View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6828_low_12 (Length: 265)

Name: NF6828_low_12
Description: NF6828
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6828_low_12
NF6828_low_12
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (1-250)||(26484784-26485033)
chr7 (1-242)||(2108817-2109058)
chr7 (1-250)||(2775449-2775698)
chr7 (1-250)||(39210827-39211076)
chr7 (1-248)||(16041413-16041660)
chr7 (1-242)||(16449810-16450051)
chr7 (46-250)||(4200682-4200886)
chr7 (39-250)||(26682804-26683015)
chr7 (1-237)||(31088281-31088517)
chr7 (1-237)||(45733550-45733786)
chr7 (1-249)||(16518221-16518469)
chr7 (1-250)||(10916672-10916921)
chr7 (1-250)||(11424580-11424829)
chr7 (1-249)||(16503185-16503433)
chr7 (1-252)||(5128082-5128333)
chr7 (1-250)||(2154663-2154912)
chr7 (1-250)||(3445396-3445645)
chr7 (1-250)||(31564194-31564443)
chr7 (1-250)||(26274898-26275147)
chr7 (1-250)||(26435347-26435596)
chr7 (1-250)||(5147144-5147393)
chr7 (1-250)||(11441662-11441911)
chr7 (1-250)||(26537674-26537923)
chr7 (1-250)||(4144927-4145176)
chr7 (1-250)||(16736264-16736513)
chr7 (1-250)||(16751318-16751567)
chr7 (1-250)||(17523622-17523871)
chr7 (1-250)||(17529344-17529593)
chr7 (1-250)||(24592345-24592594)
chr7 (1-250)||(26319673-26319922)
chr7 (1-250)||(9618741-9618990)
chr7 (1-250)||(26669718-26669967)
chr7 (1-250)||(31125010-31125259)
chr7 (1-250)||(45387433-45387682)
chr7 (1-219)||(18540889-18541107)
chr7 (1-176)||(5159609-5159784)
[»] chr6 (49 HSPs)
chr6 (1-250)||(14143146-14143395)
chr6 (1-250)||(26788030-26788279)
chr6 (1-250)||(27196403-27196652)
chr6 (1-250)||(27252588-27252837)
chr6 (1-245)||(13521939-13522183)
chr6 (1-250)||(22456795-22457044)
chr6 (1-250)||(27290231-27290480)
chr6 (1-237)||(33374130-33374366)
chr6 (1-250)||(22934741-22934990)
chr6 (1-250)||(23857186-23857435)
chr6 (1-247)||(16749940-16750186)
chr6 (1-237)||(8892185-8892420)
chr6 (1-237)||(8903420-8903655)
chr6 (1-237)||(28162743-28162979)
chr6 (1-250)||(24304479-24304728)
chr6 (1-250)||(24863803-24864052)
chr6 (1-250)||(29549561-29549810)
chr6 (1-250)||(26989087-26989336)
chr6 (1-250)||(13298812-13299061)
chr6 (1-250)||(26918466-26918715)
chr6 (1-236)||(27000159-27000394)
chr6 (1-251)||(27359852-27360102)
chr6 (1-251)||(27450195-27450445)
chr6 (1-250)||(4757850-4758099)
chr6 (1-250)||(4773092-4773341)
chr6 (1-250)||(27007813-27008062)
chr6 (1-250)||(27272441-27272690)
chr6 (1-144)||(22477240-22477383)
chr6 (1-250)||(4525372-4525621)
chr6 (1-250)||(4545636-4545885)
chr6 (1-250)||(15424178-15424427)
chr6 (4-245)||(20160790-20161031)
chr6 (4-245)||(22171800-22172041)
chr6 (4-250)||(28207543-28207789)
chr6 (1-250)||(16674225-16674474)
chr6 (1-250)||(17025363-17025612)
chr6 (1-250)||(26116271-26116520)
chr6 (1-250)||(30557877-30558126)
chr6 (1-250)||(3696167-3696416)
chr6 (1-250)||(29573099-29573348)
chr6 (7-250)||(34463207-34463450)
chr6 (4-250)||(4723995-4724241)
chr6 (1-250)||(29501501-29501750)
chr6 (1-251)||(26777475-26777725)
chr6 (1-250)||(27485215-27485464)
chr6 (1-250)||(27044473-27044723)
chr6 (1-250)||(16943888-16944137)
chr6 (121-250)||(17092301-17092430)
chr6 (100-218)||(27629593-27629711)
[»] chr3 (61 HSPs)
chr3 (1-250)||(31034076-31034325)
chr3 (1-250)||(32292802-32293051)
chr3 (1-245)||(16626470-16626714)
chr3 (1-248)||(18530438-18530685)
chr3 (1-237)||(17993756-17993992)
chr3 (1-250)||(18051312-18051561)
chr3 (1-250)||(22387537-22387786)
chr3 (1-237)||(4625994-4626230)
chr3 (1-237)||(5652437-5652673)
chr3 (1-237)||(5713277-5713513)
chr3 (1-237)||(5724187-5724423)
chr3 (1-237)||(5757054-5757290)
chr3 (1-237)||(5767945-5768181)
chr3 (1-250)||(8296022-8296271)
chr3 (1-250)||(15741053-15741302)
chr3 (1-250)||(15892665-15892914)
chr3 (1-250)||(29148714-29148963)
chr3 (1-250)||(18330719-18330968)
chr3 (1-250)||(4796612-4796861)
chr3 (1-250)||(6192366-6192615)
chr3 (1-250)||(8301226-8301475)
chr3 (7-250)||(7073268-7073511)
chr3 (1-250)||(4416969-4417218)
chr3 (1-250)||(11110308-11110557)
chr3 (1-250)||(28021325-28021574)
chr3 (1-250)||(28115913-28116162)
chr3 (1-250)||(29664929-29665178)
chr3 (1-250)||(8211788-8212037)
chr3 (1-250)||(10396183-10396432)
chr3 (1-250)||(22870815-22871064)
chr3 (1-250)||(22885874-22886123)
chr3 (1-250)||(35880816-35881065)
chr3 (1-250)||(48465977-48466226)
chr3 (1-250)||(51782073-51782322)
chr3 (1-250)||(4346646-4346895)
chr3 (1-250)||(5467035-5467284)
chr3 (1-250)||(6542421-6542670)
chr3 (1-250)||(18277011-18277260)
chr3 (1-250)||(18292312-18292561)
chr3 (1-250)||(18307613-18307862)
chr3 (1-250)||(20576806-20577055)
chr3 (1-250)||(21674743-21674992)
chr3 (1-250)||(36997036-36997285)
chr3 (1-250)||(51797162-51797412)
chr3 (1-250)||(4721681-4721930)
chr3 (1-250)||(5609281-5609530)
chr3 (1-250)||(17984915-17985164)
chr3 (1-250)||(28339352-28339601)
chr3 (1-250)||(5596316-5596565)
chr3 (1-250)||(24328209-24328458)
chr3 (1-250)||(31964432-31964681)
chr3 (1-250)||(50134030-50134279)
chr3 (1-250)||(5013762-5014011)
chr3 (1-250)||(7996612-7996861)
chr3 (1-250)||(10643120-10643369)
chr3 (1-250)||(18242789-18243038)
chr3 (1-250)||(47023503-47023752)
chr3 (1-250)||(18225241-18225490)
chr3 (1-219)||(32439204-32439422)
chr3 (1-219)||(20066093-20066311)
chr3 (1-128)||(4893260-4893387)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (1-250)||(28151950-28152199)
chr1 (1-250)||(20340253-20340502)
chr1 (1-248)||(16207951-16208198)
chr1 (1-248)||(20461169-20461416)
chr1 (1-250)||(51638306-51638555)
chr1 (1-250)||(10962758-10963007)
chr1 (1-250)||(41793226-41793475)
chr1 (1-250)||(28585069-28585318)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (1-250)||(2576-2825)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (1-250)||(29888897-29889146)
chr5 (1-250)||(23892304-23892553)
chr5 (1-245)||(33877345-33877589)
chr5 (1-236)||(22888568-22888803)
chr5 (1-237)||(11325892-11326128)
chr5 (1-248)||(25199127-25199374)
chr5 (1-237)||(13184476-13184712)
chr5 (1-250)||(24687972-24688221)
chr5 (1-237)||(13440322-13440558)
chr5 (1-250)||(23752265-23752514)
chr5 (1-250)||(30934731-30934980)
chr5 (1-250)||(9548358-9548607)
chr5 (1-250)||(11549452-11549701)
chr5 (1-250)||(23717803-23718052)
chr5 (1-250)||(24970116-24970365)
chr5 (1-250)||(37671298-37671547)
chr5 (1-250)||(15658575-15658824)
chr5 (1-250)||(22998929-22999178)
chr5 (1-250)||(31431538-31431787)
chr5 (1-250)||(33777585-33777834)
chr5 (1-250)||(13324644-13324893)
chr5 (1-250)||(28649333-28649582)
chr5 (1-250)||(15758672-15758921)
chr5 (1-250)||(31826222-31826471)
chr5 (1-250)||(43078350-43078599)
chr5 (1-236)||(18500559-18500794)
chr5 (1-250)||(2511149-2511398)
chr5 (1-250)||(30168567-30168816)
chr5 (1-250)||(33516454-33516703)
chr5 (1-250)||(37770802-37771051)
chr5 (1-251)||(32599286-32599536)
chr5 (4-250)||(37755081-37755327)
chr5 (1-250)||(8665290-8665539)
chr5 (1-250)||(9317549-9317798)
chr5 (1-250)||(12132253-12132502)
chr5 (1-250)||(24681538-24681787)
chr5 (1-250)||(24724065-24724314)
chr5 (1-250)||(30152116-30152365)
chr5 (1-250)||(37358458-37358707)
chr5 (1-250)||(40473364-40473613)
chr5 (1-250)||(6874403-6874652)
chr5 (1-250)||(18375227-18375476)
chr5 (1-250)||(26480490-26480739)
chr5 (1-250)||(3789639-3789888)
chr5 (1-250)||(29966881-29967130)
chr5 (1-250)||(30029513-30029762)
chr5 (1-250)||(34616616-34616865)
chr5 (1-251)||(28959600-28959850)
chr5 (1-250)||(5638008-5638257)
chr5 (1-219)||(33292623-33292841)
chr5 (1-219)||(41674807-41675025)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (1-248)||(1838-2084)
scaffold0415 (1-236)||(6101-6338)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (1-248)||(20477-20723)
scaffold0124 (1-250)||(30541-30790)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (1-248)||(21703073-21703320)
chr2 (1-245)||(19456333-19456577)
chr2 (4-250)||(9349889-9350135)
chr2 (1-215)||(27393054-27393268)
chr2 (1-237)||(27118773-27119009)
chr2 (1-250)||(34303210-34303459)
chr2 (1-250)||(40233596-40233845)
chr2 (1-237)||(3784739-3784975)
chr2 (1-250)||(27434351-27434600)
chr2 (1-237)||(16163684-16163920)
chr2 (1-237)||(34157096-34157331)
chr2 (1-250)||(22925935-22926184)
chr2 (1-250)||(23128473-23128722)
chr2 (1-250)||(28882299-28882548)
chr2 (1-250)||(20838003-20838252)
chr2 (1-237)||(31891248-31891484)
chr2 (1-250)||(12655627-12655876)
chr2 (1-250)||(12586895-12587144)
chr2 (1-250)||(13936451-13936700)
chr2 (1-250)||(16829245-16829494)
chr2 (1-250)||(16891987-16892236)
chr2 (1-250)||(27777307-27777556)
chr2 (1-250)||(27817065-27817314)
chr2 (1-250)||(37375246-37375495)
chr2 (1-250)||(12716509-12716758)
chr2 (1-250)||(21677089-21677338)
chr2 (1-250)||(39051729-39051978)
chr2 (1-250)||(39890159-39890408)
chr2 (1-247)||(27803792-27804038)
chr2 (1-215)||(34286439-34286653)
chr2 (1-215)||(34291499-34291713)
chr2 (1-250)||(260660-260909)
chr2 (13-250)||(32049895-32050132)
chr2 (1-250)||(11635093-11635342)
chr2 (1-250)||(11641282-11641531)
chr2 (1-250)||(19416406-19416655)
chr2 (1-250)||(31876366-31876615)
chr2 (1-250)||(34861765-34862014)
chr2 (1-250)||(37685816-37686065)
chr2 (1-250)||(37701081-37701330)
chr2 (1-250)||(37925578-37925827)
chr2 (1-165)||(34279534-34279698)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (7-263)||(1900367-1900623)
chr4 (1-245)||(15284851-15285095)
chr4 (1-248)||(15227974-15228221)
chr4 (1-215)||(15391291-15391505)
chr4 (1-237)||(14235456-14235692)
chr4 (1-237)||(24460536-24460772)
chr4 (1-250)||(17014104-17014353)
chr4 (1-250)||(14665122-14665371)
chr4 (1-250)||(24592232-24592481)
chr4 (1-250)||(36344433-36344682)
chr4 (4-250)||(5005980-5006226)
chr4 (1-250)||(6569957-6570206)
chr4 (1-250)||(14763222-14763471)
chr4 (1-250)||(18800531-18800780)
chr4 (1-250)||(27163235-27163484)
chr4 (1-250)||(33673716-33673965)
chr4 (1-250)||(39850742-39850991)
chr4 (1-250)||(40105556-40105805)
chr4 (4-250)||(21969808-21970054)
chr4 (1-250)||(14098645-14098894)
chr4 (1-250)||(31126436-31126685)
chr4 (1-250)||(30753858-30754107)
chr4 (1-250)||(54833491-54833740)
chr4 (1-219)||(34188909-34189127)
chr4 (1-219)||(24112766-24112984)
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (1-215)||(22080790-22081004)
chr8 (1-250)||(16283538-16283787)
chr8 (1-250)||(18710675-18710924)
chr8 (1-237)||(44563190-44563424)
chr8 (1-250)||(27608782-27609031)
chr8 (1-237)||(19658930-19659165)
chr8 (1-235)||(33244754-33244988)
chr8 (1-250)||(19688187-19688436)
chr8 (1-250)||(16277643-16277892)
chr8 (1-250)||(12092601-12092850)
chr8 (1-250)||(3329384-3329633)
chr8 (1-250)||(14557713-14557962)
chr8 (1-250)||(29829411-29829660)
chr8 (1-250)||(2137136-2137385)
chr8 (1-250)||(31489627-31489876)
chr8 (1-250)||(9354711-9354961)
chr8 (1-250)||(19674530-19674779)
chr8 (1-250)||(31354613-31354862)
chr8 (1-250)||(19208237-19208486)
chr8 (1-250)||(19286551-19286800)
chr8 (1-250)||(28361832-28362081)
chr8 (1-250)||(33258812-33259061)
chr8 (74-250)||(189256-189432)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (4-195)||(1-192)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (1-250)||(21650-21899)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (1-250)||(39987-40236)
scaffold0089 (1-250)||(46903-47152)
scaffold0089 (1-250)||(29852-30101)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (1-249)||(27381-27629)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (58-215)||(571-728)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (1-250)||(9655-9904)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-250)||(47-296)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (4-250)||(8041-8287)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (1-250)||(7157-7406)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (1-250)||(8984-9233)
scaffold0159 (1-250)||(20104-20353)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (1-250)||(14848-15097)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (1-250)||(26119-26369)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (13-206)||(46764-46964)
[»] scaffold2173 (1 HSPs)
scaffold2173 (100-218)||(277-395)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 26484784 - 26485033
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26484784 caggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 26484883  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  26484884 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgc 26484983  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26484984 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtcc 26485033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 2109058 - 2108817
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2109058 caggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 2108959  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  2108958 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgc 2108859  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2108858 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 2108817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 2775449 - 2775698
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2775449 caggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 2775548  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  2775549 atgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgc 2775648  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2775649 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtcc 2775698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 39211076 - 39210827
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39211076 caggggaagcttccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctttgggtcatgatgtcgaaggatgct 39210977  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  39210976 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgc 39210877  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39210876 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtcc 39210827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 16041413 - 16041660
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16041413 cagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctaaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtagaaggatgct 16041512  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16041513 acgctttgaagtacattgtgaaaaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgc 16041612  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  16041613 tgctgtgaacatgattgaggtatacgaggaagctcccagactcgatgt 16041660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16450051 - 16449810
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16450051 cagggcaagcctccacctgatcctttgcctcccaggtttcgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 16449952  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16449951 acgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgc 16449852  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16449851 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 16449810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 46 - 250
Target Start/End: Original strand, 4200682 - 4200886
Alignment:
Q  46 gacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4200682 gacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagt 4200781  T
Q  146 taacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 245  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4200782 tgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgataaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 4200881  T
Q  246 tgtcc 250  Q
     ||||    
T  4200882 cgtcc 4200886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 39 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 26683015 - 26682804
Alignment:
Q  39 ccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaa 138  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || || |||||  |||||    
T  26683015 ccggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattttaaaaaaactcatagaccaa 26682916  T
Q  139 ggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccg 238  Q
    ||||| || || |||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26682915 ggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccg 26682816  T
Q  239 gacttgatgtcc 250  Q
    ||||||| ||||    
T  26682815 gacttgacgtcc 26682804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 31088517 - 31088281
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||| ||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31088517 cagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgct 31088418  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| || |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  31088417 acgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgc 31088318  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctccc 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31088317 tgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctccc 31088281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 45733550 - 45733786
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||| ||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45733550 cagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgct 45733649  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| || |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  45733650 acgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgc 45733749  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctccc 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45733750 tgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctccc 45733786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16518469 - 16518221
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||    
T  16518469 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgct 16518370  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    ||| |||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  16518369 atgttttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 16518270  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtc 249  Q
     ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  16518269 cgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtc 16518221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 10916921 - 10916672
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||    
T  10916921 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgct 10916822  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  10916821 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 10916722  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  10916721 cgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 10916672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 11424829 - 11424580
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||    
T  11424829 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgct 11424730  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  11424729 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 11424630  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || |||| ||||||| ||||  ||||||||||||    
T  11424629 cgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtcc 11424580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16503433 - 16503185
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||    
T  16503433 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgct 16503334  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    ||| |||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  16503333 atgttttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 16503234  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtc 249  Q
     ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  16503233 cgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtc 16503185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Original strand, 5128082 - 5128333
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  5128082 cagggtaagcccccacctaatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgct 5128181  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | |||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  5128182 acgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgc 5128281  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccat 252  Q
     |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  5128282 cgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccat 5128333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 2154663 - 2154912
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| |||||||    
T  2154663 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctaggtcatgatgtcgagggatgct 2154762  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | |||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  2154763 acgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 2154862  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  2154863 cgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 2154912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 3445396 - 3445645
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  3445396 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 3445495  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||    
T  3445496 atgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgc 3445595  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
    ||||||||| ||||| || |||| ||||||| ||||  ||||||||||||    
T  3445596 tgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtcc 3445645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 31564443 - 31564194
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||| || || |    
T  31564443 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 31564344  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  31564343 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgc 31564244  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  31564243 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 31564194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 26275147 - 26274898
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  26275147 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgtt 26275048  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  26275047 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 26274948  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| ||||| | ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  26274947 cgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 26274898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 26435347 - 26435596
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  26435347 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 26435446  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  26435447 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 26435546  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  26435547 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 26435596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 5147393 - 5147144
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  5147393 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 5147294  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  5147293 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 5147194  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || |  |||||||||||  ||||||||||||    
T  5147193 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtcc 5147144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 11441662 - 11441911
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  11441662 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 11441761  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||    
T  11441762 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgc 11441861  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  11441862 cgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 11441911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 26537923 - 26537674
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  26537923 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 26537824  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||    
T  26537823 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgc 26537724  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  26537723 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 26537674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 4145176 - 4144927
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || || |    
T  4145176 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgtt 4145077  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  4145076 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 4144977  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  4144976 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 4144927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16736513 - 16736264
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||  | |||||||||||||| || || |    
T  16736513 cagggcaagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 16736414  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| ||    
T  16736413 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgc 16736314  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     || ||||| ||||| || || | ||||||||||||  | ||||||||||    
T  16736313 cgccgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtcc 16736264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16751567 - 16751318
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||  | |||||||||||||| || || |    
T  16751567 cagggcaagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 16751468  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| ||    
T  16751467 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgc 16751368  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     || ||||| ||||| || || | ||||||||||||  | ||||||||||    
T  16751367 cgccgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtcc 16751318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 17523622 - 17523871
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||  | |||||||||||||| || || |    
T  17523622 cagggcaagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 17523721  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| ||    
T  17523722 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgc 17523821  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     || ||||| ||||| || || | ||||||||||||  | ||||||||||    
T  17523822 cgccgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtcc 17523871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 17529593 - 17529344
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||  | |||||||||||||| || || |    
T  17529593 cagggcaagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 17529494  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| ||    
T  17529493 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgc 17529394  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     || ||||| ||||| || || | ||||||||||||  | ||||||||||    
T  17529393 cgccgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtcc 17529344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24592594 - 24592345
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||  | |||||||| ||||| || || |    
T  24592594 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgtt 24592495  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  24592494 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcacgc 24592395  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  24592394 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 24592345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 26319922 - 26319673
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || || |    
T  26319922 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgtt 26319823  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  26319822 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 26319723  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
      ||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  26319722 cactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 26319673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 9618741 - 9618990
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||  | |||||||| ||||| || || |    
T  9618741 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgtt 9618840  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  9618841 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 9618940  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  9618941 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 9618990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 26669967 - 26669718
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||  | |||||| ||||||| |||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| || || |    
T  26669967 cagggtaagcccccacctgatccgttgcccccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgtt 26669868  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  26669867 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 26669768  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  26669767 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 26669718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 31125010 - 31125259
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||  | || ||||||||||| || || |    
T  31125010 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgtt 31125109  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || || ||||| ||    
T  31125110 atgctttgaagtatatcgtgaagaaactcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgc 31125209  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  31125210 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 31125259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 45387433 - 45387682
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| || || |    
T  45387433 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgtt 45387532  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  45387533 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 45387632  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  | ||||||||||    
T  45387633 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgaggcttgatgtcc 45387682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 18540889 - 18541107
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||| | |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| ||| | || |||||||| || || ||||    
T  18540889 caggggaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgct 18540988  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    ||||| | || ||||| || |||||||| ||  | ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || || || || || ||||| ||    
T  18540989 atgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgc 18541088  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgag 219  Q
    ||| ||||| |||||||||    
T  18541089 tgccgtgaatatgattgag 18541107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 5159609 - 5159784
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||| | |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||  | || ||||    
T  5159609 cagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttaaggggtgct 5159708  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcct 176  Q
    ||||| | || ||||| || |||||||| ||  | ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  5159709 atgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcct 5159784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 49)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 14143395 - 14143146
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14143395 caggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 14143296  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  14143295 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgc 14143196  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14143195 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtcc 14143146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 26788030 - 26788279
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26788030 caggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 26788129  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  26788130 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgc 26788229  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26788230 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtcc 26788279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 27196403 - 27196652
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27196403 caggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 27196502  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  27196503 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgc 27196602  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27196603 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtcc 27196652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27252837 - 27252588
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27252837 caggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 27252738  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  27252737 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgc 27252638  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27252637 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtcc 27252588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13522183 - 13521939
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||| ||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13522183 cagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 13522084  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  13522083 atgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgc 13521984  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13521983 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 13521939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22457044 - 22456795
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22457044 cagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttcttacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 22456945  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22456944 acgctttaaagtacattgtgaagaagctcatagaccaaggaaagttaacttttgagaataatttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgc 22456845  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22456844 tgctgtgaacgtgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 22456795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27290480 - 27290231
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27290480 cagggcaagcctccacctgatccgttacctcccaagttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 27290381  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||| ||    
T  27290380 acgcgttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcaacaatcttcttccgaatcatgc 27290281  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
    | |||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27290280 tactgtaaatatgattgaggtatatgaggaagctcctagacttgatgtcc 27290231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 33374366 - 33374130
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||| ||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33374366 cagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgct 33374267  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  33374266 acgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacttttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgc 33374167  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctccc 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33374166 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctccc 33374130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22934990 - 22934741
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||    
T  22934990 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgct 22934891  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  22934890 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 22934791  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  22934790 cgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 22934741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23857435 - 23857186
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||    
T  23857435 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgct 23857336  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  23857335 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 23857236  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  23857235 cgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 23857186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 16749940 - 16750186
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||    
T  16749940 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgct 16750039  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  16750040 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 16750139  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatg 247  Q
     |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  16750140 cgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatg 16750186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 8892420 - 8892185
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||| ||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8892420 cagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgct 8892321  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| || |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  8892320 acgcgttgaggtacattgt-aaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgc 8892222  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctccc 237  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8892221 tgctgtaaacatgattgaagtatatgaggaagctccc 8892185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 8903655 - 8903420
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||| ||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8903655 cagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgct 8903556  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| || |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  8903555 acgcgttgaggtacattgt-aaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgc 8903457  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctccc 237  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8903456 tgctgtaaacatgattgaagtatatgaggaagctccc 8903420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 28162743 - 28162979
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |  ||| ||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  28162743 cagggcaagcctccacttgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcggaggatgct 28162842  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| || |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  28162843 acgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgc 28162942  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctccc 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28162943 tgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctccc 28162979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24304728 - 24304479
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  24304728 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgct 24304629  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    ||| |||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  24304628 atgatttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 24304529  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  24304528 cgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 24304479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 24863803 - 24864052
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||    
T  24863803 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgct 24863902  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  24863903 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 24864002  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  24864003 cgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 24864052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 29549561 - 29549810
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || |    
T  29549561 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgtt 29549660  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  29549661 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 29549760  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||||||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  29549761 cgctgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctggacttgatgtcc 29549810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 26989087 - 26989336
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||    
T  26989087 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgct 26989186  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || || |||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  26989187 atgctttgaagtatatcgtaaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 26989286  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  26989287 cgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 26989336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 13299061 - 13298812
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  13299061 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgacgtcgagggatgct 13298962  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |  ||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  13298961 acactttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 13298862  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  13298861 cgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 13298812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 26918466 - 26918715
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||    
T  26918466 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgct 26918565  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | |||||||| || || ||||| ||||| ||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  26918566 acgctttgaagtatatcgtgaaaaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 26918665  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  26918666 cgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 26918715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 27000159 - 27000394
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||    
T  27000159 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgct 27000258  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  27000259 atgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 27000358  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 236  Q
     |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  27000359 cgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcc 27000394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 27360102 - 27359852
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| ||||| |    
T  27360102 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgtt 27360003  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  27360002 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgc 27359903  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcca 251  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  |||||||||||||    
T  27359902 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcca 27359852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 27450445 - 27450195
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| ||||| |    
T  27450445 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgtt 27450346  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  27450345 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgc 27450246  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcca 251  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  |||||||||||||    
T  27450245 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcca 27450195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 4757850 - 4758099
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| ||||| |    
T  4757850 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgtt 4757949  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  4757950 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgc 4758049  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  4758050 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 4758099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 4773092 - 4773341
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||| || || |    
T  4773092 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 4773191  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  4773192 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgc 4773291  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  4773292 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 4773341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 27007813 - 27008062
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  27007813 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 27007912  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  27007913 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgaccagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgc 27008012  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | | ||||||||||  ||||||||||||    
T  27008013 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtaaggaagctcctagacttgatgtcc 27008062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27272690 - 27272441
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||  ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  27272690 cagggtaagcccccacctgatccgtcgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgctctgggtcatgatgtcgaggggtgct 27272591  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||||||  | ||||| ||| | || |||||||| ||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| ||    
T  27272590 atgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcatcgatcaagggaagctgacctttgagaataatgttccgcatgtcctcgataatcctcttccaaatcatgc 27272491  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
    ||||||||| ||||| || |||| ||||| ||||||  ||||||||||||    
T  27272490 tgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggtagctcctagacttgatgtcc 27272441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 22477383 - 22477240
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22477383 cagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctaacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 22477284  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaag 144  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22477283 acgctttaaagtacattgtgaagaagctcatagaccaaggaaag 22477240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 4525372 - 4525621
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| | ||||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  4525372 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcccaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 4525471  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || || ||||| ||    
T  4525472 atgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgc 4525571  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  4525572 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 4525621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 4545885 - 4545636
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||| || || |    
T  4545885 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 4545786  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || || ||||| ||    
T  4545785 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgc 4545686  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  4545685 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 4545636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15424427 - 15424178
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||    
T  15424427 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccttgggtcatgatgtcgaggggtgct 15424328  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  15424327 atgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 15424228  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     ||||| || |||||  | |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  15424227 cgctgtaaatatgatcaaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 15424178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 245
Target Start/End: Original strand, 20160790 - 20161031
Alignment:
Q  4 ggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || || ||||| ||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||    
T  20160790 ggcaagcctccacctgatccgttacctcccaggttctgttccgatctcaagtgtgatttccaccaaggtgccttaggtcatgatgtggaagggtgctatg 20160889  T
Q  104 ctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgc 203  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||  ||||| | ||| | ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||     
T  20160890 ctttgaagtatattgtgaaaaagctcatagaccaatggaagctgactttcgagaataacgtccctcatgttcttgacaatcctcttctgaatcatgctgt 20160989  T
Q  204 tgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 245  Q
    |||||||||||| || || | ||||||||||||  |||||||    
T  20160990 tgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 20161031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22172041 - 22171800
Alignment:
Q  4 ggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || || ||||| ||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||    
T  22172041 ggcaagcctccacctgatccgttacctcccaggttctgttccgatctcaagtgtgatttccaccaaggtgccttaggtcatgatgtggaagggtgctatg 22171942  T
Q  104 ctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgc 203  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||  ||||| | ||| | ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||     
T  22171941 ctttgaagtatattgtgaaaaagctcatagaccaatggaagctgactttcgagaataacgtccctcatgttcttgacaatcctcttctgaatcatgctgt 22171842  T
Q  204 tgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 245  Q
    |||||||||||| || || | ||||||||||||  |||||||    
T  22171841 tgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 22171800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 250
Target Start/End: Original strand, 28207543 - 28207789
Alignment:
Q  4 ggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||  | || ||||||||||| || || ||||    
T  28207543 ggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatg 28207642  T
Q  104 ctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgc 203  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  28207643 ctttgaagtatattgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgc 28207742  T
Q  204 tgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
    |||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  28207743 tgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 28207789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 16674225 - 16674474
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  16674225 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 16674324  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  16674325 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgc 16674424  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  16674425 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 16674474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 17025363 - 17025612
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||| | |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||  | || ||||||||||| || || |    
T  17025363 cagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgtt 17025462  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  17025463 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgc 17025562  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  17025563 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 17025612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 26116520 - 26116271
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  26116520 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 26116421  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || || ||||| ||    
T  26116420 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgc 26116321  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  26116320 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 26116271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 30558126 - 30557877
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| || |||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  30558126 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 30558027  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  30558026 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 30557927  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| ||||| | ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  30557926 cgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 30557877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 3696167 - 3696416
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  3696167 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 3696266  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  3696267 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 3696366  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| ||  | | ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  3696367 cgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgatgaagctcctagacttgatgtcc 3696416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 29573099 - 29573348
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || || |    
T  29573099 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgtt 29573198  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  29573199 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 29573298  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  29573299 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 29573348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 34463450 - 34463207
Alignment:
Q  7 aagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctt 106  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || |||||||    
T  34463450 aagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctt 34463351  T
Q  107 tgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgt 206  Q
    |||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| || |||||    
T  34463350 tgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgt 34463251  T
Q  207 gaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
    ||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  34463250 gaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 34463207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 4724241 - 4723995
Alignment:
Q  4 ggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||    
T  4724241 ggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatg 4724142  T
Q  104 ctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgc 203  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||| | || |||||| | ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| || ||    
T  4724141 ctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgc 4724042  T
Q  204 tgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
    |||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  4724041 tgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 4723995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 29501501 - 29501750
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  29501501 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 29501600  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||    
T  29501601 atgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgc 29501700  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  29501701 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 29501750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 26777725 - 26777475
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  26777725 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 26777626  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||    
T  26777625 atgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgc 26777526  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcca 251  Q
     |||||||| ||||| || || | |||||||  |||  |||||||||||||    
T  26777525 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaaaatcctagacttgatgtcca 26777475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 27485215 - 27485464
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||  | || ||||||||||| || || |    
T  27485215 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgtt 27485314  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || || ||||| ||    
T  27485315 atgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgc 27485414  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  | ||||||||||    
T  27485415 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtcc 27485464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 27044473 - 27044723
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggat-gc 99  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || | |     
T  27044473 cagggcaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtggt 27044572  T
Q  100 tatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacg 199  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| |    
T  27044573 tatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatg 27044672  T
Q  200 ctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
    | |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  27044673 ccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 27044723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16944137 - 16943888
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||  |||||||||| ||||| || || |    
T  16944137 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgtt 16944038  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||    
T  16944037 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgc 16943938  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
      ||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  16943937 cactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 16943888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 121 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 17092430 - 17092301
Alignment:
Q  121 aagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgagg 220  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||| || || || ||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  17092430 aagaagctcattgaccagggaaagttgacttttgagaataatacccctcatgtcctcgataatccccttccaaaccacgctgctgtgaacatgactgagg 17092331  T
Q  221 tatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
    ||| |||||||||| ||  |||||||||||    
T  17092330 tatgtgaggaagctaccaaacttgatgtcc 17092301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 100 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27629711 - 27629593
Alignment:
Q  100 tatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacg 199  Q
    |||||||| || || |||||  ||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||||  | || |    
T  27629711 tatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgaccaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataaccctcttccagaccatg 27629612  T
Q  200 ctgctgtgaacatgattga 218  Q
    |||| || |||||||||||    
T  27629611 ctgcagtaaacatgattga 27629593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 61)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 31034325 - 31034076
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31034325 caggggaagcctccacctgatccgttacctcctaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 31034226  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  31034225 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgc 31034126  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31034125 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtcc 31034076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 32292802 - 32293051
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32292802 caggggaagtctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 32292901  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  32292902 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgc 32293001  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32293002 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtcc 32293051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16626714 - 16626470
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16626714 cagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgct 16626615  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | |||||||| |||||||| || ||||||||  |||||||||| || || |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  16626614 acgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtccttgacaatcctcttccgaatcacac 16626515  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16626514 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 16626470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 18530438 - 18530685
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18530438 cagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgct 18530537  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | |||||||| |||||||| || ||||||||  |||||||||| || || |||||||| || ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18530538 acgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcgtgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgc 18530637  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  18530638 tgctgtgaacatgattgaggtatatgagggagctcccagacttaatgt 18530685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17993992 - 17993756
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17993992 cagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgct 17993893  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| || |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  17993892 acgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgc 17993793  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctccc 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17993792 tgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctccc 17993756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 18051312 - 18051561
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| || ||||    
T  18051312 cagggcaagcccccacctgatccgctgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttctatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgct 18051411  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  18051412 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 18051511  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||  ||||||||||||    
T  18051512 cgctgtgaacatgattgaagtatgtgagaaagctcctagacttgatgtcc 18051561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22387786 - 22387537
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||    
T  22387786 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgct 22387687  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  22387686 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 22387587  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  22387586 cgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 22387537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 4625994 - 4626230
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||| ||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4625994 cagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgct 4626093  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| || |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  4626094 acgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgc 4626193  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctccc 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4626194 tgctgtaaacatgattgaggtatatgagaaagctccc 4626230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 5652437 - 5652673
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5652437 cagggcaagccttcacctgacccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 5652536  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| || |||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||    
T  5652537 acgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcatgc 5652636  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctccc 237  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5652637 tgctgtgaacatgattgaggtatgtgaggaagctccc 5652673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 5713277 - 5713513
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  5713277 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 5713376  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  5713377 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgc 5713476  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctccc 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5713477 tgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctccc 5713513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 5724187 - 5724423
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  5724187 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 5724286  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  5724287 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgc 5724386  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctccc 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5724387 tgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctccc 5724423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 5757290 - 5757054
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  5757290 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 5757191  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  5757190 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgc 5757091  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctccc 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5757090 tgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctccc 5757054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 5768181 - 5767945
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  5768181 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 5768082  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  5768081 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgc 5767982  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctccc 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5767981 tgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctccc 5767945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 8296022 - 8296271
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||| ||| |||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  8296022 cagggcaagcccctacctgatctgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgct 8296121  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  8296122 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 8296221  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  8296222 cgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 8296271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15741302 - 15741053
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  15741302 cagggcaagcccccacctgattcgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgctctgggtcatgatgtcgagggatgct 15741203  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  15741202 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 15741103  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  15741102 cgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 15741053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15892914 - 15892665
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||    
T  15892914 cagggcaagcccccacctgatcctttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgct 15892815  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  15892814 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 15892715  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  15892714 cgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 15892665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 29148963 - 29148714
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||    
T  29148963 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgct 29148864  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  29148863 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 29148764  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  29148763 cgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 29148714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 18330719 - 18330968
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||    
T  18330719 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgct 18330818  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | |||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  18330819 acgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 18330918  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  18330919 cgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 18330968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 4796861 - 4796612
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||    
T  4796861 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgct 4796762  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  4796761 atgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 4796662  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  4796661 cgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 4796612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 6192366 - 6192615
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||| | | ||| | |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||    
T  6192366 cagggcaagcccccacctgatctgctgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgct 6192465  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  6192466 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 6192565  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  6192566 cgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 6192615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 8301475 - 8301226
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||    
T  8301475 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtagaggggtgct 8301376  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  8301375 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 8301276  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     ||||| || ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  8301275 cgctgtaaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 8301226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Original strand, 7073268 - 7073511
Alignment:
Q  7 aagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctt 106  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||    
T  7073268 aagcccccgcctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctt 7073367  T
Q  107 tgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgt 206  Q
    |||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  7073368 tgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgt 7073467  T
Q  207 gaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
    ||||||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  7073468 gaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 7073511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 4416969 - 4417218
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||  | |||||||||||||| || || |    
T  4416969 cagggcaaacccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 4417068  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  4417069 atgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 4417168  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  4417169 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 4417218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 11110557 - 11110308
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  11110557 cagggtaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 11110458  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  11110457 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgc 11110358  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| |||||||| || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  11110357 cgctgtgaatatgattgaagtgtgtgaggaagctccaagacttgatgtcc 11110308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 28021325 - 28021574
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | ||| |||||||||| || || |    
T  28021325 cagggcaagccaccacctgatccattacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggttatgatgtcgaggggtgtt 28021424  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  28021425 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccccacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 28021524  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  28021525 cgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 28021574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 28116162 - 28115913
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| || || |    
T  28116162 cagggcaagcccccacttgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 28116063  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | || |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  28116062 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacatttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 28115963  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || |  |||||||||||  ||||||||||||    
T  28115962 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtcc 28115913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 29665178 - 29664929
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||| | |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| || || |    
T  29665178 cagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 29665079  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  29665078 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcacgc 29664979  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  29664978 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 29664929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 8211788 - 8212037
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  8211788 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 8211887  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  8211888 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 8211987  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  8211988 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 8212037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 10396183 - 10396432
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || |    
T  10396183 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgtt 10396282  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| | || |||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  10396283 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacctttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 10396382  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  10396383 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 10396432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22871064 - 22870815
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  22871064 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 22870965  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  22870964 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgc 22870865  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | |||||||| |||  ||||||||||||    
T  22870864 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtcc 22870815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22886123 - 22885874
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  22886123 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 22886024  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  22886023 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgc 22885924  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | |||||||| |||  ||||||||||||    
T  22885923 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtcc 22885874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 35880816 - 35881065
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||| | |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| || ||||    
T  35880816 cagggcaagcccccacctgatccgctgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctaggtcatgatgtcgaggggtgct 35880915  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  35880916 atgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 35881015  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || |||| ||||||| ||||  ||||||||||||    
T  35881016 cgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtcc 35881065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 48465977 - 48466226
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  48465977 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 48466076  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  48466077 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgc 48466176  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  48466177 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 48466226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 51782073 - 51782322
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  51782073 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 51782172  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||  | || |||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  51782173 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgc 51782272  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  51782273 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 51782322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 4346895 - 4346646
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  4346895 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 4346796  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| ||||| ||    
T  4346795 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgataatcctcttccaaatcatgc 4346696  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  4346695 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 4346646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 5467035 - 5467284
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  5467035 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 5467134  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||  | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  5467135 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaaactgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 5467234  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  5467235 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 5467284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 6542670 - 6542421
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  6542670 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 6542571  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || || ||||| ||    
T  6542570 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgc 6542471  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | | ||||||||||  ||||||||||||    
T  6542470 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtaaggaagctcctagacttgatgtcc 6542421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18277260 - 18277011
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  18277260 cagggcaagcccccacctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 18277161  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||    
T  18277160 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgc 18277061  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  18277060 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 18277011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18292561 - 18292312
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  18292561 cagggcaagcccccacctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 18292462  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||    
T  18292461 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgc 18292362  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  18292361 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 18292312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18307862 - 18307613
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  18307862 cagggcaagcccccacctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 18307763  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||    
T  18307762 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgc 18307663  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  18307662 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 18307613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20577055 - 20576806
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||| | |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  20577055 cagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 20576956  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  20576955 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 20576856  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  20576855 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 20576806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 21674743 - 21674992
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  21674743 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 21674842  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||  || |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  21674843 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgctccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgc 21674942  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  21674943 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 21674992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 36997285 - 36997036
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  36997285 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 36997186  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| || || || ||||| ||    
T  36997185 atgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccatatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgc 36997086  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || |||| ||||||| ||||  ||||||||||||    
T  36997085 cgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtcc 36997036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 51797162 - 51797412
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttcca-ggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgc 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||  || ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || ||     
T  51797162 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctcacaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgt 51797261  T
Q  100 tatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacg 199  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||  | || |||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  51797262 tatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatg 51797361  T
Q  200 ctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
    | |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  51797362 ccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 51797412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 4721681 - 4721930
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||| | |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||    
T  4721681 cagggcaagcccccacctgatccgctgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgct 4721780  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |  ||||||| || || ||||| || |||||| | ||||||||| | |||||| |||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  4721781 acactttgaagtatatcgtgaaaaatctcattgatcaaggaaagctgactttttagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 4721880  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     | |||||| ||||| || |||| ||||||||||||  |||| |||||||    
T  4721881 cgttgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagactcgatgtcc 4721930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 5609530 - 5609281
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||| |||||||| || |    
T  5609530 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaagggtgtt 5609431  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || || ||||| ||    
T  5609430 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgc 5609331  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  | ||||||||||    
T  5609330 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtcc 5609281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 17985164 - 17984915
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| || |||||||| || |||||||||||  | |||||||| ||||| ||||| |    
T  17985164 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgagggatgtt 17985065  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  17985064 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgc 17984965  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  17984964 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctcctagacttgatgtcc 17984915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 28339352 - 28339601
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||| || || |    
T  28339352 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgacgtcgaggggtgtt 28339451  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || || ||||| ||    
T  28339452 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgc 28339551  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  28339552 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 28339601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 5596565 - 5596316
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  5596565 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 5596466  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||    
T  5596465 atgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgc 5596366  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  5596365 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 5596316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 24328209 - 24328458
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| || || |    
T  24328209 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgtt 24328308  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || || ||||| ||    
T  24328309 atgctttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgc 24328408  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  24328409 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 24328458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 31964681 - 31964432
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||| ||||| || || |    
T  31964681 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgtt 31964582  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||    
T  31964581 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgc 31964482  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  31964481 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 31964432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 50134279 - 50134030
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||| ||||| || || |    
T  50134279 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgtt 50134180  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||    
T  50134179 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgc 50134080  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  50134079 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 50134030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 5013762 - 5014011
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| || || |    
T  5013762 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgtt 5013861  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || || ||||| ||    
T  5013862 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgc 5013961  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  5013962 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 5014011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 7996612 - 7996861
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| || || |    
T  7996612 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgtt 7996711  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || || ||||| ||    
T  7996712 atgctttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgc 7996811  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  | ||||||||||    
T  7996812 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgaggcttgatgtcc 7996861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 10643120 - 10643369
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| || || |    
T  10643120 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgtt 10643219  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || || ||||| ||    
T  10643220 atgctttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgc 10643319  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  | ||||||||||    
T  10643320 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgaggcttgatgtcc 10643369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 18242789 - 18243038
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||  | || ||||||||||| || || |    
T  18242789 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgtt 18242888  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||    
T  18242889 atgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgc 18242988  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  18242989 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 18243038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 47023503 - 47023752
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| || || |    
T  47023503 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgtt 47023602  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||    
T  47023603 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgc 47023702  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
      ||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  47023703 cactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 47023752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 18225241 - 18225490
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||  | |||||||| ||||| || || |    
T  18225241 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgtt 18225340  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||    
T  18225341 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgc 18225440  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
      ||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  | ||||||||||    
T  18225441 cactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctcctaggcttgatgtcc 18225490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 32439204 - 32439422
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||| | |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| ||| | || |||||||| || || ||||    
T  32439204 cagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgct 32439303  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    ||||| | || ||||| || |||||||| ||  | ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || || || || || ||||| ||    
T  32439304 atgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgc 32439403  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgag 219  Q
    ||| ||||| |||||||||    
T  32439404 tgccgtgaatatgattgag 32439422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 20066093 - 20066311
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||||||||| |  || |||||| | |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| ||| | || |||||||| || || ||||    
T  20066093 cagggcaagcctccaccgggccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgct 20066192  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    ||||| | || ||||| || |||||||| ||  | ||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||| || || || || || ||||| ||    
T  20066193 atgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatatgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgc 20066292  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgag 219  Q
    ||| ||||| |||||||||    
T  20066293 tgccgtgaatatgattgag 20066311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 4893260 - 4893387
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    |||||||| |||||||| || || |||||| | |||||||  ||||| || || ||||| ||||||||||| ||| | || |||||||| || || ||||    
T  4893260 cagggcaaacctccaccggaccctttacctccaaggttccactctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgct 4893359  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagct 128  Q
    ||||| | || ||||| || ||||||||    
T  4893360 atgctctaaagtacatcgtcaagaagct 4893387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 28151950 - 28152199
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28151950 caggggaagcctccacctgatctgttacctcccaggctccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 28152049  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  28152050 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgc 28152149  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28152150 tgctgtgaacatgattgagatatatgaggaagctcccggacttgacgtcc 28152199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20340502 - 20340253
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20340502 cagggcaagcctccacctgatccgttacctcctaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 20340403  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20340402 acgctttgaagtacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatatccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgc 20340303  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  20340302 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgacgtcc 20340253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 16208198 - 16207951
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16208198 cagggaaaacctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 16208099  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16208098 acgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgc 16207999  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgt 248  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  16207998 tgctgtaaacatgattgaggtatatgagaaagctcccagacttgatgt 16207951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 20461169 - 20461416
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20461169 cagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaaggatgct 20461268  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | |||||||| |||||||| || ||||||||  |||||||||| || || ||||| || |  |||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  20461269 acgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgaaaatatcgtccctcatgtcctcgataatcctcttccgaatcacgc 20461368  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgt 248  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  20461369 tgttgtgaacatgattgaggtatatgagcaagctcgcagacttgatgt 20461416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 51638306 - 51638555
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  51638306 cagggtaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 51638405  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  51638406 atgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgc 51638505  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  51638506 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 51638555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 10962758 - 10963007
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  10962758 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgtt 10962857  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  10962858 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 10962957  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| ||  | | ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  10962958 cgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 10963007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 41793475 - 41793226
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||| ||||| || || |    
T  41793475 cagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgtt 41793376  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || |||||||||||| |  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||    
T  41793375 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgtcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgc 41793276  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  41793275 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 41793226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 28585069 - 28585318
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||  |||||||||| ||||| || || |    
T  28585069 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgtt 28585168  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||    
T  28585169 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgc 28585268  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  28585269 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 28585318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 206; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 2825 - 2576
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2825 cagggcaagcctccacctgatccgttacctcctaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 2726  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  2725 acgctttgaagtacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatatccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgc 2626  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  2625 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgacgtcc 2576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 29889146 - 29888897
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29889146 cagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccggtctgacctcatatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 29889047  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  29889046 atgctttgaagtacatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgc 29888947  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29888946 tgctgtgaacatgattgaggtgtatgaggaagctcccagacttgatgtcc 29888897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 23892304 - 23892553
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23892304 cagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaagatgct 23892403  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  23892404 atgctctgaagtacatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcatgc 23892503  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23892504 tgctgtgaacgtgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 23892553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 33877345 - 33877589
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||| ||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33877345 cagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 33877444  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  33877445 atgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgc 33877544  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33877545 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 33877589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 22888568 - 22888803
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22888568 cagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 22888667  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22888668 acgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgc 22888767  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 236  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22888768 tgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 22888803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 11325892 - 11326128
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11325892 cagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 11325991  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  11325992 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgt 11326091  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctccc 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11326092 tgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctccc 11326128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 25199127 - 25199374
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25199127 cagggcaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccgttctgatctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 25199226  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25199227 acgctttaaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgc 25199326  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgt 248  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  25199327 tgctgtaaacatgattgaggtatatgagaaagcccccagacttgatgt 25199374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13184712 - 13184476
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||| ||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13184712 cagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgct 13184613  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| || |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  13184612 acgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgc 13184513  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctccc 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13184512 tgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctccc 13184476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24688221 - 24687972
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  24688221 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgctctgggtcatgatgtcgaggggtgct 24688122  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  24688121 atgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 24688022  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  24688021 cgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 24687972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13440558 - 13440322
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||| ||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13440558 cagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgct 13440459  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| || |||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||    
T  13440458 acgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttctgaatcacgc 13440359  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctccc 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13440358 tgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctccc 13440322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23752514 - 23752265
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||    
T  23752514 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgct 23752415  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  23752414 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 23752315  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  23752314 cgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 23752265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 30934731 - 30934980
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||    
T  30934731 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgct 30934830  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  30934831 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 30934930  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||  | ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  30934931 cgctgtatatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 30934980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 9548607 - 9548358
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||    
T  9548607 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaagtgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgct 9548508  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  9548507 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 9548408  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  9548407 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 9548358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 11549452 - 11549701
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||    
T  11549452 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgct 11549551  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  11549552 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 11549651  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     ||||| || ||||| || ||||  |||||||||||  ||||||||||||    
T  11549652 cgctgtaaatatgatcgaagtatgcgaggaagctcctagacttgatgtcc 11549701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23718052 - 23717803
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||    
T  23718052 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgct 23717953  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  23717952 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 23717853  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  23717852 cgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 23717803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 24970116 - 24970365
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||    
T  24970116 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgct 24970215  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | |||||||||   ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  24970216 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagcggacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 24970315  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
    |||||| || |||||  | |||  ||||||||||||  ||||||||||||    
T  24970316 tgctgtaaatatgatcaaagtacgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 24970365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 37671547 - 37671298
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  37671547 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 37671448  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  37671447 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgc 37671348  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  37671347 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 37671298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15658824 - 15658575
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || |    
T  15658824 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgtt 15658725  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  15658724 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 15658625  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| ||  | | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  15658624 cgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 15658575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22999178 - 22998929
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||    
T  22999178 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaagtgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgct 22999079  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||    
T  22999078 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaaccatgc 22998979  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  22998978 cgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 22998929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 31431538 - 31431787
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| ||||| |    
T  31431538 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgtt 31431637  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  31431638 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgc 31431737  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  31431738 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 31431787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 33777585 - 33777834
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||    
T  33777585 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgct 33777684  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | |||||||| || || ||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  33777685 acgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 33777784  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
      ||||||| ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  33777785 cactgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 33777834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 13324893 - 13324644
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||| | |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||| || || |    
T  13324893 cagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 13324794  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  13324793 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgc 13324694  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  13324693 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 13324644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 28649333 - 28649582
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  28649333 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 28649432  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  28649433 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 28649532  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  28649533 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 28649582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15758921 - 15758672
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || || |    
T  15758921 cagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgtt 15758822  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || || ||||| ||    
T  15758821 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgc 15758722  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  15758721 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 15758672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 31826471 - 31826222
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  31826471 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 31826372  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||    
T  31826371 atgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgc 31826272  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || |||| ||||||| ||||  ||||||||||||    
T  31826271 cgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtcc 31826222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 43078350 - 43078599
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  43078350 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 43078449  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || |||||||||||| || | || |||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  43078450 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgc 43078549  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  43078550 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 43078599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18500794 - 18500559
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  18500794 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 18500695  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  18500694 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 18500595  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 236  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||    
T  18500594 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 18500559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 2511149 - 2511398
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || || |    
T  2511149 cagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgtt 2511248  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || || ||||| ||    
T  2511249 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgc 2511348  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  | ||||||||||    
T  2511349 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtcc 2511398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 30168567 - 30168816
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  30168567 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 30168666  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||    
T  30168667 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctcacttttgagaataatgtcccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgc 30168766  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || |||| ||| ||| ||||  ||||||||||||    
T  30168767 cgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaagaaactcctagacttgatgtcc 30168816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 33516454 - 33516703
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| || |||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  33516454 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 33516553  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  33516554 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 33516653  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| ||||| | ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  33516654 cgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 33516703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 37771051 - 37770802
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  37771051 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 37770952  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || ||  |||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || || ||||| ||    
T  37770951 atgctttgaagtatatcatgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgc 37770852  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | |||||||||| |  ||||||||||||    
T  37770851 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagcttctagacttgatgtcc 37770802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 32599536 - 32599286
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||| ||||| || || |    
T  32599536 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgcattaggtcatgacgtcgaggggtgtt 32599437  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||    
T  32599436 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgc 32599337  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcca 251  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||| ||  |||||||||||||    
T  32599336 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagcccctagacttgatgtcca 32599286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 250
Target Start/End: Original strand, 37755081 - 37755327
Alignment:
Q  4 ggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||    
T  37755081 ggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatg 37755180  T
Q  104 ctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgc 203  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || || ||||| || ||    
T  37755181 ctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgc 37755280  T
Q  204 tgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
    |||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  37755281 tgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 37755327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 8665539 - 8665290
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || || |    
T  8665539 cagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgtt 8665440  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||    
T  8665439 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgc 8665340  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | |||||||| |||  ||||||||||||    
T  8665339 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtcc 8665290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 9317549 - 9317798
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || || |    
T  9317549 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgtt 9317648  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  9317649 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 9317748  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  9317749 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 9317798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 12132253 - 12132502
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || || |    
T  12132253 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgtt 12132352  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  12132353 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 12132452  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  12132453 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 12132502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 24681538 - 24681787
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||| | |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  24681538 cagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 24681637  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||    
T  24681638 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgc 24681737  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  24681738 cgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 24681787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 24724065 - 24724314
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||| | |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  24724065 cagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 24724164  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||    
T  24724165 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgc 24724264  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  24724265 cgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 24724314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 30152116 - 30152365
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| || || |    
T  30152116 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgtt 30152215  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  30152216 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 30152315  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  30152316 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 30152365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 37358707 - 37358458
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||  | || ||||||||||| || || |    
T  37358707 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgtt 37358608  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||| | || |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  37358607 atgctttgaagtatattgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatattccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 37358508  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  37358507 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 37358458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 40473613 - 40473364
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||| | |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  40473613 cagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 40473514  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  40473513 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgc 40473414  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  40473413 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 40473364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 6874403 - 6874652
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||| ||||| || || |    
T  6874403 cagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgtt 6874502  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||| ||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||    
T  6874503 atgctttgaagtatatcgtgaagaagcttatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgc 6874602  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  6874603 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 6874652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18375476 - 18375227
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||  | |||||||| ||||| || || |    
T  18375476 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgtt 18375377  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||    
T  18375376 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgc 18375277  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| |||||||| || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  18375276 cgctgtgaatatgattgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 18375227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 26480490 - 26480739
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||  | |||||||| ||||| || || |    
T  26480490 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgtt 26480589  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  26480590 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 26480689  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  26480690 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 26480739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 3789639 - 3789888
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  3789639 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 3789738  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||    
T  3789739 atgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgc 3789838  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  3789839 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 3789888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 29967130 - 29966881
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||  |||||||||| ||||| || || |    
T  29967130 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgtt 29967031  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||    
T  29967030 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgc 29966931  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  29966930 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 29966881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 30029513 - 30029762
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||  |||||||||| ||||| || || |    
T  30029513 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgtt 30029612  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||    
T  30029613 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgc 30029712  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  30029713 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 30029762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 34616616 - 34616865
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  34616616 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 34616715  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||    
T  34616716 atgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgc 34616815  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | |||||||| |||  ||||||||||||    
T  34616816 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtcc 34616865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 28959850 - 28959600
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  28959850 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 28959751  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||    
T  28959750 atgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgc 28959651  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcca 251  Q
     ||||| || ||||| || || | ||||||  ||||  |||||||||||||    
T  28959650 cgctgtaaatatgatcgaagtgtgtgaggagactcctagacttgatgtcca 28959600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 5638008 - 5638257
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||  | |||||||| ||||| || || |    
T  5638008 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgtt 5638107  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  5638108 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgaaaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 5638207  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     | |||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  5638208 cgttgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 5638257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 33292623 - 33292841
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||| | |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| ||| | || |||||||| || || ||||    
T  33292623 cagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgct 33292722  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    ||||| | || ||||| || |||||||| ||  | ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || || || || || ||||| |     
T  33292723 atgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatga 33292822  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgag 219  Q
    ||| ||||| |||||||||    
T  33292823 tgccgtgaatatgattgag 33292841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 41674807 - 41675025
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| || || ||||    
T  41674807 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcagatctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggccatgatgttgaggggtgct 41674906  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    ||||| | || ||||| || |||||||| ||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| || || || || || ||||| ||    
T  41674907 atgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagctgacttttgagaataatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgc 41675006  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgag 219  Q
    ||| ||||| |||||||||    
T  41675007 tgccgtgaatatgattgag 41675025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 2084 - 1838
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2084 cagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 1985  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1984 acgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaa-ttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgc 1886  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgt 248  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  1885 tgctgtaaacatgattgaggtatatgaagaagctcccagactcgatgt 1838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 6101 - 6338
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttc-catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgc 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  | |||||||||||||| || ||     
T  6101 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgatttttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgt 6200  T
Q  100 tatgcttt-gaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 198  Q
    |||||||| ||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||     
T  6201 tatgcttttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcat 6300  T
Q  199 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 236  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||    
T  6301 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 6338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 20477 - 20723
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20477 cagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 20576  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20577 acgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaa-ttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgc 20675  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgt 248  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  20676 tgctgtaaacatgattgaggtatatgaagaagctcccagactcgatgt 20723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 30541 - 30790
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| || |||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  30541 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 30640  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  30641 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 30740  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  30741 cgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 30790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 21703320 - 21703073
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21703320 caggacaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcaaaggatgct 21703221  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21703220 acgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgc 21703121  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgt 248  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  21703120 tgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactcgatgt 21703073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19456577 - 19456333
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  19456577 cagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagaatgct 19456478  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | |||||||| |||||||| || ||||||||  |||||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19456477 acgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgc 19456378  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 245  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  19456377 tgttgtgaacatgattgaggtatgtgaggaagctcccagacttga 19456333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 9350135 - 9349889
Alignment:
Q  4 ggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatg 103  Q
    |||||||||||||| || || |||||| | |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||    
T  9350135 ggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatg 9350036  T
Q  104 ctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgc 203  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  9350035 ctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgc 9349936  T
Q  204 tgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  9349935 tgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggtcttgacgtcc 9349889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 27393054 - 27393268
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  27393054 cagggcaagcctccacctaacccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgtt 27393153  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | |||||||| |||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  27393154 acgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgc 27393253  T
Q  201 tgctgtgaacatgat 215  Q
    || ||||||||||||    
T  27393254 tgttgtgaacatgat 27393268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 27118773 - 27119009
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27118773 cagggcaagcctccacctgatccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 27118872  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  27118873 acgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgc 27118972  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctccc 237  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27118973 tgttgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctccc 27119009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 34303459 - 34303210
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34303459 cagggcaagcctccacctgatccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgct 34303360  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| || |||||||||||| | ||||| ||||||||||| || ||    
T  34303359 acgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaaacatgc 34303260  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34303259 tgctataaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 34303210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 40233596 - 40233845
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40233596 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgtt 40233695  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  40233696 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgc 40233795  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  40233796 cgctgtgaaaatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 40233845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 3784739 - 3784975
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||| ||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3784739 cagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgct 3784838  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| || |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  3784839 acgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgc 3784938  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctccc 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3784939 tgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctccc 3784975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27434600 - 27434351
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||    
T  27434600 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaagttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgct 27434501  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  27434500 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 27434401  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  27434400 cgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 27434351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 16163684 - 16163920
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||| ||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  16163684 cagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatggcgaaggatgct 16163783  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| || |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  16163784 acgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgc 16163883  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctccc 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16163884 tgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctccc 16163920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 34157096 - 34157331
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||| ||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34157096 cagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgct 34157195  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| || |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  34157196 acgcgttgaggtacattgtaaaaaa-ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgc 34157294  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctccc 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34157295 tgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctccc 34157331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22926184 - 22925935
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||| ||||| || || |    
T  22926184 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgtt 22926085  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||||||    
T  22926084 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcacgc 22925985  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22925984 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtcc 22925935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23128722 - 23128473
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  23128722 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgct 23128623  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  23128622 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 23128523  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  23128522 cgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 23128473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 28882299 - 28882548
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||    
T  28882299 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgct 28882398  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  28882399 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 28882498  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  28882499 cgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 28882548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 20838003 - 20838252
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||    
T  20838003 cagggcaagcccccacctgatctgttgcctcccaggttcaggtccgaccttaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgct 20838102  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  20838103 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 20838202  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     ||||| ||  |||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  20838203 cgctgtaaatttgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 20838252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 31891484 - 31891248
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||    
T  31891484 cagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgct 31891385  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| || || ||| |||| || |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  31891384 acgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttaagaataacgtccctcacgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgc 31891285  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctccc 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31891284 tgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctccc 31891248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 12655627 - 12655876
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||    
T  12655627 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgct 12655726  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | |||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  12655727 acgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 12655826  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     || || || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  12655827 cgccgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 12655876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 12586895 - 12587144
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||| | |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||| |    
T  12586895 cagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaaggatgtt 12586994  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  12586995 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 12587094  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  12587095 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 12587144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 13936700 - 13936451
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||| | |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  13936700 cagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 13936601  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  13936600 atgctttgaagtacatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 13936501  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  13936500 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 13936451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16829494 - 16829245
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| || |||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  16829494 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 16829395  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  16829394 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 16829295  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| ||||| | ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  16829294 cgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 16829245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 16891987 - 16892236
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| || |||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  16891987 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 16892086  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  16892087 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 16892186  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| ||||| | ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  16892187 cgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 16892236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 27777307 - 27777556
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||| | |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  27777307 cagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 27777406  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  27777407 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 27777506  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  27777507 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 27777556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 27817065 - 27817314
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||| | |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  27817065 cagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 27817164  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  27817165 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 27817264  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  27817265 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 27817314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 37375246 - 37375495
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || |    
T  37375246 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgtt 37375345  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || |||||||||||| || | || |||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  37375346 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgc 37375445  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||    
T  37375446 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtggggaagctcctagacttgatgtcc 37375495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 12716758 - 12716509
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||| | |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  12716758 cagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 12716659  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||    
T  12716658 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgc 12716559  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  12716558 cgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 12716509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21677338 - 21677089
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || || |    
T  21677338 cagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgtt 21677239  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||    
T  21677238 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgc 21677139  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | |||||||| |||  ||||||||||||    
T  21677138 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtcc 21677089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 39051978 - 39051729
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||| | |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||  | || ||||||||||| || || |    
T  39051978 cagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggccatgatgtcgaggggtgtt 39051879  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  39051878 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 39051779  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  39051778 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 39051729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 39890159 - 39890408
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| || |||| ||||||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  39890159 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcagggctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 39890258  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    ||||| |||| || || |||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  39890259 atgctctgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgc 39890358  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  39890359 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 39890408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 27803792 - 27804038
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||| | |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||  | || ||||||||||| || || |    
T  27803792 cagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggccatgatgtcgaggggtgtt 27803891  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  27803892 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 27803991  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatg 247  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  |||||||||    
T  27803992 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatg 27804038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 34286439 - 34286653
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || || |    
T  34286439 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcacgatgtcgaggggtgtt 34286538  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  34286539 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 34286638  T
Q  201 tgctgtgaacatgat 215  Q
    ||| ||||| |||||    
T  34286639 tgccgtgaatatgat 34286653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 34291499 - 34291713
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || || |    
T  34291499 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcacgatgtcgaggggtgtt 34291598  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  34291599 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 34291698  T
Q  201 tgctgtgaacatgat 215  Q
    ||| ||||| |||||    
T  34291699 tgccgtgaatatgat 34291713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 260909 - 260660
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  260909 cagggtaagcccccacctgatctgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 260810  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||  |||| |||||||| ||||| ||    
T  260809 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcaacaatcctcttccaaatcatgc 260710  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || |  ||||||| |||  ||||||||||||    
T  260709 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagttcctagacttgatgtcc 260660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 250
Target Start/End: Original strand, 32049895 - 32050132
Alignment:
Q  13 ccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaat 112  Q
    ||||| || ||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| |    
T  32049895 ccaccggacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagt 32049994  T
Q  113 acattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacat 212  Q
    | || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||    
T  32049995 atatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatat 32050094  T
Q  213 gattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
    |||||| || | |||||||| |||  ||||||||||||    
T  32050095 gattgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtcc 32050132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 11635342 - 11635093
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| || || || |    
T  11635342 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgttgaggggtgtt 11635243  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||  || | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| ||    
T  11635242 atgctttgaagtacatcgtgaagaagcttgttgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgataatcctcttccaaatcatgc 11635143  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || |  |||||||||||  ||||||||||||    
T  11635142 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtcc 11635093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 11641531 - 11641282
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| || || || |    
T  11641531 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgttgaggggtgtt 11641432  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||  || | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| ||    
T  11641431 atgctttgaagtacatcgtgaagaagcttgttgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgataatcctcttccaaatcatgc 11641332  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || |  |||||||||||  ||||||||||||    
T  11641331 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtcc 11641282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 19416655 - 19416406
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| || || |    
T  19416655 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgtt 19416556  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || || ||||| ||    
T  19416555 atgctttgaaatatatcgtgaagaaactcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgc 19416456  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  19416455 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 19416406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 31876366 - 31876615
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||  |||||||||| ||||| || || |    
T  31876366 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgtt 31876465  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||    
T  31876466 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgc 31876565  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  31876566 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 31876615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 34861765 - 34862014
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| || || |    
T  34861765 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgtt 34861864  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  34861865 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 34861964  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  |||| |||||||    
T  34861965 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagactagatgtcc 34862014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 37686065 - 37685816
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| || || |    
T  37686065 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgtt 37685966  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||| |||| ||||| ||    
T  37685965 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatccttttccaaatcatgc 37685866  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  37685865 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 37685816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 37701330 - 37701081
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| || || |    
T  37701330 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgtt 37701231  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||| |||| ||||| ||    
T  37701230 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatccttttccaaatcatgc 37701131  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  37701130 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 37701081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 37925578 - 37925827
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| || || |    
T  37925578 cagggtaagcccccacccgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgacttccatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgtt 37925677  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  37925678 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgc 37925777  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  37925778 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 37925827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 34279534 - 34279698
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || |    
T  34279534 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgtt 34279633  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtc 165  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  34279634 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtc 34279698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 7 - 263
Target Start/End: Original strand, 1900367 - 1900623
Alignment:
Q  7 aagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctt 106  Q
    |||||||||||||||||||| | |  |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  1900367 aagcctccacctgatccgttgcttctcaggtttcgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacactt 1900466  T
Q  107 tgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgt 206  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1900467 tgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaataatgtcccttatgtccttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgt 1900566  T
Q  207 gaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccatctcattgcaac 263  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||  |||||||||    
T  1900567 aaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactcgatgttcataacattgcaac 1900623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15285095 - 15284851
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15285095 cagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccggtctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgct 15284996  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | |||||||| |||||||| || ||||||||  |||||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||     
T  15284995 acgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgt 15284896  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 245  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  15284895 tgctgtgaacatgattgaggtatgtgaggaagctcccagacttga 15284851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 15227974 - 15228221
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15227974 cagggtaagcctccacctgatccattgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcacgatgttgaaggatgct 15228073  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  15228074 acgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaacctttgagaataacgtccgtcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgc 15228173  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgt 248  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  15228174 tgctgtgaacatgattggggtatatgagatagctcccagacttgatgt 15228221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15391505 - 15391291
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  15391505 caggggaagcctccacctaacccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgtt 15391406  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | |||||||| |||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  15391405 acgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgactagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttctgaatcacgc 15391306  T
Q  201 tgctgtgaacatgat 215  Q
    |||||||||||||||    
T  15391305 tgctgtgaacatgat 15391291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14235692 - 14235456
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    |||||||||||||||||| | || || ||| |||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |    
T  14235692 cagggcaagcctccacctaaccctttgcctcccaggttccatttcgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgagggatgtt 14235593  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | |||||||| | |||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  14235592 acgctttgaagttcattgtaaagaagctcatagaccagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcacgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgc 14235493  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctccc 237  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| |||||||||    
T  14235492 tgctgtgaacatgattgagacctatgaagaagctccc 14235456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 24460772 - 24460536
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||| ||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24460772 cagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgct 24460673  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| || |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  24460672 acgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgc 24460573  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctccc 237  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24460572 tgctgtaaacatgattgaagtatatgaggaagctccc 24460536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 17014104 - 17014353
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||    
T  17014104 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgct 17014203  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | |||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  17014204 acgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 17014303  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  17014304 cgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 17014353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 14665122 - 14665371
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||    
T  14665122 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgct 14665221  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  14665222 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatatcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 14665321  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  14665322 cgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 14665371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24592481 - 24592232
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||    
T  24592481 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgct 24592382  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | |||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  24592381 acgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttcccaatcatgc 24592282  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  24592281 cgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 24592232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 36344682 - 36344433
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || |    
T  36344682 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccgaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgtt 36344583  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || |||||||||||| || | || |||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  36344582 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 36344483  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  36344482 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 36344433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 250
Target Start/End: Original strand, 5005980 - 5006226
Alignment:
Q  4 ggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||    
T  5005980 ggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatg 5006079  T
Q  104 ctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgc 203  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||| |||||| || ||    
T  5006080 ctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagttgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttctgaatcatgccgc 5006179  T
Q  204 tgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
    |||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  5006180 tgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 5006226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 6569957 - 6570206
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| || || |    
T  6569957 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 6570056  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  6570057 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgc 6570156  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  6570157 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 6570206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 14763471 - 14763222
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  14763471 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 14763372  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||    
T  14763371 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgc 14763272  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  14763271 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 14763222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18800780 - 18800531
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  18800780 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 18800681  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  18800680 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 18800581  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  18800580 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 18800531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27163484 - 27163235
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| || || |    
T  27163484 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgtt 27163385  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  27163384 atgctttgaaatatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgc 27163285  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  27163284 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 27163235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 33673965 - 33673716
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  33673965 cagggcaagcctccaccggacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 33673866  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  33673865 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgc 33673766  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | |||||||| |||  ||||||||||||    
T  33673765 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtcc 33673716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 39850742 - 39850991
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||| | |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| || || |    
T  39850742 cagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 39850841  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || |||||||||||| || | || |||||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  39850842 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaacccccttccaaatcatgc 39850941  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  39850942 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 39850991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 40105805 - 40105556
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || || |    
T  40105805 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgtt 40105706  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  40105705 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 40105606  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  40105605 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 40105556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 250
Target Start/End: Original strand, 21969808 - 21970054
Alignment:
Q  4 ggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatg 103  Q
    |||||||||||||| || || |||||| | |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||    
T  21969808 ggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatg 21969907  T
Q  104 ctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgc 203  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  21969908 ctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgc 21970007  T
Q  204 tgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
    |||||| ||||||||  | | |||||||| |||  ||||||||||||    
T  21970008 tgtgaatatgattgaaatgtgtgaggaagttcctagacttgatgtcc 21970054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 14098645 - 14098894
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  14098645 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggactgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 14098744  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||    
T  14098745 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgc 14098844  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  14098845 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 14098894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 31126685 - 31126436
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  31126685 cagggtaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 31126586  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  31126585 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 31126486  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| ||||| | ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  31126485 cgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 31126436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 30753858 - 30754107
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  30753858 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 30753957  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||    
T  30753958 atgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgc 30754057  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  30754058 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 30754107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 54833491 - 54833740
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  54833491 cagggcaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 54833590  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||    
T  54833591 atgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgc 54833690  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  54833691 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 54833740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 34189127 - 34188909
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||| | |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||| | || |||||||| || || ||||    
T  34189127 cagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggtgctttagggcatgatgttgaggggtgct 34189028  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    ||||| | || ||||| || |||||||| ||  | ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || || || || || ||||| ||    
T  34189027 atgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgc 34188928  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgag 219  Q
    ||| ||||| |||||||||    
T  34188927 tgccgtgaatatgattgag 34188909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 24112766 - 24112984
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||| | |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| ||| | || |||||||| || || ||||    
T  24112766 cagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgct 24112865  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    ||||| | || ||||| || |||||||| ||  | ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || || || || || ||||| ||    
T  24112866 atgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgc 24112965  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgag 219  Q
    ||| ||||| |||||||||    
T  24112966 tgccgtgaatatgattgag 24112984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22081004 - 22080790
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  22081004 cagggaaagcctccacctaacccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgtt 22080905  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | |||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  22080904 acgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgaccagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgc 22080805  T
Q  201 tgctgtgaacatgat 215  Q
    |||||||||||||||    
T  22080804 tgctgtgaacatgat 22080790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 16283538 - 16283787
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||    
T  16283538 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcaccctgggtcatgatgtcgaagggtgct 16283637  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  16283638 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 16283737  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||    
T  16283738 cgctgtgaacatgattgaagtatgtgaggaagctcctagacttgttgtcc 16283787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 18710675 - 18710924
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| |||||  ||||||||||| | ||| | |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  18710675 cagggtaagccctcacctgatccgctgcctccaaggttcaggtctgatctcaagtgtgattttcatcagggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgtt 18710774  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  18710775 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgc 18710874  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18710875 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtcc 18710924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 44563190 - 44563424
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||| ||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44563190 cagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgct 44563289  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | || ||||  |||||||| || || |||||  ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  44563290 acgcgttgaggtacattgt-aaaaaactcatagaccaaggaaagttgacttttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgc 44563388  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctccc 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44563389 tgctgt-aacatgattgaggtatatgaggaagctccc 44563424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27609031 - 27608782
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  27609031 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgagggatgct 27608932  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  27608931 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 27608832  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  27608831 cgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 27608782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19659165 - 19658930
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||| ||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19659165 cagggcaagcctccacctgacccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgct 19659066  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19659065 acgcgttgaggtacattgtaaaaaa-ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgc 19658967  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctccc 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19658966 tgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctccc 19658930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 33244754 - 33244988
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||| | | |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33244754 cagggcaagcctccacctgacccgtcgcctcctaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgcgctgggtcatgatgtcgaaggatgct 33244853  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  33244854 acgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaaccacgc 33244953  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctc 235  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33244954 tgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctc 33244988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 19688187 - 19688436
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  19688187 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgct 19688286  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  19688287 atgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 19688386  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     ||||| || ||||| || ||||  |||||||||||  ||||||||||||    
T  19688387 cgctgtaaatatgatcgaagtatgcgaggaagctcctagacttgatgtcc 19688436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 16277643 - 16277892
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||    
T  16277643 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgct 16277742  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | |||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  16277743 acgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 16277842  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     || || || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  16277843 cgccgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 16277892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 12092850 - 12092601
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||| || || |    
T  12092850 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 12092751  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  12092750 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgc 12092651  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  12092650 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 12092601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 3329633 - 3329384
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||| || || |    
T  3329633 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 3329534  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || |||||||||||| || | ||||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  3329533 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcaagggaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgc 3329434  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
      ||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  3329433 cactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 3329384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 14557713 - 14557962
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    |||||||||||  | ||||||||||| ||| | |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||    
T  14557713 cagggcaagccctcgcctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgct 14557812  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  14557813 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 14557912  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     ||||| ||  |||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  14557913 cgctgtaaatgtgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 14557962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 29829411 - 29829660
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  29829411 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 29829510  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  29829511 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgc 29829610  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  29829611 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 29829660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 2137385 - 2137136
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||    
T  2137385 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccttgggtcatgatgtcgaggggtgct 2137286  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  2137285 atgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtctcgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 2137186  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     ||||| || ||||| || | || |||| |||||||  ||||||||||||    
T  2137185 cgctgtaaatatgatcgaagcatgtgagaaagctcctagacttgatgtcc 2137136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 31489876 - 31489627
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  31489876 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 31489777  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  31489776 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 31489677  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  31489676 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 31489627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 9354711 - 9354961
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||| ||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  9354711 cagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgacgtcgaaggatgct 9354810  T
Q  101 atgctttgaaatacattgt-gaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacg 199  Q
    | || ||||  ||||||||  || || |||||  |||||||||| || || |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  9354811 acgcgttgaggtacattgtaaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatg 9354910  T
Q  200 ctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
    | |||||||| ||||| || || | |||||||| |||  ||||||||||||    
T  9354911 ccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtcc 9354961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 19674530 - 19674779
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||||||  | || |    
T  19674530 cagggcaaacccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgagaggtgtt 19674629  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||    
T  19674630 atgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgc 19674729  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  19674730 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 19674779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 31354613 - 31354862
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||| ||||| || || |    
T  31354613 cagggcaagcctccacctgatcctttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgtt 31354712  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||    
T  31354713 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgc 31354812  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  31354813 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcccagacttgatgtcc 31354862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 19208486 - 19208237
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||  | |||||||| ||||| || || |    
T  19208486 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgtt 19208387  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  19208386 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 19208287  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  19208286 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 19208237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 19286551 - 19286800
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  19286551 cagggcaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 19286650  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||    
T  19286651 atgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgc 19286750  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  19286751 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 19286800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 28362081 - 28361832
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||  | |||||||| ||||| || || |    
T  28362081 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgtt 28361982  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  28361981 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 28361882  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  28361881 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 28361832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 33258812 - 33259061
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||  |||||||||| ||||| || || |    
T  33258812 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgtt 33258911  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||    
T  33258912 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgc 33259011  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     | |||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  33259012 cgttgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 33259061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 74 - 250
Target Start/End: Original strand, 189256 - 189432
Alignment:
Q  74 ctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgt 173  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||    
T  189256 ctctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgt 189355  T
Q  174 ccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||| ||  |||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  189356 cctcgacaatcctcttccaaatcatgcctctgttaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 189432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 192 - 1
Alignment:
Q  4 ggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  192 ggcaagcctccacctgatccgttgccttccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacg 93  T
Q  104 ctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaat 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  92 ctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaaccttcgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 21650 - 21899
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    |||||||||||||||||| | | ||| ||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| |    
T  21650 cagggcaagcctccacctaacctgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggggctctgggccaagatgttgaaggatgtt 21749  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  21750 acgctttgaagtagattgtaaagaagctcattgaccagggaaagttaacttttaagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgc 21849  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
    ||||||||||||||| |||   |||||  ||| |||||| ||||||||||    
T  21850 tgctgtgaacatgatcgagacttatgaaaaagttcccggtcttgatgtcc 21899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 40236 - 39987
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||    
T  40236 cagggcaagcccccacctgatccgttgccccccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgct 40137  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || |||||| |||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  40136 atgctttgaagtatatcgtgaaggagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 40037  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  40036 cgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 39987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 47152 - 46903
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||    
T  47152 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgct 47053  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | |||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  47052 acgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 46953  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  46952 cgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 46903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 29852 - 30101
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || ||||    
T  29852 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccaccaaggcgccctgggtcacgatgtcgaggggtgct 29951  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  29952 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 30051  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
      |||| || ||||| || |||| |||||||||||   ||||||||||||    
T  30052 cactgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcttagacttgatgtcc 30101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 27381 - 27629
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||    
T  27381 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgct 27480  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||| ||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  27481 atgctttgaagtatatcgtgaagaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 27580  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtc 249  Q
     ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  27581 cgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtc 27629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 58 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 728 - 571
Alignment:
Q  58 gatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgaga 157  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  728 gatttccatcaagatgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgaga 629  T
Q  158 acaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 215  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  628 ataatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 9655 - 9904
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  9655 cagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcagatctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 9754  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  9755 atgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 9854  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  9855 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 9904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 296 - 47
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||| |||| |||| || |||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||    
T  296 cagggcaagcccccaccggatccgttgcctcccaagttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgcgttgggtcatgatgtcgaggggtgct 197  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    | |||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  196 acgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 97  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  96 cgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 47  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 250
Target Start/End: Original strand, 8041 - 8287
Alignment:
Q  4 ggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatg 103  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||  | || ||||||||||| || || ||||    
T  8041 ggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatg 8140  T
Q  104 ctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgc 203  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  8141 ctttgaagtatattgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgc 8240  T
Q  204 tgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
    |||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  8241 tgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 8287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 7406 - 7157
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || || |    
T  7406 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgtt 7307  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  7306 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 7207  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
      ||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  7206 cactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 7157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 9233 - 8984
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| || || |    
T  9233 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgtt 9134  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  9133 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctaccaaatcatgc 9034  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  | ||||||||||    
T  9033 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtcc 8984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 20104 - 20353
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| || || |    
T  20104 cagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgtt 20203  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  20204 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctaccaaatcatgc 20303  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  | ||||||||||    
T  20304 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtcc 20353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15097 - 14848
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||  | |||||||| ||||| || || |    
T  15097 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgtt 14998  T
Q  101 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 200  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  14997 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 14898  T
Q  201 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
     ||||||||  |||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  14897 cgctgtgaatgtgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 14848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 26369 - 26119
Alignment:
Q  1 cagggcaagcctccacctgatccgttaccttcca-ggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgc 99  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | | ||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||     
T  26369 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgt 26270  T
Q  100 tatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacg 199  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| |    
T  26269 tatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatg 26170  T
Q  200 ctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtcc 250  Q
    | |||||||| ||||| ||  | | ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  26169 ccgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 26119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 46964 - 46764
Alignment:
Q  13 ccacctgatccgttaccttccaggttcc-ggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtc--at-gatgtcgaaggatgc-tatgcttt 107  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||  || |||||||| || ||| ||||||||    
T  46964 ccacctgatccgttgcctccaaggttcaaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcgaatggatgtcgaggggtgcgtatgcttt 46865  T
Q  108 gaaatacattgtgaagaagctcattaaccaagg-aaagttaac-ttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctg 205  Q
    ||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||||   || ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  46864 gaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaaagcggactttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgctg 46765  T
Q  206 t 206  Q
    |    
T  46764 t 46764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2173 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold2173
Description:

Target: scaffold2173; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 100 - 218
Target Start/End: Original strand, 277 - 395
Alignment:
Q  100 tatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacg 199  Q
    |||||||| || || |||||  ||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||||  | || |    
T  277 tatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgaccaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataaccctcttccagaccatg 376  T
Q  200 ctgctgtgaacatgattga 218  Q
    |||| || |||||||||||    
T  377 ctgcagtaaacatgattga 395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University