  |||||||| || ||||  |    
T  9777 gatgtaattcttggtatgaactggttggagtgtaaccatgttcacattaattgttataataagtcggtgtatttttcttttgtcgaagaagagagtgcag 9876  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaa 228  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||    
T  9877 cagagttcttgtctactaatcaactgaa 9904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 704 - 934
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| ||||||||||| || || ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| | |||||| |||||||| ||||||||    
T  704 gggttctgtgactacttcacttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagattgatatggtttgtttacctttgggtggtatg 803  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||  |||||||||| ||| ||| | ||  |||| |||||    |||||||||||||| |    
T  804 gatgtgattatgggtatgaactggttagagtacatccatgttcacattaattgttatagtaagtcggtgtatttctcttctactgaagaggaaagtggcg 903  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagca 231  Q
     | ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  904 aaaagtttttatctacaaagcagctgaagca 934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5066 - 4838
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| | |  ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |  |||||||||| |||    
T  5066 gggttcggtgactacttctctagtgtgtctaaggtgtcctttgtcgatgtttggtcgagactttgaaattgatttagtttgtttgtctttgagtggaatg 4967  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |  ||| | ||| |||||||||| |  ||||| || ||||| |    
T  4966 gatgtaatccttggtatgaactggttggagtataaccatgttcatattaattgtttcaataagtcggtatatttttcttctgctgaagaagagagtggag 4867  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaag 229  Q
    || |||| ||| |||||||||||||||||    
T  4866 caaagttattgactactaagcagctgaag 4838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 960 - 793
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || || |||||| ||| |||||||||||||    
T  960 gggttcggtgactacttctgtcgtatgcttaaagtgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagattgaattggtttgtttacgtttgagtggtatg 861  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagt 168  Q
    ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| ||||    
T  860 gatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaattgttttagtaagtcagt 793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 778 - 630
Alignment:
Q  83 ctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccg 182  Q
    |||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| | ||||  |||||||||||||| ||| ||||  |||| ||||| |    
T  778 ctacgtttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaactatgttcacattaattgttttagtaagtcagtgtatttctcttctg 679  T
Q  183 tcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 231  Q
       ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  678 ctaaagaggagagtggcgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 40833 - 41049
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||  ||||||||| || ||||||||| || ||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  40833 gggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaatatgtccttt--ctatgtttgatcctgattttgagattgatatggtttgtttacctttgagtggtatg 40930  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||||| ||| | ||  |||| ||||| |  |||||||||||||| |    
T  40931 gatttaattcttggtatgaactggttagagtacaaccatgttcacattaaatgttttagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcg 41030  T
Q  201 cagagtttttgtctactaa 219  Q
    || ||||||||||||||||    
T  41031 caaagtttttgtctactaa 41049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1985 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1985
Description:

Target: scaffold1985; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 104 - 254
Target Start/End: Original strand, 1 - 151
Alignment:
Q  104 gtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcag 203  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||  |||| || || | ||||||||||||||||||||    
T  1 gtgattctgggtatgaattggttggagtacaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcatcagacgaagaggaaagtggtgcag 100  T
Q  204 agtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  101 agttcatatctactaagcagctgaagcaaatggaacgagatggtatattga 151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 254
Target Start/End: Original strand, 12573 - 12792
Alignment:
Q  34 atgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtac 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||| | ||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  12573 atgtcctttgtctatgtttgatcgtaattttgaaattgatttggtttgcttacctttgagtggtatggatataattcttggcatgcactggttagagtac 12672  T
Q  134 aaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaac 233  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| ||    ||  |||| ||||| |  ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||      
T  12673 aaccatgttcatattaattgttttagtaaattggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggtgcagag-ttctatctactaagcagctgaagcagt 12771  T
Q  234 tggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    | ||||| ||||| |||||||    
T  12772 tagaacgtgatggaatcttga 12792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 1967 - 1865
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| | |||||| |||||||||| ||||||    
T  1967 gggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagattgatatggtttgtttacctttgagcggtatg 1868  T
Q  101 gat 103  Q
    |||    
T  1867 gat 1865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 111
Target Start/End: Original strand, 8107 - 8217
Alignment:
Q  3 gttcggtgactacttctc--tcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8107 gttcggtgactacttctctctcgtatgtttgcgatgttctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatg 8206  T
Q  101 gatgtgattct 111  Q
    |||||||||||    
T  8207 gatgtgattct 8217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 4215 - 4394
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||| ||| || ||||| | |||||  ||||||||||||||| | || | |||| | ||  |||| ||| |||| || |  ||||||    
T  4215 gggttcagtaactacttatcttgtttgtttaagatgtcaattgtctatgtttggtagagaatatgaagtagaaatagtatgtttaccgttaaagggtatg 4314  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||| ||| | || ||||||||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  4315 gatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatatcaattgttttagtaagacggtacacttttcttc 4394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 15400 - 15258
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  15400 gggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctacgattggtcgagattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatg 15301  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttc 143  Q
    ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15300 gatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaaccatgttc 15258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 132 - 254
Target Start/End: Original strand, 27952 - 28074
Alignment:
Q  132 acaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 231  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  27952 acaaccatgttcatattaattgttttagcaagtcagtgtatttctcttccgtagaagaggaaagtggtgcagagttcttatctaccaagcagctgaagca 28051  T
Q  232 actggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||| ||||||||||||| ||||    
T  28052 actgaaacgcgatggtattttga 28074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 57940 - 58062
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| || |||    
T  57940 gggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagcggaatg 58039  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactg 123  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  58040 gatgtgatccttggtatgaactg 58062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 114 - 231
Target Start/End: Original strand, 19073 - 19190
Alignment:
Q  114 gtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtc 213  Q
    ||||||| |||||  |||| ||||  |||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |  ||||| || ||||| ||||||||  ||||    
T  19073 gtatgaattggttacagtataaccgagttcatatcaattgctttagcaagacggtgcatttttcttctgctgaagaagagagtggagcagagttcctgtc 19172  T
Q  214 tactaagcagctgaagca 231  Q
    ||| || ||| |||||||    
T  19173 tacgaaacagttgaagca 19190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0312 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0312
Description:

Target: scaffold0312; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 975 - 844
Alignment:
Q  24 tatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactg 123  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  975 tatgtttaagatgtcatttgtctatgtttgatagtgattttgagatggatttggtttgtctacatttgagtggtatggatgtgattcttggtatgaattg 876  T
Q  124 gttggagtacaaccacgttcttattaattgtt 155  Q
    |||||| |||||||| || |  ||||||||||    
T  875 gttggaatacaaccatgtgcacattaattgtt 844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 77 - 231
Target Start/End: Original strand, 6489 - 6643
Alignment:
Q  77 gtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacattttt 176  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||| || ||| | ||  |||| |    
T  6489 gtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttatagtacaaccatgttcatattaattgtttaagtaagtcggtgtatttct 6588  T
Q  177 cttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 231  Q
    |||| |  |||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  6589 cttctgctgaagaggaaagtggcgtagagttcttatctactaagcagctgaagca 6643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 21511 - 21743
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| || || ||||||||||| || |||||| | |||||||||||| | ||||||||||| |||    
T  21511 gggttcggtgactacttctctagtgtgtctgaagtgtccgttctcgatgtttggtcgagactttgaagttgatttagtttgtttgcctttgagtggaatg 21610  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttgga-gt-acaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtgg 198  Q
    ||| | || || ||||||| ||| ||||| || | ||||| |||  |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||| || ||||     
T  21611 gatctaatacttggtatgagctgcttggatgtaataaccatgtttatattaactgttttagtaagacggtacatttttcttctgctgaagaagagagtga 21710  T
Q  199 tgcagagtttttgtctactaagcagctgaagca 231  Q
     || ||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  21711 agctgagttcttgactactaagcagcttaagca 21743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 7214 - 7141
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatt 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  7214 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctgagattggtcgtgattttgaaatggatt 7141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Original strand, 83850 - 84035
Alignment:
Q  4 ttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggat 103  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||| | |||| ||||| ||  | || || ||||| ||||||    
T  83850 ttcggtgactacttctctagtatgcttgaagtgtcctttgtcgatgtttggtagagattttgcagtggacttagtctgcttgccgttaagtgggatggat 83949  T
Q  104 gtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaaga 189  Q
    ||||  || || |||||||||||| |||  ||| | ||||  |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  83950 gtgaaactaggaatgaactggttgaagtttaactatgttcacattaattgttttagaaagacagtgcgtttttcttctgtcgaaga 84035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 200794 - 200973
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||  ||||  ||||||||||||||| | ||||||||| | ||| |||| ||| | || ||||  ||||||    
T  200794 gggttcagtaactacttctctcgtttgtttgatttgtctgttgtctatgtttggtagagattttgaagttgatctagtatgtttgccgttgacgggtatg 200893  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  200894 gatgtaatctttgggatgaactggttggagtataaccatgttcatatcaattgttttagtaagacggtgcatttttcttc 200973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 325685 - 325440
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||| | | |||||  ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||| ||| |||| ||||  || |||    
T  325685 gggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtctgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatg 325586  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| ||| | || ||||||||||| ||||| ||||  |||| ||| |||| |||||| ||||| || ||||||||||| |  ||||| || ||||| |    
T  325585 gatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattattttagaaagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggag 325486  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 246  Q
    |||| ||  |  ||||||| ||| |||||||  |||| ||||||||    
T  325485 cagaattcctaactactaaacagttgaagcagttggagcgcgatgg 325440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 60717 - 60487
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||| |||| ||| | || |||   ||||||    
T  60717 gggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgtcgggtatg 60618  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| | || ||||||||||| ||||| ||||  |||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |  ||||| |||||||  |    
T  60617 gatgtgatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgctttagtaagacggtgcatttttcttctgctgaagaagaaagtgaag 60518  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagca 231  Q
    | ||||| ||| ||||||| ||| |||||||    
T  60517 ctgagttcttgactactaaacagttgaagca 60487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 180
Target Start/End: Original strand, 79264 - 79336
Alignment:
Q  108 ttctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| || | ||| ||||| ||||| ||||  || |||||||||||    
T  79264 ttcttggtatgaactggttggagtataaccatgtccatatcaattgctttagtaagatggtgcatttttcttc 79336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1530 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1530
Description:

Target: scaffold1530; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 561 - 355
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||    
T  561 gggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacaggtatg 462  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| ||| | || ||||||||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |  ||||| || ||||| |    
T  461 gatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgggttcatatcaattgctttagcaagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggag 362  T
Q  201 cagagtt 207  Q
    |||||||    
T  361 cagagtt 355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 181 - 411
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||| | | |||| | ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||    
T  181 gggttcagtaactacttctcttgtttgtataagatgtacgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatg 280  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||||||| | || ||||||||||| | ||| ||||  |||| ||||||||| |||||||| || || ||||||||||| |  ||||| || ||||| |    
T  281 gatgtgatttttgggatgaactggttagggtataaccgagttcatattaattgctttagcaaaacggtgcatttttcttctgctgaagaagagagtggag 380  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagca 231  Q
    | |||||  | |||||||| ||| |||||||    
T  381 cggagttcctatctactaaacagttgaagca 411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20792 - 20586
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  || |||    
T  20792 gggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggaatg 20693  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| ||| | || ||||||| ||| ||||| ||||  |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||| | |||||||| |    
T  20692 gatgttatttttgggatgaactagttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaagacagtgcatttttcttctgcggaacaagaaagtggag 20593  T
Q  201 cagagtt 207  Q
    |||||||    
T  20592 cagagtt 20586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 813 - 992
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||| || | || |||||| | || |||||| || | || ||||  ||||||    
T  813 gggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaaatgtccgttgtctatgtttagtagagactttgaagtcgacttagttggttttccgttgacgggtatg 912  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||| ||| | || ||||| ||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||| || |  || |||||||||||    
T  913 gatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagtaatatggtgcatttttcttc 992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 180 - 254
Target Start/End: Original strand, 52430 - 52504
Alignment:
Q  180 ccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  52430 ccgtcgaagaggaaagtggtgtagagttcttgtctaccaagcagctgaagcagctggaacgcgatggtatgttga 52504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 110588 - 110358
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | || |||||| |  |  |||||||| |||||||||  ||||||    
T  110588 gggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcaacctagtttgtttacctttgacgggtatg 110489  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| ||| | || ||||||||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |  ||||| || ||||| |    
T  110488 gatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagcaagacggtgcatttttcttctgcagaagaagagagtggag 110389  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagca 231  Q
    | |||||  | |||||||| ||| |||||||    
T  110388 ccgagttcctatctactaaacagttgaagca 110358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 11798 - 11630
Alignment:
Q  11 actacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattc 110  Q
    ||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||| | || ||| | |  |||   ||||||||||| |||     
T  11798 actacttctcttgtttgtttgagttgtcctttgtctatgtttggtagagattttgaagttgatcttgtatgtttgctgttgtcgggtatggatgtaattt 11699  T
Q  111 tgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttctt 179  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| || |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  11698 ttgggatgaactggttggagtataaccatgttcatatcaactgttttagtaagacagtgcatttttctt 11630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 1977 - 1813
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||| | || | ||||| ||  | || || ||||| |||    
T  1977 gggttcggtgactacttctttagtatgcttgaagtgtcctttgtcgatgtttggtagagattttgcagtgaacttagtctgcttgccattcagtgggatg 1878  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagac 165  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||  ||| | |||| ||| ||||||||||| |||||    
T  1877 gatgtgatactaggtataaactggttggagtttaactatgttcatatcaattgttttagtaagac 1813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 113 - 231
Target Start/End: Original strand, 114476 - 114594
Alignment:
Q  113 ggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgt 212  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |  ||||| || ||||  ||  ||||||||     
T  114476 ggtatgaactggttggagtataaccatgtttatattaattgttttagtaagacggtgcatttttcttctgctgaagaagagagtgaagctaagtttttga 114575  T
Q  213 ctactaagcagctgaagca 231  Q
    |||||||||||||||||||    
T  114576 ctactaagcagctgaagca 114594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 2849 - 2668
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||| |||| ||| | || ||||  |||||     
T  2849 gggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgacgggtata 2750  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccg 182  Q
    ||||| ||| | || ||||||||||| ||||| ||||  |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  2749 gatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatattaattgctttagtaagacggtgcatttttcttccg 2668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 53749 - 53994
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || |||| |||||| ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| | || ||||  ||||||    
T  53749 gggttcagtgactacttctcttgtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttgccgttgacgggtatg 53848  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| ||| | || ||||| | ||| ||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |  ||||| || ||||  |    
T  53849 gatgttatttttggaatgaattagttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagtaagacggtgcatttttcttctgctgaagaagagagtgaag 53948  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 246  Q
      ||||| |||||||| || ||| |||| ||||| ||||| |||||    
T  53949 ttgagttcttgtctacgaaacagatgaaacaactagaacgtgatgg 53994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 180
Target Start/End: Original strand, 31115 - 31182
Alignment:
Q  113 ggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  31115 ggtatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagtaagacggtgcatttttcttc 31182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 94220 - 94465
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||| |||||||| |||   || |||    
T  94220 gggttcagtaactacttctctggtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaagtcgatttagtgtgtctaccgttgttggggatg 94319  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| ||| | || ||||| ||||| || || ||||  ||   |||||||||||||| |||||| || || |||||||| || ||||| || ||||| |    
T  94320 gatgttattttcgggatgaattggttagaatataaccgagtctgtattaattgttttaacaagacggtgcacttttcttctgtggaagaagagagtgggg 94419  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 246  Q
    |||||||| |  ||||||| ||| |||||||  ||||||| |||||    
T  94420 cagagtttctaactactaaacagttgaagcagttggaacgagatgg 94465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 115540 - 115343
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||| | |||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||    
T  115540 gggttcagtgactacttctcttgtttgtttgatatgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtagatttagtttgcttaccactgacggggatg 115441  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtgg 198  Q
    ||||| ||  | || ||||| ||||| ||||| ||||  |||| ||| || || || | |||||| || ||||||||||| | |||||| || |||||    
T  115440 gatgttatatttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaactgcttcaacaagaccgtgcatttttcttctgccgaagaagagagtgg 115343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 88 - 180
Target Start/End: Original strand, 8459 - 8551
Alignment:
Q  88 tttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  8459 tttgagtggaatggatgtaatacttggtatgaactggttggagtataaccatgttcatattagttgttttagtaagacggtacattattcttc 8551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 88 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 7217 - 7125
Alignment:
Q  88 tttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  7217 tttgagtggaatggatgtaatacttggtattaactggttggagtataaccatgttcatattagttgttttagtaagacggtacattattcttc 7125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 41 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 1058 - 919
Alignment:
Q  41 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacg 140  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||| ||||| ||||  |    
T  1058 ttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgag 959  T
Q  141 ttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  958 ttcatatcaattgctttagcaagacggtgcatttttcttc 919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 11938 - 11759
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| |  | |||||  | ||| | |||||| | || ||||  ||||||    
T  11938 gggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagatactttgaggttgatcttgtttgtttgccgttgacgggtatg 11839  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||| ||| | || ||||||||||| ||||| ||||  |||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11838 gatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgctttagtaagacggtacatttttcttc 11759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 25194 - 25015
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||| | ||||||||| | || |||||||  ||||| |||||||||| |||| | ||||||||  |  | || |||||| |||| ||||  || |||    
T  25194 gggttcgataactacttctttggtttgtttgagttgtccgttgtctatgtatggtagagattttgaggttaacttggtttgtttaccgttgacgggaatg 25095  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||| || || ||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  25094 gatgtaatccttggtatgaactggttgaagtataaccatgttcatattaattgctttagtaagaccgtgcatttttcttc 25015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 180
Target Start/End: Original strand, 43755 - 43924
Alignment:
Q  11 actacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattc 110  Q
    ||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| |  | |||||| | ||| |||| ||| | || ||||  |||||| |||| |||     
T  43755 actacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagatactttgaactcgatctagtatgtttgccattgacgggtatgaatgtaattt 43854  T
Q  111 tgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    | || ||||||||||| ||||| ||||  |||| ||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||    
T  43855 ttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaatttctttagtaagacagtgcatttttcttc 43924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 41 - 180
Target Start/End: Original strand, 98949 - 99088
Alignment:
Q  41 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacg 140  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| | || ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||| ||||| ||||  |    
T  98949 ttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttgccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgag 99048  T
Q  141 ttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  99049 ttcatatcaattgttttagcaagacggtgcatttttcttc 99088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 175956 - 175787
Alignment:
Q  11 actacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattc 110  Q
    ||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||| | || ||| | || ||||  ||||||||||| ||      
T  175956 actacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagattttgaagtcgatcttgtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatct 175857  T
Q  111 tgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    | || ||||||||||| ||| | || |  |||| ||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  175856 ttgggatgaactggttagagaataatcgtgttcatatcaattgttttagtaagacgatacatttttcttc 175787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 5687 - 5550
Alignment:
Q  43 gtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgtt 142  Q
    ||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||| ||||| ||||  |||    
T  5687 gtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgggtt 5588  T
Q  143 cttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    | ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  5587 catatcaattgctttagcaagacagtgcatttttcttc 5550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 41434 - 41597
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||| ||||| | ||||| ||| |||||||||   ||||||| | |||| ||||| ||| | || |||||||| |||    
T  41434 gggttcggtgactacttctttattatgcttgaagtatcctt-gtcgatgtttggtatagattttgtagtggacttagtctgtttgccgttgagtgggatg 41532  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagac 165  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||  ||| | |||| |||  |||||||||| |||||    
T  41533 gatgtgatactaggcatgaactggttggagtttaactatgttcatatatattgttttagtaagac 41597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 129 - 254
Target Start/End: Original strand, 231 - 358
Alignment:
Q  129 agtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttt--tgtctactaagcagctg 226  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||| ||| ||| | ||  |||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  231 agtacaaccatgttcacattaattgttatagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcgcagagtttttttgtctaccaagcagctg 330  T
Q  227 aagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  331 aagcaactagaacgcaatggtattttga 358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 254
Target Start/End: Original strand, 7106 - 7238
Alignment:
Q  122 tggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagc 221  Q
    ||||||||||||||||| ||||  || ||||||| ||| ||| | ||  |||| ||||| |  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  7106 tggttggagtacaaccatgttcacatgaattgttctagtaagtcggtgtatttctcttctgctgaagaggaaagtggcggagaatttttgtctactaagc 7205  T
Q  222 agctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||||||  | ||||| |||||||| ||||    
T  7206 agctgaagcagttagaacgtgatggtattttga 7238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 1209 - 1345
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||| | | |||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||| ||||||||| |||| ||||  ||||||    
T  1209 gggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtggacttagtttgtttaccgttgacgggtatg 1308  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaacc 137  Q
    ||||| ||| | || ||||||||||| ||||| ||||    
T  1309 gatgttatttttgggatgaactggttagagtataacc 1345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 8388 - 8329
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 60  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  8388 gggttcggtgactacttctcttgtgtgtttgagatgtcctttgtctatgtttgatcgtga 8329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 3496 - 3675
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||| | |||||||||||| | ||||||||| | || ||||||||  ||||  |||  || |||    
T  3496 gggttcagtgactacttctcttgtttgtttgagatgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtagacttagtttgcttaccactgacagggatg 3595  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||||||  | || ||||| ||||| ||||| |||   |||| ||| || || ||||||||||| || |||||||||||    
T  3596 gatgtgatatttgggatgaattggttagagtataactgagttcatatcaactgctttagcaagaccgtgcatttttcttc 3675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 63845 - 64024
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||| |||| ||| | || |||   ||||||    
T  63845 gggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgttgggtatg 63944  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||||||| | || ||||||||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||| |||||  | |||||||||||    
T  63945 gatgtgatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagtaagacgatgcatttttcttc 64024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 49203 - 49382
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || |||||||  ||||  ||||||||||||||| | || |||||| | ||| |||| | | | || |||   ||||||    
T  49203 gggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtctgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatctagtatatttgccgttgtcgggtatg 49302  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||| ||| | || ||||||||||| ||||| ||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  49303 gatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatattaattgctttagtaagacagtgcatttttcttc 49382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 1157 - 991
Alignment:
Q  41 ttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacg 140  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||| ||| ||||| || |  |    
T  1157 ttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactagttagagtataatcgag 1058  T
Q  141 ttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtt 207  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |  ||||| || ||||| ||||||||    
T  1057 ttcatatcaattgctttagcaagacggtgcatttttcttctgctgaagaagagagtggagcagagtt 991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 7016 - 6838
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | || ||| || | || ||||| ||| |||| ||||  || |||    
T  7016 gggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttaaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatg 6917  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttctt 179  Q
    ||||| ||| | || ||||||||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  6916 gatgttatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgttttagcaagacggtgcatttttctt 6838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 228
Target Start/End: Original strand, 5328 - 5442
Alignment:
Q  114 gtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtc 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| |||||| ||| ||| | ||  |||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  5328 gtatgaactggttggagtataaccatgttcacattcattgttatagtaagtcggtgtatttttcttctgtcgaagaagatagtggagcagagttcttgtc 5427  T
Q  214 tactaagcagctgaa 228  Q
    ||||||  |||||||    
T  5428 tactaactagctgaa 5442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 11753 - 11608
Alignment:
Q  35 tgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtaca 134  Q
    |||||| | |||||||||||| | |||||||  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||| |    
T  11753 tgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagtata 11654  T
Q  135 accacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    | |  |||| ||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  11653 atcgggttcatatcaactgctttagtaagacggtacatttctcttc 11608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 26090 - 25845
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||| ||||||||||||||| | ||||||||  | || ||||| |||||||| ||||  || |||    
T  26090 gggttcagtaactacttctctagtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgatgggaatg 25991  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| ||| | || ||||| ||||| ||||| ||||  |||  ||| |||||||||| |||||| || || ||||||||    |||||  | ||||| |    
T  25990 gatgttattttcgggatgaattggttagagtataaccgagtttgtataaattgttttaacaagacggtgcacttttcttcttcggaagaacatagtggag 25891  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 246  Q
    |||||||| |  ||||||| ||| |||||||  ||||||| |||||    
T  25890 cagagtttctaactactaaacagttgaagcagttggaacgagatgg 25845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 29505 - 29252
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || |||||||| || || |||||||  ||||| ||||||||||||||| | || |||||  | ||| | || ||| | || ||||  ||||||    
T  29505 gggttcagtaactacttcacttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttgaggttgatcttgtatgtttgccgttgacgggtatg 29406  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| ||  | || ||||||||||| ||||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||  || || || || ||||  |    
T  29405 gatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgttttagtaagatggtacatttttcttatgttgaggaagagagtgaag 29306  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    | ||||| ||| ||||||| ||| |||||||  | ||||| ||||| |||||||    
T  29305 ctgagttcttgactactaaacagttgaagcagttagaacgtgatggaatcttga 29252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1615 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1615
Description:

Target: scaffold1615; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 254
Target Start/End: Original strand, 1244 - 1312
Alignment:
Q  186 aagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatcttga 254  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| |||||||| ||||    
T  1244 aagaggaaagtggcgcagagtttttgtctactaagtagctgaagcagttagaacgtgatggtattttga 1312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 4415 - 4643
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||| | || |||||||  ||||||||||||||||||||| | || |||||| | ||| | || ||| | || ||||  ||| ||    
T  4415 gggttcagtaactacttcttttgtttgtttgagttgtcctttgtctatgtttggtagagactttgaagttgatcttgtatgtttgccgttgacgggtttg 4514  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| || || || ||||||||||| || || ||||  |||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |  || || ||||||   |    
T  4515 gatgtaatccttgggatgaactggttagaatataaccgtgttcatatcaactgttttagtaagacggtacatttctcttctgctgaggaagaaagtaaag 4614  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaag 229  Q
    | ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  4615 ctgagttcttgactactaagcagctgaag 4643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1433 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1433
Description:

Target: scaffold1433; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 1637 - 1816
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||| | ||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||| | |||||| |||| ||||  ||||||    
T  1637 gggttcggtaattacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatcttgtttgtttaccgttgacgggtatg 1736  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||| ||| | || ||||||||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||| |||||  | |||||||||||    
T  1737 gatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagtaagacgatgcatttttcttc 1816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 252
Target Start/End: Original strand, 1610 - 1849
Alignment:
Q  13 tacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctg 112  Q
    ||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||| | || ||| | || ||||  ||||||||||| ||  |     
T  1610 tacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagttgatcttgtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatcttt 1709  T
Q  113 ggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgt 212  Q
    || ||||| ||||| || || ||||  |||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |  || || ||| |||  |  ||||| |||     
T  1710 gggatgaattggttagaatataaccgtgttcatattaattgttttagtaagacgatacatttttcttctgcggaggaagaaggtgaagttgagttgttga 1809  T
Q  213 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatctt 252  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  1810 ctactaaacagatgaagcaattggaacgtgatggaatctt 1849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 7722 - 7543
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    ||||||||| | ||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||| | |||||| |||| ||||  ||||||    
T  7722 gggttcggtaattacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatcttgtttgtttaccgttgacgggtatg 7623  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||| ||| | || ||||||||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||| |||||  | |||||||||||    
T  7622 gatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagtaagacgatgcatttttcttc 7543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 252
Target Start/End: Original strand, 28623 - 28862
Alignment:
Q  13 tacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctg 112  Q
    ||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||| | || ||| | || ||||  ||||||||||| ||  |     
T  28623 tacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagttgatcttgtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatcttt 28722  T
Q  113 ggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgt 212  Q
    || ||||| ||||| || || ||||  |||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |  || || ||| |||  |  ||||| |||     
T  28723 gggatgaattggttagaatataaccgtgttcatattaattgttttagtaagacgatacatttttcttctgcggaggaagaaggtgaagttgagttgttga 28822  T
Q  213 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatggtatctt 252  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  28823 ctactaaacagatgaagcaattggaacgtgatggaatctt 28862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 50083 - 49904
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||| | |||||  |||| ||||  ||||||    
T  50083 gggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatcttgtttgcttaccgttgacgggtatg 49984  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||| ||| | || ||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  49983 gatgtaatttttgggatgaaatggttagagtataaccaagttcatatcaattgctttagtaagacggtgcatttttcttc 49904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 49506 - 49685
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||| ||||||||||||||| | ||||||||  | || ||||| |||||||| ||||  ||||||    
T  49506 gggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccattgacgggtatg 49605  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||  ||| | || ||||| ||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||| ||||    
T  49606 gatgctatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagtaagacggtgcattttgcttc 49685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 58540 - 58719
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||| ||||||||||||||| | ||||||||  | || ||||| |||||||| ||||  ||||||    
T  58540 gggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccattgacgggtatg 58639  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||  ||| | || ||||| ||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||| ||||    
T  58640 gatgctatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagtaagacggtgcattttgcttc 58719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 64928 - 65107
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||| ||||||||||||||| | ||||||||  | || ||||| |||||||| ||||  ||||||    
T  64928 gggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccattgacgggtatg 65027  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||  ||| | || ||||| ||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||| ||||    
T  65028 gatgctatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagtaagacggtgcattttgcttc 65107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29602 - 29372
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||  ||| |||| |||| ||||  ||||||    
T  29602 gggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacctagcttgtttaccgttgacgggtatg 29503  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    || |||||| | || ||||||||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||| |||| ||||||  | ||||||||||| |  ||||| || ||||| |    
T  29502 gaggtgatttttgggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttaacaagacgatgcatttttcttctgctgaagaagagagtggag 29403  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagca 231  Q
    | |||||  | |||||||| ||| |||||||    
T  29402 ctgagttcctatctactaaacagttgaagca 29372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 263204 - 263025
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||||||||  | || ||||||||| | || ||||  || |||    
T  263204 gggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatg 263105  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    || || ||| | || ||||| ||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  263104 gacgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagtaagacggtacatttttcttc 263025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 9553 - 9758
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | ||  || || | || ||||||||| |||| ||||  || |||    
T  9553 gggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagacattaaagtcgacttagtttgtttaccgttgacggg-atg 9651  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| ||| |  | ||||||||||| || || ||||  |||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||| |||||||| |    
T  9652 gatgttattttttggatgaactggttagaatataaccgagttcatatcaattgttttagcaagacggtgcatttttcttctgcggaagaagaaagtggag 9751  T
Q  201 cagagtt 207  Q
    |||||||    
T  9752 cagagtt 9758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21102 - 20992
Alignment:
Q  118 gaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctact 217  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||| ||| | ||  |||| |||||    ||| |||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  21102 gaactggttggagtataaccatgtttatattaattgttttagtaagtcggtgtatttctcttctactgaataggaaagtggcgcaaaatttttgtctact 21003  T
Q  218 aagcagctgaa 228  Q
    |||||||||||    
T  21002 aagcagctgaa 20992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 228
Target Start/End: Original strand, 175788 - 175898
Alignment:
Q  118 gaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctact 217  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||| |  |||||||||||| ||| | ||| |||||||||| || ||||| || ||||| |||| ||| ||| |||||    
T  175788 gaactggttgaagtataaccatgttcattataattgttttagtaagtcggtatatttttcttctgttgaagaagagagtggagcagggttcttgactact 175887  T
Q  218 aagcagctgaa 228  Q
    |||||||||||    
T  175888 aagcagctgaa 175898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 5175 - 5420
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || | ||| |  ||||| ||||||||||||||| | |||||||   | || ||||| |||||||| ||||  ||||||    
T  5175 gggttcagtaactacttctcttgtctctttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgtggtcgacttagtgtgtctaccgttgacgggtatg 5274  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
    ||||| ||| | || ||||| ||||| ||||| ||||  |||| ||| | ||| ||||| ||||| || ||||||||||| |  ||||| || ||||  |    
T  5275 gatgttatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcagttgctttagtaagacggtgcatttttcttctgctgaagaagagagtgaag 5374  T
Q  201 cagagtttttgtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 246  Q
      ||||| |||||||| || ||| |||| ||||| ||||| |||||    
T  5375 tggagttcttgtctacgaaacagatgaaacaacttgaacgtgatgg 5420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 180
Target Start/End: Original strand, 4670 - 4755
Alignment:
Q  95 ggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||||||||| ||| | || ||||||||||| ||||| ||||  |||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  4670 ggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgttttagtaagacgatacatttttcttc 4755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 22090 - 21921
Alignment:
Q  11 actacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattc 110  Q
    ||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | ||||||||  | |||||||||||| | ||  |||  ||||||||||| |||     
T  22090 actacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttggtagagattttgaggtcgatttagtttgtttgccgctgacgggtatggatgttattt 21991  T
Q  111 tgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    | || ||||| ||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  21990 ttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagtaagacggtgcatttttcttc 21921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5570 - 5350
Alignment:
Q  11 actacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattc 110  Q
    |||||||||||  | |||||||  ||||| ||||||||||||||| | || |||||| |  || |||| ||| | || |||   || |||||||| |||     
T  5570 actacttctcttatttgtttgacttgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcaatctagtatgtttgccgttgtcgggcatggatgtaattt 5471  T
Q  111 tgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 210  Q
    | || ||||| ||||| ||||| ||||  |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |  || ||||| ||    
T  5470 ttgggatgaattggttagagtataaccgtgttcatattaattgctttagtaagacggtacatttttcttctgttgaagaagagagcgaagctgagttctt 5371  T
Q  211 gtctactaagcagctgaagca 231  Q
    | ||||||| ||| |||||||    
T  5370 gcctactaaacagttgaagca 5350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16640 - 16524
Alignment:
Q  113 ggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtaca-tttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttg 211  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||  ||  | ||| | ||||||||| |   |||| || ||||| ||||||||||||    
T  16640 ggtatgaactggttggagtataatcatgttcatattaattgttttaataaatcggtatattttttcttctgcttaagaagagagtggagcagagtttttg 16541  T
Q  212 tctactaagcagctgaa 228  Q
     ||||||||||||||||    
T  16540 actactaagcagctgaa 16524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 34281 - 34070
Alignment:
Q  35 tgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtaca 134  Q
    ||||| |||||||||||||||   || |||||| | ||  |||||||| || | ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||| |||||||    
T  34281 tgtccgttgtctatgtttggtaaagactttgaagtcgacctagtttgtttatcgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtaca 34182  T
Q  135 accacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgtctactaagcagctgaagcaact 234  Q
    | |  |||| ||| ||||  ||||||||||| || |||||||||||    ||||| || ||||| || |||||  | |||||||| ||| |||||||  |    
T  34181 atcgagttcatatcaattactttagcaagacggtgcatttttcttctactgaagaagagagtggagcggagttcctatctactaaacagttgaagcagtt 34082  T
Q  235 ggaacgcgatgg 246  Q
    |||||| |||||    
T  34081 ggaacgtgatgg 34070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 54015 - 53780
Alignment:
Q  11 actacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattc 110  Q
    ||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | || ||| || | || ||||| ||| |||| ||||  || |||||||| |||     
T  54015 actacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagacttttaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatggatgttattt 53916  T
Q  111 tgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagttttt 210  Q
    | || ||||||| ||| ||||| ||||  |||| |||  |||||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||| || ||||| ||||| ||  |    
T  53915 ttgggatgaactagttagagtataaccgagttcatatctattgttttagcaagacggtgcatttttcttctgcggaagaagatagtggagcagaattcct 53816  T
Q  211 gtctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 246  Q
      ||||||| ||| |||||||  |||| ||||||||    
T  53815 aactactaaacagttgaagcagttggagcgcgatgg 53780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 65624 - 65803
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||| |  |||||| | || ||||||||| | ||||||||| | || ||||| ||| | || ||||  ||||||    
T  65624 gggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtcctatatccatgtttggtagagattttgaagttgacttagtatgtttgccgttgacgggtatg 65723  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||| ||| | || ||||| ||||| ||||| || |  |||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  65724 gatgttatttttggaatgaattggttagagtataatcgagttcatatcaattgctttagtaagacggtacatttttcttc 65803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 2278 - 2457
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||| | | |||| | ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||  ||||  | ||||    
T  2278 gggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgttcgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttactgttgaccgctatg 2377  T
Q  101 gatgtgattctgg-gtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttctt 179  Q
    ||||| ||| | | | ||||||||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  2378 gatgttatttttgaggatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagcaagacggtgcatttttctt 2457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 70350 - 70144
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||| |  ||||| ||||||||||||||| | ||||||||  | || ||||| |||||||| ||||  || |||    
T  70350 gggttcagtaactacttctctagtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgatgggaatg 70251  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtg 200  Q
     |||| ||| | || ||||| ||||| ||||| ||||  |||  ||| |||||||| | |||||  || ||||| ||||| |  ||||| || ||||| |    
T  70250 tatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagtttatataaattgtttcaacaagatggtgcatttgtcttctgcggaagaagagagtggag 70151  T
Q  201 cagagtt 207  Q
    |||||||    
T  70150 cagagtt 70144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 8788 - 8962
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||| |||| ||| |||| ||||  || |||    
T  8788 gggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatctagtgtgtttaccgttgacaggaatg 8887  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttt 175  Q
    || || ||| | || || |||| ||| ||||| ||||  |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  8888 gacgttatttttgggataaactagttagagtataaccgggttcatatcaattgttttagcaagacagtgcatttt 8962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 19002 - 19176
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||| |||| ||| |||| ||||  || |||    
T  19002 gggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatctagtgtgtttaccgttgacaggaatg 19101  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttt 175  Q
    || || ||| | || || |||| ||| ||||| ||||  |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  19102 gacgttatttttgggataaactagttagagtataaccgggttcatatcaattgttttagcaagacagtgcatttt 19176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 113 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15074 - 14956
Alignment:
Q  113 ggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgt 212  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || | ||| ||||| ||||| |||||  ||||||||||||| |  ||||| || ||||| |  |||||  | |    
T  15074 ggtatgaactggttggagtataaccatgtccatatcaattgctttagtaagacgttacatttttcttctgcggaagaagagagtggagtggagttcctat 14975  T
Q  213 ctactaagcagctgaagca 231  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  14974 ctactaagcagttgaagca 14956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 180
Target Start/End: Original strand, 170 - 339
Alignment:
Q  11 actacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattc 110  Q
    ||||||||||| || ||||||   |||||| | |||||||||| | | || ||||   |||||||||||||| | || |||   |||||| ||||||||     
T  170 actacttctcttgtttgtttggggtgtcctatatctatgtttgttagggactttgtggtggatttagtttgtttgccgttgtcgggtatgaatgtgattt 269  T
Q  111 tgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||  |||| ||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  270 ttggtatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaactgctttagtaagacggtacatttttcttc 339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Original strand, 923 - 1056
Alignment:
Q  113 ggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttccgtcgaagaggaaagtggtgcagagtttttgt 212  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||| ||| ||||||| || ||||||||||| |  ||||| || ||||| || |||||  | |    
T  923 ggtatgaactggttagagtataaccgagttcatatcaattgcttttgcaagacggtgcatttttcttctgcggaagaagagagtggagcggagttcctat 1022  T
Q  213 ctactaagcagctgaagcaactggaacgcgatgg 246  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||    
T  1023 ctactaaacagttgaagcagctggagcgtgatgg 1056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 180
Target Start/End: Original strand, 10122 - 10291
Alignment:
Q  11 actacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattc 110  Q
    ||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||||||| | ||||||||  | || ||||||||| | || ||||  || ||||| || |||     
T  10122 actacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggacgttattt 10221  T
Q  111 tgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    |  | ||||| ||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10222 tttgaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagtaagacggtacatttttcttc 10291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 51696 - 51611
Alignment:
Q  95 ggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||||||||| ||  | || ||||||||||| ||||| ||||  |||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  51696 ggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtataaccgtgttcatattaattgttttattaagactgtacatttttcttc 51611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 8592 - 8413
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | ||||||||  | || ||||| ||| | || ||||   |||||    
T  8592 gggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtatgtttgccgttgacgtgtatg 8493  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||| ||| | || ||||| ||||| ||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  8492 gatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaattgctttagtaagacggtgcatttttcttc 8413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 439 - 260
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | |||||||   | |||||||||||| |||| ||||  ||||||    
T  439 gggttcagtaactacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatg 340  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    || |||||| | || ||||| ||||| ||||| ||||  |||| ||| || || | ||| ||||| || |||||||||||    
T  339 gaggtgatttttggaatgaattggttagagtataaccgagttcatatcaactgctatagtaagacggtgcatttttcttc 260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 21829 - 21650
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||||||| ||| | ||||||||  | || ||||||||| ||||  |||  || |||    
T  21829 gggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgttcggtagggattttgaggtagacttagtttgtttaccgctgacgggaatg 21730  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||| ||| | || || || ||||| ||||| ||||  |||| ||| || || |||| |||||| || |||||||||||    
T  21729 gatgttatttttgggattaattggttagagtataaccgagttcatatcaactgctttaacaagaccgtgcatttttcttc 21650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 251600 - 251421
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatg 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || || |||| |||||| ||||||||||||||| | || |||| | | ||| |||||||| | || |||   ||||||    
T  251600 gggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagagactttgtagtcgatctagtttgtttgccgttgtcgggtatg 251501  T
Q  101 gatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    ||||| ||| | || ||||| ||||| ||||| ||||  ||||  || || || ||||| ||||| || |||||||||||    
T  251500 gatgttatttttgggatgaattggttagagtataaccgagttcaaataaactgctttagtaagacggtgcatttttcttc 251421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2059 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold2059
Description:

Target: scaffold2059; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Original strand, 1095 - 1125
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttg 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1095 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttg 1125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 5125 - 4980
Alignment:
Q  35 tgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtaca 134  Q
    ||||| ||||| ||||||||| | || |||||| | ||| | |||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||||||| ||||| |    
T  5125 tgtccgttgtcaatgtttggtagagactttgaagtcgatcttgtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtata 5026  T
Q  135 accacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    |||  ||||  || | ||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  5025 accgtgttcacatcatttgctttagtaagacggtgcatttttcttc 4980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 36907 - 36738
Alignment:
Q  11 actacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattc 110  Q
    ||||||||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | || |||||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||  |||     
T  36907 actacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgatattt 36808  T
Q  111 tgggtatgaactggttggagtacaaccacgttcttattaattgttttagcaagacagtacatttttcttc 180  Q
    | || |||||||| || ||||| || |  |||| ||| ||||  ||||||||||| |  |||||||||||    
T  36807 ttgggatgaactgtttagagtataatcgagttcatatcaatttctttagcaagacggcgcatttttcttc 36738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 8065 - 8117
Alignment:
Q  1 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttg 53  Q
    |||||||||||  |||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  8065 gggttcggtgaaaacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttg 8117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University