View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF6828_low_17 (Length: 201)

Name: NF6828_low_17
Description: NF6828
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF6828_low_17
NF6828_low_17
[»] chr3 (61 HSPs)
chr3 (1-187)||(4796612-4796798)
chr3 (1-187)||(22387537-22387723)
chr3 (1-187)||(35880879-35881065)
chr3 (1-187)||(18330782-18330968)
chr3 (1-187)||(8301226-8301412)
chr3 (1-187)||(15892665-15892851)
chr3 (1-187)||(6192429-6192615)
chr3 (1-187)||(7073325-7073511)
chr3 (1-187)||(8211851-8212037)
chr3 (1-187)||(8296085-8296271)
chr3 (1-187)||(10396246-10396432)
chr3 (1-187)||(20576806-20576992)
chr3 (1-187)||(29148714-29148900)
chr3 (1-187)||(48466040-48466226)
chr3 (1-187)||(4346646-4346832)
chr3 (1-187)||(5467098-5467284)
chr3 (1-187)||(15741053-15741239)
chr3 (2-187)||(18051376-18051561)
chr3 (16-187)||(4417047-4417218)
chr3 (16-187)||(29664929-29665100)
chr3 (1-187)||(4721744-4721930)
chr3 (1-187)||(5596316-5596502)
chr3 (1-187)||(18277011-18277197)
chr3 (1-187)||(18292312-18292498)
chr3 (1-187)||(18307613-18307799)
chr3 (1-187)||(21674806-21674992)
chr3 (1-187)||(22870815-22871001)
chr3 (1-187)||(22885874-22886060)
chr3 (1-187)||(51782136-51782322)
chr3 (1-187)||(51797226-51797412)
chr3 (16-187)||(28115913-28116084)
chr3 (1-187)||(6542421-6542607)
chr3 (1-187)||(18242852-18243038)
chr3 (1-187)||(28021388-28021574)
chr3 (1-187)||(31964432-31964618)
chr3 (1-187)||(50134030-50134216)
chr3 (1-187)||(5013825-5014011)
chr3 (1-187)||(11110308-11110494)
chr3 (1-187)||(47023566-47023752)
chr3 (1-187)||(17984915-17985101)
chr3 (1-187)||(24328272-24328458)
chr3 (1-187)||(36997036-36997222)
chr3 (1-187)||(5609281-5609467)
chr3 (1-187)||(7996675-7996861)
chr3 (1-187)||(10643183-10643369)
chr3 (16-187)||(28339430-28339601)
chr3 (1-187)||(18225304-18225490)
chr3 (1-173)||(5713340-5713512)
chr3 (1-173)||(5724250-5724422)
chr3 (1-173)||(5757055-5757227)
chr3 (1-173)||(5767946-5768118)
chr3 (1-187)||(31034076-31034262)
chr3 (1-187)||(32292865-32293051)
chr3 (1-178)||(5652500-5652677)
chr3 (1-182)||(16626470-16626651)
chr3 (1-185)||(18530501-18530685)
chr3 (1-152)||(32439267-32439418)
chr3 (1-152)||(20066156-20066307)
chr3 (1-173)||(17993757-17993929)
chr3 (1-173)||(4626057-4626229)
chr3 (1-65)||(4893323-4893387)
[»] chr6 (48 HSPs)
chr6 (1-187)||(26918529-26918715)
chr6 (1-187)||(26989150-26989336)
chr6 (1-181)||(27000222-27000402)
chr6 (1-184)||(16750003-16750186)
chr6 (1-187)||(24863866-24864052)
chr6 (1-187)||(15424178-15424364)
chr6 (1-187)||(22934741-22934927)
chr6 (1-187)||(23857186-23857372)
chr6 (1-187)||(24304479-24304665)
chr6 (1-187)||(29549624-29549810)
chr6 (1-187)||(16674288-16674474)
chr6 (1-187)||(34463207-34463393)
chr6 (16-187)||(4773170-4773341)
chr6 (1-188)||(27359852-27360039)
chr6 (1-188)||(27450195-27450382)
chr6 (1-187)||(3696230-3696416)
chr6 (1-187)||(4723995-4724181)
chr6 (1-187)||(4757913-4758099)
chr6 (1-187)||(13298812-13298998)
chr6 (1-187)||(17025426-17025612)
chr6 (1-187)||(26116271-26116457)
chr6 (1-187)||(29501564-29501750)
chr6 (1-187)||(29573162-29573348)
chr6 (16-187)||(4545636-4545807)
chr6 (1-187)||(4525435-4525621)
chr6 (1-187)||(27007876-27008062)
chr6 (1-187)||(27272441-27272627)
chr6 (1-187)||(30557877-30558063)
chr6 (1-187)||(27044536-27044723)
chr6 (1-187)||(28207603-28207789)
chr6 (1-188)||(26777475-26777662)
chr6 (1-187)||(27485278-27485464)
chr6 (1-187)||(16943888-16944074)
chr6 (16-182)||(20160865-20161031)
chr6 (16-182)||(22171800-22171966)
chr6 (1-187)||(27290231-27290417)
chr6 (1-187)||(14143146-14143332)
chr6 (1-187)||(22456795-22456981)
chr6 (1-187)||(26788093-26788279)
chr6 (1-187)||(27196466-27196652)
chr6 (1-187)||(27252588-27252774)
chr6 (1-182)||(13521939-13522120)
chr6 (1-173)||(33374131-33374303)
chr6 (1-173)||(8892186-8892357)
chr6 (1-173)||(8903421-8903592)
chr6 (1-173)||(28162806-28162978)
chr6 (61-187)||(17092301-17092427)
chr6 (1-81)||(22477240-22477320)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (1-187)||(23717803-23717989)
chr5 (1-187)||(33777648-33777834)
chr5 (1-187)||(9548358-9548544)
chr5 (1-187)||(23752265-23752451)
chr5 (1-187)||(24687972-24688158)
chr5 (1-187)||(11549515-11549701)
chr5 (1-187)||(15658575-15658761)
chr5 (1-187)||(28649396-28649582)
chr5 (1-187)||(30152179-30152365)
chr5 (1-187)||(30934794-30934980)
chr5 (1-187)||(8665290-8665476)
chr5 (1-187)||(22998929-22999115)
chr5 (1-187)||(40473364-40473550)
chr5 (16-187)||(13324644-13324815)
chr5 (1-187)||(3789702-3789888)
chr5 (1-187)||(9317612-9317798)
chr5 (1-187)||(12132316-12132502)
chr5 (1-187)||(15758672-15758858)
chr5 (1-179)||(18500553-18500731)
chr5 (1-187)||(24681601-24681787)
chr5 (1-187)||(24724128-24724314)
chr5 (1-187)||(31431601-31431787)
chr5 (1-187)||(37671298-37671484)
chr5 (1-187)||(37755141-37755327)
chr5 (1-187)||(43078413-43078599)
chr5 (1-187)||(2511212-2511398)
chr5 (1-187)||(24970179-24970365)
chr5 (1-187)||(33516517-33516703)
chr5 (1-187)||(34616679-34616865)
chr5 (1-187)||(6874466-6874652)
chr5 (1-187)||(26480553-26480739)
chr5 (1-187)||(37358458-37358644)
chr5 (1-187)||(37770802-37770988)
chr5 (1-188)||(28959600-28959787)
chr5 (1-187)||(18375227-18375413)
chr5 (1-187)||(29966881-29967067)
chr5 (1-187)||(30029576-30029762)
chr5 (1-187)||(31826222-31826408)
chr5 (1-187)||(5638071-5638257)
chr5 (16-188)||(32599286-32599458)
chr5 (1-187)||(30168630-30168816)
chr5 (1-187)||(29888897-29889083)
chr5 (1-187)||(23892367-23892553)
chr5 (1-185)||(22888631-22888815)
chr5 (1-152)||(41674870-41675021)
chr5 (1-185)||(25199190-25199374)
chr5 (1-182)||(33877408-33877589)
chr5 (1-173)||(11325955-11326127)
chr5 (1-152)||(33292686-33292837)
chr5 (1-173)||(13184477-13184649)
chr5 (1-173)||(13440323-13440495)
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (1-187)||(27608782-27608968)
chr8 (1-187)||(14557776-14557962)
chr8 (1-187)||(16277706-16277892)
chr8 (1-187)||(19688250-19688436)
chr8 (1-187)||(29829474-29829660)
chr8 (16-187)||(12092601-12092772)
chr8 (1-187)||(2137136-2137322)
chr8 (1-187)||(19286614-19286800)
chr8 (1-187)||(31489627-31489813)
chr8 (13-187)||(189258-189432)
chr8 (1-187)||(16283601-16283787)
chr8 (1-187)||(19208237-19208423)
chr8 (1-187)||(28361832-28362018)
chr8 (1-187)||(31354676-31354862)
chr8 (16-187)||(3329384-3329555)
chr8 (16-187)||(19674608-19674779)
chr8 (1-187)||(33258875-33259061)
chr8 (1-187)||(9354774-9354961)
chr8 (1-187)||(18710738-18710924)
chr8 (1-172)||(33244817-33244988)
chr8 (1-155)||(22080787-22080941)
chr8 (1-178)||(19658926-19659102)
chr8 (1-173)||(44563253-44563423)
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (1-187)||(11424580-11424766)
chr7 (1-187)||(10916672-10916858)
chr7 (1-187)||(26435410-26435596)
chr7 (1-186)||(16503185-16503370)
chr7 (1-187)||(2154726-2154912)
chr7 (1-187)||(5147144-5147330)
chr7 (1-186)||(16518221-16518406)
chr7 (1-189)||(5128145-5128333)
chr7 (16-187)||(31564194-31564365)
chr7 (1-187)||(4144927-4145113)
chr7 (1-187)||(26537674-26537860)
chr7 (1-187)||(26669718-26669904)
chr7 (1-187)||(24592345-24592531)
chr7 (1-187)||(26319673-26319859)
chr7 (1-187)||(45387496-45387682)
chr7 (1-187)||(9618804-9618990)
chr7 (1-187)||(11441725-11441911)
chr7 (1-187)||(26274898-26275084)
chr7 (16-187)||(16736264-16736435)
chr7 (16-187)||(16751318-16751489)
chr7 (16-187)||(17523700-17523871)
chr7 (16-187)||(17529344-17529515)
chr7 (1-187)||(31125073-31125259)
chr7 (1-187)||(3445459-3445645)
chr7 (1-179)||(16449810-16449988)
chr7 (1-185)||(16041476-16041660)
chr7 (1-187)||(26484847-26485033)
chr7 (1-173)||(2108823-2108995)
chr7 (1-187)||(2775512-2775698)
chr7 (1-187)||(39210827-39211013)
chr7 (1-187)||(4200700-4200886)
chr7 (1-152)||(18540952-18541103)
chr7 (1-187)||(26682804-26682990)
chr7 (1-149)||(5159672-5159820)
chr7 (1-173)||(31088282-31088454)
chr7 (1-173)||(45733613-45733785)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (1-187)||(28882362-28882548)
chr2 (1-187)||(13936451-13936637)
chr2 (1-187)||(23128473-23128659)
chr2 (1-187)||(27434351-27434537)
chr2 (1-187)||(12655690-12655876)
chr2 (1-187)||(20838066-20838252)
chr2 (1-187)||(27777370-27777556)
chr2 (1-187)||(27817128-27817314)
chr2 (1-187)||(39051729-39051915)
chr2 (1-184)||(27803855-27804038)
chr2 (1-187)||(12586958-12587144)
chr2 (1-187)||(12716509-12716695)
chr2 (1-187)||(21677089-21677275)
chr2 (1-187)||(32049946-32050132)
chr2 (1-187)||(16829245-16829431)
chr2 (1-187)||(16892050-16892236)
chr2 (1-187)||(34861828-34862014)
chr2 (1-187)||(37375309-37375495)
chr2 (1-187)||(37685816-37686002)
chr2 (1-187)||(37701081-37701267)
chr2 (1-187)||(37925641-37925827)
chr2 (1-187)||(39890222-39890408)
chr2 (1-187)||(40233659-40233845)
chr2 (16-187)||(11635093-11635264)
chr2 (16-187)||(11641282-11641453)
chr2 (1-187)||(260660-260846)
chr2 (1-187)||(31876429-31876615)
chr2 (1-187)||(19416406-19416592)
chr2 (1-155)||(34286502-34286656)
chr2 (1-155)||(34291562-34291716)
chr2 (1-187)||(22925935-22926121)
chr2 (1-173)||(9349903-9350075)
chr2 (1-101)||(34279597-34279697)
chr2 (1-182)||(19456333-19456514)
chr2 (1-185)||(21703073-21703257)
chr2 (1-173)||(31891249-31891421)
chr2 (1-187)||(34303210-34303396)
chr2 (1-178)||(27118836-27119013)
chr2 (1-155)||(27393117-27393271)
chr2 (1-173)||(3784802-3784974)
chr2 (1-173)||(16163747-16163919)
chr2 (1-173)||(34157159-34157330)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (1-187)||(39987-40173)
scaffold0089 (1-187)||(46903-47089)
scaffold0089 (4-187)||(29918-30101)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (1-187)||(17014167-17014353)
chr4 (1-187)||(14665185-14665371)
chr4 (1-187)||(18800531-18800717)
chr4 (1-187)||(24592232-24592418)
chr4 (1-187)||(36344433-36344619)
chr4 (16-187)||(6570035-6570206)
chr4 (1-187)||(14763222-14763408)
chr4 (1-187)||(27163235-27163421)
chr4 (1-187)||(30753921-30754107)
chr4 (1-187)||(33673716-33673902)
chr4 (1-187)||(40105556-40105742)
chr4 (1-187)||(54833554-54833740)
chr4 (1-187)||(31126436-31126622)
chr4 (16-187)||(39850820-39850991)
chr4 (1-187)||(5006040-5006226)
chr4 (1-187)||(14098708-14098894)
chr4 (1-187)||(21969868-21970054)
chr4 (1-182)||(15284851-15285032)
chr4 (1-185)||(1900424-1900608)
chr4 (1-152)||(24112829-24112980)
chr4 (19-152)||(34188913-34189046)
chr4 (1-152)||(14235478-14235629)
chr4 (1-185)||(15228037-15228221)
chr4 (1-173)||(24460537-24460709)
chr4 (1-155)||(15391288-15391442)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (1-186)||(27444-27629)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (1-187)||(9718-9904)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-187)||(47-233)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (1-187)||(8984-9170)
scaffold0159 (1-187)||(20167-20353)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (1-187)||(30604-30790)
scaffold0124 (1-185)||(20540-20723)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (1-187)||(10962821-10963007)
chr1 (1-187)||(51638369-51638555)
chr1 (1-187)||(41793226-41793412)
chr1 (1-187)||(28585132-28585318)
chr1 (1-185)||(16207951-16208135)
chr1 (1-187)||(20340253-20340439)
chr1 (1-187)||(28152013-28152199)
chr1 (1-185)||(20461232-20461416)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (1-187)||(7157-7343)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (1-187)||(14848-15034)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (1-187)||(26119-26305)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (1-179)||(6165-6344)
scaffold0415 (1-185)||(1838-2021)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-187)||(8101-8287)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (1-187)||(46717-46912)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (1-187)||(2576-2762)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (13-155)||(568-710)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (1-128)||(5-132)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (1-155)||(21713-21867)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 163; Significance: 3e-87; HSPs: 61)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 4796798 - 4796612
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4796798 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 4796699  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4796698 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 4796612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22387723 - 22387537
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22387723 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 22387624  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22387623 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 22387537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 35880879 - 35881065
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35880879 catcaaggcgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 35880978  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35880979 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtcc 35881065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 18330782 - 18330968
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18330782 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 18330881  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18330882 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 18330968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 8301412 - 8301226
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8301412 catcaaggcgccctgggtcatgatgtagaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 8301313  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8301312 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 8301226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15892851 - 15892665
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15892851 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 15892752  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15892751 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 15892665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 6192429 - 6192615
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6192429 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 6192528  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6192529 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 6192615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 7073325 - 7073511
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  7073325 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatg 7073424  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7073425 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 7073511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 8211851 - 8212037
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  8211851 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 8211950  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8211951 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 8212037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 8296085 - 8296271
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  8296085 catcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatg 8296184  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8296185 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 8296271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 10396246 - 10396432
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  10396246 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacctttgagaataatg 10396345  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10396346 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 10396432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 20576992 - 20576806
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  20576992 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 20576893  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20576892 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 20576806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 29148900 - 29148714
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29148900 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 29148801  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29148800 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 29148714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 48466040 - 48466226
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48466040 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 48466139  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48466140 tcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 48466226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 4346832 - 4346646
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  4346832 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 4346733  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4346732 tcccacacgtcctcgataatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 4346646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 5467098 - 5467284
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  5467098 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaaactgacttttgagaataatg 5467197  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5467198 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 5467284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15741239 - 15741053
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15741239 catcaaggcgctctgggtcatgatgtcgagggatgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 15741140  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15741139 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 15741053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 187
Target Start/End: Original strand, 18051376 - 18051561
Alignment:
Q  2 atcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18051376 atcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgt 18051475  T
Q  102 tccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
     || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18051476 cccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgattgaagtatgtgagaaagctcctagacttgatgtcc 18051561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 187
Target Start/End: Original strand, 4417047 - 4417218
Alignment:
Q  16 ggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcg 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  4417047 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcg 4417146  T
Q  116 acaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4417147 acaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 4417218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 29665100 - 29664929
Alignment:
Q  16 ggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcg 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  29665100 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcg 29665001  T
Q  116 acaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29665000 acaatcctcttccaaatcacgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 29664929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 4721744 - 4721930
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  4721744 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacactttgaagtatatcgtgaaaaatctcattgatcaaggaaagctgactttttagaataatg 4721843  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  4721844 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgttgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagactcgatgtcc 4721930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 5596502 - 5596316
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5596502 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 5596403  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5596402 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 5596316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18277197 - 18277011
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  18277197 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 18277098  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18277097 tcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 18277011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18292498 - 18292312
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  18292498 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 18292399  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18292398 tcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 18292312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18307799 - 18307613
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  18307799 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 18307700  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18307699 tcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 18307613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 21674806 - 21674992
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21674806 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 21674905  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
     |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21674906 ctccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 21674992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22871001 - 22870815
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  22871001 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 22870902  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22870901 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtcc 22870815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22886060 - 22885874
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  22886060 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 22885961  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22885960 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtcc 22885874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 51782136 - 51782322
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  51782136 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 51782235  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51782236 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 51782322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 51797226 - 51797412
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  51797226 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 51797325  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51797326 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 51797412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 132; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 28116084 - 28115913
Alignment:
Q  16 ggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcg 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  28116084 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacatttgagaataatgtcccacatgtcctcg 28115985  T
Q  116 acaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28115984 acaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtcc 28115913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 6542607 - 6542421
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  6542607 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatg 6542508  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6542507 ttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtaaggaagctcctagacttgatgtcc 6542421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 18242852 - 18243038
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18242852 catcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 18242951  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18242952 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 18243038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 28021388 - 28021574
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28021388 catcaaggtgccttaggttatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 28021487  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28021488 tcccccacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 28021574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 31964618 - 31964432
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31964618 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 31964519  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31964518 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 31964432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 50134216 - 50134030
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  50134216 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 50134117  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50134116 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 50134030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 5013825 - 5014011
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5013825 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 5013924  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  5013925 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 5014011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 11110494 - 11110308
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  11110494 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 11110395  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11110394 tcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaagtgtgtgaggaagctccaagacttgatgtcc 11110308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 47023566 - 47023752
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  47023566 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 47023665  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  47023666 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 47023752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 17985101 - 17984915
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17985101 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 17985002  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17985001 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctcctagacttgatgtcc 17984915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 24328272 - 24328458
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24328272 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 24328371  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  24328372 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 24328458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 36997222 - 36997036
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  36997222 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 36997123  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36997122 tcccatatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtcc 36997036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 5609467 - 5609281
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5609467 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaagggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 5609368  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5609367 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtcc 5609281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 7996675 - 7996861
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7996675 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 7996774  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  7996775 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgaggcttgatgtcc 7996861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 10643183 - 10643369
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10643183 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 10643282  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  10643283 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgaggcttgatgtcc 10643369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 187
Target Start/End: Original strand, 28339430 - 28339601
Alignment:
Q  16 ggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  28339430 ggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttg 28339529  T
Q  116 acaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  28339530 acaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 28339601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 18225304 - 18225490
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18225304 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 18225403  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18225404 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctcctaggcttgatgtcc 18225490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 5713340 - 5713512
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  5713340 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacg 5713439  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 173  Q
    | || || ||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | ||||||||||||    
T  5713440 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 5713512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 5724250 - 5724422
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  5724250 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacg 5724349  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 173  Q
    | || || ||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | ||||||||||||    
T  5724350 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 5724422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 5757227 - 5757055
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  5757227 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacg 5757128  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 173  Q
    | || || ||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | ||||||||||||    
T  5757127 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 5757055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 5768118 - 5767946
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  5768118 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacg 5768019  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 173  Q
    | || || ||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | ||||||||||||    
T  5768018 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 5767946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 31034262 - 31034076
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || || ||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||| || |    
T  31034262 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 31034163  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | || || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||| ||||    
T  31034162 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtcc 31034076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 32292865 - 32293051
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || || ||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||| || |    
T  32292865 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 32292964  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | || || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||| ||||    
T  32292965 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtcc 32293051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 5652500 - 5652677
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| |||||||| ||||| || ||||||||  |||| || |||||||| |    
T  5652500 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 5652599  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagac 178  Q
    | || || ||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||    
T  5652600 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcatgctgctgtgaacatgattgaggtatgtgaggaagctcccagac 5652677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 16626651 - 16626470
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  |||| || |||||||| |    
T  16626651 catcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 16626552  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 182  Q
    | || || ||||| |||||||| ||||| |||||  | |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  16626551 tccctcatgtccttgacaatcctcttccgaatcacactgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 16626470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 18530501 - 18530685
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  |||| || |||||||| |    
T  18530501 catcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 18530600  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgt 185  Q
    | || |  |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||||| |||||| |||||| ||||    
T  18530601 tccctcgtgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgagggagctcccagacttaatgt 18530685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 32439267 - 32439418
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||    
T  32439267 catcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatg 32439366  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgat 152  Q
    | ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||    
T  32439367 tgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgat 32439418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 20066156 - 20066307
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| |||     
T  20066156 catcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaata 20066255  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgat 152  Q
    | ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||    
T  20066256 tgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgat 20066307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 17993929 - 17993757
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| |||||||| ||||| || ||||||||  |||| || |||||||| |    
T  17993929 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 17993830  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 173  Q
    | || || ||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | ||||||||||||    
T  17993829 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 17993757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 4626057 - 4626229
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| |||||||| ||||| || ||||||||  |||| || |||||||| |    
T  4626057 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 4626156  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 173  Q
    | || || ||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||| |||||||    
T  4626157 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgagaaagctcc 4626229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Original strand, 4893323 - 4893387
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagct 65  Q
    |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||    
T  4893323 catcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagct 4893387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 48)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 26918529 - 26918715
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26918529 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 26918628  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26918629 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 26918715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 26989150 - 26989336
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26989150 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtaaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 26989249  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26989250 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 26989336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 27000222 - 27000402
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27000222 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 27000321  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttg 181  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  27000322 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctacacttg 27000402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 16750003 - 16750186
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16750003 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 16750102  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatg 184  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16750103 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatg 16750186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 24863866 - 24864052
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24863866 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 24863965  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24863966 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 24864052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15424364 - 15424178
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15424364 catcaaggcgccttgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 15424265  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15424264 tcccgcacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcaaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 15424178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22934927 - 22934741
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22934927 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatg 22934828  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22934827 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 22934741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 23857372 - 23857186
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23857372 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatg 23857273  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23857272 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 23857186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 24304665 - 24304479
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24304665 catcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgatttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 24304566  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24304565 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 24304479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 29549624 - 29549810
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29549624 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 29549723  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29549724 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctggacttgatgtcc 29549810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 16674288 - 16674474
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16674288 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 16674387  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16674388 tcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 16674474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 34463393 - 34463207
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  34463393 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 34463294  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34463293 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 34463207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 187
Target Start/End: Original strand, 4773170 - 4773341
Alignment:
Q  16 ggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcg 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  4773170 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttg 4773269  T
Q  116 acaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4773270 acaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 4773341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 27360039 - 27359852
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  27360039 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 27359940  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcca 188  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27359939 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcca 27359852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 27450382 - 27450195
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  27450382 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 27450283  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcca 188  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27450282 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcca 27450195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 3696230 - 3696416
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3696230 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 3696329  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3696330 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgatgaagctcctagacttgatgtcc 3696416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 4724181 - 4723995
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  4724181 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatg 4724082  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4724081 ttccacatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 4723995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 4757913 - 4758099
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  4757913 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 4758012  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4758013 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 4758099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 13298998 - 13298812
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13298998 catcaaggcgccctgggtcatgacgtcgagggatgctacactttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 13298899  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13298898 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 13298812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 17025426 - 17025612
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  17025426 catcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 17025525  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17025526 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 17025612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 26116457 - 26116271
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  26116457 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 26116358  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26116357 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 26116271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 29501564 - 29501750
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29501564 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 29501663  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29501664 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 29501750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 29573162 - 29573348
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29573162 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 29573261  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  29573262 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 29573348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 132; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 4545807 - 4545636
Alignment:
Q  16 ggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcg 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |    
T  4545807 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttg 4545708  T
Q  116 acaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4545707 acaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 4545636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 4525435 - 4525621
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  4525435 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatg 4525534  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4525535 ttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 4525621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 27007876 - 27008062
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  27007876 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgaccagggaaagctgacttttgagaataatg 27007975  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27007976 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtaaggaagctcctagacttgatgtcc 27008062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 27272627 - 27272441
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  27272627 catcaaggcgctctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcatcgatcaagggaagctgacctttgagaataatg 27272528  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27272527 ttccgcatgtcctcgataatcctcttccaaatcatgctgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggtagctcctagacttgatgtcc 27272441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 30558063 - 30557877
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  30558063 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 30557964  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  30557963 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 30557877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 27044536 - 27044723
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgct-atgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataat 99  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  27044536 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtggttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataat 27044635  T
Q  100 gttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27044636 gttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 27044723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 28207603 - 28207789
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28207603 catcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 28207702  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28207703 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 28207789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 124; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 26777662 - 26777475
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26777662 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 26777563  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcca 188  Q
    | ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  26777562 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaaaatcctagacttgatgtcca 26777475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 27485278 - 27485464
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27485278 catcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 27485377  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27485378 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtcc 27485464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 16944074 - 16943888
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16944074 catcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 16943975  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  16943974 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 16943888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 182
Target Start/End: Original strand, 20160865 - 20161031
Alignment:
Q  16 ggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcg 115  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||| || || || || || |    
T  20160865 ggtcatgatgtggaagggtgctatgctttgaagtatattgtgaaaaagctcatagaccaatggaagctgactttcgagaataacgtccctcatgttcttg 20160964  T
Q  116 acaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 182  Q
    ||||||| ||||  |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20160965 acaatcctcttctgaatcatgctgttgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 20161031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 22171966 - 22171800
Alignment:
Q  16 ggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcg 115  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||| || || || || || |    
T  22171966 ggtcatgatgtggaagggtgctatgctttgaagtatattgtgaaaaagctcatagaccaatggaagctgactttcgagaataacgtccctcatgttcttg 22171867  T
Q  116 acaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 182  Q
    ||||||| ||||  |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171866 acaatcctcttctgaatcatgctgttgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 22171800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 27290417 - 27290231
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||    
T  27290417 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatg 27290318  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | || || |||||| ||||||  ||||| ||||||||  |||| |||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  27290317 tccctcatgtcctcaacaatcttcttccgaatcatgctactgtaaatatgattgaggtatatgaggaagctcctagacttgatgtcc 27290231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 14143332 - 14143146
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || || ||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||| || |    
T  14143332 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 14143233  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | || || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||| ||||    
T  14143232 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtcc 14143146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22456981 - 22456795
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||||||| | ||||| |||||||||     
T  22456981 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagtacattgtgaagaagctcatagaccaaggaaagttaacttttgagaataatt 22456882  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | || || |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||  |||| || || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  22456881 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacgtgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 22456795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 26788093 - 26788279
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || || ||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||| || |    
T  26788093 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 26788192  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | || || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||| ||||    
T  26788193 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtcc 26788279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 27196466 - 27196652
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || || ||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||| || |    
T  27196466 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 27196565  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | || || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||| ||||    
T  27196566 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtcc 27196652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 27252774 - 27252588
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || || ||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||| || |    
T  27252774 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 27252675  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | || || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||| ||||    
T  27252674 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtcc 27252588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 13522120 - 13521939
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||| || || ||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||| || |    
T  13522120 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 13522021  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 182  Q
    | || || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  |||||||    
T  13522020 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 13521939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 33374303 - 33374131
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| |||||||| ||||| || ||||||||  ||||||| |||||||| |    
T  33374303 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacttttgagaataacg 33374204  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 173  Q
    | || || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||    
T  33374203 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 33374131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 8892357 - 8892186
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| |||||||| ||||| || ||||||||  |||| || |||||||| |    
T  8892357 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaa-ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 8892259  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 173  Q
    | || || ||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  8892258 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaagtatatgaggaagctcc 8892186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 8903592 - 8903421
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| |||||||| ||||| || ||||||||  |||| || |||||||| |    
T  8903592 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaa-ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 8903494  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 173  Q
    | || || ||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  8903493 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaagtatatgaggaagctcc 8903421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 28162806 - 28162978
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||  || ||||| || |||| |||||| |||||||| ||||| || ||||||||  |||| || |||||||| |    
T  28162806 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcggaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 28162905  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 173  Q
    | || || ||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | ||||||||||||    
T  28162906 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 28162978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 17092427 - 17092301
Alignment:
Q  61 aagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 160  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||   || || |||||||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||||  || || |    
T  17092427 aagctcattgaccagggaaagttgacttttgagaataatacccctcatgtcctcgataatccccttccaaaccacgctgctgtgaacatgactgaggtat 17092328  T
Q  161 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||    
T  17092327 gtgaggaagctaccaaacttgatgtcc 17092301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 22477320 - 22477240
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaag 81  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || || |||||||| || |||||||||    
T  22477320 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagtacattgtgaagaagctcatagaccaaggaaag 22477240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 23717989 - 23717803
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23717989 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 23717890  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23717889 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 23717803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 33777648 - 33777834
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33777648 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 33777747  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33777748 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 33777834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 9548544 - 9548358
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9548544 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 9548445  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9548444 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 9548358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 23752451 - 23752265
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23752451 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 23752352  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23752351 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 23752265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 24688158 - 24687972
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24688158 catcaaggcgctctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 24688059  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24688058 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 24687972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 11549515 - 11549701
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11549515 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 11549614  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  11549615 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgcgaggaagctcctagacttgatgtcc 11549701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15658761 - 15658575
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15658761 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 15658662  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15658661 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 15658575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 28649396 - 28649582
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28649396 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 28649495  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28649496 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 28649582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 30152179 - 30152365
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  30152179 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 30152278  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30152279 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 30152365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 30934794 - 30934980
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30934794 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 30934893  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30934894 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtatatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 30934980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 8665476 - 8665290
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  8665476 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 8665377  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8665376 ttccacatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtcc 8665290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22999115 - 22998929
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22999115 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 22999016  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22999015 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaaccatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 22998929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 40473550 - 40473364
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  40473550 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 40473451  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40473450 ttccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 40473364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 13324815 - 13324644
Alignment:
Q  16 ggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcg 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  13324815 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttg 13324716  T
Q  116 acaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13324715 acaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 13324644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 3789702 - 3789888
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3789702 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 3789801  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3789802 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 3789888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 9317612 - 9317798
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9317612 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 9317711  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  9317712 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 9317798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 12132316 - 12132502
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12132316 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 12132415  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  12132416 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 12132502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15758858 - 15758672
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15758858 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 15758759  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15758758 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 15758672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 18500731 - 18500553
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  18500731 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 18500632  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 179  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18500631 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 18500553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 24681601 - 24681787
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24681601 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 24681700  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24681701 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 24681787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 24724128 - 24724314
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24724128 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 24724227  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24724228 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 24724314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 31431601 - 31431787
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  31431601 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 31431700  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31431701 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 31431787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 37671484 - 37671298
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  37671484 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatg 37671385  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37671384 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 37671298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 37755141 - 37755327
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  37755141 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 37755240  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37755241 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 37755327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 43078413 - 43078599
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  43078413 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 43078512  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43078513 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 43078599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 2511212 - 2511398
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2511212 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 2511311  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2511312 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtcc 2511398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 24970179 - 24970365
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  24970179 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagcggacttttgagaataatg 24970278  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | || || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  24970279 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgctgtaaatatgatcaaagtacgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 24970365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 33516517 - 33516703
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  33516517 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 33516616  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  33516617 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 33516703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 34616679 - 34616865
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  34616679 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 34616778  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34616779 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtcc 34616865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 6874466 - 6874652
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  6874466 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagcttatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 6874565  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6874566 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 6874652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 26480553 - 26480739
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26480553 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 26480652  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  26480653 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 26480739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 37358644 - 37358458
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||     
T  37358644 catcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataata 37358545  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37358544 ttccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 37358458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 37770988 - 37770802
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  37770988 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcatgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatg 37770889  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37770888 ttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagcttctagacttgatgtcc 37770802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 124; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 28959787 - 28959600
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28959787 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 28959688  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcca 188  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  28959687 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtgtgtgaggagactcctagacttgatgtcca 28959600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18375413 - 18375227
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18375413 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 18375314  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18375313 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 18375227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 29967067 - 29966881
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29967067 catcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 29966968  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  29966967 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 29966881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 30029576 - 30029762
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  30029576 catcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 30029675  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  30029676 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 30029762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 31826408 - 31826222
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31826408 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 31826309  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31826308 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtcc 31826222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 5638071 - 5638257
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  5638071 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgaaaataatg 5638170  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  5638171 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgttgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 5638257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 32599458 - 32599286
Alignment:
Q  16 ggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcg 115  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||    
T  32599458 ggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcg 32599359  T
Q  116 acaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcca 188  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32599358 acaatccgctaccgaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagcccctagacttgatgtcca 32599286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 30168630 - 30168816
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  30168630 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctcacttttgagaataatg 30168729  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  30168730 tcccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaagaaactcctagacttgatgtcc 30168816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 29889083 - 29888897
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  29889083 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaagtacatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatg 29888984  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | || || |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  29888983 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtgtatgaggaagctcccagacttgatgtcc 29888897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 87; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 23892367 - 23892553
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||    
T  23892367 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaagatgctatgctctgaagtacatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatg 23892466  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||| || || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  23892467 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcatgctgctgtgaacgtgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 23892553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 22888631 - 22888815
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||    
T  22888631 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatg 22888730  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgt 185  Q
    | || || |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||||||||| |||||    
T  22888731 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcctagactcgatgt 22888815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 41674870 - 41675021
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41674870 catcaaggtgccctaggccatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagctgacttttgagaataatg 41674969  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgat 152  Q
    | ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||    
T  41674970 tgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgat 41675021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 25199190 - 25199374
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||    
T  25199190 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatg 25199289  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgt 185  Q
    | || || |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||| |||| || |||||||||||    
T  25199290 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgagaaagcccccagacttgatgt 25199374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 33877408 - 33877589
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||| || || ||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||| || |    
T  33877408 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 33877507  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 182  Q
    | || || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  |||||||    
T  33877508 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 33877589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 11325955 - 11326127
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || || ||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||| || |    
T  11325955 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 11326054  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 173  Q
    | || || ||||||||||| || ||||| ||||| |  ||||| || ||||| || || | ||||||||||||    
T  11326055 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgttgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 11326127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 33292686 - 33292837
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||    
T  33292686 catcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatg 33292785  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgat 152  Q
    | ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||  || |||||||||||    
T  33292786 tgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgatgccgtgaatatgat 33292837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 13184649 - 13184477
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| |||||||| ||||| || ||||||||  |||| || |||||||| |    
T  13184649 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 13184550  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 173  Q
    | || || ||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | ||||||||||||    
T  13184549 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 13184477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 13440495 - 13440323
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| |||||||| ||||| || ||||||||  |||| || |||||||| |    
T  13440495 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 13440396  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 173  Q
    | || || ||| |||||||||| ||||  ||||| || ||||| || ||||| || || | ||||||||||||    
T  13440395 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttctgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 13440323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 151; Significance: 4e-80; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 27608968 - 27608782
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27608968 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgagggatgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 27608869  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27608868 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 27608782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 14557776 - 14557962
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14557776 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 14557875  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14557876 tcccgcacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatgtgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 14557962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 16277706 - 16277892
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16277706 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 16277805  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16277806 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgccgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 16277892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 19688250 - 19688436
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  19688250 catcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatg 19688349  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  19688350 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgcgaggaagctcctagacttgatgtcc 19688436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 29829474 - 29829660
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  29829474 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 29829573  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29829574 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 29829660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 12092772 - 12092601
Alignment:
Q  16 ggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcg 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  12092772 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttg 12092673  T
Q  116 acaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12092672 acaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 12092601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 2137322 - 2137136
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2137322 catcaaggcgccttgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 2137223  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    |  | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  2137222 tctcgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagcatgtgagaaagctcctagacttgatgtcc 2137136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 19286614 - 19286800
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19286614 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 19286713  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19286714 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 19286800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 31489813 - 31489627
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31489813 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 31489714  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  31489713 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 31489627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 189258 - 189432
Alignment:
Q  13 ctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  189258 ctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcc 189357  T
Q  113 tcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  189358 tcgacaatcctcttccaaatcatgcctctgttaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 189432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 16283601 - 16283787
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16283601 catcaaggcaccctgggtcatgatgtcgaagggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 16283700  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16283701 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgattgaagtatgtgaggaagctcctagacttgttgtcc 16283787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 19208423 - 19208237
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19208423 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 19208324  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  19208323 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 19208237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 28362018 - 28361832
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28362018 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 28361919  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  28361918 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 28361832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 31354676 - 31354862
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31354676 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 31354775  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31354776 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcccagacttgatgtcc 31354862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 3329555 - 3329384
Alignment:
Q  16 ggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcg 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |    
T  3329555 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcaagggaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttg 3329456  T
Q  116 acaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3329455 acaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 3329384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 187
Target Start/End: Original strand, 19674608 - 19674779
Alignment:
Q  16 ggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcg 115  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  19674608 ggtcatgatgtcgagaggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcg 19674707  T
Q  116 acaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19674708 acaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 19674779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 33258875 - 33259061
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  33258875 catcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 33258974  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  33258975 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgttgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 33259061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 9354774 - 9354961
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaag-ctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataat 99  Q
    |||||||| ||  |||||||||| ||||| || ||||| || |||| |||||| ||||||||  ||||| || ||||||||  |||| || |||||||||    
T  9354774 catcaaggtgctatgggtcatgacgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataat 9354873  T
Q  100 gttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9354874 gttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtcc 9354961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 18710738 - 18710924
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18710738 catcagggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 18710837  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||| ||||    
T  18710838 tcccacatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtcc 18710924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 33244817 - 33244988
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| |||||||| ||||| || ||||||||  |||| || |||||||| |    
T  33244817 catcaaggtgcgctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 33244916  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctc 172  Q
    | || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||| || ||||| || || | |||||||||||    
T  33244917 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaaccacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctc 33244988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 22080941 - 22080787
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| || || || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||| | ||||| ||||| ||||    
T  22080941 catcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgaccagggaaagttaacttttgagaacaatg 22080842  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcga 155  Q
    | || || || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  22080841 tccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatcga 22080787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 19659102 - 19658926
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| |||||||| ||||| || ||||||||  |||| || |||||||| |    
T  19659102 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaa-ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 19659004  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagac 178  Q
    | || || |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| ||||    
T  19659003 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagac 19658926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 44563253 - 44563423
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| |||||||| ||||| || ||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  44563253 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaa-ctcatagaccaaggaaagttgacttttgagaataacg 44563351  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 173  Q
    | || || ||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | ||||||||||||    
T  44563352 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgt-aacatgattgaggtatatgaggaagctcc 44563423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 151; Significance: 4e-80; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 11424766 - 11424580
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11424766 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 11424667  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11424666 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtcc 11424580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 10916858 - 10916672
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10916858 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 10916759  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10916758 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 10916672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 26435410 - 26435596
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  26435410 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 26435509  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26435510 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 26435596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 16503370 - 16503185
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16503370 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgttttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 16503271  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtc 186  Q
    | || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16503270 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtc 16503185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 2154726 - 2154912
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2154726 catcaaggcgccctaggtcatgatgtcgagggatgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 2154825  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154826 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 2154912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 5147330 - 5147144
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  5147330 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 5147231  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5147230 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtcc 5147144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 16518406 - 16518221
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16518406 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgttttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatg 16518307  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtc 186  Q
    | || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16518306 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtc 16518221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 5128145 - 5128333
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5128145 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 5128244  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccat 189  Q
    | ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5128245 tcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccat 5128333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 31564365 - 31564194
Alignment:
Q  16 ggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcg 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  31564365 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttg 31564266  T
Q  116 acaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31564265 acaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 31564194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 4145113 - 4144927
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4145113 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 4145014  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  4145013 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 4144927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 26537860 - 26537674
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26537860 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 26537761  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26537760 tcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 26537674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 26669904 - 26669718
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26669904 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 26669805  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  26669804 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 26669718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 24592531 - 24592345
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24592531 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 24592432  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24592431 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcacgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 24592345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 26319859 - 26319673
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26319859 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 26319760  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  26319759 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 26319673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 45387496 - 45387682
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  45387496 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 45387595  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  45387596 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgaggcttgatgtcc 45387682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 9618804 - 9618990
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9618804 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 9618903  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  9618904 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 9618990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 11441725 - 11441911
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11441725 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 11441824  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11441825 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 11441911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 26275084 - 26274898
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26275084 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 26274985  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  26274984 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 26274898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 16736435 - 16736264
Alignment:
Q  16 ggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcg 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  16736435 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcg 16736336  T
Q  116 acaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16736335 acaatccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtcc 16736264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 16751489 - 16751318
Alignment:
Q  16 ggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcg 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  16751489 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcg 16751390  T
Q  116 acaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16751389 acaatccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtcc 16751318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 187
Target Start/End: Original strand, 17523700 - 17523871
Alignment:
Q  16 ggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcg 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  17523700 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcg 17523799  T
Q  116 acaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17523800 acaatccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtcc 17523871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 17529515 - 17529344
Alignment:
Q  16 ggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcg 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  17529515 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcg 17529416  T
Q  116 acaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17529415 acaatccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtcc 17529344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 31125073 - 31125259
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31125073 catcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 31125172  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31125173 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 31125259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 3445459 - 3445645
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3445459 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 3445558  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3445559 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgctgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtcc 3445645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 16449988 - 16449810
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||| |    
T  16449988 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaataacg 16449889  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 179  Q
    | || || |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  16449888 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 16449810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 16041476 - 16041660
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| ||||    
T  16041476 catcaaggtgctctgggtcatgatgtagaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaaaaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatg 16041575  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgt 185  Q
    | || || |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |  ||||||||||| ||||| |||||    
T  16041576 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatacgaggaagctcccagactcgatgt 16041660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 26484847 - 26485033
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || || ||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||| || |    
T  26484847 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 26484946  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | || || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||| ||||    
T  26484947 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtcc 26485033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 2108995 - 2108823
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || || ||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||| || |    
T  2108995 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 2108896  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 173  Q
    | || || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||    
T  2108895 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 2108823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 2775512 - 2775698
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||| || || ||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||| || |    
T  2775512 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 2775611  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | || || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||| ||||    
T  2775612 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtcc 2775698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 39211013 - 39210827
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || || ||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||| || |    
T  39211013 catcaaggtgctttgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 39210914  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | || || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||| ||||    
T  39210913 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtcc 39210827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 4200700 - 4200886
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||| || || ||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||| || |    
T  4200700 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 4200799  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | || || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||| ||||    
T  4200800 tccctcatgtcctcgataaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtcc 4200886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 18540952 - 18541103
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||    
T  18540952 catcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatg 18541051  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgat 152  Q
    | ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||    
T  18541052 tgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgat 18541103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 26682990 - 26682804
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||  ||||||| ||||| || ||||||||  |||| || |||||||| |    
T  26682990 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattttaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 26682891  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | || || ||| ||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||| ||||    
T  26682890 tccctcatgtcgtcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtcc 26682804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 5159672 - 5159820
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||||||  | || ||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||    
T  5159672 catcaaggcgctttagggcatgatgttaaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatg 5159771  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatat 149  Q
    | ||||| |||||||| ||||| || |||||| |||| || ||||||||    
T  5159772 tgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatgatgctgccgtgaatat 5159820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 31088454 - 31088282
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| |||||||| ||||| || ||||||||  |||| || |||||||| |    
T  31088454 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 31088355  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 173  Q
    | || || ||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | ||||||||||||    
T  31088354 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 31088282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 45733613 - 45733785
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| |||||||| ||||| || ||||||||  |||| || |||||||| |    
T  45733613 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 45733712  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 173  Q
    | || || ||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | ||||||||||||    
T  45733713 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 45733785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 151; Significance: 4e-80; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 28882362 - 28882548
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28882362 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 28882461  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28882462 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 28882548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 13936637 - 13936451
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13936637 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtacatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 13936538  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13936537 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 13936451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 23128659 - 23128473
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23128659 catcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 23128560  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23128559 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 23128473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 27434537 - 27434351
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27434537 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 27434438  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27434437 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 27434351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 12655690 - 12655876
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12655690 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 12655789  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12655790 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgccgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 12655876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 20838066 - 20838252
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20838066 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 20838165  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20838166 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatttgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 20838252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 27777370 - 27777556
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  27777370 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 27777469  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27777470 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 27777556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 27817128 - 27817314
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  27817128 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 27817227  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27817228 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 27817314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 39051915 - 39051729
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  39051915 catcaaggtgccttaggccatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 39051816  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39051815 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 39051729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 27803855 - 27804038
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  27803855 catcaaggtgccttaggccatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 27803954  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatg 184  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27803955 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatg 27804038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 12586958 - 12587144
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12586958 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaaggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 12587057  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12587058 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 12587144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 12716695 - 12716509
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  12716695 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 12716596  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12716595 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 12716509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 21677275 - 21677089
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21677275 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 21677176  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21677175 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtcc 21677089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 32049946 - 32050132
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  32049946 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 32050045  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32050046 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtcc 32050132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 16829431 - 16829245
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16829431 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 16829332  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  16829331 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 16829245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 16892050 - 16892236
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16892050 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 16892149  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  16892150 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 16892236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 34861828 - 34862014
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  34861828 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 34861927  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  34861928 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagactagatgtcc 34862014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 37375309 - 37375495
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  37375309 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 37375408  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37375409 tcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtggggaagctcctagacttgatgtcc 37375495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 37686002 - 37685816
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  37686002 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 37685903  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  37685902 tcccacacgtcctcgacaatccttttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 37685816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 37701267 - 37701081
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  37701267 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 37701168  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  37701167 tcccacacgtcctcgacaatccttttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 37701081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 37925641 - 37925827
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  37925641 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 37925740  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  37925741 tcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 37925827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 39890222 - 39890408
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  39890222 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctctgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 39890321  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39890322 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 39890408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 40233659 - 40233845
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  40233659 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 40233758  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40233759 ttccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaaaatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 40233845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 11635264 - 11635093
Alignment:
Q  16 ggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcg 115  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  11635264 ggtcatgatgttgaggggtgttatgctttgaagtacatcgtgaagaagcttgttgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcg 11635165  T
Q  116 acaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11635164 ataatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtcc 11635093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 11641453 - 11641282
Alignment:
Q  16 ggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcg 115  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  11641453 ggtcatgatgttgaggggtgttatgctttgaagtacatcgtgaagaagcttgttgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcg 11641354  T
Q  116 acaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11641353 ataatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtcc 11641282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 260846 - 260660
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  260846 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 260747  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | || || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  260746 tcccgcatgtcctcaacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagttcctagacttgatgtcc 260660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 31876429 - 31876615
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31876429 catcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 31876528  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  31876529 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 31876615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 19416592 - 19416406
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19416592 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaaactcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 19416493  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  19416492 ttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 19416406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 34286502 - 34286656
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34286502 catcaaggtgccctaggtcacgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 34286601  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcga 155  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  34286602 ttccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgccgtgaatatgatcga 34286656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 34291562 - 34291716
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34291562 catcaaggtgccctaggtcacgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 34291661  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcga 155  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  34291662 ttccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgccgtgaatatgatcga 34291716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22926121 - 22925935
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22926121 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 22926022  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||| ||||    
T  22926021 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtcc 22925935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 9350075 - 9349903
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  9350075 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacg 9349976  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 173  Q
    | || || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||    
T  9349975 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 9349903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 34279597 - 34279697
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34279597 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 34279696  T
Q  101 t 101  Q
    |    
T  34279697 t 34279697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 19456514 - 19456333
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || |  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  |||| || |||||||| |    
T  19456514 catcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagaatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 19456415  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 182  Q
    | || || |||||||||||||| ||||| ||||| || | |||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||    
T  19456414 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatgattgaggtatgtgaggaagctcccagacttga 19456333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 21703257 - 21703073
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| ||||    
T  21703257 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcaaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatg 21703158  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgt 185  Q
    | || || |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| ||||| |||||    
T  21703157 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactcgatgt 21703073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 31891421 - 31891249
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||| ||||| || ||||||||  |||| ||  ||||||| |    
T  31891421 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttaagaataacg 31891322  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 173  Q
    | || |||||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | ||||||||||||    
T  31891321 tccctcacgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 31891249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 34303396 - 34303210
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| |||||||| ||||| || ||||||||  |||| || |||||||| |    
T  34303396 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 34303297  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | || || ||| |||||||||| ||||| || ||||| ||| | || ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  34303296 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaaacatgctgctataaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 34303210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 27118836 - 27119013
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| |||||||| ||||| || ||||||||  |||| || |||||||| |    
T  27118836 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 27118935  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagac 178  Q
    | || || |||||||||||||| ||||| ||||| || | ||| || ||||| || || | |||||||||||| ||||    
T  27118936 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagac 27119013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 27393117 - 27393271
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| || || || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| ||||    
T  27393117 catcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatg 27393216  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcga 155  Q
    | || || || || |||||||| ||||| ||||| || | |||||| ||||||||    
T  27393217 tccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatgatcga 27393271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 3784802 - 3784974
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| |||||||| ||||| || ||||||||  |||| || |||||||| |    
T  3784802 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 3784901  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 173  Q
    | || || ||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | ||||||||||||    
T  3784902 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 3784974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 16163747 - 16163919
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||  |||||||||||| ||| || ||||| || |||| |||||| |||||||| ||||| || ||||||||  |||| || |||||||| |    
T  16163747 catcaaggtgctatgggtcatgatggcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 16163846  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 173  Q
    | || || ||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | ||||||||||||    
T  16163847 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 16163919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 34157159 - 34157330
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| |||||||| ||||| || ||||||||  |||| || |||||||| |    
T  34157159 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaa-ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 34157257  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 173  Q
    | || || ||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | ||||||||||||    
T  34157258 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 34157330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 40173 - 39987
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40173 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaggagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 40074  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40073 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 39987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 47089 - 46903
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47089 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 46990  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46989 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 46903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 187
Target Start/End: Original strand, 29918 - 30101
Alignment:
Q  4 caaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttc 103  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  29918 caaggcgccctgggtcacgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcc 30017  T
Q  104 cacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30018 cgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcttagacttgatgtcc 30101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 17014167 - 17014353
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17014167 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 17014266  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17014267 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 17014353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 14665185 - 14665371
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  14665185 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataata 14665284  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14665285 tcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 14665371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18800717 - 18800531
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18800717 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 18800618  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18800617 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 18800531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 24592418 - 24592232
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24592418 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 24592319  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24592318 tcccacatgtcctcgacaatcctcttcccaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 24592232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 36344619 - 36344433
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  36344619 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 36344520  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36344519 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 36344433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 187
Target Start/End: Original strand, 6570035 - 6570206
Alignment:
Q  16 ggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcg 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  6570035 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcg 6570134  T
Q  116 acaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6570135 acaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 6570206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 14763408 - 14763222
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  14763408 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 14763309  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14763308 tcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 14763222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 27163421 - 27163235
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27163421 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 27163322  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27163321 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 27163235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 30753921 - 30754107
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  30753921 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 30754020  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30754021 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 30754107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 33673902 - 33673716
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  33673902 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 33673803  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33673802 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtcc 33673716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 40105742 - 40105556
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  40105742 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 40105643  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  40105642 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 40105556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 54833554 - 54833740
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  54833554 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 54833653  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54833654 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 54833740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 31126622 - 31126436
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  31126622 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 31126523  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  31126522 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 31126436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 16 - 187
Target Start/End: Original strand, 39850820 - 39850991
Alignment:
Q  16 ggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcg 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  39850820 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttg 39850919  T
Q  116 acaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39850920 acaacccccttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 39850991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 5006040 - 5006226
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  5006040 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagttgacttttgagaataatg 5006139  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5006140 tcccacacgtcctcgacaatcctcttctgaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 5006226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 14098708 - 14098894
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  14098708 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 14098807  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  14098808 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 14098894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 21969868 - 21970054
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  21969868 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 21969967  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21969968 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaaatgtgtgaggaagttcctagacttgatgtcc 21970054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 15285032 - 15284851
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  |||| || |||||||| |    
T  15285032 catcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 15284933  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 182  Q
    | || || |||||||||||||| ||||| ||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||    
T  15284932 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgttgctgtgaacatgattgaggtatgtgaggaagctcccagacttga 15284851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 1900424 - 1900608
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || || |||||  ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  1900424 catcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacactttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaataatg 1900523  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgt 185  Q
    | ||  | ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| ||||| |||||    
T  1900524 tcccttatgtccttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactcgatgt 1900608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 24112829 - 24112980
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||    
T  24112829 catcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatg 24112928  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgat 152  Q
    | ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||    
T  24112929 tgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgat 24112980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 34189046 - 34188913
Alignment:
Q  19 catgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcctcgaca 118  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |    
T  34189046 catgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgata 34188947  T
Q  119 atccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgat 152  Q
    |||| || ||||||||||| || |||||||||||    
T  34188946 atccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgat 34188913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 14235629 - 14235478
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || || |||||||||| ||| ||||| |||||||| || || |||||| | ||||| ||||| ||||    
T  14235629 catcaaggtgctctgggccatgatgttgagggatgttacgctttgaagttcattgtaaagaagctcatagaccagggaaagttaacttttgagaacaatg 14235530  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgat 152  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  14235529 tccctcacgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 14235478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 15228037 - 15228221
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||| | || || |||||||| |    
T  15228037 catcaaggtgctctgggtcacgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaacctttgagaataacg 15228136  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgt 185  Q
    | |  || |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |  || | ||||  |||||| |||||||||||    
T  15228137 tccgtcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattggggtatatgagatagctcccagacttgatgt 15228221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 24460709 - 24460537
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| |||||||| ||||| || ||||||||  |||| || |||||||| |    
T  24460709 catcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacg 24460610  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcc 173  Q
    | || || ||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  24460609 tccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaagtatatgaggaagctcc 24460537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 15391442 - 15391288
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| || || || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||  | |||||| | ||||| ||||| ||||    
T  15391442 catcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgactagggaaagttaacttttgagaacaatg 15391343  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcga 155  Q
    | || || || || |||||||| ||||  ||||| || |||||||| ||||||||    
T  15391342 tccctcatgttcttgacaatcctcttctgaatcacgctgctgtgaacatgatcga 15391288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 146; Significance: 4e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 27444 - 27629
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27444 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 27543  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtc 186  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27544 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtc 27629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 139; Significance: 6e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 9718 - 9904
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9718 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 9817  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9818 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 9904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 139; Significance: 6e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 233 - 47
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  233 catcaaggcgcgttgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatg 134  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  133 tcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 47  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 135; Significance: 1e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 9170 - 8984
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9170 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 9071  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9070 tcccacacgtcctcgacaatcctctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtcc 8984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 20167 - 20353
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20167 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 20266  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20267 tcccacacgtcctcgacaatcctctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtcc 20353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 135; Significance: 1e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 30604 - 30790
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  30604 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatg 30703  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30704 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 30790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 20540 - 20723
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||    
T  20540 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaa-ttaacttttgagaacaatg 20638  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgt 185  Q
    | || || |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | ||| |||||||| ||||| |||||    
T  20639 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaagaagctcccagactcgatgt 20723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 135; Significance: 1e-70; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 10962821 - 10963007
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10962821 catcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 10962920  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10962921 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 10963007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 51638369 - 51638555
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  51638369 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 51638468  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51638469 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 51638555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 41793412 - 41793226
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41793412 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgtcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 41793313  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41793312 ttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 41793226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 28585132 - 28585318
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28585132 catcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 28585231  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  28585232 tcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 28585318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 16208135 - 16207951
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||    
T  16208135 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatg 16208036  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgt 185  Q
    | || || |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||| ||||||| |||||||||||    
T  16208035 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgagaaagctcccagacttgatgt 16207951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 20340439 - 20340253
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||| | ||||||||| | ||||| ||||| |||     
T  20340439 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaata 20340340  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | || || |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||| ||||    
T  20340339 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgacgtcc 20340253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 28152013 - 28152199
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || || ||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||| || |    
T  28152013 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacg 28152112  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | || || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||  | | ||||||||||||  ||||||| ||||    
T  28152113 tccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgagatatatgaggaagctcccggacttgacgtcc 28152199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 20461232 - 20461416
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  |||| || || ||||  |    
T  20461232 catcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgaaaatatcg 20461331  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgt 185  Q
    | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || | |||||| ||||| || || | |||| ||||||  |||||||||||    
T  20461332 tccctcatgtcctcgataatcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatgattgaggtatatgagcaagctcgcagacttgatgt 20461416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 7343 - 7157
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7343 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 7244  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  7243 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 7157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15034 - 14848
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15034 catcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 14935  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14934 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatgtgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 14848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 26305 - 26119
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26305 catcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 26206  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  26205 tcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 26119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 128; Significance: 2e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 6165 - 6344
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt-gaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataat 99  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  6165 catcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataat 6264  T
Q  100 gttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 179  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6265 gtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 6344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 2021 - 1838
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||    
T  2021 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaa-ttaacttttgagaacaatg 1923  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgt 185  Q
    | || || |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | ||| |||||||| ||||| |||||    
T  1922 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaagaagctcccagactcgatgt 1838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 127; Significance: 9e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 8101 - 8287
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  8101 catcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatg 8200  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8201 ttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 8287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 73; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 46912 - 46717
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtc--atg-atgtcgaggggtgc-tatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaa-gctgactttc-gaga 94  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||  ||||    
T  46912 catcaaggcgccctgggtcgaatggatgtcgaggggtgcgtatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaaagcggactttttgaga 46813  T
Q  95 ataatgttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatg-atcgaagtgtgtga-ggaagctcct-agacttgatgtcc 187  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||  |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  46812 ataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgctgtaaatatgaatcaaagtacgtgagggaagctcctaagacttgatgtcc 46717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 71; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 2762 - 2576
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||| | ||||||||| | ||||| ||||| |||     
T  2762 catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaata 2663  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 187  Q
    | || || |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||||| ||||    
T  2662 tccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgacgtcc 2576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 55; Significance: 8e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 710 - 568
Alignment:
Q  13 ctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacacgtcc 112  Q
    ||||| |||||||| || || || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| || || || |    
T  710 ctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaataatgtccctcatgttc 611  T
Q  113 tcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcga 155  Q
    | |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  610 ttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatcga 568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 52; Significance: 5e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 132 - 5
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||| | || |||||||| || |    
T  132 catcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaaccttcgagaacaacg 33  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttcc 128  Q
    | || || |||||||||||||| |||||    
T  32 tccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 5  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 21713 - 21867
Alignment:
Q  1 catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtaaaaaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatg 100  Q
    |||||||| || ||||| || ||||| || || || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||| | |||||  |||| ||||    
T  21713 catcaaggggctctgggccaagatgttgaaggatgttacgctttgaagtagattgtaaagaagctcattgaccagggaaagttaacttttaagaacaatg 21812  T
Q  101 ttccacacgtcctcgacaatccacttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcga 155  Q
    | || || || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  21813 tccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatcga 21867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University