View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6807_low_1 (Length: 659)

Name: NF6807_low_1
Description: NF6807
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6807_low_1
NF6807_low_1
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (10-648)||(4813316-4813954)
chr8 (10-648)||(16753350-16753988)
chr8 (10-648)||(25683360-25683998)
chr8 (10-648)||(28331348-28331986)
chr8 (10-648)||(28894217-28894855)
chr8 (10-648)||(15948240-15948877)
chr8 (46-648)||(35741420-35742022)
chr8 (46-648)||(10687718-10688320)
chr8 (46-648)||(18869124-18869726)
chr8 (46-648)||(33036387-33036989)
chr8 (67-648)||(19751011-19751592)
chr8 (76-648)||(26297414-26297985)
chr8 (76-648)||(26310671-26311242)
chr8 (130-358)||(26401888-26402115)
chr8 (400-648)||(34587006-34587254)
chr8 (582-648)||(590102-590168)
chr8 (507-648)||(14602472-14602613)
chr8 (593-644)||(26269085-26269136)
chr8 (412-643)||(33494104-33494336)
chr8 (400-476)||(26402157-26402233)
chr8 (558-605)||(9024621-9024668)
chr8 (151-233)||(14602865-14602947)
chr8 (586-648)||(26402319-26402381)
[»] chr7 (15 HSPs)
chr7 (10-648)||(25404110-25404748)
chr7 (10-648)||(3320878-3321516)
chr7 (10-648)||(7073504-7074142)
chr7 (10-648)||(25408867-25409505)
chr7 (157-648)||(30245853-30246344)
chr7 (46-648)||(24264777-24265379)
chr7 (46-648)||(21640721-21641323)
chr7 (46-648)||(16880958-16881560)
chr7 (67-648)||(21984164-21984741)
chr7 (46-648)||(12397790-12398388)
chr7 (67-648)||(18409697-18410269)
chr7 (67-648)||(9188620-9189202)
chr7 (64-597)||(24273377-24273910)
chr7 (440-603)||(7393598-7393761)
chr7 (592-648)||(24275878-24275934)
[»] chr6 (14 HSPs)
chr6 (10-648)||(13882192-13882830)
chr6 (10-648)||(35202153-35202791)
chr6 (10-648)||(22345090-22345728)
chr6 (46-648)||(33334530-33335132)
chr6 (372-528)||(31252839-31252995)
chr6 (46-648)||(14741025-14741627)
chr6 (523-648)||(31249541-31249666)
chr6 (130-358)||(24714114-24714342)
chr6 (127-358)||(24434617-24434848)
chr6 (541-648)||(24435022-24435129)
chr6 (402-476)||(24713996-24714070)
chr6 (498-602)||(30517219-30517323)
chr6 (535-594)||(100115-100174)
chr6 (221-250)||(100490-100519)
[»] chr3 (19 HSPs)
chr3 (10-648)||(47878979-47879617)
chr3 (10-648)||(10094896-10095534)
chr3 (10-648)||(10201782-10202420)
chr3 (10-648)||(54191961-54192599)
chr3 (10-648)||(16460917-16461555)
chr3 (10-648)||(10900462-10901100)
chr3 (10-624)||(10595862-10596474)
chr3 (46-648)||(8513125-8513727)
chr3 (46-648)||(32476371-32476973)
chr3 (46-648)||(22171762-22172364)
chr3 (46-648)||(2675674-2676276)
chr3 (67-648)||(1306902-1307483)
chr3 (67-648)||(3326964-3327544)
chr3 (130-358)||(16256390-16256618)
chr3 (280-648)||(6793554-6793922)
chr3 (77-380)||(4385860-4386163)
chr3 (10-71)||(22622792-22622853)
chr3 (148-358)||(9149880-9150081)
chr3 (195-263)||(25511862-25511930)
[»] chr2 (11 HSPs)
chr2 (10-648)||(22713324-22713962)
chr2 (10-648)||(39685700-39686338)
chr2 (10-648)||(2739658-2740296)
chr2 (10-648)||(17942274-17942912)
chr2 (10-648)||(20050852-20051490)
chr2 (328-648)||(30478048-30478368)
chr2 (46-648)||(19345308-19345911)
chr2 (148-648)||(31056989-31057489)
chr2 (67-358)||(39484078-39484369)
chr2 (498-648)||(39483797-39483947)
chr2 (564-599)||(30478007-30478042)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (10-648)||(9525181-9525819)
chr1 (195-648)||(2394109-2394562)
chr1 (10-199)||(2395808-2395997)
chr1 (46-648)||(41391483-41392085)
chr1 (130-648)||(13599274-13599792)
chr1 (186-648)||(19360152-19360614)
chr1 (67-648)||(47702511-47703092)
chr1 (67-258)||(47101482-47101673)
[»] chr5 (12 HSPs)
chr5 (10-648)||(25451210-25451848)
chr5 (46-648)||(37560047-37560649)
chr5 (46-648)||(28806176-28806778)
chr5 (46-648)||(33769070-33769672)
chr5 (46-648)||(31400446-31401048)
chr5 (67-648)||(43593152-43593733)
chr5 (67-648)||(43625946-43626527)
chr5 (67-639)||(27445863-27446435)
chr5 (130-648)||(28833090-28833608)
chr5 (543-648)||(40222012-40222117)
chr5 (532-648)||(19589332-19589448)
chr5 (535-605)||(22828375-22828441)
[»] scaffold1764 (1 HSPs)
scaffold1764 (10-648)||(172-810)
[»] chr4 (11 HSPs)
chr4 (22-648)||(4568808-4569434)
chr4 (10-504)||(15315770-15316264)
chr4 (10-648)||(16637614-16638252)
chr4 (46-648)||(18856607-18857209)
chr4 (46-648)||(9227786-9228388)
chr4 (130-648)||(16627530-16628048)
chr4 (130-648)||(3791671-3792189)
chr4 (67-358)||(5144231-5144522)
chr4 (576-648)||(15316260-15316332)
chr4 (498-648)||(3778469-3778612)
chr4 (184-258)||(11022171-11022245)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (10-605)||(511-1105)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (46-648)||(17763-18365)
scaffold0197 (46-648)||(12884-13486)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (46-648)||(839-1441)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (130-648)||(7071-7589)
scaffold0006 (397-648)||(6559-6810)
scaffold0006 (307-358)||(6849-6900)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (397-560)||(36819-36982)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (127-648)||(33071-33592)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 611; Significance: 0; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 611; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 4813954 - 4813316
Alignment:
Q  10 atggacatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaag 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4813954 atggatatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggttcagaatgaaagattctaaag 4813855  T
Q  110 tcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaag 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4813854 tcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaagcagtgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaag 4813755  T
Q  210 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtg 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4813754 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtg 4813655  T
Q  310 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagg 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4813654 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgaaaggtggtctaaggtatacaaggtcacaaccaggtagggatgctttggagg 4813555  T
Q  410 gatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaa 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4813554 gatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaa 4813455  T
Q  510 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaa 609  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4813454 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaagccatatggttgaaaggtatgattggagaa 4813355  T
Q  610 atggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4813354 atggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 4813316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 607; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 16753988 - 16753350
Alignment:
Q  10 atggacatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaag 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16753988 atggatatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaag 16753889  T
Q  110 tcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaag 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16753888 tcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaagcagtgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaag 16753789  T
Q  210 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtg 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16753788 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggttaagtg 16753689  T
Q  310 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagg 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16753688 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcacaaccaggtagggatgctttggagg 16753589  T
Q  410 gatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaa 509  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16753588 gatatgtagatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggcacagcggtaacttggaaggcaaa 16753489  T
Q  510 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaa 609  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16753488 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaagccatatggttgaaaggtatgattggagaa 16753389  T
Q  610 atggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16753388 atggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 16753350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 607; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 648
Target Start/End: Original strand, 25683360 - 25683998
Alignment:
Q  10 atggacatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaag 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25683360 atggatatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggttcagaatgaaagattctaaag 25683459  T
Q  110 tcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaag 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25683460 tcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaagcagtgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaag 25683559  T
Q  210 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtg 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25683560 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtg 25683659  T
Q  310 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagg 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25683660 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgaaaggtggtctaaggtatacaaggtcacaaccaggtagggatgctttggagg 25683759  T
Q  410 gatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaa 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25683760 gatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaa 25683859  T
Q  510 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaa 609  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25683860 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagaatacatagcccttgttgaaggggtcaaggaagccatatggttgaaaggtatgattggagaa 25683959  T
Q  610 atggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25683960 atggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 25683998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 595; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 648
Target Start/End: Original strand, 28331348 - 28331986
Alignment:
Q  10 atggacatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaag 109  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28331348 atggatatcataagggaccagaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggttcagaatgaaagattctaaag 28331447  T
Q  110 tcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaag 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28331448 tcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaagcagtgtcctaaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaag 28331547  T
Q  210 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtg 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28331548 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaaatg 28331647  T
Q  310 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagg 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28331648 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcacaaccaggtagggatgctttggagg 28331747  T
Q  410 gatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaa 509  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28331748 gatatgtagatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcagattttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaa 28331847  T
Q  510 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaa 609  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28331848 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaagccatatggttgaaaggtatgattggagaa 28331947  T
Q  610 atggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28331948 atggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 28331986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 587; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 648
Target Start/End: Original strand, 28894217 - 28894855
Alignment:
Q  10 atggacatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaag 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28894217 atggatatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggttcagaatgaaagattctaaag 28894316  T
Q  110 tcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaag 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28894317 tcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaagcagtgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaag 28894416  T
Q  210 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtg 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28894417 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaattagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtg 28894516  T
Q  310 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagg 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28894517 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgaaaggtggtctaaggtatacaaggtcacaaccaggtagggatgctttggagg 28894616  T
Q  410 gatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaa 509  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  28894617 gatatgtggatgcggactatgcagataacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcagtaacttgaaaggcaaa 28894716  T
Q  510 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaa 609  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28894717 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagaatacatagcccttgttgaaggggtcaaggaagccatatggttgaaaggtatgattggagaa 28894816  T
Q  610 atggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28894817 atggggattagtcaagggtgtgtgaagatacattgtgat 28894855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 648
Target Start/End: Original strand, 15948240 - 15948877
Alignment:
Q  10 atggacatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaag 109  Q
    ||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||||| |    
T  15948240 atggatatcatgagggaccaaaacaaaggtgagttgttcttatctaagcaggggtacttgaggaa-gtggatgagtggttcagaatgaaagattctaagg 15948338  T
Q  110 tcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaag 209  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||| | || |||||  | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  15948339 tcgttggcactcctcttggtcatcacacaaagttgtcaataaagtagtgtcctcaattcgatgaagagaaaagaaagatggaaggtactccctatccaag 15948438  T
Q  210 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtg 309  Q
    |    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| ||  ||||| |||||||||| |||  |||||||||||  ||||||| ||    
T  15948439 taattttggaagcatcatgtatgttatggtttgtagtagactgagcttatactttgcaataagtgtgataattcgagttatggcaaatatgggtcaattg 15948538  T
Q  310 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagg 409  Q
    | || ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| | | ||||||||||||| ||||| | || |||| ||||||||    
T  15948539 ctctagcaagctttaaagtgtgttctgagatatttaaatggaactttgaaaggtggtgtgaagtatacaaggtcacaaccaagaagcgatgttttggagg 15948638  T
Q  410 gatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaa 509  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||    
T  15948639 gatatgtggatgtggactatgcaggtaaagtagacactagaaaatctttgtcaggatttgtatttacattgttcggtacaatagtaacttggaaggaaaa 15948738  T
Q  510 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaa 609  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |  |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  15948739 tcaacaatatgttgtagctctttcaacaactcaagttgagtacattgcccttgttgaagagagcaaggaagccatatggcttaaaggtatgattggagaa 15948838  T
Q  610 atggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15948839 atggagattagtcaagggtgtgtgaagatacattgtgat 15948877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 46 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 35742022 - 35741420
Alignment:
Q  46 ttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaagtcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctat 145  Q
    ||||||||||| |  || || |||| ||| |||||||||||||||||||||  | | ||||||  ||| ||||||||  | ||||||||||| ||| | |    
T  35742022 ttcttatctcaacttggttatttgaagaaggtggtggagcggtttagaatgtcaaactctaaaaccgtaagcactcccttgggtcaccacacaaagttgt 35741923  T
Q  146 ctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaa--gatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgt 243  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| || |||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35741922 ccatacaacaatgtcctcaatccgaggatgagaa--gcaattgatggaaggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggaatggtttgt 35741825  T
Q  244 agtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtgggttctgagatatt 343  Q
    ||||| ||||||||  | || ||  | ||  |  | |||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  35741824 agtaggccggacttggcttatgcggttagcattgtgagtcggtttatggcaaatccgggaattgtgcattggcaagctttgaagtgggttttgaggtatt 35741725  T
Q  344 tgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtaga 443  Q
    ||||||| || ||||  || ||| | | ||| |||||| ||   | || |   || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||    
T  35741724 tgaatgggtcgttgaagggcggtttgaagtacacaagggcagctcaagatgaagacgctttggaggggtatgttgatgcggattatgcgggaaacgtgga 35741625  T
Q  444 cactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaa 543  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | |  || || ||| | | ||||||||||||||||||||| || || ||  | || |||||||||    
T  35741624 cactagaaaatccttgtcgggttttgtgtttactctttatggcacggcgattagttggaaggcaaatcaacaatccgtggtggcattatctacaactcaa 35741525  T
Q  544 gcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacatt 643  Q
    || |||||||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||  | || |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  35741524 gcggagtacatcgcacttgttgaaggtgtgaaggaggccatatggttgaaagggatgattggtgagttaggaattactcaagaatgtgtgaagatacatt 35741425  T
Q  644 gtgat 648  Q
    |||||    
T  35741424 gtgat 35741420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 46 - 648
Target Start/End: Original strand, 10687718 - 10688320
Alignment:
Q  46 ttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaagtcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctat 145  Q
    ||||||||||| |  || || |||| ||| ||||||||||| |||||||||  | | ||||||  ||| ||||||||  | ||||||||||| ||| | |    
T  10687718 ttcttatctcaacttggttatttgaagaaggtggtggagcgttttagaatgtcaaactctaaaaccgtgagcactcccttgggtcaccacacaaagttgt 10687817  T
Q  146 ctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaa--gatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgt 243  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| || |||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10687818 ccatacaacaatgtcctcaatccgaggatgagaa--gcaattgatggaaggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggaatggtttgt 10687915  T
Q  244 agtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtgggttctgagatatt 343  Q
    ||||| ||||||||  | || ||  | ||  |  | |||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  10687916 agtaggccggacttggcttatgcggttagcattgtgagtcggtttatggcaaatccgggaattgtgcattggcaagctttgaagtgggttttgaggtatt 10688015  T
Q  344 tgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtaga 443  Q
    ||||||| || ||||  || ||| | | ||| |||||| ||   | || |   || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||    
T  10688016 tgaatgggtcgttgaagggcggtttgaagtacacaagggcagctcaagatgaagacgctttggaggggtatgttgatgcggattatgcgggcaacgtgga 10688115  T
Q  444 cactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaa 543  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | |  || || ||| | | ||||||||||||||||||||| || || ||  | || |||||||||    
T  10688116 cactagaaaatccttgtcgggttttgtgtttactctttatggcacggcgattagttggaaggcaaatcaacaatccgtggtggcattatctacaactcaa 10688215  T
Q  544 gcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacatt 643  Q
    || |||||||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||  | || |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  10688216 gcggagtacatcgcacttgttgaaggtgtgaaggaggccatatggttgaaagggatgattggtgagttaggaattactcaagaatgtgtgaagatacatt 10688315  T
Q  644 gtgat 648  Q
    |||||    
T  10688316 gtgat 10688320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 46 - 648
Target Start/End: Original strand, 18869124 - 18869726
Alignment:
Q  46 ttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaagtcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctat 145  Q
    ||||||||||| |  || || |||| ||| ||||||||||| |||||||||  | | ||||||  ||| ||||||||  | ||||| ||||| ||| | |    
T  18869124 ttcttatctcaacttggttatttgaagaaggtggtggagcgttttagaatgtcaaactctaaaaccgtgagcactcccttgggtcatcacacaaagttgt 18869223  T
Q  146 ctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaa--gatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgt 243  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||| || |||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18869224 ccatacaacaatgtcctaaatccgaggatgagaa--gcaattgatggaaggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggaatggtttgt 18869321  T
Q  244 agtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtgggttctgagatatt 343  Q
    ||||||||||||||| | || ||  | ||  |  | ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  18869322 agtagaccggacttagcttatgcggttagcattgtgagtcggtttatggcaaatccgggtattgtgcattggcaagctttgaagtgggtattgaggtatt 18869421  T
Q  344 tgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtaga 443  Q
    ||||||| |||||||  || ||| | | ||| |||||| ||   | || |   || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  18869422 tgaatgggtctttgaagggcggtttgaagtacacaagggcagctcaagatgaagacgcattggaggggtatgttgatgcggactatgcgggcaatgtgga 18869521  T
Q  444 cactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaa 543  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||  | |  || || ||  | | ||||||||||||||||||||| || || ||  | || |||||||||    
T  18869522 cactagaaaatccttatcgggttttgtgtttactctttatggcacggctattagttggaaggcaaatcaacaatccgtggtggcattatctacaactcaa 18869621  T
Q  544 gcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacatt 643  Q
    || |||||||  || ||||||||||| || |||||   ||||||||||||||| |||||||| ||  | || |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18869622 gcggagtacaacgcacttgttgaaggtgtgaaggagaccatatggttgaaagggatgattggtgagttaggaattactcaagaatgtgtgaagatacatt 18869721  T
Q  644 gtgat 648  Q
    |||||    
T  18869722 gtgat 18869726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 46 - 648
Target Start/End: Original strand, 33036387 - 33036989
Alignment:
Q  46 ttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaagtcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctat 145  Q
    ||||||||||| |  || || |||| ||| ||||||||||| |||||||||  | | ||||||  ||| ||||||||  | || |||||||| ||| | |    
T  33036387 ttcttatctcaacttggttatttgaagaaggtggtggagcgttttagaatgtcaaactctaaaaccgtgagcactcccttggggcaccacacaaagttgt 33036486  T
Q  146 ctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaa--gatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgt 243  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| || |||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33036487 ccatacaacaatgtcctcaatccgaggatgagaa--gcaattgatggaaggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggaatggtttgt 33036584  T
Q  244 agtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtgggttctgagatatt 343  Q
    ||||||||||||||| | || ||  | ||  |  | ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  33036585 agtagaccggacttagcatatgcggttagcattgtgagtcggtttatggcaaatccgggtattgtgcattggcaagctttgaagtgggtattgaggtatt 33036684  T
Q  344 tgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtaga 443  Q
    ||||||| |||||||  || ||| | | ||| |||||  ||   | || |   || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  33036685 tgaatgggtctttgaagggcggtttgaagtacacaagagcagctcaagatgaagacgctttggaggggtatgttgatgcggactatgcgggaaatgtgga 33036784  T
Q  444 cactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaa 543  Q
    |||||||||||| || |  || |||||||||||  | |  || || ||  | | ||||||||||||||||||||| || || ||  | || |||||||||    
T  33036785 cactagaaaatccttattgggatttgtgtttactctttatggcacggctattagttggaaggcaaatcaacaatccgtggtggcattatctacaactcaa 33036884  T
Q  544 gcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacatt 643  Q
    |  |||||||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||  | || |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  33036885 gtggagtacatcgcacttgttgaaggtgtgaaggaggccatatggttgaaagggatgattggtgagttaggaattactcaagaatgtgtgaagatacatt 33036984  T
Q  644 gtgat 648  Q
    |||||    
T  33036985 gtgat 33036989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 67 - 648
Target Start/End: Original strand, 19751011 - 19751592
Alignment:
Q  67 ttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaagtcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaat 166  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||||  | |  |||||  ||| ||||||||  | ||||||||||| ||| | || ||||||| |||||||||||    
T  19751011 ttgaagaaggtggtggagcgttttagaatgtcaaaccctaaaaccgtgagcactcccttgggtcaccacacaaagttgtccataaaactatgtcctcaat 19751110  T
Q  167 ccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgc 266  Q
    |||| || |||||     ||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| | ||  |    
T  19751111 ccgaggatgagaagcaagagatggcaagtactccctttgcaagtggggttggaagcatcatgtatggaatggtttgtagtagacaagacttagcttatac 19751210  T
Q  267 aatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggt 366  Q
      | ||  |  | |||||| |||||||||||  ||||   ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||  || |||    
T  19751211 ggttagaattgtgagtcggattatggcaaataagggtattgtgcattggcaagctttgaagtgggtgttgaggtatttgaatgggtctttgaagggcggt 19751310  T
Q  367 ctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggtt 466  Q
     | | ||| |||||  ||   | ||  |  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||    
T  19751311 ttgaagtacacaagagcagctcaagagaaagacgctttggaggggtatgttgatgcggactatgcgggcaatgtggacacaagaaaatccttatcgggtt 19751410  T
Q  467 ttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttga 566  Q
    ||||||||||  | |  || || ||  | | ||||||||||||||||||||| || || ||  | |||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  19751411 ttgtgtttactctttatggcacggctattagttggaaggcaaatcaacaatccgtggtggcattatcaacaactcaagcggagtatattgcccttgttga 19751510  T
Q  567 aggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||  | || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19751511 aggggtgaaagaagccatatggttgaaaggtatgattggtgagttaggaattactcaagaatgtgtgaagatacattgtgat 19751592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 76 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 26297985 - 26297414
Alignment:
Q  76 gtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaagtcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaatccgatgaag 175  Q
    ||||||||||  |||||||||  | | ||||||  ||| ||||||||  | || |||||||| ||| | || ||| ||||||||||||||| ||| || |    
T  26297985 gtggtggagcattttagaatgtcaaactctaaaaccgtgagcactcccttggggcaccacacaaagttgtccatacaacaatgtcctcaattcgaggatg 26297886  T
Q  176 agaaaagcaa--gatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagt 273  Q
    ||||  ||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||  | ||     
T  26297885 agaa--gcaattgatggaaggtactccctacgcaagtggggttggaagcatcatgtatggaatggtttgtagtagaccggacttagcctatgcggttagc 26297788  T
Q  274 gtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaggt 373  Q
     |  | ||||||||||||||||||||| ||   ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||  |||||||  || ||| | | ||    
T  26297787 attgtgagtcggtttatggcaaatccgagtattgtgcattggcaagctttgaagtgggtattgaggtatttgaatgagtctttgaagggcggtttgaagt 26297688  T
Q  374 atacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtt 473  Q
    | ||||| |||   | ||     || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| || || || |||||||||||||| || || |||||||||||    
T  26297687 acacaagatcagctcaagaggaagacgctttggaggggtatgttgatgcgaactatgcgggcaatgtggacactagaaaatccttatcgggttttgtgtt 26297588  T
Q  474 tacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtc 573  Q
    |||  | |  || ||  |  | | |||||| |||||||||||||| || || ||  | || || |||||||| |||||||| || ||||||||||| ||     
T  26297587 tactctttatggcacgactattagttggaa-gcaaatcaacaatccgtggtggcgttatctaccactcaagcggagtacatcgcacttgttgaaggtgtg 26297489  T
Q  574 aaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    || || | ||||||||||||||| |||||||| ||  | || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26297488 aaagaggccatatggttgaaagggatgattggtgagttaggaattactcaagaatgtgtgaagatacattgtgat 26297414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 76 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 26311242 - 26310671
Alignment:
Q  76 gtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaagtcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaatccgatgaag 175  Q
    ||||||||||  |||||||||  | | ||||||  ||| ||||||||  | || |||||||| ||| | || ||| ||||||||||||||| ||| || |    
T  26311242 gtggtggagcattttagaatgtcaaactctaaaaccgtgagcactcccttggggcaccacacaaagttgtccatacaacaatgtcctcaattcgaggatg 26311143  T
Q  176 agaaaagcaa--gatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagt 273  Q
    ||||  ||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||  | ||     
T  26311142 agaa--gcaattgatggaaggtactccctacgcaagtggggttggaagcatcatgtatggaatggtttgtagtagaccggacttagcctatgcggttagc 26311045  T
Q  274 gtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaggt 373  Q
     |  | ||||||||||||||||||||| ||   ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||  |||||||  || ||| | | ||    
T  26311044 attgtgagtcggtttatggcaaatccgagtattgtgcattggcaagctttgaagtgggtattgaggtatttgaatgagtctttgaagggcggtttgaagt 26310945  T
Q  374 atacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtt 473  Q
    | ||||| |||   | ||     || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| || || || |||||||||||||| || || |||||||||||    
T  26310944 acacaagatcagctcaagaggaagacgctttggaggggtatgttgatgcgaactatgcgggcaatgtggacactagaaaatccttatcgggttttgtgtt 26310845  T
Q  474 tacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtc 573  Q
    |||  | |  || ||  |  | | |||||| |||||||||||||| || || ||  | || || |||||||| |||||||| || ||||||||||| ||     
T  26310844 tactctttatggcacgactattagttggaa-gcaaatcaacaatccgtggtggcgttatctaccactcaagcggagtacatcgcacttgttgaaggtgtg 26310746  T
Q  574 aaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    || || | ||||||||||||||| |||||||| ||  | || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26310745 aaagaggccatatggttgaaagggatgattggtgagttaggaattactcaagaatgtgtgaagatacattgtgat 26310671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 130 - 358
Target Start/End: Original strand, 26401888 - 26402115
Alignment:
Q  130 caccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaag--atggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcat 227  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| | || |||||  ||||   ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26401888 caccacacaaagttatccataaaacaatgtcctcaatccaaggatgagaa--gcaatttatggaaggtactccctatgtaagtggggttggaagcatcat 26401985  T
Q  228 gtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgc---aatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttg 324  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||    | || |||||    |||||||||||||||| |||||   ||||| ||||||||||||    
T  26401986 gtatggaatggtttgtagtagaccggacttagcttatgcggttagcattgtga----tcggtttatggcaaattcgggtattgtgcattggcaagctttg 26402081  T
Q  325 aagtgggttctgagatatttgaatggatctttga 358  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  26402082 aagtgggtgttgaggtatttgaatggatctttga 26402115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 400 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 34587254 - 34587006
Alignment:
Q  400 gctttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaactt 499  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || ||||| ||||||||| | || ||||||||||||||  | |  || ||  |  | | ||    
T  34587254 gctttggaggggtatgttgatgcagactatgcgggcaatgtggacacaagaaaatctctatcgggttttgtgtttactctctatggcacgactattagtt 34587155  T
Q  500 ggaaggcaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtat 599  Q
    ||||||||||||||||||| || ||  |  | |||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||| || || | ||||||||||||||||||    
T  34587154 ggaaggcaaatcaacaatccgtggtgacattatcaacaactcaagcggagtacattgcctttgtagaaggggtgaaagatgccatatggttgaaaggtat 34587055  T
Q  600 gattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    |||||| ||  | || |||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  34587054 gattggtgagttaggaattactcaagaatatgtgaagatacattgtgat 34587006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 582 - 648
Target Start/End: Original strand, 590102 - 590168
Alignment:
Q  582 catatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  590102 catatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaagggtgtgtgaagatacattgtgat 590168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 507 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 14602613 - 14602472
Alignment:
Q  507 aaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattgga 606  Q
    |||||||||||| || || ||||| || | || |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| || |||||     
T  14602613 aaatcaacaatctgtggtggctctatctataattcaagcggagtacattgcccttgttgaaggggtgaaggaagccatattgttgaaagggattattggt 14602514  T
Q  607 gaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    ||  | || |||  ||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  14602513 gagttaggaatttctcaaacatgtgcgaagatacattgtgat 14602472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 593 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 26269136 - 26269085
Alignment:
Q  593 aaggtatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattg 644  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26269136 aaggtatgatgggaaaaatggggattagtcaagggtgtgtgaagatacattg 26269085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 412 - 643
Target Start/End: Original strand, 33494104 - 33494336
Alignment:
Q  412 tatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatc 511  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||  | ||||  || |||||||| ||||  |||||||||||||| || || |  ||||| | ||||||| ||||||    
T  33494104 tatgtgcatgcggactatgcaagcaatttggacagcaggaaatctttatcagcatttgtgtttacattattaggcaaggcggttagttggaagacaaatc 33494203  T
Q  512 aacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttg-aaaggtatgattggagaaa 610  Q
    ||||||  || ||  |  | || ||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||  || ||| ||||| |||| ||||| |||| ||| |||     
T  33494204 aacaatttgtggtgacattatctacaactcaagcggagtagattgcccttgttaaaggggtacagaaagccatatagttgaaaagggatgactggtgaat 33494303  T
Q  611 tggggattagtcaaggatgtgtgaagatacatt 643  Q
    | || |||  ||||| |||||||||||||||||    
T  33494304 taggaattgctcaagaatgtgtgaagatacatt 33494336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 400 - 476
Target Start/End: Original strand, 26402157 - 26402233
Alignment:
Q  400 gctttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttac 476  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| | || || || ||||| ||||||||| | || ||||||||||||||    
T  26402157 gctttggaggggtatgttgatgcggactatacgggcaatgtggacacaagaaaatctctatcgggttttgtgtttac 26402233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 558 - 605
Target Start/End: Original strand, 9024621 - 9024668
Alignment:
Q  558 ccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattgg 605  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  9024621 ccttgttgaagggatcaaagaagccatatggttgaaagggatgattgg 9024668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 151 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14602947 - 14602865
Alignment:
Q  151 aaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatgg 233  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||||  |  ||||||| || ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14602947 aaacaatgtactcaatccgagcatgagaaaatgataatggaggatattccctgtacaagttgggttggaagcatcatgtatgg 14602865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 648
Target Start/End: Original strand, 26402319 - 26402381
Alignment:
Q  586 tggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  | || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26402319 tggttgaagggtatgattggtgagttaggaattactcaagaatgtgtgaagatacattgtgat 26402381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 611; Significance: 0; HSPs: 15)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 611; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 648
Target Start/End: Original strand, 25404110 - 25404748
Alignment:
Q  10 atggacatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaag 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25404110 atggatatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggttcagaatgaaagattctaaag 25404209  T
Q  110 tcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaag 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25404210 tcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaagcagtgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaag 25404309  T
Q  210 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtg 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25404310 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtg 25404409  T
Q  310 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagg 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25404410 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgaaaggtggtctaaggtatacaaggtcacaaccaggtagggatgctttggagg 25404509  T
Q  410 gatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaa 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25404510 gatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaa 25404609  T
Q  510 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaa 609  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25404610 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaagccatatggttgaaaggtatgattggagaa 25404709  T
Q  610 atggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25404710 atggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 25404748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 591; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 3321516 - 3320878
Alignment:
Q  10 atggacatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaag 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3321516 atggatatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagtaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaag 3321417  T
Q  110 tcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaag 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3321416 tcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaagcagtgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaag 3321317  T
Q  210 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtg 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3321316 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtg 3321217  T
Q  310 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagg 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  3321216 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcacaaccaggtagggatgttttggagg 3321117  T
Q  410 gatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaa 509  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3321116 gatatgtagatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgtttggtacagcggtaacttggaaggcaaa 3321017  T
Q  510 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaa 609  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3321016 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcggagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaagccatatggttgaaaggtatgattggagaa 3320917  T
Q  610 atggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  3320916 atggggattagtcaaggatctgtgaatatacattgtgat 3320878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 575; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 648
Target Start/End: Original strand, 7073504 - 7074142
Alignment:
Q  10 atggacatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaag 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7073504 atggatatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggttcagaatgaaagattctaaag 7073603  T
Q  110 tcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaag 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7073604 tcgttagcactcctcttggtcaccacacaaagttatctataaagcaatgtcctcaatccgatgaagagaaaatcaagatggagggtactccctatgcaag 7073703  T
Q  210 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtg 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7073704 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtg 7073803  T
Q  310 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagg 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  7073804 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgaaaggtggtctaaggtatacaaggtcacaaccaggtagggatgctttggaag 7073903  T
Q  410 gatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaa 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  7073904 gatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattattcgatacaacggtaacttggaaggcaaa 7074003  T
Q  510 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaa 609  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7074004 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagaatacatagctcttgttgaaggggtcaaggaagccatatggttgaaaggtatgattggagaa 7074103  T
Q  610 atggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7074104 atggggattagtcaagggtgtgtgaagatacattgtgat 7074142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 539; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 648
Target Start/End: Original strand, 25408867 - 25409505
Alignment:
Q  10 atggacatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaag 109  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25408867 atggatatcatgaggtaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggttcagaatgaaagattctaaag 25408966  T
Q  110 tcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaag 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  25408967 tcgttagcactcctcttggtcaccacacaaagctatctataaagcagtgtcctcaatccgaggaagagaaaaccaagatggaaggtactccctatgcaag 25409066  T
Q  210 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtg 309  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25409067 tggggttagaagcatcatgtatggtatggtttgtagtaggccggacttatcctacgcaattagtgtgataagtcagtttatggcaaatccgggtcaagtg 25409166  T
Q  310 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagg 409  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  25409167 cattggcaagctttgaagtggattctgagatatttgaatggatctttgaaaggtggtctaaggtatacaaggtcactaccaggtagggatgctttggagg 25409266  T
Q  410 gatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaa 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25409267 gatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaa 25409366  T
Q  510 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaa 609  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25409367 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagcacatagcccttgttgaaggggtcacggaagccatatggttgaaaggtatgattggagaa 25409466  T
Q  610 atggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25409467 atggggatcagtcaagggtgtgtgaagatgcattgtgat 25409505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 157 - 648
Target Start/End: Original strand, 30245853 - 30246344
Alignment:
Q  157 tgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggact 256  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  30245853 tgtcctcaatccgattaagagaaaatcaagatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaacagact 30245952  T
Q  257 tatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatcttt 356  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  30245953 tatcctacgtaattagtgtgataagtcgatttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtgggttttgagatatttcaatggatcttt 30246052  T
Q  357 gagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatct 456  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30246053 gaaaggtggtctaaggtatacaaggtcacaaccaggaagggatgctttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaatgtagacactagaaaatct 30246152  T
Q  457 ttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatag 556  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30246153 ttgttaggttttatgtttacattgttcggtacagcagtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatag 30246252  T
Q  557 cccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30246253 cccttgttgaaggggtcaaggatgtcatatggttaaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaagggtgtgtgaagatacattgtgat 30246344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 46 - 648
Target Start/End: Original strand, 24264777 - 24265379
Alignment:
Q  46 ttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaagtcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctat 145  Q
    ||||||||||| |  || || |||| ||| |||||||||||||||||||||  | | ||||||  ||| ||||||||  | ||||||||||| ||| | |    
T  24264777 ttcttatctcaacttggttatttgaagaaggtggtggagcggtttagaatgtcaaactctaaaaccgtgagcactcccttgggtcaccacacaaagttgt 24264876  T
Q  146 ctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaa--gatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgt 243  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| || |||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24264877 ccatacaacaatgtcctcaatccgaggatgagaa--gcaattgatggaaggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggaatggtttgt 24264974  T
Q  244 agtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtgggttctgagatatt 343  Q
    ||||| ||||||||  | || ||  | ||  |  | |||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  24264975 agtaggccggacttggcttatgcggttagcattgtgagtcggtttatggcaaatccgggaattgtgcattggcaagctttgaagtgggttttgaggtatt 24265074  T
Q  344 tgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtaga 443  Q
    ||||||| || ||||  || ||| | | ||| |||||| ||   | || |   || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||    
T  24265075 tgaatgggtcgttgaagggcggtttgaagtacacaagggcagctcaagatgaagacgctttggaggggtatgttgatgcggattatgcgggcaacgtgga 24265174  T
Q  444 cactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaa 543  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | |  || || ||| | | ||||||||||||||||||||| || || ||  | || |||||||||    
T  24265175 cactagaaaatccttgtcgggttttgtgtttactctttatggcacggcgattagttggaaggcaaatcaacaatccgtggtggcattatctacaactcaa 24265274  T
Q  544 gcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacatt 643  Q
    || |||||||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||  | || |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24265275 gcggagtacatcgcacttgttgaaggtgtgaaggaggccatatggttgaaagggatgattggtgagttaggaattactcaagaatgtgtgaagatacatt 24265374  T
Q  644 gtgat 648  Q
    |||||    
T  24265375 gtgat 24265379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 46 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 21641323 - 21640721
Alignment:
Q  46 ttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaagtcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctat 145  Q
    ||||||||||| |  || || |||| ||| |||||||||||||||||||||  | | ||||||  ||| ||||||||  | ||||||||||| ||| | |    
T  21641323 ttcttatctcaacttggttatttgaagaaggtggtggagcggtttagaatgtcaaactctaaaaccgtgagcactcccttgggtcaccacacaaagttgt 21641224  T
Q  146 ctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaa--gatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgt 243  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| || |||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21641223 ccatacaacaatgtcctcaatccgaggatgagaa--gcaattgatggaaggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggaatggtttgt 21641126  T
Q  244 agtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtgggttctgagatatt 343  Q
    ||||| ||||||||  | || ||  | ||  |  | |||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  21641125 agtaggccggacttggcttatgcggttagcattgtgagtcggtttatggcaaatccgggaattgtgcattggcaagctttgaagtgggttttgaggtatt 21641026  T
Q  344 tgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtaga 443  Q
    ||||||| || ||||  || ||| | | ||| |||||| ||   | || |   || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||    
T  21641025 tgaatgggtcgttgaagggcggtttgaagtacacaagggcagctcaagatgaagacgctttggaggggtatgttgatgcggattatgcgggcaacgtgga 21640926  T
Q  444 cactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaa 543  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | |  || || ||  | | ||||||||||||||||||||| || || ||  | || |||||||||    
T  21640925 cactagaaaatccttgtcgggttttgtgtttactctttatggcacggctattagttggaaggcaaatcaacaatccgtggtggcattatctacaactcaa 21640826  T
Q  544 gcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacatt 643  Q
    || |||||||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||  | || |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21640825 gcggagtacatcgcacttgttgaaggtgtgaaggaggccatatggttgaaagggatgattggtgagttaggaattactcaagaatgtgtgaagatacatt 21640726  T
Q  644 gtgat 648  Q
    |||||    
T  21640725 gtgat 21640721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 46 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 16881560 - 16880958
Alignment:
Q  46 ttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaagtcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctat 145  Q
    ||||||||||| || || || |||| ||| |||||||||||||||||||||  | | ||||||  ||| ||||||||  | ||||||||||| ||| | |    
T  16881560 ttcttatctcaacatggttatttgaagaaggtggtggagcggtttagaatgtcaaactctaaaaccgtaagcactcccttgggtcaccacacaaagttgt 16881461  T
Q  146 ctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaa--gatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgt 243  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| || |||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16881460 ctatacaacaatgtccccaatccgaggatgagaa--gcaattgatggaaggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggaatggtttgt 16881363  T
Q  244 agtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtgggttctgagatatt 343  Q
    ||||| ||||||||  | || ||  | ||  |  | |||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || |    
T  16881362 agtaggccggacttggcttatgcggttagcattgtgagtcggtttatggcaaatccgggaagtgtgcattggcaagctttgaagtgggtgttgaggtact 16881263  T
Q  344 tgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtaga 443  Q
    ||||||| || ||||  || ||| | | ||| |||||| ||   | || |   || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || || ||    
T  16881262 tgaatgggtcgttgaagggcggtttgaagtacacaagggcagctcaagatgaagacgctttggaggggtatgttgatgcggattatgcgggcaatgtgga 16881163  T
Q  444 cactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaa 543  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | |  || || ||| | | ||||||||||||||||||||| || || ||  | || |||||||||    
T  16881162 cactaggaaatccttgtcgggttttgtgtttactctttatggcacggcgattagttggaaggcaaatcaacaatccgtggtggcattatctacaactcaa 16881063  T
Q  544 gcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacatt 643  Q
    || |||||||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||  | || |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16881062 gcggagtacatcgcacttgttgaaggtgtgaaggaggccatatggttgaaagggatgattggtgagttaggaattactcaagaatgtgtgaagatacatt 16880963  T
Q  644 gtgat 648  Q
    |||||    
T  16880962 gtgat 16880958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 67 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 21984741 - 21984164
Alignment:
Q  67 ttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaagtcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaat 166  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| |     ||||||  ||| ||||||||  | || |||||||| ||| | || |||||||| ||||||||||    
T  21984741 ttgaagaaggtggtggagcggtttagaataac----tctaaaaccgtgagcactcccttgggccaccacacaaagttgtccataaaacattgtcctcaat 21984646  T
Q  167 ccgatgaagagaaaagcaa--gatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctac 264  Q
    |||| || |||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||     
T  21984645 ccgaggatgagaa--gcaattgatggaaggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggaatggtttgtagtagaccggacttagcttat 21984548  T
Q  265 gcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtg 364  Q
    ||  | ||  |  |||||||||||||||||||| |||||   ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||  || |    
T  21984547 gcggttagcattgtaagtcggtttatggcaaattcgggtattgtgcattggcaagctttgaagtgggtgttgaggtatttgaatgggtctttgaagggcg 21984448  T
Q  365 gtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcagg 464  Q
    || | | ||| |||||  ||   | ||     || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||||||| | || ||    
T  21984447 gtttgaagtacacaagagcagctcaagaggaagacgctttggaggggtatgttgatgcgaactatgcgggtaatgtggacacaagaaaatctctatcggg 21984348  T
Q  465 ttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgtt 564  Q
    ||||||||||||  | |  || ||  |  | | ||||||||||||||||||||| || || ||  | |||||||||||||  ||||| ||  ||| ||||    
T  21984347 ttttgtgtttactctctatggcacgactattagttggaaggcaaatcaacaatctgtggtggcattatcaacaactcaagtggagtatattacccctgtt 21984248  T
Q  565 gaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    |||||||| || || | |||||||||||||||||||||||| ||  | || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21984247 gaaggggtgaaagaggccatatggttgaaaggtatgattggtgagttaggaattactcaagaatgtgtgaagatacattgtgat 21984164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 12398388 - 12397790
Alignment:
Q  46 ttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaagtcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctat 145  Q
    ||||||||||| |  || || |||| ||| ||||||||||| |||||||||    | ||||||  ||| ||||||||  | || |||||||| ||| | |    
T  12398388 ttcttatctcaacttggttatttgaagaaggtggtggagcgttttagaatgtcgaactctaaaaccgtgagcactcccttggggcaccacacaaagttgt 12398289  T
Q  146 ctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaa--gatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgt 243  Q
    | ||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12398288 ccataaaacaatgtcctcaatccgaggatgagaa--gcaattgatggaaggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggaatggtttgt 12398191  T
Q  244 agtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtgggttctgagatatt 343  Q
    ||||| ||||||||| | || ||  | ||  |  | ||||||||||||| |||| ||||    ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  12398190 agtaggccggacttagcttatgcggttagcattgtgagtcggtttatggaaaattcgggaattgtgcattggcaagctttgaagtgggtattgaggtatt 12398091  T
Q  344 tgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtaga 443  Q
    ||||||| |||||||  || ||| | | ||| |||||| ||   | || |   || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||    
T  12398090 tgaatgggtctttgaagggcggtttgaagtacacaagggcaactcaagatgaagacgctttggaggggtatgttgatgcggattatgcgggcaaagtaga 12397991  T
Q  444 cactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaa 543  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | |  || || ||  | | |||||||||||||||||||    | || ||  | || |||||||||    
T  12397990 cactaggaaatccttgtcgggttttgtgtttactctttatggcacggctattagttggaaggcaaatcaacaa----tggtggcattatctacaactcaa 12397895  T
Q  544 gcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacatt 643  Q
    || ||||||||| | ||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||  | || |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12397894 gcggagtacatatcacttgttgaaggtgtgaaggaggccatatggttgaaagggatgattggtgagttaggaattactcaagaatgtgtgaagatacatt 12397795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 67 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 18410269 - 18409697
Alignment:
Q  67 ttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaagtcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaat 166  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||||  | | ||||||  ||| ||||||||  | || |||||||| ||| | || ||| |||||||||||||||    
T  18410269 ttgaagaaggtggtggagcgttttagaatgtcaaactctaaaaccgtgagcactcccttggggcaccacacaaagttgtccatacaacaatgtcctcaat 18410170  T
Q  167 ccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgc 266  Q
    |||| || ||||||     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  18410169 ccgaggatgagaaacaattgatggaaggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggaatggtttgtagtagaccggacttagcctatgc 18410070  T
Q  267 aatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggt 366  Q
      | ||  |  | ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||  || |||    
T  18410069 ggttagcattgtgagtcggtttatggcaaatccgggtattgtgcattggcaagctttgaagtgggtgttgaggtatttgaatgggtctttgaagggcggt 18409970  T
Q  367 ctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggtt 466  Q
     | | ||| |||||  ||   | ||  |  || ||||||||||| ||||| ||||||         || || || |||||||||||||| || || ||||    
T  18409969 ttgaagtacacaagagcagctcaagagaaagacgctttggaggggtatgttgatgcg---------ggcaatgtggacactagaaaatccttatcgggtt 18409879  T
Q  467 ttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttga 566  Q
    ||||||||||  | |  || || ||  | | ||||||||||||||||||||| || || ||  | || || |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  18409878 ttgtgtttactctttatggcacggctattagttggaaggcaaatcaacaatccgtggttgcattatctaccactcaagcggagtacattgcccttgttga 18409779  T
Q  567 aggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    |||||| || || | ||||||||||||||| |||||||| ||  | || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18409778 aggggtgaaagaggccatatggttgaaagggatgattggtgagttaggaattactcaagaatgtgtgaagatacattgtgat 18409697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 67 - 648
Target Start/End: Original strand, 9188620 - 9189202
Alignment:
Q  67 ttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaagtcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaat 166  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||||  | | ||||||  ||| ||||||||  | ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||    
T  9188620 ttgaagaaggtggtggagcgtttcagaatgtcaaactctaaaaccgtgagcactcccttgggtcaccacacaaagttgtccataaaacaatgtcctcaat 9188719  T
Q  167 ccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgc 266  Q
    |||| || |||||     |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||  |    
T  9188720 ccgaggatgagaagcaagagatggaaaatactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggaatggtttgtagtagactggacttagcttatcc 9188819  T
Q  267 aatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggt 366  Q
      | ||  |  | ||||||||||||||||||| ||||   ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||  || |||    
T  9188820 ggttagcattgtgagtcggtttatggcaaatctgggtattgtgcattggcaagctttgaagtgggtgttgaggtatttgaatgggtctttgaagggcggt 9188919  T
Q  367 ctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggtt 466  Q
     | | ||| |||||  ||   | ||  |  || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||    
T  9188920 ttgaagtacacaagagcagctcaagagaaagacgcttttgaggggtatgttgatgcggactatgcgggcaatgtggacacaagaaaatccttatcgggtt 9189019  T
Q  467 ttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttg-tagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttg 565  Q
    ||||||||||  | |  || || ||  | | ||||||||||||||||||||| | || | ||  | ||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  9189020 ttgtgtttactctttatggcacggctattagttggaaggcaaatcaacaatccggtggtggcattatcaacaactcaagcagattatattgcccttgttg 9189119  T
Q  566 aaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    ||||||| || || | |||||||||||||||||||||||| ||  | || |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  9189120 aaggggtgaaagaggccatatggttgaaaggtatgattggtgagttaggaattactcaagaatgtgtgaagatacagtgtgat 9189202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 64 - 597
Target Start/End: Original strand, 24273377 - 24273910
Alignment:
Q  64 tacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaagtcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctc 163  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    | ||||||  ||| ||||||||  | || |||||||| ||| | || | ||||||||||||||    
T  24273377 tacttgaagaaggtggtggagcgttttagaatgtctaactctaaaaccgtgagcactcccttggggcaccacacaaagttgtccacaaaacaatgtcctc 24273476  T
Q  164 aatccgatgaagagaaaagcaa--gatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcc 261  Q
    ||||||| || |||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |     
T  24273477 aatccgaggatgagaa--gcaattgatggaaggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggaatggtttgtagtagacaagacttagct 24273574  T
Q  262 tacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagag 361  Q
    ||  |  | ||  |  | |||||| |||||||||||  ||||   ||||| || |||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||| ||  |    
T  24273575 tatacggttagaattgtgagtcggattatggcaaataagggtattgtgcattgacaagctttgaagtgggtattgaggtatttgaatgggtcttagaagg 24273674  T
Q  362 gtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtc 461  Q
    | ||| | | ||| |||||  ||   | ||     || ||||||||||| |||||  ||||||||||||| || || || ||||| ||||||||| | ||    
T  24273675 gcggtttgaagtacacaagagcagctcaagaggaagacgctttggaggggtatgttaatgcggactatgcgggaaatgtggacacaagaaaatctctatc 24273774  T
Q  462 aggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagccctt 561  Q
     |||||| |||||||  | |  || ||| |  | | ||||||||||||||||||||| || || ||  | |||||||||||||| ||||| ||  |||||    
T  24273775 gggttttatgtttactctctatggcacaactattagttggaaggcaaatcaacaatccgtggtggcattatcaacaactcaagcggagtatatttccctt 24273874  T
Q  562 gttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggt 597  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  24273875 gttgaaggggtcaaagaggccatatggttgaaaggt 24273910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 440 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 7393761 - 7393598
Alignment:
Q  440 tagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaac 539  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| || | | |  | |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  7393761 tagacactagaaattctttgttaggttttgtgtttacgttgtttggaataacaattacttggaaggtaagtcaacaattagttgtagctctttcatcaac 7393662  T
Q  540 tcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgatt 603  Q
    || || |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  7393661 tctagaagagtacatagctctggttgaaggggtcaaggaagccatgtggttgaatggtatgatt 7393598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 592 - 648
Target Start/End: Original strand, 24275878 - 24275934
Alignment:
Q  592 aaaggtatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    |||||||||||||| ||  | || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24275878 aaaggtatgattggtgagttaggaattactcaagaatgtgtgaagatacattgtgat 24275934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 611; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 611; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 648
Target Start/End: Original strand, 13882192 - 13882830
Alignment:
Q  10 atggacatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaag 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13882192 atggatatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggttcagaatgaaagattctaaag 13882291  T
Q  110 tcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaag 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13882292 tcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaagcagtgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaag 13882391  T
Q  210 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtg 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13882392 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtg 13882491  T
Q  310 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagg 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13882492 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgaaaggtggtctaaggtatacaaggtcacaaccaggtagggatgctttggagg 13882591  T
Q  410 gatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaa 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13882592 gatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaa 13882691  T
Q  510 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaa 609  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13882692 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaagccatatggttgaaaggtatgattggagaa 13882791  T
Q  610 atggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13882792 atggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 13882830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 611; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 35202791 - 35202153
Alignment:
Q  10 atggacatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaag 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35202791 atggatatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggttcagaatgaaagattctaaag 35202692  T
Q  110 tcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaag 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35202691 tcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaagcagtgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaag 35202592  T
Q  210 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtg 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35202591 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtg 35202492  T
Q  310 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagg 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35202491 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgaaaggtggtctaaggtatacaaggtcacaaccaggtagggatgctttggagg 35202392  T
Q  410 gatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaa 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35202391 gatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaa 35202292  T
Q  510 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaa 609  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35202291 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaagccatatggttgaaaggtatgattggagaa 35202192  T
Q  610 atggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35202191 atggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 35202153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 491; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 22345728 - 22345090
Alignment:
Q  10 atggacatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaag 109  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  22345728 atggatatcatgagggaccggaacaaaggtgaattgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagtggttcataatgaaagattctaaag 22345629  T
Q  110 tcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaag 209  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  22345628 tcgttggcactcctcttggtcatcacacaaagttatcaataaagcagtgtcctcaatccgatgaagagaaaaacaagatggaaggtactccctatgcaag 22345529  T
Q  210 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtg 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22345528 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccagacttatcctacgcaattagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtg 22345429  T
Q  310 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagg 409  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  22345428 cactagcaagctttgatgtgggttttgagatatttgaatggatctttcaaaggtggtctaaggtatacaaggtcacaaccaggaagggatgctttggagg 22345329  T
Q  410 gatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaa 509  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  22345328 gatatctggatgcggactatgcaggtaatgtagacactaggaaatctctctcaggttttgtgtttacattgttcggtacaacagtaacttggaaggcaaa 22345229  T
Q  510 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaa 609  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22345228 tcaacaatctgttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagtccttgttgaaggggtcaaggaagccatatggttgaaatgtatgattggagaa 22345129  T
Q  610 atggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22345128 acggggattagtcaagggtgtgtgaagatacattgtgat 22345090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 46 - 648
Target Start/End: Original strand, 33334530 - 33335132
Alignment:
Q  46 ttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaagtcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctat 145  Q
    ||||||||||| |  || || |||| ||| ||||||||||| |||||||||  | | | ||||  ||| ||||||||  | ||||||||||| ||| | |    
T  33334530 ttcttatctcaacttggttatttgaagaaggtggtggagcgttttagaatgtcaaactttaaaaccgtaagcactcccttgggtcaccacacaaagttgt 33334629  T
Q  146 ctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaa--gatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgt 243  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||| || |||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33334630 ccatacaacaatgtccttaatccgaggatgagaa--gcaattgatggaaggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggaatggtttgt 33334727  T
Q  244 agtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtgggttctgagatatt 343  Q
    ||||| ||||||||  | || ||  | ||  |  | |||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  33334728 agtaggccggacttggcttatgcggttagcattgtgagtcggtttatggcaaatccgggaattgtgcattggcaagctttgaagtgggtgttgaggtatt 33334827  T
Q  344 tgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtaga 443  Q
    ||||||| || ||||  || ||| | | ||| |||||| ||   | || |   || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||    
T  33334828 tgaatgggtcgttgaagggcggtttgaagtacacaagggcagctcaagatgaagacgctttggaggggtatgttgatgcggattatgcgggcaacgtgga 33334927  T
Q  444 cactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaa 543  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | |  || |||||| | | ||||||||||||||||||||| || || ||  | || |||||||||    
T  33334928 cactagaaaatccttgtcgggttttgtgtttactctttatggcacagcgattagttggaaggcaaatcaacaatccgtggtggcattatctacaactcaa 33335027  T
Q  544 gcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacatt 643  Q
    || |||||||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||  | || |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  33335028 gcggagtacatcgcacttgttgaaggtgtgaaggaggccatatggttgaaagggatgattggtgagttaggaattactcaagaatgtgtgaagatacatt 33335127  T
Q  644 gtgat 648  Q
    |||||    
T  33335128 gtgat 33335132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 372 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 31252995 - 31252839
Alignment:
Q  372 gtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtg 471  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  31252995 gtatacaaggtcacaaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacaatagaaaatctttgttaggttttgtg 31252896  T
Q  472 tttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagct 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31252895 tttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagct 31252839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 46 - 648
Target Start/End: Original strand, 14741025 - 14741627
Alignment:
Q  46 ttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaagtcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctat 145  Q
    ||||||||||| |  || || |||| ||| ||||||||||| |||||||||  | | ||||||  ||| ||||||||  | ||||||||||| ||| | |    
T  14741025 ttcttatctcaacttggttatttgaagaaggtggtggagcgttttagaatgtcaaactctaaaaccgtgagcactcccttgggtcaccacacaaagttgt 14741124  T
Q  146 ctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaa--gatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgt 243  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| || |||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14741125 ccatacaacaatgtcctcaatccgaggatgagaa--gcaattgatggaaggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggaatggtttgt 14741222  T
Q  244 agtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtgggttctgagatatt 343  Q
    ||||| ||||||||| | || ||  | ||  |  | |||||||||||||||||||||||    ||||| || |||||||||||||||||  |||| ||||    
T  14741223 agtaggccggacttagcttatgcggttagcattgtgagtcggtttatggcaaatccgggaattgtgcattgacaagctttgaagtgggtaatgaggtatt 14741322  T
Q  344 tgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtaga 443  Q
    ||||||| || ||||  || ||| | | ||| | |||| ||   | || |   ||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||    
T  14741323 tgaatgggtcgttgaagggcggtttgaagtacataagggcagctcaagatgaagacactttggaggggtatgttgatgcggattatgcgggcaacgtgga 14741422  T
Q  444 cactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaa 543  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | |  || || ||  | | ||||||||||||||||||||| || || ||  | || |||||||||    
T  14741423 cactagaaaatccttgtcgggttttgtgtttactctttatggcacggctattagttggaaggcaaatcaacaatccgtggtggcattatctacaactcaa 14741522  T
Q  544 gcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacatt 643  Q
    || |||||||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||  | || |||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  14741523 gcggagtacatcgcacttgttgaaggtgtgaaggaggccatatggttgaaagggatgattggtgagttaggaattactcaagaatgtgtgaggatacatt 14741622  T
Q  644 gtgat 648  Q
    |||||    
T  14741623 gtgat 14741627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 523 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 31249666 - 31249541
Alignment:
Q  523 gtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtc 622  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31249666 gtagctctttcaacaactcaagcggaatacatagcccttgtttaaggggtcaaggaagccatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattattc 31249567  T
Q  623 aaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  31249566 aaggatgtgtgaagatacattgtgat 31249541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 130 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 24714342 - 24714114
Alignment:
Q  130 caccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgt 229  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| |  |||||     |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24714342 caccacacaaagttgtccataaaacaatgtcctcaatccgagggtgagaagcaagagatggaaagtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgt 24714243  T
Q  230 atggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtg 329  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | ||  | || ||  |  | ||||| |||||||||||| | |||   ||||| |||||||||||||||||    
T  24714242 atggaatggtttgtagtagaccggacttagcttatccgattagcattgtgagtcgatttatggcaaatacaggtattgtgcattggcaagctttgaagtg 24714143  T
Q  330 ggttctgagatatttgaatggatctttga 358  Q
    |||  |||| ||||||||||| |||||||    
T  24714142 ggtattgaggtatttgaatgggtctttga 24714114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 127 - 358
Target Start/End: Original strand, 24434617 - 24434848
Alignment:
Q  127 ggtcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatca 226  Q
    ||||||||||| ||| | || |||||| |||||||||||||| | || ||||| |   |||||||  ||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  24434617 ggtcaccacacaaagttgtccataaaaaaatgtcctcaatccaaggatgagaagaaagagatggaaagtactccttattctagtggggttggaagcatca 24434716  T
Q  227 tgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaa 326  Q
    ||||||| ||  ||||||||||||| |||||  | || ||  | |   |  | |||| ||||||||||||| |||||   ||||| ||||||||||||||    
T  24434717 tgtatggaattttttgtagtagaccagactttgcttatgcggttaacattgtgagtcagtttatggcaaattcgggtattgtgcattggcaagctttgaa 24434816  T
Q  327 gtgggttctgagatatttgaatggatctttga 358  Q
    ||||||  |||| ||||||||| | |||||||    
T  24434817 gtgggtgttgaggtatttgaatcggtctttga 24434848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 541 - 648
Target Start/End: Original strand, 24435022 - 24435129
Alignment:
Q  541 caagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatac 640  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| || |||| || || | ||||| ||||||||| |||||||| ||  | || |||| || || ||||||||||||||    
T  24435022 caagcggagtacattgcccttgttaaaagggtgaaagaggccatatagttgaaaggaatgattggtgagttaggaattactcgagaatgtgtgaagatac 24435121  T
Q  641 attgtgat 648  Q
    ||||||||    
T  24435122 attgtgat 24435129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 402 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 24714070 - 24713996
Alignment:
Q  402 tttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttac 476  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||  |||||||||||||    
T  24714070 tttggaggggtatgtagatgcggactatgcgggtaatgtggacacaagaaaatccttatcgagttttgtgtttac 24713996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 498 - 602
Target Start/End: Original strand, 30517219 - 30517323
Alignment:
Q  498 ttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggt 597  Q
    |||||| |||||||||||||  || || ||||| || |||||| |||  |||| |||  | |||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||    
T  30517219 ttggaaagcaaatcaacaatttgtggtggctctatctacaacttaagtggagtgcattacacttgttgaaggggtaaaggaagccatgttgttgaaaggt 30517318  T
Q  598 atgat 602  Q
    |||||    
T  30517319 atgat 30517323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 535 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 100174 - 100115
Alignment:
Q  535 acaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaa 594  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  | ||||||  |||||||||||||    
T  100174 acaactcaagcagagtacattgcccttgttgaacgaatgaaggaatccatatggttgaaa 100115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 100519 - 100490
Alignment:
Q  221 gcatcatgtatggtatggtttgtagtagac 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  100519 gcatcatgtatggtatggtttgtagtagac 100490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 607; Significance: 0; HSPs: 19)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 607; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 47879617 - 47878979
Alignment:
Q  10 atggacatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaag 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47879617 atggatatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggttcagaatgaaagattctaaag 47879518  T
Q  110 tcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaag 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47879517 tcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaagcagtgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaag 47879418  T
Q  210 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtg 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47879417 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtg 47879318  T
Q  310 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagg 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47879317 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgaaaggtggtctaaggtatacaaggtcacaaccaggtagggatgctttggagg 47879218  T
Q  410 gatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaa 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47879217 gatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaa 47879118  T
Q  510 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaa 609  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47879117 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaagccatatggttgaaaggtatgattggagaa 47879018  T
Q  610 atggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47879017 atggggattagtcaagggtgtgtgaagatacattgtgat 47878979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 579; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 10095534 - 10094896
Alignment:
Q  10 atggacatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaag 109  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10095534 atggatatcataagagaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggttcagaatgaaagattctaaag 10095435  T
Q  110 tcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaag 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10095434 tcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaagcaatgtcctcaatccgatgaagaaaaaagcaaggtggagggtactccctatgcaag 10095335  T
Q  210 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtg 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10095334 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagta 10095235  T
Q  310 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagg 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10095234 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaagtatacaaggtcacaaccaggtagggatgctttggagg 10095135  T
Q  410 gatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaa 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10095134 gatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacaccagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacaatgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaa 10095035  T
Q  510 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaa 609  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10095034 tcaacaatcagttgtagccctttcaacaactcaagcagaatacatagcccttgttgaaggggtcaaggaagccatatggttgaaaggtatgattggagaa 10094935  T
Q  610 atggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10094934 atggggattagtcaaggatgtatgaagatacattgtgat 10094896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 571; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 10202420 - 10201782
Alignment:
Q  10 atggacatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaag 109  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10202420 atggatatcataagagaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggttcagaatgaaagattctaaag 10202321  T
Q  110 tcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaag 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10202320 tcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaagcagtgtcctcaatccgatgaagaaaaaagcaagatggagggtactccctatgcaag 10202221  T
Q  210 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtg 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10202220 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagta 10202121  T
Q  310 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagg 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10202120 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaagtatacaaggtcacaaccaggtagggatgctttggagg 10202021  T
Q  410 gatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaa 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10202020 gatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacaccagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacaatgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaa 10201921  T
Q  510 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaa 609  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10201920 tcaacaatcagttgtagccctttcaacaactcaagcagaatacatagcccttgttgaaggggtcaaggaagccatatggttgaaaggtatgattggagaa 10201821  T
Q  610 atggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
     ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  10201820 ttggggattattcaaggatgtgtgaggatacattgtgat 10201782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 571; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 648
Target Start/End: Original strand, 54191961 - 54192599
Alignment:
Q  10 atggacatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaag 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54191961 atggatatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggttcagaatgaaagattctaaag 54192060  T
Q  110 tcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaag 209  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54192061 tcgctagcactcctcttggtcaccacacaaagctatcaataaagcagtgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggaaggtactccctatgcaag 54192160  T
Q  210 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtg 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54192161 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtg 54192260  T
Q  310 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagg 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54192261 cactggcaagctttgaagtgggttctaagatatttgaatggatcttagaaaggtggtctaaggtatacaaggtcacaaccaggtagggatgctttggagg 54192360  T
Q  410 gatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaa 509  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54192361 gatatgtggatgcgggctatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaa 54192460  T
Q  510 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaa 609  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54192461 tcaacaatcagttgtagccctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaagccatatggttgaaaggtatgattggagaa 54192560  T
Q  610 atggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  54192561 atgggaattagtcaagggtgtgtgaagatacattgtgat 54192599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 559; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 648
Target Start/End: Original strand, 16460917 - 16461555
Alignment:
Q  10 atggacatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaag 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16460917 atggatatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcaacaggggtacttgaggaaagtggtggagcggttcagaatgaaagattctaaag 16461016  T
Q  110 tcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaag 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16461017 tcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaaacagtgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaag 16461116  T
Q  210 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtg 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16461117 tgggtttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccaaacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatctgggtcaagtg 16461216  T
Q  310 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagg 409  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  16461217 cactggcaagctttgaagtggattctgagatatttgaatggatctttgaaaggtggtctaaggtatacaaggtcacaaccaggtaaggatgctttggagg 16461316  T
Q  410 gatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaa 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16461317 gatatgtggatgcggactatgcatgtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttctgtacagcggtaacttggaaggcaaa 16461416  T
Q  510 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaa 609  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16461417 tcaacaatcagttgtagccctttcaacaactcaagcggaatacgtagcccttgttgaaggggtcaaggaagccatatggttgaaaggtatgattggagaa 16461516  T
Q  610 atggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16461517 atggggattagtcaagggtgtgtgaagatacattgtgat 16461555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 547; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 648
Target Start/End: Original strand, 10900462 - 10901100
Alignment:
Q  10 atggacatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaag 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10900462 atggatatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggttcagaatgaaagattctaaag 10900561  T
Q  110 tcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaag 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10900562 tcgttggcactcctcttggtcaccacacaaagctatctataaagcagtgccctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactcccaatgcaag 10900661  T
Q  210 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtg 309  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  10900662 tggggttggaagcatgatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaattagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgagtcaagta 10900761  T
Q  310 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagg 409  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10900762 cactagcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgaaaggtggtctaaggtatacaaggtcacaaccaggtagggatgctttggagg 10900861  T
Q  410 gatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaa 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10900862 gatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttagaaggcaaa 10900961  T
Q  510 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaa 609  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10900962 tcaacaatcagttgtaaccctttcaacaactcaagtagaatacatagcccttgttgaaggggtcaaggaagccatatggttgaaatgtatgattggagaa 10901061  T
Q  610 atggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10901062 atggggattagtcaagggtgtgtgaagatacattgtgat 10901100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 500; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 10596474 - 10595862
Alignment:
Q  10 atggacatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaag 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10596474 atggatatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagtaggggtacttgaggaaagtggtggagcggttcagaatgaaagattctaaag 10596375  T
Q  110 tcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaag 209  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10596374 tcgttggcactcctcttggtcatcacacaaagctatcaataaagca--gtcctcaatccgatgaagagaaaaacaagatggagggtactccctatgcaag 10596277  T
Q  210 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtg 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10596276 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccagacttatcctacgcaattagtgtgataagtcggtttatggcaaatctgggtcaagtg 10596177  T
Q  310 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagg 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  10596176 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatgaatctttgaaaggttgtctaaggtatacaaggtcacaaccaggtagggaggctttggagg 10596077  T
Q  410 gatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaa 509  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  10596076 gatatgtggatgtggactatgtaggtaatgtagacactaggatatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacactagtaacttggaaggcaaa 10595977  T
Q  510 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaa 609  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10595976 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaagccatatggttgaaaggtatgattggagaa 10595877  T
Q  610 atggggattagtcaa 624  Q
    |||||||||||||||    
T  10595876 atggggattagtcaa 10595862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 46 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 8513727 - 8513125
Alignment:
Q  46 ttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaagtcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctat 145  Q
    ||||||||||| |  || || |||| ||| |||||||||||||||||||||  | | ||||||  ||| ||||||||  | ||||||||||| ||| | |    
T  8513727 ttcttatctcaactcggttatttgaagaaggtggtggagcggtttagaatgtcaaactctaaaaccgtgagcactcccttgggtcaccacacaaagttgt 8513628  T
Q  146 ctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaa--gatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgt 243  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| || |||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8513627 ccatacaacaatgtcctcaatccgaggatgagaa--gcaattgatggaaggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggaatggtttgt 8513530  T
Q  244 agtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtgggttctgagatatt 343  Q
    ||||| ||||||||  | || ||  | ||  |  | |||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  8513529 agtaggccggacttggcttatgcggttagcattgtgagtcggtttatggcaaatccgggaattgtgcattggcaagctttgaagtgggttttgaggtatt 8513430  T
Q  344 tgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtaga 443  Q
    ||||||| || ||||  || ||| | | ||| |||||| ||   | || |   || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  8513429 tgaatgggtcgttgaagggcggtttgaagtacacaagggcagctcaagatgaagacgctttggaggggtatgttgatgcggattatgcgggcaacgtaga 8513330  T
Q  444 cactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaa 543  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | |  || || ||| | | ||||||||||||||||||||  || || ||  | || |||||||||    
T  8513329 cactaggaaatccttgtcgggttttgtgtttactctctatggcacggcgattagttggaaggcaaatcaacaattcgtggtggcattatctacaactcaa 8513230  T
Q  544 gcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacatt 643  Q
    || |||||||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||  | || |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  8513229 gcggagtacatcgcacttgttgaaggtgtgaaggaggccatatggttgaaagggatgattggtgagttaggaattactcaagaatgtgtgaagatacatt 8513130  T
Q  644 gtgat 648  Q
    |||||    
T  8513129 gtgat 8513125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 46 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 32476973 - 32476371
Alignment:
Q  46 ttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaagtcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctat 145  Q
    ||||||||||| |  || || |||| ||| |||||||||||||||||||||  | | ||||||  ||| ||||||||  | ||||||||||| ||| | |    
T  32476973 ttcttatctcaactcggttatttgaagaaggtggtggagcggtttagaatgtcaaactctaaaaccgtgagcactcccttgggtcaccacacaaagttgt 32476874  T
Q  146 ctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaa--gatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgt 243  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| || |||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32476873 ccatacaacaatgtcctcaatccgaggatgagaa--gcaattgatggaaggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggaatggtttgt 32476776  T
Q  244 agtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtgggttctgagatatt 343  Q
    ||||| ||||||||  | || ||  | ||  |  | |||||||||||||||||||| ||    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  32476775 agtaggccggacttggcttatgcggttagcattgtgagtcggtttatggcaaatccaggaattgtgcattggcaagctttgaagtgggttttgaggtatt 32476676  T
Q  344 tgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtaga 443  Q
    ||||||| || |||   || ||| | | ||| |||||| ||   | || |   || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  32476675 tgaatgggtcgttggtgggcggtttgaagtacacaagggcagctcaagatgaagacgctttggaggggtatgttgatgcggattatgcgggcaacgtaga 32476576  T
Q  444 cactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaa 543  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | |  || || ||| | | ||||||||||||||||||||| || || ||  | || |||||||||    
T  32476575 cactaggaaatccttgtcgggttttgtgtttactctttatggcacggcgattagttggaaggcaaatcaacaatccgtggtggcattatctacaactcaa 32476476  T
Q  544 gcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacatt 643  Q
    || |||||||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||  | || |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  32476475 gcggagtacatcgcacttgttgaaggtgtgaaggaggccatatggttgaaagggatgattggtgagttaggaattactcaagaatgtgtgaagatacatt 32476376  T
Q  644 gtgat 648  Q
    |||||    
T  32476375 gtgat 32476371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 46 - 648
Target Start/End: Original strand, 22171762 - 22172364
Alignment:
Q  46 ttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaagtcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctat 145  Q
    ||||||||||| |  || || |||| ||| ||||||||||| |||||||||  | | ||||||  ||| ||||||||  | || |||||||| ||| | |    
T  22171762 ttcttatctcaacttggttatttgaagaaggtggtggagcgttttagaatgtcaaactctaaaaccgtgagcactcccttggggcaccacacaaagttgt 22171861  T
Q  146 ctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaa--gatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgt 243  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22171862 ccatacaacaatgtcctcaatccga-gaat-gaaaagcaattgatggaaggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggaatggtttgt 22171959  T
Q  244 agtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtgggttctgagatatt 343  Q
    ||||| ||||||||| | || || || ||  |  | ||||||||||||||||||| |||    ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  22171960 agtaggccggacttagcttatgcgattagcattgtgagtcggtttatggcaaatctgggaattgtgcattggcaagctttgaagtgggtattgaggtatt 22172059  T
Q  344 tgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtaga 443  Q
    ||||||| |||||||  || ||| | | ||| |||||| ||   | || |   || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  22172060 tgaatgggtctttgaagggcggtttgaagtacacaagggcagctcaagatgaagacgctttggaggggtatgttgatgcggattatgcaggcaacgtgga 22172159  T
Q  444 cactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaa 543  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||  | |  || || ||  | | ||||||||||||||||||||| || || ||  | || |||||||||    
T  22172160 cactagaaaatccttatcgggttttgtgtttactctttatggcacggctattagttggaaggcaaatcaacaatctgtggtggcattatctacaactcaa 22172259  T
Q  544 gcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacatt 643  Q
    || |||||||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||  | || |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22172260 gcggagtacatcgcgcttgttgaaggtgtgaaggaggccatatggttgaaagggatgattggtgagttaggaattactcaagaatgtgtgaagatacatt 22172359  T
Q  644 gtgat 648  Q
    |||||    
T  22172360 gtgat 22172364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 46 - 648
Target Start/End: Original strand, 2675674 - 2676276
Alignment:
Q  46 ttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaagtcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctat 145  Q
    ||||||||||| |  ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||  | | ||||||  ||| ||||||||  | || |||||||| ||| | |    
T  2675674 ttcttatctcaacttgggtatttgaagaaggtggtggagcggtttagaatgtcaaactctaaaaccgtgagcactcccttgggacaccacacaaagttgt 2675773  T
Q  146 ctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaa--gatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgt 243  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| || |||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2675774 ccatacaacaatgtcctcaatccgaggatgagaa--gcaattgatggaaggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggaatggtttgt 2675871  T
Q  244 agtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtgggttctgagatatt 343  Q
    ||||| ||||||||  | || ||  | ||  |  | |||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  2675872 agtaggccggacttggcttatgcggttagcattgtgagtcggtttatggcaaatccgggaattgtgcattggcaagctttgaagtgggttttgaggtatt 2675971  T
Q  344 tgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtaga 443  Q
    ||||||| || |||| ||| ||| | | ||| |||||| ||   | || |   || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||    
T  2675972 tgaatgggtcgttgaaaggcggtttgaagtacacaagggcagctcaagatgaagacgctttggaggggtatgttgatgcggattatgcgggcaacgtgga 2676071  T
Q  444 cactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaa 543  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||  | |  || || ||| | | ||||||||||||||||||||| || || ||  | || |||||||||    
T  2676072 cactagaaaatccttgtcgggtttcgtgttcactctttatggcacggcgattagttggaaggcaaatcaacaatccgtggtggcattatctacaactcaa 2676171  T
Q  544 gcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacatt 643  Q
    || |||||||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||  | || |||| ||||| |||||| | ||||||||    
T  2676172 gcggagtacatcgcacttgttgaaggtgtgaaggaggccatatggttgaaagggatgattggtgagttaggaattactcaagaatgtgtaaggatacatt 2676271  T
Q  644 gtgat 648  Q
    |||||    
T  2676272 gtgat 2676276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 67 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 1307483 - 1306902
Alignment:
Q  67 ttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaagtcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaat 166  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||||  | | ||||||  ||| ||||||||  | || |||||||| ||| | || ||| |||||||||||||||    
T  1307483 ttgaagaaggtggtggagcgttttagaatgtcaaactctaaaaccgtgagcactcccttggggcaccacacaaagttgtccatacaacaatgtcctcaat 1307384  T
Q  167 ccgatgaagagaaaagcaa--gatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctac 264  Q
    |||| || |||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||     
T  1307383 ccgaggatgagaa--gcaattgatggaaggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggaatggtttgtagtagaccggacttagcttat 1307286  T
Q  265 gcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtg 364  Q
    ||  | ||  |  | ||||||||||||| ||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||  || |    
T  1307285 gcggttagcattgtgagtcggtttatggaaaatccgggtattgtgcattggcaagctttgaagtgggtattgaggtatttgaatgggtctttgaagggcg 1307186  T
Q  365 gtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcagg 464  Q
    || | | ||| |||||  ||   | ||     || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||| || || ||    
T  1307185 gtttgaagtacacaagagcagctcaagaggaagacgctttggaggggtatgttgatgcggactatgcgggcaatgtggacactagaaaatccttatcggg 1307086  T
Q  465 ttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgtt 564  Q
    ||||||||||||  | |  || ||  |  | | ||||||||||||||||||||  || || ||  | || || |||||||| |||||||| |||||||||    
T  1307085 ttttgtgtttactctttatggcacgactattagttggaaggcaaatcaacaattcgtggttgcattatctaccactcaagcggagtacattgcccttgtt 1306986  T
Q  565 gaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    |||||||| || || | ||||||||||||||  |||||||| ||  | || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1306985 gaaggggtgaaagaggccatatggttgaaagagatgattggtgagttaggaattactcaagaatgtgtgaagatacattgtgat 1306902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 67 - 648
Target Start/End: Original strand, 3326964 - 3327544
Alignment:
Q  67 ttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaagtcgttagcactcctcttggt-caccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaa 165  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||||  | | ||||||  ||| ||||||| ||||||  |||||||| ||| | || ||||||||||||||||||    
T  3326964 ttgaagaaggtggtggagcgttttagaatgtcaaactctaaaaccgtgagcactc-tcttggggcaccacacaaagttgtccataaaacaatgtcctcaa 3327062  T
Q  166 tccgatgaagagaaaagcaag--atggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatccta 263  Q
    ||||| || |||||  ||||   ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||    
T  3327063 tccgaggatgagaa--gcaattaatggaaggtactccctatgcaagttgggttggaagcatcatgtatggaatgatttgtagtagaccggacttagctta 3327160  T
Q  264 cgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggt 363  Q
     ||  | ||  |  | |||||||||| |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || |||||||  ||||||||| |     
T  3327161 tgcggttagcattgtgagtcggtttacggcaaatccgggtattgtgcattggcaagctttgaagtgggtgttgaggtacttgaatgcgtctttgaga-gc 3327259  T
Q  364 ggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcag 463  Q
    ||| | | ||| |||||  ||   | ||     |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || ||||  |||||||| || || |    
T  3327260 ggtttgaagtacacaagagcagctcaagaggaagatgctttggaggggtatgtagatgcagactatgcgggcaatgtggacatgagaaaatccttatcgg 3327359  T
Q  464 gttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgt 563  Q
    |||||||||||||  | |  || || ||  | | ||||||||||||| || |||| || || |   | || || |||||||| |||||||| || |||||    
T  3327360 gttttgtgtttactctttatggcacggctattagttggaaggcaaataaaaaatctgtggtggtattatctaccactcaagcggagtacattgctcttgt 3327459  T
Q  564 tgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    ||||||  | || || | ||||||||||||||| |||||||| ||  | || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3327460 tgaaggaatgaaagaggccatatggttgaaaggaatgattggtgagttaggaattactcaagaatgtgtgaagatacattgtgat 3327544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 130 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 16256618 - 16256390
Alignment:
Q  130 caccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgt 229  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| || |||||      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16256618 caccacacaaagttgtccataaaacaatgtcctcaatccgaggatgagaaggaattgatggaaggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgt 16256519  T
Q  230 atggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtg 329  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| | || ||  | ||  |  | ||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||    
T  16256518 atggaatggtttgtagtagactggacttagcttatgcggttagcattgtgagtcggtttatggcaaatccgggtattgtgcattggcaagctttgaagtg 16256419  T
Q  330 ggttctgagatatttgaatggatctttga 358  Q
    |||  |||| |||||| |||| |||||||    
T  16256418 ggtgttgaggtatttgtatgggtctttga 16256390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 280 - 648
Target Start/End: Original strand, 6793554 - 6793922
Alignment:
Q  280 agtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaa 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| || |||||||||||||||||  | || || ||||||||||||||||  || ||| | | ||| ||||    
T  6793554 agtcggtttatggcaaatccgggtattgtgcattgacaagctttgaagtgggtgttaaggtacttgaatggatctttgaagggcggtttgaagtacacaa 6793653  T
Q  380 ggtcataaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacatt 479  Q
    |  || | | || |   || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||||||||||||  |    
T  6793654 gagcagatcgagatgaagacgctttggaggggtatgtagatgcggactatgcgggcaatgtggacacaagaaaatccttatcgggttttgtgtttactct 6793753  T
Q  480 gttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaa 579  Q
     |  |  |  ||  | | ||||||||||||||||||||| || || ||  | || || ||||||||  ||||||| || ||||||||||| || || ||     
T  6793754 ttatgacaaggctattagttggaaggcaaatcaacaatccgtggtggcattatctaccactcaagcgaagtacattgcacttgttgaaggagtgaaagag 6793853  T
Q  580 ggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    | ||||| ||||||||| |||||||| ||  | || |||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  6793854 gccatattgttgaaagggatgattggtgagttaggaattacttaagaatgtgtgaagatacattgtgat 6793922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 77 - 380
Target Start/End: Original strand, 4385860 - 4386163
Alignment:
Q  77 tggtggagcggtttagaatgaaagattctaaagtcgttagcactcctcttgg-tcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaatccgatgaag 175  Q
    |||||||||| |||||| ||  | | ||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||| ||| | || ||||||||| |||||||| |||| || |    
T  4385860 tggtggagcgttttagagtgtcaaactctaaaaccgttagcactcc-cttggatcaccacacaaagttgtccataaaacaacgtcctcaaaccgaggatg 4385958  T
Q  176 agaaaagcaagatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgt 275  Q
    || | |    ||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||| |||||||| |||| | | || |   | ||  |    
T  4385959 aggagaaagcgatggaaaatactccctatgcaagtggggttgaaagcatcatgtatgaaagggtttgcagtagaccagactcaacttatgtggttagcat 4386058  T
Q  276 gataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaggtat 375  Q
      | ||||||||||||| ||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||  |||||| | |||||     
T  4386059 cgtgagtcggtttatggaaaatccgggtattgtgcattggcaagctttgaagtgggtgttgaggtatttgaatgggtctttgaagggtggtttgaggtac 4386158  T
Q  376 acaag 380  Q
    |||||    
T  4386159 acaag 4386163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 22622853 - 22622792
Alignment:
Q  10 atggacatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgag 71  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22622853 atggatatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaagggtacttgag 22622792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 148 - 358
Target Start/End: Original strand, 9149880 - 9150081
Alignment:
Q  148 ataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagta 247  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||      |||||||  |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||  ||| |||||    
T  9149880 ataaaacaatgtcctcaatccgaggatgagaat-----gatggag--tacttcctatgcaagtggtgttggaggcatcatgtatggaattatttatagta 9149972  T
Q  248 gaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaa 347  Q
    |||| |||||| | || ||  | ||| |  | ||| ||||||||||||||| ||||   ||||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||    
T  9149973 gaccagacttagcttatgcggttagtat--tgagttggtttatggcaaatctgggtattgtgcattggcaagctttgatgtgggtgttgaggtatttgaa 9150070  T
Q  348 tggatctttga 358  Q
    ||  |||||||    
T  9150071 tgagtctttga 9150081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 263
Target Start/End: Original strand, 25511862 - 25511930
Alignment:
Q  195 tactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatccta 263  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||| |||| |||||    
T  25511862 tactccctatgcaagtggagttggaagcatcatgtatgacatggttcgtagtaggccgaacttttccta 25511930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 607; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 607; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 22713962 - 22713324
Alignment:
Q  10 atggacatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaag 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22713962 atggatatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggttcagaatgaaagattctaaag 22713863  T
Q  110 tcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaag 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22713862 tcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaagcagtgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaag 22713763  T
Q  210 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtg 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22713762 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtg 22713663  T
Q  310 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagg 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22713662 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgaaaggtggtctaaggtatacaaggtcacaaccaggtagggatgctttggagg 22713563  T
Q  410 gatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaa 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22713562 gatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaa 22713463  T
Q  510 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaa 609  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22713462 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaagccatatggttgaaaggtatgattggagaa 22713363  T
Q  610 atggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22713362 atggggattagtcaagggtgtgtgaagatacattgtgat 22713324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 595; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 648
Target Start/End: Original strand, 39685700 - 39686338
Alignment:
Q  10 atggacatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaag 109  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39685700 atggatatcataagggaccagaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggttcagaatgaaagattctaaag 39685799  T
Q  110 tcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaag 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39685800 tcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaagcagtgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaag 39685899  T
Q  210 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtg 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39685900 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtg 39685999  T
Q  310 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagg 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39686000 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcacaaccaggtagggatgctttggagg 39686099  T
Q  410 gatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaa 509  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39686100 gatatgtagatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttaggtacagcggtaacttggaaggcaaa 39686199  T
Q  510 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaa 609  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39686200 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcaaagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaagccatatggttgaaaggtatgattggagaa 39686299  T
Q  610 atggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39686300 atggggattagttaaggatgtgtgaagatacattgtgat 39686338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 583; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 648
Target Start/End: Original strand, 2739658 - 2740296
Alignment:
Q  10 atggacatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaag 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2739658 atggatatcataagggaccggaacaaaggtgagttattcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggttcagaatgaaagattctaaag 2739757  T
Q  110 tcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaag 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2739758 tcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatatataaagcagtgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaag 2739857  T
Q  210 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtg 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2739858 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccagacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccggatcaagtg 2739957  T
Q  310 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagg 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2739958 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgaaaggtggcctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggaag 2740057  T
Q  410 gatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaa 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2740058 gatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttctgtacagcggtaacttggaaggcaaa 2740157  T
Q  510 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaa 609  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2740158 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacacagcccttgttgaaggggtcaaggaagccatatggttgaaaggtatgattggagaa 2740257  T
Q  610 atggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2740258 atggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 2740296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 563; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 648
Target Start/End: Original strand, 17942274 - 17942912
Alignment:
Q  10 atggacatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaag 109  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17942274 atggatatcatgagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcatgggtacttgaggaaagtggtggagcggttcagaatgaaagattctaaag 17942373  T
Q  110 tcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaag 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17942374 tcgttagcactcctcttggtcaccacacaaagctatctataaagtagtgtcctcaatccgaggaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaag 17942473  T
Q  210 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtg 309  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17942474 tggggttggaagcattatgtatggtatggtttgtagtaggtcggacttatcctacgcaattagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtg 17942573  T
Q  310 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagg 409  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17942574 cattggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgaaaggtggtctaaggtatacaaggtcacaaccaggtagggatgctttggagg 17942673  T
Q  410 gatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaa 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17942674 gatatgtggatgcggactatgcaggtaacatagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaa 17942773  T
Q  510 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaa 609  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17942774 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaagtcatatggttgaaaggtatgattggagaa 17942873  T
Q  610 atggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17942874 atggggattagtcaagggtgtgtgaagatacattgtgat 17942912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 547; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 20051490 - 20050852
Alignment:
Q  10 atggacatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaag 109  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  20051490 atggatatcatgagggaccgaaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtgaagcggttcagaatgaaagattctaaag 20051391  T
Q  110 tcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaag 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20051390 tcgttggcactcctcttggtcaccatacaaagctatcaataaagcagggtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgaaag 20051291  T
Q  210 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtg 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20051290 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgcagtagactggacttatcctacgcaattagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtg 20051191  T
Q  310 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagg 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20051190 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgaaaggtggtctaaggtataaaaggtcacaaccaggtagggatgctttggagg 20051091  T
Q  410 gatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaa 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20051090 gatatgtggatgcggactatgcaggtaatgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcagtaacttggaaggcaaa 20050991  T
Q  510 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaa 609  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20050990 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaagccatatggttgaaaggtatgattggagaa 20050891  T
Q  610 atggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20050890 atggggattagtcaagggtgtgtgaagatacattgtgat 20050852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 328 - 648
Target Start/End: Original strand, 30478048 - 30478368
Alignment:
Q  328 tgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggact 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30478048 tgggttctgagatatttgaatggatctttgaaaggtggtctaaggtatacaaggtcacaaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggact 30478147  T
Q  428 atgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagc 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30478148 atgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcagtacagcagtaacttgaaaggcaaatcaacaatcagttgtagc 30478247  T
Q  528 tctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaagga 627  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30478248 cctttcaacaactcaagcagaatacatagcccttgttgaaggggtcaaggaagccatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaaggg 30478347  T
Q  628 tgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  30478348 tgtgtgaagatacattgtgat 30478368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 46 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 19345911 - 19345308
Alignment:
Q  46 ttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaagtcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctat 145  Q
    ||||||||||| |  || || |||| ||| |||||||||||||||||||||  | | ||||||  ||| ||||||||  | ||||||||||| ||| | |    
T  19345911 ttcttatctcaacttggttatttgaagaaggtggtggagcggtttagaatgtcaaactctaaaaccgtaagcactcccttgggtcaccacacaaagttgt 19345812  T
Q  146 ctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaa--gatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgt 243  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| || |||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19345811 ccatacaacaatgtcctcaatccgaggatgagaa--gcaattgatggaaggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggaatggtttgt 19345714  T
Q  244 agtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtgggttctgagatatt 343  Q
    ||||| ||||||||  | || ||  | ||  |  | |||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19345713 agtaggccggacttggcttatgcggttagcattgtgagtcggtttatggcaaatccgggaattgtgcattggcaagctttgaagtgggttttgaggtatt 19345614  T
Q  344 tgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtaga 443  Q
    ||||||| || ||||  || ||| | | ||| |||||| ||   | || |   || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||    
T  19345613 tgaatgggtcgttgaagggcggtttgaagtacacaagggcagctcaagatgaagacgctttggaggggtatgttgatgcggattatgcgggcaacgtgga 19345514  T
Q  444 cactagaaaat-ctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactca 542  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||  | |   | ||  || | | ||||||||||||||||||||| || || ||  | || ||||||||    
T  19345513 cactagaaaatcccttgtcgggttttgtgtttactctttatagcacgacgattagttggaaggcaaatcaacaatccgtggtggcattatctacaactca 19345414  T
Q  543 agcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacat 642  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||  | || |||| ||||| |||||||||||||||     
T  19345413 agcggagtacatcgcacttgttgaaggtgtgaaggaggccatatggttgaaagggatgattggtgagttaggaattactcaagaatgtgtgaagatacac 19345314  T
Q  643 tgtgat 648  Q
    ||||||    
T  19345313 tgtgat 19345308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 148 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 31057489 - 31056989
Alignment:
Q  148 ataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaa--gatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtag 245  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31057489 ataaaacaatgtcctcaatccgaggatgagaa--gcaattgatggaaggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggaatggtttgtag 31057392  T
Q  246 tagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttg 345  Q
    ||||||||||||| | || ||  | ||  |  | ||||| ||||||||||||| ||||   ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  31057391 tagaccggacttagcttatgcggttagcattttgagtcgttttatggcaaatctgggtattgtgcattggcaagctttgaagtgggtgttgaggtatttg 31057292  T
Q  346 aatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagaca 445  Q
    ||||| |||||||  ||   | | | ||| |||||  ||   | ||     ||   ||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||    
T  31057291 aatgggtctttgaatggctttttgaagtacacaagagcagctcaagaggaagaccatttggaggggtatgttgatgcggactatgcgggcaatgtggaca 31057192  T
Q  446 ctagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagc 545  Q
    | ||||||||| | || ||||||||||||||  | |  || || ||  | | ||| ||||| |||||||||||  | || ||  | |||||||||| |||    
T  31057191 caagaaaatctctatcgggttttgtgtttactctctatggcacggctattagttgaaaggctaatcaacaatccatggtggcattatcaacaactctagc 31057092  T
Q  546 agagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgt 645  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| || ||   |||||||||||| ||||||||||| ||  | || |||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  31057091 ggagtacattgcccttgttgaaggggtgaaagagaccatatggttgaagggtatgattggtgagttaggaattactcaagaatgtatgaagatacattgt 31056992  T
Q  646 gat 648  Q
    |||    
T  31056991 gat 31056989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 67 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 39484369 - 39484078
Alignment:
Q  67 ttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaagtcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaat 166  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||||  | | ||||||  ||| ||||||||  | || |||||||| ||| | || |||||||||||||||||||    
T  39484369 ttgaagaaggtggtggagcgttttagaatgtcaaactctaaaaccgtgagcactcccttggggcaccacacaaagttgtccataaaacaatgtcctcaat 39484270  T
Q  167 ccgatgaagagaaaagcaa--gatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctac 264  Q
    |||| || |||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||     
T  39484269 ccgaggatgagaa--gcaattgatggaaggtactccctatgcaagtgcggttggaagcatcatgtatggaatggtttgtagtagatcggacttagcttat 39484172  T
Q  265 gcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttga 358  Q
    ||  | ||  |  | ||||||||||||||||||||| ||   ||||| || |||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||    
T  39484171 gcggttagcattgtgagtcggtttatggcaaatccgagtattgtgcattgacaagctttgaagtgggtgttgaggtatttgaatgggtctttga 39484078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 498 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 39483947 - 39483797
Alignment:
Q  498 ttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggt 597  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||  | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||    
T  39483947 ttggaagacaaatcaacaatctgtggtagcattatcaacaactcaagcggagtacattgcccttgttgaaggggtgaaagagaccatatggttgaaaggt 39483848  T
Q  598 atgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    |||||||| ||  | || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39483847 atgattggtgagttaggaattactcaagaatgtgtgaagatacattgtgat 39483797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 564 - 599
Target Start/End: Original strand, 30478007 - 30478042
Alignment:
Q  564 tgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtat 599  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30478007 tgaaggggtcaaggaagccatatggttgaaaggtat 30478042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 607; Significance: 0; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 607; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 648
Target Start/End: Original strand, 9525181 - 9525819
Alignment:
Q  10 atggacatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaag 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9525181 atggatatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggttcagaatgaaagattctaaag 9525280  T
Q  110 tcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaag 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9525281 tcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaagcagtgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaag 9525380  T
Q  210 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtg 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9525381 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtg 9525480  T
Q  310 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagg 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9525481 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgaaaggtggtctaaggtatacaaggtcacaaccaggtagggatgctttggagg 9525580  T
Q  410 gatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaa 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9525581 gatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaa 9525680  T
Q  510 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaa 609  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9525681 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagaatacatagcccttgttgaaggggtcaaggaagccatatggttgaaaggtatgattggagaa 9525780  T
Q  610 atggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9525781 atggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 9525819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 195 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 2394562 - 2394109
Alignment:
Q  195 tactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggca 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2394562 tactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctatgcaataagtgtgataagtcggtttatggca 2394463  T
Q  295 aatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggta 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |    
T  2394462 aatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgaaaggtggtctaaagtatacaaggtcacaaccaggaa 2394363  T
Q  395 gggatgctttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggt 494  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  2394362 gggatgttttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaatgtagacactagaaaatctttgtcaggatttgtgtttacattgttcggtacagtagt 2394263  T
Q  495 aacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaa 594  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2394262 aacttggaaggaaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaagccatatggttgaaa 2394163  T
Q  595 ggtatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2394162 ggtatgattggagaaatggggattagtcaagggtgtgtgaagatacattgtgat 2394109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 2395997 - 2395808
Alignment:
Q  10 atggacatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaag 109  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2395997 atggatatcatgagggatcgaaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttaaggaaagtggtggagcggttcagaatgaaagattctaaag 2395898  T
Q  110 tcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactc 199  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2395897 tcgttggcactcctcttggtcatcacacaaagctatcaataaagcagtgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactc 2395808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 46 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 41392085 - 41391483
Alignment:
Q  46 ttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaagtcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctat 145  Q
    ||||||||||| |  || || |||| ||| ||||||||||| |||||||||  | | ||||||  ||| ||||||||  | ||||||||||| ||| | |    
T  41392085 ttcttatctcaacttggttatttgaagaaggtggtggagcgttttagaatgtcaaactctaaaaccgtgagcactcccttgggtcaccacacaaagttgt 41391986  T
Q  146 ctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaa--gatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgt 243  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| || |||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41391985 ccatacaacaatgtcctcaatccgaggatgagaa--gcaattgatggaaggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggaatggtttgt 41391888  T
Q  244 agtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtgggttctgagatatt 343  Q
    ||||||||| ||||| | || ||  | ||  |  | |||||||||||||||||||||||    || || ||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  41391887 agtagaccgaacttagcttatgcggttagcattgtgagtcggtttatggcaaatccgggaattgtccattggcaagctttgaagtgggtattgaggtatt 41391788  T
Q  344 tgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtaga 443  Q
    ||||||| || ||||  || ||| | | ||| |||||| ||   | || |   || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||    
T  41391787 tgaatgggtcgttgaagggcggtttgaagtacacaagggcaactcaagatgaagacgctttggaggggtatgttgatgcggattatgcgggcaacgtgga 41391688  T
Q  444 cactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaa 543  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||||||||   | |  || ||  |  | | ||||||||||||||||||||| || || ||  | || || ||||||    
T  41391687 caccagaaaatccttgtcgggttttgtgtttattctttatggcacgactattagttggaaggcaaatcaacaatccgtggtggcattatctactactcaa 41391588  T
Q  544 gcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacatt 643  Q
    || |||||||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||  | || |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  41391587 gcggagtacatcgcacttgttgaaggtgtgaaggaggccatatggttgaaagggatgattggtgagttaggaattactcaagaatgtgtgaagatacatt 41391488  T
Q  644 gtgat 648  Q
    |||||    
T  41391487 gtgat 41391483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 130 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 13599792 - 13599274
Alignment:
Q  130 caccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaa--gatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcat 227  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13599792 caccacacaaagttgtccataaaacaatgtcctcaatccgaggatgagaa--gcaattgatgaaaggtactccctatgcaagtggggttggaagcataat 13599695  T
Q  228 gtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaag 327  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||  | ||  |  | |||||||||||| | |||||||||   ||||| |||||||||||||||    
T  13599694 gtatggaatggtttgtagtagaccggacttagcttatgcggttagcattgtgagtcggtttatgccgaatccgggtattgtgcattggcaagctttgaag 13599595  T
Q  328 tgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggact 427  Q
    |||||  |||| ||||||||||| |||||||  || ||| | | ||| |||||  ||   | ||     ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||    
T  13599594 tgggtgttgaggtatttgaatggctctttgaagggcggtttgaagtacacaagagcagctcaagaggaagatgccttggaggggtatgttgatgcagact 13599495  T
Q  428 atgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagc 527  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||  | |  || ||  |  | | ||||||||||||||||||||| || || ||    
T  13599494 atgcgggtaatgtggacacaagaaaatctttatcgggttttgtgtttactctatatggcacgactattagttggaaggcaaatcaacaatccgtggtggc 13599395  T
Q  528 tctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaagga 627  Q
      | |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||||||||||||||| ||  | || |||| ||||| |    
T  13599394 attatcaacaactcaagcggagtccattgcccttgttgaaggggtgaaataggccatatggttgaaaggtatgattggtgagttaggaattactcaagaa 13599295  T
Q  628 tgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  13599294 tgtgtgaagatacattgtgat 13599274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 186 - 648
Target Start/End: Original strand, 19360152 - 19360614
Alignment:
Q  186 gatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcgg 285  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||  | ||  |  | ||||||    
T  19360152 gatggaaggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggaatggtttgtagtagaccggacttagcttatgcggttagcattgttagtcgg 19360251  T
Q  286 tttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcat 385  Q
    ||||||| ||||  ||||   ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||  || ||| | | ||| |||||  ||     
T  19360252 tttatggtaaatttgggtattgtgcattggcaagctttgaagtgggtattgaggtatttgaatgggtctttgaagggcggtttgaagtacacaagagcag 19360351  T
Q  386 aaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcgg 485  Q
      | ||     ||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||||||||||||| || |   |||||||||||||  | |  ||    
T  19360352 ctcaagaggaagattctttggaggggtatgttgatgcagactatgcgggcaatgtggacactagaaaatccttattgagttttgtgtttactctttatgg 19360451  T
Q  486 tacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcata 585  Q
     || ||  | | ||||||||||||||||||||| || || ||  | || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||    
T  19360452 cacggctattagttggaaggcaaatcaacaatccgtggtggcattatctaccactcaagcggagtacattgcccttgttgaaggggtgaaagatgccata 19360551  T
Q  586 tggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    ||||||||||| |||||||  ||  | || |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19360552 tggttgaaagggatgattgttgagttaggaattactcaagaatgtgcgaagatacattgtgat 19360614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 648
Target Start/End: Original strand, 47702511 - 47703092
Alignment:
Q  67 ttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaagtcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaat 166  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||||    | ||||||  ||| ||||||||  | || |||||||| ||| | || |||||||||||||||||||    
T  47702511 ttgaagaaggtggtggagcgttttagaatgtctaactctaaaaccgtgagcactcccttggggcaccacacaaagttgtccataaaacaatgtcctcaat 47702610  T
Q  167 ccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgc 266  Q
    || | || |||||      |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| | || ||    
T  47702611 ccaaggatgagaatcaattgatgaaaggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggaatggtttgtagtaggtcggacttagcttatgc 47702710  T
Q  267 aatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggt 366  Q
      | ||  |  | | |||||||||||||||| |||||   ||||| || |||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||| ||  || |||    
T  47702711 ggttagcattgtcattcggtttatggcaaattcgggtattgtgcattgacaagctttgaagtgggtgttgaggtatttgaatgggtcttcgaagggcggt 47702810  T
Q  367 ctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggtt 466  Q
     | | ||| |||||  ||   | ||     ||  |||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||| | || ||||    
T  47702811 ttgaagtacacaagagcagctcaagaggaagacactttggaggggtatgttgatgcggactatgcgggcaatgtggacacaagaaaatctctatcgggtt 47702910  T
Q  467 ttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttga 566  Q
    ||||||||||  | |  || ||  |  | | || |||||| ||||||||||| || || ||  | |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  47702911 ttgtgtttactctctatggcacgactattagtttgaaggctaatcaacaatccgtggtggcattatcaacaactcaagcagagtatattgctcttgttga 47703010  T
Q  567 aggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    |||||| || || | |||||||||||||| ||||||||| |   | || |||  ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  47703011 aggggtgaaagaggccatatggttgaaagatatgattggtgtgttaggaattgctcaaaaatgtgtgaagatacattgtgat 47703092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 67 - 258
Target Start/End: Original strand, 47101482 - 47101673
Alignment:
Q  67 ttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaagtcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaat 166  Q
    |||| ||| ||||||||||  |||||||||  | | ||||||| ||| ||||||||  | || |||||||| ||| | || | |||||||||||||||||    
T  47101482 ttgaagaaggtggtggagcattttagaatgtcaaactctaaagccgtgagcactcccttggggcaccacacaaagttgtccacaaaacaatgtcctcaat 47101581  T
Q  167 ccgatgaagagaaaagcaa--gatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggactta 258  Q
    |||| ||  ||||  ||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  47101582 ccgaggataagaa--gcaattgagggaaggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggaatggtttgtagtagaccgaactta 47101673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 575; Significance: 0; HSPs: 12)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 575; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 648
Target Start/End: Original strand, 25451210 - 25451848
Alignment:
Q  10 atggacatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaag 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25451210 atggatatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggttcagaatgaaagattctaaag 25451309  T
Q  110 tcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaag 209  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25451310 tcattagcactccttttggtcaccacactatgctatctataaagcagtgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaag 25451409  T
Q  210 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtg 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25451410 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagactggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagta 25451509  T
Q  310 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagg 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  25451510 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgaaaggtggtctaaggtatacaaggtcacaaccacgtagggatgctttggagg 25451609  T
Q  410 gatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaa 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25451610 gatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaa 25451709  T
Q  510 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaa 609  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  25451710 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaagccatatgattgaaaggtatgattggagaa 25451809  T
Q  610 atggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  25451810 atggggattagtcaagggtgtttgaagatacattgtgat 25451848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 46 - 648
Target Start/End: Original strand, 37560047 - 37560649
Alignment:
Q  46 ttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaagtcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctat 145  Q
    ||||||||||| |  || || |||| ||| |||||||||||||||||||||  | | ||||||  ||| ||||||||  | ||||||||||| ||| | |    
T  37560047 ttcttatctcaacttggttatttgaagaaggtggtggagcggtttagaatgtcaaactctaaaaccgtgagcactcccttgggtcaccacacaaagttgt 37560146  T
Q  146 ctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaa--gatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgt 243  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| || |||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37560147 ccatacaacaatgtcctcaatccgaggatgagaa--gcaattgatggaaggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggaatggtttgt 37560244  T
Q  244 agtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtgggttctgagatatt 343  Q
    ||||| ||||||||  | || ||| | ||  |  | |||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  37560245 agtaggccggacttggcttatgcagttagcattgtgagtcggtttatggcaaatccgggaattgtgcattggcaagctttgaagtgggttttgaggtatt 37560344  T
Q  344 tgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtaga 443  Q
    ||||||| || ||||  || ||| | | ||| |||||| ||   | || |   || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||    
T  37560345 tgaatgggtcgttgaagggcggtttgaagtacacaagggcagctcaagatgaagacgctttggaggggtatgttgatgcggattatgcgggcaacgtgga 37560444  T
Q  444 cactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaa 543  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | |  || ||  || | | ||||||||||||||||||||| || || ||  | || |||||||||    
T  37560445 cactagaaaatccttgtcgggttttgtgtttactctttatggcacgacgattagttggaaggcaaatcaacaatccgtggtggcattatctacaactcaa 37560544  T
Q  544 gcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacatt 643  Q
    || |||||||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||  | || |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  37560545 gcggagtacattgcacttgttgaaggtgtgaaggaggccatatggttgaaagggatgattggtgagttaggaattactcaagaatgtgtgaagatacatt 37560644  T
Q  644 gtgat 648  Q
    |||||    
T  37560645 gtgat 37560649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 46 - 648
Target Start/End: Original strand, 28806176 - 28806778
Alignment:
Q  46 ttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaagtcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctat 145  Q
    ||||||||||| |  || || |||| ||| |||||||||||||||||||||  | | ||||||  ||| ||||||||  | ||||||||||| ||| | |    
T  28806176 ttcttatctcaacttggttatttgaagaaggtggtggagcggtttagaatgtcaaactctaaaaccgtgagcactcccttgggtcaccacacaaagttgt 28806275  T
Q  146 ctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaa--gatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgt 243  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| || |||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28806276 ccatacaacaatgtcctcaatccgaggatgagaa--gcaattgatggaaggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggaatggtttgt 28806373  T
Q  244 agtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtgggttctgagatatt 343  Q
    ||||| ||||||||  | || ||  | ||  |  | |||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  28806374 agtaggccggacttggcttatgcggttagcattgtgagtcggtttatggcaaatccgggaattgtgcattggcaagctttgaagtgggttttgaggtatt 28806473  T
Q  344 tgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtaga 443  Q
    ||||||| || ||||  || ||| | | ||| |||||| ||   | || |   |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || || ||    
T  28806474 tgaatgggtcgttgaagggcggtttgaagtacacaagggcagctcaagatgaagatgctttggaggggtatgttgatgcggattatgcgggcaatgtgga 28806573  T
Q  444 cactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaa 543  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | |  || || ||| | | ||||||||||||||||||||| || || ||  | || |||||||||    
T  28806574 cactagaaaatccttgtcgggttttgtgtttactctctatggcacggcgattagttggaaggcaaatcaacaatccgtggtggcattatctacaactcaa 28806673  T
Q  544 gcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacatt 643  Q
    || ||||| || || ||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||  | || |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28806674 gcggagtatatcgcacttgttgaaggtgtgaaggaggccatatggttgaaagggatgattggtgagttaggaattactcaagaatgtgtgaagatacatt 28806773  T
Q  644 gtgat 648  Q
    |||||    
T  28806774 gtgat 28806778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 46 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 33769672 - 33769070
Alignment:
Q  46 ttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaagtcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctat 145  Q
    ||||||||||| |  || || |||| ||| |||||||||||||||||||||  | | ||||||  ||| ||||||||  | ||||||||||| ||| | |    
T  33769672 ttcttatctcaacttggttatttgaagaaggtggtggagcggtttagaatgtcaaactctaaaaccgtaagcactcccttgggtcaccacacaaagttgt 33769573  T
Q  146 ctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaa--gatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgt 243  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| || |||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33769572 ccatacaacaatgtcctcaatccgaggatgagaa--gcaattgatggaaggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggaatggtttgt 33769475  T
Q  244 agtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtgggttctgagatatt 343  Q
    ||||| ||||||||  | || ||  | ||  |  | |||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  33769474 agtaggccggacttggcttatgcggttagcattgtgagtcggtttatggcaaatccgggaattgtgcattggcaagctttgaagtgggttttgaggtatt 33769375  T
Q  344 tgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtaga 443  Q
    ||||||| || ||||  || ||| | | ||| |||||| ||   | || |   || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||    
T  33769374 tgaatgggtcgttgaagggcggtttgaagtacacaagggcagctcaagatgaagacgctttggaggggtatgttgatgcggattatgcgggcaacgtgga 33769275  T
Q  444 cactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaa 543  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | |  || || ||| | | ||||||||||||||||||||| || || ||  | || |||||||||    
T  33769274 cactagcaaatccttgtcgggttttgtgtttactctttatggcacggcgattagttggaaggcaaatcaacaatccgtggtggcattatctacaactcaa 33769175  T
Q  544 gcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacatt 643  Q
    || ||||||||  | ||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||  | || |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  33769174 gcggagtacatcacacttgttgaaggtgtgaaggaggccatatggttgaaagggatgattggtgagttaggaattactcaagaatgtgtgaagatacatt 33769075  T
Q  644 gtgat 648  Q
    |||||    
T  33769074 gtgat 33769070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 46 - 648
Target Start/End: Original strand, 31400446 - 31401048
Alignment:
Q  46 ttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaagtcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctat 145  Q
    ||||||||||| |  || || |||| ||| ||||||||||| |||||||||  | | ||||||   || ||||||||  | ||||||||||| ||| | |    
T  31400446 ttcttatctcaacttggttatttgaagaaggtggtggagcgttttagaatgtcaaactctaaaactgtgagcactcccttgggtcaccacacaaagttgt 31400545  T
Q  146 ctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtag 245  Q
    | ||||||||||||||||||||||| || |||||      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31400546 ccataaaacaatgtcctcaatccgaggatgagaagcatttgatggaaggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggaatggtttgtag 31400645  T
Q  246 tagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttg 345  Q
    ||| ||||||||  | || ||  | ||  |  | |||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  31400646 taggccggacttggcttatgcggttagcattgtgagtcggtttatggcaaatccgggaattgtgcattggcaagctttgaagtgggttttgaggtatttg 31400745  T
Q  346 aatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagaca 445  Q
    ||||  || ||||  || ||| | | ||| |||||| ||   | || |   || ||||||||||| ||||  |||||||| ||||| || ||||||||||    
T  31400746 aatgtgtcgttgaagggcggtttgaagtacacaagggcagctcaagatgaagacgctttggaggggtatgctgatgcggattatgcgggcaacgtagaca 31400845  T
Q  446 ctagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagc 545  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||  | |  || || ||| | | ||||||||||||||||||||| || || ||  | || |||||||||||    
T  31400846 ctagaaaatccttgtcgggttttgtgtttactctttatggcacggcgattagttggaaggcaaatcaacaatctgtggtggcattatctacaactcaagc 31400945  T
Q  546 agagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgt 645  Q
     |||||||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||  | || |||| ||||| |||||||| ||| ||||||    
T  31400946 ggagtacatcgcacttgttgaaggtgtgaaggaggccatatggttgaaagggatgattggtgagttaggaattactcaagaatgtgtgaggatgcattgt 31401045  T
Q  646 gat 648  Q
    |||    
T  31401046 gat 31401048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 67 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 43593733 - 43593152
Alignment:
Q  67 ttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaagtcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaat 166  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||||  | | ||||||  ||| ||||||||  | || |||||||| ||| | || ||| |||||||||||||||    
T  43593733 ttgaagaaggtggtggagcgttttagaatgtcaaactctaaaaccgtgagcactcccttggggcaccacacaaagttgtccatacaacaatgtcctcaat 43593634  T
Q  167 ccgatgaagagaaaagcaa--gatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctac 264  Q
    |||| || |||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| | ||     
T  43593633 ccgaggatgagaa--gcaattgatggaaggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggaatggtttgtagtaggccagacttagcttat 43593536  T
Q  265 gcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtg 364  Q
    ||  | ||  |  | |||||||||||||| || |||||    ||||| |||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||  || |    
T  43593535 gcggttagcattgtgagtcggtttatggcgaacccgggaattgtgcattggcaagccttgaagtgggtattgaggtatttgaatgggtcgttgaagggcg 43593436  T
Q  365 gtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcagg 464  Q
    || | | ||| |||||| ||   | || |   || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||||| || || ||    
T  43593435 gtttgaagtacacaagggcagctcaagatgaagacgctttggaggggtatgttgatgcggattatgcgggcaatgtggacactagaaaatccttatcggg 43593336  T
Q  465 ttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgtt 564  Q
    ||||||||||||  | |  || || ||  | | ||||||||||||||||||||| || || ||  | || ||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  43593335 ttttgtgtttactctttatggcacggctattagttggaaggcaaatcaacaatccgtggtggcattatctacaactcaagcggagtacatcgcacttgtt 43593236  T
Q  565 gaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    ||||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||  | || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43593235 gaaggtgtgaaggaggccatatggttgaaagggatgattggtgagttaggaattactcaagaatgtgtgaagatacattgtgat 43593152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 67 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 43626527 - 43625946
Alignment:
Q  67 ttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaagtcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaat 166  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||||  | | ||||||  ||| ||||||||  | || |||||||| ||| | || ||| |||||||||||||||    
T  43626527 ttgaagaaggtggtggagcgttttagaatgtcaaactctaaaaccgtgagcactcccttggggcaccacacaaagttgtccatacaacaatgtcctcaat 43626428  T
Q  167 ccgatgaagagaaaagcaa--gatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctac 264  Q
    |||| || |||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| | ||     
T  43626427 ccgaggatgagaa--gcaattgatggaaggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggaatggtttgtagtaggccagacttagcttat 43626330  T
Q  265 gcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtg 364  Q
    ||  | ||  |  | |||||||||||||| || |||||    ||||| |||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||  || |    
T  43626329 gcggttagcattgtgagtcggtttatggcgaacccgggaattgtgcattggcaagccttgaagtgggtattgaggtatttgaatgggtcgttgaagggcg 43626230  T
Q  365 gtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcagg 464  Q
    || | | ||| |||||| ||   | || |   || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||||| || || ||    
T  43626229 gtttgaagtacacaagggcagctcaagatgaagacgctttggaggggtatgttgatgcggattatgcgggcaatgtggacactagaaaatccttatcggg 43626130  T
Q  465 ttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgtt 564  Q
    ||||||||||||  | |  || || ||  | | ||||||||||||||||||||| || || ||  | || ||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  43626129 ttttgtgtttactctttatggcacggctattagttggaaggcaaatcaacaatccgtggtggcattatctacaactcaagcggagtacatcgcacttgtt 43626030  T
Q  565 gaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    ||||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||  | || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43626029 gaaggtgtgaaggaggccatatggttgaaagggatgattggtgagttaggaattactcaagaatgtgtgaagatacattgtgat 43625946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 67 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 27446435 - 27445863
Alignment:
Q  67 ttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaagtcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaat 166  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||||  | | ||||||  ||| ||||||||  | || |||||||| ||| | || ||| |||||||||||||||    
T  27446435 ttgaagaaggtggtggagcgttttagaatgtcaaactctaaaaccgtgagcactcccttggggcaccacacaaagttgtccatacaacaatgtcctcaat 27446336  T
Q  167 ccgatgaagagaaaagcaa--gatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctac 264  Q
    |||| || |||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||     
T  27446335 ccgaggatgagaa--gcaattgatggaaggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggaatggtttgtagtaggccggacttagcttat 27446238  T
Q  265 gcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtg 364  Q
    ||  | ||  |  | |||||||||||||| || |||||    ||||| |||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||  || |    
T  27446237 gcggttagcattgtgagtcggtttatggcgaacccgggaattgtgcattggcaagccttgaagtgggtattgaggtatttgaatgggtcgttgaagggcg 27446138  T
Q  365 gtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcagg 464  Q
    || | | ||| |||||| ||   | || |   || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||||| || || ||    
T  27446137 gtttgaagtacacaagggcagctcaagatgaagacgctttggaggggtatgttgatgcggattatgctggcaatgtggacactagaaaatccttatcggg 27446038  T
Q  465 ttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgtt 564  Q
    ||||||||||||  | |  || || ||  | | ||||||||||||||||||||| || || ||  | || ||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  27446037 ttttgtgtttactctttatggcacggctattagttggaaggcaaatcaacaatccgtggtggcattatctacaactcaagcggagtacatcgcacttgtt 27445938  T
Q  565 gaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagata 639  Q
    ||||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||  | || |||| ||||| |||||||||||||    
T  27445937 gaaggtgtgaaggaggccatatggttgaaagggatgattggtgagttaggaattactcaagaatgtgtgaagata 27445863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 130 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 28833608 - 28833090
Alignment:
Q  130 caccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaa--gatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcat 227  Q
    |||||||| ||| | || |||||||||||||||| ||| || || |||||  ||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28833608 caccacacaaagttgtccataaaacaatgtcctcgatctgaggatgagaa--gcaattgatggaaggtactctctatgcaagtggggttggaagcatcat 28833511  T
Q  228 gtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaag 327  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||  | ||  |  | ||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||    
T  28833510 gtatggaatggtttgtagtagaccggacttagcttatgcggttagcattgtgagtcggtttatggcaaatccgggtattgtgcattggcaagctttgaag 28833411  T
Q  328 tgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggact 427  Q
    |||||  |||| |||||||||||||||||||  || ||| | | ||| |||||  ||   | || |   ||  |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  28833410 tgggtgttgaggtatttgaatggatctttgaagggcggtttgaagtacacaagagcagctcaagatgaagacactttggaggggtatgtagatgcggact 28833311  T
Q  428 atgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagc 527  Q
    |||| || || || ||||| |||||||| || |   |||||||||||||  | |  || || ||  | | ||||||||||||||||||||| || ||  |    
T  28833310 atgcgggcaatgtggacacaagaaaatccttattgagttttgtgtttactctttatggaacggctattagttggaaggcaaatcaacaatccgtggtgac 28833211  T
Q  528 tctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaagga 627  Q
      | || || |||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || | ||| ||||||||||| |||||||| ||  | || |||| ||||| |    
T  28833210 attatctaccactcaagcggagtacattgcacttgttgaaggagtgaaagaggccatgtggttgaaaggaatgattggtgagttaggaattactcaagaa 28833111  T
Q  628 tgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  28833110 tgtgtgaagatacattgtgat 28833090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 543 - 648
Target Start/End: Original strand, 40222012 - 40222117
Alignment:
Q  543 agcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacat 642  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40222012 agcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaagccatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaagggtgtgtgaagatacat 40222111  T
Q  643 tgtgat 648  Q
    ||||||    
T  40222112 tgtgat 40222117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 532 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 19589448 - 19589332
Alignment:
Q  532 tcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtg 631  Q
    |||||||||||||  | ||||||  |||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||| ||  | || |||| ||||| |||||    
T  19589448 tcaacaactcaaggggcgtacatttcccttgttgaaggggtgaaagaggccatatggttgaaaggtatgattggtgagttaggaattactcaagaatgtg 19589349  T
Q  632 tgaagatacattgtgat 648  Q
    |||||||||||||||||    
T  19589348 tgaagatacattgtgat 19589332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 535 - 605
Target Start/End: Original strand, 22828375 - 22828441
Alignment:
Q  535 acaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattgg 605  Q
    |||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22828375 acaactcaagaagcgtacattgcccttcttgaaggggt----gaagccatatggttgaaaggtatgattgg 22828441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1764 (Bit Score: 551; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold1764
Description:

Target: scaffold1764; HSP #1
Raw Score: 551; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 648
Target Start/End: Original strand, 172 - 810
Alignment:
Q  10 atggacatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaag 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  172 atggatatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggttcagaatgaaagattctaaag 271  T
Q  110 tcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaag 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  272 tcgttagcactcctcttggtcaccacacaaagctatctataaagcagtgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatgaagggtactccctatacaag 371  T
Q  210 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtg 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  372 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaattagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgagtcaagta 471  T
Q  310 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagg 409  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  472 cactaacaagctttgaagtgggttatgagatatttgaatggatcattgaaaggtggtctaaagtatacaaggtcacaaccaggtagggatgctttggagg 571  T
Q  410 gatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaa 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  572 gatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaa 671  T
Q  510 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaa 609  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  672 tcaacaatcagttgtagccctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaagggtcaaggaagccatatggttgaaaggtatgattggaaaa 771  T
Q  610 atggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  772 atggggattagtcaagggtgtgtgaagatacattgtgat 810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 471; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 471; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 648
Target Start/End: Original strand, 4568808 - 4569434
Alignment:
Q  22 agggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaagtcgttagcactc 121  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4568808 agggaccgaaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggttcagaatgaaagattctaaagtcgttggcactc 4568907  T
Q  122 ctcttggtcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaagtggggttggaag 221  Q
    ||| |||||| ||||| ||| | || ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4568908 ctcctggtcatcacacaaagttttcaataaagcagtgttctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggatggtactccctatgcaagtggggttggaag 4569007  T
Q  222 catcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagct 321  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  4569008 catcatgtatggtatgatttgtagtagaccggacttatcctacgcaataagtgtgataagtctgtttatggaaaatccgggtcaagtgcactagtaagct 4569107  T
Q  322 ttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatg 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  4569108 ttgaagtgggttctgagatatttgaatgggtatttgaaaggtggtctaaagtatacaaggtcacaaccaggaagagatgctttggagggatatgtggatg 4569207  T
Q  422 cggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagt 521  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4569208 cggactatgcaggtaatgtagacactaggaaatctttgtcagaatttgtgtttacattgttcggtacaacagtaacttggaaggcaaatcaacaatcaat 4569307  T
Q  522 tgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagt 621  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||      
T  4569308 tgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaagtcgtatgattgaaaggtatgattggagaaatggggattaaa 4569407  T
Q  622 caaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  4569408 caagggtgtgtgaagatacattgtgat 4569434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 504
Target Start/End: Original strand, 15315770 - 15316264
Alignment:
Q  10 atggacatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaag 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15315770 atggatatcataagggaccggaacaaagttgagttgttcttatctcagtaggggtacttgaggaaagtggtggagcggttcagaatgaaagattctaaag 15315869  T
Q  110 tcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaag 209  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15315870 ttgttggcactcctcttggtcaccacacaaagctatcaataaagcagtgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaag 15315969  T
Q  210 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtg 309  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15315970 tagggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtactagaccggacttatcctacgcaattagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtg 15316069  T
Q  310 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagg 409  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15316070 cactggcaagctttaaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgaaaggtggtctaaggtatacaaggtcacaaccaggtagggatgctttggagg 15316169  T
Q  410 gatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaag 504  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  15316170 gatatgtggatgcggactgtgcaggtaatgtagacactagaaaatctttgttaggttttgtgtttacattgtttggtacaacagtaacttggaag 15316264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 648
Target Start/End: Original strand, 16637614 - 16638252
Alignment:
Q  10 atggacatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaag 109  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |    
T  16637614 atggatatcatgagggaccgaaacaaaggtgatttgttcttatctcaggaaaggtacttgaggaaagtggtggagcggttcataatgaaatattctaagg 16637713  T
Q  110 tcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaag 209  Q
    || ||  ||||||||||||||| ||||| ||| | || |||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16637714 tcattgacactcctcttggtcatcacacaaagttgtcaataaaatagtttcctcaatccgatgaagagaaaagtaagatggagggtactccctatgcaag 16637813  T
Q  210 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtg 309  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  16637814 tagggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccgaacttatcctatgcaataagtgtaataagtcgatttatggcaaattcgggtcaagtg 16637913  T
Q  310 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagg 409  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||   |||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||    
T  16637914 cactggcaagcttcgaagtgggttctgatatatttgaatgagactttgaaaggtggtctgaagtatacaaggtcacaactaagaagggatgctttggagg 16638013  T
Q  410 gatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaa 509  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  16638014 gatatgtggatgcggactatgtaggtaatgtagacactagaaaatctttgtcaggatttgtgtttacattgttctgtacatcagtaacttggaaggcaaa 16638113  T
Q  510 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaa 609  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||     
T  16638114 ccaacaatcagttgtagctctttaaacaactcaagcataatacatttcccttgttgaaggggtcaaggaagccatatgtttgaaaggtatgattggagag 16638213  T
Q  610 atggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  16638214 atgtggattagtcaagagtgtgtgaagatacattgtgat 16638252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 46 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 18857209 - 18856607
Alignment:
Q  46 ttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaagtcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctat 145  Q
    ||||||||||| |  || || |||| ||| |||||||||||||||||||||  | | ||||||  ||| ||||||||  | ||||||||||| ||| | |    
T  18857209 ttcttatctcaacttggttatttgaagaaggtggtggagcggtttagaatgtcaaactctaaaaccgtgagcactcccttgggtcaccacacaaagttgt 18857110  T
Q  146 ctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaa--gatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgt 243  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| || |||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18857109 ccatacaacaatgtcctcaatccgaggatgagaa--gcaattgatggaaggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggaatggtttgt 18857012  T
Q  244 agtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtgggttctgagatatt 343  Q
    ||||| ||||||||  | || ||  | ||  |  | |||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18857011 agtaggccggacttggcttatgcggttagcattgtgagtcggtttatggcaaatccgggaattgtgcattggcaagctttgaagtgggttttgaggtatt 18856912  T
Q  344 tgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtaga 443  Q
    ||||||| || ||||  || ||| | | ||| |||||| ||   | || |   || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||    
T  18856911 tgaatgggtcgttgaagggcggtttgaagtacacaagggcagctcaagatgaagacgctttggaggggtatgttgatgcggattatgcgggcaacgtgga 18856812  T
Q  444 cactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaa 543  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | |  || ||  |  | | ||||||||||||||||||||| || || ||  | || |||||||||    
T  18856811 cactagaaaatccttgtcgggttttgtgtttactctttatggcacgacaattagttggaaggcaaatcaacaatccgtggtggcattatctacaactcaa 18856712  T
Q  544 gcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacatt 643  Q
    || |||||||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||||| ||||| |||||||| ||  | || |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18856711 gcggagtacattgcacttgttgaaggtgtgaaggaggccatatggttaaaagggatgattggtgagttaggaattactcaagaatgtgtgaagatacatt 18856612  T
Q  644 gtgat 648  Q
    |||||    
T  18856611 gtgat 18856607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 46 - 648
Target Start/End: Original strand, 9227786 - 9228388
Alignment:
Q  46 ttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaagtcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctat 145  Q
    ||||||||||| |  || || |||| ||| ||||||||||  |||||||||  | | ||||||  ||| ||||||||  | ||||||||||| ||| | |    
T  9227786 ttcttatctcaacttggttatttgaagaaggtggtggagcattttagaatgtcaaactctaaaaccgtgagcactcccttgggtcaccacacaaagtttt 9227885  T
Q  146 ctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaa--gatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgt 243  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| || |||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  9227886 ccatacaacaatgtcctcaatccgaggatgagaa--gcaattgatggaaggtactccctatgcaagtggggttgaaagcatcatgtatggaatggtttgt 9227983  T
Q  244 agtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtgggttctgagatatt 343  Q
    ||||| ||||||||| | || ||  | ||  |  | |||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  9227984 agtaggccggacttagcttatgcggttagcattgtgagtcggtttatggcaaatccgggaattgtgcattggcaagctttgaagtgggtattgaggtatt 9228083  T
Q  344 tgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtaga 443  Q
    ||||||| || ||||  |||||| | | ||| |||||| ||   | || |   || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||    
T  9228084 tgaatgggtccttgaagggtggtttgaagtacacaagggcagctcaagatgaagacgctttggaggggtatgttgatgcggattatgcgggcaacgtgga 9228183  T
Q  444 cactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaa 543  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||  | |  || || ||  | | ||||||||||||||||||||| || || ||  | || |||||||||    
T  9228184 cactagaaaatccttatcgggttttgtgtttactctttatggcacggctattagttggaaggcaaatcaacaatctgtggtggcattatctacaactcaa 9228283  T
Q  544 gcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacatt 643  Q
    || |||||||| || ||||||||||| || ||||| |  |||||||||||||| |||||||| ||  | || |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  9228284 gcggagtacatcgcacttgttgaaggtgtgaaggaggctatatggttgaaagggatgattggtgagttaggaattactcaagaatgtgtgaagatacatt 9228383  T
Q  644 gtgat 648  Q
    |||||    
T  9228384 gtgat 9228388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 130 - 648
Target Start/End: Original strand, 16627530 - 16628048
Alignment:
Q  130 caccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaa--gatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcat 227  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||| | || |||||  ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16627530 caccacacaaagttgtccataaaacaatgtcctcaatccaaggatgagaa--gcaattgatggaaggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcat 16627627  T
Q  228 gtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaag 327  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| | || |   | ||  |  | ||||||||||||  ||||||||||   | ||| |||||||||||||||    
T  16627628 gtatggaatggtttgaagtagaccggacttagcttatgtggttagcattgtgagtcggtttatgaaaaatccgggtattgcgcattggcaagctttgaag 16627727  T
Q  328 tgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggact 427  Q
    |||||  |||| ||||||||||| |||||||  || ||| | | ||| |||||  ||   | ||     |||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  16627728 tgggtgttgaggtatttgaatgggtctttgaagggcggtttgaagtacacaagagcagctcaagaggaagatgctttggaggggtatgttgatgcagact 16627827  T
Q  428 atgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagc 527  Q
    |||| || || || ||||| ||||||||| |  | |||||| ||||| |  | |  || |  ||  | | |||||||||||||||||||||  | || ||    
T  16627828 atgcgggcaatgtggacacaagaaaatctctaccgggttttttgttttctctctatggcatggctattagttggaaggcaaatcaacaatccatggtggc 16627927  T
Q  528 tctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaagga 627  Q
      | |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || | |||||| ||||||||||||||||| ||  | || |||| ||||| |    
T  16627928 attatcaacaactcaagcggagtatattgcccttgttgaaggggtgaaagaggccatatgtttgaaaggtatgattggtgagttaggaattactcaagaa 16628027  T
Q  628 tgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  16628028 tgtatgaagatacattgtgat 16628048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 130 - 648
Target Start/End: Original strand, 3791671 - 3792189
Alignment:
Q  130 caccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaa--gatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcat 227  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  3791671 caccacacaaagttgtccataaaacaatgtcctcaatccgaggatgagaa--gcaattgatggaaggtactcc-tatgcaagtggggttggaagtatcat 3791767  T
Q  228 gtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaag 327  Q
    |||| | || ||||||||||||||||||||| | || ||  | ||  |  | ||||||||||||| |||| | |||   ||||| |||||||||||||||    
T  3791768 gtatagaatagtttgtagtagaccggacttagcttatgcggttagcattgttagtcggtttatggtaaattctggtattgtgcattggcaagctttgaag 3791867  T
Q  328 tgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggact 427  Q
    |||||  |||| ||||||||||| |||||||  || ||| | | ||| |||||  ||   | ||     || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  3791868 tgggtgttgaggtatttgaatgggtctttgaagggcggtttgaagtacacaagagcagctcaagaggaagacgctttggaggggtatgttgatgcggact 3791967  T
Q  428 atgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagc 527  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||||||| | || |||||||||| |||  | |  || ||  |  | | ||||||||| ||||||||||| || || ||    
T  3791968 atgcgggtaatgtggacacaagaaaatctctatcgggttttgtgtctactctctatggcacgactattagttggaaggctaatcaacaatctgtggtggc 3792067  T
Q  528 tctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaa-ggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaagg 626  Q
      | |||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| ||||| || || | |||||||||||||| ||||||||| ||  | || |||| |||||     
T  3792068 attatcaacaactcaagcggagtatatttcccttgttgaagggggtgaaagaggccatatggttgaaagatatgattggtgagttaggaattactcaaga 3792167  T
Q  627 atgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  3792168 atgtgtgaagatacattgtgat 3792189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 67 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 5144522 - 5144231
Alignment:
Q  67 ttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaagtcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaat 166  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||    | ||||||  ||| ||||||||  | || |||||||| ||| | || |||||||||||||||||||    
T  5144522 ttgaagaaggtggtggagcggtttagaatgtctaactctaaaaccgtgagcactcccttgggccaccacacaaagttgtccataaaacaatgtcctcaat 5144423  T
Q  167 ccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgc 266  Q
     ||| || ||||||     |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||| | || ||    
T  5144422 gcgaggatgagaaacaattgatggaaggtactccctgtgcaagtggggctggaagcatcatgtatggaaagttttgtagtagaccagacttagcttatgc 5144323  T
Q  267 aatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttga 358  Q
      | ||  |  ||||||||||||||||||||| ||||   ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||    
T  5144322 ggttagcattgtaagtcggtttatggcaaatctgggtattgtgcattggcaagctttgaagtgggtgttgaggtatttgaatgggtctttga 5144231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 576 - 648
Target Start/End: Original strand, 15316260 - 15316332
Alignment:
Q  576 ggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15316260 ggaagccatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaagggtgtgtgaagatacattgtgat 15316332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 498 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 3778612 - 3778469
Alignment:
Q  498 ttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggt 597  Q
    ||||||||||||||||||||  || || ||  | |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||       |||||||||||||||    
T  3778612 ttggaaggcaaatcaacaattcgtggtggcattatcaacaactcaatcagagtatattgcccttgttgaaggggtgaa-------atatggttgaaaggt 3778520  T
Q  598 atgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    |||||||| ||  | || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3778519 atgattggtgagttaggaattactcaagaatgtgtgaagatacattgtgat 3778469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 11022245 - 11022171
Alignment:
Q  184 aagatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggactta 258  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||  || ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||    
T  11022245 aagatggagggtacaccatatgcaagtgtcgtaggaagcaccatgtatgatatggtttgttgtagatcagactta 11022171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 468; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 468; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 605
Target Start/End: Original strand, 511 - 1105
Alignment:
Q  10 atggacatcataagggaccggaacaaaggtgagttgttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaag 109  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  511 atggatatcatgagggatcgaaacaaaggtgaggttttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggttcagaatgaaagattctaaag 610  T
Q  110 tcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaagatggagggtactccctatgcaag 209  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  611 tcgctggcactcctcttggtcatcacacaaagctatcaataaagcagtgtcctcaatccgatgaagagaaaaataagatggagggtactccctatgcaag 710  T
Q  210 tggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtg 309  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  711 tggggttggaagcatcatatatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaattagtgtgagaagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtt 810  T
Q  310 cactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagg 409  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |    
T  811 -actggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttgaaaggtggtctaaggtatacaaggtcacaaccaggaagggatgctttggaag 909  T
Q  410 gatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaa 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  910 gatatgtggatgcggactatgcaggtaatgtagacactaggaaatctttgtcaggttttgtgcttacattgttcggtacagcagtaacttggaaggcaaa 1009  T
Q  510 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattgg 605  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1010 tcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaagcggtcaaggaagccatatggttgaaaggtatgattgg 1105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 163; Significance: 1e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 46 - 648
Target Start/End: Original strand, 17763 - 18365
Alignment:
Q  46 ttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaagtcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctat 145  Q
    ||||||||||| |  || || |||| ||| |||||||||||||||||||||  | | ||||||  ||| ||||||||  | ||||||||||| ||| | |    
T  17763 ttcttatctcaacttggttatttgaagaaggtggtggagcggtttagaatgtcaaactctaaaaccgtgagcactcccttgggtcaccacacaaagttgt 17862  T
Q  146 ctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaa--gatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgt 243  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| || |||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17863 ccatacaacaatgtcctcaatccgaggatgagaa--gcaattgatggaaggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggaatggtttgt 17960  T
Q  244 agtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtgggttctgagatatt 343  Q
    ||||| ||||||||  | || ||  | ||  |  | |||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  17961 agtaggccggacttggcttatgcggttagcattgtgagtcggtttatggcaaatccgggaattgtgcattggcaagctttgaagtgggttttgaggtatt 18060  T
Q  344 tgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtaga 443  Q
    ||||||| || ||||  || ||| | | ||| |||||| ||   | || |   || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||    
T  18061 tgaatgggtcgttgaagggcggtttgaagtacacaagggcagctcaagatgaagacgctttggaggggtatgttgatgcggattatgcgggcaacgtgga 18160  T
Q  444 cactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaa 543  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | |  || || ||| | | ||||||||||||||||||||| || || ||  | || |||||||||    
T  18161 cactagaaaatccttgtcgggttttgtgtttactctttatggcacggcgattagttggaaggcaaatcaacaatccgtggtggcattatctacaactcaa 18260  T
Q  544 gcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacatt 643  Q
    || |||||||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||  | || |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18261 gcggagtacatcgcacttgttgaaggtgtgaaggaggccatatggttgaaagggatgattggtgagttaggaattactcaagaatgtgtgaagatacatt 18360  T
Q  644 gtgat 648  Q
    |||||    
T  18361 gtgat 18365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 46 - 648
Target Start/End: Original strand, 12884 - 13486
Alignment:
Q  46 ttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaagtcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctat 145  Q
    ||||||||||| |  || || |||| ||| ||||||||| | |||||||||  | | ||||||  ||| ||||||||  | ||||||||||| ||| | |    
T  12884 ttcttatctcaacttggatatttgaagaaggtggtggagagatttagaatgtcaaactctaaaaccgtgagcactcccttgggtcaccacacaaagttgt 12983  T
Q  146 ctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaa--gatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgt 243  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| || |||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12984 ccatacaacaatgtcctcaatccgaggatgagaa--gcaattgatggaaggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggaatggtttgt 13081  T
Q  244 agtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtgggttctgagatatt 343  Q
    ||||| ||||||||  | || ||  | ||  |  | |||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  13082 agtaggccggacttggcttatgcggttagcattgtgagtcggtttatggcaaatccgggaattgtgcattggcaagctttgaagtgggttttgaggtatt 13181  T
Q  344 tgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtaga 443  Q
    ||||||| || ||||  || ||| | | ||| |||||| ||   | || |   || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||    
T  13182 tgaatgggtcgttgaagggcggtttgaagtacacaagggcagctcaagatgaagacgctttggaggggtatgttgatgcggattatgcgggcaacgtgga 13281  T
Q  444 cactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaa 543  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | |  || || ||| | | ||||||||||||||||||||| || || ||  | || |||||||||    
T  13282 cactagaaaatccttgtcgggttttgtgtttactctttatggcacggcgattagttggaaggcaaatcaacaatccgtggtggcattatctacaactcaa 13381  T
Q  544 gcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacatt 643  Q
    || |||||||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||  | || |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  13382 gcggagtacatcgcacttgttgaaggtgtgaaggaggccatatggttgaaagggatgattggtgagttaggaattactcaagaatgtgtgaagatacatt 13481  T
Q  644 gtgat 648  Q
    |||||    
T  13482 gtgat 13486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 155; Significance: 6e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 46 - 648
Target Start/End: Original strand, 839 - 1441
Alignment:
Q  46 ttcttatctcagcaggggtacttgaggaaagtggtggagcggtttagaatgaaagattctaaagtcgttagcactcctcttggtcaccacactaagctat 145  Q
    ||||||||||| |  || || |||| ||| |||||||||||||||||||||  | | ||||||  ||| ||||||||  | ||||||||||| ||| | |    
T  839 ttcttatctcaactcggttatttgaagaaggtggtggagcggtttagaatgtcaaactctaaaaccgtaagcactcccttgggtcaccacacaaagttgt 938  T
Q  146 ctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaa--gatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggtatggtttgt 243  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| || |||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  939 ccatacaacaatgtcctcaatccgaggatgagaa--gcaattgatggaaggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcatgtatggaatggtttgt 1036  T
Q  244 agtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaagtgggttctgagatatt 343  Q
    ||||| ||||||||  | || ||  | ||  |  | |||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  1037 agtaggccggacttggcttatgcggttagcattgtgagtcggtttatggcaaatccgggaattgtgcattggcaagctttgaagtgggttttgaggtatt 1136  T
Q  344 tgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtaga 443  Q
    ||||||| || ||||  || ||| | | ||| |||||| ||   | || |   || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||    
T  1137 tgaatgggtcgttgaagggcggtttgaagtacacaagggcagctcaagatgaagacgctttggaggggtatgttgatgcggattatgcgggcaacgtgga 1236  T
Q  444 cactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaa 543  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | |  || || ||  | | ||||||||||||||||||||| || || ||  | || |||||||||    
T  1237 cactaggaaatccttgtcgggttttgtgtttacactttatggcacggctattagttggaaggcaaatcaacaatccgtggtggcattatccacaactcaa 1336  T
Q  544 gcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacatt 643  Q
    || |||||||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||  | || |||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  1337 gcggagtacatcgcacttgttgaaggtgtgaaggaggccatatggttgaaagggatgattggtgagttaggaattactcaagaatgtgtgaggatacatt 1436  T
Q  644 gtgat 648  Q
    |||||    
T  1437 gtgat 1441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 130 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 7589 - 7071
Alignment:
Q  130 caccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaa--gatggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcatcat 227  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7589 caccacacaaagttgtccataaaacaatgtcctcaatccgaggatgagaa--gcaattgatgaaaggtactccctatgcaagtggggttggaagcataat 7492  T
Q  228 gtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttgaag 327  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||  | ||  |  | |||||||||||| | |||||||||   ||||| |||||||||||||||    
T  7491 gtatggaatggtttgtagtagaccggacttagcttatgcggttagcattgtgagtcggtttatgccgaatccgggtattgtgcattggcaagctttgaag 7392  T
Q  328 tgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcggact 427  Q
    |||||  |||| ||||||||||| |||||||  || ||| | | ||| |||||  ||   | ||     ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||    
T  7391 tgggtgttgaggtatttgaatggctctttgaagggcggtttgaagtacacaagagcagctcaagaggaagatgccttggaggggtatgttgatgcagact 7292  T
Q  428 atgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagc 527  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||  | |  || ||  |  | | ||||||||||||||||||||| || || ||    
T  7291 atgcgggtaatgtggacacaagaaaatctttatcgggttttgtgtttactctatatggcacgactattagttggaaggcaaatcaacaatccgtggtggc 7192  T
Q  528 tctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaagga 627  Q
      | |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| || ||  |   ||||||||||||||| |||||||| ||  | || |||| ||||| |    
T  7191 attatcaacaactcaagcggagtacaaagcacttgttgaaggagtgaaaaagaccatatggttgaaaggaatgattggtgagttaggaattactcaagaa 7092  T
Q  628 tgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  7091 tgtgtgaagatacattgtgat 7071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 397 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 6810 - 6559
Alignment:
Q  397 gatgctttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaa 496  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||  | |  || ||  |  | |    
T  6810 gatgccttggaggggtatgttgatgcagactatgcgggtaatgtggacacaagaaaatctttatcgggttttgtgtttactctatatggcacgactatta 6711  T
Q  497 cttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaagg 596  Q
     ||||||||||||||||||||| || || ||  | |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| || ||  |   |||||||||||||||    
T  6710 gttggaaggcaaatcaacaatccgtggtggcattatcaacaactcaagcggagtacaaagcacttgttgaaggagtgaaaaagaccatatggttgaaagg 6611  T
Q  597 tatgattggagaaatggggattagtcaaggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
     |||||||| ||  | || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6610 aatgattggtgagttaggaattactcaagaatgtgtgaagatacattgtgat 6559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 6900 - 6849
Alignment:
Q  307 gtgcactggcaagctttgaagtgggttctgagatatttgaatggatctttga 358  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||    
T  6900 gtgcattggcaagctttgaagtgggtgttgaggtatttgaatggctctttga 6849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 88; Significance: 6e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 397 - 560
Target Start/End: Original strand, 36819 - 36982
Alignment:
Q  397 gatgctttggagggatatgtggatgcggactatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaa 496  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |    
T  36819 gatgctttggagggatatgtagatgtagactatgtaggaaatatagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgtttggaacagtggtta 36918  T
Q  497 cttggaaggcaaatcaacaatcagttgtagctctttcaacaactcaagcagagtacatagccct 560  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  36919 cttggaagacaaatcaacaatcagatatagatttttcaacaactcaactagaatacatagccct 36982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 66; Significance: 8e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 127 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 33592 - 33071
Alignment:
Q  127 ggtcaccacactaagctatctataaaacaatgtcctcaatccgatgaagagaaaagcaag--atggagggtactccctatgcaagtggggttggaagcat 224  Q
    ||||||||||| ||| | || |||||| |||||||||||||||| || |||||  | |||  |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33592 ggtcaccacacaaagttgtccataaaataatgtcctcaatccgaggatgagaa--ggaagtaatggaaagtactccctatgcaagtgggattggaagcat 33495  T
Q  225 catgtatggtatggtttgtagtagaccggacttatcctacgcaatcagtgtgataagtcggtttatggcaaatccgggtcaagtgcactggcaagctttg 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || | || ||  | ||  |  | ||| || |||| | ||||||||||   ||||| ||| ||||||||    
T  33494 catgtatggtatggtttgtagtagaccggatataacttatgcggttagcattgtgagttggattattgaaaatccgggtattgtgcattggtaagctttg 33395  T
Q  325 aagtgggttctgagatatttgaatggatctttgagaggtggtctaaggtatacaaggtcataaccaggtagggatgctttggagggatatgtggatgcgg 424  Q
    ||||||||  |||| |  |||||||| |||||||  ||  || | | ||| |||||  ||   | ||  |  || ||| | ||||| ||||| |||||||    
T  33394 aagtgggtgttgaggttcttgaatgggtctttgaagggaagtttgaagtacacaagagcagctcaagagaaagacgctctagagggttatgtagatgcgg 33295  T
Q  425 actatgcaggtaacgtagacactagaaaatctttgtcaggttttgtgtttacattgttcggtacagcggtaacttggaaggcaaatcaacaatcagttgt 524  Q
    ||||||| || ||| | ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||  | || || ||     | | ||||||| ||||||||||||| || ||    
T  33294 actatgcgggcaacatggacacaagaaaatctttatcgggttttgtgtttactctttttggcacgattattagttggaagacaaatcaacaatctgtggt 33195  T
Q  525 agctctttcaacaactcaagcagagtacatagcccttgttgaaggggtcaaggaaggcatatggttgaaaggtatgattggagaaatggggattagtcaa 624  Q
     |  || |  |||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||   |||||||  |  | || |||| |||     
T  33194 ggaactatgtacaactcaagcaaagtacatttcccttcttgaaggggtgaaggaggccatatggttgaaagacctgattggtaagttaggaattactcag 33095  T
Q  625 ggatgtgtgaagatacattgtgat 648  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  33094 gcatgtgtgaagatacattgtgat 33071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University