View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6805_low_6 (Length: 275)

Name: NF6805_low_6
Description: NF6805
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6805_low_6
NF6805_low_6
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (14-257)||(1140-1383)
[»] chr8 (50 HSPs)
chr8 (14-257)||(20010440-20010683)
chr8 (14-257)||(19851409-19851652)
chr8 (14-257)||(19857445-19857688)
chr8 (14-257)||(21682010-21682253)
chr8 (14-257)||(23654925-23655168)
chr8 (14-257)||(20007848-20008091)
chr8 (14-257)||(21840415-21840658)
chr8 (14-257)||(1266237-1266480)
chr8 (14-257)||(22061973-22062216)
chr8 (14-257)||(21324949-21325193)
chr8 (14-257)||(31417014-31417257)
chr8 (14-257)||(16265158-16265401)
chr8 (15-257)||(6679110-6679352)
chr8 (26-257)||(20388109-20388340)
chr8 (15-226)||(27347225-27347436)
chr8 (15-257)||(804213-804455)
chr8 (14-257)||(12304756-12304999)
chr8 (14-257)||(29303966-29304209)
chr8 (14-257)||(31571382-31571625)
chr8 (15-257)||(14565141-14565383)
chr8 (15-257)||(6603657-6603899)
chr8 (15-257)||(28982356-28982598)
chr8 (15-257)||(28987576-28987818)
chr8 (32-257)||(19977983-19978208)
chr8 (14-257)||(21167077-21167320)
chr8 (32-257)||(21250958-21251183)
chr8 (32-257)||(23650057-23650282)
chr8 (32-257)||(15533396-15533621)
chr8 (32-257)||(30313684-30313909)
chr8 (50-257)||(32600178-32600385)
chr8 (32-257)||(19112706-19112931)
chr8 (32-257)||(21394405-21394630)
chr8 (32-257)||(21788898-21789123)
chr8 (32-257)||(21922275-21922500)
chr8 (14-257)||(17674563-17674806)
chr8 (32-246)||(22046389-22046603)
chr8 (32-238)||(22164750-22164956)
chr8 (54-230)||(16408612-16408788)
chr8 (50-238)||(22133600-22133788)
chr8 (14-257)||(23948887-23949130)
chr8 (14-246)||(19485421-19485653)
chr8 (32-246)||(20018301-20018515)
chr8 (14-255)||(22987199-22987440)
chr8 (50-236)||(15441215-15441401)
chr8 (32-246)||(22032048-22032262)
chr8 (17-257)||(20396665-20396905)
chr8 (32-257)||(22120714-22120939)
chr8 (161-257)||(22051008-22051104)
chr8 (161-257)||(22377993-22378089)
chr8 (161-257)||(22384168-22384264)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (14-257)||(9761-10004)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (14-257)||(14049-14291)
[»] chr6 (54 HSPs)
chr6 (14-257)||(25750605-25750848)
chr6 (14-257)||(21471397-21471640)
chr6 (14-257)||(22796874-22797117)
chr6 (14-257)||(14131421-14131664)
chr6 (48-257)||(25768021-25768230)
chr6 (14-259)||(18794486-18794731)
chr6 (14-257)||(21564374-21564617)
chr6 (14-257)||(8766390-8766633)
chr6 (14-257)||(10469091-10469334)
chr6 (14-257)||(19879094-19879337)
chr6 (14-257)||(11287840-11288083)
chr6 (14-257)||(24364208-24364451)
chr6 (14-257)||(27560859-27561102)
chr6 (14-257)||(34645828-34646071)
chr6 (97-257)||(17415365-17415525)
chr6 (14-257)||(5839461-5839704)
chr6 (14-257)||(11280747-11280990)
chr6 (14-257)||(28283055-28283298)
chr6 (32-237)||(17032376-17032581)
chr6 (14-137)||(1640595-1640718)
chr6 (14-138)||(18787684-18787808)
chr6 (14-257)||(15459132-15459375)
chr6 (50-257)||(27331675-27331882)
chr6 (50-257)||(27392415-27392622)
chr6 (32-257)||(12497840-12498065)
chr6 (32-257)||(12510836-12511061)
chr6 (32-257)||(22762697-22762922)
chr6 (14-257)||(19864483-19864726)
chr6 (32-257)||(1543326-1543551)
chr6 (32-257)||(23078283-23078508)
chr6 (32-257)||(25610103-25610328)
chr6 (32-257)||(29592162-29592387)
chr6 (14-246)||(28263450-28263682)
chr6 (14-246)||(28342199-28342431)
chr6 (50-257)||(18197789-18197996)
chr6 (32-257)||(2875045-2875270)
chr6 (32-257)||(12505169-12505394)
chr6 (32-257)||(24313410-24313635)
chr6 (32-236)||(21833244-21833448)
chr6 (14-246)||(27187232-27187464)
chr6 (14-246)||(27261776-27262008)
chr6 (106-257)||(14381709-14381860)
chr6 (50-257)||(22078930-22079137)
chr6 (32-257)||(16626959-16627184)
chr6 (14-257)||(16963609-16963852)
chr6 (32-257)||(25112366-25112591)
chr6 (51-257)||(18408185-18408391)
chr6 (14-246)||(28292625-28292857)
chr6 (14-257)||(16927882-16928125)
chr6 (14-257)||(25765532-25765774)
chr6 (172-257)||(25750900-25750985)
chr6 (14-151)||(22433793-22433930)
chr6 (134-257)||(18800858-18800981)
chr6 (161-246)||(1640715-1640800)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (14-257)||(3838-4081)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (14-257)||(5102-5345)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (14-257)||(26105-26348)
[»] chr7 (49 HSPs)
chr7 (14-257)||(15102685-15102928)
chr7 (14-257)||(14264328-14264571)
chr7 (14-257)||(19147133-19147376)
chr7 (14-257)||(20746532-20746775)
chr7 (29-257)||(16072378-16072606)
chr7 (14-257)||(12206884-12207127)
chr7 (11-257)||(6413430-6413676)
chr7 (14-257)||(13665475-13665713)
chr7 (27-257)||(11388512-11388741)
chr7 (14-257)||(13021279-13021522)
chr7 (28-257)||(16950555-16950784)
chr7 (14-255)||(26288122-26288363)
chr7 (14-257)||(14286460-14286703)
chr7 (15-257)||(49152224-49152466)
chr7 (14-257)||(14129795-14130038)
chr7 (14-257)||(14433613-14433856)
chr7 (14-257)||(23199827-23200070)
chr7 (14-257)||(23505954-23506197)
chr7 (23-257)||(8212212-8212446)
chr7 (15-257)||(11306347-11306589)
chr7 (14-257)||(18054037-18054280)
chr7 (26-257)||(1491-1722)
chr7 (14-257)||(12455625-12455867)
chr7 (32-255)||(15154760-15154983)
chr7 (14-165)||(15340418-15340569)
chr7 (32-257)||(11553208-11553433)
chr7 (50-257)||(14037764-14037971)
chr7 (50-257)||(14347794-14348001)
chr7 (32-257)||(17422-17647)
chr7 (32-257)||(12687440-12687665)
chr7 (32-257)||(11237319-11237544)
chr7 (32-252)||(8198567-8198787)
chr7 (32-257)||(8707544-8707769)
chr7 (32-257)||(14954559-14954784)
chr7 (32-257)||(15161163-15161388)
chr7 (14-255)||(10870916-10871157)
chr7 (14-255)||(23516877-23517118)
chr7 (32-255)||(14332336-14332559)
chr7 (50-257)||(18177699-18177906)
chr7 (32-257)||(18551864-18552089)
chr7 (32-252)||(44791462-44791682)
chr7 (32-257)||(13686002-13686228)
chr7 (32-257)||(15203818-15204043)
chr7 (14-114)||(26118811-26118911)
chr7 (14-153)||(15479326-15479465)
chr7 (80-257)||(15624539-15624716)
chr7 (149-257)||(26118689-26118797)
chr7 (14-117)||(21661885-21661988)
chr7 (173-243)||(4440008-4440078)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (14-257)||(385782-386025)
scaffold0004 (15-257)||(117532-117774)
scaffold0004 (14-257)||(322667-322910)
scaffold0004 (14-255)||(203570-203811)
scaffold0004 (14-257)||(111984-112227)
[»] chr5 (54 HSPs)
chr5 (14-257)||(23442572-23442815)
chr5 (32-257)||(21891038-21891263)
chr5 (14-257)||(24735890-24736133)
chr5 (14-257)||(24737064-24737307)
chr5 (14-257)||(24749833-24750076)
chr5 (11-257)||(22236199-22236445)
chr5 (14-257)||(23080368-23080611)
chr5 (14-257)||(21564245-21564488)
chr5 (14-257)||(22381045-22381288)
chr5 (14-257)||(22502525-22502768)
chr5 (15-257)||(14887270-14887512)
chr5 (15-257)||(37545775-37546018)
chr5 (14-257)||(17269612-17269855)
chr5 (15-257)||(25847922-25848164)
chr5 (15-249)||(24798684-24798918)
chr5 (14-243)||(20821299-20821528)
chr5 (14-255)||(21662321-21662561)
chr5 (15-257)||(20342129-20342371)
chr5 (14-240)||(28924064-28924290)
chr5 (32-257)||(23573624-23573849)
chr5 (32-257)||(25423071-25423296)
chr5 (14-257)||(22461798-22462041)
chr5 (14-240)||(28895238-28895464)
chr5 (14-257)||(23516405-23516648)
chr5 (14-240)||(20773606-20773832)
chr5 (49-255)||(21665782-21665987)
chr5 (14-255)||(20468377-20468618)
chr5 (32-257)||(22333166-22333391)
chr5 (32-228)||(21343666-21343862)
chr5 (50-257)||(20798660-20798867)
chr5 (14-255)||(20573385-20573626)
chr5 (32-257)||(21984584-21984809)
chr5 (32-257)||(22134550-22134775)
chr5 (32-257)||(26738984-26739209)
chr5 (32-257)||(34566376-34566601)
chr5 (14-257)||(23440089-23440332)
chr5 (14-257)||(23471093-23471336)
chr5 (32-257)||(15000018-15000243)
chr5 (32-257)||(16356384-16356609)
chr5 (50-257)||(18775677-18775884)
chr5 (41-230)||(22348316-22348505)
chr5 (14-255)||(27610218-27610459)
chr5 (32-257)||(27685679-27685904)
chr5 (32-237)||(40708662-40708867)
chr5 (14-246)||(21404700-21404932)
chr5 (14-257)||(19769824-19770067)
chr5 (14-103)||(21625382-21625471)
chr5 (14-255)||(27668771-27669012)
chr5 (32-257)||(37291775-37292000)
chr5 (32-255)||(41770724-41770947)
chr5 (32-237)||(27518289-27518494)
chr5 (32-257)||(29476352-29476577)
chr5 (93-257)||(21498315-21498479)
chr5 (173-257)||(11210973-11211057)
[»] chr3 (53 HSPs)
chr3 (18-257)||(15953293-15953532)
chr3 (14-257)||(15227210-15227453)
chr3 (14-257)||(14571409-14571652)
chr3 (76-257)||(12850604-12850785)
chr3 (14-257)||(18134671-18134914)
chr3 (17-257)||(12360867-12361107)
chr3 (14-256)||(13322978-13323220)
chr3 (14-257)||(11304098-11304341)
chr3 (17-257)||(14086237-14086477)
chr3 (17-257)||(16329984-16330224)
chr3 (14-158)||(31945033-31945177)
chr3 (15-255)||(47123506-47123746)
chr3 (14-257)||(11961359-11961602)
chr3 (15-257)||(10383531-10383773)
chr3 (17-257)||(13972445-13972685)
chr3 (14-257)||(8759407-8759650)
chr3 (14-257)||(13941585-13941828)
chr3 (14-257)||(41177083-41177326)
chr3 (14-257)||(44776808-44777051)
chr3 (14-257)||(16836835-16837072)
chr3 (14-153)||(31689052-31689191)
chr3 (18-243)||(16381266-16381491)
chr3 (32-257)||(17489419-17489644)
chr3 (14-257)||(12497799-12498042)
chr3 (32-255)||(9522288-9522511)
chr3 (14-243)||(10420384-10420613)
chr3 (14-257)||(14876835-14877078)
chr3 (32-257)||(16492517-16492742)
chr3 (32-257)||(16691729-16691954)
chr3 (32-255)||(10905779-10906002)
chr3 (32-257)||(15725269-15725494)
chr3 (32-257)||(16635342-16635567)
chr3 (32-257)||(43162666-43162891)
chr3 (14-257)||(15208442-15208685)
chr3 (50-257)||(15247734-15247941)
chr3 (32-252)||(48425016-48425236)
chr3 (32-255)||(10005169-10005392)
chr3 (32-255)||(13252259-13252482)
chr3 (32-257)||(15348581-15348806)
chr3 (14-230)||(5425292-5425508)
chr3 (50-257)||(15402846-15403053)
chr3 (32-255)||(15589730-15589953)
chr3 (50-237)||(16371000-16371187)
chr3 (32-246)||(15338838-15339052)
chr3 (32-257)||(16412618-16412843)
chr3 (32-255)||(20062392-20062615)
chr3 (14-246)||(6600298-6600530)
chr3 (14-80)||(12854360-12854426)
chr3 (14-236)||(16756942-16757164)
chr3 (32-257)||(26792735-26792960)
chr3 (14-255)||(53385356-53385597)
chr3 (14-257)||(16807262-16807505)
chr3 (14-46)||(14542883-14542915)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (14-257)||(1249-1491)
scaffold0139 (14-257)||(27482-27725)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (18-257)||(47091-47330)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (14-257)||(49133-49376)
scaffold0053 (14-257)||(57916-58159)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (14-253)||(7140-7379)
[»] scaffold0326 (2 HSPs)
scaffold0326 (14-257)||(18637-18880)
scaffold0326 (14-83)||(3629-3698)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (14-257)||(1269-1512)
[»] chr4 (44 HSPs)
chr4 (14-257)||(15070345-15070588)
chr4 (14-257)||(15003461-15003704)
chr4 (14-257)||(15245856-15246099)
chr4 (17-257)||(16145847-16146087)
chr4 (14-257)||(1649374-1649617)
chr4 (17-257)||(20890918-20891157)
chr4 (15-257)||(3264891-3265133)
chr4 (26-257)||(33222862-33223093)
chr4 (14-257)||(44661963-44662206)
chr4 (15-257)||(29453634-29453876)
chr4 (15-257)||(11207328-11207570)
chr4 (14-257)||(42702835-42703078)
chr4 (14-257)||(51606278-51606521)
chr4 (69-200)||(18164343-18164474)
chr4 (14-144)||(15319515-15319645)
chr4 (32-257)||(7090383-7090607)
chr4 (50-257)||(15149843-15150050)
chr4 (32-257)||(12523626-12523851)
chr4 (32-257)||(16252282-16252507)
chr4 (14-255)||(16355284-16355525)
chr4 (14-255)||(14159424-14159665)
chr4 (32-237)||(14680517-14680722)
chr4 (14-118)||(15415215-15415319)
chr4 (14-257)||(14652240-14652483)
chr4 (14-257)||(14851203-14851446)
chr4 (32-201)||(14927152-14927321)
chr4 (32-257)||(18227283-18227508)
chr4 (32-257)||(29039241-29039466)
chr4 (32-257)||(12476550-12476775)
chr4 (32-257)||(14303815-14304039)
chr4 (32-257)||(18297155-18297380)
chr4 (32-257)||(23955697-23955922)
chr4 (32-255)||(8386362-8386585)
chr4 (14-257)||(19778630-19778873)
chr4 (14-257)||(14266736-14266979)
chr4 (32-255)||(15364336-15364559)
chr4 (32-257)||(40472990-40473215)
chr4 (130-257)||(15359187-15359314)
chr4 (27-257)||(27711281-27711511)
chr4 (14-85)||(15359326-15359397)
chr4 (32-255)||(8053462-8053685)
chr4 (155-257)||(27900459-27900561)
chr4 (155-257)||(16752666-16752768)
chr4 (32-101)||(18607823-18607892)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (14-257)||(6014-6256)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (14-257)||(51963-52206)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (14-257)||(61-304)
[»] scaffold0011 (4 HSPs)
scaffold0011 (14-222)||(68575-68783)
scaffold0011 (14-251)||(148533-148770)
scaffold0011 (14-257)||(195803-196045)
scaffold0011 (32-246)||(26644-26858)
[»] scaffold0924 (1 HSPs)
scaffold0924 (14-257)||(3854-4097)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (14-257)||(19946-20189)
scaffold0298 (14-257)||(13461-13704)
scaffold0298 (14-257)||(17231-17474)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (14-257)||(31373-31616)
scaffold0106 (49-257)||(14037-14245)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (14-257)||(2714-2957)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (14-257)||(91032-91275)
scaffold0001 (32-256)||(162094-162318)
scaffold0001 (14-257)||(448022-448265)
scaffold0001 (146-219)||(175358-175431)
[»] chr1 (33 HSPs)
chr1 (14-257)||(19854261-19854504)
chr1 (17-257)||(19665045-19665285)
chr1 (14-257)||(20940232-20940475)
chr1 (14-257)||(22433285-22433528)
chr1 (14-257)||(20244147-20244390)
chr1 (17-257)||(20075228-20075468)
chr1 (14-257)||(31550350-31550593)
chr1 (15-257)||(37677027-37677270)
chr1 (14-257)||(20294359-20294602)
chr1 (15-243)||(20395176-20395404)
chr1 (32-230)||(21747500-21747698)
chr1 (14-240)||(20856947-20857173)
chr1 (32-257)||(20249815-20250040)
chr1 (32-257)||(50620413-50620638)
chr1 (32-257)||(17045184-17045409)
chr1 (14-257)||(19761035-19761278)
chr1 (27-257)||(16350768-16350998)
chr1 (32-230)||(50612612-50612810)
chr1 (41-252)||(16369271-16369482)
chr1 (50-257)||(20136761-20136968)
chr1 (32-257)||(19106332-19106557)
chr1 (126-257)||(41307884-41308015)
chr1 (32-246)||(16078813-16079027)
chr1 (32-257)||(21830268-21830493)
chr1 (14-111)||(24476927-24477024)
chr1 (76-249)||(20836065-20836241)
chr1 (32-257)||(33391198-33391423)
chr1 (32-257)||(21836915-21837140)
chr1 (14-246)||(41354649-41354881)
chr1 (50-246)||(51333673-51333869)
chr1 (140-257)||(11382667-11382784)
chr1 (14-168)||(21163227-21163381)
chr1 (173-257)||(46518827-46518911)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (14-257)||(39702-39945)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (17-255)||(27192-27430)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (14-257)||(37165-37408)
scaffold0026 (128-257)||(27437-27566)
scaffold0026 (128-257)||(38274-38403)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (14-257)||(61313-61556)
scaffold0067 (14-257)||(52279-52522)
scaffold0067 (47-257)||(67701-67911)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (14-257)||(21771-22014)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (14-257)||(10851-11094)
scaffold0124 (14-257)||(499-742)
scaffold0124 (173-257)||(7910-7994)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (14-257)||(25965-26208)
scaffold0113 (14-257)||(16639-16882)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (14-257)||(19083-19326)
scaffold0058 (14-87)||(59042-59115)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (14-257)||(14001-14244)
scaffold0034 (86-257)||(5053-5224)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (17-257)||(49307-49547)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (14-257)||(4239-4482)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (14-249)||(14359-14594)
scaffold0203 (14-195)||(9039-9220)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (14-257)||(23087013-23087256)
chr2 (14-257)||(23293521-23293764)
chr2 (14-257)||(23276339-23276582)
chr2 (14-257)||(24653908-24654151)
chr2 (14-249)||(24944930-24945165)
chr2 (15-255)||(31830222-31830462)
chr2 (14-257)||(11358511-11358754)
chr2 (15-257)||(20832549-20832791)
chr2 (14-257)||(12573916-12574159)
chr2 (14-257)||(27787304-27787547)
chr2 (15-257)||(1063315-1063557)
chr2 (17-257)||(27365716-27365956)
chr2 (14-257)||(22757100-22757343)
chr2 (14-257)||(21325903-21326146)
chr2 (50-257)||(24675088-24675295)
chr2 (32-257)||(23138618-23138843)
chr2 (32-257)||(23550408-23550633)
chr2 (49-257)||(23063675-23063883)
chr2 (32-257)||(9609717-9609942)
chr2 (32-257)||(24708119-24708344)
chr2 (14-255)||(44386208-44386449)
chr2 (32-255)||(10868431-10868654)
chr2 (32-257)||(16924841-16925066)
chr2 (32-257)||(16998581-16998806)
chr2 (32-252)||(16981733-16981953)
chr2 (32-252)||(17063298-17063518)
chr2 (32-255)||(27217597-27217820)
chr2 (50-257)||(27377108-27377315)
chr2 (32-257)||(21145667-21145892)
chr2 (32-257)||(24261951-24262176)
chr2 (32-236)||(23188589-23188793)
chr2 (41-257)||(24878632-24878848)
chr2 (32-255)||(22325495-22325718)
chr2 (32-257)||(24709614-24709839)
chr2 (32-257)||(27370850-27371075)
chr2 (14-108)||(24833359-24833453)
chr2 (32-252)||(17066959-17067176)
chr2 (14-120)||(30211691-30211797)
chr2 (14-191)||(41609047-41609224)
chr2 (146-246)||(24825930-24826030)
chr2 (50-240)||(45529116-45529306)
chr2 (173-257)||(24831824-24831908)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (14-257)||(10839-11082)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (14-257)||(491-734)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (14-257)||(18812-19055)
scaffold0090 (134-257)||(23094-23217)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (14-257)||(42433-42676)
scaffold0010 (14-257)||(47499-47742)
scaffold0010 (70-113)||(2202-2245)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (65-257)||(4764-4956)
[»] scaffold0114 (4 HSPs)
scaffold0114 (17-257)||(20088-20328)
scaffold0114 (17-257)||(43471-43711)
scaffold0114 (17-257)||(44483-44723)
scaffold0114 (17-216)||(36021-36220)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (14-257)||(12881-13124)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (14-257)||(42746-42989)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (14-257)||(112522-112765)
scaffold0029 (14-240)||(96119-96345)
scaffold0029 (27-257)||(109911-110141)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (14-200)||(2023-2208)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (49-234)||(13376-13561)
[»] scaffold0005 (4 HSPs)
scaffold0005 (14-257)||(260271-260514)
scaffold0005 (16-257)||(278930-279171)
scaffold0005 (14-257)||(164809-165052)
scaffold0005 (50-257)||(308658-308865)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (14-255)||(25173-25414)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (37-257)||(1624-1844)
scaffold0120 (32-257)||(6004-6229)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (14-257)||(10183-10426)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (14-257)||(248576-248819)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (17-257)||(33777-34017)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (14-257)||(26224-26467)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (14-257)||(28869-29112)
scaffold0064 (14-257)||(40860-41103)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (14-257)||(7338-7577)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (14-257)||(16813-17056)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (15-255)||(38989-39229)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (17-257)||(50614-50854)
scaffold0028 (32-257)||(43135-43360)
scaffold0028 (41-230)||(8475-8664)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (41-257)||(3130-3346)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (14-210)||(136082-136278)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (50-257)||(360-567)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (14-257)||(154-397)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (14-257)||(3995-4238)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (32-257)||(82-307)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (14-255)||(27930-28171)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (32-257)||(32852-33077)
[»] scaffold0222 (1 HSPs)
scaffold0222 (14-142)||(3483-3611)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (14-149)||(45807-45943)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (32-257)||(657-882)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (32-257)||(65386-65611)
scaffold0042 (14-222)||(39924-40132)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (32-257)||(127299-127524)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (50-257)||(16986-17193)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (14-257)||(14840-15083)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (14-257)||(219517-219760)
scaffold0012 (32-255)||(229024-229247)
scaffold0012 (173-257)||(33095-33179)
[»] scaffold1508 (1 HSPs)
scaffold1508 (17-114)||(880-977)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (32-257)||(1120-1345)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (14-255)||(377-618)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (14-130)||(9182-9298)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (50-257)||(1-208)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (14-257)||(5977-6220)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (14-257)||(15179-15422)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (32-257)||(7358-7583)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (32-257)||(15474-15698)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (32-257)||(180198-180423)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (41-236)||(16947-17142)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (14-104)||(18991-19081)
scaffold0023 (65-201)||(4581-4717)
scaffold0023 (41-100)||(37003-37062)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (32-257)||(6353-6578)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (14-231)||(6146-6363)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (32-257)||(794-1018)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (32-257)||(601-826)
scaffold0044 (32-237)||(14341-14546)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (50-257)||(9342-9549)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (14-257)||(33673-33916)
scaffold0109 (50-257)||(8595-8802)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (14-257)||(64131-64374)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (50-251)||(1004-1205)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (14-257)||(5690-5933)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (52-255)||(13079-13282)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (173-257)||(1916-2000)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (26-257)||(883-1114)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (50-257)||(4505-4712)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (14-257)||(25819-26062)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (65-195)||(49507-49637)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (14-255)||(16518-16759)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (182-257)||(1-76)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (32-257)||(6918-7145)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (71-257)||(16565-16751)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (50-230)||(5220-5400)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (50-201)||(117061-117212)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (125-257)||(21941-22073)
[»] scaffold0507 (2 HSPs)
scaffold0507 (146-257)||(9065-9176)
scaffold0507 (14-118)||(6940-7044)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (14-230)||(949-1165)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (32-108)||(6254-6330)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (125-257)||(7864-7996)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (149-257)||(5311-5419)
[»] scaffold0518 (2 HSPs)
scaffold0518 (14-58)||(10787-10831)
scaffold0518 (125-257)||(10843-10975)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (14-118)||(86743-86847)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (176-257)||(7522-7603)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (92-137)||(8771-8816)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (155-228)||(909-982)
[»] scaffold0720 (1 HSPs)
scaffold0720 (14-75)||(1-62)
[»] scaffold1710 (1 HSPs)
scaffold1710 (173-257)||(1010-1094)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (14-118)||(17429-17533)


Alignment Details
Target: scaffold0165 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 1140 - 1383
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1140 acatcatctctcggaataacatacgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 1239  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  1240 ccactctgtatgccactgttccaaccctctaagatatctgatacagaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgt 1339  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1340 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 1383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 50)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 20010683 - 20010440
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20010683 acatcagctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacgtgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 20010584  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  20010583 ccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacccacacccgt 20010484  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20010483 catcggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 20010440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 19851409 - 19851652
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19851409 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacgtactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 19851508  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  19851509 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacaaccgt 19851608  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19851609 caacggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 19851652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 19857445 - 19857688
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19857445 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacgtactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 19857544  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  19857545 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacaaccgt 19857644  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19857645 caacggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 19857688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21682253 - 21682010
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21682253 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgtttcatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcattcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 21682154  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  21682153 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 21682054  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21682053 cataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 21682010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 23654925 - 23655168
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23654925 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 23655024  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||| | | ||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  23655025 ccaatatatataccactgttcaaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 23655124  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  23655125 cataggagtaactctcagaaacaaatgatctccgtcttgaaact 23655168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 20007848 - 20008091
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20007848 acatcatatctcggtataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtagcaaac 20007947  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| || || ||||||| ||| ||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  20007948 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaatgaactttggagtcaccttgttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 20008047  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20008048 cataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttggaact 20008091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 21840415 - 21840658
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21840415 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacgtggaatacatcatgcaaatttgaaagatgtggtggcaaac 21840514  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||| ||    
T  21840515 tcactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcagtgcacctcctacacctgt 21840614  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21840615 tataggagtaactcttagaaacacatgatctccctcttgaaact 21840658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 1266237 - 1266480
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1266237 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgttacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 1266336  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||    
T  1266337 caactctatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 1266436  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  1266437 catcggagtaactctcagaaatacatgatcaccctcctgaaact 1266480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22062216 - 22061973
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22062216 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 22062117  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| |||||| || || |||||||||||| | |||||||| ||| |  ||||||||||    
T  22062116 caactctatatgccacagttccaaccctctctgatatttgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatgtcctacacccgt 22062017  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22062016 cataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaact 22061973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21325193 - 21324949
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaa-gatgtggtggcaaa 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  21325193 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaatgatgtggtggcaaa 21325094  T
Q  113 cccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccg 212  Q
    || ||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||| || || |||||||||||| | |||||||| |||||  |||||||||    
T  21325093 ccaactctatatgccactgttccaaccctctatgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccg 21324994  T
Q  213 tcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  21324993 tcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaact 21324949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 31417257 - 31417014
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  31417257 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgtagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaag 31417158  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | |||||||||||||||||||| || || ||||  |||| |||||| || || |||||||||||| | |||||||| |||||  ||||||||||    
T  31417157 caactctatatgccactgttccaaccctttctgaaatctaatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 31417058  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  31417057 cataagagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaact 31417014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16265401 - 16265158
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16265401 acatcatccctttgaatcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 16265302  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || || || |||||||||||| | |||||||| ||||   | ||||||||    
T  16265301 caactctatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacatccaacacccgt 16265202  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  16265201 caaaggagtgaccctcagaaagacatgatcaccctcctgaaact 16265158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 15 - 257
Target Start/End: Original strand, 6679110 - 6679352
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 114  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6679110 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 6679209  T
Q  115 cactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtc 214  Q
     ||| | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| || |||||||||||  | |||||||| |||||| | |||||||||    
T  6679210 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccaacacccgtc 6679309  T
Q  215 ataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    | ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  6679310 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaact 6679352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 257
Target Start/End: Original strand, 20388109 - 20388340
Alignment:
Q  26 ggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatg 125  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  20388109 ggaataacatgcgaaggatctgctacatacttccgaaattgcgacacattaaacacatcatgcacattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatg 20388208  T
Q  126 ccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgac 225  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||  || | |||||||||    || |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||   |||||||    
T  20388209 tcactgtcccaactctctcagatatctaatatggaccaataaaccgtggggtcaacttcttagacttcaaagcacgaccaacacctgtcactagagtgac 20388308  T
Q  226 tctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20388309 tctcagaaacacatggtctccttcttgaaact 20388340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Original strand, 27347225 - 27347436
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 114  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  27347225 catcatccctcggaatcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtgccaaacc 27347324  T
Q  115 cactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtc 214  Q
     ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||| |||||| || || |||||||||||| | |||||||| |||||  | |||||||||    
T  27347325 aactttatatgccactgtcccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 27347424  T
Q  215 ataggagtgact 226  Q
    | ||||||||||    
T  27347425 aaaggagtgact 27347436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 804455 - 804213
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 114  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  804455 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 804356  T
Q  115 cactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtc 214  Q
     ||| | ||||||||||| ||||  ||||| || ||||| |||| ||||||||| || |||||||||||| | |||||||| |||||  | |||||||||    
T  804355 aactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 804256  T
Q  215 ataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    | ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  804255 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaact 804213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 12304756 - 12304999
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12304756 acatcatcccttggaatcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 12304855  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | |||||||||||| |||||||||| || ||||| |||| ||| || || || |||||||||||  | |||||||| |||||  | ||||||||    
T  12304856 caactctatatgccactgtttcaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaggcacgtccaacacccgt 12304955  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || ||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  12304956 caaaggagtgaccctaagaaaaacatgatcaccctcctgaaact 12304999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 29304209 - 29303966
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29304209 acatcatccctaggaatcacatgtgaaggatcctctacatacttcctaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 29304110  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | || |||||||||||||  ||||| || ||||| |||| ||| || |  || |||||||||||| | |||||||| |||||  ||||||||||    
T  29304109 caactctataagccactgttccaattctctctgaaatctgatacggacctatgatctttggagtcaacttccttgacttcaatgcacgtcctacacccgt 29304010  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  29304009 cattggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaact 29303966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 31571625 - 31571382
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  31571625 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatctgctacatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 31571526  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | |||||||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||  | || ||||| |||||  ||||||||||    
T  31571525 caactctatatgccaccgttcctattctctctgaaatctgatacgggccaatgaatttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 31571426  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  31571425 catcggagtcactctcagaaatacatgatcaccctcttgaaact 31571382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 257
Target Start/End: Original strand, 14565141 - 14565383
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 114  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14565141 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacaaatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 14565240  T
Q  115 cactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtc 214  Q
     ||| | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || | |||||| || || |||||||||||| | |||||||| |||||  | |||||||||    
T  14565241 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatatggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 14565340  T
Q  215 ataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    | ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  14565341 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaact 14565383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 257
Target Start/End: Original strand, 6603657 - 6603899
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 114  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6603657 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 6603756  T
Q  115 cactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtc 214  Q
     ||| | ||||||||||| ||||  ||||| || || || |||| |||||| || || |||||||||||  | |||||||| || ||| | |||||||||    
T  6603757 aactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatttgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtc 6603856  T
Q  215 ataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    | ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  6603857 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaact 6603899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 257
Target Start/End: Original strand, 28982356 - 28982598
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 114  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28982356 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatatttccgaagctgagaaacatgaaacacgtcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 28982455  T
Q  115 cactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtc 214  Q
     ||| | ||||||||||| ||||  ||||| || ||||| ||||  |||||||| || |||||||||||| | |||||||| |||||  | |||||||||    
T  28982456 aactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtc 28982555  T
Q  215 ataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |  |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  28982556 aacggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaact 28982598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 257
Target Start/End: Original strand, 28987576 - 28987818
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 114  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28987576 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatatttccgaagctgagaaacatgaaacacgtcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 28987675  T
Q  115 cactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtc 214  Q
     ||| | ||||||||||| ||||  ||||| || ||||| ||||  |||||||| || |||||||||||| | |||||||| |||||  | |||||||||    
T  28987676 aactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtc 28987775  T
Q  215 ataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |  |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  28987776 aacggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaact 28987818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 19977983 - 19978208
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| || ||||||   || ||||| |    
T  19977983 acatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgttacgccaccg 19978082  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    |||||||  | || |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| |||| ||||||||||||||     
T  19978083 ttccaactatttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 19978182  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||    
T  19978183 aaacacgtggtctccttcttgaaact 19978208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21167320 - 21167077
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  21167320 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatattttcgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaacc 21167221  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | |||   || |||||||||||||| || || |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| ||    
T  21167220 caactcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 21167121  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || |||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||    
T  21167120 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaact 21167077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 21250958 - 21251183
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||   || ||||| |    
T  21250958 acatgggatggatctggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 21251057  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || || |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||  | ||||| |||| ||||||||||||||     
T  21251058 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 21251157  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| | ||||||||    
T  21251158 aaacacgtggtctccttattgaaact 21251183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 23650057 - 23650282
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||   || ||||| |    
T  23650057 acatgggatggatccagtacatacttccgaagttgcaacacaagaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaactcgataagccaccg 23650156  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || |  |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||| ||||||||||||||     
T  23650157 ttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcacaggagtgactctcaa 23650256  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||  || ||||| ||||||||||    
T  23650257 aaacatgtggtctccttcttgaaact 23650282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 15533396 - 15533621
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||   || ||||| |    
T  15533396 acatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 15533495  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || || |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| | || ||||||||||||||     
T  15533496 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagccacaggagtgactctcaa 15533595  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||  || || || ||||||||||    
T  15533596 aaacatgtggtcaccttcttgaaact 15533621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 30313909 - 30313684
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||   || ||||| |    
T  30313909 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 30313810  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || || |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| |||| ||||||||||||||     
T  30313809 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 30313710  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| || |||||||    
T  30313709 aaacacgtggtctccttcctgaaact 30313684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 50 - 257
Target Start/End: Original strand, 32600178 - 32600385
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagata 149  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||| || ||||||   || ||||| |||||||| || || ||||    
T  32600178 acatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagacgtggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 32600277  T
Q  150 tctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctc 249  Q
    |||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| |||| |||||||||||||| |||||| || ||||| ||    
T  32600278 tctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 32600377  T
Q  250 ttgaaact 257  Q
     |||||||    
T  32600378 ctgaaact 32600385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 19112706 - 19112931
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||  ||| |||||||    
T  19112706 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccactg 19112805  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  19112806 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 19112905  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||    
T  19112906 aaacacgtggtctccttcttggaact 19112931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21394630 - 21394405
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| || ||||||  ||| ||||| |    
T  21394630 acatgggatggatccggtacatacttctgaagttgcgacacaggaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcggtacgccaccg 21394531  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    || | || || || |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||  | ||||| |||| ||||||||||||||     
T  21394530 ttacgactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagaacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 21394431  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||    
T  21394430 aaacacgtggtctccttcttggaact 21394405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21789123 - 21788898
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| || ||||||  ||| ||||| |    
T  21789123 acatgggatggatccggtacatacttctgaagttgcgacacaggaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcggtacgccaccg 21789024  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    || | || || || |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||  | ||||| |||| ||||||||||||||     
T  21789023 ttacgactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagaacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 21788924  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||    
T  21788923 aaacacgtggtctccttcttggaact 21788898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21922500 - 21922275
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||  ||| ||||| |    
T  21922500 acatgggatggatccagtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacgtcgtgcaaattcgaaatatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccg 21922401  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || || |||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||  |  | ||||| |||| | ||||||||||||     
T  21922400 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaatatatctcggagtcaacttcttcgacttcaaagcttgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 21922301  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||    
T  21922300 aaatacgtggtctccttcttgaaact 21922275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 17674806 - 17674563
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||| || ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  17674806 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 17674707  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    |||||  ||| ||||| |||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||    
T  17674706 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 17674607  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||    
T  17674606 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaact 17674563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 32 - 246
Target Start/End: Original strand, 22046389 - 22046603
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||   || ||||| |    
T  22046389 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcctactcgatacgccaccg 22046488  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| |||||  | ||||| ||||  |||||||||||||     
T  22046489 ttccaactctttccgatatctgatacgaaccaataaacctcggagtcaatttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcactggagtgactctcaa 22046588  T
Q  232 aaacacatgatctcc 246  Q
    |||||| || |||||    
T  22046589 aaacacgtggtctcc 22046603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 32 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22164956 - 22164750
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||   |  ||||| |    
T  22164956 acatgtgatggatccgggacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatgcgccaccg 22164857  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || || |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||  | ||||| |||| | |||||||| |||     
T  22164856 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttatttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacatgagtgactttcaa 22164757  T
Q  232 aaacaca 238  Q
    |||||||    
T  22164756 aaacaca 22164750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 54 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16408788 - 16408612
Alignment:
Q  54 acttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctg 153  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||   || ||||| |||||||| || || ||||||||    
T  16408788 acttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctg 16408689  T
Q  154 gtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctca 230  Q
     |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| |||| | ||||||||||||    
T  16408688 atacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctca 16408612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 50 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22133788 - 22133600
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagata 149  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |  || |||   || ||||| |||||||| || || ||||    
T  22133788 acatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtattccgactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 22133689  T
Q  150 tctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacaca 238  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| |||| | ||||| |||||| |||||||    
T  22133688 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacatgagtgtctctcaaaaacaca 22133600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 23948887 - 23949130
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||  ||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  23948887 acatcatctcttgggatcacatgagactgatccgaaacatacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggtggtaaac 23948986  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    |||||   || ||||| || | ||  || || |||||||| |||| ||||| |||  |||||||||||||||| || ||||| |||||    | ||| ||    
T  23948987 ccactcgctacgccaccgtactaattctttctgatatctgatacggaccaacaaacctcggagtcaacttctttgatttcaaagcacgtctaaaaccagt 23949086  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23949087 cacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaact 23949130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 19485653 - 19485421
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||| || ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  19485653 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 19485554  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    |||||  ||| ||||| || ||||| || ||  | ||||| || | |||||| || ||||  ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||    
T  19485553 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 19485454  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctcc 246  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  19485453 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcc 19485421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 32 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 20018515 - 20018301
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  |||||||||| |||||| || || |||||||||  ||| ||||| |    
T  20018515 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 20018416  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||   |||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  20018415 ttccaactctttccagtatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 20018316  T
Q  232 aaacacatgatctcc 246  Q
    |||||| || |||||    
T  20018315 aaacacgtggtctcc 20018301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 255
Target Start/End: Original strand, 22987199 - 22987440
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||  | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |  || || ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22987199 acatcatctctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgtattacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 22987298  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    |||||   || ||||| |||||||  || |  |||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||| |  | ||| | ||    
T  22987299 ccactcgatacgccaccgttccaattctttatgatatctgatacggaccaataaacttcagagtcaacttctttgacttcaatgcatgtccaacatcagt 22987398  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaa 255  Q
    ||  ||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||    
T  22987399 cactggagtgactctaaaaaatacatgatctccttcttgaaa 22987440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 50 - 236
Target Start/End: Original strand, 15441215 - 15441401
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagata 149  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |  ||    || ||||| |||||||| || || ||||    
T  15441215 acatacttacgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaatcaaacacgatacgccaccgttccaactctttccgata 15441314  T
Q  150 tctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaaca 236  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| | || |||||||||||||| |||||    
T  15441315 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagccacaggagtgactctcaaaaaca 15441401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 32 - 246
Target Start/End: Original strand, 22032048 - 22032262
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || |||   || ||||  |    
T  22032048 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgaaacatggaaaacatcgtgtaaattcgaaagatgcggtggtaatcctactcgatacgccaacg 22032147  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    || |||| || || |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||  | ||||| |||| ||||||||||||||     
T  22032148 tttcaactctttccgatatctgatacaaaccaataaatctcggagtcaatttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 22032247  T
Q  232 aaacacatgatctcc 246  Q
    |||||| || |||||    
T  22032248 aaacacgtggtctcc 22032262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 20396905 - 20396665
Alignment:
Q  17 tcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccca 116  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |||||||  ||| |||||||||| ||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  20396905 tcatctcttggaatcacatgagatggatccgaaacacacttccgaagttgttacacatgaaatgcatcatgcaaattcgaaagatgcggtagtaaaccca 20396806  T
Q  117 ctttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcat 216  Q
    ||   || |||||| || |||  || || |||||||| |||  |||||||||| |  ||||||  ||| | |||||||| |||||  ||||||| ||||     
T  20396805 ctcgatacgccactatttcaattctttctgatatctgatacagaccaataaatcttagagtcagtttccttgacttcaatgcacgtcctacaccggtcac 20396706  T
Q  217 aggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||||||||| | ||| ||||| ||||| || |||||||    
T  20396705 aggagtgactctaaaaaatacatggtctccttcctgaaact 20396665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22120939 - 22120714
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||| ||||||||||| || || |  | |||||| |||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||| |    
T  22120939 acatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaaaacgttgttcaaatttgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccg 22120840  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| || | |||||| || ||||  ||||||||| | |||||||| |||||  | ||||| |||||||||||||||||||     
T  22120839 ttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttccttgacttcaatgcacgtcccacaccagtcataggagtgactctcaa 22120740  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| || || ||||| || |||||||    
T  22120739 aaatacgtggtctccttcctgaaact 22120714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 257
Target Start/End: Original strand, 22051008 - 22051104
Alignment:
Q  161 ccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | || ||||| |||||  ||||||||||||| ||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  22051008 ccaatgaacttcggagtcaacttccttgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactttcaaaaatacatgatcaccctcttgaaact 22051104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22378089 - 22377993
Alignment:
Q  161 ccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| ||||  |||||||| |||| ||| ||||||||| | || |||||||    
T  22378089 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcactggagtgaccctcaaaaatacatgatctgcttcctgaaact 22377993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22384264 - 22384168
Alignment:
Q  161 ccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| ||||  |||||||| |||| ||| ||||||||| | || |||||||    
T  22384264 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcactggagtgaccctcaaaaatacatgatctgcttcctgaaact 22384168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 9761 - 10004
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9761 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaac 9860  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||     
T  9861 ccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgataaggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcctacacccgc 9960  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9961 cataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 10004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 14049 - 14291
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14049 acatcatccctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 14148  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  14149 ccactttgtatgccactgttccaa-cctttcagatatctagtacgaaccgataaacttcggagtcaacttcttcgacttcaacgcacgacctacacccgt 14247  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14248 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 14291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 54)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 25750605 - 25750848
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25750605 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagatgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 25750704  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  25750705 ccactctgtatgccactgttccaactctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcttacacccgt 25750804  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25750805 cacaagagtgactctcagaaacacatgatctccttcttgaaact 25750848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 21471397 - 21471640
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21471397 acatcatctcttggaatcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 21471496  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||    
T  21471497 ccactctgtatgccactgttccaactctctcagatatctggtacggatcaataaacttcggagtcaacttcttagatttcaacgcacgtcctacccccgt 21471596  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21471597 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccttcttgaaact 21471640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22797117 - 22796874
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22797117 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctgcatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 22797018  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||    
T  22797017 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatatgatacagaccaataaacttaggagtcaacttcctagacttcaatgcacgtcctacacccgt 22796918  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22796917 cataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 22796874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 14131664 - 14131421
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14131664 acatcatctctaggaataacaggcgaaggatccgttacatacttccgtaactgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgttgtggcaaac 14131565  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  14131564 ccactctatatgccactgttccaactctctcagatatctgatacggaccaataaacttcgaagtcaacttcttagacttcaatgcacgacctacacctgt 14131465  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  14131464 cataggagtgaccctcagaaacacatgatctccttcctgaaact 14131421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 48 - 257
Target Start/End: Original strand, 25768021 - 25768230
Alignment:
Q  48 ctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25768021 ctacatacttccgaagctgcgacacgtgaaacacatcatgcaaattggaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcaga 25768120  T
Q  148 tatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccc 247  Q
    ||||||||||| ||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  25768121 tatctggtacggaccaataaactttgaagtcaatttcttagacttcaacgcacgtcctacacccgtcataagagtgactctcagaaacacatgatctcct 25768220  T
Q  248 tcttgaaact 257  Q
    ||||||||||    
T  25768221 tcttgaaact 25768230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 259
Target Start/End: Original strand, 18794486 - 18794731
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18794486 acatcatctctaggaataacatgcgacggatccggtacatactttcgtaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 18794585  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |  |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  ||||||| ||    
T  18794586 ccactcgatatgccactgttccaaccctcttagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaaggcacggcctacacctgt 18794685  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactga 259  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18794686 cataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactga 18794731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21564617 - 21564374
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |  || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  21564617 acatcatctctaggaataatatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattctaaagatgaggcggcaaac 21564518  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  ||||||| ||    
T  21564517 ccactctatacgccactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgt 21564418  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  21564417 caaaggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaact 21564374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 8766633 - 8766390
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8766633 acatcatctattggaataacatgcgaaggatccgctacatactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 8766534  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || || || |||||||||||| | |||||||| |||||  |||| |  ||    
T  8766533 ccactctgtaagccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacccttgt 8766434  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  8766433 catagaagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaact 8766390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 10469334 - 10469091
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10469334 acatcatcccttggaatcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaggttcgaaagatgtggtggcaaac 10469235  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||| |||||| || || |||||||||||| | |||||||| |||||  | ||||||||    
T  10469234 caactctatatgccacagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgt 10469135  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  10469134 caaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaact 10469091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 19879094 - 19879337
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||    
T  19879094 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgcaactgtgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggtaaac 19879193  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||  | || |||||||||||||| |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| |     
T  19879194 ccaccctataagccactgttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagatttcaatgcacggcctacacctgc 19879293  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  19879294 cataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaact 19879337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 11288083 - 11287840
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| | ||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||    
T  11288083 acatcatctcttggaataacatgcgaagaatccggtacatagttccgcaactgtgacacatggaacacgtcatgcaaatttgaaagatgagggggtaaac 11287984  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||  | || |||||||||||||| |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||  ||||||||||    
T  11287983 ccaccctataagccactgttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgt 11287884  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  11287883 cataggggtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaact 11287840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 24364208 - 24364451
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24364208 acatcatcccttggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 24364307  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| |||||| || || |||||||||||  | ||||||| ||||||| | ||||||||    
T  24364308 caactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagcgcacgaccaacacccgt 24364407  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  24364408 caaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaact 24364451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 27561102 - 27560859
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| | ||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  27561102 acatcatctctcggaatgacatgcgaagggtctgctacatacttccgcaactgtgacacgtggaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 27561003  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | |||||||| ||||||| |||||| || ||||| |||| |||||| || ||||||||||||||| | || ||||| |||||  ||||||||||    
T  27561002 caactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 27560903  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  27560902 catcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaact 27560859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 34646071 - 34645828
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  34646071 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatcaggtacgtacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatc 34645972  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | | | | || ||||| |||||||| |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||| | ||||| ||    
T  34645971 caattctatacgccacagttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacgacccacacctgt 34645872  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  34645871 cataggagtgaccctcaagaacacatgatctccctcttgaaact 34645828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 97 - 257
Target Start/End: Original strand, 17415365 - 17415525
Alignment:
Q  97 aagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaac 196  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||     
T  17415365 aagatgcggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaat 17415464  T
Q  197 gcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17415465 gcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcataaacacatgatctccctcttgaaact 17415525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 5839704 - 5839461
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  5839704 acatcatcactctggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgtaaattcgaaagatgcggtggtaaac 5839605  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | |||   || |||||||||||||| || || |||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  5839604 caactcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcgaagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcctacacctgt 5839505  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||||||||||| ||||   || ||||| ||||||||||    
T  5839504 cataggagtgactctcaaaaacgtgtggtctccttcttgaaact 5839461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 11280990 - 11280747
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| | ||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||    
T  11280990 acatcatctcttggaataacatgcgaagaatccggtacatagttccgcaactgtgacacatggaacacgtcatgcaaatttgaaagatgagggggtaaac 11280891  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||  | || |||||||||||||| |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||||||||||||||| || || ||| |  ||||||| ||    
T  11280890 ccaccctataagccactgttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcatgtcctacacctgt 11280791  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  11280790 cataggtgtgattctcaagaacacatgatctccctcttgaaact 11280747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 28283298 - 28283055
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  28283298 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcgtgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 28283199  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | |||||||| || || | |||||| || ||||| ||||  ||||| || ||||||||||||||  | || ||||| |||||  ||||||||||    
T  28283198 caactctatatgccaccgtcccgatcctctctgaaatctgatacgggccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 28283099  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  28283098 catcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaact 28283055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 32 - 237
Target Start/End: Original strand, 17032376 - 17032581
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||| |    
T  17032376 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccg 17032475  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || || |||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||     
T  17032476 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaacgcacgtcccacaccagtcataggagtgactctcaa 17032575  T
Q  232 aaacac 237  Q
    ||||||    
T  17032576 aaacac 17032581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 137
Target Start/End: Original strand, 1640595 - 1640718
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1640595 acatcatctcttggaataacatgtgaaggatccgctacgtacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaat 1640694  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaa 137  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||    
T  1640695 ccactctatatgccactgtcccaa 1640718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 138
Target Start/End: Original strand, 18787684 - 18787808
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  18787684 acatcaactcttggaataacatgcgaaggatccgctacatactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaatatgtgatggcaaac 18787783  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaac 138  Q
    ||||| | |||||||||||||||||    
T  18787784 ccactctatatgccactgttccaac 18787808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 15459132 - 15459375
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  15459132 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgatacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatc 15459231  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||| | || ||||| |||||||| || || || ||||| || | |||||| || || |||||||||||| | |||||||| |||||  ||||||| ||    
T  15459232 ccactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgt 15459331  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| || || || |||||||    
T  15459332 cataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaact 15459375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 50 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 27331882 - 27331675
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagata 149  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||| |||||||| || || ||||    
T  27331882 acatacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 27331783  T
Q  150 tctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctc 249  Q
    |||| || | |||||||||| |||||||||||||| |  ||||||| |||||  | ||||| |||| |||||||||||||| ||| || ||||| || ||    
T  27331782 tctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcctttacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatccccttc 27331683  T
Q  250 ttgaaact 257  Q
    ||||||||    
T  27331682 ttgaaact 27331675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 50 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 27392622 - 27392415
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagata 149  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||| |||||||| || || ||||    
T  27392622 acatacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 27392523  T
Q  150 tctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctc 249  Q
    |||| || | |||||||||| |||||||||||||| |  ||||||| |||||  | ||||| |||| |||||||||||||| ||| || ||||| || ||    
T  27392522 tctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcctttacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatccccttc 27392423  T
Q  250 ttgaaact 257  Q
    ||||||||    
T  27392422 ttgaaact 27392415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 12497840 - 12498065
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||   || ||||| |    
T  12497840 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 12497939  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || || |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||  | ||||| |||| | ||||||||||||     
T  12497940 ttccaactctttccgatatctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaa 12498039  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| || |||||||    
T  12498040 aaacacgtggtctccttcctgaaact 12498065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 12511061 - 12510836
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||   || ||||| |    
T  12511061 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 12510962  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || || |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||  | ||||| |||| | ||||||||||||     
T  12510961 ttccaactctttccgatatctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaa 12510862  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| || |||||||    
T  12510861 aaacacgtggtctccttcctgaaact 12510836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22762922 - 22762697
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  || ||||  |    
T  22762922 acatgggagggatccgatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacaaagtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccacttgatacgccatcg 22762823  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || || |||||||| | || |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| || ||  | ||||| |||| ||||||||||||||     
T  22762822 ttccaactctttccgatatctgattcggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcac 22762723  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||    
T  22762722 aaatacgtggtctccttcttgaaact 22762697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 19864483 - 19864726
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |    
T  19864483 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatgaaagacatcatacaaattcgaaagatgcggtggtaatc 19864582  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    |||||   || ||||| |||||||  || || |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||   | ||||| ||    
T  19864583 ccactcgatacgccaccgttccaaatctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagt 19864682  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || |||||||||||| | |||||| || ||||| ||||||||||    
T  19864683 cacaggagtgactctaaaaaacacgtggtctccttcttgaaact 19864726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 1543551 - 1543326
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||| |    
T  1543551 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccg 1543452  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||  |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  1543451 ttccaactctttccaatatctgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgccctacaccagtcataggagtgactctcaa 1543352  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| || || ||||| || |||||||    
T  1543351 aaatacgtggtctccttcctgaaact 1543326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 23078283 - 23078508
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||   || ||||| |    
T  23078283 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatgtaatacttcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccg 23078382  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||  ||| || || |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||  | ||||| |||| ||||||||||||||     
T  23078383 tttaaactctttccgatatctgatacgaacaaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgcccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 23078482  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| || |||||||||||||||||||    
T  23078483 aaatacgtgatctccctcttgaaact 23078508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 25610328 - 25610103
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||| ||    || ||||| |    
T  25610328 acatgggatggatccgatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgcgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaacacgatacgccaccg 25610229  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || || |||||||  |||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||  | ||||| |||| ||| ||||||||||     
T  25610228 ttccaactctttccgatatctaatacggaccaataaatctcggaatcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccggtcacaggtgtgactctcaa 25610129  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||  || ||||| ||||||||||    
T  25610128 aaacatgtggtctccttcttgaaact 25610103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 29592387 - 29592162
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  |||||||||||||||||||| || |||||||||  ||| ||||| |    
T  29592387 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccg 29592288  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  29592287 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 29592188  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||    
T  29592187 aaacacgtggtctccttcttggaact 29592162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 28263682 - 28263450
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||| || ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  28263682 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 28263583  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    |||||  ||| ||||| || ||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||    
T  28263582 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 28263483  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctcc 246  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  28263482 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcc 28263450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 28342431 - 28342199
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||| || ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  28342431 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 28342332  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    |||||  ||| ||||| || ||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||    
T  28342331 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 28342232  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctcc 246  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  28342231 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcc 28342199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 50 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 18197996 - 18197789
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagata 149  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   || |||||||||  ||  || || ||||    
T  18197996 acatacttccgaagttgcgaaacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggcaaacccactcgatacgccactgtttaaattctttccgata 18197897  T
Q  150 tctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctc 249  Q
    |||  |||  |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||  | ||  ||||||  |||| | |||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  18197896 tcttatacagaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaattcgcgtcctacacttgtcacaagagtgactttcagaaatacatgatatccctc 18197797  T
Q  250 ttgaaact 257  Q
    ||||||||    
T  18197796 ttgaaact 18197789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 2875270 - 2875045
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||  ||| |||||||    
T  2875270 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccactg 2875171  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| |||||||| || |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  2875170 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttatttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 2875071  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||| | || ||||| ||||||||||    
T  2875070 aaactcgtggtctccttcttgaaact 2875045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 12505169 - 12505394
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||| ||||| || ||||||   || ||||| |    
T  12505169 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgaaaaatcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 12505268  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || || |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||  | ||||| |||| | ||||||||||||     
T  12505269 ttccaactctttccgatatctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaa 12505368  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| || |||||||    
T  12505369 aaacacgtggtctccttcctgaaact 12505394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 24313635 - 24313410
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||  ||| ||||| |    
T  24313635 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 24313536  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  24313535 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 24313436  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||    
T  24313435 aaacacgtggtctccttcttggaact 24313410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21833448 - 21833244
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||   || |||||      
T  21833448 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacca 21833349  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || || |||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||   | ||||| |||| ||||||||||||||     
T  21833348 ttccaactctttccgatatctgatacggacctataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacctccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 21833249  T
Q  232 aaaca 236  Q
    |||||    
T  21833248 aaaca 21833244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 27187232 - 27187464
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||| || ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||  | || ||||    
T  27187232 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgctgcggtaaac 27187331  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    |||||  ||| ||||| |||||||| || ||  | ||||| || | |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||    
T  27187332 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaatttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27187431  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctcc 246  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  27187432 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcc 27187464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 27262008 - 27261776
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||| || ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||  | || ||||    
T  27262008 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgctgcggtaaac 27261909  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    |||||  ||| ||||| |||||||| || ||  | ||||| || | |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||    
T  27261908 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaatttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27261809  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctcc 246  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  27261808 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcc 27261776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 14381860 - 14381709
Alignment:
Q  106 tggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagct 205  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| || || |||||||||||| | |||||||| |||||  ||    
T  14381860 tggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcct 14381761  T
Q  206 acacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  14381760 acacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaact 14381709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 50 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22079137 - 22078930
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagata 149  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||   || ||||| || ||||| || || ||||    
T  22079137 acatacttccgaagttgctacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgtaccaactctttccgata 22079038  T
Q  150 tctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctc 249  Q
    |||| |||| || ||||||| | |||||||||||||| |||||||| || ||  | |||||  ||| |||||||||||||| ||| || || ||||| ||    
T  22079037 tctgatacggacgaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccaatcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttc 22078938  T
Q  250 ttgaaact 257  Q
    ||||||||    
T  22078937 ttgaaact 22078930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16627184 - 16626959
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  |||||||||| |||||| || || |||||||||  ||| ||||| |    
T  16627184 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 16627085  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  16627084 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 16626985  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||    
T  16626984 aaacacgtggtctccttcttggaact 16626959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16963852 - 16963609
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |    
T  16963852 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggtacatactttcgaagttgcgacacatgtaatacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16963753  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||    || ||||  ||||||||  | || |||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||  | ||||| ||    
T  16963752 caacacgatacgccatcgttccaactatttccgatatctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcttttacttcaaagcacgtccaacaccagt 16963653  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || |||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||    
T  16963652 cacaggagtgactctcaaaaacacttggtctccttcttgaaact 16963609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 25112366 - 25112591
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||  ||| ||||| |    
T  25112366 acatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 25112465  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    |||| || || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| |||| |||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  25112466 ttccgactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcagcttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 25112565  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| || || ||||| || |||||||    
T  25112566 aaatacgtggtctccttcctgaaact 25112591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 51 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 18408391 - 18408185
Alignment:
Q  51 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatat 150  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||| || |||||    || ||||| |||||||| || || |||||    
T  18408391 catactttcgaagttgcgacacatgaaacacatagtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccacccgatacgccaccgttccaactctttccgatat 18408292  T
Q  151 ctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctct 250  Q
    ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || || ||| | |||    
T  18408291 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacacgagttactctcaaaaatacgtggtcttcttct 18408192  T
Q  251 tgaaact 257  Q
    |||||||    
T  18408191 tgaaact 18408185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 28292857 - 28292625
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||| || ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  28292857 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 28292758  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    |||||  ||| ||||| || ||||| || ||  | ||||| || | |||||| || ||||| |||||||||||  ||||||| |||||  ||||||| ||    
T  28292757 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttaacttcaaagcacgtcctacaccagt 28292658  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctcc 246  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  28292657 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcc 28292625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16928125 - 16927882
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||| ||| ||||||||||||| ||||| || |    
T  16928125 acatcatcactctgtatcacatgagatggatccggtacatactttcgaagttgcgacacatgtaatatatcgtgcgaattcgaaagatgcggtggtaatc 16928026  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | |     || ||||| |||||||| || ||  ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||  ||    
T  16928025 caagacgatacgccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacactagt 16927926  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || | |||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||    
T  16927925 cacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaact 16927882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 25765774 - 25765532
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  25765774 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttacgacacatggaacacatcgtgcaagttcgaaagatgcggtggtaatc 25765675  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    |||||   ||  |||| |||||||| || || |||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| ||    
T  25765674 ccactcgatacaccaccgttccaactctttccgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 25765575  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || | | |||||||||| || ||| || ||||| ||||||||||    
T  25765574 caca-gcgtgactctcaaaagcacgtggtctccttcttgaaact 25765532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 172 - 257
Target Start/End: Original strand, 25750900 - 25750985
Alignment:
Q  172 cggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25750900 cggagtccacttcttagatttcaacgcacgtcctacacccgtcacaggagtgactctcagaaacacatgatctccttcttgaaact 25750985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 151
Target Start/End: Original strand, 22433793 - 22433930
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  22433793 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 22433892  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatc 151  Q
    |||||   || ||||| |||||||| || || ||||||    
T  22433893 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatc 22433930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 134 - 257
Target Start/End: Original strand, 18800858 - 18800981
Alignment:
Q  134 ccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaa 233  Q
    ||||||||||| |||||||| || | |||||| || || | |||||||| ||| ||||||||  ||||   |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18800858 ccaaccctctctgatatctgatatggaccaatgaactttgaagtcaactgcttcgacttcaattcacgtcttacacccgtcataggagtaactctcagaa 18800957  T
Q  234 acacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    | |||||||| |||||||||||||    
T  18800958 atacatgatccccctcttgaaact 18800981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 246
Target Start/End: Original strand, 1640715 - 1640800
Alignment:
Q  161 ccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctcc 246  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| |||||| | ||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  1640715 ccaataaacctcggggtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggggtgactcttagaaacacatgatctcc 1640800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 3838 - 4081
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3838 acatcatctcttggaataacatgcgaaggaaccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 3937  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  3938 ccactctgtaagccactgttccaacactctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgt 4037  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4038 cataggagtgactatcagaaacacatgatctccctcttgaaact 4081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 5345 - 5102
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5345 acatcatctctcggaataacatgcgaatgatctgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcattcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 5246  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  5245 ccactatgtatgccagtgttccaaccctcttagatatctgatacgaaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacacacaacctacacccgt 5146  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5145 cataggagtgattctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 5102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 26105 - 26348
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26105 acatcatctctcagaataacttgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaac 26204  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26205 ccactctgtatgccactgttccaactctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacggcctacacccgt 26304  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26305 cataggagtgactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaact 26348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 49)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15102928 - 15102685
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15102928 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 15102829  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  15102828 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 15102729  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15102728 cataggagtaactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaact 15102685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 14264571 - 14264328
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14264571 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcaggcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 14264472  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  14264471 ccactctatatgccactgttccaaccctttcagatatctgatatggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 14264372  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14264371 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 14264328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 19147133 - 19147376
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19147133 acatcatctcttagaataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 19147232  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||    
T  19147233 tcactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgt 19147332  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19147333 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 19147376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 20746532 - 20746775
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20746532 acatcatctcttagaataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 20746631  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||    
T  20746632 tcactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgt 20746731  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20746732 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 20746775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 29 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16072606 - 16072378
Alignment:
Q  29 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgcca 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16072606 ataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgcatgcca 16072507  T
Q  129 ctgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactct 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  16072506 ctgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactct 16072407  T
Q  229 cagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16072406 cagaaacacatgatctccctcttgaaact 16072378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 12207127 - 12206884
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12207127 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 12207028  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||| | ||||| ||    
T  12207027 ccactctatatgccactgttgcaactctctcagatatctggtacgaaccaataaacttcggcgtcaacttctttgatttcaaggcacgaccaacacctgt 12206928  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  12206927 cacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaact 12206884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 257
Target Start/End: Original strand, 6413430 - 6413676
Alignment:
Q  11 tggacatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6413430 tggacatcatctctcggaataacatgcgaaggatccactacatacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggca 6413529  T
Q  111 aacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacc 210  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||| || || |||||||||||  | |||||||| |||||  |||||||    
T  6413530 aaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgattcgaaccaatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacc 6413629  T
Q  211 cgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  6413630 cgtcataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaact 6413676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 13665475 - 13665713
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13665475 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 13665574  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||      | || || |||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||    
T  13665575 caactctatatgccactgttccaaccctttctgaaatctgatacg-----gtgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcccgacctacacccgt 13665669  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  13665670 cataggagtaactctcagaaatacatgatcttcctcttgaaact 13665713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 27 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 11388741 - 11388512
Alignment:
Q  27 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgc 126  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  11388741 gaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgc 11388642  T
Q  127 cactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgact 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  11388641 cactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgact 11388542  T
Q  227 ctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  11388541 ctcaagaacacatgatct-cctcttgaaact 11388512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 13021279 - 13021522
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  13021279 acatcatctcttggaatcacatgtgaaagatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaac 13021378  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | || |||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||| | |||||||| |||||   ||| |||||    
T  13021379 caactctataagccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaataaactttggagtccacttcctcgacttcaatgcacgttttacgcccgt 13021478  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  13021479 cataggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccgtcttgaaact 13021522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 28 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16950784 - 16950555
Alignment:
Q  28 aataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgcc 127  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||    
T  16950784 aataacatgcaaatgatccgctacatacttccgaagctgcgacacataaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtgccaaaccaactctatatgcc 16950685  T
Q  128 actgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactc 227  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||| |||||| || || |||||||||||| | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  16950684 actgttccaaccctttctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactc 16950585  T
Q  228 tcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  16950584 tcagaaaaacatgatcaccctcctgaaact 16950555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 26288363 - 26288122
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  26288363 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccactacatattttcgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaac 26288264  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | ||||||||||||| |||||| || || ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||| | |||||||| || ||  ||||||||||    
T  26288263 caactctatatgccactgttcaaaccctttctgaaatctgatacgtaccaatgaattttggagtcaacttcctcgacttcaatgcgcgtcctacacccgt 26288164  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaa 255  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  26288163 cataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaa 26288122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 14286703 - 14286460
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14286703 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatctgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 14286604  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | |||||||||||||||| ||| |  || ||||| |||  |||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| ||    
T  14286603 caactctatatgccactgttccaatcctatatgaaatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacatcctacacctgt 14286504  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| ||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||    
T  14286503 catcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaact 14286460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 15 - 257
Target Start/End: Original strand, 49152224 - 49152466
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 114  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49152224 catcatctctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 49152323  T
Q  115 cactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtc 214  Q
     ||| | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| || |||||||||||| | |||||||| || ||  | |||||||||    
T  49152324 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtc 49152423  T
Q  215 ataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    | ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  49152424 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaact 49152466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 14129795 - 14130038
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  14129795 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 14129894  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | |||||||  ||||||| ||||||  | ||||| |||| |||||| || ||||||||||||||| | || ||||| |||||  |||||| |||    
T  14129895 caactctatatgccatcgttccaatcctctctaaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacactcgt 14129994  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| ||||| ||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||    
T  14129995 catcggagtaactctaaaaaatacatgatcaccctcctgaaact 14130038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 14433613 - 14433856
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  14433613 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 14433712  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | |||||||  ||||||| ||||||  | ||||| |||| |||||| || ||||||||||||||| | || ||||| |||||  |||||| |||    
T  14433713 caactctatatgccatcgttccaatcctctctaaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacactcgt 14433812  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| ||||| ||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||    
T  14433813 catcggagtaactctaaaaaatacatgatcaccctcctgaaact 14433856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 23200070 - 23199827
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  23200070 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatctgctacatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 23199971  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | |||| ||  ||||| | |||||| || ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| | || ||||| |||||  ||||||||||    
T  23199970 caactctatatgtcatcgttccgatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaatttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 23199871  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23199870 catcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaact 23199827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 23506197 - 23505954
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  23506197 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatctgctacatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 23506098  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | |||| ||  ||||| | |||||| || ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| | || ||||| |||||  ||||||||||    
T  23506097 caactctatatgtcatcgttccgatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaatttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 23505998  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23505997 catcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaact 23505954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 23 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 8212446 - 8212212
Alignment:
Q  23 ctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgt 122  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  8212446 ctcggaattacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagttgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctgt 8212347  T
Q  123 atgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagt 222  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| || |||||||||||| | |||||||| |||||  | |||||||||| ||||||    
T  8212346 atgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagt 8212247  T
Q  223 gactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  8212246 gaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaact 8212212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 11306589 - 11306347
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 114  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11306589 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagagacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 11306490  T
Q  115 cactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtc 214  Q
     ||| | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| |||||| || || |||||||||||| | |||||||| |||||  | |||||||||    
T  11306489 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 11306390  T
Q  215 ataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    | ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  11306389 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaact 11306347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 18054280 - 18054037
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  18054280 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatctgctacatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 18054181  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | |||||||| ||||| |  ||||| || ||||| ||||  ||||| || ||||||||||||||  | || ||||| |||||  ||||||||||    
T  18054180 caactctatatgccaccgttcctattctctctgaaatctgatacgggccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 18054081  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  18054080 catcggagtcactctcagaaatacatgatcaccctcttgaaact 18054037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 26 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 1722 - 1491
Alignment:
Q  26 ggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatg 125  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  1722 ggaataacatgcgaatgatctgctacatccttccgaagctgagacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatg 1623  T
Q  126 ccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgac 225  Q
    ||| |||||||||||| ||  | ||||| |||  |||||| || || |||||||||||| | |||||||| |||||  ||||||||||||||| ||| ||    
T  1622 ccagtgttccaaccctttcttaaatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagaagtaac 1523  T
Q  226 tctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    | ||| ||| |||||||| ||||| |||||||    
T  1522 tttcacaaaaacatgatcaccctcctgaaact 1491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 12455625 - 12455867
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12455625 acatcatcccttggaatcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgc-acacatgaaacacatcatgcaggttcgaaagatgtggtggcaaac 12455723  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | | | | || |||||||||| ||| ||||| || ||||| |||  |||||| || || ||| |||||||| | |||||||| ||||   | ||||||||    
T  12455724 caattctataagccactgttctaactctctctgaaatctgataccgaccaatgaactttggattcaacttcctcgacttcaatgcacatccaacacccgt 12455823  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  12455824 caaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaact 12455867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 32 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15154983 - 15154760
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||  ||| ||||| |    
T  15154983 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacgtgaaatacatcgtgcaaattcgaaagatgcagtggtaaacccactcggtaagccaccg 15154884  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || || |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  15154883 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 15154784  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaa 255  Q
    ||| || || ||||| ||||||||    
T  15154783 aaatacgtggtctccttcttgaaa 15154760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 165
Target Start/End: Original strand, 15340418 - 15340569
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15340418 acatcatctctccgaataacatgcgaaagatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 15340517  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaat 165  Q
    | ||| | |||||||| ||||||| |||||| || ||||| |||| ||||||    
T  15340518 caactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaat 15340569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 11553433 - 11553208
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||   || ||||| |    
T  11553433 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgtcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcgataagccaccg 11553334  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || || |||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  11553333 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 11553234  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| || |||||||    
T  11553233 aaacacgtggtctccttcctgaaact 11553208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 50 - 257
Target Start/End: Original strand, 14037764 - 14037971
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagata 149  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||   || |||||  ||| ||| || || ||||    
T  14037764 acatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccattcaaactctttccgata 14037863  T
Q  150 tctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctc 249  Q
    |||| || |||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||    
T  14037864 tctgatatgaaccaataaatcttggtgtcaacttctttgacttcaatgcacgcccaacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtgatctccttc 14037963  T
Q  250 ttgaaact 257  Q
    ||| ||||    
T  14037964 ttggaact 14037971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 50 - 257
Target Start/End: Original strand, 14347794 - 14348001
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagata 149  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||   || |||||  ||| ||| || || ||||    
T  14347794 acatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccattcaaactctttccgata 14347893  T
Q  150 tctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctc 249  Q
    |||| || |||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||    
T  14347894 tctgatatgaaccaataaatcttggtgtcaacttctttgacttcaatgcacgcccaacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtgatctccttc 14347993  T
Q  250 ttgaaact 257  Q
    ||| ||||    
T  14347994 ttggaact 14348001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 17647 - 17422
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||   || ||||| |    
T  17647 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 17548  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||  ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| |||| ||||||||||||||     
T  17547 ttccaactctttccgatatctgatacgggccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 17448  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||    
T  17447 aaacacgtggtctccttcttgaaact 17422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 12687440 - 12687665
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||   || ||||| |    
T  12687440 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgtcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaaacccactcgataagccaccg 12687539  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || || |||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||| ||     
T  12687540 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactcgcaa 12687639  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| || |||||||    
T  12687640 aaacacgtggtctccttcctgaaact 12687665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 11237544 - 11237319
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||  ||| ||||| |    
T  11237544 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 11237445  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  11237444 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 11237345  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||    
T  11237344 aaacacgtggtctccttcttgaaact 11237319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 252
Target Start/End: Original strand, 8198567 - 8198787
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||  ||| ||||| |    
T  8198567 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 8198666  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  8198667 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 8198766  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttg 252  Q
    |||||| || ||||| |||||    
T  8198767 aaacacgtggtctccttcttg 8198787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 8707544 - 8707769
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||  ||| ||||| |    
T  8707544 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 8707643  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  8707644 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 8707743  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||    
T  8707744 aaacacgtggtctccttcttggaact 8707769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 14954559 - 14954784
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||   || ||||| |    
T  14954559 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatggaaaacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaactcactcgataagccaccg 14954658  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || || |||||||  |||| ||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  14954659 ttccaactctttctgatatcttatacggaccaataaactttggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 14954758  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| || |||||||    
T  14954759 aaacacgtggtctccttcctgaaact 14954784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15161388 - 15161163
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||  ||| ||||| |    
T  15161388 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 15161289  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  15161288 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 15161189  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||    
T  15161188 aaacacgtggtctccttcttggaact 15161163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 255
Target Start/End: Original strand, 10870916 - 10871157
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||| || ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  |||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  10870916 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaac 10871015  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    |||||  ||| ||||| |||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||    
T  10871016 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacctcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 10871115  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaa 255  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||| || |||||    
T  10871116 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaa 10871157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 23517118 - 23516877
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||| || ||| |||| ||||| || |||||||  | |||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  23517118 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaatatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 23517019  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    |||||  ||| ||||| |||||||| || ||  | ||||| || | |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||    
T  23517018 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 23516919  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaa 255  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||| || |||||    
T  23516918 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaa 23516877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 255
Target Start/End: Original strand, 14332336 - 14332559
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  |||||||||| |||||| ||||| |||||||||  ||| ||||| |    
T  14332336 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccg 14332435  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||   |||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  14332436 ttccaactctttccagtatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 14332535  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaa 255  Q
    |||||| || ||||| || |||||    
T  14332536 aaacacgtggtctccttcctgaaa 14332559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 50 - 257
Target Start/End: Original strand, 18177699 - 18177906
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagata 149  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||  ||| ||||| |||||||| || ||  |||    
T  18177699 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaata 18177798  T
Q  150 tctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctc 249  Q
    |||| || | |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| || ||||||||||||||||  ||||| || ||||| ||    
T  18177799 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgttctacaccagttataggagtgactctcaagaacacgtggtctccttc 18177898  T
Q  250 ttgaaact 257  Q
     |||||||    
T  18177899 ctgaaact 18177906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 18552089 - 18551864
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  |||||||||| |||||| || || |||||||||  ||| ||||| |    
T  18552089 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 18551990  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| |||| |||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  18551989 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcagcttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 18551890  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||    
T  18551889 aaacacgtggtctccttcttggaact 18551864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 32 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 44791682 - 44791462
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  |||||||||| |||||| || || |||||||||  ||| ||||| |    
T  44791682 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 44791583  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  44791582 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaatttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 44791483  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttg 252  Q
    |||||| || ||||| |||||    
T  44791482 aaacacgtggtctccttcttg 44791462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 13686002 - 13686228
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatg-aaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccact 130  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| ||| || |  ||||||||||||||||| |  || |||||||||  ||| |||||     
T  13686002 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcgacggtaaacccactcggtaagccacc 13686101  T
Q  131 gttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctca 230  Q
    |||||||| || ||  |||| || |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  13686102 gttccaactctttccaatatttgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctca 13686201  T
Q  231 gaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
     |||||| || ||||| ||||| ||||    
T  13686202 aaaacacgtggtctccttcttggaact 13686228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 15203818 - 15204043
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||   ||  | || |    
T  15203818 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatactctaccg 15203917  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||  || || |  ||||| |||  |||||||||  ||||||||||||| || |||||||| || ||  | ||||| |||| |  ||||||||| |     
T  15203918 ttccaattctttctgtaatctgatacagaccaataaacctcggagtcaacttatttgacttcaatgcgcggccaacaccagtcacaaaagtgactctaaa 15204017  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15204018 aaacacatggtctccttcttgaaact 15204043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 26118911 - 26118811
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26118911 acatcatcccttggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 26118812  T
Q  114 c 114  Q
    |    
T  26118811 c 26118811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 15479465 - 15479326
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  15479465 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacatgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatc 15479366  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctg 153  Q
    | | | | || ||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  15479365 caattctatacgccacagttccaactctctcagagatctg 15479326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 80 - 257
Target Start/End: Original strand, 15624539 - 15624716
Alignment:
Q  80 acatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtca 179  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||| |||||||  || || |||||||| || |||||||||||  |||||||||    
T  15624539 acatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaattctttctgatatctgatatgaaccaataaacctcggagtca 15624638  T
Q  180 acttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    | ||| | |||||||| |||||  | ||||| |||| | |||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||    
T  15624639 atttccttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaact 15624716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 26118797 - 26118689
Alignment:
Q  149 atctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccct 248  Q
    ||||| |||| |||||| || || |||||||||||  | |||||||  |||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  26118797 atctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccct 26118698  T
Q  249 cttgaaact 257  Q
    | |||||||    
T  26118697 cctgaaact 26118689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 117
Target Start/End: Original strand, 21661885 - 21661988
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||||  |  ||||||||  | || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||    
T  21661885 acatcatctcttggaatcacatgagatggatatgaaacatacttttgtagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgcggtggtaaac 21661984  T
Q  114 ccac 117  Q
    ||||    
T  21661985 ccac 21661988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 243
Target Start/End: Original strand, 4440008 - 4440078
Alignment:
Q  173 ggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatc 243  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||  ||||||| ||||||||  | ||||||| ||||||||||||    
T  4440008 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagggttcactctcaaaaacacatgatc 4440078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 385782 - 386025
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  385782 acatcatctcacggaatcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 385881  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  385882 ccactctgtatgccactgttccaactctctcagatatctggtatgaacctataaacttcggagtcaacttcttatacttcaacgcacaacctacacccgt 385981  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  385982 cgtaggagtgactctcagaaatagatgatctccctcttgaaact 386025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 15 - 257
Target Start/End: Original strand, 117532 - 117774
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  117532 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 117631  T
Q  115 cactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtc 214  Q
     ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| || || |||||||||||| | |||||||| |||||  | |||| ||||    
T  117632 aactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacactcgtc 117731  T
Q  215 ataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  117732 ataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaact 117774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 322667 - 322910
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  322667 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccactacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 322766  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||| || | |||||| || || |||||||||||| | |||||||| |||||  ||||||||||    
T  322767 caactctatatgccattgttccaaccctctctgatatctgatatggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 322866  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  322867 cataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctcctgaaact 322910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 203811 - 203570
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  203811 acatcatccctcggaatcacatgcgatggatccaatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 203712  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| || | ||||||||| |||| |||||||||  |||| ||||||||||| | |||||| |||||  |  |||| ||    
T  203711 ccactctatatgccactgttccaactcttttagatatctgatacggaccaataaacctcggcgtcaacttctttggcttcaaagcacggccagcacctgt 203612  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaa 255  Q
    || | |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  203611 cacaagagtgactcttagaaacacatggtctccttcttgaaa 203570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 111984 - 112227
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| || || ||||| || |||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  111984 acatcatctcttgggatcacatgagatggatccgaaacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 112083  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    |||||   || ||||| |||||||  || || |||||||| |||| |||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| ||    
T  112084 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctgggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 112183  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || |||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||    
T  112184 cacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaact 112227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 54)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 23442815 - 23442572
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23442815 acatcatctctcggaataacatacgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaa 23442716  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| || || ||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  23442715 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagataactgatacggaccaatgaactttggagtcaacatcttagacttcaacacacgtcctacacccgt 23442616  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23442615 cataggagtgactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaact 23442572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21891263 - 21891038
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21891263 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 21891164  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| || ||||||||    
T  21891163 ttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaacgcacatcctacaccagtcataggtgtaactctcag 21891064  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  21891063 aaacacatgatctccctcttgaaact 21891038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 24736133 - 24735890
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24736133 acatcatctctaggaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 24736034  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  ||||||||||    
T  24736033 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgt 24735934  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24735933 cataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaact 24735890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 24737307 - 24737064
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24737307 acatcatctctaggaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 24737208  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  ||||||||||    
T  24737207 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgt 24737108  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24737107 cataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaact 24737064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 24750076 - 24749833
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24750076 acatcatctctaggaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 24749977  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  ||||||||||    
T  24749976 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgt 24749877  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24749876 cataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaact 24749833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22236445 - 22236199
Alignment:
Q  11 tggacatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggca 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22236445 tggacatcatccctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggca 22236346  T
Q  111 aacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacc 210  Q
    |||| ||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| || || |||||||||||| | |||||||| |||||  |||||||    
T  22236345 aaccaactctatatgacactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacc 22236246  T
Q  211 cgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  22236245 cgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaact 22236199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 23080611 - 23080368
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  23080611 acatcatcccttggaatcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcaacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggtaaac 23080512  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | || |||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| |||||   |||||||||    
T  23080511 caactctataagccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcttacacccgt 23080412  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  23080411 cataggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaact 23080368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21564488 - 21564245
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21564488 acatcatctcttggaatagcatgcgaaggatccgctgcatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 21564389  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||| | ||||||||||| | ||| || ||||||||||| || | |||||||||    |||||||| |||||||||||||| ||||||   ||||  ||    
T  21564388 ccactctatatgccactgtccaaactctatcagatatctgatatggaccaataaaccgtggagtcaaattcttagacttcaaagcacgactaacacgtgt 21564289  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  21564288 cacatgagtgactctcagaaacacatggtctccttcttgaaact 21564245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 22381045 - 22381288
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22381045 acatcatctcttggaatcacatgtgacggatctgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 22381144  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | || ||||| |||||||||||||| || ||||| |||| |||||| || || |||||||||||| | |||||||| |||||  ||||||||||    
T  22381145 caactctataagccaccgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 22381244  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  22381245 catcggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaact 22381288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 22502525 - 22502768
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22502525 acatcatcccttggaatcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 22502624  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||| || || || |||||||||||| | |||||||| |||||  | ||||||||    
T  22502625 caactctatatgccactgttccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgt 22502724  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  22502725 caaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaact 22502768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 14887512 - 14887270
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 114  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14887512 catcatctctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 14887413  T
Q  115 cactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtc 214  Q
     ||| | ||||||||||| ||||  ||||| || ||||| |||| ||||||||| || |||||||||||  | |||||||| |||||  | |||||||||    
T  14887412 aactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 14887313  T
Q  215 ataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    | ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  14887312 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaact 14887270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 37546018 - 37545775
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 114  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37546018 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 37545919  T
Q  115 cactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtc 214  Q
     ||| | |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||| || |||||||||||| | |||||||| |||||  | |||||||||    
T  37545918 aactctatatgccacagtaccaactctctcagaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 37545819  T
Q  215 ataggagtgactctcag-aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    | ||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||| |||||||    
T  37545818 aaaggagtgaccctcagaaaaaacatgatcaccctcctgaaact 37545775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 17269855 - 17269612
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  17269855 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatctgctacatacttccggagttgtgacacgtgaaatacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 17269756  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | |||||||| || || | |||||| || ||||| |||| |||||| || ||||||||||||||| | || ||||| |||||  ||||||||||    
T  17269755 caactctatatgccaccgtcccgatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 17269656  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  17269655 catcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaact 17269612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 257
Target Start/End: Original strand, 25847922 - 25848164
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 114  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  25847922 catcatccctcggaatcacatgtgaaggatccgcaacatacttctgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaacc 25848021  T
Q  115 cactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtc 214  Q
     ||| |||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||  | || ||||| |||||  | |||||||||    
T  25848022 aactctgtatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaatttaggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtccaacacccgtc 25848121  T
Q  215 ataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    | |||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||    
T  25848122 aaaggagtgactctcaaaaaaacatgatcaccctcctgaaact 25848164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 24798918 - 24798684
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 114  Q
    ||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24798918 catcatccctcgtaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 24798819  T
Q  115 cactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtc 214  Q
     ||| | |||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| || |||||||||||| | |||||||| || ||  | |||||||||    
T  24798818 aactctatatgccacagtaccaactctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtc 24798719  T
Q  215 ataggagtgactctcagaaacacatgatctccctc 249  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  24798718 aaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctc 24798684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Original strand, 20821299 - 20821528
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20821299 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 20821398  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | | | | || ||||| ||||||||||| || || ||||| || | |||||| || || |||||||||||| | |||||||| |||||  ||||||||||    
T  20821399 caattctatacgccacagttccaaccctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 20821498  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatc 243  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  20821499 cataggagtaaccctcagaaaaacatgatc 20821528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 21662561 - 21662321
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  21662561 acatcatccctcggaatcacatgcgatggatccgatacatatttccgaagttgcgacacttgaaatacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggcaaac 21662462  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||| | || | || ||||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||  ||| |||||||||||| || ||||| |||||| | |||||  |    
T  21662461 ccactctatacgtcattgttccaactctttccgatatctgatac-aaccaataaacctcgaagtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctat 21662363  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaa 255  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  21662362 cataggagtgactcttagaaacacatgatctgcttcttgaaa 21662321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 257
Target Start/End: Original strand, 20342129 - 20342371
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 114  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20342129 catcatccctcggaatcacatgtgaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaacc 20342228  T
Q  115 cactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtc 214  Q
     ||| | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| |||||| || || |||||||||||  | |||||||| |||||  | ||||| |||    
T  20342229 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacctgtc 20342328  T
Q  215 ataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    | ||| |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||    
T  20342329 aaaggggtgactctcagaaaaacatgatcacgctcctgaaact 20342371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 28924290 - 28924064
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  28924290 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatc 28924191  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | || ||||| |||||||| || || || ||||| || | ||| || || || |||||||||||  | |||||||| |||||  ||||||||||    
T  28924190 caactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 28924091  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatg 240  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  28924090 cataggagtaactctcagaaaaacatg 28924064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 23573624 - 23573849
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||   || ||||| |    
T  23573624 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 23573723  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || || |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| |||| ||||||||||||||     
T  23573724 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 23573823  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||    
T  23573824 aaacacgtggtctccttcttgaaact 23573849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 25423071 - 25423296
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  || ||||| |    
T  25423071 acatgggatggatccggtacatagttccgaagttgcaacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccacctgatacgccaccg 25423170  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||  | ||||| |||| | ||||||||||||     
T  25423171 ttccaactctttccgatatctgatacgggccaataaatctcggagtcaacttctttcacttcaacgcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaa 25423270  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||    
T  25423271 aaacacgtggtctccttcttgaaact 25423296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 22461798 - 22462041
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22461798 acatcgtctcttggaatgacatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 22461897  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | || ||||| |||||||| || || || |||||||| | |||||| || || |||||||||||| | |||||||| |||||  | ||||||||    
T  22461898 caactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctggtaaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacacccgt 22461997  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| || || || |||||||    
T  22461998 cataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaact 22462041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 28895464 - 28895238
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  28895464 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatc 28895365  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | || ||||  |||||||| || || || ||||| || | ||| || || || |||||||||||  | |||||||| |||||  ||||||||||    
T  28895364 caactctatacgccagagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 28895265  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatg 240  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  28895264 cataggagtaactctcagaaaaacatg 28895238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 23516405 - 23516648
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  | |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |    
T  23516405 acatcatcactctggatcacatgagatggatccgggaaatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 23516504  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | |||   |||||||| |||||||| || || |||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| ||    
T  23516505 caactcgatatgccaccgttccaactctttctgatatctaatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 23516604  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || | |||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||    
T  23516605 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaact 23516648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Original strand, 20773606 - 20773832
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  20773606 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatctggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatc 20773705  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | || ||||| |||||||| || || || ||||| || | ||| || || || |||||||||||  | |||||||| |||||  |||| |||||    
T  20773706 caactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacgcccgt 20773805  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatg 240  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||    
T  20773806 cataggagtaaccctcagaaaaacatg 20773832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 49 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 21665987 - 21665782
Alignment:
Q  49 tacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagat 148  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | || | || ||||||||| || || |||    
T  21665987 tacatatttccgaagttgcgacacttgaaatacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggcaaacccactctatacgtcattgttccaactctttccgat 21665888  T
Q  149 atctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccct 248  Q
    ||||| ||| ||||||||||  ||| |||||||||||| || ||||| |||||| | |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  21665887 atctgatac-aaccaataaacctcgaagtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctatcataggagtgactcttagaaacacatgatctgctt 21665789  T
Q  249 cttgaaa 255  Q
    |||||||    
T  21665788 cttgaaa 21665782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 20468618 - 20468377
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| || || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20468618 acatcatctcttgggatcacatgagacggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaac 20468519  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    |||||   || ||||||||| | |  || ||  |||||||  ||| |||||||||  || ||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| ||    
T  20468518 ccactcaatacgccactgtttctattctttctaatatctgacacggaccaataaacctcagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 20468419  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaa 255  Q
    || |||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||    
T  20468418 cacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaa 20468377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22333391 - 22333166
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||  ||| ||||| |    
T  22333391 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 22333292  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  22333291 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 22333192  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||    
T  22333191 aaacacgtggtctccttcttgaaact 22333166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 32 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21343862 - 21343666
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||   || ||||| |    
T  21343862 acatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccg 21343763  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactct 228  Q
    ||||||| || || |||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||  | ||||| |||| ||||||||||||    
T  21343762 ttccaactctttctgatatcttatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 21343666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 50 - 257
Target Start/End: Original strand, 20798660 - 20798867
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagata 149  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |   |||||||| | |||||| || || ||||    
T  20798660 acatatttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccaatcgatatgccaccggtccaactctttctgata 20798759  T
Q  150 tctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctc 249  Q
    | || |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| |||| |||||||||||||| |||||| || ||||| ||    
T  20798760 tttgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 20798859  T
Q  250 ttgaaact 257  Q
    ||||||||    
T  20798860 ttgaaact 20798867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 255
Target Start/End: Original strand, 20573385 - 20573626
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||  | || ||||| || ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20573385 acatcatctctttggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 20573484  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    |||||   || ||||| |||||||  || || |||||||| |||| |||||||||  | | |||||||||| | |||||||| |||||  | ||||| ||    
T  20573485 ccactcgatacgccaccgttccaattctttccgatatctgatacggaccaataaaccttgaagtcaacttccttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 20573584  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaa 255  Q
    ||  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  20573585 cagtggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaa 20573626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21984809 - 21984584
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || ||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||||||   || ||||| |    
T  21984809 acatgggatggatccggtacatacctctgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 21984710  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||| | || || |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  | |||||  ||| ||||||||||||||     
T  21984709 ttccagctctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccaatcacaggagtgactctcaa 21984610  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| || || ||||||||||||||||    
T  21984609 aaatacgtggtctccctcttgaaact 21984584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 22134550 - 22134775
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| |||||||    
T  22134550 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccactg 22134649  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  22134650 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 22134749  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| || || ||||| || |||||||    
T  22134750 aaatacgtggtctccttcctgaaact 22134775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 26739209 - 26738984
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||   || ||||| |    
T  26739209 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcttgcaaattcgaaagatgcgttggtaaacccactcgatacgccaccg 26739110  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||  || || |||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||   | ||||| |||| ||||||||| ||||     
T  26739109 ttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacatccaacaccagtcacaggagtgaccctcaa 26739010  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| | ||||||||  ||||||||||    
T  26739009 aaatatatgatctctttcttgaaact 26738984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 34566376 - 34566601
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  |||||||||||||||||||| || |||||||||  ||| ||||| |    
T  34566376 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccg 34566475  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  34566476 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaa 34566575  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||    
T  34566576 aaacacgtggtctccttcttggaact 34566601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 23440089 - 23440332
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| || |    
T  23440089 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaatacttcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 23440188  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    || ||   || ||||| |||||||| || || |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||  | ||||| ||    
T  23440189 cctctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttcattgacttcaaagcacgtccaacaccagt 23440288  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || | |||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||    
T  23440289 cacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaact 23440332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 23471093 - 23471336
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||  | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||    
T  23471093 acatcatctctttggatcacatgtgatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcgttggtaaac 23471192  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    |||||   || ||||| |||||||  || || |||| ||| |||| |||||||||  ||  |||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| ||    
T  23471193 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatacctgatacggaccaataaacctccaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 23471292  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||   |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23471293 cacttgagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaact 23471336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15000243 - 15000018
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||  ||| ||||| |    
T  15000243 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 15000144  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  15000143 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 15000044  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||    
T  15000043 aaacacgtggtctccttcttggaact 15000018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 16356384 - 16356609
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| |  || |  |||||||||||||||||||| || |||||||||  ||| ||||| |    
T  16356384 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggagaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccg 16356483  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  16356484 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaa 16356583  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||    
T  16356584 aaacacgtggtctccttcttggaact 16356609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 50 - 257
Target Start/End: Original strand, 18775677 - 18775884
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagata 149  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||   ||   ||| |||||||| || || ||||    
T  18775677 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacatcaccgttccaactctttccgata 18775776  T
Q  150 tctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctc 249  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||  | ||||| |||| |||||||||||||| ||| || || ||||||||    
T  18775777 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcagggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaagacgtggtctccctc 18775876  T
Q  250 ttgaaact 257  Q
     |||||||    
T  18775877 ctgaaact 18775884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 41 - 230
Target Start/End: Original strand, 22348316 - 22348505
Alignment:
Q  41 ggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccc 140  Q
    |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||| |||||||| |    
T  22348316 ggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaggccaccgttccaactc 22348415  T
Q  141 tctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctca 230  Q
    | ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22348416 tttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctca 22348505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 255
Target Start/End: Original strand, 27610218 - 27610459
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||| || ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  |||||||||| ||| || ||||| ||||    
T  27610218 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagttgcggtggtaaac 27610317  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    |||||  ||| ||||| |||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||    
T  27610318 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27610417  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaa 255  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||| || |||||    
T  27610418 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaa 27610459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 27685904 - 27685679
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| |||||||| || || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||  ||| ||||| |    
T  27685904 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacgtggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 27685805  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  27685804 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaa 27685705  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||    
T  27685704 aaacacgtggtctccttcttggaact 27685679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 32 - 237
Target Start/End: Original strand, 40708662 - 40708867
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||  ||| ||||| |    
T  40708662 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 40708761  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  40708762 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 40708861  T
Q  232 aaacac 237  Q
    ||||||    
T  40708862 aaacac 40708867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 21404700 - 21404932
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  21404700 acatcatctcttggaatcacatgagatggatctgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgtggtggtaaac 21404799  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||| | || || ||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||||||   ||||||||  ||||| || || | ||||||  | ||||| ||    
T  21404800 ccactctatacgcaactgtcccaactctttccgaaatctgatacgagccaataaaccacggagtcagtttctttgattttagcgcacgtccaacaccggt 21404899  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctcc 246  Q
    || | |||||||||| | |||||||||||||||    
T  21404900 cacaagagtgactctaaaaaacacatgatctcc 21404932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 19769824 - 19770067
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||| || ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  |||||||||| |||||| || || ||||    
T  19769824 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 19769923  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    |||||  ||| ||||| ||||| || || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||    
T  19769924 ccactcggtaagccaccgttccgactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 19770023  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||    
T  19770024 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaact 19770067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 103
Target Start/End: Original strand, 21625382 - 21625471
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgt 103  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21625382 acatcatctctcggaatcacatgcgaaggatccactacatactttcaaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgt 21625471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 27669012 - 27668771
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||| || ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| |||||||| || || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  27669012 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacgtggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 27668913  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    |||||  ||| ||||| |||||||| || ||  | ||||| || | |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||    
T  27668912 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27668813  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaa 255  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||| || |||||    
T  27668812 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaa 27668771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 37292000 - 37291775
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  || ||||| ||||| || |||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||  ||| ||||| |    
T  37292000 acatgagatggatccggaacttactttcgaagttgagacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 37291901  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  37291900 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttttttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 37291801  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||    
T  37291800 aaacacgtggtctccttcttggaact 37291775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 32 - 255
Target Start/End: Original strand, 41770724 - 41770947
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  |||||||||| |||||| || || |||||||||  ||| ||||| |    
T  41770724 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 41770823  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  | ||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  41770824 ttccaactctttccaaaatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 41770923  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaa 255  Q
    |||||| || ||||| || |||||    
T  41770924 aaacacgtggtctccttcctgaaa 41770947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 32 - 237
Target Start/End: Original strand, 27518289 - 27518494
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| || |||||||| || || |  |||||||||| |||||| || || |||||||||  ||| ||||| |    
T  27518289 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgtgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 27518388  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  27518389 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 27518488  T
Q  232 aaacac 237  Q
    ||||||    
T  27518489 aaacac 27518494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 29476577 - 29476352
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||  ||| ||||| |    
T  29476577 acatgagatggatccgaaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 29476478  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||| ||| || | |||||| || ||||  ||||||||||| |||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||     
T  29476477 ttccaactctttccaatacctgatatggaccaatgaacttcgtggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacatccgtcataggagtgactctcaa 29476378  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| || |||||||    
T  29476377 aaacacgtggtctccttcctgaaact 29476352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 93 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21498479 - 21498315
Alignment:
Q  93 tcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagactt 192  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||  |||  |||| |||||||| || || |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  21498479 tcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacaccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgactt 21498380  T
Q  193 caacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||  ||||  | ||||| |||| | |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  21498379 caattcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaaaactacatgatctccctcttgaaact 21498315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 11211057 - 11210973
Alignment:
Q  173 ggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||| | ||||| |||| |||| | || |||| |||||||||||| ||  |||||||||    
T  11211057 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaact 11210973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 53)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15953532 - 15953293
Alignment:
Q  18 catctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccac 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15953532 catctctcggaataacatgcgaatgatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccac 15953433  T
Q  118 tttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcata 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||    
T  15953432 tttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacgaaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcgtacacccgtcata 15953333  T
Q  218 ggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15953332 ggagtaaatctcagaaatacatgatctccctcttgaaact 15953293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 15227210 - 15227453
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15227210 acatcatctctcgaaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 15227309  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||| | ||||| ||    
T  15227310 ccactctatatgccactgttccaactctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggcgtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgt 15227409  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15227410 cacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaact 15227453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 14571409 - 14571652
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  14571409 acatcatctctcgggataacatgcgaaggatccgctacgtacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatatggtggcaagc 14571508  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  14571509 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgataaggaccaataaacttaggagtcaaattcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 14571608  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14571609 cataggagtaactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaact 14571652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 76 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 12850785 - 12850604
Alignment:
Q  76 aaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcgga 175  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  12850785 aaacacatcatgcaaattccaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagatatctggtatggaccaataaacttcgga 12850686  T
Q  176 gtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12850685 gtcaacttcttagacttcaacgcacgacctatacccgtcacaggagtgactctcagaaacacatgatcttcctcttgaaact 12850604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 18134914 - 18134671
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  18134914 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaac 18134815  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | || |||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| || || |||||||||||| | |||||||| |||||  ||||||| ||    
T  18134814 caactctataagccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtcctacaccagt 18134715  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||    
T  18134714 cataggagtaactctcagaaatacaagatcaccctcctgaaact 18134671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 12361107 - 12360867
Alignment:
Q  17 tcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccca 116  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  12361107 tcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaa 12361008  T
Q  117 ctttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcat 216  Q
    || | |||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| || || |||||||||||| | || ||||| |||||  ||||||  |||||    
T  12361007 ctctatatgccactgttccaaccttctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgatttcaatgcacgtcctacacatgtcat 12360908  T
Q  217 aggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  12360907 agaagtaactctcagaaatacatgatcaccctcctgaaact 12360867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 13323220 - 13322978
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13323220 acatcatctcttggaataacatgcgacggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatggaatacaccatgcaaattcgaaagatgtggtggaaaac 13323121  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | |   | |||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| |||||  |||| |||||    
T  13323120 caatcctatatgccactgttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacccccgt 13323021  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaac 256  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  13323020 cataggagtaactctcagaaacacatggtctccctcctgaaac 13322978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 11304341 - 11304098
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11304341 acatcatcactaggaataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacaagaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 11304242  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||| || || |||||||||||| | |||||||| |||||  ||||||| ||    
T  11304241 caactctatatgccactattccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgt 11304142  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  11304141 catagggaaaactctcagaaatacatgatcaccctcttgaaact 11304098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 257
Target Start/End: Original strand, 14086237 - 14086477
Alignment:
Q  17 tcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccca 116  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  14086237 tcatccctaggaataatatgcgaaggatccggtacatacttccgcaactgcgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaaccca 14086336  T
Q  117 ctttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcat 216  Q
    |  | || |||||||| || || |||||||||||||| || |  |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  ||||||| |||||    
T  14086337 ccctataagccactgtcccgactctctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcat 14086436  T
Q  217 aggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  14086437 aggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaact 14086477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16330224 - 16329984
Alignment:
Q  17 tcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccca 116  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  16330224 tcatcccttggaatcacatgcgaaggatccgccacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaa 16330125  T
Q  117 ctttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcat 216  Q
    || | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||| || || || |||||||||| | | |||||||| |||||  | ||||| ||||     
T  16330124 ctctatatgccactgttccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaactacctcgacttcaatgcacgtccaacacctgtcaa 16330025  T
Q  217 aggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  16330024 aggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaact 16329984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 158
Target Start/End: Original strand, 31945033 - 31945177
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31945033 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 31945132  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacg 158  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  31945133 caactttatatgccactgttccaaccctttctgatatctgatacg 31945177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 255
Target Start/End: Original strand, 47123506 - 47123746
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 114  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47123506 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacctccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 47123605  T
Q  115 cactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtc 214  Q
     ||| | |||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| || |||||||||||| | |||||||| || ||  | |||||||||    
T  47123606 aactctatatgccacagtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtc 47123705  T
Q  215 ataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaa 255  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  47123706 aaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaa 47123746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 11961602 - 11961359
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||     
T  11961602 acatcatctcttggaatcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtgggggcaaat 11961503  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | || |||||| ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| || || |||||||| ||| | |||||||| |||||   ||||| |||    
T  11961502 caactctataagccactattccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaatttcctcgacttcaatgcacgtcgtacactcgt 11961403  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  11961402 caaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaact 11961359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 257
Target Start/End: Original strand, 10383531 - 10383773
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 114  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  10383531 catcatccctcgggatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaaggtgtggtggcaaacc 10383630  T
Q  115 cactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtc 214  Q
     ||| | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||  | |||||||| |||||| | |||||||||    
T  10383631 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaatttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtc 10383730  T
Q  215 ataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    | ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  10383731 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaact 10383773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13972685 - 13972445
Alignment:
Q  17 tcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccca 116  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |    
T  13972685 tcatccctaggaataatatgcgaaggatccggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaa 13972586  T
Q  117 ctttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcat 216  Q
    || | || ||||| |||||||| || || || ||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  ||||||| |||||    
T  13972585 ctctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcat 13972486  T
Q  217 aggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  13972485 aggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaact 13972445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 8759650 - 8759407
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  8759650 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatctgctacatacttccgcagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 8759551  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | |||||||| ||||| |  ||||| || ||||| |||| |||||| || ||||||||||||||| | || ||||| |||||  ||||||||||    
T  8759550 caactctatatgccaccgttccgattctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 8759451  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  8759450 catcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaact 8759407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 13941585 - 13941828
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  13941585 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatctgctacatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 13941684  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | |||||||| ||||| |  ||||| || ||||| |||| |||||| || ||||||||||||||  | || ||||| |||||  ||||||||||    
T  13941685 caactctatatgccaccgttccgattctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 13941784  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  13941785 catcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaact 13941828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 41177083 - 41177326
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  41177083 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatctgctacatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 41177182  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | |||||||| ||||| |  ||||| || ||||| |||| |||||| || ||||||||||||||  | || ||||| |||||  ||||||||||    
T  41177183 caactctatatgccaccgttccgattctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 41177282  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  41177283 catcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaact 41177326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 44776808 - 44777051
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  44776808 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 44776907  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | |||||||| ||||| | |||||| || ||||| ||||  ||||| || |||||||| |||||| | || ||||| |||||  ||||||| ||    
T  44776908 caactctatatgccaccgttccgatcctctctgaaatctgatacgggccaatgaacttcggagttaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacctgt 44777007  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  44777008 catcggagtgactcttagaaatacatgatcaccctcttggaact 44777051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16837072 - 16836835
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |      | |||||||||||||    
T  16837072 acatcatctctcggaataagatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagt------ggtgtggtggcaaac 16836979  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | |||| ||| ||||||| |||||| || ||||| |||| |||||| || ||||||||||||||| | || ||||| |||||  ||||||||||    
T  16836978 caactctatatgtcaccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 16836879  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| ||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||    
T  16836878 catcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaact 16836835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 31689191 - 31689052
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  31689191 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtgtcaaac 31689092  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctg 153  Q
    | ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  31689091 caactctatatgccactgttccaaccctttctgatatctg 31689052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 16381491 - 16381266
Alignment:
Q  18 catctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccac 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||    
T  16381491 catctctcggaataacatgcgaaggatctgctacatatttccgaagctgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaac 16381392  T
Q  118 tttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcata 217  Q
    | | |||||||| || |||| |||||| || ||||| |||| |||||| || ||||||||||||||| | || ||||| |||||  |||||||||||||     
T  16381391 tctatatgccaccgtcccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatc 16381292  T
Q  218 ggagtgactctcagaaacacatgatc 243  Q
    ||||| ||||| | ||| ||||||||    
T  16381291 ggagtaactcttaaaaatacatgatc 16381266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 17489419 - 17489644
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||   || ||||| |    
T  17489419 acatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 17489518  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || || |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| |||| ||||||||||||||     
T  17489519 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 17489618  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||    
T  17489619 aaacacgtggtctccttcttgaaact 17489644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 12497799 - 12498042
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  12497799 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 12497898  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    |||||   || ||||| |||||||| || || |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| ||    
T  12497899 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 12497998  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || |||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||    
T  12497999 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaact 12498042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 32 - 255
Target Start/End: Original strand, 9522288 - 9522511
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||| |    
T  9522288 acatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccg 9522387  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || |  |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||  | ||||| |||| ||||||||||||||     
T  9522388 ttccaactctttttgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 9522487  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaa 255  Q
    |||||| || ||||| ||||||||    
T  9522488 aaacacgtggtctccttcttgaaa 9522511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 10420613 - 10420384
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10420613 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 10420514  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | | | | || ||||| ||||| || || || || ||||| || | |||||| || || |||||||||||| | |||||||| |||||  ||||||| ||    
T  10420513 caattctatacgccacagttccgactctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgt 10420414  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatc 243  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  10420413 cataggagtaaccctcagaaaaacatgatc 10420384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 14877078 - 14876835
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| || |    
T  14877078 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcagtggtaatc 14876979  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | |||   || ||||| |||||||| || || |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| ||    
T  14876978 caactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 14876879  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || |||||| ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||    
T  14876878 cacaggagtaactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaact 14876835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16492742 - 16492517
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||||   || ||||| |    
T  16492742 acatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 16492643  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||| || || ||  | ||||| |||| ||||||||||||||     
T  16492642 ttccaactctttccaatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgactttaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 16492543  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||    
T  16492542 aaacacgtggtctccttcttgaaact 16492517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 16691729 - 16691954
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||    |||||||| |    
T  16691729 acatgggatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccacacgatatgccaccg 16691828  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    |||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| |||| ||||||||||||||     
T  16691829 ttccaaccctttccgatatttgatacgacccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 16691928  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| || |||||||    
T  16691929 aaacacgtggtctccttcctgaaact 16691954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 32 - 255
Target Start/End: Original strand, 10905779 - 10906002
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||| |    
T  10905779 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccg 10905878  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  10905879 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 10905978  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaa 255  Q
    |||||| || ||||| ||||||||    
T  10905979 aaacacgtggtctccttcttgaaa 10906002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15725494 - 15725269
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||  ||| ||||| |    
T  15725494 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 15725395  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |     
T  15725394 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgactctaaa 15725295  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| || |||||||    
T  15725294 aaacacgtggtctccttcctgaaact 15725269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 16635342 - 16635567
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  |||||||||||||||||||| || |||||||||  ||| ||||| |    
T  16635342 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccg 16635441  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  16635442 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaa 16635541  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||    
T  16635542 aaacacgtggtctccttcttggaact 16635567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 43162666 - 43162891
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  |||||||||||||||||||| || |||||||||  ||| ||||| |    
T  43162666 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccg 43162765  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  43162766 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaa 43162865  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||    
T  43162866 aaacacgtggtctccttcttggaact 43162891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 15208442 - 15208685
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||  | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| | ||||    
T  15208442 acatcatctctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggttgtaaac 15208541  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    |||||   ||  |||| |||||||  || || |||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||  ||||||| || ||  | ||||| ||    
T  15208542 ccactcgatactccaccgttccaattctttctgatatctgattcggaccaataaacctcggagtcaacttcttttacttcaatgcgcgtccaacaccagt 15208641  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15208642 cacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaact 15208685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 50 - 257
Target Start/End: Original strand, 15247734 - 15247941
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagata 149  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||   || ||||| |||||||  || || ||||    
T  15247734 acatatttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggttgtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttccgata 15247833  T
Q  150 tctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctc 249  Q
    |||  |||| ||||||| |  |||||||||||||||| |||||||| || ||  | ||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  15247834 tctaatacggaccaatacacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttc 15247933  T
Q  250 ttgaaact 257  Q
    ||||||||    
T  15247934 ttgaaact 15247941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 252
Target Start/End: Original strand, 48425016 - 48425236
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||  ||| ||||| |    
T  48425016 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 48425115  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  48425116 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 48425215  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttg 252  Q
    |||||| || ||||| |||||    
T  48425216 aaacacgtggtctccttcttg 48425236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 255
Target Start/End: Original strand, 10005169 - 10005392
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  |||||||||| |||||| ||||| |||||||||  ||| ||||| |    
T  10005169 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccg 10005268  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  10005269 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 10005368  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaa 255  Q
    |||||| || ||||| || |||||    
T  10005369 aaacacgtggtctccttcctgaaa 10005392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 255
Target Start/End: Original strand, 13252259 - 13252482
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  |||||||||| |||||| ||||| |||||||||  ||| ||||| |    
T  13252259 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccg 13252358  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  13252359 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 13252458  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaa 255  Q
    |||||| || ||||| || |||||    
T  13252459 aaacacgtggtctccttcctgaaa 13252482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15348806 - 15348581
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  |||||||||| |||||| || || |||||||||  ||| ||||| |    
T  15348806 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 15348707  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  15348706 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 15348607  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||    
T  15348606 aaacacgtggtctccttcttggaact 15348581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5425508 - 5425292
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||| || ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  5425508 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 5425409  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    |||||  ||| ||||| |||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||    
T  5425408 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 5425309  T
Q  214 cataggagtgactctca 230  Q
    |||||||||||||||||    
T  5425308 cataggagtgactctca 5425292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 50 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15403053 - 15402846
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagata 149  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||  ||| ||||| |||||||  || ||  |||    
T  15403053 acatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaattctttccaata 15402954  T
Q  150 tctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctc 249  Q
    |||| |||| |||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||| |||||  |||| || ||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||    
T  15402953 tctgatacggaccaatgaacatcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 15402854  T
Q  250 ttgaaact 257  Q
     |||||||    
T  15402853 ctgaaact 15402846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15589953 - 15589730
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  |||||||||| |||||| || || |||||||||  ||| ||||| |    
T  15589953 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 15589854  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  15589853 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 15589754  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaa 255  Q
    |||||| || ||||| || |||||    
T  15589753 aaacacgtggtctccttcctgaaa 15589730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 50 - 237
Target Start/End: Original strand, 16371000 - 16371187
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagata 149  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||   || ||||| || ||||| || || ||||    
T  16371000 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgacatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcaatacgccaccgtcccaactctttctgata 16371099  T
Q  150 tctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacac 237  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||   | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  16371100 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacac 16371187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 32 - 246
Target Start/End: Original strand, 15338838 - 15339052
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||  ||| || || |    
T  15338838 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagctaccg 15338937  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||  || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  |||| || |||||||||||||||||||     
T  15338938 ttccaattctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggagtgactctcaa 15339037  T
Q  232 aaacacatgatctcc 246  Q
    |||||| || |||||    
T  15339038 aaacacgtggtctcc 15339052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16412843 - 16412618
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || || |  | ||||||||||||||| || || |||||||||  ||| ||||| |    
T  16412843 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaaaacgttgtccaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 16412744  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  16412743 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 16412644  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| || || ||||| || |||||||    
T  16412643 aaatacgtggtctccttcatgaaact 16412618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 32 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 20062615 - 20062392
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  |||||||||| |||||| || || |||||||||  ||| ||||| |    
T  20062615 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 20062516  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  |||| || |||||||||||||||||||     
T  20062515 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggagtgactctcaa 20062416  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaa 255  Q
    |||||| || ||||| || |||||    
T  20062415 aaacacgtggtctccttcctgaaa 20062392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 6600298 - 6600530
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||| || ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  6600298 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 6600397  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    |||||  ||| ||||| || |||||  | ||  | ||||| || | |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||    
T  6600398 ccactcggtaagccaccgtcccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 6600497  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctcc 246  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  6600498 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcc 6600530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 12854426 - 12854360
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaaca 80  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12854426 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaaca 12854360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16757164 - 16756942
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||| || ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  16757164 acatcgtcactctgaatgacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 16757065  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    |||||  ||| ||||| || ||||| || ||  | || || || | |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||    
T  16757064 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatatgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 16756965  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaaca 236  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  16756964 cataggagtgactctcaaaaaca 16756942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 26792960 - 26792735
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||| |||||  ||| ||||  |    
T  26792960 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaatccactcggtaagccatcg 26792861  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||  ||||||||||||||||| |     
T  26792860 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacactagtcataggagtgactcttaa 26792761  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||    
T  26792760 aaacacgtggtctccttcttggaact 26792735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 53385597 - 53385356
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||| || ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  53385597 acatcgtcgctctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 53385498  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    |||||  ||| ||||| || ||||| || ||  | ||||| || | |||||| || ||||| |||||||| || |||||||| |||||  ||||||| ||    
T  53385497 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaactttttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 53385398  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaa 255  Q
    || |||||||||||||| |||||| || ||||| || |||||    
T  53385397 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaa 53385356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16807505 - 16807262
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  16807505 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacataattccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaagttcgaaagatgcggtggtaatc 16807406  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    |||||   || ||||| |||||||   | |  |||||||| |||| ||| | |||| || ||||||||||||| |||||||| ||||   | ||||| ||    
T  16807405 ccactcgatacgccaccgttccaaattttttcgatatctgatacggaccgaaaaatctcagagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagt 16807306  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || |||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||    
T  16807305 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaact 16807262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 14542915 - 14542883
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatcc 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14542915 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatcc 14542883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 1491 - 1249
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  1491 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaatacatcattcaaattcgaaagatgtggtttcaaac 1392  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1391 ctactttttatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaat-aacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacccgt 1293  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1292 cataggaatgattctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 1249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 27482 - 27725
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27482 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaac 27581  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||| || || |||||||||||||| |||||| | |||||  ||||||| ||    
T  27582 caactctatatgccactgttccaaccctctctgatatcttatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcgatgcacgtcctacacctgt 27681  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27682 cataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcctgaaact 27725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 257
Target Start/End: Original strand, 47091 - 47330
Alignment:
Q  18 catctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccac 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47091 catctctcggaataacatgcgaaggatctgttacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccac 47190  T
Q  118 tttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcata 217  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||    
T  47191 tctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgttata 47290  T
Q  218 ggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47291 ggagtaaccctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 47330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 49376 - 49133
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49376 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgaaaattcgaaagatgtggtggcaaac 49277  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||    
T  49276 ccactttgtatgccgctgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaacgcacttcctacacctgt 49177  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49176 cataggtgttactctcagaaacacatgatttccctcttgaaact 49133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 58159 - 57916
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  58159 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 58060  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | |||||||| ||||||| |||||| || ||||| |||  |||||| || ||||||||||||||| | || ||||| |||||  ||||||||||    
T  58059 caactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacagaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 57960  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| ||||| ||||||| ||| |||||||| ||||  |||||||    
T  57959 catcggagtaactctcaaaaatacatgatcacccttctgaaact 57916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 7379 - 7140
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7379 acatcatctcttggaataacttgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 7280  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  7279 ccactctgtaagccactgttccaactctctcagatatctggtatggaccaatgaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgt 7180  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttga 253  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  7179 cataggagtaaccctcagaaacacatgatctccctcttga 7140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 18880 - 18637
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  18880 acatcatctctccgaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggaaaac 18781  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||    
T  18780 ccactctgtatgccactgttctaaccctctctgatatctgatacaaaccaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacatcctacacccgt 18681  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18680 cataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 18637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 3698 - 3629
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacat 83  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3698 acatcatctctccgaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacat 3629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 1512 - 1269
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1512 acatcatctctcggaataacattcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaatttcgaaagatgtggtggcaaac 1413  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  1412 ctattttttatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 1313  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1312 cataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 1269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 44)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 15070345 - 15070588
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070345 acatcatctcttggaatcacatgcgaaggatccgctgcatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 15070444  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  15070445 ccaccctgtatgccactgttccaactctctcaaatatctggtatggaccaataaacttcgtagtcaacttcataaacttcaacacacgacctacacccgt 15070544  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070545 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 15070588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15003704 - 15003461
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15003704 acatcatctattggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 15003605  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || | | ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||    
T  15003604 ccactctatatgccactgttccaactctctcagatatctgatatggatcaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgt 15003505  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15003504 cataggagtaactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaact 15003461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 15245856 - 15246099
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15245856 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacataatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 15245955  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  15245956 gcactctgtatgccactgttccaaccctctctgttatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 15246055  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  15246056 cataggggtaactctcagaaatacatgatctccctcctgaaact 15246099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 257
Target Start/End: Original strand, 16145847 - 16146087
Alignment:
Q  17 tcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  16145847 tcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgtaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaa 16145946  T
Q  117 ctttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcat 216  Q
    || | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| || || |||||||||||| | |||||||| |||||  |||||||||||||    
T  16145947 ctctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcat 16146046  T
Q  217 aggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||  |||| |||||||    
T  16146047 aggagtaactctcagaaatacatgatcatcctcctgaaact 16146087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 1649617 - 1649374
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  1649617 acatcatcccttggaattacatgtgaaggatccgctacatacttccgtagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaacc 1649518  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | |||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||| |||||| || || | |||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||    
T  1649517 caactctatatgccacagttccaatcctctctgatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacacccgt 1649418  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  1649417 cataggagtaactcttagaaatacatgatcgccctcctgaaact 1649374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 257
Target Start/End: Original strand, 20890918 - 20891157
Alignment:
Q  17 tcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccca 116  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  20890918 tcatcccttggaatcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtgttgg-aaaccca 20891016  T
Q  117 ctttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcat 216  Q
       | ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||| |||||  | ||||||||||     
T  20891017 tcctatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgatacgaaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaa 20891116  T
Q  217 aggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  20891117 aggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaact 20891157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 15 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 3265133 - 3264891
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 114  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3265133 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 3265034  T
Q  115 cactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtc 214  Q
     ||| | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| || |||||||||||| | |||||||| |||||  | |||||||||    
T  3265033 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 3264934  T
Q  215 ataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    | ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  3264933 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaact 3264891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 257
Target Start/End: Original strand, 33222862 - 33223093
Alignment:
Q  26 ggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatg 125  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||    
T  33222862 ggaatcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcatgttcgaaagatggggtggcaaaccaactctatatg 33222961  T
Q  126 ccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgac 225  Q
    ||||||||||||| ||||  || ||||| |||| |||||| || || || ||||||||| | |||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||    
T  33222962 ccactgttccaactctctttgaaatctgatacggaccaatgaactttggtgtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcaaaggagtgac 33223061  T
Q  226 tctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
     |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  33223062 cctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaact 33223093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 44662206 - 44661963
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44662206 acatcatcccttggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 44662107  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| || || |||||||||||  | ||||||| ||||||| | ||||||||    
T  44662106 caactctatatgccactgttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagcgcacgaccaacacccgt 44662007  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || |||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  44662006 caaaggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaact 44661963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 29453876 - 29453634
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 114  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29453876 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 29453777  T
Q  115 cactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtc 214  Q
     ||| | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| |||||| || || |||||||||||  | |||||||| || ||| | |||||||||    
T  29453776 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtc 29453677  T
Q  215 ataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    | ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  29453676 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaact 29453634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 11207570 - 11207328
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 114  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  11207570 catcatccctcggtatcacatgtgaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaacc 11207471  T
Q  115 cactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtc 214  Q
     ||| | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| |||||| || || |||||||||||  | |||||||| |||||  | |||||||||    
T  11207470 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 11207371  T
Q  215 ataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  11207370 aaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaact 11207328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 42702835 - 42703078
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  42702835 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatctgctacatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 42702934  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | |||||||| ||||| |  ||||| || ||||| |||| |||||| || ||||||||||||||  | || ||||| |||||  ||||||||||    
T  42702935 caactctatatgccaccgttccgattctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 42703034  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| ||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  42703035 catcggagtcactcttataaatacatgatcaccctcttgaaact 42703078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 51606521 - 51606278
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  51606521 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatctgctacatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 51606422  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | |||||||| ||||| |  ||||| || ||||| |||| |||||| || ||||||||||||||  | || ||||| |||||  ||||||||||    
T  51606421 caactctatatgccaccgttccgattctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 51606322  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| ||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  51606321 catcggagtcactcttataaatacatgatcaccctcttgaaact 51606278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 69 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18164474 - 18164343
Alignment:
Q  69 acacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaa 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||    
T  18164474 acacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaa 18164375  T
Q  169 tttcggagtcaacttcttagacttcaacgcac 200  Q
     || ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18164374 ctttggagtcagcttcttagacttcaatgcac 18164343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 144
Target Start/End: Original strand, 15319515 - 15319645
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  15319515 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgtgacacaggaaacacatcatgcagatttgaaagatgtgctggcaaac 15319614  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctc 144  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  15319615 ccactctgtatgccactgttccaactctctc 15319645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 7090383 - 7090607
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||| |    
T  7090383 acatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccg 7090482  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || || |||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |   | ||||| |||| ||||||||||||||     
T  7090483 ttccaactctttccgatatctgatacg-agcaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcatccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 7090581  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||    
T  7090582 aaatacgtggtctccttcttgaaact 7090607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 50 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15150050 - 15149843
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagata 149  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||   || | ||| |||||||| || || ||||    
T  15150050 acatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgtcaccgttccaactctttccgata 15149951  T
Q  150 tctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctc 249  Q
    |||| |||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| |||| |||||||||||||| |||||| || ||||| ||    
T  15149950 tctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 15149851  T
Q  250 ttgaaact 257  Q
    ||||||||    
T  15149850 ttgaaact 15149843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 12523626 - 12523851
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||   || ||||| |    
T  12523626 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaatccaactcgatacgccaccg 12523725  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || || |||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  12523726 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 12523825  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||    
T  12523826 aaacacgtggtctccttcttgaaact 12523851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16252507 - 16252282
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||   || ||||| |    
T  16252507 acatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaatcccactcgatacgccaccg 16252408  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || || |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| |||| | ||||||||||||     
T  16252407 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaa 16252308  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||    
T  16252307 aaacacgtggtctccttcttgaaact 16252282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16355525 - 16355284
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  16355525 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16355426  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    |||||   || ||||| |||||||  || || |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| ||    
T  16355425 ccactcgatacgccaccgttccaagtctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 16355326  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaa 255  Q
    || |||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||    
T  16355325 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtttccttcttgaaa 16355284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 255
Target Start/End: Original strand, 14159424 - 14159665
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||| ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  14159424 acatcatcactctgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttccgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14159523  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    |||||  ||| ||||| |||||||  || || |||||||| || | |||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| ||    
T  14159524 ccactcggtaagccaccgttccaattctttctgatatctgatatggaccaataaacctcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 14159623  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaa 255  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  14159624 catgggagtaactctcaggaacacatgatctcctccttgaaa 14159665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 32 - 237
Target Start/End: Original strand, 14680517 - 14680722
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||   || ||||| |    
T  14680517 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 14680616  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || || |||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  14680617 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttatttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 14680716  T
Q  232 aaacac 237  Q
    ||||||    
T  14680717 aaacac 14680722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 15415319 - 15415215
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  15415319 acattatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaggatgtggtggcaaac 15415220  T
Q  114 ccact 118  Q
    |||||    
T  15415219 ccact 15415215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 14652240 - 14652483
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||  |||| ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||  |||    
T  14652240 acatcatctctttgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacatatgaaacacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtgaac 14652339  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    |||||   || ||||| |||||||  || || |||||||| |||| |||||||||  ||| |||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| ||    
T  14652340 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 14652439  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || | |||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||    
T  14652440 cacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttgaaact 14652483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 14851446 - 14851203
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| || |  ||||| || |||||||  |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  14851446 acatcatctcttgggagcacatgagatggatccggaacatacttccgaatttgcgacacatgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14851347  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    |||||   || ||||| |||||||  || ||  ||||||| |||| |||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| |||||  | ||||| ||    
T  14851346 ccactcgatacgccaccgttccaattctttcctatatctgatacggaccaataaacctcggagttaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccggt 14851247  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || | |||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  14851246 cacatgagtgactctaaaaaatacatgatctccttcttgaaact 14851203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 14927321 - 14927152
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| |||||||    
T  14927321 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcagtacgccactg 14927222  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacg 201  Q
    ||||||| || || |||||||| |||| |||||||||| | |||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  14927221 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctaggagtcaaattctttgacttcaatgcacg 14927152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 18227508 - 18227283
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||  ||||| || ||||||   || |||||||    
T  18227508 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatacggtggtaatcccactcgatacgccactg 18227409  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || || |||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| |||| ||||||||||||||     
T  18227408 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 18227309  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| || |||||||    
T  18227308 aaacacgtgctctccttcctgaaact 18227283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 29039466 - 29039241
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  |||||||||||||||||||| || |||||||||  ||| ||||| |    
T  29039466 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccg 29039367  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  29039366 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaa 29039267  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||    
T  29039266 aaacacgtggtctccttcttggaact 29039241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 12476550 - 12476775
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||| ||||| || || |  |||||||||| |||||| ||||| |||||||||  ||| ||||| |    
T  12476550 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgatacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccg 12476649  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  12476650 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 12476749  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||    
T  12476750 aaacacgtggtctccttcttgaaact 12476775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 14304039 - 14303815
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||  ||| ||||| |    
T  14304039 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 14303940  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  14303939 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcgg-gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaa 14303841  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||    
T  14303840 aaacacgtggtctccttcttgaaact 14303815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 18297155 - 18297380
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||  ||| ||||| |    
T  18297155 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 18297254  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  18297255 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 18297354  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||    
T  18297355 aaacacgtggtctccttcttggaact 18297380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 23955697 - 23955922
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || | ||||||||||| |||||| || || |||||||||  ||| ||||| |    
T  23955697 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttatgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 23955796  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  23955797 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 23955896  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||    
T  23955897 aaacacgtggtctccttcttggaact 23955922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 255
Target Start/End: Original strand, 8386362 - 8386585
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||  ||| ||||| |    
T  8386362 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 8386461  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  8386462 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 8386561  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaa 255  Q
    |||||| || ||||| || |||||    
T  8386562 aaacacgtggtctccttcctgaaa 8386585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 19778873 - 19778630
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||| || ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  19778873 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 19778774  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    |||||   || ||||| |||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||    
T  19778773 ccactcgataagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 19778674  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||    
T  19778673 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaact 19778630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 14266979 - 14266736
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||| || ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  14266979 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 14266880  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    |||||  ||| ||||| |||||||| || ||  ||||||| || | |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||   |||||| ||    
T  14266879 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcatacaccagt 14266780  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| |||||||||| |||||  || ||||| || |||||||    
T  14266779 cataggggtgactctcaaaaacatgtggtctccttcctgaaact 14266736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 255
Target Start/End: Original strand, 15364336 - 15364559
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||| ||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||  ||| ||||| |    
T  15364336 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacatatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 15364435  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  15364436 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 15364535  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaa 255  Q
    |||||| || ||||| || |||||    
T  15364536 aaacacgtggtctccttcctgaaa 15364559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 40472990 - 40473215
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||  ||| ||||  |    
T  40472990 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccatcg 40473089  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||  |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  40473090 ttccaactctttccaatatctgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 40473189  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| || || ||||| || |||||||    
T  40473190 aaatacgtggtctccttcctgaaact 40473215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 130 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15359314 - 15359187
Alignment:
Q  130 tgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctc 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  15359314 tgttccaaccctctctgatatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgatttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctc 15359215  T
Q  230 agaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||    
T  15359214 ggaaatacatgatctccctcttgaaact 15359187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 257
Target Start/End: Original strand, 27711281 - 27711511
Alignment:
Q  27 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgc 126  Q
    |||| ||||| || |||||||  ||||||||  |||| ||||||||||| || || |  |||||||||| |||||| || || |||||||||  ||| ||    
T  27711281 gaattacatgagatggatccggaacatacttttgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagc 27711380  T
Q  127 cactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgact 226  Q
    ||| |||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||| ||||||||||    
T  27711381 caccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcacaggagtgact 27711480  T
Q  227 ctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||| |||||| || ||||| ||||| ||||    
T  27711481 ctcaaaaacacgtggtctccttcttggaact 27711511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 15359397 - 15359326
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatca 85  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15359397 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatca 15359326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 32 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 8053685 - 8053462
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  |||||||||| |||||| || || ||||||||   ||| ||||  |    
T  8053685 acatgagatggatccgaaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccacacggtaagccatcg 8053586  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||   |||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  8053585 ttccaactctttccagtatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 8053486  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaa 255  Q
    |||||| || ||||| || |||||    
T  8053485 aaacacgtggtctccttcctgaaa 8053462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 257
Target Start/End: Original strand, 27900459 - 27900561
Alignment:
Q  155 tacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaa 254  Q
    |||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| |||||  |||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  27900459 tacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgttctacactcgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaa 27900558  T
Q  255 act 257  Q
    |||    
T  27900559 act 27900561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 257
Target Start/End: Original strand, 16752666 - 16752768
Alignment:
Q  155 tacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaa 254  Q
    |||| |||||| || |||||||| |||||| | || ||||| |||||  ||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| ||||    
T  16752666 tacggaccaatgaacttcggagttaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctgaa 16752765  T
Q  255 act 257  Q
    |||    
T  16752766 act 16752768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 18607892 - 18607823
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagat 101  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  18607892 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagat 18607823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 6256 - 6014
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6256 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatcctctacatacttccgaagttgcgacacatgaaa-acatcaagcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 6158  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  6157 ccactctatatgccacagttccaactctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgacctacacccgt 6058  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6057 cataggagtaaccctcagaaacacatgagctccctcttgaaact 6014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 52206 - 51963
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52206 acatcatctcttggaataacatgcgaatgatcagctacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 52107  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||    
T  52106 ccactctgtatgccactgttccaaccctttcagatatctgatatggaccactaaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcatgtcctacacccgt 52007  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52006 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 51963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 61 - 304
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  61 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacatatttccgaagttgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaac 160  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||    
T  161 ccactctgtatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaaagcacgtcatacacccgt 260  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  261 cataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaact 304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 4)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 68783 - 68575
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  68783 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 68684  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  68683 ccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 68584  T
Q  214 cataggagt 222  Q
    |||||||||    
T  68583 cataggagt 68575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Original strand, 148533 - 148770
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  148533 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 148632  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||    
T  148633 ctactctgtatgccactgttccaaccctctctcatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 148732  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctctt 251  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  148733 cataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctctt 148770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 196045 - 195803
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  196045 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 195946  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||| || || |||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||    
T  195945 caactctatatgccactgttccaaccttctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctagacttcaatgcacgtcctacacccgt 195846  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  195845 cataggagtaaccctcagaaa-acatgatcaccctcctgaaact 195803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 32 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 26858 - 26644
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||   || ||||| |    
T  26858 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcatggaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccg 26759  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    || ||| ||| || |||||||| ||||  ||||||||  ||||||||||||||||  ||||||| || ||  | ||||| |||| |||||| |||||||     
T  26758 tttcaatcctttctgatatctgatacgggccaataaacctcggagtcaacttctttcacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtaactctcaa 26659  T
Q  232 aaacacatgatctcc 246  Q
    ||| || ||||||||    
T  26658 aaatacgtgatctcc 26644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0924 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0924
Description:

Target: scaffold0924; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 3854 - 4097
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  3854 acatcatctcaaggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacataatgcaaattcgaaagatgtggaggcaaaa 3953  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  3954 caactatgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacagaccaatgaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 4053  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4054 cataggagtaactctcagaaacacatgatctccatcttgaaact 4097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 19946 - 20189
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19946 acatcatctcttggaataacatgcaaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacgccatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 20045  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  20046 ccactctgtatgccactgttccaaccttctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtaaacttcttcgacttcaacgcacgtcctacacccgt 20145  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20146 cataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaact 20189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13704 - 13461
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  13704 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaac 13605  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| || || |||||||||||| | |||||||| |||||  ||||||||||    
T  13604 caactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 13505  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  13504 cataggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcctgaaact 13461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 17474 - 17231
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  17474 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaac 17375  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| || || |||||||||||| | |||||||| |||||  ||||||||||    
T  17374 caactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 17275  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  17274 cataggagtaaccctaagaaatacatgatcaccctcctgaaact 17231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 31373 - 31616
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31373 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacaaaaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 31472  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  31473 caactctatatgccactgttccaaacctatcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 31572  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31573 catagaagtaactctcagaaacacatgatatccctcttgaaact 31616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 49 - 257
Target Start/End: Original strand, 14037 - 14245
Alignment:
Q  49 tacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagat 148  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||| || | ||||   || ||||| |||||||| || || |||    
T  14037 tacatacttcggaagttgcgacacatgaaacacatagttcaaattcgaaagatgcggtggtaatctcactcgatacgccaccgttccaactctttccgat 14136  T
Q  149 atctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccct 248  Q
    ||||  |||  |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||  | ||||| |||| |||||||||| ||| |||||  || ||||| |    
T  14137 atctcatacagaccaataaatctcggagtcaactactttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactatcaaaaacatgtggtctcctt 14236  T
Q  249 cttgaaact 257  Q
    |||||||||    
T  14237 cttgaaact 14245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 2714 - 2957
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2714 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatcttctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 2813  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| || || ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||    
T  2814 ccactctgtatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttctcagacttcaatgcacgtcctacacccgt 2913  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  2914 cataggagtaactctcataaatacatgatatccctcttgaaact 2957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 91275 - 91032
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  91275 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatttgctacatacttccgcagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 91176  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | || |||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  91175 ctactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctaatatggactaataaactttgaagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 91076  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  91075 cgtaggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 91032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 32 - 256
Target Start/End: Original strand, 162094 - 162318
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||| |    
T  162094 acatgggatggatccggaacatacttctgaagttgcgaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccg 162193  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||| ||  | ||||| |||||||||||||||||||     
T  162194 ttccaactctttctgatatctgatacgggccaataaatctcggagtcaagttctttgacttcgacgctcgtccaacaccagtcataggagtgactctcaa 162293  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaac 256  Q
    ||| || || ||| | |||||||||    
T  162294 aaatacgtggtctacttcttgaaac 162318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 448022 - 448265
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||  | || ||||| || |||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  448022 acatcatctctttggatcacatgagatggatccggaaaatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 448121  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||||  |  ||||| |||||||  || || ||||| || |||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||| || ||  | |||   ||    
T  448122 ccacttgatgcgccaccgttccaattctttccgatatttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgctcgtccaacaatagt 448221  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
     | |||||||||||| | ||| || |||||||| ||||||||||    
T  448222 tacaggagtgactctaaaaaatacgtgatctccttcttgaaact 448265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 219
Target Start/End: Original strand, 175358 - 175431
Alignment:
Q  146 gatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcatagg 219  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||  |||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  175358 gatatctgatacggaccaataaacttcgggatcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagg 175431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 33)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 19854261 - 19854504
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19854261 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatttggtggcaaac 19854360  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||  |||||| || || |||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||    
T  19854361 caactctatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcccgacctacacccgt 19854460  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19854461 cataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaact 19854504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 19665285 - 19665045
Alignment:
Q  17 tcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19665285 tcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaa 19665186  T
Q  117 ctttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcat 216  Q
    || | ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| |||||  |||| ||||||||    
T  19665185 ctctatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacccccgtcat 19665086  T
Q  217 aggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19665085 aggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaact 19665045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 20940475 - 20940232
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20940475 acatcatctcttggaataacgtgcgaaagatacgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 20940376  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||    
T  20940375 caactctatatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 20940276  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  20940275 cataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctcctgaaact 20940232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22433528 - 22433285
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22433528 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcatattcgaaagatgtggtggcaaac 22433429  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | || ||||| ||| |||||||||| || ||||| |||||||| || || || |||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||||||    
T  22433428 caactctataggccacagttgcaaccctctctgaaatctgatacgaaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgt 22433329  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  22433328 cataggagtaaccctcaggaacacatgatcaccctcctgaaact 22433285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 20244147 - 20244390
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  20244147 acatcatctctcggaataacatgcgaaagatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaac 20244246  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | || |||||||||||||||||||| || ||||| || | ||| || || || |||||||||||  | |||||||| ||| |  | ||||||||    
T  20244247 caactctataggccactgttccaaccctctctgaaatctgatatggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcatgtcccacacccgt 20244346  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  20244347 cataggagtaaccctcagaaagacatgatcaccctcctgaaact 20244390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 20075468 - 20075228
Alignment:
Q  17 tcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccca 116  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  20075468 tcatccctcggaatcacatgcgaaggatctgctacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaa 20075369  T
Q  117 ctttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcat 216  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| |||| |||||| || || |||||||||||  | |||||||| |||||  | ||||||||||     
T  20075368 ctttatatgccactgttcccactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaa 20075269  T
Q  217 aggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  20075268 aggagtgacccttagaaaaacatgatcaccctcctgaaact 20075228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 31550593 - 31550350
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31550593 acatcatcccttggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 31550494  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| ||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| |||||| || || |||||||||||  | |||||||| || ||| | ||||||||    
T  31550493 caactctgtatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgt 31550394  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  31550393 caaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaact 31550350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 257
Target Start/End: Original strand, 37677027 - 37677270
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 114  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37677027 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagagacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 37677126  T
Q  115 cactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtc 214  Q
     ||| ||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| || |||||||||||| | |||||||| |||||  | |||||||||    
T  37677127 aactctgtatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 37677226  T
Q  215 ataggagtgactctc-agaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    | ||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  37677227 aaaggagtgaccctcaagaaaaacatgatcaccctcctgaaact 37677270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 20294359 - 20294602
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20294359 acatcatcccttggaatcacatgcgaaggatccgccacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 20294458  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || | |||||| || || |||||||||||  | |||||||| |||||  | ||||||||    
T  20294459 caactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatatggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgt 20294558  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  20294559 caaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcttgaaact 20294602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 20395404 - 20395176
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 114  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20395404 catcatccctcggaatcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgagaaatatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 20395305  T
Q  115 cactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtc 214  Q
     ||| | ||||||||| ||||||| ||||| || ||||| |||| ||| || || || |||||||| ||| | |||||||| |||||| | |||||||||    
T  20395304 aactctatatgccactattccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaaattcctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtc 20395205  T
Q  215 ataggagtgactctcagaaacacatgatc 243  Q
    | ||||||||| || ||||| ||||||||    
T  20395204 aaaggagtgaccctaagaaaaacatgatc 20395176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Original strand, 21747500 - 21747698
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||| |    
T  21747500 acatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcggtacgccaccg 21747599  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctca 230  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||  | ||||| |||| ||||||||||||||    
T  21747600 ttccaactctttccgatatctgatacgaaccaataaatctcggattcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctca 21747698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20857173 - 20856947
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20857173 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 20857074  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | || ||||| |||||||| || || || |||||||| | |||||| || || |||||||||||| | |||||||| |||||  | ||||||||    
T  20857073 caactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctggtaaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacacccgt 20856974  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatg 240  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||    
T  20856973 cataggagtaaccctcagaaaaacatg 20856947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 20249815 - 20250040
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||  ||| ||||| |    
T  20249815 acatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaaacccactcggtacgccaccg 20249914  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || || |||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | ||||| |||| ||||||||||||||     
T  20249915 ttccaactctttctgatatcttatacggaacaataaatttcggagtcaacttctttgacttcaacgctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 20250014  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||    
T  20250015 aaatacgtggtctccttcttgaaact 20250040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 50620638 - 50620413
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||   ||||||||      
T  50620638 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatacggtggtaaacccactcgatatgccacca 50620539  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || || |||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| |||| ||||||||||||||     
T  50620538 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 50620439  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| || |||||| ||||||||||||    
T  50620438 aaatacgtgatcttcctcttgaaact 50620413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 17045409 - 17045184
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||   || ||||| |    
T  17045409 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 17045310  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || || |||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| |||| ||||||||||||||     
T  17045309 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccggtcacaggagtgactctcaa 17045210  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||    
T  17045209 aaacacatggtctccttcctgaaact 17045184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 19761278 - 19761035
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| || || ||||| || |||||||  ||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  19761278 acatcatctcttgggatcacatgagacggatccgaaacatactaccgaagttgcgatacatgaaacatatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaaac 19761179  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    |||||   || ||||| |||||||  || || |||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  | |||||  |    
T  19761178 ccactcgatacgccaccgttccaattctttcggatatctgatacggtccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccaat 19761079  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || | |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19761078 cacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaact 19761035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 27 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16350998 - 16350768
Alignment:
Q  27 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgc 126  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||  ||| ||    
T  16350998 gaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagc 16350899  T
Q  127 cactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgact 226  Q
    ||| |||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  16350898 caccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgact 16350799  T
Q  227 ctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||| |||||| || ||||| ||||| ||||    
T  16350798 ctcaaaaacacgtggtctccttcttggaact 16350768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 50612810 - 50612612
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||   ||||||||      
T  50612810 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatacggtggtaaacccactcgatatgccacca 50612711  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctca 230  Q
    ||||||| || || |||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| |||| ||||||||||||||    
T  50612710 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctca 50612612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 41 - 252
Target Start/End: Original strand, 16369271 - 16369482
Alignment:
Q  41 ggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccc 140  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||   ||| ||||| |||||||| |    
T  16369271 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaacacggtacgccaccgttccaactc 16369370  T
Q  141 tctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatg 240  Q
    | || |||||||| ||   |||||||||  ||| |||||||||||| |||||||| |||||  | ||||  |||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  16369371 tttctgatatctgatatagaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacacttgtcacaggagtgactctcaaaaatacatg 16369470  T
Q  241 atctccctcttg 252  Q
    |||||| |||||    
T  16369471 atctccttcttg 16369482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 50 - 257
Target Start/End: Original strand, 20136761 - 20136968
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagata 149  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||| ||    || |||||||| ||||| || || ||||    
T  20136761 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgccgtggtaaaccaacacgatacgccactgtcccaactctttccgata 20136860  T
Q  150 tctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctc 249  Q
    |||| |||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||  | ||||| ||    
T  20136861 tctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgaggtctccttc 20136960  T
Q  250 ttgaaact 257  Q
    ||||||||    
T  20136961 ttgaaact 20136968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 19106332 - 19106557
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| ||| | || || |||   || ||||| |    
T  19106332 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtagtaatccaactcgatacgccaccg 19106431  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || || |||||||| || | ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  19106432 ttccaactctttccgatatctgatatggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaacgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 19106531  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| || |||||||    
T  19106532 aaacacgtggtctccttcctgaaact 19106557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 126 - 257
Target Start/End: Original strand, 41307884 - 41308015
Alignment:
Q  126 ccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgac 225  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||   |||||||||||||||||| ||    
T  41307884 ccactgctccaaccctctcagatatctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttttagacttcaatgcacgtcatacacccgtcataggagtaac 41307983  T
Q  226 tctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41307984 cctcagaaacacatggtctccctcttgaaact 41308015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 32 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16079027 - 16078813
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||   || |||||      
T  16079027 acatgagatggatccggaacatacttccgtagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccacca 16078928  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || || |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| |||| ||||||||||||||     
T  16078927 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 16078828  T
Q  232 aaacacatgatctcc 246  Q
    |||||| || |||||    
T  16078827 aaacacgtggtctcc 16078813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 21830268 - 21830493
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||  ||| ||||| |    
T  21830268 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 21830367  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| || | |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  21830368 ttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 21830467  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||    
T  21830468 aaacacgtggtctccttcttgaaact 21830493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 111
Target Start/End: Original strand, 24476927 - 24477024
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaa 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  24476927 acatcatctctcggaatcacatgcgagggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgaaaattcgagagatgtggtggcaa 24477024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 76 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20836241 - 20836065
Alignment:
Q  76 aaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcgga 175  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| || || |||    
T  20836241 aaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttgga 20836142  T
Q  176 gtcaacttctta---gacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctc 249  Q
    |||||||||||    ||||| || | |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  20836141 gtcaacttcttcttcgacttaaatgtacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctc 20836065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 33391423 - 33391198
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  |||||||||| |||||| || || |||||||||  ||| ||||| |    
T  33391423 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 33391324  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  33391323 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 33391224  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||    
T  33391223 aaacacgtggtctccttcttggaact 33391198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 21836915 - 21837140
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||  |||| ||||||||||| || || |  |||||||||| |||||| || || |||||||||  ||| ||||| |    
T  21836915 acatgagatggatccggaacatacttttgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 21837014  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  21837015 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 21837114  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||    
T  21837115 aaacacgtggtctccttcttggaact 21837140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 41354881 - 41354649
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||| || ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||    
T  41354881 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 41354782  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    |||||  ||| ||||| || ||||| || ||  | ||||| || | |||||| || ||||  ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||    
T  41354781 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 41354682  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctcc 246  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  41354681 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcc 41354649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 50 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 51333869 - 51333673
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagata 149  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||  ||| ||||| |||||||| || ||  |||    
T  51333869 acatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaata 51333770  T
Q  150 tctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctcc 246  Q
    | || |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  51333769 tatgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcc 51333673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 140 - 257
Target Start/End: Original strand, 11382667 - 11382784
Alignment:
Q  140 ctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacat 239  Q
    ||||| || ||||| |||| ||||||||| || |||||||||||| | |||||||| |||||  | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  11382667 ctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacat 11382766  T
Q  240 gatctccctcttgaaact 257  Q
    |||| ||||| |||||||    
T  11382767 gatcaccctcctgaaact 11382784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Original strand, 21163227 - 21163381
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || |  || ||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  21163227 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaatgtcgtgcaaattcgaaatatgcggtggtaaac 21163326  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaa 168  Q
    |||||  ||| ||||| |||||||| || || |||||||| |||| |||||||||    
T  21163327 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaa 21163381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 257
Target Start/End: Original strand, 46518827 - 46518911
Alignment:
Q  173 ggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||| | ||||| |||| |||| | || |||| |||||||||||| ||  |||||||||    
T  46518827 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaact 46518911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 39702 - 39945
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39702 acatcatctctcggaataacatgagaaggatccgctacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgcaaattcgagagatgtggtggcaaac 39801  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| || || |||||||||||||||||||| |  || ||  ||||||||||    
T  39802 ccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatcggatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttgagtgcgcgtcctacacccgt 39901  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  39902 cataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcctgaaact 39945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 255
Target Start/End: Original strand, 27192 - 27430
Alignment:
Q  17 tcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27192 tcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatatttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaatccca 27291  T
Q  117 ctttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcat 216  Q
    || |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||| |||    
T  27292 ctctgtatgccacggttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgacat 27391  T
Q  217 aggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaa 255  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  27392 aggagtaactctcagaaatacatgatatccctcttgaaa 27430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 37165 - 37408
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  37165 acatcatctctcagaataacatgtgaaggatccactacatacttccgaagttgcgagacatgtaacacatcatgcaaatttgaaagatgaggtggcaaac 37264  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  37265 ccactctgtatgccactgttccaaccctttcagatatctgatatagaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgt 37364  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  37365 cataggggtgactctaagaaacacatgatctctcccttgaaact 37408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 128 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 27566 - 27437
Alignment:
Q  128 actgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  27566 actgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaattaatttttgagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactc 27467  T
Q  228 tcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27466 tcagaaatacatgatctccctcttgaaact 27437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 128 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 38403 - 38274
Alignment:
Q  128 actgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  38403 actgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaattaatttttgagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactc 38304  T
Q  228 tcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38303 tcagaaatacatgatctccctcttgaaact 38274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 156; Significance: 6e-83; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 61556 - 61313
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  61556 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 61457  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||  |||||| || || |||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||| |    
T  61456 ccactctatatgccactgttccaacccttttagatatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccat 61357  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  61356 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctcctgaaact 61313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 52522 - 52279
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  52522 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaatttcgaaagatgaggtggcaaac 52423  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||  |||||| || || |||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||| |    
T  52422 ccactctatatgccactgttccaacccttttagatatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccat 52323  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  52322 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctcctgaaact 52279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 47 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 67911 - 67701
Alignment:
Q  47 gctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcag 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||    
T  67911 gctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaacccttttag 67812  T
Q  147 atatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctcc 246  Q
    ||||||| |||  |||||| || || |||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||| ||    
T  67811 atatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaaccctcagaaatacatgatcgcc 67712  T
Q  247 ctcttgaaact 257  Q
    ||| |||||||    
T  67711 ctcctgaaact 67701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22014 - 21771
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22014 acatcatctctcggaataacatccgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 21915  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||| || |||||| |||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||    
T  21914 caactctatatgccactgttccaaccctctccgatatcttatacggaccaatgaacttcggaatcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 21815  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| |  |||||||||||||    
T  21814 cataggagtaaccctcagaaatacatggttaccctcttgaaact 21771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 10851 - 11094
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  10851 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaac 10950  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| || || |||||||||||| | |||||||| |||||  ||||||||||    
T  10951 caactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 11050  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  11051 cataggagtaaccctaagaaatacatgatcaccctcctgaaact 11094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 742 - 499
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  742 acatcatctcttggaataacatgcaaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacgccatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 643  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| || || |||||||||||| | |||||||| |||||  ||||||||||    
T  642 caactctatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 543  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  542 cataggagtaaccctaagaaatacatgatcaccctcctgaaact 499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 7994 - 7910
Alignment:
Q  173 ggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||| | || || |||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||  |||||||||    
T  7994 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaact 7910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 26208 - 25965
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  26208 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctacatatttccgaagttgcgacgcatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaac 26109  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||| |||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||||   ||||||||||    
T  26108 ccactctgtatgccactgttccaaccctttttgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacatcctacacccgt 26009  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  26008 cataggagtaactctcagaaatacatgatccccctcttgaaact 25965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 16639 - 16882
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16639 acatcatcccttggaatcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 16738  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||  | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||| |||||| || || |||||||||||| | |||||||| |||||  | ||||||||    
T  16739 caacactatatgccactattccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgt 16838  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  16839 caaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaact 16882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 19083 - 19326
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19083 acatcatctcccggaataacatgcgaaggatccgctgcatacttccgaagttgcgacacatgaaacacaacatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 19182  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||| ||| |  ||||||||||    
T  19183 caactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacgaaccaatgaattttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatgtcctacacccgt 19282  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||| || || |||||||    
T  19283 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccatcctgaaact 19326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 59115 - 59042
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatg 87  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||  |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  59115 acatcatctcttggaatcacatgagatggatccgaaacatacatccgaagttgtgacacatgaaacacatcatg 59042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 14244 - 14001
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  14244 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaacc 14145  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | |||||||||||||||| ||| || |||||||| |||| |||||| || || |||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||||||    
T  14144 caactctatatgccactgttccaatcctttctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaatttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 14045  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  14044 cataggagtaactcttaaaaacacatgatccccctcttgaaact 14001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 86 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 5224 - 5053
Alignment:
Q  86 tgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttct 185  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| || || ||||||||||||     
T  5224 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 5125  T
Q  186 tagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| |||||||    
T  5124 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcatcctcctgaaact 5053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 149; Significance: 9e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 49547 - 49307
Alignment:
Q  17 tcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  49547 tcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgatacatgtaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaa 49448  T
Q  117 ctttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcat 216  Q
    || | || ||||| |||||||||||||| || ||||| |||| ||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||    
T  49447 ctctataggccacagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcccacacccgtcat 49348  T
Q  217 aggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49347 aggaatgaccctcagaaacacatgatcaccctcttgaaact 49307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 144; Significance: 9e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 4482 - 4239
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4482 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 4383  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | |||||||| |||||||||||||  || ||||| |||| ||| || || || |||||||||||| | |||||||| |||||  ||||||||||    
T  4382 caactctatatgccacagttccaaccctctttgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 4283  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  4282 cataggagtaactcttaaaaacacatgatccccctcttgaaact 4239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 144; Significance: 9e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14594 - 14359
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14594 acatcatctctcgaaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgaagttgcgacacctgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 14495  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| || || |||||||||||| | |||||||| |||||  ||||||||||    
T  14494 caactttatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 14395  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctc 249  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||| |||||    
T  14394 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctc 14359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 9220 - 9039
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9220 acatcatctctcgaaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgaagttgcgacacctgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 9121  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaa 195  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| || || |||||||||||| | ||||||||    
T  9120 caactttatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaa 9039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 144; Significance: 9e-76; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 23087013 - 23087256
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23087013 acatcatctcttgggataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 23087112  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
     |||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| |||||| | ||||| ||    
T  23087113 acactctatacgccactgttccaactctctcagatatctgatatggaccaataaacctcggcgtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgt 23087212  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || | |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23087213 cacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaact 23087256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 23293521 - 23293764
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  23293521 acatcatatctttgaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttagaaagatgtggtggcaaac 23293620  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| || || |||||||||||| | |||||||| |||||  ||||||||||    
T  23293621 caactctatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 23293720  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  23293721 cataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctcctgaaact 23293764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 23276339 - 23276582
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23276339 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 23276438  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| || || |||||| ||||  | |||||||| |||||  | |||||| |    
T  23276439 caactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcgacttactcgacttcaatgcacgtcccacacccat 23276538  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  23276539 cataggagtaaatctcagaaatacatgatcaccctcctgaaact 23276582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 24653908 - 24654151
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24653908 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccgctaaatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 24654007  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | |||||||||||||||||| || | || ||||| |||| |||||| || || |||||||||||| | |||||||| ||| |  ||||||||||    
T  24654008 caactctatatgccactgttccaaccttcactgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcaagtcctacacccgt 24654107  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  24654108 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaact 24654151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 24944930 - 24945165
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24944930 acatcatctcttggaataacatgcgaaggctccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacccatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 24945029  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | ||||||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||| || || |||||||||||| | |||||||| |||||  ||||||||||    
T  24945030 caactctatatgccactgttccaaccctctttgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttccttgacttcaatgcacgtcctacacccgt 24945129  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctc 249  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||| |||||    
T  24945130 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctc 24945165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 255
Target Start/End: Original strand, 31830222 - 31830462
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 114  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31830222 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 31830321  T
Q  115 cactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtc 214  Q
     ||| | |||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| || |||||||||||| | |||||||| || ||  | |||||||||    
T  31830322 aactctatatgccacagtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtc 31830421  T
Q  215 ataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaa 255  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  31830422 aaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaa 31830462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 11358754 - 11358511
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11358754 acatcatcccttggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 11358655  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | ||||||||||| |||||  |||| || ||||| |||| |||||| || || |||||||||||  | |||||||| |||||| | ||||||||    
T  11358654 caactctatatgccactgtaccaactttctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccaacacccgt 11358555  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  11358554 caaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaact 11358511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 257
Target Start/End: Original strand, 20832549 - 20832791
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 114  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20832549 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 20832648  T
Q  115 cactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtc 214  Q
     ||| | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| |||||| || || |||||||||||  | |||||||| || ||| | |||||||||    
T  20832649 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtc 20832748  T
Q  215 ataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    | ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  20832749 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaact 20832791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 12573916 - 12574159
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  12573916 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatctgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 12574015  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | |||||||| || |||| |||||| || ||||| |||| |||||| || ||||||||||||||| | || ||||| |||||  ||||||||||    
T  12574016 caactctatatgccaccgtcccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 12574115  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| || || || || ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  12574116 catcggggtaacccttagaaatacatgatcaccctcttgaaact 12574159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 27787304 - 27787547
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  27787304 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatctgctacatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 27787403  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | |||||||| ||||| |  ||||| || ||||| |||| |||||| || ||||||||||||||  | || ||||| |||||  ||||||||||    
T  27787404 caactctatatgccaccgttccgattctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 27787503  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  27787504 catcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctcttgaaact 27787547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 257
Target Start/End: Original strand, 1063315 - 1063557
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 114  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  1063315 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaagc 1063414  T
Q  115 cactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtc 214  Q
     ||| | |||||||| || ||||  ||||| || ||||| |||| |||||| || || |||||||||||  | |||||||| || ||| | |||||||||    
T  1063415 aactctatatgccacagtaccaattctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtc 1063514  T
Q  215 ataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    | ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  1063515 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaact 1063557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 27365956 - 27365716
Alignment:
Q  17 tcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccca 116  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |    
T  27365956 tcatccctaggaataatatgcgaaggattcggtacatacttccgcaactgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaa 27365857  T
Q  117 ctttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcat 216  Q
    || | || ||||| |||||||| || || || ||||| || | |||||| || || ||||||||||||||||| || || |||||  ||||||| |||||    
T  27365856 ctctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcat 27365757  T
Q  217 aggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  27365756 aggagtgaccctcaagaacacatgatctccctcttgaaact 27365716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22757343 - 22757100
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  22757343 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 22757244  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    |||||   || ||||| |||||||| || || |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||  | ||||| ||    
T  22757243 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgatttcaaagcacgtccaacaccagt 22757144  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || |||||||||||||| |||||| || ||||  ||||||||||    
T  22757143 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctctttcttgaaact 22757100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21326146 - 21325903
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  21326146 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 21326047  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    |||||   || ||||| || ||||| || || |||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||  | ||||| ||    
T  21326046 ccactcgatacgccaccgtcccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 21325947  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || |||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||    
T  21325946 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaact 21325903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 50 - 257
Target Start/End: Original strand, 24675088 - 24675295
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagata 149  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| || || |||   || ||||| |||||||| || || ||||    
T  24675088 acatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatccaactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 24675187  T
Q  150 tctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctc 249  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| |||| ||| |||||||||| |||||| || ||||| ||    
T  24675188 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggggtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 24675287  T
Q  250 ttgaaact 257  Q
    ||||||||    
T  24675288 ttgaaact 24675295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 23138618 - 23138843
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||   |||||||| |    
T  23138618 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacaccatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacctactcgatatgccaccg 23138717  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || || |||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||| || ||  | ||||| |||| | ||||||||||||     
T  23138718 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaa 23138817  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||    
T  23138818 aaatacctggtctccttcttgaaact 23138843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 23550408 - 23550633
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||   |||||||| |    
T  23550408 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacaccatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacctactcgatatgccaccg 23550507  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || || |||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||| || ||  | ||||| |||| | ||||||||||||     
T  23550508 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaa 23550607  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||    
T  23550608 aaatacctggtctccttcttgaaact 23550633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 257
Target Start/End: Original strand, 23063675 - 23063883
Alignment:
Q  49 tacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagat 148  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||   || ||||| |||||||| || ||||||    
T  23063675 tacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttcagat 23063774  T
Q  149 atctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccct 248  Q
    |||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| |||| |||||||||||| | ||| || || ||||| |    
T  23063775 atctgaaacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaaaacgtggtctcctt 23063874  T
Q  249 cttgaaact 257  Q
    |||||||||    
T  23063875 cttgaaact 23063883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 9609717 - 9609942
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  |||||||||||||||||||| || |||||||||  ||| ||||| |    
T  9609717 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccg 9609816  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  9609817 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaa 9609916  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||    
T  9609917 aaacacgtggtctccttcttggaact 9609942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 24708344 - 24708119
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||   || ||||| |    
T  24708344 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgtcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 24708245  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || || |||||||| |||| ||||| |||| | |||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| |||| ||||||||||||||     
T  24708244 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaaaaaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 24708145  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||    
T  24708144 aaacacgtggtctccttcttgaaact 24708119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 44386449 - 44386208
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||| || ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  |||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  44386449 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaac 44386350  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    |||||  ||| ||||| |||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||    
T  44386349 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaatttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 44386250  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaa 255  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||| || |||||    
T  44386249 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaa 44386208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 32 - 255
Target Start/End: Original strand, 10868431 - 10868654
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||  ||| |||||||    
T  10868431 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccactg 10868530  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  10868531 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 10868630  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaa 255  Q
    |||||| || ||||| || |||||    
T  10868631 aaacacgtggtctccttcctgaaa 10868654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 16924841 - 16925066
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||  ||| ||||| |    
T  16924841 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 16924940  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  16924941 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 16925040  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||    
T  16925041 aaacacgtggtctccttcttggaact 16925066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 16998581 - 16998806
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||  ||| ||||| |    
T  16998581 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 16998680  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  16998681 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 16998780  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||    
T  16998781 aaacacgtggtctccttcttggaact 16998806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 252
Target Start/End: Original strand, 16981733 - 16981953
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||  ||| ||||| |    
T  16981733 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 16981832  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  16981833 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 16981932  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttg 252  Q
    |||||| || ||||| |||||    
T  16981933 aaacacgtggtctccttcttg 16981953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 252
Target Start/End: Original strand, 17063298 - 17063518
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||  ||| ||||| |    
T  17063298 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 17063397  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  17063398 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 17063497  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttg 252  Q
    |||||| || ||||| |||||    
T  17063498 aaacacgtggtctccttcttg 17063518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 255
Target Start/End: Original strand, 27217597 - 27217820
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||  ||| ||||| |    
T  27217597 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 27217696  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  27217697 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 27217796  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaa 255  Q
    |||||| || ||||| || |||||    
T  27217797 aaacacgtggtctccttcctgaaa 27217820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 50 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 27377315 - 27377108
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagata 149  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || ||    || ||||| |||||||| || || ||||    
T  27377315 acatactttcgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaacccgatacgccaccgttccaactctttccgata 27377216  T
Q  150 tctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctc 249  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| |||| |||||||||||||| |||||| || ||||| ||    
T  27377215 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 27377116  T
Q  250 ttgaaact 257  Q
     |||||||    
T  27377115 ctgaaact 27377108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21145892 - 21145667
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||   || ||||  |    
T  21145892 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgataagccatcg 21145793  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||  | ||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||     
T  21145792 ttccaactctttccaatatctgatacagatcaataaacttcggggtcaacttctttgatttcaaagcacgtcctacacccgtcataggagtgactctcaa 21145693  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| || |||||||    
T  21145692 aaacacgtggtctccttcctgaaact 21145667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 24261951 - 24262176
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  |||||||||||||||||||| || |||||||||  ||| ||||| |    
T  24261951 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccg 24262050  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  |||| || |||  |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  24262051 ttccaactctttccaatatatgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 24262150  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||    
T  24262151 aaacacgtggtctccttcttggaact 24262176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 236
Target Start/End: Original strand, 23188589 - 23188793
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || | ||||   || ||||  |    
T  23188589 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatctcactcgatacgccatcg 23188688  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || || |||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| |||| ||||||||||||||     
T  23188689 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatcttggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 23188788  T
Q  232 aaaca 236  Q
    |||||    
T  23188789 aaaca 23188793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 24878848 - 24878632
Alignment:
Q  41 ggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccc 140  Q
    |||||||  |||||||| ||||| ||||||| ||| || || |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||| |    
T  24878848 ggatccggaacatactttcgaagttgcgacagatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccacttggtaagccaccgttccaactc 24878749  T
Q  141 tctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatg 240  Q
    | ||  ||||||| || | |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  24878748 tttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtg 24878649  T
Q  241 atctccctcttgaaact 257  Q
     ||||| || |||||||    
T  24878648 gtctccttcctgaaact 24878632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 32 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22325718 - 22325495
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  |||||||||| |||||| || || |||||||||  ||| ||||| |    
T  22325718 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 22325619  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| |||||||| || |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  22325618 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttgtttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 22325519  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaa 255  Q
    |||||| || ||||| || |||||    
T  22325518 aaacacgtggtctccttcctgaaa 22325495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 24709614 - 24709839
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  | |||||||| |||||| || || |||||||||  ||| ||||| |    
T  24709614 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtacaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 24709713  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||  |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  24709714 ttccaactctttccaatatctaatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 24709813  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||    
T  24709814 aaacacgtggtctccttcttggaact 24709839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 27370850 - 27371075
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  |||||||||| |||||| || || ||| |||||  ||| ||||| |    
T  27370850 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaatccactcggtaagccaccg 27370949  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||   ||||||| |||||||||||||||||||     
T  27370950 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacatcctacaccagtcataggagtgactctcaa 27371049  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||    
T  27371050 aaacacgtggtctccttcttggaact 27371075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 24833453 - 24833359
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtgg 108  Q
    |||||||||||  |||| ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24833453 acatcatctcttcgaatcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtgg 24833359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 32 - 252
Target Start/End: Original strand, 17066959 - 17067176
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| || |  ||||| ||||||||||| || || |||||||||    | ||||| |    
T  17066959 acatgagatggatccggaacatactttcgaag-tgcgacacatgaaaaacgtg-tgcaa-ttcgaaagatgcggcggtaaacccactcgtaaagccaccg 17067055  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  17067056 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 17067155  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttg 252  Q
    |||||| || ||||| |||||    
T  17067156 aaacacgtggtctccttcttg 17067176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 30211797 - 30211691
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||   |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||    
T  30211797 acatcatctcttggaatcacatgagattgatccaaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgcggtggtaaac 30211698  T
Q  114 ccacttt 120  Q
    |||||||    
T  30211697 ccacttt 30211691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 41609224 - 41609047
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||| || ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||||| ||| |||||||| || || ||||  ||||||||||||||||| ||  | ||||    
T  41609224 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacgtggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggctgtaaac 41609125  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagact 191  Q
    |||||  ||| ||||| |||||||| || ||  | ||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  41609124 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgact 41609047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 24826030 - 24825930
Alignment:
Q  146 gatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctc 245  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| || ||  | ||||| |||| |||||||||||| | ||| |||| |||||    
T  24826030 gatatctgatacgaaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactcttaaaaatacattatctc 24825931  T
Q  246 c 246  Q
    |    
T  24825930 c 24825930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 240
Target Start/End: Original strand, 45529116 - 45529306
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagata 149  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||||||||| | || ||| |||||||  |||| ||||||||| | || || || || ||||| || || || |    
T  45529116 acatgcttccgaagttgtgacacatgaaacacatcacgtaagttcaaaagatgcagtggtaaacccactctatacgcaaccgtcccaactctttccgaaa 45529215  T
Q  150 tctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatg 240  Q
    |||| || |   |||||||  |||||||||  ||||| || || | ||||||  | ||||| |||| | |||||||||||| |||||||||    
T  45529216 tctgatatgggtcaataaacctcggagtcagtttctttgattttagcgcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcataaacacatg 45529306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 24831908 - 24831824
Alignment:
Q  173 ggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||| | || || ||||||||| | || |||| |||||||||||| ||  |||||||||    
T  24831908 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccagtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaact 24831824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 11082 - 10839
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  11082 acatcatctcttggaataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaat 10983  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||| || | |||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| |||||| ||| ||| ||    
T  10982 ccactctatatgccactgttccaactttctcagatatctgatatggaccaataaacctcggtgtcaacttcttcgatttcaaggcacgacctatacctgt 10883  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  10882 cacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgtaact 10839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 491 - 734
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  491 acatcatctctagaaataacatgtgaaggatccgctacatactttggaagttccgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 590  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||| || || || |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||   ||||||| ||    
T  591 ccactctgtaagccactgttccaaccctctctgaaatttgatacggaccgataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcactgcctacacctgt 690  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  691 cataggagtaactctcaagaacacatgatctccctcttgaaact 734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 18812 - 19055
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18812 acatcatctctaggaataacatgcgaaggatccggtacatacttccacaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 18911  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||| || |  |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||| ||    
T  18912 ccactctatacgccactgtcccaactctctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacgacctacacctgt 19011  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  19012 cataggagtgactctcaagaacacatggtctccctcttgaaact 19055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 134 - 257
Target Start/End: Original strand, 23094 - 23217
Alignment:
Q  134 ccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaa 233  Q
    ||||| |||||||||||||| || |  |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  23094 ccaactctctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcaaga 23193  T
Q  234 acacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  23194 acacatggtctccctcttgaaact 23217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 42676 - 42433
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  42676 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcaagcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 42577  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| || || |||||||||||| | |||||||| ||||   ||||||||||    
T  42576 caactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacttcctacacccgt 42477  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  42476 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaact 42433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 47742 - 47499
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  47742 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcaagcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 47643  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| || || |||||||||||| | |||||||| |||    ||||||||||    
T  47642 caactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatttcctacacccgt 47543  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  47542 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaact 47499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 70 - 113
Target Start/End: Original strand, 2202 - 2245
Alignment:
Q  70 cacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  2202 cacatgagacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 2245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 65 - 257
Target Start/End: Original strand, 4764 - 4956
Alignment:
Q  65 tgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaa 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  4764 tgcgacacatgaaacacatcatgcaaatttgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatcttatacggaccaa 4863  T
Q  165 taaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    | || || |||||||| |||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4864 tgaactttggagtcaatttcttagacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaact 4956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 4)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 257
Target Start/End: Original strand, 20088 - 20328
Alignment:
Q  17 tcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  20088 tcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaa 20187  T
Q  117 ctttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcat 216  Q
    || | || |||||  ||||||| ||||| || ||||| |||| ||| || || || |||||||||||||| |||||||| |||||  | |||||||||||    
T  20188 ctctataggccacaattccaacactctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcat 20287  T
Q  217 aggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    | |||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  20288 aagagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaact 20328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 257
Target Start/End: Original strand, 43471 - 43711
Alignment:
Q  17 tcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccca 116  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  43471 tcatctctctgaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaa 43570  T
Q  117 ctttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcat 216  Q
    || | || ||||| |||||||||||||| || ||||| |||| ||| || || || |||||||||||| | || ||||| |||||  |||| || |||||    
T  43571 ctctataggccacagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgaattcaatgcacgtcctaccccggtcat 43670  T
Q  217 aggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  43671 aggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaact 43711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 257
Target Start/End: Original strand, 44483 - 44723
Alignment:
Q  17 tcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccca 116  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  44483 tcatctctctgaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaa 44582  T
Q  117 ctttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcat 216  Q
    || | || ||||| |||||||||||||| || ||||| |||| ||| || || || |||||||||||| | || ||||| |||||  |||| || |||||    
T  44583 ctctataggccacagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgaattcaatgcacgtcctaccccggtcat 44682  T
Q  217 aggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  44683 aggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaact 44723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 216
Target Start/End: Original strand, 36021 - 36220
Alignment:
Q  17 tcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccca 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  36021 tcatctctcggaaaaacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcttgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaa 36120  T
Q  117 ctttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcat 216  Q
    || | || |||||  ||||||| ||||| || ||||| |||| ||| || || || |||||||||||||| |||||||| |||||  | |||||||||||    
T  36121 ctctataggccacaattccaacactctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcat 36220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13124 - 12881
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  13124 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccactacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaagc 13025  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| |||||||||| ||||||| |||||| || ||||  |||| |||||| || |||||||| |||||| | || ||||| |||||  ||||||||||    
T  13024 caactctgtatgccaccgttccaatcctctctgaaatctaatacggaccaatgaacttcggagttaacttccttgatttcaaagcacgttctacacccgt 12925  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| ||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||    
T  12924 catcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaact 12881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 42746 - 42989
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  42746 acatcatcccttggaataacatgtgaaggatccgctagatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcaaaagatgtggtggcaaac 42845  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | || ||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||| || || |||||||||||| | |||||||| |||||  ||||||||||    
T  42846 caactctataagccactgttccaaccttctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 42945  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  42946 cataggagtgaccctaagaaaaacatgatcaccctcctgaaact 42989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 112522 - 112765
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||    
T  112522 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgcaactgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggtaaac 112621  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||  | || |||||||||||||| |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||  ||||||| ||    
T  112622 ccaccctataagccactgttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgt 112721  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  112722 cataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaact 112765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 96345 - 96119
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  96345 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 96246  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | | | | || ||||| |||||||| || || || ||||| || | ||| || || || |||||||||||  | |||||||| |||||  ||||||||||    
T  96245 caattctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 96146  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatg 240  Q
    ||||||||| || |||| ||| |||||    
T  96145 cataggagtaaccctcaaaaaaacatg 96119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 110141 - 109911
Alignment:
Q  27 gaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgc 126  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||  ||| ||    
T  110141 gaattacatgagagggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagc 110042  T
Q  127 cactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgact 226  Q
    ||| |||||||| || ||  ||||||| || | |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  110041 caccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgact 109942  T
Q  227 ctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||| ||| || || ||||| || |||||||    
T  109941 ctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaact 109911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 2208 - 2023
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  2208 acatcatctcttggaataacatgcgaagg-tccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtgtaaaac 2110  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcac 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2109 ccactctgtatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcac 2023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 49 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13561 - 13376
Alignment:
Q  49 tacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagat 148  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13561 tacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgtcactgttccaaccctctcagat 13462  T
Q  149 atctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaa 234  Q
    ||||| |||  |||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13461 atctgatacttaccaattaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaa 13376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 4)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 260271 - 260514
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  260271 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatatggtggcaaac 260370  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
      ||| | |||||||| |||| || |||||| || ||||| |||| |||||| || ||||||||||||||| | || || || |||||  ||||||||||    
T  260371 aaactctatatgccaccgttctaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgattttaaagcacgtcctacacccgt 260470  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| ||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||    
T  260471 catcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaact 260514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 279171 - 278930
Alignment:
Q  16 atcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccc 115  Q
    |||||| ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  279171 atcatcactctgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccc 279072  T
Q  116 actttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtca 215  Q
    |||   || ||||| |||||||| || || |||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||  |  | ||||| ||||    
T  279071 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggacctataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcttgtcccacaccagtca 278972  T
Q  216 taggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
     |||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||    
T  278971 caggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaact 278930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 165052 - 164809
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||  |||| ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||  |||    
T  165052 acatcatctctttgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacatatgaaacacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtgaac 164953  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    |||||   || ||||| |||||||  || || |||||||| |||| |||||||||  ||| |||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| ||    
T  164952 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 164853  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || | |||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||    
T  164852 cacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttgaaact 164809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 50 - 257
Target Start/End: Original strand, 308658 - 308865
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagata 149  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||  ||| ||||| |||||||| || ||  |||    
T  308658 acatactttcgaagttacgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaata 308757  T
Q  150 tctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctc 249  Q
    |||| |||| ||||||||| || || || |||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||    
T  308758 tctgatacggaccaataaactttggggttaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 308857  T
Q  250 ttgaaact 257  Q
    ||||||||    
T  308858 ttgaaact 308865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 25414 - 25173
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25414 acatcatcccttggaatcacatgtgatggatccgatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 25315  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||  || | ||||||||||| || ||||| |||||| | ||||| ||    
T  25314 ccactctatatgccactgttccaactctttccgatatctgatacgagccaataaacctcagcgtcaacttcttcgatttcaaagcacgaccaacacctgt 25215  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaa 255  Q
    || |||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||    
T  25214 cacaggagtgactcttagaaacacatggtctcctgcttgaaa 25173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 1844 - 1624
Alignment:
Q  37 cgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttcca 136  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||    
T  1844 cgaagaatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtgggaaaccaactctatatgccactgttcca 1745  T
Q  137 accctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaaca 236  Q
    ||||| || |||||||| |||| || ||| || || |||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||| |    
T  1744 accctttctgatatctgatacggactaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctccgaaata 1645  T
Q  237 catgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||||| || | |||||||    
T  1644 catgatcttccacctgaaact 1624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 6004 - 6229
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||   || ||||| |    
T  6004 acatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacaagaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccg 6103  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    | ||||| || || |||||||| ||||  ||||||||| | |||||||||||||| |||||||| || ||  | ||||| |||| ||| ||||||||||     
T  6104 tcccaactctttccgatatctgatacgggccaataaatcttggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggtgtgactctcaa 6203  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||    
T  6204 aaatacgtggtctccttcttgaaact 6229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 10426 - 10183
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10426 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatccggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 10327  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | |||||||| |||||||| || || ||  |||| || | |||||| || || |||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||    
T  10326 caactctatatgccacagttccaactctttctgaactctgatatggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 10227  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  10226 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaact 10183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 248576 - 248819
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  248576 acatcatcccttggaataacatgtgaaggatctgctacatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 248675  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | || |||||| |||||||  |||| || ||||| |||| |||||| || || |||||||||||| | |||||||| |||||  ||||||||||    
T  248676 caactctataagccacttttccaactttctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 248775  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  248776 cataggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaact 248819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 34017 - 33777
Alignment:
Q  17 tcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccca 116  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  34017 tcatccctaggaataatatgcgaaggatccggtacatacttccgcaactgcgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaaccca 33918  T
Q  117 ctttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcat 216  Q
    |  | || |||||||| || || |||||||||||||| || |  |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  ||||||| |||||    
T  33917 ccctataagccactgtcccgactctctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcat 33818  T
Q  217 aggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  33817 aggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaact 33777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 26224 - 26467
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26224 acatcatcccttggaatcacatgcgaaagatccgccacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 26323  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    |  || | || ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| ||| || || || |||||||||||| | |||||||| |||||  | ||||||||    
T  26324 cagctctataagccactgttcccaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgt 26423  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  26424 caaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaact 26467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 29112 - 28869
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||  |||    
T  29112 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatctgctacatacttctgaagttgcgacacatgaagcacatcatgcaaattcgagagatgtgatgggtaac 29013  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || | |||||||||    |||||||||||||| |||||||| ||||||   ||||| ||    
T  29012 ccactctatatgccactgtcccaactctctcagagatctgatatggaccaataaaccgtggagtcaacttctttgacttcaaagcacgacagacacctgt 28913  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || | |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  28912 cacatgagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaact 28869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 41103 - 40860
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||  |||    
T  41103 acatcatctcttggaataacatgcgaaggatctgctacatacttctgaagttgcgacacatgaagcacatcatgcaaattcgagagatgtgatgggtaac 41004  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || | |||||||||    |||||||||||||| |||||||| ||||||   ||||| ||    
T  41003 ccactctatatgccactgtcccaactctctcagagatctgatatggaccaataaaccgtggagtcaacttctttgacttcaaagcacgacagacacctgt 40904  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || | |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  40903 cacatgagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaact 40860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 114; Significance: 7e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 7577 - 7338
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  7577 acatcatctcttggaataacatgcgaag--tccgctacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaatatgtggtggcaaac 7480  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | |||||||||||||||||| |||  || ||||| |||| |||||| || || |||||||||||| | |||||||| |||||  |||||||| |    
T  7479 caactctatatgccactgttccaaccttct--gaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccat 7382  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||| ||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  7381 catagaagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaact 7338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 17056 - 16813
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17056 acatcatcccttggaatcacatgtgaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaac 16957  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||| |||||| || || |||||||||||  | |||||||| |||||| | ||||||||    
T  16956 caactctatatgccactgttccaactctctctgaaatctaatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccgacacccgt 16857  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  16856 caaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaact 16813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 39229 - 38989
Alignment:
Q  15 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 114  Q
    ||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  39229 catcatccctctgaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacttcgtgcaagttctaaagatgtggtggcaaacc 39130  T
Q  115 cactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtc 214  Q
     ||| | |||||||||| |||||| ||||| || ||||| |||| ||| || || || |||||||||||| | |||||||| |||||| | |||||||||    
T  39129 aactctatatgccactgctccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgaccgacacccgtc 39030  T
Q  215 ataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaa 255  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  39029 aaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaa 38989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 50854 - 50614
Alignment:
Q  17 tcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccca 116  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  50854 tcatccctaggaataatatgcgaaggatccggtacatacttccgcaactacgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaaccca 50755  T
Q  117 ctttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcat 216  Q
    |  | || |||||||| || || |||||||||||||| || |  |||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||  ||||||| |||||    
T  50754 ccctataagccactgtcccgactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcat 50655  T
Q  217 aggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  50654 aggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaact 50614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 43135 - 43360
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||| |    
T  43135 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcagtatgccaccg 43234  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  43235 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgccctacaccagtcataggagtgactctcaa 43334  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| || || ||||| || |||||||    
T  43335 aaatacgtggtctccttcctgaaact 43360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 41 - 230
Target Start/End: Original strand, 8475 - 8664
Alignment:
Q  41 ggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccc 140  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| |||||  ||||||| |    
T  8475 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaaacccactcggtaagccacccttccaactc 8574  T
Q  141 tctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctca 230  Q
    | ||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  8575 tttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtgactctca 8664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 41 - 257
Target Start/End: Original strand, 3130 - 3346
Alignment:
Q  41 ggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccc 140  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   || ||||| |||||||  |    
T  3130 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattc 3229  T
Q  141 tctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatg 240  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||| || ||  | ||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  3230 tttcaaatatctgatacgaaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatg 3329  T
Q  241 atctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| ||||||||||    
T  3330 atctccttcttgaaact 3346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 210
Target Start/End: Original strand, 136082 - 136278
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  136082 acatcatctctcgggataacatccgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaac 136181  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacc 210  Q
    | ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| || || |||||||||||| | |||||||| |||||  |||||||    
T  136182 caactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacc 136278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 50 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 567 - 360
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagata 149  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||   || |||||  |||||| ||| || ||||    
T  567 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccattccaatcctttctgata 468  T
Q  150 tctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctc 249  Q
    |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||| || | |||| ||||||||| ||||||||| || || ||    
T  467 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtccaacaccggttacaggattgactctcaaaaacacatggtccccttc 368  T
Q  250 ttgaaact 257  Q
    ||||||||    
T  367 ttgaaact 360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 154 - 397
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  154 acatcatctcttgaaataacatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggaggcaaac 253  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | ||| | |||||||| |||||||| || || || ||||| |||| |||||| || || |||||||| |||||  |||||||||||||  ||| ||||||    
T  254 caactctatatgccacagttccaactctttctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaagttcttcaacttcaacgcacgtcctatacccgt 353  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||    
T  354 cataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccctcctgaaact 397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 3995 - 4238
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||  | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  3995 acatcatctctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacaaatcatgcaaattcgaaagatgcggtagtaaac 4094  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||||  || ||||| ||||||| ||| || |||||||| || | |||||||||  |||||||||||||||| |||||||| || ||  | ||||| ||    
T  4095 ccacttgatacgccaccgttccaatcctttctgatatctgatatggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagt 4194  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||    
T  4195 cacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttaaaact 4238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 307 - 82
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||   || ||||| |    
T  307 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaactcactcgatacgccaccg 208  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || || |||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| |||| | |||||||||| |     
T  207 ttccaacactttccgatatctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctaaa 108  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  107 aaatacatgatctccttcttgaaact 82  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 255
Target Start/End: Original strand, 27930 - 28171
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27930 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 28029  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | |||   || |||||||||||||| || || |||||||| |||| |||||||||| | ||| |||||||||| |||||||  |||||  | ||||| ||    
T  28030 caactcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctaggattcaacttctttgacttcacagcacgtccaacaccagt 28129  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaa 255  Q
    ||  ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  28130 caccggagtaactctcaaaaacacatgatcaccctcttgaaa 28171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 33077 - 32852
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||| |    
T  33077 acatgagatggatccgtaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccg 32978  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || || |||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||| ||| |  | ||||| |||| | ||||||||||||     
T  32977 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttaacttcaatgcaagtccaacaccagtcacaagagtgactctcaa 32878  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| || |||||||| |||| |||||    
T  32877 aaatacgtgatctccttcttaaaact 32852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 3611 - 3483
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3611 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagtagcgacacatgatacacatcatgcaagttcgaaagatgaggtggcaaac 3512  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctc 142  Q
    | ||| | |||||||||||||||||||||    
T  3511 caactctatatgccactgttccaaccctc 3483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 149
Target Start/End: Original strand, 45807 - 45943
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatg-cgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaa 112  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  45807 acatcatctcttgaaataacatggcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaatgatgtggtggaaaa 45906  T
Q  113 cccactttgtatgccactgttccaaccctctcagata 149  Q
    || ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45907 ccaactctatatgccactgttccaaccctctctgata 45943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 657 - 882
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||    || |||||      
T  657 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaagccaacacgatacgccacca 756  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    |||||||||| || |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| |||| ||||||||||||||     
T  757 ttccaaccctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 856  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||    
T  857 aaatacgtggtctccttcttgaaact 882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 65386 - 65611
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||   || ||||| |    
T  65386 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgataagccaccg 65485  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || || |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  | || || |||| ||||||||||||||     
T  65486 ttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacgccagtcacaggagtgactctcaa 65585  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||    
T  65586 aaacacgtggtctccttcttgaaact 65611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 40132 - 39924
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  40132 acatcatcactctggatcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaagacatcatgcaagttcgaaagatgcggtggtaatc 40033  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | |||   || ||||| |||||||| || ||  ||||| | |||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||  | ||||| ||    
T  40032 caactcaatacgccaccgttccaactctttcccatatccgatacggaccaataaatctcggagtcaaattctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 39933  T
Q  214 cataggagt 222  Q
    || ||||||    
T  39932 cacaggagt 39924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 127524 - 127299
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||   || |||||      
T  127524 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgtaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccacca 127425  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || || |||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| |||| | ||||||||||||     
T  127424 ttccaactctttctgatatctgatacggatcaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 127325  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||    
T  127324 aaacacgtgatctccttcttggaact 127299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 50 - 257
Target Start/End: Original strand, 16986 - 17193
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagata 149  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  || ||||| |||||||  || || ||||    
T  16986 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccacttgatacgccaccgttccaattctttctgata 17085  T
Q  150 tctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctc 249  Q
    |||| |||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||   ||| | |||||||||||| ||| || |||||||| ||    
T  17086 tctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacacaaatcacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttc 17185  T
Q  250 ttgaaact 257  Q
    ||||||||    
T  17186 ttgaaact 17193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 14840 - 15083
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  14840 acatcatctctctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgcggtggtaagc 14939  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    |||||  ||| ||||| |||||||  || || ||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||| || |||||||| || ||  | ||||| ||    
T  14940 ccactcggtacgccaccgttccaattctttctgatatttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttatttgacttcaatgcgcgtccaacaccagt 15039  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || |||||||||| ||| ||| ||||||||||| || |||||||    
T  15040 cacaggagtgactatcaaaaatacatgatctccttcatgaaact 15083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 219760 - 219517
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||  | || ||||| || ||||| |  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || |    
T  219760 acatcatctctttggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtgttaatc 219661  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    ||||||  || ||||| |||||||  || || |||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| ||    
T  219660 ccacttgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaacgcacgtccaacaccagt 219561  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || |||||||||||||| ||| || |||||| | ||||||||||    
T  219560 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatcttcttcttgaaact 219517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 32 - 255
Target Start/End: Original strand, 229024 - 229247
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||| || || | |  ||| ||||| |    
T  229024 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcgtgcatattcgaaagatgcggtggtaaccctattcggtacgccaccg 229123  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || || |||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| || ||||||||||||||||     
T  229124 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaacaaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtcccacaccagtaataggagtgactctcaa 229223  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaa 255  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||    
T  229224 aaatacatgatctccttcttgaaa 229247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 33179 - 33095
Alignment:
Q  173 ggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |||| |||  | || |||| |||||||||||| ||  |||||||||    
T  33179 ggagtcaacttcttacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggtttcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaact 33095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1508 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold1508
Description:

Target: scaffold1508; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 977 - 880
Alignment:
Q  17 tcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  977 tcatctctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 1120 - 1345
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||  ||| ||||| |    
T  1120 acatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcaacacataaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccg 1219  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || || |||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||    ||||| |||| |||||||||||| |     
T  1220 ttccaactctttccgatatctgatacggaacaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtcgaacaccagtcacaggagtgactctaaa 1319  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||    
T  1320 aaatacgtggtctccttcttgaaact 1345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 255
Target Start/End: Original strand, 377 - 618
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||| || ||| |||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  |||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  377 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaac 476  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    |||||  ||| |||||||||||||| || ||  ||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||    
T  477 ccactcggtaagccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaatttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 576  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaa 255  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||| || |||||    
T  577 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaa 618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 130
Target Start/End: Original strand, 9182 - 9298
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  9182 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacatatgaaccacatcatgcaaattcgaaagatatggtggcaatc 9281  T
Q  114 ccactttgtatgccact 130  Q
    ||||| |||||||||||    
T  9282 ccactctgtatgccact 9298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 50 - 257
Target Start/End: Original strand, 1 - 208
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagata 149  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||   ||||||||| ||||||| || || ||||    
T  1 acatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgaaaatttgaaagatgcggtggtaaaccaactcgatatgccactattccaactctttccgata 100  T
Q  150 tctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctc 249  Q
    |||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||| |||||  | ||||| ||||  ||| ||||||||| |||||||||||  |||||    
T  101 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaactttttttacttcaaagcacgtccaacaccagtcaccggattgactctcaaaaacacatgataaccctc 200  T
Q  250 ttgaaact 257  Q
    ||||||||    
T  201 ttgaaact 208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 5977 - 6220
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || |    
T  5977 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagctgcggtggtaatc 6076  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | |||   || |||||  ||||||| || ||  ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||    ||||| ||    
T  6077 caactcgatacgccaccattccaactctttctaatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtcaaacaccagt 6176  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || |||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||    
T  6177 cacaggagtgactcttaaaaacacgtggtctccctcttgaaact 6220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15422 - 15179
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| || || ||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  15422 acatcatctcttgggatgacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 15323  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    |||||   || ||||| |||||||  || || |||||||| |||  |||||| ||  |  ||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| ||    
T  15322 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacagaccaattaaccttagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 15223  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || | |||||||||||| | | ||||||||||| || |||||||    
T  15222 cacatgagtgactctcaaagatacatgatctccttcctgaaact 15179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 7358 - 7583
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||   || ||||| |    
T  7358 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaaacccactcgctaagccaccg 7457  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| |||||  ||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  7458 ttccaactctctccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 7557  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| || || ||||| || |||||||    
T  7558 aaatacgtggtctccttcctgaaact 7583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 15474 - 15698
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||   |||||||| |    
T  15474 acatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacccatgaaacacatcgtgcaaattcgaaa-atgtggtggtaaacctactcgatatgccaccg 15572  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| |||| | || ||||| |||     
T  15573 ttccaactctttccgatatctgatacgaaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagaatgactgtcaa 15672  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||    
T  15673 aaatacgtggtctccttcttgaaact 15698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 180198 - 180423
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||   || |||||||    
T  180198 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacttgaaagacatcatgaaaattcgaaagatgcggtggtaagccaactcgatacgccactg 180297  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||| ||| || || |||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |  | ||||| ||||  ||||| |||||||     
T  180298 ttctaactctttctgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcaggtccaacaccagtcaccggagtaactctcaa 180397  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  180398 aaacacatgatcaccctcttgaaact 180423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 41 - 236
Target Start/End: Original strand, 16947 - 17142
Alignment:
Q  41 ggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccc 140  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||   || ||||| |||  ||| |    
T  16947 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaactcaatacgccaccgttaaaactc 17046  T
Q  141 tctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaaca 236  Q
    | || |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| |||| | |||||||||||| |||||    
T  17047 tttccgatatctgatacgaacaaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaaca 17142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 19081 - 18991
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19081 acatcatctctcggaataacatgcgagggatctgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtg 18991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 65 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 4717 - 4581
Alignment:
Q  65 tgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaa 164  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||   || ||||| |||||||  || || |||| ||| |||| |||||    
T  4717 tgcgacagatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcgatggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttccgatacctgatacggaccaa 4618  T
Q  165 taaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacg 201  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  4617 taaatctcggagtaaacttctttgacttcaatgcacg 4581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 37062 - 37003
Alignment:
Q  41 ggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaaga 100  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  37062 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgtaaga 37003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 6353 - 6578
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||||   ||| ||||      
T  6353 acatgggatggatccagtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcgtgcaaattcgaaagatgcggtgttaatcccactcgatataccacca 6452  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    | ||||| || ||  ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| |||| | ||||||||||||     
T  6453 tcccaactctttccaatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 6552  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||    
T  6553 aaacacgtggtctccttcttgaaact 6578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 231
Target Start/End: Original strand, 6146 - 6363
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  6146 acataatctcttggaataacatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagaagagatggcaaac 6245  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | | | | |||||||| |||||||  || || || ||||| || | |||||| || || |||||||||||| | |||||||| |||||  ||||||||||    
T  6246 caaatctatatgccacagttccaaatctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 6345  T
Q  214 cataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||||| || |||||    
T  6346 cataggagtaaccctcag 6363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 1018 - 794
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||    || ||||| |    
T  1018 acatgggatggatccggtacatacttccgaagttgctccacatgaaacacatcctgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccacacgatacgccaccg 919  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || |  |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| |||| | ||| ||||||||     
T  918 ttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacacgagggactctca- 820  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||    
T  819 aaacacgtggtctccttcttgaaact 794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 601 - 826
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| |    
T  601 acatgagatggatccgaaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccacttggtaagccaccg 700  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || ||  |||| || || | |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  701 ttccaactctttccaatatttgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 800  T
Q  232 aaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||    
T  801 aaacacgtggtctccttcttgaaact 826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 237
Target Start/End: Original strand, 14341 - 14546
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 131  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||    || ||||| |    
T  14341 acatgagatggatccggaacatacttccgaagtttcgacacatggaagacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccacccgatacgccaccg 14440  T
Q  132 ttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcag 231  Q
    ||||||| || || |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| |||| ||||||||||||||     
T  14441 ttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 14540  T
Q  232 aaacac 237  Q
    ||||||    
T  14541 aaacac 14546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 50 - 257
Target Start/End: Original strand, 9342 - 9549
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagata 149  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||| |||||||| || || ||||    
T  9342 acatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatagtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgata 9441  T
Q  150 tctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctc 249  Q
    |||| |||  |||||||||| | ||||||| |||||| |||||||| || ||  | ||||| |||| ||||||||||||||  || || || ||||| ||    
T  9442 tctgatacagaccaataaatctaggagtcaccttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaacaatacgtggtctccttc 9541  T
Q  250 ttgaaact 257  Q
    ||||||||    
T  9542 ttgaaact 9549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 33916 - 33673
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||| | || |    
T  33916 acatcatcactctggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtagtaatc 33817  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    |||||   || |||||||||||||| || |  |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| ||    
T  33816 ccactcgatacgccactgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 33717  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || | |||||||| |||  ||||| || ||||| || |||||||    
T  33716 cacatgagtgactttcaataacacgtggtctccttcctgaaact 33673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 50 - 257
Target Start/End: Original strand, 8595 - 8802
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagata 149  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||   || |||||||||||||| || |  ||||    
T  8595 acatacttccaaagttgcgacacatggaaaacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccactgttccaactcttttcgata 8694  T
Q  150 tctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctc 249  Q
    |||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||  | ||||| |||| | |||||||| |||  ||||| || ||||| ||    
T  8695 tctgatacggaccaataaatctcggagttaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaagagtgactttcaataacacgtggtctccttc 8794  T
Q  250 ttgaaact 257  Q
    ||||||||    
T  8795 ttgaaact 8802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 64374 - 64131
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |    
T  64374 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 64275  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    |||||   || ||||| |||||||| || || |||||||| |||| |||||| ||| ||  |||||||||||| |||||||| |||||  | || || |     
T  64274 ccactcgatacgccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaatgaatctcacagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaactccagc 64175  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || |||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||    
T  64174 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaact 64131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 50 - 251
Target Start/End: Original strand, 1004 - 1205
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagata 149  Q
    |||||||| ||||| ||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||  |||||||| || || ||||    
T  1004 acatactttcgaagttgcgttacatgaaagacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaacgttccaactctttccgata 1103  T
Q  150 tctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctc 249  Q
    || | |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| |||| ||| ||||||||||  || ||||||||||| ||    
T  1104 tccgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggggtgactctcaagaatacatgatctccttc 1203  T
Q  250 tt 251  Q
    ||    
T  1204 tt 1205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 5933 - 5690
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || |||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5933 acatcatcccttggaatcacatgagatggatccggaacatacttccgatgttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaac 5834  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
     |||| | || || ||||| ||||| || |  || || || ||||||||| ||||  |||||| ||  ||||| ||||| |  || ||  | ||||| ||    
T  5833 tcactctatacgcaactgtcccaactctttatgaaatatgatacgaaccattaaacctcggagacagtttcttcgactttagtgctcgtccaacaccggt 5734  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || |||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  5733 cacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttcttgaaact 5690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 52 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 13282 - 13079
Alignment:
Q  52 atacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatc 151  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||   || || ||  |||| |  || || ||||||    
T  13282 atacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgtaaattcaaaagttgtggtggtaaacccactccatacgctaccattcccattctttctgatatc 13183  T
Q  152 tggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctctt 251  Q
    || ||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||  | ||||| |||| ||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||    
T  13182 tgatacgaactaataaatctcgaagtcaatttcttagacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaataacacatggtctccttctt 13083  T
Q  252 gaaa 255  Q
    ||||    
T  13082 gaaa 13079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 173 - 257
Target Start/End: Original strand, 1916 - 2000
Alignment:
Q  173 ggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1916 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 2000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 257
Target Start/End: Original strand, 883 - 1114
Alignment:
Q  26 ggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatg 125  Q
    ||||| ||||| || |||||||  |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |   ||||    
T  883 ggaatcacatgagatggatccgaaacatacttccaaagttgcgacacgtgaaacacatcatgcatattcgaaagatgcggtggtaaacccaatcgatatg 982  T
Q  126 ccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgac 225  Q
    ||||||||||||  || || |||||||| || | |||||||||  ||||| |||| |||||  | ||||| |||||  | ||||| |||| |||||||||    
T  983 ccactgttccaattctttctgatatctgatatggaccaataaacctcggattcaatttctttcatttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 1082  T
Q  226 tctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||| | ||| ||||| ||||| || |||||||    
T  1083 tctaaaaaatacatggtctccttcctgaaact 1114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 50 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 4712 - 4505
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagata 149  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||   || |||||||||||||| || |  ||||    
T  4712 acatacttccaaagttgcgacacatggaaaacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccactgttccaactcttttcgata 4613  T
Q  150 tctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctc 249  Q
    |||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||  | ||||| |||| | |||||||| |||  ||||| || ||||| ||    
T  4612 tctgatacggaccaataaatctcggagttaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaagagtgactttcaataacacgtggtctccttc 4513  T
Q  250 ttgaaact 257  Q
    ||||||||    
T  4512 ttgaaact 4505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 26062 - 25819
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || |||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26062 acatcatcccttggaatcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 25963  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    |||||   || ||||| |||||||  || || |||||||| |||| |||||||||  || |||| |  ||| | |||||||| |||||  | || || ||    
T  25962 ccactcgatacgccacggttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacatccgagttagtttccttgacttcaatgcacgtccaaccccagt 25863  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||| | ||| || |||||||    
T  25862 cataggagtgactctaaaaaatacatggtttccttcctgaaact 25819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 65 - 195
Target Start/End: Original strand, 49507 - 49637
Alignment:
Q  65 tgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaa 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||||  ||||    
T  49507 tgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgggccaa 49606  T
Q  165 taaatttcggagtcaacttcttagacttcaa 195  Q
    ||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  49607 taaatctaggagtcaacttctttgacttcaa 49637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16759 - 16518
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||  | || ||||| || ||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16759 acatcatctctttggatcacatgagatggatcccgaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtacaaattcgaaagatgcggtggtaaac 16660  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | || |  || |||||  ||||||  || || |||||||  |||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||  | |||||  |    
T  16659 ctacatgatacgccaccattccaattctttctgatatcttatacggaccaataaatctcggtgtcaacttcttcgacttcaatgcacgtccaacaccaat 16560  T
Q  214 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaa 255  Q
    ||  |||||||| || | ||| ||||||||||| ||||||||    
T  16559 cactggagtgaccctaaaaaatacatgatctccttcttgaaa 16518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 182 - 257
Target Start/End: Original strand, 1 - 76
Alignment:
Q  182 ttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 ttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 76  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 6918 - 7145
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaaga-tgtggtggcaaacccactttgtatgccact 130  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||| || || || |||||||||  ||| |||||     
T  6918 acatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagaatgcggcggtaaacccactcggtaagccacc 7017  T
Q  131 gttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctc- 229  Q
    |||||||| || ||  ||||||| || | |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||     
T  7018 gttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctca 7117  T
Q  230 agaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    | |||||| || ||||| ||||||||||    
T  7118 aaaaacacgtggtctccttcttgaaact 7145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 71 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16751 - 16565
Alignment:
Q  71 acatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatt 170  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||   || ||||| |||||||| || |  |||||||| |||| |||| ||||      
T  16751 acatggaacatatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaactcttttcgatatctgatacggaccagtaaacc 16652  T
Q  171 tcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    || ||||||||||||| |||||||| |  ||  | ||||| |||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  16651 tctgagtcaacttctttgacttcaatgtgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatctccctcttgaaact 16565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 50 - 230
Target Start/End: Original strand, 5220 - 5400
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagata 149  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| || ||||||   || ||||| |||||||| || || ||||    
T  5220 acataattacgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcagtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttctgata 5319  T
Q  150 tctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctca 230  Q
    |||| |||  |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||| || ||  | ||||| |||| ||||||||||||||    
T  5320 tctgatacagaccaataaatctcggagtcgacttccttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctca 5400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 50 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 117212 - 117061
Alignment:
Q  50 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagata 149  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||   || ||||| ||| |||  || || ||||    
T  117212 acatacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaatatacggtggtaaacccactcgatacgccaccgttacaattctttctgata 117113  T
Q  150 tctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacg 201  Q
    | || |||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  117112 tttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacg 117061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 125 - 257
Target Start/End: Original strand, 21941 - 22073
Alignment:
Q  125 gccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtga 224  Q
    ||||| |||||||| || || |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| |||  ||||||||    
T  21941 gccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcgcaggagtga 22040  T
Q  225 ctctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||    
T  22041 ctctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaact 22073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 146 - 257
Target Start/End: Original strand, 9065 - 9176
Alignment:
Q  146 gatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctc 245  Q
    |||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  9065 gatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaacgcacgtccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatccc 9164  T
Q  246 cctcttgaaact 257  Q
    | ||||||||||    
T  9165 cttcttgaaact 9176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 118
Target Start/End: Original strand, 6940 - 7044
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||  | || ||||| || |||||||  |||||||| | ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  6940 acatcatctctttggatcacatgagatggatccggaacatactttctaagttgtgacacttgaaacacatcatgcaaattcgaaacatgcggtggcaaac 7039  T
Q  114 ccact 118  Q
    |||||    
T  7040 ccact 7044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 1165 - 949
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||  |||| || |    
T  1165 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgtaatacatcatgcaatttcgaaagttgctgtggtaatc 1066  T
Q  114 ccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgt 213  Q
    | |||   ||| ||||  ||||| |  | ||  ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||  | ||||| ||    
T  1065 caactcgatattccacctttccatctttttcttatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 966  T
Q  214 cataggagtgactctca 230  Q
    || ||||||||||||||    
T  965 cacaggagtgactctca 949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 108
Target Start/End: Original strand, 6254 - 6330
Alignment:
Q  32 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtgg 108  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  6254 acatgggatggatccggtacatacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtgg 6330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 257
Target Start/End: Original strand, 7864 - 7996
Alignment:
Q  125 gccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtga 224  Q
    ||||| |||||||| || || |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| ||||  | |||||    
T  7864 gccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccggtcaccgaagtga 7963  T
Q  225 ctctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||| |||||| || ||||| || |||||||    
T  7964 ctctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaact 7996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 149 - 257
Target Start/End: Original strand, 5311 - 5419
Alignment:
Q  149 atctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccct 248  Q
    ||||| |||| |||||| || ||||||||||||||| | || ||||| |||||  ||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  5311 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccct 5410  T
Q  249 cttgaaact 257  Q
    | |||||||    
T  5411 cctgaaact 5419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 58
Target Start/End: Original strand, 10787 - 10831
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttc 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10787 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttc 10831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 257
Target Start/End: Original strand, 10843 - 10975
Alignment:
Q  125 gccactgttccaaccctctcagatatctggtacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtga 224  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||| |||| ||| || || || |||||||||||| | |||||||| |||||  ||||||  ||||||| ||| |    
T  10843 gccactgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacatgtcatagaagtaa 10942  T
Q  225 ctctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    | || |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  10943 ccctaagaaacacatgatcaccctcctgaaact 10975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 86847 - 86743
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    |||||||||||  |||| ||||| || ||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |  |||||||| || ||||| ||||    
T  86847 acatcatctcttagaatcacatgagatggatctgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaggttcgaaagttgcggtggtaaac 86748  T
Q  114 ccact 118  Q
    |||||    
T  86747 ccact 86743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 257
Target Start/End: Original strand, 7522 - 7603
Alignment:
Q  176 gtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||| || || ||||| || |||||||    
T  7522 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaact 7603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 137
Target Start/End: Original strand, 8771 - 8816
Alignment:
Q  92 ttcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaa 137  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  8771 ttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaa 8816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 982 - 909
Alignment:
Q  155 tacgaaccaataaatttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactct 228  Q
    |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||  |||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  982 tacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcagtgcacgtcctacaccagtcataggagtgactct 909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0720 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0720
Description:

Target: scaffold0720; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 62 - 1
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatg 75  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||| | |  |||||||||||    
T  62 acatcatctcttggaataacacgcgaaggatctggtacatacttctgcaattgcgacacatg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 1094 - 1010
Alignment:
Q  173 ggagtcaacttcttagacttcaacgcacgagctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaact 257  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||| | ||||| |||| |||| | || |||| |||||||||||| ||  |||||||||    
T  1094 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaact 1010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 17533 - 17429
Alignment:
Q  14 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 113  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |  | |||||  ||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||| ||||    
T  17533 acatcatctcttggaattacatgagttgaatccgaaacacacttcggaagttatgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaacatgcgatggtaaac 17434  T
Q  114 ccact 118  Q
    |||||    
T  17433 ccact 17429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University