View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6807_high_2 (Length: 490)

Name: NF6807_high_2
Description: NF6807
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6807_high_2
NF6807_high_2
[»] chr5 (17 HSPs)
chr5 (21-477)||(17266216-17266672)
chr5 (205-474)||(21870163-21870432)
chr5 (205-474)||(21874443-21874712)
chr5 (32-477)||(23563050-23563495)
chr5 (25-449)||(23077815-23078239)
chr5 (25-399)||(22505713-22506087)
chr5 (25-399)||(25851106-25851480)
chr5 (25-405)||(20345316-20345696)
chr5 (159-477)||(14883873-14884191)
chr5 (205-477)||(18782346-18782618)
chr5 (215-358)||(21883017-21883160)
chr5 (215-282)||(23526293-23526360)
chr5 (311-477)||(27521741-27521907)
chr5 (161-471)||(20803785-20804095)
chr5 (318-477)||(27682285-27682444)
chr5 (205-399)||(21410366-21410560)
chr5 (25-105)||(20824487-20824567)
[»] chr2 (22 HSPs)
chr2 (21-477)||(12577100-12577556)
chr2 (17-449)||(19716285-19716717)
chr2 (17-449)||(19720848-19721280)
chr2 (25-449)||(23097286-23097710)
chr2 (33-435)||(23274352-23274754)
chr2 (25-477)||(20848340-20848789)
chr2 (205-477)||(23116299-23116571)
chr2 (69-273)||(24704926-24705130)
chr2 (206-343)||(28350807-28350944)
chr2 (205-273)||(22462925-22462993)
chr2 (215-414)||(22742269-22742468)
chr2 (318-477)||(10871891-10872050)
chr2 (159-477)||(24656898-24657216)
chr2 (98-268)||(11351160-11351330)
chr2 (215-261)||(21320459-21320505)
chr2 (205-291)||(23205245-23205331)
chr2 (205-291)||(23676849-23676935)
chr2 (215-282)||(23028897-23028963)
chr2 (215-273)||(24678428-24678486)
chr2 (24-52)||(23105393-23105421)
chr2 (318-414)||(24265411-24265507)
chr2 (203-339)||(24817218-24817354)
[»] chr3 (39 HSPs)
chr3 (21-476)||(13944769-13945224)
chr3 (21-477)||(8744318-8744774)
chr3 (53-477)||(16384300-16384724)
chr3 (25-477)||(16831456-16831908)
chr3 (32-472)||(17189130-17189570)
chr3 (32-438)||(31941659-31942065)
chr3 (32-449)||(12357483-12357900)
chr3 (25-474)||(24190053-24190501)
chr3 (32-438)||(31692152-31692558)
chr3 (104-474)||(14290463-14290833)
chr3 (167-477)||(18131275-18131585)
chr3 (101-456)||(12857445-12857800)
chr3 (36-474)||(35982941-35983379)
chr3 (173-474)||(16825210-16825511)
chr3 (32-438)||(12181100-12181506)
chr3 (25-399)||(47126693-47127067)
chr3 (25-477)||(10408717-10409169)
chr3 (25-399)||(28757068-28757442)
chr3 (167-449)||(11958137-11958419)
chr3 (32-435)||(17494403-17494809)
chr3 (32-223)||(11949107-11949298)
chr3 (25-399)||(16326713-16327089)
chr3 (161-471)||(11861228-11861538)
chr3 (205-477)||(23414729-23415001)
chr3 (205-471)||(15065990-15066256)
chr3 (205-477)||(16695083-16695355)
chr3 (204-416)||(15230531-15230743)
chr3 (204-416)||(15236399-15236611)
chr3 (212-330)||(12843189-12843307)
chr3 (101-294)||(13317680-13317873)
chr3 (205-477)||(16803886-16804158)
chr3 (205-282)||(23079151-23079228)
chr3 (365-449)||(2245628-2245712)
chr3 (25-225)||(10417225-10417425)
chr3 (215-282)||(14873719-14873786)
chr3 (300-477)||(3688954-3689131)
chr3 (212-273)||(17497617-17497678)
chr3 (141-273)||(12501788-12501920)
chr3 (25-76)||(13317863-13317914)
[»] chr7 (31 HSPs)
chr7 (21-477)||(18050640-18051096)
chr7 (129-477)||(14144875-14145223)
chr7 (25-477)||(14283061-14283513)
chr7 (25-474)||(11385119-11385568)
chr7 (65-403)||(15099364-15099702)
chr7 (65-390)||(12712437-12712762)
chr7 (32-474)||(12798194-12798633)
chr7 (25-449)||(16947187-16947611)
chr7 (32-477)||(13676568-13677007)
chr7 (32-402)||(19150128-19150498)
chr7 (32-402)||(20749527-20749897)
chr7 (68-474)||(12459781-12460187)
chr7 (212-474)||(14260936-14261198)
chr7 (25-449)||(13024454-13024878)
chr7 (25-155)||(14140789-14140919)
chr7 (32-477)||(26115277-26115722)
chr7 (25-399)||(26091563-26091937)
chr7 (25-399)||(40924582-40924956)
chr7 (25-399)||(49155411-49155785)
chr7 (25-399)||(13965433-13965807)
chr7 (25-399)||(21755522-21755896)
chr7 (205-471)||(9591653-9591919)
chr7 (205-477)||(17703164-17703436)
chr7 (205-477)||(16726150-16726422)
chr7 (284-390)||(13004834-13004940)
chr7 (320-477)||(11233925-11234082)
chr7 (212-357)||(15145752-15145897)
chr7 (204-416)||(12203548-12203760)
chr7 (318-477)||(15157769-15157928)
chr7 (212-330)||(14042991-14043109)
chr7 (212-330)||(14353021-14353139)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (21-477)||(53750170-53750626)
chr4 (21-477)||(51603492-51603948)
chr4 (32-438)||(16150763-16151169)
chr4 (32-438)||(16154909-16155315)
chr4 (101-467)||(15073555-15073921)
chr4 (32-393)||(14993151-14993512)
chr4 (65-438)||(15266936-15267309)
chr4 (25-399)||(20893151-20893525)
chr4 (94-438)||(18259630-18259974)
chr4 (32-399)||(11204010-11204377)
chr4 (25-477)||(29450237-29450689)
chr4 (25-399)||(3261572-3261946)
chr4 (25-416)||(7357387-7357778)
chr4 (25-477)||(44658566-44659018)
chr4 (25-294)||(27903505-27903774)
chr4 (205-471)||(13513650-13513916)
chr4 (205-477)||(18604259-18604531)
chr4 (205-476)||(18223914-18224185)
chr4 (212-402)||(14697408-14697598)
chr4 (205-471)||(16248122-16248388)
chr4 (212-405)||(8343-8536)
chr4 (212-405)||(15548-15741)
chr4 (212-327)||(16219495-16219610)
chr4 (212-327)||(16222815-16222930)
chr4 (300-414)||(8389804-8389918)
[»] scaffold0765 (1 HSPs)
scaffold0765 (25-474)||(5963-6412)
[»] chr8 (22 HSPs)
chr8 (25-474)||(22054049-22054498)
chr8 (25-477)||(22027423-22027875)
chr8 (25-477)||(16268367-16268819)
chr8 (104-474)||(21928693-21929063)
chr8 (101-435)||(22374131-22374465)
chr8 (33-449)||(31413703-31414119)
chr8 (104-435)||(19985445-19985776)
chr8 (25-416)||(28984097-28984488)
chr8 (25-449)||(29300597-29301021)
chr8 (212-404)||(22523883-22524075)
chr8 (205-411)||(30310353-30310559)
chr8 (205-477)||(15536749-15537021)
chr8 (205-477)||(22043193-22043465)
chr8 (205-477)||(32603511-32603783)
chr8 (215-273)||(21163877-21163935)
chr8 (212-282)||(21391199-21391269)
chr8 (212-282)||(21780525-21780595)
chr8 (65-240)||(6606849-6607024)
chr8 (300-360)||(19481335-19481395)
chr8 (25-80)||(28989316-28989371)
chr8 (320-477)||(18860055-18860212)
chr8 (365-402)||(20391612-20391649)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (25-474)||(203530-203979)
scaffold0003 (318-477)||(424750-424909)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (25-474)||(263375-263824)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (16-477)||(9491-9951)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (25-477)||(17187-17639)
scaffold0348 (37-462)||(4567-4992)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (25-477)||(40207-40659)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (25-477)||(64305-64757)
scaffold0067 (25-477)||(48883-49335)
scaffold0067 (25-477)||(57917-58369)
scaffold0067 (26-438)||(29774-30186)
[»] scaffold1914 (1 HSPs)
scaffold1914 (164-474)||(936-1246)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (25-449)||(218-642)
scaffold0222 (32-393)||(20970-21331)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (25-477)||(53126-53578)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (25-477)||(22271-22723)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (134-477)||(11609-11952)
scaffold0034 (32-449)||(1683-2100)
scaffold0034 (25-294)||(70521-70790)
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (17-477)||(18797666-18798126)
chr6 (25-435)||(21566878-21567288)
chr6 (17-438)||(14376800-14377221)
chr6 (32-435)||(19437993-19438396)
chr6 (65-393)||(24515343-24515671)
chr6 (32-390)||(34642517-34642876)
chr6 (216-467)||(25771019-25771270)
chr6 (68-474)||(10465696-10466102)
chr6 (84-348)||(21474643-21474907)
chr6 (25-399)||(24367384-24367758)
chr6 (176-390)||(19456158-19456372)
chr6 (176-390)||(19466303-19466517)
chr6 (25-477)||(15462320-15462772)
chr6 (205-471)||(21764976-21765242)
chr6 (212-306)||(23081594-23081688)
chr6 (217-414)||(25756523-25756720)
chr6 (205-414)||(30677932-30678141)
chr6 (318-477)||(22829234-22829393)
chr6 (371-477)||(20010346-20010452)
chr6 (365-435)||(21474908-21474978)
chr6 (215-291)||(22437043-22437119)
chr6 (365-416)||(19486200-19486251)
chr6 (159-246)||(27559045-27559132)
chr6 (284-390)||(19881639-19881745)
chr6 (210-260)||(24292844-24292894)
chr6 (206-267)||(16813805-16813866)
chr6 (206-294)||(8720733-8720821)
chr6 (283-411)||(18660161-18660289)
chr6 (300-360)||(28312886-28312946)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (17-438)||(8204-8625)
scaffold0235 (17-438)||(18418-18839)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (104-438)||(7266-7600)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (29-435)||(98328-98734)
scaffold0020 (101-433)||(176212-176544)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (17-449)||(164132-164564)
scaffold0023 (215-282)||(30472-30539)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (32-438)||(54203-54609)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (32-477)||(4912-5357)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (83-477)||(15279-15673)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (32-477)||(39038-39481)
scaffold0010 (205-477)||(14753-15025)
[»] scaffold1299 (1 HSPs)
scaffold1299 (21-393)||(1635-2007)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (25-474)||(251-700)
[»] scaffold0053 (3 HSPs)
scaffold0053 (32-474)||(62478-62920)
scaffold0053 (25-267)||(65211-65453)
scaffold0053 (288-444)||(65058-65214)
[»] scaffold0523 (2 HSPs)
scaffold0523 (32-474)||(5596-6035)
scaffold0523 (159-416)||(11507-11764)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (32-474)||(70264-70706)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (17-438)||(8755-9176)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (212-456)||(996-1240)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (212-456)||(28009-28253)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (32-444)||(619-1031)
[»] chr1 (24 HSPs)
chr1 (32-474)||(21742327-21742769)
chr1 (25-449)||(24096415-24096839)
chr1 (32-393)||(20832757-20833117)
chr1 (25-399)||(21961193-21961567)
chr1 (32-438)||(22015556-22015962)
chr1 (65-474)||(21738811-21739220)
chr1 (140-477)||(19857555-19857892)
chr1 (25-399)||(38909676-38910050)
chr1 (25-399)||(20074559-20074933)
chr1 (140-399)||(20297664-20297923)
chr1 (25-399)||(48426039-48426413)
chr1 (159-399)||(31536847-31537087)
chr1 (205-477)||(21228328-21228600)
chr1 (25-399)||(37680215-37680589)
chr1 (25-399)||(52988907-52989280)
chr1 (203-414)||(16379407-16379618)
chr1 (207-477)||(17041788-17042057)
chr1 (205-459)||(24784648-24784901)
chr1 (371-477)||(20853532-20853638)
chr1 (300-477)||(16354018-16354195)
chr1 (205-416)||(21176682-21176893)
chr1 (300-360)||(41350560-41350620)
chr1 (300-414)||(16347433-16347547)
chr1 (215-291)||(20081334-20081410)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (243-477)||(2198-2432)
[»] scaffold1530 (1 HSPs)
scaffold1530 (173-477)||(801-1105)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (32-416)||(37095-37479)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (101-456)||(29752-30106)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (65-263)||(115751-115949)
scaffold0029 (25-266)||(93808-94049)
scaffold0029 (215-273)||(8553-8611)
[»] scaffold1433 (1 HSPs)
scaffold1433 (65-438)||(1053-1426)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (65-438)||(7933-8306)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (32-438)||(34493-34899)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (167-438)||(319534-319805)
scaffold0004 (32-314)||(325863-326144)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (32-449)||(5209-5626)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (32-474)||(50261-50703)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (32-474)||(43125-43567)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (32-402)||(5337-5706)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (32-446)||(8755-9169)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (33-267)||(767-1001)
scaffold0203 (311-438)||(3793-3920)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (101-438)||(42923-43260)
scaffold0102 (218-291)||(50234-50307)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (210-474)||(33078-33342)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (67-435)||(51842-52210)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (98-477)||(153714-154093)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (32-477)||(2787-3226)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (32-449)||(9505-9920)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (132-438)||(4196-4501)
[»] scaffold2062 (1 HSPs)
scaffold2062 (32-416)||(636-1025)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (205-438)||(5644-5877)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (26-435)||(4049-4458)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (65-474)||(16826-17235)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (205-474)||(115953-116222)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (32-438)||(557-963)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (98-439)||(5824-6165)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (226-474)||(3215-3463)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (140-416)||(6069-6344)
[»] scaffold1056 (1 HSPs)
scaffold1056 (104-474)||(1949-2317)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (167-438)||(284-555)
[»] scaffold1517 (1 HSPs)
scaffold1517 (25-438)||(1229-1642)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (25-399)||(41884-42258)
[»] scaffold1426 (1 HSPs)
scaffold1426 (25-399)||(1388-1762)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (32-393)||(71-432)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (159-399)||(514134-514374)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (25-399)||(610-984)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (69-414)||(11170-11515)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (101-471)||(36723-37093)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (218-449)||(251961-252192)
scaffold0009 (205-477)||(229555-229827)
[»] scaffold0261 (4 HSPs)
scaffold0261 (284-434)||(12160-12310)
scaffold0261 (284-434)||(20340-20490)
scaffold0261 (174-240)||(12352-12418)
scaffold0261 (174-240)||(20532-20598)
[»] scaffold0276 (1 HSPs)
scaffold0276 (159-399)||(23704-23944)
[»] scaffold1845 (1 HSPs)
scaffold1845 (179-414)||(1070-1305)
[»] scaffold0054 (2 HSPs)
scaffold0054 (32-322)||(63377-63667)
scaffold0054 (345-435)||(63284-63374)
[»] scaffold0451 (1 HSPs)
scaffold0451 (205-414)||(13798-14007)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (212-414)||(16375-16577)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (205-471)||(66817-67083)
[»] scaffold2165 (1 HSPs)
scaffold2165 (159-399)||(584-824)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (215-414)||(30092-30291)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (278-416)||(625-762)
[»] scaffold0289 (1 HSPs)
scaffold0289 (205-416)||(117-328)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (205-476)||(17489-17760)
[»] scaffold0457 (1 HSPs)
scaffold0457 (300-477)||(13757-13934)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (205-477)||(139313-139585)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (215-291)||(32218-32294)
scaffold0080 (205-357)||(10062-10214)
scaffold0080 (205-357)||(12717-12869)
[»] scaffold1220 (1 HSPs)
scaffold1220 (161-459)||(21-319)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (159-477)||(28631-28949)
[»] scaffold0443 (2 HSPs)
scaffold0443 (159-240)||(12080-12161)
scaffold0443 (25-80)||(11958-12013)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (65-195)||(12916-13046)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (205-477)||(5327-5599)
[»] scaffold0679 (1 HSPs)
scaffold0679 (365-449)||(766-850)
[»] scaffold0177 (2 HSPs)
scaffold0177 (205-404)||(14817-15016)
scaffold0177 (205-339)||(11197-11331)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (365-449)||(25949-26033)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (212-348)||(104562-104698)
[»] scaffold0088 (2 HSPs)
scaffold0088 (25-240)||(30083-30298)
scaffold0088 (300-399)||(30334-30433)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (216-291)||(21944-22019)
scaffold0081 (216-291)||(37368-37443)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (215-282)||(36718-36785)
scaffold0042 (203-312)||(26679-26788)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (215-285)||(379-449)
[»] scaffold0993 (1 HSPs)
scaffold0993 (212-357)||(1318-1463)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (212-405)||(48066-48259)
scaffold0075 (212-405)||(55246-55439)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (335-399)||(17698-17762)
[»] scaffold2059 (1 HSPs)
scaffold2059 (205-348)||(601-744)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (215-266)||(453-504)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (205-348)||(208-351)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (212-327)||(7209-7324)
scaffold0270 (212-327)||(14339-14454)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (251-414)||(40273-40436)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (205-348)||(12956-13099)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (212-327)||(57467-57582)
[»] scaffold1881 (1 HSPs)
scaffold1881 (205-291)||(369-455)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (212-290)||(14420-14498)
scaffold0120 (212-273)||(11599-11660)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (212-273)||(285-346)
[»] scaffold0611 (1 HSPs)
scaffold0611 (212-273)||(9350-9411)
[»] scaffold0609 (1 HSPs)
scaffold0609 (133-270)||(1196-1333)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (212-321)||(18181-18290)
scaffold0040 (212-292)||(110795-110875)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (215-343)||(263-391)
[»] scaffold0447 (1 HSPs)
scaffold0447 (212-348)||(1696-1832)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (84-471)||(15288-15675)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (212-348)||(4560-4696)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (318-477)||(11891-12050)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (32-127)||(19022-19117)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (25-347)||(4978-5300)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (215-273)||(7564-7622)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (212-411)||(3661-3860)
[»] scaffold0605 (1 HSPs)
scaffold0605 (371-444)||(1775-1848)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (205-273)||(10065-10133)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (203-339)||(9192-9328)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 409; Significance: 0; HSPs: 17)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 17266672 - 17266216
Alignment:
Q  21 tagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaatt 120  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17266672 tagcagtctaggtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaatt 17266573  T
Q  121 atagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttg 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  17266572 atagcatacaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatcctcggtacaaacgttactcttg 17266473  T
Q  221 tggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacag 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17266472 tgacctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggcctcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcag 17266373  T
Q  321 gggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcg 420  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17266372 gggcactatacggtttaggacgactctgatgccctttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctacagcg 17266273  T
Q  421 acttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17266272 acttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 17266216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 205 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 21870432 - 21870163
Alignment:
Q  205 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 304  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || || | |||||||| ||||||||| ||| |  | |||| |||| ||||||| | | |||||    
T  21870432 acaaacattactcttgtggtctttctcaccacacttgaagcaaattatctcagtaggagcatctctcctcttaggcctcctcccatcattcaatttctgc 21870333  T
Q  305 ttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcct 404  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  21870332 ttacccttgtcagcaggggcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtatcctctt 21870233  T
Q  405 cgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgat 474  Q
    | || ||||| | || ||||||||| ||||| ||  | || |||| ||| || || ||||||||||||||    
T  21870232 catatatcctgcagctacttaccaattcagaaaagttccttatcttttgatagccaatagccctcttgat 21870163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 205 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 21874712 - 21874443
Alignment:
Q  205 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 304  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || || | |||||||| ||||||||| ||| |  | |||| |||| ||||||| | | |||||    
T  21874712 acaaacattactcttgtggtctttctcaccacacttgaagcaaattatctcagtaggagcatctctcctcttaggcctcctcccatcattcaatttctgc 21874613  T
Q  305 ttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcct 404  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  21874612 ttacccttgtcagcaggggcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtatcctctt 21874513  T
Q  405 cgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgat 474  Q
    | || ||||| | || ||||||||| ||||| ||  | || |||| ||| || || ||||||||||||||    
T  21874512 catatatcctgcagctacttaccaattcagaaaagttccttatcttttgatagccaatagccctcttgat 21874443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 32 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 23563495 - 23563050
Alignment:
Q  32 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 131  Q
    ||||| ||||||||||| || || ||||||   ||||||||||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||| || ||||| ||  ||     
T  23563495 gtaccggtcaaagcaaacaccttaccaccagtcctaaccttcttcggctgcgtacactgcgaactaatatgaccttcctcattgcagttataacaaacat 23563396  T
Q  132 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctc 231  Q
      || || | ||| || || |||||  |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |   ||| || ||||||||||||||||| ||    
T  23563395 tgtctccacccttacagtcagctagtgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctctatcacagacattactcttgtggcctttttc 23563296  T
Q  232 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatac 331  Q
     |||||||| || || || || |||| ||||||||| ||| |  | |||| |||||||| ||| |  ||||||||| |||| ||| |||| |||||||||    
T  23563295 accacacttgaagcaaacaatgtcagtaggagcatctctcctcttgggcctcctctcattatttaacctctgcttatccttttcagcaggagcactatac 23563196  T
Q  332 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 431  Q
    || || |||| | |||  |||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| | || |||||||||||    
T  23563195 ggcttcggacaactcttctgtcccttacctctacgttcactcatcatcttgtaatgagctttagtgtcctcctcataaatcctgcagctacttaccaaat 23563096  T
Q  432 cagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
     | ||||| |||||||||  || || || || || |||||||||||    
T  23563095 taaagaaatttctaatcttctgataaccaatggctctcttgatgtc 23563050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 23078239 - 23077815
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||    ||| ||||||||||||| || ||||  | |||||| ||||| ||||| || || || |||    
T  23078239 agtctgcgtactagtcaatgcaaacactttcccaccggtcctagccttcttcggctgagtacactatgaactgatatgaccttcttcgttgcagttgtag 23078140  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggc 224  Q
    ||  |||  || || ||||| || || |||||  |||| || ||||| ||||||||||| || ||| |||||||  |   |||| | || || |||||||    
T  23078139 caaacaatgtctccacgcttacattcagctagggtgtgtcctttctgaccacacctgaaacatttcctctcatctctaccacaagcattgcttttgtggc 23078040  T
Q  225 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggc 324  Q
    |||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||| |  | |||| ||| |||||||| |   ||||||| || |||||| |||| ||    
T  23078039 ctttttcaccacacttgaaacatacaatctcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcattcatcttctgcttccctttgtcagcaggagc 23077940  T
Q  325 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgactt 424  Q
    ||| || |||||||||||| |||| ||||||||||| || | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| | ||  |||    
T  23077939 actgtaaggtttaggacgactctgctgtcccttacccctcctctcactcattaccttgtaatgagctttggtgtcttcctcatatatcctgcagctgctt 23077840  T
Q  425 accaaatcagagaaaattctaatct 449  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  23077839 accaactcagagaaaattctaatct 23077815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 399
Target Start/End: Original strand, 22505713 - 22506087
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| || || || |||  ||||||||||||||| |  |  ||||| | |||||||||||||||| |||| || || |||    
T  22505713 agtctgcgtaccagtcaatgcaaacaccttgcccccagttctaaccttcttcggttcaggacactgtgaactgatgtgaccctctccattgcagttgtag 22505812  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggc 224  Q
    ||  |||  || || ||||| || || ||||   | || ||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||   |||||| || ||||||||||    
T  22505813 cagacaatgtccccacgcttacattcagctaagctatgtcccatctgaccacacctgaagcacttcctctcgtctttaccacaaacattgctcttgtggc 22505912  T
Q  225 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggc 324  Q
    ||||||| ||||||||  |||| || ||||||| ||||||||| ||| |  | |||| ||| |||||||| |   ||||||| || |||||| |||| ||    
T  22505913 ctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttaggcctcctatcatcattcatcttctgctttcctttgtcagcaggagc 22506012  T
Q  325 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 399  Q
    ||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22506013 actgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttataatgagctttggtgtc 22506087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 399
Target Start/End: Original strand, 25851106 - 25851480
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || || ||||||  |||| ||||||||||||  |  ||||| | ||| || ||||||||| |||| || || |||    
T  25851106 agtctgcgtaccagtcaaagcaaataccttcccaccagttctagccttcttcggctcaggacactgtgaactaatatgaccctctccattgcagttgtag 25851205  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggc 224  Q
    ||  |||  || || |||||| | || |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||   |||||| |||||||||||||    
T  25851206 cagacaatgtctccacgcttgtattcagctagactgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctttaccacaaacattactcttgtggc 25851305  T
Q  225 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggc 324  Q
    ||||||| ||||||||  | || || |||||| || ||||||| ||| |  | |||| ||| ||||||   |   ||||||| || |||||| |||| ||    
T  25851306 ctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaagagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtcagcaggagc 25851405  T
Q  325 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 399  Q
    ||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  25851406 actgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtc 25851480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 405
Target Start/End: Original strand, 20345316 - 20345696
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| |||||||| |||||||| || || ||||||  |||| ||||||||||||  |  ||||| | ||| || ||||| ||  |||| || || |||    
T  20345316 agtctgcgtaccagttaaagcaaataccttcccaccagttctagccttcttcggctcaggacactgtgaactaatatgaccttccccattgcagttgtag 20345415  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggc 224  Q
    ||  |||  || || |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||   |||||| ||||||||||||     
T  20345416 cagacaatgtccccacgcttgcattcaactagactgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctttaccacaaacattactcttgtggg 20345515  T
Q  225 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggc 324  Q
    ||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||| ||| |  | |||| ||| ||||||   |   ||||||| || |||||| |||| ||    
T  20345516 ctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtcagcaggagc 20345615  T
Q  325 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctc 405  Q
    |||||| || |||||||||||||  ||||||||||| || | ||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20345616 actataaggcttaggacgattctactgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcctc 20345696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 159 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 14884191 - 14883873
Alignment:
Q  159 tgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagc 258  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  ||  ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||    
T  14884191 tgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctctcccacagacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagc 14884092  T
Q  259 aggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtccctta 358  Q
     |||||||| ||| |  | |||| ||| ||||||   |  |||||||| || ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||||    
T  14884091 tggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcctctgctttcctttgtcagtaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtccctta 14883992  T
Q  359 cctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatc 458  Q
    || || | ||||||||| | ||||||||||||||||||||| || || ||||| || |  | | | ||||| |||||||| | ||| ||||| || || |    
T  14883991 cccctcctctcactcataatcttataatgagctttggtgtcttcttcatagattctgcacctattaaccaactcagagaagactctgatctgctgatacc 14883892  T
Q  459 ctatagccctcttgatgtc 477  Q
    | |||||||| ||||||||    
T  14883891 caatagcccttttgatgtc 14883873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 205 - 477
Target Start/End: Original strand, 18782346 - 18782618
Alignment:
Q  205 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 304  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||| ||||  | | || ||| |||||    | ||||||     
T  18782346 acaaacattactcttgtggcctttctcgccacagttgaaacaaacaatctccgcaggagcatccttcttcttagaccacctatcatcgaccattctctgt 18782445  T
Q  305 ttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 403  Q
    || ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||| |||| || |||||   |||| |||||| |||  ||||| |||| ||| || || || |||    
T  18782446 ttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgttggccctt-ggtcttccgctcattcacaaccttgtaattagccttagtatcttcc 18782544  T
Q  404 tcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    |||||||| || | || | | || |||| || ||||| ||  |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18782545 tcgtagattctgcagctattcactaaattagggaaaactcggatctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 18782618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 358
Target Start/End: Original strand, 21883017 - 21883160
Alignment:
Q  215 ctcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| | ||||  |||| |||||||| || || ||    | |||||| || ||||| |    
T  21883017 ctcttgtggcctttctcgccacaattaaaacagacaatctcagcagaaacatctttcttcctcggccgtctatcctcgaccattctctgtttgcccttat 21883116  T
Q  315 caacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtccctta 358  Q
    || ||||||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||||    
T  21883117 cagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggccctta 21883160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Original strand, 23526293 - 23526360
Alignment:
Q  215 ctcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccg 282  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  23526293 ctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctcagcaggagcatccttcttccttggccg 23526360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 477
Target Start/End: Original strand, 27521741 - 27521907
Alignment:
Q  311 ttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtaga 410  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  | | |||| |||  ||||| || ||||| || |||||||| || ||||    
T  27521741 ttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtgtcctcttcataga 27521840  T
Q  411 tcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    |||| | || | | ||||||||    |||| ||| | |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  27521841 tcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctcaactgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 27521907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 471
Target Start/End: Original strand, 20803785 - 20804095
Alignment:
Q  161 tgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcag 260  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| || |||||| | ||||  |  ||||| || ||||||||||||||||| ||| | || ||||| || ||||| ||||    
T  20803785 tgacccttcttgccacaccagaaacatttcttcacctcctcagggcaaacatttctcttgtggcctttctcaccataattgaaacagacaatctccgcag 20803884  T
Q  261 gagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacc 360  Q
    |||||||| ||||  | |||||||| |||||    | |||||  || ||||| ||| ||||||||||||| || |||||  || | || || ||||||      
T  20803885 gagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctatttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggagactttgttggccctta-g 20803983  T
Q  361 tcttc-gctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcc 459  Q
    ||||| |||||  ||  ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| || | || | ||||||| ||||  |||| ||  |||||||||||||     
T  20803984 tcttctgctcatccacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctcatagattctgcagctatttaccaactcaggaaaaactcggatctgttggtatct 20804083  T
Q  460 tatagccctctt 471  Q
     || ||||||||    
T  20804084 gattgccctctt 20804095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 27682444 - 27682285
Alignment:
Q  318 caggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctacc 417  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||  ||| |||| |||  ||||| || ||||| || || ||||| |||||||||||       
T  27682444 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctttctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgta 27682345  T
Q  418 gcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    || | | ||||||||    |||| ||| | |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  27682344 gctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 27682285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 399
Target Start/End: Original strand, 21410366 - 21410560
Alignment:
Q  205 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 304  Q
    |||| |||||||||| || |||||||| |||||    |||||||| |  |||| ||||| ||| ||||| || |||| ||||| |||||| |  || |||    
T  21410366 acaagcgttactcttatgacctttctctccacatcggaaacacacaacttcagtaggagtatctctctttctgggcctcctcttatcattcaccctatgc 21410465  T
Q  305 ttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 399  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || ||||||  |||| | || ||   |||||| || |||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  21410466 ttacccttatcagctggagcactgtaaggtttaccacgactttgttggtgcttacccctccgctcattcataatcttataatgagctttggtgtc 21410560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 105
Target Start/End: Original strand, 20824487 - 20824567
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgacc 105  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||   || |||||||| || || |||||||| | ||| ||||||||    
T  20824487 agtctgcgtaccagtcaaagcaaatacttttcctccagtcctgaccttcttaggttgcgtgcactgcgaactaatgtgacc 20824567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 397; Significance: 0; HSPs: 22)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 477
Target Start/End: Original strand, 12577100 - 12577556
Alignment:
Q  21 tagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12577100 tagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaatt 12577199  T
Q  121 atagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttg 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12577200 atagcatacaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacatctgaaacacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttg 12577299  T
Q  221 tggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacag 320  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  12577300 tgacctttctcgccacacttaaagcacactatctcagcaggagcatccctcttactcggcctcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagccg 12577399  T
Q  321 gggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcg 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12577400 gggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcactttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctacagcg 12577499  T
Q  421 acttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  12577500 actcaccaaatcagaaaaaattctaatctgttggtatcctatggctctcttgatgtc 12577556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 19716717 - 19716285
Alignment:
Q  17 tcactagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 116  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||  || |    
T  19716717 tcactagtagtctgcgtaccagtcaatgcaaacactttcccaccggttctaaccttcttcggctgtgtgcactgcgaactgatatggccctctttgttgc 19716618  T
Q  117 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttact 216  Q
    | ||||| ||  |||||||||  ||||||||||| |||||  |||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  19716617 agttataacaaacaacatcactacgcttgcaatcagctagagtgtgtcctttctgaccacacctgaaacacttcttctcatctttagtacaaacattact 19716518  T
Q  217 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||| ||| || | |||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  19716517 cttgtggcctttctcgccacacttgtaacaaacgatctcagcaggagcatctctcctattgggcctcctctcatcattcaatctctgctttcccttgtca 19716418  T
Q  317 acaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 416  Q
    ||| ||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  19716417 acaagggcactgtatggtttaggacgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttagtgtcttcctcatatatcctgc 19716318  T
Q  417 cgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatct 449  Q
     ||  |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  19716317 agctgcttaccaactcagagaaatttctaatct 19716285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 19721280 - 19720848
Alignment:
Q  17 tcactagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 116  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||  || |    
T  19721280 tcactagtagtctgcgtaccagtcaatgcaaacactttcccaccggttctaaccttcttcggctgtgtgcactgcgaactgatatggccctctttgttgc 19721181  T
Q  117 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttact 216  Q
    | ||||| ||  |||||||||  ||||||||||| |||||  |||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  19721180 agttataacaaacaacatcactacgcttgcaatcagctagagtgtgtcctttctgaccacacctgaaacacttcttctcatctttagtacaaacattact 19721081  T
Q  217 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||| ||| || | |||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  19721080 cttgtggcctttctcgccacacttgtaacaaacgatctcagcaggagcatctctcctattgggcctcctctcatcattcaatctctgctttcccttgtca 19720981  T
Q  317 acaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 416  Q
    ||| ||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  19720980 acaagggcactgtatggtttaggacgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttagtgtcttcctcatatatcctgc 19720881  T
Q  417 cgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatct 449  Q
     ||  |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  19720880 agctgcttaccaactcagagaaatttctaatct 19720848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 25 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 23097710 - 23097286
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || || ||||||  ||||| |||||| ||||| |||||||| | ||||||||| ||||| |||| |||||||||     
T  23097710 agtctgcgtaccagtcaaagcaaacaccttcccaccagttctaatcttctttggctgagtgcactgtgaactgatgtggccctcctcatcacaattataa 23097611  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggc 224  Q
    ||  |||||||||| | |||||| |  || |   |||| || ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||    
T  23097610 caaacaacatcacccctcttgcagttagccaatgtgtgtcctttctgaccacacttgaagcacttcttctgatctttggtacaaacattacttttgtggc 23097511  T
Q  225 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggc 324  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| ||||  ||||| ||||||||| |||||||    
T  23097510 ctttctcgccacacttaaagcaaactatctcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattcagtcgttgctttcccttgtcagcaggggc 23097411  T
Q  325 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgactt 424  Q
    ||| ||||| |||||  || |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |  || ||||||||||| || | || ||||    
T  23097410 actgtacggcttagggagactctgatgtgctttacctctccgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgaatcttcctcgtagattctgcagctactt 23097311  T
Q  425 accaaatcagagaaaattctaatct 449  Q
    || || ||||| ||| |||| ||||    
T  23097310 acaaactcagaaaaagttctgatct 23097286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 33 - 435
Target Start/End: Original strand, 23274352 - 23274754
Alignment:
Q  33 taccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaac 132  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||   |||||||||||||| ||||||||||| | |||||| || ||||| ||||| || ||||||||  | |     
T  23274352 taccagtcagagcaaacactttaccaccagtcctaaccttcttcggttgtgtgcactgtgaactgatatggccctcctcattgcagttatagcaaactat 23274451  T
Q  133 atcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcg 232  Q
     || || ||||| ||||| ||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||     
T  23274452 gtctccccgcttacaatcagctaatgtgtgtcccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatctttagtacaaacattactcttgtggcctttctca 23274551  T
Q  233 ccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacg 332  Q
    ||||||||    || || || |||| ||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||| |||||||||     
T  23274552 ccacacttgttgcaaacaatttcagtaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcatttaacctctgcttacccttgtcagcaggagcactatact 23274651  T
Q  333 gtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatc 432  Q
    | || |||||| |||| |||||||| || || || |||||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||||| ||  |||||||| ||    
T  23274652 gcttcggacgactctgttgtcccttgcccctacgttcactcatcaccttgtaatgagccttcgtatcctcttcatagatcctacagctgcttaccaactc 23274751  T
Q  433 aga 435  Q
    |||    
T  23274752 aga 23274754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 477
Target Start/End: Original strand, 20848340 - 20848789
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||  |||||||||||  |  ||||| | |||||| ||||| ||  |||| || || ||     
T  20848340 agtctgcgtaccagtcaaagcaaacacctttccaccaattctagtcttcttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccttccccattgcagttgtaa 20848439  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatc-cttcgtacaaacgttactcttgtgg 223  Q
    ||  |||  || || |||||||| || ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| ||||||||||||    
T  20848440 cagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttcc-acaaacattactcttgtgg 20848538  T
Q  224 cctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacagggg 323  Q
    |||||||| ||||||||  | || || |||||| |||||||||| ||| | || ||   ||| ||||||   |   ||||||| || |||||| |||| |    
T  20848539 cctttctcaccacacttgtagca-acaatctcaacaggagcatctctcct-cttggat-cctatcatcacccatcttctgctttcctttgtcagcaggag 20848635  T
Q  324 cactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgact 423  Q
    |||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | ||||||||||||||||||||| || || || || || |  |   |    
T  20848636 cactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgagctttggtgtcttcttcataaattctgcacctgtt 20848735  T
Q  424 taccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
     ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  20848736 aaccaactcagaaaagattctgatctgttgatatccaatagctctcttgatgtc 20848789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 205 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 23116571 - 23116299
Alignment:
Q  205 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 304  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||| || ||||| | |||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | |||||||    
T  23116571 acaaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaacaatctctgaaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgc 23116472  T
Q  305 ttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 403  Q
    || ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||| |||| |  ||||||  |||| | |||| | |  ||||| ||||||||| |||| |||||     
T  23116471 ttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgcttgccctta-gtcttcctctcattaacaaccttgtaatgagctctggtatcctct 23116373  T
Q  404 tcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    ||||||||||||| ||   | || ||||||| ||||| ||  |  ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  23116372 tcgtagatcctacagctgttcactaaatcagggaaaactcggagttgttggtatccgatcgccctcttgatgtc 23116299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 24705130 - 24704926
Alignment:
Q  69 ccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgaccctt 168  Q
    ||||||| |||||  ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||  ||||  |||  |||   ||||||||||| ||||   ||||||||||    
T  24705130 ccttcttaggctgcttgcactgagaacctatgtgaccctcttcattacaattgaagcacacaatgtcattacgcttgcaatcagctaaagtgtgaccctt 24705031  T
Q  169 ctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatcc 268  Q
    ||  ||||||  ||| || |||||  | ||||  | |||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |  |||||||||||| |||||    
T  24705030 cttgccacactggaaacatttctttacctcctcaggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagataatctcagcaggaacatcc 24704931  T
Q  269 ctctt 273  Q
     ||||    
T  24704930 ttctt 24704926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 343
Target Start/End: Original strand, 28350807 - 28350944
Alignment:
Q  206 caaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgct 305  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | || || |||||||||||| |||| ||| |  | || | |||||||||||| | ||| ||||    
T  28350807 caaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcagcaggaacatctctcctcttaggtctcctctcatcattcaatctttgct 28350906  T
Q  306 tacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacga 343  Q
      || ||||||||||| |||||||| || || ||||||    
T  28350907 cccctttgtcaacaggagcactatagggcttcggacga 28350944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22462993 - 22462925
Alignment:
Q  205 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctctt 273  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||| ||||    
T  22462993 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacagttgaaacaaacaatctccgcaggagcatccttctt 22462925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 22742468 - 22742269
Alignment:
Q  215 ctcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgt 314  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||||| || || |||||| ||| | ||||| |||| |||||||| || || |||   | |||||| || ||||| |    
T  22742468 ctcttgtggcatttctcaccacaattaaagcagacaatctcaccagcaacatccttcttcctcggccgtctatcctcaaccattctctgtttgcccttat 22742369  T
Q  315 caacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcc 413  Q
    || ||||||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||||  |||| |||||| |||  ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  22742368 cagcaggggcactataaggcttagggcgactctgctgaccctta-gtcttccgctcattcacgaccttgtaatgagccttggtatcctcttcgtaaatcc 22742270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 318 - 477
Target Start/End: Original strand, 10871891 - 10872050
Alignment:
Q  318 caggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctacc 417  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  | | |||| |||  ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |     
T  10871891 caggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcttcgtagatcctgca 10871990  T
Q  418 gcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    || | | ||||||||    |||| ||| | |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  10871991 gctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 10872050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 24657216 - 24656898
Alignment:
Q  159 tgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagc 258  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||| | ||||  | ||||||  ||||||||||||||||||| ||||| || |||||    ||||||||    
T  24657216 tgtgacccttcttgccacaccggaaacacttcttcacctcctcaggacaaacagtactcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagc 24657117  T
Q  259 aggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtccctta 358  Q
    |||| ||||| | ||  | ||||| ||||| ||    |  ||||| || ||||| |||  |||||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||||    
T  24657116 aggaacatcctttttcttaggccgtctctcctcgaccatcctctgtttgcccttatcagtaggggcactatagggcttagggcgactctgctggccctta 24657017  T
Q  359 cctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtat 457  Q
      |||| |||||| | |  ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| || | || | | | |||||| |  |||| ||  ||||||||||||    
T  24657016 -gtcttccgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcctcctcatagattctgcagctattcatcaaatctggaaaaactcggatctgttggtat 24656918  T
Q  458 cctatagccctcttgatgtc 477  Q
    || || |||||||| |||||    
T  24656917 ccgatcgccctcttaatgtc 24656898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 11351330 - 11351160
Alignment:
Q  98 atgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcat 197  Q
    |||||||||||||| || |||||  ||||  ||| |||||   |||||||||| ||||   | ||||||||||  ||||||| ||| || ||||   | |    
T  11351330 atgtgaccctcttccttgcaattgaagcacacaatatcactatgcttgcaatcagctaatgtatgacccttcttgccacaccagaaacatttctctacct 11351231  T
Q  198 ccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatcc 268  Q
    |||| | |||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||    
T  11351230 cctttggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagacaatctccgcaggagcatcc 11351160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 21320505 - 21320459
Alignment:
Q  215 ctcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcagg 261  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  21320505 ctcttgtggcctttctcgccacaattaaaacagacaatctcagcagg 21320459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 291
Target Start/End: Original strand, 23205245 - 23205331
Alignment:
Q  205 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatc 291  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| | |||||||| | ||||  | |||||||| |||||    
T  23205245 acaaacattactcttgtggcctttctcgccacagttgaaacaaacaatctccgaaggagcattcttcttcttaggccgcctatcatc 23205331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 291
Target Start/End: Original strand, 23676849 - 23676935
Alignment:
Q  205 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatc 291  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| | |||||||| | ||||  | |||||||| |||||    
T  23676849 acaaacattactcttgtggcctttctcgccacagttgaaacaaacaatctccgaaggagcattcttcttcttaggccgcctatcatc 23676935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 23028963 - 23028897
Alignment:
Q  215 ctcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccg 282  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||||| || |||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  23028963 ctcttgtggcctttctcaccacaat-aaaacagacaatctcagcaggagcatccttcttccttggccg 23028897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 273
Target Start/End: Original strand, 24678428 - 24678486
Alignment:
Q  215 ctcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctctt 273  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||| ||||| ||||    
T  24678428 ctcttgtggcctttctcaccacaattaaagcagacaatctcagcaggaacatccttctt 24678486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 24 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 23105421 - 23105393
Alignment:
Q  24 cagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaact 52  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23105421 cagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaact 23105393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 318 - 414
Target Start/End: Original strand, 24265411 - 24265507
Alignment:
Q  318 caggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcct 414  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||  ||| |||| |||  ||||| || ||||| || || ||||| |||||||||||    
T  24265411 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctttctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcct 24265507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 203 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 24817354 - 24817218
Alignment:
Q  203 gtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctct 302  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||| |||||  || | || || ||||||| || || |||  |||| || |||| |||||||||||| | ||| |    
T  24817354 gtacaagcattactcttgtggcccttctcaccacaagtatagcaaacaatctcagtagtagtatctttctttctaggcctcctctcatcattcaatcttt 24817255  T
Q  303 gcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttagg 339  Q
    | |||||||| ||| |||| |||||||| || |||||    
T  24817254 gtttacccttatcagcaggagcactataaggcttagg 24817218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 392; Significance: 0; HSPs: 39)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 476
Target Start/End: Original strand, 13944769 - 13945224
Alignment:
Q  21 tagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaatt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13944769 tagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtggccctcttcattacaatt 13944868  T
Q  121 atagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttg 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13944869 atagcatacaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacatctgaaacacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttg 13944968  T
Q  221 tggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacag 320  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||   |    
T  13944969 tgacctttctcgccacacttaaagcacactatctcagcaggagcatccctcttactcggcctcctctcatcattaagtctctgcttacccttatcagtcg 13945068  T
Q  321 gggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcg 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13945069 gggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctacagcg 13945168  T
Q  421 acttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgt 476  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  13945169 actcaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatggctctcttgatgt 13945224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 8744774 - 8744318
Alignment:
Q  21 tagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaatt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8744774 tagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggttgtgtgcactgagtactgatgtggccctcttcattacaatt 8744675  T
Q  121 atagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttg 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8744674 atagcatacaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacatctgaaacacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttg 8744575  T
Q  221 tggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacag 320  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||   |    
T  8744574 tgacctttctcgccacacttaaagcacactatctcagcaggagcatccctcttactcggcctcctctcatcattaagtctctgcttacccttatcagtcg 8744475  T
Q  321 gggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcg 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8744474 gggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcactttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctacagcg 8744375  T
Q  421 acttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  8744374 actcaccaaatcagagaaaattctaatctgctggtatcctatggctctcttgatgtc 8744318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 53 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 16384724 - 16384300
Alignment:
Q  53 tttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcgg 152  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |    
T  16384724 tttccaccagttctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatatggccctcttcattacaattatagcatacaacatcaccacgcttgcaatcag 16384625  T
Q  153 ctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactat 252  Q
    | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16384624 ccaacatgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggactttctcgccacacttaaaacaaactat 16384525  T
Q  253 ctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgt 352  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||| |||| |||    
T  16384524 ctcagcaggagcatctctcctattcggcctcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactgtatggcttaggacgactctgttgt 16384425  T
Q  353 cccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgtt 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16384424 cccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttgctgtcctcctcatagatcctacagcaacttaccaaatcagagaaaattctaatctgtt 16384325  T
Q  453 ggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    |||||||||| || |||||||||||    
T  16384324 ggtatcctatggctctcttgatgtc 16384300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 25 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 16831908 - 16831456
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || |||||     
T  16831908 agtctgcgtaccagtcaaagcaaacacctttccaccagttctaaccttcttcggctgtgtgcactgtgtactgatatggccctcttcgttgcagttataa 16831809  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggc 224  Q
    ||| |||||||||| |||||||| || |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  16831808 catacaacatcaccacgcttgcagtccgctaacacgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacattactcttgtggc 16831709  T
Q  225 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggc 324  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  16831708 ctttctcgccacacttaaaacaaactatctcagcaggagcatctctcctattcggcctcctctcatcattaagtctctgcttacccttatcagcaggggc 16831609  T
Q  325 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgactt 424  Q
    ||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||    
T  16831608 actatacggcttaggatgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcatagatcctgcaacgactt 16831509  T
Q  425 accaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  16831508 accaaatcagagaaaattcttatctgttggtaccctatggctctcttgatgtc 16831456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 32 - 472
Target Start/End: Original strand, 17189130 - 17189570
Alignment:
Q  32 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 131  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||   ||||| |||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||  |||    
T  17189130 gtaccagtcaacgcaaacactttcccaccggttctaatcttctttggctgagtacactgtgaactgatgtggccctcctcatcacaattataacaaacaa 17189229  T
Q  132 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctc 231  Q
    ||||||| | |||||| |  || | | |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17189230 catcaccccacttgcagttagccaacgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttggtacaaacgttacttttgtggcctttctc 17189329  T
Q  232 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatac 331  Q
    ||||||||||||||| || || ||| |||||||||| ||| |  | | || |||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||| ||||| |||    
T  17189330 gccacacttaaaacaaacaatatcaacaggagcatctctcctcttggacctcctctcatcattaaatctctgctttcccttgttagcaggagcactgtac 17189429  T
Q  332 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 431  Q
    || || |||||| |||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| || ||||||||| |    
T  17189430 ggcttcggacgactctgctggcccttgcctctgcggtcactcatcaccttgtaatgagcttttgtgtcctcttcatagattctacagctacttaccaact 17189529  T
Q  432 cagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttg 472  Q
    || ||||  |||| ||||  |||||||| ||||||||||||    
T  17189530 caaagaagtttctgatcttctggtatccaatagccctcttg 17189570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 32 - 438
Target Start/End: Original strand, 31941659 - 31942065
Alignment:
Q  32 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 131  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||   ||||||||||||||||| || ||||  | |||||| || ||||| ||||| |||||||| ||  |||    
T  31941659 gtaccagtcaaagcaaacaccttaccaccagtcctaaccttcttcggctgcgtacactatgaactgatatggccctcctcattgcaattataacaaacaa 31941758  T
Q  132 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctc 231  Q
    ||||||| |||||||| || |||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31941759 catcaccacgcttgcagtcagctagagtgtgtcccttctgaccacacctgaaacacttcttctcatctttggtacaaacattactcttgtggcctttctc 31941858  T
Q  232 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatac 331  Q
    |||||||||  |||| || ||||||||||||||||  ||| || | |||| |||||||||||| |   ||||||| || |||||| |||| |||||||||    
T  31941859 gccacacttgtaacaaacgatctcagcaggagcatttctcctattgggcctcctctcatcattcaacttctgcttccctttgtcagcaggagcactatac 31941958  T
Q  332 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 431  Q
    || || |||||| |||| | ||| || |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | || ||||||||| |    
T  31941959 ggcttcggacgactctgctatcctttgctccttcgatcactcatcaccttataatgagctttcgtgtcctcctcatagattctgcagctacttaccaatt 31942058  T
Q  432 cagagaa 438  Q
    |||||||    
T  31942059 cagagaa 31942065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 32 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 12357900 - 12357483
Alignment:
Q  32 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 131  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||    |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||| || ||||| || ||||||||  |||    
T  12357900 gtaccagtcagagcaaacactttaccaccggtcctaaccttcttcggttgtgtacactgcgaactgatatgaccttcctcattgcagttatagcaaacaa 12357801  T
Q  132 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctc 231  Q
    | || || ||||| ||||| ||||   |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||   ||| || ||||||||||||||||| ||    
T  12357800 cgtctccccgcttacaatcagctaatgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttatcacagacattactcttgtggcctttttc 12357701  T
Q  232 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatac 331  Q
    |||||||||  | || || ||||||||||||| ||| ||| |  | |||| |||||||||||| || |||| ||| ||||||||| |||| ||||||||     
T  12357700 gccacacttgtagcaaacaatctcagcaggagtatctctcctcttgggcctcctctcatcattcagcctctactttcccttgtcagcaggagcactatat 12357601  T
Q  332 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 431  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| | || ||| |||||||    
T  12357600 ggtttaggacgactctgatgtcccttacctctgcgctcactcatcaccttgtaatgagctttagtgtcttcttcatatatcctgcagctactcaccaaat 12357501  T
Q  432 cagagaaaattctaatct 449  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  12357500 cagagaaaattcttatct 12357483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 25 - 474
Target Start/End: Original strand, 24190053 - 24190501
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||||||| |||||  |||| |||||   ||||| |||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| |||| |||||||||     
T  24190053 agtctgcgtaccagtcaacgcaaactctttcccaccggttctaatcttctttggctgagtacactgtgaactgatgtggccctcctcatcacaattataa 24190152  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggc 224  Q
    ||  |||||||||| | |||||| |  || | | |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  24190153 caaacaacatcaccccacttgcagttagccaacgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttggtacaaacgttacttttgtggc 24190252  T
Q  225 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggc 324  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||| ||| |  |   || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  24190253 ctttctcgccacacttaaaacaaacaatatcaacaggagcatctctcctcttgtacctcctctcatcattcaatctctgctttcccttgtcagcaggagc 24190352  T
Q  325 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgactt 424  Q
    ||| ||||| || |||||| |||| ||  |||| ||||| || ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| || ||||    
T  24190353 actgtacggcttcggacgactctgctg-gccttgcctctgcggtcagtcatcaccttgtaatgagctttcgtgtcctcttcatagattctacagctactt 24190451  T
Q  425 accaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgat 474  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  24190452 accaaatcagagaagtttctgatcttctggtatccaatagccctcttgat 24190501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 32 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 31692558 - 31692152
Alignment:
Q  32 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 131  Q
    |||||||||| |||||| || || ||||||   ||||||||||||||||| || ||||| | |||||| || ||||| ||||| || ||||| ||  |||    
T  31692558 gtaccagtcagagcaaacaccttaccaccagtcctaaccttcttcggctgcgtacactgtgaactgatatggccctcctcattgcagttataacaaacaa 31692459  T
Q  132 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctc 231  Q
    ||||||| | |||||| || |||||  |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31692458 catcaccactcttgcagtcagctagagtgtgtcccttctaaccacacctgaaacacttcttctcatctttggtacaaacattactcttgtggcctttctc 31692359  T
Q  232 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatac 331  Q
     ||||||||  |||| || |||||||||| |||||  ||| || | |||| |||||||||||| |   ||||||| || |||||| |||| |||||||||    
T  31692358 accacacttgtaacaaacgatctcagcagaagcatttctcctattgggcctcctctcatcattcaacttctgcttccctttgtcagcaggagcactatac 31692259  T
Q  332 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 431  Q
    || || |||||| |||| ||||| || |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | || ||||||||| |    
T  31692258 ggcttcggacgactctgctgtcctttgctccttcgatcactcatcaccttataatgagctttcgtgtcctcctcatagattctgcagctacttaccaatt 31692159  T
Q  432 cagagaa 438  Q
    |||||||    
T  31692158 cagagaa 31692152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 104 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 14290833 - 14290463
Alignment:
Q  104 ccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcg 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||   |||||| || ||||| ||||| ||||   |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||         
T  14290833 ccctcttcatcacaattatagcaaataacatccccacgcttacaatcagctaaagtgtgtcctttctgtccacacctaaagcacttcttctcatctcaat 14290734  T
Q  204 tacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctg 303  Q
     ||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || || |  ||||||| ||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| || |||||    
T  14290733 cacacacattactcttgtggcctttctcaccacacttgaagcaaataatctcagtaggagcatctctcctcttaggcctcctctcatcattcagcctctg 14290634  T
Q  304 cttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 403  Q
     ||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  14290633 tttacctttgtcagcaggagcactatacggtttcggacgactctgctgtcccttacctctgcgctcactcatcactttataatgagctttggtatcctct 14290534  T
Q  404 tcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgat 474  Q
    || ||||| ||||  |  ||| |||| ||||| ||| |||| |||| ||| || || ||||||||||||||    
T  14290533 tcatagattctacaactgctttccaattcagaaaaatttcttatcttttgataaccaatagccctcttgat 14290463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 167 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 18131585 - 18131275
Alignment:
Q  167 ttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcat 266  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||  | |||||| |||||||||    
T  18131585 ttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttatcacaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttgtagcaatcaatctcaacaggagcat 18131486  T
Q  267 ccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcg 366  Q
    | ||| |  | |||| |||||||| ||| |||||||| || || |||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||    
T  18131485 ctctcctcttgggcctcctctcattattcagtctctgttttcctttgtcagcaggagcactatatggtttaggacgactctgctgtcctttacctctccg 18131386  T
Q  367 ctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagcc 466  Q
     ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||||| || ||| |||| ||||||||||||||| ||||  || || || || ||     
T  18131385 ttcactcatcactttgtaatgagctttagtgtcttcttcatatatcctacagctactcaccatatcagagaaaattcttatcttctgatacccaatggct 18131286  T
Q  467 ctcttgatgtc 477  Q
    |||||||||||    
T  18131285 ctcttgatgtc 18131275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 101 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 12857800 - 12857445
Alignment:
Q  101 tgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatcct 200  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||  ||| |||||  |||||||| || ||||  ||||| || |||| |||||| | ||| ||||||||||||||      
T  12857800 tgaccttcttcatcacaattgtagcaaacaatatcacgacgcttgcactcagctattatgtgtcctttctttccacatcggaaacacttcttctcatcac 12857701  T
Q  201 tcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtct 300  Q
        ||| || |||||| ||||||| || || |||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| ||||     
T  12857700 agtcacatacattactcatgtggcccttttcaccacacttgaaacagacaatctcagtaggagcatctctccttttaggcctcctctcatcattcagtcc 12857601  T
Q  301 ctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcc 400  Q
     || ||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  12857600 ttgtttacctttgtcagcaggagcactatacggttttggacgactctactgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttataatgagcttttgtatcc 12857501  T
Q  401 tcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggta 456  Q
    ||||| ||||| |||| || ||| ||||||||| | |||||||| |||| ||||||    
T  12857500 tcctcatagattctacagctactcaccaaatcaaaaaaaattcttatcttttggta 12857445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 36 - 474
Target Start/End: Original strand, 35982941 - 35983379
Alignment:
Q  36 cagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatc 135  Q
    ||||||||||||| || || |||||    ||||||||||| ||||| || || || | ||| || || || || |||||||| || |||||  ||| |||    
T  35982941 cagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacaatgcgaactaatatgtccttcctcattacagttgtagcaaacaatatc 35983040  T
Q  136 accgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgt-acaaacgttactcttgtggcctttctcgcc 234  Q
     || ||||||||||| || |   |||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  || ||| || |||||||||||||||||||| ||    
T  35983041 cccacgcttgcaatcagccaatgtgtgtcctttctgtccacatctgaaacacttcttctcatc-tcggtcacacacattactcttgtggcctttctcacc 35983139  T
Q  235 acacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggt 334  Q
    |||||| || || |  ||| ||| ||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| || ||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  35983140 acacttgaagcaaataatcacagtaggagcatctctcctcttaggcctcctctcatcattcagcctctgtttacctttgtcagcaggagcactatacggt 35983239  T
Q  335 ttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcag 434  Q
    || |||| | |||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||  |  |||||||| ||||    
T  35983240 ttcggacaactctgctgtcccttacctctgcactcactcatcactttataatgagctttggtatcctcttcatagattctacaactgcttaccaattcag 35983339  T
Q  435 agaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgat 474  Q
    | ||| |||| ||||  || || || ||||||||||||||    
T  35983340 aaaaatttcttatcttatgataaccaatagccctcttgat 35983379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 173 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 16825511 - 16825210
Alignment:
Q  173 ccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctct 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||      |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || || |||| ||||||||| |||     
T  16825511 ccacacctgaagcacttcttctcatcacggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctca 16825412  T
Q  273 tactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcact 372  Q
    |  | |||| ||||||||| || | ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||| || | |||||||| ||||| ||||||||    
T  16825411 tcttgggcctcctctcatctttcaatctctacttacccttgtcaggaggggcactatacggcttcggacgactcagctgtcccttgcctctgcgctcact 16825312  T
Q  373 catcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttg 472  Q
    ||||||||| ||||||||||| || || || || |||||||||| ||  |||||||| ||||| ||  |||| ||||  || || || ||||||||||||    
T  16825311 catcaccttgtaatgagctttcgtatcttcttcatagatcctacagctgcttaccaactcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttg 16825212  T
Q  473 at 474  Q
    ||    
T  16825211 at 16825210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 32 - 438
Target Start/End: Original strand, 12181100 - 12181506
Alignment:
Q  32 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 131  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||    |||||||||||||| || || ||||  | |||||| ||||| || |  || |||||||| ||  |||    
T  12181100 gtaccagtcaaagcaaacactttaccaccggtcctaaccttcttcggttgcgtacactacgaactgatatgaccttccttgttgcaattataacaaacaa 12181199  T
Q  132 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctc 231  Q
      || ||  |||| ||||| |||||  |||| || ||| | ||||| ||||||||||||||||||||  |   ||| || ||||||||||||||||| ||    
T  12181200 tgtccccaagcttacaatcagctagtgtgtgtcctttccgaccacaactgaagcacttcttctcatctctatcacagactttactcttgtggcctttttc 12181299  T
Q  232 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatac 331  Q
     |||||||| || || |  || |||| ||||||||| ||| |  | | || |||||||||||| |  |||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  12181300 accacacttgaagcaaaaaatgtcagtaggagcatctctcctcttggtcctcctctcatcatttaacctctacttacccttgtcagcaggagcactatac 12181399  T
Q  332 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 431  Q
    || ||  ||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||  |||||||| |    
T  12181400 ggcttcagacgactctgttgtcccttgcctcttcgttcactcatcaccttgtaatgagctttcgtgtcctcctcataaatcctacagccgcttaccaatt 12181499  T
Q  432 cagagaa 438  Q
    |||||||    
T  12181500 cagagaa 12181506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 399
Target Start/End: Original strand, 47126693 - 47127067
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || || ||||||| ||||  |||||||||||  |  ||||| | |||||| ||||| ||  |||| || || ||     
T  47126693 agtctgcgtaccagtcaaagcaaacaccttaccaccaattctagtcttcttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccttccccattgcagttgtaa 47126792  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatc-cttcgtacaaacgttactcttgtgg 223  Q
    ||  |||  || || |||||||| || ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| ||||||||||||    
T  47126793 cagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttcc-acaaacattactcttgtgg 47126891  T
Q  224 cctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacagggg 323  Q
    |||||||| ||||||||  | || || |||||| |||||||||| ||| |  | |||| ||| ||||||   |  |||||||| || |||||| |||| |    
T  47126892 cctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcctctgctttcctttgtcagcaggag 47126991  T
Q  324 cactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 399  Q
    |||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  47126992 cactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgagctttggtgtc 47127067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 477
Target Start/End: Original strand, 10408717 - 10409169
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||  |||||||||||  |  ||||| | |||||| ||||| ||  |||| || || ||     
T  10408717 agtctgcgtaccagtcaaagcaaacacctttccaccaattctagtcttcttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccttccccattgcagttgtaa 10408816  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatc-cttcgtacaaacgttactcttgtgg 223  Q
    ||  |||  || || |||||||| || ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| ||||||||||||    
T  10408817 cagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttcc-acaaacattactcttgtgg 10408915  T
Q  224 cctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacagggg 323  Q
    |||||||| ||||| ||  |||| || |||||||| |||||||| ||| |  | |||| ||| ||||||   |   |||| |||||||||||| |||| |    
T  10408916 cctttctcaccacatttgtaacaaacaatctcagctggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgtttacccttgtcagcaggag 10409015  T
Q  324 cactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgact 423  Q
    |||| || || ||||||||| |||| ||||||||||| || | ||||||||| | ||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |  | | |    
T  10409016 cactgtaaggcttaggacgactctggtgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcatagattctgcacctatt 10409115  T
Q  424 taccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
     ||||| ||||| |||| ||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  10409116 aaccaactcagaaaaaactctgatctgctgatatccaatagctcttttgatgtc 10409169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 399
Target Start/End: Original strand, 28757068 - 28757442
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||  |||||||||||  |  ||||| | ||| || ||||| ||| |||| ||||| ||     
T  28757068 agtctgcgtaccagtcaaagcaaacacctttcccccaattctagtcttcttcggctcaggacactgtgaactaatatgaccttctccattgcaattgtaa 28757167  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatc-cttcgtacaaacgttactcttgtgg 223  Q
    ||  |||  || || |||||||| || ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| ||||||||||||    
T  28757168 cagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttcc-acaaacattactcttgtgg 28757266  T
Q  224 cctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacagggg 323  Q
    |||||||| ||||||||  | || || |||||| |||||||||| ||| |  | |||| ||| ||||||   |   ||||||| || |||||| |||| |    
T  28757267 cctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtcagcaggag 28757366  T
Q  324 cactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 399  Q
    |||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  28757367 cactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtc 28757442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 167 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 11958419 - 11958137
Alignment:
Q  167 ttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcat 266  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||||||  |   |||| | || || ||||||||||| || ||||||||| |||| || || |||||||||||||    
T  11958419 ttctgaccacacctgaaacacttcctctcatctctaccacaagcattgcttttgtggcctttttcaccacacttataacaaacaatttcagcaggagcat 11958320  T
Q  267 ccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcg 366  Q
    | ||| |  |  ||| ||| |||||||| | |||||| || || |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |     
T  11958319 ctctcctcttaagcctcctatcatcattcattctctgtttccctttgtcagcaggagcactgtaaggtttaggacgattctgctgtcccttacctctcct 11958220  T
Q  367 ctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatct 449  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || ||||  | ||  |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  11958219 ctcactcatcaccttgtaatgaacttttgtgtcttcctcataaatcccgcagctgcttaccaactcagagaaaactctaatct 11958137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 32 - 435
Target Start/End: Original strand, 17494403 - 17494809
Alignment:
Q  32 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 131  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||    |||||||||||||| || || ||||| | ||| || ||||| || || || || ||||||||  |||    
T  17494403 gtaccagtcagagcaaacactttaccaccggtcctaaccttcttcggttgagtacactgcgaactaatatgaccttcctcgttgcagttatagcaaacaa 17494502  T
Q  132 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctc 231  Q
      || || | ||| || || |||||  |||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||  |   |||||| ||||||||||||||||| ||    
T  17494503 tgtctccacacttacagtcagctagtgtgtgtcctttctgaccacacctga-gcacttcttctcatctctatcacaaacattactcttgtggcctttttc 17494601  T
Q  232 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaac----aggggcact 327  Q
     ||||| || || || || ||||||| | ||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| |  |||||||||||||| ||| |    ||| |||||    
T  17494602 accacatttgaagcaaacaatctcagtatgagcatctctcctcttgggcctcctctcatcatttaacctctgcttacccttctcagccagcaggagcact 17494701  T
Q  328 atacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttacc 427  Q
    ||| || || | |||| | || ||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||  ||||||    
T  17494702 atatggcttcgaacgactttgttgtcccttggctctgcgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtatcctcctcatagattctacagctgcttacc 17494801  T
Q  428 aaatcaga 435  Q
    || |||||    
T  17494802 aactcaga 17494809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11949298 - 11949107
Alignment:
Q  32 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 131  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||| ||  || |||||   |||||||||||| || ||||| || ||||||||  |||    
T  11949298 gtaccagtcagagcaaacactttaccaccgatcctaaccttcttcgtctacgtacactgcaaactgatgtgaccttcctcattgcagttatagcaaacaa 11949199  T
Q  132 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtgg 223  Q
    |||| || ||||| ||||| ||||  ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  11949198 catctccccgcttacaatcagctaatatgtgtcctttctgaccacatctgaagcacttcttctcatctttagtacaaacattactcttgtgg 11949107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 16327089 - 16326713
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||  |||||||||||||||||  || ||||| | |||||| ||||||||| |||| || || |||    
T  16327089 agtctgcgtaccagtcaatgcaaacacctttccaccagttctaaccttcttcggcttagtacactgcgaactgatatgaccctctccattgcagttgtag 16326990  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggc 224  Q
    ||  |||  || || ||||| || || ||||   |||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||  |   |||||| || ||||||||||    
T  16326989 cagacaatgtccccacgcttacattcagctaaattgtgtcccttctgaccacacctgaaacatttcctctcatctctaccacaaacattgctcttgtggc 16326890  T
Q  225 ctttctcgccacacttaaaacacacta-tctcagcaggagca-tccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggg 322  Q
    |||| || ||||||||| |||| || | |||||||||||||| || ||| |  | || | ||| |||||||| |   | ||||| || |||||| ||||     
T  16326889 ctttttcaccacacttataacaaacaagtctcagcaggagcagtctctcctcttgggtctcctatcatcattcaccttttgctttcctttgtcagcagga 16326790  T
Q  323 gcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 399  Q
    ||||| |  || ||||||||| |||| |||||||| || || | ||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  16326789 gcactgtcaggcttaggacgactctgctgtcccttgcccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtc 16326713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 161 - 471
Target Start/End: Original strand, 11861228 - 11861538
Alignment:
Q  161 tgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcag 260  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| || |||||| | ||||  | |||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||| | || ||||| ||||    
T  11861228 tgacccttcttaccacaccagaaacatttcttcacctcctctggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaatagacaatctccgcag 11861327  T
Q  261 gagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacc 360  Q
    |||||||| ||||  | |||||||| |||||    | |||||| || || || ||| ||||||||||||| || |||||  || |||| || |||||| |    
T  11861328 gagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcctttatcagcaggggcactatagggcttagggtgactctggtggccctta-c 11861426  T
Q  361 tctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcc 459  Q
    |||| | |||| |||  ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| || | | ||||| ||||  |||| ||  ||||||||||||||    
T  11861427 tcttccactcattcacaaccttgtaatgagccttggtgtcttcctcatagattctacagctattcaccaactcaggaaaaactcagatctgttggtatcc 11861526  T
Q  460 tatagccctctt 471  Q
     || ||||||||    
T  11861527 gattgccctctt 11861538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 205 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 23415001 - 23414729
Alignment:
Q  205 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 304  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||||| |||||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | ||||||     
T  23415001 acaaacattactcttgtggcctttctcgccatagttgaaacagacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 23414902  T
Q  305 ttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 403  Q
    || ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||| |||  || |||||   |||| |||||| |||  ||||| | |||||| || || ||||||    
T  23414901 ttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctattggccctt-ggtcttccgctcattcacaaccttgtcatgagccttagtatcctcc 23414803  T
Q  404 tcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    |||||||| || | |  | | || ||||||| ||||| ||  | |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  23414802 tcgtagattctgcaggtattcactaaatcagggaaaactcggagctgttggtatccgattgccctcttgatgtc 23414729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 471
Target Start/End: Original strand, 15065990 - 15066256
Alignment:
Q  205 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 304  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| |||||||||||||| |||| || ||||| || |||||    | ||||||     
T  15065990 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatcgcagcaggagcatccttcttccttggccgtctatcatcgaccattctctgt 15066089  T
Q  305 ttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 403  Q
    || ||||| ||| |||||| |||||| || ||||| ||| |||| || ||||||  |||| |||||| ||| || ||| |||||||| ||||| || |||    
T  15066090 ttgcccttatcagcaggggaactatagggcttagggcgactctgctggccctta-gtcttccgctcattcaccatcttgtaatgagccttggtatcttcc 15066188  T
Q  404 tcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctctt 471  Q
    || || || |||| ||   | ||||| || ||||||| ||  |||| ||||||||| || ||||||||    
T  15066189 tcataaattctacagctgttcaccaactcggagaaaactcggatctattggtatccaattgccctctt 15066256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 477
Target Start/End: Original strand, 16695083 - 16695355
Alignment:
Q  205 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 304  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||    |||||||| ||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | ||||||     
T  16695083 acaaacattactcttgcggcctttctcgccacaattgaaacaagtaatctcagctggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 16695182  T
Q  305 ttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 403  Q
    || | ||| ||| ||||||||||||| || || || ||| ||||||| |||||   |||| | |||| | |  ||||| |||||||| || || ||||||    
T  16695183 ttgcacttatcagcaggggcactataaggcttcgggcgactctgatggccctt-ggtcttccactcatttacaaccttgtaatgagccttagtatcctcc 16695281  T
Q  404 tcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    || |||||||| | || | | || ||||||| ||||| ||  |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16695282 tcatagatcctgcagctattcactaaatcagggaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctcttgatgtc 16695355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 416
Target Start/End: Original strand, 15230531 - 15230743
Alignment:
Q  204 tacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctg 303  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || ||||||||  | || || |||||||||||| ||||  |  |  | |||| |||||||||||| | ||| ||    
T  15230531 tacaaacattactcttgtggcccttttcaccacacttgtagcaaacaatctcagcaggaacatcttttctcttaggcctcctctcatcatttaatctttg 15230630  T
Q  304 cttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtccctta--cctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcct 401  Q
    ||| || |||||| |||| |||||||| || |||||||||   || || || ||   |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  15230631 cttccctttgtcagcaggagcactatagggcttaggacgaccttgttggcctttgttcctcttc--tcactcataaccttataatgagctttggtatcct 15230728  T
Q  402 cctcgtagatcctac 416  Q
    |||| ||||| ||||    
T  15230729 cctcatagattctac 15230743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 416
Target Start/End: Original strand, 15236399 - 15236611
Alignment:
Q  204 tacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctg 303  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || ||||||||  | || || |||||||||||| ||||  |  |  | |||| |||||||||||| | ||| ||    
T  15236399 tacaaacattactcttgtggcccttttcaccacacttgtagcaaacaatctcagcaggaacatcttttctcttaggcctcctctcatcatttaatctttg 15236498  T
Q  304 cttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtccctta--cctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcct 401  Q
    ||| || |||||| |||| |||||||| || |||||||||   || || || ||   |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  15236499 cttccctttgtcagcaggagcactatagggcttaggacgaccttgttggcctttgttcctcttc--tcactcataaccttataatgagctttggtatcct 15236596  T
Q  402 cctcgtagatcctac 416  Q
    |||| ||||| ||||    
T  15236597 cctcatagattctac 15236611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 12843307 - 12843189
Alignment:
Q  212 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  || | || || |||||| ||||||||||  |||| || ||||||||||||||| | | |||||| || ||||    
T  12843307 ttactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatctcaacaggagcatctttcttcctaggccgcctctcatcaatcattctctgtttgccct 12843208  T
Q  312 tgtcaacaggggcactata 330  Q
    | ||| |||| ||||||||    
T  12843207 tatcagcaggagcactata 12843189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13317873 - 13317680
Alignment:
Q  101 tgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatcct 200  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||  | ||||| || ||||||||||| ||||  |  ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  13317873 tgaccttcttcattacagttataacaaaccacatccccacgcttgcaatccgctaaaacatgacctttttgaccacatctgaaacacttcttctcatctt 13317774  T
Q  201 tcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcatt 294  Q
    | || ||||| ||||| |||||||||||  | ||||||||  |||| || |  ||| |||||||||| |||   || |||| ||||||||||||    
T  13317773 tggtgcaaacattacttttgtggccttttgcaccacacttgtaacaaacaacatcaacaggagcatctctccccctaggcctcctctcatcatt 13317680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 205 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 16804158 - 16803886
Alignment:
Q  205 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 304  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||||    |||||||| ||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | ||||||     
T  16804158 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagctggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 16804059  T
Q  305 ttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 403  Q
    || ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||| |||| || |||||   |||| |||||| |||  ||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  16804058 ttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggccctt-ggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcc 16803960  T
Q  404 tcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    || || || || | || | | ||||||||||  |||| ||  |||||||||||| | || |||||||| |||||    
T  16803959 tcataaattctgcagctattaaccaaatcaggaaaaactcggatctgttggtattcgatcgccctcttaatgtc 16803886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 205 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 23079228 - 23079151
Alignment:
Q  205 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccg 282  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| |||||||||||||| |||| || |||||    
T  23079228 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacaaacaatcacagcaggagcatccttcttccttggccg 23079151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 365 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 2245712 - 2245628
Alignment:
Q  365 cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatct 449  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||  || ||| ||||| ||||| ||  |||||||||    
T  2245712 cgctcactcatcaccttataatgagctttggtatcatcctcataaatcctaaagctactcaccaactcagaaaagtttctaatct 2245628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 10417425 - 10417225
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| |||||||| || || | |||||| | ||| ||||||||||| |||  ||| ||| |     
T  10417425 agtctgcgtaccagtcaaagcaaatacttttcctccagttctgaccttcttaggttgcgggcactgcgaactaatgtgaccctcatcaccacagttaaaa 10417326  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggc 224  Q
    ||  ||| ||| || ||||||||||| || | ||  ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| |  || ||| | |||||||||||||    
T  10417325 caaacaatatctccacgcttgcaatccgccaacacatgacctttctgaccgcatctgaaacatttcttctcatcttgagtgcaagcattactcttgtggc 10417226  T
Q  225 c 225  Q
    |    
T  10417225 c 10417225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 14873786 - 14873719
Alignment:
Q  215 ctcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccg 282  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  14873786 ctcttatggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctcagcatgagcatccttcttcctcggccg 14873719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 300 - 477
Target Start/End: Original strand, 3688954 - 3689131
Alignment:
Q  300 tctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 399  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||  | | |||| |||  ||||| || ||||| || || ||    
T  3688954 tctgtttacccttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatc 3689053  T
Q  400 ctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    ||| ||||||||||| | || | | ||||||||    |||| ||| | |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  3689054 ctcttcgtagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 3689131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 273
Target Start/End: Original strand, 17497617 - 17497678
Alignment:
Q  212 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctctt 273  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| || ||||| |||||||||||| ||||    
T  17497617 ttactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctgcaggagcatccttctt 17497678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 273
Target Start/End: Original strand, 12501788 - 12501920
Alignment:
Q  141 gcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacactt 240  Q
    |||||||||| ||||   ||||||||||||  ||||||| ||| || |||||  | ||||  | |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  12501788 gcttgcaatcagctaatgtgtgacccttcttgccacaccggaaacatttctttacctcctcaggacaaacattgctcttgtggcctttctcgccacaatt 12501887  T
Q  241 aaaacacactatctcagcaggagcatccctctt 273  Q
     |||||    |||||||||||| ||||| ||||    
T  12501888 gaaacaggtaatctcagcaggaacatccttctt 12501920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 13317914 - 13317863
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttc 76  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||    
T  13317914 agtctgcgtaccagtcaaagcaaacacttttccaccagttctgaccttcttc 13317863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 385; Significance: 0; HSPs: 31)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 18051096 - 18050640
Alignment:
Q  21 tagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18051096 tagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaatt 18050997  T
Q  121 atagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttg 220  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18050996 ataacatacaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacatctgaaacacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttg 18050897  T
Q  221 tggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacag 320  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||   |    
T  18050896 tgacctttctcgccacacttaaagcacactatctcagcaggagcatccctcttactcggcctcctctcatcattaagtctctgcttacccttatcagtcg 18050797  T
Q  321 gggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcg 420  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18050796 gagcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctacagcg 18050697  T
Q  421 acttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  18050696 actcaccaaatcagagaaaattctaatctgctggtatcctatggctctcttgatgtc 18050640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 129 - 477
Target Start/End: Original strand, 14144875 - 14145223
Alignment:
Q  129 caacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggccttt 228  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14144875 caacatcaccacgcttgcaatcagctaacacgtgacccttttgaccacacctgaagcacttcttctcctccttggtacaaacgttactcttgtggccttt 14144974  T
Q  229 ctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcacta 328  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  14144975 ctcgccatacttaaaacaaactatctcagcaggagcatctctcctatatggcctcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactg 14145074  T
Q  329 tacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttacca 428  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |  ||||| ||||    
T  14145075 tacggcttaggacgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgccctcctcatagatcctgcaacgactcacca 14145174  T
Q  429 aatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  14145175 aatcagggaaaattctaatctgttggtatcctatggctctcttgatgtc 14145223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 25 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 14283513 - 14283061
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||   |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| || || |||||     
T  14283513 agtctgcgtaccagtcaaagcaaacactttcccaccggttctaaccttcttcggctgtgggcactgtgtgctgatatgaccctcttcgttgcagttataa 14283414  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggc 224  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  14283413 catacaacatcaccacgcttgcaatcagctaatgtgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacattactcttgtggc 14283314  T
Q  225 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggc 324  Q
    ||||||||||||||||  |||| || | ||||||||||||||| ||| ||   |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  14283313 ctttctcgccacacttgtaacaaacaacctcagcaggagcatctctcctaacgggcctcctctcatcattgagtctctgcttacccttatcagcaggggc 14283214  T
Q  325 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgactt 424  Q
    ||||||||| || || ||| |||| |||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  ||||||    
T  14283213 actatacggcttcgggcgactctgctgtcccttattccttctctcactcatcaccttgtaatgagctttagtgtcctcctcatagatcctgcaacgactt 14283114  T
Q  425 accaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  | |||||||||||    
T  14283113 accaaatcagagaaaattctaatctgttgctaccctatgactctcttgatgtc 14283061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 11385568 - 11385119
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || || ||||||  ||||| |||||| || || |||||||| | ||||||||| ||||| |||| |||||||||     
T  11385568 agtctgcgtaccagtcaaagcaaacaccttcccaccagttctaatcttctttggttgagtgcactgtgaactgatgtggccctcctcatcacaattataa 11385469  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggc 224  Q
    ||  |||||||||| | |||||| |  || |   |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||    
T  11385468 caaacaacatcacccctcttgcagttagccaatgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttggtacaaacattacttttgtggc 11385369  T
Q  225 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggc 324  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||| |  | ||||  ||||||||||| ||||  ||||| ||||||||| |||||||    
T  11385368 ctttctcgccacacttatagcaaactatctcagcaggagcatctctcctcttgggccttctctcatcattcagtcgttgctttcccttgtcagcaggggc 11385269  T
Q  325 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgactt 424  Q
    ||| ||||| |||||| || |||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| |  || ||||| ||||| || | ||  |||    
T  11385268 actgtacggcttaggatgactctgttgtcccttacccctccgctcactcatcatcttgtaatgagcttttgaatcttcctcatagattctgcagctgctt 11385169  T
Q  425 accaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgat 474  Q
    ||||| ||||| ||| |||| ||||  || || || || |||||||||||    
T  11385168 accaactcagaaaaagttctgatcttctgatagccaatggccctcttgat 11385119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 65 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 15099702 - 15099364
Alignment:
Q  65 ctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgac 164  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| | |||||| ||||| || ||||| || ||||| ||  | |  || || ||||| |||||  ||||  |||| |    
T  15099702 ctaaccttcttcggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcctcattgcagttataacaaacgatgtccccacgcttacaatcatctagagtgtgtc 15099603  T
Q  165 ccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagc 264  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||| ||||||    
T  15099602 ccttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctctatcacaaacgttactcttgtggcctttctcaccacacttgaagcaaactatgtcagtaggagc 15099503  T
Q  265 atccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt 364  Q
    ||| ||| |  | |||| |||| ||||||| |  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||  | |||||| |||| |||||||| |||||     
T  15099502 atctctcctcttgggcctcctcccatcatttaacctctgcttacccttgtcagcaggagcactatacggcgtcggacgactctgctgtcccttgcctcta 15099403  T
Q  365 cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 403  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  15099402 cgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtgtcctcc 15099364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 65 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 12712762 - 12712437
Alignment:
Q  65 ctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgac 164  Q
    |||||||||||| | || |||||||||| | |||| ||||||||  |||| || ||||||||| ||| |||||| || |||||||| |||| || |||||    
T  12712762 ctaaccttcttccgttgagtgcactgagaattgatatgaccctccccattgcagttatagcatacaatatcaccacgtttgcaatcagctaacacgtgac 12712663  T
Q  165 ccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||     
T  12712662 ccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatctttggtacaaacattacttttgtggcctttctcgccacacttaaagcaaactatctcaacaggagt 12712563  T
Q  265 atccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt 364  Q
     || ||     | || |  ||||||||||| ||||  ||||| |||||  || |||| ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| || ||     
T  12712562 gtctcttcccttgggtcttctctcatcattcagtcgttgctttcccttaccagcaggagcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttgcccctc 12712463  T
Q  365 cgctcactcatcaccttataatgagc 390  Q
    || ||||||||||||||  |||||||    
T  12712462 cgttcactcatcaccttggaatgagc 12712437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 32 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 12798633 - 12798194
Alignment:
Q  32 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 131  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||    ||| ||||||| |||||||| ||||| | |||||| ||||| ||||||||||| || |||||  |||    
T  12798633 gtaccagtcaacgcaaaaaccttgccacctgtcctagccttcttaggctgtgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaa 12798534  T
Q  132 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgt-acaaacgttactcttgtggcctttct 230  Q
    |||| || ||||  ||||| ||||   |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |  || |||||| |||||||||||||||||      
T  12798533 catccccacgctcacaatcagctaaagtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatc-tcggtcacaaacattactcttgtggcctttt- 12798436  T
Q  231 cgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactata 330  Q
      |||||||| ||||| || || |||| | ||||||| ||| |  |  ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  12798435 --ccacacttgaaacaaacaatatcagtatgagcatctctcctcttgagcctcctctcatcattcaatctctgcttacccttgtcagcaggagcactata 12798338  T
Q  331 cggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaa 430  Q
    ||| || |||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||| || || ||||||| ||  ||||||||     
T  12798337 cggcttcggacgactctgctgtcccttgcctctgcgctcactcatcaccttgtaaagagctttcgtatcctcttcataaatcctacagctgcttaccaac 12798238  T
Q  431 tcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgat 474  Q
    ||||| ||  |||| ||||  || || || ||||||||||||||    
T  12798237 tcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 12798194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 25 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 16947611 - 16947187
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| |||||| |||| ||||| ||||| |||||   |||| |||||||| ||||  | ||||| | |||||| ||||||||||| || || || |||    
T  16947611 agtctgcgtaccattcaatgcaaacactttcccaccggttctagccttcttcagctgaatacactgtgaactgatatgaccctcttcgttgcagttgtag 16947512  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggc 224  Q
    ||  |||  || || ||||| || || |||||  |||| || ||||| |||||||| |  |||||| |||||||  |   |||| | |||||||||||||    
T  16947511 caaacaatgtctccacgcttacattcagctagtgtgtgtcctttctgaccacacctaacacacttcctctcatctctaccacaagcattactcttgtggc 16947412  T
Q  225 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggc 324  Q
    |||| || ||||||||  |||| || || ||| | |||||||| ||| |  | ||||  ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16947411 ctttttcaccacacttgtaacaaacaatttcaactggagcatctctcctcttgggccttctctcatcattcattctctgctttcccttgtcagcaggggc 16947312  T
Q  325 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgactt 424  Q
    ||| || |||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||| || | || |||     
T  16947311 actgtatggtttaggacgactctgctgtcccttaccccttctctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatcctcttcatagattctgcagctactc 16947212  T
Q  425 accaaatcagagaaaattctaatct 449  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  16947211 accaattcagagaaaattctaatct 16947187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 32 - 477
Target Start/End: Original strand, 13676568 - 13677007
Alignment:
Q  32 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 131  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||   ||||||||||||||| ||||  ||||| | |||||| || ||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  13676568 gtaccagtcagagcaaacactttaccaccggttctaaccttcttcggttgtgcacactgtgaactgatatggccctcctcattgcagttatagcaaacta 13676667  T
Q  132 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctc 231  Q
      || || ||||| ||||| ||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   |||||| |||||||||||||||||||     
T  13676668 tgtctccccgcttacaatcagctaatgtgtgtcccttctgtccacacctgaagtacttcttctcatctttatcacaaacattactcttgtggcctttctt 13676767  T
Q  232 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatac 331  Q
     ||||||||  | || || |||||| |||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| |  ||||| || || |||||| |||| |||||||||    
T  13676768 accacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattcaacctctgttttcctttgtcagcaggagcactatac 13676867  T
Q  332 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 431  Q
    ||||||||| || |||| ||||  ||||||||      || ||||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| | || ||| |||||||    
T  13676868 ggtttaggatgactctgctgtcatttacctct------acacatcaccttgtaatgagctttagtatcttcttcatatatcctgcagctactcaccaaat 13676961  T
Q  432 cagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    ||||||||||||| ||||  || || || || || |||||||||||    
T  13676962 cagagaaaattcttatcttctgatacccaatggctctcttgatgtc 13677007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 32 - 402
Target Start/End: Original strand, 19150128 - 19150498
Alignment:
Q  32 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 131  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||| ||||||| || || || ||||| | ||| || || || ||||||||||| || |||||  |||    
T  19150128 gtaccagtcaacgcaaatactttaccacctatcctagccttcttaggttgcgtacactgcgaactaatatgtccttcttcattacagttgtagcaaacaa 19150227  T
Q  132 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctc 231  Q
     ||| || ||||||||||| || |   |||| || ||||| |||||||| ||||||||||||| |||      ||| || ||||| ||||||||||||||    
T  19150228 tatctccacgcttgcaatcagccaatgtgtgtcctttctgaccacacctaaagcacttcttctgatctcgatcacacacattactgttgtggcctttctc 19150327  T
Q  232 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatac 331  Q
     |||||||| || || || || |||| ||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  19150328 accacacttgaagcaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttaggcctcctctcatcattcaacctctgcttacccttgtcagcaggggcactaaac 19150427  T
Q  332 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctc 402  Q
    || || |||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  19150428 ggcttcggacgactctgctgtcccttacctatgcgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtatcctc 19150498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 32 - 402
Target Start/End: Original strand, 20749527 - 20749897
Alignment:
Q  32 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 131  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||| ||||||| || || || ||||| | ||| || || || ||||||||||| || |||||  |||    
T  20749527 gtaccagtcaacgcaaatactttaccacctatcctagccttcttaggttgcgtacactgcgaactaatatgtccttcttcattacagttgtagcaaacaa 20749626  T
Q  132 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctc 231  Q
     ||| || ||||||||||| || |   |||| || ||||| |||||||| ||||||||||||| |||      ||| || ||||| ||||||||||||||    
T  20749627 tatctccacgcttgcaatcagccaatgtgtgtcctttctgaccacacctaaagcacttcttctgatctcgatcacacacattactgttgtggcctttctc 20749726  T
Q  232 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatac 331  Q
     |||||||| || || || || |||| ||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  20749727 accacacttgaagcaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttaggcctcctctcatcattcaacctctgcttacccttgtcagcaggggcactaaac 20749826  T
Q  332 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctc 402  Q
    || || |||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  20749827 ggcttcggacgactctgctgtcccttacctatgcgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtatcctc 20749897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 68 - 474
Target Start/End: Original strand, 12459781 - 12460187
Alignment:
Q  68 accttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgaccct 167  Q
    |||||||||||||| || ||||| | ||| || ||||| |||||||| || ||||||||  |||  || || ||||| || || |||||  |||| ||||    
T  12459781 accttcttcggctgagtacactgtgaactaatatgaccttcttcattgcagttatagcagacaatgtccccacgcttacattcagctagggtgtgtccct 12459880  T
Q  168 tctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatc 267  Q
    |||| |||||||| || || ||| |||||||  |   |||| | || |||||||||||||| || ||||||||  |||| || |||||||||||| ||||    
T  12459881 tctgaccacacctaaaacatttcctctcatctctaccacaagcattgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacagacaatctcagcaggaacatc 12459980  T
Q  268 cctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgc 367  Q
     ||| |  | |||| ||| |||||||| | | ||||||| ||||||||| || | ||| | || || ||||||||| |||| ||||||||||| || | |    
T  12459981 tctcctcttgggcctcctatcatcattcattttctgctttcccttgtcagcaagagcattgtaaggcttaggacgactctgctgtcccttacccctcctc 12460080  T
Q  368 tcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccc 467  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| | ||  || ||||| |||||||||| ||||||||  || || ||||||||||    
T  12460081 tcactcatcaccttgtaatgagcttttgtgtcttcctcatatatcctgcagctgctcaccaactcagagaaaactctaatcttctgataccctatagccc 12460180  T
Q  468 tcttgat 474  Q
    |||||||    
T  12460181 tcttgat 12460187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 212 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 14261198 - 14260936
Alignment:
Q  212 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || || |  ||||||| ||||||||  |||    | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  14261198 ttactcttgtggcctttctcaccacacttgaagcaaataatctcagtaggagcatatctccccttaggcctcctctcatcattcagtctctacttaccct 14261099  T
Q  312 tgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagat 411  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||| |||  |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| || || ||    
T  14261098 tgtcagcaggggcactatacggcttcggacgactctactgtcccttacctttgcgctcactgatcaccttgtaatgagctttcgtatcctcttcatatat 14260999  T
Q  412 cctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgat 474  Q
    ||| | || ||| ||||| ||||||||| | || |||| ||| || || ||||||||||||||    
T  14260998 cctgcagctactcaccaactcagagaaattccttatcttttgatagccaatagccctcttgat 14260936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 449
Target Start/End: Original strand, 13024454 - 13024878
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||    ||| ||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||| ||||| || || || |||    
T  13024454 agtctgcgtaccagtcaatgcaaacactttcccaccggtcctagccttcttcggctgagtacactgagaactgatatgaccttcttcgttgcagttgtag 13024553  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggc 224  Q
    ||  |||  || || ||||| || || |||||  |||| || ||||  ||||||||||| || ||| ||||||   |   | || | || || |||||||    
T  13024554 cagacaatgtctccacgcttacattcagctagggtgtgtcctttctaaccacacctgaaacatttcctctcatatctaccataagcattgcttttgtggc 13024653  T
Q  225 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggc 324  Q
    |||| || ||||||||  |||| || || |||||||||||||| ||| |  | |||| ||| |||||||| |  |||||||| || |||||| |||| ||    
T  13024654 ctttttcaccacacttgtaacaaacaatttcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcattcatcctctgcttccctttgtcagcaggagc 13024753  T
Q  325 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgactt 424  Q
    ||| || ||||||||||||||||  ||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| | ||  |||    
T  13024754 actgtaaggtttaggacgattctactgtcccttacccctcctctcactcatcaccttgtaatgagctttggtgtcttcctcatatatcctgcagctgctt 13024853  T
Q  425 accaaatcagagaaaattctaatct 449  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||    
T  13024854 accaactcagagaaaactctaatct 13024878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 155
Target Start/End: Original strand, 14140789 - 14140919
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  14140789 agtctgcgtaccagtcaaagcaaataccttcccaccagttctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtggccctcttcgttacaattataa 14140888  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggcta 155  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14140889 catacaacatcaccacgcttgcaatcagcta 14140919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 26115722 - 26115277
Alignment:
Q  32 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 131  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||  ||||  ||||||||| |  |  ||||| ||||| || ||||| ||| |||| ||||| || ||  |||    
T  26115722 gtaccagtcaaagcaaacacctttccaccagttctagtcttcttcggttcaggacactgtgtactaatatgaccttctccattgcaattgtaacagacaa 26115623  T
Q  132 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatc-cttcgtacaaacgttactcttgtggcctttct 230  Q
      || || |||||||| || ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  26115622 tgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttcc-acaaacattactcttgtggcctttct 26115524  T
Q  231 cgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactata 330  Q
    | ||||||||  |||| || |||||||| |||||||| ||| |  | |||| ||| |||||| | |   ||||||| || |||||| |||| ||||| ||    
T  26115523 caccacacttgtaacaaacaatctcagccggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcactcatcttctgctttcctttgtcagcaggagcactgta 26115424  T
Q  331 cggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaa 430  Q
     || |||||||||||||| | ||||||||| || | ||||||||| | ||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||  |   | |||||     
T  26115423 aggcttaggacgattctgttatcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcatagattctacacctgttaaccaac 26115324  T
Q  431 tcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    |||||||| | ||| ||||| || ||||| || || |||||||||||    
T  26115323 tcagagaagactctgatctgctgatatccaatggctctcttgatgtc 26115277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 26091937 - 26091563
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||  |||||||||||  |  ||||| | |||||| ||||| ||  |||| || || ||     
T  26091937 agtctgcgtaccagtcaaagcaaacacctttccaccaattctagtcttcttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccttccccattgcagttgtaa 26091838  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatc-cttcgtacaaacgttactcttgtgg 223  Q
    ||  |||  || || |||||||| || ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| ||||||||||||    
T  26091837 cagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttcc-acaaacattactcttgtgg 26091739  T
Q  224 cctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacagggg 323  Q
    |||||||| ||||||||  | || || |||||| |||||||||| ||| |  | |||| ||| ||||||   |   ||||||| || |||||| |||| |    
T  26091738 cctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtcagcaggag 26091639  T
Q  324 cactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 399  Q
    |||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  26091638 cactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtc 26091563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 40924956 - 40924582
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||  |||||||||||  |  ||||| | |||||| ||||| ||  |||| || || ||     
T  40924956 agtctgcgtaccagtcaaagcaaacacctttcccccaattctagtcttcttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccttccccattgcagttgtaa 40924857  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatc-cttcgtacaaacgttactcttgtgg 223  Q
    ||  |||  || || |||||||| || ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| ||||||||||||    
T  40924856 cagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttcc-acaaacattactcttgtgg 40924758  T
Q  224 cctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacagggg 323  Q
    |||||||| ||||||||  | || || |||||| |||||||||| ||| |  | |||| ||| ||||||   |   ||||||| || |||||| |||| |    
T  40924757 cctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtcagcaggag 40924658  T
Q  324 cactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 399  Q
    |||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  40924657 cactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgagctttggtgtc 40924582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 399
Target Start/End: Original strand, 49155411 - 49155785
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||  |||||||||||  |  ||||| | |||||| ||||| ||  |||| || || ||     
T  49155411 agtctgcgtaccagtcaaagcaaacacctttccaccaattctagtcttcttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccttccccattgcagttgtaa 49155510  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatc-cttcgtacaaacgttactcttgtgg 223  Q
    ||  |||  || || |||||||| || ||||   | ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| ||||||||||||    
T  49155511 cagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactatgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttcc-acaaacattactcttgtgg 49155609  T
Q  224 cctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacagggg 323  Q
    |||||||| ||||||||  | || || |||||| |||||||||| ||| |  | |||| ||| || |||   |  |||||||| || |||||| |||| |    
T  49155610 cctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcctcacccatcctctgctttcctttgtcagcaggag 49155709  T
Q  324 cactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 399  Q
    |||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  49155710 cactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgagctttggtgtc 49155785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 13965807 - 13965433
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||  |||| ||||||||||||  |  ||||| | |||||| ||||||||| |||| ||||| |||    
T  13965807 agtctgcgtaccagtcaatgcaaacaccttcccaccagttctagccttcttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccctctccattgcaattgtag 13965708  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggc 224  Q
    ||  ||| ||| || |||||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||  | ||||| ||   |||||| ||||||||||||     
T  13965707 cagacaatatccccacgcttgcattcagctagactgtgacccttctgaccacacctgaagcattttctatcatctttaccacaaacattactcttgtggt 13965608  T
Q  225 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggc 324  Q
    ||||||| ||||||||  | ||  | ||||||||||||||||| ||| |  | |||| ||| ||||||   |   ||||||| || |||||| |||| ||    
T  13965607 ctttctcaccacacttgtagcaatcaatctcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtcagcaggagc 13965508  T
Q  325 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 399  Q
    ||| || || ||||||||||| || ||||||||||| || | ||||||||| | ||  |||||||||||||||||    
T  13965507 actgtaaggcttaggacgattatgttgtcccttacccctcctctcactcattatctggtaatgagctttggtgtc 13965433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 399
Target Start/End: Original strand, 21755522 - 21755896
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| || || || |||  |||||||||||||||||  |  ||||| |  || || ||||||||| |||| || || |||    
T  21755522 agtctgcgtaccagtcaatgcaaacaccttgcccccagttctaaccttcttcggctcaggacactgtgagctaatatgaccctctccattgcagttgtag 21755621  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggc 224  Q
    ||  ||| ||| || ||||| || || ||||   ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||   |||||| || ||||||||||    
T  21755622 cagacaatatccccacgcttacattcagctaaagtgtgacccttctgaccacacctgaaacacttcctctcatctttaccacaaacattgctcttgtggc 21755721  T
Q  225 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggc 324  Q
    |||| || ||||||||  |||| || |||||||  |||||||| ||| |  | |||| | | |||||| | |   ||||||| || |||||| |||| ||    
T  21755722 ctttttcaccacacttgtaacaaacaatctcagagggagcatctctcctcttaggcctcatgtcatcactcatattctgctttcctttgtcagcaggagc 21755821  T
Q  325 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 399  Q
    ||| || || ||||||||||| || ||||||||||| || | ||||||||| | ||| |||||||||||| ||||    
T  21755822 actgtaaggcttaggacgattttgttgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttgatgtc 21755896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 205 - 471
Target Start/End: Original strand, 9591653 - 9591919
Alignment:
Q  205 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 304  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||| ||||  | |||||||| ||||||   | |||||||    
T  9591653 acaaacattgctcttgtggcctttctcgccacagttgaaacagacaatctctgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcaaccattctctgc 9591752  T
Q  305 ttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 403  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| || |||||   |||| | |||| | |  ||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  9591753 ttgcccttatcaacaggggcactataaggcttagggcgactctgctggccctt-ggtcttcctctcattaacaaccttgtaatgagctctggtatcctcc 9591851  T
Q  404 tcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctctt 471  Q
    || ||||| || | || | | ||||||||||  |||| ||  |||||||||||||| || ||||||||    
T  9591852 tcatagattctgcagctattcaccaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctctt 9591919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 205 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 17703436 - 17703164
Alignment:
Q  205 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 304  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||| || || || |||||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | ||||||     
T  17703436 acaaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaacaatatccgcaggagcatccttcttctttggccgcctatcatcgaccattctctgt 17703337  T
Q  305 ttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 403  Q
    || ||||| |||  |||||||||||| |||||||| ||| |||| || |||||   |||| |||||| |||  ||||| ||||||||| |||| |||||     
T  17703336 ttgcccttatcagtaggggcactataaggtttagggcgactctgctggccctt-ggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagctctggtatcctct 17703238  T
Q  404 tcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    || |||||||||| ||   | |||||||  | ||||| ||  |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  17703237 tcatagatcctacagctgttcaccaaataggcgaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctcttgatgtc 17703164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 205 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 16726422 - 16726150
Alignment:
Q  205 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 304  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||| || || || |||||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | ||||||     
T  16726422 acaaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaacaatatccgcaggagcatccttcttctttggccgcctatcatcgaccattctctgt 16726323  T
Q  305 ttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcct 404  Q
    || ||||| |||  ||||||||| || |||||||| ||| |||| || |||||     |||||||| |||  ||||| ||||||||| |||| ||||| |    
T  16726322 ttgcccttatcagtaggggcactttaaggtttagggcgactctgctggcccttggtctttcgctcattcacaaccttgtaatgagctctggtatcctctt 16726223  T
Q  405 cgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    | |||||||||| ||   | |||||||  | ||||| ||  |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16726222 catagatcctacagctgttcaccaaataggcgaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctcttgatgtc 16726150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 390
Target Start/End: Original strand, 13004834 - 13004940
Alignment:
Q  284 ctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttat 383  Q
    ||||||||||| ||||  ||||| |||||| || ||||||| || ||||| ||||||||| |||| |||||||| || || || |||||||||||||| |    
T  13004834 ctctcatcattcagtcgttgctttcccttgccagcaggggcgctgtacggcttaggacgactctgttgtcccttgcccctccgttcactcatcaccttgt 13004933  T
Q  384 aatgagc 390  Q
    |||||||    
T  13004934 aatgagc 13004940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 320 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 11234082 - 11233925
Alignment:
Q  320 ggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgc 419  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||  | | |||| |||  ||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||| | ||    
T  11234082 ggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagc 11233983  T
Q  420 gacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
     | | ||||||||    |||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  11233982 tattgaccaaatcctgaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 11233925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 15145897 - 15145752
Alignment:
Q  212 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 311  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||  ||||  | || |||||||||||||||||| ||||  | || ||||| ||||||   | |||||| || ||||    
T  15145897 ttactcctgtggcctttctcaccacaagtaaagaagacaatctcagcaggagcatccttcttcttagggcgcctatcatcaactactctctgtttgccct 15145798  T
Q  312 tgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtccctt 357  Q
    | ||| |||||| |||||| || ||||||||| |||| || |||||    
T  15145797 tatcagcagggggactataaggcttaggacgactctgttgaccctt 15145752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 12203760 - 12203548
Alignment:
Q  204 tacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctg 303  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  | || || ||| |||||||| |||| ||| |  | || | |||||||||||| | ||| ||    
T  12203760 tacaaacattactcttgtggcccttctcaccacacttgtagcaaacaatcacagcaggaacatctctcctcttaggtctcctctcatcattcaatctttg 12203661  T
Q  304 cttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcc-ct-tacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcct 401  Q
     || || |||||| |||| ||||| || || |||||||||   || || || || | |||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  12203660 tttccctttgtcagcaggagcactgtagggcttaggacgaccttgctggcctctgttcctcttc--tcactcataaccttataatgaactttggtatcct 12203563  T
Q  402 cctcgtagatcctac 416  Q
    |||| ||||| ||||    
T  12203562 cctcatagattctac 12203548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 15157928 - 15157769
Alignment:
Q  318 caggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctacc 417  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||  ||| |||| |||  ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| |     
T  15157928 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctttctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 15157829  T
Q  418 gcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    || | | ||||||||    |||| ||| | |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  15157828 gctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 15157769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 330
Target Start/End: Original strand, 14042991 - 14043109
Alignment:
Q  212 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  || | || || |||||| || |||||||  |||| || || ||||||||||||   | |||||| |||||||    
T  14042991 ttactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcatacaatctcaacatgagcatctttctttctagggcgcctctcatcaaccattctctgtttaccct 14043090  T
Q  312 tgtcaacaggggcactata 330  Q
    | ||| |||| ||||||||    
T  14043091 tatcagcaggagcactata 14043109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 330
Target Start/End: Original strand, 14353021 - 14353139
Alignment:
Q  212 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  || | || || |||||| || |||||||  |||| || || ||||||||||||   | |||||| |||||||    
T  14353021 ttactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcatacaatctcaacatgagcatctttctttctagggcgcctctcatcaaccattctctgtttaccct 14353120  T
Q  312 tgtcaacaggggcactata 330  Q
    | ||| |||| ||||||||    
T  14353121 tatcagcaggagcactata 14353139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 385; Significance: 0; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 53750626 - 53750170
Alignment:
Q  21 tagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaatt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  53750626 tagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtggccctcttcattacaatt 53750527  T
Q  121 atagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttg 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53750526 atagcatacaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacatctgaaacacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttg 53750427  T
Q  221 tggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacag 320  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||   |    
T  53750426 tgacctttctcgccacacttaaagcacactatctcagcaggagcatccctcttactcggcctcctctcatcattaagtctctgcttacccttatcagtcg 53750327  T
Q  321 gggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcg 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  53750326 gggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcactttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctacagcg 53750227  T
Q  421 acttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  53750226 actcaccaaatcagagaaaattctaatctgctggtatcctatggctctcttgatgtc 53750170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 51603948 - 51603492
Alignment:
Q  21 tagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaatt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51603948 tagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtggccctcttcattacaatt 51603849  T
Q  121 atagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttg 220  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51603848 atagcacacaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacatctgaaacacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttg 51603749  T
Q  221 tggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacag 320  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||   |    
T  51603748 tgacctttctcgccacacttaaagcacactatctcagcaggagcatccctcttactcggcctcctctcatcattaagtctctgcttacccttatcagtcg 51603649  T
Q  321 gggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcg 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  51603648 gggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcactttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctacagcg 51603549  T
Q  421 acttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  51603548 actcaccaaatcagagaaaattctaatctgctggtatcctatggctctcttgatgtc 51603492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 32 - 438
Target Start/End: Original strand, 16150763 - 16151169
Alignment:
Q  32 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 131  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||   ||||||||||||||| |   |||| || |  || || || |||||||||| ||| ||||||||  |||    
T  16150763 gtaccagtcaatgcaaacactttcccaccggttctaaccttcttcggtttcttgcattgcgagctaatatgcccctcttcatcacagttatagcaaacaa 16150862  T
Q  132 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctc 231  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||  |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16150863 catcaccacgcttgcaatcagctagtgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttagtacaaacattactcttgtggcctttctc 16150962  T
Q  232 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatac 331  Q
    |||||||||| | || || || ||| |||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| |   ||||||| || ||||||  ||| |||||||||    
T  16150963 gccacacttatagcaaacaatatcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattcaacttctgctttcctttgtcagtaggagcactatac 16151062  T
Q  332 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 431  Q
    || || |||||| |||| ||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | || ||||||||| |    
T  16151063 ggcttcggacgactctgctgtcctttgccccttcgatcactcatcaccttgtaatgagcttttgtgtcctcctcatagattctgcagctacttaccaatt 16151162  T
Q  432 cagagaa 438  Q
    |||||||    
T  16151163 cagagaa 16151169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 32 - 438
Target Start/End: Original strand, 16154909 - 16155315
Alignment:
Q  32 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 131  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||   ||||||||||||||| |   |||| || |  || || || |||||||||| ||| ||||||||  |||    
T  16154909 gtaccagtcaatgcaaacactttcccaccggttctaaccttcttcggtttcttgcattgcgagctaatatgcccctcttcatcacagttatagcaaacaa 16155008  T
Q  132 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctc 231  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||  |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16155009 catcaccacgcttgcaatcagctagtgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttagtacaaacattactcttgtggcctttctc 16155108  T
Q  232 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatac 331  Q
    |||||||||| | || || || ||| |||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| |   ||||||| || ||||||  ||| |||||||||    
T  16155109 gccacacttatagcaaacaatatcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattcaacttctgctttcctttgtcagtaggagcactatac 16155208  T
Q  332 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 431  Q
    || || |||||| |||| ||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | || ||||||||| |    
T  16155209 ggcttcggacgactctgctgtcctttgccccttcgatcactcatcaccttgtaatgagcttttgtgtcctcctcatagattctgcagctacttaccaatt 16155308  T
Q  432 cagagaa 438  Q
    |||||||    
T  16155309 cagagaa 16155315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 101 - 467
Target Start/End: Original strand, 15073555 - 15073921
Alignment:
Q  101 tgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatcct 200  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||   |||||||||| ||||   |||| || |||| ||||||||| || ||||||||||||||      
T  15073555 tgaccttcttcatcacaattatagcaaacaacatcacaaagcttgcaatcagctaatgtgtgtcctttctttccacacctaaaacacttcttctcatcac 15073654  T
Q  201 tcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtct 300  Q
        ||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| ||| | || |||| |||||||||||| |||||    
T  15073655 ggtcacatacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacagacaatctcagtaggagcatctctcctcctaggcctcctctcatcattcagtct 15073754  T
Q  301 ctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcc 400  Q
    ||| ||| | |||||| |||| |||||||||||||| |||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  15073755 ctgtttaactttgtcagcaggagcactatacggtttcggacgactcagctgtcccttacctctacgctcactcatcaccttataatgagcttttgtatcc 15073854  T
Q  401 tcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccc 467  Q
    || || |||||||||| || ||| ||||||||||| ||| | || |||| |||||| || |||||||    
T  15073855 tcttcatagatcctacagctactcaccaaatcagaaaaattccttatcttttggtagccgatagccc 15073921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 32 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 14993512 - 14993151
Alignment:
Q  32 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 131  Q
    |||||| |||||||||| || || |||||    ||||||||||| || || || ||||| | |||||| ||||| || ||||| || || |||||  |||    
T  14993512 gtaccattcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggttgcgtacactgcgaactgatatgaccttcctcattgcagttgtagcaaacaa 14993413  T
Q  132 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctc 231  Q
    |||| ||  |||||||||| ||||   |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||  ||      |||||| ||||||||||||||||| ||    
T  14993412 catccccatgcttgcaatcagctaaagtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttcttctcacggtcacaaacattactcttgtggcctttttc 14993313  T
Q  232 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatac 331  Q
     |||||||| ||||| || || |||| ||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14993312 accacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattcaatctctgcttacccttgtcagcaggggcactatac 14993213  T
Q  332 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagcttt 393  Q
    || ||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14993212 ggcttcagacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttt 14993151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 65 - 438
Target Start/End: Original strand, 15266936 - 15267309
Alignment:
Q  65 ctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgac 164  Q
    ||||||||||||||||| || ||||  | |||||| ||||| ||||| || || ||||||||  |||  || ||  |||| ||||| |||||  |||| |    
T  15266936 ctaaccttcttcggctgcgtacactacgaactgatatgaccttcttcgttgcagttatagcaaacaatgtctccatgcttacaatcagctagagtgtgtc 15267035  T
Q  165 ccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagc 264  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |   |||||| |||||||| ||||| |||||  ||||||| || || || || |  | ||||||    
T  15267036 ctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctctgtcacaaacattactcttatggcccttctcatcacacttgaagcaaacaatattcgtaggagc 15267135  T
Q  265 atccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt 364  Q
    ||| ||| |  | |||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||| |||| |||||||| |||||     
T  15267136 atctctcctcttgggcctcctctcatcatttaacctctgcttacccttgtcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgttgtcccttgcctctg 15267235  T
Q  365 cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaa 438  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| | || ||||| ||||||||||||    
T  15267236 cgttcactcatcaccttgtaatgagctttcgtgtcctcctcataaatcctgcagctacttatcaaatcagagaa 15267309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 25 - 399
Target Start/End: Original strand, 20893151 - 20893525
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||  || ||||| | |||||| || ||||||||||| || || |||    
T  20893151 agtctgcgtaccagtcaaagcaaacacctttccaccagttctaaccttcttcggctcagtacactgcgaactgatatgcccctcttcattgcagttgtag 20893250  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggc 224  Q
     |  ||| ||| || |||||||| || ||||   |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |   |||||| || ||||||| ||    
T  20893251 tagacaatatccccacgcttgcattcagctaaattgtgtcccttctgaccacacctgaagcacttcctctcatctctaccacaaacattgctcttgttgc 20893350  T
Q  225 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggc 324  Q
    |||| || ||||||||  |||| || ||||||| ||||||||| ||| |  | |||| ||| |||||||| |   ||||||| || |||||| |||| ||    
T  20893351 ctttttcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttaggcctcctatcatcattcatcttctgctttcctttgtcagcaggagc 20893450  T
Q  325 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 399  Q
    ||| || || ||||||||| |||| |||||||| || || | ||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  20893451 actttaaggcttaggacgactctgctgtcccttgcccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtc 20893525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 438
Target Start/End: Original strand, 18259630 - 18259974
Alignment:
Q  94 actgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttc 193  Q
    |||||| ||||| || ||||| || ||||||||  |||  || || ||||| ||||| |||||  |||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18259630 actgatatgaccttcctcattgcagttatagcaaacaatgtccccacgcttacaatcagctagagtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttc 18259729  T
Q  194 tcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcat 293  Q
    |||||  |   |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| || || || | || |||||||||  || |  | |||| |||||||||||    
T  18259730 tcatctctatcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttaaagcaaacaatattagtaggagcatctgtcctcttgggcctcctctcatcat 18259829  T
Q  294 taagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagcttt 393  Q
    | |  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||| || |||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  18259830 ttaacctctgcttacccttgtcagcaggagcactatacggcttcggatgactctgctgtcccttgcccctacgctcactcatcaccttgtaatgagattt 18259929  T
Q  394 ggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaa 438  Q
     || || || || ||||||||   || |||||| |||||||||||    
T  18259930 tgtatcttcttcatagatcctgtagctacttactaaatcagagaa 18259974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 32 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 11204377 - 11204010
Alignment:
Q  32 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 131  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||  |||| |||| |||||||  |  ||||| | |||||| ||||||||| |||| ||||| |||||  |||    
T  11204377 gtaccagtcaaagcaaacaccttcccaccagttctagcctttttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccctctccattgcaattgtagcagacaa 11204278  T
Q  132 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctc 231  Q
     ||| || |||||||| |  |||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||  | |||||  |   |||||| || |||||||||||||||||    
T  11204277 tatccccacgcttgcattaagctagactgtgacccttctgaccacacctgaagcattttctatcatctctaccacaaacattgctcttgtggcctttctc 11204178  T
Q  232 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatac 331  Q
     ||||||||| |||| || ||||||| ||||||||| ||| |  | || | ||| |||||||| |   ||| ||| || |||||| |||| ||||||||     
T  11204177 accacacttataacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttgggtctcctatcatcattcatcttctactttcctttgtcagcaggagcactataa 11204078  T
Q  332 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 399  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  11204077 ggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtc 11204010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 29450689 - 29450237
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||  |||||||||||  |  ||||| | |||||||||||| ||  |||| || || ||     
T  29450689 agtctgcgtaccagtcaaagcaaacacctttcccccaattctagtcttcttcggctcaggacactgtgaactgatgtgaccttccccattgcagttgtaa 29450590  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatc-cttcgtacaaacgttactcttgtgg 223  Q
    ||  |||  || || |||||||| || ||||   ||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||| | ||  |||||| ||||||||||||    
T  29450589 cagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaaacacttcctatcatctcctcc-acaaacattactcttgtgg 29450491  T
Q  224 cctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacagggg 323  Q
    |||||||| ||||||||  | || || |||||| |||||||||| ||| |  | |||| ||| ||||||   |   ||||||| || |||||| |||| |    
T  29450490 cctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttaggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtcagcaggag 29450391  T
Q  324 cactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgact 423  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | ||||||||||||||||||||| || || || ||  | |  | | |    
T  29450390 cactgtaaggtttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgagctttggtgtcttcttcataaattttgcacctatt 29450291  T
Q  424 taccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
     ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  29450290 aaccaactcagaaaagattctgatctgttgatatccaatagcccttttgatgtc 29450237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 3261946 - 3261572
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||  |||||||||||  |  ||||| | |||||| ||||| ||  |||| || || ||     
T  3261946 agtctgcgtaccagtcaaagcaaacacctttccaccaattctagtcttcttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccttccccattgcagttgtaa 3261847  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatc-cttcgtacaaacgttactcttgtgg 223  Q
    ||  |||  || || |||||||| || ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| ||||||||||||    
T  3261846 cagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttcc-acaaacattactcttgtgg 3261748  T
Q  224 cctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacagggg 323  Q
    |||||||| ||||||||  | || || |||||| |||||||||| ||| |  | |||| ||| ||||||   |   ||||||| || |||||| |||| |    
T  3261747 cctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtcagcaggag 3261648  T
Q  324 cactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 399  Q
    |||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  3261647 cactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtc 3261572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 416
Target Start/End: Original strand, 7357387 - 7357778
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || || |||| |  |||| ||||||||||||  |  ||||| | ||| || ||||||||| |||| || || |||    
T  7357387 agtctgtgtaccagtcaatgcaaacaccttcccactagttctagccttcttcggctcaggacactgtgaactaatatgaccctctccattgcagttgtag 7357486  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggc 224  Q
    ||  |||  || || |||||||| || ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||   | |||| || ||||||||||    
T  7357487 cagacaatgtctccacgcttgcattcagctaaattgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctctcatctttaccataaacattgctcttgtggc 7357586  T
Q  225 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggc 324  Q
    ||||||| |||| |||  |||| || ||||||||||||||||| ||| |  | |||| ||| ||||||   |   ||||||| || |||||| |||| ||    
T  7357587 ctttctcaccactcttgtaacaaacaatctcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtcagcaggagc 7357686  T
Q  325 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 416  Q
    | | || || |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | ||| |||||||| |||||||| || || || |||||||    
T  7357687 aatgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagccttggtgtcttcttcataaatcctac 7357778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 44659018 - 44658566
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| |||||| |||||||||| || |||||||||  ||||  ||||||||| |  |  ||||| | ||| || ||||  ||| |||| ||||| ||     
T  44659018 agtctgcgtaccattcaaagcaaacacctttccaccagttctagtcttcttcggttcaggacactgtgaactaatatgacattctccattgcaattgtaa 44658919  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatc-cttcgtacaaacgttactcttgtgg 223  Q
    ||  ||| ||| || |||||||| || ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| ||||||||||||    
T  44658918 cagacaatatccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttcc-acaaacattactcttgtgg 44658820  T
Q  224 cctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacagggg 323  Q
    |||||||| ||||||||  | || || |||||| |||||||||| ||| |  | |||| ||| |||| |   |   ||||||| || |||||  |||| |    
T  44658819 cctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatgacccatcttctgctttcctttgtccgcaggag 44658720  T
Q  324 cactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgact 423  Q
    |||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | ||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||  |   |    
T  44658719 cactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcatagattctacacctgtt 44658620  T
Q  424 taccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
     ||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||| || || |||||||||||    
T  44658619 aaccaactcagagaagactctgatctgctgatatccaatggctctcttgatgtc 44658566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 294
Target Start/End: Original strand, 27903505 - 27903774
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |  ||| |||||||| || || |||||||| | ||| ||||  ||||| |||||||| |||||     
T  27903505 agtctgcgtaccagtcaaagcaaatacttttcctcaagttctgaccttcttaggttgcgtgcactgtgaactaatgttgccctcctcattacagttataa 27903604  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggc 224  Q
    ||  ||| ||| || |||||||| || || | ||  ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || |||||||||||||    
T  27903605 caaacaatatctccacgcttgcattcagccaacacatgacctttctgaccacatctgaaacacttcttctcatctttggtgcagacattactcttgtggc 27903704  T
Q  225 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcatt 294  Q
    ||||| | ||||||||  |||| || |  ||| |||||||||| |||   || |||||||||||||||||    
T  27903705 ctttcgcaccacacttgtaacaaacaacatcaacaggagcatctctccccctaggccgcctctcatcatt 27903774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 205 - 471
Target Start/End: Original strand, 13513650 - 13513916
Alignment:
Q  205 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 304  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||| ||||  | |||||||| ||||||   | |||||||    
T  13513650 acaaacattgctcttgtggcctttctcgccacagttgaaacagacaatctctgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcaaccattctctgc 13513749  T
Q  305 ttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 403  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| || |||||   |||| | |||| | |  ||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  13513750 ttgcccttatcaacaggggcactataaggcttagggcgactctgctggccctt-ggtcttcctctcattaacaaccttgtaatgagctctggtatcctcc 13513848  T
Q  404 tcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctctt 471  Q
    || ||||| || | || | | ||||||||||  |||| ||  |||||||||||||| || ||||||||    
T  13513849 tcatagattctgcagctattcaccaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctctt 13513916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 205 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 18604531 - 18604259
Alignment:
Q  205 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 304  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| | |||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | |||||||    
T  18604531 acaaacattactcttgtggcctttctcgccacagttaaaacaaataatctccgaaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgc 18604432  T
Q  305 ttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 403  Q
    || ||||| ||| |||||||| |||| || ||||| ||| |||| || ||||||  |||| | |||| | |  ||||| ||||||||| |||| |||||     
T  18604431 ttgcccttatcagcaggggcattataaggcttagggcgactctgctggccctta-gtcttcctctcattaacaaccttgtaatgagctatggtatcctct 18604333  T
Q  404 tcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    || |||||||||| ||   | |||||||||| ||||| ||  |  ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18604332 tcatagatcctacagctgttcaccaaatcagggaaaactcggagttgttggtatccgatcgccctcttgatgtc 18604259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 205 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 18224185 - 18223914
Alignment:
Q  205 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 304  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||| ||||  | ||||| || |||||    | ||||||     
T  18224185 acaaacattacacttgtggcctttctcgccacagttgaaacaaacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgtctatcatcgaccattctctgt 18224086  T
Q  305 ttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 403  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| || |||||   |||| |||||| |||  ||||| |||||||| ||||| || |||    
T  18224085 ttgcccttatcaacaggggcactataaggcttagggcgactctgctggccctt-ggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcttcc 18223987  T
Q  404 tcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgt 476  Q
    |||||||| || | || | | || ||||||| ||||| |   |||||||||||||| || ||| |||| ||||    
T  18223986 tcgtagattctgcagctattcactaaatcagggaaaactgggatctgttggtatccgatcgccatcttcatgt 18223914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 402
Target Start/End: Original strand, 14697408 - 14697598
Alignment:
Q  212 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 311  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||  || | || || |||||||||| ||||||  |||| || |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  14697408 ttactcttatggcctttctcaccacaagtatagcaaacaatctcagcagtagcatctttctttctaggcctcctctcatcattcaatctttgcttaccct 14697507  T
Q  312 tgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctc 402  Q
    | ||| |||| ||||| || || || |||||| | || || ||||| ||| | | |||| |||  || || |||||||||||||| |||||    
T  14697508 tatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactttgctgacccttgcctttcctctcattcacaactttgtaatgagctttggtatcctc 14697598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 16248388 - 16248122
Alignment:
Q  205 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 304  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| | || |||||    |||||||  ||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | ||||||     
T  16248388 acaaacattactcttgtggcctttctcaccataattgaaacatgtaatctcagttggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 16248289  T
Q  305 ttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttc-gctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 403  Q
    |  ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||||  ||||| ||||| |||  ||||| |||||||| || || ||||||    
T  16248288 tggcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttag-tcttctgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcctcc 16248190  T
Q  404 tcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctctt 471  Q
    |  |||||||| | || | | |||||||||| ||||| ||  |||||||||||||  || ||||||||    
T  16248189 ttatagatcctgcagctattaaccaaatcagggaaaactcggatctgttggtatctgatcgccctctt 16248122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 405
Target Start/End: Original strand, 8343 - 8536
Alignment:
Q  212 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  || | || || |||||| ||||||||||  ||||  | || ||||||||||||   | |||||| |||||||    
T  8343 ttactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatctcaacaggagcatctttctttatagggcgcctctcatcaaccattctctgtttaccct 8442  T
Q  312 tgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctc 405  Q
    | ||| |||| ||||| || || ||||||||| |||| || || ||  || |||||||| |||  | ||| |||||||  ||||| ||||||||    
T  8443 tatcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgacctttggcttttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcctcctc 8536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 15741 - 15548
Alignment:
Q  212 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  || | || || |||||| ||||||||||  |||| || || ||||||||||||   | |||||| |||||||    
T  15741 ttactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatctcaacaggagcatctttctttctagggcgcctctcatcaaccattctctgtttaccct 15642  T
Q  312 tgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctc 405  Q
    | ||| |||| ||||| || |  ||||||||| |||| || || ||  || |||||||| |||  | ||| |||||||  ||||| ||||||||    
T  15641 tatcagcaggagcactgtaagtcttaggacgactctgctgacctttgacttttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcctcctc 15548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 327
Target Start/End: Original strand, 16219495 - 16219610
Alignment:
Q  212 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 311  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  || | ||||  |||||| ||||||||||  |||| || |||| |||||| ||||||| ||| || || ||||    
T  16219495 ttactcttatggcctttctcgccacaagtatagcacataatctcaacaggagcatctttctttctaggcctcctctcgtcattaactctttgttttccct 16219594  T
Q  312 tgtcaacaggggcact 327  Q
    | ||| |||| |||||    
T  16219595 tatcagcaggagcact 16219610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 327
Target Start/End: Original strand, 16222815 - 16222930
Alignment:
Q  212 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 311  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  || | ||||  |||||| ||||||||||  |||| || |||| |||||| ||||||| ||| || || ||||    
T  16222815 ttactcttatggcctttctcgccacaagtatagcacataatctcaacaggagcatctttctttctaggcctcctctcgtcattaactctttgttttccct 16222914  T
Q  312 tgtcaacaggggcact 327  Q
    | ||| |||| |||||    
T  16222915 tatcagcaggagcact 16222930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 300 - 414
Target Start/End: Original strand, 8389804 - 8389918
Alignment:
Q  300 tctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 399  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||  | |  ||| |||  ||||| || ||||| ||||| ||    
T  8389804 tctgtttacccttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatc 8389903  T
Q  400 ctcctcgtagatcct 414  Q
    |||||| ||||||||    
T  8389904 ctcctcatagatcct 8389918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0765 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 1)
Name: scaffold0765
Description:

Target: scaffold0765; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 25 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 6412 - 5963
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  6412 agtctgtgtaccagtcaaagcaaatacctttccaccagttctaaccttcttctgttgtgtgcactgagtactgatgtggccctattcgttacaattatag 6313  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggc 224  Q
    ||| ||| ||| || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6312 catacaatatcgccacgcttacaatcagctagcacgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggc 6213  T
Q  225 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggc 324  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||| || |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  6212 ctttctcgccacacttaaaacaaactatctcgacaggagcatctctcctattcggcctcctctcatcattcagtctttgcttacccttgtcagcaggggc 6113  T
Q  325 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgactt 424  Q
    ||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |   |||||    
T  6112 actgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacctcttcgttcactcatcactttataatgagctttggtgtcctcctcataaatcctgcaatgactt 6013  T
Q  425 accaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgat 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  6012 accaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatggctctcttgat 5963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 22)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 25 - 474
Target Start/End: Original strand, 22054049 - 22054498
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || |||||     
T  22054049 agtctgcgtaccagtcaaagcaaacacttttccaccagttctatccttcttcggctgtgtgcactgtgtactgatatggccctcttcgttgcagttataa 22054148  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggc 224  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| ||||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  22054149 catacaacatcaccacgcttgcaatccgctaaaaggtgacccttctgaccacatctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacattactcttgtggc 22054248  T
Q  225 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggc 324  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  22054249 ctttctcgccacacttaaaacaaactatctcagcagaagcatctctcctattcggcctcctctcatcattaagtctctgcttacccttatcagcaggggc 22054348  T
Q  325 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgactt 424  Q
    ||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||     
T  22054349 actgtacggcttaggacgactctgccgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcacagatcctgcaacgactc 22054448  T
Q  425 accaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgat 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22054449 accaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatggctctcttgat 22054498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 25 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 22027875 - 22027423
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||  | ||||||    
T  22027875 agtctgcgtaccggtcaatgcaaacacttttccaccggttctaaccttcttcggctgtgtgcactgagaactgatatggccctcttcattgtagttatag 22027776  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggc 224  Q
    ||  |||| || || | ||| ||||| ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  22027775 caaacaacgtctcccctcttacaatcagctaatgtgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttggtacaaacattactcttgtggc 22027676  T
Q  225 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggc 324  Q
    |||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||| || | |||| |||||||||||| | ||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  22027675 ctttatcgccacacttgtaacaaactatctcagcaggagcatctctcctattgggcctcctctcatcattcaatctttgctttcccttgtcagcaggggc 22027576  T
Q  325 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgactt 424  Q
    ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |  ||||||    
T  22027575 actgtacggtttaggacgactctgctgtcccttaccacttcgctcactcatcaccttataatgatcttttgtgtcctcctcatagatcctgcaacgactt 22027476  T
Q  425 accaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  22027475 accaaatcagagaaaattctaatctgttgataccctatggctctcttgatgtc 22027423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 16268819 - 16268367
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||  |  ||||| | |||||| ||||||||| |||| ||||| |||    
T  16268819 agtctgcgtaccagtcaaagcaaacacttttccaccagttctagccttcttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccctctccattgcaattgtag 16268720  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggc 224  Q
    ||  ||| ||| || |||||||| || |||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||| |||||||||||||    
T  16268719 cagacaatatccccacgcttgcattcagctaggctatgacccttctgaccacacctgaagcacttcctctcatctttaccacaaacattactcttgtggc 16268620  T
Q  225 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggc 324  Q
    ||||||| ||||||||  |||| || ||||||| ||||||||| |||||  | |||| ||| |||||| | |   ||||||| || |||||| || | ||    
T  16268619 ctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcttcttaggcctcctgtcatcactcatcttctgctttcctttgtcagcaagagc 16268520  T
Q  325 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgactt 424  Q
    ||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| |  || ||||||||||||||||| || || || || ||||  | | |     
T  16268519 actgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcattatattgtaatgagctttggtgtcttcttcataaattctacaactatta 16268420  T
Q  425 accaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    ||||| |||||||| | ||| ||||| || || || |||||||| ||||||||    
T  16268419 accaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagcccttttgatgtc 16268367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 104 - 474
Target Start/End: Original strand, 21928693 - 21929063
Alignment:
Q  104 ccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcg 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||||  | |   |||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  |    
T  21928693 ccctcttcatcacaattatagcaaacgacatcaccacgcttgcaatcacccaaagtgtgtcctttctgtccacatctgaaacacttcttctcatc-tcgg 21928791  T
Q  204 t-acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctct 302  Q
    | ||  || ||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||| ||| | || |||| |||||||||||| || ||||    
T  21928792 tcacttacattactctcgtggcccttttcgccacacttgaaacaaagaatctcagtaggagcatctctcctcctaggcctcctctcatcattcagcctct 21928891  T
Q  303 gcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctc 402  Q
    | || || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  21928892 gttttcctttgtcagcaggagcactatacggtttaggacgactctgttgtcccttacctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtatcctc 21928991  T
Q  403 ctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgat 474  Q
     || ||||| |||| ||  |||||||| ||||| ||| |||| ||||  || || || ||||||||||||||    
T  21928992 ttcatagattctacagctgcttaccaattcagaaaaatttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 21929063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 101 - 435
Target Start/End: Original strand, 22374131 - 22374465
Alignment:
Q  101 tgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatcct 200  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||| ||||   |||| || |||| ||||||||| || |||||||| |||||      
T  22374131 tgaccttcttcatcacaattatagcaaacaatatcaccacgcttgcaatcagctaatgtgtgtcctttctttccacacctaaaacacttcttttcatcac 22374230  T
Q  201 tcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtct 300  Q
        ||| || |||||||||||| |||| || |||||||| ||||| || ||||||| ||||| ||| ||| | || |||| |||||| |||||||||||    
T  22374231 ggtcacatacattactcttgtggtctttttcaccacacttgaaacagacaatctcagtaggagaatctctcctcctaggcctcctctcctcattaagtct 22374330  T
Q  301 ctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcc 400  Q
     || ||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  22374331 ttgtttacctttgacagcaggggcactatacggtttcggacgactctactgtcccttacctctgcgctcactcatcaccttataatgagcttttgtatcc 22374430  T
Q  401 tcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcaga 435  Q
    ||||  |||||||||| || ||| |||||||||||    
T  22374431 tcctgatagatcctacagctactcaccaaatcaga 22374465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 33 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 31414119 - 31413703
Alignment:
Q  33 taccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaac 132  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||   |||| ||||||||| ||| || ||||| | |||||| ||||| ||||| || || || |||||  |||     
T  31414119 taccagtcaatgcaaacactttcccaccggttctagccttcttcgactgagtacactgtgaactgatatgaccttcttcgttgcagttgtagcaaacaat 31414020  T
Q  133 atcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcg 232  Q
     || || ||||| || || |||||  |||| || ||||| |||||||| || |||||| |||||||  |   |||| | || ||||| |||||||| ||     
T  31414019 gtccccacgcttacattcagctagtgtgtgtcctttctgaccacacctaaaacacttcctctcatctctaccacaagcattgctcttatggcctttttca 31413920  T
Q  233 ccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacg 332  Q
    |||||||| ||||| || || ||| |||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||| || || |    
T  31413919 ccacacttgaaacaaacaatttcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattcattctctgctttcccttgtcagcaggggcgctgtaag 31413820  T
Q  333 gtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatc 432  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| | ||   ||||||| |     
T  31413819 gtttaggacgactctgctgtcccttaccccttcgctcactcatcattttgtaatgagctttggtgtcttcctcatatatcctgcagctgtttaccaactt 31413720  T
Q  433 agagaaaattctaatct 449  Q
    |||||||||| ||||||    
T  31413719 agagaaaattttaatct 31413703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 104 - 435
Target Start/End: Original strand, 19985445 - 19985776
Alignment:
Q  104 ccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcg 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||| || | ||||||||| ||||   |||| |  ||||||||||| |||||  |||||||||||||         
T  19985445 ccctcttcatcacaattatagcaaacaacatccccactcttgcaatcagctaatgtgtgtcatttctgtccacatctgaaatacttcttctcatcacggt 19985544  T
Q  204 tacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctg 303  Q
     ||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| ||| |  | |||| |||||||||| | |  |||||    
T  19985545 cacatacattactcttgtggcttttttcgccacacttgaaacaaacaatctcagtaggagcatctctcctcttaggcctcctctcatcaatcatcctctg 19985644  T
Q  304 cttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 403  Q
     |||||||||||  |||||||||||||||| || |||||| |||| | |||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  19985645 tttacccttgtccgcaggggcactatacggcttcggacgactctgctatcccttgccactgcgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtatcctct 19985744  T
Q  404 tcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcaga 435  Q
    || || |||||||  |  ||||||||||||||    
T  19985745 tcatatatcctacaactgcttaccaaatcaga 19985776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 416
Target Start/End: Original strand, 28984097 - 28984488
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||  |||||||||||  |  ||||| | |||||| ||||| ||  |||| || || ||     
T  28984097 agtctgtgtaccagtcagagcaaacacctttccaccaattctagtcttcttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccttccccattgcagttgtaa 28984196  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatc-cttcgtacaaacgttactcttgtgg 223  Q
    ||  |||  || || |||||||| || ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| ||||||||||||    
T  28984197 cagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttcc-acaaacattactcttgtgg 28984295  T
Q  224 cctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacagggg 323  Q
    |||||||| ||||||||  |||| || |||||| | |||||||| ||| |  | |||| ||| ||||||   |  |||||||| ||||||||  |||| |    
T  28984296 cctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcaactggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcctctgctttcccttgtccgcaggag 28984395  T
Q  324 cactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 416  Q
    |||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | ||| ||||||||||||||||| || || || |||||||    
T  28984396 cactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcataaatcctac 28984488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 29301021 - 29300597
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||| ||||| | ||| ||||| ||||| |  ||| ||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||    
T  29301021 agtctgcgtacccgtcaatgaaaacactttcccaccgatcctagccttcttcggctgagtacactgagaactgatatgaccttcttcattgcagttatag 29300922  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggc 224  Q
     |  |||  || || ||||| || || |||||  |||| ||  |||| |||||||| || |||||| | |||||  |   |||| | || ||||||||||    
T  29300921 tagacaatgtccccacgcttacattcagctagtgtgtgtcctctctgaccacacctaaaacacttcctttcatctctaccacaagcattgctcttgtggc 29300822  T
Q  225 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggc 324  Q
    || | || |||||||||||||| || || ||||| ||| |||| | | |  | |||| ||| |||||||| |   ||||||| || |||||| |||| ||    
T  29300821 ctctttcaccacacttaaaacaaacaatttcagcgggaacatctcccctcttgggcctcctatcatcattcatcttctgcttccctttgtcagcaggagc 29300722  T
Q  325 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgactt 424  Q
    ||| || |||||||||||| ||| |||||||||||| || | ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| | ||  |||    
T  29300721 actgtaaggtttaggacgactctaatgtcccttacccctcctctcactcattaccttgtaatgagcttttgtgtcctcctcatatatcctgcagctgctt 29300622  T
Q  425 accaaatcagagaaaattctaatct 449  Q
    || || |||||||||| ||||||||    
T  29300621 actaactcagagaaaactctaatct 29300597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 212 - 404
Target Start/End: Original strand, 22523883 - 22524075
Alignment:
Q  212 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 311  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  || | ||||| |||||| ||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||| ||| || || ||||    
T  22523883 ttactcctgtggcctttctcgccacaagtatagcacacaatctcaacaggagcatctttcttcctaggccgcctctcatcattaactctttgttttccct 22523982  T
Q  312 tgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcct 404  Q
    | ||| |||||||||| || || || |||||| |||| || || || ||| |||||||| |||  | ||| |||||||| || || |||||||    
T  22523983 tatcagcaggggcactgtaaggctttggacgactctgctgacctttgccttttcgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatcctcct 22524075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 205 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 30310559 - 30310353
Alignment:
Q  205 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 304  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || || |||||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | ||||||     
T  30310559 acaaacattactcttgtggcctttctcgccacagttgaaacaaacaatatccgcaggagcatccttcttctttggccgcctatcatcgaccattctctgt 30310460  T
Q  305 ttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 403  Q
    || ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||| || |||||   |||| |||||| |||  ||||| |||||||| || || ||||||    
T  30310459 ttgcccttatcagcaggggcactataaggtttagggcgactctgctgaccctt-ggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcctcc 30310361  T
Q  404 tcgtagat 411  Q
    ||||||||    
T  30310360 tcgtagat 30310353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 205 - 477
Target Start/End: Original strand, 15536749 - 15537021
Alignment:
Q  205 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 304  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |  ||||| | |||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | |||||||    
T  15536749 acaaacattactcttgtggccttcttcgccacaattaaaacaaataatctccgaaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgc 15536848  T
Q  305 ttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 403  Q
    || ||||| ||  ||||||||||||| || ||||| ||| |||| || |||||   |||| |||||| |||  ||||| |||||||| ||  | || |||    
T  15536849 ttgcccttatcggcaggggcactataaggcttagggcgactctgctggccctt-ggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttactatcttcc 15536947  T
Q  404 tcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    ||||||||||| | || | | || ||||||| ||||| || ||  ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  15536948 tcgtagatcctgcagctattcactaaatcagggaaaactcgaagttgttggtatccgatcgccctcttgatgtc 15537021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 477
Target Start/End: Original strand, 22043193 - 22043465
Alignment:
Q  205 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 304  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||    |||||||  ||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | ||||||     
T  22043193 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagttggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 22043292  T
Q  305 ttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 403  Q
    || |||||||||  |||||||||||| || |||||  || |||| || |||||   |||| |||||| |||  ||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  22043293 ttgcccttgtcagtaggggcactataaggcttagggtgactctgctggccctt-ggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcc 22043391  T
Q  404 tcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    || || ||||| |  | | | |||||||||| ||||| ||  |||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  22043392 tcataaatcctgcatctattaaccaaatcagggaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctcttaatgtc 22043465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 477
Target Start/End: Original strand, 32603511 - 32603783
Alignment:
Q  205 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 304  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||| || ||||| || || || | |||||||||| ||||  | || ||||| |||||    | |||||||    
T  32603511 acaaacattactcttgtggcctttcccaccacagttgaaacaaacaatttccgaaggagcatccttcttcttaggtcgcctatcatcgaccattctctgc 32603610  T
Q  305 ttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcg-ctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 403  Q
    || ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||||  |||||  |||| | |  ||||| ||||||||| |||| |||||     
T  32603611 ttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttag-tcttcctctcattaacaaccttgtaatgagctctggtatcctct 32603709  T
Q  404 tcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    ||||||||||||| ||   | |||||||||| ||||| ||  |  ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  32603710 tcgtagatcctacagctgttcaccaaatcagggaaaactcggagttgttgatatccgatcgccctcttgatgtc 32603783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 215 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21163935 - 21163877
Alignment:
Q  215 ctcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctctt 273  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  21163935 ctcttgtggtctttctcgccacaattaaaacagacaatctcagcaggagcatccttctt 21163877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 21391269 - 21391199
Alignment:
Q  212 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccg 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||   |||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  21391269 ttactcttgtggcctttctcaccacaagaaaaacaaacaatctcagcaggagcatccttcttcctcggccg 21391199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 21780595 - 21780525
Alignment:
Q  212 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccg 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||   |||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  21780595 ttactcttgtggcctttctcaccacaagaaaaacaaacaatctcagcaggagcatccttcttcctcggccg 21780525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 6607024 - 6606849
Alignment:
Q  65 ctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgac 164  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| | |||||  || || ||||||| ||||||  ||||  ||| ||| || |||||||| || |||| | | || |    
T  6607024 ctaaccttcttaggctgtgtacactgtgaactgagatgtccttcttcatcacaattgaagcaaacaatatccccacgcttgcattcagctatcgtatgcc 6606925  T
Q  165 ccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacactt 240  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||| ||     | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  6606924 ccttctttccacatcggaagcacttcttctcctcaccattgcaaacattactcttgtggcccttctcaccacactt 6606849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 300 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 19481395 - 19481335
Alignment:
Q  300 tctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacc 360  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  19481395 tctgtttacccttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttacc 19481335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 80
Target Start/End: Original strand, 28989316 - 28989371
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggct 80  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||  |||||||||||    
T  28989316 agtctgtgtaccagtcagagcaaacacctttccaccaattctagtcttcttcggct 28989371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 477
Target Start/End: Original strand, 18860055 - 18860212
Alignment:
Q  320 ggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgc 419  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||  | | |||| |||  ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||||| ||    
T  18860055 ggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctacagc 18860154  T
Q  420 gacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
     | | |||||||| |  |||| ||| | ||||||||| || || ||||||||||||||    
T  18860155 tattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 18860212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 365 - 402
Target Start/End: Original strand, 20391612 - 20391649
Alignment:
Q  365 cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctc 402  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  20391612 cgctcactcataaccttataatgagctttggtatcctc 20391649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 25 - 474
Target Start/End: Original strand, 203530 - 203979
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||     
T  203530 agtctgcgtaccagtcaaagcaaacacttttccactagttctaaccttcttcgactgtgtgcactgtgtactgatatggccctcttcgttacagttataa 203629  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggc 224  Q
    ||| ||||||||||   ||||||||| ||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  203630 catacaacatcaccatccttgcaatccgctaaaaggtgacccttctgaccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacattactcttgtggc 203729  T
Q  225 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggc 324  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||   |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  203730 ctttctcgccacacttaaaacaaactatctcaccaggagcatctctcctaacgggcctcctctcatcattcagtctctgcttacccttgtcagcaggggc 203829  T
Q  325 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgactt 424  Q
    ||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||    
T  203830 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcatagatcctgcaacgactt 203929  T
Q  425 accaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgat 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  203930 accaaatcagagaaaattctaatctgttggtaccctatggctctcttgat 203979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 318 - 477
Target Start/End: Original strand, 424750 - 424909
Alignment:
Q  318 caggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctacc 417  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||| | || |||||||| ||  | |||||| ||| || ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |     
T  424750 caggggcattgtacggcttaggacgactatgctgtcccttgcccttccgctcattcaccatcttgtaatgagccttggtatcctcctcatagattctgca 424849  T
Q  418 gcgacttaccaaatc-agagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    || | | |||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  424850 gctattaaccaaatccaga-aaaactctaatctgttgatatccaatcgccctcttaatgtc 424909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 25 - 474
Target Start/End: Original strand, 263375 - 263824
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||     
T  263375 agtctgcgtaccagtcaaagcaaacacttttccactagttctaaccttcttcgactgtgtgcactgtgtactgatatggccctcttcgttacagttataa 263474  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggc 224  Q
    ||| ||||||||||   ||||||||| ||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  263475 catacaacatcaccatccttgcaatccgctaaaaggtgacccttctgaccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacattactcttgtggc 263574  T
Q  225 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggc 324  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||   |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  263575 ctttctcgccacacttaaaacaaactatctcagcaggagcatctctcctaacgggcctcctctcatcattcagtctctgcttacccttgtcagcaggggc 263674  T
Q  325 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgactt 424  Q
    ||| ||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |  ||||||    
T  263675 actgtacggcttaagacgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgaactttggtgtcctcctcatagatcctgcaacgactt 263774  T
Q  425 accaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgat 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  263775 accaaatcagagaaaattctaatctgttggtaccctatggctctcttgat 263824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 16 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 9951 - 9491
Alignment:
Q  16 atcactagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcatta 115  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || | |||||| ||     
T  9951 atcattagtagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacttttccaccagttctaaccttcttcggcagtgtgcactgtgtactgatatggcactcttcgttg 9852  T
Q  116 caattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttac 215  Q
    || ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||  | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  9851 cagttataacatacaacatcaccacgcttgcaatccgctaaaaggtgacccttctaaccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacattac 9752  T
Q  216 tcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||   |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  9751 tcttgtggcctttctcgccacacttaaaacaaactatctcagcaggagcatctctcctaacgggcctcctctcatcattaagtctcagcttacccttatc 9652  T
Q  316 aacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatccta 415  Q
    | |||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  9651 agcaggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcatagatcctg 9552  T
Q  416 ccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||    
T  9551 caacgacttaccaaatc-gagaaaattctaatctgttggtacactatggctctcttgatgtc 9491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 25 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 17639 - 17187
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||     
T  17639 agtctgcgtaccagtcaaagcaaacattttcccaccagttctaaccttcttcggctgtgtacactgagtactgatatggccctcttcgttgcaattgtaa 17540  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggc 224  Q
    ||| |||||||||| ||| || |||| ||||   |||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  17539 catacaacatcaccacgcatgtaatccgctaatgtgtgacccttttgatcacacctaaagcacttcttctcatccttggtacaaacattactcttgtggc 17440  T
Q  225 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggc 324  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||| ||||| || || ||||||||| |||||||    
T  17439 ctttctcgccacacttataacaaactatctcagcaggagcatctctcctattcggcctcctctcatcattcagtctttgttttcccttgtcagcaggggc 17340  T
Q  325 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgactt 424  Q
    ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  ||| ||    
T  17339 actgtacggtttaggacgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagcttttgtgtcctcctcatagatcctgcaacgattt 17240  T
Q  425 accaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  17239 accaaatcagagaagattctaatctgttgctaccctatggctctcttgatgtc 17187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 37 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 4992 - 4567
Alignment:
Q  37 agtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatca 136  Q
    |||||||||||| |||||||||||   |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||| || || || ||||| ||| ||||||||    
T  4992 agtcaaagcaaacacttttccaccggttctaaccttcctcggctgtgtacactgagtactgatatggccctcctcgttgcagttataacatacaacatca 4893  T
Q  137 ccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccac 236  Q
    || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  4892 ccacgcttgcaatcagctaacatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatctttggtacaaacattactcttgtggcctttctggccac 4793  T
Q  237 acttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggttt 336  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| || | |||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  4792 acttataacagactatctcagcaggagcatctctcctatttggcctcctctcatcattcagtctttgctttcccttgtcaaaaggggcactgtacggttt 4693  T
Q  337 aggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagag 436  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||     |||||||||||| ||||    
T  4692 aggacgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgaggttttgtgtcctcctcatagattctgaaatgacttaccaaattagag 4593  T
Q  437 aaaattctaatctgttggtatcctat 462  Q
    || ||||||||||||||||| |||||    
T  4592 aagattctaatctgttggtaccctat 4567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 25 - 477
Target Start/End: Original strand, 40207 - 40659
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||     
T  40207 agtctgcgtaccagtcaaagcaaacactttcccaccggttctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatatggccctcttcgttgcagttataa 40306  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggc 224  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  40307 catacaacatcacaacgcttgcaatccgctaacatgtgacccttctaaccacacctgaagcacttcttatcatctttggtacaaacattactcttgtggc 40406  T
Q  225 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggc 324  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  40407 ctttctcgccacacttataacagactatctcagcaggagcatctctcctattcggcctcctctcatcattcagtctttgctttcccttgtcagcaggggc 40506  T
Q  325 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgactt 424  Q
    ||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| || |  ||||||    
T  40507 actgtacggtttaggacgactctgttgtcccatacctcttcgctcactcatcaccttataatgagcttttgtgtcctctttatagattctgcaacgactt 40606  T
Q  425 accaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    ||||||| |||||| |||||||| | |||||| ||||| || |||||||||||    
T  40607 accaaattagagaagattctaatatattggtaccctatggctctcttgatgtc 40659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 25 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 64757 - 64305
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||| | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| || || |||||||||| ||||||||||    
T  64757 agtctgcgtaccagccaaagcaaacactttcctaccagttctaaccttcttcggttgtgtgcactgtgaactaatatggccctcttcatcacaattatag 64658  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggc 224  Q
    ||  | |||||||| ||||||||||  |||||  |||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  64657 caaactacatcaccacgcttgcaattagctagtgtgtgtcctttctgaccacacctgaaacatttcttctcatccttggtacaaacattactcttgtggc 64558  T
Q  225 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggc 324  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||    
T  64557 ctttctcgccacacttgtaacaaactatctcagcaggagcatccctcctattcggcctcctttcatcattcagtctctgctttcccttgtcagccggggc 64458  T
Q  325 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgactt 424  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |  ||||||    
T  64457 actatacggtttaggacgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagcttttgagtcctcctcatatatcctgcaacgactt 64358  T
Q  425 accaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  64357 accaaatcagagaaaattctaatctgttgataccctatggctctcttgatgtc 64305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 25 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 49335 - 48883
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||| | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| || || |||||||||| ||||||||||    
T  49335 agtctgcgtaccagccaaagcaaacactttcctaccagttctaaccttcttcggttgtgtgcactgtgaactaatatggccctcttcatcacaattatag 49236  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggc 224  Q
    ||  | |||||||| ||||||||||  |||||  |||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  49235 caaactacatcaccacgcttgcaattagctagtgtgtgtcctttctgaccacacctgaaacatttcttctcatccttggtacaaacattactcttgtggc 49136  T
Q  225 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggc 324  Q
    | ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||    
T  49135 ccttctcgccacacttgtaacaaactatctcagcaggagcatccctcctattcggcctcctttcatcattcagtctctgctttcccttgtcagccggggc 49036  T
Q  325 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgactt 424  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |  ||||||    
T  49035 actatacggtttaggacgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagcttttgagtcctcctcatatatcctgcaacgactt 48936  T
Q  425 accaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||||||    
T  48935 accaaatcagagaaaattctaatctgctgataccctatggctctcttgatgtc 48883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 25 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 58369 - 57917
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||| | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| || || |||||||||| ||||||||||    
T  58369 agtctgcgtaccagccaaagcaaacactttcctaccagttctaaccttcttcggttgtgtgcactgtgaactaatatggccctcttcatcacaattatag 58270  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggc 224  Q
    ||  | |||||||| ||||||||||  |||||  |||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  58269 caaactacatcaccacgcttgcaattagctagtgtgtgtcctttctgaccacacctgaaacatttcttctcatccttggtacaaacattactcttgtggc 58170  T
Q  225 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggc 324  Q
    | ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||    
T  58169 ccttctcgccacacttgtaacaaactatctcagcaggagcatccctcctattcggcctcctttcatcattcagtctctgctttcccttgtcagccggggc 58070  T
Q  325 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgactt 424  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |  ||||||    
T  58069 actatacggtttaggacgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagcttttgagtcctcctcatatatcctgcaacgactt 57970  T
Q  425 accaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||||||    
T  57969 accaaatcagagaaaattctaatctgctgataccctatggctctcttgatgtc 57917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 438
Target Start/End: Original strand, 29774 - 30186
Alignment:
Q  26 gtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagc 125  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || |||||    |||||||||||||| || || ||||| | |||||| ||||| || ||||| ||| |||| |    
T  29774 gtctgcgtaccagtcaaagcaaacaccttaccacctgtcctaaccttcttcggttgcgtacactgcgaactgatatgaccttcctcattgcaaatataac 29873  T
Q  126 atccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcc 225  Q
    |  | |  || || | ||| ||||| |||||  |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |   |||||||||||||||||||||    
T  29874 aaacgatgtccccacacttacaatcagctagagtgtgtcccttttgaccacacctgaagcacttcttctcatctctatcacaaacgttactcttgtggcc 29973  T
Q  226 tttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggca 325  Q
    |||||| |||||||| || || ||||| |||| |||| |||| ||| |  | |||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||| |||    
T  29974 tttctcaccacacttgaagcaaactatgtcagtaggaacatctctcctcttgggcctcctctcatcatttaaactctgcttacccttgtcagcaggagca 30073  T
Q  326 ctatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgactta 425  Q
    |||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||  ||||    
T  30074 ctatacggcttcggacgactctgctgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtgtcctcctcataaatcctacagctgctta 30173  T
Q  426 ccaaatcagagaa 438  Q
    |||||||||||||    
T  30174 ccaaatcagagaa 30186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1914 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold1914
Description:

Target: scaffold1914; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 164 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 1246 - 936
Alignment:
Q  164 cccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggag 263  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  1246 cccttctgtccacatctgaaacacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtgacctttctcgccacacttaaagcatactatctcagcagaag 1147  T
Q  264 catccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctct 363  Q
    || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1146 cacccttcttactcggcctcctctcatcattaagtctctgcttacccttatcagccggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctct 1047  T
Q  364 tcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctata 463  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||     
T  1046 tcgctcactcttcaccttataatgagctttggtgtcctcctcatagatcctgcagcgactcaccaaattagagaaaattctgatctgttggtatcctatg 947  T
Q  464 gccctcttgat 474  Q
    |||||||||||    
T  946 gccctcttgat 936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 25 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 642 - 218
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||| || ||||||    
T  642 agtctgtgtaccagtcaatgcaaacactttcccatcggttctaaccttcttcggctgtgtgcactgtgaactgatatggccctcttcattgcagttatag 543  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggc 224  Q
    ||  |||||||||| ||||||||||| |||||  |||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  542 caaacaacatcaccacgcttgcaatcagctaggctgtgtcctttctgaccacacctgaaacacttcttctcatccttggtacaaacatcactcttgtggc 443  T
Q  225 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggc 324  Q
    |||||  |||||| ||  |||| || ||||||||||||||||| ||| || | |||| |||||||||||| | | ||||||| ||||||||| |||||||    
T  442 ctttcctgccacatttgtaacaaacgatctcagcaggagcatctctcctattgggcctcctctcatcattcaatatctgctttcccttgtcagcaggggc 343  T
Q  325 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgactt 424  Q
    ||| ||||| |||||  || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||     
T  342 actgtacggcttagggtgactctgttgtcccttacctcttcgttcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctacaactactc 243  T
Q  425 accaaatcagagaaaattctaatct 449  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  242 accaaatcagagaagattcttatct 218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 32 - 393
Target Start/End: Original strand, 20970 - 21331
Alignment:
Q  32 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 131  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||   ||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||  | ||||| ||||| || ||||||||    |    
T  20970 gtaccagtcagagcaaacactttaccaccggttctaaccttcttcggttgtgtacactgtgaactgatacggccctcctcattgcagttatagcaaatta 21069  T
Q  132 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctc 231  Q
      || || ||||| |||||  |||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21070 tgtctccccgcttacaatcaactaatgtgtgtcccttctgtccacacctgaagcacttcttctcacctttagtacaaacattactcttgtggcctttctc 21169  T
Q  232 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatac 331  Q
     ||||||||  | || || |||||||||| |||||| ||| |  | |||| |||||||||||| || ||||| || || |||||| ||||||||||||||    
T  21170 accacacttgtagcaaacaatctcagcagaagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattcagcctctgttttcctttgtcagcaggggcactatac 21269  T
Q  332 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagcttt 393  Q
    |||||||||||| |||  |||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21270 ggtttaggacgactctactgtcccttgcctttacgctcactcatcaccttgtaatgagcttt 21331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 25 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 53578 - 53126
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||| |||||| || | |||||| || |||||||||||||| |||||     
T  53578 agtctgcgtaccagtcaatgcaaatactttcccaccggttctaaccttcttcggctatgtgcattgtgaactgatatggccctcttcattacagttataa 53479  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggc 224  Q
    ||| | || ||||| |||||||||||  |||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  53478 cataccacgtcaccacgcttgcaatcaactaggatgtgtcctttttgaccacacctgaatcatttcttctcatccttagtacaaacattactcttgtggc 53379  T
Q  225 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggc 324  Q
    ||||||||||||||||  |||| || ||| ||||| ||||||| ||| || | |||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  53378 ctttctcgccacacttgtaacaaacgatcccagcaagagcatctctcctattgggcctcctctcatcattcaatctctgctttcccttgtcagcaggggc 53279  T
Q  325 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgactt 424  Q
    ||| || ||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | || |||     
T  53278 actgtatggtttaggacgaacttgatgtcccttatctcttcgctcactcatcaccttataatgagccttggtgtcttcctcatatatcctgcagctactc 53179  T
Q  425 accaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||| || || || || |||||||||||    
T  53178 accaaatccgagaagattctaatcttttgatacccaatggctctcttgatgtc 53126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 25 - 477
Target Start/End: Original strand, 22271 - 22723
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||| |   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| || ||||||    
T  22271 agtctgagtaccagtcaatgcaaacactataccaacggttctaaccttcttcggctgtgtgcactgagaactgatatggccctcttcattgcagttatag 22370  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggc 224  Q
    ||  |||||||||| |||||||||||  ||||  |||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  22371 caaacaacatcaccacgcttgcaatcaactagggtgtgtcctttctgaccacacttgaagcatttcttctcatccttagtaaaaacattactcttgtggc 22470  T
Q  225 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggc 324  Q
    ||||||||||||||||  |||| || |||||| |||||||||| ||| || | |||| |||||||||||| ||||| || || || |||||  |||||||    
T  22471 ctttctcgccacacttgtaacaaacgatctcaacaggagcatctctcctattgggcctcctctcatcattcagtctttgatttcctttgtcggcaggggc 22570  T
Q  325 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgactt 424  Q
    ||| || ||||||||| || |||  ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | || ||||    
T  22571 actgtatggtttaggaagactctactgtcccttaccccttcgcccactcatcaccatataatgagcttttgtgtcctcctcatagattctgcagctactt 22670  T
Q  425 accaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || || || || || |||||||||||    
T  22671 accaaatcagagaaaattcttatcttctgatacccaatggctctcttgatgtc 22723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 168; Significance: 8e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 134 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 11952 - 11609
Alignment:
Q  134 tcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgc 233  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11952 tcaccacgcttgcaatcagctagagtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttagtacaaacattactcttgtggcctttctcgc 11853  T
Q  234 cacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacgg 333  Q
    |||||||  |||| || ||||||| ||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||| ||    
T  11852 cacacttgtaacaaacgatctcagtaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattaagtctctgctttcctttgtcagcaggagcactatatgg 11753  T
Q  334 tttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatca 433  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||| | ||  ||||||||||||    
T  11752 tttaggacgactctgctgtcccttacctcttctctcactcatcaccttataatgagccttagtgtcctcttcatatatcctgcagctgcttaccaaatca 11653  T
Q  434 gagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    ||||||||| |||||| ||| || ||||| || |||||||||||    
T  11652 gagaaaattttaatcttttgataccctatggctctcttgatgtc 11609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 32 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 2100 - 1683
Alignment:
Q  32 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 131  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||    |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||| || ||||| || ||||||||  |||    
T  2100 gtaccagtcagagcaaacactttaccaccggtcctaaccttcttcggttgtgtacactgcgaactgatatgaccttcctcattgcagttatagcaaacaa 2001  T
Q  132 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctc 231  Q
    | || || ||||| ||||| ||||   |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| ||||||||||||||||||||    
T  2000 cgtctccccgcttacaatcagctaatgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttatcacaaacattactcttgtggcctttctc 1901  T
Q  232 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatac 331  Q
     ||||||||  | || || || ||||||||||||||  || |  | |||| |||||||||||| || ||||| || || |||||| |||| ||||||||     
T  1900 accacacttgtagcaaacaatttcagcaggagcatctatcctcttgggcctcctctcatcattcagcctctgttttcctttgtcagcaggagcactatat 1801  T
Q  332 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 431  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || || || || || ||| | | || ||| |||||||    
T  1800 ggtttaggatgactctgctgtcccttacctctgcgctcactcatcaccttgtaatgagctttagtatcttcttcatatatcatgctgctactcaccaaat 1701  T
Q  432 cagagaaaattctaatct 449  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  1700 cagagaaaattcttatct 1683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 294
Target Start/End: Original strand, 70521 - 70790
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||  ||| |||||||| || || |||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| |||||     
T  70521 agtctgcgtaccagtcaaaacaaatacttttcctccagttctgaccttcttaggttgcgtgcactgtgaactaatgtggccctcctcattacagttataa 70620  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggc 224  Q
    ||  ||| ||| || |||||||| || || | ||  ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || || || || |||| ||||||||    
T  70621 caaacaatatctccacgcttgcattcagccaacacatgacctttatgaccgcatctgaaacacttcttctcatctttggtgcagacattacccttgtggc 70720  T
Q  225 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcatt 294  Q
    ||||| | ||||||||  |||| || |  ||| |||||||||| |||   || |||||||||||||||||    
T  70721 ctttcgcaccacacttgtaacaaacaacatcaacaggagcatctctccccctaggccgcctctcatcatt 70790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 477
Target Start/End: Original strand, 18797666 - 18798126
Alignment:
Q  17 tcactagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 116  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||   |||||||||||| || || |||||||| | |||||| || || || ||||| |    
T  18797666 tcactagtagtctgcgtaccagtcaatgcaaacactttcccaccggttctaaccttctttggttgagtgcactgtgaactgatatggccttcatcattgc 18797765  T
Q  117 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttact 216  Q
    | ||||||||  |||| ||||| ||||||||||| |||||  |||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||| || || ||||| |||||    
T  18797766 agttatagcaaacaacgtcaccacgcttgcaatcagctagagtgtgtcccttctgaccacacctgaaacatttctgctcatctttagtgcaaacattact 18797865  T
Q  217 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||  |||||||||||||| |  | |||| |||||||||||| | ||| ||||| |||||||||    
T  18797866 cttgtggcctttctcgccacacttataacaaacaatatccacaggagcatccctcctcttgggcctcctctcatcattcaatctttgctttcccttgtca 18797965  T
Q  317 acaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 416  Q
     |||| ||||||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||  |||||||| || ||||| || |    
T  18797966 gcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttgcctctgcggtcactcatcaccttgtaatgagcttctgtgtcctcttcatagattctgc 18798065  T
Q  417 cgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
     || ||||||||| ||||||||  |||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  18798066 agctacttaccaactcagagaagtttctgatcttctggtatccaatagccctcttgatgtc 18798126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 21567288 - 21566878
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| |||||| ||||| |||||||| | ||||||||| ||||| | || |||||||||     
T  21567288 agtctgcgtaccagtcaaagcaaacacttttccaccggttctaatcttctttggctgagtgcactgggaactgatgtggccctccttatcacaattataa 21567189  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggc 224  Q
    ||  |||||||||| | |||||| |  || |   |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||    
T  21567188 caaacaacatcacccctcttgcagttagccaatgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttagtacaaacattacttttgtggc 21567089  T
Q  225 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggc 324  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| |  | ||||  ||||||||||| ||||  ||||| ||||||||| |||||||    
T  21567088 ctttctcgccacacttaaagcaaactatttcagcaggagcatctctcctcttgggccttctctcatcattcagtcgttgctttcccttgtcagcaggggc 21566989  T
Q  325 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgactt 424  Q
    ||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||| |  || ||||| ||||| |||| ||  |||    
T  21566988 actgtacggcttaggacgactctgttgtcccttactcctccgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgaatcttcctcatagattctacagctgctt 21566889  T
Q  425 accaaatcaga 435  Q
    ||||| |||||    
T  21566888 accaactcaga 21566878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 14377221 - 14376800
Alignment:
Q  17 tcactagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 116  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| || || | ||||||||| ||||||||||| |    
T  14377221 tcactagtagtctgcgtaccagtcaatgcaaacacttttccaccggttctaaccttcttcggctgtgtacattgcgaactgatgtggccctcttcattgc 14377122  T
Q  117 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttact 216  Q
    | ||||| ||  |||||||||| ||||| ||||  ||||   |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  14377121 agttataacaaacaacatcaccacgcttacaattagctaaagtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttagtacaaacattact 14377022  T
Q  217 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 316  Q
    ||||||||||||||| || |||||  | || || |  ||| |||||||||| ||| || | || | |||||||||||| |  ||||| || |||||||||    
T  14377021 cttgtggcctttctcaccgcacttgtagcaaacaacatcaacaggagcatctctcctattgggtctcctctcatcattcaacctctgttttcccttgtca 14376922  T
Q  317 acaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 416  Q
     |||| ||||||||||| || |||||| |||| |||||||| |  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  14376921 gcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttgctccttcgatcactcatcaccttgtaatgagctttcgtgtcctcctcatagatcctgc 14376822  T
Q  417 cgcgacttaccaaatcagagaa 438  Q
     || ||| ||||| ||||||||    
T  14376821 agctactaaccaattcagagaa 14376800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 32 - 435
Target Start/End: Original strand, 19437993 - 19438396
Alignment:
Q  32 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 131  Q
    |||||||||| |||||| || || |||| |   |||||||||||||||||||||||||| | |||||| || | |||||| || || ||||| ||| |||    
T  19437993 gtaccagtcagagcaaacaccttaccactagtcctaaccttcttcggctgtgtgcactgcgaactgatatggcgctcttcgttgcagttataacatacaa 19438092  T
Q  132 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctc 231  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||  |||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  19438093 catcaccacgcttgcaatcagctagagtgtgtcctttctgaccacacctgaaacacttattctcatctttagtacaaacattactcaagtggcctttctc 19438192  T
Q  232 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatac 331  Q
     ||||||||  |||  || ||||||||||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||| ||||||||     
T  19438193 accacacttgtaacgaacgatctcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcatttaacctctgcttacccttgtcagcaggagcactatat 19438292  T
Q  332 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 431  Q
    || || |||||| |||| |||||||||||||| |  |||||||  ||||| |||| ||| || || ||||| || |||||||||| ||  |||||||| |    
T  19438293 ggcttcggacgactctgctgtcccttacctctcctttcactcactaccttgtaataagccttcgtatcctcttcatagatcctacagctgcttaccaact 19438392  T
Q  432 caga 435  Q
    ||||    
T  19438393 caga 19438396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 65 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 24515671 - 24515343
Alignment:
Q  65 ctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgac 164  Q
    |||||| || |||| || || ||||| | |||||||||||| || ||||| || ||||| ||  ||||||| || | ||| ||||| |||||  |||| |    
T  24515671 ctaaccgtcctcggttgcgtacactgcgaactgatgtgaccttcctcattgcagttataacaaacaacatctcccctcttccaatcagctagtgtgtgtc 24515572  T
Q  165 ccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagc 264  Q
      ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || || ||| |||||||    
T  24515571 ttttctgaccacacctgaaacacttcttctcatctttagtacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttataacaaacaatatcaacaggagc 24515472  T
Q  265 atccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt 364  Q
    ||| ||| |  | |||| |||||||||||| || ||||| || ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||     
T  24515471 atctctcctcttgggcctcctctcatcattcagcctctgttttcccttgtcagcaggagcactatatggtttaggacgactctgttgtcccttgcctctg 24515372  T
Q  365 cgctcactcatcaccttataatgagcttt 393  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||    
T  24515371 cggtcactcatcaccttgtaatgagcttt 24515343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 32 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 34642876 - 34642517
Alignment:
Q  32 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 131  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||| |||||    |||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||  |||| || || |||||| |||    
T  34642876 gtaccagccaaggcaaacactttcccaccggtcctaaccttcttcggttgagtgcactgagaactgatatgaccctccccattgcagttgtagcatacaa 34642777  T
Q  132 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctc 231  Q
     |||||| || || ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  34642776 tatcaccacgtttacaatcagctaacacgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatctttggtacaaacattacttttgtggcccttctc 34642677  T
Q  232 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttact--cggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactat 329  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||  || || |  ||   || | ||| |||||||| ||||  ||||| |||||  || |||| |||||||    
T  34642676 gccacacttaaagcaaactatctccgcaggagtgtctct-tcccttggggtctcctttcatcattcagtcgttgctttcccttaccagcaggagcactat 34642578  T
Q  330 acggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagc 390  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||| || || || |||||||||||||| ||||||||    
T  34642577 acggcttaggacgactctgttgtcccttgcccctccgttcactcatcaccttgtaatgagc 34642517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 216 - 467
Target Start/End: Original strand, 25771019 - 25771270
Alignment:
Q  216 tcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtc 315  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  25771019 tcttgtggcctttttcaccacacttgaaacagacaatctcagtaggagcatctctcctcttaggcctcctctcatcattcagcctctgtttacctttgtc 25771118  T
Q  316 aacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatccta 415  Q
    | |||| |||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| || || ||||||    
T  25771119 agcaggagcactatacggttacggacgactctgttgtcccttacctctgcgctcactcatcactctataatgagcttttgtatcctcttcataaatccta 25771218  T
Q  416 ccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccc 467  Q
    | ||  |||||||| ||||| ||| | || |||| |||||| || |||||||    
T  25771219 cagctgcttaccaactcagaaaaattccttatcttttggtagccaatagccc 25771270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 68 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 10466102 - 10465696
Alignment:
Q  68 accttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgaccct 167  Q
    |||||||||||||| || ||||| | ||| || ||||| |||||||| || ||||||||  |||  || || ||||| || || |||||  |||| ||||    
T  10466102 accttcttcggctgagtacactgtgaactaatatgaccttcttcattgcagttatagcagacaatgtccccacgcttacattcagctagggtgtgtccct 10466003  T
Q  168 tctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatc 267  Q
    |||| |||||||| || || ||| |||||||  |   |||| | || |||||||||||||| || ||||||||  |||| || |||||||||||| ||||    
T  10466002 tctgaccacacctaaaacatttcctctcatctctaccacaagcattgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacagacaatctcagcaggaacatc 10465903  T
Q  268 cctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgc 367  Q
     ||| |  | |||| ||| |||||||| | | ||||||| ||||||||| || | ||| | || || ||||||||| |||| ||||||||||| || | |    
T  10465902 tctcctcttgggcctcctatcatcattcattttctgctttcccttgtcagcaagagcattgtaaggcttaggacgactctgctgtcccttacccctcctc 10465803  T
Q  368 tcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccc 467  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| | ||  || ||||| |||||||||| ||||||||  || || ||||||||||    
T  10465802 tcactcatcaccttgtaatgagcttttgtgtcttcctcatatatcctgcagctgctcaccaactcagagaaaactctaatcttctgataccctatagccc 10465703  T
Q  468 tcttgat 474  Q
    |||||||    
T  10465702 tcttgat 10465696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 84 - 348
Target Start/End: Original strand, 21474643 - 21474907
Alignment:
Q  84 tgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaa 183  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||| |||||  ||| |||||| |||||||| || || |   |||| || ||||  ||||| | |||    
T  21474643 tgcactgagaactaatatgaccctcttcatcacaattgtagcacacaatatcaccacgcttgcactcagccaatgtgtgtcctttcttcccacatcggaa 21474742  T
Q  184 gcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgc 283  Q
     ||||||||||||||      ||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| ||| | || |||| |    
T  21474743 acacttcttctcatcacggtcacatacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatctcagtaggagcatctctcctcctaggcctc 21474842  T
Q  284 ctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctg 348  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||| ||||    
T  21474843 ctctcatcattcagcatctgcttacccttgtcagcaggagcactatacggcttcggacgactctg 21474907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 399
Target Start/End: Original strand, 24367384 - 24367758
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || || ||||||  ||||   |||||||| |  | |||||| | ||| || ||||| ||| |||| ||||| ||     
T  24367384 agtctgcgtaccagtcaaagcaaacaccttcccaccagttctagttttcttcggttcagggcactgtgaactaatatgaccttctccattgcaattgtaa 24367483  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatc-cttcgtacaaacgttactcttgtgg 223  Q
    ||  |||  || || |||||||| || ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| ||||||||||||    
T  24367484 cagacaatgtccccccgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttcc-acaaacattactcttgtgg 24367582  T
Q  224 cctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacagggg 323  Q
    |||||||| ||||||||  | || || |||||| || ||||||| ||| |  | |||| ||| ||||||   |   ||||||| || |||||| |||| |    
T  24367583 cctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacatgagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtcagcaggag 24367682  T
Q  324 cactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 399  Q
    |||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  24367683 cactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtc 24367758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 176 - 390
Target Start/End: Original strand, 19456158 - 19456372
Alignment:
Q  176 cacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttac 275  Q
    |||||||||||||||||||||||  |   ||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || || || ||||||| ||||| ||| ||| |      
T  19456158 cacctgaagcacttcttctcatctctatcacagacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaagcaaacaatctcagtaggagtatctctcctct 19456257  T
Q  276 tcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcat 375  Q
    | |||| |||||||||||| || || || || || |||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||     
T  19456258 tgggcctcctctcatcattcagcctttgttttcctttgtcagcaggagcactatatggtttaggacgactctgttgtcccttacctctgcgttcactcac 19456357  T
Q  376 caccttataatgagc 390  Q
    || ||| ||||||||    
T  19456358 cagcttgtaatgagc 19456372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 176 - 390
Target Start/End: Original strand, 19466303 - 19466517
Alignment:
Q  176 cacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttac 275  Q
    |||||||||||||||||||||||  |   ||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || || || ||||||| ||||| ||| ||| |      
T  19466303 cacctgaagcacttcttctcatctctatcacagacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaagcaaacaatctcagtaggagtatctctcctct 19466402  T
Q  276 tcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcat 375  Q
    | |||| |||||||||||| || || || || || |||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||     
T  19466403 tgggcctcctctcatcattcagcctttgttttcctttgtcagcaggagcactatatggtttaggacgactctgttgtcccttacctctgcgttcactcac 19466502  T
Q  376 caccttataatgagc 390  Q
    || ||| ||||||||    
T  19466503 cagcttgtaatgagc 19466517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 477
Target Start/End: Original strand, 15462320 - 15462772
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||  ||| |||||||| || || |||||||| | ||| ||||| ||||| |||  ||| |||||     
T  15462320 agtctgcgtaccagtcaaggcaaatacttttcctccagttctgaccttcttaggttgcgtgcactgcgaactaatgtggccctcctcaccacagttataa 15462419  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggc 224  Q
    ||  | | ||| || |||||||| || || | ||  ||||| ||||| || || ||||| || |||||||||||  | || || || |||||||||||||    
T  15462420 cacacgatatctccccgcttgcactcagccaacacatgacctttctgaccgcatctgaaacatttcttctcatctctggtgcagacattactcttgtggc 15462519  T
Q  225 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggc 324  Q
    ||||| | ||||||||  ||||||| |  ||| ||||||  || |||   || ||| ||||||||||||| | |||||| || || |||| | |||| ||    
T  15462520 ctttcgcaccacacttgtaacacacaacatcaacaggagtctctctccctctaggctgcctctcatcattcaatctctgtttgcctttgttagcaggagc 15462619  T
Q  325 actatacggtttaggacgattctgatgtccctta--cctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgac 422  Q
    ||| || || || || ||| |    || ||||||  |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||| || ||    
T  15462620 actgtagggcttcgggcgactactctgacccttattcctcttc--tcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatcctcctcataaatcctacagctac 15462717  T
Q  423 ttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    | ||||| || |||||||| || ||||  || ||||| || || |||||||||||    
T  15462718 tcaccaactccgagaaaatcctgatcttctgatatccaatggctctcttgatgtc 15462772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 205 - 471
Target Start/End: Original strand, 21764976 - 21765242
Alignment:
Q  205 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 304  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | |||||      
T  21764976 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctaa 21765075  T
Q  305 ttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcct 404  Q
    || ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||| |||| || |||| |    | | |||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21765076 ttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggccctcagtgttccactcattcacaaccttgtaatgagctttggtgtcctcct 21765175  T
Q  405 cgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctctt 471  Q
    | |||||  ||| ||   | ||||||||||  |||| ||  |||||||||||||| || ||||||||    
T  21765176 catagattttacagctgttcaccaaatcagcaaaaactcggatctgttggtatccaattgccctctt 21765242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 306
Target Start/End: Original strand, 23081594 - 23081688
Alignment:
Q  212 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgctt 306  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  || |||| || |||||| ||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  23081594 ttactcttgtggcctttctcaccacaagtataacaaacaatctcaacaggagcatctttcttcctaggccgcctctcatcattaactctttgctt 23081688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 25756720 - 25756523
Alignment:
Q  217 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 316  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | |||||| || ||||| |||    
T  25756720 cttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatca 25756621  T
Q  317 acaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcct 414  Q
    ||  |||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||||  |||| || ||| | | |||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  25756620 actagggcactatagggcttagggcgactctgctggccctta-gtcttccggtcattaaccaccttgtaatgagctcgggtgtcctcctcatagatcct 25756523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 30678141 - 30677932
Alignment:
Q  205 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 304  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||  | || || | ||||||||||| |||  |||| || |||| |||||||||||| |  || |||    
T  30678141 acaaacattactcttgtggctcttctcaccacacttgtagcaaacaacctcagcaggagtatctttctttctaggcctcctctcatcattcaccctttgc 30678042  T
Q  305 ttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcct 404  Q
    ||||  || ||| |||| ||  | || || || ||||||||||| || | |||||| || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| || ||||    
T  30678041 ttacatttatcagcaggagcgttgtaaggctttggacgattctgctgactcttacccctccgctcactcataaccttgtaattagctttggtatcttcct 30677942  T
Q  405 cgtagatcct 414  Q
    | ||||||||    
T  30677941 catagatcct 30677932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 318 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 22829393 - 22829234
Alignment:
Q  318 caggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctacc 417  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||  | | |||  |||  | |||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |     
T  22829393 caggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttgcccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgca 22829294  T
Q  418 gcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    || | | |||||||| |  |||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  22829293 gctattgaccaaatctggaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 22829234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 20010452 - 20010346
Alignment:
Q  371 ctcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctct 470  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||| || || |||| || ||| ||||| || ||||||||||| ||||  || ||||| || || ||||    
T  20010452 ctcatcaccttataatgagcctttgtatcctcctcataaattctacagctactcaccaattctgagaaaattctgatcttctgatatccaatggctctct 20010353  T
Q  471 tgatgtc 477  Q
    |||||||    
T  20010352 tgatgtc 20010346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 365 - 435
Target Start/End: Original strand, 21474908 - 21474978
Alignment:
Q  365 cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcaga 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||| ||  |||||||| |||||    
T  21474908 cgctcactcatcaccttataatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacagctgcttaccaattcaga 21474978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 291
Target Start/End: Original strand, 22437043 - 22437119
Alignment:
Q  215 ctcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatc 291  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||| ||||| ||||  | |||||||| |||||    
T  22437043 ctcttgtggcctttctcaccacaattaaagcagacaatctcagcaggaacatccttcttcttaggccgcctatcatc 22437119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 365 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 19486251 - 19486200
Alignment:
Q  365 cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 416  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  19486251 cgctcactcataaccttgtaatgagctttggtatcctcttcgtagattctac 19486200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 27559132 - 27559045
Alignment:
Q  159 tgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaaca 246  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||| | ||||  | ||||||  ||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  27559132 tgtgacccttcttgccacaccggaaacacttcttcacctcctcaggacaaacagtactcttgtggcctttctcaccacaattgaaaca 27559045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 284 - 390
Target Start/End: Original strand, 19881639 - 19881745
Alignment:
Q  284 ctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttat 383  Q
    ||||||||||| ||||  ||||| |||||  || ||||||| || ||||| ||||||||| | || ||| |||| || || || |||||||||||||| |    
T  19881639 ctctcatcattcagtcgttgctttcccttaccagcaggggcgctgtacggcttaggacgactttgttgttccttgcccctccgttcactcatcaccttgt 19881738  T
Q  384 aatgagc 390  Q
    |||||||    
T  19881739 aatgagc 19881745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 24292894 - 24292844
Alignment:
Q  210 cgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcag 260  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  24292894 cgttgctcttgtggcctttctcgccacaattgaaacacacaatctctgcag 24292844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 267
Target Start/End: Original strand, 16813805 - 16813866
Alignment:
Q  206 caaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatc 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | || || |||||||||||| ||||    
T  16813805 caaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcagcaggatcatc 16813866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 206 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 8720821 - 8720733
Alignment:
Q  206 caaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcatt 294  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | || || |||||| ||||| |||| ||| |  | |||| ||||||||||||    
T  8720821 caaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcatcaggatcatctctcctcttaggcctcctctcatcatt 8720733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 283 - 411
Target Start/End: Original strand, 18660161 - 18660289
Alignment:
Q  283 cctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcacctta 382  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||| |||| ||||| || || || |||||| | || || | ||||||| | | ||||||||   ||||     
T  18660161 cctctcatcattaaccctctgctcacccttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactttgctgactcttacctttcctctcactcacagccttg 18660260  T
Q  383 taatgagctttggtgtcctcctcgtagat 411  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||    
T  18660261 taatgagctttcgtatcctcctcatagat 18660289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 300 - 360
Target Start/End: Original strand, 28312886 - 28312946
Alignment:
Q  300 tctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacc 360  Q
    |||| ||||| |||||| | |||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  28312886 tctgtttacctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttacc 28312946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 8625 - 8204
Alignment:
Q  17 tcactagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 116  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||   ||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||| || |||| |||||| |    
T  8625 tcactagtagtctgcgtaccagtcaatgcaaacactttcccaccggttctaaccttcttcggttgattgcactgcgaactgatatggccctattcattgc 8526  T
Q  117 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttact 216  Q
    | ||||| ||  |||| ||||| ||||||||||| |||||  |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  8525 agttataacaaacaacgtcaccacgcttgcaatcagctagagtgtgtcccttctgaccacacctgaaacacttcttctcatccttagtacaaacattact 8426  T
Q  217 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 316  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||| || || ||| || ||||||| ||| |  | || | |||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  8425 cttgtggccattctcgccacacttataacaaacaatatcaacatgagcatctctcctcttgggtctcctctcatcattcagcctctgctttcccttgtca 8326  T
Q  317 acaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 416  Q
     |||| ||||||||||| || |||||| |||| |||||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| || |    
T  8325 gcaggagcactatacggcttcggacgactctgttgtcccttgcccctgcggtcactcatcaccttgtaatgagctttcatgtcctcctcatagattctgc 8226  T
Q  417 cgcgacttaccaaatcagagaa 438  Q
     || ||||||||| ||||||||    
T  8225 agcaacttaccaattcagagaa 8204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 18839 - 18418
Alignment:
Q  17 tcactagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 116  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||   ||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||| || |||| |||||| |    
T  18839 tcactagtagtctgcgtaccagtcaatgcaaacactttcccaccggttctaaccttcttcggttgattgcactgcgaactgatatggccctattcattgc 18740  T
Q  117 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttact 216  Q
    | ||||| ||  |||| ||||| ||||||||||| |||||  |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  18739 agttataacaaacaacgtcaccacgcttgcaatcagctagagtgtgtcccttctgaccacacctgaaacacttcttctcatccttagtacaaacattact 18640  T
Q  217 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 316  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||| || || ||| || ||||||| ||| |  | || | |||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  18639 cttgtggccattctcgccacacttataacaaacaatatcaacatgagcatctctcctcttgggtctcctctcatcattcagcctctgctttcccttgtca 18540  T
Q  317 acaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 416  Q
     |||| ||||||||||| || |||||| |||| |||||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| || |    
T  18539 gcaggagcactatacggcttcggacgactctgttgtcccttgcccctgcggtcactcatcaccttgtaatgagctttcatgtcctcctcatagattctgc 18440  T
Q  417 cgcgacttaccaaatcagagaa 438  Q
     || ||||||||| ||||||||    
T  18439 agcaacttaccaattcagagaa 18418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 104 - 438
Target Start/End: Original strand, 7266 - 7600
Alignment:
Q  104 ccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcg 203  Q
    |||||||||| | | ||||| ||  |||||||||| ||||||||||| |||||  |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  7266 ccctcttcatcatagttataacaaacaacatcaccacgcttgcaatcagctagagtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttag 7365  T
Q  204 tacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctg 303  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||| ||| || | |||| |||||||||||| |  |||||    
T  7366 tacaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttgtaacaaacaatctcagcaggagcatctctcctattgggcctcctctcatcattcaacctctg 7465  T
Q  304 cttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 403  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||| || |  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  7466 cttacccttgtcaacaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcctttgctccttcgatcactcatcaccttgtaatgagctttcgtgtcctcc 7565  T
Q  404 tcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaa 438  Q
    || ||||| || | || ||||||||| ||||||||    
T  7566 tcatagattctgcagctacttaccaattcagagaa 7600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 29 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 98734 - 98328
Alignment:
Q  29 tgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatc 128  Q
    ||||||||||||| |||||| || || ||||||   |||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| || || ||||| |||     
T  98734 tgtgtaccagtcagagcaaacaccttaccaccagtcctaaccttcttcggctgtgtgcactgcgaactgatatggccctcttcgttgcagttataacata 98635  T
Q  129 caacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggccttt 228  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||  |||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  98634 caacatcaccacgcttgcaatcagctagagtgtgtcctttctgaccacacctgaaacacttcttctcatctttagtacaaacattactcttgtggccttt 98535  T
Q  229 ctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcacta 328  Q
    ||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||| |||    | |||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||| || | ||||||    
T  98534 ctcgccacacttgtaacaaacgatctcagcaggagcatctctccacttgggcctcctctcatcatttaacctctgcttacccttgtcagcatgagcacta 98435  T
Q  329 tacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttacca 428  Q
    || || || |||||| |||| |||||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| || | |||||||| ||  |||||||    
T  98434 tatggcttcggacgactctgttgtcccttacctctcctttcactcattaccttgtaatgagccttcgtatcctcttcattgatcctacagctgcttacca 98335  T
Q  429 aatcaga 435  Q
    | |||||    
T  98334 actcaga 98328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 101 - 433
Target Start/End: Original strand, 176212 - 176544
Alignment:
Q  101 tgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatcct 200  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||   |||| || |||| ||||||||| || ||||||||||||||      
T  176212 tgaccttcttcatcacaattatagcaaacaacatcaccacgcttgcaatcagctaatgtgtgtcctttctttccacacctaaaacacttcttctcatcac 176311  T
Q  201 tcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtct 300  Q
        ||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||| | || |||| |||||||||||| |||||    
T  176312 ggtcacatacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacagacaatctctgtaggagcatctctcctcctaggcctcctctcatcattcagtct 176411  T
Q  301 ctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcc 400  Q
    ||| ||| | ||||   |||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  176412 ctgtttaactttgttggcaggagcactatacggtttcggacgactctgctgtcccttacctctacgctcactcatcaccttataatgagcttttgtatcc 176511  T
Q  401 tcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatca 433  Q
    || || |||||||||| || ||| |||||||||    
T  176512 tcttcatagatcctacagctactcaccaaatca 176544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 164564 - 164132
Alignment:
Q  17 tcactagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 116  Q
    ||||||| |||||  ||||| ||||| ||||| ||||| |||||   |||||||||||||||||| ||  | || | |||||| || || |||||||| |    
T  164564 tcactagtagtctacgtaccggtcaatgcaaacactttcccaccggttctaaccttcttcggctgagtataatgcgaactgatatggccttcttcattgc 164465  T
Q  117 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttact 216  Q
    | ||||| ||  |||||| ||| |||||||||||  |||   |||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  164464 agttataacaaacaacattaccacgcttgcaatcaactaaagtgtgtcctttctgaccacacctgaaacacttcttctcatccttagaacaaacattact 164365  T
Q  217 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||| || ||| || | |||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||    
T  164364 cttgtggcctttctcgccacacttgtaacaaacgatctcagcaggagcgtctctcctattgggcctcctctcatcattcaacctctgttttcccttgtca 164265  T
Q  317 acaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 416  Q
     |||||||||| || | |||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| || ||||| |    
T  164264 gcaggggcactgtatgatttaggacgactctgctgtcctttacctcttcgttcactcatcaccttgtaatgagctttcgtgttctcctcatatatcctgc 164165  T
Q  417 cgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatct 449  Q
     || ||| ||||| || ||||||||||| ||||    
T  164164 agctactcaccaactcggagaaaattctgatct 164132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 30539 - 30472
Alignment:
Q  215 ctcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccg 282  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  30539 ctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctcagcaggagcatccttcttccttggccg 30472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 32 - 438
Target Start/End: Original strand, 54203 - 54609
Alignment:
Q  32 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 131  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||     |||||||| ||||| ||||||||| | |  ||||| |||||||||||||| || ||||| ||  |||    
T  54203 gtaccagtgaaagcaaacactttaccactggtcctaacctttttcggttgtgtgcaccgtgagctgatatgaccctcttcattgcagttataacaaacaa 54302  T
Q  132 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctc 231  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54303 catcaccacgcttgcaataagctagagtgtgtcccttctgaccacacctgaaacacttcttctcatctttagtacaaacattactcttgtggcctttctc 54402  T
Q  232 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatac 331  Q
    |||||||||  |||| || ||||||||| ||||||  |   || | |||| |||||||||||| |  |||||||| || |||||| |||| |||||||||    
T  54403 gccacacttgtaacaaacgatctcagcaagagcatttcatctattgggcctcctctcatcattcaacctctgcttccctttgtcagcaggagcactatac 54502  T
Q  332 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 431  Q
    || || |||||| |||||||||| || |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| || | || ||||||||| |    
T  54503 ggctttggacgactctgatgtcctttgctccttcgatcactcatcaccttataatgagctttcatgtcctcctcatagattctgcagctacttaccaatt 54602  T
Q  432 cagagaa 438  Q
    |||||||    
T  54603 cagagaa 54609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 32 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 5357 - 4912
Alignment:
Q  32 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 131  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||   ||||||||||||||| | ||| ||||  | |||||| || ||||| ||||| || ||||||||  |||    
T  5357 gtaccagtcagagcaaacactttaccaccggttctaaccttcttcggttatgtacactatgaactgatatggccctcctcattgcagttatagcaaacaa 5258  T
Q  132 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctc 231  Q
    |||| |  ||||| ||||| ||||   |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||| || ||||||||||||||||| ||    
T  5257 catctctccgcttacaatcagctaaagtgtgtcccttctgaccacacctgaagcacttcttctcatccttatcacagacattactcttgtggcctttttc 5158  T
Q  232 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatac 331  Q
    |||||||||  | || || ||||||||||||||||| ||| | || |||| |||||||| ||| || || ||||| ||||||||| |||| ||||||||     
T  5157 gccacacttgtagcaaacaatctcagcaggagcatctctcctcctaggccacctctcattattcagcctttgctttcccttgtcagcaggagcactatat 5058  T
Q  332 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 431  Q
    |||||||||||| |||  | ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||| | | || ||| ||||| |    
T  5057 ggtttaggacgactctactttcctttacctcttcgttcactcatcaccttgtaatgagctttagtgtcttcctcatatatcatgcagctactcaccaatt 4958  T
Q  432 cagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    ||||||||||||||||||  || || || || || |||||||||||    
T  4957 cagagaaaattctaatcttctgatacccaatggctctcttgatgtc 4912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 83 - 477
Target Start/End: Original strand, 15279 - 15673
Alignment:
Q  83 gtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctga 182  Q
    |||||||| | |||||| || ||||||||||| || ||||| ||  |||||||||| ||||||||||| |||||  |||| |  ||||| ||||||||||    
T  15279 gtgcactgtgaactgatatggccctcttcattgcagttataacaaacaacatcaccacgcttgcaatcagctagagtgtgtcatttctgaccacacctga 15378  T
Q  183 agcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccg 282  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || |  ||||||||||||||||| ||| || | ||||     
T  15379 agcacttcttctcgtccttagtacaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttatagcagaaaatctcagcaggagcatctctcctattgggcct 15478  T
Q  283 cctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcacctta 382  Q
    |||||||||||| |  |||||||| | ||||||| |||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||| || |   |||| ||||||||||||||     
T  15479 cctctcatcatttaacctctgctttcgcttgtcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgttgtcctttgctcattcgatcactcatcaccttg 15578  T
Q  383 taatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||| || | || ||||||||| ||||||||| |||| ||||  || || || || || |||||||||||    
T  15579 taatgagctttcgtttcctcctcatagattctgcagctacttaccaattcagagaaatttctgatcttctgatacccaatggctctcttgatgtc 15673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 32 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 39481 - 39038
Alignment:
Q  32 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 131  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||    |||||||||||||  ||||| ||||| | ||||||  |||| || ||||| || ||||||||  |||    
T  39481 gtaccagtcagagcaaacactttaccaccggtcctaaccttcttcgattgtgtacactgcgaactgatacgaccttcctcattgcagttatagcaaacaa 39382  T
Q  132 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctc 231  Q
    |||| || ||||| ||||  ||||   |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| ||||||||||||||||||||    
T  39381 catctccccgcttacaattagctaatgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttatcacaaacattactcttgtggcctttctc 39282  T
Q  232 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatac 331  Q
     ||||||||  | || || ||||||||||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||| ||||||||     
T  39281 accacacttgtagcaaacaatctcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattcagcctctgctttcccttgtcagcaggagcactatat 39182  T
Q  332 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 431  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| || ||||| | || ||| ||||| |    
T  39181 ggtttaggaagactctgctgtcccttacctcttcgttcactcatcaccttgtaatgagctttagtatcttcctcatatatcctgcagctactcaccaact 39082  T
Q  432 cagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    |  |||||||||||||||  ||||| || || || |||||||||||    
T  39081 c--agaaaattctaatcttctggtacccaatggctctcttgatgtc 39038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 205 - 477
Target Start/End: Original strand, 14753 - 15025
Alignment:
Q  205 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 304  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||| ||||  | |||||| | |||||    | ||||||     
T  14753 acaaacattactcttgtggccattctcgccacacttgaaacaaacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcatatcatcgaccattctctgt 14852  T
Q  305 ttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 403  Q
    || ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||| |||| || |||||   |||| |||||| |||  ||||  |||||||| ||||| || |||    
T  14853 ttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgctggccctt-ggtcttccgctcattcacaacctagtaatgagccttggtatcttcc 14951  T
Q  404 tcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    |||||||| || | || | | || |||||||  |||| ||  |||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  14952 tcgtagattctgcagctattcactaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctcttaatgtc 15025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1299 (Bit Score: 133; Significance: 6e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold1299
Description:

Target: scaffold1299; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 2007 - 1635
Alignment:
Q  21 tagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaatt 120  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||   ||||| |||||| ||||| |||||||| | ||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  2007 tagcagtctgcgtactagtcaaagcaaacactttcccaccggttctaatcttctttggctgagtgcactgggaactgatgtggccctcctcatcacaatt 1908  T
Q  121 atagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttg 220  Q
    ||| ||  |||||||||| | |||||| |  || |   |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||    
T  1907 ataacaaacaacatcacccctcttgcagttagccaatgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttggtacaaacattacttttg 1808  T
Q  221 tggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacag 320  Q
    ||||||||||||||||||||| | || | ||| ||||||| |||||| ||| |  | ||||  ||||||||||| ||||  ||||| ||||||||| |||    
T  1807 tggcctttctcgccacacttatagcaaattatttcagcagtagcatctctcctcttgggccttctctcatcattcagtcgttgctttcccttgtcagcag 1708  T
Q  321 gggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagcttt 393  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||| | ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1707 gggcactgtacggcttaggacgactctgttttcccttacccctccgctcactcatcaccttgtaatgagcttt 1635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 25 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 700 - 251
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||   ||||| |||||| ||||| |||||||| | ||||||||| ||||| |||| |||||||||     
T  700 agtctgcgtaccagtcaacgcaaacactttcccaccggttctaatcttctttggctgagtgcactgtgaactgatgtggccctcctcatcacaattataa 601  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggc 224  Q
    ||  ||||||||   | |||||| |  || |   |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||    
T  600 caaacaacatcattcctcttgcagttagccaatgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttggtacaaacattacttttgtggc 501  T
Q  225 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggc 324  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||| |  | || |  ||||||||||| || |  ||||| ||||||||| ||||||     
T  500 ctttctcgccacacttaaagcaaactatctcagtaggagcatctctcctcttgggtcttctctcatcattcagccgttgctttcccttgtcagcaggggg 401  T
Q  325 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgactt 424  Q
    ||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |  || ||||||||||| || | ||  |||    
T  400 actgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccctccgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgaatcttcctcgtagattctgcagctgctt 301  T
Q  425 accaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgat 474  Q
    ||||| ||||| ||| |||| ||||  || || || || |||||||||||    
T  300 accaactcagaaaaagttctgatcttctgatagccaatggccctcttgat 251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 32 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 62920 - 62478
Alignment:
Q  32 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 131  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||    ||||| ||||| ||||| || ||||| | |||||| ||||| | ||||||||| || ||| |  |||    
T  62920 gtaccagtcaaagcaaacactttgccacctgtcctaactttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttattcattacagttgtagaaaacaa 62821  T
Q  132 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctc 231  Q
    |||| || ||||| ||||| ||||   ||||  | ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    ||| || ||||||||||||||||||||    
T  62820 catccccacgcttacaatcagctaaagtgtgtactttctgaccacacctaaagcacttcttctcatcatggtcacatacattactcttgtggcctttctc 62721  T
Q  232 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatac 331  Q
     |||||||| ||  | || || |||| ||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  62720 accacacttgaattaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttaggcctcctctcatcattcaatctctgcttacccttgtcagcaggggcactatac 62621  T
Q  332 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 431  Q
    || || |||||| |||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| | || ||||||||| |    
T  62620 ggcttcggacgactctgctgccccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtatcctcttcatatatcctgcagctacttaccaact 62521  T
Q  432 cagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgat 474  Q
    |||||||| | || |||| ||| || || ||||||||||||||    
T  62520 cagagaaattccttatcttttgatagccaatagccctcttgat 62478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 65453 - 65211
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||    ||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||| || || |||| |||||||||     
T  65453 agtctgcgtaccagtcaatgcatacacttttccaccggtcctaaccttctttggctgggtgcactgtgaactgatgtggccttcctcatcacaattataa 65354  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggc 224  Q
    ||  ||||||| || | ||| ||||  || | | |||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  65353 caaacaacatctcctctcttacaattagccaacgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcactttttctcatctttggtacaaacattactcttgtggc 65254  T
Q  225 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatc 267  Q
    ||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||    
T  65253 ctttctcgccacacttgtaacaaacaacctcagcaggagcatc 65211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 288 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 65214 - 65058
Alignment:
Q  288 catcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatg 387  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| || || || ||| |||| ||||| |||   |||| ||||||||||||||| |||||    
T  65214 catcattcagtctctgcttgcccttatcagcaggggcactatatggcttcgggcgactctgttgtccattattccttctctcactcatcaccttgtaatg 65115  T
Q  388 agctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattct 444  Q
    |||||| || ||||| || || || || | || ||| ||||| ||||||||| ||||    
T  65114 agcttttgtatcctcttcataaattctgcagctactcaccaactcagagaaatttct 65058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 125; Significance: 4e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 32 - 474
Target Start/End: Original strand, 5596 - 6035
Alignment:
Q  32 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 131  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||    ||||||||||| || || || ||||| | |||||| ||||| |||||||||||||| |||||  |||    
T  5596 gtaccagtcaacgcaaacactttgccacctgtcctaaccttcttaggttgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacaattgtagcaaacaa 5695  T
Q  132 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctc 231  Q
    |||| || ||||| ||||| ||||   |||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||      ||| |||||||||||||||||||||||    
T  5696 catccccacgcttacaatcagctaaagtgtgtcctttctgaccacacctaaagcacttcttctcatctcgatcacacacgttactcttgtggcctttctc 5795  T
Q  232 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatac 331  Q
     |||||||| || || | |||||||| ||||||||| ||| |  |  ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||   ||||||    
T  5796 accacacttgaagcaaattatctcagtaggagcatctctcctcttaagcctcctctcatcattcaatctctgcttacccttgtcagcaggg---ctatac 5892  T
Q  332 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 431  Q
    || || |||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||| || || ||||| | || ||||||||| |    
T  5893 ggcttcggacgactatgttgtcccttacctctgcgctcactcatcaccttgtaataagctttcgtatcctcttcatatatcctgcagctacttaccaatt 5992  T
Q  432 cagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgat 474  Q
    |||||||| | || |||| ||| || || ||||||||||||||    
T  5993 cagagaaattccttatcttttgatagccaatagccctcttgat 6035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 11764 - 11507
Alignment:
Q  159 tgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatc-cttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcag 257  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||  ||| || |||||||||||||||||||  ||||||||  | || || ||||||     
T  11764 tgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttcc-acatacattactcttgtggcctttcttaccacacttgtatcatacaatctcat 11666  T
Q  258 caggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtccctt 357  Q
    | || ||||| ||| |  | |||  ||| ||||||   |   ||||||| || |||||| || | ||| | || || |||||||||||||| ||||||||    
T  11665 ctggtgcatctctcctcttgggcttcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtcagcaagagcaatgtaaggcttaggacgattctgttgtccctt 11566  T
Q  358 acctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 416  Q
    ||| || | ||||||||| | ||| ||||||||||||||||| || || || |||||||    
T  11565 acccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcataaatcctac 11507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 32 - 474
Target Start/End: Original strand, 70264 - 70706
Alignment:
Q  32 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 131  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||    ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| || || || || |||||||| || |||||  |||    
T  70264 gtaccagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactaatatgtccttcctcattacagttgtagcaaacaa 70363  T
Q  132 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgt-acaaacgttactcttgtggcctttct 230  Q
     ||| || ||||||||||| || |   |||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  || ||| || |||||||||||||||||||    
T  70364 tatccccacgcttgcaatcagccaatgtgtgtcctttctgtccacatctgaaacacttcttctcatc-tcggtcacacacattactcttgtggcctttct 70462  T
Q  231 cgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactata 330  Q
    | ||||||||||| || |  ||||||| ||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| || ||||| ||||| |||||| |||| ||||||||    
T  70463 caccacacttaaagcaaataatctcagtaggagcatctctcctcttaggcctcctctcatcattcagcctctgtttacctttgtcagcaggagcactata 70562  T
Q  331 cggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaa 430  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||  ||||||||     
T  70563 cggtttcggacgactctgttgtcccttacctctgcgctcactcatcactttataatgagctttggtatcctcttcatagattctacagctgcttaccaat 70662  T
Q  431 tcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgat 474  Q
    ||||| ||| |||| ||||  || || || ||||||||||||||    
T  70663 tcagaaaaatttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 70706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 438
Target Start/End: Original strand, 8755 - 9176
Alignment:
Q  17 tcactagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 116  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||    |||||||||||||| || |||||||| | |||||| || || ||||| || |    
T  8755 tcactagtagtatgcgtaccagtcaatgcaaacactttcccaccggtactaaccttcttcggttgagtgcactgcgaactgatatggccttcttcgttgc 8854  T
Q  117 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttact 216  Q
    | || |||||  |||  ||||| ||||||||||| |||||  |||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  8855 agttgtagcaaacaatgtcaccacgcttgcaatcagctagagtgtgtcctttctgaccacacctgaaacacttcttctcatctttagtacaaacattact 8954  T
Q  217 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 316  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||| ||| |  | || |  ||||||||||| ||  ||||||| || ||||||    
T  8955 cttgtggccattctcgccacacttataacaaacaatctcatcaggagcatctctcctcttgggtcttctctcatcattcagcttctgcttccctttgtca 9054  T
Q  317 acaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 416  Q
     |||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||| || |  ||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||  | |    
T  9055 gcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcctttgctccttcgatcactcatcacctaataatgagatttcgtgtcctcctcatagattatgc 9154  T
Q  417 cgcgacttaccaaatcagagaa 438  Q
     || ||||||||| ||||||||    
T  9155 agctacttaccaattcagagaa 9176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 121; Significance: 9e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 212 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 1240 - 996
Alignment:
Q  212 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 311  Q
    |||| |||||||||||| || ||||| |||||||| || |||| || ||||||||| ||| | || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1240 ttacccttgtggcctttttcaccacatttaaaacagacaatcttagtaggagcatctctcctcctaggcctcctctcatcattcagtctctgcttaccct 1141  T
Q  312 tgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagat 411  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  1140 tgtcaacaggagcactatacggtttcggacgactctgctgtcccttacctctgcgctcactcatcaccttataatgagcttttgtgtcctcctcatatat 1041  T
Q  412 cctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggta 456  Q
     || | || ||| ||||||||||||||| | || |||| ||||||    
T  1040 tctgcagctactcaccaaatcagagaaattccttatcttttggta 996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 121; Significance: 9e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 212 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 28253 - 28009
Alignment:
Q  212 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 311  Q
    |||| |||||||||||| || ||||| |||||||| || |||| || ||||||||| ||| | || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28253 ttacccttgtggcctttttcaccacatttaaaacagacaatcttagtaggagcatctctcctcctaggcctcctctcatcattcagtctctgcttaccct 28154  T
Q  312 tgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagat 411  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  28153 tgtcaacaggagcactatacggtttcggacgactctgctgtcccttacctctgcgctcactcatcaccttataatgagcttttgtgtcctcctcatatat 28054  T
Q  412 cctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggta 456  Q
     || | || ||| ||||||||||||||| | || |||| ||||||    
T  28053 tctgcagctactcaccaaatcagagaaattccttatcttttggta 28009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 121; Significance: 9e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 32 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 1031 - 619
Alignment:
Q  32 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 131  Q
    ||||| ||||||||||| || || ||||||   |||||||||||||| || || ||||| | |||||| ||||| || ||||| || |||||  |  |||    
T  1031 gtaccggtcaaagcaaacaccttaccaccagtcctaaccttcttcggttgcgtacactgcgaactgatatgaccttcctcattgcagttataataaacaa 932  T
Q  132 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctc 231  Q
      || || ||||| ||||| |||||  |||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |   |||||||||||||||||||||||| ||    
T  931 tgtccccacgcttacaatcagctagagtgtatcctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctctatcacaaacgttactcttgtggcctttttc 832  T
Q  232 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatac 331  Q
     |||||||| || || || ||||| | ||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| |  |||| ||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  831 accacacttgaagcaaacaatctcggtaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcatttaacctcttcttacccttgtcagcaggagcattatac 732  T
Q  332 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 431  Q
    || || |||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||| | || |||||||||||    
T  731 ggcttcggacgactctgttgtcccttacctctgcgttcactcatcaccttgtaatgagctttgttgtcctcctcataaatcctgcagctacttaccaaat 632  T
Q  432 cagagaaaattct 444  Q
    |||||||| ||||    
T  631 cagagaaatttct 619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 24)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 32 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 21742769 - 21742327
Alignment:
Q  32 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 131  Q
    ||||||||||| ||||| || || |||||    ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| || || || || |||||||| || |||||  |||    
T  21742769 gtaccagtcaacgcaaataccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactaatatgtccttcctcattacagttgtagcaaacaa 21742670  T
Q  132 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgt-acaaacgttactcttgtggcctttct 230  Q
    |||| || ||||||||||| || |   |||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  || ||| || |||||||||||||||||||    
T  21742669 catccccacgcttgcaatcagccaatgtgtgtcctttctgaccacacctaaagcacttcttctcatc-tcggtcacatacattactcttgtggcctttct 21742571  T
Q  231 cgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactata 330  Q
    | |||||||| || || |  ||||||| ||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  21742570 caccacacttgaagcaaataatctcagtaggagcatctctcctcttaggcctcctctcatcattcagtctctgcttacccttgtcagtaggagcactata 21742471  T
Q  331 cggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaa 430  Q
    |||||| |||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| | || ||| |||||     
T  21742470 cggtttcggacgactctactgtcccttacctctgcgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatcctcttcatatatcctgcagctactcaccaac 21742371  T
Q  431 tcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgat 474  Q
    |||||||||||||| ||||  |  || || ||||||||||||||    
T  21742370 tcagagaaaattcttatcttctcataaccaatagccctcttgat 21742327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 24096839 - 24096415
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||   |||| ||||||||||||| || ||||| | |||||| ||||| ||||| || || || |||    
T  24096839 agtctgcgtaccagtcaatgcaaacactttcccaccggttctagccttcttcggctgagtacactgtgaactgatatgaccttcttcgttgcagttgtag 24096740  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggc 224  Q
    ||  |||  || || ||||| || || |||||  |||| || ||||| |||||||| || |||||| |||||||  |   |||| | |||||||||||||    
T  24096739 caaacaatgtccccacgcttacattcagctagtgtgtgtcctttctgaccacacctaaaacacttcctctcatctctaccacaagcattactcttgtggc 24096640  T
Q  225 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggc 324  Q
    |||| || |||||||| ||||| || |||||| |||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| |  ||||| || || |||||| |||| ||    
T  24096639 ctttttcaccacacttgaaacaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattcatcctctgttttcctttgtcagcaggagc 24096540  T
Q  325 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgactt 424  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| | ||  ||     
T  24096539 actataaggtttaggacgactctgttgtcccttacttcttcgctcactcgtcaccttgtaatgagctttggtgtcttcctcatatatcctgcagctgctc 24096440  T
Q  425 accaaatcagagaaaattctaatct 449  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  24096439 accaactcagagaaaattctaatct 24096415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 32 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 20833117 - 20832757
Alignment:
Q  32 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 131  Q
    |||||||||| |||||| ||||| | |||    ||||||||| |||| || || ||||| | |||||||||||| || ||||| || ||||| ||  |||    
T  20833117 gtaccagtcagagcaaacactttactaccggtcctaaccttcctcggttgcgtacactgcgaactgatgtgaccttcctcattgcagttataacaaacaa 20833018  T
Q  132 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctc 231  Q
    |||| || | ||||||||| |||||  |||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20833017 catctcccctcttgcaatcagctagtgtgtgtcctttctgaccacacctgaaacaattcttctcatctttagtacaaacattactcttgtggcctttctc 20832918  T
Q  232 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatac 331  Q
    |||||||||  | || || || ||| |||||||||| ||| |  | || | |||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||| ||||||||     
T  20832917 gccacacttgtagcaaacaatatcaacaggagcatctctcctcttgggtctcctctcatcattcagcctctgctttcccttgtcagcaggagcactata- 20832819  T
Q  332 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagcttt 393  Q
     ||||||||||| |||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  20832818 tgtttaggacgactctgctgtcccttgcctctacggtcactcatcaccttgtaatgagcttt 20832757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 399
Target Start/End: Original strand, 21961193 - 21961567
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||  | |||||| | |||||| ||||||||| |||| || || |||    
T  21961193 agtctgcgtaccagtcaaagcaaatacctttccaccagttctaaccttcttcggctcagggcactgcgaactgatatgaccctctccattgcagttgtag 21961292  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggc 224  Q
    ||  ||| ||| || ||||| || || ||||   |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||| || ||||||||||    
T  21961293 cagacaatatccccacgcttacattcagctaaactgtgtcccttctgaccacacctgaagcacttcctctcatctttaccacaaacattgctcttgtggc 21961392  T
Q  225 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggc 324  Q
    |||| || ||||||||  |||| || ||||||| ||||||||| ||| |  | || | ||| |||||||| |   ||||||| || ||||||  ||| ||    
T  21961393 ctttttcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttgggtctcctatcatcattcatcttctgctttcctttgtcagaaggagc 21961492  T
Q  325 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 399  Q
    ||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  21961493 actgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacctctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtc 21961567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 32 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 22015962 - 22015556
Alignment:
Q  32 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 131  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||    ||||||||||||||||| || |||||   ||| || ||| | || || || || ||||| ||  |||    
T  22015962 gtaccagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttcggctgcgtacactgcaaactaatatgatcttcctcgttgcagttataacaaacaa 22015863  T
Q  132 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctc 231  Q
    |||| || ||||||||||| ||||   |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |   |||||| ||||| || |||||||| ||    
T  22015862 catccccacgcttgcaatcagctaaagtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctctatcacaaacattacttttttggcctttttc 22015763  T
Q  232 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatac 331  Q
     |||||||| || || || || |  | ||||||||| |||||  | |||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  22015762 tccacacttgaatcaaacaatatttgtaggagcatctctcttctttggcctcctctcatcatttattctcttcttacccttgtcagcaggagcactatac 22015663  T
Q  332 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 431  Q
    || || |||||| |||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | || || |||||||||| ||  ||||||||||    
T  22015662 ggcttcggacgactctgctgtccctttcccctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtaacttcttcatagatcctacagctgcttaccaaat 22015563  T
Q  432 cagagaa 438  Q
    |||||||    
T  22015562 cagagaa 22015556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 65 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 21739220 - 21738811
Alignment:
Q  65 ctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgac 164  Q
    ||||||||||| ||||  || ||||| | |||||| ||||| ||||||||| | || |||||   |||||| || ||||| |||||  |||   |||| |    
T  21739220 ctaaccttcttaggctccgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattatagttgtagcaaaaaacatccccacgcttacaatcaactaaggtgtgtc 21739121  T
Q  165 ccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagc 264  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || || |  ||||||| ||||||    
T  21739120 ctttctgaccacacctaaagcacttcttctcatctcgatcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgaagcaaataatctcagtaggagc 21739021  T
Q  265 atccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt 364  Q
    | | ||| |  | |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||| ||||| || || |||||| |||| ||||||||||||||     
T  21739020 acctctcctcttaggcctcctctcatcattcaatctctgcttacccttgtcagcatgggcgctatatggcttcggacgactctgttgtcccttacctctg 21738921  T
Q  365 cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatag 464  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| | || ||||||||| ||||| ||| | || | || ||| || || ||||    
T  21738920 cggtcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatcctcttcatatatcctgcagctacttaccaattcagaaaaattccttaccttttgatagccaatag 21738821  T
Q  465 ccctcttgat 474  Q
    ||||||||||    
T  21738820 ccctcttgat 21738811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 140 - 477
Target Start/End: Original strand, 19857555 - 19857892
Alignment:
Q  140 cgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacact 239  Q
    ||||| ||||| |||||  |||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||  |   ||| || ||||||||||||||||| || |||||||    
T  19857555 cgcttacaatcagctagtgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcatttcttctcatctctatcacagacattactcttgtggcctttttcaccacact 19857654  T
Q  240 taaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttagg 339  Q
    | || || || ||||| | || |||||| ||| |  | |||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  19857655 tgaagcaaacaatctcggtagaagcatctctcctcttaggcctcctctcatcattcaacctctgcttacccttgtcagcaggagcactatatggtttagg 19857754  T
Q  340 acgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaa 439  Q
    |||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||| ||| ||  |||||||| ||||| ||     
T  19857755 acgactctgttgtcccttacctctgcgttcactcatcaccttgtaatgagccttagtatcctcttcatagatcttacagctgcttaccaactcagaaaag 19857854  T
Q  440 attctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
     |||||||||  || || || || || |||||||||||    
T  19857855 tttctaatcttctgatagccaatggctctcttgatgtc 19857892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 38910050 - 38909676
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||  |  ||||| | |||||| ||||| ||  |||| || || ||     
T  38910050 agtctgcgtaccagtcaaggcaaaaacctttccaccaattctagtcttcttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccttccccattgcagttgtaa 38909951  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatc-cttcgtacaaacgttactcttgtgg 223  Q
    ||  |||  || || |||||||| || ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| ||||||||||||    
T  38909950 cagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttcc-acaaacattactcttgtgg 38909852  T
Q  224 cctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacagggg 323  Q
    |||||||| ||||||||  | || || |||||| |||||||||| ||| |  | |||| ||| ||||||   |  |||||||| || |||||| |||| |    
T  38909851 cctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcctctgctttcctttgtcagcaggag 38909752  T
Q  324 cactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 399  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || | | ||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  38909751 cactgtaaggtttaggacgattctgttgtcccttacccctcctcccactcattatcttgtaatgagctttggtgtc 38909676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 20074933 - 20074559
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |  || || |||  |||||||||||||||||  |  ||||| | | |||| ||||||||| |||| || || |||    
T  20074933 agtctgcgtaccagtcaatgcaaacatcttgcccccagttctaaccttcttcggctcaggacactgcgaattgatatgaccctctccattgcagttgtag 20074834  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggc 224  Q
    ||  ||| ||| || |||||||| || || |   ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||| || ||||||||||    
T  20074833 cagacaatatccccacgcttgcattcagccaagctgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctctcatctttactacaaacattgctcttgtggc 20074734  T
Q  225 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggc 324  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||| |||||||  |||||||| ||| |  |  ||| ||| |||||| | |   ||||||| || |||||| |||  ||    
T  20074733 ctttctcaccacacttgtaacacacaatctcagtgggagcatctctcctcttaagcctcctgtcatcactcatcttctgctttcctttgtcagcagaagc 20074634  T
Q  325 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 399  Q
    ||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  20074633 actgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtc 20074559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 140 - 399
Target Start/End: Original strand, 20297664 - 20297923
Alignment:
Q  140 cgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacact 239  Q
    |||||||| || |||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20297664 cgcttgcattcagctaggctgtgacccttctaaccacacctgaagcacttcctctcatctttaccacaaacattactcttgtggcatttctcaccacact 20297763  T
Q  240 taaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttagg 339  Q
    |  |||| || ||||||||||||||||| ||| |  | |||| ||| ||||||   |   |||| || |||||||||  ||| ||||| || || |||||    
T  20297764 tgtaacaaacaatctcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctgtcatcacccatcttctgttttcccttgtcagtaggagcactgtaaggcttagg 20297863  T
Q  340 acgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 399  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  20297864 acgattctgatgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtc 20297923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 399
Target Start/End: Original strand, 48426039 - 48426413
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||  |||||||||||  |  ||||| | |||||| ||||| ||  |||| || || ||     
T  48426039 agtctgcgtaccagtcaaagcaaacacctttccaccaattctagtcttcttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccttccccattgcagttgtaa 48426138  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatc-cttcgtacaaacgttactcttgtgg 223  Q
    ||  |||  || || |||||||| || ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| ||||||||||||    
T  48426139 cagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttcc-acaaacattactcttgtgg 48426237  T
Q  224 cctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacagggg 323  Q
    |||||||| ||||||||  | || || |||||| |||||||||| ||| |  | |||| ||| ||||||   |   ||||||| || |||||| |||| |    
T  48426238 cctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtcagcaggag 48426337  T
Q  324 cactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 399  Q
    |||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  48426338 cactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtc 48426413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 159 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 31537087 - 31536847
Alignment:
Q  159 tgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagc 258  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||  | |||||  |   |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||     
T  31537087 tgtgacccttctgaccacacctgaagcattttctatcatctctaccacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacacttataacaaacaatctcaga 31536988  T
Q  259 aggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtccctta 358  Q
    ||||||||| ||| |  | || | ||| |||||||| |  |||||||| || |||||| |||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  31536987 aggagcatctctcctcttgggtctcctatcatcattcatcctctgctttcctttgtcagcaggagcactataaggcttaggacgattctgctgtccctta 31536888  T
Q  359 cctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 399  Q
    || || | ||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  31536887 cccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtc 31536847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 205 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 21228600 - 21228328
Alignment:
Q  205 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 304  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | ||||||     
T  21228600 acaaacattactcttgtggcctttctcgccacagttgaaacaaacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 21228501  T
Q  305 ttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttc-gctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 403  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||||  ||||| ||||| |||  ||||| |||||||| || || ||||||    
T  21228500 ttacccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggccctta-gtcttctgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcctcc 21228402  T
Q  404 tcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    || |||||||| | || | | || ||||||| ||||| ||  |||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  21228401 tcatagatcctgcagctattaactaaatcagggaaaactcagatctgttggtatccgatcgccctcttaatgtc 21228328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 399
Target Start/End: Original strand, 37680215 - 37680589
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || || ||||||| ||||  |||| ||||||  |  ||||| | ||| || ||||| ||| |||| ||||| ||     
T  37680215 agtctgcgtaccagtcaaagcaaacaccttcccaccaattctagtcttcctcggctcaggacactgtgaactaatatgaccttctccattgcaattgtaa 37680314  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatc-cttcgtacaaacgttactcttgtgg 223  Q
    ||  |||  || || |||||||| || ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| ||||||||||||    
T  37680315 cagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttc-cacaaacattactcttgtgg 37680413  T
Q  224 cctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacagggg 323  Q
    |||||||| ||||||||  | || || |||||| |||||| ||| ||| |  | |||| ||| ||||||   |   ||||||| || ||||||  ||| |    
T  37680414 cctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagtatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtcagtaggag 37680513  T
Q  324 cactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 399  Q
    |||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  37680514 cactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtc 37680589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 399
Target Start/End: Original strand, 52988907 - 52989280
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| || || || |||  ||||||||||||||| |  |  || || | |||||| ||||||||| |||| || || |||    
T  52988907 agtctgcgtaccagtcaatgcaaacaccttgcccccagttctaaccttcttcggttcaggacattgtgaactgatatgaccctctccattgcagttgtag 52989006  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggc 224  Q
    ||  |||  || || ||||| || || ||||   ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||   |||||| || ||||||||||    
T  52989007 cagacaatgtccccacgcttacattcagctaaattgtgacccttctgaccacacctgaaacacttcctctcatctttaccacaaacattgctcttgtggc 52989106  T
Q  225 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggc 324  Q
    |||| || ||||||||  |||| || ||||||| ||||||||| ||| |  | |||| ||| |||||||| |   ||||||| || |||||| |||| ||    
T  52989107 ctttttcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttaggcctcctatcatcattcatcttctgctttcctttgtcagcaggagc 52989206  T
Q  325 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 399  Q
    ||| || || ||||||||||| || ||||||||||| || | ||||||||| |  || |||||||||||||||||    
T  52989207 actgtaaggcttaggacgattttgctgtcccttacccctcctctcactcatta-tttgtaatgagctttggtgtc 52989280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 203 - 414
Target Start/End: Original strand, 16379407 - 16379618
Alignment:
Q  203 gtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctct 302  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||   | | || || |||||||||  | ||||  |||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16379407 gtacaaacattacttttgtggcctttctcaccacaagcatagcaaacaatctcagcaacaacatctttctttctcggcctcctctcatcattaactctct 16379506  T
Q  303 gcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctc 402  Q
    | || ||||| ||| ||| |||||| || || ||||||||| |||| || ||||| ||| | |||||| |||  ||||| |||||||| || || |||||    
T  16379507 gtttgcccttatcagcagaggcactgtaaggcttaggacgactctgttgacccttgcctttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcctc 16379606  T
Q  403 ctcgtagatcct 414  Q
    ||| || |||||    
T  16379607 ctcataaatcct 16379618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 207 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 17042057 - 17041788
Alignment:
Q  207 aaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgctt 306  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |  ||||| | |||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | |||||||||    
T  17042057 aaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaaa-atctccgaaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgctt 17041959  T
Q  307 acccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctc 405  Q
     ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||||  |||| | |||| | |  ||||| ||||||||| |||| ||||| ||    
T  17041958 gcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgctggccctta-gtcttcctctcattaacaaccttgtaatgagctctggtatcctcttc 17041860  T
Q  406 gtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    ||||||||||| ||   | |||||||||| ||||| ||  |  ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  17041859 gtagatcctacagctgttcaccaaatcagggaaaactcggagttgttggtatccgatcgccctcttgatgtc 17041788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 24784901 - 24784648
Alignment:
Q  205 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 304  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||| | || ||||| || ||||| |||||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | ||||||     
T  24784901 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccataattgaaacagacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 24784802  T
Q  305 ttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 403  Q
    || ||||| ||| ||| ||||||||| || |||||  || |||| || ||||||  |||| |||||| |||  ||||| |||||||| ||| | ||||||    
T  24784801 ttgcccttatcagcagaggcactatagggcttagggagactctgttggccctta-gtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttgttatcctcc 24784703  T
Q  404 tcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcc 459  Q
    || ||||| |||| ||   | |||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||    
T  24784702 tcatagattctacagctgttcaccaaatcag-gaaaactcggatctgttggtatcc 24784648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 20853638 - 20853532
Alignment:
Q  371 ctcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctct 470  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||| || || |||| || ||| ||||| || ||||||||||| ||||  || ||||| || || ||||    
T  20853638 ctcatcaccttataatgagcctttgtatcctcctcataaattctacagctactcaccaattctgagaaaattctgatcttctgatatccaatggctctct 20853539  T
Q  471 tgatgtc 477  Q
    |||||||    
T  20853538 tgatgtc 20853532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 300 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 16354195 - 16354018
Alignment:
Q  300 tctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 399  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||  | | |||| |||  ||||| || ||||| || || ||    
T  16354195 tctgtttacccttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatc 16354096  T
Q  400 ctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    ||| ||||||||||| | || | | ||||||||    |||| ||| | |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  16354095 ctcttcgtagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 16354018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 205 - 416
Target Start/End: Original strand, 21176682 - 21176893
Alignment:
Q  205 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 304  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||| ||||| |||| ||| || |||||  ||||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | ||||||     
T  21176682 acaaacattgctcttgtggactttctcaccacaattaatacagacaatctccacaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 21176781  T
Q  305 ttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 403  Q
    || ||||| ||| ||||||||||||| |  ||||| | | |||| || ||||||  |||| |||||| |||  ||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  21176782 ttgcccttatcagcaggggcactatatgtcttagggctactctgctggccctta-gtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcc 21176880  T
Q  404 tcgtagatcctac 416  Q
    || ||||| ||||    
T  21176881 tcatagattctac 21176893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 300 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 41350620 - 41350560
Alignment:
Q  300 tctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacc 360  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  41350620 tctgtttacccttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttacc 41350560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 300 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 16347547 - 16347433
Alignment:
Q  300 tctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 399  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||  | | |||| |||  ||||| || ||||| || || ||    
T  16347547 tctgtttacccttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatc 16347448  T
Q  400 ctcctcgtagatcct 414  Q
    ||| |||||||||||    
T  16347447 ctcttcgtagatcct 16347433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 215 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 20081410 - 20081334
Alignment:
Q  215 ctcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatc 291  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||| || ||||| ||||  | |||||||| |||||    
T  20081410 ctcttgtggcctttctcaccacaattaaagcagacaatctcagcatgaacatccttcttcttaggccgcctatcatc 20081334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 243 - 477
Target Start/End: Original strand, 2198 - 2432
Alignment:
Q  243 aacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacg 342  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| || || ||| |||||||||||| |  || ||||| || ||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  2198 aacaaactatctcagcaggagcatctctcctattccgcctcctctcatcattcaacctttgctttcctttgtcagtaggggcactgtacggtttaggacg 2297  T
Q  343 attctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaatt 442  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |  |||||||| |||||||||||||||    
T  2298 actctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagcttttgtgtcctcctcatagatcttgcaacgacttactaaatcagagaaaatt 2397  T
Q  443 ctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||    
T  2398 ctaatctgttgataccctatggctctcttcatgtc 2432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1530 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold1530
Description:

Target: scaffold1530; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 173 - 477
Target Start/End: Original strand, 801 - 1105
Alignment:
Q  173 ccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctct 272  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||   ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||  | || || ||||||||||||||||| |||     
T  801 ccacacctgaagtacttcttctcatctttatcacagacattactcttgtggcctttctagccacacttgtagcaaacaatctcagcaggagcatctctcc 900  T
Q  273 tactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcact 372  Q
    |  | |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  901 tcttaggcctcctctcatcattcaatctctgcttacccttgtcagcaggagcactatatggtttaggacgactctgttgtcccttacctctgcgctcact 1000  T
Q  373 catcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttg 472  Q
    ||||||||| |||||||| ||  | |||||||| || || || | || ||| ||||| |||||||||||||||||||  || || || || || ||||||    
T  1001 catcaccttgtaatgagccttattatcctcctcatatattctgcagctactcaccaactcagagaaaattctaatcttctgatacccaatggctctcttg 1100  T
Q  473 atgtc 477  Q
    |||||    
T  1101 atgtc 1105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 32 - 416
Target Start/End: Original strand, 37095 - 37479
Alignment:
Q  32 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 131  Q
    ||||| ||||||| ||| || || ||||||   ||||||||||||||||| || ||||| | |||||| ||||| || ||||| || ||||||||  |||    
T  37095 gtaccggtcaaagaaaacaccttaccaccagtcctaaccttcttcggctgcgtacactgtgaactgatatgaccttcctcattgcagttatagcaaacaa 37194  T
Q  132 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctc 231  Q
     ||| || | ||| ||||| |||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| ||||||||||||||||||||    
T  37195 tatccccacacttacaatcagctagtgtgtgtcccttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttatcacaaacattactcttgtggcctttctc 37294  T
Q  232 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatac 331  Q
    ||||||||| || || |  || |||| |||||  || ||| |  | |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||  || | |||||||||    
T  37295 gccacacttgaagcaaaaaatatcagtaggagtgtctctcctcttgggcctcctctcatcattcaatctctgcttacccttgtcggcaagagcactatac 37394  T
Q  332 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 416  Q
    || || |||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||    
T  37395 ggcttcggacgactctgctgtcccttacctctacgttcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatcttcttcatagatcctac 37479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 116; Significance: 8e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 101 - 456
Target Start/End: Original strand, 29752 - 30106
Alignment:
Q  101 tgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatcct 200  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||| |||||||| || ||||   |||| || |||   ||||||| ||| |||||||||||||| |    
T  29752 tgaccttcttcatcacaattgtagcaaacaacatcaccacgcttgcactcagctattgtgtgtcctttcgtcccacaccggaaacacttcttctcatcat 29851  T
Q  201 tcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtct 300  Q
       ||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| | |||||||||  ||||||||| ||| | || |||| |||||||||||| |||||    
T  29852 ggttacaaacattactcttgtggcccttttcaccacacttgaaatagactatctcaataggagcatctctcctcctaggcctcctctcatcattcagtct 29951  T
Q  301 ctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcc 400  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  29952 ctgcttacctttgtcagcaggagcactagacggtttcggacgactctgctgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttataatgagcctttgtatcc 30051  T
Q  401 tcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggta 456  Q
    || || ||||| ||||  | ||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  30052 tcttcatagattctacaactactcaccaaatcagag-aaattcttatcttttggta 30106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 65 - 263
Target Start/End: Original strand, 115751 - 115949
Alignment:
Q  65 ctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgac 164  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||  |||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||||| |||| || |||||    
T  115751 ctaaccttcttcggttgagtgcactgagaactgatatgaccctccccattgcaattatagcatactatatcaccacgcttgcaatcagctaacacgtgac 115850  T
Q  165 ccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggag 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  115851 ccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatctttggtacaaacattacttttgtggcctttctcgccacacttaaagcaaactatttcagcaggag 115949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 94049 - 93808
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||   || |||||||| || || |||||||| | ||| ||||||||||| |||  ||| ||| |     
T  94049 agtctgcgtaccagtcaaagcaaatacttttcctccagtcctgaccttcttaggttgagtgcactgcgaactaatgtgaccctcatcaccacagttaaaa 93950  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggc 224  Q
    ||  ||| ||| || ||||||||||| || | ||  ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| |  || ||| | |||||||||||||    
T  93949 caaacaatatctccacgcttgcaatccgccaacacatgacctttctgaccgcatctgaaacatttcttctcatcttgagtgcaagcattactcttgtggc 93850  T
Q  225 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcat 266  Q
    | ||| | ||||| ||  |||| || | |||| |||||||||    
T  93849 ccttcacaccacatttgtaacaaacaacctcaacaggagcat 93808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 273
Target Start/End: Original strand, 8553 - 8611
Alignment:
Q  215 ctcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctctt 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||| |||| ||| ||||    
T  8553 ctcttgtggcctttctcgccacaattaaaacagataatctcagcaagagcgtccttctt 8611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1433 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold1433
Description:

Target: scaffold1433; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 65 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 1426 - 1053
Alignment:
Q  65 ctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgac 164  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| | |||||| ||||| || ||||| ||| | |||||  ||| ||| || ||||| || || ||||   |||| |    
T  1426 ctaaccttcttaggctgagtacactgcgaactgatatgaccttcctcattgcaagtgtagcaaacaatatccccacgcttacattcagctaaagtgtgtc 1327  T
Q  165 ccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagc 264  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |   |||| | ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| | |||||||| ||||||    
T  1326 ctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctctatcacaagcattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaattatctcagtaggagc 1227  T
Q  265 atccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt 364  Q
    ||| ||| |  | |||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||| ||||| || || || |||||| |||| |||||||| |||||     
T  1226 atctctcctcttgggcctcctctcatcattcagcctctgtttacccttgtcagcaggagcactgtatggcttcggacgactctgttgtcccttgcctcta 1127  T
Q  365 cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaa 438  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  1126 cgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatcctcttcatagatcctacagctgcttaccaaatcagagaa 1053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 65 - 438
Target Start/End: Original strand, 7933 - 8306
Alignment:
Q  65 ctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgac 164  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| | |||||| ||||| || ||||| ||| | |||||  ||| ||| || ||||| || || ||||   |||| |    
T  7933 ctaaccttcttaggctgagtacactgcgaactgatatgaccttcctcattgcaagtgtagcaaacaatatccccacgcttacattcagctaaagtgtgtc 8032  T
Q  165 ccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagc 264  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |   |||| | ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| | |||||||| ||||||    
T  8033 ctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctctatcacaagcattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaattatctcagtaggagc 8132  T
Q  265 atccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt 364  Q
    ||| ||| |  | |||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||| ||||| || || || |||||| |||| |||||||| |||||     
T  8133 atctctcctcttgggcctcctctcatcattcagcctctgtttacccttgtcagcaggagcactgtatggcttcggacgactctgttgtcccttgcctcta 8232  T
Q  365 cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaa 438  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  8233 cgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatcctcttcatagatcctacagctgcttaccaaatcagagaa 8306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 111; Significance: 8e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 32 - 438
Target Start/End: Original strand, 34493 - 34899
Alignment:
Q  32 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 131  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||    ||||||||||||||||| || ||||  | ||| || ||||| || ||||| || ||||| ||  |||    
T  34493 gtaccagtcaaggcaaacacctttccacctgtcctaaccttcttcggctgcgtacactacgaactaatatgaccttcctcattgcagttataacaaacaa 34592  T
Q  132 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctc 231  Q
    | || || ||||| |||||  |||   |||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||  |   ||| || ||||||||||||||||||||    
T  34593 cgtccccacgcttacaatcaactaatgtgtgtcctttctaaccacacctgaagcacttcttctcatctctatcacagacattactcttgtggcctttctc 34692  T
Q  232 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatac 331  Q
     |||||||| ||||| || || |||| ||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| |  || ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  34693 accacacttgaaacaaacaatgtcagtaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcatttaacctttgcttacccttgtcagcaggagcactatac 34792  T
Q  332 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 431  Q
     | || |||||| |||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| | || |||||||||||    
T  34793 agcttcggacgactctgctgtcccttgcctctgcgttcactcatcaccttgtaatgagcttttgtgtcctcctcataaatcctgcagctacttaccaaat 34892  T
Q  432 cagagaa 438  Q
    |||||||    
T  34893 cagagaa 34899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 167 - 438
Target Start/End: Original strand, 319534 - 319805
Alignment:
Q  167 ttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcat 266  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||||||||||||  | || || ||| ||||||||||||    
T  319534 ttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttatcacagacattactcttgtggcctttctcgccacacttgtagcaaacaatcccagcaggagcat 319633  T
Q  267 ccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcg 366  Q
    | ||| || | |||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||| || || |||||    
T  319634 ctctcctattgggcctcctctcatcattcagcctctgcttatccttgtcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcctttgccccttcg 319733  T
Q  367 ctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaa 438  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || || | || ||||||||| ||||||||    
T  319734 atcacttatcaccttgtaatgagctttcgtgtcctcctcataaattctgcagctacttaccaattcagagaa 319805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Original strand, 325863 - 326144
Alignment:
Q  32 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 131  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||   |||||||||||| || ||||||||||| | |||||| || ||||||||||| || ||||| ||  |||    
T  325863 gtaccagtcaaagcaaacactttaccaccggttctaaccttctttggttgtgtgcactgtgaactgatatggccctcttcattgcagttataacaaacaa 325962  T
Q  132 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctc 231  Q
    |||| || ||||| ||||  ||||   |||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||   ||| || |||||||||||| |||||||    
T  325963 catctccccgcttacaattagctaatgtgtgtcctttctgaccacacttgaagcacttcttctcatctttatcacagacattactcttgtggtctttctc 326062  T
Q  232 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgt 314  Q
    |||||||||  | || || ||||||||||||||||| ||| || | |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  326063 gccacacttgtagcaaacaatctcagcaggagcatctctccta-ttggcctcctctcatcattcagcctctgcttacccttgt 326144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 106; Significance: 8e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 32 - 449
Target Start/End: Original strand, 5209 - 5626
Alignment:
Q  32 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 131  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||    |||||||||||||| || || ||||| | |||||| ||||| || ||||| || ||||| ||  |||    
T  5209 gtaccagtcagagcaaacactttaccaccggtcctaaccttcttcggttgagtacactgcgaactgatatgaccttcctcattgcagttataacaaacaa 5308  T
Q  132 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctc 231  Q
    | || || ||||| ||||  ||||   |||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||   ||| || |||||| |||||||||||||    
T  5309 cgtctccccgcttacaattagctaatgtgtgtcctttctaaccacacctgaagcacttcttctcatctttatcacagacattactcctgtggcctttctc 5408  T
Q  232 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatac 331  Q
    ||| |||||  | || || ||||||||||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| |  ||||| || ||||| ||| |||| ||||||||     
T  5409 gccgcacttgtagcaaacaatctcagcaggagcatctctcctcgtgggcctcctctcatcattcaacctctgttttcccttatcagcaggagcactatat 5508  T
Q  332 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 431  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| | || ||| ||||| |    
T  5509 ggtttaggacgactctgttgtcctttacctcttcgttcactcatcaccttgtaatgagctttagtatcttcttcatatatcctgcagctactcaccaact 5608  T
Q  432 cagagaaaattctaatct 449  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  5609 cagagaaaattcttatct 5626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 32 - 474
Target Start/End: Original strand, 50261 - 50703
Alignment:
Q  32 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 131  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||    ||||||||||| ||||| || ||||  | |||||| ||||| || ||||| || || |||||  |||    
T  50261 gtaccagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgggtacactacgaactgatatgaccttcctcattgcagttgtagcaaacaa 50360  T
Q  132 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgt-acaaacgttactcttgtggcctttct 230  Q
     ||| || ||||| ||||| ||||   |||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||| |||||||||||| |||| |    
T  50361 tatccccacgcttacaatcagctaaggtgtgtcctttctgaccacacctgaaacacttcttctcatc-tcggtcacaaacattactcttgtggtcttttt 50459  T
Q  231 cgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactata 330  Q
    | |||||||| ||||| || || |||| ||||||||| ||| |  | |||| ||||||||||||   ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50460 caccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattccatctatgcttacccttgtcagcaggggcactata 50559  T
Q  331 cggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaa 430  Q
    ||| || |||| | |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || || || || |||||||||| ||  ||||||||     
T  50560 cggcttcggaccactctgctgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatcttcttcatagatcctacagctgcttaccaac 50659  T
Q  431 tcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgat 474  Q
    ||||| ||  |||| ||||  || || || ||||||||||||||    
T  50660 tcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 50703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 32 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 43567 - 43125
Alignment:
Q  32 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 131  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||    | ||||||||| ||||   ||||||| |  || || ||||||||||||| ||||||||||||  |||    
T  43567 gtaccagtcaaagcaaacaccttgccacctgtccgaaccttcttgggcttcttgcactgcgagctaatatgaccctcttcatcacaattatagcaaacaa 43468  T
Q  132 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctc 231  Q
    |||| || ||||| ||||| ||||   |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||      ||| || |||||||||||||| || ||    
T  43467 catccccacgcttacaatcagctaaagtgtgtcctttctgtccacacctaaagcacttcttctcatctcgatcacacacattactcttgtggcccttttc 43368  T
Q  232 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatac 331  Q
     | |||||| ||||| || ||||||  ||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| || ||||| ||||| |||| |  ||| |||||||||    
T  43367 acgacacttgaaacagacaatctcattaggagcatctctcctcttaggcctcctctcatcattcagcctctgtttacctttgttagaaggagcactatac 43268  T
Q  332 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 431  Q
     |||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||| |  || ||||||| ||  ||||||||||    
T  43267 agttttggacgactctgttgtcccttacctctgcgctcactcatcaccttgtaatgacatttggtatcctcttaatatatcctacagctgcttaccaaat 43168  T
Q  432 cagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgat 474  Q
    | |||||| | || |||| ||| || || ||||||||||||||    
T  43167 ctgagaaattccttatcttttgataaccaatagccctcttgat 43125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 32 - 402
Target Start/End: Original strand, 5337 - 5706
Alignment:
Q  32 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 131  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||    |||  |||||| ||||| || ||||| | |||||| ||||| ||||||||||| || |||||  |||    
T  5337 gtaccagtcaacgcaaaaaccttgccacctgacctagacttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaa 5436  T
Q  132 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgt-acaaacgttactcttgtggcctttct 230  Q
    |||| || ||||| ||||| ||||   |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |  || |||||| ||||||||||||||||| |    
T  5437 catccccacgcttacaatcagctaaagtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatc-tcggtcacaaacattactcttgtggccttttt 5535  T
Q  231 cgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactata 330  Q
    | |||||||| ||||| || || |||| ||||||||| ||| | || |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  5536 caccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcct-cttggcctcctctcatcattcaatctctgcttacccttgtcagtaggggcactgta 5634  T
Q  331 cggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctc 402  Q
    ||| ||  || || |||| ||||||||  ||||  ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  5635 cggcttccgatgactctgctgtcccttgactctatgctcactcatcactttgtaatgagctttggtatcctc 5706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 32 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 9169 - 8755
Alignment:
Q  32 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 131  Q
    |||||||||| |||||| || || |||||    |||||||||||||  ||||| ||||| | | |||| ||||| || ||||| || ||||||||  |||    
T  9169 gtaccagtcagagcaaacacattaccaccggtcctaaccttcttcgtttgtgtacactgcgaattgatttgaccttcctcattgcagttatagcaaacaa 9070  T
Q  132 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctc 231  Q
    |||| || ||||| ||||  ||||   |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||| || ||||||||||||| ||||||    
T  9069 catctccccgcttacaattagctaatgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatccttatcacagacattactcttgtggcttttctc 8970  T
Q  232 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatac 331  Q
     ||||||||  | || || |||| ||||| |||||| ||| |  | |||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||  |||| ||||||||     
T  8969 accacacttgtagcaaacaatcttagcagaagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattcagcctctgctttcccttgtctgcaggagcactatat 8870  T
Q  332 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 431  Q
    |||||| ||| | |||| | ||| ||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| || || ||||| || ||||| | || ||| ||||| |    
T  8869 ggtttatgacaactctgctatcctttacctcttcgttcactcataaccttgtcatgagctttagtatcttcctcatatatcctgcagctactcaccaact 8770  T
Q  432 cagagaaaattctaa 446  Q
    |||||||||||||||    
T  8769 cagagaaaattctaa 8755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 33 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 1001 - 767
Alignment:
Q  33 taccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaac 132  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||   |||||||||| |||| || || ||||| | |||||| |||||||||||||| || ||||| ||  |||     
T  1001 taccagtcaaagcaaacactttaccaccggttctaaccttcctcggttgcgtacactgtgaactgatatgaccctcttcattgcagttataacaaacaat 902  T
Q  133 atcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcg 232  Q
    |||||| ||||||||||| |||||  |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||| |    
T  901 atcaccacgcttgcaatcagctagagtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttagtacaaacattactcttatggcctttcttg 802  T
Q  233 ccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatc 267  Q
    ||||||||  |||| || |||||||||||||||||    
T  801 ccacacttgtaacaaacaatctcagcaggagcatc 767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 311 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 3920 - 3793
Alignment:
Q  311 ttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtaga 410  Q
    |||||| |||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||| || |  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  3920 ttgtcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcctttgctccttcgatcactcatcaccttgtaatgagctttcgtgtcctcctcataga 3821  T
Q  411 tcctaccgcgacttaccaaatcagagaa 438  Q
    | || | || ||||||||| ||||||||    
T  3820 ttctgcagctacttaccaattcagagaa 3793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 101 - 438
Target Start/End: Original strand, 42923 - 43260
Alignment:
Q  101 tgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatcct 200  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||  ||||||| || |||||  |||| ||||   |||| || ||||| | |||||| ||||||||||||||||| |    
T  42923 tgaccttctgcattacaattgtagcaaacaacatccccacgcttaaaatccgctaaagtgtgtcctttctgactacacctaaagcacttcttctcatc-t 43021  T
Q  201 tcgt-acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtc 299  Q
      || |||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | |||||||| ||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| |  |    
T  43022 cggtcacaaacattactcttgtggcctttctcacaacacttgaaacaaattatctcagtaggagcatctctcctcttaggcctcctctcatcattcaacc 43121  T
Q  300 tctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 399  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||  |||||||| ||||  |||| |||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  43122 tctgtttacccttgtcagcaggggcactatacggcttcggacgactctactgtcccttgcctcggcgcttactcatcaccttgtaatgagcttttgtatc 43221  T
Q  400 ctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaa 438  Q
    ||| || |||||| ||| ||  |||||||||||||||||    
T  43222 ctcatcatagatcttacagctgcttaccaaatcagagaa 43260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 218 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 50307 - 50234
Alignment:
Q  218 ttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatc 291  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||| ||||| ||||  | |||||||| |||||    
T  50307 ttgtggcctttctcaccacaattaaagcagacaatctcagcaggaacatccttcttcttaggccgcctatcatc 50234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 210 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 33342 - 33078
Alignment:
Q  210 cgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacc 309  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||| |||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| |  ||||| || ||    
T  33342 cgttgctcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatttcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattcatcctctgttttcc 33243  T
Q  310 cttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtag 409  Q
     |||||| |||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||     
T  33242 tttgtcagcaggagcactgtatggtttaggacgactctgctgtcccttaccccttcgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtgtcttcctcatat 33143  T
Q  410 atcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgat 474  Q
    ||||| | ||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||| || || ||||| || |||||    
T  33142 atcctgcagctgcttaccaactcagagaaaattctaatcttttgatacccaatagctcttttgat 33078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 67 - 435
Target Start/End: Original strand, 51842 - 52210
Alignment:
Q  67 aaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgaccc 166  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| | ||| || | ||| ||||||| ||| |||||| |  ||||||||||  |||||||||  ||||   |||| ||     
T  51842 aaccttctttggctgcgtacactgtgaactaatattaccttcttcatcacagttatagaaaacaacatcaccatgcttgcaataagctaaagtgtgtcct 51941  T
Q  167 ttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcat 266  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||||||      ||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||    
T  51942 ttcttaccacacctaaagcacttcttctcatctcgatcacatacattactcttgtggcctttctcaccacacttgaaacagataatctcagtaggagcat 52041  T
Q  267 ccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcg 366  Q
    | ||| | || |||| |||||||||||| || ||||| ||||| |||||| |||| ||||||||| |||| |||||  |||| |||||||||||||| ||    
T  52042 ctctcctcctaggcctcctctcatcattcagcctctgtttacctttgtcagcaggagcactatacagtttcggacggctctgctgtcccttacctctgcg 52141  T
Q  367 ctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcaga 435  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||| ||  |||||||| |||||    
T  52142 ctcactcatcactttataatgagcctttgtatcctcttcataaatcctacagctgcttaccaattcaga 52210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 96; Significance: 7e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 98 - 477
Target Start/End: Original strand, 153714 - 154093
Alignment:
Q  98 atgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcat 197  Q
    |||||||| || ||||| || ||||||||  |||  || || ||||| ||||| ||||   |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  153714 atgtgaccttcctcattgcagttatagcaaacaatgtctccacgcttacaatcagctaatgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttctcat 153813  T
Q  198 ccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaag 297  Q
    |  |   ||| || |||||||| |||| ||| || |||||||| || || || |||||||  |||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| ||    
T  153814 ctctatcacagacattactcttatggcttttttcaccacacttgaagcaaacaatctcagtgggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattcag 153913  T
Q  298 tctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtg 397  Q
    || |||||||||||||||| |||| |||||||| || || |||||| |||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||| ||     
T  153914 tcgctgcttacccttgtcagcaggagcactatatggcttcggacgactctgctgtcccttacctctttgttcacccatcaccttgtaatgagctttcgtc 154013  T
Q  398 tcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    |||||||| || ||||||| ||  |||||||| ||||||||  |||||||||  || || || || || |||||||||||    
T  154014 tcctcctcataaatcctacagctgcttaccaactcagagaagtttctaatcttctgataaccaatggctctcttgatgtc 154093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 32 - 477
Target Start/End: Original strand, 2787 - 3226
Alignment:
Q  32 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 131  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||   ||||||||||||||| ||||  ||||| | |||||| || ||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  2787 gtaccagtcagagcaaacactttaccaccggttctaaccttcttcggttgtgcacactgtgaactgatatggccctcctcattgcagttatagcaaacta 2886  T
Q  132 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctc 231  Q
      || || ||||| ||||| ||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   |||||| |||||||||||||||||||     
T  2887 tgtctccccgcttacaatcagctaatgtgtgtcccttctgtccacacctgaagaacttcttctcatctttatcacaaacattactcttgtggcctttctt 2986  T
Q  232 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatac 331  Q
     ||||||||  | || || |||||| |||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| |  ||||| || || |||||| |||| |||||||||    
T  2987 accacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattcaacctctgttttcctttgtcagcaggagcactatac 3086  T
Q  332 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 431  Q
    ||||||||| || |||| ||||  ||||||||      || ||||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| | || ||| |||||||    
T  3087 ggtttaggatgactctgctgtcatttacctct------acacatcaccttgtaatgagctttagtatcttcttcatatatcctgcagctactcaccaaat 3180  T
Q  432 cagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    ||||||||||||| ||||  || || || || || |||||||||||    
T  3181 cagagaaaattcttatcttctgatacccaatggctctcttgatgtc 3226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 32 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 9920 - 9505
Alignment:
Q  32 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 131  Q
    |||||||||| |||||| || || ||||||   |||||||||||||| || || || || | ||| || || ||||| ||||| || ||||||||  |||    
T  9920 gtaccagtcagagcaaacaccttaccaccagtcctaaccttcttcggttgcgtacattgtgaacttatatggccctcctcattgcagttatagcaaacaa 9821  T
Q  132 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctc 231  Q
    |||| || ||||| |||||  ||||  |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||| || |||||||||||||| |||||    
T  9820 catctccccgcttacaatcaactagggtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatccttatcacagacattactcttgtggcccttctc 9721  T
Q  232 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatac 331  Q
     ||||||||  | || || || |||||||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| |  || ||||| ||||| ||| || | ||||||||     
T  9720 accacacttgtagcaaacaatatcagcaggagcatctctcctgtttggcctcctctcatcattcatcctttgctttcccttatcagcaagagcactatat 9621  T
Q  332 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 431  Q
    ||||||||| || |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| || || ||||||||  | ||||| | || ||| ||||| |    
T  9620 ggtttaggatgactctgctgtcctttacctcttcgttcactcatcaccttgtaaagagccttagtatcctcctc--atatcctgcagctactcaccaact 9523  T
Q  432 cagagaaaattctaatct 449  Q
    ||||||| ||||| ||||    
T  9522 cagagaagattcttatct 9505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 132 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 4501 - 4196
Alignment:
Q  132 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctc 231  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||   |||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||  |   |||||| |||||||| |||||||||||    
T  4501 catcaccacgcttacaatcagctaatgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcatttcttctcatctctatcacaaacattactcttttggcctttctc 4402  T
Q  232 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatac 331  Q
    ||||||||| || || || || |||| ||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||| ||| | |||    
T  4401 gccacacttgaagcaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcatttaaactctgcttacccttgtcagcaggagcagtgtac 4302  T
Q  332 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 431  Q
    || || |||||| |||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||| || ||||||| ||  ||||||||||    
T  4301 ggcttcggacgactctgttgtcccttgcctctacgttcactcatcaccttgtaatgag-tttcgtatcctcctcataaatcctacagctgcttaccaaat 4203  T
Q  432 cagagaa 438  Q
    |||||||    
T  4202 cagagaa 4196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2062 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold2062
Description:

Target: scaffold2062; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 32 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 1025 - 636
Alignment:
Q  32 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactga-----tgtgaccctcttcattacaattatagca 126  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||   |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||     ||||||| || || || || ||||||||    
T  1025 gtaccagtcaaagcaaacaccttaccaccagtcctaaccttcttcggttgtgtacactgcgaactgaactgatgtgaccttcctcgttgcagttatagca 926  T
Q  127 tccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcct 226  Q
      |||  ||||| ||||| ||||| |||||  |||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||  |   ||| || |||||||||||||||    
T  925 aacaatgtcaccacgcttacaatcagctagtgtgtgtcctttctgaccacacatgaagcacttcttctcatctctatcacagacattactcttgtggcct 826  T
Q  227 ttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcac 326  Q
    || || |||||||| || || || || ||   ||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| | ||    
T  825 ttttcaccacacttgaagcaaacaatatccataggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattcagtcgctgcttacccttgtcagcaggagtac 726  T
Q  327 tatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 416  Q
    |||| || || |||||| |||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| || |||||||    
T  725 tatatggcttcggacgactctgttgtcccttacctctacattcactcatcaccttgtaatgagatttcgtgtcctcctcataaatcctac 636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 205 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 5877 - 5644
Alignment:
Q  205 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 304  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||  || | || || |||| ||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| |||||||||    
T  5877 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgtaataaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattcagtctctgc 5778  T
Q  305 ttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcct 404  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| || ||| || |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || || || |    
T  5777 ttacccttgtcagcaggagcactatacggcttcggatgactctgctgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatcttctt 5678  T
Q  405 cgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaa 438  Q
    | |||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  5677 catagatcctacagctgcttaccaaatcagagaa 5644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 4458 - 4049
Alignment:
Q  26 gtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagc 125  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || |||||    ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| || || || || |||||||| || ||||    
T  4458 gtctgcgtaccagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactaatatgtccttcctcattacagttgtagc 4359  T
Q  126 atccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcc 225  Q
    |  ||| ||| || ||||||||||| || |   |||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||      ||| || ||||| |||| | |    
T  4358 aaacaatatccccacgcttgcaatcagccaatgtgtgtcctttctgaccacacctaaagcacttcttctcatctcgatcacacacattacttttgtagtc 4259  T
Q  226 tttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggca 325  Q
    |||||| |||||||| || || |  ||||||| ||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| |  ||||| ||||| |||||| |||| |||    
T  4258 tttctcaccacacttgaagcaaataatctcagtaggagcatctctcctcttaggcctcctctcatcattcaacctctgtttacctttgtcagcaggagca 4159  T
Q  326 ctatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgactta 425  Q
    ||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||  | |||||    
T  4158 ctatacggtttcggacgactctactgtcccttacctctgcgctcactcatcactttataatgagcttttgtatcctcttcatagatcctacaactactta 4059  T
Q  426 ccaaatcaga 435  Q
    |||| |||||    
T  4058 ccaattcaga 4049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 474
Target Start/End: Original strand, 16826 - 17235
Alignment:
Q  65 ctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgac 164  Q
    ||||||||||| | ||| || ||||| | ||| || || || || |||||||| || |||||  ||| ||| || ||||||||||| || |   |||| |    
T  16826 ctaaccttcttagtctgcgtacactgcgaactaatatgtccttcctcattacagttgtagcaaacaatatccccacgcttgcaatcagccaatgtgtgtc 16925  T
Q  165 ccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagc 264  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||||||      ||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |  ||||||| ||||||    
T  16926 ctttctgaccacacctaaagcacttcttctcatctcgatcacacacattactcttgtggcctttctctccacacttgaaacaaataatctcagtaggagc 17025  T
Q  265 atccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt 364  Q
    ||| ||| |  | |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||| || |||||| |||| |||||||| ||| |     
T  17026 atctctcctcttaggcctcctctcatcattcagtttctgcttacccttgtcggcaggagcactatacggcttcggacgactctgttgtcccttgcctttg 17125  T
Q  365 cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatag 464  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| || || || ||||  |  |||||||| ||||| ||| | || |||| ||| || || ||||    
T  17126 cgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtattctcttcatatattctacatctgcttaccaattcagaaaaattccttatctattgatagccaatag 17225  T
Q  465 ccctcttgat 474  Q
    ||||||||||    
T  17226 ccctcttgat 17235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 205 - 474
Target Start/End: Original strand, 115953 - 116222
Alignment:
Q  205 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 304  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||| | ||||| || || |||| ||||||||||||| |  | |||| |||||||||||| ||||||| |    
T  115953 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacatgaaacaaacaatatcagtaggagcatccctcctcttaggcctcctctcatcattcagtctcttc 116052  T
Q  305 ttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcct 404  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    || || |    
T  116053 ttacccttgtcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttcaaatcttctt 116152  T
Q  405 cgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgat 474  Q
    |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||| || |  || || || ||||||||||||||    
T  116153 cacagatcctacagctgcttaccaaatcagagaaatttcttattttctgataaccaatagccctcttgat 116222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 91; Significance: 7e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 32 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 963 - 557
Alignment:
Q  32 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 131  Q
    ||||| ||||||||||| || || ||||||   ||||||||||| ||||| || ||||| | |||||| || || || || || || ||||| ||  |||    
T  963 gtaccggtcaaagcaaacaccttaccaccagtcctaaccttctttggctgcgtacactgcgaactgatatgtccttcctcgttgcagttataacaaacaa 864  T
Q  132 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctc 231  Q
      || || ||||| ||||| |||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |   |||||| ||||||||||||||||| ||    
T  863 tgtccccacgcttacaatcagctagtgtgtgtcccttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctctatcacaaacattactcttgtggcctttttc 764  T
Q  232 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatac 331  Q
     |||||||| || ||  | || || | ||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| |  |||||||| ||||||||  |||| |||||||||    
T  763 accacacttgaagcaatcaatgtccgtaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcatttaacctctgcttccccttgtcggcaggagcactatac 664  T
Q  332 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 431  Q
    || || |||||| | || |||||||| |||||  | |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  | ||||| | || |||||||||||    
T  663 ggcttcggacgactttgctgtcccttgcctctatgttcactcatcaccttgtaatgagctttggtatcttcctcagaaatcctgcagctacttaccaaat 564  T
Q  432 cagagaa 438  Q
    |||||||    
T  563 cagagaa 557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 98 - 439
Target Start/End: Original strand, 5824 - 6165
Alignment:
Q  98 atgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcat 197  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||  ||||||| || ||||||||||| ||||   |||| || ||||||||||| ||||| |||||||||| ||    
T  5824 atgtgtccctcttcatcacaattataacaaacaacatccccacgcttgcaatcagctaatgtgtgtcctttctgtccacatctgaaacacttcttcttat 5923  T
Q  198 ccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaag 297  Q
    |      ||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||  |||||  ||| ||||| ||| | || |||| |||||||||||| ||    
T  5924 ctcaatcacacacattactcttgtggcctttctcaccacacttgaaatagacagtctcattaggggcatctctcctcctaggcctcctctcatcattcag 6023  T
Q  298 tctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtg 397  Q
      |||| || || |||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||     
T  6024 catctgttttcctttgtcagcaggagcactatacggtttcggacgactctgctgacccttacctctgcgctcactcatcactttataatgagctttcgta 6123  T
Q  398 tcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaa 439  Q
    ||||| || || || |||  ||  ||||||||||| ||||||    
T  6124 tcctcttcatatattctaaagctgcttaccaaatccgagaaa 6165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 226 - 474
Target Start/End: Original strand, 3215 - 3463
Alignment:
Q  226 tttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggca 325  Q
    |||||| |||||||| || || |  ||||||| ||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3215 tttctccccacacttgaagcaaataatctcagtaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattcaatctctgcttacccttgtcagcaggggca 3314  T
Q  326 ctatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgactta 425  Q
    |||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| | |  |||||    
T  3315 ctatacggcttcggacgactctgttgtcccttgcctctgcgctcactcatcaccttataatgagctttcgtatcctcttcatatatcctgcaggtactta 3414  T
Q  426 ccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgat 474  Q
    |||| ||||| ||  | || |||| ||| || || ||||||||||||||    
T  3415 ccaattcagaaaagttccttatcttttgataaccaatagccctcttgat 3463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 140 - 416
Target Start/End: Original strand, 6069 - 6344
Alignment:
Q  140 cgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacact 239  Q
    ||||||||||| |||||  |||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |   ||| || ||||||||||||||||| || |||||||    
T  6069 cgcttgcaatcagctagtgtgtgtcctttctgaccacatctgaagcacttcttctcatctctatcacagacattactcttgtggcctttttcaccacact 6168  T
Q  240 taaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttagg 339  Q
    | || || || || |||| | ||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| |  || |||||||||||||||  ||| ||||||||||| || ||    
T  6169 tgaagcaaacaatgtcagtaagagcatctctcctcttgggcctcctctcatcatttaacct-tgcttacccttgtcagtaggagcactatacggcttcgg 6267  T
Q  340 acgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 416  Q
    |||| |||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  6268 acgactctgctgtcccttgcctctgcgttcactcatcaccttgtaatgagctttcgtgtcctcctcataaatcctac 6344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1056 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold1056
Description:

Target: scaffold1056; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 104 - 474
Target Start/End: Original strand, 1949 - 2317
Alignment:
Q  104 ccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcg 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||| ||||   | || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |    
T  1949 ccctcttcatcacaattatagcatacaacatc-ccacgcttacaatcagctaaagtatgtcctttctgtccacacctaaagcacttcttctcatc-tcgg 2046  T
Q  204 t-acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctct 302  Q
    | ||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || || |  || |||| ||||||||| | | |  | |||| |||||||||||| || ||||    
T  2047 tcacacacattactcttgtggcctttctcaccacacttgaagcaaataatttcagtaggagcatctcacctcttaggcctcctctcatcattcagcctct 2146  T
Q  303 gcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctc 402  Q
    | ||||| |||||| |||  |||||| ||||||| |||||| |||  | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  2147 gtttacctttgtcagcagaagcacta-acggtttcggacgactctactatcccttacctctgcgctcactcatcactttataatgagcttttgtatcctc 2245  T
Q  403 ctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgat 474  Q
     || ||||| |||| ||  ||||| || ||||| ||| |||| ||||  || || || ||||||| ||||||    
T  2246 ttcatagattctacagctgcttactaattcagaaaaatttcttatcttctgataaccaatagcccgcttgat 2317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 167 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 555 - 284
Alignment:
Q  167 ttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcat 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |   ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||   ||||||||    
T  555 ttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctgtatcacaaacactacttttgtggcctttctcgccacacttgaaacaaacaatatctataggagcat 456  T
Q  267 ccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcg 366  Q
    | ||| |  | ||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||| ||    
T  455 ctctcctcttgggccttctctcatcatttaacctctgcttacccttgtcagaaggagcactatacggcttcggacgactgtgctgtcccttacctctacg 356  T
Q  367 ctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaa 438  Q
     | |||||||||||| |||||||||||  |||||||||| || ||||| |  |  |||||||||||||||||    
T  355 tttactcatcaccttgtaatgagctttcctgtcctcctcataaatcctgcaactgcttaccaaatcagagaa 284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1517 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold1517
Description:

Target: scaffold1517; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 1642 - 1229
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||    || |||||||||||||| || ||||| | |||||| ||||| |||||||| || || |||    
T  1642 agtctgcgtaccagtcaatgcaaacactttccctccggtcctgaccttcttcggctgagtacactgcgaactgatatgaccttcttcattgcagttgtag 1543  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggc 224  Q
    ||  |||  || || | ||| || || |||||  |||| |||||||  |||||||| || || ||| || ||||  |   |||| | || ||||||||||    
T  1542 caaacaatgtccccacacttacattcagctagggtgtgtcccttctaaccacacctaaaacatttcctcacatctctaccacaagcattgctcttgtggc 1443  T
Q  225 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggc 324  Q
    |||| || ||||||||  |||| || ||||||||||||||||| ||| |  | |||| ||| |||||||| | | |||| || ||||||||| |||| ||    
T  1442 ctttttcaccacacttgtaacagacaatctcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcattcattttctgttttcccttgtcagcaggagc 1343  T
Q  325 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgactt 424  Q
    ||| || || ||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||| ||  |||    
T  1342 actgtaaggcttaggacgactctgctgtcccttacctctcctctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtgtcttcctcatatatcctacagctgctt 1243  T
Q  425 accaaatcagagaa 438  Q
    ||||| ||||||||    
T  1242 accaactcagagaa 1229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 399
Target Start/End: Original strand, 41884 - 42258
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||  |||||||||||  |  ||||| | |||||| ||||| ||  |||| || || ||     
T  41884 agtctgcgtaccagtcaaagcaaacacctttcccccaattctagtcttcttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccttccccattgcagttgtaa 41983  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatc-cttcgtacaaacgttactcttgtgg 223  Q
    ||  |||  || || |||||||| || ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| ||||||||||||    
T  41984 cagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttcc-acaaacattactcttgtgg 42082  T
Q  224 cctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacagggg 323  Q
    |||||||| ||||||||  | || || |||||| |||||||||| ||| |  | |||| ||| ||||||   |   ||||||| || |||||| |||| |    
T  42083 cctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtcagcaggag 42182  T
Q  324 cactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 399  Q
    |||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  42183 cactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgagctttggtgtc 42258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1426 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold1426
Description:

Target: scaffold1426; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 1762 - 1388
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||  ||||||||||||||| |  |  ||||| | |||||| ||||||||| |||| || || |||    
T  1762 agtctgcgtaccagtcaatgcaaacactttgcccccagttctaaccttcttcggttcgggacactgtgaactgatatgaccctctccattgcagttgtag 1663  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggc 224  Q
    ||   ||  || || |||||||| || ||||   |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||| ||||||||||| |    
T  1662 cagataatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgtcccttctgaccacacctgaagcacttcctctcatctttaccacaaacattactcttgtgtc 1563  T
Q  225 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggc 324  Q
    ||||||| ||||||||  |||| || ||||||| ||||||||| ||| |  | |||| ||| |||||| | |   ||||||| || |||||| |||| ||    
T  1562 ctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttaggcctcctatcatcactcatcttctgctttcctttgtcagcaggagc 1463  T
Q  325 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 399  Q
    ||| || || ||| |||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| |  || |||||||||||||||||    
T  1462 actgtaaggcttatgacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatgttgtaatgagctttggtgtc 1388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 432 - 71
Alignment:
Q  32 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 131  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||    |||||||||||||| || || || || | ||| || ||||| || ||||| || ||||| ||  |||    
T  432 gtaccagtcaaagcaaacaccttgccaccggtcctaaccttcttcggttgcgtacattgcgaactaatatgaccttcctcattgcagttataacaaacaa 333  T
Q  132 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctc 231  Q
      || || ||||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||| |||||||||||||||||||  |   ||| || ||||||||||||||||||||    
T  332 tgtccccacgcttacaatcagctagtgtgtgtcttttctgaccacacatgaagcacttcttctcatctctatcacagacattactcttgtggcctttctc 233  T
Q  232 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatac 331  Q
    ||||||||| || || || || |||| |||||| || ||  |  | |||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||| ||| | |||    
T  232 gccacacttgaagcaaacaatatcagtaggagcctctctgctcttgggcctcctctcatcatttaacctctgcttacccttgtcagcaggagcattttac 133  T
Q  332 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagcttt 393  Q
    || || |||||| |||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  132 ggcttcggacgactctgctgtcccttgcctctgcgttcactcatcaccttgtaatgagcttt 71  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 159 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 514374 - 514134
Alignment:
Q  159 tgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagc 258  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||   |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||  |||| || |||||||     
T  514374 tgtgtcccttctgaccacacctgaagcacttcctctcgtctttaccacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcaga 514275  T
Q  259 aggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtccctta 358  Q
    ||||||||| ||| |  | |||| ||| |||||||| |   ||| ||| || |||||| |||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||||    
T  514274 aggagcatctctcctcttaggcctcctatcatcattcatcttcttctttcctttgtcagcaggagcactttaaggcttaggacgattctgctgtccctta 514175  T
Q  359 cctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 399  Q
    || || | ||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  514174 cccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtc 514134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 399
Target Start/End: Original strand, 610 - 984
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| || || || |||  ||||||||||||||| |  |  ||||| | ||| || ||||||||| |||| || || |||    
T  610 agtctgcgtaccagtcaatgcaaacaccttgcccccagttctaaccttcttcggttcaggacactgtgaacttatatgaccctctccattgcagttgtag 709  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggc 224  Q
    ||  |||  || || ||||| || || ||||   ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||   |||||| || ||||||||||    
T  710 cagacaatgtccccacgcttacattcagctaaattgtgacccttctgaccgcacctgaagcacttcctctcatctttaccacaaacattgctcttgtggc 809  T
Q  225 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggc 324  Q
    |||| || ||||||||  |||| || ||||||| ||||||||| ||| |  | |||| ||| |||||| | |   ||| ||| || |||||| |||| ||    
T  810 ctttttcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttaggcctcctatcatcaatcaacttctactttcctttgtcagcaggagc 909  T
Q  325 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 399  Q
    ||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  910 actgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtc 984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 69 - 414
Target Start/End: Original strand, 11170 - 11515
Alignment:
Q  69 ccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgaccctt 168  Q
    ||||||||||||| || ||||| |  ||||| |||||||||||||| || || |||||  |||  || || ||||| || || |||||   ||| |||||    
T  11170 ccttcttcggctgagtacactgtgagctgatatgaccctcttcattgcagttgtagcagacaatgtccccacgcttacattcagctagtgcgtgtccctt 11269  T
Q  169 ctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatcc 268  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||  |   |||| | || |||||||||||||| || ||||||||  |||| || ||||||| |||||||||     
T  11270 ctgaccacacctgaagcacttcctctcatctctaccacaagcattgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatct 11369  T
Q  269 ctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgct 368  Q
    ||| |  | || | ||| |||||||| |   ||||||| || |||||| |||| |||||||| || ||||||||| |||| || |||||||| || | ||    
T  11370 ctcctcttaggactcctatcatcattcaaaatctgctttcctttgtcagcaggagcactataaggcttaggacgaatctgctgacccttacccctcctct 11469  T
Q  369 cactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcct 414  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  11470 cactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcctcataaatcct 11515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 101 - 471
Target Start/End: Original strand, 36723 - 37093
Alignment:
Q  101 tgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatcct 200  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||  ||| |||||  ||||||||||| |||| | | ||||||||||  ||||||| ||| || |||||| | ||||    
T  36723 tgaccctcttccttgcaattaaagcacacaatatcactacgcttgcaatcagctaacgtatgacccttcttgccacaccggaaacatttcttcacctcct 36822  T
Q  201 tcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtct 300  Q
      | |||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | |||    
T  36823 ctggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagacgatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattct 36922  T
Q  301 ctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 399  Q
    ||| || ||||| ||| ||||||||||||| || |||||  || |||| || ||||||  |||| |||||| | |  ||||| |||||||||||||||||    
T  36923 ctgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggagactctgctggccctta-gtcttccgctcatttacaaccttgtaatgagctttggtgtc 37021  T
Q  400 ctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctctt 471  Q
    |||||| ||||| |||| |    | ||||||||||  |||| ||  |||||||||||||| || ||||||||    
T  37022 ctcctcatagattctacagttgttcaccaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatccaattgccctctt 37093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 218 - 449
Target Start/End: Original strand, 251961 - 252192
Alignment:
Q  218 ttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaa 317  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||| || ||||||| ||| |  | |||| ||| |||||||| |   | || || ||  || ||     
T  251961 ttgtggcctttttcaccacacttgaaacacacaatctcaacaagagcatctctcctcttgggcctcctatcatcattcatcttatgttttcctgtggcag 252060  T
Q  318 caggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctacc 417  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |     
T  252061 caggagcactgtaaggtttaggacgattatgttgtcccttacccctcctctcactcatcaccttgtaatgagctttggtgtcttcctcatatatcctgca 252160  T
Q  418 gcgacttaccaaatcagagaaaattctaatct 449  Q
    ||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  252161 gctgcttaccaattcagagaaaattctaatct 252192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 205 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 229827 - 229555
Alignment:
Q  205 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 304  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||| ||||| | |||||||| |||||    | ||||||     
T  229827 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaaacaatctccgcaggagcatccttcttattaggccgcctatcatcgaccattctctgt 229728  T
Q  305 ttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 403  Q
    || ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||| |||| ||  |||||  |||| | |||| |||  ||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  229727 ttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggtcctta-gtcttcctctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcc 229629  T
Q  404 tcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    || || || || | || | | ||||||||||  |||| ||  |||||||||||||  || |||||||| |||||    
T  229628 tcataaattctgcagctattaaccaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatctgatcgccctcttaatgtc 229555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 4)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 284 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 12310 - 12160
Alignment:
Q  284 ctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttat 383  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| || |||||| | || | |||||| ||||| || |||||||||||||| |    
T  12310 ctctcatcattcagtctctgcttacccttgtcagcaggagcactgtacggcttcggacgactatgctatcccttgcctctacgatcactcatcaccttgt 12211  T
Q  384 aatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcag 434  Q
    ||||| |||| || |||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||    
T  12210 aatgatctttcgtatcctcctcataaatcctacagctgcttaccaaatcag 12160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 284 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 20490 - 20340
Alignment:
Q  284 ctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttat 383  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| || |||||| | || | |||||| ||||| || |||||||||||||| |    
T  20490 ctctcatcattcagtctctgcttacccttgtcagcaggagcactgtacggcttcggacgactatgctatcccttgcctctacgatcactcatcaccttgt 20391  T
Q  384 aatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcag 434  Q
    ||||| |||| || |||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||    
T  20390 aatgatctttcgtatcctcctcataaatcctacagctgcttaccaaatcag 20340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12418 - 12352
Alignment:
Q  174 cacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacactt 240  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12418 cacacctaaagcacttcttctcatctttacgaaaaacattactcttgtggcctttctcgccacactt 12352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 174 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20598 - 20532
Alignment:
Q  174 cacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacactt 240  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20598 cacacctaaagcacttcttctcatctttacgaaaaacattactcttgtggcctttctcgccacactt 20532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0276 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0276
Description:

Target: scaffold0276; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 23944 - 23704
Alignment:
Q  159 tgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatc-cttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcag 257  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||  ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||  | || || ||||||     
T  23944 tgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttcc-acatacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtatcaaacaatctcaa 23846  T
Q  258 caggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtccctt 357  Q
    |||||||||| ||| |  | |||| ||| ||||||   |   ||||||| || |||||| |||| ||||| || || ||||||||| |||| ||||||||    
T  23845 caggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgttgtccctt 23746  T
Q  358 acctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 399  Q
    ||| || | ||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  23745 acccctcctctcactcataatcttataatgagttttggtgtc 23704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1845 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1845
Description:

Target: scaffold1845; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 179 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 1305 - 1070
Alignment:
Q  179 ctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcg 278  Q
    |||||||||||| |||||||  |   |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||| ||| |  | |    
T  1305 ctgaagcacttcctctcatctctaccacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagcaggagcatctctcctcttgg 1206  T
Q  279 gccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcac 378  Q
    | | ||| |||||||| |   ||||||| || |||||| |||| ||||| || || |||||||||||||  |||||||| || || | ||||||||| |     
T  1205 gtctcctatcatcattcatcttctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattcttctgtccctttcccctcctctcactcattat 1106  T
Q  379 cttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcct 414  Q
    ||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  1105 cttgtaatgagctttggtgtcttcttcgtaaatcct 1070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 32 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 63667 - 63377
Alignment:
Q  32 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 131  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||     ||||||||||| ||||| || ||||| | |||||| ||||| || |||||| | || |||||  |||    
T  63667 gtaccagtcaaagcaaacaccttgccacttgtcctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcctcattatagttgtagcaaacaa 63568  T
Q  132 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgt-acaaacgttactcttgtggcctttct 230  Q
     ||| ||  |||| ||||| ||||   |||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||| ||||||||||||||||| |    
T  63567 tatccccatgcttacaatcagctaaagtgtgtcctttctgaccacacctgaaacacttcttctcatc-tcggtcacaaacattactcttgtggcctttat 63469  T
Q  231 cgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggg 322  Q
    | |||||||| ||||| || || |||| ||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||    
T  63468 caccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattcaatctttgcttacccttgtcagcaggg 63377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 345 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 63374 - 63284
Alignment:
Q  345 tctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcaga 435  Q
    |||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||||| || ||||||||| |||||    
T  63374 tctgctgtaccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatcctcttcataaatcctacagctacttaccaattcaga 63284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0451 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0451
Description:

Target: scaffold0451; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 205 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 14007 - 13798
Alignment:
Q  205 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 304  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | ||||||     
T  14007 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 13908  T
Q  305 ttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 403  Q
    || ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||||  |||| |||||| | |  ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  13907 ttgcccttatcatcaggggcactatagggcttagggcgactctgttggccctta-gtcttccgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcctcc 13809  T
Q  404 tcgtagatcct 414  Q
    |||||||||||    
T  13808 tcgtagatcct 13798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 212 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 16577 - 16375
Alignment:
Q  212 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 311  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||  | || || | ||||||||||| |||  |||| || |||| |||||||||||| |  || |||||||| |    
T  16577 ttactcttgtggcccttctcaccacacttgtagcaaacaacctcagcaggagtatctttctttctaggcctcctctcatcattcaccctttgcttacctt 16478  T
Q  312 tgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagat 411  Q
    | ||| |||| |||||||| || || |||||| |||| || | |||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  16477 tatcagcaggagcactataaggctttggacgactctgctgactcttacccctccgctcactcataaccttgtaatgagctttggtatcttcctcatagat 16378  T
Q  412 cct 414  Q
    |||    
T  16377 cct 16375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 205 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 67083 - 66817
Alignment:
Q  205 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 304  Q
    |||||| || |||||||||||||| || ||||||||| |||| || ||||| | ||||||||| ||| |  | || | ||| |||||||| |   ||| |    
T  67083 acaaacattgctcttgtggcctttttcaccacacttataacaaacaatctcggaaggagcatctctcctcttgggtctcctatcatcattcatcatctac 66984  T
Q  305 ttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcct 404  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || | ||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  66983 tttcctttgtcaacaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttgcccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcct 66884  T
Q  405 cgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctctt 471  Q
    | || ||||| | ||   |||||||||||||||| | ||| ||||| || || || ||||| |||||    
T  66883 cataaatcctgcagctgtttaccaaatcagagaacactctgatctgctgatacccaatagctctctt 66817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2165 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold2165
Description:

Target: scaffold2165; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 159 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 824 - 584
Alignment:
Q  159 tgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagc 258  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||| |||| || ||   |||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||  |||| || |||||||     
T  824 tgtgtcccttttgaccacacctgaagcacttcctctcgtctttaccacaaacattgctcttgtggcctttctcaccaaacttgtaacaaacaatctcaga 725  T
Q  259 aggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtccctta 358  Q
    ||||||||| ||| |  | |||| ||| |||||||| |   ||||||| || ||||||| ||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||||    
T  724 aggagcatctctcctcttaggcctcctatcatcattcatcttctgctttcctttgtcaataggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtccctta 625  T
Q  359 cctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 399  Q
    || || | || |||||| | ||| |||| | ||||||||||    
T  624 cccctcctctaactcattatcttgtaataaactttggtgtc 584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 215 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 30291 - 30092
Alignment:
Q  215 ctcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgt 314  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| |||| || |||||||||||||||||  || |  | |||| ||| |||||||| |   |||| || || ||||    
T  30291 ctcttgtggcctttttcaccacacttataacaaacaatctcagcaggagcatctttcctcttgggcctcctgtcatcattcatcttctgtttccctttgt 30192  T
Q  315 caacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcct 414  Q
    || |||| ||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||| || | ||||||||| | ||  ||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  30191 cagcaggagcactgtaaggtttaggacgattctgttatcccttacccctcctctcactcattatctagtaatgagcttttgtgtcctcctcatatatcct 30092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 278 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 762 - 625
Alignment:
Q  278 ggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatca 377  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  ||||| |||||| |||| ||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  762 ggcctcctctcatcattcagtctctatttacctttgtcagcaggagcactgtacggtttcggacgactctgctgtcccttacctctacactcactcatca 663  T
Q  378 ccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 416  Q
    ||||||  |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  662 ccttat-gtgagcttttgtatcctcttcataaatcctac 625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0289
Description:

Target: scaffold0289; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 205 - 416
Target Start/End: Original strand, 117 - 328
Alignment:
Q  205 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 304  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | ||||||     
T  117 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagacaatctctgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 216  T
Q  305 ttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 403  Q
    || ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||| ||||  | ||||||  |||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  217 tttcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgccggccctta-gtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagctttggtgtcctcc 315  T
Q  404 tcgtagatcctac 416  Q
    || ||||| ||||    
T  316 tcatagattctac 328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 205 - 476
Target Start/End: Original strand, 17489 - 17760
Alignment:
Q  205 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 304  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | ||| ||     
T  17489 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctatgt 17588  T
Q  305 ttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 403  Q
    || ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||||  |||| |||||| |||  ||| | |||||||| ||||| ||||||    
T  17589 ttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggccctta-gtcttccgctcattcacaaccgtgtaatgagccttggtatcctcc 17687  T
Q  404 tcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgt 476  Q
    || || || || | || | | ||||||||||  |||| ||  |||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  17688 tcataaattctgcagctattaaccaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatccgattgccctcttaatgt 17760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0457 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0457
Description:

Target: scaffold0457; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 300 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 13934 - 13757
Alignment:
Q  300 tctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 399  Q
    ||||||| || |||||| |||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  13934 tctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttttaatgagctttggtgtc 13835  T
Q  400 ctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
     || || ||||| ||||  |   | ||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||  ||||| |||||||||||    
T  13834 ttcttcatagattctacacctgttaaccaactcagagaagactctgatctgctgatatctaatagctctcttgatgtc 13757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 205 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 139585 - 139313
Alignment:
Q  205 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 304  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||    |||||||| |||| |||||||||  | |||||||| |||||    | ||||||     
T  139585 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcaagtaatctcagctggagtatccctcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 139486  T
Q  305 ttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 403  Q
    || ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||| |||| || |||||   |||| |||||| |||  ||||| |||||||| || || || |||    
T  139485 ttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgctggccctt-ggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagcctttgtatcttcc 139387  T
Q  404 tcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    ||||||||||| | || | | || ||||||| ||||||||  | |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  139386 tcgtagatcctgcagctattcactaaatcagggaaaattcggagctgttgatatccgatcgccctcttgatgtc 139313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 291
Target Start/End: Original strand, 32218 - 32294
Alignment:
Q  215 ctcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatc 291  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||  | |||||||| |||||    
T  32218 ctcttgtggcctttctcgccacaattaaaacagacaatctcagcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatc 32294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 10214 - 10062
Alignment:
Q  205 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 304  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| | || ||||| || || || |||||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | |||||||    
T  10214 acaaacattactcttgtggcctttcccgccatagttgaaacaaacaatatccgcaggagcatccttcttctttggccgcctatcatcgaccattctctgc 10115  T
Q  305 ttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtccctt 357  Q
    || ||||| ||| || |||||||||| |||||||| ||| |||| || |||||    
T  10114 ttgcccttatcagcaagggcactataaggtttagggcgactctgctgaccctt 10062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 12869 - 12717
Alignment:
Q  205 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 304  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| | || ||||| || || || |||||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | |||||||    
T  12869 acaaacattactcttgtggcctttcccgccatagttgaaacaaacaatatccgcaggagcatccttcttctttggccgcctatcatcgaccattctctgc 12770  T
Q  305 ttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtccctt 357  Q
    || ||||| ||| || |||||||||| |||||||| ||| |||| || |||||    
T  12769 ttgcccttatcagcaagggcactataaggtttagggcgactctgctgaccctt 12717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1220
Description:

Target: scaffold1220; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 459
Target Start/End: Original strand, 21 - 319
Alignment:
Q  161 tgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcag 260  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| || |||||| | ||||| | |||||| || || |||||||||||||| |||||  | ||||| || ||||| |||     
T  21 tgacccttcttgccacaccggaaacatttcttcacctcctttggacaaacattgcttttgtggcctttctcaccacaaatgaaacagacaatctccgcaa 120  T
Q  261 gagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacc 360  Q
    |||||||| ||||  | |||||||| |||||   ||  ||||  || ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||||      
T  121 gagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgacaatactctatttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggccctta-g 219  T
Q  361 tctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcc 459  Q
    |||| |||||| |||  ||||| | ||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||   | ||||||||||  |||| ||| |||| |||||||||    
T  220 tcttccgctcattcacaaccttgtgatgagctttggtgtcttcctcataaatcctacagctgttcaccaaatcaggaaaaactctgatcttttggtatcc 319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 159 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 28949 - 28631
Alignment:
Q  159 tgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagc 258  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||| || |||||  | ||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||    |||| |||    
T  28949 tgtgacccttcttgccacaccggaaacatttctttacctccttaggacaaacattgctcttgtggcctttctcgccacaattgaaacaggtaatcttagc 28850  T
Q  259 aggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtccctta 358  Q
    |||| ||||| ||||  | ||||| ||||| ||    | |||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| | |  ||| || ||||||    
T  28849 aggaacatccttcttcttaggccgtctctcctcgaccattctctgtttgcccttatcaacaggggcactatatggcttagggcaacactgctggccctta 28750  T
Q  359 cctcttc-gctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtat 457  Q
      ||||| ||||| | |  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||   | || ||||| |  |||||||  ||||||||||||    
T  28749 -gtcttctgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcctcctcgtagattctgcagctgttcactaaatctggaaaaattcggatctgttggtat 28651  T
Q  458 cctatagccctcttgatgtc 477  Q
    || || |||||||| |||||    
T  28650 ccgatcgccctcttaatgtc 28631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Original strand, 12080 - 12161
Alignment:
Q  159 tgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatc-cttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacactt 240  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12080 tgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttc-cacaaacattactcttgtggcctttctcaccacactt 12161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 80
Target Start/End: Original strand, 11958 - 12013
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggct 80  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||  |||||||||||    
T  11958 agtctgtgtaccagtcaaagcaaacacctttccaccaattctagtcttcttcggct 12013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 195
Target Start/End: Original strand, 12916 - 13046
Alignment:
Q  65 ctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgac 164  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| | |||||| ||||| ||||||||||| || |||||  ||||||| || ||||| ||||| ||||   |||| |    
T  12916 ctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccccacgcttacaatcagctaaagtgtgtc 13015  T
Q  165 ccttctgtccacacctgaagcacttcttctc 195  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  13016 ctttctgaccacacctaaagcacttcttctc 13046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 477
Target Start/End: Original strand, 5327 - 5599
Alignment:
Q  205 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 304  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | ||||||     
T  5327 acaaacattactcttatggcccttctcgccacagttgaaacaaacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 5426  T
Q  305 ttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 403  Q
    || ||||| ||| || |||||||||| || ||||| ||| |||| || |||||   |||| |||||| |||  ||||| |||||||| || || |||||     
T  5427 ttgcccttatcagcaagggcactataaggcttagggcgactctgctggccctt-ggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcctca 5525  T
Q  404 tcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
    || ||||| || | || | | ||||||||||  |||| ||  |||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  5526 tcatagattctgcagctattcaccaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctcttaatgtc 5599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0679 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0679
Description:

Target: scaffold0679; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 365 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 850 - 766
Alignment:
Q  365 cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatct 449  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||| || ||| ||||| ||||| ||  |||||||||    
T  850 cgctcactcatcaccttataatgagctttggtatcatcctcataaatcctacagctactcaccaactcagaaaagtttctaatct 766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 15016 - 14817
Alignment:
Q  205 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 304  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| | |||||||||| ||||  | ||| |||| |||||    | ||||||     
T  15016 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctccgtaggagcatccttcttcttaggctgcctatcatcgaccattctctgt 14917  T
Q  305 ttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 403  Q
    || ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||||  |||| |||||| |||  ||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  14916 ttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggccctta-gtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcc 14818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 11331 - 11197
Alignment:
Q  205 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 304  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| | |||||||||| ||||  | ||| |||| |||||    | ||||||     
T  11331 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctccgtaggagcatccttcttcttaggctgcctatcatcgaccattctctgt 11232  T
Q  305 ttacccttgtcaacaggggcactatacggtttagg 339  Q
    || ||||| ||| ||||||||||||| || |||||    
T  11231 ttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagg 11197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 365 - 449
Target Start/End: Original strand, 25949 - 26033
Alignment:
Q  365 cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatct 449  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||| || ||| ||||| ||||| ||  |||||||||    
T  25949 cgctcactcatcaccttataatgagctttggtatcatcctcataaatcctacagctactcaccaactcagaaaagtttctaatct 26033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 348
Target Start/End: Original strand, 104562 - 104698
Alignment:
Q  212 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  || | || || |||||| ||||||||||  |||| || ||||||||||||||| | | |||||| || ||||    
T  104562 ttactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcaaacaatctcaacaggagcatctttctttctaggccgcctctcatcaatcattctctgttttccct 104661  T
Q  312 tgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctg 348  Q
    | ||| |||| |||||||| || || |||||| ||||    
T  104662 tatcagcaggagcactataaggctttggacgactctg 104698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 240
Target Start/End: Original strand, 30083 - 30298
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| |||||| |||| ||||| || |||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||| | |||||| ||||||||| |||| || || ||     
T  30083 agtctgcgtaccaatcaatgcaaacacctttccaccatttctaaccttcttcggctcaggacactgcgaactgatatgaccctctccattgcagttgtaa 30182  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggc 224  Q
    ||  |||  || || ||||| || || |||||  |||| |  ||||| ||||||||||| |||||| |||||||  |   ||||||||| || |||||||    
T  30183 cagacaatgtccccacgcttacattcagctaggttgtgtcttttctgaccacacctgaatcacttcctctcatctctaccacaaacgttgcttttgtggc 30282  T
Q  225 ctttctcgccacactt 240  Q
    ||||||| ||||||||    
T  30283 ctttctcaccacactt 30298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 399
Target Start/End: Original strand, 30334 - 30433
Alignment:
Q  300 tctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 399  Q
    ||||||| || |||||| |||| ||||| || || ||||||||| |||| |||||||| || || | |||||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  30334 tctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgtcccttgcccctcctctcactcattgtcttgtaatgagctttggtgtc 30433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 291
Target Start/End: Original strand, 21944 - 22019
Alignment:
Q  216 tcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatc 291  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||| || ||||| || |||||    
T  21944 tcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctcagcaggagcatccttcttccttggccgtctatcatc 22019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 291
Target Start/End: Original strand, 37368 - 37443
Alignment:
Q  216 tcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatc 291  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||| || ||||| || |||||    
T  37368 tcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctcagcaggagcatccttcttccttggccgtctatcatc 37443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 36785 - 36718
Alignment:
Q  215 ctcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccg 282  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  36785 ctcttatggcctttctcgccacaattaaaacagacaatctcagcaggagcatccttcttccttggccg 36718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 312
Target Start/End: Original strand, 26679 - 26788
Alignment:
Q  203 gtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctct 302  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| |||||  || | || || | |||||||| || |||  |||| || |||| |||||||||||| | ||| |    
T  26679 gtacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcaaacaacctcagcagtagtatctttctttctaggcctcctctcatcattcactcttt 26778  T
Q  303 gcttaccctt 312  Q
    ||||||||||    
T  26779 gcttaccctt 26788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 215 - 285
Target Start/End: Original strand, 379 - 449
Alignment:
Q  215 ctcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcct 285  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||| |||| || ||||||||    
T  379 ctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacaaacaatctcagcaggaacatccttcttccttggccgcct 449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 357
Target Start/End: Original strand, 1318 - 1463
Alignment:
Q  212 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  || |||| || |||||| ||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||   | |||||| |||||||    
T  1318 ttactcttgtggcctttctcaccacaagtataacaaacaatctcaacaggagcttccatctttctcgggcgcctatcatcaaccattctctgtttaccct 1417  T
Q  312 tgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtccctt 357  Q
    | ||| |||| ||||| || || ||||| ||| |||| || |||||    
T  1418 tatcagcaggagcactgtaaggcttagggcgactctgttggccctt 1463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 405
Target Start/End: Original strand, 48066 - 48259
Alignment:
Q  212 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  || | || || |||||| ||||||||||  |||| || || ||||||||||||   | |||||| |||||||    
T  48066 ttactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatctcaacaggagcatctttctttctagggcgcctctcatcaaccattctctgtttaccct 48165  T
Q  312 tgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctc 405  Q
    | ||| |||| ||||| || || ||||||||| |||| || || ||  || |||||||| |||  | ||| |||||||  ||||| ||||||||    
T  48166 tatcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgacctttggcttttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcctcctc 48259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 55439 - 55246
Alignment:
Q  212 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  || | || || |||||| ||||||||||  |||| || || ||||||||||||   | |||||| |||||||    
T  55439 ttactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatctcaacaggagcatctttctttctagggcgcctctcatcaaccattctctgtttaccct 55340  T
Q  312 tgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctc 405  Q
    | ||| |||| ||||| || |  ||||||||| |||| || || ||  || |||||||| |||  | ||| |||||||  ||||| ||||||||    
T  55339 tatcagcaggagcactgtaagtcttaggacgactctgctgacctttgtcttttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcctcctc 55246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 399
Target Start/End: Original strand, 17698 - 17762
Alignment:
Q  335 ttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 399  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| || | ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  17698 ttaggacgactctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttataatgagctttggtgtc 17762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2059 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold2059
Description:

Target: scaffold2059; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 744 - 601
Alignment:
Q  205 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 304  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| ||||| || |||||    |||||||| ||||||||||||||  | |||||||| |||||    | ||||||     
T  744 acaaacattactcttgtggtctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagctggagcatccctcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 645  T
Q  305 ttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctg 348  Q
    || ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||| ||||    
T  644 ttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctg 601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 266
Target Start/End: Original strand, 453 - 504
Alignment:
Q  215 ctcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcat 266  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  453 ctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctcagcaggagcat 504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 348
Target Start/End: Original strand, 208 - 351
Alignment:
Q  205 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 304  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||| || || || |||||||||||| ||||  | |||  ||| |||||    | |||||||    
T  208 acaaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaacaatatccgcaggagcatccttcttctttggcttcctatcatcgaccattctctgc 307  T
Q  305 ttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctg 348  Q
    || ||||| ||  ||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  308 ttgcccttatctgcaggggcactataaggtttagggcgactctg 351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 327
Target Start/End: Original strand, 7209 - 7324
Alignment:
Q  212 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 311  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||  || | || || |||||| ||||||||||  |||| || |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  7209 ttactcttatggcctttctcaccacaagtatagcaaacaatctcaacaggagcatctttctttctaggcctcctctcatcattcattctttgcttaccct 7308  T
Q  312 tgtcaacaggggcact 327  Q
    | ||| |||| |||||    
T  7309 tatcagcaggagcact 7324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 327
Target Start/End: Original strand, 14339 - 14454
Alignment:
Q  212 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 311  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||  || | || || |||||| ||||||||||  |||| || |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  14339 ttactcttatggcctttctcaccacaagtatagcaaacaatctcaacaggagcatctttctttctaggcctcctctcatcattcattctttgcttaccct 14438  T
Q  312 tgtcaacaggggcact 327  Q
    | ||| |||| |||||    
T  14439 tatcagcaggagcact 14454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 251 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 40436 - 40273
Alignment:
Q  251 atctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgat 350  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| ||||||   | |||||| || ||||| ||| |||||||||| || || ||||||||| |||| |    
T  40436 atctcagcaggagcatctttctttctcgggcgcctatcatcaaccactctctgttttcccttatcagcaggggcactgtaaggcttaggacgactctgtt 40337  T
Q  351 gtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcct 414  Q
    | |||||  |  |||||||| |||  | ||| |||||||  ||||| ||||||||||| |||||    
T  40336 gacccttggcctttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcctcctcgtaaatcct 40273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 13099 - 12956
Alignment:
Q  205 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 304  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||| || || || |||||||||||| ||||  | |||  ||| |||||    | |||||||    
T  13099 acaaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaacaatatccgcaggagcatccttcttctttggcttcctatcatcgaccattctctgc 13000  T
Q  305 ttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctg 348  Q
    || ||||| ||  ||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  12999 ttgcccttatctgcaggggcactataaggtttagggcgactctg 12956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 57582 - 57467
Alignment:
Q  212 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 311  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  || |  | || |||||| ||||||||||  |||| || |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  57582 ttactcttatggcctttctcgccacaagtatagtaaacaatctcaacaggagcatctttctttctaggcctcctctcatcattcattctttgcttaccct 57483  T
Q  312 tgtcaacaggggcact 327  Q
    | ||| |||| |||||    
T  57482 tatcagcaggagcact 57467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1881 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1881
Description:

Target: scaffold1881; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 455 - 369
Alignment:
Q  205 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatc 291  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| | |||||||||| ||||  | |||||||| |||||    
T  455 acaaacattgctcttgtggcctttctcgccacaattgaaacaaacaatctccgtaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatc 369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 290
Target Start/End: Original strand, 14420 - 14498
Alignment:
Q  212 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcat 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| || ||||| |||||||||||| ||||  | |||||||| ||||    
T  14420 ttactcttatggcctttctcgccacaagtaaaacagacaatctctgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcat 14498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 273
Target Start/End: Original strand, 11599 - 11660
Alignment:
Q  212 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctctt 273  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| || ||||| ||| |||||||| ||||    
T  11599 ttactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctgcatgagcatccttctt 11660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 346 - 285
Alignment:
Q  212 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctctt 273  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| || ||||| |||||||||||| ||||    
T  346 ttactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctgcaggagcatccttctt 285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0611 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0611
Description:

Target: scaffold0611; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 9411 - 9350
Alignment:
Q  212 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctctt 273  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| || ||||| |||||||||||| ||||    
T  9411 ttactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctgcaggagcatccttctt 9350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0609 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0609
Description:

Target: scaffold0609; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 133 - 270
Target Start/End: Original strand, 1196 - 1333
Alignment:
Q  133 atcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcg 232  Q
    |||||| |||||||| || |||| | | || ||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||     | ||||| |||||||||||||| |||||     
T  1196 atcaccacgcttgcattcagctatcgtatgccccttctttccacatcggaagcacttcttctcctcaccattgcaaacattactcttgtggcccttctca 1295  T
Q  233 ccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccct 270  Q
    ||||||||  |||| || ||||||| |||| |||||||    
T  1296 ccacacttgtaacaaacaatctcagtaggaacatccct 1333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 321
Target Start/End: Original strand, 18181 - 18290
Alignment:
Q  212 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 311  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||  |  | || || |||||||||| ||||||  |||| || |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18181 ttactcttatggcctttctcaccacaagtgtagcaaacaatctcagcagtagcatctttctttcttggcctcctctcatcattaactctttgcttaccct 18280  T
Q  312 tgtcaacagg 321  Q
    | ||| ||||    
T  18281 tatcagcagg 18290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 110875 - 110795
Alignment:
Q  212 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatca 292  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  || | || || |||||| ||||||||||  |||| || || ||||||||||||    
T  110875 ttactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatctcaacaggagcatctttctttctagggcgcctctcatca 110795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 343
Target Start/End: Original strand, 263 - 391
Alignment:
Q  215 ctcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgt 314  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||| ||||| ||||  | ||||| || || ||    | |||||| || ||||| |    
T  263 ctcttgtggcctttctcaccacaattaaagcagacaatctcagcaggaacatccttcttcttaggccgtctatcctcgaccattctctgtttgcccttat 362  T
Q  315 caacaggggcactatacggtttaggacga 343  Q
    || |||||||||| ||||| |||||||||    
T  363 cagcaggggcactgtacggcttaggacga 391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 1832 - 1696
Alignment:
Q  212 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 311  Q
    |||||||| |||||||||||||||||   | | ||||| ||||||  |||||||||  |||| || |||| |||||||||||||| ||| || || ||||    
T  1832 ttactcttatggcctttctcgccacaagcatagcacacaatctcattaggagcatctttctttctaggcctcctctcatcattaactctttgttttccct 1733  T
Q  312 tgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctg 348  Q
    | ||| |||| ||||| || || || |||||| ||||    
T  1732 tatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactctg 1696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 15675 - 15288
Alignment:
Q  84 tgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaa 183  Q
    ||||||||| || ||| |||||||| ||||| |||||  ||||  |||  |||  | |||||||||| ||||   | ||||||||||  ||||||| |||    
T  15675 tgcactgagaaccgatatgaccctcatcattgcaattgaagcacacaatgtcattgtgcttgcaatcagctaatgtatgacccttcttgccacaccggaa 15576  T
Q  184 gcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgc 283  Q
     ||||||||  | ||||  | |||||  || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |  ||||| |||||||||||| ||||  | ||||||    
T  15575 acacttctttgcctcctctggacaaaaattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagatgatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgc 15476  T
Q  284 ctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcacctta 382  Q
    || |||||    | |||||| || ||||| ||| | ||||||||||| || ||||| | | |||| || | ||||  |||| | |||| | |  || ||     
T  15475 ctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagctggggcactatagggcttagggcaactctgctggcgctta-gtcttccactcatttacaacattg 15377  T
Q  383 taatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctctt 471  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||   | ||||||||||  |||| ||  |||||||||||||| || ||||||||    
T  15376 taatgagctttcgtgtcctcctcatagattctacagctgttcaccaaatcaggaaaaactcagatctgttggtatccaattgccctctt 15288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 4696 - 4560
Alignment:
Q  212 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 311  Q
    |||||||| |||||||||||||||||   | | ||||| ||||||  |||||||||  |||| || |||| |||||||||||||| ||| || || ||||    
T  4696 ttactcttatggcctttctcgccacaagcatagcacacaatctcattaggagcatctttctttctaggcctcctctcatcattaactctttgttttccct 4597  T
Q  312 tgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctg 348  Q
    | ||| |||| ||||| || || || |||||| ||||    
T  4596 tatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactctg 4560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 318 - 477
Target Start/End: Original strand, 11891 - 12050
Alignment:
Q  318 caggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcg-ctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 416  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||  |||  |||  | ||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| |    
T  11891 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgc-tcttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgc 11989  T
Q  417 cgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 477  Q
     || | | |||||||| |  |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  11990 agctattgaccaaatccggaaaaactctaatctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 12050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 19117 - 19022
Alignment:
Q  32 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcat 127  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||    |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||| || ||||| || |||||||||    
T  19117 gtaccagtcagagcaaacactttaccaccggtcctaaccttcttcggttgtgtacactgcgaactgatatgaccttcctcattgcagttatagcat 19022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 5300 - 4978
Alignment:
Q  25 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 124  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||    ||| ||||||||||||| || ||||  | |||||| ||||| ||||| || || || |||    
T  5300 agtctgcgtaccagtcaatgcaaacactttcccaccggtcctagccttcttcggctgagtacactatgaactgatatgaccttcttcgttgcagttgtag 5201  T
Q  125 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttcgtacaaacgttactcttgtggc 224  Q
    ||  |||  || || ||||| || || |||||  |||| || ||||| ||||||||||| || ||| ||||||   |   |||| | ||  | |||||||    
T  5200 cagacaatgtctccacgcttacattcagctagggtgtgtcctttctgaccacacctgaaacatttcctctcatttctaccacaagcattgtttttgtggc 5101  T
Q  225 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcaacaggggc 324  Q
    |||| ||  ||| |||  |||| || || |||||||||||||| ||| |  | |||| ||| |||||||| |  |||||||| || |||||| |||| ||    
T  5100 ctttttcatcactcttttaacaaacaatttcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcattcatcctctgcttccctttgtcagcaggagc 5001  T
Q  325 actatacggtttaggacgattct 347  Q
    ||| || ||||||||||||||||    
T  5000 actgtaaggtttaggacgattct 4978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 7622 - 7564
Alignment:
Q  215 ctcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctctt 273  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||| ||||| ||||    
T  7622 ctcttgtggcctttctcaccacaattaaagcagacaatctcagcaggaacatccttctt 7564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 3860 - 3661
Alignment:
Q  212 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 311  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||  | || || |||||| ||| | |||| ||| |  | || | |||||||||||| | ||| || || ||||    
T  3860 ttactcttgtggcccctctcgccacacttgtagcaaacaatctcaacagaaacatctctcctcttaggtctcctctcatcattcaatctttgtttcccct 3761  T
Q  312 tgtcaacaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcc-ct-tacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtag 409  Q
    ||||| |||| |||||||| || |||||||||   || || || || | |||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  3760 tgtcagcaggagcactatagggcttaggacgaccttgctggcctctgttcctcttc--tcactcataaccttataatgtgctttggtatcctcctcatag 3663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0605 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0605
Description:

Target: scaffold0605; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 444
Target Start/End: Original strand, 1775 - 1848
Alignment:
Q  371 ctcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattct 444  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||| || || |||| || ||| ||||| || |||||||||||    
T  1775 ctcatcaccttataatgagcctttgtatcctcctcataaattctacagctactcaccaattctgagaaaattct 1848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 205 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 10133 - 10065
Alignment:
Q  205 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctctt 273  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| | |||||||||| ||||    
T  10133 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagacaatctccgtaggagcatccttctt 10065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 203 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 9328 - 9192
Alignment:
Q  203 gtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctct 302  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||| |||||  || | || || ||||||| || || |||  |||| || |||| |||||||||||| | ||| |    
T  9328 gtacaagcattactcttgtggcccttctcaccacaagtatagcaaacaatctcagtagtagtatctttctttctaggcctcctctcatcattcaatcttt 9229  T
Q  303 gcttacccttgtcaacaggggcactatacggtttagg 339  Q
    | |||||||| ||| |||| |||||||| || |||||    
T  9228 gtttacccttatcagcaggagcactataaggcttagg 9192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University