View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6791_low_7 (Length: 293)

Name: NF6791_low_7
Description: NF6791
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6791_low_7
NF6791_low_7
[»] chr1 (13 HSPs)
chr1 (6-286)||(51052338-51052618)
chr1 (6-286)||(11909107-11909387)
chr1 (5-286)||(35540906-35541187)
chr1 (5-286)||(6050460-6050741)
chr1 (35-255)||(37191243-37191463)
chr1 (49-254)||(47623111-47623314)
chr1 (159-255)||(16917842-16917938)
chr1 (31-255)||(43388250-43388474)
chr1 (5-88)||(6259674-6259757)
chr1 (5-83)||(4842261-4842339)
chr1 (31-114)||(51993902-51993985)
chr1 (194-246)||(22191823-22191875)
chr1 (210-286)||(28351776-28351852)
[»] chr5 (24 HSPs)
chr5 (6-286)||(12825057-12825337)
chr5 (6-286)||(30732316-30732596)
chr5 (5-286)||(42513577-42513858)
chr5 (5-286)||(27117163-27117444)
chr5 (6-202)||(12820035-12820231)
chr5 (20-285)||(23238256-23238521)
chr5 (5-286)||(28535677-28535958)
chr5 (3-270)||(8227881-8228148)
chr5 (5-286)||(35983793-35984074)
chr5 (5-146)||(3418640-3418781)
chr5 (5-286)||(42927988-42928269)
chr5 (5-255)||(19255155-19255406)
chr5 (149-286)||(31641513-31641649)
chr5 (47-254)||(10776663-10776870)
chr5 (47-255)||(33385407-33385615)
chr5 (159-255)||(25857457-25857553)
chr5 (47-255)||(27766941-27767149)
chr5 (159-255)||(8300215-8300311)
chr5 (36-255)||(18359125-18359343)
chr5 (32-253)||(27795367-27795588)
chr5 (126-264)||(33169636-33169774)
chr5 (173-286)||(26072917-26073030)
chr5 (143-284)||(27165956-27166097)
chr5 (149-251)||(18089798-18089900)
[»] chr2 (10 HSPs)
chr2 (6-286)||(4552027-4552307)
chr2 (5-255)||(41206873-41207123)
chr2 (31-255)||(12645419-12645643)
chr2 (59-255)||(15917565-15917761)
chr2 (35-253)||(28252607-28252825)
chr2 (31-253)||(14439636-14439857)
chr2 (36-255)||(10999984-11000202)
chr2 (32-255)||(17764995-17765218)
chr2 (31-255)||(40176552-40176775)
chr2 (36-255)||(38604407-38604626)
[»] chr3 (21 HSPs)
chr3 (5-286)||(2364134-2364415)
chr3 (6-286)||(19920231-19920511)
chr3 (5-286)||(10323573-10323854)
chr3 (6-286)||(7312635-7312914)
chr3 (5-286)||(34332817-34333098)
chr3 (5-286)||(40930530-40930811)
chr3 (169-242)||(7032339-7032412)
chr3 (31-255)||(11203702-11203926)
chr3 (31-254)||(33496430-33496653)
chr3 (36-255)||(35214404-35214623)
chr3 (173-255)||(29523778-29523860)
chr3 (29-255)||(26771022-26771248)
chr3 (31-255)||(12342259-12342482)
chr3 (31-255)||(36801108-36801332)
chr3 (31-246)||(7031059-7031274)
chr3 (126-264)||(963187-963325)
chr3 (53-255)||(19890583-19890785)
chr3 (149-264)||(2755843-2755958)
chr3 (152-246)||(16178952-16179046)
chr3 (149-286)||(15312584-15312721)
chr3 (149-264)||(3140853-3140968)
[»] chr8 (18 HSPs)
chr8 (5-286)||(8299660-8299941)
chr8 (5-286)||(7924243-7924524)
chr8 (5-286)||(171960-172241)
chr8 (5-286)||(13396245-13396526)
chr8 (17-286)||(41665371-41665640)
chr8 (3-282)||(32266419-32266698)
chr8 (5-286)||(9922458-9922739)
chr8 (5-116)||(20496941-20497052)
chr8 (31-255)||(13200006-13200230)
chr8 (31-255)||(2170223-2170449)
chr8 (31-255)||(20824179-20824403)
chr8 (31-255)||(37434015-37434239)
chr8 (31-255)||(43270333-43270557)
chr8 (173-255)||(17699507-17699589)
chr8 (31-220)||(2529769-2529958)
chr8 (31-253)||(13879522-13879744)
chr8 (106-240)||(34137011-34137145)
chr8 (160-255)||(5181682-5181777)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (5-286)||(105845-106126)
[»] chr7 (12 HSPs)
chr7 (5-286)||(4938130-4938411)
chr7 (3-286)||(11277254-11277537)
chr7 (7-286)||(47876842-47877121)
chr7 (5-286)||(37919401-37919682)
chr7 (5-172)||(31177421-31177588)
chr7 (5-286)||(235439-235722)
chr7 (3-286)||(29967830-29968113)
chr7 (5-286)||(17720492-17720773)
chr7 (35-255)||(25619346-25619566)
chr7 (36-255)||(37254646-37254865)
chr7 (134-255)||(18532614-18532735)
chr7 (31-88)||(18530393-18530450)
[»] chr4 (18 HSPs)
chr4 (5-286)||(23642593-23642874)
chr4 (5-286)||(13270893-13271174)
chr4 (5-286)||(47418662-47418942)
chr4 (5-286)||(47685897-47686178)
chr4 (5-286)||(1828542-1828823)
chr4 (19-286)||(19755135-19755405)
chr4 (19-286)||(19784401-19784671)
chr4 (5-286)||(15740078-15740359)
chr4 (5-286)||(7403770-7404051)
chr4 (5-137)||(159842-159974)
chr4 (31-255)||(12697696-12697920)
chr4 (31-255)||(8360983-8361207)
chr4 (36-255)||(20002606-20002832)
chr4 (152-255)||(55725719-55725822)
chr4 (173-255)||(45472742-45472824)
chr4 (155-253)||(11587233-11587331)
chr4 (32-253)||(54483194-54483415)
chr4 (152-246)||(5790134-5790228)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (5-286)||(11207-11488)
[»] chr6 (15 HSPs)
chr6 (5-263)||(12733982-12734240)
chr6 (5-286)||(2553494-2553775)
chr6 (5-286)||(24767426-24767707)
chr6 (92-286)||(18651236-18651430)
chr6 (169-286)||(21168220-21168337)
chr6 (35-253)||(14373026-14373244)
chr6 (37-255)||(20883066-20883284)
chr6 (31-255)||(17579114-17579338)
chr6 (31-255)||(17573688-17573912)
chr6 (47-255)||(10577282-10577490)
chr6 (31-255)||(21630140-21630366)
chr6 (173-255)||(17606367-17606449)
chr6 (155-255)||(15958846-15958946)
chr6 (5-119)||(21168082-21168196)
chr6 (126-264)||(13937678-13937816)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (3-286)||(3107-3390)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 13)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Original strand, 51052338 - 51052618
Alignment:
Q  6 gagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaat 105  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51052338 gagagtcgacacctaccacgcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaat 51052437  T
Q  106 cccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51052438 cccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagca 51052537  T
Q  206 aggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatgtc 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51052538 aggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtc 51052618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 11909387 - 11909107
Alignment:
Q  6 gagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaat 105  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11909387 gagagtcgacacctaccacgcctaaccaatcctgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaat 11909288  T
Q  106 cccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagca 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11909287 cccacatccagaaacacatagccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagca 11909188  T
Q  206 aggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatgtc 286  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11909187 atgatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtc 11909107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 5 - 286
Target Start/End: Original strand, 35540906 - 35541187
Alignment:
Q  5 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaa 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35540906 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatgccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaa 35541005  T
Q  105 tcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagc 204  Q
    |||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35541006 tcccacatccagcaacgcataatcgttcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattatgttttgtgggtaaccgatccctcagtagtcgccaagc 35541105  T
Q  205 aaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatgtc 286  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35541106 aaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtc 35541187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 286
Target Start/End: Original strand, 6050460 - 6050741
Alignment:
Q  5 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaa 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6050460 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatgccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaa 6050559  T
Q  105 tcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagc 204  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  6050560 tcccacatccagcaacgcagaaccgctcctccacagatagaatgccacaatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagc 6050659  T
Q  205 aaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatgtc 286  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6050660 aaggatagagactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccacattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtc 6050741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 37191463 - 37191243
Alignment:
Q  35 tcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcct 134  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||   |||||||| |||  ||||||||| |  ||||| || || ||||    
T  37191463 tcccgcaccataggccataatgcaccgaaaattggacaagacaaaaacatatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgtgacacaaaatcgatcct 37191364  T
Q  135 ccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgttt 234  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||| ||   ||| |||||||| ||||| ||||  || ||||||||||||||| | ||||| | | ||||| ||||    
T  37191363 ccacagatgtaatgccacgatctgccaagttggatttagtaggtaatcgatctctcaacagccgccaagcaaggatataaacttttaaatgaaccagttt 37191264  T
Q  235 atgccaaattaagtccatatt 255  Q
    |||||| ||||| ||||||||    
T  37191263 atgccagattaactccatatt 37191243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 49 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 47623314 - 47623111
Alignment:
Q  49 ccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatg 148  Q
    |||||| |||||||||  ||  ||||||| |||||| |||   ||||||||  ||  |||||| |||||||||||  ||||| |||||| ||  | ||||    
T  47623314 ccataaggcaccaaaaaatgggcaagacagaaacaagtgattcacatcttcatcatgcccacaaccagaaacaca--accgcccctccataggaataatg 47623217  T
Q  149 ccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagt 248  Q
     |||| |||||||||||    || |||||||| || ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  47623216 tcacggtttgccaaatttcccttcgtaggtaagcggtccctcaaaagccgccaagcaagaatagatactttgagaggtacctgtttatgccaaattaatt 47623117  T
Q  249 ccatat 254  Q
    ||||||    
T  47623116 ccatat 47623111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16917938 - 16917842
Alignment:
Q  159 ccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatatt 255  Q
    ||||||||  ||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16917938 ccaaattagatttagtaggtaagcgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatatt 16917842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 255
Target Start/End: Original strand, 43388250 - 43388474
Alignment:
Q  31 ccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgc 130  Q
    |||| |||||||||  ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||   |||||||| ||   ||  ||||| |  ||||| |||||     
T  43388250 ccaagcccgcaccaaaggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcctgcatcccgttacacaaaaccga 43388349  T
Q  131 tcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacct 230  Q
    |  ||||||| || ||| ||||| |   |||| ||   ||| |||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  43388350 ttttccacagctataatcccacgttccaccaattttgatttagtaggtaaacgatccctcaacaatcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacct 43388449  T
Q  231 gtttatgccaaattaagtccatatt 255  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  43388450 gtttatgccaaattaactccatatt 43388474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 88
Target Start/End: Original strand, 6259674 - 6259757
Alignment:
Q  5 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatga 88  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||  | |||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6259674 tgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggccataaagcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatga 6259757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 83
Target Start/End: Original strand, 4842261 - 4842339
Alignment:
Q  5 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaaca 83  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  4842261 tgagattcgacccctaccactcctagccatgcccgcaccataggccataatgcattaaaagttacacaagacaaaaaca 4842339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 51993985 - 51993902
Alignment:
Q  31 ccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatcc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||   || ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||  |||||||||    
T  51993985 ccaatcccgcaccataggccacaaagcaccgaagaatggacaagacaaaatcaaatgagacacatcttcaacatgcccacatcc 51993902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 194 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22191875 - 22191823
Alignment:
Q  194 agtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaa 246  Q
    |||| ||||||||| ||||| || || | ||||||||||||||||||||||||    
T  22191875 agtctccaagcaagaatagaaaccttcaaaggaacctgtttatgccaaattaa 22191823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 286
Target Start/End: Original strand, 28351776 - 28351852
Alignment:
Q  210 tagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatgtc 286  Q
    |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||| | |||| ||||||||    
T  28351776 tagagactttcagagggaccggtttatgccaaattaactccatattttgatgtgaatggggatactccagtgatgtc 28351852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 24)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Original strand, 12825057 - 12825337
Alignment:
Q  6 gagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaat 105  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12825057 gagagtcgacacctaccacgcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaat 12825156  T
Q  106 cccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12825157 cccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagca 12825256  T
Q  206 aggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatgtc 286  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12825257 aggatacatactttgagaggaacttgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtc 12825337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 30732596 - 30732316
Alignment:
Q  6 gagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaat 105  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30732596 gagagtcgacacctaccacgcctaaccaatcccgcaccatcggctataatgcaccaaaagttgtacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaat 30732497  T
Q  106 cccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30732496 cccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagca 30732397  T
Q  206 aggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatgtc 286  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30732396 aagatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtc 30732316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 286
Target Start/End: Original strand, 42513577 - 42513858
Alignment:
Q  5 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaa 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  42513577 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatgccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaaaaaatgagtaacatcttcgacaa 42513676  T
Q  105 tcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagc 204  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  42513677 tcccacatccagcaacgcataaccgctcctccacagatagaatgtcacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagc 42513776  T
Q  205 aaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatgtc 286  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42513777 aaggatagagactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccacattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtc 42513858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 5 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 27117444 - 27117163
Alignment:
Q  5 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaa 104  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27117444 tgagagtcgacccctaccactcctaaccaatcccacaccatcggccataatgctccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacat 27117345  T
Q  105 tcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagc 204  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27117344 tcccacagccagaaacacataaccgctcctccatagatagaatgccacggtttaccaaattaagttttgtgggtaaccggtccctcagaagtcgccaagc 27117245  T
Q  205 aaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatgtc 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  27117244 aaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggatctgctcctgtgatgtc 27117163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 6 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 12820231 - 12820035
Alignment:
Q  6 gagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaat 105  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12820231 gagagtcgacacctaccacgcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagagacatcttcgacaat 12820132  T
Q  106 cccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaa 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12820131 cccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcataagtcgccaa 12820035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 285
Target Start/End: Original strand, 23238256 - 23238521
Alignment:
Q  20 accactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaa 119  Q
    |||||||||| |||  | |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  23238256 accactcctagccatgctcgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaa 23238355  T
Q  120 cacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatacttt 219  Q
    |||| |||||| |||||| || || ||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  23238356 cacacaaccgcgcctccaaagctaaaatgccacggtttgccaaattacttttcgtaggtaaccgatctctcaaaagtctccaagcaaggatagaaacttt 23238455  T
Q  220 gagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatgt 285  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23238456 gagaggaacctatttatgccaaattaactccatattatggtgtaactggggttgctcctgtgatgt 23238521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 28535958 - 28535677
Alignment:
Q  5 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaa 104  Q
    |||||||| || ||||||||||| | |||  |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||     
T  28535958 tgagagtcaacccctaccactccaagccatgcccgcaccattggccataaggcactaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgatcgacatcttctacat 28535859  T
Q  105 tcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagc 204  Q
    ||||||| ||||||||||| | | || |||||| || || ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28535858 tcccacaaccagaaacacacatctgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagc 28535759  T
Q  205 aaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatgtc 286  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||    
T  28535758 aaggatagaaactttgagaggaacctgtgtatgccaaattaactccatgttttgatgtaactgaggctgctcctgtgatgtc 28535677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 270
Target Start/End: Original strand, 8227881 - 8228148
Alignment:
Q  3 aatgagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgac 102  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||| |||  | |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  8227881 aatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaac 8227980  T
Q  103 aatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaa 202  Q
      || |||||||||||||||| |||||| |||||| || || |||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  8227981 gttctcacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgtcacggtttgccaaattacttttcgtaggtaaccgatctctcaaaagtctccaa 8228080  T
Q  203 gcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattgggg 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  8228081 gcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgtcaaattaactccatattatggtgtaactgggg 8228148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 35984074 - 35983793
Alignment:
Q  5 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaa 104  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |  ||  |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||     
T  35984074 tgagagtcgacccctaccactccaagtcatgcccgcaccattggccataaggcactaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgattgacaacttctacat 35983975  T
Q  105 tcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagc 204  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||| |||||| || || |||| || | ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35983974 tcccacaaccaaaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgtcatggtttgccaaattattttttgtaggtaaccgattcctcagaagtcgccaagc 35983875  T
Q  205 aaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatgtc 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||    
T  35983874 aaggatagatactttgagaggaacctgtgtaagccaaattaactccatgttttgatgtaactgaggctgctcctgtgatgtc 35983793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 146
Target Start/End: Original strand, 3418640 - 3418781
Alignment:
Q  5 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaa 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3418640 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatgccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaa 3418739  T
Q  105 tcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaa 146  Q
    |||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  3418740 tcccacatccagcaacgcataatcgttcctccacagatagaa 3418781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 286
Target Start/End: Original strand, 42927988 - 42928269
Alignment:
Q  5 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaa 104  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||  |||||||||  || ||||| |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||   |||||||| ||      
T  42927988 tgagagtcgacccctaccactccgagccatgcccgcaccaatggtcataaggcactaaaagttggacatgacaagaacaaatgattgacatcttcaacgt 42928087  T
Q  105 tcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagc 204  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||| ||||||  | || ||||||||  |||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  42928088 tcccgcatccagagacacacaaccgcacctccaagggtaaaatgccacagtttgtcaaattattttttgtagttaaccgatccctcagaagccgccaaac 42928187  T
Q  205 aaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatgtc 286  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  42928188 aaggatagagactttgagaggaacctgtttataccaaattaactccatatttggatgtaactggggctgttcctgcgatgtc 42928269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 19255406 - 19255155
Alignment:
Q  5 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaa 104  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| | |||  |||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||   |||||||| ||      
T  19255406 tgagaatcgacccctaccactccgagccatgcccgcaccaatgtccataaggcaccaaaagttggacaagacaagaacaaatgattgacatcttcaacgt 19255307  T
Q  105 tcccacatccagaaacacataaccgctc-ctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaag 203  Q
     ||| |||||||  ||||| |||||| | |||||  |  | |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  19255306 gcccgcatccagtgacacacaaccgcgcgctccaagggaataatgccacaatttgccaaattattttttgtaggtaaccgatccctcagaaaccgccaag 19255207  T
Q  204 caaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatatt 255  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  19255206 caaggatagatactttgagagaaatctgtttatgccaaattaactccatatt 19255155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 149 - 286
Target Start/End: Original strand, 31641513 - 31641649
Alignment:
Q  149 ccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagt 248  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |    
T  31641513 ccacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccgatccctcagtagtctccatgcaaggatagaaacttt-agaggaacctgtgtatgccaaattaact 31641611  T
Q  249 ccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatgtc 286  Q
    |||| || || ||||| || ||||||||||||||||||    
T  31641612 ccatgttttgatgtaagtgaggctgctcctgtgatgtc 31641649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 254
Target Start/End: Original strand, 10776663 - 10776870
Alignment:
Q  47 ggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaa 146  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||   |||||||| ||   ||||||||| || ||||| ||||| |  |||||||||| ||    
T  10776663 ggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacttgcccacatcccgatacacaaaaccgattttccacagatataa 10776762  T
Q  147 tgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaa 246  Q
    | |||||     |||||||   ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  10776763 tcccacgtgccaccaaatttgatttagtaggtaaacgatccctcagcagtcgccaagcaaggatagaaacttttaagggaacctgtttatgccaaattaa 10776862  T
Q  247 gtccatat 254  Q
     |||||||    
T  10776863 ctccatat 10776870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 47 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 33385615 - 33385407
Alignment:
Q  47 ggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaa 146  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||   |||||||| ||   ||||||||| || ||||| ||||| |  |||||||||| ||    
T  33385615 ggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgatacacaaaaccgattttccacagatataa 33385516  T
Q  147 tgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaa 246  Q
    | |||||     |||||||   ||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  33385515 ttccacgtgccaccaaatttgatttagtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaagggaacctgtttatgccaaattaa 33385416  T
Q  247 gtccatatt 255  Q
     ||||||||    
T  33385415 ctccatatt 33385407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 25857553 - 25857457
Alignment:
Q  159 ccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatatt 255  Q
    ||||||||  ||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25857553 ccaaattagatttagtaggtaagcgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatatt 25857457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 255
Target Start/End: Original strand, 27766941 - 27767149
Alignment:
Q  47 ggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaa 146  Q
    ||||| || ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||   |||||||| ||   ||| ||||| |  ||||| ||||| |  |||||| ||| ||    
T  27766941 ggccacaaagcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccgcatcccgttacacaaaaccgattttccacatatataa 27767040  T
Q  147 tgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaa 246  Q
    | ||||| |   |||||||   |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  27767041 tcccacgttccaccaaatttgattttgtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatataaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaa 27767140  T
Q  247 gtccatatt 255  Q
     ||||||||    
T  27767141 ctccatatt 27767149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 8300311 - 8300215
Alignment:
Q  159 ccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatatt 255  Q
    ||||||||  ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8300311 ccaaattagatttagtaggtaagcgatccctcaacagtcgccaaacaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatatt 8300215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 36 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18359343 - 18359125
Alignment:
Q  36 cccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctc 135  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| ||| | | |||||||||||||| ||||   |||||||| |||  |||| |||| |  ||||| ||||| |||||    
T  18359343 cccgccccataggccacaatgcaccgaaaatcggacaagacaaaaacatatgattcacatcttcaacatgcccagatcccgtgacacaaaaccgatcctc 18359244  T
Q  136 cacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgttta 235  Q
    |||| ||| ||||| ||||| |||||| ||   ||| |||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||    
T  18359243 cacatatataatgc-acgatctgccaagttggatttagtaggtaaacgatccctcaacaaccgccaagcaaggattgaaacttttaaaggaacctgttta 18359145  T
Q  236 tgccaaattaagtccatatt 255  Q
    ||| | ||||| ||||||||    
T  18359144 tgctagattaactccatatt 18359125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 253
Target Start/End: Original strand, 27795367 - 27795588
Alignment:
Q  32 caatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgct 131  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| || |  ||||||| ||       
T  27795367 caatcccgcaccataggccacaaagcaccaaagaaaggacaagacaaaaacaaatgagacacatcttcaacatgcccacagcccgtgacacatagcctag 27795466  T
Q  132 cctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctg 231  Q
    ||||||  | || |||||||||||||||||||||   ||| ||||| || ||||||||||  |  |||||||||| ||  |  ||||||||||| |||||    
T  27795467 cctccaacggtaaaatgccacgatttgccaaattggctttagtaggcaaacgatccctcaacaaccgccaagcaaagactgtaactttgagaggtacctg 27795566  T
Q  232 tttatgccaaattaagtccata 253  Q
    ||| ||||| | ||| ||||||    
T  27795567 tttgtgccagactaactccata 27795588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 264
Target Start/End: Original strand, 33169636 - 33169774
Alignment:
Q  126 accgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagg 225  Q
    |||||||||||| |||||  |  |||||| ||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||  ||||| ||||| | |||    
T  33169636 accgctcctccaaagataagaccccacgacttgccaaattttgtttagtaggtaaccggtccctcagcaaacgccaagcaaaaatagacactttcaaagg 33169735  T
Q  226 aacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaa 264  Q
     |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||    
T  33169736 cacctgtttgtgccaaatcaactccatattttgatgtaa 33169774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 286
Target Start/End: Original strand, 26072917 - 26073030
Alignment:
Q  173 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattggggct 272  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||| ||| |||||  ||||| | |||||| | ||||||||||||||| |||| ||| || || || |||||||    
T  26072917 gtaggtaatcgatccctcaacagtcgccaaacaaagatagggactttcaaaggaacatatttatgccaaattaactccaaattttgatgcaaatggggct 26073016  T
Q  273 gctcctgtgatgtc 286  Q
    | ||||| ||||||    
T  26073017 gttcctgcgatgtc 26073030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 27166097 - 27165956
Alignment:
Q  143 agaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaa 242  Q
    ||||| |||||| ||||||||||   |||| ||||||| |||||| ||||   ||||||| | | |||||| ||||| ||||| |||||||  |||||||    
T  27166097 agaattccacgacttgccaaatttgcttttataggtaaacgatccttcagcgttcgccaaacgaagatagagacttttagaggtacctgttggtgccaaa 27165998  T
Q  243 ttaagtccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatg 284  Q
    |||| |||||||| || ||||| | ||| || ||||||||||    
T  27165997 ttaattccatattttgatgtaaattgggttgttcctgtgatg 27165956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 18089900 - 18089798
Alignment:
Q  149 ccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagt 248  Q
    |||||||||||||||||  |  | |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||| |||||| ||||| |  || |||||||| ||||||||||| |    
T  18089900 ccacgatttgccaaattttgcctagtaggtaaacgatctctcaatagtcgtcaagcaaagatagagactttcaacggtacctgtttgtgccaaattaact 18089801  T
Q  249 cca 251  Q
    |||    
T  18089800 cca 18089798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 10)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Original strand, 4552027 - 4552307
Alignment:
Q  6 gagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaat 105  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4552027 gagagtcgacacctaccacgcctaaccaatcccgcaccatcggtcataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacattttcgacaat 4552126  T
Q  106 cccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4552127 cccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagca 4552226  T
Q  206 aggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatgtc 286  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4552227 aggatagatactttaagaggaacctatttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtc 4552307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 255
Target Start/End: Original strand, 41206873 - 41207123
Alignment:
Q  5 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaa 104  Q
    |||||||| || ||||||||||| | |||  |||||| ||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||   |||||||| ||      
T  41206873 tgagagtcaacccctaccactccgagccatgcccgcatcaatggccataaggcaccaaaagttggacaagacaagaacaaatgattgacatcttcaacgt 41206972  T
Q  105 tcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagc 204  Q
     ||| |||||||  ||||| |||||| ||||||  |  | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41206973 gcccgcatccagtgacacacaaccgcgcctccaagggaataatgccacgatttgccaaattattttttgtaggtaaccgatccctcagaagccgccaagc 41207072  T
Q  205 aaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatatt 255  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41207073 aaggatagagactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatatt 41207123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 255
Target Start/End: Original strand, 12645419 - 12645643
Alignment:
Q  31 ccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgc 130  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||  |||||| || | |||||| |||||     
T  12645419 ccaagcccgcaccataggccacaatgcgccaaaaattgggcaagacaaaaacaaatgagtcacatcttcaacatgcccacaccctgtaacacaaaaccga 12645518  T
Q  131 tcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacct 230  Q
     |||||| || |||||| |  |||| || ||||||   |||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||| || ||||| |||| |||||    
T  12645519 gcctccaaaggtagaattctgcgatctgtcaaattgtattttgtaggtaagcgatccctcaatagccgccaagcaaggattgaaacttttagagaaacct 12645618  T
Q  231 gtttatgccaaattaagtccatatt 255  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  12645619 gtttatgccaaattaactccatatt 12645643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 59 - 255
Target Start/End: Original strand, 15917565 - 15917761
Alignment:
Q  59 ccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttg 158  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||   |||||||| |||  |||||| ||||  ||||| |||||| | |||| ||  | ||| ||||||||||    
T  15917565 ccaaaagttggacaagacaaaaacatatgattcacatcttcaacatgcccacaaccagtgacacacaaccgcacttccaaaggaataataccacgatttg 15917664  T
Q  159 ccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatatt 255  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| || |||||    
T  15917665 ccaaattaacttttgtaggtaaacgatccctcagcagtccccaagcaaggatacagactttcagaggaacctatttatgcgaaattaactcaatatt 15917761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 253
Target Start/End: Original strand, 28252607 - 28252825
Alignment:
Q  35 tcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcct 134  Q
    ||||||||||  | |||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||   ||||||||  ||   ||||| || ||||||||||||||| |||    
T  28252607 tcccgcaccaaagaccataaggcaccaaaaaatggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcatcatgaccacaaccggaaacacataaccgcccct 28252706  T
Q  135 ccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgttt 234  Q
    ||| |   | ||||||| | |||||||||||    || |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  28252707 ccatatgaataatgccatggtttgccaaatttcccttcgtaggtaagcgatccctcaaaagccgccaagcaagaatagatacttttagaggtacctgttt 28252806  T
Q  235 atgccaaattaagtccata 253  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  28252807 atgccaaattaattccata 28252825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 31 - 253
Target Start/End: Original strand, 14439636 - 14439857
Alignment:
Q  31 ccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgc 130  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||   |||||||| ||   ||||||||| |  ||| | |||||     
T  14439636 ccaagcccgcaccataggccacaatgcatcaaaaattggacaagacaaaa-caaatgattcacatcttcaacctacccacatcccgttacataaaaccga 14439734  T
Q  131 tcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacct 230  Q
     | |||||||||||||| ||||| | | |||||||   ||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||| | |||||| ||||| | ||||||||    
T  14439735 gcttccacagatagaatcccacgttctaccaaatttgatttagtaggtaaacgatccctcaacagtcgtcaagccaagatagaaacttttaaaggaacct 14439834  T
Q  231 gtttatgccaaattaagtccata 253  Q
    |||||||||| ||||| ||||||    
T  14439835 gtttatgccagattaactccata 14439857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 36 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 11000202 - 10999984
Alignment:
Q  36 cccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctc 135  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| || |||||||||   |||||||| |||  ||||||| | |  ||||| |||||  | ||    
T  11000202 cccgcaccataggccacaatgcaccaaaaattggacaagataagaacaaatgattcacatcttcaacatgcccacattccgttacacaaaaccgagcttc 11000103  T
Q  136 cacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgttta 235  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||   ||| ||||| || |||||||| |  || | ||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||    
T  11000102 cacagatagaatcccacgttctgccaaatttgatttagtaggcaaacgatccct-aacagccaccaagcaaggatagaaacttttaaagaaacctgttta 11000004  T
Q  236 tgccaaattaagtccatatt 255  Q
    || || ||||| ||||||||    
T  11000003 tggcagattaactccatatt 10999984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 17765218 - 17764995
Alignment:
Q  32 caatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgct 131  Q
    ||||||| |||||  | |||||| ||||||||| |||  |||||||||||||| |||   |||||||| ||    ||||| ||||  ||||| ||||||     
T  17765218 caatccctcaccaatgaccataaggcaccaaaaattgggcaagacaaaaacaagtgattcacatcttccacgtgaccacaaccagtgacacacaaccgcg 17765119  T
Q  132 cctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctg 231  Q
    |||||| ||  |  || ||||| |||||||||||   ||| ||||||||  |||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||    
T  17765118 cctccaaaggaatgataccacggtttgccaaatttgctttcgtaggtaaatgatccctcaatagccgccaagcaagaatagagactttaagaggagcctg 17765019  T
Q  232 tttatgccaaattaagtccatatt 255  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||    
T  17765018 tttatgccatattaactccatatt 17764995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 255
Target Start/End: Original strand, 40176552 - 40176775
Alignment:
Q  31 ccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgc 130  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||   || |||| |||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||| |  ||||| | ||      
T  40176552 ccaatcccgcaccataggccacaaagcaccgaagaatggacaaaacaaaaacaaatgagacacatcttcaacatgcccacatcccgtgacacaaagccta 40176651  T
Q  131 tcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacct 230  Q
     ||||||  | || || ||| ||||||| |||||| | ||| |||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||  || ||||| ||||| ||||    
T  40176652 gcctccatcggta-aaagccgcgatttgtcaaattgactttagtaggtaaacgatccctcaacaaccgccaagcaaggactgaaacttttagaggtacct 40176750  T
Q  231 gtttatgccaaattaagtccatatt 255  Q
    |||| ||||| | ||| ||||||||    
T  40176751 gtttgtgccagactaactccatatt 40176775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 36 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 38604626 - 38604407
Alignment:
Q  36 cccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctc 135  Q
    |||||||||| |||||||| |  || ||||| | |||  ||||||||| ||||   |||||||| |||  |||||| || || |||||||||||  ||||    
T  38604626 cccgcaccataggccataaagtcccgaaagtcggacacaacaaaaacacatgatttacatcttcaacatgcccacagcctgagacacataaccgagcctc 38604527  T
Q  136 cac-agatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgttt 234  Q
    ||  ||| || |||||||||| ||||||||| | | |||||||||| ||||| || |  ||  |||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||    
T  38604526 catgaga-aggatgccacgatatgccaaattgactattgtaggtaaacgatctcttaacagcagccatgcaaggattgaaacttttagaggtacttgttt 38604428  T
Q  235 atgccaaattaagtccatatt 255  Q
    |||||| ||||| ||||||||    
T  38604427 atgccagattaactccatatt 38604407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 21)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 5 - 286
Target Start/End: Original strand, 2364134 - 2364415
Alignment:
Q  5 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaa 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2364134 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatgccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaa 2364233  T
Q  105 tcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagc 204  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2364234 tcccacatccagcaacgcataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagtagtcgccaagc 2364333  T
Q  205 aaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatgtc 286  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2364334 aaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtc 2364415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 19920511 - 19920231
Alignment:
Q  6 gagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaat 105  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  19920511 gagagtcgacacctaccacgcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgagaagcatcttcgacatt 19920412  T
Q  106 cccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagca 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19920411 cccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgcctcgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagca 19920312  T
Q  206 aggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatgtc 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  19920311 aggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatatgatggtgtaactggggcttctcctgtgatgtc 19920231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 5 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 10323854 - 10323573
Alignment:
Q  5 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaa 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10323854 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatgccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaa 10323755  T
Q  105 tcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagc 204  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10323754 tcccacatccagcaacgcataaccgctcatccccagatagaatgccacgagttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagtagtcgccaagc 10323655  T
Q  205 aaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatgtc 286  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10323654 aaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatactatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtc 10323573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 6 - 286
Target Start/End: Original strand, 7312635 - 7312914
Alignment:
Q  6 gagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaat 105  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7312635 gagagtcgacacctaccacgcctaaccaatcccgcaccatcggct-taatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaat 7312733  T
Q  106 cccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagca 205  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  7312734 cccacatccagaaacacaaagccgctcctccacagacagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagca 7312833  T
Q  206 aggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatgtc 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7312834 aggatagatactttgagaggtacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtc 7312914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 34333098 - 34332817
Alignment:
Q  5 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaa 104  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||      
T  34333098 tgagagtcgacccctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgt 34332999  T
Q  105 tcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagc 204  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||| || || ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  34332998 tcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattattttttgtaggtaatcgatctctcagaagttgccaagc 34332899  T
Q  205 aaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatgtc 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  34332898 aaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatattatgatgtaactggggctgctcctgtgatgtc 34332817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 40930811 - 40930530
Alignment:
Q  5 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaa 104  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||  |||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||      
T  40930811 tgagagtcgacccctaccactccaagccatgcccgcaccattggccataaggcactaaaagttgaacaagacaaaaacaaatgattgacatcttcgacgt 40930712  T
Q  105 tcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagc 204  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||| || || || |||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  40930711 tcccacaaccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaaggccacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatccctcaaaagtcgccaagc 40930612  T
Q  205 aaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatgtc 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| || || || || || || |||||||||||||||    
T  40930611 aaggatagatactttgagaggaacctgtttatgtcaaactaactccatgttttgatgcaactgaggttgctcctgtgatgtc 40930530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 169 - 242
Target Start/End: Original strand, 7032339 - 7032412
Alignment:
Q  169 ttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  7032339 ttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgcaaggatagaaattttgagaggaacctgtttgtgccaaa 7032412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 255
Target Start/End: Original strand, 11203702 - 11203926
Alignment:
Q  31 ccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgc 130  Q
    |||| |||||||||  ||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||   |||||||| ||   ||| ||||| |  ||||| |||||     
T  11203702 ccaagcccgcaccaaaggccacaatgaaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccgcatcccgttacacaaaaccga 11203801  T
Q  131 tcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacct 230  Q
    |  ||||||| || ||| ||||| |   |||||||   ||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||    
T  11203802 ttttccacagctataatcccacgttccaccaaatttgatttagtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaagtatagaaacttttaaaggaacct 11203901  T
Q  231 gtttatgccaaattaagtccatatt 255  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  11203902 gtttatgccaaattaactccatatt 11203926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 254
Target Start/End: Original strand, 33496430 - 33496653
Alignment:
Q  31 ccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgc 130  Q
    |||| |||||||||  ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||   |||||||| ||    || |||||    ||||| |||||     
T  33496430 ccaagcccgcaccaaaggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgtccgcatcccattacacaaaaccga 33496529  T
Q  131 tcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacct 230  Q
    |  |||||||||| ||| ||||| |   |||||||   ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||    
T  33496530 ttttccacagatataatcccacgttccaccaaatttgatttagtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaatgatagaaacttttaaaggaacct 33496629  T
Q  231 gtttatgccaaattaagtccatat 254  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  33496630 gtttatgccaaattaactccatat 33496653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 36 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 35214623 - 35214404
Alignment:
Q  36 cccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctc 135  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||   |||||||| |||  || |||||| |  ||||| ||| |  | ||    
T  35214623 cccgcaccataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaagaacaaatgattcacatcttcaacatgccaacatcccgttacacaaaactgagcttc 35214524  T
Q  136 cacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgttta 235  Q
    |||| ||||||| ||||| | || ||||||   ||| ||||| || ||||||||||  |  |||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  35214523 cacatatagaatcccacgttctggcaaatttgatttagtaggcaaacgatccctcaacatccgccaaacaaggatagaaacttttaaaggaacctgttta 35214424  T
Q  236 tgccaaattaagtccatatt 255  Q
    ||||| ||||| ||||||||    
T  35214423 tgccagattaactccatatt 35214404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 173 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 29523860 - 29523778
Alignment:
Q  173 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatatt 255  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29523860 gtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatatt 29523778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 26771248 - 26771022
Alignment:
Q  29 aaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataacc 128  Q
    |||||| ||| |||||  |||||||| |||| |||| |||  |||||||||||||| |||   |||||||| ||   |||||| ||||  ||||| |||     
T  26771248 aaccaagccctcaccaatggccataaggcactaaaaattgggcaagacaaaaacaagtgattcacatcttccacgtgcccacaaccagtgacacacaact 26771149  T
Q  129 gctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaac 228  Q
    || |||||| ||  |  || ||||| |||||||||||   ||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| ||||| |||||| |    
T  26771148 gcacctccaaaggaatgataccacggtttgccaaatttgctttcgtaggtaaacgatccctcaaaagccgccaagtaagaatagagactttaagaggagc 26771049  T
Q  229 ctgtttatgccaaattaagtccatatt 255  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  26771048 ctgtttatgccacattaactccatatt 26771022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 12342482 - 12342259
Alignment:
Q  31 ccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgc 130  Q
    |||| |||||||||  ||||| |||||||||||| ||| |||||| || || ||||||   |||||||| ||   ||| ||||| |  ||||| |||||     
T  12342482 ccaagcccgcaccaaaggccacaatgcaccaaaaattggacaagagaagaataaatgattcacatcttcaacctgcccgcatcccgttacacaaaaccga 12342383  T
Q  131 tcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacct 230  Q
    |  ||||||| || ||| ||||| |   |||||||   ||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||    
T  12342382 ttttccacagctataatcccacgttccaccaaatttgatttagtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaactttta-aagaacct 12342284  T
Q  231 gtttatgccaaattaagtccatatt 255  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  12342283 gtttatgccaaattaactccatatt 12342259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 36801332 - 36801108
Alignment:
Q  31 ccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgc 130  Q
    |||| |||||||||  ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||   |||||||| ||   ||||||||| || ||||| |||||     
T  36801332 ccaagcccgcaccaaaggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgatttacatcttcaacctgcccacatcccgatacacaaaaccga 36801233  T
Q  131 tcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacct 230  Q
    |  |||||||||| |||  |||      |||||||   ||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||| |  |||||||    
T  36801232 ttttccacagatataatctcacatgccaccaaatttgatttagtaggtaaacgatccctcagcagttgccaagcaaggatataaacttttaagggaacct 36801133  T
Q  231 gtttatgccaaattaagtccatatt 255  Q
     ||||||| ||||||| ||||||||    
T  36801132 atttatgctaaattaactccatatt 36801108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 7031274 - 7031059
Alignment:
Q  31 ccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgc 130  Q
    |||| |||||||||  ||||| || ||||||||||| | |||||||||||| ||||||   |||||||| ||   ||||||||| |  ||||| |||||     
T  7031274 ccaagcccgcaccagaggccacaaagcaccaaaagtcggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgg 7031175  T
Q  131 tcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacct 230  Q
    |  ||||||| || ||| || ||     ||||||||  ||| |||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||    
T  7031174 ttttccacagctaaaatccctcgtgccaccaaattagatttagtaggtaagcgatccctcaacagacgccaagcaaggatagaaagttttaaaggaacct 7031075  T
Q  231 gtttatgccaaattaa 246  Q
    ||||||||||||||||    
T  7031074 gtttatgccaaattaa 7031059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 963325 - 963187
Alignment:
Q  126 accgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagg 225  Q
    |||||||||||| |||||  |  |||| | ||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||  ||||| ||||| | |||    
T  963325 accgctcctccaaagataagaccccacaacttgccaaattttgtttagtaggtaaccggtccctcagcaaacgccaagcaaaaatagacactttcaaagg 963226  T
Q  226 aacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaa 264  Q
     |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||    
T  963225 cacctgtttgtgccaaatcaactccatattttgatgtaa 963187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 255
Target Start/End: Original strand, 19890583 - 19890785
Alignment:
Q  53 aatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccac 152  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||    |||||| |||  ||||||||| |  || || |  || ||||||||| ||  ||||||||    
T  19890583 aatgcaccgaaaattggacaagacaaaaacatatgagtcgtatcttcaacatgcccacatcctgtgacgcaaattcgatcctccacaaatgtaatgccac 19890682  T
Q  153 gatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccat 252  Q
    ||| |||||| ||   ||| |||||||| ||||||||||  |  ||| | |||||||| || ||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  19890683 gatctgccaagttggatttagtaggtaatcgatccctcaacaaccgcaatgcaaggatggaaacttttaaaggaacctgtttatgccagattaactccat 19890782  T
Q  253 att 255  Q
    |||    
T  19890783 att 19890785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 264
Target Start/End: Original strand, 2755843 - 2755958
Alignment:
Q  149 ccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagt 248  Q
    |||||| ||||||||||   ||| ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||  ||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||| || |    
T  2755843 ccacgacttgccaaattttatttagtaggtaaccggtccctcagcaaacgccaagcaaatatagacactttcaaaggtacctgtttgtgccaaatcaact 2755942  T
Q  249 ccatattatggtgtaa 264  Q
    ||||||| || |||||    
T  2755943 ccatattttgatgtaa 2755958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 246
Target Start/End: Original strand, 16178952 - 16179046
Alignment:
Q  152 cgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaa 246  Q
    ||||||||||||||   ||| |||||||  |||||| |||  || ||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16178952 cgatttgccaaattctctttagtaggtagacgatccttcatcaggcgccacgcaaaaatagatactttaagaggtacctgtttatgccaaattaa 16179046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 149 - 286
Target Start/End: Original strand, 15312584 - 15312721
Alignment:
Q  149 ccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagt 248  Q
    ||||||||| |||||||   |||  |||| || |||| |||||| |||| ||||||||  ||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  15312584 ccacgattttccaaattctctttaataggcaaacgattcctcagcagtcaccaagcaaatatatagacttttagaggtacctgtttatgccaaattaact 15312683  T
Q  249 ccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatgtc 286  Q
    ||| ||| || ||||| ||||  || ||||| ||||||    
T  15312684 ccaaattttgatgtaaatgggtatgttcctgcgatgtc 15312721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 149 - 264
Target Start/End: Original strand, 3140853 - 3140968
Alignment:
Q  149 ccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagt 248  Q
    |||||| ||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| |   |||||||||  ||||| ||||| | ||| |||||||| | |||||| || |    
T  3140853 ccacgacttgccaaattttgtttagtaggtaaccggtccctcagtaaatgccaagcaaatatagacactttcaaaggcacctgtttgtaccaaatcaact 3140952  T
Q  249 ccatattatggtgtaa 264  Q
    ||||||| || |||||    
T  3140953 ccatattttgatgtaa 3140968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 18)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 5 - 286
Target Start/End: Original strand, 8299660 - 8299941
Alignment:
Q  5 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaa 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8299660 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatgccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaggacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaa 8299759  T
Q  105 tcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagc 204  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8299760 tcccacatccagcaacacataatcgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagtagtcgccaagc 8299859  T
Q  205 aaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatgtc 286  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8299860 aaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccaaattatggtgtaattggggctactcctgtgatgtc 8299941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 5 - 286
Target Start/End: Original strand, 7924243 - 7924524
Alignment:
Q  5 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaa 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7924243 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatgccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaa 7924342  T
Q  105 tcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagc 204  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  7924343 tcccacatccagcaacgcataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagc 7924442  T
Q  205 aaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatgtc 286  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7924443 aaggatagagactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccacattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtc 7924524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 5 - 286
Target Start/End: Original strand, 171960 - 172241
Alignment:
Q  5 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaa 104  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  171960 tgagagtcgacccctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcgtcaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacat 172059  T
Q  105 tcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagc 204  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  172060 taccacagccagaaacacataaccgctcctccatagatagaatgtcacggtttaccaaattaagttttgtgggtaaccggtccctcagaagtcgccaagc 172159  T
Q  205 aaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatgtc 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  172160 aaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccattttatggtgtaactggttctgctcctgtgatgtc 172241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 286
Target Start/End: Original strand, 13396245 - 13396526
Alignment:
Q  5 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaa 104  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||      
T  13396245 tgagattcgacccctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgt 13396344  T
Q  105 tcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagc 204  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||| || || ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  13396345 tcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccgatctctcaggagtcgccaagc 13396444  T
Q  205 aaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatgtc 286  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13396445 aaggatagatactttgagaggaacttgtttatgccaaattaactccatatgatgatgtaattggggctgctcctgtgatgtc 13396526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 41665640 - 41665371
Alignment:
Q  17 cctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccag 116  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||    
T  41665640 cctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccag 41665541  T
Q  117 aaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatac 216  Q
    ||||||| |||||| |||||| || || |||| || | ||||||||||||  ||||||||||||| |||| || || | |||||||||||||||||||||    
T  41665540 aaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgtcatggtttgccaaattattttttgtaggtaactgatctcttaggaatcgccaagcaaggatagatac 41665441  T
Q  217 tttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatgtc 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41665440 tttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatatgatgatgtaattggggctgctcctgtgatgtc 41665371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 282
Target Start/End: Original strand, 32266419 - 32266698
Alignment:
Q  3 aatgagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgac 102  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||| |||  | |||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  32266419 aatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccacaatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaac 32266518  T
Q  103 aatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaa 202  Q
      ||||||||||||||||||| |||||| |||||| || || ||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  32266519 gttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattacttttcgtaggtaaccgatctctcaaaagtctccaa 32266618  T
Q  203 gcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattggggctgctcctgtga 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || || ||||| |||||    
T  32266619 gcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccaaattatggtgtaactgtggttgctcttgtga 32266698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 286
Target Start/End: Original strand, 9922458 - 9922739
Alignment:
Q  5 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaa 104  Q
    |||||||| || ||||||||||| | |||  | |||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||     
T  9922458 tgagagtcaacccctaccactccaagccatgctcgcaccaatggccataaggcactaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgattgacatcttctacat 9922557  T
Q  105 tcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagc 204  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||| |||||| || || ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  9922558 tcccacaaccagaaacacacatccgcgcctccagaggtaaaatgccacggtttgccaaattatcttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgtcatgc 9922657  T
Q  205 aaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatgtc 286  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  || || ||||| || ||||||||||||||||||    
T  9922658 aaggatagaaactttgagaggaacctgtgtatgccaaattaactccaagttttgatgtaagtgaggctgctcctgtgatgtc 9922739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 116
Target Start/End: Original strand, 20496941 - 20497052
Alignment:
Q  5 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaa 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20496941 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatgccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaa 20497040  T
Q  105 tcccacatccag 116  Q
    ||||||||||||    
T  20497041 tcccacatccag 20497052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 255
Target Start/End: Original strand, 13200006 - 13200230
Alignment:
Q  31 ccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgc 130  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||| |||||  |||||||| |||  |||||| |||| |||||| |||||     
T  13200006 ccaagcccgcaccataggccacaatgcgccaaaaattgggcaagacaaaaacatatgagtcacatcttcaacatgcccacacccagtaacacaaaaccga 13200105  T
Q  131 tcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacct 230  Q
     |||||| || |||||| |  || | |||||||||   |||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  13200106 gcctccataggtagaattctgcgctctgccaaattgtattttgtaggtaaacgatccctcaatagctgccaagcaaggattgaaacttttagaggaacct 13200205  T
Q  231 gtttatgccaaattaagtccatatt 255  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||    
T  13200206 gtttatgccaaactaactccatatt 13200230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 31 - 255
Target Start/End: Original strand, 2170223 - 2170449
Alignment:
Q  31 ccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataac--c 128  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   |||||||| ||   |||||| || |  ||||| |||  |    
T  2170223 ccaagcccgcaccataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacaccccgttacacaaaacacc 2170322  T
Q  129 gctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaac 228  Q
    | |  |||||||||||||| ||||| | | |||||||   ||| |||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  2170323 gattttccacagatagaatcccacgttctaccaaatttgatttagtaggtaaacgatccctcaacggtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaac 2170422  T
Q  229 ctgtttatgccaaattaagtccatatt 255  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  2170423 ctgtttatgccagattaactccatatt 2170449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 255
Target Start/End: Original strand, 20824179 - 20824403
Alignment:
Q  31 ccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgc 130  Q
    |||| |||||||||  ||||| || ||||||||||| | |||||||||||| ||||||   |||||||| ||   ||||||||| |  ||||| |||||     
T  20824179 ccaagcccgcaccagaggccacaaagcaccaaaagtcggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgg 20824278  T
Q  131 tcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacct 230  Q
    |  ||||||| || ||| || ||     ||||||||  ||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  20824279 ttttccacagctataatccctcgtgccaccaaattagatttagtaggtaagcgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacct 20824378  T
Q  231 gtttatgccaaattaagtccatatt 255  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  20824379 gtttatgccaaattaactccatatt 20824403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 255
Target Start/End: Original strand, 37434015 - 37434239
Alignment:
Q  31 ccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgc 130  Q
    |||| |||||||||  ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||   |||||||| ||   ||| ||||| |  ||||| |||||     
T  37434015 ccaagcccgcaccaaaggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccgcatcccgttacacaaaaccga 37434114  T
Q  131 tcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacct 230  Q
    |  |||||||||| ||| ||||| |   |||||||   ||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||| |    
T  37434115 ttttccacagatataatcccacgttccaccaaatttgatttagtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaagaatagagacttttaaaggaacat 37434214  T
Q  231 gtttatgccaaattaagtccatatt 255  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  37434215 gtttatgccaaattaactccatatt 37434239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 255
Target Start/End: Original strand, 43270333 - 43270557
Alignment:
Q  31 ccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgc 130  Q
    |||| |||||||||| | ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   |||||||| ||   |||||| || |  ||||| |||||     
T  43270333 ccaagcccgcaccatagaccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacaacccgttacacaaaaccga 43270432  T
Q  131 tcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacct 230  Q
     | ||||||||||||||  |||| | | |||||||   ||| ||||| || |||||| |||  |||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||    
T  43270433 gcttccacagatagaatctcacgttctaccaaatttgttttagtaggcaaacgatccttcaacagtcgccaagtaaggatagaaacttttaaaggaacct 43270532  T
Q  231 gtttatgccaaattaagtccatatt 255  Q
    |||||||||| || || ||||||||    
T  43270533 gtttatgccagatgaactccatatt 43270557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 173 - 255
Target Start/End: Original strand, 17699507 - 17699589
Alignment:
Q  173 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatatt 255  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17699507 gtaggtaaacgatccctcagcagtcgccaagcaaggatagaaacttttaagggaacctgtttatgccaaattaactccatatt 17699589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 220
Target Start/End: Original strand, 2529769 - 2529958
Alignment:
Q  31 ccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgc 130  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||  || ||| |||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||  |||||| || | |||||| |||||     
T  2529769 ccaagcccgcaccataggccacaatgtgccgaaaattgggcaagacaaaaacaaatgagtcacatcttcaacatgcccacaccctgtaacacaaaaccga 2529868  T
Q  131 tcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttg 220  Q
     |||||| |  |||||| ||||||| | |||||||   |||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||| || ||||||    
T  2529869 gcctccaaaagtagaattccacgatctaccaaattgtattttgtaggtaagcgatccctcaatagccgccaagcaaggattgaaactttg 2529958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 13879744 - 13879522
Alignment:
Q  31 ccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgc 130  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||    | |||||||||||||| |||||| |||||||| |||  ||||||||| |  ||||| | ||      
T  13879744 ccaatcccgcaccataggccacaaagcaccaaagaaaggacaagacaaaaacagatgagacacatcttcaacatgcccacatcccgtgacacaaagccta 13879645  T
Q  131 tcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacct 230  Q
     ||||||  | || |||||||||||||||||||||   ||| |||||||| ||||||||||  |  |||||||||| ||  |  ||||||||||| ||||    
T  13879644 gcctccaacggtaaaatgccacgatttgccaaattggctttagtaggtaaacgatccctcaacaaccgccaagcaaagactgtaactttgagaggtacct 13879545  T
Q  231 gtttatgccaaattaagtccata 253  Q
     ||| ||||| | ||| ||||||    
T  13879544 atttgtgccagactaactccata 13879522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 34137145 - 34137011
Alignment:
Q  106 cccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagca 205  Q
    |||||| |||| | |||| |||||| |||||||||  |  || || || |||||||||||   ||| |||||||| |||||| ||| ||| |||||||||    
T  34137145 cccacaaccagtagcacacaaccgcccctccacaggaatgataccgcggtttgccaaattttctttcgtaggtaaacgatccatcataagccgccaagca 34137046  T
Q  206 aggatagatactttgagaggaacctgtttatgcca 240  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  34137045 agaatagagactttgagaggtacctgtttatgcca 34137011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 160 - 255
Target Start/End: Original strand, 5181682 - 5181777
Alignment:
Q  160 caaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatatt 255  Q
    |||||||  |||||| |||||  ||||||||||  | |||||| |||| ||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  5181682 caaattatcttttgttggtaaatgatccctcagccgccgccaaacaagaatatagacttttagaggcacctgtttatgccaaattatctccatatt 5181777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 5 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 106126 - 105845
Alignment:
Q  5 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaa 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  106126 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatgccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaa 106027  T
Q  105 tcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagc 204  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  106026 tcccacatccagcaacgcataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagc 105927  T
Q  205 aaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatgtc 286  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  105926 aaggatagagactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccacattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtc 105845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 12)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 5 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 4938411 - 4938130
Alignment:
Q  5 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaa 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4938411 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatgccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaa 4938312  T
Q  105 tcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagc 204  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4938311 tcccacatccagcaacgcataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagc 4938212  T
Q  205 aaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatgtc 286  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4938211 aaggatagagactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccacattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtc 4938130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 11277537 - 11277254
Alignment:
Q  3 aatgagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgac 102  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||| |||  | |||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||  ||||||||| ||    
T  11277537 aatgagaatcgactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataatgcactaaaatttacacaagactaaaacaaatgattaacatcttcaac 11277438  T
Q  103 aatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaa 202  Q
      ||||||||||||||||||| |||||| |||||| || || ||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  11277437 gttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattatttttcgtaggtaaccgatctctcaaaagtcgccaa 11277338  T
Q  203 gcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatgtc 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  11277337 gcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatattatggtgtaactggggttgctcctgtgatgtc 11277254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 286
Target Start/End: Original strand, 47876842 - 47877121
Alignment:
Q  7 agagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatc 106  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||  |||||| ||   | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||  ||    
T  47876842 agagtcgacccctaccactcctagccatgcccgcatcaattgtcataatgcactaaaagttgaacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttc 47876941  T
Q  107 ccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaa 206  Q
    || |||||||||||||| |||||| |||||| || || ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  47876942 ccgcatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattattttttgtaggtaactgatctctcagaagtcgccaagcaa 47877041  T
Q  207 ggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatgtc 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  47877042 ggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccctattttgatgtaactggggctgctcctgtgatgtc 47877121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 286
Target Start/End: Original strand, 37919401 - 37919682
Alignment:
Q  5 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaa 104  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||      
T  37919401 tgagattcgacccctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaataaatgattaacatcttcaacgt 37919500  T
Q  105 tcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagc 204  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||| |||||| || || ||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  37919501 tcccacaactagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagc 37919600  T
Q  205 aaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatgtc 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37919601 aaggatagatactttgagaggaacctgtttataccaaattaacttcatatgatgatgtaattggggctgctcctgtgatgtc 37919682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 31177588 - 31177421
Alignment:
Q  5 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaa 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31177588 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatgccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaa 31177489  T
Q  105 tcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagtttt 172  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31177488 tcccacatccagcaacacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgtcaaattaagtttt 31177421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 235722 - 235439
Alignment:
Q  5 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaa 104  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||  |||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||      
T  235722 tgagagtcgacccctaccactccgagccatgcccgcaccattggccataaggcactaaaagttgaacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgt 235623  T
Q  105 tcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaat--taagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaa 202  Q
    || | || ||||||||||| |||||| |||||| || || ||||||||| ||||||||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  235622 tctcgcaaccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaatgattttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaa 235523  T
Q  203 gcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatgtc 286  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  235522 gcaaggatagagactttgagatgaacctgtttatgccaaattaactccatattttgatgtaactggggctgctcctgtgatgtc 235439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 286
Target Start/End: Original strand, 29967830 - 29968113
Alignment:
Q  3 aatgagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgac 102  Q
    ||||||| || || || |||||||||| |||  | |||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  29967830 aatgagaatctactcccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaac 29967929  T
Q  103 aatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaa 202  Q
      ||||||||||||||||||| |||||| |||||| || || ||||||| | ||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| |||||  |||    
T  29967930 gttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccatggtttgccaaattacttttcgtaggtaaccgatctctcaaaagtcctcaa 29968029  T
Q  203 gcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatgtc 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  29968030 gcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatactatggtgtaactggggttgctcctgtgatgtc 29968113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 286
Target Start/End: Original strand, 17720492 - 17720773
Alignment:
Q  5 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaa 104  Q
    |||||||| || ||||||||||| | |||  |  ||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||     
T  17720492 tgagagtcaacccctaccactccaagccatgcttgcaccaatggccataaggcactaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcttcat 17720591  T
Q  105 tcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagc 204  Q
    ||||||| | ||||||||| | |||| |||||| || || ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17720592 tcccacaactagaaacacacatccgcgcctccagaggtaaaatgccacggtttgccaaattatcttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccatgc 17720691  T
Q  205 aaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatgtc 286  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  || || ||||| || ||||||||||||||||||    
T  17720692 aaggatagaaactttgagaggaacctgtgtatgccaaattaactccaagttttgatgtaagtgaggctgctcctgtgatgtc 17720773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 255
Target Start/End: Original strand, 25619346 - 25619566
Alignment:
Q  35 tcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcct 134  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||   |||||||| |||  ||||||||| |  ||||| || || ||||    
T  25619346 tcccgcaccttaggccacaatgcaccgaaaattggacaagacaaaaacatatgattcacatcttcaacatgcccacatcctgtgacacaaaatcggtcct 25619445  T
Q  135 ccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgttt 234  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||| ||   ||| |||||||| || |||||||  |  ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  25619446 ccacagatgcaatgccacgatctgccaagttggatttagtaggtaatcgttccctcaacaaccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgttt 25619545  T
Q  235 atgccaaattaagtccatatt 255  Q
    |||||| ||||| ||||||||    
T  25619546 atgccatattaactccatatt 25619566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 36 - 255
Target Start/End: Original strand, 37254646 - 37254865
Alignment:
Q  36 cccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctc 135  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||   |||||||| | |   |||||| | |  ||||| |||||   |||    
T  37254646 cccgcaccataggccacaatgcaccgaaaattggacaagacaaaaacatatgattcacatcttcaaaatgtccacattccgtgacacaaaaccgagtctc 37254745  T
Q  136 cacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgttta 235  Q
    |||||||| |||||||| || |||||| ||   ||| |||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||| || ||||| | || ||||||||||    
T  37254746 cacagatataatgccacaatctgccaagttggatttagtaggtaaacgatccctcaacaaccgccaagcaaggattgaaacttttaaagtaacctgttta 37254845  T
Q  236 tgccaaattaagtccatatt 255  Q
    ||||| ||||| ||||||||    
T  37254846 tgccagattaactccatatt 37254865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 134 - 255
Target Start/End: Original strand, 18532614 - 18532735
Alignment:
Q  134 tccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtt 233  Q
    |||||||||||||| ||||| | | ||||| |   ||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||    
T  18532614 tccacagatagaattccacgttctaccaaaattgatttagtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatataaacttttaaaggaacctgtt 18532713  T
Q  234 tatgccaaattaagtccatatt 255  Q
    ||||| | ||||| ||||||||    
T  18532714 tatgcgagattaactccatatt 18532735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 88
Target Start/End: Original strand, 18530393 - 18530450
Alignment:
Q  31 ccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatga 88  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  18530393 ccaagcccgcaccataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaacaaatga 18530450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 18)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 5 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 23642874 - 23642593
Alignment:
Q  5 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaa 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23642874 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatgccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaa 23642775  T
Q  105 tcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagc 204  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  23642774 tcccacatccagcaacgcataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagc 23642675  T
Q  205 aaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatgtc 286  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23642674 aaggatagagactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccacattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtc 23642593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 13271174 - 13270893
Alignment:
Q  5 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaa 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  13271174 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatgccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaataaattagtaacatcttcgacaa 13271075  T
Q  105 tcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagc 204  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  13271074 tcccacatccagtaactcataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagc 13270975  T
Q  205 aaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatgtc 286  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13270974 aaggatagagactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccacattatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtc 13270893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 5 - 286
Target Start/End: Original strand, 47418662 - 47418942
Alignment:
Q  5 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaa 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47418662 tgagagtcgacacctac-actcctaaccaatgccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaa 47418760  T
Q  105 tcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagc 204  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47418761 tcccacatcctgcaacgcataaccgctcctccccagatagaatgccacgagttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagtagtcgccaagc 47418860  T
Q  205 aaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatgtc 286  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47418861 aaggatagatactttgagagggacctgtttatgccaaattaagtccatactatggtgtaactggggctgctcctgtgatgtc 47418942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 5 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 47686178 - 47685897
Alignment:
Q  5 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaa 104  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  47686178 tgagagtcgacccctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcactaaaagttgcacaagacaaaaacaaacgagaaacatcttcgacat 47686079  T
Q  105 tcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  47686078 tcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagataaaatgccacggtttgccaaattatgttttgtaggtaaccgatctctcaaaagtcgccaagc 47685979  T
Q  205 aaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatgtc 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  47685978 aaggatagatactttgagaggaacctgtttatgtcaaattaagtccagattatggtgtaacttgggctgctcttgtgatgtc 47685897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 1828823 - 1828542
Alignment:
Q  5 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaa 104  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||  | |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||     
T  1828823 tgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggtcataaagcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgatcaacatcttcaacat 1828724  T
Q  105 tcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagc 204  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||| || || ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||| | ||  |||| ||||||    
T  1828723 tcccacacccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattagtttttgtaggtaacctatctcgcaatagtctccaagc 1828624  T
Q  205 aaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatgtc 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  1828623 aaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatattatgatgtaactggggctgctcctgtgatgtc 1828542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 286
Target Start/End: Original strand, 19755135 - 19755405
Alignment:
Q  19 taccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaa 118  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  19755135 taccactcctagccatgcccgcaccattgaccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgctcccacatccagaa 19755234  T
Q  119 acacataaccgctcctccacag---atagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagata 215  Q
    ||||| |||||| |||||| ||   ||| |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19755235 acacacaaccgcgcctccaaaggtaataaaatgtcacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccgatctctcaggagtcgccaagcaaggatagata 19755334  T
Q  216 ctttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatgtc 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  19755335 ctttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatatgatgatgaaattggggctgctcttgtgatgtc 19755405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 19784671 - 19784401
Alignment:
Q  19 taccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaa 118  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  19784671 taccactcctagccatgcccgcaccattgaccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgctcccacatccagaa 19784572  T
Q  119 acacataaccgctcctccacag---atagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagata 215  Q
    ||||| |||||| |||||| ||   ||| |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19784571 acacacaaccgcgcctccaaaggtaataaaatgtcacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccgatctctcaggagtcgccaagcaaggatagata 19784472  T
Q  216 ctttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatgtc 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  19784471 ctttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatatgatgatgaaattggggctgctcttgtgatgtc 19784401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 286
Target Start/End: Original strand, 15740078 - 15740359
Alignment:
Q  5 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaa 104  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||  | |||||||  |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||  |||     
T  15740078 tgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggccataaggcaccaaaagttagacaagacaaaaacaaatgattaacatctttaacat 15740177  T
Q  105 tcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagc 204  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||| || || |||||||||  ||| |||||||  |||||||||||||||||| | || ||||| ||||||    
T  15740178 tcccacacccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggcttgtcaaattattttttgtaggtaaccgatctcgcaaaagtctccaagc 15740277  T
Q  205 aaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatgtc 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  15740278 aaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatattatggtgtaactggggctgctcctatgatgtc 15740359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 286
Target Start/End: Original strand, 7403770 - 7404051
Alignment:
Q  5 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaa 104  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||  ||| |||||  |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||   |||||||| ||      
T  7403770 tgagagtcgacccctaccactccgagccatgcccacaccaatggccataaggcactaaaagttggacaagacaaaaacaaatgattgacatcttcaacgt 7403869  T
Q  105 tcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagc 204  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||| |||||| |  || ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7403870 tcccgcatccagagacacacaaccgcgcctccaaacgtaaaatgccacggtttgccaaattcttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagc 7403969  T
Q  205 aaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatgtc 286  Q
    ||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||| | |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  7403970 aaggatagagactttgaaatgaacttgtttatgccaaattaacttcatattttgatgtaactggggctgctcctgtgatgtc 7404051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 159974 - 159842
Alignment:
Q  5 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaa 104  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  159974 tgagagtcgacacctaccacttctaaccaatgccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaa 159875  T
Q  105 tcccacatccagaaacacataaccgctcctcca 137  Q
    |||||||||||| ||| ||||| || |||||||    
T  159874 tcccacatccagcaacgcataatcgttcctcca 159842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 255
Target Start/End: Original strand, 12697696 - 12697920
Alignment:
Q  31 ccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgc 130  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||   |||||||| ||   ||| ||||| |  ||||| |||||     
T  12697696 ccaagcccgcaccaaaggccataatgcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccgcatcccgttacacaaaaccga 12697795  T
Q  131 tcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacct 230  Q
    |  ||||||| || ||| ||||| |   |||||||   ||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  12697796 ttttccacagctataatcccacgttccaccaaatttgatttagtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacct 12697895  T
Q  231 gtttatgccaaattaagtccatatt 255  Q
    |||||||||||||||| | ||||||    
T  12697896 gtttatgccaaattaatttcatatt 12697920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 255
Target Start/End: Original strand, 8360983 - 8361207
Alignment:
Q  31 ccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgc 130  Q
    |||| |||||||||  ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||   |||||||| ||   ||||||||| || ||||| |||||     
T  8360983 ccaagcccgcaccaaaggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgatacacaaaaccga 8361082  T
Q  131 tcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacct 230  Q
    |  || ||||||| ||| |||||     |||||||   |||  ||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |  |||||||    
T  8361083 ttttcaacagatataattccacgtgccaccaaatttgatttactaggtaaacgattcctcagcagtcgccaaacaaggatagaaacttttaagggaacct 8361182  T
Q  231 gtttatgccaaattaagtccatatt 255  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  8361183 gtttatgccaaattaactccatatt 8361207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 36 - 255
Target Start/End: Original strand, 20002606 - 20002832
Alignment:
Q  36 cccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccg---ctc 132  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||  || |||||||||||||| ||||   |||||||| |||  ||||||||| |  ||||| |||||   |||    
T  20002606 cccgcaccataggccacaatgcaccgaaaaatggacaagacaaaaacatatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgtgacacaaaaccgagcctc 20002705  T
Q  133 c----tccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaac 228  Q
    |    |||||||||  ||||||||| | |||||| ||   ||| |||||||| ||||||||||  || |||||||||| |||||| ||||| | | ||||    
T  20002706 cacagtccacagatgtaatgccacggtctgccaagttggatttagtaggtaaacgatccctcaacagccgccaagcaatgatagaaacttttaaaagaac 20002805  T
Q  229 ctgtttatgccaaattaagtccatatt 255  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  20002806 ctgtttatgccaaattaactccatatt 20002832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 55725822 - 55725719
Alignment:
Q  152 cgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtcca 251  Q
    |||| |||||||||   |||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  55725822 cgatctgccaaattgtattttgtaggtaagcgatccctcaatagccgccaagcaaggattgaaacttttagaggaacttgtttatgccaaattaactcca 55725723  T
Q  252 tatt 255  Q
    ||||    
T  55725722 tatt 55725719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 173 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 45472824 - 45472742
Alignment:
Q  173 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatatt 255  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45472824 gtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaaacaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatatt 45472742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 11587331 - 11587233
Alignment:
Q  155 tttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccata 253  Q
    |||||||||||   ||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||| ||||||    
T  11587331 tttgccaaattttctttcgtaggtaaacgattcctcagaagccgccaagcaagaatagatactttgataggtatctatttatgccaaattaactccata 11587233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 54483415 - 54483194
Alignment:
Q  32 caatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgct 131  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||||   || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||| |  ||||| | ||       
T  54483415 caatcccgcaccataggccacaaagcaccaaagaatggacaagacaaaaacaaatgagacacatcttcaacatgcccacatcccgtgacacaaagcctag 54483316  T
Q  132 cctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctg 231  Q
    ||||||  |||| |||||| ||||||| ||||||   ||| |||||||| ||||||||||  |  |||||||||| ||  |  ||||| ||||| |||||    
T  54483315 cctccatcgataaaatgccgcgatttgtcaaattggttttagtaggtaaacgatccctcaacaaccgccaagcaaagactgtaacttttagaggtacctg 54483216  T
Q  232 tttatgccaaattaagtccata 253  Q
    ||| ||||| | ||| ||||||    
T  54483215 tttgtgccagactaactccata 54483194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 5790228 - 5790134
Alignment:
Q  152 cgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaa 246  Q
    ||||||||||||||   ||| |||||||| |||||| |||  || | ||| ||||  ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  5790228 cgatttgccaaattctctttagtaggtaaacgatccttcatcaggcaccacgcaaaaatagatactttaagaggtacttgtttatgccaaattaa 5790134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 238; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 5 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 11488 - 11207
Alignment:
Q  5 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaa 104  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||     
T  11488 tgagagtcgacccctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgctccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgaaaaacattttcgacat 11389  T
Q  105 tcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11388 tcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacggtttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctgagaagtcgccaagc 11289  T
Q  205 aaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatgtc 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  11288 aaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccagattatggtgtagctgggtctgctcctgtgatgtc 11207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 15)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 5 - 263
Target Start/End: Original strand, 12733982 - 12734240
Alignment:
Q  5 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaa 104  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12733982 tgagagtcgacccctaccactcctaaccaatcctgcaccatcggccataatgctccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacat 12734081  T
Q  105 tcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagc 204  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12734082 tcccacatctagaaacacataaccgctcctccagagatagaatgccacgggttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagc 12734181  T
Q  205 aaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgta 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12734182 aaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaaatccatattatgatgta 12734240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 286
Target Start/End: Original strand, 2553494 - 2553775
Alignment:
Q  5 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaa 104  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||| |||  |||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||      
T  2553494 tgagaatcgacccctatcactcctagccatgcccgcaccattggtcataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgt 2553593  T
Q  105 tcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagc 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |||||| || || ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  2553594 tcccacatccagaaacacacaactgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccgatctttcaaaagtcgccaagc 2553693  T
Q  205 aaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatgtc 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  2553694 aaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatattatggtgtaactggggctgctcttgtgatgtc 2553775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 24767707 - 24767426
Alignment:
Q  5 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaa 104  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||  |||||||||  || ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| ||      
T  24767707 tgagagtcgacccctaccactccgagccatgcccgcaccaatggtcataaggcactaaaagttggacaagacaaaaacaaattattaacatcttcaacgt 24767608  T
Q  105 tcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagc 204  Q
    |||| || ||| ||||||| |||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  24767607 tcccgcaaccaaaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacgatttgccaaattattttttgtaggtaaccgatccctaagaagtcgtcaagc 24767508  T
Q  205 aaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatgtc 286  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  24767507 aaggatagagactttgataggaacctgtttatgcaaaattaactccatattttgatgtaactagggctgctcctgtgatgtc 24767426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 92 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 18651430 - 18651236
Alignment:
Q  92 acatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctca 191  Q
    |||||||| ||  |||| |||||||| ||||| |||||| | |||| || || ||| ||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18651430 acatcttcaacggtcccgcatccagagacacacaaccgcgcatccaaaggtaaaatcccacggttttccaaattattttttgtaggtaaccgatccctca 18651331  T
Q  192 gaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatgtc 286  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||    
T  18651330 gaagtcgccaagcaaggatagagactttgagaggaacctgtttatgccaaattaactccatattttgatctaactggggctgctcctgtgatgtc 18651236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 169 - 286
Target Start/End: Original strand, 21168220 - 21168337
Alignment:
Q  169 ttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattgg 268  Q
    |||||||||||| |||||   || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  21168220 ttttgtaggtaatcgatcttgcaaaagtctccaagctaggatagatactttgagaggaacctatttatgccaaattaactccatattatggtgtaactgg 21168319  T
Q  269 ggctgctcctgtgatgtc 286  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21168320 ggctgctcctgtgatgtc 21168337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 14373244 - 14373026
Alignment:
Q  35 tcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcct 134  Q
    ||||||||||  | |||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||   ||||||||  ||  |||| | || |||||||| |||||| |||    
T  14373244 tcccgcaccaaagaccataaggcaccaaaaaatggacaagacaaaaacaaatgatttacatcttcatcatgcccataaccggaaacacacaaccgcccct 14373145  T
Q  135 ccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgttt 234  Q
    ||| ||| | ||||||||| |||||||||||   ||| |||||||| |  | ||||| |||  |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14373144 ccatagaaataatgccacggtttgccaaatttcctttcgtaggtaagccgttcctcaaaagctgccaagcaagaatagatacttttagaggtacctgttt 14373045  T
Q  235 atgccaaattaagtccata 253  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  14373044 atgccaaattaaatccata 14373026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 20883284 - 20883066
Alignment:
Q  37 ccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctcc 136  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||   | |||||| |||  ||||||||| |  ||||| |||||  |||||    
T  20883284 ccgcaccataggccacaatgcaccgaaaattggacaagacaaaaacatatgattcatatcttcaacatgcccacatcccgtgacacaaaaccgagcctcc 20883185  T
Q  137 acagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttat 236  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||| ||   ||| |||||||| | ||||||||  || ||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||    
T  20883184 acagatataatgccacgatctaccaagttcgatttagtaggtaaacaatccctcaacagccgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctatttat 20883085  T
Q  237 gccaaattaagtccatatt 255  Q
    |||| ||||| ||||||||    
T  20883084 gccagattaactccatatt 20883066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 17579338 - 17579114
Alignment:
Q  31 ccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgc 130  Q
    |||| |||||||||  ||||| || ||||||||||| | |||||||||||| ||||||   |||||||| ||   ||||||||| |  ||||| |||||     
T  17579338 ccaagcccgcaccagaggccacaaggcaccaaaagtcggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgg 17579239  T
Q  131 tcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacct 230  Q
    |  ||||||| || ||| || ||     ||||||||  ||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  17579238 ttttccacagctataatccctcgtgccaccaaattagatttagtaggtaagcgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacct 17579139  T
Q  231 gtttatgccaaattaagtccatatt 255  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  17579138 gtttatgccaaattaactccatatt 17579114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 17573912 - 17573688
Alignment:
Q  31 ccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgc 130  Q
    |||| |||||||||  ||||| || ||||||||||| | |||||||||||| ||||||   |||||||| ||   ||||||||| |  ||||| |||||     
T  17573912 ccaagcccgcaccagaggccacaaggcaccaaaagtcggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgttacacaaaaccgg 17573813  T
Q  131 tcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacct 230  Q
    |  ||||||| || ||| || ||     ||||||||  ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||    
T  17573812 ttttccacagctataatccctcgtgccaccaaattagatttagtaggtaagcgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaatcttttaaaggaacct 17573713  T
Q  231 gtttatgccaaattaagtccatatt 255  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  17573712 gtttatgccaaattaactccatatt 17573688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 10577490 - 10577282
Alignment:
Q  47 ggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaa 146  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||   |||||||| ||   ||| ||||| |  ||||| ||||| |  ||||||| || ||    
T  10577490 ggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccgcatcccgttacacaaaaccgattttccacagttataa 10577391  T
Q  147 tgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaa 246  Q
    | ||||| |   |||||||   ||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10577390 tcccacgttccaccaaatttgatttagtaggtaaacgatccctcaacagtcgccaagcaaggatataaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaa 10577291  T
Q  247 gtccatatt 255  Q
     || |||||    
T  10577290 ctctatatt 10577282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 21630366 - 21630140
Alignment:
Q  31 ccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccagaaacacataaccgc 130  Q
    |||| |||||||||  ||||| || ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||   |||||||| ||   ||| ||||| |  ||||| |||||     
T  21630366 ccaagcccgcaccaaaggccacaaagcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccgcatcccgttacacaaaaccga 21630267  T
Q  131 tcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaag--ttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaac 228  Q
    |  |||||||||| ||| ||||| |   |||||||     |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||    
T  21630266 ttttccacagatataatcccacgttccaccaaatttttgattttgtaggtaaacgatccctcaatagtcgccaaacaaggatagaaacttttaaaggaac 21630167  T
Q  229 ctgtttatgccaaattaagtccatatt 255  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  21630166 ctggttatgccaaattaactccatatt 21630140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 173 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 17606449 - 17606367
Alignment:
Q  173 gtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatatt 255  Q
    ||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17606449 gtaggtaaatgatccctcaacagtcgccaagcaaggatagaaacttttaaaggaacctgtttatgccaaattaactccatatt 17606367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15958946 - 15958846
Alignment:
Q  155 tttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatat 254  Q
    |||||||||||   ||| ||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||    
T  15958946 tttgccaaatttgctttcgtaggtaaatgatccctcaaaagccgccaagcaagaatagagactttaagaggaacctgtttatgccatattaacttcatat 15958847  T
Q  255 t 255  Q
    |    
T  15958846 t 15958846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 119
Target Start/End: Original strand, 21168082 - 21168196
Alignment:
Q  5 tgagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaa 104  Q
    ||||| ||||| || |||||||||| |||  | |||| ||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||     
T  21168082 tgagaatcgacccccaccactcctagccatgctcgcatcaatggccataaagcaccaaaagttacacaagacaaaaacatatgattaacatcttcaacat 21168181  T
Q  105 tcccacatccagaaa 119  Q
    ||||||| |||||||    
T  21168182 tcccacacccagaaa 21168196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 264
Target Start/End: Original strand, 13937678 - 13937816
Alignment:
Q  126 accgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagcaaggatagatactttgagagg 225  Q
    |||||||||||| |||||  |  |||| | ||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||  ||||| ||||| | |||    
T  13937678 accgctcctccaaagataagaccccacaacttgccaaattttgtttagtaggtaaccggtccctcagcaaacgccaagcaaaaatagacactttcaaagg 13937777  T
Q  226 aacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaa 264  Q
     |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||    
T  13937778 cacctgtttgtgccaaatcaactccatattttgatgtaa 13937816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 286
Target Start/End: Original strand, 3107 - 3390
Alignment:
Q  3 aatgagagtcgacacctaccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgac 102  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  3107 aatgagagtcgactcccaccactcctaaccatgctcgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaac 3206  T
Q  103 aatcccacatccagaaacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaa 202  Q
      ||||||||||||||||||| |||||| |||||| || || ||||||| | |||||||||||   ||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  3207 gttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccatggtttgccaaattgcttttcgtaggtaaccgatctctcaaaagtctccaa 3306  T
Q  203 gcaaggatagatactttgagaggaacctgtttatgccaaattaagtccatattatggtgtaattggggctgctcctgtgatgtc 286  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  3307 gcaaggatagaaactttaagaggaacctgtttatgccaaattaactccatattatggtgtaactagggttgctcctgtgatgtc 3390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University