View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6828_high_2 (Length: 715)

Name: NF6828_high_2
Description: NF6828
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6828_high_2
NF6828_high_2
[»] chr6 (83 HSPs)
chr6 (21-704)||(27187269-27187952)
chr6 (21-704)||(27261288-27261971)
chr6 (21-704)||(28292137-28292820)
chr6 (21-704)||(28262962-28263645)
chr6 (21-704)||(28341711-28342394)
chr6 (21-702)||(24312935-24313616)
chr6 (21-702)||(29591687-29592368)
chr6 (21-704)||(1542849-1543532)
chr6 (21-702)||(2874570-2875251)
chr6 (21-702)||(16626484-16627165)
chr6 (21-702)||(25112385-25113066)
chr6 (21-702)||(5838986-5839667)
chr6 (21-699)||(19864520-19865198)
chr6 (21-690)||(25609640-25610309)
chr6 (21-693)||(27331209-27331881)
chr6 (21-693)||(27391949-27392621)
chr6 (21-693)||(16927416-16928088)
chr6 (21-693)||(18407718-18408391)
chr6 (21-681)||(22078478-22079136)
chr6 (21-681)||(16963155-16963815)
chr6 (21-693)||(22762231-22762903)
chr6 (21-693)||(23078302-23078974)
chr6 (21-488)||(12497859-12498326)
chr6 (21-488)||(12510575-12511042)
chr6 (248-697)||(22433929-22434378)
chr6 (21-488)||(12505188-12505655)
chr6 (21-447)||(25765312-25765737)
chr6 (21-693)||(25768024-25768696)
chr6 (21-693)||(21471434-21472106)
chr6 (394-681)||(17032589-17032876)
chr6 (21-693)||(19879131-19879803)
chr6 (56-690)||(15459204-15459838)
chr6 (67-693)||(17415365-17415991)
chr6 (56-693)||(34645362-34645999)
chr6 (21-693)||(10468625-10469297)
chr6 (80-693)||(14381243-14381856)
chr6 (21-693)||(21563908-21564580)
chr6 (21-693)||(22796408-22797080)
chr6 (38-697)||(11280277-11280936)
chr6 (21-692)||(27560394-27561065)
chr6 (131-628)||(1640715-1641212)
chr6 (21-690)||(24364245-24364914)
chr6 (117-692)||(28282590-28283165)
chr6 (56-693)||(18794558-18795195)
chr6 (21-506)||(8766111-8766596)
chr6 (21-278)||(21833172-21833429)
chr6 (281-693)||(19453513-19453925)
chr6 (21-208)||(17032395-17032582)
chr6 (21-408)||(18197608-18197995)
chr6 (366-693)||(5296982-5297308)
chr6 (371-692)||(27559765-27560086)
chr6 (21-285)||(14131363-14131627)
chr6 (119-507)||(18800873-18801261)
chr6 (21-279)||(25750642-25750900)
chr6 (38-387)||(11287680-11288029)
chr6 (477-693)||(15896383-15896599)
chr6 (474-693)||(21569767-21569986)
chr6 (194-294)||(11291818-11291918)
chr6 (146-681)||(16382161-16382696)
chr6 (587-702)||(21836964-21837079)
chr6 (540-693)||(8762709-8762862)
chr6 (602-693)||(20637077-20637168)
chr6 (587-693)||(18197504-18197610)
chr6 (146-681)||(16098008-16098543)
chr6 (146-681)||(23996206-23996741)
chr6 (146-681)||(25742876-25743410)
chr6 (146-468)||(15078365-15078687)
chr6 (21-115)||(22433830-22433924)
chr6 (150-266)||(25750908-25751024)
chr6 (146-681)||(18837696-18838231)
chr6 (159-468)||(21412939-21413248)
chr6 (159-467)||(1648786-1649094)
chr6 (221-681)||(18571684-18572144)
chr6 (631-697)||(22442710-22442776)
chr6 (161-466)||(25655456-25655760)
chr6 (221-436)||(16233242-16233457)
chr6 (21-109)||(18787721-18787809)
chr6 (578-663)||(23027522-23027607)
chr6 (23-99)||(1640634-1640710)
chr6 (389-468)||(1652274-1652353)
chr6 (560-681)||(21927577-21927698)
chr6 (561-681)||(1648602-1648722)
chr6 (491-639)||(14625068-14625216)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (21-704)||(109434-110117)
scaffold0029 (21-693)||(112559-113231)
scaffold0029 (56-693)||(95636-96273)
[»] chr3 (75 HSPs)
chr3 (21-704)||(15589251-15589934)
chr3 (21-693)||(53384888-53385560)
chr3 (21-704)||(20061913-20062596)
chr3 (21-704)||(10005188-10005871)
chr3 (21-704)||(10905798-10906481)
chr3 (21-704)||(48425035-48425718)
chr3 (21-704)||(16635361-16636044)
chr3 (21-704)||(16756444-16757127)
chr3 (21-704)||(43162685-43163368)
chr3 (21-702)||(15348106-15348787)
chr3 (21-704)||(6600335-6601007)
chr3 (21-702)||(13252278-13252959)
chr3 (21-702)||(5424791-5425471)
chr3 (21-702)||(15402371-15403052)
chr3 (21-702)||(15724795-15725475)
chr3 (21-702)||(26792260-26792941)
chr3 (21-702)||(15338857-15339538)
chr3 (21-702)||(16412143-16412824)
chr3 (21-702)||(12497836-12498517)
chr3 (21-702)||(14876360-14877041)
chr3 (21-702)||(16806787-16807468)
chr3 (21-699)||(16371001-16371679)
chr3 (21-693)||(17489438-17490110)
chr3 (21-702)||(16691748-16692433)
chr3 (21-693)||(16492051-16492723)
chr3 (21-693)||(9522307-9522979)
chr3 (21-693)||(15247735-15248407)
chr3 (21-693)||(15208479-15209151)
chr3 (21-693)||(15227247-15227919)
chr3 (56-693)||(13971979-13972616)
chr3 (21-693)||(13322511-13323183)
chr3 (21-693)||(14086271-14086943)
chr3 (21-693)||(15952827-15953499)
chr3 (392-699)||(11564545-11564852)
chr3 (176-685)||(15015634-15016131)
chr3 (413-693)||(14126464-14126744)
chr3 (21-683)||(18134215-18134877)
chr3 (21-693)||(12360401-12361073)
chr3 (21-692)||(8758942-8759613)
chr3 (21-692)||(41177120-41177791)
chr3 (21-690)||(13941622-13942291)
chr3 (21-690)||(10383567-10384235)
chr3 (21-693)||(11303632-11304304)
chr3 (56-693)||(12850138-12850775)
chr3 (21-690)||(47123542-47124211)
chr3 (454-699)||(15061777-15062022)
chr3 (117-692)||(16836370-16836945)
chr3 (56-690)||(10419907-10420541)
chr3 (117-692)||(44776941-44777516)
chr3 (21-594)||(11960992-11961565)
chr3 (21-693)||(16329520-16330190)
chr3 (117-692)||(16380788-16381362)
chr3 (350-690)||(28754245-28754585)
chr3 (356-693)||(17492563-17492900)
chr3 (383-693)||(14573889-14574199)
chr3 (350-687)||(4678365-4678702)
chr3 (314-585)||(13001800-13002070)
chr3 (23-285)||(14571448-14571710)
chr3 (356-597)||(26008948-26009189)
chr3 (146-681)||(8274281-8274816)
chr3 (539-693)||(16828061-16828215)
chr3 (146-681)||(16742585-16743120)
chr3 (146-680)||(15576473-15577007)
chr3 (473-693)||(16338371-16338591)
chr3 (159-674)||(18748401-18748916)
chr3 (194-436)||(17192865-17193107)
chr3 (219-433)||(6712539-6712753)
chr3 (146-436)||(13975172-13975462)
chr3 (296-468)||(14183007-14183179)
chr3 (532-681)||(6152733-6152882)
chr3 (21-108)||(31689067-31689154)
chr3 (21-108)||(31945070-31945157)
chr3 (511-681)||(13967222-13967392)
chr3 (362-436)||(6152978-6153052)
chr3 (554-648)||(17193224-17193318)
[»] chr5 (69 HSPs)
chr5 (21-702)||(27668294-27668975)
chr5 (21-702)||(19769861-19770542)
chr5 (21-702)||(40708681-40709362)
chr5 (21-704)||(34566395-34567078)
chr5 (21-704)||(27518308-27518991)
chr5 (21-702)||(22332691-22333372)
chr5 (21-704)||(16356403-16357086)
chr5 (21-702)||(41770743-41771424)
chr5 (21-702)||(14999543-15000224)
chr5 (21-702)||(27610255-27610936)
chr5 (21-702)||(27685204-27685885)
chr5 (23-702)||(37291300-37291979)
chr5 (21-681)||(29475898-29476558)
chr5 (21-702)||(22134569-22135250)
chr5 (21-702)||(22348326-22349005)
chr5 (21-699)||(23573643-23574321)
chr5 (21-702)||(18775678-18776352)
chr5 (22-681)||(23516443-23517102)
chr5 (21-674)||(20798661-20799314)
chr5 (21-661)||(23440126-23440766)
chr5 (21-690)||(25423090-25423759)
chr5 (63-693)||(21497850-21498479)
chr5 (21-563)||(21984248-21984790)
chr5 (21-693)||(20467909-20468581)
chr5 (21-693)||(23471130-23471802)
chr5 (21-693)||(26738540-26739190)
chr5 (196-693)||(21339099-21339596)
chr5 (21-690)||(24749370-24750039)
chr5 (21-693)||(22235733-22236405)
chr5 (21-693)||(21563786-21564451)
chr5 (21-693)||(21890572-21891244)
chr5 (21-693)||(22381082-22381754)
chr5 (21-693)||(23079902-23080574)
chr5 (21-690)||(22502562-22503231)
chr5 (21-690)||(14886807-14887476)
chr5 (21-657)||(22461835-22462471)
chr5 (21-690)||(25847958-25848627)
chr5 (21-690)||(20342165-20342834)
chr5 (56-693)||(28923581-28924218)
chr5 (21-666)||(37545336-37545982)
chr5 (56-693)||(20821371-20822008)
chr5 (56-693)||(28894755-28895392)
chr5 (117-692)||(17269148-17269722)
chr5 (21-690)||(24798213-24798882)
chr5 (56-681)||(20773678-20774302)
chr5 (21-583)||(21404737-21405285)
chr5 (21-435)||(24735682-24736096)
chr5 (251-693)||(21831574-21831998)
chr5 (21-327)||(23442472-23442778)
chr5 (384-615)||(919-1150)
chr5 (455-690)||(24716342-24716577)
chr5 (21-279)||(24737012-24737270)
chr5 (21-225)||(20573422-20573626)
chr5 (461-690)||(24620111-24620340)
chr5 (402-693)||(28916226-28916517)
chr5 (21-198)||(21343666-21343843)
chr5 (461-693)||(21496481-21496713)
chr5 (146-681)||(21937013-21937548)
chr5 (579-693)||(21407597-21407711)
chr5 (146-681)||(24581219-24581753)
chr5 (146-681)||(27011092-27011627)
chr5 (146-468)||(11210732-11211054)
chr5 (21-249)||(21662297-21662524)
chr5 (21-249)||(21665758-21665985)
chr5 (533-681)||(25244175-25244323)
chr5 (533-681)||(25308327-25308475)
chr5 (221-436)||(23503526-23503741)
chr5 (371-438)||(21229241-21229308)
chr5 (533-594)||(16065604-16065665)
[»] chr2 (62 HSPs)
chr2 (21-704)||(16998600-16999283)
chr2 (21-704)||(16981752-16982435)
chr2 (21-704)||(17063317-17064000)
chr2 (21-704)||(9609736-9610419)
chr2 (21-704)||(10868450-10869133)
chr2 (21-704)||(27217616-27218299)
chr2 (21-702)||(44385731-44386412)
chr2 (21-702)||(22325018-22325699)
chr2 (21-704)||(17066978-17067658)
chr2 (21-702)||(24261970-24262651)
chr2 (21-702)||(24709633-24710314)
chr2 (21-702)||(27370869-27371550)
chr2 (21-704)||(21145201-21145873)
chr2 (21-693)||(23188608-23189279)
chr2 (21-699)||(24675089-24675767)
chr2 (21-699)||(24707647-24708325)
chr2 (21-539)||(16924860-16925378)
chr2 (21-699)||(21325431-21326109)
chr2 (21-540)||(24878319-24878838)
chr2 (21-699)||(22756630-22757306)
chr2 (21-690)||(23063677-23064346)
chr2 (316-702)||(41608547-41608933)
chr2 (79-674)||(24825472-24826067)
chr2 (21-693)||(30211088-30211760)
chr2 (25-693)||(45529121-45529783)
chr2 (21-693)||(27365250-27365922)
chr2 (21-693)||(23293558-23294230)
chr2 (21-693)||(23276376-23277048)
chr2 (21-582)||(23087050-23087611)
chr2 (21-681)||(11358057-11358717)
chr2 (21-690)||(20832585-20833254)
chr2 (21-690)||(31830258-31830927)
chr2 (21-692)||(27787341-27788012)
chr2 (117-692)||(12574049-12574624)
chr2 (21-690)||(1063351-1064020)
chr2 (21-294)||(23138637-23138910)
chr2 (21-294)||(23550427-23550700)
chr2 (21-234)||(27377101-27377314)
chr2 (542-704)||(16923010-16923172)
chr2 (540-704)||(16925479-16925643)
chr2 (356-693)||(19652223-19652557)
chr2 (547-702)||(20442675-20442830)
chr2 (535-702)||(24876911-24877078)
chr2 (389-690)||(20828227-20828528)
chr2 (21-161)||(41609047-41609187)
chr2 (396-693)||(24948564-24948861)
chr2 (160-681)||(22276018-22276538)
chr2 (512-690)||(21125331-21125509)
chr2 (22-261)||(24653946-24654185)
chr2 (605-693)||(23107901-23107989)
chr2 (198-626)||(23817291-23817719)
chr2 (578-693)||(23110892-23111007)
chr2 (539-693)||(24641860-24642014)
chr2 (21-190)||(24944967-24945136)
chr2 (146-468)||(12640315-12640637)
chr2 (146-681)||(24831370-24831905)
chr2 (248-681)||(25128474-25128907)
chr2 (194-681)||(22761752-22762239)
chr2 (159-681)||(24569851-24570373)
chr2 (248-302)||(27368394-27368448)
chr2 (21-82)||(24833355-24833416)
chr2 (392-468)||(23890753-23890829)
[»] chr1 (46 HSPs)
chr1 (21-702)||(16350293-16350974)
chr1 (21-702)||(51333187-51333868)
chr1 (21-702)||(33390723-33391404)
chr1 (21-702)||(19106351-19107032)
chr1 (21-702)||(21830287-21830968)
chr1 (21-663)||(41354202-41354844)
chr1 (21-702)||(21836934-21837615)
chr1 (21-702)||(17044709-17045390)
chr1 (21-702)||(16078350-16079008)
chr1 (21-681)||(50619959-50620619)
chr1 (21-693)||(16369281-16369953)
chr1 (21-565)||(20249834-20250378)
chr1 (21-575)||(20136762-20137316)
chr1 (21-693)||(19760569-19761241)
chr1 (21-438)||(21747519-21747935)
chr1 (21-690)||(19854298-19854966)
chr1 (21-689)||(20939770-20940438)
chr1 (21-690)||(37677063-37677733)
chr1 (56-693)||(20835591-20836231)
chr1 (21-695)||(22432817-22433491)
chr1 (21-681)||(20856476-20857136)
chr1 (21-690)||(20294396-20295065)
chr1 (444-693)||(21749348-21749597)
chr1 (119-623)||(41307907-41308411)
chr1 (473-693)||(22361947-22362167)
chr1 (21-327)||(19664945-19665251)
chr1 (422-693)||(24099306-24099577)
chr1 (21-441)||(31550136-31550556)
chr1 (21-210)||(50612602-50612791)
chr1 (389-693)||(19662844-19663143)
chr1 (446-690)||(31539703-31539947)
chr1 (568-693)||(20139361-20139486)
chr1 (21-274)||(20244184-20244437)
chr1 (146-681)||(20831107-20831642)
chr1 (21-135)||(21163264-21163378)
chr1 (117-285)||(11382674-11382842)
chr1 (21-285)||(20075170-20075434)
chr1 (611-681)||(20250376-20250446)
chr1 (146-681)||(20914319-20914854)
chr1 (198-434)||(22135520-22135756)
chr1 (21-195)||(20395194-20395368)
chr1 (159-312)||(21202371-21202524)
chr1 (532-681)||(22135272-22135421)
chr1 (656-701)||(41353357-41353402)
chr1 (146-320)||(46518830-46519004)
chr1 (539-648)||(20184683-20184792)
[»] chr7 (72 HSPs)
chr7 (21-704)||(18177700-18178383)
chr7 (21-704)||(8198586-8199269)
chr7 (21-704)||(10870953-10871636)
chr7 (21-702)||(11236844-11237525)
chr7 (21-702)||(15160688-15161369)
chr7 (21-704)||(44790980-44791663)
chr7 (21-702)||(8707563-8708244)
chr7 (21-702)||(18551389-18552070)
chr7 (21-702)||(14332355-14333036)
chr7 (21-702)||(13686021-13686703)
chr7 (21-704)||(11552731-11553414)
chr7 (21-704)||(12687459-12688142)
chr7 (21-702)||(16947-17628)
chr7 (21-704)||(14954578-14955261)
chr7 (22-582)||(23516520-23517080)
chr7 (21-696)||(15154294-15154964)
chr7 (242-702)||(9596236-9596696)
chr7 (56-693)||(15624545-15625182)
chr7 (21-693)||(12206418-12207090)
chr7 (21-693)||(15102221-15102891)
chr7 (21-573)||(15203837-15204389)
chr7 (212-693)||(11771881-11772362)
chr7 (32-693)||(21661933-21662591)
chr7 (21-693)||(14263862-14264534)
chr7 (21-693)||(19147170-19147842)
chr7 (21-693)||(20746569-20747241)
chr7 (21-693)||(11388046-11388717)
chr7 (353-693)||(14039986-14040326)
chr7 (353-693)||(14350016-14350356)
chr7 (21-693)||(16071912-16072584)
chr7 (21-690)||(8211749-8212418)
chr7 (21-690)||(11305884-11306553)
chr7 (21-693)||(13021316-13021988)
chr7 (21-693)||(16950089-16950761)
chr7 (21-692)||(18053572-18054243)
chr7 (21-690)||(49152260-49152929)
chr7 (21-693)||(6413470-6414142)
chr7 (21-693)||(14285994-14286666)
chr7 (21-693)||(13665512-13666168)
chr7 (167-537)||(35964646-35965016)
chr7 (21-692)||(14129832-14130503)
chr7 (25-693)||(1025-1693)
chr7 (21-692)||(14433650-14434321)
chr7 (117-690)||(23505491-23506064)
chr7 (21-693)||(12455662-12456333)
chr7 (21-348)||(14037765-14038092)
chr7 (21-348)||(14347795-14348122)
chr7 (117-636)||(23199418-23199937)
chr7 (117-690)||(26118226-26118799)
chr7 (218-692)||(15340587-15341061)
chr7 (353-690)||(13968289-13968626)
chr7 (578-704)||(23203242-23203368)
chr7 (578-704)||(23509369-23509495)
chr7 (223-581)||(12456940-12457298)
chr7 (159-681)||(14936443-14936965)
chr7 (146-681)||(4440011-4440546)
chr7 (146-681)||(7823983-7824518)
chr7 (146-681)||(27107426-27107961)
chr7 (159-681)||(15364036-15364558)
chr7 (194-436)||(12368473-12368715)
chr7 (29-285)||(26288063-26288318)
chr7 (146-681)||(21674185-21674720)
chr7 (249-405)||(12193742-12193898)
chr7 (350-639)||(45146842-45147131)
chr7 (21-140)||(15340455-15340574)
chr7 (152-689)||(40790-41327)
chr7 (560-681)||(17924148-17924269)
chr7 (566-674)||(23641951-23642059)
chr7 (533-655)||(15171642-15171764)
chr7 (161-302)||(13378796-13378937)
chr7 (350-468)||(13353438-13353556)
chr7 (599-657)||(17144936-17144994)
[»] chr4 (63 HSPs)
chr4 (21-704)||(8386381-8387064)
chr4 (21-702)||(18297174-18297855)
chr4 (21-700)||(19778157-19778836)
chr4 (21-704)||(29038764-29039447)
chr4 (21-704)||(12476569-12477252)
chr4 (21-702)||(27711305-27711986)
chr4 (21-702)||(14303340-14304020)
chr4 (21-702)||(23955716-23956397)
chr4 (21-702)||(40473009-40473690)
chr4 (21-704)||(12523645-12524328)
chr4 (21-702)||(8052985-8053666)
chr4 (21-704)||(14680536-14681219)
chr4 (21-595)||(14266368-14266942)
chr4 (21-699)||(16251810-16252488)
chr4 (21-702)||(18226808-18227489)
chr4 (21-693)||(16354816-16355488)
chr4 (21-696)||(7090402-7091076)
chr4 (21-693)||(14850737-14851409)
chr4 (191-696)||(1639793-1640298)
chr4 (325-699)||(15147249-15147623)
chr4 (21-515)||(14159461-14159955)
chr4 (21-693)||(15002995-15003667)
chr4 (21-498)||(14652277-14652754)
chr4 (212-693)||(8706078-8706559)
chr4 (21-693)||(1648908-1649580)
chr4 (21-693)||(15245893-15246565)
chr4 (192-693)||(15414657-15415158)
chr4 (21-690)||(3264428-3265097)
chr4 (21-690)||(11206865-11207534)
chr4 (21-690)||(29453171-29453840)
chr4 (21-693)||(33222887-33223564)
chr4 (21-330)||(15149740-15150049)
chr4 (21-246)||(15364355-15364580)
chr4 (119-693)||(15358721-15359295)
chr4 (128-693)||(27900462-27901027)
chr4 (21-693)||(20890952-20891623)
chr4 (242-693)||(15077825-15078276)
chr4 (21-597)||(16145881-16146459)
chr4 (21-690)||(44661500-44662169)
chr4 (21-501)||(15070382-15070862)
chr4 (503-693)||(14691353-14691543)
chr4 (21-507)||(51605998-51606484)
chr4 (187-350)||(16676417-16676580)
chr4 (552-693)||(14159970-14160111)
chr4 (221-639)||(13247814-13248232)
chr4 (542-693)||(15319641-15319792)
chr4 (146-681)||(14997410-14997945)
chr4 (146-681)||(9290929-9291464)
chr4 (21-172)||(14927151-14927302)
chr4 (146-468)||(15293013-15293335)
chr4 (146-468)||(55375214-55375536)
chr4 (128-285)||(16752669-16752826)
chr4 (159-436)||(12132298-12132574)
chr4 (21-252)||(42702872-42703103)
chr4 (219-639)||(12342548-12342968)
chr4 (39-181)||(18164332-18164474)
chr4 (21-71)||(18607823-18607873)
chr4 (146-302)||(16445234-16445390)
chr4 (550-690)||(18549694-18549834)
chr4 (21-89)||(15415214-15415282)
chr4 (356-468)||(16685557-16685669)
chr4 (554-593)||(15423974-15424013)
chr4 (320-435)||(18549949-18550064)
[»] chr8 (71 HSPs)
chr8 (21-702)||(19112725-19113406)
chr8 (21-700)||(17674090-17674769)
chr8 (21-663)||(19484974-19485616)
chr8 (21-652)||(20017865-20018496)
chr8 (21-702)||(22120239-22120920)
chr8 (21-702)||(30313209-30313890)
chr8 (21-683)||(15533415-15534077)
chr8 (21-702)||(32600179-32600860)
chr8 (21-681)||(22133127-22133787)
chr8 (21-702)||(22046408-22047089)
chr8 (24-681)||(16408131-16408788)
chr8 (21-702)||(19978002-19978683)
chr8 (21-681)||(22164278-22164937)
chr8 (29-699)||(21166606-21167275)
chr8 (21-693)||(23650076-23650748)
chr8 (21-693)||(21921809-21922481)
chr8 (21-693)||(21250977-21251648)
chr8 (21-693)||(21788433-21789104)
chr8 (21-693)||(21393939-21394611)
chr8 (262-702)||(18856853-18857293)
chr8 (21-693)||(22987236-22987903)
chr8 (289-702)||(22040162-22040575)
chr8 (141-693)||(22377528-22378079)
chr8 (141-693)||(22383703-22384254)
chr8 (24-693)||(20396199-20396868)
chr8 (21-681)||(20388134-20388794)
chr8 (224-691)||(23949158-23949624)
chr8 (23-681)||(19851448-19852106)
chr8 (23-681)||(19857484-19858142)
chr8 (21-693)||(1266274-1266945)
chr8 (21-693)||(23654962-23655634)
chr8 (21-693)||(31416548-31417220)
chr8 (21-693)||(22061507-22062179)
chr8 (21-693)||(29303500-29304172)
chr8 (21-693)||(20009974-20010646)
chr8 (21-690)||(14565177-14565846)
chr8 (21-693)||(21840452-21841124)
chr8 (21-690)||(6679146-6679815)
chr8 (21-692)||(31570917-31571588)
chr8 (21-690)||(803750-804419)
chr8 (21-690)||(6603693-6604362)
chr8 (21-690)||(12304793-12305462)
chr8 (131-692)||(22051008-22051569)
chr8 (356-693)||(20975725-20976062)
chr8 (21-293)||(22032067-22032339)
chr8 (353-690)||(16271301-16271638)
chr8 (20-381)||(21681856-21682217)
chr8 (21-399)||(20007885-20008263)
chr8 (21-372)||(21324804-21325156)
chr8 (21-259)||(23948924-23949162)
chr8 (21-225)||(15441216-15441420)
chr8 (417-693)||(22371371-22371647)
chr8 (473-690)||(27355035-27355252)
chr8 (146-681)||(16877181-16877716)
chr8 (159-681)||(22315364-22315886)
chr8 (146-681)||(21196588-21197123)
chr8 (21-258)||(16265127-16265364)
chr8 (575-702)||(22129005-22129132)
chr8 (146-681)||(21850423-21850958)
chr8 (146-465)||(20652635-20652954)
chr8 (146-681)||(22982596-22983128)
chr8 (21-261)||(28982392-28982632)
chr8 (21-261)||(28987612-28987852)
chr8 (350-681)||(23157098-23157428)
chr8 (21-196)||(27347261-27347436)
chr8 (656-701)||(19484130-19484175)
chr8 (532-681)||(23900822-23900971)
chr8 (569-695)||(19863639-19863765)
chr8 (569-695)||(19868276-19868402)
chr8 (152-435)||(19863223-19863506)
chr8 (152-435)||(19867860-19868143)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (21-702)||(414-1095)
[»] scaffold0028 (6 HSPs)
scaffold0028 (21-704)||(43154-43837)
scaffold0028 (21-702)||(8485-9155)
scaffold0028 (315-702)||(15241-15617)
scaffold0028 (56-693)||(50148-50785)
scaffold0028 (187-318)||(13832-13963)
scaffold0028 (146-674)||(106226-106754)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (21-702)||(620-1301)
scaffold0044 (21-702)||(14360-15041)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (21-702)||(6937-7620)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (21-702)||(7377-8047)
[»] scaffold0042 (3 HSPs)
scaffold0042 (21-702)||(65405-66086)
scaffold0042 (240-681)||(39466-39906)
scaffold0042 (21-190)||(39926-40095)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (21-702)||(33198-33879)
scaffold0109 (21-702)||(8596-9277)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (21-702)||(4030-4711)
[»] scaffold0005 (4 HSPs)
scaffold0005 (21-699)||(278458-279136)
scaffold0005 (21-343)||(308659-308981)
scaffold0005 (21-498)||(164538-165015)
scaffold0005 (21-692)||(260308-260979)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (21-693)||(6372-7044)
scaffold0403 (383-688)||(3153-3458)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (143-702)||(7519-8078)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (85-702)||(7854-8471)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (21-693)||(6023-6695)
scaffold0120 (21-693)||(1158-1830)
scaffold0120 (146-407)||(22819-23080)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (21-699)||(63659-64337)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (21-698)||(6014-6691)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (86-702)||(21932-22548)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (21-695)||(676-1350)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (21-699)||(451-1128)
[»] scaffold0106 (4 HSPs)
scaffold0106 (21-693)||(14039-14711)
scaffold0106 (239-702)||(17660-18122)
scaffold0106 (21-693)||(31410-32082)
scaffold0106 (625-693)||(18489-18557)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (21-693)||(328-999)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (29-693)||(5229-5893)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (21-693)||(9343-10015)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (21-693)||(229043-229715)
scaffold0012 (21-693)||(219051-219723)
scaffold0012 (146-657)||(32667-33176)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (34-693)||(49506-50165)
scaffold0081 (540-699)||(19121-19280)
scaffold0081 (599-699)||(34604-34704)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (21-699)||(180217-180877)
scaffold0020 (415-693)||(101186-101464)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (21-693)||(14713-15385)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (21-693)||(32387-33058)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (272-702)||(12738-13168)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (21-693)||(25353-26025)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (21-693)||(14877-15549)
scaffold0040 (461-693)||(113121-113353)
[»] scaffold0011 (6 HSPs)
scaffold0011 (21-693)||(26167-26839)
scaffold0011 (21-693)||(195338-196008)
scaffold0011 (21-689)||(148570-149238)
scaffold0011 (21-190)||(68577-68746)
scaffold0011 (146-436)||(121841-122131)
scaffold0011 (248-468)||(180151-180371)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (21-693)||(112021-112693)
scaffold0004 (21-693)||(203102-203774)
scaffold0004 (21-693)||(117568-118240)
scaffold0004 (21-693)||(322704-323376)
scaffold0004 (21-693)||(385819-386491)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (21-693)||(908-1580)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (21-681)||(1005-1659)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (21-689)||(4032-4699)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (21-693)||(3140-3812)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (21-615)||(126911-127505)
scaffold0022 (502-693)||(80128-80319)
[»] scaffold0894 (2 HSPs)
scaffold0894 (21-570)||(1139-1688)
scaffold0894 (561-693)||(2914-3046)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (21-693)||(116539-117211)
scaffold0037 (146-618)||(98140-98612)
[»] scaffold0507 (3 HSPs)
scaffold0507 (98-693)||(9047-9642)
scaffold0507 (146-309)||(351-514)
scaffold0507 (350-465)||(216-331)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (198-693)||(15832-16327)
scaffold0333 (21-358)||(15493-15829)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (21-693)||(16050-16722)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (21-696)||(24702-25377)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (122-479)||(628-985)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (22-671)||(12633-13282)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (21-693)||(5225-5896)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (308-681)||(6336-6709)
scaffold0358 (21-81)||(6273-6333)
[»] scaffold0023 (7 HSPs)
scaffold0023 (220-696)||(4085-4561)
scaffold0023 (405-693)||(130532-130820)
scaffold0023 (239-693)||(58972-59426)
scaffold0023 (543-699)||(29008-29163)
scaffold0023 (405-507)||(134626-134728)
scaffold0023 (35-185)||(4567-4717)
scaffold0023 (21-99)||(36974-37052)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (21-693)||(3875-4547)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (335-693)||(10-368)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (21-642)||(10425-11045)
[»] scaffold0001 (8 HSPs)
scaffold0001 (21-693)||(90566-91238)
scaffold0001 (22-477)||(448060-448515)
scaffold0001 (461-693)||(390834-391066)
scaffold0001 (21-284)||(162113-162376)
scaffold0001 (383-636)||(114542-114795)
scaffold0001 (119-189)||(175361-175431)
scaffold0001 (608-693)||(89888-89973)
scaffold0001 (146-290)||(78666-78810)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (21-690)||(41970-42639)
scaffold0010 (21-693)||(47033-47705)
scaffold0010 (440-689)||(2340-2589)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (21-693)||(19983-20655)
scaffold0298 (21-693)||(12995-13667)
scaffold0298 (21-693)||(16765-17437)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (21-494)||(2-475)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (21-663)||(27519-28161)
scaffold0139 (21-689)||(787-1454)
scaffold0139 (539-663)||(34290-34414)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (21-693)||(6670-7342)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (21-693)||(9798-10465)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (21-693)||(33311-33983)
scaffold0076 (146-681)||(40383-40918)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (21-693)||(47124-47796)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (21-693)||(51497-52169)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (21-693)||(13535-14207)
scaffold0034 (56-693)||(4587-5224)
scaffold0034 (548-693)||(67897-68042)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (31-693)||(4760-5422)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (344-693)||(7963-8311)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (21-693)||(6183-6856)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (308-693)||(1552-1937)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (21-693)||(27226-27897)
[»] scaffold0192 (2 HSPs)
scaffold0192 (21-693)||(26142-26814)
scaffold0192 (359-693)||(26862-27196)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (21-693)||(48841-49513)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (21-693)||(248613-249285)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (21-484)||(16987-17450)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (21-693)||(28402-29075)
scaffold0064 (21-693)||(40393-41066)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (324-573)||(46531-46780)
scaffold0007 (21-683)||(86154-86810)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (21-693)||(18171-18843)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (21-693)||(39739-40410)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (21-693)||(60848-61519)
scaffold0067 (21-693)||(67236-67907)
scaffold0067 (21-693)||(51814-52485)
[»] scaffold0483 (2 HSPs)
scaffold0483 (21-628)||(9782-10389)
scaffold0483 (587-693)||(12060-12166)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (22-693)||(42784-43455)
[»] scaffold0235 (4 HSPs)
scaffold0235 (21-693)||(21305-21977)
scaffold0235 (221-468)||(26006-26253)
scaffold0235 (503-639)||(26288-26424)
scaffold0235 (620-693)||(11091-11164)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (21-693)||(19120-19792)
scaffold0058 (65-285)||(58448-58668)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (21-693)||(528-1200)
scaffold0104 (626-693)||(12582-12649)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (21-680)||(37202-37861)
scaffold0026 (119-397)||(38103-38382)
scaffold0026 (119-279)||(27385-27545)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (401-699)||(197106-197404)
scaffold0017 (350-468)||(21927-22045)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (21-693)||(98-770)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (21-693)||(2751-3423)
scaffold0035 (569-690)||(12833-12954)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (21-693)||(48668-49339)
scaffold0053 (21-633)||(57511-58122)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (21-690)||(16350-17019)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (21-693)||(6872-7542)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (56-417)||(16375-16736)
scaffold0138 (620-693)||(8721-8794)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (21-693)||(38-705)
scaffold0124 (21-693)||(10888-11560)
scaffold0124 (146-681)||(7456-7991)
[»] scaffold0761 (2 HSPs)
scaffold0761 (461-699)||(4727-4965)
scaffold0761 (146-681)||(32-567)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (135-693)||(1908-2466)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (56-681)||(18884-19509)
scaffold0090 (119-681)||(23109-23671)
[»] scaffold0114 (4 HSPs)
scaffold0114 (21-693)||(43505-44177)
scaffold0114 (21-693)||(44517-45189)
scaffold0114 (21-636)||(20122-20737)
scaffold0114 (21-186)||(36055-36220)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (21-693)||(26261-26933)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (152-693)||(1-541)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (117-693)||(10865-11441)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (21-681)||(25511-26171)
scaffold0113 (21-285)||(16676-16940)
[»] scaffold0375 (2 HSPs)
scaffold0375 (452-699)||(3442-3689)
scaffold0375 (236-352)||(3694-3810)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (21-692)||(12420-13087)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (117-693)||(5309-5885)
[»] scaffold0324 (2 HSPs)
scaffold0324 (453-693)||(19636-19876)
scaffold0324 (21-206)||(16957-17142)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (21-584)||(13994-14557)
scaffold0203 (21-165)||(9039-9183)
[»] scaffold1001 (1 HSPs)
scaffold1001 (351-617)||(1-267)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (21-485)||(5756-6219)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (413-693)||(18839-19119)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (239-690)||(2992-3443)
scaffold0222 (21-108)||(3487-3574)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (21-381)||(206-566)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (511-693)||(25464-25646)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (236-693)||(5086-5543)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (176-681)||(880-1385)
[»] scaffold0198 (2 HSPs)
scaffold0198 (21-285)||(27967-28231)
scaffold0198 (620-699)||(24097-24176)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (21-279)||(30-288)
[»] scaffold0149 (3 HSPs)
scaffold0149 (464-693)||(11302-11531)
scaffold0149 (473-693)||(6871-7091)
scaffold0149 (21-200)||(13380-13559)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (452-693)||(2509-2750)
[»] scaffold1710 (2 HSPs)
scaffold1710 (218-655)||(86-523)
scaffold1710 (146-291)||(946-1091)
[»] scaffold0682 (2 HSPs)
scaffold0682 (21-302)||(191-472)
scaffold0682 (608-693)||(470-555)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (357-693)||(5969-6307)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (398-680)||(4945-5227)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (542-693)||(1988-2139)
[»] scaffold0249 (2 HSPs)
scaffold0249 (21-417)||(4912-5308)
scaffold0249 (412-681)||(1618-1887)
[»] scaffold0924 (1 HSPs)
scaffold0924 (21-411)||(3891-4281)
[»] scaffold0126 (2 HSPs)
scaffold0126 (452-693)||(41350-41589)
scaffold0126 (21-108)||(45845-45932)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (21-453)||(38761-39193)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (21-285)||(1211-1475)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (146-681)||(46279-46814)
scaffold0066 (491-693)||(68225-68427)
[»] scaffold0574 (2 HSPs)
scaffold0574 (539-692)||(844-997)
scaffold0574 (21-249)||(4217-4445)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (21-285)||(14086-14349)
scaffold0266 (491-681)||(9507-9697)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (146-681)||(23519-24054)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (475-693)||(4884-5102)
scaffold0165 (21-229)||(1177-1385)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (350-681)||(7497-7828)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (575-693)||(4425-4543)
scaffold0270 (575-693)||(11555-11673)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (146-681)||(14383-14918)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (453-693)||(32953-33193)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (146-681)||(3284-3818)
[»] scaffold0244 (2 HSPs)
scaffold0244 (539-654)||(17877-17992)
scaffold0244 (221-525)||(25959-26263)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (146-681)||(13033-13568)
[»] scaffold0808 (2 HSPs)
scaffold0808 (159-468)||(913-1222)
scaffold0808 (554-681)||(700-827)
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (608-693)||(39645-39730)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (146-681)||(3521-4056)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (248-467)||(71446-71665)
scaffold0021 (566-681)||(33059-33174)
scaffold0021 (167-302)||(13397-13532)
scaffold0021 (587-681)||(24529-24623)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (21-180)||(136119-136278)
scaffold0019 (389-501)||(136278-136390)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (21-170)||(2023-2172)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (159-436)||(14661-14938)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (146-681)||(24005-24540)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (221-458)||(1293-1530)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (146-681)||(27912-28447)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (566-689)||(81470-81593)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (194-681)||(3590-4077)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (159-468)||(9125-9434)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (146-681)||(14782-15316)
scaffold0132 (221-681)||(43738-44198)
[»] scaffold0305 (2 HSPs)
scaffold0305 (532-674)||(11167-11309)
scaffold0305 (350-436)||(10985-11071)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (219-470)||(8748-8999)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (539-681)||(5693-5835)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (511-681)||(18541-18711)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (159-291)||(5879-6011)
scaffold0447 (159-291)||(10493-10625)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (362-681)||(14478-14798)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (159-291)||(8488-8620)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (502-681)||(3565-3744)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (362-466)||(2897-3001)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (389-468)||(17-96)
[»] scaffold1061 (1 HSPs)
scaffold1061 (620-693)||(2187-2260)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 604; Significance: 0; HSPs: 83)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 604; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 704
Target Start/End: Original strand, 27187269 - 27187952
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27187269 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgctgcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaat 27187368  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27187369 ctgatatggaccaatgaatttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 27187468  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27187469 ttaaattcaagatcttttcttcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagttt 27187568  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  27187569 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcatctccgaccatacagagcctcgaacggtgccat 27187668  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27187669 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 27187768  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27187769 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 27187868  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 704  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27187869 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctccttgatgt 27187952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 604; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 704
Target Start/End: Complemental strand, 27261971 - 27261288
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27261971 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgctgcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaat 27261872  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27261871 ctgatatggaccaatgaatttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 27261772  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27261771 ttaaattcaagatcttttcttcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagttt 27261672  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  27261671 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcatctccgaccatacagagcctcgaacggtgccat 27261572  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27261571 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 27261472  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27261471 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 27261372  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 704  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27261371 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctccttgatgt 27261288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 580; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 704
Target Start/End: Complemental strand, 28292820 - 28292137
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  28292820 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaat 28292721  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28292720 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttaacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 28292621  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    | ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28292620 ttaaattcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagttt 28292521  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28292520 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 28292421  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28292420 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaatggaagatgactgtccgaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaataaa 28292321  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  28292320 tcctctagtgactgaattgtcctctccaactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 28292221  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 704  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  28292220 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttgatgt 28292137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 704
Target Start/End: Complemental strand, 28263645 - 28262962
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  28263645 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaatat 28263546  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28263545 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 28263446  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28263445 ttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagttt 28263346  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28263345 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatatccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 28263246  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28263245 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaataaa 28263146  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28263145 tcctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatccgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 28263046  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 704  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| || |||||||    
T  28263045 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcaaaatctctttgatgt 28262962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 704
Target Start/End: Complemental strand, 28342394 - 28341711
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  28342394 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaatat 28342295  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28342294 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 28342195  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28342194 ttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagttt 28342095  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28342094 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatatccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 28341995  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28341994 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaataaa 28341895  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28341894 tcctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatccgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 28341795  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 704  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| || |||||||    
T  28341794 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcaaaatctctttgatgt 28341711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 574; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 24313616 - 24312935
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  24313616 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 24313517  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  24313516 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 24313417  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    || |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24313416 tggaactcaagatctttcctatgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 24313317  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24313316 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 24313217  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24313216 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaa 24313117  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  24313116 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 24313017  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  24313016 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 24312935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 566; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 29592368 - 29591687
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  29592368 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 29592269  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  29592268 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 29592169  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29592168 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 29592069  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  29592068 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 29591969  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29591968 tccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcgagaacacaaattctcaacaaa 29591869  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29591868 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcactctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 29591769  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  29591768 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaagggacaccatgcaacttcacaatctccttgat 29591687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 564; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 704
Target Start/End: Complemental strand, 1543532 - 1542849
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  1543532 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 1543433  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1543432 ctgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgccctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcc 1543333  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  1543332 tgaaactcaagatcttttctgcgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgggacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 1543233  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1543232 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttatgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 1543133  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1543132 tccaatactagaatgatagctattattgtaagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagctcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 1543033  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1543032 tcctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 1542933  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 704  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||    
T  1542932 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatgt 1542849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 562; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 2875251 - 2874570
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  2875251 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccactgttccaactctttccaatat 2875152  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  2875151 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttatttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaactcgtggtctccttct 2875052  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2875051 tgaaactcaaaatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatccgaactttctcagtagttt 2874952  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2874951 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacccgactcaaaccagcacaacggggttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 2874852  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2874851 tccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 2874752  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2874751 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 2874652  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||    
T  2874651 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaagttcacaatctccttgat 2874570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 16627165 - 16626484
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16627165 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 16627066  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16627065 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 16626966  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16626965 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcaatagttt 16626866  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16626865 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 16626766  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16626765 tccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattttcaacaaa 16626666  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  16626665 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcatctttgaacccaaggcctcttgcaaacttt 16626566  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  16626565 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 16626484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 554; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Original strand, 25112385 - 25113066
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  25112385 catacttctgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccgactctttccaatat 25112484  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25112485 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcagcttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcc 25112584  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25112585 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataagtcttttgtcgactctgcgacgctttaattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagttt 25112684  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  25112685 gctgaacgatcgctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcataacggaattctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccat 25112784  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25112785 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaa 25112884  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  25112885 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataggccgaacttaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactct 25112984  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  25112985 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 25113066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 458; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 5839667 - 5838986
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  5839667 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgtaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaactcgatacgccactgttccaactctttccgatat 5839568  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||     
T  5839567 ctgatacggaccaataaacttcgaagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcaaaaacgtgtggtctccttct 5839468  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||| |    
T  5839467 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttctcttaaatcatcttgactttctctgtagtct 5839368  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  5839367 gctgaacaatctctggtcctaagaccaccctatctcctgattcaaaccaacacaacgaagttctacatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcat 5839268  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  5839267 tccaatgctagaatgataactattattatacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccctgctcaagaacacaaactctcaacaaa 5839168  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  5839167 tcctctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactct 5839068  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  5839067 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctaactgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatttccttgat 5838986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 699
Target Start/End: Original strand, 19864520 - 19865198
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||  | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| | ||    
T  19864520 catacttctgaagttgcgacacatgaaagacatcatacaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaaatctttccgatat 19864619  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  19864620 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaacacgtggtctccttct 19864719  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |    
T  19864720 tgaaactcaagatcttttctgcacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtct 19864819  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  19864820 gctgaccaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagccgcaaaaggtgccat 19864919  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  19864920 tccaataccaaaatgataactattattatacgtgaactcaatcaacggaagatgactagcccaggttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaa 19865019  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  19865020 tcctctagcgactgaatcgtcctatccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactct 19865119  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 699  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  19865120 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgtaggaacaccatgaaacttcacaatctcctt 19865198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 25610309 - 25609640
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  25610309 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgcgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaacacgatacgccaccgttccaactctttccgatat 25610210  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    || ||| |||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||     
T  25610209 ctaatacggaccaataaatctcggaatcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccggtcacaggtgtgactctcaaaaacatgtggtctccttct 25610110  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  25610109 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgtgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagttt 25610010  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  25610009 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaatggagttctgcatctccgaccatacaaagcatcataaggtgccat 25609910  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  25609909 tccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactttatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaa 25609810  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  25609809 tcttctaacgactgaatcgtcctttccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttt 25609710  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 690  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  25609709 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatggtcgaaggaacaccatgcaacttcac 25609640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 27331881 - 27331209
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||  | ||    
T  27331881 catacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatat 27331782  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| || |||||     
T  27331781 ctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcctttacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatccccttct 27331682  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  27331681 tgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttaactttctcagtagttt 27331582  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | |||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27331581 gttgaacattctcgggtcctaaaaccaccctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccat 27331482  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  27331481 tccaatactagaatgataactattattgtacatgaacactatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagcacacaaaccctcaacaag 27331382  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  27331381 tcctctagcgactgaatcgtcctctctgacagaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaactcaaagcctcttgcaaacttt 27331282  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||    
T  27331281 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgaaagaacaccatgcaacttcacaat 27331209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 27392621 - 27391949
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||  | ||    
T  27392621 catacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatat 27392522  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| || |||||     
T  27392521 ctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcctttacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatccccttct 27392422  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  27392421 tgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttaactttctcagtagttt 27392322  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | |||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27392321 gttgaacattctcgggtcctaaaaccaccctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccat 27392222  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  27392221 tccaatactagaatgataactattattgtacatgaacactatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagcacacaaaccctcaacaag 27392122  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  27392121 tcctctagcgactgaatcgtcctctctgacagaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaactcaaagcctcttgcaaacttt 27392022  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||    
T  27392021 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgaaagaacaccatgcaacttcacaat 27391949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 16928088 - 16927416
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || |||| |||||||||||||||| ||||| || |  ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16928088 catactttcgaagttgcgacacatgtaatatatcgtgcgaattcgaaagatgcggtggtaatccaagacgatacgccaccgttccaactctttccaatat 16927989  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16927988 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacactagtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 16927889  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||  |||||| | ||||| |    
T  16927888 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttttcgactctgcggcgctttcatcttttcttgaatcatctttactttccctgtagtct 16927789  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16927788 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 16927689  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||||    
T  16927688 tccaatactagaatgatagctattgttatacgtgaactctattaacgggagatgactgtcccaagttccagcttgctctagcacacaaatcctcaacaaa 16927589  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||||    
T  16927588 tcctctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttggtacctaaagcctcttgcaaacttt 16927489  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  16927488 tccaaaatctagaagtaaatctcgggtctctatttgatacaatgctcgaaggaataccatgcaacttcacaat 16927416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 18408391 - 18407718
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  18408391 catactttcgaagttgcgacacatgaaacacatagtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccacccgatacgccaccgttccaactctttccgatat 18408292  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||| ||||     
T  18408291 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacacgagttactctcaaaaatacgtggtcttcttct 18408192  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||| ||| ||||| |||||||    
T  18408191 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactattttgtcgactctacgacgctttcatcttctcttgaattatcttaaccttctcggtagttt 18408092  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  18408091 gttgaacaatctctggtcctaataccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcataaggtgccat 18407992  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctatta-ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 519  Q
    |||||||||||||||||| ||| || || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  18407991 tccaatactagaatgataactagtatttgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaa 18407892  T
Q  520 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 619  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  18407891 atcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccctctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactt 18407792  T
Q  620 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  18407791 ttccaaaatctagacgtaaaccttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 18407718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 22079136 - 22078478
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| | ||    
T  22079136 catacttccgaagttgctacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgtaccaactctttccgatat 22079037  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||| ||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  22079036 ctgatacggacgaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccaatcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttct 22078937  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||| | ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  22078936 tgaaactcaagatctttcctaagcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcatcttttctggaatcatcttaaccttctcagtggttt 22078837  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22078836 gttgaacaatctctagtcctaagaccactttttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccat 22078737  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| | ||||||||    
T  22078736 tccaatactagaa--ataactattattgtacgtgaactttatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcgagttcacaaactttcaacaaa 22078639  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22078638 tcttccagcgactgaatcgtcctctccgactaaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagagcctaaagcctcttgcaaacttt 22078539  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22078538 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatg 22078478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 16963815 - 16963155
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||| |||||||||| ||||| | ||    
T  16963815 catactttcgaagttgcgacacatgtaatacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaacacgatacgccatcgttccaactatttccgatat 16963716  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||     
T  16963715 ctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcttttacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacttggtctccttct 16963616  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||  |||||||| ||||| |    
T  16963615 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatctttactttctctgtagtct 16963516  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16963515 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaatcaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccat 16963416  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||| | |||||||| || |||||||| || ||||||    
T  16963415 tccaatactagaatgatagctattgttagacgtgaactctattaacgggagatgactgtcccaagtttcaccttgctctagcacacaaatccttaacaaa 16963316  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||||    
T  16963315 ttctctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttggtacctaaagcctcttgcaaacttt 16963216  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16963215 tccaaaatctagaagtaaatctcgggtctctatctgatataatgctcgaaggaacaccatg 16963155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 22762903 - 22762231
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| | ||    
T  22762903 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacaaagtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccacttgatacgccatcgttccaactctttccgatat 22762804  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||  |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  22762803 ctgattcggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcacaaatacgtggtctccttct 22762704  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| |||  | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| |||| |||    
T  22762703 tgaaactcaagatctgtcctacgcttatcattgtaactctattgtcgactctccgaaactttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaattt 22762604  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  22762603 gttgaacaatctctggtcctaagactactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccacacaaagtctcgtaaggtgccat 22762504  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  22762503 tccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatctcaagttcctccttcctcaagtacacaaactctcaacaaa 22762404  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||| |||||||||    
T  22762403 tcttctaacgactgaatcgtcctctccgactaaccatcagtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttataacctaaagcctctggcaaacttt 22762304  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22762303 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 22762231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 23078302 - 23078974
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || || |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||| | ||    
T  23078302 catacttccgaagttgcgatacatgtaatacttcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgtttaaactctttccgatat 23078401  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| | || ||| ||  |||| |||||||||||||||||||| || || || |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  23078402 ctgatacgaacaaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgcccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatctccctct 23078501  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  23078502 tgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgagtctgcgatgctttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 23078601  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  23078602 gttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttatgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccat 23078701  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  23078702 tccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctataaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaag 23078801  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |  || | ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||  | || |||| |||||| ||||| |    
T  23078802 tattccaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctctctgcggacgatacgccgaactcaacctcaacttataacctaaagactcttgtaaactct 23078901  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23078902 tcaaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaat 23078974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 488
Target Start/End: Original strand, 12497859 - 12498326
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  12497859 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 12497958  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||| || |||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12497959 ctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 12498058  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  12498059 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 12498158  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  12498159 gttgaacaatctcgggtcctaagaccattctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcat 12498258  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 488  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12498259 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 12498326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 12511042 - 12510575
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  12511042 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 12510943  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||| || |||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12510942 ctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 12510843  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  12510842 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 12510743  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  12510742 gttgaacaatctcgggtcctaagaccattctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcat 12510643  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 488  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12510642 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 12510575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 248 - 697
Target Start/End: Original strand, 22433929 - 22434378
Alignment:
Q  248 tcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagacca 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22433929 tcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagacca 22434028  T
Q  348 ctctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattatt 447  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22434029 ctctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactgttatt 22434128  T
Q  448 ataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctcc 547  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||    
T  22434129 gtaagtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctctttgctcaagtacacaaaccctcaacaaatcttctaacgacttaatcgtcctctcc 22434228  T
Q  548 gactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 647  Q
    |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  22434229 gactaatcatctgtctgcggatgatacgctgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatccagaagtaaatcttggat 22434328  T
Q  648 ctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 697  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  22434329 ctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcactatttcc 22434378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 21 - 488
Target Start/End: Original strand, 12505188 - 12505655
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  12505188 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgaaaaatcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 12505287  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||| || |||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12505288 ctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 12505387  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |    
T  12505388 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatattctcttgaatcatcttaacattctcagtagtat 12505487  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||    
T  12505488 gatgaacaatctcgggtcctaagaccaatctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataaaaaacctcaaaaggtgacat 12505587  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 488  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12505588 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 12505655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 21 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 25765737 - 25765312
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| | ||    
T  25765737 catacttccaaagttacgacacatggaacacatcgtgcaagttcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacaccaccgttccaactctttccgatat 25765638  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||   |||||||||||| |||||||||||||||     
T  25765637 ctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagcg-tgactctcaaaagcacgtggtctccttct 25765539  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |    
T  25765538 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcattttctcttgaatcatctttactttctcagtagtct 25765439  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25765438 gctgaacaatctctggtcctaagaccactttttcacctgactcaaaccaacacaatggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 25765339  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattatt 447  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  25765338 tccaatactagaatgataactattatt 25765312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 25768024 - 25768696
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| |||||||| || || ||||  |||||||| |||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  25768024 catacttccgaagctgcgacacgtgaaacacatcatgcaaattggaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagatat 25768123  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||| || |||||||| ||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||| || ||||||||     
T  25768124 ctggtacggaccaataaactttgaagtcaatttcttagacttcaacgcacgtcctacacccgtcataagagtgactctcagaaacacatgatctccttct 25768223  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||| ||  || ||||| |||||||    
T  25768224 tgaaactcaagatccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcaacttgaccttctccgtagttt 25768323  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  25768324 gatgaactaaatccggtccaaagaccacactttctcccgactcaaaccaacacaatggagtcctgcacctccgaccacacaaagcttcgaacggtgccat 25768423  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || |  || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| | ||||    
T  25768424 accaatactcgaatggtaacagttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactcttagcaaa 25768523  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| |  |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| |    
T  25768524 tcctcgaatgactgaatcgttttctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaactttgaacccaaggcatcttggaaactct 25768623  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||| ||| |||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  25768624 tccaaaatcttgaattaaacctcggatctctatcggacacaatactcgatggaactccatgtaacttcacaat 25768696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 21471434 - 21472106
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  21471434 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagatat 21471533  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||| || ||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||     
T  21471534 ctggtacggatcaataaacttcggagtcaacttcttagatttcaacgcacgtcctacccccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccttct 21471633  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   || | ||  || ||||| ||||| |    
T  21471634 tgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttattaacttgaccttctccgtagtct 21471733  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  || ||||| || ||  | ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21471734 gatgaaccaaatccggtcccaacactgcactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtcctgcacctccgtccatacaaagcttcgaacggtgccat 21471833  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| |  ||     
T  21471834 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaaatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactcttagaaag 21471933  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||  |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  21471934 tcctctaatgactgaatagttctctcccactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaatctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactct 21472033  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  21472034 tccaaaaccttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatggaactccatgaaacttcacaat 21472106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 394 - 681
Target Start/End: Original strand, 17032589 - 17032876
Alignment:
Q  394 accatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcct 493  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17032589 accatataaagcttcaaaaggtgccattctgatactagaatgataactattagtgtaagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcct 17032688  T
Q  494 tgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaact 593  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  17032689 tgttcaagaacacaaattctcaacaaatcttctagcgactgaattgtcctttccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaact 17032788  T
Q  594 tcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17032789 tcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 17032876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 19879131 - 19879803
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||| |  || ||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  19879131 catacttccgcaactgtgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactgttccaactctctcagatat 19879230  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| | ||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||     
T  19879231 ctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagatttcaatgcacggcctacacctgccataggagtgactctcaagaacacatgatctccctct 19879330  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| |  |||   || | || ||| || || |||||||    
T  19879331 tgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgaccctttcatctgttctcttattaacttaaccttttctgtagttt 19879430  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| || ||||| || || | ||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| || || || ||||||||    
T  19879431 gttgaactatgtctggccccaacatcacactttctcccgattcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgtccatacaatgcttcaaacggtgccat 19879530  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| | |    
T  19879531 accaatactcgaatggtaactattgttgtaagtaaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaataga 19879630  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||  || || || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  19879631 tcctctaaggattgtatcgtcctctctgactgtccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgagcccaaagcatcttgcaaactct 19879730  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  19879731 tccagaatctagatgtgaacctcggatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 19879803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 56 - 690
Target Start/End: Original strand, 15459204 - 15459838
Alignment:
Q  56 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 155  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||     
T  15459204 tgcaaattcgaaagatgaggtggtaatcccactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcc 15459303  T
Q  156 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 255  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  15459304 tcgacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttgtcatggta 15459403  T
Q  256 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttca 355  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||||||   |||||||| ||||| |  ||||| |  || ||||| || || || |||||     
T  15459404 gctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctaatcatcctgactttctccgtagtctcgtgaaccaaatccggtcccaacacaacactttct 15459503  T
Q  356 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 455  Q
    || ||||||||||| || |  ||||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || ||||    
T  15459504 cccgactcaaaccaacatagaggagtcctacacctccgaccatataaagcttcaaatggtgccataccaatacttgaatgataactgttattgtatgtga 15459603  T
Q  456 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 555  Q
    | || ||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |  || |  ||||||||||  || || ||||||||||||||||||||    
T  15459604 attctatcaatggtagatgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacatacccttagtaaatcctctaaagattggattgtcctctccgactgacc 15459703  T
Q  556 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 655  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || || ||||| || || || |||||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  15459704 atcagtctgcggatgataagccgaactcaacttcaattttgaacccaacgcgtcctgtaaactcctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatct 15459803  T
Q  656 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 690  Q
    || || || ||||| ||||||||||| | ||||||    
T  15459804 gacactatactcgacggaacaccatgcaacttcac 15459838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 67 - 693
Target Start/End: Original strand, 17415365 - 17415991
Alignment:
Q  67 aagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaa 166  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||     
T  17415365 aagatgcggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaat 17415464  T
Q  167 gcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtc 266  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| || ||||| || |||||||||||  | |||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  17415465 gcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcataaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtc 17415564  T
Q  267 gactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaa 366  Q
    |||||| |||||| ||||| || ||    |||||||  |||||||| ||||| || ||||| |  || ||||| || || || |||||  ||||||||||    
T  17415565 gactctacgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactttcttctgactcaaa 17415664  T
Q  367 ccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaac 466  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||  ||||||| ||||| || || || || || |||||||| ||| ||    
T  17415665 ccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgtcatatcaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcgac 17415764  T
Q  467 ggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcg 566  Q
    || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | | ||| ||||||||| |  || || || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17415765 ggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactatcagcaaatcctccaatgattggatcgtcctcttcgactgaccatctgtctgcg 17415864  T
Q  567 gatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgct 666  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||    
T  17415865 gatgataagccgaacttaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatact 17415964  T
Q  667 cgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||    
T  17415965 cgacggtacaccatgtagcttcacaat 17415991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 56 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 34645999 - 34645362
Alignment:
Q  56 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 155  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || | || ||| ||||| ||||||||| | ||  | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  34645999 tgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaattctatacgccacagttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttct 34645900  T
Q  156 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 255  Q
    | || || || ||||| || ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  34645899 tagattttaatgcacgacccacacctgtcataggagtgaccctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgata 34645800  T
Q  256 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttca 355  Q
     ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  |||   |||| || ||| || || |||||||| ||||| || |||||||| || | ||| |||||     
T  34645799 gctcttctgtcgactctgcgacgctttcatatgttctcttatcaacttaaccttttctgtagtttgttgaactatgtctggtcccaacatcacactttct 34645700  T
Q  356 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 455  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |    
T  34645699 cccgactcaaaccaacacaaaggagtcctgcatctgcgaccatacaatgcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttataagtaa 34645600  T
Q  456 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 555  Q
    | || |||||||| |  || |||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |  || | |||||||||||  || || ||||||||||||||||||||    
T  34645599 attctatcaacggtaagtggctatcccacgctccaccttgctcaagtacacatacccttagcaaatcctctaaagattggattgtcctctccgactgacc 34645500  T
Q  556 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 655  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  34645499 atcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgatcccaacgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaaccttggatccctatct 34645400  T
Q  656 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  34645399 gatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 34645362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 10469297 - 10468625
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||  ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  10469297 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaggttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaaccctctctgaaat 10469198  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  10469197 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 10469098  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||   |||| |   |||||||||||||| |    
T  10469097 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 10468998  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  10468997 catgaaccaaatccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 10468898  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| | | |||||||| || ||||| |  |||||||||    
T  10468897 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtgaactcaatcaacggtaggtgactatcccaagcttcaccttgctcgagcacacacaccctcaacaaa 10468798  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| |    
T  10468797 tcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgaacccaaagcatcctgtaaactct 10468698  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||    
T  10468697 tccaaaacctagaggtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaat 10468625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 80 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 14381856 - 14381243
Alignment:
Q  80 aaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacac 179  Q
    ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  14381856 aaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacac 14381757  T
Q  180 cagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgc 279  Q
    | ||||||||| | || |||| ||| || || || || ||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  14381756 ccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcgtgataactcttctgtccactctgcgacgc 14381657  T
Q  280 cttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacgga 379  Q
     ||||| || |||   |||||||  |||||||| ||||| || ||||| |  || | ||| || || || || || | ||||||||||||||| || |||    
T  14381656 tttcatcttttctcttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatccgatcccaacacgacactctctcatgactcaaaccagcataaagga 14381557  T
Q  380 gttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactat 479  Q
    || || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| |    
T  14381556 gtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactgt 14381457  T
Q  480 cccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccga 579  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||| |  || |  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  14381456 cccaagttccaccttgcttaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgatttgatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagctga 14381357  T
Q  580 actcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacacca 679  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||| || || |||    
T  14381356 actcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctattcgacacaatactcgacggtactcca 14381257  T
Q  680 tgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||||||    
T  14381256 tgtagcttcacaat 14381243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 21564580 - 21563908
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||| | ||| |||||||| || || |  ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  21564580 catacttccgtaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattctaaagatgaggcggcaaacccactctatacgccactgttccaaccctctcagatat 21564481  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| || ||||| ||     
T  21564480 ctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcaaaggagtgactctcaagaacacatgatctccctct 21564381  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||| |  |||   |||| || ||| || |   |||| |    
T  21564380 tgaaactcaaggtccttcctacgtttgtcatgatagctcttctgtcgactctacgacgctttcatctgttctcttatcaacttaaccttttttttagtct 21564281  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||| || |||||||| || | ||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| | ||| |||||||| |||||||| ||||| ||  ||||    
T  21564280 gctgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcctgactcaaaccaacataaaggagtccggcacctccgaccgtacaaagcttcgaacggaaccat 21564181  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || |||||  | || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  21564180 accaatactcgaatggtaactattgatgtaggtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacatactctcagcaaa 21564081  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  21564080 tcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactct 21563981  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||| ||||| || || | |||||||||  | ||||| |||||  | |||||||| ||||| |||||    
T  21563980 tccaaaatcttgaagtgaacctcgaatctctatcctacacaatactcgaccgtacaccatgaagcttaacaat 21563908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 22797080 - 22796408
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  22797080 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatat 22796981  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
     |||||  ||||||| ||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| || ||||| ||     
T  22796980 atgatacagaccaataaacttaggagtcaacttcctagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctct 22796881  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||| ||||| || ||    ||||||| ||| ||||| ||||| |    
T  22796880 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttatgtagactttgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttaaccttctctgtagtct 22796781  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  || ||||  || || || || || ||||||||||| || || || ||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||    
T  22796780 gatgaaccaaatccggtcgcaacactacactctctcctgactcaaatcaacataaaggagtcctgcacctccgaccgtacaaagctttgaacggtgccat 22796681  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  22796680 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaatctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaa 22796581  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||  ||| ||||| || |||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  22796580 tcctctgacgattgaatcgttctctccgactgaccatatgtttgcgaatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaatgcatcttgcaaactct 22796481  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  22796480 tccaaaatcttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaat 22796408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 38 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 11280936 - 11280277
Alignment:
Q  38 gacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatga 137  Q
    ||||||||||| || |  |||||||| |||||||| || ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | ||  | ||||||||||| ||||| |    
T  11280936 gacacatggaacacgtcatgcaaatttgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactgttccaactctctcagatatctgatatgggccaataa 11280837  T
Q  138 acttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttt 237  Q
    |||| || ||||||||||| || || || ||| |||||||||| ||||||||  ||| |||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| || ||    
T  11280836 actttggagtcaacttcttagattttaatgcatgtcctacacctgtcataggtgtgattctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtcctt 11280737  T
Q  238 tctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggt 337  Q
     ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  |||   || | || ||| || || |||||||| ||||| || ||||||    
T  11280736 cctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatatgttctcttattaacttaaccttttctgtagtttgttgaactatgtctggt 11280637  T
Q  338 cctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgat 437  Q
    || || | ||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| |    
T  11280636 cccaacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcatcttcgatcatacaatgcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggt 11280537  T
Q  438 agctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaat 537  Q
    | ||||| || ||||| || ||  ||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| | ||| ||||  || || ||    
T  11280536 aactattgttgtaagtaaattctgtcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaaaagatcttctaaggattgcat 11280437  T
Q  538 tgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagta 637  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||     
T  11280436 tgtcctctctgactggccatcggtctgaggatggtaagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagatgtg 11280337  T
Q  638 aatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 697  Q
    || || |||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| | |||||||||||||    
T  11280336 aacctcggatctctatctgatacaatactcgatgtaataccatgcaacttcacaatttcc 11280277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 21 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 27561065 - 27560394
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||| |  || ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||||| || || || || |||| ||| |||||||||||||   | ||  ||||    
T  27561065 catacttccgcaactgtgacacgtggaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaat 27560966  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| | ||| || || || || ||     
T  27560965 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctct 27560866  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||   ||||||||  ||||| || ||||| |    
T  27560865 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctccctgatcatcttgactttttctgtagtct 27560766  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
     |||||| |  || ||||| || || || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27560765 cctgaactaaatccggtcccaacacaacactttctcctgattcaaaccaacacaatggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccat 27560666  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||| ||||| |||||||| || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | |||||||||     
T  27560665 tcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaag 27560566  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || || |  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  27560565 tcttccaatgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactct 27560466  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 692  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27560465 tccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 27560394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 131 - 628
Target Start/End: Original strand, 1640715 - 1641212
Alignment:
Q  131 ccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaa 230  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||| |||  ||||||| | |||||| || |||||||||| ||| ||||    
T  1640715 ccaataaacctcggggtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggggtgactcttagaaacacatgatctccttcctaaaattcaa 1640814  T
Q  231 gatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatca-tctgaactttctcagtagtttgctgaacaa 329  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||   |||| | ||| |||| || ||||| || ||||| |    
T  1640815 ggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctcttatcaatttgaccttt-tctgtagtctgatgaacta 1640913  T
Q  330 tctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatact 429  Q
    | |||||||| || |  || |||||||| |||| |||||| || |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  1640914 tatctggtcccaacattacactttcacccgacttaaaccaacataacggagttctgcacctccgtccatgcaaagcttcgaacggtgccataccaatact 1641013  T
Q  430 agaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagc 529  Q
     ||||| || || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| |    
T  1641014 cgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaac 1641113  T
Q  530 gactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaat 628  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1641114 gactgaatcgttctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaat 1641212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 21 - 690
Target Start/End: Original strand, 24364245 - 24364914
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  24364245 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaat 24364344  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||  | |||||||  ||||| || ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  24364345 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagcgcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 24364444  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||   |||| |   |||||||||||||| |    
T  24364445 tgaaactcaagatcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 24364544  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      ||||| |  || ||||| || || || || ||||  |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| | ||||||    
T  24364545 catgaaccaagtccggtcccaacacaacactctcactcgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacgatgccat 24364644  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||    
T  24364645 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaa 24364744  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || || | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |    
T  24364745 tcttccaacgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactct 24364844  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 690  Q
    |||| || |||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  24364845 tccagaacctagaagtgaacctcggatctctattcgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 24364914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 117 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 28283165 - 28282590
Alignment:
Q  117 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 216  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| | ||| || || || ||    
T  28283165 aaatctgatacgggccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcacc 28283066  T
Q  217 ttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagta 316  Q
     || |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||  ||||| || |||    
T  28283065 ctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgta 28282966  T
Q  317 gtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtg 416  Q
    || | |||||| |  || ||||| |  || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  28282965 gtctcctgaaccaaatccggtcccagcacaacactttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtg 28282866  T
Q  417 ccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaa 516  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||    
T  28282865 ccattcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaa 28282766  T
Q  517 caaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaa 616  Q
    ||| || || |  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || |||    
T  28282765 caagtcttccaatgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaa 28282666  T
Q  617 cttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 692  Q
    || ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28282665 ctcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 28282590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 56 - 693
Target Start/End: Original strand, 18794558 - 18795195
Alignment:
Q  56 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 155  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||  | |   | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  18794558 tgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactcgatatgccactgttccaaccctcttagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttct 18794657  T
Q  156 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 255  Q
    | || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| || ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  18794658 tagattttaaggcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactgaaggtctttcctacgattgtcatgata 18794757  T
Q  256 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttca 355  Q
     ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  |||   |||| || ||| || || ||||| || || || || ||||| || || | ||| |||||     
T  18794758 gctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaacttaaccttttctgtagtctgttgcactatgtctggccccaacatcacactttct 18794857  T
Q  356 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 455  Q
    ||| |||||||||| ||||| |||||| |||| || ||||| ||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || || |    
T  18794858 cctaactcaaaccaacacaaaggagttatgcaccttcgaccgtacaaggcttcaaatggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtaggtaa 18794957  T
Q  456 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 555  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  | ||||||||  || || || ||||||||||| |||||    
T  18794958 actctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtagatcctctaaagattgtatcgtcctctccgattgacc 18795057  T
Q  556 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 655  Q
    ||| || || |||||||| ||| ||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||    
T  18795058 atccgtatgaggatgataagccaaactcagcctcaatttcgaacccaaagcatcttgcaaacgcttccataatctagaagtgaacctcggatctctatct 18795157  T
Q  656 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    || ||| | ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  18795158 gacacagtactcgacggaacaccatgcatcttcacaat 18795195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 8766596 - 8766111
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  |||||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  8766596 catactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactgttccaaccctctctgaaat 8766497  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||||| |  ||||||| | | || |||| |||||| || || || |||    
T  8766496 ctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacccttgtcatagaagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcc 8766397  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  8766396 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgacgccttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtct 8766297  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      ||||| |  || |||||  | || || || || ||||||||||||||||| ||  |||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  8766296 catgaaccaaatccggtccccacacgacactctctcctgactcaaaccagcataaatgagtcctgcacctccaaccatacaaagcttcgaacggtgccat 8766197  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacac 506  Q
     |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  8766196 accaatactcgaatggtaactgttattgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagaacac 8766111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 21833429 - 21833172
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||| | ||    
T  21833429 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccattccaactctttccgatat 21833330  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  21833329 ctgatacggacctataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacctccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacatgtggtttccttct 21833230  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacg 278  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21833229 tgaaattcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacg 21833172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 281 - 693
Target Start/End: Original strand, 19453513 - 19453925
Alignment:
Q  281 ttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggag 380  Q
    ||||| ||||||  |||||||| ||||||||| ||||| || ||||| |  |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||    
T  19453513 ttcatcttctctctgatcatcttaactttctctgtagtctgatgaaccaaatctggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcataaaggag 19453612  T
Q  381 ttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatc 480  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  | || || || | |||||| ||||| || || ||||||||    
T  19453613 tcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaattgttgttgtatgcgaactctatcaatggtaggtgactatc 19453712  T
Q  481 ccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaa 580  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||   |||||||| |  || |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19453713 ccaagctccaccttgctcaagcacacacactctctgtaaatcctccaatgattagatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaa 19453812  T
Q  581 ctcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccat 680  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || | ||| ||||| || |||||||    
T  19453813 ctcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaggtgaacctcggatccctatccgacataatactcgacggtacaccat 19453912  T
Q  681 gtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||||||    
T  19453913 gtagcttcacaat 19453925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Original strand, 17032395 - 17032582
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||    
T  17032395 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccgatat 17032494  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacg 208  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17032495 ctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaacgcacgtcccacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacg 17032582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 18197995 - 18197608
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||  || | ||||| | ||    
T  18197995 catacttccgaagttgcgaaacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggcaaacccactcgatacgccactgtttaaattctttccgatat 18197896  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    || |||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||  |||| | || ||||| ||| ||| || || | ||| ||     
T  18197895 cttatacagaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaattcgcgtcctacacttgtcacaagagtgactttcagaaatacatgatatccctct 18197796  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||| ||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||  || ||||||||||| |    
T  18197795 tgaaacttaaggtctttccgacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatcttttcttaaatcatctttaccttctcagtagtct 18197696  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctc 408  Q
    | | ||||||| |||||||||| |||||  | |||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18197695 gttaaacaatcgctggtcctaaaaccacattctcacctgacttaaacgaacacaacggagttctgcacctccgaccatacaaagcctc 18197608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 366 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 5297308 - 5296982
Alignment:
Q  366 accagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaa 465  Q
    ||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||    
T  5297308 accagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaattctatcaa 5297209  T
Q  466 cggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgc 565  Q
    ||| || ||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||||     
T  5297208 cggtaggtgactatccca-gctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctga 5297110  T
Q  566 ggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgc 665  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |    
T  5297109 ggatgataagccgaacccaacctcaatttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatac 5297010  T
Q  666 tcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  5297009 tcgaaggaactccatgtagcttcacaat 5296982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 371 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 27560086 - 27559765
Alignment:
Q  371 cacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaa 470  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || || || |||||||| |||||||| |    
T  27560086 cacaatggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaacggta 27559987  T
Q  471 gatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatg 570  Q
    | ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| || || |  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27559986 ggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatg 27559887  T
Q  571 atatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaa 670  Q
    ||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||    
T  27559886 ataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaa 27559787  T
Q  671 ggaacaccatgtagcttcacaa 692  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  27559786 ggaactccatgtagcttcacaa 27559765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 14131627 - 14131363
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  | || |||||||||| ||| ||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  14131627 catacttccgtaactgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgttgtggcaaacccactctatatgccactgttccaactctctcagatat 14131528  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||| |||||| || |||||||||    
T  14131527 ctgatacggaccaataaacttcgaagtcaacttcttagacttcaatgcacgacctacacctgtcataggagtgaccctcagaaacacatgatctccttcc 14131428  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat 285  Q
    |||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14131427 tgaaactccaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcat 14131363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 119 - 507
Target Start/End: Original strand, 18800873 - 18801261
Alignment:
Q  119 atctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||  |||||| |||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || || || |    
T  18800873 atctgatatggaccaatgaactttgaagtcaactgcttcgacttcaattcacgtcttacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatccccct 18800972  T
Q  219 cctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 318  Q
    | |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  |||||||| |||||    
T  18800973 cttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctaatcatcttgactttctccgtagt 18801072  T
Q  319 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcc 418  Q
     || ||||| |  || ||||| || || || ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  |||    
T  18801073 ctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctcctaactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacgaggcc 18801172  T
Q  419 attccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaca 507  Q
    || |||||||| ||||| || || || || ||| ||||||| || ||||| || ||||||||||||| ||| |||||||| || |||||    
T  18801173 ataccaatactcgaatggtaactgttgttgtaaatgaactctataaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctctagtacaca 18801261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 279
Target Start/End: Original strand, 25750642 - 25750900
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || | ||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  25750642 catacttccgaagatgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagatat 25750741  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| | || ||||||||| |||||| || ||||||||     
T  25750742 ctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcttacacccgtcacaagagtgactctcagaaacacatgatctccttct 25750841  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgc 279  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  25750842 tgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgc 25750900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 11288029 - 11287680
Alignment:
Q  38 gacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatga 137  Q
    ||||||||||| || |  |||||||| |||||||| || ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | ||  | ||||||||||| ||||| |    
T  11288029 gacacatggaacacgtcatgcaaatttgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactgttccaactctctcagatatctgatatgggccaataa 11287930  T
Q  138 acttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttt 237  Q
    |||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| || ||    
T  11287929 actttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggggtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtcctt 11287830  T
Q  238 tctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggt 337  Q
     ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  |||   || | || ||| || || |||||||| ||||| || ||||||    
T  11287829 cctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatatgttctcttattaacttaaccttttctgtagtttgttgaactatgtctggt 11287730  T
Q  338 cctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgca 387  Q
    || || | ||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  11287729 cccaacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgca 11287680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 477 - 693
Target Start/End: Original strand, 15896383 - 15896599
Alignment:
Q  477 tatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgc 576  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || || | |||||||||  | || |||||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  15896383 tatcccaagttcctccttgctctagtacacaaactctcaacaagtcttccaacgactgaatcattctttccgactgattatctgtctgcggatgatacgc 15896482  T
Q  577 cgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaaca 676  Q
    |||||||||  ||||||| || || | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||   |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15896483 cgaactcaacttcaacttagaacctacagcctcttgcaaactcttccaaaatatagaagtatacctcacatctctatctgatacaatgctcgacggaaca 15896582  T
Q  677 ccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||||||||||    
T  15896583 ccatgtagcttcacaat 15896599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 474 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 21569986 - 21569767
Alignment:
Q  474 gactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgata 573  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21569986 gactatcccaagctccaccttgctcaagtacacatactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgata 21569887  T
Q  574 tgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagga 673  Q
     | ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || | |||||||||  | ||||| |||||  |     
T  21569886 agtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcgaatctctatcctacacaatactcgaccgt 21569787  T
Q  674 acaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||| ||||| |||||    
T  21569786 acaccatgaagcttaacaat 21569767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 194 - 294
Target Start/End: Original strand, 11291818 - 11291918
Alignment:
Q  194 actctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11291818 actctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctctt 11291917  T
Q  294 g 294  Q
    |    
T  11291918 g 11291918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 146 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 16382696 - 16382161
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||| |  |||| |||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  16382696 gtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 16382597  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 345  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  16382596 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 16382497  T
Q  346 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 445  Q
      | || || || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||| | || ||     
T  16382496 agcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttg 16382397  T
Q  446 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 545  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  16382396 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 16382297  T
Q  546 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 645  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  16382296 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 16382197  T
Q  646 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  16382196 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 16382161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 587 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 21837079 - 21836964
Alignment:
Q  587 ctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagct 686  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  21837079 ctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaact 21836980  T
Q  687 tcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||| ||||||||    
T  21836979 tcacaatctccttgat 21836964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 540 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 8762862 - 8762709
Alignment:
Q  540 tcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 639  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| ||    
T  8762862 tcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccagaatctagaagtgaa 8762763  T
Q  640 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
     || ||||||||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  8762762 cctcggatctctatccgacacaatactcgacggtacgccatgtagcttcacaat 8762709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 602 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 20637168 - 20637077
Alignment:
Q  602 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  20637168 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 20637077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 587 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 18197610 - 18197504
Alignment:
Q  587 ctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagct 686  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18197610 ctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgatggaacaccatgtagct 18197511  T
Q  687 tcacaat 693  Q
    |||||||    
T  18197510 tcacaat 18197504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 146 - 681
Target Start/End: Original strand, 16098008 - 16098543
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||| |||  | |||||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||    
T  16098008 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggtttcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctct 16098107  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 345  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || |  ||||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  16098108 tatcatgataactcttctgtctactctaagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttatgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacaa 16098207  T
Q  346 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 445  Q
      | ||||| |||||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||| || || || ||||| || |||||||||||| |  | ||     
T  16098208 ggcactttctcctgactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcttcaaacggagccataccgatactagaatgaaaattgttg 16098307  T
Q  446 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 545  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |     ||||||| |  | |||||||| |  | ||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  16098308 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcatcccaactaacaccttgctccaacatacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 16098407  T
Q  546 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 645  Q
        ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  16098408 ttttctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 16098507  T
Q  646 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||| | |||||| ||||| || ||||| | ||||||    
T  16098508 atcccgatctgacacaatactagaaggtataccatg 16098543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 146 - 681
Target Start/End: Original strand, 23996206 - 23996741
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || ||||||||| | || || ||||||||||| || ||  | |||||||||| ||| || || | ||    
T  23996206 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcataggattcacccttaaaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 23996305  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 345  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  23996306 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 23996405  T
Q  346 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 445  Q
      | || || || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| ||||||| |||| | || ||     
T  23996406 agcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaggcctcaaacagtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 23996505  T
Q  446 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 545  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      || |||    | |||||||| |  ||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  23996506 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtctcaaccaacaccttgctctaacacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 23996605  T
Q  546 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 645  Q
    ||  ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  ||||||||| || ||||||  |||||||||| ||  |    
T  23996606 ccatctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaaccttcccaaaacttagaagtaaacctcag 23996705  T
Q  646 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  23996706 atcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 23996741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 146 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 25743410 - 25742876
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||| | || |  | ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  25743410 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattctccctcaaaaacacttgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 25743311  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtccta-aga 344  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||| |||||||| ||||||| ||| || || ||||| |  || ||||  || ||||||| | |    
T  25743310 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgctctcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctacaaa 25743211  T
Q  345 ccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatt 444  Q
     ||||  |||||||||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| | || ||    
T  25743210 gcact--ttcacctgactcaaaccaacacaacggtgtcctacagctccgaccatacaaagcctcaaacggagccattccaatactagaatgaaaactgtt 25743113  T
Q  445 attataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctc 544  Q
     || ||||| ||||| || ||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    ||  || ||||||    
T  25743112 gttgtaagtaaactcaattaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctagatagtcctc 25743013  T
Q  545 tccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 644  Q
    |||| ||| ||||| ||||| ||||| || |  || |||||||||||||| |  ||||||||  |||| ||||| | ||||||  |||||||||| ||      
T  25743012 tccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagtagatctcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgtaaactctcccaaaacgtagaagtaaacctca 25742913  T
Q  645 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    |||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  25742912 gatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 25742876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 146 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 15078687 - 15078365
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||||||||  ||| | | ||||||||| || || || ||  |||||||||| | ||| |||||   ||    
T  15078687 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcactggattcagtctcaaaaatacatgatcaccaacctgaaactcgatatcctttctcttct 15078588  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 345  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| || ||| ||||||||| ||| || || ||||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  15078587 tatcatgataactcttatgtctactctgagacgctttcatcttttctcggatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacaa 15078488  T
Q  346 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 445  Q
      | ||||| |||||||||||||| |||||||| ||  | || |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | || ||     
T  15078487 ggcactttctcctgactcaaaccaacacaacggtgtcttacacctccgatcatacaaagcctcaaacggtgccattccaatactagaatgaaaactgttg 15078388  T
Q  446 ttataagtgaactcgatcaacgg 468  Q
    || ||||| ||||| ||||||||    
T  15078387 ttgtaagtaaactcaatcaacgg 15078365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 115
Target Start/End: Original strand, 22433830 - 22433924
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttcc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  22433830 catacttccgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttcc 22433924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 150 - 266
Target Start/End: Original strand, 25750908 - 25751024
Alignment:
Q  150 acttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtc 249  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25750908 acttcttagatttcaacgcacgtcctacacccgtcacaggagtgactctcagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtc 25751007  T
Q  250 atgataactcttttgtc 266  Q
    ||| |||||||| ||||    
T  25751008 atggtaactcttctgtc 25751024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 146 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 18838231 - 18837696
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||| |  ||||||||||| | || ||||| |||| |||| | || | ||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  18838231 gtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacaccggtcacaggattcacccacaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 18838132  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 345  Q
    | |||||||||||||| | |  |||||| ||||||||||| || ||||| ||||||| ||| || || ||||| |  || ||||  || ||| |||| |     
T  18838131 tatcatgataactcttctatgtactctgagacgccttcatcttttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtgctaacat 18838032  T
Q  346 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 445  Q
      | || || || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||| | || ||     
T  18838031 agcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattcggatactagaatgaaaactgttg 18837932  T
Q  446 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 545  Q
    || ||||| ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  18837931 ttgtaagtaaactcaatcaatggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 18837832  T
Q  546 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 645  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  18837831 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaaactcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaaattagaagtaaacctcgg 18837732  T
Q  646 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  18837731 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 18837696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 21413248 - 21412939
Alignment:
Q  159 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 258  Q
    ||||||||||||| || |||||||| | |||| | |||| ||| ||||  || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||    
T  21413248 acttcaaagcacgaccaacaccagttacaggattcactcacaagaacatatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 21413149  T
Q  259 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 358  Q
    |||  ||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||| || || |||||||  || ||||   | |||||||| |   | ||||| ||     
T  21413148 cttcggtctactctgagacgctttcatcttttcttggatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaactcccggtcctaacaatgcgctttctccg 21413049  T
Q  359 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 458  Q
    || |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||  ||||||| || ||| |||||||| | || ||||| ||||| ||||    
T  21413048 gattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacagtgccataccgatattagaatgaaaactgttattgtaagtaaact 21412949  T
Q  459 cgatcaacgg 468  Q
    | ||||||||    
T  21412948 caatcaacgg 21412939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 1649094 - 1648786
Alignment:
Q  159 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 258  Q
    ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||| ||    
T  1649094 acttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgatagct 1648995  T
Q  259 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 358  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||| || || || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |   |  | || ||     
T  1648994 cttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaataaagcattctctccg 1648895  T
Q  359 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 458  Q
    ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| | || || || ||||| ||||    
T  1648894 gactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 1648795  T
Q  459 cgatcaacg 467  Q
    | |||||||    
T  1648794 caatcaacg 1648786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 221 - 681
Target Start/End: Original strand, 18571684 - 18572144
Alignment:
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||||| || ||||||| ||| || || |||||||    
T  18571684 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttccttttctcctgaatcatcttaacattttccgtagttt 18571783  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      || | ||  ||||||| ||| |   | |||||||||||||||||||| |||||| | || || || |||| ||||||||||||||| || || | |||    
T  18571784 cttgcataacttctggtcttaataaagcactttcacctgactcaaaccaacacaacagtgtcctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggagtcat 18571883  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||| |||||||||||| | || || || ||||| ||||| || ||| | | ||     |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||    
T  18571884 tccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaattaactgtaaatattcgtcccaactaacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaa 18571983  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| |     || || ||||||||||  |  ||||| ||||| ||||| || || ||| ||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| |    
T  18571984 tcctccaaactttggatagtcctctccgttttcccatcggtctgaggatggtaagcagaaatcaatctcaacttggttcccaaagcagcttgcaaactct 18572083  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
     ||||||  |||||||||| || |||||   |||||| ||||| ||  |||||| ||||||    
T  18572084 cccaaaacttagaagtaaacctcggatcctgatctgacacaatactataaggaataccatg 18572144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 631 - 697
Target Start/End: Original strand, 22442710 - 22442776
Alignment:
Q  631 agaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  22442710 agaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcactatttcc 22442776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 466
Target Start/End: Original strand, 25655456 - 25655760
Alignment:
Q  161 ttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactct 260  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||  || | |||||||||||||| || || ||  ||||||||||||  || ||||| | ||| | |||||||||||    
T  25655456 ttcaaagcacgaccaacaccagttatcagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttattatgataactct 25655555  T
Q  261 tttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctga 360  Q
    | |||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||| |   |||| |  || ||||  |||| |||||| |   | |||||| ||||    
T  25655556 tctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacttttttcttagtctcttgcacaacttctgatcctaacaaagcactttca-ctga 25655654  T
Q  361 ctcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcg 460  Q
    ||||||||| |||||||   | || || ||||||||||||||| |||| ||||||  |||| | |||||||||||| | || || || ||||| |||||     
T  25655655 ctcaaaccaacacaacgacatcctacacctccgaccatacaaatcctcaaaaggtttcatttcgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcc 25655754  T
Q  461 atcaac 466  Q
    ||||||    
T  25655755 atcaac 25655760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 436
Target Start/End: Original strand, 16233242 - 16233457
Alignment:
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||| || ||||| || |||| ||| || || ||||| |    
T  16233242 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactttgagacgccttcatcttttcttgaataatcttaaccttttccgtagtct 16233341  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      || ||||  ||  ||||||| |   | || || || ||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16233342 cttgcacaacttccagtcctaacaaagcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacaccttcgaccatacaaagcctcaaacggtgccat 16233441  T
Q  421 tccaatactagaatga 436  Q
    ||| ||||||| ||||    
T  16233442 tccgatactagcatga 16233457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 109
Target Start/End: Original strand, 18787721 - 18787809
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaact 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||| |  || |||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  18787721 catactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaatatgtgatggcaaacccactctatatgccactgttccaact 18787809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 578 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 23027607 - 23027522
Alignment:
Q  578 gaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 663  Q
    |||||||| |||||||| |  |||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  23027607 gaactcaacctcaacttagttcccaaagcatcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatccctatctgacacaat 23027522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 99
Target Start/End: Original strand, 1640634 - 1640710
Alignment:
Q  23 tacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccac 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||| |||||| ||| |||||    
T  1640634 tacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaatccactctatatgccac 1640710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 389 - 468
Target Start/End: Original strand, 1652274 - 1652353
Alignment:
Q  389 ctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacgg 468  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| | || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  1652274 ctccgaccatacaaagcctcaaacggagccattccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacgg 1652353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 560 - 681
Target Start/End: Original strand, 21927577 - 21927698
Alignment:
Q  560 gtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgata 659  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |  ||||| ||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || |    
T  21927577 gtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaatgcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgaca 21927676  T
Q  660 caatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    |||| || ||||||| ||||||    
T  21927677 caatactagaaggaataccatg 21927698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 561 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 1648722 - 1648602
Alignment:
Q  561 tctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 660  Q
    |||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||    
T  1648722 tctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacac 1648623  T
Q  661 aatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||| || ||||||| ||||||    
T  1648622 aatactagaaggaataccatg 1648602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 491 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 14625216 - 14625068
Alignment:
Q  491 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 590  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||| |||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  14625216 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcatctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 14625117  T
Q  591 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 639  Q
    | || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||    
T  14625116 atttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaa 14625068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 596; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 596; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 704
Target Start/End: Complemental strand, 110117 - 109434
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  110117 catacttccgaagttgcgacacatggaagacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 110018  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  110017 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcc 109918  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109917 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 109818  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  109817 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccgt 109718  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  109717 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctctttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 109618  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  109617 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaacttt 109518  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 704  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  109517 tccaaaatctagaagtaaatcttggttctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctccttgatgt 109434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 112559 - 113231
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  112559 catacttccgcaactgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactgttccaactctctcagatat 112658  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||     
T  112659 ctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctct 112758  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  |||   ||||  |  || || |  |||||||    
T  112759 tgaaactcaagatccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaagtttaccttttatgtagttt 112858  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| || |||||||| || | ||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||    
T  112859 gttgaactatgtctggtcccaacatcacactttcccccgattcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaccatacaatgcttcaaacggtgccat 112958  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || || || || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||| |  ||||||| |    
T  112959 accaatactcgaatggtaactgttgttgtaagtaaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgcacaagtacacacaccctcaacaga 113058  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || ||||  || || || ||||||||  ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  113059 tcttctaaggattgtatcgtcctctctaactgaccatctttctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactct 113158  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||| |||||||| || || || | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  113159 tccagaatctagatgtgaacctcgaatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcagcttcacaat 113231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 56 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 96273 - 95636
Alignment:
Q  56 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 155  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| | || ||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||      
T  96273 tgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaattctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttc 96174  T
Q  156 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 255  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  96173 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcaaaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgata 96074  T
Q  256 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttca 355  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||   ||||| |  ||||||||| ||||| |  ||||| |  || || || || || || |||||     
T  96073 gctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctccctgatcaccctaactttctccgtagtctcatgaaccaagtccggccccaacacaacactttct 95974  T
Q  356 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 455  Q
    || ||||||||||| || |  |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||    
T  95973 cccgactcaaaccaacatagaggagttctacacctccgaccatataaagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtga 95874  T
Q  456 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 555  Q
    | || ||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |  || | |||||||||||  || || |||||||| |||||||||||    
T  95873 attctatcaatggtagatgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacatacccttagcaaatcctctaaagattggattgtcctttccgactgacc 95774  T
Q  556 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 655  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  95773 atcagtctgcggatgataagccgaactcaacctcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaacttctccaaaatctcgaagtaaaccttgggtctctatct 95674  T
Q  656 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    || || || ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  95673 gacactatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 95636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 596; Significance: 0; HSPs: 75)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 596; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 704
Target Start/End: Complemental strand, 15589934 - 15589251
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15589934 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 15589835  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15589834 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 15589735  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15589734 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 15589635  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15589634 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 15589535  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15589534 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgcttaagaacacaaattctcaacaaa 15589435  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15589434 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 15589335  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 704  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  15589334 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttgatgt 15589251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 593; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 53385560 - 53384888
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  53385560 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaat 53385461  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53385460 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaactttttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 53385361  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53385360 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 53385261  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  53385260 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacagagcctcgaacggtgccat 53385161  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53385160 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcatccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 53385061  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53385060 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatccgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 53384961  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  53384960 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaat 53384888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 592; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 704
Target Start/End: Complemental strand, 20062596 - 20061913
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  20062596 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 20062497  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20062496 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 20062397  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20062396 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 20062297  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20062296 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 20062197  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20062196 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 20062097  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20062096 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 20061997  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 704  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  20061996 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaattctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttgatgt 20061913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 584; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 704
Target Start/End: Original strand, 10005188 - 10005871
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  10005188 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 10005287  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10005288 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 10005387  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10005388 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 10005487  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10005488 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 10005587  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10005588 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaa 10005687  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  10005688 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgtaaacttt 10005787  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 704  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  10005788 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 10005871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 580; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 704
Target Start/End: Original strand, 10905798 - 10906481
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  10905798 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 10905897  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  10905898 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 10905997  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10905998 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 10906097  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  10906098 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccaaccatacaaagcctcgaacggtgccat 10906197  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10906198 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcctcgttcaagaacacaaattctcaacaaa 10906297  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10906298 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 10906397  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 704  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  10906398 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 10906481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 580; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 704
Target Start/End: Original strand, 48425035 - 48425718
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  48425035 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 48425134  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  48425135 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 48425234  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48425235 tggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 48425334  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  48425335 gctgaacaatctctagtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagccttgaacggtgccat 48425434  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48425435 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 48425534  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  48425535 tcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 48425634  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 704  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  48425635 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgt 48425718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 704
Target Start/End: Original strand, 16635361 - 16636044
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16635361 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 16635460  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16635461 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 16635560  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16635561 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 16635660  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16635661 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 16635760  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16635761 tccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 16635860  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16635861 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 16635960  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 704  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  16635961 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 16636044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 704
Target Start/End: Complemental strand, 16757127 - 16756444
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  16757127 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaat 16757028  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16757027 atgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttcc 16756928  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16756927 ttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagttt 16756828  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  16756827 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcatctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaggcctcgaacgatgccat 16756728  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16756727 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgctcaagcacacaaattctcaacaaa 16756628  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16756627 tcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 16756528  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 704  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  16756527 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttgatgt 16756444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 704
Target Start/End: Original strand, 43162685 - 43163368
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  43162685 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 43162784  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  43162785 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 43162884  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43162885 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 43162984  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  43162985 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 43163084  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43163085 tccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 43163184  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  43163185 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 43163284  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 704  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  43163285 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 43163368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 566; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 15348787 - 15348106
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15348787 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 15348688  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  15348687 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 15348588  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15348587 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 15348488  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15348487 gctgaacaatctttggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaggcctcgaacggtgccat 15348388  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15348387 tccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 15348288  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15348287 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 15348188  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||    
T  15348187 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcataatctccttgat 15348106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 562; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 704
Target Start/End: Original strand, 6600335 - 6601007
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6600335 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgtcccaactttttccaaaat 6600434  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6600435 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 6600534  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6600535 ttgaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagttt 6600634  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6600635 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacagagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 6600734  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||    
T  6600735 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacgaaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaac-----------acaaa 6600823  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  6600824 tcctctagcgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 6600923  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 704  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  6600924 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttgatgt 6601007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 554; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Original strand, 13252278 - 13252959
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  13252278 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 13252377  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13252378 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 13252477  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13252478 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 13252577  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  13252578 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagtcctgcatctccgaccatacaaggcctcgaacggtgccat 13252677  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13252678 tccaatactagaatggtaactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaa 13252777  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13252778 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 13252877  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  13252878 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 13252959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 550; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 5425471 - 5424791
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  5425471 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 5425372  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  5425371 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaag-cacgtggtctccttcc 5425273  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5425272 tgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 5425173  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  5425172 gctgaacaatctctggtcctaagaccgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctctgaccatacagagcctcgaacggtgccat 5425073  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5425072 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaa 5424973  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  5424972 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 5424873  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||    
T  5424872 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaactttacaatctccttgat 5424791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 546; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 15403052 - 15402371
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||    
T  15403052 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaattctttccaatat 15402953  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15402952 ctgatacggaccaatgaacatcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 15402853  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15402852 tgaaactcaaaatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaaccttctcagtagttt 15402753  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15402752 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatgtaaagcctcgaaaggtgccat 15402653  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  15402652 tccaatacttgaatgataactattattatatgtgaactcgattaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcgagaacacaaatcctcaacaaa 15402553  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15402552 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccagctgtctatggatgatacgccgaactcaatctcagcttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 15402453  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  15402452 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgagggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 15402371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 542; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 15725475 - 15724795
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15725475 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 15725376  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15725375 ctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgactctaaaaaacacgtggtctccttcc 15725276  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  15725275 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatccgaa-tttctcagtagtct 15725177  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15725176 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 15725077  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15725076 tccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 15724977  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15724976 tcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 15724877  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| | | |||| || ||||||||    
T  15724876 tccaaaatctacaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgcctgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgat 15724795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 538; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 26792941 - 26792260
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  26792941 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaatccactcggtaagccatcgttccaactctttccaatat 26792842  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  26792841 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacactagtcataggagtgactcttaaaaacacgtggtctccttct 26792742  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26792741 tggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 26792642  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26792641 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcataatggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 26792542  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26792541 tccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgcttaagaacacaaattctcaacaaa 26792442  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  26792441 tcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaactttgaacccaaagcctcttgcaaacttt 26792342  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  26792341 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctggaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 26792260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 534; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Original strand, 15338857 - 15339538
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||    
T  15338857 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagctaccgttccaattctttccaatat 15338956  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15338957 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 15339056  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15339057 taaaactcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatttgctcttggatcatctgaaccttctcagtagttt 15339156  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15339157 gatgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgtatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 15339256  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  15339257 tccaatacttgaatgataactattattatatgtgaactcgattaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcgagaacacaaatcctcaacaaa 15339356  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  15339357 tcctctagcgactgaattgtcctcttcgactgaccatctgtctgtcgatgatacgccgaactcaatctcagctacgaacccaaagcctcttgcaaacttt 15339456  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  15339457 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgagggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 15339538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 534; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 16412824 - 16412143
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16412824 catacttccgaagttgtgacacatggaaaacgttgtccaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 16412725  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  16412724 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttca 16412625  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16412624 tgaaactcaaggtcattcctacgcttatcatgataactcttttgccaactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttcttagtagttt 16412525  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  16412524 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccaaccatataaagcctcgaaaggtgccat 16412425  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16412424 tccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctgaagaacacaaattctcaacaaa 16412325  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16412324 tcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtttgtggttgatactccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 16412225  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  16412224 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 16412143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 530; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Original strand, 12497836 - 12498517
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  12497836 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 12497935  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  12497936 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 12498035  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  12498036 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 12498135  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12498136 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 12498235  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12498236 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 12498335  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12498336 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 12498435  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||    
T  12498436 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatttgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgat 12498517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 502; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 14877041 - 14876360
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  14877041 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcagtggtaatccaactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 14876942  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||     
T  14876941 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtaactctcaaaaacacgtggtctccttct 14876842  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||| |    
T  14876841 tgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtct 14876742  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14876741 gctgaacaatctcgggtcctaagaccgctctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 14876642  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14876641 tccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaatatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 14876542  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14876541 tcttctagcgactgaattgtcctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 14876442  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||| ||||||||    
T  14876441 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaatctcacaatctccttgat 14876360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 486; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 16807468 - 16806787
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| | | ||    
T  16807468 cataattccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaagttcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaaattttttcgatat 16807369  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||| |  ||  || | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16807368 ctgatacggaccgaaaaatctcagagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 16807269  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |    
T  16807268 tgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataattcttctgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcattttaactttctcagtagtct 16807169  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  16807168 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcat 16807069  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16807068 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 16806969  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  16806968 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaactttgaacccaaagcctcttgctaacttt 16806869  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||    
T  16806868 tccaaaacctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacgatctccttgat 16806787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 471; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 699
Target Start/End: Original strand, 16371001 - 16371679
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||| |||||| ||||  | ||    
T  16371001 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacgacatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcaatacgccaccgtcccaactctttctgatat 16371100  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||     
T  16371101 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtagtcttcttct 16371200  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  16371201 tgaaattcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 16371300  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  16371301 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccat 16371400  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16371401 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaatgaaagatgaatatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 16371500  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  16371501 tcctctagcgactgaatcgtcctttccgaccgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttt 16371600  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 699  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16371601 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatttcctt 16371679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 465; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 17489438 - 17490110
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  17489438 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 17489537  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  17489538 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 17489637  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  17489638 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagttt 17489737  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17489738 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccat 17489837  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  17489838 tccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaga 17489937  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  17489938 tcttctaacgactgaatcatcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttt 17490037  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  17490038 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatcggacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 17490110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 453; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Original strand, 16691748 - 16692433
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  ||||| | ||    
T  16691748 catacttccgaagttgtgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccacacgatatgccaccgttccaaccctttccgatat 16691847  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
     ||||| |  ||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16691848 ttgatacgacccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 16691947  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||| ||  | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |    
T  16691948 tgaaactcaagatccttcttgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttttcagtagtct 16692047  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16692048 gctgaacaatctcgggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatatccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 16692147  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16692148 tccaatactagaatgataactattgttgtatgtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcccccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 16692247  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcct----cttgcaaa 616  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||    
T  16692248 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatccgtctgtggatgataagctgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctctagcttgcaaa 16692347  T
Q  617 cttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||    
T  16692348 cttttccaaaatctagaagtaaatcttagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacaatctccttgat 16692433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 441; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 16492723 - 16492051
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16492723 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccaatat 16492624  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16492623 ctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgactttaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 16492524  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  16492523 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagttt 16492424  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||    
T  16492423 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgatacaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcacaaggtgtcat 16492324  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  16492323 tccaatactagaatgataactgttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtacctccttgctcaagaacacaaacccttaacaaa 16492224  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  16492223 tcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgatacaccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttt 16492124  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  16492123 tccataatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 16492051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 437; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 9522307 - 9522979
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||   | ||    
T  9522307 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttttgatat 9522406  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  9522407 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 9522506  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| | ||| |||||||||||||    
T  9522507 tgaaagtcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgtgacgctttcatcttttcttgaatcattttaaccttctcagtagttt 9522606  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9522607 gttgaacaatctctggtcctaagaccactctctcacctgactcaaaccaagacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccat 9522706  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  9522707 tccaatactagaatgataaatattattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtccctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaa 9522806  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  9522807 tcttctagcgactgaaacgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactct 9522906  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  9522907 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 9522979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 15247735 - 15248407
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| | ||    
T  15247735 catatttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggttgtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttccgatat 15247834  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    || ||| ||||||||  || |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| || || ||||||||     
T  15247835 ctaatacggaccaatacacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttct 15247934  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||   | ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  15247935 tgaaactcattgtttttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 15248034  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  15248035 gttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctacatctccgactatacaaagcctcaaaaggtgccat 15248134  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || |||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  15248135 tccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactatatcaatagaagatgactatcccaagttcctccttgctcaattacacaaactctcaacaaa 15248234  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||| ||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  15248235 tcctctaacgactaaatcgttctctccaactgaccatctgtctgctgatgatacgccgagctcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactct 15248334  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  15248335 tccaaaatctagaagtaaatctcatatctctatctgatacaatgctcaaaggaacaccatgcaacttcacaat 15248407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 15208479 - 15209151
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||  | ||    
T  15208479 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggttgtaaacccactcgatactccaccgttccaattctttctgatat 15208578  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||  |||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| || || ||||||||     
T  15208579 ctgattcggaccaataaacctcggagtcaacttcttttacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttct 15208678  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||  | ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  15208679 tgaaactcaatgtttttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 15208778  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  15208779 gttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgtccatataaagcctcaaaaggtgccat 15208878  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  15208879 tccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaatagaagatgactatcccaagttcctccttgctcaaatacacaaactctcaacaaa 15208978  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || |||| |||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || || | | ||||||||||| | |    
T  15208979 tcttctaacgactgaatcattctctcagactgaccatctgtctgcggatgatacgccgagctcaacctcaacttagaacctacaacctcttgcaaaatct 15209078  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  15209079 tccaaaatctagaagtaaatctcatatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 15209151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 15227247 - 15227919
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  15227247 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttccaactctctcagatat 15227346  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||     
T  15227347 ctggtacggaccaataaacttcggcgtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttct 15227446  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatca-tctgaactttctcagtagtt 319  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||   |||| | ||| |||| |  |||||     
T  15227447 tgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacactttcatcttctctcttatcaatttgacctttttt-gtagtc 15227545  T
Q  320 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 419  Q
    |||||||| |  |||||||| || |  || | |||||  ||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||| |||||||    
T  15227546 tgctgaactaaatctggtcccaacattacaccttcactcgactcaaaccaacataacggagttctgcacctccaaccatacaaatcttcgaacggtgcca 15227645  T
Q  420 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 519  Q
    | |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| | |||||||||    
T  15227646 taccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggcaggtgactatcccaagctccaccttgcttaagtacacacactctcaacaa 15227745  T
Q  520 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 619  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||  ||| ||||||||||| || |||||| | |||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  15227746 atcctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccaattgtttgcggatgataagctgaactccacctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaactt 15227845  T
Q  620 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  15227846 ttccaaaatctagatgtaaatcttggatctctatccgatacaatactcgatggaacaccatgcagcttcgcaat 15227919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 56 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 13972616 - 13971979
Alignment:
Q  56 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 155  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || |||| ||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  13972616 tgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccaataaacttcggagtcaacttct 13972517  T
Q  156 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 255  Q
    | || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  13972516 tagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgata 13972417  T
Q  256 actcttttgtcgactctgcgacgccttcatt--ttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactcttt 353  Q
     ||||| ||||||||||||||||| |||||   |||||||  || | || ||| || || |||||||| ||||| || |||||||| || | ||| ||||    
T  13972416 gctcttctgtcgactctgcgacgctttcatccgttctctt--attaacttaaccttttccgtagtttgttgaactatgtctggtcccaacatcacacttt 13972319  T
Q  354 cacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagt 453  Q
    | || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |||||    
T  13972318 ctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaccatacaaggcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtaagt 13972219  T
Q  454 gaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactga 553  Q
     ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| | ||||||||  || || || |||||||||||||||    
T  13972218 aaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaatagatcctctaaggattgtatcgtcctctccgactga 13972119  T
Q  554 ccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctat 653  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||    
T  13972118 ccatctgtctggggatgataagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctat 13972019  T
Q  654 ctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  13972018 ctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 13971979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 13323183 - 13322511
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| || || ||||| |  | ||| ||||| |||||||   | ||||| ||    
T  13323183 catacttccgaagctgcgacacatggaatacaccatgcaaattcgaaagatgtggtggaaaaccaatcctatatgccactgttccaatcctctccaatat 13323084  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||| | ||||||| |||||| |||||||| |||    
T  13323083 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacccccgtcataggagtaactctcagaaacacatggtctccctcc 13322984  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  | |||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  13322983 tgaaacccaagatctttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatcctttctatgatcatcttgactttctctgtagtct 13322884  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  || ||||| || ||  | || | |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  13322883 gatgaaccaaatccggtcccaacacagcactctgacctgactcaaaccagcataaaggagttctgcacctccgaccgtacaaagcttcgaatggtgccat 13322784  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| ||  | || || || || ||||| ||||| || || ||||||||||||| | | ||||||||||| ||||| | ||| |  |||    
T  13322783 accaatactcgaatggtaattgttgttgtaggtaaactctatcaaaggtaggtgactatcccaagcttcaccttgctcaagcacacatactcttaggaaa 13322684  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||| |||||| | ||||||||||| |    
T  13322683 tcctctaaggattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaaccttaacctcgaacccaaaacatcttgcaaactct 13322584  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||| |||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  13322583 tccagaatctagaagtaaacctcagatccctatctgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 13322511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 14086271 - 14086943
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||| |  |||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| | ||||||||| || || ||| | ||  | ||    
T  14086271 catacttccgcaactgcgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactctctcagatat 14086370  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||     
T  14086371 ctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctct 14086470  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatt--ttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 318  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   |||||||  || | || ||| || || |||||    
T  14086471 tgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatccgttctctt--attaacttaaccttttccgtagt 14086568  T
Q  319 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcc 418  Q
    ||| ||||| || |||||||| || | ||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||||    
T  14086569 ttgttgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaccatacaaggcttcaaacggtgcc 14086668  T
Q  419 attccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaaca 518  Q
    || |||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| |    
T  14086669 ataccaatactcgaatggtaactattgttgtaagtaaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaata 14086768  T
Q  519 aatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaact 618  Q
     ||||||||  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  14086769 gatcctctaaggattgtatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaact 14086868  T
Q  619 tttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
     ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  14086869 cttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 14086943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 15953499 - 15952827
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||   || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  15953499 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatat 15953400  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| | |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| | | ||||| ||| || || ||||| ||     
T  15953399 ctgatacgaaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcgtacacccgtcataggagtaaatctcagaaatacatgatctccctct 15953300  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  |||||||| ||||| |    
T  15953299 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctctgtagtct 15953200  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || ||||| || ||||||||| | || || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15953199 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctcccgactcaaacaaacataaaggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 15953100  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| |||||  | || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||     
T  15953099 accaatactcgaatggcaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaac 15953000  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||  || || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  15952999 tcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatatgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaaactct 15952900  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  15952899 tccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgtaacttcacaat 15952827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 392 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 11564852 - 11564545
Alignment:
Q  392 cgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctc 491  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11564852 cgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctc 11564753  T
Q  492 cttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaa 591  Q
    ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  11564752 ctttctcaagaacacacactctcagcaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactaaccatctgtctgcagatgatacgccgaactcaatttcaa 11564653  T
Q  592 cttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcaca 691  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11564652 cttcgaacccaaagcctcttgctaacttttccaaaatctagaagaaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcaca 11564553  T
Q  692 atttcctt 699  Q
    || |||||    
T  11564552 atctcctt 11564545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 176 - 685
Target Start/End: Complemental strand, 15016131 - 15015634
Alignment:
Q  176 acaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcg 275  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |    
T  15016131 acaccggtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgag 15016032  T
Q  276 acgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaa 375  Q
    |||| ||||| |||||    |||| || ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||  |||||  | ||||| || ||| |||| |||||    
T  15016031 acgctttcatcttctccctaatcaacttaaccttctctgtagtttgttgaacaatttctggtcctagtaccacattctcaccggattcataccaacacaa 15015932  T
Q  376 cggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatga 475  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || || |||||  |||||||||||||||| |  ||||||    
T  15015931 tggagttctgcatctccgatcatacaatgcttcgaacggtgccattccaatgctagaatggtaactgttattgcaagtgaactcgatcaatgagagatga 15015832  T
Q  476 ctatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatg 575  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||            ||||||||||||||    
T  15015831 ctatcccaagttccgccttgctcaagtacacaaattctcaacaagtcctccaacgtctgaattgtcctctccga------------ctgcggatgatatg 15015744  T
Q  576 ccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaac 675  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  15015743 ccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactcttcctaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgacggaac 15015644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 413 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 14126744 - 14126464
Alignment:
Q  413 ggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattc 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14126744 ggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactc 14126645  T
Q  513 tcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttg 612  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  14126644 tcaacaaatcctctagcgactgaatcctcctcaccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttg 14126545  T
Q  613 caaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  14126544 aaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 14126464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 21 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 18134877 - 18134215
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| || |||||||| || || ||||| |||| ||||||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  18134877 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccactgttccaaccctctctgaaat 18134778  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||  | || || |||    
T  18134777 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtaactctcagaaatacaagatcaccctcc 18134678  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||| |  ||||| || ||||| |    
T  18134677 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctccgatcattttgactttatctgtagtct 18134578  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  18134577 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggattcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 18134478  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||    
T  18134477 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaa 18134378  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| |  || || || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| |    
T  18134377 tcctccaatgattggatcgtccgctccgactgaccatctgtctgaggatgataagttgaactcaacctcaacttcgaacccaaagtgtcctgcaaactct 18134278  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 683  Q
    |||| |||||| |||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||    
T  18134277 tccagaatctataagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgta 18134215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 12361073 - 12360401
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| |||||||| || ||  ||||    
T  12361073 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccttctctgaaat 12360974  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | || ||||| |||||||||||||  ||||||| | | ||||||| ||| || || || || |||    
T  12360973 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgatttcaatgcacgtcctacacatgtcatagaagtaactctcagaaatacatgatcaccctcc 12360874  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||    |||||||  |||||||| |||||      
T  12360873 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctctgtagtcc 12360774  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  |||||||| || ||  | || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  12360773 gatgaaccaagtctggtcccaatacagcactctctcctgactcaaaccagcataatggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 12360674  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| | | |||| |||    
T  12360673 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatccgaagctccaccttgctcaagtacacacactttcaataaa 12360574  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || || |    
T  12360573 tcctccaaagattgtatggtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgtaatctct 12360474  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||| |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||| | || ||||||||||||||||||||    
T  12360473 tccataatctagatgtgaacctcggatccctatccgacacaatactctacggtacaccatgtagcttcacaat 12360401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 21 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 8759613 - 8758942
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || || |||| ||| ||||||||||| | | | ||  ||||    
T  8759613 catacttccgcagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaat 8759514  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| | ||| || || || || ||     
T  8759513 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctct 8759414  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||  ||||| || ||||| |    
T  8759413 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtct 8759314  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
     |||||| |  || ||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  8759313 cctgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccat 8759214  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||| ||||| |||||||| || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | |||||||||     
T  8759213 tcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaag 8759114  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  8759113 tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactct 8759014  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 692  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8759013 tccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 8758942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 21 - 692
Target Start/End: Original strand, 41177120 - 41177791
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || || |||| ||| ||||||||||| | | | ||  ||||    
T  41177120 catacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaat 41177219  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| | ||| || || || || ||     
T  41177220 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctct 41177319  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||  ||||| || ||||| |    
T  41177320 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtct 41177419  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
     |||||| |  || ||||| |  || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  41177420 cctgaaccaaatccggtcccagcacaacactttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccat 41177519  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||| ||||| |||||||| || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | |||||||||     
T  41177520 tcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccatgttcaagcacacacactctcaacaag 41177619  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  41177620 tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactct 41177719  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 692  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41177720 tccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 41177791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 690
Target Start/End: Original strand, 13941622 - 13942291
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || || |||| ||| ||||||||||| | | | ||  ||||    
T  13941622 catacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaat 13941721  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| | ||| || || || || ||     
T  13941722 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctct 13941821  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||  ||||| || ||||| |    
T  13941822 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtct 13941921  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
     |||||| |  || ||||| || || || ||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  13941922 cctgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctccttattcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaagggtgccat 13942021  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||| ||||| |||||||| || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | |||||||||     
T  13942022 tcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaag 13942121  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  13942122 tcctccattgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactct 13942221  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 690  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  13942222 tccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcac 13942291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 21 - 690
Target Start/End: Original strand, 10383567 - 10384235
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| |||||||| || || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  10383567 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaaggtgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaat 10383666  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||| || || ||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  10383667 ctgatacggaccaatgaatttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 10383766  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||   |||| |   |||||||||||||| |    
T  10383767 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 10383866  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      ||||| |  || ||||| || || |  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  10383867 catgaactaaatccggtcccaacacaatactttcacccgactcaaaccagcacaaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 10383966  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||    
T  10383967 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtgaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaa 10384066  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||| ||    
T  10384067 tcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgcaaacatt 10384166  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 690  Q
    |||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||  | ||||||||||| ||||||||    
T  10384167 tccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatact-aacggaacaccatgaagcttcac 10384235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 11304304 - 11303632
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||| |||||||||||||| | || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||  |||||||  | ||  | ||    
T  11304304 catacttctgaagttgcgacacaagaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactattccaaccctctctgatat 11304205  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||    ||||||| ||| || || || || ||     
T  11304204 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgtcatagggaaaactctcagaaatacatgatcaccctct 11304105  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||| | ||  ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||   |||||||  || ||||| ||||  |    
T  11304104 tgaaactcaagagccttcatacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactttgcgacgctttcatcttttctcttatcatctttaccttctccgtagcct 11304005  T
Q  321 gctgaa-caatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 419  Q
    | |||| |||  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  11304004 gatgaatcaaattc-ggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgcct 11303906  T
Q  420 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 519  Q
    | |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||  |||||||| || ||||||||||||| |||  |||||||||| ||||| | ||| |||||    
T  11303905 taccaatactcgaatggtaactgttattgtatgtgaactatatcaacggtaggtgactatcccaagctccaacttgctcaagtacacacactcttaacaa 11303806  T
Q  520 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 619  Q
    |||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||     
T  11303805 atcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaggcgtcctgcaaactc 11303706  T
Q  620 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  11303705 ttccaaaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 11303632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 56 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 12850775 - 12850138
Alignment:
Q  56 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 155  Q
    ||||||||| ||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||| | ||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  12850775 tgcaaattccaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttct 12850676  T
Q  156 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 255  Q
    | |||||||| ||||| |||| ||| |||| |||| ||||||||| |||||| || ||| | || |||||||||||  | ||| | ||||||||||| ||    
T  12850675 tagacttcaacgcacgacctatacccgtcacaggagtgactctcagaaacacatgatcttcctcttgaaactcaagggcctttattcgcttgtcatggta 12850576  T
Q  256 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttca 355  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||| || |||   ||||  |  ||||| |  |||||||| ||||| |  |||||||| || || || |||||     
T  12850575 actcttctgtcgactctgcgacactttcatcttttctcttatcaatttgactttttatgtagtttgatgaactaaatctggtcccaacactacactttct 12850476  T
Q  356 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 455  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | | ||| |||||||| |||||||| ||||| ||  | || || || ||||    
T  12850475 cccgactcaaaccaacacaatggagttctgcacctccgaccatacaaatctttgaacggtgccataccaatacttgaatggtaattgttgttgtacgtga 12850376  T
Q  456 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 555  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  12850375 actctatcaacgatagatgactatcccaagctccaccttgctcaagaacacacaatctcagcaaatcctctaacgactgaatcgttctctccgactgacc 12850276  T
Q  556 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 655  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||  ||||||||||     
T  12850275 atctgtctacggattataagccgaactcaacctcaactttgaatccaaggcctcttgtaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcagatctctatcc 12850176  T
Q  656 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    || |||||||| || || |||||||| | |||||||||    
T  12850175 gacacaatgcttgatgggacaccatgcaacttcacaat 12850138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 21 - 690
Target Start/End: Original strand, 47123542 - 47124211
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||| ||||||| || || ||||| || |||| |||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  47123542 catacctccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagtaccaactctctctgaaat 47123641  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||| ||||||||| ||| || || || || |||    
T  47123642 ctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcc 47123741  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| || |||   |||| |   |||||||||||||| |    
T  47123742 tgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 47123841  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      || || |  || ||||| || || || |||||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  47123842 catgcaccaaatccggtcccaacacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 47123941  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||    
T  47123942 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaattcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaa 47124041  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||| || || |||||||    
T  47124042 tcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttt 47124141  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 690  Q
    |||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  47124142 tccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagtttcac 47124211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 454 - 699
Target Start/End: Original strand, 15061777 - 15062022
Alignment:
Q  454 gaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactga 553  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15061777 gaactcaatcaatggaaaatgactatcccaagttccaccttgctcaagaacataaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctttccgactga 15061876  T
Q  554 ccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctat 653  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15061877 ccatctgtctgcgtatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactattccaaaatctagaagtaaatcttggatctctat 15061976  T
Q  654 ctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 699  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15061977 ctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatttcctt 15062022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 117 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 16836945 - 16836370
Alignment:
Q  117 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 216  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| || || || ||    
T  16836945 aaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcacc 16836846  T
Q  217 ttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagta 316  Q
     ||||||||||||||  | || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||    |||||||  || ||||||||     
T  16836845 ctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgtgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtc 16836746  T
Q  317 gtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtg 416  Q
    || |  ||||| |  |||||||| || || || || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16836745 gtctcatgaaccaaatctggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataacggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtg 16836646  T
Q  417 ccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaa 516  Q
    |||| || ||||| ||||| || || || || || |||||||| | ||| || || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||  | ||||||    
T  16836645 ccatacctatactcgaatggtaactgttgttgtaggtgaactctaccaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacgcactctcaa 16836546  T
Q  517 caaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaa 616  Q
    ||||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  16836545 caaatcctccaaggattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaa 16836446  T
Q  617 cttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 692  Q
    || ||||| |||||||| || || || ||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  16836445 ctcttccagaatctagatgtgaacctcggatctctatccgatgcaatactcgacggaactccatgaagcttcacaa 16836370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 56 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 10420541 - 10419907
Alignment:
Q  56 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 155  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| | || ||| ||||| ||||| ||| ||||  |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||     
T  10420541 tgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaattctatacgccacagttccgactctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcc 10420442  T
Q  156 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 255  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  10420441 tcgacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatggta 10420342  T
Q  256 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttca 355  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||||||   |||||||| || || |  ||||| |  || ||||| || || || |||||     
T  10420341 gctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctaatcatcctgactttctccgtggtctcatgaaccaaatccggtcccaacacaacactttct 10420242  T
Q  356 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 455  Q
    || ||||||||||| || |  ||||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| || || || || ||||    
T  10420241 cccgactcaaaccaacatagaggagtcctacacctccgaccatataaagcttcaaatggtgccataccaatacttgaatgataactgttgttgtatgtga 10420142  T
Q  456 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 555  Q
    | || ||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |  || |  ||||||||||  || || ||||||||||||||||||||    
T  10420141 attctatcaatggtagatgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacatacccttagtaaatcctctaaagattggattgtcctctccgactgacc 10420042  T
Q  556 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 655  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  10420041 atcagtctgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaacgcgtcctgtaaactcctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatct 10419942  T
Q  656 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 690  Q
    || || || ||||| ||||||||||| | ||||||    
T  10419941 gacactatactcgacggaacaccatgcaacttcac 10419907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 117 - 692
Target Start/End: Original strand, 44776941 - 44777516
Alignment:
Q  117 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 216  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| | ||| || || || ||    
T  44776941 aaatctgatacgggccaatgaacttcggagttaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacctgtcatcggagtgactcttagaaatacatgatcacc 44777040  T
Q  217 ttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagta 316  Q
     || || ||||||||  | || || | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  ||||| || |||    
T  44777041 ctcttggaactcaagggccttcctcctcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgta 44777140  T
Q  317 gtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtg 416  Q
    || | |||||| |  |||||||| || || || ||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||    
T  44777141 gtctcctgaactaaatctggtcccaacacaacactttctcctgtctcgaaccaacacaaaggagtcctgcaccttcgaccatataatgcttcgaatggtg 44777240  T
Q  417 ccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaa 516  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||    
T  44777241 ccattcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggcaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaa 44777340  T
Q  517 caaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaa 616  Q
    ||| || || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| || || |||    
T  44777341 caagtcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgagcccaaagcatcctgtaaa 44777440  T
Q  617 cttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 692  Q
    || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  44777441 ctcttccagaacctagaagtaaacctcggatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgtagcttcacaa 44777516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 21 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 11961565 - 11960992
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||| | |||| |||||||||  |||||||| | ||  ||||    
T  11961565 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtgggggcaaatcaactctataagccactattccaactctctctgaaat 11961466  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| ||||||| |||||  |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  11961465 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaatttcctcgacttcaatgcacgtcgtacactcgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 11961366  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||| | || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||| || ||    ||||| |  || || ||||| || |    
T  11961365 tgaaactcaagagccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcaaagccttcatcttttcccttatcattttgaccttttcagtcgtct 11961266  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      ||||| |  || ||||| || || || || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  11961265 catgaaccacatccggtcccaacacaacactctcacctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 11961166  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||    
T  11961165 gccaatactcgaatgatagctgttgttataagtgaactcaatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactcttaacaaa 11961066  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaactt 594  Q
    ||||| |  || || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  11961065 tcctccaatgattggatcgtcctttccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaactt 11960992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 16330190 - 16329520
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| | ||  ||||    
T  16330190 catacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaactctctctgaaat 16330091  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||| | | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  16330090 ctgatacggaccgatgaactttggagtcaactacctcgacttcaatgcacgtccaacacctgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 16329991  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||| | |||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| || ||    |||| |   |||||||||||||| |    
T  16329990 tgaaactcaagagcctttctttgcttgtcatggtaactcttatgtcgactctgtgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtct 16329891  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      ||||| |  || ||||| || || || || ||||||||||||||||| || |  ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  16329890 catgaaccaagtccggtcccaacacaacactctcacctgactcaaaccaacatagaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 16329791  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||    |||||||||    
T  16329790 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtgaactcaatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctaaagtacacacc--ctcaacaaa 16329693  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || || |  || ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |    
T  16329692 tcttccaatgattgaattgtcctctccgactaaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcttgtaaactct 16329593  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||| || |||||| | || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||    
T  16329592 tccagaacctagaaatgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaat 16329520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 117 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 16381362 - 16380788
Alignment:
Q  117 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 216  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||||| || || || ||    
T  16381362 aaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttaaaaatacatgatcacc 16381263  T
Q  217 ttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagta 316  Q
     ||| ||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||   |||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  || || || |||    
T  16381262 atcccgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactct---gtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgaccttttctgta 16381166  T
Q  317 gtttgctgaacaatctctggtcctaagacca---ctctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaag 413  Q
    || |  ||||| |  || |||||  | ||||   | || || || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  16381165 gtctcatgaaccaaatccggtcccca-accataacactctctccggactcaaaccagcacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaacg 16381067  T
Q  414 gtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattct 513  Q
    |||| || || ||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||| || || ||| ||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||    
T  16381066 gtgcgatacctatactcgaatggtaactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgattatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactct 16380967  T
Q  514 caacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgc 613  Q
    ||||| |||||| |  || || ||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||    
T  16380966 caacagatcctccaatgattggatcatcctctccgactgaccatctgtctgagaatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcgtcctgc 16380867  T
Q  614 aaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 692  Q
    ||||| ||||| || ||||| || ||  | ||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  16380866 aaactcttccagaacctagaggtgaacatcggatccctatccgacacaatacttgaaggaactccatgtagcttcacaa 16380788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 350 - 690
Target Start/End: Original strand, 28754245 - 28754585
Alignment:
Q  350 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 449  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||    
T  28754245 ctttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttat 28754344  T
Q  450 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 549  Q
    |||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || |||||||||||||||||    
T  28754345 aagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccga 28754444  T
Q  550 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 649  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||    
T  28754445 ctgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtaaacctcggatct 28754544  T
Q  650 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 690  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||    
T  28754545 ctatctgacacaatactagacggaacaccatgaagcttcac 28754585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 356 - 693
Target Start/End: Original strand, 17492563 - 17492900
Alignment:
Q  356 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 455  Q
    ||||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||| | |||||||| ||||| || || ||||    
T  17492563 cctgactcaaaccagcttaaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgatcggtgccataccaatattcgaatgataactattgttgtatgtga 17492662  T
Q  456 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 555  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || |||||||||||||||||    
T  17492663 actctatcaacggtaggtgactatcccaagatccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgacc 17492762  T
Q  556 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 655  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||     
T  17492763 atctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaagttcgaccccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatcc 17492862  T
Q  656 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    || ||||  | | | ||||||||||| | |||||||||    
T  17492863 gaaacaacacacaacggaacaccatgcaacttcacaat 17492900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 383 - 693
Target Start/End: Original strand, 14573889 - 14574199
Alignment:
Q  383 ctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccc 482  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  14573889 ctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgattggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatccc 14573988  T
Q  483 aagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaact 582  Q
    ||| ||| ||||||||||| | ||| |   ||| ||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14573989 aagctccaccttgctcaagtatacacaccatcagcaaatcctctaacgactgaatcgtactctctgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaact 14574088  T
Q  583 caatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgt 682  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||   |||||||||||| ||||| ||||| | ||| ||||||    
T  14574089 caacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctgaaatctctatctgacacaatactcgacgaaactccatgt 14574188  T
Q  683 agcttcacaat 693  Q
    | |||||||||    
T  14574189 aacttcacaat 14574199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 350 - 687
Target Start/End: Original strand, 4678365 - 4678702
Alignment:
Q  350 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 449  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || || |    
T  4678365 ctttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaagggtgccattcctatactcgaatgataactgttgttgt 4678464  T
Q  450 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 549  Q
    | |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||| |  || || || |||||||||||    
T  4678465 aggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcctccaatgattggatcgtcctctccga 4678564  T
Q  550 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 649  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || |||||     
T  4678565 ctgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatcc 4678664  T
Q  650 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagctt 687  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  4678665 ctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagctt 4678702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 314 - 585
Target Start/End: Original strand, 13001800 - 13002070
Alignment:
Q  314 gtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaag 413  Q
    |||||||| ||||| |  |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| || || |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  13001800 gtagtttgatgaactaaatctggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacataatggagttttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacg 13001899  T
Q  414 gtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattct 513  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| || ||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||    
T  13001900 gtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctattaacggtaaatgactatcccaagctcc-ccttgctcaagtacacacactct 13001998  T
Q  514 caacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaa 585  Q
    || ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  13001999 catcaaatcctctaacgactgaatcgttctctccgaatgaccatctgtttgcgggtgataagccgaactcaa 13002070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 285
Target Start/End: Original strand, 14571448 - 14571710
Alignment:
Q  23 tacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatct 122  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||  || || || ||||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||||    
T  14571448 tacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatatggtggcaagcccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatct 14571547  T
Q  123 gatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctg 222  Q
    |||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| || ||||| || ||    
T  14571548 gataaggaccaataaacttaggagtcaaattcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcaaaaacacatgatctccctcttg 14571647  T
Q  223 aaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat 285  Q
    |||||||||  | || |||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  14571648 aaactcaagggccttcctacgcttgtcacggtaactcttcagtcgactctgcgacgctttcat 14571710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 356 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 26009189 - 26008948
Alignment:
Q  356 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 455  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |    
T  26009189 cctgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaccatacaaggcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtaagtaa 26009090  T
Q  456 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 555  Q
    ||||  ||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  | ||||||||  || || || |||||||||||||||||    
T  26009089 actctctcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtagatcctctaaagattgtatcgtcctctccgactgacc 26008990  T
Q  556 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 597  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| |||||    
T  26008989 atctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcga 26008948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 146 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 8274816 - 8274281
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  8274816 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 8274717  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 345  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  8274716 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 8274617  T
Q  346 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 445  Q
      | || || || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| | || ||     
T  8274616 agcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 8274517  T
Q  446 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 545  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |     ||||| |||||||    
T  8274516 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactttgaatagtcctct 8274417  T
Q  546 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 645  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  ||||||||| || ||||||  |||||||||| || ||    
T  8274416 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaaccttcccaaaacttagaagtaaacctcgg 8274317  T
Q  646 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  8274316 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 8274281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 539 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 16828215 - 16828061
Alignment:
Q  539 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 638  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  16828215 gtcctctccgactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaaattcttccaaaatctagaagtga 16828116  T
Q  639 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    | || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  16828115 acctcggatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaat 16828061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 146 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 16743120 - 16742585
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | ||| |||||| ||| ||||| | ||    
T  16743120 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgacactcaatatcctttctcctct 16743021  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 345  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || ||||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  16743020 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacaa 16742921  T
Q  346 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 445  Q
      | || || || ||||||||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| | || ||     
T  16742920 agcactctctccggactcaaaccaacaaaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 16742821  T
Q  446 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 545  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| |  ||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||    
T  16742820 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctct 16742721  T
Q  546 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 645  Q
    | | ||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  || |||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  16742720 ctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcctaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctggg 16742621  T
Q  646 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  16742620 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 16742585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 146 - 680
Target Start/End: Original strand, 15576473 - 15577007
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||    
T  15576473 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctct 15576572  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 345  Q
    | |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || ||||| |   | ||||  || ||||| || |     
T  15576573 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtctctcgcacaacttccggtccaaacaa 15576672  T
Q  346 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 445  Q
      | || || || ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||  | || ||     
T  15576673 agcactctctccagactcaaaccaacataacggtgttctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgcaaactgttg 15576772  T
Q  446 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 545  Q
    || ||||| ||||| |||||||  | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  15576773 ttgtaagtaaactcaatcaacgataaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 15576872  T
Q  546 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 645  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  15576873 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 15576972  T
Q  646 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccat 680  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| |||||    
T  15576973 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccat 15577007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 473 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 16338591 - 16338371
Alignment:
Q  473 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 572  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |  || |||||||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  16338591 tgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacaccctaaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 16338492  T
Q  573 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 672  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||| | || || ||||| ||||| || ||||| || || ||    
T  16338491 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaactgaacctcggatccctatccgacacaatacttgacgg 16338392  T
Q  673 aacaccatgtagcttcacaat 693  Q
     ||||| || |||||||||||    
T  16338391 tacaccgtgcagcttcacaat 16338371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 159 - 674
Target Start/End: Original strand, 18748401 - 18748916
Alignment:
Q  159 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 258  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | |||  | ||||| |||||||| || || ||  | ||||||||||  |  || || | ||| |||||||||||    
T  18748401 acttcaaagcacgtccaacaccagttacagggttcactcttaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatgttcttcctcctcttatcatgataact 18748500  T
Q  259 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 358  Q
    ||| |||| |||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||| |||||| || ||||| |  || |||| ||| |||||||| |   | |||||||||    
T  18748501 cttctgtctactctgagacactttcatcttatcttgaatcatcttaactttttccgtagtctcttgcacaacctccggtcctaacaaagcactttcacct 18748600  T
Q  359 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 458  Q
    || |||||||| |||||||  || || || ||||||||||||||| |||| || |||||||| || |||||||||||| |  | || || ||| | ||||    
T  18748601 gattcaaaccaacacaacgacgtcctacacctccgaccatacaaaccctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaattgttgttgtaactaaact 18748700  T
Q  459 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 558  Q
    | |||||||| | |       ||||| |  | |||||||| | |||||||  ||| ||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| |||||    
T  18748701 caatcaacggtaaacattcgacccaactgacaccttgctccaaaacacaagctcttaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatc 18748800  T
Q  559 tgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 658  Q
     ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||   ||||||     
T  18748801 ggtctggggatgataagcagaactcaacctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcctgatctgac 18748900  T
Q  659 acaatgctcgaaggaa 674  Q
    ||||| || |||||||    
T  18748901 acaatactagaaggaa 18748916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 194 - 436
Target Start/End: Original strand, 17192865 - 17193107
Alignment:
Q  194 actctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctt 293  Q
    ||||| |||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||    
T  17192865 actctaaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctctt 17192964  T
Q  294 ggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccg 393  Q
    | ||||||| ||| || || ||| | |  || ||||  || |||| ||| || || ||||| ||| | |||||||| |||||||| || || || |||||    
T  17192965 gaatcatcttaaccttttccgtactctcttgcacaacttccggtcgtaacacaacactttctccttattcaaaccaacacaacggcgtcctacacctccg 17193064  T
Q  394 accatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatga 436  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| ||||    
T  17193065 accatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatga 17193107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 219 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 6712753 - 6712539
Alignment:
Q  219 cctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 318  Q
    ||||||||||||  || || || | ||| |||||||||||||| || | |||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||||| ||| || |  |||||    
T  6712753 cctgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataactcttctgcctactctgagacgctttcatcttcttttgaatcatcttaaccttttatgtagt 6712654  T
Q  319 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcc 418  Q
     |  || |||| ||| |||||||| |   | ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| || || | ||||||||||||||| || ||||||    
T  6712653 ctcttgtacaacctccggtcctaacaaagcactttcgcctgactcataccaacacaacggcgttctacaccttctaccatacaaagcctcaaacggtgcc 6712554  T
Q  419 attccaatactagaa 433  Q
    ||||| |||||||||    
T  6712553 attccgatactagaa 6712539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 146 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 13975462 - 13975172
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||| |  |||||||| |||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  13975462 gtcaacttcctacacttcaaaacacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 13975363  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 345  Q
    | |||||||| ||||| |||| |||||| || |||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  |  ||||  || || ||||| |     
T  13975362 tatcatgatagctcttctgtctactctgagatgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttccacaacttccggccctaacaa 13975263  T
Q  346 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatga 436  Q
        || || || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||    
T  13975262 aggactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatga 13975172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 296 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 14183179 - 14183007
Alignment:
Q  296 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgac 395  Q
    ||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||| || | ||| || || || |||||||  |||||| |||| ||||| || ||||| |||||||       
T  14183179 atcatcttaaccttctcaatagtctgctgaacaatttccgatcccaacacaacactttcactcgactcataccaacacaaaggtgttctacatctcctct 14183080  T
Q  396 catacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacgg 468  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||  ||||| | ||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  14183079 catacaaagcatcgaaaggagccataccaatacttaaatgaaaactattgttgtaagtaaactcaatcaacgg 14183007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 532 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 6152882 - 6152733
Alignment:
Q  532 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 631  Q
    |||||| |||||||| |  || ||||| ||||| ||||  || || ||||||||||||||||| |  | ||||||  |||||||||||| ||||||  ||    
T  6152882 ctgaatagtcctctctgtttgcccatcagtctgaggatagtaagcagaactcaatctcaacttagttctcaaagcagcttgcaaactttcccaaaactta 6152783  T
Q  632 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
     |||||||||| ||||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  6152782 taagtaaatctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 6152733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 31689154 - 31689067
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaac 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || |  ||||| |||| ||| ||||| ||||||||    
T  31689154 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtgtcaaaccaactctatatgccactgttccaac 31689067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 108
Target Start/End: Original strand, 31945070 - 31945157
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaac 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||  ||| ||||| ||||||||    
T  31945070 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgccactgttccaac 31945157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 511 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 13967392 - 13967222
Alignment:
Q  511 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 610  Q
    ||||||||||||||| ||   |||||| ||||||| || ||| ||||| ||||| ||||| |  || ||||||||||||||||| |  || |||||  ||    
T  13967392 tctcaacaaatcctccagactctgaatagtcctcttcgtctgcccatccgtctgaggatggttagcagaactcaatctcaacttagttccaaaagcagct 13967293  T
Q  611 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||||||| || ||||||  |||||||||| || || || | ||  || |||||||| ||||||| ||||||    
T  13967292 tgcaaaccttcccaaaacttagaagtaaacctcggttcccgatacgacacaatgctagaaggaataccatg 13967222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 362 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 6153052 - 6152978
Alignment:
Q  362 tcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatga 436  Q
    |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || || |||||  | ||||||||||||    
T  6153052 tcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaatggagccatctcgatactagaatga 6152978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 554 - 648
Target Start/End: Original strand, 17193224 - 17193318
Alignment:
Q  554 ccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatc 648  Q
    ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |  |||||||   |||||||||||| || |||  |||||||||| ||||||||    
T  17193224 ccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagaagcttgcaaactttccctaaacttagaagtaaaccttggatc 17193318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 594; Significance: 0; HSPs: 69)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 594; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 27668975 - 27668294
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27668975 catactttcgaagttgcgacacgtggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaat 27668876  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27668875 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 27668776  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27668775 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 27668676  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27668675 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 27668576  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27668575 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaa 27668476  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27668475 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 27668376  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  27668375 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 27668294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 578; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Original strand, 19769861 - 19770542
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  19769861 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccgactctttccaatat 19769960  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  19769961 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 19770060  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19770061 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 19770160  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19770161 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 19770260  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19770261 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 19770360  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19770361 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 19770460  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  19770461 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 19770542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 578; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Original strand, 40708681 - 40709362
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  40708681 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 40708780  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||     
T  40708781 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgcggtctccttct 40708880  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40708881 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 40708980  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40708981 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 40709080  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40709081 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 40709180  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  40709181 tcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 40709280  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||    
T  40709281 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttaacaatctccttgat 40709362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 704
Target Start/End: Original strand, 34566395 - 34567078
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  34566395 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 34566494  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  34566495 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 34566594  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34566595 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 34566694  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  34566695 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 34566794  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34566795 tccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 34566894  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34566895 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 34566994  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 704  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  34566995 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 34567078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 572; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 704
Target Start/End: Original strand, 27518308 - 27518991
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27518308 catactttcgaagttgtgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 27518407  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27518408 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgaggtctccttcc 27518507  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27518508 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 27518607  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  27518608 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccaaccatacaaagcctcgaacggtgccat 27518707  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27518708 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcccccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 27518807  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27518808 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgtcgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 27518907  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 704  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  27518908 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 27518991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 570; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 22333372 - 22332691
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  22333372 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 22333273  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  22333272 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 22333173  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |    
T  22333172 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatccggactttctcagtagtct 22333073  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22333072 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 22332973  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22332972 tccaatacttgaatgataactattattgtctgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctgaacaaa 22332873  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22332872 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctttctgcggatgatatgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 22332773  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||    
T  22332772 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgat 22332691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 568; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 704
Target Start/End: Original strand, 16356403 - 16357086
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16356403 catactttcgaagttgcgacacatggagaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 16356502  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16356503 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 16356602  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16356603 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 16356702  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16356703 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 16356802  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16356803 tccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 16356902  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16356903 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 16357002  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 704  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  16357003 tccaaaatctagaagtaaatcttggatccctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 16357086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 566; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Original strand, 41770743 - 41771424
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41770743 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaat 41770842  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41770843 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 41770942  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41770943 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 41771042  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41771043 gctgaacaatctctggtcctaagaccgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 41771142  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41771143 tccaatactagaatgataactattattataagtgagctcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaa 41771242  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  41771243 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctgaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 41771342  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  41771343 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 41771424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 562; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 15000224 - 14999543
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15000224 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 15000125  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  15000124 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 15000025  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15000024 tggaactcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 14999925  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  14999924 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagtctcgaaaggtgccat 14999825  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14999824 tccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaaattcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 14999725  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  14999724 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatatgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaaacctcttgcaaacttt 14999625  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  14999624 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 14999543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Original strand, 27610255 - 27610936
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27610255 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagttgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 27610354  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27610355 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 27610454  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27610455 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcggcgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 27610554  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27610555 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 27610654  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27610655 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagtccctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 27610754  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27610755 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacaccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 27610854  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  27610855 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 27610936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 27685885 - 27685204
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27685885 catactttcgaagttgcgacacgtggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 27685786  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  27685785 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 27685686  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27685685 tggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattctctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 27685586  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  27685585 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaggcctcgaaaggtgtcat 27685486  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27685485 tccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 27685386  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27685385 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 27685286  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  27685285 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 27685204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 556; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 37291979 - 37291300
Alignment:
Q  23 tacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatct 122  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  37291979 tactttcgaagttgagacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatct 37291880  T
Q  123 gatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctg 222  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37291879 gatacggaccaataaacttcggggtcaacttttttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttg 37291780  T
Q  223 aaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgc 322  Q
     |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37291779 gaactcaagatctttcctacacttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtctgc 37291680  T
Q  323 tgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattc 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37291679 tgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattc 37291580  T
Q  423 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 522  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37291579 caatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 37291480  T
Q  523 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 622  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37291479 ctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 37291380  T
Q  623 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  37291379 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 37291300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 545; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 29476558 - 29475898
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |     
T  29476558 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatac 29476459  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29476458 ctgatatggaccaatgaacttcgtggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacatccgtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 29476359  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  29476358 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgtgacgccttcattttctcttggatcatccgaactttttcagtagtct 29476259  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29476258 gttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 29476159  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29476158 tccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaaaaaa 29476059  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  29476058 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttcgaaccccaagcctcttgcaaacttt 29475959  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29475958 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatg 29475898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 542; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Original strand, 22134569 - 22135250
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  22134569 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccactgttccaactctttccaatat 22134668  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22134669 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcc 22134768  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  22134769 tgaaactcaagatcttttctgcgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtct 22134868  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22134869 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaactagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 22134968  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22134969 tccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaaaaattctcaacaaa 22135068  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22135069 ttctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctatctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 22135168  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||    
T  22135169 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgat 22135250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 519; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Original strand, 22348326 - 22349005
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  22348326 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaggccaccgttccaactctttccaatat 22348425  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22348426 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcc 22348525  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
     ||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22348526 cgaaactcaagat--tttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgattctgcgacgctttaattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagttt 22348623  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22348624 gctgaacaatctctggtcctaagactactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcacctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 22348723  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22348724 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatccccaacaaa 22348823  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22348824 tcattgagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctctgcttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 22348923  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  22348924 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 22349005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 499; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 699
Target Start/End: Original strand, 23573643 - 23574321
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  23573643 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 23573742  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  23573743 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 23573842  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  23573843 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 23573942  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  23573943 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccat 23574042  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  23574043 tccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaa 23574142  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  23574143 tcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactct 23574242  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 699  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  23574243 tccaaaatctagaagtaaatcttggatcaataaatgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatttcctt 23574321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 460; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Original strand, 18775678 - 18776352
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||   ||||||||||||| ||||| | ||    
T  18775678 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacatcaccgttccaactctttccgatat 18775777  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  18775778 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcagggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaagacgtggtctccctcc 18775877  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  18775878 tgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattctctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 18775977  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18775978 gctgaacaatctcgggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 18776077  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    || ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  18776078 tcgaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatca-------atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaagtttcaacaaa 18776170  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |    
T  18776171 tcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacctaaggcctcttgcaaactct 18776270  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||    
T  18776271 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcataatctccttgat 18776352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 456; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 681
Target Start/End: Original strand, 23516443 - 23517102
Alignment:
Q  22 atacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatc 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||  | |||    
T  23516443 atacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaactcgatatgccaccgttccaactctttctgatatc 23516542  T
Q  122 tgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcct 221  Q
    | ||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23516543 taatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtctccttctt 23516642  T
Q  222 gaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttg 321  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||| ||| ||||  ||||||||    
T  23516643 gaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatgatcttaaccttcttggtagtttg 23516742  T
Q  322 ctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccatt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  23516743 ctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataccaagcctcaaaaggtgccatt 23516842  T
Q  422 ccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaat 521  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  23516843 ccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaacggaagatgattatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaat 23516942  T
Q  522 cctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactttt 621  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||    
T  23516943 cctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaaccctcttgcaaactctt 23517042  T
Q  622 ccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23517043 tcaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 23517102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 442; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 674
Target Start/End: Original strand, 20798661 - 20799314
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||| ||||  | ||    
T  20798661 catatttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccaatcgatatgccaccggtccaactctttctgatat 20798760  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
     ||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  20798761 ttgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 20798860  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |    
T  20798861 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtct 20798960  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  20798961 gctgaacaatctttggtcctaagacctctctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccat 20799060  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  20799061 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactcgcaacaaa 20799160  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  20799161 tcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtccgcggataataagccaaactcaatctcaacttagaacccaaaacctcttgcaaacttt 20799260  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 674  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20799261 tccaaaatctaaaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 20799314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 433; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 661
Target Start/End: Original strand, 23440126 - 23440766
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  23440126 catacttccgaagttgcgacacatggaatacttcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccctctcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 23440225  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||     
T  23440226 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttcattgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 23440325  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  23440326 tgaaacttaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcattttaactttctcagtagttt 23440425  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  23440426 gctgaacaatctctggttttaagaccactctttctcctaactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctgaaaaggtgccat 23440525  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23440526 tccaatactagaatgataactattattgtatgtaaactcaatcaatggaagatgactatcccaagttccaccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 23440625  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  23440626 tcctctagcgactgaatttttctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacaccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttt 23440725  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgataca 661  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23440726 tccaaaacctagaagtaaatcttggatctctatctgataca 23440766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 690
Target Start/End: Original strand, 25423090 - 25423759
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  25423090 catagttccgaagttgcaacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccacctgatacgccaccgttccaactctttccgatat 25423189  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| || ||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||     
T  25423190 ctgatacgggccaataaatctcggagtcaacttctttcacttcaacgcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 25423289  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  25423290 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagttt 25423389  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25423390 gttgaacaatctttggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccat 25423489  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  25423490 tccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatccctagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaa 25423589  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || |||| ||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  25423590 tcttctaacgactgaatcgtcttctctgtctgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttt 25423689  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 690  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  25423690 tccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcac 25423759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 63 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 21498479 - 21497850
Alignment:
Q  63 tcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgactt 162  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||  | |||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||    
T  21498479 tcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacaccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgactt 21498380  T
Q  163 caaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttt 262  Q
    |||  ||||||| ||||| |||| | || ||||||||||||  || || ||||| || |||||||| |  ||| | |||||||| ||||| |||||||||    
T  21498379 caattcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaaaactacatgatctccctcttgaaactcgatgtctatcctacgcttatcatggtaactcttt 21498280  T
Q  263 tgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgact 362  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  21498279 tgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctcgggtcctaaaaccacactttcacctgact 21498180  T
Q  363 caaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgat 462  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||    
T  21498179 caaaccaacacaacggagttctacatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataacttttattttacgtgaactctat 21498080  T
Q  463 caacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtc 562  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||    
T  21498079 caatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacataaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgttctctccggctgaccatctatc 21497980  T
Q  563 tgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaa 662  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21497979 tgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaaattttccaaaatccagaagtaaatcttggatctctatctgacacaa 21497880  T
Q  663 tgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  21497879 tgctcgaa-gaacaccatgcaacttcacaat 21497850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 21984790 - 21984248
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||| || |||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||| | ||    
T  21984790 catacctctgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccagctctttccgatat 21984691  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||     
T  21984690 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccaatcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccctct 21984591  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  21984590 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataacttttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagttt 21984491  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21984490 gttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaatggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccat 21984391  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  21984390 tccaatactagaatgattactattattgtacgtgaactctatcaatgaaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaa 21984291  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtct 563  Q
    || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21984290 tcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtct 21984248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 20468581 - 20467909
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||| | | | |||| || ||    
T  20468581 catacttccgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcaatacgccactgtttctattctttctaatat 20468482  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||| | |||||||| ||| || | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  20468481 ctgacacggaccaataaacctcagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttcc 20468382  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||| || |||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  20468381 tgaaattcaaggtctttcctacgtttatcatgataactcttcagtcaactctgcgacgctttcatcttttcttggatcaacttaacattctcagtagttt 20468282  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||| || | |||||| || || || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||| || ||| || || ||||||||    
T  20468281 gctgaacgatttatggtcccaaaactacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagtcctacacctccgaccatgcagagcttcaaatggtgccat 20468182  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  20468181 tccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaaatctcaacaag 20468082  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| | |||||||||  |||| || ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  20468081 tcctccaacgactgaatcatcctttcagactggccatctgtctgcggataatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactct 20467982  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  20467981 tccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgcttgacagaacaccatgtagcttcacaat 20467909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 23471130 - 23471802
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  | |     
T  23471130 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcgttggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatac 23471229  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||| ||   |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||   || ||||||||||||| || || ||||||||     
T  23471230 ctgatacggaccaataaacctccaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacttgagtgactctcaaaaatacatgatctccttct 23471329  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||| || | ||| ||||||| ||| |||||| ||||||    
T  23471330 tgaaactcaaggtcttgcctacgcttatcatgattactcttttgccgactctgagacgctttcatcttttgttgaatcatcttaaccttctcaatagttt 23471429  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | |||||||| | ||| || || || || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23471430 gttgaacaatttatggccccaaaactacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcatcaaaaggtgccat 23471529  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  23471530 tccaatactagaatgatagctgttattgtacgtgaactctattaatgggagatgactatcccaagttcccccttgctcaagtacacaaactctcaacaag 23471629  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| | |||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| || |||||||| || || |||||||||| |||||| |    
T  23471630 tcctccaacgactgaatcattctctccgactgaccatctgtctacggatgatacgcctaactaaacctcaacttagaacctaaagcctctttcaaactct 23471729  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  23471730 tccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgcttgaaggaaaaccatgtagcttcacaat 23471802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 26739190 - 26738540
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  | ||    
T  26739190 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcttgcaaattcgaaagatgcgttggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatat 26739091  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||| |||| |||||||| |  || |||| |||     
T  26739090 ctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacatccaacaccagtcacaggagtgaccctcaaaaatatatgatctctttct 26738991  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  26738990 tgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 26738891  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||  |||||||    
T  26738890 gttgtacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcgaaccaacacaatggagttctgcatctccaaccatacaaagccttaaattgtgccat 26738791  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||| |||| |||| ||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  26738790 tccattactggaataataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacataaactctcaacaaa 26738691  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||                 
T  26738690 tcctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttagaacctaaagcc------------- 26738604  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
             || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  26738603 ---------tataagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 26738540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 196 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 21339596 - 21339099
Alignment:
Q  196 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 295  Q
    ||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||     
T  21339596 tctcaaaaatacttggtctcgttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttga 21339497  T
Q  296 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgac 395  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21339496 atcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgac 21339397  T
Q  396 catacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttg 495  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21339396 catacaaagcctcgaatggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaattctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttg 21339297  T
Q  496 ctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttc 595  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||     
T  21339296 ctcaagtacacaaactctcaacaagttctctaacgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaactta 21339197  T
Q  596 gagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    || || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21339196 gaacctaaaacctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 21339099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 21 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 24750039 - 24749370
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||| | |||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  24750039 catacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatat 24749940  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||     
T  24749939 ctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctct 24749840  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  |||   |||| || ||| || || ||||| |    
T  24749839 tgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaacttaaccttttctgtagtct 24749740  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||| || |||||||| || | ||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24749739 gctgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcccgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 24749640  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||    
T  24749639 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaa 24749540  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||  ||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  24749539 tcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctaaggatgctaagtcgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactct 24749440  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 690  Q
    |||| ||||| ||||| || || | ||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24749439 tccagaatcttgaagtgaacctcgaatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcac 24749370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 22236405 - 22235733
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| | ||| ||||||||  | ||  | ||    
T  22236405 catacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgacactgttccaaccctctctgatat 22236306  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || || || || |||    
T  22236305 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcc 22236206  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  || |||||  |||||||| ||||| |    
T  22236205 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgaccatcttgactttctctgtagtct 22236106  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| | ||| ||||| || || || || || ||||||||||||||| | || |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  22236105 gatgaaccaactccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagaataaaggagtcttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacgatgccat 22236006  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||    
T  22236005 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaattctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaa 22235906  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| |  || || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |    
T  22235905 tcctccaaagattgtatcatcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaagcgtcttgcaaactct 22235806  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  22235805 tccagaatctagaagtgaaccttggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 22235733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 21564451 - 21563786
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| || | |||| | ||  | ||    
T  21564451 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgtccaaactctatcagatat 21564352  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||||||||||| |||   || ||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||  |||| | || ||||||||| |||||| |||||||||||     
T  21564351 ctgatatggaccaataaaccgtggagtcaaattcttagacttcaaagcacgactaacacgtgtcacatgagtgactctcagaaacacatggtctccttct 21564252  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatca-tctgaactttctcagtagtt 319  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||| | ||| | ||||||   |||| | ||| |||| || |||||     
T  21564251 tgaaactcaaggtcctttcttcgcttgtcatgataactcttctgccgactttgcgacactttcgtcttctctcttatcaatttgaccttt-tctgtagtc 21564153  T
Q  320 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 419  Q
    || ||||| || ||| |||| || || || |||       |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  21564152 tgatgaactatatctagtcccaacactacactt-------actcaaaccaacataacggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgtca 21564060  T
Q  420 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 519  Q
    | |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||| | ||||| |||    
T  21564059 taccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagcttcaccttgctcaagtacacacactctcagcaa 21563960  T
Q  520 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 619  Q
    |||||||| ||||||||| |   ||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  21563959 atcctctaacgactgaatcgctttctccgactgaccatatgtttgcggatgataagctgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttgcaaactt 21563860  T
Q  620 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21563859 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgacacaatgctcgatggaacaccatgcagcttcacaat 21563786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 21891244 - 21890572
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  21891244 catacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatat 21891145  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||  | ||||||| |||||| || ||||| ||     
T  21891144 ctgatacggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaacgcacatcctacaccagtcataggtgtaactctcagaaacacatgatctccctct 21891045  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  |||||||| ||||| |    
T  21891044 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctatcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctctgtagtct 21890945  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  |||| ||| || || || ||||| || ||||||||||| || || |||||  || | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21890944 gatgaaccaaatctgttcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacataatggagtcttgtacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 21890845  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||| ||||||||| ||| | |||||||||  |||| ||||||| ||||    
T  21890844 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgagtatcccaagctccacgttgctcaagtgcacacattctcagcaaa 21890745  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  21890744 tcctctaacgactgaatcgttctctctgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactct 21890645  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  21890644 tccaaaatcttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatggaactccatggaacttcacaat 21890572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 22381082 - 22381754
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||||||||||||||||||  | ||  ||||    
T  22381082 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccaccgttccaaccctctctgaaat 22381181  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  22381182 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatcggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 22381281  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    ||||| |  || ||||||||||| |    
T  22381282 tgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcattttgaccttctcagtagtct 22381381  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      ||||| |  || ||||| || || || || |||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  22381382 catgaaccaaatccggtcccaacacaacactctcacctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaatagtgccat 22381481  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     || ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||    
T  22381482 acctatactcgagtgatagctgttgttatatgtgaactcaatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaa 22381581  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || || |  || || || |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  22381582 tcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgcctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcctgcaaactct 22381681  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||| || ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22381682 tccagaacctagaggtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaat 22381754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 23080574 - 23079902
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  23080574 catacttccgaagctgcaacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggtaaaccaactctataagccactgttccaaccctctctgaaat 23080475  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  23080474 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcttacacccgtcataggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 23080375  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||  ||  | ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| || ||    |||||||  |||||||||||||| |    
T  23080374 tgaaactatagggcctttctccgcttgtcatgataactcttctgtcgaatctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctcagtagtct 23080275  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      || || |  |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  23080274 catgcaccaagtctggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcatagaggagtcctgcacctccgaccatataaagcttcgaacggtgccat 23080175  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  23080174 accaatactcgagtgatagctgttgttatatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaa 23080075  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || || |  || || || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||| || |||||||| |    
T  23080074 tcttccaatgattggatcgtcctctccgactaaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcaaacccaaagcatcctgcaaactct 23079975  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||| || ||||| || || || | ||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||    
T  23079974 tccagaacctagaggtgaacctcgaatccctatccgatacaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaat 23079902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 21 - 690
Target Start/End: Original strand, 22502562 - 22503231
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| | ||  ||||    
T  22502562 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaactctctctgaaat 22502661  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  22502662 ctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 22502761  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| || ||||| || ||    |||| |   |||||||||||||| |    
T  22502762 tgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtct 22502861  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      ||||| |  |||||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || |||||  | || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  22502862 catgaaccaagtctggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcttacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 22502961  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||    
T  22502962 gccaatactcgagtgatagctgttgttataagtgaactcaatcaatggcaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaa 22503061  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| |    
T  22503062 tcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaatgcgtcctgtaaactct 22503161  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 690  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22503162 tccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatgctcgatggaacaccatgaagcttcac 22503231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 21 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 14887476 - 14886807
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||| | | ||  ||||    
T  14887476 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaattctctctgaaat 14887377  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  14887376 ctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 14887277  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||   |||| |   |||||||||||||| |    
T  14887276 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 14887177  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      || || |  || ||||| || || || |||||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  14887176 catgcaccaaatccggtcccaacacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccggccatacaaggcttcgaacggtgccat 14887077  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  14887076 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaa 14886977  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||| || || |||||||    
T  14886976 tcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttt 14886877  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 690  Q
    |||| || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  14886876 tccagaacctagaagtgaacctcggatctctatctgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcac 14886807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 21 - 657
Target Start/End: Original strand, 22461835 - 22462471
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||| | |||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||  ||||    
T  22461835 catacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatacgccacagttccaactctttctgaaat 22461934  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||| || |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | || |||| ||| || ||||| ||||||    
T  22461935 ctggtaaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcc 22462034  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    |||||||  |||||||| |||||||    
T  22462035 tgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctccctaatcatcttgactttctctgtagttt 22462134  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      ||||| |  || || || || || || ||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  22462135 catgaaccaattccggccccaacacaacactttctcccgactcgaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 22462234  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||| ||| ||||| || || || || || || || || ||||| || || ||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||| |  |||    
T  22462235 accaacactcgaatggtaactgttgttgtatgtaaattctatcaatggtaggtgactgtcccaagctccaccctgctcaagtacacatattcttagtaaa 22462334  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||  || || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |    
T  22462335 tcctctaatgattggatcgtcctttccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaactct 22462434  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctga 657  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  22462435 tccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctga 22462471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 21 - 690
Target Start/End: Original strand, 25847958 - 25848627
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||| |||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| ||||||||| | ||  ||||    
T  25847958 catacttctgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctgtatgccacagttccaactctctctgaaat 25848057  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||| || || ||||||||  | || |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||| || || || || |||    
T  25848058 ctgatacggaccaatgaatttaggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcaaaaaaacatgatcaccctcc 25848157  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatca-tctgaactttctcagtagtt 319  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||   |||| ||||| |||||||||||||     
T  25848158 tgaaactcaagatcctttttccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaatctga-ctttctcagtagtc 25848256  T
Q  320 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 419  Q
    |  ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  25848257 tcatgaaccaagtccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgcca 25848356  T
Q  420 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 519  Q
    | |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||||||||| | ||| || ||||||||    
T  25848357 taccaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcatacacatcctcaacaa 25848456  T
Q  520 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 619  Q
    ||| || |  || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||| |     
T  25848457 atcttccaatgattgaattgttctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaattc 25848556  T
Q  620 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 690  Q
    ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  25848557 ttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctcgacggaacaccatgaagcttcac 25848627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 21 - 690
Target Start/End: Original strand, 20342165 - 20342834
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  20342165 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaat 20342264  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||  ||||||||| ||| || || || |  |||    
T  20342265 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacctgtcaaaggggtgactctcagaaaaacatgatcacgctcc 20342364  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||   |||| |   |||||||||||||| |    
T  20342365 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 20342464  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      ||||| |  || ||||| || || || || ||||| ||||||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  20342465 catgaaccaagtccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaactagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 20342564  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||    
T  20342565 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtgaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacaccctcaacaaa 20342664  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |    
T  20342665 tcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactct 20342764  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 690  Q
    |||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || || |||||||| ||||||||    
T  20342765 tccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgacggtacaccatgaagcttcac 20342834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 56 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 28924218 - 28923581
Alignment:
Q  56 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 155  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || |||| ||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||      
T  28924218 tgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttc 28924119  T
Q  156 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 255  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28924118 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgata 28924019  T
Q  256 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttca 355  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||   ||||| || ||||| |  ||||| |  || ||||| || || || |||||     
T  28924018 gctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcctgactttttccgtagtctcatgaaccaaatccggtcccaaaacaacactttct 28923919  T
Q  356 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 455  Q
    || ||||| ||||| || |  ||||| || ||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||    
T  28923918 cccgactcgaaccaacatagaggagtcctacacttccgaccatataaagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtga 28923819  T
Q  456 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 555  Q
    | || ||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |  || | |||||||||||  || || ||||||||||||||||||||    
T  28923818 attctatcaatggtagatgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacatacccttagcaaatcctctaaagattggattgtcctctccgactgacc 28923719  T
Q  556 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 655  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||    
T  28923718 atcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgatcccaacgcatcttgtaaacttctccaaaacctcgaagtaaaccttgggtctctatct 28923619  T
Q  656 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    || || || ||||| ||||  ||||| | |||||||||    
T  28923618 gacactatactcgacggaatcccatgcaacttcacaat 28923581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 21 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 37545982 - 37545336
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  37545982 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagtaccaactctctcagaaat 37545883  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctca-aaaacacgtggtctccttc 219  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| |||| || || || || ||    
T  37545882 ctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaaacatgatcaccctc 37545783  T
Q  220 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 319  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| || |||   |||| |   ||||||||||||||     
T  37545782 ctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactgttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaaccttactttctcagtagtc 37545683  T
Q  320 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 419  Q
    |  || || |  || ||||| || || || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||  ||||||    
T  37545682 tcatgtaccaaatccggtcccaacacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaggcttcgaacagtgcca 37545583  T
Q  420 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 519  Q
    | |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  37545582 taccaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaa 37545483  T
Q  520 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 619  Q
    ||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| || || || ||| ||    
T  37545482 atcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaaatt 37545383  T
Q  620 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgct 666  Q
    ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||||||    
T  37545382 ttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgct 37545336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 56 - 693
Target Start/End: Original strand, 20821371 - 20822008
Alignment:
Q  56 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 155  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| | || ||| ||||| ||||||||  ||||  |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||     
T  20821371 tgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaattctatacgccacagttccaaccctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcc 20821470  T
Q  156 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 255  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || || || ||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||| ||    
T  20821471 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccttcctgaaattcaaggtctttcttacgcttgtcatggta 20821570  T
Q  256 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttca 355  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||  ||||||||| ||||| |  ||||| |  || || || || || || |||||     
T  20821571 gctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcctaactttctctgtagtctcatgaaccaaatccggccccaacacaacactttct 20821670  T
Q  356 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 455  Q
    || ||||||||||| || |  ||||| || ||  |||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| || || || || ||||    
T  20821671 cccgactcaaaccaacatagaggagtcctacacttccgaccatataaagcttcaaatggtgccataccaatacttgaatgataactgttgttgtatgtga 20821770  T
Q  456 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 555  Q
      || ||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |  || | |||||||||||  || || ||||||||||||||||||||    
T  20821771 gttctatcaatggtagatgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacatacccttagcaaatcctctaaagattggattgtcctctccgactgacc 20821870  T
Q  556 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 655  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||  |||||||||| |||||||| || || |||||||||    
T  20821871 atcagtctgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaacgcgtcctgtaaactcctccaaaatcttgaagtaaacctcgggtctctatct 20821970  T
Q  656 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    || || || ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  20821971 gacactatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 20822008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 56 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 28895392 - 28894755
Alignment:
Q  56 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 155  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || |||| ||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||      
T  28895392 tgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccagagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttc 28895293  T
Q  156 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 255  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28895292 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgata 28895193  T
Q  256 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttca 355  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||   ||||| || ||||| |  ||||| |  || ||||| || || || |||||     
T  28895192 gctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcctgactttttccgtagtctcatgaaccaaatccggtcccaaaacaacactttct 28895093  T
Q  356 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 455  Q
    || ||||| ||||| || |  ||||| || ||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||    
T  28895092 cccgactcgaaccaacatagaggagtcctacacttccgaccatataaagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtga 28894993  T
Q  456 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 555  Q
    | || ||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |  || | ||||| | |||  || || ||||||||||||||||||||    
T  28894992 attctatcaatggtagatgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacatacccttagcaaattcactaaagattggattgtcctctccgactgacc 28894893  T
Q  556 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 655  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||| |||||  | ||||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||    
T  28894892 atcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgatcccaacacatcttgtaaacttctccaaaacctcgaagtaaaccttgggtctctatct 28894793  T
Q  656 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    || || || ||||| ||||  ||||| | |||||||||    
T  28894792 gacactatactcgacggaatcccatgcaacttcacaat 28894755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 117 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 17269722 - 17269148
Alignment:
Q  117 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 216  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| | ||| || || || ||    
T  17269722 aaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcacc 17269623  T
Q  217 ttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagta 316  Q
     || |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  ||||| || |||    
T  17269622 ctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgta 17269523  T
Q  317 gtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtg 416  Q
    || | |||||| |  || ||||| || || || || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  17269522 gtctcctgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtg 17269423  T
Q  417 ccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaa 516  Q
    ||||||| ||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||    
T  17269422 ccattcctatactcgaatggtaactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaa 17269323  T
Q  517 caaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaa 616  Q
    ||| || || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | | |||||| ||||| |||| ||| || || |||    
T  17269322 caagtcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaa-ttagtctcaatttcgaacccagagcgtcctgtaaa 17269224  T
Q  617 cttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 692  Q
    || ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17269223 ctcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 17269148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 24798882 - 24798213
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  24798882 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagtaccaactctctctgaaat 24798783  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| || ||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||| ||||||||| ||| || || || || |||    
T  24798782 ctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcc 24798683  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcat-ctgaactttctcagtagtt 319  Q
     ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  |||| || ||    ||||| |||| |||||||||||||     
T  24798682 agaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctctcatcttttcccttatcattctga-ctttctcagtagtc 24798584  T
Q  320 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 419  Q
    |  ||||| |  ||  |||| || || || |||||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  24798583 tcgtgaaccaaatccagtcccaacacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgcca 24798484  T
Q  420 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 519  Q
    | |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  24798483 taccaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctcctccttgctcaagcacacacactctcaacaa 24798384  T
Q  520 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 619  Q
    ||| || |  || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  |||  ||||| ||||| || || || |||||     
T  24798383 atcttccaatgattgaattgtcctttccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcagtttcgaccccaaggcgtcctgtaaactc 24798284  T
Q  620 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 690  Q
    ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  24798283 ttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcac 24798213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 56 - 681
Target Start/End: Original strand, 20773678 - 20774302
Alignment:
Q  56 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 155  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || |||| ||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||      
T  20773678 tgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttc 20773777  T
Q  156 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 255  Q
    | |||||||| ||||||||||| || ||||||||| | || |||| ||| || ||| | ||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  20773778 tcgacttcaatgcacgtcctacgcccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggcccccttcctgaaactgaagctctttccgacgcttgtcatgata 20773877  T
Q  256 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttca 355  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||  |||||||| ||||| |  ||||| |  || ||||| || || ||  ||||     
T  20773878 gctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctaatcatcttgactttctctgtagtctcatgaaccaattccggtcccaaaacaacattttct 20773977  T
Q  356 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 455  Q
    || ||||| ||||| || || |||||  | ||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||    
T  20773978 cccgactcgaaccaacataaaggagtcttacacttccgaccatataaagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtga 20774077  T
Q  456 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 555  Q
    | || ||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |  || | |||||||||||  || || | ||||||||||||||||||    
T  20774078 attctatcaatggtagatgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacatacccttagcaaatcctctaaagattgga-tgtcctctccgactgacc 20774176  T
Q  556 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 655  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||    
T  20774177 atcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaacttctccaaaatctcgaagtaaaccttgggtctctgtct 20774276  T
Q  656 gatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    || || || ||||| ||||| |||||    
T  20774277 gacactatactcgacggaaccccatg 20774302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 21 - 583
Target Start/End: Original strand, 21404737 - 21405285
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||  || || ||||||||||| || ||||||||||||| ||| || || || |||||| ||||| ||||    
T  21404737 catacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgtggtggtaaacccactctatacgcaactgtcccaactctttccgaaat 21404836  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |  ||||| |||  ||| ||||  |||||||| || |  |||||||| ||||| |||| | || ||||||| |||||||| || |||||||      
T  21404837 ctgatacgagccaataaaccacggagtcagtttctttgattttagcgcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctaaaaaacacatgatctccttg- 21404935  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
                   || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| || |||   |||| || ||| ||||||||||| |    
T  21404936 ---------------ttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgtgacaccttcatattttctctaatcaacttaaccttctcagtagtct 21405020  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaa--gcctcgaaaggtgcc 418  Q
    | |||||||| |||||||| |  | |||  | ||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||   || ||||| ||||||    
T  21405021 gttgaacaatgtctggtcccagtatcacaatctcaccggactcataccaacacaacgaagttctgcatctccgaccatacaacacgcttcgaacggtgcc 21405120  T
Q  419 attccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaaca 518  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  21405121 attccaatactagaatggtaactgttattataagtgaactcgatcaatgaaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacataaactctcaaca 21405220  T
Q  519 aatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 583  Q
    | ||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  21405221 agtcctccaacgactgaattgtcctctccgtctgtccatctgtctgtggatgatacgccgaactc 21405285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 24736096 - 24735682
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||| | |||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  24736096 catacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatat 24735997  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||     
T  24735996 ctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctct 24735897  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  |||   |||| || ||| || || ||||| |    
T  24735896 tgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaacttaaccttttctgtagtct 24735797  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||| || |||||||| || | ||| |||||  | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24735796 gctgaactatgtctggtcccaacatcacactttcttccgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 24735697  T
Q  421 tccaatactagaatg 435  Q
     |||||||| |||||    
T  24735696 accaatactcgaatg 24735682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 251 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 21831998 - 21831574
Alignment:
Q  251 tgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactc 350  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   || | || ||| || |  ||||| || |||||||| || ||||| || || || |    
T  21831998 tgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttattagcttaaccttttatgtagtctggtgaacaatatccggtcccaacactacac 21831899  T
Q  351 tttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattata 450  Q
      ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||| |||||| ||||||||| | || || || || ||    
T  21831898 cctcacccgactcaaaccaacataacggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcaaatggtgtcattcctatactagaaaggtaactgttgttgta 21831799  T
Q  451 agtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgac 550  Q
     |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||                   
T  21831798 cgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagtcccaccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctaacgactga--------------- 21831714  T
Q  551 tgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctc 650  Q
       |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21831713 ---ccatgtgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttcgatctc 21831617  T
Q  651 tatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||  || |||||||||||    
T  21831616 tatctgacacaatgctcgacagaacacggtgcagcttcacaat 21831574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 23442778 - 23442472
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||| |||||   || ||||| ||||||||  | ||  | |     
T  23442778 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaaccactttgtatgccactgttccaaccctctcagataa 23442679  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||     
T  23442678 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacatcttagacttcaacacacgtcctacacccgtcataggagtgactctcaaaaacacatgatctccctct 23442579  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  |||||||| ||||| |    
T  23442578 tgaaactcaagagccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctctgtagtct 23442479  T
Q  321 gctgaac 327  Q
    | |||||    
T  23442478 gatgaac 23442472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 384 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 1150 - 919
Alignment:
Q  384 tgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccca 483  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||| |    
T  1150 tgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatccta 1051  T
Q  484 agttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 583  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| | |||||  ||||||||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1050 agctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctctaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactc 951  T
Q  584 aatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaa 615  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  950 aacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaa 919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 455 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 24716577 - 24716342
Alignment:
Q  455 aactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgac 554  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||    
T  24716577 aactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgac 24716478  T
Q  555 catctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatc 654  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || | |||||||||    
T  24716477 catctgtctgaggatgctaagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatcttgaagtgaacctcgaatctctatc 24716378  T
Q  655 tgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 690  Q
     || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24716377 cgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcac 24716342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 24737270 - 24737012
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||| | |||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  24737270 catacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatat 24737171  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||     
T  24737170 ctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctct 24737071  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgc 279  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24737070 tgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgc 24737012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Original strand, 20573422 - 20573626
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| | ||    
T  20573422 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttccgatat 20573521  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||| | |  ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| || || ||||||||     
T  20573522 ctgatacggaccaataaaccttgaagtcaacttccttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcagtggagtgactctcaaaaatacatgatctccttct 20573621  T
Q  221 tgaaa 225  Q
    |||||    
T  20573622 tgaaa 20573626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 461 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 24620340 - 24620111
Alignment:
Q  461 atcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctg 560  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||||||||    
T  24620340 atcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctg 24620241  T
Q  561 tctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 660  Q
    |||| ||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || | ||||||||| || ||    
T  24620240 tctgaggatgctaagtcgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatcttgaagtgaacctcgaatctctatccgacac 24620141  T
Q  661 aatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 690  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24620140 aatactcgacggaacaccatgaagcttcac 24620111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 402 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 28916517 - 28916226
Alignment:
Q  402 aagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 501  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||| || ||||| || |||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  28916517 aagcttcgaatggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaattctatcaatggtagatgactatcccaagctccaccctgctcaag 28916418  T
Q  502 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 601  Q
     ||||| |  || | |||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||| |||    
T  28916417 tacacatacccttagcaaatcctctaaagattggattgtcctctccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgatccc 28916318  T
Q  602 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    || || ||||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||  ||||| | |||||||||    
T  28916317 aacgcatcttgtaaacttctccaaaacctcgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaatcccatgcaacttcacaat 28916226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21343843 - 21343666
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  | ||    
T  21343843 catacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaactctttctgatat 21343744  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactct 198  Q
    || ||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  21343743 cttatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgctcgtccaacaccagtcacaggagtgactct 21343666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 461 - 693
Target Start/End: Original strand, 21496481 - 21496713
Alignment:
Q  461 atcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctg 560  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || ||||| || |||||| |||||||||||     
T  21496481 atcaacgatagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattgaatcgttctctcctactgaccatcta 21496580  T
Q  561 tctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 660  Q
    | |||| |||||| ||||||||||| || ||||| || ||||  || | ||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||    
T  21496581 tttgcgaatgataagccgaactcaaccttaacttagaacccagggcattttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacac 21496680  T
Q  661 aatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||| || || ||||| ||||| | |||||||||    
T  21496681 aatacttgatggaaccccatgcaacttcacaat 21496713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 146 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 21937548 - 21937013
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || || |||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  21937548 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcacccttaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 21937449  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 345  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || || || || |     
T  21937448 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggcccaaacaa 21937349  T
Q  346 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 445  Q
      | ||||| || || |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||| | || ||     
T  21937348 agcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttg 21937249  T
Q  446 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 545  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||||| |    
T  21937248 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtccttt 21937149  T
Q  546 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 645  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  21937148 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 21937049  T
Q  646 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  21937048 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 21937013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 579 - 693
Target Start/End: Original strand, 21407597 - 21407711
Alignment:
Q  579 aactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacacc 678  Q
    ||||||| |||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21407597 aactcaaactcaacttaggacccaacgcctcctgcaaactcttccgaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgacggaacacc 21407696  T
Q  679 atgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||||||||    
T  21407697 atgtagcttcacaat 21407711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 146 - 681
Target Start/End: Original strand, 24581219 - 24581753
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | || || | ||||||||| || ||  | |||||||||| ||| || || | ||    
T  24581219 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcacccttacaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 24581318  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 345  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || || ||||  || ||||  || |||||||| |     
T  24581319 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtggtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 24581418  T
Q  346 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 445  Q
      | || || || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| | || ||     
T  24581419 agcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 24581518  T
Q  446 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 545  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      ||||||    | |||||||| |  ||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  24581519 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaaccaacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 24581618  T
Q  546 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 645  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  ||||||||| || ||||||  |||||||||| || ||    
T  24581619 ctgtctg-ccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaaccttcccaaaacttagaagtaaacctcgg 24581717  T
Q  646 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  24581718 atcccaatccgacacaatactagaaggaataccatg 24581753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 146 - 681
Target Start/End: Original strand, 27011092 - 27011627
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| | || | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| || || | ||    
T  27011092 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 27011191  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 345  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  27011192 tatcatgataactcttatgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 27011291  T
Q  346 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 445  Q
      | || || ||  |||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||| |||| | || ||     
T  27011292 agcactctctccgaactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaatggtgtcattccgatactagcatgaaaactgttg 27011391  T
Q  446 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 545  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| |  ||| ||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  27011392 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctctaacacataagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 27011491  T
Q  546 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 645  Q
    ||| ||| ||||| ||||| ||||| || ||  |||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  27011492 ccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcaaaactcaatctcaacttagttcccaaagcaacttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 27011591  T
Q  646 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  27011592 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 27011627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 146 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 11211054 - 11210732
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| |||||| || | ||    
T  11211054 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatctttcctcctct 11210955  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 345  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| || || ||||| ||||| || ||||||| |||||| || ||||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  11210954 tatcatgataactcttctgtctactctgagatgctttcatcttctcctgaatcatcttaactttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacaa 11210855  T
Q  346 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 445  Q
     || || || || ||||||||||| |||||||  || || || |||| ||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||| | |||||     
T  11210854 aacactctctccggactcaaaccaacacaacgatgtcctacacctcctaccatacaaggcctcaaacggtgtcattccaatactagaatgaaaactattg 11210755  T
Q  446 ttataagtgaactcgatcaacgg 468  Q
    || ||||| ||||| ||||||||    
T  11210754 ttgtaagtaaactcaatcaacgg 11210732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21662524 - 21662297
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| || || ||||  ||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||| | ||  ||||||||| ||||| | ||    
T  21662524 catatttccgaagttgcgacacttgaaatacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggcaaacccactctatacgtcattgttccaactctttccgatat 21662425  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||   |||||| ||| |||  ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||  |||||||| ||||||| | |||||| || ||| ||||     
T  21662424 ctgata-caaccaataaacctcgaagtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctatcataggagtgactcttagaaacacatgatctgcttct 21662326  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtc 249  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  21662325 tgaaattcaaggtctttcctacgcttgtc 21662297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21665985 - 21665758
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| || || ||||  ||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||| | ||  ||||||||| ||||| | ||    
T  21665985 catatttccgaagttgcgacacttgaaatacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggcaaacccactctatacgtcattgttccaactctttccgatat 21665886  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||   |||||| ||| |||  ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||  |||||||| ||||||| | |||||| || ||| ||||     
T  21665885 ctgata-caaccaataaacctcgaagtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctatcataggagtgactcttagaaacacatgatctgcttct 21665787  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtc 249  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  21665786 tgaaattcaaggtctttcctacgcttgtc 21665758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 533 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 25244323 - 25244175
Alignment:
Q  533 tgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctag 632  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| |  ||| |||| |||||||| |  |||||||||  ||||||||| | | ||||  |||    
T  25244323 tgaatagtcctctcggtctgaccatcagtctgaggatgataaggagaattcaacctcaacttagttcccaaagccgattgcaaactctcctaaaacttag 25244224  T
Q  633 aagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||    
T  25244223 aagtaaacctcggatctctatctgacacaatgctagatggaataccatg 25244175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 533 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 25308475 - 25308327
Alignment:
Q  533 tgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctag 632  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| |  ||| |||| |||||||| |  |||||||||  ||||||||| | | ||||  |||    
T  25308475 tgaatagtcctctcggtctgaccatcagtctgaggatgataaggagaattcaacctcaacttagttcccaaagccgattgcaaactctcctaaaacttag 25308376  T
Q  633 aagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||    
T  25308375 aagtaaacctcggatctctatctgacacaatgctagatggaataccatg 25308327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 436
Target Start/End: Original strand, 23503526 - 23503741
Alignment:
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||| ||| || || ||||| |    
T  23503526 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtct 23503625  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      || || |  || |||||||| |   | |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||  | |||||||||||||||||||  || || |||||    
T  23503626 cttgcaccacttccggtcctaacaaagcactttcaccagactcaaaccaacacaacggtgtcctagacctccgaccatacaaagccttaaacggagccat 23503725  T
Q  421 tccaatactagaatga 436  Q
     || | ||||||||||    
T  23503726 accgacactagaatga 23503741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 371 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 21229308 - 21229241
Alignment:
Q  371 cacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgata 438  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21229308 cacaaaggagtcctgcatctgcgaccatacaatgcttcgaatggtgccattcctatactcgaatgata 21229241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 533 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 16065665 - 16065604
Alignment:
Q  533 tgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaactt 594  Q
    |||||||| |||||||  |||||||| ||||| |||| ||| || |||||||||||||||||    
T  16065665 tgaattgttctctccgcatgaccatcagtctgaggataataagcagaactcaatctcaactt 16065604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 592; Significance: 0; HSPs: 62)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 592; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 704
Target Start/End: Original strand, 16998600 - 16999283
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16998600 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 16998699  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16998700 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 16998799  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16998800 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 16998899  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16998900 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 16998999  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16999000 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 16999099  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16999100 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 16999199  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 704  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  16999200 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 16999283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 588; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 704
Target Start/End: Original strand, 16981752 - 16982435
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16981752 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 16981851  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16981852 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 16981951  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16981952 tggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 16982051  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16982052 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 16982151  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16982152 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 16982251  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16982252 tcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 16982351  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 704  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  16982352 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgt 16982435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 588; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 704
Target Start/End: Original strand, 17063317 - 17064000
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  17063317 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 17063416  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  17063417 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 17063516  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17063517 tggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 17063616  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17063617 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 17063716  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17063717 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 17063816  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17063817 tcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 17063916  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 704  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  17063917 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgt 17064000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 704
Target Start/End: Original strand, 9609736 - 9610419
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  9609736 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 9609835  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  9609836 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 9609935  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9609936 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 9610035  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  9610036 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 9610135  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9610136 tccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 9610235  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  9610236 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 9610335  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 704  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  9610336 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 9610419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 572; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 704
Target Start/End: Original strand, 10868450 - 10869133
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  10868450 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccactgttccaactctttccaatat 10868549  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10868550 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 10868649  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10868650 tgaaattcaagatctttcctacgcttatcatgatagctcttttgtcgactctgcgacaccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 10868749  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  10868750 gctgaacaatctctggtcctaagaccaccctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccgtacaaagcctcgaacggtgccat 10868849  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10868850 tccaatactagaatgataactattgttataagtgaactcgatcaacgggagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 10868949  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10868950 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 10869049  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 704  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  10869050 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttgatgt 10869133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 572; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 704
Target Start/End: Original strand, 27217616 - 27218299
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27217616 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 27217715  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217716 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 27217815  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27217816 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgtatcatctgaactttctcagtagttt 27217915  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27217916 gctgaaaaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 27218015  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27218016 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgattaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 27218115  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27218116 tcctctagcgactgaattgttctgtccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 27218215  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 704  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  27218216 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 27218299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 566; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 44386412 - 44385731
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  44386412 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 44386313  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44386312 ctgatacggaccaatgaatttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 44386213  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44386212 tgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcgttttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 44386113  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44386112 gctgaacaatctctggtcctaagaccgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 44386013  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44386012 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagtccctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 44385913  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44385912 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgatcatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 44385813  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||    
T  44385812 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatccccttgat 44385731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 562; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 22325699 - 22325018
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  22325699 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 22325600  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22325599 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttgtttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 22325500  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22325499 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 22325400  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22325399 gctgaacaatctctggccctaagaccgctctttctcctgattcaaaccaacaccacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 22325300  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22325299 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaa 22325200  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22325199 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 22325100  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  22325099 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 22325018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 556; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 704
Target Start/End: Original strand, 17066978 - 17067658
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  17066978 catactttcgaagt-gcgacacatgaaaaacgt-gtgcaa-ttcgaaagatgcggcggtaaacccactcgtaaagccaccgttccaactctttccaatat 17067074  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  17067075 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 17067174  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17067175 tggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 17067274  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17067275 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 17067374  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17067375 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 17067474  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17067475 tcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 17067574  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 704  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  17067575 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgt 17067658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 554; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Original strand, 24261970 - 24262651
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  24261970 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 24262069  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
     |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  24262070 atgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 24262169  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24262170 tggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 24262269  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24262270 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 24262369  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24262370 tccaatacttgaatgataactattattgtatgtggactcgatcaacgggagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 24262469  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24262470 tcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 24262569  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  24262570 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 24262651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 554; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Original strand, 24709633 - 24710314
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  24709633 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtacaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 24709732  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  24709733 ctaatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 24709832  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24709833 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 24709932  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||    
T  24709933 gctgaacaatctctggtcctaagaccgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaggcctcaaacggtgtcat 24710032  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24710033 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 24710132  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  24710133 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 24710232  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  24710233 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgcttgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 24710314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 550; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Original strand, 27370869 - 27371550
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27370869 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaatccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 27370968  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  27370969 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacatcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 27371068  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27371069 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 27371168  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27371169 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacatagttcttcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 27371268  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27371269 tccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 27371368  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27371369 tcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 27371468  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  27371469 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 27371550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 498; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 704
Target Start/End: Complemental strand, 21145873 - 21145201
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  21145873 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgataagccatcgttccaactctttccaatat 21145774  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21145773 ctgatacagatcaataaacttcggggtcaacttctttgatttcaaagcacgtcctacacccgtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 21145674  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21145673 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagttt 21145574  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21145573 gctggacaatctttggtcctaagaccactctttcacctaactcaaaccagcacaacggagttttgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 21145474  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           |||    
T  21145473 tccaatactagaatgataactattgttgtatgtgaactcgatcaacggaagatggctatcccaagttcctccttgctcaagaacac-----------aaa 21145385  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  21145384 tcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaacttt 21145285  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 704  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||    
T  21145284 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatgt 21145201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 477; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 23188608 - 23189279
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| |||||||||| ||||| | ||    
T  23188608 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatctcactcgatacgccatcgttccaactctttccgatat 23188707  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23188708 ctgatacggaccaataaatcttggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttcc 23188807  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||   | ||| ||||||||||| |    
T  23188808 tgacactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatctatttaaccttctcagtagtct 23188907  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23188908 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacaca-cggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 23189006  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||| | |||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||    
T  23189007 tcctaaactagaatgataactattgttgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaaaaacacaaactctcaataaa 23189106  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23189107 tcctctagcgactgaactgtcctctccgactgaccatctatctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 23189206  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  23189207 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaat 23189279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 471; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 699
Target Start/End: Original strand, 24675089 - 24675767
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  24675089 catacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatccaactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 24675188  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||     
T  24675189 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggggtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 24675288  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  24675289 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 24675388  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  24675389 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaatggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccat 24675488  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  24675489 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacagactctcagcaaa 24675588  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  24675589 tcctctagcgactgaatcatcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactct 24675688  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 699  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||    
T  24675689 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatatgatacaatgctcgaaagaacaccatgcaacttcacaatctcctt 24675767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 467; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 24708325 - 24707647
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  24708325 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgtcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 24708226  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||  ||  | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  24708225 ctgatacggaccaaaaaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 24708126  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||| || || ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  24708125 tgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgatatttcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 24708026  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  24708025 gctgaacaatttctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccat 24707926  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  24707925 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaataaa 24707826  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  24707825 tcttctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactct 24707726  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 699  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  24707725 tccaaaatctaaaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcataatttcctt 24707647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 459; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 539
Target Start/End: Original strand, 16924860 - 16925378
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16924860 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 16924959  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16924960 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 16925059  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16925060 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 16925159  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16925160 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 16925259  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16925260 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 16925359  T
Q  521 tcctctagcgactgaattg 539  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16925360 tcctctagcgactgaattg 16925378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 459; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 21326109 - 21325431
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| | ||    
T  21326109 catacttctgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgtcccaactctttccgatat 21326010  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  21326009 ctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 21325910  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  21325909 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtggttt 21325810  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  21325809 gttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacccgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccagataaagcctcaaaaggtgccat 21325710  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  21325709 tccaatactagaataataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagcacacaaactctcaacaaa 21325610  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  21325609 tcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccggactcaatctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttt 21325510  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 699  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  21325509 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatataatgctcgacagaacaccatgcaacttcacaatttcctt 21325431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 24878838 - 24878319
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  24878838 catactttcgaagttgcgacagatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccacttggtaagccaccgttccaactctttccaatat 24878739  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24878738 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcc 24878639  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24878638 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatccgaactttctcagtagttt 24878539  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  24878538 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcacctccgaccatataaagcctcgaaaggtgtcat 24878439  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24878438 tccaatactataatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaa 24878339  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgt 540  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  24878338 tcctcgagcgactgaattgt 24878319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 22757306 - 22756630
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  22757306 catacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 22757207  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  22757206 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgatttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctctttct 22757107  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| || ||||||||||||| | |    
T  22757106 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcaccttaactttctcagtaatct 22757007  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  22757006 gttgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactc--accaacacaacggagttctacatctccgaccatataaagcctcaaagggtgccat 22756909  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||||||||| | || || ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||  |||||||||    
T  22756908 tccaatactagaacggtaactgttattgtacgtgaagtctatcaacggaagatgactatccgaagtccctcctttctcaagtacacaaaccctcaacaaa 22756809  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  22756808 tcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtgtatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgaaaactct 22756709  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 699  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  22756708 tccaaaatctagaggtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 22756630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 690
Target Start/End: Original strand, 23063677 - 23064346
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||  | ||    
T  23063677 catacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttcagatat 23063776  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||| | |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  23063777 ctgaaacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaaaacgtggtctccttct 23063876  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  23063877 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtctactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagttt 23063976  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  23063977 gttcaacaatctctggtcctaagaccacactttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcataaggtgccat 23064076  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  23064077 tccaatacttgaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtacctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaa 23064176  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || || |  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  23064177 tcttcaaaagactgaatcatcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttt 23064276  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 690  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  23064277 tccaaaatctagaagtaaaacttggatctctatctgacacaatgcttgaaggaacaccatgcaacttcac 23064346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 316 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 41608933 - 41608547
Alignment:
Q  316 agtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggt 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41608933 agtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggt 41608834  T
Q  416 gccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctca 515  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41608833 gccattccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctca 41608734  T
Q  516 acaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaa 615  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41608733 acaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctacggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaa 41608634  T
Q  616 acttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||    
T  41608633 acttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctgtctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatccccttgat 41608547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 79 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 24826067 - 24825472
Alignment:
Q  79 taaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctaca 178  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||  | |||||||| | |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||    
T  24826067 taaacccactcgatacgccaccgtcccaattctttctgatatctgatacgaaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaaca 24825968  T
Q  179 ccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacg 278  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||| || |  |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24825967 ccagtcacaggagtgactcttaaaaatacattatctccttcctaaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcctttgtcgactctgcgacg 24825868  T
Q  279 ccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacgg 378  Q
    | ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  24825867 ctttcatcttttcttggatcatcttaaccttctcagtagtttgctgaacaatttctggtcccaaaactacactctcacctgactcaacccaacacaacgg 24825768  T
Q  379 agttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgacta 478  Q
    ||| || || ||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  24825767 agtcctacacctccgaccatacagagcttcaaaaggtgccataccaatactagaatgttaactattattatacgtgaactctatcaacgggagatgacta 24825668  T
Q  479 tcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccg 578  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24825667 tcccaagttccaccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcttccagcgactgaatcgttctttccgattgaccatctgtctgcggatgatacgccg 24825568  T
Q  579 aactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 674  Q
    |||| || |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24825567 aacttaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 24825472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 30211760 - 30211088
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||  || || |||||||||||||| ||||||||||||  ||| || |||   |||||||||||| ||||    
T  30211760 catacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgcggtggtaaacccactttatacgcaaccaccccaactttttccgaaat 30211661  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| || ||||| ||| |||| ||||  |||||||| || |  || ||||| ||||| |||| | |  ||||||| |||||||| |||||||||||     
T  30211660 ctgatacgggccaataaacctcggagtcagtttctttgattttagcgcccgtccaacaccggtcacatgggtgactctaaaaaacacatggtctccttct 30211561  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||   |||| || ||| ||||||||||| |    
T  30211560 tgaaactcaagatccttcctacgcttatcacggtaactcttttgtctactctgcgacgctttcatcttttctctaatcaacttaaccttctcagtagtct 30211461  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | |||| ||| | ||||| ||  || || || |||   |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||    
T  30211460 gttgaataatgtatggtcttagtactacactctcattggactcataccaacacaacagagttctgcatctccgaccatacaacgtttcgaacggtgccat 30211361  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  30211360 tccaatgctagaatggtaactgttattgtaagtgaactcgaccaatggaagatgactatcccaagttcccccttgctcaagtacacaaactctcaacaag 30211261  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |    
T  30211260 tcctccaacgactgaattgtcctctccgtctgtccatctgtctgcggatgatacaccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactct 30211161  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30211160 tccaaaatctagaagtaaatcttggatccctatctgatacaatactcgatggaacaccatgtagcttcacaat 30211088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 25 - 693
Target Start/End: Original strand, 45529121 - 45529783
Alignment:
Q  25 cttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctga 124  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||   | || ||| |||||||| | ||||||||||||| ||| || ||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  45529121 cttccgaagttgtgacacatgaaacacatcacgtaagttcaaaagatgcagtggtaaacccactctatacgcaaccgtcccaactctttccgaaatctga 45529220  T
Q  125 tatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaa 224  Q
    |||||  |||| ||| |||| ||||  |||||||| || |  |||||||| |||||||||| | || ||||||||| |||||| |||||| |      ||    
T  45529221 tatgggtcaataaacctcggagtcagtttctttgattttagcgcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcataaacacatggtcttc------aa 45529314  T
Q  225 actcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctg 324  Q
    |||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || |||   |||| || ||| |||| |||||| || ||    
T  45529315 actcaagatccttcctaggcttatcatgataactcttttgtctactctgcgatgctttcatcttttctctaatcaacttaaccttcttagtagtctgttg 45529414  T
Q  325 aacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattcca 424  Q
    |||||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  45529415 aacaatgtccggtcccaataccacactctcaccggactcataccaacacaatggagttttgcatctccgaccatacaacgcttcgaacggtgccattcca 45529514  T
Q  425 atactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcct 524  Q
    || ||| |||| || || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  45529515 atgctaaaatggtaactgttattataaatgaactcgatcaatggaagatgattatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctgaacaagtcct 45529614  T
Q  525 ctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcca 624  Q
    | | ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  45529615 ccaacgactgaattgtcctctacgtctgtccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactcttcca 45529714  T
Q  625 aaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  45529715 aaatctagaagtaaatcttggatccctatctgatacaatactcgatgcaacaccatgtagcttcacaat 45529783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 27365922 - 27365250
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || ||||| || |||| ||| ||||| ||||||||| ||||  ||||    
T  27365922 catacttccgcaactgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacagttccaactctttctgaaat 27365823  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||     
T  27365822 ctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgaccctcaagaacacatgatctccctct 27365723  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  |||   || | || ||| || || |||||||    
T  27365722 tgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttattaacttaaccttttccgtagttt 27365623  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| || |||||||| || | ||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| || || || ||||||||    
T  27365622 gttgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgtccatacaaggcttcaaacggtgccat 27365523  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| | |    
T  27365522 accaatactcgaatggtaactattgttgtaagtaaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaataga 27365423  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  27365422 tcctctaaggattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactct 27365323  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  27365322 tccagaatctagaagtgaacctcggatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 27365250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 23293558 - 23294230
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| || |||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  23293558 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttagaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgaaat 23293657  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || || || |||    
T  23293658 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctcc 23293757  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| || |||  ||||||||  ||||||||  |||| |    
T  23293758 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttccgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctatagtct 23293857  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || || |||||||||||||  || || ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  23293858 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccgacataaaggagtcctcaacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 23293957  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  23293958 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagcaaa 23294057  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
     |||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |    
T  23294058 ccctccaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgtaagctct 23294157  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  23294158 tccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 23294230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 23276376 - 23277048
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||| | ||    
T  23276376 catactttcgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatat 23276475  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||| ||||  | |||||||| |||||||| |||||  |||||||| | | ||||| ||| || || || || |||    
T  23276476 ctgatacggaccaatgaactttggagtcgacttactcgacttcaatgcacgtcccacacccatcataggagtaaatctcagaaatacatgatcaccctcc 23276575  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||   |||||||| ||||| |    
T  23276576 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcatgactttctccgtagtct 23276675  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || | ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  23276676 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaagaagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 23276775  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| |||||||| || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| | | | ||| ||||    
T  23276776 accaatactcgaatgataactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacaaacactttcagcaaa 23276875  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  23276876 tcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaaccttaacttcgaacccaatgcatcttgcaaactct 23276975  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||| ||||||||||| || || | ||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  23276976 tccagaatctagaagtgaacctcgaatcactatccgacacaatactcgacggtacaccatgcagcttcacaat 23277048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 21 - 582
Target Start/End: Original strand, 23087050 - 23087611
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||| ||||| ||| ||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  23087050 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacacactctatacgccactgttccaactctctcagatat 23087149  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||| | || |||||||||||||||| |||||||||||     
T  23087150 ctgatatggaccaataaacctcggcgtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttct 23087249  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||   ||||  | ||| || ||| |||| |    
T  23087250 tgaaactcaaggacctttctacacttgtcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttctctcttatcaatttaaccttttcaatagtct 23087349  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |  ||||||| |||||||| || |  || |||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  23087350 gacgaacaatatctggtcccaacattacactttcacccgactcaaaccaacataacggagttccgcacctccgaccatacaaagcttcgaatggtgccat 23087449  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||| | ||||| || || || || || |||||||| |||||||  || ||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| | ||||| ||||    
T  23087450 accaatagtcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacgataggtgactatcccaagctccaccttgctaaagtacacacactctcagcaaa 23087549  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaact 582  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||    
T  23087550 tcctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgccgatgataagctgaact 23087611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 21 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 11358717 - 11358057
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||||| ||  ||||    
T  11358717 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactttctctgaaat 11358618  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||| |||| ||||||||| ||| || || || || |||    
T  11358617 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcc 11358518  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||   |||| |   |||||||||||||| |    
T  11358517 tgaaactcaagatcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 11358418  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  11358417 catgaaccaagtccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 11358318  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| |||||||| || ||||| |  |||||||||    
T  11358317 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctctagcacacacaccctcaacaaa 11358218  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |    
T  11358217 tcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactct 11358118  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||    
T  11358117 tccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatgctagacggaacaccatg 11358057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 21 - 690
Target Start/End: Original strand, 20832585 - 20833254
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  20832585 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaat 20832684  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||| || || ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  20832685 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 20832784  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatca-tctgaactttctcagtagtt 319  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| || ||||| || |||   |||| ||||| |||||||||||||     
T  20832785 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgaagctttcatcttttctcttatcaatctga-ctttctcagtagtc 20832883  T
Q  320 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 419  Q
    |  ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  20832884 tcatgaaccaaatccggtcccaatacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgcca 20832983  T
Q  420 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 519  Q
    | |||||||| || |||||||| || ||||||||||| || ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||    
T  20832984 taccaatactcgagtgatagctgttgttataagtgaattcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaa 20833083  T
Q  520 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 619  Q
    ||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||||    
T  20833084 atcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactt 20833183  T
Q  620 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 690  Q
    ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  20833184 ttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 20833254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 21 - 690
Target Start/End: Original strand, 31830258 - 31830927
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  31830258 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagtaccaactctctctgaaat 31830357  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||| ||||||||| ||| || || || || |||    
T  31830358 ctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcc 31830457  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| || |||   |||| |   |||||||||||||| |    
T  31830458 tgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 31830557  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      || || |  || ||||| || || || |||||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  31830558 catgcaccaaatccggtcccaacacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 31830657  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||    
T  31830658 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaattcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaa 31830757  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||| || || |||||||    
T  31830758 tcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttt 31830857  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 690  Q
    |||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  31830858 tccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagtttcac 31830927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 21 - 692
Target Start/End: Original strand, 27787341 - 27788012
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || || |||| ||| ||||||||||| | | | ||  ||||    
T  27787341 catacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaat 27787440  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| | ||| || || || || ||     
T  27787441 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctct 27787540  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||| ||  ||||| || ||||| |    
T  27787541 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcaccttgactttttctgtagtct 27787640  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
     |||||| |  || ||||| |  || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27787641 cctgaaccaaatccggtcccagcacaacactttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccat 27787740  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||| ||||| || ||||| || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | |||||||||     
T  27787741 tcctatactcgagtgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaag 27787840  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || || |  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  27787841 tcttccaatgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactct 27787940  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 692  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27787941 tccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 27788012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 117 - 692
Target Start/End: Original strand, 12574049 - 12574624
Alignment:
Q  117 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 216  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||  | || || | ||| || || || ||    
T  12574049 aaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggggtaacccttagaaatacatgatcacc 12574148  T
Q  217 ttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagta 316  Q
     || |||||||||||  | || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||  ||||| || |||    
T  12574149 ctcttgaaactcaagggccttcctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgta 12574248  T
Q  317 gtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtg 416  Q
    || | |||||| |  || ||||| || || || ||||| | |||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  12574249 gtctcctgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctcttgactcgaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtg 12574348  T
Q  417 ccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaa 516  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || || || || |||||||| ||||| || || ||||| ||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||    
T  12574349 ccattcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactgtcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaa 12574448  T
Q  517 caaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaa 616  Q
    ||| || || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || |||    
T  12574449 caagtcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaa 12574548  T
Q  617 cttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 692  Q
    || ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12574549 ctcttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 12574624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 690
Target Start/End: Original strand, 1063351 - 1064020
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||| | |||| ||| ||||| || |||| | | ||  ||||    
T  1063351 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaagcaactctatatgccacagtaccaattctctctgaaat 1063450  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||| || || ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  1063451 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 1063550  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  |||| || |||   |||| |   |||||||||||||| |    
T  1063551 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctctcatcttttctcttatcaaccttactttctcagtagtct 1063650  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      || || |  |||||||| || || || || ||||  |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  1063651 catgtaccaaatctggtcccaacacaacactctcacacgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 1063750  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  1063751 accaatacttgaatgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaa 1063850  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || ||    || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  |||| ||||| ||||| || || || ||||| |    
T  1063851 tcttcccatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaatttcgaacccaaggcgtcctgtaaactct 1063950  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 690  Q
    |||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||| || |||||    
T  1063951 tccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactagacggaacaccatgaagtttcac 1064020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 294
Target Start/End: Original strand, 23138637 - 23138910
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||  | ||    
T  23138637 catacttccgaagttgcgacacatgaaagacaccatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacctactcgatatgccaccgttccaactctttctgatat 23138736  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || ||||||||||||| || |||||||||||     
T  23138737 ctgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaatacctggtctccttct 23138836  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttg 294  Q
    |||||||| || |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  23138837 tgaaactcgaggtctttcgtacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttg 23138910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 294
Target Start/End: Original strand, 23550427 - 23550700
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||  | ||    
T  23550427 catacttccgaagttgcgacacatgaaagacaccatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacctactcgatatgccaccgttccaactctttctgatat 23550526  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || ||||||||||||| || |||||||||||     
T  23550527 ctgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaatacctggtctccttct 23550626  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttg 294  Q
    |||||||| || |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  23550627 tgaaactcgaggtctttcgtacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttg 23550700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27377314 - 27377101
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  27377314 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaacccgatacgccaccgttccaactctttccgatat 27377215  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27377214 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 27377115  T
Q  221 tgaaactcaagatc 234  Q
    ||||||||||||||    
T  27377114 tgaaactcaagatc 27377101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 542 - 704
Target Start/End: Original strand, 16923010 - 16923172
Alignment:
Q  542 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 641  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16923010 ctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 16923109  T
Q  642 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 704  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  16923110 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgt 16923172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 540 - 704
Target Start/End: Original strand, 16925479 - 16925643
Alignment:
Q  540 tcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 639  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16925479 tcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 16925578  T
Q  640 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 704  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  16925579 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 16925643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 356 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 19652557 - 19652223
Alignment:
Q  356 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 455  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |   | ||||    
T  19652557 cctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgt---atgtga 19652461  T
Q  456 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 555  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || |||||||||||||||||    
T  19652460 actctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaaagattgtatcgtcctctccgactgacc 19652361  T
Q  556 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 655  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||  ||||     
T  19652360 atctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatccttatcc 19652261  T
Q  656 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    || ||||| ||||| || || |||| || |||||||||    
T  19652260 gacacaatactcgacggtactccatataacttcacaat 19652223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 547 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 20442830 - 20442675
Alignment:
Q  547 cgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgga 646  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20442830 cgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgga 20442731  T
Q  647 tctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  20442730 tctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacatcacaatctccttgat 20442675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 535 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 24877078 - 24876911
Alignment:
Q  535 aattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaa 634  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24877078 aattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatgtagaa 24876979  T
Q  635 gtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  24876978 gtaaatcttggatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 24876911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 389 - 690
Target Start/End: Original strand, 20828227 - 20828528
Alignment:
Q  389 ctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 488  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| || ||||| || |  ||||||||||||| ||    
T  20828227 ctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataagtgaattcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctc 20828326  T
Q  489 ctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatct 588  Q
    | ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||    
T  20828327 caccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacct 20828426  T
Q  589 caacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttc 688  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||    
T  20828427 caacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttc 20828526  T
Q  689 ac 690  Q
    ||    
T  20828527 ac 20828528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 41609187 - 41609047
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41609187 catacttccaaagttgcgacacgtggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggctgtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaat 41609088  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgact 161  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41609087 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgact 41609047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 396 - 693
Target Start/End: Original strand, 24948564 - 24948861
Alignment:
Q  396 catacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttg 495  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| |||||    
T  24948564 catacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttg 24948663  T
Q  496 ctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttc 595  Q
    |||||| ||||| | ||||   |||||||| |  || |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  24948664 ctcaagcacacacactctctgtaaatcctccaatgattagatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacatc 24948763  T
Q  596 gagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||  |||| || ||||||||||| ||||| |||||| |||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  24948764 gaaaccaatgcatcttgcaaactcttccagaatctataagtgaacctcggatccctatctgatacaatactcgacggtacaccatgcagcttcacaat 24948861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 160 - 681
Target Start/End: Original strand, 22276018 - 22276538
Alignment:
Q  160 cttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactc 259  Q
    |||||||||||| || ||||| |||| |||| | |||||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  22276018 cttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactc 22276117  T
Q  260 ttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctg 359  Q
    || |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  ||  ||||||| |   | || || || |    
T  22276118 ttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccagtcctaacaaggcactctctccgg 22276217  T
Q  360 actcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactc 459  Q
    |||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | || || || ||||| |||||    
T  22276218 actcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactc 22276317  T
Q  460 gatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatct 559  Q
     |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||||| ||  |||||     
T  22276318 aatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtctacccatca 22276417  T
Q  560 gtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgata 659  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |   |||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || |    
T  22276418 gtctggggatggtaagcagaactcaatctcaacttagtttccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatc-gaca 22276516  T
Q  660 caatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    |||| || ||||||| ||||||    
T  22276517 caatactagaaggaataccatg 22276538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 512 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 21125509 - 21125331
Alignment:
Q  512 ctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctctt 611  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||||| || ||||    
T  21125509 ctcaacaaatcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagtcgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatctt 21125410  T
Q  612 gcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 690  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  21125409 gcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatctctatctgacacaatactcgatggaaccccatgtaacttcac 21125331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 22 - 261
Target Start/End: Original strand, 24653946 - 24654185
Alignment:
Q  22 atacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatc 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| |||||||| ||  |  |||||    
T  24653946 atacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccttcactgaaatc 24654045  T
Q  122 tgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcct 221  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||| |||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || || || || ||||    
T  24654046 tgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcaagtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcct 24654145  T
Q  222 gaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactctt 261  Q
    ||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||    
T  24654146 gaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactctt 24654185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 605 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 23107989 - 23107901
Alignment:
Q  605 gcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  23107989 gcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatcggacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 23107901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 198 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 23817719 - 23817291
Alignment:
Q  198 tcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggat 297  Q
    |||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| |  || |||||||||||||| |||| |||||| ||||| || || |||||||||||    
T  23817719 tcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctccttttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttgatcttctcttggat 23817620  T
Q  298 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 397  Q
    ||||| |||||| || ||||| |  || |||| ||| |||||||| |   | ||||  | |||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  23817619 catcttaactttttccgtagtctcttgcacaacctccggtcctaacaaagcactttatcttgactcaaaccaacacaacggtgtcctacatctccgacca 23817520  T
Q  398 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 497  Q
    ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | || || || ||||| ||||| ||||| || | |      ||||||    | |||||||    
T  23817519 tacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaatggtaaacatacgtcccaacagacaccttgct 23817420  T
Q  498 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 597  Q
    | | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| || ||||  | ||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |     
T  23817419 ccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagttctctttgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagt 23817320  T
Q  598 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaa 626  Q
     ||||||||  |||||||||||| |||||    
T  23817319 tcccaaagcagcttgcaaactttcccaaa 23817291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 578 - 693
Target Start/End: Original strand, 23110892 - 23111007
Alignment:
Q  578 gaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 677  Q
    |||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  23110892 gaactcaaccttaactttgaacccaatgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgacacaatgctcgacggaacac 23110991  T
Q  678 catgtagcttcacaat 693  Q
     ||| | |||||||||    
T  23110992 aatgcaacttcacaat 23111007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 539 - 693
Target Start/End: Original strand, 24641860 - 24642014
Alignment:
Q  539 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 638  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  24641860 gtcctatccgactaaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaagtcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtga 24641959  T
Q  639 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    | || ||| ||||||| || | ||| ||||| || |||||||||| |||||||||    
T  24641960 acctcggacctctatccgacataatactcgacggtacaccatgtaacttcacaat 24642014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 190
Target Start/End: Original strand, 24944967 - 24945136
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||  ||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | |   ||||    
T  24944967 catacttccgaagctgcgacacatgaaacccatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctttgaaat 24945066  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagga 190  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  24945067 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttccttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagga 24945136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 146 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 12640637 - 12640315
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| ||||  ||| | || ||||| ||||| || |||||  |||||||||||| ||| || || | ||    
T  12640637 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccgacaccggtcaccggattcaccctcaagaacacatgatctccaacctgaaactcaatatccttcctcctct 12640538  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 345  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  12640537 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 12640438  T
Q  346 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 445  Q
      | || || || ||||||||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||| | || ||     
T  12640437 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttg 12640338  T
Q  446 ttataagtgaactcgatcaacgg 468  Q
    || ||||| ||||| ||||||||    
T  12640337 ttgtaagtaaactcaatcaacgg 12640315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 146 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 24831905 - 24831370
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || |||||||||||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||  | | ||    
T  24831905 gtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccagtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcgttctct 24831806  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 345  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  24831805 tatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 24831706  T
Q  346 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 445  Q
      |  | || || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||  |||| | || ||     
T  24831705 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactaacatgaaaactgttg 24831606  T
Q  446 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 545  Q
    || ||||| ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| |  ||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  24831605 ttgtaagtaaactcaatcaatggtaaacattcgtcccaactaacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 24831506  T
Q  546 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 645  Q
    | | ||| ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  |||||||   |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||  |    
T  24831505 ctgtctgcccatcggactgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagtccccaaaggagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcag 24831406  T
Q  646 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  24831405 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 24831370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 248 - 681
Target Start/End: Original strand, 25128474 - 25128907
Alignment:
Q  248 tcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagacca 347  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| || || ||||| |||||||| ||||||| |||||| || ||||| |  || |||| ||| | |||||| |  |    
T  25128474 tcatgataactcttctgtctactctgagatgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttttccgtagtctcttggacaacctccgatcctaacaaaa 25128573  T
Q  348 ctctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattatt 447  Q
    | |||||||| ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||||| |||||| | || || ||    
T  25128574 cactttcacccgactcaaaccaacataacggcgtcctacacctccgaccatacaaagcatcaaacggtgtcataccgatacttgaatgaaaactgttgtt 25128673  T
Q  448 ataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctcc 547  Q
     ||||| ||||| |||||||  | |       ||||| |  | | |||||| | || ||||  ||| || ||||||||||    |||||| ||||||||     
T  25128674 gtaagtaaactcaatcaacgacaaacattcgacccaactgacactttgctccaaaatacaagctcttaataaatcctctaaactctgaatagtcctctct 25128773  T
Q  548 gactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 647  Q
      ||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||    
T  25128774 atctgcccatcggtatggggatgataagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcatcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggat 25128873  T
Q  648 ctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    | | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  25128874 cccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 25128907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 194 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 22762239 - 22761752
Alignment:
Q  194 actctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctt 293  Q
    |||||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||||||  | | |||||||||||||||||| |  | |||||| ||||| ||||| |||||||    
T  22762239 actctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatctttcatcctcttgtcatgataactcttcttcctactctgagacgctttcatcttctctt 22762140  T
Q  294 ggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccg 393  Q
    ||||||||| ||| || |  ||||| |  || ||||  || |||||||| |   | ||||| ||||| |||||||| |||||||  || || || |||||    
T  22762139 ggatcatcttaaccttttatgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactttctcctgattcaaaccaacacaacgacgtcctacacctccg 22762040  T
Q  394 accatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcct 493  Q
    |||||||||||| || || |||||||| || |||||||||||| | || || || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||    
T  22762039 accatacaaagcttcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacacct 22761940  T
Q  494 tgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaact 593  Q
    ||||  | |||||||  ||||||||||||||| |     ||||  |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||||||    
T  22761939 tgcttcaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactttgaagagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagaagaactcaatctcaact 22761840  T
Q  594 tcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    | |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| ||  |||||| ||||||    
T  22761839 tagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactaaaaggaataccatg 22761752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 159 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 24570373 - 24569851
Alignment:
Q  159 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 258  Q
    ||||||||||||| || |||||||| | | || | |||||||| || || || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||| ||    
T  24570373 acttcaaagcacgaccaacaccagttacatgattcactctcaagaatacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgatagct 24570274  T
Q  259 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 358  Q
    ||| | || |||||| ||||  ||||| ||||||||  |||||| ||| || || ||||| |  |  ||||  || |||||||| |  || ||||| |||    
T  24570273 cttctatctactctgagacgttttcatcttctcttgattcatcttaaccttttccgtagtctctttcacaacttccggtcctaacaaaacactttctcct 24570174  T
Q  359 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 458  Q
     |||||||||| |||||||| || || || ||| ||| ||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | || || || ||||| ||||    
T  24570173 aactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctctgacgatataaagcctcaaacggtgccattccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaact 24570074  T
Q  459 cgatcaacggaagatgacta-tcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccat 557  Q
    | |||||||| | |  |||  ||| || |    |||||||| | |||||||| |||||||||||| || |    |||||| ||||| || |  || ||||    
T  24570073 caatcaacggtaaac-actcgtccgaactgaaaccttgctccaaaacacaaactctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctttctgtttgcccat 24569975  T
Q  558 ctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctga 657  Q
    | || || ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||| | ||||||    
T  24569974 cggtgtgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctga 24569875  T
Q  658 tacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
     ||||| || ||||||| ||||||    
T  24569874 cacaatactagaaggaataccatg 24569851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 248 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 27368448 - 27368394
Alignment:
Q  248 tcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  27368448 tcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatct 27368394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 24833416 - 24833355
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaa 82  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || ||||||    
T  24833416 catacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaa 24833355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 392 - 468
Target Start/End: Original strand, 23890753 - 23890829
Alignment:
Q  392 cgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacgg 468  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| | || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  23890753 cgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacgg 23890829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 590; Significance: 0; HSPs: 46)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 590; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 16350974 - 16350293
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16350974 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 16350875  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16350874 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 16350775  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16350774 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 16350675  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16350674 gctgaacaatttctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 16350575  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16350574 tccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 16350475  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16350474 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 16350375  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  16350374 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 16350293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 582; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 51333868 - 51333187
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  51333868 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 51333769  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  51333768 atgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttat 51333669  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51333668 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 51333569  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51333568 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 51333469  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51333468 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 51333369  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  51333368 tcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 51333269  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  51333268 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 51333187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 570; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 33391404 - 33390723
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  33391404 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 33391305  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  33391304 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 33391205  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33391204 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 33391105  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  33391104 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaggcctcgaacggtgccat 33391005  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33391004 tccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 33390905  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  33390904 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 33390805  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  33390804 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 33390723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 562; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Original strand, 19106351 - 19107032
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  19106351 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtagtaatccaactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 19106450  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19106451 ctgatatggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaacgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 19106550  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  19106551 tgaaactcaagatcttttctccgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 19106650  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  19106651 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcgaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagactcaaaaggtgccat 19106750  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19106751 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 19106850  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19106851 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 19106950  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  19106951 tccaaaatctagaagtaaatattggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 19107032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Original strand, 21830287 - 21830968
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  21830287 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 21830386  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  21830387 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 21830486  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  21830487 tgaaactcaagatcttttccacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttagatcatctgaaccttctcagtagttt 21830586  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21830587 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctacatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 21830686  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21830687 tccaatacttgaatgataactattattatatgtgaactcgattaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcgagaacacaaatcctcaacaaa 21830786  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21830787 tcctccagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 21830886  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||    
T  21830887 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgat 21830968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 555; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 41354844 - 41354202
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  41354844 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaat 41354745  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41354744 ctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 41354645  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  41354644 ttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtggttt 41354545  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41354544 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcaccggattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 41354445  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41354444 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttactcaagaacacaaattctcaacaaa 41354345  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  41354344 tcctctagcgactgaattgtcctctccgattgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcagacttt 41354245  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41354244 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 41354202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 554; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Original strand, 21836934 - 21837615
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  21836934 catacttttgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 21837033  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  21837034 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 21837133  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21837134 tggaactcaagatcttttctacgctgatcatgataactcttttgtcgactatgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactgtctcagtagttt 21837233  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21837234 gttgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttgtgcatctccgaccatacaaagcgtcgaacggtgccat 21837333  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21837334 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 21837433  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21837434 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 21837533  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  21837534 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 21837615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 514; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 17045390 - 17044709
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  17045390 catacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 17045291  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17045290 ctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcc 17045191  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  17045190 tgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 17045091  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17045090 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 17044991  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17044990 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcatccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 17044891  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17044890 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcagatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 17044791  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  17044790 tccaaaacctagaagtaaatcttggatctctgtctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctccttgat 17044709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 16079008 - 16078350
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||| | ||    
T  16079008 catacttccgtagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccattccaactctttccgatat 16078909  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16078908 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 16078809  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||                   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  16078808 tg-------------------cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 16078728  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16078727 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagccttaaaaggtgccat 16078628  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16078627 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgattatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 16078528  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |    
T  16078527 tcctccagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaagccaaagcctcttgcaaactct 16078428  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| | ||||||| ||||||||    
T  16078427 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag----accatgtaacctcacaatctccttgat 16078350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 50620619 - 50619959
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || ||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  | ||    
T  50620619 catacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatacggtggtaaacccactcgatatgccaccattccaactctttctgatat 50620520  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||| | ||     
T  50620519 ctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatcttcctct 50620420  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  50620419 tgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatcttttgttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 50620320  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  50620319 attgaacaatctcaggtcctaaaaccacactttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgcaat 50620220  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  50620219 tccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaatttcctccttgctcaagtacacaaaccctcaacaaa 50620120  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  50620119 tcctctaacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactct 50620020  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50620019 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 50619959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 16369281 - 16369953
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||||| ||||  | ||    
T  16369281 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaacacggtacgccaccgttccaactctttctgatat 16369380  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||| |||| ||||||||||||| || || ||||||||     
T  16369381 ctgatatagaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacacttgtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttct 16369480  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| |||||||  || || ||| ||||||    
T  16369481 tggaattcaaggtctttcctacgcttatcatgataacccttttgtcgactctacgacgctttcatcttttcttgaatcatctttaccttttcaatagttt 16369580  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||| |||    
T  16369581 gttgaacaatctctggtcctaaaaccacattctcacctcactcaaaccaacacaacgaagttctgcacctcctaccatacaaagcctcaaaaagtgtcat 16369680  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  16369681 tccaatactagaatgataactgttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccacgttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaag 16369780  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || || | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||  |    
T  16369781 tcttccaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttatagcctaaagcctcttgcaaaccct 16369880  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16369881 tccaaaatctagaagtaaatctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 16369953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 565
Target Start/End: Original strand, 20249834 - 20250378
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||  | ||    
T  20249834 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatat 20249933  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    || ||| ||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  20249934 cttatacggaacaataaatttcggagtcaacttctttgacttcaacgctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttct 20250033  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  20250034 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 20250133  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20250134 gttgaacgatctctggtcctaagaccactctttcgcttgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccat 20250233  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  20250234 tccaatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttccaccttgctcaagtacataaactctcaacaaa 20250333  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgc 565  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20250334 tcctccaacgactgaatcgtcctctccaactgaccatctgtctgc 20250378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 575
Target Start/End: Original strand, 20136762 - 20137316
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| || |||||| ||||| | ||    
T  20136762 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgccgtggtaaaccaacacgatacgccactgtcccaactctttccgatat 20136861  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||  ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||     
T  20136862 ctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgaggtctccttct 20136961  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  20136962 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacactttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 20137061  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||    
T  20137062 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctaactcaaaccaacacaacgaagttctgcatctccgaccatacaaagcttcataaggcgccat 20137161  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  20137162 tcctatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtccctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaa 20137261  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatg 575  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20137262 tcctctagcgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctacggatgatatg 20137316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 19761241 - 19760569
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| || | ||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  | ||    
T  19761241 catactaccgaagttgcgatacatgaaacatatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttcggatat 19761142  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| || ||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| | || |||||||||||||||| |||||||||||     
T  19761141 ctgatacggtccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccaatcacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttct 19761042  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  19761041 tgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttggatcaacttaaccttctcagtagttt 19760942  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||| || |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||| ||| |||||||||| |||    
T  19760941 gctgaacgatatctggtcccaaaactacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagtcctacacctccgaccatacagagcttcgaaaggtgtcat 19760842  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||     
T  19760841 tccaatactagaatgataactgttattgtacatgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcagcaag 19760742  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || || | ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| || || ||||| ||||||||||| |    
T  19760741 tcttccaacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaacttaacttcaacttagaacctaaagcttcttgcaaactct 19760642  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    || |||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19760641 tctaaaatctagaggtaaacctcggatttctatccgatacaatgttcgatggaacaccatgtagcttcacaat 19760569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 21 - 438
Target Start/End: Original strand, 21747519 - 21747935
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  21747519 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatat 21747618  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| | |||||| ||  ||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| | | ||||||||||||     
T  21747619 ctgatacgaaccaataaatctcggattcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaacatatgtggtctccttct 21747718  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
     |||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  21747719 agaaactcaagatcttt-ctacgcttattatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 21747817  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  21747818 gttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcgcctaactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgagcatacaaagcctcataaggtgccat 21747917  T
Q  421 tccaatactagaatgata 438  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21747918 tccaatactagaatgata 21747935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 21 - 690
Target Start/End: Original strand, 19854298 - 19854966
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||  || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  19854298 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatttggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgaaat 19854397  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || ||||| ||     
T  19854398 ctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcccgacctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctct 19854497  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  19854498 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtct 19854597  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||  |||||||    
T  19854598 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcgtaaaggagtcctgcacctccgactatacaaagcttcgaaccgtgccat 19854697  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| || || | |||||  |||    
T  19854698 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactc-atcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacgcacactctcagtaaa 19854796  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  19854797 tcctccagtgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactct 19854896  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 690  Q
    |||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  19854897 tccaaaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcac 19854966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 21 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 20940438 - 20939770
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  20940438 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgatat 20940339  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || || || |||    
T  20940338 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctcc 20940239  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||  ||||||||  ||||||||  ||||||    
T  20940238 tgaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctatagttt 20940139  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || || |||||||||||| |||| || ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20940138 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaactagcataaaggagtcctatacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 20940039  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
      ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||    
T  20940038 aacaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaataaa 20939939  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| |  || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||   ||||||||| | |||||| | ||||||||||| |    
T  20939938 tcctccaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagtcgaactcggcctcaacttctaacccaaaacgtcttgcaaactct 20939839  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttca 689  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||    
T  20939838 tccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgacggtacaccatgtagcttca 20939770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 21 - 690
Target Start/End: Original strand, 37677063 - 37677733
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  37677063 catacttccgaagctgagagacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctgtatgccactgtaccaactctctctgaaat 37677162  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa-aaacacgtggtctccttc 219  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| ||||| ||| || || || || ||    
T  37677163 ctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcaagaaaaacatgatcaccctc 37677262  T
Q  220 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 319  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    |||| |   ||||||||||||||     
T  37677263 ctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtc 37677362  T
Q  320 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 419  Q
    |  ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  37677363 tcatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgcca 37677462  T
Q  420 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 519  Q
    | |||||||| || |||||||| || ||||||||||| || ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| || || | |||||||||    
T  37677463 taccaatactcgagtgatagctgttgttataagtgaattcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacgcacactctcaacaa 37677562  T
Q  520 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 619  Q
    ||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || |||||     
T  37677563 atcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactc 37677662  T
Q  620 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 690  Q
    ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  37677663 ttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcac 37677733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 56 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 20836231 - 20835591
Alignment:
Q  56 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 155  Q
    ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| | ||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  20836231 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttct 20836132  T
Q  156 tt---gacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatg 252  Q
    |    ||||| || | |||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || || || |||| ||||| |||  | || | ||||||||||||    
T  20836131 tcttcgacttaaatgtacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctaaaacttaagggccttccaacgcttgtcatg 20836032  T
Q  253 ataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctt 352  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| || ||||| |  |||||||| || || || ||     
T  20836031 ataactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaaccaaatctggtcccaaaacaacactc 20835932  T
Q  353 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 452  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| || || || || || |    
T  20835931 tctcctgactcaaaccagcataaaggagttctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggagccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacg 20835832  T
Q  453 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 552  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||| |  ||  | || || |||||||| ||    
T  20835831 tgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctccaaggatggtatcgttctctccgattg 20835732  T
Q  553 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 652  Q
    ||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||  | || ||||| ||||||||||| || || ||||| |||    
T  20835731 accgtctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgtcagctcttccagaatctagaagtgaacctcggatcccta 20835632  T
Q  653 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  20835631 tccgacacaattctcgacggtacaccatgtagcttcacaat 20835591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 21 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 22433491 - 22432817
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  |||| |||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||| ||||  | ||  ||||    
T  22433491 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcatattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacagttgcaaccctctctgaaat 22433392  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  ||||| || || || |||    
T  22433391 ctgatacgaaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccctcaggaacacatgatcaccctcc 22433292  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||  |||||||| |||||| || ||||| |    
T  22433291 tgaaactcaaggggctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttaactttttctgtagtct 22433192  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      ||||| |  |  ||||| || ||||| ||  | ||||||||||||||||| || ||||| || || |||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  22433191 catgaaccaaattcggtcccaacaccacactcgctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccaaccatacaaagcttcgaatggtgccat 22433092  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     || ||||| ||||| || || || ||||| |||||||| |||| | | || ||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||| |  |||||||||    
T  22433091 acctatactcgaatggtaactgttgttatatgtgaactctatcagcagtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaaccacacacaccctcaacaaa 22432992  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || || |  || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  22432991 tcttccaatgattggattgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactct 22432892  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaattt 695  Q
    |||| || ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  22432891 tccagaacctataagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaacttcatgcagcttcacaattt 22432817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 21 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 20857136 - 20856476
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||| | |||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||  ||||    
T  20857136 catacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatacgccacagttccaactctttctgaaat 20857037  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||| || |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | || |||| ||| || ||||| ||||||    
T  20857036 ctggtaaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcc 20856937  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||| |||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    |||||||  |||||||| |||||||    
T  20856936 tgaaacgcaaggtccttcctacgcttgtcgtgatagctcttttgtcgactctgcgacactttcatcttctccctaatcatcttgactttctccgtagttt 20856837  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      ||||| |  ||  | || || || || ||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  20856836 catgaaccaattccagccccaacacaacactttctcccgactcgaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcaaacggtgccat 20856737  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||| ||| ||||| || || || || || || || || ||||| || || ||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||| |  |||    
T  20856736 accaacactcgaatggtaactgttgttgtatgtaaattctatcaatggtaggtgactgtcccaagctccaccctgctcaagtacacatattcttagtaaa 20856637  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||  || || || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |    
T  20856636 tcctctaatgattggatcgtcctttccgactgaccatatgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaactct 20856537  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || || || |||||||||||    
T  20856536 tccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatacttgacggaacaccatg 20856476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 21 - 690
Target Start/End: Original strand, 20294396 - 20295065
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  20294396 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaat 20294495  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || ||     
T  20294496 ctgatatggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctct 20294595  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcat-ctgaactttctcagtagtt 319  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    ||||| |||| ||| |||||||||     
T  20294596 tgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcattctgacctt-ctcagtagtc 20294694  T
Q  320 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 419  Q
    |  ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||| ||||||||| || ||||| |||||||    
T  20294695 tcatgaaccaagtccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccaaccatacaaggcttcgaacggtgcca 20294794  T
Q  420 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 519  Q
    | |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||| ||| || |||||||| ||||| |  ||||||||    
T  20294795 taccaatactcgagtgatagctgttgttataagtgaactcaatcaatggaaggtgactatccgaagctccaccctgctcaagcacacacaccctcaacaa 20294894  T
Q  520 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 619  Q
    ||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || | |||     
T  20294895 atcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtagactc 20294994  T
Q  620 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 690  Q
    ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  20294995 ttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgaagcttcac 20295065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 444 - 693
Target Start/End: Original strand, 21749348 - 21749597
Alignment:
Q  444 tattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcct 543  Q
    ||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  21749348 tattatacgtgaactttatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcct 21749447  T
Q  544 ctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctt 643  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21749448 ctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctt 21749547  T
Q  644 ggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21749548 ggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 21749597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 119 - 623
Target Start/End: Original strand, 41307907 - 41308411
Alignment:
Q  119 atctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctt 218  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| | || |||| |||||| |||||||| |    
T  41307907 atctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttttagacttcaatgcacgtcatacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatggtctccct 41308006  T
Q  219 cctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 318  Q
    | |||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   || || |  |||||||| |||||    
T  41308007 cttgaaactcaaggggctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttattattttgactttctccgtagt 41308106  T
Q  319 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcc 418  Q
     || ||||| |  ||  |||| || ||||| ||||| ||  |||||||||| || || |||||  |||| || |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  41308107 ctgatgaaccaaatccagtcccaacaccacactttctcccaactcaaaccaacataaaggagtcatgcaccttcgaccatacaaagcttcgaacggtgcc 41308206  T
Q  419 attccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaaca 518  Q
    || |||||||| ||||| ||  | || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||    
T  41308207 ataccaatactcgaatgctaattgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagca 41308306  T
Q  519 aatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaact 618  Q
    |||||||||  || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  41308307 aatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaatctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaact 41308406  T
Q  619 tttcc 623  Q
     ||||    
T  41308407 cttcc 41308411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 473 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 22362167 - 22361947
Alignment:
Q  473 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 572  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || | | ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22362167 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctgaacaaatcttccaacaactaaatcgtcctctccgactgaccatatgtctgcggatgat 22362068  T
Q  573 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 672  Q
    | ||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22362067 acgccgaactcaacctcaacttagatcttaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgggtctctatctgacacaatgctcgaagg 22361968  T
Q  673 aacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  22361967 aacaccatgcaacttcacaat 22361947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 19665251 - 19664945
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  19665251 catacttccgaagttgcgacacatgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgaaat 19665152  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||| | ||||||| ||| || || ||||| ||     
T  19665151 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacccccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctct 19665052  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  19665051 tgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtct 19664952  T
Q  321 gctgaac 327  Q
    | |||||    
T  19664951 gatgaac 19664945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 422 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 24099577 - 24099306
Alignment:
Q  422 ccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaat 521  Q
    |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  24099577 ccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaat 24099478  T
Q  522 cctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactttt 621  Q
    |||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  24099477 cctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacctcgatcccaaagcatcttgcaaactctt 24099378  T
Q  622 ccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  24099377 ccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccgtgtagcttcacaat 24099306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 31550556 - 31550136
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  31550556 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctgtatgccactgtaccaactctctctgaaat 31550457  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||| || || ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  31550456 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 31550357  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |||   |||| |   |||||||| ||||| |    
T  31550356 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactttgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctccgtagtct 31550257  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      ||||| |  || ||||| || || || |||||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  31550256 catgaactaaatccggtcccaacacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 31550157  T
Q  421 tccaatactagaatgatagct 441  Q
     |||||||| || ||||||||    
T  31550156 accaatactcgagtgatagct 31550136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 50612791 - 50612602
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || ||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  | ||    
T  50612791 catacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatacggtggtaaacccactcgatatgccaccattccaactctttctgatat 50612692  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtg 210  Q
    |||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  50612691 ctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtg 50612602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 389 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 19663143 - 19662844
Alignment:
Q  389 ctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 488  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||    
T  19663143 ctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccgatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctc 19663044  T
Q  489 ctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatct 588  Q
    | ||||| ||||| ||||| | |||||        || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  19663043 caccttgttcaagcacacacactctcagtt-----tccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacct 19662949  T
Q  589 caacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttc 688  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  19662948 caacttcgaacccaaagcatcttgtaaactcttccaaaatctagaggtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttc 19662849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 446 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 31539947 - 31539703
Alignment:
Q  446 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 545  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || |||||||||||||    
T  31539947 ttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctct 31539848  T
Q  546 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 645  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||  ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || || ||    
T  31539847 ccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacttcattttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcgg 31539748  T
Q  646 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 690  Q
    ||||||||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  31539747 atctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagtttcac 31539703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 568 - 693
Target Start/End: Original strand, 20139361 - 20139486
Alignment:
Q  568 atgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctc 667  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20139361 atgatacgccaaactcaacctcaactcagaacctaaagcttcttgtaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctc 20139460  T
Q  668 gaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||||||| | |||||||||    
T  20139461 gaaggaacaccatgcaacttcacaat 20139486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 274
Target Start/End: Original strand, 20244184 - 20244437
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  20244184 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataggccactgttccaaccctctctgaaat 20244283  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||  | |||||||| ||| |||| ||||| ||||||||| | || |||| ||| || || || || |||    
T  20244284 ctgatatggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcatgtcccacacccgtcataggagtaaccctcagaaagacatgatcaccctcc 20244383  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgc 274  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20244384 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 20244437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 146 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 20831642 - 20831107
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||| |  |||| |||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  20831642 gtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 20831543  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 345  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || || || || |     
T  20831542 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggcccaaacaa 20831443  T
Q  346 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 445  Q
      | ||||| || || |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||| | || ||     
T  20831442 agcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttg 20831343  T
Q  446 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 545  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  20831342 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 20831243  T
Q  546 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 645  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  20831242 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 20831143  T
Q  646 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  20831142 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 20831107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 21163264 - 21163378
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||    
T  21163264 catacttccgaagttgcgacacatggaaaatgtcgtgcaaattcgaaatatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccgatat 21163363  T
Q  121 ctgatatggaccaat 135  Q
    |||||| ||||||||    
T  21163364 ctgatacggaccaat 21163378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 117 - 285
Target Start/End: Original strand, 11382674 - 11382842
Alignment:
Q  117 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 216  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||| ||||||||| ||| || || || ||    
T  11382674 aaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcacc 11382773  T
Q  217 ttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat 285  Q
     ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  11382774 ctcctgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcat 11382842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 20075434 - 20075170
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||  ||| ||||| ||||| ||| | ||  ||||    
T  20075434 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgccactgttcccactctctctgaaat 20075335  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| || | ||| || || || || |||    
T  20075334 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgacccttagaaaaacatgatcaccctcc 20075235  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat 285  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| | |||||| ||||| || |||||    
T  20075234 tgaaactcaagagcctttctccgcttgtcatggtaactcttctatcgactttgcgaagctttcat 20075170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 611 - 681
Target Start/End: Original strand, 20250376 - 20250446
Alignment:
Q  611 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20250376 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatttctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 20250446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 146 - 681
Target Start/End: Original strand, 20914319 - 20914854
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||| |||| | || |||||||| || || || ||  | |||||||||| ||| ||||| |  |    
T  20914319 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctccatt 20914418  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 345  Q
    | | |||||||||||| | || |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || ||||| |  || ||||  || ||| |||| |     
T  20914419 tataatgataactcttctctctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggttctaacat 20914518  T
Q  346 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 445  Q
      | ||||| || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| |  | ||     
T  20914519 agcactttctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagtatgaaaattgttt 20914618  T
Q  446 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 545  Q
    || ||||| ||||| ||||| || | |      | |||| || | |||||||| |  ||||||  ||||||||||||||| |    || ||| |||||||    
T  20914619 ttgtaagtaaactcaatcaatggtaaactttcgttccaacttacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaatcctccaaactctaaatagtcctct 20914718  T
Q  546 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 645  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||| ||  |||||||||| || ||    
T  20914719 cagtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaagttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccagaacttagaagtaaacctcgg 20914818  T
Q  646 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  20914819 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 20914854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 198 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 22135756 - 22135520
Alignment:
Q  198 tcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggat 297  Q
    |||||||||| ||||| ||  ||||||||| ||  || ||||| | ||| |||||||||||||| || | |||||| ||||| ||||| ||| | || ||    
T  22135756 tcaaaaacacatggtcaccaacctgaaacttaatgtcctttctcctcttatcatgataactcttctgcctactctgagacgctttcatcttcccctgaat 22135657  T
Q  298 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 397  Q
    ||||| |||||| |  |||||||  || ||||  ||||||||||| |   | |||||||||||||||||||| ||||| || || || || || ||||||    
T  22135656 catcttaacttttttcgtagtttcttgcacaacttctggtcctaacaaagcactttcacctgactcaaaccaacacaatggcgtcctacaccttcgacca 22135557  T
Q  398 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaat 434  Q
    ||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||    
T  22135556 tacaaagcctcaaacggtgccatatcgatactagaat 22135520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 20395368 - 20395194
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| || || | ||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||  |||||||| | ||  ||||    
T  20395368 catacttccgaagctgagaaatatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactattccaactctctctgaaat 20395269  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgac 195  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| |||| |||| ||||    
T  20395268 ctgatacggaccgatgaacttaggagtcaaattcctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtcaaaggagtgac 20395194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 21202524 - 21202371
Alignment:
Q  159 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 258  Q
    ||||||||| |||||| ||||| || |||||| | |||||||||||||  || || ||  |||||||||||| ||| ||| | | ||| |||||||||||    
T  21202524 acttcaaagtacgtccaacaccggttataggattcactctcaaaaacatatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttgtcctcttatcatgataact 21202425  T
Q  259 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctc 312  Q
    ||| || |  ||||| || || ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||    
T  21202424 cttctgccttctctgagatgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctc 21202371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 532 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 22135421 - 22135272
Alignment:
Q  532 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 631  Q
    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |  || |||||  |||||||||||| ||||||  ||    
T  22135421 ctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcctaaagcagcttgcaaactttcccaaaacata 22135322  T
Q  632 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    |||||||| || ||||| | ||| || ||||| ||  |||||| ||||||    
T  22135321 gaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactataaggaataccatg 22135272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 656 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 41353402 - 41353357
Alignment:
Q  656 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 701  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  41353402 gatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctccttga 41353357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 320
Target Start/End: Original strand, 46518830 - 46519004
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| || || | ||    
T  46518830 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 46518929  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    | |||||||| ||||| |||| |||||| |||| ||| || ||||| || ||||||| ||| || || |||||||    
T  46518930 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgtcttaatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagttt 46519004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 539 - 648
Target Start/End: Original strand, 20184683 - 20184792
Alignment:
Q  539 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 638  Q
    |||||||| | ||| | ||| ||||| | |||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||| ||||| | ||||||  |||||||||    
T  20184683 gtcctctctgtctgcctatcagtctgggaatgataagcagaactcaatctcaacttggttcccaaagctacttgtaaactctcccaaaacatagaagtaa 20184782  T
Q  639 atcttggatc 648  Q
    |||| |||||    
T  20184783 atctcggatc 20184792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 588; Significance: 0; HSPs: 72)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 588; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 704
Target Start/End: Original strand, 18177700 - 18178383
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  18177700 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 18177799  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18177800 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgttctacaccagttataggagtgactctcaagaacacgtggtctccttcc 18177899  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  18177900 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcgaatcatctaaactttctcagtagttt 18177999  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  18178000 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccat 18178099  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  18178100 tccaatactagaatgatagctattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaga 18178199  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18178200 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 18178299  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 704  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18178300 tccaaaatctaaaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgttcgaaggaacaccatgtagcttcacaatctccttgatgt 18178383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 584; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 704
Target Start/End: Original strand, 8198586 - 8199269
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  8198586 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 8198685  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  8198686 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 8198785  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8198786 tggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 8198885  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  8198886 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 8198985  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8198986 tccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 8199085  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  8199086 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 8199185  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 704  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  8199186 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 8199269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 580; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 704
Target Start/End: Original strand, 10870953 - 10871636
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  10870953 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 10871052  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10871053 ctgatacggaccaatgaacctcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 10871152  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10871153 tgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 10871252  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10871253 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 10871352  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10871353 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 10871452  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10871453 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 10871552  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 704  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||    
T  10871553 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaataccatgcagcttcacaatctctttgatgt 10871636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 574; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 11237525 - 11236844
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  11237525 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 11237426  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  11237425 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 11237326  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11237325 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattctctcttggatcatccgaactttctcagtagttt 11237226  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11237225 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggggttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 11237126  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11237125 tccaatacttgaatggtaactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 11237026  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11237025 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 11236926  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||    
T  11236925 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacaatctccttgat 11236844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 574; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 15161369 - 15160688
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15161369 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 15161270  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  15161269 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 15161170  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15161169 tggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattctctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 15161070  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15161069 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 15160970  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15160969 tccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 15160870  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15160869 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 15160770  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  15160769 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 15160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 572; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 704
Target Start/End: Complemental strand, 44791663 - 44790980
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  44791663 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 44791564  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  44791563 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaatttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 44791464  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44791463 tggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 44791364  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  44791363 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 44791264  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44791263 tccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 44791164  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  44791163 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 44791064  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 704  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  44791063 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 44790980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 566; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Original strand, 8707563 - 8708244
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  8707563 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 8707662  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  8707663 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 8707762  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8707763 tggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 8707862  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8707863 gttgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 8707962  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8707963 tccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 8708062  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  8708063 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccaaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 8708162  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  8708163 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 8708244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 562; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 18552070 - 18551389
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  18552070 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 18551971  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  18551970 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcagcttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 18551871  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18551870 tggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 18551771  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18551770 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 18551671  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18551670 tccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 18551571  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18551570 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 18551471  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  18551470 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 18551389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 554; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Original strand, 14332355 - 14333036
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  14332355 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccagtat 14332454  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14332455 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 14332554  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14332555 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 14332654  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  14332655 gctgaacaatttctggtcctaagaccactctttctccttattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaggcctcgaacggtgccat 14332754  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14332755 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaataaa 14332854  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14332855 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 14332954  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  14332955 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 14333036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 551; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Original strand, 13686021 - 13686703
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaa-cattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaa 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  13686021 catactttcgaagttgcgacacatggaaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcgacggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaata 13686120  T
Q  120 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttc 219  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13686121 tttgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 13686220  T
Q  220 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 319  Q
     || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13686221 ttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgctttcattctctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 13686320  T
Q  320 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13686321 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccatcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgcca 13686420  T
Q  420 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 519  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13686421 ttccaatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 13686520  T
Q  520 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13686521 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactt 13686620  T
Q  620 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  13686621 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 13686703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 536; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 704
Target Start/End: Complemental strand, 11553414 - 11552731
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||    
T  11553414 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacgtcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcgataagccaccgttccaactctttccgatat 11553315  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11553314 ctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 11553215  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  11553214 tgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 11553115  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11553114 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 11553015  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  11553014 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacggatcctcaacaaa 11552915  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11552914 tcctctagcaactgaattgtcctctccgactgtccatctatctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 11552815  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 704  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||    
T  11552814 tccaaaatctagaaggaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatgt 11552731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 524; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 704
Target Start/End: Original strand, 12687459 - 12688142
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||    
T  12687459 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacgtcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaaacccactcgataagccaccgttccaactctttctgatat 12687558  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12687559 ctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactcgcaaaaacacgtggtctccttcc 12687658  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  12687659 tgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 12687758  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12687759 gttggacaatctctggtcctaagaccattctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 12687858  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  12687859 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagcacacaaactctcaacaaa 12687958  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12687959 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 12688058  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 704  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||| ||||    
T  12688059 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgatacaatgctcgaaggaataccatgcaacttcacaatctccttaatgt 12688142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 502; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 17628 - 16947
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  17628 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 17529  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| || ||||| ||  || | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  17528 ctgatacgggccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 17429  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  17428 tgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataacttttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 17329  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17328 gctgaacaatttcgggtcctaagaccactctttcacctgactgaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 17229  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17228 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaaactgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 17129  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  17128 tcctctagcgactgaattgtcctctccaactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactct 17029  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  17028 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcctcacaatctccttgat 16947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 496; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 704
Target Start/End: Original strand, 14954578 - 14955261
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||    
T  14954578 catacttccgaagttgcgatacatggaaaacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaactcactcgataagccaccgttccaactctttctgatat 14954677  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14954678 cttatacggaccaataaactttggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 14954777  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  14954778 tgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 14954877  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||    
T  14954878 gctggacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagtctcaaaaggtgtcat 14954977  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14954978 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagcacacaaattctcaacaaa 14955077  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  14955078 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctgttgcaaacttt 14955177  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 704  Q
    |  |||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| | | ||||||| ||||| ||||    
T  14955178 tgaaaatcctagaagtaaatcttggatctctatccaatacaatgctcgaaggaataccatgcaacgtcacaatctccttaatgt 14955261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 493; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 23517080 - 23516520
Alignment:
Q  22 atacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatc 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23517080 atacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatc 23516981  T
Q  122 tgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcct 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23516980 tgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcct 23516881  T
Q  222 gaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttg 321  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23516880 gaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttg 23516781  T
Q  322 ctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccatt 421  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23516780 ctgaacaatctcttgtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccggcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccatt 23516681  T
Q  422 ccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaat 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23516680 ccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagtccctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaat 23516581  T
Q  522 cctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaact 582  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  23516580 gctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatctttctgtggatgatacgccgaact 23516520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 15154964 - 15154294
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||    
T  15154964 catacttccgaagttgcgacacgtgaaatacatcgtgcaaattcgaaagatgcagtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatat 15154865  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  15154864 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttct 15154765  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  15154764 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactcggtgacactttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 15154665  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | |||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  15154664 gttgaacaatctc-----ctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcataaggtgccat 15154570  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  15154569 cccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaag 15154470  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||  ||||||||||    
T  15154469 tcctctagcgattgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctgctgcaaacttt 15154370  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttc 696  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15154369 tccaaaatctagaagtgaatcttggatctctatttgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatttc 15154294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 242 - 702
Target Start/End: Original strand, 9596236 - 9596696
Alignment:
Q  242 cgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtccta 341  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9596236 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctctgtagtctgctgaacaatctctggtccta 9596335  T
Q  342 agaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagct 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  9596336 agaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacgaagttctacatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaataatagaatgatgact 9596435  T
Q  442 attattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtc 541  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9596436 attattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtc 9596535  T
Q  542 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 641  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9596536 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaatttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 9596635  T
Q  642 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  9596636 ttggatctctatctgatacaatgctcgaagggacaccatgtaacctcacaatctccttgat 9596696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 56 - 693
Target Start/End: Original strand, 15624545 - 15625182
Alignment:
Q  56 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 155  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||  | |||||||||| |||||| ||| |||| ||||| |||     
T  15624545 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaattctttctgatatctgatatgaaccaataaacctcggagtcaatttcc 15624644  T
Q  156 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 255  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||    
T  15624645 ttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtctttcctaagcttatcatgata 15624744  T
Q  256 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttca 355  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||| |||| ||||||||| ||||| || |||||||| || |  || || |||    
T  15624745 actcttctatcgactctgcgacgctttcatcttctcttggatcaacttaaccttctaagtagtttgatgaacgatttctggtcccaaaattacactctca 15624844  T
Q  356 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 455  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||  || ||||| |||| ||||| ||||||||||||||| || ||||| || ||||    
T  15624845 cctgactcgaaccaacacaatggagtcctacacctccgaccatacagtgcttcgaatggtgtcattctaatactagaatgataactgttattgtacgtga 15624944  T
Q  456 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 555  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| | |||||| ||||| || |||||||||||    
T  15624945 actctatcaacagaagatgactatcccaagttcctccatgctcaagtacataaactctcaacaagtcctccaacgactggattgttctttccgactgacc 15625044  T
Q  556 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 655  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15625045 atctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacccaaaacctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatct 15625144  T
Q  656 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15625145 gacacaatgctcggcggaacaccatgtagcttcacaat 15625182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 12207090 - 12206418
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||| ||||| | ||  | ||    
T  12207090 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttgcaactctctcagatat 12206991  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||| || | |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||     
T  12206990 ctggtacgaaccaataaacttcggcgtcaacttctttgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttct 12206891  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatca-tctgaactttctcagtagtt 319  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| | ||| |||| || |||||     
T  12206890 tgaaacttaagatcctttctacacttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttttatcaatttgaccttt-tctgtagtc 12206792  T
Q  320 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 419  Q
    |||||||| || || ||||| || |  || |||||||| ||||||||||| || ||||||||  |||| |||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  12206791 tgctgaactatatccggtcccaacattacactttcacccgactcaaaccaacataacggagtattgcacctccgatcatacaaaacttcgaacggtgcca 12206692  T
Q  420 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 519  Q
    | |||||||| ||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| | |||    
T  12206691 taccaatactcgaatggtaactattgttgtacgtgaactctatcaacggcaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactcttagcaa 12206592  T
Q  520 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 619  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  12206591 atcctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagctgaactcaacctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaactt 12206492  T
Q  620 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  12206491 ttccaaaatctcgatgtaaatcttggatctctatccaacacaatactcgacggaacaccatgcagcttcacaat 12206418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 15102891 - 15102221
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  15102891 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatat 15102792  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| || ||||| ||     
T  15102791 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcaaaaacacatgatctccctct 15102692  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||   |||||||  |||||||| ||||| |    
T  15102691 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacactttcattttttctcttatcatcttgactttctctgtagtct 15102592  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||  |  || ||||| || | |||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15102591 gatgaatcaaatccggtcccaacaacactctctc--ctgactcgaaccaacacaaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 15102494  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  15102493 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaa 15102394  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  15102393 tcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactct 15102294  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||  |||| || | ||||||||||||||||||    
T  15102293 tccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatattcgatggtaaaccatgtagcttcacaat 15102221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 21 - 573
Target Start/End: Original strand, 15203837 - 15204389
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||| | ||||   |||    
T  15203837 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatactctaccgttccaattctttctgtaat 15203936  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||  ||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||| || || || |||||||||| |  | ||||||| |||||||| |||||||||||     
T  15203937 ctgatacagaccaataaacctcggagtcaacttatttgacttcaatgcgcggccaacaccagtcacaaaagtgactctaaaaaacacatggtctccttct 15204036  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||| || ||| ||||| |||||||    
T  15204037 tgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcatggatcaacttaaccttctctgtagttt 15204136  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||  |||||||| || || || || |||||| |||| ||||| ||||||||||| || || ||| |||||||||  || || || ||| ||||    
T  15204137 gctgaacaaaatctggtcccaaaactacactatcaccttactcgaaccaacacaacggagtcctacacctctgaccatacagcgcttcaaatggttccat 15204236  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  15204237 tccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactattccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaa 15204336  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgata 573  Q
    ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15204337 tcctccaacgactgaattgtcctttccgactgaccatctgtctgcggatgata 15204389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 212 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 11772362 - 11771881
Alignment:
Q  212 tctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttct 311  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  | ||||| ||||||| ||| ||||    
T  11772362 tctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgttttcatcatttcttgaatcatcttaaccttct 11772263  T
Q  312 cagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaa 411  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || |  ||| |||||||||  ||    
T  11772262 cagtagtttgttgaacaatttccggtcctaaaaccacactctcacctgactcaaatcaacacaacgaagttctgcaccttcttccacacaaagccttaaa 11772163  T
Q  412 aggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatt 511  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |    
T  11772162 tggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtttctccttgctcaagtacacaaact 11772063  T
Q  512 ctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctctt 611  Q
    ||||||||||| || |  |||||||| ||  | ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||    
T  11772062 ctcaacaaatcttccaatgactgaatcgttttttccgactaaccatctgtctgcagatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctctt 11771963  T
Q  612 gcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11771962 gcaaactcctccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaat 11771881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 32 - 693
Target Start/End: Original strand, 21661933 - 21662591
Alignment:
Q  32 agttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggac 131  Q
    ||||| |||||||| || ||||  || || |||||||||||||| |||||||||||   ||| || ||||  |||||| ||| | |||||||||| || |    
T  21661933 agttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgcggtggtaaacccacgttatacgcaaccgccccaactctttgcgaaatctgatacgggc 21662032  T
Q  132 caatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaag 231  Q
    |||| ||| |||| || |  |||||||| || |  || ||||| ||||| || | |||  |||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||    
T  21662033 caataaacctcggagttagtttctttgattttagtgcccgtccaacaccggtaagaggggtgactctcaaaaacacatggtctcctt---gaaactcaag 21662129  T
Q  232 atcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatc 331  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || |||   |||| || ||| || ||| |||| || ||||||||     
T  21662130 atccttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgtgacgctttcatcttttctctaatcaacttaacattttcattagtctgttgaacaatg 21662229  T
Q  332 tctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactag 431  Q
    |||||||| |  ||||| || ||||| ||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  21662230 tctggtcccagtaccacactctcaccggactcatcacaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaacgcttcgaacggtgccattccaatgctag 21662329  T
Q  432 aatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcga 531  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | |||    
T  21662330 aatggtaactattattgtaagtgaactcgattaatggaagatgactatcccaagatcccccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctccaacga 21662429  T
Q  532 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 631  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||| | |||||| ||||||||||||    
T  21662430 ctgaattgtcctctccgtctatccatctgtctgcggatgatacgcctaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctacaaactcttccaaaatcta 21662529  T
Q  632 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21662530 gaagtaaatcttggatccctatctaatacaatactcgatggaacaccatgtaacttcacaat 21662591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 14264534 - 14263862
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||  ||||  | ||    
T  14264534 catacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcaggcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctttcagatat 14264435  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| ||     
T  14264434 ctgatatggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctct 14264335  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||    |||||||  || ||||  ||||| |    
T  14264334 tgaaactcaagcgccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcgcttatcatcttgacattcttcgtagtct 14264235  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  |  ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14264234 gatgaaccaaatacggtcccaacactacactttctcctgactcaaaccaacataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 14264135  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||| || ||| | | ||||| ||||    
T  14264134 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacagtagatgactatcccaagctccaccttgctcgagtacagacactctcatcaaa 14264035  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  14264034 tcctctaacgattgaattgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaacccaatgcatcttgcaaactct 14263935  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||||||||| || || |||| |||||| || ||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  14263934 tccaaaatctagaagtgaacctcggatttctatccgacacaatactcgatggaacaccatgcaacttcacaat 14263862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 19147170 - 19147842
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || |||| |||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  19147170 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaactcactctgtatgccactgttccaaccctctcagatat 19147269  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| ||     
T  19147270 ctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctct 19147369  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  || ||||| ||||| |    
T  19147370 tgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtct 19147469  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  19147470 gatgaaccaaatctggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 19147569  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||| ||||| ||| ||||||| ||| ||||| | ||||| ||||    
T  19147570 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactattccaagctccaccttgcttaagtacacacactctcagcaaa 19147669  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| |||| ||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  19147670 tcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagttgaactcaacctcatcttagaacccaaggcatcttgcaaactct 19147769  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||| ||||| || ||  |||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  19147770 tccaaaatcttgaagtgaacctcagatctctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaat 19147842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 20746569 - 20747241
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || |||| |||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  20746569 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaactcactctgtatgccactgttccaaccctctcagatat 20746668  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| ||     
T  20746669 ctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctct 20746768  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  || ||||| ||||| |    
T  20746769 tgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtct 20746868  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20746869 gatgaactaaatctggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 20746968  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||| ||||| ||| ||||||| ||| ||||| | ||||| ||||    
T  20746969 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactattccaagctccaccttgcttaagtacacacactctcagcaaa 20747068  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| |||| ||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  20747069 tcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagttgaactcaacctcatcttagaacccaaggcatcttgcaaactct 20747168  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||| ||||| || ||  |||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  20747169 tccaaaatcttgaagtgaacctcagatctctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaat 20747241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 11388717 - 11388046
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||| | |||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  11388717 catacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatat 11388618  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||| |     
T  11388617 ctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctcct-ct 11388519  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||| | || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  |||   |||| || ||| || || ||||| |    
T  11388518 tgaaactcatggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaacttaaccttttctgtagtct 11388419  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||| || |||||||| || | ||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||| |||| |||    
T  11388418 gctgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaacatacaaagcttcgaacggtgtcat 11388319  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  | |    
T  11388318 accaatactcgaatggtaactattgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaga 11388219  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  11388218 tcctctaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgaacccaaagcatcttgcaaactct 11388119  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  11388118 tccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 11388046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 353 - 693
Target Start/End: Original strand, 14039986 - 14040326
Alignment:
Q  353 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 452  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| || |    
T  14039986 tcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctctgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataactgttattgtacg 14040085  T
Q  453 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 552  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||    
T  14040086 tgaactctattaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactcttaacaaatcctctaacgattgaatcgttctctccgactg 14040185  T
Q  553 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 652  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14040186 accatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctagagcctcttgcaaaattttccaaaatgtagaagtaaatcttggatctcta 14040285  T
Q  653 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  14040286 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 14040326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 353 - 693
Target Start/End: Original strand, 14350016 - 14350356
Alignment:
Q  353 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 452  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| || |    
T  14350016 tcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctctgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataactgttattgtacg 14350115  T
Q  453 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 552  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||    
T  14350116 tgaactctattaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactcttaacaaatcctctaacgattgaatcgttctctccgactg 14350215  T
Q  553 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 652  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14350216 accatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctagagcctcttgcaaaattttccaaaatgtagaagtaaatcttggatctcta 14350315  T
Q  653 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  14350316 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 14350356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 16072584 - 16071912
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||||| || || |||||||||    | ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  16072584 catacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgcatgccactgttccaaccctctcagatat 16072485  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| || ||||| ||     
T  16072484 ctgatatggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctct 16072385  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  || |||||  |||| |    
T  16072384 tgaaactcaagggccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccatagtct 16072285  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |  |||| |  |||||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16072284 gacgaaccaaatctggtcccaacactacactttctcctgactcaaaccaacataaaggagttatgcgcctccgaccatacaaagcttcgaatggtgccat 16072185  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||||   || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  16072184 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaaccataggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaa 16072085  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  16072084 tcctctaacgattgaatcgtcctctctgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaacccaatgcatcttgcaaactct 16071985  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||||||| | || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  16071984 tccaaaatctagaactgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatggaactccatgtaacttcacaat 16071912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 21 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 8212418 - 8211749
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  8212418 catacttccgaagttgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctgtatgccactgtaccaactctctctgaaat 8212319  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  8212318 ctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 8212219  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    |||| |   |||||||||||||| |    
T  8212218 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtct 8212119  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| || |||||    
T  8212118 catgaaccaaatccggtcccaatacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggcgccat 8212019  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  8212018 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaa 8211919  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || || |  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||    
T  8211918 tcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcttgtaaacttt 8211819  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 690  Q
    |||| || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  8211818 tccagaacctagaagtgaacctcggatctctatctgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcac 8211749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 21 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 11306553 - 11305884
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  11306553 catacttccgaagctgagagacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaat 11306454  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  11306453 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 11306354  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    |||| |   |||||||||||||| |    
T  11306353 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtct 11306254  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      ||||| |  || ||||| || || |  |||||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  11306253 catgaactaaatccggtcccaacacaatactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 11306154  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  11306153 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggtaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaa 11306054  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || || |  || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |    
T  11306053 tcttccaatgattgaattgtcctttccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactct 11305954  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 690  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  11305953 tccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 11305884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 13021316 - 13021988
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||||||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  13021316 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataagccactgttccaaccctctctgaaat 13021415  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||| ||||| | |||||||| ||||||  ||| || ||||||||| |||| |||| ||| || || || || ||     
T  13021416 ctgatacggaccaataaactttggagtccacttcctcgacttcaatgcacgttttacgcccgtcataggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccgtct 13021515  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||| ||  | ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    |||||||  || ||||||||||| |    
T  13021516 tgaaactctagggcctttttccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtagtct 13021615  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      ||||| |  || |||||||| ||||| || |  |||||||||||||| || |  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13021616 catgaaccaagtccggtcctaacaccacactctttcctgactcaaaccaacatagaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 13021715  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || ||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  13021716 accaatactcgaatgatagctgttgttataagtgaactctatcaacagtaggtgattatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaa 13021815  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| |  || || || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  13021816 tcctccaatgattggatagtcctctccgactaaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaacttt 13021915  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||| || ||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||    
T  13021916 tccagaacctagaggtgaacctcggatccctatctgatacaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaat 13021988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 16950761 - 16950089
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  || ||||  ||||| ||||||||||| || |  ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  ||||  ||||    
T  16950761 catacttccgaagctgcgacacataaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtgccaaaccaactctatatgccactgttccaaccctttctgaaat 16950662  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || || || |||    
T  16950661 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcc 16950562  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||| |  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||| || ||    |||||||  |||||||||||||| |    
T  16950561 tgaaactcatgggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacactttcatcttttcccttatcatcttgactttctcagtagtct 16950462  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  ||  |||| || || || || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16950461 gatgaaccaagtcctgtcccaacacaacactctcacctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 16950362  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||| || || ||||||| |||   ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  16950361 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaatggtaggtgactattccatactccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaa 16950262  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  16950261 tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataatccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactct 16950162  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||| ||||||||||| || || | ||||||||| || ||||| |||||  | || |||||||||||||||||    
T  16950161 tccagaatctagaagtgaacctcgaatctctatccgacacaatactcgacagtactccatgtagcttcacaat 16950089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 21 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 18054243 - 18053572
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || || |||| ||| ||||||||||| | | | ||  ||||    
T  18054243 catacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttcctattctctctgaaat 18054144  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||| ||| || || || || ||     
T  18054143 ctgatacgggccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactctcagaaatacatgatcaccctct 18054044  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||  ||||| || ||||| |    
T  18054043 tgaaactcaagggccttcctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtct 18053944  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
     |||||| |  || ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  18053943 cctgaaccaaatccggtcccaacacaactctttctcctgactcgaaccaacacaacggagtcctgcaccctcgaccatacaaagcttcgaatggtgccat 18053844  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||| ||||| |||||||| || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | |||||||||     
T  18053843 tcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaag 18053744  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  18053743 tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactct 18053644  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 692  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18053643 tccagaacctagaagtgaacctcggatccctatctgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 18053572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 21 - 690
Target Start/End: Original strand, 49152260 - 49152929
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  49152260 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaat 49152359  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  49152360 ctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 49152459  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||   |||| |   |||||||||||||| |    
T  49152460 tgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 49152559  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      || || |  || ||||| || || || |||||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  49152560 catgcaccaaatccggtcccaacacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 49152659  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  49152660 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacatactctcaacaaa 49152759  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || || |  || |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||| || || |||||||    
T  49152760 tcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatccgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttt 49152859  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 690  Q
    |||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  49152860 tccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcac 49152929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 6413470 - 6414142
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  6413470 catacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgaaat 6413569  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||  | |||||||||||| || ||||||||  | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||| |||||| || || || |||    
T  6413570 ctgattcgaaccaatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcc 6413669  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||   | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    |||||||  |||||||||||||| |    
T  6413670 tgaaactcaaaggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatgttttcccttatcatcttgactttctcagtagtct 6413769  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  ||  | || || || || || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  6413770 gatgaaccaaatccagacccaacacaacactctctcctgattcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 6413869  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||||||||  || ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  6413870 accaatactcgaatggtaactgttattgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagccccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaa 6413969  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| |  || || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |    
T  6413970 tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccttctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacctaaagcatcttgcaaactct 6414069  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||| ||||| || ||  |||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  6414070 tccaaaatcttgaagtgaacctcagatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 6414142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 14286666 - 14285994
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| |||||||   | |   ||||    
T  14286666 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaatcctatatgaaat 14286567  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| || || || || |||    
T  14286566 ctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacatcctacacctgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcc 14286467  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||    |||||||  || |||||||| || |    
T  14286466 tgaaactcaagggtctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcgtct 14286367  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || ||   |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  14286366 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctattgactcaaaccagcacaaaggagtcctgcacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 14286267  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||    
T  14286266 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaataaa 14286167  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||  || || || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| || |    
T  14286166 tcctctaaagattgtatcgtcctcttcgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaaagcatcttgcaagctct 14286067  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||| ||||||||| || || || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  14286066 tccgaaatctagatgtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 14285994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 13665512 - 13666168
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  ||||  ||||    
T  13665512 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctttctgaaat 13665611  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||     ||||||| || ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || ||| | ||     
T  13665612 ctgatacgg-----tgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcccgacctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcttcctct 13665706  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| |||||||    
T  13665707 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtgatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagttt 13665806  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | |||||           | || || |  || || ||||||||||||||||| || |||||  |||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  13665807 gatgaac-----------ccaacacaaaactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcatgcccctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 13665895  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||    
T  13665896 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaa 13665995  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||  || || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || || |    
T  13665996 tcctctaatgattggatcgtcctctctgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgtaagctct 13666095  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  13666096 tccagaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacgatacaccatgtagcttcacaat 13666168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 167 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 35965016 - 35964646
Alignment:
Q  167 gcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtc 266  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  35965016 gcacgtcatacactagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtccccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtc 35964917  T
Q  267 gactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaa 366  Q
     |||||||||||||||||| || |||   |||| || ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |  || || || || || |||||| |    
T  35964916 tactctgcgacgccttcatcttttctctaatcaacttaaccttctcagtagtttgttgaacaatgtctggtcccagtactacactatcgccagactcata 35964817  T
Q  367 ccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaac 466  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||     
T  35964816 ccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaacgcttcgaacggtgccattccaatactagaatggtaactgttattataagtgaactcgatcaat 35964717  T
Q  467 ggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaat 537  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||    
T  35964716 agaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctccaacgactgaat 35964646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 21 - 692
Target Start/End: Original strand, 14129832 - 14130503
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || || |||| ||| |||| ||||||||   | || |||||    
T  14129832 catacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccatcgttccaatcctctctaaaat 14129931  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||  ||||| ||| | ||||| ||||| || || || || |||    
T  14129932 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacactcgtcatcggagtaactctaaaaaatacatgatcaccctcc 14130031  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||    |||||||  || ||||||||  | |    
T  14130032 tgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcatct 14130131  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      ||||| |  || ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14130132 catgaaccaaatccggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcataacggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 14130231  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     || ||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||| |    
T  14130232 acctatactcgaatggtaactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaga 14130331  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |    
T  14130332 tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaactcaaagcatcctgcaaactct 14130431  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 692  Q
    |||| || ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  14130432 tccagaacctagaggtgaacctcggatccctatccgacacaatacttgaaggaactccatgtagcttcacaa 14130503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 25 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 1693 - 1025
Alignment:
Q  25 cttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctga 124  Q
    ||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||  ||||||||  ||||  ||||||||    
T  1693 cttccgaagctgagacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccagtgttccaaccctttcttaaatctga 1594  T
Q  125 tatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaa 224  Q
    ||  ||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||| | | ||| ||| ||| || || || || |||||||    
T  1593 tacagaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagaagtaactttcacaaaaacatgatcaccctcctgaa 1494  T
Q  225 actcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctg 324  Q
    |||||||  | ||||| | ||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || ||    |||||||  || ||||||||||| || ||    
T  1493 actcaagggcctttctcctcttgtcatggtaactcttctgtcgaatctgtgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtagtctgatg 1394  T
Q  325 aacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattcca 424  Q
    ||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||| ||||||||||||| | ||| |||||||| |||    
T  1393 aaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtccttcacctctgaccatacaaagctttgaacggtgccatacca 1294  T
Q  425 atactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcct 524  Q
    ||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  1293 atactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcct 1194  T
Q  525 ctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcca 624  Q
    | |  || || || ||| | ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  1193 ccaatgattggatcgtcttttccgactaaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacctcgatcccaaagcatcttgcaaactcttcca 1094  T
Q  625 aaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
     ||||||||||| || |||| ||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  1093 gaatctagaagtgaaccttgtatccctatccgacacaatactcgacggtactccatgtagcttcacaat 1025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 21 - 692
Target Start/End: Original strand, 14433650 - 14434321
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || || |||| ||| |||| ||||||||   | || |||||    
T  14433650 catacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccatcgttccaatcctctctaaaat 14433749  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||  ||||| ||| | ||||| ||||| || || || || |||    
T  14433750 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacactcgtcatcggagtaactctaaaaaatacatgatcaccctcc 14433849  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||    |||||||  || ||||||||  | |    
T  14433850 tgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcatct 14433949  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      ||||| |  || ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14433950 catgaaccaaatccggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcataacggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 14434049  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     || ||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||| |    
T  14434050 acctatactcgaatggtaactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaga 14434149  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| |  || || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |    
T  14434150 tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaactcaaagcatcctgcaaactct 14434249  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 692  Q
    |||| || ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  14434250 tccagaacctagaggtgaacctcggatccctatccgacacaatactagaaggaactccatgtagcttcacaa 14434321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 117 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 23506064 - 23505491
Alignment:
Q  117 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 216  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| | ||| || || || ||    
T  23506064 aaatctgatacggaccaatgaatttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcacc 23505965  T
Q  217 ttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagta 316  Q
     || |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||   ||||| ||  ||||| || |||    
T  23505964 ctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctccctgatcagcttgactttttctgta 23505865  T
Q  317 gtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtg 416  Q
    || | ||| || |  || ||||| || || || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  23505864 gtctcctggaccaaatccggtcccaacacaacactttctcccgactcaaaccaacacaacggagttctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtg 23505765  T
Q  417 ccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaa 516  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||||||||| | ||||||    
T  23505764 ccattcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagaacacacactctcaa 23505665  T
Q  517 caaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaa 616  Q
    ||| || || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| || || |||    
T  23505664 caagtcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaa 23505565  T
Q  617 cttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 690  Q
    || ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  23505564 ctcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatacacgaaggaactccatgtagcttcac 23505491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 12455662 - 12456333
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| || ||||  ||||  ||||||||||| || || ||||| | || ||||||||| |||| |||| | ||  ||||    
T  12455662 catacttccgaagctgc-acacatgaaacacatcatgcaggttcgaaagatgtggtggcaaaccaattctataagccactgttctaactctctctgaaat 12455760  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||  ||||||||||||| ||  |||||||| | |||||||| |||| ||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  12455761 ctgataccgaccaatgaactttggattcaacttcctcgacttcaatgcacatccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 12455860  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||| ||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||    |||| ||  |||||||||||||| |    
T  12455861 tgaaactctagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcaccttgactttctcagtagtct 12455960  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      || || |  || ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || || |||| |||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  12455961 catgtaccaagtccggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctcctaccatacaaagcttcgaacggtaccat 12456060  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     || ||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |||| ||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | | |||||||     
T  12456061 acctatactcgaatggtaactgttattgtatgtgaactctatcagcggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactgtcaacaat 12456160  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | |    
T  12456161 tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctggggatgataagccgagctcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgtaaattct 12456260  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  12456261 tccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccgtgtagcttcacaat 12456333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 348
Target Start/End: Original strand, 14037765 - 14038092
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||| | ||    
T  14037765 catacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccattcaaactctttccgatat 14037864  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||||| |||||| ||  | || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  14037865 ctgatatgaaccaataaatcttggtgtcaacttctttgacttcaatgcacgcccaacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtgatctccttct 14037964  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  14037965 tggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgctttcatcttttcttgaatcattttaactttctcagtagttt 14038064  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccac 348  Q
    | |||||||| |||||||| || |||||    
T  14038065 gttgaacaatttctggtcccaaaaccac 14038092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 348
Target Start/End: Original strand, 14347795 - 14348122
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||| | ||    
T  14347795 catacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccattcaaactctttccgatat 14347894  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||||| |||||| ||  | || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  14347895 ctgatatgaaccaataaatcttggtgtcaacttctttgacttcaatgcacgcccaacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtgatctccttct 14347994  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  14347995 tggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgctttcatcttttcttgaatcattttaactttctcagtagttt 14348094  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccac 348  Q
    | |||||||| |||||||| || |||||    
T  14348095 gttgaacaatttctggtcccaaaaccac 14348122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 117 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 23199937 - 23199418
Alignment:
Q  117 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 216  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| | ||| || || || ||    
T  23199937 aaatctgatacggaccaatgaatttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcacc 23199838  T
Q  217 ttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagta 316  Q
     || |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||   ||||| ||  ||||| || |||    
T  23199837 ctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctccctgatcagcttgactttttctgta 23199738  T
Q  317 gtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtg 416  Q
    || | ||| || |  || ||||| || || || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  23199737 gtctcctggaccaaatccggtcccaacacaacactttctcccgactcaaaccaacacaacggagttctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtg 23199638  T
Q  417 ccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaa 516  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||||||||| | ||||||    
T  23199637 ccattcctatactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagaacacacactctcaa 23199538  T
Q  517 caaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaa 616  Q
    ||| || || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| || || |||    
T  23199537 caagtcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaa 23199438  T
Q  617 cttttccaaaatctagaagt 636  Q
    || ||||| || ||||||||    
T  23199437 ctcttccagaacctagaagt 23199418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 117 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 26118799 - 26118226
Alignment:
Q  117 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 216  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||| |||||| || ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || ||    
T  26118799 aaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcacc 26118700  T
Q  217 ttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat--tttctcttggatcatctgaactttctcag 314  Q
     |||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||  ||||||||  |||| |   ||||||||||    
T  26118699 ctcctgaaactcaagctccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcctttctctt--atcaacctgactttctcag 26118602  T
Q  315 tagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaagg 414  Q
    |||| |  ||||| |  || ||||| || || || |||||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||    
T  26118601 tagtctcatgaaccaaatccggtcccaacacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacgg 26118502  T
Q  415 tgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctc 514  Q
    |||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | ||||    
T  26118501 tgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctc 26118402  T
Q  515 aacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgca 614  Q
    |||||||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || |    
T  26118401 aacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgta 26118302  T
Q  615 aacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 690  Q
    |||  ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||| || |||||    
T  26118301 aacgcttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgccggaacaccatgaagtttcac 26118226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 218 - 692
Target Start/End: Original strand, 15340587 - 15341061
Alignment:
Q  218 tcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtag 317  Q
    ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||    |||| ||  || |||||||| |    
T  15340587 tcctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgtgacgctttcatcttttcccttatcagcttgaccttctcagtcg 15340686  T
Q  318 tttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgc 417  Q
    | || ||||| |  || ||||| || || || || || |||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  15340687 tctgatgaaccaaatccggtcccaatacaacactctctcctgactcaaactagcataacggagtcctgcacctccgaccatacaaaacttcgaacggtgc 15340786  T
Q  418 cattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaac 517  Q
    ||| || ||||| ||||| ||  | || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||    
T  15340787 catacctatactcgaatggtaaatgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaac 15340886  T
Q  518 aaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaac 617  Q
    |||||||| |   | |  || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  15340887 aaatcctccaattatttgatcgtcctttccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcatcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaac 15340986  T
Q  618 ttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 692  Q
    | ||||| || ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| || |||||||| | ||||||||||||||    
T  15340987 tcttccagaacctagatgtgaacctcggatccctatccgacacaatactagaaggaactctatgtagcttcacaa 15341061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 353 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 13968626 - 13968289
Alignment:
Q  353 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 452  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||  | || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  13968626 tcacccgactcaaaccagcataaaggagtcatacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataag 13968527  T
Q  453 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 552  Q
    ||||| | ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||    
T  13968526 tgaacccaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactg 13968427  T
Q  553 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 652  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| |||    
T  13968426 accatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatcccta 13968327  T
Q  653 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 690  Q
    || || ||||| || || || |||||||| ||||||||    
T  13968326 tccgacacaatacttgacggtacaccatgaagcttcac 13968289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 578 - 704
Target Start/End: Complemental strand, 23203368 - 23203242
Alignment:
Q  578 gaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 677  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23203368 gaactcaatctcaacttcgaccccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 23203269  T
Q  678 catgtagcttcacaatttccttgatgt 704  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23203268 catgcagcttcacaatctccttgatgt 23203242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 578 - 704
Target Start/End: Complemental strand, 23509495 - 23509369
Alignment:
Q  578 gaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 677  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23509495 gaactcaatctcaacttcgaccccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 23509396  T
Q  678 catgtagcttcacaatttccttgatgt 704  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23509395 catgcagcttcacaatctccttgatgt 23509369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 223 - 581
Target Start/End: Original strand, 12456940 - 12457298
Alignment:
Q  223 aaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgc 322  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||   || | |   |||||||||||||| |      
T  12456940 aaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatgaacctgactttctcagtagtctca 12457039  T
Q  323 tgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattc 422  Q
    ||||| |  || ||||| || ||||| || || |||||||||||| |||| || ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  12457040 tgaaccaagtccggtcccaacaccacactctctcctgactcaaactagcataaaggagtcctatacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatac 12457139  T
Q  423 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 522  Q
    ||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | | |||||| |||||    
T  12457140 caatactcgagtgatagctgttgttatatgtgaactcaatcaacggtaggtgactatctcaagttccaccttgctcaagcacagacactctcaataaatc 12457239  T
Q  523 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaac 581  Q
     || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  12457240 ttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaac 12457298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 159 - 681
Target Start/End: Original strand, 14936443 - 14936965
Alignment:
Q  159 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 258  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| | || | |||||||||||||| || || ||  ||||||||||||  || ||||| | ||| |||||||||||    
T  14936443 acttcaaagcacgaccaacaccagtcacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttatcatgataact 14936542  T
Q  259 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 358  Q
    ||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| || ||  ||||||  || ||||  || |||||||| |   | | |||||||    
T  14936543 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccttagtttattgcacaacttccggtcctaacaaagcaccttcacct 14936642  T
Q  359 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 458  Q
    || |||||||| |||||||  || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | || || || ||||| ||||    
T  14936643 gattcaaaccaacacaacgacgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaact 14936742  T
Q  459 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 558  Q
    | |||||||| | |      |||||| |  | | |||||| |  ||||||  |||||||||||||||||    |||||| |||||||| | ||| |||||    
T  14936743 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacacattgctccaacacacaagctctcaacaaatcctctaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatc 14936842  T
Q  559 tgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 658  Q
     ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| |  || |||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| |||    
T  14936843 ggtctggggatgataagaagaactcaatctcaacttagttcctaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgat 14936942  T
Q  659 acaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||||| || ||||||| ||||||    
T  14936943 acaatactagaaggaataccatg 14936965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 146 - 681
Target Start/End: Original strand, 4440011 - 4440546
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| || || ||  ||||||||||||  || || || | ||    
T  4440011 gtcaacttcctacacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcctct 4440110  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 345  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || || ||||| |  || ||||  || || ||||| |     
T  4440111 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggccctaacaa 4440210  T
Q  346 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 445  Q
      | ||||||||||| || ||||| |||||||   |||| || || |  |||||||||||||| |   ||||||| ||  ||||||||||| | || ||     
T  4440211 agcactttcacctgattcgaaccaacacaacgacattctacaccttcttccatacaaagcctcaagcagtgccataccggtactagaatgaaaactgttg 4440310  T
Q  446 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 545  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||| |||||||| |    |||||| |||||||    
T  4440311 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaataaatcctccaaactctgaatagtcctct 4440410  T
Q  546 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 645  Q
    | | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||    
T  4440411 ctgtctgcccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcgg 4440510  T
Q  646 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  4440511 atcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 4440546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 146 - 681
Target Start/End: Original strand, 7823983 - 7824518
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||| |  |||| |||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  7823983 gtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 7824082  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 345  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || || || || |     
T  7824083 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggcccaaacaa 7824182  T
Q  346 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 445  Q
      | ||||| || || |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||| | || ||     
T  7824183 agcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttg 7824282  T
Q  446 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 545  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||||| |    
T  7824283 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtccttt 7824382  T
Q  546 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 645  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  || |||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  7824383 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcctaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 7824482  T
Q  646 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  7824483 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 7824518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 146 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 27107961 - 27107426
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||| |  |||| |||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  27107961 gtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 27107862  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 345  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || || || || |     
T  27107861 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggcccaaacaa 27107762  T
Q  346 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 445  Q
      | ||||| || || |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||| | || ||     
T  27107761 agcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttg 27107662  T
Q  446 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 545  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||||| |    
T  27107661 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtccttt 27107562  T
Q  546 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 645  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  27107561 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 27107462  T
Q  646 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  27107461 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 27107426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 159 - 681
Target Start/End: Original strand, 15364036 - 15364558
Alignment:
Q  159 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 258  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||| | || | |||||||||||||| || || ||  ||||||||||||  || ||||| | ||| |||||||||||    
T  15364036 acttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttatcatgataact 15364135  T
Q  259 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 358  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || ||  || |||  || ||||  || |||| ||| |   | ||||| |||    
T  15364136 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccttatttttttgcacaacttccggtcttaacatatcactttctcct 15364235  T
Q  359 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 458  Q
     | |||||||| |||||||  || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||| | || || || ||||| ||||    
T  15364236 tattcaaaccaacacaacgtcgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaact 15364335  T
Q  459 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 558  Q
    | |||||||| | |      |||||| |  | | |||||| |  ||||||  |||||||||||||||||    |||||| |||||||| | ||| |||||    
T  15364336 caatcaacggtaaacattcgtcccaactgacacattgctccaacacacaagctctcaacaaatcctctaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatc 15364435  T
Q  559 tgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 658  Q
     ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  || |||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| |||    
T  15364436 ggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcctaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgat 15364535  T
Q  659 acaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||||| || ||||||| ||||||    
T  15364536 acaatactagaaggaataccatg 15364558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 194 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 12368715 - 12368473
Alignment:
Q  194 actctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctt 293  Q
    ||||||||||||||||| || ||  ||||||| |||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  12368715 actctcaaaaacacgtgatcaccaacctgaaagtcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcattttctctt 12368616  T
Q  294 ggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccg 393  Q
    ||||||||| ||| || |  ||||| |  || ||||  || ||||| || |   | ||||| || || || ||||| |||||||| || || || |||||    
T  12368615 ggatcatcttaacctttttcgtagtctcttgcacaacttccggtccaaacaaagcactttctccggattcgaaccaacacaacggtgtcctacacctccg 12368516  T
Q  394 accatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatga 436  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||    
T  12368515 accatacaaagcctcaaatggagccataccaatactagaatga 12368473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 26288318 - 26288063
Alignment:
Q  29 cgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatg 128  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||  ||||| || |||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| |||| |||  ||||  |||||||||| |    
T  26288318 cgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttcaaaccctttctgaaatctgatacg 26288219  T
Q  129 gaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactc 228  Q
     ||||||||| || || ||||||||| | |||||||| || ||||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || || || || |||||||| ||    
T  26288218 taccaatgaattttggagtcaacttcctcgacttcaatgcgcgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaa-tc 26288120  T
Q  229 aagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat 285  Q
     ||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  26288119 tagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttatgtcgactctgcgacgctttcat 26288063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 146 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 21674720 - 21674185
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||| | |||| ||| | |  | |||||||||||||| || || ||  | ||||| ||||  || || || | ||    
T  21674720 gtcaatttcttacacttcaaagcacgtccaataccaatcacaaggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaattcaatgtccttcctcctct 21674621  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 345  Q
    | |||||||||||||| |||| ||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||| |  ||| || ||||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  21674620 tatcatgataactcttctgtctactttgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttatatttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacaa 21674521  T
Q  346 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 445  Q
      | ||||| |||||||||||||| |||||||  ||  | || |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | || ||     
T  21674520 agcactttctcctgactcaaaccaacacaacgttgtcttacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactgttg 21674421  T
Q  446 ttataagtgaactcgatcaacgg--aagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcct 543  Q
    || ||||| || || ||||||||  || ||  | |||| || |  |  ||||||| | |||||||  |||||||||||||||||    |||||| |||||    
T  21674420 ttgtaagtaaattcaatcaacggtaaacatt-cgatcc-aactgacatcttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctctaaactctgaatagtcct 21674323  T
Q  544 ctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctt 643  Q
    ||| | ||| ||||| ||||| | |||||| ||  |||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| ||     
T  21674322 ctcagtctggccatcggtctgggcatgataagcataactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctc 21674223  T
Q  644 ggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  21674222 ggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 21674185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 249 - 405
Target Start/End: Original strand, 12193742 - 12193898
Alignment:
Q  249 catgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccac 348  Q
    ||||||||||||| || | |||||| |||||  |||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||  || |||| ||  |||||||| |   |    
T  12193742 catgataactcttctgcctactctgagacgctctcatcttctcttgaatcatcttaaccttctccgtagtttcttgcacaaccttcggtcctaacaaagc 12193841  T
Q  349 tctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagc 405  Q
      |||||||||||||| |||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  12193842 attttcacctgactcataccaacacaaaggagttctacacctccgaccatacaaagc 12193898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 350 - 639
Target Start/End: Original strand, 45146842 - 45147131
Alignment:
Q  350 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 449  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || ||||||||||||| |||||| || |||| ||| || |||||||||||  | || || || |    
T  45146842 ctttcacctgattcaaaccaacacaatggcgtcctacacctccgaccatacagagcctccaacggtgtcataccgatactagaatgcaaactgttgttgt 45146941  T
Q  450 aagtgaactcgatcaacggaagatgactat-cccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccg 548  Q
    |||| ||||| |||||||| | |  | | | ||||| |  | |||||||| |  ||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| |    
T  45146942 aagtaaactcaatcaacggtaaac-attctgcccaactgacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctg 45147040  T
Q  549 actgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 639  Q
     ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |  || |||||  |||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  45147041 tctgcccatccgtctgaggatgataagcagaactcaacctcaacttggttccaaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaa 45147131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 140
Target Start/End: Original strand, 15340455 - 15340574
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||||||||||   | ||  ||||    
T  15340455 catacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaat 15340554  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaact 140  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  15340555 ctgatacggaccaatgaact 15340574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 41327 - 40790
Alignment:
Q  152 ttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcat 251  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || ||||  ||| ||||||| ||||| || || || |||||||||||||| |  | |||||| || || ||||    
T  41327 ttcttagacttcaaagcacgtccaacgcccgtcaccggagtgactcttaaaaatacatgatccccttcctgaaactccaattattttcttcgtttatcat 41228  T
Q  252 gataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactct 351  Q
    |||| ||||| |||| | | || || || ||||||| |||  | ||| | |  || ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||  |  |    
T  41227 gatagctcttctgtctaatttgtgatgctttcatttcctcccgaatcgttttgaccttctcggtcgtctgctgaacaatctctggtcccaacactgcaat 41128  T
Q  352 ttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataa 451  Q
     || || |||||  |||| ||||| || ||||  ||||||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||| ||||||||||  | || || ||||||    
T  41127 ctcgccagactcgtaccaacacaaaggtgttcgacatctcctaccatacaacgcctcaaatggtgccatcccagtactagaatggaaactgttgttataa 41028  T
Q  452 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 551  Q
    || ||||| || || || |  | |  ||||||| |||| ||||| || |  |||||   ||| ||||| || || |  || ||||| || || ||   ||    
T  41027 gtaaactcaattaatgggaagtaagcatcccaacttcccccttgttccaacacacatgctcttaacaagtcttccaatgattgaatggttctttcgatct 40928  T
Q  552 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 651  Q
    ||||||| || || || |||||||| ||||||| | | ||||| |  |||||||    ||||||||||  |||||| || || || || |||||||||||    
T  40927 gaccatcagtttgtgggtgatatgcagaactcagttttaacttagtacccaaagtactttgcaaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctct 40828  T
Q  652 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttca 689  Q
    ||| || ||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  40827 atccgaaacaatactcgaaggaagaccatgcagcttca 40790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 560 - 681
Target Start/End: Original strand, 17924148 - 17924269
Alignment:
Q  560 gtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgata 659  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    ||||||||  ||||||||||||| |||||  |||||||||| || ||||| | ||| || |    
T  17924148 gtctggggatgataagccgaactcaacctcaacttatttcccaaagcagcttgcaaactttttcaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgaca 17924247  T
Q  660 caatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    |||| || ||||||| ||||||    
T  17924248 caatactagaaggaataccatg 17924269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 566 - 674
Target Start/End: Original strand, 23641951 - 23642059
Alignment:
Q  566 ggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgc 665  Q
    |||||||| || |||||||| || ||||| |  ||||| ||| |||||||||| | ||||||| | | ||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  23641951 ggatgataagcagaactcaaccttaacttagtccccaacgccgcttgcaaactctcccaaaatgtcggagtaaactttggatctctatctgacacaatgc 23642050  T
Q  666 tcgaaggaa 674  Q
    | |||||||    
T  23642051 tagaaggaa 23642059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 533 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 15171764 - 15171642
Alignment:
Q  533 tgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctag 632  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||  |||| || ||||| ||  |||||||||||||||| |   |||||||| |||| |||||||||| |||  |||    
T  15171764 tgaatagtcctcttcgtctgaccatcgatctgaggctgataagcaaaactcaatctcaacttagtttccaaagccgcttgaaaacttttccgaaacatag 15171665  T
Q  633 aagtaaatcttggatctctatct 655  Q
    ||||||| ||  |||||||||||    
T  15171664 aagtaaacctcagatctctatct 15171642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 302
Target Start/End: Original strand, 13378796 - 13378937
Alignment:
Q  161 ttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactct 260  Q
    ||||||||||| || || | ||| |||||| | |||||||||||||| || || ||  ||||||||||||  |  ||||| | ||| |||| ||||| ||    
T  13378796 ttcaaagcacgaccaactcaagttataggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaattttctttctcctcttatcataataacgct 13378895  T
Q  261 tttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatct 302  Q
    | |||| |||||| || || ||||| ||||||||||||||||    
T  13378896 tctgtctactctgagatgctttcatcttctcttggatcatct 13378937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 350 - 468
Target Start/End: Original strand, 13353438 - 13353556
Alignment:
Q  350 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 449  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||  || || || || | ||||||||||||||| || ||||||||  |  || |||||||| | || |||||||    
T  13353438 ctttcacctgactcataccaacacaacgacgtcctacaccttctaccatacaaagcctcaaacggtgccatatcggtaatagaatgaaaactcttattat 13353537  T
Q  450 aagtgaactcgatcaacgg 468  Q
    |||| ||||| ||| ||||    
T  13353538 aagtaaactcaatcgacgg 13353556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 599 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 17144994 - 17144936
Alignment:
Q  599 cccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctga 657  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||  | |||||||| || ||||||||||||||    
T  17144994 cccaaagcctcttgcatactcttccaaaactttgaagtaaacctcggatctctatctga 17144936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 588; Significance: 0; HSPs: 63)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 588; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 704
Target Start/End: Original strand, 8386381 - 8387064
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  8386381 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 8386480  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8386481 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 8386580  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8386581 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 8386680  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  8386681 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggcgccat 8386780  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8386781 tccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 8386880  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  8386881 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 8386980  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 704  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  8386981 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgt 8387064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 586; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Original strand, 18297174 - 18297855
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  18297174 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 18297273  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  18297274 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 18297373  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18297374 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 18297473  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18297474 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 18297573  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18297574 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 18297673  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18297674 tcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 18297773  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  18297774 tccgaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 18297855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 19778836 - 19778157
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  19778836 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactctttccaatat 19778737  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  19778736 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 19778637  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19778636 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 19778537  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19778536 gctgaacaatctctggtcctaagaccgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 19778437  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19778436 tccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 19778337  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19778336 tcctctagcaactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 19778237  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttg 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  19778236 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttg 19778157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 704
Target Start/End: Complemental strand, 29039447 - 29038764
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  29039447 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 29039348  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  29039347 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 29039248  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29039247 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 29039148  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  29039147 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 29039048  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29039047 tccaatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 29038948  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29038947 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 29038848  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 704  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  29038847 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 29038764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 572; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 704
Target Start/End: Original strand, 12476569 - 12477252
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  12476569 catactttcgaagttgcgatacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 12476668  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  12476669 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 12476768  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12476769 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaacttcctcagtagttt 12476868  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12476869 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 12476968  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12476969 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 12477068  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12477069 tcctcttgcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 12477168  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 704  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  12477169 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgt 12477252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 570; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Original strand, 27711305 - 27711986
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27711305 catacttttgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 27711404  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  27711405 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 27711504  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27711505 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 27711604  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  27711605 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagtctcgaacggtgccat 27711704  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27711705 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 27711804  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27711805 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcagatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 27711904  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  27711905 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 27711986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 566; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 14304020 - 14303340
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  14304020 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 14303921  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  14303920 ctgatacggaccaatgaacttcggg-tcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 14303822  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  14303821 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatccgaactttctcagtagtct 14303722  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14303721 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 14303622  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14303621 tccaatactagcatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 14303522  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14303521 tcttctagcgactgaattgtcctctccgactaaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 14303422  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||    
T  14303421 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgat 14303340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 550; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Original strand, 23955716 - 23956397
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  23955716 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttatgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 23955815  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  23955816 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 23955915  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23955916 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 23956015  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  23956016 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaggcctcgaacggtgccat 23956115  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23956116 tccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgacggtcctaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaa 23956215  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  23956216 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaacttaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 23956315  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  23956316 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 23956397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 550; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Original strand, 40473009 - 40473690
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  40473009 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccatcgttccaactctttccaatat 40473108  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40473109 ctgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcc 40473208  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  40473209 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattttctcttgaatcatttgaactttctcagtagttt 40473308  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40473309 gctgaacaatctccggtcctaagaccactctttcacctgactcgaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 40473408  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40473409 tccaatactagaataataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaa 40473508  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  40473509 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcaaacccaaagcctcttgcaaacttt 40473608  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  40473609 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 40473690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 544; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 704
Target Start/End: Original strand, 12523645 - 12524328
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  12523645 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaatccaactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 12523744  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  12523745 ctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 12523844  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  12523845 tgaaactcaagatctttcctacggttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 12523944  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12523945 gctgaacaatctctggtcctaaaaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 12524044  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12524045 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaa 12524144  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12524145 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 12524244  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 704  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  12524245 tccaaaatctagaagtaaatctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgt 12524328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 542; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 8053666 - 8052985
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||  ||    
T  8053666 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccacacggtaagccatcgttccaactctttccagtat 8053567  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8053566 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 8053467  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8053466 tgaaattcaagatctcttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 8053367  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  8053366 gctgaacaatttctggtcctaagaccactctctctcctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctccgaccatacaaggcctcgaacggtgccat 8053267  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8053266 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctgaagaacacaaattctcaacaaa 8053167  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  8053166 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 8053067  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  8053066 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 8052985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 512; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 704
Target Start/End: Original strand, 14680536 - 14681219
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  14680536 catacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 14680635  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14680636 ctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttatttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcgttcc 14680735  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  14680736 tgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 14680835  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14680836 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 14680935  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  14680936 tccaatactagaatgataactattattgtatatgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagcacacaaactctcaacaaa 14681035  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14681036 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 14681135  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 704  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||| ||||    
T  14681136 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgatacaatgctcgaaggaataccatgcaacttcacaatctccttaatgt 14681219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 495; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 14266942 - 14266368
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  14266942 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 14266843  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14266842 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcatacaccagtcataggggtgactctcaaaaacatgtggtctccttcc 14266743  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  14266742 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctctcagatcatctgaaccttctcagtagttt 14266643  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14266642 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 14266543  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14266542 tccaatactggaatgatagctattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaa 14266443  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttc 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14266442 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctatctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttc 14266368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 491; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 16252488 - 16251810
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  16252488 catacttctgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 16252389  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16252388 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 16252289  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |    
T  16252288 tgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgcttttattttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtct 16252189  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  16252188 gctgaagaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcat 16252089  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  16252088 tccaataatagaatgataactattattgtacgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaacttacaacaaa 16251989  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16251988 tcctctagtgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtctgcgaatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 16251889  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 699  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  16251888 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctcctt 16251810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 18227489 - 18226808
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  18227489 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatacggtggtaatcccactcgatacgccactgttccaactctttccgatat 18227390  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  || | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18227389 ctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtgctctccttcc 18227290  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||  || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |    
T  18227289 tgaaactcaagattcttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttcttagtagtct 18227190  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18227189 tctgaacaatctcgggtcctaagaccactctttcacctgactaaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 18227090  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18227089 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 18226990  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||      
T  18226989 tcctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcc 18226890  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  18226889 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctcgatctgatacaatgctcgaaggcacaccatgtaacctcacaatctccttgat 18226808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 473; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 16355488 - 16354816
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| | ||    
T  16355488 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaagtctttccgatat 16355389  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  16355388 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtttccttct 16355289  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  16355288 tgaaattcaagatctttcctgcgcttatcatgataattattttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 16355189  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  16355188 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggaattctccatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccat 16355089  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    || ||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16355088 tcaaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgcttaagaacacaaattctcaacaaa 16354989  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  16354988 tcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgcctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactct 16354889  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  16354888 tccaaaatctagaagtaaatcttggatatctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgaaacttcacaat 16354816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 696
Target Start/End: Original strand, 7090402 - 7091076
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  7090402 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatat 7090501  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| | | |||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  7090502 ctgatacg-agcaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcatccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttct 7090600  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  7090601 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactcttcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 7090700  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||    
T  7090701 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaactgagttctgcatctccgaccatataaagcctcataaggttccat 7090800  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||    
T  7090801 tctaatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctaaagaacccaaaccctcaacaaa 7090900  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || |||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  7090901 tcttctaacgactaaatcgtcctctccgactgactatctgtctgcggatgatatgctgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttt 7091000  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttc 696  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  7091001 tctaaaatctagaagtaaattttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatttc 7091076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 14851409 - 14850737
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| | ||    
T  14851409 catacttccgaatttgcgacacatgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttcctatat 14851310  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| | || ||||||| ||||| || || ||||||||     
T  14851309 ctgatacggaccaataaacctcggagttaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccggtcacatgagtgactctaaaaaatacatgatctccttct 14851210  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||    
T  14851209 tgaaactcaaggtttttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgtatcatcttaaccttctcaatagttt 14851110  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| |||||||||||    
T  14851109 gttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcgagccaacacaacggagttctgcaccttcttccatacaaagcctcaaaaggtgccat 14851010  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  14851009 tccaatactagaatgataattgttattgtatgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaag 14850910  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || || | |||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  14850909 tcttccaacgactgaatcattctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactct 14850810  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14850809 tccaaaatctagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaat 14850737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 191 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 1640298 - 1639793
Alignment:
Q  191 ctgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttct 290  Q
    |||| ||||||||| || || |||||||| || |||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |    
T  1640298 ctgagtctcaaaaatacatgatctccttcttggaactcaaggtctttcctatgcttatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgccttcatctttt 1640199  T
Q  291 cttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatct 390  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  1640198 cttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctcgggtcctaaaaccaccctctcacctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcatct 1640099  T
Q  391 ccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcct 490  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  1640098 tcgaccatacaaagcctcaaaaggtgacattccaatactagaatgataaatattattgtaagtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtccct 1639999  T
Q  491 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 590  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||    
T  1639998 ccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctccagcgactgaatcgttctttccgactaaccatctgtctgcggatgatacgccaaactccacctca 1639899  T
Q  591 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 690  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  1639898 acttcgaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgcttgaaggaacaccatgcaacttcac 1639799  T
Q  691 aatttc 696  Q
    ||||||    
T  1639798 aatttc 1639793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 325 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 15147623 - 15147249
Alignment:
Q  325 aacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattcca 424  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  15147623 aacaatatctggtcctaagaacactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattcca 15147524  T
Q  425 atactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcct 524  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  15147523 atactagaatgataactattattatacgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcct 15147424  T
Q  525 ctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcca 624  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  15147423 ctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgtcgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttcca 15147324  T
Q  625 aaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 699  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  15147323 aaatctaaaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatttcctt 15147249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 21 - 515
Target Start/End: Original strand, 14159461 - 14159955
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||  | ||    
T  14159461 catacttccgaagttccgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaattctttctgatat 14159560  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||  ||||| || |||||| |     
T  14159561 ctgatatggaccaataaacctcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcatgggagtaactctcaggaacacatgatctcctcct 14159660  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| || |||||||| |    
T  14159661 tgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttcagtagtct 14159760  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||||||||| ||||| || |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  14159761 gttgaacaatctccggtcccaaaaccacattctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccgtacaaagcctcaaaaggtgccat 14159860  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctca 515  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||    
T  14159861 tccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctattaatggaaggtgactatcccaagttccaccttgctcaagtacataaactctca 14159955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 15003667 - 15002995
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  15003667 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttccaactctctcagatat 15003568  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| || ||||| ||     
T  15003567 ctgatatggatcaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaactctcaaaaacacatgatctccctct 15003468  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  |||||||| ||||| |    
T  15003467 tgaaactcaagggattttctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtct 15003368  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| || ||  |||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  15003367 gatgaactaaatctggtcccaacaccacactttctcccgactcaaaccaacataaaggagtcctccacttccgaccatacaaagctttgaacggtgccat 15003268  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  || | ||||    
T  15003267 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacatacgcttagcaaa 15003168  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  15003167 tcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactct 15003068  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||| ||||| || || || ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  15003067 tccaaaatcttgaagtgaacctcgggtctctttccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaat 15002995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 21 - 498
Target Start/End: Original strand, 14652277 - 14652754
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  | ||    
T  14652277 catacttccgaagttgcgacatatgaaacacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtgaacccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatat 14652376  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  14652377 ctgatacggaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttct 14652476  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  14652477 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 14652576  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| || |||||||| || |  || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| |||    
T  14652577 gttgaacgatttctggtcccaaaaatacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagttctgcaccttcgaccatacagagcctcaaaaggtgtcat 14652676  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctc 498  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  14652677 tccaatgctagaatgataactgttattgtacgtgaattctatcaacggaagatgaatatcccaagttcatctttgctc 14652754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 212 - 693
Target Start/End: Original strand, 8706078 - 8706559
Alignment:
Q  212 tctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttct 311  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| || |||   || | || |||||| |    
T  8706078 tctccttccttaaattcaaggtctttcctacgcttgtcgtgataactcttgtgtcgattctgcgacgctttcatcttttctcttattagcttaacttttt 8706177  T
Q  312 cagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaa 411  Q
    |  |||| || |||||||| || ||||| || || || |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  8706178 ctatagtctggtgaacaatatccggtcccaacactacactttcacccgactcaaaccaacataacgaagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaa 8706277  T
Q  412 aggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatt 511  Q
     |||| |||||  ||||||||||| || || || || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |    
T  8706278 tggtgtcattcatatactagaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagtcccaccttgctcaagtacacaaact 8706377  T
Q  512 ctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctctt 611  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || | ||| |||||||    
T  8706378 ctcaacaaatcctctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaactcaacgcctctt 8706477  T
Q  612 gcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  8706478 gcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgacggaacaccatgcagcttcacaat 8706559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 1649580 - 1648908
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||| || ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || || || |||| ||| ||||| |||||||   | ||  | ||    
T  1649580 catacttccgtagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaacccaactctatatgccacagttccaatcctctctgatat 1649481  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| | ||| || || || || |||    
T  1649480 ctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttagaaatacatgatcgccctcc 1649381  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||| || || || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||  ||| ||||  |||||||  ||||| |    
T  1649380 tgaaactcaaggtccttcctccgcttgtcgtggtaactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgattatcttgactttcttcgtagtct 1649281  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      ||||| |  || ||||| || ||||| || || | ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  1649280 catgaaccaaatccggtcccaacaccacactctctcatgactcaaaccagcataaaggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgacat 1649181  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || || || || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||    
T  1649180 accaatactcgaatggtaactgttgttgtaagtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacacactcaacaaa 1649081  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  1649080 tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactct 1648981  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    || ||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  1648980 tctaaaatctggaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgaagcttcacaat 1648908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 15245893 - 15246565
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||| |||||  || ||||| ||||||||  | ||    ||    
T  15245893 catacttctgaagttgcgacacatgaaacacataatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacgcactctgtatgccactgttccaaccctctctgttat 15245992  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||||||| ||| || || ||||| |||    
T  15245993 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggggtaactctcagaaatacatgatctccctcc 15246092  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||   | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  || ||||  ||||| |    
T  15246093 tgaaactcaaaggccttcctacgtttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatctttaccttcttcgtagtct 15246192  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || ||||| |||||||||||| || | || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15246193 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctcctgactcaaactagaataaaggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 15246292  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| |  || || || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  15246293 accaatactcgaatggtgactgttgttgtacgtcaactctatcaacggtagttgactatcccaacctccaccttgctcaagtacacacactctcaccaaa 15246392  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  15246393 tcctctaatgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctggggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactct 15246492  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||||||||| || || | ||||||||| |||||||| ||||| | ||| ||||||| |||||||||    
T  15246493 tccaaaatctagaagtgaacctcgaatctctatccgatacaatactcgacgaaactccatgtaacttcacaat 15246565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 192 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 15415158 - 15414657
Alignment:
Q  192 tgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctc 291  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  15415158 tgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaattcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctc 15415059  T
Q  292 ttggatca-tctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatct 390  Q
        |||| | ||| |||| || ||||| || ||||| || |||||||| || |  || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  15415058 ccttatcaatttgaccttt-tccgtagtctgttgaactatatctggtcccaacattacactttcacccgactcaaaccaacataacggagttctgcacct 15414960  T
Q  391 ccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcct 490  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||     
T  15414959 ccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggcagatgactatcccaaactcca 15414860  T
Q  491 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 590  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||| |||||| |||| ||| ||||| || ||||||||||| | |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||    
T  15414859 ccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcatctaacgattgaatcgttctctccgactggctatctgtttgcggatgataagctgaactcaacctca 15414760  T
Q  591 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 690  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||| ||||||||    
T  15414759 actttgaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagatgtaaatcttggatctctatccgacacaatacttgacggaacaccatgcagcttcac 15414660  T
Q  691 aat 693  Q
    |||    
T  15414659 aat 15414657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 21 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 3265097 - 3264428
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  3265097 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaat 3264998  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  3264997 ctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 3264898  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||   |||| |   |||||||||||||| |    
T  3264897 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 3264798  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  3264797 catgaaccaaatccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 3264698  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||    
T  3264697 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaa 3264598  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| || || || |||||||    
T  3264597 tcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttt 3264498  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 690  Q
    |||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  3264497 tccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 3264428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 11207534 - 11206865
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  11207534 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaat 11207435  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||| ||| || || || || |||    
T  11207434 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcc 11207335  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||   |||| |   |||||||||||||| |    
T  11207334 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 11207235  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  11207234 catgaaccaagtccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 11207135  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| | ||| || |  ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||    
T  11207134 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtgaactcaaccaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacaccctcaacaaa 11207035  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |    
T  11207034 tcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactct 11206935  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 690  Q
    || | || |||||||| || ||  |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  11206934 tcaagaacctagaagtgaacctcagatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcac 11206865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 21 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 29453840 - 29453171
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  29453840 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaat 29453741  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||| || || ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  29453740 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 29453641  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||   |||| |   |||||||||||||| |    
T  29453640 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaaccttactttctcagtagtct 29453541  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      ||||| |  ||  |||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  29453540 catgaaccaaatcccgtcccaatacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 29453441  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||    
T  29453440 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaa 29453341  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || |||||||    
T  29453340 tcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttt 29453241  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 690  Q
    |||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  29453240 tccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 29453171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 33222887 - 33223564
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||  ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| | |   ||||    
T  33222887 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcatgttcgaaagatggggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaactctctttgaaat 33222986  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  33222987 ctgatacggaccaatgaactttggtgtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 33223086  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    |||| ||  ||||||||||||||||    
T  33223087 tgaaactcaagttcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacttgactttctcagtagttt 33223186  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      ||||| |  |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || | ||| |||| |||    
T  33223187 catgaaccaagtctggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaatgctttgaatggtgtcat 33223286  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     ||||||||  | || ||  | || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||    
T  33223287 accaatactctattgttattttttgttttatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaa 33223386  T
Q  521 tcctctagcgactgaat-----tgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaa 615  Q
    || || |  || || ||     | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||    
T  33223387 tcttccaatgattggatcgtcctctcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcctgtaa 33223486  T
Q  616 acttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  33223487 actcttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgggacaccatgtagcttcacaat 33223564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 21 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 15150049 - 15149740
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||| | ||    
T  15150049 catacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgtcaccgttccaactctttccgatat 15149950  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  15149949 ctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 15149850  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||| |    
T  15149849 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcaatagtct 15149750  T
Q  321 gctgaacaat 330  Q
    ||||||||||    
T  15149749 gctgaacaat 15149740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 21 - 246
Target Start/End: Original strand, 15364355 - 15364580
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15364355 catactttcgaagttgcgacatatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 15364454  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15364455 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 15364554  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgctt 246  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15364555 tgaaattcaagatcttttctacgctt 15364580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 119 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 15359295 - 15358721
Alignment:
Q  119 atctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctt 218  Q
    ||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||  ||| || || ||||| |    
T  15359295 atctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgatttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcggaaatacatgatctccct 15359196  T
Q  219 cctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 318  Q
    | |||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  || ||||| |||||    
T  15359195 cttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgaaaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatctttaccttctccgtagt 15359096  T
Q  319 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcc 418  Q
     || ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  15359095 ctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgcc 15358996  T
Q  419 attccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaaca 518  Q
    || |||||||  ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||| | | |||||  |    
T  15358995 ataccaatacatgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacagacactctcagta 15358896  T
Q  519 aatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaact 618  Q
    ||||||| |  || || || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| |||    
T  15358895 aatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctctctgaggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcagact 15358796  T
Q  619 tttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
     |||| |||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  15358795 cttcccaaatcttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 15358721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 128 - 693
Target Start/End: Original strand, 27900462 - 27901027
Alignment:
Q  128 ggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaact 227  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||  ||||||||| | || |||| ||| || || || || ||||||||||    
T  27900462 ggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgttctacactcgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaact 27900561  T
Q  228 caagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaac 327  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| |  |||||    
T  27900562 caaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttctatcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctcatgaac 27900661  T
Q  328 aatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaata 427  Q
     |  || ||||| || || || ||||| || |||||||||||||| || | ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  27900662 caaatccggtcccaacacaacactttctcccgactcaaaccagcataaagaagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaata 27900761  T
Q  428 ctagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctcta 527  Q
    || ||||| || || || || || |||||||| || ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  || | |||||||||||    
T  27900762 ctcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatgaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacatacccttagcaaatcctcta 27900861  T
Q  528 gcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaa 627  Q
      || || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  27900862 aagattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctacggatgataagctgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgtaaactcttccaaaa 27900961  T
Q  628 tctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||| |||||||| |  || |||||||| || || || ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  27900962 tcttgaagtaaaccccgggtctctatccgacactatactcgacggaacaccatgcatcttcacaat 27901027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 20890952 - 20891623
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| |  || |||||||  | ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  20890952 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtgttgg-aaacccatcctatatgccactgttccaaccctctctgaaat 20891050  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| | |||||| ||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  20891051 ctgatacgaaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 20891150  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    |||| |   |||||||||||||| |    
T  20891151 tgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtct 20891250  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      ||||| |  |  ||||| || || || || |||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20891251 catgaaccaaattcggtcccaacacaacactctcacctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccggccatacaaagcttcgaacggtgccat 20891350  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||    
T  20891351 accaatacttgaatgatagctattgttatatgtgaactcaatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaacaaa 20891450  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  20891451 tcttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcctgtaaactct 20891550  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||| || |||||||| || || |||||| |||| || ||||| || || || ||||| || | |||||||||    
T  20891551 tccagaacctagaagtgaacctcggatctttatccgacacaatacttgacggtacaccgtgcaacttcacaat 20891623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 242 - 693
Target Start/End: Original strand, 15077825 - 15078276
Alignment:
Q  242 cgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtccta 341  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  || ||||| ||||| || ||||| |  |||||||| |    
T  15077825 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaactaaatctggtccca 15077924  T
Q  342 agaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagct 441  Q
    | || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  15077925 acactacactttctcccgactcaaaccaacacaatggagttctgcacctctgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaact 15078024  T
Q  442 attattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtc 541  Q
     || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| ||     
T  15078025 gttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactgaatcgtt 15078124  T
Q  542 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 641  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  15078125 ctcttcgactgaccatttgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtaaacc 15078224  T
Q  642 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    | ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  15078225 tcggatctctatccgacacaatactcgatggaaccccatgcaacttcacaat 15078276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 597
Target Start/End: Original strand, 16145881 - 16146459
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| | ||  ||||    
T  16145881 catacttccgaagctgcgacacatgtaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaactctctctgaaat 16145980  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || ||  | |||    
T  16145981 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcatcctcc 16146080  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||    |||| ||  |||||||| ||||| |    
T  16146081 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcaccttgactttctccgtagtct 16146180  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  |||||||| || || || || |  ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  16146181 gatgaaccaaatctggtcccaacacaacactctgtcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaatcttcgaacggtgccat 16146280  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag--aacacaaattctcaaca 518  Q
     |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||   ||||| | ||| |  |    
T  16146281 accaatactcgaatggtaactgttattgtatgtgaattctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacacactcttagta 16146380  T
Q  519 aatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 597  Q
    ||||||| |  || ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  16146381 aatcctccaaagattgaatcgtcctcttcgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaaccccaacttcga 16146459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 44662169 - 44661500
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| | ||  ||||    
T  44662169 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaactctctctgaaat 44662070  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||  | |||||||  ||||| || ||||| |||| |||| | || |||| ||| || || || || |||    
T  44662069 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagcgcacgaccaacacccgtcaaaggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 44661970  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||   |||| |   |||||||||||||| |    
T  44661969 tgaaactcaagatcctttctccgcttgtcacggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 44661870  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  44661869 catgaaccaagtccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 44661770  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacgg-aagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 519  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |  |||| |||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  44661769 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaagacaaga-gactgtcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaa 44661671  T
Q  520 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 619  Q
    ||| || | ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || || || |||||     
T  44661670 atcttccaacgattgaatcgtcctcttcgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcgtcctgtaaactc 44661571  T
Q  620 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 690  Q
    ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  44661570 ttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 44661500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 21 - 501
Target Start/End: Original strand, 15070382 - 15070862
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||| |  || ||||| ||||||||| | || || ||    
T  15070382 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccaccctgtatgccactgttccaactctctcaaatat 15070481  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||| ||||||||||| |||||||  ||||||||| |  |||||||  |||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| ||     
T  15070482 ctggtatggaccaataaacttcgtagtcaacttcataaacttcaacacacgacctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctct 15070581  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  || ||||| ||||| |    
T  15070582 tgaaactcaagggcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtct 15070681  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15070682 gatgaactaaatctggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacacaatggagttctgcacctctgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 15070781  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 501  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  15070782 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaag 15070862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 503 - 693
Target Start/End: Original strand, 14691353 - 14691543
Alignment:
Q  503 acacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccca 602  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || |    
T  14691353 acacaaactctcaacaagtcctctaacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaacttaacctcaacttagaaccta 14691452  T
Q  603 aagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14691453 aagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 14691543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 51606484 - 51605998
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || || |||| ||| ||||||||||| | | | ||  ||||    
T  51606484 catacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaat 51606385  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| | ||| || || || || ||     
T  51606384 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttataaatacatgatcaccctct 51606285  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||  ||||| || ||||| |    
T  51606284 tgaaactcaagggcctttctccgtttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtct 51606185  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
     |||||| |  || ||||| |  || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  51606184 cctgaaccaaatccggtcccagcacaacactttctcctgactcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccat 51606085  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaca 507  Q
    ||| ||||| || ||||| || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| |||||    
T  51606084 tcctatactcgagtgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacaca 51605998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 187 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16676580 - 16676417
Alignment:
Q  187 aggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatt 286  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  16676580 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttgctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcatt 16676481  T
Q  287 ttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactc 350  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16676480 ttctcttaaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactc 16676417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 552 - 693
Target Start/End: Original strand, 14159970 - 14160111
Alignment:
Q  552 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 651  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14159970 gaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttgggtctct 14160069  T
Q  652 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
     ||| |||||||| | |||||||||||||| | |||||||||    
T  14160070 gtctaatacaatgtttgaaggaacaccatgcaacttcacaat 14160111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 221 - 639
Target Start/End: Original strand, 13247814 - 13248232
Alignment:
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || || |||||||    
T  13247814 tgaaactcaatatcttttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagttt 13247913  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      || ||||  || |||||||| |   | ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| || || |||||    
T  13247914 cttgcacaacttccggtcctaacaaagcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgttctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggagccat 13248013  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgacta-tcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 519  Q
     | ||||||||||||| | || || || ||||| ||||| |||||||| | |  | || |||||| |  | |||||||| |  ||||||  |||||||||    
T  13248014 cctaatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggta-aacattagtcccaactgacaccttgctctaacacacaagctctcaacaa 13248112  T
Q  520 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 619  Q
    |||||| |    |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  ||||||||||     
T  13248113 atcctccaaactctgaatagtcctctccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactc 13248212  T
Q  620 ttccaaaatctagaagtaaa 639  Q
    | ||| ||  ||||||||||    
T  13248213 tcccagaacttagaagtaaa 13248232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 542 - 693
Target Start/End: Original strand, 15319641 - 15319792
Alignment:
Q  542 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 641  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| || |    
T  15319641 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcctcttgtaaactcttccaaaaccttgaagtgaacc 15319740  T
Q  642 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | |||||||||    
T  15319741 tcggatctctatctgacacaatgctcgatgggacaccatgcaacttcacaat 15319792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 146 - 681
Target Start/End: Original strand, 14997410 - 14997945
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| | || | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  14997410 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaagattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 14997509  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 345  Q
    | ||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||| || ||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  |  |||||||| |     
T  14997510 tatcatgatgactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaactttcggtcctaacaa 14997609  T
Q  346 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 445  Q
      | || || |  ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||| | || ||     
T  14997610 agcactctctctggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccaatactagcatgaaaactgttg 14997709  T
Q  446 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 545  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  14997710 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactaacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 14997809  T
Q  546 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 645  Q
    ||| ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |   |||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  14997810 ccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaactttgttgccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 14997909  T
Q  646 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||| | ||||||    
T  14997910 atcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 14997945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 146 - 681
Target Start/End: Original strand, 9290929 - 9291464
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||| |  ||||||||||| | || ||| | |||| |||| | || |||||||| || || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||    
T  9290929 gtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacatcggtcacaggattcaccctcaaaaatacctgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctct 9291028  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 345  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  9291029 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 9291128  T
Q  346 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 445  Q
      | ||||| || ||||||||||| ||||| || || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | ||  |     
T  9291129 agcactttctccggactcaaaccaacacaatggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactgctg 9291228  T
Q  446 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 545  Q
    || ||||| ||||| |||||||  | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    || ||| |||||||    
T  9291229 ttgtaagtaaactcaatcaacgataaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctaaatagtcctct 9291328  T
Q  546 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 645  Q
    ||| ||| ||||| ||||| ||||| || || | ||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  9291329 ccgtctgtccatcggtctgaggatggtaagcagtactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 9291428  T
Q  646 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||| | ||| || ||||| ||  |||||| ||||||    
T  9291429 atcccgatccgacacaatactataaggaataccatg 9291464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 14927302 - 14927151
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  14927302 catacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcagtacgccactgttccaactctttccgatat 14927203  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgt 172  Q
    |||||| |||||||| ||  | || ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14927202 ctgatacggaccaataaatctaggagtcaaattctttgacttcaatgcacgt 14927151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 146 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 15293335 - 15293013
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || ||| ||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| || || |  |    
T  15293335 gtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccattcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctccttt 15293236  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 345  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  15293235 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttctgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 15293136  T
Q  346 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 445  Q
      | ||||| || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| | || ||     
T  15293135 agcactttctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 15293036  T
Q  446 ttataagtgaactcgatcaacgg 468  Q
    || ||||| ||||| ||||||||    
T  15293035 ttgtaagtaaactcaatcaacgg 15293013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 146 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 55375536 - 55375214
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||| |  |||||||||| || || |||||||| | |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  55375536 gtcaacttcatacacttcaaagctcgaccaacaccagttacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 55375437  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 345  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||  || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  ||||||||||| |     
T  55375436 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctactgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgtacaacttctggtcctaacaa 55375337  T
Q  346 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 445  Q
      | ||||||||||| |||||||| |||||| | || || || |||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||  | || ||     
T  55375336 agcactttcacctgattcaaaccaacacaacagtgtcctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagaatgtaaactgttg 55375237  T
Q  446 ttataagtgaactcgatcaacgg 468  Q
    || ||||| ||||| ||||||||    
T  55375236 ttgtaagtaaactcaatcaacgg 55375214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 128 - 285
Target Start/End: Original strand, 16752669 - 16752826
Alignment:
Q  128 ggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaact 227  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| || || || || ||||||||||    
T  16752669 ggaccaatgaacttcggagttaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaact 16752768  T
Q  228 caagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat 285  Q
    ||||  | ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  16752769 caagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcat 16752826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 12132574 - 12132298
Alignment:
Q  159 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 258  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | || | || ||||||||||| || || ||  | ||||||||||  || || || | ||| |||||| ||||    
T  12132574 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgacaact 12132475  T
Q  259 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 358  Q
    ||| || | ||| || ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || || ||||| |  || ||||  ||||| ||||| |  || |||||||||    
T  12132474 cttctgcctactttgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttctggacctaacaaaacactttcacct 12132375  T
Q  359 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatga 436  Q
    |||||| |||| |||||||  ||||| |||| |||| ||||||||||||| || |||| ||| || ||||||||||||    
T  12132374 gactcataccaacacaacgacgttctacatc-ccgatcatacaaagcctcaaacggtgtcataccgatactagaatga 12132298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 252
Target Start/End: Original strand, 42702872 - 42703103
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || || |||| ||| ||||||||||| | | | ||  ||||    
T  42702872 catacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaat 42702971  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| | ||| || || || || ||     
T  42702972 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttataaatacatgatcaccctct 42703071  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatg 252  Q
    |||||||||||  | ||||| || ||||||||    
T  42703072 tgaaactcaagggcctttctccgtttgtcatg 42703103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 219 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 12342968 - 12342548
Alignment:
Q  219 cctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 318  Q
    |||||||||||| ||  || || | ||| |||||||||||||| || | |||||| |||||| | || |||||||| ||||||| ||| || |  |||||    
T  12342968 cctgaaactcaatattcttcctcctcttatcatgataactcttctgcctactctgagacgcccttatattctcttgaatcatcttaaccttttatgtagt 12342869  T
Q  319 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcc 418  Q
     |  || |||| ||| |||||||  |   | ||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| || |||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  12342868 ctcttgcacaacctccggtcctagtaaagcactttcacctgactcataccaacacaacgacgttctacacctccaaccatacaaagcctcaaacggtgcc 12342769  T
Q  419 attccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaaca 518  Q
    || ||||||||||||||| |  | || || ||||| ||||| |||||||| | |     | ||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||    
T  12342768 atcccaatactagaatgaaaattgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcaacccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaaca 12342669  T
Q  519 aatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaact 618  Q
    |||| || |    ||||||  ||||||||| ||| ||||| || || |||||||| ||  ||||||| || ||||| |  ||||||||  ||||||||||    
T  12342668 aatcttcaaaactctgaatattcctctccgtctgcccatcagtatggggatgataagcataactcaaccttaacttagttcccaaagcagcttgcaaact 12342569  T
Q  619 tttccaaaatctagaagtaaa 639  Q
     | ||||||| ||||||||||    
T  12342568 ctcccaaaatttagaagtaaa 12342548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 18164474 - 18164332
Alignment:
Q  39 acacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaa 138  Q
    ||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | |||||||| |||||||||||    
T  18164474 acacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaa 18164375  T
Q  139 cttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacacca 181  Q
    ||| || |||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  18164374 ctttggagtcagcttcttagacttcaatgcacatcctacacca 18164332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 18607873 - 18607823
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagat 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18607873 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagat 18607823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 16445390 - 16445234
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || ||||||| |||| | || || |||||||| || || ||  | |||||||||| ||| || || | ||    
T  16445390 gtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccagtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 16445291  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatct 302  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  16445290 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatct 16445234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 550 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 18549834 - 18549694
Alignment:
Q  550 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 649  Q
    ||||||||| || || || |||||||| ||||||| | | ||||| |  ||||||||   ||||||||||  |||||| || || || || |||||||||    
T  18549834 ctgaccatcagtttgtgggtgatatgcagaactcagttttaacttagttcccaaagcacattgcaaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatct 18549735  T
Q  650 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 690  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  18549734 ctatccgaaacaatactcgaaggaacaccatgcaacttcac 18549694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 15415282 - 15415214
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| |||||| |||| || || ||||||||||    
T  15415282 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaggatgtggtggcaaacccactc 15415214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 356 - 468
Target Start/End: Original strand, 16685557 - 16685669
Alignment:
Q  356 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 455  Q
    ||||||||| |||| || ||||  ||||| || ||||  |||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||| | || || || ||||| |    
T  16685557 cctgactcataccaacataacgacgttctacacctccttccatacaaagcctcaaacggtgccataccaatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaa 16685656  T
Q  456 actcgatcaacgg 468  Q
    |||| ||||||||    
T  16685657 actcaatcaacgg 16685669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 554 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 15424013 - 15423974
Alignment:
Q  554 ccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaact 593  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15424013 ccatctgtctgtggatggtatgccgaactcaatctcaact 15423974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 18550064 - 18549949
Alignment:
Q  320 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 419  Q
    |||||||||||||||||||| || ||  |  |||| || |||||  |||| ||||| || ||||  ||||||| |||||||||  |||| || |||||||    
T  18550064 tgctgaacaatctctggtcccaacactgcaatttcgccagactcgtaccaacacaaaggtgttcgacatctcctaccatacaatacctcaaatggtgcca 18549965  T
Q  420 ttccaatactagaatg 435  Q
    | ||||||||||||||    
T  18549964 tcccaatactagaatg 18549949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 574; Significance: 0; HSPs: 71)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 574; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Original strand, 19112725 - 19113406
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  19112725 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccactgttccaactctttccaatat 19112824  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  19112825 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 19112924  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19112925 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 19113024  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19113025 gctgaataatctctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 19113124  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19113125 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcctccctgctcaagaacacaaattctcaacaaa 19113224  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19113225 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 19113324  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  19113325 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 19113406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 572; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 17674769 - 17674090
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  17674769 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 17674670  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  17674669 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 17674570  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17674569 tggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 17674470  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17674469 gctgaacaatctctggtcctaagaccgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 17674370  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17674369 tccaatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 17674270  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17674269 tcctctagcaactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 17674170  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttg 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  17674169 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttg 17674090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 555; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 19485616 - 19484974
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  19485616 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaat 19485517  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19485516 ctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 19485417  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  19485416 ttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctcggatcatctgaactttctcagtggttt 19485317  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19485316 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcaccggattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgccat 19485217  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19485216 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttactcaagaacacaaattctcaacaaa 19485117  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  19485116 tcctctagcgactgaattgtcctctccgattgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcagacttt 19485017  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19485016 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 19484974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 540; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 20018496 - 20017865
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  20018496 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccagtat 20018397  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20018396 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 20018297  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20018296 tcaaattcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 20018197  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  20018196 gctgaacaatttctggtcctaagaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaggcctcgaacggtgccat 20018097  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20018096 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 20017997  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20017996 tcctctaacgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttt 20017897  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 652  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20017896 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 20017865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 534; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 22120920 - 22120239
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  22120920 catacttccaaagttgcgacacatggaaaacgttgttcaaatttgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 22120821  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22120820 ctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttccttgacttcaatgcacgtcccacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcc 22120721  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  22120720 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttggatcatccgaactttctcagtagtct 22120621  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22120620 gctgaacaatctctgatcctaagaccactctttcacctcactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 22120521  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22120520 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 22120421  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  22120420 tcctctagcgactgaattgtcctctccaactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactct 22120321  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | | |||| || ||||||||    
T  22120320 tccaaaatctagaattaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaataccatgcaacctcacgatctccttgat 22120239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 510; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 30313890 - 30313209
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  30313890 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 30313791  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30313790 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 30313691  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  30313690 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 30313591  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  30313590 gctgaacaatctcgagccctaagaccactctttcacctgactcaaaccaccacaatggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccgt 30313491  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  30313490 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaactaa 30313391  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30313390 tcctctagcgactgaattgtcctctccaactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 30313291  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  30313290 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctccttgat 30313209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 495; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 683
Target Start/End: Original strand, 15533415 - 15534077
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  15533415 catacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 15533514  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||| |||||     
T  15533515 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagccacaggagtgactctcaaaaacatgtggtcaccttct 15533614  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||| |    
T  15533615 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgtatcattttaactttctcagtagtct 15533714  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15533715 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 15533814  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15533815 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 15533914  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15533915 tcctctagcgactgaattgtcctctccaactgaccatctttctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 15534014  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 683  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15534015 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgaaggaacaccatgta 15534077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 490; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Original strand, 32600179 - 32600860
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  32600179 catacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagacgtggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 32600278  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32600279 ctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 32600378  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |    
T  32600379 tgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtct 32600478  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32600479 actgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgaccgaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 32600578  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32600579 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 32600678  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32600679 tcctataacgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 32600778  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  32600779 tccaaaacctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctccttgat 32600860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 489; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 22133787 - 22133127
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  22133787 catacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtattccgactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 22133688  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || || |||||||||||||   ||||||||||    
T  22133687 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacatgagtgtctctcaaaaacacaatgtctccttcc 22133588  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  22133587 tgaaactcaagatctttcctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 22133488  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22133487 gctgaacaatctcgggtcctaagaccactctttcacttgactcaaacccgcacaacggagttctgcatcaccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 22133388  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22133387 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 22133288  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22133287 tcttctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 22133188  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22133187 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatttgatacaatgctcgaaggaacaccatg 22133127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 482; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Original strand, 22046408 - 22047089
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  22046408 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcctactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 22046507  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| | |||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046508 ctgatacgaaccaataaacctcggagtcaatttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcactggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 22046607  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    | |||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  22046608 taaaactcaagatccttcctgcgtttatcatgataactcttttgtcgactatgcgacactttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 22046707  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  22046708 gctgaacaatctctggtcctaggaccactctttcacctgattcaaaccagcacaacggagttctgcatctctgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 22046807  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22046808 tccaatactagaatgataaccattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 22046907  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
T  22046908 tcctctagcgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaatttcgaacctaaagcctcttgcaaactct 22047007  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  22047008 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatatgatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctccttgat 22047089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 16408788 - 16408131
Alignment:
Q  24 acttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||    
T  16408788 acttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctg 16408689  T
Q  124 atatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctga 223  Q
    ||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||| || |||||||||||||| ||     
T  16408688 atacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcaacaatacgtggtctccttcttgg 16408589  T
Q  224 aactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgct 323  Q
    |||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  16408588 aacttaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgct 16408489  T
Q  324 gaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattcc 423  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16408488 gaacaatctccggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgtatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccattcc 16408389  T
Q  424 aatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcc 523  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16408388 aatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcc 16408289  T
Q  524 tctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcc 623  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  16408288 tctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttcc 16408189  T
Q  624 aaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16408188 aaaatctataagtaaatcttgggtctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 16408131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Original strand, 19978002 - 19978683
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  19978002 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgttacgccaccgttccaactatttccgatat 19978101  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  19978102 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 19978201  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  19978202 tgaaactcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 19978301  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  19978302 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatcttcgaccatataaagcctccaaaggtgccat 19978401  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  19978402 tccaatactagaatgataattgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacactaaatctcaacaaa 19978501  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |    
T  19978502 tcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgtcgagctcaatctcaacttagaacccaaagcctcctgcaaactct 19978601  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  19978602 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatttgttacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatttcattgat 19978683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 465; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 22164937 - 22164278
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  22164937 catacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatgcgccaccgttccaactctttccgatat 22164838  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||| ||||||||||   ||||||||||    
T  22164837 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttatttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacatgagtgactttcaaaaacacaatgtctccttcc 22164738  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  22164737 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 22164638  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22164637 gctgaacaatctcgggtccgaagaccactctttcacttgactcaaacctgcacaacggagttctgcatcaccgaccgtacaaagcctcaaaaggtgccat 22164538  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22164537 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 22164438  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22164437 tcttc-agcgactgaattgtcctctctgactgaccatatgtctgcggatgacacgctgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 22164339  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22164338 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctaatacaatgctcgaaggaacaccatg 22164278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 451; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 29 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 21167275 - 21166606
Alignment:
Q  29 cgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatg 128  Q
    ||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||| |    
T  21167275 cgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaacccaactcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacg 21167176  T
Q  129 gaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactc 228  Q
    ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21167175 gaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactc 21167076  T
Q  229 aagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaaca 328  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  21167075 aagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaaca 21166976  T
Q  329 atctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatac 428  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  21166975 atctctggtcctaagaccactcttccacctgattcaaaccaacacaattgagttctgcatcttcgaccatataaagcctcaaaaggtgccattccaatac 21166876  T
Q  429 tagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctag 528  Q
    |||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  21166875 tagaatgataactgttattgtacgtaaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctag 21166776  T
Q  529 cgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaat 628  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21166775 cgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaat 21166676  T
Q  629 ctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 699  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||    
T  21166675 ctagaagtaaatcttggatctctatctgata-aatgctcgaaggaacaccatgcaactttacaatctcctt 21166606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 445; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 23650076 - 23650748
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | ||    
T  23650076 catacttccgaagttgcaacacaagaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaactcgataagccaccgttccaactcttttcgatat 23650175  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||     
T  23650176 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttct 23650275  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  23650276 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgatgcttttatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 23650375  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||    
T  23650376 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcataaggcgccat 23650475  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||     
T  23650476 tccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctattaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacgcaaactctcaacaag 23650575  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  23650576 tcctctagcgactgaatcgttctctccgattgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttt 23650675  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  23650676 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgaaacaatactcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 23650748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 437; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 21922481 - 21921809
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  21922481 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacgtcgtgcaaattcgaaatatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatat 21922382  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||  |  |||| ||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  21922381 ctgatacggaccaatatatctcggagtcaacttcttcgacttcaaagcttgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacgtggtctccttct 21922282  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| || ||||| ||||||| ||| || ||||||||||    
T  21922281 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtggactctgcgacactttcatcttttcttgaatcatcttaaccttttcagtagttt 21922182  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  21922181 gctgaacaatctctggtcctaagaccactcttccacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatagaaagcctcataaggtgccat 21922082  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  21922081 tccaatagtagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaa 21921982  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  21921981 tcctctagctattgaatcgtcctctacgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttt 21921882  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21921881 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 21921809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 21250977 - 21251648
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  21250977 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 21251076  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  21251077 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttat 21251176  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||  ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  21251177 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgctttcatct-ctctttaatcatcttaaccttctcggtagttt 21251275  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |   |||||| |||    
T  21251276 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatcttcgaccatacaaagcgtaataaggtgtcat 21251375  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
      |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  21251376 ctcaatactagaatgataactgttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaacaaa 21251475  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  21251476 tcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgactatctgtctgtggatgatacgccaaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttt 21251575  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21251576 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 21251648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 21789104 - 21788433
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||| |||||||||||||| | || |||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | ||| ||||| | ||    
T  21789104 catacttctgaagttgcgacacaggaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcggtacgccaccgttacgactctttccgatat 21789005  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  21789004 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagaacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 21788905  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    || ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  21788904 tggaactcaagatctttcatgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagttt 21788805  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  21788804 gctaaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgatttaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatac-aagcctcataaggtgccat 21788706  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  21788705 tccaatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatgggagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaacaaa 21788606  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||    
T  21788605 tcttctaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttaaaacctaaagcctcttgcaaacttt 21788506  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21788505 tccaaaatctggaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 21788433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 21394611 - 21393939
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||| |||||||||||||| | || |||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | ||| ||||| | ||    
T  21394611 catacttctgaagttgcgacacaggaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcggtacgccaccgttacgactctttccgatat 21394512  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  21394511 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagaacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 21394412  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    || ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  21394411 tggaactcaagatctttcatgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagttt 21394312  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccga-ccatacaaagcctcgaaaggtgcca 419  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||    
T  21394311 gctaaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgatttaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacccatac-aagcctcataaggtgcca 21394213  T
Q  420 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 519  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  21394212 ttccaatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatgggagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaacaa 21394113  T
Q  520 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 619  Q
    ||| ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||||||    
T  21394112 atcttctaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttaaaacctaaagcctcttgcaaactt 21394013  T
Q  620 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21394012 ttccaaaatctggaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 21393939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 262 - 702
Target Start/End: Original strand, 18856853 - 18857293
Alignment:
Q  262 ttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgac 361  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18856853 ttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatccgaactttcttagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagacgactctttcacctgac 18856952  T
Q  362 tcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcga 461  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  18856953 tcaaaccagcacaacagagttatgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatacctattattgtatgtgaactcga 18857052  T
Q  462 tcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgt 561  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18857053 tcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgt 18857152  T
Q  562 ctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgataca 661  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18857153 ctgcgggtgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacaca 18857252  T
Q  662 atgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||    
T  18857253 atgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgat 18857293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 22987236 - 22987903
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||   | ||    
T  22987236 catacttccgaagttgcgacacatgtattacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttatgatat 22987335  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||  ||| ||||||| ||||| || || ||||||||     
T  22987336 ctgatacggaccaataaacttcagagtcaacttctttgacttcaatgcatgtccaacatcagtcactggagtgactctaaaaaatacatgatctccttct 22987435  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| | | |||||||| ||||||    
T  22987436 tgaaaatcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatattatctttctcaatagttt 22987535  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | |||||||| | || |||||| ||||| || |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  22987536 gttgaacaatttatgctcctaaaaccacactctcacctaactcgaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccgtacaaagcctcaaaaggtgtcat 22987635  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| ||  ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  22987636 tccaatactagaatgataattgttattgtacatgaactctattaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaag 22987735  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || || |||||||||| |||||| |    
T  22987736 tcctctaacgactgaatcgtcctttccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaacgcaacctcaacttagaacctaaagcctcttacaaactct 22987835  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||     ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22987836 tccaaaatct-----taaatctcgaatctctatctcatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 22987903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 289 - 702
Target Start/End: Original strand, 22040162 - 22040575
Alignment:
Q  289 ctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcat 388  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  22040162 ctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaggaccactctttcacctcattcaaaccagcacaacggagttctgcat 22040261  T
Q  389 ctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 488  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22040262 ctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattcgaatactagaatgataactaatattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 22040361  T
Q  489 ctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatct 588  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22040362 atccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgattgaattgtcctctccaactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatct 22040461  T
Q  589 caacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttc 688  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||    
T  22040462 caatttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatgttggatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgtaacctc 22040561  T
Q  689 acaatttccttgat 702  Q
    ||||| ||||||||    
T  22040562 acaatctccttgat 22040575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 141 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 22378079 - 22377528
Alignment:
Q  141 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttct 240  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||| |||| |||||||| || || ||| ||||||||||||||| |||||| ||    
T  22378079 tcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcactggagtgaccctcaaaaatacatgatctgcttcctgaaactcaatatctttcct 22377980  T
Q  241 acgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 340  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| | |||||| |||||||||    
T  22377979 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctccgtagtttgtttaacaatttctggtcct 22377880  T
Q  341 aagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagc 440  Q
    || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |  |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  22377879 aaaaccacactctcacccgactcgaaccaacacaaaggagttctgcaccttcttccatacaa-gcctcaaatggtgccattccaatactagaatgataac 22377781  T
Q  441 tattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgt 540  Q
    |||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || | ||||||||| ||    
T  22377780 tattgttgtacgtgaactctattaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcttccaacgactgaatcgt 22377681  T
Q  541 cctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaat 640  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  22377680 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaaccaaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 22377581  T
Q  641 cttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22377580 ctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 22377528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 141 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 22384254 - 22383703
Alignment:
Q  141 tcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttct 240  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||| |||| |||||||| || || ||| ||||||||||||||| |||||| ||    
T  22384254 tcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcactggagtgaccctcaaaaatacatgatctgcttcctgaaactcaatatctttcct 22384155  T
Q  241 acgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 340  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| | |||||| |||||||||    
T  22384154 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctccgtagtttgtttaacaatttctggtcct 22384055  T
Q  341 aagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagc 440  Q
    || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |  |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  22384054 aaaaccacactctcacccgactcgaaccaacacaaaggagttctgcaccttcttccatacaa-gcctcaaatggtgccattccaatactagaatgataac 22383956  T
Q  441 tattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgt 540  Q
    |||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || | ||||||||| ||    
T  22383955 tattgttgtacgtgaactctattaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcttccaacgactgaatcgt 22383856  T
Q  541 cctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaat 640  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  22383855 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaaccaaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 22383756  T
Q  641 cttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22383755 ctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 22383703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 24 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 20396868 - 20396199
Alignment:
Q  24 acttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctg 123  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||  |||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||  || ||| | ||||  | |||||    
T  20396868 acttccgaagttgttacacatgaaatgcatcatgcaaattcgaaagatgcggtagtaaacccactcgatacgccactatttcaattctttctgatatctg 20396769  T
Q  124 atatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctga 223  Q
    |||  ||||||| ||  |  | ||||  ||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  20396768 atacagaccaataaatcttagagtcagtttccttgacttcaatgcacgtcctacaccggtcacaggagtgactctaaaaaatacatggtctccttcctga 20396669  T
Q  224 aactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgct 323  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||| | |||| || ||| |||||||||||||| |    
T  20396668 aactcaaggtcttttctacgcttatcatgataacacttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcgcatcaacttaaccttctcagtagtttgtt 20396569  T
Q  324 gaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattcc 423  Q
    |||| || ||| |||| || || || || || |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  20396568 gaacgatatctagtcccaaaactacactctcgcctgactcgaaccaacacaacggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaatggtgccattcc 20396469  T
Q  424 aatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcc 523  Q
    |||||||||||||||  | ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  20396468 aatactagaatgataattgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagtcgcaccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcc 20396369  T
Q  524 tctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcc 623  Q
    || | ||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | || ||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  20396368 tccaacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcagatgatacgccgaactcaaccacagcttagaacccaaagcctcttgcaaactcttcc 20396269  T
Q  624 aaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||   | |||||||| | |||||||||    
T  20396268 aaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgacacaatgctcggcaggacaccatgcaacttcacaat 20396199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 21 - 681
Target Start/End: Original strand, 20388134 - 20388794
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||| |||||||||||  || ||||  |||| |||||||||||| || || |||||||||| ||| | ||| || |||||| | ||  | ||    
T  20388134 catacttccgaaattgcgacacattaaacacatcatgcacattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgtcactgtcccaactctctcagatat 20388233  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    || |||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||   || ||||||||| |||||| |||||||||||     
T  20388234 ctaatatggaccaataaaccgtggggtcaacttcttagacttcaaagcacgaccaacacctgtcactagagtgactctcagaaacacatggtctccttct 20388333  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatca-tctgaactttctcagtagtt 319  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||   |||| | ||| |||| |  |||||     
T  20388334 tgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctacgacgctttcatcttctctcttatcaatttgacctttttt-gtagtc 20388432  T
Q  320 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 419  Q
    || ||||| || ||| |||| || || ||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||    
T  20388433 tgatgaactatatctcgtcccaacactacattttaacccgactcaaaccaacacaacggagttctgcacctccaaccatacaaagcttcgaacggtgcca 20388532  T
Q  420 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 519  Q
    | |||||||| ||||| || || || || ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||| ||    
T  20388533 tgccaatactcgaatggtaactgttgttgtacatgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaaaaa 20388632  T
Q  520 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 619  Q
    |||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||| |||||||    
T  20388633 atcctctaacgactgaatctttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttacaaactt 20388732  T
Q  620 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  20388733 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaattatcgacggaacaccatg 20388794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 224 - 691
Target Start/End: Original strand, 23949158 - 23949624
Alignment:
Q  224 aactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgct 323  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23949158 aactcaaggtccttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcatcttaactttctcagtagtttgct 23949257  T
Q  324 gaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattcc 423  Q
     ||| || |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  23949258 -aacgatttctggtcccaaaactacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagtcctacacctccgaccatatagagcttcgaaaggtgccattcc 23949356  T
Q  424 aatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcc 523  Q
    ||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||     
T  23949357 aatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtct 23949456  T
Q  524 tctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcc 623  Q
    || | ||||||||| ||  | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| ||| ||||| ||| ||||    
T  23949457 tccaacgactgaatcgttatttccgactgaccatctatctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaaacctattgcatactcttcc 23949556  T
Q  624 aaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcaca 691  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23949557 aaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgacggaacaccatgtagcttcaca 23949624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 23 - 681
Target Start/End: Original strand, 19851448 - 19852106
Alignment:
Q  23 tacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatct 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||   || ||||| ||||||||  | ||  | ||||    
T  19851448 tactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatct 19851547  T
Q  123 gatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctg 222  Q
    | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||  ||| ||||||||| |||||| || ||||| || ||    
T  19851548 ggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacaaccgtcaacggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttg 19851647  T
Q  223 aaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgc 322  Q
    |||||||||  | |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  || ||||  ||||| |      
T  19851648 aaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatattttctcttatcatcttgaccttctatgtagtctaa 19851747  T
Q  323 tgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattc 422  Q
    ||||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |    
T  19851748 tgaactaaatctggtcccaacaccacactttcacccgactcaaaccaacacaatggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggttccatac 19851847  T
Q  423 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 522  Q
    ||||||||||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  19851848 caatactagaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactataccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatc 19851947  T
Q  523 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 622  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||| |||| |||    
T  19851948 ctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgcgaactcttc 19852047  T
Q  623 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  19852048 caaaaccttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatggaacaccatg 19852106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 23 - 681
Target Start/End: Original strand, 19857484 - 19858142
Alignment:
Q  23 tacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatct 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||   || ||||| ||||||||  | ||  | ||||    
T  19857484 tactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagatatct 19857583  T
Q  123 gatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctg 222  Q
    | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||  ||| ||||||||| |||||| || ||||| || ||    
T  19857584 ggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacaaccgtcaacggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttg 19857683  T
Q  223 aaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgc 322  Q
    |||||||||  | |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  || ||||  ||||| |      
T  19857684 aaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatattttctcttatcatcttgaccttctatgtagtctaa 19857783  T
Q  323 tgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattc 422  Q
    ||||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |    
T  19857784 tgaactaaatctggtcccaacaccacactttcacccgactcaaaccaacacaatggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggttccatac 19857883  T
Q  423 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 522  Q
    ||||||||||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  19857884 caatactagaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactataccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatc 19857983  T
Q  523 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 622  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||| |||| |||    
T  19857984 ctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgcgaactcttc 19858083  T
Q  623 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  19858084 caaaaccttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatggaacaccatg 19858142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 1266274 - 1266945
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  1266274 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgaaat 1266373  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||| | ||||||| ||| || || || || |||    
T  1266374 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcagaaatacatgatcaccctcc 1266473  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||    ||||||| | ||| |||||| || |    
T  1266474 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttacctt-ctcagtcgtct 1266572  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || || |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  1266573 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaactagcacaaaggagtcctgcacctctgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 1266672  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||    
T  1266673 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaa 1266772  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||  || || || |||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || |    
T  1266773 tcctctaaagattggatcgtcctctccgaccgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaatctcaactttgaacccaaagcatcttgcaagctct 1266872  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  1266873 tccataatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctcgacggtacaccatgcagcttaacaat 1266945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 23654962 - 23655634
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||| |  |||  |||| |||| |||  | ||  | ||    
T  23654962 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccaatatatataccactgttcaaaccctctctgatat 23655061  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||  || ||||| ||     
T  23655062 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacaaatgatctccgtct 23655161  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  || ||||| ||||| |    
T  23655162 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctatcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtct 23655261  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  23655262 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactttcacccgactcaaaccagcataaaggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 23655361  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     | |||||| |||||||| || || || || |||||||| |||||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  23655362 actaatactcgaatgataactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactgtcccaggctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaa 23655461  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||  || || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||| ||||| || ||||||||||| |    
T  23655462 tcctctaatgattggatcgtcctctctgactgaccatctgtctgcggatgataacccgaactcaacctcaactccgaacccaaggcgtcttgcaaactct 23655561  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| | |||||||||    
T  23655562 tccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgcaacttcacaat 23655634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 31417220 - 31416548
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||| | |||| ||| ||||| ||||||||  ||||  ||||    
T  31417220 catacttccgtagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaagcaactctatatgccactgttccaaccctttctgaaat 31417121  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    || ||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||| || | ||||||| ||| || || || || |||    
T  31417120 ctaatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataagagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcc 31417021  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttca--ttttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 318  Q
    |||||||||||  | ||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| |||  |||||||  ||||||||||||||    
T  31417020 tgaaactcaagggcctttatccgcttatcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcaccttttccctt--atcatcttgactttctcagtagt 31416923  T
Q  319 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcc 418  Q
     || || || |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  31416922 ctgatgcactaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcatgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgcc 31416823  T
Q  419 attccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaaca 518  Q
    || | |||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  31416822 atactaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaaca 31416723  T
Q  519 aatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaact 618  Q
    ||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  31416722 aatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaact 31416623  T
Q  619 tttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
     ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  31416622 cttccagaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtactccatgtagcttcacaat 31416548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 22062179 - 22061507
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  22062179 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaaccctctctgatat 22062080  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
     ||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||| |||||||||| ||||||||| | || |||| |||||| || || || |||    
T  22062079 ttgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcc 22061980  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  22061979 tgaaactcaagagcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttttctgatcatcttgactttctctgtagtct 22061880  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  22061879 catgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagctttgaacggtgccat 22061780  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||    
T  22061779 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttcctcaagcacacacactctcaacaaa 22061680  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    | ||| |  || || || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||| ||| |    
T  22061679 tactccaatgattggatcgtcctcttcgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcagactct 22061580  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||| || |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  22061579 tccagaacctagaagtgaaccttggatccctatccgacacaatactcgacggaactccatgtagtttcacaat 22061507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 29304172 - 29303500
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||||||||| ||||||| | | ||  ||||    
T  29304172 catacttcctaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccactgttccaattctctctgaaat 29304073  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||| |||| ||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  29304072 ctgatacggacctatgatctttggagtcaacttccttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcattggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 29303973  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcat-ctgaactttctcagtagtt 319  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||    ||||| |||| |||||||||||||     
T  29303972 tgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcattctga-ctttctcagtagtc 29303874  T
Q  320 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 419  Q
    |  ||||| |  || ||||| || || || || |||||||||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  29303873 tcatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctcacctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgcca 29303774  T
Q  420 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 519  Q
    | || ||||| ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| || || |||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  || |||||    
T  29303773 tacctatactcgaatgatagttgttgttataagtgaactctatcaacggtaggtggctatcccaagctccaccttgctcaagtacacacacccttaacaa 29303674  T
Q  520 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 619  Q
    ||| || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| || || |||||     
T  29303673 atcatccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacctcgaacccaaagcgtcctgtaaactc 29303574  T
Q  620 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29303573 ttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaaccccatgtagcttcacaat 29303500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 20010646 - 20009974
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  20010646 catacttccgaagttgcgacacgtgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatat 20010547  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||| |||||| || ||||| ||     
T  20010546 ctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacccacacccgtcatcggagtgactctcagaaacacatgatctccctct 20010447  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | ||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||| || |||||  |||| |    
T  20010446 tgaaactcaagcgccttcttacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatctggaccttctctatagtct 20010347  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  |||||||| || | ||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  20010346 gatgaactaaatctggtcccaacaacacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtcctacacctccgaccatacaaagtttcgaacggtgccat 20010247  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  20010246 accaatacttgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaa 20010147  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||  || ||||| || ||||| || ||||| ||||| |    
T  20010146 tcctctaacgactgaatcgttctctccgaatgaccatctgcctgcggatgataagccgaactcacccttaactttgaacccaaggcatcttgtaaactct 20010047  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||| || ||||| || ||   || |||||| || ||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  20010046 tccaaaaccttgaagtgaacctgaaatttctatccgacacaatactcgatggaacaccatgcaacttcacaat 20009974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 21 - 690
Target Start/End: Original strand, 14565177 - 14565846
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || | || |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  14565177 catacttccgaagctgagaaacatgaaacaaatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaat 14565276  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  14565277 ctgatatggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 14565376  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| || ||    |||| |   |||||||||||||| |    
T  14565377 tgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtct 14565476  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      ||||| |  || ||||| || || |  |||||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  14565477 cgtgaaccaaatccggtcccaacacaatactttcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 14565576  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  14565577 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaa 14565676  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || || |  || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  14565677 tcttccaatgattgaattgtcctttccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactct 14565776  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 690  Q
    |||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  14565777 tccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcac 14565846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 21840452 - 21841124
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||| || || |||| |||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  21840452 catacttccgaagttgcgacacgtggaatacatcatgcaaatttgaaagatgtggtggcaaactcactctgtatgccactgttccaaccctctcagatat 21840551  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||  |||| ||||||||| || |||||| | ||||| | |||||| || ||||| ||     
T  21840552 ctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcagtgcacctcctacacctgttataggagtaactcttagaaacacatgatctccctct 21840651  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || || |||   |||||||  || ||||| ||||| |    
T  21840652 tgaaactcaagtgccttccttcgcttgtcatggtaactattctgtcgactctgcgacgcttttatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtct 21840751  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21840752 gatgaactaaatctggtcccaacaccacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggggtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 21840851  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  21840852 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaattctatcaacgatagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaa 21840951  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||  || ||||| || |||||||||||||||| ||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||  ||||| |    
T  21840952 tcctctaatgattgaatcgttctctccgactgaccatttgtttgcagatgatgagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttttaaactct 21841051  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  21841052 tccaaaatcttgaagtgaacctcggatctctatctgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaat 21841124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 21 - 690
Target Start/End: Original strand, 6679146 - 6679815
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||||| | ||  ||||    
T  6679146 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaactctctctgaaat 6679245  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  6679246 ctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 6679345  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||   |||| |   |||||||||||||| |    
T  6679346 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 6679445  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  6679446 catgaaccaaatccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 6679545  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  6679546 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaa 6679645  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| || || || |||||||    
T  6679646 tcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttt 6679745  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 690  Q
    |||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  6679746 tccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 6679815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 21 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 31571588 - 31570917
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||| || || || || |||| ||| ||||||||||| | | | ||  ||||    
T  31571588 catacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttcctattctctctgaaat 31571489  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||| ||| || || || || ||     
T  31571488 ctgatacgggccaatgaatttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactctcagaaatacatgatcaccctct 31571389  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||  ||||| || ||||| |    
T  31571388 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtct 31571289  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
     |||||| |  || ||||| |  || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  31571288 cctgaaccaaatccggtcccagcacaacactttctcctgactcgaaccaacacaacggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaatggtgccat 31571189  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | |||||||||     
T  31571188 tcctatactcgaatgataactattgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaag 31571089  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || || |  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  31571088 tcttccaatgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactct 31570989  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 692  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31570988 tccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 31570917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 21 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 804419 - 803750
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||| | | ||  ||||    
T  804419 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaattctctctgaaat 804320  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  804319 ctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 804220  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| || ||    |||| |   ||||||| |||||| |    
T  804219 tgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttcttagtagtct 804120  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  804119 cgtgaaccaaatccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 804020  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||    
T  804019 accaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggtaagtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaa 803920  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |    
T  803919 tcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccaaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactct 803820  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 690  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  803819 tccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 803750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 21 - 690
Target Start/End: Original strand, 6603693 - 6604362
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||| | | ||  ||||    
T  6603693 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaattctctctgaaat 6603792  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
     ||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||| || || ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  6603793 ttgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 6603892  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||   |||| |   |||||||||||||| |    
T  6603893 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 6603992  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      ||||| |  || ||||| || || || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  6603993 catgaaccaaatccggtcccaacacaacactctcacccgactcaaaccaacacaaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 6604092  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| || |||||||| || ||||| || ||||| ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||    
T  6604093 accaatactcgagtgatagctgttgttatacgtaaactcaatcaaaggtaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaa 6604192  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || |||||||    
T  6604193 tcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttt 6604292  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 690  Q
    |||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  6604293 tccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 6604362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 21 - 690
Target Start/End: Original strand, 12304793 - 12305462
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||| ||||  | ||  ||||    
T  12304793 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtttcaaccctctctgaaat 12304892  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||  | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||| |||| || | ||| || || || || |||    
T  12304893 ctgatacggaccgatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctaagaaaaacatgatcaccctcc 12304992  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    |||| |   |||||||||||||| |    
T  12304993 tgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctgactttctcagtagtct 12305092  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      ||||| |  || ||||| || ||  | || ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  12305093 catgaaccaagtccggtcccaacacagcactctcacccgactcaaaccagcataaaggggtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 12305192  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||    
T  12305193 accaatgctcgagtgatagctgttgttataagtgaactcaatcaatggcatgtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaa 12305292  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |  || || ||||| |    
T  12305293 tcttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaatgtgtcctgtaaactct 12305392  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 690  Q
    |||| ||  ||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  12305393 tccagaacatagaagtgaacctcggatccctatctgacacaatgctcgacggaacaccatgaagcttcac 12305462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 131 - 692
Target Start/End: Original strand, 22051008 - 22051569
Alignment:
Q  131 ccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaa 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||| ||||||| || || || || || ||||||||||    
T  22051008 ccaatgaacttcggagtcaacttccttgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactttcaaaaatacatgatcaccctcttgaaactcaa 22051107  T
Q  231 gatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaat 330  Q
    |  | || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||    |||||||  || ||||| || || || ||||| |     
T  22051108 gggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctctgtcgtctgttgaaccaa 22051207  T
Q  331 ctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatacta 430  Q
     |||||||| || || || || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||     
T  22051208 atctggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataacggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccatacctatactc 22051307  T
Q  431 gaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcg 530  Q
    ||||| || || || || || |||||||| || || || || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||| |||||| | ||    
T  22051308 gaatggtaactgttgttgtaggtgaactctataaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacagatcctccaacg 22051407  T
Q  531 actgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatct 630  Q
    | || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| || ||    
T  22051408 attggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaatctcaacttggaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacct 22051507  T
Q  631 agaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 692  Q
    ||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  22051508 agaggtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatttagcttcacaa 22051569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 356 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 20976062 - 20975725
Alignment:
Q  356 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 455  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||    
T  20976062 cctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtga 20975963  T
Q  456 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 555  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||||||||||||||||    
T  20975962 actctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctaaagtacacacactctcagtaaatcctccaatgattgtatcgtcctctccgactgacc 20975863  T
Q  556 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 655  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||| ||||    
T  20975862 atctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcatgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctccatct 20975763  T
Q  656 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  20975762 gacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 20975725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 293
Target Start/End: Original strand, 22032067 - 22032339
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||| |||| ||||| ||||| | ||    
T  22032067 catacttccgaagttgcgaaacatggaaaacatcgtgtaaattcgaaagatgcggtggtaatcctactcgatacgccaacgtttcaactctttccgatat 22032166  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||   |||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22032167 ctgatacaaaccaataaatctcggagtcaatttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccatcc 22032266  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctt 293  Q
    | |||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22032267 taaaactcaagatccttcctacgtttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctctt 22032339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 353 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 16271638 - 16271301
Alignment:
Q  353 tcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataag 452  Q
    ||||| ||| |||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  16271638 tcacccgacgcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccataccaatactcgagtgatagctgttgttataag 16271539  T
Q  453 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 552  Q
    |||| || ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||    
T  16271538 tgaattcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctctccgactg 16271439  T
Q  553 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 652  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| |||    
T  16271438 accatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccataacctagaagtgaacctcggatcccta 16271339  T
Q  653 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 690  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16271338 tccgacacaatgctcgacggaacaccatgaagcttcac 16271301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 21682217 - 21681856
Alignment:
Q  20 tcatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||  | ||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | |    
T  21682217 tcatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcattcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagata 21682118  T
Q  120 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttc 219  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| || ||||| ||    
T  21682117 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctc 21682018  T
Q  220 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 319  Q
     |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||   |||||||  |||||||| |||||     
T  21682017 ttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtc 21681918  T
Q  320 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagt 381  Q
    || ||||| |  |||||||| || || || || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  21681917 tgatgaaccaaatctggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagt 21681856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 399
Target Start/End: Original strand, 20007885 - 20008263
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| ||  | |||||||||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  20007885 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtagcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatat 20007984  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| ||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| || ||||| ||     
T  20007985 ctgatatggaccaatgaactttggagtcaccttgttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctct 20008084  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    || ||||||||  | || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||   |||||||  || ||||| ||||| |    
T  20008085 tggaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactatgcgacgctttcatcttttctcttatcatctttaccttctccgtagtct 20008184  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccata 399  Q
    | ||||| |  |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||  |||| |||||||||||    
T  20008185 gatgaaccaaatctggtcccaacaccacactttctcccgactcaaaccaacataaaggagtcatgcacctccgaccata 20008263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 21325156 - 21324804
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaa-gatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||| |||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | |   | |    
T  21325156 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaatgatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctatgata 21325057  T
Q  120 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttc 219  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || || || || ||    
T  21325056 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctc 21324957  T
Q  220 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 319  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||   |||||||  |||||||| |||||     
T  21324956 ctgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgttttcatcttttctcttatcatcttgactttctctgtagtc 21324857  T
Q  320 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagca 372  Q
    || ||||| |  || ||||| || ||||| || || |||||||||||||||||    
T  21324856 tgatgaaccaaatccggtcccaacaccacactatctcctgactcaaaccagca 21324804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 23948924 - 23949162
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| | || | ||||  | ||    
T  23948924 catacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgctacgccaccgtactaattctttctgatat 23949023  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||     
T  23949024 ctgatacggaccaacaaacctcggagtcaacttctttgatttcaaagcacgtctaaaaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttct 23949123  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactc 259  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||| |||||||    
T  23949124 tgaaactcaaggtccttcctacgcttatcataataactc 23949162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Original strand, 15441216 - 15441420
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |  || ||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  15441216 catacttacgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaatcaaacacgatacgccaccgttccaactctttccgatat 15441315  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||| |||||     
T  15441316 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagccacaggagtgactctcaaaaacatgtggtcaccttct 15441415  T
Q  221 tgaaa 225  Q
    |||||    
T  15441416 tgaaa 15441420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 417 - 693
Target Start/End: Original strand, 22371371 - 22371647
Alignment:
Q  417 ccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaa 516  Q
    |||| |||||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| || ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||| |||||||     
T  22371371 ccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaaatctatcaacggtaggtgactatcccaagctccacgttgctcaagtacacacattctcag 22371470  T
Q  517 caaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaa 616  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||| |||||||| || ||||| || |||||||||    
T  22371471 caaatcctctaacgactgaatcgttctctccgactcaccatctgtttgcggattataagccgaacccaacctcaactttgaacccaacgcatcttgcaaa 22371570  T
Q  617 cttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    || |||||||| || |||||||| || ||||||||||  || ||||| ||||| ||||  ||||| | |||||||||    
T  22371571 ctcttccaaaaccttgaagtaaacctcggatctctattcgacacaatactcgatggaagcccatgaaacttcacaat 22371647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 473 - 690
Target Start/End: Original strand, 27355035 - 27355252
Alignment:
Q  473 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 572  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  27355035 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatccgtttgaggatgat 27355134  T
Q  573 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 672  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  27355135 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 27355234  T
Q  673 aacaccatgtagcttcac 690  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  27355235 aacaccatgaagcttcac 27355252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 146 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 16877716 - 16877181
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| ||||  ||| | || ||||| ||||| || |||||  |||||||||||| ||| || || | ||    
T  16877716 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccgacaccggtcaccggattcaccctcaagaacacatgatctccaacctgaaactcaatatccttcctcctct 16877617  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 345  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  16877616 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 16877517  T
Q  346 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 445  Q
      | || || || ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| | || ||     
T  16877516 agcactctctccggactcaaaccaacataacggtgtcctgcacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 16877417  T
Q  446 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 545  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  16877416 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 16877317  T
Q  546 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 645  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |  ||||||||  ||||||||| || ||||||  |||||||||| || ||    
T  16877316 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatcttaacttagttcccaaagcagcttgcaaaccttcccaaaacttagaagtaaacctcgg 16877217  T
Q  646 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  16877216 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 16877181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 159 - 681
Target Start/End: Original strand, 22315364 - 22315886
Alignment:
Q  159 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 258  Q
    ||||||||||||| |||||||| || | |||| | |||||||||||||| || || ||  ||||||||||||  || || || | ||| |||||||||||    
T  22315364 acttcaaagcacgacctacaccggttacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataact 22315463  T
Q  259 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 358  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  |||||||  || |||||||        |||||||||    
T  22315464 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttctgtagtttcttgaacaacttccggtcctacccaagaactttcacct 22315563  T
Q  359 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 458  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||| || || | ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | || || |||||||| ||||    
T  22315564 gactcataccaacacaatggcgttctacaccttctaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagaatgaaaactgttgttataagtaaact 22315663  T
Q  459 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 558  Q
    | |||||||| |||     | ||||| |  | |||||||| | |||||||  ||| |||||||| || |    || ||| |||||||||| ||| |||||    
T  22315664 caatcaacggtagacattcaacccaactgacaccttgctccaaaacacaagctcttaacaaatcttccaaactctaaatagtcctctccgtctgcccatc 22315763  T
Q  559 tgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 658  Q
      |||| |||||||| || | |||||| |||||||| |  ||||||||   ||||||||||| |||||| ||| ||||||| || ||||| | ||| ||     
T  22315764 actctggggatgataagcaggactcaacctcaacttagttcccaaagcagtttgcaaactttcccaaaacctaaaagtaaacctcggatcccgatccgac 22315863  T
Q  659 acaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||||| || ||||||| ||||||    
T  22315864 acaatactggaaggaataccatg 22315886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 146 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 21197123 - 21196588
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||| |  ||||||||| ||| || || ||||| | |||| | |||||||||||||| || || ||| |||||||||||| ||| ||||| | ||    
T  21197123 gtcaacttcctacacttcaaagtacgaccaactccagttacaggattcactctcaaaaacacatgatcacctacctgaaactcaatatcctttctcctct 21197024  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 345  Q
    | |||||||||||| | || | |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |   |||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  21197023 tatcatgataactcctctgccaactctgagacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttttacatagtctcttgcacaacttccggtcctaacaa 21196924  T
Q  346 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 445  Q
      | ||||| || || |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | || ||     
T  21196923 agcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccaatactagaatgaaaactgttg 21196824  T
Q  446 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 545  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |    |||||||| | |||||||  |||||||||||||||||    || ||| |||||||    
T  21196823 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgataccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctctaaactctaaatagtcctct 21196724  T
Q  546 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 645  Q
      | ||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |   |||||||   |||||| || | ||||||  |||||||||| || ||    
T  21196723 atgtctgcccatcggtctggggatgataagcagaactcaatctcaacttagtttccaaagcagtttgcaagctctcccaaaacgtagaagtaaacctcgg 21196624  T
Q  646 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||  | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  21196623 attccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 21196588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16265364 - 16265127
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  16265364 catacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgaaat 16265265  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  16265264 ctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacatccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaagacatgatcaccctcc 16265165  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 258  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  16265164 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaact 16265127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 575 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 22129132 - 22129005
Alignment:
Q  575 gccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 674  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22129132 gccgaactcaacctcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaattaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaa 22129033  T
Q  675 caccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
     |||||| | | |||| || ||||||||    
T  22129032 taccatgcaacctcacgatctccttgat 22129005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 146 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 21850958 - 21850423
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||| |  |||||||| |||| || ||||| |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||  | | ||    
T  21850958 gtcaacttcctacacttcaaatcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcatcctct 21850859  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 345  Q
    | |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || || ||||| |     
T  21850858 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggccctaacaa 21850759  T
Q  346 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 445  Q
      | || || || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||| |||| | || ||     
T  21850758 agcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtaccattccgatactagcatgaaaactgttg 21850659  T
Q  446 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 545  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  21850658 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 21850559  T
Q  546 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 645  Q
    ||| ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  21850558 ccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 21850459  T
Q  646 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  21850458 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 21850423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 146 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 20652954 - 20652635
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||| | || | ||||||||||| || || || ||  | |||||||| | ||| ||||| | ||    
T  20652954 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcactctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactctatatcctttctcctct 20652855  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 345  Q
    | | |||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |  || || | ||| |||||||| |     
T  20652854 tataatgataactcttctgtccactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttctccgtagtctcttgcaccacctccggtcctaacaa 20652755  T
Q  346 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 445  Q
      | ||||| || |||| |||||| |||||||| || || || |||| ||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | |||||     
T  20652754 ggcactttctccggacttaaaccaacacaacggtgtcctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactattg 20652655  T
Q  446 ttataagtgaactcgatcaa 465  Q
    || ||||| ||||| |||||    
T  20652654 ttgtaagtaaactcaatcaa 20652635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 146 - 681
Target Start/End: Original strand, 22982596 - 22983128
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||||   ||||||||||||| || |||||| ||| | || | ||||| |||||| | || || ||  |||||||||||| ||||||||  |  |    
T  22982596 gtcaacttctgacacttcaaagcacgaccaacaccaatcacatgattcactctaaaaaacgcatgatcaccaacctgaaactcaatatcttttcaccttt 22982695  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 345  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| || || ||||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||| |  || ||||  || ||| |||  ||    
T  22982696 tatcatgataactcttctgtctactctgagatgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttccatagtctcttgcacaacttccggttcta--ac 22982793  T
Q  346 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 445  Q
     |  |  |||| |||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || | |||||||||| |  | ||     
T  22982794 aaagcactcacttgactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgacactagaatgaaaattgttg 22982893  T
Q  446 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 545  Q
    || ||||| ||||| |||||||| |||    | |||||| |  | |||||||| |  ||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  22982894 ttgtaagtaaactcaatcaacggtagacatttgtcccaactgacaccttgctccaagacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 22982993  T
Q  546 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 645  Q
    | |  || ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  ||||| |||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  22982994 ctgtttgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgc-aactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 22983092  T
Q  646 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  22983093 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 22983128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 261
Target Start/End: Original strand, 28982392 - 28982632
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||| |||||||| || || ||||| || || | |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||| | | ||  ||||    
T  28982392 catatttccgaagctgagaaacatgaaacacgtcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaattctctctgaaat 28982491  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| || ||||| ||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||  ||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  28982492 ctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaacggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 28982591  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactctt 261  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28982592 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 28982632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 261
Target Start/End: Original strand, 28987612 - 28987852
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||| |||||||| || || ||||| || || | |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| || |||| | | ||  ||||    
T  28987612 catatttccgaagctgagaaacatgaaacacgtcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgtaccaattctctctgaaat 28987711  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| || ||||| ||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||  ||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  28987712 ctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaacggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 28987811  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactctt 261  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28987812 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 28987852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 350 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 23157428 - 23157098
Alignment:
Q  350 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 449  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||| ||| || |||||||||||| | || || || |    
T  23157428 ctttcacctgattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaatggtgtcataccgatactagaatgaaaactgttgttgt 23157329  T
Q  450 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 549  Q
    |||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    ||||||  || ||||||     
T  23157328 aagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactaacaccttgctcca-aacacaagttctcaacaaatcctctaaactctgaataatcttctccgt 23157230  T
Q  550 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 649  Q
    | | ||||| ||||| || ||||| |  |||||||||||| |||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || | |||     
T  23157229 cggcccatcagtctgggggtgataagtagaactcaatctctacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcgaatcc 23157130  T
Q  650 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  23157129 cgatccgacacaatactagaaggaataccatg 23157098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 196
Target Start/End: Original strand, 27347261 - 27347436
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || |||| |||||| ||||||||||| || |  ||||| |||  ||| ||||| || |||||  | ||  ||||    
T  27347261 catacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtgccaaaccaactttatatgccactgtcccaaccctctctgaaat 27347360  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgact 196  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||    
T  27347361 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgact 27347436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 656 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 19484175 - 19484130
Alignment:
Q  656 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 701  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19484175 gatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctccttga 19484130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 532 - 681
Target Start/End: Original strand, 23900822 - 23900971
Alignment:
Q  532 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 631  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||  |||||||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  ||    
T  23900822 ctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctggggatgataagtagaactcagcctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacata 23900921  T
Q  632 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    |||||||| ||  |||| | |||||| |||||  | ||||||| ||||||    
T  23900922 gaagtaaacctcagatcccgatctgacacaatattagaaggaataccatg 23900971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 569 - 695
Target Start/End: Original strand, 19863639 - 19863765
Alignment:
Q  569 tgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcg 668  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||| |  ||||||||   ||||||||||  |||||| || || || || |||||||||||||| || ||||| ||||    
T  19863639 tgatatgcagaactcagttttaacttagtacccaaagcactttgcaaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatactcg 19863738  T
Q  669 aaggaacaccatgtagcttcacaattt 695  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||    
T  19863739 aaggaacaccatgcaacttcactattt 19863765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 569 - 695
Target Start/End: Original strand, 19868276 - 19868402
Alignment:
Q  569 tgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcg 668  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||| |  ||||||||   ||||||||||  |||||| || || || || |||||||||||||| || ||||| ||||    
T  19868276 tgatatgcagaactcagttttaacttagtacccaaagcactttgcaaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatactcg 19868375  T
Q  669 aaggaacaccatgtagcttcacaattt 695  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||    
T  19868376 aaggaacaccatgcaacttcactattt 19868402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 435
Target Start/End: Original strand, 19863223 - 19863506
Alignment:
Q  152 ttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcat 251  Q
    ||||| |||||||||||||| || || || ||||  ||| ||||||| ||||| || || || |||||||||||||| |    ||| || |  || ||||    
T  19863223 ttcttagacttcaaagcacgcccaacgcccgtcaccggagtgactcttaaaaatacatgatcgccttcctgaaactccaatgatttccttcttttatcat 19863322  T
Q  252 gataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactct 351  Q
    |||| ||||| |||| ||| || || || |||||| ||||| | ||||| |  || || || || || |||||||||||||| ||||| || ||  |  |    
T  19863323 gatagctcttctgtctactttgtgatgctttcattctctctcgaatcattttgaccttttcggtcgtctgctgaacaatctccggtcccaacactgcaat 19863422  T
Q  352 ttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatg 435  Q
     || || |||||  |||| ||||| || ||||  ||||||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  19863423 ctcgccagactcgtaccaacacaaaggtgttcgacatctcctaccatacaacgcctcaaatggtgccatcccaatactagaatg 19863506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 435
Target Start/End: Original strand, 19867860 - 19868143
Alignment:
Q  152 ttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcat 251  Q
    ||||| |||||||||||||| || || || ||||  ||| ||||||| ||||| || || || |||||||||||||| |    ||| || |  || ||||    
T  19867860 ttcttagacttcaaagcacgcccaacgcccgtcaccggagtgactcttaaaaatacatgatcgccttcctgaaactccaatgatttccttcttttatcat 19867959  T
Q  252 gataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactct 351  Q
    |||| ||||| |||| ||| || || || |||||| ||||| | ||||| |  || || || || || |||||||||||||| ||||| || ||  |  |    
T  19867960 gatagctcttctgtctactttgtgatgctttcattctctctcgaatcattttgaccttttcggtcgtctgctgaacaatctccggtcccaacactgcaat 19868059  T
Q  352 ttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatg 435  Q
     || || |||||  |||| ||||| || ||||  ||||||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  19868060 ctcgccagactcgtaccaacacaaaggtgttcgacatctcctaccatacaacgcctcaaatggtgccatcccaatactagaatg 19868143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 558; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Original strand, 414 - 1095
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  414 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaagccactgttccaactctttccaatat 513  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  514 ctgatacggaccaatgaatttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 613  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  614 tgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcgttttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 713  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  714 gctgaacaatctctggtcctaagaccgctctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaacggtgtcat 813  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  814 tccaatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagtccctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 913  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  914 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgatcatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 1013  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||    
T  1014 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatccccttgat 1095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 556; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 556; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 704
Target Start/End: Original strand, 43154 - 43837
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  43154 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcagtatgccaccgttccaactctttccaatat 43253  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43254 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgccctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcc 43353  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  43354 tgaaactcaagatcttttctgcacttatcatggtaactcttttgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 43453  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  43454 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaacatataaagcctcgaaaggtgccat 43553  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43554 tccaatactagaatgatagctattattgtaagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagctcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 43653  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43654 tcctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 43753  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgatgt 704  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||    
T  43754 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatgt 43837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 508; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Original strand, 8485 - 9155
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  8485 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaaacccactcggtaagccacccttccaactctttccaatat 8584  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8585 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcc 8684  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    | ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  8685 taaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtct 8784  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8785 gctgaacaatctccggtcctaagaccactctttcacctaactcgaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 8884  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||    
T  8885 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaac-----------acaaa 8973  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8974 tcctccagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 9073  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  9074 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 9155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 315 - 702
Target Start/End: Original strand, 15241 - 15617
Alignment:
Q  315 tagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaagg 414  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15241 tagtctgctgaacaatctccggtcctaagaccactctttcacctgactcgaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaagg 15340  T
Q  415 tgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctc 514  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  15341 tgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaac---------- 15430  T
Q  515 aacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgca 614  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15431 -acaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgatcccaaagcctcttgca 15529  T
Q  615 aacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  15530 aacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 15617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 56 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 50785 - 50148
Alignment:
Q  56 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 155  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| | ||||||||| || || ||| | ||  | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  50785 tgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttct 50686  T
Q  156 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 255  Q
    | || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| || || |||||||||| |||| |    
T  50685 tagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgttatgaca 50586  T
Q  256 actcttttgtcgactctgcgacgccttcatt--ttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactcttt 353  Q
     ||||| ||||||||||||||||| |||||   |||||||  || | || ||| || || |||||||| ||||| || |||||||| || | ||| ||||    
T  50585 gctcttctgtcgactctgcgacgctttcatccgttctctt--attaacttaaccttttccgtagtttgttgaactatgtctggtcccaacatcacacttt 50488  T
Q  354 cacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagt 453  Q
    | || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |||||    
T  50487 cccccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaccatacaaggcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtaagt 50388  T
Q  454 gaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactga 553  Q
     ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| | ||||| ||  || || || || ||||||||||||    
T  50387 aaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaatagatcctttaaggattgtatcgttctctccgactga 50288  T
Q  554 ccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctat 653  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||    
T  50287 ccatccgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgagcccaaagcatcttggaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctat 50188  T
Q  654 ctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
     ||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  50187 ttgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 50148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 187 - 318
Target Start/End: Original strand, 13832 - 13963
Alignment:
Q  187 aggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatt 286  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13832 aggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatt 13931  T
Q  287 ttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 318  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  13932 ttctcttgaatcatctgaactttcttagtagt 13963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 146 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 106754 - 106226
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||| |  |||| |||||| | || ||||| |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  106754 gtcaacttcctacactttaaagcaggaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 106655  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 345  Q
    | ||||||||| |||| |||| |||||| || || ||||| ||||| || ||||||  ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  106654 tatcatgataaatcttatgtctactctgagatgctttcatcttctcctgaatcatcctaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 106555  T
Q  346 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 445  Q
      | ||||| |  || |||||||| |||||||| || || || |||| ||||||||||||||| || || ||||| || |||||||||||| | || ||     
T  106554 agcactttctctggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccaaccatacaaagcctcaaacggagccataccgatactagaatgaaaactgttg 106455  T
Q  446 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 545  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |    ||||| || |  ||||||  ||||||||||||||| |    ||| || |||||||    
T  106454 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgataccttgttccaacacacaagctctcaacaaatcctccaaactctggatagtcctct 106355  T
Q  546 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 645  Q
     || ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||| ||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  106354 tcgtctgcccatcggtctggggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcagactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 106255  T
Q  646 atctctatctgatacaatgctcgaaggaa 674  Q
    ||| | |||||| ||||| || |||||||    
T  106254 atcccgatctgacacaatactagaaggaa 106226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 554; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 554; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Original strand, 620 - 1301
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  620 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccacttggtaagccaccgttccaactctttccaatat 719  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  720 ttgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 819  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |    
T  820 tgaaactcaagatcttttctacgcttatggtgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttcttactagtct 919  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  920 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 1019  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1020 tccaatactttaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcctaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 1119  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1120 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaattcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 1219  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||    
T  1220 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgat 1301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 506; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Original strand, 14360 - 15041
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  14360 catacttccgaagtttcgacacatggaagacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccacccgatacgccaccgttccaactctttccgatat 14459  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14460 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtatccttcc 14559  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  14560 tgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 14659  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14660 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacttgactcaaaccaacacaacggagttctacatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 14759  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14760 tccaatactagaatgatgactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 14859  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  14860 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcaaacccaaagcctcttgcaaacttt 14959  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||    
T  14960 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaaccccatgtaacctcacaatctccttgat 15041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 544; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 544; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Original strand, 6937 - 7620
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaaga-tgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaa 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  6937 catactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagaatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaata 7036  T
Q  120 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaa-acacgtggtctcctt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  7037 tctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaaacacgtggtctcctt 7136  T
Q  219 cctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 318  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  7137 cttgaaactcaagatcttttccacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttagatcatctgaaccttctcagtagt 7236  T
Q  319 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcc 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7237 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctacatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgcc 7336  T
Q  419 attccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaaca 518  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  7337 attccaatacttgaatgataactattattatatgtgaactcgattaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcgagaacacaaatcctcaaca 7436  T
Q  519 aatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaact 618  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7437 aatcctccagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaact 7536  T
Q  619 tttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||    
T  7537 tttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgat 7620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 508; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 508; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Original strand, 7377 - 8047
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  7377 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaaacccactcgctaagccaccgttccaactctctccaatat 7476  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7477 ctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcc 7576  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  7577 tgaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtct 7676  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7677 gttgaacagtctccggtcctaagaccactctttcacctgactcgaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccat 7776  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||    
T  7777 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaac-----------acaaa 7865  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7866 tcctctagcgactgaattgtcctctccgcctgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 7965  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  7966 tccaaaatctagaagtaaatcttggacctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgat 8047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 506; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 506; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Original strand, 65405 - 66086
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||    
T  65405 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgataagccaccgttccaactctttctgatat 65504  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  65505 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacgccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 65604  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  65605 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 65704  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  65705 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 65804  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  65805 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcttccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 65904  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  65905 tcttctagcgactgaattgtcctttctaactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaatttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 66004  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||    
T  66005 tccaaaatctagaagtaaatcttggatccctatctgatacaatactcgaaggaacaccatgtaacctcacgatctccttgat 66086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 240 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 39906 - 39466
Alignment:
Q  240 tacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcc 339  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39906 tacgcttatcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcc 39807  T
Q  340 taagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatag 439  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  39806 taagaccactttttcacctgattcaaaccaacacgacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtaccattccaatactagaatgataa 39707  T
Q  440 ctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattg 539  Q
    || ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39706 ctgttattgtatgtgaaatctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcg 39607  T
Q  540 tcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 639  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39606 tcctctccgactga-catctgtctgtggatgatacgccgaactcaatcttaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttcgaaaatctagaagtaaa 39508  T
Q  640 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39507 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 39466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 40095 - 39926
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  40095 catacttccgaagttgtgacacatgaaagacatcatgcaagttcgaaagatgcggtggtaatccaactcaatacgccaccgttccaactctttcccatat 39996  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagga 190  Q
    | |||| |||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  39995 ccgatacggaccaataaatctcggagtcaaattctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacagga 39926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 486; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 486; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 33879 - 33198
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| | | ||    
T  33879 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtagtaatcccactcgatacgccactgttccaactcttttcgatat 33780  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  33779 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacatgagtgactttcaataacacgtggtctccttcc 33680  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |    
T  33679 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtct 33580  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  33579 gttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaatggagttctgcatctccaaccatacaaagcttcaaaaggtgccat 33480  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33479 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 33380  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || ||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33379 tcttctagcgactgaattttcgtttccggctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 33280  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||||| ||||||||    
T  33279 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaattctcgaaggaacaccatgcaatctcacaatctccttgat 33198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 482; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Original strand, 8596 - 9277
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| | | ||    
T  8596 catacttccaaagttgcgacacatggaaaacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccactgttccaactcttttcgatat 8695  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||| |||| |||||||||||||||||     
T  8696 ctgatacggaccaataaatctcggagttaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaagagtgactttcaataacacgtggtctccttct 8795  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |    
T  8796 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtct 8895  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  8896 gttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaatggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcaaaaggtgccat 8995  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8996 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 9095  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9096 tcttctagcgactgaattttcgtttccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 9195  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||||| ||||||||    
T  9196 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaattctcgaaggaacaccatgcaatctcacaatctccttgat 9277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 482; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 482; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 4711 - 4030
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| | | ||    
T  4711 catacttccaaagttgcgacacatggaaaacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccactgttccaactcttttcgatat 4612  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||| |||| |||||||||||||||||     
T  4611 ctgatacggaccaataaatctcggagttaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacaagagtgactttcaataacacgtggtctccttct 4512  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |    
T  4511 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtct 4412  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  4411 gttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaatggagttctgcatctccgaccatacaaagcttcaaaaggtgccat 4312  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4311 tccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 4212  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4211 tcttctagcgactgaattttcgtttccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttt 4112  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||||| ||||||||    
T  4111 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaattctcgaaggaacaccatgcaatctcacaatctccttgat 4030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 467; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 467; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 279136 - 278458
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  279136 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 279037  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||| || ||  |||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  279036 ctgatacggacctataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcttgtcccacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 278937  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  278936 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 278837  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  278836 gctgaacaatctcttgtcctaggaccactctttctcctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccat 278737  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  278736 tccaatactagaatgataactattattgtatgcgaactcaatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaa 278637  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || || |||||||||||||| |    
T  278636 tcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaatttagaaccgaaggcctcttgcaaactct 278537  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 699  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  278536 tccaaaacctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 278458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 21 - 343
Target Start/End: Original strand, 308659 - 308981
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  308659 catactttcgaagttacgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatat 308758  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  308759 ctgatacggaccaataaactttggggttaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 308858  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  308859 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatccgaactttctcagtagtct 308958  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaag 343  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  308959 gctgaacaatctctggtcctaag 308981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 21 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 165015 - 164538
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  | ||    
T  165015 catacttccgaagttgcgacatatgaaacacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtgaacccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatat 164916  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  164915 ctgatacggaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttct 164816  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  164815 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 164716  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| || |||||||| || |  || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| |||    
T  164715 gttgaacgatttctggtcccaaaaatacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagttctgcaccttcgaccatacagagcctcaaaaggtgtcat 164616  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctc 498  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  164615 tccaatgctagaatgataactgttattgtacgtgaattctatcaacggaagatgaatatcccaagttcatctttgctc 164538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 692
Target Start/End: Original strand, 260308 - 260979
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| ||||||||||  || || ||||  |||| ||| |||||||||| ||   | ||  ||||    
T  260308 catacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatatggtggcaaacaaactctatatgccaccgttctaatcctctctgaaat 260407  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || || ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| || || || || |||    
T  260408 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgattttaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcc 260507  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||    |||||||  || |||||||| || |    
T  260508 tgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcgtct 260607  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  260608 gatgaaccaaatccggtcccaatacaacactctctcctgactcaaaccagcataacagagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 260707  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     || ||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||  || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||    
T  260708 acctatactcgaatggtaactgttgttgtaggtgaactctatcagtggtaggtgactgtcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaa 260807  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| |  || |  || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  260808 tcctccaatgattagatcgtcctttccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactct 260907  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 692  Q
    |||| || ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  260908 tccagaacctagaggtgaacctcggatccctatccgacacaatactagaaggaactccatgtagcttcacaa 260979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 453; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 453; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 6372 - 7044
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||  ||||| | |||||| ||||||| ||    
T  6372 catacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcgtgcaaattcgaaagatgcggtgttaatcccactcgatataccaccatcccaactctttccaatat 6471  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||     
T  6472 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 6571  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  6572 tgaaactcaagatcttttctacgtttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatctactcttgaatcatcttaaccttctctgtagttt 6671  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6672 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccat 6771  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  6772 tccaatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaacaaa 6871  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  6872 tcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttt 6971  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6972 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 7044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 383 - 688
Target Start/End: Original strand, 3153 - 3458
Alignment:
Q  383 ctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccc 482  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  3153 ctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttcttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatccc 3252  T
Q  483 aagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaact 582  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  3253 aagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagacgaact 3352  T
Q  583 caatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgt 682  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||    
T  3353 caacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgacggaacaccatgt 3452  T
Q  683 agcttc 688  Q
    | ||||    
T  3453 aacttc 3458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 452; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 143 - 702
Target Start/End: Original strand, 7519 - 8078
Alignment:
Q  143 ggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctac 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7519 ggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctac 7618  T
Q  243 gcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaa 342  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7619 gcttatcatgataactcatttgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctttggtcctaa 7718  T
Q  343 gaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagcta 442  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7719 gaccactctttcacctaactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccataaaaaacctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataacta 7818  T
Q  443 ttattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcc 542  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  7819 ttattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatcctctagcgattgaattgttc 7918  T
Q  543 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 642  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7919 tctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 8018  T
Q  643 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||    
T  8019 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatacaacttcacaatctccttgat 8078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 450; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 85 - 702
Target Start/End: Original strand, 7854 - 8471
Alignment:
Q  85 cactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtc 184  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  7854 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccggtc 7953  T
Q  185 ataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttca 284  Q
    |  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  7954 accgaagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttca 8053  T
Q  285 ttttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttct 384  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  8054 ttttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacttgactcaaaccaacacaacggagttct 8153  T
Q  385 gcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaa 484  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8154 gcatcaccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaa 8253  T
Q  485 gttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactca 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  8254 gttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactca 8353  T
Q  585 atctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtag 684  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  8354 atctcaacatcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaaactagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaataccatgtaa 8453  T
Q  685 cttcacaatttccttgat 702  Q
    | |||||||  |||||||    
T  8454 cctcacaatcaccttgat 8471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 437; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 437; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 6023 - 6695
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| | ||    
T  6023 catacttccgaagttgcgacacaagaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgtcccaactctttccgatat 6122  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| || ||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  6123 ctgatacgggccaataaatcttggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggtgtgactctcaaaaatacgtggtctccttct 6222  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  6223 tgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgatgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagttt 6322  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6323 gttgaacaatctttggtcctaagaccactctttcaccagactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgtaaggtgccat 6422  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  6423 tccaatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaag 6522  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||    
T  6523 tcctctagtgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcatgcaaacttt 6622  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6623 tccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 6695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 1830 - 1158
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  ||||  | ||    
T  1830 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtgggaaaccaactctatatgccactgttccaaccctttctgatat 1731  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||  ||| || || ||| |  ||    
T  1730 ctgatacggactaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctccgaaatacatgatcttccacc 1631  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||    |||||||  ||||||||  |||| |    
T  1630 tgaaactcaagggccttcctacacttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctctctagtct 1531  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  1530 gatgaaccaaatccggtcccaatacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 1431  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||    
T  1430 tccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaa 1331  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| |  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  1330 tcctccaaagattgtatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaaccacaacttcgaacccaaagcatcttgcaagctct 1231  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||||||||| || || ||||| || || || || || ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  1230 tccaaaatctagaagtgaacctcggatccctgtccgacacgatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 1158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 146 - 407
Target Start/End: Original strand, 22819 - 23080
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||  || ||||| |||| | || | |||||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  22819 gtcaacttcctacacttcaaagcacaaccaacaccggtcacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 22918  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 345  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| ||||| || ||||||| ||| || || ||||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  22919 tatcatgataactcttctgtctactctgagactccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacaa 23018  T
Q  346 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcct 407  Q
      | |||||||||||||||||||| |||||||| || |  || |||| ||||||||||||||    
T  23019 agcactttcacctgactcaaaccaacacaacggtgtccaacacctcctaccatacaaagcct 23080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 431; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 431; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 64337 - 63659
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||  | ||    
T  64337 catacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttctgatat 64238  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||  ||   ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  64237 ctgatacggaccaatgaatctcacagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaactccagccacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 64138  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    || |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||| |    
T  64137 tggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtct 64038  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  64037 gctgaacaatatctggtcctaagaccactctttctcctaactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccat 63938  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||||||||||| ||  | ||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  63937 tccaatactagaatgttaattgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgattatcccaagttcctctttgctcaagtacacaaactctcaacaaa 63838  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |    
T  63837 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccagagcctcttgcaaactct 63738  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 699  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  63737 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctttttctgatataatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 63659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 426; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 698
Target Start/End: Original strand, 6014 - 6691
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| |||||||| |||| || ||    
T  6014 catacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagctgcggtggtaatccaactcgatacgccaccattccaactctttctaatat 6113  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  6114 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtcaaacaccagtcacaggagtgactcttaaaaacacgtggtctccctct 6213  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||| |  || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  6214 tgaaactcaagatcctgcctgcgcttattatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 6313  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6314 gctgcacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacagagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 6413  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  6414 tccaatactagaatgataaatgttattgtatgtgaactcaatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgatcaagaacataaactctcaacaaa 6513  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  6514 tcctctaacgactgaatcgtcctctccgactaaccatctgtctacggatgatacgccgaacacaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactct 6613  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcct 698  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  6614 tccaaattctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcct 6691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 421; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 86 - 702
Target Start/End: Original strand, 21932 - 22548
Alignment:
Q  86 actcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtca 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  21932 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcg 22031  T
Q  186 taggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat 285  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22032 caggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcacttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcat 22131  T
Q  286 tttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctg 385  Q
     |||||||| ||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  22132 cttctcttgaatcattttaactttctcaatagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagatctg 22231  T
Q  386 catctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaag 485  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22232 catctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgtcattccaatactagaatgataactgttattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgattatcccaag 22331  T
Q  486 ttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaa 585  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22332 ttcctccttgctcaaggacacaaactcgcaacaaatcctctagcgactgaattgtccactccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaa 22431  T
Q  586 tctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagc 685  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  22432 tttcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagaaacaccatgtaac 22531  T
Q  686 ttcacaatttccttgat 702  Q
     ||||||| ||||||||    
T  22532 ctcacaatctccttgat 22548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 415; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 695
Target Start/End: Original strand, 676 - 1350
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||| |||||||  ||||| | ||    
T  676 catactttcgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaagccaacacgatacgccaccattccaaccctttccgatat 775  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  776 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttct 875  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  876 tgaaactcaagatcttttctatgcttatcatgataactcttttgttgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagttt 975  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  976 gttgaacaatctctggtcctaaaaccacactatcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaacatacaaagcctcaaaaggtgccat 1075  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||  ||||||||     
T  1076 tccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatagaagatgactatcccaagttccttcttgctcaagtacgcaaaccctcaacaag 1175  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||    
T  1176 tcctctagcgactgaatcgtcctttcggactgaccatatgtctgaggatgatacgccaaactcaatctcaacttagaacctaaagcctcctgcaaacttt 1275  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaattt 695  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1276 tccaaaatctagaagtaaatcttagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaattt 1350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 411; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 1128 - 451
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| |||||||| ||| | ||||| || ||||||||  ||||| ||||| |||||||  | ||    
T  1128 catacttccgaagttgcgacacatgtaatacatcatgcaatttcgaaagttgctgtggtaatccaactcgatattccacctttccatctttttcttatat 1029  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  1028 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaa-acgtggtctccttct 930  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  929 tggaactcaagatcttttctacgcttttcatgataactcttttgtcgactctgtgacgcttccatcttctcttgaatcatcttaactttctcggtagttt 830  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  829 gttgaacaatctctggtcctaagatgactctttcacctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgccat 730  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||||| ||||||||  | ||||| || |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  729 tccaatactggaatgataattgttattgtacgtgaactctatccatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaacactcaacaaa 630  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  629 tcctctagcaactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgctgatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctctttcaaacttt 530  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 699  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  529 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 409; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 14039 - 14711
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  14039 catacttcggaagttgcgacacatgaaacacatagttcaaattcgaaagatgcggtggtaatctcactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 14138  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    || |||  ||||||| ||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||     
T  14139 ctcatacagaccaataaatctcggagtcaactactttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactatcaaaaacatgtggtctccttct 14238  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||  |||||||    
T  14239 tgaaactcaagatctctcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttcttggtagttt 14338  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14339 gctgaacaatctatggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccat 14438  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  14439 tccaatactagaatgataactattattatacgtgaactatatcaatggaagatgactttcccaagttcctccttactcaagaacacaaaccctcaacaaa 14538  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  14539 tcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgagcatctgtttgcggctgatacgccgaactcaacctcaacttagaatctaaagcctcttgcaaacttt 14638  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  14639 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaatgaacaccatgcaacttcacaat 14711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 239 - 702
Target Start/End: Original strand, 17660 - 18122
Alignment:
Q  239 ctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtc 338  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  17660 ctacgcttatcattataacacttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttcttagtagtctgctgaacaatctctggtc 17759  T
Q  339 ctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgata 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17760 ctaagaccactctttcacctgactcaa-ccaacacaacgaagttctacatctctgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgata 17858  T
Q  439 gctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaatt 538  Q
     |||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  17859 actattattttatgtgaactcgatcagtggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagtgactgaatt 17958  T
Q  539 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 638  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17959 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaa 18058  T
Q  639 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||    
T  18059 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccgtgtaacctcacaatctccttgat 18122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 31410 - 32082
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| |||||||   | ||  | ||    
T  31410 catacttccgaagttgcgacacaaaaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaacctatcagatat 31509  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| | | ||||||| |||||| || | ||| ||     
T  31510 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagaagtaactctcagaaacacatgatatccctct 31609  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||  ||||||||  |||||||  |||||||    
T  31610 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactattctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctatgtagttt 31709  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  || | ||| || || || ||||| ||| ||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  31710 gatgaaccaaatccgatcccaacacaacgctttctcctaactcaaaccagcataaaggagtcatgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 31809  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
      ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  31810 atcaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccactttgctcaagtacacacactctcagcaaa 31909  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||  || || || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  31910 tcctctaatgattggatcgtcctctccgactgacaatctgtttgcggatgataagctgaactcaaccccaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactct 32009  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  32010 tccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaat 32082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 625 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 18557 - 18489
Alignment:
Q  625 aaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  18557 aaatctagaagtaaatcttggatctctatatgatacaatgcttgaaggaacaccatgcaacttcacaat 18489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 397; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 999 - 328
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||| | | ||    
T  999 catacttccgaagttgctccacatgaaacacatcctgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccacacgatacgccaccgttccaactcttttcgatat 900  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| |||||||||||||||     
T  899 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacacgagggactctcaaaa-cacgtggtctccttct 801  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  800 tgaaacttaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcggtagttt 701  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||    
T  700 gttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttttgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgtcat 601  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  600 tccaatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatgggagatgattatctcaagttccttcttgctcaagaacacaaaccctcaacaaa 501  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||| || || |||||||||||||||||||    
T  500 tcttctaacgactgaatcatcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacaccgaactcaacctcagcttagaacctaaagcctcttgcaaacttt 401  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  400 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatcacacacaatgctcgaaggaataccatgcaacttcacaat 328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 397; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 29 - 693
Target Start/End: Original strand, 5229 - 5893
Alignment:
Q  29 cgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatg 128  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||  | ||||||||      
T  5229 cgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcagtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttctgatatctgataca 5328  T
Q  129 gaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactc 228  Q
    ||||||| ||  |||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||    
T  5329 gaccaataaatctcggagtcgacttccttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatatgtggtctccttctttaaactc 5428  T
Q  229 aagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaaca 328  Q
    ||||||||| || || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  5429 aagatctttcctgcgtttaccatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttttcagtagtttgctgaaca 5528  T
Q  329 atctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatac 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  5529 atctctggtcctaagaccactctttcacctgaatcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccgatac 5628  T
Q  429 tagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctag 528  Q
    | |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| || |||||    
T  5629 tggaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacgcaaactctcaacaagtcttctag 5728  T
Q  529 cgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaat 628  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || |||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  5729 cgactgaatcgtcctctccgactaacaatctgtctacagatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaat 5828  T
Q  629 ctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  5829 ctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 5893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 389; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 9343 - 10015
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  9343 catactttcgaagttgcgacacatgaaacacatagtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatat 9442  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||  ||||||| ||  | || |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||     
T  9443 ctgatacagaccaataaatctaggagtcaccttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaacaatacgtggtctccttct 9542  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||| | ||| |||||||    
T  9543 tgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgccttcatcttctcttgaatcatcttaacctactcggtagttt 9642  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  9643 gttaaacaatctctggtcctaaaaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacagagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgtaaggtgccct 9742  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||  ||||| || |||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||     
T  9743 tccaatactagaatgataactatcattgtacgtgaactttatcaatggtagatgattaaccctagttcctccttgctcaagtacacaagctctcaacaag 9842  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||||||||| |    
T  9843 tcttctagcgactgaatcgtcctctccgactgatcatctgtttgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttagaacgtaaagcctcttgcaaactct 9942  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  9943 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 10015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 385; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 229043 - 229715
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||||||||||| ||||| || | ||| || ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  229043 catacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcgtgcatattcgaaagatgcggtggtaaccctattcggtacgccaccgttccaactctttccgatat 229142  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||  ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| || || ||||||||     
T  229143 ctgatacggaccaacaaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtcccacaccagtaataggagtgactctcaaaaatacatgatctccttct 229242  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  229243 tgaaattcaaggtcttttctacgtttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 229342  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  229343 gttgaacaatctctggtcctaaaaccacactttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaaacctcataaggtgccat 229442  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  229443 tccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgaatatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaag 229542  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||| ||||||||| || || ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| || ||||| || || ||| |||||||||||||||    
T  229543 tcctctaacgactgaatcgttctttccgactgaccatttgtctgcgaatgatacgccgaactcaaccttaacttagaacctaaatcctcttgcaaacttt 229642  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  229643 tccaaactctataagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 229715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 219723 - 219051
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||||||||||| | ||||  | ||    
T  219723 catacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtgttaatcccacttgatacgccaccgttccaattctttctgatat 219624  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||     
T  219623 ctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaacgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatcttcttct 219524  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  219523 tgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 219424  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| || |  |||| |||| |||| || ||||||||    
T  219423 gttgaacgatttctggtcctaaaaccacactctcacctgacttgaaccaacacaacggagttctgcaccttcttccattcaaaacctcaaatggtgccat 219324  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || ||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  219323 tccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaattctataaacggaagatgattatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaag 219224  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||| ||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  219223 tcctctaacgaatgaatcgttctcttcgactgaccatctgtctgcggatgataccccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactct 219124  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  219123 tccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatttgatacaatgctcgaaggaacaccatgtcacttcacaat 219051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 146 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 33176 - 32667
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| || ||||| |||| |||  | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  33176 gtcaacttcttacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggtttcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 33077  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtccta--ag 343  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| || || || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  ||||| ||||  |     
T  33076 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttctgggcctaacaa 32977  T
Q  344 accactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctat 443  Q
    | ||||||    || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||  || |||||||| || ||||||| |||| | || |    
T  32976 agcactct----ccggactcaaaccaacacaacggtgttctacacctcctaccatacaaagccttaaatggtgccataccgatactagcatgaaaactgt 32881  T
Q  444 tattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcct 543  Q
    | || ||||| ||||| | |||||| | |      |||||  |  | |||||||| |  ||||||  |||||||||||| || |     ||||| |||||    
T  32880 tgttgtaagtaaactcaaccaacggtaaacattcgtcccacctaacaccttgctccaacacacaagatctcaacaaatcttccaaactttgaatagtcct 32781  T
Q  544 ctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctt 643  Q
    ||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||     
T  32780 ctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaactttgttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctc 32681  T
Q  644 ggatctctatctga 657  Q
    ||||| | ||||||    
T  32680 ggatcccgatctga 32667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 364; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 34 - 693
Target Start/End: Original strand, 49506 - 50165
Alignment:
Q  34 ttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggacca 133  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| | |||||||| || |||    
T  49506 ttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgggcca 49605  T
Q  134 atgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagat 233  Q
    || ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||| |||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||| |    
T  49606 ataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaacaatcacaggagtgactctaaaaaatatgtggtctccttcttgaaactcaaggt 49705  T
Q  234 cttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctc 333  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||| | || ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49706 ctttcctacgcttatcatgataaatcttttgccaactctgcgacgctttcctcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctc 49805  T
Q  334 tggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaa 433  Q
      ||||||| || || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  49806 gagtcctaaaacaaccctttaacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctctgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaa 49905  T
Q  434 tgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgact 533  Q
    ||||| |||||||| || |||||| | ||||| ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||  |||||    
T  49906 tgataactattattgtacgtgaacactatcaatggaggataactatcgaaagttcctccttgctcaagtacacaaactcttaacaaatcttcttacgact 50005  T
Q  534 gaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctaga 633  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50006 gaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctaga 50105  T
Q  634 agtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  50106 agtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcaaaggaacaccatgcaacttcacaat 50165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 540 - 699
Target Start/End: Original strand, 19121 - 19280
Alignment:
Q  540 tcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 639  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19121 tcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaa 19220  T
Q  640 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 699  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  19221 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 19280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 599 - 699
Target Start/End: Original strand, 34604 - 34704
Alignment:
Q  599 cccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcct 698  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  34604 cccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcct 34703  T
Q  699 t 699  Q
    |    
T  34704 t 34704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 360; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 699
Target Start/End: Original strand, 180217 - 180877
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||  || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||| |||| ||||  | ||    
T  180217 catacttccgaagttgcgacacttgaaagacatcatgaaaattcgaaagatgcggtggtaagccaactcgatacgccactgttctaactctttctgatat 180316  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||| ||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||| | |||||||||||||| || || || ||     
T  180317 ctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcaggtccaacaccagtcaccggagtaactctcaaaaacacatgatcaccctct 180416  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||| |    
T  180417 tgaaactcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcaatagtct 180516  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  180517 gctgaacaatatctggtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaatggagttctgcatctccgaccatataaagcctcaaaaggtgtcat 180616  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  180617 tccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacccaaactctcaacaaa 180716  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||||                  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  180717 tcctctag------------------cgactgaccatctgtctgctgatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactgt 180798  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 699  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  180799 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 180877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 415 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 101464 - 101186
Alignment:
Q  415 tgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctc 514  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||    
T  101464 tgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctc 101365  T
Q  515 aacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgca 614  Q
    |||||||||||||  || || ||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  101364 aacaaatcctctaatgattggatcatcctctctgactgaccatctatctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgca 101265  T
Q  615 aacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  101264 aactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaat 101186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 357; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 15385 - 14713
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  | ||    
T  15385 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatat 15286  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||  ||||||| ||| |  | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||||||||| | || || |||||||||    
T  15285 ctgatacagaccaattaaccttagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaagatacatgatctccttcc 15186  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  15185 tgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgctttcatcttttcttggatcaacttaaccttctcagtagttt 15086  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| || |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| || || ||||||||    
T  15085 gttgaacgatatctggtcccaaaactacactctcacctgactcgaaccaacacaacgaagttctgcacctccgaccatacagagcttcaaatggtgccat 14986  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  14985 tccaatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaag 14886  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||| |  |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| |||||||||||||||    
T  14885 tcccccggcgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtccgcgggtgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaatcctcttgcaaacttt 14786  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  14785 tccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgataaaatgtttgacggaacaccatgtagcttcacaat 14713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 349; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 33058 - 32387
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  33058 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatat 32959  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  |||  |||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| | || ||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  32958 ctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttaacttcaatgcaagtccaacaccagtcacaagagtgactctcaaaaatacgtgatctccttct 32859  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| || ||||| || ||||| ||||||| ||| |||| ||||||||    
T  32858 taaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgaccctacgatgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttcttagtagttt 32759  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  32758 gttgaacaatttctggccctaaaaccacactcccacctgactcaaaccaacacaacggagttcttcatctccgatcatacaaagcctcaaaagatgccat 32659  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  32658 tccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaag 32559  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || |||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| |    
T  32558 tcttctaacgactggatcgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccaaactcaacctcaacttagaacctaaagcttcttgcaaactct 32459  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||| | |||||||||    
T  32458 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatttgatac-attctcgaaagaacaccatgcaacttcacaat 32387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 347; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 272 - 702
Target Start/End: Original strand, 12738 - 13168
Alignment:
Q  272 tgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagc 371  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  12738 tgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctaactcaaaccaac 12837  T
Q  372 acaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaag 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  12838 acaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaag 12937  T
Q  472 atgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 571  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12938 atgtctatcccaagttcctccttgctcaagaacacacactctcagcaaatcctctagtgactaaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatga 13037  T
Q  572 tatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 671  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13038 taagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 13137  T
Q  672 gaacaccatgtagcttcacaatttccttgat 702  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  13138 gaacaccatgtaacttcacaatctccttgat 13168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 337; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 26025 - 25353
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||  | ||    
T  26025 catacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccacggttccaattctttctgatat 25926  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||| || | || |  ||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||| || |||| |||||||    
T  25925 ctgatacggaccaataaacatccgagttagtttccttgacttcaatgcacgtccaaccccagtcataggagtgactctaaaaaatacatggtttccttcc 25826  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||  || || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| | || ||| |||||||||||||    
T  25825 tgaaactcaaagtccttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggattaacttaaccttctcagtagttt 25726  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||| || |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||  || ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  25725 gctgaacgatatctggtcccaaaactacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagttctacacttctgaccatacaaagcttcgaatggtgccat 25626  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||     
T  25625 tccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttccaccttgctaaagtacacaaactctcaacaag 25526  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  25525 tcctccaacgactgaattgttctttcagactgaccatctgtctccggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactct 25426  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25425 tccaaaatctagaagtaaaccatggaactctatctgacacaatgctcgacggaacaccatgtagcttcacaat 25353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 337; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 14877 - 15549
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| | ||||  | ||    
T  14877 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgcggtggtaagcccactcggtacgccaccgttccaattctttctgatat 14976  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
     ||||| |||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||| || || ||||||||     
T  14977 ttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttatttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactatcaaaaatacatgatctccttca 15076  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  15077 tgaaactcaaggtctttcctaagcttatcatgataactcatatgtcgactctgagacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 15176  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  15177 gttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcgaaccaacacaatggagttctgcacttcctaccatacaaagcctcaaatggtgccat 15276  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||     
T  15277 tccaatactggaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaatggaagatgattatcccaagttcctccttgctcaagtacacaacctctcaacaag 15376  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||  | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  15377 tccttcaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgatatgtcgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactct 15476  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  15477 tccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaactttacaat 15549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 461 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 113353 - 113121
Alignment:
Q  461 atcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctg 560  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||| |||| || ||||| |||||||||||||    
T  113353 atcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacgcaaactctcaacaaatcttctagagaccgaatcgttctctctgactgaccatctg 113254  T
Q  561 tctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 660  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  113253 tctgcggatgacacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaattaaatcttggatctctatctgatac 113154  T
Q  661 aatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  113153 aatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 113121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 26839 - 26167
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||  | ||    
T  26839 catacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcatggaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgtttcaatcctttctgatat 26740  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| || ||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  26739 ctgatacgggccaataaacctcggagtcaacttctttcacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtaactctcaaaaatacgtgatctccttcc 26640  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  26639 tggaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 26540  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | |||||||| | | ||||||| ||||| || |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| ||||||| |||    
T  26539 gttgaacaatttattgtcctaaaaccacactctcacctaactcgaaccaacacaacggagttctgcaccttcttccatacaaagcctcaaaaggtgtcat 26440  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  26439 tccaatgctagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacagaacatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaag 26340  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || || |   ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  26339 tcttccaataactgaatcgttttttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactct 26240  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26239 tccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaat 26167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 196008 - 195338
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| |||||||| || ||  | ||    
T  196008 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccttctctgatat 195909  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || || || || |||    
T  195908 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaa-acatgatcaccctcc 195810  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  195809 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgtctctacgacgctttcatcttctctatgatcatcttgactttctctgtagtct 195710  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  195709 gatgaaccaagtccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatataaagcttcgaacggtgccat 195610  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| | ||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| | |||||  |||    
T  195609 accaatactcggatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaggtacacacactctcagtaaa 195510  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||  |  || || || |||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | ||||||||| |    
T  195509 tccttcaaagattgtatcgtcctctccgac-gaccatctgtctgaggatggtaagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatgttgcaaactct 195411  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  195410 tccaaaatcttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgcagcttcacaat 195338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 21 - 689
Target Start/End: Original strand, 148570 - 149238
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  148570 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacctactctgtatgccactgttccaaccctctctcatat 148669  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || || || ||     
T  148670 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctct 148769  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |  |||| |||  | |||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||| || ||    ||||||   ||||||||  |||| |    
T  148770 tagaacttaagggcctttctacggttgtcatggtaactcttccgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcctgactttctctatagtct 148869  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| || |||||    
T  148870 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaaggttcgaacggagccat 148969  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || ||  | || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||| | |||||  |||    
T  148970 accaatactcgaatggtaactgctgttgtatgtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaacctccaccttgttcaagcacacacactctcagtaaa 149069  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| |  || || || ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||   ||||||||| ||||| || ||||||| ||| |    
T  149070 tcctccaatgattggatcgtcctttccgactgaccatctttctgaggatgataagccgaactcaactccaacttcgaacccaatgcatcttgcagactct 149169  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttca 689  Q
    |||||||||||||||| || || ||||| ||||| || | ||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  149170 tccaaaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacataatactcgacggtacaccatgtagcttca 149238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 68746 - 68577
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  68746 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatat 68647  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagga 190  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  68646 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagga 68577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 146 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 122131 - 121841
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||| |||| | || |||||||| || || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  122131 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 122032  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 345  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| || || ||| |||  || ||||  || | |||||| |     
T  122031 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatgttaaccttttccgtaatttcttgcacaacttccgttcctaacaa 121932  T
Q  346 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatga 436  Q
     || ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| || || |||| ||| ||||||||||||    
T  121931 aacactttccccggattcaaaccaacacaacggtgttctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggagccaatccgatactagaatga 121841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 248 - 468
Target Start/End: Original strand, 180151 - 180371
Alignment:
Q  248 tcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagacca 347  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  |  |||||||| |  |    
T  180151 tcatgataactcttctgtctactctgagacgacttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttgcggtcctaacaaaa 180250  T
Q  348 ctctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattatt 447  Q
    | ||||| || ||||||||||| ||||| || || || || |||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | || || ||    
T  180251 cactttctccggactcaaaccaacacaatggtgtcctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagaatgaaaactgttgtt 180350  T
Q  448 ataagtgaactcgatcaacgg 468  Q
     ||||| ||||| ||||||||    
T  180351 gtaagtaaactcaatcaacgg 180371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 112021 - 112693
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  | ||    
T  112021 catacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatat 112120  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||| | || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  112121 ctgatacggaccaataaacctgggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttcc 112220  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||| || ||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||  |||| || |||||||||| || ||| |||||| ||||||    
T  112221 tgaaactcaaggtccttcttacgcttatcatgatatctcttttgtcgactctgtgatgctatcatcttttcttggatcaacttaaccttctcaatagttt 112320  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| || |||||||| || || || || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || || |||| |||    
T  112321 gttgaacgatatctggtcccaaaactacactctctcctgactcgaaccaacacaacggagttctgcacctccgaccatacagagcttcaaatggtgtcat 112420  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    | |||||||||||||||| || |||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  112421 ttcaatactagaatgataactgttattgcatgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaag 112520  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| | ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  112521 tcctccaacgactgaatcgtccttttcgactgaccatctgtctacggatgatacgccgaactcaacttcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactct 112620  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  112621 tccaaaatctagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgcttggcggaacaccatgtagcttcacaat 112693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 203774 - 203102
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||   | ||    
T  203774 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttccaactcttttagatat 203675  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||  |||| |||| | || ||||||| | |||||| |||||||||||     
T  203674 ctgatacggaccaataaacctcggcgtcaacttctttggcttcaaagcacggccagcacctgtcacaagagtgactcttagaaacacatggtctccttct 203575  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   || | || ||| || |  ||||| |    
T  203574 tgaaattcaaggtctttcctgcgcttatcgtgataaatcttctgtcgactctgcgacgctttcatattttctcttattagcttaaccttttatgtagtct 203475  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | |||||||| |  ||||| || || || || ||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  203474 ggtgaacaatattcggtcccaacactacactctcacccgactcaaaccaacataacagagttctgcacctccgaccatacaaagctttgaatggtgccat 203375  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||| ||||||||||| || || || || || |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  203374 tcctatactagaatggtaacttttgttgtacgtgaactctatcagcggtagatgactatcccaagtcccaccttgctcaagtacacaaactctcaacaaa 203275  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||  | | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  203274 tcctctaatggcagaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttgcaaacttt 203175  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  203174 tccaaaatctacaagtaaatcttggatctctatttgacacaatgctcgacggaacaccatgtagcttcacaat 203102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 117568 - 118240
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||| | ||    
T  117568 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatat 117667  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||  ||||||||| | || |||| ||| || || || || |||    
T  117668 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacactcgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcc 117767  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  117768 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctccgtagtat 117867  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || || |||||||||||||| || || |||||  | || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  117868 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccaacataaaggagtcttacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 117967  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  117968 accaatactcgaatggtaactattgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactataccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaa 118067  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||  || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  118068 tcctctaatgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactct 118167  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  118168 tccaaaatcttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgtagcttcacaat 118240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 322704 - 323376
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||  ||||||||  | ||  | ||    
T  322704 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccattgttccaaccctctctgatat 322803  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || || || |||    
T  322804 ctgatatggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctcc 322903  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  322904 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctccgtagtct 323003  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  || || || || || || || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  323004 gatgaaccaaatccggacccaacacaacactctctcctgattcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgatcatacaaagcttcgaacggtgccat 323103  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||    
T  323104 accaatactggaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaa 323203  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  323204 tcctccaaagattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccaaactcagcctcaacttcgaacccaaggcgtcttgcaaactct 323303  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || | ||| ||||| || |||||||| | |||||||||    
T  323304 tccagaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacaaaatactcgacggtacaccatgcaacttcacaat 323376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 385819 - 386491
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  385819 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagatat 385918  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||| |||| ||| || |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||| |  || ||||| ||     
T  385919 ctggtatgaacctataaacttcggagtcaacttcttatacttcaacgcacaacctacacccgtcgtaggagtgactctcagaaatagatgatctccctct 386018  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| || |||   ||||||| ||| ||||| ||||| |    
T  386019 tgaaactcaagggtctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtggactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttaaccttctccgtagtct 386118  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      ||||| |  |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||  |||||||    
T  386119 aatgaactaaatctggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacacaatggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttagaacagtgccat 386218  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  386219 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaa 386318  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  386319 tcctctaacgactgaatcgttatctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactct 386418  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  386419 tccaaaaccttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 386491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 908 - 1580
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||| |||||||||||| || || ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||| | ||||  | ||    
T  908 catacttccaaagttgcgacacgtgaaacacatcatgcatattcgaaagatgcggtggtaaacccaatcgatatgccactgttccaattctttctgatat 1007  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||  |||| |||||| | ||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  1008 ctgatatggaccaataaacctcggattcaatttctttcatttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaatacatggtctccttcc 1107  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| || || || |||||||||  || ||  |||||||||||||    
T  1108 tgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcaaatctgcgacgctttaatcttttcttggatccacttaatcttctcagtagttt 1207  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||| || |||||||| || || || || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  1208 gctgaacgatatctggtcccaaaactacactctcacctgactcaaaccaacacaacagagttctgcacctccaaccatacaaagcttcgaatggtgccat 1307  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||| ||||||| ||||||||||    
T  1308 tccaatactaaaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatctcaagttccaccttattcaagtacacaaactctcaacaaa 1407  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| | |||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  1408 tcctccaacgactgaattgttcttttcgactaaccatctgtctgcggatgatacaccgaactcaacttcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactct 1507  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  1508 tccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgacacaatgttcgatggaacaccttgtagcttcacaat 1580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 681
Target Start/End: Original strand, 1005 - 1659
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||| | ||    
T  1005 catactttcgaagttgcgttacatgaaagacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaacgttccaactctttccgatat 1104  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    | |||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||  |||||||||| || || || ||||||||     
T  1105 ccgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggggtgactctcaagaatacatgatctccttct 1204  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| ||||  ||| ||| ||| |||||||||||||    
T  1205 ttgaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgccgactctgcgacgatttcactttttctta-atcgtcttaaccttctcagtagttt 1303  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||     ||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1304 gttg-----tctctggtcctaaaaccacattctcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 1398  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||    
T  1399 tccaatactagaatgataaatgttatagtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaaattcctcctttctcaagtacacaaactcttaacaaa 1498  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || |||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  1499 tcttctaacgactaaatcgttctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactaaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactct 1598  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1599 tccaaaatctagaagtaaaactaagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 1659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 689
Target Start/End: Original strand, 4032 - 4699
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||   ||||  | ||    
T  4032 catacttccgaagttgcgacacatgaaacaaatcatgcaaattcgaaagatgcggtagtaaacccacttgatacgccaccgttccaatcctttctgatat 4131  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| || || ||||||||     
T  4132 ctgatatggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttct 4231  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    | ||||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  4232 taaaactcaaggtctttcctacgcttatcatagtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcatcttaaccttctcagtagttt 4331  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      ||||| || ||||||||||| || || || |||||||| || ||||| ||||||| ||||||||| || |  |||||||||||||| || ||||||||    
T  4332 attgaacgatttctggtcctaaaactacactctcacctgattcgaaccaacacaacgaagttctgca-cttcttccatacaaagcctcaaacggtgccat 4430  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||| ||     
T  4431 tccaatactagaatgataattgttattgtacgtgaactctattaatggaagatgactatcccaagtttctccttgctcaagtaaacaaactctcaagaag 4530  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||  | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||||| |    
T  4531 tccttcaacgactgaatcgtcctctccgaccgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttataacctaaagcctcttgcaaactct 4630  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttca 689  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4631 tccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttca 4699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 3140 - 3812
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| || ||    
T  3140 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttcaaatat 3239  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| | |||||| ||| |||  |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| || || ||||||||     
T  3240 ctgatacgaaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttct 3339  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  3340 tgaaacttaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttggatcatcttaaccttctcagtagttt 3439  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | || || || ||||| || ||    || || |||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  3440 gttgcacgatttctggccccaaatttacactctcacttgactcaaactaacacaatggagttctgcatctccggccatacaaagcctcgaatggtgccat 3539  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||     
T  3540 tccaatactagaatggtaactgttattgtacatgaactctattaacggaagatgactatcccaagtttctccttgctcaagtacagaaactctcaacaag 3639  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || |  | ||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  3640 tctttcaacgactaaatcgttctttccgactgaccatttgtctgcagatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactct 3739  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  3740 tccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 3812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 21 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 127505 - 126911
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  | ||    
T  127505 catacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgtaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccattccaactctttctgatat 127406  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||| |||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||     
T  127405 ctgatacggatcaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtgatctccttct 127306  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  127305 tggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctggaacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 127206  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  127205 gttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgacttaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgccat 127106  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || | |||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  127105 tccaatactagaatgataactgttattgtacgcgaactctatcaatggacgatgactatcccaagtccctccttgctcaagtacacaaactctcaacaag 127006  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaa 615  Q
    |||| || ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||| || |  ||||||||||||||    
T  127005 tcctataacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgttgaactcaacctcaacttagaacataaagcctcttgcaa 126911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 502 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 80319 - 80128
Alignment:
Q  502 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 601  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  80319 aacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgaatgaccatctgtccgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaaccc 80220  T
Q  602 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  80219 aaagcctctttcaaactcttccaaaatctttaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctctaaggaacaccatgcaacttcacaat 80128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 2)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 21 - 570
Target Start/End: Original strand, 1139 - 1688
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  1139 catacttccgaagttgcaacacataaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatat 1238  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||| |||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  1239 ctgatacggaacaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtcgaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaatacgtggtctccttct 1338  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  1339 tgaaactcaagatctttcctacacttatcatggtaacttttttgtcgactctgcgacgctttcatcttatcttgaatcatcttaaccttctcggtagttt 1438  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1439 gttgaacaatctctagtcctaagaccactctttcacccgactcaaaccaacacaacggagttctacatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccat 1538  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  1539 ttcaatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaa 1638  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatg 570  Q
    || || | ||| || || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  1639 tcttccaacgagtgcatcgtcctctccaactgaccatctgtctgctgatg 1688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 561 - 693
Target Start/End: Original strand, 2914 - 3046
Alignment:
Q  561 tctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 660  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2914 tctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 3013  T
Q  661 aatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  3014 aatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 3046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 117211 - 116539
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || ||||  ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||  | ||    
T  117211 catacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaatatacggtggtaaacccactcgatacgccaccgttacaattctttctgatat 117112  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
     ||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||| | || ||||||||||||| || || |||| |||     
T  117111 ttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacactattcacatgagtgactctcaaaaatacttgttctctttct 117012  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  117011 tgaaactcaaggtctttcctacgtttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttggatcaacttaaccttctcagtagttt 116912  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||| || | |||||| || || || || ||||||||||| ||||| |||||| |||| || || ||||||||||||| | | || || |||| |||    
T  116911 gctgaacgatttatggtcccaaaactacactctcacctgactcgaaccaacacaacagagtcctacacctccgaccatacagaacttcaaatggtgtcat 116812  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||     
T  116811 tccaatactagaatgataactgttattgtacgtcaactctatcaacggaagatgactaacccaagttcctccttgctctagtacacaaactctcaacaag 116712  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| | |||| |||| || || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  116711 tcctccaacgacggaatcgttcttttcgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactct 116612  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  116611 tccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgacgaaacaccatgtagcttcacaat 116539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 146 - 618
Target Start/End: Original strand, 98140 - 98612
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || ||||||||| | || || ||||||||||| || ||  | |||||||||| ||| || || | ||    
T  98140 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcataggattcacccttaaaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttactcctct 98239  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 345  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  ||||||||||| |     
T  98240 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttctggtcctaacaa 98339  T
Q  346 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 445  Q
     || || || || ||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||||| |||| || ||| |||| || ||||||| |||| | || ||     
T  98340 aacactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaaacctcaaacggtaccataccgatactagcatgaaaactgttg 98439  T
Q  446 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 545  Q
    ||  |||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  98440 ttgaaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 98539  T
Q  546 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaact 618  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  ||||||||||    
T  98540 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaact 98612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 3)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 98 - 693
Target Start/End: Original strand, 9047 - 9642
Alignment:
Q  98 accgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactc 197  Q
    |||||||||| | ||||  | ||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||| ||||||    
T  9047 accgttccaattctttctgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaacgcacgtccaacaccggtcacaggagtgactc 9146  T
Q  198 tcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggat 297  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  9147 tcaaaaatacatgatccccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggat 9246  T
Q  298 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 397  Q
     |||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |||||| |||| ||||  || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || | ||||    
T  9247 tatcttaaccttctcagcagtttgttgaacaatttctggtgctaaaaccagactctcacctgaatcaaaccaacacaacggagtcctgcaccttctacca 9346  T
Q  398 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 497  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9347 tacaaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtatgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgct 9446  T
Q  498 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 597  Q
    |||| |||||||  |||||||| || || | ||| ||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||    
T  9447 caagtacacaaaccctcaacaagtcttccaacgattgaatcgttctttccgactgacaatctgtctgcggatgatatgccgaacttaacctaaacttaga 9546  T
Q  598 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9547 acctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgatacaatgctcgaatgaacaccatgtagcttcacaat 9642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 514 - 351
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || |||| ||| | |||| | |||||||| ||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || | ||    
T  514 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacactagttacaggattcactctcaagaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatccttcctcctct 415  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaacttt 309  Q
    | |||||||||||||| || | |||||| || || ||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  414 tatcatgataactcttctgcctactctgagatgctttcatcttctcttgaatcatcttaacttt 351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 331 - 216
Alignment:
Q  350 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 449  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| | || || || || |||||| |||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | || || || |    
T  331 ctttcacctgaatcaaaccaacataaccgcgtcctacaccttcgaccacacaaagcctcaaatggtgccataccgatactagaatgaaaactgttgttgt 232  T
Q  450 aagtgaactcgatcaa 465  Q
    |||| ||||| |||||    
T  231 aagtaaactcaatcaa 216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 300; Significance: 1e-168; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 198 - 693
Target Start/End: Original strand, 15832 - 16327
Alignment:
Q  198 tcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggat 297  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| || | ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||    
T  15832 tcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcgaggtatttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaat 15931  T
Q  298 catctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 397  Q
    ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15932 cattttaactttctcagtagtttgttgaacaatctcgtgtcctaaaaccaccctttcacctaactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgacca 16031  T
Q  398 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 497  Q
     | ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16032 aaaaaagcctcataagatgccattccaatactagaatgataaatattattgtacgtgaacactatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgct 16131  T
Q  498 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 597  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  16132 caagtacacaaactctcaacaagtcctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgatacgccgaactcaacctcaacttaga 16231  T
Q  598 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  16232 acctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtatatcttggatctctatatgatgcaattctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 16327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 358
Target Start/End: Original strand, 15493 - 15829
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||    
T  15493 catacttccgaagttgcgacccatgaaacacatcgtgcaaattcgaaa-atgtggtggtaaacctactcgatatgccaccgttccaactctttccgatat 15591  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| | |||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  15592 ctgatacgaaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaagaatgactgtcaaaaatacgtggtctccttct 15691  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||| || | ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  15692 tgaaactcgaggtatttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcattttaactttctcagtagttt 15791  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 358  Q
    | |||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||    
T  15792 gttgaacaatctcgagtcctaaaaccaccctttcacct 15829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 297; Significance: 1e-166; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 16722 - 16050
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| |||||| |||||| | ||||  | ||    
T  16722 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtacaaattcgaaagatgcggtggtaaacctacatgatacgccaccattccaattctttctgatat 16623  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    || ||| |||||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||  ||| |||| || ||||| || || ||||||||     
T  16622 cttatacggaccaataaatctcggtgtcaacttcttcgacttcaatgcacgtccaacaccaatcactggagtgaccctaaaaaatacatgatctccttct 16523  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||   |||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  16522 tgaaatataagatcctccctacgcttatcatgataactcttttgtcgagtctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagttt 16423  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | |||||||| |||| || ||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||   |||||||||||||| || |||| |||    
T  16422 gttgaacaatttctgttcttaaaaccacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagttttgcacctcgttccatacaaagcctcaaatggtgtcat 16323  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    | |||||||||||||||| |||||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||     
T  16322 tgcaatactagaatgataactattattgtacgtgaattctattaatggaagatgactatcccaagtccctccttgctcaagtacgcaaactctcaacaag 16223  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| | ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || ||||||| ||||||||| |    
T  16222 tcctccaacgactgaatcgttctctccgactgaccatttgtctgcggatgatacgccgaacttaacctcaacttagaacctaaagcctattgcaaactct 16123  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16122 tccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaat 16050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 292; Significance: 1e-163; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 21 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 25377 - 24702
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  25377 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttccaactctttccgatat 25278  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |  ||||| ||| || | ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||| |||| ||||||| | |||||| ||||||||| |     
T  25277 ctgatacgagccaataaacctcagcgtcaacttcttcgatttcaaagcacgaccaacacctgtcacaggagtgactcttagaaacacatggtctcctgct 25178  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||   || | || ||| || || ||||| |    
T  25177 tgaaattcaagatctttcctacgtttgtcgtgataagtcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctcttattagcttaaccttttctgtagtct 25078  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | |||||||| || ||||| || || || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||| |||    
T  25077 ggtgaacaatatccggtcccaacactacactttcacccgactcaaaccaacagaacggagttctgcacctccgaccatgcaaagcttcgaatggtgtcat 24978  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     | ||||||||||||||| || || || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  24977 ccaaatactagaatgataactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagtcccaccttgcttaagtacacaaactctcaacaaa 24878  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  24877 tcctctaacgactgaatcattctctccgactgaccatctgtttacggatgataagccgaactcaacctcaacttagatcccaacgcctcttgcaaacttt 24778  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttc 696  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||    
T  24777 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctcaatctgacacaatgctcgacggaacaccatgcaactacacaatttc 24702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 122 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 985 - 628
Alignment:
Q  122 tgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcct 221  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  985 tgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcagtgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctaaaaaatacgtggtctccttcct 886  T
Q  222 gaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttg 321  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  885 taaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtttg 786  T
Q  322 ctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccatt 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  785 ctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaatggagttctgcatctccgaccatataaagcctcgaaaggtgccatt 686  T
Q  422 ccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactat 479  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  685 ccaatactagaacgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactat 628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 282; Significance: 1e-157; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 22 - 671
Target Start/End: Complemental strand, 13282 - 12633
Alignment:
Q  22 atacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatc 121  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||||  || |||||| |||| || || ||||||||||||| ||| || ||| |||| | | ||||  | |||    
T  13282 atacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgtaaattcaaaagttgtggtggtaaacccactccatacgctaccattcccattctttctgatatc 13183  T
Q  122 tgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcct 221  Q
    ||||| | || ||| ||  |||  ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  13182 tgatacgaactaataaatctcgaagtcaatttcttagacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaataacacatggtctccttctt 13083  T
Q  222 gaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttg 321  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13082 gaaattcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcatctaaactttctcagtagtttg 12983  T
Q  322 ctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccatt 421  Q
    ||||| ||| |||||||| || ||  | || | ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  12982 ctgaagaatttctggtcccaaaactgcactctaacctgactcgaaccaacacaatggagtcctacacctccgaccatacagagcttcgaatggtgccatt 12883  T
Q  422 ccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaat 521  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |    
T  12882 ccaatactagaatggtaactgttattatatgtgaactctatcaacgggagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagt 12783  T
Q  522 cctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactttt 621  Q
    | || | |||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  12782 cttccaacgactgtatcgttctttccgactgaccatctatctgcggatgatacgctgaactgaacatcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactctt 12683  T
Q  622 ccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 671  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12682 ccaaaatctagaagtaaacctcagatctctatctgatacgatgctcgaag 12633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 5896 - 5225
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||| || || || |||||| |||   ||||    
T  5896 catacttccgatgttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaactcactctatacgcaactgtcccaactctttatgaaat 5797  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
     ||||| | |||| | ||| |||| | ||  ||||| ||||| |  || ||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||     
T  5796 atgatacgaaccattaaacctcggagacagtttcttcgactttagtgctcgtccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttct 5697  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||   |||| || ||| ||||| || ||||    
T  5696 tgaaactcaagatccttt-tgcgcttatcatgataactcttttgtctactctgcgacgctttcatcttctctctaatcaacttaaccttctctgttgttt 5598  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | |||||||| || |||||||  |||||  | ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| |||    
T  5597 gttgaacaatttcaggtcctagtaccacattctcaccggactcataccaacacaacggagttctgcatctccgaccaaacaacgcttcgaacggtgtcat 5498  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    |||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  5497 tccaatgctagaatggtaactgttattatacgtgaactcaatcaatggaagattactatcccaagttcctccttgctcgagtacacaaactctcaacaaa 5398  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| | ||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| || ||||| ||||| |||||||  |    
T  5397 tcctcgaacgaatgaattgtcctctctgtctgtccatcggtctgcggatgatacgtcgaactcaaactcagcttagaacccaacgcctcctgcaaaccct 5298  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5297 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgtagcttcacaat 5225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 308 - 681
Target Start/End: Original strand, 6336 - 6709
Alignment:
Q  308 ttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcct 407  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6336 ttctcagtagtttgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgattcaaaccaacacaatggagttctgcatctccgaccatacaaagcct 6435  T
Q  408 cgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaca 507  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6436 catagggtgccattccaatactagaatgataactgttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaca 6535  T
Q  508 aattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcc 607  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||    
T  6536 aaccctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgactatctatttgcggatgatatgccgaactcaacctcaacttagaatctaaagcc 6635  T
Q  608 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  6636 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatggtcgaaggaacaccatg 6709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 81
Target Start/End: Original strand, 6273 - 6333
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaa 81  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  6273 catacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaa 6333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 7)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 220 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 4561 - 4085
Alignment:
Q  220 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 319  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||  || |||||||||    
T  4561 ctgaaactcgagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaagcttgtcagtagtt 4462  T
Q  320 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 419  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||  ||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  4461 tgttgaacaatttctggtcctaaaaccacactctcacctgactcgaaccaacacaaaggagttctacaaatccaaccatacaaagcctcaaatggtgcca 4362  T
Q  420 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 519  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||  ||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||| | ||||| |||||||||    
T  4361 ttccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactatatcaatggatgatgactagcccaagttactccttgctgaagtaaacaaactctcaacaa 4262  T
Q  520 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 619  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||     
T  4261 atcctctaacgactgaatcgttctctccaactgaccatctgtgtgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactc 4162  T
Q  620 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttc 696  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4161 ttccaaaatctataagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatttc 4085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 405 - 693
Target Start/End: Original strand, 130532 - 130820
Alignment:
Q  405 cctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaac 504  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  130532 cctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactgttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcatccttgctcaagaac 130631  T
Q  505 acaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaa 604  Q
    ||| |  |||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||    
T  130632 acataccctcagcaaatcttctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaa 130731  T
Q  605 gcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  130732 gcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaat 130820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 239 - 693
Target Start/End: Original strand, 58972 - 59426
Alignment:
Q  239 ctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtc 338  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||| |||||    |||| || ||| ||||  |||||||  |  ||||| || ||||    
T  58972 ctacgctgatcatgataacgcttttgtctactctacgacgctttcatcttctcccaaatcaacttaaccttctgtgtagttttttcgacaatttccggtc 59071  T
Q  339 ctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgata 438  Q
    |||  |||||  | | ||| || ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||    
T  59072 ctagtaccacattcttaccggattcataccaacacaatggagttctgcatctccgaccatacaatgcttcgaatggtgccatcccaatgctagaatggta 59171  T
Q  439 gctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaatt 538  Q
     || ||||| ||  ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  59172 actgttattgtacatgaactcgatcaatgagagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctccaacgactgaatt 59271  T
Q  539 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 638  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  59272 gtcctctctgtctgcccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactctcccaaaatctagaagtaa 59371  T
Q  639 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| || |||||    
T  59372 atcttggatctctatctgatacaatacttgacggaacaccatatagttttacaat 59426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 543 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 29163 - 29008
Alignment:
Q  543 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 642  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29163 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaag-aaatct 29065  T
Q  643 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 699  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  29064 tggatctctatctgatacaatgctcaaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 29008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 405 - 507
Target Start/End: Original strand, 134626 - 134728
Alignment:
Q  405 cctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaac 504  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  134626 cctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataactgttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcatccttgctcaagaac 134725  T
Q  505 aca 507  Q
    |||    
T  134726 aca 134728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 35 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 4717 - 4567
Alignment:
Q  35 tgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaa 134  Q
    ||||||| ||| || ||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| | | |||||| |||||||    
T  4717 tgcgacagatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcgatggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttccgatacctgatacggaccaa 4618  T
Q  135 tgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtca 185  Q
    | ||  |||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4617 taaatctcggagtaaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtca 4567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 37052 - 36974
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccac 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||| |||| |||| ||||| || ||| |||| |||||    
T  37052 catacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgtaagaggcggtggtaatccaactagatacgccac 36974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 3875 - 4547
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  |||||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  3875 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactgttccaacactctcagatat 3974  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||| || ||||| ||     
T  3975 ctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtgactatcagaaacacatgatctccctct 4074  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||| ||||| || |||   |||||||  || ||||| ||||| |    
T  4075 tgaaactcaaggactttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgattctccgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtct 4174  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  4175 gatgaactaaatctggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtcctgcacctccgaccatacgaagcttcgaacggtgccat 4274  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     ||||||||  |||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | | ||||||||    
T  4275 accaatactcaaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactatcaacaaa 4374  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  4375 tcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctctctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactct 4474  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||| || ||||| || || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  4475 tccaaaaccttgaagtgaacctcggatctctttccgacacaatactcgatggaacaccatgcaacttcacaat 4547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 335 - 693
Target Start/End: Original strand, 10 - 368
Alignment:
Q  335 ggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaat 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  10 ggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacataatgaagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgtcattccaatactagaat 109  T
Q  435 gatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactg 534  Q
    |||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || || |||||    
T  110 gataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcttcaagagactg 209  T
Q  535 aattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaa 634  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  210 aatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaaggctcttgcaaactcttccaaaatctagaa 309  T
Q  635 gtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  310 gtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 250; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 21 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 11045 - 10425
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || ||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||  | ||    
T  11045 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaatccactctatatgccactgttccaactttctcagatat 10946  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||| ||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||     
T  10945 ctgatatggaccaataaacctcggtgtcaacttcttcgatttcaaggcacgacctatacctgtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttct 10846  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||||  ||  | ||||| ||||| |    
T  10845 tgtaactcaagatcctttctacacttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctcttatcaattg-gccttctctgtagtct 10747  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| || |||||||| || |  || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  10746 gttgaactatatctggtcccaacattacactttcacccgactcaaaccaacgtaacggagttctgcacctccgaccacacaaagcttcgaacggtgccat 10647  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || || || || || || ||| | |||||||  |  ||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  10646 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtaaacactatcaacgacaagtgactattccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaa 10547  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  10546 tcctctaacgactaaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagctgaactcaatctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttt 10447  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatct 642  Q
    || |||||||||| ||||||||    
T  10446 tcgaaaatctagatgtaaatct 10425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 8)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 91238 - 90566
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  91238 catacttccgcagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacctactctgtatgccactgttccaaccctctcagatat 91139  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    || |||||||| ||| ||||| |  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||| | ||||||| |||||| || ||||| ||     
T  91138 ctaatatggactaataaactttgaagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcgtaggagtaactctcagaaacacatgatctccctct 91039  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  |||||||| ||||| |    
T  91038 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtct 90939  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  |||||||| ||  | || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  90938 gatgaactaaatctggtcccaacgctacactttctcctgactcaaaccaacataaaggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 90839  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  90838 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcagcggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagaacacacactctcagcaaa 90739  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||   |||||  | ||||||||||| |    
T  90738 tcctctaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcacacccaagccatcttgcaaactct 90639  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  90638 tccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgatacaatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 90566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 22 - 477
Target Start/End: Original strand, 448060 - 448515
Alignment:
Q  22 atacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatc 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||| | ||||| | ||     
T  448060 atacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccacttgatgcgccaccgttccaattctttccgatatt 448159  T
Q  122 tgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcct 221  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||  ||| | |||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| |    
T  448160 tgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgctcgtccaacaatagttacaggagtgactctaaaaaatacgtgatctccttctt 448259  T
Q  222 gaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttg 321  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  448260 gaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgatagctcttctgtcgactctgcgacactttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttg 448359  T
Q  322 ctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccatt 421  Q
     |||||||| |||||||  || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| || |||||||||    
T  448360 ttgaacaatttctggtcaaaaaaccacactctcacctgactcgaaccaacacaacggagttctgcaccttcttccatacaaagcctcaaatggtgccatt 448459  T
Q  422 ccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgact 477  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||| || |||||    
T  448460 ccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacgggaggtgact 448515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 461 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 391066 - 390834
Alignment:
Q  461 atcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctg 560  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  391066 atcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctctaacgactgaatcgttctttccgactgaccatctg 390967  T
Q  561 tctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 660  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  390966 tctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctttatctgatac 390867  T
Q  661 aatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  390866 aatgctcgatggaacaccatgcaacttcacaat 390834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Original strand, 162113 - 162376
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||  | ||    
T  162113 catacttctgaagttgcgaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatat 162212  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| || ||||| ||  |||| ||||| |||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  162213 ctgatacgggccaataaatctcggagtcaagttctttgacttcgacgctcgtccaacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctacttct 162312  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttca 284  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  162313 tgaaacacaagatcttttttacgcttatcatgataactcttttgttgactctgcgacgctttca 162376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 383 - 636
Target Start/End: Original strand, 114542 - 114795
Alignment:
Q  383 ctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatccc 482  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||  | ||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  114542 ctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgagtggtaagtgttattgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatccc 114641  T
Q  483 aagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaact 582  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  114642 aagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtccactccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaact 114741  T
Q  583 caatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagt 636  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||    
T  114742 caacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagt 114795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #6
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 119 - 189
Target Start/End: Original strand, 175361 - 175431
Alignment:
Q  119 atctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 189  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  175361 atctgatacggaccaataaacttcgggatcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagg 175431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #7
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 608 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 89973 - 89888
Alignment:
Q  608 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  89973 tcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgatacaatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 89888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 146 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 78810 - 78666
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| | || | |||||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  78810 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactcctgtcacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 78711  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttct 290  Q
    | |||||||||||||| |||| | |||| || |||||||| ||||    
T  78710 tatcatgataactcttctgtctaatctgagatgccttcatcttct 78666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 21 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 42639 - 41970
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| | ||  ||||    
T  42639 catacttccgaagttgcgacacatggaacacatcaagcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaactctctctgaaat 42540  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||| ||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || || || || |||    
T  42539 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacttcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcc 42440  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||| || |||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  42439 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttcagtcgactctgcgacgcttccatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtct 42340  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  |  ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  42339 gatgaaccaaatacggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 42240  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  42239 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaa 42140  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  42139 tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactct 42040  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 690  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  42039 tccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 41970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 47705 - 47033
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| | ||  ||||    
T  47705 catacttccgaagttgcgacacatggaacacatcaagcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaactctctctgaaat 47606  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||  ||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || || || || |||    
T  47605 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatttcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcc 47506  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||| || |||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  47505 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttcagtcgactctgcgacgcttccatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtct 47406  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  |  ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  47405 gatgaaccaaatacggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtccttcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 47306  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||    
T  47305 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcttaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaa 47206  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  47205 tcctctaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaactct 47106  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||| || |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||||||    
T  47105 tccagaacctagaagtgaaccttggatccctatccgacacaatacttgacggtacaccatgcagcttcacaat 47033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 440 - 689
Target Start/End: Original strand, 2340 - 2589
Alignment:
Q  440 ctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattg 539  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  2340 ctattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactaccccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctaacgactgaatcg 2439  T
Q  540 tcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 639  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  2440 ttctctccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttacaacctaaagcctcttgcacactcttccaaaatctagaggtaaa 2539  T
Q  640 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttca 689  Q
     || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2540 cctcggatctctatctgatacattgctcgaaggaacaccatgtagcttca 2589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 245; Significance: 1e-135; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 19983 - 20655
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||    ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| |||||||| || ||  | ||    
T  19983 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacgccatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccttctctgatat 20082  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || ||||| ||     
T  20083 ctgatacggaccaatgaactttggagtaaacttcttcgacttcaacgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctct 20182  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||    |||||||  | ||||||  |||| |    
T  20183 tgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgggacgctttcatcttttcccttatcatcttgagtttctctatagtct 20282  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  || ||||| ||||| || || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  20283 gatgaaccaaatccggtcccaagacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgtcat 20382  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20383 accaatactcgaatggtaacttttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagaacacaaactctcaacaaa 20482  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| |  || || || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  20483 tcctccaatgattggatcgtcctctccgactaaacatctgtctgcggatgataaaccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactct 20582  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  20583 tccaaaatctagaagtgaacctcggatcgctatccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaat 20655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 13667 - 12995
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||| ||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||| | ||    
T  13667 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatat 13568  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| | ||| || || || || |||    
T  13567 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcc 13468  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  13467 tgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtct 13368  T
Q  321 gctgaa-caatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 419  Q
    | |||| |||| || ||||| || || || || ||   ||||||||||||||| ||  |||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  13367 gatgaatcaat-tccggtcccaacacaacactctctattgactcaaaccagcataaatgagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgcca 13269  T
Q  420 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 519  Q
    | |||||||| ||||  || || || || || |||||||| ||| |||| || ||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  ||    
T  13268 taccaatactcgaatagtaactgttgttgtatgtgaactctatctacggtaggtgactatcctaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaa 13169  T
Q  520 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 619  Q
    |||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || ||     
T  13168 atcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaatccaatgcatcttgtaagctc 13069  T
Q  620 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||| ||||| | || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  13068 ttccaaaatttagaaatgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 12995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 17437 - 16765
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||| ||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||| | ||    
T  17437 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatat 17338  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || || | ||| || || || || |||    
T  17337 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctaagaaatacatgatcaccctcc 17238  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  17237 tgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtct 17138  T
Q  321 gctgaa-caatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 419  Q
    | |||| |||| || ||||| || || || || ||   ||||||||||||||| ||  |||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  17137 gatgaatcaat-tccggtcccaacacaacactctctattgactcaaaccagcataaatgagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgcca 17039  T
Q  420 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 519  Q
    | |||||||| ||||  || || || || || |||||||| ||| |||| || ||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  ||    
T  17038 taccaatactcgaatagtaactgttgttgtatgtgaactctatctacggtaggtgactatcctaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaa 16939  T
Q  520 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 619  Q
    |||||| |  || || || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || ||     
T  16938 atcctccaatgattggatcgtccgctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaatccaatgcatcttgtaagctc 16839  T
Q  620 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||| ||||| | || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  16838 ttccaaaatttagaaatgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 16765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 21 - 494
Target Start/End: Original strand, 2 - 475
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  |||||||| ||||| | ||    
T  2 catacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgaaaatttgaaagatgcggtggtaaaccaactcgatatgccactattccaactctttccgatat 101  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| || |  || ||     
T  102 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaactttttttacttcaaagcacgtccaacaccagtcaccggattgactctcaaaaacacatgataaccctct 201  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||| |||||||||| |||| |    
T  202 tgaaactcaagatcctttctacggttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgactcatcttaactttctcaatagtct 301  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  302 gctgaacaatatctagtcctaagaccactctttctcctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccaaccatataaagcctcaaaaggtgccat 401  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcctt 494  Q
    |||||||||||||| |||  | ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  402 tccaatactagaattataattgttattgtatgtgaactctatcaacggaagatggctatcacaagttccacctt 475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 21 - 663
Target Start/End: Original strand, 27519 - 28161
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||  ||||||||| ||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  27519 catacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgatat 27618  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    || ||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| || ||||| |||    
T  27619 cttatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcgatgcacgtcctacacctgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcc 27718  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  27719 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctttgatcatcttgactttctctgtagtct 27818  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | |||||    |||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  27819 gatgaaccgaatctggtcccaacacaacactttctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaaacttcgaacggtgccat 27918  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||  |||    
T  27919 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaattctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcagtaaa 28018  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  28019 tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgatcccaaggcgtcttgcaaactct 28118  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 663  Q
    ||||||||||| |||| || || |||||||||||||| |||||    
T  28119 tccaaaatctataagtgaacctcggatctctatctgacacaat 28161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 1454 - 787
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  | ||||||||||||||| ||    ||||| |||   || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  1454 catacttccgaagttgcgacacatgaaatacatcattcaaattcgaaagatgtggtttcaaacctactttttatgccactgttccaaccctctcagatat 1355  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| || ||||| ||     
T  1354 ctgatacggaccaat-aacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacccgtcataggaatgattctcagaaacacatgatctccctct 1256  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  |||||||  ||||| |    
T  1255 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttcttcgtagtct 1156  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  |||||||| || |||||  |||| | |||||||||||| || |  ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  1155 gatgaactaaatctggtcccaacaccacattttctcttgactcaaaccaacatagaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggttccat 1056  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || ||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||| | ||||| || |    
T  1055 accaatactcgaatggtaactattgttgtacatgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcgagtacacacactctcagcaga 956  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  955 tcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggacgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactct 856  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttca 689  Q
    ||||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| | ||||||||||| |||||    
T  855 tccaaaaccttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatgaaacaccatgtaacttca 787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 539 - 663
Target Start/End: Original strand, 34290 - 34414
Alignment:
Q  539 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 638  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||| |    
T  34290 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgatcccaaggcgtcttgcaaactcttccaaaatctataagtga 34389  T
Q  639 atcttggatctctatctgatacaat 663  Q
    | || |||||||||||||| |||||    
T  34390 acctcggatctctatctgacacaat 34414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 7342 - 6670
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  7342 catacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactgttccaactctctcagatat 7243  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | || |||| |||||| || ||||| ||     
T  7242 ctggtatggaccaatgaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtaaccctcagaaacacatgatctccctct 7143  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||| ||  || || || |||||||    
T  7142 tgacactcaagggcttttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatattttctcttatcaacttgaccttttctgtagttt 7043  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  |||||||| || ||||| |||||    ||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||  |||    
T  7042 gatgaactaaatctggtcccaacaccacactttctgtcgactcaaaccaacacaattgagttctgcacctccgaccatacaatgcttcgaacggtatcat 6943  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| ||  | || ||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  6942 accaatactcgaatggtaattgttgttatacgtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaa 6843  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||| || |||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |    
T  6842 tcctctaacggctgaatcgttctctccgactgaccatttgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcctcttgtaaactct 6743  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||| || ||||| || ||  |||||||||| || |||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  6742 tccaaaaccttgaagtgaacctcagatctctatccgacacaatgttcgatggaaccccatgtaacttcacaat 6670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 9798 - 10465
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||| ||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  9798 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatat 9897  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||||| || ||||| ||     
T  9898 ctgataaggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcctacacccgccataggagtaactctcagaaacacatgatctccctct 9997  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||| |     | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  || ||||| ||||| |    
T  9998 tgaaactcacg-----tcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtct 10092  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  |||||||| || ||||| ||||| || | ||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10093 gatgaactaaatctggtcccaacaccacactttctcccgtctcaaaccaacataaaggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 10192  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||| | ||||| ||||    
T  10193 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgttcaagtagacacactctcagcaaa 10292  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| |    
T  10293 tcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgaaaactct 10392  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  10393 tccaaaatcttgaagtgaaccttggatctctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaat 10465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 33983 - 33311
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||| |  |||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||| || || |||||||| | ||||||||| || || ||| | ||  | ||    
T  33983 catacttccgcaactgcgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactctctcagatat 33884  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||     
T  33883 ctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatgatctccctct 33784  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatt--ttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 318  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   |||||||  || | || ||| || || |||||    
T  33783 tgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatccgttctctt--attaacttaaccttttccgtagt 33686  T
Q  319 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcc 418  Q
    ||| ||||| || |||||||| || | ||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||||    
T  33685 ttgttgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagttctgcaccttcgaccatacaaggcttcaaacggtgcc 33586  T
Q  419 attccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaaca 518  Q
    || |||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| |    
T  33585 ataccaatactcgaatggtaactattgttgtaagtaaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaata 33486  T
Q  519 aatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaact 618  Q
     ||||||||  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  33485 gatcctctaaggattgtatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaact 33386  T
Q  619 tttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
     ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  33385 cttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 33311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 146 - 681
Target Start/End: Original strand, 40383 - 40918
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||| |  |||| |||||||| || || || |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  40383 gtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 40482  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 345  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || || || || |     
T  40483 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggcccaaacaa 40582  T
Q  346 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 445  Q
      | ||||| || || |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||| | || ||     
T  40583 agcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttg 40682  T
Q  446 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 545  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||||| |    
T  40683 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtccttt 40782  T
Q  546 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 645  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  40783 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 40882  T
Q  646 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  40883 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 40918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 47124 - 47796
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  47124 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatat 47223  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||| | || |||| |||||| || ||||| ||     
T  47224 ctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgttataggagtaaccctcagaaacacatgatctccctct 47323  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  |||||||| ||||| |    
T  47324 tgaaactcaagggccttcctacgcttttcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtct 47423  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  47424 gatgaactaaatccggtcccaacacaacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgtcat 47523  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  47524 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaa 47623  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||  || ||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  47624 tcctctaatgattgaatcgttctctctgactgaccatttgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactct 47723  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||||||||| || || || |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  47724 tccaaaatctagaagtgaacctcgggtctctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaat 47796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 52169 - 51497
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  ||||  | ||    
T  52169 catacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctttcagatat 52070  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||||||||| | ||||| || ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| ||     
T  52069 ctgatatggaccactaaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctct 51970  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| || ||||| || |||   |||||||  || ||||| |||||||    
T  51969 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgaagctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagttt 51870  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || ||||| || ||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||||| ||||||||| ||||| |||| |||    
T  51869 gatgaaccaaatccggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacacaaaggagtcatgcacctccgactatacaaagcttcgaacggtgtcat 51770  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  51769 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacacactctcagcaaa 51670  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||  || |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  51669 tcctctactgattgaattgttctctccgactaaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaacccaatgcatcttgcaaactct 51570  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||| |||| || ||  |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  51569 tccaaaatctaaaagtgaacctcagatctctatccgacacaatactcgatggaacaccatgtaacttcacaat 51497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 14207 - 13535
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || || || |||| ||| ||||| |||||||   ||||  | ||    
T  14207 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaacccaactctatatgccactgttccaatcctttctgatat 14108  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| || || || ||     
T  14107 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaatttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttaaaaacacatgatccccctct 14008  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||    |||||||  |||||||||||||| |    
T  14007 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctcagtagtct 13908  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  13907 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcatctccgaccatacaaggcttcgaacggtgccat 13808  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     | |||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  13807 actaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccactttgctcaagcacacacactctcaacaaa 13708  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| | ||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  13707 tcctccaacgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactct 13608  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||| ||||| || ||  |||  ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  13607 tccaaaatcttgaagtgaacctctgattcctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 13535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 56 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 5224 - 4587
Alignment:
Q  56 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 155  Q
    ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  | |||||||| |||||||||||||| || |||||||||     
T  5224 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 5125  T
Q  156 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 255  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || ||  | ||||||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  5124 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcatcctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgata 5025  T
Q  256 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttca 355  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| |  ||||| |  || ||||| || || || || ||     
T  5024 actcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctaatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctct 4925  T
Q  356 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 455  Q
    | ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||  |||| || || || || || ||||    
T  4924 cttgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagattcgaacggtgccataccaatactcaaatggtaactgttgttgtatgtga 4825  T
Q  456 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 555  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||||||||||||||||    
T  4824 actctatcaacggtaggtgactatcccaagctccacctttctcaagtacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgacc 4725  T
Q  556 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 655  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||| |||| || || ||||| |||||     
T  4724 atctgtctgaggacgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccagaatctaaaagtgaacctcggatccctatcc 4625  T
Q  656 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    || | ||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  4624 gacataatactcgacggtacaccatgtagctttacaat 4587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 548 - 693
Target Start/End: Original strand, 67897 - 68042
Alignment:
Q  548 gactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 647  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || |    
T  67897 gactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaacctcgggt 67996  T
Q  648 ctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  67997 ctctatccgacactatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 68042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 31 - 693
Target Start/End: Original strand, 4760 - 5422
Alignment:
Q  31 aagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatgga 130  Q
    ||||||||||||||| || ||||  |||||||| |||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | |||| ||| |||    
T  4760 aagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaatttgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatcttatacgga 4859  T
Q  131 ccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaa 230  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || ||||| || ||||||||||    
T  4860 ccaatgaactttggagtcaatttcttagacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaa 4959  T
Q  231 gatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaat 330  Q
    |  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  |||||||||||||| || ||||| |     
T  4960 gggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctcagtagtctgatgaaccaa 5059  T
Q  331 ctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatacta 430  Q
     |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | || ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||     
T  5060 atctggtcccaacaccacactttctcctgactcaaaccattataaaggagttctgcacctctgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactc 5159  T
Q  431 gaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcg 530  Q
    ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||   |||||||||| ||    
T  5160 gaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcggaaaatcctctaacg 5259  T
Q  531 actgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatct 630  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||    
T  5260 attgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcagatgataagttgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccaaaatct 5359  T
Q  631 agaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||| || || | ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| | |||||||||    
T  5360 agaagtgaacctcgaatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgcaacttcacaat 5422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 230; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 344 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 8311 - 7963
Alignment:
Q  344 accactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctat 443  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  8311 accactctttcacctgattcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgccattccaatactagaatgataactgt 8212  T
Q  444 tattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcct 543  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  8211 tattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacataccctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcct 8112  T
Q  544 ctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctt 643  Q
    |||||||||||||| | |||  |||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8111 ctccgactgaccatttttctttggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgc-aacttttccaaaatctagaagtaaatctt 8013  T
Q  644 ggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  8012 ggatctctatctgacacaatgctcgacggaacaccatgcaacttcacaat 7963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 230; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 6183 - 6856
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||| | |||||||||||| || || |  ||||||||||||||| | |  || ||||| | || ||| ||||| ||||||| | ||||  ||||    
T  6183 catacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagaagagatggcaaaccaaatctatatgccacagttccaaatctttctgaaat 6282  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaa-aaacacgtggtctccttc 219  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || ||||  ||| || ||||| |||||    
T  6283 ctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcaggaaaaacatggtcaccttc 6382  T
Q  220 ctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 319  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  ||||||||||||||     
T  6383 ctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctatgatcatcttgactttctcagtagtc 6482  T
Q  320 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 419  Q
    |  ||||| |  || ||||| || || || ||||| ||  |||||||| |||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  6483 tcatgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctcccaactcaaacaagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgcca 6582  T
Q  420 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 519  Q
    | |||||||| ||||| || ||||| || || ||||| || ||||| || || ||||||||||||  |||||| |||||||| ||||| || |||| |||    
T  6583 taccaatacttgaatggtaactattgttgtatgtgaattctatcaatggtaggtgactatcccaaactcctccctgctcaagtacacatatcctcagcaa 6682  T
Q  520 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 619  Q
    ||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||  ||||     
T  6683 atcctctaaagattggattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaatttcgaacccaacgcatcttgtgaactc 6782  T
Q  620 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || || ||||| || | |||||| | |||||||||    
T  6783 ttccaaaatctagaagtgaaccttgggtctctatcggacactatactcgaggggataccatgcaacttcacaat 6856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 230; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 308 - 693
Target Start/End: Original strand, 1552 - 1937
Alignment:
Q  308 ttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcct 407  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1552 ttctcagtggtttgttgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatataaagcct 1651  T
Q  408 cgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaca 507  Q
    |  ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1652 cataaggtgccattccaacactggaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacaca 1751  T
Q  508 aattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcc 607  Q
    || |||||| ||||| || |   | |||||  |||||  |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||    
T  1752 aactctcaaaaaatcatcaaaaaaatgaatcatcctcaacgacagaccatctatctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcc 1851  T
Q  608 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||    
T  1852 tcttgcaaacttttacaaaatctagaagtaaatcttggatctatatctgatacaatgtttgaaggaacaccatgcaacttcacaat 1937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 27226 - 27897
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || || |||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  27226 catatttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaatcccactctgtatgccacggttccaaccctctctgatat 27325  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||| | ||||||| ||| || || | ||| ||     
T  27326 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgacataggagtaactctcagaaatacatgatatccctct 27425  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||| |||||  |||  ||||||| |||||| |||||||| |||||||||| || ||| ||||| || |||   |||||||  |||||||| ||||| |    
T  27426 tgaaattcaaggccttc-ctacgctcgtcatggtaactcttctgtcgactctacggcgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtct 27524  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  |||||||| || || ||  |||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27525 gatgaaccaaatctggtcccaacacaacattttctcctgactcgaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 27624  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  27625 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaa 27724  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  27725 tcctccaatgattgtatagtcctctccgactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactct 27824  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  27825 tccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 27897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 225; Significance: 1e-123; HSPs: 2)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 26142 - 26814
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||| ||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  26142 catacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagatat 26241  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||     
T  26242 ctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaaaaacacatgatctccctct 26341  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| || || || |||   |||||||  || ||||| ||||| |    
T  26342 tgaaactcaagggcctttctacgcttgtaatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttgatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtct 26441  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  || | ||| || || ||  |||| || ||||||||||  ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  26442 gatgaaccaaatccgctcccaacactacattttctcccgactcaaaccgacacaaaggagtcttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 26541  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||||||||| || || || || || |||||||| |||||||| ||||||||||   ||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  26542 accaatactagaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactataaaaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaa 26641  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| || || |    
T  26642 tcctctaacgactaaatcgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgtaagctct 26741  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||| || ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| | |||||||||    
T  26742 tccaaaaccttgaagtgaaccttggatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgcaacttcacaat 26814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 359 - 693
Target Start/End: Original strand, 26862 - 27196
Alignment:
Q  359 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 458  Q
    ||||||||||  ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||    
T  26862 gactcaaaccgacacaaaggagtcttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatacttgaatggtaactgttgttgtacgtgaact 26961  T
Q  459 cgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatc 558  Q
    | |||||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  26962 ctatcaacggtagatgactatctgaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactaaatcgttctctccgactgaccatc 27061  T
Q  559 tgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgat 658  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| || || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||     
T  27062 tgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgtaagctcttccaaaaccttgaagtgaaccttggatctctatccgac 27161  T
Q  659 acaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||| ||||| || |||||||| | |||||||||    
T  27162 acaatactcgatggtacaccatgcaacttcacaat 27196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 225; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 49513 - 48841
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  49513 catacttccgaagctgcgatacatgtaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacagttccaaccctctctgaaat 49414  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||| |||| |||||| || || || ||     
T  49413 ctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggaatgaccctcagaaacacatgatcaccctct 49314  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||  ||||||||  ||||| || ||||| |    
T  49313 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttttctgtagtct 49214  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      ||||| |  |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  49213 catgaaccaaatctggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 49114  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     || ||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||    
T  49113 acctatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaatggcaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaataaa 49014  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  49013 tcctctaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactct 48914  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||| || |||||||| || || ||||  ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  48913 tccagaacctagaagtgaacctcggattcctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagctttacaat 48841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 225; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 248613 - 249285
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| |||||||||  |||||||||| ||  ||||    
T  248613 catacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccacttttccaactttctctgaaat 248712  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  248713 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 248812  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||| ||    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||    |||||||  ||||||| |||||| |    
T  248813 tgaaactctagggactttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttcttagtagtct 248912  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      ||||| |  |  ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || || |||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  248913 catgaaccaagttcggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctcctaccatacaaagcttcgaacggtgccat 249012  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     || ||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |||| ||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  249013 acctatactcgaatggtaactgttattgtatgtgaactctatcagcggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaa 249112  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  249113 tcctccaacgattggatcgtcctctcagactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactct 249212  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  249213 tccagaacctagaggtaaacctcggatccctatctgacacaatactcgacggtactccatgtagcttcacaat 249285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 21 - 484
Target Start/End: Original strand, 16987 - 17450
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||  | ||    
T  16987 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccacttgatacgccaccgttccaattctttctgatat 17086  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||| | || ||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  17087 ctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacacaaatcacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttct 17186  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| || ||||| ||||||| ||| ||| |||||||||    
T  17187 tgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacactttcatcttttcttgaatcatcttaaccttcacagtagttt 17286  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||  || |||||||| || || ||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  17287 gttgaatgatttctggtcccaaaactacaatctcacctgactcgaaccaacacaacggagttctacacctccgaccatacagagcctcaaaaggtgccat 17386  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaa 484  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  17387 tccaatgctagaatgataactgttattgtacgtgaattctatcaacggaagatgactatcccaa 17450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 29075 - 28402
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |  ||||  ||||||||||| ||||| |  ||  ||||||||| ||| ||||| || |||||| | ||  | ||    
T  29075 catacttctgaagttgcgacacatgaagcacatcatgcaaattcgagagatgtgatgggtaacccactctatatgccactgtcccaactctctcagagat 28976  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||| | || |||||||||||||||| |||||||||||     
T  28975 ctgatatggaccaataaaccgtggagtcaacttctttgacttcaaagcacgacagacacctgtcacatgagtgactctcaaaaacacatggtctccttct 28876  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg-atca-tctgaactttctcagtagt 318  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |   |||| | ||| |||| ||  ||||    
T  28875 tgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgatgctttcatcttctcctcttatcaatttgaccttt-tctatagt 28777  T
Q  319 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcc 418  Q
     || ||||| || | |||||| || ||  | || |||||  |||||||| |  | ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  28776 ctgatgaactatatatggtcccaacactgcactgtcacccaactcaaacaaagataacagagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgcc 28677  T
Q  419 attccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaaca 518  Q
    || |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||| | ||||| ||    
T  28676 ataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagcttcaccttgctcaagtacacatactctcagca 28577  T
Q  519 aatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaact 618  Q
    |||||||||  ||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||| || ||||| |||||||||||| |    
T  28576 aatcctctaatgactggatcgttctctccaactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccccaacttagaacccaacgcctcttgcaaagt 28477  T
Q  619 tttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  28476 ttttcaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgacacaatgctcgacggaacaccatgcaacttcacaat 28402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 41066 - 40393
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |  ||||  ||||||||||| ||||| |  ||  ||||||||| ||| ||||| || |||||| | ||  | ||    
T  41066 catacttctgaagttgcgacacatgaagcacatcatgcaaattcgagagatgtgatgggtaacccactctatatgccactgtcccaactctctcagagat 40967  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||| | || |||||||||||||||| |||||||||||     
T  40966 ctgatatggaccaataaaccgtggagtcaacttctttgacttcaaagcacgacagacacctgtcacatgagtgactctcaaaaacacatggtctccttct 40867  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg-atca-tctgaactttctcagtagt 318  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |   |||| | ||| |||| ||  ||||    
T  40866 tgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgatgctttcatcttctcctcttatcaatttgaccttt-tctatagt 40768  T
Q  319 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcc 418  Q
     || ||||| || | |||||| || ||  | || |||||  |||||||| |  | ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  40767 ctgatgaactatatatggtcccaacactgcactgtcacccaactcaaacaaagataacagagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgcc 40668  T
Q  419 attccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaaca 518  Q
    || |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||| | ||||| ||    
T  40667 ataccaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagcttcaccttgctcaagtacacatactctcagca 40568  T
Q  519 aatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaact 618  Q
    |||||||||  ||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||| || ||||| |||||||||||| |    
T  40567 aatcctctaatgactggatcgttctctccaactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccccaacttagaacccaacgcctcttgcaaagt 40468  T
Q  619 tttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  40467 ttttcaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgacacaatgctcgacggaacaccatgcaacttcacaat 40393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 324 - 573
Target Start/End: Original strand, 46531 - 46780
Alignment:
Q  324 gaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattcc 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46531 gaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctcctaccatataaagcctcgaaaggtgccattcc 46630  T
Q  424 aatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcc 523  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46631 aatactagaatgataactattattgtaagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatcc 46730  T
Q  524 tctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgata 573  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  46731 tctagcgactgaattgtcctctccaactgaccatctgtctgtggatgata 46780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 21 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 86810 - 86154
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||  || |  |||||||| ||||| ||||||||||||| ||| || ||||  |||||| ||||| ||||    
T  86810 catacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaggttcgaaagttgcggtggtaaacccactctatacgcaaccgacccaactctttccgaaat 86711  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
     ||||| || ||||| ||| |||  ||||  |||||||| || |  |||||||| ||||| |||| | || ||||||| |||||||| |||| ||||||     
T  86710 ttgatacgggccaataaacctcgaagtcagtttctttgattttagtgcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctaaaaaacacatggtatccttct 86611  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||| || |||   |||| || ||| ||||||||||| |    
T  86610 tgaaactcaagatccttcctacgattatcatgataactcttttgtctactctgtgacgcttccatcttttctcttatcaacttaaccttctcagtagtct 86511  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | |||| ||| |||||||| |  |||||  | ||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||    
T  86510 gttgaaaaatgtctggtcccagtaccacagtctcaccggactcataccaacacaacagagttctgcatctccgaccatacaacgcttcgaacggtaccat 86411  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
    | |||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  86410 tgcaatgctagaatggtaactgttattataagtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaag 86311  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| |  || |||||||||||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||     | |||    |||||||  | ||||| ||||| |||||||| |    
T  86310 tcctccaatgattgaattgtcctctccgcctgtccacccgtctgtggatgata----cacctc--cgtcaacttataacccaacgcctcctgcaaactct 86217  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 683  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  86216 tcaaaaatctagaagtaaatcttgggtctctatttgatacaatactcgacggaacaccatgta 86154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 18843 - 18171
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||| ||||||| || || ||||||||||  || ||||| |||| |||  | ||  | ||    
T  18843 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggaaaacccactctgtatgccactgttctaaccctctctgatat 18744  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||   |||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| || ||||| ||     
T  18743 ctgatacaaaccaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctct 18644  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||   |||||||  |||||||| ||||| |    
T  18643 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtct 18544  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  |||||||| ||  | || ||||| ||||||||||| || || || |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  18543 gatgaactaaatctggtcccaactctacactttctcctgactcaaatcaacataaaggagttttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 18444  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| | | | | ||||    
T  18443 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcatgtacacacacttttagcaaa 18344  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||  || || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |    
T  18343 tcctctaatgattggatcgtcctcttcgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactct 18244  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||  || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  18243 tccaaaatctagaagtgaaccttggatctctatacgacacaatactcgacggaactccatgaaacttcacaat 18171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 39739 - 40410
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||  ||||||||||| ||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  39739 catacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgcaaattcgagagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatat 39838  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    | |||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |  || ||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || ||||| |||    
T  39839 cggatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttgagtgcgcgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcc 39938  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   || ||||  ||||||||  |||| |    
T  39939 tgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatagtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttataatcttgactttctcgttagtct 40038  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  || ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| ||| || ||   || |||    
T  40039 gatgaaccaaatccggtcccaataccacactttctcccgactcaaaccaacataaaggagt-ctgcacctccgaccatacagagcttcaaacattgtcat 40137  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  40138 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaaaggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaacaaa 40237  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  40238 tcctccaatgactgaatcgtcctctccgactgaccatctctttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactct 40337  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  40338 tccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgtaacttcacaat 40410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 61519 - 60848
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||  |||   | ||    
T  61519 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaacccttttagatat 61420  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||| | || |||| ||| || || || || |||    
T  61419 ctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctcc 61320  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  61319 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtct 61220  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      ||||| |  |||| ||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  61219 catgaaccaaatctgatcccaacaccaccctctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 61120  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     || ||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||  ||    
T  61119 acctatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaaaggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaa-taa 61021  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  61020 tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactct 60921  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  60920 tccagaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaat 60848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 67907 - 67236
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||  |||   | ||    
T  67907 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaacccttttagatat 67808  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||| | || |||| ||| || || || || |||    
T  67807 ctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctcc 67708  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  67707 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtct 67608  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      ||||| |  |||| ||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  67607 catgaaccaaatctgatcccaacaccaccctctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 67508  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     || ||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||  ||    
T  67507 acctatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaaaggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaa-taa 67409  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  67408 tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactct 67309  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  67308 tccagaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaat 67236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 52485 - 51814
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||| ||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||  |||   | ||    
T  52485 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaatttcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaacccttttagatat 52386  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||| | || |||| ||| || || || || |||    
T  52385 ctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctcc 52286  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  52285 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtct 52186  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      ||||| |  |||| ||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  52185 catgaaccaaatctgatcccaacaccaccctctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 52086  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     || ||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||  ||    
T  52085 acctatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaaaggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaa-taa 51987  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  51986 tcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactct 51887  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51886 tccagaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaat 51814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 220; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 21 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 10389 - 9782
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||| | |||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||  || |    
T  10389 catacttccgcaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaactctttctgaact 10290  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || || || || |||    
T  10289 ctgatatggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcc 10190  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  10189 tgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgatgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtct 10090  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      ||||| |  || ||||| || || || ||||| || ||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10089 catgaaccaaatccggtcccaacacaacactttctcccgacccaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaatggtgccat 9990  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  || | ||||    
T  9989 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacatacccttagcaaa 9890  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||  || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || || || || ||||| || ||||| ||||| |    
T  9889 tcctctaaagattggattgtcctctccgactgaccatatgtctgcggatgataagccgaactcaaccttaattttgaacccaatgcatcttgtaaactct 9790  T
Q  621 tccaaaat 628  Q
    ||||||||    
T  9789 tccaaaat 9782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 587 - 693
Target Start/End: Original strand, 12060 - 12166
Alignment:
Q  587 ctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagct 686  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12060 ctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagct 12159  T
Q  687 tcacaat 693  Q
    |||||||    
T  12160 tcacaat 12166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 220; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 22 - 693
Target Start/End: Original strand, 42784 - 43455
Alignment:
Q  22 atacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatc 121  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||| ||||||| || || ||||| |||| ||||||||| |||||||| || ||  |||||    
T  42784 atacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcaaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccactgttccaaccttctctgaaatc 42883  T
Q  122 tgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcct 221  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| || | ||| || || || || ||||    
T  42884 tgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgaccctaagaaaaacatgatcaccctcct 42983  T
Q  222 gaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttg 321  Q
    ||||||| ||    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||    |||||||  ||||||| |||||| |     
T  42984 gaaactctagggactttctccgcttgtcatggtaactattctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttcttagtagtctc 43083  T
Q  322 ctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccatt 421  Q
     ||||| |  || ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||     
T  43084 atgaaccaagtccggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcatagaggagtcctacacctccgaccatacaacgcttcgaacggtgccata 43183  T
Q  422 ccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaat 521  Q
    |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  43184 ccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaat 43283  T
Q  522 cctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactttt 621  Q
    |||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  43284 cctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaaattcagcttcgatcccaaagcatcttgcaaactctt 43383  T
Q  622 ccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  43384 ccagaacctagaagtgaacctcggatccctatctgatacaatactcgacggtacaccgtgtagcttcacaat 43455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 4)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 21977 - 21305
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||| | ||    
T  21977 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatat 21878  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    || ||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || ||||  || ||     
T  21877 cttatacggaccaatgaacttcggaatcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatggttaccctct 21778  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||    |||||||  |||||||||||||| |    
T  21777 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctcagtagtct 21678  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || |   | ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21677 gatgaaccaagtccggtcccaacacaacacccactcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 21578  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  21577 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaa 21478  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| |  || || || ||| ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || |    
T  21477 tcctccaaagattgtatcgtcgtctccgactgaccgtctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctct 21378  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||  | ||||||||||||||||||||    
T  21377 tccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgacagcacaccatgtagcttcacaat 21305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 221 - 468
Target Start/End: Original strand, 26006 - 26253
Alignment:
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||    
T  26006 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactatgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagttt 26105  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      || ||||  || ||||| || |   | ||||| || || |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  26106 cttgcacaacttccggtccaaacaaagcactttctccggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccat 26205  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacgg 468  Q
     || ||||||| |||| | || || || ||||| || |||||||||||    
T  26206 accgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaattcgatcaacgg 26253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 503 - 639
Target Start/End: Original strand, 26288 - 26424
Alignment:
Q  503 acacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccca 602  Q
    ||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||    
T  26288 acacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaagttagttccca 26387  T
Q  603 aagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 639  Q
    ||||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||    
T  26388 aagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaa 26424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 620 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 11164 - 11091
Alignment:
Q  620 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||  | ||||||||||||||||||||    
T  11164 ttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgacagcacaccatgtagcttcacaat 11091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 19120 - 19792
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||   ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||| | ||    
T  19120 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacaacatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatat 19219  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| | ||||||||| || || ||||||||| | |||||||| ||| |||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || || || || |||    
T  19220 ctgatacgaaccaatgaattttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccatcc 19319  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||   ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  19320 tgaaactcaaggtcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttccctgatcatcttgactttctctgtagtct 19419  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      ||||| |  || ||||| || || || || |  ||||||||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  19420 catgaaccaaatccggtcccaatacaacactctatcctgactcaaaccagaataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 19519  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| |||||||| || || || || |||||||| |||||| | || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  19520 accaatactcgaatgataactgttgttgtatgtgaactctatcaacagtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaa 19619  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| |  || || || ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  19620 tcctccaatgattggatcgtcgtctccgactgaccatctgtctgaggatcataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactct 19719  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19720 tccagaacctagaagtgaacctcggatccctatcagacacaatactcgacggaactccatgtagcttcacaat 19792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 65 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 58668 - 58448
Alignment:
Q  65 gaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttca 164  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| |||| | ||||  |||||||||| || ||||| ||| |||| ||||  |||||||| ||||    
T  58668 gaaagatgcggtggtaaacccactctatacgcaaccgtcccaattctttctgaaatctgatacgggccaataaacctcggagtcagtttctttgatttca 58569  T
Q  165 aagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttg 264  Q
      ||| |||| ||||| |||| | || || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||    
T  58568 gtgcatgtccaacaccggtcacatgagtggctctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaagatccttcctatgcttatcatgataactcttttg 58469  T
Q  265 tcgactctgcgacgccttcat 285  Q
    || ||| |||||||| |||||    
T  58468 tctactatgcgacgctttcat 58448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 528 - 1200
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  |||||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  528 catactttggaagttccgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactgttccaaccctctctgaaat 627  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
     ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| || || || ||||  |||||||| ||||||||| | |||||||| ||||| || ||||| ||     
T  628 ttgatacggaccgataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcactgcctacacctgtcataggagtaactctcaagaacacatgatctccctct 727  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  | |   |||| || ||| || || ||||| |    
T  728 tgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcacgatagctcttatgtcgactctgcgacgctttcatctgttttcttatcaacttaaccttttctgtagtct 827  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    ||||||| || |||||||| || | ||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  828 gctgaactatgtctggtcccaacatcacactttctcccgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaaaggagccat 927  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||    
T  928 accaatactcgaatggtaactgttattgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcgcaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaa 1027  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || |    
T  1028 tcctccaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctct 1127  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||  ||||||||||| || ||  |||||||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  1128 tcctgaatctagaagtgaacctcagatctctatccgacacaatactcgacggtaccccatgtagcttcacaat 1200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 626 - 693
Target Start/End: Original strand, 12582 - 12649
Alignment:
Q  626 aatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  12582 aatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggtaccccatgtagcttcacaat 12649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 21 - 680
Target Start/End: Original strand, 37202 - 37861
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||| |||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  ||||  | ||    
T  37202 catacttccgaagttgcgagacatgtaacacatcatgcaaatttgaaagatgaggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctttcagatat 37301  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||  ||||||| | |||||| || ||||   |     
T  37302 ctgatatagaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggggtgactctaagaaacacatgatctctccct 37401  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||   | || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   ||||||| ||||||||| ||||| |    
T  37402 tgaaactcaatggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttaactttctccgtagtct 37501  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  || ||||| || || ||  |||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  37502 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacagtttctcctgactcaaaccaacacaaaggggtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgcgat 37601  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| ||  | || || || |||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  37602 accaatactcgaatggtaattgttgttgtacgtgaactccatcaacggtagatgactatctcaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaa 37701  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||| || ||||| || || |    
T  37702 tcctctagtgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgataggctgaactgaacctcaactttgaacccaaggcatcttgtaagctct 37801  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccat 680  Q
    ||||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||    
T  37802 tccaaaaccttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctcgatggaaccccat 37861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 119 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 38382 - 38103
Alignment:
Q  119 atctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctt 218  Q
    |||||||| |||||||| || ||  | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || ||||| |    
T  38382 atctgatacggaccaattaatttttgagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccct 38283  T
Q  219 cctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 318  Q
    | |||||||||||  | || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| | ||| || |||   |||||||  |||||||| |||||    
T  38282 cttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcttggtaactcttctgtcgactctgcgacgcttccatcttttctctaatcatcttgactttctccgtagt 38183  T
Q  319 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactc-aaaccagcacaacggagttctgcatctccgacca 397  Q
     || |||   |  || ||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||||||    
T  38182 ctgatgattcaaatccggtcccaacacaacactttctcctgactcaaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgacca 38103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 119 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 27545 - 27385
Alignment:
Q  119 atctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctt 218  Q
    |||||||| |||||||| || ||  | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || ||||| |    
T  27545 atctgatacggaccaattaatttttgagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccct 27446  T
Q  219 cctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgc 279  Q
    | |||||||||||  | || ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  27445 cttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcgtggtaactcttctgtcgactctgcgacgc 27385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 401 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 197404 - 197106
Alignment:
Q  401 aaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaa 500  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  197404 aaagcctcaaaaggtgccattccaatactagaatgataattgttattgtatgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaa 197305  T
Q  501 gaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcc 600  Q
    | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  197304 gtacacaaactctcagcaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgaccgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacc 197205  T
Q  601 caaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 699  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||| |||||    
T  197204 taaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatttgatacaatgctcgaaggaacgccatacaacttcacaatctcctt 197106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 350 - 468
Target Start/End: Original strand, 21927 - 22045
Alignment:
Q  350 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 449  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| ||  |||| || | || ||||||||||||||| || ||||||||  | |||||||||||| |  | || ||||    
T  21927 ctttcacctgactcataccaacacaatggcattctacaccccctaccatacaaagcctcaaatggtgccatatcgatactagaatgaaaattgttgttat 22026  T
Q  450 aagtgaactcgatcaacgg 468  Q
    |||| ||||| ||||||||    
T  22027 aagtaaactcaatcaacgg 22045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 98 - 770
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || |||||||||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  98 catatttccgaagttgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctctgatat 197  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || ||||| ||     
T  198 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaaagcacgtcatacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctct 297  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  |  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| || ||||| || ||    |||||||  |||||||| ||||| |    
T  298 tgaaactcaagggcccttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgatgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctctgtagtct 397  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  398 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccgtacaaagcttcgaacggtgccat 497  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     | |||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||    
T  498 acgaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactcttaacaaa 597  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| |  || || ||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || |    
T  598 tcctccaaagattggatcatcctctccgtctgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaagctct 697  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||    ||||| ||||| || |||||||| | |||||||||    
T  698 tccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccaccacaatactcgatggtacaccatgcaacttcacaat 770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 2751 - 3423
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  2751 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctctgatat 2850  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || | ||| ||     
T  2851 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttctcagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcataaatacatgatatccctct 2950  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| | ||||| || ||    |||||||  |||||||| || || |    
T  2951 tgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaacccttctgtcgactctgcgacactttcatcttttcccttatcatcttgactttctctgttgtct 3050  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  3051 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagctttgaacggtgccat 3150  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || |||||||||||||  || ||||| ||||| ||||| | |||||  |||    
T  3151 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagcaccaccttgttcaagcacacacactctcagtaaa 3250  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| |  || || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | ||||| ||| |    
T  3251 tcctccaatgattggattgtcctcttcgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcattttgcagactct 3350  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||||||||| || ||  |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  3351 tccaaaatctagaagtgaacctcagatcactatccgacacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 3423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 569 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 12954 - 12833
Alignment:
Q  569 tgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcg 668  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||| |  ||||||||   ||||||||||  |||||| || || || || |||||||||||||| || ||||| | ||    
T  12954 tgatatgcagaactcagttttaacttagtacccaaagcactttgcaaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatacacg 12855  T
Q  669 aaggaacaccatgtagcttcac 690  Q
    ||||||||||||| | ||||||    
T  12854 aaggaacaccatgcaacttcac 12833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 49339 - 48668
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| || || |||||||||   || ||| | ||||||||  | ||  | ||    
T  49339 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgaaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccgctgttccaaccctctcagatat 49240  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||  | ||||||| |||||| || | ||| ||     
T  49239 ctgatacggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaacgcacttcctacacctgtcataggtgttactctcagaaacacatgatttccctct 49140  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| || ||||| || |||   |||||||  || ||||| ||||| |    
T  49139 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctatcgactctgcgatgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtct 49040  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  ||  |||| || ||||| ||||||| |||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  49039 gatgaaccaaatccagtcccaataccacactttcacgtgactcgaaccaacataaaggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgtacggtgccat 48940  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| | |||     
T  48939 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctaagcaa- 48841  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    |||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  48840 tcctctaatgattgaatcgtcctttccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccttaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactct 48741  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||| |||| ||||| || || |||||| |||| || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  48740 tccaacatcttgaagtgaacctcggatctttatccgacacaatactcgacggaaccccatgtaacttcacaat 48668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 58122 - 57511
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||||||||||   | ||  ||||    
T  58122 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaat 58023  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||  |||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| || || || || | |    
T  58022 ctgatacagaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcacccttc 57923  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||| || ||    |||||||  ||  ||||||| || |    
T  57922 tgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaact-ttttgtcaactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccctctcagtcgtct 57824  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  57823 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataacggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 57724  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||| | ||||| ||||| | ||||||||||    
T  57723 accaatactcgaatggtaactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccacctcgttcaagcacacacactctcaacaaa 57624  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| |  || || || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||| |    
T  57623 tcctccaatgattggatcgtcttctccgactgaccatctgtctgaggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgttctgcaaactct 57524  T
Q  621 tccaaaatctaga 633  Q
    |||| || |||||    
T  57523 tccagaacctaga 57511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 21 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 17019 - 16350
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| | ||  ||||    
T  17019 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaactctctctgaaat 16920  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    || ||| |||||||||||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  16919 ctaatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 16820  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatca-tctgaactttctcagtagtt 319  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| || |||   |||| ||||| |||||||||||||     
T  16819 tgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcggctctgcgaagctttcatcttttctcttatcaatctga-ctttctcagtagtc 16721  T
Q  320 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 419  Q
    |  ||||| |  || ||||| || || || || ||||| |||| ||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  16720 tcatgaaccaagtccggtcccaacacaacactctcacccgacttaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgcca 16621  T
Q  420 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 519  Q
    | |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  16620 taccaatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaa 16521  T
Q  520 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 619  Q
    ||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||     
T  16520 atcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactc 16421  T
Q  620 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 690  Q
    ||||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16420 ttccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcac 16350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 198; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 7542 - 6872
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||  ||||| ||||||| ||| || || ||||| |||| ||| ||||| |||||||| || |   ||||    
T  7542 catacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaatatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccttctg--aaat 7445  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||  |||||| | | || |||| ||| || || || || |||    
T  7444 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccatcatagaagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcc 7345  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||| |||  | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||  ||||||||  |||||||| ||||  |    
T  7344 tgaaacttaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagact 7245  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  || ||||| || || || |  || |||||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  7244 gatgaaccaaatccggtcccaacacaacaccctctcctgacacaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatataaagcttcgaacggcgccat 7145  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||    
T  7144 accaatacttgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacgttagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaa 7045  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| |  || || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  7044 tcctccaaagattgtatcgtccactccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaacgcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaactct 6945  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    | || ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||||||    
T  6944 ttcagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgacggtacaccatgtagcttcacaat 6872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 56 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 16736 - 16375
Alignment:
Q  56 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 155  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | | |||||||| |||||| | ||| || | ||||||||||    
T  16736 tgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccgttccaactcttttcgatatctgatacggaccagtaaacctctgagtcaacttct 16637  T
Q  156 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 255  Q
    |||||||||| |  ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  16636 ttgacttcaatgtgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacgtgatctccctcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatggta 16537  T
Q  256 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttca 355  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| || | ||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||| || |||    
T  16536 actcttttgtcaactctgcgacgctttcatcttttattgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttttggtcctaaaaccacactctca 16437  T
Q  356 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgc 417  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16436 cctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcaaaaggtgc 16375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 620 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 8794 - 8721
Alignment:
Q  620 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  8794 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctaatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 8721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 705 - 38
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||    ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  705 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacgccatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgaaat 606  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || || | ||| || || || || |||    
T  605 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctaagaaatacatgatcaccctcc 506  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  505 tgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtct 406  T
Q  321 gctgaa-caatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 419  Q
    | |||| |||| || ||||| || || || || ||   ||||||||||||||| ||  |||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  405 gatgaatcaat-tccggtcccaacacaacactctctattgactcaaaccagcataaatgagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgcca 307  T
Q  420 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 519  Q
    | || ||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | ||||         
T  306 taccgatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctc----- 212  T
Q  520 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 619  Q
    |   || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  211 agtttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgtaaactc 112  T
Q  620 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  111 ttccaaaatctagaggtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 38  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 10888 - 11560
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||| ||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||| | ||    
T  10888 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatat 10987  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || || | ||| || || || || |||    
T  10988 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctaagaaatacatgatcaccctcc 11087  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| ||||| |    
T  11088 tgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtct 11187  T
Q  321 gctgaa-caatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 419  Q
    | |||| |||| || ||||| || || || || ||   ||||||||||||||| ||  |||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  11188 gatgaatcaat-tccggtcccaacacaacactctctattgactcaaaccagcataaatgagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgcca 11286  T
Q  420 ttccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaa 519  Q
    | |||||||| ||||  || || || || || |||||||| ||| |||| || ||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  ||    
T  11287 taccaatactcgaatagtaactgttgttgtatgtgaactctatctacggtaggtgactatcctaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaa 11386  T
Q  520 atcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactt 619  Q
    |||||| |  || || || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || ||     
T  11387 atcctccaatgattggatcgtccgctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaatccaatgcatcttgtaagctc 11486  T
Q  620 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||| ||||| | || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  11487 ttccaaaatttagaaatgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 11560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 146 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 7991 - 7456
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| |||| | |||||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| || || | ||    
T  7991 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcctct 7892  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 345  Q
    | |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || | |||||  || ||||  ||||||||||| |     
T  7891 tatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgcagtttcttgcacaacttctggtcctaacaa 7792  T
Q  346 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 445  Q
      |  | || || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| | || ||     
T  7791 agcattctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 7692  T
Q  446 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 545  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |     ||||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  7691 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcatcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 7592  T
Q  546 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 645  Q
    ||| ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  7591 ccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 7492  T
Q  646 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||||| ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  7491 atctcgatccgacacaatactagaaggaataccatg 7456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 461 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 4965 - 4727
Alignment:
Q  461 atcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctg 560  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4965 atcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctg 4866  T
Q  561 tctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 660  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4865 tctgtggatgatacgccgaactcaatcccaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 4766  T
Q  661 aatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 699  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  4765 aatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 4727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 146 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 567 - 32
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||| || ||||| |||| |||| | || ||||||||||| ||  | ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  567 gtcaacttcctacactccaaagcacggccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgagcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 468  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 345  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || ||||| |  |  ||||  || |||||||| |     
T  467 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtctctttcacaacttccggtcctaacaa 368  T
Q  346 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 445  Q
      | |||||||| ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||| |  | ||     
T  367 agcactttcaccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaatggtgccattccgatacaagaatgaaaattgttg 268  T
Q  446 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 545  Q
    || ||||| ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  267 ttgtaagtaaactcaatcaatggtaaacattcgtcccaactaacaccttgctccaaaacacaagttctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 168  T
Q  546 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 645  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  167 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 68  T
Q  646 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||||| |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  67 atctcgatctgacacaatactagaaggaataccatg 32  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 135 - 693
Target Start/End: Original strand, 1908 - 2466
Alignment:
Q  135 tgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatc 234  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| || |||||||||||  |    
T  1908 tgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggc 2007  T
Q  235 ttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttca--ttttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 332  Q
     || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||  |||||||  ||  |||| ||||| ||  |||  |  |    
T  2008 cttcctatgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgtcgctttcaccttttctctt--atcatcttgaccctctccgtagtctgaagaatcaaat 2105  T
Q  333 ctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactaga 432  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||    
T  2106 ctggtcccaacaccacactttctcctgactcgaaccaacataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcga 2205  T
Q  433 atgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgac 532  Q
    ||| || || |  || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| | | ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  ||     
T  2206 atggtaactgtagttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctacaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgat 2305  T
Q  533 tgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctag 632  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |    
T  2306 taaatcgtcctctccgactgaccatctgtctacggatgatatgccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcgtg 2405  T
Q  633 aagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||| || || |||| |||||| || ||||| ||||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  2406 aagtgaacctcggatgtctatccgacacaatactcgatggaagtccatgtaacttcacaat 2466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 56 - 681
Target Start/End: Original strand, 18884 - 19509
Alignment:
Q  56 tgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttct 155  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| || |||||| | ||  | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  18884 tgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatacgccactgtcccaactctctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttct 18983  T
Q  156 ttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgata 255  Q
    | || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||||||||||    
T  18984 tagattttaatgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatggtctccctcttgaaactcaaggtccttcatacgcttgtcatgata 19083  T
Q  256 actcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttca 355  Q
     ||||| ||| ||||||||||||| ||||| |  ||||  |||| || ||  || || ||||| || ||||| || | ||| || || | ||| |||||     
T  19084 gctcttctgttgactctgcgacgctttcatctgttcttttatcaacttaatcttttctgtagtctgttgaactatgtatggccccaacatcacactttct 19183  T
Q  356 cctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtga 455  Q
    || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |    
T  19184 cccgactcgaaccaacacaaaggagttctgcatcttcgaccatacaatgcttcaaacggtgccataccaatactcgaatggtaactattgttgtaagtaa 19283  T
Q  456 actcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgacc 555  Q
    ||||   |||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||| || || || ||||||| ||||||| |    
T  19284 actcttccaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacattctcagtaaatcctctagagattgtatcgtcctcttcgactgatc 19383  T
Q  556 atctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 655  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||    |||||||||||     
T  19384 atctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgaacccagagcatcttgcaaactcttctagaatctagaagtgaactgcggatctctatcc 19483  T
Q  656 gatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||    
T  19484 gacacaatactcgacggaacaccatg 19509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 119 - 681
Target Start/End: Original strand, 23109 - 23671
Alignment:
Q  119 atctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcctt 218  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |    
T  23109 atctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatggtctccct 23208  T
Q  219 cctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 318  Q
    | ||||||||||| || ||  |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||| |  ||||  |||| || ||  || || |||||    
T  23209 cttgaaactcaaggtccttcatacgcttgtcatgatagctcttctgttgactctgcgacgctttcatctgttcttttatcaacttaatcttttctgtagt 23308  T
Q  319 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcc 418  Q
     || ||||| || | ||| || || | ||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||||    
T  23309 ctgttgaactatgtatggccccaacatcacactttctcccgactcgaaccaacacaaaggagttctgcatcttcgaccatacaatgcttcaaacggtgcc 23408  T
Q  419 attccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaaca 518  Q
    || |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||   |||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||  |    
T  23409 ataccaatactcgaatggtaactattgttgtaagtaaactcttccaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacattctcagta 23508  T
Q  519 aatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaact 618  Q
    |||||||||| || || || ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |||| ||| |||||||||||    
T  23509 aatcctctagagattgtatcgtcctcttcgactgatcatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgaacccagagcatcttgcaaact 23608  T
Q  619 tttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
     ||| | ||||||||||| ||    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  23609 cttctagaatctagaagtgaactgcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatg 23671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 4)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 43505 - 44177
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  43505 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataggccacagttccaaccctctctgaaat 43604  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | || ||||| ||||||||||| || ||||||||| | || |||| |||||| || || || |||    
T  43605 ctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgaattcaatgcacgtcctaccccggtcataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcc 43704  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | ||||| |||||||||||  ||||||| | |||||||| |||||| ||||| || |||  |||||||| |||||| || ||||| |    
T  43705 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggcaactcttctatcgactctacgacgctttcatcttttctctgatcatcttaactttttctgtagtct 43804  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      ||||| |  || | ||| || ||||| || || ||||||||| ||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  43805 catgaaccaaatccgttcccaacaccacactctctcctgactcataccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 43904  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     || ||||| ||||| || || ||||| || | |||||| |||| | | || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  43905 acctatactcgaatggtaactgttattgtatgcgaactctatcagcagtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacatactctcaacaaa 44004  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| |  || || |   |||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  44005 tcctccaatgattggaccatcctctccgactgaccatgtatctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaccccaaagcgtcctgtaaactct 44104  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44105 tccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaat 44177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 44517 - 45189
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  44517 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataggccacagttccaaccctctctgaaat 44616  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | || ||||| ||||||||||| || ||||||||| | || |||| |||||| || || || |||    
T  44617 ctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgaattcaatgcacgtcctaccccggtcataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcc 44716  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | ||||| |||||||||||  ||||||| | |||||||| |||||| ||||| || |||  |||||||| |||||| || ||||| |    
T  44717 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggcaactcttctatcgactctacgacgctttcatcttttctctgatcatcttaactttttctgtagtct 44816  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      ||||| |  || | ||| || ||||| || || ||||||||| ||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  44817 catgaaccaaatccgttcccaacaccacactctctcctgactcataccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 44916  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     || ||||| ||||| || || ||||| || | |||||| |||| | | || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  44917 acctatactcgaatggtaactgttattgtatgcgaactctatcagcagtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacatactctcaacaaa 45016  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| |  || || |   |||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  45017 tcctccaatgattggaccatcctctccgactgaccatgtatctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaccccaaagcgtcctgtaaactct 45116  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45117 tccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaat 45189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 636
Target Start/End: Original strand, 20122 - 20737
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||  |||||||  | ||  ||||    
T  20122 catacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacaattccaacactctctgaaat 20221  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| || | || |||| |||||| || || || |||    
T  20222 ctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataagagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcc 20321  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  ||||| |  ||||| |    
T  20322 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctaatcatcttgacttttttcgtagtct 20421  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      ||||| |  || ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||| ||||||||| |||||   || |||    
T  20422 catgaaccaaatccggtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgactatacaaagcttcgaacaatgtcat 20521  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     || ||||| ||||| || || ||||| || |||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  20522 acctatactcgaatggtaactgttattgtatgtgaactctatcagtggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaa 20621  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| |  || || || ||||||||||| |||||| |||||||   |||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||| |  || ||||| |    
T  20622 tcctccaatgattggatcgtcctctccgattgaccacctgtctgacaatgataagccgaactcaacctcaacttcaaacccaaagcgttctgtaaactct 20721  T
Q  621 tccaaaatctagaagt 636  Q
    |||| || ||||||||    
T  20722 tccagaaactagaagt 20737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 186
Target Start/End: Original strand, 36055 - 36220
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||  |||||||  | ||  ||||    
T  36055 catacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcttgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacaattccaacactctctgaaat 36154  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcat 186  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  36155 ctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcat 36220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 21 - 693
Target Start/End: Original strand, 26261 - 26933
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || |||||  ||| ||||||||| ||||| ||  | ||  ||||    
T  26261 catacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccagctctataagccactgttcccaccctctctgaaat 26360  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  26361 ctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 26460  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||| | ||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    |||| |  ||||||||||||||| |    
T  26461 tgaaactcaagagcctttcttcacttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatcaacctaactttctcagtagtct 26560  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      ||||| |  |||||||| || || ||  ||||||||||||||||||| || || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||| ||||    
T  26561 catgaaccaaatctggtcccaacacaacattttcacctgactcaaaccaacataaaggagtcctacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtaccat 26660  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||    
T  26661 cccaatactcgagtgatagctgttgttataagtgaactcaatcaatggcaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaacaaa 26760  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  26761 tcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactct 26860  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||| || |||||||| || ||  |||| ||||| || ||||| || || |  ||||| || |||||||||||    
T  26861 tccagaacctagaagtgaacctcagatccctatccgacacaatacttgacgatacaccgtgcagcttcacaat 26933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 178; Significance: 1e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 152 - 693
Target Start/End: Original strand, 1 - 541
Alignment:
Q  152 ttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcat 251  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| || |||||||||||  | || |||||||||||||    
T  1 ttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcat 100  T
Q  252 gataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactct 351  Q
    | |||||||| || |||||||  ||||| ||||| || |||   |||||||  || ||||| ||||| || ||||| |  || ||||| || || || ||    
T  101 ggtaactcttctgccgactctatgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaaccaaatccggtcccaacactacact 200  T
Q  352 ttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataa 451  Q
    ||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| | | ||||  ||||||| ||||| || || || || ||     
T  201 ttctcctgactcaaaccaacataatggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacgtt-ccataacaatactcgaatggtaactgttgttgtac 299  T
Q  452 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 551  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  300 gtgaactctatcatcggtagatgactatcccaagctccaccttggtcaagtacacacactctcagcaaatcctctagcgactgaatcgttctctccgact 399  T
Q  552 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 651  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  400 gaccatctgtttgtggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatctct 499  T
Q  652 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||| || ||||| ||||| || ||| |||| | |||||||||    
T  500 atccgacacaatactcgatggtacatcatgcaacttcacaat 541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 177; Significance: 5e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 117 - 693
Target Start/End: Original strand, 10865 - 11441
Alignment:
Q  117 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 216  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||  ||||||| | | || || | |||||| || || ||    
T  10865 aaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacatgtcatagaagtaaccctaagaaacacatgatcacc 10964  T
Q  217 ttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagta 316  Q
     ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || |||  ||||||||  |||||||| |||    
T  10965 ctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctaagacgcattcatcttttctctgatcatcttgactttctctgta 11064  T
Q  317 gtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtg 416  Q
    || |  ||||| |  || ||||| || ||||| || || ||| ||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  11065 gtctcatgaaccaaatccggtcccaacaccacactctctcctaactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacggtg 11164  T
Q  417 ccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaa 516  Q
    |||| || ||||| ||||| ||  | || || || |||||||| |||| | | || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||    
T  11165 ccatacctatactcgaatggtaaatgttgttgtatgtgaactctatcagcagtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaa 11264  T
Q  517 caaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaa 616  Q
    ||||||||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  11265 caaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactgaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaa 11364  T
Q  617 cttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    || ||||| || || ||||| || || ||||||| ||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11365 ctcttccagaacctcgaagtgaacctcggatctccatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaat 11441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 177; Significance: 5e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 21 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 26171 - 25511
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| || ||||  ||||| || |||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  |||   | ||    
T  26171 catatttccgaagttgcgacgcatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctttttgatat 26072  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| || || || || ||     
T  26071 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatccccctct 25972  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||    |||||||  || ||||| ||||| |    
T  25971 tgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgagacgctttcatcttttcccttatcatctttaccttctccgtagtct 25872  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | || || |  || ||||| |  || || || || ||| ||||||||||||| || ||| |  |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  25871 gatggaccaaatccggtcccagcacaacactctctcctaactcaaaccagcataaaggattcttgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 25772  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||| | || || | |||||  |||    
T  25771 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcatgtacccacactctcagtaaa 25672  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| |  || || ||  ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  25671 tcctccaatgattggatcatcctctctgaccgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaatctct 25572  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  25571 tccataatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatg 25511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Original strand, 16676 - 16940
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| || | ||| |||||  |||||||  | ||  ||||    
T  16676 catacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaacactatatgccactattccaaccctctctgaaat 16775  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||| || || || || |||    
T  16776 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcc 16875  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat 285  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  16876 tgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctgcgaagctttcat 16940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 172; Significance: 5e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 452 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 3689 - 3442
Alignment:
Q  452 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 551  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3689 gtgaactctatgaacggaagatgactatccgaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgact 3590  T
Q  552 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 651  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  3589 gaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgtaaacttttccaaaatctttatgtaaatcttggatctct 3490  T
Q  652 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 699  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||    
T  3489 atttgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacaatctcctt 3442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 236 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 3810 - 3694
Alignment:
Q  236 tttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 335  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  3810 tttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcgttagtttgctgaactatctctg 3711  T
Q  336 gtcctaagaccactctt 352  Q
    |||||||||||||||||    
T  3710 gtcctaagaccactctt 3694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 171; Significance: 2e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 13087 - 12420
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || || || ||||  || |||||||||||||   | ||  ||||    
T  13087 catacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaagccaactctgtatgccaccgttccaatcctctctgaaat 12988  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    || ||| ||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||| | ||||||||||| || || || || |||    
T  12987 ctaatacggaccaatgaacttcggagttaacttccttgatttcaaagcacgttctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcc 12888  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||| || | |||||||| |||||| ||||| || ||    |||||||  || |||||||| || |    
T  12887 tgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctatcgactctacgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcgtct 12788  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | ||||| |  ||||||||||| || || || || ||||||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  12787 gatgaaccaaatctggtcctaatacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaagagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 12688  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     || ||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||| || ||     || | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||||    
T  12687 acctatactcgaatggtaactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtag----gtagcacaagctccaccatgttcaagcacacacactctcaacaaa 12592  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    ||||| |  || || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  12591 tcctccaatgattggatcgtcctttccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactct 12492  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 692  Q
    ||||||||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12491 tccaaaatctagatgtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggaactccatgtagcttcacaa 12420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 170; Significance: 7e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 117 - 693
Target Start/End: Original strand, 5309 - 5885
Alignment:
Q  117 aaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctcc 216  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| || || || ||    
T  5309 aaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcacc 5408  T
Q  217 ttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat-tttctcttggatcatctgaactttctcagt 315  Q
     ||||||||||||||  | || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| || |  |||||||  || ||||||||    
T  5409 ctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcatctttttcctt-atcatcttgaccttctcagt 5507  T
Q  316 agtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggt 415  Q
     || || ||||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| | ||| |||    
T  5508 cgtctgatgaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataacggagtcctgcacttccgaccatacaaagctttgaacggt 5607  T
Q  416 gccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctca 515  Q
    ||||| ||| |||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||   ||||||||| ||||| | |||||    
T  5608 gccataccattactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaagttgctcaagcacacacactctca 5707  T
Q  516 acaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaa 615  Q
    |||||||||||| ||| || || ||||| ||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||  ||||    
T  5708 acaaatcctctaacgattggatcgtcctttccgactaaccatctttctgacgatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtccagcaa 5807  T
Q  616 acttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
     || ||| | || ||||| || || |||||||| ||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  5808 gctcttcaagaacctagaggtgaaccttggatccctatccgacacaatactagaaggaactccatgtagcttcacaat 5885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 169; Significance: 3e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 453 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 19876 - 19636
Alignment:
Q  453 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 552  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  19876 tgaactctatcaatgggagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaacaaatcctctaacgactgaattgtcttcaccgactg 19777  T
Q  553 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 652  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19776 accatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctctttcaaacttttccataatctagaagtaaatcttggatctcta 19677  T
Q  653 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  19676 tctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 19636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Original strand, 16957 - 17142
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||  |||| ||||| | ||    
T  16957 catacttccgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaactcaatacgccaccgttaaaactctttccgatat 17056  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaaca 206  Q
    |||||| | || ||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||    
T  17057 ctgatacgaacaaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaaca 17142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 168; Significance: 1e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 14557 - 13994
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||  ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  14557 catacttccgaagttgcgacacctgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgccactgttccaaccctctctgaaat 14458  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || || || || |||    
T  14457 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcc 14358  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    | |||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||  ||| ||||  |||| |    
T  14357 taaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctttgatcatcttgactatctctatagtct 14258  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    | | ||| |  || ||||| || || || || || ||||||||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14257 gataaaccaaatccggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccaggataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 14158  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||    
T  14157 accaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacattctcagtaaa 14058  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactca 584  Q
    ||||| |  || || || || |||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  14057 tcctccaaagattggatcgttctcttcgactgaccatctgtctacggatgataagctgaactca 13994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 9183 - 9039
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||  ||| ||||| ||||||||  | ||  ||||    
T  9183 catacttccgaagttgcgacacctgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgccactgttccaaccctctctgaaat 9084  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaa 165  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||    
T  9083 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaa 9039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1001 (Bit Score: 167; Significance: 4e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold1001
Description:

Target: scaffold1001; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 351 - 617
Target Start/End: Original strand, 1 - 267
Alignment:
Q  351 tttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattata 450  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1 tttcacctgattcaaaccaacacaacggagttttgcatctccgaccatacaaagcctcataaggtgtcattccaatactagaatgataactattattata 100  T
Q  451 agtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgac 550  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |  |||||||  || || ||||||    
T  101 cgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcatcaaaagactgaaacgtactatccgac 200  T
Q  551 tgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaac 617  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||    
T  201 taaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaac 267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 165; Significance: 7e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 6219 - 5756
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||||||| | ||  | ||    
T  6219 catacttccgaagttgcgacacatg-aaaacatcaagcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccacagttccaactctctcagatat 6121  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | || |||| |||||| ||  |||| ||     
T  6120 ctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgacctacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatgagctccctct 6021  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||   |||| ||  || || || |||||||    
T  6020 tgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacactttcatcttttctcttatcaacttgaccttttctgtagttt 5921  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
    |  |||| |  |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5920 gacgaactaaatctggtcccaacactacactttctcccgactcaaaccaacacaatggagttctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccat 5821  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaag 485  Q
     |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  5820 accaatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaag 5756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 165; Significance: 7e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 413 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 19119 - 18839
Alignment:
Q  413 ggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattc 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  19119 ggtgccattccaatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaaaggaagatgactatcctaagttcctccttgctcaagtacacaaactc 19020  T
Q  513 tcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttg 612  Q
    |||| || ||||| | |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || |  ||||||||||     
T  19019 tcaataagtcctccaacgactgaatcattctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaacgcaacctcaacttagaacttaaagcctcttt 18920  T
Q  613 caaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18919 caaactcttccaaaatctagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaat 18839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 156; Significance: 2e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 239 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 3443 - 2992
Alignment:
Q  239 ctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtc 338  Q
    ||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| ||||||||| ||||| || ||||| |  || | ||    
T  3443 ctacgtttatcacgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttaactttctctgtagtctgatgaaccaaatccgttc 3344  T
Q  339 ctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgata 438  Q
    | || || || || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  3343 ccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggta 3244  T
Q  439 gctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaatt 538  Q
     || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | || |||||||||||| |  || || ||     
T  3243 actgttgttctatgtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactcgcaacaaatcctccaaagattggatc 3144  T
Q  539 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 638  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||| |||| |    
T  3143 gtgccctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcatgcaaactcttccagaatctataagtga 3044  T
Q  639 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 690  Q
    | || ||||| ||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||    
T  3043 acctcggatccctatccgacacaatacttgacggtacaccatgtagcttcac 2992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 3574 - 3487
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaac 108  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  | ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||    
T  3574 catacttccgaagtagcgacacatgatacacatcatgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaac 3487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 566 - 206
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||   ||||  | ||    
T  566 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccaccattccaatcctttctgatat 467  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | |||| |||||||||||||||| ||||| |||||     
T  466 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtccaacaccggttacaggattgactctcaaaaacacatggtccccttct 367  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||  | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  366 tgaaactcaatgtctttcctacgcttatcatggtagttgttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcatcttaaccttctcagtagttt 267  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagt 381  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||  | || |||||||| || ||||| |||||| ||||    
T  266 gctgtacaatttctggtcccaaaactgcactctcacctgattcgaaccaacacaacagagt 206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 147; Significance: 4e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 511 - 693
Target Start/End: Original strand, 25464 - 25646
Alignment:
Q  511 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 610  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  25464 tctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgcctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctct 25563  T
Q  611 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  25564 tgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatatctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgaaacttcacaat 25646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 142; Significance: 4e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 236 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 5543 - 5086
Alignment:
Q  236 tttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 335  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||  ||||||||  ||||||||  |||| |  ||||| |  || |    
T  5543 tttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctatagtctcatgaaccaaatccg 5444  T
Q  336 gtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatg 435  Q
    |||| || ||||| || || |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||||| |||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||    
T  5443 gtcccaacaccacactctctcctgactcaaaccatcagaaaggagtcctacacctccgaccatccaaagcttcgaacggtgccatacctatactcgaatg 5344  T
Q  436 atagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactga 535  Q
     || || || || || |||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || ||     
T  5343 gtaactgttgttgtatgtgaactctatcattggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattgg 5244  T
Q  536 attgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaag 635  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| | || |||||||| ||||| || |||||||    
T  5243 atcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaaacatcctgcaaactcttccagaacctagaag 5144  T
Q  636 taaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    | || ||   ||| ||||| || ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  5143 tgaacctcaaatccctatccgacacaatactcgaaagaactccatgtagcttcacaat 5086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 138; Significance: 9e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 176 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 1385 - 880
Alignment:
Q  176 acaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcg 275  Q
    ||||| ||||||||| | || |||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  1385 acacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcaactctgcg 1286  T
Q  276 acgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaa 375  Q
    |||| ||||| |||||    |||||||  |||||||| ||||| |  ||||| |  || || || || || || ||||| || | ||| |||||||| ||    
T  1285 acgctttcatcttctccctaatcatcttgactttctccgtagtctcatgaaccaaatccggccccaacacaacactttctcccgtctcgaaccagcataa 1186  T
Q  376 cggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatga 475  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || || || || ||||| || || |||    
T  1185 aggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaatggtaactgttattgtatgtaaattctatcaatggtaggtga 1086  T
Q  476 ctatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatg 575  Q
    || ||||||| ||| || |||||||| ||||| | ||| |  ||||||||||  || || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  1085 ctgtcccaagctccaccctgctcaagtacacatactcttagtaaatcctctaaagattggatcgtcctttccgaatgaccatctgtctgcggatgataag 986  T
Q  576 ccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaac 675  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||  |||||||  |||| ||||||| ||| || || ||||| |||||    
T  985 ccgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaactcttccaaaatcttcaagtaaactttgggtctctatttgacactatactcgacggaac 886  T
Q  676 accatg 681  Q
     |||||    
T  885 cccatg 880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 133; Significance: 9e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Original strand, 27967 - 28231
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  27967 catacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaactcgatacgccactgttccaactctttccgatat 28066  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  | ||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| | |||||||||||||| || || || ||     
T  28067 ctgatacggaccaataaatctaggattcaacttctttgacttcacagcacgtccaacaccagtcaccggagtaactctcaaaaacacatgatcaccctct 28166  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat 285  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28167 tgaaattcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 28231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 620 - 699
Target Start/End: Original strand, 24097 - 24176
Alignment:
Q  620 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 699  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  24097 ttccaaaatctagaagttaatcttggatctctatccgatccaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 24176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 288 - 30
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||| | ||    
T  288 catacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaactcactcgatacgccaccgttccaacactttccgatat 189  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||| ||  || | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||||| ||||| || || ||||||||     
T  188 ctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctaaaaaatacatgatctccttct 89  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgc 279  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  88 tgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctgcgacgc 30  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 464 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 11531 - 11302
Alignment:
Q  464 aacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtct 563  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||    
T  11531 aacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaacaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtct 11432  T
Q  564 gcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 663  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||| |||||    
T  11431 gcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcagatctctatctgacacaat 11332  T
Q  664 gctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
     ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  11331 actcgatggaactccatgtaacttcacaat 11302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 473 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 7091 - 6871
Alignment:
Q  473 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 572  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7091 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaacaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 6992  T
Q  573 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 672  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  6991 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcagatctctatctgacacaatactcgatgg 6892  T
Q  673 aacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||| ||||||| |||||||||    
T  6891 aactccatgtaacttcacaat 6871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 13559 - 13380
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || | ||| ||||||||  | ||  | ||    
T  13559 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgtcactgttccaaccctctcagatat 13460  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctca 200  Q
    ||||||   |||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  13459 ctgatacttaccaattaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaactctca 13380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 122; Significance: 3e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 452 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 2750 - 2509
Alignment:
Q  452 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 551  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || |||||||||||||    
T  2750 gtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgact 2651  T
Q  552 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 651  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  2650 gaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggaatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaaccttggatctct 2551  T
Q  652 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||| |||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||    
T  2550 atccgatacaatactcgacggtacaccatgtaacttcacaat 2509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 118; Significance: 8e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 218 - 655
Target Start/End: Original strand, 86 - 523
Alignment:
Q  218 tcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtag 317  Q
    |||| |||||||||  | || |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||  ||||||||  |||||||| ||||    
T  86 tcctaaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgatgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtag 185  T
Q  318 tttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgc 417  Q
    | || ||||| |  |||||||| || || || || || ||||||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  186 tctgatgaaccaaatctggtcccaacacaacactctctcctgactcaaaccagcataaaggattcctgcacctccgaccatataaagcttcgaacggtgc 285  T
Q  418 cattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaac 517  Q
    ||| | |||||| ||||| || |  || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||| | ||| |      
T  286 catacaaatactcgaatggtaacggttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccacattgctcaagcacacacactcttact 385  T
Q  518 aaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaac 617  Q
    ||||||||||  || || || |||||||||   ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| || || || ||||||||||    
T  386 aaatcctctaaagattgtatcgtcctctccatttgaccatctgtgtgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgatcctaaggcgtcttgcaaac 485  T
Q  618 ttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatct 655  Q
    | ||||| |||||| |||| || || ||||| ||||||    
T  486 tcttccagaatctataagtgaacctcggatccctatct 523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 146 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 1091 - 946
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  1091 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 992  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctc 291  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  991 tatcatgataactcttatgtctactctgagacgccttcatcttctc 946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 118; Significance: 8e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 302
Target Start/End: Original strand, 191 - 472
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||| | |||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| ||||  ||||    
T  191 catacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggaggcaaaccaactctatatgccacagttccaactctttctgaaat 290  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||| |||||  ||||||| |||||||||| ||| ||||||||| | || |||| ||| || ||||| || |||    
T  291 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaagttcttcaacttcaacgcacgtcctatacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccctcc 390  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatct 302  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  391 tgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatct 472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 608 - 693
Target Start/End: Original strand, 470 - 555
Alignment:
Q  608 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || |||||||| || || || ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  470 tcttgtaaactctttcaaaatcttgaagtaaacctcgggtctctatccgacactatactcgacggaacaccatgcatcttcacaat 555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 116; Significance: 1e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 357 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 6307 - 5969
Alignment:
Q  357 ctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaa 456  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| | |||||| || ||||| ||||| || || ||||| || |||||    
T  6307 ctgactcaaaccagcataaaggagtcctacacctccgaccatacaaagcttcgaacgatgccatacctatactcgaatggtaactgttattgtatgtgaa 6208  T
Q  457 ctcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaat--tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgac 554  Q
    ||| |||| | | || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |   ||||||||||||||| |  || || || ||||||||||||||||    
T  6207 ctctatcagcagtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgactgac 6108  T
Q  555 catctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatc 654  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||  |||| || |||||||| || ||  |||| |||||    
T  6107 catctatctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcatccagaacctagaagtgaacctcagatccctatc 6008  T
Q  655 tgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
     || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6007 cgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaat 5969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 398 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 5227 - 4945
Alignment:
Q  398 tacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgct 497  Q
    |||||||| ||||| | |||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||    
T  5227 tacaaagcttcgaacgatgccataccaatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaacttgct 5128  T
Q  498 caagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 597  Q
    |||||||||| | |||||  |||| |||||  || ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  5127 caagaacacacactctcagtaaatactctaaagattgaatcgtcatctcagactgaccatctgtctgcggatgataagccgaacttaacctcaacttcga 5028  T
Q  598 gcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccat 680  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||    
T  5027 acccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggtacaccat 4945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 108; Significance: 7e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 542 - 693
Target Start/End: Original strand, 1988 - 2139
Alignment:
Q  542 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 641  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1988 ctctccgactaaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 2087  T
Q  642 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||    
T  2088 ttgggtctctatctgatacaatgctcgacggaacacgatgcaacttcacaat 2139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 105; Significance: 4e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 5308 - 4912
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  | ||||||||||||||| || || |||||||||   || ||||  ||||||||  | |   | ||    
T  5308 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcattcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactatgtatgccagtgttccaaccctcttagatat 5209  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| | |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||  |||  |||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| || ||||| ||     
T  5208 ctgatacgaaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacacacaacctacacccgtcataggagtgattctcagaaacacatgatctccctct 5109  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||   |||||||  || ||||| || || |    
T  5108 tgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtggtct 5009  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgc 417  Q
    | ||||| |  | |||| | || ||||| ||||| ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  5008 gatgaactaaatatggttccaacaccacactttctccccactcaaaccaacacaaaggagtcctgcacctccgaccatacaaagcttcgaacggtgc 4912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 412 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 1887 - 1618
Alignment:
Q  412 aggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatt 511  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||  | || || || |||||||  |||||||  || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |    
T  1887 aggtgccataccaatactcgaatggtaattgttgttgtacgtgaactttatcaacgacaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacact 1788  T
Q  512 ctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctctt 611  Q
    || | ||||||||||| ||  | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || | ||| || ||||    
T  1787 cttagcaaatcctctaacggttaaatcgttctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaacttcaactttgaactcaatgcatctt 1688  T
Q  612 gcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  1687 gcaaactcttccaaaacctcgaagtgaacctcggatctctatctgacacaatactcgatggaactccatg 1618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0924 (Bit Score: 103; Significance: 7e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0924
Description:

Target: scaffold0924; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 411
Target Start/End: Original strand, 3891 - 4281
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||| | |||   || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  3891 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacataatgcaaattcgaaagatgtggaggcaaaacaactatgtatgccactgttccaaccctctcagatat 3990  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| || ||||| ||     
T  3991 ctgatacagaccaatgaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccatct 4090  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||   |||||||  |||||||| ||||| |    
T  4091 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttatgtcgactctacgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtct 4190  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaa 411  Q
    | | ||| |  || ||||| || || || ||||| | ||||||||||||  | |  ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  4191 gataaactaaatccggtcccaacactacactttctcttgactcaaaccaatatataggagtcctgcaccttcgaccatacaaagcttcgaa 4281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 103; Significance: 7e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 452 - 693
Target Start/End: Original strand, 41350 - 41589
Alignment:
Q  452 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 551  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||||||||||||    
T  41350 gtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaatcctccaaagattggatcgtcctctccgact 41449  T
Q  552 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 651  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |  ||||||||    
T  41450 gaccatctgtctgcggatgataagccgaa--caacctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaaccccggatctct 41547  T
Q  652 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||  || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  41548 attcgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 41589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 108
Target Start/End: Original strand, 45845 - 45932
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaac 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||| |||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||    
T  45845 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaatgatgtggtggaaaaccaactctatatgccactgttccaac 45932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 102; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 39193 - 38761
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || || | |||||| ||| ||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| | ||||||| | ||  ||||    
T  39193 catacttccgaagctgagaaacatgaaacacttcgtgcaagttctaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgctccaactctctctgaaat 39094  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | |||||||| ||||| || ||||| |||| |||| ||||||||| ||| || || || || |||    
T  39093 ctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgaccgacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcc 38994  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat-tttctcttggatcatctgaactttctcagtagtt 319  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||| || |  |||| |   ||||||||||||||     
T  38993 tgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatgataactcttctgtcgactctacgaagctttcatctttttcct-tatcaacctgactttctcagtagtc 38895  T
Q  320 tgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcca 419  Q
    |  ||||| |  || ||||| || || || || |||||||||||||||||||| || |||||  | || |||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  38894 tcatgaaccaaatccggtcccaacacaacgctctcacctgactcaaaccagcataaaggagtcttacacctccgaccatacaaggcttcgaacggtgcca 38795  T
Q  420 ttccaatactagaatgatagctattattataagt 453  Q
    | |||||||| || |||||||| || ||||||||    
T  38794 taccaatactcgagtgatagctgttgttataagt 38761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 97; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 1475 - 1211
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| | |   || ||||| ||||||||  | ||  | ||    
T  1475 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaatttcgaaagatgtggtggcaaacctattttttatgccactgttccaaccctctctgatat 1376  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| || ||||| ||     
T  1375 ctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctct 1276  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat 285  Q
    |||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  1275 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgagacgctttcat 1211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 96; Significance: 1e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 146 - 681
Target Start/End: Original strand, 46279 - 46814
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| || | |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  46279 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggttacaggatttaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 46378  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 345  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  46379 tatcatgataactcttttgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 46478  T
Q  346 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 445  Q
      | || || || ||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| | || ||     
T  46479 agcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaactgttg 46578  T
Q  446 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 545  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |     ||||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  46579 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcatcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 46678  T
Q  546 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 645  Q
    | |  |||||||| || || ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  ||||| |||| || ||    
T  46679 ctgtatgaccatcggtatgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaaattagaaataaacctcgg 46778  T
Q  646 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  46779 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 46814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 491 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 68427 - 68225
Alignment:
Q  491 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 590  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | || || ||||| |||||| |||||||||    
T  68427 ccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctttaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctatttgtgggtgataagccgaagtcaatctca 68328  T
Q  591 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 690  Q
    |||| || |||||   |||||||||||| |||||||| || ||||| || ||  |||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||    
T  68327 actttgaacccaagttctcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcagatctctatccgacacaatactcgatggaaccccatgcaacttcac 68228  T
Q  691 aat 693  Q
    |||    
T  68227 aat 68225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 94; Significance: 2e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 539 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 997 - 844
Alignment:
Q  539 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 638  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  997 gtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtga 898  T
Q  639 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 692  Q
    | || ||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  897 acctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaa 844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4445 - 4217
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||  | |   ||||    
T  4445 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaaccctctttgaaat 4346  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| || || || ||     
T  4345 ctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttaaaaacacatgatccccctct 4246  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtc 249  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  4245 tgaaactcaagggcctttctccgcttgtc 4217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 93; Significance: 6e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 285
Target Start/End: Original strand, 14086 - 14349
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||   || ||||| |||||||| ||| |  | ||    
T  14086 catacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccttt-cagatat 14184  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||  || | ||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| ||     
T  14185 ctagtacgaaccgataaacttcggagtcaacttcttcgacttcaacgcacgacctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctct 14284  T
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcat 285  Q
    |||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  14285 tgaaactcaagggcctttctatgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 14349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 491 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 9697 - 9507
Alignment:
Q  491 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 590  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| || || || || |||||||||||||    
T  9697 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtctgcccatcggtctgtggttggtaagcagaactcaatctca 9598  T
Q  591 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    |||| |   |||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  9597 actttgtttccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 9507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 84; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 146 - 681
Target Start/End: Original strand, 23519 - 24054
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || || || |||| | || | || |||||||||||||| || |   | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  23519 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacatgattcaccctcaaaaacacgtgatcactaacttgaaactcaatatcctttctcctct 23618  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 345  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || |||| ||| |||||||| |     
T  23619 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacctccggtcctaacaa 23718  T
Q  346 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 445  Q
      | || || || ||||||||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| |  | ||     
T  23719 agcactctctccagactcaaaccaacataacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagcatgaaaaatgttg 23818  T
Q  446 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 545  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||| ||| |    |||||| |||||||    
T  23819 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactaacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatactccaaactctgaatagtcctct 23918  T
Q  546 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 645  Q
    ||| ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  23919 ccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 24018  T
Q  646 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  24019 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 24054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 83; Significance: 6e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 475 - 693
Target Start/End: Original strand, 4884 - 5102
Alignment:
Q  475 actatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatat 574  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  4884 actattccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataa 4983  T
Q  575 gccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 674  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| | |  ||||||||||| |||||||| || |||||||| || | ||||||||| || || |||||||| ||||    
T  4984 gccgaactcaacctcaacttagaacccgaggaatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtaaacctcgaatctctatccgacacgatgctcgatggaa 5083  T
Q  675 caccatgtagcttcacaat 693  Q
    | ||||| | |||||||||    
T  5084 ccccatgcaacttcacaat 5102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 229
Target Start/End: Original strand, 1177 - 1385
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||||||  | |   | ||    
T  1177 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctaagatat 1276  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcc 220  Q
    ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| ||     
T  1277 ctgatacagaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctct 1376  T
Q  221 tgaaactca 229  Q
    |||||||||    
T  1377 tgaaactca 1385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 80; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 350 - 681
Target Start/End: Original strand, 7497 - 7828
Alignment:
Q  350 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattat 449  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |  | || || |    
T  7497 ctttcacctgactcaaaccaacacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagtctcaaacggtgccattccaatactagaatgaaaattgttgttgt 7596  T
Q  450 aagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccga 549  Q
    |||| ||||| |||||||| | |      |||||| |    |||||||| |  ||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||| |     
T  7597 aagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgataccttgctccaagacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctcggt 7696  T
Q  550 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 649  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || |||||     
T  7697 ctgcccatctgtctggggatgataagcagaactcaatctcaaattagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacatagaagtaaacctcggatcc 7796  T
Q  650 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
      ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  7797 ggatccgacacaatactagaaggaataccatg 7828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 575 - 693
Target Start/End: Original strand, 4425 - 4543
Alignment:
Q  575 gccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 674  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4425 gccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatatagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 4524  T
Q  675 caccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  4525 caccatgtaacttcacaat 4543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 575 - 693
Target Start/End: Original strand, 11555 - 11673
Alignment:
Q  575 gccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 674  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555 gccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatatagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 11654  T
Q  675 caccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  11655 caccatgtaacttcacaat 11673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 76; Significance: 9e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 146 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 14918 - 14383
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||  |||| | || | || ||||||||||| || || ||  ||||||| |||| ||| ||||| | ||    
T  14918 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacactggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaattcaatatcctttctcctct 14819  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 345  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  || |||||||| |     
T  14818 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccggtcctaacaa 14719  T
Q  346 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 445  Q
      | ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||||| | || ||     
T  14718 agcgctttctccggattcaaaccaacacaacggtgttctacacctcctaccatacaaagcctcaaacggagccattccgatagtagaatgaaaactgttg 14619  T
Q  446 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 545  Q
    || ||||| ||||| |||| ||| | |     ||||||| |  | |||||||| |  ||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  14618 ttgtaagtaaactcaatcatcggtaaacattcatcccaactgacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 14519  T
Q  546 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 645  Q
    ||| ||| ||||| ||||| | | | || || ||||||| ||||||||| |   |||||||  |||||||||| | ||| ||  |||||||||| || ||    
T  14518 ccgtctgcccatcggtctgagaacggtaagcagaactcagtctcaacttagtttccaaagcagcttgcaaactctcccagaacttagaagtaaacctcgg 14419  T
Q  646 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  14418 atcacgatctgacacaatactagaaggaataccatg 14383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 73; Significance: 6e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 453 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 33193 - 32953
Alignment:
Q  453 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 552  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || || || ||||||||||||||    
T  33193 tgaactctatcaacggtaggtgattatcccaagctccaccttgctcaagcacacataccctcaacaaatcttccaatgattggatcgtcctctccgactg 33094  T
Q  553 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 652  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||| | || |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| |||    
T  33093 accatctgtctgaggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaatcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcggatcccta 32994  T
Q  653 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    || ||   ||| ||||| || ||||| || |||||||||||    
T  32993 tccgacgaaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaat 32953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 146 - 681
Target Start/End: Original strand, 3284 - 3818
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || | ||| |||| |||| | |||||||||||||| || || ||  |||||||||| |  || ||||| | ||    
T  3284 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaataccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcgatgtcctttctcctct 3383  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 345  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| || ||  |||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  3384 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccatagtctcttgcacaacttccggtcctaacaa 3483  T
Q  346 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 445  Q
      | ||||| ||||| |||||| | |||||||| ||  | ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | || ||     
T  3484 agcactttctcctgattcaaactaacacaacggtgtcttacatcttcgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactgttg 3583  T
Q  446 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 545  Q
    || ||||| ||||| ||||| || | |    | |||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||||||||    | |||| |||||||    
T  3584 ttgtaagtaaactcaatcaaaggtaaacatttgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctctaaactcggaatagtcctct 3683  T
Q  546 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 645  Q
    | |  || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||  ||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  3684 ctgtttgcccatcggtctg-ggatgataagcagaactcaacgtcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 3782  T
Q  646 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||| | |||| | ||||| || ||||||| ||||||    
T  3783 atcccgatcttacacaatactagaaggaataccatg 3818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 539 - 654
Target Start/End: Original strand, 17877 - 17992
Alignment:
Q  539 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 638  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  17877 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaactcaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtga 17976  T
Q  639 atcttggatctctatc 654  Q
    |||| |||||||||||    
T  17977 atctcggatctctatc 17992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 221 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 26263 - 25959
Alignment:
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| || || || ||||||| ||| || || |||||||    
T  26263 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaaccttttccgtagttt 26164  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      || ||||  ||| ||||||| |     |||||||| || | |||||| |||||||| || || || ||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  26163 cttgcacaacttctagtcctaacaaagaactttcaccggattaaaaccaacacaacggtgtcctacacctcggaccatacaaagcctcaaacggtgccat 26064  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     || ||||||| |||| | || || || ||||| ||||| |||||||| | |   ||||||||| |  | |||||||| |  ||||||  ||||||||||    
T  26063 accgatactagcatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacatctatcccaactgacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaa 25964  T
Q  521 tcctc 525  Q
    |||||    
T  25963 tcctc 25959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 146 - 681
Target Start/End: Original strand, 13033 - 13568
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||| |||  | |||||||| ||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||    
T  13033 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacagggttcactctcaacaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctct 13132  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 345  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | ||| || || ||||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  13133 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttggatcattttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacaa 13232  T
Q  346 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 445  Q
      |||| || || || |||||||| ||||| || || || || ||| |||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | || ||     
T  13233 ggctctctctccggattcaaaccaacacaatggtgtcctacacctctgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactgttg 13332  T
Q  446 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 545  Q
    || || || ||||| |||||||| | |       ||||| |  | |||||||| |  ||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  13333 ttgtaggtaaactcaatcaacggtaaacattcgacccaaataacaccttgctccaacacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 13432  T
Q  546 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 645  Q
    |||  || ||||| || || ||||| || || ||||||||||| ||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||||| ||    
T  13433 ccgtttgcccatcggtatgaggatggtaagcagaactcaatctgaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaatctcgg 13532  T
Q  646 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  13533 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 13568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 159 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 1222 - 913
Alignment:
Q  159 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 258  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||| | ||||| ||||| || || || ||  || ||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||    
T  1222 acttcaaagcacgaccaacaccagtcacaggattcactctaaaaaatacatgatcgccaaccagaaactcaatatcttttctcctcttatcatgataact 1123  T
Q  259 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 358  Q
    ||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| ||| || || ||||| |  || ||||  || |||||||| |   | |||||||||    
T  1122 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttggaccatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactttcacct 1023  T
Q  359 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 458  Q
     |||||||||| ||||  || || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| | |||| | || || || ||||| ||||    
T  1022 aactcaaaccaacacattggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattctgatacttgtatgaaaactgttgttgtaagtaaact 923  T
Q  459 cgatcaacgg 468  Q
    | ||||||||    
T  922 caatcaacgg 913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 554 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 827 - 700
Alignment:
Q  554 ccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctat 653  Q
    ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||    
T  827 ccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgat 728  T
Q  654 ctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    |||| ||||| || |||| || ||||||    
T  727 ctgacacaatactagaagaaataccatg 700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 608 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 39730 - 39645
Alignment:
Q  608 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  39730 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgatggaacaccatgcaacttcacaat 39645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 68; Significance: 5e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 146 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 4056 - 3521
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||| |  |||| |||||||| || ||||| |||| |||| | ||||| |||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| | ||    
T  4056 gtcaacttcctacactttaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcactcttaaaaacacatgatcatcaacctgaaactcaatatcctttctcctct 3957  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 345  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  ||  | ||||| |     
T  3956 tatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaacttccaggcctaacaa 3857  T
Q  346 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 445  Q
      | || || |  || |||||||| ||||| || || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||| | || ||     
T  3856 agcactctctctggattcaaaccaacacaatggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatactagcatgaaaactgttg 3757  T
Q  446 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 545  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |      |||||| |  | |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||||| |    
T  3756 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcgtcccaactgacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtccttt 3657  T
Q  546 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 645  Q
    | | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||    
T  3656 ctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcgg 3557  T
Q  646 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  3556 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 3521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 68; Significance: 5e-30; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 248 - 467
Target Start/End: Original strand, 71446 - 71665
Alignment:
Q  248 tcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagacca 347  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || || ||||| |  || ||||  || |||||||| || |    
T  71446 tcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacacaa 71545  T
Q  348 ctctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattatt 447  Q
    | ||||| || || |||||||| |||||| | || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | || || ||    
T  71546 cactttctccagattcaaaccaacacaacagtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaacggtgccattccgatactagaatgaaaactgttgtt 71645  T
Q  448 ataagtgaactcgatcaacg 467  Q
     ||||| ||||| |||||||    
T  71646 gtaagtaaactcaatcaacg 71665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 566 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 33174 - 33059
Alignment:
Q  566 ggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgc 665  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||| | |||||| ||||| |    
T  33174 ggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatac 33075  T
Q  666 tcgaaggaacaccatg 681  Q
    | ||||||| ||||||    
T  33074 tagaaggaataccatg 33059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 167 - 302
Target Start/End: Original strand, 13397 - 13532
Alignment:
Q  167 gcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtc 266  Q
    ||||| || |||||||| | |||| | |||||||| || ||||| || ||  |||||||||||| ||| ||||| |  || |||||||| ||||| | ||    
T  13397 gcacgaccaacaccagttacaggattaactctcaagaatacgtgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctccttttatcatgatagctcttctatc 13496  T
Q  267 gactctgcgacgccttcattttctcttggatcatct 302  Q
     |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13497 tactctgagacgctttcatcttctcttggatcatct 13532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 587 - 681
Target Start/End: Original strand, 24529 - 24623
Alignment:
Q  587 ctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    |||||||| | |||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| | || |||||| ||||| || || |||| ||||||    
T  24529 ctcaacttagtgcccaaagcaacttgcaaactctcccaaaatatagaagtaaatcttgggtgtcgatctgacacaatactagatggaataccatg 24623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 68; Significance: 5e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 180
Target Start/End: Original strand, 136119 - 136278
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||| ||||||||| | ||  ||||    
T  136119 catacttccgaagttgcgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctatatgccacagttccaactctctctgaaat 136218  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacacc 180  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  136219 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacc 136278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 389 - 501
Target Start/End: Original strand, 136278 - 136390
Alignment:
Q  389 ctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 488  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||  || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||    
T  136278 ctccgaccatacaaagcttcgaacggtgccataccaatactcgaattgtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctc 136377  T
Q  489 ctccttgctcaag 501  Q
    | |||||||||||    
T  136378 caccttgctcaag 136390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 2172 - 2023
Alignment:
Q  21 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgataagccaccgttccaactttttccaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || |  ||||||||||  || ||||| ||||||||  | ||| | ||    
T  2172 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtgtaaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctccgatat 2073  T
Q  121 ctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcac 170  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||    
T  2072 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcac 2023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 436
Target Start/End: Original strand, 14661 - 14938
Alignment:
Q  159 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 258  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | || | |||||||||||||| || || ||  ||||||||||||  || || || | ||| |||||||||||    
T  14661 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgattcactctcaaaaacacatgatccccaacctgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataact 14760  T
Q  259 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 358  Q
    ||| |||| |||||| ||| | ||||| |||||||  ||||||| || ||| || ||||| |  || ||||  || |||||||| |  || |||||||||    
T  14761 cttctgtctactctgagactctttcatcttctcttcaatcatcttaaatttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacaaaacactttcacct 14860  T
Q  359 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatga 436  Q
    ||||||||| | |||||||   | || || ||| |||||||||||||||| || |||||||| || |||| |||||||    
T  14861 gactcaaacaaacacaacgacatcctacacctcggaccatacaaagcctcaaacggtgccataccgatacaagaatga 14938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 146 - 681
Target Start/End: Original strand, 24005 - 24540
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||||||||  ||| | ||||| |||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||    
T  24005 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcaccggattaactctaaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctct 24104  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 345  Q
    | |||||||||||||| |||| ||| || || || || || ||||| || ||||||| ||| || ||  |||| |  || ||||  ||||||||||| |     
T  24105 tatcatgataactcttctgtctactttgagatgctttaatcttctcctgaatcatcttaaccttttccatagtctcttggacaacttctggtcctaacaa 24204  T
Q  346 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 445  Q
      | || |||| |||||| ||| | |||||||| || || || ||| |||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||| |  ||||     
T  24205 agcactctcacttgactcgaactaacacaacggtgtcctacacctctgaccatacaaagcctcaaacggtgtcattccgatactagaatgaaaattattg 24304  T
Q  446 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 545  Q
    || ||||| ||||| | ||| || | |     ||||||| |  | |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    ||| || |||||||    
T  24305 ttgtaagtaaactctaccaaaggtaaacattcatcccaactaacaccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctggatagtcctct 24404  T
Q  546 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 645  Q
    ||| ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||    ||||||||  |||||||||| | ||||||   |||||| || |||||    
T  24405 ccgtctgcccatcagtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaaattaattcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactgagaagtgaaccttgg 24504  T
Q  646 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  24505 atcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 24540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 58; Significance: 5e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 221 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 1530 - 1293
Alignment:
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||| ||| |||||   ||| |||||||||||||| | || |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || || ||||| |    
T  1530 tgaaactcaatatcctttctcttcttatcatgataactcttctatctactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttccgtagtct 1431  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      || ||||  || |||||||| |   | |||||||||||||||||| | |||||||| || || || ||| | |||||||||||||| || |||| |||    
T  1430 cttgcacaacttccggtcctaacaaggcactttcacctgactcaaactaacacaacggtgtcctacacctcagtccatacaaagcctcaaacggtgtcat 1331  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 458  Q
    ||| |||||||||||| | || || || ||||||||||    
T  1330 tccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtgaact 1293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 56; Significance: 8e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 146 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 28447 - 27912
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||| | || | || ||||||||||| || || ||| | || ||||||| ||| ||||| | ||    
T  28447 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcacctacttgtaactcaatatcctttctcctct 28348  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 345  Q
    | |||||||||||||| |||| ||| || || |||||||| |||||||| ||||||| ||| || || |||||||  || ||||  |  |||||||| |     
T  28347 tatcatgataactcttctgtctactttgagatgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtttcttgcacaactttcggtcctaacaa 28248  T
Q  346 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 445  Q
      | |||||||||||||||||||| ||||| || || || || || | ||||||||||||||| || |||| ||| || ||||||| |||| |  | ||     
T  28247 agcactttcacctgactcaaaccaacacaatggtgtcctacaccttctaccatacaaagcctcaaacggtgtcataccgatactagcatgaaaattgttg 28148  T
Q  446 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 545  Q
    || ||||| ||||| |||||| | | |      |||||| |  | |||||| | | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||    
T  28147 ttgtaagtaaactcaatcaacagtaaacattcgtcccaactaacaccttgcaccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctct 28048  T
Q  546 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 645  Q
    ||| ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |  ||||||||  |||| ||||| | ||| ||  ||||||||||  | ||    
T  28047 ccgtctgcccatcggtctggggatggtaagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagcagcttgtaaactctcccagaacttagaagtaaacatcgg 27948  T
Q  646 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  27947 atcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 27912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 56; Significance: 8e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 566 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 81593 - 81470
Alignment:
Q  566 ggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgc 665  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| |    
T  81593 ggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaagctcttccaaaatctagatgtgaacctcggatccctatccgacacaatac 81494  T
Q  666 tcgaaggaacaccatgtagcttca 689  Q
    |||| || ||||||||||||||||    
T  81493 tcgacggtacaccatgtagcttca 81470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 194 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 4077 - 3590
Alignment:
Q  194 actctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctctt 293  Q
    |||||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||| ||||| |    
T  4077 actctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttatgtctactttgagacgccttcatcttctcct 3978  T
Q  294 ggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccg 393  Q
    | ||||||| ||| || |  ||||| |  || ||||  || |||| ||| |   | || || || ||||||||||| |||||||| || || || |||||    
T  3977 gaatcatcttaacctttttcgtagtctcttgcacaacttccggtcttaacaaagcactctctccggactcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccg 3878  T
Q  394 accatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcct 493  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| || |||||||||| | | || || || ||||| ||||| ||||| || | |      |||||| || | |||    
T  3877 accatacaaagcctcaaacggagccatgccgatactagaataaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaatggtaaacattcgtcccaacttacacct 3778  T
Q  494 tgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaact 593  Q
    ||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||| | ||||| |  | ||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||    
T  3777 tgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgattagtcctttttgtctgcccatctgtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaact 3678  T
Q  594 tcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    | |  || ||||   |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | |||  | ||||| || ||||||| ||||||    
T  3677 tagttccgaaagtagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccaacacaatactagaaggaataccatg 3590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 468
Target Start/End: Original strand, 9125 - 9434
Alignment:
Q  159 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 258  Q
    ||||||||||||| || |||||||| | | || | |||||||| || || || || ||  |||||||||||| ||| |||||   ||| |||||||| ||    
T  9125 acttcaaagcacgaccaacaccagttacatgattcactctcaagaatacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcatcttatcatgatagct 9224  T
Q  259 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacct 358  Q
    ||| | || |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| || || ||||| |  || ||||  ||  ||||||| |   | |||||||||    
T  9225 cttctatctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttctgtagtctcttgcacaacttcctgtcctaacaaagcactttcacct 9324  T
Q  359 gactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaact 458  Q
    ||||||||||| ||||||||    || ||||| ||||||||||||||||| || |||| |||  | |||||||||||| | || || |||||||| ||||    
T  9325 gactcaaaccaacacaacggtaacctacatcttcgaccatacaaagcctcaaacggtgtcatcgcgatactagaatgaaaactgttgttataagtaaact 9424  T
Q  459 cgatcaacgg 468  Q
      ||||||||    
T  9425 aaatcaacgg 9434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 48; Significance: 5e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 146 - 681
Target Start/End: Original strand, 14782 - 15316
Alignment:
Q  146 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 245  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || |||||||||| |||| | || || |||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||    
T  14782 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 14881  T
Q  246 tgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcctaagac 345  Q
    | ||||||||||| || |||| |||||| ||| ||||||| ||||| |  ||||||| ||| || || ||||| |  || ||||  || |||||||| |     
T  14882 tatcatgataacttttctgtctactctgagacaccttcatcttctcctaaatcatcttaaccttttccgtagtctcttgcacaacttccggtcctaacaa 14981  T
Q  346 cactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctatta 445  Q
      | || || || ||||||||||| |||||||| || || || |||| |||||||||| |||| || ||||| ||  | |||||||||||| | || ||     
T  14982 agcactctctccggactcaaacca-cacaacggtgtcctacacctcctaccatacaaaacctcaaacggtgctatatcgatactagaatgaaaactgttg 15080  T
Q  446 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 545  Q
    || ||||| ||||| |||||||| | |     ||||||| |  | |||||||| |  | |||   |||||||||||| ||||    |||||| |||||||    
T  15081 ttgtaagtaaactcaatcaacggtaaacattcatcccaactgacaccttgctccaacagacacgctctcaacaaatcttctaaactctgaatagtcctct 15180  T
Q  546 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 645  Q
    ||| ||| ||||  ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |  ||||| ||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||    
T  15181 ccgtctgcccattggtctgaggatggtaagcagaactcaacctcaacttagttcccaaggcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcgg 15280  T
Q  646 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||| | |||||| ||||| || |||| || ||||||    
T  15281 atcccgatctgacacaatactagaagaaataccatg 15316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 221 - 681
Target Start/End: Original strand, 43738 - 44198
Alignment:
Q  221 tgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagttt 320  Q
    |||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||| ||| || || ||||| |    
T  43738 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttatgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtct 43837  T
Q  321 gctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccat 420  Q
      || ||||  || |||||||| |   | ||||| || ||||||||||| |||| ||| ||  | || |||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  43838 cttgcacaacttccggtcctaataaagcactttctccggactcaaaccaacacagcggtgtcatacacctcctaccatacaaagcctcaaacggtgccat 43937  T
Q  421 tccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaa 520  Q
     |  |||||||||||| | || || || ||||| ||||| ||||| || | |      |||||| |  | |  ||||| | |||||||  ||||||||||    
T  43938 actgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaatggtaaacattcgtcccaactaacacactgctccaaaacacaagctctcaacaaa 44037  T
Q  521 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttt 620  Q
    || ||||    |||||| |||||||||  ||| ||||| || |  ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| |    
T  44038 tcttctaaactctgaatagtcctctccatctgcccatcggtataaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactct 44137  T
Q  621 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
     ||||||  |||||||||| || |||||   ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  44138 cccaaaacttagaagtaaacctcggatccagatccgacacaatactagaaggaataccatg 44198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 532 - 674
Target Start/End: Original strand, 11167 - 11309
Alignment:
Q  532 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 631  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |  ||||||||  ||| |||||| | ||||||  ||    
T  11167 ctgaatggtcctctccatctgcccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagcagcttacaaactctcccaaaactta 11266  T
Q  632 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 674  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||| || |||||||    
T  11267 gaagtaaatcttggatctcgatctgacataatactagaaggaa 11309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 350 - 436
Target Start/End: Original strand, 10985 - 11071
Alignment:
Q  350 ctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatga 436  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| | ||||| || |||| ||||||||||| ||| || |||| ||| || ||||||||||||    
T  10985 ctttcacctgactcataccaacacaacagcgttctacacctcctaccatacaaagtctcaaacggtgtcatcccgatactagaatga 11071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 8999 - 8748
Alignment:
Q  219 cctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttggatcatctgaactttctcagtagt 318  Q
    ||||||||||||  || || || | ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| || || |||||    
T  8999 cctgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagt 8900  T
Q  319 ttgctgaacaatctctggtcctaagaccactctttcacctgactcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgcc 418  Q
     |  || ||||  || |||||||| |   | |||||  | || |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||  ||| |    
T  8899 ctcttgcacaacttccggtcctaacaaagcactttcttcggattcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaactgtgtc 8800  T
Q  419 attccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaa 470  Q
    ||||| ||| ||| |||| | || || || ||||| ||||| ||||||||||    
T  8799 attccgatattagtatgaaaactgtttttgtaagtaaactcaatcaacggaa 8748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 539 - 681
Target Start/End: Original strand, 5693 - 5835
Alignment:
Q  539 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 638  Q
    ||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||    
T  5693 gtcctatccgtctgcccatcagtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacatagaagtaa 5792  T
Q  639 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    | || ||||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  5793 acctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 5835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 511 - 681
Target Start/End: Original strand, 18541 - 18711
Alignment:
Q  511 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 610  Q
    |||||||||||| |||| |  |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  || |||||  ||    
T  18541 tctcaacaaatcttctaacctctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttccgaaagcagct 18640  T
Q  611 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    |||||||| | ||||||  ||||||||||  ||||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  18641 tgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacgttggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 18711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 159 - 291
Target Start/End: Original strand, 5879 - 6011
Alignment:
Q  159 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 258  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  | ||| |||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||    
T  5879 acttcaaagcacgaccaacaccggtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgatactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 5978  T
Q  259 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctc 291  Q
    ||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||    
T  5979 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctc 6011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 159 - 291
Target Start/End: Original strand, 10493 - 10625
Alignment:
Q  159 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 258  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||    
T  10493 acttcaaagcacgaccaacaccggtcaaaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 10592  T
Q  259 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctc 291  Q
    ||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||    
T  10593 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctc 10625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 362 - 681
Target Start/End: Original strand, 14478 - 14798
Alignment:
Q  362 tcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcga 461  Q
    |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||||||| | || || || ||||| ||||| |    
T  14478 tcaaaccaacacaacggtgtcctacacctccgaccatacaaagcctcaaatggcgccataccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaa 14577  T
Q  462 tcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgt 561  Q
    ||||| | | |  |   |||||| |  |  ||||||| | |||||||  ||| ||||||||||| |    |||||| | ||||||   ||| ||||||||    
T  14578 tcaacagtaaacaatcgtcccaactgacagcttgctccaaaacacaagctcttaacaaatcctccaaactctgaatagccctctcgatctgcccatctgt 14677  T
Q  562 ctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc-aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 660  Q
    ||  |||||||| || |||||||| |||||||| |  ||| |||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| |||| ||| | |||| | ||    
T  14678 cttgggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaaccttgaatcccgatctaacac 14777  T
Q  661 aatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    ||| || ||||||| ||||||    
T  14778 aatactagaaggaataccatg 14798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 159 - 291
Target Start/End: Original strand, 8488 - 8620
Alignment:
Q  159 acttcaaagcacgtcctacaccagtcataggactgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttgtcatgataact 258  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  | ||| |||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||    
T  8488 acttcaaagcacgaccaacaccggtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgatactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 8587  T
Q  259 cttttgtcgactctgcgacgccttcattttctc 291  Q
    ||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||    
T  8588 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctc 8620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 502 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 3744 - 3565
Alignment:
Q  502 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 601  Q
    |||||||  |||||||||||| || |  || | |||||||||||  |  |||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||  |||||||| |  |||    
T  3744 aacacaagctctcaacaaatcttccaaagatttaattgtcctcttggtttgaccatcagtctgaggatgataagcaaaactcagcctcaacttagttccc 3645  T
Q  602 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 681  Q
    |||||  |||||||||| | ||||||  |  ||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||    
T  3644 aaagctgcttgcaaactctcccaaaactttaaagtaaacctcggatctctatctgacacaatgctagatggaataccatg 3565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 362 - 466
Target Start/End: Original strand, 2897 - 3001
Alignment:
Q  362 tcaaaccagcacaacggagttctgcatctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcga 461  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| ||| | |||||||  ||| |||||||| | || || || ||||| ||||| |    
T  2897 tcaaaccaacacaacggtgttctacacctcctaccatacaaagcctcaaaaagagccattctgatagtagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaa 2996  T
Q  462 tcaac 466  Q
    |||||    
T  2997 tcaac 3001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 389 - 468
Target Start/End: Original strand, 17 - 96
Alignment:
Q  389 ctccgaccatacaaagcctcgaaaggtgccattccaatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacgg 468  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||| | || || || ||||| ||||| ||||||||    
T  17 ctccgaccatacaaggcctcaaacggtgccataccgatactagaatgaaaactgttgttgtaagtaaactcaatcaacgg 96  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1061
Description:

Target: scaffold1061; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 620 - 693
Target Start/End: Original strand, 2187 - 2260
Alignment:
Q  620 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 693  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||| || || ||||| | |||||||||    
T  2187 ttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatttgaaacaatactcgacgggactccatgcaacttcacaat 2260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University