View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6802_low_16 (Length: 336)

Name: NF6802_low_16
Description: NF6802
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6802_low_16
NF6802_low_16
[»] chr4 (30 HSPs)
chr4 (2-333)||(71627-71958)
chr4 (2-333)||(13624569-13624900)
chr4 (2-333)||(50277844-50278175)
chr4 (11-258)||(51685834-51686081)
chr4 (11-333)||(8109850-8110172)
chr4 (11-333)||(10730030-10730352)
chr4 (11-333)||(10943799-10944121)
chr4 (11-313)||(44677040-44677342)
chr4 (2-240)||(50904053-50904291)
chr4 (11-333)||(21018628-21018950)
chr4 (11-198)||(46438767-46438954)
chr4 (1-313)||(14317298-14317610)
chr4 (11-219)||(50020836-50021044)
chr4 (6-237)||(41931108-41931339)
chr4 (11-219)||(37016735-37016943)
chr4 (65-244)||(30706657-30706836)
chr4 (8-255)||(30723877-30724124)
chr4 (8-333)||(6178840-6179165)
chr4 (8-333)||(49168207-49168532)
chr4 (8-240)||(40355546-40355778)
chr4 (8-333)||(31424436-31424761)
chr4 (8-333)||(49093117-49093443)
chr4 (8-333)||(1306170-1306497)
chr4 (11-124)||(50196100-50196213)
chr4 (8-240)||(41796168-41796400)
chr4 (92-324)||(55278829-55279060)
chr4 (2-145)||(21535440-21535583)
chr4 (153-218)||(40886781-40886846)
chr4 (277-333)||(30706869-30706925)
chr4 (277-333)||(50196295-50196351)
[»] chr6 (15 HSPs)
chr6 (1-333)||(24085850-24086184)
chr6 (2-333)||(32642582-32642912)
chr6 (5-333)||(18005475-18005803)
chr6 (11-246)||(31770773-31771008)
chr6 (2-258)||(26172600-26172864)
chr6 (11-255)||(26440140-26440384)
chr6 (18-244)||(3384135-3384361)
chr6 (8-333)||(22303926-22304251)
chr6 (23-239)||(2406954-2407170)
chr6 (226-333)||(32641897-32642004)
chr6 (8-333)||(6203845-6204170)
chr6 (8-333)||(11690812-11691137)
chr6 (8-333)||(30826654-30826979)
chr6 (129-333)||(2406059-2406263)
chr6 (8-258)||(27638444-27638694)
[»] chr3 (30 HSPs)
chr3 (8-333)||(48891213-48891538)
chr3 (2-333)||(42804993-42805324)
chr3 (3-287)||(50758790-50759074)
chr3 (2-333)||(30253126-30253457)
chr3 (23-270)||(17562438-17562685)
chr3 (8-333)||(36130181-36130506)
chr3 (2-333)||(20353231-20353562)
chr3 (2-246)||(41614959-41615202)
chr3 (8-333)||(2272088-2272413)
chr3 (32-333)||(599587-599888)
chr3 (8-270)||(4005506-4005767)
chr3 (11-322)||(49266412-49266723)
chr3 (2-333)||(48565566-48565890)
chr3 (67-333)||(9473034-9473300)
chr3 (23-246)||(42759373-42759596)
chr3 (11-246)||(47071299-47071534)
chr3 (12-239)||(44232418-44232645)
chr3 (15-219)||(16646211-16646414)
chr3 (8-333)||(42901192-42901517)
chr3 (8-333)||(46698347-46698672)
chr3 (8-333)||(46401401-46401726)
chr3 (8-333)||(49141550-49141875)
chr3 (8-333)||(50477809-50478134)
chr3 (99-246)||(6927918-6928065)
chr3 (158-333)||(52388630-52388805)
chr3 (11-112)||(51807875-51807976)
chr3 (8-333)||(54388821-54389146)
chr3 (8-333)||(34048121-34048446)
chr3 (99-333)||(50214199-50214426)
chr3 (8-110)||(52388827-52388929)
[»] chr5 (16 HSPs)
chr5 (3-333)||(8699462-8699792)
chr5 (11-246)||(38407967-38408202)
chr5 (8-333)||(8577575-8577900)
chr5 (14-333)||(5199469-5199781)
chr5 (35-333)||(7760060-7760351)
chr5 (11-333)||(511646-511961)
chr5 (2-233)||(42538483-42538714)
chr5 (12-219)||(42937788-42937994)
chr5 (2-244)||(38970731-38970973)
chr5 (8-270)||(8752-9014)
chr5 (25-244)||(15939358-15939577)
chr5 (8-333)||(28879294-28879619)
chr5 (8-333)||(19038199-19038524)
chr5 (8-333)||(28238769-28239094)
chr5 (8-331)||(30707743-30708066)
chr5 (128-218)||(40623144-40623234)
[»] chr1 (23 HSPs)
chr1 (2-333)||(49855053-49855383)
chr1 (2-313)||(47505031-47505341)
chr1 (11-246)||(19522394-19522629)
chr1 (2-333)||(47660562-47660893)
chr1 (35-333)||(52804590-52804888)
chr1 (8-333)||(19158716-19159041)
chr1 (11-333)||(22526701-22527016)
chr1 (2-258)||(45828266-45828521)
chr1 (2-244)||(11196552-11196794)
chr1 (45-244)||(38120284-38120483)
chr1 (11-333)||(95132-95447)
chr1 (23-333)||(31780697-31781000)
chr1 (8-333)||(13637036-13637361)
chr1 (2-121)||(35256509-35256628)
chr1 (2-108)||(50341404-50341510)
chr1 (153-246)||(21143777-21143870)
chr1 (8-126)||(3729587-3729705)
chr1 (8-246)||(26878412-26878650)
chr1 (176-333)||(16269827-16269984)
chr1 (207-333)||(50617929-50618055)
chr1 (271-333)||(51336863-51336925)
chr1 (23-96)||(21143690-21143763)
chr1 (170-333)||(3729379-3729542)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (2-333)||(12040-12371)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (1-333)||(51771-52103)
chr8 (11-333)||(34819646-34819968)
chr8 (2-240)||(39831872-39832110)
chr8 (25-333)||(39604001-39604308)
chr8 (2-333)||(21176349-21176680)
chr8 (11-313)||(20858712-20859014)
chr8 (11-333)||(34367646-34367968)
chr8 (25-333)||(40075736-40076037)
chr8 (12-333)||(35554295-35554609)
chr8 (2-313)||(5301363-5301674)
chr8 (6-333)||(45132433-45132760)
chr8 (1-267)||(5679548-5679816)
chr8 (8-333)||(15033801-15034126)
chr8 (11-219)||(41243215-41243423)
chr8 (11-219)||(43214102-43214310)
chr8 (8-333)||(1055222-1055547)
chr8 (8-333)||(23019323-23019648)
chr8 (8-333)||(26662143-26662468)
chr8 (8-333)||(22532-22857)
chr8 (158-253)||(30761402-30761497)
chr8 (8-333)||(42482542-42482867)
chr8 (8-333)||(486769-487094)
chr8 (242-333)||(41243120-41243211)
chr8 (277-333)||(43214349-43214405)
[»] chr7 (27 HSPs)
chr7 (2-333)||(47670239-47670570)
chr7 (2-333)||(36980250-36980579)
chr7 (4-253)||(9491976-9492225)
chr7 (2-270)||(5538650-5538918)
chr7 (2-333)||(13322724-13323055)
chr7 (2-333)||(27450723-27451054)
chr7 (12-258)||(16680159-16680405)
chr7 (12-258)||(17654395-17654641)
chr7 (11-333)||(10521530-10521851)
chr7 (2-212)||(11630418-11630628)
chr7 (8-333)||(17837656-17837974)
chr7 (32-246)||(34741448-34741662)
chr7 (2-191)||(11632680-11632869)
chr7 (2-333)||(37342935-37343271)
chr7 (8-258)||(42505045-42505295)
chr7 (8-333)||(41883236-41883561)
chr7 (8-333)||(48406054-48406379)
chr7 (131-333)||(47522013-47522215)
chr7 (8-333)||(9368438-9368763)
chr7 (8-258)||(17460373-17460623)
chr7 (8-258)||(17592591-17592841)
chr7 (8-333)||(35607427-35607752)
chr7 (56-333)||(15071319-15071596)
chr7 (153-240)||(41734613-41734700)
chr7 (287-333)||(9491930-9491976)
chr7 (277-333)||(11630317-11630373)
chr7 (277-313)||(17747741-17747777)
[»] chr2 (17 HSPs)
chr2 (12-333)||(7416482-7416803)
chr2 (2-333)||(40538229-40538546)
chr2 (11-333)||(29398641-29398963)
chr2 (14-333)||(10825954-10826266)
chr2 (11-333)||(39950193-39950515)
chr2 (11-324)||(36653541-36653854)
chr2 (14-270)||(7189515-7189771)
chr2 (8-333)||(28471224-28471549)
chr2 (8-333)||(45431201-45431526)
chr2 (8-333)||(15833952-15834277)
chr2 (8-333)||(30493997-30494322)
chr2 (8-333)||(5354667-5354992)
chr2 (8-333)||(17423162-17423487)
chr2 (8-333)||(43981217-43981542)
chr2 (8-333)||(43536740-43537065)
chr2 (8-126)||(22680215-22680332)
chr2 (95-324)||(20067502-20067730)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (207-313)||(56473-56579)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 30)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Original strand, 71627 - 71958
Alignment:
Q  2 caggctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||| |||    
T  71627 caggctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattatgtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttggccgagagggttttgaggcagtacggat 71726  T
Q  102 acgtccagaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  71727 acgtccagaccatccctagacatctgtcggatgttgtagagctgtcatcggctcagattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggc 71826  T
Q  202 ggccaattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcactt 301  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  71827 ggccgattggggtgagcatgcaggagagcagacatggcgtatggcggatggctatgtacgatggtacaccgttgtgtctcaccctcagattttgtcactt 71926  T
Q  302 cttctaggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  71927 cttctaggagatattctgaggcctccaaatga 71958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 13624900 - 13624569
Alignment:
Q  2 caggctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagat 101  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||| | |||||||||||||| |||    
T  13624900 caggctttcgaggaagtattctggtattcaggttggattatgtgcggtgatcgtagggcgtaccgtcacttgcccaagagggttttgaggcagtacggat 13624801  T
Q  102 acgtccagaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggc 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13624800 acgtccagaccgtccctagacatccgtcggatgttgtagatctgtcaccggctgagattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggc 13624701  T
Q  202 ggccaattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcactt 301  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||||||||||||||||||  ||| |    
T  13624700 ggccgattggggtgagcatgcaagagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtatgatggtacatcgttgtgtctcaccctcagatttttccacat 13624601  T
Q  302 cttctaggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  13624600 cttccaggagatattctgatgcctccaaatga 13624569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Original strand, 50277844 - 50278175
Alignment:
Q  2 caggctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagat 101  Q
    |||| ||| |||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||    
T  50277844 caggattttgaggaggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgtttgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggat 50277943  T
Q  102 acgtccagaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggc 201  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||| || ||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50277944 acgtccagaccgtccccagacatccgacggatgttgtagagttgccaccgcctcatattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggc 50278043  T
Q  202 ggccaattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcactt 301  Q
     ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||   |||| ||||      |||||||||||| |||||||||| |    
T  50278044 agccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatggctatgtgttatggcacactagggtgtctcaccctcatattttgtcacct 50278143  T
Q  302 cttctaggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||  |||||||    
T  50278144 cttccaggagatcttccgaggccagcaaatga 50278175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Original strand, 51685834 - 51686081
Alignment:
Q  11 gaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccaga 110  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  51685834 gaggaggttttctggtattcaggctggattatatgcggtgttcgtagggtctaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacagatacgtccaga 51685933  T
Q  111 ccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattg 210  Q
    || |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  | |||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51685934 ccgtccctagacatccgacggatgttgtagagctgccaccgcctcagattgtgcaggcattcgtcaacttctgcactcacacgcttaaggcggccgattg 51686033  T
Q  211 gggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgt 258  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  51686034 gggtgagcaggcaggagaacagacatggcggatgacagatggctatgt 51686081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 333
Target Start/End: Original strand, 8109850 - 8110172
Alignment:
Q  11 gaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccaga 110  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  8109850 gaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgtggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtccaga 8109949  T
Q  111 ccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattg 210  Q
    || |||| ||||||||  || |||||||||||||| ||  | |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  8109950 ccgtccccagacatccgacgaatgttgtagagctgccaccgtctcagattgtgcaggcattcgtcgactttcgcactcatacgcttaaggcagccgattg 8110049  T
Q  211 gggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttctagga 310  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||   ||||| |||||||||||   |||||||||      ||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||    
T  8110050 gggtgagcaggcaagagagcagacatggttgatggcggatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcagatttttccacatcttccagga 8110149  T
Q  311 gatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    ||| ||| ||||||  |||||||    
T  8110150 gatcttccgaggccagcaaatga 8110172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 10730352 - 10730030
Alignment:
Q  11 gaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccaga 110  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||  |||||||| |||||| |||| ||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  10730352 gaggaggttttctggtatttaggctggattttgtgcggtgttcgtagagtgtaccgtcacttgcctgagagggttttgaggcagtacagatacgtccaga 10730253  T
Q  111 ccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattg 210  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||  |  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  10730252 ccatccctagaaatccgacggatgttgttgagctgctaccgcctcagattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgctgaaggaggccgattg 10730153  T
Q  211 gggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttctagga 310  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||| ||||||   || ||||||||   |||||||||      ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  10730152 gggtgagcaggcacgagagcagacatgacgtatgagggagggctatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccagga 10730053  T
Q  311 gatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    ||| ||| ||||||  |||||||    
T  10730052 gatcttccgaggccagcaaatga 10730030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 10944121 - 10943799
Alignment:
Q  11 gaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccaga 110  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||  |||||||| |||||| |||| ||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  10944121 gaggaggttttctggtatttaggctggattttgtgcggtgttcgtagagtgtaccgtcacttgcctgagagggttttgaggcagtacagatacgtccaga 10944022  T
Q  111 ccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattg 210  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||  |  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  10944021 ccatccctagaaatccgacggatgttgttgagctgctaccgcctcagattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgctgaaggaggccgattg 10943922  T
Q  211 gggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttctagga 310  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||| ||||||   || ||||||||   |||||||||      ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  10943921 gggtgagcaggcacgagagcagacatgacgtatgagggagggctatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccagga 10943822  T
Q  311 gatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    ||| ||| ||||||  |||||||    
T  10943821 gatcttccgaggccagcaaatga 10943799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 44677342 - 44677040
Alignment:
Q  11 gaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccaga 110  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||| ||| ||| | |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  44677342 gaggaggttttttggtattctggctggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccaagagggttttgaggcagtacggatacatccaga 44677243  T
Q  111 ccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattg 210  Q
    ||||||| || ||||   | ||||||||| | ||  ||  | || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44677242 ccatccccaggcatctgactgatgttgtaaacctcccaccgccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattg 44677143  T
Q  211 gggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttctagga 310  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||  ||||| ||||||| ||| | |||||||||      ||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||    
T  44677142 gggtgagcaggcaggagaacagacatggcacatggcggatggctgtgtgctatggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctcttccagga 44677043  T
Q  311 gat 313  Q
    |||    
T  44677042 gat 44677040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 50904053 - 50904291
Alignment:
Q  2 caggctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagat 101  Q
    |||| ||| |||||||  || |||| |||||| ||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||    
T  50904053 caggattttgaggagggtttttggttttcaggttggatcatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgtccgagagggttttgaggcagtacagat 50904152  T
Q  102 acgtccagaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggc 201  Q
    ||||||||||| |||| || |||||  ||||||||||||||||  ||  | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  50904153 acgtccagaccgtccccaggcatccgacggatgttgtagagcttccaccgcctcatattgtgcaggcgttcgtcgatttccgcactcacacgcttaaggt 50904252  T
Q  202 ggccaattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcg 240  Q
    |||| |||| |||||||| | || |||||||||||||||    
T  50904253 ggccgattgaggtgagcaggtaggagagcagacatggcg 50904291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 21018950 - 21018628
Alignment:
Q  11 gaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccaga 110  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||   |||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  21018950 gaggaggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgtctgtagcgtgtaccgtcactttcccgagaaggttttgaggcagtacggatacgtgcaga 21018851  T
Q  111 ccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattg 210  Q
    ||||||| ||||||||  | ||||||   || ||  ||  | ||   ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |    
T  21018850 ccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgcctttcattatgcaggtgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgatcg 21018751  T
Q  211 gggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttctagga 310  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||      |||||||||| |||| ||| ||| ||||| ||||    
T  21018750 gggtgagcaggcaggagaggagacatggcggatggcggatggctatgtcctatggtacactagggtgtctcaccctaagatcttgccacctcttccagga 21018651  T
Q  311 gatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    ||| ||| ||||||| |||||||    
T  21018650 gatcttccgaggcctgcaaatga 21018628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Original strand, 46438767 - 46438954
Alignment:
Q  11 gaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccaga 110  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  46438767 gaggagatattctagtattcaggctggattatttgcggtgttcgtagggtgtaccgttacttgcccgagagggttttgaggcagtacagatacgtccaga 46438866  T
Q  111 ccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaa 198  Q
       |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  | |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46438867 gggtccctagacatccgacggatgttgtagagctgacaccgcctcagattgtgcagacattcgtcgacttccgcactcacacgcttaa 46438954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 14317298 - 14317610
Alignment:
Q  1 tcaggctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacaga 100  Q
    ||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || |||||| ||||||| | ||||||||| |||||||    
T  14317298 tcagggttttgaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtataccatcacttgcccgagagggttttgaggcggtacaga 14317397  T
Q  101 tacgtccagaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaagg 200  Q
    |||||||| ||  ||||||| |||||  ||||||||||||||||| || |  |||| |||||||| || ||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  14317398 tacgtccaaactgtccctagtcatccgacggatgttgtagagctgccactacctcagattgtgcaagcatttcttgacttccgcactcacacgcttaagg 14317497  T
Q  201 cggccaattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcact 300  Q
     | |  | ||||||||||  || | |||||| ||||||||||||   || ||||||||   |||||||||      |||||||||||| |||||| |||     
T  14317498 agcctgaatggggtgagccggcgggagagcaaacatggcgtatgagggagggctatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccctcatattttgccacc 14317597  T
Q  301 tcttctaggagat 313  Q
    ||||| |||||||    
T  14317598 tcttccaggagat 14317610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 50021044 - 50020836
Alignment:
Q  11 gaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccaga 110  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| | |||||||| |    
T  50021044 gaggaggttttctggtattcaggttggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacgggtacgtccata 50020945  T
Q  111 ccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattg 210  Q
    || |||| ||||||||  ||||||||||||||||  ||  | |||| ||||||||||| |||||| |||  |||||||||| ||| |||| |||| ||||    
T  50020944 ccgtccccagacatccgacggatgttgtagagctaccaccgactcagattgtgcaggcattcgtcaactctcgcactcacatgctcaaggaggccgattg 50020845  T
Q  211 gggtgagca 219  Q
    |||||||||    
T  50020844 gggtgagca 50020836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 41931339 - 41931108
Alignment:
Q  6 ctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgt 105  Q
    |||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||| |||| |||| |  ||||| ||| | ||||||||||| || |||||||    
T  41931339 cttttgaggaggttttctggtattaaggatggattatgtgcggtgttcgtagagtgtaccgttatctacccaagagggttttgaggcagcacggatacgt 41931240  T
Q  106 ccagaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggcc 205  Q
    ||| ||  |||||||||||||  | |||||||| |||||| ||  | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  41931239 ccaaacagtccctagacatccgactgatgttgttgagctgccaccgcctcagattgtgcagactttcgtcgacttccgcactcacatgattaaggaggcc 41931140  T
Q  206 aattggggtgagcatgcagaagagcagacatg 237  Q
     ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  41931139 gattggggtgagcaggcagcagagcagacatg 41931108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 37016943 - 37016735
Alignment:
Q  11 gaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccaga 110  Q
    |||||||| || |||||||| || ||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||| ||| |||||||| |||    
T  37016943 gaggaggttttctggtattctggttggattatgtgtggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcaatacggatacgtcaaga 37016844  T
Q  111 ccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattg 210  Q
    ||||||| |||||||   ||||||||||||| ||  ||| | || | ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  37016843 ccatccccagacatctgacggatgttgtagacctcccatcgccttacattgtgcagacgttcgttgacttccgcactcacacacttaaggcggacgattg 37016744  T
Q  211 gggtgagca 219  Q
    |||||||||    
T  37016743 gggtgagca 37016735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 65 - 244
Target Start/End: Original strand, 30706657 - 30706836
Alignment:
Q  65 cgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccagaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgc 164  Q
    |||||||| || |||| | | ||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  | |||| |||||||    
T  30706657 cgtcacttgcctgagagggtgttgaggcagtacgaatacgtctagacgatccctagacatccgacggatgttgtagagctgacaccgcctcagattgtgc 30706756  T
Q  165 aggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatg 244  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  30706757 aggcattcgtagacttctgcactcacacgtttaaggaggccgattggggtgagctggcagcagagcagacatggcgtatg 30706836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 30724124 - 30723877
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |    
T  30724124 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 30724025  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||   || ||  ||  | ||   |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  30724024 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttcaattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacga 30723925  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggcta 255  Q
    | |||||||||| |||| |||| | ||||||||  |||| ||||||||    
T  30723924 tcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggcta 30723877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 6179165 - 6178840
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |    
T  6179165 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 6179066  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||   || ||  |   | ||   |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  6179065 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgc 6178966  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttcta 307  Q
    | |||||||||| |||| |||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |  ||||||||      ||||||||||||||| ||| ||| | ||| |    
T  6178965 tcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 6178866  T
Q  308 ggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||    
T  6178865 ggagatcttccgaggcctgcaaatga 6178840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 333
Target Start/End: Original strand, 49168207 - 49168532
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |    
T  49168207 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 49168306  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||   || ||  |   | ||   |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  49168307 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgc 49168406  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttcta 307  Q
    | |||||||||| |||| |||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |  ||||||||      ||||||||||||||| ||| ||| | ||| |    
T  49168407 tcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 49168506  T
Q  308 ggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||    
T  49168507 ggagatcttccgaggcctgcaaatga 49168532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 40355778 - 40355546
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||  |||  |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  40355778 ttcgaggaggttttatggtattctgggtggattatgtgtagtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtcc 40355679  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||||||||||||  | | ||||   || ||  ||  | ||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  40355678 agaccatccctagacatccgactgctgttagggacctcccaccgtcttccattgtgcaggtgttcgtcgacttccgcactcacacgattaaggcggacga 40355579  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcg 240  Q
    | |||||||||| |||| |||| | ||||||||    
T  40355578 tcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcg 40355546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 333
Target Start/End: Original strand, 31424436 - 31424761
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |    
T  31424436 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 31424535  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||   || ||  |   | ||   |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  31424536 agaccatccccagacatccgactgatgttaaggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgc 31424635  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttcta 307  Q
    | |||||||||| |||| |||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |  ||| ||||      ||||||||||||||| ||| ||| | ||| |    
T  31424636 tcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggcacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 31424735  T
Q  308 ggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||    
T  31424736 ggagatcttccgaggcctgcaaatga 31424761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 333
Target Start/End: Original strand, 49093117 - 49093443
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |    
T  49093117 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 49093216  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||   || ||  |   | ||   |||||||||   ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |      
T  49093217 agaccatccctagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcatcgacttccgcactcacatgcttaaggcggacgc 49093316  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacat-ggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttct 306  Q
    | |||||||||| |||| |||| | |||| ||||  |||| ||||||||||| |  ||||||||      ||||||||||||||| ||| ||| | |||     
T  49093317 tcggggtgagcaggcaggagaggatacatgggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcc 49093416  T
Q  307 aggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  49093417 aggagatcttccgaggcctgcaaatga 49093443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 1306497 - 1306170
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |    
T  1306497 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 1306398  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||   || ||  |   | ||   |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  1306397 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgc 1306298  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatg--gcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttc 305  Q
    | |||||||||| | || |||| | |||||  |||  |||| ||||||||||| |  ||||||||      ||||||||||||||| ||| ||| | |||    
T  1306297 tcggggtgagcaggtaggagaggatacatggcgcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattc 1306198  T
Q  306 taggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
     ||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  1306197 caggagatcttccgaggcctgcaaatga 1306170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 124
Target Start/End: Original strand, 50196100 - 50196213
Alignment:
Q  11 gaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccaga 110  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||     
T  50196100 gaggaggttttctggtattcaggttggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgttcagg 50196199  T
Q  111 ccatccctagacat 124  Q
    || |||| ||||||    
T  50196200 ccgtccccagacat 50196213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 41796400 - 41796168
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||||| |  |||||||||| | ||||||| ||||||| | |||||||||| ||| ||||||| |    
T  41796400 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtactgtcacttgcccgagagggttttgaggcaatacggatacgtgc 41796301  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||   || ||  ||  | ||   |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |      
T  41796300 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgc 41796201  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcg 240  Q
     ||||||||||| | || |||| ||||||||||    
T  41796200 ctggggtgagcaggtaggagaggagacatggcg 41796168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 55279060 - 55278829
Alignment:
Q  92 cagtacagatacgtccagaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcaca 191  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||  | |||||||| ||||||| || || ||| |||||||||||  || | || || || ||| |||    
T  55279060 cagtacaaatacgtccagaacatccctaga-atccgactgatgttgttgagctgtgatcggatcagattgtgcaggcactccttgagtttcgtacttaca 55278962  T
Q  192 cgcttaaggcggccaattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagat 291  Q
     | |||||| | || |||| |||||||   || ||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||      | ||||||||| |||    
T  55278961 tgattaaggagcccgattgaggtgagccaacaaaagaggagacatggcggatggaggatggctatgtactatggtacactagggtgactcaccctctgat 55278862  T
Q  292 tttgtcacttcttctaggagatattctgaggcc 324  Q
    |||| ||||||||| |||| || ||| ||||||    
T  55278861 tttgccacttcttccaggatatcttccgaggcc 55278829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 21535583 - 21535440
Alignment:
Q  2 caggctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagat 101  Q
    |||| ||| |||||| | ||||| |||||||||| | ||| |||| ||| |  ||||||||  |||||||| || ||||   ||||| ||| |||| |||    
T  21535583 cagggttttgaggagattttatgttattcaggctaggttatgtgcagtgttattagggtgtatcgtcacttgcctgagagagttttgcggctgtacggat 21535484  T
Q  102 acgtccagaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctg 145  Q
    | ||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21535483 atgtcgagaccgtccctagacatccgacggatgttgtagagctg 21535440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 40886846 - 40886781
Alignment:
Q  153 ctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattggggtgagc 218  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||| | || ||||||||||||    
T  40886846 ctcagattgtgcaggctttcgttgatttccgtactcacacgattaaggagcccgattggggtgagc 40886781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 277 - 333
Target Start/End: Original strand, 30706869 - 30706925
Alignment:
Q  277 gtctcaccctcagattttgtcacttcttctaggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||||  |||||||    
T  30706869 gtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttcggaggccaacaaatga 30706925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 277 - 333
Target Start/End: Original strand, 50196295 - 50196351
Alignment:
Q  277 gtctcaccctcagattttgtcacttcttctaggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||||  |||||||    
T  50196295 gtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttccgaggccagcaaatga 50196351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 15)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 24086184 - 24085850
Alignment:
Q  1 tcaggctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttaccc-gagaagattttgaggcagtacag 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||    
T  24086184 tcaggctttcgaggaggtattctggtattcaggatggattatgtgcggtgatcgtagggtgtaccgtcacttgccccgagagggttttgaggcagtacag 24086085  T
Q  100 atacgtccagaccatccct-agacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaa 198  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||  | || | |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24086084 atacgtccagaccgtcccttagacattcgtcggatgttgtagagctgtcaccgactgagattgtgcatgttttcgtcgacttccgcactcacacacttaa 24085985  T
Q  199 ggcggccaattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtca 298  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||    
T  24085984 ggcggccgattggggtgagcatgcaggagagcaggcatggcgtatggcagatggctatgtacgatggtacaccgttgtgtctcaccctcagattttgcca 24085885  T
Q  299 cttcttctaggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  24085884 cttcttgtaggagatattcggaggcctccaaatga 24085850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Original strand, 32642582 - 32642912
Alignment:
Q  2 caggctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagat 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||    
T  32642582 caggctttcgaggaggtattctggtattcaggctgaattatgtgcggtgatcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggat 32642681  T
Q  102 acgtccagaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggc 201  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32642682 acgtcctgaccgtccctagacatccgtcggatgttgtagagttgtcaccggctgagattgtgcaggctttcgtcgacttccgtactcacacgcttaaggc 32642781  T
Q  202 ggccaattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcactt 301  Q
    |||  ||| ||||||||||| || || | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||    
T  32642782 ggctgatt-gggtgagcatgtaggagggtagacatggcgtatgacagatggctatgtacgatggtacaccgttgtgtctcaccctcaaattttgccactt 32642880  T
Q  302 cttctaggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  32642881 cttccaggagatattccgaggcctccaaatga 32642912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 5 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 18005803 - 18005475
Alignment:
Q  5 gctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacg 104  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||  || |||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  18005803 gctttcgaggaggtattctagtattcaggctggattacgtgtggtgattgtagggtgcaccatcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacg 18005704  T
Q  105 tccagaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggc 204  Q
    |||||||| ||||||||||||  |  | |||||||||| |||||  | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18005703 tccagaccgtccctagacatctgttagctgttgtagagatgtcaccgactgagattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggc 18005604  T
Q  205 caattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttctt 304  Q
    | |||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18005603 cgattggggtgagcatgcagcagaggaaacatggtgtatggcagatggctatgtacgaaggtacaccgttgtgtctcaccctcagattttgccacttctt 18005504  T
Q  305 ctaggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    | ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  18005503 ccaggagattttccgaggcctccaaatga 18005475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 31770773 - 31771008
Alignment:
Q  11 gaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccaga 110  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  31770773 gaggaggttttatggtattctggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcctgagagggttttgaggcagtacggatacgtccaga 31770872  T
Q  111 ccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattg 210  Q
    || |||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||  | |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31770873 ccgtccccagacatccgacggatgttgtagagctgccaccgcctcacattgtgtaggcgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattg 31770972  T
Q  211 gggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggc 246  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  31770973 gggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggc 31771008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 258
Target Start/End: Original strand, 26172600 - 26172864
Alignment:
Q  2 caggctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagat 101  Q
    |||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||    
T  26172600 caggattttgaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagagttttgaggcagtacggat 26172699  T
Q  102 acgtccagaccatccctagacatcc--------atcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacg 193  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||        | ||||||||||||||||| ||  | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26172700 acgtccagaccgtccccagacatccgacggatgaacggatgttgtagagctgccaccgcctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcactcacacg 26172799  T
Q  194 cttaaggcggccaattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgt 258  Q
    |||||||||||| |||||| | |||| |||| ||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||    
T  26172800 cttaaggcggccgattgggataagcaggcaggagagcagacattgcggatggcggatgtctatgt 26172864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 255
Target Start/End: Original strand, 26440140 - 26440384
Alignment:
Q  11 gaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccaga 110  Q
    |||||||| || |||||||| || ||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  26440140 gaggaggttttctggtattctggttggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcaatacggatacgtccaga 26440239  T
Q  111 ccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattg 210  Q
    |||||||||||||||   | ||||||||||| ||  || || || | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||    
T  26440240 ccatccctagacatctgactgatgttgtagacctcccactgccttacattgtgcaagcgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcgactgattg 26440339  T
Q  211 gggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggcta 255  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  26440340 gggtgagccggcaggagagcagacatggcggatggcggatggcta 26440384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 244
Target Start/End: Original strand, 3384135 - 3384361
Alignment:
Q  18 tattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccagaccatccc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||| || |||| | | |||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  3384135 tattatggtattcaggctggattatttgcggtgttcgtagggtgcaccgtcacttgcctgagagggtgttgaggcagtacggatacgtccatacgatccc 3384234  T
Q  118 tagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattggggtgag 217  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || || || |||| ||||||||| | ||||| ||||| | || |||||||||||||| | || ||||  |||||    
T  3384235 tagacatcctacggatgttgtagagatgacactgcctcagattgtgcagacattcgtagactttcacattcacacgcttaaggagaccgattgaagtgag 3384334  T
Q  218 catgcagaagagcagacatggcgtatg 244  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||    
T  3384335 caggcagcagagcagacatggcatatg 3384361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 333
Target Start/End: Original strand, 22303926 - 22304251
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |    
T  22303926 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 22304025  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||   || ||  |   | ||   |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  22304026 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgc 22304125  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttcta 307  Q
    | |||||||||| |||| |||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |  ||||||||      ||||||||||||||| ||| ||| | ||| |    
T  22304126 tcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 22304225  T
Q  308 ggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||    
T  22304226 ggagatcttctgaggcctgcaaatga 22304251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 239
Target Start/End: Original strand, 2406954 - 2407170
Alignment:
Q  23 tggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccagaccatccctagac 122  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||  |||||||| | | ||||||| | ||||| | |||| ||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||    
T  2406954 tggtattcaggctggattatatgcggtgtacgtagggtctactgtcacttgctcgagagggttttaaggcaatacggatacgtctagaccgtccctaaac 2407053  T
Q  123 atccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattggggtgagcatgc 222  Q
    ||||  ||||||||||||||||| || |  |||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||| || ||    
T  2407054 atccgacggatgttgtagagctgccactacctcaaattgtgcagacattcgtcgacttccgcacttacacgcttaaggcggccgatcgaggtgaacaggc 2407153  T
Q  223 agaagagcagacatggc 239  Q
    || |||||||| |||||    
T  2407154 aggagagcagaaatggc 2407170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 226 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 32642004 - 32641897
Alignment:
Q  226 agagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttctaggagatattctgaggcct 325  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  32642004 agagcagacatggcgtatgacagatggctatgtacgatggtacaccgttgtgtctcaccctcaaattttgtcacttcttccaggagatattccgaggcct 32641905  T
Q  326 ccaaatga 333  Q
    ||||||||    
T  32641904 ccaaatga 32641897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 333
Target Start/End: Original strand, 6203845 - 6204170
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |    
T  6203845 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 6203944  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||   || ||  |   | ||   |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  6203945 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgc 6204044  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttcta 307  Q
    | |||||||||| |||| |||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |  ||||||||      ||||||||||||||| ||| ||| | ||| |    
T  6204045 tcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 6204144  T
Q  308 ggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||    
T  6204145 ggagatcttccgaggcctgcaaatga 6204170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 333
Target Start/End: Original strand, 11690812 - 11691137
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |    
T  11690812 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 11690911  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||   || ||  |   | ||   |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  11690912 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgc 11691011  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttcta 307  Q
    | |||||||||| |||| |||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |  ||||||||      ||||||||||||||| ||| ||| | ||| |    
T  11691012 tcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 11691111  T
Q  308 ggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||    
T  11691112 ggagatcttccgaggcctgcaaatga 11691137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 30826979 - 30826654
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |    
T  30826979 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 30826880  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||   || ||  |   | ||   |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  30826879 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgc 30826780  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttcta 307  Q
    | |||||||||| |||| |||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |  ||||||||      ||||||||||||||| ||| ||| | ||| |    
T  30826779 tcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 30826680  T
Q  308 ggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||    
T  30826679 ggagatcttccgaggcctgcaaatga 30826654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 129 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 2406263 - 2406059
Alignment:
Q  129 cggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattggggtgagcatgcagaaga 228  Q
    ||||||||| ||||||| ||  | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||    
T  2406263 cggatgttgcagagctgccaccgcctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggaga 2406164  T
Q  229 gcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttctaggagatattctgaggcctcca 328  Q
    ||||||||| || | | | |||||||||||   |||||||||      ||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||| ||| ||||||  ||    
T  2406163 gcagacatgacggacgacggatggctatgtgttatggtacacaagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaagagatcttccgaggccagca 2406064  T
Q  329 aatga 333  Q
    |||||    
T  2406063 aatga 2406059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 258
Target Start/End: Original strand, 27638444 - 27638694
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |    
T  27638444 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 27638543  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||   || ||  ||  | ||   |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |      
T  27638544 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgc 27638643  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgt 258  Q
    | |||||||||| |||| |||| | ||||||||  |||| |||||||||||    
T  27638644 tcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgt 27638694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 30)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 8 - 333
Target Start/End: Original strand, 48891213 - 48891538
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  48891213 ttcgaggaggtattctggtattcaggctggattatatgcagtgttcgtaaggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtcc 48891312  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48891313 agaccgtccctagacatccgtcggatgttgtagagctgtcatcggctgagattgtgcagactttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccga 48891412  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttcta 307  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  48891413 ttggagtgagcatgcatgagagcaggcatggcgtatggcagatggctatgtacgatggtacaccgttgtgtctcaccctcagattttgccacttcttcca 48891512  T
Q  308 ggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||||||||  |||||||||||||||    
T  48891513 ggagatattacgaggcctccaaatga 48891538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 42805324 - 42804993
Alignment:
Q  2 caggctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagat 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42805324 caggctttcgaggaggtattctggtattcaggctggattatgtgcggtgatcatacggtgcaccgtcactagcccgagaggattttgaggcagtacagat 42805225  T
Q  102 acgtccagaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggc 201  Q
    |||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  42805224 acgttcggaccgtccctagacatccgtcggatgttgtagagctgttaccggctcagattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcgtacgcttaaggc 42805125  T
Q  202 ggccaattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcactt 301  Q
    || | |||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  42805124 gggcgattggggtgagcatgcatgagaggagacatggtgtatggcagatggctatgtacgatggtacaccattgtgtctcaccctcagattttgccactt 42805025  T
Q  302 cttctaggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42805024 cttccaggagatattctgaggcctccaaatga 42804993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 287
Target Start/End: Original strand, 50758790 - 50759074
Alignment:
Q  3 aggctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagata 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||| | |||||||||||||| ||||    
T  50758790 aggctttcgaggaggtattctggtattcaggctggattatgtgcggtgattgtagggtgtaccgtcacttgaccgagagggttttgaggcagtacggata 50758889  T
Q  103 cgtccagaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcg 202  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50758890 cgtccagaccgtccctagacatccgccggatgttgtagagctgtcaccggctgagattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcg 50758989  T
Q  203 gccaattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctc 287  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  50758990 gccgattggggtgagcatgcaggagagcagacatggcgtatggtagatggctatgtacgatggtacaccgttgtgtctcaccctc 50759074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 30253457 - 30253126
Alignment:
Q  2 caggctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| | ||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||    
T  30253457 caggctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattatgtgtggtgatcagagggtataccgtcacttgctcgagagggttttgaggcagtacagat 30253358  T
Q  102 acgtccagaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggc 201  Q
    || |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30253357 acatccaaaccgtccctagacatccgtcggatgttgtagagctgtcactgcctgagattgtgcaggttttcatcgacttccgcactcacacgcttaaggc 30253258  T
Q  202 ggccaattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcactt 301  Q
    |||  | |||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||  ||||||||||| |||||    
T  30253257 ggctgactggggtgagcatgcaagagaacaaacatggcgtatggcagatggctatgtacgatggtacatcgttgtgtctcatgctcagattttgccactt 30253158  T
Q  302 cttctaggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  30253157 cttctgggagatattccgaggcctccaaatga 30253126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 23 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 17562685 - 17562438
Alignment:
Q  23 tggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccagaccatccctagac 122  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  17562685 tggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtccagaccgtccctagac 17562586  T
Q  123 atccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattggggtgagcatgc 222  Q
    |||  |||||||||||||||||||||| | || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  17562585 atctgtcggatgttgtagagctgtcatcgtcttagattgtgcagtctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggc 17562486  T
Q  223 agaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacac 270  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  17562485 aggagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtgctatggtacac 17562438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 333
Target Start/End: Original strand, 36130181 - 36130506
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||| ||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| |    
T  36130181 ttcgaggaggttttctggtattctggctggattatgtgtggtgtccgtagggtgtaccgtcactttcccgagagggttttgaggcagtacagatacgtgc 36130280  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||  || |  || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  36130281 agaccatccccagacatcccacggatgttgtagagctcccactcccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacga 36130380  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttcta 307  Q
    |||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||| | | |||||||||      ||||||||||||||||||| ||| ||| |      
T  36130381 ttggggtgagcaggcaggagagcatacatggcggatggctgatggctatatgctatggtacactagggtgtctcaccctcagattttgccacctctccct 36130480  T
Q  308 ggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||    
T  36130481 ggagatcttccgaggcctgcaaatga 36130506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Original strand, 20353231 - 20353562
Alignment:
Q  2 caggctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagat 101  Q
    |||| ||| |||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||| |  ||||||||||||| |||    
T  20353231 caggattttgaggagattttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcctgagaggggtttgaggcagtacggat 20353330  T
Q  102 acgtccagaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggc 201  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||  | |||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20353331 acgtccagacgatccctagacatccgacggatgttgtagagctaccaccgcctcagactgtgcaggcattcgtcgacttccacactcacacgcttaaggc 20353430  T
Q  202 ggccaattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcactt 301  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||   |||||||||      ||||||||||||||||||  ||| |    
T  20353431 ggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggctgatggcggatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcagatttttccacct 20353530  T
Q  302 cttctaggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||  | ||||| ||||||||||  |||||||    
T  20353531 ctttcacgagatcttctgaggccaacaaatga 20353562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 2 - 246
Target Start/End: Original strand, 41614959 - 41615202
Alignment:
Q  2 caggctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagat 101  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||    
T  41614959 caggattttgaggaggttttatggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtatcgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggat 41615058  T
Q  102 acgtccagaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggc 201  Q
    |||||||||   ||||||||||||   ||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41615059 acgtccagagggtccctagacatctggcggatgttgtagagctgtcaccgcctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcactcacacgcttagggc 41615158  T
Q  202 ggccaattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggc 246  Q
    |||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  41615159 ggccga-tggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggc 41615202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 2272413 - 2272088
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |    
T  2272413 ttcgaggaggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 2272314  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||| ||| ||  ||  |  |   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  2272313 agaccatccccagacatccgactgatgttgcagacctcccaccgctttccattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacga 2272214  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttcta 307  Q
    | |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||      ||||||||||||||| ||| ||| ||||| |    
T  2272213 tcggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatggctatgtcctatggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctcttcca 2272114  T
Q  308 ggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||||| || |||||||| |||||||    
T  2272113 ggagatcttttgaggcctgcaaatga 2272088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 32 - 333
Target Start/End: Original strand, 599587 - 599888
Alignment:
Q  32 ggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccagaccatccctagacatccatcgg 131  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||   |||    
T  599587 ggctggattatgtgtggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtccagaccatcctcagacatctcacgg 599686  T
Q  132 atgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattggggtgagcatgcagaagagca 231  Q
    |||||||||||||| ||||| || | ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||| |||| ||||||    
T  599687 atgttgtagagctgccattgccttacattgtgcaggtgttcgtcgacttctgcactcacacgcttaaggtggacgattggggtgagcaggcaggagagca 599786  T
Q  232 gacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttctaggagatattctgaggcctccaaat 331  Q
    | ||||||| ||||| |||||||||   | |||||||||    | ||||||||||||||||| | ||| |||||  |||||| ||| ||||||| |||||    
T  599787 gtcatggcggatggctgatggctattagctatggtacactaggatgtctcaccctcagatttcgccacctcttcctggagatcttccgaggcctgcaaat 599886  T
Q  332 ga 333  Q
    ||    
T  599887 ga 599888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 4005767 - 4005506
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||| | |    
T  4005767 ttcgaggatgttttctggtattctggctggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacatgc 4005668  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  || |  || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |    
T  4005667 agaccatccctagacatcccacggatgttgtagagctcccactcccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaagcgg-cga 4005569  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacac 270  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| | | |||||||||    
T  4005568 ttggggtgagtaggcaggagagcagacatggcggatggctgatggctatatgctatggtacac 4005506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 49266723 - 49266412
Alignment:
Q  11 gaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccaga 110  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||| | |||||| || ||||||| | |||||||||||||| || |||||||||    
T  49266723 gaggaggttttctggtatttaggctggattatgtgaggtggtcgtagggtctaccgtcatttgcccgagagggttttgaggcagtacggagacgtccaga 49266624  T
Q  111 ccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattg 210  Q
    || |||| | |||||   ||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||     
T  49266623 ccgtccccaaacatctgacggatgttgtagagctgtcaccgcctcagattgtgcaggcattcgtcgactttcgcactcacacgcttaaggtggccgatta 49266524  T
Q  211 gggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttctagga 310  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||| || |||   |||||||||      ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  49266523 gggtgagcaggcaggaaagcagacatggcggatggcagatgactgtgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccagga 49266424  T
Q  311 gatattctgagg 322  Q
    ||| ||| ||||    
T  49266423 gatcttccgagg 49266412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Original strand, 48565566 - 48565890
Alignment:
Q  2 caggctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagat 101  Q
    |||| ||| |||||||| || |||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  48565566 caggattttgaggaggttttctggtgttcaggctagattatgtgtggtgttcgtagggtgtactgtcacttacccgagcgggttttgaggcagtacagat 48565665  T
Q  102 acgtccagaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggc 201  Q
    ||||||||| | ||  |||||||||  | ||||||||||||||| ||  | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48565666 acgtccagagcgtctttagacatccgaccgatgttgtagagctgccaccgcctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggc 48565765  T
Q  202 ggccaattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcactt 301  Q
    || | | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||       |||||||||||   ||||||||| |    ||||||||||||||||||| ||| |    
T  48565766 ggtcgaatggggtgagcaggcacaagagcagacatggcg-------gatggctatgtgttatggtacactgaggtgtctcaccctcagattttgccacct 48565858  T
Q  302 cttctaggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||| || |||| ||| ||||||  |||||||    
T  48565859 cttccagaagatcttccgaggccagcaaatga 48565890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 67 - 333
Target Start/End: Original strand, 9473034 - 9473300
Alignment:
Q  67 tcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccagaccatccctagacatcc-atcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgca 165  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||| ||||| ||  | |||| ||||| ||    
T  9473034 tcacttgcccgagagggttttgaggcagtacagatacgtccagaccgtccccagacatccgatcg-atgttgtacagctgccaccgtctcacattgtcca 9473132  T
Q  166 ggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatgg 265  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||| || ||||| ||||||||||| | ||||    
T  9473133 ggcgttcgtcgacttccgcactcagacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagaggagacatgacggatggcggatggctatgtcctatgg 9473232  T
Q  266 tacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttctaggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||||      ||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  9473233 tacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctcttccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 9473300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 246
Target Start/End: Original strand, 42759373 - 42759596
Alignment:
Q  23 tggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccagaccatccctagac 122  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||    
T  42759373 tggtattcaggctgaattatgtgcggtgttcgtagggtgtagcgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacatccagagcgtccctagac 42759472  T
Q  123 atccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattggggtgagcatgc 222  Q
    ||||  || |||||||||||||| ||  | |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||  |    
T  42759473 atccgacgaatgttgtagagctgccaccgcctcagattgtgcatgcattcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggtggtcgattggggtgagcagac 42759572  T
Q  223 agaagagcagacatggcgtatggc 246  Q
    | |||||||||||||||| |||||    
T  42759573 acaagagcagacatggcggatggc 42759596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 47071534 - 47071299
Alignment:
Q  11 gaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccaga 110  Q
    |||||||| || |||||||| | ||||||||  ||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47071534 gaggaggttttctggtattctgactggattatatgcggcgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggattttgaggcagtacggatacgtccaga 47071435  T
Q  111 ccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattg 210  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||  ||  | || | |||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||    
T  47071434 ccatccccagacatccgacggatgttgtagacctcccaccgccttacattgtgtaggcgttcgtcgacttccgcactcacatgcttaaggcggctgattg 47071335  T
Q  211 gggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggc 246  Q
     |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  47071334 aggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggc 47071299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 239
Target Start/End: Original strand, 44232418 - 44232645
Alignment:
Q  12 aggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccagac 111  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||| | |||||||   ||||| | |||||||||||| | |||||||||||||    
T  44232418 aggaggttttctggtattcaggctggattatgtgtggtgttcatagggtgtactgtcactttttcgagagggttttgaggcagtgcggatacgtccagac 44232517  T
Q  112 catccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattgg 211  Q
    | |||| |||||||   | ||||||||||||||| ||  | |||| ||| |||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44232518 cgtccccagacatctgacagatgttgtagagctgccaccgcctcagattatgcagatattcgtcggcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattgg 44232617  T
Q  212 ggtgagcatgcagaagagcagacatggc 239  Q
    |||||||| |||  |||||| |||||||    
T  44232618 ggtgagcaggcaagagagcatacatggc 44232645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Original strand, 16646211 - 16646414
Alignment:
Q  15 aggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccagaccat 114  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | | |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16646211 aggtattctggtattctggctg-attatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcactttcccgatagggttttgaggcagtacggatacatccagaccat 16646309  T
Q  115 ccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattggggt 214  Q
    ||| |||||||    | |||||||||| ||| ||  | || | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  16646310 cccaagacatctgaagtatgttgtagacctgccaccgccttacattatgcaggcgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcagacgattggggt 16646409  T
Q  215 gagca 219  Q
    |||||    
T  16646410 gagca 16646414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 42901517 - 42901192
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |    
T  42901517 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 42901418  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||   || ||  |   | ||   |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  42901417 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgc 42901318  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttcta 307  Q
    | |||||||||| |||| |||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |  ||||||||      ||||||||||||||| ||| ||| | ||| |    
T  42901317 tcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 42901218  T
Q  308 ggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||    
T  42901217 ggagatcttccgaggcctgcaaatga 42901192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 46698672 - 46698347
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |    
T  46698672 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 46698573  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||   || ||  |   | ||   |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |      
T  46698572 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaagacggacgc 46698473  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttcta 307  Q
    | |||||||||| |||| |||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |  ||||||||      ||||||||||||||| ||| ||| | ||| |    
T  46698472 tcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 46698373  T
Q  308 ggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||    
T  46698372 ggagatcttccgaggcctgcaaatga 46698347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 333
Target Start/End: Original strand, 46401401 - 46401726
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |    
T  46401401 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 46401500  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||   || ||  ||  | ||   |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |      
T  46401501 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgt 46401600  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttcta 307  Q
      |||||||||| |||| |||| ||||||||||   ||| ||||||||||| |  |||||| |      ||||||||||||||| ||| ||| | ||| |    
T  46401601 ccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 46401700  T
Q  308 ggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||    
T  46401701 ggagatcttccgaggcctgcaaatga 46401726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 49141875 - 49141550
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |    
T  49141875 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 49141776  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||   || ||  |   | ||   |||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |      
T  49141775 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcatcgatttccgcactcacacgcttaaggcggacgc 49141676  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttcta 307  Q
    | |||||||||| |||| |||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |  ||||||||      ||||||||||||||| ||| ||| | ||| |    
T  49141675 tcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 49141576  T
Q  308 ggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||    
T  49141575 ggagatcttccgaggcctgcaaatga 49141550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 50478134 - 50477809
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |    
T  50478134 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 50478035  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||   || ||  |   | ||   |||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |      
T  50478034 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgttgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgc 50477935  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttcta 307  Q
    | |||||||||| |||| |||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |  ||||||||      ||||||||||||||| ||| ||| | ||| |    
T  50477934 tcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 50477835  T
Q  308 ggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    | |||| ||| ||||||| |||||||    
T  50477834 gtagatcttccgaggcctgcaaatga 50477809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 246
Target Start/End: Original strand, 6927918 - 6928065
Alignment:
Q  99 gatacgtccagaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaa 198  Q
    ||||||||||||   ||||| |||||||  |||||| |||| ||||| || |  |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6927918 gatacgtccagagggtccctcgacatccgacggatgctgtaaagctgacactaactcagattgcgcaggcattcgtcgacttccgcactcacacgcttaa 6928017  T
Q  199 ggcggccaattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggc 246  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||    
T  6928018 ggcggccgattggggtgagcaggcgcaagagcagacatggcggatggc 6928065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 158 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 52388805 - 52388630
Alignment:
Q  158 attgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatg 257  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||     
T  52388805 attgtgcaggcgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgattggggtgagcaggcaggagagtagacatggcggatggctgatggctata 52388706  T
Q  258 tacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttctaggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    | | |||||| ||      ||||||||||||||||||| ||| |||    |||||| ||| ||||||| |||||||    
T  52388705 tgctatggtagactagggtgtctcaccctcagattttgccacctctcaatggagatcttccgaggcctgcaaatga 52388630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 112
Target Start/End: Original strand, 51807875 - 51807976
Alignment:
Q  11 gaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccaga 110  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  51807875 gaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtccaga 51807974  T
Q  111 cc 112  Q
    ||    
T  51807975 cc 51807976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 333
Target Start/End: Original strand, 54388821 - 54389146
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||||| |  ||||||| || ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |    
T  54388821 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggcgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 54388920  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||| ||   || ||  |   | ||   |||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  54388921 agaccatccccagacatccgactgattttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcatcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgc 54389020  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttcta 307  Q
    | |||||||||| |||| |||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |  ||||||||      ||||||||||||||| ||| ||| | ||| |    
T  54389021 tcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 54389120  T
Q  308 ggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||    
T  54389121 ggagatcttccgaggcctgcaaatga 54389146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 333
Target Start/End: Original strand, 34048121 - 34048446
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||||| |  | |||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |    
T  34048121 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccatagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 34048220  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||   || ||  |   | ||   |||||||||   ||| |||| || ||||||||||||||||||||||        
T  34048221 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcatcgattttcgcactcacacgcttaaggcggtagc 34048320  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttcta 307  Q
    |||||||||||| |||| |||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |  ||||||||      ||||||||||||||| ||| ||| | ||| |    
T  34048321 ttggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 34048420  T
Q  308 ggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||    
T  34048421 ggagatcttccgaggcctgcaaatga 34048446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 99 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 50214426 - 50214199
Alignment:
Q  99 gatacgtccagaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaa 198  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||||| ||||||||  | |||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50214426 gatacgtccagaccgtccccagacatccgacggatattgtaaagctgtcaccgcctcacattgtgtaggcgttcgtcgacttcctcactcacacgcttaa 50214327  T
Q  199 ggcggccaattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtca 298  Q
    | || || |||||||||||||   |  |||||||||||||||       ||||||||||| | |||||||||      |||||||||||| || ||| ||    
T  50214326 gacgaccgattggggtgagcagctaagagagcagacatggcg-------gatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcaccctcaaatcttgcca 50214234  T
Q  299 cttcttctaggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||||  |||||||    
T  50214233 cctcttccaggagatattccgaggccagcaaatga 50214199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 52388929 - 52388827
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||| | ||||||||  |||||||||| |||||||||  |||||| | |||||||| |||| |||||||| |    
T  52388929 ttcgaggaggttttctggtattctggctggataatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgtccgagagggttttgaggtagtatagatacgtgc 52388830  T
Q  108 aga 110  Q
    |||    
T  52388829 aga 52388827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 16)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 3 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 8699792 - 8699462
Alignment:
Q  3 aggctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagata 102  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  8699792 aggcttttgaggaggtattctggtattcaggctggattatgtgcggtgatcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggata 8699693  T
Q  103 cgtccagaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcg 202  Q
    |||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  8699692 cgtctagaccgcccctagacatccgtcggatgttgtagagctgtcgccggctgagattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttgaggag 8699593  T
Q  203 gccaattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttc 302  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  8699592 gccgattggggtgagcatgcaggagagcagacatggcgtttgacagatgcctatgtacgatggtacaccgttgtgtctcaccctcagattttgccacttc 8699493  T
Q  303 ttctaggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  8699492 ttccaggagatattccgaggcctcctaatga 8699462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 38408202 - 38407967
Alignment:
Q  11 gaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccaga 110  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  38408202 gaggaggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtccaga 38408103  T
Q  111 ccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattg 210  Q
    || |||| | ||||| | ||||||||||||||||| ||  | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38408102 ccgtccccatacatctaacggatgttgtagagctgccaccgcctcacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattg 38408003  T
Q  211 gggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggc 246  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  38408002 gggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggc 38407967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 8577900 - 8577575
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |    
T  8577900 ttcgaggaggttttctggtattctgggtggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 8577801  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |  ||||  || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  8577800 agaccatccccagacatcccacggatgttgtagagatcccattcccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcactcacacgattaaggcggacga 8577701  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttcta 307  Q
    | ||||| |||| |||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||   |||||||||      ||||||||||||||| ||| ||| ||||| |    
T  8577700 tcggggtcagcaggcaggagaggagacatggcggacggcagatggctatgtcatatggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctcttcca 8577601  T
Q  308 ggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||    
T  8577600 ggagatcttctgaggcctgcaaatga 8577575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 333
Target Start/End: Original strand, 5199469 - 5199781
Alignment:
Q  14 gaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccagacca 113  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||       
T  5199469 gaggttttctggtattcaggctgaattatgtgcgatgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtccagaggg 5199568  T
Q  114 tccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattgggg 213  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  | |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||    
T  5199569 tccctagacatccgacggatgttgtagagctgtcaccgcctcaaattgtgtaggcattcgtcgacttccgcactcacacgtttaaggcggccgattgagg 5199668  T
Q  214 tgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttctaggagat 313  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||       |||||||||||   |||||||||      ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  5199669 tgagcaggcaggagagcagacatggcg-------gatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcagattttgccatctcttctaggagat 5199761  T
Q  314 attctgaggcctccaaatga 333  Q
     ||| ||||||  |||||||    
T  5199762 cttccgaggccagcaaatga 5199781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 35 - 333
Target Start/End: Original strand, 7760060 - 7760351
Alignment:
Q  35 tggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccagaccatccctagacatccatcggatg 134  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  7760060 tggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtgcgaatacgtccagaccatccccagacatctaacggatg 7760159  T
Q  135 ttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattggggtgagcatgcagaagagcagac 234  Q
    ||||||| ||| ||  |  | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  7760160 ttgtagacctgccaccgctttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagagcagac 7760259  T
Q  235 atggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttctaggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    ||||||       ||||||||||| | |||||||||      |||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  7760260 atggcg-------gatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcaccctcaaatcttgtcacctcttccaggagatcttctgaggcctgcaaatga 7760351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 511961 - 511646
Alignment:
Q  11 gaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccaga 110  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  511961 gaggaggttttctggtattcatgctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtccaga 511862  T
Q  111 ccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattg 210  Q
     | ||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||  | |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  511861 gcgtccctagacattcgacggatgttgtagagctgccaccgcctcagattgtacaggcattcatcgacttccgcactcacacgtttaaggcggccgattg 511762  T
Q  211 gggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttctagga 310  Q
    ||||||||| ||| ||||| | ||       |||||||||||||||||   |||||||||      ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  511761 gggtgagcaggcacaagagaatac-------atggcagatggctatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccagga 511669  T
Q  311 gatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    ||| ||| ||||||  |||||||    
T  511668 gatcttccgaggccagcaaatga 511646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 233
Target Start/End: Original strand, 42538483 - 42538714
Alignment:
Q  2 caggctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagat 101  Q
    |||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||  ||    
T  42538483 caggattttgaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcatagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacgaat 42538582  T
Q  102 acgtccagaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggc 201  Q
    | ||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||    |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  42538583 atgtccagagcgtccctagacatccgacggatgttgtagagctgccaccacctcagattgtgcaggcatttgtcgacttccgcactcacacgcttacagc 42538682  T
Q  202 ggccaattggggtgagcatgcagaagagcaga 233  Q
    | || ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  42538683 gaccgattggggtgagcaggcacaagagcaga 42538714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 42937994 - 42937788
Alignment:
Q  12 aggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccagac 111  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42937994 aggaggttttctggttttcaggctggatcatgtgcggtgttcgtagggtgttc-gtcacttgcccgagggggttttgaggcagtacagatacgtccagac 42937896  T
Q  112 catccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattgg 211  Q
      ||||||| ||||   ||||||||||||||||  ||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  42937895 tgtccctaggcatctgacggatgttgtagagcttccaccgcctcatattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcgaccgattgg 42937796  T
Q  212 ggtgagca 219  Q
    ||||||||    
T  42937795 ggtgagca 42937788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 244
Target Start/End: Original strand, 38970731 - 38970973
Alignment:
Q  2 caggctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagat 101  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||| || || ||||| ||||||||| || |||| | | ||||||||||||||||    
T  38970731 cagggttttgaggagatattatggtattcaggctggattatttgcagtgttcataaggtgtaccgtcacttgcctgagagggtgttgaggcagtacagat 38970830  T
Q  102 acgtccagaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggc 201  Q
    |||| ||||  |||||| ||||||   || |||||||||||||| ||  | || | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38970831 acgtacagaagatccctggacatctgacgaatgttgtagagctgacaccgccttagattgtgcaagcattcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggc 38970930  T
Q  202 ggccaattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatg 244  Q
    | || |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  38970931 gaccgattggggtgagcagacagcagagcagacatggcgtatg 38970973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 9014 - 8752
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| |    
T  9014 ttcgaggaggttttctggtattttggctggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacagatacgtgc 8915  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||   || ||  |   | |||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |    
T  8914 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccgccgcctcccattgtgcaggtgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcagacga 8815  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacac 270  Q
    | |||||||||| |||| |||| ||||||| || ||| | |||| |||||| | |||||||||    
T  8814 tcggggtgagcaggcaggagaggagacatgacggatgacggatgactatgtcctatggtacac 8752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 244
Target Start/End: Original strand, 15939358 - 15939577
Alignment:
Q  25 gtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccagaccatccctagacat 124  Q
    ||||||||| || |||| ||| |||| |||||| |||| | ||||  | | | ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||    
T  15939358 gtattcaggatgaattatgtgtggtgttcgtagagtgtactgtcatctgctcaagaggattttgaggcagtacggatatgtccagacggtccctagacat 15939457  T
Q  125 ccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattggggtgagcatgcag 224  Q
    ||    |||||||| |||||| ||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||| ||||    
T  15939458 ccgattgatgttgttgagctgccaccgcctcatattgtgcaggcttttgtcgacttccgcactcacacgcttaaggagaccgattgggatgagcaggcag 15939557  T
Q  225 aagagcagacatggcgtatg 244  Q
     |||||||||| ||||||||    
T  15939558 tagagcagacaaggcgtatg 15939577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 333
Target Start/End: Original strand, 28879294 - 28879619
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |    
T  28879294 ttcgaggagattttctggtattcaggctggatcatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 28879393  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||    ||||||   || ||  ||  | ||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  28879394 agaccatccccagacatccgattgatgttagggacctcccaccgtcttccattgtgcaggtgttcgtcgacttccgcactcacacgattaaggcggacga 28879493  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttcta 307  Q
    | ||| |||||| |||| |||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |  ||||||||      ||||||||||||||| ||  ||| ||||  |    
T  28879494 tcgggatgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatctttccacctctttca 28879593  T
Q  308 ggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||    
T  28879594 ggagatcttccgaggcctgcaaatga 28879619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 19038524 - 19038199
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |    
T  19038524 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 19038425  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||   || ||  ||  | ||   |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |      
T  19038424 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgc 19038325  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttcta 307  Q
      |||||||||| |||| |||| ||||||||||   ||| ||||||||||| |  |||||| |      ||||||||||||||| ||| ||| | ||| |    
T  19038324 ccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 19038225  T
Q  308 ggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||    
T  19038224 ggagatcttccgaggcctgcaaatga 19038199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 28239094 - 28238769
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |    
T  28239094 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgcccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 28238995  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||   || ||  |   | ||   |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  28238994 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgc 28238895  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttcta 307  Q
    | | |||||||| |||| |||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |   |||||||      ||||||||||||||| ||| ||| | ||| |    
T  28238894 tcgaggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctggggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 28238795  T
Q  308 ggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||    
T  28238794 ggagatcttccgaggcctgcaaatga 28238769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 331
Target Start/End: Original strand, 30707743 - 30708066
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||  || ||||||| ||| ||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |    
T  30707743 ttcgaggaggttttctggtattatgggtggattatgtgtggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 30707842  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||  | | ||||   || ||  ||  | ||   ||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  30707843 agaccatccccagacatccgactgctgttagggacctcccaccgtcttccattatgcaggtgttcgttgacttccgcactcacacgattaaggcggacga 30707942  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttcta 307  Q
    | |||||||||| |||| |||| | ||||||||  |||| |||||||||||   |||||||||      ||||||||||||||| ||| ||| | ||| |    
T  30707943 tcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcatatggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 30708042  T
Q  308 ggagatattctgaggcctccaaat 331  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||    
T  30708043 ggagatcttccgaggcctgcaaat 30708066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 40623234 - 40623144
Alignment:
Q  128 tcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattggggtgagc 218  Q
    |||||||||||| ||||| ||  | |||| ||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||    
T  40623234 tcggatgttgtaaagctgccaccgcctcagattgtgcagacatttgttgacttccgcactcacacgcttaaggagcctgattggggtgagc 40623144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 23)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 49855383 - 49855053
Alignment:
Q  2 caggctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagat 101  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| | ||| |||||| |||||||    
T  49855383 caggctttcgagggggtattctggtattcaagttggattatgtgcggtgatcgtagggtgtaccgtgacttgcccgagagggttt-gaggcactacagat 49855285  T
Q  102 acgtccagaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggc 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  49855284 acgtccagaccgtccctagacatctgtcggatgttgtagagctgtcaccggctcaaattgtgcagactttcgtcgacttgcgcactcacacacttaaggc 49855185  T
Q  202 ggccaattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcactt 301  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  49855184 ggccgattggggtgagcatgcaggagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacgatggtacaccgttgtgtctcaccctcagattttgccactt 49855085  T
Q  302 cttctaggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||   ||||||||||  ||||||||||||||    
T  49855084 ctttcgggagatattccaaggcctccaaatga 49855053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 313
Target Start/End: Original strand, 47505031 - 47505341
Alignment:
Q  2 caggctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagat 101  Q
    |||| ||| |||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  47505031 caggattttgaggaggttttctggtaatcaggctggattatgtgcggtgttcgt-gggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacaaat 47505129  T
Q  102 acgtccagaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggc 201  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||  |||||||||||||||  |||  | |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47505130 acgtccagactgtccccagacatccgacggatgttgtagagcgatcaccgcctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcgctcacacgcttaaggc 47505229  T
Q  202 ggccaattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcactt 301  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||      ||||||||||||||| ||| ||| |    
T  47505230 ggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcagatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacct 47505329  T
Q  302 cttctaggagat 313  Q
    |||| |||||||    
T  47505330 cttccaggagat 47505341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 19522629 - 19522394
Alignment:
Q  11 gaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccaga 110  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  19522629 gaggaggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtatcgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtccaga 19522530  T
Q  111 ccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattg 210  Q
    || |||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||  | |||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  19522529 ccgtccccagacattcgacggatgttgtagagctgccaccgcctcacattgtgcaggcgttcgtcaacttccgccctcacacgcttaaggcagccgattg 19522430  T
Q  211 gggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggc 246  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  19522429 gggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggc 19522394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Original strand, 47660562 - 47660893
Alignment:
Q  2 caggctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagat 101  Q
    |||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||    
T  47660562 cagggttttgaggagatattctggtattcaggctggattatctgcggtgtttgtagggtgtaccgtcacttacccgagagggttttgaggaagtacggat 47660661  T
Q  102 acgtccagaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggc 201  Q
    |||||||||   ||||||||||||   || |||||||||||||| ||    |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  47660662 acgtccagagggtccctagacatcggacgaatgttgtagagctgacaccacctcagattgtgcaggcattcgtcgacttctgcactcacacgcttaaggt 47660761  T
Q  202 ggccaattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcactt 301  Q
    |||| ||||||||||||   ||  ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||   |||||||||      ||||||||||||||||||| ||| |    
T  47660762 ggccgattggggtgagccgacacgagagcagacatggcggatggcggatgactatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccctcagattttgccacct 47660861  T
Q  302 cttctaggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||| ||||||| ||||||||||  |||||||    
T  47660862 cttccaggagatcttctgaggccagcaaatga 47660893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 35 - 333
Target Start/End: Original strand, 52804590 - 52804888
Alignment:
Q  35 tggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccagaccatccctagacatccatcggatg 134  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||    
T  52804590 tggattatgtgaggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtccagaccgtccccagacatccgacggatg 52804689  T
Q  135 ttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattggggtgagcatgcagaagagcagac 234  Q
    ||||||||||| || || |||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  52804690 ttgtagagctgccactgcctcacattgtgcagacgttcgtcgacttccacactcacacacttaaggcggctgattggggtgagcaggcaggagagcagac 52804789  T
Q  235 atggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttctaggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||| | ||| | ||||||||||| | |||||||||      ||||||||||||||| ||| ||  ||||| || |||||||| ||||||  |||||||    
T  52804790 atggaggatgacggatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccagctcttccagtagatattccgaggccagcaaatga 52804888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 333
Target Start/End: Original strand, 19158716 - 19159041
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |    
T  19158716 ttcgaggaggttttctggtattctgggtggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcactttcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 19158815  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||  || |  || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  19158816 agaccatccccaaacatcccacggatgttgtagagctcccactcccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcactcacacgattaaggcggacga 19158915  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttcta 307  Q
    | ||||| |||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||||||||   |||||||||      ||||||||||||||| ||| ||| ||||| |    
T  19158916 tcggggtcagcaggcaggagaggagacatggcggacggcggatggctatgtcatatggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctcttcca 19159015  T
Q  308 ggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||    
T  19159016 ggagatcttccgaggcctgcaaatga 19159041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 333
Target Start/End: Original strand, 22526701 - 22527016
Alignment:
Q  11 gaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccaga 110  Q
    |||||||| || | ||| || |||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22526701 gaggaggttttctagtactctggctggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtccaga 22526800  T
Q  111 ccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattg 210  Q
    || |||| ||||||||  | ||||||||||||||| ||  | |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  22526801 ccgtccccagacatccgaccgatgttgtagagctgccaccgcctcacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgccctcacacgcttaaggcggccgattg 22526900  T
Q  211 gggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttctagga 310  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||||       ||||||||||| | |||||||||      ||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||||    
T  22526901 gggtgagcaggcaggagagcaaacatggcg-------gatggctatgtcctatggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccagga 22526993  T
Q  311 gatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    ||| ||| ||||||| |||||||    
T  22526994 gatcttccgaggcctgcaaatga 22527016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 258
Target Start/End: Original strand, 45828266 - 45828521
Alignment:
Q  2 caggctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagat 101  Q
    |||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||||||| ||| ||| | |||||||| |||||| ||    
T  45828266 caggattttgaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcatagggtataccgtcacttgcccaagagggttttgaggtagtacaaat 45828365  T
Q  102 acgtccagaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggc 201  Q
    |||| || | | |||||||||||||  | ||||||||||||||| || || |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45828366 acgttcatagcgtccctagacatcctacagatgttgtagagctgccactgcctcagattgtgcag-cattcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggc 45828464  T
Q  202 ggccaattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgt 258  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  45828465 ggccgattggggtgagcaggcacaagagcagacatggcgaatggaggatggctatgt 45828521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 244
Target Start/End: Original strand, 11196552 - 11196794
Alignment:
Q  2 caggctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagat 101  Q
    |||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||  | |||| | | |||||||||||| |||    
T  11196552 caggattttgaggaggttttttggtattcaggctggattatgtgcggtattcgtagggtgtaccgtcacttgtctgagagggtgttgaggcagtacggat 11196651  T
Q  102 acgtccagaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggc 201  Q
    |||||||||  ||||||||||||||  || |||||||||||||| ||  | || | ||||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  11196652 acgtccagatgatccctagacatccgacgaatgttgtagagctgacaccgccttagattgtgcagacattcgtcgatttccgcactcacatgcttaaggc 11196751  T
Q  202 ggccaattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatg 244  Q
    |||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  11196752 ggccgattagggtgagcaggcagcagagcagacatgtcgtatg 11196794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 45 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 38120483 - 38120284
Alignment:
Q  45 gcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccagaccatccctagacatccatcggatgttgtagagct 144  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| || |||| | | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||   ||||||||||||||||    
T  38120483 gcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcctgagagggtgttgaggcagtacggatacgtccagacgatccctaaacatctgacggatgttgtagagct 38120384  T
Q  145 gtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatg 244  Q
    | || || |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  38120383 gacactgcctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccacactcacacgcttcaggccgccgattggggtgagcaggtagcagagcagacatggcgtatg 38120284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 95447 - 95132
Alignment:
Q  11 gaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccaga 110  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||| ||| ||||  |||||||||| ||||||||| ||||| | | |||||||||||||| ||||  ||||||    
T  95447 gaggaggttttctggtattctggctggattatgtgtggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgatagggttttgaggcagtacggatatttccaga 95348  T
Q  111 ccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattg 210  Q
    ||||||| ||||||||  | ||||||||||| ||  ||  | || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  95347 ccatccccagacatccgactgatgttgtagacctcccaccgccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggatgattg 95248  T
Q  211 gggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttctagga 310  Q
    |||||||||  ||| |||| ||||||||||       ||||||||||| | || ||||||      ||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||    
T  95247 gggtgagcagacaggagagtagacatggcg-------gatggctatgtcctatagtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctcttccagga 95155  T
Q  311 gatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    ||| ||||||||||| |||||||    
T  95154 gatcttctgaggcctgcaaatga 95132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 31781000 - 31780697
Alignment:
Q  23 tggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccagaccatccctagac 122  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||   ||||||||| || |||||| ||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||    
T  31781000 tggtattctggttggattatgtgcggtgtctgtagggtgtaccatcacttgcccgagagggttatgaggcagtacggatacgtccagaccatccccaaac 31780901  T
Q  123 atccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattggggtgagcatgc 222  Q
    ||||  | ||||||||||| ||  ||  | || | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  31780900 atccgactgatgttgtagacctcccaccgccttacattgtgcagacgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagtaggc 31780801  T
Q  223 agaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttctaggagatattctgagg 322  Q
    || |||||||||||||||       ||||||||||| | |||||||||      ||||||||||||||| ||| ||| ||||| || |||| ||| ||||    
T  31780800 aggagagcagacatggcg-------gatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctcttccagcagatcttccgagg 31780708  T
Q  323 cctccaaatga 333  Q
    ||| |||||||    
T  31780707 cctgcaaatga 31780697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 13637361 - 13637036
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||||| |  |||||||||| || |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| |    
T  13637361 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccatcacttgcccgagagggttttgaggcagtacagatacgtgc 13637262  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||   |||||  |   | ||   |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  13637261 agaccatccccagacatccgactgatgttagggagctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgc 13637162  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttcta 307  Q
    | |||||||||| |||| |||| | ||||||||  |||| |||||||||||   |||||||||      ||||||||||||||| ||| ||| | ||| |    
T  13637161 tcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcatatggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 13637062  T
Q  308 ggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||    
T  13637061 ggagatcttctgaggcctgcaaatga 13637036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 35256628 - 35256509
Alignment:
Q  2 caggctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagat 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||   ||||||| |||||| |||    
T  35256628 caggctttcgaggaggtattctggtattcaggctggattatgtgcggtgatcgtagggtgtaccgtcacttgcctgagagagttttgagacagtacggat 35256529  T
Q  102 acgtccagaccatccctaga 121  Q
    |||| |||| | ||||||||    
T  35256528 acgttcagatcgtccctaga 35256509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 50341510 - 50341404
Alignment:
Q  2 caggctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagat 101  Q
    |||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||    
T  50341510 caggatttagaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggat 50341411  T
Q  102 acgtcca 108  Q
    |||||||    
T  50341410 acgtcca 50341404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 153 - 246
Target Start/End: Original strand, 21143777 - 21143870
Alignment:
Q  153 ctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggc 246  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  21143777 ctcacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcactcacacacttaaggtggccgattggggtgagcaagcagaagagcagacaaggcggatggc 21143870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 3729705 - 3729587
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |    
T  3729705 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 3729606  T
Q  108 agaccatccctagacatcc 126  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  3729605 agaccatccccagacatcc 3729587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 246
Target Start/End: Original strand, 26878412 - 26878650
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |    
T  26878412 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgagacagtacggatacgtgc 26878511  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||   || ||  |   | ||   |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  26878512 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggaagc 26878611  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggc 246  Q
    | |||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||    
T  26878612 tcggggtgagcaagcaggagaggatacatggcgaatggc 26878650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 176 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 16269984 - 16269827
Alignment:
Q  176 gacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgtta 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||   ||| |||||||   |||||||||    |    
T  16269984 gacttccgcactcacacgcttaaggagcccaattggggtgagccggcaggagagcagacatggcggatgagggatcgctatgtgttatggtacactacga 16269885  T
Q  276 cgtctcaccctcagattttgtcacttcttctaggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
     |||||||||| ||||| || ||| ||||| ||||||| || |||||||  |||||||    
T  16269884 tgtctcacccttagattgtgccacctcttccaggagatcttgtgaggccagcaaatga 16269827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 207 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 50618055 - 50617929
Alignment:
Q  207 attggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttct 306  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||     ||||||||||||||| |||  || |||||     
T  50618055 attggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcagatgactatgtgctatggtacaccagggtgtctcaccctcagatcttgcaacctcttcc 50617956  T
Q  307 aggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    ||||||| ||| ||||||  |||||||    
T  50617955 aggagatcttccgaggccagcaaatga 50617929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 271 - 333
Target Start/End: Original strand, 51336863 - 51336925
Alignment:
Q  271 cgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttctaggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51336863 cgttacatctcacccttagattttgccacttcttccaggagatattctgaggcctccaaatga 51336925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 96
Target Start/End: Original strand, 21143690 - 21143763
Alignment:
Q  23 tggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagta 96  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  21143690 tggtattctggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagta 21143763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 3729542 - 3729379
Alignment:
Q  170 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtaca 269  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||| | |||| |||| | ||||||||  || | ||||||||||| |  |||||||    
T  3729542 ttcgttgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagtaggcaggagaggatacatggcgggtgacggatggctatgtcctgtggtaca 3729443  T
Q  270 ccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttctaggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |      ||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  3729442 ctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 3729379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Original strand, 12040 - 12371
Alignment:
Q  2 caggctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagat 101  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || | ||||| | ||||||||||||||  ||    
T  12040 caggcttttgaggacgtattctggtattcaggctggattatgtgcggtgatcgtagggtgtaccgtcatttgctcgagagggttttgaggcagtacgaat 12139  T
Q  102 acgtccagaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggc 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12140 acgtcctgaccatccctagacatccgtcggatgttgtagagctgtcaccgcctcagattgtgtagtctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaagga 12239  T
Q  202 ggccaattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcactt 301  Q
    || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  12240 ggtcgattggggtgagcatgcaggagagcagacatggcgtatggcggatggctatgtaggatggtacaccattgtgtctcaccctcagattttgccactt 12339  T
Q  302 cttctaggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||| |||| |||||| |||||| ||||||||    
T  12340 cttccaggaaatattccgaggccaccaaatga 12371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Original strand, 51771 - 52103
Alignment:
Q  1 tcaggctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacaga 100  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||    
T  51771 tcaggctttcgagggggtattctgatattcatgctagattatgtgcggtgatcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacgga 51870  T
Q  101 tacgtccagaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaagg 200  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51871 tacgtccagtccgtccctagacatccgtcagatgttgtagagctgtcaccgactcagattgtgcaggatttcgtcgacttccgcactcacacgcttaagg 51970  T
Q  201 cggccaattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcact 300  Q
    ||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||  ||||    
T  51971 cggtcgattggggtgagcatgcatgagagcagacatggcatatgacagatggctatgtacgatggtacaccgttgtgtctcaccctcacatttttccact 52070  T
Q  301 tcttctaggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    ||||  | ||||||||| |||||||||||||||    
T  52071 tctttcatgagatattccgaggcctccaaatga 52103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 34819968 - 34819646
Alignment:
Q  11 gaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccaga 110  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  34819968 gaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtattcgtaggatgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtccaga 34819869  T
Q  111 ccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattg 210  Q
     | |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  | |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  34819868 gcgtccctagacatccgacggatgttgtagagctgccaccgcctcagattgtgtaggcattcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcagccgattg 34819769  T
Q  211 gggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttctagga 310  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||   |||||||||      || |||||||||||||||  ||| ||||| ||||    
T  34819768 gggtgagcaggcacaggagcagacatggcggatggcggatggctatgtgttatggtacactaaggtgtttcaccctcagatttttccacctcttccagga 34819669  T
Q  311 gatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    ||| ||| ||||||  |||||||    
T  34819668 gatcttccgaggccagcaaatga 34819646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 39832110 - 39831872
Alignment:
Q  2 caggctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagat 101  Q
    |||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||    
T  39832110 caggattttgaggaggttttgtggtattcaggctggattatgtgcggtgttcctaaggtgtaccgtcacttacccgagagggttttaaggcagtacggat 39832011  T
Q  102 acgtccagaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggc 201  Q
    ||||||||||| || | ||||||||  | ||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39832010 acgtccagaccgtctccagacatccgaccgatgttgtagagctgtcaccgcctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggc 39831911  T
Q  202 ggccaattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcg 240  Q
    || | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  39831910 ggtcgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcg 39831872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 25 - 333
Target Start/End: Original strand, 39604001 - 39604308
Alignment:
Q  25 gtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccagaccatccctagacat 124  Q
    |||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  39604001 gtattctggatggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccaagagggttttgaggcagtacgaatacgtccagaccatccc-agacat 39604099  T
Q  125 ccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattggggtgagcatgcag 224  Q
    ||  ||||||||||||| ||| ||  | || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  39604100 ccgacggatgttgtagacctgccaccgccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggtggccgattggggtgagcatgcag 39604199  T
Q  225 aagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttctaggagatattctgaggcc 324  Q
     |||| ||||||| || ||||| |||| |||||| | |||||||||      ||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||| || ||||||||||    
T  39604200 gagagtagacatgacggatggcggatgactatgtcctatggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctcttccaggaaatcttctgaggcc 39604299  T
Q  325 tccaaatga 333  Q
    | |||||||    
T  39604300 tgcaaatga 39604308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 21176680 - 21176349
Alignment:
Q  2 caggctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagat 101  Q
    |||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||| |  |||| | ||||| |||||||  |||    
T  21176680 cagggttttgaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtaggatgtaccgtcactttcttgagagggttttgcggcagtaaggat 21176581  T
Q  102 acgtccagaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggc 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||  || | |||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  21176580 acgtccagagcatccctagacatccgacggatgttgtagagctgcgatcgcctcagattgtggaggcattcatcgacttccgcactcacacgcttaagga 21176481  T
Q  202 ggccaattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcactt 301  Q
    |  | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||   |||| |||||| | ||||||||| |    ||| ||||||||||||||| ||| |    
T  21176480 gcacgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcgtatgagggatgactatgtgctatggtacactgcggtgtcacaccctcagattttgacacct 21176381  T
Q  302 cttctaggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||| || |||| ||||||||||  |||||||    
T  21176380 cttccagaagatcttctgaggccagcaaatga 21176349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 313
Target Start/End: Original strand, 20858712 - 20859014
Alignment:
Q  11 gaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccaga 110  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  20858712 gaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtccaga 20858811  T
Q  111 ccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattg 210  Q
    || |||| | ||||||  |||||||||||||| |||||  | || | ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  20858812 ccgtccccaaacatccgacggatgttgtagagttgtcaccgccttagattgtgcaggcattcgtcaacttccacactcacacccttaaggcggcctattg 20858911  T
Q  211 gggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttctagga 310  Q
    | ||||||| |||| |||||| ||||||   ||||| |||||||||||   |||||||||      ||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||    
T  20858912 gagtgagcaggcaggagagcatacatggatgatggcggatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcagatttttccacctcttccagga 20859011  T
Q  311 gat 313  Q
    |||    
T  20859012 gat 20859014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 34367968 - 34367646
Alignment:
Q  11 gaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccaga 110  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||   ||| ||||| || |||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||    
T  34367968 gaggaggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgtctgtatggtgtaccttcacttgcccgagagggttttgaggcagtacgaatacgtccaga 34367869  T
Q  111 ccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattg 210  Q
    ||||||  ||||||||  | ||||||||||| ||  ||  | || | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34367868 ccatcctcagacatccgactgatgttgtagacctcccaccgccttacattgtgcaggcgttcgtcgactttcgcactcacacgcttaaggcggccgattg 34367769  T
Q  211 gggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttctagga 310  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||       |||||||||||||| ||| ||| ||||  ||||    
T  34367768 gggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatggctatgtgctatggtacactagggtatctcaccctcagatcttgccacctctttcagga 34367669  T
Q  311 gatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    ||| ||||||||||| |||||||    
T  34367668 gatcttctgaggcctgcaaatga 34367646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 40076037 - 40075736
Alignment:
Q  25 gtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccagaccatccctagacat 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  40076037 gtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtatcgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacagatacatccagagaatccctagacat 40075938  T
Q  125 ccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattggggtgagcatgcag 224  Q
    |   ||||||||||||||||| ||    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||     
T  40075937 cagacggatgttgtagagctgacaccacctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcaaccgattggggtgagcaggcac 40075838  T
Q  225 aagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttctaggagatattctgaggcc 324  Q
    ||||||||||||||||       |||||||||||   |||||||||      ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||||    
T  40075837 aagagcagacatggcg-------gatggctatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttccgaggcc 40075745  T
Q  325 tccaaatga 333  Q
      |||||||    
T  40075744 agcaaatga 40075736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 333
Target Start/End: Original strand, 35554295 - 35554609
Alignment:
Q  12 aggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccagac 111  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||||||  || |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||     
T  35554295 aggagatattctggtatccaggctggattatttgtggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtccagag 35554394  T
Q  112 catccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattgg 211  Q
      |||||||||||||  |||||  |||||||||| ||  | |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35554395 ggtccctagacatccgacggataatgtagagctgacaccgcctcagattgtgcaggaattcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattgg 35554494  T
Q  212 ggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttctaggag 311  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||||       |||||||||||   |||||||||      ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  35554495 ggtgagcaggcacaaaagcagacatggcg-------gatggctatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggag 35554587  T
Q  312 atattctgaggcctccaaatga 333  Q
    || ||| ||||||  |||||||    
T  35554588 atcttccgaggccagcaaatga 35554609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 5301674 - 5301363
Alignment:
Q  2 caggctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagat 101  Q
    |||| ||| |||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||| | || |||| | |||||||||  || ||  |||||||||| ||||| |||    
T  5301674 caggattttgaggaggttttctggtattcaagctggattatgtgcggtgtttgttgggtctaccgtcacttgtccaagtggattttgaggtagtacggat 5301575  T
Q  102 acgtccagaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggc 201  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||  || |  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5301574 acgtccataccgtccctagacatccgacggatgttgtagagctcccactacctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggc 5301475  T
Q  202 ggccaattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcactt 301  Q
    |||| |||| || ||||| |||| ||||||||||||  | ||||| |||| ||||||   |||||||||      ||||||||||||||||||| ||| |    
T  5301474 ggccgattgaggcgagcaggcaggagagcagacatgatggatggcggatgactatgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcagattttgccacct 5301375  T
Q  302 cttctaggagat 313  Q
    |||| |||||||    
T  5301374 cttccaggagat 5301363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 6 - 333
Target Start/End: Original strand, 45132433 - 45132760
Alignment:
Q  6 ctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgt 105  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||| ||| ||  | ||||||| | |||||||| ||||| |||||||    
T  45132433 cttttgaggaggttttttggtattcaggatggattatgtgcggtgttcgtagagtgtaccgacatctgcccgagagggttttgaggtagtacggatacgt 45132532  T
Q  106 ccagaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggcc 205  Q
    |||||   |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||  | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  45132533 ccagatggtccctagacatccgacggatgttgttgagctgccaccgcctcagattgtgcaagctttcgtcgacttccgcactcacatgcttaaggaggcc 45132632  T
Q  206 aattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttc 305  Q
     ||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||   || ||||||||   |||||||||      ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  45132633 gattggggtgagcaggtagcagatcagacatggcgtatgagggagggctatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccctcagattttgccacctcttc 45132732  T
Q  306 taggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
     ||||||| ||| ||||||  |||||||    
T  45132733 caggagatcttccgaggccagcaaatga 45132760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 5679548 - 5679816
Alignment:
Q  1 tcaggctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgtt--ccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtaca 98  Q
    ||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||   ||||||||| || |||| | ||||| ||||||||     
T  5679548 tcagggttttgaggaggttttctggtattcaggctggattatgtacggtgtttgtagggtgtataccgtcacttgcctgagagggttttgcggcagtacg 5679647  T
Q  99 gatacgtccagaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaa 198  Q
    |||||||||||| | |||||||||| | | ||||||||||||||| |  |  | |||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5679648 gatacgtccagagcgtccctagacaactaacggatgttgtagagcggcgaccgcctcagattgtgcagccattcatcgacttccgcactcacacgcttaa 5679747  T
Q  199 ggcggccaattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggta 267  Q
    || | || ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||   ||||||||||| | ||||||    
T  5679748 ggagcccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcgtatgagggatggctatgtgctatggta 5679816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 15034126 - 15033801
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |    
T  15034126 ttcgaggaggttttctggtattctgggtggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 15034027  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||    | ||  ||  | ||   |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  15034026 agaccatccccagacatccgactgatgttaggaacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacga 15033927  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttcta 307  Q
    | |||||||||| |||| |||| | |||||||| ||||| ||||||||||| |  ||||||||      ||||||||||||||| ||| ||| ||||| |    
T  15033926 tcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcggatggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctcttcca 15033827  T
Q  308 ggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||    
T  15033826 ggagatcttccgaggcctgcaaatga 15033801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 41243423 - 41243215
Alignment:
Q  11 gaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccaga 110  Q
    |||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||| || ||||   |||||||||||||| ||||||||||||    
T  41243423 gaggagattttatggtattctggctggattatgtgcgctgttcgtagggtgtaccgtcacttgccagagagtgttttgaggcagtacggatacgtccaga 41243324  T
Q  111 ccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattg 210  Q
    ||||||| ||||||||  | ||||||||||| ||| ||  | || | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||    
T  41243323 ccatccccagacatccgacagatgttgtagacctgccaccgccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcactgacacgcttaaggcagacgattg 41243224  T
Q  211 gggtgagca 219  Q
    |||||||||    
T  41243223 gggtgagca 41243215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 43214102 - 43214310
Alignment:
Q  11 gaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccaga 110  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||  |||||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||    
T  43214102 gaggaggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgtccgtaggatgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacgaatacgtccaga 43214201  T
Q  111 ccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattg 210  Q
    ||||||| ||||||||  | ||||||| ||| ||   |  | || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||    
T  43214202 ccatccccagacatccgactgatgttgcagacctccgaccgccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcgaacgattg 43214301  T
Q  211 gggtgagca 219  Q
    |||||||||    
T  43214302 gggtgagca 43214310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 333
Target Start/End: Original strand, 1055222 - 1055547
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |    
T  1055222 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 1055321  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||   || ||  |   | ||   |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  1055322 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgc 1055421  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttcta 307  Q
    | |||||||||| |||| |||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |  ||||||||      ||||||||||||||| ||| ||| | ||| |    
T  1055422 tcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 1055521  T
Q  308 ggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||    
T  1055522 ggagatcttccgaggcctgcaaatga 1055547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 23019648 - 23019323
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |    
T  23019648 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 23019549  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||   || ||  |   | ||   |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  23019548 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgc 23019449  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttcta 307  Q
    | |||||||||| |||| |||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |  ||||||||      ||||||||||||||| ||| ||| | ||| |    
T  23019448 tcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 23019349  T
Q  308 ggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||    
T  23019348 ggagatcttccgaggcctgcaaatga 23019323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 333
Target Start/End: Original strand, 26662143 - 26662468
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |    
T  26662143 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 26662242  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||   || ||  |   | ||   |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  26662243 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgc 26662342  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttcta 307  Q
    | |||||||||| |||| |||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |  ||||||||      ||||||||||||||| ||| ||| | ||| |    
T  26662343 tcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 26662442  T
Q  308 ggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||    
T  26662443 ggagatcttccgaggcctgcaaatga 26662468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 22857 - 22532
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||| ||| ||    |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |    
T  22857 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgtggcatccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 22758  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||   || ||  |   | ||   |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  22757 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgc 22658  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttcta 307  Q
    | |||||||||| |||| |||| | ||||||||  ||||||||| |||||| |  ||||||||      ||||||||||||||| ||| ||| | ||| |    
T  22657 tcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcagatgactatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 22558  T
Q  308 ggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||    
T  22557 ggagatattccgaggcctgcaaatga 22532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 158 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 30761497 - 30761402
Alignment:
Q  158 attgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggc 253  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  30761497 attgtgcaagcattcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggtggccgattggggtgagcatgcaggagagcagacatggtggatggcagatggc 30761402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 42482867 - 42482542
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |    
T  42482867 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggattttgaggcagtacggatacgtgc 42482768  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||   || ||  |   | ||   |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |      
T  42482767 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttgaggcggacgc 42482668  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttcta 307  Q
    | |||||||||| |||| | || | |||||| |  |||| ||||||||| | |  ||||||||      ||||||||||||||| ||| ||| | ||| |    
T  42482667 tcggggtgagcaggcaggaaaggatacatggtgggtggcggatggctatatcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 42482568  T
Q  308 ggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||    
T  42482567 ggagatcttccgaggcctgcaaatga 42482542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 487094 - 486769
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| |  |||||||| || ||||||| |||||| |   ||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |    
T  487094 ttcgaggaggtttcctggtattctggatggattatgtgcggcgtctgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 486995  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||   || ||  |   | ||   |||||||||   ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  486994 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgtttatcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgc 486895  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttcta 307  Q
    | |||||||||| |||| |||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |  ||||||||      ||||||||||||||| ||| ||| | ||| |    
T  486894 tcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 486795  T
Q  308 ggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||||| ||  ||||||| |||||||    
T  486794 ggagatctttcgaggcctgcaaatga 486769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 41243211 - 41243120
Alignment:
Q  242 atggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttctaggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||      ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||  |||||| |||||||    
T  41243211 atggcagatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcaccctcagattttgtcacctcttccaggagatcttccaaggcctgcaaatga 41243120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 333
Target Start/End: Original strand, 43214349 - 43214405
Alignment:
Q  277 gtctcaccctcagattttgtcacttcttctaggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||    
T  43214349 gtctcaccctcagatcttgccacctcttccaggagatattatgaggcctgcaaatga 43214405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 27)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 47670570 - 47670239
Alignment:
Q  2 caggctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagat 101  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | | |||||||||||||| |||    
T  47670570 caggcttttgaggaggtattctggtattcaggctggattatgtgcggtgatcgtagggtgcaccgtcacttgcccgaaagggttttgaggcagtacggat 47670471  T
Q  102 acgtccagaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggc 201  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  47670470 acgtccagaccgtacctagacatccgtcggaggttgtagagctgtcaccggctgagattgtgcaggctttcgtcaacttccgcactcacgcgcttaagtc 47670371  T
Q  202 ggccaattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcactt 301  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||| || ||  |||||||||||||| |||| |||||    
T  47670370 ggccgattggggtgagcatccaggagaggagacatggcgtatagcatatggctatgtatgatggtacgccattgtgtctcaccctcagaatttgccactt 47670271  T
Q  302 cttctaggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  47670270 cttccaggagatatttcgaggcctccaaatga 47670239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Original strand, 36980250 - 36980579
Alignment:
Q  2 caggctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagat 101  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||    
T  36980250 caggctttcgaggaggtattcctgtattcaggctgaattatgtgtggtgatcgtagggtgtaccgtcactttcccgagaggattttgaggcagtacggat 36980349  T
Q  102 acgtccagaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggc 201  Q
    ||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||  | || | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  36980350 acgtccagactgtccctagacatctgtcggatgttgtagagctgtcaccgactgagattgtgcaggctttcgtcgactttcacactcacacacttaaggc 36980449  T
Q  202 ggccaattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcactt 301  Q
    |||| ||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||  | |||  ||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||| | |||||    
T  36980450 ggccgatttgggtgtgcatacaggagagcagacatggcgtatg--acatgattatgtacgatggtacaccgttgtgcctcaccctcagatttagccactt 36980547  T
Q  302 cttctaggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36980548 cttccaggagatattctgaggcctccaaatga 36980579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9492225 - 9491976
Alignment:
Q  4 ggctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatac 103  Q
    |||||||||| ||||||| | | ||||||| | ||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| | |||| ||||||||| |||||    
T  9492225 ggctttcgagaaggtattctagcattcaggtttgattatgtgtggtgatcgtagagtgtaccgtcactttcccgagagggttttaaggcagtacggatac 9492126  T
Q  104 gtccagaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcgg 203  Q
      ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9492125 acccagaccatccctagacatccgtcggatgttgtagagctgtcaccggctgagattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcga 9492026  T
Q  204 ccaattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggc 253  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  9492025 ccaattggggtgagcatgtaggagaggagacatggcgtatagcagatggc 9491976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 5538918 - 5538650
Alignment:
Q  2 caggctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagat 101  Q
    |||| ||| |||||||| || |||||||| || ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||||| ||    
T  5538918 caggattttgaggaggttttctggtattctggttggattatgtgcggtgttcgtacggtgtaccgtcacttgcccgagtgggttttgaggcagtacaaat 5538819  T
Q  102 acgtccagaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggc 201  Q
    || || |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5538818 acatctagaccaaccctagacatccgatggatgttgtagagctgccatcgcctcacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcactcacacacttaaggc 5538719  T
Q  202 ggccaattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacac 270  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  5538718 ggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatggctatgtgctatggtacac 5538650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Original strand, 13322724 - 13323055
Alignment:
Q  2 caggctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagat 101  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| |||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||    
T  13322724 caggattttgaggaggttttatggtattctggctggataatgtgtggtgttcgtaaggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggat 13322823  T
Q  102 acgtccagaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggc 201  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||    ||||||||||||||| ||    |||| ||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||     
T  13322824 acgtccagaccgtccccagacatccgaaagatgttgtagagctgccaccacctcacattgtgcaggcgttcatcgactttagcactcacacgcttaaggg 13322923  T
Q  202 ggccaattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcactt 301  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| | |||||||||  |   ||||||||||||||| ||| ||| |    
T  13322924 ggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatggcgatgttctatggtacactatggtgtctcaccctcagatattgccacct 13323023  T
Q  302 cttctaggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||  |||||||    
T  13323024 cttccaggagatcttccgaggccagcaaatga 13323055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 27451054 - 27450723
Alignment:
Q  2 caggctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagat 101  Q
    |||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||| ||||||||| ||| ||| | |||||||| ||||| |||    
T  27451054 caggattttgaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgtttatagggtgtaccgtcactttcccaagagggttttgaggtagtacggat 27450955  T
Q  102 acgtccagaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggc 201  Q
    ||||||| ||| || | ||| ||||    ||||||||||||||||||    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27450954 acgtccaaaccgtctccagatatccgaacgatgttgtagagctgtcaccacctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggc 27450855  T
Q  202 ggccaattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcactt 301  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||   |||||||||      ||||||||||||||||||| ||| |    
T  27450854 ggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatggctgtgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcagattttgccacct 27450755  T
Q  302 cttctaggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||| | ||||| ||| ||||||  |||||||    
T  27450754 cttccaagagatcttccgaggccagcaaatga 27450723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 258
Target Start/End: Original strand, 16680159 - 16680405
Alignment:
Q  12 aggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccagac 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  || | | | ||||||||||||||  |||||||||| |    
T  16680159 aggaggttttatggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgtccaatagggttttgaggcagtacgaatacgtccagcc 16680258  T
Q  112 catccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattgg 211  Q
      |||| ||||||||  |||||||||| |||||| ||  | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  16680259 tgtccccagacatccgacggatgttgtcgagctgccaccgcctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattag 16680358  T
Q  212 ggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgt 258  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  16680359 ggtgagcaggcaggagagcagacttggcggatggcggatggctatgt 16680405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 258
Target Start/End: Original strand, 17654395 - 17654641
Alignment:
Q  12 aggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccagac 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  || | | | ||||||||||||||  |||||||||| |    
T  17654395 aggaggttttatggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgtccaatagggttttgaggcagtacgaatacgtccagcc 17654494  T
Q  112 catccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattgg 211  Q
      |||| ||||||||  |||||||||| |||||| ||  | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  17654495 tgtccccagacatccgacggatgttgtcgagctgccaccgcctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattag 17654594  T
Q  212 ggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgt 258  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  17654595 ggtgagcaggcaggagagcagacttggcggatggcggatggctatgt 17654641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 333
Target Start/End: Original strand, 10521530 - 10521851
Alignment:
Q  11 gaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccaga 110  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||| ||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  10521530 gaggaggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccaagagg-ttttgaggcagtacggatacgtccaga 10521628  T
Q  111 ccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattg 210  Q
    ||||||| ||||||||  | ||||||| ||| ||   |  | || | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||    
T  10521629 ccatccccagacatccgactgatgttgcagacctccgaccgcctgacattgtacaggcgttcgtcgactttcgcactcacacgcttaaggcggacgattg 10521728  T
Q  211 gggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttctagga 310  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||   |||||||||      |||||||||||| || ||| ||| ||||| ||||    
T  10521729 gggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatggctatgtcatatggtacactagggtgtctcaccctcatatcttgccacctcttccagga 10521828  T
Q  311 gatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    ||| ||| ||| ||| |||||||    
T  10521829 gatcttccgagacctgcaaatga 10521851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 11630628 - 11630418
Alignment:
Q  2 caggctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagat 101  Q
    |||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || |||||| ||||||| | ||||||||||||||  ||    
T  11630628 caggattttgaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtctaccatcactttcccgagagggttttgaggcagtacgtat 11630529  T
Q  102 acgtccagaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggc 201  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  | |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11630528 acgtcaagaccgtccctagacatccgacggatgttgtagagctgccaccgcctcagattgtgcaggcattcgttgacttccgcactcacacgcttaaggc 11630429  T
Q  202 ggccaattggg 212  Q
    |||| ||||||    
T  11630428 ggccgattggg 11630418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 333
Target Start/End: Original strand, 17837656 - 17837974
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||  |||||||||    
T  17837656 ttcgaggaggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgtccgtatggtgtaccgtcacttgcccgagatggttttgaggcagtatggatacgtcc 17837755  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||| ||| ||  ||  | ||   ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |    
T  17837756 agaccatccccagacatccgactgatgttgcagacctcccaccgccttccattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcacttacacgcttaaggcagacga 17837855  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttcta 307  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||       ||||||||||| | |||||||||      ||||||||||||||| ||| ||| ||||| |    
T  17837856 ttggggtgagcaagcaggagagcagacatggcg-------gatggctatgtcctatggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctcttcca 17837948  T
Q  308 ggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||    
T  17837949 ggagatcttccgaggcctgcaaatga 17837974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 32 - 246
Target Start/End: Original strand, 34741448 - 34741662
Alignment:
Q  32 ggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccagaccatccctagacatccatcgg 131  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||  ||| | ||||||| ||||| | | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||   |||    
T  34741448 ggctggattatgtgcggtgttcgtagaatgtactgtcacttgcccgatagggttttgaagcagtacggatacgtccagaccgtccccagacatctgacgg 34741547  T
Q  132 atgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattggggtgagcatgcagaagagca 231  Q
    |||||||||||||| ||  | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  34741548 atgttgtagagctgccaccgcctcacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcagccgattggggtgagcaggcaggagagca 34741647  T
Q  232 gacatggcgtatggc 246  Q
    ||||||||| |||||    
T  34741648 gacatggcggatggc 34741662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11632869 - 11632680
Alignment:
Q  2 caggctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagat 101  Q
    |||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || |||||| ||||||| | ||||||||||||||  ||    
T  11632869 caggattttgaggaggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtctaccatcactttcccgagagggttttgaggcagtacgtat 11632770  T
Q  102 acgtccagaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcaca 191  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  | |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  11632769 acgtcaagaccgtccctagacatccgacggatgttgtagagctgccaccgcctcagattgtgcaggcattcgttgacttccgcactcaca 11632680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Original strand, 37342935 - 37343271
Alignment:
Q  2 caggctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatc-----gtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagta 96  Q
    |||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||  ||| ||| ||     ||||||||| ||||||||| || |||| | | || ||||| ||    
T  37342935 cagggttttgaggagatattctggtattcaggctggattatttgcagtgttcgtagagtagggtgtaccgtcacttgcctgagagggtgttaaggcaata 37343034  T
Q  97 cagatacgtccagaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgctt 196  Q
    | ||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  | |||| ||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||    
T  37343035 cggatacgtccagacaaaccctagacatccggcggatgttgtagagctgacaccgcctcagattgtgcagacattcgtatacttccgcactcacacgctt 37343134  T
Q  197 aaggcggccaattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgt 296  Q
    |||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||   || ||||||||   |||||||||      ||||||||||||||||||      
T  37343135 aaggaggccgattggggtgagcaggcagcagagcagacatggcatatgagggagggctatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccctcagatttttc 37343234  T
Q  297 cacttcttctaggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    ||| ||||  ||||||| ||| ||||||  |||||||    
T  37343235 cacctctttcaggagatcttccgaggccagcaaatga 37343271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 42505295 - 42505045
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||| ||| ||| | |||||||||||||| ||||||| |    
T  42505295 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccaagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 42505196  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||   || ||  ||  | ||   |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  42505195 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgcctttcattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacga 42505096  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgt 258  Q
    | |||||||||| |||| |||| | ||||||||  |||| |||||||||||    
T  42505095 tcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgt 42505045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 333
Target Start/End: Original strand, 41883236 - 41883561
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |    
T  41883236 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 41883335  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||   || ||  |   | ||   |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  41883336 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgc 41883435  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttcta 307  Q
    | |||||||||| |||| |||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |  ||||||||      ||||||||||||||| ||| ||| | ||| |    
T  41883436 tcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 41883535  T
Q  308 ggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||    
T  41883536 ggagatcttccgaggcctgcaaatga 41883561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 333
Target Start/End: Original strand, 48406054 - 48406379
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |    
T  48406054 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 48406153  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||   || ||  |   | ||   |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  48406154 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgc 48406253  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttcta 307  Q
    | |||||||||| |||| |||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |  ||||||||      ||||||||||||||| ||| ||| | ||| |    
T  48406254 tcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 48406353  T
Q  308 ggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||    
T  48406354 ggagatcttccgaggcctgcaaatga 48406379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 131 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 47522215 - 47522013
Alignment:
Q  131 gatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattggggtgagcatgcagaagagc 230  Q
    ||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||    
T  47522215 gatgttgtagagctgtcaccgcctcagattgtgcaggcattcttcgacttccgcacttacacgtttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggaaagc 47522116  T
Q  231 agacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttctaggagatattctgaggcctccaaa 330  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||   |||||||||      ||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||| ||| ||||||  ||||    
T  47522115 agacatggcggatggcggatgactatgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcagattttgccacctattccaggagatcttccgaggccagcaaa 47522016  T
Q  331 tga 333  Q
    |||    
T  47522015 tga 47522013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 9368763 - 9368438
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |    
T  9368763 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 9368664  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||   || ||  ||  | ||   |||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  9368663 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcatcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgc 9368564  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttcta 307  Q
    | |||||| ||| |||| |||| | ||| ||||  |||| ||||||||||| |  ||||||||      ||||||||||||||| ||| ||| | ||| |    
T  9368563 tcggggtgtgcaggcaggagaggatacacggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 9368464  T
Q  308 ggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||    
T  9368463 ggagatcttccgaggcctgcaaatga 9368438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 17460623 - 17460373
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || ||||||||  | ||||||| |||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |    
T  17460623 ttcgaggaggttttctggtattcttgatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 17460524  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||   || ||  |   | ||   |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  17460523 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgc 17460424  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgt 258  Q
    | |||||||||| |||| |||| | ||||||||  |||| |||||||||||    
T  17460423 tcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgt 17460373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 258
Target Start/End: Original strand, 17592591 - 17592841
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || ||||||||  | ||||||| |||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |    
T  17592591 ttcgaggaggttttctggtattcttgatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 17592690  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||   || ||  |   | ||   |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  17592691 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgc 17592790  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgt 258  Q
    | |||||||||| |||| |||| | ||||||||  |||| |||||||||||    
T  17592791 tcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgt 17592841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 35607752 - 35607427
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || ||||||||  | ||||||| |||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||  ||||||| |    
T  35607752 ttcgaggaggttttctggtattctagatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtatggatacgtgc 35607653  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||   || ||  |   | ||   |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  35607652 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgc 35607553  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttcta 307  Q
    | |||||||||| |||| |||| | |||||||   |||| ||||||||||| |  ||||||||      ||||||||||||||| ||| ||| | ||| |    
T  35607552 tcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcaggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 35607453  T
Q  308 ggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||    
T  35607452 ggagatcttccgaggcctgcaaatga 35607427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 56 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 15071596 - 15071319
Alignment:
Q  56 agggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccagaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctc 155  Q
    ||||||| || |||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||  | ||||||   || ||  ||  | ||     
T  15071596 agggtgtaccatcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgcctt 15071497  T
Q  156 atattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggcta 255  Q
      |||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||| |||| |||| | ||||||||  |||| ||||||||    
T  15071496 ccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacatgcttaaggcggacgatcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggcta 15071397  T
Q  256 tgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttctaggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||   |||||||||      ||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  15071396 tgtcatatggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 15071319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 153 - 240
Target Start/End: Original strand, 41734613 - 41734700
Alignment:
Q  153 ctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcg 240  Q
    |||| ||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  41734613 ctcagattatgcatgcattcgtagacttccgcactcacacgcttaaggaggccgattggggtgagcaggcagcagagcagacatggcg 41734700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 9491976 - 9491930
Alignment:
Q  287 cagattttgtcacttcttctaggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  9491976 cagattttgccacttcttctaggagatattccaaggcctccaaatga 9491930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 277 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 11630373 - 11630317
Alignment:
Q  277 gtctcaccctcagattttgtcacttcttctaggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||||  |||||||    
T  11630373 gtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttccgaggccagcaaatga 11630317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 277 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 17747777 - 17747741
Alignment:
Q  277 gtctcaccctcagattttgtcacttcttctaggagat 313  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  17747777 gtctcaccctctgattttgccacttcttctaggagat 17747741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 17)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 333
Target Start/End: Original strand, 7416482 - 7416803
Alignment:
Q  12 aggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccagac 111  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||  ||||||||| ||||| | | |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  7416482 aggaggtattctggtattcaggctggattatgtgcaatgatcgtaaggtgcaccgtcacttgcccgatagggttttgaggcagtacggatatgtccagac 7416581  T
Q  112 catccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattgg 211  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | || | ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||     
T  7416582 cgtccctagacatccgtcggatgttgtagagctgtcaccgactgagattgtgcatactttcttcgacttccgcactcacacgcttaaggcagccgattgc 7416681  T
Q  212 ggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttctaggag 311  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  7416682 ggtgagcatgcaggagaggagacatggcatatggcagatggctatgtacgatggtacgccattgcgtctcactctcagattttgccacttcttccaggag 7416781  T
Q  312 atattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  7416782 atattccgaggcctccaaatga 7416803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 333
Target Start/End: Original strand, 40538229 - 40538546
Alignment:
Q  2 caggctttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagat 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||    
T  40538229 caggctttcgaggaggtattttggtattcaggctggattatgtgcgatgatcgtagggtgcaccgtcactttcccgagagggttttgaggcagtacggat 40538328  T
Q  102 acgtccagaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||  |||| | |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40538329 acgtccagaccatccctagacatctgttggaggttgtagagctgtcaccggctgagattgtgtaggcttttgtcgacttccacactcacacgcttaaggc 40538428  T
Q  202 ggccaattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcactt 301  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||    ||          ||||||| ||||||| || ||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  40538429 ggccgattggggtgagcatgcaggagaggagacatg----at----------tatgtacgatggtacgccattgtgtctcaccctcagattttgccactt 40538514  T
Q  302 cttctaggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  40538515 cttccaagagatattctgaggcctccaaatga 40538546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 29398963 - 29398641
Alignment:
Q  11 gaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccaga 110  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  29398963 gaggaggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgttacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtcctga 29398864  T
Q  111 ccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattg 210  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||||||  || ||  | || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  29398863 ccatccccagacatccgacggatgttgtagacttgccaccgccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgattg 29398764  T
Q  211 gggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttctagga 310  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||| | |||||||||      ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  29398763 gggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatgactatgtgctatggtacactagggtgtctcaccctcagattttgtcatctcttccagga 29398664  T
Q  311 gatattctgaggcctccaaatga 333  Q
     || |||  |||||| |||||||    
T  29398663 aatcttcctaggcctgcaaatga 29398641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 10826266 - 10825954
Alignment:
Q  14 gaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccagacca 113  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10826266 gaggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtccagacca 10826167  T
Q  114 tccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattgggg 213  Q
    |||  ||||||||  ||||||||||||| ||| ||  | || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  10826166 tccgcagacatccgacggatgttgtagacctgccaccgccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcactcacatgcttaaggcggacgattgggg 10826067  T
Q  214 tgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttctaggagat 313  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||       ||||||||||| | |||||||||      ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  10826066 tgagcaggcagaatagcagacatggcg-------gatggctatgtcctatggtacactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagat 10825974  T
Q  314 attctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||| ||||||| |||||||    
T  10825973 attccgaggcctgcaaatga 10825954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 333
Target Start/End: Original strand, 39950193 - 39950515
Alignment:
Q  11 gaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccaga 110  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  39950193 gaggaggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgtctgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtccaga 39950292  T
Q  111 ccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattg 210  Q
    ||||||  ||||||||  | ||||||| ||| ||  ||  | || | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  39950293 ccatccgcagacatccgactgatgttgcagacctcccaccgccttacattgtacaggcgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgattg 39950392  T
Q  211 gggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttctagga 310  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||      ||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||    
T  39950393 gggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatggctatgtcctatggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctcttccagga 39950492  T
Q  311 gatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    ||| ||| ||||||| |||||||    
T  39950493 gatcttccgaggcctgcaaatga 39950515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 36653854 - 36653541
Alignment:
Q  11 gaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccaga 110  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  36653854 gaggaggttttttggtattcaggttggattatgtgcggtgttcatagggtgtaccgtcacttgtccgagagggttttgaggcagtacagatacgtccaga 36653755  T
Q  111 ccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattg 210  Q
    || |||| ||||||||  | ||||||||||||||||||  | ||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36653754 ccgtccccagacatccgaccgatgttgtagagctgtcaccgcctcagtttgtgaaggcattcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattg 36653655  T
Q  211 gggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttctagga 310  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||| | ||| | |||||||||||   |||||| ||      ||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  36653654 gggtgagcagacaggagagcagacatggtggatgacggatggctatgtgttatggtatactcgggtgtctcgccctcagattttgccacctcttccagga 36653555  T
Q  311 gatattctgaggcc 324  Q
    ||| ||| ||||||    
T  36653554 gatcttccgaggcc 36653541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Original strand, 7189515 - 7189771
Alignment:
Q  14 gaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtccagacca 113  Q
    ||||| || |||||||| | |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7189515 gaggttttctggtattctgactggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtccagacca 7189614  T
Q  114 tccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaattgggg 213  Q
    |||| ||||||||  | ||||||||||| ||  || || || | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7189615 tccccagacatccgactgatgttgtagacctcccactgccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgtactcacacgcttaaggcggccgattgggg 7189714  T
Q  214 tgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacac 270  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||  ||| | ||||||||| | | |||||||||    
T  7189715 tgagcaggcaggagagcagacatggctgatgacggatggctatatgctatggtacac 7189771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 333
Target Start/End: Original strand, 28471224 - 28471549
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||| |    
T  28471224 ttcgaggaggttttttggtattctgggtggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggtagtacagatacgtgc 28471323  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||   || ||  ||  | ||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  28471324 agaccatccccagacatccgactgatgttagggatctcccaccgtcttccattgtgcaggtgttcgtcgacttccgcactcacacgattaaggcggacga 28471423  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttcta 307  Q
    | |||||||||| | || |||| | ||||||||   ||| |||||||||||   |||||||||      ||||||||||||||| ||| ||| ||||| |    
T  28471424 tcggggtgagcaggtaggagaggatacatggcgggcggcggatggctatgtcatatggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctcttcca 28471523  T
Q  308 ggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||||| ||| ||| ||| |||||||    
T  28471524 ggagatcttccgagacctgcaaatga 28471549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 333
Target Start/End: Original strand, 45431201 - 45431526
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||| ||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||  ||||||| |    
T  45431201 ttcgaggaggttttctggtattctggctggattatgtgtggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtatggatacgtgc 45431300  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||   || ||  ||  | ||   ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  45431301 agaccatccccagacatcctactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcaggtgttcgtcaacttccgcactcacacgattaaggcggacga 45431400  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttcta 307  Q
    | |||||||||| |||| | || | ||||||||  |||| |||||||||||   |||||||||      ||||||||||||||| ||| ||| | |||||    
T  45431401 tcggggtgagcaggcaggaaaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcatatggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccaccttttcta 45431500  T
Q  308 ggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||    
T  45431501 ggagatcttccgaggcctgcaaatga 45431526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 333
Target Start/End: Original strand, 15833952 - 15834277
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||  |||||| | |||||||||||||| ||||||| |    
T  15833952 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgtccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 15834051  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||   || ||  |   | ||   |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  15834052 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgc 15834151  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttcta 307  Q
    | |||||||||| |||| |||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |  ||||||||      ||||||||||||||| ||| ||| | ||| |    
T  15834152 tcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 15834251  T
Q  308 ggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||    
T  15834252 ggagatcttctgaggcctgcaaatga 15834277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 30494322 - 30493997
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |    
T  30494322 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 30494223  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||   || ||  |   | ||   |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  30494222 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgc 30494123  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttcta 307  Q
    | |||||||||| |||| |||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |  ||||||||      ||||||||||||||| ||| ||| | ||| |    
T  30494122 tcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 30494023  T
Q  308 ggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||    
T  30494022 ggagatcttccgaggcctgcaaatga 30493997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 333
Target Start/End: Original strand, 5354667 - 5354992
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||      
T  5354667 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgt 5354766  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||   || ||  |   | ||   |||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  5354767 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcatcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgc 5354866  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttcta 307  Q
    | |||||||||| |||| |||| | ||||||||  |||| ||||||||||| |  ||||||||      ||||||||||||||| ||| ||| | ||| |    
T  5354867 tcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 5354966  T
Q  308 ggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||    
T  5354967 ggagatcttccgaggcctgcaaatga 5354992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 333
Target Start/End: Original strand, 17423162 - 17423487
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |    
T  17423162 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 17423261  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||   || ||  ||  | ||   |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |      
T  17423262 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgc 17423361  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttcta 307  Q
      |||||||||| |||| |||| ||||||||||   ||| ||||||||||| |  |||||| |      ||||||||||||||| ||| ||| | ||| |    
T  17423362 ccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 17423461  T
Q  308 ggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||    
T  17423462 ggagatcttccgaggcctgcaaatga 17423487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 333
Target Start/End: Original strand, 43981217 - 43981542
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |    
T  43981217 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 43981316  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||   || ||  |   | ||   |||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  43981317 agaccatccccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcatcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgc 43981416  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttcta 307  Q
    | |||||||||| |||| |||| | ||||||||   ||| ||||||||||| |  ||||||||      ||||||||||||||| ||| ||| | ||| |    
T  43981417 tcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 43981516  T
Q  308 ggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||    
T  43981517 ggagatcttccgaggcctgcaaatga 43981542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 43537065 - 43536740
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||| | |    
T  43537065 ttcgaggaggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacatgc 43536966  T
Q  108 agaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccaa 207  Q
    |||| ||||| |||||||   | ||||||   || ||  |   | ||   |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  43536965 agactatccccagacatctgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgc 43536866  T
Q  208 ttggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttcta 307  Q
    | |||||||||| |||| |||| | ||||||||  |||||||||||||||| |  ||||||||      ||||||||||||||| ||| ||| | ||| |    
T  43536865 tcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcagatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 43536766  T
Q  308 ggagatattctgaggcctccaaatga 333  Q
    | |||| ||| ||||||| |||||||    
T  43536765 gtagatcttccgaggcctgcaaatga 43536740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 126
Target Start/End: Original strand, 22680215 - 22680332
Alignment:
Q  8 ttcgaggaggtattatggtattcaggctggattaagtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttacccgagaagattttgaggcagtacagatacgtcc 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |    
T  22680215 ttcgaggaggttttctggtattctggttggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgc 22680314  T
Q  108 agaccatccctagacatcc 126  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  22680315 agaccatccc-agacatcc 22680332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 20067730 - 20067502
Alignment:
Q  95 tacagatacgtccagaccatccctagacatccatcggatgttgtagagctgtcattggctcatattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgc 194  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||||   ||||||||| ||||||  |   | ||| ||||||||||| ||| | |||||||| ||| |||||     
T  20067730 tacagatacatccagaacgtccctagacatccgatggatgttgttgagctgcgacaagatcagattgtgcaggcattccttgacttccgtactgacacga 20067631  T
Q  195 ttaaggcggccaattggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagatttt 294  Q
    |||||| |  | ||||||||||||  |||| | || ||| |||||| ||||  ||||||||||||  ||||||||       ||||||||||| ||||||    
T  20067630 ttaaggagctcgattggggtgagccagcaggatag-agaaatggcggatggaggatggctatgtaatatggtacattagggtgtctcaccctctgatttt 20067532  T
Q  295 gtcacttcttctaggagatattctgaggcc 324  Q
    | ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  20067531 gccacttcttctaggagatcttccgaggcc 20067502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 313
Target Start/End: Original strand, 56473 - 56579
Alignment:
Q  207 attggggtgagcatgcagaagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacaatggtacaccgttacgtctcaccctcagattttgtcacttcttct 306  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||     ||||||||||||||| |||  || |||||     
T  56473 attggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcagatgactatgtgctatggtacaccagggtgtctcaccctcagatcttgcaacctcttcc 56572  T
Q  307 aggagat 313  Q
    |||||||    
T  56573 aggagat 56579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University