View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6819_low_14 (Length: 312)

Name: NF6819_low_14
Description: NF6819
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6819_low_14
NF6819_low_14
[»] chr7 (8 HSPs)
chr7 (15-304)||(13458708-13458995)
chr7 (15-293)||(4442600-4442878)
chr7 (15-293)||(27172954-27173232)
chr7 (15-293)||(7826573-7826851)
chr7 (15-293)||(27105093-27105371)
chr7 (15-224)||(17926292-17926501)
chr7 (158-258)||(11284626-11284726)
chr7 (15-164)||(22034738-22034887)
[»] chr8 (8 HSPs)
chr8 (17-304)||(23902914-23903201)
chr8 (15-293)||(21194305-21194583)
chr8 (15-293)||(20650108-20650386)
chr8 (15-304)||(22437053-22437329)
chr8 (15-251)||(23154838-23155073)
chr8 (15-293)||(16414841-16415114)
chr8 (15-293)||(21848090-21848368)
chr8 (15-255)||(24931619-24931855)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (15-303)||(6307-6596)
[»] chr2 (10 HSPs)
chr2 (15-304)||(25130924-25131213)
chr2 (15-293)||(22280420-22280698)
chr2 (15-293)||(24567518-24567796)
chr2 (39-293)||(22739504-22739758)
chr2 (125-255)||(25878531-25878661)
chr2 (15-227)||(24829105-24829316)
chr2 (15-227)||(12638818-12639030)
chr2 (125-227)||(12644485-12644587)
chr2 (125-226)||(34821575-34821675)
chr2 (119-267)||(27541905-27542058)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (15-304)||(22133123-22133412)
chr1 (15-270)||(41215261-41215516)
chr1 (15-293)||(20828774-20829052)
chr1 (15-293)||(20527752-20528030)
chr1 (15-293)||(20927753-20928031)
chr1 (100-267)||(20171946-20172113)
chr1 (41-184)||(21200445-21200588)
chr1 (157-210)||(12200390-12200443)
[»] scaffold0962 (1 HSPs)
scaffold0962 (74-304)||(2346-2575)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (15-293)||(7870-8148)
scaffold0021 (40-304)||(21177-21420)
scaffold0021 (40-304)||(30753-30996)
scaffold0021 (15-293)||(90215-90493)
[»] chr6 (13 HSPs)
chr6 (39-258)||(23025251-23025470)
chr6 (15-293)||(16379828-16380106)
chr6 (15-270)||(18401193-18401448)
chr6 (15-293)||(1646269-1646547)
chr6 (15-293)||(16100563-16100841)
chr6 (15-293)||(16647424-16647702)
chr6 (15-258)||(16234907-16235149)
chr6 (144-258)||(18578098-18578212)
chr6 (140-227)||(18836178-18836265)
chr6 (152-255)||(19985697-19985800)
chr6 (195-271)||(14133824-14133900)
chr6 (115-199)||(14131087-14131171)
chr6 (15-59)||(14131018-14131062)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (15-291)||(4217-4493)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (15-255)||(3196-3436)
[»] chr3 (14 HSPs)
chr3 (30-293)||(6150402-6150665)
chr3 (15-293)||(30149670-30149948)
chr3 (17-304)||(17200950-17201237)
chr3 (15-291)||(13964906-13965179)
chr3 (15-298)||(15948015-15948297)
chr3 (15-293)||(8271948-8272226)
chr3 (30-258)||(15612430-15612658)
chr3 (15-255)||(30140119-30140359)
chr3 (15-227)||(12795880-12796092)
chr3 (15-227)||(18915370-18915582)
chr3 (51-227)||(16258822-16258998)
chr3 (176-291)||(22150288-22150403)
chr3 (15-247)||(3295969-3296201)
chr3 (119-241)||(29680805-29680928)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (15-293)||(12938-13216)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (15-293)||(26109-26387)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (15-293)||(34798-35076)
[»] chr5 (4 HSPs)
chr5 (15-294)||(23508282-23508561)
chr5 (15-293)||(21934680-21934958)
chr5 (15-293)||(24583808-24584086)
chr5 (44-227)||(23505202-23505383)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (15-293)||(23676-23954)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (15-293)||(73910-74187)
scaffold0011 (15-293)||(78291-78568)
scaffold0011 (17-291)||(175828-176102)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (15-293)||(26490-26767)
scaffold0008 (15-293)||(131802-132080)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (15-293)||(5617-5895)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (46-293)||(934-1181)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (15-290)||(5122-5397)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (15-270)||(2435-2690)
[»] chr4 (5 HSPs)
chr4 (15-293)||(15290468-15290746)
chr4 (16-293)||(14999331-14999608)
chr4 (15-258)||(9292850-9293093)
chr4 (50-298)||(12340172-12340420)
chr4 (15-258)||(15139015-15139257)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (15-258)||(17696-17938)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (106-304)||(3303-3501)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (68-293)||(24944-25169)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (15-293)||(926-1202)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (15-293)||(15623-15901)
scaffold0162 (15-227)||(10553-10765)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (15-270)||(1288-1543)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (30-227)||(800-997)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (66-293)||(7175-7401)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (44-255)||(93791-94002)
[»] scaffold1488 (1 HSPs)
scaffold1488 (16-206)||(205-395)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (144-258)||(2320-2434)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (144-258)||(24913-25027)
[»] scaffold1486 (1 HSPs)
scaffold1486 (17-250)||(222-455)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (17-250)||(53967-54200)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (45-258)||(46431-46643)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (15-236)||(8196-8417)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (39-227)||(3331-3519)
scaffold0409 (39-227)||(11586-11774)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (15-227)||(51554-51766)
[»] scaffold1424 (1 HSPs)
scaffold1424 (66-227)||(38-198)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (15-227)||(10757-10970)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (201-293)||(2292-2384)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (107-270)||(77229-77398)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (164-255)||(21077-21168)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 8)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 15 - 304
Target Start/End: Original strand, 13458708 - 13458995
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13458708 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcacttgctccgcagtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 13458807  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  13458808 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatggttcaacggcatacacacaaaatccaac 13458907  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgttgatgtccatc 304  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13458908 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttag--cacactaaagaagtagtcacctaaccactagccggggtgttgatgaccatc 13458995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 4442600 - 4442878
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||  ||| || |||| |||||||||||||| || | ||||  |||||||||||||||    
T  4442600 acatcataaacacacaagcctcatcgtccaaagacttcttcacttgctccgcgatcaagaacttcccacctaagtcatctaccagcttcgaaaatgttat 4442699  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  4442700 actcttggtcaaacaattaatgctaaccccaaaagataacatcaaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatacaac 4442799  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 293  Q
    | ||||||||  |||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4442800 tcaaaatcaatgttaccaaaattagcatgacacctagcacacactaaggaagtagttaccgaaccactagccggggtgt 4442878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 27172954 - 27173232
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    |||||||||||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||||||| ||||| || |     
T  27172954 acatcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccgacttagaaaaagtcac 27173053  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  27173054 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 27173153  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 293  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  27173154 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgt 27173232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 7826573 - 7826851
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    |||||||||||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||||||| ||||| || |     
T  7826573 acatcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccgacttagaaaaagtcac 7826672  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  7826673 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 7826772  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 293  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  7826773 tcaaaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgt 7826851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 27105371 - 27105093
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    |||||||||||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||| ||||| || |     
T  27105371 acatcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 27105272  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  27105271 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 27105172  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 293  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  27105171 tcaaaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgt 27105093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Original strand, 17926292 - 17926501
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    |||||||||||||  ||| |||| ||||||| |||||||||||||  ||| ||||||| |||||||| |||| |||   ||||| |||||||||||||||    
T  17926292 acatcataaacacacaagtttcaccgtccaaggacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttccctcctacctcagctaccggcttcgaaaatgttat 17926391  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  17926392 actcttgattaaacaattaatgctaacaccaaaagacaacattcaatccataccagagatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaggatccaac 17926491  T
Q  215 ttaaaatcaa 224  Q
    | ||||||||    
T  17926492 tcaaaatcaa 17926501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 158 - 258
Target Start/End: Original strand, 11284626 - 11284726
Alignment:
Q  158 caatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacaca 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11284626 caatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaaaatccaactcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacaca 11284725  T
Q  258 c 258  Q
    |    
T  11284726 c 11284726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 164
Target Start/End: Original strand, 22034738 - 22034887
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaa--atgtt 112  Q
    ||||||| ||||||  || |||| | ||||||||||| ||||||| || | ||||||| ||||| |||||||  || | ||||  |||| |||  |||||    
T  22034738 acatcatgaacactctagattcaccatccaaagacttattcacttgtttcgcggtcaagaactttccacctacttcatctacc--cttctaaagaatgtt 22034835  T
Q  113 atactcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatcca 164  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||    
T  22034836 atactcttggttaaacagttaatgttaacaccaaaagataacatccagtcca 22034887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 8)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 17 - 304
Target Start/End: Original strand, 23902914 - 23903201
Alignment:
Q  17 atcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatac 116  Q
    ||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  23902914 atcatgaacacacaagcttcaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaactttccacctaactcatctaccggcttcgaaaatgttatac 23903013  T
Q  117 tcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaactt 216  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  23903014 tcttggttaagcagttaatgctaacaccaaaagacaacatccaatccatacaaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaactc 23903113  T
Q  217 aaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgttgatgtccatc 304  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  23903114 aaaatcaacatttccaaaattaacaggacacttagcacacactaaggaagtagtcaccgaaccactagccggggtgtcgatgaccatc 23903201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 21194583 - 21194305
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    ||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | |||| |  | ||||| ||| ||||| ||||     
T  21194583 acatcatgaacacacaagcttcaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatctaatttttctaccggctttgaaaaagttac 21194484  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| |||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21194483 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaaaataacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaac 21194384  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 293  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  21194383 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaacctctagccggggtgt 21194305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 20650386 - 20650108
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    ||||||| |||||  |||||||| | || ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| || |     
T  20650386 acatcatgaacacacaagcttcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatctaactcgtctaccggcttcgaaaaagtcac 20650287  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20650286 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagttaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaac 20650187  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 293  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||| |||| || | ||||||||    
T  20650186 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttatcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctggtcggggtgt 20650108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 304
Target Start/End: Original strand, 22437053 - 22437329
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||| |             ||||| ||||||||||||||     
T  22437053 acatcatgaacacttaagcttcaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaactttc-------------taccggcttcgaaaatgttac 22437139  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  22437140 acttttggtcaaacaattaatgctaaccccaaaagataacattcaatccatacaaaaaatcacatccatatgattcaatggaagacacacaagatctaac 22437239  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgttgatgtccatc 304  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  22437240 tcaaaatcaacattaccaaaattaacatgacacttagcacacactaaagaagtagtcactgaaccactagtcggggtgtcgatgaccatc 22437329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 23155073 - 23154838
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    |||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||  || |||||| | ||||  ||||||||| ||||     
T  23155073 acatcataaacacacaagtttcaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcttacttaactcttctaccagcttcgaaaacgttac 23154974  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  23154973 actcttagtcaaacagttaatgctaaccccaaaagacaacaaccaatccat-cccaaaatcacatccatatgcttcaacggaagatacacaagatcaaac 23154875  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttag 251  Q
    | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  23154874 tcaaaatcaacattaccataattaacatgacacttag 23154838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 16414841 - 16415114
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    ||||||| |||||  |||||||| | || ||||| ||||||||||  |||||| |||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||| ||||| ||||     
T  16414841 acatcatgaacacacaagcttcaccatctaaagatttcttcacttgctccacgttcaagaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagttac 16414940  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     || |  ||||| |||||||    
T  16414941 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttc-----aaaaatcacaagatccaac 16415035  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 293  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  16415036 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgt 16415114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 21848368 - 21848090
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    |||||||||||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||   || || |||| ||||||| | ||||||  | |||||  || ||||| || |     
T  21848368 acatcataaacacacaagcctcaccttctaaagacttcttcacttgccccgcgttcaaaaacttcctatctaacttttctaccggtttagaaaaagtcac 21848269  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  21848268 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaataacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 21848169  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 293  Q
    | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  21848168 tcaaaatcaacatcaacaaaattaacaggacacttagcacacataaacgaagtagtcaccgaaccactagccggggtgt 21848090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 24931855 - 24931619
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    |||||||| ||||  |||||||| | || | ||| ||||| ||||  ||| || |||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||| ||||| || |     
T  24931855 acatcatagacacacaagcttcaccatctagagatttctttacttgctccgcgatcaagaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 24931756  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    | |||| |||||||    
T  24931755 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacgga----aaacaagatccaac 24931660  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcaca 255  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24931659 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcaca 24931619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 15 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 6596 - 6307
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    ||||||| |||||  |||||||| |||| |||||||| |||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  6596 acatcatgaacacacaagcttcaccgtctaaagacttattcacttgctccgcggtcaagaacttcccacctaactcatctaccgacttcgaaaatgttat 6497  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  6496 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaagacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaacacacacaagatccaac 6397  T
Q  215 ttaaaatcaacattacc-aaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgttgatgtccat 303  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  6396 tcaaaatcaacattaccaaaaattaacagggcacttagcacacactaaggaagtagtcactgaaccactagccggggtgtcgatgaccat 6307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 10)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 15 - 304
Target Start/End: Original strand, 25130924 - 25131213
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||    
T  25130924 acatcataaacacacaagcttcaccgtccaaagacttcttcacttgctctgcggtcaagaacttcccacctaactcatctaccggcttcgaaaacgttat 25131023  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25131024 actcttggttaaacaattaatgctaaccccaaaagataacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaac 25131123  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgttgatgtccatc 304  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  25131124 tcaaaatcaatattaccaaaattaacagggcacttagcacacactaaggaagtagtcaccgaaccactagccggggtgtcgatgaccatc 25131213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 22280420 - 22280698
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||| |||||  ||||||||| |||| ||||||| ||||||  | ||||||| | ||||| ||| ||||| ||||     
T  22280420 acatcataaacacacaagcttcaccgtctaaagatctcttcacttgttccgcggtcaagaacttcatatctaactcttctaccggcttagaaaaagttac 22280519  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  22280520 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 22280619  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 293  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  22280620 tcaaaatcaacattacctaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgt 22280698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 24567796 - 24567518
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    ||||||| |||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||  ||  ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||||||||| ||||     
T  24567796 acatcatgaacacacaagcttcaccgtctaaagacttcttcacttgctctgcggtcaagaacttcctatctaactcttctaccggcttcgaaaaagttac 24567697  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  24567696 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagataacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttccatggaagacacacaagatccaac 24567597  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 293  Q
    | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| || | | |||| |||| ||||||||    
T  24567596 tcaaaatcaacagtaccaaaatcaacaggacacttagcacacataaaagaagttgtcatcgaaccgctagtcggggtgt 24567518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 39 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22739758 - 22739504
Alignment:
Q  39 cgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatactcttggttaaacagttaatgct 138  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  ||||| | ||||||| | ||||||| |  |||| ||||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||    
T  22739758 cgtccaaagacttcttcacttgctctgcggtctagaacttcctatctaactcttccaccggcttcgaaaaagttacactcttagtcaaacaattaatgct 22739659  T
Q  139 aacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacattaccaaaatta 238  Q
    ||| |||||    || | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  22739658 aaccccaaaaattaataaccattccatgccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattacaaaaatta 22739559  T
Q  239 acaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 293  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  22739558 acaggacacttagcacacataaaagaagtagttaccgaaccgctagccgaggtgt 22739504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 125 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 25878661 - 25878531
Alignment:
Q  125 aaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaa 224  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  25878661 aaacaattaatgctaaccccaaaagttaacaaccaattcataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaa 25878562  T
Q  225 cattaccaaaattaacaggacacttagcaca 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25878561 cattaccaaaattaacaggacacttaacaca 25878531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24829316 - 24829105
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    |||||||||||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||| ||||| ||||     
T  24829316 acatcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaacgttac 24829217  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  24829216 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacattcatatgcttcaacggaagaca-aaaagatccaac 24829118  T
Q  215 ttaaaatcaacat 227  Q
    | |||||||||||    
T  24829117 tcaaaatcaacat 24829105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12639030 - 12638818
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    ||||||| |||||  |||||||| | || |||||  |||||||||  ||  ||||||| ||||||| | ||||||| | |||||  ||  |||| || |     
T  12639030 acatcatgaacacacaagcttcaccatctaaagatctcttcacttgctctgcggtcaagaacttcctatctaactcttctaccggtttacaaaaagtcac 12638931  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||| | || ||||| |||||| |||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12638930 actcctagtcaaacaattaatggtaaccccaaaagctaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaaaatccaac 12638831  T
Q  215 ttaaaatcaacat 227  Q
    | |||||||||||    
T  12638830 tcaaaatcaacat 12638818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 125 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12644587 - 12644485
Alignment:
Q  125 aaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaa 224  Q
    ||||| |||||| |||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  12644587 aaacaattaatggtaaccccaaaagccaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaaaatccaactcaaaatcaa 12644488  T
Q  225 cat 227  Q
    |||    
T  12644487 cat 12644485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 125 - 226
Target Start/End: Original strand, 34821575 - 34821675
Alignment:
Q  125 aaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaa 224  Q
    ||||| |||||| |||| ||||| | ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  34821575 aaacaattaatggtaaccccaaaagccaacaaccaatccataccaaaa-tcgcatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactcaaaatcaa 34821673  T
Q  225 ca 226  Q
    ||    
T  34821674 ca 34821675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 119 - 267
Target Start/End: Original strand, 27541905 - 27542058
Alignment:
Q  119 ttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaa-----aaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaa 213  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||| || |     |||||||||||||||||| ||| || |  || || ||||||||    
T  27541905 ttggttaaacaattaatgttaaccccaaaagacaacatccaattcattccgaaaattaaatcacatccatatgctccaaaggtatgcaaaccaaatccaa 27542004  T
Q  214 cttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagt 267  Q
       |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||    
T  27542005 tgcaaaatccacattaccaaaattaacatgacacttaacacacaccaaggaagt 27542058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 166; Significance: 7e-89; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 22133412 - 22133123
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||| ||||||||| ||||     
T  22133412 acatcataaacacacaagctccaccgtccaaagacttcttcacttgctccacggtcaagaacttcccacttaactcttctaccggcttcgaaaacgttac 22133313  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22133312 actcttagtcaaacatttaatactaaccccaaaagataacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaac 22133213  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgttgatgtccatc 304  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  22133212 tcaaaatcaacattaccaaaattaataggacacttagcgcacacaaaacaagtagtcaccgaaccattagccggggtgtcgatgaccatc 22133123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 41215516 - 41215261
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    |||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  41215516 acatcataaacacacaagcctcaccgtccaaagacttcttcacttgctctgcggtcaagaacttcccacctaactcatctaccggcttcgaaaatgttat 41215417  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||    
T  41215416 actattcgttaaacaattaatgctaaccccaaaagataacatccaatcaataccaaaaatcacatccatatgctaaaacggaagacaaacaagatccaac 41215317  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagt 270  Q
    | ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41215316 tcaaaattaatgttaccaaaattaacatgacacttagcacacactaaggaagtagt 41215261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 20829052 - 20828774
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    |||||||||||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||| ||||| || |     
T  20829052 acatcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 20828953  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  20828952 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 20828853  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 293  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  20828852 tcaaaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgt 20828774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 20527752 - 20528030
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    |||||||||||||  |||||||| | || ||||| ||||||||||  | | ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||| ||| ||||| || |     
T  20527752 acatcataaacacagaagcttcaccatctaaagatttcttcacttgcttcgcggtcaagaacttcccatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 20527851  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  20527852 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccatatcaaaaatcacatccatatgctttaacggaagacaaacaagatccaac 20527951  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 293  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  20527952 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaacctctagtcggggtgt 20528030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 20927753 - 20928031
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    |||||||||||||  |||||| | | || ||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | ||||||| | |||||  || |||||||| |     
T  20927753 acatcataaacacacaagctttaccatctaaagatttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatctaactcttctaccggtttagaaaatgtcac 20927852  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  20927853 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaacaatccataccaaaaatcacatctatatgcttcaacggaagacaaacaagatctaac 20927952  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 293  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  20927953 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacatttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgt 20928031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 100 - 267
Target Start/End: Original strand, 20171946 - 20172113
Alignment:
Q  100 cttcgaaaatgttatactcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaaga 199  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||||  ||||| ||| ||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |  |||||| |      
T  20171946 cttcgagaatgttatacttttggtcaaaaaattaatgtcaacactaaaagacgacatccagtccttaccgaaaatcacatccatattcaccaacggcaag 20172045  T
Q  200 cacacaaaatccaacttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagt 267  Q
    || |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  20172046 caaacaagatccaactcaaaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacaaactaaggaagt 20172113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 41 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 21200588 - 21200445
Alignment:
Q  41 tccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatactcttggttaaacagttaatgctaa 140  Q
    ||||||||||||||||||| ||   |||| || ||||||||| |||  || | ||| | ||| || | ||||||||||||||||||| |||||||  |||    
T  21200588 tccaaagacttcttcacttgttgtgcggttaaaaacttcccatctacttcatttactggcttagagattgttatactcttggttaaatagttaatattaa 21200489  T
Q  141 caccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccata 184  Q
    |||||||  | | ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21200488 caccaaaatatagcattcaatccataccaaaaatcacattcata 21200445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 210
Target Start/End: Original strand, 12200390 - 12200443
Alignment:
Q  157 ccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatc 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||| |||||    
T  12200390 ccaattcataccaaaaatcacatccatacccgtcaacggcagacacactaaatc 12200443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0962
Description:

Target: scaffold0962; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 74 - 304
Target Start/End: Original strand, 2346 - 2575
Alignment:
Q  74 aacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatactcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaa 173  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  2346 aacttcccacctaactcatctaccgacttcgaaaatgttatactcttggttaaacagttaatgctaacaccagaagacaacatccaatccataccaaaaa 2445  T
Q  174 tcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttac 273  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  2446 tcacacccatatgctttaac-gaagacacacaagatccaactcaaaatcaaaattaccaaaattaataggacacttagcacacactaaggaagtagtcac 2544  T
Q  274 ctaaccactagccggggtgttgatgtccatc 304  Q
    | ||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  2545 cgaacaactagtcggggtgtcgatgaccatc 2575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 7870 - 8148
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    ||||||| |||||  |||||||  |||||||||||||||||||||  ||  ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||||||||||||||     
T  7870 acatcatgaacacacaagcttcgccgtccaaagacttcttcacttgctctgcggtcaagaacttcctatctaactcttctaccggcttcgaaaatgttac 7969  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||  |||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  7970 acttctggtcaaacaattaatgctaaccccaaaagagaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatacaac 8069  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 293  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  8070 ttaaaatcaacatcaccaaaattgacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgt 8148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 40 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 21420 - 21177
Alignment:
Q  40 gtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatactcttggttaaacagttaatgcta 139  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  21420 gtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacctaactcttttaccggcttcgaaaatgttatactcttggtcaaacaattaatgcta 21321  T
Q  140 acaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacattaccaaaattaa 239  Q
    || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||                     ||||||||||||||||    
T  21320 accccaaaagataacatccaatcgataccaaaaatcacatctatatgcttcaacggaagacac---------------------acattaccaaaattaa 21242  T
Q  240 caggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgttgatgtccatc 304  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  21241 taggacacttagcacacactaaagaagtagtcaccgaaccactagccggggtgtcgatgaccatc 21177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 40 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 30996 - 30753
Alignment:
Q  40 gtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatactcttggttaaacagttaatgcta 139  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  30996 gtccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacctaactcttttaccggcttcgaaaatgttatactcttggtcaaacaattaatgcta 30897  T
Q  140 acaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacattaccaaaattaa 239  Q
    || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||                     ||||||||||||||||    
T  30896 accccaaaagataacatccaatcgataccaaaaatcacatctatatgcttcaacggaagacac---------------------acattaccaaaattaa 30818  T
Q  240 caggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgttgatgtccatc 304  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  30817 taggacacttagcacacactaaagaagtagtcaccgaaccactagccggggtgtcgatgaccatc 30753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 90215 - 90493
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    ||||||| |||||  |||||||| | || | ||| ||||| ||||  ||| || |||| ||||||| | ||||||| | || || ||| ||||| ||||     
T  90215 acatcatgaacacacaagcttcaccatctagagatttctttacttgctccgcgatcaagaacttcctatctaactcttctatcggcttagaaaaagttac 90314  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  90315 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatacgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 90414  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 293  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||    
T  90415 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgccagccggggtgt 90493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 13)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 39 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 23025470 - 23025251
Alignment:
Q  39 cgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatactcttggttaaacagttaatgct 138  Q
    |||||||||||||||||||||  | | ||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  23025470 cgtccaaagacttcttcacttgcttcgcggtcaagaactttccacctaactcatctaccggcttcgaaaatgttacactcttggttaaacaattaatgct 23025371  T
Q  139 aacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacattaccaaaatta 238  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  23025370 aaccccaaaagataacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacgcacaagatccaactcaaaatcaatgttaccaaaatta 23025271  T
Q  239 acaggacacttagcacacac 258  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  23025270 acaagacacttagcacacac 23025251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 16380106 - 16379828
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    |||||||||||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||| ||||| || |     
T  16380106 acatcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 16380007  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  16380006 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 16379907  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 293  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  16379906 tcaaaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgt 16379828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 15 - 270
Target Start/End: Original strand, 18401193 - 18401448
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    ||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||  ||||| ||||     
T  18401193 acatcatgaacacacaagcttcatcatccaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatctaactcttctaccggctaagaaaaagttac 18401292  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||||| || ||||| |||||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18401293 actcttagtcaaacaattaatgataacccaaaaagataacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagagacacaagatccaac 18401392  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagt 270  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18401393 tcaaaatcaacattaccgaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagt 18401448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 1646547 - 1646269
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    |||||||||||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | |||| || | ||||| ||| ||||| || |     
T  1646547 acatcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaattcttctaccggcttagaaaaagtcac 1646448  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  1646447 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagaaaaacaagatccaac 1646348  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 293  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  1646347 tcaaaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgt 1646269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 16100563 - 16100841
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    ||||||| |||||  |||||||| | || ||||||||||||||||  ||| ||||||  ||||||  | ||||||| | ||||| ||| ||||| ||||     
T  16100563 acatcatgaacacccaagcttcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaggaacttcatatctaactcttctaccggcttagaaaaagttac 16100662  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||||| || ||||| |||||| |||| | ||| |  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  16100663 actcttagtcaaacaattaatggtaaccctaaaagctaacaactaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacgcaagatccaac 16100762  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 293  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  16100763 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagtcggggtgt 16100841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 16647702 - 16647424
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    |||||||||||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||   || ||||||| ||||||  | ||||||| | |||||  || ||||| || |     
T  16647702 acatcataaacacacaagcctcaccttctaaagacttcttcacttgccccgcggtcaaaaacttcatatctaactcttctaccggtttagaaaaagtcac 16647603  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  16647602 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 16647503  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 293  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  16647502 tcaaaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagtcggggtgt 16647424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 258
Target Start/End: Original strand, 16234907 - 16235149
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    |||||||||||||  |||||||  | || |||||  |||||||||  ||| ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||| ||||| || |     
T  16234907 acatcataaacacacaagcttcgccatctaaagatctcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 16235006  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  16235007 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccaaaacaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacaaacaagatccaac 16235106  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacac 258  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16235107 tcaaaatcaacattacc-aaattaacaggacacttagcacacac 16235149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 144 - 258
Target Start/End: Original strand, 18578098 - 18578212
Alignment:
Q  144 caaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacattaccaaaattaacagg 243  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  18578098 caaaagacaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaaaattaacaag 18578197  T
Q  244 acacttagcacacac 258  Q
    |||||||||||||||    
T  18578198 acacttagcacacac 18578212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 140 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18836265 - 18836178
Alignment:
Q  140 acaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacat 227  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  18836265 acaccaaaagacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacagacaagatccaactcaaaatcaacat 18836178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 152 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 19985800 - 19985697
Alignment:
Q  152 aacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttag 251  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19985800 aacaaccaattcatacaaaaaatcacatctatatgcttcaacggaagacaaacaggatccaactcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttaa 19985701  T
Q  252 caca 255  Q
    ||||    
T  19985700 caca 19985697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 195 - 271
Target Start/End: Original strand, 14133824 - 14133900
Alignment:
Q  195 gaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagtt 271  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14133824 gaagacacacaagatccagctcaaaatcaaccttaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaggaagtagtt 14133900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 199
Target Start/End: Original strand, 14131087 - 14131171
Alignment:
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaaga 199  Q
    ||||||||| ||||| ||||| | ||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  14131087 actcttggtcaaacaattaatacaaactccaaaagataacatccaatccataccaaagatcacatccatatgtttcaatggaaga 14131171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 59
Target Start/End: Original strand, 14131018 - 14131062
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactt 59  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  14131018 acatcataaacacacaagcttcaccgtcgaaagacttcttcactt 14131062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 4493 - 4217
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    |||||||||||||  |||||||| | || |||||||||||||||| |||  ||||||  ||||||| | ||||||| | ||||| ||| ||||| ||||     
T  4493 acatcataaacacacaagcttcaccatctaaagacttcttcacttgttcagcggtcatgaacttcctatctaactcctctaccggcttagaaaaagttac 4394  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4393 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagataacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaac 4294  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggt 291  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  4293 tcaaagtcaacattaccaaaattaacagggcatttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggt 4217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 15 - 255
Target Start/End: Original strand, 3196 - 3436
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    ||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||| || ||||||| | ||| ||| | ||||| ||||||||| ||||     
T  3196 acatcatgaacacacaagcttcaccgtccaaagacttcttcacttgctccgcggttaagaacttcctatctagctcttctaccggcttcgaaaacgttaa 3295  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  3296 actcttggtcaaacaattaatgctaaccccaaaagataacatccaatccataccaaaaatcacattcatatgcttcaatggaagacacacaagatccaac 3395  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcaca 255  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3396 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttaccaca 3436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 14)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 6150665 - 6150402
Alignment:
Q  30 aagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatactcttggttaaaca 129  Q
    |||||||| | || |||||||||||||| |  || ||| |||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||||||||| || | |||||| || |||||    
T  6150665 aagcttcaccatctaaagacttcttcacctgctctacgatcaagaacttcctatctaactcttctaccggcttcgaaaaagtcacactcttagtcaaaca 6150566  T
Q  130 gttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacatta 229  Q
     ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  6150565 attaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactcaaaatcaacatta 6150466  T
Q  230 ccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  6150465 ccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtaaccgaacctctagccggggtgt 6150402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 30149670 - 30149948
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    |||||||||||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||| ||||| || |     
T  30149670 acatcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 30149769  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  30149770 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 30149869  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 293  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  30149870 tcaaaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgt 30149948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 304
Target Start/End: Original strand, 17200950 - 17201237
Alignment:
Q  17 atcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatac 116  Q
    ||||| |||||  |||| ||| ||| |||||||||||||||||  | | ||||||| ||||||| || |||||||| |||||  || ||||||  || ||    
T  17200950 atcatgaacacacaagcctcaccgttcaaagacttcttcacttgctacgcggtcaagaacttcctacttaactcgtctaccggttttgaaaatactacac 17201049  T
Q  117 tcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaactt 216  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| ||||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  17201050 tcttagttaaccaattaatgctaaccccaaaagatatcaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaactc 17201149  T
Q  217 aaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgttgatgtccatc 304  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||  |||||| |||| |||||    
T  17201150 aaaatcaacattacctaaattaacaggacaattagcacacacaaaagaagtagtcaccgaaccgctagcacgggtgtcgatgaccatc 17201237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 13965179 - 13964906
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    |||||||||||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||   |||||||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||| ||||| || |     
T  13965179 acatcataaacacacaagcctcaccttctaaagacttcttcacttgccccacggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 13965080  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  13965079 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 13964980  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggt 291  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  13964979 tcaaaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacaca-taa--aagtagtcaccgaaccgctagccggggt 13964906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 15948297 - 15948015
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    ||||||| |||||  |||||||| | || ||||||||||||||||  ||  ||||||| ||  ||  | ||||||| | ||||| ||| |||||  |||     
T  15948297 acatcatgaacacacaagcttcaccatctaaagacttcttcacttgctctgcggtcaagaatctcttatctaactcttctaccggcttagaaaactttac 15948198  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||||| || || || ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  15948197 actcttagtcaa-caattaatgctaactccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttaaacggaagacaaacaagatccaac 15948099  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgttgatg 298  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  15948098 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgttgatg 15948015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 8272226 - 8271948
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    |||||||||||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||   || ||||||| ||||||| | ||||||| | |||||  || ||||| || |     
T  8272226 acatcataaacacacaagcctcaccttctaaagacttcttcacttgccccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggtttagaaaaagtcac 8272127  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||| | || ||||| ||||||| ||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  8272126 actcctagtcaaacaattaatgcgaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 8272027  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 293  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  8272026 tcaaaatcaacatcaccaaaattaacaggacatttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgt 8271948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 30 - 258
Target Start/End: Original strand, 15612430 - 15612658
Alignment:
Q  30 aagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatactcttggttaaaca 129  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||   ||  |||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||| ||||| || | |||| | || |||||    
T  15612430 aagcctcatcttctaaagacttcttcacttgccccgtggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcacactcctagtcaaaca 15612529  T
Q  130 gttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacatta 229  Q
     ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  15612530 attaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactcaaaatcaacatta 15612629  T
Q  230 ccaaaattaacaggacacttagcacacac 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15612630 ccaaaattaacaggacacttagcacacac 15612658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 255
Target Start/End: Original strand, 30140119 - 30140359
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    |||||||||||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||| ||||| || |     
T  30140119 acatcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 30140218  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  30140219 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaataacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 30140318  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcaca 255  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  30140319 tcaaaatcaacatcaccaaaattaacagaacacttaacaca 30140359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Original strand, 12795880 - 12796092
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    |||||||||||||| |||||||| | || |||||  |||||||||  ||  ||||||| ||||||| | ||||||| | || || ||| ||||| ||||     
T  12795880 acatcataaacactcaagcttcaccatctaaagatctcttcacttgctctgcggtcaagaacttcctatctaactcttctaacggcttagaaaaagttac 12795979  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  12795980 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 12796079  T
Q  215 ttaaaatcaacat 227  Q
    | |||||||||||    
T  12796080 tcaaaatcaacat 12796092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Original strand, 18915370 - 18915582
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    ||||||| |||||  |||||||| | || |||||  |||||||||  ||  ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||||||| ||||| ||||     
T  18915370 acatcatgaacacacaagcttcaccatctaaagatctcttcacttgctctgcggtcaagaacttcctatctaactcttctaccgacttagaaaacgttac 18915469  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||||| || ||||| |||||| |||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  18915470 actcttagtaaaacaattaatgataacaccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagccaaacaagatccaac 18915569  T
Q  215 ttaaaatcaacat 227  Q
    | ||| |||||||    
T  18915570 tcaaagtcaacat 18915582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 51 - 227
Target Start/End: Original strand, 16258822 - 16258998
Alignment:
Q  51 tcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatactcttggttaaacagttaatgctaacaccaaagga 150  Q
    |||||||||  ||| ||||||| ||||||| | | ||||| | ||||| ||||||||| || | |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |     
T  16258822 tcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatccaactcttctaccggcttcgaaaaagtcacactcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagc 16258921  T
Q  151 caacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacat 227  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  16258922 taacaaccaatccataccaaaaataacatccatattcttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacat 16258998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 176 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 22150403 - 22150288
Alignment:
Q  176 acatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacct 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||     
T  22150403 acatccatatgcttcaacggaagacaaacaagacccaactcaaaattaacataaccaaaattaacaagacacttagcacacataaaagaagtagtcaccg 22150304  T
Q  276 aaccactagccggggt 291  Q
    |||| |||||||||||    
T  22150303 aaccgctagccggggt 22150288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 3296201 - 3295969
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    |||||||||||||   ||||||  | ||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||| | | | |||   | | || ||||||||    
T  3296201 acatcataaacacactagcttcgccatccgaagacttcttcagtttctccgcggtcaagaacttcccacctaccacatctactagcgtagagaatgttat 3296102  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||| | ||| || | |||||| ||||| || || ||||||| |||||||  |||||| |  || || ||||||||     
T  3296101 acttttggttaaacagttaatgttaacccaaaaagatagcatccagtccattccgaatatcacattcatatgcaccaacggcaagcaaactaaatccaat 3296002  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacac 247  Q
    | ||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  3296001 tcaaaatcaacgttgccaaaattaataggacac 3295969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 119 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 29680928 - 29680805
Alignment:
Q  119 ttggttaaacagttaatgctaacacc-aaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaactta 217  Q
    ||||||||||| |||||  |||| || ||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |  |   | || |||||||| | |    
T  29680928 ttggttaaacaattaatattaacccccaaaagataacatctaatccattccaaaaatcacatccatatgctccaaagataagtaaactaaatccaattca 29680829  T
Q  218 aaatcaacattaccaaaattaaca 241  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||    
T  29680828 aaatccacaataccaaaattaaca 29680805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 13216 - 12938
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    |||||||||||||  |||||||| | || ||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||| ||||| || |     
T  13216 acatcataaacacataagcttcaccatctaaagatttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 13117  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  13116 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaattcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 13017  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 293  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  13016 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcactaaaccgctagccggggtgt 12938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 26109 - 26387
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    |||||||||||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||| ||||| || |     
T  26109 acatcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 26208  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  26209 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 26308  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 293  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  26309 tcaaaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgt 26387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 34798 - 35076
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    |||||||||||||  |||||||| | ||||| || ||||||||||  ||| ||||||| || |||| | ||||||| | ||||||||| ||||| || |     
T  34798 acatcataaacacacaagcttcaccatccaatgatttcttcacttgctccgcggtcaagaatttcctatctaactcttctaccgacttagaaaaagtcac 34897  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  34898 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 34997  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 293  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  34998 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacatttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgt 35076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 4)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 23508282 - 23508561
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    |||||||||||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||| ||||| || |     
T  23508282 acatcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 23508381  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  23508382 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatctaac 23508481  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgtt 294  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  23508482 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttaacacacataaaagaagtagtcaccaaaccgctagccggggtgtt 23508561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 21934958 - 21934680
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    |||||||||||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||| ||||| || |     
T  21934958 acatcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 21934859  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  21934858 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 21934759  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 293  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||    
T  21934758 tcaaaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccagggtgt 21934680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 24583808 - 24584086
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    |||||||||||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||   || |||| || ||||||| | ||||||| | |||||  || ||||| || |     
T  24583808 acatcataaacacacaagcctcaccttctaaagacttcttcacttgccccgcggttaaaaacttcctatctaactcttctaccggtttagaaaaagtcac 24583907  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  24583908 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 24584007  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 293  Q
    | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  24584008 tcaaaatcaatatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgt 24584086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 227
Target Start/End: Original strand, 23505202 - 23505383
Alignment:
Q  44 aaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatactcttggttaaacagttaatgctaacac 143  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | | ||||| | ||||||||||||||| || | |||||| || ||||| ||||||||||| |    
T  23505202 aaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatccaactcttctaccgacttcgaaaa-gtcacactcttagtcaaacaattaatgctaaccc 23505300  T
Q  144 caaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacat 227  Q
    |||| |  ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  23505301 caaaagctaacaatcaatccatac-aaaaatcacatccatatgcttcaacagaagacaaacaagatccaactcaaaatcaacat 23505383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 23676 - 23954
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    |||||||||||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||  | | ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||| ||||| || |     
T  23676 acatcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgcttcgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 23775  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  23776 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 23875  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 293  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  23876 tcaaaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgt 23954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 74187 - 73910
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    |||||||||||||  ||||| || | || ||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | |||| ||  |||||| ||||||||| ||||     
T  74187 acatcataaacacacaagct-caccatctaaagatttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatctaattctgataccggcttcgaaaaagttac 74089  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  74088 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacagccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatcgaac 73989  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 293  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  73988 tcaaaatcaacattaacaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgt 73910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 78568 - 78291
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    |||||||||||||  ||||| || | || ||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | |||| ||  |||||| ||||||||| ||||     
T  78568 acatcataaacacacaagct-caccatctaaagatttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatctaattctgataccggcttcgaaaaagttac 78470  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  78469 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacagccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatcgaac 78370  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 293  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  78369 tcaaaatcaacattaacaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgt 78291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 176102 - 175828
Alignment:
Q  17 atcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatac 116  Q
    |||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||| ||| | |||   ||| || || |||||||    
T  176102 atcataaacacactagcttcacagtccaaagacttcttcacttgctccaaggtcaacaacttcccacctacctcatctactagcttagagaaagttatac 176003  T
Q  117 tcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaactt 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| | ||||||     
T  176002 tcttggttaaacaattaatgctaacactaaaagacaacatccagtccataccaaaaatcacatccatgtgctttaacggaagaaacacaagaaccaactc 175903  T
Q  217 aaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggt 291  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||   || |||||||| ||| ||||||| | ||||||    
T  175902 aaaatcaacattaccaaagttaacgggacacttagaacacctcaaggaagtagtcaccgaaccactggtcggggt 175828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 26490 - 26767
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    ||||||| |||||  |||||||| | || ||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||| ||||| ||||     
T  26490 acatcatgaacacacaagcttcaccatctaaagatttcttcacttgctccacggtcaagaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagttac 26589  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||||| || ||||| ||| ||||||| ||||| |  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26590 actcttagtcaaacaattactgctaaccccaaaagctaacaaccaatctataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaac 26689  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 293  Q
     | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  26690 -tcaaattaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgt 26767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 132080 - 131802
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    |||||||||||||  |||||||| | || ||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||| ||||| || |     
T  132080 acatcataaacacacaagcttcaccatctaaagatttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 131981  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||| | || ||||| || || ||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  131980 actcctagtcaaacaatttattctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 131881  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 293  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  131880 ttaaaattaacattaccaaaattaataggacatttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgt 131802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 5895 - 5617
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    ||||||| |||||  |||||||| |||| ||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||| | | ||||||| | ||||| ||| ||||| ||||     
T  5895 acatcatgaacacacaagcttcaccgtctaaagatttcttcacttgctccgcggtcaagaactttctatctaactcttctaccggcttagaaaaagttac 5796  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||     
T  5795 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagataacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacagaagacaaacaagatcaaat 5696  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 293  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||  ||||| |||||||    
T  5695 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaactgctagcaggggtgt 5617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 46 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 1181 - 934
Alignment:
Q  46 agacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatactcttggttaaacagttaatgctaacacca 145  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||| ||| ||  | ||||||| | ||||| ||| ||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  1181 agacttcttcacttgctccgcggtcaagaacctcttatctaactcttttaccggcttagaaaacgttacactcttagtcaaacaattaatgctaacccca 1082  T
Q  146 aaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacattaccaaaattaacaggac 245  Q
     | |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  1081 gaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactcaaaatcagtattaccaaaattaacaggac 982  T
Q  246 acttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 293  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  981 acttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccactagccggggtgt 934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 5397 - 5122
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    |||||||||||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||| ||||| || |     
T  5397 acatcataaacacacaagcctcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 5298  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  5297 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 5198  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccgggg 290  Q
      ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  5197 acaaaatcaacatcaccaaaattaacagaacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccgggg 5122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 270
Target Start/End: Original strand, 2435 - 2690
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    ||||||| |||||  |||||||| | || ||||||||||||||||  ||| || |||| ||||| | | ||||||| | ||||| ||||||||| ||||     
T  2435 acatcatgaacacacaagcttcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcgatcaagaactttctatctaactcttctaccggcttcgaaaaagttac 2534  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||    
T  2535 actcttagtgaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgctttaacggaaaacacacaagatctaac 2634  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagt 270  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  2635 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcgcacataaaagaagtagt 2690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 5)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 15290746 - 15290468
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    |||||||||||||  |||  ||| | || ||||||||||||||||   || ||||||| ||||||| | ||||||| | |||||  || ||||| || |     
T  15290746 acatcataaacacacaagtctcaccttctaaagacttcttcacttgccccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggtttagaaaaagtcac 15290647  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||| | || ||||| |||| |||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  15290646 actcctagtcaaacaattaacgctaaccccaaaagcgaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 15290547  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 293  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  15290546 tcaaaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgt 15290468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 293
Target Start/End: Original strand, 14999331 - 14999608
Alignment:
Q  16 catcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttata 115  Q
    |||||| |||||  |||||||| | || ||||||||||||||||  ||| ||| ||| ||| ||  | ||||| | | ||||| |||  |||| |||| |    
T  14999331 catcatgaacacacaagcttcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggccaagaacctcttatctaacccttctaccggcttacaaaacgttaca 14999430  T
Q  116 ctcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaact 215  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  14999431 ctcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaataacaaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaact 14999530  T
Q  216 taaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 293  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  14999531 caaaatcaacatcaccaaaattaacaggacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgt 14999608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 258
Target Start/End: Original strand, 9292850 - 9293093
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    ||||||| |||||  ||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||  |||||| ||||||| | | |||||   ||||  ||||| ||| || |     
T  9292850 acatcatgaacacacaagtttcaccgtccaaaaacttcttcacttgctccgtggtcaagaacttcctatccaactctcctaccagcttcggaaaagtcac 9292949  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||  |||| |  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9292950 actcttagtcaaacaattaatgctaacctcaaaagctaacaatcaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 9293049  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacac 258  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9293050 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacac 9293093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 50 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 12340420 - 12340172
Alignment:
Q  50 ttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatactcttggttaaacagttaatgctaacaccaaagg 149  Q
    ||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| ||| |  |  | ||| || |||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||| |    
T  12340420 ttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcccacctacctcctccaatggcttagataatgttatactcttggttaagcaattgatgttaacaccaaaag 12340321  T
Q  150 acaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacactt 249  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| | |||||| |||||||    
T  12340320 acaacatctagtccataccaaaaatcacgtccatgtgcttcaacggaagacacacaagatccaactcaaagtcaacattaccagagttaacatgacactt 12340221  T
Q  250 agcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgttgatg 298  Q
    ||| ||||| || |||||||| ||| ||||||| | |||||||| ||||    
T  12340220 agcgcacaccaaggaagtagtcaccgaaccactggtcggggtgtcgatg 12340172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 15139257 - 15139015
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    |||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||| ||||  |||  |||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||  ||||| || |     
T  15139257 acatcataaacacacaagcttcaccatctaaagacttctttacttgctccgtggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggctaagaaaaagtcac 15139158  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  15139157 actcctagtcaaacaattaatgctaactccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaattacatccataagcttcaacggaagaca-acaagatccaac 15139059  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacac 258  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15139058 tcaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacac 15139015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 17938 - 17696
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    |||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||  || |||||||| ||||||  | ||||||| | ||||| ||| ||||| || |     
T  17938 acatcataaacacacaagcttcaccatctaaagacttcttcacttgctctacggtcaaaaacttcttatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 17839  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||    
T  17838 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaatggaagacacacaagattcaac 17739  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacac 258  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17738 -taaaatcaacattaccgaaattaacaggacacttagcacacac 17696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 106 - 304
Target Start/End: Original strand, 3303 - 3501
Alignment:
Q  106 aaatgttatactcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacaca 205  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  3303 aaatattatactcttggttaagcagttaatgctaacaccaaaagacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatgtgcttcaacgaaagacacaca 3402  T
Q  206 aaatccaacttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgttgatgtccatc 304  Q
    | ||||||||  ||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  | ||||| | |||||||| |||| |||||    
T  3403 agatccaactctaaatcaacactaccaaaacgaacaagacacttagcacaccctaacgaagtagtcactgagccactggtcggggtgtcgatgaccatc 3501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 68 - 293
Target Start/End: Original strand, 24944 - 25169
Alignment:
Q  68 gtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatactcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccatac 167  Q
    ||||| ||||||| | ||||||| |  |||| ||| ||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||    
T  24944 gtcaagaacttcctatctaactcttcaaccggctttgaaaaagttacactcttcgtcaaacaattaatgctaaccccaaaagataacaaccaatccatac 25043  T
Q  168 caaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagt 267  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||    
T  25044 caaaaatcacatccatatgctttaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaaaattaataggacatttagcacccataaaagaagt 25143  T
Q  268 agttacctaaccactagccggggtgt 293  Q
    ||| ||| | || |||||||||||||    
T  25144 agtcaccgatccgctagccggggtgt 25169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 926 - 1202
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    |||||||||||||  |||||||  ||||||| || ||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | |||| || | || || ||| ||||  || |     
T  926 acatcataaacacacaagcttctccgtccaatgatttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatctaattcttctatcggcttagaaa--gtcac 1023  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  1024 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagagaaacaagatccaac 1123  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 293  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  1124 tcaaaatcaacatcaccaaaattaacaagacacttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagccggggtgt 1202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 15623 - 15901
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| | || | ||||||||||||||  ||| ||||||| ||| ||  | ||||||| | ||||| ||| ||||| ||||     
T  15623 acatcatgaacacaaaagcttcaccatctagagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacctcttatctaactcttctaccggcttagaaaaagttac 15722  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||||| || ||||| ||||||||| | ||||| |  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  15723 actcttagtcaaacaattaatgctagccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaactcacatccatatgcttcaacggaaggcaaacaagatccaac 15822  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 293  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||| | ||||||    
T  15823 tcaaaatcagcattaccaaaattaacaggacatttagcacacataaaagaagtagtcaccgaaccgctagacagggtgt 15901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 10765 - 10553
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||| ||| | |||||||||| |||| || |||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||| ||||| || |     
T  10765 acatcataaacacacaagcttcaccgtctaaaaatttcttcacttgttccgcgttcaagaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 10666  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  ||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  10665 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaatcaatccataccaaaaattacatccatattcttcaacggaagacatacaagatccaac 10566  T
Q  215 ttaaaatcaacat 227  Q
    | |||||||||||    
T  10565 tcaaaatcaacat 10553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 1543 - 1288
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    |||||||||||||  |||||||| | || ||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | |||||   | || || ||| | ||| || |     
T  1543 acatcataaacacacaagcttcaccatctaaagatttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatctaaccgttctatcggcttaggaaaagtcac 1444  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  1443 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacagaagacaaacaagatccaac 1344  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagt 270  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  1343 tcaaaatcaacattaccaaaattaataggacacttagcacacataaaagaagtagt 1288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 227
Target Start/End: Original strand, 800 - 997
Alignment:
Q  30 aagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatactcttggttaaaca 129  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||  ||||||||| |||| |||||| || |||||    
T  800 aagcttcaacgtctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctatctaactcttctaccagcttcgaaaaagttacactcttagtcaaaca 899  T
Q  130 gttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacat 227  Q
     ||||||||||| ||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  900 attaatgctaaccccaaaagataacaactaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacat 997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 66 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 7401 - 7175
Alignment:
Q  66 cggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatactcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccat 165  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||| ||| | || | |||| | || ||||| ||||| ||||| ||||| | ||||| |||||||||    
T  7401 cggtcaagaacttcctatctaactcttctaccggcttagaataagtcacactcctagtcaaacaattaatactaaccccaaaagccaacaaccaatccat 7302  T
Q  166 accaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaa 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  7301 accaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactcaaaatcaacatcaccaaaattaactggacatttagcacaca-taaagaa 7203  T
Q  266 gtagttacctaaccactagccggggtgt 293  Q
    ||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  7202 gtagtcactgaaccgctagccggggtgt 7175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 94002 - 93791
Alignment:
Q  44 aaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatactcttggttaaacagttaatgctaacac 143  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| | | ||||| | ||||| ||| ||||| || | |||||| || ||||| ||||||||||| |    
T  94002 aaagacttcttcacttgctccacggtcaagaacttcctatccaactcttctaccggctttgaaaaagtcacactcttagtcaaacaattaatgctaaccc 93903  T
Q  144 caaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacattaccaaaattaacagg 243  Q
    |||| |  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  93902 caaaagttaacaatcaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactccaaatcaacattaccgaaattaacagg 93803  T
Q  244 acacttagcaca 255  Q
    ||||||| ||||    
T  93802 acacttaacaca 93791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1488 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold1488
Description:

Target: scaffold1488; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 395 - 205
Alignment:
Q  16 catcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttata 115  Q
    ||||||||||||  |||||||  |||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||  || |||||| | ||||| |||||||||||||| |    
T  395 catcataaacacacaagcttctccgtctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcttacttaactcttctaccggcttcgaaaatgttaca 296  T
Q  116 ctcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaa 206  Q
    |||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  295 ctcttaatcaaacaattaatgctaaccccaaaagataacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaa 205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 144 - 258
Target Start/End: Original strand, 2320 - 2434
Alignment:
Q  144 caaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacattaccaaaattaacagg 243  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  2320 caaaagacaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaaaattaacaag 2419  T
Q  244 acacttagcacacac 258  Q
    |||||||||||||||    
T  2420 acacttagcacacac 2434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 144 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 25027 - 24913
Alignment:
Q  144 caaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacattaccaaaattaacagg 243  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25027 caaaagacaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacgggagacacacaagatccaactcaaaatcaacattaccaaaattaacagg 24928  T
Q  244 acacttagcacacac 258  Q
    |||||||||||||||    
T  24927 acacttagcacacac 24913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1486 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold1486
Description:

Target: scaffold1486; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Original strand, 222 - 455
Alignment:
Q  17 atcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatac 116  Q
    ||||| |||||  |||||||| | || ||||||||||||||||  ||| || |||| ||||||| |  |||||| | || || ||| ||||| || | ||    
T  222 atcatgaacacacaagcttcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcgatcaagaacttcctatataactcttctatcggcttagaaaaagtcacac 321  T
Q  117 tcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaactt 216  Q
    |||| || ||||| ||||||||||| |||||    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  322 tcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaacctaacgaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactt 421  T
Q  217 aaaatcaacattaccaaaattaacaggacactta 250  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  422 aaaatcaacattatcaaaattaacaggacactta 455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 54200 - 53967
Alignment:
Q  17 atcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatac 116  Q
    ||||| |||||  |||||||| | || ||||||||||||||||  ||| || |||| ||||||| |  |||||| | || || ||| ||||| || | ||    
T  54200 atcatgaacacacaagcttcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcgatcaagaacttcctatataactcttctatcggcttagaaaaagtcacac 54101  T
Q  117 tcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaactt 216  Q
    |||| || ||||| ||||||||||| |||||    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  54100 tcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaaactaacgaccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactt 54001  T
Q  217 aaaatcaacattaccaaaattaacaggacactta 250  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54000 aaaatcaacattatcaaaattaacaggacactta 53967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 45 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 46643 - 46431
Alignment:
Q  45 aagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatactcttggttaaacagttaatgctaacacc 144  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||| ||||| |||| ||||||  | ||| | ||||||||||| ||    
T  46643 aagacttcttcacttgctctgcggtcaagaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagttacactcttattcaaaaaattaatgctaacccc 46544  T
Q  145 aaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacattaccaaaattaacagga 244  Q
    ||| |  |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  46543 aaaagctaacaactaatccataccaaaa-tcacatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaactcaaaatcaacattaccgaaatttacagga 46445  T
Q  245 cacttagcacacac 258  Q
    ||||||||| ||||    
T  46444 cacttagcaaacac 46431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 8417 - 8196
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    ||||||| |||||  |||||||| | || ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||| ||||| || |     
T  8417 acatcatgaacacacaagcttcaccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaaaaacttcctatctaactcttctaccggcttagaaaaagtcac 8318  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  8317 actcctagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccataccaaaaataaaatccatatgcttcaacggaagacaaacaagatccaac 8218  T
Q  215 ttaaaatcaacattaccaaaat 236  Q
    | ||||||||||| ||||||||    
T  8217 tcaaaatcaacatcaccaaaat 8196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 3519 - 3331
Alignment:
Q  39 cgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatactcttggttaaacagttaatgct 138  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| || |||| ||||||  || |||||| | ||||| |||||||||  ||| |||||| || ||||| |||||| |    
T  3519 cgtccaaagacttcttcacttgctccgcgatcaagaacttcttacttaactcttctaccggcttcgaaaacattacactcttagtcaaacaattaatgat 3420  T
Q  139 aacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacat 227  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  3419 aaccccaaaagataacatccaatccataccaaaaatcacatctatatgcttcaaccgaagacacaaaagatccaactcaaaatcaacat 3331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 11774 - 11586
Alignment:
Q  39 cgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatactcttggttaaacagttaatgct 138  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| || |||| ||||||  || |||||| | ||||| |||||||||  ||| |||||| || ||||| |||||| |    
T  11774 cgtccaaagacttcttcacttgctccgcgatcaagaacttcttacttaactcttctaccggcttcgaaaacattacactcttagtcaaacaattaatgat 11675  T
Q  139 aacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacat 227  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  11674 aaccccaaaagataacatccaatccataccaaaaatcacatctatatgcttcaaccgaagacacaaaagatccaactcaaaatcaacat 11586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Original strand, 51554 - 51766
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    ||||||| |||||  |||||||  | || ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| ||| ||||| | ||||| ||| ||||| ||||     
T  51554 acatcatgaacacacaagcttcgccatctaaagacttcttcacttgctccgcggtcaagaacttcctacccaactcttctaccggcttagaaaaagttac 51653  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||  |||| |  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||     
T  51654 actcttagtcaaacaattaatgctaaccacaaaagctaacaaccaatccatgccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagataaacaagatccaat 51753  T
Q  215 ttaaaatcaacat 227  Q
    | |||||||||||    
T  51754 tcaaaatcaacat 51766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1424 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1424
Description:

Target: scaffold1424; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 227
Target Start/End: Original strand, 38 - 198
Alignment:
Q  66 cggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttatactcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccat 165  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||| ||||||||| || | | |||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||    
T  38 cggtcaagaacttcctatctaactcttctaccggcttcgaaaaagtaacaatcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagctaacaaccaatccat 137  T
Q  166 accaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacat 227  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  138 accaaaaataacatccatatgcttcaacggaagacaaac-aaatccaactcaaaatcaacat 198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 10970 - 10757
Alignment:
Q  15 acatcataaacactaaagcttcatcgtccaaagacttcttcactttttccacggtcaataacttcccacctaactcgtataccgacttcgaaaatgttat 114  Q
    ||||||| |||||  |||||||  | || ||||||||||||||||  ||  ||||||| ||| ||  | ||||||| | ||||| ||| ||||| ||||     
T  10970 acatcatgaacacacaagcttcgccatctaaagacttcttcacttgctctgcggtcaagaacctcttatctaactcttctaccggcttagaaaacgttac 10871  T
Q  115 actcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaac 214  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  10870 actcttagtcaaacaattaatgctaaccccaaaagttaacaaccaatccataccaaaaatcacatccatatgctttaacggaagacaaacaagatccaac 10771  T
Q  215 t-taaaatcaacat 227  Q
    |  |||||||||||    
T  10770 tccaaaatcaacat 10757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 201 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 2384 - 2292
Alignment:
Q  201 acacaaaatccaacttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagttacctaaccactagccggggtgt 293  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  2384 acacaagatccaactcaaaatcaacattaccaaaattaacaagacacttagcacacacaaaagaagtagtcaccgaaccactagccggggtgt 2292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 270
Target Start/End: Original strand, 77229 - 77398
Alignment:
Q  107 aatgttatactcttggttaaacagttaatgctaacaccaaaggacaacatccaatccataccaaaaatcacatccatatgc------ttcaacggaagac 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||        |||||  |       
T  77229 aatgttatactcttggttaaatagttaatgttaactccaaaggataacatccaatccataccgaaaataacatccatttgcaccaatgacaacgttacca 77328  T
Q  201 acacaaaatccaacttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcacacactaaagaagtagt 270  Q
    | | || || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  77329 aaataacattcaactcaaaatcaacgttaccaaaattaacaggaaacttagcacaaactaaggaagtagt 77398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 164 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 21168 - 21077
Alignment:
Q  164 ataccaaaaatcacatccatatgcttcaacggaagacacacaaaatccaacttaaaatcaacattaccaaaattaacaggacacttagcaca 255  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||| |||||| ||  |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  21168 ataccgaaaatcacatccatatgcttcaacagaagacaaacaagatacaactcaaaatcgacgctaccaaaactaacgggacacttagcaca 21077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University